CN105543236B - 一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种烟草反转录转座子基因Ntrt1，其特征在于：具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。其编码的蛋白质，其特征在于：具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列；用于调节烟草植株的高矮。

Description

一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途
技术领域
本发明涉及一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途，属于植物基因工程领域。
背景技术
反转录转座子( retrotransposon) 是真核生物基因组中一类可移动的遗传元件，其转座依赖于反转录酶的反转录反应，以DNA-RNA-DNA方式进行。反转录转座子最早在动物和酵母中发现，在植物基因组中也广泛存在，且占基因组的比例也各不相同。例如，水稻基因中反转录转座子的比例约18%，而玉米中则达到50%~80%，在小麦中高达达90%。反转录转座子按其结构可分为两类：长末端重复反转录转座子(long terminal repeats,LTRs)和非长末端重复反转录转座子(non-long terminal repeats, non-LTRs)。LTR在转座子的5，端和3，端有一对同向高度相似的序列，主要包括一些调控元件，通常含有LTR转录需要的启动子和终止子，LTR的转录通常由RNA 聚合酶II负责，其方向为5，端到3，端。LTR类反转录转座子又可分为Ty1-copia与Ty3-gypsy两个亚类，他们都编码一个多聚蛋白（polyprotein），随后被蛋白酶切割形成有gag和pol 2个功能多肽。gag蛋白的主要功能是包涵反转录转座时的RNA中间体，而pol编码的蛋白主要是和反转录转座子的生活周期有关。non-LTR根据长度和组成的不同又可分为长散在元件(long interspersed nuclearelements，LINEs) 和短散在元件( short interspersed nuclear elements，SINEs) 两种类型。LINE在所有植物中都有分布，而SINE仅在被子植物中有分布。
植物反转录转座子在其基因组中具有较多的拷贝，其主要作用是造成染色体的倒位、易位、重复，以及核苷酸序列的缺失、插入等突变，从而对基因组的结构、大小及部分基因功能造成重要影响。
尽管利用生物信息学方法可以对为止功能基因进行预测，但基因的最终功能还是要靠生物学鉴定。随着分子生物学的发展，基因转导、反义技术、RNA干扰、基因敲除、基因芯片技术以及蛋白质组学等方法用于植物基因功能的鉴定。尤其是近年来，VIGS（Virusinduced gene silencing）作为一种快速的鉴定植物基因功能的方法，越来越受到研究者的重视。
因此，如何开发一种能够调节烟草株高的LTR类反转录转座子是本领域技术人员亟待解决的技术问题。
发明内容
本发明要解决的技术问题是：提供一种烟草反转录转座子基因Ntrt1以及该基因编码的蛋白质，该基因的活性与烟草植株高矮密切相关。
本发明的技术方案是：一种烟草反转录转座子基因Ntrt1，具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。
一种烟草反转录转座子基因Ntrt1编码的蛋白质，具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。
一种烟草反转录转座子基因Ntrt1用于调节烟草植株的高矮。
本发明的有益效果：本发明提供一个烟草LTR类反转录转座子基因，被命名为Ntrt1，编码3个ORF，研究了该基因在调节植物株高方面的功能。Ntrt1基因是调节烟草株高的重要的因子。
利用同源克隆及RACE的方法，从烟草栽培品种“贵烟1号”cDNA中克隆得到了一个烟草反转录转座子的全长cDNA序列，命名为Ntrt1。利用Real time PCR研究了该基因在烟草不同组织中的表达水平，结果表明，该基因能在烟草的根、茎、叶中表达，在叶片中的表达量最高。构建了基于双生病毒卫星诱导的Nttr1的基因沉默载体，以中国番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leaf curl China virus，TYLCCNV）为辅助病毒在烟草中沉默了该基因，Ntrt1基因沉默烟草与对照相比，烟草植株明显变矮，说明该基因在烟草的生长发育中具有重要作用。
附图说明
图1为反转录转座子3’RACE和5’RACE及全长cDNA的克隆；
图2为Nt-rt1基因在烟草不同组织的相对表达水平；
图3为Nt-rt1基因沉默载体构建示意图；
图4为烟草Nt-rt1基因在接种沉默载体和对照载体植株中的表达水平；
图5为烟草Nt-rt1基因在接种沉默载体和对照载体植株株高。
具体实施方式
1、材料与方法
1.1 实验材料与仪器
1.1.1 植物材料：烟草栽培品种“贵烟1号”。
1.1.2 主要仪器：BD SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit、dNTP、 AMV(Reverse Transcriptase XL)、oligo d(T)18、Ribonuclease Inhibitor、DNA MarkerDL2000、pMD18-T 载体等购自Takara公司；Trans Taq DNA聚合酶 HiFi、大肠杆菌(Escherichia coli) DH5α 购自北京全式金生物技术有限公司；提取总RNA所用Trizol 试剂盒购自 Invitrogen公司；氨苄青霉素、DEPC、CaCl2 购自上海生工生物工程有限公司；DNAGel Extraction kit 购自Omega公司，PCR引物由上海英骏公司合成。
1.2试验方法
1.2.1烟草叶片总RNA的提取
取新鲜烟草叶片约0.1g置于无RNase的研钵中，加入液氮，迅速进行研磨，直至粉末状。然后用移液器加入1.0 ml Trizol于研钵中，继续进行研磨。待研钵中的固态物融化后，将其用移液器转移至1.5ml Eppendorf管中；用力振荡15s，室温静置5min；加入0.2 ml氯仿，混合后静置5min，4°C, 12,000g离心15min；小心取上清液移入一个新的Eppendorf管中，再加入0.5ml异丙醇，室温静置10min，然后于4°C, 12,000g离心10min；倒掉上清后，加入1.0ml 75%乙醇沉淀洗涤，4°C, 7500g离心5min，弃掉上清液；将EP管倒置在超净工作台10-15min，加入20μl经过DEPC处理过的去离子水中，将所获得的RNA用凝胶电泳和分光光度计检测浓度和纯度。
1.2.2 cDNA第一链的合成
在无RNase的0.2ml Eppendorf管中，按以下比例将所需反应物加入：
名称 体积
RNA template 1μg
5×Reverse Transcriptase XL(AMV) buffer 4μl
Oligo d(T)18 (50pmol/μl) 1μl
Ribonuclease Inhibitor (40U/μl) 0.5μl
Reverse Transcriptase XL (AMV) (5U/μl) 0.5μl
dNTP Mixture（each 2.5mM） 2μl
RNase free Water up to 20μl
Total 20μl
在PCR仪上按以下程序进行反应：37°C，10min；42°C，1.5h；99°C，5min；5°C，5min。反应结束后取1μl用作RT-PCR检测，或者保存于-20°C冰箱备用。
1.2.3 5’-RACE和3’-RACE
（1）引物的设计
根据序列检测正确的烟草反转录转座子中间片段，结合RACE试剂盒（Clontech BDSMART™ RACE cDNA Amplification Kit, Takara, Japan）操作指南引物设计的基本原则，设计下列特异性引物，引物使用时浓度为10μM：
Forward Primers for 3’-RACE
3-GSP-1: 5'-GTTGGCACTGTTGCTGGACTA-3'
3-GSP-2: 5'-GCTGACCTATGCAGGCAACCATG-3'
Reverse Primers for 5’-RACE
5-GSP-1: 5'-ACTCCTGGTACTCTTTCACGTCG-3'
5-GSP-2: 5'-CAACAGTCCACGAAGTTCAGAC-3'
（2）RACE用cDNA第一链的合成
用于RACE的cDNA第一链的合成主要参考Clontech BD SMART™ RACE试剂盒的相关操作指南，其主要操作步骤如下：
在0.5ml Eppendorf管中分别加入下述反应溶液：
5’-RACE Ready cDNA
名称 体积
RNA sample 3μl
5’-CDS primer A 1μl
SMART II A oligo 1μl
Total 5μl
3’-RACE Ready cDNA
名称 体积
RNA sample 3μl
3’-CDS primer A 1μl
Sterile H2O 1μl
Total 5μl
将上述反应液混匀并瞬时离心使所有溶液沉到管底；在70°C水浴2min；然后迅速在冰上冷却2min；瞬时离心使反应液沉在管底；
每管中分别加入以下反应液：
名称 体积
5×First-Strand Buffer 2μl
DTT (20mM) 1μl
dNTP Mixture (10mM) 1μl
PowerScript Reverse Tanscriptase 1μl
Sterile H<sub>2</sub>O 5μl
Total 10μl
用移液器将各管中的反应液轻轻混匀，短暂离心使反应液沉到管底；在PCR仪上42°C温育1h；用Tricine-EDTA buffer稀释第一链反应物：
如果起始总RNA>200ng，则加200μl buffer；
如果起始总RNA<200ng，则加100μl buffer；
72°C水浴7min，将样品保存在-20°C，可以保存三个月。
（3）RACE反应
1）扩增反转录转座子 5’及3’的体系及条件：
在0.2ml离心管中加入下列试剂：
名称 体积
5’-RACE-Ready cDNA/3’-RACE-Ready cDNA 1μl
Forward primer (10μM) 1μl
UPM (10×)或NUP 2.5或1μl
10×PCR buffer (Mg2+) 2.5μl
dNTP Mixture (each 2.5mM) 2μl
HiFi Taq (5U/μl) 0.2μl
ddH2O 15.8或17.3μl
Total 25μl
PCR反应程序为：加热盖，95°C预变性5min；然后95°C变性30s，55°C退火30s，72°C延伸5min，35个循环；最后72°C再延伸10min。
2) PCR扩增步骤
以5’-RACE-Ready cDNA为模板，以UPM和5-GSP-1为引物进行第一轮PCR反应，将产物稀释5倍后作模板，以NUP和5-GSP-2为引物进行第二轮巢式PCR反应即可得到反转录转座子 5’。
最后以3’-RACE-Ready cDNA为模板，以UPM和3-GSP-1为引物进行第一轮PCR反应，将产物稀释5倍后作模板，以NUP和3-GSP-2为引物进行第二轮巢式PCR反应即可得到反转录转座子 3。
（4）胶回收、连接、转化和验证 将RT-PCR扩增的产物经0.8％琼脂糖凝胶电泳后按DNA Gel Purlfication kit 试剂盒说明书回收目的片段后，连接到pMDl8-T 载体中，然后将其转入DH5α感受态细胞中，挑斑验证正确后送上海英骏公司测序。
1.2.4 序列分析及系统学分析 序列分析方法采用DNAstar、Vector等软件进行，序列比对、氨基酸同源性分析及系统树构建等采用ClustalW和MEGA 4.1等分析。分子量、等电点、信号肽、糖基化位点分析采用http://web.expasy.org/compute_pi/ http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 、http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/等在线分析软件。
1.2.5 基因沉默载体的构建
用PCR扩增Ntrt1基因3’-UTR区300bp的片段，并根据载体的酶切位点在该片段的3端分别添加Bam H I和XbaI的酶切位点，将该片段通过Bam H I和Xba I双酶切后插入到本实验构建的 pBinPLUS-2mDNA1（2mDNA1）中，得到沉默载体2mDNA1-Ntrt1。
1.2.6 病毒接种与沉默效率检测
栽培烟草品种“贵烟1号”盆栽于温室中，温度保持在25 °C，湿度60%。在烟草3-4叶期时进行接种，为了进行病毒诱导的基因沉默测试，所有2mDNA1衍生沉默载体克隆都通过电击法导入农杆菌EHA105，并与含辅助病毒中国番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leafcurl China virus, TYLCCNV)侵染性克隆pBinPLUS-1.7A的农杆菌等比例混合后注射接种烟草，接种TYLCCNV和空载体的植物为对照。
1.2.7 基因表达分析
在30 dpi沉默出现最为彻底的时候分别采取沉默植株和接种2mDNA1空载体植株的叶片，用TRIzol法抽提这些叶片的总RNA，抽提的植物总RNA最后溶于50μL无核糖核酸酶的水，用oligo d(T) 18 引物 和 superscript reverse transcriptase (Promega)进行cDNA第一链的合成。利用2mDNA1上插入片段的外侧序列上设计的引物进行real time RT-PCR扩增以保证扩增产物反映是内源基因mRNA的水平。以延伸因子EF-1-α（Elongationfactor 1-alpha 1 gene，EF-1-α）作为半定量RT-PCR的内参。
结果与分析
2.1 5’-RACE和3’-RACE PCR扩增结果
根据的273 bp的烟草反转录转座子中间片段，设计了两对特异性引物：3-GSP-1、3-GSP-2和5-GSP-1、5-GSP-2分别用于扩增烟草反转录转座子基因的3’-RACE和5’-RACE反应，先用外侧引物3-GSP-1和5-GSP-1与UPM分别进行扩增，然后以其各自的扩增产物为模板，再用内测引物3-GSP-2和5-GSP-2与NUP进行PCR扩增，分别得到了2540bp和2890bp左右的目的条带(图1)，测序后全长拼接mRNA 全长 5586bp。
图1所示为该基因3，RACE和5，RACE及全长cDNA的克隆及测序结果。
1.2.2 烟草反转录转座子的序列分析
获得基因全长5586bp ，命名为Ntrt1（Genbank 登录：KC899077），该基因编码3个ORF，编码的氨基酸分别为Gag/pol 多聚蛋白，反转录转座子的中心蛋白以及一个整合酶，其cDNA序列和氨基酸序列见序列表。
在ORF3的N端，存在HX3-7HX23-32CX2C的整合酶的典型锌指结构，说明在扩增的区域中含有整合酶，所以扩增的该段mRNA区域应为ty3-gypsy类反转录转座子。
2.2基因表达分析
分别提取烟草的叶片、根、茎中的总RNA，反转录成cDNA，利用quantitative realtime RT-PCR (qRT-RCR) 分析Nt-rt1在烟草体内不同组织的表达情况，研究结果表明，在检测的组织中，均检测到了该基因的表达，说明该基因的表达没有明显的组织特异性，其中叶片中的表达量最高，根和茎中的表达量相对较低（图2）。
2.3 沉默载体的构建与病毒接种
在前期构建的沉默载体2mDNA1的多克隆位点中插入了300bp Nt-rt1的基因片段，构建成 2mDNA1：Nt-rt1的侵染性克隆pBinPLUS-2mDNA1-Nt-rt1（图3），取酶切鉴定正确的转化子（图3）与辅助病毒中国番茄黄化曲叶病毒Tomato yellow leaf curl China virus(TYLCCNV)一起通过农杆菌注射接种烟草，接种病毒与空载体的作为对照。
2.4表型调查
在接种30天后，提取接种植株与对照叶片，提取RNA并反转录成cDNA，利用realtime PCR检测Nt-rt1基因的表达水平，结果显示，接种沉默载体中目的基因的表达水平显著下调，约为对照载体的15%（图4）。调查接种沉默载体与对照株高差异，当Ntrt1基因沉默后，烟草发育受到抑制，平均株高为66.6cm，高明显低于对照89.7cm（图5）。说明烟草Ntrt1基因对烟草的发育具有重要作用。
3 结论
烟草反转录转座子基因Ntrt1能够调节烟草株高，具有较强的应用前景。
4 附录
烟草反转录转座子基因Ntrt1的核酸序列及其编码的氨基酸序列。
序列表
SEQ ID NO:1 核酸序列:
CCTTC GCAGG TGGTT ATGGT GATTC GTTCT ACGGA AACCA AAGAA AAGAC 50
AGTGA GTGCA AGGCC AGTGG TTCAG TTAAA AGCAG TAGAA GACAA GCCAG 100
TGCTA GTAAT GGGAA AGGGA CCGTT TGTGG CCGAG AAAAA GCAGA AGCCA 150
GTCAA GATAG TGGTA CCAAG GTCAG TATCC ACGCC CGTGG TGGTT GTGAA 200
GGGAG TCTAT ATAGA GCCGG TTGTC ATAAA ACCGG TAGTC CAGTT ACCCA 250
TGGTT GATAG CAAAG CCGTA CCCTA GAAAT ATGAC AAAGT AGTGG TGACA 300
TACAA AGGAA AGGAA ATTGA GGAAG AAAGT TGTGA AGCAC AGGGA CTGAC 350
CCGAT CAGGA CGTTG TTTCG CCCCT GAAGA GTTGA GAAAA GCTAA GGGCG 400
CAAAA GACAA TCCAG TGCCA GTTAA AAAAG CTGTA ACGGA AGAGG AAGCA 450
GAAGA GTTTC TGAAA AAGAT GAAAG GACAA GATTA TTCCA TTGTT GATCA 500
ACTGA GAAAA ACACC GGCCC AAATC TCGTT ATTGT CATTA TTAAT TCACT 550
CTGAT GAGCA TTGCC GAGCT TTAAT GAAGA TATTG AATGA GGCTC ATGTG 600
CCTGA CAAAA TCTCA GTAAA CCATT TAGAG ACAAT TGCCA ACAAG ATCTT 650
TGAAG TGAAC AGGAT AGCAT TTTCT GATGA TGAAT TGCCA ATGGA AGGCA 700
CAGAA CACAA CAAGG CTCTC TATTT GACGG TCAAA TGTGA AGGTT CAATG 750
GTTAC TCGGG CACTA ATCGA TAACG GGTCG AGCGC TAATA TTTGC ACGTT 800
ATCCA CATTG AACAA GTTAA AGATT GATGA GGATA GAATC CGCAA AAATA 850
GCATT TGTGT TCGAG GGTTC GATGG AGGGG GAACA AACAC AGTAG GGGAT 900
ATTGT ACTCG AATTG ACTAT TGGCC TAGTC GAGTT CACGA TGGAA TTTCA 950
GGTGT TGGAT GCTGC AGTAT CCTAT AATCT TTTGT TGGGT CGACC GTGGA 1000
TTCAT GCGGC AAAAG CCGTG CCCTC CACAC TGCAC CAAAT GATCA AATTC 1050
GAGTG GGACA GACAA GAAAT TGTGT TACAT GGGGA AGATC CCACA TGCGC 1100
CGTGA ATGAT GCCAT TGTAC CCTTT ATAGA GACCG AAGAT GATAA GGGGC 1150
CATGG GTGTA TCAGA TCCTC GACAC GGTTC CGGTG AGCAG GTTGC CTGAG 1200
GGTAA AAGTA TGCCA TGTCC CAGGG TGTCA GCTAC TACCG TCATG GTAGT 1250
ATCAG AAATG TTGAA TAACG GGTTC GTGCC CGGGA AGGGT TTGGG GGTTG 1300
AATTG CAGGG CATTA CTCAA CCTGT GTCTT TGCCC AAAAA TCTGG ACACC 1350
TTCGG GTTAG GGTTC AAACC AACAG GTGTA GATGT CAGAA AGGCC CGTAA 1400
ATTGA AGAAG AAATC TTGGG TGCTC CCTAA ACCAA TTCCT CGATT GTTCA 1450
GGTCC TTCAT CAGGC TGAAT ATCAA GAAAT AGTCA TTGGC AAAGA TATCG 1500
GGTTC GTTAG TTGAG GCGGA TGGGA ATTTG GATAA GGTGT TTGAG AAAGT 1550
ATTTG CTGAA GTAAA CATGG TTGAG GCCGG GGAAG GGTCA AGCAG AGCAG 1600
ACATA CAGTA CATCG GACCA CGTGC TAACA TCAGC AATTG GGAAG CTACT 1650
CCTCT TCCAG TTCGG AGGGA GTCGT GGTAG TGGGT TTTGT TTTCC TTTTT 1700
GTCAC CTGGA TTATT CCAGG GTTTG TAATC CAGTT GTTAT GTTCC GTCCG 1750
TTTGG ATGAG TTAAA ACCTT GTTGT CTTTA CGTTT AATGA AATGC AATTT 1800
TCTTC GTCCC TAATT CTCTT TCCAT TTTCG TTTCT TTTCT TTGTA CAGTT 1850
CTCTT TATGC TGATA TCAAT GACAT GACAT GCATG AGGAA TCTTC GGCCC 1900
AGTTT TAAAA GCCAA TCTAA TTCAG AAGTA ATAAT ACAAG AGAAC GAGTG 1950
TGATG ATGGG ATGGA TTGTA ATAAT GATGA AGCTT ATGAG GAAAT TAGTA 2000
AAGAA TTAAG CCACT TTGAA GAAAA ACCCA AACCT AACCT AAATG ACACA 2050
GAAGC AGTTA ATCTA GGGGA CCAAG ATAAT GTACG GGAAA CTAAA ATAAG 2100
TGTTC ATTTG GATCC ACAAC TCAAG GAGGA GATAA TTAAA GTATT GCATG 2150
AGTAC AAAGA CGTTT TTGCA TGGTC ATATG ATGAT ATGCC GGGTC TAAGC 2200
ACCGA TTTGG TGGTT CATAA ATTGC CCACT GATCC AGCAC TCCTC CCTGT 2250
CAAGC AGAAG TTGAG AAAGT TCAAA ACAGA CCTAA GTGTG AAGAT CAAAG 2300
AAGAG ATCAC CAAGC AATTT GAGGC AAGGG TCATT CAGGT TACAC GGTAC 2350
CCCAC TTGGT TAGCC AATGT CGTGC CTGTG CCAAA GAAAG ATGGC AAGAC 2400
CAGGG TGTGC GTCGA TTATC GAGAC CTTAA CAAAG CAAGC CCAAA AGATA 2450
ATTTC CCACT GCCCA ACATC CATAT ACTGA TCGAC AATTG TGCCA AACAT 2500
GATAT TGGCT CTTTT GTGGA TTGTT ATGCG GGTTA TCATC AGATT CTAAT 2550
GGATA AGGAA GATGC AGAAA AGACG GCATT CATCA CGCCG TGGGG AACGT 2600
ATTGT TATTG GGTCA TGCCG TTTGG TTTGA AAAAT GCTGG GGCAA CTTAT 2650
ATGAG GGCCA TGACA ACTAT CTTCC ATGAT ATGAT ACATA AAGAA ATTGA 2700
GGTAT ACGTG GATGA TGTGA TCGTT AAGTC TAGAC AGCAA TCTGA CCATG 2750
TCAGA GATTT GAGAA AATTC TTTCA AAGGC TTCTC AGGTA CAATC TTAAG 2800
CTCAA TCCTG CGAAA TGTGC TTTCG GGGTG CCATC TGGGA AGTTG TTGGG 2850
ATTCA TAGTT AGCCG GAGAG GTATT GAATT AGACC CGTCA AAGAT CAAAG 2900
CTATT CAGGA ATTGC CACCT CCAAG AAACA AAACT GAGGT GATGA GTTTG 2950
TTGGG AAGAC TGAAC TATAT CAGCA GGTTC ATTGC TCAGC TCACG GCAAC 3000
ATGTG AACCA ATTTT CAAAT TGTTA AGGAA AGATG CCGCG GTCAA ATGGA 3050
CTGAT GAATG TCAGG AGGCT TTTGA TAAGA TAAAG GGGTA TTTGT CAAAC 3100
CCACC TGTGT TGGTC CCACC AGAAC CAGAG AGGCC TTTGA TTCTA TATCT 3150
GACAG TTATG GACAG TTCAT TCGGC TGTGT ACTGG GGCAA CATGA TGTTA 3200
CAGGC AGAAA GGAGC AGGCT ATCTA CTATC TCAGT AAGAA GTTCA CATCT 3250
TACGA GGTCA AGTTT ACTCA TCTGG AAAGG ACATG TTGTG CCCTA ACTTG 3300
GGTGG CACAG AAATT GAAAC ATTAC TTGTC ATCTT ACACC ACTTA CCTTA 3350
TATCT CGCTT GGACC CGTTG AAGTA TATTT TCCAG AAACC CATGC CCACA 3400
GGAAG GCTTG CAAAG TGGCA GATCT TACTT ACAGA GTTCG ACATT GTCTA 3450
TGTGA CACGG ACTGC TATGA AAGCA CAGGC ATTAG CCGAT CACTT GGCTG 3500
AGGAC CCCGT TGATG AAGAT TATGA GCCTT TGAAA ACTTA TTTCC CTGAT 3550
GAAGA GATAA TGCAC ATTGA AGAAT TAGAA CAAGC TGAGA AGTCG GGATG 3600
GAAAC TTTTC TTTGA TGGGG CTGCA AATAT GAAGG GTGTG GGAAT AGGAT 3650
CAGTA CTTAT TTCGG AAACA GGTCA GCATT ACCCT GTTAC AGCTC GGCTT 3700
CATTT CTATT GTACA AACAA CATGG CAGAA TATGA GGCAT GTGTA TTGGG 3750
ATTGA GATTA GCTGT GGATA TGGGT GTACA GGAAG TCTTG GTCAT GGGTG 3800
ACTCG GACTT ACTGG TACAC CAGAT TCAAG GGGAA TGGGA AACAC GGGAC 3850
TTGAA GCTTA TACCG TATCG ACAAT GTCTG CATGA GCTTT GCCAG TGTTT 3900
TCAGG CCATA GAATT CAGAC ACATT CCAAG GATTC ATAAT GAGGT TGCTG 3950
ACGCT TTGGC TACTT TGGCG TCAAT GTTGC ACCAT CCAGA TAAGG GCTAT 4000
GTTGA TCCAT TGCAG ATTCA AGTCC GTGAT CAGCA TGCTT ACTGC AATGT 4050
GATAG AAGAG GAAAT CGATG GAGAG CCATG GTTCC ATGAT ATCAA AGAGT 4100
ACATC AAAGC GGGAG TGTAT CCAAC GTAGG CCACC GGTGA TCAGA AAAGA 4150
ACAAT TCGAC GGTTG GTAAG TGGGT TTTTC CTTAG TGGAG GAGTA CTGTA 4200
CAAAA GAACG CCAGA GCTCG GTTTG TTGAG ATGTA TAGAT GCACG GCAGG 4250
CCACA ACTAT CATGA CTGAG GTTCA TTCCG GAGTT TGCGG ACCGC ATATG 4300
AGTGG GTATG TTCTA GCAAA GAAAA TTCTT CGAGC AGGTT ATTAT TGGCT 4350
CACGA TGGAG CGAGA TTGTA TCAGT TTTGT GCGTA AGTGT CATCA ATGCC 4400
AAATA CATGG AGATT TGATT CATGC TCCAC CATCA GAATT ACATA CGATG 4450
TCCGC GCCAT GGCCT TTTGT TGCAT GGGGC ATGGA TGTTA TTGGG CCAAT 4500
TGATC CAGCA GCATC AAATG GGCAC AGATT TATCT TGATA GCTAT AGATT 4550
ATTTT ACCAA ATGGG TGGAA GCGAA GACAT TCAAG TCTGT GACCA AGAAG 4600
GCTGT AGTTG ACTTC ATGCA TGCAA ATATC ATATG TCGGT TTGGG ATCCC 4650
AAAGG TAATC ATCAC AGATA ATGGG GCTAA TCTTA ATAGT CATTT GATGA 4700
AGGAG ACATG TGAGC AGTTT AAGAT TGCTC ACAGG CACTC TACTC CGTAC 4750
CGTCC CAAGC CAAAT GGTGC GGTTG AAGCG GCCAA TAAGA ACATA AAGAA 4800
AATAC TCCGG AAGAT GGTTG AAGGA TCTAG ACAAT GGCAC GAGAA ATTGC 4850
CTTTT GCATT GTTAG GATAT CGCAC CACCA TGCGT ACCTC GGTAG GGGCG 4900
ACTCC TTACT CATTG GTATA TGGTA CCGAG GCAGT AATAC CCGCA GAAGT 4950
GGAAA TCCCA TCTCT GCGAA TCATT GCAGA GGCTG AGATC GATGA TGATG 5000
AATGG GTAAA AAGCC GTCTT GAGCA GTTGA GTTTG ATCGA TGAGA AAAGA 5050
TTGGC ATCAG TGTGT CATGG CCAAC TGTAC CAATG AAGAA TGGCA AGAGC 5100
ATACA ACAAA AAGGT ACGTC CAAGG AAATT TGAAG TCGGG CAATT AGTAC 5150
TGAGG CGGAT CTTGC CTCAT TGGGC TGAGG CAAAA GGAAA ATTTG CCCCA 5200
AACTG GCAGG GACCA TTTGT GGTAA CCAGA GTGTT GTCTA ATGGA GCATT 5250
GTATT TGACA GATGT GGAAG GAAAA TGTGT AGAAA TGACC ATCAA TTCCG 5300
ATGCG GTCAA GAGAT ATTAT GTATG ATTTC TTTAT GTTCT GAATG TATCT 5350
GTTCA TATTT GGCAT ATCTT AAAGA TTGAA ATGAT GAAGG CATTT TGTTC 5400
TGCTA TCCAA ACACT CATAT CCCTT GTTAT CCCCT TCGAG CCTTA CTTAT 5450
TTTTC ATACA CCTCT TTCGG AATCA GCGGC ACTAT CAGAG AACAC AAGTG 5500
CCGAA CATAA AAAAA AAAAA AAAAA AGTAC TCTGC GTTGA TACCA CTGCT 5550
TAATC TCTAG AGGAT CCCCG GGTAC CGAGC TCGAA T 5586
3个ORF编码的蛋白序列分别为 (总共1362个氨基酸)：
SEQ ID NO:2 ORF1：
MKGQDYSIVDQLRKTPAQISLLSLLIHSDEHCRALMKILNEAHVPDKISVNHLETIANKIFEVNRIAFSDDELPMEGTEHNKALYLTVKCEGSMVTRALIDNGSSANICTLSTLNKLKIDEDRIRKNSICVRGFDGGGTNTVGDIVLELTIGLVEFTMEFQVLDAAVSYNLLLGRPWIHAAKAVPSTLHQMIKFEWDRQEIVLHGEDPTCAVNDAIVPFIETEDDKGPWVYQILDTVPVSRLPEGKSMPCPRVSATTVMVVSEMLNNGFVPGKGLGVELQGITQPVSLPKNLDTFGLGFKPTGVDVRKARKLKKKSWVLPKPIPRLFRSFIRLNIKK
SEQ ID NO:3 ORF2：
MTCMRNLRPSFKSQSNSEVIIQENECDDGMDCNNDEAYEEISKELSHFEEKPKPNLNDTEAVNLGDQDNVRETKISVHLDPQLKEEIIKVLHEYKDVFAWSYDDMPGLSTDLVVHKLPTDPALLPVKQKLRKFKTDLSVKIKEEITKQFEARVIQVTRYPTWLANVVPVPKKDGKTRVCVDYRDLNKASPKDNFPLPNIHILIDNCAKHDIGSFVDCYAGYHQILMDKEDAEKTAFITPWGTYCYWVMPFGLKNAGATYMRAMTTIFHDMIHKEIEVYVDDVIVKSRQQSDHVRDLRKFFQRLLRYNLKLNPAKCAFGVPSGKLLGFIVSRRGIELDPSKIKAIQELPPPRNKTEVMSLLGRLNYISRFIAQLTATCEPIFKLLRKDAAVKWTDECQEAFDKIKGYLSNPPVLVPPEPERPLILYLTVMDSSFGCVLGQHDVTGRKEQAIYYLSKKFTSYEVKFTHLERTCCALTWVAQKLKHYLSSYTTYLISRLDPLKYIFQKPMPTGRLAKWQILLTEFDIVYVTRTAMKAQALADHLAEDPVDEDYEPLKTYFPDEEIMHIEELEQAEKSGWKLFFDGAANMKGVGIGSVLISETGQHYPVTARLHFYCTNNMAEYEACVLGLRLAVDMGVQEVLVMGDSDLLVHQIQGEWETRDLKLIPYRQCLHELCQCFQAIEFRHIPRIHNEVADALATLASMLHHPDKGYVDPLQIQVRDQHAYCNVIEEEIDGEPWFHDIKEYIKAGVYPT
SEQ ID NO:4 ORF3：
MTEVHSGVCGPHMSGYVLAKKILRAGYYWLTMERDCISFVRKCHQCQIHGDLIHAPPSELHTMSAPWPFVAWGMDVIGPIDPAASNGHRFILIAIDYFTKWVEAKTFKSVTKKAVVDFMHANIICRFGIPKVIITDNGANLNSHLMKETCEQFKIAHRHSTPYRPKPNGAVEAANKNIKKILRKMVEGSRQWHEKLPFALLGYRTTMRTSVGATPYSLVYGTEAVIPAEVEIPSLRIIAEAEIDDDEWVKSRLEQLSLIDEKRLASVCHGQLYQ
<110> 贵州省烟草科学研究院
<120>一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途
<160> 4
<210> 1
<211> 5586
<212> DNA
<213> 反转录转座子基因Ntrt1
<400> 1
CCTTC GCAGG TGGTT ATGGT GATTC GTTCT ACGGA AACCA AAGAA AAGAC 50
AGTGA GTGCA AGGCC AGTGG TTCAG TTAAA AGCAG TAGAA GACAA GCCAG 100
TGCTA GTAAT GGGAA AGGGA CCGTT TGTGG CCGAG AAAAA GCAGA AGCCA 150
GTCAA GATAG TGGTA CCAAG GTCAG TATCC ACGCC CGTGG TGGTT GTGAA 200
GGGAG TCTAT ATAGA GCCGG TTGTC ATAAA ACCGG TAGTC CAGTT ACCCA 250
TGGTT GATAG CAAAG CCGTA CCCTA GAAAT ATGAC AAAGT AGTGG TGACA 300
TACAA AGGAA AGGAA ATTGA GGAAG AAAGT TGTGA AGCAC AGGGA CTGAC 350
CCGAT CAGGA CGTTG TTTCG CCCCT GAAGA GTTGA GAAAA GCTAA GGGCG 400
CAAAA GACAA TCCAG TGCCA GTTAA AAAAG CTGTA ACGGA AGAGG AAGCA 450
GAAGA GTTTC TGAAA AAGAT GAAAG GACAA GATTA TTCCA TTGTT GATCA 500
ACTGA GAAAA ACACC GGCCC AAATC TCGTT ATTGT CATTA TTAAT TCACT 550
CTGAT GAGCA TTGCC GAGCT TTAAT GAAGA TATTG AATGA GGCTC ATGTG 600
CCTGA CAAAA TCTCA GTAAA CCATT TAGAG ACAAT TGCCA ACAAG ATCTT 650
TGAAG TGAAC AGGAT AGCAT TTTCT GATGA TGAAT TGCCA ATGGA AGGCA 700
CAGAA CACAA CAAGG CTCTC TATTT GACGG TCAAA TGTGA AGGTT CAATG 750
GTTAC TCGGG CACTA ATCGA TAACG GGTCG AGCGC TAATA TTTGC ACGTT 800
ATCCA CATTG AACAA GTTAA AGATT GATGA GGATA GAATC CGCAA AAATA 850
GCATT TGTGT TCGAG GGTTC GATGG AGGGG GAACA AACAC AGTAG GGGAT 900
ATTGT ACTCG AATTG ACTAT TGGCC TAGTC GAGTT CACGA TGGAA TTTCA 950
GGTGT TGGAT GCTGC AGTAT CCTAT AATCT TTTGT TGGGT CGACC GTGGA 1000
TTCAT GCGGC AAAAG CCGTG CCCTC CACAC TGCAC CAAAT GATCA AATTC 1050
GAGTG GGACA GACAA GAAAT TGTGT TACAT GGGGA AGATC CCACA TGCGC 1100
CGTGA ATGAT GCCAT TGTAC CCTTT ATAGA GACCG AAGAT GATAA GGGGC 1150
CATGG GTGTA TCAGA TCCTC GACAC GGTTC CGGTG AGCAG GTTGC CTGAG 1200
GGTAA AAGTA TGCCA TGTCC CAGGG TGTCA GCTAC TACCG TCATG GTAGT 1250
ATCAG AAATG TTGAA TAACG GGTTC GTGCC CGGGA AGGGT TTGGG GGTTG 1300
AATTG CAGGG CATTA CTCAA CCTGT GTCTT TGCCC AAAAA TCTGG ACACC 1350
TTCGG GTTAG GGTTC AAACC AACAG GTGTA GATGT CAGAA AGGCC CGTAA 1400
ATTGA AGAAG AAATC TTGGG TGCTC CCTAA ACCAA TTCCT CGATT GTTCA 1450
GGTCC TTCAT CAGGC TGAAT ATCAA GAAAT AGTCA TTGGC AAAGA TATCG 1500
GGTTC GTTAG TTGAG GCGGA TGGGA ATTTG GATAA GGTGT TTGAG AAAGT 1550
ATTTG CTGAA GTAAA CATGG TTGAG GCCGG GGAAG GGTCA AGCAG AGCAG 1600
ACATA CAGTA CATCG GACCA CGTGC TAACA TCAGC AATTG GGAAG CTACT 1650
CCTCT TCCAG TTCGG AGGGA GTCGT GGTAG TGGGT TTTGT TTTCC TTTTT 1700
GTCAC CTGGA TTATT CCAGG GTTTG TAATC CAGTT GTTAT GTTCC GTCCG 1750
TTTGG ATGAG TTAAA ACCTT GTTGT CTTTA CGTTT AATGA AATGC AATTT 1800
TCTTC GTCCC TAATT CTCTT TCCAT TTTCG TTTCT TTTCT TTGTA CAGTT 1850
CTCTT TATGC TGATA TCAAT GACAT GACAT GCATG AGGAA TCTTC GGCCC 1900
AGTTT TAAAA GCCAA TCTAA TTCAG AAGTA ATAAT ACAAG AGAAC GAGTG 1950
TGATG ATGGG ATGGA TTGTA ATAAT GATGA AGCTT ATGAG GAAAT TAGTA 2000
AAGAA TTAAG CCACT TTGAA GAAAA ACCCA AACCT AACCT AAATG ACACA 2050
GAAGC AGTTA ATCTA GGGGA CCAAG ATAAT GTACG GGAAA CTAAA ATAAG 2100
TGTTC ATTTG GATCC ACAAC TCAAG GAGGA GATAA TTAAA GTATT GCATG 2150
AGTAC AAAGA CGTTT TTGCA TGGTC ATATG ATGAT ATGCC GGGTC TAAGC 2200
ACCGA TTTGG TGGTT CATAA ATTGC CCACT GATCC AGCAC TCCTC CCTGT 2250
CAAGC AGAAG TTGAG AAAGT TCAAA ACAGA CCTAA GTGTG AAGAT CAAAG 2300
AAGAG ATCAC CAAGC AATTT GAGGC AAGGG TCATT CAGGT TACAC GGTAC 2350
CCCAC TTGGT TAGCC AATGT CGTGC CTGTG CCAAA GAAAG ATGGC AAGAC 2400
CAGGG TGTGC GTCGA TTATC GAGAC CTTAA CAAAG CAAGC CCAAA AGATA 2450
ATTTC CCACT GCCCA ACATC CATAT ACTGA TCGAC AATTG TGCCA AACAT 2500
GATAT TGGCT CTTTT GTGGA TTGTT ATGCG GGTTA TCATC AGATT CTAAT 2550
GGATA AGGAA GATGC AGAAA AGACG GCATT CATCA CGCCG TGGGG AACGT 2600
ATTGT TATTG GGTCA TGCCG TTTGG TTTGA AAAAT GCTGG GGCAA CTTAT 2650
ATGAG GGCCA TGACA ACTAT CTTCC ATGAT ATGAT ACATA AAGAA ATTGA 2700
GGTAT ACGTG GATGA TGTGA TCGTT AAGTC TAGAC AGCAA TCTGA CCATG 2750
TCAGA GATTT GAGAA AATTC TTTCA AAGGC TTCTC AGGTA CAATC TTAAG 2800
CTCAA TCCTG CGAAA TGTGC TTTCG GGGTG CCATC TGGGA AGTTG TTGGG 2850
ATTCA TAGTT AGCCG GAGAG GTATT GAATT AGACC CGTCA AAGAT CAAAG 2900
CTATT CAGGA ATTGC CACCT CCAAG AAACA AAACT GAGGT GATGA GTTTG 2950
TTGGG AAGAC TGAAC TATAT CAGCA GGTTC ATTGC TCAGC TCACG GCAAC 3000
ATGTG AACCA ATTTT CAAAT TGTTA AGGAA AGATG CCGCG GTCAA ATGGA 3050
CTGAT GAATG TCAGG AGGCT TTTGA TAAGA TAAAG GGGTA TTTGT CAAAC 3100
CCACC TGTGT TGGTC CCACC AGAAC CAGAG AGGCC TTTGA TTCTA TATCT 3150
GACAG TTATG GACAG TTCAT TCGGC TGTGT ACTGG GGCAA CATGA TGTTA 3200
CAGGC AGAAA GGAGC AGGCT ATCTA CTATC TCAGT AAGAA GTTCA CATCT 3250
TACGA GGTCA AGTTT ACTCA TCTGG AAAGG ACATG TTGTG CCCTA ACTTG 3300
GGTGG CACAG AAATT GAAAC ATTAC TTGTC ATCTT ACACC ACTTA CCTTA 3350
TATCT CGCTT GGACC CGTTG AAGTA TATTT TCCAG AAACC CATGC CCACA 3400
GGAAG GCTTG CAAAG TGGCA GATCT TACTT ACAGA GTTCG ACATT GTCTA 3450
TGTGA CACGG ACTGC TATGA AAGCA CAGGC ATTAG CCGAT CACTT GGCTG 3500
AGGAC CCCGT TGATG AAGAT TATGA GCCTT TGAAA ACTTA TTTCC CTGAT 3550
GAAGA GATAA TGCAC ATTGA AGAAT TAGAA CAAGC TGAGA AGTCG GGATG 3600
GAAAC TTTTC TTTGA TGGGG CTGCA AATAT GAAGG GTGTG GGAAT AGGAT 3650
CAGTA CTTAT TTCGG AAACA GGTCA GCATT ACCCT GTTAC AGCTC GGCTT 3700
CATTT CTATT GTACA AACAA CATGG CAGAA TATGA GGCAT GTGTA TTGGG 3750
ATTGA GATTA GCTGT GGATA TGGGT GTACA GGAAG TCTTG GTCAT GGGTG 3800
ACTCG GACTT ACTGG TACAC CAGAT TCAAG GGGAA TGGGA AACAC GGGAC 3850
TTGAA GCTTA TACCG TATCG ACAAT GTCTG CATGA GCTTT GCCAG TGTTT 3900
TCAGG CCATA GAATT CAGAC ACATT CCAAG GATTC ATAAT GAGGT TGCTG 3950
ACGCT TTGGC TACTT TGGCG TCAAT GTTGC ACCAT CCAGA TAAGG GCTAT 4000
GTTGA TCCAT TGCAG ATTCA AGTCC GTGAT CAGCA TGCTT ACTGC AATGT 4050
GATAG AAGAG GAAAT CGATG GAGAG CCATG GTTCC ATGAT ATCAA AGAGT 4100
ACATC AAAGC GGGAG TGTAT CCAAC GTAGG CCACC GGTGA TCAGA AAAGA 4150
ACAAT TCGAC GGTTG GTAAG TGGGT TTTTC CTTAG TGGAG GAGTA CTGTA 4200
CAAAA GAACG CCAGA GCTCG GTTTG TTGAG ATGTA TAGAT GCACG GCAGG 4250
CCACA ACTAT CATGA CTGAG GTTCA TTCCG GAGTT TGCGG ACCGC ATATG 4300
AGTGG GTATG TTCTA GCAAA GAAAA TTCTT CGAGC AGGTT ATTAT TGGCT 4350
CACGA TGGAG CGAGA TTGTA TCAGT TTTGT GCGTA AGTGT CATCA ATGCC 4400
AAATA CATGG AGATT TGATT CATGC TCCAC CATCA GAATT ACATA CGATG 4450
TCCGC GCCAT GGCCT TTTGT TGCAT GGGGC ATGGA TGTTA TTGGG CCAAT 4500
TGATC CAGCA GCATC AAATG GGCAC AGATT TATCT TGATA GCTAT AGATT 4550
ATTTT ACCAA ATGGG TGGAA GCGAA GACAT TCAAG TCTGT GACCA AGAAG 4600
GCTGT AGTTG ACTTC ATGCA TGCAA ATATC ATATG TCGGT TTGGG ATCCC 4650
AAAGG TAATC ATCAC AGATA ATGGG GCTAA TCTTA ATAGT CATTT GATGA 4700
AGGAG ACATG TGAGC AGTTT AAGAT TGCTC ACAGG CACTC TACTC CGTAC 4750
CGTCC CAAGC CAAAT GGTGC GGTTG AAGCG GCCAA TAAGA ACATA AAGAA 4800
AATAC TCCGG AAGAT GGTTG AAGGA TCTAG ACAAT GGCAC GAGAA ATTGC 4850
CTTTT GCATT GTTAG GATAT CGCAC CACCA TGCGT ACCTC GGTAG GGGCG 4900
ACTCC TTACT CATTG GTATA TGGTA CCGAG GCAGT AATAC CCGCA GAAGT 4950
GGAAA TCCCA TCTCT GCGAA TCATT GCAGA GGCTG AGATC GATGA TGATG 5000
AATGG GTAAA AAGCC GTCTT GAGCA GTTGA GTTTG ATCGA TGAGA AAAGA 5050
TTGGC ATCAG TGTGT CATGG CCAAC TGTAC CAATG AAGAA TGGCA AGAGC 5100
ATACA ACAAA AAGGT ACGTC CAAGG AAATT TGAAG TCGGG CAATT AGTAC 5150
TGAGG CGGAT CTTGC CTCAT TGGGC TGAGG CAAAA GGAAA ATTTG CCCCA 5200
AACTG GCAGG GACCA TTTGT GGTAA CCAGA GTGTT GTCTA ATGGA GCATT 5250
GTATT TGACA GATGT GGAAG GAAAA TGTGT AGAAA TGACC ATCAA TTCCG 5300
ATGCG GTCAA GAGAT ATTAT GTATG ATTTC TTTAT GTTCT GAATG TATCT 5350
GTTCA TATTT GGCAT ATCTT AAAGA TTGAA ATGAT GAAGG CATTT TGTTC 5400
TGCTA TCCAA ACACT CATAT CCCTT GTTAT CCCCT TCGAG CCTTA CTTAT 5450
TTTTC ATACA CCTCT TTCGG AATCA GCGGC ACTAT CAGAG AACAC AAGTG 5500
CCGAA CATAA AAAAA AAAAA AAAAA AGTAC TCTGC GTTGA TACCA CTGCT 5550
TAATC TCTAG AGGAT CCCCG GGTAC CGAGC TCGAA T 5586
<210> 2
<211> 337
<212> 氨基酸
<213> 反转录转座子基因Ntrt1
<400> 2
MKGQDYSIVD QLRKTPAQIS LLSLLIHSDE HCRALMKILN EAHVPDKISV NHLETIANKI 60
FEVNRIAFSD DELPMEGTEH NKALYLTVKC EGSMVTRALI DNGSSANICT LSTLNKLKID 120
EDRIRKNSIC VRGFDGGGTN TVGDIVLELT IGLVEFTMEF QVLDAAVSYN LLLGRPWIHA 180
AKAVPSTLHQ MIKFEWDRQE IVLHGEDPTC AVNDAIVPFI ETEDDKGPWV YQILDTVPVS 240
RLPEGKSMPC PRVSATTVMV VSEMLNNGFV PGKGLGVELQ GITQPVSLPK NLDTFGLGFK 300
PTGVDVRKAR KLKKKSWVLP KPIPRLFRSF IRLNIKK 337
<210> 3
<211> 751
<212> 氨基酸
<213> 反转录转座子基因Ntrt1
<400> 3
MTCMRNLRPS FKSQSNSEVI IQENECDDGM DCNNDEAYEE ISKELSHFEE KPKPNLNDTE 60
AVNLGDQDNV RETKISVHLD PQLKEEIIKV LHEYKDVFAW SYDDMPGLST DLVVHKLPTD 120
PALLPVKQKL RKFKTDLSVK IKEEITKQFE ARVIQVTRYP TWLANVVPVP KKDGKTRVCV 180
DYRDLNKASP KDNFPLPNIH ILIDNCAKHD IGSFVDCYAG YHQILMDKED AEKTAFITPW 240
GTYCYWVMPF GLKNAGATYM RAMTTIFHDM IHKEIEVYVD DVIVKSRQQS DHVRDLRKFF 300
QRLLRYNLKL NPAKCAFGVP SGKLLGFIVS RRGIELDPSK IKAIQELPPP RNKTEVMSLL 360
GRLNYISRFI AQLTATCEPI FKLLRKDAAV KWTDECQEAF DKIKGYLSNP PVLVPPEPER 420
PLILYLTVMD SSFGCVLGQH DVTGRKEQAI YYLSKKFTSY EVKFTHLERT CCALTWVAQK 480
LKHYLSSYTT YLISRLDPLK YIFQKPMPTG RLAKWQILLT EFDIVYVTRT AMKAQALADH 540
LAEDPVDEDY EPLKTYFPDE EIMHIEELEQ AEKSGWKLFF DGAANMKGVG IGSVLISETG 600
QHYPVTARLH FYCTNNMAEY EACVLGLRLA VDMGVQEVLV MGDSDLLVHQ IQGEWETRDL 660
KLIPYRQCLH ELCQCFQAIE FRHIPRIHNE VADALATLAS MLHHPDKGYV DPLQIQVRDQ 720
HAYCNVIEEE IDGEPWFHDI KEYIKAGVYP T 751
<210> 4
<211> 274
<212> 氨基酸
<213> 反转录转座子基因Ntrt1
<400> 4
MTEVHSGVCG PHMSGYVLAK KILRAGYYWL TMERDCISFV RKCHQCQIHG DLIHAPPSEL 60
HTMSAPWPFV AWGMDVIGPI DPAASNGHRF ILIAIDYFTK WVEAKTFKSV TKKAVVDFMH 120
ANIICRFGIP KVIITDNGAN LNSHLMKETC EQFKIAHRHS TPYRPKPNGA VEAANKNIKK 180
ILRKMVEGSR QWHEKLPFAL LGYRTTMRTS VGATPYSLVY GTEAVIPAEV EIPSLRIIAE 240
AEIDDDEWVK SRLEQLSLID EKRLASVCHG QLYQ??? 274

Claims (1)

1.一种烟草反转录转座子基因Ntrt1在烟草植株高矮的调节中的用途，所述的Ntrt1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
CN201510859299.0A 2015-12-01 2015-12-01 一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途 Active CN105543236B (zh)

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US7271314B1 (en) * 1999-05-25 2007-09-18 National Institute Of Agrobiological Sciences Method for disrupting genes using tobacco retrotransposon
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Patent Citations (3)

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Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Nicotiana tacacum retrotransposon, complete sequence;Guo,Y.;《GENBANK：KC899077.1》;20150901;全文 *

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