CN102115786A - 鲑鱼肾杆菌实时荧光rt-pcr检测方法和试剂盒 - Google Patents

鲑鱼肾杆菌实时荧光rt-pcr检测方法和试剂盒 Download PDF

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CN102115786A CN2010100426345A CN201010042634A CN102115786A CN 102115786 A CN102115786 A CN 102115786A CN 2010100426345 A CN2010100426345 A CN 2010100426345A CN 201010042634 A CN201010042634 A CN 201010042634A CN 102115786 A CN102115786 A CN 102115786A
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Abstract

本发明建立了检测鲑鱼肾杆菌的Taq Man实时荧光定量PCR,优化反应条件,经特异性、敏感性及临床应用试验,表明该方法特异性强,敏感度高,适于鲑鱼肾杆菌的快速诊断和口岸检疫,也为鲑科鱼类的疫病调查、鲑鱼肾杆菌的流行病学研究提供了一种可靠方法。

Description

鲑鱼肾杆菌实时荧光RT-PCR检测方法和试剂盒
技术领域
本发明涉及微生物的检测方法和检测试剂盒,特别是涉及鲑鱼肾杆菌实时荧光RT-PCR检测法和试剂盒。
背景技术
细菌性肾病(Bacterial Kidney Disease,BKD)又称Dee病,是由鲑鱼肾杆菌(Renibacterium salmoninarum)引起鲑科鱼类的一种慢性传染病。1930年首次报道BKD在棕鲑、虹鳟和溪鳟中发生。此后,在加拿大、智利、英国、法国、德国、冰岛、意大利、西班牙、南斯拉夫等地养殖的14种鲑科鱼类均有发生(Austin,B.Austin,D.A.Baterial Fish Pathogens:Disease ofFarmed and Wild Fish[M].Praxis Publishing Ltd,Chichester,1999,17-18.)。鲑鱼肾杆菌属于革兰氏阳性细菌,对人工养殖和天然的许多种鲑科鱼类,尤其是大麻哈鱼造成巨大的经济损失。Evenden等报道,BKD可对太平洋鲑鱼(Oncorhynchus spp.)和大西洋鲑鱼(Salmo salar)的野生种群造成80%和40%的损失(Evenden,AJ,Grayson TH,Gilpin ML,et al.Renibacterium salmoninarum and bacterial kidney disease-the unfinishediigsaw[J].Annu Rev Fish Dis,1993,3:87-104)。BKD潜伏期长,常呈慢性感染,此时,病鱼没有任何外部症状,或者仅仅出现体表变黑、腹水、贫血、轻度溃疡等症状,但在适宜温度(13~18℃)下,鲑鱼肾杆菌能引起鲑科鱼类急性发病,大量死亡。
鲑鱼肾杆菌的生长条件苛刻,生长速度缓慢,造成对该病的诊断十分困难。目前的诊断方法主要依靠常规的细菌分离鉴定和免疫学技术(直接荧光抗体试验、间接荧光抗体试验和酶联免疫吸附试验)。但这些方法费时费力,灵敏度低,特异性较差,难以满足鲑鱼肾杆菌的流行病学调查、现场诊断和口岸快速检测的需要。因此,迫切需要建立检测周期短、灵敏度高、特异性强的检测方法。
实时荧光技术,是近年来新问世的一种高敏感性的检测技术,它融合了PCR技术的核酸高效扩增,探针技术的高特异性,光谱技术的高敏感性和高精确定量等优点,直接探测PCR过程中荧光信号的变化以获得定量的结果,它可以做到每循环一次就收集一个数据,建立实时扩增曲线,做到真正意义上的定量。同时该技术在密闭系统内完成检测,不需要常规PCR的电泳观察环节,减少了对工作环境的污染,降低假阳性结果发生。因此,自从该技术建立以来,迅速、广泛地应用于植物、动物和人类的寄生虫,病毒和细菌等病原的检测研究中。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术的不足,提供一种能够快速、高灵敏度的鲑鱼肾杆菌实时荧光RT-PCR检测方法。
本发明的另一目的在于提供一种鲑鱼肾杆菌的检测试剂盒。
为实现上述目的,本发明采用了以下技术方案:
本发明公开了鲑鱼肾杆菌(Renibacterium salmoninarum)的实时荧光RT-PCR检测方法,所述方法包括利用特异性探针和引物对,以细菌DNA为模板进行实时荧光RT-PCR反应,所述引物对分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列;
Seq ID No.1:5’-CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC-3’
Seq ID No.2:5’-GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC-3’
所述探针为能与鲑鱼肾杆菌的基因组DNA位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为15~30bp的寡核苷酸序列,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
优选的,所述探针含有Seq ID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CGG ATT GCC GTC GCC GCA GC-3’。
在本发明的具体实施方式中,所述探针5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMRA。
所述RT-PCR反应的引物终浓度优选为0.9~1.1μmol/L,更优选1.0μmol/L;探针终浓度为0.09~0.11μmol/L,更优选0.1μmol/L。
所述RT-PCR的反应的退火温度优选为53℃~57℃,更优选55℃。
在本发明一个具体的实施方式中,所述RT-PCR的反应条件包括:50℃,2min;94℃,10min;40循环:94℃20s,55℃40s。
本发明还公开了鲑鱼肾杆菌(Renibacterium salmoninarum)的检测试剂盒,所述试剂盒含有能扩增出鲑鱼肾杆菌的基因片段的引物对,所述引物对分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列,
Seq ID No.1:5’-CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC-3’
Seq ID No.2:5’-GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC-3’。
优选的,所述检测试剂盒用于实时荧光RT-PCR检测,并且所述试剂盒还含有能与鲑鱼肾杆菌的基因组DNA位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为15~30bp的寡核苷酸探针,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
所述探针优选含有Seq ID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CGG ATT GCC GTC GCC GCA GC-3’。
进一步的,所述探针5’端标记的荧光报告基团优选为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团优选为TAMRA
由于采用了以上技术方案,使本发明具备的有益效果在于:
本发明建立了检测鲑鱼肾杆菌的Taq Man实时荧光定量PCR,优化反应条件,经特异性、敏感性及临床应用试验,表明该方法特异性强,敏感度高,可以为BKD的诊断和口岸检测提供一种快速、特异、敏感,且能定量的检测方法,也为鲑科鱼类的疫病调查、鲑鱼肾杆菌的流行病学研究提供了一种可靠方法。结果表明,该方法的检测灵敏度为5个细菌/反应;通过SDS软件分析,细菌数量(X)与Ct值的关系为:Ct=-3.30lgX+43.75,相关系数R2=0.970;对鲑鱼肾杆菌具有较好的特异性,而与其它15种常见鱼类致病菌均无交叉反应。另外,若是分离的细菌,可直接经煮沸法和反复冻融处理后直接作模板,从而在不影响检测灵敏度的前提下,缩短了检测时间,一般2个小时就可以得到结果。另外,本方法在检测鲑鱼肾杆菌过程中,采用闭管操作,避免开管电泳和反转录,进一步减少污染的可能性,且不需要PCR后处理,即可直接读取结果,进一步缩短了检测时间,一般2个小时就可以得到结果。TaqMan探针实时荧光PCR能够快速、准确检测鲑鱼肾杆菌,适合于BDK的诊断、口岸检测和流行病学研究。
附图说明
图1为鲑鱼肾杆菌不同稀释度(10-1-10-7)的灵敏度试验结果图;
图2为实时荧光RT-PCR检测鲑鱼肾杆菌的特异性实验结果图。
具体实施方式
实时荧光技术,是近年来新问世的一种高敏感性的检测技术,它融合了PCR技术的核酸高效扩增,探针技术的高特异性,光谱技术的高敏感性和高精确定量等优点,直接探测PCR过程中荧光信号的变化以获得定量的结果,它可以做到每循环一次就收集一个数据,建立实时扩增曲线,做到真正意义上的定量。同时该技术在密闭系统内完成检测,不需要常规PCR的电泳观察环节,减少了对工作环境的污染,降低假阳性结果发生。因此,自从该技术建立以来,迅速、广泛地应用于植物、动物和人类的寄生虫,病毒和细菌等病原的检测研究中。目前已经进行该项研究的鱼类病毒有ISAV(Munir and Kibenge,2004)、KHV(Gilad et al.,2004)、Betanodavirus(Valle et al.,2005)、SVCV(张利峰等,2005;Yue et al.,2007)、VHSV(Chico et al.,2006)、IHNV(Dhar et al.,2008)、IPNV(Bowers et al.,2008)和VNNV(罗卫等,2008)。而本发明则建立了实时荧光RT-PCR方法检测鲑鱼肾杆菌。
本发明选取鲑鱼肾杆菌编码57kDa主要可溶性蛋白基因中的保守序列,利用Primer Express2.0软件设计引物和TaqMan探针,以标准株(Rs PlymLea 223Ds)作外标准品进行定量分析,并优化反应体系,检测其灵敏度和特异性,制作标准曲线,建立了检测鲑鱼肾杆菌的实时荧光定量PCR,并进行临床应用。结果表明,该方法的检测灵敏度为5个细菌/反应;通过SDS软件分析,细菌数量(X)与Ct值的关系为:Ct=-3.30lgX+43.75,相关系数R2=0.970;对鲑鱼肾杆菌具有较好的特异性,而与其它15种常见鱼类致病菌均无交叉反应。TaqMan探针实时荧光PCR能够快速、准确检测鲑鱼肾杆菌,适合于BDK的诊断、口岸检测和流行病学研究。
实施例1
1材料与方法
1.1材料
1.1.1试验菌株
鲑鱼肾杆菌由英国Weymouth的OIE参考实验室B.J.Hill博士赠送(编号:Rs Plym Lea 223Ds);其它15种常见鱼类致病菌菌株由东京大学鱼病学研究室提供,菌株名称及培养方法见表1。
表1实验中使用的菌株及其培养方法
  菌株名称   菌株编号   培养基   温度
鲑鱼肾杆菌Renibacterium salmoninarum   Rs Plym Lea223dS KDM2 15℃
  嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila   IAM12460   BHIA   25℃
  杀鲑产气单胞菌Aeromonas salmonicida   ATCC14174   BHIA   25℃
  柱状嗜纤维菌Cytophaga columaris   ATCC43622   TYE   25℃
  迟缓爱德华氏菌Edwardsiella tarda   ATCC1594T   BHIA   25℃
  嗜冷屈桡杆菌Flavobacterium psychrophilum   FPC832   TYE   18℃
  嗜冷屈桡杆菌Flavobacterium psychrophilum   FPC832   TYE   18℃
  绿针假单胞菌Pseudomonas chlororaphis   IAM12354   TBHIA(0.5%NaCl)   15℃
  荧光假单胞菌Pseudomonas fluorescens   IAM12022   BHIA   25℃
  恶臭假单胞菌Pseudomonas putida   IAM12354   TBHIA   25℃
  金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus   IAM1011   BHIA   25℃
  表皮葡萄球菌Staphylococcus epidermidis   IAM12012   BHIA   25℃
  鳗弧菌Vibrio anguillarum   N℃IMB829   BHIA(2%NaCl)   25℃
  病海鱼弧菌Vibrio ordalii   ATCC33509   BHIA(2%NaCl)   25℃
  海弧菌Vibrio pelagius   ATCC25916   TBHIA(2%NaCl)   25℃
  鲁克氏耶尔森氏菌Yersinia ruckeri   ATCC29473   BHIA   25℃
1.1.2试剂
1.1.2.1细菌培养基:肾病血清增菌培养基(简称KDM2,L-半胱氨酸0.1g,胰蛋白胨1g,酵母提取物0.05g,琼脂1.5g,蒸馏水90mL),用NaOH调整pH至6.5~6.8,121℃高压灭菌20min,培养前加入10%胎牛血清和1.5%已培养过鲑鱼肾杆菌的KDM2灭菌肉汤。
1.1.2.2反应试剂盒:Taqman Universal PCR Master Mix为美国ABI公司产品。
1.1.2.3引物和探针的设计与合成:
根据鲑鱼肾杆菌编码57kDa主要可溶性蛋白基因序列,利用PrimerExpress2.0软件设计引物和探针,并由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。
序列为:
正向引物:5’-CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC-3’  Seq ID No.1
反向引物:5’-GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC-3’  Seq ID No.2
探针:5’-FAM-CGG ATT GCC GTC GCC GCA GC-TAMRA-3’  Seq ID No.3
1.2方法
1.2.1鲑鱼肾杆菌的增菌培养
将鲑鱼肾杆菌接种于KDM2中,15℃培养15天。
1.2.2细菌DNA的提取
煮沸法提取细菌DNA。将菌液100℃煮5min,反复冻融后直接作为模板。
或使用CTAB-酚氯仿方法抽提核酸,或其他等效方法。
1.2.3细菌计数与定量标准品的制备
取培养的鲑鱼肾杆菌1mL,作10倍系列稀释,并取连续三个稀释度用血球计数板计数,每个稀释度取三个样品计数,求每个稀释度的平均值。同时取500μL作为定量标准品。
1.2.4实时荧光PCR扩增
取10倍系列稀释的菌液为模板,在ABI7500实时荧光PCR仪进行PCR扩增,其反应体系为:模板2μL,Taqman Universal PCR Master Mix 5μL,引物各1μL,探针0.2μL,运行程序:50℃,2min;94℃,10min;40循环:94℃20s,60℃40s。使用SDS软件对结果进行分析。
1.2.5灵敏度试验
将鲑鱼肾杆菌菌液进行10-1-10-7稀释,经血球计数板计数后,对每一稀释度用煮沸的方法抽取核酸后,按照1.2.4进行实时定量PCR扩增,检测引物的灵敏度。以出现特征S曲线的最大稀释倍数对应的绝对菌数为检测极限。
1.2.6特异性试验
将鲑鱼肾杆菌与恶臭假单胞菌(P.putide)、鳗弧菌(V.anguillarum)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、嗜水气单胞菌(AeromonasHydrophila)、耶尔森氏菌(Y.ruckeri)、灿烂弧菌(Vibrio splendidius)、鮰鱼爱德华氏菌(Edardsiella ictaluri)、迟缓爱德华氏菌(E.tarda)、金黄色葡萄球菌(S.aureus)、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、病海鱼弧菌(Vibrio ordalii)、绿针假单胞菌(P.chlororaphis)分别为模版,同时设立阴性对照和空白对照,其他组分一样,同时放入ABI7500实时定量PCR仪进行反应,检测引物和探针的特异性。
1.2.7数据分析
实时定量PCR结束后,利用ABI7500SDS软件进行数据分析,包括查看扩增曲线、Ct值、形成相对定量和绝对定量标准曲线,用于扩大实验的数据分析。阈值设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照品扩增曲线的最高点,阴性对照和空白对照应无Ct值并且无扩增曲线,阳性对照的Ct值应≤40.0,并出现特定的扩增曲线。否则实验无效。样品的Ct值≤40个循环并且出现特定的扩增曲线,结果判定为阳性;Ct值≥40个循环,结果判定为阴性。
1.2.8临床应用
对2006年送检的鱼类样品18份样品,取肾组织分别进行细菌培养和抽提核酸。进行实时定量PCR检测,同时设阳性和阴性对照。根据扩增曲线和Ct值综合判定:以出现S型扩增曲线,且Ct≤40判为阳性,否则为阴性。同时比较两种方法检测结果的一致性。
2结果
2.1实时定量PCR最佳反应条件
在ABI7500实时定量PCR仪上设定激发光为FAM,淬灭基团为TAMRA,使用美国ABI公司提供的Taqman Universal PCR Master Mix(含Gold DNAPolymerase,Amp Erase UNG,dNTP,buffer),将引物浓度和探针浓度(终浓度)分别从0.2-2.0μmol/L(级差0.2μmol/L)、0.025-0.5μmol/L(级差0.025μmol/L),互相组合后进行扩增,根据扩增结果,优化出其10μL反应体系中各个组分的最佳用量见表2。
表2实时定量PCR最佳反应体系的组分及浓度
  组分   数量   试剂浓度   终浓度
  Mixture   5μL   2x   1x
  引物   各1μL   10μmol/L   各1μmol/L
  探针   0.2μL   5μmol/L   0.1μmol/L
  模板   1μL
  dH2O   1.8μL
同时,从50℃-65℃不断调整其退火和荧光收集的温度,根据结果,确定最佳反应程序为:50℃,2min;94℃,10min;40循环:94℃20s,55℃40s。
2.2实时定量PCR的灵敏度
将鲑鱼肾杆菌菌液作10-1-10-7稀释后进行实时定量PCR扩增,其中10-1-10-5稀释度有典型的S型扩增曲线,见图1。根据细菌数量(X)对应的Ct值的相关性,利用分析软件得到标准曲线:Ct=-3.30lgX+43.75,相关系数R2=0.970,其最小稀释度对应的灵敏度为5个细菌/反应。表明该方法的灵敏度高。
2.3特异性试验
将鲑鱼肾杆菌与其他15种鱼类常见病原菌一起进行实时定量PCR,结果表明,只有鲑鱼肾杆菌有典型的S型扩增曲线(见图2)。表明实验所设计的引物和探针特异性强。
2.4临床应用
分别使用已建立的鲑鱼肾杆菌实时荧光定量PCR和普通PCR以及细菌分离的方法对2006年送检的18份鱼类样品进行检测,其结果完全一致。
3讨论
细菌性肾病是危害鲑科鱼类的重要传染病之一,其病原为鲑鱼肾杆菌。自1930年首次在美国报道以来,已在英国、法国、德国、意大利等国家人工养殖或野生的14种鲑科鱼类时有发生,而我国还没该病的报道,但怀疑牙鲆有可能感染鲑鱼肾杆菌,从而影响牙鲆鱼的出口。因此,建立特异性强,灵敏度高、快速检测鲑鱼肾杆菌的方法,势在必行。本发明建立了检测鲑鱼肾杆菌的Taq Man实时荧光定量PCR,优化反应条件,经特异性、敏感性及临床应用试验,表明该方法特异性强,敏感度高,适于鲑鱼肾杆菌的快速诊断和口岸检疫,也为鲑科鱼类的疫病调查、鲑鱼肾杆菌的流行病学研究提供了一种可靠方法。
鲑鱼肾杆菌对生长条件要求苛刻,生长速度缓慢,且多呈慢性感染,这给该病的诊断和检测造成困难。当前的检测方法主要有细菌的分离鉴定、免疫学及分子生物学方法。鲑鱼肾杆菌虽能在人工培养基KDM2中可缓慢生长,但由于KDM2培养基不是选择性培养基,在自然环境中和粪便中分离的样品,有可能会造成污染。另外,细菌分离的灵敏度低,易漏检。Paclibare等研究表明该培养基的灵敏度为300个细菌/mL肾组织匀浆。免疫荧光技术灵敏度低,且存在交叉方法,也限制该方法的使用。根据p57蛋白的抗原位点设计的ELISA虽适于多个组织样品和大量样品的检测,但该方法只能检出感染严重的鱼类,而不能检测无症状的鱼类,不能区分死菌和活菌。2002年,刘荭等建立了快速检测鲑鱼肾杆菌的Nested-PCR,其灵敏度为1.8×105CFU.mL-1,与其它15种常见的鱼类致病菌没有交叉反应,PCR方法虽然具有高度的特异性和敏感性,但不能很好的实现鲑鱼肾杆菌的定量检测。上述方法从灵敏度、特异性、实用性及快速简便等方面考察,各有利弊,不能满足快速且准确的口岸检疫和临床诊断。
本发明建立的Taq Man实时荧光定量PCR,少至5个细菌即可检出,灵敏度高;对其它15种常见的鱼类致病菌进行检测,均无交叉反应,说明该方法特异性强;另外,若是分离的细菌,可直接经煮沸法和反复冻融处理后直接作模板,从而在不影响检测灵敏度的前提下,缩短了检测时间,一般2个小时就可以得到结果。另外,本方法在检测鲑鱼肾杆菌过程中,采用闭管操作,避免开管电泳和反转录,进一步减少污染的可能性,且不需要PCR后处理,即可直接读取结果,进一步缩短了检测时间,一般2个小时就可以得到结果。另外,本试验采用FAM和TERAM标记的Taqman探针,增加了体系的特异性,避免了交叉反应,实现了真正意义上的实时定量,从而对病原检测和检验检疫工作有重要的参考价值,显示了良好的应用前景。
实时定量PCR也存在一定的假阳性和假阴性,故要严格控制反应污染,优化反应条件,选择适当的退火温度,设立严格的阳性和阴性对照。本实验优化了反应体系和反应条件,提高了反应的特异性和敏感性。
实施例2
一种的检测试剂盒,用于鲑鱼肾杆菌的实时荧光RT-PCR检测。所述试剂盒含有以下引物和探针:
 引物   序列5’--3’   Seq ID No.
 正向引物F   CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC   1
 反向引物R   GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC   2
探针Probe   FAM-CGG ATT GCC GTC GCC GCAGC-TAMRA 3
其中,探针5’端标记的FAM为荧光报告基团,3’端标记的TAMRA为荧光淬灭基团。
所述试剂盒还包括使用说明书。
以上内容是结合具体的实施方式对本发明所作的进一步详细说明,不能认定本发明的具体实施只局限于这些说明。对于本发明所属技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干简单推演或替换,都应当视为属于本发明的保护范围。
序列表
<110>深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心
<120>鲑鱼肾杆菌实时荧光RT-PCR检测方法和试剂盒
<130>DHC0910510
<160>3
<170>PatentIn version 3.3
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>1
ccgaagagcc caccaatgac    20
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>2
gacttagacg acgccgtagc    20
<210>3
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>3
cggattgccg tcgccgcagc    20

Claims (10)

1.鲑鱼肾杆菌(Renibacterium salmoninarum)的实时荧光RT-PCR检测方法,所述方法包括利用特异性探针和引物对,以细菌DNA为模板进行实时荧光RT-PCR反应,其特征在于:所述引物对分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列;
Seq ID No.1:5’-CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC-3’
Seq ID No.2:5’-GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC-3’
所述探针为能与鲑鱼肾杆菌的基因组DNA位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为15~30bp的寡核苷酸序列,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述探针含有SeqID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CGG ATT GCC GTC GCC GCA GC-3’。
3.根据权利要求1或2所述的检测方法,其特征在于:所述探针5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMRA。
4.根据权利要求1~3任意一项所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR反应的引物终浓度为0.9~1.1μmol/L,探针终浓度为0.09~0.11μmol/L。
5.根据权利要求1~4任意一项所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR的反应的退火温度为53℃~57℃。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述RT-PCR的反应条件包括:50℃,2min;94℃,10min;40循环:94℃20s,55℃40s。
7.鲑鱼肾杆菌(Renibacterium salmoninarum)的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有能扩增出鲑鱼肾杆菌的基因片段的引物对,所述引物对分别含有Seq ID No.1和Seq ID No.2所示的序列,
Seq ID No.1:5’-CCG AAG AGC CCA CCA ATG AC-3’
Seq ID No.2:5’-GAC TTA GAC GAC GCC GTA GC-3’。
8.根据权利要求7所述的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒用于实时荧光RT-PCR检测,并且所述试剂盒还含有能与鲑鱼肾杆菌的基因组DNA位于所述引物对之间的序列相同或互补、且长度为15~30bp的寡核苷酸探针,并且所述探针的5’端和3’端分别标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团。
9.根据权利要求8所述的检测试剂盒,其特征在于:所述探针含有Seq ID No.3所示的序列,
Seq ID No.3:5’-CGG ATT GCC GTC GCC GCA GC-3’。
10.根据权利要求9所述的检测试剂盒,其特征在于:所述探针5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMRA。
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