CN103597074A - 成纤维细胞生长因子受体4表达的反义调节 - Google Patents

成纤维细胞生长因子受体4表达的反义调节 Download PDF

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Abstract

本文提供了用于在动物中降低成纤维细胞生长因子受体4(FGFR4)mRNA和蛋白质的表达的方法、化合物和组合物。所述方法、化合物和组合物用于治疗、预防、延迟或改善代谢性疾病或其症状。

Description

成纤维细胞生长因子受体4表达的反义调节
序列表
本发明与电子格式的序列表一同提交。序列表以于2012年6月15日创建的命名为BIOL0157WOSEQ.txt的文件来提供，其大小为144Kb。序列表的电子格式中的信息以其整体通过引用并入本文。
领域
本文提供了在动物中降低成纤维细胞生长因子受体4（FGFR4）mRNA和蛋白的表达的方法、化合物和组合物。所述方法、化合物和组合物用于，例如，治疗、预防、延迟或改善与代谢疾患相关联的疾病、尤其是与肥胖相关联的疾患。
背景
肥胖被认为是长期的代谢性疾病。有一些与肥胖相关的严重的医疗后遗症。世界范围中有10亿以上超重的人，其中有1亿是临床上肥胖的。据估计每年仅在美国治疗肥胖相关的疾病的增加的医疗费用在一千亿美元以上。目前治疗肥胖的方法包括行为改变、饮食、外科手术（胃成形术）、施用阻止食欲刺激信号或营养物（脂肪）的吸收的药剂，和增加产热或脂肪代谢的剂。这些方法中的一些具有缺点，原因在于其依赖于患者意志，是侵入性的，或具有不需要的副作用。对调控肥胖的机制的理解可能提供重要的治疗信息。
肥胖通常与胰岛素抗性相关且与其共同构成2型糖尿病和心血管疾病的晚期发展的风险因子。胰岛素抗性发生于2型糖尿病发生之前，且胰岛素被过量生产以补偿胰岛素抗性并维持正常葡萄糖水平。随之发生2型糖尿病，由于胰不能够再产生足够的胰岛素以维持正常葡萄糖水平。2型糖尿病的早期阶段与胰岛素的升高的水平相关联，但随疾病进展，胰可能不能产生胰岛素，导致升高的血糖水平。糖尿病是心脏病和中风的重要的风险因子，且是失明和晚期肾衰竭的首要原因。
糖尿病是以由于缺陷的胰岛素作用导致的高血糖为特征的疾病，该缺陷的胰岛素作用可能由降低的胰岛素产生或胰岛素抗性或两者而导致。糖尿病是影响世界中很大部分的人的多基因疾患。其被分为两种类型。在I型糖尿病，或胰岛素依赖型糖尿病（IDDM）中，患者产生极少或不产生调控葡萄糖利用的激素-胰岛素。在2型糖尿病或非胰岛素依赖型糖尿病（NIDDM）中，患者通常具有与非糖尿病人类相比较相同的血浆胰岛素水平；然而，这些患者在主要的胰岛素敏感型组织（即，肌肉、肝和脂肪组织）中已形成对葡萄糖和脂质代谢的胰岛素刺激作用的抗性，且血浆胰岛素水平不足以克服显著的胰岛素抗性。此外，由长期高血糖导致的葡萄糖毒性诱导组织依赖型胰岛素抗性（Nawano等,Am.J.Physiol.Endocrinol.Metab.,278,E535-543）加重疾病。2型糖尿病占所有糖尿病病例的90%以上。其为以高血糖为特征的代谢疾患，导致继发并发症诸如神经病、肾病、视网膜病、高甘油三酯血症、肥胖和通常被称为代谢综合征的其它心血管疾病。
代谢综合征是增加其心血管疾病和糖尿病的风险的医学疾患的组合。该综合征，包括高血压、高甘油三酯、降低的HDL和肥胖，在一些个体中易于共同出现。代谢综合征以多种其它的名称来称谓，例如（代谢）综合征X、胰岛素抗性综合征或雷文综合征(Reaven'ssyndrome)。
糖尿病和肥胖（现在有时总称为“糖胖症（diabesity）”）是互相关连的，因为已知肥胖加重糖尿病的病状且60%以上的糖尿病患者是肥胖的。大部分的人类肥胖与胰岛素抗性和来普汀抗性相关联。事实上，已提出肥胖可能比糖尿病本身对胰岛素作用具有更大的影响（Sindelka等,Physiol Res.,51,85-91）。此外，已知市场上的用于治疗糖尿病的一些化合物诱导体重增加，这是该疾病的治疗的非常不希望的副作用。因此，具有治疗糖尿病和肥胖二者的潜力的化合物将提供超越目前治疗的显著的改进。
成纤维细胞生长因子受体4（也称作FGF受体-4，TKF；成纤维细胞生长因子受体相关的酪氨酸激酶；羟基芳基蛋白激酶；酪氨酰蛋白激酶；Fgfr4；FGFR-4；FGFR4；CD334、FGFR4_HUMAN和JTK2）对酸性和/或碱性的成纤维细胞生长因子具有高亲和力（Armstrong等,Genes Chromosomes Cancer,4,94-98）。
虽然已显示FGFR通常在整个身体中广泛分布，目前为止，仅在几个组织中发现FGFR4。在所测试的包括人类淋巴细胞和巨噬细胞的多种细胞和组织中，发现FGFR4在肺中和在肺起源的一些肿瘤中以及非来源于肺组织的恶性肿瘤中表达。（Holtrich等,Proc.Nat.Acad.Sci.,.88,10411-10415）。已发现FGFR4在肝中和在脂肪组织中表达（Patel等,JCEM,90(2),1226–1232）。还已发现FGFR4在某些癌细胞系中表达（Bange等,Cancer Res.,62,840-847）。
此外，已显示FGFR4在系统脂类和葡萄糖内环境稳定中具有作用。正常饮食的FGFR4缺陷的小鼠表现出了代谢综合征的特征，包括胰岛素抗性的增加的量，以及高胆固醇血症。在某些肥胖小鼠模型中FGFR4缺陷显示减轻了高脂肪饮食诱导的脂肪肝，其也是与代谢综合征的关联。FGFR4的恢复，尤其在FGFR4缺陷的小鼠的肝细胞中，降低了血浆脂质水平并重建了高脂肪饮食诱导的脂肪肝，但无法恢复葡萄糖耐受和对胰岛素的敏感性（Huang等,Diabetes,56,2501-2510）。
FGFR4的反义抑制提供了超越传统小分子抑制剂的独特的优点，原因在于反义抑制剂不依赖于化合物对蛋白的竞争性结合并通过直接降低FGFR4的表达抑制活性。教导FGFR4翻译抑制剂的代表性美国专利包括美国专利公开第US2010/0292140号，其以其整体通过引用并入本文。反义技术作为降低某些基因产物的表达的有效的方式而出现，且可能因此证明为特别有用于调节FGFR4的大量治疗、诊断和研究应用。
目前缺少用于治疗代谢疾患的可接受的选择。因此本文的目的是提供用于治疗此类疾病和疾患的化合物和方法。本发明涉及FGFR4基因表达的新颖的、高效力的抑制剂的发现。
本申请中引用的所有文献或文献的部分，包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍和论文，关于本文所讨论的文献的部分及其整体通过引用清楚地并入本文。
概述
本文提供的是用于调节FGFR4的表达和治疗、预防、延迟或改善与代谢疾患相关联的疾病、尤其是与肥胖和/或其症状相关联的疾患的方法、化合物和组合物。
详述
应理解的是，如权利要求所称，上述一般说明和以下的详细描述在本文中仅是示例性的和阐释性的并非限制性的描述。在本文中，除非另外指明，单数的使用包括复数。如本文所用，除非另外指明，“或”的使用意味着“和/或”。此外，术语“包括（including）”以及其它形式，例如“包括（includes）”和“包括（included）”，是非限制性的。同样，除非另外特别指明，术语诸如“元素”或“组分”包括含一个单位的元素和组分，和含一个以上子单位的元素和组分。
本文所用的章节标题仅用于组织的目的，并不被解释为限制所描述的主题物质。该申请中所引用的所有文献或文献的部分，包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍和论文，关于本文所讨论的文献的部分及其整体通过引用清楚地并入本文。
定义
除非提供特定的定义，关于本文所描述的分析化学、合成有机化学和医药化学所用的名称及其程序和技术是本领域中熟知和常用的那些。标准计算可用于化学合成和化学分析。其中允许的是，本申请中所引用的所有文献，或文献的部分，包括但不限于所有专利、申请、公开的申请或其它期刊出版物，GENBANK登录号和通过诸如美国国立生物技术信息中心（NCBI）的数据库可获得的相关的序列信息和贯穿本文的公开内容中提及的其它数据，关于本文所讨论的文献的部分及其整体通过引用并入。
除非另外指明，以下的术语具有下面的含义：
“2’-O-甲氧乙基”（也为2’-MOE和2’-O(CH2)2-OCH3）指岩藻糖基环的2’位置的O-甲氧基-乙基修饰。2’-O-甲氧基乙基修饰的糖是修饰的糖。
“2’-O-甲氧乙基核苷酸”意为含2’-O-甲氧乙基修饰的糖部分的核苷酸。
“3’靶位”指与特定的反义化合物的3’-大部分核苷酸互补的靶核酸的核苷酸。
“5’靶位”指与特定的反义化合物的5’-大部分核苷酸互补的靶核酸的核苷酸。
“5-甲基胞嘧啶”意为具有与5’位置连接的甲基修饰的胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶是修饰的核碱基。
“约”意为值的±10%之内。例如，若称，“可将标志物增加约50%”，其含义为可将标志物增加45%-55%之间。
“活性药剂”意为药物组合物中当被施用于个体时提供治疗益处的物质。例如，在某些实施方案中，靶向FGFR4的反义寡核苷酸是活性药剂。
“活性靶区域”或“靶区域”意为一种或多种活性反义化合物所靶向的区域。“活性反义化合物”意为降低靶核酸水平或蛋白水平的反义化合物。
“脂肪形成”意为来自前成脂肪细胞的脂肪细胞的形成。“脂肪生成”意为脂肪的产生或形成，无论是脂肪变性或脂肪浸润。
“脂肪组织”或“体脂”或“脂肪库”是由脂肪细胞组成的疏松结缔组织。存在脂肪组织的两种类型：白色脂肪组织（WAT）和棕色脂肪组织（BAT）。
“肥胖症（adiposity）”或“肥胖（obesity）”指肥胖或与去脂肪体重有关的过高的量的体脂或脂肪组织的状态。体脂的量包括整个身体中脂肪的分布和脂肪组织存储的体积和量二者的考虑。体脂分布可通过皮肤褶测量、腰臀圆周比率或诸如超声、计算机断层摄影术或磁共振成像的技术来评估。根据疾病控制和预防中心，具有30或更高的体重指数（BMI）的个体被认为是肥胖的。如本文所用，术语“肥胖”包括其中由于体内脂肪组织的过量积累导致的超出物理需求的体脂的增加的病症。术语“肥胖”包括但不限于以下的病症：成年型肥胖；饮食性肥胖；内源性或炎症性肥胖；内分泌性肥胖；家族性肥胖；胰岛功能亢进性肥胖；增生-肥大性肥胖；性腺功能减退性肥胖；甲状腺机能减退性肥胖；终身性肥胖；病理性肥胖和外源性肥胖。
“同时施用”指两种剂以任何方式的共施用，其中二者的药理作用在患者中同时显现。同时施用不需要两种剂在单一的药物组合物中、在相同的剂型中或通过相同的施用路径来施用。两种剂的作用不必同时显现。作用仅需要重叠一段时间且不必在时间上共同延长。
“施用”意为向动物提供剂，且包括但不限于通过医学专业人员和自行施用来施用。
“药剂”意为当被施用于动物时可提供治疗益处的活性物质。“第一药剂”意为本文提供的治疗化合物。例如，第一药剂可以是靶向FGFR4的反义寡核苷酸。“第二药剂”意为本文所描述的第二治疗化合物（例如，靶向FGFR4的第二反义寡核苷酸）和/或非FGFR4治疗化合物。
“改善”指相关的疾病、疾患或病症的至少一种指征、病征或症状的减轻。指征的严重度可通过主观的或客观的测量来确定，这对于本领域中的那些技术人员是已知的。
“动物”指人类或非人动物，包括但不限于小鼠、大鼠、兔、狗、猫、猪和非人灵长类，包括但不限于猴子和黑猩猩。
“反义活性”意为可归因于反义化合物与其靶核酸的杂交的任何可检测的或可测量的活性。在某些实施方案中，反义活性是靶核酸或由所述靶核酸编码的蛋白的量或表达的降低。
“反义化合物”意为能够经历通过氢键合与靶核酸杂交的低聚化合物。
“反义抑制”意为与在不存在反义化合物的情况下的靶核酸水平或靶蛋白水平相比较，在存在与靶核酸互补的反义化合物的情况下靶核酸水平或靶蛋白水平的降低。
“反义寡核苷酸”意为具有允许与靶核酸的对应区域或片段杂交的核碱基序列的单链寡核苷酸。
“双环糖”意为由两个非偕位环原子的桥连所修饰的岩藻糖基环。双环糖是修饰的糖。
“双环核酸”或“BNA”指核苷或核苷酸，其中核苷或核苷酸的呋喃糖部分包括连接呋喃糖环上的两个碳原子的桥，从而形成双环糖系统。
“生物标志物”意在指基因或蛋白或蛋白片段，其指示FGFR4抑制剂的作用。其意味着“生物标志物”被用作检测剂。
“帽子结构”或“末端帽子部分”意为已在反义化合物的任一末端被掺入的化学修饰。
“化学上不同的区域”指以某些方式在化学上不同于相同的反义化合物的另一区域的反义化合物的区域。例如，具有2’-O-甲氧基乙基核苷酸的区域在化学上不同于具有无2’-O-甲氧基乙基修饰的核苷酸的区域。
“嵌合反义化合物”意为具有至少两个化学上不同的区域的反义化合物。
“共施用”意为两种或多种药剂对个体的施用。两种或多种药剂可以在单一的药物组合物中，或可以在分离的药物组合物中。两种或多种药剂中每一种可通过相同的或不同的施用路径来施用。共施用包括平行施用或相继施用。
“胆固醇”是发现于所有动物组织的细胞膜中的固醇分子。胆固醇必定通过脂蛋白在动物血浆中转运，所述脂蛋白包括极低密度脂蛋白（VLDL）、中密度脂蛋白（IDL）、低密度脂蛋白（LDL）和高密度脂蛋白（HDL）。“血浆胆固醇”指血浆或血清中存在的酯化的和/或非酯化的胆固醇的所有脂蛋白（VDL、IDL、LDL、HDL）的总和。
“互补性”意为第一核酸和第二核酸的核碱基之间配对的能力。
“cET”或“被限制的乙基”意为包括连接4’-碳和2’-碳的桥连基的双环糖部分，其中桥连基具有式：4’-CH(CH3)-O-2’。
“被限制的乙基核苷”（也作cEt核苷）意为包括含4’-CH(CH3)-O-2’桥连基的双环糖部分的核苷。
“连续核碱基”意为相互紧密连接的核碱基。
“脱氧核苷酸”意为在核苷酸的糖部分的2’位置处具有氢的核苷酸。脱氧核苷酸可被多种取代基中的任一修饰。
“糖尿病（diabetes mellitus）”或“糖尿病（diabetes）”是以由于不足的胰岛素水平或降低的胰岛素敏感性导致的无序的代谢和异常高的血糖（高血糖）为特征的综合征。特征性症状为由于高血糖水平导致的过量的尿产生（多尿症），试图补偿增加的排尿的过度口渴和增加的液体摄取（烦渴），由于高血糖对眼睛光学的作用导致的视力模糊，原因不明的体重减轻和嗜睡症。
“糖尿病性血脂障碍”或“伴血脂障碍的2型糖尿病”意为以2型糖尿病、降低的HDL-C、升高的甘油三酯和升高的小的、致密的LDL颗粒为特征的病症。
“稀释剂”意为组合物中无药理学活性、但是制药必需的或需要的成分。例如，注射的组合物中的稀释剂可以是液体，例如，盐溶液。
“血脂障碍”指液体和/或脂蛋白代谢的疾患，包括液体和/或脂蛋白生产过剩或缺乏。血脂障碍可表现为液体注入胆固醇和甘油三酯和脂蛋白诸如低密度脂蛋白（LDL）胆固醇的升高。
“剂量单位”意为提供药剂的形式，例如，丸剂、片剂或本领域中已知的其它剂量单位。在某些实施方案中，剂量单位是包含冻干的反义寡核苷酸的管瓶。在某些实施方案中，剂量单位是包含重新配成的反义寡核苷酸的药瓶。
“剂量”意为在单一施用或在特定的时间段中提供的药剂的特定的量。在某些实施方案中，剂量可在一个、两个或更多个大丸剂、片剂或注射中施用。例如，在某些实施方案中，其中需要皮下施用，需要的剂量需要非单一注射所容易容纳的量，因此，可使用两个或更多个注射来实现需要的量。在某些实施方案中，药剂通过延长的时间段内的输注或连续地输注来施用。剂量可表示为每小时、每天、每周或每月药剂的量。
“有效量”或“治疗有效量”意为在需要剂的个体中足以实现需要的生理转归的活性剂的量。根据待治疗的个体的健康和身体状况、待治疗的个体的分类的组、组合物的组成、个体医疗条件的评估和其它相关因素的不同，个体中的有效量可不同。
“成纤维细胞生长因子受体4”或“FGFR4”意为FGFR4的任何核酸或蛋白。
“FGFR4表达”意为从编码FGFR4的基因转录的mRNA的水平或从mRNA翻译的蛋白的水平。FGFR4表达可通过诸如mRNA印迹或蛋白质印迹的领域已知方法来确定。
“FGFR4核酸”意为编码FGFR4的任何核酸。例如，在某些实施方案中，FGFR4核酸包括编码FGFR4的DNA序列、从编码FGFR4的DNA转录的RNA序列（包括含内含子和外显子的基因组DNA）和编码FGFR4的mRNA序列。“FGFR4mRNA”意为编码FGFR4蛋白的mRNA。
“完全互补”或“100%互补”意为第一核酸的核碱基序列的每个核碱基在第二核酸的第二核碱基序列中具有互补的核碱基。在某些实施方案中，第一核酸是反义化合物和靶核酸是第二核酸。
“间隙聚体(gapmer)”意为嵌合的反义化合物，其中具有支持RNase H裂解的多个核苷的内部区域位于具有一个或多个核苷的外部区域之间，其中构成内部区域的核苷在化学上不同于构成外部区域的核苷。内部区域可被称为“间隙区段”和外部区域可被称为“翼状区段”。
“间隙变宽”意为嵌合的反义化合物，其具有位于具有1至6个核苷的5’和3’翼状区段之间并与翼状区段紧邻的12个或更多个连续的2’-脱氧核苷的间隙区段。
“葡萄糖”是细胞用作能量的来源和炎性中间体的单糖。“血浆葡萄糖”指血浆中存在的葡萄糖。
“杂交”意为互补的核酸分子的复性。在某些实施方案中，互补的核酸分子包含反义化合物和靶核酸。
“高脂血症”或“高脂血”是以升高的血清脂质或循环（血浆）脂质为特征的病症。该病症表现为异常高的脂肪浓度。循环血液中的脂质级分是胆固醇、低密度脂蛋白、极低密度脂蛋白和甘油三酯。
“高甘油三酯血症”意为以升高的甘油三酯水平为特征的病症。
“鉴定”或“选择具有代谢性的动物”意为鉴定或选择已被诊断患有代谢性疾病或代谢性疾患的受试者，或鉴定或选择具有代谢性疾病的任何症状的受试者，包括但不限于代谢综合征、高血糖、高甘油三酯血症、高血压、升高的胰岛素抗性、降低的胰岛素敏感性、超正常的体重和/或超正常的体脂或其任何组合。此类鉴定可通过任何方法来实现，包括但不限于标准的临床测试或评估，例如测量血清或循环（血浆）血糖，测量血清或循环（血浆）甘油三酯，测量血压、测量体脂、测量体重和类似的方法。
“紧邻”意为在紧邻的元素之间不存在介入元素。
“个体”或“受试者”或“动物”意为选择用于治疗或疗法的人类或非人类动物。
“抑制表达或活性”指RNA或蛋白的表达或活性的降低或阻遏，且不必定指表达或活性的完全消除。
“胰岛素抗性”被定义为其中正常的胰岛素的量足以产生来自脂肪细胞、肌肉细胞和肝细胞的正常胰岛素应答。脂肪细胞中的胰岛素应答导致存储的甘油三酯的水解，其升高了血浆中的游离脂肪酸。肌肉中的胰岛素抗性降低了葡萄糖摄取，而肝中的胰岛素抗性减少了葡萄糖存储，二者均起作用以升高血糖。由于胰岛素抗性导致的胰岛素和葡萄糖的高血浆水平导致了代谢综合征和2型糖尿病。
“胰岛素敏感性”是个体有效地处理葡萄糖的程度的量度。具有高胰岛素敏感性的个体有效地处理葡萄糖而具有低胰岛素敏感性的个体不会有效地处理葡萄糖。
“核苷间键”指核苷之间的化学键。
“静脉内施用”意为到静脉内的施用。
“连接的核苷”意为化合在一起的邻接的核苷。
“脂质降低疗法”或“脂质降低剂”意为提供给受试者以在受试者中降低一种或多种脂质的治疗方案。在某些实施方案中，提供脂质降低疗法以在受试者中降低ApoB、总胆固醇、LDL-C、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、甘油三酯、小致密LDL颗粒和Lp(a)。脂质降低疗法的例子包括抑制素、贝特类(fibrates)和MTP抑制剂。
“主要风险因子”指导致特定的疾病或病症的高风险的因子。在某些实施方案中，冠心病的主要风险因子包括但不限于吸烟、高血压、低HDL-C、冠心病家族史、年龄和本文所公开的其它因子。
“代谢性疾病”或“代谢疾患”指以代谢功能的改变或失调为特征的病症。“代谢的”和“代谢”是本领域中熟知的术语且通常包括在生活有机体中发生的生物过程的全部范围。代谢性疾病或疾患包括但不限于肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
“代谢综合征”意为以代谢起源的脂质和非脂质心血管风险因子的簇集为特征的病症。在某些实施方案中，通过以下因子中的任何3个的存在来鉴定代谢综合征：男性中腰围大于102cm或女性中腰围大于88cm；至少150mg/dL的血清甘油三酯；男性中HDL-C小于40mg/dL或女性中小于50mg/dL；至少130/85mmHg的血压；和至少110mg/dL的空腹葡萄糖。这些决定因素可在临床实践中容易地测量（JAMA,2001,285:2486-2497）。
“错配”或“非互补性核碱基”指当第一核酸的核碱基不能够与第二核酸或靶核酸的对应的核碱基配对的情况。
“混合性血脂异常”意为以升高的胆固醇和升高的甘油三酯为特征的病症。
“修饰的核苷间键”指来自天然存在的核苷间键（即，磷酸二酯核苷间键）的取代或任何变化。
“修饰的核碱基”指除腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶外的任何核碱基。“未修饰的核碱基”意为嘌呤碱基腺嘌呤（A）和鸟嘌呤（G）和嘧啶碱基胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和尿嘧啶（U）。
“修饰的核苷”意为独立地具有修饰的糖部分或修饰的核碱基的核苷。
“修饰的核苷酸”意为独立地具有修饰的糖部分、修饰的核苷间键或修饰的核碱基的核苷酸。“修饰的核苷”意为独立地具有修饰的糖部分或修饰的核碱基的核苷。
“修饰的寡核苷酸”意为含至少一个修饰的核苷酸的寡核苷酸。
“修饰的糖”指自天然的糖的置换或改变。
“基序”意为反义化合物中化学上不同的区域的类型。
“天然存在的核苷间键”意为3’到5’磷酸二酯键。
“天然的糖部分”意为存在于DNA(2’-H)或RNA(2’-OH)中的糖。
“非酒精性脂肪肝病”或“NAFLD”意为以肝的脂肪炎症为特征的病症，其非过量酒精使用所导致（例如，超过20g/天的酒精消耗）。在某些实施方案中，NAFLD与胰岛素抗性和代谢综合征相关。NAFLD包括范围从肝细胞中的单纯甘油三酯积累（肝脂质沉着症）到具有炎症的肝脂质沉着症（脂肪性肝炎）、纤维变性和肝硬变的疾病范围。
“非酒精性脂肪性肝炎”（NASH）发生自超越甘油三酯的沉积的NAFLD的进展。“第二次击中”能够诱导NASH的发展所需的坏死、炎症和纤维化。第二次击中的候选者可分组为大类：导致氧化应激升高的因子和促进促炎症细胞因子的表达的因子。
“核酸”指构成单体核苷酸的分子。核酸包括核糖核酸（RNA）、脱氧核糖核酸（DNA）、单链核酸、双链核酸、小干扰核糖核酸（siRNA）和小RNA（miRNA）。核酸还可包括单一分子中的这些元素的组合。
“核碱基”意为能够与另一核酸的碱基配对的杂环部分。
“核碱基序列”意为不依赖于任何糖、连接或核碱基修饰的连续核碱基的顺序。
“核苷”意为与糖连接的核碱基。
“核苷模拟物”包括用于在寡聚化合物诸如例如具有吗啉代、环己烯基、环己基、四氢吡喃基、双环或三环糖模拟物，例如，非呋喃糖单元的核苷模拟物的一个或多个位置处替换糖或糖和碱基且不一定要替换键的那些结构。
“核苷酸”意为具有与核苷的糖部分共价连接的磷酸基的核苷。
“核苷酸模拟”包括用于在寡聚化合物诸如例如肽核酸或吗啉代（由-N(H)-C(=O)-O-或其它非磷酸二酯键连接的吗啉代）的一个或多个位置处替换核苷和键的那些结构。
“寡聚化合物”或“寡聚体”指包括两个或多个亚结构且能够与核酸分子的区域杂交的聚合结构。在某些实施方案中，寡聚化合物是寡核苷。在某些实施方案中，寡聚化合物是寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物是反义化合物。在某些实施方案中，寡聚化合物是反义寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物是嵌合的寡核苷酸。
“寡核苷酸”意为连接的核苷的聚合物，其每一个可以是修饰的或未修饰的，相互独立。
“胃肠外施用”意为通过注射或输注的施用。胃肠外施用包括皮下施用、静脉内施用、肌内施用、动脉内施用、腹膜内施用或颅内施用，例如，鞘内或脑室内施用。施用可以是连续的或长期的、或短期的或间歇的。
“肽”意为通过由酰胺键连接至少两个氨基酸形成的分子。肽指多肽和蛋白。
“药剂”意为当被施用于个体时提供治疗利益的物质。例如，在某些实施方案中，靶向FGFR4的反义寡核苷酸为药剂。
“药物组合物”意为适宜于施用于个体的物质的混合物。例如，药物组合物可包括一种或多种活性剂和无菌水溶液。
“药学上可接受的载体”意为不干扰寡核苷酸的结构的基质或稀释剂。此类载体中的某些使药物组合物被配制为，例如，片剂、丸剂、糖锭剂、液体、凝胶、糖浆、膏剂、悬浮液和锭剂以用于受试者口服摄入。例如，药学上可接受的载体可以是无菌水溶液。
“药学上可接受的衍生物”包括药学上可接受的盐、缀合物、前药或本文所描述的化合物的异构体。
“药学上可接受的盐”意为反义化合物的生理上或药学上可接受的盐，即，保留亲代寡核苷酸的需要的生物活性且不会另外赋予不需要的毒理学作用的盐。
“硫代磷酸酯键”意为核苷之间的键，其中磷酸二酯键通过用硫原子替代非桥连氧原子中之一而被修饰。硫代磷酸酯键是修饰的核苷间键。
“部分”意为核酸的限定数目的连续（即，连接的）核碱基。在某些实施方案中，部分是靶核酸的限定数目的连续核碱基。在某些实施方案中，部分是反义化合物的限定数目的连续核碱基。
“预防”指延迟或阻碍疾病、疾患或病症的发病或发展，持续几分钟到无限期的时间段。预防还意为降低发生疾病、疾患或病症的风险。
“前药”意为以无活性形式制备的治疗剂，其在体内或细胞中通过内源性酶或其它化学物品或条件的作用由此转化为活性形式。
“副作用”意为可归因于治疗的除需要的作用外的生理性应答。在某些实施方案中，副作用包括注射位点反应、肝功能测试异常、肾功能异常、肝毒性、肾毒性、中枢神经系统异常、肌病和不适。例如，血清中升高的转氨酶水平可指示肝毒性或肝功能异常。例如，升高的胆红素可指示肝毒性或肝功能异常。
“单链寡核苷酸”意为未与互补链杂交的寡核苷酸。
“可特异性杂交的”指在反义寡核苷酸和靶核酸之间具有足够程度的互补性以诱导需要的效应的反义化合物，而在其中需要特定的结合的条件下（即，体内测定和治疗性处理的情况中的生理条件下）对非靶核酸表现出极小的作用或无作用。
“抑制素”意为抑制HMG-CoA还原酶的活性的剂。
“皮下施用”意为仅在皮肤下面的施用。
“靶向”或“靶向的”意为将与靶核酸特异性杂交并诱导需要的效应的反义化合物的设计和选择的过程。
“靶核酸”、“靶RNA”和“靶RNA转录”均指能够由反义化合物来靶向的核酸。
“靶区段”意为反义化合物所靶向的靶核酸的核苷酸的序列。“5’靶位”指靶区段的5’-端核苷酸。“3’靶位”指靶区段的3’-端核苷酸。
“治疗有效量”意为向个体提供治疗益处的剂的量。
“治疗性生活方式改变”意为目的为降低脂肪/脂肪组织量和/或胆固醇的饮食和生活方式改变。此类改变可降低发生心脏病的风险，并可包括日总卡路里、总脂肪、饱和的脂肪、多不饱和脂肪、单不饱和脂肪、糖类、蛋白、胆固醇、不可溶性纤维的饮食摄入的建议，以及身体活动的建议。
“甘油三酯”或“TG”意为由与三个脂肪酸分子结合的甘油组成的脂质或中性脂肪。
“2型糖尿病”（也称作“2型糖尿病”或“糖尿病，2型”和以前被称作“糖尿病2型”、“非胰岛素依赖型糖尿病（NIDDM）”、“肥胖相关糖尿病”或“成人发作糖尿病”）是代谢性疾患，主要以胰岛素抗性、相关胰岛素缺陷和高血糖为特征。
“治疗”指向动物施用药物组合物以引起疾病、疾患或病症的改变或改善。
“未修饰的核苷酸”意为天然存在的核碱基、糖部分和核苷间键组成的核苷酸。在某些实施方案中，未修饰的核苷酸是RNA核苷酸（即，β-D-核糖核苷）或DNA核苷酸（即，β-D-脱氧核糖核苷）。
某些实施方案
某些实施方案提供了用于抑制FGFR4表达的方法、化合物和组合物。
某些实施方案提供了靶向FGFR4核酸的反义化合物。在某些实施方案中，FGFR4核酸是以下中列出的序列中的任一：GENBANK登录号NM_002011.3（作为SEQ ID NO:1并入本文），GENBANK登录号：NT_023133.11（从核苷第21323018位至第21335213位截短）（作为SEQ ID NO:2并入本文）；和GENBANK登录号AB209631.1（作为SEQ ID NO:3并入本文）；和GENBANK登录号NM_022963.2（作为SEQ ID NO:4并入本文）。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号NW_001121000.1（从核苷第3094000位至第3109000位截短）（SEQ ID NO:5）中所列的恒河猴序列。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号BC033313.1（SEQ ID NO:6）中所列的鼠类序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-6中任一者的等长部分互补的核碱基序列的12至30个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的12至30个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由12至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由12至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物是或包含ISISNO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由12至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由12至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，所述化合物或组合物是或包含ISIS NO:463588。
在某些实施方案中，所述化合物或组合物是或包含ISIS NO:463690。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的15至30个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由15至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由15至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物是或包含ISISNO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由15至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由15至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物是或包含ISISNO:463588。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物是或包含ISISNO:463690。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的18至21个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由18至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由18至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由18至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由18至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至35个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至30个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至30个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至25个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至24个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至24个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至24个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至24个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至24个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至23个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至23个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至23个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至23个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至23个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至22个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至22个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至22个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至22个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至22个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至21个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20至21个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20至21个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由具有与SEQ ID NO:1-4中任一者的等长部分互补的核碱基序列的20个核苷组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:7-322中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含修饰的寡核苷酸的盐。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物还包含药学上可接受的载体或稀释剂。
在某些实施方案中，如跨越修饰的寡核苷酸的整体所测量的，修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:1-4的任何一个至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补。
在某些实施方案中，如跨越修饰的寡核苷酸的整体所测量的，修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:7-322的任何一个具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
在某些实施方案中，如跨越修饰的寡核苷酸的整体所测量的，修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中的任何一个具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
在某些实施方案中，如跨越修饰的寡核苷酸的整体所测量的，修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:16的任何一个具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
在某些实施方案中，如跨越修饰的寡核苷酸的整体所测量的，修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:45的任何一个具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
在某些实施方案中，反义化合物或修饰的寡核苷酸靶向FGFR4核酸的区域。在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的区域的所述化合物或寡核苷酸具有与区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。例如，该部分可与本文所列的区域的等长部分互补的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，所述化合物或寡核苷酸靶向SEQ ID NO:1的以下核苷酸区域：第160-179位、第191-210位、第191-211位、第191-212位、第191-213位、第192-211位、第192-212位、第192-213位、第193-212位、第193-213位、第194-213位、第196-215位、第196-216位、第197-216位、第200-219位、第202-221位、第202-222位、第203-222位、第290-310位、第290-309位、第290-311位、第290-312位、第290-312位、第291-310位、第291-311位、第291-312位、第292-311位、第292-312位、第293-312位、第309-328位、第332-351位、第338-357位、第338-358位、第339-358位、第347-366位、第349-368位、第357-376位、第368-387位、第368-388位、第368-389位、第368-390位、第368-391位、第369-380位、第369-389位、第369-390位、第369-391位、第370-389位、第370-390位、第370-391位、第371-390位、第371-391位、第372-391位、第388-407位、第388-408位、第389-408位、第392-411位、第404-423位、第431-450位、第431-451位、第432-451位、第443-462位、第443-463位、第444-463位、第601-620位、第624-643位、第734-753位、第757-806位、第787-807位、第788-807位、第790-809位、第790-810位、第791-810位、第970-989位、第1024-1043位、第1024-1044位、第1024-1045位、第1024-1046位、第1024-1047位、第1024-1048位、第1024-1105位、第1025-1044位、第1025-1045位、第1025-1046位、第1025-1047位、第1025-1048位、第1026-1045位、第1026-1046位、第1026-1047位、第1026-1048位、第1027-1046位、第1027-1047位、第1027-1048位、第1028-1047位、第1028-1048位、第1029-1048位、第1031-1050位、第1031-1051位、第1032-1051位、第1084-1103位、第1084-1105位、第1086-1105位、第1097-1116位、第1097-1117位、第1097-1122位、第1100-1119位、第1100-1120位、第1100-1121位、第1100-1122位、第1101-1120位、第1101-1121位、第1101-1122位、第1102-1121位、第1102-1122位、第1103-1122位、第1105-1124位、第1105-1125位、第1106-1125位、第1110-1029位、第1110-1130位、第1111-1130位、第1115-1134位、第1185-1204位、第1255-1274位、第1290-1309位、第1290-1310位、第1291-1310位、第1301-1320位、第1417-1436位、第1468-1487位、第1468-1488位、第1469-1488位、第1559-1578位、第1562-1581位、第1564-1583位、第1619-1638位、第2325-2344位、第2325-2345位、第2326-2345位、第2438-2457位、第2812-2831位、第2816-2835位、第2816-2836位、第2816-2837位、第2816-2838位、第2817-2836位、第2817-2837位、第2817-2838位、第2818-2837位、第2818-2838位、第2819-2838位、第2822-2481位、第2822-2842位、第2822-2843位、第2822-2844位、第2823-2842位、第2823-2843位、第2823-2844位、第2824-2843位、第2824-2844位、第2825-2844位、第2951-2970位、第2951-2971位、第2951-2972位、第2951-2973位、第2951-2974位、第2951-2975位、第2951-3000位、第2952-2971位、第2952-2972位、第2952-2973位、第2952-2974位、第2952-2975位、第2953-2972位、第2953-2973位、第2953-2974位、第2953-2975位、第2954-2973位、第2954-2974位、第2954-2975位、第2955-2974位、第2955-2975位、第2956-2975位。
在某些实施方案中，反义化合物或修饰的寡核苷酸靶向FGFR4核酸的区域。在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的区域的所述化合物或寡核苷酸具有与区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。例如，部分可以是与本文所列的区域的相等长度的部分互补的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，所述化合物或寡核苷酸靶向SEQ IDNO:2的以下核苷酸区域：第3165-3184位、第3196-3215位、第3197-3216位、第3196-3217位、第3196-3218位、第3197-3216位、第3197-3217位、第3197-3218位、第3198-3217位、第3198-3218位、第3199-3218位、第3201-3220位、第3201-3221位、第3202-3221位、第3205-3224位、第3207-3226位、第3207-3227位、第3208-3227位、第3991-4011位、第3991-4010位、第3991-4012位、第3991-4013位、第3992-4011位、第3992-4012位、第3992-4013位、第3993-4012位、第3993-4013位、第3994-4013位、第4010-4029位、第4033-4052位、第4039-4058位、第4039-4059位、第4040-4059位、第4048-4067位、第4050-4069位、第4058-4077位、第4069-4088位、第4069-4089位、第4069-4091位、第4069-4091位、第4069-4092位、第4070-4091位、第4070-4090位、第4070-4091位、第4070-4092位、第4071-4090位、第4071-4091位、第4071-4092位、第4072-4091位、第4072-4092位、第4073-4092位、第4089-4108位、第4089-4109位、第4090-4109位、第4093-4112位、第4105-4124位、第4132-4151位、第4132-4152位、第4133-4152位、第4144-4163位、第4144-4164位、第4145-4164位、第4506-4522位、第4528-4547位、第4638-4657位、第5268-5290位、第5271-5291位、第5272-5291位、第5274-5293位、第5274-5294位、第5275-5294位、第5966-5985位、第6020-6039位、第6020-6040位、第6020-6041位、第6020-6042位、第6020-6043位、第6020-6044位、第6020-6235位、第6021-6040位、第6021-6041位、第6021-6042位、第6021-6043位、第6021-6044位、第6022-6041位、第6022-6042位、第6022-6043位、第6022-6044位、第6023-6042位、第6023-6043位、第6023-6044位、第6024-6043位、第6024-6044位、第6025-6044位、第6027-6046位、第6027-6047位、第6028-6047位、第6214-6235位、第6214-6233位、第6214-6235位、第6216-6235位、第6227-6246位、第6227-6247位、第6227-6252位、第6230-6249位、第6230-6250位、第6230-6251位、第6230-6252位、第6231-6250位、第6231-6251位、第6231-6252位、第6232-6251位、第6232-6252位、第6233-6252位、第6235-6254位、第6235-6255位、第6236-6255位、第6241-6260位、第6245-6264位、第6315-6334位、第6784-6803位、第6974-6993位、第7025-7044位、第7025-7045位、第7026-7045位、第7059-7081位、第7221-7240位、第7223-7242位、第7278-7297位、第10866-10885位、第10866-10866位、第10867-10886位、第11108-11127位、第11482-11501位、第11486-11505位、第11486-11506位、第11486-11507位、第11486-11508位、第11487-11506位、第11487-11507位、第11487-11508位、第11488-11507位、第11488-11508位、第11489-11508位、第11492-11511位、第11492-11512位、第11492-11513位、第11492-1151位、第11493-11512位、第11493-11513位、第11493-11514位、第11494-11513位、第11494-11514位、第11495-11514位、第11621-11640位、第11621-11641位、第11621-11642位、第11621-11643位、第11621-11644位、第11621-11645位、第11621-11670位、第11622-11641位、第11622-11642位、第11622-11643位、第11622-11644位、第11622-11645位、第11623-11642位、第11623-11643位、第11623-11644位、第11623-11645位、第11624-11643位、第11624-11644位、第11624-11645位、第11625-11644位、第11625-11645位、第11626-11645位。
某些实施方案提供了包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述连接的核苷包含与选自SEQ ID NO:1的第191-210位或第369-388位核苷酸的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸具有与选自SEQ ID NO:1的第191-210位或第369-388位核苷酸的区域内的等长部分互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸与编码人FGFR4的核酸，例如SEQ ID NO:190%、95%、99%或100%互补。
某些实施方案提供了包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述连接的核苷包含与选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位或第4070-4089位核苷酸的区域内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸具有与选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位或第4070-4089位核苷酸的区域内的等长部分互补的至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸与编码人FGFR4的核酸，例如SEQ ID NO:290%、95%、99%或100%互补。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第788-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第188-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸的区域内100%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在选自SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸的区域内100%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第191-210位核苷内100%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第3196-3215位核苷内100%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内60%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内70%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内80%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内90%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内95%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:1的第369-388位核苷内100%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
某些实施方案提供了包含由在SEQ ID NO:2的第4070-4089位核苷内99%互补的20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的区域的所述化合物或寡核苷酸具有与SEQ ID NO:1的第191-210位或第369-388位区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的区域的所述化合物或寡核苷酸具有与SEQ ID NO:2的第3196-3215位或第4070-4089位区域的等长核碱基部分互补的连续核碱基部分。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下核苷酸区域，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：第160-179位、第191-210位、第191-211位、第191-212位、第191-213位、第192-211位、第192-212位、第192-213位、第193-212位、第193-213位、第194-213位、第196-215位、第196-216位、第197-216位、第200-219位、第202-221位、第202-222位、第203-222位、第290-210位、第290-309位、第290-311位、第290-312位、第290-312位、第291-310位、第291-311位、第291-312位、第292-311位、第292-312位、第293-312位、第309-328位、第332-351位、第338-357位、第338-358位、第339-358位、第347-366位、第349-368位、第357-376位、第368-387位、第368-388位、第368-389位、第368-390位、第368-391位、第369-380位、第369-389位、第369-390位、第369-391位、第370-389位、第370-390位、第370-391位、第371-390位、第371-391位、第372-391位、第388-407位、第388-408位、第389-408位、第392-411位、第404-423位、第431-450位、第431-451位、第432-451位、第443-462位、第443-463位、第444-463位、第601-620位、第624-643位、第734-753位、第767-806位、第787-807位、第788-807位、第790-809位、第790-810位、第791-810位、第970-989位、第1024-1043位、第1024-1044位、第1024-1045位、第1024-1046位、第1024-1047位、第1024-1048位、第1024-1105位、第1025-1044位、第1025-1045位、第1025-1046位、第1025-1047位、第1025-1048位、第1026-1045位、第1026-1046位、第1026-1047位、第1026-1048位、第1027-1046位、第1027-1047位、第1027-1048位、第1028-1047位、第1028-1048位、第1029-1048位、第1031-1050位、第1031-1051位、第1032-1051位、第1074-1051位、第1084-1103位、第1084-1105位、第1086-1105位、第1097-1116位、第1097-1117位、第1097-1122位、第1100-1119位、第1100-1119位、第1100-1120位、第1100-1121位、第1100-1122位、第1101-1120位、第1101-1121位、第1101-1122位、第1102-1121位、第1102-1122位、第1103-1122位、第1105-1124位、第1105-1125位、第1106-1125位、第1110-1029位、第1110-1130位、第1111-1130位、第1115-1134位、第1185-1204位、第1255-1274位、第1290-1309位、第1290-1310位、第1291-1310位、第1301-1320位、第1417-1436位、第1468-1487位、第1468-1488位、第1469-1488位、第1559-1578位、第1562-1581位、第1564-1583位、第1619-1638位、第2325-2344位、第2325-2345位、第2326-2345位、第2438-2457位、第2812-2831位、第2816-2835位、第2816-2836位、第2816-2837位、第2816-2838位、第2817-2836位、第2817-2837位、第2817-2838位、第2818-2837位、第2818-2838位、第2819-2838位、第2822-2481位、第2822-2842位、第2822-2843位、第2822-2844位、第2822-2844位、第2823-2842位、第2823-2843位、第2823-2844位、第2824-2843位、第2824-2844位、第2825-2844位、第2951-2970位、第2951-2971位、第2951-2972位、第2951-2973位、第2951-2974位、第2951-2975位、第2951-2975位、第2951-3000位、第2952-2971位、第2952-2972位、第2952-2973位、第2952-2974位、第2952-2975位、第2953-2972位、第2953-2973位、第2953-2974位、第2953-2975位、第2954-2973位、第2954-2974位、第2954-2975位、第2955-2974位、第2955-2975位和第2956-2975位。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:2的以下核苷酸区域，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：第3165-3184位、第3196-3215位、第3196-3216位、第3196-3217位、第3196-3218位、第3197-3216位、第3197-3217位、第3197-3218位、第3198-3217位、第3198-3218位、第3199-3218位、第3201-3220位、第3201-3221位、第3202-3221位、第3205-3224位、第3207-3226位、第3207-3227位、第3208-3227位、第3991-4011位、第3991-4010位、第3991-4012位、第3991-4013位、第3991-4014位、第3992-4011位、第3992-4012位、第3992-4013位、第3993-4012位、第3993-4013位、第3994-4013位、第4010-4029位、第4033-4052位、第4039-4058位、第4039-4059位、第4040-4059位、第4048-4067位、第4050-4069位、第4058-4077位、第4069-4088位、第4069-4089位、第4069-4090位、第4069-4091位、第4069-4092位、第4070-380位、第4070-4090位、第4070-4091位、第4070-4092位、第4071-4090位、第4071-4091位、第4071-4092位、第4072-4091位、第4072-4092位、第4073-4092位、第4089-4108位、第4089-4109位、第4090-4109位、第4093-4112位、第4105-4124位、第4132-4151位、第4132-4152位、第4133-4152位、第4144-4163位、第4144-4164位、第4145-4164位、第4506-4522位、第4528-4547位、第4638-4657位、第5268-5290位、第5271-5291位、第5272-5291位、第5274-5293位、第5274-5294位、第5275-5294位、第5966-5985位、第6020-6039位、第6020-6040位、第6020-6041位、第6020-6042位、第6020-6043位、第6020-6044位、第6020-6045位、第6021-6040位、第6021-6041位、第6021-6042位、第6021-6043位、第6021-6044位、第6022-6041位、第6022-6042位、第6022-6043位、第6022-6044位、第6023-6042位、第6023-6043位、第6023-6047位、第6024-6043位、第6024-6044位、第6025-6044位、第6027-6046位、第6027-6047位、第6028-6047位、第6214-6235位、第6214-6233位、第6214-6235位、第6216-6235位、第6227-6246位、第6227-6247位、第6227-6252位、第6230-6249位、第6230-6249位、第6230-6250位、第6230-6251位、第6230-6252位、第6231-6250位、第6231-6251位、第6231-6252位、第6232-6251位、第6232-6252位、第6233-6252位、第6235-6254位、第6235-6255位、第6236-6255位、第6230-6260位、第6241-6260位、第6245-6264位、第6315-6334位、第6784-6803位、第6974-6993位、第7025-7044位、第7025-7045位、第7026-7045位、第7221-7240位、第7223-7242位、第7278-7297位、第10866-10885位、第10866-10886位、第10867-10886位、第11008-11127位、第11482-11501位、第11486-11505位、第11486-11506位、第11486-11507位、第11486-11508位、第11487-11506位、第11487-11507位、第11487-11508位、第11488-11507位、第11488-11508位、第11489-11508位、第11492-11511位、第11492-11512位、第11492-11513位、第11492-11514位、第11493-11512位、第11493-11513位、第11493-11514位、第11494-11513位、第11494-11514位、第11495-11514位、第11621-11640位、第11621-11641位、第11621-11642位、第11621-11643位、第11621-11644位、第11621-11645位、第11621-11670位、第11622-11641位、第11622-11642位、第11622-11643位、第11622-11644位、第11622-11645位、第11623-11642位、第11623-11643位、第11623-11644位、第11623-1645位、第11624-11643位、第11624-11644位、第11624-11645位、第11625-11644位、第11625-11645位和第11626-11645位。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、59、61、62、64、65、66、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115和116。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少70%抑制：7、14、15、16、17、18、19、20、22、23、24、27、28、29、30、32、33、34、35、38、39、43、44、45、46、47、48、49、50、51、54、59、61、64、69、70、72、73、75、77、78、79、80、81、82、83、85、86、87、89、90、91、92、94、97、98、103、105、106、111、112、113和116。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少75%抑制：7、14、16、17、22、24、28、29、30、32、33、34、39、43、44、45、46、47、49、50、59、61、69、70、72、73、75、77、78、79、80、83、85、89、90、91、92、105、106、111和112。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少80%抑制：7、14、16、17、28、29、33、39、45、47、49、50、72、80、90、91和106。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少85%抑制：7、14、16、29、45、50、80、90和91。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下核苷酸区域，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：第908-927位、第992-1011位、第1138-1157位、第1138-1161位、第1142-1161位、第1345-1364位、第1386-1405位、第1386-1413位、第1394-1413位、第1461-1480位、第1461-1482位、第1461-1484位、第1461-1486位、第1461-1490位、第1463-1482位、第1463-1484位、第1463-1486位、第1463-1490位、第1465-1484位、第1465-1486位、第1465-1490位、第1467-1486位、第1467-1490位、第1471-1490位、第1542-1561位、第1941-1960位、第1941-1962位、第1941-1964位、第1943-1962位、第1943-1964位、第1945-1964位、第2053-2072位、第2104-2123位、第2104-2125位、第2104-2127位、第2104-2129位、第2104-2131位、第2104-2133位、第2104-2135位、第2104-2137位、第2106-2125位、第2106-2127位、第2106-2129位、第2106-2131位、第2106-2133位、第2106-2135位、第2106-2137位、第2108-2127位、第2108-2129位、第2108-2131位、第2108-2133位、第2108-2135位、第2108-2137位、第2110-2129位、第2110-2131位、第2110-2133位、第2110-2135位、第2110-2137位、第2112-2131位、第2112-2133位、第2112-2135位、第2112-2137位、第2114-2133位、第2114-2135位、第2114-2137位、第2116-2135位、第2116-2137位、第2118-2137位、第2271-2290位、第2838-2857位、第3122-3141位、第3122-3144位、第3125-3144位、第3165-3184位、第3325-3344位、第3325-3346位、第3325-3348位、第3325-3350位、第3325-3352位、第3325-3354位、第3325-3356位、第3325-3358位、第3325-3360位、第3325-3362位、第3325-3362位、第3327-3346位、第3327-3346位、第3327-3348位、第3327-3350位、第3327-3352位、第3327-3354位、第3327-3356位、第3327-3358位、第3327-3360位、第3327-3362位、第3329-3348位、第3329-3348位、第3329-3350位、第3329-3352位、第3329-3354位、第3329-3356位、第3329-3358位、第3329-3360位、第3329-3362位、第3331-3350位、第3331-3352位、第3331-3354位、第3331-3356位、第3331-3358位、第3331-3360位、第3331-3362位、第3333-3352位、第3333-3354位、第3333-3356位、第3333-3358位、第3333-3360位、第3333-3362位、第3335-3354位、第3335-3356位、第3335-3358位、第3335-3360位、第3335-3362位、第3337-3356位、第3337-3358位、第3337-3360位、第3337-3362位、第3339-3358位、第3339-3360位、第3339-3362位、第3341-3360位、第3341-3362位、第3343-3362位、第3386-3405位、第3386-3413位、第3386-3417位、第3386-3419位、第3386-3423位、第3386-3427位、第3386-3434位、第3386-3434位、第3394-3413位、第3394-3417位、第3394-3423位、第3394-3427位、第3394-3434位、第3398-3417位、第3398-3419位、第3398-3423位、第3398-3427位、第3398-3434位、第3400-3419位、第3400-3423位、第3400-3427位、第3400-3434位、第3404-3423位、第3404-3427位、第3404-3434位、第3408-3427位、第3408-3434位、第3415-3434位、第3445-3464位、第3445-3466位、第3445-3468位、第3445-3470位、第3447-3466位、第3447-3468位、第3447-3470位、第3449-3468位、第3449-3470位、第3451-3470位、第3499-3518位、第3571-3590位、第3571-3592位、第3571-3594位、第3571-3596位、第3571-3598位、第3573-3592位、第3573-3594位、第3573-3596位、第3573-3598位、第3575-3594位、第3575-3596位、第3575-3598位、第3577-3596位、第3577-3598位、第3579-3598位、第3772-3791位、第3772-3793位、第3772-3795位、第3772-3797位、第3772-3801位、第3772-3807位、第3772-3817位、第3774-3793位、第3774-3795位、第3774-3797位、第3776-3795位、第3776-3797位、第3778-3797位、第3782-3801位、第3782-3817位、第3788-3807位、第3788-3817位、第3798-3817位、第3993-4012位、第4799-4818位、第7684-7703位、第7690-7709位、第7692-7711位。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：29、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234和235。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少70%抑制：29、117、119、120、122、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、145、146、147、150、151、152、153、154、155、156、157、158、160、161、162、163、164、165、166、167、169、170、171、174、180、183、184、185、186、187、188、189、190、193、195、198、199、200、201、202、203、206、207、208、209、210、211、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、225、226、227、228、229、231、233、234和235。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少75%抑制：29、117、120、128、129、131、132、133、135、136、137、138、139、140、141、146、152、153、154、155、156、160、161、162、163、164、165、166、167、169、174、180、186、187、188、198、199、201、202、207、208、209、213、214、215、216、217、219、220、221、223、225、227、228、229、231、233和235。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少80%抑制：29、117、131、132、133、135、136、137、138、140、141、152、153、154、155、156、160、162、163、164、174、186、187、188、199、201、202、207、208、213、214、215、216、217、219、220、221、223、227、229、231和233。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少85%抑制：29、117、132、135、136、140、141、154、156、163、164、187、188、199、201、215、216、217、219、220、221、223、227、229、231和233。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下核苷酸区域，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：第101-120位、第101-122位、第101-124位、第101-125位、第101-126位、第101-127位、第102-126位、第103-122位、第103-124位、第103-125位、第103-126位、第103-127位、第105-124位、第105-125位、第105-127位、第106-125位、第106-126位、第106-127位、第107-126位、第107-127位、第108-127位、第1122-1141位、第1165-1184位、第1193-1218位、第1198-1217位、第1199-1218位、第1323-1342位、第1323-1344位、第1323-1346位、第1323-1347位、第1323-1352位、第1325-1344位、第1325-1346位、第1325-1347位、第1327-1346位、第1327-1347位、第1328-1347位、第1333-1352位、第1333-1354位、第1333-1354位、第1333-1356位、第1333-1358位、第1333-1360位、第1335-1354位、第1335-1356位、第1335-1358位、第1335-1360位、第1337-1356位、第1337-1358位、第1337-1360位、第1339-1358位、第1339-1360位、第1341-1360位、第1392-1411位、第1392-1417位、第1393-1412位、第1394-1413位、第1394-1415位、第1394-1417位、第1396-1415位、第1396-1417位、第1398-1417位、第1413-1432位、第1413-1433位、第1413-1434位、第1414-1433位、第1414-1434位、第1415-1434位、第1445-1464位、第1445-1466位、第1445-1468位、第1445-1470位、第1445-1471位、第1447-1466位、第1447-1468位、第1447-1470位、第1447-1471位、第1449-1468位、第1449-1470位、第1449-1471位、第1451-1470位、第1451-1471位、第1452-1471位、第1462-1481位、第1462-1481位、第1462-1482位、第1462-1483位、第1462-1484位、第1462-1485位、第1462-1487位、第1463-1482位、第1463-1482位、第1463-1483位、第1463-1484位、第1463-1485位、第1463-1487位、第1464-1483位、第1464-1484位、第1464-1485位、第1464-1487位、第1465-1484位、第1465-1485位、第1465-1487位、第1466-1485位、第1466-1487位、第1468-1487位、第1501-1521位、第1501-1522位、第1503-1522位、第1569-1588位、第1569-1589位、第1569-1590位、第1569-1591位、第1569-1592位、第1569-1593位、第1569-1594位、第1569-1596位、第1569-1598位、第1570-1589位、第1570-1590位、第1570-1591位、第1570-1592位、第1570-1593位、第1570-1594位、第1570-1596位、第1570-1598位、第1571-1590位、第1571-1591位、第1571-1591位、第1571-1592位、第1571-1592位、第1571-1593位、第1571-1593位、第1571-1594位、第1571-1594位、第1571-1596位、第1571-1596位、第1571-1598位、第1571-1598位、第1572-1591位、第1572-1592位、第1572-1593位、第1572-1594位、第1572-1596位、第1572-1598位、第1573-1592位、第1573-1593位、第1573-1594位、第1573-1596位、第1573-1598位、第1574-1593位、第1574-1594位、第1574-1596位、第1574-1598位、第1575-1594位、第1575-1596位、第1575-1598位、第1577-1596位、第1577-1598位、第1579-1598位、第1778-1797位、第1778-1799位、第1778-1805位、第1778-1809位、第1778-1811位、第1778-1821位、第1780-1799位、第1786-1805位、第1790-1809位、第1790-1811位、第1790-1821位、第1792-1811位、第1792-1821位、第1802-1821位、第1944-1963位、第1996-2015位、第2053-2072位、第2074-2093位、第2418-2437位、第4988-5007位、第5120-5139位、第5121-5140位、第5121-5146位、第5122-5141位、第5122-5142位、第5122-5143位、第5122-5144位、第5122-5146位、第5123-5142位、第5123-5143位、第5123-5144位、第5123-5146位、第5124-5143位、第5124-5144位、第5124-5144位、第5124-5146位、第5125-5146位、第5127-5146位、第5150-5169位、第5150-5170位、第5150-5171位、第5151-5170位、第5151-5171位、第5152-5171位、第7801-7820位、第7801-7822位、第7803-7822位。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少65%抑制：29、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321和322。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少70%抑制：29、239、240、241、242、243、244、245、247、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、268、269、270、271、272、274、275、276、277、278、279、280、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、294、295、296、297、298、299、300、301、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、317、319、320和322。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少75%抑制：29、239、240、241、242、243、244、245、247、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、264、266、269、271、272、274、275、276、277、278、279、283、284、286、287、288、291、298、299、300、305、306、307、308、309、310、312、313、315、317、319和320。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少80%抑制：29、241、242、243、244、245、247、250、253、254、255、256、259、260、261、262、264、266、271、272、274、276、278、283、284、286、287、299、300、305、306、307、308、310、312、313、317和320。
在某些实施方案中，SEQ ID NO:1或2或3的以下SEQ ID NO中所列核碱基序列，当被反义化合物或寡核苷酸所靶向时，表现出至少85%抑制：29、241、242、243、244、247、254、256、259、260、264、272、278、299、300、305、306、307、308、310、317和320。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少65%抑制：ISISNO:299005、299010、299018、299022、299024、299025、299028、299029、299030、463588、463589、463590、463592、463593、463594、463596、463598、463599、463601、463625、463627、463628、463629、463630、463636、463645、463648、463654、463655、463656、463657、463670、463672、463673、463677、463678、463679、463689、463690、463691、463692、463693、463708、463709、463712、463717、463718、463724、463733、463734、463735、463751、463763、463770、463774、463791、463805、463832、463834、463835、463836、463837、463838、463860、463861、463871、463874、463875、463876、463877、463878、463880、463882、463883、463884、463893、463894、463906、463907、463908、463909、463910、463912、463913、463918、463919、463922、463937、463938、463947、463967、463994、464002、464004、464013、464014、464015、464030、464033、464037、464038、464041、464043、464046、464048和464049。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1的区域，编码人FGFR4的核酸并显示FGFR4mRNA的至少70%抑制：ISIS NO:299005、299029、299030、463588、463589、463590、463592、463593、463596、463598、463599、463627、463628、463629、463630、463645、463648、463654、463655、463670、463672、463679、463689、463690、463691、463692、463693、463708、463709、463712、463724、463751、463763、463774、463834、463835、463837、463838、463861、463874、463875、463876、463877、463878、463880、463882、463884、463893、463894、463907、463908、463909、463910、463913、463922、463937、464002、464013、464014、464038、464041、464043和464049。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少75%抑制：ISISNO:299005、299029、463588、463589、463596、463599、463628、463629、463630、463645、463648、463654、463672、463679、463689、463690、463691、463692、463708、463709、463751、463763、463834、463835、463837、463838、463861、463874、463875、463876、463877、463882、463884、463907、463908、463909、463910、464013、464014、464038和464041。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少80%抑制：ISISNO:299005、299029、463588、463589、463628、463629、463648、463672、463690、463692、463708、463709、463837、463877、463908、463909和464014。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少85%抑制：ISISNO:299005、299029、463588、463629、463690、463709、463877、463908和463909。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少65%抑制：ISIS NO:463629、299004、464138、464139、464167、464168、464170、464173、299055、464181、464203、464207、464208、464209、464210、464213、464214、464215、464216、464222、464223、464224、464225、464226、464227、464228、464238、464239、464254、464258、464266、464268、464269、464270、464278、464280、464284、464285、464286、464287、464288、464290、464291、464292、464298、464299、464300、464308、464309、464310、464311、464333、464342、464425、464428、464429、464430、464433、464449、464453、464568、464569、464575、464576、464579、464581、464582、464584、464585、464586、464587、464588、464589、464590、464591、464593、464617、464622、464623、464657、464658、464677、464682、464683、464684、464685、464686、464687、464688、464689、464692、464696、464698、464699、464701、464703、464705、464706、464707、464708、464709、464710、464711、464716、464717、464718、464719、464720、464726、464727、464728、464729、464730、464732、464734、464735、464736、464740、464800和464801。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少70%抑制：ISIS NO:463629、299004、464138、464139、464168、464203、464207、464208、464209、464210、464213、464214、464215、464216、464222、464223、464224、464225、464226、464227、464228、464238、464258、464266、464268、464278、464280、464284、464285、464286、464287、464288、464290、464291、464298、464299、464300、464308、464309、464310、464311、464333、464425、464428、464429、464449、464579、464584、464585、464586、464587、464588、464589、464590、464591、464622、464657、464682、464683、464684、464685、464686、464687、464692、464696、464698、464699、464701、464703、464706、464707、464708、464709、464710、464711、464716、464717、464718、464719、464720、464727、464728、464729、464730、464732、464735、464740、464800和464801。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少75%抑制：ISIS NO:463629、299004、464139、464208、464209、464213、464214、464215、464222、464223、464224、464225、464226、464227、464228、464266、464284、464285、464286、464287、464288、464298、464299、464300、464308、464309、464310、464311、464333、464425、464449、464579、464587、464588、464589、464682、464683、464685、464686、464696、464698、464699、464706、464707、464708、464709、464710、464716、464717、464718、464720、464727、464729、464730、464732、464735、464740和464801。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少80%抑制：ISIS NO:463629、299004、464213、464214、464215、464222、464223、464224、464225、464227、464228、464284、464285、464286、464287、464288、464298、464300、464308、464309、464449、464587、464588、464589、464683、464685、464686、464696、464698、464706、464707、464708、464709、464710、464716、464717、464718、464720、464729、464732、464735和464740。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少85%抑制：ISIS NO:463629、299004、464214、464222、464223、464227、464228、464286、464288、464308、464309、464588、464589、464683、464685、464708、464709、464710、464716、464717、464718、464720、464729、464732、464735和464740。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2或3的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少65%抑制：ISIS NO:463629、479530、479532、479533、479534、479535、479536、479537、479538、479539、479540、479541、479542、479543、479544、479545、479546、479547、479548、479549、479550、479551、479552、479553、479554、479555、479556、479557、479558、479560、479561、479562、479564、479565、479566、479567、479568、479569、479570、479572、479573、479574、479576、479577、479582、479583、479584、479585、479594、479596、479597、479608、479613、479614、479622、479625、479626、479641、479682、479689、479690、479691、479692、479693、479694、479696、479697、479698、479699、479703、479704、479705、479706、479716、479721、479722、479725、479731、479732、479736、479737、479738、479739、479740和479741。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2或3的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少70%抑制：ISIS NO:463629、479530、479532、479533、479534、479535、479536、479537、479539、479541、479542、479543、479544、479545、479546、479547、479548、479549、479550、479551、479552、479553、479554、479555、479556、479557、479558、479561、479562、479564、479565、479566、479568、479569、479570、479572、479573、479574、479576、479582、479583、479584、479585、479594、479596、479597、479608、479613、479614、479626、479641、479682、479689、479690、479691、479692、479693、479697、479698、479699、479703、479704、479705、479706、479716、479721、479722、479725、479731、479736、479738、479739和479741。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2或3的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少75%抑制：ISIS NO:463629、479530、479532、479533、479534、479535、479536、479537、479539、479542、479543、479544、479545、479546、479547、479548、479549、479550、479551、479552、479553、479554、479556、479558、479562、479565、479566、479568、479569、479570、479572、479573、479574、479583、479584、479594、479596、479597、479614、479690、479691、479692、479698、479699、479703、479704、479705、479706、479721、479722、479731、479736、479738和479739。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2或3的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少80%抑制：ISIS NO:463629、479533、479534、479535、479536、479537、479539、479542、479545、479546、479547、479548、479551、479552、479553、479554、479556、479558、479565、479566、479568、479570、479573、479583、479584、479594、479596、479691、479692、479698、479699、479703、479704、479706、479721、479722、479736和479739。
在某些实施方案中，以下反义化合物靶向SEQ ID NO:1或2或3的区域，编码人FGFR4的核酸，且显示FGFR4mRNA的至少85%抑制：ISIS NO:463629、479533、479534、479535、479536、479539、479546、479548、479551、479552、479556、479566、479573、479691、479692、479698、479699、479703、479704、479706、479736和479739。
在某些实施方案中，本文所提供的化合物具有比ISIS NO:299005高的治疗潜力。在某些实施方案中，本文提供的化合物具有超越ISIS NO:299005的更好的体内抑制。在某些实施方案中，本文提供的化合物具有比ISIS NO:299005更好的耐受性特征。
在某些实施方案中，本文所提供的化合物由单链的修饰的寡核苷酸组成。
在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个连接的核苷组成。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由19个连接的核苷组成。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由18个连接的核苷组成。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由17个连接的核苷组成。在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由16个连接的核苷组成。
在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸的至少一个核苷间键是修饰的核苷键键。在某些实施方案中，每个核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。
在某些实施方案中，所述修饰的寡核苷酸的至少一个核苷包含修饰的核碱基。在某些实施方案中，修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸包括：a)由连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间且每个翼状区段的每个核苷包含修饰的糖。
在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成，10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段，5个连接的核苷组成的5’翼状区段，5个连接的核苷组成的3’翼状区段，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键和每个胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，修饰的寡核苷酸由17个连接的核苷组成，10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段，3个连接的核苷组成的5’翼状区段，4个连接的核苷组成的3’翼状区段，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键和每个胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含与SEQ ID NO:1-4的任何的等长部分互补的至少8个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含与SEQ ID NO:1的任何的等长部分互补的至少8个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:7-322的至少19个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138的至少19个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:16的至少19个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:45的至少19个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:7-322的至少20个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138的至少20个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225中任一者的化合物。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:16的至少20个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588的化合物。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO:45的至少20个连续核碱基的核碱基序列，其中修饰的寡核苷酸包括：a)由10个连接的脱氧核苷组成的间隙区段；b)由5个连接的核苷组成的5’翼状区段；和c)由5个连接的核苷组成的3’翼状区段。间隙区段位于5’翼状区段和3’翼状区段之间，每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基修饰的糖，每个核苷间键是硫代磷酸酯键且每个胞嘧啶残基是5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463690的化合物。
某些实施方案提供了用于抑制FGFR4表达的方法、化合物和组合物。
某些实施方案提供了在动物中降低FGFR4表达的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为15至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为18至21个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至35个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至25个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至24个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至23个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至22个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20至21个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中预防、改善或治疗代谢性疾病的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。代谢性疾病或疾患的例子包括但不限于肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中预防、改善或治疗代谢性疾病的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。代谢性疾病或疾患的例子包括但不限于肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中预防、改善或治疗代谢性疾病的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。代谢性疾病或疾患的例子包括但不限于肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了在动物中预防、改善或治疗肥胖的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225的化合物。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463690的化合物。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中预防、改善或治疗肥胖的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225的化合物。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463690的化合物。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中预防、改善或治疗代谢性疾病的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588、463589、463690、463691、463835、463837或464225的化合物。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463588。在某些实施方案中，所述化合物或组合物包含ISIS NO:463690的化合物。
某些实施方案提供了在动物中降低体重的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，体重降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中降低体重的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，体重降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中降低体重的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中体重的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，体重降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了在动物中减少脂肪组织的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，肥胖症降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中减少脂肪组织的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，肥胖症降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中减少脂肪组织的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中肥胖症的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，肥胖症降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了在动物中增加脂肪酸氧化的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，脂肪酸氧化增加了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中增加脂肪酸氧化的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，脂肪酸氧化增加了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中增加脂肪酸氧化的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，在动物中增加脂肪酸氧化预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，脂肪酸氧化增加了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了在动物中降低葡萄糖水平的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，葡萄糖水平降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的用于在动物中降低葡萄糖水平的化合物。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，葡萄糖水平降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在动物中降低葡萄糖水平的药物中的用途。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为12至30个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，所述化合物包含靶向FGFR4的长度为20个连接的核苷的修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢性疾病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗肥胖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗代谢综合征。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗胰岛素抗性。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗高血糖。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗NAFLD。在某些实施方案中，动物中葡萄糖水平的降低预防、改善或治疗糖尿病性血脂异常。在某些实施方案中，葡萄糖水平降低了至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
在某些实施方案中，FGFR4具有如以下GENBANK登录号的任一者中所列的序列：GENBANK登录号NM_002011.3（作为SEQ IDNO:1并入本文)、GENBANK登录号：NT_023133.11（从第21323018位至第21335213位核苷截短）（作为SEQ ID NO:2并入本文）；GENBANK登录号AB209631.1（作为SEQ ID NO:3并入本文）；和GENBANK登录号NM_022963.2（作为SEQ ID NO:4并入本文）。在某些实施方案中，FGFR4具有SEQ ID NO:1-4中所列的人类序列。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号NW_001121000.1从第3094000位至第3109000位截短中所列的恒河猴序列（SEQ IDNO:5）。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号BC033313.1中所列的鼠类序列（SEQ ID NO:6）。
在某些实施方案中，本文所提供的化合物或组合物包含其盐、和药学上可接受的载体或稀释剂。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文所提供的化合物或组合物包含其盐、和药学上可接受的载体或稀释剂。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，本文所提供的化合物或组合物包含其盐、和药学上可接受的载体或稀释剂。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20至25个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，所述组合物包含修饰的寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了用于治疗患有FGFR4相关的疾病或病症的动物的方法，其包括：a)鉴定患有FGFR4相关疾病或病症的所述动物，和b)向所述动物施用治疗有效量的化合物，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由12至30个连接的核苷组成且具有如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少90%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，施用于动物的治疗有效量的化合物在动物中治疗或减少FGFR4相关疾病或病症，或其症状。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了用于治疗FGFR4相关疾病或病症的化合物，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由12至30个连接的核苷组成且具有如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少90%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了化合物用于治疗FGFR4相关疾病或病症的用途，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由12至30个连接的核苷组成且具有如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少90%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了用于治疗患有FGFR4相关疾病或病症的动物的方法，其包括：a)鉴定患有FGFR4相关疾病或病症的所述动物，和b)向所述动物施用治疗有效量的化合物，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少100%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，施用于动物的治疗有效量的化合物在动物中治疗或减少FGFR4相关疾病或病症，或其症状。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了用于治疗FGFR4相关疾病或病症的化合物，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少100%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了化合物在制备用于治疗FGFR4相关疾病或病症的药物中的用途，所述化合物包含修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成且如跨越所述修饰的寡核苷酸的整体所测量的与SEQ ID NO:1-4中的任一者至少100%互补的核碱基序列。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是肥胖。在某些实施方案中，FGFR4相关疾病或病症是糖尿病。
某些实施方案提供了治疗、预防或改善代谢性疾病的方法。在某些实施方案中，代谢性疾病是肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了用于治疗、预防或改善代谢性疾病的如本文所描述的化合物。在某些实施方案中，代谢性疾病是肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于治疗、预防或改善代谢性疾病的药物中的用途。在某些实施方案中，，代谢性疾病是肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合。
某些实施方案提供了方法，其包括向动物施用如本文针对动物所描述的化合物。在某些实施方案中，所述方法包括向动物施用由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了修饰的寡核苷酸在制备用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的药物中的用途，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了方法，其包括向动物施用如本文针对动物所描述的化合物。在某些实施方案中，所述方法包括向动物施用由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了修饰的寡核苷酸在制备用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的药物中的用途，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:16中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了方法，其包括向动物施用如本文针对动物所描述的化合物。在某些实施方案中，所述方法包括向动物施用由20至35个连接的核苷组成且具有包含SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了修饰的寡核苷酸在制备用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的药物中的用途，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有SEQ ID NO:45中所列核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了方法，其包括向动物施用如本文针对动物所描述的化合物。在某些实施方案中，所述方法包括向动物施用由20至35个连接的核苷组成且具有包含选自ISIS NO:463588中所列核碱基序列中的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含ISIS NO:463588的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了修饰的寡核苷酸在制备用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的药物中的用途，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含ISIS NO:463588的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了方法，其包括向动物施用如本文针对动物所描述的化合物。在某些实施方案中，所述方法包括向动物施用由20至35个连接的核苷组成且具有包含选自ISIS NO:463690中所列核碱基序列中的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列的修饰的寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的修饰的寡核苷酸，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含ISIS NO:463690的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
某些实施方案提供了修饰的寡核苷酸在制备用于治疗代谢性疾病、糖尿病和/或肥胖的药物中的用途，所述修饰的寡核苷酸由20至35个连接的核苷组成且具有包含ISIS NO:463690的核碱基序列的至少20个连续核碱基的核碱基序列。
在某些实施方案中，动物是人。
在某些实施方案中，所述施用预防、治疗、改善或减缓如本文所描述的代谢性疾病的进展。
在某些实施方案中，所述施用预防、治疗、改善或减缓如本文所描述的肥胖的进展。
在某些实施方案中，所述施用预防、治疗、改善或减缓如本文所描述的糖尿病的进展。
在某些实施方案中，所述化合物与第二药剂共施用。
在某些实施方案中，所述化合物与第二药剂同时施用。
在某些实施方案中，所述施用是胃肠外施用。
某些实施方案还提供了用于在动物中降低FGFR4mRNA或蛋白表达的方法，其包括向动物施用如本文所描述的化合物或组合物以在动物中降低FGFR4mRNA或代表表达。在某些实施方案中，动物是人。在某些实施方案中，降低FGFR4mRNA或蛋白表达预防、治疗、改善或减缓了代谢性疾病的进展。在某些实施方案中，代谢性疾病或病症是糖尿病。在某些实施方案中，代谢性疾病或病症是肥胖。
某些实施方案提供了用于治疗患有代谢性疾病的人的方法，其包括鉴定患有疾病的人类并向所述人施用如本文所描述的治疗有效量的化合物或组合物。在某些实施方案中，治疗减少了选自由以下组成的组的症状：代谢性症状、高血糖、高甘油三酯血症、高血压、升高的血糖水平、升高的胰岛素抗性、降低的胰岛素敏感性、超过正常体重和/或超过正常体脂或其任何组合。
某些实施方案提供了用于治疗患有肥胖的人的方法，其包括鉴定患有疾病的人类并向所述人施用如本文所描述的治疗有效量的化合物或组合物。在某些实施方案中，治疗减少了选自由以下组成的组的症状：代谢性症状、高血糖、高甘油三酯血症、高血压、升高的血糖水平、升高的胰岛素抗性、降低的胰岛素敏感性、超过正常体重和/或超过正常体脂或其任何组合。
某些实施方案提供了用于治疗患有糖尿病的人的方法，其包括鉴定患有疾病的人类并向所述人施用如本文所描述的治疗有效量的化合物或组合物。在某些实施方案中，治疗减少了选自由以下组成的组的症状：代谢性症状、高血糖、高甘油三酯血症、高血压、升高的血糖水平、升高的胰岛素抗性、降低的胰岛素敏感性、超过正常体重和/或超过正常体脂或其任何组合。
还提供的是用于减少或预防代谢性疾病的方法，其包括向人施用治疗有效量的如本文所描述的化合物或组合物，从而减少或预防代谢性疾病。
还提供的是用于减少或预防肥胖的方法，其包括向人施用治疗有效量的如本文所描述的化合物或组合物，从而减少或预防糖尿病。
还提供的是用于减少或预防糖尿病的方法，其包括向人施用治疗有效量的如本文所描述的化合物或组合物，从而减少或预防糖尿病。
还提供的是用于改善代谢性疾病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢性疾病的症状。
还提供的是用于改善肥胖的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的肥胖的症状。
还提供的是用于改善糖尿病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢性疾病的症状。
还提供的是用于改善代谢综合征的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢综合征的症状。
还提供的是用于改善代谢性疾病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢性疾病的症状。
还提供的是用于改善肥胖的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的肥胖的症状。
还提供的是用于改善糖尿病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的糖尿病的症状。
还提供的是用于改善代谢综合征的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢综合征的症状。
还提供的是用于改善代谢性疾病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢性疾病的症状。
还提供的是用于改善肥胖的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的肥胖的症状。
还提供的是用于改善糖尿病的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的糖尿病的症状。
还提供的是用于改善代谢综合征的症状的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而改善人的代谢综合征的症状。
还提供的是用于降低与代谢性疾病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的谢性疾病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与肥胖相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的肥胖的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与糖尿病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的糖尿病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与代谢综合征相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20至35个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的代谢综合征的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与代谢性疾病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的谢性疾病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与肥胖相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的肥胖的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与糖尿病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的糖尿病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与代谢综合征相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的代谢综合征的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与代谢性疾病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的谢性疾病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与肥胖相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的肥胖的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与糖尿病相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的糖尿病的症状的进展速率。
还提供的是用于降低与代谢综合征相关的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:1、2、3、4或5特异性地杂交，从而降低人的代谢综合征的症状的进展速率。
还提供的是用来制备用于代谢性疾病的治疗、预防或改善的药物的方法和化合物。
还提供的是用来制备用于肥胖的治疗、预防或改善的药物的方法和化合物。
还提供的是用来制备用于糖尿病的治疗、预防或改善的药物的方法和化合物。
还提供的是用来制备用于代谢综合征的治疗、预防或改善的药物的方法和化合物。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于治疗、改善或预防代谢性疾病的药物中的用途。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于治疗、改善或预防肥胖的药物中的用途。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于治疗、改善或预防糖尿病的药物中的用途。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于治疗、改善或预防代谢综合征的药物中的用途。
某些实施方案提供了通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合疗法用于治疗、预防或改善如本文所描述的代谢性疾病的如本文所描述的化合物。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合疗法用于治疗、预防或改善如本文所描述的糖尿病的如本文所描述的化合物。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合治疗来治疗、预防或改善代谢性疾病的药物中的用途。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合治疗来治疗、预防或改善肥胖的药物中的用途。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合治疗来治疗、预防或改善糖尿病的药物中的用途。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于通过与如本文所描述的附加药剂或疗法的组合治疗来治疗、预防或改善糖尿病的药物中的用途。药剂或疗法可以共施用或同时施用。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在患者中治疗、预防或改善如本文所描述的代谢性疾病的药物中的用途，所述患者随后被施用如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在患者中治疗、预防或改善如本文所描述的肥胖的药物中的用途，所述患者随后被施用如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在患者中治疗、预防或改善如本文所描述的糖尿病的药物中的用途，所述患者随后被施用如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了如本文所描述的化合物在制备用于在患者中治疗、预防或改善如本文所描述的代谢综合征的药物中的用途，所述患者随后被施用如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了用于治疗、预防或改善如本文所描述的代谢性疾病的试剂盒，其中所述试剂盒包括：
(i)如本文所描述的化合物；和可选地
(ii)如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了用于治疗、预防或改善如本文所描述的肥胖的试剂盒，其中所述试剂盒包括：
(i)如本文所描述的化合物；和可选地
(ii)如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了用于治疗、预防或改善如本文所描述的糖尿病的试剂盒，其中所述试剂盒包括：
(i)如本文所描述的化合物；和可选地
(ii)如本文所描述的附加药剂或疗法。
某些实施方案提供了用于治疗、预防或改善如本文所描述的代谢综合征的试剂盒，其中所述试剂盒包括：
(i)如本文所描述的化合物；和可选地
(ii)如本文所描述的附加药剂或疗法。
如本文所描述的试剂盒还可包括用于利用该试剂盒通过如本文所描述的组合治疗来治疗、预防或改善如本文所描述的代谢性疾病的说明书。在某些实施方案中，代谢性疾病是肥胖。在某些实施方案中，代谢性疾病是糖尿病。
在某些实施方案中，FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19基因表达水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用是FGF15和/或FGF19基因表达水平的升高。在某些实施方案中，FGF15和/或FGF19核酸是以下中所列序列中的任一者：GENBANK登录号NM_008003.2（作为SEQ ID NO:345并入本文）、GENBANK登录号：XM_001100825.1（作为SEQ ID NO:346并入本文）；和GENBANK登录号NM_005117.1（作为SEQ ID NO:347并入本文）。
某些实施方案提供了通过测量回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平的升高在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法。
某些实施方案提供了通过测量回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平的升高预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达(d)检测FGF15基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达(d)检测FGF19基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平(d)检测FGF15蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平(d)检测FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达(d)检测FGF15基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达(d)检测FGF19基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平(d)检测FGF15蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平(d)检测FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了用于治疗代谢性疾病的方法，所述代谢性疾病包括肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合，所述方法包括向在血液或组织中具有基线水平的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的受试者施用如第一剂量的本文所描述的化合物或组合物，并向所述受试者施用化合物或组合物的一个或多个另外剂量直至血液或组织中的FGF15或FGF19的水平在一定量的时间未从基线升高一定程度。
在一些方面，将一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周未从基线水平升高。
在某些方面，可将一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平未从基线升高至少约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述的百分比中的任何之间的任何值。
一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物的施用可持续直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平相对于基线水平的所述升高在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周不会发生。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围中的任何之间的任何量。
在某些方面，将一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平未从基线水平升高至少约1pg/mL、5pg/mL、10pg/mL、15pg/mL、20pg/mL、25pg/mL、30pg/mL、35pg/mL、40pg/mL、45pg/mL、50pg/mL、55pg/mL、60pg/mL、65pg/mL、70pg/mL、75pg/mL、80pg/mL、85pg/mL、90pg/mL、95pg/mL、100pg/mL、105pg/mL、110pg/mL、115pg/mL、120pg/mL、125pg/mL、130pg/mL、135pg/mL、140pg/mL、145pg/mL、150pg/mL、155pg/mL、160pg/mL、165pg/mL、170pg/mL、175pg/mL、180pg/mL、185pg/mL、190pg/mL、195pg/mL、200pg/mL、205pg/mL、210pg/mL、215pg/mL、220pg/mL、225pg/mL、230pg/mL、235pg/mL、240pg/mL、245pg/mL、250pg/mL、255pg/mL、260pg/mL、265pg/mL、270pg/mL、275pg/mL、280pg/mL、290pg/mL、295pg/mL、300pg/mL、350pg/mL、400pg/mL、450pg/mL、500pg/mL、550pg/mL、600pg/mL、650pg/mL、700pg/mL、750pg/mL、800pg/mL、850pg/mL、900pg/mL、950pg/mL、1,000pg/mL、2,000pg/mL或前述浓度的任何之间的任何值。一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物的施用可持续直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平相对于基线水平的所述升高在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周不会发生。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何之间的任何量。
将被理解的是可在前述的时间段中施用一个或多个剂量的本文所描述的化合物或组合物。例如，可在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周的过程中向受试者施用一个或多个剂量的本文所描述的化合物或组合物。在某些实施方案中，将另外剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平未从基线水平升高至少约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述时间段中的前述百分比的任何之间的任何值。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何之间的任何量。
多个实施方案涉及治疗代谢性疾病的方法，所述代谢性疾病包括肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合，所述方法包括(a)获得受试者的血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的基线水平，(b)向受试者施用如本文所描述的化合物或组合物的剂量，(c)在施用本文所描述的化合物或组合物之后获得血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平，和(d)重复步骤(b)和(c)直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平相对于基线在一定量的时间未升高一定量。
在若干方面，重复步骤(b)和(c)直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周相对于基线未升高。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何之间的任何量。
在某些方面，可将一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19的水平未从基线水平升高至少约1pg/mL、5pg/mL、10pg/mL、15pg/mL、20pg/mL、25pg/mL、30pg/mL、35pg/mL、40pg/mL、45pg/mL、50pg/mL、55pg/mL、60pg/mL、65pg/mL、70pg/mL、75pg/mL、80pg/mL、85pg/mL、90pg/mL、95pg/mL、100pg/mL、105pg/mL、110pg/mL、115pg/mL、120pg/mL、125pg/mL、130pg/mL、135pg/mL、140pg/mL、145pg/mL、150pg/mL、155pg/mL、160pg/mL、165pg/mL、170pg/mL、175pg/mL、180pg/mL、185pg/mL、190pg/mL、195pg/mL、200pg/mL、205pg/mL、210pg/mL、215pg/mL、220pg/mL、225pg/mL、230pg/mL、235pg/mL、240pg/mL、245pg/mL、250pg/mL、255pg/mL、260pg/mL、265pg/mL、270pg/mL、275pg/mL、280pg/mL、290pg/mL、295pg/mL、300pg/mL、350pg/mL、400pg/mL、450pg/mL、500pg/mL、550pg/mL、600pg/mL、650pg/mL、700pg/mL、750pg/mL、800pg/mL、850pg/mL、900pg/mL、950pg/mL、1,000pg/mL、2,000pg/mL或前述浓度的任何之间的任何值。一个或多个另外剂量的本文所描述的化合物或组合物的施用可持续直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平相对于基线水平的所述升高在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周不会发生。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围中的任何之间的任何量。
在某些实施方案中，治疗代谢性疾病和/或肥胖的方法包括(a)获得受试者的血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的基线水平，(b)将本文所描述的化合物或组合物的剂量施用于受试者，(c)在施用本文所描述的化合物或组合物之后获得血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平；和(d)重复步骤(b)和(c)直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平相对于基线在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周未升高约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述百分比的任何百分比之间中的任何值。在若干方面，本文所描述的化合物或组合物的每个剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围中的任何之间的任何量。
某些实施方案提供了治疗代谢性疾病的方法，所述代谢性疾病包括肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合，所述方法包括将第一剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于在血液或组织中具有基线水平的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的受试者，并将一个或多个另外较高剂量的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19的水平在一定量的时间从基线水平升高一定程度。在一些方面，所述方法还包括向受试者施用另外剂量的化合物或组合物以将血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白维持在基线水平以上的一定水平。将理解的是一个或多个另外较高剂量可以是相对于第一剂量或最近施用的另外较高剂量。
在一些方面，可将一个或多个另外较高剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周从基线水平升高。
在若干方面，本文所描述的化合物或组合物的一个或多个另外较高剂量为第一剂量或最近施用的另外较高剂量的至少约1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3.、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9.0、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9或10.0倍的量。在某些方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何之间的任何的量。
在某些方面，可将本文所描述的化合物或组合物的一个或多个另外较高剂量施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平从基线水平升高至少约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述百分比的任何之间的任何值。
本文所描述的化合物或组合物的一个或多个另外较高剂量的施用可持续直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平相对于基线水平的所述升高在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周发生。在某些方面，可将另外剂量的化合物或组合物施用于受试者以维持血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白在超过基线水平的一定水平上。在某些方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何之间的任何的量。
在某些方面，可将本文所描述的化合物或组合物的一种或多种较高的量施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平从基线水平升高至少约1pg/mL、5pg/mL、10pg/mL、15pg/mL、20pg/mL、25pg/mL、30pg/mL、35pg/mL、40pg/mL、45pg/mL、50pg/mL、55pg/mL、60pg/mL、65pg/mL、70pg/mL、75pg/mL、80pg/mL、85pg/mL、90pg/mL、95pg/mL、100pg/mL、105pg/mL、110pg/mL、115pg/mL、120pg/mL、125pg/mL、130pg/mL、135pg/mL、140pg/mL、145pg/mL、150pg/mL、155pg/mL、160pg/mL、165pg/mL、170pg/mL、175pg/mL、180pg/mL、185pg/mL、190pg/mL、195pg/mL、200pg/mL、205pg/mL、210pg/mL、215pg/mL、220pg/mL、225pg/mL、230pg/mL、235pg/mL、240pg/mL、245pg/mL、250pg/mL、255pg/mL、260pg/mL、265pg/mL、270pg/mL、275pg/mL、280pg/mL、290pg/mL、295pg/mL、300pg/mL、350pg/mL、400pg/mL、450pg/mL、500pg/mL、550pg/mL、600pg/mL、650pg/mL、700pg/mL、750pg/mL、800pg/mL、850pg/mL、900pg/mL、950pg/mL、1,000pg/mL、2,000pg/mL或前述浓度的任何之间的任何值。一个或多个另外较高剂量的本文所描述的化合物或组合物的施用可持续直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平相对于基线水平的所述升高在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周发生。在某些方面，可将另外剂量的化合物或组合物施用于受试者以将血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白维持在超过基线水平的前述浓度的任何处。在若干方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何范围之间中的任何量。
将理解的是可在前述的时间段中施用一个或多个较高剂量的本文所描述的化合物或组合物。例如，可在至少约一周、两周、三周、四周、五周、六周、七周、八周、九周、十周、十一周、十二周、十三周、十四周、十五周、十六周、十七周、十八周、十九周、二十周、二十一周、二十二周、二十三周、二十四周、二十五周、二十六周、二十七周、二十八周、二十九周、三十周、三十一周、三十二周、三十三周、三十四周、三十五周、三十六周、三十七周、三十八周、三十九周、四十周、四十一周、四十二周、四十三周、四十四周、四十五周、四十六周、四十七周、四十八周、四十九周或五十周的过程中将一个或多个剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者。在某些实施方案中，可将另外较高剂量的本文所描述的化合物或组合物施用于受试者直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平未从基线水平升高至少约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述时间段中的前述百分比的任何百分比之间中的任何值。在某些方面，可将另外剂量的化合物或组合物施用于受试者以将血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白维持在超过基线水平的前述升高的水平中的任一水平。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何范围之间中的任何量。
在某些实施方案中，治疗包括肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合的代谢性疾病的方法包括(a)获得受试者的血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的基线水平，(b)向受试者施用一定剂量的本文所描述的化合物或组合物，(c)在施用本文所描述的化合物或组合物之后获得血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平；和(d)重复步骤(b)和(c)直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平相对于基线水平升高至少约1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、100%、101%、102%、103%104%、105%、106%、107%、108%、109%、110%、111%、112%、113%、114%、115%、116%、117%、118%、119%、120%、121%、122%、123%、124%、125%、126%、127%、128%、129%、130%、131%、132%、133%、134%、135%、136%、137%、138%、139%、140%、141%、142%、143%、144%、145%、146%、147%、148%、149%、150%、151%、152%、153%、154%、155%、156%、157%、158%、159%、160%、161%、162%、163%、164%、165%、166%、167%、168%、169%、170%、171%、172%、173%、174%、175%、176%、177%、178%、179%、180%、181%、182%、183%、184%、185%、186%、187%、188%、189%、190%、191%、192%、193%、194%、195%、196%、197%、198%、199%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%或前述百分比的任何百分比之间中的任何值。在某些方面，步骤(d)中施用的剂量可以是比先前所施用的较高的剂量直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平升高前述百分比中的任一者。在某些方面，所述方法还包括向受试者施用另外剂量的化合物或组合物以将血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白维持在超过基线水平的前述升高的水平中的任一水平。在若干方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何范围之间中的任何量。
在某些实施方案中，治疗包括肥胖、糖尿病、高血糖、前驱糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）、代谢综合征、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症或其组合的方法包括(a)获得受试者的血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的基线水平，(b)向受试者施用一定剂量的本文所描述的化合物或组合物，(c)在施用本文所描述的化合物或组合物之后获得血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平；和(d)重复步骤(b)和(c)直至血液或组织中的FGF15或FGF19蛋白的水平升高至少约1pg/mL、5pg/mL、10pg/mL、15pg/mL、20pg/mL、25pg/mL、30pg/mL、35pg/mL、40pg/mL、45pg/mL、50pg/mL、55pg/mL、60pg/mL、65pg/mL、70pg/mL、75pg/mL、80pg/mL、85pg/mL、90pg/mL、95pg/mL、100pg/mL、105pg/mL、110pg/mL、115pg/mL、120pg/mL、125pg/mL、130pg/mL、135pg/mL、140pg/mL、145pg/mL、150pg/mL、155pg/mL、160pg/mL、165pg/mL、170pg/mL、175pg/mL、180pg/mL、185pg/mL、190pg/mL、195pg/mL、200pg/mL、205pg/mL、210pg/mL、215pg/mL、220pg/mL、225pg/mL、230pg/mL、235pg/mL、240pg/mL、245pg/mL、250pg/mL、255pg/mL、260pg/mL、265pg/mL、270pg/mL、275pg/mL、280pg/mL、290pg/mL、295pg/mL、300pg/mL、350pg/mL、400pg/mL、450pg/mL、500pg/mL、550pg/mL、600pg/mL、650pg/mL、700pg/mL、750pg/mL、800pg/mL、850pg/mL、900pg/mL、950pg/mL、1,000pg/mL、2,000pg/mL或前述浓度的任何浓度之间中的任何值。在某些方面，步骤(d)中施用的剂量可以是高于先前施用的较高剂量直至血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平升高前述百分比中的任一者。在某些方面，所述方法还包括向受试者施用另外剂量的化合物或组合物以将血液或组织中的FGF15或FGF19维持在超过基线水平的前述升高的浓度中的任何处。在一些方面，本文所描述的化合物或组合物的每种剂量可以为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、约100-200mg或前述范围的任何范围之间中的任何量。
血液或组织诸如肝组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平可通过一些已知的测定来获得。例如，FGF15或FGF19mRNA水平可通过定量RT-PCR来获得。FGF15或FGF19蛋白水平可例如通过利用大量熟知的免疫结合测定中的任何来获得，例如但不限于酶联免疫吸附测定（ELISA），其还称作“夹心测定”，酶法免疫测定，放射免疫测定（RIA）、荧光免疫测定（FIA）、化学发光免疫测定（CLIA）、计数免疫测定（CIA）、过滤介质酶免疫测定（MEIA）或荧光连接的免疫吸附测定（FLISA）。抗FGF15或FGF19mRNA或蛋白的一些商业上的抗体适宜于获得血液或组织中的FGF15或FGF19mRNA或蛋白的水平。此类商业上可获得的抗体可获自例如Abcam或SantaCruz Biotechnology。还可通过高效液相色谱（HPLC）、质谱法或表面等离子共振获得FGF15或FGF19蛋白水平。
反义化合物
寡聚化合物包括但不限于寡核苷酸、寡核苷、寡核苷酸类似物、寡核苷酸模拟物、反义化合物、反义寡核苷酸和siRNA。寡聚化合物可以是对于靶核酸“反义的”，意味着能够通过氢键与靶核酸进行杂交。
在某些实施方案中，反义化合物具有核碱基序列，当以5’到3’方向书写时，所述核碱基序列包含其所靶向的靶核酸的靶区段的反向互补物。在某些此类实施方案中，反义寡核苷酸具有核碱基序列，当以5’到3’方向书写时，所述核碱基序列包含其所靶向的靶核酸的靶区段的反向互补物。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物长度为12至30个核苷酸。换言之，反义化合物是12至30个连接的核碱基。在另外的实施方案中，反义化合物包含由8至80、10至50、15至30、18至21、20至80、20至35、20至30、20至29、20至28、20至27、20至26、20至25、20至24、20至23、20至22、20至21或20个连接的核碱基组成的修饰的寡核苷酸。在某些此类实施方案中，反义化合物包含由长度为8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79或80个（或上述值中任何两个限定的范围）连接的核碱基组成的修饰的寡核苷酸。
在某些实施方案中，反义化合物包括缩短的或截短的修饰的寡核苷酸。缩短的或截短的修饰的寡核苷酸可具有从5’端（5’截短）或可选地从3’端（3’截短）缺失的单一核苷。缩短的或截短的寡核苷酸可具有从5’端缺失的两个核苷或可选地可具有从3’端缺失的两个亚单位。或者，缺失的核苷可遍及修饰的寡核苷酸而分布，例如，在具有从5’端缺失的一个核苷和从3’端缺失的一个核苷的反义化合物中。
当单一的另外的核苷以延长的寡核苷酸存在时，另外的核苷可位于寡核苷酸的5’或3’端。当两个或多个另外的核苷存在时，添加的核苷可相互邻接，例如，在具有添加到5’端（5’添加）或可选地添加到3’端（3’添加）的两个核苷的寡核苷酸中。或者，添加的核苷可遍及反义化合物而分布，例如，在具有添加到5’端的一个核苷和添加到3’端的一个亚单位的寡核苷酸中。
增加或减小反义化合物诸如反义寡核苷酸的长度、和/或引入错配碱基而不消除活性是可能的。例如，在Woolf等(Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:7305-7309、1992)中，在卵母细胞注射模型中测试了13-25个核碱基长度的一系列反义寡核苷酸诱导靶RNA的裂解的能力。在靠近反义寡核苷酸的末端具有8或11个错配碱基的25个核碱基长度的反义寡核苷酸能够指导靶mRNA的特异性裂解，虽然程度低于不含错配的反义寡核苷酸。相似地，利用13个核碱基反义寡核苷酸（包括具有1个或3个错配的寡核苷酸）实现了靶向特异性裂解。
Gautschi等（J.Natl.Cancer Inst.93:463-471、March2001）证明了与bcl-2mRNA具有100%互补性且具有对于bcl-xL mRNA的3个错配的寡核苷酸在体外和体内降低bcl-2和bcl-xL的表达的能力。此外，该寡核苷酸表面了体内的有效的抗肿瘤活性。
Maher和Dolnick（Nuc.Acid.Res.16:3341-3358,1988）在兔网织红细胞中分别测试了一系列串联的14个核碱基反义寡核苷酸，和由两个或三个串联的反义寡核苷酸的序列组成的串联的28个和42个核碱基反义寡核苷酸阻滞人类DHFR的翻译的能力。单独的三种14个核碱基反义寡核苷酸中的每个能够抑制反义，虽然处于比28或42个核碱基反义寡核苷酸更适度的水平。
反义化合物基序
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物具有以模式或基序排列的化学上修饰的亚单位，以赋予反义化合物诸如增强的抑制活性、对于靶核酸的升高的结合亲和力或对于体内核酸酶降解的抗性的性质。
嵌合的反义化合物通常含有至少一个修饰的区域以赋予对核酸酶降解的升高的抗性、升高的细胞摄入、对于靶核酸的升高的结合亲和力、和/或升高的抑制活性。嵌合的反义化合物的第二区域可任选地作为细胞核酸内切酶RNase H的底物，其裂解RNA:DNA双链体的RNA链。
具有间隙聚体基序的反义化合物是所考虑的嵌合的反义化合物。在间隙聚体中，具有支持RNaseH裂解的多个核苷酸的内部区域位于具有化学上不同于内部区域的核苷的多个核苷酸的外部区域之间。在具有间隙聚体基序的反义寡核苷酸的情况中，间隙区段通常用作核酸内切酶裂解的底物，而翼状区段包括修饰的核苷。在某些实施方案中，间隙聚体的区域通过构成每个不同的区域的糖部分的类型来区分。用于区分间隙聚体的区域的糖部分的类型在一些实施方案中可包括β-D-核糖核苷、β-D-脱氧核糖核苷、2’-修饰的核苷（此类2’-修饰的核苷尤其可包括2’-MOE和2’-O-CH3）和双环糖修饰的核苷（此类双环糖修饰的核苷可包括具有受限乙基的那些）。在某些实施方案中，翼部可包括一些修饰的糖部分，包括，例如2’-MOE和受限的乙基。在某些实施方案中，翼部可包括一些修饰的和未修饰的糖部分。在某些实施方案中，翼部可包括2’-MOE核苷、受限的乙基核苷和2’-脱氧核苷的不同的组合。
每个不同的区域可包括均一的糖部分、变化的或交替的糖部分。翼部-间隙-翼部基序通常被描述为“X-Y-Z”，其中“X”代表5’-翼部的长度，“Y”代表间隙的长度，和“Z”代表3’-翼部的长度。“X”和“Z”可包括均一的、变化的或交替的糖部分。在某些实施方案中，“X”和“Y”可包括一种或多种2’-脱氧核苷。“Y”可包括2’-脱氧核苷。如本文所用，被描述为“X-Y-Z”的间隙聚体具有使得间隙位于紧邻5’-翼部和3’翼部中每一个的构型。这样，在5’-翼部与间隙之间或间隙与3’-翼部之间无介入核苷酸存在。如本文所描述的反义化合物中的任何可具有间隙聚体基序。在某些实施方案中，“X”和“Z”是相同的，在另外的实施方案中其是不同的。在某些实施方案中，“Y”在8和15个核苷之间。X、Y或Z可以是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30或更多个核苷中的任一者。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物具有5-10-5间隙聚体基序。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物具有3-10-4间隙聚体基序。
靶核酸、靶区域和核苷酸序列
在某些实施方案中，FGFR4核酸是以下中所列出的序列中的任一者：GENBANK登录号NM_002011.3（作为SEQ ID NO:1并入本文）、GENBANK登录号：NT_023133.11（从第21323018位至第21335213位核苷截短）（作为SEQ ID NO:2并入本文）；GENBANK登录号AB209631.1（作为SEQ ID NO:3并入本文）和GENBANK登录号NM_022963.2（作为SEQ ID NO:4并入本文）。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号NW_001121000.1从第3094000位至第3109000位核苷截短的中所列出的恒河猴序列（SEQID NO:5）。在某些实施方案中，FGFR4具有GENBANK登录号BC033313.1中所列出的鼠类序列（SEQ ID NO:6）。
应理解的是本文所包含的实施例中的每个SEQ ID NO中所列出的序列与对糖部分、核苷间键或核碱基的任何修饰无关。这样，SEQID NO所限定的反义化合物可独立地包括，对糖部分、核苷间键或核碱基的一种或多种修饰。由Isis编号（Isis No）所描述的反义化合物指示核碱基序列和基序的组合。
在某些实施方案中，靶区域是结构上限定的靶核酸的区域。例如，靶区域可包括3’UTR、5’UTR、外显子、内含子、外显子/内含子接头、编码区域、翻译起始区域、翻译终止区域或其它限定的核酸区域。FGFR4的结构上限定的区域可通过从诸如NCBI的序列数据库的登录号来获得，且该信息通过引用并入本文。在某些实施方案中，靶区域可包括从靶区域中的一个靶区段的5’靶位到相同的靶区域中的另一靶区段的3’靶位。
靶向包含反义化合物所杂交的至少一个靶区段的确定，从而发生需要的作用。在某些实施方案中，需要的作用是mRNA靶核酸水平的降低。在某些实施方案中，需要的作用是靶核酸编码的蛋白的水平的降低或与靶核酸关联的表型改变。
靶区域可包含一个或多个靶区段。靶区域中的多个靶区段可以重叠的。或者，其可以是非重叠的。在某些实施方案中，靶区域中的靶区段被不超过约300个核苷酸所隔开。在某些实施方案中，靶区域中的靶区段被大量核苷酸所隔开，所述大量核苷酸为约，不超过，不超过约靶核酸上的250、200、150、100、90、80、70、60、50、40、30、20或10个或前述的值的任何两个所限定的范围的核苷酸。在某些实施方案中，靶区域中的靶区段被不超过或不超过约靶核酸上的5个核苷酸所隔开。在某些实施方案中，靶区段是连续的。考虑的是由为本文所列的5’靶位或3’靶位中任一者的起始核酸的范围所限定的靶区域。
适宜的靶区段可见于5’UTR、编码区域、3’UTR、内含子、外显子或外显子/内含子接头处。含有起始密码子或终止密码子的靶区段也是适宜的靶区段。适宜的靶区段可特异性地排除某些结构上限定的区域诸如起始密码子或终止密码子。
适宜的靶区段的决定可包括靶核酸的序列与贯穿基因组的其它序列的比较。例如，可使用BLAST算法来鉴定不同的核酸之间的相似性的区域。该比较可避免可能以非特异性方式与除所选择的靶核酸外的序列杂交的反义化合物序列的选择（即，非靶序列或脱靶序列）。
活性靶区域中的反义化合物的活性（例如，如通过靶核酸水平的百分比减少所限定的）可能存在差异。在某些实施方案中，FGFR4mRNA水平的降低指示FGFR4表达的抑制。FGFR4蛋白的水平的降低还指示了靶mRNA表达的抑制。此外，表型改变指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，降低的葡萄糖水平、降低的磷脂水平和降低的体重可指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，与代谢性疾病相关联的症状的改善可指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，与糖尿病相关联的症状的改善可指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，胰岛素抗性的降低指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，糖尿病生物标志物的降低可指示FGFR4表达的抑制。在某些实施方案中，FGFR4表达的降低伴随FGF15和/或FGF19基因表达的升高和/或FGF15和/或FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4表达的降低伴随回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平的升高。因此，某些实施方案提供了通过测量回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平测量FGFR表达的降低的方法。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19基因表达水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19基因表达水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸引起的抗肥胖作用的生物标志物是FGF15和/或FGF19基因表达水平的升高。
某些实施方案提供了通过在动物中测量回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平的升高检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达(d)检测FGF15基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达(d)检测FGF19基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平(d)检测FGF15蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平(d)检测FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达(d)检测FGF15基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达(d)检测FGF19基因表达的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了通过测量回肠FGF15和/或回肠FGF19基因表达和血浆FGF15和/或血浆FGF19蛋白水平的升高预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法。
某些实施方案提供了预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平(d)检测FGF15蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
某些实施方案提供了预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：(a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平(b)施用FGFR4抑制剂(c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平(d)检测FGF19蛋白水平的升高。在某些实施方案中，FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
杂交
在一些实施方案中，杂交发生在本文所公开的反义化合物和FGFR4核酸之间。杂交的最常见的机制包括核酸分子的互补核碱基之间的氢键结合（例如，Watson-Crick，Hoogsteen或反向的Hoogsteen氢键合）。
杂交可在不同的条件下发生。严格的条件是序列依赖性的且由待被杂交的核酸分子的性质和组成决定。
确定序列是否是与靶核酸可杂交的方法是本领域中熟知的。在某些实施方案中，本文提供的反义化合物是与FGFR4核酸特异性可杂交的。
互补性
当反义化合物的足够数目的核碱基可与靶核酸相应的核碱基氢键结合时，反义化合物和靶核酸是相互互补的，从而将发生需要的作用（例如，靶核酸诸如FGFR4核酸的反义抑制）。
反义化合物可跨越FGFR4核酸的一个或多个区段杂交，从而插入的或邻接的区段不参与杂交事件（例如，环结构、错配或发夹结构）。
在某些实施方案中，本文所提供的反义化合物，或其特定的部分与FGFR4核酸、靶区域、靶区段或其特定的部分为，或至少为70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补。反义化合物与靶核酸的互补性百分比可利用常规方法来确定。
例如，反义化合物，其中反义化合物的20个核碱基中的18个与靶区域互补，且因此将特异性杂交，则其代表90%互补性。在该例中，其余的非互补核碱基可聚集或散布于互补的核碱基，且不必相互连续或与互补核碱基连续。这样，具有4个非互补核碱基翼部为与靶核酸完全互补的两个区域的长度为18个核碱基的反义化合物将具有与靶核酸的77.8%的整体互补性且因此将属于本发明的范围。反义化合物与靶核酸的区域的互补性百分比可利用本领域中已知的BLAST（基本局部比对搜索工具）和PowerBLAST程序来常规地确定（Altschul等，J.Mol.Biol.,1990,215,403410；Zhang和Madden,Genome Res.,1997,7,649656）。同源性、序列同一性或互补性百分比可通过使用例如Smith和Waterman的算法（Adv.Appl.Math.,1981,2,482489）的Gap程序（Wisconsin Sequence Analysis Package,针对Unix的版本8,Genetics Computer Group,University Research Park,Madison Wis.）利用默认设置来确定。
在某些实施方案中，本文所提供的反义化合物或其特定的部分与靶核酸或其特定的部分完全互补（即，100%互补）。例如，反义化合物可与FGFR4核酸或其靶区域或靶区段或靶序列完全互补。如本文所用，“完全互补”意为反义化合物的每个核碱基能够与靶核酸的相应的核碱基精确的碱基配对。例如，20个核碱基的反义化合物与400个核碱基长的靶序列完全互补，只要靶核酸的对应的20个核碱基部分与反义化合物完全互补。完全互补还可用于指第一和/或第二核酸的特定的部分。例如，30个核碱基反义化合物的20个核碱基部分可以与400个核碱基长度的靶序列“完全互补”。若靶序列具有对应的20个核碱基部分，其中每个核碱基与反义化合物的20个核碱基部分互补，则30个核碱基寡核苷酸的20个核碱基部分与靶序列完全互补。同时，根据反义化合物的其余10个核碱基是否还与靶序列互补，整个30个核碱基反义化合物可能或可能不与靶序列完全互补。
非互补性核碱基的位置可在反义化合物的5’端或3’端。或者，非互补性核碱基可在反义化合物的内部位置。当存在两个或多个非互补性核碱基时，其可以是连续的（即，连接的）或非连续的。在一个实施方案中，非互补性核碱基位于间隙聚体反义寡核苷酸的翼状区段中。
在某些实施方案中，长度为或长度最多至12、13、14、15、16、17、18、19或20个核碱基的反义化合物相对于靶核酸诸如FGFR4核酸或其特定的部分包括不超过4个、不超过3个、不超过2个或不超过1个非互补性核碱基。
在某些实施方案中，长度为或长度最多至12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核碱基的反义化合物相对于靶核酸诸如FGFR4核酸或其特定的部分包括不超过6个、不超过5个、不超过4个、不超过3个、不超过2个或不超过1个非互补性核碱基。
本文提供的反义化合物还包括与靶核酸的部分互补的那些。如本文所用，“部分”指靶核酸的区域或区段中限定的数目的连续的（即，连接的）核碱基。“部分”还可指反义化合物的限定数目的连续核碱基。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少8个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少12个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少13个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少14个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少15个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少16个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少17个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少18个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少19个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段的至少20个核碱基部分互补。还考虑的是与靶区段的至少9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多个，或由这些值中的任何两个限定的范围的核碱基部分互补的反义化合物。
同一性
本文提供的反义化合物还可与特定的核苷酸序列、SEQ ID NO或特定的Isis编号代表的化合物或其部分具有特定的同一性百分比。如本文所用，若其具有相同的核碱基配对能力则反义化合物与本文所公开的序列相同。例如，在未公开的DNA序列中胸腺嘧啶的位置含有尿嘧啶的RNA被认为与该DNA序列是相同的，因为尿嘧啶和胸腺嘧啶均可与腺嘌呤配对。还考虑了本文所描述的反义化合物的缩短的或延长的形式以及相对于本文所提供的反义化合物具有非相似的碱基的化合物。非相似的碱基可以是相互邻接的或散布在反义化合物中。根据相对其所比较的序列具有相同的碱基配对的碱基的数目计算反义化合物的同一性百分比。
在某些实施方案中，本文公开了与反义化合物、SEQ ID NO或其部分中的一个或多个至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一的反义化合物或其部分。
修饰
核苷是碱基-糖组合。核苷的核碱基（也称作碱基）部分通常是杂环碱基部分。核苷酸是还包括与核苷的糖部分共价连接的磷酸基团的核苷。对于包括戊呋喃糖基糖的那些核苷，可将磷酸基团与糖的2’、3’或5’羟基部分连接。通过邻接的核苷相互的共价键形成线性聚合的寡核苷酸而形成寡核苷酸。在寡核苷酸结构中，常涉及磷酸基团形成寡核苷酸的核苷间键。
对反义化合物的修饰包括对于核苷间键、糖部分或核碱基的置换或改变。由于需要的性质诸如，例如，增强的细胞摄入、对核酸靶标的增强的亲和力、在核酸酶的存在下增强的稳定性或升高的抑制活性，修饰的反义化合物常优于天然的形式。
还可应用化学修饰的核苷来升高缩短的或截短的反义寡核苷酸对于其靶核酸的结合亲和力。因此，利用具有此类化学修饰的核苷的较短的反义化合物常获得相当的结果。
修饰的核苷间键
RNA和DNA的天然存在的核苷间键是3’至5’磷酸二酯键。由于需要的性质诸如，例如，增强的细胞摄入、对核酸靶标的增强的亲和力和在核酸酶的存在下增强的稳定性，具有一个或多个修饰的，即，非天然存在的核苷间键的反义化合物常优于具有天然存在的核苷间键而被选择。
具有修饰的核苷间键的寡核苷酸包括保留磷原子的核苷间键以及不具有磷原子的核苷间键。含核苷间键的代表性磷包括但不限于磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯、氨基磷酸酯和硫代磷酸酯。制备含磷键和含非磷键的方法是熟知的。
在某些实施方案中，靶向FGFR4的反义化合物包括一种或多种修饰的核苷间键。在某些实施方案中，修饰的核苷间键是硫代磷酸酯键。在某些实施方案中，反义化合物的每个核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。
修饰的糖部分
本文所提供的反义化合物可任选地含有其中糖基团已被修饰的一个或多个核苷。此类糖修饰的核苷可赋予反义化合物增强的核酸酶稳定性、升高的结合亲和力或一些其它有利的生物性质。在某些实施方案中，核苷包含化学上修饰的呋喃核糖环部分。化学上修饰的呋喃核糖环的例子包括但不限于取代基（包括5’和2’取代基团）的添加；非偕位还原子的桥连基以形成双环核酸（BNA）；S、N(R)或C(R1)(R)2（R=H，C1-C12烷基或保护基）对核糖基环氧原子的替代；和其组合。化学上修饰的糖的例子包括，2’-F-5’-甲基取代的核苷（参见，于8/21/08公布的PCT国际申请WO2008/101157，关于其它公开的5’、2’-双取代的核苷），在2’-位置具有另外的置换时S对核糖基环氧原子的替代（参见，于2005年6月16日公开的美国专利申请US2005/0130923），或可选地，BNA的5’-取代（参见，于11/22/07公布的PCT国际申请WO2007/134181，其中LNA被例如5’-甲基或5’-乙烯基所置换）。
具有修饰的糖部分的核苷的例子包括但不限于包括5’-乙烯基、5’-甲基(R或S)、4’-S、2’-F、2’-OCH3和2’-O(CH2)2OCH3取代基的核苷。2’位置的取代基还可选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C1-C10烷基、OCF3、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)和O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)，其中每个Rm和Rn独立地为H或取代的或未取代的C1-C10烷基。
如本文所用，“双环核苷”指包括双环糖部分的修饰的核苷。双环核苷的例子包括但不限于在4’和2’核糖基还原子之间包括桥连基的核苷。在某些实施方案中，本文提供的反义化合物包括一个或多个双环核苷，其中桥连基包括4’至2’双环核苷。此类4’至2’双环核苷的例子包括但不限于以下式中之一：4’-(CH2)-O-2’（LNA）；4’-(CH2)-S-2’；4’-(CH2)2-O-2’（ENA）；4’-CH(CH3)-O-2’和4’-CH(CH2OCH3)-O-2’和其类似物（参见，于2008年7月15日公布的美国专利7,399,845）；4’-C(CH3)(CH3)-O-2’和其类似物（参见于2009年1月8日公开的PCT国际申请WO2009/006478）；4’-CH2-N(OCH3)-2’和其类似物（参见2008年11月11日公开的PCT国际申请WO2008/150729）；4’-CH2-O-N(CH3)-2’（参见于2004年9月2日公开的美国专利申请US2004/0171570）；4’-CH2-N(R)-O-2’，其中R是H、C1-C12烷基或保护基（参见，于2008年9月23日公布的美国专利7,427,672）；4’-CH2-C(H)(CH3)-2’（参见，Chattopadhyaya等,J.Org.Chem.,2009,74,118-134）；和4’-CH2-C(=CH2)-2’和其类似物（参见，于2008年12月8日公开的PCT国际申请WO2008/154401）。还参见，例如：Singh等,Chem.Commun.,1998,4,455-456；Koshkin等,Tetrahedron,1998,54,3607-3630；Wahlestedt等,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2000,97,5633-5638；Kumar等,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219-2222；Singh等,J.Org.Chem.,1998,63,10035-10039；Srivastava等,J.Am.Chem.Soc.,129(26)8362-8379（2007年7月4日）；Elayadi等,Curr.Opinion Invens.Drugs,2001,2,558-561；Braasch等,Chem.Biol.,2001,8,1-7；Orum等,Curr.Opinion Mol.Ther.,2001,3,239-243；美国专利第U.S.6,670,461号、第7,053,207号、第6,268,490号、第6,770,748号、第6,794,499号、第7,034,133号、第6,525,191号、第7,399,845号；公开的PCT国际申请WO2004/106356、WO94/14226、WO2005/021570和WO2007/134181；美国专利公开第US2004/0171570号、第US2007/0287831号和第US2008/0039618号；和美国专利序列号12/129,154、60/989,574、61/026,995、61/026,998、61/056,564、61/086,231、61/097,787和61/099,844；和PCT国际申请第PCT/US2008/064591号、第PCT/US2008/066154号和第PCT/US2008/068922号。前述双环核苷的每一个可被制备为具有一个或多个立体化学糖构型，包括例如，α-L-呋喃核糖和β-D-呋喃核糖（参见于1999年3月25日作为WO99/14226公开的PCT国际申请PCT/DK98/00393）。
在某些实施方案中，BNA核苷的双环糖部分包括但不限于在戊呋喃糖基糖部分的4’和2’位置之间具有至少一个桥连基的化合物，其中所述桥连基独立地包括1个或从2个至4个连接的基团，所述连接的基团独立地选自-[C(Ra)(Rb)]n-、-C(Ra)=C(Rb)-、-C(Ra)=N-、-C(=NRa)-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(Ra)2-、-S(=O)x-和-N(Ra)-；
其中：
x是0、1或2；
n是1、2、3或4；
每个Ra和Rb独立地为H、保护基、羟基、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C5-C7脂环基、取代的C5-C7脂环基、卤素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(=O)2-J1)或硫氧基(S(=O)-J1)；和
每个J1和J2独立地为H、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C1-C12氨基烷基、取代的C1-C12氨基烷基或保护基。
在某些实施方案中，双环糖部分的桥连基是，-[C(Ra)(Rb)]n-、-[C(Ra)(Rb)]n-O-、-C(RaRb)-N(R)-O-或-C(RaRb)-O-N(R)-。在某些实施方案中，桥连基是4’-CH2-2’、4’-(CH2)2-2’、4’-(CH2)3-2’、4’-CH2-O-2’、4’-(CH2)2-O-2’、4’-CH2-O-N(R)-2’和4’-CH2-N(R)-O-2’-，其中每个R独立地为H、保护基或C1-C12烷基。
在某些实施方案中，双环核苷由同分异构构型进一步限定。例如，含4’-2’亚甲基-氧桥连基的核苷可以为α-L构型或β-D构型。先前，已将α-L-亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA掺入到显示反义活性的反义寡核苷酸中。（Frieden等.,Nucleic Acids Research,2003,21,6365-6372).
在某些实施方案中，双环核苷包括但不限于如以下所描述的(A)α-L-亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA、(B)β-D-亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA、(C)亚乙基氧(4’-(CH2)2-O-2’)BNA、(D)氨基氧(4’-CH2-O-N(R)-2’)BNA、(E)氧氨基(4’-CH2-N(R)-O-2’)BNA、(F)甲基(亚甲基氧)(4’-CH(CH3)-O-2’)BNA、(G)亚甲基-硫代(4’-CH2-S-2’)BNA、(H)亚甲基-氨基(4’-CH2-N(R)-2’)BNA、(I)甲基碳环(4’-CH2-CH(CH3)-2’)BNA和(J)丙烯基碳环(4’-(CH2)3-2’)BNA。
Figure BDA0000435860670001131
其中Bx是碱基部分且R独立地为H、保护基或C1-C12烷基。
在某些实施方案中，双环核苷具有式I：
其中：
Bx是杂环碱基部分；
-Qa-Qb-Qc-是-CH2-N(Rc)-CH2-、-C(=O)-N(Rc)-CH2-、-CH2-O-N(Rc)-,-CH2-N(Rc)-O-或-N(Rc)-O-CH2；
Rc是C1-C12烷基或氨基保护基；和
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接。
在某些实施方案中，双环核苷具有式II：
Figure BDA0000435860670001142
其中：
Bx是杂环碱基部分；
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接。
Za是C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、取代的C1-C6烷基、取代的C2-C6烯基、取代的C2-C6炔基、酰基、取代的酰基、取代的酰胺、硫醇或取代的硫基。
在一个实施方案中，取代的基团的各自独立地为具有取代基的单取代的或多取代的，所述取代基独立地选自卤素、氧代、羟基、OJc、NJcJd、SJc、N3、OC(=X)Jc和NJeC(=X)NJcJd，其中每个Jc、Jd和Je独立地为H、C1-C6烷基或取代的C1-C6烷基和X是O或NJc。
在某些实施方案中，双环核苷具有式III：
Figure BDA0000435860670001151
其中：
Bx是杂环碱基部分；
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接；
Zb是C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、取代的C1-C6烷基、取代的C2-C6烯基、取代的C2-C6炔基或取代的酰基(C(=O)-)。
在某些实施方案中，双环核苷具有式IV：
Figure BDA0000435860670001161
其中：
Bx是杂环碱基部分；
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接；
Rd是C1-C6烷基、取代的C1-C6烷基、C2-C6烯基、取代的C2-C6烯基、C2-C6炔基或取代的C2-C6炔基；
每个qa、qb、qc和qd独立地为H、卤素、C1-C6烷基、取代的C1-C6烷基、C2-C6烯基、取代的C2-C6烯基、C2-C6炔基或取代的C2-C6炔基、C1-C6烷氧基、取代的C1-C6烷氧基、酰基、取代的酰基、C1-C6氨基烷基或取代的C1-C6氨基烷基；
在某些实施方案中，双环核苷具有式V：
Figure BDA0000435860670001162
其中：
Bx是杂环碱基部分；
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接；
qa、qb、qe和qf各自独立地为H、卤素、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基或取代的C2-C12炔基、C1-C12烷氧基、取代的C1-C12烷氧基、OJj、SJj、SOJj、SO2Jj、NJjJk、N3、CN、C(=O)OJj、C(=O)NJjJk、C(=O)Jj、O-C(=O)-NJjJk、N(H)C(=NH)NJjJk、N(H)C(=O)NJjJk或N(H)C(=S)NJjJk；
或qe和qf共同为=C(qg)(qh)；
qg和qh各自独立地为H、卤素、C1-C12烷基或取代的C1-C12烷基。
已描述了亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA单体腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、5-甲基-胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶的合成和制备以及其寡聚化和核酸识别性质（参见，例如，Koshkin等.,Tetrahedron,1998,54,3607-3630）。WO98/39352和WO99/14226中描述了BNA及其制备。
还已制备了亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA、亚甲基氧(4’-CH2-O-2’)BNA和2’-硫代-BNA的类似物（参见，例如，Kumar等.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219-2222）。还已描述了包括作为核酸聚合酶的底物的寡聚脱氧核苷酸双链体的封闭的核苷类似物的制备（参见，例如，Wengel等,WO99/14226）。此外，本领域中已描述了新颖的构象受限的高亲和力寡核苷酸类似物2’-氨基-BNA的合成（参见，例如，Singh等,J.Org.Chem.,1998,63,10035-10039）。此外，已制备了2’-氨基-和2’-甲基氨基-BNA’s且先前已报道了其具有互补RNA和DNA链的双链体的热稳定性。
在某些实施方案中，双环核苷具有式VI：
Figure BDA0000435860670001181
其中：
Bx是杂环碱基部分；
Ta和Tb各自独立地为H、羟基保护基、缀合基团、反应性磷基团、磷部分或与支持介质的共价连接。
每个qi、qj、qk和ql独立地为H、卤素、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基或取代的C2-C12炔基、C1-C12烷氧基、取代的C1-C12烷氧基、OJj、SJj、SOJj、SO2Jj、NJjJk、N3、CN、C(=O)OJj、C(=O)NJjJk、C(=O)Jj、O-C(=O)NJjJk、N(H)C(=NH)NJjJk、N(H)C(=O)NJjJk或N(H)C(=S)NJjJk；和
qi和qj或ql和qk共同为=C(qg)(qh)，其中qg和qh各自独立地为H、卤素、C1-C12烷基或取代的C1-C12烷基。
已公开了具有4’-(CH2)3-2’桥连基的一种碳环双环核苷和烯基类似物，桥连基4’-CH=CH-CH2-2’（参见，例如，Freier等,Nucleic AcidsResearch,1997,25(22),4429-4443和Albaek等,J.Org.Chem.,2006,71,7731-7740）。还已描述了碳环双环核苷的合成和制备及其寡聚化和生物化学研究（参见，例如，Srivastava等,J.Am.Chem.Soc.2007,129(26),8362-8379）。
如本文所用，“4’-2’双环核苷”或“4’到2’双环核苷”指含包括连接2’碳原子和4’碳原子的桥连基的呋喃糖环的双环核苷。
如本文所用，“单环核苷”指包括非双环糖部分的修饰的糖部分的核苷。在某些实施方案中，核苷的糖部分或糖部分类似物可在任何位置被修饰或被取代。
如本文所用，“2’-修饰的糖”意为在2’位置处修饰的呋喃糖基糖。在某些实施方案中，此类修饰包括选自以下的取代基：卤化物，包括但不限于取代的和未取代的烷氧基、取代的和未取代的硫代烷基、取代的和未取代的氨基烷基、取代的和未取代的烷基、取代的和未取代的烯丙基和取代的和未取代的炔基。在某些实施方案中，2’修饰选自取代基，包括但不限于：O[(CH2)nO]mCH3、O(CH2)nNH2、O(CH2)nCH3、O(CH2)nONH2、OCH2C(=O)N(H)CH3和O(CH2)nON[(CH2)nCH3]2，其中n和m为从1到约10。其它的2’-取代基还可选自：C1-C12烷基；取代的烷基；烯基；炔基；烷芳基；芳烷基；O-烷芳基或O-芳烷基；SH；SCH3；OCN；Cl；Br；CN；CF3；OCF3；SOCH3；SO2CH3；ONO2；NO2；N3；NH2；杂环烷基；杂环烷芳基；氨基烷基氨基；聚烷基氨基；取代的甲硅烷基；RNA裂解基团；报告基团；插入子；和用于提高药物代谢性质的基团；和用于提高反义化合物的药物代谢性质的基团，和具有相似的性质的其它取代基。在某些实施方案中，修饰的核苷酸包括2’-MOE侧链（参见，例如，Baker等,J.Biol.Chem.,1997,272,11944-12000）。已描述了此类2’-MOE置换具有与未修饰的核苷和其它修饰的核苷诸如2’-O-甲基、O-丙基和O-氨基丙基相比较提高的结合亲和力。还已显示了具有2’-MOE取代基的寡核苷酸为基因表达的反义抑制剂，具有体内应用的期望的特征（参见，例如，Martin,P.,Helv.Chim.Acta,1995,78,486-504；Altmann等,Chimia,1996,50,168-176；Altmann等,Biochem.Soc.Trans.,1996,24,630-637；和Altmann等,Nucleosides Nucleotides,1997,16,917-926）。
如本文所用，“修饰的四氢吡喃核苷”或“修饰的THP核苷”意为在正常的核苷中对于戊呋喃糖基残基中具有六元四氢吡喃“糖”取代的核苷（糖取代物）。修饰的THP核苷包括但不限于在本领域中被称作己糖醇核酸（HNA）、木密醇核酸（ANA）、甘露醇核酸（MNA）（参见Leumann,CJ.Bioorg.&Med.Chem.(2002)10:841-854），氟代HNA（F-HNA）或具有式X的那些化合物：
式X：
其中对于式X的所述至少一个四氢吡喃核苷类似物中的每一个独立地：
Bx是杂环碱基部分；
T3和T4各自独立地为将四氢吡喃核苷类似物与反义化合物连接的核苷间键基团或T3和T4中之一为将四氢吡喃核苷类似物与反义化合物连接的核苷间键基团且T3和T4中另外的为H、羟基保护基团、连接的缀合基团或5’或3’端基；
q1、q2、q3、q4、q5、q6和q7各自独立地为H、C1-C6烷基、取代的C1-C6烷基、C2-C6烯基、取代的C2-C6烯基、C2-C6炔基或取代的C2-C6炔基；以及
R1和R2中之一为氢且另外的选自卤素、取代或未取代的烷氧基，NJ1J2、SJ1、N3、OC(=X)J1、OC(=X)NJ1J2、NJ3C(=X)NJ1J2、和CN，其中X是O、S或NJ1，和每个J1、J2和J3独立地为H或C1-C6烷基。
在某些实施方案中，提供了式X的修饰的THP核苷，其中qm、qn、qp、qr、qs、qt和qu每一个为H。在某些实施方案中，qm、qn、qp、qr、qs、qt和qu中的至少一个非H。在某些实施方案中，qm、qn、qp、qr、qs、qt和qu中的至少一个为甲基。在某些实施方案中，提供了式X的THP核苷，其中R1和R2为F。在某些实施方案中，R1为氟和R2为H，R1为甲氧基和R2为H，和R1为甲氧基乙氧基和R2为H。
如本文所用，“2’-修饰的”或“2’-取代的”指包括在2’位置含除H或OH外的取代基的糖的核苷。2’-修饰的核苷包括但不限于双环核苷，其中连接糖环的两个碳原子桥连接糖环和核苷的2’碳和另一个碳与非桥连基的2’取代基，诸如烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C1-C10烷基、-OCF3、O-(CH2)2-O-CH3、2’-O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)或O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)，其中每个Rm和Rn独立地为H或取代的或未取代的C1-C10烷基。2’-修饰的核苷还可在例如糖的其它位置和/或核碱基处包括其它修饰。
如本文所用，“2’-F”指在2’位置处包括氟代基团的糖。
如本文所用，“2’-OMe”或“2’-OCH3”或“2’-O-甲基”每个指在糖环的2’位置处包括-OCH3基团的糖。
如本文所用，“寡核苷酸”指包括多个连接的核苷的化合物。在某些实施方案中，多个核苷中的一个或多个是修饰的。在某些实施方案中，寡核苷酸包括一个或多个核糖核苷（RNA）和/或脱氧核糖核苷（DNA）。
许多其它的双环和三环糖取代物环系统也是本领域中已知的，可用于修饰用于掺入到反义化合物中的核苷（参见，例如，参见论文：Leumann，J.C,Bioorganic&Medicinal Chemistry,2002,10,841-854）。
此类环系统可进行多种另外的取代以增强活性。
用于制备修饰的糖的方法是本领域中的那些技术人员熟知的。
在具有修饰的糖部分的核苷酸中，维持核碱基部分（天然的、修饰的或其组合）以与适当的核酸靶标杂交。
在某些实施方案中，反义化合物包括一个或多个具有修饰的糖部分的核苷酸。在某些实施方案中，修饰的糖部分是2’-MOE。在某些实施方案中，2’-MOE修饰的核苷酸以间隙聚体基序排列。在某些实施方案中，修饰的糖部分是cEt。在某些实施方案中，cEt修饰的核苷酸贯穿间隙聚体基序的翼部排列。
修饰的核碱基
核碱基（或碱基）修饰或置换虽然功能上与天然存在的或合成的未修饰的核碱基是可互换的，结构上与之不同。天然的和修饰的核碱基能够参与氢键结合。此类核碱基修饰可赋予反义化合物核酶稳定性、结合亲和力或一些其它的有利的生物性质。修饰的核碱基包括合成的和天然的核碱基诸如，例如，5-甲基胞嘧啶（5-me-C）。某些核碱基置换，包括5-甲基胞嘧啶，对于提高反义化合物对于靶核酸的结合亲和力是特别有用的。例如，已显示5-甲基胞嘧啶置换提高核酸双链体稳定性0.6-1.2℃（Sanghvi,Y.S.,Crooke,S.T.和Lebleu,B.,编,Antisense Research and Applications,CRC Press,Boca Raton,1993,第276-278页）。
另外未修饰的核碱基包括5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、6-甲基和腺嘌呤和鸟嘌呤的其它烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基和其它烷基衍生物、2-硫尿嘧啶、2-硫胸腺嘧啶和2-硫胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和胞嘧啶、5-丙炔基（-C≡C-CH3）尿嘧啶和胞嘧啶和嘧啶碱基的其它炔基衍生物，6-偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5-尿嘧啶（假尿嘧啶）、4-硫尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫代、8-硫烷基、8-羟基和其它8-取代的腺嘌呤和鸟嘌呤，5-卤代尤其是5-溴代、5-三氟甲基和5-取代的尿嘧啶和胸腺嘧啶、7-甲基鸟嘌呤和7-甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-氨基-腺嘌呤、8-氮鸟嘌呤和8-氮腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤和7-脱氮腺嘌呤和3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。
杂环碱基部分还可包括其中嘌呤或嘧啶碱基被其它杂环取代的那些，例如7-脱氮-腺嘌呤、7-脱氮鸟苷、2-氨基嘧啶和2-吡啶酮。对于升高反义化合物的结合亲和力特别有用的核碱基包括5-取代的嘧啶、6-氮杂嘧啶和N-2、N-6和O-6取代的嘌呤，包括2氨基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶和5-丙炔基胞嘧啶。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物包括一个或多个修饰的核碱基。在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的间隙增宽的反义寡核苷酸包括一个或多个修饰的核碱基。在某些实施方案中，修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，每个胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
用于配制药物组合物的组合物和方法
可将反义寡核苷酸与药学上可接受的活性的或惰性的物质相混合以制备药物组合物或制剂。用于药物组合物的配制的组合物和方法取决于大量的标准，包括但不限于施用路径、疾病的程度或待施用的剂量。
通过将反义化合物与适宜的药学上可接受的稀释剂或载体相组合而将靶向FGFR4核酸的反义化合物用于药物组合物。药学上可接受的稀释剂包括磷酸缓冲盐溶液（PBS）。PBS是适用于待胃肠外递送的组合物的稀释剂。因此，在某些实施方案中，应用于本文所描述的方法的是包含靶向FGFR4核酸的反义化合物和药学上可接受的稀释剂的药物组合物。在某些实施方案中，药学上可接受的稀释剂是PBS。在某些实施方案中，反义化合物是反义寡核苷酸。
包含反义化合物的药物组合物包含任何药学上可接受的盐、酯或所述酯的盐或任何其它寡核苷酸，当将其施用于包括人的动物时能够提供（直接地或间接地）生物活性代谢物或其残余物。因此，例如，本公开内容还涉及反义化合物的药学上可接受的盐、前药、所述前药的药学上可接受的盐和其它生物等效物。适宜的药学上可接受的盐包括但不限于钠盐和钾盐。
本文所描述的化合物的药学上可接受的盐可通过本领域中熟知的方法来制备。对于药学上可接受的盐的综述，参见Stahl和Wermuth,Handbook of Pharmaceutical Salts:Properties,Selection and Use（Wiley-VCH,Weinheim,Germany,2002）。反义寡核苷酸的钠盐对于针对人的治疗施用是有用的良好接受的。因此在一个实施方案中，本文所描述的化合物为钠盐的形式。
前药可包括在反义化合物的一端或两端掺入另外的核苷，通过体内的内源性核酸酶将其裂解，以形成活性的反义化合物。
缀合的反义化合物
可将反义化合物与增强所得的反义寡核苷酸的活性、细胞分布或细胞摄入的一个或多个部分或缀合物共价连接。典型的缀合物基团包括胆固醇部分和脂质部分。另外的缀合物基团包括糖类、磷脂、生物素、吩嗪、叶酸、菲啶、蒽醌、吖啶、荧光素、罗丹明、香豆素和染料。
还可修饰反义化合物以具有一个或多个稳定基团，所述稳定基团通常与反义化合物的一个或两个末端连接以增强诸如例如核酸酶稳定性的性质。包括在稳定基团中的是帽子结构。这些末端修饰保护具有末端核酸的反义化合物避免核酸外切酶降解，且能够协助细胞内的递送和/或定位。帽子可存在于5’-末端（5’-帽子）或3’-末端（3’-帽子）或可存在于两个末端。帽子结构是本领域中熟知的且包括，例如，反向脱氧无碱基帽子（inverted deoxy abasic cap）。可用于覆盖反义化合物的一端或两端以赋予核酸酶稳定性的另外的3’和5’-稳定基团包括于2003年1月16日公布的WO03/004602中公开的那些。
细胞结构和反义化合物处理
反义化合物对FGFR4核酸的水平、活性或表达的作用可在多种细胞类型中进行体外测试。用于此类分析的细胞类型可获自商业销售者（例如，美国典型培养物保藏中心，Manassus,VA;Zen-Bio,Inc.,Research Triangle Park,NC;Clonetics Corporation,Walkersville,MD）和利用商业上可获得的试剂（例如，Invitrogen Life Technologies,Carlsbad,CA）根据销售者的说明收集细胞。示例性的细胞类型包括但不限于HepG2细胞和原代肝细胞。
反义寡核苷酸的体外测试
本文所描述的是用于利用反义寡核苷酸处理细胞的方法，所述反义寡核苷酸可以是适当修饰的以用于利用其它反义化合物进行处理。
通常，当培养中的细胞达到约60-80%汇合时用反义寡核苷酸处理细胞。
常用于将反义寡核苷酸引入培养的细胞中的一种试剂包括阳离子脂质转染试剂
Figure BDA0000435860670001251
（Invitrogen,Carlsbad,CA）。反义寡核苷酸与
Figure BDA0000435860670001252
在
Figure BDA0000435860670001253
1（Invitrogen,Carlsbad,CA）中混合以达到反义寡核苷酸的需要的终浓度，和通常范围在2至12ug/mL每100nM反义寡核苷酸的
Figure BDA0000435860670001254
浓度。
用于将反义寡核苷酸引入培养的细胞中的另一试剂包括
Figure BDA0000435860670001255
（Invitrogen,Carlsbad,CA）。反义寡核苷酸与1中低血清培养基（Invitrogen,Carlsbad,CA）中的相混合以达到反义寡核苷酸的需要的终浓度，和通常范围在2至12ug/mL每100nM反义寡核苷酸的浓度。
用于将反义寡核苷酸引入培养的细胞中的另一试剂包括
Figure BDA0000435860670001259
（Invitrogen,Carlsbad,CA）。反义寡核苷酸与
Figure BDA00004358606700012510
1中低血清培养基（Invitrogen,Carlsbad,CA）中的
Figure BDA00004358606700012511
相混合以达到反义寡核苷酸的需要的终浓度，和通常范围在2至12ug/mL每100nM反义寡核苷酸的
Figure BDA00004358606700012512
浓度。
用于将反义寡核苷酸引入培养的细胞中的另外的技术包括电穿孔。
通过常规方法利用反义寡核苷酸处理细胞。通常在反义寡核苷酸处理后16-24小时收获细胞，此时通过本领域中已知的和本文描述的方法测量靶核酸的RNA或蛋白水平。通常，当以多个重复进行处理时，数据呈现为重复处理的平均值。
所用的反义寡核苷酸的浓度在细胞系间是不同的。确定对于特定的细胞系的最佳反义寡核苷酸浓度的方法是本领域中熟知的。当利用
Figure BDA0000435860670001261
Lipofectin或Cytofectin转染时通常使用浓度范围从1nM至300nM的反义寡核苷酸。当利用电穿孔转染时使用范围从625至20,000nM的较高浓度的反义寡核苷酸。
RNA分离
可基于总细胞RNA或聚(A)+mRNA进行RNA分析。RNA分离的方法是本领域中熟知的。RNA制备利用本领域中熟知的方法来进行，例如，根据制备商推荐的方案利用
Figure BDA0000435860670001262
Reagent（Invitrogen,Carlsbad,CA）。
靶水平或表达的抑制的分析
可用本领域中已知的多种方式来测定FGFR4核酸的水平或表达的抑制。例如，靶核酸可通过例如Northern印迹分析、竞争性聚合酶链式反应（PCR）或定量实时PCR来定量。RNA分析可基于总细胞RNA或聚(A)+mRNA进行。RNA分离的方法是本领域中熟知的。RNA印迹分析也是本领域中常用的。定量实时PCR可利用从PE-Applied Biosystems,Foster City,CA可获得的商业上可获得的ABI
Figure BDA0000435860670001263
7600、7700或7900Sequence Detection System，根据制备商的说明来进行。
靶RNA水平的定量实时PCR分析
靶RNA水平的定量可通过利用
Figure BDA0000435860670001271
7600、7700或7900Sequence Detection System（PE-Applied Biosystems,Foster City,CA）根据制备商的说明通过定量实时PCR来实现。定量实时PCR的方法是本领域中熟知的。
在实时PCR之前，将分离的RNA进行逆转录酶（RT）反应，其产生随后可用作实时PCR扩增的底物的互补DNA（cDNA）。在相同的样品孔中相继地进行RT和实时PCR反应。RT和实时PCR试剂获自Invitrogen（Carlsbad,CA）。RT、实时PCR反应通过本领域中的技术人员熟知的方法来进行。
利用表达恒定的基因诸如亲环蛋白A的表达水平或通过利用
Figure BDA0000435860670001272
（Invitrogen,Inc.Carlsbad,CA）定量总RNA使通过实时PCR获得的基因（或RNA）靶标量标准化。亲环蛋白A表达由通过与靶标同时运行的、多重的或分别的实时PCR定量。总RNA利用RNA定量试剂（Invitrogen,Inc.Eugene,OR）定量。通过进行RNA定量的方法在Jones,L.J.等,（Analytical Biochemistry,1998,265,368-374）中教导。
Figure BDA0000435860670001275
4000instrument（PE Applied Biosystems）被用于测量
Figure BDA0000435860670001276
荧光。
设计探针和引物以与FGFR4核酸杂交。用于设计实时PCR探针和引物的方法是本领域中熟知的，且可包括诸如PRIMER EXPRESS
Figure BDA0000435860670001277
Software（Applied Biosystems,Foster City,CA）软件的使用。
蛋白水平的分析
通过测量FGFR4蛋白水平评价FGFR4核酸的反义抑制。FGFR4的蛋白水平可以本领域中熟知的多种方法来评估或定量，例如免疫共沉淀、蛋白质印迹（免疫印迹）、酶联免疫吸附测定（ELISA）、定量蛋白测定、蛋白活性测定（例如，半胱天冬酶活性测定）、免疫组织化学、免疫细胞化学或荧光激活的细胞分选（FACS）。可鉴定针对靶标的抗体并从多种来源获得，例如MSRS抗体目录（AerieCorporation,Birmingham,MI），或可通过本领域中熟知的常规单克隆或多克隆抗体生成方法来制备。用于检测人类和大鼠FGFR4的抗体是商业上可获得的。
反义化合物的体内测试
在动物中测试反义化合物，例如，反义寡核苷酸以评价其抑制FGFR4的表达并产生表型改变的能力。测试可在正常动物中或在实验疾病模型中进行。为对动物进行施用，在药学上可接受的稀释剂诸如磷酸缓冲盐溶液中配制反义寡核苷酸。施用包括胃肠外施用途径。在用反义寡核苷酸处理一段时间后，从组织分离RNA并测量FGFR4核酸表达的改变。还测量FGFR4蛋白水平的改变。
某些适应症
在某些实施方案中，本文提供了治疗个体的方法，其包括施用如本文所描述的一种或多种药物组合物。在某些实施方案中，个体具有代谢性疾病。
如以下实例中所示，已显示如本文所描述的靶向FGFR4的化合物降低代谢性疾病的生理症状的严重度，所述代谢性疾病包括肥胖或肥胖症、代谢综合征、糖尿病、胰岛素抗性、糖尿病性血脂异常或高甘油三酯血症。在实验中的某些中，化合物降低了体重，例如，动物持续经受症状，但与未治疗的动物相比较症状较不严重。在实验中的某些中，化合物减少了体脂，例如，动物持续经受症状，但与未治疗的动物相比较症状较不严重。在实验中的某些中，化合物减少了脂肪组织，例如，动物持续经受症状，但与未治疗的动物相比较症状较不严重。然而，在实验中的另一些中，化合物显示减少了肥胖的症状；例如，较长时间治疗的动物比较短时间施用化合物的那些动物经受较不严重的症状。然而，在实验中的另一些中，化合物显示减少了糖尿病的症状；例如，较长时间治疗的动物比较短时间施用化合物的那些动物经受较不严重的症状。然而，在实验中的另一些中，化合物显示抑制体重增加；例如，较长时间治疗的动物比较短时间施用化合物的那些动物经受较不严重的症状。然而，在实验中的另一些中，化合物显示降低血糖水平；例如，较长时间治疗的动物比较短时间施用化合物的那些动物经受较不严重的症状。然而，在实验中的另一些中，化合物显示增加了脂肪酸氧化；例如，较长时间治疗的动物比较短时间施用化合物的那些动物经受较不严重的症状。因此以下示出的化合物重建功能的能力证明通过利用本文所描述的化合物进行治疗可逆转疾病的症状。
肥胖以大量的物理和生理症状为特征。在以上所描述的方法中可如上所列地改善或调节与肥胖相关联的本领域中的技术人员之一已知的任何症状。在某些实施方案中，症状是选自由以下组成的组的身体症状：脂肪组织量或体重的增加、体重增加、脂垫重量的增加、热卡摄取和能量消耗失衡、体脂增加、体重增加、具有30或更高的体重指数(BMI)、身架增加、增多的出汗、睡眠呼吸暂停、失眠、不能成功进行突然的身体活动、昏睡、背和关节问题、呼吸暂停的增加、胸部区域肥胖的增加、腹部尺寸或脂肪的增加、极度饥饿或极度疲劳。
在某些实施方案中，症状是选自由以下组成的组的生理症状：高血压、高血压症、高胆固醇水平、2型糖尿病、中风、心机能不全、心脏病、冠心动脉阻塞、女性中的乳腺癌、胃-食道反流疾病、臀和膝盖关节炎和减少的预期寿命。
在某些实施方案中，身体症状是过量的体重。在某些实施方案中，症状是过量的脂肪量。在某些实施方案中，症状是30或更高的体重指数。在某些实施方案中，症状是呼吸暂停。在某些实施方案中，症状是增多的出汗。在某些实施方案中，症状是睡眠呼吸暂停。在某些实施方案中，症状是失眠。在某些实施方案中，症状是不能成功进行突然的身体活动。在某些实施方案中，症状是昏睡。在某些实施方案中，症状是背和关节问题。
在某些实施方案中，生理症状是高血压。在某些实施方案中，症状是高血压症。在某些实施方案中，症状是高胆固醇水平。在某些实施方案中，症状是2型糖尿病。在某些实施方案中，症状是中风。在某些实施方案中，症状是心机能不全。在某些实施方案中，症状是心脏病。在某些实施方案中，症状是冠心动脉阻塞。在某些实施方案中，症状是女性中的乳腺癌。在某些实施方案中，症状是胃-食道反流疾病。在某些实施方案中，症状是臀和膝盖关节炎。在某些实施方案中，症状是减少的预期寿命。
糖尿病以大量的物理和生理症状为特征。在以上所描述的方法中可如上所列地改善或调节与2型糖尿病相关联的本领域中的技术人员之一已知的任何症状。在某些实施方案中，症状是选自由以下组成的组的身体症状：升高的血糖水平、升高的体重、小便频数、异常渴感、极度饥饿、极度疲劳、视力模糊、频繁感染、肢端麻刺感或麻木、干燥和瘙痒的皮肤、体重减轻、缓慢愈合的溃疡和肿胀的牙龈。
在某些实施方案中，症状是选自由以下组成的组的生理症状：升高的胰岛素抗性、升高的血糖水平、升高的脂肪量、降低的代谢速率、降低的血糖清除率、降低的血糖耐受性、降低的胰岛素敏感性、降低的肝胰岛素敏感性、升高的脂肪组织大小和重量、升高的体脂和升高的体重。
在某些实施方案中，身体症状是升高的体重增加。在某些实施方案中，症状是小便频数。在某些实施方案中，症状是异常渴感。在某些实施方案中，症状是极度饥饿。在某些实施方案中，症状是极度疲劳。在某些实施方案中，症状是视力模糊。在某些实施方案中，症状是频繁感染。在某些实施方案中，症状是肢端麻刺感或麻木。在某些实施方案中，症状是干燥和瘙痒的皮肤。在某些实施方案中，症状是体重减轻。在某些实施方案中，症状是缓慢愈合的溃疡。在某些实施方案中，症状是肿胀的牙龈。在某些实施方案中，症状是升高的胰岛素抗性。在某些实施方案中，症状是升高的脂肪量。在某些实施方案中，症状是降低的代谢速率。在某些实施方案中，症状是降低的血糖清除率。在某些实施方案中，症状是降低的血糖耐受性。在某些实施方案中，症状是降低的胰岛素敏感性。在某些实施方案中，症状是降低的肝胰岛素敏感性。在某些实施方案中，症状是升高的脂肪组织大小和重量。在某些实施方案中，症状是升高的体脂。在某些实施方案中，症状是升高的体重。
在某些实施方案中，提供了治疗个体的方法，其包括施用如本文所描述一种或多种药物组合物。在某些实施方案中，个体具有代谢相关疾病。
在某些实施方案中，靶向FGFR4核酸的反义化合物的施用导致FGFR4表达降低了至少约15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95或99%，或这些值中的任何两个所限定的范围。
在某些实施方案中，包含靶向FGFR4的反义化合物的药物组合物用于制备用来治疗罹患或易感代谢性疾病的患者的药物。
在某些实施方案中，本文所描述的方法包括施用含修饰的寡核苷酸的化合物，所述修饰的寡核苷酸具有SEQ ID NO:16中所列序列的如本文所描述的连续核碱基部分。
在某些实施方案中，本文所描述的方法包括施用含修饰的寡核苷酸的化合物，所述修饰的寡核苷酸具有SEQ ID NO:45中所列序列的如本文所描述的连续核碱基部分。
施用
在某些实施方案中，根据是否需要局部治疗或系统治疗和根据待治疗的区域的不同，如本文所描述的化合物和组合物可以多种方式来施用。施用可以是局部的、肺部的，例如，通过粉末或气溶胶的吸入或吹入，包括通过喷雾器来进行；气管内、鼻内、表皮和透皮，口服或胃肠外。如本文所描述的化合物和组合物可直接施用至组织或器官。
在某些实施方案中，如本文所描述的化合物和组合物是胃肠外施用的。“胃肠外施用”意味着通过注射或输注来施用。胃肠外施用包括皮下施用、静脉内施用、肌内施用、动脉内施用、腹膜内施用或颅内施用，例如，小脑内施用、鞘内施用、脑室内施用、脑室施用、脑血管内施用、大脑室内施用或大脑室施用。施用可以是连续的，或慢性的，或短期的或间歇的。
在某些实施方案中，胃肠外施用通过注射来进行。注射可利用注射器或泵来递送。在某些实施方案中，注射是弹丸注射。在某些实施方案中，注射被直接施用至组织或器官。
在某些实施方案中，如本文所描述的化合物和组合物是胃肠外施用的。
在某些实施方案中，胃肠外施用是皮下的。
在另外的实施方案中，用于施用的制剂是本文所描述的化合物和盐水。
在某些实施方案中，反义寡核苷酸通过注射或输注来递送，每月一次、每两月一次、每90天一次、每3个月一次、每6个月一次、一年两次或一年一次。
某些组合疗法
在某些实施方案中，本文所描述的一种或多种药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些实施方案中，所述一种或多种其它的药剂被设计为与本文所描述的一种或多种药物组合物治疗相同的疾病、疾患或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它的药剂被设计为与本文所描述的一种或多种药物组合物治疗不同的疾病、疾患或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它的药剂被设计为治疗本文所描述的一种或多种药物组合物的不想要的副作用。在某些实施方案中，一种或多种药物组合物与另一药剂共施用以治疗该其它药剂的不想要的作用。在某些实施方案中，一种或多种药物组合物与另一药剂共施用以产生组合作用。在某些实施方案中，一种或多种药物组合物与另一药剂共施用以产生协同作用。
在某些实施方案中，第一药剂和一种或多种第二药剂同时施用。在某些实施方案中，第一药剂和一种或多种第二药剂在不同的时间施用。在某些实施方案中，第一药剂和一种或多种第二药剂在单一的药物制剂中共同制备。在某些实施方案中，第一药剂和一种或多种第二药剂独立制备。
在某些实施方案中，第二化合物在本文所描述的药物组合物的施用之前施用。在某些实施方案中，第二化合物在本文所描述的药物组合物的施用之后施用。第二化合物与本文所描述的戊呋喃糖基糖同时施用。在某些实施方案中，共施用的第二化合物的剂量与若单独施用第二化合物将施用的剂量相同。在某些实施方案中，共施用的第二化合物的剂量低于若单独施用第二化合物将施用的剂量。在某些实施方案中，共施用的第二化合物的剂量高于若单独施用第二化合物将施用的剂量。
在某些实施方案中，第二化合物的共施用增强了第一化合物的作用，从而化合物的共施用导致了高于单独施用第一化合物的作用。在某些实施方案中，共施用导致当单独施用时化合物的作用的加成的作用。在某些实施方案中，共施用导致当单独施用时化合物的作用的超加成的作用。在某些实施方案中，第一化合物为反义化合物。在某些实施方案中，第二化合物为反义化合物。
在某些实施方案中，FGFR4反义寡核苷酸的递送伴随第二药剂的递送。或者，递送可以在相同的制剂中或可以分别施用。在某些实施方案中，在利用第二药剂治疗之前施用FGFR4反义寡核苷酸。在某些实施方案中，在停止利用肥胖诱导药物或药剂治疗之后施用FGFR4反义寡核苷酸。
在某些实施方案中，第二药剂包括但不限于降糖剂。降糖剂可包括但不限于治疗生活方式改变、PPAR激动剂、二肽基肽酶（IV）抑制剂、GLP-1类似物、胰岛素或胰岛素类似物、胰岛素促分泌素、SGLT2抑制剂、人糊精类似物、双胍、α-葡糖苷酶抑制剂或其组合。降糖剂可包括但不限于二甲双胍、磺酰脲、罗格列酮、氯茴苯酸、噻唑烷二酮、α-葡糖苷酶抑制剂或其组合。磺酰脲可以是醋磺环己脲、氯磺丙脲、甲苯磺丁脲、甲磺氮卓脲、格列美脲、格列甲嗪、格列本脲或格列齐特。氯茴苯酸可以是那格列奈或瑞格列奈。噻唑烷二酮可以是匹格列酮或罗格列酮。α-葡糖苷酶可以是阿卡波糖或米格列醇。
在一些实施方案中，降糖治疗剂剂是GLP-1类似物。在一些实施方案中，GLP-1类似物是唾液素-4(exendin-4)或利拉鲁肽(liraglutide)。
在其它实施方案中，降糖治疗剂是磺酰脲。在一些实施方案中，磺酰脲是醋磺环己脲、氯磺丙脲、甲苯磺丁脲、甲磺氮卓脲、格列美脲、格列甲嗪、格列本脲或格列齐特。
在一些实施方案中，降糖药物是双胍。在一些实施方案中，双胍是二甲双胍，和在一些实施方案中，与利用单独的二甲双胍治疗之后观察到的乳酸酸中毒相比较血糖水平下降而无升高的乳酸酸中毒。
在一些实施方案中，降糖药物是氯茴苯酸。在一些实施方案中，氯茴苯酸是那格列奈或瑞格列奈。
在一些实施方案中，降糖药物是噻唑烷二酮。在一些实施方案中，噻唑烷二酮是匹格列酮、罗格列酮或曲格列酮。在一些实施方案中，血糖水平下降而无比利用单独的罗格列酮出列所观察到的更高的体重增加。
在一些实施方案中，降糖药物是α-葡糖苷酶抑制剂。在一些实施方案中，α-葡糖苷酶抑制剂是阿卡波糖或米格列醇。
在某个实施方案中，共施用的降糖剂是ISIS113715。
在某个实施方案中，降糖疗法是治疗性生活方式改变。
在某些实施方案中，第二药剂包括但不限于降脂剂。降脂剂可包括但不限于阿伐他汀、辛伐他汀、罗苏伐他汀和依泽替米贝。在某些此类实施方案中，降脂剂在本文所描述的药物组合物的施用之前来施用。在某些此类实施方案中，降脂剂在本文所描述的药物组合物的施用之后来施用。在某些此类实施方案中，降脂剂与本文所描述的药物组合物同时施用。在某些此类实施方案中，共施用的降脂剂的剂量与若单独施用降脂剂将施用的剂量相同。在某些此类实施方案中，共施用的降脂剂的剂量低于若单独施用降脂剂将施用的剂量。在某些此类实施方案中，共施用的降脂剂的剂量高于若单独施用降脂剂将施用的剂量。
在某些实施方案中，共施用的降脂剂是HMG-CoA还原酶抑制剂。在某些此类实施方案中HMG-CoA还原酶抑制剂是抑制素。在某些此类实施方案中，抑制素选自阿伐他汀、辛伐他汀、帕伐他汀、氟伐地汀和罗苏伐他汀。
在某些实施方案中，共施用的降脂剂是胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，胆固醇吸收抑制剂是依泽替米贝。
在某些实施方案中，共施用的降脂剂是共配制的HMG-CoA还原酶抑制剂和胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，共配制的降脂剂是依泽替米贝/辛伐他汀。
在某些实施方案中，共施用的降脂剂是微粒体甘油三酯转运蛋白抑制剂（MTP抑制剂）。
在某些实施方案中，共施用的降脂剂是靶向ApoB的寡核苷酸。
在某些实施方案中，第二药剂包括但不限于抗肥胖药物或药剂。此类抗肥胖剂包括但不限于奥利斯特、西布曲明或利莫那班，且可作为脂肪或体重降低剂如本文所描述的来施用。在某些实施方案中，反义化合物可与食欲抑制剂共施用。所述食欲抑制剂包括但不限于安非拉酮、氯苯咪吲哚、奥利斯特、苯甲曲秦、苯丁胺和西布曲明，且可如本文所描述的来施用。在某些实施方案中，抗肥胖剂是基于CNS的，例如但不限于西布曲明或基于GLP-1的，例如但不限于利纳夫特。
在某些实施方案中，第二药剂包括但不限于抗精神病药物或药剂。所述抗精神病剂治疗可如以上所描述的来施用以降低与利用抗精神病剂进行的治疗相关联的代谢性异常。在一个特定的实施方案中，FGFR4反义化合物的施用导致升高的代谢率或减少肥胖症或降低体重或全部三种而不影响精神治疗剂的CNS作用。
由于FGFR4反义寡核苷酸升高代谢率和胰岛素敏感性以及减少肥胖症和体重的能力，可施用这些化合物以减少与抗精神病剂治疗相关联的代谢性异常。在某些实施方案中，FGFR4反义化合物的递送在减少与利用精神治疗剂的治疗应用相关联的代谢性异常的方法中来递送。此类体重诱导抗精神病剂包括但不限于氯氮平、奥氮平、阿立哌唑、利哌利酮和齐拉西酮。
还提供了经由注射施用靶向FGFR4核酸的反义化合物的方法，所述方法还包括在注射位点施用局部的类固醇。
可与本发明的药物组合物共施用的药剂的另外的例子包括但不限于皮质激素，包括但不限于强的松；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白（IVIg）；镇痛药（例如，扑热息痛）；抗炎剂，包括但不限于非甾体抗炎药（例如，布洛芬COX-1抑制剂和COX-2抑制剂）；水杨酸盐；抗生素；抗病毒剂；抗真菌剂；抗糖尿病剂（例如，双胍、葡糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲和噻唑烷二酮）；肾上腺素能调节剂；利尿剂；激素（例如，促同化激素、雄激素、雌激素、降钙素、孕酮、生长抑素和甲状腺激素）；免疫调节剂；肌松药；抗组胺剂；骨质疏松剂（例如，双磷酸酯、降钙素和雌激素）；前列腺素、抗瘤剂；镇静剂；槲叶毒葛或有毒漆树产物；抗体；和疫苗。
在某些实施方案中，本发明的药物组合物可与降脂治疗联合施用。在某些此类实施方案中，降脂治疗是治疗生活方式改变。在某些此类实施方案中，降脂治疗是LDL血浆分离置换法。
制剂
本文提供的化合物还可与例如脂质体、受体靶向分子或其它制剂的其它分子、分子结构或化合物的混合物混合、缀合或关联以协助摄入、分布和/或吸收。教导所述摄入、分布和/或吸收促进制剂的制备的代表性美国专利包括但不限于U.S.:5,108,921；5,354,844；5,416,016；5,459,127；5,521,291；5,543,158；5,547,932；5,583,020；5,591,721；4,426,330；4,534,899；5,013,556；5,108,921；5,213,804；5,227,170；5,264,221；5,356,633；5,395,619；5,416,016；5,417,978；5,462,854；5,469,854；5,512,295；5,527,528；5,534,259；5,543,152；5,556,948；5,580,575；和595,756，其每一个通过引用并入本文。
本文提供的反义化合物包括任何药学上可接受的盐、酯、或所述酯的盐，或任何其它化合物，当将其施用于包括人的动物时能够提供（直接地或间接地）生物活性代谢物或其残余物。
术语“药学上可接受的盐”指本文提供的化合物的生理上和药学上可接受的盐：即，保留母体化合物的需要的生物活性而不对其赋予不想要的毒理作用。术语“药学上可接受的盐”包括从药学上可接受的非毒性酸或碱（包括无机的或有机的酸和碱）制备的盐。对于寡核苷酸，药学上可接受的盐及其应用的优选的例子进一步描述于美国专利6,287,860，其以其整体并入本文。已显示钠盐为寡核苷酸药物的适宜的形式。
术语“药学上可接受的衍生物”包括但不限于本文所描述的化合物的药学上可接受的盐、水合物、水化物、酯、前药、多晶型物、异构体、同位素标记的变体。
本发明还包括包括本文所提供的反义化合物的药物组合物和制剂。根据是否需要局部治疗或系统治疗和根据待治疗的区域的不同，如本文所描述的药物组合物可以多种方式来施用。施用可以是胃肠外的。胃肠外施用包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内或肌内注射或输注；或颅内施用，例如，小脑内施用、鞘内施用、脑室内施用、脑室施用、脑血管内施用、大脑脑室内施用或大脑脑室施用。
在肝和血浆中靶向FGFR4表达优选的是胃肠外施用。据认为具有至少一个2’-O-甲氧基乙基修饰的寡核苷酸对于口服施用是特别有用的。用于局部施用的药物组合物护腕制剂可包括透皮贴片、软膏、洗剂、乳膏、凝胶、滴剂、栓剂、喷雾、液体和粉末。常规的药物载体、水溶液、粉末或油基，增稠剂和类似物可能是需要的或有利的。涂层的保险套、手套和类似物也可能是有用的。
如本文所描述的药物制剂，其可通常以单位剂量形式来呈现，可根据药物工业中熟知的常规技术来制备。此类技术包括将活性成分与药物载体或赋形剂相结合的步骤。通常，制剂通过以下来制备：将活性成分与液体载体或精细分割的固体载体或两者均匀地且密切地结合，且然后，若需要的话，使产品成型。
可将如本文所描述的组合物配制为许多可能的剂型中的任何，例如但不限于片剂、胶囊、凝胶胶囊、液体糖浆、软凝胶、栓剂和灌肠剂。还可将如本文所描述的组合物配制为水溶液、非水溶液或混合的介质中的悬浮液。水成悬浮液还可包含提高悬浮液的粘度的物质，包括，例如，羧甲基纤维素钠、山梨醇和/或葡聚糖。悬浮液还可包含稳定剂。
本文所描述的药物组合物包括但不限于溶液、乳液、泡沫和含脂质体的制剂。本文所描述的药物组合物和制剂可包括一种或多种渗透增强剂、载体、赋形剂或其它活性的或无活性的成分。
乳液通常是一种液体以通常直径大于0.1μm的液滴的形式分散于另一液体的异源系统。除分散相外乳液可包含另外的组分，且活性药物可作为水相、油相中的溶液而存在或其自身作为分相而存在。微乳剂被包括作为本文所描述的实施方案。乳剂及其应用是本领域中熟知的且进一步描述于美国专利6,287,860，其以其整体并入本文。
制剂包括脂质体制剂。如在本发明中所用的，术语“脂质体”意为由以球形双层或双层排列的两亲性脂质组成的囊泡。脂质体是单层的或多层的囊泡，其具有由亲脂性物质形成的膜和包含待递送的组合物的水性内部。阳离子脂质体是带正电荷的脂质体，认为其与带负电荷的DNA分子相互作用而形成稳定的复合物。认为pH敏感性的或带负电荷的脂质体而非具有其的复合物捕获DNA。阳离子和非阳离子脂质体均已用于将DNA递送到细胞。
脂质体还包括“空间稳定的”脂质体，如本文所用的术语，指包括一种或多种特定的脂质的脂质体，当将所述特定的脂质掺入到脂质体中时，导致相对于缺少此类特定的脂质的脂质体增强的循环寿命。脂质体及其应用进一步描述于美国专利6,287,860，其以其整体并入本文。
在另一个实施方案中，制剂包括盐水制剂。在某些实施方案中，制剂由本文所描述的化合物和盐水组成。在某些实施方案中，制剂基本上由本文所描述的化合物和盐水组成。在某些实施方案中，盐水是药学上可接受的等级的盐水。在某些实施方案中，盐水是缓冲盐水。在某些实施方案中，盐水是磷酸缓冲盐水（PBS）。
在某些实施方案中，制剂不含脂质体。在某些实施方案中，制剂不含空间上稳定的脂质体。在某些实施方案中，制剂不含磷脂。在某些实施方案中，制剂基本上由本文所描述的化合物组成且不含脂质体。
药物制剂和组合物还可包括表面活性剂。表面活性剂及其应用还描述于美国专利6,287,860中，其以其整体并入本文。
在一个实施方案中，本发明应用了多种渗透增强剂以实现核酸尤其是寡核苷酸的有效递送。渗透增强剂及其应用进一步描述于美国专利6,287,860，其以其整体并入本文。
本领域中的技术人员之一将意识到根据其预期用途，即，施用的途径常规设计制剂。
用于局部施用的制剂包括其中本文提供的寡核苷酸与局部递送剂诸如脂质、脂质体、脂肪酸、脂肪酸酯、类固醇、螯合剂和表面活性剂混合的那些。优选的脂质和脂质体包括中性的（例如，二油酰基磷脂酰基DOPE乙醇胺、二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱DMPC、二硬脂酸磷脂酰胆碱），阴离子的（例如，二肉豆蔻酰磷脂酰甘油DMPG）和阳离子的（例如，二油酰基四甲基氨基丙基DOTAP和二油酰基磷脂酰乙醇胺DOTMA）。
用于包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内、肌内注射或输注，或颅内的胃肠外施用的组合物和制剂可包括无菌水溶液，其还可包含缓冲液、稀释剂和其它适宜的调节剂诸如，但不限于渗透增强剂、载体化合物和其它药学上可接受的载体或稀释剂。
本文提供的某些实施方案提供了药物组合物，所述药物组合物包含一种或多种寡聚化合物和通过非反义机制发挥作用的一种或多种其它化学治疗剂。化学治疗剂的例子包括但不限于癌症化学治疗药物诸如柔红霉素、道诺霉素、放线菌素D、阿霉素、表柔比星、伊达比星、依索比星、博莱霉素、马磷酰胺、异环磷酰胺、阿糖胞苷、二氯乙基亚硝脲、白消安、丝裂霉素C、放线菌素D、光辉霉素、强的松、羟孕酮、睾酮、他莫昔芬、达卡巴嗪、甲基苄肼、六甲三聚氰胺、五甲密胺、米托蒽醌、安吖啶、苯丁酸氮芥、甲基环己基硝脲、氮芥、苯丙氨酸氮芥、环磷酰胺、6-巯基嘌呤、6-硫鸟嘌呤、阿糖胞苷、5-氮杂胞苷、羟基脲、脱氧柯福霉素、4-羟基过氧环磷酰胺、5-氟尿嘧啶（5-FU）、5-氟脱氧尿苷（5-FUdR）、氨甲蝶呤（MTX）、秋水仙素、紫杉醇、长春新碱、长春花碱、依托泊甙（VP-16）、曲美沙特，依立替康、拓扑替康、吉西他滨、替尼泊甙、顺铂和己烯雌酚（DES）。当与本文所提供的化合物一起使用时，所述化学治疗剂可单独地（例如，5-FU和寡核苷酸）、相继地（例如，5-FU和寡核苷酸持续一段时间，然后为MTX和寡核苷酸）或与一种或多种其它的所述化学治疗剂（例如，5-FU、MTX和寡核苷酸，或5-FU、放射疗法和寡核苷酸）组合使用。抗炎药物，包括但不限于非类固醇类抗炎药物和皮质类固醇，和抗病毒药物，包括但不限于利巴韦林、阿糖腺苷、无环鸟苷和更昔洛韦，也可组合于本文所提供的组合物中。反义化合物和其它非反义药物的组合物也在本发明的范围中。两种或多种组合的化合物可一起使用或相继使用。
在另一个相关实施方案中，本文所提供的组合物可包含靶向第一核酸的一种或多种反义化合物，尤其是寡核苷酸，和靶向第二核酸靶标的一种或多种另外的反义化合物。或者，本文所提供的组合物可包含靶向相同的核酸靶标的不同的区域的两种或多种反义化合物。反义化合物的大量例子是本领域中已知的。两种或多种组合的化合物可一起使用或相继使用。
剂量
剂量取决于待治疗的疾病状态的严重度和反应性，治疗的进展持续从几天到几个月，或直至达到治愈或实现疾病状态的减少。最佳剂量计划可从患者的体内中的药物积累的测量结果来计算。最佳剂量可根据单独的寡核苷酸的相对效力而不同，且通常可基于在体外和体内动物模型中发现有效的EC50来评估。通常，剂量为从每千克体重0.01μg至100g，且可被一天一次或多次、一周一次、一月一次或一年一次或以需要的间隔来施用。在成功治疗之后，可能需要的是使患者进行维持治疗以避免疾病状态的复发，其中寡核苷酸以维持剂量来施用，范围从每kg体重0.01μg至100g，一天一次或多次。
虽然根据其优选的实施方案具体地描述了本发明，以下的实施例仅用于说明而不意在限制本发明。参考文献、GENBANK登录号、和本说明书中列出的类似内容中的每一项以其整体通过引用并入本文。
某些化合物
在若干种细胞类型中在体外测试了不同长度、基序和骨架组成的约1454种新设计的和先前公开的反义化合物对人FGFR4mRNA的作用。将新化合物与9种先前设计的化合物相比较，包括ISIS299005、ISIS299010、ISIS299018、ISIS299022、ISIS299024、ISIS299025、ISIS299028、ISIS299029和ISIS299030，先前已在体外确定了其为最有效的反义化合物中的某些（参见，例如，美国专利公开第US2010/0292140号）。在1454中新设计的和9种先前设计的反义化合物中，根据体外效力选择了53种化合物以用于进一步研究。在HepG2中测试了选择的化合物的剂量依赖抑制（实施例8和9）。
然后在CD1小鼠模型以及Sprague-Dawley大鼠模型中测试了某些寡核苷酸的耐受性。测试其耐受性的寡核苷酸包括寡核苷酸，ISIS299005（SEQ ID NO:7）、ISIS463588（SEQ ID NO:16）、ISIS463589（SEQ ID NO:17）、ISIS463628（SEQ ID NO:28）、ISIS463690（SEQID NO:45）、ISIS463691（SEQ ID NO:46）、ISIS463835（SEQ IDNO:70）、ISIS463837（SEQ ID NO:72）、ISIS464222（SEQ ID NO:135）、ISIS464225（SEQ ID NO:138）、ISIS464228（SEQ ID NO:141）、ISIS464286（SEQ ID NO:154）、ISIS464308（SEQ ID NO:163）、ISIS464449（SEQ ID NO:174）、ISIS464587（SEQ ID NO:186）、ISIS464588（SEQ ID NO:187）、ISIS464589（SEQ ID NO:188）、ISIS464718（SEQ ID NO:221）、ISIS479533（SEQ ID NO:241）、ISIS479551（SEQ ID NO:259）、ISIS479691（SEQ ID NO:299）、ISIS479692（SEQ ID NO:300）、ISIS479698（SEQ ID NO:305）、ISIS479699（SEQ ID NO:306）、ISIS479703（SEQ ID NO:307）、ISIS479704（SEQ ID NO:308）、ISIS479706（SEQ ID NO:310）和ISIS479736（SEQ ID NO:317）。根据其互补序列，化合物与以下位置的区域互补：SEQ ID NO:1的第192-211位、第191-210位、第193-212位、第291-310位、第369-388位、第370-389位、第788-807位、第790-809位、第2951-2970位、第2954-2973位和第2981-3000位；SEQ ID NO:2的第11621-11640位、第11624-11643位、第11651-11670位、第1463-1482位、第3325-3344位、第7802-7821位、第2110-2129位、第2112-2131位、第2114-2133位、第3575-3594位、第2111-2130位、第3570-3589位、第11623-11639位、第11624-11640位、第11652-11668位、第11653-11669位、第2113-2129位、第2114-2130位、第2116-2132位、第3571-3587位；和SEQ IDNO:3的第103-122位、第1569-1588位、第5122-5138位、第5123-5139位、第5151-5167位、第5152-5168位、第105-121,106-122位、第108-124位和第1570-1586位。
在体内模型中，测量了肝功能标志物，例如丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶和胆红素，和肾功能标志物，例如BUN和肌酸酐。（实施例11）。
测试了具有SEQ ID NO:7（ISIS299005）、16（ISIS463588）、17（ISIS463589）、45（ISIS463690）、46（ISIS463691）、70（ISIS463835）、72（ISIS463837）和138（ISIS464225）中所列序列的核碱基序列的八种寡核苷酸。根据其互补序列，化合物与区域SEQ IDNO:1的第192-211位、第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第788-807位、第790-809位和第2954-2973位。在某些实施方案中，如本文进一步描述的，靶向所列区域的化合物包括修饰的寡核苷酸，如本文进一步描述的，所述修饰的寡核苷酸具有SEQ ID NO中所列序列的一些核碱基部分，在某些实施方案中，如本文进一步描述的，靶向所列的区域或具有所列的SEQ ID NO中列出的序列的核碱基部分的化合物可以为不同的长度，且如本文进一步描述的，可具有多个基序中之一。在某些实施方案中，靶向所列的SEQID NO中列出的序列的序列的区域或具有其核碱基部分的化合物具有特定的长度和基序，如由ISIS NO:299005、463588、463589、463690、463691、463835、463837和464225所表明的。
在CD/1GS大鼠模型中测定此8种化合物，ISIS299005（SEQ IDNO:7）、ISIS463588（SEQ ID NO:16）、ISIS463589（SEQ ID NO:17）、ISIS463690（SEQ ID NO:45）、ISIS463691（SEQ ID NO:46）、ISIS463835（SEQ ID NO:70）、ISIS463837（SEQ ID NO:72）和ISIS464225（SEQ ID NO:138）对耐受性的长期作用，进行13周（实施例12）。测量体重和器官重、肝功能标志物，例如丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶和胆红素，和肾功能标志物，例如BUN和肌酸酐。还测试了8种化合物的粘度。（实施例14）
在CD1小鼠肝中测试了在全部三种体内模型中表现出非常好的耐受性的ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690（实施例13）。
在短尾猴中测试了此8种化合物，ISIS299005（SEQ ID NO:7）、ISIS463588（SEQ ID NO:16）、ISIS463589（SEQ ID NO:17）、ISIS463690（SEQ ID NO:45）、ISIS463691（SEQ ID NO:46）、ISIS463835（SEQ ID NO:70）、ISIS463837（SEQ ID NO:72）和ISIS464225（SEQ ID NO:138）的效力、药物代谢动力学曲线和耐受性（实施例15）。在这些猴中的抑制研究表明利用这些化合物中的一些进行的治疗导致了肝组织中FGFR4mRNA的降低。尤其是，与利用先前公开的化合物ISIS299005进行治疗，利用ISIS463588进行的治疗分别导致了肝组织和肾组织中FGFR4mRNA的显著更大的降低。注意的是与PBS对照相比较，ISIS463588导致了FGFR4mRNA的更高的降低，无论使用引物探针组与否。因此，关于效力，在猴研究中利用ISIS463588进行的处理是最有效的。与利用先前公开的化合物ISIS299005进行的处理相比较，利用ISIS463690进行的处理还分别导致了肝组织和肾组织中FGFR4mRNA的更大的降低。
已知FGF19在转基因小鼠中减少了肥胖症并提高了胰岛素敏感性（Fu,L.等,Endocrinology.145:2594-2603,2004）。FGF19还以作为FGFR4的高亲和力配体为特征（Xie,M.-H.等,Cytokine.11:729-735,1999）。然而，利用FGF19蛋白治疗小鼠诱导了在FGF19转基因小鼠中观察到的与升高的肝细胞增殖和肝肿瘤形成一致的肝细胞增殖（Wu,X.等,JBC285(8):5165-5170,2010）。来普汀是发现在分配个体中与正常体重个体相比较以非常高的水平存在的激素（Considine,R.V.等,N.Engl.J.Med.334:292-295,1996）。在全部治疗组中对FGF19mRNA和血浆水平的评估表明了FGF19mRNA和蛋白水平的显著升高。尤其是，用ISIS463588治疗的猴具有最显著的FGF19水平的升高。来普汀血浆水平的评估表明了在利用ISIS463588或ISIS463690处理的猴中的显著降低。在利用ISIS寡核苷酸治疗之后在短尾猴中的进行了耐受性研究（实施例15）。这包括肝代谢物、肾代谢物、促炎因子诸如C-反应性蛋白、补体C3和细胞因子的血浆水平的测量。该结果表明在实施例15中利用ISIS寡核苷酸进行的治疗，反义寡核苷酸保持在可接受的水平，且因此对于猴是可耐受的。特别地，在该模型中利用ISIS463588进行的治疗是非常良好耐受的。
还在猴中进行了三个最良好耐受的ISIS寡核苷酸，ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690的药物代谢动力学研究，并表明全部三种的药物代谢动力学是最佳的。
因此，在体内研究中，尤其在短尾猴中，表明与ISIS299005相比较ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690是更有效的寡核苷酸，且还是显著更加可耐受的。
因此，本文提供的是具有提高的特性的任何一种或多种的反义化合物。在某些实施方案中，本文提供的是包括如本文所进一步描述的修饰的寡核苷酸的化合物，所述修饰的寡核苷酸靶向或特异性地与SEQ ID NO:1的核苷酸的区域杂交。
在某些实施方案中，如实施例8中所描述的，当利用电穿孔递送到HepG2细胞系时，如本文所描述的化合物是有效的，根据为具有小于1.5μM的体外IC50、小于1.4μM的体外IC50、小于1.3μM的体外IC50、小于1.2μM的体外IC50、小于1.1μM的体外IC50、小于1.0μM的体外IC50、小于0.9μM的体外IC50、小于0.8μM的体外IC50、小于0.7μM的体外IC50、小于0.6μM的体外IC50中的至少一项。在某些实施方案中，如通过FGFR4mRNA的水平降低60%、65%、70%、75%或80%所证明的，如本文所描述的化合物是有效的。在另外的实施方案中，如通过FGF15和FGF19mRNA和蛋白的水平升高100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%或1000%所证明的，如本文所描述的化合物是有效的。在另外的实施方案中，如通过来普汀的血浆水平降低30%、35%或40%所证明的，化合物是体内有效的。
在某些实施方案中，如通过ALT或AST值的增加不超过盐水处理的动物的4倍、3倍或2倍；或肝、脾或肾重量的增加不超过30%、20%、15%、12%、10%、5%或2%中的至少一项所证明的，如本文所描述的化合物是高度可耐受的。
实施例
非限制性公开内容并通过引用并入
虽然已连同根据某些实施方案具体描述了本文所描述的某些化合物、组合物和方法，以下实施例仅用作说明本文所描述的化合物而并不意在限制本发明。本申请中所列出的参考文献中的每一个以其整体通过引用并入本文。
实施例1：HepG2细胞中人成纤维细胞生长因子受体（FGFR4）的反义抑制
设计靶向FGFR4核酸的反义寡核苷酸并在体外测试其对FGFR4mRNA的作用。利用电穿孔以4,500nM反义寡核苷酸转染20,000个细胞/每孔的密度的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理时间之后，从细胞分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人引物探针组RTS3232（正向序列TCATCAACGGCAGCAGCTT，本文称作SEQ ID NO:327；反向序列AGCTATTGATGTCTGCAGTCTTTAGG，本文称作SEQ ID NO:328；探针序列AGCCGACGGTTTCCCCTATGTGCA，本文称作SEQ IDNO:329）来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001471
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。测试了全部458种寡核苷酸。仅将表现高于65%体外抑制或用于随后的测定的那些寡核苷酸显示于表1中。
还利用另外的引物探针组RTS1325（正向序列TTGCTGTGCCGTGTCCAA，本文称作SEQ ID NO:330；反向序列TCCAAGAAGCCGAGCAGAAC，本文称作SEQ ID NO:331；探针序列AGCTGCCGTGCCTGTGTCCTGAT，本文称作SEQ ID NO:332）。“n/a”表明特定的反义寡核苷酸未利用RTS1325进行测试。
表1中新设计的嵌合的反义寡核苷酸为5-10-5MOE间隙聚体。间隙聚体为20个核苷酸长度，其中中央间隙区段由10个2’-脱氧核苷组成，且在5’方向和3’方向两侧为各包括5个核苷的翼状区段。5’翼状区段中的每个核苷酸和3’翼状区段中的每个核苷酸具有2’-MOE修饰。贯穿每个间隙聚体的核苷间键为硫代磷酸酯（P=S）键。贯穿每个间隙聚体的全部胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的5’端核苷。“终止位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的3’端核苷。表1中所列的每个间隙聚体靶向人FGFR4mRNA，本文称作SEQ ID NO:1（GENBANK登录号NM_002011.3）。
表1
靶向SEQ ID NO:1的嵌合的反义寡核苷酸对人FGFR4mRNA水平的抑制
Figure BDA0000435860670001481
Figure BDA0000435860670001491
Figure BDA0000435860670001501
实施例2：在HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
在HepG2细胞中以各种剂量测试了来自实施例1中表现出人FGFR4的显著体外抑制的间隙聚体。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0.6nM、1.3nM、2.5nM、5.0nM和10.0μM浓度的如表2中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表2中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50），并通过将所用的寡核苷酸的浓度对比在每个浓度处获得的FGFR4mRNA表达的抑制百分比绘制曲线，并记录与对照相比较获得的寡核苷酸在FGFR4mRNA表达的50%抑制处的浓度。如表2中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表2
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
Figure BDA0000435860670001511
Figure BDA0000435860670001521
实施例3：HepG2细胞中人成纤维细胞生长因子受体（FGFR4）的反义抑制
设计靶向FGFR4核酸的另外的反义寡核苷酸并在体外测试其对FGFR4mRNA的作用。实施例1中所描述的反义寡核苷酸中的一些也包括在本测定中以用于比较。利用电穿孔以4,500nM反义寡核苷酸转染20,000个细胞/每孔的密度的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理时间之后，从细胞分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001522
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。测试了全部772种寡核苷酸。仅将表现高于65%抑制的那些寡核苷酸显示于表3和4中。
表3中新设计的嵌合的反义寡核苷酸为5-10-5MOE间隙聚体。间隙聚体为20个核苷酸长度，其中中央间隙区段由10个2’-脱氧核苷组成，且在5’方向和3’方向两侧为各包括5个核苷的翼状区段。5’翼状区段中的每个核苷酸和3’翼状区段中的每个核苷酸具有2’-MOE修饰。贯穿每个间隙聚体的核苷间键为硫代磷酸酯（P=S）键。贯穿每个间隙聚体的全部胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的5’端核苷。“终止位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的3’端核苷。
表3中所列的每个间隙聚体靶向人FGFR4mRNA，本文称作SEQID NO:1（GENBANK登录号NM_002011.3），或人FGFR4基因组序列，本文称作SEQ ID NO:2（GENBANK登录号：NT_023133.11从第21323018位至第21335213位截短），或靶向二者。反义寡核苷酸中的一些被设计以靶向变体基因序列，并列于表4中。表4中列出的每个间隙聚体针对任一SEQ ID NO:3（GENBANK登录号AB209631.1）。
表3
靶向SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的嵌合的反义寡核苷酸对人FGFR4mRNA的抑制
Figure BDA0000435860670001531
Figure BDA0000435860670001541
Figure BDA0000435860670001551
Figure BDA0000435860670001561
表4
靶向SEQ ID NO:3的嵌合的反义寡核苷酸对人FGFR4mRNA水平的抑制
Figure BDA0000435860670001562
实施例4：HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
在HepG2细胞中以各种剂量测试了来自实施例3中表现出人FGFR4的显著体外抑制的间隙聚体。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0.6μM、1.3μM、2.5μM、5.0μM和10.0μM浓度的如表5中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001563
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表5中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50）。如表5中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表5
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
Figure BDA0000435860670001571
实施例5：HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
在HepG2细胞中以各种剂量进一步测试了来自以上所描述的研究中导致人FGFR4mRNA的显著抑制的间隙聚体。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0.3μM、0.6μM、1.3μM、2.5μM、5.0μM和10.0μM浓度的如表6中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表6中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50）。如表6中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表6
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
Figure BDA0000435860670001591
实施例6：HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
在HepG2细胞中以各种剂量测试了来自实施例4中表现出人FGFR4mRNA的显著体外抑制的间隙聚体。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0.6μM、1.3μM、2.5μM、5.0μM和10.0μM浓度的如表7中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001592
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表7中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50）。如表7中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表7
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
ISIS编号 0.6μM 1.3μM 2.5μM 5.0μM 10.0μM IC50(μM)
463629 44 73 86 96 98 <0.6
464222 40 65 81 88 96 0.7
464225 47 76 84 92 86 <0.6
464228 56 80 86 92 95 <0.6
464284 24 47 62 78 90 1.6
464286 23 60 73 86 93 1.2
464287 19 62 69 89 91 1.3
464308 38 54 78 90 96 1.0
464449 27 69 80 91 94 0.9
464587 24 68 74 88 91 1.1
464588 42 75 81 88 92 <0.6
464589 36 69 78 90 92 0.8
464716 52 60 75 90 95 0.6
464718 38 61 76 91 95 0.9
464732 30 39 65 85 94 1.5
实施例7：HepG2细胞中人成纤维细胞生长因子受体（FGFR4）的反义抑制
设计靶向FGFR4核酸的另外的反义寡核苷酸并在体外测试其对FGFR4mRNA的作用。ISIS463629和ISIS463762也包括在本测定中以用于比较。利用电穿孔以4,500nM反义寡核苷酸转染20,000个细胞/每孔的密度的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理时间之后，从细胞分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001601
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。测试了全部230种寡核苷酸。仅将表现高于65%抑制的那些寡核苷酸显示于表8中。
表8中新设计的嵌合的反义寡核苷酸为5-10-5MOE间隙聚体或3-10-4MOE间隙聚体。5-10-5间隙聚体为20个核苷酸长度，其中中央间隙区段由10个2’-脱氧核苷组成，且在5’方向和3’方向两侧为各包括5个核苷的翼状区段。3-10-4间隙聚体为17个核苷酸长度，其中中央间隙区段由10个2’-脱氧核苷组成，且在5’方向和3’方向两侧为各包括4个核苷的翼状区段。5’翼状区段中的每个核苷酸和3’翼状区段中的每个核苷酸具有2’-MOE修饰。贯穿每个间隙聚体的核苷间键为硫代磷酸酯（P=S）键。贯穿每个间隙聚体的全部胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的5’端核苷。“终止位点”表明了人类基因序列中间隙聚体所靶向的3’端核苷。
表8中所列的每个间隙聚体靶向人FGFR4mRNA，本文称作SEQID NO:1（GENBANK登录号NM_002011.3），或人FGFR4基因组序列，本文称作SEQ ID NO:2（GENBANK登录号：NT_023133.11，从第21323018位至第21335213位截短），或SEQ ID NO:3（GENBANK登录号AB209631.1），或全部三种。
表8
靶向SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3的嵌合的反义寡核苷酸对人FGFR4mRNA的抑制
Figure BDA0000435860670001611
Figure BDA0000435860670001621
Figure BDA0000435860670001631
实施例8：HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
在HepG2细胞中以各种剂量测试了来自实施例5、6和7中表现出人FGFR4mRNA的显著体外抑制的间隙聚体。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0.6μM、1.3μM、2.5μM、5.0μM和10.0μM浓度的如表9中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001641
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表9中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50）。如表9中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表9
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
Figure BDA0000435860670001642
Figure BDA0000435860670001651
实施例9：HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
进一步选择了来自实施例7和8中表现出对FGFR4mRNA的显著的体外抑制的间隙聚体并以各种剂量在HepG2细胞中进行测试。将细胞以20,000个细胞/每孔接种并利用0156μM、0.31μM、0.63μM、1.25μM、2.50μM和5.00μM浓度的如表10中所列举的反义寡核苷酸利用电穿孔进行转染。在约16小时的处理时间之后，从细胞中分离RNA并通过定量实时PCR测量FGFR4mRNA水平。使用人FGFR4引物探针组RTS3232来测量mRNA水平。如通过
Figure BDA0000435860670001652
所测量的，根据总RNA含量调整FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于未处理的对照细胞，FGFR4的抑制百分比。
表10中还显示了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度（IC50）。如表10中所说明的，在反义寡核苷酸处理的细胞中FGFR4mRNA水平以剂量依赖方式显著降低了。
表10
利用电穿孔HepG2细胞中人FGFR4的剂量依赖性反义抑制
Figure BDA0000435860670001661
实施例10：靶向FGFR4的反义寡核苷酸在CD1小鼠中的耐受性
小鼠（Charles River,MA）是多用途的小鼠模型，常用于安全性和有效性测试。利用选自如上所描述的研究的ISIS反义寡核苷酸处理小鼠并关于多种标志物的水平的改变进行评估。
处理
利用50mg/kg以下一周两次皮下注射5只雄性CD1小鼠的组，持续6周：ISIS299005、ISIS463588、ISIS463589、ISIS463628、ISIS463690、ISIS463691、ISIS463835、ISIS463837、ISIS464222、ISIS464225、ISIS464228、ISIS464286、ISIS464308、ISIS464449、ISIS464587、ISIS464588、ISIS464589、ISIS464718、ISIS479533、ISIS479551、ISIS479691、ISIS479692、ISIS479698、ISIS479699、ISIS479703、ISIS479704、ISIS479706或ISIS479736。一组雄性CD1小鼠利用PBS一周两次皮下注射，持续6周。在最后给药之后48小时对小鼠进行安乐死，并收获血浆以用于进一步分析。利用ISIS479691导致了小鼠的死亡且因此将该ISIS寡核苷酸从进一步的研究中去除。
血浆化学标志物
为评估ISIS寡核苷酸对代谢性功能的作用，利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量转氨酶、胆红素、白蛋白、肌酸酐和BUN的血浆浓度。转氨酶水平表示为IU/L；胆红素、肌酸酐和BUN水平表示为mg/dL；和白蛋白表示为g/dL。结果呈现于表11中。导致任何血浆化学标志物的水平的有害改变的ISIS寡核苷酸排除在以后的研究之外。
表11
6周时CD1小鼠血浆中的ALT、AST、胆红素、BUN、肌酸酐和白蛋白水平
Figure BDA0000435860670001671
Figure BDA0000435860670001681
实施例11：靶向人FGFR4的反义寡核苷酸在Sprague-Dawley大鼠中的耐受性
Sprague-Dawley大鼠是用于安全性和有效性评估的多用途模型。利用选自实施例10中所描述的研究的ISIS反义寡核苷酸处理大鼠并关于多种标志物的水平的改变进行评估。
处理
以12-小时光/暗循环维持7周龄雄性Sprague-Dawley大鼠并利用Purina正常大鼠固型食物，饮食5001进行无限制地喂养。利用50mg/kg以下一周两次皮下注射4只Sprague-Dawley大鼠的组，持续4周：ISIS299005、ISIS463588、ISIS463589、ISIS463628、ISIS463690、ISIS463691、ISIS463835、ISIS463837、ISIS464222、ISIS464225、ISIS464228、ISIS464286、ISIS464308、ISIS464449、ISIS464587、ISIS464718、ISIS479533、ISIS479551、ISIS479691、ISIS479692、ISIS479698、ISIS479699、ISIS479703、ISIS479704、ISIS479706或ISIS479736。一组雄大鼠利用PBS一周两次皮下注射，持续4周。最后给药之后48小时，使大鼠安乐死并收获血浆以用于进一步分析。
肝功能
为评估ISIS寡核苷酸对肝功能的作用，利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量转氨酶的血浆浓度。测量ALT（丙氨酸转氨酶）和AST（天冬氨酸转氨酶）的血浆浓度，且结果呈现于表12中，以IU/L表示。利用相同的临床化学分析器还测量了胆红素的血浆水平，且结果也呈现于表12中，表示为mg/dL。将导致任何血浆化学标志物的水平的有害改变的ISIS寡核苷酸排除在以后的研究之外。
表12
反义寡核苷酸处理对Sprague-Dawley大鼠的肝中的ALT、AST和胆红素的作用
Figure BDA0000435860670001691
Figure BDA0000435860670001701
肾功能
为评估ISIS寡核苷酸对肾功能的作用，利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量血液尿素氮（BUN）和肌酸酐。结果呈现于表13，以mg/dL来表示。
表13
反义寡核苷酸处理对Sprague-Dawley大鼠的肾功能标志物（mg/dL）的作用
Figure BDA0000435860670001702
实施例12：靶向人FGFR4的反义寡核苷酸在CD/IGS大鼠中的耐受性
CD/IGS大鼠是用于安全性和有效性评估的多用途模型。利用选自实施例10和11中所描述的研究的ISIS反义寡核苷酸处理大鼠并关于多种标志物的水平的改变进行评估。
处理
以12-小时光/暗循环维持10-12周龄雄性CD/IGS大鼠并利用Purina正常大鼠固型食物，饮食5001进行无限制地喂养。利用30mg/kg以下一周两次皮下注射4只CD/IGS大鼠的组，持续12周：ISIS299005、ISIS463588、ISIS463589、ISIS463690、ISIS463691、ISIS463835、ISIS463837或ISIS464225。6只大鼠的一组利用PBS一周两次皮下注射，持续12周并用作对照组。在不同的时间点收集尿和血液样品。在最后给药之后48小时，测量体重，使大鼠安乐死并收获器官和血浆以用于进一步分析。
肝功能
为评估ISIS寡核苷酸对肝功能的作用，在第8周和第12周利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量多种肝功能标志物的血浆浓度。测量ALT（丙氨酸转氨酶）和AST（天冬氨酸转氨酶）的血浆浓度，且结果呈现于表14和15中，以IU/L表示。利用相同的临床化学分析器还测量了胆红素的血浆水平和BUN，且结果也呈现于表14和15中，表示为mg/dL。将导致任何血浆化学标志物的水平的有害改变的ISIS寡核苷酸排除在以后的研究之外。
表14
第8周CD/IGS大鼠的ALT、AST、胆红素和BUN
Figure BDA0000435860670001721
表15
在第12周CD/IGS大鼠的肝中的ALT、AST、TBIL和BUN水平
Figure BDA0000435860670001722
Figure BDA0000435860670001731
实施例13：CD1小鼠肝中反义寡核苷酸的药物代谢动力学测量结果
利用ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690处理CD1小鼠，并评估寡核苷酸半衰期以及寡核苷酸降解和从肝中消除的经过时间。
处理
将10只CD1小鼠的组，每只用50mg/kg的ISIS463588、ISIS463589或ISIS463690皮下注射，每周两次，持续2周（4次给药）。将5只小鼠的组，来自每组的每只在最终给药后3天和56天安乐死。收获肝脏以用于分析。
寡核苷酸浓度的测量结果
测量了全长寡核苷酸的浓度以及总寡核苷酸浓度（包括降解的形式）。所用的方法是先前公开的方法的修改形式（Leeds等,1996；Geary等,1999），其由固相提取后的酚氯仿（液体-液体）提取组成。在提取之前添加内标（ISIS355868，27-聚体2’-O-甲氧基乙基修饰的硫代磷酸酯寡核苷酸，GCGTTTGCTCTTCTTCTTGCGTTTTTT，本文称作SEQ ID NO:323）。利用校准曲线计算组织样品浓度，定量下限(LLOQ)约1.14μg/g。然后利用WinNonlin软件（PHARSIGHT）计算半衰期。
结果呈现于表16中，表示为μg/g肝组织。从这些值中计算ISIS寡核苷酸的半衰期，并也呈现于表17中。认为每个寡核苷酸的半衰期是最优的。
表16
CD1小鼠的肝中的ISIS寡核苷酸的寡核苷酸浓度
Figure BDA0000435860670001741
表17
CD1小鼠的肝中的ISIS寡核苷酸的半衰期
ISIS编号 天数
463588 22.4
463589 15.9
463690 18.7
实施例14：靶向人FGFR4的ISIS反义寡核苷酸的粘度的测量结果
测量了选自以上所描述的体内研究的反义寡核苷酸的粘度以筛选出在浓度为165-185mg/mL时具有大于40cP的粘度的反义寡核苷酸。具有大于40cP的粘度的寡核苷酸则太黏稠而不能施用于任何受试者。
称量ISIS寡核苷酸（32-35mg）到玻璃小瓶中，添加120μL的水并通过在50℃加热小瓶将反义寡核苷酸溶于溶液中。将预热的样品的部分（75μL）吸到微量粘度计（Cambridge）。将微量粘度计的温度设定在25℃并测量样品的粘度。将预热的样品的另一部分（20μL）吸到10mL水中，以用于在85℃下260nM处的UV读数（Cary UVinstrument）。结果呈现于表18中并表明反义寡核苷酸溶液的大部分在以上所指定的标准下的粘度方面是最佳的。
表18.
靶向人FGFR4的ISIS反义寡核苷酸的粘度和浓度
Figure BDA0000435860670001751
实施例15：短尾猴中靶向人FGFR4的ISIS反义寡核苷酸的作用
利用选自实施例11-14中所描述的研究的ISIS反义寡核苷酸处理中国短尾猴。评估反义寡核苷酸效力和耐受性，以及其在肝和肾中的药物代谢动力学曲线。所测试的人类反义寡核苷酸还与恒河猴基因组序列GENBANK登录号NW_001121000.1（从第3094000位至第3109000位核苷酸截短）（SEQ ID NO:5）截短具有交叉反应性。人类寡核苷酸和恒河猴序列之间的互补性越大，人类寡核苷酸越可能与恒河猴序列交叉反应。对于SEQ ID NO:5的每个寡核苷酸的起始位点呈现于表19中。“靶标起始位点”指示恒河猴基因序列中间隙聚体所靶向的5’端核苷酸。
表19
与SEQ ID NO:5互补的反义寡核苷酸
Figure BDA0000435860670001752
Figure BDA0000435860670001761
治疗
该研究在Charles River Laboratories,Nevada进行，在研究之前，在给药开始之前使猴对其指定的居所适应至少13天。确定动物对猴逆转录病毒（SRV）以及对其它相关病毒具有至少一种阴性血清抗体测试。还进行了结核病测试。在不锈钢铁笼中单独的圈养动物，如USDA Animal Welfare Act（9CFR，部分1、2和3）中所说明的。猴为2.5至8岁，重量在2.5和4.0kg之间。5只随机分配的雄性恒河猴的8个组每个利用ISIS寡核苷酸进行皮下注射，利用适当大小的不锈钢加药针和注射器注射到轮流使用的6个给药位点中的任一中。这些位点是每个大腿的外侧部分上的一个位点和背上的四个分开的位点。第一周（第1、3和5天）以40mg/kg的剂量对猴每隔一天给药一次，作为负荷剂量，且随后第2周-13周利用ISIS299005、ISIS463588、ISIS463589、ISIS463690、ISIS463691、ISIS463835、ISIS463837或ISIS464225以20mg/kg（40mg/kg/周）的维持剂量一周给药两次。8只恒河猴的对照组在第一周（第1、3和5天）每隔一天利用PBS皮下注射一次，随后在第2周-13周一周两次。
在研究过程中，每天两次观察猴疾病或痛苦的症状。在整个研究过程兽医护理是可获得的，且通过兽医人员对动物进行检查，以对临床症状或其它变化进行保证。在研究期末，在通过氯胺酮和
Figure BDA0000435860670001762
诱导的深度麻醉下使动物安乐死，然后放血。在10分钟放血内收集所有器官。
RNA分析
从肝和肾组织提取总RNA以进行PCR分析，并利用人类引物探针组RTS3232和恒河猴引物探针组rhFGFR4_LTS00467（正向序列TCATCAACGGCAGCAGCTT，本文称作SEQ ID NO:333；反向序列TGAGCTATTGATGTCTGCAGTCTTC，本文称作SEQ ID NO:334；探针序列CCGACGGCTTCCCCTATGTGCA，本文称作SEQ ID NO:335）测量FGFR4mRNA水平。结果表示为相对于PBS对照对FGFR4的抑制百分比，关于亲环蛋白表达水平和/或利用
Figure BDA0000435860670001773
进行标准化。如表20和21中所示，利用ISIS反义寡核苷酸进行的处理导致了与PBS对照相比较FGFR4mRNA的显著降低。
表20
恒河猴肝中相对于PBS对照FGFR4mRNA的抑制%
Figure BDA0000435860670001771
表21
恒河猴肝中相对于PBS对照FGFR4mRNA的抑制%
Figure BDA0000435860670001772
FGF19和来普汀水平
已知FGF19在转基因小鼠中降低肥胖症并提高胰岛素敏感性（Fu,L.等,Endocrinology.145:2594-2603,2004）。FGF19还以作为FGFR4的高度亲和力配体为特征（Xie,M.-H.等,Cytokine.11:729-735,1999）。来普汀是在肥胖个体中发现与正常体重的个体相比较以非常高的水平存在的激素。（Considine,R.V.等,N.Engl.J.Med.334:292-295,1996）。
通过RT-PCR分析利用引物探针组rhFGF19_LTS00681（正向序列CCCCATGTGGGAATTGATCT，本文称作SEQ ID NO:336；反向序列CATGCCTGCTTCAGTCAGTTCT，本文称作SEQ ID NO:337；探针序列TTTGCCCTTCCCAAACCCCTCCA，本文称作SEQ ID NO:338）在回肠组织样品中测量FGF19mRNA水平。结果显示于表22中，表示为超过PBS对照的表达百分比。数据表明利用任何ISIS寡核苷酸进行处理增强了FGF19的表达。
评估利用ISIS299005、ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690处理的猴的血浆样品的FGF19水平。评估利用ISIS463588和ISIS463690处理的猴的血浆样品的来普汀水平。利用ELISA测定试剂盒（R&D Systems）在给药前和第23、65和89天测量FGF19的血浆水平。利用ELISA测定试剂盒(Alpco)在给药前和第58和93天测量来普汀的血浆水平。结果呈现于表23和24。数据说明利用任何ISIS寡核苷酸进行的处理升高了FGF19血浆水平并降低了来普汀水平。尤其是，利用ISIS463588进行的处理导致了与PBS对照以及其它实验血浆样品相比较FGF19血浆水平的最高的增加。利用ISIS463588进行的处理导致了与PBS对照相比较来普汀水平的最显著的降低。
表22
恒河猴中的回肠FGF19mRNA水平（超过PBS对照的表达%）
Figure BDA0000435860670001791
表23
恒河猴中的血浆FGF19水平（pg/ml）
给药前 第23天 第65天 第89天
PBS 106 79 104 84
ISIS299005 125 110 191 202
ISIS463588 192 146 309 401
ISIS463589 111 117 177 151
ISIS463690 184 154 287 266
表24
恒河猴中的血浆来普汀水平（ng/ml）
给药前 第58天 第93天
PBS 0.21 0.60 0.53
ISIS463588 0.15 0.23 0.26
ISIS463690 0.27 0.32 0.36
耐受性研究
肝功能
为评估ISIS寡核苷酸对肝功能的作用，从所有的研究组中收集血液样品。在第58天给药后48小时通过股骨静脉穿刺收集血液样品并关于血清进行处理。利用自动化的临床化学分析器（HitachiOlympus AU400e,Melville,NY）测量不同的代谢物的浓度。测量ALT和AST的血浆浓度，且结果呈现于表25中，以IU/L表示。相似地测量了同为肝功能标志物的胆红素，且结果呈现于表25中，表示为mg/dL。结果表示利用ISIS463588以及其它一些ISIS寡核苷酸进行的处理关于猴的肝功能是良好耐受的。
表25
恒河猴血浆中的ALT、AST和胆红素（第58天）
Figure BDA0000435860670001801
肾功能
为评估ISIS寡核苷酸对肾功能的作用，从所有的研究组中收集血液样品。在第58天给药后48小时通过股骨静脉穿刺收集血液样品并关于血清进行处理。利用自动化的临床化学分析器（HitachiOlympus AU400e,Melville,NY）测量BUN和肌酸酐的浓度。结果呈现于表26中，以mg/dL来表示。
结果表明ISIS寡核苷酸的大部分对肾功能不具有任何有害作用。尤其是，利用ISIS463588的处理关于猴的肾功能是良好耐受的。
表26
第58天恒河猴中的血浆BUN和肌酸酐水平（mg/dL）
Figure BDA0000435860670001802
Figure BDA0000435860670001811
炎症的标志物的分析
为评估ISIS寡核苷酸对参与炎症的因子的作用，从所有可获得的动物收集血液以用于C-反应性蛋白（CRP）和补体C3分析以及胞嘧啶和趋化因子水平的测量。在第93天给药后48小时通过股骨静脉穿刺收集血液样品并分别关于血清和血浆进行处理。利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量血清CRP和血浆补体C3。数据呈现于表27和28中，表示为mg/dL。
对于细胞因子水平分析，收集血液（每种1mL）且然后在2-8℃下离心3,000转，持续10分钟。将用ISIS463588、ISIS463589和ISIS463690处理的小鼠的血浆样品送至Aushon Biosystems Inc.(Billerica,MA)以用于趋化因子和细胞因子水平的测量。利用各自的交叉反应人类抗体测量IL-6、MIP-1α、IL-8、MIP-1β、MCP-1、IL-1β和RANTES，并利用各自的灵长类抗体测量IFN-γ和IL-1β。在给药前和第93天进行测量。结果呈现于表29-36中。
数据表明ISIS寡核苷酸的大部分是非促炎性的。具体地，利用ISIS463588进行的处理关于猴中的非促炎性是良好耐受的，由于炎症的标志物CRP无改变。
表27
恒河猴中的CRP（mg/dL）
Figure BDA0000435860670001812
Figure BDA0000435860670001821
表28
恒河猴中的补体C3（mg/dL）
给药前 第30天 第58天 第93天
PBS 114.3 109.1 112.5 113.3
ISIS299005 108.3 92.1 99.6 91.4
ISIS463588 106.7 91.9 94.9 95.7
ISIS463589 116.3 102.0 105.1 100.9
ISIS463690 113.3 89.4 85.6 78.7
ISIS463691 123.5 89.2 70.6 97.6
ISIS463835 105.5 66.2 66.5 69.0
ISIS463837 107.1 91.1 88.7 86.5
ISIS464225 104.7 91.9 92.7 80.1
表29
恒河猴中的IL-6（pg/mL）
Figure BDA0000435860670001822
表30
恒河猴中的IL-8（pg/mL）
Figure BDA0000435860670001823
Figure BDA0000435860670001831
表31
恒河猴中的MIP-1α（pg/mL）
给药前 第93天
PBS 7.6 8.9
ISIS463588 8.9 10.8
ISIS463589 7.9 11.2
ISIS463690 13.8 18.9
表32
恒河猴中的MIP-1β（pg/mL）
给药前 第93天
PBS 249 229
ISIS463588 219 211
ISIS463589 175 196
ISIS463690 362 478
表33
恒河猴中的MCP-1（pg/mL）
给药前 第93天
PBS 200 275
ISIS463588 420 496
ISIS463589 343 363
ISIS463690 441 709
表34
恒河猴中的IFN-γ（pg/mL）
Figure BDA0000435860670001832
Figure BDA0000435860670001841
表35
恒河猴中的IL-1β（pg/mL）
给药前 第93天
PBS 0.09 0.28
ISIS463588 0.07 0.08
ISIS463589 0.13 0.06
ISIS463690 0.20 0.36
表36
恒河猴中的RANTES（pg/mL）
给药前 第93天
PBS 43339 48967
ISIS463588 45962 51326
ISIS463589 38382 30985
ISIS463690 37330 29209
血液学
为在恒河猴中评估ISIS寡核苷酸对血液学参数的任何作用，在第93天将来自可获得的研究动物中的每个的约1.3mL的血液收集到含K2-EDTA的管中。利用ADVIA120血细胞分析器（Bayer,USA）分析样品的红细胞（RBC）计数、白细胞（WBC）计数T、单独的白细胞计数，例如单核细胞、中性粒细胞、淋巴细胞的计数以及血小板计数、血红蛋白含量和血细胞比容。数据呈现于表37和38中。
数据表明ISIS寡核苷酸的大部分对任何血液学参数不具有任何有害作用。具体地，利用ISIS463588进行的处理关于猴的血液学参数是良好耐受的。
表37
恒河猴中的血细胞
Figure BDA0000435860670001851
表38
恒河猴中的血液学参数
药物代谢动力学研究
寡核苷酸浓度的测量
测量了全长寡核苷酸的浓度以及总寡核苷酸浓度（包括降解的形式）。所用的方法是先前公开的方法的修改形式（Leeds等,1996；Geary等,1999），其由固相提取后的酚氯仿（液体-液体）提取组成。在提取之前添加内标（ISIS355868，27-聚体2’-O-甲氧基乙基修饰的硫代磷酸酯寡核苷酸，GCGTTTGCTCTTCTTCTTGCGTTTTTT，本文称作SEQ ID NO:323）。利用校准曲线计算组织样品浓度，定量下限（LLOQ）约1.14μg/g。结果呈现于表39中，表示为μg/g组织。计算肾中对比肝中的浓度的比率并呈现于表39中。利用ISIS寡核苷酸进行的处理不会导致比率的任何异常。
表39
恒河猴的肝和肾中的全长寡核苷酸浓度（μg/g）
ISIS编号 肾 肝 肾/肝
463588 1717 1033 1.7
463589 1663 1227 1.4
463690 1395 1226 1.1
总之，研究的结果表明ISIS463588是用于代谢性疾病诸如糖尿病、肥胖、胰岛素抗性和胰岛素缺陷的治疗的有效的和可耐受的反义寡核苷酸。
实施例16：鼠类FGFR4的反义抑制在热限制的饮食诱导的肥胖（DIO）小鼠中的体内作用
DIO小鼠是C57BL/6小鼠，从6周龄开始喂养高脂肪饮食，并且是用于与研究治疗剂对减少肥胖症和提高胰岛素敏感性的作用相关的测定的标准模型。在该测定中使用了反义寡核苷酸ISIS393250，5-10-5MOE间隙聚体，其具有序列5’-GCCACATTTCCTTCCAGCTG-3（SEQ ID NO:324），且具有鼠类FGFR4mRNA上的第337位的靶标起始位点（GENBANK登录号BC033313.1(SEQ ID NO:6)）。评估ISIS393250对热限制下的DIO模型的作用。
处理
雄性6周龄C57BL/6小鼠（Jackson Laboratories）利用58千卡%高脂肪饮食（研究饮食D12330）无限制地喂养4个月以诱导肥胖。基于体重和体脂含量将小鼠分为4个组。利用25mg/kg ISIS393250一周两次皮下施用处理第一组小鼠，持续6周。利用25mg/kg对照寡核苷酸，ISIS141923（CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC(SEQ ID NO:325)，具有非已知的鼠类靶标的5-10-5MOE间隙聚体）皮下施用处理第二组小鼠，一周两次，持续6周。利用PBS一周两次皮下施用处理小鼠的两个对照组，持续6周。在两周处理之后，通过提供FGFR4ASO处理的小鼠在前两周处理过程中每天消耗的食物的量的95%对寡核苷酸处理的小鼠和PBS对照组小鼠之一进行热限制。第二PBS对照组利用与前两周处理中相同的食物的量持续进行无限制地喂养。
测量每周体重并在不同的时间点利用Echo MRI身体组成分析仪监测身体组成。在处理6周后对小鼠进行安乐死。
RNA分析
从肝中提取RNA以用于鼠类FGFR4表达的RT-PCR分析。使用引物探针组mFGFR4_LTS00702（正向序列CCCTGAGGCCAGATACACAGATAT，本文称作SEQ ID NO:339；反向序列ACGGATGACTTGCCGATGATA，本文称作SEQ ID NO:340；探针序列CTCACTGGTTCTGCTTGTGCTCCTGCT，本文称作SEQ ID NO:341）进行分析。结果表明利用ISIS393250进行的处理降低了鼠类FGFR4水平的76%。
体重和身体组成分析
测量每周体重并呈现于表40中。体脂含量数据呈现于表41中，表示为对应体重的百分比。去脂肪体重呈现于表42中，以克表示。在对小鼠进行安乐死之后测量白色脂肪组织重量并呈现于表43中，以克表示。数据表明热限制显著降低了体重和总体脂含量。利用ISIS393250进行的处理进一步降低了体重和脂肪含量两者，但对脂肪除外体重无影响。利用ISIS141923进行的处理无作用。因此，FGFR4表达的反义抑制对罹患肥胖的受试者的体重和体脂含量具有有利的作用。
表40
每周体重（g）
Figure BDA0000435860670001881
表41
体脂含量（体重%）
Figure BDA0000435860670001882
表42
脂肪除外体重（g）
Figure BDA0000435860670001883
表43
白色脂肪组织重量（g）
热限制的 附睾 肾周
PBS 否 2.5 1.1
PBS 是 2.2 0.9
ISIS141923 是 2.2 0.9
ISIS393250 是 1.8 0.7
代谢速率和活动能力分析
通过测量小鼠的氧消耗和热产生评价了代谢速率。利用间接的量热系统（Oxymax system,Columbus Instruments）测量了两个参数。利用相同的仪器还评估活动能力。代谢速率和活动能力均在黑暗（此时小鼠通常更活跃）和光亮中评估。结果呈现于表44-46中。结果表明热限制诱导了整体氧消耗。利用ISIS393250进行的处理防止了氧消耗的这种下降且不影响活动能力。因此，具有热限制的饮食的肥胖受试者中的FGFR4表达的反义抑制将是有利的，因为其将防止受试者中代谢速率的任何下降。
表44
O2消耗（mL/kg瘠瘦组织/小时）
热限制的 黑暗 光亮
PBS 否 4275 3327
PBS 是 4085 3259
ISIS141923 是 4094 3258
ISIS393250 是 4268 3359
表45
热产生（kcal/kg瘠瘦组织/小时）
热限制的 黑暗 光亮
PBS 否 19.8 15
PBS 是 19.1 15.1
ISIS141923 是 19.1 15.1
ISIS393250 是 19.7 15.7
表46
活动能力（事件/分钟）
Figure BDA0000435860670001901
实施例17：热限制的饮食诱导的肥胖（DIO）小鼠中鼠类FGFR4的反义抑制的体内作用
评估了ISIS446259（TCCATTTCCTCAGAGGCCTC（SEQ ID NO:326），5-10-5MOE间隙聚体，具有GENBANK登录号BC033313.1(SEQ ID NO:6)上第407位的靶起始位点）对热限制下的DIO小鼠的作用。
处理
将雄性6周龄C57BL/6小鼠（Jackson Laboratories）利用58千卡%高脂肪饮食（研究饮食D12330）无限制地喂养3.5个月以诱导肥胖。基于体重和体脂含量将小鼠分为4个组。利用25mg/kg ISIS446259一周两次皮下施用处理第一组小鼠，持续8周。利用25mg/kg对照寡核苷酸，ISIS141923皮下施用处理第二组小鼠，一周两次，持续8周。利用PBS一周两次皮下施用处理小鼠的两个对照组，持续8周。在两周处理之后，通过提供FGFR4ASO处理的小鼠在前两周处理过程中每天消耗的食物的量的90%对寡核苷酸处理的小鼠和PBS对照组小鼠之一进行热限制。第二PBS对照组利用与前两周处理中相同的食物的量持续进行无限制地喂养。
测量每周体重并在不同的时间点利用Echo MRI身体组成分析仪监测身体组成。在处理8周后对小鼠进行安乐死。
RNA分析
从肝中提取RNA以用于鼠类FGFR4表达的RT-PCR分析。使用引物探针组mFGFR4_LTS00702分析mRNA水平。结果表明利用ISIS446259进行的处理降低了鼠类FGFR4水平的83%。
体重和身体组成分析
测量每周体重并呈现于表47中。体脂含量数据呈现于表48中，表示为对应体重的百分比。去脂肪体重呈现于表49中，以克表示。数据表明热限制显著降低了体重和总体脂含量。利用ISIS446259进行的处理进一步降低了体重和脂肪含量两者，但对脂肪除外体重无影响。利用ISIS141923进行的处理无作用。因此，除了通过单独进行热限制所观察到的作用之外，FGFR4表达的反义抑制对罹患肥胖的受试者的体重和体脂含量具有有利的作用。
表47
每周体重（g）
表48
体脂含量（体重%）
热限制的 第0周 第2周 第5周 第8周
PBS 否 41 43 43 42
PBS 是 41 43 41 39
ISIS141923 是 40 40 37 35
ISIS446259 是 41 41 35 30
表49
瘦体重（g）
Figure BDA0000435860670001921
血脂分析
为评估ISIS寡核苷酸对胆固醇和甘油三酯代谢的作用，在处理期末测量每种的血浆水平。对小鼠进行安乐死并通过心脏穿刺收集血液。利用自动化的临床化学分析器（Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY）测量脂质水平。结果呈现于表50中，表示为mg/dL。结果表明在小鼠中利用ISIS446259进行的处理降低了胆固醇和甘油三酯两者的水平。因此，FGFR4的反义抑制对脂质特性具有有利的作用并在肥胖受试者中可用于减少肥胖症。
表50
胆固醇和脂质水平（mg/dL）
Figure BDA0000435860670001922
Figure BDA0000435860670001931
实施例18：DIO小鼠中鼠类FGFR4对FGF15水平的体内反义抑制作用
在DIO小鼠中评估了ISIS393250和ISIS446259对FGF15水平的作用。
处理
雄性6周龄C57BL/6小鼠（Jackson Laboratories）利用58千卡%高脂肪饮食（研究饮食D12330）无限制地喂养3.5个月以诱导肥胖。C57BL/6小鼠的组喂养正常的Purina小鼠固型食物并用作天然的对照。基于体重和体脂含量将DIO小鼠分组。第一组DIO小鼠利用25mg/kg ISIS393250一周两次皮下施用进行处理，持续4周。第二组DIO小鼠利用25mg/kgISIS446259皮下施用进行处理，一周两次，持续4周。第三组DIO小鼠利用25mg/kg对照寡核苷酸，ISIS141923皮下施用进行处理，一周两次，持续4周。对照组的DIO小鼠用皮下施用PBS进行处理，一周两次，持续4周。在治疗4周后对小鼠进行安乐死。
FGF15水平
FGF15是FGF19的啮齿类等效物（Wright,T.J.等,Dev.Biol.269:264-275,2004），因此对于降低小鼠的肥胖症和提高胰岛素敏感性是重要的。
从肝和回肠中提取RNA。通过关于FGFR4mRNA水平的RT-PCR分析利用引物探针组mFGFR4_LTS00702分析肝RNA。利用引物探针组mFgf15_LTS00635（正向序列GACCAAAACGAACGAAATTTGTT，本文称作SEQ ID NO:342;反向序列ACGTCCTTGATGGCAATCG，本文称作SEQ ID NO:343；探针序列AATTCCGCGCGGTCGCTCTG，本文称作SEQ ID NO:344）通过关于FGF15水平的RT-PCR分析分析回肠RNA。结果呈现于表51中并证明利用任一反义寡核苷酸进行的处理显著降低了FGFR4mRNA水平且还显著增强了FGF15表达水平。
在第2周和第4周利用ELISA用抗FGF15抗体（Santa CruzBiotechnology Inc）还分析了小鼠组的血浆样品的FGF15蛋白水平。结果呈现于表52中并证明FGFR4的反义抑制导致了FGF15的升高的血浆水平。
表51
相对于对照FGFR4和FGF15mRNA水平
Figure BDA0000435860670001941
表52
第2周和第4周的FGF15血浆水平（ng/ml）
第2周 第4周
PBS 0.13 0.13
ISIS141923 0.12 0.14
ISIS393250 0.69 0.96
ISIS446259 0.18 0.25
C57BL/6对照 0.1 0.12
实施例19：C57BL/6小鼠中鼠类FGFR4对FGF15水平的体内反义抑制作用
在C57BL/6小鼠中评估了ISIS393250对FGF15水平的作用。
治疗
雄性6周龄C57BL/6小鼠（Jackson Laboratories）利用正常Purina小鼠固型食物喂养。将小鼠随机分成3组。第一组的小鼠利用50mg/kg ISIS393250一周两次皮下施用进行处理，持续5.5周。第二组的小鼠利用50mg/kg对照寡核苷酸，ISIS141923皮下施用进行处理，一周两次，持续5.5周。对照组的小鼠用皮下施用PBS进行处理，一周两次，持续5.5周。
FGFR4水平
从肝中提取RNA并通过用于FGFR4mRNA水平的RT-PCR分析利用引物探针组mFGFR4_LTS00702分析RNA。结果呈现于表53中且证明利用ISIS393250进行的处理显著降低了FGFR4mRNA水平。
表53
FGFR4mRNA抑制水平（%）
ISIS编号 %
141923 0
393250 79
FGF15水平
利用ELISA用抗FGF15抗体（Santa Cruz Biotechnology Inc）分析小鼠组的血浆样品的FGF15蛋白水平。结果呈现于表54中且证明FGFR4的反义抑制导致了FGF15的升高的血浆水平。
表54
第16天FGF15血浆水平
ng/mL
PBS 0.07
ISIS141923 0.08
ISIS393250 0.28
实施例20：ob/ob小鼠中鼠类FGFR4对FGF15水平的体内反义抑制作用
来普汀是由脂肪产生的调节食欲的激素。人类和非人类动物中该激素的缺陷均导致肥胖。ob/ob小鼠具有来普汀基因的突变，其导致肥胖和高血糖。这样，这些小鼠是用于研究肥胖和糖尿病和本文提供的相关症状的有用的模型。这些小鼠模型还用于测试所设计的用于治疗、预防或改善所述病症的化合物、组合物和方法。
根据本发明，在肥胖的ob/ob小鼠模型中研究了FGFR4的反义抑制作用。雄性12周龄ob/ob（C57Bl/6J-Lepob/Lepob）小鼠购自JacksonLaboratories（Bar Harbor,ME）并用于本研究。
处理
基于体重和体脂含量将小鼠分组。第一组的小鼠利用25mg/kgISIS393250皮下施用进行处理，一周两次，持续14周。第二组利用25mg/kg对照寡核苷酸，ISIS141923进行处理，一周两次，持续14周。将对照组的小鼠利用PBS皮下施用进行处理，一周两次，持续14周。
FGFR4水平
从肝中提取RNA并通过用于FGFR4mRNA水平的RT-PCR分析利用引物探针组mFGFR4_LTS00702进行分析。结果呈现于表55中，且证明利用ISIS393250进行的处理显著降低了FGFR4mRNA水平。
表55
FGFR4mRNA抑制水平（%）
ISIS编号 %
141923 0
393250 89
FGF15水平
利用ELISA用抗FGF15抗体（Santa Cruz Biotechnology Inc）分析了小鼠组的血浆样品的FGF15蛋白水平。结果呈现于表56中，且证明了FGFR4的反义抑制导致了FGF15的升高的血浆水平。
表56
第4周和第8周FGF15血浆水平（ng/mL）
第4周 第8周
PBS 0.5 1.2
ISIS141923 0.8 0.5
ISIS393250 4.2 4.2
实施例21：猴原代肝细胞中鼠类FGFR4的反义抑制作用
在猴原代肝细胞中评估了利用ISIS299004进行的FGFR4的反义抑制对脂肪酸氧化的作用。使用AICAR（参考？）作为阳性对照。
处理
原代肝细胞购自APL/Lovelace In Vitro Enterprises并在William E培养基中培养。将细胞以每个25ml培养瓶1百万细胞的密度接种。在4-5小时培养后，利用30nM的ISIS299004或1000μM AICAR处理细胞18小时。细胞的对照组利用PBS进行处理。利用引物探针组cynoFGFR4_MGB_LTS00689（正向序列GCACCAGGGATGAGCTTGAC，本文称作SEQ ID NO:348;反向序列CCAAGTCTCCCACTTTCCAGTT，本文称作SEQ ID NO:349；探针序列AAGAGCCTGACTCCAGT，本文称作SEQ ID NO:350）测量FGFR4水平。利用ISIS299004进行的处理将FGFR4水平降低了83%。
为评估脂肪酸氧化，将细胞置于含1-14c油酸和BSA的低葡萄糖培养基中，并用含悬挂储器活塞的橡胶塞盖住培养瓶。然后将细胞在37℃下在5%CO2下孵育1.5小时。孵育后，将200μl的1M氢氧海胺（14CO2收集剂）添加到储器活塞并将1ml的10%的高氯酸溶液添加到细胞。然后将烧瓶转移到37℃振荡孵育器中，持续40分钟。在孵育完成后，将含氢氧海胺的悬挂活塞储器与培养瓶分开并置于闪烁液中过夜，且第二天在闪烁计数器中读数。通过利用DCTMBiorad蛋白测定试剂盒（Bearden,J.Biochem.Biophys.Acta.533:525.1978）基于等量的原代猴肝细胞进行基于Bradford的蛋白测量。将获自蛋白读数器的值用于通过闪烁计数器计数的CO2产生的标准化。结果呈现于表57中，且表明原代肝细胞中FGFR4的反义抑制增加了脂肪酸氧化。进行了5个独立的脂肪酸氧化实验，其证明了结果的相似的趋向。
表57
CO2产生（对照的%）
CO2
ISIS141923 +2
ISIS299004 +48
AICAR +44
Figure IDA0000435860700000011
Figure IDA0000435860700000031
Figure IDA0000435860700000041
Figure IDA0000435860700000051
Figure IDA0000435860700000061
Figure IDA0000435860700000091
Figure IDA0000435860700000101
Figure IDA0000435860700000111
Figure IDA0000435860700000121
Figure IDA0000435860700000131
Figure IDA0000435860700000141
Figure IDA0000435860700000151
Figure IDA0000435860700000161
Figure IDA0000435860700000171
Figure IDA0000435860700000191
Figure IDA0000435860700000221
Figure IDA0000435860700000241
Figure IDA0000435860700000251
Figure IDA0000435860700000261
Figure IDA0000435860700000281
Figure IDA0000435860700000291
Figure IDA0000435860700000311
Figure IDA0000435860700000321
Figure IDA0000435860700000331
Figure IDA0000435860700000351
Figure IDA0000435860700000361
Figure IDA0000435860700000371
Figure IDA0000435860700000381
Figure IDA0000435860700000401
Figure IDA0000435860700000411
Figure IDA0000435860700000421
Figure IDA0000435860700000431
Figure IDA0000435860700000441
Figure IDA0000435860700000451
Figure IDA0000435860700000461
Figure IDA0000435860700000471
Figure IDA0000435860700000481
Figure IDA0000435860700000511
Figure IDA0000435860700000521
Figure IDA0000435860700000531
Figure IDA0000435860700000551
Figure IDA0000435860700000561
Figure IDA0000435860700000571
Figure IDA0000435860700000581
Figure IDA0000435860700000601
Figure IDA0000435860700000611
Figure IDA0000435860700000621
Figure IDA0000435860700000641
Figure IDA0000435860700000651
Figure IDA0000435860700000661
Figure IDA0000435860700000671
Figure IDA0000435860700000691
Figure IDA0000435860700000701
Figure IDA0000435860700000711
Figure IDA0000435860700000721
Figure IDA0000435860700000731
Figure IDA0000435860700000741
Figure IDA0000435860700000751
Figure IDA0000435860700000761
Figure IDA0000435860700000791
Figure IDA0000435860700000801
Figure IDA0000435860700000811
Figure IDA0000435860700000831
Figure IDA0000435860700000841
Figure IDA0000435860700000851
Figure IDA0000435860700000871
Figure IDA0000435860700000881
Figure IDA0000435860700000891
Figure IDA0000435860700000901
Figure IDA0000435860700000911

Claims (109)

1.一种包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述连接的核苷包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少8个连续核碱基。
2.如权利要求1所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸由15至25个连接的核苷组成。
3.如权利要求1所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸由18至21个连接的核苷组成。
4.一种包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述连接的核苷包含与SEQ ID NO:1的第191-210位、第193-212位、第369-388位、第370-389位、第788-807位、第790-809位和第2954-2973位核苷酸内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。
5.一种包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸的化合物，其中所述连接的核苷包含与SEQ ID NO:2的第3196-3215位、第3198-3217位、第4070-4089位、第4071-4090位、第5272-5291位、第5274-5293位和第11624-11643位核苷酸内的等长核碱基部分互补的至少8个连续核碱基部分。
6.如权利要求2所述的化合物，其中所述核碱基序列包含SEQID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少15个连续核碱基。
7.如权利要求3所述的化合物，其中所述核碱基序列包含SEQ IDNO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少18个连续核碱基。
8.如权利要求1-7中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸是单链寡核苷酸。
9.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2至少90%互补。
10.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2至少95%互补。
11.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2100%互补。
12.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中至少一种核苷间键是修饰的核苷间键。
13.如权利要求12所述的化合物，其中每个核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。
14.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸的至少一个核苷包含修饰的糖。
15.如权利要求14所述的化合物，其中所述至少一种修饰的糖是双环糖。
16.如权利要求15所述的化合物，其中所述至少一种双环糖的每一个包含4’-CH2-N(R)-O-2’桥连基，其中R独立地为H、C1-C12烷基或保护基。
17.如权利要求15所述的化合物，其中所述至少一种双环糖的每一个包含4’-CH(CH3)-O-2’桥连基。
18.如权利要求14所述的化合物，其中至少一种修饰的糖包含2’-O-甲氧基乙基基团。
19.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其包含至少一种四氢吡喃修饰的核苷，其中四氢吡喃环取代所述呋喃糖环。
20.如权利要求19所述的化合物，其中所述至少一种四氢吡喃修饰的核苷的每一个具有结构：
Figure FDA0000435860660000031
其中Bx是任选地受保护的杂环碱基部分。
21.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中至少一种核苷包含修饰的核碱基。
22.如权利要求21所述的化合物，其中所述修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶。
23.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸包括：
间隙区段，其由连接的脱氧核苷组成；
5’翼状区段，其由连接的核苷组成；和
3’翼状区段，其由连接的核苷组成；
其中所述间隙区段位于所述5’翼状区段和所述3’翼状区段之间，并且其中每个翼状区段的每个核苷包含修饰的糖。
24.如权利要求23所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸包括：
间隙区段，其由10个连接的脱氧核苷组成；
5’翼状区段，其由5个连接的核苷组成；和
3’翼状区段，其由5个连接的核苷组成；
其中所述间隙区段位于所述5’翼状区段和所述3’翼状区段之间，其中每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；并且其中每个核苷间键是硫代磷酸酯键。
25.如权利要求23所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸由12至30个连接的核苷组成，其中所述连接的核苷包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少8个连续核碱基并包括
间隙区段，其由10个连接的脱氧核苷组成；
5’翼状区段，其由5个连接的核苷组成；和
3’翼状区段，其由5个连接的核苷组成；
其中所述间隙区段位于所述5’翼状区段和所述3’翼状区段之间，其中每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；并且其中每个核苷间键是硫代磷酸酯键。
26.如权利要求23所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸包括：
间隙区段，其由8个连接的脱氧核苷组成；
5’翼状区段，其由6个连接的核苷组成；和
3’翼状区段，其由6个连接的核苷组成；
其中所述间隙区段位于所述5’翼状区段和3’翼状区段之间，其中每个翼状区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；并且其中每个核苷间键是硫代磷酸酯键。
27.如权利要求1-8中任一项所述的化合物，其中所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成。
28.一种组合物，其包含如权利要求1-27中任一项所述的化合物或其盐和药学上可接受的载体或稀释剂中的至少一种。
29.一种方法，其包括向动物施用如权利要求1-26中任一项所述的化合物或组合物。
30.如权利要求29所述的方法，其中所述动物是人。
31.如权利要求29所述的方法，其中施用所述化合物预防、治疗、改善或减缓了代谢性疾病的进展。
32.如权利要求31所述的方法，其中所述代谢性疾病是肥胖。
33.如权利要求29所述的方法，其包括共施用所述化合物或组合物和第二药剂。
34.如权利要求33所述的方法，其中所述化合物或组合物和所述第二药剂是同时施用的。
35.一种在动物中降低FGFR4mRNA或蛋白表达的方法，其包括向所述动物施用如权利要求1-27中任一项所述的化合物或组合物，从而在所述动物中降低FGFR4mRNA或蛋白表达。
36.如权利要求35所述的方法，其中所述动物是人。
37.如权利要求35所述的方法，其中降低FGFR4mRNA或蛋白表达预防、治疗、改善或减缓代谢性疾病的进展。
38.如权利要求35所述的方法，其中降低FGFR4mRNA或蛋白表达预防、治疗、改善或减缓肥胖的进展。
39.如权利要求35所述的方法，其包括共施用所述化合物或组合物和第二药剂。
40.如权利要求38所述的方法，其中所述化合物或组合物和所述第二药剂是同时施用的。
41.一种用于治疗患代谢性疾病的人的方法，其包括鉴定所述患代谢性疾病的人并向所述人施用治疗有效量的如权利要求1-27中任一项所述的化合物或组合物，从而治疗所述代谢性疾病。
42.如权利要求41所述的方法，其中所述代谢性疾病是肥胖。
43.如权利要求41所述的方法，其中所述治疗降低了以下中的至少一种：胰岛素抗性、葡萄糖水平、脂肪量、脂垫重量、脂肪组织大小和重量、体脂、体重或其组合。
44.如权利要求41所述的方法，其中所述治疗提高了代谢速率。
45.如权利要求41所述的方法，其包括共施用所述化合物或组合物和第二药剂。
46.如权利要求45所述的方法，其中所述化合物或组合物和所述第二药剂是同时施用的。
47.一种用于减少或预防代谢性疾病的方法，其包括向人施用治疗有效量的如权利要求1所述的化合物，从而减少或预防代谢性疾病。
48.如权利要求47所述的方法，其中所述代谢性疾病是肥胖。
49.如权利要求47所述的方法，其包括共施用所述化合物或组合物和第二药剂。
50.如权利要求49所述的方法，其中所述化合物或组合物和所述第二药剂是同时施用的。
51.一种用于改善代谢性疾病的症状的方法，其包括向需要其的人施用如权利要求1所述的化合物，从而在所述人中改善代谢性疾病的症状。
52.一种用于降低与代谢性疾病相关联的症状的进展速率的方法，其包括向需要其的人施用如权利要求1所述的化合物，从而在所述人中降低代谢性疾病的症状的进展的所述速率。
53.一种用于逆转由与代谢性疾病相关联的症状所指示的退化的方法，其包括向需要其的人施用如权利要求1所述的化合物，从而在所述人中逆转由代谢性疾病的症状所指示的退化。
54.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述代谢性疾病是肥胖。
55.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述修饰的寡核苷酸是单链寡核苷酸。
56.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2至少90%互补。
57.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2至少95%互补。
58.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述修饰的寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO1或2100%互补。
59.如权利要求51、52或53中任一项所述的方法，其中所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组成。
60.如权利要求50-59中任一项所述的方法，其中所述化合物包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其中所述连接的核苷包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少12个连续核碱基。
61.如权利要求50-59中任一项所述的方法，其中所述化合物包含由20个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸，其中所述连接的核苷包含SEQ ID NO:16、17、45、46、70、72或138中所列序列的至少19个连续核碱基。
62.一种在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达
d)检测FGF15基因表达的升高
63.如权利要求62所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
64.一种在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达
d)检测FGF19基因表达的升高
65.如权利要求64所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
66.一种预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15基因表达
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15基因表达
d)检测FGF15基因表达的升高
67.如权利要求66所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
68.一种预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19基因表达
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19基因表达
d)检测FGF19基因表达的升高
69.如权利要求68所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸。
70.一种在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平
d)检测FGF15蛋白水平的升高
71.如权利要求70所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
72.一种在动物中检测FGFR4抑制剂的抗肥胖作用的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平
d)检测FGF19蛋白水平的升高
73.如权利要求72所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
74.一种预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF15蛋白水平
e)施用FGFR4抑制剂
f)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF15蛋白水平
g)检测FGF15蛋白水平的升高
75.如权利要求74所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
76.一种预测动物对FGFR4抑制剂的反应性的方法，其包括：
a)在施用FGFR4抑制剂之前测量个体中的FGF19蛋白水平
b)施用FGFR4抑制剂
c)在施用FGFR4抑制剂之后测量FGF19蛋白水平
d)检测FGF19蛋白水平的升高
77.如权利要求76所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是靶向FGFR4的修饰的反义寡核苷酸
78.一种估计FGFR4水平的方法，其包括测量FGF15或FGF19水平。
79.一种治疗肥胖的方法，其包括：
(a)向血液中具有基线水平的FGF19的受试者施用第一剂量的FGFR4抑制剂；和
(b)向所述受试者施用一个或多个另外剂量的FGFR4抑制剂直至所述受试者的血液中的FGF19的水平至少8周未从所述基线水平升高。
80.如权利要求79所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平至少10周未从所述基线水平升高。
81.如权利要求79所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平至少12周未从所述基线水平升高。
82.如权利要求79所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平至少14周未从所述基线水平升高。
83.如权利要求79所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平至少16周未从所述基线水平升高。
84.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过1-1,000%。
85.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过1-500%。
86.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过1-100%。
87.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过1-50%。
88.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过1-10%。
89.如权利要求79-83中任一项所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过约1-2,000pg/mL。
90.如权利要求89所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过约1-500pg/mL。
91.如权利要求89所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过约1-100pg/mL。
92.如权利要求89所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过约1-50pg/mL。
93.如权利要求89所述的方法，其中所述受试者的血液中的所述FGF19的水平未从所述基线水平升高超过约1-10pg/mL。
94.一种治疗肥胖的方法，其包括：
(a)向血液中具有基线水平的FGF19的受试者施用第一剂量的FGFR4抑制剂；和
(b)向所述受试者施用一个或多个另外较高剂量的FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高。
95.如权利要求94所述的方法，还包括步骤(c)：以有效维持所述升高的FGF19的水平的量施用一种或多种后续剂量的FGFR4抑制剂。
96.如权利要求94或95所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中的所述一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高至少约1-1,000%。
97.如权利要求96所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中的所述一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高至少约1-500%。
98.如权利要求96所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中的所述一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高至少约1-100%。
99.如权利要求96所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中的所述一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高至少约1-50%。
100.如权利要求96所述的方法，其中向所述受试者施用所述步骤(b)中的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平从所述基线水平升高至少约1-10%。
101.如权利要求94或95中所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中所述的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平升高至少约1-2,000pg/mL。
102.如权利要求101所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中所述的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平升高至少约1-500pg/mL。
103.如权利要求101所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中所述的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平升高至少约1-100pg/mL。
104.如权利要求101所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中所述的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平升高至少约1-50pg/mL。
105.如权利要求101所述的方法，其中向所述受试者施用步骤(b)中所述的一个或多个另外较高剂量的所述FGFR4抑制剂直至所述FGF19的水平升高至少约1-10pg/mL。
106.如权利要求79-105中任一项所述的方法，其中所述FGFR4抑制剂是如权利要求1-27中任一项所述的化合物或如权利要求28中所述的组合物。
107.如权利要求106所述的方法，其中所述化合物或组合物的每个剂量为约50-2000mg、约50-400mg、约50-200mg、约50-100mg、或约100-200mg。
108.如权利要求79-107中任一项所述的方法，其中所述受试者是动物。
109.如权利要求108所述的方法，其中所述动物是人。
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