CN104774866B - 拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因与甲酸脱氢酶基因的双表达应用 - Google Patents

拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因与甲酸脱氢酶基因的双表达应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因与甲酸脱氢酶基因的双表达应用,本发明以拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因cDNA构建植物表达载体,通过农杆菌介导转入烟草,检测正确后将拟南芥甲酸脱氢酶FDH基因cDNA所构建的植物表达载体通过农杆菌介导转入其中,获得插入两个外源基因SHMT/FDH的双表达转基因烟草,可提高植物对甲醛的吸收和耐受能力;实验结果表明双表达转基因烟草通过改变烟草叶绿素和可溶性糖含量而有效降低HCHO对植物的毒害,使转基因烟草叶片能在较高浓度HCHO胁迫下保持较好的HCHO吸收能;双表达转基因烟草能有效的降低氧化胁迫的发生,且这种效果比单表达转基因烟草更显著。

Description

拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因与甲酸脱氢酶基因的双表达 应用
技术领域
本发明属于植物基因工程领域,具体涉及拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因与甲酸脱氢酶FDH基因的植物表达载体在制备吸收甲醛能力增强的双表达转基因植物中的应用。
背景技术
甲醛(HCHO)被广泛的用于化工合成﹑工业制造、医药合成等所涉及的化学领域及其他工业领域,尤其是在化学农药及其中间体合成领域甲醛有着举足轻重的作用。现代化学农药的生产过程中不能避免的要产生大量含甲醛的农药生产废水,这些农药生产废水中普遍含有大量的甲醛以及醇、苯、酚、三聚甲醛、甲缩醛等物质,由于废水中甲醛的存在使得其处理变得十分困难。而且按照国家标准《污水综合排放标准(GB8978-1996)》规定:二级排放标准的甲醛含量不得高于2mg/L,所以含甲醛的农药生产废水要直接排放不仅不符合环保要求,并且对动植物都具有严重的危害性。由于甲醛在工业生产中的用途很广,完全的限制是不现实的,所以必须对工业生产中甲醛废水进行无害化处理。另一方面随着生活质量的不断提高装修已成为现代生活的一部分,而装修所用的材料胶合板、细木工板、中密度纤维板和刨花板等含有大量HCHO,这是因为目前生产人造板材使用的多种胶粘剂比如脲醛树脂、三聚氰甲醛、胺基甲醛树酯、酚醛树脂等多以HCHO为主要成分,所以HCHO气体成为装修房间中空气污染的主要化学物质之一。
HCHO是一种广泛存在的有毒化学物质,它可以溶于水中以液态存在,也可以挥发成为气体以气态形式存在。HCHO可以被还原为甲醇也可以被氧化为甲酸,而这三种物质对生物都具有一定的毒性。其中HCHO由于含有羰基基团因此具有较强的亲电特征,其具有十分活泼的化学性质能与各种脂类、核酸和蛋白质发生非特异性反应,并能导致生物体内各种相关物质失去生物活性。HCHO对人和动物具有较强毒性,它能导致皮肤敏感并能引起皮肤炎症;HCHO也能进入呼吸系统并引起该系统出现变态反应,通过血液循环被运输到全身引起肺部病变、肝脏器官损伤、免疫调节能力下降等。如果我们长期使用含有HCHO的水,会引发胃部不适、免疫障碍、贫血以及引起神经性病变,会对生物体产生急性或慢性的危害。如果人们暂时留在含有低剂量HCHO气体的室内时会使人产生不舒服的感觉,而长时间呼吸微量的HCHO会导致慢性呼吸道疾病,鼻咽癌、结肠癌、脑癌、月经紊乱、妊娠综合症、新生儿染色体异常、细胞核的基因突变,DNA单链内交连和DNA与蛋白质交连、白血病、青少年记忆力和智力下降等。当房间内HCHO气体浓度升高时,可刺激人眼使人流眼泪并引起咽喉不适或疼痛。而人体接触更高浓度HCHO气体可引起咳嗽、恶心或肺水肿等不良反应,如果HCHO气体浓度达到30mg/m3时可致人死亡。相对于油漆中的苯、甲苯、二甲苯、TDI、VOC等有害物质来说,甲醛具有潜伏周期长(3-15年)、隐藏深、分布广、易挥发、治理难、危害大等特性。
甲酸脱氢酶(FDH)和丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物一碳代谢的两个关键酶,FDH可将甲酸氧化为CO2,SHMT介导Gly和Ser之间的相互转换。FDH和SHMT的表达可被多种非生物胁迫诱导,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要作用。在拟南芥甲醛代谢过程中FDH能将甲醛代谢产生的甲酸氧化为CO2,SHMT则催化Gly和5,10-13CH2-THF(四氢叶酸)的反应产生丝氨酸。FDHSHMT的表达都受甲醛胁迫的诱导。丝氨酸(Ser)是拟南芥甲醛代谢的重要产物之一,但在烟草甲醛代谢过程没有产生Ser。本研究尝试利用PrbcS启动子在WT烟草叶片中过量表达拟南芥光呼吸途径的SHMT1产生SHMT转基因烟草,将烟草甲醛的碳代谢流引入Ser的合成,增强烟草对甲醛的抗性和吸收能力。
利用PrbcS启动子在SHMT转基因叶片中过量表达拟南芥甲酸代谢途径的FDH产生SHMT/FDH双转基因烟草,用13C-NMR分析转基因烟草对2mM和6mM液体甲醛的代谢机制,结果表明在转基因烟草叶片中SHMTFDH的同时过量表达不能将甲醛的碳代谢流引入Ser的合成,但却能将甲醛的碳代谢流引入葡萄糖([U-13C]Gluc)的合成,在烟草中引入了一条新的甲醛代谢途径。SHMT/FDH双转基因烟草叶片甲醛代谢产生[4-13C]Asn、[3-13C]Gln、[U-13C]OA和H13COOH的量大于FDHSHMT单转基因烟草,说明甲醛胁迫下FDHSHMT在转基因烟草叶片中的同时过量表达使烟草原有甲醛代谢途径的作用大大增强,这使得SHMT/FDH转基因烟草对液体甲醛的抗性和吸收能力比FDHSHMT单转基因烟草的强。
发明内容
本发明的目的在于将拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因的植物表达载体与甲酸脱氢酶FDH基因的植物表达载体在制备吸收甲醛能力增强的双表达转基因植物中的应用,其中丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因的GenBank登录号为6899944,甲酸脱氢酶FDH基因的GenBank登录号为6625952,制备含有拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因(即SHMT基因)和甲酸脱氢酶基因(即FDH基因)的耐受甲醛的双表达转基因植物。
本发明所述的丝氨酸羟甲基转移酶基因SHMT的cDNA来源于拟南芥(Arabidopsis thaliana),GenBank登录号为6899944,甲酸脱氢酶基因FDH的cDNA来源于拟南芥(Arabidopsis thaliana),GenBank登录号为6625952。
本发明的上述目的是通过下述的技术方案得以实现的:
1、植物表达载体的构建
1.1 SHMT基因植物表达载体的构建
(1)从GenBank中查找拟南芥SHMT基因的cDNA序列,并设计序列如下的一对引物:
上游引物 5' GCATGCATGGCGATGGCCATGGCTCTTC 3'(含有SphI位点);
下游引物 5' CTCGAGTTAGTTCTTGTACTTCATG 3'(含有XhoI位点);
上游引物5'端形成SphI酶切位点;下游引物3'末端加XhoI酶切位点,以拟南芥第一链cDNA为模板扩增,通过PCR扩增得到SHMT基因的全长cDNA(1554bp);
(2)回收并纯化SHMT全长基因cDNA片段,并将其连接到pMD-19T载体上,采用碱裂解法提取质粒DNA,通过PCR检测和酶切检测获得重组质粒pMD19-SHMT
(3)构建入门载体pENTR-PrbcS-SHMT,用SphI和XhoI酶切pMD19-SHMT和pENTR-PrbcS-ADH,回收SHMT的cDNA片段和载体DNA片段pENTR,进行连接、转化感受态细胞,得到入门载体pENTR-PrbcS-SHMT
(4)构建植物表达载体pK2-PrbcS-SHMT,通过Gateway技术的LR反应把SHMT亚克隆到植物表达载体pK2GW7中,获得SHMT基因的植物表达载体pK2-PrbcS-SHMT
1.2 FDH基因植物表达载体的构建
(1)从GenBank中查找拟南芥FDH基因的cDNA序列,并设计序列如下的一对引物:
上游引物 5' GCATGCATGGCGATGAGACAAGCCGCTAAGG 3'(含有SphI位点);
下游引物 5' CTCGAGTTACCGGTACTGAGGAGCAAGTTCA 3'(含有XhoI位点)
上游引物5'端加GCATGC特征序列,并由此形成SphI酶切位点;下游引物3'末端加XhoI酶切位点,以拟南芥第一链cDNA为模板扩增,通过PCR扩增得到FDH基因的全长cDNA(1155bp);
(2)回收并纯化FDH全长基因cDNA片段,并将其连接到pMD-19T载体上,采用碱裂解法提取质粒DNA,通过PCR检测和酶切检测获得重组质粒pMD19-FDH
(3)构建入门载体pENTR-PrbcS-T*-FDH,用SphI和XhoI酶切pMD19-FDH和pENTR-PrbcS-T*-GFP,回收FDH的cDNA片段和载体DNA片段pENTR,进行连接、转化感受态细胞,得到入门载体pENTR-PrbcS-T*-FDH
(4)构建植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH,通过Gateway技术的LR反应把FDH亚克隆到植物表达载体pH2GW7中,获得FDH基因的植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH
本发明的植物表达载体对那些能实施转基因操作的植物都适用,如烟草、拟南芥、矮牵牛、非洲菊等。在本发明的实施中以烟草为例说明该表达载体的应用过程。
2、烟草的转化
采用电转化转化质粒pK2-PrbcS-SHMT进入农杆菌感受态细胞,涂布在Spe平板上生长两天后,用菌落PCR检测质粒是否转化到农杆菌中。PCR扩增用SHMT的上下游引物, 扩增片段理论长度为1.6kb,PCR产物经电泳检测显示与理论值相符,表明质粒已转入农杆菌中。制备烟草(Nicotiana tabacum cv.Xanthi)的无菌苗,通过农杆菌介导,用叶盘法转化烟草,然后通过组织培养获得小苗,筛选具有卡那霉素(Km)抗性植株,将其转移到MS培养基(含有3%蔗糖)上继续培养,从而获得无菌的转基因烟草植株。
以已经成功筛选出的过量表达拟南芥SHMT烟草作为受体,将pH2-PrbcS-T*-FDH植物表达载体转入农杆菌(A.tumefaciens C58C1,pMP90)中。使用植物叶盘法由农杆菌介导将pH2-PrbcS-T*-FDH植物表达载体转化进入已经检测正确的过量表达拟南芥SHMT烟草中。转化完成后的叶盘置于25℃恒定光照(100μmol∙m-2∙s-1)下进行培养,转基因小苗需在含有卡那霉素(Km,50μg/ml)和潮霉素(Hyg,20μg/ml)的双抗性培养基上进行筛选,所得的再生苗中就有过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草。
3、SHMT/FDH基因插入情况的检测
为了检测目的基因SHMT/FDH是否插入有卡那霉素和潮霉素抗性植株烟草的基因组,以抗性苗的基因组为模板,利用SHMTFDH上下游引物做PCR检测,PCR扩增产物片段理论长度分别为1.6kb和1.2kb,PCR产物经电泳检测显示与理论值相符,说明目的基因SHMT/ FDH已插入到烟草基因组中。
4、SHMT/FDH基因转录水平的检测
为了检测目的基因SHMT/FDH在双表达转基因烟草中是否转录,提取抗性苗RNA,利用SHMTFDH上下游引物进行RT-PCR检测,RT-PCR扩增片段理论长度分别为1.6kb和1.2kb,RT-PCR产物经电泳检测显示与理论值相符,说明目的基因SHMT/FDH已在转基因烟草中正常转录。
5、SHMT/FDH基因表达水平的检测
为了检测目的基因SHMTFDH编码的蛋白在双表达转基因烟草中是否表达,选取经RT-PCR检测正确的转基因株系的嫩叶,提取总蛋白进行Western分析,一抗分别为SHMTFDH的鼠抗体。根据SHMTFDH基因的核酸序列推测表达的蛋白大小分别约为57.2kDa和42.1kDa,Western分析结果检测到的蛋白质条带大小与理论预测值相符,说明SHMTFDH编码的蛋白在烟草中已成功表达。
6、转基因烟草甲醛吸收能力检测
根据蛋白表达水平,选择高表达的转基因株系进行甲醛吸收能力检测,分别用2、4、6mM HCHO溶液处理野生型烟草(WT)植株、SHMT转基因烟草和SHMT/FDH转基因烟草植株0、6、12、18、24、30、36、42和48 h,检测处理液中剩余HCHO的含量。
结果发现在2mM HCHO溶液中过量表达拟南芥SHMT烟草及过量表达拟南芥SHMT/ FDH烟草其吸收HCHO的能力较为相似,均略高于野生型的烟草,尤其是在24 h后过量表达拟南芥SHMT烟草及过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草的HCHO吸收速度均明显快于野生型,其中以过量表达SHMT/FDH烟草的HCHO吸收速度最快。但是到48 h后无论是两种转基因烟草还是野生型烟草均将2mM HCHO溶液中的HCHO吸收完毕。
4mM HCHO溶液处理时,两种转基因烟草和野生型烟草其吸收曲线整体趋势相似,但是在24 h后野生型烟草及过量表达拟南芥SHMT烟草的HCHO吸收速度有一个明显的下降,而过量表达拟南芥SHMT/FDH双基因的烟草只出现了略微的下降,而且48 h后两种转基因烟草已经将溶液中所有HCHO吸收完毕,但野生型烟草所在的溶液中还残余8.3%的HCHO。
6mM HCHO处理时,过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草吸收曲线的斜率明显高于野生型烟草以及过量表达拟南芥SHMT烟草,这些结果表明在烟草中过量表达拟南芥SHMT基因及过量表达拟南芥SHMT/FDH双基因增强了烟草对液体HCHO的吸收能力,并且过量表达拟南芥SHMT/FDH双基因的烟草对HCHO的吸收能力最强。
7、转基因烟草对甲醛的抗性检测
(1)叶绿素含量的测定:2mM液体HCHO胁迫并没有严重的损伤各植株的光合作用,叶片还保持较高的生命活力,这个结果与2mM液体HCHO胁迫下野生型烟草和这两种转基因烟草的HCHO吸收能力相一致,但是当HCHO胁迫的浓度提高到6mM时,烟草中过量表达拟南芥SHMT及过量表达拟南芥SHMT/FDH能有效降低HCHO对植物的毒害作用,使得转基因烟草的叶片能在较高浓度HCHO胁迫下保持较好的HCHO吸收能力。
(2)可溶性糖和总蛋白含量的测定:野生型和两种转基因植株对于2mM液体HCHO均具有一定耐受性,同时2mM液体HCHO胁迫也没有导致可溶性总蛋白的显著性变化,当6mM液体HCHO胁迫48小时后,野生型的可溶性总糖含量相对于未处理时没有显著性变化,而两种转基因植株的可溶性总糖含量却发生了显著上升,且由于过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草对于HCHO胁迫的耐受性明显强于野生型和过量表达拟南芥SHMT烟草,所以其总蛋白含量还维持在较高水平。
(3)过氧化氢(H2O2)、丙二醛(MDA)和羰基化蛋白(PC)含量的测定:高浓度HCHO处理后H2O2含量上升说明烟草细胞受到氧化损伤,而在烟草中过量表达拟南芥SHMT基因和过量表达SHMT/FDH双基因均可以减轻烟草细胞所受到的这种氧化损伤,2 mM HCHO处理48 h后MDA、PC含量在野生型和两种转基因植株叶片中并未出现显著性变化,但是在6 mM HCHO处理48 h后野生型植株叶片中MDA、PC含量分别出现了39.8%和22.5%的极显著性升高。说明高浓度HCHO胁迫会导致烟草中膜脂过氧化和蛋白质过氧化水平都显著性升高,但是通过烟草中过量表达拟南芥SHMT基因和过量表达拟南芥SHMT/FDH基因能有效的降低这种氧化胁迫的发生。
实验结果表明本发明的重组载体pK2-PrbcS-SHMT在转基因植株中的应用可提高其对甲醛的吸收速率和抗性,且SHMT/FDH双表达转基因植物的甲醛吸收速率和抗性较SHMT单表达转基因植物更高。
附图说明
图1为本发明中pMD19-SHMT的克隆策略示意图;
图2为本发明中入门载体pENTR-PrbcS-SHMT的克隆策略示意图;
图3为本发明中植物表达载体pK2-PrbcS-SHMT的克隆策略示意图;
图4为本发明中 pMD19-T-FDH的克隆策略示意图;
图5为本发明中入门载体pENTR-PrbcS-T*-FDH的克隆策略示意图;
图6为本发明中植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH的克隆策略示意图;
图7 为本发明中SHMT基因在转基因烟草中的整合、转录和表达的检测电泳图;其中A图:SHMT基因在转基因烟草基因组中整合情况检测,以pK2-PrbcS-SHMT质粒为模板为正对照(PC),以野生型烟草基因组模板为负对照(WT);B图:SHMT基因在转基因烟草中转录水平检测电泳图,以pK2-PrbcS-SHMT质粒为模板为正对照(PC),以野生型烟草基因组模板为负对照(WT);C图:SHMT蛋白在转基因烟草中表达水平检测,以提取的拟南芥中总蛋白为正对照(PC),提取的野生型烟草中总蛋白为负对照(WT);D图:提取5号和6号转基因烟草的线粒体和细胞质蛋白进行SHMT蛋白的定位分析;图中1~6为抗生素筛选的转基因烟草;
图8为本发明中 SHMT基因和FDH基因在过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草中整合情况的检测;其中A图:SHMT基因在转基因烟草基因组中整合情况检测;B图:SHMT基因在转基因烟草中转录水平检测;C图:FDH蛋白在转基因烟草中表达水平检测;D图:FDH基因在转基因烟草中转录水平检测;图中1~7为双抗素筛选的转基因烟草;
图9为本发明中 SHMT基因和FDH基因在过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草中表达水平和定位的检测;其中A图:FDH基因在转基因烟草中表达水平检测;B图:FDH基因在转基因烟草中表达水平检测;C图:SHMT蛋白定位于细胞质、线粒体;FDH蛋白定位于叶绿体;图中6~8为双抗素筛选的转基因烟草;
图10为本发明中WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草在2mM甲醛处理时溶液中剩余HCHO含量百分比及叶片吸收液体HCHO曲线;其中A图:2mM溶液中剩余HCHO含量占起始HCHO含量的百分比,CK空白对照为未放入任何植物叶片的2mM HCHO溶液用于监测HCHO的挥发;B图:2mM植物净吸收HCHO量占起始HCHO含量的百分比;
图11为本发明中WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草在4mM甲醛处理时溶液中剩余HCHO含量百分比及叶片吸收液体HCHO曲线;其中A图:4mM溶液中剩余HCHO含量占起始HCHO含量的百分比,CK空白对照为未放入任何植物叶片的4mM HCHO溶液用于监测HCHO的挥发;B图:4mM植物净吸收HCHO量占起始HCHO含量的百分比;
图12为本发明中WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草在6mM甲醛处理时溶液中剩余HCHO含量百分比及叶片吸收液体HCHO曲线;其中A图:6mM溶液中剩余HCHO含量占起始HCHO含量的百分比,CK空白对照为未放入任何植物叶片的6mM HCHO溶液用于监测HCHO的挥发;B图:6mM植物净吸收HCHO量占起始HCHO含量的百分比;
图13为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素a含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素a含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素a含量;WT为野生型烟草;
图14为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素b含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素b含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中叶绿素b含量;WT为野生型烟草;
图15为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中总叶绿素含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中总叶绿素含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中总叶绿素含量;WT为野生型烟草;
图16为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总糖含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总糖含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总糖含量;WT为野生型烟草;
图17为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总蛋白含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总蛋白含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中可溶性总蛋白含量;WT为野生型烟草;
图18为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中H2O2含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中H2O2含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中H2O2含量;WT为野生型烟草;
图19为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中MDA含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中MDA含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中MDA含量;WT为野生型烟草;
图20为本发明中液体HCHO胁迫下WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中PC含量变化情况;其中A图:2mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中PC含量;B图:6mM HCHO溶液处理0h和48h时WT、SHMTSHMT/FDH转基因烟草叶片中PC含量;WT为野生型烟草。
具体实施方式
试剂与仪器:
试剂主要分为分子生物学实验试剂、植物遗传转化所需的培养基以及转基因植物鉴定和检测所需的各种试剂;各种限制性内切酶、Taq DNA聚合酶、反转录酶、RNA酶抑制剂、dNTP、质粒提取试剂盒等为宝生物工程有限公司(大连)产品,TRIzoL Reagent RNA提取试剂盒、Gateway LR clonase Enzyme Mix kit购自Invitrogen公司;其余试剂均为国产分析纯。
仪器均为分子生物学以及基因工程实验室常用仪器。
所有引物序列均在大连宝生物公司合成。
本发明实施例中所用方法如无特别说明均为常规方法。
实施例1:SHMT/FDH基因cDNA的PCR扩增及TA克隆
用TRIzoL Reagent(Invitrogen)从拟南芥(Arabidopsis thaliana)幼苗中提取总RNA,取植物嫩叶约0.1g,加入1ml的TRIzoL提取液在研钵中研磨,室温静置5min后移入离心管,再加入0.2ml氯仿,振荡混匀,离心15min(12000rpm),转移上清液至新管,加入0.5ml异丙醇,混匀室温放置10min,4℃离心10min(12000rpm),弃上清,沉淀用75%乙醇1ml清洗,4℃离心5min(7500rpm),弃乙醇真空干燥沉淀或自然晾干,用20μl焦碳酸二乙酯(DEPC)处理水溶解RNA。使用M-MuLV Reverse Transcriptase Kit(TaKaRa)进行cDNA的合成,取植物总RNA约0.1μg-5μg,oligo(dT) 50ng,10mM dNTP mix 1μl,用DEPC处理水补足至10μl,混匀后,短暂离心将之收集于管底,置于65℃加热5min,冰浴10min,加入反应混合物9μl(5×reaction buffer 4μl,25mM MgCl2 4μl,0.1M DTT 2μl,RNA酶抑制剂1μl),将上述混合物混匀,短暂离心将之收集于管底,25℃保温2min,加入1μl M-MuLV ReverseTranscriptase,将上述混合物混匀,短暂离心将之收集于管底,25℃保温20min,然后42℃保温70min,合成cDNA。
从GenBank中查找拟南芥SHMT基因的cDNA序列(1554bp),并设计序列如下的一对引物:上游引物 5' CACCGCATGCCGATGGCCATGGCTCTTC 3'(含有SphI位点);下游引物 5'CTCGAGTTAGTTCTTGTACTTCATG 3'(含有XhoI位点);从GenBank中查找拟南芥FDH基因的cDNA序列(1155bp),并设计序列如下的一对引物:上游引物 5'GCATGCATGGCGATGAGACAAGCCGCTAAGG 3'(含有SphI位点);下游引物 5'CTCGAGTTACCGGTACTGAGGAGCAAGTTCA 3'(含有XhoI位点)
以cDNA为模板,用SHMT基因cDNA上下游特异性引物进行PCR,扩增得到SHMT的全长cDNA 1554bp。回收并纯化SHMT全长基因片段,并将其连接到pMD-19T (大连宝生物公司)载体上(图1),转化大肠杆菌感受态DH5α(天根生化科技),采用碱裂解法提取质粒DNA,经1%琼脂糖凝胶电泳,选取大小和理论值相符的重组质粒做进一步的PCR检测和双酶切检测。以重组质粒为模板,用引物5'和3'引物扩增得到1554bp的PCR产物。根据阳性重组质粒pMD19-SHMT载体两端的多克隆位点,用EcoR I单酶切重组质粒,经1%琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,连接成功的重组质粒pMD19-SHMT单酶切产物理论上为2.7kb和1.6kb左右的条带。
FDH基因以同样的方式进行cDNA的扩增与TA克隆(图4),连接成功的重组质粒pMD19T-FDH单酶切产物理论上为2.7kb和1.2kb左右的条带。
实施例2:构建入门载体pENTR-PrbcS-SHMT与pENTR-PrbcS-T*-FDH
SphI和XhoI双酶切pMD19-SHMT和pENTR-PrbcS-ADH,通过琼脂糖凝胶电泳分离已切开的载体和插入片段,分别回收pMD19-SHMT被切割后产生的SHMT基因的cDNA片段(1.6kb)和pENTR-PrbcS-ADH被切割后产生的载体片段pENTR-PrbcS,然后用宝生物(TaKaRa)的连接酶试剂盒连接pENTR-PrbcS和SHMT基因的cDNA片断产生入门载体pENTR-PrbcS- SHMT(图2)。用连接反应混合物转化高效率(108)的大肠杆菌感受态细胞(DH5α,购自天根生化科技公司),把转化好的大肠杆菌涂于加有卡那霉素(Km,50μg/ml)的平板上,于37℃过夜培养,筛选Km抗性重组子菌落,从Km抗性重组子菌落中提取质粒,选出连接成功的质粒载体pENTR-PrbcS-SHMT。以pENTR-PrbcS-SHMT为模板,利用SHMT基因上下游引物进行PCR扩增,扩增结果得到约1.6kb左右的条带。用SphI(Takara)和Xho I(Takara)双酶切检测,连接成功的质粒在琼脂糖凝胶电泳图上只产生两条带,分别为约4.7kb和1.6kb。确认是连接成功的质粒后,重新转化大肠杆菌DH5α,挑单个菌落进行液体培养,用试剂盒纯化质粒pENTR-PrbcS-SHMT
FDH基因以同样的方式构建入门载体pENTR-PrbcS-T*-FDH(图5),SphI(Takara)和Xho I(Takara)双酶切检测,连接成功的质粒在琼脂糖凝胶电泳图上只产生两条带,分别为约4.7kb和1.2kb
实施例3:构建植物表达载体pK2-PrbcS-SHMT和pH2-PrbcS-T*-FDH
通过Gateway技术的LR反应把SHMT亚克隆到植物表达载体pK2GW7中(图3)。用质粒抽提试剂盒纯化Gateway的目的载体pK2GW7,在Gateway的LR反应体系中加pENTR-PrbcS-SHMT和pK2GW7各150ng,1μl LR Clonase II Enzyme Mix (Invitrogen),混均于25℃反应过夜,通过整合酶作用把SHMT整合到pK2GW7中获得SHMT的植物表达载体质粒pK2-PrbcS-SHMT。反应混合物用于转化高效率(108)大肠杆菌感受态细胞(DH5α,购自天根生化科技公司),把转化好的大肠杆菌涂于加有壮观霉素(Spe,50μg/ml)的平板上,37℃过夜培养,筛选Spe抗性重组子菌落。从Spe抗性重组子菌落中提取质粒,选出大小和对照质粒pK2GW7相似的整合成功的质粒pK2-PrbcS- SHMT进行PCR检测,以pENTR-PrbcS-SHMT为正对照模板,pK2GW7为负对照模板。pK2-PrbcS-SHMT和pENTR-PrbcS-SHMT扩增产物均出现约1.6kb的条带,负对照没有扩增产物。进一步用酶切验证重组质粒的正确性,用SphI和XhoI酶切检测pK2-PrbcS-SHMT,酶切结果得到4.7kb和1.6kb左右的两条带。确认是整合成功的质粒后,重新转化大肠杆菌DH5α,挑单个菌落进行液体培养,用试剂盒纯化质粒。pK2GW7携带的筛选标记基因为卡那霉素抗性基因(Km),这样可用加有卡那霉素的平板筛选转基因植物。
FDH基因以同样的方式构建植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH(图6),用SphI和XhoI酶切检测pH2-PrbcS-T*-FDH,酶切结果得到4.7kb和1.2kb左右的两条带。确认是整合成功的质粒后,重新转化大肠杆菌DH5α,挑单个菌落进行液体培养,用试剂盒纯化质粒。pH2GW7携带的筛选标记基因为潮霉素抗性基因(Hyg),这样可用加有潮霉素的平板筛选转基因植物。
实施例4:用植物表达载体转化农杆菌
制备农杆菌的感受态细胞,用电脉冲法将上述构建好的植物表达载体pK2-PrbcS-SHMT转入农杆菌(Agrobacterium tumefaciens C58C1,pMP90)中,在加有壮观霉素的平板上筛选转化子。取少量质粒加入农杆菌感受态细胞中,轻轻混匀;将混合物加入到预冷的电转化杯中,轻轻敲击杯身使混和液落至杯底;将电转化杯置于电转化仪(BIO-RAD)滑槽中,用1mm的电击杯和200欧姆,2.5kV/0.2cm的参数进行电击,电击后立即取出电转化杯,迅速加入0.5mlSOC培养基,混匀,转移到1.5ml的离心管中;28℃, 200rpm摇床培养3-5h;室温下,7500rpm离心1min,弃大部分上清,保留100ml将细胞悬浮;把农杆菌涂布于有壮观霉素(Spe,50mg/ml)的LB固体培养基上,28℃培养2天获得单菌落;首先用牙签挑取农杆菌菌落放入20μl ddH2O中,98℃处理5分钟后取出10μl农杆菌裂解液作为PCR反应的模板。PCR检测pK2-PrbcS- SHMT转化结果,正对照扩增体系模板使用pENTR-PrbcS-SHMT质粒,负对照使用pK2GW7质粒,扩增片断理论长度约为1.6kb,PCR产物经电泳分析显示其片段大小与理论预测值相符,表明质粒已转入农杆菌。
以同样的方法将FDH的植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH转入农杆菌(Agrobacterium tumefaciens C58C1,pMP90)中并检验质粒是否成功转入农杆菌,扩增片断理论长度约为1.2kb。
实施例5:用含有植物表达载体的农杆菌转化烟草
挑取携带有质粒pK2-PrbcS-SHMT的农杆菌单菌落接种于50ml的LB培养基中(含Spe,100μg/ml),180rpm,28℃培养24h,待菌液OD600至1.0左右,离心10min(3000rpm),沉淀菌体。再用10ml左右的MS液体培养基悬浮,离心10min(3000rpm),沉淀菌体。重复以上操作2~3次。最后加入一定体积的MS液体培养基重悬浮,使菌体的OD600值为0.5。制备烟草(Nicotiana tabacum cv.Xanthi)的无菌苗,通过农杆菌介导,用叶盘法转化烟草,然后通过组织培养获得小苗,进一步筛选获得所需的转基因植物。把无菌烟草的叶片切成小片叶盘,在制备好的农杆菌菌液中浸染15~20min,用无菌吸水纸吸干后,平铺于愈伤组织诱导培养基MS1(MS+NAA02.1μg/ml+BAP 0.02μg/ml)上黑暗共培养2天,将外植体转移至含卡那霉素(50μg/ml)的芽诱导培养基MS4(MS+NAA0.53μg/ml+BAP0.5μg/ml)上进行芽的诱导,约15天继代一次。待有芽生成后,转入含卡那霉素(50μg/ml)的MS培养基上进行根的诱导。
以同样的方法用含有FDH植物表达载体pH2-PrbcS-T*-FDH的农杆菌转化进入已经检测正确的过量表达拟南芥SHMT基因烟草中。转化完成后的叶盘置于25℃恒定光照(100μmol∙m-2∙s-1)下进行培养,转基因小苗需在含有卡那霉素(Km,50μg/ml)和潮霉素(Hyg,20μg/ml)的双抗培养基上进行筛选,所得的再生苗中就有过量表达拟南芥SHMT/FDH烟草。
实施例6:SHMTSHMT/FDH基因在转基因烟草中插入情况及表达水平的检测
为了确认通过卡那霉素筛选的转基因烟草株系确实含有导入的目的基因DNA片段,用PCR方法对筛选到的转基因烟草作进一步的鉴定。首先采用CTAB法提取植物基因组:称取植物叶片100mg左右置于1.5ml离心管中,加液氮用特制研棒研磨至粉末状;加入900μl预热到65℃的2×CTAB缓冲液(Tris-HCl pH 7.5 100mM,EDTA 20mM,NaCl 1.4M,CTAB 2%),65℃度水浴加热20分钟后取出冷却;加入500μl氯仿-异戊醇混合液(24:1)摇匀,4℃离心10min(7500rpm)后转移上清至1.5ml EP管;再次加入500μl氯仿-异戊醇混合液(24:1)摇匀,4℃离心10min(7500rpm);取出上清置于新的EP管中,加入1/10体积3M pH5.2 醋酸钠和等体积异丙醇,摇匀后4℃离心20min(12000rpm);弃上清,用75%乙醇清洗两次后,干燥,用含RNase的TE缓冲液溶解并降解RNA,获得的基因组DNA样品。以转SHMT烟草抗性苗基因组作为模板,用SHMT基因上下游引物进行PCR扩增检测SHMT是否插入烟草基因组。扩增产物大小约为1.6kb,和预期推测一致,说明目的基因均已插入这些转基因株系的基因组,野生型烟草基因组PCR产物未出现目标条带(图7A)。
为了考察目的基因在转基因烟草株系中的转录情况,从转基因植物中抽取总RNA,反转录成cDNA后用于RT-PCR分析,检测SHMT基因在转基因植物中的转录水平。采用TRIzoLReagent(Invitrogen)提取RNA,取植物嫩叶约0.1g,加入1ml的TRIzoL提取液在研钵中研磨,室温静置5min后移入离心管,再加入0.2ml氯仿,振荡混匀,离心15min(12000rpm),转移上清液至新管,加入0.5ml异丙醇,混匀室温放置10min,4℃离心10min(12000rpm),弃上清,沉淀用75%乙醇1ml清洗,4℃离心5min(7500rpm),弃乙醇真空干燥沉淀或自然晾干,用20μl焦碳酸二乙酯(DEPC)处理水溶解RNA。所获得的RNA样品用凝胶电泳检测质量和浓度。使用Reverse Transcriptase进行cDNA的合成,取植物总RNA约0.1μg-5μg,oligo(dT) 50ng,10mM dNTP mix 1μl,用DEPC处理水补足至10μl,混匀后,短暂离心将之收集于管底,置于65℃加热5min,冰浴10min,加入反应混合物9μl(5×reaction buffer 4μl,25mM MgCl2 4μl,0.1M DTT 2μl,RNA酶抑制剂1μl),将上述混合物混匀,短暂离心将之收集于管底,25℃保温2min,加入1μl M-MuLV Reverse Transcriptase,将上述混合物混匀,短暂离心将之收集于管底,25℃保温20min,然后42℃保温70min,合成cDNA。以cDNA为模板,用SHMT基因的上下游引物进行RT-PCR分析,考察转基因烟草中是否有目的基因的转录物。结果证明转基因烟草植株均有目的基因的转录物,而野生型的烟草则没有,说明目的基因SHMT已在转基因烟草中正常转录(图7B)。
为了检测目的基因SHMT编码的蛋白在烟草中是否表达,选取经RT-PCR检测正确的转基因株系的嫩叶,提取总蛋白进行Western分析。一抗为SHMT的蛋白抗体。根据SHMT基因的核酸序列推测表达的蛋白大小约为57.2kD,Western分析结果说明检测到的蛋白质条带大小与理论预测值相符,说明SHMT编码的蛋白在烟草中已成功表达(图7C),定为分析为线粒体蛋白与细胞质蛋白(图7D)。
以同样的方法检测SHMT/FDH双表达转基因烟草中SHMTFDH基因的插入情况(图8A、C)及表达水平(图8B、D),SHMTFDH基因理论扩增产物大小分别约1.6kb和1.2kb,蛋白大小分别约为57.2和42.1(图9)。
实施例7:转基因烟草对液体甲醛吸收能力的测定
甲醛可与Nash试剂(醋酸氨:15%,冰醋酸:0.3%,乙酰丙酮:0.2%)发生化学反应产生有颜色的物质,该物质的最大吸收波长为410nm,因此可以制备标准曲线,根据HCHO-Nash标准曲线即可计算出反应液中甲醛的含量,利用该方法可以测定植物对甲醛的吸收速率。
为了检测过表达拟南芥SHMT基因和双表达拟南芥SHMT/FDH基因后对烟草吸收液体HCHO能力的影响,我们分别称取3g野生型和两种转基因烟草小苗叶片,然后分别加入100mL的HCHO处理液2mM(2 mmol L-1, 5 mmol L-1 KHCO3 和 0.1%MES),4 mM(4 mmol L-1, 5mmol L-1 KHCO3 和 0.1%MES),6 mM(6 mmol L-1, 5 mmol L-1 KHCO3 和 0.1%MES)。同时以只含同样处理液的培养瓶(透气孔封死)作为对照,检测HCHO的挥发程度。所有样品均在25℃条件下持续光照并振荡培养(100 μmol∙m-2∙s-1/80 rpm)。在6、12、18、24、30、36、42、48h分别取50μl处理液,加Nash试剂450ml,再加水500ml于30℃水浴30min,测定OD410,再根据标准曲线计算出处理液残存甲醛浓度,及叶片吸收甲醛百分比。结果表明在烟草中过量表达拟南芥的SHMT基因和双表达拟南芥SHMT/FDH基因增强了烟草对液体HCHO的吸收速率,而且过量表达拟南芥SHMT/FDH双基因的烟草对HCHO的吸收能力更强(图10、11、12)。
实施例8:转基因烟草对甲醛的抗性检测
(1)叶绿素含量的测定:HCHO溶液处理烟草叶片结束后用预冷无菌蒸馏水冲洗叶片4~5次,纸巾吸干叶片表面残留的蒸馏水,95%乙醇提取叶绿素,紫外分光光度法测定665nm和649nm处的光吸收值A665和A649,根据下述公式计算得到叶绿素a、叶绿素b和总叶绿素的含量(图13、14、15)。其中叶绿素a(Ca(mg/L))=13.95×A665-6.88×A649;叶绿素b(Cb(mg/L))=24.96×A649-7.32×A665;总叶绿素浓度C(a+b)=Ca+Cb。叶绿素含量(mg/gF.W.)=(色素浓度×提取液体积×稀释倍数)/(样品鲜重×1000)。
(2)取HCHO处理后的叶片0.5 g用植物蛋白提取液(50 mM This-HCl、10%甘油、10mMβ-巯基乙醇、1 mM PMSF、2 mM EDTA、10%不溶性PVP)进行抽提,所获得的抽提液可用于可溶性总蛋白含量的测定及分析。可溶性总糖含量采用蒽酮比色法测定:分别吸取葡萄糖溶液(0.4μg/μl)0、40、80、120、160、200μl,为了让终体积达到200 μl,每个体系中另加入ddH2O补足,至此可溶性糖含量可分别达到0、16、32、48、64、80μg。向每管加入1 ml蒽酮,待混合反应后,放入沸水浴中加热10 min,冰上迅速冷却后,分光光度计测625 nm处光吸收值,记OD625,制作的标准曲线回归方程为y=41.077x+0.0331(其中x:OD625,y:可溶性糖的浓度(mg/ml),R2=0.9957),之后开始配制样品的反应体系(20μL抽提液+180μL ddH2O+1ml蒽酮),同样读取625nm处的光吸收值OD625,套入标准曲线公式中,计算出可溶性总糖含量(图16)。采用Bradford法测定可溶性蛋白含量:取2μl蛋白的抽提液加入800μL H2O、200μLBradford solution混合均匀后,在室温放置2min,用分光光度计读取595nm处的光吸收值OD595,代入标准曲线y=32.594x-0.224(其中x:OD595,y:蛋白含量(μg),R2=0.9995),计算出蛋白的含量。根据上样量计算可溶性总蛋白含量(图17)。
(3)取HCHO处理后的叶片0.5 g用液氮速冻后充分研磨,This-HCl缓冲液(1 mol/L,pH 7.5)充分抽提,抽提液可用于可溶性糖以及各项氧化胁迫相关生理指标的测定及分析。过氧化氢(H2O2)的含量的测定我们采用二甲酚橙法。用MiliQ水来配制试剂A(3.3mMFeSO4,3.3mM (NH4)2SO4,412.5mM H2SO4)与试剂B(165μM二甲酚橙,165mM山梨醇)。使用前需将试剂A与试剂B按照1:10的比例混合后成为工作试剂。此工作试剂和H2O2待测液按照2:1的比例混合后,水浴30℃显色30min后,测定其560nm处光吸收值OD560,参照标准曲线y=0.1734x-0.0055(x:H2O2浓度(mg/mL),y:OD560,R2=0.9995)计算H2O2含量(图18)。丙二醛(MDA)含量采用硫代巴比妥酸法来测定。在0.4mL含有0.6% TBA(硫代巴比妥酸)20% TCA(三氯乙酸)的溶液中加入0.4mL抽提液,沸水浴15min后即刻置于冰上冷却。(12000 rpm/10min),读上清液的光吸收值OD532和OD450。代入公式中:MDA浓度(μmol·L-1)= 6.45∙OD532-0.56∙OD450从而计算 MDA的浓度(图19)。羰基化蛋白(PC)的含量的测定,我们采用2,4-二硝基苯肼(DNPH)法。将0.1 mL样品抽提液与0.4mL 10mM的DNPH的溶液混合后,黑暗处反应1h,其间每隔10 min摇一次,后加入0.5mL 的20% TCA溶液用来沉淀蛋白,(12000 rpm /15min),后弃上清。沉淀用1 mL乙酸/乙酸乙酯混合液(乙酸:乙酸乙酯=1:1,V/V)洗三次,后加入盐酸胍(1.25mL 6M)充分的溶解沉淀,金属浴(37℃15 min)后测定370nm处的光吸收值OD370。PC浓度(mol/L)=(测定管吸光度-空白管吸光度)×(稀释体积)/22(22为PC毫摩尔消光系数)(图20)。
序列表
<110> 昆明理工大学
<120> 拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶基因与甲酸脱氢酶基因的双表达应用
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
caccgcatgc cgatggccat ggctcttc 28
<210> 2
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
ctcgagttag ttcttgtact tcatg 25
<210> 3
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
gcatgcatgg cgatgagaca agccgctaag g 31
<210> 4
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
ctcgagttac cggtactgag gagcaagttc a 31

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1.拟南芥丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因的植物表达载体与甲酸脱氢酶FDH基因的植物表达载体在制备吸收甲醛能力增强的双表达转基因植物中的应用,其中丝氨酸羟甲基转移酶SHMT基因的GenBank登录号为6899944,甲酸脱氢酶FDH基因的GenBank登录号为6625952。
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