CN105745020A - 可运输的复合液体池 - Google Patents
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Abstract
一种单次使用的盒体,其中该盒体限定多个盲孔,每个盲孔限定一个开口,该多个盲孔中的至少一个包含两种互相不混溶的液体,这两种液体都不与水混溶,这两种互相不混溶的液体中的一种具有大于水的比重并且这两种互相不混溶的液体中的另一种具有小于水的比重。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求2013年11月25日提交的序列号为61/908,479的美国临时申请以及2013年11月25日提交的序列号为61/908,489的美国临时申请的权益,将其通过引用以其全文结合在此。
背景
当前的生物化学处理方法,典型地在多孔板的肉眼可见的孔中进行,具有许多缺陷,这些缺陷通过使用复合液体池或CLC得到了解决。CLC描述于2010年7月22日提交的美国临时申请序列号61/344,434,2011年4月1日提交的61/470,515和2011年4月1日提交的61/470,520、以及2011年8月3日提交的美国申请号13/147,679,每个申请特此通过引用以其全部内容结合在此。CLC允许生物化学方案(如核酸扩增)在标准多孔板中能使用远低于处理必需量的试剂进行。使用CLC还允许便于处理,因为可以相对容易地移动、组合以及分开CLC。
概述
披露了用于CLC的装置、系统、以及方法。
附图简要说明
图1示意性地显示盒体,该盒体界定了多个盲孔。
图2示意性地显示图1的盒体的横截面(空)。
图3示意性地显示图1的盒体的横截面,其中油与试剂密封在每个盲孔中,并且包括对一个孔的特写。
图4示意性地显示板,该板由如图1中所示多个盒体构成,为清楚起见,按未密封示出。
图5示意性地显示图4的板,盲孔上覆盖有密封。
图6描绘了本发明系统的实施例。将油A和油B置于导管中,该导管顶部和底部是开放的。任一个开口都能够闭合。该导管可以处于截头圆锥的形状。油B具有高于油A的密度,并且这些油不混溶。可将样品添加至该导管中。该样品具有介于油A的密度与油B的密度之间的密度。此外,该样品与油A和油B两者实质上不混溶。可以按任何顺序将样品、油A以及油B添加至该导管中。
图7描绘了一种从该系统中分配样品的方法。经由该导管的底部开口将油B从系统中分配出去。经由该导管的底部开口将一定体积的样品从系统中分配出去。这可以通过向该导管的顶部开口施加正压力来实现。使油B返回该导管。这可以在该导管的底部与油B接触的同时,通过向该导管的顶部施加负压力来实现。
注意图6和7示出每个弯液面都是凸的,即向上凸出至中央极大,如典型的油在聚丙烯导管中的情况中那样。如果该容器和/或液体构成不同并且具有不同的相对湿润特性,弯液面可以是凸的,即向下凸出至中央极小,如很多油在具有聚四氟乙烯内表面的容器中的情况中那样。
详细描述
CLC通常由三种实质上互相不混溶的液体的组合形成,这三种液体具有三种不同的密度。在底部的是一种载液,三种中密度最大,而在顶部的是一种封装流体,三种中密度最小。在该载液与该封装流体之间的是包含在CLC中的流体(典型地水性的),该流体可以是例如生物样品或试剂、缓冲剂、或生物化学方案的其他规定要素。三种互相不混溶的液体的这种总体安排可有利地应用于除了用于操纵生物化学方案之外的情况中,例如在可运输的盒体中的盲孔中储存、或在具有通孔的装置中储存并且从中分配,例如开口的导管。
图1示意性地显示盒体1,该盒体界定了多个盲孔。这些盲孔是共线的,沿着该盒体1的长度直线排列。第一盲孔2定位在该盒体1的一端。图2显示同一个盒体1的横截面。如所示,这些孔是空的。图3显示与图2相同的盒体1的相同的横截面,但在这种情况下,显示这些孔填充有流体。在一些实施例中,一个或多个孔包含三种流体,这三种流体具有三种不同的密度或比重,所有三种流体是互相不混溶的。在孔2的底部的是高密度流体3,由交叉影线所示,例如具有密度大约为1.9g/cc的福瑞特(Fluorinert)FC-40(氟碳化油)。在该高密度流体3之上是互相不混溶的低密度流体4,由相反的交叉影线所示,例如具有密度大约为0.92g/cc的苯基甲基聚硅氧烷(硅油)。在这两种油之间的是水性要素5,其具有约为1.0g/cc的密度。两种油与该水性要素实质上是互相不混溶的,赋予CLC的功能性给每个孔的内容物。
在一些实施例中,一个或多个孔可完全留为空白,而其他孔包括一种或多种流体,例如油。在一些实施例中,一些孔或所有孔可仅包括这两种油,预期添加水性要素。剩余的孔可包含油与水性要素,该水性要素包含进行生物化学方案(例如测定具体生物制剂存在)所需的试剂,或通过PCR扩增核酸所需的试剂。在任何情况下,可以将密封的盒体(如下文所讨论)与包含在一个或多个孔中的CLC大小相称量的所需试剂进行运输。因为所需试剂的数量非常少,这样一个盒体的成本可以保持得很低。两种互相不混溶、围绕水性溶液的油的存在还为该水性溶液提供稳定性,因为这些水性要素分被安全地密封在相当于一个固定的CLC中。
在一些实施例中,将一些或所有水性组分或试剂干燥(例如冻干或冷冻干燥)以增强稳定性与运输。
图4和5示出一系列盒体,像图1-3中所示的那些盒体,组装到一起以制成单板6。每一行孔对应于单个的盒体。该板可以由相互附着的盒体制成,这些盒体先前是独立的,或者该板可以是一体形成的单件(在这种实施例中,在此对于盒体的特征的描述也适用于单独或一体形成的板的一行或一段)。图5示出密封的板。用手撕型薄膜7对每盒体中的第一孔进行密封。在这个实施例中,该薄膜7旨在被使用者用手打开,并且将样品插入第一行孔中,即每个盒体中的第一孔。用单个密封件8覆盖其余的孔。在这种情况下,该密封件8是可刺破性薄膜。当使用盒体1或板6时,液体处理系统可通过刺破该密封件8获取这些孔中的液体。该薄膜7和该密封件8下面孔的位置以虚线所示。虽然该第一孔显示在该板/盒体的一端处,可以将其放置在任何位置。任何孔都可以被指定为接收样品的孔,或被认为是“第一”孔。该密封件可以是任何适合的材料,例如金属箔或聚合物膜或其组合。
单次使用的盒体可包括密封件并且限定多个共线的盲孔,每个盲孔限定一个开口,该多个盲孔中的至少一个包含两种互相不混溶的液体,两者都不与水混溶,这两种互相不混溶的液体中的一种具有大于水的比重而这两种互相不混溶的液体中的另一种具有小于水的比重。该密封件可覆盖由至少一个盲孔限定的开口,由此使得该盲孔的内部对这两种互相不混溶的液体实质上防漏。
在一些实施例中,所有的盲孔包含同样的两种互相不混溶的液体。在一些实施例中,至少一个盲孔仅包含这两种互相不混溶的液体。
在一些实施例中,该盒体可具有第一盲孔,该第一盲孔(a)定位在该多个盲孔的直线的一端,并且(b)被该密封件的一部分密封,该密封件被适配为被人类使用者用手撕掉,从而暴露该第一盲孔的开口。在一些实施例中,该第一盲孔仅包含这两种互相不混溶的液体。在一些实施例中,除该第一盲孔外,该多个盲孔中的至少一个包含处在水性溶液中的试剂,其中该试剂是预先确定的生物化学方案的要素。在一些实施例中,进行该预先确定的生物化学方案所需的所有试剂分开地包含在除该第一盲孔之外的该多个盲孔中。在一些实施例中,该预先确定的生物学方案是利用PCR的核酸扩增。在一些实施例中,该密封件的至少一部分是可刺破性薄膜,该薄膜封闭由至少一个盲孔限定的开口。任选地,将一种或多种此类试剂干燥,并且一些孔可以是空的以允许混合或废物处理。
在一些实施例中,该板可包括多个盒体,该板通过该多个该盒体的连接或其他整合而形成,这些盒体排列在该板中,这样使得每多个共线的盲孔平行于所有其他者。可替代地,这样一种板可以用这些盲孔以任何其他图案形成,例如通过使用具有其他构型的盒体。如所指出的,该板也可以是单个、整体件。
本发明所述系统的实施例可以包括这样一种盒体或板;盒体或板接收器,该接收器被设定大小和成形为与该盒体或板配合;液体处理系统,当该盒体已经与该盒体接收器配合时,该系统能够通过将液体导管插入这些盲孔中的任一个而刺破封闭该多个盲孔中的任一个的可刺破性薄膜;以及控制器,该控制器可操作地连接至该液体处理系统。该控制器可以被编程为,例如,使该液体处理系统在这些盲孔中的一个中形成复合液体池,并且对该复合液体池与这些试剂进行操作,从而进行该预先确定的生物化学方案。
在一些实施例中,该系统包括热循环仪。在一些实施例中,该系统包括冷却单元。在一些实施例中,该系统包括光学荧光激发与检测模块。在一些实施例中,该系统包括毛细管。在一些实施例中,该系统包括磁分离模块。
实施生物化学方案的方法可以包括:提供系统,该系统使用如上文所述盒体或板;将该盒体或板插入该接收器中;将生物样品沉积到第一盲孔中(在将该盒体或板插入该接收器中之前或之后);激活该控制器,这样使得该控制器使该液体处理系统形成包含该生物样品的水性溶液的复合液体池,并且对该复合液体池与这些试剂进行操作,从而对该生物样品实施该预先确定的生物学方案。
除了其中生物样品或试剂存储在盲孔的系统之外,在一些实施例中,本披露还提供了用于存储以及从导管(如通孔)中分配样品的系统和方法。该导管可以具有任何方向的流动并且被控制器所控制。在某些实施例中,将样品(如试剂或生物分子)悬浮在两种流体(如油)之间。在某些实施例中,按需要使用该样品,并且然后一旦分配了需要体积的样品就进行重新悬浮。在某些实施例中,如果需要多个单位的样品,则可在每单位分配之后、或在多个单位分配之后、或在全部所需单位的样品分配之后将该样品重新悬浮。
示例性实施例
在某些实施例中,本发明涉及一种系统,该系统包括导管、泵、第一流体(例如流体A)、第二流体(例如流体B)、以及样品。该导管可限定顶部开口和底部开口,并且可包括布置在该顶部开口和该底部开口之间的内表面。该第一流体、该样品、以及该第二流体可以布置在该导管之内在该顶部开口和该底部开口之间。该第一流体、该第二流体以及该样品可以是实质上互相不混溶的。该第一流体可以比该样品密度低,而该样品可以比该第二流体密度低。该样品可以布置在该第一流体和该第二流体之间,这样使得该样品的整个表面区域仅与该第一流体、该第二流体或该导管的内表面处于流体接触。在一些实施例中,泵可以被配置为向该导管中位置处施加正压力、负压力、或不施加外压力。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统基本上由导管(如一个通孔)、第一流体(例如流体A)、第二流体(例如流体B)、与样品,以及任选地泵组成。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的底部开口的构件。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的顶部开口的构件。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品在水性溶液中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品包括试剂。试剂的实例包括可用于测序珠粒制备、焦磷酸测序、核酸连接、以及聚合酶链式反应中的那些试剂。在某些实施例中,该试剂在珠粒上。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品包括生物分子。生物分子的实例包括(并且不限于)细胞、核酸、蛋白质、酶、血液、唾液、以及有机材料。在某些实施例中,该生物分子在珠粒上。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品包括多于一种试剂或多于一种生物分子、或试剂与生物分子。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第一流体与该第二流体是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第一流体与该样品是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第二流体与该样品是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第一流体或该第二流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第一流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第二流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中用于生成不混溶相的这些油,例如该第一流体或该第二流体,可以包括并且不限于硅油、全氟碳油和全氟聚醚油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中所涉及的流体密度的典型值涉及以下值内范围,该第二流体为约1,300至约2,000kg/m3,该第一流体为约700至约990kg/m3,而该样品为约900至约1200kg/m3。一组这样的操作流体与密度的实例在此概述但不限于这些;该第二流体是福瑞特(Fluorinert)FC-40(氟碳化油)密度大约为1,900kg/m3;该第一流体是苯基甲基聚硅氧烷(硅油)密度大约为920kg/m3;而该样品是PCR试剂的水性基溶液,该溶液具有大约1000kg/m3的密度。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第二流体是全氟化胺油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油和聚山梨醇酯添加剂的溶液。这些添加剂具有在2至8范围内的亲水亲油平衡数值。这些添加剂的组合总亲水亲油平衡数值在2至8范围内。聚山梨醇酯添加剂的实例为脱水山梨糖醇单油酸酯、脱水山梨糖醇三硬脂酸酯、以及聚山梨醇酯20,但不限于这些。该第一流体之中的这些添加剂在0.001%与10%之间的范围内。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品是在水性介质中的固体粒子悬浮液,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,而该第二流体是基于氟碳的油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该样品是在水性介质中的基于苯基甲基聚硅氧烷的油,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,而该第二流体是基于氟碳的油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是实质上竖直定向的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是竖直定向的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是毛细管。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管处于截头圆锥的形状。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管处于截头圆锥的形状;并且该导管的顶部开口的内直径大于该导管的底部开口的内直径。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是移液管头。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管由聚合物、陶瓷或金属制成。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管包括疏水表面。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是聚合物毛细管,如聚四氟乙烯(PTFE)毛细管。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是一次性的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管是可重复使用的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中在直径方面该导管具有典型地是在从约10微米至约10毫米的范围内的内直径。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管的内直径沿着该导管的长度从该导管的底部至该导管的顶部是可变的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管具有至少约10微米或更大的壁厚。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管的内部形状可以是(并不一定限于)圆形、圆锥形、正方形、卵形、矩形的外形,具有一个波状面,具有至少一个平表面,或具有表面增强特征。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该导管的外部形状可以是(并不一定限于)圆形、圆锥形、正方形、卵形、矩形的外形,具有一个波状面,具有至少一个平表面,或具有表面增强特征。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵是真空泵。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵是吸耳球。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵是用于施加正压力的装置。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵是用于施加负压力的装置。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵可操作地连接至该导管的顶部。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该泵可操作地连接至该导管的底部。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统还包括控制器。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该控制器可操作地连接至该泵。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中多个导管在盒内被组装到一起。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中多个导管在板上被组装到一起。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统在约0℃、约3℃、约5℃、约10℃、约15℃、约20℃、约25℃、约30℃、约35℃、约37℃、约40℃、或约45℃下。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些系统中的任一种,其中该系统是微量移液器。
在某些实施例中,本发明涉及一种用于将样品存储在系统中的方法,该方法包括:
提供导管、泵、第一流体、第二流体、以及样品,其中
该导管具有顶部开口、底部开口,以及布置在该顶部开口和该底部开口之间的内表面;
该第一流体与该第二流体是实质上不混溶的;
该第一流体与该样品是实质上不混溶的;
该第二流体与该样品是实质上不混溶的;
该第一流体比该样品密度低;
该样品比该第二流体密度低;并且
该泵被配置为向该导管中位置处施加正压力、负压力、或不施加外压力;并且
按任何顺序向该导管中装入该第一流体、该第二流体、以及该样品,这样使得该第一流体、该样品、以及该第二流体布置在该导管之内在该顶部开口和该底部开口之间,并且该样品布置在该第一流体和该第二流体之间,这样使得该样品的整个表面区域仅与该第一流体、该第二流体或该导管的内表面处于流体接触。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统基本上由导管、泵、第一流体(例如流体A)、第二流体(例如流体B)、以及样品组成。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的底部开口的构件。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法进一步包括以下步骤:
在向该导管中装入该第一流体、该第二流体、或该样品之前暂时密封或暂时封闭该导管的底部开口。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的顶部开口的构件。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括以下步骤:
在向该导管中装入该第一流体、该第二流体、或该样品之前暂时密封或暂时封闭该导管的顶部开口。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中在该样品或该第二流体之前将该第一流体装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中在该第一流体或该第二流体之前将该样品装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中在该第一流体或该样品之前将该第二流体装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该第一流体经由该导管的顶部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该第一流体经由该导管的底部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该第二流体经由该导管的顶部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该第二流体经由该导管的底部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该样品经由该导管的顶部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该样品经由该导管的底部开口装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中经由该导管的底部开口将该第一流体、该第二流体、或该样品装入该导管中的步骤包括向该导管的顶部开口施加负压力。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该样品在水性溶液中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该样品包括试剂。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该样品包括生物分子。生物分子的实例包括(并且不限于)细胞、核酸、蛋白质、酶、血液、唾液、以及有机材料。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一流体与该第二流体是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一流体与该样品是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第二流体与该样品是不混溶的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一流体或该第二流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第二流体是油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中用于生成不混溶相的这些油,例如该第一流体或该第二流体,可以包括并且不限于硅油、全氟碳油和全氟聚醚油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中所涉及的流体密度的典型值涉及以下值内范围,该第二流体为约1,300至约2,000kg/m3,该第一流体为约700至约990kg/m3,而该样品为约900至约1200kg/m3。一组这样的操作流体与密度的实例在此概述但不限于这些;该第二流体是福瑞特(Fluorinert)FC-40(氟碳化油)密度大约为1,900kg/m3;该第一流体是苯基甲基聚硅氧烷(硅油)密度大约为920kg/m3;而该样品是PCR试剂的水性基溶液,该溶液具有大约1000kg/m3的密度。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第二流体是全氟化胺油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油和聚山梨醇酯添加剂的溶液。这些添加剂具有在2至8范围内的亲水亲油平衡数值。这些添加剂的组合总亲水亲油平衡数值在2至8范围内。聚山梨醇酯添加剂的实例为脱水山梨糖醇单油酸酯、脱水山梨糖醇三硬脂酸酯、以及聚山梨醇酯20,但不限于这些。该第一流体之中的这些添加剂在0.001%与10%之间的范围内。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该样品是在水性介质中的固体粒子悬浮液,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,而该第二流体是基于氟碳的油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该样品是在水性介质中的基于苯基甲基聚硅氧烷的油,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,而该第二流体是基于氟碳的油。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是实质上竖直定向的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是竖直定向的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是毛细管。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管处于截头圆锥的形状。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管处于截头圆锥的形状;并且该导管的顶部开口的内直径大于该导管的底部开口的内直径。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是移液管头。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管由聚合物、陶瓷或金属制成。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管包括疏水表面。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是聚合物毛细管,如PTFE材料毛细管。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是一次性的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是可重复使用的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中在直径方面该导管具有典型地是在从约10微米至约10毫米的范围内的内直径。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管的内直径沿着该导管的长度从该导管的底部至该导管的顶部是可变的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管具有至少约10微米或更大的壁厚。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管的内部形状可以是(并不一定限于)圆形、圆锥形、正方形、卵形、矩形的外形,具有一个波状面,具有至少一个平表面,或具有表面增强特征。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管的外部形状可以是(并不一定限于)圆形、圆锥形、正方形、卵形、矩形的外形,具有一个波状面,具有至少一个平表面,或具有表面增强特征。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵是真空泵。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵是吸耳球。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵是用于施加正压力的装置。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵是用于施加负压力的装置。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵可操作地连接至该导管的顶部。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该泵可操作地连接至该导管的底部。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统进一步包括控制器。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该控制器可操作地连接至该泵。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中多个导管在盒内被组装到一起。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中多个导管在板上被组装到一起。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括将该样品在该系统中存储一段时间的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该第一段时间的数量级为分钟、天、月、或年。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括将该样品在约0℃、约3℃、约5℃、约10℃、约15℃、约20℃、约25℃、约30℃、约35℃、约37℃、约40℃、或约45℃的温度下在该系统中存储的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括将该样品在约0℃、约3℃、约5℃、约10℃、约15℃、约20℃、约25℃、约30℃、约35℃、约37℃、约40℃、或约45℃的温度下在该系统中存储一段时间的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统是在仪器上。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统是微量移液器。
在某些实施例中,本发明涉及一种从上述系统的任何一种中分配样品的方法,该方法包括以下步骤
从该导管经由底部开口分配该第二流体;并且
从该导管经由底部开口分配一定体积的样品。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括从该导管中分配该第一流体的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管施加的负压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管施加的正压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管的底部开口施加的负压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管的顶部开口施加的正压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括向该导管中重新装入该第二流体的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中将该第二流体经由该底部开口重新装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管的顶部开口施加的负压力将该第二流体重新装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中利用由该泵向该导管的底部开口施加的正压力将该第二流体重新装入该导管中。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中从该导管中分配出的样品的体积为从约10nL至约20μL。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中从该导管中分配出的样品的体积为约10nL、约20nL、约30nL、约40nL、约50nL、约60nL、约70nL、约80nL、约90nL、约100nL、约200nL、约300nL、约400nL、约500nL、约600nL、约700nL、约800nL、约900nL,1μL、约2μL、约3μL、约4μL、约5μL、约6μL、约7μL、约8μL、约9μL、约10μL、约11μL、约12μL、约13μL、约14μL、约15μL、约16μL、约17μL、约18μL、约19μL、或约20μL。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中从该导管中分配出的样品的体积为预先确定的体积。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该系统包括死体积。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该死体积为从约10nL至约200nL。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该死体积为约10nL、约20nL、约30nL、约40nL、约50nL、约60nL、约70nL、约80nL、约90nL、约100nL、约110nL、约120nL、约130nL、约140nL、约150nL、约160nL、约170nL、约180nL、约190nL、或约200nL。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中这些步骤是自动化的。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中这些步骤是自动化的并且由该控制器控制。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,该方法还包括清洁或净化该导管的步骤。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中用清洁剂清洁或净化该导管。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是可重复使用的;并且该清洁剂是蒸汽。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是可重复使用的;并且该清洁剂是漂白剂。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是可重复使用的;并且该清洁剂包含酶。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该导管是可重复使用的;并且该清洁剂包含DNA消化酶。
在某些实施例中,本发明涉及在此描述的这些方法中的任一种,其中该清洁剂包括漂白剂、碱、洗涤剂、表面消毒剂、温和洗涤剂、温和的酸、或消毒剂。
应用
复合液体池加工
在一个实施例中,该样品被分配到一个定位在互不混溶的流体的自由表面上的不混溶流体池中。所生成的复合流体池可以被运输,和/或合并,和/或混合,和/或在其上进行生化处理。
在一个实施例中,该样品被分配到一个定位在互不混溶的流体(该流体具有机械稳定特征结构)的自由表面上的不混溶流体池中。
在一个实施例中,当从该导管中分配到自由表面上时,该第二流体、该样品、以及该第一流体生成复合液体池。
在一个实施例中,该样品具有顺磁性珠粒与缓冲液。
在一个实施例中,该样品包含缓冲液。
本系统和方法可以适于的复合液体池系统的实例披露于例如PCT/IE2011/000040中,其通过引用结合在此。
测序
很多下一代测序(NGS)平台需要多个由特定范围内的碱基对长度的DNA片段组成的DNA文库。此外,这些DNA片段需要用特定核苷酸序列(接头)进行标记以使得使用PCR对这些序列进行扩增并且使得这些文库片段退火至测序仪流动池。当在单一流动池内复用样品时,还可以向这些DNA片段中添加序列特异性指标以识别单独样品。DNA的标记片段化(tagmentation)(DNA被片断化并用接头进行标记)以及常用接头和指标的添加在两个单独的生物反应中实现。在这些反应后,清洁该DNA文库以移除过量的核苷酸、酶、引物、盐及其他污染物。因此,标记片段化DNA、纯化经标记片段化的DNA、添加常用接头和指标以及纯化最终文库产物所需要的工作流程是复杂且劳动密集型的。在一个实施例中,上述系统和方法可以用于使遗传测序自动化。
遗传测序珠粒涂覆
遗传测序珠粒制备是这样一个过程,小珠粒通过该过程在应用特异性化学中进行涂覆。在一个实施例中,在遗传筛查之前,通过本发明的系统和方法实现珠粒的涂覆。
这些方法提供了用于操纵和结合子微升量流体的便利方式,而这使用传统技术当前是不可能实现的,由此降低了最初样品体积并且通过降低反应体积来改进了珠粒涂覆效率。使用PCR和热循环以及遗传测序以进一步处理是应用特异性的。
该技术的使用极大地简化了对于这些相对较小的靶标体积的收集程序。该系统促进100%体积恢复,因为在处理中该生物样品不会引起任何移液损失。这些特征使得更容易促进生物化学程序的自动化。
用于NGS测序的DNA文库的大小选择
每个下一代测序仪都具有一个最适读数长度(碱基对)。在文库构建过程中,DNA被片段化为具有较大碱基对长度范围的DNA分子。当前,大小选择通过在微量滴定板上使用顺磁性珠粒实施并且是劳动密集型的并且遭遇由于移液误差和使用者方案变化造成的低效率。本发明的系统和方法可以用于DNA文库的大小选择。
核酸纯化
本发明的系统和方法可以用于在PCR之前和/或之后纯化和/或分离样品。
基因分型
本发明的系统和方法可以用于基因分型试剂或样品的储存和分配。
化合物筛选
本发明的系统和方法可以用于药物化合物筛选试剂或样品的储存和分配。
实例
下列实例举例说明具体的实施方案,但不应当被视为限制所公开主题的范围。
实例1
多个室或孔(例如1至384个室)填充有两种不混溶的油,这样使得一种油位于另一种之上(参见图1)。每个室在底部限定开口。这些室可以排列在存储板上。向这些室中添加试剂并且位于两种油之间的界面处,从而在一些情况下将形成复合液体池或CLC(复合液体池在美国专利号8,465,707中详细描述,将其通过引用以其全部内容特此结合)。以这种方式,试剂可以在室温下长时间储存,而不会由于冻结和/或解冻使试剂降解。作为下层的油并且当需要其时,油B是通过对油A之上的室施加正压并且迫使下层的油从室的底部出去而被移除。然后,试剂向下移动至室口并且准备好被分配(参见图2)。使用压力分配方法,可以形成液滴并且可以直接从该存储板平行地从该存储板中的该多个室中分配出去。根据需要,可以将液滴分配至另一个CLC、孔板、或至任何室或流体。一旦试剂完成分配,可以通过抽吸一等份的油B并且再次将该试剂作为液滴悬浮在油B和油A之间而使其返回储存。不存在污染的问题,因为在整个过程中所使用的是相同试剂,并且因此可以重复任意次数直至该试剂耗尽。可以在任何时间装载、丢弃、或清洁并且重新使用该板。
Claims (92)
1.一种单次使用的盒体,其中:
该盒体限定多个盲孔,每个盲孔限定一个开口,该多个盲孔中的至少一个包含两种互相不混溶的液体,这两种液体都不与水混溶,这两种互相不混溶的液体中的一种具有大于水的比重并且这两种互相不混溶的液体中的另一种具有小于水的比重。
2.如权利要求1所述的盒体,该盒体进一步包括密封件,该密封件覆盖由该多个盲孔限定的开口,由此使得这些盲孔的内部对这两种互相不混溶的液体实质上防漏。
3.如权利要求2所述的盒体,其中第一盲孔被该密封件的一部分密封,该密封件被适配为被人类使用者用手撕掉,从而暴露该第一盲孔的开口。
4.如权利要求2或3之一所述的盒体,其中该密封件的至少一部分是可刺破性薄膜,该薄膜封闭由至少一个盲孔限定的开口。
5.如权利要求1-4中任一项所述的盒体,其中该多个盲孔是共线的。
6.如权利要求1-5中任一项所述的盒体,其中所有的盲孔至少包含同样的两种互相不混溶的液体。
7.如权利要求1-6中任一项所述的盒体,其中至少一个盲孔仅包含这两种互相不混溶的液体。
8.如权利要求1-7中任一项所述的盒体,其中第一盲孔仅包含这两种互相不混溶的液体。
9.如权利要求8所述的盒体,其中除该第一盲孔外,该多个盲孔中的至少一个包含处在水性溶液中的试剂,其中该试剂是预先确定的生物化学方案的要素。
10.如权利要求9所述的盒体,其中实施该预先确定的生物化学方案所需的所有试剂分开地包含在除该第一盲孔之外的该多个盲孔中。
11.如权利要求10所述的盒体,其中该预先确定的生物学方案是利用PCR的核酸扩增。
12.一种由多个盒体组成的多孔板,每个盒体根据权利要求1-11中任一项所述,该板由该多个盒体一体地形成,这些盒体排列在该板中,这样使得每多个共线的盲孔平行于所有其他者。
13.一种系统,该系统包括:
根据权利要求9所述的盒体;
盒体接收器,该盒体接收器被设定大小和成形为与该盒体配合;
液体处理系统,当该盒体已经与该盒体接收器配合时,该系统能够通过将液体导管插入这些盲孔中的任一个而刺破封闭该多个盲孔中的任一个的可刺破性薄膜;以及
控制器,该控制器可操作地连接至该液体处理系统,该控制器被编程为使该液体处理系统:
在这些盲孔中的一个中形成复合液体池;并且
对该复合液体池与这些试剂进行操作,从而实施该预先确定的生物化学方案。
14.如权利要求13所述的系统,该系统进一步包括热循环仪。
15.如权利要求13所述的系统,该系统进一步包括冷却单元。
16.如权利要求13所述的系统,该系统进一步包括光学荧光激发与检测模块。
17.如权利要求13所述的系统,其中该液体导管包括毛细管。
18.如权利要求13所述的系统,其中该液体导管包括磁分离模块。
19.一种实施生物化学方案的方法,该方法包括:
提供根据权利要求13所述的系统;
将生物样品沉积到该第一盲孔中;
将该盒体插入该盒体接收器中;
激活该控制器,这样使得该控制器使该液体处理系统:
形成包含该生物样品的水性溶液的复合液体池;并且
对该复合液体池与这些试剂进行操作,从而对该生物样品实施该预先确定的生物学方案。
20.如权利要求19所述的方法,其中该预先确定的生物学方案被设计为实施(a)文库制备、(b)核酸测序、(c)PCR、(d)数字PCR、以及(e)qPCR中的一项。
21.一种系统,该系统包括导管、泵、第一流体、第二流体、以及样品,其中:
该导管限定顶部开口和底部开口,并且包括布置在该顶部开口和该底部开口之间的内表面;
该第一流体、该样品、以及该第二流体布置在该导管之内在该顶部开口和该底部开口之间;
该第一流体、该第二流体以及该样品是实质上互相不混溶的;
该第一流体比该样品密度低,并且该样品比该第二流体密度低;
该样品布置在该第一流体和该第二流体之间,这样使得该样品的整个表面区域仅与该第一流体、该第二流体或该导管的内表面处于流体接触;并且
该泵被配置为向该导管中位置处施加正压力、负压力、或不施加外压力。
22.如权利要求21所述的系统,其中该系统进一步包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的底部开口的构件。
23.如权利要求21或22所述的系统,其中该系统进一步包括用于暂时密封或暂时封闭该导管的顶部开口的构件。
24.如权利要求21-23中任一项所述的系统,其中该样品在水性溶液中。
25.如权利要求21-24中任一项所述的系统,其中该样品包括试剂。
26.如权利要求21-25中任一项所述的系统,其中该样品包括生物分子。
27.如权利要求21-25中任一项所述的系统,其中该样品包括细胞、核酸、蛋白质、酶、血液、唾液、或有机材料。
28.如权利要求21-27中任一项所述的系统,其中该第一流体与该第二流体是不混溶的。
29.如权利要求21-28中任一项所述的系统,其中该第一流体与该样品是不混溶的。
30.如权利要求21-29中任一项所述的系统,其中该第二流体与该样品是不混溶的。
31.如权利要求21-30中任一项所述的系统,其中该第一流体或该第二流体是油。
32.如权利要求21-30中任一项所述的系统,其中该第一流体是油。
33.如权利要求21-30中任一项所述的系统,其中该第二流体是油。
34.如权利要求21-30中任一项所述的系统,其中该第一流体或该第二流体是硅油、全氟碳油或全氟聚醚油。
35.如权利要求21-34中任一项所述的系统,其中该第二流体的密度为从约1,300kg/m3至约2,000kg/m3。
36.如权利要求21-35中任一项所述的系统,其中该第一流体的密度为从约700kg/m3至约990kg/m3。
37.如权利要求21-36中任一项所述的系统,其中该样品的密度为从约900kg/m3至约1200kg/m3。
38.如权利要求21-37中任一项所述的系统,其中该第二流体是密度约为1,900kg/m3的氟碳化油。
39.如权利要求21-38中任一项所述的系统,其中该第一流体是苯基甲基聚硅氧烷。
40.如权利要求21-39中任一项所述的系统,其中该样品是PCR试剂的水性基溶液,该溶液具有大约1000kg/m3的密度。
41.如权利要求21-37中任一项所述的系统,其中该第二流体是全氟化胺油。
42.如权利要求21-38中任一项所述的系统,其中该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油和聚山梨醇酯添加剂的溶液。
43.如权利要求21-37中任一项所述的系统,其中该样品是在水性介质中的固体粒子悬浮液,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,并且该第二流体是基于氟碳的油。
44.如权利要求21-37中任一项所述的系统,其中该样品是在水性介质中的基于苯基甲基聚硅氧烷的油,该第一流体是基于苯基甲基聚硅氧烷的油,并且该第二流体是基于氟碳的油。
45.如权利要求21-44中任一项所述的系统,其中该导管是实质上竖直定向的。
46.如权利要求21-44中任一项所述的系统,其中该导管是竖直定向的。
47.如权利要求21-46中任一项所述的系统,其中该导管是毛细管。
48.如权利要求21-46中任一项所述的系统,其中该导管处于截头圆锥的形状。
49.如权利要求21-46中任一项所述的系统,其中该导管处于截头圆锥的形状;并且该导管的顶部开口的内直径大于该导管的底部开口的内直径。
50.如权利要求21-46中任一项所述的系统,其中该导管是移液管头。
51.如权利要求21-50中任一项所述的系统,其中该导管由聚合物、陶瓷或金属制成。
52.如权利要求21-51中任一项所述的系统,其中该导管包括疏水表面。
53.如权利要求21-50中任一项所述的系统,其中该导管是聚合物毛细管,比如聚四氟乙烯(PTFE)毛细管。
54.如权利要求21-53中任一项所述的系统,其中该导管是一次性的。
55.如权利要求21-53中任一项所述的系统,其中该导管是可重复使用的。
56.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵是真空泵。
57.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵是吸耳球。
58.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵是用于施加正压力的装置。
59.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵是用于施加负压力的装置。
60.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵可操作地连接至该导管的顶部开口。
61.如权利要求21-55中任一项所述的系统,其中该泵可操作地连接至该导管的底部。
62.如权利要求21-61中任一项所述的系统,其中该系统进一步包括控制器。
63.如权利要求62所述的系统,其中该控制器可操作地连接至该泵。
64.如权利要求21-63中任一项所述的系统,其中多个导管在板上被组装到一起。
65.一种从如权利要求21-64中任一项所述的系统中分配样品的方法,该方法包括以下步骤
从该导管经由底部开口分配该第二流体;并且
从该导管经由底部开口分配一定体积的样品。
66.如权利要求65所述的方法,该方法进一步包括从该导管中分配该第一流体的步骤。
67.如权利要求65或66所述的方法,其中利用由该泵向该导管施加的负压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
68.如权利要求65或66所述的方法,其中利用由该泵向该导管施加的正压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
69.如权利要求65或66所述的方法,其中利用由该泵向该导管的底部开口施加的负压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
70.如权利要求65或66所述的方法,其中通过由该泵向该导管的顶部开口施加的正压力从该导管中分配该第一流体、该样品或该第二流体。
71.如权利要求45-70中任一项所述的方法,该方法进一步包括向该导管中重新装入该第二流体的步骤。
72.如权利要求71所述的方法,其中将该第二流体经由该底部开口重新装入该导管中。
73.如权利要求71所述的方法,其中利用由该泵向该导管的顶部开口施加的负压力将该第二流体重新装入该导管中。
74.如权利要求71所述的方法,其中利用由该泵向该导管的底部开口施加的正压力将该第二流体重新装入该导管中。
75.如权利要求65-74中任一项所述的方法,其中从该导管中分配出的样品的体积为从约10nL至约20μL。
76.如权利要求65-75中任一项所述的方法,其中从该导管中分配出的样品的体积为预先确定的体积。
77.如权利要求65-76中任一项所述的方法,其中这些步骤是自动化的。
78.如权利要求65-76中任一项所述的方法,其中这些步骤是自动化的并且由该控制器控制。
79.一种用于将样品存储在系统中的方法,该方法包括:
提供导管、泵、第一流体、第二流体、以及样品,其中
该导管限定顶部开口和底部开口,并且包括布置在该顶部开口和该底部开口之间的内表面;
该第一流体、该第二流体以及该样品是实质上互相不混溶的;
该第一流体比该样品密度低,并且该样品比该第二流体密度低;并且
该泵被配置为向该导管中位置处施加正压力、负压力、或不施加外压力;并且
按任何顺序向该导管中装入该第一流体、该第二流体、以及该样品,这样使得该第一流体、该样品、以及该第二流体布置在该导管之内在该顶部开口和该底部开口之间,并且该样品布置在该第一流体和该第二流体之间,这样使得该样品的整个表面区域仅与该第一流体、该第二流体或该导管的内表面处于流体接触。
80.如权利要求79所述的方法,其中该系统是如权利要求21-64中任一项所述的系统。
81.如权利要求79或80所述的方法,该方法进一步包括以下步骤:
在向该导管中装入该第一流体、该第二流体、或该样品之前暂时密封或暂时封闭该导管的底部开口。
82.如权利要求79-81中任一项所述的方法,该方法进一步包括以下步骤:
在向该导管中装入该第一流体、该第二流体、或该样品之前暂时密封或暂时封闭该导管的顶部开口。
83.如权利要求79-82中任一项所述的方法,其中在该样品或该第二流体之前将该第一流体装入该导管中。
84.如权利要求79-82中任一项所述的方法,其中在该第一流体或该第二流体之前将该样品装入该导管中。
85.如权利要求79-82中任一项所述的方法,其中在该第一流体或该样品之前将该第二流体装入该导管中。
86.如权利要求79-85中任一项所述的方法,其中将该第一流体经由该导管的顶部开口装入该导管中。
87.如权利要求79-85中任一项所述的方法,其中将该第一流体经由该导管的底部开口装入该导管中。
88.如权利要求79-87中任一项所述的方法,其中将该第二流体经由该导管的顶部开口装入该导管中。
89.如权利要求79-87中任一项所述的方法,其中将该第二流体经由该导管的底部开口装入该导管中。
90.如权利要求79-89中任一项所述的方法,其中将该样品经由该导管的顶部开口装入该导管中。
91.如权利要求79-89中任一项所述的方法,其中将该样品经由该导管的底部开口装入该导管中。
92.如权利要求79-85中任一项所述的方法,其中经由该导管的底部开口将该第一流体、该第二流体、或该样品装入该导管中的步骤包括向该导管的顶部开口施加负压力。
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WO2017096372A1 (en) * | 2015-12-04 | 2017-06-08 | Color Genomics, Inc. | Methods and compositions for low volume liquid handling |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060120926A1 (en) * | 2002-12-20 | 2006-06-08 | Arkray, Inc. | Liquid storage container and cartridge |
WO2008065996A1 (fr) * | 2006-11-28 | 2008-06-05 | Shimadzu Corporation | Plaque de réaction |
CN103153466A (zh) * | 2010-07-22 | 2013-06-12 | 基因细胞生物系统有限公司 | 复合液体池 |
US20130236377A1 (en) * | 2006-03-09 | 2013-09-12 | Nam Yong Kim | Apparatus for performing a reaction in a droplet and method of using the same |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6258325B1 (en) * | 1993-04-19 | 2001-07-10 | Ashok Ramesh Sanadi | Method and apparatus for preventing cross-contamination of multi-well test plates |
US7763471B2 (en) * | 2006-04-18 | 2010-07-27 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Method of electrowetting droplet operations for protein crystallization |
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Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060120926A1 (en) * | 2002-12-20 | 2006-06-08 | Arkray, Inc. | Liquid storage container and cartridge |
US20130236377A1 (en) * | 2006-03-09 | 2013-09-12 | Nam Yong Kim | Apparatus for performing a reaction in a droplet and method of using the same |
WO2008065996A1 (fr) * | 2006-11-28 | 2008-06-05 | Shimadzu Corporation | Plaque de réaction |
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