CN109642208A - 用于培养细胞的器皿 - Google Patents
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Abstract
本发明的多个方面涉及细胞培养器皿和使用所述器皿搅动细胞并维持细胞悬浮的方法。在一些实施例中,所述器皿具有本体,所述本体被安排为容纳一定体积的液体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有可变形部分,所述可变形部分被安排为引起所述液体足够的运动来维持所述细胞悬浮。在一些实施例中,所述可变形部分位于所述器皿本体的基部和侧壁中的至少一个中。在一些实施例中,所述可变形部分根据某个变形图形而变形。在一些实施例中,通过具有一个或多个可移动构件的变形板使所述可变形部分变形,所述可移动构件接触所述可变形部分。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求保护2016年4月12日提交的、题为“VESSEL FOR CULTURING CELLS[用于培养细胞的器皿]”的美国临时申请序列号62/321,691根据35U.S.C.§119(E)的权益,所述申请的全部内容通过援引并入本文。
技术领域
多个方面涉及用于培养细胞的器皿和用于使用这样的器皿搅动细胞并维持细胞悬浮的方法。一些方面涉及在细胞培养培殖器中使用这样的器皿以及使用这样的培殖器的方法。
背景技术
细胞培养器皿(例如,旋转瓶和磁搅拌器)用于搅拌含有细胞的液体,通过搅动器的转动来搅动细胞并维持细胞悬浮。细胞培养在研究背景和临床背景中均是有用的技术。例如,通常进行哺乳动物细胞的培养是为了建立克隆细胞系、组织制剂、体外受精制剂,或为了扩增干细胞群。
发明内容
目前用于培养细胞的可用器皿(诸如旋转瓶和磁搅拌器)使用搅动器(例如,分别为叶轮或磁搅拌棒)引起液体运动,这进而使细胞在液体内运动。这种转动可以搅动细胞还有维持细胞悬浮。在一些实施例中,搅动器(和流体)的转动对细胞施加剪应力。不幸的是,细胞容易受到剪应力的伤害并且因此可能在细胞培养期间溶解。在一些实施例中,使用较小的器皿(例如,烧瓶和/或烧杯),可以避免浪费另外在较大器皿中使用的不需要的培养基量。然而,在这样的实施例中,在较小的器皿中培养的细胞比在较大的器皿中发生溶解的频率更高。
申请人已经认识到,通过器皿的一部分的变形使培养器皿中的液体运动,可以实现各种优点。因此,本文中披露的实施例提供了一种具有可变形部分的器皿,所述可变形部分响应于变形而引起液体的足够运动来搅动细胞并维持细胞悬浮。在一些实施例中,可变形部分上的不同的变形图形(例如,变形波)用于引起器皿中的液体的运动。在一些实施例中,减小了当通过可变形部分的变形使液体运动时施加于细胞的剪应力,这样可以使液体中的细胞溶解的频率降到最低。
根据一个方面,此文件提供了一种用于培养细胞的器皿。在一些实施例中,所述器皿包括被安排为容纳一定体积的液体的器皿本体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有可变形部分,所述可变形部分被安排为使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。在一些实施例中,所述可变形部分位于所述器皿的基部上,但是所述可变形部分可以位于所述器皿的另一部分(例如,器皿的侧壁)上。
在一些实施例中,变形图形可以包括所述器皿的可变形部分(例如,器皿的底部的一部分)上的变形波,但是可以产生其他图形来引起所述体积的液体的运动。例如,变形图形的形状可以是圆形的。
在一些实施例中,通过使用者手动向可变形部分施加变形。在其他实施例中,使变形自动化。例如,在一些实施例中,器皿可以放在具有一个或多个可移动构件的变形板上,所述可移动构件被配置为使器皿的可变形部分变形。
在一些实施例中,此文件提供了一种用于培养细胞的器皿。在一些实施例中,所述器皿包括器皿本体,所述器皿本体被配置为容纳一定体积的液体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有基部和侧壁,所述基部的至少一部分是可变形的。响应于所述基部的变形图形,维持所述细胞悬浮,同时使施加于所述细胞的剪应力减小到最小。
根据又一个方面,此文件提供了一种用于培养细胞的系统。在一些实施例中,所述系统包括:器皿,所述器皿的本体被安排为容纳一定体积的液体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有可变形部分:以及一个或多个可移动构件,所述可移动构件被配置为使所述可变形部分变形以使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。
在又一个实施例中,此文件提供了一种培养细胞的方法。在一些实施例中,所述方法包括将含有待培养的细胞的一定体积的液体放入具有可变形部分的器皿中、并且使所述可变形部分变形以使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。
在一些实施例中,所述可变形部分与所述器皿形成为一体或永久地附接到所述器皿上。在其他实施例中,所述可变形部分可以可移除地附接到器皿上。
应了解,前述概念、以及下面讨论的附加概念可以以任何合适组合进行安排,因为本披露在此方面不受限制。
从以下描述结合附图,可以更加完全理解本发明教导内容的前述及其他方面、实施例、和特征。
附图说明
附图并不是按比例绘制的。在附图中,可以由相似的数字表示不同的图中示出的每个相同或几乎相同的部件。为清楚起见,可能并不是每个图中的每个部件都标有标记。现在将参考附图通过举例来描述本发明的不同实施例,在附图中:
图1A和图1B是用于培养细胞的现有技术器皿的示意性图示;
图2A是根据一个实施例的用于培养细胞的器皿的示意性图示;
图2B-2E是图2A的器皿的基部的示意性图示,所述基部带有可变形部分的不同安排;
图3是通过可移动构件使器皿的可变形部分变形从而在器皿中混合液体的示意性图示;
图4是图3的系统截面侧视图;
图5A-5D是应用于可变形部分的变形图形的示意性图示;
图6是在操纵位置具有成像器、操纵器、和带有可变形部分的器皿的细胞培养培殖器的说明性实施例的示意图;
图7-8是细胞培养培殖器的说明性实施例的示意图;图7示出了具有第二成像器的细胞培养培殖器的示意图;图8示出了细胞培养培殖器的示意图,其中,成像位置和操纵位置是同一位置;并且
图9是描绘细胞培养培殖器的另外的部件的示意图。
具体实施方式
目前用于培养细胞的可用器皿(例如,旋转瓶和磁搅拌器)依赖于用于引起液体运动的转动搅动器。例如,可以通过搅动细胞并维持细胞悬浮的叶轮或磁搅拌器来使液体转动。在一些实施例中,搅动器和液体的转动对细胞施加剪应力。不幸的是,细胞可能易受到这样的剪应力的伤害,在这样的实施例中剪应力可能导致细胞溶解。与在较大的培养器皿中相比,在较小的培养器皿中,看到这样的溶解还可能频率更高。在这样的实施例中,细胞溶解可能损害细胞培养的完整性并使结果无用。
申请人已经认识到,通过器皿的一部分的变形使器皿中的液体运动,可以实现各种优点。因此,本文件中披露的实施例提供了一种具有可变形部分的器皿,所述可变形部分响应于变形而引起液体的足够运动来维持细胞悬浮。在一些实施例中,不同的变形图形(例如,变形波)可以施加于器皿的可变形部分以引起液体的运动。
如本文中所使用的,器皿的“可变形部分”是指器皿的能够朝器皿的内部至少部分地变形(例如,运动)以引起器皿中的液体运动的部分。在一些实施例中,可变形部分保持形状,使得在变形之后,可变形部分恢复到其原始形状。如将了解的,在其原始形状下,可变形部分可以是平面的并且与器皿的不变形和/或不可变形部分相连。例如,在基部的至少一部分可变形的实施例中,可变形部分的原始形状是可变形部分与基部的其余部分相连(例如,与基部的不可变形部分和/或可变形但还没有变形的部分相连)。在一些实施例中,可变形部分具有足够的刚性来维持培养器皿的形状(例如,维持为烧杯的形状),同时仍然允许可变形部分变形。
在一些实施例中,可以手动施加(例如,通过使用者的手施加)器皿的可变形部分的变形。在其他实施例中,可以通过变形板的可移动构件来施加变形。例如,器皿可以放在具有可移动构件的板上,所述可移动构件可以从所述板向外延伸以使器皿的可变形部分变形。
在一些实施例中,具有可变形部分的培养器皿可以用于具有培殖器柜的细胞培养培殖器中,所述培殖器柜带有内部室以用于在一个或多个细胞培养器皿中培养细胞。在这样的实施例中,培养器皿可以放在操纵器位置(例如,放在变形板处),操纵器位置被安排为使可变形部分变形。在这样的实施例中,操纵器(诸如移液管)可以用于在细胞培养期间将一定体积的液体移入和移出器皿。在一些实施例中,培殖器柜还具有从外部环境通向内部室的门开口。成像器可以用于对内部室内的细胞成像。细胞培养器皿转移装置可以用于在内部室内部的位置之间移动一个或多个细胞培养器皿。
如本文使用的,“培殖器柜”是壳体,所述壳体包括被配置为固持一个或多个细胞培养器皿的一个或多个室。在一些实施例中,培殖器柜包括转移室和内部室,其中之一或二者被配置为固持一个或多个细胞培养器皿。在一些实施例中,培殖器可以包括一个或多个其他元件,例如:一个或多个气体源(例如,压缩气瓶或臭氧发生器);管道(例如,用于传送一种或多种液体或气体,例如水、蒸馏水、去离子水、细胞培养基、空气、二氧化碳、臭氧以及氧气);空气流动机构(例如,阀、释放阀、针孔、气体调节器、以及质量流量调节器);压力机构(例如,泵,例如干式涡旋泵、旋转泵、动量传输泵、扩散泵、或隔膜泵;抽吸管道;真空系统;以及鼓风机);环境监测器和控件(例如,气体传感器和/或监测器,用于感测和/或控制例如二氧化碳、氧气和臭氧等气体的浓度;热量源或散热片;温度监测器和控件;湿度监测器;气体洗涤器;空气过滤器;用于测量颗粒物质的器械;压力计;以及流量计);门(例如,开口或面板);窗(例如,由玻璃、塑料、复合材料、或其他基本上透明的材料制成的光学窗口,用于观察培殖器柜内部的区域);端口(例如,以允许引入或去除一种或多种气体或液体);光源(例如,灯、灯泡、激光器以及二极管);光学元件(例如,显微镜物镜、反射镜、透镜、滤光器、孔口、波板、窗口、偏振器、光纤、分束器、以及合束器);成像元件(例如,条形码读取器、相机等等);电气元件(例如,电路、电缆、电源线、以及电源,如电池、发电机、以及直流或交流电源);计算机;机械元件(例如,马达、轮子、齿轮、机器人元件、以及致动器,例如气动致动器、电磁致动器、具有凸轮的马达、压电致动器、以及带有导螺杆的马达);以及控制元件(例如,转盘、按钮、键、扳机、开关、指针、螺钉、拨号盘、屏幕、以及触摸屏)。在一些实施例中,这些其他元件中的一个或多个是培殖器的一部分、但在培殖器柜的外部。在一些实施例中,这些其他元件中的一个或多个元件被包含在培殖器柜内。
如本文使用的,“内部室”是布置在培殖器柜内的室。内部室可以包括一个或多个窗(例如,由玻璃、塑料、复合材料、或其他基本上透明材料制成的光学窗口,用于观察培殖器柜内部的区域)。内部室可以包括至少一个门(例如,以允许将物品转移到内部室中或转移出来)。在一些实施例中,所述至少一个门可以被布置在内部室与转移室之间。在某些实施例中,互锁件可以防止门在不希望的时候打开(例如,当培殖器柜的一部分开向周围环境时,从而使得污染物不能进入内部室)。内部室可以具有任何适当的大小和几何形状。在一些实施例中,培殖器柜可以包括一个或多个分区以限定内部室的不同区域。一个或多个内部室或其分区可以具有不同的环境条件。内部室内部的环境(例如,空气压力、气体含量、温度、光和湿度)可以由一个或多个计量器、监测器、传感器、控件、泵、阀、孔口、和/或光源来测量和/或控制。在一些实施例中,内部室可以例如围绕一个或多个窗或门具有不漏气体的或密闭密封。在特定实施例中,密封剂(例如油脂)和/或机械元件(例如O形环、垫圈、隔膜、KF、LF、QF、快速联接件)或其他密封机构可以被用于建立一个或多个不漏气体的密封。在一些实施例中,凹槽、凹陷、突出部、和/或模制的塑料元件可以便于建立一个或多个不漏气体的密封。
内部室可以由任何有用的材料制成。在一些实施例中,内部室可以包括一种或多种塑料、聚合物、金属、或玻璃。
如本文使用的,“门”是在被打开时允许在两个或更多个环境或区域之间实现连通、并且在被关闭时阻止这两个或更多个环境或区域之间的连通的元件。门可以为任何类型,例如滑动门、隐藏门、摆动门、铰接门、回转门、枢转门、或折叠门。门可以是手动、机械或电动运行的。例如,操作者可以通过手动地抓、拉、推和/或以其他方式与门或其元件(例如,把手)相互作用、或通过操作机械控制件(例如,按钮、扳机、转盘、键、开关、指针、螺钉、拨号盘、屏幕、或触摸屏)来打开或关闭门。在某些实施例中,门可以被电气或数字控制件、例如被计算机控制。门可以是自动打开的门。例如,门可以包括传感器,例如压力、红外、运动或远程传感器,所述传感器检测门是打开还是关闭的和/或控制所述门何时打开或关闭。门可以通过机械、气动、电气或其他方式打开。在一些实施例中,一个或多个门可以包括一个或多个锁定机构。在具体环境中,一个或多个门可以包括一个或多个互锁件(例如,机械互锁件,例如销、杆或锁;或电气互锁件,例如开关)以防止一个或多个门在不希望的时刻(例如,当一个或多个室开向外部环境时)打开。
可以使用用于移动一个或多个物品的转移装置来使物品在转移室与内部室之间移动。在一些实施例中,所述转移装置包括传送带或其他类似的用于操控物品的装置。可以被转移装置移动的物品的非限制性实例包括细胞培养器皿、移液管、容器、注射器、以及在细胞培养中使用的其他材料和器械。在一些实施例中,可以包括多于一个转移装置。在一些实施例中,一个或多个转移装置被定位在转移室中和/或内部室中。在一些实施例中,转移装置可以包括一个或多个机器人元件。例如,转移装置可以包括能够抓取、提升、推动、抓紧、滑动、旋转、平移、释放、升高、降低、和/或倾斜一个或多个物品(例如,移液管)的一个或多个机器人臂。
在一些实施例中,所述转移装置是细胞培养器皿转移装置。如本文使用的,“细胞培养器皿转移装置”是指可以将一个或多个细胞培养器皿从第一位置转移至第二位置的装置。在一些实施例中,所述转移装置被锚固在内部室内。在某些实施例中,所述转移装置可以将一个或多个物品从培殖器柜中的多个位置转移或转移至这些位置。例如,细胞培养器皿转移装置可以用于将细胞培养器皿从转移室移动至内部室、和/或从储存位置移动至成像位置。在一些实施例中,培殖器柜包括用于移动一个或多个物品的多于一个转移装置(例如,用于在多个室之间和在其之内转移物品的分开的装置)。细胞培养器皿转移装置可以包括一个或多个元件,例如阀(例如,电磁阀或气动阀)、齿轮、马达(例如,电动马达或步进马达)、载物台(例如,xy或xyz载物台)、活塞、制动器、线缆、滚珠丝杠组件、齿条小齿轮安排、抓取件、臂、枢转点、联结器、平移元件、或其他机械或电气元件。在一些实施例中,细胞培养器皿转移装置可以包括一个或多个机器人元件。例如,细胞培养器皿转移装置可以包括能够抓取、提升、推动、抓紧、滑动、旋转、平移、释放、升高、降低、和/或倾斜一个或多个细胞培养器皿的机器人臂。在一些情况下,所述细胞培养器皿转移装置选择性地且可释放地抓取一个或多个细胞培养器皿。在某些实施例中,细胞培养器皿转移装置可以包括联接至机械抓取器上的臂。例如,臂可以在一端处或附近包括用于可释放地抓取细胞培养器皿的机械抓取器并且在另一端处或附近牢固地联接至培殖器的表面或元件上。在一些实施例中,机器人臂包括沿着所述臂的枢转点(在所述枢转点处,所述机械抓取器联接至所述臂上)以及一个或多个枢转和/或平移关节,以允许所述臂的一部分灵活地旋转和平移。以此方式,机器人臂可以触及培殖器柜内(例如,在内部室的储存阵列内)在不同的水平和竖直位置处的一个或多个细胞培养器皿。
在一些实施例中,细胞培养器皿转移装置是自动化转移装置。例如,所述自动化转移装置可以是由计算机控制的机器人臂,所述计算机被编程来将细胞培养器皿从在培殖器的内部室内的储存位置移动到在培殖器的内部室内的成像位置。在一些实施例中,细胞培养器皿转移装置是手动操作的。例如,位于培殖器的内部室内部的机器人臂可以通过受使用者控制的控制杆从在培殖器的内部室外部的位置来进行操作,以便将细胞培养器皿从在培殖器的内部室内的储存位置移动至在培殖器的内部室内的成像位置。
如本文使用的,“细胞培养器皿”是包括壳体和用于培养细胞的一个或多个室的装置。在一些实施例中,所述壳体是框架。所述框架可以联接至盖件上。所述一个或多个室可以包括细胞培养基,所述细胞培养基包括一个或多个膜。在一些实施例中,细胞培养器皿可以包括用于促进细胞生长的营养素。在某些实施例中,细胞培养器皿可以完全包封一个或多个细胞或细胞群。细胞培养器皿的壳体可以包括一个或多个孔隙或开口,以允许气体在细胞培养器皿与其周围环境之间传递。细胞培养器皿的非限制性实例包括细颈瓶、悬浮培养瓶、旋转瓶、平板、培殖皿和/或袋。在某些实施例中,细胞培养器皿包括透明的或光学透亮的窗口。例如,联接至细胞培养器皿的壳体上的盖件可以包括光学透亮的部分,以用于例如用显微镜或其他成像器来观察细胞。在一些实施例中,细胞培养器皿包括基本上非反射性的一个或多个部分。在一些实施例中,细胞培养器皿是带条形码的。因此,在一些实施例中,所述培殖器包括条形码读取器。
在一些实施例中,细胞培养器皿可以预先装备有对于特定目的所希望的一种或多种试剂,例如用于细胞生长、用于细胞分化、用于使细胞经受特定测定条件等等。在一些实施例中,预先装备的细胞培养器皿在实验之前包含对于执行特定实验有用的试剂(例如,细胞生长培养基、生长因子、选择剂、标记试剂等)。预先装备的细胞培养器皿可以通过提供不需要添加试剂的、准备好细胞培养的器皿来利于实验方案。例如,来自患者的祖细胞可以被添加到预先装备有细胞分化的试剂的细胞培养器皿中,其目的是扩增用于自体细胞治疗的分化细胞群。预先装备的细胞培养器皿可以在任何适当的温度下储存,所述温度是由预先装备的细胞培养器皿内的试剂的推荐储存参数确定的。在一些实施例中,预先装备的细胞培养储存器皿在使用之前被储存在约-80℃与约37℃之间的温度下。在一些实施例中,预先装备的细胞培养储存器皿在使用之前被储存在约-80℃与约-20℃之间的温度下。在一些实施例中,预先装备的细胞培养储存器皿在使用之前被储存在约-20℃与约4℃之间的温度下。在一些实施例中,预先装备的细胞培养储存器皿在使用之前被储存在约4℃与约37℃之间的温度下。在一些实施例中,预先装备的细胞培养器皿是可抛弃式的。在一些实施例中,预先装备的细胞培养器皿是可重复使用的和/或可再填充的。
如本文使用的,“储存位置”是指储存一个或多个细胞培养器皿的位置(例如,在培殖器柜内)。例如,一个或多个细胞培养器皿可以被储存在储存位置并且之后被转移到不同的位置(例如,成像位置)。储存位置可以被布置在培殖器柜的内部室中。储存位置可以被配置为储存多个细胞培养器皿。例如,储存位置可以包括一个或多个储存阵列、支架、搁架、鸽子洞、立方体、托盘、槽缝、或其他位置或机构。在一些实施例中,储存位置可以被配置为水平地储存细胞培养器皿,而在其他实施例中储存位置可以被配置为竖直地储存细胞培养器皿。例如,储存位置可以包括多个槽缝,以用于接纳彼此竖直堆叠的细胞培养器皿。储存位置可以被配置为固持1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、100个、或任何其他数目的细胞培养器皿。在一些实施例中,储存位置可以被配置为固持多于100个细胞培养器皿。在一些实施例中,储存位置可以包括用于使一个或多个储存阵列、支架、搁架、鸽子洞、立方体、托盘、槽缝、或其他位置或机构移动的机构。例如,储存位置可以包括一个或多个马达和可移动载物台(例如,xy或xyz载物台),以用于将储存支架从内部室内部的一个位置移动至内部室内部的另一个位置,例如,以利于触及被储存在不同位置中的一个或多个细胞培养器皿。在一些实施例中,所述培殖器柜可以包括用于移动一个或多个细胞培养器皿的一个或多个细胞培养器皿转移装置。
储存位置可以被配置成牢固地固持或接纳一个或多个细胞培养器皿。例如,所述储存位置的一个或多个部件可以包括一个或多个锁定机构,所述锁定机构具有一个或多个粘性、磁性、电气和/或机械部件(例如,卡扣、紧固件、锁、扣、垫圈、O形环、隔膜、弹簧、以及其他接合构件)。在一些实施例中,储存位置和/或细胞培养器皿可以包括一个或多个凹槽或凹陷、和/或可以涉及模制的塑料件。例如,细胞培养器皿可以包括一个或多个突起的特征(例如,边沿或钮状物),所述特征被模制成用于插入在储存位置处的一个或多个对应的凹槽、孔洞、或凹陷中。在一些情况下,细胞培养器皿可以包括一个或多个凹槽、孔洞、或凹陷,其被模制成与储存位置处的一个或多个对应的突起的特征相配合。
如本文使用的,“成像器”是指用于测量光(例如,透射或散射光)、颜色、形貌、或其他可检测参数(例如元件数量)或其组合的成像装置。成像器也可以被称为成像装置。在某些实施例中,成像器包括一个或多个透镜、光纤、相机(例如,电荷耦合器件相机或CMOS相机)、孔口、反射镜、光源(例如,激光器或灯)、或其他光学元件。成像器可以是显微镜。在一些实施例中,成像器是明视场显微镜。在其他实施例中,成像器是全息成像器或显微镜。在其他实施例中,成像器是荧光成像器或显微镜。
如本文使用的,“荧光显微镜”是指能够检测从存在于细胞或其他生物实体的表面内和/或其上的荧光标记发出的光的成像装置,所述标记响应于对不同波长的光的吸收而发出特定波长的光。
如本文使用的,“明视场显微镜”是照射样本并且基于样本所吸收的光来产生图像的成像器。任何适当的明视场显微镜都可以与本文提供的培殖器柜组合使用。
如本文使用的,“全息成像器”是通过测量电磁辐射(例如,波前)的强度和相位信息来提供关于物体(例如,样本)的信息的成像器。例如,全息显微镜测量在穿过样本之后透射的光以及通过将穿过所述样本透射的光束与参考光束组合而得到的干涉图案(例如,相位信息)。
全息成像器也可以是以下装置,所述装置不干扰单独的参考光束地、并且在所述基本上相干源与检测器之间具有或不具有任何折射或反射光学元件地经由一个或多个辐射检测器记录来自基本上相干源的、被有待成像的物体直接衍射或散射的电磁辐射图案。
在一些实施例中,培殖器柜包括单一成像器。在一些实施例中,培殖器柜包括两个成像器。在一些实施例中,这两个成像器是相同类型的成像器(例如,两个全息成像器或两个明视场显微镜)。在一些实施例中,第一成像器是明视场显微镜,并且第二成像器是全息成像器。在一些实施例中,培殖器柜包括多于2个成像器。在一些实施例中,细胞培养培殖器包括三个成像器。在一些实施例中,细胞培养培殖器具有3个成像器,包括:全息显微镜、明视场显微镜、以及荧光显微镜。
如本文使用的,“成像位置”是成像器对一个或多个细胞进行成像的位置。例如,成像位置可以在光源上方和/或与一个或多个光学元件(例如,镜头、孔口、反射镜、物镜、和集光器)竖直对准。
如本文使用的,“基准标记”是指利于一个或多个部件对齐的特征。在一些实施例中,基准标记可以包括在荧光介质、或印刷或压印的荧光材料上的一个或多个孔洞孔口。在其他实施例中,基准标记可以包括网格、线、或符号。在一些实施例中,一个或多个细胞培养器皿包括一个或多个基准标记,以利于一个或多个细胞培养器皿与成像器对齐。在一些实施例中,基准标记可以与移动的部分(包括转移装置和机器人装置)相关联。
在一些实施例中,细胞培养器皿与成像器基本上对齐。在一些实施例中,通过使用至少一个基准标记,使细胞培养器皿与成像器基本上对齐。如本文使用的,术语“基本上对齐”暗示着,一个或多个元件是基本上重叠、相同和/或彼此共线的。一个或多个细胞培养器皿在一个或多个位置(例如,成像位置)的基本上对齐可以通过允许获得细胞培养器皿的重叠图像而利于对样本的分析。例如,细胞培养器皿可以在第一成像位置被第一成像器成像、随后在第二成像位置被第二成像器成像。如果相应成像器的成像视野基本上对齐,则第一和第二成像器所记录的图像可以进行组合(“拼接在一起”)以进行分析。存在于一个或多个细胞培养器皿上的一个或多个基准标记可以利于基本上对齐。在一些情况下,存在于一个或多个成像或其他位置(例如,操纵或维持位置)处的一个或多个基准标记可以利于基本上对齐。
如本文使用的,“用于对细胞加以操纵的操纵器”是指用于对内部室内的细胞加以操纵的操纵器。所述操纵器可以包括一个或多个针管、毛细管、移液管、和/或微操纵器。例如,操纵器可以包括细胞拾取器。用于对细胞加以操纵的操纵器可以通过基于预定判据来检测在第一位置处存在所希望细胞或细胞群、并且将所希望细胞或细胞群从第一位置转移至第二位置来运行。细胞拾取器可以基于手动或自动分析来检测、拾取和/或转移所希望或不希望的(例如,预分化细胞去除)细胞或细胞群。在一些实施例中,可以对成像器产生的信息进行分析以检测所希望或不希望的细胞。细胞拾取器接着可以将所希望或不希望的细胞转移至第二位置。例如,成像器可以对处于成像位置处的细胞培养器皿中或其上的细胞成像,并且将图像用于识别所希望或不希望的细胞或细胞群。所述细胞拾取器接着可以将所希望或不希望的细胞转移,例如通过用针管、毛细管、移液管、或微操纵器接触每个或所有所希望细胞,并且完成将这个或这些细胞从其第一位置转移至在细胞培养器皿中或其上或在内部室中其他地方的第二位置。在一些实施例中,细胞的第一位置可以在细胞培养器皿中或其上。在特定实施例中,细胞拾取器将细胞从在细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在同一细胞培养器皿上的第二位置。在其他实施例中,细胞拾取器将细胞从在第一细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在第二细胞培养器皿中或其上的第二位置。在某些其他实施例中,细胞拾取器将细胞从在细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在内部室中而不在细胞培养器皿中或其上的第二位置。
在一些实施例中,操纵器包括至少一个微电极。如本文使用的,术语“微电极”是指用于向细胞递送电刺激的电导体。例如,微电极可以用于通过电穿孔将遗传物质递送至细胞中。在一些实施例中,操纵器包括至少一个微注入器。一般,微注入器是玻璃微移液管,所述玻璃微移液管已被牵拉形成尖锐的中空结构,所述中空结构能够刺穿细胞膜并且用作将遗传物质引入细胞中的导管。
在一些实施例中,操纵器是手动操作的。例如,具有位于培殖器柜的内部室内部的细胞拾取器的操纵器可以电子链接至位于培殖器柜的内部室之外的使用者引导的控制杆上并且受其控制。在一些实施例中,使用者引导的控制杆连接至显示装置上。在一些实施例中,显示装置示出了由培殖器柜的内部室内部的成像装置捕捉的图像。
在一些实施例中,操纵器是自动化的。例如,在培殖器柜的内部室内部的操纵器可以电子连接至在培殖器柜之外的控制器上,所述控制器电子连接至指导所述操纵器的计算机上。例如,控制器可以指导操纵器对流体地连接到操纵器的一个或多个移液管管尖施加真空。
用于对细胞加以操纵的操纵器的一个或多个元件可以在操纵之前被灭菌,例如通过使用灭菌成分或方法(例如,乙醇或臭氧气体、UV光、过氧化氢)。
如本文使用的,“操纵位置”是指细胞被对细胞加以操纵的操纵器(例如,细胞拾取器)操纵所在的位置。在某些实施例中,操纵位置可以与成像位置相同。
根据一个方面,细胞培养培殖器包括具有成像位置和操纵位置的培殖器柜。细胞培养器皿的细胞在成像位置处被成像器成像、并且在操纵位置处被操纵器操纵。在一些实施例中,成像位置和操纵位置是培殖器柜内的两个不同的位置。所述细胞培养培殖器可以包括使细胞培养器皿在成像位置与储存位置之间移动的转移装置。在其他实施例中,成像位置和操纵位置相同,这样使得培养器皿的细胞在操纵位置处被成像。
在一些实施例中,可以将成像器与操纵器结合使用。例如,成像器可以对处于成像位置处的细胞培养器皿中或其上的细胞成像,并且将图像用于识别所希望的细胞或细胞群。所述细胞拾取器(可以处于或可以不处于成像位置处)接着可以将所希望或不希望的细胞转移,例如通过用针管、毛细管、移液管、或微操纵器接触每个或所有所希望细胞,并且完成将这个或这些细胞从其第一位置转移至在细胞培养器皿中或其上或内部室中其他地方的第二位置。在一些实施例中,细胞拾取器将细胞从在细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在同一细胞培养器皿上的第二位置。在其他实施例中,细胞拾取器将细胞从在第一细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在第二细胞培养器皿中或其上的第二位置。在某些其他实施例中,细胞拾取器将细胞从在细胞培养器皿中或其上的第一位置转移到在内部室中而不在细胞培养器皿中或其上的第二位置。
在一些实施例中,培殖器柜内的单一位置可以用作成像位置和操纵位置。在一个实施例中,细胞在被操纵器操纵时被成像。在一些实施例中,成像位置和成像位置可以是培殖器柜内的分开的位置。
在一些实施例中,操纵器包括传感器,这些传感器允许其报告其位置并且确定它何时碰触到了细胞培养器皿的底部。在一些实施例中,成像器可以用于指导操纵器以实现可重复性和准确性。在一些实施例中,操纵器中的顺应性(例如,弹性)可以用于减轻对极高机械准确性的需要。
在一些实施例中,使用一个或多个操纵器操纵此文件中所述的一个或多个移液管。在一些实施例中,使用纵器将移液管管尖放在移液管上和/或从移液管上取下。
现在转到图,图1A和图1B展示了根据现有技术的培养器皿。如图1A中所示,在一个实例中,培养器皿是旋转瓶(300a),所述旋转瓶通过在液体中心附近转动(参见标记为R1的箭头)的叶轮(304)来引起液体(302)的运动。在一些实施例中,可以通过齿轮驱动的马达(未示出)使叶轮(304)转动。如图1B中所示,在另一个实例中,培养器皿包括通过磁搅拌棒(306)的转动(参见标记为R2的箭头)引起液体(302)运动的磁搅拌器(300b)。如将了解的,可以通过搅拌板308中的转动磁体310或一组固定电磁体(未示出)产生的转动磁场来使磁搅拌棒转动。
图2A展示了根据本文件的培养器皿(500),其中可变形部分被安排为引起器皿中的一定体积的液体的运动。如图2中所示,在一个实施例中,器皿(500)具有带侧壁(512)、基部(514)和敞口顶部(516)的本体(511)。在这样的实施例中,器皿本体(511)被安排为容纳一定体积的带有细胞的液体(502)。在一些实施例中,盖件(未示出)可以放在器皿本体(511)上以盖上敞口顶部(516)。如将了解的,尽管图2中的器皿具有圆柱形的本体(511),在其他实施例中可以使用其他形状的器皿。
在一些实施例中,器皿本体(511)的至少一部分是可变形的。例如,如图2A中所示,基部(514)的部分(518)可以是可变形的。在一些实施例中,可变形部分(518)可以位于基部(514)的内部区域中,但是可变形部分(518)还可以位于基部(514)的另一个合适区域中。在一些实施例中,整个基部(514)被配置为是可变形的。
在一些实施例中,如图2A和图2B所示,可变形部分(518)的形状可以是圆形的。如将了解的,可变形部分的形状还可以是方形的或三角形的,如图2C和图2D所示,或者具有另一种合适的形状(例如,矩形、卵形)。
尽管图2A中仅示出了一个可变形部分,但在其他实施例中,基部(514)可以具有两个或更多个可变形部分(518)。例如,如图2E中所展示的,在一些实施例中,基部(514)可以具有两个可变形部分(518)。如将了解的,在这样的实施例中,两个或更多个可变形部分不需要具有相同的大小。即,第一可变形部分可以大于第二可变形部分。两个或更多个可变形部分也不需要具有相同的形状。例如,第一可变形部分可以是矩形的,而第二可变形部分可以是圆形的。
尽管显示了器皿本体的基部的仅一部分是可变形的,但将了解的是,器皿本体的其他部分可以是可变形的。例如,侧壁的一部分、或侧壁的两个或更多个部分可以是可变形的。在一些实施例中,整个侧壁可以是可变形的。
在其他实施例中,器皿本体可以在侧壁和基部上均包括可变形部分(例如,一个或多个可变形部分)。在这样的实施例中,侧壁和基部不需要包括多个具有相同数量、大小或形状的可变形部分。例如,虽然整个基部可以是可变形的,但侧壁可以包括仅一个较小的、方形的可变形部分。
在一些实施例中,可变形部分由柔性材料制成,所述柔性材料是诸如塑料或弹性体材料或聚合物。如将了解的,也可以使用其他合适的材料。在一些实施例中,用于形成可变形部分的(多种)材料的类型、厚度和/或特性在可变形部分之间可以相同或者可以不同。例如,可变形部分的内部区域可以比外部区域更薄。这样的可变形部分还可以在内部区域中比在外部区域中由具有更小杨氏模量(例如,更容易变形)的材料(塑料)制成。在其他实施例中,第一可变形构件可以由具有第一厚度的第一材料形成,并且第二可变形构件可以由具有第二厚度的第一材料形成,第一和第二厚度不同。
如将了解的,大小、形状、数量、以及用于形成(多个)可变形部分的材料可以用于定制施加于液体的变形的强度和位置。在这样的实施例中,这可以影响流体运动的强度和方形。例如,更具柔性的可变形部分可以允许发生更强有力的变形来引起流体流动。在另一个实例中,如果需要水平方向的流体流动,则可以将可变形部分定位于器皿本体的侧壁上。在一些实施例中,侧壁中的更易变形的部分可以允许更大的变形来引起水平方向上的流体流动。以类似的方式,较大的可变形部分可以允许一处较大的变形和/或若干处较小的变形来引起这样的流体流动。
在一些实施例中,可变形部分与器皿本体形成为一体。例如,器皿本体可以包括单种塑料材料,其中可变形部分比器皿本体的其余部分制得更薄且更具延展性。可变形部分还可以由与器皿本体的其余部分不同的材料制成,其中可变形部分(例如,通过胶水、焊接、热密封等)附接到器皿本体上。
在其他实施例中,可变形部分可以可移除地附接到器皿本体上。例如,器皿本体的基部可以包括开口,可变形部分卡扣到或螺纹连接到所述开口。在其他实施例中,器皿本体的基部可以是与侧壁可分离的,使得带有一个或多个可变形部分的基部或侧壁可以分别附接到对应的侧壁或基部(例如,其可以具有或可以不具有可变形部分)。
在一些实施例中,可以准备具有侧壁和若干不同基部的套件,其中每个基部形成有不同形状、大小和数量的可变形部分和/或用于形成所述可变形部分的材料不同。如将了解的,使用者可以选择具有所需数量和/或形状的可变形部分的基部并且之后可以将基部附接(例如,螺纹附接)至侧壁。使用者还可以选择具有用于形成可变形部分的所需材料的基部并将基部附接至侧壁。在这样的实施例中,使用者可以选择将会递送所需变形水平(和流体流动运动)的基部,并且可以将这样的基部附接至侧壁以用于细胞培养。
尽管描述了套件具有一个侧壁和不同的基部,但在其他实施例中,套件可以具有一个基部和若干侧壁,所述侧壁带有不同的可变形部分供从中选择和附接到基部以便进行细胞培养。在另一个实施例中,套件可以具有若干基部和若干套件,每个都具有不同的可变形部分供选择和彼此附接。
根据一个方面,可变形部分被安排为引起所述一定量液体的运动,足以维持细胞悬浮。如本文中使用的,维持细胞悬浮是指细胞在液体中运动。即,细胞没有下降到器皿本体的基部。如将了解的,在这样的是实施例中,器皿本体中所述体积的液体以一定的速度运动,足以搅动细胞,使得细胞不再停留在器皿本体的基部。
根据另一个方面,可变形部分可以诸如通过变形板(520)自动变形,以产生液体运动。例如,如图3和图4中所示,器皿(500)的基部(514)可以放在变形板(520)的顶表面(522)上,变形板(520)具有通过致动器(526)可移动的可移动构件(524)。一旦变形板(520)接合(例如,打开),可移动构件(524)就可以移动到向前位置,超出顶表面(522),接触可变形构件(514)并使其变形。如将了解的,顶表面(522)可以由柔性材料(例如,弹性体材料)形成,所述柔性材料允许可移动构件从其中向外延伸。在一些实施例中,顶表面(522)由形状保持材料形成,使得顶表面恢复到其原始构型。
图3和图4展示了可变形部分518的变形(528),所述变形是通过变形板(520)的可移动构件(524)产生的。如这些图中所示,变形(528)朝器皿本体(511)的内部延伸。如这些图中所示,变形引起也朝着器皿本体(511)内部的液体运动,如标记为D的箭头所展示的。例如,变形(528)可以引起液体的波纹效应。
尽管图3和图4仅示出了一个可移动构件,但应了解到,在其他实施例中,变形板可以具有两个或更多个可移动构件。在这样的实施例中,可移动构件可以附接至同一致动器上并由其致动,但是每个可移动构件还可以具有自己的对应致动器。如还将了解的,可移动构件可以直接或间接连接至致动器。
尽管显示了器皿位于具有可移动构件的变形板的顶部,可移动构件向外延伸(例如,沿竖直方向)使基部上的可变形部分变形,但在可变形部分位于侧壁的实施例中,器皿可以与具有可移动构件的壳体相邻放置,这些可移动构件向外延伸(例如,沿水平方向)使侧壁上的可变形部分变形。
转回到图3,致动器(526)操作性地连接至控制器,所述控制器指导致动器使可移动构件(527)移动。例如,响应于使用者命令(例如,按下变形板上的启动按钮),控制器可以指导致动器使可移动构件在向前位置与缩回位置之间移动。如将了解的,在向前位置,致动器可以向外延伸超出穿过变形板(520)的顶表面(522)的平面P-P。在缩回位置,可移动构件(528)保持在顶表面(522)下方、在变形板的壳体(529)内。
在一些实施例中,控制器(527)指导致动器(526)使可移动构件(524)移动并使可变形部分仅变形一次。在这样的实施例中,使用者必须继续提供使用者命令(例如,按下板上的启动按钮)以继续使可移动构件移动。在其他实施例中,响应于使用者命令,控制器(527)可以指导致动器(526)实施程序,其中发生一系列变形。
在一些实施例中,所述程序可以设定使可变形部分变形的时段(例如,持续三小时)或者设定进行变形的次数(例如,1000次变形)。在其他实施例中,所述程序可以设定变形的频率(例如,每分钟变形10次)和/或变形的强度(例如,强)。例如,使用者可以控制可变形部分变形的强度和因此搅动细胞的强度。如将了解的,关于强度和频率,所述程序可以指导致动器使可变形部分在程序的持续时间内变形的强度和频率相同。然而,变形的强度和频率可以根据所需的液体运动而变化。例如,变形可以是开始慢且不频繁,并且越来越强和越频繁。
如图4中所示,在一个实施例中,可移动构件可以通过可变形部分(518)的同一位置在向前位置与缩回位置之间反复移动来使可变形部分(518)变形。在其他实施例中,一旦可移动构件位于向前位置,致动器(526)可以使可移动构件(524)沿不同方向跨可变形部分(518)运动。即,可移动构件可以在可变形部分(518)上产生变形图形(530)。例如,如图5A中所示,在一些实施例中,可以使可移动构件(524)移动,从而产生波状的变形图形(530)。如图5C中所示,在其他实施例中,可以使可移动构件(524)转动,从而产生圆形变形图形(530)。还可以使可移动构件(524)运动,从而产生蛇形变形图形(530),如图5D中所示。如将了解的,在其他实施例中,可以使用其他变形图形。如将进一步了解的,变形图形可以被选择为在液体中产生某些流动方向(例如,流动型线),以便搅动细胞。
在具有两个或更多个可移动构件的实施例中,每个可移动构件可以在可变形构件上产生变形图形(530)。在一些实施例中,可移动构件可以在可变形构件(518)上产生相同的变形图形(530)。例如,如图5B中所示,产生了两个波状变形图形。如将了解的,在其他实施例中,第一和第二可移动构件产生的变形图形不需要相同。
图7展示了在细胞培养培殖器中使用带有一个或多个可变形部分(518)的器皿(500)的实施例。所述细胞培养培殖器包括培殖器柜,所述培殖器柜具有用于在一个或多个细胞培养器皿(诸如器皿(500))中培殖细胞的内部室(1100)。所述培殖器柜包括外部门(1101),所述外部门打开和关闭以允许外部环境与培殖器柜之间的连通。在一些实施例中,所述外部门打开和关闭以允许外部环境与内部室之间的连通。内部室被配置为固持一个或多个细胞培养器皿,诸如器皿(500)。所述一个或多个细胞培养器皿被储存在储存位置(1102)中。在一些实施例中,储存位置是自立结构。例如,储存位置可以是试管或培养瓶架,其可以从培殖器的内部室中被移出以用于填装和卸载培养器皿。在一些实施例中,储存位置固连至内部室的表面上。例如,储存位置可以是一系列支架或搁架,这些支架或搁架连接至内部室的壁或底板上、并且因此不能从培殖器柜中移出。
在一些实施例中,细胞培养培殖器包括用于移动一个或多个细胞培养器皿的细胞培养器皿转移装置(1103)。所述细胞培养转移装置可以固连至培殖器的内部室的任何适当的表面上。例如,细胞培养器皿转移装置可以固连至内部室的顶部或顶板上。替代地,细胞培养器皿转移装置可以固连至内部室的侧壁上。在一些实施例中,细胞培养器皿转移装置没有固连至内部室的壁上。例如,细胞培养器皿转移装置可以搁置在可以绕内部室移动的有轮的三脚架或其他移动结构上。
在一些实施例中,转移装置将一个或多个细胞培养器皿从储存位置(1102)移动至成像位置(1105)或移动至操纵位置(1107)。转移装置(1103)还可以将一个或多个细胞培养器皿从成像位置(1105)移动至操纵位置(1107)或从操纵位置(1107)移动至成像位置(1105)。当成像或操纵完成时,转移装置(1103)将一个或多个细胞培养器皿从成像位置(1105)或操纵位置(1107)移动至储存位置(1102)。
在一些实施例中,培殖器柜包括第一成像位置(1105)和操纵位置(1107)。在一些实施例中,在内部室的与成像器相对的表面上定位了一个或多个成像位置。在一些实施例中,成像位置是平台,要么是自立的要么固连至内部室的表面上。在一些实施例中,平台是可移动的。例如,可移动平台可以固连至两个或更多个杆上,这些杆允许平台相对于成像器向左、向右、向前、向后、向上或向下移动。在一些实施例中,所述可移动平台是机动化的。
在一些实施例中,培殖器柜包括第一成像器(1104),所述第一成像器在细胞培养器皿处于第一成像位置(1105)时对这些器皿的细胞进行成像。在一些实施例中,第一成像器是明视场显微镜。在一些实施例中,第一成像器是全息显微镜。
在一些实施例中,操纵器(1106)在细胞培养器皿处于操纵位置(1107)时对这些器皿的细胞加以操纵。在一些实施例中,所述操纵器具有针管、毛细管、移液管、和/或微操纵器的阵列。例如,所述操纵器可以包括细胞拾取器。在一些实施例中,操纵器具有细胞拾取器。一般,操纵位置与成像位置共有许多特征,如在此所描述的。
如图6中所示,在一个实施例中,带有可变形部分(518)的器皿(500)可以放在操纵位置(1107)以使液体(502)与细胞混合。在这样的实施例中,操纵位置(1107)可以包括本文中所述的带有一个或多个可移动构件(524)的变形板,所述可移动构件使可变形部分(518)变形(例如,根据所描述的变形图形(530))。
图7描绘了细胞培养培殖器的另一个说明性实施例。在一些实施例中,培殖器柜具有第二成像器(1108)。第二成像位置可以在操纵位置(1107)处或附近。在一些实施例中,第二成像位置和操纵位置(1107)是同一位置。在一些实施例中,第二成像器(1108)在细胞被操纵器(1106)操纵时对细胞培养器皿的细胞进行成像。在一些实施例中,第二成像器是明视场显微镜。在一些实施例中,第二成像器是全息显微镜。
图8描绘了细胞培养培殖器的一个说明性实施例。在一些实施例中,细胞培养培殖器具有成像位置和操纵位置,它们是同一位置(1105)。
图9描绘了细胞培养培殖器的另外的部件的说明性实施例。如将了解的,另外的部件是培殖器的没有在前述实施例和图之一中另外列出或示出的任何部件。在一些实施例中,细胞培养培殖器包括带条形码的细胞培养器皿(1109)。因此,在一些实施例中,细胞培养培殖器具有被定位在培殖器柜的内部室内部的条形码扫描器(1110)。在一些实施例中,条形码读取器与计算机(1111)通信以转发与已经扫描了条形码的细胞培养器皿相关的信息。在一些情况下,条形码扫描器可以固连至内部室的任何表面上。例如,条形码扫描器可以紧邻成像位置(1105)固连至内部室的壁上。
在一些实施例中,细胞培养培殖器包含测量内部室内部的环境条件的至少一个探测器和/或至少一个传感器(1113)。用于测量环境条件的探测器的实例包括但不限于温度探测器、压力探测器、二氧化碳(CO2)传感器、氧(O2)传感器以及相对湿度传感器。在一些实施例中,所述至少一个探测器和/或至少一个传感器位于器械壳体(1112)内。所述至少一个探测器和/或至少一个传感器连接至控制器(1114)上。在一些实施例中,控制器(1114)与计算机(1111)通信。此外,控制器(1114)可以与流体分配系统(1115)通信。例如,如果CO2传感器指示在内部室为低CO2水平,控制器(1114)可以指导流体分配系统(1116)将CO2气体注入内部室中以增加内部室的CO2水平。
如将了解的,控制器(1114)还可以与操纵位置(1107)通信,以使一个或多个可移动构件(524)移动,从而使器皿的可变形部分(518)(例如,器皿基部(514))变形来混合器皿中的液体(502)。在这样的实施例中,控制器可以指导搅动器根据程序使一个或多个可移动构件运动。
自动化细胞培养
本文涉及用于在受控条件下(例如,在无菌和/或灭菌条件下)培养、操纵和/或监测细胞的培殖器和方法。在一些方面,培殖器和方法包括自动化部件。在一些方面,培殖器和方法对于长期细胞培养(例如,生长和维持用于重组蛋白质表达的细胞、或生长和/或分化用于治疗应用,例如植入,的细胞)是有用的。在一些实施例中,细胞培养物在本文描述的培殖器中的培养器皿内生长,所述培养器皿是诸如器皿(500)。在这样的实施例中,液体的混合可以通过使器皿本体(514)的可变形部分(518)变形来进行。
培养器皿
诸如器皿(500)等细胞培养器皿可以被配置为培养不同类型的细胞,包括真核细胞或原核细胞。在一些实施例中,细胞是哺乳动物细胞(例如,人类细胞、犬细胞、牛细胞、羊细胞、猫细胞,或啮齿类动物细胞,例如兔细胞、小鼠细胞、或大鼠细胞)。在一些实施例中,细胞是昆虫细胞、禽类细胞、微生物细胞(例如,酵母细胞,如酿酒酵母细胞、乳酸克鲁维酵母细胞或巴斯德毕赤酵母细胞;或细菌细胞,如大肠杆菌细胞、枯草芽孢杆菌细胞或棒状杆菌细胞)、昆虫细胞(例如,果蝇细胞、或Sf9或Sf21细胞)、植物细胞(例如,藻细胞)或任何其他类型的细胞。
在一些实施例中,培养细胞是为了生产天然产品(例如,紫杉醇、色素、脂肪酸、生物燃料等)。在一些实施例中,培养细胞是为了表达重组产物(例如,重组蛋白产物如抗体、激素、生长因子、或其他治疗性肽或蛋白质)。在一些实施例中,扩增和/或分化细胞是用于治疗目的,例如植入受试者(例如,人类受试者)体内,以便提供或补充受试者缺失或有缺陷的细胞功能、组织功能或器官功能。
在一些实施例中,细胞是来自永生化细胞系。细胞系的非限制性实例包括人类细胞,例如HeLa细胞、前列腺癌细胞(例如,DU145、PC3和/或Lncap细胞)、乳腺癌细胞(例如,MCF-7、MDA-MB-438、和/或T47D细胞)、急性髓性白血病细胞(例如,THP-1细胞)、胶质母细胞瘤细胞(例如,U87细胞)、神经母细胞瘤细胞(例如,SHSY5Y细胞)、骨癌细胞(例如,Saos-2细胞)、以及慢性髓性白血病细胞(例如,KBM-7细胞)。在一些实施例中,细胞系包括灵长类细胞系、啮齿动物细胞系(例如,大鼠或小鼠细胞系)、犬细胞系、猫细胞系、斑马鱼细胞系、非洲爪蟾细胞系、植物细胞系、或任何其他细胞。在一些实施例中,细胞是人293细胞(例如,293-T或HEK 293细胞)、鼠3T3细胞,中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、CML T1细胞、或Jurkat细胞。
在一些实施例中,细胞是原代细胞、饲养细胞或干细胞。在一些实施例中,细胞从受试者(例如,人类受试者)分离出的。在一些实施例中,细胞是从组织或活组织检查样本分离出的原代细胞。在一些实施例中,细胞是造血细胞。在一些实施例中,细胞是干细胞,例如,胚胎干细胞、间充质干细胞、癌症干细胞等。在一些实施例中,细胞是从组织或器官(例如,人类组织或器官)(包括但不限于实体组织和器官)分离出的。在一些实施例中,细胞可以从胎盘、脐带、骨髓、肝脏、血液(包括脐带血)、或任何其他合适的组织分离出。在一些实施例中,从患者分离出患者特异性细胞,以用于培养(例如,用于细胞扩增和可选的分化)、并且随后再植入同一患者或不同患者。因而,在一些实施例中,在本文描述的培殖器中生长的细胞可以用于同种异体或自体治疗。在一些实施例中,为了提供免疫疗法(例如,嵌合抗原受体疗法(CAR-T)或CRISPR/Cas修饰细胞的递送)的目的,可以对在本文披露的培殖器中生长的细胞进行遗传修饰、扩增并再引入患者。
在一些实施例中,原代细胞培养物包括上皮细胞(例如,角膜上皮细胞、乳腺上皮细胞等)、成纤维细胞、成肌细胞(例如,人骨骼肌成肌细胞)、角质形成细胞、内皮细胞(例如,微血管内皮细胞)、神经细胞、平滑肌细胞、造血细胞、胎盘细胞、或其中两种或更多种的组合。
在一些实施例中,细胞是重组细胞(例如,杂交瘤细胞、或表达一种或多种重组产物的细胞)。在一些实施例中,细胞被一种或多种病毒感染。
原代细胞分离
在一些实施例中,从组织或生物样本中分离出细胞以在本文提供的培殖器中进行离体培养。在一些实施例中,从血液中分离出细胞(例如,白血细胞)。在一些实施例中,使用物理和/或酶促破坏从组织或生物样本中释放细胞。在一些实施例中,使用一种或多种酶(例如胶原酶、胰蛋白酶、或链霉蛋白酶)来消化细胞外基质。在一些实施例中,将组织或生物样本置于培养基中(例如,有或没有物理或酶促破坏),并且可以分离在培养基中释放和生长的细胞以用于进一步培养。细胞培养
如本文使用的,细胞培养是指在受控条件下(例如,离体)维持和/或生长细胞的过程。在一些实施例中,在促进细胞生长和复制的条件、促进重组产物表达的条件、促进分化的条件(例如,分化成一种或多种组织特异性细胞类型)、或其中两种或更多种的组合的条件下培养细胞。
在一些实施例中,细胞培养器皿被配置为培养悬浮的细胞。在一些实施例中,细胞培养器皿被配置为培养贴壁细胞。在一些实施例中,细胞培养器皿被配置为2D或3D细胞培养。在一些实施例中,细胞培养器皿包括一个或多个表面或微载体以支持细胞生长。在一些实施例中,这些细胞培养器皿被涂覆有细胞外基质组分(例如,胶原蛋白、纤维蛋白和/或层粘连蛋白组分)以增加粘附特性并提供生长和分化所需的其他信号。在一些实施例中,细胞培养器皿包含一种或多种合成水凝胶,例如聚丙烯酰胺或聚乙二醇(PEG)凝胶,以支持细胞生长。在一些实施例中,细胞培养器皿包括具有嵌入的营养素(例如,凝胶或琼脂,例如用于某些细菌或酵母培养物)的固体支撑物。在一些实施例中,细胞培养器皿包含液体培养基。
在一些实施例中,在任何合适的培养基之一中培养细胞。可以针对不同的细胞类型或针对不同的应用使用具有不同范围的pH、葡萄糖浓度、生长因子和其他补充物的不同培养基。在一些实施例中,可以使用定制的细胞培养基或商业上可获得的细胞培养基,例如达尔伯克氏改良伊格尔培养基(Dulbecco’s Modified Eagle Medium)、最低必需培养基、RPMI培养基、HA或HAT培养基、或可以从生命技术公司(Life Technologies)或其他商业来源获得的其他培养基。在一些实施例中,细胞培养基包含血清(例如,胎牛血清、小牛血清、马血清、猪血清、或其他血清)。在一些实施例中,细胞培养基是无血清的。在一些实施例中,细胞培养基包含人血小板裂解液(hPL)。在一些实施例中,细胞培养基包含一种或多种抗生素(例如,放线菌素D、氨苄青霉素、羧苄青霉素、头孢噻肟、膦胺霉素、庆大霉素、卡那霉素、新霉素、青霉素、青霉素链霉素、多粘菌素B、链霉素、四环素、或任何其他合适的抗生素、或其中两种或更多种的任何组合)。在一些实施例中,细胞培养基包含一种或多种盐(例如,平衡盐、氯化钙、氯化钠、氯化钾、氯化镁等)。在一些实施例中,细胞培养基包含碳酸氢钠。在一些实施例中,细胞培养基包含一种或多种缓冲液(例如,HEPES或其他合适的缓冲液)。在一些实施例中,包含一种或多种补充物。补充物的非限制性实例包括还原剂(例如,2-巯基乙醇)、氨基酸、胆固醇补充物、维生素、转铁蛋白、表面活性剂(例如,非离子型表面活性剂)、CHO补充物、原代细胞补充物、酵母溶液、或其中两种或更多种的任何组合。在一些实施例中,将一种或多种生长或分化因子添加到细胞培养基中。生长或分化因子(例如,WNT家族蛋白、BMP家族蛋白、IGF家族蛋白等)可以单独地或组合地添加,例如作为包含用于引起向特定谱系分化的不同因子的分化混合物。液体培养基的生长或分化因子和其他方面可以使用整合在培殖器内的自动化液体处理器来添加。
在一些方面.本文描述的装置和方法提供并维持用于细胞生长的适当的温度和气体混合物。应了解的是,不同细胞类型的细胞生长条件不同,并且本文描述的装置可以被编程用于保持不同的条件。在一些实施例中,对哺乳动物细胞使用大致37℃和5%CO2的条件。
在一些实施例中(例如,对于贴壁细胞培养物),可以通过抽吸直接去除培养基,并用新鲜培养基代替。在一些实施例中(例如,对于非贴壁/悬浮培养物),培养基的改变可以涉及将细胞培养物离心、去除旧的培养基并用新鲜培养基代替。在一些实施例中,离心机位于培殖器的内部室中。在一些实施例中,培养器皿允许连续的培养基替换。在一些实施例中,本文描述的培殖器可以包括可以用于处理、替代、供应和/或维持培养基的不同方面以支持细胞的一种或多种组分。培殖器可以包括容纳废弃培养基的储器和/或容纳新鲜培养基的储器。这样的储器可以存在于(例如,用于临时储存)培殖器内部的制冷器内或培殖器的冷藏部分内。在一些实施例中,在培殖器外部提供了一个或多个储器,并且提供了进入和离开培殖器空间的管路以用于向液体处置器单元(例如,具有抽吸器的液体处置单元)或培殖器内的临时储器进行供应或取出,以利于细胞饲养、培养基更换、以及其他相关需要。对于悬浮细胞,可以在培殖器内提供用于将细胞与废弃培养基分离的装置(例如,一个或多个离心机,以利于细胞造粒)以利于作为本文提供的培殖器的一部分的培养基自动更换。在一些实施例中,本文提供了一种系统,所述系统包括连接至计算机的细胞培养培殖器,所述计算机能够自动监测和调整细胞培养条件,以实现细胞培养物的最佳生长。
在一些实施例中,在本文描述的培殖器内传代细胞。在一些实施例中,将细胞培养物拆分,并将细胞培养物子集转移至新鲜培养器皿来进一步生长。在一些实施例中(例如,对于贴壁细胞培养物),在将细胞转移至新鲜培养器皿之前使其从表面上解除附接(例如,机械地,例如温和铲刮,和/或以酶促方式,例如使用胰蛋白酶-EDTA或一种或多种其他的酶)。在一些实施例中(例如,对于悬浮细胞培养物),将小体积的细胞培养物转移至新鲜培养器皿。
在一些实施例中,在本文描述的培殖器和器皿内的培养期间以其他方式对细胞培养物加以操纵。例如,可以将细胞培养物用核酸(例如,DNA或RNA)转染或暴露于病毒感染(例如,使用重组病毒颗粒来递送DNA或RNA)。
可以使用无菌技术来防止或最小化在生长和操纵过程中对细胞培养物的污染。在一些实施例中,使用适当的技术来对用于细胞培养的设备(例如,移液管、流体处置装置、操纵装置、其他自动化装置或机器人装置等)进行灭菌。非限制性技术包括热暴露(例如,高压灭菌)、表面消毒(例如,使用酒精、漂白剂或其他消毒剂)、照射、和/或暴露于消毒气体(例如,臭氧、过氧化氢等),如在此描述的。在一些实施例中,使用适当的技术将培养基灭菌。非限制性技术包括热暴露(例如,高压灭菌)、抗微生物/抗病毒处理、过滤、和/或辐照。
在一些实施例中,细胞培养物的操纵是在无菌条件下进行的,例如在已经被消毒并且已经过滤空气以去除潜在污染物的环境中(例如,培殖器室内部)进行。
在一些实施例中,在符合GMP的条件下(包括使用符合GMP的培养基或符合GMP的液体处置设备,并结合标准操作程序(SOP)来执行方法)生长和维持细胞培养物。
在一些实施例中,可以监测和/或评估细胞培养物以检测污染。在一些实施例中,可以检测来自不同类型的生物体的细胞造成的污染。在一些实施例中,可以使用任何合适的技术检测支原体、细菌、酵母或病毒对哺乳动物细胞培养物的污染。在一些实施例中,细胞培养物污染可以通过测定是污染(例如,通过细菌或酵母)的特征、而不是在培养物中生长的细胞(例如,哺乳动物细胞)的特征的一种或多种培养物特性(例如,pH、浊度等)的变化或变化速率来检测。在一些实施例中,可以使用一种或多种分子检测测定法(例如,PCR、ELISA、RNA标记、或其他酶促技术)或基于细胞的测定法来检测污染(例如,支原体、细菌、酵母、病毒、或其他污染)。
在一些实施例中,可以监测和/或评估细胞培养物以检测被相似类型的细胞污染(例如,被不同人类细胞或不同哺乳动物细胞污染的人类细胞系)。在一些实施例中,可以使用DNA测序或DNA指纹分析(例如,短串联重复STR指纹分析)、同工酶分析、人淋巴细胞抗原(HLA)分型、染色体分析、核型分析、细胞形态学、或其他技术来评估细胞培养物及其潜在的污染。
在一些实施例中,使用本文提供的装置和方法产生的细胞可以被冷冻以保存它们供以后使用和/或用于运输。在一些实施例中,将细胞在生长和/或分化之后并且在冷冻之前与冷冻保存成分混合。可以将冷冻保存成分添加至细胞培养器皿中,或可以将细胞与冷冻保存成分一起从细胞培养器皿转移至冷冻保存器皿中。可以包含在冷冻保存成分中的冷冻保护剂的非限制性实例包括DMSO、甘油、PEG、蔗糖、海藻糖、和右旋糖。在一些实施例中,可以在培殖器中或附近存在冰箱以利于冷冻细胞培养物中分离出的细胞。
细胞培养培殖器:
本文涉及用于在受控条件下(例如,在无菌和/或灭菌条件下)培养、操纵和/或监测细胞的培殖器和方法。在一些实施例中,本文中提供的细胞培养培殖器包括培殖器柜,所述培殖器柜限定了用于在一个或多个细胞培养器皿中培养细胞的内部室,其中所述内部室被配置为固持一个或多个细胞培养器皿。在一些情况下,除了从转移室通向内部室的内部门之外,培殖器包括从外部环境直接开向内部室的至少一个外部门(例如,1、2、3、4、或更多个外部门),例如用于在培殖器未运行的时间段期间、例如培殖器维修期间提供到内部室的替代性通路。在一些实施例中,培殖器包括在内部室的用于储存一个或多个细胞培养器皿的储存位置。在一些实施例中,在培殖器中提供了细胞培养器皿转移装置,用于将一个或多个细胞培养器皿从第一成像位置移动至储存位置和/或从储存位置移动至第一成像位置。
在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜是矩形立方体形状的。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有在1ft2至16ft2范围内的矩形占地面积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有最大约为1ft2、2ft2、3ft2、4ft2、5ft2、6ft2、7ft2、8ft2、9ft2、10ft2、11ft2、12ft2、13ft2、14ft2、15ft2、或16ft2的矩形占地面积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有在1ft3至100ft3范围内的总的室容积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有最大约为1ft3、5ft3、10ft3、25ft3、50ft3或100ft3的室容积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有在0.09m2至1.78m2范围内的矩形占地面积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有最大约为0.1m2、0.2m2、0.3m2、0.4m2、0.5m2、0.6m2、0.7m2、0.8m2、0.9m2、1.0m2、1.1m2、1.2m2、1.3m2、1.4m2、1.5m2、1.6m2、或1.7m2的矩形占地面积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有在0.03m3至3m3范围内的总的室容积。在一些实施例中,本文提供的培殖器或培殖器柜具有最大约为0.03m3、0.1m3、0.3m3、1m3、或3m3的室容积。
材料
在一些实施例中,培殖器柜是单层壁的。在一些实施例中,培殖器是双层壁的。在一些实施例中,在培殖器柜的双层壁之间提供隔热材料,以控制来自所述柜的热损失并且利于所述柜中的温度控制。在一些实施例中,培殖器柜的外壁包括金属片材,例如,14-20号规格的冷轧钢。在一些实施例中,培殖器柜的内壁(例如,室表面)包括电抛光的不锈钢。在一些实施例中,培殖器柜的内壁(例如,室表面)包括耐腐蚀材料,例如钛、钴-铬、钽、铂、锆、铌、不锈钢、及其合金。然而,在一些实施例中,培殖器柜的室表面包括聚合物材料例如聚四氟乙烯(PTFE)、或者以商品名Parylene获知的聚合物材料。在一些实施例中,室表面可以具有抗微生物特性,例如结合到聚合物表面涂层中的铜或银或抗微生物复合物。
监测装备
在一些实施例中,培殖器内的环境是由控制系统控制的,所述控制系统可以被配置为控制培殖器内部(例如,在一个或多个内部室中)的温度、湿度、二氧化碳、氧气和其他气态组分(例如,诸如臭氧和过氧化氢的灭菌气体)。在一些实施例中,控制系统相应地控制每个内部室内部的环境条件(例如,温度、湿度、二氧化碳、氧气和其他气态组分)。例如,为了保护敏感的机械、电子和光学部件,可以将内部室的湿度维持在比具有存储位置的内部室更低的水平。在一些实施例中,培殖器进一步配备有具有预限定传感器的监测系统。监测装置的实例包括但不限于:氧气监测器、二氧化碳监测器、臭氧气体检测器、过氧化氢监测器、以及多气体监测器。例如,在一些实施例中,培殖器有利地包括响应于与细胞生长有关的不同参数的多个传感器,这些参数可以包括温度、空气纯度、污染物水平、pH、湿度、N2、CO2、O2、和光。借助于此监测系统,可以使用传感器持续培养或过程的持续时间地测量培殖器中的参数。在一些实施例中,由传感器测得的参数被所述监测系统经由线路传输至计算机控制的监测与控制系统,以进行如本文所讨论的进一步处理。
在一些实施例中,可以将环境监测系统与本文描述的培殖器结合使用。在一些实施例中,可以将提供对系统的温度、空气成分(例如,CO2浓度、O2浓度等)和/或湿度的测量的一个或多个传感器与培殖器相关联(例如,装配在培殖器柜内)。在一些实施例中,可以将一个或多个这样的传感器作为培殖器的部分并入(例如,附接至、集成至、或以其他方式连接至培殖器的内部壁或门上)。在一些情况下,可以将一个或多个传感器定位在培殖器柜外部或内部的任何适合的位置(例如,在转移室和/或内部室内部,例如附接至内部壁上、和/或内部上或下表面上)。
在一些实施例中,提供了气体传感器,所述气体传感器可以以百分之几、百万分之几或任何其他标准单位提供与所述传感器接触的气体(例如,柜中的气体、或环境空气)的浓度的实时读数。用于在本文提供的方法和培殖器中使用的气体传感器包括CO2传感器、O2传感器、N2传感器、臭氧气体检测器、过氧化氢监测器、多气体监测器、以及CO传感器。这样的传感器可以从多个商业来源获得。在一些情况下,可以基于由本文描述的传感器提供的信息来调节或控制培殖器的环境。例如,可以基于来自CO2传感器的对于在培殖器中存在低于所希望浓度CO2的指示来增加培殖器中的CO2水平。
在一些实施例中,可以将一个或多个加热或冷却元件并入培殖器中(例如,柜或门的内表面上、和/或集成在其中一个或多个壁中和/或柜的底座中),以用于控制培殖器内的温度的目的。在一些实施例中,可以使用加热元件来解冻液体,例如细胞培养基或其他试剂。
在一些实施例中,将一个或多个空气或氧气源、碳过滤器和/或一个或多个加湿或除湿系统连接至培殖器,并将其配置成用于控制培殖器内的氧气、二氧化碳和/或湿度的水平(例如,响应于来自在培殖器中或附接至培殖器上的一个或多个传感器的信号)。在一些实施例中,一个或多个控制器附接至这些传感器和其他系统上,以控制培殖器的内部环境。
在一些实施例中,培殖器可以包括一个或多个光源(例如,白炽灯泡、LED、UV或其他光源)。这些光源可以被置于培殖器内以照亮所述柜内的区域。在一些实施例中,使用可以被放置在培殖器内或外部的相机或其他光敏装置来监测培养系统的运行。在实施例中,光源是灭菌光源。例如,可以将UV灯定位在培殖器的转移室和/或内部室内部。
在一些实施例中,培殖器包括透明物体(例如,窗口),所述透明物体允许来自培殖器内的可见光或其他光波长被放在培殖器外部的相机或其他光敏装置检测到。在一些实施例中,可以擦拭所述透明物体的内表面(例如,从柜的内部)以防止或去除可能积聚在所述内表面上的并且干扰系统的监测的凝结液滴(例如,由于培殖器内部的潮湿空气)。在一些实施例中,可以用被控制器自动控制的擦拭件来擦拭所述表面。
密封件
在一些实施例中,培养柜包括窗、门、或开口,在培殖器柜经过了灭菌之后,其在关闭时被密封以保持无菌性。在一些实施例中,培殖器柜的每个密封件都是不漏空气的,达到阈值压力水平(例如,最高达1atm)。在一些实施例中,提供垫圈来确保所希望水平的密封能力。总体上,“垫圈”被理解为填充两个物体之间的空间的机械密封件,一般是用于在处于压缩下时防止这两个物体之间的泄漏。垫圈通常是通过从例如垫圈纸、橡胶、硅酮、金属、软木、毡、氯丁橡胶、丁腈橡胶、玻璃纤维或塑料聚合物(如聚三氟氯乙烯)的片材材料切割而成。通常希望的是,垫圈是由提供某种程度屈服的材料制成,使得其能够变形并且紧密地填充其被设计用于的空间(包括任何轻微的不规则性在内)。在一些实施例中,垫圈可以与直接对垫圈表面施加的密封剂一起使用,以恰当地起作用。在一些实施例中,垫圈材料可以包括不与二氧化碳或臭氧反应的闭孔氯丁橡胶泡沫。
转移装置
本文披露的培殖器典型地包括用于在培殖器内将一个或多个物品例如从第一位置移动至第二位置的一个或多个转移装置。在一些实施例中,所述一个或多个物品是一个或多个细胞培养器皿(例如,器皿(500))。在其他实施例中,所述一个或多个物品是对于维持一个或多个细胞培养器皿有用的并且包括但不限于移液管、毛细管、液体(例如,细胞培养基)、营养素、和其他材料。在一些实施例中,转移装置包括机器人臂。在一些实施例中,所述机器人臂包括在培殖器柜内的平台,所述平台可以沿着轨道或传送机移动,所述轨道或传送机沿着培殖器柜的内表面(例如,内壁、底座等)朝不同方向延伸。在一些实施例中,培殖器柜可以配置有多于一个(例如,2、3、4、或5、或更多个)机器人臂,以增加所述器械的通过量并且在机器人臂之一失效的事件中提供冗余性。
在一些实施例中,转移装置进一步包括联接至机器人臂上的抓取器组件。在一些实施例中,所述抓取器组件包括安装在机器人臂的末端上的一个或多个抓取器,每个抓取器具有两个或更多个(例如,3、4、5、或更多个)抓取指形件。在一些实施例中,机器人臂上的抓取指形件中的每个抓取指形件具有凹槽、摩擦板、橡胶垫、或其他抓取表面。所述抓取表面可以允许这些指形件在所述柜内抓取和输送多种不同类型的容器(例如,培养器皿)。在一些实施例中,所述机器人臂可以具有绝对编码器,所述绝对编码器联接至所述抓取器组件或所述平台上、或所述抓取器组件和/或所述平台中的每一者一个单独的绝对编码器,以便确定所述机器人臂是否处于可以安全归位(例如,返回至停放或储存构型和/或位置或操作坐标系的原点)而不撞到障碍物的位置。
在一些实施例中,因为在某些情形下可能希望机器人臂的伸展范围不延伸至培殖器柜的一些区域,因此机器人臂可以替代地通过向穿梭机或传送带插入容器或移除容器而到达这些位置,所述穿梭机或传送带例如位于培殖器柜底板或其他表面上、沿着轴线(例如,x轴线、y轴线)移动并且提供对所述机器人臂不能到达的位置中的一些位置的通路。
在一些实施例中,培殖器柜被设计成与外部测定或实验室自动化系统结合使用。例如,在一些实施例中,培殖器柜可以具有门,所述门具有开口,所述开口足够大而允许抓取臂枢转到培殖器柜外部,使这些指形件具有充分的伸展以便将培养器皿或其他容器或部件从实验室自动化系统的输送线路输送到培殖器柜中、或将外部测定部件输送到培殖器柜中和/或从培殖器柜中输送出来。
在一些实施例中,机器人臂被设计用于携带(除其他之外)培养器皿,在此情况下,机器人臂的移动被控制成防止此类器皿颠簸或加速、或可能造成样本从器皿中溅出的其他移动。在一些实施例中,机器人臂被设计成用于携带(除其他之外)培养器皿,在此情况下,机器人臂的移动被控制成防止此类器皿以导致新加到平板上的细胞在所述培养器皿的特定区域中聚集/集中的方式移动。
在一些实施例中,因为机器人臂在培殖器柜中的特定位置之间输送器皿或其他容器,所以机器人臂、或培殖器的其他部件可以被设计成用于精确地跟踪器皿或其他容器所处的位置。在一些情况下,在可以与机器人臂一起使用的培殖器柜中,可能有一些区域是例如培殖器柜的其他部件或培殖器柜的壁所在的地方,并且因此是机器人臂的某些移动可能受到限制的地方。在这些情况下,可以针对这些臂的不同马达中的每一个马达(例如,x马达、θ马达和z马达)使用归位机构,以便在机器人臂被上电之后、或者如果机器人臂与另一个物体碰撞的话在恢复运行之前将机器人臂恰当地定位至已知位置。
在一些实施例中,将不间断电源(“UPS”)附接至培殖器柜上或其内部、或者包含在培殖器柜中,以允许有序关闭培殖器的操作,包括保存多种不同自动化和样本信息以及完成正在进行的任何输送或转移过程(例如,将机器人手臂正携带的容器或器皿输送至其目的地)。可以通过可听信号、视觉信号、电子信号(例如,电子邮件或文本消息)或以某种其他方式来警示操作者存在未经授权的打开培殖器。
在一些实施例中,提供传感器或其他特征来检测培殖器的一个或多个门何时被打开(例如,培殖器柜的门、例如外部或内部门何时被打开)。这样的特征是有用的,因为它们允许操作者保持跟踪或被警示可能危害无菌性、破坏生产、损害测定或实验等的任何对培殖器(例如,培殖器柜)的未经计划或未经授权的打开。
在一些实施例中,将射频信标或其他信号源定位在培殖器内(例如,在培殖器柜内),其可以用于确定培殖器柜内的一个或多个装置的位置(例如,具有传感器的装置,所述装置可以检测信号并使用所述信号来确定其位置)。在一些实施例中,这些装置可以具有信号源,并且所述一个或多个传感器可以位于培殖器柜的其中一个或多个室内部(例如,位于内部室的内部表面上)。
在一些实施例中,可以使用光信号或激光(例如,激光信号的网格)来确定培殖器柜内的一个或多个装置或部件的位置。这样的信息可以被例如有线或无线地传送至外部计算机或监测站。所述信息可以用于控制转移装置、例如机器人臂在培殖器柜内的操作,以确保转移装置可以在培殖器柜内适当地抓住、操纵、或操控装置或物品。
在一些实施例中,在容器或器皿被放入培殖器柜中之前,使用者可以基于正被插入培殖器柜中的具体容器、器皿、配料或细胞来选择自动化系统方案。与培殖器和/或一个或多个培殖器部件、以及正在生长的细胞有关的相关信息可以被输入数据系统中。例如,可以将一个或多个标识符、例如条形码(例如,1D或2D条形码)放在容器或器皿上,并且可以指明其他重要信息,例如,容器的类型、容器的内容物、将对容器中的样本执行什么测定或操纵。在一些实施例中,与培殖器系统和/或细胞有关的信息可以被包含在一个或多个条形码中、在单独的数据系统上、或其组合形式上。使用者还可以输入标识器皿或其他容器的维度(例如,高度、直径)的信息,或者所述系统自身可以被配置为确定器皿或其他容器的高度或其他尺寸。使用此信息,例如当分析模块准备好对在器皿中生长的细胞执行测定或其他操纵时、或已经完成了执行测定或操纵时,可以请求机器人臂输送特定容器。
计算机和控制设备
本文提供的培殖器包括若干部件,包括传感器、环境控制系统、机器人等,这些部件可以在计算机、处理器、微控制器或其他控制器的方向上一起工作。所述部件可以包括例如:转移装置(例如,机器人臂)、液体处置装置、用于将培养器皿、附接至所披露的移液管管尖的操纵器、或其他部件递送至培殖器柜或从培殖器柜中递送出来的递送系统、用于控制培殖器柜的温度和其他环境方面的环境控制系统、门操作系统、成像或检测系统、以及细胞培养测定系统。
在一些情况下,诸如对细胞培养培殖器和/或本文提供的或与之接口连接的部件的控制操作等的操作可以使用硬件、软件或其组合来实施。当在软件中实施时,可以在任何适合的处理器或处理器集合上执行软件代码,无论其是提供在单一部件中还是分布在多个部件之间。这样的处理器可以被实施为集成电路,其中在集成电路部件中具有一个或多个处理器。可以使用处于任何适当的格式的电路系统来实现处理器。
计算机可以以多种形式中的任一种形式来实现,例如机架式计算机、台式计算机、膝上型计算机、或平板计算机。此外,计算机可以被嵌入通常不被视为计算机但具有适当处理能力的装置中,包括个人数字助理(PDA)、智能电话或任何其他适合的便携式、移动式或固定式电子装置,包括培殖器本身。
在一些情况下,计算机可以具有一个或多个输入装置和输出装置。这些装置可以尤其用于呈现用户界面。可以用于提供用户界面的输出装置的实例包括用于视觉呈现输出的打印机或显示屏、以及用于对输出进行可听呈现的扬声器或其他声音生成装置。可以用于用户界面的输入装置的实例包括键盘和指点装置,诸如鼠标、触摸板、以及数字化写字板。在其他实例中,计算机可以通过语音识别或以其他可听格式、通过可见手势、通过触觉输入(例如,包括振动、触觉和/或其他力)或其任何组合来接收输入信息。
一个或多个计算机可以通过一个或多个网络以任何合适的形式互连,包括作为局域网或广域网,诸如企业网络或因特网。这样的网络可以基于任何合适的技术、并且可以根据任何合适的协议来运行并且可以包括无线网络、有线网络或者光纤网络。
本文中概括的不同方法或过程可以经被编码为在采用各种各样的操作系统或平台中的任一种的一个或多个处理器上可执行的软件。这样的软件可以使用多种合适的编程语言和/或编程或脚本工具中的任一种来编写、并且可以被编译为在架构或虚拟机上执行的可执行的机器语言代码或中间代码。
用于控制本文提供的方法或过程的一种或多种算法可以被实施为可读存储介质(或多个可读介质)(例如,计算机存储器、一个或多个软盘、光盘(CD)、光盘、数字视频盘(DVD)、磁带、闪存、现场可编程门阵列或其他半导体设备中的电路配置、或其他有形存储介质),所述可读存储介质编码有一个或多个程序,所述程序在一个或多个计算机或其他处理器上执行时执行用于实施本文描述的这些不同方法或过程的方法。
在一些实施例中,计算机可读存储介质可以将信息保留足够的时间以提供非暂态形式的计算机可执行指令。这样的一个或多个计算机可读存储介质可以是可运输的,使得其上存储的一个或多个程序可以被加载到一个或多个不同的计算机或其他处理器上,以实现本文描述的方法或过程的不同方面。如本文使用的,术语“计算机可读储存介质”仅涵盖可以被认为是制造物(例如,制造品)或机器的计算机可读介质。替代或另外地,本文描述的方法或过程可以被实施为除计算机可读存储介质之外的计算机可读介质,诸如传播信号。
术语“程序”或“软件”在本文是以一般意义使用的,是指可以被采用来对计算机或其他处理器编程以实施本文描述的方法或过程的不同方面的任何类型的代码或可执行指令集。此外,应了解的是,根据这个实施例的一个方面,在被执行时实施本文描述的方法或过程的一个或多个程序不需要位于单一计算机或处理器上、而是可以以模块化方式分布在多个不同的计算机或处理器中来执行不同的程序或操作。
可执行指令可以呈由一个或多个计算机或其他装置执行的许多形式,例如程序模块。一般而言,程序模块包括执行具体任务或实现具体抽象数据类型的例程、程序、对象、部件、数据结构等。典型地,程序模块的功能在不同实施例中可以根据需要进行组合或分配。
而且,数据结构可以以任何合适的形式存储在计算机可读介质中。数据存储的非限制性实例包括结构化、非结构化、本地化、分布式、短期和/或长期的存储。可以用于传送数据的协议的非限制性实例包括专有和/或工业标准协议(例如,HTTP、HTML、XML、JSON、SQL、web服务、文本、电子表格等、或其任何组合)。为了简化说明,可以将数据结构示出为具有通过数据结构中的位置而相关的字段。这样的关系同样可以通过为字段指定在计算机可读介质中的储存位置来实现,这些位置传达字段之间的关系。然而,可以使用任何合适的机制来建立数据结构的字段中的信息之间的关系,包括通过使用指针、标签、或建立数据元素之间的关系的其他机制。
在一些实施例中,可以从与培殖器相关联的一个或多个传感器(例如,位于培殖器柜内、或位于培殖器内但在培殖器柜外部)获得与所述培殖器的操作有关的信息(例如,温度、湿度、气体成分、图像、细胞培养条件等、或其任何组合),并且所述信息可以被存储在计算机可读介质中以提供关于细胞培养培殖期间的条件的信息。在一些实施侧中,可读介质包括数据库。在一些实施例中,所述数据库包含来自单一培殖器的数据。在一些实施例中,所述数据库包含来自多个培殖器的数据。在一些实施例中,数据以使其防篡改的方式被存储。在一些实施例中,所述器械(例如,培殖器)生成的所有数据都被存储。在一些实施例中,存储数据子集。
在一些实施例中,所述部件(例如,计算机)控制在培殖器内部执行的多个不同过程。例如,计算机可以直接控制设备(例如,操纵器、成像器、流体处置系统等)。在一些实施例中,计算机控制对细胞培养物的成像、细胞拾取、细胞去除(例如,细胞丛去除)、细胞培养条件监测、细胞培养条件的调整、对培殖器内的细胞培养器皿移动的跟踪、和/或对先前过程的规划。
细胞测定
在一些实施例中,本文提供的培殖器柜配置有显微镜或其他成像器、或用于监测细胞生长、细胞生存力或其他方面的目的的其他装置。在一些实施例中,所述显微镜或成像器与在培殖器柜内执行的测定(例如基于图像的表型筛选或测定)结合使用。
在某些实施例中,本文提供的培殖器被配置成允许在培殖器柜内或在可操作地连接至培殖器柜上的室(例如,作为培殖器的一部分的单独测定室)内进行一个或多个测定。在一些实施例中,本文提供的培殖器被配置成允许执行细胞计数测定、复制标记测定、细胞膜完整性测定、基于细胞ATP的生存力测定、线粒体还原酶活性测定、半胱天冬酶活性测定、膜联蛋白V染色测定、DNA含量测定、DNA降解测定、核碎裂测定、或其组合。其他示例性测定包括BrdU、EdU、或H3-胸苷掺入测定;使用核酸染料如Hoechst染料、DAPI、放线菌素D、7-氨基放线菌素D、或碘化丙啶的DNA含量测定;细胞代谢测定,如AlamarBlue、MTT、XTT、和CellTitre Glo;核碎裂测定;胞质组蛋白相关DNA碎裂测定;PARP裂解测定;以及TUNEL染色测定。
治疗和实验于预
在某些实施例中,本文提供的培殖器被配置成允许在培殖器柜内实现高通量筛选(HTS)。在一些实施例中,HTS是指每天测试最多达例如100,000种复合物。在一些实施例中,可以以多孔格式(例如,96孔、384孔格式、或1,536孔格式)进行筛选测定、并且可以使用自动化方案进行。在这样的高通量测定中,有可能在一天内筛选几千种不同的复合物或成分。具体而言,微量滴定板的每个孔都可以用于对选定的测试复合物进行单独的测定,或者如果要观察浓度或培殖时间效应,则多个孔可以包含单一复合物的测试样本。有可能每天测定许多平板;使用这些测定可以针对最多约为6,000、20,000、50,000或超过100,000种不同复合物进行测定筛选。典型地,本文描述的测定的HTS实施方式涉及使用自动化。在一些实施例中,包括一个或多个机器人臂的一体式机器人系统在多个测定站之间输送测定微平板以用于复合物、细胞和/或试剂的添加,混合,培殖,以及最终的读出或检测。在一些方面,HTS测定可以包括同时准备、培殖和分析许多平板,从而进一步加速数据收集过程。
在一些实施例中,测定可以包括测试细胞、对照细胞、以及一种或多种测试复合物,例如10、100、1000、10,000、或更多测试复合物。细胞和测试试剂可以以适于评估所述一种或多种测试复合物对细胞的作用的方式安排在一个或多个器皿中。这些测定可以在本文描述一个或多个培殖器的一个或多个培殖器柜中进行。典型地,这些器皿包含适合的组织培养基,并且这些测试复合物存在于组织培养基中并且可以以自动化方式被递送至本文提供的培殖器的培殖器柜内的培养基。可以选择适合于培养特定细胞类型的培养基来使用。在一些实施例中,培养基不含或基本上不含血清或组织提取物,而在其他实施例中,存在这样的组分。在一些实施例中,在塑料或玻璃表面上培养细胞。
以上方面和实施例可以以任何合适的组合来采用,因为本发明在此方面不受限制。
应理解的是,在此参照某些说明性实施例和附图描述了本发明的方面。本文描述的说明性实施例不一定旨在示出本发明的所有方面,而是用于描述几个说明性实施例。因此,本发明的方面不旨在被狭窄地就这些说明性实施例来加以解释。此外,应理解的是,本发明的方面可以单独使用或以与本发明的其他方面的任何合适的组合来使用。
如此描述了本发明的至少一个实施例的若干方面之后,应了解的是,本领域技术人员会容易想到不同的变更、修改以及改进。这样的变更、修改以及改进旨在是本披露的一部分、并且旨在落入本发明的精神和范围之内。因而,先前的描述和附图仅是以举例的方式的。
虽然本文已经描述和展示了本发明的若干实施例,但是本领域普通技术人员会容易设想到多种多样其他的装置和/或结构来执行本文描述的功能、和/或获得结果和/或其中一个或多个优点,并且这样的改变和/或修改中的每一者都被认为落入本发明的范围之内。更广义地,本领域技术人员会容易认识到,本文描述的所有的参数、尺寸、材料、和构型意在是示例性的,并且实际的参数、尺寸、材料、和/或构型将取决于使用本发明的传授内容的这个或这些具体应用。本领域的技术人员仅仅使用常规实验就将认识到或能够确认本文描述的发明的具体实施例的许多等效物。因此,应理解的是,前述实施例仅是通过举例来呈现的,并且在所附权利要求及其等效物的范围内,本发明可以与具体描述和要求保护的方式不同地进行实践。本发明涉及本文描述的每一单独的特征、系统、物品、材料、和/或方法。此外,如果此类特征、系统、物品、材料、和/或方法并不相互矛盾,则两个或更多个此类特征、系统、物品、材料、和/或方法的任何组合被包含在本发明的范围之内。
如本文在说明书中使用的,不定冠词“一种”和“一个”除非明确地作相反指示,否则应当理解为是指“至少一个”。
如本文在说明书中以及在权利要求中使用的,短语“和/或”应理解为是指要素“之一或两者”如此联合,即,多个要素在一些情况下共同存在并且在其他情况下分开存在。除了通过“和/或”项具体指明的要素之外可以任选地存在其他要素,而无论与具体指明的那些要素相关或无关,除非明确地作相反指示。因此,作为非限制性实例,当与开放式语言(如“包括”)结合使用时,对“A和/或B”的引用在一个实施例中能够指代A而没有B(任选地包括B以外的元件);而在另一实施例中,指代B而没有A(任选地包括A以外的元件);而在又一个实施例中,指代A和B两者(任选地包括其他元件);等。
如本文在说明书中和权利要求中使用的,“或”应理解为具有与上文定义的“和/或”相同的含义。例如,当在列表中划分多个项时,“或”或“和/或”应解释为包容性的,例如,包含多个要素或要素列表中的至少一个要素,但也包含一个以上的要素,并且可选地包含额外的未列出的项。只有清楚地作出相反指示的术语,例如“仅一个”或“确切一个”或在权利要求中使用时为“由......组成”,是指包含多个要素或要素列表中的确切一个要素。一般来说,当之前有排他性术语、如“任一个”、“之一”、“......中的仅一个”、或“......中的确切一个”时,本文使用的术语“或”应当仅被解释为指示排他性的替代项(例如,“一个或另一个但非两者”)。当在权利要求中使用时,“基本上由......组成”应具有其在专利法领域中使用的普通含义。
如本文在说明书中和权利要求中使用的,参引一个或多个要素的列表的短语“至少一个”应理解为是指选自该要素列表中的任意一个或多个要素中的至少一个要素,但不一定包含该要素列表内具体列出的各个和所有要素中的至少一个要素,并且不排除要素列表中的要素的任何组合。这个定义还允许可以可选地存在除了短语“至少一个”所指的、在要素列表中明确指明的要素之外的要素,无论是与明确指明的那些要素相关还是不相关。因此,作为非限制性实例,在一个实施例中,“A和B中的至少一者”(或等效地,“A或B中的至少一个”,或等效地,“A和/或B中的至少一个”)可以指至少一个:任选地包括超过一个A而不存在B(以及任选地包括除了B之外的元件);在另一实施例中,指至少一个,任选地包括超过一个B,而不存在A(以及任选地包括除了A之外的元件);在另一实施例中,指至少一个,任选地包括超过一个A,以及指至少一个,任选地包括超过一个B(以及任选地包括其他元件);等。
在权利要求以及上面的说明书中,诸如“包括”、“包含”、“携带”、“具有”、“含有”、“涉及”、“具备”等的所有过渡性短语应被理解为是开放式的,例如意思是“包括但不限于”。如美国专利局专利审查程序手册第2111.03节所述,只有过渡性短语“由......组成”和“基本上由......组成”应分别是封闭式或半封闭式过渡性短语。
在权利要求中使用诸如“第一”、“第二”、“第三”等顺序术语来修饰权利要求要素本身并不意味着一个权利要求要素相对于另一个权利要求要素的任何优先级、在先、或顺序,或方法的动作被执行的时间顺序,而是仅被用作标记,以将具有某个名称的一个权利要求要素与具有相同名称的另一个要素(但是使用了顺序术语)进行区分从而区分这些权利要求要素。
还应理解的是,除非明确地作相反指示,否则在本文所要求保护的包括多于一个步骤或动作的任何方法中,所述方法的步骤或动作的顺序不一定限于所述方法的步骤或动作被叙述的顺序。
Claims (34)
1.一种用于培养细胞的器皿,所述器皿包括:
被安排为容纳一定体积的液体的器皿本体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有可变形部分,所述可变形部分被安排为使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。
2.如权利要求1所述的器皿,其中,所述器皿本体包括基部和侧壁。
3.如权利要求1所述的器皿,其中,所述可变形部分位于所述基部和所述侧壁中的至少一个上。
4.如权利要求1所述的器皿,其中,所述可变形部分与所述器皿本体形成为一体。
5.如权利要求1所述的器皿,其中,所述可变形部分可移除地附接至所述器皿本体。
6.如权利要求3所述的器皿,其中,所述可变形部分的形状是圆形、卵形、矩形、三角形和方形中的一种。
7.如权利要求1所述的器皿,其中,响应于所述可变形部分的变形,使所述体积的液体运动。
8.如权利要求1所述的器皿,其中,所述可变形部分沿着朝所述器皿本体的内部的方向变形。
9.如权利要求1所述的器皿,进一步包括第二可变形部分。
10.如权利要求9所述的器皿,其中,所述可变形部分位于所述器皿本体的基部和侧壁中的一个上,并且所述第二可变形部分位于所述器皿本体的基部和侧壁中的另一个上。
11.如权利要求1所述的器皿,其中,所述可变形部分被安排为响应于某个变形图形而产生所述体积的液体的运动。
12.如权利要求1所述的器皿,所述器皿与变形板组合,所述变形板具有一个或多个可移动构件,所述可移动构件被配置为使所述可变形部分变形以产生所述体积的液体的运动。
13.一种用于培养细胞的器皿,所述器皿包括:
被配置为容纳一定体积的液体的器皿本体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有基部和侧壁,所述基部的至少一部分是可变形的;
其中,响应于所述基部的变形图形,维持所述细胞悬浮,同时使施加于所述细胞的剪应力减小到最小。
14.如权利要求13所述的器皿,其中,所述基部的整个部分是可变形的。
15.如权利要求13所述的器皿,其中,所述变形图形包括波状图形、圆形图形、和蛇形图形中的一种。
16.如权利要求13所述的器皿,其中,响应于所述基部处的变形图形,所述可变形部分沿着朝所述器皿本体的内部的方向变形。
17.如权利要求13所述的器皿,其中,所述侧壁的至少一部分是可变形的。
18.如权利要求13所述的器皿,其中,所述器皿本体是圆柱形的。
19.一种用于培养细胞的系统,所述系统包括:
器皿,所述器皿具有本体,所述本体被配置为容纳一定体积的液体,所述液体含有待培养的细胞,所述器皿本体具有可变形部分;以及
一个或多个可移动构件,所述可移动构件被安排为使所述可变形部分变形以使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。
20.如权利要求19所述的系统,进一步包括变形板,所述变形板具有壳体和顶表面,其中,所述可移动构件设置在所述壳体中。
21.如权利要求20所述的系统,其中,所述一个或多个可移动构件移动到向前位置以接触所述可变形部分并使其变形。
22.如权利要求21所述的系统,其中,在所述向前位置,所述一个或多个可移动构件延伸超出某个平面,所述平面延伸穿过所述顶表面。
23.如权利要求19所述的系统,进一步包括控制器,其中,所述控制器指导所述一个或多个可移动构件使所述可变形部分变形。
24.如权利要求19所述的系统,进一步包括致动器,所述致动器被安排为使所述一个或多个可移动构件移动。
25.如权利要求23所述的系统,其中,所述控制器指导所述一个或多个可移动构件执行一系列变形。
26.如权利要求23所述的系统,其中,所述一个或多个可移动构件被安排为在所述可变形部分中产生变形图形。
27.如权利要求26所述的系统,其中,所述变形图形包括波状图形、圆形图形、和蛇形图形中的一种。
28.一种培养细胞的方法,所述方法包括:
将含有待培养的细胞的一定体积的液体放入具有可变形部分的器皿中;并且
使所述可变形部分变形以使所述体积的液体产生足够的运动来维持所述细胞悬浮。
29.如权利要求28所述的方法,其中,使所述可变形部分变形包括手动使所述可变形部分变形。
30.如权利要求28所述的方法,进一步包括将所述器皿放在具有一个或多个可移动构件的变形板上;其中,使所述可变形部分变形包括通过所述一个或多个可移动构件使所述可变形部分变形。
31.如权利要求28所述的方法,其中,将含有待培养的细胞的一定体积的液体放入具有可变形部分的器皿中包括将含有待培养的细胞的一定体积的液体放入在器皿本体的侧壁和基部中的至少一个上具有可变形部分的器皿中。
32.如权利要求30所述的方法,其中,通过所述一个或多个可移动构件使所述可变形部分变形包括将所述一个或多个可移动构件移动至向前位置,所述位置延伸超出了延伸穿过所述顶表面的平面。
33.如权利要求30所述的方法,其中,通过所述一个或多个可移动构件使所述可变形部分变形包括使所述可变形部分与所述一个或多个可移动构件相接触以使所述可变形构件朝器皿本体的内部移动。
34.如权利要求30所述的方法,其中,通过所述一个或多个可移动构件使所述可变形部分变形包括在所述可变形部分中产生变形图形。
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