CN109053882A - 一种ns1蛋白的结合蛋白以及应用 - Google Patents

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Abstract

本发明提供的包括与NS1蛋白结合的抗原结合结构域的分离的结合蛋白，该结合蛋白能够特异性地识别并结合NS1蛋白，具有较高的灵敏度和特异性，从而实现对登革热病毒的检测。

Description

一种NS1蛋白的结合蛋白以及应用
技术领域
本发明涉及生物技术和医学技术领域，尤其是涉及一种NS1蛋白的结合蛋白以及应用。
背景技术
登革热(dengue fever,DF)是由4个血清型病毒(DENV-1、DENV-2、DENV-3、DENV-4)引起的急性蚊媒传染病，主要通过埃及伊蚊和白纹伊蚊传播。DF是分布最广，发病最多，危害较大的一种虫媒病毒性疾病，广泛流行于全球热带和亚热带的非洲、美洲、东南亚和西太平洋地区的100多个国家和地区。
在临床上，DF是一种严重的流感样的疾病。主要表现为起病突然、高热、剧烈头痛、眼眶后痛、肌肉和关节痛，可伴有皮疹、淋巴腺肿和白血球减少，可波及所有人群，但症状可因病人的年龄不同而不同。一般将这种病型称为古典登革热，此类型传播迅速，可引起较大规模的流行。在登革热流行期，易感人群的罹患率通常为40％-50％，可高达80％-90％，但病死率很低。登革热出血热是以高热、出血、肝大，严重病例循环衰竭为特征，病死率高，是较为严重的一种临床类型。伴有休克综合症的称为登革休克综合症。
登革热没有特效的治疗方法。如果没有适应的治疗，登革出血热的病死率可超过20％，经过有效的支持疗法，病死率可低于1％。登革热诊断要点：1)流行病学资料，发病关15天的活动情况，有否去过流行区，蚊虫叮咬历；2)临床特征，突然起病，发热，“三痛三红”，皮诊；3)实验室检查，白细胞、血小板下降；检测血清特性IgM阳性；恢复期IgG比急性期有4倍增长；分离到病毒或特异性抗原。临床上用于登革病毒的检测方法有病毒培养、血清学检测、病毒核酸检测等。病毒分离所需时间较长，达不到快速诊断的目的，而常规的血清学诊断又因存在广泛的交叉反应而受到干扰。
现有的NS1蛋白的特异性单克隆抗体活性低、亲和力差，无法很好地应用于NS1蛋白的检测中，因此本领域对于有效且特异性结合检测NS1蛋白并对其进行检测的抗体存在着强烈需求。
有鉴于此，特提出本发明。
发明内容
本发明涉及一种新颖的包含NS1蛋白抗原结合结构域的分离的结合蛋白，并对该结合蛋白的制备、应用等方面进行研究。
所述抗原结合结构域包括选自下述氨基酸序列的至少一个互补决定区，或与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少80％的序列同一性且与NS1蛋白具有KD≤6.55×10- 8mol/L的亲和力；
互补决定区CDR-VH1为G-Y-X1-F-T-X2-Y-W-I-G，其中，
X1是S或T，X2是D或E；
互补决定区CDR-VH2为D-M-X1-P-G-D-X2-Y-I-N-Y-X3-E-K-F-K-G，其中，
X1是F或V，X2是V、L或I，X3是Q或N；
互补决定区CDR-VH3为T-N-F-X1-T-X2-G-G-X3-D-Y，其中，
X1是I或L，X2是L或V，X3是V、L或I；
互补决定区CDR-VL1为K-S-S-X1-S-L-L-X2-S-D-G-X3-T-Y-L-N，其中，
X1是Q或N，X2是E或D，X3是R或K；
互补决定区CDR-VL2为L-V-X1-K-X2-D-S，其中，
X1是S或T，X2是V、I或L；
互补决定区CDR-VL3为W-X1-G-T-H-F-X2-H-T，其中，
X1是Q、Y或W，X2是A或P。
一个重要优点在于，所述结合蛋白活性强，与NS1蛋白具有很高的亲和力。
本发明提供的包括与NS1蛋白结合的抗原结合结构域的分离的结合蛋白，该结合蛋白能够特异性地识别并结合NS1蛋白，具有较高的灵敏度和特异性，从而实现对登革热病毒的检测。并且，无需利用小鼠腹腔诱生杂交瘤细胞来生产该结合蛋白，生产难度小的同时，抗体功能更加稳定。
附图说明
为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本发明的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本发明实施例2提供的抗NS1蛋白的结合蛋白的单克隆抗体电泳图。
具体实施方式
本发明可通过后续对于本发明一些实施方案描述以及其中所包括的实施例的详细内容而更容易被了解。
在进一步叙述本发明之前，应明了本发明不会被局限于所述特定实施方案中，因为这些实施方案必然是多样的。亦应明了本说明书中所使用的用语仅是为了阐述特定实施方案，而非作为限制，因为本发明的范围将会被仅仅界定在所附的权利要求中。
除非本文另有定义，连同本发明使用的科学和技术术语应具有本领域普通技术人员通常理解的含义。术语的含义和范围应当清晰，然而，在任何潜在不明确性的情况下，本文提供的定义优先于任何字典或外来定义。在本申请中，除非另有说明，“或”的使用意味着“和/或”。此外，术语“包括”及其他形式的使用是非限制性的。
一般地，连同本文描述的细胞和组织培养、分子生物学、免疫学、微生物学、遗传学以及蛋白和核酸化学和杂交使用的命名法和其技术是本领域众所周知和通常使用的那些。除非另有说明，本发明的方法和技术一般根据本领域众所周知，且如各种一般和更具体的参考文献中所述的常规方法来进行，所述参考文献在本说明书自始至终引用和讨论。酶促反应和纯化技术根据制造商的说明书、如本领域通常实现的或如本文所述来进行。连同本文描述的分析化学、合成有机化学以及医学和药物化学使用的命名法、以及其实验室程序和技术是本领域众所周知和通常使用的那些。
为了本发明可以更容易地理解，选择的术语在下文定义。
术语“氨基酸”表示天然存在或非天然存在的梭基α-氨基酸。术语“氨基酸”用在本申请中可以包括天然存在的氨基酸和非天然存在的氨基酸。天然存在的氨基酸包括丙氨酸(三字母密码：A1a，单字母密码：A)，精氨酸(Arg，R)，天冬酰胺(Asn，N)，天冬氨酸(Asp，D)，半胱氨酸(Cys，c)，谷氨酰胺(G1n，Q)，谷氨酸(G1u，E)，甘氨酸(G1y，G)，组氨酸(His，H)，异亮氨酸(I1e，I)，亮氨酸(Leu，L)，赖氨酸(Lys，K)，甲硫氨酸(Met，M)，苯丙氨酸(Phe，F)，脯氨酸(Pro，P)，丝氨酸(Ser，S)，苏氨酸(Thr，T)，色氨酸(Trp，W)，酪氨酸(Tyr，Y)，和缬氨酸(Va1，V)。非天然存在的氨基酸包括但不限于α-氨基己二酸，氨基丁酸，瓜氨酸，高瓜氨酸，高亮氨酸，高精氨酸，羟基脯氨酸，正亮氨酸，吡啶基丙氨酸，肌氨酸等等。
术语“分离的结合蛋白”是这样的蛋白，其由于衍生起源或来源不与天然结合的组分结合，所述天然结合的组分在其天然状态下与其伴随；基本上不含来自相同物种的其他蛋白；由来自不同物种的细胞表达；或在自然界中不存在。因此，化学合成或在不同于其天然起源的细胞的细胞系统中合成的蛋白将是与其天然结合的组分“分离的”。还可以通过分离，使用本领域众所周知的蛋白纯化技术，使得蛋白基本上不含大然结合的组分。
术语“包括抗原结合结构域的分离的结合蛋白”泛指包含CDR区的一切蛋白/蛋白片段。“抗体”此用语包括多克隆抗体及单克隆抗体以及这些抗体的抗原化合物结合片段，包括Fab、F(ab’)2、Fd、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位，以及这些抗体和片段的单链衍生物。抗体的类型可以选择IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD。此外，“抗体”此用语包括天然发生的抗体以及非天然发生的抗体，包括例如嵌合型(chimeric)、双功能型(bifunctional)和人源化(humanized)抗体，以及相关的合成异构形式(isoforms)。“抗体”此用语可和“免疫球蛋白”互换使用。
抗体的“可变区”或“可变结构域”是指抗体的重链或轻链的氨基端结构域。重链的可变结构域可以被称为“VH”。轻链的可变结构域可以被称为“VL”。这些结构域通常是抗体的最可变的部分，并含有抗原结合位点。轻链或重链可变区由被三个称为“互补决定区”或“CDR”的高变区打断的构架区构成。抗体的构架区，即构成要件轻链和重链的组合的构架区，起到定位和对齐CDR的作用，所述CDR主要负责与抗原的结合。
当在本文中使用时，“构架”或“FR”区意味着抗体可变结构域的排除被定义为CDR的那些区域之外的区域。每个抗体可变结构域构架可以被进一步细分成被CDR分隔开的毗邻区域(FR1、FR2、FR3和FR4)。
通常情况下，重链和轻链的可变区VL/VH可由以下编号的CDR与FR按如下组合排列连接获得：FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4。
当在本文中使用时，与多肽或核酸相关联的术语“纯化的”或“分离的”是指多肽或核酸不是处于其天然介质中或天然形式下。因此，术语“分离的”包括从其原始环境，例如如果它是天然存在的，从天然环境取出的多肽或核酸。例如，分离的多肽通常不含通常与其结合或通常与其混合或在溶液中的至少某些蛋白质或其他细胞组分。分离的多肽包括细胞裂解物中包含的天然生产的所述多肽，纯化或部分纯化形式的所述多肽，重组多肽，被细胞表达或分泌的所述多肽，以及在异源宿主细胞或培养物中的所述多肽。与核酸相关联，术语分离的或纯化的指示例如所述核酸不在其天然的基因组背景中(例如在载体中，作为表达盒，连接到启动子，或人工引入到异源宿主细胞中)。
本发明提供的一种包含抗原结合结构域的分离的结合蛋白，所述抗原结合结构域包括选自下述氨基酸序列的至少一个互补决定区，或与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少80％的序列同一性且与NS1蛋白具有KD≤6.55×10-8mol/L的亲和力；
互补决定区CDR-VH1为G-Y-X1-F-T-X2-Y-W-I-G，其中，
X1是S或T，X2是D或E；
互补决定区CDR-VH2为D-M-X1-P-G-D-X2-Y-I-N-Y-X3-E-K-F-K-G，其中，
X1是F或V，X2是V、L或I，X3是Q或N；
互补决定区CDR-VH3为T-N-F-X1-T-X2-G-G-X3-D-Y，其中，
X1是I或L，X2是L或V，X3是V、L或I；
互补决定区CDR-VL1为K-S-S-X1-S-L-L-X2-S-D-G-X3-T-Y-L-N，其中，
X1是Q或N，X2是E或D，X3是R或K；
互补决定区CDR-VL2为L-V-X1-K-X2-D-S，其中，
X1是S或T，X2是V、I或L；
互补决定区CDR-VL3为W-X1-G-T-H-F-X2-H-T，其中，
X1是Q、Y或W，X2是A或P。
本领域公知，抗体的结合特异性及亲合力均主要由CDR序列决定，根据成熟、公知的现有各项技术可轻易地将非CDR区域的氨基酸序列改变而获得具有相类似的生物活性的变体。因此，本发明也包括该结合蛋白的“功能性衍生物”。“功能性衍生物”是指氨基酸替换的变体，一个功能性衍生物保留有可检测的结合蛋白活性，优选为能结合NS1蛋白的抗体的活性。“功能性衍生物”可以包含“变体”和“片段”，因其具有与本发明所述的结合蛋白完全相同的CDR序列，因此具有相类似的生物活性。
在一些实施方式中，所述抗原结合结构域与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少85％，或90％，或91％，或92％，或93％，或94％，或95％，或96％，或97％，或98％，或99％的序列同一性且与NS1蛋白具有KD≤6.550×10-8mol/L，KD值也可以选择4.587×10-8mol/L、2.798×10-8mol/L、1.282×10-8mol/L、1.891×10-9mol/L、4.601×10-9mol/L、6.592×10-9mol/L、8.002×10-9mol/L、9.614×10-9mol/L、2.324×10-10mol/L、3.540×10-10mol/L、6.121×10-10mol/L、9.876×10-10mol/L，或者2.324×10-10mol/L≤KD≤6.550×10-8mol/L，或者2.324×10-10mol/L≤KD≤9.614×10-9mol/L。
其中，亲和力按照本发明说明书中的方法测定。
在一些实施方式中，
所述互补决定区CDR-VH1中，X1是T；
所述互补决定区CDR-VH2中，X1是F；
所述互补决定区CDR-VH3中，X2是L；
所述互补决定区CDR-VL1中，X2是D；
所述互补决定区CDR-VL2中，X1是S；
所述互补决定区CDR-VL3中，X2是P。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X2是D。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X2是E。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是V，X3是Q。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是V，X3是N。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是L，X3是Q。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是L，X3是N。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是I，X3是Q。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是I，X3是N。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是V。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是L。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是I。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是V。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是L。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是I。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是Q，X2是R。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是Q，X2是K。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是N，X2是R。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是N，X2是K。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是V。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是I。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是L。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Q。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Y。
在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是W。
在一些实施方式中，所述结合蛋白中包括至少3个CDRs；或者，所述结合蛋白包括至少6个CDRs。
在一些实施方式中，所述结合蛋白为包含可变区和恒定区的完整抗体。
在一些实施方式中，所述结合蛋白为纳米抗体、F(ab’)2、Fab’、Fab、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位中的一种。
在一些实施方式中，所述结合蛋白包括序列依次如SEQ ID NO:1-4所示的轻链骨架区FR-L1、FR-L2、FR-L3及FR-L4，和/或，序列依次如SEQ ID NO:5-8所示的重链骨架区FR-H1、FR-H2、FR-H3及FR-H4。
在一些实施方式中，所述结合蛋白还包含抗体恒定区序列。
在一些实施方式中，所述恒定区序列选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD任何其中之一恒定区的序列。
在一些实施方式中，所述恒定区的种属来源为牛、马、乳牛、猪、绵羊、山羊、大鼠、小鼠、狗、猫、兔、骆驼、驴、鹿、貂、鸡、鸭、鹅、火鸡、斗鸡或人。
在一些实施方式中，所述恒定区来源于小鼠；
轻链恒定区序列如SEQ ID NO:9所示；
重链恒定区序列如SEQ ID NO:10所示。
本发明还提供了一种分离的核酸，所述核酸编码上述的结合蛋白。
在本文中，核酸包含其保守置换的变体(例如简并密码子的置换)和互补序列。术语“核酸”和“多核苷酸”是同义的，包含基因、cDNA分子、mRNA分子以及它们的片段例如寡核苷酸。
本发明还提供了一种载体，所述载体包含上述的核酸。
其中的核酸序列与至少一种调节序列可操作连接。“可操作连接”指的是编码序列以允许编码序列的表达的方式与调节序列连接。调节序列选择用来在合适的宿主细胞中指导目的蛋白质的表达，包含启动子、增强子和其它的表达调控元件。
在本文中，载体可以指包含本发明的核酸或其片段的、能够携带遗传信息并且可以将遗传信息递送到细胞中的分子或试剂。典型的载体包括质粒、病毒、噬菌体、黏粒和微型染色体。载体可以是克隆载体(即用于将遗传信息转移到细胞中的载体，可以繁殖所述细胞并且可以选择存在或不存在所述遗传信息的所述细胞)或表达载体(即包含必要的遗传元件从而允许所述载体的遗传信息在细胞中表达的载体)。因此，克隆载体可以包含选择标记，以及与所述克隆载体所指定的细胞类型相匹配的复制起点，而表达载体则包含对于影响指定靶细胞中的表达必要的调节元件。
本发明的核酸或其片段可以插入到合适的载体中以形成携带本发明核酸片段的克隆载体或表达载体。这种新载体也是本发明的一部分。所述载体可以包括质粒、噬菌体、黏粒、微型染色体或病毒，也包括只在特定细胞中瞬时表达的裸DNA。本发明克隆载体和表达载体能够自发的复制，因此能够为用于随后克隆的高水平表达或高水平复制目的提供高拷贝数。表达载体可以包括用于驱动本发明的核酸片段表达的启动子，可选的编码使所述肽表达产物分泌或整合到膜上的信号肽的核酸序列，本发明的核酸片段，以及可选的编码终止子的核酸序列。当在生产菌株或细胞系中操作表达载体时，载体引入到宿主细胞中时可以整合到宿主细胞的基因组中，也可以不能被整合到宿主细胞基因组中。载体通常携带复制位点，以及能够在转化细胞中提供表型选择的标记序列。
本发明的表达载体用于转化宿主细胞。这种转化细胞也是本发明的一部分，可以是用于增殖本发明的核酸片段和载体、或用于重组制备本发明的多肽的培养细胞或细胞系。本发明的转化细胞包括微生物如细菌(如大肠杆菌、芽抱杆菌等)。宿主细胞也包括来自多细胞生物如真菌、昆虫细胞、植物细胞或哺乳动物细胞，优选来自哺乳动物的细胞，例如CHO细胞。所述转化细胞能够复制本发明的核酸片段。当重组制备本发明的肽组合时，所述表达产物可以输出到培养基中或携带在所述转化细胞的表面。
本发明还提供了一种生产上述结合蛋白的方法，包括如下步骤：
在培养基中培养上述的宿主细胞，从培养基中或从所培养的宿主细胞中回收产生的结合蛋白。
所述方法可以是例如，用编码至少一部分结合蛋白的核酸载体转染宿主细胞，在合适的条件下培养该宿主细胞使其表达该结合蛋白。宿主细胞也可以用一个或多个表达载体转染，该表达载体可以单独或结合地包含编码至少一部分结合蛋白的DNA。利用常规的纯化蛋白质和肽的技术可从培养基或细胞裂解物中分离结合蛋白，所述技术包括硫酸铵沉淀，层析(如离子交换，凝胶过滤，亲合层析等)和/或电泳。
构建合适的含有目的编码和调控序列的载体可以使用本领域公知的标准连接和限制技术进行。将分离的质粒、DNA序列或合成的寡核苷酸按需要的形式切割、加尾和再连接。可以用任何方法向编码序列中引入突变以产生本发明的变体，这些突变可以包含缺失或插入或置换等。
本发明也提供抗体，能与NS1蛋白的表位发生反应，包含单克隆的和多克隆的抗体。该抗体可以含有完整的结合蛋白，或其片段或衍生物。优选的抗体含有全部或部分的结合蛋白。
本发明还提供了上述的结合蛋白在制备用于检测登革热感染的产品中的应用。
在一些实施方案中，本发明提供的结合蛋白可以用于检侧一种或多种靶分子在生物样品中的存在。术语“检测”用于本文中时，包括定量或定性检测。在一些实施方案中，生物样品包含细胞或组织。
本发明的免疫测定包括胶体金免疫测定，还包括ELISA以及其它利用抗原抗体反应的试验或方法。
在一些实施方案中，本发明提供一种制品(例如试剂盒)，所述制品包含可用于诊断登革热病毒感染的材料。该制品包括容器和在容器上或与容器一起的标签或包装说明书。适合的容器包括，例如，瓶子或注射器等。所述容器可以由各种材料如玻璃或塑料制成。容器装有组合物，所述组合物是单独地或与可有效用于诊断登革热的另一种组合物结合。组合物中至少一种活性试剂是本发明提供的结合蛋白。
在一些实施方案中，本发明还提供了包括上述的结合蛋白、核酸或载体的检测试剂盒。
检测测试样品中的NS1蛋白抗原的方法，其包括：
a)在足以发生抗体/抗原结合反应的条件下，使所述测试样品中的NS1蛋白抗原与如上所述的结合蛋白接触以形成免疫复合物；和
b)检测所述免疫复合物的存在，所述复合物的存在指示所述测试样品中所述NS1蛋白抗原的存在；
在此实施方式中，所述结合蛋白可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。
在一些实施方式中，在步骤a)中，所述免疫复合物中还包括第二抗体，所述第二抗体与所述结合蛋白结合；
在此实施方式中，所述结合蛋白以第一抗体的形式与所述第二抗体形成配对抗体，用于结合NS1蛋白的不同抗原表位；
所述的第二抗体可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。
在一些实施方式中，在步骤a)中，所述免疫复合物中还包括第二抗体，所述第二抗体与所述NS1蛋白抗原结合；
在此实施方式中，所述结合蛋白作为所述第二抗体的抗原，所述的第二抗体可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。
在一些实施方式中，所述显示信号强度的指示剂包括荧光物质、量子点、地高辛标记探针、生物素、放射性同位素、放射性造影剂、顺磁离子荧光微球、电子致密物质、化学发光标记物、超声造影剂、光敏剂、胶体金或酶中的任一种。
在一些实施方式中，所述荧光物质包括Alexa 350、Alexa 405、Alexa 430、Alexa488、Alexa 555、Alexa 647、AMCA、氨基吖啶、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665、BODIPY-FL、BODIPY-R6G、BODIPY-TMR、BODIPY-TRX、5-羧基-4′，5′-二氯-2′，7′-二甲氧基荧光素、5-羧基-2′，4′，5′，7′-四氯荧光素、5-羧基荧光素、5-羧基罗丹明、6-羧基罗丹明、6-羧基四甲基罗丹明、Cascade Blue、Cy2、Cy3、Cy5、Cy7、6-FAM、丹磺酰氯、荧光素、HEX、6-JOE、NBD(7-硝基苯并-2-氧杂-1，3-二唑)、Oregon Green 488、Oregon Green 500、Oregon Green514、Pacific Blue、邻苯二甲酸、对苯二甲酸、间苯二甲酸、甲酚固紫、甲酚蓝紫、亮甲酚蓝、对氨基苯甲酸、赤藓红、酞菁、偶氮甲碱、花青、黄嘌呤、琥珀酰荧光素、稀土金属穴状化合物、三双吡啶基二胺铕、铕穴状化合物或螯合物、二胺、双花青苷、La Jolla蓝染料、别藻蓝蛋白、allococyanin B、藻蓝蛋白C、藻蓝蛋白R、硫胺、藻红青蛋白、藻红蛋白R、REG、罗丹明绿、罗丹明异硫氰酸酯、罗丹明红、ROX、TAMRA、TET、TRIT(四甲基罗丹明异硫醇)、四甲基罗丹明和德克萨斯红中的任一种。
在一些实施方式中，所述放射性同位素包括110In、111In、177Lu、18F、52Fe、62Cu、64Cu、67Cu、67Ga、68Ga、86Y、90Y、89Zr、94mTc、94Tc、99mTc、120I、123I、124I、125I、131I、154-158Gd、32P、11C、13N、15O、186Re、188Re、51Mn、52mMn、55Co、72As、75Br、76Br、82mRb和83Sr中的任一种。
在一些实施方式中，所述酶包括辣根过氧化酶、碱性磷酸酶和葡萄糖氧化酶中的任一种。
在一些实施方式中，所述荧光微球为：聚苯乙烯荧光微球，内部包裹有稀土荧光离子铕。
如在一些实施方案中，本发明提供用于确定例如感染登革热的受试者中的NS1蛋白存在的试剂盒，所述试剂盒包含至少一种本发明提供的结合蛋白，相关的缓冲剂，用于使液体样品与所述结合蛋白反应所需的试剂，以及用于确定NS1蛋白和结合蛋白之间存在阳性或阴性结合反应的试剂。为了确定NS1蛋白的存在，所述试剂盒可以例如利用带有标记的结合蛋白作为抗体，其中所述标记可以是任何合适的标记，如胶体金标记。
下文提供了一些实例用于示例性说明本发明，而不是限制本发明的范围。
实施例1
本实施例中限制性内切酶、Prime Star DNA聚合酶购自Takara公司。MagExtractor-RNA提取试剂盒购自TOYOBO公司。SMARTERTM RACE cDNA AmplificationKit试剂盒购自Takara公司。pMD-18T载体购自Takara公司。质粒提取试剂盒购自天根公司。引物合成和基因测序由Invitrogen公司完成。分泌Anti-Dengue NS1 11E2单克隆抗体的杂交瘤细胞株为本申请人实验室已有的杂交瘤细胞株，复苏备用。
1、引物
扩增Heavy Chain和Light Chain 5’RACE引物：
SMARTER II A Oligonucleotide：5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACXXXXX-3’；
5'-RACE CDS Primer(5'-CDS)：5’-(T)25VN-3’(N＝A,C,G,orT；V＝A,G,orC)；
Universal Primer A Mix(UPM)：5’-
CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’；
Nested Universal Primer A(NUP)：5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’；
MIgG-CKR：5’-CTAACACTCATTCCTGTTGAAGC-3’；
MIgG-CHR：5’-TCATTTACCCGGAGTCCGGGAGAAGCTC-3’。
2、抗体可变区基因克隆及测序
从分泌Anti-Dengue NS1 11E2单克隆抗体的杂交瘤细胞株中提取中RNA，用SMARTERTM RACE cDNA Amplification Kit试剂盒及试剂盒中的SMARTER II AOligonucleotide和5'-CDS引物进行第一链cDNA合成，获得的第一链cDNA产物作为PCR扩增模板。Light Chain基因以Universal Primer A Mix(UPM)、Nested Universal Primer A(NUP)和MIgG-CKR引物进行扩增，Heavy Chain基因以Universal Primer A Mix(UPM)、Nested Universal Primer A(NUP)和MIgG-CHR引物进行扩增。其中Light Chain的引物对扩增出0.72KB左右的目的条带，Heavy Chain的引物对扩增出1.4KB左右的目的条带。用琼脂糖凝胶电泳纯化回收，产物用rTaq DNA聚合酶进行加A反应后插入到pMD-18T载体中，转化到DH5α感受态细胞中，长出菌落后分别取Heavy Chain及Light Chain基因克隆各4个克隆送Invitrogen公司进行测序。
3、Anti-Dengue NS1 11E2抗体可变区基因的序列分析
将上述测序得到的基因序列放在IMGT抗体数据库中进行分析，并利用VNTI11.5软件进行分析确定重链和轻链引物对扩增出的基因都是正确的，其中Light Chain扩增出的基因片段中，VL基因序列为339bp，属于VkII基因家族，其前方有60bp的前导肽序列；HeavyChain引物对扩增出的基因片段中，VH基因序列为354bp，属于VH1基因家族，其前方有57bp的前导肽序列。
4、重组抗体表达质粒的构建
pcDNATM3.4vector为构建的重组抗体真核表达载体，该表达载体已经引入HindIII、BamHI、EcoRI等多克隆酶切位点，并命名为pcDNA3.4A表达载体，后续简称3.4A表达载体；根据上述pMD-18T中抗体基因测序结果，设计Anti-Dengue NS1 11E2抗体的HeavyChain和Light Chain基因特异性引物，两端分别带有HindIII、EcoRI酶切位点和保护碱基，引物如下：
DN11E2-HF：5’-CATAAGCTTATGAAATGGAGCTGGGTTATCCTCTTCTTCC-3’；
DN11E2-HR：5’-GACGAATTCTCATTTACCCGGAGTCCGGGAGAAGCTC-3’；
DN11E2-LF：5’-CCCAAGCTTATGGAGACAGACACACTCCTGCTATGG-3’；
DN11E2-LR：5’-CCCGAATTCCTAACACTCATTCCTGTTGAAGCTCTTGAC-3’。
通过PCR扩增方法扩出0.72KB的Light Chain基因片段和1.4KB的Heavy Chain基因片段。Heavy Chain和Light Chain基因片段分别采用HindIII/EcoRI双酶切，3.4A载体采用HindIII/EcoRI双酶切，将片段和载体纯化回收后Heavy Chain基因和Light Chain基因分别连接3.4A表达载体中，分别得到Heavy Chain和Light Chain的重组表达质粒。
5、筛选稳定细胞株
5.1质粒用超纯水稀释至400ng/ml，调节CHO细胞1.43×107cells/ml于离心管中，100μl质粒与700μl细胞混合，转入电转杯，电转，第3、5、7天取样计数，第7天收样检测。
包被液稀释相应抗原到指定浓度，每孔100μL，4℃过夜；次日，洗涤液清洗2次，拍干；加入封闭液(20％BSA+80％PBS)，每孔120μL，37℃，1h，拍干；加入稀释后的细胞上清，100μL/孔，37℃,30min(部分上清1h)；洗涤液清洗5次，拍干；加入羊抗鼠IgG-HRP，每孔100μL，37℃,30min；洗涤液清洗5次，拍干；加入显色液A液(50μL/孔)，加入显色液B液(50μL/孔)，10min；加入终止液，50μL/孔；酶标仪上450nm(参考630nm)处读OD值。以标准品浓度和OD值作标准曲线，计算细胞上清中抗体含量。
5.2重组抗体表达质粒线性化
准备下述试剂：Buffer 50μl、DNA 100μg/管、PuvⅠ酶10μl、无菌水补至500μl，37℃水浴酶切过夜；先用等体积酚/氯仿/异戊醇(下层)25:24:1，再用氯仿(水相)依次进行抽提；0.1倍体积(水相)3M醋酸钠和2倍体积乙醇冰上沉淀，70％乙醇漂洗沉淀，去除有机溶剂，待乙醇挥发完全用适量的灭菌水进行复融，最后进行浓度的测定。
重组抗体表达质粒稳定转染，加压筛选稳定细胞株：
质粒用超纯水稀释至400ng/ml，调节CHO细胞1.43×107cells/ml于离心管中，100μl质粒与700μl细胞混合，转入电转杯，电转，次日计数；25μmol/L MSX 96孔加压培养约25天。
显微镜下观察标记长有细胞的克隆孔,并记录汇合度；取培养上清，送样检测；挑选抗体浓度、相对浓度高的细胞株转24孔，3天左右转6孔；3天后保种批培，调整细胞密度0.5×106cells/ml，2.2ml进行批培养，细胞密度0.3×106cells/ml，2ml进行保种；7天6孔批培上清送样检测，挑选抗体浓度及细胞直径较小的细胞株转TPP保种传代。
6、生产重组抗体
6.1细胞扩培
细胞复苏之后先在125ml规格的摇瓶中培养，接种体积为30ml，培养基为100％Dynamis培养基，放置于转速120r/min，温度为37℃，二氧化碳为8％的摇床中。培养72h，以50万cells/ml接种密度接种扩培，扩培体积根据生产需求进行计算，培养基为100％Dynamis培养基。之后每72h扩培一次。当细胞量满足生产需求时，严格控制接种密度为50万cells/ml左右进行生产。
6.2摇瓶生产及纯化
摇瓶参数：转速120r/min，温度为37℃，二氧化碳为8％。流加补料：在摇瓶中培养至72h时开始每天补料，HyCloneTM Cell BoostTM Feed 7a每天流加初始培养体积的3％，Feed 7b每天流加量为初始培养体积的千分之一，一直补到第12天(第12天补料)。葡萄糖在第六天补加3g/L。第13天收样。用proteinA亲和层析柱进行亲和纯化。纯化后得到500mg重组抗体，取4μg纯化的抗体进行还原性SDS-PAGE，电泳图如图1所示。在还原性SDS-PAGE后显示两条带，1条为约24KD的轻链(序列如SEQ ID NO:11所示)，另一条为约49KD的重链(序列如SEQ ID NO:12所示)。
实施例2
实施例1得到的抗体(具有序列如SEQ ID NO:11以及12所示的轻链和重链)虽然具备结合NS1蛋白的能力，但亲和力和抗体活性均不够理想，因而申请人通过对该抗体的轻链CDR及重链CDR进行突变。
经分析，重链的互补决定区(WT)：
CDR-VH1为G-Y-S(X1)-F-T-D(X2)-Y-W-I-G；
CDR-VH2为D-M-V(X1)-P-G-D-L(X2)-Y-I-N-Y-Q(X3)-E-K-F-K-G；
CDR-VH3为T-N-F-I(X1)-T-V(X2)-G-G-L(X3)-D-Y；
轻链的互补决定区：
CDR-VL1为K-S-S-Q(X1)-S-L-L-E(X2)-S-D-G-R(X3)-T-Y-L-N；
CDR-VL2为L-V-T(X1)-K-V(X2)-D-S；
CDR-VL3为W-Q(X1)-G-T-H-F-A(X2)-H-T；
其中，X1、X2、X3均为突变位点。
表1与抗体活性有关的突变位点
在突变后对抗体活性进行检测，包被液稀释羊抗鼠IgG 1μg/ml进行微孔板包被，每孔100μL，4℃过夜；次日，洗涤液清洗2次，拍干；加入封闭液(20％BSA+80％PBS)，每孔120μL，37℃，1h，拍干；加入稀释后的DN单克隆抗体，100μL/孔，37℃,60min；甩掉板内液体，拍干，加入20％鼠阴性血封闭，每孔120μl，37℃，1h；甩掉板内液体，拍干，加入稀释10倍的(DN-(I+II+III+IV)-NS)抗原(公司自产昆虫表达)，每孔100μL，37℃,40min；洗涤液清洗5次，拍干；加入标记HRP的另一株DN单克隆抗体(1:4K)，每孔100μL，37℃，30min；加入显色液A液(50μL/孔)，加入显色液B液(50μL/孔)，10min；加入终止液，50μL/孔；酶标仪上450nm(参考630nm)处读OD值。部分结果如下：
表2抗体活性分析数据
抗体浓度(ng/ml) WT 突变1 突变2 突变3 突变4 突变5
1000 2.316 2.403 2.075 0.847 0.514 -
333.333 2.376 2.413 2.153 0.347 0.061 -
111.111 2.198 2.331 1.998 0.056 - -
37.037 1.655 1.806 1.414 - - -
12.346 0.838 0.970 0.645 - - -
4.115 0.448 0.453 0.234 - - -
1.372 0.297 0.315 0.147 - - -
0 0.163 0.191 0.078 - - -
“-”代表无活性。
从上表可知，突变1的活性效果最佳，因而以突变1作为骨架序列筛选效价较好的突变位点(保证筛选得到的抗体活性与突变1相近，抗体活性±10％)，部分结果如下。
表3与抗体亲和力有关的突变位点
亲和力分析
利用AMC传感器，纯化出来的抗体用PBST稀释到10ug/ml，DN质控品重组蛋白(公司自产重组抗原)用PBST进行梯度稀释：465.1nmol/ml、232.6nmol/ml、116.3nmol/ml、58.1nmol/ml、29.1nmol/ml、14.5nmol/ml、7.27nmol/ml、0nmol/ml。
运行流程：缓冲液1(PBST)中平衡60s，抗体溶液中固化抗体300s，缓冲液2(PBST)中孵育180s，抗原溶液中结合420s，缓冲液2中解离1200s，用10mM pH 1.69GLY溶液及缓冲液3进行传感器再生，输出数据。KD表示平衡解亲常数即亲和力；Kon表示结合速率；Koff表示解离速率。
表4亲和力分析数据
从表4可以看出，表3中列出的突变位点对抗体的亲和力影响不大。
为验证上述结果，以WT作为骨架序列重复上述实验，进行突变位点的亲和力验证，部分结果如下。
表5以WT为骨架进行的突变
表6亲和力分析数据
位点 KD(M) Kon(1/Ms) Koff(1/S)
WT 5.884E-08 6.771E+03 3.984E-04
WT 1-1 1.282E-08 4.568E+03 5.856E-05
WT 1-4 2.798E-08 5.079E+03 1.421E-04
WT 1-7 6.550E-08 3.528E+03 2.311E-04
WT 1-20 4.587E-08 3.121E+03 1.432E-04
WT 1-30 2.041E-08 7.284E+03 1.487E-04
从表5和表6分析，在保证具有抗体活性的前提下，上述突变位点与其他位点的关联也不大。
最后应说明的是：以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 东莞市朋志生物科技有限公司
<120> 一种NS1蛋白的结合蛋白以及应用
<130> 2010
<160> 12
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 23
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 1
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
1 5 10 15
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys
20
<210> 2
<211> 15
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 2
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<211> 32
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 3
Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Val Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ser Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser
20 25
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<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 6
Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Ile Gly
1 5 10
<210> 7
<211> 30
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 7
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1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
20 25 30
<210> 8
<211> 11
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 8
Trp Gly Arg Gly Thr Ser Leu Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 9
<211> 108
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 9
Lys Arg Ala Asp Ala Ala Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Pro Ser Ser
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Glu Gln Leu Thr Ser Gly Gly Ala Ser Val Val Cys Phe Leu Asn Asn
20 25 30
Phe Tyr Pro Lys Asp Ile Asn Val Lys Trp Lys Ile Asp Gly Ser Glu
35 40 45
Arg Gln Asn Gly Val Leu Asn Ser Trp Thr Asp Gln Asp Ser Lys Asp
50 55 60
Ser Thr Tyr Ser Met Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Lys Asp Glu Tyr
65 70 75 80
Glu Arg His Asn Ser Tyr Thr Cys Glu Ala Thr His Lys Thr Ser Thr
85 90 95
Ser Pro Ile Val Lys Ser Phe Asn Arg Asn Glu Cys
100 105
<210> 10
<211> 330
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 10
Ala Lys Thr Thr Pro Pro Ser Val Tyr Pro Leu Ala Pro Val Cys Gly
1 5 10 15
Asp Thr Thr Gly Ser Ser Val Thr Leu Gly Cys Leu Val Lys Gly Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Leu Thr Trp Asn Ser Gly Ser Leu Ser Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Asp Leu Tyr Thr Leu
50 55 60
Ser Ser Ser Val Thr Val Thr Ser Ser Thr Trp Pro Ser Gln Ser Ile
65 70 75 80
Thr Cys Asn Val Ala His Pro Ala Ser Ser Thr Lys Val Asp Lys Lys
85 90 95
Ile Glu Pro Arg Gly Pro Thr Ile Lys Pro Cys Pro Pro Cys Lys Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Asn Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Ile Lys Asp Val Leu Met Ile Ser Leu Ser Pro Ile Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser Glu Asp Asp Pro Asp Val Gln Ile Ser Trp
145 150 155 160
Phe Val Asn Asn Val Glu Val His Thr Ala Gln Thr Gln Thr His Arg
165 170 175
Glu Asp Tyr Asn Ser Thr Leu Arg Val Val Ser Ala Leu Pro Ile Gln
180 185 190
His Gln Asp Trp Met Ser Gly Lys Glu Phe Lys Cys Lys Val Asn Asn
195 200 205
Lys Asp Leu Pro Ala Pro Ile Glu Arg Thr Ile Ser Lys Pro Lys Gly
210 215 220
Ser Val Arg Ala Pro Gln Val Tyr Val Leu Pro Pro Pro Glu Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Lys Gln Val Thr Leu Thr Cys Met Val Thr Asp Phe Met
245 250 255
Pro Glu Asp Ile Tyr Val Glu Trp Thr Asn Asn Gly Lys Thr Glu Leu
260 265 270
Asn Tyr Lys Asn Thr Glu Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Tyr Phe
275 280 285
Met Tyr Ser Lys Leu Arg Val Glu Lys Lys Asn Trp Val Glu Arg Asn
290 295 300
Ser Tyr Ser Cys Ser Val Val His Glu Gly Leu His Asn His His Thr
305 310 315 320
Thr Lys Ser Phe Ser Arg Thr Pro Gly Lys
325 330
<210> 11
<211> 219
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 11
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
1 5 10 15
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Ser Asn Ser Leu Leu Asp Ser
20 25 30
Asp Gly Lys Thr Tyr Leu Asn Trp Leu Leu Gln Arg Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Arg Leu Ile Tyr Leu Val Thr Lys Ile Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Val Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ser Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Trp Trp Gly
85 90 95
Thr His Phe Pro His Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Val Lys
100 105 110
Arg Ala Asp Ala Ala Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Pro Ser Ser Glu
115 120 125
Gln Leu Thr Ser Gly Gly Ala Ser Val Val Cys Phe Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Lys Asp Ile Asn Val Lys Trp Lys Ile Asp Gly Ser Glu Arg
145 150 155 160
Gln Asn Gly Val Leu Asn Ser Trp Thr Asp Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Met Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Lys Asp Glu Tyr Glu
180 185 190
Arg His Asn Ser Tyr Thr Cys Glu Ala Thr His Lys Thr Ser Thr Ser
195 200 205
Pro Ile Val Lys Ser Phe Asn Arg Asn Glu Cys
210 215
<210> 12
<211> 448
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 12
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Thr
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asp Met Val Pro Gly Asp Leu Tyr Ile Asn Tyr Gln Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Thr Asn Phe Ile Thr Val Gly Gly Leu Asp Tyr Trp Gly Arg Gly Thr
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Ser Leu Thr Val Ser Ser Ala Lys Thr Thr Pro Pro Ser Val Tyr Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Val Cys Gly Asp Thr Thr Gly Ser Ser Val Thr Leu Gly
130 135 140
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145 150 155 160
Ser Gly Ser Leu Ser Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Asp Leu Tyr Thr Leu Ser Ser Ser Val Thr Val Thr Ser Ser Thr
180 185 190
Trp Pro Ser Gln Ser Ile Thr Cys Asn Val Ala His Pro Ala Ser Ser
195 200 205
Thr Lys Val Asp Lys Lys Ile Glu Pro Arg Gly Pro Thr Ile Lys Pro
210 215 220
Cys Pro Pro Cys Lys Cys Pro Ala Pro Asn Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Ile Phe Pro Pro Lys Ile Lys Asp Val Leu Met Ile Ser Leu
245 250 255
Ser Pro Ile Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Glu Asp Asp Pro
260 265 270
Asp Val Gln Ile Ser Trp Phe Val Asn Asn Val Glu Val His Thr Ala
275 280 285
Gln Thr Gln Thr His Arg Glu Asp Tyr Asn Ser Thr Leu Arg Val Val
290 295 300
Ser Ala Leu Pro Ile Gln His Gln Asp Trp Met Ser Gly Lys Glu Phe
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Asn Asn Lys Asp Leu Pro Ala Pro Ile Glu Arg Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Pro Lys Gly Ser Val Arg Ala Pro Gln Val Tyr Val Leu
340 345 350
Pro Pro Pro Glu Glu Glu Met Thr Lys Lys Gln Val Thr Leu Thr Cys
355 360 365
Met Val Thr Asp Phe Met Pro Glu Asp Ile Tyr Val Glu Trp Thr Asn
370 375 380
Asn Gly Lys Thr Glu Leu Asn Tyr Lys Asn Thr Glu Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Tyr Phe Met Tyr Ser Lys Leu Arg Val Glu Lys Lys
405 410 415
Asn Trp Val Glu Arg Asn Ser Tyr Ser Cys Ser Val Val His Glu Gly
420 425 430
Leu His Asn His His Thr Thr Lys Ser Phe Ser Arg Thr Pro Gly Lys
435 440 445

Claims (10)

1.一种包含抗原结合结构域的分离的结合蛋白，其特征在于，所述抗原结合结构域包括选自下述氨基酸序列的至少一个互补决定区，或与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少80％的序列同一性且与NS1蛋白具有KD≤6.55×10-8mol/L的亲和力；
互补决定区CDR-VH1为G-Y-X1-F-T-X2-Y-W-I-G，其中，
X1是S或T，X2是D或E；
互补决定区CDR-VH2为D-M-X1-P-G-D-X2-Y-I-N-Y-X3-E-K-F-K-G，其中，
X1是F或V，X2是V、L或I，X3是Q或N；
互补决定区CDR-VH3为T-N-F-X1-T-X2-G-G-X3-D-Y，其中，
X1是I或L，X2是L或V，X3是V、L或I；
互补决定区CDR-VL1为K-S-S-X1-S-L-L-X2-S-D-G-X3-T-Y-L-N，其中，
X1是Q或N，X2是E或D，X3是R或K；
互补决定区CDR-VL2为L-V-X1-K-X2-D-S，其中，
X1是S或T，X2是V、I或L；
互补决定区CDR-VL3为W-X1-G-T-H-F-X2-H-T，其中，
X1是Q、Y或W，X2是A或P；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是T；
所述互补决定区CDR-VH2中，X1是F；
所述互补决定区CDR-VH3中，X2是L；
所述互补决定区CDR-VL1中，X2是D；
所述互补决定区CDR-VL2中，X1是S；
所述互补决定区CDR-VL3中，X2是P；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH1中，X2是D；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH1中，X2是E；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是V，X3是Q；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是V，X3是N；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是L，X3是Q；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是L，X3是N；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是I，X3是Q；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH2中，X2是I，X3是N；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是V；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是L；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I，X3是I；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是V；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是L；
进一步地，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L，X3是I；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是Q，X2是R；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是Q，X2是K；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是N，X2是R；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL1中，X1是N，X2是K；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是V；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是I；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是L；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Q；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Y；
进一步地，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是W。
2.根据权利要求1所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白中包括至少3个CDRs；或者，所述结合蛋白包括至少6个CDRs。
3.根据权利要求1所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白为纳米抗体、F(ab’)2、Fab’、Fab、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位中的一种；
进一步地，所述结合蛋白包括序列依次如SEQ ID NO:1-4所示的轻链骨架区FR-L1、FR-L2、FR-L3及FR-L4，和/或，序列依次如SEQ ID NO:5-8所示的重链骨架区FR-H1、FR-H2、FR-H3及FR-H4。
4.根据权利要求3所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白还包含抗体恒定区序列；
进一步地，所述恒定区序列选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD任何其中之一恒定区的序列；
进一步地，所述恒定区的种属来源为牛、马、乳牛、猪、绵羊、山羊、大鼠、小鼠、狗、猫、兔、骆驼、驴、鹿、貂、鸡、鸭、鹅、火鸡、斗鸡或人；
进一步地，所述恒定区来源于小鼠；
轻链恒定区序列如SEQ ID NO:9所示；
重链恒定区序列如SEQ ID NO:10所示。
5.一种分离的核酸，其特征在于，所述核酸编码权利要求1-4任一项所述的结合蛋白。
6.一种载体，其特征在于，其包含权利要求5所述的核酸。
7.一种宿主细胞，其特征在于，所述宿主细胞包括权利要求5所述的核酸或权利要求6所述的载体。
8.一种生产权利要求1-4任一项所述的结合蛋白的方法，其特征在于，包括如下步骤：
在培养基中培养权利要求7所述的宿主细胞，从培养基中或从所培养的宿主细胞中回收产生的结合蛋白。
9.权利要求1-4任一项所述的结合蛋白在制备用于检测登革热感染的产品中的应用。
10.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1-4任一项所述的结合蛋白、权利要求5所述的分离的核酸或权利要求6所述的载体中的一种或多种；
优选地，所述试剂盒还包括用于标记所述结合蛋白的标记。
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