CN105574364B - 载体设计方法及载体设计装置 - Google Patents
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Abstract
一种载体设计方法及装置,该方法包括:接收包括载体骨架类型标识的载体骨架选择指令;根据载体骨架选择指令获取与载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,元件属性包括长度属性,元件包括基础元件;对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;根据与载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;将拼接后载体按照各元件的长度属性、元件属性结构数据进行可视化显示。本发明实施例的方案实现了基因载体的自动化拼装和工业化输出,大大提高了载体设计的效率,提高了载体产出数量及产出的质量。
Description
技术领域
本发明涉及生物工程及计算机领域,特别是涉及一种载体设计方法及载体设计装置。
背景技术
载体,指在基因工程重组DNA(Deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸,一种分子,可组成遗传指令,以引导生物发育与生命机能运作)技术中,将DNA片段(目的基因)转移至受体细胞的一种能自我复制的DNA分子。依赖限制性核酸内切酶、DNA连接酶和其他修饰酶的作用,将适当切割和修饰后的目的基因添加到载体骨架上,构成载体,再导入受体细胞,可实现目的基因在受体细胞内的正确表达。载体被广泛应用于生物医学研究领域,其作用之一是作为运载工具,之二是被用于受体细胞内对目的基因进行大量复制。
目前市面上各生物科技公司、研究室及高校产出的载体骨架众多,多达数百种,选择何种载体骨架才能满足切身需要,是广大实验人员困惑不已却又不得不面对的难题。同时,还会面临如下问题:
需要花费大量时间进行调研和比较,才能选择出合适的载体骨架;
载体构成元件多种多样,也需花费大量时间进行调研和比较,才能选择合适的元件,并需将元件按照其属性一一拼接成为载体;
载体元件选择及拼接过程中要么凭空想象元件排列组合进行拼接,要么通过实验指导载体拼接进程,前者容易导致拼接结果出现偏差,而后者则往往需要花费大量的人力、物力和时间;
载体构建步骤复杂,对于新手来说无疑是一项无比艰巨的任务。
发明内容
基于此,本发明实施例的目的在于提供一种载体设计方法,本发明实施例的另一目的在于提供一种载体设计装置,其可以大大提高载体设计的效率,且可以提高载体产出数量及产出的质量。
为达到上述目的,本发明实施例采用以下技术方案:
一种载体设计方法,包括步骤:
接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令中包括载体骨架类型标识;
根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;
对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
将拼接后载体按照各元件的长度属性、元件属性结构数据进行可视化显示。
一种载体设计装置,包括:
指令接收模块,用于接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令中包括载体骨架类型标识;
元件获取模块,用于根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;
元件属性解析模块,用于对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
拼接模块,用于根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
载体显示模块,用于将所述拼接后载体按照各元件的元件属性结构数据进行可视化显示。
根据如上所述的本发明实施例的方案,其将范围宽广、杂乱无章的载体数据按照统一标准进行分类,将载体骨架类型标识与该载体骨架的元件及元件属性进行关联,在需要设计载体时,基于选取的载体骨架类型标识就可以自动获得对应的元件及元件属性,并据此进行拼接得到完整的拼接后载体进行可视化显示,实现了基因载体的自动化拼装和工业化输出,彻底颠覆了生物技术领域的传统格局,大大提高了载体设计的效率,提高了载体产出数量及产出的质量。
附图说明
图1是一个实施例中的本发明方案的工作环境示意图;
图2是一个实施例中用户终端的组成结构示意图;
图3是一个实施例中本发明的的载体设计方法的流程示意图;
图4是另一个实施例中的载体设计方法的流程示意图;
图5是另一个实施例中的载体设计方法的流程示意图;
图6是一个具体示例中的载体设计方法的流程示意图;
图7是一个具体示例中的拼接后载体的可视化示意图;
图8是一个具体示例中酶切分析结果的示意图;
图9是一个实施例中本发明的载体设计装置的结构示意图。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本发明进行进一步的详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施方式仅仅用以解释本发明,并不限定本发明的保护范围。
图1示出了本发明一个实施例中的工作环境示意图。如图1所示,本发明实施例的方案涉及服务器100以及用户终端101,用户终端101可以通过各种网络通信方式与服务器100进行通信,服务器100上设置有数据库,用以存储归纳得到的各载体骨架体系以及各载体骨架体系下的载体骨架信息,还存储各载体的元件以及元件属性的信息,用户终端101可以从服务器100获得所需求的载体骨架以及该载体骨架的元件、元件属性,并将该载体骨架、该载体骨架的元件拼接为载体进行展示。
在一些实现方式中,在用户终端101的存储空间允许的情况下,用户终端101也可以从服务器100获得相关信息后,例如载体骨架体系、载体骨架信息、以及载体骨架的元件以及元件属性后,可以直接存储在用户终端本地,在后续需要设计载体时,直接从用户终端本地就可以查询获得相应的载体骨架、元件、元件属性等信息,无需每次设计都连接网络。
用户终端101在一个实施例中的结构示意图如图2所示。该用户终端包括通过系统总线连接的处理器、供电模块、存储介质、通信接口和内存。其中,用户终端101的存储介质存储有操作系统和一种载体设计装置,该装置用于实现一种载体设计方法。用户终端的通信接口用于与服务器100通信,该用户终端101可以采用任何可能的方式来实现,例如PC(personal computer,个人计算机)、笔记本电脑、智能平板、智能手机等等。
图3中示出了一个实施例中的载体设计方法的流程示意图。如图3所示,本实施例中的载体设计方法包括步骤:
步骤S301:接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令中包括载体骨架类型标识;
步骤S302:根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;
步骤S303:对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
步骤S304:根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
步骤S305:将拼接后载体根据各元件的元件属性结构数据进行可视化显示。其中,在一个具体示例中,可以是将拼接后载体按照各元件的长度属性模拟成环图后,根据各元件属性结构数据进行可视化显示。
根据如上所述的本发明实施例的方案,其将范围宽广、杂乱无章的载体数据按照统一标准进行分类,将载体骨架类型标识与该载体骨架的元件及元件属性进行关联,在需要设计载体时,基于选取的载体骨架类型标识就可以自动获得对应的元件及元件属性,并据此进行拼接得到完整的拼接后载体进行可视化显示,实现了基因载体的自动化拼装和工业化输出,彻底颠覆了生物技术领域的传统格局,大大提高了载体设计的效率,提高了载体产出数量及产出的质量。
结合如上说明,用户终端可以直接从服务器获得相关信息,也可以是在获得相关信息后存储在本地以供后续使用,因此,在上述步骤S302中获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性时,可以有不同的获取方式。
其中一种获取方式,可以是根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求,所述载体骨架请求包括所述载体骨架类型标识;接收服务器根据所述载体骨架请求返回的载体骨架请求响应,所述载体骨架请求响应包括与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
另外一种获取方式,可以是根据所述载体骨架选择指令,从本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
另一种获取方式,还可以是在根据所述载体骨架选择指令,在本地数据库没有获得与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性时,再根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求。
在上述步骤S301接收载体骨架选择指令之前,需要能够查看载体骨架的相关信息,以便能从中选择合适的载体骨架,因此,如图4所示,在另一个实施例中,在上述步骤S301之前,还可以包括步骤:
步骤S3001:向服务器发送载体骨架信息获取请求;
步骤S3002:接收服务器根据所述载体骨架信息获取请求返回的载体骨架信息获取响应,所述载体骨架信息获取响应中包括各载体骨架体系的载体骨架信息;
步骤S3003:对各载体骨架信息进行解析,将各载体骨架信息解析为适合于显示载体骨架信息的载体骨架结构数据;
步骤S3004:根据解析后得到的各载体骨架结构数据将各载体骨架信息进行显示。
此外,在一个具体示例中,上述元件还可以包括个性化元件,即,与上述载体骨架类型标识对应的各元件除了包含必须具备的基础元件之外,还可以包含自定义元件,该自定义元件可以由用户基于实际需要灵活确定。其中,在初始获得与上述载体骨架类型标识对应的各元件时,相应的个性化元件可以以个性化元件类别标识来标识,对应的元件属性为虚拟属性。同一类别的个性化元件的虚拟属性可以相同。
据此,在上述步骤S304、步骤S305中得到初始的拼接后载体后,可以基于实际需要来对拼接后载体进行调整,因此,在另一实施例中,如图5所示,在上述步骤S305之后,还可以包括步骤:
步骤S306:调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
其中,具体的对拼接后载体的调整方式,可以是添加不同的个性化元件,或者是对个性化元件的元件属性进行调整。以添加个性化元件为例:
在其中一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:基于个性化元件推荐列表,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:基于个性化元件历史记录收藏夹,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑后,根据编辑后的个性化元件的元件属性将该编辑后的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据编辑后的个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收自定义指令,根据该自定义指令调用载体编辑工具,并将通过载体编辑工具得到的自定义个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据自定义个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
其中,在上述对拼接后载体的调整过程中,调整次数可以有多次,以选用、添加或者删减不同的个性化元件,或者是对个性化元件的元件属性进行调整,每次调整后,都可以将调整后的拼接后载体进行可视化显示,以供用户观看拼接后载体。
在上述步骤S305或者步骤S306确定的拼接后载体进行可视化显示的过程中,还可以供用户查看相关元件的元件属性,具体的方式可以是:
基于可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,所述属性查看指令包括元件标识;获取与所述元件标识对应的元件的元件属性;将获得的与所述元件标识对应的元件的元件属性进行显示。其中,这里的元件标识可以是基础元件的元件标识,也可以是个性化元件的元件标识。
在基于可视化显示的拼接后载体确定初步符合要求时,可进一步进行酶切分析,确定拼接后载体是否满足预期结果。因此,如图5所示,本发明实施例的载体设计方法还可以包括步骤:
步骤S307:接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接后载体进行酶切分析,得到酶切分析结果,并将酶切分析结果进行显示。
终端用户可以基于显示的酶切分析结果决定是否需要修改个性化元件。在需要修改的情况下,可返回上述步骤S306,进一步对拼接后载体进行调整。在不需要修改的情况下,则载体设计完成。上述拼接后载体即为设计的载体。
此时,如图5所示,本实施例中的方法还可以包括步骤:
步骤S307:接收载体构建指令,根据该载体构建指令将所述拼接后载体作为构建的载体进行存储或者添加到载体设计记录中。
从而构建好的载体可以存储起来,也可以是添加到载体设计记录中便于后续查看,其中,这里的载体设计记录可以是购物篮、购物记录、收藏夹等各种表现形式。
另一方面,如图5所示,本实施例中的方法还可以包括:
步骤S308:接收订单生成指令;根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体;接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。
从而基于设计好的载体,进一步生成订单,以获得与该设计好的拼接后载体对应的实物载体。
以下结合一个具体示例对本发明实施例的方案进行进一步的详细说明。图6中示出了一个具体示例中的载体设计方法的流程示意图,在该具体示例中是结合用户终端与服务器的交互过程为例进行说明。
首先,对本发明实施例方案中的载体骨架体系、载体骨架类型等做一个简要说明。在本发明实施例的方案中,将大部分的真核表达载体骨架归纳为几个体系,在本实施例中为7个体系,称之为载体骨架体系,每个体系根据需要再细分为多个小类别,本发明实施例中称之为载体骨架类型,以便于在设计载体的过程中逐步缩小范围,快速确定载体骨架。
在确定载体骨架类型后,即可按归类后的载体骨架类型,收集每一类载体骨架类型的组成元件以及元件的元件属性。在本发明实施例中,将组成元件从总体上分为两类:基础元件和个性化元件。其中,基础元件为同一个载体骨架类型的载体骨架均具有的永恒不变的元件;个性化元件指同一个载体骨架类型的载体骨架均具有,但是根据用户需求不同而改变的元件。个性化元件依据相似度的不同,可以分为多个小类,以便于在确定个性化元件时,可以有目的地选择或自定义个性化元件,而不是大海捞针式的选择。
随后,建立每一个载体骨架类型及其基础元件和个性化元件类别之间的关联。从而可以便于在设计载体的过程中,在选择了载体骨架类型之后,基于这种关联关系自动获得和添加关联的基础元件,并可以通过个性化元件类别来对选择或定义个性化元件进行指引。
在载体骨架体系的归纳分类、以及各载体骨架体系下的载体骨架类型的细分,基于载体骨架的真核表达方式可以有不同的方式。在本实施例中,以归类为7个载体骨架体系为例,这7个体系可以分别命名为Mammalian Gene Expression Vectors,Mammalian shRNAKnockdown Vectors,CRISPR Vectors,TALEN Vectors,Mammalian Promoter/EnhancerTesting Vectors,Bacterial Protein Expression Vectors和Mammalian HomologousRecombination Donor Vector。
其中,各个载体骨架体系下包含的各载体骨架类型的细分方式,可以是如下所述:
Mammalian Gene Expression Vectors载体骨架体系下包含6个载体骨架类型,分别记为:Lentivirus,MMLV retrovirus,Adenovirus,Adeno-associated virus(AAV),Regular plasmid,PiggyBac;
Mammalian shRNA Knockdown Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,分别记为:Lentivirus,PiggyBac;
CRISPR Vectors载体骨架体系下包含1个载体骨架类型,记为:Regular plasmid(single gRNA);
TALEN Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,记为:Regular plasmid;
Mammalian Promoter/Enhancer Testing Vectors载体骨架体系下包含1个载体骨架类型,记为:In vivo enhancer testing;
Bacterial Protein Expression Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,分别记为:pET,pBAD;
Mammalian Homologous Recombination Donor Vector载体骨架体系下包含1个载体骨架类型,记为:pDonor。
本领域技术人员可以理解的是,这里提及的载体骨架体系的个数、名称,以及各体系下的载体骨架类型的个数、划分和名称等等,仅仅是一种示例性的说明,便于技术人员理解以及后文的举例应用,并不用于对载体骨架体系以及载体骨架类型的划分方式做具体限定。
通过上述方式得到的载体骨架体系、各载体骨架体系下的载体骨架类型、与各载体骨架类型关联的基础元件与个性化元件类别、各基础元件及其元件属性、各类别个性化元件及其元件属性等信息,都可以存储在服务器100上,也可以是存储在服务器100关联的数据库中,用户终端101可以从服务器100上或者通过服务器100从其关联的数据库中获得这些信息。
结合图6所示,用户终端的用户在访问涉及本发明实施例方案的相关页面时,例如服务器100提供的相关页面时,用户终端会接收到该访问请求。在接收到该访问请求后,基于本发明实施例的方案,用户终端向服务器100发送载体骨架信息获取请求,该载体骨架信息获取请求可以通过访问相关页面的方式发出。
服务器100接收到该载体骨架信息获取请求后,从服务器本地或者从关联的数据库提取所有载体骨架体系的载体骨架信息,并向用户终端101返回载体骨架信息获取响应,该载体骨架信息获取响应中会包含所有的载体骨架体系的载体骨架信息。
用户终端接收到该载体骨架信息获取响应之后,对各载体骨架信息进行解析,将各载体骨架信息的数据库结构类型数据解析适合于用户终端101展示载体骨架信息所适用的结构数据(本发明实施例中称之为载体骨架结构数据),并基于解析后的载体骨架结构数据对各载体骨架信息进行显示,以方便用户查看和选择。其中,在进行显示时,在某一个特定的显示界面上,可以是只显示部分需要显示的载体骨架信息,一方面可能是由于用户终端的显示界面的限制,不能同时将全部的载体骨架信息显示在显示界面上,另一方面也可能是用户终端的用户已经确定相应的载体骨架体系,因而可以只对相应的载体骨架体系的载体骨架信息进行显示即可。当然,可能的情况下,也可以是将所有载体骨架体系的全部载体骨架信息进行显示。
基于显示的载体骨架信息,用户终端101的用户可以从中选择合适的载体骨架,并通过点击等方式来发出载体骨架选择指令,该载体骨架选择指令会关联或者包含着用户选中的载体骨架信息的载体骨架类型标识。
本发明实施例方法在接收到该载体骨架选择指令后,根据该载体骨架选择指令获取与该载体骨架类型标识对应的所有元件以及元件的元件属性,这里的元件包括基础元件以及个性化元件。具体的获取方式可以有所不同。
在其中一种获取方式中,如图6所示,可以是由用户终端向服务器发送载体骨架请求,该载体骨架请求中包含上述载体骨架类型标识,该载体骨架类型标识为载体骨架类型的唯一性标识。
服务器100接收到该载体骨架请求后,从服务器本地或者从关联的数据库提取与载体骨架类型标识对应的载体骨架类型相关的所有基础元件和所有个性化元件类别,并提取所有基础元件以及个性化元件的元件属性,然后向用户终端返回载体骨架请求响应。
用户终端接收到该载体骨架请求响应,从而获得与该载体骨架类型标识对应的所有元件以及元件的元件属性。
在另一种获取方式,如图6所示,可以是根据所述载体骨架选择指令,从本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
图6中没有示出的另外一种获取方式可以是,根据所述载体骨架选择指令,在本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性,如果没有获取结果,再根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求。
在获得与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性之后,如图6所示,对所有的元件(包括基础元件和个性化元件)的元件属性进行解析,将提取到的元件属性的数据库结构类型数据,解析为适用于用户终端显示元件属性所适用的结构数据(本发明实施例称之为元件属性结构数据),解析得到的元件属性结构数据可以基于实际需要进行显示,在显示时,可以是只显示需要显示的元件属性结构数据。其中,对各载体骨架信息和对元件属性进行解析的解析思路一致,但操作细节可能有差异,这与载体骨架信息的数据库结构类型数据与元件属性信息的数据库结构类型数据有关,也与用户终端适用于展示的结构数据有关,而具体采用什么样的操作方式进行解析,可以基于上述载体骨架类型标识确定。具体的解析方式采用目前已有的方式进行,也可以采用以后可能出现的任何方式进行。
随后,开始启动拼接过程,根据与上述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将上述确定的与该载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体。在拼接过程中,基础元件和个性化元件根据各元件的属性进行拼接,其中,个性化元件由于尚未确定,因而可以采用对应的个性化元件类别进行标识,其相应的元件属性也采用类别个性化元件统一的虚拟值作为其元件属性。即,同一类别的个性化元件在正式选择前,都采用其个性化元件类别来进行标识,且具有相同的虚拟的元件属性。这是因为,当载体骨架类型标识确定,选定好载体骨架后,对应的基础元件已全部确定,而个性化元件类别也已确定,但是具体是该个性化元件类别下的什么样的个性化元件此时还尚未确定。
在得到拼接后载体后,结合图6所示,可启动可视化展示过程,将拼接后载体根据各元件的元件属性结构数据进行可视化显示,具体可以是将拼接后载体按照各元件的长度属性模拟成环图后,根据各元件的其他元件属性结构数据进行可视化显示。综合考虑各元件的长度属性,可以确定各元件的长度比例,基于各元件的长度比例,就可以将拼接后载体根据其他的元件属性模拟成环图进行显示。
在一个实施例中,显示的拼接后载体中,各元件还可以附带各自的元件属性或者与各自的元件属性相关联,且可以随着长度属性等属性的不同而表观不一,以供用户终端的用户查看各元件的元件属性,例如,用户终端的用户可以通过点击可视化显示的拼接后载体上的元件来查看该元件相应的元件属性。
因此,如图6所示,本实施例的方法还可以基于可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,该属性查看指令包括元件标识,然后获取与该元件标识对应的元件的元件属性,这里的元件属性可以是指上述解析得到适合于显示的元件属性结构数据;然后将获得的元件属性进行显示。其中,这里的元件标识可以是基础元件的元件标识,也可以是个性化元件的元件标识。
在上述得到拼接后载体后,可以通过不同的方式来确定个性化元件,以下结合其中几种方式进行举例说明。
第一种方式,可以是提供一个使用率高且时下主流的个性化元件的列表,该列表可以称之为个性化元件推荐列表,并从个性化元件推荐列表中来选择合适的个性化元件,具体可以是用户通过点击显示的个性化元件推荐列表中的某个使用率高且时下主流的个性化元件的信息发出个性化元件选择指令,该个性化元件选择指令中会包含该点击的个性化元件的个性化元件标识。
本发明实施例的方法在接收到该个性化元件选择指令后,获取与该个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到上述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。从而可以直接将选择的个性化元件添加到上述已拼接的拼接后载体,且实时地对调整后的拼接后载体进行显示。
第二种实现方式,可以是提供一个个性化元件历史记录收藏夹,该个性化元件历史记录收藏夹包含了用户终端的用户设计且保存了的所有个性化元件的信息,也可以是包含了用户终端的用户之前曾添加过的个性化元件的信息,从而可以从个性化元件历史记录收藏夹中来选择合适的个性化元件。具体可以是:用户通过点击显示的个性化元件历史记录收藏夹中的个性化元件的信息发出个性化元件选择指令。本发明实施例方法接收到个性化元件选择指令后的处理方式可以与上述方式中的相同。
第三种处理方式,可以是从提供的所有个性化元件中选择。例如,用户通过提供的查询输入框输入关键字,并通过点击提供的查询按钮等方式发出查询指令,该查询指令中会包含上述关键字。本发明实施例方法在接收到该查询指令后,根据查询指令查询与该关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示。由于查询结果可能会有多个,因此,用户可以基于查询结果来从中选择一个或多个合适的个性化元件,并采用用户终端所提供的相应方式,例如,点击、选中等方式来发出个性化元件选择指令。
本发明实施例方法在接收到该个性化元件选择指令后,获取与该个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到上述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整上述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
另一方面,在这种实现方式中,在基于查询结果获得合适的个性化元件及其元件属性后,还可以是对其进行编辑后再添加到上述拼接后载体中。因此,在获取与上述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性之后,还可以进一步接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑后,根据编辑后的个性化元件的元件属性将该编辑后的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据编辑后的个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。具体的个性化元件的编辑方式在本发明实施例中不做限定。
第四种实现方式,可以是通过载体编辑工具自定义个性化元件。具体可以是在接收到自定义之后,根据该自定义指令调用载体编辑工具,在本发明实施例方法采用软件来实现的情况下,该载体编辑工具可以是本发明实施例方法对应的软件的一部分,也可以是独立的工具,用户终端的用户可以通过该载体编辑工具,自由创建专属自身的个性化元件,然后将通过载体编辑工具得到的自定义个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据自定义个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
其中,上述个性化元件推荐列表中的个性化元件信息,可以是在上述向服务器发送载体骨架请求时,服务器返回的载体骨架响应中就可以包含,且用户终端在接收到载体骨架响应后,可以自动对个性化元件推荐列表中的个性化元件的元件属性进行解析。
上述第二种方式中,可以是在用户通过点击提取历史记录等按钮发出提取历史记录指令时,用户终端向服务器发送历史记录请求,该历史记录请求中可以包含用户信息、个性化元件类别。服务器100接收到该历史记录请求后,提取与该用户信息对应的历史记录,然后基于提取的历史记录向用户终端返回历史记录响应,该历史记录响应中会包含个性化元件历史记录收藏夹。其中,由于历史记录中可能包含所有个性化元件类别的内容,在一个实施例中,该历史记录响应中包含的个性化元件历史记录收藏夹中,可以是只包含历史记录中与上述用户信息、个性化元件类别对应的个性化元件的信息,以与当前设计的载体骨架类型对应。
此外,在上述第三种实现方式中,在接收到查询指令后,可以是在用户终端本地查询与该关键字匹配的个性化元件,可以是将该查询指令向服务器发送,从服务器中查询到与该关键字匹配的个性化元件。
如上所述,根据添加的个性化元件,都会根据添加的个性化元件的真实的元件属性(例如明确的长度属性等)来调整上述得到的拼接后载体,并对调整后的拼接后载体进行可视化显示,实时展现最新的拼接后载体的环图。
在具体的确定个性化元件的过程中,上述各种不同的方式中可以采用任何一种方式进行,且各种不同的方式可以结合起来进行,且调整次数可以有多次,以选用、添加或者删减不同的个性化元件,或者是对个性化元件的元件属性进行调整。
由于个性化元件可能具有多个类别,且每一类别可能包含多个个性化元件,为了防止用户因元件数量过多造成思绪混乱,用户终端可以采用步骤指引的方式引导用户进行个性化元件的选择,伴随着步骤指引,可视化显示的拼接后载体中,相应的个性化元件可以进行高亮闪烁,以视觉互动的方式来提醒用户当前选择的个性化元件在可视化图形中对应的是哪一个模块,用户点击可视化图形中的该个性化元件,还可以对该性化元件进行修改。以下结合其中几个具体示例进行举例说明。
在一个具体示例中,假设用户选定的某种载体骨架类型,其对应的个性化元件有3类,分别为Promoter,ORF,Marker,在确定个性化元件时,在用户终端的显示界面的相应位置(不同于拼接后载体的可视化显示位置),例如显示界面的左侧,可以出现Step1,Step2,Step3的步骤指引,其中Step1为Add Promoter,即添加Promoter,Step2为Add ORF,即添加ORF,Step3为Add Marker,即添加Marker。在每一个步骤中,用户均可以通过上述提到的四种方式的一种或多种确定个性化元件。在用户终端的显示界面的相应位置,例如上侧还可以有Promoter,ORF,Marker的标题链接,以方便用户快速进入指定步骤。
当用户在Step1,则上侧Promoter标题高亮,而相应的拼接后载体的可视化显示的载体环图中,名为Promoter的元件亦高亮闪烁,提示用户当前正处于添加Promoter的步骤。当用户选择一个Promoter类型的个性化元件,如CMV,则Step1步骤可被标注“√”,以提醒用户该步骤的元件已确定,而相应的载体环图中名为Promoter的元件会即时被替换为CMV,并根据CMV的真实元件属性调整其在图中的外观,点击载体环图的该元件,还可以查看并修改元件属性。同时,用户终端的显示界面的某个显示位置,例如显示界面的下侧,可以显示“CMV+”的加法算式,提醒用户已添加一个名为CMV的元件。
相应地,当用户在Step2,则上侧ORF标题高亮,而相应的载体环图中名为ORF的元件亦高亮闪烁,提示用户当前正处于添加ORF的步骤。当用户选择一个ORF类型的个性化元件,如EGFP,则Step2步骤被标注“√”,提醒用户该步骤的元件已确定,而相应的载体环图中名为ORF的元件会即时被替换为EGFP,并根据其真实的元件属性调整其在图中的外观,点击载体环图的该元件,还可以查看并修改元件属性。同时,用户终端的显示界面的某个显示位置,例如显示界面的下侧,可以显示“CMV+EGFP+”的加法算式,提醒用户已添加一个名为CMV和一个名为EGFP的元件。
用户终端的显示界面的这些显示位置的提示互相关联,点击任意一个,其它3个会同时跳转到相应的显示方式,如点击加法算式中的CMV,则可以自动关联跳转至Step1,上侧的Promoter标题高亮,载体环图中CMV元件高亮闪烁。从而可以满足不同操作习惯的用户以最顺手的方式进入个性化元件定制步骤,用最短的时间设计出满意的载体;另一方面,步骤指引和视觉互动一目了然,可以以清晰的主线牵引用户进行载体设计。
在另一个实施例中,同样假设用户选定的某种载体骨架类型,其对应的个性化元件有3类,分别为Promoter,ORF,Marker,在确定个性化元件时,在用户终端的显示界面的左侧,可以出现Step1,Step2,Step3的步骤指引,其中Step1为Add Promoter,Step2为AddORF,Step3为Add Marker。此外,在显示界面的相关位置,例如右上角,可以设定有数字确定控件,例如名称显示为Number of ORFs的输入控件或者数字选择控件。如果用户在该Number of ORFs的控件中选择2,则在构建多基因表达载体时,用户终端的显示界面的左侧变为Step1,Step2,Step3,Step4,Step5步骤指引,其中Step1为Add Promoter,Step2为AddORF,Step3为Add Linker,Step4为Add ORF,Step5为Add Marker。采用与上述示例中类似的方式,假设用户在5个步骤分别选择CMV,EGFP,3xGGGGS,EmGFP,Neo,则用户终端显示界面的下侧出现“CMV+EGFP+3xGGGGS+EmGFP+Neo”的加法算式,完成后可构建完整的环形载体。
在另一个实施例中,同样假设用户选定的某种载体骨架类型,其对应的个性化元件有3类,分别为Promoter,ORF,Marker,在确定个性化元件时,在用户终端的显示界面的左侧,可以出现Step1,Step2,Step3的步骤指引,其中Step1为Add Promoter,Step2为AddORF,Step3为Add Marker。此外,在显示界面的相关位置,例如显示界面的右上角,可以设定有批量添加控件,例如显示为Add ORF in batch的控件。如果用户在该Add ORF in batch的控件中选择要批量添加,例如控件中处于ON状态,则Step2中可添加多个ORF类型的个性化元件,可随即添加EGFP,Venus,CyPet;最后进入Step3:Add Marker步骤添加Neo。显示界面的下侧出现“CMV+(EGFPx+Venusx+CyPetx)+Neo”的加法算式,完成后可构建分别包含CMV+EGFPx+Neo、CMV+Venusx+Neo、CMV+CyPetx+Neo的3个载体。
在基于可视化显示的拼接后载体确定初步符合要求时,可进一步进行酶切分析,确定拼接后载体是否满足预期结果。因此,在本发明实施例方法中,用户终端还接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接后载体进行酶切分析,得到酶切分析结果,并将酶切分析结果进行显示。具体的酶切分析方式可以采用目前已有的方式进行,例如可以采用开源的程序包来完成。
在一个实施例中,假设用户选定的载体骨架类型的个性化元件类别有3类,分别为Promoter,ORF,Marker,用户在分别选定CMV,EGFP,Neo这三个个性化元件后,可以对构建得到的拼接后载体进行酶切分析。在进行载体分析时,可以采用默认的多种酶进行分析,例如采用200多种酶对载体进行酶切分析。多得到的酶切分析结果可以进行显示,以供用户查看酶切分析结果。
在其中一种实现方式中,默认的酶切分析结果的示意图中还可以显示出仅存在一个酶切位点的酶及其切割载体的位置。在酶切分析结果示意图的相关位置,例如下方,还可以列出所有参与分析的酶,这些所有参与分析的酶中,可以分类别进行显示,例如可以分为三类:于该载体上存在多于一个酶切位点的酶;于该载体上仅有一个酶切位点的酶,即可视化酶切图中可见的酶;于该载体上不存在酶切位点的酶。
此外,在一个具体示例中,还可以提供关于酶的选择框,可供用户随意挑选一个或多个酶对载体进行酶切分析,观察特定酶对载体的切割情况。以用户选择了AatII,AccI,Acc65I,AccB7I,AccIII,AflIII,Aor51HI,ApaI共8个酶对载体进行酶切分析为例,其酶切分析结果的示意图如图8所示。在该酶切分析结果的显示界面的相关位置,例如右上角,还可以设置有酶切位点个数选择控件,例如Display按钮,便于用户对酶切位点的个数进行选择,以显示不同的酶切位点的个数情况下的切割情况,例如:可视化展示仅有一个酶切位点的酶对载体的切割情况、可视化展示仅有两个酶切位点的酶对载体的切割情况、可视化展示仅有三个酶切位点的酶对载体的切割情况和可视化展示存在4个或更多酶切位点的酶对载体的切割情况。在确定了酶切位点的个数,相应的标题也可以做适应性的改变,可视化的酶切分析结果的图展示仅存在相应个数酶切位点的酶及其切割载体的位置,而图的下方可以同时列出参与分析的8个酶,且这8个酶可以按照分类的方式进行显示,例如:于该载体上存在酶切位点且位点不为两个的酶;于该载体上仅有两个酶切位点的酶,即可视化酶切图中可见的酶;于该载体上不存在酶切位点的酶。
用户根据酶切分析结果决定是否需要修改载体的个性化元件。仍需修改个性化元件,则返回上述步骤,重新选择或自定义个性化元件,完善载体设计。其中,何种情况下需要修改或不需修改可以用户看了结果后,主观地判断是否满足他的需求,然后决定是否需要修改。
若无需修改,则载体设计和构建完成,用户可查看载体设计的概况和详情,并可把设计好的载体存储起来,也可以是添加到载体设计记录中进行保存,便于后续查看,这里的载体设计记录可以是收藏夹、购物篮、购物记录等各种表现方式,该载体设计记录还可以发送至服务器进行保存。
另一方面,在载体设计完成后,还可以通过订单的方式来获得与该设计好的载体对应的实物载体。因此,如图6所示,基于本实施例中的方法,还可以接收订单生成指令;根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体;接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。其中,这里的订单生成结果可以是是否成功生成订单的信息。
基于与上述方法相同的思想,本发明实施例还提供一种载体设计装置。图9中示出了一个实施例中载体设计装置的结构示意图。
如图9所示,本实施例中的载体设计装置包括:
指令接收模块901,用于接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令中包括载体骨架类型标识;
元件获取模块902,用于根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;
元件属性解析模块903,用于对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
拼接模块904,用于根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
载体显示模块905,用于将所述拼接后载体根据各元件的元件属性结构数据进行可视化显示。
根据如上所述的本发明实施例的方案,其将范围宽广、杂乱无章的载体数据按照统一标准进行分类,将载体骨架类型标识与该载体骨架的元件及元件属性进行关联,在需要设计载体时,基于选取的载体骨架类型标识就可以自动获得对应的元件及元件属性,并据此进行拼接得到完整的拼接后载体进行可视化显示,实现了基因载体的自动化拼装和工业化输出,彻底颠覆了生物技术领域的传统格局,大大提高了载体设计的效率,提高了载体产出数量及产出的质量。
用户终端可以直接从服务器获得相关信息,也可以是在获得相关信息后存储在本地以供后续使用,因此,如图9所示,上述元件获取模块902可以包括:
元件远程获取模块9021,用于根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求,所述载体骨架请求包括所述载体骨架类型标识;接收服务器根据所述载体骨架请求返回的载体骨架请求响应,所述载体骨架请求响应包括与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性;
元件本地获取模块9022,用于根据所述载体骨架选择指令,从本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
在另一种方式中,元件远程获取模块9021还可以是在元件本地获取模块9022在本地数据库没有获得与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性时,再根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求。
在上述接收载体骨架选择指令之前,需要能够查看载体骨架的相关信息,以便能从中选择合适的载体骨架,因此,如图9所示,本实施例中的装置还可以包括:
骨架信息获取模块906,用于向服务器发送载体骨架信息获取请求,接收服务器根据所述载体骨架信息获取请求返回的载体骨架信息获取响应,所述载体骨架信息获取响应中包括各载体骨架体系的载体骨架信息;
骨架信息解析模块907,用于对各载体骨架信息进行解析,将各载体骨架信息解析为适合于显示载体骨架信息的载体骨架结构数据;
骨架信息显示模块908,用于根据解析后得到的各载体骨架结构数据将各载体骨架信息进行显示。
此外,在一个具体示例中,上述元件还可以包括个性化元件,即,与上述载体骨架类型标识对应的各元件除了包含必须具备的基础元件之外,还可以包含自定义元件,该自定义元件可以由用户基于实际需要灵活确定。其中,在初始获得与上述载体骨架类型标识对应的各元件时,相应的个性化元件可以以个性化元件类别标识来标识,对应的元件属性为虚拟属性。同一类别的个性化元件的虚拟属性可以相同。个性化元件的添加可以采用不同的方式进行。
据此,如图9所示,本实施例中的装置还可以包括个性化元件获取模块909、个性化元件查询模块910、个性化元件编辑模块911、自定义个性化元件模块912中的任意一项或者任意组合。其中:
个性化元件获取模块909,用于基于个性化元件推荐列表或者个性化元件历史记录收藏夹,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性;
个性化元件查询模块910,用于接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性;
个性化元件编辑模块911,用于接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对所述个性化元件查询模块获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑,获得编辑后的个性化元件及编辑后的个性化元件的元件属性;
自定义个性化元件模块912,接收自定义指令,根据该自定义指令调用载体编辑工具,并获得通过载体编辑工具得到的自定义的个性化元件及个性化元件的元件属性。
此时,上述拼接模块904,还用于根据个性化元件获取模块909、个性化元件查询模块910、个性化元件编辑模块911或者自定义个性化元件模块912确定的个性化元件的元件属性将对应的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据该个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体;
而上述载体显示模块905,还用于将拼接模块904调整后的拼接后载体进行可视化显示。
在载体显示模块905对确定的拼接后载体进行可视化显示的过程中,还可以供用户查看相关元件的元件属性,因此,在一个具体示例中,具体的方式可以是:
载体显示模块905,还用于基于所述可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,所述属性查看指令包括元件标识;获取与所述元件标识对应的元件的元件属性;将获得的与所述元件标识对应的元件的元件属性进行显示。其中,这里的元件标识可以是基础元件的元件标识,也可以是个性化元件的元件标识。
在基于可视化显示的拼接后载体确定初步符合要求时,可进一步进行酶切分析,确定拼接后载体是否满足预期结果。因此,如图9所示,本实施例中的装置还可以包括:
酶切分析模块9013,用于接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接好的载体进行酶切分析,得到酶切分析结果,并将酶切分析结果进行显示。
终端用户可以基于显示的酶切分析结果决定是否需要修改个性化元件。在需要修改的情况下,可以返回个性化元件获取模块909、个性化元件查询模块910、个性化元件编辑模块911、自定义个性化元件模块912进一步对拼接后载体进行调整。
在不需要修改的情况下,则载体设计完成。上述拼接后载体即为设计的载体。如图9所示,本实施例中的装置还可以包括:
记录模块914,用于接收载体构建指令,根据该载体构建指令将所述拼接后载体作为构建的载体进行存储或者添加到载体设计记录中。
从而构建好的载体可以存储起来,也可以是添加到载体设计记录中便于后续查看,其中,这里的载体设计记录可以是购物篮、购物记录、收藏夹等各种表现形式。
另一方面,如图9所示,本实施例中的装置还可以包括:
订单生成模块915,用于接收订单生成指令,根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体,接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。
从而基于设计好的载体,进一步生成订单,以获得与该设计好的拼接后载体对应的实物载体。
本发明实施例的载体设计装置的其他技术特征,可以与上述载体设计方法中的相同。
本领域普通技术人员可以理解实现上述实施例方法中的全部或部分流程,是可以通过计算机程序来指令相关的硬件来完成,所述的程序可存储于计算机可读取存储介质中,该程序在执行时,可包括如上述各方法的实施例的流程。其中,所述的存储介质可为磁碟、光盘、只读存储记忆体(Read-Only Memory,ROM)或随机存储记忆体(Random AccessMemory,RAM)等。
以上所述实施例的各技术特征可以进行任意的组合,为使描述简洁,未对上述实施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述,然而,只要这些技术特征的组合不存在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。
Claims (12)
1.一种载体设计方法,其特征在于,包括步骤:
接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令包括载体骨架类型标识;
根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;所述基础元件为同一个载体骨架类型的载体骨架均具有的固定不变的元件;
对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
将拼接后载体根据各元件的元件属性结构数据进行可视化显示;
在接收载体骨架选择指令之前,还包括以下步骤:
向服务器发送载体骨架信息获取请求;
接收服务器根据所述载体骨架信息获取请求返回的载体骨架信息获取响应,所述载体骨架信息获取响应中包括各载体骨架体系的载体骨架信息;
对各载体骨架信息进行解析,将各载体骨架信息解析为适合于显示载体骨架信息的载体骨架结构数据;
根据解析后得到的各载体骨架结构数据将各载体骨架信息进行显示。
2.根据权利要求1所述的载体设计方法,其特征在于,根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性的方式包括下述各项中的任意一项:
根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求,所述载体骨架请求包括所述载体骨架类型标识;接收服务器根据所述载体骨架请求返回的载体骨架请求响应,所述载体骨架请求响应包括与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性;
根据所述载体骨架选择指令,从本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
3.根据权利要求1所述的载体设计方法,其特征在于,所述元件还包括个性化元件,所述方法还包括下述各项中的任意一项:
基于个性化元件推荐列表或者个性化元件历史记录收藏夹,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑后,根据编辑后的个性化元件的元件属性将该编辑后的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据编辑后的个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
接收自定义指令,根据该自定义指令调用载体编辑工具,并将通过载体编辑工具得到的自定义个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据自定义个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
4.根据权利要求1所述的载体设计方法,其特征在于,还包括步骤:
接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接好的载体进行酶切分析,得到酶切分析结果;
将酶切分析结果进行显示。
5.根据权利要求1所述的载体设计方法,其特征在于,还包括下述各项中的任意一项或者任意组合:
接收载体构建指令,根据该载体构建指令将所述拼接后载体作为构建的载体进行存储或者添加到载体设计记录中;
接收订单生成指令;根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体;接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。
6.根据权利要求1至5任意一项所述的载体设计方法,其特征在于,还包括下述各项中的任意一项或者任意组合:
将拼接后载体按照各元件的长度属性模拟成环图后,根据各元件属性结构数据进行可视化显示;
基于所述可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,所述属性查看指令包括元件标识;获取与所述元件标识对应的元件的元件属性;将获得的与所述元件标识对应的元件的元件属性进行显示。
7.一种载体设计装置,其特征在于,包括:
骨架信息获取模块,用于向服务器发送载体骨架信息获取请求,接收服务器根据所述载体骨架信息获取请求返回的载体骨架信息获取响应,所述载体骨架信息获取响应中包括各载体骨架体系的载体骨架信息;
骨架信息解析模块,用于对各载体骨架信息进行解析,将各载体骨架信息解析为适合于显示载体骨架信息的载体骨架结构数据;
骨架信息显示模块,用于根据解析后得到的各载体骨架结构数据将各载体骨架信息进行显示;
指令接收模块,用于接收载体骨架选择指令,所述载体骨架选择指令中包括载体骨架类型标识;
元件获取模块,用于根据所述载体骨架选择指令获取与所述载体骨架类型标识对应的各元件以及各元件的元件属性,所述元件属性包括长度属性,所述元件包括基础元件;所述基础元件为同一个载体骨架类型的载体骨架均具有的固定不变的元件;
元件属性解析模块,用于对各元件的元件属性进行解析,将各元件的元件属性解析为适用于显示元件属性的元件属性结构数据;
拼接模块,用于根据与所述载体骨架类型标识对应的拼接规则、各元件的元件属性,将与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架、各元件拼接为完整的载体,得到拼接后载体;
载体显示模块,用于将所述拼接后载体根据各元件的元件属性结构数据进行可视化显示。
8.根据权利要求7所述的载体设计装置,其特征在于,所述元件获取模块包括:
元件远程获取模块,用于根据所述载体骨架选择指令向服务器发送载体骨架请求,所述载体骨架请求包括所述载体骨架类型标识;接收服务器根据所述载体骨架请求返回的载体骨架请求响应,所述载体骨架请求响应包括与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性;
元件本地获取模块,用于根据所述载体骨架选择指令,从本地数据库获取与所述载体骨架类型标识对应的载体骨架的各元件以及各元件的元件属性。
9.根据权利要求7所述的载体设计装置,其特征在于,所述元件还包括个性化元件,所述装置还包括个性化元件获取模块、个性化元件查询模块、个性化元件编辑模块、自定义个性化元件模块中的任意一项或者任意组合:
所述个性化元件获取模块,用于基于个性化元件推荐列表或者个性化元件历史记录收藏夹,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性;
所述个性化元件查询模块,用于接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性;
所述个性化元件编辑模块,用于接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对所述个性化元件查询模块获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑,获得编辑后的个性化元件及编辑后的个性化元件的元件属性;
自定义个性化元件模块,接收自定义指令,根据该自定义指令调用载体编辑工具,并获得通过载体编辑工具得到的自定义的个性化元件及个性化元件的元件属性;
所述拼接模块,还用于根据个性化元件获取模块、个性化元件查询模块、个性化元件编辑模块或者自定义个性化元件模块确定的个性化元件的元件属性将对应的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据该个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体;
所述载体显示模块,还用于将所述拼接模块调整后的拼接后载体进行可视化显示。
10.根据权利要求7所述的载体设计装置,其特征在于,还包括:
酶切分析模块,用于接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接好的载体进行酶切分析,得到酶切分析结果,并将酶切分析结果进行显示。
11.根据权利要求7所述的载体设计装置,其特征在于,还包括记录模块和/或订单生成模块:
所述记录模块,用于接收载体构建指令,根据该载体构建指令将所述拼接后载体作为构建的载体进行存储或者添加到载体设计记录中;
所述订单生成模块,用于接收订单生成指令,根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体,接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。
12.根据权利要求7至11任意一项所述的载体设计装置,其特征在于,还包括下述各项中的任意一项或者任意组合:
所述载体显示模块将拼接后载体按照各元件的长度属性模拟成环图后,根据各元件属性结构数据进行可视化显示;
所述载体显示模块,还用于基于所述可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,所述属性查看指令包括元件标识;获取与所述元件标识对应的元件的元件属性;将获得的与所述元件标识对应的元件的元件属性进行显示。
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