CN108949984B - 基因desi2在三阴乳腺癌诊断、预后评估及治疗中的应用 - Google Patents

基因desi2在三阴乳腺癌诊断、预后评估及治疗中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了DESI2在三阴乳腺癌诊断、预后评估及治疗中的应用。本发明发现基因的表达水平与乳腺癌的预后密切相关,这提示了DESI2不仅具有成为乳腺癌辅助诊断标记物的潜能,还可以通过其表达水平变化来进行预后评估。此外,体内外实验还证明沉默DESI2基因的表达水平能显著抑制乳腺癌的侵袭、转移能力。提供了DESI2基因的一条靶向DESI2基因的反义寡核苷酸链可用于制备治疗乳腺癌疾病的药剂。说明本发明DESI2基因可为乳腺癌患者观察、监测以及用于预后评估等,具有客观性和准确性等优点,可用于临床指导,实现乳腺癌的个体化治疗。

Description

基因DESI2在三阴乳腺癌诊断、预后评估及治疗中的应用
技术领域
本发明属于分子生物学和肿瘤药物领域,涉及基因DESI2在乳腺癌诊断、治疗及预后评估中的应用。
背景技术
乳腺癌是全球女性常见恶性肿瘤,在女性恶性肿瘤中致死率居首位,大量女性因为乳腺癌的转移复发而死亡。由于乳腺癌的高度异质性,导致了乳腺癌患者在临床表现、治疗反应性和预后等方面存在显著差异。
近年来,乳腺癌分子亚型概念的提出,对于临床个体化治疗的指导和预后的判断可以起到重要作用。细胞内多种蛋白的周转率、活性、再生以及定位,都与肿瘤的发生与演进密切相关,其功能异常与包括肿瘤在内的多种疾病的发生密切相关。肿瘤是一类细胞周期性疾病,许多癌基因、抑癌基因直接参与细胞周期的调控,或者本身就是细胞周期调控机制的主要成分。因此,明确乳腺癌患者分子亚型不仅为乳腺癌个体化治疗方案提供支持,也为研究乳腺癌分子机制提供了科学依据。
乳腺癌中恶性程度最高的一种亚型,称为三阴性乳腺癌,是以雌激素受体(ER)阴性/黄体激素受体(PR)阴性/表皮生长因子受体(HER2)阴性为特征,三阴乳腺癌中有80-90%属于basal-like 型,其发病率约占乳腺癌中的17%~25%。由于其缺乏抗雌激素和抗HER2靶向治疗的靶标,以及有极高的概率会发生转移复发,它是预后最差的一种乳腺癌类型。因此对三阴乳腺癌需要尽早发现尽早治疗,越早发现治愈率将大大提高。然而,目前临床上并没有特异诊断、治疗、预后乳腺癌的分子标志物。
发明内容
本发明目的之一在于提供定量检测DESI 2基因的试剂在制备诊断、预后评估三阴乳腺癌的产品中的应用。
本发明另一目的在于提供抑制DESI 2表达的试剂在制备治疗或辅助治疗三阴乳腺癌的产品中的应用。
本发明所采取的技术方案是:
定量检测DESI 2的试剂在制备乳腺癌检测、辅助检测、或/和乳腺癌预后评估的产品中的应用。
进一步的,所述定量检测DESI 2的试剂选自定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂、定量检测DESI 2的蛋白表达水平的试剂中的至少一种。
进一步的,所述定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂选自定量检测DESI 2的引物。
进一步的,所述定量检测DESI 2的引物为:
DESI2-QF:CCTTCAGCAACGAAGTGGCACA(SEQ ID NO:1);
DESI2-QR:GGATCTGAATGGAGTCCAGGAG(SEQ ID NO:2)。
进一步的,所述的乳腺癌为三阴乳腺癌。
抑制DESI 2表达的试剂在制备治疗或辅助治疗乳腺癌的产品中的应用。
进一步的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自抑制DESI 2 RNA转录的试剂、或抑制DESI 2蛋白表达的试剂中的至少一种。
进一步的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自沉默DESI 2表达的siRNA、沉默DESI 2表达的shRNA、沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链中的至少一种。
进一步的,所述沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链选自以下至少一种:
DESI2-AON#1序列: GCGAGGAATCTCTTTC(SEQ ID NO :5);
DESI2-AON#2序列:CGGAGGCCGCTCTCAC(SEQ ID NO :6);
DESI2-AON#4序列:CTGAATGAAAAACTCC(SEQ ID NO :8);
DESI2-AON#5序列:GGAGCTGAAGTAGGCA(SEQ ID NO :9)。
进一步的,所述乳腺癌为三阴乳腺癌。
本发明的有益效果是:
本发明发现了DESI2基因表达与三阴乳腺癌密切相关,而且从生存分析中发现DESI2基因的表达水平与乳腺癌的预后密切相关,这提示了DESI2不仅具有成为乳腺癌辅助诊断标记物的潜能,还可以通过其表达水平变化来进行预后评估。此外,体内外实验还证明沉默DESI2基因的表达水平能显著抑制乳腺癌的侵袭、转移能力。提供了DESI2基因的一条靶向DESI2基因的反义寡核苷酸链可用于制备治疗乳腺癌疾病的药剂。说明本发明DESI2基因可为乳腺癌患者观察、监测以及用于预后评估等,具有客观性和准确性等优点。
附图说明
图1 为DESI2基因在乳腺癌中表达量差异的箱形图;图1的A和B对TCGA(TheCancer Genome Atlas)数据库中的数据分析得出,在600例非三阴乳腺癌组织(non-TNBC)以及115例三阴乳腺癌肿瘤组织(TNBC)中,三阴乳腺癌的DESI2的mRNA表达水平显著高于非三阴乳腺癌,且在分子亚型中basal-like(简称BL)亚型中尤为显著;图1的C对METABRIC数据库分析得出ER-HER2-(雌激素受体阴性、人表皮生长因子受体2阴性)的DESI2表达水平显著升高;图1的D对GOBO数据库中分析得出乳腺癌组织中basal亚型的DESI2的表达水平高于其它亚型;图1的E为 GOBO数据库中在乳腺癌的细胞系中相对于非basal亚型乳腺癌细胞系,DESI2基因在basal亚型乳腺癌细胞系中表达水平较高;(注:ER:雌激素受体;PR:孕激素受体;HER2:人表皮生长因子受体2;KI67:增殖细胞相关的核抗原;ER-HER2-KI67-:雌激素受体阴性、孕激素受体阴性、人表皮生长因子受体2阴性、增殖细胞相关的核抗原阴性;ER-HER2-KI67+:雌激素受体阴性、人表皮生长因子受体2阴性、增殖细胞相关的核抗原阳性;乳腺癌的4种分子亚型:LuA:luminal A型(LuA),luminal B型(LuB),HER-2过表达型(Her2),basal-like型(BL); NL:normal-like)。
图2 为DESI2基因的mRNA相对表达的柱状图:图2的A为相对于非三阴乳腺癌(non-TNBC)细胞系,DESI2 mRNA表达水平在三阴乳腺癌(TNBC)细胞系较高;图2的B为相对于非三阴乳腺癌(non-TNBC)肿瘤组织,DESI2 mRNA表达水平在三阴乳腺癌(TNBC)肿瘤组织较高;
图3为DESI2基因的蛋白高表达水平与乳腺癌差的预后相关;图3的A为DESI2染色阳性率在三阴乳腺癌中相对较高;图3的B为DESI2染色强度大于6分以上为高表达,低于6分的为DESI2低表达;图3的C为相对于无转移的乳腺癌患者(Met-),在所有有转移的乳腺癌患者(Met+)中,三阴乳腺癌患者(TNBC patients)发生肿瘤转移比例较大,且其DESI2高表达患者发生肿瘤转移较大;图3的D为所有乳腺癌患者中,DESI2高表达(DESI2 High)患者较DESI2低表达(DESI2 Low)患者的无复发生存率(RFS,Relapse-free survival)明显较低;图3的E为三阴乳腺癌患者(TNBC patients)中,DESI2高表达患者较DESI2低表达患者的无复发生存率(RFS,Relapse-free survival)明显较低;图3的F为在所有乳腺癌患者中,DESI2高表达患者较DESI2低表达患者的无复发生存时间较短。
图4的A和B分别为DESI 2基因的mRNA相对表达量柱状图和免疫印迹图,验证筛选出一段最佳的DESI2反义寡核苷酸链序列(DESI2-AON#1)能有效下调DESI2的表达;
图5为DESI2上调和下调表达对乳腺癌侵袭和迁移的影响,其中A、B图为体外试验乳腺癌的划痕实验;C、D图为体外试验乳腺癌的transwell实验,结果显示高表达DESI2能促进乳腺癌细胞侵袭和迁移(A、C图),而下调DESI2(DESI2-AON#1)能抑制乳腺癌细胞的侵袭和迁移(B、D图);
图6为DESI2对小鼠体内肿瘤转移的作用检测图;其中A图为裸鼠体内肿瘤转移模型实验,DESI2-AON#1显著抑制乳腺癌细胞在肺器官的肿瘤细胞定殖及克隆形成能力;B图为活体荧光成像仪检测各组小鼠体内肿瘤形成情况显示,DESI2-AON#1有效抑制乳腺癌细胞在肺器官的肿瘤细胞定殖及克隆形成能力。
具体实施方式
定量检测DESI 2的试剂在制备乳腺癌检测、辅助检测、或/和乳腺癌预后评估的产品中的应用。
优选的,所述定量检测DESI 2的试剂选自定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂、定量检测DESI 2的蛋白表达水平的试剂中的至少一种。
优选的,所述定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂选自定量检测DESI 2的引物或探针。
优选的,所述定量检测DESI 2的引物为:
DESI2-QF:CCTTCAGCAACGAAGTGGCACA(SEQ ID NO:1);
DESI2-QR:GGATCTGAATGGAGTCCAGGAG(SEQ ID NO:2)。
优选的,所述产品为试剂盒或芯片。
优选的,所述的乳腺癌为三阴乳腺癌。
抑制DESI 2表达的试剂在制备治疗或辅助治疗乳腺癌的产品中的应用。
优选的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自抑制DESI 2 RNA转录的试剂、或抑制DESI 2蛋白表达的试剂中的至少一种。
优选的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自沉默DESI 2表达的siRNA、沉默DESI 2表达的shRNA、沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链中的至少一种。
优选的,所述沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链选自以下至少一种:
DESI2-AON#1序列: GCGAGGAATCTCTTTC(SEQ ID NO :5);
DESI2-AON#2序列:CGGAGGCCGCTCTCAC(SEQ ID NO :6);
DESI2-AON#4序列:CTGAATGAAAAACTCC(SEQ ID NO :8);
DESI2-AON#5序列:GGAGCTGAAGTAGGCA(SEQ ID NO :9)。
优选的,所述治疗或辅助治疗乳腺癌包括抑制乳腺癌侵袭、迁移或/和转移。
优选的,所述产品为药剂。
优选的,所述乳腺癌为三阴乳腺癌。
一种乳腺癌检测、辅助检测、或/和乳腺癌预后评估的产品,所述产品中含有定量检测DESI 2的试剂。
优选的,所述定量检测DESI 2的试剂选自定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂、定量检测DESI 2的蛋白表达水平的试剂中的至少一种。
优选的,所述定量检测DESI 2的RNA转录水平的试剂选自定量检测DESI 2的引物或探针。
优选的,所述定量检测DESI 2的引物为:
DESI2-QF:CCTTCAGCAACGAAGTGGCACA(SEQ ID NO:1);
DESI2-QR:GGATCTGAATGGAGTCCAGGAG(SEQ ID NO:2)。
优选的,所述产品为试剂盒或芯片。
优选的,所述的乳腺癌为三阴乳腺癌。
一种治疗或辅助治疗乳腺癌的产品,所述产品中含有抑制DESI 2表达的试剂。
优选的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自抑制DESI 2 RNA转录的试剂、或抑制DESI 2蛋白表达的试剂中的至少一种。
优选的,所述抑制DESI 2表达的试剂选自沉默DESI 2表达的siRNA、沉默DESI 2表达的shRNA、沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链中的至少一种。
优选的,所述沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链选自以下至少一种:
DESI2-AON#1序列: GCGAGGAATCTCTTTC(SEQ ID NO :5);
DESI2-AON#2序列:CGGAGGCCGCTCTCAC(SEQ ID NO :6);
DESI2-AON#4序列:CTGAATGAAAAACTCC(SEQ ID NO :8);
DESI2-AON#5序列:GGAGCTGAAGTAGGCA(SEQ ID NO :9)。
优选的,所述产品为药剂。
优选的,所述乳腺癌为三阴乳腺癌。
一种抑制乳腺癌侵袭、迁移或/和转移的产品,所述产品中含有抑制DESI 2表达的试剂。
下面结合具体实施例对本发明作进一步的说明。
实施例1 DESI2在乳腺癌中表达上调
1.TCGA、METABRIC、GOBO数据库分析
方法:运用SPSS 统计学分析法,分别对TCGA、METABRIC、GOBO数据库中乳腺癌组织的mRNA水平进行整合分析。统计学分析用 SPSS20.0 统计软件进行处理。
结果:从整合的临床组织样品TCGA数据中,可以明确三阴乳腺癌肿瘤组织的DESI2基因RNA水平高于非三阴肿瘤组织(图1的A),且在分子亚型中basal-like亚型(BL)中尤为显著(图1的B),而其他乳腺癌肿瘤组织相对表达较低;从METABRIC数据库中整合的临床组织样品显示,ER-HER2-亚型乳腺癌的DESI2表达水平相对表达水平较高(图1的C);从GOBO数据库中整合的乳腺癌临床组织样品和乳腺癌细胞系显示,basal亚型乳腺癌临床组织和basal亚型乳腺癌细胞系相对表达水平较高(图1的D和E)。
分析:SPSS统计分析结果表明,TCGGA、METABRIC、GOBO数据资料中的三阴乳腺癌患者肿瘤组织和三阴乳腺癌细胞系中的DESI2的表达明显高于其他的非三阴乳腺癌组织和其他细胞系(P<0.05),在乳腺癌中检测到DESI2高表达更能确诊为乳腺癌。TCGGA、METABRIC、GOBO数据库资料分析提示DESI2可作为辅助诊断的指标。
2.qRT-PCR检测乳腺癌组织中DESI2基因的mRNA水平
本发明使用qRT-PCR对乳腺癌组织中的DESI2进行验证。
方法:
(1)乳腺癌组织来源:从中山大学肿瘤防治中心收集11例乳腺癌患者肿瘤组织,其中包括4例非三阴乳腺癌组织(non-TNBC)和7例三阴乳腺癌组织(TNBC)。
(2)细胞系和细胞培养:14株乳腺癌细胞系:T47D、MDAMB-415、MCF-7、MDAMB-453、ZR-75-1、SK-BR-3、MCF10A、HCC1806、HCC1937、MDA-MB-231、MDA-MB-468、BT-549、SUM159PT、BT-20。将细胞培养于含有10%FBS的DMEM(Dulbecco's Minimum Essential Medium,Invitrogen,Carlsbad,USA)培养基中,放置37℃的5% CO2培养箱。
(3)实时荧光定量PCR:收集上述组织和14种细胞,分别利用Trizol提取RNA,使用MMLV反转录酶(Promega )进行反转录合成cDNA,使用2× SYBR mix (Roche)对各组细胞中的 DESI2的表达水平进行qRT-PCR检测。
以GAPDH做内参。所用qRT-PCR引物为:
DESI2-QF:CCTTCAGCAACGAAGTGGCACA(SEQ ID NO:1);
DESI2-QR:GGATCTGAATGGAGTCCAGGAG(SEQ ID NO:2);
GAPDH-QF:GCACCGTCAAGGCTGAGAAC(SEQ ID NO:3);
GAPDH-QR:TGGTGAAGACGCCAGTGGA(SEQ ID NO:4);
将每个样本获得的DESI2基因的Ct值减去其内参基因GAPDH的Ct值得到△ Ct,结果用2-△△Ct表示。
结果:
定量PCR结果显示,三阴乳腺癌(TNBC)肿瘤组织的DESI2的mRNA表达水平明显高于非三阴乳腺癌(non-TNBC)肿瘤组织(图2的A);相对于非三阴乳腺癌细胞(T47D、MDAMB-415、MCF-7、MDAMB-453、ZR-75-1、SK-BR-3),DESI2基因在三阴乳腺癌细胞系(MCF10A、HCC1937、MDA-MB-231、MDA-MB-468、BT-549、SUM159PT、BT-20)显著高表达(图2的B)。
上述结果说明,在三阴乳腺癌病人(TNBC patients)的肿瘤组织和三阴乳腺癌细胞系中DESI2高表达;因此,用本发明的诊断试剂盒检测到临床样本中DESI2高表达,更能确诊为该组织样本为三阴乳腺癌(TNBC)。临床样本的分析提示DESI2可作为辅助诊断的指标。
3.免疫组化检测DESI2基因蛋白在乳腺癌组织切片中的表达水平
方法:
对选取的338例乳腺癌组织切片,使用DESI2抗体进行免疫组化染色。免疫组化方法为:
(1)60℃烤片1 h 30 min;
(2)脱蜡及复水:二甲苯两缸,每次15min;100%乙醇两次,95%乙醇一次,75%乙醇一次,蒸馏水洗两次,每次各3min;
(3)切片于湿盒内,加3%双氧水,室温25min,蒸馏水洗两次,每次各3min;
(4)柠檬酸盐修复液,高压修复,冒气后3min;
(5)切片在修复液中自然冷却至室温;
(6)1×PBST,3min×3次;
(7)甩干,加A液(非特异性染色阻断剂)于室温,湿盒内15min;
(8)弃封闭液,加一抗;
(9) 1×PBST,3min×3次,甩干;
(10)加B液(生物素羊抗兔/鼠IgG)15min,1×PBST,3min×3次,甩干;
(11)加C液(链霉卵白素)15min,1×PBST,3min×3次;
(12)DAB显色,自来水终止染色;
(13)自来水流水漂洗;
(14)苏木素复染3min,自来水刷洗至无紫色;
(15)95%盐酸酒精分化10~15s,自来水漂洗返蓝45min;
(16)60%乙醇,80%乙醇,100%乙醇脱水2min;
(17)放入二甲苯2min,透明化后,未干时滴加100uL树酯,封片。
结果:
肿瘤细胞比例(以DAB显色为例)的标准:高倍镜(20×)下综合染色强度和阳性细胞所占比例进行半定量测定,染色强度评分标准: 不着色0分,黄色1分,棕黄色2分,黄褐色3分;阳性细胞所占比例评分标准: 无阳性细胞者0分,阳性细胞数<10%者1分; 10%~35%者2分,36%~75%者3分,≥75%者4分。两种评分相乘得到分值 SI(Staining Index):0~1分为Negative; 2~4分为 Weak;6~8分为 Moderate;9~12分为 strong。
根据以上评分得出,DESI2染色在乳腺癌患者呈阳性,高表达DESI2基因(DESI2-H)的乳腺癌患者在三阴乳腺癌中尤为显著(图3的A和B)。
4. DESI2高表达水平与差的预后相关
方法:
所有统计学分析用 SPSS20.0 统计软件进行处理。采用 Kaplan-Meier 方法绘制生存分析曲线,并采用 log-rank 检验方法检测其统计学意义。检验系数P<0.05认为在统计学上有显著性差异。运用 SPSS 统计软件分析 DESI2的表达与肿瘤转移和乳腺癌患者无复发生存率(Relapse-free Survival,RFS)的关系。
结果:
如图 3的C 所示,相对于无转移的乳腺癌患者(Met-),在所有有转移的乳腺癌患者(Met+)中,三阴乳腺癌患者(TNBC patients)发生肿瘤转移比例较大,且其DESI2高表达患者发生肿瘤转移较大;如图 3的D和E所示,临床选取的338例标本中DESI2高表达(DESI2High)的乳腺癌病人比DESI2低表达(DESI2 Low)的乳腺癌病人的无复发生存率(RFS,Relapse-free survival)明显较低,且在三阴乳腺癌患者(TNBC patients)中DESI2高表达的乳腺癌病人比DESI2低表达的乳腺癌病人的无复发生存率(RFS)较低;根据图3的F显示,高表达的DESI2基因的乳腺癌患者中,其无复发生存时间亦较短。
分析:SPSS统计分析结果显示DESI2高表达与乳腺癌病人无复发生存率负相关(P<0.05),且在有肿瘤转移中DESI2高表达比例较大,DESI2高表达明确指示较差的生存预后。因此,DESI2可作为患者生存预后的潜在指标。
实施例 2:通过靶向DESI2基因的反义寡核苷酸链技术下调DESI2基因的表达
方法:三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231具有较高的DESI2表达水平,因此将其应用于RNA干扰实验。使用靶向DESI2基因的反义寡核苷酸链转染MDA-MB-231细胞,转染试剂使用Lipofectamine TM 2000 (Invitrogen),按照试剂说明书进行转染。转染后48小时,抽提细胞的RNA和裂解细胞获得蛋白质,运用qRT-PCR方法和免疫印迹法检测基因沉默效果。
结果:5个针对DESI2基因干扰分子被应用于沉默DESI2的表达,从图4的A和B中可知,DESI2-AON#1被证实能够有效地稳定沉默DESI2基因的表达。而本发明所用到5个DESI2-AON2序列分别为:
DESI2-AON#1序列: GCGAGGAATCTCTTTC(SEQ ID NO :5)
DESI2-AON#2序列:CGGAGGCCGCTCTCAC(SEQ ID NO :6)
DESI2-AON#3序列:TCCGGATGAGGCACCT(SEQ ID NO :7)
DESI2-AON#4序列:CTGAATGAAAAACTCC(SEQ ID NO :8)
DESI2-AON#5序列:GGAGCTGAAGTAGGCA(SEQ ID NO :9)。
实施例 3:构建稳定高表达 DESI2的细胞系和转染DESI2-AON#1的细胞系。
1.构建稳定的DESI2高表达的细胞株
(1)构建DESI2的表达质粒
使用本发明前部分的引物,扩增DESI2前体的cDNA全长序列,将纯化的DESI2全长序列连接到pLVX-IRES-Hygro-DESI2表达载体(购自Clontech公司),获得含有DESI2序列的过表达质粒pLVX-IRES-Hygro-DESI2,转导到三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231和BT549,工作浓度为5nM。使用Western Blot和qRT-PCR方法对表达的蛋白进行验证。
(2)转染人乳腺癌细胞MDA-MB-231和BT549
分别利用Lipofectamine TM 2000(Invitrogen)和优化的质粒(Invitrogen,K4975-00)将获得的pLVX-IRES-Hygro-DESI2,以及对照的pLVX-IRES-Hygro空载体转入293FT细胞,并于6小时后加入DMEM培养基辅以10%的胎牛血清,总体积共18毫升,并在36小时及60小时后收集慢病毒上清,转导进入三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231和BT549细胞。
用Hygro(0.5μg/mL;Sigma-aldrich)筛选10天左右,得到稳定的DESI2高表达的细胞株MDA-MB-231 DESI2和BT549 DESI2,对照细胞株为MDA-MB-231 Vector和 BT549Vector。
(3)培养稳定的高表达DESI2的细胞株
使用辅以10%的胎牛血清的DMEM培养基(Gibco BRL)培养三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231和BT549,并在37℃的含5%浓度二氧化碳的无菌细胞培养箱中进行培养。
(4)验证稳定的高表达DESI2的细胞株
使用Western Blot和qRT-PCR方法对表达的蛋白进行验证。
2.构建DESI2-AON#1低表达的细胞株
(1)构建DESI2-AON#1的表达质粒,分别用阴性对照AON-Vector及可以下调DESI2的DESI2-AON#1处理三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231和BT549,工作浓度为5nM。
结果:分别获得对照组细胞MDA-MB-231 AON-Vector,BT549 AON-Vector和沉默DESI2的细胞MDA-MB-231 DESI2-AON#1、BT549 DESI2-AON#1。
实施例4:DESI2促进乳腺癌细胞的侵袭、迁移和转移
1.体外实验:划痕实验
方法:先用marker笔在6孔板背后,用直尺比着,均匀的划横线,道与道之间大约隔0.5~1cm,并横穿过孔,每孔至少穿过3条线。在孔中加入约5×105个细胞,过夜。第二天用枪头比着直尺,枪头要垂直不能倾斜,尽量垂直于背后的横线划痕。细胞用PBS洗3次,去除划下的细胞,加入无血清培养基,放入37℃ 5%CO2培养箱培养。0小时和24小时分别取样并拍照。
结果:如图5的A图所示,和空载体对照细胞相比,DESI2的高表达对于乳腺癌细胞的迁移有显著的促进作用;图5的B图显示,DESI2的下调表达对于乳腺癌细胞的迁移有显著的抑制作用。
2.体外实验:transwell实验
方法:消化细胞,用基础培养基稀释细胞浓度至2×105个/mL,于24孔板中加入500uL 辅以20%的胎牛血清的DMEM培养基,transwell小室中加入200uL细胞悬液。放入37℃5%CO2培养箱培养。24h后,用PBS洗小室;固定,经10%甲醛固定5分钟,再用1%的结晶紫染色30s,用自来水清洗,用棉签轻轻擦拭小室里的细胞,晾干,拍照。
结果:如图5的C图所示,和空载体对照细胞相比,DESI2的高表达对于乳腺癌细胞的侵袭有显著的促进作用;图5的D图显示,DESI2的下调表达对于乳腺癌细胞的侵袭有显著的抑制作用。
3.体内实验:小鼠体内肿瘤转移模型
方法:通过尾静脉向小鼠体内注射2×105个MDA-MB-231或BT549细胞。3 天后将小鼠分成两组(n = 10),分别向小鼠腹腔注射DESI2-AON#1或sramble阴性对照。3天/次,每次注射100μL,浓度为2mg/ml。监测注射后35天内肺内转移肿瘤结节的形成情况。
结果:图6的A和B结果显示,注射DESI2-AON#1 沉默 DESI2的裸鼠在肺器官中形成的肿瘤的能力明显低于对照组,甚至检测不到肿瘤细胞。采用HE 染色方法发现,注射DESI2-AON#1小鼠在肺器官形成的肿瘤克隆数、肿瘤大小和结节数明显低于对照组,部分小鼠没有发现肿瘤结节(图6 A)。图6的B的活体荧光成像仪检测的结果显示,尾静脉注射DESI2-AON#1沉默 DESI2的小鼠在肺器官中形成的肿瘤的能力明显低于对照组,甚至检测不到肿瘤细胞。
分析:用DESI2-AON#1处理后降低乳腺癌细胞在肺器官肿瘤形成能力。结果还表明DESI2-AON#1具有抑制乳腺癌细胞转移的效果。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含本发明的保护范围之内。
SEQUENCE LISTING
<110> 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所)
广州杰尔克生物技术有限公司
<120> 基因DESI2在三阴乳腺癌诊断、预后评估及治疗中的应用
<130>
<160> 9
<170> PatentIn version 3.5
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<400> 9
ggagctgaag taggca 16

Claims (1)

1.抑制DESI 2表达的试剂在制备治疗或辅助治疗三阴乳腺癌的产品中的应用,所述抑制DESI 2表达的试剂为沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链,所述沉默DESI 2表达的反义寡核苷酸链为:DESI2-AON#1序列: GCGAGGAATCTCTTTC。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112575081B (zh) * 2019-09-28 2022-08-19 中国医学科学院肿瘤医院 一种长链非编码rna分子在诊断和/或治疗三阴性乳腺癌中的用途
CN112646886B (zh) * 2020-12-23 2022-10-18 江门市中心医院 Foxd1在侵袭性乳腺癌中的应用
CN113274502B (zh) * 2021-05-05 2023-01-03 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所) 用于特定型三阴乳腺癌免疫治疗的组合物
CN113667748B (zh) * 2021-07-19 2023-07-25 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所) circIKBKB的抑制剂及其检测试剂在乳腺癌骨转移诊断、治疗和预后试剂盒的应用

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014193309A1 (en) * 2013-05-30 2014-12-04 Agency For Science, Technology And Research Method For Determining Cancer Prognosis
CN104531710A (zh) * 2014-12-30 2015-04-22 何劲松 三阴乳腺癌标志物col4a2及其应用
KR20160110104A (ko) * 2015-03-10 2016-09-21 한양대학교 산학협력단 항호르몬제 내성 및 삼중-음성 유방암의 진단 및 치료를 위한 바이오마커 및 이를 포함하는 조성물
CN106834523A (zh) * 2017-03-30 2017-06-13 何东宁 一种通过建立miRNAs表达水平预测三阴性乳腺癌复发转移时间及预后的方法

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20070099209A1 (en) * 2005-06-13 2007-05-03 The Regents Of The University Of Michigan Compositions and methods for treating and diagnosing cancer
CN101130081B (zh) * 2007-08-14 2010-11-03 四川大学 Pnas-4基因在制备抗肿瘤及抗肿瘤辅助药物中的用途
US20110217297A1 (en) * 2010-03-03 2011-09-08 Koo Foundation Sun Yat-Sen Cancer Center Methods for classifying and treating breast cancers
US20170107577A1 (en) * 2014-03-11 2017-04-20 The Council Of The Queensland Institute Of Medical Research Determining Cancer Aggressiveness, Prognosis and Responsiveness to Treatment

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014193309A1 (en) * 2013-05-30 2014-12-04 Agency For Science, Technology And Research Method For Determining Cancer Prognosis
CN104531710A (zh) * 2014-12-30 2015-04-22 何劲松 三阴乳腺癌标志物col4a2及其应用
KR20160110104A (ko) * 2015-03-10 2016-09-21 한양대학교 산학협력단 항호르몬제 내성 및 삼중-음성 유방암의 진단 및 치료를 위한 바이오마커 및 이를 포함하는 조성물
CN106834523A (zh) * 2017-03-30 2017-06-13 何东宁 一种通过建立miRNAs表达水平预测三阴性乳腺癌复发转移时间及预后的方法

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