CN108148836A - 一种肝再生相关长链非编码rna及其抑制剂和应用 - Google Patents

一种肝再生相关长链非编码rna及其抑制剂和应用 Download PDF

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liver regeneration
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张婷
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张春艳
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    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
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Abstract

本发明公开了一种肝再生相关长链非编码RNA及其抑制剂和应用。本发明通过构建的大鼠2/3肝切除模型,采用大鼠lncRNA array v 2.0芯片筛选出肝再生中的差异表达lncRNA,用关联推定法预测lncRNA的功能,筛选出了肝再生相关的1ncRNA TCONS_00042303,其转录本核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,根据该序列,设计并合成了lncRNA TCONS_00042303的抑制剂;本发明提供的抑制剂能够抑制体外培养的BRL‑3A细胞的lncRNA TCONS_00042303表达,促进肝细胞增殖。本发明为治疗肝移植预后辅助治疗提供了新的药物靶点,具有良好的应用前景和理论价值。

Description

一种肝再生相关长链非编码RNA及其抑制剂和应用
技术领域
本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种大鼠肝再生相关lncRNA的筛选方法,本发明还涉及一种肝再生相关长链非编码RNA及其抑制剂,以及在制备调节肝细胞增殖的药物中的应用。
背景技术
肝是机体的重要器官,有储存物质、代谢、生物转化、解毒、造血和合成胆色素等功能。肝受物理因素、化学因素及切除等损伤后,残肝可通过再生能力补偿损伤/丢失的肝组织,恢复肝的结构、重量和体积。肝细胞是肝再生的核心成分,肝再生涉及的细胞活化、增殖及凋亡等生理活动,并与肝功能、生长发育、肝病发生等密切相关,切除肝病变区域是临床治疗肝硬化和肝癌的重要手段,在部分肝切除后,如何有效地激发残余肝的再生潜能是术后病人得以存活的关键。因此,对肝切除或肝损伤诱导的肝再生的分子机制的研究对肝疾病的治疗及药物的开发中都具有十分重要的意义。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是指核苷酸数大于200nt的非编码RNA转录本。lncRNA种类丰富,功能复杂,位于不同的亚细胞核区域,在不同物种间序列保守性低,有组织与发育阶段特异性,同时具有快速进化潜力。lncRNA可转录自基因与非基因区域,包括基因的上游区域、基因间区域、基因内部内含子区域等,大多数的lncRNA被确定是转录和翻译过程中的关键调节因子,在染色质重塑、转录及转录后调节、细胞内物质运输、细胞核亚结构形成、干细胞多能性、体细胞重编程、发育调节、疾病发生等活动中发挥中重要作用。已证实多种疾病尤其是癌症如肝癌、乳腺癌、卵巢癌、胃癌等都涉及到lncRNA的异常表达。研究lncRNA对肝细胞增殖和肝再生的调节作用,对揭示肝再生机制、建立预防和治疗肝病方法等都具有重要理论意义和应用价值。
以RNA为靶点的反义寡核苷酸药物研究已得到越来越多的重视。实验证实以病毒基因、肿瘤发生相关基因、细胞因子以及其他疾病相关基因为靶点的反义寡核苷酸药物有明显的生物学效应。因此,从lncRNA角度筛选新的药物靶点可为治疗相关疾病提供了一种新的治疗策略。
发明内容
本发明的目的提供一种长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)TCONS_00042303的应用方法,具体是利用lncRNA TCONS_00042303为靶点调节肝细胞增殖。
一种肝再生相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),所述lncRNA为lncRNA TCONS_00042303,所述lncRNA TCONS_00042303转录本核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
本发明还提供了一种用于调节肝细胞增殖的抑制剂,所述抑制剂是用于调节lncRNA TCONS_00042303转录本核苷酸序列表达水平的DNA或RNA。
在根据本发明的一个实施方案中,该抑制剂是基于lncRNA TCONS_00042303转录本核苷酸序列设计的siRNA。
在根据本发明的一个实施方案中,该抑制剂选自以下6种siRNA中的一种或多种:
1)siRNA-1:SEQ ID NO:6atgatgtgggatgtacaag
2)siRNA-2:SEQ ID NO:7tgcttgatgatgtaggtcc
3)siRNA-3:SEQ ID NO:8tcattgttgatttgtcagc
4)siRNA-4:SEQ ID NO:9agccatgatgtgggatgtac
5)siRNA-5:SEQ ID NO:10cctccttccttcatgtggac
6)siRNA-6:SEQ ID NO:11ccctcctcgtgtgattgcag。
本发明还提供了一种用于调节肝细胞增殖的制剂,该制剂包含上述抑制剂。该制剂可以是医疗药物组合物,也可以是用于实验目的的试剂,例如加入药学上可接受的辅料,或是实验技术中的溶剂等。
与现有技术相比,本发明至少具有以下优点:
本发明成功筛选出lncRNA TCONS_00042303,其可作为调节肝细胞增殖的靶点,lncRNA TCONS_00042303的抑制剂可进一步用于制备促进肝细胞增殖的药剂,本发明可为肝移植预后辅助治疗提供强有力的分子生物学工具,具有重要的临床意义和应用前景。
附图说明
图1为用MTT法检测lncRNA TCONS_00042303的抑制剂对BRL-3A细胞增殖活性的影响;
图2A、图2B和图2C显示了lncRNA TCONS_00042303的抑制剂对BRL-3A细胞周期的影响;其中图2A为对照组流式细胞仪检测结果、图2B为试验组流式细胞仪检测结果和图2C为对照组和试验组的细胞周期对比柱形图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作进一步详述,以下实施例只是描述性的,不是限定性的,不能以此限定本发明的保护范围。
实施例1:大鼠肝再生模型制备与取材
实验大鼠为成年健康雄性Sprague-Dawley大鼠,体重230±20g,由河南师范大学实验动物中心提供。饲养温度为21±2℃,相对湿度为60±10%,光照时间12h/d(8:00-20:00),自由饮水、摄食。取114只上述大鼠,随机分为19组,每组6只。其中,正常对照(0h)1组,2/3肝切除(partial hepatectomy,PH)与假手术对照(sham operation,SO)各9组。PH组按Higgins和Anderson方法进行,SO组除不切除肝叶外,其他同PH。手术后2、6h时,取肝右叶置于组织储存试剂(例如RNALater)中,于-20℃保存备用。
实施例2:lncRNAs的高通量测序
取适量上述保存于-20℃的肝组织置于装有液氮的研钵中研磨,按总RNA提取试剂盒(Ambion,美国)操作指南提取和纯化总RNAs。用琼脂糖凝胶电泳(180V,0.5h)检测总RNA质量,28S rRNA∶18S rRNA约为2∶1,分别测定OD260和OD280,在OD260/OD280≥2.0,视为RNA合格。miRNAs的定性和定量分析由上海伯豪生物技术公司进行,用单端Solexa microRNA-Seq高通量测序法,从实验组(PH)和假手术组(SO)的0、2、6h等3个时间点的大鼠再生肝中检测。
实施例3:lncRNA和mRNA表达丰度以及差异表达lncRNA的筛选
利用cuffdiff软件对mRNA在三个样本中的表达量进行分析,采用经典的RPKM(Reads Per Kilobases per Million reads)公式计算表达量。将从样本中重建的所有转录本(或见基因座)整体进行差异表达分析,结果无分子类型的偏好。对于无生物学重复样的项目设计,我们采用DESeq进行差异表达分析,并将表达值差异倍数为log2(FC)绝对值大于1且p-value小于0.05的基因或转录本定义为肝再生相关lncRNA。高通量测序结果表明,在PH后2h,检测到911条lncRNA,其中522条与肝再生相关;在PH后6h,检测到908条lncRNA,其中680条与肝再生相关(表1)。
表1大鼠肝再生中lncRNA转录本表达变化数目统计
实施例4:lncRNA的功能预测
利用0、2和6h三个样本,可以将每条lncRNA的表达值与所有差异表达基因的表达值进行共表达分析,确定每条lncRNA与哪些差异表达基因存在共表达关系。在具体分析中,我们将共表达关系定义为:特定1ncRNA与特定基因表达值相关系数绝对值大于0.8,且相关性检验的p值小于0.05。通过该定义,找到每条lncRNA对应的共表达靶基因集合,并利用GO和KEGG对靶基因进行功能富集分析,并以此结果作为对lncRNA的功能预测结果。对每一条lncRNA的靶基因集合进行GO和KEGG功能富集分析,以预测每条lncRNA的功能。
实施例5:实时荧光定量PCR检测
lncRNA测序结果需要进一步验证结果的可靠性。实验中对挑选出来的差异表达lncRNA,用RT-PCR检测在大鼠肝切除后不同时间点的表达变化。实验利用Oligo 6和PrimerPremier 5.0软件设计了检测lncRNA TCONS 00042303及内参的引物(表2)。引物由上海生物工程公司合成。按Trigol试剂盒说明书提取大鼠肝中总RNA。根据AMV逆转录试剂盒(Promega,美国)的操作说明进行反转录得到cDNA。然后用cDNA作为模板,进行PCR反应,并筛选PCR的最佳反应温度、时间和模板量。然后进行荧光定量PCR,qRT-PCR的条件均为:95℃2min,95℃15sec,60℃20sec,72℃20sec,40个循环。每个样品重复检测3次,所得数据用2-ΔΔCt法作相对定量处理。得到与高通量检测结果相符的lncRNA,并把它们作为候选lncRNA。
表2实时荧光定量PCR引物序列
实时荧光定量PCR检测lncRNA TCONS_00042303在肝再生的0、2和6h的表达情况。结果表明两种用不同方法检测lncRNA的表达趋势一致,数据可信。
实施例6:lncRNA TCONS_00042303的抑制剂的设计及合成
本实施例依据lncRNA TCONS_00042303的核苷酸序列,设计并合成了lncRNATCONS_00042303的抑制剂(表3)。
表3lncRNATCONS_00042303的抑制剂核苷酸序列
实施例7:大鼠肝细胞培养
实验所用大鼠正常肝细胞BRL-3A购自中国科学院上海生命科学研究院细胞资源中心,培养基为含10%胎牛血清(FBS)的DMEM高糖培养基,细胞培养于37℃、饱和湿度、5%CO2的培养箱里。取对数生长期细胞进行传代,5×104个细胞/瓶。
实施例8:MTT法检测肝细胞增殖
取对数生长期的BRL-3A细胞,0.25%胰酶(Invitrogen,美国)消化,按1ml/孔、含5×104个/ml细胞的细胞悬液接种于24孔细胞培养板中,在37℃、5%CO2、饱和湿度下培养,保证在转染时,细胞密度达到30-50%时进行转染,参照riboFECTTM CP(锐博,中国)转染试剂使用说明进行转染。每个实验设置3个复孔,同时设置空白对照和阴性对照。实验重复3次。
在含细胞和培养基的96孔板里加入10μl/孔MTT(Geneview,美国),使其最终浓度达0.5g/L,于37℃避光培养4h,彻底弃去培养液后,每孔加入100μl二甲基亚砜(Geneview,美国),轻轻震荡10min,充分溶解甲瓒晶体。最后,用酶标仪(Biotek,美国)于490nm波长处检测各孔的吸光值。实验重复3次,每个实验组设置3个复孔。检测结果如图1所示,浓度为100nM lncRNA TCONS_00042303的抑制剂,转染细胞后48、72和96h时实验组吸光度值与对照组差异明显。
实施例9:细胞周期检测
为检测lncRNA TCONS_0002798对大鼠正常肝细胞BRL-3A的细胞周期的影响,将细胞接种于24孔细胞培养板中,1×105个细胞/孔,待细胞长到50~60%汇合度时,加入脂质体2000(Invitrogen,美国)分别与模拟物、模拟物对照、抑制剂、抑制剂对照转染细胞,抑制剂转染浓度为100nM/孔。在5%CO2、37℃培养箱中培养48h后收集细胞。用70%乙醇于-20℃固定细胞过夜,用PBS洗涤和200目筛网过滤细胞后,再用碘化丙啶染液(50μg/mL PI,100μg/mL RNase A)室温避光染色30min,用流式细胞术检测细胞周期。流式细胞术检测结果显示(图2A、图2B和图2C),流式细胞仪检测细胞周期结果表明,转染lncRNA TCONS_00042303抑制剂后48h,实验组(S+G2M%)细胞增殖率为(39.13±0.586)%,阴性对照组细胞增殖率为(23.92±1.931)%,两者S+G2M细胞数差异显著(p<0.05)表明降低lncRNA TCONS_00042303表达水平增加BRL-3A细胞在S+G2M的比例。因此lncRNA TCONS_00042303对BRL-3A细胞的增殖具有明显的抑制作用。
以上,仅为本发明较佳的具体实施方式,但发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明透露的技术范围内,可想到的变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应该以权利要求书的保护范围为准。
序列表
<110> 河南师范大学
<120> 一种肝再生相关长链非编码RNA及其抑制剂和应用
<130> EY01PT011702324
<160> 11
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 7030
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 1
gtttctcggc caatcttttt cttctatttt cagagatctc ttattttcat tcagaaaaaa 60
aaaatctcat cacaggtcag tcaatagata tttctaaaca atccttgtac gtttctcggc 120
caatcttttt cttctatttt cagagatctc ttattttcat tcagaaaaaa aaaatctcat 180
cacaggtcag tcaatagata tttctaaaca atccttgtac atcccacatc atggctaacc 240
tagaagaaaa taaagtatca gacagtaagg gcttcaattt gaaatcagag gaaaacaaaa 300
ctaacaaaat cccagcaagc aagcacttgc tgaagtgtat ctgtgggaga ggaccgagag 360
cctaaggaaa agtgagcgtc cacaccagtt ttctaggaac ccattctgtt tacacctgct 420
acattggtgt aattgttatt attaatccct caaccttcaa aactgtaccg gtttggatga 480
taaaccataa agttacctta atgatggctc atctatagaa gtggattcaa caaagactat 540
aaccatagca actaggaacc atgctgatgg gcgctttgtt tgcacagatg acctcacact 600
ccgagtgtat tttagcttgg atgagacaat tccttctatt gccggtgaga tttgtaaagg 660
ctgggcttgt cctgttggtt aatctgatgc aaagactctt ctctgtgttc atattctgat 720
ctctgggata ggcttagact actgctaaga catgccgggt cttttgtcta tgggaaacag 780
gtcaagatca gccctaagga atgggcaaaa agtgaacggt agtcacttca gtgtagtcca 840
catgaaggaa ggaggcagga ggtctcacca gctcagcttg acagcctggt ctgagcatcc 900
actccatgct gggtgctcag cctttagtca gtgagacaga aggaattgca tgagcaacaa 960
cagaatagtc aagcactaag aaaagcttgg cctgcgatca atttggtgtt ggtggaagtg 1020
tgcattatac atcagtggga ggcaggagac atggctgtcg atgctggcag aggctaaatg 1080
atggaggacc tacatcatca agcattatgg gtttcctctg gaattgaaac ggcatctcca 1140
atgtcatccc atcctggggc ctctccttgt tctgacagtt acattttgca gcaagatgac 1200
ctggttttca ggatcttact gatctctcag aacctctgtg ctccccacct ggggctctgt 1260
ccatgtcttg atcacattat cagatgtagc agatctgatg acacagttcc tagggatcca 1320
ggacaaagag taccagcagc aactgccagc cttgggcact cgtcctcgtg tttgtggtca 1380
cctctagacg ctacagaaga actgatgcag caagaacaat cgattgatgg gggtcaagtt 1440
ggggtttcca cagcaattgc tgacaatgcc gagctgacat agaaggcgct gtctactctt 1500
ctggggcact tagatggtat aaaaggccac ttaacccagt gtgcagttgc agccttgagc 1560
tgcgaatctt gaactccctg ccattctgat gtacagcatg taaaaagcac gtgattatgt 1620
ttatcctggg agtgcgcgct cttggccaca gcagcagatc agtctggaat aagcaaatag 1680
aatcacccca aaaggcaaac tgcaaaagct atctgcaatc acacgaggag ggcatgccaa 1740
cagagattct tttcaaagaa gagaattaca ggaaagaaat agatgactaa gaacttttaa 1800
aaaatcaagt gcagacgttt gttttcccat ttgctagacg tgagggctaa acatgatact 1860
gtctctaggg ttgatttgct gacaaatcaa caatgatgtg agggagtgtg gccagccttc 1920
tttttcccct gaggacggcg gagatgccaa gagatggagg ccatcttgtc taaaatagga 1980
ccgtgaggtt actggctgag tttggtctat cctaggtcat gtggataccc agttcacctt 2040
ggatatccat ccaaaatgcc taagtgagta tatggtgatg gagtttaaat tgtgaccctc 2100
cctggagaga agactccaga ccgttcacgt ttcctggctg gtcacaccag cactattctg 2160
cctgatgact tgacaaactt ggtccagaat ctacttcctt tgtacaggaa ttcaggctct 2220
atgaaatcta tcagccaagc cacaatggct ttggtttttc aagacaagct ctctctgtgt 2280
agccccgaat gtcctggaac tccctctgaa tttgaactca gagatccact tgcctctgcc 2340
tccaggctgc tgggactaaa ggtgtccacc tccacttcca gaagacaaac ttcttgccag 2400
ggaggctgac atacattgtg atgtaaactc ccttgactgg tccagtttgg tagccattgg 2460
gctccattac ctatctgtag gcagctcttt gagaaacact gacatattca tggctgtggc 2520
ttgggccatc ttcacaggcc agaaagggct tcgtttatca gtcagtcaac atgcagagag 2580
aacagtttgt tttggaacaa ttcaagtctg taaaaagatc caatagtaca aagacctcct 2640
gggtgccttc cacctgggtc tcttttgaat tctgcctatg gtgtacctgc tactaagggg 2700
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atgaggacct cattacacat gatcacaggg ttttccctat acagcctcat agcaatctgg 2820
gtcatatatt tttggcaaaa aaatgttaga aaagtgattc agtgcttctt tactgctccc 2880
ttaccaagtg gcccttgtga atttgttcca atgcttgtgg tagtgggttc gattgcttga 2940
ttgagatggg gtttgcccct gtttttttct ttttattaag gttgcttttt ttaaaaaaat 3000
gtgattaata ttatataaat atttcattac ccagtctaca accgtgtgtg tgtgtgtgtg 3060
tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgta tgtgtgtgta tgtgtgtgta tgtgtgtgtg 3120
tgtgaaggct ggagctccct gttgacagtc tttctcaatt actctccctt gatttctaga 3180
aacagggtct ctcactgaag cgggacctcc cagttcggtt agactggtaa gcctctgggt 3240
cctcttgtcc atgccctggg ccttcccagc tctgggtcta gaaatgtctg cttccctact 3300
tggtttttca catgggtgct gggggtcaag tgaaggtctt cacattcagg gggcaaatcc 3360
cccagtcccc acttgtttgc tttaatatca actgatgctt cttgctggag tttttttgcc 3420
aagatgttta ccaaatggta attttctaat tgtgtcactc cctgtatatt taacaactgg 3480
tattcctatg aaagcacaca ctgtctcatc tccattttaa aactcactta taagccattc 3540
actagttaat gggttataat cctttattgc cactttattg atacttaagt tgatctacat 3600
tatgacagag tcccaagcat gtgacatccc acatcatggc taacctagaa gaaaataaag 3660
tatcagacag taagggcttc aatttgaaat cagaggaaaa caaaactaac aaaatcccag 3720
caagcaagca cttgctgaag tgtatctgtg ggagaggacc gagagcctaa ggaaaagtga 3780
gcgtccacac cagttttcta ggaacccatt ctgtttacac ctgctacatt ggtgtaattg 3840
ttattattaa tccctcaacc ttcaaaactg taccggtttg gatgataaac cataaagtta 3900
ccttaatgat ggctcatcta tagaagtgga ttcaacaaag actataacca tagcaactag 3960
gaaccatgct gatgggcgct ttgtttgcac agatgacctc acactccgag tgtattttag 4020
cttggatgag acaattcctt ctattgccgg tgagatttgt aaaggctggg cttgtcctgt 4080
tggttaatct gatgcaaaga ctcttctctg tgttcatatt ctgatctctg ggataggctt 4140
agactactgc taagacatgc cgggtctttt gtctatggga aacaggtcaa gatcagccct 4200
aaggaatggg caaaaagtga acggtagtca cttcagtgta gtccacatga aggaaggagg 4260
caggaggtct caccagctca gcttgacagc ctggtctgag catccactcc atgctgggtg 4320
ctcagccttt agtcagtgag acagaaggaa ttgcatgagc aacaacagaa tagtcaagca 4380
ctaagaaaag cttggcctgc gatcaatttg gtgttggtgg aagtgtgcat tatacatcag 4440
tgggaggcag gagacatggc tgtcgatgct ggcagaggct aaatgatgga ggacctacat 4500
catcaagcat tatgggtttc ctctggaatt gaaacggcat ctccaatgtc atcccatcct 4560
ggggcctctc cttgttctga cagttacatt ttgcagcaag atgacctggt tttcaggatc 4620
ttactgatct ctcagaacct ctgtgctccc cacctggggc tctgtccatg tcttgatcac 4680
attatcagat gtagcagatc tgatgacaca gttcctaggg atccaggaca aagagtacca 4740
gcagcaactg ccagccttgg gcactcgtcc tcgtgtttgt ggtcacctct agacgctaca 4800
gaagaactga tgcagcaaga acaatcgatt gatgggggtc aagttggggt ttccacagca 4860
attgctgaca atgccgagct gacatagaag gcgctgtcta ctcttctggg gcacttagat 4920
ggtataaaag gccacttaac ccagtgtgca gttgcagcct tgagctgcga atcttgaact 4980
ccctgccatt ctgatgtaca gcatgtaaaa agcacgtgat tatgtttatc ctgggagtgc 5040
gcgctcttgg ccacagcagc agatcagtct ggaataagca aatagaatca ccccaaaagg 5100
caaactgcaa aagctatctg caatcacacg aggagggcat gccaacagag attcttttca 5160
aagaagagaa ttacaggaaa gaaatagatg actaagaact tttaaaaaat caagtgcaga 5220
cgtttgtttt cccatttgct agacgtgagg gctaaacatg atactgtctc tagggttgat 5280
ttgctgacaa atcaacaatg atgtgaggga gtgtggccag ccttcttttt cccctgagga 5340
cggcggagat gccaagagat ggaggccatc ttgtctaaaa taggaccgtg aggttactgg 5400
ctgagtttgg tctatcctag gtcatgtgga tacccagttc accttggata tccatccaaa 5460
atgcctaagt gagtatatgg tgatggagtt taaattgtga ccctccctgg agagaagact 5520
ccagaccgtt cacgtttcct ggctggtcac accagcacta ttctgcctga tgacttgaca 5580
aacttggtcc agaatctact tcctttgtac aggaattcag gctctatgaa atctatcagc 5640
caagccacaa tggctttggt ttttcaagac aagctctctc tgtgtagccc cgaatgtcct 5700
ggaactccct ctgaatttga actcagagat ccacttgcct ctgcctccag gctgctggga 5760
ctaaaggtgt ccacctccac ttccagaaga caaacttctt gccagggagg ctgacataca 5820
ttgtgatgta aactcccttg actggtccag tttggtagcc attgggctcc attacctatc 5880
tgtaggcagc tctttgagaa acactgacat attcatggct gtggcttggg ccatcttcac 5940
aggccagaaa gggcttcgtt tatcagtcag tcaacatgca gagagaacag tttgttttgg 6000
aacaattcaa gtctgtaaaa agatccaata gtacaaagac ctcctgggtg ccttccacct 6060
gggtctcttt tgaattctgc ctatggtgta cctgctacta aggggtcaat tcatgaacta 6120
gatttcctat ctgtttcttc atcagagcac cgtgccctca acctcatgag gacctcatta 6180
cacatgatca cagggttttc cctatacagc ctcatagcaa tctgggtcat atatttttgg 6240
caaaaaaatg ttagaaaagt gattcagtgc ttctttactg ctcccttacc aagtggccct 6300
tgtgaatttg ttccaatgct tgtggtagtg ggttcgattg cttgattgag atggggtttg 6360
cccctgtttt tttcttttta ttaaggttgc tttttttaaa aaaatgtgat taatattata 6420
taaatatttc attacccagt ctacaaccgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt 6480
gtgtgtgtgt gtgtatgtgt gtgtatgtgt gtgtatgtgt gtgtgtgtga aggctggagc 6540
tccctgttga cagtctttct caattactct cccttgattt ctagaaacag ggtctctcac 6600
tgaagcggga cctcccagtt cggttagact ggtaagcctc tgggtcctct tgtccatgcc 6660
ctgggccttc ccagctctgg gtctagaaat gtctgcttcc ctacttggtt tttcacatgg 6720
gtgctggggg tcaagtgaag gtcttcacat tcagggggca aatcccccag tccccacttg 6780
tttgctttaa tatcaactga tgcttcttgc tggagttttt ttgccaagat gtttaccaaa 6840
tggtaatttt ctaattgtgt cactccctgt atatttaaca actggtattc ctatgaaagc 6900
acacactgtc tcatctccat tttaaaactc acttataagc cattcactag ttaatgggtt 6960
ataatccttt attgccactt tattgatact taagttgatc tacattatga cagagtccca 7020
agcatgtgac 7030
<210> 2
<211> 25
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 2
tccctataca gcctcatagc aatct 25
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 3
caagcaatcg aacccactac cac 23
<210> 4
<211> 17
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 4
ctcgcttcgg cagcaca 17
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 5
aacgcttcac gaatttgcgt 20
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 6
taaacacaca gcttgatcg 19
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 7
ttagcaagtc tagatgtgg 19
<210> 8
<211> 19
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 8
ttcatttgga cttggtcag 19
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 9
agtgtaggtc cctgagcagc 20
<210> 10
<211> 20
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 10
ggtgcttcct tgatccacac 20
<210> 11
<211> 20
<212> DNA
<213> human artificial
<400> 11
ccctaagcca ccatgctact 20

Claims (5)

1.一种肝再生相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),其特征在于,所述lncRNA为lncRNA TCONS_00042303,所述lncRNA TCONS_00042303转录本核苷酸序列如SEQID NO.1所示。
2.一种用于调节肝细胞增殖的抑制剂,其特征在于,所述抑制剂是用于调节lncRNATCONS_00042303转录本核苷酸序列表达水平的DNA或RNA。
3.如权利要求2所述的抑制剂,其特征在于,所述抑制剂是基于lncRNA TCONS_00042303转录本核苷酸序列设计的siRNA。
4.如权利要求书1或2所述的抑制剂,其特征在于,所述抑制剂选自以下6种siRNA中的一种或多种:
1)siRNA-1:SEQ ID NO:6 atgatgtgggatgtacaag
2)siRNA-2:SEQ ID NO:7 tgcttgatgatgtaggtcc
3)siRNA-3:SEQ ID NO:8 tcattgttgatttgtcagc
4)siRNA-4:SEQ ID NO:9 agccatgatgtgggatgtac
5)siRNA-5:SEQ ID NO:10 cctccttccttcatgtggac
6)siRNA-6:SEQ ID NO:11 ccctcctcgtgtgattgcag。
5.一种用于调节肝细胞增殖的制剂,其特征在于,所述制剂包含如权利要求2~4中任一项所述的抑制剂。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110144347A (zh) * 2019-03-26 2019-08-20 河南师范大学 干扰Clhc1基因表达的小干扰RNA及其应用与药物
CN113201590A (zh) * 2020-08-05 2021-08-03 上海健康医学院 用于评估肝细胞癌早期复发风险的lncRNA、评估方法及装置

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CN113201590B (zh) * 2020-08-05 2024-05-07 上海健康医学院 用于评估肝细胞癌早期复发风险的lncRNA、评估方法及装置

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