CN110184356A - 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用 - Google Patents

一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN110184356A
CN110184356A CN201910496712.XA CN201910496712A CN110184356A CN 110184356 A CN110184356 A CN 110184356A CN 201910496712 A CN201910496712 A CN 201910496712A CN 110184356 A CN110184356 A CN 110184356A
Authority
CN
China
Prior art keywords
sequence
probe
single strand
ddx11
strand dna
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201910496712.XA
Other languages
English (en)
Other versions
CN110184356B (zh
Inventor
黄晓军
阮国瑞
周亚兰
江浩
吴利新
王子龙
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Beijing Jinyu Medical Examination Laboratory Co ltd
Original Assignee
Peking University People's Hospital (second Clinical Medical College Of Peking University)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Peking University People's Hospital (second Clinical Medical College Of Peking University) filed Critical Peking University People's Hospital (second Clinical Medical College Of Peking University)
Priority to CN201910496712.XA priority Critical patent/CN110184356B/zh
Publication of CN110184356A publication Critical patent/CN110184356A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110184356B publication Critical patent/CN110184356B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118Prognosis of disease development
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种正常核型AML患者预后风险评估标记物。本发明保护用于检测DDX11基因的产品或用于检测DDX11基因突变的产品在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)‑(a4)中的至少一种:(a1)正常核型AML患者预后风险评估;(a2)正常核型AML患者累积复发率评估;(a3)正常核型AML患者无复发生存率评估;(a4)正常核型AML分层诊断。所述DDX11基因如序列表的序列1所示。本发明发现DDX11基因突变是成人正常核型AML患者累积复发率和无复发生存率的独立危险因素。用于检测DDX11基因突变的产品将在正常核型AML的分层诊断和预后评估中发挥重要作用。

Description

一种正常核型AML患者预后风险评估标记物及其应用
技术领域
本发明属于医学检测技术领域,具体涉及一种正常核型AML患者预后风险评估标记物及其应用。
背景技术
急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML)是一种起源于造血干细胞的恶性克隆性疾病,在血液系统恶性肿瘤中发病率最高,具有高度的分子生物学和临床异质性。利用细胞遗传学分析可将成人AML患者分为高、中、低危组,用于指导治疗和判断预后,然而,大约50%的成人AML患者初诊时具有正常的细胞遗传学且临床预后具有显著的差异,部分患者即使在接受强烈的诱导化疗及标准的巩固治疗甚至异基因造血干细胞移植后仍面临着疾病的进展和/或复发,提示新的预后相关分子标记物的发现和验证对于成人正常核型AML更精确的危险度分层及预后评估十分必要,且可能提供治疗靶点。
人类DDX11基因(NCBI编号:NM_001257144)位于12p11.21,是一种ATP依赖性的DNA解螺旋酶,参与多种生物过程,如DNA复制、DNA修复和异染色质组织以及核糖体RNA合成等,在维持基因组稳定性中起到重要作用。然而,目前尚未见DDX11在AML,尤其是在正常核型AML预后风险评估中的相关报道。
发明内容
本发明的目的是提供一种正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估标记物。
本发明首先保护用于检测DDX11基因的产品在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病患者分层诊断。
本发明还保护用于检测DDX11基因突变的产品在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病患者分层诊断。
本发明还保护一种试剂盒,所述试剂盒包括用于检测DDX11基因的产品或用于检测DDX11基因突变的产品;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病患者分层诊断。
进一步的,所述用于检测DDX11基因突变的产品或所述用于检测DDX11基因的产品包括用于检测DDX11基因突变或用于检测DDX11基因的引物和/或探针。
更进一步的,所述用于检测DDX11基因突变的产品或所述用于检测DDX11基因的产品包括由探针1-探针36组成的探针组;
所述探针1为序列表中序列1所示的单链DNA分子;
所述探针2为序列表中序列2所示的单链DNA分子;
所述探针3为序列表中序列3所示的单链DNA分子;
所述探针4为序列表中序列4所示的单链DNA分子;
所述探针5为序列表中序列5所示的单链DNA分子;
所述探针6为序列表中序列6所示的单链DNA分子;
所述探针7为序列表中序列7所示的单链DNA分子;
所述探针8为序列表中序列8所示的单链DNA分子;
所述探针9为序列表中序列9所示的单链DNA分子;
所述探针10为序列表中序列10所示的单链DNA分子;
所述探针11为序列表中序列11所示的单链DNA分子;
所述探针12为序列表中序列12所示的单链DNA分子;
所述探针13为序列表中序列13所示的单链DNA分子;
所述探针14为序列表中序列14所示的单链DNA分子;
所述探针15为序列表中序列15所示的单链DNA分子;
所述探针16为序列表中序列16所示的单链DNA分子;
所述探针17为序列表中序列17所示的单链DNA分子;
所述探针18为序列表中序列18所示的单链DNA分子;
所述探针19为序列表中序列19所示的单链DNA分子;
所述探针20为序列表中序列20所示的单链DNA分子;
所述探针21为序列表中序列21所示的单链DNA分子;
所述探针22为序列表中序列22所示的单链DNA分子;
所述探针23为序列表中序列23所示的单链DNA分子;
所述探针24为序列表中序列24所示的单链DNA分子;
所述探针25为序列表中序列25所示的单链DNA分子;
所述探针26为序列表中序列26所示的单链DNA分子;
所述探针27为序列表中序列27所示的单链DNA分子;
所述探针28为序列表中序列28所示的单链DNA分子;
所述探针29为序列表中序列29所示的单链DNA分子;
所述探针30为序列表中序列30所示的单链DNA分子;
所述探针31为序列表中序列31所示的单链DNA分子;
所述探针32为序列表中序列32所示的单链DNA分子;
所述探针33为序列表中序列33所示的单链DNA分子;
所述探针34为序列表中序列34所示的单链DNA分子;
所述探针35为序列表中序列35所示的单链DNA分子;
所述探针36为序列表中序列36所示的单链DNA分子。
所述用于检测DDX11基因突变的产品或所述用于检测DDX11基因的产品还可包括构建文库所需的试剂和/或PCR扩增所需试剂和/或基因组DNA提取所需试剂和/或纯化试剂。所述构建文库所需的试剂具体可包括末端修复所需试剂、加A尾所需试剂。所述PCR扩增所需试剂具体可为KAPA HiFi HotStart ReadyMix(2X)试剂盒(KAPA,KK2602)中的试剂。
本发明还保护DDX11基因作为靶标在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病患者分层诊断。
本发明还保护一种正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者预后风险评估。
所述方法中,如果待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因发生突变,待测患者与DDX11基因未发生突变的患者相比,累积复发率高和/或无复发生存率低。
本发明还保护一种正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者累积复发率评估。
所述方法中,如果待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因发生突变,待测患者与DDX11基因未发生突变的患者相比,累积复发率高。
本发明还保护一种正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者无复发生存率评估。
所述方法中,如果待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因发生突变,待测患者与DDX11基因未发生突变的患者相比,无复发生存率低。
以上任一所述DDX11基因全长如序列表的序列37所示,DDX11基因编码区序列如序列表的序列38所示,DDX11基因编码的蛋白质(DDX11蛋白)如序列表的序列39所示。
以上任一所述DDX11基因突变包括单个核苷酸变异、小片段插入缺失和拷贝数变异。
以上任一所述DDX11基因突变具体可为如下(b1)-(b14)中的任一种:
(b1)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第408位氨基酸的密码子由编码V的密码子突变为编码M的密码子;
(b2)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第316位氨基酸由编码T的密码子突变为编码L的密码子;
(b3)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第213位氨基酸的密码子由编码R的密码子突变为编码G的密码子;
(b4)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第191位氨基酸的密码子由编码E的密码子突变为编码A的密码子;
(b5)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第363位氨基酸的密码子由编码Q的密码子突变为编码K的密码子;
(b6)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第716位氨基酸的密码子由编码V的密码子突变为编码I的密码子;
(b7)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第764位氨基酸的密码子由编码G的密码子突变为编码V的密码子;
(b8)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第826位氨基酸的密码子由编码P的密码子突变为编码S的密码子;
(b9)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第182位氨基酸的密码子由编码P的密码子突变为编码R的密码子;
(b10)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第233位氨基酸的密码子由编码S的密码子突变为编码G的密码子;
(b11)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第274位氨基酸的密码子由编码S的密码子突变为编码N的密码子;
(b12)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第163位氨基酸的密码子缺失(NM_001257144(DDX11):c.487_489del(p.163_163del));
(b13)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第214位氨基酸的密码子由编码V的密码子突变为编码VDE的密码子(NM_001257144(DDX11):c.641_642insGGATGA(p.V214delinsVDE));
(b14)编码野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)第261位氨基酸的密码子由编码G的密码子(密码子GGC)突变为碱基GC(NM_001257144(DDX11):c.781delG(p.G261fs))。
以上任一所述DDX11基因突变具体可为如下(c1)-(c14)中的任一种:
(c1)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第1222位核苷酸由G突变为A;
(c2)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第947位核苷酸由C突变为T;
(c3)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第637位核苷酸由A突变为G;
(c4)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第572位核苷酸由A突变为C;
(c5)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第1087位核苷酸由C突变为A;
(c6)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第2146位核苷酸由G突变为A;
(c7)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第2291位核苷酸由G突变为T;
(c8)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第2476位核苷酸由C突变为T;
(c9)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第545位核苷酸由C突变为G;
(c10)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第697位核苷酸由A突变为G;
(c11)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第821位核苷酸由G突变为A;
(c12)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第487-489位核苷酸缺失;
(c13)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第641-642位核苷酸中间插入GGATGA(NM_001257144(DDX11):c.641_642insGGATGA(p.V214delinsVDE));
(c14)野生型DDX11基因(序列表的序列38)第781位核苷酸G缺失(NM_001257144(DDX11):c.781delG(p.G261fs))。
本发明通过研究发现DDX11基因突变是成人正常核型急性髓系白血病患者累积复发率(CIR)和无复发生存率(RFS)的独立危险因素。用于检测DDX11基因突变的产品将在正常核型急性髓系白血病的分层诊断和预后评估中发挥重要作用。
附图说明
图1为DDX11基因部分突变类型的Sanger测序验证结果。图1A为样本0951D:NM_001257144(DDX11):c.487_489del(p.163_163del),Exon5,del GAA。图1B为样本338B:NM_001257144(DDX11):c.641_642insGGATGA(p.V214delinsVDE),Exon6,ins GGATGA。图1C为样本2798E:NM 001257144(DDX11):c.781delG(p.G261fs),Exon7,del G。图1D为样本1032B:NM_001257144(DDX11):c.947C>T(p.P316L),Exon9,C>T。图1E为样本1682B:NM_001257144(DDX11):c.1087C>A(p.Q363K),Exon9,C>A。
图2为患者累积复发率(CIR)和无复发生存率(RFS)统计结果。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。
完全缓解(CR)定义为骨髓原始细胞<5%,中性粒细胞>1.0×109/L,血小板>100×109/L,无髓外白血病浸润,持续4周以上。
复发定义为完全缓解的患者出现骨髓原始细胞>5%或发生髓外白血病(参照文献:Bruce D.Cheson,John M.Bennett,Clara D.Bloomfield,et al.RevisedRecommendations of the International Working Group for Diagnosis,Standardization of Response Criteria,Treatment Outcomes,and ReportingStandards for Therapeutic Trials in Acute Myeloid Leukemia[J].Journal ofClinical Oncology,2003,21(24):4642-4649)。
DDX11基因全长如序列表的序列37所示,DDX11基因编码区序列如序列表的序列38所示,DDX11基因编码序列39所示的蛋白质。
实施例1、DDX11基因突变与正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估
一、研究对象
1、入选标准
收集2008年3月至2018年4月北京大学人民医院初诊为正常核型急性髓系白血病的310例患者作为研究组。入选标准:①年龄≥16岁;②符合正常核型急性髓系白血病标准诊断(参照WHO关于髓系肿瘤分类标准);③均为初诊患者,此前未进行任何相关治疗。患者或患者监护人(若患者年龄<18岁)均签署知情同意书。本研究获得北京大学人民医院医学伦理会批准,遵循赫尔辛基宣言。患者情况观察截止时间为2019年1月20日。
2、治疗方案及转归
1)诱导治疗方案:根据《成人急性髓系白血病(非急性早幼粒细胞白血病)中国诊疗指南(2017年版)》将诱导治疗方案分为标准剂量方案和低强度化疗方案。
标准剂量方案包括:IA10[去甲氧柔红霉素(IDA)10~12mg/m2×3d联合阿糖胞苷(Ara-C)100mg/m2×7d]、HAA[高三尖杉酯碱(HHT)2mg/m2×7d、阿克拉霉素(Acla)20mg×7d、Ara-C100mg/m2×7d]。
低强度化疗方案包括:IA8(IDA 8mg/m2×3d联合Ara-C 100mg/m2×7d)、小剂量DA[柔红霉素(DNR)40~45mg/m2×3d联合Ara-C100mg/m2×7d]、CAG±D(G-CSF联合Ara-C 20mg每12h 1次×14d、Acla 20mg×4d±地西他滨20mg/m2×5d)、小剂量MA(米托蒽醌2mg×7d或4mg×5d联合Ara-C 100mg/m2×7d)和其他方案(包括地西他滨50mg×4d或20mg/m2×5d联合米托蒽醌2mg×5d、阿糖胞苷等)。
所有患者接受诱导治疗方案,获得部分缓解(PR)患者采用原方案再进行诱导治疗;未缓解(NR)患者换用其他方案;获得完全缓解(CR)患者按照下述方法进行巩固治疗。
2)获得完全缓解(CR)后的治疗:获得CR后,给予高剂量Ara-C(2g/m2每12h 1次×3d)或以原方案巩固1个疗程后给予高剂量Ara-C巩固治疗。患者接受3~4个疗程高剂量Ara-C后,接受DA、MA、HAA或AE(阿糖胞苷、依托泊甙)等方案化疗,巩固治疗至少6个疗程。根据疾病危险分层、微小残留病(MRD)水平、供者、社会经济、自身状况、个人和家庭意愿等因素,部分在巩固化疗中位2(0~7)个疗程后接受异基因造血干细胞移植(allo-HSCT),移植方案参见文献:1.Huang XJ,Liu DH,Liu KY,et al.Haploidentical hematopoietic stemcell transplantation without in vitro T-cell depletion for the treatment ofhematological malignancies[J].Bone Marrow Transplant,2006,38(4):291-297.DOI:10.1038/sj.bmt.1705445.2.S,Schlenk RF,Kayser S,et al.Cytogenetics andage are major determinants of outcome in intensively treated acute myeloidleukemia patients older than 60years:results from AMLSG trial AML HD98-B[J].Blood,2006,108(10):3280-3288.DOI:10.1182/blood-2006-04-014324。
中枢神经系统白血病预防:患者在诱导和巩固化疗期间接受4-6次三联药物(甲氨蝶呤、阿糖胞苷和地塞米松)鞘内注射(参照文献:Yan CH,Jiang Q,Wang J,Xu LP,Liu DH,Jiang H,Chen H,Zhang XH,Liu KY,Huang XJ.Superior survival of unmanipulatedhaploidentical hematopoietic stem cell transplantation compared withchemotherapy alone used as post-remission therapy in adults with standard-risk acute lymphoblastic leukemia in first complete remission.Biol BloodMarrow Transplant.2014Sep;20(9):1314-21.)。
3)患者转归:292例(94.2%)患者经1-2疗程诱导缓解后达CR,18例患者为原发难治性,经历3-4疗程诱导治疗后达缓解。所有患者达CR之后均接受了巩固治疗,其中180例接受以化疗为主的巩固治疗,130例患者在巩固化疗中位2(0~7)个疗程后行异基因造血干细胞移植进行巩固治疗。130例行异基因造血干细胞移植患者中83例为半相合移植,39例为同胞全相合移植,8例为非血缘移植。
二、研究方案
1、标本采集
310例患者均在初诊时进行标本采集,采集方法为:采集患者骨髓4mL,加入EDTA抗凝,应用密度梯度离心法提取单个核细胞。采用美国Invitrogen公司DNAzol提取单个核细胞总DNA。
2、测序
对步骤1得到的样本进行深度靶区测序(TRS)。测序方法如下:取总量0.6μg以上的DNA样品建库。先将样本进行片段化,然后经末端修复、加A尾和连接接头后进行PCR。再利用生物素标记的探针进行杂交,用链霉素磁珠捕获外显子组区域。最后对捕获的区域加上标签后进行测序。具体步骤如下:
(1)对基因组DNA进行片段化处理,将基因组DNA经Covaris超声破碎仪随机打断成长度为200-300bp的片段;
(2)对步骤(1)获得的片段化的双链DNA进行末端修复;然后将“A”碱基加入到DNA片段的3’末端;最后在DNA片段两端分别连接上带有特异index的接头,得到连接产物;纯化连接产物以除去未连接的接头序列,采用KAPA HiFi HotStart ReadyMix(2X)试剂盒(KAPA,KK2602)对纯化后的连接产物进行PCR扩增,并纯化PCR产物,得到带有特异index的DNA文库;
(3)将表1中的各探针的5’端均进行生物素标记,得到生物素标记的探针。然后将带有特异index的DNA文库与生物素标记的探针进行液相杂交,捕获目的DNA片段;
表1、探针序列
(4)使用带链霉素的磁珠(DynabeadsTMM-270Streptavidin,Invitrogen,65305)捕获杂交的目的DNA片段并分离纯化(Ampure XP beads,Beckman,A63882),除去未结合的DNA片段;
(5)采用KAPA HiFi HotStart ReadyMix(2X)试剂盒(KAPA,KK2602)对捕获的DNA片段进行PCR扩增,并纯化PCR产物;
(6)文库构建完成后先使用Qubit 4.0进行初步定量,随后使用Agilent 2100对文库的Insert size进行检测,Insert size符合预期后,使用Q-PCR方法对文库的有效浓度进行准确定量,以保证文库质量;
(7)库检合格后,根据文库的有效浓度及数据产出需求进行Illumina HiSeqPE150测序。PE150(Pair end 150bp)为高通量双端测序,每端各测150bp。在构建的小片段文库中插入DNA,即插入片段是高通量测序直接测序的片段。双端测序是将每条插入片段的两端进行测序的方法。
3、测序结果分析
Mutect2用于鉴定SNV和INDEL的配对样本变体调用。通过正常样本的背景数据库过滤获得了候选变体。Pindel用于检测FLT3-ITD。为确保数据质量,采用以下标准过滤原始变异结果:每个样本的目标平均有效测序深度>=1000x;单个核苷酸变异和插入或缺失的等位基因突变频率>=1%;通过高映射质量(>=30)和基本质量(>=30)过滤所有读数;突变体读数需要由正链和负链同时支持。在dbSNP和ExAC数据库中报告而在COSMIC数据库中未报告为造血相关或体细胞突变的SNP位点被排除。所有变体均由ANNOVAR软件注释。
4、统计分析
采用SPSS19.0、Graphad Prism 5.0和R统计软件进行数据分析。运用Kaplan-Meier法计算生存率,Log-rank检验进行生存分析,建立Cox比例风险回归模型对DDX11基因突变情况及其他可能影响预后的因素进行多因素分析,研究DDX11基因突变对累积复发率(CIR)和无复发生存率(RFS)等预后指标的影响。将P>0.1变量从模型中逐步剔除,以P<0.05为差异有统计学意义。
三、研究结果
高频基因突变显示,在310例患者中,共有DDX11突变阳性患者23例,占7.4%。23例DDX11突变阳性患者具体突变情况如下:
4例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第1222位核苷酸由G突变为A。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第408位氨基酸由V突变为M;
4例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第947位核苷酸由C突变为T。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第316位氨基酸由T突变为L;
3例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第637位核苷酸由A突变为G。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第213位氨基酸由R突变为G;
2例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第572位核苷酸由A突变为C。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第191位氨基酸由E突变为A;
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第1087位核苷酸由C突变为A。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第363位氨基酸由Q突变为K。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第2146位核苷酸由G突变为A。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第716位氨基酸由V突变为I。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第2291位核苷酸由G突变为T。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第764位氨基酸由G突变为V。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第2476位核苷酸由C突变为T。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第826位氨基酸由P突变为S。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第545位核苷酸由C突变为G。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第182位氨基酸由P突变为R。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第697位核苷酸由A突变为G。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第233位氨基酸由S突变为G。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第821位核苷酸由G突变为A。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第274位氨基酸由S突变为N。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第487-489位核苷酸缺失。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第163位氨基酸缺失。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第641-642位核苷酸中间插入GGATGA。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第214位氨基酸由V突变为VDE。
1例:与野生型DDX11基因的编码区(序列表的序列38)的区别在于:第781位核苷酸G缺失。与野生型DDX11蛋白(序列表的序列39)的区别在于:第261位氨基酸G后发生移码突变。
对23例突变患者所涉及的全部14种突变类型中的5种进行了Sanger测序验证。部分测序结果如图1所示。测序结果表明:本发明方法得到的检测结果与Sanger测序法得到的结果完全一致。说明本发明得到的DDX11基因突变检测结果是可靠的。
由于DDX11检出频率(7.4%)相对较低,随机选取初诊时年龄、白细胞计数、FLT3-ITD及NPM1基因突变状态等预后相关因素相匹配的DDX11野生型患者113例与23例DDX11突变型患者进行预后分析以更好的平衡两组患者之间除DDX11因素之外的其他已知预后相关因子。
单因素分析结果表明:相比DDX11野生型患者,DDX11突变型患者具有较高的5年CIR(100%vs.59.2%,P=<0.001)以及更差的5年RFS(0vs.38.4%,P=<0.001)(图2)。
纳入DDX11突变、年龄(大于等于60岁或小于60岁)、白细胞计数(大于等于100×109/L或小于100×109/L)、巩固治疗两个疗程后的MRD(大于等于0.01%或小于0.01%)、FLT3-ITD、NPM1、DNMT3A突变状态预后相关因素,多因素分析显示,DDX11突变是CIR(HR=2.15[1.12,4.13];P=0.021)和RFS(HR=2.12[1.03,4.38];P=0.042)的独立危险因素(表2)。
表2、310例患者CIR和RFS多因素分析
预后指标 纳入因素 HR(95%可信区间) P值
CIR
NPM1(突变/野生) 0.45(0.21,0.93) 0.031
流式微小残留(+/-) 7.60(3.85,15.01) <0.001
FLT3-ITD(突变/野生) 2.049(1.08,3.85) 0.028
DNMT3A(突变/野生) 3.53(1.73,7.21) <0.001
DDX11(突变/野生) 2.15(1.12,4.13) 0.021
RFS
NPM1(突变/野生) 0.41(0.20,0.84) 0.014
流式微小残留(+/-) 8.07(3.95,16.51) <0.001
FLT3-ITD(突变/野生) 2.02(1.03,3.95) 0.040
DNMT3A(突变/野生) 3.61(1.72,7.58) 0.001
DDX11(突变/野生) 2.12(1.03,4.38) 0.042
结果表明,DDX11基因突变是成人正常核型急性髓系白血病患者CIR和RFS的独立危险因素。本发明可能在正常核型急性髓系白血病的分层诊断和预后评估中发挥重要作用。
序列表
<110> 北京大学人民医院(北京大学第二临床医学院)
<120> 一种正常核型AML患者预后风险评估标记物及其应用
<160> 39
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
catggctaat gaaacacaga aggttggtgc catccatttt ccttttccct tcacacccta 60
ttccatccag gaagacttca tggcagagct gtaccgggtt ttggaggctg gcaagattgg 120
<210> 2
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
ggtgccatcc attttccttt tcccttcaca ccctattcca tccaggaaga cttcatggca 60
gagctgtacc gggttttgga ggctggcaag attgggatat ttgagagtcc aactggcact 120
<210> 3
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
ggggaagtcc ttaagtctta tttgtggggc cctctcttgg ctccgtgact ttgaacagaa 60
gaagcgtgaa gaagaggcac gactccttga aactggaact ggccccttac atgatgagaa 120
<210> 4
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
agatgaatcc ctgtgtctgt cttcttcctg cgaaggggct gcaggcaccc cgaggcctgc 60
tggagaaccg gcctgggtta ctcagtttgt gcagaagaaa gaagagaggg acctggtgga 120
<210> 5
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
ctgtgtctgt cttcttcctg cgaaggggct gcaggcaccc cgaggcctgc tggagaaccg 60
gcctgggtta ctcagtttgt gcagaagaaa gaagagaggg acctggtgga ccgactaaag 120
<210> 6
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
ggcggagcag gccaggagga agcagcgaga agaacgcctg cagcagctgc agcacagggt 60
gcagctcaag tatgcagcca agcgcctggt gagcctcatt tcttgggggg caggattatg 120
<210> 7
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
gaggcaggaa gaagaagaaa gagagaatct cctccgcctc agcagggaga tgctagagac 60
aggcccggag gctgagcggc tggagcagct ggagtctggg gaggaggagc tggtcctcgc 120
<210> 8
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
cagcagggag atgctagaga caggcccgga ggctgagcgg ctggagcagc tggagtctgg 60
ggaggaggag ctggtcctcg ccgaatacga gagtgatgag gagaaaaagg tggcgagcag 120
<210> 9
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
gagtggatga ggatgaggat gacctggagg aagaacacat aactaaggta acacaagtgt 60
cctcagctgg tgctgtgctg ggggtatagg ctgggctgtg cacccctggg gaggaggctg 120
<210> 10
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
gatttattac tgtagtcgga cacactccca gctggcccag tttgtgcatg aggtgaagaa 60
gagccccttt ggcaaggatg ttcggctggt ctcccttggc tcccggcagg taaacagtag 120
<210> 11
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
gaacctttgt gtaaatgaag acgtgaaaag cctaggttct gtgcagctta tcaacgaccg 60
ctgtgtggac atgcagagaa gcaggcacgg tagccactgg gaccatggtg tagccgcagg 120
<210> 12
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
gagaagaaga aaggagctga ggaggagaag ccaaagagga ggaggcagga gaagcaggca 60
gcctgcccct tctacaacca cgagcagatg ggccttctcc gggatgaggc cctggcagag 120
<210> 13
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
ggccttctcc gggatgaggc cctggcagag gtgaaggaca tggagcagct gctggccctt 60
gggaaggagg cccgggcctg tccctattac gggagccgcc ttgccatccc tgcagcccag 120
<210> 14
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
gctggtggtg ctgccctatc agatgctgct gcatgcggcc actcggcagg ccgcgggcat 60
ccggctgcag gaccaggtgg tgatcatcga cgaggcgcac aacctgatcg acaccatcac 120
<210> 15
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
gcggccactc ggcaggccgc gggcatccgg ctgcaggacc aggtggtgat catcgacgag 60
gcgcacaacc tgatcgacac catcacgggc atgcacagcg tggaggtcag cggctcccag 120
<210> 16
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
gctctgccag gcccattccc agctgctgca gtacgtggag cgatacgggt gagatgtgac 60
cctctgaggt agtgggacag tcccttggtg gccccctgcg tgggcctctg agaggcaggc 120
<210> 17
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
ggaagcgttt gaaggccaag aacctgatgt acctgaagca gatcctgtat ttgctggaga 60
aattcgtggc tgtgctaggg ggtgagagcc tcgtccccct gctgaccccg ggcctgcaaa 120
<210> 18
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 18
gggaacatta agcaaaatcc caatacacag agtctgtcac agacaggtaa gagagttgcc 60
ctcagagggc ccagagctga tctgagccac ttccgagctt aaccctggga ctgaaacctg 120
<210> 19
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 19
gggacggagc tgaagaccat caacgacttt ctcttccaga gccagatcga caacatcaac 60
ctgttcaagg tagaggtttc cacctttcca cattccacat ccaatttcct tcctgtcacc 120
<210> 20
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 20
ggtgcagcga tactgtgaga agagcatgat cagcagaaag gtaactgctc ccatcttgtg 60
gtcctgaaca agacccagct gtgccccaac cccctgccct tgccatgctt tcctcccctg 120
<210> 21
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 21
gctctttgga ttcactgaac ggtacggagc agtgttctca tcccgggagc agcccaaact 60
ggctgggttt cagcaattcc tgcagagcct gcagcccagg acgactgaag gtgaggcagg 120
<210> 22
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 22
gctcttgcag cccctgcaga cgagagtcag gccagcaccc tgcgaccagc ttctccactg 60
atgcacatcc aaggcttcct ggcagctctc actacggcca accaggacgg cagggtcatc 120
<210> 23
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 23
ctgcagacga gagtcaggcc agcaccctgc gaccagcttc tccactgatg cacatccaag 60
gcttcctggc agctctcact acggccaacc aggacggcag ggtcatcctg agccgccaag 120
<210> 24
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 24
ggcagcctca gtcagagcac cctgaagttt ttgctcctga atccagctgt gcactttgcc 60
caagtggtga aggaatgccg ggcagtggtc attgcggggg gtaccatgca gccggtaagg 120
<210> 25
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 25
ggtgtctgac ttccggcagc agctgctggc ctgtgccggg gtggaagctg agcgcgtggt 60
ggagttttcc tgtggtgaga agctgtgccc agggtggggc aggctagagg tcaggttctg 120
<210> 26
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 26
ggtcacgtga tccctccaga caacatcctg cccctcgtca tctgcagcgg gatctccaac 60
cagccgctgg aattcacgtt ccagaaaaga gagctgcctc agatggtcag tcccagccag 120
<210> 27
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 27
gatggacgag gtgggtcgca ttctctgtaa cctgtgcggt gtggttcctg gaggggtggt 60
ctgtttcttc ccctcctacg agtacctgcg ccaggtccat gcccactggg agaagggtgg 120
<210> 28
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 28
ctgtgcggtg tggttcctgg aggggtggtc tgtttcttcc cctcctacga gtacctgcgc 60
caggtccatg cccactggga gaagggtggc ctgctgggcc gtctggctgc caggaagaag 120
<210> 29
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 29
gatattccag gaacctaaga gcgcacacca ggtggagcag gtgctgctgg catattccag 60
gtgcatccag gtgcgggcgt catgctgggc ttgggtctga gatcgtgtgg gggtggcagc 120
<210> 30
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 30
ggcctgtggc caggagagag gccaggtgac aggggccctg ctcctctctg tggttggagg 60
aaagatgagt gaagggatca acttctctga caacctaggc cggtaagtag tggttctgct 120
<210> 31
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 31
ggtgtgtggt gatggtgggc atgcccttcc ccaacatcag gtctgcagag ctgcaggaga 60
agatggccta cttggatcaa accctcgtga gtgaccccag tgtcacagag ggtgacagga 120
<210> 32
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 32
gagcccccgg ccaggcaccc ccagggaagg ctctggtgga gaacctgtgc atgaaggccg 60
tcaaccagtc cataggtgag cctggctgcc tccagctggg tggacagatg ggggctggag 120
<210> 33
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 33
ggcagggcca tcaggcacca gaaggatttt gccagcgtag tgctcctgga ccagcgatat 60
gcccggcccc ctgtcctggc caagctgccg gcctggatcc gagcccgtgt ggaggtcaaa 120
<210> 34
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 34
gtagtgctcc tggaccagcg atatgcccgg ccccctgtcc tggccaagct gccggcctgg 60
atccgagccc gtgtggaggt caaagctacc tttggccccg ccattgctgc tgtgcagaag 120
<210> 35
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 35
gtttcaccgg gagaagtcgg cctcttcctg atgggcaacc acaccactgc ctggcgccgt 60
gcccttcctt tgtcctgccc gctggagaca gtgtttgtcg tgggcgtggt ctgcggggat 120
<210> 36
<211> 120bp
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 36
gtctgcgggg atcctgttac aaaggtgaaa cccaggagga gagtgtggag tccagagtgc 60
tgccaggacc caggcacagg cgttagctcc cgtaggagaa aatgggggaa tcctgaatga 120
<210> 37
<211> 3823
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 37
tgcgcagcgg cgggggttgt tccggctgcc tttcactgag gggacccgcc agtttctaac 60
tcagtggcgt ttgccctgat tcccggggcc tggctttcag cgtagcaatt ctgccggcga 120
agaaggtcca tggctaatga aacacagaag gttggtgcca tccattttcc ttttcccttc 180
acaccctatt ccatccagga agacttcatg gcagagctgt accgggtttt ggaggctggc 240
aagattggga tatttgagag tccaactggc actgggaagt ccttaagtct tatttgtggg 300
gccctctctt ggctccgtga ctttgaacag aagaagcgtg aagaagaggc acgactcctt 360
gaaactggaa ctggcccctt acatgatgag aaagatgaat ccctgtgtct gtcttcttcc 420
tgcgaagggg ctgcaggcac cccgaggcct gctggagaac cggcctgggt tactcagttt 480
gtgcagaaga aagaagagag ggacctggtg gaccgactaa aggcggagca ggccaggagg 540
aagcagcgag aagaacgcct gcagcagctg cagcacaggg tgcagctcaa gtatgcagcc 600
aagcgcctga ggcaggaaga agaagaaaga gagaatctcc tccgcctcag cagggagatg 660
ctagagacag gcccggaggc tgagcggctg gagcagctgg agtctgggga ggaggagctg 720
gtcctcgccg aatacgagag tgatgaggag aaaaaggtgg cgagcagagt ggatgaggat 780
gaggatgacc tggaggaaga acacataact aagatttatt actgtagtcg gacacactcc 840
cagctggccc agtttgtgca tgaggtgaag aagagcccct ttggcaagga tgttcggctg 900
gtctcccttg gctcccggca gaacctttgt gtaaatgaag acgtgaaaag cctaggttct 960
gtgcagctta tcaacgaccg ctgtgtggac atgcagagaa gcaggcacga gaagaagaaa 1020
ggagctgagg aggagaagcc aaagaggagg aggcaggaga agcaggcagc ctgccccttc 1080
tacaaccacg agcagatggg ccttctccgg gatgaggccc tggcagaggt gaaggacatg 1140
gagcagctgc tggcccttgg gaaggaggcc cgggcctgtc cctattacgg gagccgcctt 1200
gccatccctg cagcccagct ggtggtgctg ccctatcaga tgctgctgca tgcggccact 1260
cggcaggccg cgggcatccg gctgcaggac caggtggtga tcatcgacga ggcgcacaac 1320
ctgatcgaca ccatcacggg catgcacagc gtggaggtca gcggctccca gctctgccag 1380
gcccattccc agctgctgca gtacgtggag cgatacggga agcgtttgaa ggccaagaac 1440
ctgatgtacc tgaagcagat cctgtatttg ctggagaaat tcgtggctgt gctagggggg 1500
aacattaagc aaaatcccaa tacacagagt ctgtcacaga cagggacgga gctgaagacc 1560
atcaacgact ttctcttcca gagccagatc gacaacatca acctgttcaa ggtgcagcga 1620
tactgtgaga agagcatgat cagcagaaag ctctttggat tcactgaacg gtacggagca 1680
gtgttctcat cccgggagca gcccaaactg gctgggtttc agcaattcct gcagagcctg 1740
cagcccagga cgactgaagc tcttgcagcc cctgcagacg agagtcaggc cagcaccctg 1800
cgaccagctt ctccactgat gcacatccaa ggcttcctgg cagctctcac tacggccaac 1860
caggacggca gggtcatcct gagccgccaa ggcagcctca gtcagagcac cctgaagttt 1920
ttgctcctga atccagctgt gcactttgcc caagtggtga aggaatgccg ggcagtggtc 1980
attgcggggg gtaccatgca gccggtgtct gacttccggc agcagctgct ggcctgtgcc 2040
ggggtggaag ctgagcgcgt ggtggagttt tcctgtggtc acgtgatccc tccagacaac 2100
atcctgcccc tcgtcatctg cagcgggatc tccaaccagc cgctggaatt cacgttccag 2160
aaaagagagc tgcctcagat gatggacgag gtgggtcgca ttctctgtaa cctgtgcggt 2220
gtggttcctg gaggggtggt ctgtttcttc ccctcctacg agtacctgcg ccaggtccat 2280
gcccactggg agaagggtgg cctgctgggc cgtctggctg ccaggaagaa gatattccag 2340
gaacctaaga gcgcacacca ggtggagcag gtgctgctgg catattccag gtgcatccag 2400
gcctgtggcc aggagagagg ccaggtgaca ggggccctgc tcctctctgt ggttggagga 2460
aagatgagtg aagggatcaa cttctctgac aacctaggcc ggtgtgtggt gatggtgggc 2520
atgcccttcc ccaacatcag gtctgcagag ctgcaggaga agatggccta cttggatcaa 2580
accctcagcc cccggccagg cacccccagg gaaggctctg gtggagaacc tgtgcatgaa 2640
ggccgtcaac cagtccatag gcagggccat caggcaccag aaggattttg ccagcgtagt 2700
gctcctggac cagcgatatg cccggccccc tgtcctggcc aagctgccgg cctggatccg 2760
agcccgtgtg gaggtcaaag ctacctttgg ccccgccatt gctgctgtgc agaagtttca 2820
ccgggagaag tcggcctctt cctgatgggc aaccacacca ctgcctggcg ccgtgccctt 2880
cctttgtcct gcccgctgga gacagtgttt gtcgtgggcg tggtctgcgg ggatcctgtt 2940
acaaaggtga aacccaggag gagagtgtgg agtccagagt gctgccagga cccaggcaca 3000
ggcgttagct cccgtaggag aaaatggggg aatcctgaat gaacagtggg tcctggctgt 3060
ccttggggcg ttccagggca gctcccctcc tggaatagaa tctttctttc catcctgcat 3120
ggctgagagc caggcttcct tcctggtctc cgcaggaggc tgtggcagct gtggcatcca 3180
ctgtggcatc tccgtcctgc ccaccttctt aagaggcgag atggagcagg cccatctgcc 3240
tctgcccttt ctagccaagg ttatagctgc cctggactgc tcactctctg gtctcaattt 3300
aaaatgatcc atggccacag ggctcctgcc caggggcttg tcaccttccc ctcctccttc 3360
ctgagtcact ccttcagtag aaggccctgc tccctatcct gtcccacagc cctgcctgga 3420
tttgtatcct tggcttcgtg ccagttcctc caagtctatg gcacctccct ccctctcaac 3480
cacttgagca aactccaaga caccttctac cccaacacca gcaattatgc caagggccgt 3540
taggctctca acatgactat agagaccccg tgtcatcacg gagacctttg ttcctgtggg 3600
aaaatatccc tcccacctgc aacagctgcc cctgctgact gcgcctgtct tctccctctg 3660
accccagaga aaggggctgt ggtcagctgg gatcttctgc caccatcagg gacaaacggg 3720
ggcaggagga aagtcactga tgcccagatg tttgcatcct gcacagctat aggtccttaa 3780
ataaaagtgt gctgttggtt aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa 3823
<210> 38
<211> 2913
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 38
atggctaatg aaacacagaa ggttggtgcc atccattttc cttttccctt cacaccctat 60
tccatccagg aagacttcat ggcagagctg taccgggttt tggaggctgg caagattggg 120
atatttgaga gtccaactgg cactgggaag tccttaagtc ttatttgtgg ggccctctct 180
tggctccgtg actttgaaca gaagaagcgt gaagaagagg cacgactcct tgaaactgga 240
actggcccct tacatgatga gaaagatgaa tccctgtgtc tgtcttcttc ctgcgaaggg 300
gctgcaggca ccccgaggcc tgctggagaa ccggcctggg ttactcagtt tgtgcagaag 360
aaagaagaga gggacctggt ggaccgacta aaggcggagc aggccaggag gaagcagcga 420
gaagaacgcc tgcagcagct gcagcacagg gtgcagctca agtatgcagc caagcgcctg 480
aggcaggaag aagaagaaag agagaatctc ctccgcctca gcagggagat gctagagaca 540
ggcccggagg ctgagcggct ggagcagctg gagtctgggg aggaggagct ggtcctcgcc 600
gaatacgaga gtgatgagga gaaaaaggtg gcgagcagag tggatgagga tgaggatgac 660
ctggaggaag aacacataac taagatttat tactgtagtc ggacacactc ccagctggcc 720
cagtttgtgc atgaggtgaa gaagagcccc tttggcaagg atgttcggct ggtctccctt 780
ggctcccggc agaacctttg tgtaaatgaa gacgtgaaaa gcctaggttc tgtgcagctt 840
atcaacgacc gctgtgtgga catgcagaga agcaggcacg agaagaagaa aggagctgag 900
gaggagaagc caaagaggag gaggcaggag aagcaggcag cctgcccctt ctacaaccac 960
gagcagatgg gccttctccg ggatgaggcc ctggcagagg tgaaggacat ggagcagctg 1020
ctggcccttg ggaaggaggc ccgggcctgt ccctattacg ggagccgcct tgccatccct 1080
gcagcccagc tggtggtgct gccctatcag atgctgctgc atgcggccac tcggcaggcc 1140
gcgggcatcc ggctgcagga ccaggtggtg atcatcgacg aggcgcacaa cctgatcgac 1200
accatcacgg gcatgcacag cgtggaggtc agcggctccc agctctgcca ggcccattcc 1260
cagctgctgc agtacgtgga gcgatacggg aagcgtttga aggccaagaa cctgatgtac 1320
ctgaagcaga tcctgtattt gctggagaaa ttcgtggctg tgctaggggg gaacattaag 1380
caaaatccca atacacagag tctgtcacag acagggacgg agctgaagac catcaacgac 1440
tttctcttcc agagccagat cgacaacatc aacctgttca aggtgcagcg atactgtgag 1500
aagagcatga tcagcagaaa gctctttgga ttcactgaac ggtacggagc agtgttctca 1560
tcccgggagc agcccaaact ggctgggttt cagcaattcc tgcagagcct gcagcccagg 1620
acgactgaag ctcttgcagc ccctgcagac gagagtcagg ccagcaccct gcgaccagct 1680
tctccactga tgcacatcca aggcttcctg gcagctctca ctacggccaa ccaggacggc 1740
agggtcatcc tgagccgcca aggcagcctc agtcagagca ccctgaagtt tttgctcctg 1800
aatccagctg tgcactttgc ccaagtggtg aaggaatgcc gggcagtggt cattgcgggg 1860
ggtaccatgc agccggtgtc tgacttccgg cagcagctgc tggcctgtgc cggggtggaa 1920
gctgagcgcg tggtggagtt ttcctgtggt cacgtgatcc ctccagacaa catcctgccc 1980
ctcgtcatct gcagcgggat ctccaaccag ccgctggaat tcacgttcca gaaaagagag 2040
ctgcctcaga tgatggacga ggtgggtcgc attctctgta acctgtgcgg tgtggttcct 2100
ggaggggtgg tctgtttctt cccctcctac gagtacctgc gccaggtcca tgcccactgg 2160
gagaagggtg gcctgctggg ccgtctggct gccaggaaga agatattcca ggaacctaag 2220
agcgcacacc aggtggagca ggtgctgctg gcatattcca ggtgcatcca ggcctgtggc 2280
caggagagag gccaggtgac aggggccctg ctcctctctg tggttggagg aaagatgagt 2340
gaagggatca acttctctga caacctaggc cggtgtgtgg tgatggtggg catgcccttc 2400
cccaacatca ggtctgcaga gctgcaggag aagatggcct acttggatca aaccctcagc 2460
ccccggccag gcacccccag ggaaggctct ggtggagaac ctgtgcatga aggccgtcaa 2520
ccagtccata ggcagggcca tcaggcacca gaaggatttt gccagcgtag tgctcctgga 2580
ccagcgatat gcccggcccc ctgtcctggc caagctgccg gcctggatcc gagcccgtgt 2640
ggaggtcaaa gctacctttg gccccgccat tgctgctgtg cagaagtttc accgggagaa 2700
gtcggcctct tcctgatggg caaccacacc actgcctggc gccgtgccct tcctttgtcc 2760
tgcccgctgg agacagtgtt tgtcgtgggc gtggtctgcg gggatcctgt tacaaaggtg 2820
aaacccagga ggagagtgtg gagtccagag tgctgccagg acccaggcac aggcgttagc 2880
tcccgtagga gaaaatgggg gaatcctgaa tga 2913
<210> 39
<211> 970
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 39
Met Ala Asn Glu Thr Gln Lys Val Gly Ala Ile His Phe Pro Phe Pro
1 5 10 15
Phe Thr Pro Tyr Ser Ile Gln Glu Asp Phe Met Ala Glu Leu Tyr Arg
20 25 30
Val Leu Glu Ala Gly Lys Ile Gly Ile Phe Glu Ser Pro Thr Gly Thr
35 40 45
Gly Lys Ser Leu Ser Leu Ile Cys Gly Ala Leu Ser Trp Leu Arg Asp
50 55 60
Phe Glu Gln Lys Lys Arg Glu Glu Glu Ala Arg Leu Leu Glu Thr Gly
65 70 75 80
Thr Gly Pro Leu His Asp Glu Lys Asp Glu Ser Leu Cys Leu Ser Ser
85 90 95
Ser Cys Glu Gly Ala Ala Gly Thr Pro Arg Pro Ala Gly Glu Pro Ala
100 105 110
Trp Val Thr Gln Phe Val Gln Lys Lys Glu Glu Arg Asp Leu Val Asp
115 120 125
Arg Leu Lys Ala Glu Gln Ala Arg Arg Lys Gln Arg Glu Glu Arg Leu
130 135 140
Gln Gln Leu Gln His Arg Val Gln Leu Lys Tyr Ala Ala Lys Arg Leu
145 150 155 160
Arg Gln Glu Glu Glu Glu Arg Glu Asn Leu Leu Arg Leu Ser Arg Glu
165 170 175
Met Leu Glu Thr Gly Pro Glu Ala Glu Arg Leu Glu Gln Leu Glu Ser
180 185 190
Gly Glu Glu Glu Leu Val Leu Ala Glu Tyr Glu Ser Asp Glu Glu Lys
195 200 205
Lys Val Ala Ser Arg Val Asp Glu Asp Glu Asp Asp Leu Glu Glu Glu
210 215 220
His Ile Thr Lys Ile Tyr Tyr Cys Ser Arg Thr His Ser Gln Leu Ala
225 230 235 240
Gln Phe Val His Glu Val Lys Lys Ser Pro Phe Gly Lys Asp Val Arg
245 250 255
Leu Val Ser Leu Gly Ser Arg Gln Asn Leu Cys Val Asn Glu Asp Val
260 265 270
Lys Ser Leu Gly Ser Val Gln Leu Ile Asn Asp Arg Cys Val Asp Met
275 280 285
Gln Arg Ser Arg His Glu Lys Lys Lys Gly Ala Glu Glu Glu Lys Pro
290 295 300
Lys Arg Arg Arg Gln Glu Lys Gln Ala Ala Cys Pro Phe Tyr Asn His
305 310 315 320
Glu Gln Met Gly Leu Leu Arg Asp Glu Ala Leu Ala Glu Val Lys Asp
325 330 335
Met Glu Gln Leu Leu Ala Leu Gly Lys Glu Ala Arg Ala Cys Pro Tyr
340 345 350
Tyr Gly Ser Arg Leu Ala Ile Pro Ala Ala Gln Leu Val Val Leu Pro
355 360 365
Tyr Gln Met Leu Leu His Ala Ala Thr Arg Gln Ala Ala Gly Ile Arg
370 375 380
Leu Gln Asp Gln Val Val Ile Ile Asp Glu Ala His Asn Leu Ile Asp
385 390 395 400
Thr Ile Thr Gly Met His Ser Val Glu Val Ser Gly Ser Gln Leu Cys
405 410 415
Gln Ala His Ser Gln Leu Leu Gln Tyr Val Glu Arg Tyr Gly Lys Arg
420 425 430
Leu Lys Ala Lys Asn Leu Met Tyr Leu Lys Gln Ile Leu Tyr Leu Leu
435 440 445
Glu Lys Phe Val Ala Val Leu Gly Gly Asn Ile Lys Gln Asn Pro Asn
450 455 460
Thr Gln Ser Leu Ser Gln Thr Gly Thr Glu Leu Lys Thr Ile Asn Asp
465 470 475 480
Phe Leu Phe Gln Ser Gln Ile Asp Asn Ile Asn Leu Phe Lys Val Gln
485 490 495
Arg Tyr Cys Glu Lys Ser Met Ile Ser Arg Lys Leu Phe Gly Phe Thr
500 505 510
Glu Arg Tyr Gly Ala Val Phe Ser Ser Arg Glu Gln Pro Lys Leu Ala
515 520 525
Gly Phe Gln Gln Phe Leu Gln Ser Leu Gln Pro Arg Thr Thr Glu Ala
530 535 540
Leu Ala Ala Pro Ala Asp Glu Ser Gln Ala Ser Thr Leu Arg Pro Ala
545 550 555 560
Ser Pro Leu Met His Ile Gln Gly Phe Leu Ala Ala Leu Thr Thr Ala
565 570 575
Asn Gln Asp Gly Arg Val Ile Leu Ser Arg Gln Gly Ser Leu Ser Gln
580 585 590
Ser Thr Leu Lys Phe Leu Leu Leu Asn Pro Ala Val His Phe Ala Gln
595 600 605
Val Val Lys Glu Cys Arg Ala Val Val Ile Ala Gly Gly Thr Met Gln
610 615 620
Pro Val Ser Asp Phe Arg Gln Gln Leu Leu Ala Cys Ala Gly Val Glu
625 630 635 640
Ala Glu Arg Val Val Glu Phe Ser Cys Gly His Val Ile Pro Pro Asp
645 650 655
Asn Ile Leu Pro Leu Val Ile Cys Ser Gly Ile Ser Asn Gln Pro Leu
660 665 670
Glu Phe Thr Phe Gln Lys Arg Glu Leu Pro Gln Met Met Asp Glu Val
675 680 685
Gly Arg Ile Leu Cys Asn Leu Cys Gly Val Val Pro Gly Gly Val Val
690 695 700
Cys Phe Phe Pro Ser Tyr Glu Tyr Leu Arg Gln Val His Ala His Trp
705 710 715 720
Glu Lys Gly Gly Leu Leu Gly Arg Leu Ala Ala Arg Lys Lys Ile Phe
725 730 735
Gln Glu Pro Lys Ser Ala His Gln Val Glu Gln Val Leu Leu Ala Tyr
740 745 750
Ser Arg Cys Ile Gln Ala Cys Gly Gln Glu Arg Gly Gln Val Thr Gly
755 760 765
Ala Leu Leu Leu Ser Val Val Gly Gly Lys Met Ser Glu Gly Ile Asn
770 775 780
Phe Ser Asp Asn Leu Gly Arg Cys Val Val Met Val Gly Met Pro Phe
785 790 795 800
Pro Asn Ile Arg Ser Ala Glu Leu Gln Glu Lys Met Ala Tyr Leu Asp
805 810 815
Gln Thr Leu Ser Pro Arg Pro Gly Thr Pro Arg Glu Gly Ser Gly Gly
820 825 830
Glu Pro Val His Glu Gly Arg Gln Pro Val His Arg Gln Gly His Gln
835 840 845
Ala Pro Glu Gly Phe Cys Gln Arg Ser Ala Pro Gly Pro Ala Ile Cys
850 855 860
Pro Ala Pro Cys Pro Gly Gln Ala Ala Gly Leu Asp Pro Ser Pro Cys
865 870 875 880
Gly Gly Gln Ser Tyr Leu Trp Pro Arg His Cys Cys Cys Ala Glu Val
885 890 895
Ser Pro Gly Glu Val Gly Leu Phe Leu Met Gly Asn His Thr Thr Ala
900 905 910
Trp Arg Arg Ala Leu Pro Leu Ser Cys Pro Leu Glu Thr Val Phe Val
915 920 925
Val Gly Val Val Cys Gly Asp Pro Val Thr Lys Val Lys Pro Arg Arg
930 935 940
Arg Val Trp Ser Pro Glu Cys Cys Gln Asp Pro Gly Thr Gly Val Ser
945 950 955 960
Ser Arg Arg Arg Lys Trp Gly Asn Pro Glu
965 970

Claims (10)

1.用于检测DDX11基因的产品在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病分层诊断。
2.用于检测DDX11基因突变的产品在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病分层诊断。
3.一种试剂盒,包括用于检测DDX11基因的产品;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病分层诊断。
4.一种试剂盒,包括用于检测DDX11基因突变的产品;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病分层诊断。
5.根据权利要求1或2所述的应用或权利要求3或4所述的试剂盒,其特征在于:所述用于检测DDX11基因突变的产品或所述用于检测DDX11基因的产品为用于检测DDX11基因突变或用于检测DDX11基因的引物和/或探针。
6.根据权利要求5所述的应用或试剂盒,其特征在于:所述用于检测DDX11基因突变的产品为由探针1-探针36组成的探针组;
所述探针1为序列表中序列1所示的单链DNA分子;
所述探针2为序列表中序列2所示的单链DNA分子;
所述探针3为序列表中序列3所示的单链DNA分子;
所述探针4为序列表中序列4所示的单链DNA分子;
所述探针5为序列表中序列5所示的单链DNA分子;
所述探针6为序列表中序列6所示的单链DNA分子;
所述探针7为序列表中序列7所示的单链DNA分子;
所述探针8为序列表中序列8所示的单链DNA分子;
所述探针9为序列表中序列9所示的单链DNA分子;
所述探针10为序列表中序列10所示的单链DNA分子;
所述探针11为序列表中序列11所示的单链DNA分子;
所述探针12为序列表中序列12所示的单链DNA分子;
所述探针13为序列表中序列13所示的单链DNA分子;
所述探针14为序列表中序列14所示的单链DNA分子;
所述探针15为序列表中序列15所示的单链DNA分子;
所述探针16为序列表中序列16所示的单链DNA分子;
所述探针17为序列表中序列17所示的单链DNA分子;
所述探针18为序列表中序列18所示的单链DNA分子;
所述探针19为序列表中序列19所示的单链DNA分子;
所述探针20为序列表中序列20所示的单链DNA分子;
所述探针21为序列表中序列21所示的单链DNA分子;
所述探针22为序列表中序列22所示的单链DNA分子;
所述探针23为序列表中序列23所示的单链DNA分子;
所述探针24为序列表中序列24所示的单链DNA分子;
所述探针25为序列表中序列25所示的单链DNA分子;
所述探针26为序列表中序列26所示的单链DNA分子;
所述探针27为序列表中序列27所示的单链DNA分子;
所述探针28为序列表中序列28所示的单链DNA分子;
所述探针29为序列表中序列29所示的单链DNA分子;
所述探针30为序列表中序列30所示的单链DNA分子;
所述探针31为序列表中序列31所示的单链DNA分子;
所述探针32为序列表中序列32所示的单链DNA分子;
所述探针33为序列表中序列33所示的单链DNA分子;
所述探针34为序列表中序列34所示的单链DNA分子;
所述探针35为序列表中序列35所示的单链DNA分子;
所述探针36为序列表中序列36所示的单链DNA分子。
7.DDX11基因作为靶标在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为如下(a1)-(a4)中的至少一种:
(a1)正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估;
(a2)正常核型急性髓系白血病患者累积复发率评估;
(a3)正常核型急性髓系白血病患者无复发生存率评估;
(a4)正常核型急性髓系白血病分层诊断。
8.一种正常核型急性髓系白血病患者预后风险评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者预后风险评估。
9.一种正常核型急性髓系白血病患者预后复发率评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者累积复发率评估。
10.一种正常核型急性髓系白血病患者预后无复发生存率评估方法,包括如下步骤:检测待测患者单个核细胞DNA中DDX11基因突变情况,根据DDX11基因突变情况进行患者无复发生存率评估。
CN201910496712.XA 2019-06-10 2019-06-10 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用 Active CN110184356B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910496712.XA CN110184356B (zh) 2019-06-10 2019-06-10 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910496712.XA CN110184356B (zh) 2019-06-10 2019-06-10 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110184356A true CN110184356A (zh) 2019-08-30
CN110184356B CN110184356B (zh) 2022-09-27

Family

ID=67720986

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910496712.XA Active CN110184356B (zh) 2019-06-10 2019-06-10 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110184356B (zh)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107312861A (zh) * 2017-08-01 2017-11-03 北京大学人民医院 一种b‑all患者预后风险评估标记物
CN108707670A (zh) * 2018-06-11 2018-10-26 北京大学人民医院 一种在b-all患者中有预后评估意义的标记物

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107312861A (zh) * 2017-08-01 2017-11-03 北京大学人民医院 一种b‑all患者预后风险评估标记物
CN108707670A (zh) * 2018-06-11 2018-10-26 北京大学人民医院 一种在b-all患者中有预后评估意义的标记物

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JOSE-MARIO C-C等: "Identification and Biochemical characterization of a novel mutation in DDX11 causing Warsaw Breakage syndrome", 《HUMAN MUTATION》 *
YA-LAN ZHOU等: "Dead/H-Box helicase 11(DDX11) mutations correlate with increased relapse risk in persons with acute myeloid leukaemia and promote proliferation and survival of human AML cells in vitro and in immune deficient mice", 《BLOOD》 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN110184356B (zh) 2022-09-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5421374B2 (ja) 悪性神経膠腫におけるイソクエン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子および他の遺伝子の遺伝子変化
ES2374954T3 (es) Variaciones genéticas asociadas con tumores.
CN107075730A (zh) 循环核酸的鉴定及用途
EP2865262B1 (en) Method for preparing patient-specific glioblastoma animal model, and use thereof
CN104736723B (zh) 用于预测对fgf‑18化合物的响应性的遗传标记
CN107312861B (zh) 一种b-all患者预后风险评估标记物
CN108707670A (zh) 一种在b-all患者中有预后评估意义的标记物
CN109952383A (zh) 用于预测恩扎妥林活性的方法和组合物
WO2019004080A1 (ja) 融合遺伝子及び/又はエクソンスキッピングにより生ずる転写産物を検出するためのプローブ及び方法
CN108277283A (zh) lncRNA组合在制备预测肾透明细胞癌预后及分子靶向药物治疗敏感性的产品中的应用
CN110229897A (zh) Med12基因突变检测试剂盒及其应用
CN109837340A (zh) 用于肺癌无创诊断的外周血基因标记物
CA2666057C (en) Genetic variations associated with tumors
CN106845154A (zh) 一种用于ffpe样本拷贝数变异检测的装置
Qu et al. Two novel polymorphisms in PLCE1 are associated with the susceptibility to esophageal squamous cell carcinoma in Chinese population.
CN111518896B (zh) 用于检测尼古丁依赖相关的snp位点的引物组、应用、产品及方法
CN102912018B (zh) 一种检测WT1基因mRNA表达量的试剂盒
KR20230146139A (ko) 암 유전자 및 항암제 대사 관련 유전자 변이 분석을 위한 차세대 염기 서열 분석(ngs) 기반 혼합 진단 패널
CN107604069A (zh) 基于Taqman‑MGB探针的人JAK2 V617F突变检测试剂盒和方法
CN110184356A (zh) 一种正常核型aml患者预后风险评估标记物及其应用
CN111187834A (zh) 胃肠道间质瘤的靶点depdc5及其在诊断和治疗中的应用
CN107267611B (zh) 一种检测p.Pro189Ala位点基因型的引物组及其检测试剂盒和应用
KR20170051747A (ko) 피부 주름 발생 민감도 진단용 단일염기다형성 마커 및 이의 용도
KR101676089B1 (ko) 폐암환자의 예후진단용 다형성 마커 및 이를 이용한 폐암 예후 예측방법
CN114514327A (zh) 使用同步标志物检测评估弥漫性神经胶质瘤和对治疗的应答性

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
TR01 Transfer of patent right
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20230731

Address after: 100020 101, 201, 301 and 401, 1 / F, 2 / F, building 26, yard 6, Jingshun East Street, Chaoyang District, Beijing

Patentee after: BEIJING JINYU MEDICAL EXAMINATION LABORATORY Co.,Ltd.

Address before: 100044 No. 11 South Main Street, Xicheng District, Beijing, Xizhimen

Patentee before: PEKING University PEOPLE'S HOSPITAL (PEKING UNIVERSITY SECOND CLINICAL MEDICAL College)