CN109929024A - 羊λ3干扰素突变体及其制备方法和应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种羊λ3干扰素突变体及其制备方法和应用。本发明首先公开了一种羊λ3干扰素突变体，其氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示。本发明将所述羊λ3干扰素突变体第58位氨基酸由丙氨酸突变成缬氨酸得到氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的突变体，其抗病毒活性明显提高。本发明进一步将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示突变体进行氨基酸单位点突变、双位点突变和多位点突变，获得多个抗病毒活性提高的羊λ3干扰素突变体。本发明利用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕生物反应器中表达的所述羊λ3干扰素突变体的抗病毒活性大幅度提高。本发明提供的羊λ3干扰素突变体能够用于制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂。

Description

羊λ3干扰素突变体及其制备方法和应用

技术领域

本发明涉及一种羊λ3干扰素突变体，还涉及一种利用家蚕杆状病毒表达系统制备所述羊λ3干扰素突变体的方法；本发明还涉及所述羊λ3干扰素突变体在制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂中的应用，属于羊λ3干扰素突变体的制备及应用领域。

背景技术

干扰素是一类在同种细胞上具有抗病毒活性的蛋白质，其活性的发挥又受细胞基因组的调节和控制，涉及RNA和蛋白质的合成。IFN蛋白家族根据其编码基因的序列、染色体定位和受体特异性分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型干扰素。Ⅰ型干扰素包括IFN-α、IFN-β、IFN-ω、IFN-δ、IFN-ε、IFN-ζ、IFN-τ等，哺乳动物中主要是IFN-α和IFN-β，Ⅰ型干扰素具有较强的抗病毒活性，主要通过干扰病毒的复制抑制其增殖，还具有抗肿瘤和免疫调节的功能。Ⅱ型干扰素只有IFN-γ一个成员，又称为免疫干扰素，主要作用是激活巨噬细胞杀灭微生物。Ⅲ型干扰素是新发现的细胞因子，包括λ1(IL-29)、λ2(IL-28a)和λ3(IL-28b)。Ⅲ型干扰素与Ⅰ型干扰素关系密切，但有特殊的生理学功能，如刺激主要组织相容性复合体(major histocom-patibility complex，MHC)分子的活化和表达，调节先天免疫和获得性免疫等。由于干扰素具有广谱抗病毒、抗肿瘤的活性以及强大的免疫调节作用，现已成为病毒学、细胞学、分子生物学、临床医学、免疫学、肿瘤学等相关领域的研究热点之一。

羊是常见的家畜之一，羊全身是宝，其毛皮可制成多种毛织品和皮革制品；在医疗保健方面，羊更能发挥其独特的作用，羊肉、羊血等等可用于多种疾病的治疗，具有较高的药用价值。然而一些病毒性疾病影响着羊类的生存和发展，也影响着人们的日常生活。因此，需要优质、廉价的羊λ干扰素产品来应对这一问题。

发明内容

本发明所要解决的第一个技术问题是提供一种羊λ3干扰素及羊λ3干扰素突变体，所述羊λ3干扰素突变体具有高抗病毒活性；

本发明所要解决的第二个技术问题是提供一种利用家蚕杆状病毒表达系统制备所述羊λ3干扰素或羊λ3干扰素突变体的方法；

本发明所要解决的第三个技术问题是提供所述羊λ3干扰素或羊λ3干扰素突变体在制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂中的用途。

为解决上述技术问题，本发明所采取的技术方案是：

本发明首先公开了一种羊λ3干扰素，其氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示，其编码基因的多核苷酸序列为(a)或(b)或(c)所示：

(a)、SEQ ID No.2所示的多核苷酸序列；或

(b)、与SEQ ID No.2的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的多核苷酸序列，该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；或

(c)、与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有80％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有85％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；更优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有90％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性。

本发明进一步公开了一种羊λ3干扰素突变体，是将所述羊λ3干扰素的第19位氨基酸由丝氨酸(S)突变成脯氨酸(P)得到的突变体；所述突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示。

本发明进一步公开了一种羊λ3干扰素突变体，是将氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示的羊λ3干扰素突变体的第58位氨基酸由丙氨酸(A)突变成缬氨酸(V)得到的突变体；所述突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.6所示。

本发明进一步公开了一种羊λ3干扰素突变体，是将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行P30L、M41L、R59K、D64E、Q68P、G74S、G75S、L77I、T81S、L100V、M110L、G116H、R117S、E120D、Q127R、H128N、V129I、G144S、P145S、Q162R或F179L任何一种氨基酸单位点突变获得的突变体；优选为，将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S、G75S、T81S、R117S、H128N或V129I任何一种氨基酸单位点突变获得的突变体。其中，将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G75S氨基酸单位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.7所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ IDNO.8所示。

其中，本发明所述氨基酸单位点突变P30L，表示将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体的第30位氨基酸由脯氨酸(P)突变成亮氨酸(L)；G75S表示将第75位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)；依此类推。

本发明还公开了一种羊λ3干扰素突变体，是将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S、G74S-T81S、G74S-R117S、G74S-H128N、G74S-V129I、G75S-T81S、G75S-R117S、G75S-H128N、G75S-V129I、T81S-R117S、T81S-H128N、T81S-V129I、R117S-H128N、R117S-V129I或H128N-V129I任何一种氨基酸双位点突变获得的突变体；优选为，将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S、G75S-R117S或H128N-V129I任何一种氨基酸双位点突变获得的突变体。其中，将氨基酸序列为SEQ IDNO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G75S-R117S氨基酸双位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.9所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.10所示。

其中，本发明所述氨基酸双位点突变G74S-G75S，表示将氨基酸序列为SEQ IDNO.5所示的羊λ3干扰素突变体的第74位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)，并且将第75位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)；氨基酸双位点突变G75S-R117S表示将第75位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)，并且将第117位氨基酸由精氨酸(R)突变成丝氨酸(S)；依此类推。

本发明还公开了一种羊λ3干扰素突变体，是将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S、G74S-G75S-H128N、G74S-G75S-V129I、G75S-R117S-H128N、G75S-R117S-V129I或R117S-H128N-V129I任何一种氨基酸多位点突变获得的突变体；优选为，将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S氨基酸多位点突变获得的突变体。其中，将氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S氨基酸多位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ IDNO.11所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.12所示。

其中，本发明所述氨基酸多位点突变G74S-G75S-R117S表示将氨基酸序列为SEQID NO.5所示的羊λ3干扰素突变体的第74位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)，并且将第75位氨基酸由甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S)，同时将第117位氨基酸由精氨酸(R)突变成丝氨酸(S)；依此类推。

本发明分析了NCBI上所有羊λ3干扰素氨基酸序列，最终确定以登录号为XP_014962163.1的氨基酸序列为羊λ3干扰素原始氨基酸序列(其氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示)，与猪、牛Ⅲ型干扰素氨基酸序列对比并进行信号肽突变，即将原始氨基酸序列第19位丝氨酸(S)变成脯氨酸(P)，即S19P，获得IFN的羊λ3干扰素信号肽突变体，命名为OvIFN-λ3-S突变体，其氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示。本发明利用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕生物反应器中表达所述羊λ3干扰素及其突变体，抗病毒活性测定结果表明在蚕幼虫体内表达的羊λ3干扰素(SEQ ID NO.1)有较为显著的抗病毒活性，效价达1.04×10⁶U/mL；在蚕幼虫体内表达的OvIFN-λ3-S抗病毒效价为2.02×10⁶U/mL，高于OvIFN-λ3，说明通过突变信号肽只有一个特异性切割位点的方法来提高OvIFN-λ3抗病毒活性是可行和有效的。

本发明进一步将羊λ3干扰素信号肽突变体OvIFN-λ3-S进行保守序列突变，即将OvIFN-λ3-S氨基酸序列的第58位丙氨酸(A)变成缬氨酸(V)，即A58V，并根据家蚕密码子偏好性对其基因序列进行密码子优化，对影响基因转录效率、翻译效率和蛋白折叠的GC含量、CpG二核苷酸含量、密码子偏好性、mRNA的二级结构、mRNA自由能稳定性、RNA不稳定性基序、重复序列等多种相关参数进行优化设计，有利于提高所优化基因在家蚕中的转录效率与翻译效率，并保持最终翻译成的蛋白序列不变；为了提高在家蚕杆状病毒真核表达体系中的翻译起始效率，在基因前面加了Kozak序列AAC，为了提高翻译终止效率，终止密码子改为TAA。此外，还去除了基因序列内部的BamHI、EcoRI、SmaI等限制性酶切位点，在基因上游加上了BamHI，在基因下游加上了EcoRI限制性酶切位点；得到新的羊λ3干扰素突变体OvIFN-λ3-S-C-O突变体，其氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示，优化后的基因核苷酸序列为SEQ IDNO.6所示。抗病毒活性测定结果表明，在蚕幼虫体内表达的OvIFN-λ3-S-C-O有较为显著的抗病毒活性，效价达3.98×10⁶U/mL。

本发明进一步在OvIFN-λ3-S-C-O突变体的基础上，以密码子优化后的OvIFN-λ3-S-C-O突变体的基因序列为模板设计多对引物，利用融合PCR法进行氨基酸单位点突变、氨基酸双位点突变、氨基酸多位点突变，获得了多个羊λ3干扰素突变体。

其中，在OvIFN-λ3-S-C-O突变体的基础上，分别进行G74S、G75S、T81S、R117S、H128N、V129I这6个位点单位点突变后，表达的羊λ3干扰素效价高于信号肽突变的保守序列表达测得的效价，抗病毒效价达到4.67×10⁶-5.21×10⁶U/mL；而其余位点突变后效价不变甚至降低，说明这6个位点的突变是有效突变，可以达到提高抗病毒活性的目的。其中，进行G75S单位点突变获得的OvIFN-λ3-S-C-O-G75S突变体具有最强抗病毒作用。

本发明进一步将抗病毒活性提高的单突变位点G74S、G75S、T81S、R117S、H128N、V129I两两组合，将OvIFN-λ3-S-C-O突变体进行双位点突变。抗病毒活性的检测结果表明，G74S-G75S、G75S-R117S、H128N-V129I三组双突变后，表达的羊λ3干扰素效价高于保守序列、单突变序列表达测得的效价，抗病毒效价达到6.13×10⁶-6.42×10⁶U/mL，而其余几组位点突变后效价不变甚至降低，说明这3个组合位点的突变是有效突变，可以达到提高抗病毒活性的目的。其中，进行G75S-R117S双位点突变获得的OvIFN-λ3-S-C-O-G75S-R117S突变体具有最强抗病毒作用。

本发明进一步将获得的具有高效价的双突变位点组合，将OvIFN-λ3-S-C-O突变体进行氨基酸多位点突变。突变体抗病毒活性的检测结果表明，G74S-G75S-R117S三位点突变后，表达的羊λ3干扰素效价远高于保守序列、单突变序列、双突变序列表达测得的效价，为7.94×10⁶U/mL；而其余几组位点突变后效价不变甚至降低。说明此组合位点的突变是有效突变，可以达到提高抗病毒活性的目的。

本发明还公开了含有所述羊λ3干扰素或者羊λ3干扰素突变体的编码基因的重组载体或重组宿主细胞。其中，所述重组载体为重组表达载体或重组克隆载体。

本发明所构建的转移载体包括：

(1)含有羊λ3干扰素(OvIFN-λ3)基因和含有羊λ3干扰素信号肽突变体(OvIFN-λ3-S突变体)基因的载体pVL-OvIFN-λ3、pVL-OvIFN-λ3-S；

(2)含有OvIFN-λ3-S突变体进行保守序列突变并优化后的突变体(OvIFN-λ3-S-C-O突变体)基因序列的载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O；

(3)含有OvIFN-λ3-S-C-O突变体进行氨基酸单位点突变后的突变体(OvIFN-λ3-S-C-O-M1突变体)基因序列的载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1；

(4)含有OvIFN-λ3-S-C-O突变体进行氨基酸双位点突变后的突变体(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2突变体)基因序列的载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2；

(5)含有OvIFN-λ3-S-C-O突变体进行氨基酸多位点突变后的突变体(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3突变体)基因序列的载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3。

本发明所获得的重组杆状病毒包括：重组家蚕核型多角体病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3、OvIFN-λ3-S)、rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O、OvIFN-λ3-S-C-O-M1、OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2、OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3)。

本发明还公开了所述的羊λ3干扰素或者羊λ3干扰素突变体在制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂中的用途。

其中，所述羊病毒性疾病包括：羊痘病毒感染、羊传染性脓疱病毒感染或水疱性口炎病毒感染所致疾病，或者牛呼吸道合胞体病毒病中的任何一种或多种。

本发明还公开了一种制备所述羊λ3干扰素或者羊λ3干扰素突变体的方法，包括以下步骤：(1)分别将所述羊λ3干扰素或者所述羊λ3干扰素突变体的编码基因克隆到杆状病毒转移载体中，构建得到重组转移载体；(2)将重组转移载体与杆状病毒DNA共转染昆虫细胞，获得重组杆状病毒；(3)将重组杆状病毒感染昆虫细胞或昆虫宿主，培养被感染的昆虫细胞或昆虫宿主表达相应的蛋白，纯化，即得。

其中，所述杆状病毒转移载体选自AcRP23-lacZ、AcRP6-SC、AcUWl-lacZ、BacPAK6、Bac to Pac、Bacmid、BlucBacII(pETL)、p2Bac、p2Blue、p89B310、pAc360、pAc373、pAcAB3、pAcAB 4、PAcAS3、pAcC129、pAcC4、DZI、pAcGP67、pAcIEl、pAcJPl、pAcMLF2、pAcMLF 7、pAcMLF 8、pAcMPl、pAcMP2、pAcRP23、pAcRP25、pAcRW4、pAcsMAG、pAcUWl、pAcUW21、pAcUW2A、pAcUW2B、pAcUW3、pAcUW31、pAcUW41、pAcUW42、pAcUW43、pAcUW51、pAcVC2、pAcVC 3、pAcYMl、pAcJcC5、pBacl、pBac2、pBlueBacIII、pBlueBacHis、pEV55、mXIV、pIEINeo、pJVETL、pJVNhel、pJVP10、pJVrsMAG、pMBac、pP10、pPAKl、pPBac、pSHONEX 1.1、pSYN XIV VI+、pSYNVI+wp、pSYNXIV VI-、pVL1391、pVL 1392、pVL 1393、pVL941、pVL 945、pVL 985、pVTBac、pBM030或pUAC-5；

所述杆状病毒选自家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid、BmNPV、AcMNPV、ApNPV、HaNPV、HzNPV、LdMNPV、MbMNPV、OpMNPV、SlMNPV、SeMNPV或SpltNPV；

所述昆虫宿主选自家蚕(Bombyx mori)、野蚕(Bombyx mandarina)、蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricim)、樟蚕(Dictyoploca japanica)、樗蚕(Philosamia cynthiapryeri)、柞蚕(Antheraea pernyi)、日本柞蚕(Antheraea yamamai)、野天蚕(Antheraeapolyphymus)、苜蓿尺蠖(Atographa califorica)、茶尺蠖(Ectropis obliqua)、甘兰夜蛾(Mamestra brassicae)、斜纹夜蛾(Spodoptera littoralis)、秋粘虫(Spodopterafrugiperda)、粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)、行军虫(Thaumetopoea wilkinsoni)、棉铃虫(Heliothis armigera)、美国棉铃虫(Heliothis zea)、烟青虫(Heliothis assulta)、烟草夜蛾(Heliothis virescens)、东方粘虫(Pseudaletia separata)或舞毒蛾(Lymantriadispar)；

优选的，所述杆状病毒转移载体为pVL1393；所述杆状病毒为家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid；所述昆虫宿主为家蚕(Bombyx mori)。

所述感染是指重组杆状病毒通过吞食或透过表皮来感染1-5龄的昆虫幼虫或蛹体；优选为，将重组家蚕杆状病毒感染家蚕细胞或穿刺接种1-5龄的家蚕幼虫或蛹，在感染3-6天后收集含各种羊λ3干扰素基因的家蚕幼虫或蛹的体液或组织匀浆；其中，所述的蛹最优为1-2天的早期嫩蛹。

本发明技术方案与现有技术相比，具有以下有益效果：

本发明通过分析NCBI上所有羊λ3干扰素氨基酸序列，进行序列比对及信号肽分析，最终确定以登录号为XP_014962163.1的氨基酸序列为主要参考序列，与猪、牛Ⅲ型干扰素氨基酸序列对比并进行信号肽突变，再选取每个位点上的出现频率高的偏好氨基酸进行优化，设计一条保守序列；并以保守序列为模板设计多对引物用融合PCR法进行氨基酸单位点突变、氨基酸双位点突变、氨基酸多位点突变，获得了多个羊λ3干扰素突变体。本发明利用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕生物反应器中表达所述羊λ3干扰素突变体，所表达的羊λ3干扰素突变体的抗病毒活性大幅度提高，具有较为明显的抗病毒活性。本发明方法工艺简单，可快速获得大量安全可靠的羊λ3干扰素。本发明所述的羊λ3干扰素突变体能够用于制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂，对畜牧业的发展具有重大意义。

本发明所涉及到的术语定义

除非另外定义，否则本文所用的所有技术及科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所了解相同的含义。

术语“多核苷酸”或“核苷酸”意指单股或双股形式的脱氧核糖核苷酸、脱氧核糖核苷、核糖核苷或核糖核苷酸及其聚合物。除非特定限制，否则所述术语涵盖含有天然核苷酸的已知类似物的核酸，所述类似物具有类似于参考核酸的结合特性并以类似于天然产生的核苷酸的方式进行代谢。除非另外特定限制，否则所述术语也意指寡核苷酸类似物，其包括PNA(肽核酸)、在反义技术中所用的DNA类似物(硫代磷酸酯、磷酰胺酸酯等等)。除非另外指定，否则特定核酸序列也隐含地涵盖其保守修饰的变异体(包括(但不限于)简并密码子取代)和互补序列以及明确指定的序列。特定而言，可通过产生其中一个或一个以上所选(或所有)密码子的第3位经混合碱基和/或脱氧肌苷残基取代的序列来实现简并密码子取代(Batzer等人，NucleicA-cidRes.19:5081(1991)；Ohtsuka等人，J.Biol.Chem.260:2605-2608(1985)；和Cassol等人，(1992)；Rossolini等人，MolCell.Probes8:91-98(1994))。

术语“同源性”，指与天然核酸序列的序列相似性。“同源性”包括与本发明的调控片段的核苷酸序列具有优选地85％或更高，更优选地90％或更高，以及最优选地95％或更高同一性的核苷酸序列。同源性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件，两个或多个序列之间的同源性可以用百分比(％)表示，其可以用来评价相关序列之间的同源性。

术语“互补的”在此指的是两种包括反向平行核苷酸序列的核苷酸序列，反向平行核苷酸序列能在反向平行核苷酸序列的互补碱基残基之间形成氢键后彼此相互配对。本领域已知的是，当都从5’到3’的方向看序列时，两种互补链的核苷酸序列是彼此反向互补的。本领域也已知的是，两种在给定的条件组下能彼此杂交的序列不必必须是100％完全互补的。

术语“严谨杂交条件”意指在所属领域中已知的低离子强度和高温的条件。通常，在严谨条件下，探针与其靶序列杂交的可检测程度比与其它序列杂交的可检测程度更高(例如超过本底至少2倍)。严谨杂交条件是序列依赖性的，在不同的环境条件下将会不同，较长的序列在较高温度下特异性杂交。通过控制杂交的严谨性或洗涤条件可鉴定与探针100％互补的靶序列。对于核酸杂交的详尽指导可参考有关文献(Tijssen,Techniques inBiochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nucleic Probes,"Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acidassays.1993)。更具体的，所述严谨条件通常被选择为低于特异序列在规定离子强度pH下的热熔点(Tm)约5-10℃。Tm为在平衡状态下50％与目标互补的探针杂交到目标序列时所处的温度(在指定离子强度、pH和核酸浓度下)(因为目标序列过量存在，所以在Tm下在平衡状态下50％的探针被占据)。严谨条件可为以下条件：其中在pH 7.0到8.3下盐浓度低于约1.0M钠离子浓度，通常为约0.01到1.0M钠离子浓度(或其它盐)，并且温度对于短探针(包括(但不限于)10到50个核苷酸)而言为至少约30℃，而对于长探针(包括(但不限于)大于50个核苷酸)而言为至少约60℃。严谨条件也可通过加入诸如甲酰胺的去稳定剂来实现。对于选择性或特异性杂交而言，正信号可为至少两倍的背景杂交，视情况为10倍背景杂交。例示性严谨杂交条件可如下：50％甲酰胺，5×SSC和1％SDS，在42℃下培养；或5×SSC，1％SDS，在65℃下培养，在0.2×SSC中洗涤和在65℃下于0.1％SDS中洗涤。所述洗涤可进行5、15、30、60、120分钟或更长时间。

术语“突变”和“突变体”在此具有它们的常用含义，指的是在核酸或多肽序列中的遗传的、天然存在的或引入的变化，它们的意义与本领域人员通常所知的意义相同。

术语“宿主细胞”或“重组宿主细胞”意指包含本发明多核苷酸的细胞，而不管使用何种方法进行插入以产生重组宿主细胞，例如直接摄取、转导、f配对或所属领域中已知的其它方法。外源性多核苷酸可保持为例如质粒的非整合载体或者可整合入宿主基因组中。

术语“转染”指真核细胞由于外源DNA掺入而获得新的遗传标志的过程。

附图说明

图1为细胞病变比例对应的荧光图；其中，A，“-”：无细胞病变；B，“±”：几个细胞病变；C，“+”：20％～30％细胞病变；D，“++”：50％～60％细胞病变；

图2为重组质粒pVL-OvIFN-λ3的双酶切鉴定；其中，M：DNA分子质量标准；1：重组质粒pVL-OvIFN-λ3双酶切产物；2：重组质粒pVL-OvIFN-λ3-S双酶切产物；-为阴性对照；

图3为细胞出现荧光的各种比例的情况；其中，A：干扰素抑制VSV病毒显示的荧光；B：VSV病毒感染对照组显示的荧光；C：部分细胞感染VSV病毒显示的荧光。

具体实施方式

下面结合具体实施例来进一步描述本发明，本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但是应理解所述实施例仅是范例性的，不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是，在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换，但这些修改或替换均落入本发明的保护范围。

1、试验材料与试剂

转移载体pVL1393，E.coli菌株TOP10，BmN细胞，Vero细胞，VSV-GFP病毒，均由中国农业科学院生物技术研究所保存和提供；试验家蚕品种JY1为江苏科技大学蚕业研究所提供，亲本病毒BmBacmid DNA按照文献(专利号：ZL 201110142492.4，授权日期：2013.01.23)中所公开的方法构建。限制性内切酶、T₄DNA连接酶购自Promega公司，PCR反应所用的LATaq DNA聚合酶及其它相关试剂均购自TakaRa公司，脂质体购自Invitrogen公司，DMEM细胞培养基、胎牛血清为GIBCO公司产品。有关溶液和培养基的配置方法参照相关工具书(Josephetal.，分子克隆实验指南第三版，2002；奥斯伯，等人，精编分子生物学指南，1998)；除非另外说明，否则百分比和份数按重量计算。

2、实验方法

实验方法中用于定点突变的融合PCR方法，参照邝翡婷等人(一种载体构建的新方法：重组融合PCR法，基因组学与应用生物学，2012年，第31卷，第6期，第634-639页)所描述的方法进行。

实验方法中计算干扰素的效价，利用Vero/VSV*GFP系统，使用Reed-Muench方法，具体操作参照刘兴健，等(猫ω-like干扰素在家蚕中的表达和生物活性检测，生物技术进展，2015，5(6)：441-445)以及Summers MD等(A manual of methods for baculovirusvectors and insect cell culture procedures[R].Texas Agricultural ExperimentStation，1987)所描述的方法进行，其中判断细胞病变的标准参照图1。

每一个实施案例中的最佳改良方案均作为下一实施案例改良方案的比较标准。实施例1羊λ3干扰素及其信号肽突变体基因在家蚕生物反应器中的表达与检测1、实验方法

1.1目的基因合成和重组质粒的构建

本发明分析了NCBI上所有羊λ3干扰素氨基酸序列，进行序列比对及信号肽分析，最终确定以登录号为XP_014962163.1的氨基酸序列为原始序列，其氨基酸序列为SEQ IDNO.1所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。序列分析过程中发现该序列的信号肽有多个切割峰，鉴于之前信号肽的切割位点影响干扰素的分泌效率的发现，本发明决定对羊λ3干扰素氨基酸序列进行突变。用SignalP4.1在线对猪牛羊三种哺乳动物IFN-λ3氨基酸序列或相关序列进行信号肽预测，结果发现猪IFN-λ3氨基酸或相关序列为单峰，牛和羊IFN-λ3氨基酸或相关序列为双峰，故据此，以猪IFN-λ3氨基酸或相关序列为基准，对羊IFN-λ3氨基酸原始序列进行改造。参考猪λ3干扰素氨基酸序列设计，比较信号肽对抗病毒活性的影响，获得了羊λ3干扰素信号肽优化的突变体。即将原始氨基酸序列第19位S变成P，获得IFN的羊λ3干扰素信号肽突变体，命名为OvIFN-λ3-S突变体，其氨基酸序列如SEQ IDNO.3所示，基因序列如SEQ ID NO.4所示。

用DNAman软件分析限制酶酶切位点，根据酶切位点分析结果以及转移载体pVL1393和pUC57上的多克隆位点，在目的基因两端加入目的基因序列中不存在的限制酶酶切位点。依据分析结果在其5'端加入BamHI酶切位点和Kozak序列，3'端加入EcoRI酶切位点，使用TAA作为终止密码子，确定好的基因序列交由南京金斯瑞生物科技有限公司合成，并插入pUC57载体，形成质粒pUC57-OvIFN-λ3。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用BamHI和EcoRI对合成的质粒pUC57-OvIFN-λ3进行双酶切处理，玻璃奶法回收目的片段，T₄DNA连接酶连接目的片段和进行双酶切处理并灭活后的杆状病毒转移载体pVL1393，16℃，连接过夜。将连接产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3。

将测序正确的质粒pVL-OvIFN-λ3用BamHI和EcoRI进行双酶切处理，琼脂糖凝胶电泳后采用玻璃奶法回收目的片段，再应用融合PCR技术设计引物对目的片段进行定点突变，之后用T₄DNA连接酶连接目的片段及进行双酶切处理并灭活后的杆状病毒转移载体pVL1393(16℃，过夜连接)。将连接产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3-S。

由羊λ3干扰素原始核苷酸序列突变成羊λ3干扰素信号肽突变体核苷酸序列所需引物：

(1)两侧上下游引物：

F:TCATACCGTCCCACCATCGGGCGCGGATCCAACATGGCCCCAGG；

R:GATCTGCAGCGGCCGCTCCGGAATTCTTAGACACACTGGTCTCCACTGGC；

(2)中间上下游引物：

F:ATGACTGCGGCGCTGCCTAGGACAGGAGCAGTTCCTGTGCCCTC；

R:GAGGGCACAGGAACTGCTCCTGTCCTAGGCAGCGCCGCAGTCAT。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒pVL-OvIFN-λ3、pVL-OvIFN-λ3-S和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3)、rBmBacmid(OvIFN-λ3-S)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3)、rBmBacmid(OvIFN-λ3-S)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3)、rBmBacmid(OvIFN-λ3-S)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3)、rBmBacmid(OvIFN-λ3-S)。

1.4羊λ3型干扰素及其突变体在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，OvIFN-λ3在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。1.5羊λ3型干扰素及其突变体蛋白抗病毒活性检测

采用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的羊λ3型干扰素的抗病毒活性。将状态良好的Vero细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含70mL/L胎牛血清的DMEM培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满VERO细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO₂条件下培养18～24h。将稀释至100TCID₅₀的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO₂条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-OvIFN-λ3、pVL-OvIFN-λ3-S经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500-750bp之间，与目的基因片段591bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。电泳结果如图2所示。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明羊λ3型干扰素及其信号肽突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2羊干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的羊λ3型干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组羊λ3干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力(图3)。根据羊λ3型干扰素对Vero细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素的效价。检测结果列于表1，抗病毒活性测定结果表明，在蚕幼虫体内表达的OvIFN-λ3有较为显著的抗病毒活性，效价达1.04×10⁶U/mL，OvIFN-λ3-S抗病毒效价高于OvIFN-λ3，为2.02×10⁶U/mL，达到了预期的效果，说明通过突变信号肽只有一个特异性切割位点的方法来提高OvIFN-λ3抗病毒活性是可行和有效的。

表1重组羊λ3干扰素抗病毒活性的检测结果

实施例2OvIFN-λ3-S突变体进行保守序列突变并优化后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1羊λ3型干扰素突变体基因的构建

本发明将从NCBI上获得的所有羊λ3干扰素氨基酸序列及相关序列进行比对，得到一条保守序列。该保守序列与原始氨基酸序列相比区别在于将原始氨基酸序列的第58位A变成V。故基于实施例1的结果，本发明将羊λ3干扰素信号肽突变体(OvIFN-λ3-S突变体)的氨基酸序列的第58位A变成V，得到新的羊λ3干扰素突变体，命名为OvIFN-λ3-S-C突变体，其氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示。

另外，本发明利用OptimumGene^TM技术对上述羊λ3干扰素突变体基因进行优化，根据生物反应器家蚕的密码子偏好性对基因序列进行改造，对影响基因转录效率、翻译效率和蛋白折叠的GC含量、CpG二核苷酸含量、密码子偏好性、mRNA的二级结构、mRNA自由能稳定性、RNA不稳定性基序、重复序列等多种相关参数进行优化设计，有利于提高所优化基因在家蚕中的转效率录与翻译效率，并保持最终翻译成的蛋白序列不变。

为了提高在家蚕杆状病毒真核表达体系中的翻译起始效率，在基因前面加了Kozak序列AAC，为了提高翻译终止效率，终止密码子改为TAA。此外，还去除了基因序列内部的BamHI、EcoRI、SmaI等限制性酶切位点，在基因上游加上了BamHI，在基因下游加上了EcoRI限制性酶切位点，以便后续克隆到真核转移载体pVL1393中。

所设计的λ3型干扰素突变体基因进行优化后的序列由生物科技公司人工合成，命名为OvIFN-λ3-S-C-O突变体，其核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示，合成的基因片段插入pUC57载体，形成质粒pUC57-OvIFN，命名为pUC57-OvIFN-λ3-S-C-O。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用BamHI和EcoRI对合成的质粒pUC57-OvIFN-λ3-S-C-O进行双酶切处理，玻璃奶法回收目的片段，T₄DNA连接酶连接目的片段和进行双酶切处理并灭活后的杆状病毒转移载体pVL1393，16℃，连接过夜。将连接产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3-S-C-O。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒pVL-OvIFN-λ3-S-C-O和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O)。

1.4羊λ3型干扰素突变体在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，OvIFN-λ3在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。

1.5羊λ3型干扰素突变体蛋白抗病毒活性检测

采用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的羊λ3型干扰素的抗病毒活性。将状态良好的Vero细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含70mL/L胎牛血清的DMEM培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满VERO细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO₂条件下培养18～24h。将稀释至100TCID₅₀的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO₂条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500-750bp之间，与目的基因片段591bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明羊λ3型干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2羊干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的羊λ3型干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组羊λ3干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据羊λ3型干扰素对Vero细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素的效价。检测结果列于表2，抗病毒活性测定结果表明在蚕幼虫体内表达的OvIFN-λ3-S-C-O有较为显著的抗病毒活性，效价达3.98×10⁶U/mL，达到了预期的效果，说明在羊λ3干扰素信号肽突变体上进行保守序列突变并优化的方法来提高OvIFN-λ3抗病毒活性是可行和有效的。

表2羊λ3干扰素突变体优化后抗病毒活性的检测结果

实施例3OvIFN-λ3-S-C突变体优化并进行氨基酸单位点突变后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1羊λ3型干扰素突变体基因的构建

基于实施例2的结果，本发明获得了具有高抗病毒活性的羊λ3干扰素突变体——OvIFN-λ3-S-C突变体，以密码子优化后的OvIFN-λ3-S-C-O突变体的基因序列为模板，设计多对引物对保守序列进行定点突变，定点突变是利用融合PCR的方法进行，融合PCR的方法见前述“2、实验方法”。

突变位点分别为P30L、M41L、R59K、D64E、Q68P、G74S、G75S、L77I、T81S、L100V、M110L、G116H、R117S、E120D、Q127R、H128N、V129I、G144S、P145S、Q162R、F179L；所得的羊λ3干扰素突变体命名为OvIFN-λ3-S-C-O-M1(P30L、M41L、R59K、D64E、Q68P、G74S、G75S、L77I、T81S、L100V、M110L、G116H、R117S、E120D、Q127R、H128N、V129I、G144S、P145S、Q162R、F179L)突变体。

OvIFN-λ3-S-C-O突变体核苷酸序列进行氨基酸单位点、双位点及多位点突变所需引物：

(1)两侧上下游引物：

F:TCATACCGTCCCACCATCGGGCGCGGATCCAACATGGCTCCTGGCTG

R:GATCTGCAGCGGCCGCTCCGGAATTCTTAAACACACTGATCTCCGCTAGCC

(2)中间上下游引物

1.

F:CCAGTGCCATCCGCTCTCAGAGCTCTCCCTCCAGCTAGAGGCTGTC

R:GACAGCCTCTAGCTGGAGGGAGAGCTCTGAGAGCGGATGGCACTGG

2.

F:GCTAGAGGCTGTCACTTGGCCCAATTCAAAAGCCTCTCCCCAC

R:GTGGGGAGAGGCTTTTGAATTGGGCCAAGTGACAGCCTCTAGC

3.

F:GCTTTCAAGACAGTTAAGGACGCCTTCGAAGATTCAAGACTGCAA

R:TTGCAGTCTTGAATCTTCGAAGGCGTCCTTAACTGTCTTGAAAGC

4.

F:AGAGACGCCTTCGAAGAATCAAGACTGCAAAAAGACTGGGATTGCG

R:CGCAATCCCAGTCTTTTTGCAGTCTTGATTCTTCGAAGGCGTCTCT

5.

F:GAAGATTCAAGACTGCCAAAAGACTGGGATTGCGGTGGAAGATTG

R:CAATCTTCCACCGCAATCCCAGTCTTTTGGCAGTCTTGAATCTTC

6.

F:AAAGACTGGGATTGCTCGGGAAGATTGTTCCCGAGAACTAGAGACCTCA

R:TGAGGTCTCTAGTTCTCGGGAACAATCTTCCCGAGCAATCCCAGTCTTT

7.

F:GACTGGGATTGCGGTTCCAGATTGTTCCCGAGAACTAGAGACCTCAAGC

R:GCTTGAGGTCTCTAGTTCTCGGGAACAATCTGGAACCGCAATCCCAGTC

8.

F:GATTGCGGTGGAAGAATCTTCCCGAGAACTAGAGACCTCAAGCACC

R:GGTGCTTGAGGTCTCTAGTTCTCGGGAAGATTCTTCCACCGCAATC

9.

F:AGATTGTTCCCGAGATCAAGAGACCTCAAGCACCTGCAAGTTTGG

R:CCAAACTTGCAGGTGCTTGAGGTCTCTTGATCTCGGGAACAATCT

10.

F:GCTCTCGAAGCCGAAGTGGCTCTGACATTGACTGTCCTGGAAGCTATG

R:CATAGCTTCCAGGACAGTCAATGTCAGAGCCACTTCGGCTTCGAGAGC

11.

F:ACTGTCCTGGAAGCTTTGGCCAACTCATCTCTGGGTAGATCATTG

R:CAATGATCTACCCAGAGATGAGTTGGCCAAAGCTTCCAGGACAGT

12.

F:GCCAACTCATCTCTGCACAGATCATTGGAACAACCGCTGTTGACTTTG

R:CAAAGTCAACAGCGGTTGTTCCAATGATCTGTGCAGAGATGAGTTGGC

13.

F:AACTCATCTCTGGGTTCATCATTGGAACAACCGCTGTTGACTTTGC

R:GCAAAGTCAACAGCGGTTGTTCCAATGATGAACCCAGAGATGAGTT

14.

F:CTGGGTAGATCATTGGATCAACCGCTGTTGACTTTGCAGCACG

R:CGTGCTGCAAAGTCAACAGCGGTTGATCCAATGATCTACCCAG

15.

F:CCGCTGTTGACTTTGAGACACGTCCACTCTAAACTCCAAGCCTGC

R:GCAGGCTTGGAGTTTAGAGTGGACGTGTCTCAAAGTCAACAGCGG

16.

F:CTGTTGACTTTGCAGAATGTCCACTCTAAACTCCAAGCCTGCGTG

R:CACGCAGGCTTGGAGTTTAGAGTGGACATTCTGCAAAGTCAACAG

17.

F:TTGACTTTGCAGCACATCCACTCTAAACTCCAAGCCTGCGTGCC

R:GGCACGCAGGCTTGGAGTTTAGAGTGGATGTGCTGCAAAGTCAA

18.

F:GCTCAGCCAACCGCCTCCCCTAGACCAAGAGGTAGACTGCACCACTGG

R:CCAGTGGTGCAGTCTACCTCTTGGTCTAGGGGAGGCGGTTGGCTGAGC

19.

F:CAGCCAACCGCCGGCTCGAGACCAAGAGGTAGACTGCACCACTGGTTG

R:CAACCAGTGGTGCAGTCTACCTCTTGGTCTCGAGCCGGCGGTTGGCTG

20.

F:AGACTCCAAGAAGCTAGAAAAAAGGAATCGCAAGATTGTCTGGAAGC

R:GCTTCCAGACAATCTTGCGATTCCTTTTTTCTAGCTTCTTGGAGTCT

21.

F:GTGATGTTCAATTTGCTCAGACTCCTGACAAGAGACCTCAAGTGCGTG

R:CACGCACTTGAGGTCTCTTGTCAGGAGTCTGAGCAAATTGAACATCAC

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用重组酶(pEASY-Uni seamless Cloning and Assembly Kit)将玻璃奶法回收的上述目的片段与经过BamHI和EcoRI双酶切的灭活杆状病毒转移载体pVL1393同源重组。重组产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1(P30L、M41L、R59K、D64E、Q68P、G74S、G75S、L77I、T81S、L100V、M110L、G116H、R117S、E120D、Q127R、H128N、V129I、G144S、P145S、Q162R、F179L)。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-C-O-M1)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1)。

1.4羊λ3型干扰素突变体在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，OvIFN-λ3在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。

1.5羊λ3型干扰素突变体蛋白抗病毒活性检测

采用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的羊λ3型干扰素突变体的抗病毒活性。将状态良好的Vero细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含70mL/L胎牛血清的DMEM培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满VERO细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO₂条件下培养18～24h。将稀释至100TCID₅₀的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO₂条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500-750bp之间，与目的基因片段591bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明羊λ3型干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2羊干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的羊λ3型干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组羊λ3干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据羊λ3型干扰素对Vero细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素效价，检测结果列于表3，所有羊λ3干扰素突变体测得效价在1.26×10⁵U/mL～5.21×10⁶U/mL，其中G74S、G75S、T81S、R117S、H128N、V129I这6个位点突变后，表达的羊λ3干扰素效价略高于信号肽突变的保守序列表达测得的效价，而其余位点突变后效价不变甚至降低，说明这6个位点的突变是有效突变，可以达到提高OvIFN-λ3-S-C突变体抗病毒活性的目的。其中，OvIFN-λ3-S-C-O-G75S突变体具有最强抗病毒作用，其氨基酸序列为SEQ ID NO.7所示，编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.8所示。

表3重组羊λ3干扰素单位点突变抗病毒活性的检测结果

实施例4OvIFN-λ3-S-C-O-M1突变体进行氨基酸双位点突变后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1羊λ3型干扰素突变体基因的构建

鉴于实施例3的结果，确定部分位点的突变是有效突变，可以达到提高OvIFN-λ3-S-C突变体的抗病毒活性目的。考虑到氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构，并决定着蛋白质的高级结构，且实施例3中进行的氨基酸单位点突变有部分突变位点的位置可能是相互关联的，故尝试进行氨基酸双位点突变。本发明将抗病毒活性提高的单突变位点G74S、G75S、T81S、R117S、H128N、V129I两两组合，进行双位点突变，双位点突变是在实施例3获得的单位点突变序列的基础之上，以其(OvIFN-λ3-S-C-O-M1)作为模板，利用相应的引物(详见实施例3)，通过融合PCR的方法进行第二位的定点突变，从而获得双位点突变的目的片段，融合PCR的方法见前述“2、实验方法”。

双突变位点为G74S-G75S、G74S-T81S、G74S-R117S、G74S-H128N、G74S-V129I、G75S-T81S、G75S-R117S、G75S-H128N、G75S-V129I、T81S-R117S、T81S-H128N、T81S-V129I、R117S-H128N、R117S-V129I、H128N-V129I共15种组合，所获得的羊λ3干扰素突变体命名为OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2(G74S-G75S、G74S-T81S、G74S-R117S、G74S-H128N、G74S-V129I、G75S-T81S、G75S-R117S、G75S-H128N、G75S-V129I、T81S-R117S、T81S-H128N、T81S-V129I、R117S-H128N、R117S-V129I、H128N-V129I)突变体。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用重组酶(pEASY-Uni seamless Cloning and Assembly Kit)将玻璃奶法回收的上述目的片段与经过BamHI和EcoRI双酶切的灭活杆状病毒转移载体pVL1393同源重组。重组产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2(G74S-G75S、G74S-T81S、G74S-R117S、G74S-H128N、G74S-V129I、G75S-T81S、G75S-R117S、G75S-H128N、G75S-V129I、T81S-R117S、T81S-H128N、T81S-V129I、R117S-H128N、R117S-V129I、H128N-V129I)。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2)。

将重组家蚕杆状病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBmBacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2)。

1.4羊λ3型干扰素突变体在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，OvIFN-λ3在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。

1.5羊λ3型干扰素突变体蛋白抗病毒活性检测

采用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的羊λ3型干扰素突变体的抗病毒活性。将状态良好的Vero细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含70mL/L胎牛血清的DMEM培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满VERO细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO₂条件下培养18～24h。将稀释至100TCID₅₀的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO₂条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500-750bp之间，与目的基因片段591bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明羊λ3型干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2羊干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的羊λ3型干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组羊λ3干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据羊λ3型干扰素对Vero细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素效价，检测结果列于表4，所有羊λ3干扰素突变体测得效价在

1.58×10⁵U/mL～6.42×10⁶U/mL，其中G74S-G75S、G75S-R117S、H128N-V129I三组双突变后，表达的羊λ3干扰素效价略高于保守序列、单突变序列表达测得的效价，而其余几组位点突变后效价不变甚至降低，说明这3个组合位点的突变是有效突变，可以达到提高OvIFN-λ3-S-C-O-M1突变体抗病毒活性的目的。其中，OvIFN-λ3-S-C-O-G75S-R117S突变体具有最强抗病毒作用，其氨基酸序列为SEQ ID NO.9所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQID NO.10所示。

表4重组羊λ3干扰素双位点突变抗病毒活性的检测结果

实施例5OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2突变体进行氨基酸多位点突变后在家蚕生物反应器中的表达与检测

1、实验方法

1.1羊λ3型干扰素突变体基因的构建

鉴于实施例4的结果，考虑到氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构，并决定着蛋白质的高级结构，推测可能是由于进行的氨基酸单位点突变有部分突变位点的位置相互靠近彼此关联的，故尝试进行氨基酸多位点突变。本发明将获得的具有高效价的双突变位点组合，确定第三个突变位点，多位点突变是在实施例4获得的双位点突变序列的基础之上，以其(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2)作为模板，利用相应的引物(详见实施例3)，通过融合PCR的方法进行第三位的定点突变，从而获得多位点突变的目的片段，融合PCR的方法见前述“2、实验方法”。

获得了以下6种组合：G74S-G75S-R117S、G74S-G75S-H128N、G74S-G75S-V129I、G75S-R117S-H128N、G75S-R117S-V129I、R117S-H128N-V129I。所获得的羊λ3干扰素突变体命名为OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3(G74S-G75S-R117S、G74S-G75S-H128N、G74S-G75S-V129I、G75S-R117S-H128N、G75S-R117S-V129I、R117S-H128N-V129I)突变体。

1.2构建重组杆状病毒转移载体

用重组酶(pEASY-Uni seamless Cloning and Assembly Kit)将玻璃奶法回收的上述目的片段与经过BamHI和EcoRI双酶切的灭活杆状病毒转移载体pVL1393同源重组。重组产物转化大肠杆菌感受态细胞TOP10，挑选菌落培养，提质粒，用BamHI和EcoRI双酶切鉴定阳性克隆，将鉴定正确的重组质粒送北京擎科生物技术有限公司测序，测序正确的质粒命名为pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3(G74S-G75S-R117S、G74S-G75S-H128N、G74S-G75S-V129I、G75S-R117S-H128N、G75S-R117S-V129I、R117S-H128N-V129I)。

1.3重组家蚕杆状病毒的获得、纯化与扩增

根据已有文献报道的方法进行BmN细胞的复苏、传代以及重组病毒的筛选。当BmN细胞培养至细胞单层达80％左右时，倒掉旧培养基，用无血清TC-100培养基洗三次，加1.5mL无FBS培养基。向一灭菌管中依次加入1μg家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid DNA，2μg重组转移质粒pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3和5μL脂质体，用无菌双蒸水补足体积到60μL，轻轻混匀，静置15min后，逐滴加入到培养瓶中进行共转染。27℃培养4h后补加1.5mL无血清培养基和300μL FBS。27℃恒温培养4～5天，至细胞脱落浮起，收集细胞培养液，获得含有目的基因的重组病毒rBm-Bacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3)。

重组家蚕杆状病毒的纯化和扩增方法如下：接种适量细胞(约70～80％)于35mm小平皿中，细胞贴壁后，吸去培养基，将收集的细胞培养液进行不同浓度稀释，取1mL加到贴壁细胞中，分布均匀。27℃感染1h后，吸去感染液，将2％低融点琼脂糖凝胶于60℃水浴中融化，冷至40℃与40℃预热的2×TC-100培养基(含20％FBS)混合均匀，每个平皿加4mL胶，待凝固后用Parafilm封口，27℃倒置培养3～5d，显微镜观察。把不含有多角体的空斑挑选出来，重复以上步骤，经过2～3轮的纯化获得纯的重组家蚕杆状病毒rBm-Bacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3)。

将重组家蚕杆状病毒rBm-Bacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3)感染正常生长的BmN细胞，培养3天后收集上清液，上清中即含有大量的重组病毒rBm-Bacmid(OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3)。

1.4羊λ3型干扰素突变体在家蚕体内表达

将重组病毒培养液按10⁵PFU/头的剂量注射5龄起蚕，在27℃、70％～80％湿度的条件下培养，家蚕幼虫生长晚期，OvIFN-λ3在多角体基因启动子的作用下得到高效表达。接种感染3.5d～4d左右，可以观察到家蚕幼虫体节肿胀、行为异常、食欲下降等症状，当观察到幼虫体积明显缩小，停止进食时，收集血淋巴，-20℃保存备用。

1.5羊λ3型干扰素突变体蛋白抗病毒活性检测

采用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测蚕血淋巴中表达的羊λ3型干扰素突变体的抗病毒活性。将状态良好的Vero细胞以3.0×10⁵个/mL的密度接种于96孔培养板中。将已超声破碎并过滤除菌的蚕血淋巴用含70mL/L胎牛血清的DMEM培养液配制成不同稀释度的溶液，将稀释好的样品按100μL/孔接种于已经铺满VERO细胞的培养孔内，每个稀释度和对照蚕血至少设12个复孔，同时设不加蚕血淋巴及VSV*GFP的细胞对照组和添加VSV*GFP的病毒对照组，于37℃、5％CO₂条件下培养18～24h。将稀释至100TCID₅₀的VSV*GFP病毒，按100μL/孔加入已经吸弃上清液的培养孔内，置于37℃、5％CO₂条件下培养。在倒置荧光显微镜下观察，当病毒对照组各孔中大量细胞出现荧光，而细胞对照组中的细胞仍完全生长良好，无荧光出现时，则表明对照系统完全合格，即可作全面观察。

2、实验结果

2.1重组转移载体的鉴定

重组转移载体pVL-OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2-M3经BamHI和EcoRI双酶切，在1％琼脂糖凝胶电泳分离出2个片段，小片段位于500-750bp之间，与目的基因片段591bp大小相符，大片段位于8000bp上方，与pVL1393片段9607bp大小相符。将酶切鉴定正确的质粒送北京擎科新业生物技术有限公司进行核苷酸测序，用MegaAlign比对结果表明序列与原先设计的序列一致，表明羊λ3型干扰素突变体基因已成功插入到pVL1393转移载体中BamHI和EcoRI之间。

2.2羊干扰素重组病毒的获得及重组产物的检测

应用微量细胞病变抑制法在Vero/VSV*GFP系统上检测家蚕幼虫表达的羊λ3型干扰素抗病毒活性。在倒置荧光显微镜下观察到，细胞对照组中的细胞生长状态良好，无荧光出现；感染病毒对照组中的细胞发生病变，大多数细胞出现荧光，添加重组羊λ3干扰素蛋白的细胞具有抵抗病毒感染的能力。根据羊λ3型干扰素对Vero细胞的保护作用，观察细胞的病变程度，待有绿色荧光细胞出现，这一孔细胞就记为“+”，按照Reed-Muench方法计算干扰素效价，检测结果列于表5，所有羊λ3干扰素突变体测得效价在3.24×10⁵U/mL～7.94×10⁶U/mL，其中G74S-G75S-R117S三位点突变后，表达的羊λ3干扰素效价远高于保守序列、单突变序列、双突变序列表达测得的效价，为7.94×10⁶U/mL。而其余几组位点突变后效价不变甚至降低，说明此组合位点的突变是有效突变，可以达到提高OvIFN-λ3-S-C-O-M1-M2突变体抗病毒活性的目的。OvIFN-λ3-S-C-O-G74S-G75S-R117S突变体的氨基酸序列为SEQ IDNO.11所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.12所示。

表5重组羊λ3干扰素多位点突变抗病毒活性的检测结果

SEQUENCE LISTING

<110> 中国农业科学院生物技术研究所

<120> 羊λ3干扰素突变体及其制备方法和应用

<130> BJ-2002-171105A

<160> 12

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 196

<212> PRT

<213> artifical sequence

<400> 1

Met Ala Pro Gly Cys Thr Leu Val Leu Val Leu Met Leu Met Thr Ala

1 5 10 15

Ala Leu Ser Arg Thr Gly Ala Val Pro Val Pro Ser Ala Pro Arg Ala

20 25 30

Leu Pro Pro Ala Arg Gly Cys His Met Ala Gln Phe Lys Ser Leu Ser

35 40 45

Pro Gln Glu Leu Gln Ala Phe Lys Thr Ala Arg Asp Ala Phe Glu Asp

50 55 60

Ser Arg Leu Gln Lys Asp Trp Asp Cys Gly Gly Arg Leu Phe Pro Arg

65 70 75 80

Thr Arg Asp Leu Lys His Leu Gln Val Trp Glu Arg Pro Val Ala Leu

85 90 95

Glu Ala Glu Leu Ala Leu Thr Leu Thr Val Leu Glu Ala Met Ala Asn

100 105 110

Ser Ser Leu Gly Arg Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

115 120 125

Val His Ser Lys Leu Gln Ala Cys Val Pro Ala Gln Pro Thr Ala Gly

130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

145 150 155 160

Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

165 170 175

Asn Leu Phe Arg Leu Leu Thr Arg Asp Leu Lys Cys Val Ala Ser Gly

180 185 190

Asp Gln Cys Val

195

<210> 2

<211> 591

<212> DNA

<213> artifical sequence

<400> 2

atggccccag gctgcacgct ggtgctggtg ctgatgctga tgactgcggc gctgagcagg 60

acaggagcag ttcctgtgcc ctctgccccc agggccctcc cacctgccag gggctgccac 120

atggcccagt tcaagtctct gtcccctcaa gagctgcagg ccttcaagac ggccagggat 180

gcctttgaag actcgcgctt gcagaaggac tgggactgcg gcggccgcct gttccccagg 240

acccgggacc tgaagcacct gcaggtgtgg gagcgccccg tggctctgga ggcagagctg 300

gccctgacgc tgacggtcct ggaggccatg gctaactcgt ccctgggccg cagcctggag 360

cagccccttc tcacgctgca gcacgtccac tccaagctcc aggcctgtgt cccagctcag 420

cccacagcag gccccaggcc ccggggccgc ctccaccact ggctgcaccg gctccaggag 480

gcccaaaaga aggagtccca ggactgcctc gaagcctccg tgatgttcaa cctcttccgc 540

ctcctcaccc gggacctgaa atgtgttgcc agtggagacc agtgtgtctg a 591

<210> 3

<211> 196

<212> PRT

<213> artifical sequence

<400> 3

Met Ala Pro Gly Cys Thr Leu Val Leu Val Leu Met Leu Met Thr Ala

1 5 10 15

Ala Leu Pro Arg Thr Gly Ala Val Pro Val Pro Ser Ala Pro Arg Ala

20 25 30

Leu Pro Pro Ala Arg Gly Cys His Met Ala Gln Phe Lys Ser Leu Ser

35 40 45

Pro Gln Glu Leu Gln Ala Phe Lys Thr Ala Arg Asp Ala Phe Glu Asp

50 55 60

Ser Arg Leu Gln Lys Asp Trp Asp Cys Gly Gly Arg Leu Phe Pro Arg

65 70 75 80

Thr Arg Asp Leu Lys His Leu Gln Val Trp Glu Arg Pro Val Ala Leu

85 90 95

Glu Ala Glu Leu Ala Leu Thr Leu Thr Val Leu Glu Ala Met Ala Asn

100 105 110

Ser Ser Leu Gly Arg Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

115 120 125

Val His Ser Lys Leu Gln Ala Cys Val Pro Ala Gln Pro Thr Ala Gly

130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

145 150 155 160

Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

165 170 175

Asn Leu Phe Arg Leu Leu Thr Arg Asp Leu Lys Cys Val Ala Ser Gly

180 185 190

Asp Gln Cys Val

195

<210> 4

<211> 591

<212> DNA

<213> artifical sequence

<400> 4

atggccccag gctgcacgct ggtgctggtg ctgatgctga tgactgcggc gctgcctagg 60

acaggagcag ttcctgtgcc ctctgccccc agggccctcc cacctgccag gggctgccac 120

atggcccagt tcaagtctct gtcccctcaa gagctgcagg ccttcaagac ggccagggat 180

gcctttgaag actcgcgctt gcagaaggac tgggactgcg gcggccgcct gttccccagg 240

acccgggacc tgaagcacct gcaggtgtgg gagcgccccg tggctctgga ggcagagctg 300

gccctgacgc tgacggtcct ggaggccatg gctaactcgt ccctgggccg cagcctggag 360

cagccccttc tcacgctgca gcacgtccac tccaagctcc aggcctgtgt cccagctcag 420

cccacagcag gccccaggcc ccggggccgc ctccaccact ggctgcaccg gctccaggag 480

gcccaaaaga aggagtccca ggactgcctc gaagcctccg tgatgttcaa cctcttccgc 540

ctcctcaccc gggacctgaa atgtgttgcc agtggagacc agtgtgtctg a 591

<210> 5

<211> 196

<212> PRT

<213> artifical sequence

<400> 5

Met Ala Pro Gly Cys Thr Leu Val Leu Val Leu Met Leu Met Thr Ala

1 5 10 15

Ala Leu Pro Arg Thr Gly Ala Val Pro Val Pro Ser Ala Pro Arg Ala

20 25 30

Leu Pro Pro Ala Arg Gly Cys His Met Ala Gln Phe Lys Ser Leu Ser

35 40 45

Pro Gln Glu Leu Gln Ala Phe Lys Thr Val Arg Asp Ala Phe Glu Asp

50 55 60

Ser Arg Leu Gln Lys Asp Trp Asp Cys Gly Gly Arg Leu Phe Pro Arg

65 70 75 80

Thr Arg Asp Leu Lys His Leu Gln Val Trp Glu Arg Pro Val Ala Leu

85 90 95

Glu Ala Glu Leu Ala Leu Thr Leu Thr Val Leu Glu Ala Met Ala Asn

100 105 110

Ser Ser Leu Gly Arg Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

115 120 125

Val His Ser Lys Leu Gln Ala Cys Val Pro Ala Gln Pro Thr Ala Gly

130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

145 150 155 160

Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

165 170 175

Asn Leu Phe Arg Leu Leu Thr Arg Asp Leu Lys Cys Val Ala Ser Gly

180 185 190

Asp Gln Cys Val

195

<210> 6

<211> 588

<212> DNA

<213> artifical sequence

<400> 6

atggctcctg gctgcacctt ggtgctcgtt ctgatgttga tgaccgctgc cttgcctaga 60

acaggagctg tcccagtgcc atccgctcca agagctctcc ctccagctag aggctgtcac 120

atggcccaat tcaaaagcct ctccccacaa gaattgcagg ctttcaagac agttagagac 180

gccttcgaag attcaagact gcaaaaagac tgggattgcg gtggaagatt gttcccgaga 240

actagagacc tcaagcacct gcaagtttgg gaaagacccg tcgctctcga agccgaactc 300

gctctgacat tgactgtcct ggaagctatg gccaactcat ctctgggtag atcattggaa 360

caaccgctgt tgactttgca gcacgtccac tctaaactcc aagcctgcgt gccagctcag 420

ccaaccgccg gccctagacc aagaggtaga ctgcaccact ggttgcacag actccaagaa 480

gctcagaaaa aggaatcgca agattgtctg gaagccagtg tgatgttcaa tttgttcaga 540

ctcctgacaa gagacctcaa gtgcgtggct agcggagatc agtgtgtt 588

<210> 7

<211> 196

<212> PRT

<213> artifical sequence

<400> 7

Met Ala Pro Gly Cys Thr Leu Val Leu Val Leu Met Leu Met Thr Ala

1 5 10 15

Ala Leu Pro Arg Thr Gly Ala Val Pro Val Pro Ser Ala Pro Arg Ala

20 25 30

Leu Pro Pro Ala Arg Gly Cys His Met Ala Gln Phe Lys Ser Leu Ser

35 40 45

Pro Gln Glu Leu Gln Ala Phe Lys Thr Val Arg Asp Ala Phe Glu Asp

50 55 60

Ser Arg Leu Gln Lys Asp Trp Asp Cys Gly Ser Arg Leu Phe Pro Arg

65 70 75 80

Thr Arg Asp Leu Lys His Leu Gln Val Trp Glu Arg Pro Val Ala Leu

85 90 95

Glu Ala Glu Leu Ala Leu Thr Leu Thr Val Leu Glu Ala Met Ala Asn

100 105 110

Ser Ser Leu Gly Arg Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

115 120 125

Val His Ser Lys Leu Gln Ala Cys Val Pro Ala Gln Pro Thr Ala Gly

130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

145 150 155 160

Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

165 170 175

Asn Leu Phe Arg Leu Leu Thr Arg Asp Leu Lys Cys Val Ala Ser Gly

180 185 190

Asp Gln Cys Val

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<212> DNA

<213> artifical sequence

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atggctcctg gctgcacctt ggtgctcgtt ctgatgttga tgaccgctgc cttgcctaga 60

acaggagctg tcccagtgcc atccgctcca agagctctcc ctccagctag aggctgtcac 120

atggcccaat tcaaaagcct ctccccacaa gaattgcagg ctttcaagac agttagagac 180

gccttcgaag attcaagact gcaaaaagac tgggattgcg gttccagatt gttcccgaga 240

actagagacc tcaagcacct gcaagtttgg gaaagacccg tcgctctcga agccgaactc 300

gctctgacat tgactgtcct ggaagctatg gccaactcat ctctgggtag atcattggaa 360

caaccgctgt tgactttgca gcacgtccac tctaaactcc aagcctgcgt gccagctcag 420

ccaaccgccg gccctagacc aagaggtaga ctgcaccact ggttgcacag actccaagaa 480

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<210> 9

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Ala Leu Pro Arg Thr Gly Ala Val Pro Val Pro Ser Ala Pro Arg Ala

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Leu Pro Pro Ala Arg Gly Cys His Met Ala Gln Phe Lys Ser Leu Ser

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Ser Ser Leu Gly Ser Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

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130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

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Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

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195

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<212> DNA

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<210> 11

<211> 196

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1 5 10 15

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Pro Gln Glu Leu Gln Ala Phe Lys Thr Val Arg Asp Ala Phe Glu Asp

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100 105 110

Ser Ser Leu Gly Ser Ser Leu Glu Gln Pro Leu Leu Thr Leu Gln His

115 120 125

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130 135 140

Pro Arg Pro Arg Gly Arg Leu His His Trp Leu His Arg Leu Gln Glu

145 150 155 160

Ala Gln Lys Lys Glu Ser Gln Asp Cys Leu Glu Ala Ser Val Met Phe

165 170 175

Asn Leu Phe Arg Leu Leu Thr Arg Asp Leu Lys Cys Val Ala Ser Gly

180 185 190

Asp Gln Cys Val

195

<210> 12

<211> 588

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gccttcgaag attcaagact gcaaaaagac tgggattgct cgtccagatt gttcccgaga 240

actagagacc tcaagcacct gcaagtttgg gaaagacccg tcgctctcga agccgaactc 300

gctctgacat tgactgtcct ggaagctatg gccaactcat ctctgggttc atcattggaa 360

caaccgctgt tgactttgca gcacgtccac tctaaactcc aagcctgcgt gccagctcag 420

ccaaccgccg gccctagacc aagaggtaga ctgcaccact ggttgcacag actccaagaa 480

gctcagaaaa aggaatcgca agattgtctg gaagccagtg tgatgttcaa tttgttcaga 540

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Claims (10)

1.一种羊λ3干扰素，其特征在于：其氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示，其编码基因的多核苷酸序列为(a)或(b)或(c)所示：

(a)、SEQ ID No.2所示的多核苷酸序列；或

(b)、与SEQ ID No.2的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的多核苷酸序列，该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；或

(c)、与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有80％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有85％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性；更优选的，与SEQ ID No.2的多核苷酸序列至少有90％以上同源性的多核苷酸序列，且该多核苷酸编码的蛋白仍具有干扰素的功能或活性。

2.一种羊λ3干扰素突变体，其特征在于：将权利要求1所述羊λ3干扰素的第19位氨基酸由丝氨酸突变成脯氨酸得到的突变体；

所述突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.3所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ IDNO.4所示。

3.一种羊λ3干扰素突变体，其特征在于：将权利要求2所述羊λ3干扰素突变体的第58位氨基酸由丙氨酸突变成缬氨酸得到的突变体；

所述突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.5所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ IDNO.6所示。

4.一种羊λ3干扰素突变体，其特征在于：将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行P30L、M41L、R59K、D64E、Q68P、G74S、G75S、L77I、T81S、L100V、M110L、G116H、R117S、E120D、Q127R、H128N、V129I、G144S、P145S、Q162R或F179L中的任何一种氨基酸单位点突变获得的突变体；

优选为，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S、G75S、T81S、R117S、H128N或V129I中的任何一种氨基酸单位点突变获得的突变体；

其中，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G75S氨基酸单位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.7所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.8所示。

5.一种羊λ3干扰素突变体，其特征在于：将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S、G74S-T81S、G74S-R117S、G74S-H128N、G74S-V129I、G75S-T81S、G75S-R117S、G75S-H128N、G75S-V129I、T81S-R117S、T81S-H128N、T81S-V129I、R117S-H128N、R117S-V129I或H128N-V129I中的任何一种氨基酸双位点突变获得的突变体；

优选为，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S、G75S-R117S或H128N-V129I任何一种氨基酸双位点突变获得的突变体；

其中，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G75S-R117S氨基酸双位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.9所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.10所示。

6.一种羊λ3干扰素突变体，其特征在于：将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S、G74S-G75S-H128N、G74S-G75S-V129I、G75S-R117S-H128N、G75S-R117S-V129I或R117S-H128N-V129I任何一种氨基酸多位点突变获得的突变体；

优选为，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S氨基酸多位点突变获得的突变体；

其中，将权利要求3所述的羊λ3干扰素突变体进行G74S-G75S-R117S氨基酸多位点突变获得的突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO.11所示，其编码基因的核苷酸序列为SEQ IDNO.12所示。

7.含有权利要求1所述羊λ3干扰素的编码基因或者含有权利要求2至6任何一项所述羊λ3干扰素突变体的编码基因的重组载体或重组宿主细胞。

8.权利要求1所述羊λ3干扰素或者权利要求2至6任何一项所述的羊λ3干扰素突变体在制备预防或治疗羊病毒性疾病的药物或试剂中的用途。

9.按照权利要求8所述的用途，其特征在于，所述羊病毒性疾病包括：羊痘病毒感染、羊传染性脓疱病毒感染或水疱性口炎病毒感染所致疾病，或者牛呼吸道合胞体病毒病中的任何一种或多种。

10.一种制备权利要求1所述羊λ3干扰素或者权利要求2至6任何一项所述羊λ3干扰素突变体的方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)分别将权利要求1所述羊λ3干扰素的编码基因或者权利要求2至6任何一项所述羊λ3干扰素突变体的编码基因克隆到杆状病毒转移载体中，构建得到重组转移载体；

(2)将重组转移载体与杆状病毒DNA共转染昆虫细胞，获得重组杆状病毒；

(3)将重组杆状病毒感染昆虫细胞或昆虫宿主，培养被感染的昆虫细胞或昆虫宿主表达相应的蛋白，纯化，即得；

其中，所述杆状病毒转移载体选自AcRP23-lacZ、AcRP6-SC、AcUWl-lacZ、BacPAK6、Bacto Pac、Bacmid、BlucBacII(pETL)、p2Bac、p2Blue、p89B310、pAc360、pAc373、pAcAB3、pAcAB4、PAcAS3、pAcC129、pAcC4、DZI、pAcGP67、pAcIEl、pAcJPl、pAcMLF2、pAcMLF 7、pAcMLF 8、pAcMPl、pAcMP2、pAcRP23、pAcRP 25、pAcRW4、pAcsMAG、pAcUWl、pAcUW21、pAcUW2A、pAcUW2B、pAcUW3、pAcUW31、pAcUW41、pAcUW42、pAcUW43、pAcUW51、pAcVC2、pAcVC 3、pAcYMl、pAcJcC5、pBacl、pBac2、pBlueBacIII、pBlueBacHis、pEV55、mXIV、pIEINeo、pJVETL、pJVNhel、pJVP10、pJVrsMAG、pMBac、pP10、pPAKl、pPBac、pSHONEX 1.1、pSYN XIV VI+、pSYNVI+wp、pSYNXIVVI-、pVL1391、pVL 1392、pVL 1393、pVL941、pVL 945、pVL 985、pVTBac、pBM030或pUAC-5；

所述杆状病毒选自家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid、BmNPV、AcMNPV、ApNPV、HaNPV、HzNPV、LdMNPV、MbMNPV、OpMNPV、SlMNPV、SeMNPV或SpltNPV；

所述昆虫宿主选自家蚕(Bombyx mori)、野蚕(Bombyx mandarina)、蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricim)、樟蚕(Dictyoploca japanica)、樗蚕(Philosamia cynthiapryeri)、柞蚕(Antheraea pernyi)、日本柞蚕(Antheraea yamamai)、野天蚕(Antheraeapolyphymus)、苜蓿尺蠖(Atographa califorica)、茶尺蠖(Ectropis obliqua)、甘兰夜蛾(Mamestra brassicae)、斜纹夜蛾(Spodoptera littoralis)、秋粘虫(Spodopterafrugiperda)、粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)、行军虫(Thaumetopoea wilkinsoni)、棉铃虫(Heliothis armigera)、美国棉铃虫(Heliothis zea)、烟青虫(Heliothis assulta)、烟草夜蛾(Heliothis virescens)、东方粘虫(Pseudaletia separata)或舞毒蛾(Lymantriadispar)；

优选的，所述杆状病毒转移载体为pVL1393；所述杆状病毒为家蚕杆状病毒亲本株BmBacmid；所述昆虫宿主为家蚕(Bombyx mori)。

所述感染是指重组杆状病毒通过吞食或透过表皮来感染1-5龄的昆虫幼虫或蛹体。