CN102612696B - 具有报告验证器和报告增强器的医学信息系统 - Google Patents
具有报告验证器和报告增强器的医学信息系统 Download PDFInfo
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Abstract
一种医学信息系统(170)包括:验证器(140),其被配置为利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个验证第一报告中的图像发现物,所述图像发现物是基于由成像装置(110)产生的解剖结构图像而生成的;以及增强器(160),其被配置为利用来自包括医学发现物的第二报告的信息增强所述第一报告。
Description
技术领域
本申请涉及管理医学信息,并且更具体地涉及验证和/或增强医学报告中的医学信息。
背景技术
随着成像采集技术的发展,存在日常采集的极大量成像数据。放射学家必须人工查阅大量的图像。因此,放射学家有可能忽视图像中与诊断和治疗医学状况相关的信息。一旦放射学家读取了患者的图像,放射学家将口述发现物,并且这些发现物随后被用于生成放射学报告。
病理学和其他诊断结果也是读取图像的重要部分。例如,额外或继续的成像和非成像研究的选择、图像的解释以及患者治疗可能依赖于病理学结果。在临床实践中,放射学结果可能保持为非决定性的,直到获得病理学结果为止。
为了改善放射学结果的诊断精确度,放射学研究中至关重要的是使特定成像发现物与病理发现物相关。遗憾的是,这可能要求放射学家人工检索病理学报告或其他诊断结果。这种过程可能是耗时的且易于出错的。
在放射学家口述具有非决定性诊断的发现物之后,放射学家将移到不同患者的下一组图像,并且稍后一次或多次返回到具有非决定性诊断的报告,以便基于病理学报告和/或其他报告更新该报告。
在临床工作流程中,将病理学数据添加到放射学报告也可以通过减少放射学报告结果的不明确和不确定性来帮助咨询医师。
发明内容
本申请的各方面解决了上述及其他问题。
根据本发明的一个方面,一种医学信息系统(170)包括:验证器(140),其被配置为利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个验证第一报告中的图像发现物,所述图像发现物是基于由成像装置(110)产生的解剖结构图像而生成的;以及增强器(160),其被配置为利用来自包括医学发现物的第二报告的信息增强所述第一报告。
根据本发明的另一方面,一种计算机可读介质在其上存储有计算机可执行指令,所述指令在被处理器执行时执行一方法,所述方法包括:利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个验证第一报告中的发现物,以及利用来自利用医学发现物生成的第二报告的信息增强所述第一报告。
根据本发明的另一方面,一种医学信息系统(170)包括验证器(140),该验证器被配置为利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个验证第一报告中的图像发现物,所述图像发现物是基于由成像装置(110)生成的解剖结构图像的。
根据本发明的另一方面,一种医学信息系统(170)包括增强器(160),该增强器被配置为利用来自包括医学发现物的第二报告的信息增强包括图像发现物的第一报告,所述图像发现物是基于由成像装置(110)生成的解剖结构图像的。
上面限定的各方面以及本发明的更多方面将从以下要描述的实施例的示例变得显而易见并且通过参考实施例的示例得以解释。
下面将参考实施例的示例更详细地描述本发明,但是本发明并不局限于此。
附图说明
图1图示说明医学信息系统的框图;
图2图示说明用于验证放射学报告的系统的框图;
图3图示说明用于增强放射学报告的系统的框图;
图4图示说明用于验证放射学报告的方法的流程图;
图5图示说明用于增强放射学报告的方法的流程图。
具体实施方式
参考图1,一种系统(100)包括产生用于生成患者的解剖结构的一个或多个图像的成像数据的成像装置110,并且这些图像可以经由监视器和/或影片来显示。成像装置110例如是X射线、计算机断层摄影(CT)、磁共振成像(MRI)、单光子发射断层摄影(SPECT)、正电子发射断层摄影(PET)和超声成像(US)成像装置。
读取站115被用于读取影片或在监视器上观察图像。放射学家116检查来自影片或监视器的图像并且将发现物口述到记录设备中。录音打字员120使用诸如在计算系统如个人计算机或类似设备上运行的文字处理软件的报告发生器130来生成具有口述发现物的放射学报告。
诸如数据库、服务器等的电子报告储存库150存储具有口述发现物的放射学报告。
可选的报告验证器140验证报告中的信息。如下面更详细描述的,报告验证器140基于一组预定义模板和/或基于该组预定义模板生成的经处理的数据来验证报告中的发现物。
可选的报告增强器160在报告被生成并被存储在储存库150中后利用相关信息来增强报告。如下所述,此类额外信息包括来自由诸如病理学部门、实验室部门和/或其他部门的非成像部门生成的报告和/或另一成像报告的信息。
图示的报告验证器140和报告增强器160是医学信息系统170的部分并且因此可以通过执行存储在计算机可读介质中的一个或多个指令的一个或多个处理器来实现。
现在参考图2,图示说明了一种示例性报告验证器140,其包括以下示例性元件和元件相互作用。
报告验证器140包括放射学报告解析器(分析器)240,其解析放射学报告并且提取或获得医学发现物,所述医学发现物被存储在解析放射学报告储存库242中。所提取的发现物可以被存储成与放射学报告相同或不同的格式。放射学报告解析器240可以包括从放射学报告中提取相关发现物的自然语言处理(NLP)引擎或模块。此类NLP模块的一个示例包括医学语言提取和编码系统(MEDLEE)模块,其提取放射学报告中的文本发现物并且将它们编码成可以如下面更详细描述的那样被处理的数据格式。
模板数据库230存储一般化报告特征的一组预定义模板。可选地提供模板发生器275以基于从之前生成的放射学报告提取的报告特征和图像中的特征生成该组预定义模板。例如,之前生成的针对眩晕症的脑扫描的放射学报告通常识别脑的五个位置。这一信息可以被存储在针对眩晕症的脑扫描的预定义模板中。模板数据库230中的模板可以在生成报告时利用发现物进行更新。
图像处理器220处理图像数据库210(其包括用于生成报告的图像)中的图像并且生成指示该图像的信息或数据。可选地基于模板数据库230中的预定义模板对图像进行分割。由图像处理器220生成的信息或数据可以包括图像数据和/或从该图像数据生成的图像。经处理的数据和/或经分割的图像被存储在数据存储器235中。经处理的数据可以被存储成各种格式,例如用于创建报告的软件的自然格式。
具有逻辑电路262的计算系统260匹配经解析的放射学报告中的发现物、存储在模板数据库230中的该组预定义模板中的特征和/或数据存储器230中的经处理的数据。在一个示例中,匹配意味着比较经解析的放射学报告中的发现物与存储在模板数据库230中的该组预定义模板中的相关特征和/或数据存储器230中的经处理的数据以确定是否存在差异。逻辑电路262包括使用来自规则数据库270的规则以确定是否存在差异的第一逻辑电路。
逻辑电路262还包括使用来自规则数据库270的多个规则的第二逻辑电路,所述多个规则包括用于根据匹配或不匹配经解析的放射学报告中的发现物与存储在模板数据库230中的该组预定义模板中的相关特征和/或数据存储器230中的经处理的数据的结果确定要采取的推荐动作的指导方针。
例如,规则数据库270可以包含一规则,即,如果在放射学报告中的发现物与该组预定义模板中的一般化报告特征之间未发现差异,则计算系统260的通知部件264发送通知给放射学家,以指示不存在差异。规则数据库270中的另一规则可以调用通知部件264以发送通知给放射学家,以指示放射学报告中的相关发现物与经处理的数据之间不存在差异。该通知可以是警报、具有正常和紧急优先级的电子邮件、常规邮件或其他通知手段。
规则数据库270中的另一规则可以调用通知部件264以发送通知给放射学家,以指示放射学报告中的发现物与经处理的数据之间存在差异。例如,针对眩晕症的脑扫描的放射学报告中的发现物可能是在脑上存在四个斑点。图像的经处理的数据可能指示在脑上存在五个斑点。放射学家可以验证该差异并增强放射学报告、记录该差异、约定进一步的测试和/或请求另一放射学家或咨询医师检查该图像。作为替代,逻辑电路262可以利用来自经处理的数据的信息自动增强放射学报告,并且通知部件264将发送通知给放射学家,以指示该报告已经被增强。
规则数据库270中的另一规则可以命令逻辑电路262尝试协调经处理的数据与未在放射学报告中报告的发现物之间的差异。例如,经处理的数据可能指示相关图像示出脑上的五个斑点但是在放射学报告中没有关于斑点的记录。根据该规则,逻辑电路262可以尝试基于在该组预定义模板中针对眩晕症的脑扫描的典型发现物的历史来协调脑上的这五个斑点指示眩晕症。通知部件264将发送通知给放射学家以指示该差异。放射学家将验证该差异并增强放射学报告、拒绝它、约定额外的测试或请求另一放射学家或咨询医师检查该图像。作为替代,逻辑电路262可以利用来自经处理的数据的信息即在脑上存在五个斑点自动增强放射学报告,并且发送通知给放射学家,以指示该报告已经被增强。
作为上述内容的另一示例,神经放射学报告中经常提到的一个特征是图像中是否存在“中线移位”。中线移位经常与可能致命的高颅内压力相关联。放射学家将在神经放射学报告中记录“未注意到中线结构的移位或其他阳性肿块迹象。”如果这一特征被图像处理器220确定为确实存在于实际图像中并且放射学家并未在放射学报告中记录它,则逻辑电路部件262将利用来自规则数据库270的规则识别该差异并且基于该差异执行根据规则数据库270中的规则的动作。
尽管以上描述提供了规则数据库270中的不同规则的一些示例,这些仅是示例并且本文也可预期各种其他规则,这对于本领域技术人员来说是容易理解的。
虽然上面在放射学的背景下讨论了报告,但是本文也可预期来自其他部门的其他报告。
现在参考图3,图示说明了一种示例性报告增强器160,其具有以下示例性元件和元件相互作用。
放射学报告解析器(分析器)340解析来自报告储存库150的放射学报告以提取或获得医学发现物,所述医学发现物被以XML或其他格式存储在报告数据库330中。放射学报告解析器340可以包括从放射学报告中提取相关发现物的自然语言处理(NLP)引擎或模块,例如医学语言提取和编码系统(MEDLEE)模块,其提取放射学报告中的文本发现物并且将它们编码成可以如下面更详细描述的那样处理的数据格式。诸如医学系统命名法——临床术语(SNOMED CT)和RADLEX的本体论被用于识别放射学报告中的术语,诸如解剖体。
非放射学报告储存库370存储非放射学报告,例如该示例性实施例中的病理学报告。
非放射学报告解析器(分析器)372解析病理学报告并且提取或获得医学发现物,所述医学发现物被存储在报告数据库330中。所提取的发现物可以被存储成与在非放射学报告储存库370中存储的病理学报告相同或不同的格式。适当格式的一个示例是XML格式。
非放射学报告解析器372可以包括自然语言处理(NLP)引擎或模块,诸如医学语言提取和编码系统(MEDLEE)模块,其提取病理学报告中的文本发现物并且将它们编码成可以如下面更详细描述的那样处理的数据格式。诸如医学系统命名法——临床术语(SNOMEDCT)和RADLEX的本体论被用于识别放射学报告中的术语,诸如解剖体。对于病理学,可能需要SNOMED与诸如基因本体论的其他本体论的组合以识别受体,诸如HER-2/Neu受体。
计算系统360包括逻辑电路362,其确定报告数据库330中存储的经解析的放射学报告何时对于特定医学发现物是非决定性的以及具有病理学数据的相关病理学报告何时是可用的。逻辑电路362还确定之前是否更新过放射学报告,并且在“是”的情况下确保利用最近的病理学报告更新放射学报告。
如果之前尚未利用病理学数据更新放射学报告,则逻辑电路362使用来自基于规则知识的数据库365的规则来匹配放射学报告中的发现物和病理学报告中的病理学数据。基于规则知识的数据库365可以包括多个规则,其包括用于映射放射学报告中的发现物和病理学报告中的病理学数据的指导方针。
例如,逻辑电路362可以执行一规则,该规则确定放射学报告中的发现物对于乳腺组织中的癌是否是非决定性的以及放射学报告需要利用病理学数据进行增强。特别地,该规则可以调用逻辑电路362以确定放射学报告对于HER-2/Neu受体的存在是否是非决定性的,该HER-2/Neu受体通常存在于乳腺癌中。人类表皮生长因子受体2是在乳腺癌中给予更高侵袭性的蛋白质。乳腺组织的活检的病理学报告可能包含表述“未识别过表达的HER-2/Nue”,这指示针对该蛋白质的阴性结果。作为替代,病理学报告可能包含表述“识别出过表达的HER-2/Nue”,这指示阳性结果。
计算系统360可以包括将逻辑电路362的输出构造成放射学报告的格式的通知部件364。例如,具有被逻辑电路362确定为阴性结果的HER2/Neu受体被利用适当的语言构造成放射学报告,其中放射学报告的格式为[“病理学发现物示出‘HER2/Neu’”][阴性]。逻辑电路362可以执行一规则,该规则导致通知部件364发送通知给放射学家,以指示放射学报告已经被增强。该通知可以是警报、具有正常和紧急优先级的电子邮件、常规邮件或其他通知手段。
作为替代,逻辑电路362可以执行一规则,该规则调用通知部件364来发送通知给放射学家,以指示放射学家应该验证放射学报告和来自病理学报告的病理学数据、拒绝它或者就该问题咨询另一放射学家或咨询医师以作进一步分析。
逻辑电路362可以执行一规则,该规则确定放射学报告中的发现物是否与存储在基于规则知识的数据库365中的治疗计划中的发现物匹配,从而评估该治疗计划是否有效。例如,如果放射学报告指示在组织样品中存在HER2/Neu受体,则逻辑电路362可以评估肿瘤的尺寸是否已经根据治疗计划减小。通知部件364可以将逻辑电路362的输出构造成放射学报告的格式并且可以利用这一额外数据增强放射学报告。逻辑电路362可以执行一规则,该规则调用通知部件364来发送通知给放射学家,以指示已经利用这一信息增强了放射学报告。
在替代实施例中,逻辑电路362可以执行一规则,该规则调用通知部件364来发送通知给放射学家,以指示放射学家应该利用经增强的病理学和治疗数据验证放射学报告、拒绝它或者就该问题咨询另一放射学家或咨询医师以作进一步分析。
然后逻辑电路362可以利用非决定性发现物来处理下一个经解析的放射学报告。
在图示的实施例中,报告增强器160包括查询引擎325,该查询引擎允许临床医生、放射学家或咨询医师查询病理学数据、诊断数据或治疗数据对于一个或多个放射学报告来说是否可用以及是否已经利用该信息增强了放射学报告。查询引擎325可以是经由全球计算机网络与报告数据库330通信的基于网络的应用程序,或者是经由计算机局域网或其他计算机网络与报告数据库330通信的基于控制台的应用程序。
参考图4,图示说明了一种示例性方法400。应该认识到动作的次序并不是限制性的。因此,一个或多个动作可以以不同的次序发生,包括与一个或多个其他动作同时发生。另外,可以省略一个或多个动作,和/或可以添加一个或多个其他动作。
在410处,生成一个或多个电子放射学报告。
在420处,解析放射学报告以从报告中提取发现物。
在430处,所提取的信息被存储在报告储存库中。
在450处,确定从放射学报告中所提取的信息与一组预定义模板中的一般化报告特征之间是否存在任何差异。
如果不存在差异,则在480处向放射学家发送通知,以指示从放射学报告中所提取的信息与该组预定义模板中的所有特征之间不存在差异。
如果存在差异,则在490处向放射学家发送通知,以指示放射学家应该验证从放射学报告中所提取的信息与该组预定义模板中的特征之间的差异和/或增强报告。
在460处,确定从放射学报告中所提取的信息与基于该组模板生成的经处理的数据之间是否存在任何差异。
如果不存在差异,则在480处向放射学家发送通知,以指示从放射学报告中所提取的发现物与该组预定义模板中的特征之间不存在差异。
如果存在差异,则在490处向放射学家发送通知,以指示放射学家应该验证从放射学报告中所提取的信息与该组预定义模板中的特征之间的差异和/或增强报告。
在470处,确定经处理的数据与该组预定义模板中的报告特征之间是否存在任何差异。
如果不存在差异,则在480处向放射学家发送通知,以指示经处理的数据与该组预定义模板中的特征之间不存在差异。
如果存在差异,则在490处向放射学家发送通知,以指示放射学家应该验证经处理的数据与该组预定义模板中的特征之间的差异和/或增强报告。
图5图示说明了一种示例性方法500。应该认识到动作的次序并不是限制性的。因此,一个或多个动作可以以不同的次序发生,包括与一个或多个其他动作同时发生。另外,可以省略一个或多个动作,和/或可以添加一个或多个其他动作。
在510处,确定与患者的医学状况的诊断相关的电子放射学报告是否可用。
如果放射学报告可用,则在520处解析放射学报告以提取相关发现物。
在530处,确定放射学报告中的诊断是非决定性的。
在540处,确定具有与放射学报告相关的信息的诸如病理学报告的另一电子非放射学报告是否可用。
如果病理学报告可用,则在550处解析病理学报告以提取相关信息。
在560处,利用来自病理学报告的相关信息增强放射学报告。
在570处,向放射学家发送通知以告知已经利用来自病理学报告的相关信息增强了放射学报告,然后到达510处。
在替代实施例中,动作560和570被省略,并且向放射学家发送通知,以指示放射学家应该验证来自病理学报告的相关信息和/或增强放射学报告。
上述内容可以通过计算机可读指令的方式来实现,该计算机可读指令在被(多个)计算机处理器执行时促使该(多个)处理器执行上述动作。在这种情况下,这些指令被存储在计算机可读存储介质中,该计算机可读存储介质与诸如专用工作站、家用计算机、分布式计算系统和/或其他计算机的相关计算机相关联或者可由该计算机访问。这些动作不需要与数据采集同时执行。
应该注意到术语“包括”并不排除其他元件或步骤,并且“一”或“一个”并不排除多个。另外结合不同实施例描述的元件可以进行组合。还应该注意到权利要求中的参考标记不应被解读为限制权利要求的范围。
Claims (11)
1.一种医学信息系统(170),其包括:
验证器(140),其被配置为利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个来验证第一报告中的图像发现物以用于特定成像研究,所述图像发现物是通过由放射学家检查由成像装置(110)产生的解剖结构图像而生成的,其中,所述一组预定义模板包括针对所述成像研究应该出现在所述图像中的一般化特征,所述验证器比较所述第一报告中的所述图像发现物与所述组的一般化特征或所述经处理的数据,并且所述验证器仅响应于所述第一报告中的所述图像发现物与所述组的一般化特征或所述经处理的数据之间不存在差异而验证所述图像发现物;以及增强器(160),其被配置为利用来自包括医学发现物的第二报告的信息以增强所述第一报告,其中,所述增强器(160)包括:
第二报告分析器(372),用于从所述第二报告获得一组预定发现物;以及
逻辑电路(362),其根据一个或多个规则处理所述第一报告和所述第二报告。
2.如权利要求1所述的医学信息系统(170),所述验证器(140)还包括:
第一报告分析器(240),其被配置为从所述第一报告获得一组所述图像发现物;
图像处理器(220),其基于所述一组预定义模板处理图像,其中,所述图像是用于生成所述第一报告的图像;以及
逻辑电路(262),其被配置为基于一个或多个规则处理所述第一报告和所述经处理的数据。
3.如权利要求2所述的医学信息系统(170),其中,所述验证器(140)还包括发送通知的通知部件(264),该通知指示根据所述验证器的所述逻辑电路(262)中使用的所述规则中的一个或多个对所述第一报告和所述经处理的数据进行处理的结果。
4.如权利要求3所述的医学信息系统(170),其中,所述通知指示所述第一报告中的所述图像发现物与所述一组预定义模板之间不存在差异。
5.如权利要求3所述的医学信息系统(170),其中,所述通知指示所述第一报告中的所述图像发现物与所述经处理的数据匹配。
6.如权利要求3所述的医学信息系统(170),其中,所述通知指示所述第一报告中的所述图像发现物与所述经处理的数据之间存在差异。
7.如权利要求3、4或6中任一项所述的医学信息系统(170),其中,所述验证器中的所述逻辑电路(262)协调不在所述第一报告中的图像发现物和在所述经处理的数据中的之间的差异。
8.如权利要求1-6中任一项所述的医学信息系统(170),其中,所述第一报告是具有从所述图像确定的医学发现物的放射学报告。
9.如权利要求1所述的医学信息系统(170),其中,所述增强器还包括发送通知的通知部件(364),该通知指示根据所述规则中的一个或多个对所述第一报告和所述第二报告进行处理的结果。
10.如权利要求1所述的医学信息系统(170),其中,所述逻辑电路(362)基于一规则确定所述第一报告中的所述图像发现物是否是非决定性的以及是否存在具有与所述第一报告相关的信息的第二报告,并且利用所述信息增强所述第一报告。
11.一种用于管理医学信息的方法,包括:
利用一组预定义模板或基于该组预定义模板生成的经处理的数据中的至少一个来验证第一报告中的发现物,所述图像发现物是通过由放射学家检查由成像装置(110)产生的解剖结构图像而生成的,其中,所述一组预定义模板包括针对所述成像研究应该出现在所述图像中的一般化特征,验证器比较所述第一报告中的所述图像发现物与所述组的一般化特征或所述经处理的数据,并且所述验证器仅响应于所述第一报告中的所述成像发现物与所述组的一般化特征或所述经处理的数据之间不存在差异而验证所述图像发现物;以及
利用来自包括医学发现物的第二报告的信息以增强所述第一报告,其中,所述增强包括
从所述第二报告获得一组预定发现物;以及
根据一个或多个规则处理所述第一报告和所述第二报告。
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