CN109576392B - 一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种辅助筛选具有不同千粒重性状小麦/品种的方法及其专用引物。一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对325F/R,由序列表的序列3所示的单链DNA片段和序列表4所示的单链DNA片段组成。利用所述引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦/品种的方法,以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增,若扩增产物长度为275bp,则待测小麦的基因型为TaMGD‑B1a,具有较高千粒重;若扩增产物长度为325bp,则待测小麦的基因型为TaMGD‑B1b,具有较低千粒重。本发明方法及引物对用于小麦育种材料的早代选择,不受环境和栽培条件的限制,选择目标清晰准确,节省时间和资源,有利于高产小麦的选育,加快育种进程。
Description
技术领域
本发明涉及一种辅助筛选具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物。
背景技术
小麦是世界第一大粮食作物,在我国为仅次于水稻的第二大粮食作物,其产量高低和品质优劣直接影响到人类食物供应程度和营养水平。淀粉是小麦籽粒中含量最多而且也是最重要的碳水化合物,约占粒重70%以上,籽粒淀粉含量、直/支比例、淀粉粒度分布以及淀粉糊化特性等决定小麦的产量和品质。
淀粉的生物合成在造粉体中通过一系列酶促反应完成。研究表明造粉体不仅仅是合成和储藏淀粉的场所,同时具有广阔的代谢功能,可能通过调控碳氮代谢等来影响淀粉的合成。李三峰(2017)认为造粉体的发育直接影响到淀粉含量和复合淀粉颗粒的形态,最终影响稻米产量。Myers(2011)对玉米opaque5突变体的研究发现编码MGDG合酶基因的突变影响胚乳的发育,表明造粉体在淀粉粒形成中起重要的调控功能。在水稻上的研究表明,叶片中MGDG与光合作用关系紧密,可以提高叶片的光合速率。
造粉体膜与淀粉含量及特征形成有关,而糖脂是造粉体膜的主要成分,其中单半乳糖甘油二酯(MGDG)、双半乳糖甘油二酯(DGDG)占淀粉表面总极性脂的95%左右。单半乳糖甘油二酯合成酶(MGD)是合成MGDG的关键酶。关于TaMGD与籽粒粒重的关系未见相关报道。
功能标记(Functional marker)是一类基于基因特征序列开发的标记,与目标基因共分离,大大提高了选择的准确性,在MAS中有着广泛应用前景。而小麦千粒重是一个数量性状,受基因型、环境及其互作的影响。因此,克隆和开发小麦TaMGD基因对小麦高产育种具有重要意义。
发明内容
本发明针对现有技术不足,提出一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物,并将之用于辅助筛选具有不同千粒重性状小麦及小麦育种。
本发明采用的技术方案:
一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对325F/R,由序列表的序列3所示的单链DNA片段和序列表4所示的单链DNA片段组成。
所述引物对325F/R的应用如下:
(1)鉴定待测小麦携带基因型是TaMGD-B1a基因还是TaMGD-B1b基因;
(2)辅助筛选携带TaMGD-B1a基因或是TaMGD-B1b基因的小麦品种;
(3)辅助鉴定/测定待测小麦的千粒重;
(4)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重;
(5)用于制作辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒;
所述等位基因TaMGD-B1a如序列表的序列 1 所示;所述等位基因TaMGD-B1b如序列表的序列 2 所示。
以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1所述引物对325F/R扩增得到的DNA片段:所述DNA片段为序列表1自5’末端2508-2782所示的核苷酸或序列表2中自5’末端2506-2830所示的核苷酸;
所述DNA片段的应用,为如下(a)或(b):
(a)辅助鉴定待测小麦的千粒重;
(b)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重。
序列表1所示的DNA分子;序列表2所示的DNA分子。
等位基因TaMGD-B1a和TaMGD-B1b的应用,为如下:
(a)辅助鉴定待测小麦的千粒重;(b)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重。
所述等位基因TaMGD-B1a如序列表的序列1所示;所述等位基因TaMGD-B1b如序列表的序列2所示。
一种利用所述引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦/品种的方法,包括以下步骤:以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增,若扩增产物长度为275bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1a,具有较高千粒重;若扩增产物长度为325bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1b,具有较低千粒重。
发明有益效果:
本发明首次公开了普通小麦TaMGD基因的等位变异序列TaMGD-B1a和TaMGD-B1b,提供了鉴定TaMGD-B1a和TaMGD-B1b等位变异的功能标记及其与粒重的关系。
本发明还开发了辅助选择高千粒重小麦品种的引物对325F/R,通过该分子标记对小麦DNA进行PCR扩增,用于鉴定和筛选具有较高千粒重的小麦品种或品系。
本发明标记可用于小麦育种材料的早代选择,不受环境和栽培条件的限制,选择目标清晰准确,节省时间和资源,加快育种进程,有利于高产小麦的选育,同时高千粒重小麦籽粒有利于磨粉品质的改善。
附图说明
图1为来源于普通小麦的2个籽粒粒重相关基因TaMGD-B1a与TaMGD-B1b的序列对比;图中下划线部分为外显子,加粗部分为差异片段,加粗且加下划线部分为引物序列;
图2为引物对325F/R对16个不同粒重材料的多态性检测,M:500bp DNA Maker。
具体实施方式
下面通过具体实施方式,对本发明技术方案做进一步的详细描述。以下各实施例仅用于说明本发明,不应当构成对本发明保护范围的限定。本领域技术人员在现有技术范围内,采用惯用技术手段的置换以及和现有技术进行简单组合,均不脱离本发明保护范围。
实施例1
一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对325F/R,所述引物对325F/R由:上游引物325F所示单链DNA片段:5’-CCCTTGTCTATTCATTACTGCC-3’(序列表3)以及下游引物325R所示单链DNA片段:5’-ACCACAAATGACAACAAGCTG-3’组成(序列表4)。
所述引物对325F/R的可应用于:
(1)鉴定待测小麦携带基因型是TaMGD-B1a基因还是TaMGD-B1b基因;
(2)辅助筛选携带TaMGD-B1a基因或是TaMGD-B1b基因的小麦品种;
(3)辅助鉴定/测定待测小麦的千粒重;
(4)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重;
(5)用于制作辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒;
实施例2
本实施例为利用前述引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦/品种的方法,包括以下步骤:以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增,若扩增产物长度为275bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1a,具有较高千粒重;若扩增产物长度为325bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1b,具有较低千粒重。
实施例3
本实施例公开了获得基因型TaMGD-B1a和TaMGD-B1b基因的方法,采用小麦品种许科316和郑麦366进行DNA提取及MGD序列分析:
1、TaMGD-B1a与TaMGD-B1b基因的获得
根据中国春MGD基因序列(GeneID:TRIAE_CS42_6BL_TGACv1_499471_AA1583540.1)
设计特异性引物MGD-BF/R(表1),分别扩增许科316和郑麦366小麦籽粒MGD基因。引物设计采用Primier Primer5软件。
表1 用于扩增小麦MGD基因全长的引物序列
PCR反应以郑麦366和许科316基因组DNA为模板,50 µl PCR反应体系为:模板DNA200ng,Phanta® Max Super-Fidelity DNA Polymerase(南京诺唯赞生物科技有限公司)1µl,上下游引物(10 μmol·L-1)各2µl,2×buffer 25µl,ddH2O补充反应体系至50 µl。引物对MGD-BF/R PCR反应的退火温度为62℃(除预变性和变性温度修改为98℃外,其余程序均参照说明书设置)。PCR产物经琼脂糖凝胶电泳分离后切胶纯化回收克隆至ZT4-Blunt载体(北京庄盟国际生物基因科技有限公司),测序由北京六合华大基因完成。
图1所示为来源于普通小麦的2个籽粒粒重相关基因TaMGD-B1a与TaMGD-B1b的序列对比。图中,TaMGD-B1a为许科316系列,TaMGD-B1b为郑麦366序列;下划线所在碱基部分为外显子,加粗部分为差异片段,加粗且加下划线部分为引物序列。
2、郑麦366与许科316 MGD基因差异分析
许科316品种扩增出的基因型定义为TaMGD-B1a(序列如序列表1所示),郑麦366品种扩增出的基因型定义为TaMGD-B1b(序列如序列表2所示)。
所述等位基因TaMGD-B1a和/或TaMGD-B1b,可应用于:(a)辅助鉴定待测小麦的千粒重;(b)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重。
实施例4
本实施例以实验的方式,通过对小麦千粒重性状与基因型的相关性分析,具体阐述了利用引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法。
一、功能标记引物设计
根据序列表中的序列1、序列2设计引物对325F/R,PCR产物包含上述50bp InDel。
325F(上游引物):5’-CCCTTGTCTATTCATTACTGCC-3’(序列3)
325R(下游引物):5’-ACCACAAATGACAACAAGCTG-3’(序列4)
用引物对325F/R扩增小麦基因组DNA,会得到两种PCR产物类型,类型TaMGD-B1a长度为275bp,类型TaMGD-B1b长度为325bp,参见图2。
二、小麦千粒重性状与基因型的相关性分析
试验材料包括136份中国冬小麦栽培品种(2017年种植于河南荥阳);
1、小麦籽粒千粒重的测定
2、小麦基因型的测定
提取小麦基因组DNA,按照以下步骤进行基因型鉴定:
①以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增。
PCR反应体系:模板DNA 200ng,2×T5 Super PCR Mix(北京擎科新业生物技术有限公司)1µl,上下游引物(10μmol·L-1)各0.5µl ,用ddH2O补充反应体系至20ul。
PCR反应程序:首先98℃、3min;然后98℃、10s,57℃、10s,72℃、10s,共34个循环;最后72℃、5min。扩增产物于4℃保存。
②将PCR产物进行2%琼脂糖凝胶电泳检测。
图2为16个品种检测结果图。依次为中国春、郑麦366、平安8号、洛麦23、洛麦24、驻麦305、丰德存10号、宁麦9号、许科316,花培8号、周麦22、周麦23、平安0658、西农364、豫农186、新麦2111。
材料Ⅰ136个样本中,74个样本扩增出275bp片段,基因型为TaMGD-B1a类型,62个样本扩增出325bp片段,基因型为TaMGD-B1b。136个小麦品种,千粒重测定结果和基因型鉴定结果见表2。
表2:136份中国冬小麦的品种、千粒重测定结果和基因型测定结果
编号 | 品种名称 | 千粒重 | 片段长度 |
1 | 泰禾麦2号 | 58.73 | 275bp |
2 | 中保麦1号 | 58.23 | 275bp |
3 | 泉麦29 | 57.80 | 275bp |
4 | 西农916 | 57.30 | 275bp |
5 | 鄂麦170 | 57.20 | 275bp |
6 | 中农875 | 56.81 | 275bp |
7 | 周麦22 | 56.74 | 275bp |
8 | 涡麦66 | 56.72 | 275bp |
9 | 泛麦7073 | 56.62 | 275bp |
10 | 郑麦7698 | 56.52 | 275bp |
11 | 新麦2111 | 56.52 | 275bp |
12 | 中新16 | 56.33 | 275bp |
13 | 赛德麦601 | 56.08 | 275bp |
14 | 郑麦1860 | 55.93 | 275bp |
15 | 豫农502 | 55.88 | 275bp |
16 | 赛德麦3号 | 55.86 | 275bp |
17 | 轮选166 | 55.56 | 275bp |
18 | 泛麦803-1 | 55.48 | 275bp |
19 | 轮选66 | 55.39 | 275bp |
20 | 洛麦32 | 55.34 | 275bp |
21 | 存麦18号 | 55.12 | 275bp |
22 | 周麦27 | 55.00 | 275bp |
23 | 郑麦936 | 54.91 | 275bp |
24 | 濮麦1165 | 54.41 | 275bp |
25 | 中育1152 | 54.35 | 275bp |
26 | 中麦170 | 54.03 | 275bp |
27 | 济麦22 | 53.99 | 325bp |
28 | 宁08-30 | 53.89 | 325bp |
29 | 锦绣21 | 53.74 | 325bp |
30 | 濮兴8号 | 53.73 | 275bp |
31 | 中育1428 | 53.71 | 275bp |
32 | 泛育麦17 | 53.56 | 275bp |
33 | 豫农186 | 53.50 | 275bp |
34 | 金丰205 | 53.43 | 275bp |
35 | 周麦18 | 53.39 | 275bp |
36 | 西农188 | 53.23 | 275bp |
37 | 郑麦618 | 52.91 | 275bp |
38 | 盛农2号 | 52.79 | 325bp |
39 | 中农麦4007 | 52.78 | 275bp |
40 | 周麦16 | 52.73 | 275bp |
41 | 郑麦119 | 52.71 | 325bp |
42 | 良星66 | 52.64 | 275bp |
43 | 农大2011 | 52.48 | 325bp |
44 | 豫农211 | 52.36 | 325bp |
45 | 鄂麦526 | 52.35 | 275bp |
46 | 周麦23 | 52.29 | 275bp |
47 | 郑麦1342 | 52.13 | 275bp |
48 | 郑品麦22号 | 52.09 | 275bp |
49 | 郑麦136 | 52.04 | 325bp |
50 | 平安0602 | 52.04 | 275bp |
51 | 良星99 | 51.78 | 325bp |
52 | 平安0518 | 51.74 | 275bp |
53 | 郑168 | 51.71 | 275bp |
54 | 丰德存麦20 | 51.62 | 275bp |
55 | 光泰68 | 51.54 | 325bp |
56 | 兰考380 | 51.52 | 325bp |
57 | 徐9074 | 51.48 | 275bp |
58 | 瑞泉麦168 | 51.34 | 325bp |
59 | 郑育麦16 | 51.34 | 325bp |
60 | 存麦12 | 51.06 | 325bp |
61 | 郑99515 | 50.93 | 325bp |
62 | 平安0658 | 50.90 | 275bp |
63 | 郑品麦24号 | 50.84 | 275bp |
64 | 西农585 | 50.75 | 325bp |
65 | 郑麦103 | 50.74 | 325bp |
66 | 中育12 | 50.66 | 275bp |
67 | 泛区麦16 | 50.62 | 275bp |
68 | 淮核12013 | 50.29 | 325bp |
69 | 矮抗58 | 50.17 | 325bp |
70 | 洛麦29 | 50.17 | 325bp |
71 | 中农895 | 50.12 | 275bp |
72 | 百农金光588 | 50.11 | 325bp |
73 | 新科麦169 | 49.90 | 325bp |
74 | 农大2011 | 49.88 | 275bp |
75 | 郑品麦25号 | 49.66 | 275bp |
76 | 豫丰11 | 49.41 | 275bp |
77 | 百农307 | 49.37 | 325bp |
78 | 百农418 | 49.32 | 325bp |
79 | 中育9398 | 49.10 | 325bp |
80 | 中泛159 | 49.09 | 325bp |
81 | 中麦247 | 49.01 | 325bp |
82 | 郑麦369 | 48.87 | 325bp |
83 | 轮选21 | 48.79 | 325bp |
84 | 濮兴5号 | 48.79 | 275bp |
85 | 龙科1221 | 48.54 | 325bp |
86 | 郑麦1354 | 48.46 | 275bp |
87 | 西农529 | 48.24 | 275bp |
88 | 瑞华1426 | 48.23 | 325bp |
89 | 瑞华1101 | 48.21 | 275bp |
90 | 益科麦5号 | 47.95 | 325bp |
91 | 中泛7039 | 47.90 | 275bp |
92 | 西农364 | 47.74 | 275bp |
93 | 瑞华055 | 47.71 | 325bp |
94 | 百农416 | 47.63 | 325bp |
95 | 中金13 | 47.53 | 275bp |
96 | 中育9307 | 47.52 | 325bp |
97 | 西农167 | 47.33 | 275bp |
98 | 龙科1211 | 47.23 | 325bp |
99 | 新麦45 | 47.14 | 325bp |
100 | 西农524 | 47.11 | 275bp |
101 | 百农207 | 47.10 | 325bp |
102 | 中泛428 | 47.06 | 275bp |
103 | 资0821(R.toPM) | 46.94 | 275bp |
104 | 泛麦8号 | 46.90 | 325bp |
105 | 丹麦118 | 46.90 | 325bp |
106 | 扬辐麦9144 | 46.84 | 275bp |
107 | 兰考198 | 46.82 | 325bp |
108 | 轮选33 | 46.72 | 275bp |
109 | 赛德麦4号 | 45.90 | 325bp |
110 | PIC447 | 45.89 | 275bp |
111 | 丰德存10号 | 45.81 | 325bp |
112 | 西农511 | 45.77 | 275bp |
113 | 新麦31 | 45.61 | 325bp |
114 | 09M20 | 45.58 | 325bp |
115 | NMAS020 | 45.08 | 325bp |
116 | 濮麦8062 | 44.46 | 325bp |
117 | 新麦26 | 43.86 | 275bp |
118 | 瑞华1426 | 43.27 | 325bp |
119 | 周麦24 | 43.25 | 325bp |
120 | 望水白 | 43.24 | 325bp |
121 | 中麦66 | 42.94 | 275bp |
122 | 封麦6号 | 42.88 | 275bp |
123 | 新麦35 | 42.19 | 275bp |
124 | 南农0686 | 41.58 | 325bp |
125 | 洛麦24 | 41.55 | 325bp |
126 | 10M20 | 41.55 | 325bp |
127 | 驻麦305 | 41.10 | 325bp |
128 | 泛麦803 | 40.96 | 275bp |
129 | 宁麦9号 | 40.20 | 325bp |
130 | 洛麦23 | 40.16 | 325bp |
131 | 平安8号 | 39.48 | 325bp |
132 | 节燕2000-1 | 38.39 | 325bp |
133 | 网93 | 38.34 | 325bp |
134 | 苏麦3号 | 37.00 | 325bp |
135 | 苏夫 | 35.00 | 325bp |
136 | NMAS001 | 34.26 | 325bp |
表3:小麦TaMGD基因等位变异与籽粒粒重高低关系的统计分析结果
试验材料 | 等位变异 | 检测材料数目 | 平均千粒重(g) | 标准差 |
І | TaMGD-B1a | 74 | 51.86 A | 4.19 |
TaMGD-B1b | 62 | 47.09 B | 4.76 |
通过对小麦千粒重与基因型的相关性分析,得出以下结论:以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增,若产物长度为275bp,说明该小麦材料基因型为TaMGD-B1a,具有较高千粒重;若产物长度为325bp,则该小麦材料基因型为TaMGD-B1b,具有较低千粒重。
本发明引物对325F/R,除了用于小麦基因型的测定,用于辅助鉴定/测定/比较待测小麦/品种的千粒重,还可用于制作辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒。采用该引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦,用于小麦育种,可提高选择效率,加快育种进程。
SEQUENCE LISTING
<110> 河南农业大学
<120> 一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对及其应用
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 4295
<212> DNA
<213> 小麦(Triticum aestivum L.)
<400> 1
atggaggcgc cgacggcggc gccgcgggtg cggtcgatcc gggagacggt gctggagagc 60
gtggcggcgt accaccagca gcagcggatg cgccgcaggt tccgcaagag cctctcctac 120
gcgggggagc tctcctccgc gggccgggcc ggcgcctcgt cctccccgtc cgcctccctc 180
gcctcgctcg ccgggcccga ggacgacgac gagcccttct gggaggagga ggagggcacg 240
gtcgagctgg tccagctcgg cgccaaccgc gccaagaacg tcctcgtcct catgagcgac 300
accggcggcg gccaccgcgc ctccgccgag gccatcaagg acgccttccg catcgaattc 360
ggcgacgact accgggtaaa tcaccctatt attcctctgc tcccgcgccg cgaatcattc 420
ccctccccct ccccctctgt ctgtccgtga atataaacaa acaaattgtt atcggaatct 480
ccccccaatc tgcctgtcaa tccaagtggc cgcgcccgcg ctgatgatgg gtttcgattt 540
cgatttcgat ttgggcattc gtgcccacgg caggtgttcg tcaaggacct gtgcaaggac 600
cacgccggct ggccgctcaa caacatggag agctcctaca agttcatggt gaagcacgtg 660
cagctctgga aggtggcctt ccacggcaca tcgccccgat gggtccacaa cttctacctc 720
gccgccctcg cctccttcta cgccaagtac gtcgtacgga tcgcttccct tctctcgcac 780
tcccacccac ggatcctcct gcaataggat ttcaccaaat ttagtactac tagttcttgc 840
aacgtttttc ttgcttcacc tcacccacat cgtccgtcgg gatcgtcata aacaaacaaa 900
taattaatta attcgatgtg atttgtggct tcacactcac gccagactgt ttttcctgtc 960
attggctggt tccttagcat cgcaaatggc tgacctgatc gcagatttta tagtggatcg 1020
gcacttttgt cagcattttg atcgcactaa tatatattat aatcccagat ctcacccgac 1080
gatatggcgc tcataatttt atataaggac cacggctgtc ttgactggag acgctaaaat 1140
atctgtgctg gattccttgt catgtaatgc atgtgaattt gctgttgatt cctgaataaa 1200
attgtgccaa ggtcagatat ccagccatgt ggactggttc aggctgcgcg tataggtttg 1260
ccaggttgta ggacagtgac cgggcagcat atggagaagt tcagtttgta ccatgcgcat 1320
cagattgcca ctctgtgctg gtgtcaccct ctaggtgtgg tgatattcta ggaggtcaca 1380
aaaattgagt gcatcgcatc gctgccatcc cttgagagaa ttatttaata agtgagttaa 1440
caatctgtcc ttgtataaca ttgctcccaa accatgacct ataaaccaca ttgttagtgt 1500
gcatatgcaa gctttcattt cttggattac tattttttca tactccaaac cataaacatt 1560
gtgtacacat ttgcagttta aagtcaatta acttgtactc ctttttttgg ctctatttcg 1620
atgccgtcat tgctaagaat cgtcaattat tgctaaacgg ttacctgtaa tgcttgtgtc 1680
atttagactt tgacctgcaa tctaagttca atgacccaca cggtagactt tgtctctaca 1740
tcaagtcgac atgtaatctt ttttttctga ataatttctt gtttatggtt gtaggaaggt 1800
tgaggctgga ttgaagaagt acaagccaga cataataatt agtgttcacc ccctcatgca 1860
acacattcct ctatgggtac tcaaatggca aggtctgcag aacagagtag tcttcgccac 1920
tgtcatcacc gacctcaaca cttgccaccc tacatggtag gctcagctct caaaaaggcg 1980
aaacctggat actgttcttt ttcatgaaaa ttaactggtt cttacacact tcaatcatag 2040
acttataaca tctggctata caaatataca ggttccatgc tgatgtaaat agatgttact 2100
gcccatcaga ggaagtagcc aagagggcag aactggatga cctaaaaagt tctcagatcc 2160
gtgtgttcgg tcttcccatt cgaccatcat tctgccgtgc tgttcttgtt aaggtaaccc 2220
ctttttaaaa ttaggactgt cgttacttgt ttatgtgccc aagtggtttc aaattttgta 2280
tgcgagtttt ccaaatatgt tgtctattca ttaactgcca agcattgtgt acagcaattc 2340
tccagaatgt aaagcattct ggtctgtagc cttatgattc tactatatgt gttccgcaaa 2400
caaacaaatg tatgcttgta ctgtgatgtg tcttcatgca aatgctcgct tttgaaataa 2460
cgcatcttct aaacaaacat gatagttcgc ttgtagtttt tttttatccc ttgtctattc 2520
attactgcct aggacattct gtgctgaaca gtgatgtgtc ttgatgcaaa tgcttgcttt 2580
caactgacac atttttaaac caattgctca ccaggatgat ttgcggaagg aacttgaatt 2640
ggatcctgac ctaccggcag tgttgctgat gggaggtgga gagggcatgg gtcctgtaaa 2700
gaagaccgca aaagcccttg gagatgcatt gtttgacaaa gagctcggaa aaccaatcgg 2760
gcagcttgtt gtcatttgtg gtcggaacaa aacactgagc tcctcattgc aggctcttga 2820
atggaaaatg ccaataaagg tataaacaat atgttcaact ctccgttttt ttaaaacttc 2880
aacttgtttc ttatttagcc cacacaaaga gaataatttg ttaactgcct ttcttttatt 2940
aaacaaaaga ttagaggatt cgagacccaa atggagaaat ggatgggggc ttgtgactgc 3000
attataacaa aggtatatat attactgacc cttctctatt gttagcgtgc tgcttccttt 3060
gaaggtcgtg tggtactcat aattttgttt tcctgttgtt attttggttc aataggctgg 3120
accaggcacc attgctgaag ccttgattag gggtcttcct atcatcctta atgacttcat 3180
acctggacag gtttgtgtcc acttactttc caccttataa atgttgattt aagcattcaa 3240
agtgtatgta tttgcaacga tgcagtgaac cgaaaacccg acagctactg ctcgaaacaa 3300
tcttctgata tgttgtcctt gaaccttaac aaaatacatc tgtttggatc aagatatagt 3360
ataagttggc cattgatgca gtgccatgct tgtttacggt tattgtcttg cgaacttctt 3420
cccatgtgat ctttacagat ctgtagaatc aatcctcatg aacttcattc tgatgaatag 3480
atactggttt tgtgcagtaa aaactatgca tgtttatggt tattcttttt tttttgaccg 3540
gttgaggcta gtacagtatg ataaacaaag tggtcgtgca ttgtttatct ttatgggcaa 3600
catacatcct gcaagagttg tgcgcttctg tctgcttagc aggcagtcta catcaaacga 3660
tatcatctta acatagtaat gttttcttgc atcccaggaa gtcggcaacg tcccttatgt 3720
cgtggacaac ggcgcaggcg tgttctccaa gagccccaag gaaactgccg aacttgtggc 3780
ccgctggttc ggtccaggcg cggaggaatg caagaggatg tcggagaacg cgttgaaatt 3840
ggcccagccg gaagccgtgt tcgacatcgt gagggacatc cacgagctct cccaggagca 3900
aggggtgaag gcgcagatct ccagctccct gacatcgtcc ttcttcatgc catctcctga 3960
agccagccat tgcccaagcc ccatcccgct cgtgtgaagc cttggaagac gtgtacatag 4020
ctagagcacc gcaacacctc tttgcgcctt tcatatcctt gatgaaaaga aaagaaaaga 4080
aaaggaaagg aaaacgtggc acgcgatttg gcctggtttg ttccatctgt tgtcgcggtc 4140
gggggatctc gatgtttttc tgttcatggc ctctcgccgt agttctcaca ggcttgtttg 4200
accgacaggt gctcttgtgc gatattgtgt tggtgtaaag tttgtgaaaa atgatcattg 4260
gttgaacatc attcttttac ggttccctcc ttgca 4295
<210> 2
<211> 4343
<212> DNA
<213> 小麦(Triticum aestivum L.)
<400> 2
atggaggcgc cgacggcggc gccgcgggtg cggtcgatcc gggagacggt gctggagagc 60
gtggcggcgt accaccagca gcagcggatg cgccgcaggt tccgcaagag cctctcctac 120
gcgggggagc tctcctccgc gggccgggcc ggcgcctcgt cctccccgtc cgcctccctc 180
gcctcgctcg ccgggcccga ggacgacgac gagcccttct gggaggagga ggagggcacg 240
gtcgagctgg tccagctcgg cgccaaccgc gccaagaacg tcctcgtcct catgagcgac 300
accggcggcg gccaccgcgc ctccgccgag gccatcaagg acgccttccg catcgaattc 360
ggcgacgact accgggtaaa tcaccctatt attcctctgc tcccgcgccg cgaatcattc 420
ccctccccct ccccctctgt ctgtccgtga ataaacaaac aaattgttat cggaatctcc 480
ccccaatctg tctgtcaatc caagtggccg cgcccgcgct gatgatgggt ttcgatttcg 540
atttcgattt gggcattcgt gcccacggca ggtgttcgtc aaggacctgt gcaaggacca 600
cgccggctgg ccgctcaaca acatggagag ctcctacaag ttcatggtga agcacgtgca 660
gctctggaag gtggccttcc acggcacatc gccccgatgg gtccacaact tctacctcgc 720
cgccctcgcc tccttctacg ccaagtacgt cgtacggatc gcttcccttc tctcgcactc 780
ccacccacgg atcctcctgc aataggattt caccaaattt agtactacta gttcttgcaa 840
cgtttttctt gcttcacctc acccacatcg tccgtcggga tcgtcataaa caaacaaata 900
attaattaat tcgatgtgat ttgtggcttc acactcacgc cagactgttt ttcctgtcat 960
tggctggttc cttagcatcg caaatggctg acctgatcgc agattttata gtggatcggc 1020
acttttgtca gcattttgat cgcactaata tatattataa tcccagatct cacccgacga 1080
tatggcgctc ataattttat ataaggacca cggctgtctt gactggagac gctaaaatat 1140
ctgtgctgga ttccttgtca tgtaatgcat gtgaatttgc tgttgattcc tgaataaaat 1200
tgtgccaagg tcagatatcc agccatgtgg actggttcag gctgcgcgta taggtttgcc 1260
aggttgtagg acagtgaccg ggcagcatat ggagaagttc agtttgtacc atgcgcatca 1320
gattgccact ctgtgctggt gtcaccctct aggtgtggtg atattctagg aggtcacaaa 1380
aattgagtgc atcgcatcgc tgccatccct tgagagaatt atttaataag tgagttaaca 1440
atctgtcctt gtataacatt gctcccaaac catgacctat aaaccacatt gttagtgtgc 1500
atatgcaagc tttcatttct tggattacta ttttttcata ctccaaacca taaacattgt 1560
gtacacattt gcagtttaaa gtcaattaac ttgtactcct ttttttggct ctatttcgat 1620
gccgtcattg ctaagaatcg tcaattattg ctaaacggtt acctgtaatg cttgtgtcat 1680
ttagactttg acctgcaatc taagttcaat gacccacacg gtagactttg tctctacatc 1740
aagtcgacat gtaatctttt ttttctgaat aatttcttgt ttatggttgt aggaaggttg 1800
aggctggatt gaagaagtac aagccagaca taataattag tgttcacccc ctcatgcaac 1860
acattcctct atgggtactc aaatggcaag gtctgcagaa cagagtagtc ttcgccactg 1920
tcatcaccga cctcaacact tgccacccta catggtaggc tcagctctca aaaaggcgaa 1980
acctggatac tgttcttttt catgaaaatt aactggttct tacacacttc aatcatagac 2040
ttataacatc tggctataca aatatacagg ttccatgctg atgtaaatag atgttactgc 2100
ccatcagagg aagtagccaa gagggcagaa ctggatgacc taaaaagttc tcagatccgt 2160
gtgttcggtc ttcccattcg accatcattc tgccgtgctg ttcttgttaa ggtaacccct 2220
ttttaaaatt aggactgtcg ttacttgttt atgtgcccaa gtggtttcaa attttgtatg 2280
cgagttttcc aaatatgttg tctattcatt aactgccaag cattgtgtac agcaattctc 2340
cagaatgtaa agcattctgg tctgtagcct tatgattcta ctatatgtgt tccgcaaaca 2400
aacaaatgta tgcttgtact gtgatgtgtc ttcatgcaaa tgctcgcttt tgaaataacg 2460
catcttctaa acaaacatga tagttcgctt gtagtttttt tttatccctt gtctattcat 2520
tactgcctag gacattctgt gctgtagccc tatgattcta ccgtattttc cagaaacaaa 2580
caaatgtatg gctgaacagt gatgtgtctt gatgcaaatg ctcgctttca actgacacat 2640
ttttaaacca attactcacc aggatgattt gcggaaggaa cttgaattgg atcctgacct 2700
accggcagtg ttgctgatgg gaggtggaga gggcatgggt cctgtaaaga agaccgcaaa 2760
agcccttgga gatgcattgt ttgacaaaga gctcggaaaa ccaatcgggc agcttgttgt 2820
catttgtggt cggaacaaaa cactgagctc ctcattgcag gctcttgaat ggaaaatgcc 2880
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gtatatatat tactgaccct tctctattgt tagcgtgctg cttcctttga aggtcgtgtg 3120
gtactcataa ttttgttttc ctgttgttat tttggttcaa taggctggac caggcaccat 3180
tgctgaagcc ttgattaggg gtcttcctat catccttaat gacttcatac ctggacaggt 3240
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acagtatgat aaacaaagtg gtcgtgcatt gtttatcttt atgggcaaca tacatcctgc 3660
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atagtaatgt tttcttgcat cccaggaagt cggcaacgtc ccttatgtcg tggacaacgg 3780
cgcaggcgtg ttctccaaga gccccaagga aactgccgaa cttgtggccc gctggttcgg 3840
tccaggcgcg gaggaacgca agaggatgtc ggagaacgcg ttgaaattgg cccagccgga 3900
agccgtgttc gacattgtga gggacatcca cgagctctcc caggagcaag gggtgaaggc 3960
gcagatctcc agctccctga catcgtcctt cttcatgcca tctcctgaag ccagccattg 4020
cccaagcccc atcccgctcg tgtgaagcct tggaagacgt gtacatagct agagcaccgc 4080
aacacctctt tgcgcctttc atatccttga tgaaaagaaa agaaaagaaa aggaaaggaa 4140
aacgtggcac gcgatttggc ctggtttgtt ccatctgttg tcgcggtcgg gggatctcga 4200
tgtttttctg ttcatggcct ctcgccgtag ttctcacagg cttgtttgac cgacaggtgc 4260
tcttgtgcga tattgtgttg gtgtaaagtt tgtgaaaaat gatcattggt tgaacatcat 4320
tcttttacgg ttccctcctt gca 4343
<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Triticum aestivum L.)
<400> 3
cccttgtcta ttcattactg cc 22
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Triticum aestivum L.)
<400> 4
accacaaatg acaacaagct g 21
Claims (8)
1.一种辅助选择高千粒重小麦品种的引物对325F/R,由SEQ ID No:3所示的单链DNA片段和SEQ ID No:4所示的单链DNA片段组成。
2.权利要求1所述引物对325F/R的如下应用:
(1)鉴定待测小麦携带基因型是TaMGD-B1a基因还是TaMGD-B1b基因;
(2)辅助筛选携带TaMGD-B1a基因或是TaMGD-B1b基因的小麦品种;
(3)辅助鉴定/测定待测小麦的千粒重;
(4)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重;
(5)用于制作辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒;
所述等位基因TaMGD-B1a如SEQ ID No:1 所示,等位基因TaMGD-B1b如SEQ ID No: 2所示。
3.以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1所述引物对325F/R扩增得到的DNA片段:所述DNA片段为SEQ ID No:1中自5’末端2508-2782所示的核苷酸或SEQ ID No:2中自5’末端2506-2830所示的核苷酸。
4.权利要求3所述DNA片段的应用,为如下(a)或(b):
(a)辅助鉴定待测小麦的千粒重;
(b)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重。
5.SEQ ID No:1所示的DNA分子。
6.SEQ ID No:2所示的DNA分子。
7.等位基因TaMGD-B1a和/或TaMGD-B1b的如下应用:
(a)辅助鉴定待测小麦的千粒重;
(b)辅助比较不同待测小麦品种的千粒重;
所述等位基因TaMGD-B1a如SEQ ID No:1所示,等位基因TaMGD-B1b如SEQ ID No:2所示。
8.一种利用权利要求1所述引物对325F/R辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦/品种的方法,包括以下步骤:以小麦基因组DNA为模板,用引物对325F/R进行PCR扩增,若扩增产物长度为275bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1a,具有较高千粒重;若扩增产物长度为325bp,则待测小麦的基因型为TaMGD-B1b,具有较低千粒重。
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CN113699268B (zh) * | 2021-09-02 | 2022-09-30 | 河北师范大学 | 小麦千粒重性状相关snp位点及其应用 |
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
BR112012006616A2 (pt) * | 2009-09-25 | 2018-07-10 | Basf Plant Science Co Gmbh | método para intensificar traços relacionados a rendimento em plantas com relação a plantas de controle, planta ou parte da mesma, construto, uso de um construto, planta. ou parte da planta ou célula de planta transformada com um construto, método para a produção de uma planta transgênica, planta transgênica, partes colhíveis de uma planta, produtos derivados de uma planta, uso de um ácido nucleíco, molécula de ácido nucleíco isolado, polipeptídeo isolado, uso de qualquer um, dois ou mais ácidos nucleícos e método para aprimorar os traços relacionados a rendimento em plantas. |
CN110462043A (zh) * | 2016-09-02 | 2019-11-15 | 联邦科学技术研究组织 | 具有修饰的性状的植物 |
-
2019
- 2019-01-15 CN CN201910033908.5A patent/CN109576392B/zh active Active
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