CN109628591B - 用于肺腺癌预后预测的标志物 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一组用于肺腺癌预后预测的标志物，由OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU组成，并基于OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU这4个指标建立了预测肺腺癌预后的数学模型：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量。当P高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。此模型对于预测肺腺癌预后的AUC达到0.71，当cut‑off为0.216时，此模型预测肺腺癌病人的3年总生存期的敏感度为53.3％，特异度为82.9％，肺腺癌高风险组病人的平均总生存期约为46个月，低风险组病人平均总生存期约为94个月。

Description

用于肺腺癌预后预测的标志物
技术领域
本发明涉及一种用于肺腺癌预后预测的标志物。
背景技术
肺癌是严重危害人类健康和生命的疾病，在世界范围内其发病率和死亡率均已跃居至癌症的首位。在中国，肺癌是发病率和死亡率上升速度最快的恶性肿瘤，已取代肝癌成为恶性肿瘤死亡的首要因素。腺癌是肺癌最主要的组织学类型，占所有病例的50％以上，是肺癌防治和研究的重点之一。与其他恶性肿瘤一样，早发现、早诊断、早治疗是降低肺腺癌死亡率的关键。肺腺癌大多起源于较小的支气管粘膜分泌液的上皮细胞，大多数腺癌位于肺组织的周围，呈球形肿块，靠近胸膜部位。在周围型肺癌中，肺腺癌的发病率居肺癌各组织学类型之首，且其发病率呈明显升高趋势。肺腺癌患者中女性病人较多，发病年龄也较小。
对于肺癌的诊断检查，临床上常用的方法有以下几种：(1)X线检查；(2)支气管镜检查；(3)放射性核素检查；(4)细胞学检查；(5)剖胸探查术；(6)ECT检查；(7)纵隔镜检查。但是上述诊断方法均不能满足对肺癌早期诊断的这种要求。因此目前非常有必要寻找适合肺癌早期诊断的方法。肿瘤标记物是指肿瘤细胞或者组织由于癌基因或其他肿瘤相关基因及其产物异常表达所产生的生物活性物质或其本身由癌组织脱落，而在正常组织或良性疾病时有一定程度表达或产量甚微。它反映了癌的发生发展过程，可在肿瘤患者组织、体液及排泄物中检出，广泛应用于肿瘤的诊断，监测复发、转移，预后，预测疗效等。相比传统的肺癌诊断方法，使用基因标志物来诊断肺腺癌的转移具有及时性、特异性和灵敏性，从而使患者在癌症早期就能预判肺腺癌转移风险，针对风险高低，采取相应的预防措施。
CN105803068A中公开了一种诊治肺腺癌的分子标记物，本发明证明，PCSK1N基因在肺腺癌组织中呈高表达，抑制PCSK1N基因的表达可以促进肺腺癌细胞的凋亡、抑制肺腺癌细胞的迁移，为肺腺癌的诊断和治疗提供了一种特异性手段。
CN105624313A中公开了一种用于肺腺癌诊疗的分子标记物，UPK3B基因在肺腺癌组织中呈低表达，促进UPK3B的表达可以促进肺腺癌细胞的凋亡，本发明大大提高了肺腺癌诊断的敏感性和特异性，同时为肺腺癌的治疗提供了新的分子靶点。
CN107034271A公开了DUOX1基因作为肺腺癌的诊治标志物的用途，通过实验证明DUOX1基因在癌旁组织和肺腺癌组织中的表达存在显著差异，据此可将DUOX1用于开发诊断肺腺癌的产品。
上述专利中虽然公开了可用作肺腺癌标志物的基因，但是其说明书中仅记载了基因表达两在肺腺癌组织中呈现差异性表达，并未明确如何使用这些基因进行肺腺癌诊断。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于肺腺癌预后预测的标志物，该组合标志物具有灵敏度高，特异度好的优点。
本发明所采取的技术方案是：
一组用于肺腺癌预后预测的标志物，由OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU组成。
进一步地，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认。
进一步地，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
定量OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU表达量的试剂在制备肺腺癌诊断试剂中的应用。
进一步地，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认。
进一步地，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
一种肺腺癌预后预测试剂盒，该试剂盒中含有定量OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU表达量的试剂。
进一步地，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认。
进一步地，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
一种肺腺癌预后猜测方法，包括如下步骤：
1.定量待测组织中的OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU的表达量；
2.根据OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU的表达量确定肺腺癌的预后；
特别的，上述预后预测方法中，预后预测公式为P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量。当P高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
本发明的有益效果是：
本发明基于OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU这4个指标建立了预测肺腺癌预后的数学模型：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量。当P高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。此模型对于预测肺腺癌预后的AUC达到0.71，当cut-off为0.216时，此模型预测肺腺癌病人的3年总生存期的敏感度为53.3％，特异度为82.9％，肺腺癌高风险组病人的平均总生存期约为46个月，低风险组病人平均总生存期约为94个月。
附图说明
图1是标志物及预后预测公式预测测试组中肺腺癌病人预后的ROC；
图2是测试组患者进行单因素生存分析结果；
图3是验证组患者进行单因素生存分析结果。
具体实施方式
下面将结合实施例进一步阐述本发明，应理解，以下实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的保护范围。
实施例1
一组用于肺腺癌预后预测的标志物，由OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU组成，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
实施例2
定量OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU表达量的试剂在制备肺腺癌诊断试剂中的应用，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
实施例3
一种肺腺癌预后预测试剂盒，该试剂盒中含有定量OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU表达量的试剂，预后预测公式根据LASSO Cox回归模型确认，预后预测公式为：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
实施例4
一种肺腺癌预后猜测方法，包括如下步骤：
1.定量待测组织中的OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU的表达量；
2.根据OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU的表达量确定肺腺癌的预后；
预后预测公式为P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量。当P高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
标志物及预后预测公式的预后效果
本发明基于OPN3、GALNT2、FAM83A、KYNU这4个指标建立了预测肺腺癌预后的数学模型：P＝0.0004A+0.0042B+0.0055C+0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3的表达量、B为GALNT2的表达量、C为FAM83A的表达量、D为KYNU的表达量。当P高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
随机选择348名患者作为测试组，收集其肺腺癌基因表达数据以及临床数据，使用预后预测公式对测试集患者进行肺腺癌预后预测，ROC曲线如图1所示，其AUC为0.71，当cut-off为0.216时，此公式预测肺腺癌病人的3年总生存期的敏感度为53.3％，特异度为82.9％，对测试组患者进行单因素生存分析，结果如图2所示，高风险组病人的平均总生存期约为45个月，低风险组病人平均总生存期约为95个月(P<0.001)。
随机选择150名患者作为验证组，收集其肺腺癌基因表达数据以及临床数据，使用预后预测公式对验证组患者进行肺腺癌预后预测，将验证组患者分为高风险组患者和低风险组患者，对测试组患者进行单因素生存分析，结果如图3所示，高风险组病人的平均总生存期约为48个月，低风险组病人平均总生存期约为93个月(P＝0.016)。
在总组中，肺腺癌高风险组病人的平均总生存期约为46个月，低风险组病人平均总生存期约为94个月。

Claims (2)

1.一组用于人肺腺癌预后预测的标志物，其特征在于：所述标志物由OPN3基因、GALNT2基因、FAM83A基因和KYNU基因组成；所述预后预测公式为：P=0.0004A+0.0042B+0.0055C +0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3基因的表达量、B为GALNT2基因的表达量、C为FAM83A基因的表达量、D为KYNU基因的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
2.定量权利要求1所述标志物表达量的试剂在制备肺腺癌预后预测试剂中的应用，其特征在于：所述预后预测公式为：P=0.0004A+0.0042B+0.0055C +0.0077D，式中P为风险系数，A为OPN3基因的表达量、B为GALNT2基因的表达量、C为FAM83A基因的表达量、D为KYNU基因的表达量，当风险系数高于0.216时定义为高风险，反之则为低风险。
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