CN105039362B - 一种基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶及其方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提出了一种基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶及其方法,该葡萄糖氧化酶由GOD‐M524L‐M528L突变基因构成。方法为:计算机模拟分析葡萄糖氧化酶序列,设计葡萄糖氧化酶编码基因突变体为GOD‐M524L‐M528L;全基因合成该基因序列,通过重叠延伸PCR扩增;克隆到pPIC9K载体上,线性化后电转入毕赤酵母GS115菌株中,再经培养表达、检测筛选,摇瓶发酵,收集发酵上清液,将发酵上清液透析去除盐离子,经层析纯化得到纯酶样品,经过氧化处理3.5h后检测,对照组GOD的残留酶活只有20%,而突变葡萄糖氧化酶GOD‐M524L‐M528L的残留酶活则达到30%,提高了其抗氧化性。
Description
技术领域
本发明涉及的是分子酶工程技术,特别是一种基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶及其方法。
背景技术
葡萄糖氧化酶GOD是氧化还原酶(E1.1.3.4),它能专一性的将葡萄糖氧化为葡萄糖酸和过氧化氢,根据反应条件的不同,其反应式如下:
在没有过氧化氢酶存在下,每摩尔葡萄糖氧化酶氧化时消耗1摩尔氧气。
C6H12O6+O2→C6H12O7+H2O2
在有过氧化氢酶存在下,每摩尔葡萄糖氧化酶氧化时消耗0.5摩尔氧气。
C6H12O6+1/2O2→C6H12O7
在有乙醇和过氧化氢酶同时存在下,过氧化氢同时被用于乙醇的氧化作用,此时,每摩尔葡萄糖氧化酶氧化时消耗1摩尔氧气。
C6H12O6+C2H5OH+O2→C6H12O7+CH3CHO+H2O
甲硫氨酸(Met)是构成蛋白质必需氨基酸的一种,为蛋白质甲基化和转硫化所必需,甲硫氨酸易被氧化,它易受到过氧化氢、次氯酸盐、羟基自由基的氧化而生成甲硫氨酸亚砜,甲硫氨酸亚砜被进一步氧化可形成甲硫氨酸砜。甲硫氨酸亚砜可以在特定条件下可以还原为甲硫氨酸,而甲硫氨酸被氧化为甲硫氨酸砜在生物学是不可逆的。
H2O2被认为是葡萄糖氧化酶GOD的竞争性抑制剂,其竞争性抑制的米氏常数和氧气对于葡萄糖氧化酶GOD的抑制的米氏常数几乎一样。同时,反应产物H2O2对葡萄糖氧化酶中Met的氧化而使其活性降低或失活。如何提高突变葡萄糖氧化酶抗氧化性,使其在葡萄糖氧化为葡萄糖酸的生产中提高生产率,降低生产成本,具有很大意义。
发明内容
本发明的目的是采用基因突变的方法,定点突变常规葡萄糖氧化酶,提高突变葡萄糖氧化酶抗氧化性,使其在葡萄糖氧化为葡萄糖酸的生产中提高生产率,降低生产成本。
本发明是这样实现的,通过计算机辅助分析设计,定点突变葡萄糖氧化酶(GOD)特定位点甲硫氨酸,将甲硫氨酸替换为亮氨酸,并将其在毕赤酵母中表达,筛选出提高突变葡萄糖氧化酶抗氧化性,使其在葡萄糖氧化为葡萄糖酸的生产中提高生产率,降低生产成本。
所述该基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶由GOD‐M524L‐M528L突变基因构成,即将其基因序列524位和528位的MET氨基酸突变为LEU。
1.计算机模拟分析葡萄糖氧化酶序列及分子对接
通过对葡萄糖氧化酶序列分析(如图1),本发明涉及的GOD的黄素腺嘌呤二核苷酸(flavin adenine dinucleotide,FAD)结合区(下划线标示)对应的氨基酸残基为16‐54、239‐306、529‐553、560‐583,FAD结合扩展区(方框标示)对应的氨基酸残基为Y68、R230、C521,FAD覆盖区(波浪线标示)对应的氨基酸残基为76‐96,黄素附着环(双下划线标示)对应的氨基酸残基为97‐114。本实验后面设计氨基酸定点突变时都尽量避开这些结合位点。
在对葡萄糖氧化酶蛋白序列分析的基础上,设计葡萄糖氧化酶编码基因的三个突变体为GOD‐8,GOD‐M523L‐M524L(见序列表NO2)和GOD‐M524L‐M528L(见序列表NO3),通过计算机同源建模辅助分析三个突变体结构,将三个突变体分别与底物葡萄糖进行分子对接(基于CDOCKER对接分析软件),以研究GOD突变后活性的影响。
2.葡萄糖氧化酶及突变体表达载体的构建
通过全基因合成突变体GOD‐8基因序列;并通过重叠延伸PCR扩增GOD‐M523L‐M524L、GOD‐M524L‐M528L突变体基因序列,具体如下:
GOD‐M523L‐M524L通过两轮PCR扩增,突变位点设计引物为GOD‐M1‐F、GOD‐M1‐R、GOD‐F‐EcoRⅠ和GOD‐R‐NotⅠ。
GOD‐M524L‐M528L通过两轮PCR扩增,突变位点设计引物为GOD‐M2‐F、GOD‐M1‐R、GOD‐F‐EcoRⅠ和GOD‐R‐NotⅠ。
3.毕赤酵母中的表达、筛选及纯化
合成突变体基因后,通过分子克隆到pPIC9K载体上,重组表达载体用SalⅠ线性化后电转入毕赤酵母GS115菌株中,28℃培养3~4天,将MD平板上长出来的重组子,同时转接到MD和MM平板上,28℃温箱培养48h。将显色液(将10mL含1%琼脂糖的去离子水加热溶化,待冷却到60℃以下,立即加入2mL18%D‐葡萄糖,200μL1%溶于甲醇的邻联茴香胺溶液和400μL 90U/mL辣根过氧化物酶、混匀,混合物即为显色液)倾倒于待检测平板上,室温静置显色,显色30min后,根据显色圈大小判断GOD在毕赤酵母表达菌株中的表达情况。将筛选得到表达活性较高的菌株于BMGY和BMMY培养基中摇瓶表达,摇瓶120h后,收集发酵上清液。将发酵上清液在0.05mM Tris‐HCL(PH8.0)中透析去除盐离子。经Cellulose DE层析柱纯化得到纯酶样品。
所述的BMGY培养基为:1%酵母抽提物,2%蛋白胨,1.5%琼脂,121℃灭菌20分钟后,加入1.34%YNB,4×10-5%生物素,100mM pH6.0磷酸缓冲液,1%甘油
所述的BMMY培养基为:1%酵母抽提物,2%蛋白胨,1.5%琼脂,121℃灭菌20分钟后,加入1.34%YNB,4×10-5%生物素,100mM pH6.0磷酸缓冲液,0.5%甲醇
4.酶活性及酶蛋白含量的测定
GOD测酶活的原理:在葡萄糖氧化酶的作用下,葡萄糖和氧反应,生成葡萄糖酸和过氧化氢,过氧化氢和无色的还原型邻联茴香胺在过氧化物酶的作用下,生成水和红色的氧化型邻联茴香胺。
GOD酶活单位定义:在37℃,pH6.0的条件下,1分钟从1μmol的β‐D‐葡萄糖氧化成D‐葡萄糖酸和H2O2所需的酶量为一个葡萄糖氧化酶酶活力单位,以U/g(U/ml)表示。
标准曲线的绘制:
选用葡萄糖氧化酶标准品,配制各种浓度葡萄糖氧化酶标准溶液。用磷酸盐缓冲液稀释成0.8U/mL,1.2U/mL,1.6U/mL,2.0U/mL,2.4U/mL,2.8U/mL。取10ml试管中,加入2.5ml邻联茴香胺,0.3ml葡萄糖溶液,0.1ml过氧化氢酶溶液组成反应体系,反应体系在37℃保温5min后,分别加入各种浓度葡萄糖氧化酶标准溶液0.1mL,反应3min后,加入2M H2SO4(浓硫酸:水v/v=1:8)2mL,振荡摇匀以终止反应,利用分光光度计540nm波长测定吸光值。
以葡萄糖氧化酶浓度为Y轴、吸光度OD值为X轴,绘制标准曲线。
测定步骤:吸取适当稀释的酶液(根据具体浓度确定稀释倍数),按上开始操作。利用葡萄糖氧化酶标准曲线计算试验样品中葡萄糖氧化酶的浓度。
试样酶活力的计算:
Y=[K(AE‐AB)+C0]×D
Y—试样稀释液中的葡萄糖氧化酶活力,U/mL;AE—酶反应液的吸光度;
AB—酶空白样的吸光度;K—标准曲线的斜率;
CO—标准曲线的截距;D—试样的总稀释倍数。
本发明采用Bradford法测蛋白质浓度。标准曲线的绘制:将标准蛋白液稀释成10μg/ml、20μg/ml、40μg/ml、60μg/ml、80μg/ml及100μg/ml的蛋白浓度梯度溶液,分别取1ml放入10ml试管中,每管加入5ml考马斯亮蓝试剂,混匀,静止5min,于595nm测定其吸光度,以蛋白浓度为横坐标,以吸光度为纵坐标,绘制标准曲线。
可溶蛋白的测定:取1ml待测样品放入10ml试管中,每管加入5ml考马斯亮蓝试剂,混匀,静止5min,于595nm测定其吸光度,通过标准曲线计算出其可溶蛋白的浓度。
5.葡萄糖氧化酶抗氧化性测定
取待测的GOD样品4ml,加入1ml过氧化氢,37℃保温3.5h,每隔0.5h取一次样,立刻加入过量过氧化氢酶(400u/μL)除去多余的过氧化氢,测定残留酶活力。
本发明通过计算机辅助分析设计了葡萄糖氧化酶的三种不同突变体,并通过毕赤酵母表达得到相应的纯酶,性质分析表明其中一种突变体抗氧化性明显提高。此方法避免了随机突变的实验盲目性,可有效提高酶分子改造的效率。此方法亦适用于其他酶分子性质的改造。
附图说明
图1、GOD氨基酸序列及结合位点的推测
图2、GOD和D-葡萄糖相互作用二维平面图
图3、GOD-8和D-葡萄糖相互作用二维平面图
图4、GS115-pPic9K-GOD-8平板检测
图5、GOD-M523L-M524L和底物相互作用二维平面图
图6、GS115-pPic9K-GOD平板筛选
图7、GS115-pPic9K-GOD-M523L-M524L平板筛选
图8、GOD-M524L-M528L和底物相互作用二维平面图
图9、GS115-pPic9K-GOD-M524L-M528L平板筛选
具体实施方式:
实施实例1:GOD及突变体GOD-8数据分析
GOD和底物D‐葡萄糖CDOCKER对接后共有10个pose,其中最优pose的‐CDOCKERenergy为5.07234,CDOCKER interaction energy为26.6475(如图2)。按发明具体实施步骤进行毕赤酵母表达,测得纯化后的GOD酶活为442.755U/ml,可溶蛋白为136.476μg/ml,比活力为3.24U/μg。
GOD‐8和底物D‐葡萄糖CDOCKER对接后共有10个pose,其中最优pose的‐CDOCKERenergy为6.77139,CDOCKER interaction energy为30.6795(如图3)。按发明具体实施步骤进行毕赤酵母表达,通过平板显色筛选,发现突变体GOD‐8没有活性(如图4)。
实施实例2:突变体GOD-M523L-M524L数据分析
GOD‐M523L‐M524L和底物D‐葡萄糖CDOCKER对接后共有10个pose,其中最优pose的‐CDOCKER energy为0.242621,‐CDOCKER interaction energy为25.579(如图5)。按发明具体实施步骤进行毕赤酵母表达,通过平板显色筛选,突变体GOD‐M523L‐M524L活性(如图7)比野生型GOD(如图6)低,突变体GOD‐M523L‐M524L纯化的酶活为1.210U/ml,可溶蛋白为26.476μg/ml,比活力为0.0457U/μg,因为此突变体酶活很低,在被过氧化氢处理后即测不出酶活,所以没有比较其与GOD的抗氧化性。
实施实例3:突变体GOD-M524L-M528L数据分析
GOD‐M524L‐M528L和底物D‐葡萄糖CDOCKER对接后共有10个pose,其中最优pose的CDOCKER energy为0.877411,CDOCKER interaction energy为23.5475(如图8)。按发明具体实施步骤进行毕赤酵母表达,通过平板显色筛选,突变体GOD‐M524L‐M528L(如图9)活性比野生型GOD高。突变体GOD‐M524L‐M528L纯化的酶活为245.843/ml,可溶蛋白为48.476μg/ml,比活力为3.59U/μg。将GOD和GOD‐M524L‐M528L被过氧化氢处理3.5h后,随着葡萄糖氧化酶在过氧化氢孵育的时间的增加,GOD‐M524L‐M528L的抗氧化性一直是高于GOD的,在被过氧化氢处理3.5h后,GOD的残留酶活只有20%,而GOD‐M524L‐M528L的残留酶活则达到30%,说明将524位和528位的MET氨基酸突变为LEU,能提高其抗氧化性。
Claims (1)
1.一种基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶,其特征在于该基因突变提高抗氧化性的葡萄糖氧化酶由GOD-M524L-M528L突变基因构成,即将其基因序列524位和528位的MET氨基酸突变为LEU,其具体序列为序列表NO3:葡萄糖氧化酶突变体GOD-M524L-M528L基因序列。
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