CN107493403B - 一种数字病理切片扫描系统 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种数字病理切片扫描系统,属于切片扫描技术领域;系统包括扫描端、图像处理端、远程服务端、第一客户端以及第二客户端;扫描端对病理切片进行扫描形成原始病理切片图像并传输至图像处理端进行处理;图像处理端对原始病理切片图像进行处理形成数字病理切片图像并发送至远程服务端;第一客户端向远程服务端传输一包括主治医师信息的病历信息;远程服务端将数字病理切片图像与主治医师信息进行关联保存于对应主治医师信息的存储单元中;已验证登录主治医师账号的第二客户端被允许访问对应主治医师账号的存储单元中保存的数字病理切片。上述技术方案的有益效果是:剔除不合格的数字病理切片图像,提高医师的查阅效率。

Description

一种数字病理切片扫描系统
技术领域
本发明涉及切片扫描技术领域,尤其涉及一种数字病理切片扫描系统。
背景技术
通过观察人体的切片组织来判断人体相应组织器官是否有病变异常的检查手段是现代医学中较为常见并且比较重要的检查手段之一。传统的切片观察是通过显微镜肉眼观察玻片上的切片组织来实现的,这种观察方式比较耗费人力,并且观察结果并不是非常精确。
随着科学技术的不断发展,开始出现一种数字切片扫描系统来替代传统的切片组织观察的方法。数字切片扫描系统是一种能够对切片组织进行扫描并形成该切片组织表面细胞图像的数字扫描系统。数字切片扫描系统扫描得到的病理切片图像并非一般的图像,而是可以提供给使用者进行任意放大或缩小操作的图像,在使用者放大图像中的局部区域时能够观察到该区域内细胞组织的放大图,从而使得医师能够更清楚准确地通过观察切片组织判断人体相关的组织器官是否出现病变异常。
然而现有的数字切片扫描系统中通常只根据扫描生成数字病理切片图像,并不会对生成的图像做进一步的处理,并且由于图像本身携带信息的丰富性和复杂性,会导致图像局部不清晰、亮度不均匀以及其他会影响图像观察的问题,导致医师无法准确观察到图像某处细胞组织的具体情况,影响了最终的判断结果。
发明内容
根据现有技术中存在的上述问题,现提供一种数字病理切片扫描系统,能够提高数字病理切片的清晰度和可读性,剔除不合格的数字病理切片图像,提高医师的查阅效率。
上述技术方案具体包括:
一种数字病理切片扫描系统,其中,包括扫描端、图像处理端、远程服务端、第一客户端以及第二客户端,所述扫描端连接所述图像处理端,所述远程服务端分别与所述图像处理端、所述第一客户端以及所述第二客户端连接;
所述扫描端用于对待扫描病理切片进行扫描以形成原始病理切片图像,并将所述原始病理切片图像传输至所述图像处理端进行处理;
所述图像处理端用于对所述扫描端传输的所述原始病理切片图像进行处理以形成对应的数字病理切片图像并保存,同时将所述数字病理切片图像发送至所述远程服务端;
所述图像处理端进一步包括:
第一检测单元,用于检测所述原始病理切片图像的亮度值,并输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值是否合格的第一检测结果;
第二检测单元,用于检测由多幅数字病理图片拼接形成的所述原始病理切片图像的拼接处的清晰度,并输出用于表示所述拼接处的所述清晰度是否合格的第二检测结果;
输出单元,分别连接所述第一检测单元和所述第二检测单元,用于根据所述第一检测结果和所述第二检测结果,将所述亮度值和所述清晰度均合格的所述原始病理切片图像作为所述数字病理切片图像并发送至所述远程服务端;
所述第一客户端用于向所述远程服务端传输一病历信息,所述病历信息中包括用于表示所述第一客户端选择的主治医师账号的主治医师信息;
所述远程服务端中包括一存储空间,所述存储空间内分别预设有对应于每个所述主治医师信息的存储单元;
所述远程服务端将获取的所述数字病理切片图像与所述病历信息中包括的所述主治医师信息进行关联,并将所述数字病理切片图像保存于对应所述主治医师信息的所述存储单元中;
所述远程服务端同时允许已验证登录所述主治医师账号的所述第二客户端访问对应所述主治医师账号的所述存储单元中保存的所述数字病理切片。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述第一检测单元具体包括:
第一检测模块,用于测出所述原始病理切片图像的亮度值;
第一标准模块,提供一预设的与所述原始病理切片图像对应的标准图像的亮度范围;
第一比较模块,分别与所述第一检测模块和所述第一标准模块连接,用于将所述原始病理切片图像的亮度值与所述标准图像的亮度范围进行比较:
当所述原始病理切片图像的亮度值在所述标准图像的亮度范围内时,输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值合格的所述第一检测结果;以及
当所述图像的亮度值不在所述标准图像的亮度范围内时,输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值不合格的所述第一检测结果。
优选的,该判断图像亮度的系统,其中,所述第一检测单元还包括:
图像补偿模块,连接所述第一比较模块,当所述第一比较模块输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值不合格的所述第一检测结果时,所述图像补偿模块根据不合格的所述原始病理切片图像的所述亮度值与所述标准图像的所述亮度范围之间的差值输出一光照补偿指令,所述图像处理端将所述光照补偿指令反馈至所述扫描端,以控制所述扫描端重新扫描得到所述原始病理切片图像。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述第二检测单元具体包括:
第二检测模块,于两幅相互拼接的所述数字病理图片中,处理得到一幅所述数字病理图片的图像梯度并计为第一梯度值,以及处理得到另一幅所述数字病理图片的图像梯度并计为第二梯度值;
第二标准模块,预先提供一预设的梯度比值;
第二比较模块,分别连接所述第二检测模块和所述第二标准模块,用于将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并在所述比值与所述预设的梯度比值不相匹配时判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的所述拼接处的清晰度不合格,并进而输出用于表示所述原始病理切片图像的拼接处的清晰度不合格的所述第二检测结果。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,当所述第一梯度值小于或等于所述第二梯度值时,所述预设的梯度比值小于或等于1;
则所述第二比较模块将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值小于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值大于或等于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,当所述第一梯度值大于所述第二梯度值时,所述预设的梯度比值大于1;
则所述第二比较模块将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值大于或等于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值小于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述第二检测单元中还包括:
标识模块,连接所述第二比较模块,用于标识出在所述数字病理图片上被所述第二比较模块判断为清晰度不合格的拼接处。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述第二检测单元中还包括:
存储模块,连接所述第二比较模块,用于暂存被所述第二比较模块判断为清晰度合格的所述数字病理图片。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述数字病理切片扫描系统中,对应同一个人体组织进行切片并通过所述扫描端扫描形成两张不同的所述原始病理切片图像;
所述图像处理端中,对两张所述原始病理切片图像分别进行亮度值和拼接处的清晰度的检测,并形成分别对应于两张所述原始病理切片图像的两张数字病理切片图像,计为第一切片图和第二切片图;
所述第一切片图位于以所述第一切片图的一个端点为原点位置的第一XOY坐标轴中,以及
所述第二切片图位于以所述第二切片图的一个端点为原点位置的第二XOY坐标轴中;
则所述图像处理端还包括:
调整单元,连接所述输出单元,用于在所述输出单元发送所述数字病理切片图像前,依据所述第一切片图和所述第二切片图之间的位置关系对所述第二切片图进行调整,并将调整后的所述第二切片图和所述第一切片图整合形成一对应的所述数字病理切片图像,以供所述输出单元发送至所述远程服务端。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述调整单元具体包括:
背景处理模块,用于扩大所述第一切片图的外轮廓尺寸,并以空白背景填充所述第一切片图中被扩大的部分;
第一旋转模块,连接所述背景处理模块,用于将所述第二切片图中与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点和所述第一切片图中的一预设旋转点对齐;
第一灰度处理模块,连接所述第一旋转模块,用于在所述第一切片图上处理得到预设的第一判断点的灰度值,以及在所述第二切片图上处理得到于对应于所述第一判断点的第二判断点的灰度值,随后处理得到所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的灰度比较值;
第二旋转模块,连接所述第一旋转模块,用于将所述第二切片图以与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点为轴心顺时针旋转一预设角度;
判断模块,分别连接所述第一灰度处理模块和所述第二旋转模块,用于在所述第二旋转模块旋转所述第二切片图后,判断所述第二切片图是否相对于初始位置已经旋转360度,并输出一判断结果;
所述第一灰度处理模块还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时重新进行灰度处理的操作;
所述第二旋转模块还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时继续对所述第二切片图进行旋转操作;
调整模块,分别连接所述第一灰度处理模块和所述判断模块,用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置已经旋转达到360度时获取取值最小的所述灰度比较值,并根据被获取的所述灰度比较值对应的所述第一切片图和所述第二切片图之间的所述位置关系对所述第二切片图进行调整。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述背景处理模块将所述第一切片图扩大至宽和高均为A的图像,并以空白背景填充所述第一切片图中被扩充的部分;
其中,
W1用于表示所述第一切片图的宽度;
H1用于表示所述第一切片图的高度。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述预设旋转点的坐标(m,n)的取值范围满足下述范围关系:
0≤m<W1-W2
0≤n<H1-H2
其中,
m用于表示所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的X轴坐标;
n用于表示所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的Y轴坐标;
W1用于表示所述第一切片图的宽度;
H1用于表示所述第一切片图的高度
W2用于表示所述第二切片图的宽度;
H2用于表示所述第二切片图的高度。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,预设的所述第一判断点的坐标具有一预设的取值范围;
则所述第一灰度处理模块中进一步包括:
第一灰度处理部件,用于在所述第一切片图上处理得到所述取值范围内的每个所述第一判断点的灰度值并计为第一灰度值;
第二灰度处理部件,用于在所述第二切片图上处理得到对应于所述取值范围内的每个所述第一判断点的每个所述第二判断点的灰度值并计为第二灰度值;
第三灰度处理部件,分别连接所述第一灰度处理部件和所述第二灰度处理部件,用于根据所述第一灰度值和对应的所述第二灰度值,分别处理得到对应的每个灰度比较值;
灰度值获取部件,连接所述第三灰度处理部件,用于获取取值最小的所述灰度比较值,并计为所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的所述灰度比较值。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述第三灰度处理部件依据下述公式处理得到所述灰度比较值:
其中,
S(m,n)用于表示所述灰度比较值;
(m,n)用于表示所述预设旋转点的坐标值,m为所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的X轴坐标,n为所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的Y轴坐标;
(i,j)用于表示所述第二判断点的坐标值,i为所述第二判断点在所述第二XOY坐标轴中的X轴坐标,j为所述第二判断点在所述第二XOY坐标轴中的Y轴坐标;
W2用于表示所述第二切片图的宽度;
H2用于表示所述第二切片图的高度。
P1用于表示所述第一灰度值;
P2用于表示所述第二灰度值。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述灰值获取部件获取取值最小的所述灰度比较值,并计为所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的所述灰度比较值后,还用于记录所述第二切片图于所述当前的位置关系下相对于初始位置的旋转角度;
则所述调整模块依照被获取的取值最小的所述灰度比较值所对应的所述旋转角度对所述第二切片图进行旋转。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述扫描端对所述病理切片进行扫描之前,通过预扫描先获取所述病理切片的预览图;
所述图像处理端还包括:
识别单元,用于对所述预览图进行识别得到所述预览图中的切片组织图片;
所述图像处理端将所述切片组织图片传回至所述扫描端,所述扫描端根据所述切片组织图片对所述病理切片进行扫描。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,预先通过所述扫描端扫描得到一空白切片图像;
所述识别单元具体包括:
图像获取模块,分别获取所述空白切片图像的背景图和所述预览图;
第二灰度处理模块,连接所述图像获取模块,用于将所述预览图的灰度值减去所述背景图的灰度值,得到一切片信息图像;
第一剔除模块,连接所述第二灰度处理模块,用于遍历处理所述切片信息图像的连通域,并剔除所述切片信息图像中的污渍;
第二剔除模块,连接所述第一剔除模块,用于在经过污渍剔除的所述切片信息图像上根据所述连通域的属性分别判断所述切片信息图中的各个连通域是否为切片组织,并剔除被判断为不是所述切片组织的所述连通域;
保留模块,连接所述第二剔除模块,用于保留剔除不是所述切片组织的所述连通域后的所述切片信息图像并作为所述切片组织图片。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述图像获取模块中包括:
获取部件,用于分别获取所述空白切片图像的背景图和所述预览图;
剪除部件,连接所述获取部件,用于分别剪除所述背景图和所述预览图的边缘部分。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述输出单元具体包括:
切割模块,用于将所述数字病理切片图像切割成多个局部图像;
坐标加密模块,连接所述切割模块,用于分别对每个所述局部图像的坐标信息进行加密操作以得到每个所述局部图像的加密信息;
所述输出单元向所述远程服务端发送所述局部图像以及对应的所述加密信息,以向所述远程服务端发送所述数字病理切片图像;
所述第二客户端访问所述远程服务端并获取保存的关联于一个所述数字病理切片图像的所述局部图像和对应的所述加密信息后,对每个所述加密信息进行解析以得到对应的所述坐标信息,随后根据所述坐标信息将所述局部图像依次拼接形成完成的所述数字病理切片图像并进行显示,以供所述第二客户端的使用者对所述数字病理切片图像进行诊断。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述数字病理切片扫描系统中包括多个扫描端,每个所述扫描端对应于一个所述图像处理端;
每个所述图像处理端分别具有一唯一的授权码,每个所述扫描端分别具有一唯一的机器码,由所述授权码和所述机器码构成一密钥;
所述密钥提供给所述图像处理端中的所述输出单元对所述数字病理切片图像进行加密操作,并且所述图像处理端在向所述远程服务端发送所述数字病理切片图像的同时向所述远程服务端提供所述密钥。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述远程服务端中的每个所述存储单元中具体包括:
第一存储模块,用于保存所述数字病理切片图像中的所述局部图像;
第二存储模块,用于保存分别与每个所述局部图像对应的所述加密信息;
第三存储模块,用于保存对应于所述数字病理切片图像的所述密钥;
所述远程服务端中还包括:
访问单元,连接所述存储空间,用于根据所述第二客户端的访问请求,从对应的所述存储单元中分别获取所述局部图像、所述加密信息和所述密钥并发送至所述第二客户端。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,
所述远程服务端具体包括:
第一获取单元,用于获取所述图像处理端发送的所述数字病理切片图像;
第二获取单元,用于获取所述第一客户端发送的所述病历信息;
数据解析单元,连接所述第二获取单元,用于根据所述病历信息解析得到所述主治医师信息;
分配处理单元,分别连接所述数据解析单元、所述第一获取单元、所述第二获取单元和所述存储空间,用以根据解析出的所述主治医师信息,将对应的所述病历信息和所述数字病理切片图像保存于所述存储空间中对应的所述存储单元中,于所述存储单元中,所述数字病理切片图像和所述病历信息相互关联保存;
权限认证单元,与所述存储空间连接,用以对所述第二客户端提供的所述主治医师账号的账户信息和密码进行验证;
并于验证通过后赋予所述第二客户端于对应的所述存储单元中访问所述病历信息以及所述数字病理切片图像的权限;
病历处理单元,与所述存储空间连接,用以供远程登录的所述第二客户端对所述数字病理切片图像进行诊断,以形成与所述数字病理切片图像对应的诊断报告,并将所述诊断报告保存于所述存储空间中对应于所述数字病理切片图像的所述存储单元中。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述远程服务端还包括:
诊断提示单元,连接所述病历处理单元,用以根据生成的所述诊断报告形成一与所述病历信息对应的诊断提示信息;
推送单元,连接所述诊断提示单元,用以将所述诊断提示信息发送至输出所述病历信息的所述第一客户端。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,还包括一短信通知服务端,所述短信通知服务端提供一接口连接所述远程服务端,所述短信通知服务端还远程连接所述第二客户端;
所述远程服务端还包括:
通知单元,连接所述数据解析单元,用以根据解析得到的所述主治医师信息,生成对应的会诊提示信息;
通过所述远程服务端调用所述接口控制所述短信通知服务端将所述会诊提示信息发送至对应所述主治医师信息的所述第二客户端。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述扫描端进一步包括:
载片平台,所述待扫描病理切片被放置于所述载片平台上,以供所述扫描端进行扫描;
自动加载装置,设置于所述载片平台下方并连接所述载片平台,多个所述待扫描病理切片被放置在所述自动加载装置中,所述自动加载装置一次托起一个所述待扫描病理切片至所述载片平台上,以供所述扫描端进行扫描;
照明扫描装置,设置在所述载片平台的上方,用于对所述载片平台上放置的所述待扫描病理切片进行扫描,以得到所述原始病理切片图像。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述照明扫描装置进一步包括:
LED光源,用于在所述扫描端对所述待扫描病理切片进行扫描时提供扫描所需的光源;
扫描单元,设置于所述LED光源的一侧,用于对所述待扫描病理切片进行扫描;
明荧切换装置,设置于所述扫描单元上并连接所述扫描单元,用于控制所述扫描单元在明场扫描模式和荧光扫描模式之间进行切换。
优选的,该数字病理切片扫描系统,其中,所述自动加载装置包括切片盒和加载器;
所述切片盒内预先放置有多个包括待扫描的所述病理切片的玻片,每个所述玻片具有一预设的编号;
当使用者通过所述编号选中所述玻片进行扫描时,所述加载器将所述切片盒内被选择的所述玻片推出并放置在所述载片平台的切片盒仓位中,以供所述照明扫描装置进行扫描。
上述技术方案的有益效果是:提供一种数字病理切片扫描系统,能够提高数字病理切片的清晰度和可读性,剔除不合格的数字病理切片图像,提高医师的查阅效率。
附图说明
图1是本发明的较佳的实施例中,一种数字病理切片扫描系统的总体结构示意图;
图2是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,第一检测单元的具体结构示意图;
图3是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,第二检测单元的具体结构示意图;
图4是本发明的较佳的实施例中,由多幅数字病理图片拼接形成原始病理切片图像的示意图;
图5是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,调整单元的具体结构示意图;
图6-8是本发明的较佳的实施例中,对切片图进行旋转调整的示意图;
图9是本发明的较佳的实施例中,于图5的基础上,第一灰度处理模块的具体结构示意图;
图10是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,识别单元的具体结构示意图;
图11是本发明的较佳的实施例中,于图7的基础上,图像获取模块的具体结构示意图;
图12-20是本发明的较佳的实施例中,对切片组织进行识别的示意图;
图21是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,输出单元的具体结构示意图;
图22是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,远程服务端中每个存储单元的具体结构示意图;
图23是本发明的较佳的实施例中,于图1的基础上,远程服务端的具体结构示意图;
图24-31是本发明的较佳的实施例中,数字病理切片扫描系统中扫描端的具体结构示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
需要说明的是,在不冲突的情况下,本发明中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。
下面结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明,但不作为本发明的限定。
根据现有技术中存在的上述问题,现提供一种数字病理切片扫描系统,该系统具体如图1中所示,包括扫描端A、图像处理端B、远程服务端C、第一客户端D以及第二客户端E,扫描端A连接图像处理端B,远程服务端C分别与图像处理端B、第一客户端D以及第二客户端E连接;
扫描端A用于对待扫描病理切片进行扫描以形成原始病理切片图像,并将原始病理切片图像传输至图像处理端进行处理;
图像处理端B用于对扫描端A传输的原始病理切片图像进行处理以形成对应的数字病理切片图像并保存,同时将数字病理切片图像发送至远程服务端C;
图像处理端B进一步包括:
第一检测单元B1,用于检测原始病理切片图像的亮度值,并输出用于表示原始病理切片图像的亮度值是否合格的第一检测结果;
第二检测单元B2,用于检测由多幅数字病理图片拼接形成的原始病理切片图像的拼接处的清晰度,并输出用于表示拼接处的清晰度是否合格的第二检测结果;
输出单元B3,分别连接第一检测单元B1和第二检测单元B2,用于根据第一检测结果和第二检测结果,将亮度值和清晰度均合格的原始病理切片图像作为数字病理切片图像并发送至远程服务端;
第一客户端D用于向远程服务端C传输一病历信息,病历信息中包括用于表示第一客户端选择的主治医师账号的主治医师信息;
远程服务端C中包括一存储空间C1,存储空间C1内分别预设有对应于每个主治医师信息的存储单元C11;
远程服务端C将获取的数字病理切片图像与病历信息中包括的主治医师信息进行关联,并将数字病理切片图像保存于对应主治医师信息的存储单元C11中;
远程服务端C同时允许已验证登录主治医师账号的第二客户端E访问对应主治医师账号的存储单元C11中保存的数字病理切片。
具体地,本实施例中,上述扫描端A即数字病理切片扫描仪,在该扫描仪上对病理切片进行扫描并生成原始病理切片图像。并且为了使得扫描端A扫描得到的数字病理切片图像更清晰和容易识别,在将图像传送至远程服务端C之前需要架设一个图像处理端B来对该原始病理切片图像进行预先处理。该图像处理端A可以为一个图像处理服务器。
进一步地,由于大部分检测都是在室内进行,因此,医疗器械所拍摄的或检测的图像会受室内灯光的影响,从而生成较暗的图片,通常对于生成图片的亮度判断是由人工进行的,只有通过人工判断亮度符合要求的图像才会被传送至远程服务端C保存并供医师查看,但是这种人工判断亮度的方式既耗费人力,又因其主观性太强导致判断标准不一,判断准确率无法保证,最后导致传送至远程服务端C的图像依然可能存在亮度问题。则在本实施例中,在该图像处理端B设置一个第一检测单元B1用于对原始病理切片图像亮度值进行检测,若一些原始病理切片图像的亮度值不符合要求,则将这些原始病理切片图像判断为不合格的图像并不予传送至远程服务端C。上述第一检测单元B1可以由图像处理端B中的一第一处理器形成,即采用第一处理器对原始病理切片图像的亮度进行判断。
同时,原始病理切片图像是非常庞大的图像,为了图像中切片组织信息显示的丰富性和完整性,可能会考虑由多幅数字病理图片拼接形成一幅完整的原始病理切片图像,但是由于显微镜或光学放大系统扫描得到的高分辨数字图像容易受周围环境或者显微镜自身设备的影响,导致扫描得到的各个数字图像分辨率有差异,有的数字图像很清晰,而有的很模糊。因此,将各个数字病理图片拼接出来的整张原始病理切片图像的精度就不会很高。则针对这种情况,在图像处理端B中设置一个第二检测单元B2用于对由多幅数字病理图片拼接形成的原始病理切片图像中各个拼接处进行清晰度检测,检测不合格的图像不予传送至远程服务端C。
本实施例中,上述第二检测单元B2同样可以由图像处理端B中的一第二处理器形成,即采用第二处理器来对由多幅数字病理图片拼接形成的原始病理切片图像中的拼接处进行清晰度检测。
本实施例中,上述第一处理器和第二处理器可以集成于图像处理端B的同一个处理芯片上,即采用同一个处理芯片同时完成图像的亮度检测和拼接处的清晰度检测。相应地,上述第一处理器和第二处理器也可以独立设置并独立工作。
本实施例中,对于单独一幅数字病理图片形成的原始病理切片图像可以不做拼接处清晰度的检测,即不通过上述第二检测单元B2的检测。
本实施例中,采用一输出单元B3将同时被上述第一检测单元B1和第二检测单元B2检测为合格的原始病理切片图像作为数字病理切片图像并输出。具体地,上述输出单元B3可以为图像处理端B中的通信接口,用于通过远程通信的方式(例如有线/无线通信方式)将经过处理(亮度检测/拼接处清晰度检测)的数字病理切片图像发送至远程服务端C。
本实施例中,对于患者而言,对不同的主治医师的信任程度可能各不相同,例如对于有一定经验并且处理过较复杂案例的主治医师的信任程度要远远高于一般的主治医师,对于一些经验比较缺乏且没有较高知名度的主治医师的信任程度则要低很多。鉴于此,本发明技术方案中提供一种可以由患者主动选择查看数字病理切片图像的主治医师的系统功能。
具体地,上述第一客户端D为患者使用的客户端,上述第二客户端E为主治医师使用的客户端。则上述扫描端A在对病理切片进行扫描并上传相应的数字病理切片图像至远程服务端C的同时,允许该病理切片相关联的第一客户端D向远程服务端C上传病历信息。该病历信息中可以包括患者通过第一客户端D选择的主治医师信息,当然上述病历信息中也可以包括患者自身的一些体征信息以及初步诊断信息等常规信息。
则在上述远程服务端C的存储空间C1中设置多个存储单元C11,每个存储单元C11对应于一个主治医师信息。具体地,可以将一个存储单元C11看作是一个具体的存储路径,该存储路径对应一个特定的主治医师信息。则若患者指定某个主治医师为该患者的医师并得到确认后,患者会通过第一客户端D将包括该被指定的主治医师信息的病历信息发送至远程服务端C,远程服务端C根据该病历信息解析得到对应的主治医师信息,并将对应该患者的数字病理切片图像(可以在扫描端A对病理切片进行扫描之前事先与对应的患者进行关联)保存到该被指定的主治医师所对应的存储单元C11中。
本实施例中,当主治医师需要浏览数字病理切片图像时,通过第二客户端E成功登录后远程服务端C开放给主治医师浏览与其关联的存储单元C11中保存的数字病理切片图像。主治医师可以选择在远程服务端C对数字病理切片图像进行在线浏览,或者将该数字病理切片图像下载到第二客户端E中进行离线浏览。
则本实施例中,上述第一客户端D可以为移动终端或者其他计算机设备。上述第二客户端E可以为具有一定处理能力,能够提供给主治医师正常浏览数字病理切片图像的终端。
本发明的较佳的实施例中,如图2中所示,上述第一检测单元B1具体包括:
第一检测模块B11,用于测出原始病理切片图像的亮度值;
第一标准模块B12,提供一预设的与原始病理切片图像对应的标准图像的亮度范围;
第一比较模块B13,分别与第一检测模块B11和第一标准模块B12连接,用于将原始病理切片图像的亮度值与标准图像的亮度范围进行比较:
当原始病理切片图像的亮度值在标准图像的亮度范围内时,输出用于表示原始病理切片图像的亮度值合格的第一检测结果;以及
当图像的亮度值不在标准图像的亮度范围内时,输出用于表示原始病理切片图像的亮度值不合格的第一检测结果。
通过一具体实施例对上述第一检测单元B1进行描述:现有一待判断的标签图通过第一检测模块B11检测出亮度值为164.097;第一标准模块B12中预设的标准图像的亮度范围为175~230。则上述第一比较模块B13将待判断的原始病理切片图像的亮度值164.097与预设的标准图的亮度范围175~230进行比较,从而判断出该原始病理切片图像的亮度值不在标准图的亮度范围之内,因此第一比较模块B13输出用于表示该原始病理切片图像不合格的第一检测结果。
上述实施例通过将待判断的图像的亮度与标准图像的亮度范围进行比较,当待判断的图像的亮度处于标准图像的亮度范围内时,图像亮度合格,否则图像亮度就不合格。这种图像亮度的判断不依赖于人工判断,不仅避免了人工主观因素带来的判断误差,而且通过系统自动判断提高了工作效率。
本发明的较佳的实施例中,仍然如图2中所示,上述第一检测单元B1中还包括图像补偿模块B14,连接第一比较模块B13,当第一比较模块B13输出用于表示原始病理切片图像的亮度值不合格的第一检测结果时,图像补偿模块B14根据不合格的原始病理切片图像的亮度值与标准图像的亮度范围之间的差值输出一光照补偿指令,图像处理端B将光照补偿指令反馈至扫描端A,以控制扫描端A重新扫描得到原始病理切片图像。
具体地,本实施例中,图像补偿模块B14与第一比较模块B13连接,当第一比较模块B13检测出不合格的图像时,图像补偿模块B14根据不合格的图像的亮度与标准图像的亮度范围之间的差值,输出对不合格的图像进行光照补偿的具体操作指令,扫描端A根据该具体操作指令,控制其照明光源(下文中会说明)进行相应的光照补偿操作,以重新扫描得到原始病理切片图像。
本发明的较佳的实施例中,上述图像处理端B还可以包括一连接第一检测单元B1的报警单元(图中未示出),当第一检测单元B1中的第一比较模块B13检测出某个原始病理切片图像的亮度不合格时(即亮度值不在预设的亮度范围内时),报警单元发出报警声,以提示工作人员重新扫描病理切片得到原始病理切片图像。
本发明的较佳的实施例中,工作人员重新扫描得到原始病理切片图像后,依然将该原始病理切片图像送入第一检测单元B1和第二检测单元B2进行检测。
本发明的较佳的实施例中,上述原始病理切片图像可以为对病理切片进行扫描得到的切片图像,也可以为空白切片图。即上述第一检测单元B1同样可以用来判断空白切片图的亮度是否合格。假设提供一扫描得到的空白切片的背景图,其所检测到的背景亮度为234.891。提供一预设的背景亮度范围在230~252之间的标准图。采用本发明技术方案中的第一检测单元B1可以判断得到,所扫描的空白切片的背景亮度在标准图的范围之内,因此,该空白切片的背景图是合格的。
同样地,也可以采用该实施例判断检测的病理切片的背景图是否在合格的范围之内,即可以采用第一检测单元B1同时检测原始病理切片图像中的切片组织所在的部位的亮度是否合格,以及检测原始病理切片图像中的背景部分的亮度是否合格,在上述两者的亮度均合格的情况下第一检测单元B1判断该原始病理切片图像的亮度合格。
综上,采用本发明技术方案中提供的第一检测单元B1对原始病理切片图像进行亮度值判断的工作原理具体包括:
首先测出图像的亮度值;
其次提供一预设的与图像对应的标准图像的亮度范围值;
随后判断图像的亮度值是否在标准图像的亮度范围值之内:若图像的亮度值在标准图像的亮度范围值内,则判断图像合格;若图像的亮度值不在标准图像的亮度范围值内,则判断图像不合格。
本发明的较佳的实施例中,如图3中所示,上述第二检测单元B2具体包括:
第二检测模块B21,于两幅相互拼接的数字病理图片中,处理得到一幅数字病理图片的图像梯度并计为第一梯度值,以及处理得到另一幅数字病理图片的图像梯度并计为第二梯度值;
第二标准模块B22,预先提供一预设的梯度比值;
第二比较模块B23,分别连接第二检测模块B21和第二标准模块B22,用于将第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值进行比较,并在比值与预设的梯度比值不相匹配时判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格,并进而输出用于表示原始病理切片图像的拼接处的清晰度不合格的第二检测结果。
本实施例中,上述原始病理切片图像由至少两幅数字病理图片拼接形成。图4中示出了由一幅数字病理图片11和另一幅数字病理图片12拼接成的原始病理切片图像作为示例,以对本发明的方案进行说明。
该一幅数字病理图片11和另一幅数字病理图片12是互相拼接的,因此,可以见同一个细胞组织可能同时被显示在一幅数字病理图片11和另一幅数字病理图片12的拼接处13。为了保证拼接处13的细胞清晰度一致,因此本发明的重点就在于如何判断这两张数字病理图片的拼接处13的清晰度是否合格。进一步地,一幅原始病理切片图像中至少有一处拼接处13,本实施例中仅以其中一个拼接处13为例进行说明。
本实施例中,第二检测模块B21处理得到数字病理图片11的梯度值作为第一梯度值,以及处理得到数字病理图片12的梯度值作为第二梯度值。在此之前,第二标准单元B22提供一预设的梯度比值,该梯度比值可以根据原始病理切片图像的整体清晰度预先设置,也可以由使用者根据实际情况设置。上述第二比较模块B23将第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值进行比较:
当第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值不相匹配时,上述第二比较模块B23判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处13的清晰度不合格;
相应地,当第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值相匹配时,上述第二比较模块B23判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处13的清晰度合格。
上述清晰度判断方法能够客观地判断图像的画质,不仅避免了因人为主观因素造成的评价结果不一致的缺点,还减少了评判画质的工作人员的工作量。
本发明的一个较佳的实施例中,当第一梯度值小于或等于第二梯度值时,预设的梯度比值小于或等于1;
则第二比较模块B23将第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在第一梯度值与第二梯度值的比值小于预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在第一梯度值与第二梯度值的比值大于或等于预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
本发明的另一个较佳的实施例中,当第一梯度值大于第二梯度值时,预设的梯度比值大于1;
则第二比较模块B23将第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在第一梯度值与第二梯度值的比值大于或等于预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在第一梯度值与第二梯度值的比值小于预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
具体地,本发明中列举了判断两幅拼接的数字病理图片之间的拼接处13的清晰度合格以及不合格的情况:
1)当第一梯度值小于或等于第二梯度值,两幅数字病理图片的梯度值的比值越小,说明两张数字病理图片的清晰度差距越大;当比值小于预设的梯度比值时,说明两张数字病理图片的清晰度都不合格。因此,在这种情况下,所谓第一梯度值与第二梯度值的比值和预设的梯度比值相匹配,是指比值大于或等于预设的梯度比值的情况。
2)当第一梯度值大于第二梯度值时,两幅数字病理图片的梯度值的比值越大,说明两张数字病理图片的清晰度插叙越大;当比值大于或等于预设的梯度比值时,说明两张数字病理图片的清晰度都不合格。因此,在这种情况下,所谓第一梯度值与第二梯度值的比值和预设的梯度比值相匹配,是指比值小于预设的梯度比值的情况。
本发明的较佳的实施例中,仍然如图3中,上述第二检测单元B2中还包括:
标识模块B24,连接第二比较模块B23,用于标识出在数字病理图片上被第二比较模块判断为清晰度不合格的拼接处。
具体地,本实施例中,在判断出不合格的拼接处13之后,可以在不合格的拼接处13用不同的方式标识出来,例如用圆形虚线框,或者方框,或者带有颜色的标记等。也可以采用一个额外的检测系统为每个拼接处设置一序号,当检测出一拼接处13不合格时,在该检测系统中显示出该拼接处13所对应的序号。本实施例中采用了如图4中所示的圆形虚线框的标识方式标识出清晰度不合格的拼接处13。
本发明的一个较佳的实施例中,并不是存在一处不清晰的拼接处就要将整幅原始病理切片图像确认为不合格,具体地,当标识模块B24标识出清晰度不合格的数字病理图片的拼接处13之后,可以根据数字病理图片的具体情况确定是否采用该数字病理切片。例如,当数字病理切片中所标出的清晰度不合格的拼接处13的个数超过预设的个数时(可以为3个、5个或者由使用者根据实际情况设置),则判断整张原始病理切片图像不合格,需要重新对数字病理切片扫描和重新检测。反之,只要不合格的拼接处13的个数未超过预设的个数,仍然认为可以使用该原始病理切片图像,即认为该原始病理切片图像整体合格。
本发明的较佳的实施例中,仍然如图3中所示,上述第二检测单元B2中还包括:
存储模块B25,连接第二比较模块B23,用于暂存被第二比较模块判断为清晰度合格的数字病理图片。
综上,本发明技术方案中,采用第二检测单元B2对由多幅数字病理图片拼接形成的原始病理切片图像进行拼接处清晰度检测的工作原理具体包括:
首先,于两幅相互拼接的数字病理图片中,处理得到一幅数字病理图片11的图像梯度并计为第一梯度值,以及处理得到另一幅数字病理图片12的图像梯度并计为第二梯度值;
其次,将第一梯度值与第二梯度值的比值与预设的梯度比值进行比较,并在比值与预设的梯度比值不相匹配时判断相互拼接的两幅数字病理图片之间的拼接处13的清晰度不合格。
本发明的较佳的实施例中,上述数字病理切片扫描系统中,可以对应同一个人体组织进行切片并通过扫描端扫描形成两张不同的原始病理切片图像;
则上述图像处理端B中,对两张原始病理切片图像分别进行亮度值和拼接处的清晰度的检测,并形成分别对应于两张原始病理切片图像的两张数字病理切片图像,计为第一切片图和第二切片图;
第一切片图位于以第一切片图的一个端点为原点位置的第一XOY坐标轴中,以及
第二切片图位于以第二切片图的一个端点为原点位置的第二XOY坐标轴中;
则仍然如图1中所示,上述图像处理端B还包括:
调整单元B4,连接输出单元B3,用于在输出单元发送数字病理切片图像前,依据第一切片图和第二切片图之间的位置关系对第二切片图进行调整,并将调整后的第二切片图和第一切片图整合形成一对应的数字病理切片图像,以供输出单元发送至远程服务端。
具体地,本实施例中,在临床医学诊断中,经常会有在同一块组织上切薄片并使用不同的染色剂染色的情况出现,如此做成的若干个切片图中的组织位置和角度都可能有所不同,而医生在浏览切片图时经常需要比较多幅相同组织的切片图像,在相同位置处比较图像信息从而得到比较准确的诊断结果。现有常用的做法是在数字切片浏览的相关软件内添加一个单幅图像角度旋转的功能,并人为地使用该功能,以通过肉眼查看和调整的方式将多张切片图像调整成一致的位置。上述方法费时费力,并且人工调整存在调整速度较慢、调整精度不高等问题,从而影响到后续的诊断结果,降低了医生的工作效率。因此本发明技术方案中提供调整单元B4来实现上述情况下实现数字病理切片自动旋转匹配的目的。
本发明的较佳的实施例中,上述调整单元B4可以采用上述图像处理端B中的一个第三处理器形成,即采用一第三处理器实现上述调整单元B4的功能。
本发明的较佳的实施例中,上述第三处理器同样可以与第一处理器和第二处理器一起集成于一处理芯片内。相应地,上述三个处理器也可以分别独立设置并独立工作。
进一步地,本发明的较佳的实施例中,如图5中所示,上述调整单元B4具体包括:
背景处理模块B41,用于扩大所述第一切片图的外轮廓尺寸,并以空白背景填充所述第一切片图中被扩大的部分;
第一旋转模块B42,连接所述背景处理模块B41,用于将所述第二切片图中与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点和所述第一切片图中的一预设旋转点对齐;
第一灰度处理模块B43,连接所述第一旋转模块B42,用于在所述第一切片图上处理得到预设的第一判断点的灰度值,以及在所述第二切片图上处理得到于对应于所述第一判断点的第二判断点的灰度值,随后处理得到所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的灰度比较值;
第二旋转模块B44,连接所述第一旋转模块B42,用于将所述第二切片图以与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点为轴心顺时针旋转一预设角度;
判断模块B45,分别连接所述第一灰度处理模块B41和所述第二旋转模块B44,用于在所述第二旋转模块B44旋转所述第二切片图后,判断所述第二切片图是否相对于初始位置已经旋转360度,并输出一判断结果;
所述第一灰度处理模块B41还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时重新进行灰度处理的操作;
所述第二旋转模块B44还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时继续对所述第二切片图进行旋转操作;
调整模块B46,分别连接所述第一灰度处理模块B41和所述判断模块B45,用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置已经旋转达到360度时获取取值最小的所述灰度比较值,并根据被获取的所述灰度比较值对应的所述第一切片图和所述第二切片图之间的所述位置关系对所述第二切片图进行调整。
具体地,本实施例中,首先采用上述背景处理模块B41扩大上述第一切片图的外轮廓,并在扩大部分以空白背景填充。例如,初始的第一切片图T1如图6所示,扩大后的第一切片图T1`如图7所示,扩大的仅为第一切片图T1的外轮廓,并非扩大整个第一切片图T1,因此在扩大后的第一切片图T1`中,其主体部分(初始的第一切片图T1的部分)并未被扩大,因此第一切片图T1`中,其切片组织并未被拉伸变形,随后在被扩大的部分以空白背景填充,以形成如图7中所示的经过扩大的第一切片图T1`。
本实施例中,在扩充第一切片图后,采用上述第一旋转模块B42将第二切片图中与第二XOY坐标轴的原点位置重合的端点和扩充后的第一切片图中的一预设旋转点对齐。具体地,第二切片图中与第二XOY坐标轴的原点位置重合的端点即在第二XOY坐标轴中的坐标为(0,0)的端点,将其与扩充后的第一切片图中的预设旋转点对齐。对齐后无需关心第一切片图与第二切片图当前的位置关系,即无需关心第一切片图与第二切片图之间的夹角度数。
本实施例中,随后采用上述第一灰度处理模块B43处理得到扩充后的第一切片图上的一预设的第一判断点的灰度值,以及处理得到上述第二切片图上的对应于第一判断点的第二判断点的灰度值。具体地,所谓第二判断点对应于第一判断点是指:当第二切片图的端点与第一切片图的预设旋转点对齐时,第二切片图与与第一切片图重叠,第二判断点即为与第一判断点位置重合的点。例如在第一切片图中的第一判断点在第一XOY坐标轴下的坐标为(i+m,j+n),则第二切片图中的第二判断点在第二XOY坐标轴下的坐标就为(i,j),则第二判断点在位置上与第一判断点重合,随后分别计算得到第一判断点和第二判断点上的灰度值,并进而计算得到当前位置下的灰度比较值。
本实施例中,在计算得到上述灰度比较值后,采用第二旋转模块B44,每次都将第二切片图以与第二XOY坐标轴的原点位置重合的端点为轴心顺时针旋转一预设角度,旋转之后采用判断模块B45判断该第二切片图是否已经旋转了360度,若否则继续通过上述第二旋转模块B44以及通过判断模块B45进行判断,直至该第二切片图已经旋转过360度为止。本发明的一个较佳的实施例中,上述步骤S4中的预设角度可以为1度,即将第二切片图每旋转1度就进行判断,直到顺时针旋转360度为止。
本实施例中,在第二切片图顺时针旋转360度之后,获取旋转每预设角度(例如旋转每1度)后处理得到的对应的灰度比较值,随后采用一调整模块B46提取所有灰度比较值中取值最小的一个,并根据该被提取的灰度比较值所对应的第一切片图和第二切片图之间的位置关系对第二切片图进行调整。具体地,根据上述被提取的灰度比较值对应的第二切片图旋转的角度以及第二切片图的初始位置获取第二切片图的调整方案并对第二切片图进行调整,上述初始位置是指第二切片图的端点未与第一切片图的预设旋转点重合时的位置,也即第二切片图与第一切片图放置方向相同时的位置(具体参照图6和图8)。例如被提取的灰度比较值对应的第二切片图旋转的角度为180度,则调整方案为在第二切片图的初始位置的基础上将其顺时针旋转180度。
本发明的较佳的实施例中,背景处理模块B41将第一切片图扩大至宽和高均为A的图像,并以空白背景填充第一切片图中被扩充的部分;
其中,
W1用于表示第一切片图的宽度;
H1用于表示第一切片图的高度。
具体地,本实施例中,上述第一切片图和第二切片图之间的尺寸可能并不一致,这里用W1表示第一切片图的宽度,以及用H1表示第一切片图的高度;相应地,用W2表示第二切片图的宽度,以及用H2表示第二切片图的高度,上述设定在下文中仍然适用。
则采用上述背景处理模块B41将第一切片图扩充至宽和高均为A的矩形图,A的取值根据上述公式(1)处理得到,并且在被扩充的部分以空白背景填充。具体地,如图6所示为扩充前的第一切片图T1,如图7所示为扩充后的第一切片图T1`。
本发明的较佳的实施例中,上述预设旋转点的坐标(m,n)的取值范围满足下述范围关系:
0≤m<W1-W2; (2)
0≤n<H1-H2; (3)
其中,
m用于表示预设旋转点在第一XOY坐标轴中的X轴坐标;
n用于表示预设旋转点在第一XOY坐标轴中的Y轴坐标。
本发明的较佳的实施例中,预设的第一判断点的坐标具有一预设的取值范围;
则如图9中所示,上述第一灰度处理模块B43中进一步包括:
第一灰度处理部件B431,用于在第一切片图上处理得到取值范围内的每个第一判断点的灰度值并计为第一灰度值;
第二灰度处理部件B432,用于在第二切片图上处理得到对应于取值范围内的每个第一判断点的每个第二判断点的灰度值并计为第二灰度值;
第三灰度处理部件B433,分别连接第一灰度处理部件B431和第二灰度处理部件B432,用于根据第一灰度值和对应的第二灰度值,分别处理得到对应的每个灰度比较值;
灰度值获取部件B434,连接第三灰度处理部件B433,用于获取取值最小的灰度比较值,并计为第一切片图与第二切片图在当前的位置关系下的灰度比较值。
具体地,本实施例中,上述第一判断点可以被表示为P1(i+m,j+n),第二判断点可以被表示为P2(i,j)。则:
0≤i<W2; (4)
0≤j<H2; (5)
再结合上述公式(2)和(3)可以得知:
上述第二判断点的取值范围为(0,0)至(W1,H1)。
换言之,需要保证上述第一判断点位于上述第一切片图T1的范围内,以及上述第二判断点位于上述第二切片图T2(如图8所示)的范围内,并且上述第一判断点和第二判断点的位置相对应。
随后,本实施例中,对于一个选定的第一判断点以及对应的第二判断点,分别获取其灰度值。对于第一判断点的灰度值计为第一灰度值,以及对于第二判断点的灰度值计为第二灰度值,随后根据上述第一灰度值和第二灰度值处理得到当前选定的第一判断点和第二判断点之间的灰度比较值。
进一步地,本发明的较佳的实施例中,处理得到灰度比较值的公式如下:
其中,S(m,n)用于表示P1(i+m,j+n)和P2(m,n)之间的灰度比较值。
随后,循环对取值范围内的第一判断点以及对应的第二判断点进行灰度比较值的处理,并取得到的所有灰度比较值中取值最小的那个作为最终在当前位置关系下的灰度比较值S(m,n)。本发明的较佳的实施例中,上述第一切片图与第二切片图的位置关系可以由第二切片图以与第一切片图重合的端点进行顺时针旋转的旋转角度来表示,因此上述灰度比较值S(m,n)也可以表示为S(ag),其中ag表示第二切片图当前的旋转角度。
因此,本发明的较佳的实施例中,第二切片图每旋转一预设角度,就处理得到该旋转角度状态下的灰度比较值。例如当第二切片图顺时针旋转到30度时,则计算得到灰度比较值S(30°),当第二切片图顺时针旋转到60度时,则计算得到灰度比较值S(60°),以此类推。即上述灰度值获取部件B434中,在获取取值最小的所述灰度比较值,并计为所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的所述灰度比较值后,记录所述第二切片图于所述当前的位置关系下相对于初始位置的旋转角度。
本发明的较佳的实施例中,仍然如图1中所示,上述扫描端A对病理切片进行扫描之前,通过预扫描先获取病理切片的预览图;
图像处理端B还包括:
识别单元B5,用于对预览图进行识别得到预览图中的切片组织图片;
图像处理端B将切片组织图片传回至扫描端A,扫描端A根据切片组织图片对病理切片进行扫描。
具体地,在切片扫描之前,需要对切片的预览图进行预备处理,较准确的识别出组织,并提取相关信息(即存在切片组织的区域),这样才能使扫描更加精确,可以有效减少最终形成的数字病理切片图像中包括的空白部分,提高医师的识别效率。
则本实施例中,在扫描端对切片组织进行正式的扫描之前,先对其进行大致扫描并形成一切片组织的预览图,并将该预览图传送至图像处理端B中。同时,在图像处理端B中设置一识别单元B5,该识别单元B5用于根据上述扫描端A传来的预览图识别图中切片组织所在的区域,识别单元B5保留切片组织所在的区域并删除其他区域,以此形成一切片组织图片并传回扫描端A。扫描端A最终根据该切片组织图片对病理切片进行正式的扫描,即只扫描切片组织图片所对应的切片组织的部分,形成相应的原始病理切片图像并传送至图像处理端B进行进一步处理。
本发明的较佳的实施例中,上述识别单元B5可以为设置在图像处理端B中的一第四处理器,即可以采用第四处理器实现上述识别单元B5的功能。上述第四处理器可以与上述第一处理器、第二处理器以及第三处理器集成在同一个处理芯片中,也可以与上述处理器独立设置并且独立工作,在此不再赘述。
本发明的较佳的实施例中,预先通过扫描端A对空白玻片进行扫描得到一空白切片图像;
则如图10中所示,上述识别单元B5具体包括:
图像获取模块B51,分别获取空白切片图像的背景图和预览图;
第二灰度处理模块B52,连接图像获取模块B51,用于将预览图的灰度值减去背景图的灰度值,得到一切片信息图像;
第一剔除模块B53,连接第二灰度处理模块B52,用于遍历处理切片信息图像的连通域,并剔除切片信息图像中的污渍;
第二剔除模块B54,连接第一剔除模块B53,用于在经过污渍剔除的切片信息图像上根据连通域的属性分别判断切片信息图中的各个连通域是否为切片组织,并剔除被判断为不是切片组织的连通域;
保留模块B55,连接第二剔除模块B54,用于保留剔除不是切片组织的连通域后的切片信息图像并作为切片组织图片。
现有技术中,通常使用图像处理技术,将预览图灰度化,再根据亮度差别区分出切片的组织、背景、杂质、或切片的染色污迹,从而识别并提取组织部分。这种方法一般是针对某一种或几种特定的切片组织类别进行识别,不适用于大多数切片,且在采用传统的亮度识别方法的过程中,经常出现遗漏组织或者将杂质和污渍误识别为组织的情况,导致很难进行准确有效的识别,从而降低了识别切片组织的准确率和效率。
则本实施例中,通过对组织和杂质在颜色特征和几何形状特征上进行判别,尽可能有效的识别出组织部分,同时对大多数的杂质和污渍进行识别并将其剔除,从而更精确地分离出切片预览图中的组织部分。
具体地,上述识别单元B5的工作原理如下文中所述:
首先,扫描出空白切片的背景图以及待识别的组织切片的预览图;
其次,将预览图的灰度值减去背景图的灰度值,得到一切片信息图;
再次,遍历处理切片信息图的连通域,剔除切片信息图中的污渍;
随后,根据连通域的属性分别判断切片信息图中的各个连通域是否为切片组织,并剔除被判断为不是切片组织的连通域;
最后,保留剔除不是切片组织的连通域后的切片信息图并作为切片组织图片输出。
本发明的较佳的实施例中,上述第二剔除模块B54可以根据下文中所述的一种或几种规则来对切片组织进行判断:
1)上述第二剔除模块B54可以在经过剔除切片信息图中的污渍后的剩余的连通域中找出面积最大的连通域,并分别将其他的剩余的连通域的面积与面积最大的连通域的面积相比计算得到一面积差值,将面积差值在一预设的面积差值范围内的连通域判断为切片组织。
一方面,一般杂质的面积比较小,而组织的面积比较大,因此可以通过几何形状来判别出是否为切片组织。另一方面,在扫描组织之前,需要利用染料在组织切片上给予颜色,使其与组织或细胞内的某种成分发生作用,经过透明后通过光谱吸收和折射,使其各种微细结构能显现不同颜色,这样在显微镜下就可显示出组织细胞的各种成分。而大多数杂质颜色偏黄,因此可以利用杂质和组织细胞的颜色差异来判断是否为切片组织。例如,在剔除污渍后的连通域中找出面积最大的连通域,将另一连通域与该面积最大的连通域的面积进行比较,得到一面积差值,若该面积差值在预设的面积差值范围内,则说明该另一连通域面积也比较大,可以判断为连通域。
2)上述第二剔除模块B54可以计算经过剔除切片信息图中的污渍后的剩余的连通域的RGB各通道的颜色均值,并分别根据剩余的各个连通域的RGB各通道的颜色值与RGB各通道的颜色均值处理得到对应的RGB差值,将同一个连通域的RGB差值均在一预设的RGB差值范围内所对应的连通域判断为切片组织。
在颜色判别规则中,首先累加所有连通域的R通道的总色值、G通道的总色值和B通道的总色值,然后求得所有连通域的R通道的均值、G通道的均值和B通道的均值,当所要判断的剩余连通域的R色值、G色值、B色值与计算的R通道的均值、G通道的均值和B通道的均值相差比较大时,例如同一个连通域的RGB差值均在一预设的RGB差值范围内,则该剩余的连通域判断为染色组织。当所要判断的剩余连通域的R色值、G色值、B色值与计算的对应的R通道的均值、G通道的均值和B通道的均值相差比较小时,此时同一个连通域的RGB差值不在预设的RGB差值范围内,则该剩余的连通域判断为杂质。
3)上述第二剔除模块B54可以将在切片信息图中与切片信息图的边缘相接触的连通域判断为不是切片组织的连通域。
该规则可以称为触边判别规则,其判断连通域是否与切片信息图的边缘相接触,与切片信息图的边缘相接触的连通域判断为杂质。
4)上述第二剔除模块B54可以将经过剔除切片信息图中的污渍后的剩余的连通域的亮度值在一预设的亮度范围内的连通域判断为是切片组织的连通域。
杂质和组织的亮度值不同,因此可以根据亮度来判别出杂质和组织。
上面列举了4种上述第二剔除模块B54可以依仗来对切片组织进行判断的规则的实施例,本发明中,可以采用其中一种或多种实施方式应用在第二剔除模块B54中。例如,可以将符合上述4种规则中至少两种的区域判断为视为存在有切片组织的连通域,最后生成一切片组织图片。为了提高精度,可以同时应用上述4种规则,即选出同时符合上述4种规则的区域视为存在有切片组织的连通域,从而生成切片组织图片并输出。
本发明的较佳的实施例中,上述第一剔除模块B53可以应用下文中所述的至少一种剔除规则来剔除切片信息图中的污渍,具体包括:
剔除面积小于一预设的面积的连通域;
剔除长宽比例小于一预设的长宽系数的连通域;
剔除面积占比系数小于一预设的面积占比系数的连通域。
在本实施例中,在上述第一剔除模块B53中可以同时根据连通域的面积、长宽和面积占比系数这三个方面分别对切片信息图中的污渍进行剔除。需要说明的是,上述三种规则的判断不受执行先后顺序的影响,可以同时执行上述三种规则判断,也可以按照任何可以执行的顺序来剔除切片信息图中的污渍,本领域技术人员可以预见上述三种规则判断在第一剔除模块B53中的执行顺序不影响剔除切片信息图的污渍的效果。
具体地,上文中:
采用剔除面积小于一预设的面积的连通域这一判断规则,是因为杂质中的灰尘和切片上的点状污渍的面积都在几百个像素级别,远小于组织的面积,因此可以将面积小于一预设的面积的连通域删除,该预设的面积可以设置为与一般杂质的面积大小相近,例如1200像素。
对于采用剔除长宽比例小于一预设的长宽系数这一判断规则,例如剔除长宽比例小于1/5或者大于5的连通域这一步骤,其是删除长宽比例特殊的连通域。这是由于切片染色或其他操作原因,盖玻片边缘的染色污渍往往呈水平长条形或垂直长条形,其长度和宽度要么很大要么很小,因此,可以剔除这部分长宽比例特殊的连通域。
在剔除面积占比系数小于一预设的面积占比系数的连通域这一判断规则中,将连通域的面积除以该面积区域的长宽乘积,得到面积占比系数,当面积占比系数小于一预设的面积占比系数,例如1/9时,说明此连通域的轮廓很大,但是切片信息很少,因为这是由盖玻片边缘的多个长条污渍连接组成的区域,因此应予以剔除。
本实施例中,上述第一剔除模块B53可以采用具有图像识别和比对功能的处理器实现,在此不再赘述。
本发明的较佳的实施例中,如图11中所示,上述图像获取模块B51中包括:
获取部件B511,用于分别获取空白切片图像的背景图和预览图;
剪除部件B512,连接获取部件B511,用于分别剪除背景图和预览图的边缘部分。
具体地,本实施例中,病理切片放置在载玻片上,并覆盖一盖玻片,一方面可以防止灰尘落到组织上,另一方面可以固定住组织。背景图和预览图的边缘部分为载玻片和盖玻片的边缘部分,此处没有组织信息,为了尽可能排除干扰项,需要将这些边缘部分裁剪剔除,以剔除干扰项。
本发明的较佳的实施例中,在上述第一剔除模块B53对切片信息图中的污渍进行剔除之前,为了更明显地突出切片组织和大部分杂质之间的区别,可以采用上述第一剔除模块B53先对上述切片信息图做图像二值化的处理,再进行污渍的剔除操作。现有技术中已有较多实现图像二值化处理的具体实现方式,在此不再赘述。
进一步地,本实施例中,为了更好地将切片组织和大部分杂质区分开,以对识别切片组织进行识别,可以将上述图像二值化处理所依据的阈值设置地偏低一些,以满足识别要求。
进一步地,本发明的较佳的实施例中,在对上述切片信息图进行图像二值化处理之后,还可以采用上述第一剔除模块B53再对切片信息图进行开运算处理,以分离细小的连通域与较大的连通域之间的边缘,平滑切片信息图的图像轮廓。
本发明的一个较佳的实施例中,以图12-20为例说明本发明技术方案中上述识别单元B5的工作原理:
图12-20示出了本发明技术方案中采用识别单元B5对病理切片的预览图进行识别并最终得到切片组织图片的整个过程。其中图12所示为一空白切片的背景图,图13为拍摄的有组织的预览图。背景图和预览图的边缘很容易拍到仪器部分,因此为排除预览图和/或背景图边缘的干扰,可以剪除图12和/或图13中的边缘。图14示出了剪除图13的边缘的实施例。接着,将剪除后的背景图的灰度值减去剪除后的预览图的灰度值,得到一如图15所示的切片信息图。在图15的基础上,进行图像二值化处理,用以进一步区分组织和杂质,得到图16。接着,对图16所示的图片进行开运算,去掉微小杂质,得到图17。进一步的,可以通过执行几何形状判别的规则(上述第二剔除模块B54所应用的第一种规则)得到图18所示的组织切片图;还可以通过颜色判别规则(上述第二剔除模块B54所应用的第二种规则)得到图19所示的组织切片图;基于图18和图19,综合判断出连通域是否为视为组织,识别后的结果如图20。换言之,本实施例中,上述第二剔除模块B54同时应用了两种连通域的判断规则,只有同时满足这两种判断规则的连通域才被视为存在有切片组织的连通域。
本发明的较佳的实施例中,如图21中所示,上述输出单元B3具体包括:
切割模块B31,用于将数字病理切片图像切割成多个局部图像;
坐标加密模块B32,连接切割模块B31,用于分别对每个局部图像的坐标信息进行加密操作以得到每个局部图像的加密信息;
输出单元B3向远程服务端C发送局部图像以及对应的加密信息,以向远程服务端C发送数字病理切片图像;
第二客户端E访问远程服务端C并获取保存的关联于一个数字病理切片图像的局部图像和对应的加密信息后,对每个加密信息进行解析以得到对应的坐标信息,随后根据坐标信息将局部图像依次拼接形成完成的数字病理切片图像并进行显示,以供第二客户端E的使用者对数字病理切片图像进行诊断。
具体地,目前的数字病理切片图像在传输过程中基本不做加密处理,或者做一些常见的数据加密操作。因此目前的数字病理切片图像在传输过程中很容易造成信息泄露,无法保证患者的信息安全,其数据保密性较差。则本实施例中针对上述情况在数字病理切片图像的加密传输方面做了改进。
具体地,本实施例中,每个上述数字病理切片图像分别被切割成多个局部图像,每个上述局部图像分别对应一唯一的上述坐标信息,由多个上述局部图构成一对应上述数字病理切片图像的全局图。
对数字病理切片图像进行加密操作后再上传至远程服务端C并由远程服务端C进行管理,当医师(第二客户端E)需要通过客户端对数字病理切片图像进行浏览时,需要先对数字病理切片图像进行解密操作,如果数字病理切片图像泄露到外网,除了管理该数字病理切片图像的远程服务端C,其他的客户端无法获得相关的数字病理切片图像的加密信息,因此就无法打开该数字病理切片图像,从而保护患者的信息安全。
并且,将数字病理切片图像的全局图分割成多个局部图像,对每个局部图像的坐标信息分别进行加密处理以完成对数字病理切片图像的加密操作,避免因为数字病理切片图像太大影响加密后的数字病理切片图像的浏览速度。医师通过第二客户端E对数字病理切片图像进行解密操作时分别对上述多个局部图像进行解密处理,能够保证浏览速度,提高用户体验。
因此,本实施例中,上述输出单元B3除了实现传输数字病理切片图像的功能,还包括了对数字病理切片图像进行分割并分别对局部图像进行加密的功能。则上述输出单元B3可以为包括数据通信功能的处理芯片,即将通信芯片与实现数据加密功能的处理器集成于一个处理芯片上来实现上述输出单元B3的功能。
综上,本发明技术方案中,上述输出单元B3对数字病理切片图像进行加密并且传输的工作原理具体包括:
首先,采用扫描端A对病理切片进行扫描以得到原始病理切片图像,并且对原始病理切片图像进行处理从而形成可以传输给远程服务端C的数字病理切片图像;
随后,在上述输出单元B3内,采用切割模块B31对数字病理切片图像进行切割以得到多个局部图像以及每个上述局部图像的对应于上述数字病理切片图像的全局图的坐标信息,并且采用上述坐标加密模块B32对每个上述局部图像的坐标信息分别进行加密操作以得到每个局部图像的加密信息;
最后,采用上述输出单元B3将上述局部图像和相应的加密信息发送至远程服务端C中包括;
当医师需要浏览数字病理切片图像时,可以采用第二客户端E从上述远程服务端C中调取对应于需要浏览的数字病理切片图像的所有局部图像和对应的加密信息,并对上述加密信息进行解密,以获取每个局部图像对应的上述坐标信息,随后上述第二客户端E根据所有坐标信息将上述局部图像按照对应的位置进行拼接操作以得到完整的数字病理切片图像并提供给医师进行浏览。
本发明的较佳的实施例中,上述数字病理切片扫描系统中包括多个扫描端A,每个扫描端A对应于一个图像处理端B(图1中仅示出一个扫描端A)。
每个图像处理端分别具有一唯一的授权码,每个扫描端分别具有一唯一的机器码,由授权码和机器码构成一密钥;
密钥提供给图像处理端中的输出单元对数字病理切片图像进行加密操作,并且图像处理端在向远程服务端发送数字病理切片图像的同时向远程服务端提供密钥。
具体地,本实施例中,上述数字病理切片扫描系统中可以包括多台扫描仪设备(扫描端A),每台扫描仪设备连接一个专用的图像处理服务器(图像处理端B)。由一个特定的扫描端A扫描得到的原始病理切片图像经由其专用的图像处理端B进行处理后得到数字病理切片图像并上传至远程服务端C。因此可以认为,在上述数字病理切片扫描系统中,一个扫描端A和其对应的图像处理端B一起可以构成一个用于扫描得到数字病理切片图像的工作站。
本实施例中,每个扫描端A具有一唯一的机器码,每个图像处理端B同样具有一唯一的授权码,则经由一个特定的扫描端A扫描得到的原始病理切片图像通过其专用的图像处理端B处理得到一数字病理切片图像,该数字病理切片图像所对应的密钥即为由该扫描端A的机器码和图像处理端B的授权码构成的密钥,因此能够保证从不同的扫描端A和其对应的图像处理端B输出的数字病理切片图像的密钥各不相同,换言之,通过密钥就能够区分数字病理切片图像的来源工作站。
本发明的较佳的实施例中,如图22中所示,上述远程服务端C中的每个存储单元C11中具体包括:
第一存储模块C111,用于保存数字病理切片图像中的局部图像;
第二存储模块C112,用于保存分别与每个局部图像对应的加密信息;
第三存储模块C113,用于保存对应于数字病理切片图像的密钥;
则如图22中所示,上述远程服务端C中还包括:
访问单元C2,连接存储空间C1,用于根据第二客户端的访问请求,从对应的存储单元C11中分别获取局部图像、加密信息和密钥并发送至第二客户端E。
具体地,本实施例中,在每个存储单元C11中除了保存有指定由该存储单元C11相关联的主治医师查看的数字病理切片图像的局部图像之外,还需要保存每个局部图像的加密信息以及该数字病理切片图像的密钥。在第二客户端E对上述数字病理切片图像进行访问时,远程服务端C提供一访问单元C2,能够将上述存储单元C11中的局部图像、加密信息以及密钥发送至第二客户端E,以供第二客户端E进行解密操作。
本发明的其他实施例中,若第二客户端E采用在线访问的方式浏览数字病理切片图像,则上述远程服务端C同样可以提供在线解密的功能,即通过保存在对应的存储单元C11提取局部图像、加密信息和密钥,直接在远程服务端C进行解密和拼接之后呈现给主治医师一幅完整的数字病理切片图像。
本发明的较佳的实施例中,如图23中所示,上述远程服务端C具体包括:
第一获取单元C3,用于获取图像处理端发送的数字病理切片图像;
第二获取单元C4,用于获取第一客户端发送的病历信息;
数据解析单元C5,连接第二获取单元C4,用于根据病历信息解析得到主治医师信息;
分配处理单元C6,分别连接数据解析单元C5、第一获取单元C3、第二获取单元C4和存储空间C1,用以根据解析出的主治医师信息,将对应的病历信息和数字病理切片图像保存于存储空间中对应的存储单元C11中,于存储单元C11中,数字病理切片图像和病历信息相互关联保存;
权限认证单元C7,与存储空间C1连接,用以对第二客户端E提供的主治医师账号的账户信息和密码进行验证;
并于验证通过后赋予第二客户端E于对应的存储单元C11中访问病历信息以及数字病理切片图像的权限;
病历处理单元C8,与存储空间C1连接,用以供远程登录的第二客户端E对数字病理切片图像进行诊断,以形成与数字病理切片图像对应的诊断报告,并将诊断报告保存于存储空间C1中对应于数字病理切片图像的存储单元C11中。
具体地,本实施例中,针对现有的主治医师在出差或者参加活动处在外地不能对患者及时诊断的问题,本发明中通过第一客户端D和扫描端A的配合将外部获取的患者的数字病理切片图像与被选择的主治医师信息进行关联,通过网络将患者的病历信息发送至远程服务端C的方式指定特定的主治医师对患者的数字病理切片图像进行浏览和诊断;
远程服务端C对每个主治医师分配有对应的存储单元C11,第一客户端1发送的病历信息以及相关的数字病理切片图像通过远程服务端C中的数据解析单元C4解析获取其中的主治医师信息后,将该病历信息以及对应的数字病理切片图像保存至对应主治医师的存储单元C11中,进而方便第二客户端E的主治医师在登录远程服务端C中时及时查看有多少患者的数字病理切片图像,方便主治医师及时作出诊断。
主治医师在需要对患者的数字病理切片图像作出诊断时,通过在第二客户端E中输入账户信息以及密码登录到远程服务端C,远程服务端C对账户信息以及密码作出认证并于认证通过时提供给第二客户端E访问存储空间C中相应的存储单元C11的权限。具体地,远程服务端C可以将相应的存储单元C11的访问路径发送至第二客户端E,第二客户端E可以根据该访问路径对相应的存储单元C11下保存的数字病理切片图像进行浏览和诊断。
本实施例中,上述远程服务端C的病历处理单元C7对第二客户端E的主治医师作出的诊断结果进行处理以形成诊断报告,并保存于远程服务端C中,其中远程服务端E还可以将诊断报告发送至对应的第一客户端D中,方便对应的患者及时得知诊断结果。
本实施例中,上述远程服务端C通过提供数据访问接口的方式供第二客户端E于远程服务端C中访问对应的患者的病历信息以及相关的数字病理切片图像,进而作出及时的诊断。
本发明的较佳的实施例中,仍然如图23中所示,上述远程服务端还包括:
诊断提示单元C9,连接病历处理单元C8,用以根据生成的诊断报告形成一与病历信息对应的诊断提示信息;
推送单元C10,连接诊断提示单元C9,用以将诊断提示信息发送至输出病历信息的第一客户端D。
具体地,本实施例中,当第二客户端E的主治医师在作出诊断之后,上述诊断提示单元C8会生成与患者的病历信息对应的诊断提示信息,诊断提示信息用以表示主治医师已经作出了诊断,此时通过推送单元C9将诊断提示信息推送至对应的第一客户端D,第一客户端D可根据该诊断提示信息于远程服务端C中获取对应患者的诊断报告。
本发明的较佳的实施例中,如图1和23中所示,上述数字病理切片扫描系统中还包括一短信通知服务端F,短信通知服务端F提供一接口连接远程服务端C,短信通知服务端F还远程连接第二客户端E;
如图23中所示,远程服务端C还包括:
通知单元C11,连接数据解析单元C4,用以根据解析得到的主治医师信息,生成对应的会诊提示信息;
则在生成会诊提示信息后,可以通过远程服务端E调用接口控制短信通知服务端F将会诊提示信息以短信提示的方式发送至对应主治医师信息的第二客户端E。
具体地,本实施例中,为了及时的提醒主治医师对患者进行就诊,远程服务端E通过通知单元C11生成会诊提示信息,并通过调用接口通过短信通知服务端F将该会诊提示信息发送至对应的主治医师的第二客户端E中,方便第二客户端E的主治医师及时查看数字病理切片图像并作出诊断。
本发明的较佳的实施例中,如图24所示,上述扫描端A进一步包括:
载片平台A1,待扫描的病理切片被放置于载片平台A1上,以供扫描端A进行扫描;
自动加载装置A2,设置于载片平台A1下方并连接载片平台A1,多个待扫描病理切片被放置在自动加载装置A2中,自动加载装置A2一次托起一个待扫描病理切片至载片平台上,以供扫描端A进行扫描;
照明扫描装置A3,设置在载片平台A1的上方,用于对载片平台A1上放置的待扫描病理切片进行扫描,以得到原始病理切片图像。
具体地,本实施例中,如图24所示,上述扫描端包括可在水平的XY平面上移动的载片平台A1,该载片平台A1的移动通过驱动马达进行控制。该载片平台A1上方设置照明扫描装置A3,用于提供扫描端A进行扫描所需的光源,并且对载片平台A1上的玻片上固定的病理切片进行扫描。
本发明的较佳的实施例中,上述自动加载装置A2中包括切片盒A21以及加载器A22,切片盒A21中可以预先安装有多个固定有病理切片的玻片,每个玻片都有对应的编号,一个切片盒A21优选地可以一次性容纳40片玻片,切片盒A21的具体结构如图25-26所示。
当需要对某个病理切片进行扫描时,该自动加载装置A2中的驱动电路板控制加载器A22将切片盒A21相应编号的玻片加载到该自动加载装置A2上方的载片平台A1中,以供扫描端A进行扫描。具体地,如图27-28中所示,当需要对某个病理切片进行扫描时,上述自动加载装置A2首先升至与载片平台A1同高的位置,随后通过加载器A22(图27-28中为推出舌)将切片盒A21中对应编号的玻片推出至载片平台A1的切片盒仓位A11中,供之后扫描端A进行扫描。
自动加载装置A2中其余的部分为导轨和上升装置等辅助设备,在此不再赘述。
本发明的较佳的实施例中,如图29-31所示,上述照明扫描装置A3进一步包括:
LED光源A31,用于在扫描端A对待扫描的病理切片进行扫描时提供扫描所需的光源;
扫描单元A32,设置于LED光源A31的一侧,用于对待扫描病理切片进行扫描;
明荧切换装置A33,设置于扫描单元A32上并连接扫描单元A32,用于控制扫描单元A32在明场扫描模式和荧光扫描模式之间进行切换。
具体地,本实施例中,图29中所示的部分实际位于图24中所示部分的背面。图29中,LED光源A31位于扫描单元A32的一侧并提供给扫描单元A32进行扫描时所需的光源。扫描单元A32可以为常规的扫描镜头,包括多片物镜以及线相机,其扫描光路也与现有扫描镜头的光路类似,在此不再赘述。
本实施例中,上述明荧切换装置A33能使得扫描单元A32可以在明场扫描模式和荧光扫描模式两种模式下进行工作。所谓明场扫描模式即采用明场透射光对病理切片进行扫描;所谓荧光扫描模式即采用荧光反射光对病理切片进行扫描。本实施例中,图30为当扫描单元A32工作在明场扫描模式下的状态,图31为通过明荧切换装置A33遮蔽透镜使得扫描单元A32工作在荧光扫描模式下的状态。
以上所述仅为本发明较佳的实施例,并非因此限制本发明的实施方式及保护范围,对于本领域技术人员而言,应当能够意识到凡运用本发明说明书及图示内容所作出的等同替换和显而易见的变化所得到的方案,均应当包含在本发明的保护范围内。

Claims (26)

1.一种数字病理切片扫描系统,其特征在于,包括扫描端、图像处理端、远程服务端、第一客户端以及第二客户端,所述扫描端连接所述图像处理端,所述远程服务端分别与所述图像处理端、所述第一客户端以及所述第二客户端连接;
所述扫描端用于对待扫描的病理切片进行扫描以形成原始病理切片图像,并将所述原始病理切片图像传输至所述图像处理端进行处理;
所述图像处理端用于对所述扫描端传输的所述原始病理切片图像进行处理以形成对应的数字病理切片图像并保存,同时将所述数字病理切片图像发送至所述远程服务端;
所述图像处理端进一步包括:
第一检测单元,用于检测所述原始病理切片图像的亮度值,并输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值是否合格的第一检测结果;
第二检测单元,用于检测由多幅数字病理图片拼接形成的所述原始病理切片图像的拼接处的清晰度,并输出用于表示所述拼接处的所述清晰度是否合格的第二检测结果;
输出单元,分别连接所述第一检测单元和所述第二检测单元,用于根据所述第一检测结果和所述第二检测结果,将所述亮度值和所述清晰度均合格的所述原始病理切片图像作为所述数字病理切片图像并发送至所述远程服务端;
所述第一客户端用于向所述远程服务端传输一病历信息,所述病历信息中包括用于表示所述第一客户端选择的主治医师账号的主治医师信息;
所述远程服务端中包括一存储空间,所述存储空间内分别预设有对应于每个所述主治医师信息的存储单元;
所述远程服务端将获取的所述数字病理切片图像与所述病历信息中包括的所述主治医师信息进行关联,并将所述数字病理切片图像保存于对应所述主治医师信息的所述存储单元中;
所述远程服务端同时允许已验证登录所述主治医师账号的所述第二客户端访问对应所述主治医师账号的所述存储单元中保存的所述数字病理切片;
其中,所述数字病理切片扫描系统中,对应同一个人体组织进行切片并通过所述扫描端扫描形成两张不同的所述原始病理切片图像;
所述图像处理端中,对两张所述原始病理切片图像分别进行亮度值和拼接处的清晰度的检测,并形成分别对应于两张所述原始病理切片图像的两张数字病理切片图像,计为第一切片图和第二切片图;
所述第一切片图位于以所述第一切片图的一个端点为原点位置的第一XOY坐标轴中,以及
所述第二切片图位于以所述第二切片图的一个端点为原点位置的第二XOY坐标轴中;所述图像处理端还包括:
调整单元,连接所述输出单元,用于在所述输出单元发送所述数字病理切片图像前,依据所述第一切片图和所述第二切片图之间的位置关系对所述第二切片图进行调整,并将调整后的所述第二切片图和所述第一切片图整合形成一对应的所述数字病理切片图像,以供所述输出单元发送至所述远程服务端。
2.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第一检测单元具体包括:
第一检测模块,用于测出所述原始病理切片图像的亮度值;
第一标准模块,提供一预设的与所述原始病理切片图像对应的标准图像的亮度范围;
第一比较模块,分别与所述第一检测模块和所述第一标准模块连接,用于将所述原始病理切片图像的亮度值与所述标准图像的亮度范围进行比较:
当所述原始病理切片图像的亮度值在所述标准图像的亮度范围内时,输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值合格的所述第一检测结果;以及
当所述图像的亮度值不在所述标准图像的亮度范围内时,输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值不合格的所述第一检测结果。
3.根据权利要求2所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第一检测单元还包括:
图像补偿模块,连接所述第一比较模块,当所述第一比较模块输出用于表示所述原始病理切片图像的所述亮度值不合格的所述第一检测结果时,所述图像补偿模块根据不合格的所述原始病理切片图像的所述亮度值与所述标准图像的所述亮度范围之间的差值输出一光照补偿指令,所述图像处理端将所述光照补偿指令反馈至所述扫描端,以控制所述扫描端重新扫描得到所述原始病理切片图像。
4.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第二检测单元具体包括:
第二检测模块,于两幅相互拼接的所述数字病理图片中,处理得到一幅所述数字病理图片的图像梯度并计为第一梯度值,以及处理得到另一幅所述数字病理图片的图像梯度并计为第二梯度值;
第二标准模块,预先提供一预设的梯度比值;
第二比较模块,分别连接所述第二检测模块和所述第二标准模块,用于将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并在所述比值与所述预设的梯度比值不相匹配时判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的所述拼接处的清晰度不合格,并进而输出用于表示所述原始病理切片图像的拼接处的清晰度不合格的所述第二检测结果。
5.如权利要求4所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,当所述第一梯度值小于或等于所述第二梯度值时,所述预设的梯度比值小于或等于1;
则所述第二比较模块将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值小于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值大于或等于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
6.如权利要求4所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,当所述第一梯度值大于所述第二梯度值时,所述预设的梯度比值大于1;
则所述第二比较模块将所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值与所述预设的梯度比值进行比较,并根据比较结果:
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值大于或等于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度不合格;
在所述第一梯度值与所述第二梯度值的比值小于所述预设的梯度比值时,判断相互拼接的两幅所述数字病理图片之间的拼接处的清晰度合格。
7.如权利要求4所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第二检测单元中还包括:
标识模块,连接所述第二比较模块,用于标识出在所述数字病理图片上被所述第二比较模块判断为清晰度不合格的拼接处。
8.如权利要求5或6所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第二检测单元中还包括:
存储模块,连接所述第二比较模块,用于暂存被所述第二比较模块判断为清晰度合格的所述数字病理图片。
9.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述调整单元具体包括:
背景处理模块,用于扩大所述第一切片图的外轮廓尺寸,并以空白背景填充所述第一切片图中被扩大的部分;
第一旋转模块,连接所述背景处理模块,用于将所述第二切片图中与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点和所述第一切片图中的一预设旋转点对齐;
第一灰度处理模块,连接所述第一旋转模块,用于在所述第一切片图上处理得到预设的第一判断点的灰度值,以及在所述第二切片图上处理得到于对应于所述第一判断点的第二判断点的灰度值,随后处理得到所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的灰度比较值;
第二旋转模块,连接所述第一旋转模块,用于将所述第二切片图以与所述第二XOY坐标轴的所述原点位置重合的所述端点为轴心顺时针旋转一预设角度;
判断模块,分别连接所述第一灰度处理模块和所述第二旋转模块,用于在所述第二旋转模块旋转所述第二切片图后,判断所述第二切片图是否相对于初始位置已经旋转360度,并输出一判断结果;
所述第一灰度处理模块还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时重新进行灰度处理的操作;
所述第二旋转模块还用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置旋转尚未达到360度时继续对所述第二切片图进行旋转操作;
调整模块,分别连接所述第一灰度处理模块和所述判断模块,用于根据判断结果,在所述第二切片图相对于初始位置已经旋转达到360度时获取取值最小的所述灰度比较值,并根据被获取的所述灰度比较值对应的所述第一切片图和所述第二切片图之间的所述位置关系对所述第二切片图进行调整。
10.如权利要求9所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述背景处理模块将所述第一切片图扩大至宽和高均为A的图像,并以空白背景填充所述第一切片图中被扩充的部分;
其中,
W1用于表示所述第一切片图的宽度;
H1用于表示所述第一切片图的高度。
11.如权利要求9所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述预设旋转点的坐标(m,n)的取值范围满足下述范围关系:
0≤m<W1-W2;
0≤n<H1-H2;
其中,
m用于表示所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的X轴坐标;
n用于表示所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的Y轴坐标;
W1用于表示所述第一切片图的宽度;
H1用于表示所述第一切片图的高度
W2用于表示所述第二切片图的宽度;
H2用于表示所述第二切片图的高度。
12.如权利要求9所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,预设的所述第一判断点的坐标具有一预设的取值范围;
则所述第一灰度处理模块中进一步包括:
第一灰度处理部件,用于在所述第一切片图上处理得到所述取值范围内的每个所述第一判断点的灰度值并计为第一灰度值;
第二灰度处理部件,用于在所述第二切片图上处理得到对应于所述取值范围内的每个所述第一判断点的每个所述第二判断点的灰度值并计为第二灰度值;
第三灰度处理部件,分别连接所述第一灰度处理部件和所述第二灰度处理部件,用于根据所述第一灰度值和对应的所述第二灰度值,分别处理得到对应的每个灰度比较值;
灰度值获取部件,连接所述第三灰度处理部件,用于获取取值最小的所述灰度比较值,并计为所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的所述灰度比较值。
13.如权利要求12所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述第三灰度处理部件依据下述公式处理得到所述灰度比较值:
其中,
S(m,n)用于表示所述灰度比较值;
(m,n)用于表示所述预设旋转点的坐标值,m为所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的X轴坐标,n为所述预设旋转点在所述第一XOY坐标轴中的Y轴坐标;
(i,j)用于表示所述第二判断点的坐标值,i为所述第二判断点在所述第二XOY坐标轴中的X轴坐标,j为所述第二判断点在所述第二XOY坐标轴中的Y轴坐标;
W2用于表示所述第二切片图的宽度;
H2用于表示所述第二切片图的高度;
P1用于表示所述第一灰度值;
P2用于表示所述第二灰度值。
14.如权利要求12所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述灰度值获取部件获取取值最小的所述灰度比较值,并计为所述第一切片图与所述第二切片图在当前的位置关系下的所述灰度比较值后,还用于记录所述第二切片图于所述当前的位置关系下相对于初始位置的旋转角度;
则所述调整模块依照被获取的取值最小的所述灰度比较值所对应的所述旋转角度对所述第二切片图进行旋转。
15.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述扫描端对所述病理切片进行扫描之前,通过预扫描先获取所述病理切片的预览图;
所述图像处理端还包括:
识别单元,用于对所述预览图进行识别得到所述预览图中的切片组织图片;
所述图像处理端将所述切片组织图片传回至所述扫描端,所述扫描端根据所述切片组织图片对所述病理切片进行扫描。
16.如权利要求15所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,预先通过所述扫描端扫描得到一空白切片图像;
所述识别单元具体包括:
图像获取模块,分别获取所述空白切片图像的背景图和所述预览图;
第二灰度处理模块,连接所述图像获取模块,用于将所述预览图的灰度值减去所述背景图的灰度值,得到一切片信息图像;
第一剔除模块,连接所述第二灰度处理模块,用于遍历处理所述切片信息图像的连通域,并剔除所述切片信息图像中的污渍;
第二剔除模块,连接所述第一剔除模块,用于在经过污渍剔除的所述切片信息图像上根据所述连通域的属性分别判断所述切片信息图中的各个连通域是否为切片组织,并剔除被判断为不是所述切片组织的所述连通域;
保留模块,连接所述第二剔除模块,用于保留剔除不是所述切片组织的所述连通域后的所述切片信息图像并作为所述切片组织图片。
17.如权利要求16所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述图像获取模块中包括:
获取部件,用于分别获取所述空白切片图像的背景图和所述预览图;
剪除部件,连接所述获取部件,用于分别剪除所述背景图和所述预览图的边缘部分。
18.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述输出单元具体包括:
切割模块,用于将所述数字病理切片图像切割成多个局部图像;
坐标加密模块,连接所述切割模块,用于分别对每个所述局部图像的坐标信息进行加密操作以得到每个所述局部图像的加密信息;
所述输出单元向所述远程服务端发送所述局部图像以及对应的所述加密信息,以向所述远程服务端发送所述数字病理切片图像;
所述第二客户端访问所述远程服务端并获取保存的关联于一个所述数字病理切片图像的所述局部图像和对应的所述加密信息后,对每个所述加密信息进行解析以得到对应的所述坐标信息,随后根据所述坐标信息将所述局部图像依次拼接形成完成的所述数字病理切片图像并进行显示,以供所述第二客户端的使用者对所述数字病理切片图像进行诊断。
19.如权利要求18所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述数字病理切片扫描系统中包括多个扫描端,每个所述扫描端对应于一个所述图像处理端;
每个所述图像处理端分别具有一唯一的授权码,每个所述扫描端分别具有一唯一的机器码,由所述授权码和所述机器码构成一密钥;
所述密钥提供给所述图像处理端中的所述输出单元对所述数字病理切片图像进行加密操作,并且所述图像处理端在向所述远程服务端发送所述数字病理切片图像的同时向所述远程服务端提供所述密钥。
20.如权利要求19所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述远程服务端中的每个所述存储单元中具体包括:
第一存储模块,用于保存所述数字病理切片图像中的所述局部图像;
第二存储模块,用于保存分别与每个所述局部图像对应的所述加密信息;
第三存储模块,用于保存对应于所述数字病理切片图像的所述密钥;
所述远程服务端中还包括:
访问单元,连接所述存储空间,用于根据所述第二客户端的访问请求,从对应的所述存储单元中分别获取所述局部图像、所述加密信息和所述密钥并发送至所述第二客户端。
21.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,
所述远程服务端具体包括:
第一获取单元,用于获取所述图像处理端发送的所述数字病理切片图像;
第二获取单元,用于获取所述第一客户端发送的所述病历信息;
数据解析单元,连接所述第二获取单元,用于根据所述病历信息解析得到所述主治医师信息;
分配处理单元,分别连接所述数据解析单元、所述第一获取单元、所述第二获取单元和所述存储空间,用以根据解析出的所述主治医师信息,将对应的所述病历信息和所述数字病理切片图像保存于所述存储空间中对应的所述存储单元中,于所述存储单元中,所述数字病理切片图像和所述病历信息相互关联保存;
权限认证单元,与所述存储空间连接,用以对所述第二客户端提供的所述主治医师账号的账户信息和密码进行验证;
并于验证通过后赋予所述第二客户端于对应的所述存储单元中访问所述病历信息以及所述数字病理切片图像的权限;
病历处理单元,与所述存储空间连接,用以供远程登录的所述第二客户端对所述数字病理切片图像进行诊断,以形成与所述数字病理切片图像对应的诊断报告,并将所述诊断报告保存于所述存储空间中对应于所述数字病理切片图像的所述存储单元中。
22.如权利要求21所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述远程服务端还包括:
诊断提示单元,连接所述病历处理单元,用以根据生成的所述诊断报告形成一与所述病历信息对应的诊断提示信息;
推送单元,连接所述诊断提示单元,用以将所述诊断提示信息发送至输出所述病历信息的所述第一客户端。
23.如权利要求21所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,还包括一短信通知服务端,所述短信通知服务端提供一接口连接所述远程服务端,所述短信通知服务端还远程连接所述第二客户端;
所述远程服务端还包括:
通知单元,连接所述数据解析单元,用以根据解析得到的所述主治医师信息,生成对应的会诊提示信息;
通过所述远程服务端调用所述接口控制所述短信通知服务端将所述会诊提示信息发送至对应所述主治医师信息的所述第二客户端。
24.如权利要求1所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述扫描端进一步包括:
载片平台,所述待扫描病理切片被放置于所述载片平台上,以供所述扫描端进行扫描;
自动加载装置,设置于所述载片平台下方并连接所述载片平台,多个所述待扫描的所述病理切片被放置在所述自动加载装置中,所述自动加载装置一次托起一个所述待扫描病理切片至所述载片平台上,以供所述扫描端进行扫描;
照明扫描装置,设置在所述载片平台的上方,用于对所述载片平台上放置的所述待扫描病理切片进行扫描,以得到所述原始病理切片图像。
25.如权利要求24所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述照明扫描装置进一步包括:
LED光源,用于在所述扫描端对所述待扫描的所述病理切片进行扫描时提供扫描所需的光源;
扫描单元,设置于所述LED光源的一侧,用于对所述待扫描病理切片进行扫描;
明荧切换装置,设置于所述扫描单元上并连接所述扫描单元,用于控制所述扫描单元在明场扫描模式和荧光扫描模式之间进行切换。
26.如权利要求24所述的数字病理切片扫描系统,其特征在于,所述自动加载装置包括切片盒仓位和加载器;
所述切片盒仓位内预先放置有多个包括待扫描的所述病理切片的玻片,每个所述玻片具有一预设的编号;
当使用者通过所述编号选中所述玻片进行扫描时,所述加载器将所述切片盒仓位内被选择的所述玻片推出并放置在所述载片平台的切片盒中,以供所述照明扫描装置进行扫描。
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