CN111118202B

CN111118202B - 甘蓝型油菜种子油酸含量性状的c03染色体主效qtl位点、snp分子标记及应用

Info

Publication number: CN111118202B
Application number: CN202010115915.2A
Authority: CN
Inventors: 向阳; 杜才富; 梁龙兵; 唐敏强; 秦信蓉; 喻时周
Original assignee: GUIZHOU RAPE INSTITUTE
Current assignee: GUIZHOU RAPE INSTITUTE
Priority date: 2020-02-25
Filing date: 2020-02-25
Publication date: 2023-04-07
Anticipated expiration: 2040-02-25
Also published as: CN111118202A

Abstract

本发明提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点，位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间。较佳地，对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率为62.51％。与第一SNP分子标记紧密连锁，其位于第53853975位碱基，为A或G，该突变导致多态性。与第二SNP分子标记紧密连锁，其位于第57808820位碱基，为C或T，该突变导致多态性。与峰值SNP分子标记紧密连锁，其位于第56392730位碱基，为G或T，该突变导致多态性。还提供了相关的SNP分子标记及应用。本发明的C03染色体主效QTL位点对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

Description

甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点、SNP分子标记及应用

技术领域

本发明涉及分子生物学及油菜育种技术领域，特别涉及甘蓝型油菜种子油酸含量性状技术领域，具体是指一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点、SNP分子标记及应用。

背景技术

油菜是产油率最高的油料作物之一,是世界上特别是亚洲、欧洲和北美洲地区最重要的油料作物之一。我国油菜常年播种面积近700万公顷,总产量1200多万吨，年产油450万吨以上，年产值近130亿元(官春云,2010)。种植面积和总产一度均居世界首位。2009年统计数据显示，我国国产菜籽油占国产油料作物产量的57.2％，占国产植物油总量的42.8％,占国内植物油消费总量的17.4％。油菜产业成为我国植物油供给安全的重要保障。近年我国植物油年实际消费量高到2473.8万吨，但我国植物油年产只有900万～1000万吨,自给率仅40.6％。2013年我国油菜籽、菜籽油进口总量分别达到360万吨和148万吨，同比增幅分别达19％和27％，油料已成为我国对国际市场依存度最大的大宗农产品。

同时，随着人民生活水平的提高，对食用油的品质也提出了新的要求。亚油酸是一些包括鞘脂类和二十碳脂类在内的结构和功能脂的合成前体，由于动物体无法自身合成，因此是人体必须从外界摄入的必需脂肪酸。油酸具有降低血浆中低密度脂蛋白(LDL)胆固醇而不作用于高密度脂蛋白(HDL)胆固醇的作用，而LDL-胆固醇是冠状动脉疾病的真正危险因子，HDL-胆固醇则可抑制冠状动脉疾病。故高油酸植物油对人体的心血管具有很好的保健作用。近年来人们还发现高油酸油能有效甲酯化，有利于生物柴油的生产。菜籽油的营养价值高于大豆油，油酸含量接近橄榄油，俗称“东方橄榄油”，是消费者喜爱的优质健康食用油。因此，选育高油酸保健油菜新品种，开发高油酸优质营养健康菜籽油有利于保障我国食用植物油供给安全，有效推动我国健康产业的良性发展。

油酸含量受硬脂酸和亚油酸含量影响。促进油酸减饱和基因有两个:FAD2基因(存在内质网中)和FAD6基因(存在叶绿体中)。油酸含量从60％到近90％不等的事实也说明高油酸性状遗传比较复杂。高油酸遗传特性研究主要有3种观点：多基因控制、多基因控制和受环境影响、单基因控制。多数研究认为油酸遗传特性由多基因控制。

因此，需要提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的主效QTL位点，其对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择。

发明内容

为了克服上述现有技术中的缺点，本发明的一个目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点，其对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其可以检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记的应用，可以检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程，适于大规模推广应用。

本发明的另一目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记的应用，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。

为达到以上目的，在本发明的第一方面，提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点，其特点是，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间。

较佳地，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率为62.51％。

较佳地，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点与第一SNP分子标记紧密连锁，所述第一SNP分子标记位于所述第53853975位碱基，所述第53853975位碱基为A或G，该突变导致多态性。

较佳地，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点与第二SNP分子标记紧密连锁，所述第二SNP分子标记位于所述第57808820位碱基，所述第57808820位碱基为C或T，该突变导致多态性。

较佳地，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点与峰值SNP分子标记紧密连锁，所述峰值SNP分子标记位于所述的甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基，所述第56392730位碱基为G或T，该突变导致多态性。

在本发明的第二方面，提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其特点是，所述SNP分子标记位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基，所述第53853975位碱基为A或G，该突变导致多态性。

在本发明的第三方面，提供上述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

在本发明的第四方面，提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其特点是，所述SNP分子标记位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基，所述第57808820位碱基为C或T，该突变导致多态性。

在本发明的第五方面，提供上述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

在本发明的第六方面，提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记，其特点是，所述峰值SNP分子标记位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基，所述第56392730位碱基为G或T，该突变导致多态性。

在本发明的第七方面，提供上述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

本发明的有益效果主要在于：

1、本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间，其对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

2、本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，包括位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基的SNP分子标记、位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基的SNP分子标记和位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基的峰值SNP分子标记，其可以检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程，适于大规模推广应用。

3、本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，包括位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基的SNP分子标记、位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基的SNP分子标记和位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基的峰值SNP分子标记，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。

4、本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记的应用，包括位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基的SNP分子标记的应用、位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基的SNP分子标记的应用和位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基的峰值SNP分子标记的应用，其可以检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程，适于大规模推广应用。

5、本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记的应用，包括位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基的SNP分子标记的应用、位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基的SNP分子标记的应用和位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基的峰值SNP分子标记的应用，其设计巧妙，检测简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。

本发明的这些和其它目的、特点和优势，通过下述的详细说明、附图和权利要求得以充分体现，并可通过所附权利要求中特地指出的手段、产品和它们的组合得以实现。

附图说明

图1是本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的分布结果的示意图。

图2是本发明中利用甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记进行等位分析的示意图。

具体实施方式

本发明人经过深入的研究，首次揭示一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点及其SNP分子标记，利用其可以有效地对甘蓝型油菜种子油酸含量进行高效改良。

本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点，位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间。

还提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基，所述第53853975位碱基为A或G，该突变导致多态性。即为上述的第一SNP分子标记。

还提供上述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

还提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，位于甘蓝型油菜的C03染色体的第57808820位碱基，所述第57808820位碱基为C或T，该突变导致多态性。即为上述的第二SNP分子标记。

还提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记，位于甘蓝型油菜的C03染色体的第56392730位碱基，所述第56392730位碱基为G或T，该突变导致多态性。

还提供上述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件如J.萨姆布鲁克等编著，分子克隆实验指南，第三版，科学出版社，2002中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。

实施例1、甘蓝型油菜种子油酸含量性状的表型的测定

1.关联群体的种子油酸含量表型的测定

(1)对627份核心种质材料(来自贵州省油菜研究所种子库)的农艺和品质性状进行田间考种分析，选用300个来源世界各地的甘蓝型油菜高世代品系构成自然群体，其中包括98份资源、110份育种材料、92份品种或亲本；按区域划分，其中246份属于国内，54份属于国外来源。在贵阳市开阳县青禾乡和长顺县威远镇油菜基地完成3年2点的表型鉴定。

(2)采用直播定苗,行距40cm,株距25cm，行长3.5m，每个小区4行。试验材料田块四周种植保护行。

(3)种子油酸含量：在植株正常成熟后，每个小区取10株甘蓝型油菜，使用近红外扫描仪测定各成熟干净种子的种子油酸含量，单位为％。将300份材料的所有环境的表型值平均，结果汇总如下：

表1 300份材料的所有环境的种子油酸含量表型值的平均值

关联群体的种子油酸含量分布结果表明种子油酸含量性状表现分布呈连续性双峰分布，证明种子油酸含量性状受两个主效基因位点控制，见图1所示。

2.关联群体高质量SNP数据集的获得

采用CTAB方法提取叶片总DNA，提取关联群体的每份材料的叶片总DNA，具体方法为：

将幼嫩叶片置10％乙醇中漂洗；然后剪取0.1-0.2g叶片放入碾钵中，利用液氮快速碾磨至粉末状，装入2mL离心管中；加入预热DNA提取液700μL；混匀后置65℃水浴锅中1h，每10-15min混匀1次；加入700μL混合液(苯酚：氯仿:异戊醇＝25∶24∶1)，轻轻颠倒混匀10min；室温下，10 000×g离心15min；吸取上清液至新的2mL离心管中；加入等体积混合液(氯仿∶异戊醇＝24∶1)，颠倒混匀，静置5min，10000×g，离心15min，用枪吸取上清液到新的离心管中；加入2倍体积无水乙醇，混匀后在–20℃静置1h，10 000×g，离心10min，弃上清液；再加入500μL预冷的75％乙醇洗涤沉淀，去上清液；经过连续2次洗涤沉淀后，晾干；加入含有2％RNase A溶液100μL，在37℃静置1h后4℃过夜；用等体积混合液(氯仿∶异戊醇＝24∶1)再次抽提DNA溶液，颠倒混匀，静置10min，10 000×g，离心15或20min，去除RNase A，吸取上清液(约60μL)，再次离心，1min；利用琼脂糖凝胶电泳(0.8％)和紫外分光光度计检测DNA浓度、质量及完整性；确定所有DNA样品的吸光度260/280比值在1.8-2.0之间。然后将DNA样品干冰运输至测序公司(华大基因科技有限公司)，每个材料测序深度大约为9×。

根据上文描述获得高质量DNA后，测序公司(华大基因科技有限公司)进行9×覆盖深度的测序后返回的数据，先使用FastQC软件进行测序质量评估，然后对测序序列进行adapter和低质量reads过滤。得到每个材料的双端测序的clean data，然后使用bwa软件进行mapping以及GATK软件进行变异检测，得到关联群体总的SNP数据集后，根据最小等位基因频率≥0.05，缺失率≤0.1和杂合率≤0.15进行SNP数据集质量过滤，最终得到高质量的群体SNP数据集用于后续分析。

3.全基因组关联分析

使用plink软件对上一步产生的高质量SNP数据集的VCF文件进行格式转换，然后使用EMMAX软件将得到的种子油酸含量表型和SNP数据集进行全基因关联分析，得到种子油酸含量性状每个位点的P值，当P值小于5×10^-7的SNP即为显著SNP，P值最小的SNP即为峰值SNP，将峰值SNP在群体中的不同等位基因类型将材料进行分组，进行方差分析，组间方差与总方差的比值的百分比，即为该峰值SNP的贡献率。

通过分析，将甘蓝型油菜种子油酸含量性状的主效QTL位点的区间限定在甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间，对应的SNP为chrC03_53853975(A/G)，chrC03_57808820(C/T)，峰值SNP为：chrC03_56392730(G/T)，该QTL对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率为62.51％(根据峰值SNP的不同等位基因类型将材料分组，进行单因素方差分析，组间方差除以总方差的百分比即为贡献率)。

种子油酸含量性状的峰值SNP为：chrC03_56392730(G/T)，对应种子油酸含量表型分组为：当chrC03_56392730位置的SNP为GG时，材料的平均种子油酸含量为31.83％；GT时,材料的平均种子油酸含量为37.66％；TT时，材料的平均种子油酸含量为57.93％，见图2所示。

种子油酸含量性状的其中一个边界SNP为：chrC03_53853975(A/G)，对应种子油酸含量表型分组为：当chrC03_53853975位置的SNP为AA时，材料的平均种子油酸含量为40.21％；AG时,材料的平均种子油酸含量为45.07％；GG时，材料的平均种子油酸含量为59.12％，该边界SNP的贡献率为45.25％。

种子油酸含量性状的另一个边界SNP为：chrC03_57808820(C/T)，对应种子油酸含量表型分组为：当chrC03_57808820位置的SNP为CC时，材料的平均种子油酸含量为57.16％；CT时,材料的平均种子油酸含量为48.10％；TT时，材料的平均种子油酸含量为38.24％，该边界SNP的贡献率为37.67％。

甘蓝型油菜的全基因组序列已经公布，见http://www.genoscope.cns.fr/brassicanapus/。包含chrC03_53853975(A/G)的前后各400bp序列(共801bp)如SEQ ID NO:1所示，包含chrC03_57808820(C/T)的前后各400bp序列(共801bp)如SEQ ID NO:2所示，包含chrC03_56392730(G/T)的前后各400bp序列(共801bp)如SEQ ID NO:3所示。本领域技术人员可以采用常规方法根据上述序列设计检测SNP位点的特异性引物，从而检测SNP位点的基因型，由此可以检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程。

因此，本发明通过种子油酸含量性状的表型分析和全基因组重测序，然后进行全基因组关联分析，在甘蓝型油菜第C03号染色体上检测到一个甘蓝型油菜种子油酸含量性状的主效QTL位点，对甘蓝型油菜种子油酸含量的贡献率为62.51％。该甘蓝型油菜种子油酸含量性状的主效QTL位点位于甘蓝型油菜的C03染色体的第53853975位碱基～第57808820位碱基之间，边界显著SNP为chrC03_53853975(A/G)，chrC03_57808820(C/T)，峰值SNP为chrC03_56392730(G/T)，根据该与主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记，可以用于检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以用于预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低，可以用于对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行有效选择，还可以用于种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种，加速甘蓝型油菜高种子油酸含量育种的进程。

通过本发明公布的SNP分子标记进行分子标记辅助选择，鉴定方法简单，选择效率高，可预测甘蓝型油菜种子油酸含量。选择目标明确，不受环境的影响。可在甘蓝型油菜生育早期鉴定出种子油酸含量高的甘蓝型油菜单株，淘汰其它单株。

综上，本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点对甘蓝型油菜种子油酸含量性状的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

由此可见，本发明的目的已经完整并有效的予以实现。本发明的功能及结构原理已在实施例中予以展示和说明，在不背离所述原理下，实施方式可作任意修改。所以，本发明包括了基于权利要求精神及权利要求范围的所有变形实施方式。

序列表

<110> 贵州省油菜研究所

<120> 甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点、SNP分子标记及应用

<160> 3

<210> 1

<211> 801

<212> DNA

<213> 甘蓝型油菜（Brassica napus, L.）

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)...(801)

<223> 包含chrC03_53853975（A/G）的前后各400bp序列的基因组序列

<400> 1

acagaagcct ggagagattc atcatcctaa caaagctaca gtttctttgc agaaagccaa 60

caactttccc agctcactga acagtcatgg aactttagta aacctggcag gaaaattaat 120

gagccaaagt tagtttaaaa acccatcaaa gttactgaca aaagttcaaa tctttcaccc 180

caaaacagca atacacagaa ggaacaagag gaggttaagg aacctcacct gcttcaagcc 240

ccaatcattc aaaatgaaaa tgctattgag tgagaagaga caaccgtgta ctgaagggaa 300

tcagctgaaa ggaaacaata aatgaacaaa tgggctattc aatattgggt cccatttcaa 360

gatctaacac caagcaaggc aaagagataa aaaagagaga gaggaataaa ttttatctta 420

cccgaatgaa ataaattaga aacctttcac tgcaaaacaa tgacgagaga gatgaagaag 480

aaggaagaca aagacttgga gtggaagcag agtcaatttg tttccttagc tcatgcactg 540

caactacgga gtgctggata tggtttcgag catagttgac tgagagccag tgagaatctt 600

tgtgggttac cctttgaatg tcacactgta agagtattaa gaaccaaaca gagaaggcga 660

aaacaaaaaa aaagtgatga tagaaaaatt gcaagttttc atgtacgaca gtgacgaacg 720

acaaggactc ggtaaatggg tactcttgag gcgtgtgaag gagaaaaata gcagaaaaaa 780

aaaatacaca aaaggaaata g 801

<210> 2

<211> 801

<212> DNA

<213> 甘蓝型油菜（Brassica napus, L.）

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)...(801)

<223> 包含chrC03_57808820（C/T）的前后各400bp序列的基因组序列

<400> 2

gaaaaacgag aggaactaga gctagtcatt ggctgaagca cctgattgga tatcatatga 60

aatctagcaa cttcaataag aatgacagaa aggtggaact gttggattca aattgaggag 120

aggagaatta ttttcttggg tatgtgttat taactcacgg tttaatagat gtaattagat 180

tttaatcagg tttactattg gttaaaagtc aggtttataa aattctcggt ttagtttagg 240

tacagtaaac cagggcaatc aatctgtatg ggtttggagg ttttgaattt aaagtttacg 300

gagaattaca tatttaaatt ttgttttgtg gagaaatact tttcaaactt ttaattcgag 360

gatatataga atgaggtcat agtttgggag acatttgatg ttatacgatt accctataaa 420

attcacccct taccttaaag atttccgtta agcctttttt ctaacaaaaa aaatctcaaa 480

aatctgcaag aatagatatt gggcctaatt aggcatgtat tcaacagaac tatgtatata 540

tttttagatt agaccgatag gaatgcatta tgggtttaac ccgtctgtag tgtatttcaa 600

gtttgcagtg ttgctattga gatgagtggg tcaaagaaaa aattgtgagt ggtaattatc 660

aattttgcgt gtagccttaa cgcttacagt ttttaaaaat gtcggtttat taaaattatt 720

aatatacagt aaacgttaac gtaaacgcaa tacaaatata gtgtgattgg tggaaaagag 780

ctgaaagaaa aatggtaaaa a 801

<210> 3

<211> 801

<212> DNA

<213> 甘蓝型油菜（Brassica napus, L.）

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)...(801)

<223> 包含chrC03_56392730 (G/T)的前后各400bp序列的基因组序列

<400> 3

gctgggacac actgtttatc tgtgggatgc ttcaagtggc tccacatctg agcttgtgac 60

cattgatgaa gagaaaggac ctgtgacaag tatcaactgg gcacctgatg gtcgtcatgt 120

tgctcttggt ctcaacaact ctgaagtgca actgtgggat tctgcttcca accgtcaagt 180

aactacaaaa aaaaaaaaaa tcctctctct tatgttcaga cataatgtgc tgtctacttt 240

aacctgatgt gttgtacttt tttttttctg cagctaagga cattgaaggg ttgtcaccag 300

tcaagagtag gatccttggc gtggaacaat catattctga caactggagg aatggacgga 360

cagatcgtca acaacgacgt acggatcaga tcacacgtct tgagacctac aggggtcaca 420

ctcaagaaat ttgtgggctc aagtggtcag gatccggaca gcaactagcg agtggtggca 480

acgacaacgt ggtacacata tgggaccgtt ccgtggcctc ttcaaactcc accacgcagt 540

ggcttcacag gcttgaggag catacgtctg cagttaaagc ccttgcctgg tgccctttcc 600

aggcgaatct gctagcgact ggtggcggtg gaggagatag gacgattaag ttctggaaca 660

ctcacacggg ggcttgtttg aactcagtag acactggctc acaagtgtgt tcgttgttgt 720

ggagcaagaa tgaaagagag ttgcttagct cacacgggtt tgcacataat cagcttacgt 780

tgtggaagta tccatctatg g 801

Claims

1.一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述核苷酸序列的第401位碱基为A或G，该突变导致多态性。

2.根据权利要求1所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

3.一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示，所述核苷酸序列的第401位碱基为C或T，该突变导致多态性。

4.根据权利要求3所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。

5.一种甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记，其特征在于，所述峰值SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ IDNO:3所示，所述核苷酸序列的第401位碱基为G或T，该突变导致多态性。

6.根据权利要求5所述的甘蓝型油菜种子油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点的峰值SNP分子标记在检测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、预测甘蓝型油菜种子油酸含量的高低、对甘蓝型油菜种子油酸含量的高低进行选择或种子油酸含量高的甘蓝型油菜的分子标记辅助育种中的应用。