CN109477849B - 自动分析系统和方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种样品自动分析方法和系统。根据某些实施例,提供了在自动化样品分析系统中分析样品的方法。该方法包括将样品和样品制备盒引入系统,在样品制备站分离和纯化样品中存在的分析物(例如,核酸和/或蛋白质),并在包括纯化的分析物的测定混合物中进行分析物检测测定。还提供了自动化样品分析系统,其可用于例如执行本公开的方法。在某些方面,所述方法和系统在补充或移除样品、散装流体、试剂、物件、废物等中的一种或任何组合期间提供连续的操作者访问。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求2016年3月15日提交的美国临时专利申请62/308,617和2016年7月1日提交的美国临时专利申请62/357,772的权益,这些申请通过引用以其整体并入本文。
背景技术
分子分析正在改变医疗保健专业人员检测和诊断疾病和病症的方式。选择关键技术,包括聚合酶链反应(PCR)和新一代测序,有助于改变分析患者样品的能力。随着这些技术进步被纳入常规诊断测试,分类系统可能会受到影响,并且治疗方法将会发生变化。
实时PCR分析改进了临床实验室量化和诊断医学病症和疾病(包括癌症、微生物感染等)的方式。该测试方法通常将PCR化学与扩增产物的荧光探针检测结合在同一反应容器中。通常,PCR和扩增产物检测均在一小时或更短时间内完成,这比常规PCR检测方法快得多。实时PCR测定提供与常规PCR结合Southern印迹分析相当的灵敏度和特异性,并且由于扩增和检测步骤在相同的封闭容器中进行,因此降低了将扩增的核酸释放到环境中的风险。优异的灵敏度、特异性和速度的结合使得实时PCR技术成为基于培养或免疫测定的测试方法的有吸引力的替代方法,所述测试方法用于诊断癌症、传染病以及通过基于核酸的分析可检测的任何其他疾病或医学病症。
发明内容
本公开的各方面包括样品分析方法和系统。根据某些实施例,提供了在自动化样品分析系统中分析样品的方法。该方法包括将样品和样品制备盒引入系统,在样品制备站分离和纯化样品中存在的分析物(例如,核酸和/或蛋白质),并在包括纯化的分析物的测定混合物中进行分析物检测测定。还提供了自动化样品分析系统,其可用于例如执行本公开的方法。在某些方面,所述方法和系统在补充或移除样品、散装流体、试剂、物件、废物等中的一种或任何组合期间提供连续的操作者访问。
附图说明
图1示出了根据本公开的一个实施例的自动分析系统的外部视图。
图2示出了根据一个实施例的自动分析系统的外部视图,其中某些装载和存储区域的搁架和抽屉打开。
图3显示了根据一个实施例的自动分析系统的样品装载区域。
图4A和4B示出了根据一个实施例的样品装载区域和分离式搁架。该搁架用于将多个样品管架装载到系统中,例如,以单个运动。
图5示出了根据一个实施例的包括样品管识别码读取器的样品装载区域。
图6示出了根据一个实施例的移液管尖端装载区域。
图7示出了根据一个实施例的移液管尖端架装载抽屉。抽屉可从系统中取出,并可从上方或侧面装入移液管尖端架。
图8显示了根据一个实施例的辅助试剂装载区域。
图9显示了根据一个实施例的辅助试剂包保持器。
图10显示了根据一个实施例的测定试剂装载区域。
图11显示了根据一个实施例的测定试剂装载区域。
图12显示了根据一个实施例的测定试剂装载区域。
图13显示了根据一个实施例的样品处理(SP)盒装载区域。
图14显示了图13的SP盒装载区域,其中门打开并且SP盒存储单元朝向系统的前部,以便于系统的操作者装载SP盒堆叠。
图15显示了存在于套管中的SP盒的单个堆叠。
图16显示了根据一个实施例的SP盒装载区域。
图17显示了根据一个实施例的SP盒。
图18显示了根据一个实施例的SP盒。
图19显示了根据一个实施例的SP盒升降机的某些部件。
图20显示了根据一个实施例的具有对准漏斗的SP盒升降机。
图21显示了图20中所示的对准漏斗的侧视图。
图22显示了根据一个实施例的散装试剂存储区域。
图23显示了根据一个实施例的散装试剂存储区域。
图24显示了根据一个实施例的SP盒工作流程。
图25显示了根据一个实施例的机器人SP盒处理器。
图26显示了根据一个实施例的机器人SP盒处理器的SP盒夹持器。
图27显示了根据一个实施例的散装试剂加注站。
图28显示了根据一个实施例的样品制备站的样品制备单元。
图29显示了根据一个实施例的磁体、柱塞杆、柱塞和SP盒孔。
图30显示了根据一个实施例的样品制备站的样品制备单元。
图31示出了根据一个实施例的自动样品分析系统的背景下的机器人移液器。
图32显示了根据一个实施例的机器人移液器。
图33显示了根据一个实施例的机器人移液器。
图34显示了根据一个实施例的机器人移液器与移液管尖端的接合。
图35显示了根据一个实施例的机器人移液器从样品管抽吸样品。
图36显示了根据一个实施例将样品分配到SP盒的各个孔中。
图37显示了根据一个实施例的机器人移液器对辅助试剂的吸入。
图38显示了根据一个实施例的机器人移液器拾取反应容器(RV)盖。
图39显示了根据一个实施例的机器人移液器对RV加盖。
图40显示了根据一个实施例的加盖的RV从SP盒转移到样品分析单元的孔中。
图41显示了根据一个实施例将加盖的RV放置到样品分析单元的孔中。
图42显示了根据一个实施例在由机器人移液器释放后加盖的RV进入样品分析单元的孔中。
图43显示了根据一个实施例的样品分析单元。
图44显示了根据一个实施例的样品分析单元,其中盖子位于样品分析单元中的RV上方,并且检测模块正在执行扫描以在核酸扩增期间询问RV。
图45显示了根据一个实施例的固体废物斜槽。
图46显示了根据一个实施例的固体废物容器。
图47显示了根据一个实施例的连接到样品分析单元的护罩,用于容纳从样品分析单元发出的可能的污染物。
图48显示了根据一个实施例的测定试剂板载体和测定试剂板。
图49显示了根据一个实施例的具有用于干燥剂包的凹口的测定试剂板载体,干燥剂包用于提高测定试剂的稳定性。
图50显示了根据一个实施例的测定试剂板载体、干燥剂包凹口、干燥剂包和测定试剂板的横截面视图。
图51显示了根据本公开某些实施例的系统的样品处理和移液特征。
具体实施方式
本公开的各方面包括样品分析方法和系统。根据某些实施例,提供了在自动化样品分析系统中分析样品的方法。该方法包括将样品和样品制备盒引入系统,在样品制备站分离和纯化样品中存在的分析物(例如,核酸和/或蛋白质),并在包括纯化的分析物的测定混合物中进行分析物检测测定。还提供了自动化样品分析系统,其可用于例如执行本公开的方法。在某些方面,所述方法和系统在补充或移除样品、散装流体、试剂、物件、废物等中的一种或任何组合期间提供连续的操作者访问。
在更详细地描述本系统和方法之前,应理解本公开不限于所描述的特定实施例,因为这种方式当然可以改变。还应理解,本文使用的术语仅用于描述特定实施例的目的,而不是限制性的。
在提供值范围的情况下,应理解,除非上下文另有明确规定,否则在该范围的上限和下限与在该所述范围中的任何其他所述值或中间值之间的每个中间值(至下限单位的十分之一)均包含在本系统和方法中。这些较小范围的上限和下限可以独立地包括在较小范围内,并且也包括在系统和方法中,受所述范围中任何具体排除的限制。如果所述的范围包括一个或两个限制,则排除这些所包含限制中的一个或两个的范围也包括在系统和方法中。
本文给出了某些范围,其中数值前面有术语“约”。术语“约”在本文中用于提供其前面的确切数字的字面支持,以及接近或近似该术语前面的数字的数字。在确定数字是否接近或近似具体陈述的数字时,接近或近似未陈述的数字可以是在其呈现的上下文中提供具体陈述的数字的实质等同物的数字。
除非另外定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本公开所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义。尽管与本文描述的那些类似或等同的任何方法和材料也可用于本发明的实践或测试,但现在描述代表性的说明性系统和方法。
本说明书中引用的所有出版物和专利均通过引用结合到本文中,如同每个单独的出版物或专利被具体和单独地指出通过引用并入本文,并且通过引用并入本文以公开和描述与这些出版物被引用相关的方法和/或材料。任何出版物的引用是为了其在申请日之前的公开内容,并且不应被解释为承认本发明无权因为在先发明而占先于这些出版物。此外,提供的出版日期可能与实际出版日期不同,实际出版日期可能需要独立确认。
应注意,如本文和所附权利要求中所使用的,单数形式“一”、“一个”和“该”包括复数指示物,除非上下文另有明确说明。还应注意,可以撰写权利要求以排除任何可选要素。因此,本声明旨在作为与权利要求元素的叙述相关使用例如“单独”、“仅”等专用术语或使用“否定”限制的先行基础。
对于本领域技术人员在阅读本公开内容后将显而易见的是,本文描述和示出的每个单独实施例具有离散的组件和特征,其可以容易地与任何其他几个实施例的特征分离或组合而不背离本系统和方法的范围或精神。任何陈述的方法可以按照所述事件的顺序或以逻辑上可能的任何其他顺序进行。
系统和方法
本公开的方面包括样品分析系统和方法。该分析系统可以适于进行各种感兴趣的分析,包括但不限于核酸分析。在某些方面,分析系统是自动化的,意味着系统能够在没有使用者干预的情况下执行样品分析和任何必要的样品制备步骤。本公开的方法可以包括以任何合适的组合由本公开的系统执行的任何功能。
根据某些实施例,分析系统是自动化核酸制备和分析系统。现在将描述根据本公开的某些实施例的自动化核酸制备和分析系统的方面。
设计本公开的自动化核酸制备和分析系统以进行连续自动化核酸制备和分析(例如,同时系统的操作者可以获得补充消耗品和试剂,去除废物等)和发现可用于例如在临床实验室中进行核酸测试。该系统可以是完全集成和自动化的分子诊断分析仪,其在临床实验室中利用实时PCR技术。该系统是集成的,因为它执行样品制备(例如,核酸分离和纯化)和分析(例如,实时PCR分析)二者。该系统可以从来自各种样品容器类型(例如,尺寸、形状、样品管盖的存在或类型等中的一种或多种可以变化的样品管)的感兴趣的样品(例如,血浆、血清、全血、体液、拭子样品等)中分离、洗涤、纯化和扩增感兴趣的DNA或RNA靶标。
在某些方面,本公开的系统包括用于样品处理和核酸分析的冗余组件,用于例如样品、试剂、样品处理盒、移液管尖端和/或类似物的冗余装载/存储区域。冗余组件使系统能够连续运行(包括提供样品结果/数据),并在补充或移除样品、散装流体、试剂、物件(例如,反应容器和反应容器盖、样品处理(SP)盒、移液管尖端和托盘、测定板、辅助试剂包和/或类似物)和废物期间提供连续的操作员访问,而不停止系统的操作。“连续的操作员访问”意味着系统的操作者可以在不停止系统操作的情况下补充和/或移除样品、散装流体、试剂、物件和废物,例如,不中断系统的样品制备和分析功能的任何方面。
因此,在某些方面,提供了在自动化样品分析系统中连续分析样品的方法。该方法包括将样品和样品制备(SP)盒装入系统,在包括两个或更多SP盒散装试剂加注位置的SP盒散装试剂加注站给SP盒加注散装试剂,和在包括两个或更多SP盒样品加注位置的SP盒样品加注站将样品移液到SP盒中。该方法还包括通过在包括两个或更多个SP盒样品制备位置的样品制备站处分离和纯化样品中存在的分析物来制备SP盒中的样品用于分析。该方法还包括将纯化的分析物与测定试剂组合以形成测定混合物,并对测定混合物进行分析物检测测定以分析样品。在不停止系统操作的情况下,系统的操作者可以连续访问系统以补充或去除样品、散装流体、试剂、物件和废物中的一种或任何组合。
在某些方面,本公开的系统采用“前后紧接(lockstep)”方案,其中方案的步骤尽可能接近地彼此跟随。在一些情况下,基于不同方案的相应步骤确定前后紧接方案,其中这些方案将并行或同时执行。因此,前后紧接方案不需要仅由特定方案的连续最短步骤组成,而是可以包括并行执行的各种方案的一个或多个最长步骤。在一些实施例中,所述系统和方法涉及根据每个特定测定所需的最长处理和/或分析步骤运行多个测定。例如,在一些情况下,多测定处理方法可以包括在与所有多个测定中所需的最长SPU盒制备步骤相对应的一段时间内制备样品。SP盒制备步骤可包括将必需的试剂等分到多孔容器的样品处理孔中以准备样品处理,例如裂解和提取核酸。用于不同测定的SP盒制备步骤将变化,例如,因为某些测定可能需要比另一测定更多或更少的试剂。如本文所述的多测定处理和分析的方法通过限制自动化过程的步骤(包括样品处理和分析)的调度复杂性来提供自动化多测定处理/分析装置的简化编程(例如,软件编程)。在某些方面,本公开的系统实施如律师案卷号ADDV-057PRV中所述的前后紧接测定方案,其公开内容通过引用整体并入本文。
根据某些实施例,本公开的系统提供对所有测定的随机访问,意味着系统允许以任何顺序对任何测试(测定)进行排序和处理,条件是系统具有用于所请求测试的必需试剂/消耗品。机上测定的总数可以变化,并且在某些方面是并行2或更多、5或更多、10或更多、15或更多、20或更多、30或更多、40或更多(例如,48或更多、或50或更多次测定。测定可以相同或不同。在某些实施例中,可以并行处理多达12种不同的目标测定。可以进行任何感兴趣的测定。在某些方面,该系统进行测定以检测样品中微生物核酸的存在或不存在。例如,该系统可以包括用于进行实时PCR分析的测定试剂,以确定样品中细菌核酸、病毒核酸、酵母核酸等的存在或不存在。在某些方面,该系统包括用于测试来自下列的一种或多种的核酸的存在或不存在的试剂:人免疫缺陷病毒(HIV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、沙眼衣原体(CT)、淋病奈瑟氏球菌(NG)、人乳头瘤病毒(HPV)、巨细胞病毒(CMV)、爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、多瘤病毒BK(BKV)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、艰难梭菌(C.Diff.)、耐万古霉素肠球菌(VRE)、腺病毒、结核分枝杆菌(TB)、水痘带状疱疹病毒(VZV)、单纯疱疹病毒(HSV)、约翰坎宁安病毒(JCV)、肠道病毒、淋巴肉芽肿(LGV)、呼吸道病毒组(RVP)病毒、人疱疹病毒6(HHV6)、阴道毛滴虫、生殖支原体、诺罗病毒和寨卡病毒。
根据某些方面,本公开的系统包括样品装载区域和样品制备(SP)盒装载区域,所述样品装载区域包括两个或更多个样品装载位置,所述样品制备(SP)盒装载区域包括两个或更多个SP盒装载位置。“装载区域”是指装载物体并且可选地(全部或部分)移除的区域。例如,样品装载区域包括可以装载和移除样品的区域。本公开的系统还可包括SP盒散装试剂加注站(其包括两个或更多个SP盒加注位置)、机器人移液器、SP盒样品加注站(其包括两个或更多个SP盒样品加注位置)、样品制备站(其包括两个或多个SP盒样品制备位置)、包含两个或更多样品分析单元的样品分析站、以及与仪器和外部系统连接的样品分析系统控制中心(SCC)。
图1示出了根据本公开的一个实施例的自动分析系统的外部视图。在该实例中,系统100是自动化核酸制备和分析系统,其包括样品装载区域102、移液管尖端装载区域104、辅助试剂装载区域106、测定试剂板装载区域108、样品处理(SP)盒装载区域110、散装流体存储区域112和固体废物存储区域114。辅助试剂可包括磁性颗粒、洗脱缓冲液和/或类似物,其可用于例如在系统的样品制备站分离、纯化和洗脱核酸。该系统包括本地用户界面(LUI)116。LUI 116包括用于向操作员显示图形用户界面的触摸屏显示器。显示器可以使操作者能够在本地查看患者结果,评估仪器的状态等。图1没有显示系统的内部部件,包括样品加注站、样品制备站、样品分析站和其他内部系统部件。
图2示出了根据本公开的一个实施例的自动分析系统的外部视图。在该实例中,系统200是自动化核酸制备和分析系统,其包括样品装载区域202、移液管尖端装载区域204、辅助试剂装载区域206、测定试剂板装载区域208、SP盒装载区域210、反应容器废物存储区域212、散装流体存储区域214和固体废物存储区域216。如图2所示,每个装载或存储区域包括搁架或抽屉,以便于系统的操作者装载和/或移除相关物品,其中图2中系统200的搁架或抽屉被示出处于打开位置。在该实例中,样品存在于管中并且装载到系统中,在样品管架中,其包括样品管架203。在移液管尖端装载区域204中示出了由系统的机器人移液器使用的移液管尖端205。辅助试剂包,包括辅助试剂包207,显示在辅助试剂装载区域206中。测定试剂板,包括测定试剂板209,显示在测定试剂板装载区域208中。包括SP盒211的SP盒显示在SP盒装载区域210中。散装流体(散装试剂)容器,包括散装流体容器215,显示在散装流体存储区域214中。图2中未示出系统的内部组件,包括样品加注站、样品制备站、样品分析站和其他内部系统组件。
现在将更详细地描述可以存在于本公开的系统中并且可以用于执行本公开的方法的各种区域和站。
样品装载区域
如上概述,本公开的自动分析系统包括样品装载区域。样品装载区域可包括两个或更多个样品装载位置。根据某些实施例,装载到系统中的样品存在于样品管中。样品管可以单独装载到系统中,或者可以与样品管架内的其他样品管一起装载。当采用样品管架时,两个或更多个样品装载位置可以是装载所述架的两个或更多个通道。例如,样品管装载区域可包括具有两个或更多个通道的平台,使用者将样品管架置于通道中。通道可以通过通道分隔器分开。通道数量可以变化。在某些方面,装载区域包括2至20个通道,例如5至15个通道(例如,12个通道)。
根据某些实施例,样品装载区域包括装载搁架,其在闭合/向上(不可用)和打开/向下(可用)装载位置之间枢转。图3所示是样品装载区域302,其中装载搁架304处于打开/向下(可用)装载位置。样品管架306存在于装载搁架304的通道中。
图4A所示是样品装载区域402,其中装载搁架404处于打开/向下(可用)装载位置。三个样品管架存在于装载搁架404的相应通道中。在该实例中,系统包括分离的样品架搁架406,当样品进入实验室时,操作员可以将其装载远离系统。一旦将所需数量的架装载到搁架406上,就可以在单个运动中将架从搁架406装载到系统的样品装载区域402。图4B示出了在单个运动中从搁架传送多个架到样品引入区域之后的这种搁架以及所述样品引入区域。该功能可用于例如在一个平台上合并高体积和低体积样品。
根据某些实施例,样品装载区域包括与每个通道对齐的通道指示灯,以向操作员指示包括通道/处理状态、通道可用性等的信息。图4A中显示通道指示灯,例如通道指示灯408,其位于它们各自的通道上方,以指示通道的处理状态/可用性。
在某些方面,样品装载区域包括样品管识别码读取器。样品管识别码读取器可以是样品管条形码读取器。识别码可以变化,并且在某些方面是一维码、二维码(例如,QR码)等。包括样品管识别码读取器的样品装载区域在图5中示出。示出了处于向下/打开(可用)位置的样品架搁架502、内部样品架区域504和设置在样品架搁架502和内部样品架区域504之间的面板506。在该实例中,由操作员放置在样品架搁架502上的样品管架由系统从样品架搁架502运输到内部样品架区域504。在确定将特定样品管架从样品架搁架运输到内部样品架区域后,系统将样品管识别码读取器(这里是条形码读取器摄像机508)移动到与样品管架行进相邻的位置,并且随着样品管架从样品架搁架行进到内部样品架区域,条形码读取器摄像机508连续读取存在于样品管架中的样品管上存在的条形码。摄像机还可识别系统可用的独特的架和管特性,以防止潜在的使用者错误。
这样,根据某些实施例,本公开的方法可以包括在样品管架被装载到系统中后读取样品架和样品管上存在的样品识别信息(例如,样品条形码)。
在某些方面,样品装载区域包括样品管架识别码读取器。例如,样品装载区域可包括设置在装载区域的样品管架区域附近的一个或多个摄像机,用于读取存在于架上的条形码。
根据某些实施例,样品装载区域包括检测系统,用于检测样品装载区域的通道(例如,外部和/或内部通道)内的架的存在和/或位置。检测系统可以包括设置在样品装载区域的前部和/或后部的位置传感器,用于检测架是否被部分插入、完全插入或在完成样品分析后已经被系统弹出。根据某些实施例,当架完全插入通道时,架通过固定机构固定就位。例如,可以通过存在于通道表面上的锁定肋将架固定就位,该锁定肋与存在于架下侧的凹口配接。在完全插入时可逆地固定架阻止使用者移除进行中的架,同时仍然允许在例如系统断电的情况下移除。
在某些方面,系统的样品装载区域适于从不同的自动化系统自动接收样品。例如,该系统可以用作单独的自动化样品制备和分析系统,或者与一个或多个其他系统(例如,一个或多个其他自动化样品制备和分析系统)集成(例如,配置在工作单元中)。工作单元可以适于在工作单元的各个系统之间自动运输样品管(例如,存在于样品管架中)。例如,包括存在于第一系统中的一个或多个样品管的架可以被运输到工作单元的不同系统,例如,以平衡系统之间的工作负荷。对于工作单元的系统之间的样品管运输,每个系统可包括内部样品管(或样品管架)传送系统,其包括传送带。系统可以定位成使得相邻系统的内部传送系统的传送带对齐,允许在系统之间输送管架。在美国专利申请序列号62/269,535中描述了关于用于在系统/模块之间运输容器的内部样品管(或样品管架)传送系统的细节,其公开内容通过引用整体并入本文。
移液管尖端装载区域
本公开的自动化样品分析系统可包括移液管尖端装载区域。在某些方面,移液管尖端装载区域包括一个或多个(例如,2个)移液管尖端抽屉,每个抽屉具有用于两个或更多个移液管尖端架的位置,以便于将尖端架装载到系统中。根据某些实施例,可以从系统中完全移除一个或多个抽屉,以使得能够在远离系统的位置处装载尖端架,例如,在临床诊断实验室或设施内的不同区域。
根据一个实施例的移液管尖端装载区域在图6中示出。示出的是移液管尖端装载区域600,其包括两个移液管尖端架抽屉602和604以及内部移液管尖端架抽屉容器606。面板608分离移液管尖端装载区域600的外部和内部部分。在该实例中,每个移液管尖端架抽屉包括用于5个移液管尖端架的位置。图6的右边显示的是移液管尖端架抽屉602,其包括移液管尖端架610-618,其中抽屉602已从自动化样品分析系统中完全移除。
图7示出了根据一个实施例的移液管尖端架抽屉。尖端架抽屉702具有5个移液管尖端架的位置。抽屉包括在5个位置中的每个位置处的侧开口,以使得能够将尖端架侧向装载到位置中。在将尖端架装载到抽屉中时,尖端架的侧向装载可以减少尖端从尖端架移位的发生,当从顶部装载尖端架时,该位移发生在可观的水平,例如,这是由于当从上方装载时不精确放置尖端架进入抽屉中的打开位置。在图7中,尖端架抽屉702的5个尖端架位置中的4个被占用,并且最右侧的打开位置可以通过在该位置的一侧上缺少壁而能够从上方或从侧面装载。
辅助试剂装载区域
在某些方面,本公开的自动化样品分析系统包括辅助(或辅助性)试剂装载区域。辅助试剂可包括例如用于在样品制备站捕获核酸的磁性颗粒,用于在样品制备站处洗脱纯化的核酸的洗脱缓冲液,和/或类似物。
根据某些实施例,辅助试剂装载区域包括一个或多个抽屉,各个辅助试剂管或一组联动的辅助试剂管装载到所述抽屉中。图8是根据一个实施例的示例性辅助试剂装载区域的图示。辅助试剂装载区域包括抽屉802和804。在该实例中,每个抽屉具有6个辅助试剂管的位置。关于抽屉802,存在6个辅助试剂管,包括辅助试剂管806。在装载和关闭一个或多个辅助试剂装载抽屉后,系统已装载了辅助试剂。
在某些方面,当一个或多个辅助试剂管包括磁性颗粒时,辅助试剂装载区域包括混合马达以混合磁性颗粒,从而将颗粒保持在悬浮状态,以便通过系统的移液器机器人进行一致的抽吸。图8显示混合马达808,用于将磁性颗粒保持在插入到具有马达的位置的辅助试剂管内的悬浮状态。混合马达可以通过沿逆时针和顺时针方向交替旋转辅助试剂管来工作。
根据某些实施例,操作者以辅助试剂包的形式将辅助试剂管装载到系统中。图9显示根据一个实施例的辅助试剂包保持器。在该实例中,试剂包保持器902设计成与3个辅助试剂管的顶部(例如,盖)配接,使得操作者可以在单个运动中将3个辅助试剂管引入辅助试剂装载区域。包保持器902包括允许进入辅助试剂管顶部的开口,使得能够通过系统的移液器机器人抽吸管的内容物。辅助试剂包的管内的试剂类型可以变化,并且可以由系统的操作者选择。
测定试剂装载区域
在某些方面,本公开的自动化样品分析系统包括测定试剂装载区域。测定试剂包括在样品制备后与样品组合并且是系统进行所需测定所必需的那些试剂。
根据某些实施例,样品分析站执行基于核酸扩增的测定(例如,样品分析站可以包括进行实时PCR和检测的单元),并且测定试剂包括选自以下的一种或多种核酸扩增试剂:对目标靶特异性的扩增引物(例如,标记的扩增引物)、热稳定聚合酶、聚合酶的辅因子(例如,Mg2+)、适合于该测定的缓冲液和/或类似物。试剂可以液体或非液体形式装载到系统中。在某些方面,将装载到系统中的试剂冻干。冻干试剂具有储存稳定的优点,使得装载到系统中的冻干试剂可长时间稳定,例如30天或更长时间。
测定试剂可以在各个管中装载到系统中。在其他方面,将包含测定试剂的一个或多个板装载到系统中。板可以是任何所需的形式(48孔、96孔、384孔等)。板可以在板的每个孔中包括相同的测定试剂,或者板中的测定试剂可以从孔到孔有变化。
在某些方面,该系统进行测定以检测样品中微生物核酸的存在或不存在,使得该系统可包括用于进行实时PCR分析的测定试剂以确定样品中存在或不存在细菌核酸核酸、病毒核酸、酵母核酸和/或类似物。装载到系统中的测定试剂板可包括液体或冻干试剂,其包括用于扩增和检测选自以下的一种或多种微生物靶的扩增引物:人免疫缺陷病毒(HIV)、丙型肝炎病毒(HCV)、乙型肝炎病毒(HBV)、沙眼衣原体(CT)、淋病奈瑟氏球菌(NG)、人乳头瘤病毒(HPV)、巨细胞病毒(CMV)、爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、多瘤病毒BK(BKV)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、艰难梭菌(C.Diff.)、耐万古霉素肠球菌(VRE)、腺病毒、结核分枝杆菌(TB)、水痘带状疱疹病毒(VZV)、单纯疱疹病毒(HSV)、约翰坎宁安病毒(JCV)、肠道病毒、淋巴肉芽肿(LGV)、呼吸道病毒组(RVP)病毒、人疱疹病毒6(HHV6)、阴道毛滴虫、生殖支原体、诺罗病毒和寨卡病毒。
可以使用一种或多种测定板载体将测定板装载到系统中。测定板载体可包括单个测定板位置,或两个或更多个测定板位置。当两个或更多个测定板存在于测定板载体中时,每个测定板中的试剂可以是相同的,或者不同测定板之间的试剂可以是不同的。例如,载体中的每个板可以包括相同的测定试剂(即,用于进行相同的测试,例如HIV),或载体中的板可以包括与载体中不同板中的那些不同的测定试剂。根据某些实施例,该系统包括具有测定板的测定板载体,使得5或更多、10或更多、20或更多(例如,24或更多)、30或更多、40或更多(例如,48或更多)、或者50或更多种不同的测定可以在系统中并行运行。
根据一个实施例的测定试剂装载区域的外部视图在图10和图11中示出。在该实例中,测定试剂装载区域1000包括11个测定板载体,其包括测定试剂板载体1002。图11显示了从系统中移出并装载有测定试剂板的测定试剂板载体1002。在该实例中,载体保持两个测定试剂板,其包括用于实时核酸扩增和检测的冻干试剂。两个板可以包括相同的测定试剂,或者两个板可以关于它们包含的特定测定试剂彼此不同。在该实例中,将测定试剂装载到系统中包括将测定试剂板载体装载测定板并将载体插入11个位置中的可用位置。
图12中示出了根据本公开的实施例的测定试剂装载区域。如所示,测定试剂装载区域1202包括具有槽的面板1204,用于将测定试剂板载体(其包括测定试剂板载体1206)装载到系统中。如右图所示,在该实例中,板载体具有5个用于测定试剂板的位置,每个板具有6×16形式的96个孔。
在一些实施例中,在包括干燥剂材料的密封封装(例如,气密密封或基本上气密密封的封装)中提供测定试剂板。干燥剂材料可以提供在测定试剂板封装内的包中。在一些实施例中,干燥剂材料包的大小使得测定试剂板的一个或多个孔的底部可以搁置在干燥剂材料包上。在测定试剂板封装内,干燥剂材料包可以提供在测定试剂板的下方、顶部等处。在某些方面,将测定试剂板引入测定试剂板载体包括从测定试剂板封装中取出测定试剂板和干燥剂包,将干燥剂包放入测定试剂板载体中,然后放置测定试剂板可能会高于干燥剂包。这种干燥剂包及其配置增加了系统可用于进行测定的测定试剂的时间长度。在某些方面,与不存在干燥剂包时的试剂的使用寿命相比,干燥剂包将试剂的使用寿命增加5天或更多天,例如6天或更多天、7天或更多天、8天或更多天、9天或更多天、10天或更多天、11天或更多天、12天或更多天、13天或更多天、14天或更多天、或15天或更多天。因此,当提供这样的干燥剂时,改善了测定试剂的“机载”稳定性。
图48显示了存在于测定试剂板载体4802的各个测定试剂板位置中的两个测定试剂板4804和4806。在每个测定试剂板下面是干燥剂包(未示出),以增加系统可用于进行测定的测定试剂的时间长度。载体可以包括凹口,该凹口的尺寸适于接收其各自的测定试剂板搁置在其上方(例如,在其上)的干燥剂包。例如,图49显示凹口4807的尺寸设计成接收干燥剂包4808,当放置在测定试剂板载体4802的各自的测定试剂板位置时,测试试剂板4806搁置在干燥剂包4808上方(例如,在其上)。图50显示了测定试剂板载体4802的横截面视图,其具有尺寸适于接收干燥剂包4808的凹口,当放置在载体的各自的测定试剂板位置时,测试试剂板4806搁置在干燥剂包4808上方(例如,在其上)。
样品处理(SP)盒装载区域
本公开的自动样品分析系统可采用样品处理(SP)盒以促进样品处理,并因此可包括SP盒装载区域。
根据一个实施例的SP盒装载区域在图13中示出。示出的是SP盒装载区域1300,其包括门1302和1304,门1302和1304使操作者能够进入装载区域的内部部分。在该实例中,内部部分分别包括门1302和1304后面的SP盒存储单元1306和1308。在某些方面,每个存储单元包括一个或多个SP盒升降机。例如,如图13所示,SP盒存储单元1306和1308每个包括两个SP盒升降机(参见存储单元1306的升降机1310和1312)。升降机适于利用堆叠底部的向上的力在堆叠的顶部释放SP盒,一次释放一个SP盒。图14示出了图13的SP盒装载区域,其中门打开并且SP盒存储单元朝向系统的前部,以便于系统的操作者装载SP盒堆叠。图15示出了存在于套筒中的SP盒的单个堆叠。在某些方面,操作者移除套筒拉片以将SP盒堆叠暴露于升降机。堆叠/套筒中的SP盒的数量可以变化。在某些方面,每个堆叠/套筒具有10至30个SP盒,例如20个SP盒。
图16图解根据一个实施例的SP盒装载区域,其中SP盒套筒1604正被装载到SP盒存储单元1606的可用位置(左图),以及其中SP盒套筒1604已被装载到SP盒存储单元1606的位置(右图)。
图17示出了根据本公开的一个实施例的SP盒。在该实例中,SP盒1700具有孔的4个通道(通道1702-1708),其中每个通道可以处理一个样品。
图18中示出了类似的4通道SP盒。在该实例中,SP盒1800包括可移除的反应容器(RV)1802、可移除的RV盖1804和可移除的柱塞(1806)(上图)。如下面将更详细描述的,柱塞可用于其中样品制备涉及基于磁性颗粒的核酸捕获的实施例中。下图示出了SP盒1800的侧视图。示出的是孔1808-1822。在该特定实施例中:孔1808是洗脱孔;孔1810是辅助孔,可用于保持水以再水化冻干测定试剂;孔1812-1816是具有洗涤溶液的洗涤孔,在其中洗涤存在于磁性颗粒上的核酸;孔1818是裂解孔,其具有裂解溶液,用于裂解样品中的细胞以释放其中的核酸;孔1820是预处理孔,其可包括含有蛋白酶的溶液,用于在裂解前预处理样品;并且孔1822的尺寸适于容纳在样品制备过程中已经使用过的柱塞。
根据某些实施例,本公开的系统和方法包括并使用律师案卷号ADDV-055PRV中描述的任何SP盒,其公开内容通过引用整体并入本文。
图19示出了根据一个实施例的SP盒升降机的某些部件。SP盒升降机1900包括SP盒升降起1902,其由马达1906驱动沿着轨道1904移动。当升降器1902沿着轨道1904向上移动时,升降器在SP盒堆叠(未示出)的底部上施加向上的力,以将堆叠顶部的SP盒(这里是SP盒1908)呈现给系统的机器人SP盒处理器,用于随后转移到系统内的一个或多个加注站。
图20示出了根据一个实施例的SP盒装载区域。SP盒装载区域2000包括两个SP盒式升降机。在每个升降机的顶部是对准漏斗,例如对准漏斗2002。如图21所示,对准漏斗可包括防升弹簧2004和SP盒漏斗2006。随着升降器在SP盒堆叠的底部施加向上的力,漏斗2006将SP盒漏向防升弹簧2004,该力被防升弹簧抵抗至阈值。当SP盒被向上推并超过防升弹簧时,堆叠的顶部SP盒被呈现(可用)在合适的对准位置,以便由系统的机器人SP盒处理器接合和运输。
本公开的SP盒升降机可包括用于感测升降机顶部处的SP盒的存在的传感器。例如,图20中的顶部SP盒存在传感器2008是能够确定在升降机的顶部位置处是否存在SP盒的光学传感器。当在顶部位置未检测到SP盒时,系统能够指示机器人SP处理器开始从不同的SP盒升降机中检索SP盒。该系统还能够通知操作员应该重新装载SP升降机。
散装流体存储区域
根据某些实施例,本公开的自动化样品分析系统包括散装流体(或“散装试剂”)存储区域。散装试剂是通常使用的试剂,其可以用泵和喷嘴分配到目标容器(例如,SP盒)中,并且不需要特殊操作,例如,容器内容物的重新悬浮。在某些方面,散装流体/试剂包括裂解缓冲液、醇(例如乙醇)、核酸洗涤溶液、分子级水、蒸气阻挡试剂和/或类似物。
在某些方面,将散装试剂储存在散装流体存储区域中的瓶子中。散装试剂瓶的大小可以包含所需体积的散装试剂。例如,瓶子的尺寸可以设定为含有500ml至1.5L(例如1L)的散装流体。
根据某些实施例,在包括带键盖的瓶子中提供一种或多种散装试剂。带键盖可包括具有至少一个环形环凸起的键控元件。一个或多个环形环提供环和由环限定的空间的特定结构。由一个或多个环形环形成的特定结构用作“键”,其需要在散装试剂存储区域中的接收设备上的相应结构,以使得能够接收盖上的键控元件。例如,接收设备上的相应键控元件的形状和尺寸将适当地对准并接收带键盖的一个或多个环形环。例如,接收设备上的键控元件可包括一个或多个环形槽或孔,其适当地定位成与带键盖上的一个或多个环形环对准。此外,接收设备上的键控元件可以包括一个或多个环形环,所述环形环适当地定位成与带键盖上的键控元件上的一个或多个空间对准,所述空间由带键盖上的一个或多个环形环限定。关于可用于本公开系统的散装试剂瓶和散装试剂存储区域的带键盖的进一步细节可以在美国专利申请公开号2014/0263316中找到。
根据一个实施例的散装试剂存储区域在图22中示出。在该实例中,散装试剂存储区域2200是具有前盖2202和用于存储容纳在瓶子(例如,瓶子2204和2206)内的散装试剂的内部存储区域的抽屉。该实例中还包括固体废物斜槽2208和固体废物容器2210。该系统可以适于通过固体废物斜槽将用过的移液管尖端、用过的反应容器等处理到固体废物容器中。在该实例中,散装试剂存储区域包括流体接口2212,其与散装流体分配站连接(例如,通过软管),该分散站将散装流体分配到SP盒的适当孔中。
图23显示了根据一个实施例的散装试剂存储区域。这里示出的是散装试剂存储区域2300,其是具有内部隔室的抽屉,用于以反向方向装载/存储散装试剂瓶。在该实例中,抽屉具有四个位置,每个位置设计成与具有如上所述的带键盖(未示出)的散装试剂瓶特别配接。带键盖减少了人为错误的机会。例如,由于裂解缓冲液瓶的带键盖与洗涤缓冲液槽的盖接收部分之间缺乏互补性,裂解缓冲液不能装载到洗涤缓冲液槽中。
散装试剂存储区域可包括与一个或多个散装试剂瓶流体连通的一个或多个贮存器。例如,当将散装试剂瓶装入散装试剂存储区域时,瓶子的液体内容物可以排空到贮存器中,使得系统的操作者在连续操作系统期间的任何方便时间能够移除瓶子(并且如果需要用新的(填充的)试剂瓶更换瓶子)。
SP盒传输和SP盒加注站
在某些方面,本公开的系统在存在于样品制备站的一个或多个位置处的SP盒中进行样品制备。SP盒可以被运输并放置在样品制备站的位置,该位置已经填充了样品制备过程所需的试剂和样品。
可以采用在样品制备之前填充SP盒的任何合适方法。根据某些实施例,SP盒经受SP盒工作流程,如图24所示。在该实例中,通过机器人SP盒处理器(未示出)从SP盒装载区域(图24中标记为“1”)的SP盒升降机的顶部拾取SP盒,并由处理器运输至SP盒散装试剂加注站(图24中标记为“2”)的两个或多个位置之一。在SP盒散装试剂加注站将散装试剂分配到SP盒的适当孔中后,机器人SP盒处理器将SP盒运送到SP盒样品加注站的两个或多个位置中的一个(图24中标记为“3”)。在SP盒样品加注站将样品(以及可选的其他试剂)分配到SP盒的适当孔中后,机器人SP盒处理器将SP盒运送到样品制备站的两个或多个位置之一(图24中标记为“4”),其中发生样品制备(例如,核酸分离和纯化)。该系统可以包括SP盒废物机器人,其在样品处理完成后,拾取SP盒S和丢弃使用过的SP盒在SP盒废物容器中。
本公开的机器人SP盒处理器可以具有多种功能,包括从SP盒装载区域处的升降机、散装加注站、样品加注站和样品处理站取回SP盒。机器人SP盒处理器还可以用于将SP盒分配到:散装加注站、样品加注站、样品处理站和废物机器人5。机器人SP盒处理器可以设计成允许机器人移液装置在相邻的样品制备单元中工作而不受干扰,向系统提供指示其是否具有SPU盒的信息,确定在任何位置SPU盒的存在或不存在,等等。
图25中示出了根据本公开的一个实施例的机器人SP盒处理器。机器人SP盒处理器2500能够在X、Y和Z方向上移动。双连杆臂2502允许在Y轴上移动。沿着轨道2504和2506的移动分别使得能够在Z轴和X轴上移动。SP盒处理器2500包括用于夹持SP盒2510的SP盒夹持器2508。
图26中示出了机器人SP盒处理器的SP盒夹持器的更详细视图。SP盒夹持器2600包括两个被动指状物(其包括被动指状物2602),其通过向下移动然后向前插入到SP盒2606的相应槽(其包括槽2604)中以使被动指状物与盒接合。然后,弯曲/抓握两个主动指状物(其包括主动指状物2608),以将主动指状物插入SP盒2606的相应槽(其包括槽2610)中。为了完成抓握,主动指状物被驱动朝向被动指状物。图26的下图显示SP盒夹持器2600和SP盒2606的侧视图,其中被动指状物2602和主动指状物2608被插入SP盒2606的相应槽中,用于夹持盒以使得能够拾取并将SP盒运送到系统内的期望位置。可以通过取下主动指状物并从SP盒的相应插槽中移除主动和被动指状物来执行将SP盒释放到系统内的期望位置。机器人SP盒处理器可包括一个或多个光学传感器,用于例如原始位置、盒存在和/或类似物。
当系统包括散装试剂加注站时,这种加注站包括一个或多个(例如,2个或更多个)SP盒散装试剂加注位置。散装试剂加注站与散装试剂存储区域流体连通,并将在样品制备过程中使用的SP盒散装试剂分配到适当孔中,例如分子级水、乙醇、裂解试剂、洗涤试剂、蒸汽屏障液体(例如油)和/或类似物中的一种或多种。
根据一个实施例的散装剂试剂加注站在图27中示出。在该实例中,散装试剂加注站2700包括两个SP盒散装试剂加注位置。图27显示SP盒2702和2704。该站包括散装试剂分配头2706,其可以沿着轨道2708行进,以便定位以将散装试剂分配到SP盒的适当孔中。该站包括光学传感器2710和2712,用于检测该站处SP盒的存在和/或位置。
系统可包括SP盒样品加注站。这样的站可以包括一个或多个(例如,2个或更多个)SP盒样品加注位置。对于样品加注,机器人移液器从样品装载区域内部存在的样品管中吸取样品,将样品输送到样品加注站,并将样品分配到存在于样品加注站的一个或多个SP盒样品加注位置处的SP盒的相应孔中。
根据某些方面,本公开的方法包括将SP盒从SP盒装载区域运送到SP盒散装试剂加注站的两个或更多个位置中的一个位置。在某些方面,该方法包括将SP盒从SP盒散装试剂加注站运输到SP盒样品加注站的两个或更多个位置中的一个。该方法可以包括将SP盒从SP盒样品加注站运输到样品制备站的两个或更多个样品制备位置中的一个。任何(例如,每个)上述运输步骤可以由机器人SP盒处理器执行。
样品制备站
本公开的自动分析系统包括样品制备站。样品制备可包括一个或多个(例如,2个或更多个)SP盒样品制备位置。通过机器人SP盒处理器将SP盒运送到一个或多个SP盒样品制备位置。运送到样品制备位置的SP盒包括样品,并且还可包括样品制备过程所需的大多数(如果不是全部)试剂。
根据某些实施例,样品制备站使用的SP盒与图18中所示的SP盒相似或相同。也就是说,SP盒可以是四通道盒,其容纳处理患者样品以纯化核酸所需的试剂。另外,对于每个纯化的样品,盒存储混合柱塞、反应容器(RV)和RV盖。在某些方面,RV和RV盖如律师案卷号ADDV-056PRV中所述,其公开内容通过引用整体并入本文。盒设计成与站的样品处理位置配接,该站具有使用混合柱塞所需的硬件并使用磁性颗粒操作从样品中纯化核酸。柱塞、RV和RV盖的机载存储允许例如使用单个机器人运动同时递送提取核酸和进行扩增和检测所需的所有材料至样品制备站。
柱塞可具有几乎完全填充所有孔的底部部分的体积的形状。这迫使孔中的流体上下驱动,其范围足够大以充分混合试剂。柱塞的尖端可以是带凹槽的,以便提供足够的空间以确保当混合期间柱塞浸没在液体中时流体可以容易地向上流动。根据某些实施例,柱塞是如律师案卷号ADDV-059PRV中所述的柱塞,其公开内容通过引用整体并入本文。
样品制备站可包括一个或多个样品制备(SP)模块。根据一个实施例的SP模块在图28中示出。如所示,SP模块2800包括三个SP盒样品制备位置,其中两个在图28中由SP盒2802和2804占据。SP模块2800执行提取核酸所需的机械运动。SP模块2800具有将混合柱塞从盒中拉出并将其沿着SP盒移动到不同的孔以混合试剂的特征。使用连接到垂直平移柱塞杆的柱塞进行混合。SP模块2800还具有两个可独立控制和可移动的加热器。第一加热器用于加热预处理和裂解孔中的试剂。第二加热器用于加热洗脱液中的流体。两个加热器可以在各自的孔中混合期间接合。
SP模块2800通过将磁铁插入柱塞中而将磁性微粒从一个孔移动到另一个孔,该柱塞将颗粒吸引到柱塞的外壁。一旦颗粒磁性附着在柱塞上,它就会移动到下一个孔中。通过从柱塞内部移除磁体释放颗粒。通过SP模块2800的柱塞垂直运动导致孔中的混合。
图29中示出图28中所示SP模块的侧视图。图29顶部示出3组4个磁体2902、3组4个柱塞2904以及3组用于保持柱塞的SP盒的4个SP盒孔2906。图29的底部示出位于其最下方位置的元件,其中磁体和柱塞塌缩在SP盒的孔中。
图30中示出图28中所示SP模块的另一视图。在该实例中,柱塞附接到每个柱塞杆(未示出),并且每个磁体插入柱塞中。在下降到包括其上附着有核酸的磁性颗粒的孔中时,磁性颗粒将附着到柱塞的外壁,使得颗粒能够从孔到孔移动以进行洗涤,并最终从颗粒中洗脱核酸。
在某些方面,与移液相反,使用磁性颗粒移动目标材料(例如,核酸)具有减少或消除样品处理/提取期间的飞溅/交叉污染机会的益处(图51)。
机器人移液器
本公开的自动分析系统包括机器人移液器。机器人移液器能够进入移液所需的系统位置,以完成样品制备和处理,以及RV封盖和运输。
机器人移液器与例如以下相互作用:在移液管尖端装载区域的内部位置处的移液管尖端;样品装载区内部位置的样品管,辅助试剂装载区内部位置存在的辅助试剂,样品制备站,测定试剂(例如,测定试剂装载区内部位置存在的冻干分析试剂),移液管尖端和/或RV废物位置,以及样品分析站。移液器能够执行例如将样品和试剂转移到SP盒的预处理或裂解孔中;将预处理样品从预处理孔转移到裂解孔中;进入洗脱液孔、辅助孔和柱塞处置位置;进入SP盒上的RV盖;用洗脱液和试剂填充RV;进入SP盒上装满的RV;以及进入分析站的RV孔。
在某些方面,机器人移液器具有与SP盒的通道相同数量的移液筒。例如,当SP盒具有4个通道(即,4通道SP盒)时,机器人移液器可具有4个移液筒,使得机器人移液器可以同时从SP盒的每个通道/沟道的相应孔吸取和/或分配试剂、样品、纯化的核酸,和/或类似物。
图31中示出了根据一个实施例的分析系统的背景下的机器人移液器。自动样品分析系统3100包括样品装载区域3102、移液管尖端装载区域3104、辅助试剂装载区域3106、测定试剂托盘装载区域3108、四个样品制备单元(例如,样品制备单元3110)和四个样品分析单元,例如,样品分析单元3112。机器人移液器3114可在X、Y和Z轴上移动(例如,经由驱动/伺服马达组件)以与上述系统区域/站中的每一个相互作用。能够使机器人移液器在各个轴上移动的部件在
图32中进一步详细示出。图33中示出了根据一个实施例的机器人移液器的放大视图。在该实例中,机器人移液器3300具有4个筒/沟道。筒/沟道3302附接到移液管尖端3304。
图34中提供了在移液管尖端装载区域处具有筒3402和3404的机器人移液器3400的图示。示出了支撑两个相应的移液管尖端(尖端3406和3408)的筒3402和3404。
图35示出了根据一个实施例的由机器人移液器从样品管架中存在的样品管抽吸样品。示出了移液管尖端3502从存在于样品管架3506中的样品管3504抽吸样品。
图36中提供了一个图示,其示出了根据一个实施例的由机器人移液器在样品制备站的样品制备单元的样品制备位置处将样品分配到SP盒的孔中。在位置3602处出现的是4通道SP盒3604。机器人移液器3606具有四个筒和相关的移液管尖端,并将样品分配到4通道SP盒3604的相应孔中。
图37中提供了根据一个实施例的由机器人移液器在辅助试剂装载区域抽吸辅助试剂的图示。示出了附接到机器人移液器(未示出)的移液管尖端3702,其从存在于自动化样品分析系统的辅助试剂装载区域处的洗脱缓冲液管3704吸出洗脱缓冲液。
图38示出了在样品制备单元处拾取存在于SP盒中的反应容器(RV)帽的机器人移液器的图示。示出了附接到RV盖3806和3808的机器人移液器的移液器筒3802和3804,以准备盖住存在于SP盒的相邻位置处的RV。
图39中提供了根据一个实施例的机器人移液器对具有RV盖的RV封盖的图示。在该实例中,移液器具有四个筒,每个将RV盖推入样品制备单元的SP盒中的相应RV中。
图40显示了通过机器人移液器将加盖的RV从SP盒运送到样品分析单元的RV孔。4个移液器筒的远端与加盖的RV的RV盖配接,使得能够通过机器人移液器运输加盖的RV。图40显示了由机器人移液器将加盖的RV放置到样品分析单元的RV孔中。图41显示了在机器人移液器的筒释放加盖的RV的RV盖之后,样品分析单元的各自RV孔中的加盖的RV。
根据某些实施例,机器人移液器可包括用于捕获系统的图像以用于局部分析以及用于维护、执行、自动校正等目的的远程分析的摄像机。在一些实施例中,摄像机还可用于读取存在于测定板和辅助瓶上的条形码。它还可用于识别消耗品特征,例如尖端类型。
根据某些实施例,机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域的样品管吸取样品,并将样品分配到SP盒的第一孔中。在某些方面,机器人移液器从SP盒的第二孔抽吸纯化的样品,并将纯化的样品分配到测定试剂孔(例如,测定试剂板的孔)中。测定试剂孔可包括冻干的测定试剂。根据某些实施例,机器人移液器将包含纯化的样品和测定试剂的混合物从测定试剂板转移至反应容器。在某些方面,反应容器存在于SP盒中。根据某些实施例,机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。在某些方面,机器人移液器拾取加盖的反应容器并将加盖的反应容器输送到样品分析站的一个样品分析单元的孔中。
在某些方面,本公开的方法可以包括使用机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域处的样品管吸取样品,并将样品分配到SP盒的第一孔中。根据某些实施例,本公开的方法可以包括使用机器人移液器从SP盒的第二孔抽吸纯化的样品并将纯化的样品分配到测定试剂孔中,例如测定试剂的孔中。测定试剂孔可包括冻干的测定试剂。在某些方面,本公开的方法可以包括使用机器人移液器将包含纯化样品和来自测定试剂孔的测定试剂的混合物转移至反应容器,例如SP盒中存在的反应容器。根据某些实施例,本公开的方法可以包括使用机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。在某些方面,本公开的方法可以包括使用机器人移液器拾取加盖的反应容器并将加盖的反应容器运输到样品分析站的样品分析单元的孔中。
在一些实施例中,机器人移液器包括可用于例如减少或消除交叉污染的特征。例如,在某些方面,机器人移液器具有以下特征中的一个或多个(例如,任何组合):基于空气的移液机构;检测容器中液体液位(例如,样品管、试剂管、SP盒中的液位等)的能力;从液体的上层(例如顶部)吸出的能力,以防止移液管尖端外部的液滴污染;阻止或防止液体粘附在移液器尖端的外面的移液器尖端材料;形成(或“抽吸”)气隙以在移动之前将吸入的液体进一步向上移动移液管尖端,例如以防止在移动期间滴落(例如,从样品管到将被分配吸出的样品的容器));移液器(例如,移液器的一个或多个筒)内的一个或多个压力传感器,用于感测例如移液管尖端中的流体移动(例如,尖端中的意外流体移动);使移液器(例如,带有样品)从不在SP盒上方行进的移动路径。
样品分析站
本公开的自动分析系统包括样品分析站。分析站适于进行一种或多种感兴趣的测定。在某些方面,所述分析站包括执行实时核酸扩增和检测(例如,实时PCR)的一个或多个分析单元。
在实时PCR中,在扩增反应期间的多个时间点测量核酸的量,以确定最初存在于样品中的目标核酸分析物的实际或相对量。实时PCR可以是定量的、半定量的或定性的。实时PCR通常在热循环仪中进行,其具有用至少一个特定波长的光束照射每个扩增样品并检测由激发的荧光团发射的荧光的能力,所述荧光团结合到扩增子中或在扩增期间未猝灭。可以使用非特异性荧光染料(例如,DNA结合染料,例如SYBR Green)或特异性荧光杂交探针。使用不同颜色的标记,荧光探针可用于多重测定,以监测同一管中的几个靶序列。
使用荧光标记探针的一种方法依赖于基于DNA的探针,其一端具有荧光报告基因,而探针另一端具有荧光猝灭剂。报告基因与猝灭剂的紧密接近阻止了其荧光的检测。当与靶序列结合时,Taq聚合酶的5′至3′外切核酸酶活性对探针的分解破坏了报告基因-猝灭剂的接近性,因此允许荧光的未猝灭发射,其可以在用特定波长的光激发后检测。因此,在每个PCR循环中报告基因探针靶向的产物的增加由于探针的破坏和报告基因的释放而导致荧光成比例增加。
根据某些实施例,本公开的自动分析系统的样品分析站包括一个或多个相同或基本相同的分析单元,其适于进行实时核酸扩增和检测。例如,分析站可包括1至10个分析单元,其中每个分析单元具有一个或多个用于热循环和检测的反应容器(RV)孔。在某些方面,本公开的分析系统的样品分析站包括4个样品分析单元。根据某些实施例,四个单元中的每一个具有12个RV孔。因此,在某些实施例中,本公开的自动分析系统能够同时对48个样品进行RT-PCR。可以并行进行的48种测定可以是相同的测定或不同的测定。
根据某些实施例,该系统包括如律师案卷号ADDV-058PRV中所述的实时核酸扩增和检测单元,其公开内容通过引用整体并入本文。
图43中示出了根据一个实施例的样品分析站的样品分析单元的图示。样品分析单元4300包括具有12个RV孔的热循环仪4302。如图所示,在热循环仪的每个孔中存在加盖的RV。图43中显示盖子4306(其可以是或可以不是加热的盖子)处于允许加盖的RV进入RV孔的位置。每个孔具有由检测模块4304允许光学询问用于检测与产生的核酸扩增产物的存在和/或量相关的荧光信号的光学窗口。在该实施例中,检测模块4304扫描经过RV孔的光学窗口以光学地询问每个RV的内容物,以检测其中产生的核酸扩增产物的存在和/或量。图44显示图43的样品分析单元,其中盖4306在热循环期间与加盖的RV的顶部接触。
在某些方面,样品分析单元或其模块包括一个或多个用于容纳任何污染的部件,所述污染例如在热循环期间从反应容器中发出的反应混合物的雾化部分等。在一些实施例中,提供了从样品分析单元抽出空气的一个或多个风扇。在一些实施例中,样品分析单元的每个热循环器单元具有专用风扇,用于将空气从热循环器单元吸走。在某些方面,一个或多个风扇通过护罩封闭(例如,气密地或基本密封地)。护罩可以连接(例如,气密地或基本密封地)到一个或多个管道,该管道将从样品分析单元抽出的空气引导出系统,例如,从位于系统外部的通风口(例如,位于系统的侧面)引出。图47中示出了示例实施例。在该实例中,护罩4702包围风扇(未示出),风扇将空气抽出样品分析单元4700或其模块。护罩连接到管道(未示出),该管道将从样品分析单元抽出的空气引导出系统。
液体和固体废物存储区域
根据某些实施例,本公开的自动分析系统包括一个或多个液体废物存储区域和/或一个或多个固体废物存储区域。
在某些方面,本公开的系统适于将液体废物处置在一个或多个液体废物存储区域处的一个或多个液体废物容器中,其中液体废物可以来自例如用过的SP盒、加注站(例如,溢流、清洗、灌注和吹扫液体)、散装试剂支架溢流和/或类似物。根据某些实施例,系统包括两个液体废物容器,例如两个2升液体废物容器。根据某些实施例,液体废物存储区域存在于系统的抽屉中,如图22所示。也就是说,液体废物存储区域可以存在于抽屉中,抽屉还包括散装试剂存储区域。
该系统可包括一个或多个固体废物存储区域。根据一个实施例,本公开的分析系统包括存在于系统的抽屉中的固体废物存储区域,如图22所示。在那里,用于处理加盖的反应容器(例如,已经经过样品分析)的容器2210、移液管尖端等存在于抽屉中,该抽屉还包括散装试剂存储区域和液体废物存储区域。固体废物可以由系统(例如,通过系统的机器人移液器)释放在槽2208的上部开口上方,槽2208设置在容器2210上方。抽屉和槽可以配置成使得槽仅在抽屉关闭时与容器连通。一种这样的方法在图45中示出,示出了对应于三个不同抽屉位置的三个图。右图示出了当抽屉处于打开位置时槽4500、槽盖板4502、槽盖板手柄4504和抽屉的部分4506。当抽屉处于打开位置时,抽屉的部分4506和槽盖板手柄4504定位成使得槽盖板4502阻挡槽4500的下端,从而防止在门打开时液体废物离开槽的底部。中图示出了抽屉的部分4506向左移动,从而在抽屉被关闭时沿顺时针方向推动槽盖板手柄4504,使得随着抽屉正在关闭槽盖板4502开始移动远离槽4500的下端。左图示出了抽屉的部分4506保持槽盖板手柄4504的位置使得当抽屉处于关闭位置时,槽盖板4502远离槽4500的下端定位。
可以实施其他机构/配置以确保当抽屉关闭时槽仅与容器连通。例如,在某些方面,马达可操作地连接到槽盖板。马达由系统电子装置控制,以定位槽盖板,使得当抽屉关闭时槽与容器连通,而当抽屉打开时,槽不与容器连通。根据一些实施例,当期望访问抽屉的内容物时,系统的使用者可以例如经由用户界面(例如,按钮、触摸屏等)请求这种访问。根据这样的要求,系统电子装置指示马达定位槽盖板,使得槽不再与容器连通。可选地,当做出这样的请求时,系统电子装置指示抽屉上的锁定机构将抽屉从锁定配置切换到解锁配置,例如,在槽盖板手柄定位成使得槽不再与容器连通之后。可以向系统的使用者提供指示器(例如,灯或其特定颜色)以指示可以安全地打开抽屉。
上述机构/配置用作临时存储缓冲器,以允许一个更换窗口,例如,用于更换或清空移液管尖端/RV废物容器,清空或更换液体废物容器,更换散装试剂容器,等等,而不会破坏系统的功能。
在某些方面,本公开的分析系统包括固体废物存储区域,其包括一个或多个固体废物容器,使用过的SP盒安置在其中。图46中示出了这种存储区域的示例,其可以对应于图2的区域216。在该实施例中,固体废物存储区域4600包括两个SP盒废物容器4602和4604,其中设置有使用过的SP盒。可以通过固体(或液体/固体)废物处理模块(例如,液体/固体废物处理模块4606)从样品处理站的样品处理单元移除盒来处理SP盒,所述废物处理模块将SP盒运输至在两个容器中的一个上方的位置,并将SP盒子落入容器中。
本地用户界面
本公开的自动分析系统可以包括本地用户界面(LUI)。在某些方面,LUI包括触摸屏显示器(例如,触摸屏LCD显示器)和用于向客户显示图形用户界面的相关计算机硬件。LUI显示器可以安装在使用者可访问的位置,并且在某些方面,安装在系统的前部,例如,安装在系统的样品引入站上方。
显示器可以使使用者能够在本地查看患者结果并评估仪器的状态。LUI可以能够显示条形码信息,提供样品ID跟踪和输入,显示仪器状态、通道状态、试剂状态、QC状态、故障状况等。
LUI可以连接到其他系统,例如实验室信息系统或中间件。当连接到实验室信息系统或中间件时,操作员可以下载订单到系统控制中心以便在仪器上进行处理。操作员还可以将完成的测试结果传送到实验室信息系统。在某些方面,系统控制中心还可以连接到其他系统以便于远程故障排除和系统更新的分发。
根据本公开的实施例的LUI在图1中示出,其中LUI安装在系统的样品引入站上方。
尽管有所附权利要求,但本公开还由以下条款限定:
1.在自动样品分析系统中连续分析样品的方法,包括:
将样品和样品制备(SP)盒装入系统;
在包含两个或更多SP盒散装试剂加注位置的SP盒散装试剂加注站中给SP盒加注散装试剂;
将样品移液到SP盒样品加注站的SP盒中,所述SP盒样品加注站包括两个或更多个SP盒样品加注位置;
通过在包含两个或更多个SP盒样品制备位置的样品制备站处分离和纯化样品中存在的分析物来制备SP盒中的样品用于分析;
将纯化的分析物与测定试剂合并以形成测定混合物;和
对测定混合物进行分析物检测测定以分析样品,
其中,在不停止系统操作的情况下,系统的操作者可以连续访问系统以补充或去除样品、散装流体、试剂、物件和废物中的一种或任何组合。
2.根据条款1所述的方法,包括执行两种或多种不同分析物检测测定,其中,所述系统提供了对两种或多种不同分析物检测测定的任一种的随机接入。
3.根据条款1或条款2所述的方法,其中装载到系统中的样品存在于样品管中。
4.根据条款3所述的方法,其中所述样品管存在于样品管架中,并且其中装载样品至系统包括装载样品管架到系统中的样品装载站的两个或更多个通道的一个中。
5.根据条款4所述的方法,其中系统包括2至20个样品管架通道。
6.根据条款4或条款5所述的方法,包括当样品管被装载到系统中时读取存在于所述样品管上的样品识别信息。
7.根据条款4至6任一项所述的方法,包括在样品管架装载到系统中后读取存在于所述样品管架上的样品管架识别信息。
8.根据条款1至7中任一项所述的方法,其中所述SP盒被装载到系统的盒装载区域,并且其中所述方法包括从SP盒装载区域输送SP盒至SP盒散装试剂加注站的两个或更多位置中的一个。
9.根据条款8所述的方法,包括从SP盒散装试剂加注站输送SP盒到SP盒样品加注站的两个或更多个位置中的一个。
10.根据条款9所述的方法,包括从SP盒样品加注站输送SP盒至样品制备站的两个或更多个位置中的一个。
11.根据条款8至10中任一项所述的方法,其中所述输送使用机器人SP盒处理器执行。
12.根据条款1至11中任一项所述的方法,其中系统包括移液管尖端存储区域。
13.根据条款12所述的方法,包括使用机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域处的样品管吸取样品,并将样品分配到SP盒的第一孔中。
14.根据条款13所述的方法,包括使用机器人移液器从SP盒的第二孔吸移纯化的样品并将纯化的样品分配到测定试剂孔中。
15.根据条款14所述的方法,其中所述测定试剂孔是测定试剂板的孔。
16.根据条款15所述的方法,其中所述测定试剂孔包括冻干测定试剂。
17.根据条款15或条款16所述的方法,包括使用机器人移液器将包含纯化的样品和测定试剂的混合物从测定试剂板转移至反应容器。
18.根据条款15所述的方法,其中所述反应容器存在于SP盒中。
19.根据条款17或条款18所述的方法,包括使用机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。
20.根据条款19所述的方法,其中系统包括样品分析站,其包括两个或更多个样品分析单元。
21.根据条款20所述的方法,包括使用机器人移液器拾取加盖的反应容器并将加盖的反应容器输送到样品分析站的一个样品分析单元的孔中。
22.根据条款1至21中任一项所述的方法,其中执行分析物检测测定包括执行核酸检测测定。
23.根据条款22所述的方法,其中进行核酸检测测定包括进行实时核酸扩增和检测。
24.根据条款22条或条款23所述的方法,其中在所述SP盒中制备样品用于分析包括分离和纯化样品中存在的核酸。
25.根据条款24所述的方法,其中分离和纯化样品中存在的核酸包括使用磁性颗粒捕捉核酸。
26.根据条款1到25中任一项所述的方法,包括将在系统运行期间产生的液体废物置于液体废物存储区域。
27.根据条款26所述的方法,其中所述液体废物存储区域包括液体废物槽和液体废物容器。
28.根据条款27所述的方法,其中所述液体废物存储区域存在于抽屉中,以及所述液体废物槽仅当抽屉关闭时与所述液体废物容器连通。
29.根据条款1到25中任一项所述的方法,包括将在系统运行期间产生的固体废物置于固体废物存储区域。
30.根据条款29所述的方法,其中所述固体废物存储区域包括两个或更多个固体废物存储容器。
31.自动化样品分析系统,其包括:
样品装载区域,其包括两个或更多个样品装载位置;
样品制备(SP)盒装载区域,其包括两个或更多个SP盒装载位置;
SP盒散装试剂加注站,其包括两个或更多个SP盒加注位置;
机器人移液器;
SP盒样品加注站,其包括两个或更多个SP盒样品加注位置;
样品制备站,其包括两个或更多个SP盒样品制备位置;
样品分析站,其包括两个或更多个样品分析单元;和
样品分析系统控制中心,
其中,在不停止系统操作的情况下,在补充或去除样品、散装流体、试剂、物件和废物中的一种或任何组合期间,系统提供连续的操作员访问。
32.根据条款31所述的自动分析系统,其中所述系统适于执行两个或更多个不同测定,并提供到两个或更多个不同测定的任一种的随机接入。
33.根据条款31或条款32所述的自动分析系统,其中样品存在于样品管中,并且其中所述两个或更多个样品装载位置包括两个或更多个样品管架通道。
34.根据条款33所述的自动分析系统,其中所述样品装载区域包括1至20个样品管架通道。
35.根据条款31至34中任一项所述的自动分析系统,其中所述样品装载区域包括样品管识别码读取器。
36.根据条款31至35中任一项所述的自动分析系统,其中,随着样品管架被装载到系统,所述样品管识别码读取器读取样品管架中存在的样品管上存在的识别码。
37.根据条款31至36中任一项所述的自动分析系统,其中所述样品装载区域包括样品管架识别码读取器。
38.根据条款31至37中任一项所述的自动分析系统,其包括机器人SP盒处理器,其将SP盒从SP盒装载区域传送到SP盒散装试剂加注站的两个或更多个位置中的一个。
39.根据条款38所述的自动分析系统,其中机器人SP盒处理器将SP盒从SP盒散装试剂加注站运送到SP盒样品加注站的两个或更多个位置中的一个。
40.根据条款39所述的自动分析系统,其中所述机器人SP盒处理器从SP盒样品加注站运送SP盒到样品制备站的两个或更多个位置中的一个。
41.根据条款31至40中任一项所述的自动分析系统,其包括移液管尖端存储区域。
42.根据条款41所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域中的样品管吸移样品,并分配所述样品到SP盒的第一孔中。
43.根据条款31至42中任一项所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器从在系统的辅助试剂装载区域存在的辅助试剂管吸移辅助试剂并分配辅助试剂到SP盒的孔。
44.根据条款43所述的自动分析系统,其中所述辅助试剂包括磁性颗粒。
45.根据条款44所述的自动分析系统,其中所述磁性颗粒通过存在于辅助试剂装载区域的混合马达保持在悬浮中。
46.根据条款45所述的自动分析系统,其中所述辅助试剂管的底部被插入到混合马达中以及混合马达交替地在逆时针和顺时针方向上旋转辅助试剂管,以保持磁性颗粒在悬浮中。
47.根据条款42至46中任一项所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器从SP盒的第二孔中吸移纯化样品并分配纯化样品到测定试剂孔中。
48.根据条款47所述的自动分析系统,其中所述测定试剂孔是测定试剂板的孔。
49.根据条款47或条款48所述的自动分析系统,其中所述测定试剂孔包括冻干测定试剂。
50.根据条款47至49中任一项所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器从所述测定试剂板转移包括纯化样品和测定试剂的混合物到反应容器中。
51.根据条款50所述的自动分析系统,其中所述反应容器存在于SP盒中。
52.根据条款50或条款51所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。
53.根据条款50至52中任一项所述的自动分析系统,其中所述机器人移液器拾取盖住的反应容器并将盖住的反应容器输送到样品分析站的样品分析单元中的一个的孔。
54.根据条款31至53中任一项所述的自动分析系统,其中所述系统是自动化核酸分析系统。
55.根据条款54所述的自动分析系统,其中所述样品制备站是核酸分离和纯化站。
56.根据条款55所述的自动分析系统,其中所述样品制备站是基于磁性颗粒的核酸分离和纯化站。
57.根据条款54至56中任一项所述的自动分析系统,其中所述样品分析单元是实时核酸扩增和检测单元。
58.根据条款31至57中任一项所述的自动分析系统,其包括固体废物存储区域。
59.根据条款58所述的自动系统,其中所述固体废物存储区域包括固体废物槽和固体废物容器。
60.根据条款59所述的自动系统,其中所述固体废物存储区域存在于抽屉至,并且当抽屉打开时固体废物槽不与固体废物容器连通。
61.根据条款58所述的自动系统,其中所述固体废物存储区域包括存在于抽屉中的两个或更多个固体废物存储容器。
62.根据条款31至61中任一项所述的自动系统,其包括液体废物存储区域。
尽管前述发明已通过说明和实例为了清楚理解的目的相当详细地描述,但是本领域的普通技术人员显而易见的是鉴于本发明的教导,在不背离所附权利要求的精神或范围的情况下可以对其进行某些变化和修改。
因此,前述仅仅说明了本发明的原理。应当理解,本领域技术人员将能够设计各种布置,这些布置虽然未在本文中明确描述或示出,但体现了本发明的原理并且包括在其精神和范围内。此外,本文叙述的所有实例和条件语言主要旨在帮助读者理解由发明人为将来的技术所贡献的本发明的原理和概念,并且应解释为但不限于这种具体叙述的实例和条件。而且,本文叙述本发明的原理、方面和实施例以及其具体例子的描述旨在包括结构和其功能等同方案。另外,期望这种等同方案包括目前已知的等同方案和将来发展的等同方案,即,发展的实施相同功能的任何要素,无论结构如何。所以,本发明的范围不旨在限于本文显示和描述的示例性实施例。相反,本发明的范围和精神由所附权利要求体现。
Claims (58)
1.一种通过自动样品分析系统连续分析样品的方法,包括:
将样品装入样品装载区域,所述样品装载区域包括两个或更多个样品装载位置;
将样品制备(SP)盒装入SP盒装载区域,所述SP盒装载区域包括两个或更多个SP盒装载位置;
用机器人SP盒处理器将所述SP盒从SP盒装载区域输送至SP盒散装试剂加注站的两个或更多个位置中的一个;
给SP盒加注散装试剂,所述散装试剂来自所述SP盒散装试剂加注站;
将所述SP盒从散装试剂加注站输送至SP盒样品加注站的两个或更多个位置中的一个;
用机器人移液器将样品从所述样品装载区域移液到所述SP盒样品加注站的SP盒中;
将SP盒从所述SP盒样品加注站输送至样品制备站的两个或更多个位置中的一个;
通过在包含两个或更多个SP盒样品制备位置的样品制备站处分离和纯化样品中存在的分析物来制备SP盒中的样品用于分析样品中的分析物;
将纯化的分析物与测定试剂合并以形成测定混合物;和
在样品分析站中对测定混合物进行分析物检测测定以分析样品,所述样品分析站包括两个或更多个样品分析单元,
其中,在不停止系统操作的情况下,系统的操作者能够连续访问系统以补充或去除样品、散装试剂、物件和废物。
2.根据权利要求1所述的方法,包括执行两种或更多种不同分析物检测测定,其中所述系统提供了对两种或更多种不同分析物检测测定的任一种的随机接入。
3.根据权利要求1所述的方法,其中装载到系统中的样品存在于样品管中。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述样品管存在于样品管架中,并且其中装载样品至系统包括装载样品管架到系统中的样品装载站的两个或更多个通道的一个中。
5.根据权利要求4所述的方法,其中系统包括样品装载站的2至20个样品管架通道。
6.根据权利要求4所述的方法,包括当样品管架被装载到系统中时读取存在于所述样品管上的样品识别信息。
7.根据权利要求4所述的方法,包括在样品管架装载到系统中后读取存在于所述样品管架上的样品管架识别信息。
8.根据权利要求1所述的方法,其中系统包括移液管尖端存储区域,其中所述移液管尖端存储区域存储所述移液管尖端。
9.根据权利要求8所述的方法,包括使用机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域处的样品管吸移样品,并将样品分配到SP盒的第一孔中。
10.根据权利要求9所述的方法,包括使用机器人移液器从SP盒的第二孔吸移纯化的样品并将纯化的样品分配到测定试剂孔中。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述测定试剂孔是测定试剂板的孔。
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述测定试剂孔包括冻干测定试剂。
13.根据权利要求11所述的方法,包括使用机器人移液器将包含纯化的样品和测定试剂的混合物从测定试剂板转移至反应容器。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述反应容器存在于SP盒中。
15.根据权利要求13所述的方法,包括使用机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。
16.根据权利要求15所述的方法,其中系统包括样品分析站,其包括两个或更多个样品分析单元。
17.根据权利要求16所述的方法,包括使用机器人移液器拾取加盖的反应容器并将加盖的反应容器输送到样品分析站的一个样品分析单元的孔中。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的方法,其中执行分析物检测测定包括执行核酸检测测定。
19.根据权利要求18所述的方法,其中进行核酸检测测定包括进行实时核酸扩增和检测。
20.根据权利要求18所述的方法,其中在所述SP盒中制备样品用于分析包括分离和纯化样品中存在的核酸。
21.根据权利要求20所述的方法,其中分离和纯化样品中存在的核酸包括使用磁性颗粒捕捉核酸。
22.根据权利要求1所述的方法,包括将在系统运行期间产生的液体废物置于液体废物存储区域。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述液体废物存储区域包括液体废物槽和液体废物容器。
24.根据权利要求23所述的方法,其中所述液体废物存储区域存在于抽屉中,以及所述液体废物槽仅当抽屉关闭时与所述液体废物容器连通。
25.根据权利要求1所述的方法,包括将在系统运行期间产生的固体废物置于固体废物存储区域。
26.根据权利要求25所述的方法,其中所述固体废物存储区域包括两个或更多个固体废物存储容器。
27.自动化样品分析系统,其包括:
样品装载区域,其包括两个或更多个样品装载位置;
样品制备(SP)盒装载区域,其包括两个或更多个SP盒装载位置;
SP盒散装试剂加注站,其包括两个或更多个SP盒加注位置;
机器人SP盒处理器;
机器人移液器;
SP盒样品加注站,其包括两个或更多个SP盒样品加注位置;
样品制备站,其包括两个或更多个SP盒样品制备位置;
样品分析站,其包括两个或更多个样品分析单元;和
样品分析系统控制中心,
其中,在不停止系统操作的情况下,在补充或去除样品、散装流体、试剂、物件和废物中的一种或任何组合期间,系统提供连续的操作员访问,
其中所述自动化样品分析系统用于执行权利要求1所述的连续分析样品的方法。
28.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其中所述系统适于执行两个或更多个不同测定,并提供到两个或更多个不同测定的任一种的随机接入。
29.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其中样品存在于样品管中,并且其中所述两个或更多个样品装载位置包括两个或更多个样品管架通道。
30.根据权利要求29所述的自动化样品分析系统,其中所述样品装载区域包括1至20个样品管架通道。
31.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其中所述样品装载区域包括样品管识别码读取器。
32.根据权利要求31所述的自动化样品分析系统,其中,随着样品管架被装载到系统,所述样品管识别码读取器读取样品管架中存在的样品管上存在的识别码。
33.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其中所述样品装载区域包括样品管架识别码读取器。
34.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其包括机器人SP盒处理器,其将SP盒从SP盒装载区域传送到SP盒散装试剂加注站的两个或更多个位置中的一个。
35.根据权利要求34所述的自动化样品分析系统,其中机器人SP盒处理器将SP盒从SP盒散装试剂加注站运送到SP盒样品加注站的两个或更多个位置中的一个。
36.根据权利要求35所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人SP盒处理器从SP盒样品加注站运送SP盒到样品制备站的两个或更多个位置中的一个。
37.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其包括移液管尖端存储区域。
38.根据权利要求37所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器从移液管尖端存储区域拾取一次性移液管尖端,从存在于样品引入区域中的样品管吸移样品,并分配所述样品到SP盒的第一孔中。
39.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器从在系统的辅助试剂装载区域存在的辅助试剂管吸移辅助试剂并分配辅助试剂到SP盒的孔。
40.根据权利要求39所述的自动化样品分析系统,其中所述辅助试剂包括磁性颗粒。
41.根据权利要求40所述的自动化样品分析系统,其中所述磁性颗粒通过存在于辅助试剂装载区域的混合马达保持在悬浮中。
42.根据权利要求41所述的自动化样品分析系统,其中所述辅助试剂管的底部被插入到混合马达中以及混合马达交替地在逆时针和顺时针方向上旋转辅助试剂管,以保持磁性颗粒在悬浮中。
43.根据权利要求38所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器从SP盒的第二孔中吸移纯化样品并分配纯化样品到测定试剂孔中。
44.根据权利要求43所述的自动化样品分析系统,其中所述测定试剂孔是测定试剂板的孔。
45.根据权利要求43所述的自动化样品分析系统,其中所述测定试剂孔包括冻干测定试剂。
46.根据权利要求44所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器从所述测定试剂板转移包括纯化样品和测定试剂的混合物到反应容器中。
47.根据权利要求46所述的自动化样品分析系统,其中所述反应容器存在于SP盒中。
48.根据权利要求46所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器拾取反应容器盖并盖住反应容器。
49.根据权利要求48所述的自动化样品分析系统,其中所述机器人移液器拾取盖住的反应容器并将盖住的反应容器输送到样品分析站的样品分析单元中的一个的孔。
50.根据权利要求27至49中任一项所述的自动化样品分析系统,其中所述系统是自动化核酸分析系统。
51.根据权利要求50所述的自动化样品分析系统,其中所述样品制备站是核酸分离和纯化站。
52.根据权利要求51所述的自动化样品分析系统,其中所述样品制备站是基于磁性颗粒的核酸分离和纯化站。
53.根据权利要求50所述的自动化样品分析系统,其中所述样品分析单元是实时核酸扩增和检测单元。
54.根据权利要求50所述的自动化样品分析系统,其包括固体废物存储区域。
55.根据权利要求54所述的自动化样品分析系统,其中所述固体废物存储区域包括固体废物槽和固体废物容器。
56.根据权利要求55所述的自动化样品分析系统,其中所述固体废物存储区域存在于抽屉中,并且当抽屉打开时固体废物槽不与固体废物容器连通。
57.根据权利要求54所述的自动化样品分析系统,其中所述固体废物存储区域包括存在于抽屉中的两个或更多个固体废物存储容器。
58.根据权利要求27所述的自动化样品分析系统,其包括液体废物存储区域。
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