CN109913431A - 一种来源于白曲霉的单胺氧化酶用于手性胺中间体的制备 - Google Patents

一种来源于白曲霉的单胺氧化酶用于手性胺中间体的制备 Download PDF

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CN109913431A CN201711321498.1A CN201711321498A CN109913431A CN 109913431 A CN109913431 A CN 109913431A CN 201711321498 A CN201711321498 A CN 201711321498A CN 109913431 A CN109913431 A CN 109913431A
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Abstract

本发明属于生物技术领域,涉及基因工程、生物转化和生物催化、有机合成技术,公开了一种来源于白曲霉的单胺氧化酶基因及其在催化不对称氧化反应制备手性胺中间体中的应用。本发明单胺氧化酶AaMAO7‑6基因为1527 bp,编码由509个氨基酸组成的单胺氧化酶。本发明单胺氧化酶基因构建的重组菌单胺氧化酶表达后,全细胞或者酶用于转化顺式‑7‑氮杂双环[3,3,0]辛烷,生成特拉瑞韦(Telaprevir)的关键手性中间体。本发明具有反应条件温和,立体选择性高,易于工业化等优点。

Description

一种来源于白曲霉的单胺氧化酶用于手性胺中间体的制备
技术领域
本发明属于应用微生物与酶工程领域,具体涉及一株白曲霉及其基因组编码的一种新型单胺氧化酶,并利用来源于该菌株的单胺氧化酶作为生物催化剂制备若干手性胺中间体。
背景技术
手性胺是重要和关键的药物结构单元,目前约40%的药物含有手性胺结构,手性胺高效制造技术是手性药物制造工业进步与发展所必须的关键技术。目前,手性胺的制备主要以化学不对称拆分和合成为主,生物催化制造手性胺则主要采用脂肪酶和转氨酶作为催化剂,对单胺氧化酶(MAO)的研究和使用较少。
光学活性Δ1-吡咯烷类化合物是制备很多药物的关键手性中间体,这些分子中包含多个手性中心,合成难度极高。例如,(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸是治疗丙型肝炎药物特拉瑞韦(Telaprevir)的关键手性中间体,该药物由Vertex公司与强生公司联合开发。
采用手性酸试剂通过非对应异构体结晶成盐的拆分方法仍是目前获得光学纯手性胺的主要方法,但理论收率仅有50%成为这一技术的最大弊端。利用过渡金属催化亚胺不对称氢化还原是获得手性胺的另一重要途径,然而这一方法也存在很多不足:如需要活化的亚胺底物;需要使用过渡金属,如Rh,Ru,Ir和Ti,但昂贵的价格限制了它们在工业化中的应用。
近年来,随着生物催化技术的不断发展,研究者们积极探索发现和挖掘新酶作为生物催化剂用于手性胺的合成。采用单胺氧化酶不对称氧化消旋胺底物来获得光学纯手性胺的研究目前还主要停留在实验室研发阶段,成果主要集中在国外几个课题组,如英国的turner小组。
为获得高效的手性胺催化工艺,首先应解决单胺氧化酶来源极其有限的问题,迄今为止成功应用的只有黑曲霉单胺氧化酶。从环境中筛选新型微生物菌株作为催化剂是常用的有效途径之一。然而原始菌株直接转化可能存在安全性、遗传稳定性问题,原始菌株内的其他酶可能对底物作用生成副产物等问题,因此将原始菌株的关键单胺氧化酶基因克隆并异源表达,以重组菌或者酶用于生物转化则可避免上述问题,且这种催化体系较为简单,稳定,产物分离提纯容易,易于工业化。
发明内容
本发明的目的是公开一个产自新筛选的白曲霉(Aspergillus albicans 14)的高对映选择性单胺氧化酶AaMAO7-6,并利用该酶与化学磺化反应相偶联,一锅法反应构建含三个手性中心且水溶性和稳定性更好的光学纯(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠中间体,再通过化学腈化和水解,得到高光学纯度的特拉瑞韦(Telaprevir)关键手性中间体(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸。
基于上述发明目的,本发明首先提供一种单胺氧化酶AaMAO7-6。该酶是从一株白曲霉(Aspergillus albicans 14)中通过基因狩猎法克隆调取出来的。该菌从植物园土壤中富集、分离并经过多轮筛选后获得。
本发明还提供一种上述单胺氧化酶AaMAO7-6作为生物催化剂转化底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷,并与化学磺化反应相偶联,一锅法反应生成光学纯(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠中间体,再通过化学氰化和水解,得到高光学纯度的特拉瑞韦(Telaprevir)关键手性中间体(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸的应用。
其中,从上述白曲霉(Aspergillus albicans 14)中关键单胺氧化酶基因AaMAO7-6的调取和转化包括以下步骤:
(1)基因狩猎法克隆扩增AaMAO7-6基因:
采用CTAB法提取白曲霉(Aspergillus albicans 14)的基因组DNA。通过对已报道对单胺氧化酶基因进行序列对比和同源分析,根据N端和C端保守序列设计兼并引物,以提取的白曲霉(Aspergillus albicans 14)基因组DNA为模板进行PCR,将其中的单胺氧化酶基因克隆扩增出来。
其中,上述步骤中涉及的AaMAO7-6基因 PCR扩增所用引物为:
正向5¢- GGA TCC ATG TCC CGC TCC AGC GAA GGC-3¢(酶切位点Bam H I),反向 5¢- GAA TTC CTA CAA CCT AGC CCT CCC CTC CCT-3¢(酶切位点EcoR I);
PCR条件为,95 °C预变性5 分钟,95 °C变性30 秒,55 °C退火30 秒,72 °C延伸90 秒,30个循环,最后72 °C延伸10 分钟。PCR产物连入pMD19T载体构建TA克隆,测序结果显示含有一段由34个核苷酸组成的内含子序列。
AaMAO7-6基因(含内含子)碱基数为1561bp,其序列为(SEQ ID No.1)
ATGTCCCGCTCCAGCGAAGGCTACCTCTGGACCCCTGAGCAAATCACCTCAGGCCTACCCACAGACGCAGTCCACCCCAGCACGCCCGCCCTCCGCACCCACTACGACGTGATAGTCATCGGGGCCGGATTCGCCGGACTAATTACAGCCCGCGACCTAAGCAGAAAGCACAATCTCAACGTCCTGCTCCTAGAAGCGCGGGACCGCATCGGTGGTCGAACATGGACAGCCAAGGTTCTCGGCGAGGAGATCGAAATGGGCGGGACCTGGGTTCACTGGAACCAGCCGCATCTGTATGCCGAGCTGCATCGGTACGGACTGCACCGGAATCTGAAGACCTCTGCGGGGTCATTCACGCCTGTGGATCAGTGGTTCAGGTCCAGTAGTGGTCCTGTGGAGAAGGTTTCTGTTGAAGATTACCAGGCTACGCTTGAGCGCGTTGCAGAGAAGTTTTTCGCAATTGATGGGCTGGACAGTCGTGCGTTGATGCCGTATCCGCATGATTCGCTGAGGGAGCCGGCGCCGTGGAAGAGGTATGATTATCTTAGTGTGGAGGAGCGGTTGGAGATGTCGGATTTGGATGGGTTGCCGGGGTGGGAGAAAGAGCTGTTTGCGTCTAATGTTAGTACGTTTGGGAGTGCGCCGGTGAAGGATATTGGGTTTGTGGAGGCGCTGCGGTGGTTTGCGCTGGGAGGGCATAGTATGGCTGGGGTGTTTGAGTTGGCGGGGGTGTACAAATTGGGGAGTGGAGGGATGACTTCTTTTGCGAGGGCTATTTTGGGGGACTTCACTGGTCATGTTAGCTTTGGAACGGTTGTTGAGCAGATTAATCATGGTCGTGATATGGTAGAGGTTGTCACTAAGGATGGGAGGAGGGTTGGGGCTCGTGCGGTGGTGTCGACGGTTCCGCTGTATGTTTCTTTCCTATCTCACCTTCTGTTGCTTTAGATATATCCACCTGACTAACCTAACGACAGAAACTGCCTCAACGACATCCAATTTCAACCCCCACTCACCCCCCTCCGACAAGCAGCCATCACAAAAGGCCACATTAACAAAGGCGCAGAGATCCACTTCAAGCTTCGCGAAACACTACCGGGTTGGTTCTTTACTGCACATGACGGCAGTGACTCCAGCTTTGTCTTTGCGTTCTCAGATCACAATGGAACCCAGCTAACAGGCCCGTCTGGCACCTGGTGCATTGGATTTGGGTACAACGATCAACTTACTAATAAGAAGGATAGCAAATATATCTTGCAGAGATTCAAGCATGATGTTAACCCGGATGTGGATATTGATGCCTATGCCACCCATGATTGGATGAATGATCCGTATGCGAAAGGGGCTTGGGCGTGCTGGGGACCAAATACTGCGTCAGAATACTTGGAGGAACTTCAGAAACCGCATGGACGGGTTGTGTTTGCGAGCGCGGATTGGGCGGACGGGTGGAGGGGGTTTGTGGATGGTGCGATTGAGAGGGGACAGGCTGCTGTGGGGGAGGTTTTGGGGATGCTGGAGGGGAGAGAGGGAGGGGAGGGCTAGGTTGTAG
采用重叠PCR除去AaMAO7-6基因中的内含子。重叠PCR所用引物为正向5¢-TATCTCACCTTCTGTTGCTTCCTAACGACAGAAACTGCCT-3¢,反向 5¢-AGGCAGTTTCTGTCGTTAGGAAGCAACAGAAGGTGAGATA-3¢;
PCR条件为,50ul反应体系,变性95℃ 30秒,退火55℃ 30秒,延伸72℃ 1分30秒,共30个循环,采用Pfu DNA polymerase。PCR产物连入pMD19T载体构建TA克隆,测序结果显示已正确除去内含子序列。
AaMAO7-6基因(除去内含子)碱基数为1527 bp,其序列为(SEQ ID No.2)
ATGTCCCGCTCCAGCGAAGGCTACCTCTGGACCCCTGAGCAAATCACCTCAGGCCTACCCACAGACGCAGTCCACCCCAGCACGCCCGCCCTCCGCACCCACTACGACGTGATAGTCATCGGGGCCGGATTCGCCGGACTAATTACAGCCCGCGACCTAAGCAGAAAGCACAATCTCAACGTCCTGCTCCTAGAAGCGCGGGACCGCATCGGTGGTCGAACATGGACAGCCAAGGTTCTCGGCGAGGAGATCGAAATGGGCGGGACCTGGGTTCACTGGAACCAGCCGCATCTGTATGCCGAGCTGCATCGGTACGGACTGCACCGGAATCTGAAGACCTCTGCGGGGTCATTCACGCCTGTGGATCAGTGGTTCAGGTCCAGTAGTGGTCCTGTGGAGAAGGTTTCTGTTGAAGATTACCAGGCTACGCTTGAGCGCGTTGCAGAGAAGTTTTTCGCAATTGATGGGCTGGACAGTCGTGCGTTGATGCCGTATCCGCATGATTCGCTGAGGGAGCCGGCGCCGTGGAAGAGGTATGATTATCTTAGTGTGGAGGAGCGGTTGGAGATGTCGGATTTGGATGGGTTGCCGGGGTGCGAGAAAGAGCTGTTTGCGTCTAATGTTAGTACGTTTGGGAGTGCGCCGGTGAAGGATATTGGGTTTGTGGAGGCGCTGCGGTGGTTTGCGCTGGGAGGGCATAGTATGGCTGGGGTGTTTGAGTTGGCGAGGGTGTACAAATTGGGGAGTGGAGGGATGACTTCTTTTGCGAGGGCTATTTTGGGGGACTTCACTGGTCATGTTAGCTTTGGAACGGTTGTTGAGCAGATTAATCATGGTCGTGATATGGTAGAGGTTGTCACTAAGGATGGGAGGAGGGTTGGGGCTCGTGCGGTGGTGTCGACGGTTCCGCTGTATGTTTCTTTCCTATCTCACCTTCTGTTGCTTCCTAACGACAGAAACTGCCTCAACGACATCCAATTTCAACCCCCACTCATCCCCCTCCGACAAGCAGCCATCACAAAAGGCCACATTAACAAAGGCGCAAAGATCCACTTCAAGCTTCGCGAAACACTACCGGGTTGGTTCTTTACTGCACATGACGGCAGTGACTCCAGCTTTGTCTTTGCGTTCTCAGATCACAATGGAACCCAGCTAACAGGCCCGTCTGGCACCTGGTGCATTGGATTTGGGTACAACGATCAACTTACTAATAAGAAGGATAGCAAATATATCTTGCAGAGATTCAAGCATGATGTTAACCCGGATGTGGATATTGATGCCTATGCCACCCATGATTGGATGAGTGATCCGTATGCGAAAGGGGCTTGGGCGTGCTGGGGACCAAATACTGCGTCAGAATACTTGGAGGAACTTCAGAAACCGCATGGACGGGTTGTGTTTGCGAGCGCGGATCGGGCGGACGGGTGGAGGGGGTTTGTGGATGGTGCGATTGGGAGGGGACAGGCTGCTGTGGGGGAGGTTTTGGGGATGCTGGAGGGGAGAGAGGGAGGGGAGGGCTAGGTTGTAG
AaMAO7-6基因(除去内含子)编码509个氨基酸,序列为(SEQ ID No.3):
MSRSSEGYLWTPEQITSGLPTDAVHPSTPALRTHYDVIVIGAGFAGLITARDLSRKHNLNVLLLEARDRIGGRTWTAKVLGEEIEMGGTWVHWNQPHLYAELHRYGLHRNLKTSAGSFTPVDQWFRSSSGPVEKVSVEDYQATLERVAEKFFAIDGLDSRALMPYPHDSLREPAPWKRYDYLSVEERLEMSDLDGLPGWEKELFASNVSTFGSAPVKDIGFVEALRWFALGGHSMAGVFELAGVYKLGSGGMTSFARAILGDFTGHVSFGTVVEQINHGRDMVEVVTKDGRRVGARAVVSTVPLYVSFLSHLLLLPNDRNCLNDIQFQPPLTPLRQAAITKGHINKGAEIHFKLRETLPGWFFTAHDGSDSSFVFAFSDHNGTQLTGPSGTWCIGFGYNDQLTNKKDSKYILQRFKHDVNPDVDIDAYATHDWMNDPYAKGAWACWGPNTASEYLEELQKPHGRVVFASADWADGWRGFVDGAIERGQAAVGEVLGMLEGREGGEGVV
而后将测序正确的质粒以Bam H I和EcoR I酶切,将其连入以同样酶消化的pET 28a(+)空载体中,构建重组质粒,并转入大肠杆菌BL21(DE3)中,构建重组菌,中以常规方法过量表达。后文涉及生物转化和应用的基因及酶均指去除内含子后的序列及蛋白表达产物。
(2)重组菌生物催化:
挑取单克隆至LB(含卡那霉素50 μg/ml)培养基中,37 °C过夜培养,以1%的接种量转接至LB(含卡那霉素50 μg/ml)培养基中,37 °C培养3 h,加入0.5 mM IPTG诱导后,30 °C继续培养至20~36 h。8000 rpm,4 °C离心收集菌体,用pH值为8.0、0.1 M浓度的磷酸钾缓冲溶液洗涤2次,获得湿菌体。
取上述新鲜培养的湿菌体重悬于pH值为8.0、1 M浓度的磷酸钾缓冲液,加入底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷,反应过程中向反应体系中通入氧气,转化体系中菌体浓度为50~150 g/L,底物终浓度为1~20 g/L,转化温度为30 °C,转速为230 rpm,转化时间为1~24 h。反应过程中采用TLC检测反应情况,展开剂比例为石油醚:乙酸乙酯:三乙胺=15:1:0.1,碘显显色。
(3)AaMAO7-6酶的蛋白纯化
AaMAO7-6酶的纯化采用镍柱亲和层析(Bio-Rad)。将上述步骤(2)诱导培养20~36 h后的菌体以13, 000rpm,4 °C离心收集,重悬于Buffer A(50 mM磷酸盐缓冲液,pH 8.0,300mM NaCl,10 mM咪唑),超声破碎(超声10 s,间隔30 s,30次),之后以13, 000rpm,4 °C离心20 分钟,将上清液加入已用Buffer A平衡的柱料中,轻微混匀30 分钟,用含有20 mM咪唑的Buffer A漂洗杂蛋白,再用含250 mM咪唑的Buffer A的缓冲液洗脱目的蛋白,最后电泳鉴定纯度,并用BCA Protein Assay kit 测定蛋白浓度。
(4)单胺氧化酶AaMAO7-6不对称氧化与亲核加成磺化偶联反应:
表达AaMAO7-6酶的大肠杆菌重组菌的菌体培养、获得湿菌体的步骤同步骤(2)。
生物转化条件:在三口圆底反应烧瓶中分别加入磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),底物和湿菌体/酶,其中顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷终浓度为20 g/L,湿菌体终浓度为50g/L, 过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)终浓度为1000 KU/L,在37°C, 250 rpm条件下开始反应24小时,反应过程中保持通入氧气。反应过程中滴加NaHSO3溶液(NaHSO3摩尔物质的量为底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷的1.2倍),不对称氧化生成的亚胺中间体随即与NaHSO3发生反式亲核加成反应,生成水溶性和稳定性更好的含3个手性中心的(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠产物,反应过程中滴加3N NaOH调节反应体系pH维持在8.0左右。
(5)氰化反应制备(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-腈
氰化反应条件:环戊基甲醚(CPME)50mL加入到步骤(4)的反应液中,溶液降温至10°C。缓慢滴加15mL NaCN水溶液(NaCN摩尔物质的量为底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷的1.2倍),于半小时滴加完毕。10°C继续反应1小时,过滤除去不溶物,取有机相,水相用CPME 3×20mL萃取,合并有机相,无水硫酸钠干燥后减压蒸馏除去溶剂,残留物即为(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-腈。
(6)水解反应制备(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸
水解反应条件:将步骤(5)得到的(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-腈与10mL浓盐酸(33%)分别加入到50 mL圆底烧瓶中,加热回流过夜。降温至室温后向圆底烧瓶中加入氨水条件体系pH至7.0。采用离子交换层析法进行纯化,已填好的阳离子交换树脂柱先用1N HCl洗涤,后用纯水洗涤至pH中性为止。将反应液上柱,用纯水洗涤3~5个柱体积后用5%的氨水洗涤,接收洗脱产物,洗脱过程用茚三酮显色进行监测,减压蒸馏除去溶剂所得类白色固体即为(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸的铵盐。步骤(4)~(6),反应总收率约45%,产物(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸光学纯度为90%ee值。产物在乙醇-甲基叔丁基醚混合液中重结晶后总收率35%,光学纯度提高到95%ee值。此氨基酸产物的光学纯度采用手性高效液相色谱(HPLC)分析法来确定。手性HPLC条件: 手性柱Chirex 3126 (D)-Penicillamine(50 mm× 4.6 mm,5 micron),流动相 H2O : CH3CN = 90: 10, 2 mM CuSO4, 流速 0.8 mL / min,,柱温25 °C, 监测波长247nm,产物保留时间 Tr= 6.6 分钟和9.8分钟。
本发明涉及的白曲霉(Aspergillus albicans 14)其关键单胺氧化酶基因AaMAO7-6可高立体选择性转化顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷生成亚胺中间体(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,并可与化学磺化反应相偶联,一锅法反应构建 (1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠中间体,再通过化学腈化和水解,得到高光学纯度的特拉瑞韦(Telaprevir)关键手性中间体(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸。目前国内外还未有专利及文献报道从白曲霉(Aspergillus albicans)中挖掘单胺氧化酶以及将其用于特拉瑞韦(Telaprevir)关键手性中间体(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸的制备。AaMAO7-6与已报道的功能蛋白MAO-N-D5(PDB数据库ID:2VVM)的最高相似度为33.2%,为(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸生物催化合成提供了可供选择的新型酶源。
目前,国内外还未有专利及文献报道采用单胺氧化酶不对称氧化与化学磺化反式亲核加成反应相偶联,一锅法反应生成光学纯(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠中间体用于制备特拉瑞韦(Telaprevir)关键手性中间体(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-羧酸。
凡是与AaMAO7-6氨基酸相似度高于70%且具有催化顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷生成(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉功能的酶均属于本发明的保护范围。另外,采用单胺氧化酶不对称氧化与化学磺化反式亲核加成反应相偶联,一锅法反应生成光学纯(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠的合成方法也在本发明的保护范围。
附图说明
图1是AaMAO7-6蛋白纯化后SDS-PAGE图。
具体实施方式
以下结合实施例详细地说明本发明。实施方案为便于更好的理解本发明,但并非对本发明的限制。
实施例1:基因组DNA提取
采用CTAB法提取基因组DNA操作方法如下:
菌株培养:将少量白曲霉(Aspergillus albicans 14)斜面种子接种于曲霉培养基中,30 °C,230 rpm培养24~36 h制备种子液,以0.5%~2%的接种量转接至曲霉培养基中扩大培养,培养条件:30 °C,230 rpm, 48~72 h。曲霉培养基成分:0.3% KH2PO4;0.15% MgSO4•7H2O;0.1% 酵母膏;0.06% 蛋白胨;2% 葡萄糖;20% 土豆。
取0.5~1.0g菌丝体至研钵中,加石英砂液氮研磨粉碎。将该粉末转移到2.0 ml的EP管中,加入600 ul的DNA抽提液 (每50mg菌体加500μl),振荡,混匀,55℃保温60 分钟。用4 mol/L NaCl调整溶液NaCl浓度为1.4 mol/L,然后加入1/10体积的10% CTAB溶液,混匀,65℃保温10 分钟。加入等体积氯仿/异戊醇,颠倒混匀,冰浴30 分钟。4℃,15000 r/分钟离心10 分钟。将上清液转移到另一EP管中,加入等体积的异丙醇混匀,冰浴30 分钟。取出EP管,10000 r/分钟,4℃离心10分钟,弃上清液,75%乙醇洗涤两次,空气干燥,加入150 ulddH2O溶解沉淀即得基因组总DNA。DNA抽提液组成:0.1 mol/L Tris-HCl(pH 8.0),0.01mol/L EDTA, 2% SDS,100 μg/ml Proteinase K,0.5% β-mercaptoethanol。
实施例2:基因狩猎法克隆扩增AaMAO7-6基因
通过对已报道对单胺氧化酶基因进行序列对比和同源分析,根据N端和C端保守序列设计兼并引物,以实施例1中获得的基因组DNA为模板进行PCR,将其中的单胺氧化酶基因克隆扩增出来。
PCR反应体系为50ul,分别由5 ul ×10 pfu DNA polymerase buffer(含Mg2+),1ul primer F,1 ul primer R,4 ul dNTP,1 ul 基因组DNA,0.5 ul Pfu DNA polymerase和37.5 ul ddH2O组成。其中, PCR扩增所用引物为:
primer F: 5¢- GGA TCC ATG TCC ACG TAC CAA GCC AAG -3¢(酶切位点Bam H I),primer R: 5¢- GAA TTC CTA GAT CTT TTC GAA CGA TCC CGG-3¢(酶切位点EcoR I);
PCR条件为,95 °C预变性5 分钟,95 °C变性30 秒,55 °C退火30 秒,72 °C延伸90 秒,30个循环,最后72 °C延伸10 分钟。PCR产物连入pMD19T载体构建TA克隆,测序结果显示含有一段由57个核苷酸组成的内含子序列。AaMAO7-6基因(含内含子)碱基数为1561 bp,其序列为(SEQ No.1)。
采用重叠PCR除去AaMAO7-6基因中的内含子。
第一轮PCR:将之前提取的质粒pMD19T-AaMAO7-6作为模板,进行PCR,反应体系(50ul)如下:
前段基因(a):5 ul ×10 pfu buffer(含Mg2+),1 ul primer F,1 ul primer Rm,4ul dNTP,1 ul pMD19T-AaMAO7-6,0.5 ul Pfu DNA polymerase, 37.5 ul ddH2O。
后段基因(b):5 ul ×10 pfu buffer(含Mg2+),1 ul primer Fm,1 ul primer R,4 ul dNTP,1 ul pMD19T-AaMAO7-6,0.5 ul Pfu DNA polymerase, 37.5 ul ddH2O。重叠PCR所用引物为Fm 5¢- GAGACCTTGTCAAAGTTGGTAAGAAGACCTTGCTTATCGA-3¢,Rm 5¢-TCGATAAGCAAGGTCTTCTTACCAACTTTGACAAGGTCTC-3¢;
PCR条件为,95 °C预变性5 分钟,95 °C变性30 秒,55 °C退火30 秒,72 °C延伸90 秒,30个循环,最后72 °C延伸10 分钟。
采用凝胶回收试剂盒回收2段PCR产物,回收产物编号:7-6-a和7-6-b。
第二轮PCR:将之前回收的PCR产物7-6-a和7-6-b作为模板,进行PCR,反应体系(50ul)如下:5 ul ×10 pfu buffer(含Mg2+),1 ul primer F,1 ul primer R,4 ul dNTP,1ul 7-6-a,1 ul 7-6-b,0.5 ul Pfu DNA polymerase, 36.5 ul ddH2O。
采用凝胶回收试剂盒回收PCR产物,并与pMD19-T载体连接,转化到感受态细胞E.coli DH5α中,LB平板(含氨苄青霉素100 ug/mL)培养,通过蓝白斑筛选选出阳性克隆进行培养,提取质粒和测序。
10 ul 连接体系: 1 ul pMD19-T载体,5 ul NEB solution I,4 ul PCR回收产物,16℃下过夜连接。
转化:将连接片段4ul转化到E. coli DH5α中,LA平板(含10 ul ×5 X-gal,7 ul1M IPTG)37℃培养。
蓝白斑筛选:挑取白色单克隆菌落(每个平板挑2个菌)到3ml LB液体培养基(含氨苄青霉素100 ug/mL)的试管中,37℃,180rpm下培养17小时。
采用细菌质粒小提试剂盒提取质粒pMD19T-AaMAO7-6。质粒测序结果显示已正确除去内含子序列。AaMAO7-6基因(除去内含子)碱基数为1527 bp,其序列为(SEQ No.2)
实施例3:将AaMAO7-6基因构建在基因工程菌株中
对质粒pMD19T-AaMAO7-6进行双酶切。酶切体系40 ul, 由33 ul pMD19T-AaMAO7-6,1.0 ul BSA,1.0 ul BamH I,4 ul NEB Buffer 3组成,37℃酶切3小时后补加1.0 ul EcoRI,继续于37℃酶切3小时。
对载体pET28a进行双酶切。酶切体系40 ul, 由33 ul pET28a,1.0 ul BSA,1.0ul BamH I,4 ul NEB Buffer 3组成,37℃酶切3小时后补加1.0 ul EcoR I,继续于37℃酶切3小时。
酶切产物采用凝胶回收试剂盒进行回收和纯化。
连接:10 ul 体系,6 ul AaMAO7-6(BamH I / EcoR I),2 ul pET28a (BamH I /EcoR I),1 ul T4 DNA ligase Buffer,1 ul T4 DNA ligase。16℃下连接过夜。
转化与培养:将连接的10 ul载体 pET28-AaMAO7-6转化到感受态细胞E. coliDH5α中,涂布在LB平板(含卡那霉素50 μg/ml),于37℃培养箱培养过夜。从生长含有pET28-AaMAO7-6的E. coli DH5α平板上挑取单克隆菌落,于含卡那霉素(Kan)抗性的LB液体培养基中培养,37℃,180rpm。采用细菌质粒小提试剂盒提取质粒pET28-AaMAO7-6。
转化到基因工程菌中与培养:将2ul质粒pET28-AaMAO7-6转化到感受态细胞E.coli BL21中,涂布在LB平板(含卡那霉素50 μg/ml),于37℃培养箱培养过夜。从生长含有pET28-AaMAO7-6的E. coli BL21平板上挑取单克隆菌落,于含Kan抗性的LB液体培养基中培养,180rpm,37℃,培养过夜。以1%的接种量转接至LB(含卡那霉素50 μg/ml)培养基中,37°C培养3 小时,加入0.5 mM IPTG诱导后,30 °C继续培养至16~20小时。8000 rpm,4 °C离心收集菌体,用pH值为8.0、0.1 M浓度的磷酸钾缓冲溶液洗涤2次,获得湿菌体可用于后续生物转化反应。
实施例4:单胺氧化酶AaMAO7-6重组菌全细胞生物催化
单胺氧化酶AaMAO7-6重组菌的培养方法和菌体收集方法见说明书发明内容部分。
(1)取菌体1.0 g,重悬于10 ml磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),加入底物10 mg,30°C,230 rpm转化3h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为23%。
(2)取菌体1.0g,重悬于10 ml磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),加入底物10 mg,反应瓶中通入纯氧,30°C,230 rpm转化3 h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为29%。
(3)取菌体1.0 g,重悬于10 ml磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),加入底物10 mg,过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)1 ul,反应瓶中通入纯氧,30°C,230 rpm转化3 h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为43%。
(4)取菌体1.0 g,重悬于10 ml磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),加入底物10 mg,过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)1 ul,反应瓶中通入纯氧,37°C,230 rpm转化24 h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为78%。
(5)取菌体1.5 g,重悬于10 ml磷酸盐缓冲液(pH 8.0,0.1M),加入底物500 mg,过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)1 ul,反应瓶中通入纯氧,37°C,230 rpm转化24 h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为42%。
实施例5:单胺氧化酶AaMAO7-6纯酶生物催化
转化体系:磷酸钾缓冲液(0.1M,pH 8.0),纯酶浓度2 g/L,底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷,过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)1 ul,反应瓶中通入纯氧,30 °C生物转化3h。以10 ml乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,减压浓缩得到产物(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉,经TLC薄层层析色谱分析,底物的转化率为21%。
实施例6:单胺氧化酶AaMAO7-6不对称氧化与磺化反应偶联
单胺氧化酶AaMAO7-6重组菌的培养方法和菌体收集方法见说明书发明内容部分。
在100 mL圆底三口反应烧瓶中分别加入10 mL重悬菌液(用0.1M,pH 8.0磷酸钾缓冲液重悬1.5g湿菌体),2克顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷,过氧化氢酶(CAT,30KU/mg)5ul,反应瓶中持续通入氧气,反应开始后缓慢滴加5 mL NaHSO3溶液(NaHSO3 2.2g),于1h内加毕,随后继续在37°C, 230 rpm条件下反应24小时,反应过程中滴加3N NaOH调节反应体系pH维持在8.0左右。反应结束后用10 ml乙酸乙酯萃取,除去有机相,水相加入3N HCl调节pH<2,用3×10 ml 甲基叔丁基醚(MTBE)萃取,无水硫酸钠干燥,减压蒸馏后得类白色固体即为(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸,收率80%。
序列表
<110> 成都渊源生物科技有限公司
<120> 一种来源于白曲霉的单胺氧化酶用于手性胺中间体的制备
<130> 说明书
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1549
<212> DNA
<213> Aspergillus albicans
<400> 1
atgtcccgct ccagcgaagg ctacctctgg acccctgagc aaatcacctc aggcctaccc 60
acagacgcag tccaccccag cacgcccgcc ctccgcaccc actacgacgt gatagtcatc 120
ggggccggat tcgccggact aattacagcc cgcgacctaa gcagaaagca caatctcaac 180
gtcctgctcc tagaagcgcg ggaccgcatc ggtggtcgaa catggacagc caaggttctc 240
ggcgaggaga tcgaaatggg cgggacctgg gttcactgga accagccgca tctgtatgcc 300
gagctgcatc ggtacggact gcaccggaat ctgaagacct ctgcggggtc attcacgcct 360
gtggatcagt ggttcaggtc cagtagtggt cctgtggaga aggtttctgt tgaagattac 420
caggctacgc ttgagcgcgt tgcagagaag tttttcgcaa ttgatgggct ggacagtcgt 480
gcgttgatgc cgtatccgca tgattcgctg agggagccgg cgccgtggaa gaggtatgat 540
tatcttagtg tggaggagcg gttggagatg tcggatttgg atgggttgcc ggggtgggag 600
aaagagctgt ttgcgtctaa tgttagtacg tttgggagtg cgccggtgaa ggatattggg 660
tttgtggagg cgctgcggtg gtttgcgctg ggagggcata gtatggctgg ggtgtttgag 720
ttggcggggg tgtacaaatt ggggagtgga gggatgactt cttttgcgag ggctattttg 780
ggggacttca ctggtcatgt tagctttgga acggttgttg agcagattaa tcatggtcgt 840
gatatggtag aggttgtcac taaggatggg aggagggttg gggctcgtgc ggtggtgtcg 900
acggttccgc tgtatgtttc tttcctatct caccttctgt tgctttagat atatccacct 960
gactaaccta acgacagaaa ctgcctcaac gacatccaat ttcaaccccc actcaccccc 1020
ctccgacaag cagccatcac aaaaggccac attaacaaag gcgcagagat ccacttcaag 1080
cttcgcgaaa cactaccggg ttggttcttt actgcacatg acggcagtga ctccagcttt 1140
gtctttgcgt tctcagatca caatggaacc cagctaacag gcccgtctgg cacctggtgc 1200
attggatttg ggtacaacga tcaacttact aataagaagg atagcaaata tatcttgcag 1260
agattcaagc atgatgttaa cccggatgtg gatattgatg cctatgccac ccatgattgg 1320
atgaatgatc cgtatgcgaa aggggcttgg gcgtgctggg gaccaaatac tgcgtcagaa 1380
tacttggagg aacttcagaa accgcatgga cgggttgtgt ttgcgagcgc ggattgggcg 1440
gacgggtgga gggggtttgt ggatggtgcg attgagaggg gacaggctgc tgtgggggag 1500
gttttgggga tgctggaggg gagagaggga ggggagggct aggttgtag 1549
<210> 2
<211> 1528
<212> DNA
<213> Aspergillus albicans
<400> 2
atgtcccgct ccagcgaagg ctacctctgg acccctgagc aaatcacctc aggcctaccc 60
acagacgcag tccaccccag cacgcccgcc ctccgcaccc actacgacgt gatagtcatc 120
ggggccggat tcgccggact aattacagcc cgcgacctaa gcagaaagca caatctcaac 180
gtcctgctcc tagaagcgcg ggaccgcatc ggtggtcgaa catggacagc caaggttctc 240
ggcgaggaga tcgaaatggg cgggacctgg gttcactgga accagccgca tctgtatgcc 300
gagctgcatc ggtacggact gcaccggaat ctgaagacct ctgcggggtc attcacgcct 360
gtggatcagt ggttcaggtc cagtagtggt cctgtggaga aggtttctgt tgaagattac 420
caggctacgc ttgagcgcgt tgcagagaag tttttcgcaa ttgatgggct ggacagtcgt 480
gcgttgatgc cgtatccgca tgattcgctg agggagccgg cgccgtggaa gaggtatgat 540
tatcttagtg tggaggagcg gttggagatg tcggatttgg atgggttgcc ggggtgcgag 600
aaagagctgt ttgcgtctaa tgttagtacg tttgggagtg cgccggtgaa ggatattggg 660
tttgtggagg cgctgcggtg gtttgcgctg ggagggcata gtatggctgg ggtgtttgag 720
ttggcgaggg tgtacaaatt ggggagtgga gggatgactt cttttgcgag ggctattttg 780
ggggacttca ctggtcatgt tagctttgga acggttgttg agcagattaa tcatggtcgt 840
gatatggtag aggttgtcac taaggatggg aggagggttg gggctcgtgc ggtggtgtcg 900
acggttccgc tgtatgtttc tttcctatct caccttctgt tgcttcctaa cgacagaaac 960
tgcctcaacg acatccaatt tcaaccccca ctcatccccc tccgacaagc agccatcaca 1020
aaaggccaca ttaacaaagg cgcaaagatc cacttcaagc ttcgcgaaac actaccgggt 1080
tggttcttta ctgcacatga cggcagtgac tccagctttg tctttgcgtt ctcagatcac 1140
aatggaaccc agctaacagg cccgtctggc acctggtgca ttggatttgg gtacaacgat 1200
caacttacta ataagaagga tagcaaatat atcttgcaga gattcaagca tgatgttaac 1260
ccggatgtgg atattgatgc ctatgccacc catgattgga tgagtgatcc gtatgcgaaa 1320
ggggcttggg cgtgctgggg accaaatact gcgtcagaat acttggagga acttcagaaa 1380
ccgcatggac gggttgtgtt tgcgagcgcg gatcgggcgg acgggtggag ggggtttgtg 1440
gatggtgcga ttgggagggg acaggctgct gtgggggagg ttttggggat gctggagggg 1500
agagagggag gggagggcta ggttgtag 1528
<210> 3
<211> 508
<212> PRT
<213> Aspergillus albicans
<400> 3
Met Ser Arg Ser Ser Glu Gly Tyr Leu Trp Thr Pro Glu Gln Ile Thr
1 5 10 15
Ser Gly Leu Pro Thr Asp Ala Val His Pro Ser Thr Pro Ala Leu Arg
20 25 30
Thr His Tyr Asp Val Ile Val Ile Gly Ala Gly Phe Ala Gly Leu Ile
35 40 45
Thr Ala Arg Asp Leu Ser Arg Lys His Asn Leu Asn Val Leu Leu Leu
50 55 60
Glu Ala Arg Asp Arg Ile Gly Gly Arg Thr Trp Thr Ala Lys Val Leu
65 70 75 80
Gly Glu Glu Ile Glu Met Gly Gly Thr Trp Val His Trp Asn Gln Pro
85 90 95
His Leu Tyr Ala Glu Leu His Arg Tyr Gly Leu His Arg Asn Leu Lys
100 105 110
Thr Ser Ala Gly Ser Phe Thr Pro Val Asp Gln Trp Phe Arg Ser Ser
115 120 125
Ser Gly Pro Val Glu Lys Val Ser Val Glu Asp Tyr Gln Ala Thr Leu
130 135 140
Glu Arg Val Ala Glu Lys Phe Phe Ala Ile Asp Gly Leu Asp Ser Arg
145 150 155 160
Ala Leu Met Pro Tyr Pro His Asp Ser Leu Arg Glu Pro Ala Pro Trp
165 170 175
Lys Arg Tyr Asp Tyr Leu Ser Val Glu Glu Arg Leu Glu Met Ser Asp
180 185 190
Leu Asp Gly Leu Pro Gly Trp Glu Lys Glu Leu Phe Ala Ser Asn Val
195 200 205
Ser Thr Phe Gly Ser Ala Pro Val Lys Asp Ile Gly Phe Val Glu Ala
210 215 220
Leu Arg Trp Phe Ala Leu Gly Gly His Ser Met Ala Gly Val Phe Glu
225 230 235 240
Leu Ala Gly Val Tyr Lys Leu Gly Ser Gly Gly Met Thr Ser Phe Ala
245 250 255
Arg Ala Ile Leu Gly Asp Phe Thr Gly His Val Ser Phe Gly Thr Val
260 265 270
Val Glu Gln Ile Asn His Gly Arg Asp Met Val Glu Val Val Thr Lys
275 280 285
Asp Gly Arg Arg Val Gly Ala Arg Ala Val Val Ser Thr Val Pro Leu
290 295 300
Tyr Val Ser Phe Leu Ser His Leu Leu Leu Leu Pro Asn Asp Arg Asn
305 310 315 320
Cys Leu Asn Asp Ile Gln Phe Gln Pro Pro Leu Thr Pro Leu Arg Gln
325 330 335
Ala Ala Ile Thr Lys Gly His Ile Asn Lys Gly Ala Glu Ile His Phe
340 345 350
Lys Leu Arg Glu Thr Leu Pro Gly Trp Phe Phe Thr Ala His Asp Gly
355 360 365
Ser Asp Ser Ser Phe Val Phe Ala Phe Ser Asp His Asn Gly Thr Gln
370 375 380
Leu Thr Gly Pro Ser Gly Thr Trp Cys Ile Gly Phe Gly Tyr Asn Asp
385 390 395 400
Gln Leu Thr Asn Lys Lys Asp Ser Lys Tyr Ile Leu Gln Arg Phe Lys
405 410 415
His Asp Val Asn Pro Asp Val Asp Ile Asp Ala Tyr Ala Thr His Asp
420 425 430
Trp Met Asn Asp Pro Tyr Ala Lys Gly Ala Trp Ala Cys Trp Gly Pro
435 440 445
Asn Thr Ala Ser Glu Tyr Leu Glu Glu Leu Gln Lys Pro His Gly Arg
450 455 460
Val Val Phe Ala Ser Ala Asp Trp Ala Asp Gly Trp Arg Gly Phe Val
465 470 475 480
Asp Gly Ala Ile Glu Arg Gly Gln Ala Ala Val Gly Glu Val Leu Gly
485 490 495
Met Leu Glu Gly Arg Glu Gly Gly Glu Gly Val Val
500 505

Claims (3)

1.一种单胺氧化酶AaMAO7-6,其特征在于其核苷酸序列为SEQ No.2所示,其氨基酸序列为SEQ No.3所示。
2.权利要求1所述的单胺氧化酶AaMAO7-6作为生物催化剂在转化
底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷生成(3AR,6AS)-六氢环戊二烯并[C]吡咯啉中的应用。
3.权利要求1所述的单胺氧化酶AaMAO7-6与化学亲核试剂通过不对称氧化与磺化反应相偶联,一锅法反应转化底物顺式-7-氮杂双环[3,3,0]辛烷生成(1S,3AR,6AS)-八氢环戊二烯并[C]吡咯-1-磺酸钠中间体的应用。
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