CN101748069B - 一种重组蓝藻 - Google Patents

一种重组蓝藻 Download PDF

Info

Publication number
CN101748069B
CN101748069B CN200810239558XA CN200810239558A CN101748069B CN 101748069 B CN101748069 B CN 101748069B CN 200810239558X A CN200810239558X A CN 200810239558XA CN 200810239558 A CN200810239558 A CN 200810239558A CN 101748069 B CN101748069 B CN 101748069B
Authority
CN
China
Prior art keywords
ala
lys
ile
sequence
gly
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN200810239558XA
Other languages
English (en)
Other versions
CN101748069A (zh
Inventor
周杰
解鹃
高成华
张延平
李寅
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Microbiology of CAS
Original Assignee
Institute of Microbiology of CAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Microbiology of CAS filed Critical Institute of Microbiology of CAS
Priority to CN200810239558XA priority Critical patent/CN101748069B/zh
Publication of CN101748069A publication Critical patent/CN101748069A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101748069B publication Critical patent/CN101748069B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Abstract

本发明公开了一种重组蓝藻。该重组蓝藻,是通过包括如下步骤的方法得到的重组蓝藻:向色球藻科蓝藻中导入如下1)或2)中所述的丁醇合成相关基因:1)所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:电子转移黄素蛋白A亚基、烯酰水合酶、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶;2)所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:电子转移黄素蛋白B亚基、烯酰水合酶、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶。本发明实现了利用蓝藻将地球上取之不尽的太阳能和温室气体二氧化碳转化为能源产品丁醇,避免了能源再生过程中对粮食等其它有机物的浪费,同时又有利于环境保护。因此,利用本发明重组蓝藻来生产丁醇是实现可再生清洁能源持续、健康发展的理想途径之一。

Description

一种重组蓝藻
技术领域
本发明涉及一种重组蓝藻。
背景技术
全球面临的能源问题、环境问题向人们提出了发展可再生清洁能源的要求,而粮食短缺问题又要求可再生清洁能源的发展要实现不与人争粮、不与作物争地、不与人和作物争淡水。
丁醇(butanol)是一种重要的化工原料,主要用于制造增塑剂、溶剂、萃取剂等,是一种高附加值化学品,全球年需求量超过140万吨。此外,丁醇还是一种极具潜力的新型生物燃料,具有如下优点:其热值、辛烷值与汽油相当,含氧量与汽油中常用的甲基叔丁基醚相近;其不腐蚀管道,便于管道输送;其蒸汽压低,安全性高,能与汽油以任意比混合。
丁醇可由发酵和石油化工合成法生产,由于石油危机,丁醇发酵生产成为研究热点。发酵生产主要是通过丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)发酵粮食生产丁醇。从70年代起三十几年的研究,阐明了丙酮丁醇梭菌的丁醇代谢途径,使丁醇发酵生产取得了很大进展。但丁醇发酵生产存在发酵底物成本高、产物丁醇中混杂有丙酮、丙酮丁醇梭菌严格厌氧及丁醇对细胞有毒害等缺点。因此,科学家们在改进发酵生产丁醇的同时也在探索用非厌氧菌生物合成丁醇。美国和日本的科学家先后将丙酮丁醇梭菌的丁醇合成途径导入大肠杆菌中,并得到有丁醇产生的菌株。这种方法虽然解决了梭菌发酵生产丁醇时产物中混有丙酮和产丁醇梭菌的严格厌氧不利于操作的问题,但大肠杆菌仍为异养菌,其原料成本依然很高,没有解决发展生物能源与粮食问题的冲突。
蓝藻(blue-green algae)又称蓝细菌(cyanobacteria),是可以进行放氧光合作用的原核生物。蓝藻能够利用二氧化碳和太阳能快速繁殖,而且其广泛分布在淡水、海水甚至是污水中,是生物合成能源产品的理想宿主。作为原核生物,蓝藻细胞结构简单、遗传背景与大肠杆菌相似,易于基因操作。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种产丁醇的重组蓝藻。
本发明所提供的重组蓝藻,是通过包括如下步骤的方法得到的重组蓝藻:向蓝藻中导入如下1)、2)或3)中所述的丁醇合成相关基因:
1)所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:电子转移黄素蛋白A亚基、烯酰水合酶(又称烯酰辅酶A水合酶)、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶;
2)所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:电子转移黄素蛋白B亚基、烯酰水合酶、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶;
3)所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:电子转移黄素蛋白A亚基、电子转移黄素蛋白B亚基、烯酰水合酶、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶。
所述丁醇合成相关基因还可包括如下酶的编码基因:3-羟丁酰辅酶A脱氢酶和/或乙酰辅酶A乙酰转移酶(又称硫解酶)和/或丁醇脱氢酶。
所述方法还可包括灭活所述蓝藻中的至少一个聚-β羟基丁酸酯合成相关基因的步骤。
所述灭活的方法可为用至少一个的所述丁醇合成相关基因替换至少一个的所述聚-β羟基丁酸酯合成相关基因。
所述聚-β羟基丁酸酯合成相关基因具体可为聚-β羟基丁酸酯合成酶的编码基因;所述灭活的方法具体可为用所述乙醇脱氢酶的编码基因替换所述聚-β羟基丁酸酯合成酶的编码基因。
所述灭活的方法可以是通过同源重组实现的。
本发明方法中导入的丁醇合成相关基因可以自行通过复制型重组质粒来进行表达(即不包括灭活所述色球藻科蓝藻中的至少一个聚-β羟基丁酸酯合成相关基因的步骤的情况),也可以整合到染色体上进行表达(即包括灭活所述色球藻科蓝藻中的至少一个聚-β羟基丁酸酯合成相关基因的步骤情况),或者二者同时进行。
所述各酶可以是如下氨基酸序列的蛋白质:
所述烯酰水合酶为如下1)或2)所述的蛋白质:
1)由序列表中序列3所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
2)将序列表中序列3的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有烯酰水合酶功能的由1)衍生的蛋白质;
所述丁酰辅酶A脱氢酶为如下a)或b)所述的蛋白质:
a)由序列表中序列4所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
b)将序列表中序列4的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有丁酰辅酶A脱氢酶功能的由a)衍生的蛋白质;
所述电子转移黄素蛋白B亚基为如I或II所述的蛋白质:
I由序列表中序列5所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
II将序列表中序列5的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有电子转移黄素蛋白B亚基功能的由I衍生的蛋白质;
所述电子转移黄素蛋白A亚基为如下i或ii所述的蛋白质:
i由序列表中序列6所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
ii将序列表中序列6的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有电子转移黄素蛋白A亚基功能的由i衍生的蛋白质;
所述3-羟丁酰辅酶A脱氢酶为如下①或②所述的蛋白质:
①由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
②将序列表中序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有3-羟丁酰辅酶A脱氢酶功能的由①衍生的蛋白质;
所述丁醇脱氢酶为如下A或B所述的蛋白质:
A.由序列表中序列8所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
B.将序列表中序列8的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有丁醇脱氢酶功能的由A衍生的蛋白质;
所述乙醇脱氢酶为如下A)或B)所述的蛋白质:
A)由序列表中序列9所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
B)将序列表中序列9的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有乙醇脱氢酶功能的由A)衍生的蛋白质;
所述乙酰辅酶A乙酰转移酶(又称硫解酶)为如下(1)或(2)所述的蛋白质:
(1)由序列表中序列10所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(2)将序列表中序列10的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有乙酰辅酶A乙酰转移酶功能的由(1)衍生的蛋白质。
所述导入的各酶的核苷酸序列可以如下:
所述烯酰水合酶的编码基因为如下1)、2)或3)所述的基因:
1)其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第1-786位核苷酸的DNA分子;
2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
3)与1)限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述丁酰辅酶A脱氢酶的编码基因为如下a)、b)或c)所述的基因:
a)其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第800-1939位核苷酸的DNA分子;
b)在严格条件下与a)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
c)与a)限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述电子转移黄素蛋白B亚基的编码基因为如I、II或III所述的基因:
I其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第1958-2737位核苷酸的DNA分子;
II在严格条件下与I限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
III与I限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述电子转移黄素蛋白A亚基的编码基因为如下i、ii或iii所述的基因:
i其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第2756-3766位核苷酸的DNA分子;
ii在严格条件下与i限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
iii与i限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述3-羟丁酰辅酶A脱氢酶的编码基因为如下①、②或③所述的基因:
①核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第3871-4719位核苷酸的DNA分子;
②在严格条件下与①限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
③与①限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述乙醇脱氢酶的编码基因为如下A、B或C所述的基因:
A.其核苷酸序列为序列表中序列2自5’末端第610-3186位核苷酸的DNA分子;
B.在严格条件下与A限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
C.与A限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述丁醇脱氢酶的编码基因为如下(1)、(2)或(3)所述的基因:
(1)其核苷酸序列为序列表中序列11所示的DNA分子;
(2)在严格条件下与(1)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
(3)与(1)限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
所述乙酰辅酶A乙酰转移酶的编码基因为如下(1)、(2)或(3)所述的基因:
(1)其核苷酸序列为序列表中序列12所示的DNA分子;
(2)在严格条件下与(1)限定的DNA序列杂交且编码所述蛋白的DNA分子;
(3)与(1)限定的DNA序列有90%以上同源性且编码所述蛋白的DNA分子;
本发明中所用的出发菌可以蓝藻门中的任一蓝藻,具体可以是色球藻科蓝藻,具体可如色球藻科蓝藻为淡水蓝藻聚球藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)和海水蓝藻聚球藻7002(Synechococcus sp.PCC 7002)。
本发明中得到的重组蓝藻具体为蓝藻集胞藻(Synechocystis sp.)SMB-100CGMCC No.2795和聚球藻(Synechococcus sp.)SMB-101 CGMCC No.2794。
蓝藻集胞藻(Synechocystis sp.)SMB-100已于2008年12月10日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址:北京市朝阳区大屯路,中国科学院微生物研究所,邮编100101),保藏号为CGMCC No.2795。
聚球藻(Synechococcus sp.)SMB-101已于2008年12月10日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址:北京市朝阳区大屯路,中国科学院微生物研究所,邮编100101),保藏号为CGMCC No.2794。
本发明利用了蓝藻可以进行光合自养的特性、可以在海水和污水中生长的特性及易于进行基因操作的优点。
本发明对蓝藻代谢途径进行改造和重建,在蓝藻中建立丁醇合成途径,使其具有产丁醇的能力。这样构建的重组蓝藻根据其自身的光合自养的特点来大量繁殖,从而产生更多的能源产品丁醇。本发明中使用蓝藻自身的诱导启动子,在控制丁醇合成途径的同时又避免了丁醇对蓝藻的毒害作用。
本发明实现了利用蓝藻将地球上取之不尽的太阳能和温室气体二氧化碳转化为能源产品丁醇,避免了能源再生过程中对粮食等其它有机物的浪费,同时又有利于环境保护。因此,利用本发明重组蓝藻来生产丁醇是实现可再生清洁能源持续、健康发展的理想途径之一。
附图说明
图1为重组蓝藻SMB-100的鉴定。
图2为标准品中丁醇的色谱图。
图3为重组蓝藻SMB-100培养液中丁醇的色谱图。
图4为重组蓝藻SMB-101的鉴定。
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从生物公司购买。
下述实施例中的百分含量,如无特别说明,均为质量百分含量。
本发明的总体构思如下:
一、通过代谢工程改造,在蓝藻中建立丁醇合成途径:
1、从丙酮丁醇梭菌中克隆丁醇合成途径中所需酶的编码基因:烯酰水合酶(crt)、丁酰辅酶A脱氢酶(bcd)、电子转移黄素蛋白B亚基(etfB)、电子转移黄素蛋白A亚基(etfA)、3-羟丁酰辅酶A脱氢酶(hbd)和乙醇脱氢酶(adhe)。其中前五个基因crt、bcd、etfB、etfB和hbd为一个操作子,将其命名为命名为crt操纵子。
2、在蓝藻中诱导表达crt操纵子:构建蓝藻表达载体pAM-crt,使crt操纵子在蓝藻内源铜诱导启动子的启动下,在蓝藻中诱导表达。
3、在蓝藻中表达乙醇脱氢酶基因(adhe):通过同源重组,将adhe基因整合在蓝藻基因组DNA上,并使其表达。
二、工程蓝藻的鉴定及丁醇的诱导合成与检测:
1、基因水平鉴定上述丁醇合成途径所需酶的编码基因已成功转入蓝藻中;
2、通过诱导激活工程藻中建立的丁醇合成途径,使工程藻产丁醇;通过液相色谱检测工程蓝藻中有丁醇产生。
下述实施例中,出发菌分别为色球藻科集胞藻属淡水蓝藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)(Zhang S,Spann KW,et al.Identification oftwo genes,sll0804 and slr1306,as putative components of theCO2-concentrating mechanism in the cyanobacterium Synechocystis sp.strainPCC 6803.J Bacteriol.2008 190:8234-7;)(中国科学院微生物研究所)和色球藻科聚球藻属海水蓝藻聚球藻7002(Synechococcus sp.PCC 7002);(Jin ZHeinnickel M,et al.Biogenesis of iron-sulfur clusters in photosystem I:holo-NfuA from the cyanobacterium Synechococcus sp.PCC 7002 rapidly andefficiently transfers[4Fe-4S]clusters to apo-PsaC in vitro.J Biol Chem.2008,283:28426-35)(中国科学院微生物研究所)。
丙酮丁醇梭菌为丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)ATCC824(US2007020740(A1));蓝藻表达载体pAM2770(Wu X,Li DW,et al.The Anabaenasp.strain PCC 7120 asr1734 gene encodes a negative regulator of heterocystDevelopment.Molecul Microbiol.2007,64:782-794.)(中国科学院微生物研究所);质粒pRL271(Wei TF,Ramasubramanian TS,et al.Anabaena sp.strain PCC7120 ntcA Gene required for growth on nitrate and heterocyst development.JBacteriol.1994,176:4473-4482.)。(中国科学院微生物研究所)。
下述实施例中Synechocystis sp.PCC 6803及其工程菌转化、筛选及培养时所用培养基为BG-11培养基,基因工程菌株筛选时添加10μg/ml的卡那霉素和10μg/ml的氯霉素。
下述实施例中Synechococcus sp.PCC 7002及其工程菌转化、筛选及培养时所用培养基为Medium 957培养基,基因工程菌株筛选时添加10μg/ml的卡那霉素和10μg/ml的氯霉素。
BG-11培养基组成:每升培养基中含有NaNO3 1.5g,K2HPO4 0.04g,MgSO4·7H2O0.075g,CaCl2·2H2O 0.036g,柠檬酸0.006g,柠檬酸铁铵0.006g,EDTA(disodiumsalt)0.001g,Na2CO3 0.02g,Trace metal mix A5 1.0ml,琼脂10.0g,蒸馏水1.0L,pH 7.1±0.3。
Medium 957培养基组成:每升培养基中含有蒸馏水250.0ml,海水750.0ml,MgSO4·7H2O 0.04g,CaCl2·2H2O 0.02g,NaNO3 0.75g,K2HPO4·3H2O 0.02g,柠檬酸3.0mg,柠檬酸铁铵3.0mg,EDTA(disodium potassium salt)乙二胺四乙酸0.5mg,Na2CO3 0.02g,Trace metal mix A51.0ml,琼脂10.0g,pH 8.5±0.3。
Trace metal mix A5组成:每升中含有H3BO3 2.86g,MnCl2·4H2O 1.81g,ZnSO4·7H2O 0.222g,NaMoO4·2H2O 0.39g,CuSO4·5H2O 0.079g,Co(NO3)2·6H2O49.4mg,蒸馏水1.0L。
实施例1、色球藻科集胞藻属(Synechocystis)淡水蓝藻集胞藻的重组构建
本实施例中使用的出发蓝藻为淡水蓝藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC6803)。
一、向出发菌中导入丁醇合成相关基因
本实验中的丁醇合成相关基因由crt基因、bcd基因、etfB基因、etfA基因和hbd基因组成,组成一个crt操纵子,各基因均来自梭菌。
1、crt操纵子的扩增:
提取丙酮丁醇梭菌基因组DNA;
根据丙酮丁醇梭菌基因组中crt操纵子DNA序列和蓝藻表达载体pAM2770上的酶切位点设计引物如下:
crtF:ATTC GAGCTC AATGGAACTAAACAATGTCATCCT(下划线部分为SacI酶切位点);
crtR:CG GGATCC ATGGGGATTCTTGTAAACTTATT(下划线部分为BamHI酶切位点)。
以丙酮丁醇梭菌基因组DNA为模板、以crtF和crtR为引物,进行PCR扩增;对扩增产物进行测序,得到的基因的序列如序列表中序列1所示,表明扩增产物为有crt基因、bcd基因、etfB基因、etfA基因和hbd基因的crt操纵子,序列正确,其中自序列1的5’末端第1-786位核苷酸为crt基因的序列,第800-1939位核苷酸为bcd基因的序列,第1958-2737核苷酸为etfB基因的序列,第2756-3766位核苷酸为etfA基因的序列,第3871-4719位核苷酸为hbd基因的序列。
2、重组蓝藻表达载体pAM-crt的构建:
为避免丁醇对蓝藻生长的毒害作用,使用蓝藻内源启动子铜诱导启动子petE在蓝藻中诱导表达crt操纵子。
用限制性内切酶SacI和BamHI酶切上述crt操纵子;用限制性内切酶SacI和BamHI酶切蓝藻表达载体pAM2770,回收大片段;将两酶切产物连接,连接产物转化至大肠杆菌中,通过50μg/ml卡那霉素筛选,得到重组质粒。重组质粒序列分析结果表明,crt操纵子正确插入到pAM2770载体上铜诱导启动子petE下游SacI和BamHI位点,并且插入的序列正确,将正确的阳性重组蓝藻表达载体命名为pAM-crt。
3、pAM-crt对蓝藻Synechocystis sp.PCC 6803的转化及筛选:
转化方法:具体步骤为收集处于对数生长期的蓝藻细胞,用培养基BG-11洗涤细胞后,将质粒pAM-crt加入到蓝藻培养液中混匀,光照下静止培养5小时;
筛选:在含有卡那霉素的固体BG-11培养基平板上筛选重组子,卡那霉素筛选浓度为10μg/ml;
将得到的阳性重组蓝藻命名为PCC 6803/pAM-crt。
4、空载体pAM2770对蓝藻Synechocystis sp.PCC 6803的转化及筛选:
转化方法:具体步骤为收集处于对数生长期的蓝藻细胞,用培养基BG-11洗涤细胞后,将质粒pAM2770加入到蓝藻培养液中混匀,光照下静止培养5小时。
筛选:在含有卡那霉素的固体BG-11培养基平板上筛选重组子,卡那霉素筛选浓度为10μg/ml。;
将得到的含空载体的重组蓝藻命名为PCC 6803/pAM2770。
二、用丙酮丁醇梭菌丁醇合成途径中adhe基因替换蓝藻Synechocystis sp.PCC 6803中PHB合成酶基因
由于蓝藻中存在聚羟基丁酸(PHB)次级代谢途径,PHB合成与丁醇合成有共同的前体,而PHB合成酶的敲除不影响蓝藻生长,因此,用丁醇合成途径中最后一个酶乙醇脱氢酶基因(adhe)来取代蓝藻基因组中的PHB合成酶基因(phb),构建整合表达载体pUC-up-adhe-Cm-down,通过同源重组,用adhe和氯霉素抗性基因(Cm)取代蓝藻PHB合成酶基因。
1、蓝藻同源重组整合表达载体pUC-up-adhe-Cm-down的构建:
adhe基因的获得:以丙酮丁醇梭菌的基因组DNA为模板,用下述引物(adheF/adheR)进行PCR扩增,PCR产物测序,得到adhe基因,其核苷酸序列如序列表中序列2中第610-3186位核苷酸所示。
up为蓝藻基因组DNA中phb编码区上游的600bp DNA片段,通过以下方法获得:以淡水蓝藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)的基因组DNA为模板,用下述引物进行PCR扩增,PCR产物测序,得到up序列,其核苷酸序列如序列表中序列2中第1-609位核苷酸所示。
down为蓝藻基因组DNA中phb编码区下游的600bp DNA片段,通过以下方法获得:以淡水蓝藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)的基因组DNA为模板,用下述引物(downF/downR)进行PCR扩增,PCR产物测序,得到down序列,其核苷酸序列如序列表中序列2中第4402-4996位核苷酸所示。
Cm序列的获得:以质粒pRL271为模板,用下述引物(CmF/CmR)进行PCR扩增,PCR产物测序,得到Cm序列,其核苷酸序列如序列表中序列2中第3352-4401位核苷酸所示。
up-adhe的获得:首先PCR分别扩增得到up和adhe,然后再把两片段混在一起作模板,用upF/adheR引物对进行第二轮PCR扩增,得到up-adhe;
Cm-down的获得:首先PCR分别扩增得到Cm和down,然后再把两片段混在一起作模板,用CmF/downR引物对进行第二轮PCR扩增,得到Cm-down;;
pUC-up-adhe-Cm-down的获得:用限制性内切酶XbaI酶切Cm-down,用限制性内切酶XbaI酶切pUC-18载体,连接得到重组载体pUC-18/Cm-down;用限制性内切酶BamHI酶切up-adhe,用限制性内切酶BamHI酶切pUC-18/Cm-down,连接得到重组载体pUC-up-adhe-Cm-down。
阳性质粒的转化及筛选:用pUC-up-adhe-Cm-down转化大肠杆菌,经50μg/ml氨苄霉素和30μg/ml氯霉素筛选阳性克隆。
阳性质粒的验证:将筛选得到的阳性质粒进行测序,表明插入的up-adhe-Cm-down序列如序列表中序列2所示,得到载体pUC-up-adhe-Cm-down正确;
扩增各片段及融合PCR所需引物如下:
upF:5’-CGCGGATCCCAGATTCGGTCTTCCCCCAGGCG(BamHI)
upR:5’-CTTTTTGATTTGTAACTTTCATGGTCAAAATCCACCTTACTACTGGC(up-adhe融合所需嵌合引物)
adheF:5’-ATGAAAGTTACAAATCAAAAAGA
adheR:5’-CGCGGATCCAAAGAATTGTGGAGTAAAGGATA(BamHI)
CmF:5’-GCTCTAGAGGTTGATAATGAACTGTGCTGAT(XbaI)
CmR:5’-GTTGCCCTAATGTATTCCAGCAAATCGAATTTCTGCCATTCATCCG
(Cm-down融合所需嵌合引物)
downF:5’-TTGCTGGAATACATTAGGGCAAC
downR:5’-GCTCTAGAGATATCGAAGCGGACAACGGCAT(XbaI)
2、将pUC-up-adhe-Cm-down转化至实验一中的重组蓝藻PCC 6803/pAM-crt中:
转化方法:具体步骤为收集处于对数生长期的重组蓝藻PCC 6803/pAM-crt细胞,用培养基BG-11洗涤细胞后,将质粒pUC-up-adhe-Cm-down加入到细胞液中混匀,光照下静止培养5小时。
筛选:在含有氯霉素的固体BG-11培养基平板上筛选重组子,氯霉素筛选浓度为10μg/ml;将筛选得到的重组蓝藻命名为SMB-100。
同时向蓝藻PCC 6803/pAM2770中转入空载体pUC-18,将得到的重组蓝藻命名为PCC 6803/pAM2770/pUC,作为对照;同时向蓝藻PCC 6803中转入空载体pUC18,作为对照,将得到的重组蓝藻命名为PCC 6803/pUC。
三、重组蓝藻SMB-100的验证及目标产物丁醇的检测
(1)基因水平鉴定:
分别提取蓝藻SMB-100、PCC 6803/pAM2770、PCC 6803/pUC和PCC 6803/pAM2770/pUC的总DNA;再分别以crtF、crtR和phb700F、phb700R(蓝藻PHB合成酶基因的上下游700bp处设计的引物)为引物,进行PCR扩增。结果如图1A所示,在SMB-100中用引物crtF、crtR扩增得到4.7kb的DNA片段,大小与crt操纵子一致;在对照组中用引物crtF、crtR没有扩增到条带,表明上述丁醇合成途径所需酶的编码基因crt操纵子已成功转入蓝藻SMB-100中。结果如图1B所示,在SMB-100中,用引物phb700F、phb700R扩增得到5.3kb的DNA片段,大小与up-adhe-Cm-down一致;在对照组中用引物phb700F、phb700R扩增到3.4kb片段,该片段为PHB合成酶基因(2kb)及其上下游700bp,这表明adhe基因已成功转入蓝藻SMB-100中,并且adhe基因已通过同源重组成功取代PHB合成酶基因。(图1中,A为crt操纵子导入重组蓝藻SMB-100的鉴定,泳道1:DNA Maker λDNA/HindIII,泳道2:SMB-100,泳道3:对照组PCC 6803/pAM2770,泳道4:对照组PCC 6803/pUC、泳道5:对照组PCC 6803/pAM2770/pUC;B为adhe基因整合到SMB-100基因组的鉴定,泳道1:DNA MakerλDNA/HindIII,泳道2:SMB-100,泳道3:对照组PCC6803/pAM2770,泳道4:对照组PCC 6803/pUC,泳道5:对照组PCC6803/pAM2770/pUC)。phb700F:5’-TACAACATTTTTCTGTAGGC-3’,phb700R:5’-ATGTCGCCTATCAACTGTTGA-3’。
(2)重组蓝藻SMB-100生产丁醇性能的检测:
将重组蓝藻SMB-100接种于不含铜的BG-11培养基中,在30℃、60μmol m-2s-1光照、振荡的条件下培养至对数生长后期,使其细胞密度达到OD730=1.5;向培养液中加入2μM CuSO4使铜诱导启动子petE启动adhe基因和crt操纵子的表达,进而诱导丁醇合成;在铜诱导48小时后,取培养液进行液相色谱检测。
液相色谱检测方法为:样品前处理:取培养液12000rpm离心1min,取上清液,用0.22μm滤膜过滤;色谱条件:Agilent 1200液相色谱仪,示差检测器;BioRadAminex HPX-87H有机酸柱(300*7.8mm),柱温15℃;上样量10μl;流动相为0.05mM H2SO4,流速0.5ml/min。
丁醇标准品购自Sigma公司(目录号:4C006217);在如上色谱条件下标准品中丁醇的保留时间为40.9分钟,丁醇标准品的检测图谱如图2所示(A表示丁醇)。
重组蓝藻SMB-100培养液的上清的检测图谱如图3所示(A表示丁醇)。
实验设3次重复,结果取平均数。结果表明,工程藻SMB-100生产丁醇的能力为0.27g/L培养液。
实施例2、色球藻科聚球藻属海水蓝藻聚球藻7002的重组构建
本实施例中使用的出发蓝藻为海水蓝藻聚球藻7002(Synechococcus sp.PCC7002)。
一、向出发菌中导入丁醇合成相关基因
导入基因的序列及导入方法均与实施例1中一所述一致。
转入空载体pAM2770的重组蓝藻命名为PCC 7002/pAM2770。
二、用梭菌丁醇合成途径中adhe基因替换蓝藻Synechocystis sp.PCC 6803中PHB合成酶基因
方法均与实施例1中二所述一致。
既导入空载体pAM2770又导入空载体pUC18的蓝藻命名为PCC7002/pAM2770/pUC,作为对照;向蓝藻PCC 7002中转入空载体pUC18的蓝藻命名为PCC 7002/pUC。
将得到的含有adhe基因和crt操纵子的重组蓝藻命名为SMB-101。
三、蓝藻SMB-101的验证及目标产物丁醇的检测
(1)基因水平鉴定:
鉴定方法与实施例1中三所述一致。
结果如图4A所示,在SMB-101中用引物crtF、crtR扩增得到4.7kb的DNA片段,大小与crt操纵子一致;在对照组中用引物crtF、crtR没有扩增到条带,表明上述丁醇合成途径所需酶的编码基因crt操纵子已成功转入蓝藻SMB-101中。结果如图4B所示,在SMB-101中,用引物phb700F、phb700R扩增得到5.3kb的DNA片段,大小与up-adhe-Cm-down一致;在对照组中用引物phb700F、phb700R扩增到3.4kb片段,该片段为PHB合成酶基因(2kb)及其上下游700bp这表明adhe基因已成功转入蓝藻SMB-101中,并且adhe基因已通过同源重组成功取代PHB合成酶基因。(图4中,A为crt操纵子导入重组蓝藻SMB-101的鉴定,1:DNA MakerλDNA/HindIII;2:SMB-101;3:对照组PCC 7002/pAM2770,4:对照组PCC 7002/pUC,5:对照组PCC 7002/pAM2770/pUC;B为adhe基因整合到SMB-101基因组的鉴定,1:DNA MakerλDNA/HindIII;2:SMB-101;3:对照组PCC 7002/pAM2770,4:对照组PCC 7002/pUC,5:对照组PCC 7002/pAM2770/pUC)。phb700F:5’-TACAACATTTTTCTGTAGGC-3’,phb700R:5’-ATGTCGCCTATCAACTGTTGA-3’。
(2)重组蓝藻SMB-101生产丁醇性能的检测:
将重组蓝藻SMB-101接种于不含铜的Medium 957培养基中,在30℃、60μmolm-2s-1光照、振荡的条件下培养至对数生长后期,使其细胞密度达到OD730=1.5;向培养液中加入2μM CuSO4使铜诱导启动子petE启动adhe基因和crt操纵子的表达,进而诱导丁醇合成;在铜诱导48小时后,取培养液进行液相色谱检测。
色谱检测方法及条件同实施例1中三一致。
实验设3次重复,结果取平均数。结果表明,工程藻SMB-101生产丁醇的能力为0.22g/L培养液。
序列表
<210>1
<211>4736
<212>DNA
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>1
atggaactaa acaatgtcat ccttgaaaag gaaggtaaag ttgctgtagt taccattaac    60
agacctaaag cattaaatgc gttaaatagt gatacactaa aagaaatgga ttatgttata    120
ggtgaaattg aaaatgatag cgaagtactt gcagtaattt taactggagc aggagaaaaa    180
tcatttgtag caggagcaga tatttctgag atgaaggaaa tgaataccat tgaaggtaga    240
aaattcggga tacttggaaa taaagtgttt agaagattag aacttcttga aaagcctgta    300
atagcagctg ttaatggttt tgctttagga ggcggatgcg aaatagctat gtcttgtgat    360
ataagaatag cttcaagcaa cgcaagattt ggtcaaccag aagtaggtct cggaataaca    420
cctggttttg gtggtacaca aagactttca agattagttg gaatgggcat ggcaaagcag    480
cttatattta ctgcacaaaa tataaaggca gatgaagcat taagaatcgg acttgtaaat    540
aaggtagtag aacctagtga attaatgaat acagcaaaag aaattgcaaa caaaattgtg    600
agcaatgctc cagtagctgt taagttaagc aaacaggcta ttaatagagg aatgcagtgt    660
gatattgata ctgctttagc atttgaatca gaagcatttg gagaatgctt ttcaacagag    720
gatcaaaagg atgcaatgac agctttcata gagaaaagaa aaattgaagg cttcaaaaat    780
agataggagg taagtttata tggattttaa tttaacaaga gaacaagaat tagtaagaca    840
gatggttaga gaatttgctg aaaatgaagt taaacctata gcagcagaaa ttgatgaaac    900
agaaagattt ccaatggaaa atgtaaagaa aatgggtcag tatggtatga tgggaattcc    960
attttcaaaa gagtatggtg gcgcaggtgg agatgtatta tcttatataa tcgccgttga    1020
ggaattatca aaggtttgcg gtactacagg agttattctt tcagcacata catcactttg    1080
tgcttcatta ataaatgaac atggtacaga agaacaaaaa caaaaatatt tagtaccttt    1140
agctaaaggt gaaaaaatag gtgcttatgg attgactgag ccaaatgcag gaacagattc    1200
tggagcacaa caaacagtag ctgtacttga aggagatcat tatgtaatta atggttcaaa    1260
aatattcata actaatggag gagttgcaga tacttttgtt atatttgcaa tgactgacag    1320
aactaaagga acaaaaggta tatcagcatt tataatagaa aaaggcttca aaggtttctc    1380
tattggtaaa gttgaacaaa agcttggaat aagagcttca tcaacaactg aacttgtatt    1440
tgaagatatg atagtaccag tagaaaacat gattggtaaa gaaggaaaag gcttccctat    1500
agcaatgaaa actcttgatg gaggaagaat tggtatagca gctcaagctt taggtatagc    1560
tgaaggtgct ttcaacgaag caagagctta catgaaggag agaaaacaat ttggaagaag    1620
ccttgacaaa ttccaaggtc ttgcatggat gatggcagat atggatgtag ctatagaatc    1680
agctagatat ttagtatata aagcagcata tcttaaacaa gcaggacttc catacacagt    1740
tgatgctgca agagctaagc ttcatgctgc aaatgtagca atggatgtaa caactaaggc    1800
agtacaatta tttggtggat acggatatac aaaagattat ccagttgaaa gaatgatgag    1860
agatgctaag ataactgaaa tatatgaagg aacttcagaa gttcagaaat tagttatttc    1920
aggaaaaatt tttagataat ttaaggaggt taagaggatg aatatagttg tttgtttaaa    1980
acaagttcca gatacagcgg aagttagaat agatccagtt aagggaacac ttataagaga    2040
aggagttcca tcaataataa atccagatga taaaaacgca cttgaggaag ctttagtatt    2100
aaaagataat tatggtgcac atgtaacagt tataagtatg ggacctccac aagctaaaaa    2160
tgctttagta gaagctttgg ctatgggtgc tgatgaagct gtacttttaa cagatagagc    2220
atttggagga gcagatacac ttgcgacttc acatacaatt gcagcaggaa ttaagaagct    2280
aaaatatgat atagtttttg ctggaaggca ggctatagat ggagatacag ctcaggttgg    2340
accagaaata gctgagcatc ttggaatacc tcaagtaact tatgttgaga aagttgaagt    2400
tgatggagat actttaaaga ttagaaaagc ttgggaagat ggatatgaag ttgttgaagt    2460
taagacacca gttcttttaa cagcaattaa agaattaaat gttccaagat atatgagtgt    2520
agaaaaaata ttcggagcat ttgataaaga agtaaaaatg tggactgccg atgatataga    2580
tgtagataag gctaatttag gtcttaaagg ttcaccaact aaagttaaga agtcatcaac    2640
taaagaagtt aaaggacagg gagaagttat tgataagcct gttaaggaag cagctgcata    2700
tgttgtctca aaattaaaag aagaacacta tatttaagtt aggagggatt tttcaatgaa    2760
taaagcagat tacaagggcg tatgggtgtt tgctgaacaa agagacggag aattacaaaa    2820
ggtatcattg gaattattag gtaaaggtaa ggaaatggct gagaaattag gcgttgaatt    2880
aacagctgtt ttacttggac ataatactga aaaaatgtca aaggatttat tatctcatgg    2940
agcagataag gttttagcag cagataatga acttttagca catttttcaa cagatggata    3000
tgctaaagtt atatgtgatt tagttaatga aagaaagcca gaaatattat tcataggagc    3060
tactttcata ggaagagatt taggaccaag aatagcagca agactttcta ctggtttaac    3120
tgctgattgt acatcacttg acatagatgt agaaaataga gatttattgg ctacaagacc    3180
agcgtttggt ggaaatttga tagctacaat agtttgttca gaccacagac cacaaatggc    3240
tacagtaaga cctggtgtgt ttgaaaaatt acctgttaat gatgcaaatg tttctgatga    3300
taaaatagaa aaagttgcaa ttaaattaac agcatcagac ataagaacaa aagtttcaaa    3360
agttgttaag cttgctaaag atattgcaga tatcggagaa gctaaggtat tagttgctgg    3420
tggtagagga gttggaagca aagaaaactt tgaaaaactt gaagagttag caagtttact    3480
tggtggaaca atagccgctt caagagcagc aatagaaaaa gaatgggttg ataaggacct    3540
tcaagtaggt caaactggta aaactgtaag accaactctt tatattgcat gtggtatatc    3600
aggagctatc cagcatttag caggtatgca agattcagat tacataattg ctataaataa    3660
agatgtagaa gccccaataa tgaaggtagc agatttggct atagttggtg atgtaaataa    3720
agttgtacca gaattaatag ctcaagttaa agctgctaat aattaagata aataaaaaga    3780
attatttaaa gcttattatg ccaaaatact tatatagtat tttggtgtaa atgcattgat    3840
agtttcttta aatttaggga ggtctgttta atgaaaaagg tatgtgttat aggtgcaggt    3900
actatgggtt caggaattgc tcaggcattt gcagctaaag gatttgaagt agtattaaga    3960
gatattaaag atgaatttgt tgatagagga ttagatttta tcaataaaaa tctttctaaa    4020
ttagttaaaa aaggaaagat agaagaagct actaaagttg aaatcttaac tagaatttcc    4080
ggaacagttg accttaatat ggcagctgat tgcgatttag ttatagaagc agctgttgaa    4140
agaatggata ttaaaaagca gatttttgct gacttagaca atatatgcaa gccagaaaca    4200
attcttgcat caaatacatc atcactttca ataacagaag tggcatcagc aactaaaaga    4260
cctgataagg ttataggtat gcatttcttt aatccagctc ctgttatgaa gcttgtagag    4320
gtaataagag gaatagctac atcacaagaa acttttgatg cagttaaaga gacatctata    4380
gcaataggaa aagatcctgt agaagtagca gaagcaccag gatttgttgt aaatagaata    4440
ttaataccaa tgattaatga agcagttggt atattagcag aaggaatagc ttcagtagaa    4500
gacatagata aagctatgaa acttggagct aatcacccaa tgggaccatt agaattaggt    4560
gattttatag gtcttgatat atgtcttgct ataatggatg ttttatactc agaaactgga    4620
gattctaagt atagaccaca tacattactt aagaagtatg taagagcagg atggcttgga    4680
agaaaatcag gaaaaggttt ctacgattat tcaaaataag tttacaagaa tcccca        4736
<210>2
<211>4996
<212>DNA
<220>
<223>
<400>2
cagattcggt cttcccccag gcgatcgcca aggaaaaatt atttttctga cccgctaccg    60
tggcgacaat ggtggccagg ttgatactcc tcaggttggt taacagccta tccaaaactt    120
gctagagtgt tcattggcca aaaatcccat taattctttt attattaccg ctttgccatg    180
gttaacacct acaccgccga aatccaacac cagggtcaga cctataccat ctccgttccc    240
gaggataaaa cggtgctcca agcggcggat gatgagggga tacaactacc tacttcctgt    300
ggcgctgggg tttgcactac ctgtgcggcg ttaatcaccg aaggcacagc ggagcaggct    360
gacggcatgg gagtttcagc ggaactacag gctgagggat atgctctact ttgtgtagcc    420
tatccccgct cagatttgaa aattatcacc gaaaaagaag acgaagttta tcagcggcag    480
ttcggcggcc aaggttagat tcggctggaa ttctcccttc ccatgacaaa tcttccagag    540
caacacttgc caccccaaaa agctgagcca taattcaggt agcggccagt agtaaggtgg    600
attttgacca tgaaagttac aaatcaaaaa gaactaaaac aaaagctaaa tgaattgaga    660
gaagcgcaaa agaagtttgc aacctatact caagagcaag ttgataaaat ttttaaacaa    720
tgtgccatag ccgcagctaa agaaagaata aacttagcta aattagcagt agaagaaaca    780
ggaataggtc ttgtagaaga taaaattata aaaaatcatt ttgcagcaga atatatatac    840
aataaatata aaaatgaaaa aacttgtggc ataatagacc atgacgattc tttaggcata    900
acaaaggttg ctgaaccaat tggaattgtt gcagccatag ttcctactac taatccaact    960
tccacagcaa ttttcaaatc attaatttct ttaaaaacaa gaaacgcaat attcttttca    1020
ccacatccac gtgcaaaaaa atctacaatt gctgcagcaa aattaatttt agatgcagct    1080
gttaaagcag gagcacctaa aaatataata ggctggatag atgagccatc aatagaactt    1140
tctcaagatt tgatgagtga agctgatata atattagcaa caggaggtcc ttcaatggtt    1200
aaagcggcct attcatctgg aaaacctgca attggtgttg gagcaggaaa tacaccagca    1260
ataatagatg agagtgcaga tatagatatg gcagtaagct ccataatttt atcaaagact    1320
tatgacaatg gagtaatatg cgcttctgaa caatcaatat tagttatgaa ttcaatatac    1380
gaaaaagtta aagaggaatt tgtaaaacga ggatcatata tactcaatca aaatgaaata    1440
gctaaaataa aagaaactat gtttaaaaat ggagctatta atgctgacat agttggaaaa    1500
tctgcttata taattgctaa aatggcagga attgaagttc ctcaaactac aaagatactt    1560
ataggcgaag tacaatctgt tgaaaaaagc gagctgttct cacatgaaaa actatcacca    1620
gtacttgcaa tgtataaagt taaggatttt gatgaagctc taaaaaaggc acaaaggcta    1680
atagaattag gtggaagtgg acacacgtca tctttatata tagattcaca aaacaataag    1740
gataaagtta aagaatttgg attagcaatg aaaacttcaa ggacatttat taacatgcct    1800
tcttcacagg gagcaagcgg agatttatac aattttgcga tagcaccatc atttactctt    1860
ggatgcggca cttggggagg aaactctgta tcgcaaaatg tagagcctaa acatttatta    1920
aatattaaaa gtgttgctga aagaagggaa aatatgcttt ggtttaaagt gccacaaaaa    1980
atatatttta aatatggatg tcttagattt gcattaaaag aattaaaaga tatgaataag    2040
aaaagagcct ttatagtaac agataaagat ctttttaaac ttggatatgt taataaaata    2100
acaaaggtac tagatgagat agatattaaa tacagtatat ttacagatat taaatctgat    2160
ccaactattg attcagtaaa aaaaggtgct aaagaaatgc ttaactttga acctgatact    2220
ataatctcta ttggtggtgg atcgccaatg gatgcagcaa aggttatgca cttgttatat    2280
gaatatccag aagcagaaat tgaaaatcta gctataaact ttatggatat aagaaagaga    2340
atatgcaatt tccctaaatt aggtacaaag gcgatttcag tagctattcc tacaactgct    2400
ggtaccggtt cagaggcaac accttttgca gttataacta atgatgaaac aggaatgaaa    2460
taccctttaa cttcttatga attgacccca aacatggcaa taatagatac tgaattaatg    2520
ttaaatatgc ctagaaaatt aacagcagca actggaatag atgcattagt tcatgctata    2580
gaagcatatg tttcggttat ggctacggat tatactgatg aattagcctt aagagcaata    2640
aaaatgatat ttaaatattt gcctagagcc tataaaaatg ggactaacga cattgaagca    2700
agagaaaaaa tggcacatgc ctctaatatt gcggggatgg catttgcaaa tgctttctta    2760
ggtgtatgcc attcaatggc tcataaactt ggggcaatgc atcacgttcc acatggaatt    2820
gcttgtgctg tattaataga agaagttatt aaatataacg ctacagactg tccaacaaag    2880
caaacagcat tccctcaata taaatctcct aatgctaaga gaaaatatgc tgaaattgca    2940
gagtatttga atttaaaggg tactagcgat accgaaaagg taacagcctt aatagaagct    3000
atttcaaagt taaagataga tttgagtatt ccacaaaata taagtgccgc tggaataaat  3060
aaaaaagatt tttataatac gctagataaa atgtcagagc ttgcttttga tgaccaatgt  3120
acaacagcta atcctaggta tccacttata agtgaactta aggatatcta tataaaatca  3180
ttttaaaaaa taaagaatgt aaaatagtct ttgcttcatt atattagctt catgaagcac  3240
atagactatt ttacatttta ctcttgtttt ttatctttca agtggttgct tgtacgaatc  3300
tgtaccatct ttaatattaa ttaccttgta tcctttactc cacaattctt tgttgataat  3360
gaactgtgct gattacaaaa atactaaaaa tgcccatatt ttttcctcct tataaaatta  3420
gtataattat agcacgcgaa ttcatcgaat aaatacctgt gacggaagat cacttcgcag  3480
aataaataaa tcctggtgtc cctgttgata ccgggaagcc ctgggccaac ttttggcgaa  3540
aatgagacgt tgatcggcac gtaagaggtt ccaactttca ccataatgaa ataagatcac  3600
taccgggcgt attttttgag ttatcgagat tttcaggagc taaggaagct aaaatggaga  3660
aaaaaatcac tggatatacc accgttgata tatcccaatg gcatcgtaaa gaacattttg  3720
aggcatttca gtcagttgct caatgtacct ataaccagac cgttcagctg gatattacgg  3780
cctttttaaa gaccgtaaag aaaaataagc acaagtttta tccggccttt attcacattc  3840
ttgcccgcct gatgaatgct catccggaat tccgtatggc aatgaaagac ggtgagctgg  3900
tgatatggga tagtgttcac ccttgttaca ccgttttcca tgagcaaact gaaacgtttt  3960
catcgctctg gagtgaatac cacgacgatt tccggcagtt tctacacata tattcgcaag  4020
atgtggcgtg ttacggtgaa aacctggcct atttccctaa agggtttatt gagaatatgt  4080
ttttcgtctc agccaatccc tgggtgagtt tcaccagttt tgatttaaac gtggccaata  4140
tggacaactt cttcgccccc gttttcacca tgggcaaata ttatacgcaa ggcgacaagg  4200
tgctgatgcc gctggcgatt caggttcatc atgccgtttg tgatggcttc catgtcggca  4260
gaatgcttaa tgaattacaa cagtactgcg atgagtggca gggcggggcg taattttttt  4320
aaggcagtta ttggtgccct taaacgcctg gtgctacgcc tgaataagtg ataataagcg  4380
gatgaatggc agaaattcga tttgctggaa tacattaggg caacactcag gactcatcta  4440
gtgctttaac tgatacatcc accgcttgta cgtcaatagt tccaggggga gtggggcggg  4500
taaattgtcc attgctcact tccaactctt ccccgcaact ggggcatcgg catggctgac  4560
cgtcaaaacc agtgaagtga tactgacaaa cgggacactc cccatccacc aattttctct  4620
tcagccacca gcggaatacc aaaaagccca ccgttggtgc cagaaacaat agcaaaatca  4680
acagagcaat gccattgaca acccatttca gaccaatggc actgaggagc atggccacgg  4740
caaggacagt caagccacag cccaggcctg attggttgac ggtaacaaat ttgggggaaa  4800
agttgttcac agatggctcc taccaacagc attaccgctg ggatcactat tttccatcct  4860
agtccattag ctccgcagtt ggaataccaa ggtatcctcc cctgggctaa aggttttgaa  4920
caggtcgcac accatgccta tcccattaaa atcacgttgt caatcacatg gataatgccg  4980
ttgtccgctt cgatat                                                  4996
<210>3
<211>261
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>3
Met Glu Leu Asn Asn Val Ile Leu Glu Lys Glu Gly Lys Val Ala Val
1              5                   10                  15
Val Thr Ile Asn Arg Pro Lys Ala Leu Asn Ala Leu Asn Ser Asp Thr
            20                 25                  30
Leu Lys Glu Met Asp Tyr Val Ile Gly Glu Ile Glu Asn Asp Ser Glu
        35                 40                  45
Val Leu Ala Val Ile Leu Thr Gly Ala Gly Glu Lys Ser Phe Val Ala
    50                 55                  60
Gly Ala Asp Ile Ser Glu Met Lys Glu Met Asn Thr Ile Glu Gly Arg
65                  70                 75                  80
Lys Phe Gly Ile Leu Gly Asn Lys Val Phe Arg Arg Leu Glu Leu Leu
                85                 90                  95
Glu Lys Pro Val Ile Ala Ala Val Asn Gly Phe Ala Leu Gly Gly Gly
            100                105                 110
Cys Glu Ile Ala Met Ser Cys Asp Ile Arg Ile Ala Ser Ser Asn Ala
        115                120                 125
Arg Phe Gly Gln Pro Glu Val Gly Leu Gly Ile Thr Pro Gly Phe Gly
    130                135                 140
Gly Thr Gln Arg Leu Ser Arg Leu Val Gly Met Gly Met Ala Lys Gln
145                150                 155                 160
Leu Ile Phe Thr Ala Gln Asn Ile Lys Ala Asp Glu Ala Leu Arg Ile
                165                170                 175
Gly Leu Val Asn Lys Val Val Glu Pro Ser Glu Leu Met Asn Thr Ala
            180                185                 190
Lys Glu Ile Ala Asn Lys Ile Val Ser Asn Ala Pro Val Ala Val Lys
        195                200                 205
Leu Ser Lys Gln Ala Ile Asn Arg Gly Met Gln Cys Asp Ile Asp Thr
    210                215                 220
Ala Leu Ala Phe Glu Ser Glu Ala Phe Gly Glu Cys Phe Ser Thr Glu
225                230                 235                 240
Asp Gln Lys Asp Ala Met Thr Ala Phe Ile Glu Lys Arg Lys Ile Glu
                245                250                 255
Gly Phe Lys Asn Arg
            260
<210>4
<211>378
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>4
Met Asp Phe Asn Leu Thr Arg Glu Gln Glu Leu Val Arg Gln Met Val
1              5                   10                  15
Arg Glu Phe Ala Glu Asn Glu Val Lys Pro Ile Ala Ala Glu Ile Asp
            20                  25                  30
Glu Thr Glu Arg Phe Pro Met Glu Asn Val Lys Lys Met Gly Gln Tyr
        35                  40                  45
Gly Met Met Gly Ile Pro Phe Ser Lys Glu Tyr Gly Gly Ala Gly Gly
    50                 55                  60
Asp Val Leu Ser Tyr Ile Ile Ala Val Glu Glu Leu Ser Lys Val Cys
65                 70                  75                  80
Gly Thr Thr Gly Val Ile Leu Ser Ala His Thr Ser Leu Cys Ala Ser
               85                  90                  95
Leu Ile Asn Glu His Gly Thr Glu Glu Gln Lys Gln Lys Tyr Leu Val
            100                105                 110
Pro Leu Ala Lys Gly Glu Lys Ile Gly Ala Tyr Gly Leu Thr Glu Pro
        115                120                 125
Asn Ala Gly Thr Asp Ser Gly Ala Gln Gln Thr Val Ala Val Leu Glu
    130                135                 140
Gly Asp His Tyr Val Ile Asn Gly Ser Lys Ile Phe Ile Thr Asn Gly
145                150                 155                 160
Gly Val Ala Asp Thr Phe Val Ile Phe Ala Met Thr Asp Arg Thr Lys
                165                170                 175
Gly Thr Lys Gly Ile Ser Ala Phe Ile Ile Glu Lys Gly Phe Lys Gly
            180                185                 190
Phe Ser Ile Gly Lys Val Glu Gln Lys Leu Gly Ile Arg Ala Ser Ser
        195                200                 205
Thr Thr Glu Leu Val Phe Glu Asp Met Ile Val Pro Val Glu Asn Met
    210                215                 220
Ile Gly Lys Glu Gly Lys Gly Phe Pro Ile Ala Met Lys Thr Leu Asp
225                230                 235                 240
Gly Gly Arg Ile Gly Ile Ala Ala Gln Ala Leu Gly Ile Ala Glu Gly
                245                250                 255
Ala Phe Asn Glu Ala Arg Ala Tyr Met Lys Glu Arg Lys Gln Phe Gly
            260                265                 270
Arg Ser Leu Asp Lys Phe Gln Gly Leu Ala Trp Met Met Ala Asp Met
        275                280                 285
Asp Val Ala Ile Glu Ser Ala Arg Tyr Leu Val Tyr Lys Ala Ala Tyr
    290                295                 300
Leu Lys Gln Ala Gly Leu Pro Tyr Thr Val Asp Ala Ala Arg Ala Lys
305                310                 315                 320
Leu His Ala Ala Asn Val Ala Met Asp Val Thr Thr Lys Ala Val Gln
                325                330                 335
Leu Phe Gly Gly Tyr Gly Tyr Thr Lys Asp Tyr Pro Val Glu Arg Met
            340                345                 350
Met Arg Asp Ala Lys Ile Thr Glu Ile Tyr Glu Gly Thr Ser Glu Val
        355                360                 365
Gln Lys Leu Val Ile Ser Gly Lys Ile Phe
    370                375
<210>5
<211>259
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>5
Met Asn Ile Val Val Cys Leu Lys Gln Val Pro Asp Thr Ala Glu Val
1              5                   10                  15
Arg Ile Asp Pro Val Lys Gly Thr Leu Ile Arg Glu Gly Val Pro Ser
            20                25                   30
Ile Ile Asn Pro Asp Asp Lys Asn Ala Leu Glu Glu Ala Leu Val Leu
        35                 40                  45
Lys Asp Asn Tyr Gly Ala His Val Thr Val Ile Ser Met Gly Pro Pro
    50                 55                  60
Gln Ala Lys Asn Ala Leu Val Glu Ala Leu Ala Met Gly Ala Asp Glu
65                 70                  75                  80
Ala Val Leu Leu Thr Asp Arg Ala Phe Gly Gly Ala Asp Thr Leu Ala
                85                 90                  95
Thr Ser His Thr Ile Ala Ala Gly Ile Lys Lys Leu Lys Tyr Asp Ile
            100                105                 110
Val Phe Ala Gly Arg Gln Ala Ile Asp Gly Asp Thr Ala Gln Val Gly
        115                120                 125
Pro Glu Ile Ala Glu His Leu Gly Ile Pro Gln Val Thr Tyr Val Glu
    130                135                 140
Lys Val Glu Val Asp Gly Asp Thr Leu Lys Ile Arg Lys Ala Trp Glu
145                150                 155                 160
Asp Gly Tyr Glu Val Val Glu Val Lys Thr Pro Val Leu Leu Thr Ala
                165                170                 175
Ile Lys Glu Leu Asn Val Pro Arg Tyr Met Ser Val Glu Lys Ile Phe
            180                185                 190
Gly Ala Phe Asp Lys Glu Val Lys Met Trp Thr Ala Asp Asp Ile Asp
        195                200                 205
Val Asp Lys Ala Asn Leu Gly Leu Lys Gly Ser Pro Thr Lys Val Lys
    210                215                 220
Lys Ser Ser Thr Lys Glu Val Lys Gly Gln Gly Glu Val Ile Asp Lys
225                230                 235                 240
Pro Val Lys Glu Ala Ala Ala Tyr Val Val Ser Lys Leu Lys Glu Glu
                245                250                 255
His Tyr Ile
<210>6
<211>336
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>6
Met Asn Lys Ala Asp Tyr Lys Gly Val Trp Val Phe Ala Glu Gln Arg
1              5                   10                  15
Asp Gly Glu Leu Gln Lys Val Ser Leu Glu Leu Leu Gly Lys Gly Lys
            20                 25                  30
Glu Met Ala Glu Lys Leu Gly Val Glu Leu Thr Ala Val Leu Leu Gly
        35                 40                  45
His Asn Thr Glu Lys Met Ser Lys Asp Leu Leu Ser His Gly Ala Asp
    50                 55                  60
Lys Val Leu Ala Ala Asp Asn Glu Leu Leu Ala His Phe Ser Thr Asp
65                 70                  75                  80
Gly Tyr Ala Lys Val Ile Cys Asp Leu Val Asn Glu Arg Lys Pro Glu
                85                 90                  95
Ile Leu Phe Ile Gly Ala Thr Phe Ile Gly Arg Asp Leu Gly Pro Arg
            100                105                 110
Ile Ala Ala Arg Leu Ser Thr Gly Leu Thr Ala Asp Cys Thr Ser Leu
        115                120                 125
Asp Ile Asp Val Glu Asn Arg Asp Leu Leu Ala Thr Arg Pro Ala Phe
    130                135                 140
Gly Gly Asn Leu Ile Ala Thr Ile Val Cys Ser Asp His Arg Pro Gln
145                150                 155                 160
Met Ala Thr Val Arg Pro Gly Val Phe Glu Lys Leu Pro Val Asn Asp
                165                170                 175
Ala Asn Val Ser Asp Asp Lys Ile Glu Lys Val Ala Ile Lys Leu Thr
            180                185                 190
Ala Ser Asp Ile Arg Thr Lys Val Ser Lys Val Val Lys Leu Ala Lys
        195                200                 205
Asp Ile Ala Asp Ile Gly Glu Ala Lys Val Leu Val Ala Gly Gly Arg
    210                215                 220
Gly Val Gly Ser Lys Glu Asn Phe Glu Lys Leu Glu Glu Leu Ala Ser
225                230                 235                 240
Leu Leu Gly Gly Thr Ile Ala Ala Ser Arg Ala Ala Ile Glu Lys Glu
                245                250                 255
Trp Val Asp Lys Asp Leu Gln Val Gly Gln Thr Gly Lys Thr Val Arg
            260                265                 270
Pro Thr Leu Tyr Ile Ala Cys Gly Ile Ser Gly Ala Ile Gln His Leu
        275                280                 285
Ala Gly Met Gln Asp Ser Asp Tyr Ile Ile Ala Ile Asn Lys Asp Val
    290                295                 300
Glu Ala Pro Ile Met Lys Val Ala Asp Leu Ala Ile Val Gly Asp Val
305                310                 315                 320
Asn Lys Val Val Pro Glu Leu Ile Ala Gln Val Lys Ala Ala Asn Asn
                325                330                 335
<210>7
<211>282
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>7
Met Lys Lys Val Cys Val Ile Gly Ala Gly Thr Met Gly Ser Gly Ile
1              5                   10                  15
Ala Gln Ala Phe Ala Ala Lys Gly Phe Glu Val Val Leu Arg Asp Ile
            20                 25                  30
Lys Asp Glu Phe Val Asp Arg Gly Leu Asp Phe Ile Asn Lys Asn Leu
        35                 40                  45
Ser Lys Leu Val Lys Lys Gly Lys Ile Glu Glu Ala Thr Lys Val Glu
    50                 55                  60
Ile Leu Thr Arg Ile Ser Gly Thr Val Asp Leu Asn Met Ala Ala Asp
65                 70                  75                  80
Cys Asp Leu Val Ile Glu Ala Ala Val Glu Arg Met Asp Ile Lys Lys
                85                 90                  95
Gln Ile Phe Ala Asp Leu Asp Asn Ile Cys Lys Pro Glu Thr Ile Leu
            100                105                 110
Ala Ser Asn Thr Ser Ser Leu Ser Ile Thr Glu Val Ala Ser Ala Thr
        115                120                 125
Lys Arg Pro Asp Lys Val Ile Gly Met His Phe Phe Asn Pro Ala Pro
    130                135                 140
Val Met Lys Leu Val Glu Val Ile Arg Gly Ile Ala Thr Ser Gln Glu
145                150                 155                 160
Thr Phe Asp Ala Val Lys Glu Thr Ser Ile Ala Ile Gly Lys Asp Pro
                165                170                 175
Val Glu Val Ala Glu Ala Pro Gly Phe Val Val Asn Arg Ile Leu Ile
            180                185                 190
Pro Met Ile Asn Glu Ala Val Gly Ile Leu Ala Glu Gly Ile Ala Ser
        195                200                 205
Val Glu Asp Ile Asp Lys Ala Met Lys Leu Gly Ala Asn His Pro Met
    210                215                 220
Gly Pro Leu Glu Leu Gly Asp Phe Ile Gly Leu Asp Ile Cys Leu Ala
225                230                 235                 240
Ile Met Asp Val Leu Tyr Ser Glu Thr Gly Asp Ser Lys Tyr Arg Pro
                245                250                 255
His Thr Leu Leu Lys Lys Tyr Val Arg Ala Gly Trp Leu Gly Arg Lys
            260                265                 270
Ser Gly Lys Gly Phe Tyr Asp Tyr Ser Lys
        275                280
<210>8
<211>390
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>8
Met Val Asp Phe Glu Tyr Ser Ile Pro Thr Arg Ile Phe Phe Gly Lys
1              5                   10                  15
Asp Lys Ile Asn Val Leu Gly Arg Glu Leu Lys Lys Tyr Gly Ser Lys
            20                 25                  30
Val Leu Ile Val Tyr Gly Gly Gly Ser Ile Lys Arg Asn Gly Ile Tyr
        35                 40                  45
Asp Lys Ala Val Ser Ile Leu Glu Lys Asn Ser Ile Lys Phe Tyr Glu
    50                 55                  60
Leu Ala Gly Val Glu Pro Asn Pro Arg Val Thr Thr Val Glu Lys Gly
65                 70                  75                  80
Val Lys Ile Cys Arg Glu Asn Gly Val Glu Val Val Leu Ala Ile Gly
                85                 90                  95
Gly Gly Ser Ala Ile Asp Cys Ala Lys Val Ile Ala Ala Ala Cys Glu
            100                105                 110
Tyr Asp Gly Asn Pro Trp Asp Ile Val Leu Asp Gly Ser Lys Ile Lys
        115                120                 125
Arg Val Leu Pro Ile Ala Ser Ile Leu Thr Ile Ala Ala Thr Gly Ser
    130                135                 140
Glu Met Asp Thr Trp Ala Val Ile Asn Asn Met Asp Thr Asn Glu Lys
145                150                 155                 160
Leu Ile Ala Ala His Pro Asp Met Ala Pro Lys Phe Ser Ile Leu Asp
                165                170                 175
Pro Thr Tyr Thr Tyr Thr Val Pro Thr Asn Gln Thr Ala Ala Gly Thr
            180                185                 190
Ala Asp Ile Met Ser His Ile Phe Glu Val Tyr Phe Ser Asn Thr Lys
        195                200                 205
Thr Ala Tyr Leu Gln Asp Arg Met Ala Glu Ala Leu Leu Arg Thr Cys
    210                215                 220
Ile Lys Tyr Gly Gly Ile Ala Leu Glu Lys Pro Asp Asp Tyr Glu Ala
225                230                 235                 240
Arg Ala Asn Leu Met Trp Ala Ser Ser Leu Ala Ile Asn Gly Leu Leu
                245                250                 255
Thr Tyr Gly Lys Asp Thr Asn Trp Ser Val His Leu Met Glu His Glu
            260                265                 270
Leu Ser Ala Tyr Tyr Asp Ile Thr His Gly Val Gly Leu Ala Ile Leu
        275                280                 285
Thr Pro Asn Trp Met Glu Tyr Ile Leu Asn Asn Asp Thr Val Tyr Lys
    290                295                 300
Phe Val Glu Tyr Gly Val Asn Val Trp Gly Ile Asp Lys Glu Lys Asn
305                310                 315                 320
His Tyr Asp Ile Ala His Gln Ala Ile Gln Lys Thr Arg Asp Tyr Phe
                325                330                 335
Val Asn Val Leu Gly Leu Pro Ser Arg Leu Arg Asp Val Gly Ile Glu
            340                345                 350
Glu Glu Lys Leu Asp Ile Met Ala Lys Glu Ser Val Lys Leu Thr Gly
        355                360                 365
Gly Thr Ile Gly Asn Leu Arg Pro Val Asn Ala Ser Glu Val Leu Gln
    370                375                 380
Ile Phe Lys Lys Ser Val
385                390
<210>9
<211>858
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>9
Met Lys Val Thr Asn Gln Lys Glu Leu Lys Gln Lys Leu Asn Glu Leu
1              5                   10                  15
Arg Glu Ala Gln Lys Lys Phe Ala Thr Tyr Thr Gln Glu Gln Val Asp
            20                 25                  30
Lys Ile Phe Lys Gln Cys Ala Ile Ala Ala Ala Lys Glu Arg Ile Asn
        35                 40                  45
Leu Ala Lys Leu Ala Val Glu Glu Thr Gly Ile Gly Leu Val Glu Asp
    50                 55                  60
Lys Ile Ile Lys Asn His Phe Ala Ala Glu Tyr Ile Tyr Asn Lys Tyr
65                 70                  75                  80
Lys Asn Glu Lys Thr Cys Gly Ile Ile Asp His Asp Asp Ser Leu Gly
                85                 90                  95
Ile Thr Lys Val Ala Glu Pro Ile Gly Ile Val Ala Ala Ile Val Pro
            100                105                 110
Thr Thr Asn Pro Thr Ser Thr Ala Ile Phe Lys Ser Leu Ile Ser Leu
        115                120                 125
Lys Thr Arg Asn Ala Ile Phe Phe Ser Pro His Pro Arg Ala Lys Lys
    130                135                 140
Ser Thr Ile Ala Ala Ala Lys Leu Ile Leu Asp Ala Ala Val Lys Ala
145                150                 155                 160
Gly Ala Pro Lys Asn Ile Ile Gly Trp Ile Asp Glu Pro Ser Ile Glu
                165                170                 175
Leu Ser Gln Asp Leu Met Ser Glu Ala Asp Ile Ile Leu Ala Thr Gly
            180                185                 190
Gly Pro Ser Met Val Lys Ala Ala Tyr Ser Ser Gly Lys Pro Ala Ile
        195                200                 205
Gly Val Gly Ala Gly Asn Thr Pro Ala Ile Ile Asp Glu Ser Ala Asp
    210                215                 220
Ile Asp Met Ala Val Ser Ser Ile Ile Leu Ser Lys Thr Tyr Asp Asn
225                230                 235                 240
Gly Val Ile Cys Ala Ser Glu Gln Ser Ile Leu Val Met Asn Ser Ile
                245                250                 255
Tyr Glu Lys Val Lys Glu Glu Phe Val Lys Arg Gly Ser Tyr Ile Leu
            260                265                 270
Asn Gln Asn Glu Ile Ala Lys Ile Lys Glu Thr Met Phe Lys Asn Gly
        275                280                 285
Ala Ile Asn Ala Asp Ile Val Gly Lys Ser Ala Tyr Ile Ile Ala Lys
     290                295                 300
Met Ala Gly Ile Glu Val Pro Gln Thr Thr Lys Ile Leu Ile Gly Glu
305                310                 315                 320
Val Gln Ser Val Glu Lys Ser Glu Leu Phe Ser His Glu Lys Leu Ser
                325                330                 335
Pro Val Leu Ala Met Tyr Lys Val Lys Asp Phe Asp Glu Ala Leu Lys
            340                345                 350
Lys Ala Gln Arg Leu Ile Glu Leu Gly Gly Ser Gly His Thr Ser Ser
        355                360                 365
Leu Tyr Ile Asp Ser Gln Asn Asn Lys Asp Lys Val Lys Glu Phe Gly
    370                375                 380
Leu Ala Met Lys Thr Ser Arg Thr Phe Ile Asn Met Pro Ser Ser Gln
385                390                 395                 400
Gly Ala Ser Gly Asp Leu Tyr Asn Phe Ala Ile Ala Pro Ser Phe Thr
                405                410                 415
Leu Gly Cys Gly Thr Trp Gly Gly Asn Ser Val Ser Gln Asn Val Glu
            420                425                430
Pro Lys His Leu Leu Asn Ile Lys Ser Val Ala Glu Arg Arg Glu Asn
        435                440                 445
Met Leu Trp Phe Lys Val Pro Gln Lys Ile Tyr Phe Lys Tyr Gly Cys
    450                455                 460
Leu Arg Phe Ala Leu Lys Glu Leu Lys Asp Met Asn Lys Lys Arg Ala
465                470                 475                 480
Phe Ile Val Thr Asp Lys Asp Leu Phe Lys Leu Gly Tyr Val Asn Lys
                485                490                 495
Ile Thr Lys Val Leu Asp Glu Ile Asp Ile Lys Tyr Ser Ile Phe Thr
            500                505                 510
Asp Ile Lys Ser Asp Pro Thr Ile Asp Ser Val Lys Lys Gly Ala Lys
        515                520                 525
Glu Met Leu Asn Phe Glu Pro Asp Thr Ile Ile Ser Ile Gly Gly Gly
    530                535                 540
Ser Pro Met Asp Ala Ala Lys Val Met His Leu Leu Tyr Glu Tyr Pro
545                550                 555                 560
Glu Ala Glu Ile Glu Asn Leu Ala Ile Asn Phe Met Asp Ile Arg Lys
                565                570                 575
Arg Ile Cys Asn Phe Pro Lys Leu Gly Thr Lys Ala Ile Ser Val Ala
            580                585                 590
Ile Pro Thr Thr Ala Gly Thr Gly Ser Glu Ala Thr Pro Phe Ala Val
        595                600                 605
Ile Thr Asn Asp Glu Thr Gly Met Lys Tyr Pro Leu Thr Ser Tyr Glu
    610                615                 620
Leu Thr Pro Asn Met Ala Ile Ile Asp Thr Glu Leu Met Leu Asn Met
625                630                 635                 640
Pro Arg Lys Leu Thr Ala Ala Thr Gly Ile Asp Ala Leu Val His Ala
                645                650                 655
Ile Glu Ala Tyr Val Ser Val Met Ala Thr Asp Tyr Thr Asp Glu Leu
            660                665                 670
Ala Leu Arg Ala Ile Lys Met Ile Phe Lys Tyr Leu Pro Arg Ala Tyr
        675                680                 685
Lys Asn Gly Thr Asn Asp Ile Glu Ala Arg Glu Lys Met Ala His Ala
    690                695                 700
Ser Asn Ile Ala Gly Met Ala Phe Ala Asn Ala Phe Leu Gly Val Cys
705                710                 715                 720
His Ser Met Ala His Lys Leu Gly Ala Met His His Val Pro His Gly
                725                730                 735
Ile Ala Cys Ala Val Leu Ile Glu Glu Val Ile Lys Tyr Asn Ala Thr
            740                745                 750
Asp Cys Pro Thr Lys Gln Thr Ala Phe Pro Gln Tyr Lys Ser Pro Asn
        755                760                 765
Ala Lys Arg Lys Tyr Ala Glu Ile Ala Glu Tyr Leu Asn Leu Lys Gly
    770                775                 780
Thr Ser Asp Thr Glu Lys Val Thr Ala Leu Ile Glu Ala Ile Ser Lys
785                790                 795                 800
Leu Lys Ile Asp Leu Ser Ile Pro Gln Asn Ile Ser Ala Ala Gly Ile
                805                810                 815
Asn Lys Lys Asp Phe Tyr Asn Thr Leu Asp Lys Met Ser Glu Leu Ala
            820                825                 830
Phe Asp Asp Gln Cys Thr Thr Ala Asn Pro Arg Tyr Pro Leu Ile Ser
        835                840                 845
Glu Leu Lys Asp Ile Tyr Ile Lys Ser Phe
    850                855
<210>10
<211>392
<212>PRT
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>10
Met Lys Glu Val Val Ile Ala Ser Ala Val Arg Thr Ala Ile Gly Ser
1              5                   10                  15
Tyr Gly Lys Ser Leu Lys Asp Val Pro Ala Val Asp Leu Gly Ala Thr
            20                 25                  30
Ala Ile Lys Glu Ala Val Lys Lys Ala Gly Ile Lys Pro Glu Asp Val
        35                 40                  45
Asn Glu Val Ile Leu Gly Asn Val Leu Gln Ala Gly Leu Gly Gln Asn
    50                 55                  60
Pro Ala Arg Gln Ala Ser Phe Lys Ala Gly Leu Pro Val Glu Ile Pro
65                 70                  75                  80
Ala Met Thr Ile Asn Lys Val Cys Gly Ser Gly Leu Arg Thr Val Ser
                85                 90                  95
Leu Ala Ala Gln Ile Ile Lys Ala Gly Asp Ala Asp Val Ile Ile Ala
            100                105                 110
Gly Gly Met Glu Asn Met Ser Arg Ala Pro Tyr Leu Ala Asn Asn Ala
        115                120                 125
Arg Trp Gly Tyr Arg Met Gly Asn Ala Lys Phe Val Asp Glu Met Ile
    130                135                 140
Thr Asp Gly Leu Trp Asp Ala Phe Asn Asp Tyr His Met Gly Ile Thr
145                150                 155                 160
Ala Glu Asn Ile Ala Glu Arg Trp Asn Ile Ser Arg Glu Glu Gln Asp
                165                170                 175
Glu Phe Ala Leu Ala Ser Gln Lys Lys Ala Glu Glu Ala Ile Lys Ser
            180                185                 190
Gly Gln Phe Lys Asp Glu Ile Val Pro Val Val Ile Lys Gly Arg Lys
        195                200                 205
Gly Glu Thr Val Val Asp Thr Asp Glu His Pro Arg Phe Gly Ser Thr
    210                215                 220
Ile Glu Gly Leu Ala Lys Leu Lys Pro Ala Phe Lys Lys Asp Gly Thr
225                230                 235                 240
Val Thr Ala Gly Asn Ala Ser Gly Leu Asn Asp Cys Ala Ala Val Leu
                245                250                 255
Val Ile Met Ser Ala Glu Lys Ala Lys Glu Leu Gly Val Lys Pro Leu
            260                265                 270
Ala Lys Ile Val Ser Tyr Gly Ser Ala Gly Val Asp Pro Ala Ile Met
        275                280                 285
Gly Tyr Gly Pro Phe Tyr Ala Thr Lys Ala Ala Ile Glu Lys Ala Gly
    290                295                 300
Trp Thr Val Asp Glu Leu Asp Leu Ile Glu Ser Asn Glu Ala Phe Ala
305                310                 315                 320
Ala Gln Ser Leu Ala Val Ala Lys Asp Leu Lys Phe Asp Met Asn Lys
                325                330                 335
Val Asn Val Asn Gly Gly Ala Ile Ala Leu Gly His Pro Ile Gly Ala
            340                345                 350
Ser Gly Ala Arg Ile Leu Val Thr Leu Val His Ala Met Gln Lys Arg
        355                360                 365
Asp Ala Lys Lys Gly Leu Ala Thr Leu Cys Ile Gly Gly Gly Gln Gly
    370                    375                    380
Thr Ala Ile Leu Leu Glu Lys Cys
385                390
<210>11
<211>1173
<212>DNA
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>11
gtggttgatt tcgaatattc aataccaact agaatttttt tcggtaaaga taagataaat    60
gtacttggaa gagagcttaa aaaatatggt tctaaagtgc ttatagttta tggtggagga    120
agtataaaga gaaatggaat atatgataaa gctgtaagta tacttgaaaa aaacagtatt    180
aaattttatg aacttgcagg agtagagcca aatccaagag taactacagt tgaaaaagga    240
gttaaaatat gtagagaaaa tggagttgaa gtagtactag ctataggtgg aggaagtgca    300
atagattgcg caaaggttat agcagcagca tgtgaatatg atggaaatcc atgggatatt    360
gtgttagatg gctcaaaaat aaaaagggtg cttcctatag ctagtatatt aaccattgct    420
gcaacaggat cagaaatgga tacgtgggca gtaataaata atatggatac aaacgaaaaa    480
ctaattgcgg cacatccaga tatggctcct aagttttcta tattagatcc aacgtatacg    540
tataccgtac ctaccaatca aacagcagca ggaacagctg atattatgag tcatatattt    600
gaggtgtatt ttagtaatac aaaaacagca tatttgcagg atagaatggc agaagcgtta    660
ttaagaactt gtattaaata tggaggaata gctcttgaga agccggatga ttatgaggca    720
agagccaatc taatgtgggc ttcaagtctt gcgataaatg gacttttaac atatggtaaa    780
gacactaatt ggagtgtaca cttaatggaa catgaattaa gtgcttatta cgacataaca    840
cacggcgtag ggcttgcaat tttaacacct aattggatgg agtatatttt aaataatgat    900
acagtgtaca agtttgttga atatggtgta aatgtttggg gaatagacaa agaaaaaaat    960
cactatgaca tagcacatca agcaatacaa aaaacaagag attactttgt aaatgtacta    1020
ggtttaccat ctagactgag agatgttgga attgaagaag aaaaattgga cataatggca    1080
aaggaatcag taaagcttac aggaggaacc ataggaaacc taagaccagt aaacgcctcc    1140
gaagtcctac aaatattcaa aaaatctgtg taa                                 1173
<210>12
<211>1179
<212>DNA
<213>梭菌属丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)
<400>12
atgaaagaag ttgtaatagc tagtgcagta agaacagcga ttggatctta tggaaagtct    60
cttaaggatg taccagcagt agatttagga gctacagcta taaaggaagc agttaaaaaa    120
gcaggaataa aaccagagga tgttaatgaa gtcattttag gaaatgttct tcaagcaggt    180
ttaggacaga atccagcaag acaggcatct tttaaagcag gattaccagt tgaaattcca    240
gctatgacta ttaataaggt ttgtggttca ggacttagaa cagttagctt agcagcacaa    300
attataaaag caggagatgc tgacgtaata atagcaggtg gtatggaaaa tatgtctaga    360
gctccttact tagcgaataa cgctagatgg ggatatagaa tgggaaacgc taaatttgtt    420
gatgaaatga tcactgacgg attgtgggat gcatttaatg attaccacat gggaataaca    480
gcagaaaaca tagctgagag atggaacatt tcaagagaag aacaagatga gtttgctctt    540
gcatcacaaa aaaaagctga agaagctata aaatcaggtc aatttaaaga tgaaatagtt    600
cctgtagtaa ttaaaggcag aaagggagaa actgtagttg atacagatga gcaccctaga    660
tttggatcaa ctatagaagg acttgcaaaa ttaaaacctg ccttcaaaaa agatggaaca    720
gttacagctg gtaatgcatc aggattaaat gactgtgcag cagtacttgt aatcatgagt    780
gcagaaaaag ctaaagagct tggagtaaaa ccacttgcta agatagtttc ttatggttca    840
gcaggagttg acccagcaat aatgggatat ggacctttct atgcaacaaa agcagctatt    900
gaaaaagcag gttggacagt tgatgaatta gatttaatag aatcaaatga agcttttgca    960
gctcaaagtt tagcagtagc aaaagattta aaatttgata tgaataaagt aaatgtaaat    1020
ggaggagcta ttgcccttgg tcatccaatt ggagcatcag gtgcaagaat actcgttact    1080
cttgtacacg caatgcaaaa aagagatgca aaaaaaggct tagcaacttt atgtataggt    1140
ggcggacaag gaacagcaat attgctagaa aagtgctag                           1179

Claims (7)

1.一种重组蓝藻,是通过包括如下步骤的方法得到的重组蓝藻:向蓝藻中导入丁醇合成相关基因;所述丁醇合成相关基因包括如下酶的编码基因:
电子转移黄素蛋白A亚基、电子转移黄素蛋白B亚基、烯酰水合酶、丁酰辅酶A脱氢酶、乙醇脱氢酶和3-羟丁酰辅酶A脱氢酶;
所述烯酰水合酶为由序列表中序列3所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述丁酰辅酶A脱氢酶为由序列表中序列4所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述电子转移黄素蛋白B亚基为由序列表中序列5所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述电子转移黄素蛋白A亚基为由序列表中序列6所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述3-羟丁酰辅酶A脱氢酶为由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述乙醇脱氢酶为由序列表中序列9所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
所述蓝藻为淡水蓝藻集胞藻(Synechocystis sp.)PCC 6803或海水蓝藻聚球藻(Synechococcus sp.)PCC 7002。
2.根据权利要求1所述的重组蓝藻,其特征在于:所述方法包括灭活所述蓝藻中的至少一个聚-β羟基丁酸酯合成相关基因的步骤。
3.根据权利要求2所述的重组蓝藻,其特征在于:所述灭活的方法为用至少一个的所述丁醇合成相关基因替换至少一个的所述聚-β羟基丁酸酯合成相关基因。
4.根据权利要求3所述的重组蓝藻,其特征在于:所述聚-β羟基丁酸酯合成相关基因为聚-β羟基丁酸酯合成酶的编码基因;所述灭活的方法为用所述乙醇脱氢酶的编码基因替换所述聚-β羟基丁酸酯合成酶的编码基因。
5.根据权利要求4所述的重组蓝藻,其特征在于:所述灭活的方法是通过同源重组实现的。
6.根据权利要求1-5中任一所述的重组蓝藻,其特征在于:
所述烯酰水合酶的编码基因为:其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第1-786位核苷酸的DNA分子;
所述丁酰辅酶A脱氢酶的编码基因为:其核苷酸序列为序列表中序列1自5’ 末端第800-1939位核苷酸的DNA分子;
所述电子转移黄素蛋白B亚基的编码基因为:其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第1958-2737位核苷酸的DNA分子;
所述电子转移黄素蛋白A亚基的编码基因为:其核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第2756-3766位核苷酸的DNA分子;
所述3-羟丁酰辅酶A脱氢酶的编码基因为:核苷酸序列为序列表中序列1自5’末端第3871-4719位核苷酸的DNA分子;
所述乙醇脱氢酶的编码基因为:其核苷酸序列为序列表中序列2自5’末端第610-3186位核苷酸的DNA分子。
7.根据权利要求6所述的重组蓝藻,其特征在于:所述重组蓝藻为蓝藻集胞藻SMB-100 CGMCC No.2795.和聚球藻SMB-101 CGMCC No.2794。 
CN200810239558XA 2008-12-12 2008-12-12 一种重组蓝藻 Expired - Fee Related CN101748069B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN200810239558XA CN101748069B (zh) 2008-12-12 2008-12-12 一种重组蓝藻

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN200810239558XA CN101748069B (zh) 2008-12-12 2008-12-12 一种重组蓝藻

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101748069A CN101748069A (zh) 2010-06-23
CN101748069B true CN101748069B (zh) 2012-08-08

Family

ID=42475685

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN200810239558XA Expired - Fee Related CN101748069B (zh) 2008-12-12 2008-12-12 一种重组蓝藻

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN101748069B (zh)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10093552B2 (en) 2008-02-22 2018-10-09 James Weifu Lee Photovoltaic panel-interfaced solar-greenhouse distillation systems
US9259662B2 (en) 2008-02-22 2016-02-16 James Weifu Lee Photovoltaic panel-interfaced solar-greenhouse distillation systems
PL2250276T3 (pl) * 2008-02-23 2017-07-31 James Weifu Lee Organizmy zaprojektowane do fotobiologicznego wytwarzania butanolu z ditlenku węgla i wody
CN102517303B (zh) * 2011-11-24 2013-08-07 中国科学院微生物研究所 一种产乳酸的重组蓝藻及其制备方法与应用
CN109913508A (zh) * 2018-06-05 2019-06-21 嘉兴欣贝莱生物科技有限公司 一种利用蓝藻合成根皮素的方法
CN109666683B (zh) * 2019-02-27 2021-10-29 昆明理工大学 乙酰辅酶A乙酰转移酶基因RKAcaT2及其应用
CN111424023B (zh) * 2020-05-08 2021-06-18 北京大学 产酰胺酶类溶菌酶的蓝藻工程菌及其应用

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
J.L.Fortman 等.Biofuel alternatives to ethanol:pumping the microbial well.《Trends in Biotechnology》.2008,第26卷(第7期),全文. *
Shota Atsumi 等.Metabolic engineering of Escherichia coli for 1-butanol production.《Metabolic Engineering》.2008,第10卷(第6期),全文. *
程皆能 等.丙酮-丁醇发酵.《微生物生物学》.复旦大学出版社,1987,第55-56页. *
靳孝庆 等.丙酮丁醇发酵的研究进展及其高产策略.《化工进展》.2007,第26卷(第12期),全文. *

Also Published As

Publication number Publication date
CN101748069A (zh) 2010-06-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11821019B2 (en) Biological production of multi-carbon compounds from methane
Gao et al. Photosynthetic production of ethanol from carbon dioxide in genetically engineered cyanobacteria
US8163516B2 (en) Selection of ADH in genetically modified cyanobacteria for the production of ethanol
RU2723620C2 (ru) Система, способы и композиции для биопереработки
CN103502435B (zh) 重组微生物及其用途
CN101748069B (zh) 一种重组蓝藻
CN102245779A (zh) 大宗化学品的生物合成
CN103314101A (zh) 通过蛋白质生物质发酵的重组微生物的生物燃料和化学生产
Dedysh et al. Facultative methane oxidizers
CN101918539A (zh) 包含发酵基因卡盒的自养生物进行光驱动的co2还原生成有机化合物以用作燃料或用作工业半成品
Wen et al. Combined evolutionary engineering and genetic manipulation improve low pH tolerance and butanol production in a synthetic microbial Clostridium community
ES2909579T3 (es) Arginina como única fuente de nitrógeno para microorganismos fijadores de C1
EP3080243B1 (en) Use of enzymes which catalyze pyruvate synthesis from formate and acetyl-coa and bacteria expressing same
CA2787253A1 (en) Production of hydrocarbons in microorganisms
CN105255951B (zh) 一种通过过量表达hac1基因提高酒精生产效率的方法
CN112080452B (zh) 一种高产苯乳酸地衣芽孢杆菌基因工程菌、生产苯乳酸的方法和应用
CN102181368B (zh) 一种利用蓝藻将co2转化为丙酮及异丙醇的技术
CN109486835B (zh) 一种源于蓝藻的产烷烃关键基因突变子及其应用
CN113840909A (zh) 从气态底物发酵生产2-苯乙醇
WO2019207812A1 (ja) ヒドロゲノフィラス属細菌形質転換体
CN114015634B (zh) 高产琥珀酸的重组大肠杆菌及其构建方法和应用
CN101423815B (zh) 重组丙酮丁醇梭菌及其构建方法与应用
KR101411828B1 (ko) 에탄올 생산용 재조합 방선균 및 이를 이용한 에탄올 생산방법
CN102382863B (zh) 一种提高工程菌脂肪酸胞外分泌能力的方法
Seo Production of 1-butanol and butanol isomers by metabolically engineered Clostridium beijerinckii and Saccharomyces cerevisiae

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20120808

Termination date: 20141212

EXPY Termination of patent right or utility model