CN101687025A - B型流感嗜血杆菌 - Google Patents

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Abstract

揭示了含有衍生自b型流感嗜血杆菌、包括多种脂蛋白的各种氨基酸序列的多肽。这些多肽可用于开发预防和/或治疗细菌性脑膜炎的疫苗。它们还可用于诊断目的,以及作为抗生素的靶点。还揭示了抗这些多肽的抗体以及编码核酸。

Description

B型流感嗜血杆菌
本文引用的所有文献均以其全文纳入本文中作为参考。
技术领域
本发明属于流感嗜血杆菌(嗜血杆菌属influenzae)免疫学和疫苗学领域。
背景技术
流感嗜血杆菌是一种小的、不能运动的革兰氏阴性球杆菌。它是造成广谱人类感染的呼吸道病原体,其中包括:上呼吸道的无症状集群(colonization)(即迁移);从集群的粘膜表面延伸的感染,造成中耳炎(中耳发炎)、支气管炎、结膜炎、窦炎、尿道感染和肺炎;以及侵入性感染,如菌血症、脓毒性关节炎、会厌炎、肺炎、脓胸、心包炎、蜂窝织炎、骨髓炎和脑膜炎。流感嗜血杆菌(H.influenzae)是第一种被公布全部基因组序列的细菌[1]。
流感嗜血杆菌菌株是有荚膜(可分型)或没有荚膜的(不可分型),荚膜菌株有六种主要的血清型(a-f)。95%的流感嗜血杆菌造成的侵入性疾病是由B型流感嗜血杆菌(′Hib′)菌株造成的。Hib疾病最严重的表现为脑膜炎,但20世纪80年代基于偶联Hib荚膜糖的疫苗出现极大的降低该病的发病率。偶联疫苗的制造涉及糖类和载体的制备和随后的偶联,就制造而言,简单的蛋白质抗原将更加方便。
血清型d菌株KW20的基因组序列[1,2]已被用于理解基础流感嗜血杆菌生物学,但还无法用于抵抗致病性流感嗜血杆菌菌株,这是因为血清型d菌株通常不是病原体。
本发明的一个目的是提供用于开发预防和/或治疗由b型流感嗜血杆菌菌株造成的感染的疫苗的多肽。具体地说,本发明的一个目的是提供用于改进预防和/或治疗由Hib造成的细菌性脑膜炎的疫苗的多肽。所述多肽还可用于诊断目的以及作为抗生素的靶点。
发明概述
多肽
本发明提供了包含实施例中所述流感嗜血杆菌氨基酸序列的多肽。这些氨基酸序列是SEQ ID NO 2-3706中的偶数序列。因此有1853个氨基酸序列,并被称为HIBnnnn,其中nnnn为0001-1853之间的数字。
本发明还提供了包含与实施例中所述的流感嗜血杆菌氨基酸序列具有序列相同性的氨基酸序列的多肽。根据具体的序列,序列相同性程度优选大于50%(例如60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)。这些多肽包括同源物、直向同源物、等位基因变体和功能突变体。一般地,两种多肽序列之间相同性为50%或更高被认为是功能等效的标志。优选用MPSRCH程序(Oxford Molecular)中运行的Smith-Waterman同源性检索算法来确定多肽间的相同性,其采用带有参数缺口开放罚分=12和缺口延伸罚分=1的仿射缺口检索来进行。
与实施例的Hib序列相比,这些多肽可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)保守的氨基酸取代,即用具有相关侧链的另一种氨基酸取代原有氨基酸。遗传编码氨基酸通常分成4种家族:(1)酸性,即天冬氨酸、谷氨酸;(2)碱性,即赖氨酸、精氨酸、组氨酸;(3)非极性,即丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸;和(4)不带电荷的极性氨基酸,即甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸。有时将苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸一起称为芳族氨基酸。通常,在这些家族中的单个氨基酸取代不会对生物活性产生重要影响。而且,相对于实施例中的Hib序列,所述多肽可以有一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)单个氨基酸的缺失。而且,相对于实施例中的Hib序列,所述多肽还可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)插入(如1、2、3、4或5个氨基酸)。
优选的本发明的多肽如下所述,包含那些脂质化的、位于外膜中的、位于内膜中的、或位于周质中的多肽。尤其优选的多肽是同时属于这些范畴中1种以上的多肽,如位于外膜中的脂质化多肽,如HIB0374、HIB0382、HIB0426、HIB0733、HIB0734、HIB1564和HIB1654。两种优选的脂蛋白是HIB 1027和HIB 1255。翻译后加工信号肽后脂蛋白的N端半胱氨酸共价连接于脂质。
本发明还提供包含实施例中公开的流感嗜血杆菌氨基酸序列的片段的多肽。所述片段包含该序列中至少n个连续氨基酸,针对特定序列,n为7或更大(如8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100或更大)。
所述片段可包含该序列的至少一个T细胞表位,或优选地,B细胞表位。T细胞表位和B细胞表位可凭经验鉴定(如采用PEPSCAN[3,4]或类似方法)或预测(如采用Jameson-Wolf抗原性指数[5]、矩阵基方法[6]、TEPITOPE[7]、神经网络[8]、OptiMer&EpiMer[9,10]、ADEPT[11]、Tsites[12]、亲水性[13]、抗原性指数[14]或参考文献15公开的方法等)。其它优选片段为(a)本发明的Hib多肽的N端信号肽、(b)不具有N端信号肽的Hib多肽、(c)不具有其N端氨基酸残基的Hib多肽。
本发明的多肽可以许多方式制备,如化学合成(全部或部分)、用蛋白酶消化较长多肽、RNA翻译、从细胞培养物(如重组表达的细胞培养物)或生物体本身(如经过细菌培养或直接来自患者的生物体)进行纯化等。制备长度<40个氨基酸的多肽的优选方法包括体外化学合成[16,17]。尤其优选固相的肽合成,如基于tBoc或Fmoc[18]化学的方法。也可部分或全部采用酶合成[19]。作为对化学合成的替代方法,还可采用生物合成,例如可以通过翻译来制备多肽。这可在体外或体内进行。生物学方法通常限于制备L氨基酸多肽,然而操纵翻译机制(如氨酰基tRNA分子)可用于引入D氨基酸(或其它非天然氨基酸,如碘化酪氨酸或甲基苯丙氨酸、叠氮高丙氨酸等)[31]。然而,含有D氨基酸时,优选采用化学合成方法。可在C末端和/或N末端对本发明的多肽进行共价修饰。
本发明的多肽可采取各种形式(如天然、融合、糖基化、非糖基化、脂质化、非脂质化、磷酸化、非磷酸化、十四烷基化、非十四烷基化、单体、多聚体、颗粒、变性等)。
优选提供纯化或基本纯化形式,即基本上不含其它多肽(如不含天然产生的多肽),尤其是不含其它嗜血杆菌或宿主细胞多肽的本发明的多肽,一般至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯,即其它表达多肽占该组合物的约50%以下,更优选约10%以下(如5%或更少)。本发明的多肽优选为流感嗜血杆菌多肽。本发明的多肽优选具有表I中所述相关序列的功能。
本发明的多肽可连接于固相载体。本发明的多肽可包含可检测标记(如放射性或荧光标记或生物素标记)。
术语“多肽”指任何长度的氨基酸聚合物。所述聚合物可以是直链或支链,它可包含修饰氨基酸,并且可被非氨基酸所中断。所述术语还涵盖经天然修饰或介入(interVention)修饰的氨基酸聚合物;例如,二硫键形成、糖基化、脂质化、乙酰化、磷酸化或任何其它操控或修饰,如与标记组分偶联。该定义还包括(例如)含有一个或多个氨基酸类似物(包括(如)非天然氨基酸等)以及其它本领域公知修饰的多肽。多肽可以单链或结合链的形式存在。本发明的多肽可以是天然或人工糖基化的多肽(即所述多肽的糖基化模式与在相应的天然产生多肽中发现的糖基化模式不同)。
本发明提供的多肽包含序列-X-Y-或-Y-X-,其中:-X-为上述定义的氨基酸序列,-Y-并非上述定义的序列,即本发明提供融合蛋白。当多肽编码序列的N末端密码子并非ATG时,所述密码子将会按照该密码子的标准氨基酸进行翻译而不是翻译成Met,这种情况发生在该密码子翻译成起始密码子时。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,所述方法包括在诱导多肽表达的条件下培养本发明的宿主细胞的步骤。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,其中所述多肽部分或完全用化学方法合成。
本发明提供了一种含有两种或多种本发明多肽的组合物。
本发明还提供一种以通式NH2-A-[-X-L-]n-B-COOH表示的杂交多肽,其中X为上述定义的本发明的多肽,L为任选的接头氨基酸序列,A为任选的N末端氨基酸序列,B为任选的C末端氨基酸序列,n为大于1的整数。n值在2和x之间,x值一般为3、4、5、6、7、8、9或10。优选地,n为2、3或4;更优选地为2或3;最优选地,n=2。在每种n的例子中,-X-可以相同或不同。在[-X-L-]的每种n的例子中,接头氨基酸序列-L-可有或无。例如,当n=2时,该杂交体可以是NH2-X1-L1-X2-L2-COOH、NH2-X1-X2-COOH、NH2-X1-L1-X2-COOH、NH2-X1-X2-L2-COOH等。接头氨基酸序列-L-一般为短序列(如20个或更少氨基酸,即19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括有助于克隆的短肽序列、聚甘氨酸接头(即Glyn,其中n=2、3、4、5、6、7、8、9、10或更大)、和组氨酸标签(即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的接头氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。-A-和-B-为任选序列,一般为短序列(如40个或更少氨基酸,即39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括指导多肽运输的前导序列,或有助于克隆或纯化的短肽序列(如组氨酸标签,即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的N末端和C末端氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。
可采用各种试验来评估本发明的多肽的体内免疫原性。例如,多肽可重组表达并通过免疫印迹法用来筛选患者血清。多肽和患者血清之间发生阳性反应说明患者以前对所研究蛋白产生了免疫应答,即该蛋白为免疫原。这种方法还可用来鉴定优势免疫蛋白。
抗体
本发明提供了与本发明多肽结合的抗体。它们可以是多克隆或单克隆抗体,并可由任何合适方法制备(如通过重组表达)。为了增加其与人免疫系统的相容性,所述抗体可以是嵌合抗体或人源化抗体[如,参考文献21和22],或可采用完全人抗。所述抗体可以包含可检测标记(如用于诊断试验)。本发明抗体可以连接于固相载体。本发明抗体优选为中和抗体。
单克隆抗体对鉴定和纯化与之结合的单个多肽尤其有用。本发明的单克隆抗体也可以用作免疫测定、放射性免疫试验(RIA)或酶联免疫吸附试验(ELISA)等的试剂。在这些应用中,可用可分析检测试剂如放射性同位素、荧光分子或酶标记抗体标记抗体。以上述方法制备的单克隆抗体还可用于本发明的多肽的分子鉴定或表征(表位作图)。
本发明抗体优选特异于嗜血杆菌属细菌,即相对于非嗜血杆菌属细菌它们优选地与嗜血杆菌属细菌结合。更优选地,所述抗体对Hib具有特异性,即相对于非b型流感嗜血杆菌菌株它们优选地与Hib细菌结合。
本发明抗体优选地以纯化或基本纯化形式提供。一般地,抗体存在于基本上不含其它多肽的组合物中,如组合物中其它多肽少于90%(重量),通常少于60%,更通常少于50%。
本发明抗体可以是任何同种型(如IgA、IgG、IgM,即α、γ或μ重链),然而通常为IgG。在IgG同种型中,抗体可以是IgG1、IgG2、IgG3、IgG4亚类。本发明抗体可具有κ或λ轻链。
本发明抗体可具有各种形式,包括完整抗体,抗体片段如F(ab’)2和F(ab)片段、Fv片段(非共价异二聚体)、单链抗体(如单链Fv分子(scFv))、小抗体、寡抗体(oligobody)等。术语“抗体”不暗指任何特定来源,并包括由非常规方法(如噬菌体展示)所获得的抗体。
本发明提供一种检测本发明多肽的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品与本发明抗体接触;和(b)检测所述复合物。
本发明提供一种检测本发明抗体的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品(如血液或血清样品)与本发明的多肽接触;和(b)检测所述复合物。
核酸
本发明提供了含有实施例中所述流感嗜血杆菌核苷酸序列的核酸。这些核酸序列是SEQ ID NO 1-3706中的奇数序列。
本发明还提供了含有与实施例中所述的流感嗜血杆菌核苷酸序列具有序列相同性的核苷酸序列的核酸。序列之间的相同性优选用上述Smith-Waterman同源检索算法确定。
本发明还提供可与实施例中所述的流感嗜血杆菌核酸杂交的核酸。杂交反应可以在不同“严格”条件下进行。本领域众所周知并公开了提高杂交严格性的条件[如参考文献23第7.52页]。相关条件的例子包括(以严格性递增的顺序):培育温度:25℃、37℃、50℃、55℃和68℃;缓冲液浓度:10×SSC、6×SSC、1×SSC、0.1×SSC(其中SSC为0.15M NaCl和15mM柠檬酸盐的缓冲液)及采用其它缓冲体系的等效物;甲酰胺浓度:0%、25%、50%和75%;培育时间从5分钟到24小时;1次、2次或更多次洗涤步骤;1分钟、2分钟或15分钟的洗涤培育时间;洗涤溶液:6×SSC、1×SSC、0.1×SSC或去离子水。杂交技术及其优化为本领域公知[如见参考文献23-26等]。
一些实施方式中,本发明核酸在低严格条件下与靶点杂交;在其它实施方式中它在中等严格条件下杂交;优选实施方式中,它在高度严格条件下杂交。低严格杂交条件的示例性参数组为50℃和10×SSC。中等严格杂交条件的示例性参数组为55℃和1×SSC。高度严格杂交条件的示例性参数组为68℃和0.1×SSC。
还提供了包含这些序列片段的核酸。它们应该包含流感嗜血杆菌序列中的至少n个连续核苷酸,根据特定序列,n为10或更多(如12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200或更多)。
本发明提供通式5’-X-Y-Z-3’的核酸,其中:-X-为由x个核苷酸组成的核苷酸序列;-Z-为z个核苷酸组成的核苷酸序列;-Y-为由以下片段组成的核苷酸序列:(a)选自SEQ ID NO:1-5079中奇数编码的序列的片段;或(b)(a)的互补物;所述核酸5’-X-Y-Z-3’不是(i)SEQ ID NO:1-3705中奇数编码的序列的片段,也不是(ii)(i)的互补物。-X-和/或-Z-部分可包含启动子序列(或其互补物)。
本发明还提供了编码本发明多肽和多肽片段的核酸。
本发明包括的核酸含有与序列表中所列序列互补的序列(如作为反义链或探针,或用作引物)以及实际所示定位的序列。
本发明核酸可用于杂交反应(如Northern或Southern印迹、或用于核酸微阵列或‘基因芯片’)、扩增反应(如PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)和其它核酸技术。
本发明核酸可具有各种形式(如单链、双链、载体、引物、探针、标记等)。本发明核酸可以是环状或支链,然而通常为直链。除非另有限定或要求,采用核酸的本发明任何实施方式均可采用双链形式和组成该双链形式的两条互补的单链形式。引物和探针通常为单链,反义核酸通常也是单链。
优选以纯化或基本纯化的形式,即基本上不含其它核酸(如不含天然产生的核酸)、尤其不含其它嗜血杆菌属或宿主细胞核酸的形式提供本发明核酸,通常为至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯。本发明核酸优选地为流感嗜血杆菌核酸。
本发明核酸可以多种方式制备,如完全或部分采用化学合成(如DNA的亚磷酰胺合成),用核酸酶(如限制性酶)消化较长核酸,连接基因组或cDNA文库中的较短核酸或核苷酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以连接于固相载体(如珠子、平板、滤纸、膜、玻片、微阵列载体、树脂等)。可用(如)放射性标记或荧光标记、或生物素标记标记本发明核酸。当该核酸用于检测技术,如该核酸是引物或探针时,标记特别有用。
术语“核酸”通常包括任何长度的核苷酸的聚合形式,其包含脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸和/或其类似物。它包括DNA、RNA、DNA/RNA杂交体。它还包括DNA或RNA类似物,如含有修饰主链(如肽核酸(PNA)或硫代磷酸酯)或修饰碱基的类似物。因此本发明包括mRNA、tRNA、rRNA、核酶、DNA、cDNA、重组核酸、支链核酸、质粒、载体、探针、引物等。当本发明的核酸采用RNA形式时,它可能或可能不带有5’帽。
本发明核酸包含Hib序列,然而它们还可以包含非Hib序列(如上述通式5’-X-Y-Z-3’的核酸)。这对探针而言尤其适用,从而可使探针包含与Hib靶核酸互补的第一序列和不与靶核酸互补的第二序列。引物中的任何此类非互补序列优选位于互补序列的5’。典型的非互补序列包含限制性位点或启动子序列。
本发明的核酸可用许多方法制备,如化学合成(至少一部分),用核酸酶(如限制性酶)消化较长核酸,连接基因组或cDNA文库中的较短核酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以是载体的一部分,即设计用于转导/转染一种或多种细胞类型的核酸构建物的一部分。载体可以是,例如,设计用来分离、增殖和复制插入核苷酸的“克隆载体”,设计用来在宿主细胞中表达核苷酸序列的“表达载体”,设计用来生产重组病毒或病毒样颗粒的“病毒载体”,或包括超过一种类型的载体的属性的“穿梭载体”。优选的载体为质粒。“宿主细胞”包括单个细胞或细胞培养物,其可以作为或已经作为外源核酸的受体。宿主细胞包括单个宿主细胞的后代,并且由于天然、偶然或有意的突变和/或改变,所述后代不一定与原始亲代细胞完全相同(形态方面或总DNA互补物(complement)方面)。宿主细胞包括用本发明核酸在体内或体外转染或感染的细胞。
当核酸为DNA时,应理解,RNA序列中的“U”会被DNA中的“T”取代。相似地,当核酸为RNA时,应理解,DNA序列中的“T”会被RNA中的“U”取代。
当术语“互补物”或“互补”用于核酸时,指Watson-Crick碱基配对。因此C的互补物为G,G的互补物为C,A的互补物为T(或U),T(或U)的互补物为A。还可能使用如I(嘌呤肌苷)这样的碱基,与嘧啶(C或T)互补。所述术语还暗示了方向,即5’-ACAGT-3’的互补物为5’-ACTGT-3’而不是5’-TGTCA-3’。
本发明核酸可用于,例如:制备多肽;作为在生物样品中检测核酸的杂交探针;产生核酸的额外拷贝;产生核酶或反义寡核苷酸;作为单链DNA引物或探针;或作为形成三链的寡核苷酸。
本发明提供一种制备本发明核酸的方法,其中所述核酸部分或全部采用化学方法合成。
本发明提供包含本发明核苷酸序列的载体(如,克隆或表达载体)和转染有所述载体的宿主细胞。
本发明还提供包含用于扩增嗜血杆菌属细菌(例如流感嗜血杆菌)核酸序列内所含模板序列的引物(如PCR引物)的试剂盒,所述试剂盒包含第一引物和第二引物,其中所述第一引物与所述模板序列基本互补,所述第二引物与所述模板序列的互补物基本互补,其中基本互补的所述引物部分确定了待扩增模板序列的末端。所述第一引物和/或第二引物可包括可检测标记(如荧光标记)。
本发明还提供一种试剂盒,其包括第一和第二单链寡核苷酸,其可以扩增单链或双链核酸(或其混合物)内所含的嗜血杆菌属模板核酸序列,其中:(a)所述第一寡核苷酸包含与所述模板核酸序列基本互补的引物序列;(b)所述第二寡核苷酸包含与所述模板核酸序列的互补物基本互补的引物序列;(c)所述第一寡核苷酸和/或所述第二寡核苷酸包含不与所述模板核酸互补的序列;和(d)所述引物序列确定了待扩增模板序列的末端。所述特征(c)的非互补序列优选位于所述引物序列的上游(即其5’方向)。(c)序列中一种或两种可包含限制性位点[如参考文献27]或启动子序列[如28]。第一寡核苷酸和/或第二寡核苷酸可包括可检测标记(如荧光标记)。
所述模板序列可以是基因组序列,例如SEQ ID NO:3707的任何部分。
本发明提供了检测本发明核酸的方法,所述方法包括以下步骤:(a)在杂交条件下将生物样品与本发明核酸探针接触以形成双链体;和(b)检测所述双链体。
本发明提供检测生物样品(如血液)中的流感嗜血杆菌的方法,该方法包括在杂交条件下将生物样品与本发明核酸接触的步骤。所述方法可以包括核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)或杂交(如微阵列、印迹、在溶液中与探针杂交等)。已经报道过用PCR检测临床样品中的流感嗜血杆菌[如,见参考文献29和30]。在参考文献31中总体描述了基于核酸的临床试验。
本发明提供一种制备靶序列片段的方法,其中通过延伸核酸引物制备所述片段。所述靶序列和/或引物为本发明的核酸。所述引物延伸反应可涉及核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)。
本发明的核酸扩增可以是定量和/或实时扩增。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至少7个核苷酸(如8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、225、250、275、300个核苷酸或更长)。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至多500个核苷酸(如450、400、350、300、250、200、150、140、130、120、110、100、90、80、75、70、65、60、 55、50、45、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15个核苷酸或更短)。
本发明的引物和探针,以及其它用于杂交的核酸的长度优选为10-30个核苷酸(如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸)。
药物组合物
本发明提供的组合物含有:(a)本发明的多肽、抗体和/或核酸;和(b)药学上可接受的载体。这些组合物可能适合用作免疫原性组合物,例如,或者用作诊断试剂,或者用作疫苗。本发明的疫苗可以是预防性疫苗(即用于预防感染)或治疗性疫苗(即用于治疗感染),但一般是预防性疫苗。
“药学上可接受的载体”包括自身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体的任何载体。合适的载体一般为大的、代谢缓慢的大分子如蛋白质、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、多聚氨基酸、氨基酸共聚物、蔗糖、海藻糖、乳糖和脂质聚集体(如油滴或脂质体)。此类载体对本领域技术人员为公知技术。所述疫苗还可包含稀释剂,如水、盐水、甘油等。此外,可存在助剂,如湿润剂或乳化剂、pH缓冲物质等。无菌无热原的磷酸盐缓冲生理盐水是典型的载体。对药学上可接受赋形剂的详细讨论参见参考文献142。
本发明的组合物可包含抗微生物剂、尤其是以多剂量形式包装时。
本发明的组合物可包含去污剂,如吐温(聚山梨醇酯),例如吐温80。去污剂的含量通常很低,如<0.01%。
本发明的组合物可包含钠盐(如氯化钠)以提供张度(tonicity)。NaCl浓度一般为10±2mg/ml。
本发明的组合物通常包含缓冲液。一般为磷酸盐缓冲液。
本发明的组合物,尤其是当其将被冻干或当它们包含由冻干材料重建获得的物质时,可包含(如)约15-30mg/ml(如25mg/ml)的糖醇(如甘露醇)或二糖(如蔗糖或海藻糖)。在冻干前可将用于冻干的组合物的pH调整为约6.1。
本发明的多肽可与其它免疫调节剂一起给药。具体说,组合物通常包含疫苗佐剂。可用于本发明组合物的佐剂包括,但不限于:
A.含矿物质的组合物
适合用作本发明佐剂的含矿物质的组合物包括无机盐(如铝盐和钙盐)。本发明包括无机盐,如氢氧化物(例如羟基氧化物)、磷酸盐(例如羟磷酸盐、正磷酸盐)、硫酸盐等[例如参见参考文献32的第8和9章]或不同无机化合物的混合物,该化合物采用任何合适的形式(例如凝胶、晶体、无定形等),优选吸附于盐。含矿物质的组合物制成金属盐颗粒[33]。
特别优选磷酸铝,尤其使当组合物含有流感嗜血杆菌糖类抗原时,典型的佐剂为无定形羟基磷酸铝,其PO4/Al摩尔比为0.84-0.92,包括约0.6mgAl3+/ml。可以采用低剂量磷酸铝进行吸附,如每剂量每个偶联物采用50-100μgAl3+。当组合物中含有一种以上偶联物时,不需要吸附所有的偶联物。
B.油乳剂
适合用作本发明佐剂的油乳剂组合物包括鲨烯-水乳剂,如MF59(采用微流化机将5%鲨烯、0.5%吐温80和0.5%Span 85制成亚微米颗粒)[参考文献32的第10章;还参见参考文献34]。也可使用完全弗氏佐剂(CFA)和不完全弗氏佐剂(IFA)。
C.皂苷制剂[参考文献32第22章]
皂苷制剂也可用作本发明的佐剂。皂苷为甾醇糖苷和三萜糖苷的异种组,其发现于广泛的植物种类的树皮、叶、茎、根甚至花中。分离自皂树(Quillaia Saponaria,Molina)树皮的皂苷作为佐剂已广泛研究。在商业上,皂苷还可获自丽花菝葜(Smilax ornata)(墨西哥菝葜)、满天星(Gypsophilla paniculata)(婚纱花)和肥皂草(Saponaria officianalis)(皂根)。皂苷佐剂制剂包括纯化制剂如QS21和脂质制剂如ISCOM。QS21以StimulonTM销售。
皂苷组合物采用HPLC和RP-HPLC纯化。已鉴定出采用这些技术特别纯化的部分,包括:QS7、QS17、QS18、QS21、QH-A、QH-B和QH-C。优选地,皂苷为QS21。制备QS21的一种方法示于参考文献35。皂苷制剂还可包含甾醇,如胆固醇[36]。
皂苷和胆固醇的组合可用于形成免疫刺激复合物(ISCOM)的独特颗粒[参考文献32第23章]。ISCOM通常也包含磷脂,如磷脂酰乙醇胺或磷脂酰胆碱。任何已知皂苷均可用于ISCOM。优选地,ISCOM包含一种或多种QuilA、QHA和QHC。ISCOM在参考文献36-38中进一步描述。任选地,ISCOM不含另外的去污剂[39]。
有关皂苷基佐剂的进展的综述可见参考文献40和41。
D.病毒体或病毒样颗粒
病毒体和病毒样颗粒(VLP)也可用作本发明的佐剂。这些结构通常包含一种或多种来自病毒的蛋白,所述病毒任选结合磷脂或用磷脂配制。它们通常为不致病、不复制且通常不含有任何天然病毒基因组。所述病毒蛋白可由重组方法制备或从完整病毒中分离。这些适用于病毒体或VLP的病毒蛋白包括由如下病毒衍生的蛋白:流感病毒(如HA或NA)、乙肝病毒(如核心蛋白或衣壳蛋白)、戊肝病毒、麻疹病毒、辛德比斯病毒(Sindbis)、轮状病毒、口蹄疫病毒、反转录病毒、诺沃克病毒(NorWalk)、人乳头状瘤病毒、HIV、RNA噬菌体、Q β噬菌体(如外被蛋白)、GA噬菌体、fr噬菌体、AP205噬菌体、和Ty(如反转录转座子Ty蛋白p1)。VLP在参考文献42-47中进一步讨论。病毒体在参考文献48中进一步讨论。
E.细菌或微生物衍生物
适用于本发明的佐剂包括细菌或微生物衍生物,如肠细菌脂多糖(LPS)的非毒性衍生物、脂质A衍生物、免疫刺激性寡核苷酸和ADP核糖基化毒素及其脱毒衍生物。
LPS的非毒性衍生物包括单磷酰脂质A(MPL)和3-O-脱酰化MPL(3dMPL)。3dMPL为带有4、5或6条酰化链的3脱-O-酰化单磷酰脂质A的混合物。优选的“小颗粒”形式的3脱-O-酰化单磷酰脂质A在参考文献49中公开。此类3dMPL“小颗粒”足够小,能通过0.22μm膜进行无菌过滤[49]。其它非毒性LPS衍生物包括单磷酰脂质A模拟物,如氨烷基氨基葡糖苷磷酸衍生物,如RC-529[50,51]。
脂质A衍生物包括大肠杆菌来源的脂质A的衍生物,如OM-174。OM-174在参考文献52和53中进行了描述。
适合用作本发明佐剂的免疫刺激性寡核苷酸包括含有CpG基序(含有通过磷酸键与鸟嘌呤连接的未甲基化胞嘧啶的二核苷酸序列)的核苷酸序列。含有回文或聚(dG)序列的双链RNA和寡核苷酸也显现出免疫刺激性。
CpG可包括核苷酸修饰/类似物,如硫代磷酸修饰并可为双链或单链。参考文献54、55和56公开了可能的类似物取代,如用2’-脱氧-7-脱氮鸟苷代替鸟苷。CpG寡核苷酸的佐剂效果在参考文献57-62中进一步讨论。
CpG序列可指向TLR9,如基序GTCGTT或TTCGTT[63]。CpG序列可特异性诱导Th1免疫应答,如CpG-A ODN,或可更特异性地诱导B细胞应答,如CpG-B ODN。CpG-A和CpG-B ODN在参考文献64-66中讨论。优选的CpG为CpG-A ODN。
优选地,构建CpG寡核苷酸使5’端能进行受体识别。可选地,两种CpG寡核苷酸以其3’端相连以形成“免疫聚体(immunomers)”。参见例如,参考文献63和67-69。
细菌ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物可用作本发明的佐剂。优选地,蛋白获自大肠杆菌(大肠杆菌热不稳定肠毒素“LT”)、霍乱(“CT”)或百日咳(“PT”)。采用脱毒ADP-核糖基化毒素作为粘膜佐剂在参考文献70中描述,作为肠道外佐剂在参考文献71中描述。毒素或类毒素优选为包含A和B亚基的全毒素形式。优选地,A亚基包含脱毒突变;B亚基优选不突变。优选地,佐剂为脱毒LT突变体,如LT-K63、LT-R72和LT-G192。采用ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物,尤其是LT-K63和LT-R72作为佐剂可参见参考文献72-79。氨基酸取代的参比数字优选根据参考文献80(特别纳入本文作参考)中所列的ADP-核糖基化毒素的A和B亚基的比对得到。
F.人免疫调节剂
适合用作本发明佐剂的人免疫调节剂包括细胞因子如白介素(如IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12[81]等)[82]、干扰素(如干扰素γ)、巨噬细胞集落刺激因子和肿瘤坏死因子。
G.生物粘合剂和粘膜粘合剂
生物粘合剂和粘膜粘合剂也可用作本发明的佐剂。合适的生物粘合剂包括酯化透明质酸微球体[83]或粘膜粘合剂如聚(丙烯酸)、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、多糖和羧甲基纤维素的交联衍生物。壳聚糖及其衍生物也可用作本发明的佐剂[84]。
H.微粒
微粒也可用作本发明的佐剂。优选为可生物降解及无毒性物质(如聚(α羟酸)、聚羟基丁酸、聚原酸酯、聚酐、聚己酸内酯等)材料形成的颗粒(即直径在约100nm-约150μm的颗粒,更优选直径在约200nm-约30μm,最优选直径在约500nm-约10μm),优选具有丙交酯乙交酯共聚物,任选处理以具有带负电表面(如用SDS处理)或带正电表面(例如用阳离子去污剂如CTAB处理)。
I.脂质体(参考文献32第13和14章)
适合用作佐剂的脂质体制剂的例子如参考文献85-87中所述。
J.聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯制剂
适用于本发明的佐剂包括聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯[88]。此类制剂进一步包括结合有辛苯昔醇的聚氧乙烯山梨聚糖酯表面活性剂[89]和结合有至少一种其它非离子表面活性剂如辛苯昔醇的聚氧乙烯烷基醚或酯表面活性剂[90]。优选的聚氧乙烯醚选自:聚氧乙烯-9-月桂基醚(laureth 9)、聚氧乙烯-9-硬脂酰醚、聚氧乙烯-8-硬脂酰醚、聚氧乙烯-4-月桂基醚、聚氧乙烯-35-月桂基醚和聚氧乙烯-23-月桂基醚。
K.磷腈(PCPP)
PCPP制剂描述于例如参考文献91和92中。
L.胞壁酰肽
适合用作本发明佐剂的胞壁酰肽的例子包括N-乙酰-胞壁酰-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰-去甲胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺(去甲MDP)和N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺酰-L-丙氨酸-2-(1’-2’-二棕榈酰-sn-甘油-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)。
M.咪唑并喹啉(imidazoquinolone)化合物
适合用作本发明佐剂的咪唑并喹啉化合物的例子包括咪喹莫特(Imiquamod)及其同系物(例如″瑞喹莫德3M″),见参考文献93和94所述。
本发明也包括联用一种或多种以上鉴定的佐剂的各方面。例如,以下佐剂组合物可用于本发明:(1)皂苷和水包油乳剂[95];(2)皂苷(例如QS21)+无毒的LPS衍生物(例如3dMPL)[96];(3)皂苷(例如QS21)+无毒的LPS衍生物(例如3dMPL)+胆固醇;(4)皂苷(例如QS21)+3dMPL+IL-12(任选+固醇)[97];(5)联用3dMPL与例如QS21和/或水包油乳剂[98];(6)含有10%角鲨烯、0.4%吐温80TM、5%普朗尼克嵌段聚合物L121和thr-MDP的SAF,微流化为亚微米乳剂或搅拌产生较大粒度的乳剂;(7)RibiTM佐剂系统(RAS),(RibiImmunochem),其中含有2%角鲨烯、0.2%吐温80和一种或多种由单磷酰基脂质A(monophosphorylipid A)(MPL)、海藻糖二分枝菌酸酯(TDM)和细胞壁骨架(CWS),优选MPL+CWS(DetoxTM)组成的细菌细胞壁组分;和(8)一种或多种无机盐(例如铝盐)+LPS的无毒衍生物(例如3dMPL)。
参考文献32的第7章公开了用作免疫刺激剂的其它物质。
特别优选使用氢氧化铝或磷酸铝佐剂,且抗原通常被吸附到这些盐上。磷酸钙是另一种优选的佐剂。
本发明的组合物的pH优选在6-8之间,优选地为大约7。采用缓冲液维持pH的稳定。当组合物包含氢氧化铝盐时,优选采用组氨酸缓冲液[99]。组合物可以是无菌和/或无热原的。本发明的组合物可与人体等渗。
所述组合物可装在小瓶中,或者它们可装在预填充的注射器中。所述注射器可以带有或不带有针头。注射器包括单剂量的组合物,而小瓶可包括单剂量或多剂量。可注射组合物通常为液体溶液或悬液。或者,其可以固态形态存在(如冻干),在注射前用液态载体溶解或悬浮。
本发明的组合物可以单剂或以多剂形式包装。就多剂形式而言,小瓶优于预填充注射器。可以常规方法得到有效剂量体积,但注射用组合物的人剂量一般为0.5ml。
当本发明的组合物需要在临用前临时制备(如一组分以冻干形式存放)并以药盒形式存放时,所述药盒可包括两个小瓶,或者可包括一个预填充的注射器和一个小瓶,注射之前用注射器中的内容物将小瓶中的内容物再活化。
用作疫苗的免疫原性组合物包括免疫学有效量的抗原、和其它任何所需组分。‘免疫学有效量’指将所述量(以单剂量给药或作为连续剂量的一部分给药)给予个体能有效治疗或预防。所述量取决于待治疗个体的健康和身体状况、年龄、待治疗个体的分类组(如非人灵长类、灵长类等)、个体免疫系统合成抗体的能力、所需保护程度、疫苗的剂型、治疗医生对医学状况的评估和其它相关因素。预计所述量将落入可通过常规试验确定的相对宽的范围内,每个剂量中每种脑膜炎球菌糖类抗原的含量一般为每抗原1μg-10mg。
药物应用
本发明还提供一种治疗患者的方法,包括给予患者治疗有效量的本发明组合物。患者可能自身处于患该病的风险中或可能为孕妇(‘母体免疫’)。
本发明提供用作药剂(如作为免疫原性组合物或作为疫苗)或用作诊断试剂的本发明的核酸、多肽或抗体。它还提供使用本发明的核酸、多肽或抗体来制造:(i)治疗或预防由流感嗜血杆菌引起的疾病和/或感染的药剂;(ii)检测是否存在流感嗜血杆菌或针对流感嗜血杆菌的抗体的诊断试剂;和/或(iii)能产生针对流感嗜血杆菌的抗体的试剂。所述流感嗜血杆菌可以是任何血清型或菌株,但优选为b型流感嗜血杆菌。所述疾病可以是,例如,中耳炎、支气管炎、结膜炎、窦炎、尿道感染、肺炎、菌血症、脓毒性关节炎、会厌炎、肺炎、脓胸、心包炎、蜂窝组织炎、骨髓炎或脑膜炎。本发明特别适用于预防由Hib造成的细菌性脑膜炎。
患者优选为人。当疫苗用于预防性用途时,人优选儿童(如幼童或婴儿);当疫苗用于治疗性用途时,人优选成年人。准备用于儿童的疫苗也可给予成年人,如用于评价安全性、剂量、免疫原性等。
一种检验治疗性治疗效果的方法包括在给予本发明组合物之后监控感染情况。一种检验预防治疗效果的方法包括在给药后监控针对给予的多肽的免疫应答情况。本发明的组合物的免疫原性可通过如下方法确定:将它们给予测试对象(如12-16个月大的儿童或动物模型(如南美栗鼠模型),然后确定包括ELISA效价(GMT)在内的IgG的标准参数。通常在给予该组合物大约4周后测定这些免疫应答情况,并与给予组合物之前测定的值进行比较。当给予一个以上剂量的组合物时,可进行一次以上的给药后测定。
给予多肽抗原为一种优选的诱导免疫力的治疗方式。给予本发明的抗体为另一种优选的治疗方式。这种被动免疫方式尤其适用于新生婴儿或怀孕妇女。这一方法一般采用单克隆抗体,如人源化抗体或完整的人抗体。
本发明的组合物通常直接给予患者。直接递送可通过如下方式实现:胃肠道外注射(如皮下、腹膜内、静脉内、肌肉内或组织间隙)、直肠施用、口服(如片剂、喷雾剂)、阴道施用、外用、透皮施用、鼻内施用、舌下施用、眼部施用、耳部施用、肺部施用或其它粘膜施用。优选肌肉内施用到大腿或上臂。注射可通过针头(如皮下注射针头)实现,然而还可使用无针注射。典型的肌肉内剂量为0.5ml。
本发明可用于引起全身性和/或粘膜性免疫。
剂量治疗可以是单剂量方案或多剂量方案。多剂量可用于初次免疫方案和/或用于加强免疫方案。加强剂量方案可接在初次剂量方案之后。初次剂量之间的合适间隔(如4-16周)、以及初次和加强免疫之间的合适间隔可用常规方法确定。
细菌感染影响身体的各个部分,因此组合物可以制备成各种形式。例如,组合物可以制备为液体溶液或悬液形式的注射剂。还可制备适于在注射前溶解或悬浮于液体载体中的固体形式(如冻干或喷雾冷冻干燥的组合物)。该组合物可制备成局部给药剂型,如软膏剂、乳膏剂或粉末剂。该组合物可制备成口服给药剂型,如片剂或胶囊、喷雾剂或糖浆(任选地进行调味)。所述组合物可制备成肺部给药剂型,如使用细粉或喷雾的吸入器。所述组合物可制备成栓剂或阴道栓剂。所述组合物可制备成鼻、耳或眼给药剂型,如喷雾剂、滴剂、凝胶或粉末[如参考文献100和101]。
本发明组合物的其它抗原组分
本发明还提供一种包含本发明的多肽和一种或多种下述其它抗原的组合物:
-脑膜炎奈瑟球菌(N.meningitides)血清组A、C、W135和/或Y(优选所有四种)的糖类抗原,如在参考文献102中公开的血清组C的寡糖[还参见参考文献103]或参考文献104中的寡糖。
-肺炎链球菌(streptococcus pneumoniae)的糖类抗原[如105,106,107]。
-甲肝病毒抗原,如灭活病毒[如108,109]。
-乙肝病毒抗原,如表面抗原和/或核心抗原[如109,110]。
-白喉抗原,如白喉类毒素[如参考文献111第3章],例如CRM197突变体[例如112]。
-破伤风抗原,如破伤风类毒素[如参考文献111第4章]。
-百日咳博德特菌(Bordetella pertussis)的抗原,如百日咳博德特菌的百日咳全毒素(PT)和丝状血凝素(FHA),任选地还与百日咳杆菌黏附素(pertactin)和/或凝集原2和3混合[如参考文献113和114]。
-流感嗜血杆菌B(Haemophilus influenzae B)的糖类抗原[如103]。
-骨髓灰质炎抗原[如115,116]如IPV。
-麻疹、腮腺炎和/或风疹抗原[如参考文献111第9、10和11章]。
-流感抗原[如参考文献111第19章],如血凝素和/或神经氨酸酶表面蛋白。
-卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis)的抗原[如117]。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的蛋白质抗原[如118,119]。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的糖抗原。
-酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)(A型链球菌)的抗原[如119,120,121]。
-金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的抗原[如122]。
本组合物可包含一种或多种这些其它抗原。
在需要时可对毒性蛋白抗原进行脱毒(如通过化学和/或遗传方法对百日咳毒素进行脱毒[114])。
该组合物中含有白喉抗原时,优选还包含破伤风抗原和百日咳抗原。类似地,在包含破伤风抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和百日咳抗原。类似地,在包含百日咳抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和破伤风抗原。因此优选DTP组合物。
糖类抗原优选为偶联物形式。偶联物的载体蛋白包括细菌毒素(例如白喉类毒素或破伤风类毒素)、脑膜炎奈瑟球菌外膜蛋白[123]、合成肽[124,125]、热休克蛋白[126,127]、百日咳蛋白[128,129]、来自流感嗜血杆菌的蛋白D[130,131]、细胞因子[132]、淋巴因子[132]、流感嗜血杆菌蛋白、激素[132]、生长因子[132]、来自艰难梭菌(C.difficile)的毒素A或毒素B[133]、摄铁蛋白[134]、含有各种病原体衍生抗原的多个人CD4+T细胞表位的人工蛋白[135]例如N19蛋白[136]、肺炎球菌表面蛋白PspA[137]、肺炎球菌溶血素[138]等。优选的载体蛋白为CRM197蛋白[139]。
该组合物中各抗原的浓度一般为至少1μg/ml。总体而言,任何给定抗原的浓度都足以引起针对该抗原的免疫应答。
作为将蛋白质抗原用于本发明的免疫原性组合物的替代方式,也可采用编码该抗原的核酸(优选DNA,如质粒形式)。
抗原优选吸附于铝盐。
筛选方法
本发明提供了测定测试化合物是否结合本发明多肽的方法。如果测试化合物结合本发明的多肽且这种结合抑制流感嗜血杆菌的生命周期,则该测试化合物可被用作抗生素或用作设计抗生素的先导化合物。该方法将通常包括以下步骤:使测试化合物接触本发明的多肽,并测定该测试化合物是否结合所述多肽。优选的用于这些方法的本发明多肽是酶(例如tRNA合成酶)、膜转运蛋白和核糖体多肽。合适的测试化合物包括多肽、多肽、碳水化合物、脂质、核酸(例如DNA、RNA及其修饰形式)以及小的有机化合物(例如MW在200和2000Da之间的化合物)。测试化合物可单独提供,但通常将作为文库(例如组合文库)的一部分。检测结合相互作用的方法包括NMR、滤膜结合试验、凝胶阻滞试验、置换试验、表面胞质基因共振试验、反向双杂交试验等。可使结合本发明多肽的化合物接触Hib细菌然后监测生长抑制情况以检测其抗生素活性。本发明还提供了用这些方法鉴定的化合物。
优选地,该方法包括以下步骤:(a)使本发明的多肽接触一种或多种候选化合物以形成混合物;(b)培育该混合物以使多肽和一种或多种候选化合物相互作用;和(c)评价候选化合物是否结合该多肽或调节其活性。
一旦在体外鉴定出一种候选化合物为结合本发明多肽的化合物,然后可能需要进行进一步的试验以证实该化合物在体内抑制细菌生长和/或存活的功能。因此,该方法还包括使化合物接触Hib细菌并评价其功效的步骤。
用于该筛选方法的多肽可游离在溶液中、附着于固相载体、定位于细胞表面或定位于细胞内。优选通过直接或间接与候选化合物结合的标记来监测候选化合物与多肽的结合。该标记可以是荧光团、放射性同位素或其它可检测标记。
概述
本发明提供了计算机可读介质(如软盘、硬盘、CD-ROM、DVD等)和/或含有序列表中一个或多个序列的计算机存储器和/或计算机数据库。
所述术语“包含”涵盖“包括”及“由...组成”,如“包含”X的组合物可仅由X组成或可包括其它物质,如X+Y。
涉及数值x的术语“约”指(例如)x±10%。
所述术语“基本上”并不排除“完全地”,如“基本上不含”Y的组合物可以是完全不含Y。在需要时,术语“基本上”可从本发明的定义中省略。
序列表中氨基酸序列中的N末端残基表示为由相应核苷酸序列中的第一个密码子编码的氨基酸。当第一个密码子不是ATG时,应理解的是,当该密码子是起始密码子时它将被翻译成甲硫氨酸,而当该序列位于融合伴侣C末端时它将被翻译成所示的非-Met氨基酸。本发明尤其公开并包含了用N末端甲硫氨酸残基(例如甲酰基-甲硫氨酸残基)代替任何所指出的非-Met残基的序列表中的各氨基酸序列。
如上所述,本发明的核酸和多肽可包含序列:
(a)与序列表中所示的序列相同(即100%相同);
(b)与序列表中所示的序列具有序列相同性;
(c)与(a)或(b)的序列相比具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个单个核苷酸或氨基酸改变(缺失、插入、取代),这些改变可位于分开的位置上或者可以是连续的;和
(d)当采用成对比对算法与序列表中的特定序列进行比对时,x个单体(氨基酸或核苷酸)的移动窗口从起点(N末端或5’)移至终点(C末端或3’),因此当对p个单体进行比对时(此时p>x)就有p-x+1个这样的窗口,各窗口具有至少x·y个相同的比对单体,其中:x选自20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、150、200;y选自0.50、0.60、0.70、0.75、0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99;且如果x·y不是整数则向上取整至最接近的整数。优选的成对比对算法为Needleman-Wunsch整体比对算法[140],采用默认参数(例如,缺口开放罚分=10.0,缺口延伸罚分=0.5,采用EBLOSUM62评分矩阵)。用EMBOSS软件包中的Needle工具可以方便地实施该算法[141]。
本发明的核酸和多肽还可能在序列(a)-(d)的N端/5’和/或C端/3’处连有其它序列。
除非另有说明,本发明的实施将采用本领域技术人员能够实施的常规的化学方法、生物化学方法、分子生物学方法、免疫学方法和药理学方法。此类技术已在参考文献中得到充分阐述。见,如,参考文献142-149等。
附图简述
无附图。
实施本发明的方式
已经对Hib分离物(HK707菌株)进行了基因组测序。基因组序列示于SEQ ID NO:3707。鉴定出该基因组中总共有1853个编码序列,这些编码序列及其翻译产物都在序列表中给出。对这些多肽序列的注释在表I中给出。从测序材料中选出特别感兴趣的多肽编码序列供进一步研究,尤其关注的是供开发疫苗的免疫原性蛋白。
脂蛋白
在1853个编码序列中,以下32个被鉴定为脂蛋白:HIB0150;HIB0158;HIB0164;HIB0233;HIB0374;HIB0382;HIB0426;HIB0469;HIB0723;HIB0733;HIB0734;HIB0740;HIB0750;HIB0761;HIB0838;HIB0971;HIB0984;HIB1015;HIB1027;HIB1038;HIB1160;HIB1253;HIB1255;HIB1349;HIB1384;HIB1407;HIB1557;HIB1564;HIB1654;HIB1655;HIB1679和HIB1722。脂蛋白暴露于表面,因此它们代表了例如可用于诊断和免疫目的的可接触的免疫原性靶点。此外,已经在博氏疏螺旋体(B.burgdorferi)[150]中发现,OspA蛋白在脂质化形式时具有免疫原性,但在非脂质化形式时无免疫原性,作者总结认为,翻译后的脂质附着是决定OspA免疫原性的关键决定因素。
HIB1027和HIB1255显示与脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)的蛋白′287′和′741′类似,这两种蛋白都使用于疫苗的候选蛋白。HIB1027和HIB1255的排列对比如下(T-COFFEE版本2.08):
HIB1027    MKLNLSKFSLTILTTVMLASCGSGGGDNTQLVSPPKPAEQSKPAEQSKPA
HIB1255    MKITFTRSLLATAVMVGLTACGSGGGNG----------------------
           **:.:::*:.**::******:.
HIB1027    DQSKSVEQSILGMPERLPTNTGLAFSIKTEDEGNINTIKNEQELIATNNF
HIB1255    -MNNNTTSQVTG-------KTGAMYTVSLTNDNKIGTVTKTP--LNNSDI
             .:....:*:**:::.::.:*.*:.::..::
HIB1027    ASINVDGKNIPIDFKLEPSQGWTKEGAFIEELNLAPHICCGKYT-----D
HIB1255    NSLNLD-------------------SASTQRINEAMNKISEEFKSKTGLD
            *:*:*              .*:.:**:. ::.   *
HIB1027    VRFGAIASHSFGQDDILFYNGNPSNSVPESGEVTYKGESIMADKGNSVFG
HIB1255    VVTGA-AIVSNGEKFHIIYNGNPTETMPVQGSIHYKGSAVLGGWSADAPL
           ******:.::*****::::*.*.:***.:::.....
HIB1027    GYRKGTSEFKVNFGDKKLSGSLNVDSPKYDVESGESKFNKVKVDINADIS
HIB1255    SIEKGTSQFDVNFADSTLTGTLNV--PNFSL-----------VSISASVS
           ..****:*.***.*..*:*:****::.:*.*.*.:*
HIB1027    GNKFYGSAKSSSFVSEAVSEGKFYGDGAKELGGMVKAkDNSWVGAYGAKA
HIB1255    GNSFSGRATSPDAPDGAVVEGKFYGKDALGLSGMLKT--NTFTDNFGGAG
           **.***.*...********..**.**:*:*::..:*..
HIB1027    Q-----------
HIB1255    IFSAIDETKITQ
脂蛋白通常具有N端半胱氨酸残基,脂质共价附着于该残基。为通过细菌表达制备脂蛋白,通常需要合适的N端信号肽来指导二酰基甘油基转移酶进行脂化,然后用脂蛋白特异性(II型)SPA酶(Spase)切割。因此,本发明的脂蛋白将通常具有N端半胱氨酸,但新生蛋白质的翻译后修饰产物通常具有N端甲硫氨酸。这种脂蛋白可与脂双层结合并可用去污剂溶解。
对HIB1027序列进行加工和脂化将得到以下成熟序列(SEQ ID NO:3708):
CGSGGGDNTQLVSPPKPAEQSKPAEQSKPADQSKSVEQSILGMPERLPTNTGLAFSIKTEDEGNINTIKNEQELI
ATNNFASINVDGKNIPIDFKLEPSQGWTKEGAFIEELNLAPHICCGKYTDVRFGAIASHSFGQDDILFYNGNPSN
SVPESGEVTYKGESIMADKGNSVFGGYRKGTSEFKVNFGDKKLSGSLNVDSPKYDVESGESKFNKVKVDINADIS
GNKFYGSAKSSSFVSEAVSEGKFYGDGAKELGGMVKAKDNSWVGAYGAKAQ
对HIB 1255序列进行加工和脂化将得到以下成熟序列(SEQ ID NO:3709):
CGSGGGNGMNNNTTSQVTGKTGAMYTVSLTNDNKIGTVTKTPLNNSDINSLNLDSASTQRINEAMNKISEEFKSK
TGLDVVTGAAIVSNGEKFHIIYNGNPTETMPVQGSIHYKGSAVLGGWSADAPLSIEKGTSQFDVNFADSTLTGTL
NVPNFSLVSISASVSGNSFSGRATSPDAPDGAVVEGKFYGKDALGLSGMLKTNTFTDNFGGAGIFSAIDETKITQ
与流感嗜血杆菌Rd和不可分型的流感嗜血杆菌的基因组相比,HIB1255是位于同源序列hi1192和hi1193之间的插入片段的一部分。该2.3kb的插入片段含有三个编码序列,且其GC含量为32.4%。
它们与脑膜炎奈瑟球菌(N.meningitidis)疫苗抗原的类似性以及在非致病菌株中不存在说明,HIB1027和HIB1255是有用的Hib免疫原。
内膜和外膜
由于流感嗜血杆菌是一种革兰氏阴性菌,因此其细胞壁包括外膜。在1853个编码序列中,以下17个序列被鉴定为位于该外膜中:HIB0124;HIB0374;HIB0382;HIB0394;HIB0426;HIB0733;HIB0734;HIB0965;HIB0966;HIB1224;HIB1561;HIB1564;HIB1566;HIB1654;HIB1665;HIB1679;和HIB1835。外膜蛋白(OMP)是暴露于表面的,因此它们代表了例如可用于诊断和免疫目的的可接触的免疫原性靶点。OMP通常是侵袭素、粘附素等,如果其被阻断将能预防细菌感染。
由于流感嗜血杆菌是一种革兰氏阴性菌,因此它还具有内膜。在1853个编码序列环中,以下一对序列被鉴定为位于内膜中:HIB 1055;HIB1086。内膜蛋白是有用的免疫学靶点,例如可用于诊断和免疫目的。
周质
由于流感嗜血杆菌是一种革兰氏阴性菌,因此在其细胞胞质膜和其外膜之间具有周质。在1853个编码序列中,以下16个序列被鉴定为位于周质中:HIB0089;HIB0288;HIB0338;HIB0341;HIB0525;HIB0999;HIB1088;HIB1141;HIB1172;HIB1185;HIB1238;HIB1334;HIB1576;HIB1583;HIB1709;和HIB1761。周质蛋白是有用的免疫学靶点,例如可用于诊断和免疫目的。
应该理解,本发明仅通过实施例的方式进行描述,可以在本发明的范围和精神内进行改变。
表I-注释
  HIB   注释
  0001   甘油醛-3-磷酸脱氢酶,C-末端结构域
  0002   FadD(LACS)[6.2.1.3]
  0003   蛋白质
  0004   预测的金属依赖性水解酶
  0005   甲酸脱氢酶家族辅助蛋白FdhD(fdhD)
  0006   1.2.1.2[1.2.1.2]
  0007   甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2]
  0008   甲酸脱氢酶,β亚基(FdxH)[1.2.1.2]
  0009   甲酸脱氢酶,γ亚基[1.2.1.2]
  0010   甲酸脱氢酶辅助蛋白FdhE(fdhE)
  0011   核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶(riml)[2.3.1.128]
  0012   DNA聚合酶III,ψ亚基(holD)[2.7.7.7]
  0013   核糖体RNA小亚基甲基转移酶C(rRNA(鸟嘌呤-N(2)-)-甲基转移酶)(16S rRNA m2G1207甲基转移酶)(AE005668)[2.1.1.52]
  0014   GTP-结合蛋白Era(era)
  0015   核糖核酸酶III(rnc)[3.1.26.3]
  0016   信号肽酶I(SPase I)[前导肽酶I](lepB)[3.4.21.89]
  0017   GTP-结合蛋白LepA(lepA)
  0018   蛋白(pf1)[2.3.1.54]
  0019   尿嘧啶-DNA糖基化酶(ung)[3.2.2.-]
  0020   tRNA-i(6)A37硫转移酶MiaB(miaB)
  0021   2-酮戊二酸/苹果酸转运蛋白(SODiT1)
  0022   2.7.7.61(citG)[2.7.7.61]
  0023   柠檬酸裂合酶,α亚基(citF)[2.8.3.10]
  0024   柠檬酸裂合酶,β亚基(citE)[4.1.3.6]
  0028   柠檬酸裂合酶酰基载体蛋白(citD)
  0026   柠檬酸裂合酶连接酶(citC)[6.2.1.22]
  0027   硫辛酸合成酶(lipA)
  0028   硫辛酸-蛋白连接酶B(lipB)
  0029   UPF0250蛋白
  0030   青霉素结合蛋白5前体(D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶片段A)(DD肽酶)(DD羧肽酶)(PBP-5)(dacA)[3.4.16.4]
  0031   RlpA样蛋白前体(rlpA)
  0032   杆菌形状决定蛋白RodA(rodA)
  0033   青霉素-结合蛋白2(PBP-2)(pbp2)
  0034   保守性假拟蛋白TIGR00246
  0035   iojap-相关蛋白
  0036   假拟膜蛋白
  0037   ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
  0038   杆菌形状决定蛋白(mreB)
  0039   杆菌形状决定蛋白MreC(mreC)
  0040   杆菌形状决定蛋白MreD(mreD)
  0041   保守性假拟蛋白TIGR01619
  0042   外切脱氧核糖核酸酶III(xth)[3.1.11.2]
  0043   假尿苷合酶Rlu家族蛋白,TIGR01621
  0044   保守性假拟蛋白TIGRO162O
  0045   完整的膜蛋白
  0046   保守性假拟蛋白YtfJ-家族,TIGR01626
  0047   PhnA蛋白同源物(phnA)
  0048   IS103orf(orfB)
  0049   推定的谷氨酸-半胱氨酸连接酶/推定的氨基酸连接酶
  0050   膜蛋白,TerC家族
  0051   切除核酸酶ABC,C亚基(uvrC)
  0052   3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸胞苷酰转移酶(kdsB)[2.7.7.38]
  0053   四酰基二糖4′-激酶(lpxK)[2.7.1.130]
  0054   脂质A输出ATP结合性通透酶蛋白MsbA(msbA)
  0055   DNA内化相关感受态蛋白ComEC/Rec2DNA
  0056   DnaK抑制蛋白同源物(dksA)
  0057   PcnB(pcnB)[2.7.7.19]
  0058   2-氨基-4-羟基-6-羟甲基二氢蝶啶焦磷酸激酶(folK)[2.7.6.3]
  0059   保守性假拟蛋白TIGR00150
  0060   N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶[3.5.1.28]
  0061   DNA错配修复蛋白mutL(mutL)
  0062   tRNAδ(2)-异戊烯基焦磷酸转移酶(miaA)[2.5.1.8]
  0063   谷氨酸-氨-连接酶腺苷酰基转移酶(谷氨酰胺-合成酶腺苷酰基转移酶)(ATASE)(glnE)[2.7.7.42]
  0064   DNA修复蛋白RecN(recN)
  0065   预测的激酶[2.7.123]
  0066   热休克蛋白B25.3同源物(grpE)
  0067   核苷酸转移酶结构域蛋白
  0068   核苷酸转移酶底物结合蛋白,HI0074家族亚家族
  0069   厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶(nrdD)[1.17.4.2]
  0070   酰基-CoA硫酯酶H(tesB)[3.1.2.-]
  0071   半胱胺酰-tRNA合成酶(cysS)[6.1.1.16]
  0072   肽酰-脯氨酰顺-反异构酶B(PPI酶B)(旋转异构酶)(ppiB)[5.2.1.8]
  0073   Mg-依赖性DNA酶[3.1.21.-]
  0074   5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-高半胱氨酸甲基转移酶(甲硫氨酸合酶,维生素-B12依赖性同工酶)(钴胺素-依赖性甲硫氨酸合酶)
  0075   硫氧还蛋白(trx)
  0076   2-羟酸脱氢酶同源物(IdhA)[1.1.1.-]
  0077   胱硫醚γ-裂合酶同源物(metB)[2.5.1.48]
  0078   苏氨酸合酶(thrC)[4.2.3.1]
  0079   高丝氨酸激酶(thrB)[2.7.1.39]
  0080   双功能天冬氨酸激酶/高丝氨酸脱氢酶(AK-HD)[包括:天冬氨酸激酶;高丝氨酸脱氢酶(EC1.1.1.3)][2.7.2.4]
  0081   保守性假拟蛋白TIGR00044
  0082   甘油酸激酶[2.7.1.31]
  0083   H+/葡糖酸同向转运蛋白(symporter)(gntP)
  0084   糖二酸利用调节物
  0085   4-羟基丁酸脱氢酶(gntP)[1.1.1.61]
  0086   假拟HTH-型转录调节物(gIpR)
  0087   甲基转移酶
  0088   保守性假拟蛋白
  0089   铁-利用周质蛋白前体(主要的铁离子结合蛋白)(铁-调节的40kDa蛋白)(MIRP)(Fe(3+)-结合蛋白)(hitA)
  0090   假拟蛋白
  0091   铁ABC转运蛋白,通透酶蛋白hitB    [经验证](III)
  0092   铁利用蛋白C(hitC)[3.6.3.30]
  0093   D-丙氨酰-D-丙氨酸羧基肽酶
  0094   琥珀酰-二氨基庚二酸脱琥珀酰酶(dapE)[3.5.1.18]
  0095   蛋白质[1.-.-.-]
  0096   热休克蛋白htpG(htpG)
  0097   保守性假拟蛋白T1GR00486
  0098   信号识别颗粒蛋白(ffh)
  0099   类似于[SwissProt登录号P37908]
  0100   未知功能的蛋白质(DUF1212)家族
  0101   蛋白yjjB
  0102   保守性假拟蛋白
  0103   丝氨酰-tRNA合成酶(serS)[6.1.1.11]
  0104   谷胱甘肽S-转移酶(bphH)[2.5.1.18]
  0105   血红素/血液结合素利用蛋白C前体(hemR)
  0106   血红素/血液结合素利用蛋白C前体(hemR)
  0107   预测的N6-腺嘌呤-特异性DNA甲基化酶
  0108   裂解胞壁质转糖基酶A(AF226403)[3.2.1.-]
  0109   HesA/MoeB/ThiF家族蛋白
  0110   高亲和摄锌系统蛋白znuA前体(AE005408)
  0111   保守性假拟蛋白
  0112   UDP-N-乙酰胞壁酸:L-丙氨酰-γ-D-谷氨酰胺酰-间-二氨基庚二酸连接酶(mpl)
  0113   胱硫醚β-裂合酶(metC)[4.4.1.8]
  0114   TsaA(tsaA)[1.6,4.-]
  0115   CDP-二酰甘油-甘油-3-磷酸3-磷脂酰转移酶(pgsA)[2.7.8.5]
  0116   无机焦磷酸酶(ppa)[3.6.1.1]
  0117   黄嘌呤/尿嘧啶通透酶家族蛋白
  0118   假拟蛋白
  0119   尿苷激酶(udk)[2.7.1.48]
  0120   脱氧胞苷三磷酸脱氨基酶(dCTP脱氨基酶)(dcd)[3.5.4.13]
  0121   保守性假拟蛋白
  0122   糖流出转运蛋白
  0123   GTP-结合蛋白engA
  0124   外膜蛋白P2前体(OMP P2)(ompP2)
  0125   N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰酶(nagA)[3.5.1.25]
  0126   葡糖胺-6-磷酸异构酶(nagB)[3.5.99.6]
  0127   N-乙酰神经氨酸裂合酶(nanA)[4.1.3.3]
  0128   转录调节物
  0129   2.7.1.60[2.7.1.60]
  0130   可能的N-乙酰甘露糖胺-6-P差向异构酶[5.1.3.9]
  0131   蛋白HI0146前体
  0132   N-乙酰神经氨酸转运蛋白小亚基
  0133   蛋白HI0148前体
  0134   保守性假拟蛋白
  0135   Hf1C蛋白(hf1C)
  0136   HflK蛋白(hflK)[3.4.-.-]
  0137   假拟4’-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶[2.7.8.-]
  0138   假拟蛋白
  0139   厌氧性C4-二羧酸转运蛋白(dcuB)
  0140   酰基载体蛋白(ACP)-相v蛋白
  0141   3-氧酰基-[酰基-载体蛋白]还原酶(3-酮酰基-酰基载体蛋白还原酶)(fabG)[1.1.1.100]
  0142   丙二酰CoA-酰基载体蛋白转酰酶(fabD)[2.3.1.39]
  0143   假拟蛋白
  0144   3-氧酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶II(B-酮酰基-ACP合酶III)(KAS III)(fabH)[2.3.1.41]
  0145   假拟蛋白
  0146   核糖体蛋白L32(rpmF)
  0147   未表征的ACR,COG1399
  0148   磷脂酰丝氨酸脱羧酶(psd)[4.1.1.65]
  0149   谷胱甘肽-二硫化物还原酶(gor)[1.8.1.7]
  0150   假拟脂蛋白HI0162前体
  0151   BoIA蛋白同源物(bolA)
  0152   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,A亚基(ngrA)[1.6.5.-]
  0153   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,B亚基(ngrB)[1.6.5.-]
  0154   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,C亚基(ngrC)[1.6,5.-]
  0155   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,D亚基(ngrD)[1.6.5.-]
  0156   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,E亚基(ngrE)[1.65.-]
  0157   NADH:泛醌氧化还原酶,Na(+)-转位,F亚基(ngrF)[1.6.5.-]
  0158   硫胺生物合成脂蛋白apbE前体
  0159   ApbE家族
  0160   tRNA(5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷酸)-甲基转移酶(trmU)[2.1.1.61]
  0161   保守性假拟蛋白TIGR00726
  0162   核糖体大亚基假尿苷合酶D(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)(sfhB)[4.2.1.70]
  0163   未知
  0164   脂蛋白,推定的
  0165   甲酸乙酰转移酶活化酶,裂合酶1-特异性(act)[1.97.1.4]
  0166   甲酸乙酰转移酶(pflB)[2.3.1.54]
  0167   甲酸转运蛋白1FocA(甲酸通道1)(甲酸)
  0168   假拟蛋白
  0169   ROK家族蛋白VC1532
  0170   钠/丙氨酸同向转运蛋白
  0171   蛋白[3.1.1.1]
  0172   醇脱氢酶(adhC)[1.1.1.1]
  0173   转录调节物,MerR家族NMB1303(可能的)
  0174   o261(YIGT)
  0175   Sec-非依赖性蛋白易位酶蛋白tatB同源物
  0176   Sec-非依赖性蛋白易位酶TatC(tatC)
  0177   NADP-特异性谷氨酸脱氢酶(NADP-GDH)(gdhA)[1.4.1.4]
  0178   铁抑制蛋白(fur)
  0179   黄素氧还蛋白
  0180   水解酶,α/β折叠家族(acoC)[3.1.-.-]
  0181   SeqA蛋白
  0182   O-琥珀酰苯甲酸-CoA连接酶(menE)[6.2.1.26]
  0183   UPF0003蛋白HI0195.1前体(aefA)
  0184   分支酸合酶(aroC)[4.2.3.5]
  0185   对青霉素不敏感的胞壁质内肽酶前体(mepA)[3.4.99.-]
  0186   预测的通透酶(orf9)
  0187   脂质A生物合成(KDO)2-(月桂酰)-脂质A酰基转移酶(msbB)[2.3.1.-]
  0188   硒化物,水二激酶(selD)[2.7.9.3]
  0189   核糖体蛋白L19(rplS)
  0190   tRNA(鸟嘌呤-N1)-甲基转移酶(trmD)[2.1.1.31]
  0191   16S rRNA加工蛋白rimM
  0192   核糖体蛋白S16(rpsP)
  0193   蛋白HI0205前体
  0194   NAD焦磷酸酶/5’-核苷酸酶NadN(nadN)
  0195   莽草酸激酶(aroK)[2.7.1.71]
  0196   3-脱氢奎尼酸合酶(aroB)[4.2.3.4]
  0197   DNA腺嘌呤甲基化酶(脱氧腺苷-甲基转移酶)(DNA腺嘌呤甲基转移酶)(M.HindIV)(dam)[2.1.1.72]
  0198   磷脂酰甘油磷酸酶B(pgpB)[3.1.3.27]
  0199   GTP环式水解酶(ribA)[3.5.4.25]
  0200   假拟结合蛋白HI0213前体(AA1)
  0201   未知功能的蛋白质(DUF454)家族
  0202   寡肽酶A(prlC)[3.4.24.70]
  0203   I型限制性-修饰系统,M亚基(hsdM)[2.1.1.72]
  0204   HP790-样蛋白(hsdS)[3.1.21.3]
  0205   反密码子核酸酶NMB0832
  0206   DNA-结合蛋白(部分)
  0207   I型位点-特异性脱氧核糖核酸酶HsdR(hsdR)[3.1.21.3]
  0208   膜蛋白ykgB
  0209   假拟蛋白
  0210   需氧呼吸控制传感蛋白[2.7.3.-]
  0211   尿嘧啶-DNA糖基化酶
  0212   BirA双功能蛋白[包括:生物素操纵子阻抑物;生物素-[乙酰-CoA-羧化酶]合成酶(生物素-蛋白连接酶)](birA)[6.3.4.15]
  0213   肌苷-5’-单磷酸脱氢酶(guaB)[1.1.1.205]
  0214   假拟蛋白
  0215   GMP合酶[谷氨酰胺-水解](谷氨酰胺酰氨基转移酶)(GMP合成酶)(guaA)[6.3.5.2]
  0216   rarD蛋白(rarD)
  0217   AsnC-家族转录调节物
  0218   Na+/H+反向转运蛋白NhaA(nhaA)
  0219   支链氨基酸转运系统II载体蛋白(brnQ)
  0220   谷胱甘肽亚精胺合酶(orfa)[6.3.1.8]
  0221   假拟胞质蛋白
  0222   保守性假拟蛋白
  0223   蛋白HI0246前体
  0224   S-腺苷甲硫氨酸tRNA核糖基转移酶-异构酶(gueA)[5.-.-.-]
  0225   保守性假拟蛋白
  0226   SSB(ssb)
  0227   切除核酸酶ABC,A亚基(uvrA)
  0228   3.4.21.-(igal)[3.4.21.-]
  0229   假拟蛋白
  0230   蛋白质
  0231   保守性假拟蛋白
  0232   多核糖核苷酸核苷酸转移酶(多核苷酸磷酸化酶)(PNP酶)(pnp)[2.7.7.8]
  0233   脂蛋白nlpI同源物前体
  0234   冷激DEAD-盒蛋白A同源物(ATP-依赖性RNA解旋酶deaD同源物)(deaD)
  0235   保守性假拟蛋白
  0236   在细菌中保守的未表征的蛋白
  0237   砷酸还原酶(arsC)[1.20.4.1]
  0238   PerM(perM)
  0239   蛋白-输出膜蛋白secF(secF)
  0240   蛋白-输出膜蛋白secD(secD)
  0241   前蛋白易位酶,YajC亚基(yajC)
  0242   未表征的蛋白家族UPF0033超家族
  0243   未知功能结构域蛋白的结构域
  0244   queuine(Q嘌呤)tRNA-核糖基转移酶(tgt)[2.4.2.29]
  0245   保守性假拟蛋白
  0246   保守性假拟蛋白
  0247   TonB蛋白(tonB)
  0248   生物聚合物转运exbD蛋白(exbD)
  0249   生物聚合物转运exbB蛋白(exbB)
  0250   细菌铁蛋白共迁移(comigratory)蛋白同源物(bcp)
  0251   二氢二吡啶甲酸合酶(dapA)[4.2.1.52]
  0252   蛋白
  0253   核糖体亚基界面蛋白(yfiA)
  0254   糖基转移酶(葡糖基)[2.4.1.44]
  0255   非正规的嘌呤NTP焦磷酸酶,rdgB/HAM1家族(rdgB)
  0256   KDO激酶[2.7.1.-]
  0257   OpsX[2.-.-.-]
  0258   血红素/血液结合素利用蛋白C前体(hemR)
  0259   血红素-血液结合素利用蛋白B(hxuB)
  0260   血红素/血液结合素-结合蛋白前体(血红素:血液结合素利用蛋白A)(hxuA)
  0261   血红素-血液结合素利用蛋白A(hxuA)
  0262   二氢新蝶呤醛缩酶(folB)[4.1.2.25]
  0263   保守性假拟蛋白TIGR00023
  0264   传感蛋白narQ同源物(narQ)[2.7.3.-]
  265   UDP-N-乙酰烯醇式丙酮酰葡糖胺还原酶(murB)[1.1.1.158]
  0266   RNA聚合酶σ-32因子(rpoH)[2.7.7.6]
  267   tRNA-二氢尿苷合酶C[1.--.-]
  268   DnaJ-样蛋白djlA(orf81)
  0269   乳清酸磷酸核糖基转移酶(pyrE)[2.4.2.10]
  270   核糖核酸酶PH(rph)[2.7.7.56]
  0271   谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(gltX)[6.1.1.17]
  0272   保守性假拟蛋白
  273   核糖核酸酶BN,推定的[3.1.-.-]
  0274   SEC-C基序结构域蛋白
  275   MOSC结构域蛋白
  0276   假拟蛋白
  0277   尿苷磷酸化酶(udp)[2.4.2.3]
  0278   跨膜转运蛋白
  0279   预测的水解酶或酰基转移酶[3.1.-.-]
  0280   2-琥珀酰-6-羟基-2,4-环己二烯-1-羧酸合酶/2-酮戊二酸脱羧酶(menD)[4.1.1.71]
  0281   维生素K2(Menaquinone)-特异性异分支酸合酶(异分支酸变位酶)(menF)[5.4.4.2]
  0282   保守性假拟蛋白
  0283   天冬氨酸转氨酶(ASPAT)[2.6.1.-]
  0284   色氨酸-特异件转运蛋白(色氨酸通透酶)(mtr)
  0285   L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17]
  0286   丝氨酸转运蛋白(sdaC)
  0287   铜-转位P-型ATP酶[3.6.3.4]
  0288   周质汞离子结合蛋白(merP)
  0289   重金属转运P-型ATP酶CAC3655(merP)
  0290   重金属转运P-型ATP酶CAC3655(merP)
  0291   重金属转运CPx-型ATP酶(merP)
  0292   Cu(I)-反应性转录调节物(cueR)
  0293   Met Apo-阻抑物,MetJ
  0294   转录终止因子Rho(rho)
  0295   PilD(hopD)[3.4.23.43]
  0296   蛋白转运蛋白hofC同源物(pilC)
  0297   蛋白转运蛋白hofB同源物(pilB)
  0298   前菌毛素肽酶依赖性蛋白D同源物前体(PilE)
  0299   AmpD蛋白同源物(ampD)
  0300   镁和钴流出蛋白corC(tlyC)
  0301   载脂蛋白N-酰基转移酶(ALPN-酰基转移酶)(铜内稳态蛋白cutE同源物)(cutE)[2.3.1.-]
  0302   保守性假拟蛋白TIGR00046
  0303   未表征的ACR,COG1678
  0304   保守性假拟蛋白TIGR00250
  0305   重组相关蛋白rdgC
  0306   吡咯啉-5-羧酸还原酶(proC)[1.5.1.2]
  0307   MFS转运蛋白
  0308   酪氨酸重组酶XerD(xerD)
  0309   保守性假拟蛋白
  0310   Holliday连接DNA解旋酶RuvB(ruvB)
  0311   Holliday连接DNA解旋酶RuvA(ruvA)
  0312   交叉连接内切脱氧核糖核酸酶RuvC(ruvC)[3.1.22.4]
  0313   保守性假拟蛋白TIGR01033
  0314   dATP焦磷酸水解酶(ntpA)[3.6.1.-]
  0315   天冬氨酰基-tRNA合成酶(aspS)[6.1.1.12]
  0316   HI0318同源物
  0317   甲基转移酶,推定的
  0318   乳酰谷胱甘肽裂合酶(gloA)[4.4.1.5]
  0319   核糖核酸酶T(rnt)[3.1.13.-]
  0320   预测的通透酶
  0321   保守性假拟蛋白
  0322   翻译延伸因子P(efp)
  0323   赖氨酸2;3-氨基变位酶
  0324   不透明相关蛋白oapA(oapA)
  0325   OapB(oapB)
  0326   DNA修复蛋白RecO(recO)
  0327   23S rRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumA(rumA)[2.1.1.-]
  0328   GTP焦磷酸激酶(ATP:GTP 3’-焦磷酸转移酶)(ppGpp合成酶I)((P)ppGpp合成酶)(relA)[2.7.6.5]
  0329   二乙酰甘油激酶(DAGK)(甘油二酯激酶)(DGK)(dgkA)[2.7.1.107]
  0330   钼蛋白(Molybdopterin)生物合成mog蛋白(mog)
  0331   氮调节蛋白P-II
  0332   未知功能的结构域,推定的
  0333   引发体蛋白N’(复制因子Y)(priA)
  0334   tRNA(鸟嘌呤-N(7)-)-甲基转移酶(tRNA(m7G46)-甲基转移酶)[2.1.1.33]
  0335   蛋白
  0336   铁氧还蛋白-型蛋白NapF(napF)
  0337   NapD蛋白(napD)
  0338   周质硝酸还原酶,大亚基(napA)[1.7.99.4]
  0339   铁氧还蛋白-型蛋白napG同源物(napG)
  0340   铁氧还蛋白-型蛋白napH同源物(napH)
  0341   周质硝酸还原酶,二血红素细胞色素c亚基(napB)
  0342   细胞色素c-型蛋白napC(napC)
  0343   腺苷酸激酶(adk)[2.7.4.3]
  0344   未命名的蛋白质产物;ORF3(ampG1)
  0345   UDP-葡萄糖4-差向异构酶(galE)[5.1.3.2]
  0346   未命名的蛋白质产物;ORF1
  0347   ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
  0348   ABC转运蛋白通透酶蛋白(通透酶)
  0349   硫胺生物合成相关蛋白(nmtl)
  0350   转录激活物tenA(侧向同源物)
  0351   YfeD(螯合的)
  0352   YfeC(螯合的)
  0353   YfeB(螯合的)
  0354   YfeA(螯合的)
  0355   假拟蛋白
  0356   青霉素-结合蛋白7同源物前体(PBP-7)(D-丙氨酰-D-丙氨酸-内肽酶)(DD-内肽酶)[3.4.99.-]
  0357   假拟蛋白
  0358   自由基SAM酶,Cfr家族
  0359   可能的菌毛生源和颤搐运动蛋白PHF同源物(Tfp)
  0360   保守性假拟蛋白
  0361   4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶(ispG)[1.17.4.3]
  0362   组氨酰-tRNA合成酶(hisS)[6.1.1.21]
  0363   蛋白
  0364   未知功能的蛋白质(DUF528)超家族
  0365   铁氧还蛋白,2Fe-2S型,ISC系统(fdx)
  0366   Fe-S蛋白装配侣伴蛋白HscA(hscA)
  0367   保守性假拟蛋白
  0368   辅-侣伴蛋白Hsc20(hscB)
  0369   铁-硫簇装配蛋白IscA(iscA)
  0370   FeS簇装配支架IscU(iscU)
  0371   半胱氨酸脱硫酶IscS(iscS)[4.4.1.-]
  0372   铁-硫簇装配转录因子IscR(iscR)
  0373   RNA甲基转移酶,TrmH家族,组I
  0374   外膜蛋白P6前体(OMP P6)(15kDa肽聚糖-相关脂蛋白)(PC蛋白)(pal)
  0375   TolB蛋白前体(tolB)
  0376   TolA蛋白(tolA)
  0377   TolR蛋白(tolR)
  0378   TolQ蛋白(tolQ)
  0379   YbgC蛋白
  0380   Dnt(dinG)
  0381   金属依赖性蛋白酶的灭活同源物(M22)[3.4.-.-]
  0382   饥饿-可诱导的外膜脂蛋白
  0383   长链脂肪酸-CoA连接酶(长链酰基-CoA合成酶)(fadD)[6.2.1.3]
  0384   核糖核酸酶D(md)[3.1.26.3]
  0385   O-抗原乙酰基转移酶XF0778(LPS)
  0386   GTP-结合蛋白YchF(ychF)
  0387   肽酰-tRNA水解酶(pth)[3.1.129]
  0388   蛋白
  0389   蛋白
  0390   外切脱氧核糖核酸酶VII,大亚基(xseA)[3.1.11.6]
  0391   保守性假拟蛋白TIGR00052
  0392   Icc蛋白同源物(icc)[3.1.4.17]
  0393   C4-二羧酸转运蛋白同源物b2343
  0394   外膜蛋白P1前体(OMP P1)(fadL)
  0395   甲基化的DNA-蛋白-半胱氨酸甲基转移酶(6-O-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶)(O-6-甲基鸟嘌呤-DNA-烷基转移酶)(datl)[2.1.1.63]
  0396   DNA错配修复蛋白mutH(mutH)
  0397   MesJ(mesJ)
  0398   吡哆醛激酶[2.7.1.35]
  0399   乙酰-CoA羧化酶,羧基1转移酶,α亚基(accA)[6.4.1.2]
  0400   高亲和摄锌系统膜蛋白znuB(PA5501)
  0401   高亲和摄锌系统ATP-结合蛋白znuC(afuC)
  0402   假拟蛋白
  0403   膜蛋白ECs2566[类似][3.424.-]
  0404   转录调控蛋白tyrR同源物(tyrR)
  0405   宿主因子I(hfg)
  0406   核糖体大亚基假尿苷合酶C(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)(orfx)[4.2.1.70]
  0407   核糖核酸酶E(rne)[3.1.4.-]
  0408   Opa蛋白
  0409   羟乙基噻唑激酶(thiM)[2.7.1.50]
  0410   磷酸甲基嘧啶激酶(thiD)[2.7.4.7]
  0411   硫胺-磷酸焦磷酸化酶(thiE)[2.5.1.3]
  0412   主要易化家族转运蛋白(AE005578)
  0413   假拟蛋白
  0414   胶原酶(prtC)[3.4.-.-]
  0415   ATP-依赖性RNA解旋酶srmB同源物(srmB)
  0416   预测的O-甲基转移酶(假拟)
  0417   YfiF蛋白(片段)[2.1.1.-]
  0418   CDP-二酰基甘油-丝氨酸O-磷脂酰转移酶(磷脂酰丝氨酸合酶)(pssA)[2.7.8.8]
  0419   脂肪酸代谢调节蛋白(fadR)
  0420   Na+/H+反向转运蛋白NhaB(nhaB)
  0421   二硫键形成蛋白B(二硫化物氧化还原酶)(dsbB)[1.8.4.-]
  0422   葡糖胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶,异构化(gimS)[2.6.1.16]
  0423   DNA-结合蛋白HU-2(hupA)
  0424   组氨酸-tRNA连接酶(hisS)[6.1.1.21]
  0425   蛋白
  0426   饥饿-可诱导的外膜脂蛋白
  0427   长链脂肪酸-CoA连接酶(长链酰基-CoA合成酶)(fadD)[6.2.1.3]
  0428   蛋白
  0429   NADH焦磷酸酶(MutT)[3.6.1.-]
  0430   蛋白HI0433(ORFG)
  0431   感受态蛋白F(DNA转化蛋白comF)(蛋白COM101A)(comF)
  0432   感受态蛋白E前体(DNA转化蛋白comE)(comE)
  0433   假拟蛋白
  0434   感受态蛋白D(DNA转化蛋白comD)(comD)
  0435   感受态蛋白C(DNA转化蛋白comC)(comC)
  0436   感受态蛋白B(DNA转化蛋白comB)(comB)
  0437   感受态蛋白A(DNA转化蛋白comA)(comA)
  0438   青霉素-结合蛋白1A(ponA)[2.4.2.-]
  0439   蛋白HI0441(ORFJ)
  0440   假拟蛋白
  0441   保守性假拟蛋白TIGR00103
  0442   重组蛋白RecR(recR)
  0443   DNA拓扑异构酶III(topB)[5.99.1.2]
  0444   蛋白-输出膜蛋白secG(secG)
  0445   CP4-57整合酶样蛋白
  0446   噬菌体φ-R73引发酶样蛋白[2.7.7.-]
  0447   保守性假拟蛋白
  0448   保守性假拟蛋白
  0449   假拟蛋白
  0450   假拟蛋白
  0451   保守性假拟蛋白
  0452   保守性假拟蛋白
  0453   保守性假拟蛋白
  0454   噬菌体-相关蛋白
  0455   保守性假拟蛋白
  0456   假拟蛋白
  0457   保守性假拟蛋白
  0458   噬菌体末端酶,大亚基,推定的
  0459   噬菌体末端酶,小亚基,推定的,P27家族
  0460   噬菌体φ-105穴蛋白样蛋白
  0461   噬菌体QLRG家族,推定的DNA包装
  0462   噬菌体头-尾衔接子,推定的
  0463   噬菌体门蛋白,HK97家族
  0464   Caudo病毒(caudovirus)前头蛋白酶
  0465   噬菌体主要衣壳蛋白,HK97家族
  0466   PIS系统,果糖-特异性IIBC组件(EIIBC-Fru)(果糖-通透酶IIBC组件)(磷酸转移酶II,BC组件)(EC 2.7.1.69)(EH-Fru)(fruA)[2.7.1.69]
  0467   1-磷酸果糖激酶(果糖1-磷酸激酶)(fruK)[2.7.1.56]
  0468   PTS系统,果糖-特异性IIA/FPr组件(EIIA-Fru)(果糖-通透酶IIA/Pr组件)(磷酸转移酶II,A/FP组件)(磷酸转移酶FPr蛋白)(假-HPr)(EIII-Fru)(果糖PTS二磷酰基转移蛋白)(P17127)[2.7.1.69]
  0469   脂蛋白,推定的
  0470   毒性-相关蛋白D(vapD)
  0471   毒性-相关蛋白D(vapD)
  0472   保守性假拟蛋白
  0473   CBS结构域蛋白(AF212041)
  0474   未知功能的蛋白质(DUF1523)超家族
  0475   HI0454[3.1.21.-]
  0476   DNA聚合酶III,δ亚基(holB)[2.7.7.7]
  0477   胸苷酸激酶(tmk)[2.7.4.9]
  0478   保守性假拟蛋白TIGR00247
  0479   保守性假拟蛋白TIGR00247
  0480   存活蛋白surA同源物前体(PPI酶)[5.2.1.8]
  0481   PyrR双功能蛋白[包括:嘧啶操纵子调节蛋白,尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT酶)](pyrR)[2,4.2.9]
  0482   MazG蛋白同源物(mazG)
  0483   蛋白(lapB)
  0484   ATP-依赖性蛋白酶La(Ion)[3.4.21.53]
  0485   氧-依赖性粪卟啉原III氧化酶,推定的
  0486   核糖5-磷酸异构酶A(rpiA)[5.3.1.6[
  0487   D-3-磷酸甘油酸脱氢酶(PGDH)(serA)[1.1.1.95]
  0488   预测的氨基甲基转移酶
  0489   保守性假拟蛋白TIGR00255
  0490   ATP磷酸核糖基转移酶(hisG)[2.4.2.17]
  0491   假拟蛋白
  0492   ATP磷酸核糖基转移酶(hisG)[2.4.2.17]
  0493   组氨醇脱氢酶(hisD)[1.1.1.23]
  0494   组氨醇-磷酸氨基转移酶(hisC)[2.6.1.9]
  0495   组氨酸生物合成双功能蛋白hisB[包括:组氨醇-磷酸酶;咪唑甘油-磷酸脱水酶(EC4.2.1.19)(IGPD)][3.1.3.15]
  0496   咪唑甘油磷酸合酶,谷氨酰胺酰氨基转移酶亚基(hisH)[2.4.2.-]
  0497   磷酸核糖基亚胺甲基-5-氨基咪唑氨甲酰核糖酸异构酶(hisA)[5.3.1.16]
  0498   咪唑甘油磷酸合酶,环化酶亚基(hisF)
  0499   组氨酸生物合成双功能蛋白hisIE[包括:磷酸核糖基-AMP环式水解酶(PRA-CH);磷酸核糖基-ATP焦磷酸酶(EC 3.6.1.31)(PRA-PH)](PRA-CH)[3.5.4.19]
  0500   酪氨酸-特异件转运蛋白1(酪氨酸通透酶1)(tyrP)
  0501   ATP合酶F1,ε亚基(atpC)[3.6.3.14]
  0502   ATP合酶F1,β亚基(atpD)[3.6.3.14]
  0503   ATP合酶F1,γ亚基(atpG)[3.6.3.14]
  0504   ATP合酶F1,α亚基(atpA)[3.6.3.14]
  0505   ATP合酶F1,δ亚基(aipH)[3.6.3.14]
  0506   ATP合酶F0,B亚基(atpF)[3.6.3.14]
  0507   ATp合酶C链(脂质-结合蛋白)(二环己基碳二亚胺-结合蛋白)(atpE)[3.6.3.14]
  0508   ATP合酶F0,A亚基(atpB)[3.6.3.14]
  0509   保守性假拟蛋白
  0510   甲基转移酶GidB(gidB)
  0511   保守性假拟蛋白
  0512   CbbY家族蛋白VCA0662
  0513   预测的膜蛋白
  0514   自诱导物-2产生蛋白LuxS(luxS)
  0515   转座酶
  0516   HAD超家族(亚家族nB)磷酸酶,TIGR01672(AphA)[3.1.3.-]
  0517   热休克蛋白(hsIV)[3,4.25.-]
  0518   热休克蛋白HsIVU,ATP酶亚基HsIU(hsIU)
  0519   亚精胺/腐胺-结合蛋白2前体(potD)
  0520   OrdL[1.-.-.-]
  0521   DNA重组蛋白rmuC同源物(YIGN)
  0522   高亲和性核糖转运蛋白rbsD(rbsD)
  0523   核糖转运ATP-结合蛋白rbsA(rbsA)
  0524   核糖转运系统通透酶蛋白rbsC(rbsC)
  0525   D-核糖-结合周质蛋白前体(rbsB)
  0526   核糖激酶(rbsK)[2.7.1.15]
  0527   rbs阻抑物类似物(rbsR)
  0528   保守性假拟蛋白TIGR00645
  0529   未知功能的蛋白质,TIGR01935
  0530   1,4-二羟基-2-萘甲酸八异戊二烯基转移酶(menA)[2.5.-.-]
  0531   蛋白rcsF(orf3)
  0532   亚碲酸抗性蛋白tehA同源物(tehA)
  0533   DNA-指导的RNA聚合酶β’链(RNAP β’亚基)(转录酶β’链)(RNA聚合酶β’亚基)(rpoC)[2.7.7.6]
  0534   DNA-指导的RNA聚合酶,β亚基(rpoB)[2.7.7.6]
  0535   核糖体蛋白L1(rplA)
  0536   核糖体蛋白L11(rplK)
  0537   嘌呤核苷磷酸化酶(deoD)[2.4.2.1]
  0538   NupC家族蛋白VC2352
  0539   NupC家族蛋白VC2352(nupC)
  0540   丙酮酸-甲酸裂合酶-活化酶
  0541   蛋白
  0542   ADP-庚糖-脂多糖庚糖基转移酶III(RFAF)
  0543   未表征的BCR,YitT家族COG1284亚家族,推定的
  0544   果糖-bis磷酸醛缩酶,II类(fbaA)[4.1.2.13]
  0545   磷酸甘油酸激酶(pgk)[2.7.2.3]
  0646   未命名的蛋白质产物;与核糖核酸酶有一些类似
  0547   铁氧还蛋白(fdx)
  0548   酪氨酸-特异性转运蛋白2(酪氨酸通透酶2)(tyrP)
  0549   胸苷激酶
  0550   Gcp(gcp)[3.4.24.57]
  0551   核糖体蛋白S21(rpsU)
  0552   DNA引发酶(dnaG)[2.7.7.-]
  0553   RNA聚合酶σ因子rpoD(σ-70)(rpoD)
  0554   天冬氨酸氨-裂合酶(aspA)[4.3.1,1]
  0555   脲酶辅助蛋白ureH(ureH)
  0556   脲酶辅助蛋白UreG(ureG)
  0557   脲酶辅助蛋白ureF(ureF)
  0558.   脲酶辅助蛋白ureE(ureE)
  0559   脲酶,α亚基(ureC)[3.5.1.5]
  0560   脲酶,β亚基(ureB)[3.5.1.5]
  0561   脲酶,γ亚基(ureA)[3.5.1.5]
  0562   侣伴蛋白,10kDa(groES)
  0563   60kDa侣伴蛋白(蛋白Cpn60)(groEL蛋白)(groEL)
  0564   核糖体蛋白L9(rpII)
  0565   核糖体蛋白S18(rpsR)
  0566   单链结合蛋白家族
  0567   30S核糖体蛋白(rpS6)
  0568   翻译起始因子IF-1(infA)
  0569   脂多糖生物合成蛋白lic2B[2.-.-.-]
  0570   LgtG
  0571   二甲基腺苷转移酶(ksgA)[2.1.1.-]
  0572   脂多糖核心[2.-.-.-]
  0573   双(5′-核酸基)-四磷酸酯酶(对称)[3.6.1.41]
  0574   保守性假拟蛋白
  0575   6-磷酸葡糖酸脱氢酶,脱羧化(gnd)[1.1.1.44]
  0576   保守性假拟蛋白
  0577   假拟蛋白
  0578   完整的膜蛋白
  0579   6-磷酸葡糖酸内酯酶(pgl)[3.1.1.31]
  0580   葡萄糖-6-磷酸1-脱氢酶(zwf)[1.1.1.49]
  0581   3(2’),5’-双磷酸核苷酸酶(cysQ)[3.1.3.7]
  0582   保守性假拟蛋白
  0583   寡肽转运蛋白,OPT家族
  0584   热休克蛋白15同源物(HSP15)(HSP15)
  0585   调节蛋白asnC(asnC)
  0586   天冬氨酸-氨连接酶(asnA)[6.3.1.1]
  0587   磷酸乙醇酸磷酸酶,细菌(gph)[3.1.3.18]
  0588   核酮糖-磷酸3-差向异构酶(rpe)[5.1.3.1]
  0589   DNA促旋酶,B亚基(gyrB)[5.99.1.3]
  0590   假拟蛋白
  0591   转录辅助蛋白tex同源物(tex)
  0592   转录延伸因子GreB(greB)
  0593   可能的tetR家族转录调节物
  0594   过氧化氢-可诱导的基因激活物(oxyR)
  0595   蛋白[1.11.1.-]
  0596   蛋白slyX同源物-相关蛋白
  0597   SlyD(fkpA)[5.2.1.8]
  0598   在细菌中保守的未表征的蛋白
  0599   未表征的硫氧化蛋白dsrE
  0600   DsrF家族蛋白
  0601   保守性假拟蛋白
  0602   翻译延伸因子Tu(tuf)
  0603   翻译延伸因子G(fusA)
  0604   核糖体蛋白S7(rpsG)
  0605   核糖体蛋白S12(rpsL)
  0606   葡萄糖-抑制的分裂蛋白A(gidA)
  0607   2’,3’-环-核苷酸2’-磷酸二酯酶(cpdB)[3.1.4.16]
  0608   氨基苯甲酰-谷氨酸利用蛋白A同源物[3.5.-.-]
  0609   c4-二羧酸厌氧性载体家族蛋白亚家族
  0610   肽酶E同源物(pepE)[3.4.13.21]
  0611   σ(E)的正调节物,RseC/MucC超家族
  0612   腐胺-鸟氨酸反向转运蛋白(腐胺转运蛋白)(potE)
  0613   鸟氨酸脱羧酶(speF)[4.1.1.171
  0614   转录调节物azlB(lrp)
  0615   转运蛋白
  0616   氨基甲酸激酶(arcC)[2.7.2.2]
  0617   鸟氨酸氨甲酰基转移酶(argF)[2.1.3.3]
  0618   预测的水解酶(YIGL)
  0619   crcB蛋白(crcB)
  0620   调节蛋白RecX(recX)
  0621   recA蛋白(recA)
  0622   TfoX(tfoX)
  0623   翻译延伸因子Tu(tuf)
  0624   PsiE蛋白同源物
  0625   hemY蛋白(hemY)
  0626   蛋白(hemX)[2.1.1.107]
  0627   腺苷酸环化酶,I类(cyaA)[4.6.1.1]
  0628   甘油-3-磷酸脱氢酶[NAD(P)+](NAD(P)H-依赖性甘油-3-磷酸脱氢酶)(gpsA)[1.1.1.94]
  0629   丝氨酸乙酰转移酶(SAT)(cysE)[2.3.1.30]
  0630   莽草酸5-脱氢酶/奎尼酸5-脱氢酶家族蛋白(aroe)[1.1.1.25]
  0631   未命名的蛋白质产物;类似于钠:硫酸同向转运蛋白-家族蛋白(huNaDC)
  0632   亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP)/次甲基四氢叶酸环式水解酶(EC 3.5.4.9)(folD)[1.5.1.5]
  0633   L-岩藻糖通透酶(fucP)
  0634   L-墨角藻糖磷酸醛缩酶(fucA)[4.1.2.17]
  0635   岩藻糖操纵子fucU蛋白(fucU)
  0636   L-墨角藻糖激酶(L-墨角藻糖激酶)(fucK)[2.7.1.51]
  0637   L-岩藻糖异构酶(fucl)[5.3.1.25]
  0638   L-岩藻糖操纵子激活物(fucR)
  0639   RNA聚合酶相关蛋白rapA(ATP-依赖性解旋酶hepA)(hepA)[3.6.1.-]
  0640   核糖体大亚基假尿苷合酶A(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)[4.2.1.70]
  0641   蛋白glpG同源物[3.4.21.-]
  0642   甘油-3-磷酸调节子抑制(glpR)
  0643   283kDa膜蛋白(hlpA)
  0644   D-甲硫氨酸转运系统通透酶蛋白MeU(膜)
  0645   D-甲硫氨酸转运ATP-结合蛋白MetN(atp_结合)
  0646   组氨醇磷酸酶
  0647   肽脱甲基酶(def)[3.5.1.88]
  0648   甲硫氨酰基-tRNA甲酰基转移酶(fmt)[2.1.2.9]
  0649   sun蛋白(sun)[2.1.1.-]
  0650   Trk系统摄钾蛋白trkA(K(+)-摄取蛋白trkA)(trkA)
  0651   大电导率机械敏感性通道蛋白(mscL)
  0652   未表征的保守性蛋白
  0653   RNA聚合酶σ-E因子(σ-24)(rpoE)
  0654   σ-E因子负调节蛋白同源物(mclA)
  0655   σ-E因子调节蛋白rseB同源物前体(rseB)
  0656   泛酸激酶(coaA)[2.7.1.33]
  0657   翻译延伸因子EF-Tu(tufB)
  0658   翻译延伸因子EF-Tu(tufB)
  0669   翻译延伸因子EF-Tu(tufB)
  0660   保守性假拟蛋白
  0661   假拟蛋白
  0662   保守性假拟蛋白
  0663   tRNA-二氢尿苷合酶A[1.-.-.-]
  0664   C4-二羧酸转运蛋白同源物b2343
  0665   色氨酰-tRNA合成酶(trpS)[6.1.1.2]
  0666   在细菌中保守的未表征的蛋白
  0667   腺苷酸琥珀酸裂合酶(purB)[4.3.2.2]
  0668   核糖体蛋白(rpL10)
  0669   核糖体蛋白L7/L12(rplL)
  0670   UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(glmU)[2.7.7.23]
  0671   保守性假拟蛋白
  0672   PldB(pldB)[3.1.1.5]
  0673   天冬氨酸-半醛脱氢酶(asd)[1.2.1.11]
  0674   膜蛋白,MgtC/SapB家族
  0675   Fe-S氧化还原酶[1.8.-.-]
  0676   药物活性调节物B(mdaB)[1.6.99.-]
  0677   ATP-依赖性DNA解旋酶Rep(rep)[3.6.1.-]
  0678   未知功能的蛋白质(DUF1375)超家族
  0679   泛酰巯基乙胺-磷酸腺苷酰基转移酶(coaD)[2.7.7.3]
  0680   3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸转移酶(KDO转移酶)(kdtA)[2.-.-.-]
  0681   UDP-葡萄糖-脂多糖β1-4葡糖基转移酶[2.-.-.-]
  0682   DNA-3-甲基腺嘌呤糖基化酶(3-甲基腺嘌呤-DNA糖苷酶)(TAG)(tagl)[3.2.2.20]
  0683   假拟蛋白
  0684   莽草酸5-脱氢酶(aroE)[1.1.1.25]
  0665   蛋白(SUA5)
  0686   DNA拓扑异构酶(topA)[5.99.1.2]
  0687   具有复制的ATP酶结构域的ABC转运蛋白的ATP酶组件
  0688   预测的转录调节物
  0689   保守性假拟蛋白
  0690   血红蛋白和血红蛋白-结合珠蛋白结合蛋白B前体
  0691   CydD(cydD)
  0692   ABC转运蛋白,ATP-结合/通透酶蛋白
  0693   保守性假拟蛋白
  0694   保守性假拟蛋白
  0695   保守性假拟蛋白
  0696   假拟HTH-型转录调节物HI0666.1
  0697   果糖-1,6-双磷酸酶,II类(glpX)[3.1.3.11]
  0698   在细菌中保守的未表征的蛋白
  0699   蛋白mioC同源物(mioC)[1.8.1.2]
  0700   D-酪氨酰-tRNA(Tyr)脱酰基酶(dtd)[3.1.-.-]
  0701   2C-甲基-D-赤藓醇2,4-环二磷酸合酶(ispF)[4.6.1.12]
  0702   2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸胞苷酰转移酶(ispD)[2.7.7.60]
  0703   细胞分裂蛋白ftsB同源物
  0704   黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(XGPRT)(gptB)[2.4.2.22]
  0705   X-His二肽酶(pepD)[4.13.3]
  0706   酪氨酸重组酶XerC(xerC)
  0707   乙酰基转移酶,GNAT家族
  0708   丙糖磷酸异构酶(tpiA)[5.3.1.1]
  0709   硫代硫酸硫转移酶glpE(glpE)[2.8.1.1]
  0710   rarD蛋白(rarD)
  0711   HTH-型转录激活物ilvY(ilvY)
  0112   假拟蛋白
  0713   酮醇-酸还原异构酶(HvC)[1.1.1.86]
  0714   厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基C(G-3-P脱氢酶)(glpC)[1.1.99.5]
  0715   厌氧性甘油-3~磷酸脱氢酶亚基B(厌氧性G-3-P脱氢酶亚基B)(厌氧性G3P脱氢酶B)(glpB)[1.1.99.5]
  0716   厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基A(G-3-P脱氢酶)(glpA)[1.1.99.5]
  0717   甘油-3-磷酸转运蛋白(glpT)
  0718   甘油磷酸二酯磷酸二酯酶前体(glpQ)[3.1.4.46]
  0719   甘油摄取易化蛋白(glpF)
  0720   甘油激酶(glpK)[2.7.1.30]
  0721   黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(XGPRT)(gptB)[2.4.2.22]
  0722   甘油磷酸二酯磷酸二酯酶(glpQ)[3.1.4.46]
  0723   5’-核苷酸酶,脂蛋白e(P4)家族
  0724   核糖体大亚基假尿苷合酶E(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)[4.2.1.70]
  0725   外切聚磷酸酶[3.6.1.11]
  0726   蛋白
  0727   蛋白HI0698前体
  0728   FKBP-型肽酰-脯氨酰顺-反异构酶slyD(PPI酶)(旋转异构酶)(slyD)[5.2.1.8]
  0729   蛋白
  0730   保守性假拟蛋白TIGR00094
  0731   酸性磷酸酶SurE(surE)[3.1.3.2]
  0732   LppB(lppB)
  0733   外膜抗原性脂蛋白B前体
  0734   外膜抗原性脂蛋白B前体
  0733   色氨酸酶(L-色氨酸吲哚-裂合酶)(TNA酶)(TNA酶)[4.1.99.1]
  0736   TnaB(mtr)
  0737   DNA错配修复蛋白MutS(mutS)
  0738   L-丝氨酰-tRNA硒转移酶(selA)[2.9.1.1]
  0739   硒基半胱氨酸-特异性翻译延伸因子(selB)
  0740   脂蛋白,推定的
  0741   翻译的负调节物
  0742   保守性假拟蛋白TIGR00053
  0743   血红蛋白和血红蛋白-结合珠蛋白结合蛋白C前体
  0744   PT重复家族
  0745   引发因子(fig)[5.2.1.8]
  0746   ATP-依赖性Clp蛋白酶,蛋白水解亚基ClpP(clpP)[3.4.21.92]
  0747   ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚基ClpX(clpX)
  0748   前蛋白转位酶SecE亚基(secE)
  0749   转录终止/抗终止因子NusG(nusG)
  0750   VacJ脂蛋白同源物前体(vacJ)
  0751   内切核糖核酸酶L-PSP,推定的
  0752   假拟蛋白
  0753   蛋白酶HtpX(热休克蛋白)(htpX)[3.4.24.-]
  0754   预测的氧化还原蛋白,二硫键形成的调节物
  0755   保守性假拟蛋白TIGR00257
  0756   Trk系统摄钾蛋白trkH(trkH)
  0757   假拟UPF0241蛋白
  0758   保守性假拟蛋白
  0759   硝酸-亚硝酸反应调节蛋白同源物(narP)
  0760   二氨基庚二酸脱羧酶(lysA)[4.1.1.20]
  0761   脂蛋白,推定的
  0762   CyaY蛋白(cyaY)
  0763   ATP-依赖性DNA解旋酶RecQ(recQ)[3.6.1.-]
  0764   脯氨酰-tRNA合成酶(proS)[6.1.1.15]
  0765   有机溶剂耐受性蛋白前体
  0766   蛋白suf1同源物前体(suf1)
  0767   1-酰基-sn-甘油-3-磷酸酰基转移酶(1-AGP酰基转移酶)(1-AGPAT)(溶血磷脂酸酰基转移酶)(LPAAT)(plsC)[2.3.1.51]
  0768   UDP-2,3-二酰基葡糖胺水解酶(lpxH)[3.6.1.-]
  0769   钠-和氯化物-依赖性转运蛋白NMB1975(SNF)
  0770   IIvG(ALS-II)[4.1.3.18]
  0771   Na+-依赖性SNF家族转运蛋白(SNF)
  0772   IlvG(ILVG)[4.1.3.18]
  0773   二羟酸脱水酶(ilvD)[4.2.1.9]
  0774   苏氨酸氨-裂合酶,生物合成(ilvA)[4.3.1.19]
  0775   DNA聚合酶IIIα亚基(dnaE)[2.7.7.7]
  0776   假拟蛋白
  0777   YhxB(cpsG)[5.4.2.8]
  0778   蛋白-输出蛋白SecB(secB)
  0779   硫氰酸酶结构域蛋白
  0780   L-天冬酰胺酶II(ansB)[3.5.1.1]
  0781   L-天冬酰胺酶II(ansB)[3.5.1.1]
  0782   厌氧性C4-二羧酸转运蛋白dcuB(dcuB)
  0783   NADH脱氢酶(ndh)[1.6.99.3]
  0784   甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)(plsB)[2.3.1.15]
  0785   LexA阻抑物(lexA)[3.4.21.88]
  0786   二氨基庚二酸差向异构酶(dapF)[5.1.1.7]
  0767   硫醇过氧化物酶(tpx)[1.11.1.-]
  0788   磷酸核糖基甲酰基甘氨脒合酶(purL)[6.3.5.3]
  0789   Lex2A
  0790   Lex2B(lex2B)[2.-.-.-]
  0791   yibQ基因产物
  0792   M23/M37肽酶结构域蛋白蛋白
  0793   2,3-双磷酸甘油酸-依赖性磷酸甘油酸变位酶(磷酸甘油变位酶)(PGAM)(BPG-依赖性PGAM)(dPGM)(gpmA)[5.4.2.1]
  0794   核糖体蛋白L31(rpmE)
  0795   假拟蛋白
  0796   A/G-特异性腺嘌呤糖基化酶(mutY)[3.2.2.-]
  0797   UPF0269蛋白
  0798   膜-结合裂解胞壁质转糖基酶C前体(胞壁质水解酶C)(mltC)[3.2.1.-]
  0799   Ser/Thr蛋白磷酸酶超家族
  0800   烟酰胺-核苷酸腺苷酰基转移酶[2.7.7.1]
  0801   假拟蛋白
  0802   34-二羟基-2-丁酮4-磷酸合酶(ribB)
  0803   脂多糖生物合成蛋白IpsA[2.-.-.-]
  0804   RNA甲基转移酶,TrmH家族,组2
  0805   甲基转移酶,推定的
  0806   细胞分裂蛋白ftsY同源物(ftsY)
  0807   细胞分裂ATP-结合蛋白ftsE(ftsE)
  0808   假拟蛋白插入通透酶FtsX(ftsX)
  0809   乙酰-CoA乙酰基转移酶(乙酰乙酰-CoA硫解酶)(atoB)[2.3.1.9]
  0810   膜蛋白,推定的
  0811   乙酸CoA-转移酶β亚基(乙酰-CoA:乙酰乙酸CoA转移酶β亚基)(atoA)[2.8.3.8]
  0812   乙酸CoA-转移酶α亚基(乙酰-CoA:乙酰乙酸CoA转移酶α亚基)[2.8.3.8]
  0813   假拟HTH-型转录调节物
  0814   核糖体蛋白S10(rpsJ)
  0815   核糖体蛋白L3(rplC)
  0816   核糖体蛋白L4/L1家族(rplD)
  0817   核糖体蛋白L23(rplW)
  0818   核糖体蛋白L2(rplB)
  0819   核糖体蛋白S19(rpsS)
  0820   核糖体蛋白L22(rplV)
  0821   核糖体蛋白S3(rpsC)
  0822   核糖体蛋白L16(rplP)
  0823   核糖体蛋白L29(rpmC)
  0824   核糖体蛋白S17(rpsQ)
  0825   保守性假拟蛋白
  0826   核糖体蛋白L14(rplN)
  0827   核糖体蛋白L24(rplX)
  0828   核糖体蛋白(rpL5)
  0829   核糖体蛋白S14p/S29e(rpsN)
  0830   核糖体蛋白S8(rpsH)
  0831   核糖体蛋白(rpL6)
  0832   核糖体蛋白L18(rplR)
  0833   核糖体蛋白S5(rpsE)
  0834   核糖体蛋白L30(rpmD)
  0835   核糖体蛋白L15(rplO)
  0836   前蛋白易位酶secY亚基(secY)
  0837   核糖体蛋白L36(rpmJ)
  0838   脂蛋白,推定的
  0839   核糖体蛋白S13p/S18e(rpsM)
  0840   2,3-双磷酸甘油酸-依赖性磷酸甘油酸变位酶(磷酸甘油变位酶)(PGAM)(BPG-依赖性PGAM)(dPGM)(gpmA)[5.4.2.1]
  0841   前蛋白易位酶secY亚基(secY)
  0842   核糖体蛋白L36(rpmJ)
  0843   核糖体蛋白S13p/S18e(rpsM)
  0844   核糖体蛋白S11(rpsK)
  0845   核糖体蛋白(rpS4)
  0846   核糖体蛋白S11(rpsK)
  0847   核糖体!蛋白S4(rpsD)
  0848   DNA-指导的RNA聚合酶,α亚基(rpoA)[2.7.7.6]
  0849   核糖体蛋白L17(rplQ)
  0860   环核苷酸-结合结构域蛋白
  0851   芳基硫酸酯酶调节物(YDEM)[1.-.-.-]
  0852   未知功能的结构域,推定的
  0853   1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(dxr)[1.1.1.267]
  0854   核糖体回收因子(frr)
  0855   磷酸烯醇式丙酮酸羧基激酶(ATP)(pckA)[4.1.1.49]
  0856   33kba侣伴蛋白(热休克蛋白33同源物)(HSP33)(HSP33)
  0857   假拟蛋白
  0858   精氨琥珀酸裂合酶裂合酶(argH)[4.3.2.1]
  0859   UTP-葡萄糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶(galU)[2.7.7.9]
  0860   碳储存调节物(csrA)
  0861   丙氨酰-tRNA合成酶(alaS)[6.1.1.7]
  0862   遍在应激蛋白A同源物(uspA)
  0863   Xaa-Pro氨基肽酶(X-Pro氨基肽酶)(氨基肽酶P II)(APP-I1)(氨基酰基脯氨酸氨基肽酶)(pepP)[3.4.11.9]
  0864   假拟UPF0149蛋白
  0865   醛糖1-差向异构酶(变旋酶)(galM)[5.1.3.3]
  0866   半乳糖激酶(galK)[2.7.16]
  0867   半乳糖激酶(galK)[2.7.1.6]
  0868   半乳糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶(galT)[2.7.7.10]
  0869   假拟蛋白
  0870   假拟蛋白
  0871   半乳糖阻抑物(gaiR)
  0872   D-半乳糖-结合蛋白(mglB)
  0873   半乳糖苷转运ATP-结合蛋白mglA(mglA)
  0874   半乳糖苷转运系统通透酶蛋白mglC(mglC)
  0875   膜蛋白,推定的
  0876   胞内分隔蛋白A(ispZ)
  0877   酰基CoA硫酯水解酶家族蛋白NMB0925[3.1.2.-]
  0878   蛋白(AB020211)
  0879   假拟可溶性裂解胞壁质转糖基酶前体[3.2.1.-]
  0880   可溶性裂解胞壁质转糖基酶(Slt70)[3.2.1.-]
  0881   trp操纵子阻抑物(trpR)
  0882   单功能生物合成肽聚糖转糖基酶(mtgA)[2.4.2.-]
  0883   延胡索酸还原酶亚基D(frdD)[1.3.99.1]
  0884   延胡索酸还原酶亚基C(frdC)[1.3.99.1]
  0885   延胡索酸还原酶铁-硫蛋白(frdB)[1.3.99.1]
  0886   延胡索酸还原酶,黄素蛋白亚基(frdA)[1.3.99.1]
  0887   赖氨酰-tRNA合成酶-相关蛋白GenX
  0888   转录调节蛋白cpxR同源物(cpxR)
  0889   小蛋白A
  0890   37kDa拟核-相关蛋白同源物
  0891   未知功能的蛋白质(DUF1414)超家族
  0892   预测的水解酶
  0893   保守性假拟蛋白
  0894   钼蛋白(molybdopterin)-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白A(mob)
  0895   蛋白yihD(o89)
  0896   硫醇:二硫化物交换蛋白dsbA前体(por)[5.3.4.1]
  0897   蛋白HI0847(ORF3)(YIFE)
  0898   tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶(trmA)[2.1.1.35]
  0899   gtg起点,可能的备用起点
  0900   σ-E因子调节蛋白RseC STY2830
  0901   钼蛋白-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白B(mobB)
  0902   药物抗性易位酶家族蛋白NMB1435(Cereon)
  0903   血红素-结合脂蛋白前体hbpA[已验证](dppA)
  0904   蛋白
  0905   保守性蛋白
  0906   DNA聚合酶I(POL I)(polA)[2.7.7.7]
  0907   功能未知的家族(DUF710)超家族
  0908   蛋白
  0909   ClpB蛋白(clpB)[3.4.21.-]
  0910   RNA甲基转移酶,TrmH家族,组3
  0911   核糖核酸酶R(rnr)[3.1.-.-]
  0912   保守性假拟完整的膜蛋白亚家族
  0913   吡多胺5’-磷酸氧化酶(pdxH)[1.4.3.5]
  0914   GTP-结合蛋白TypA(typA)
  0915   谷氨酰胺合成酶,I型(ginA)[6.3.1.2]
  0916   Wzz同源物(WZZE)
  0917   保守性假拟蛋白
  0918   糖基转移酶,组2家族蛋白(部分))[2.-.-.-]
  0919   HIO869
  0920   膜蛋白,推定的
  0921   HIO871
  0922   HIO872(rfbP)[2.-.-.-]
  0923   dTDP-葡萄糖4,6-脱水酶(rfbB)[4.2.1.46]
  0924   O-抗原聚合酶家族
  0925   3.4.11.23(pepA)[3.4.11.23]
  0926   核苷二磷酸激酶(NDK)(NDP激酶)(核苷-2-P激酶)(ndk)[2.7.4.6]
  0927   GTP1/Obg家族蛋白(F390)
  0928   假拟转运蛋白
  0929   核糖体蛋白L27(rpmA)
  0930   核糖体蛋白L21(rplU)
  0931   八异戊二烯基-二磷酸合酶(八异戊二烯基焦磷酸合成酶)(OPP合成酶)(ispB)[2.5.1.-]
  0932   蛋白
  0933   Na(±)-连接的D-丙氨酸甘氨酸通透酶(丙氨酸)
  0034   需氧呼吸控制蛋白arcA同源物(arcA)
  0935   硫醇:二硫化物交换蛋白dsbD前体(蛋白-二硫化物还原酶)(二硫化物还原酶)(C-型细胞色素生源蛋白cycZ)(dsbD)[1.8.1.8]
  0936   DoxD-样家族
  0937   双功能嘌呤生物合成蛋白PurH(purH)
  0938   磷酸核糖基胺-甘氨酸连接酶(purD)[6.3.4.13]
  0939   丝氨酸羟基甲基转移酶(glyA)[2.1.2.1]
  0940   脱磷酸-CoA激酶(coaE)[2.7.1.24]
  0941   未知功能的结构域(DUF329)超家族
  0942   3.6.1.-(rhlB)[3.6.1.-]
  0943   转录调节物(Bm3R1)
  0944   膜融合蛋白
  0945   AcrB(acrB)
  0946   细胞分裂蛋白FtsN(ftsN)
  0947   多药物耐性蛋白B同源物(emrB)
  0948   多药物耐性蛋白A同源物(emrA)
  0949   二氢叶酸还原酶(fllA)[1.5.1.3]
  0950   谷氨酸5-激酶(proB)[2.72.11]
  0951   (二)核苷多磷酸水解酶(invA)[3.6.1.-]
  0952   预测的通透酶
  0953   前脂蛋白二酰基甘油基转移酶(tgt)[2.4.99.-]
  0954   胸苷酸合酶(thyA)[2.1.1.451
  0955   胞苷/脱氧胞苷酸脱氨基酶家族蛋白
  0966   保守性假拟蛋白
  0967   保守性假拟蛋白
  0958   前蛋白易位酶,SecA亚基(secA)
  0959   突变基因mutT蛋白(7,8-二氢-8-氧鸟嘌呤-三磷酸酶)(8-氧-dGTP酶)(dGTP焦磷酸水解酶)(mutT)[3.6.1.-]
  0960   谷胱甘肽-调节的钾-流出系统蛋白(K(+)/H(+)反向转运蛋白)(kefC)
  0961   可能的醌/维生素K2生物合成甲基转移酶[2.1.1.-]
  0962   核糖体蛋白S2(rpsB)
  0963   翻译延伸因子Ts(tsO
  0964   UDP-3-O-[3-羟基十四酰]葡糖胺N-酰基转移酶(lpxD)[2.3.1.-]
  0965   外膜蛋白26前体
  0966   保护性表面抗原D15前体(80kDaD15抗原)(D-15-Ag)(外膜蛋白D15)(D15)
  0967   膜-相关锌金属蛋白酶,推定的
  0968   磷脂酸胞苷酰转移酶(edsA)[2.7.7.41]
  0969   十一异戊二烯基二磷酸合酶(uppS)[2.5.1.31]
  0970   亮氨酰-tRNA合成酶(leuS)[6.1.1.4]
  0971   可能的罕见脂蛋白B(rlpB)
  0072   DNA聚合酶III,δ亚基(holA)[2.7.7.7]
  0973   假拟蛋白
  0974   Eag0007(AF269166)
  0975   未命名的蛋白质产物;高度类似于摩氏摩根菌的稳定性蛋白StbD
  0976   假拟蛋白
  0977   Fels-2原噬菌体蛋白
  0978   甘氨酰-tRNA合成酶,β亚基(glyS)[6.1.1.14]
  0979   类似于大肠杆菌ORE,由GenBank登录号X97282编码;并类似于流感嗜血杆菌蛋白HI0925,由GenBank登录号U32774编码;并类似于流感嗜血杆菌蛋白HI1162,由GenBank登录号U32796编码
  0980   保守性假拟蛋白
  0981   甘氨酰-tRNA合成酶,α亚基(glyQ)[6.1.1.14]
  0982   过氧化氢酶(hktE)[1.11.1.6]
  0983   合成酶/酰胺酶(orfa)
  0984   脂蛋白,推定的
  0985   保守性假拟蛋白
  0986   烯醇酶(eno)[4.2.1.11]
  0987   保守性假拟蛋白TIGR00275
  0988   甲酸-依赖性亚硝酸还原酶复合物nrfFG亚基前体(nrfF)
  0989   硫醇:二硫化物交换蛋白DsbE(dsbE)
  0990   细胞色素c-型生源蛋白CcmF(ccmF)
  0991   肌醇-1-单磷酸酶(IMP酶)(肌醇-1-磷酸酶)(I-1-P酶)(suhB)[3.1.3.25]
  0992   保守性假拟蛋白
  0993   保守性假拟蛋白
  0994   保守性假拟蛋白
  0995   保守性假拟蛋白
  0996   外切脱氧核糖核酸酶V,γ亚基(recC)[3.1.11.5]
  0997   保守性假拟蛋白TIGR00244
  0998   核黄素生物合成蛋白RibD(ribD)
  0999   周质丝氨酸蛋白酶DegS(degS)[3.4.21.-]
  1000   甲酰氨基嘧啶-DNA糖基化酶(mutM)[3.2.2.23]
  1001   L-2,4-二氨基丁酸脱羧酶(DABA脱羧酶)(DABA-DC)[4.1.1.-]
  1002   PIN(PilT N末端)结构域(vapC)
  1003   可能的毒性-相关蛋白(vapB)
  1004   二氨基丁酸-2-酮戊二酸氨基转移酶(L-二氨基丁酸转氨酶)(二氨基丁酸转氨酶)(DABA氨基转移酶)(DABA-AT)(L-2,4-二氨基丁酸:2-酮戊二酸4-氨基转移酶)(DABA-AT)[2.6.1.76]
  1005   核糖体蛋白L33(rpmG)
  1006   核糖体蛋白-相关蛋白
  1007   DNA修复蛋白radC同源物(radC)
  1008   磷酸泛酰半胱氨酸脱羧酶/磷酸泛酸-半胱氨酸连接酶(coaBC)
  1009   脱氧尿苷5’-三磷酸核苷酸水解酶(dUTP酶)(dUTP焦磷酸酶)(dut)[3.6.1.23]
  1010   Ttk蛋白同源物(ttk)
  1011   未表征的蛋白家族(UPF0270)家族
  1012   代谢产物基因激活物(cAMP受体蛋白)(cAMP调节蛋白)(crp)
  1013   23S rRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumB(rumB)[2.1.1.-]
  1014   β-氨基己糖苷酶(N-乙酰-β-氨基葡糖苷酶)(β-N-乙酰氨基己糖苷酶)(exoII)[3.2.1.52]
  1015   脂蛋白,推定的
  1016   组氨酸三联体蛋白同源物(Ap4A)
  1017   异亮氨酰-tRNA合成酶(IleS)[6.1.1.5]
  1018   核黄素生物合成蛋白RibF(ribF)
  1019   完整的膜蛋白MviN(mviN)
  1020   核糖体蛋白S20(rpsT)
  1021   保守性假拟蛋白
  1022   萘甲酸合酶(menB)[4.1.3.36]
  1023   o-琥珀酰苯甲酸(OSB)合成酶(menC)[4.2.1.-]
  1024   3-脱氢奎尼酸脱水酶,II型(aroQ)[4.2.1.10]
  1025   乙酰-CoA羧化酶,生物素羧基载体蛋白(accB)
  1026   乙酰-CoA羧化酶,生物素羧化酶(accC)[6.4.1.2]
  1027   Eag0010
  1028   未知功能的蛋白质(DUF560)家族
  1029   钠/泛酸同向转运蛋白
  1030   钠/泛酸同向转运蛋白(pan F)
  1031   Tou6(DMT)
  1032   细胞丝化蛋白(fic)
  1033   核糖体蛋白L11甲基转移酶(prmA)[2.1.1.-]
  1034   tRNA-二氢尿苷合酶B(nifR3)[1.-.-.-]
  1035   DNA-结合蛋白fis(fis)
  1036   SsrA-结合蛋白(smpB)
  1037   磷酸果糖激酶
  1038   脂蛋白,推定的
  1039   UPF0246蛋白yaaA(ECO 110K)
  1040   Smf蛋白(DNA加工链A)(dprA)
  1041   2-异丙基苹果酸合酶(leuA)[2.3.3.13]
  1042   3-异丙基苹果酸脱氢酶(leuB)[1.1.1.85]
  1043   3-异丙基苹果酸脱水酶,大亚基(leuC)[4.2.1.33]
  1044   3-异丙基苹果酸脱水酶,小亚基(leuD)[4.2.1.33]
  1045   免疫球蛋白A1蛋白酶前体(IGA1蛋白酶)(igal)[3.4.21.72]
  1046   DNA复制和修复蛋白recF(recF)
  1047   DNA聚合酶III,β亚基(dnaN)[2.7.7.7]
  1048   染色体复制引发蛋白DnaA(dnaA)
  1049   运铁蛋白-结合蛋白1前体(tbp1)
  1050   运铁蛋白-结合蛋白2前体(tbp2)
  1051   未知功能的蛋白质(DUF560)家族
  1052   核糖体蛋白L34(rpmH)
  1053   核糖核酸酶P蛋白组件(rnpA)[3.1.26.5]
  1054   保守性假拟蛋白TIGR00278
  1055   内膜蛋白oxaA
  1056   tRNA修饰GTP酶TrmE(trmE)
  1057   5.2.1.8[5.2.1.8]
  1058   硫酯酶结构域蛋白
  1059   脂蛋白信号肽酶(IspA)[3.4.23.36]
  1060   二磷酸4-羟基-3-甲基丁-2-烯酯还原酶(ispH)[1.17.1.2]
  1061   假拟蛋白
  1062   蛋白HI1008前体
  1063   DeoR-家族转录调节物STY3044(glpR)
  1064   3-羟基异丁酸脱氢酶(TSAR)[1.1.-.-]
  1065   tRNA合酶样蛋白
  1066   L-墨角藻糖-1-磷酸醛缩酶样蛋白(fucA)[4.1.2.17]
  1067   羟基丙酮酸异构酶[5.3.1.22]
  1068   4-羟基丁酸脱氢酶[1.1.1.61]
  1069   GntP(gntP)
  1070   假拟环化酶超家族
  1071   假拟蛋白
  1072   甘油摄取易化蛋白(glpF)
  1073   蛋白V6(插入序列IS1016)
  1074   ISPsy8,转座酶OrfA,推定的
  1075   IS3-家族转座酶,OrfB(orfB)
  1076   ISPsy9,转座酶OrfB(orfB)
  1077   HcsB
  1078   HcsA””
  1079   Bcs4
  1080   Bcs3
  1081   未命名的蛋白质产物;orf2
  1082   CDP-核糖醇焦磷酸化酶[1.-.-.-]
  1083   CDP-核糖醇焦磷酸化酶(假拟)[2.7.7.60]
  1084   BexD(AF067140)
  1085   BexC
  1086   荚膜多糖输出内膜蛋白bexB(bexB)
  1087   ATP-结合蛋白bexA[3.6.3.38]
  1088   硫胺ABC转运蛋白,周质结合蛋白(tHIB)
  1089   硫胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白(thiP)
  1090   硫胺转运ATP-结合蛋白thiQ[3.6.3.25]
  1091   生物素合酶(bioS)[2.8.1.6]
  1092   酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.1]
  1093   蛋白ahpA前体(smp-样)
  1094   磷酸丝氨酸磷酸酶(PSP)(O-磷酸丝氨酸磷酸水解酶)(PSP酶)(serB)[3.1.3.3]
  1095   UPF0234蛋白
  1006   镁和钴转运蛋白CorA(corA)
  1097   预测的完整的膜蛋白
  1098   YafJ
  1099   假拟蛋白
  1100   假拟蛋白
  1101   螺旋-转角-螺旋结构域蛋白
  1102   假拟蛋白
  1103   假拟蛋白
  1104   假拟蛋白
  1105   铁氧还蛋白-型蛋白NapF(napF)
  1106   胞质侣伴蛋白TorD家族
  1107   DMSO还原酶锚亚基(DmsC)(dmsC)[1.8.99.-]
  1108   厌氧性二甲亚砜还原酶链B(DMSO还原酶铁-硫亚基)(dmsB)[1.8.-.-]
  1109   厌氧性二甲亚砜还原酶链A前体(DMSO还原酶)(dmsA)[1.8.99.-]
  1110   蛋白HI1048前体
  1111   MerT(merT)
  1112   MerP(merP)
  1113   ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白NMB0264(AF035964)
  1114   MtrA(AJ233398)
  1115   羧基粘康酸内酯脱羧酶家族蛋白
  1116   限制性修饰系统-R蛋白
  1117   限制性修饰系统-R蛋白[3.1.21.5]
  1118   修饰甲基化酶LlaFI(甲基转移酶)[2.1.1.72]
  1110   核糖核酸酶HII(rnhB)[3.1.26.4]
  1120   脂质-A-二糖合酶(lpxB)[2.4.1.182]
  1121   酰基-[酰基-载体-蛋白]-UDP-N-乙酰葡糖胺O-酰基转移酶(lpxA)[2.3.1.129]
  1122   β-羟基酰基-(酰基-载体-蛋白)脱水酶FabZ(fabZ)[4.2.1.-]
  1123   Dca
  1124   尿苷酸激酶(pyrH)[2.7.4.-]
  1125   NrfD蛋白同源物(nrfD)[1.-.-.-]
  1126   Nrf℃蛋白同源物前体(nrfC)[1.-.-.-]
  1127   细胞色素c-型蛋白nrfB前体(nrfB)
  1128   细胞色素c-552前体(氨-形成细胞色素c亚硝酸还原酶)(细胞色素c亚硝酸还原酶)(nrfA)[1.7.2.2]
  1129   ATP-依赖性螺旋帽HrpA(hrpA)
  1130   未表征的小膜蛋白
  1131   未知功能的蛋白质(DUF441)超家族
  1132   保守性假拟蛋白
  1133   细胞色素d泛醇氧化酶,亚基II(cydB)[1.10.3.-]
  1134   CydA(cydA)[1.10.3.-]
  ¨35   CTP合酶(pyrG)[6.3.4.2]
  1136   PnuC转运蛋白(pnuC)
  1137   PnuC转运蛋白
  1138   假拟蛋白
  1139   氨基酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白NMB0789(ABC)
  1140   氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白(通透酶)
  1141   氨基酸ABC转运蛋白,周质氨基酸-结合蛋白NMB0787
  1142   UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧基乙烯基转移酶(murA)[2.5.1.7]
  1143   蛋白
  1144   STAS结构域,推定的
  1145   蛋白HI1084前体
  1146   VpsC
  1147   未命名的蛋白质产物;高度类似于大肠杆菌的ABC转运蛋白,通透酶蛋白YrbE
  1148   ABC转运蛋白ATP结合蛋白
  1149   超氧化物岐化酶(Mn)(sodA)[1.15.1.1]
  1150   血红素输出蛋白CcmA(ccmA)
  1151   血红素输出蛋白CcmB(ccmB)
  1152   血红素输出蛋白C(细胞色素c-型生源蛋白ccmC)(ccmC)
  1153   血红素输出蛋白D(细胞色素c-型生源蛋白ccmD)-相关蛋白
  1154   细胞色素c-型生源蛋白ccmE(ccmE)
  1155   细胞色素c-型生源蛋白CcmF(ccmF)
  1156   硫醇:二硫化物交换蛋白dsbE(细胞色素c生源蛋白ccmG)(dsbE)
  1157   CcmH(nrfF)
  1158   CcmH(nrfF)
  1159   保守性假拟蛋白
  1160   脂蛋白,推定的
  1161   DNA连接酶,NAD-依赖性(ligA)[6.5.1.2]
  1162   细胞分裂蛋白ZipA(zipA)
  1163   CysZ蛋白同源物(cysZ)
  1164   半胱氨酸合酶A(cysK)[2.5.1.47]
  1165   转运蛋白,MFS超家族(MFS)
  1166   脂多糖庚糖基转移酶II(rfaF)
  1167   木糖操纵子调节蛋白(xylR)
  1168   Na+/H+反向转运蛋白NhaC(nhaC)
  1169   氨基转移酶[2.6.1.-]
  1170   木糖转运系统通透酶蛋白xylH(xylH)
  1171   D-木糖转运ATP-结合蛋白xylG(xylG)
  1172   D-木糖-结合周质蛋白前体(xytF)
  1173   木糖异构酶(xylA)[5.3.1.5]
  1174   木酮糖激酶(xylB)[2.7.1.17]
  1175   ADP-L-甘油-D-甘露糖-庚糖-6-差向异构酶(rfaD)[5.1.3.20]
  1176   硫氧还蛋白样蛋白
  1177   脱氧核糖-磷酸醛缩酶(deoC)[4.1.2.4]
  1178   Mg螯合酶-相关蛋白
  1179   保守性可能的细胞分裂GTP-结合蛋白
  1180   LapB(lapB)
  1181   寡肽转运ATP-结合蛋白oppF(oppF)
  1182   寡肽转运ATP-结合蛋白oppD(oppD)
  1183   寡肽转运系统通透酶蛋白oppC(oppC)
  1184   寡肽转运系统通透酶蛋白oppB(oppB)
  1185   周质寡肽-结合蛋白前体(oppA)
  1186   转醛酶(talB)[2.2.1.2]
  1187   转醛酶(talB)[2.2.1.2]
  1188   碳饥饿蛋白
  1189   mraZ蛋白(mraZ)
  1190   S-腺苷-甲基转移酶MraW(mraW)[2.1.1.-]
  1191   细胞分裂蛋白FtsL(ftsL)
  1192   肽聚糖合成酶ftsl(肽聚糖糖基转移酶3)(青霉素-结合蛋白3)(PBP-3)(ftsl)[2.4.1.129]
  1193   UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酸-2,6-二氨基庚二酸连接酶(EC 6.3.2.13)(UDP-N-乙酰胞壁酰-三肽合成酶)(内消旋-二氨基庚二酸-加成酶)(UDP-MurNAc-三肽合成酶)(MurE)[6.3.2.13]
  1194   UDP-N-乙酰胞壁酰-三肽-D-丙氨酰-D-丙氨酸连接酶(EC 6.3.2.10)(UDP-MurNAc-五肽合成酶)(D-丙氨酰-D-丙氨酸-加成酶)(murF)[6.3.2.10]
  1195   磷酸-N-乙酰胞壁酰-五肽-转移酶(mraY)[2.7.8.13]
  1196   UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(murD)[6.3.2.9]
  1197   细胞分裂蛋白ftsW(ftsW)
  1198   UDP-N-乙酰葡糖胺-N-乙酰胞壁酰-(五肽)焦磷酰基-十一异戊烯N-乙酰葡糖胺转移酶(murG)[2.4.1.-]
  1199   UDP-N-乙酰胞壁酸-丙氨酸连接酶(murC)[6.3.2.8]
  1200   D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶(D-丙氨酰丙氨酸合成酶)(D-Ala-D-Ala连接酶)(ddlB)[6.3.2.4]
  1201   细胞分裂蛋白ftsQ同源物(ftsQ)
  1202   细胞分裂蛋白FtsA(ftsA)
  1203   细胞分裂蛋白FtsZ(ftsZ)
  1204   UDP-3-O-酰基N-乙酰葡糖胺脱乙酰酶(lpxC)[3.5.1.-]
  1205   P-蛋白[包括:分支酸变位酶(CM);预苯酸脱水酶(EC 4.2.1.51)(PDT)](PDT)[5.4.99.5]
  1206   未命名的蛋白质产物;ORF193肽片段(AA 1-192)(1524是密码子中的第二个碱基)(P-环)
  1207   PTS IIA样氮-调控蛋白PtsN(ptsN)
  1208   ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
  1209   蛋白HI1149前体
  1210   未命名的蛋白质产物;类似于大肠杆菌的YrbK前体蛋白
  1211   未知功能的蛋白质(DUF615)超家族
  1212   PmbA蛋白同源物(pmbA)
  1213   次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(hpt)[2.4.2.8]
  1214   保守性假拟蛋白
  1215   激酶样蛋白(gttP)
  1216   厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶活化蛋白(EC 1.97.1.4)(III类厌氧性核苷酸还原酶小组件)(nrdG)[1.97.1.4]
  1217   转运ATP-结合蛋白cydC(cydC)
  1218   转运ATP-结合蛋白cydD(cydD)
  1219   硫氧还蛋白-二硫化物还原酶(trxB)[1.8.1.9]
  1220   蛋白
  1221   亚铁螯合酶(hemH)[4.99.1.1]
  1222   在细菌中保守的未表征的蛋白
  1223   蛋白
  1224   外膜蛋白P5前体(OMP P5)(ompA)
  1225   谷氧还蛋白-相关蛋白
  1226   组氨醇-磷酸氨基转移酶(hisC)[2.6.1.9]
  1227   磷酸丝氨酸氨基转移酶(serC)[2.6.1.52]
  1228   UPF0265蛋白
  1229   分支酸结合酶[4.1.3.-]
  1230   p-氨基苯甲酸合酶组件I(pabB)[4.1.3.-]
  1231   TrpG(trpG)[4.1.3.27]
  1232   S-腺苷甲硫氨酸合成酶(metK)[2.5.1.6]
  1233   蛋白sprT(sprT)
  1234   OPA蛋白
  1235   保守性假拟蛋白
  1236   精氨酸转运系统通透酶蛋白artM(artM)
  1237   精氨酸转运系统通透酶蛋白artTQ(artQ)
  1238   精氨酸结合周质蛋白前体(artI)
  1239   精氨酸转运ATP-结合蛋白artP(artP)
  1240   磷酸庚糖异构酶(gmhA)
  1241   假拟蛋白
  1242   DNA连接酶(聚脱氧核糖核苷酸合酶[ATP])[6.5.1.1]
  1243   二肽转运ATP-结合蛋白dppF(dppF)
  1244   二肽转运ATP-结合蛋白dppD(dppD)
  1245   二肽转运系统通透酶蛋白dppC(dppC)
  1246   二肽转运系统通透酶蛋白dppB(dppB)
  1247   假拟蛋白
  1248   假拟蛋白
  1249   DNA螺旋酶II(uvrD)[3.6.1.-]
  1250   Vng6305c
  1251   6-丙酮酰四氢蝶呤合酶,推定的[4.2.3.12]
  1252   exsB蛋白
  1253   脂蛋白,推定的
  1254   Eag0009
  1255   Eag0010
  1256   Eag0011
  1257   支链氨基酸氨基转移酶(ilvE)[2.6.1.42]
  1258   甘氨酸切割系统转录激活物同源物(gcvA)
  1259   SAM-依赖性甲基转移酶样蛋白
  1260   琥珀酰-CoA合成酶β链(SCS-β)(sueC)[6.2.1.5]
  1261   琥珀酰-CoA合成酶α链(SCS-α)(sucD)[6.2.1.5]
  1262   Sua5/YciO/YrdC/YwlC家族蛋白
  1263   核糖体大亚基假尿苷合酶B(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)[4.2.1.70]
  1264   HTH-型转录调节物cysB(Cys调节子转录激活物)(cysB)
  1265   2.1.1.72[2.1.1.72]
  1266   假拟UPF0115蛋白
  1267   磷酸乙酰转移酶(pta)[2.3.1.8]
  1268   乙酸激酶(ackA)[2.72.1]
  1269   假拟蛋白
  1270   b2295
  1271   CvpA家族蛋白(cvpA)
  1272   酰氨基磷酸核糖基转移酶(purF)[2.4.2.14]
  1273   保守的假拟蛋白TIGR01777
  1274   精氨酸阻抑物(argR)
  1275   苹果酸脱氢酶,NAD-依赖性(mdh)[1.1.1.37]
  1276   赖氨酰-tRNA合成酶(赖氨酸-tRNA连接酶)(LysRS)(lysU)[6.1.1.6]
  1277   赖氨酰-tRNA合成酶(赖氨酸-tRNA连接酶)(LysRS)(lysU)[6.1.1.6]
  1278   肽链释放因子2(RF-2)(RF)
  1279   硫醇:二硫化物交换蛋白dsbC前体(dsbC)[5.3.4.1]
  1280   单链-DNA-特异性外切核酸酶RecJ(recJ)[3.1.-.-]
  1281   DSBA-样硫氧还蛋白结构域家族
  1282   MTA/SAH核苷酶
  1283   TonB-依赖性受体NMB 1497(Y08983)
  1284   LctP(lctP)
  1285   胞苷酸激酶(cmk)[2.7.4.14]
  1286   核糖体蛋白S1(rpsA)
  1287   整合宿主因子,β亚基(ihfB)
  1288   预测的膜蛋白
  1289   预测的N-乙酰葡糖胺基转移酶
  1290   乳清苷5-磷酸脱羧酶(pyrF)[4.1.1.23]
  1291   翻译抑制因子SUI1,推定的
  1292   DnaA家族蛋白(dnaA)
  1293   尿嘧啶通透酶(uraA)
  1294   假拟蛋白
  1295   尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(upp)[2.4.2.9]
  1296   DNA聚合酶III,亚基γ/τ(dnaX)[2.7.7.7]
  1297   腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(apt)[2.4.2.7]
  1298   二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)[1.8.1.4]
  1299   丙酮酸脱氢酶复合物二氢硫辛酰胺乙酰转移酶(aceF)[2.3.1.12]
  1300   丙酮酸脱氢酶E1组件(aceE)[1.2.4.1]
  1301   假拟蛋白
  1302   甲基乙二醛合酶(mgsA)[4.2.3.3]
  1303   保守性假拟蛋白
  1304   dnaK-型分子侣伴蛋白(dnaK)
  1305   热休克蛋白dnaJ(dnaJ)
  1306   γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)[1.2.1.41]
  1307   膜蛋白
  1308   膜蛋白,推定的
  1309   双环霉素抗性蛋白同源物(bcr)
  1310   核糖体小亚基假尿苷合酶A(16S假尿苷酸516合酶)(16S假尿苷516合酶)(尿嘧啶水解酶)(rsuA)[4.2.1.70]
  1311   CpsH蛋白
  1312   假拟蛋白
  1313   NADP-依赖性苹果酸酶(NADP-ME)(脱草酰乙酸)[1.1.1.40]
  1314   硫酸酯酶
  1315   UvrABC系统蛋白B(UvrB蛋白)(切除核酸酶ABC亚基B)(uvrB)
  1316   高亲和镍-转运蛋白家族
  1317   未知功能的蛋白质(DUF1007)超家族
  1318   蛋白质性杀伤抑制蛋白(假拟)
  1319   未命名的蛋白质产物;与毒性相关蛋白A(vapA)有一些类似
  1320   ABC转运蛋白ATP-结合蛋白(ABC)
  1321   侵袭基因表达上调节物,SirB超家族
  1322   类似于[SwissProt登录号P44140](GNAT)
  1323   保守性假拟蛋白
  1324   转录-修复偶合因子(mfd)
  1325   HtrA[3.4.21.-]
  1326   乙酰-CoA羧化酶,羧基转移酶,β亚基(accD)[6.4.1.2]
  1327   叶酰聚谷氨酸合酶(叶酰聚-γ-谷氨酸合成酶)(FPGS)(folC)[6.3.2.17]
  1328   假拟蛋白
  1329   SanA蛋白同源物(sanA)
  1330   高丝氨酸O-乙酰转移酶(metX)[2.3.1.31]
  1331   DNA促旋酶,A亚基(gyrA)[5.99.1.3]
  1332   ycaO蛋白
  1333   保守性假拟蛋白
  1334   可能的铁ABC转运蛋白周质结合蛋白(III)
  1335   HemU(I)
  1336   铁(III)
  1337   保守性假拟蛋白
  1338   GloB[3.1.2.6]
  1339   亚碲酸抗性蛋白TehB(tehB)
  1340   甲硫氨酰基-tRNA合成酶(甲硫氨酸-tRNA连接酶)(MetRS)(metG)[6.1.1.10]
  1341   Mrp(mrp)
  1342   NAD(P)H硝基还原酶[1.-.-.-]
  1343   胞苷5””单磷酸N-乙酰神经氨酸合成酶(neuA)[2.7.7.43]
  1344   YhbC-样蛋白
  1345   转录延伸蛋白nusA(nusA)
  1346   翻译起始因子IF-2(infB)
  1347   HSDR(hsdR)[3.1.21.3]
  1348   保守性假拟蛋白
  1349   前脂蛋白,推定的
  1350   假拟蛋白
  1351   保守性假拟蛋白
  1352   HsdA(hsdS)
  1353   ALXA和HSDM(hsdM)[2.1.1.72]
  1354   核糖体-结合因子A(rbfA)
  1355   tRNA假尿苷合酶B(tRNA假尿苷55合酶)(Psi55合酶)(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)(truB)[4.2.1.70]
  1356   T-蛋白[包括:分支酸变位酶(CM);预苯酸脱氢酶(EC 1.3.1.12)(PDH)](PDH)[5.4.99.5]
  1357   可能的GTP环式水解酶
  1358   含有锌带的蛋白
  1359   可能的GTP环式水解酶
  1360   含有锌带的蛋白
  1361   在细菌中保守的未表征的蛋白(orf5)
  1362   含有锌带的蛋白
  1363   在细菌中保守的未表征的蛋白(orf5)
  1364   半胱氨酸亚磺酸脱亚磺酸酶(CSD)(CSD)[2.8.1.7]
  1365   微球菌核酸酶样蛋白(SNA酶)[3.1.31.1]
  1366   穴蛋白样蛋白cidA2
  1367   膜蛋白,推定的
  1368   脱氧尿苷三磷酸三磷酸水解酶样蛋白(DGTP酶)[3.1.5.1]
  1369   假拟蛋白
  1370   ABC转运蛋白ATP-结合蛋白uup-1
  1371   蛋白yadF[4.2.1.1]
  1372   天冬酰胺酰-tRNA合成酶(asnS)[6.1.1.22]
  1373   6,7-二甲基-8核糖醇2,4-二氧二氢蝶啶合酶(ribH)[2.5.1.9]
  1374   转录抗终止因子NusB(nusB)
  1375   硫胺-单磷酸激酶(thiL)[2.7.4.16]
  1376   磷脂酰甘油磷酸酶A(pgpA)[3.1.3.27]
  1377   苏氨酸流出蛋白
  1378   二氢二吡啶甲酸还原酶(dapB)[1.3.1.26]
  1379   未命名的蛋白质产物;类似于大肠杆菌的铁氧还蛋白样蛋白YfaE(petF1)[1.17.1.-]
  1380   保守性假拟蛋白
  1381   苯基丙氨酰-tRNA合成酶,α亚基(pheS)[6.1.1.20]
  1382   苯基丙氨酰-tRNA合成酶,β亚基(pheT)[6.1.1.20]
  1383   整合宿主因子,α亚基(ihfA)
  1384   脂蛋白(nlpC)
  1385   保守性假拟蛋白
  1386   假拟5’(3’)-脱氧核糖核苷酸酶(dNT)[3.1.3.-]
  1387   NAD-依赖性脱乙酰酶(调节蛋白SIR2同源物)(DMB)[3.5.1.-]
  1388   保守性假拟蛋白
  1389   XpsR,假拟
  1390   死亡自愈家族蛋白
  1391   DNA易位酶ftsK
  1392   转录调节物,Sir2家族(DMB)[3.5.1.-]
  1393   可能的磷酸蛋白磷酸酶同源物Imo1821,推定的
  1394   未知功能的蛋白质DUF262家族
  1395   假拟ATP酶蛋白,推定的
  1396   芳基硫酸酯酶A[3.1.6.-]
  1397   HI1317(片段)
  1398   翻译起始因子IF-3(infC)
  1399   核糖体蛋白L35(rpL35)
  1400   核糖体蛋白L20(rplT)
  1401   外切脱氧核糖核酸酶V,β亚基(recB)[3.1.11.5]
  1402   外切脱氧核糖核酸酶V,α亚基(recD)[3.1.11.5]
  1403   假拟UPF02S8蛋白
  1404   离子蛋白酶(Ion)[3.4.21.-]
  1405   β-羟基酰基-(酰基-载体-蛋白)脱水酶FabA(fabA)[4.2.1.-]
  1406   保守性假拟蛋白
  1407   脂蛋白,推定的
  1408   核糖体蛋白S15(rpsO)
  1409   D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶/D-丙氨酰-D-丙氨酸-内肽酶(dacB)[3.4.16.4]
  1410   转录延伸因子greA(转录物切割因子greA)(greA)
  1411   保守性假拟蛋白TIGR00253
  1412   核糖体RNA大亚基甲基转移酶J(rrmJ)[2.1.1.-]
  1413   细胞分裂蛋白ftsH同源物1(ftsH)[3.4.24.-]
  1414   保守性假拟蛋白
  1415   在细菌中保守的未表征的蛋白(orf5)
  1416   硒基半胱氨酸裂合酶(CSD)[2.8.1.7]
  1417   ABC转运蛋白ATP-结合蛋白uup-1
  1418   ABC转运蛋白ATP-结合蛋白uup-1
  1419   细胞分裂蛋白ftsH同源物1(ftsH)[3.4.24.-]
  1420   HmcB(AP001508)
  1421   HmcC[3.4.22.-]
  1422   HmcD
  1423   亚精胺/腐胺-结合蛋白1前体(potD)
  1424   亚精胺/腐胺转运系统通透酶potC(potC)
  1425   亚精胺/腐胺转运系统通透酶蛋白potB(potB)
  1426   亚精胺/腐胺转运ATP-结合蛋白potA(potA)
  1427   肽酶T(pepT)[3.4.11.14]
  1428   蛋白(napA)
  1429   胞苷脱氨基酶(cdd)[3.5.4.5]
  1430   甲基转移酶,推定的
  1431   钠/脯氨酸同向转运蛋白(putP)
  1432   核糖核酸酶G(RNA酶G)(胞质轴向丝蛋白)(cafA)[3.1.4.-]
  1433   谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(glnS)[6.1.1.18]
  1434   YcgN
  1435   4-α-葡聚糖转移酶(malQ)[2.4.1.25]
  1436   1,4-α-葡聚糖分支酶(glgB)[2.4.1.18]
  1437   糖原去分支酶GlgX(glgX)[3.2.1.-]
  1438   葡萄糖-1-磷酸腺苷酰基转移酶(glgC)[2.7.7.27]
  1439   糖原合酶(淀粉[细菌糖原]合酶)(glgA)[2.4.1.21]
  1440   假拟蛋白
  1441   假拟蛋白
  1442   糖原磷酸化酶(glgP)[2.4.1.1]
  1443   NAD(P)转氢酶,α亚基(pntA)[1.6.1.1]
  1444   NAD(P)转氢酶亚基β(吡啶核苷酸转氢酶亚基β)(烟酰胺核苷酸转氢酶亚基β)(pntB)[1.6.1.2]
  1445   细菌调节蛋白,LysR家族(PA4174)
  1446   DNA拓扑异构酶(topA)[5.99.1.2]
  1447   酰基载体蛋白磷酸二酯酶(acpD)[3.1.4.14]
  1448   苏氨酰-tRNA合成酶(thrS)[6.1.1.3]
  1449   PqqL[3.4.99.-]
  1450   保守性假拟蛋白
  1451   钼-蝶呤-结合蛋白(mopl)
  1452   异化的亚硫酸还原酶,γ亚基(dsvC)[1.8.-.-]
  1463   YdaO蛋白
  1454   杀伤因子kicB(kicB)
  1455   染色体分配蛋白mukE(kicA)
  1456   MukB(mukB)
  1457   保守性假拟蛋白
  1458   整合膜蛋白
  1459   外切脱氧核糖核酸酶I(外切核酸酶I)(DNA脱氧核糖磷酸二酯酶)(dRP酶)(sbcB)[3.1.11.1]
  1460   磷酸调节子传感蛋白phoR(phoR)[2.7.3.-]
  1461   磷酸调节子转录调节蛋白phoB(phoB)
  1462   磷酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(pstB)[3.6.3.27]
  1463   磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PtsA(pstA)
  1464   磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PstC(pstC)
  1465   磷酸ABC转运蛋白,磷酸-结合蛋白(pstS)
  1466   非血.红素铁蛋白同源物(rsgA)
  1467   铁蛋白样蛋白2(rsgA)
  1468   可能的糖基转移酶
  1469   氨基苯甲酸合酶组件I(trpE)[4.1.3.27]
  1470   氨基苯甲酸合酶组件II(谷氨酰胺酰氨基-转移酶)(trpG)[4.1.3.27]
  1471   未表征的蛋白,4-草酰巴豆酸互变异构酶同源物
  1472   邻氨基苯甲酸磷酸核糖基转移酶(trpD)[2.4.2.18]
  1473   色氨酸生物合成蛋白trpCF[包括:吲哚-3-甘油磷酸合酶(IGPS);N-(5’-磷酸-核糖基)氨基苯甲酸异构酶(EC 5.3.1.24)(PRAI)](trpC)[4.1.1.48]
  1474   氢化酶装配侣伴蛋白HypC/HupF(hypC)
  1475   缬氨酰-tRNA合成酶(valS)[6.1.1.9]
  1476   修饰甲基化酶HindIII(腺嘌呤-特异性甲基转移酶HindIII)(M.HindIII)(hindIIIM)[2.1.1.72]
  1477   II型限制性酶HindIII(内切核酸酶HindIII)(R.HindIII)(hindIIIR)[3.1.21.4]
  1478   U FF0267蛋白
  1479   保守性假拟蛋白
  1480   DNA聚合酶III,χ亚基(holC)[2.7.7.7]
  1481   延胡索酸水化酶,II类(fumC)[4.2.1.2]
  1482   保守性假拟蛋白
  1483   蛋白trpH
  1484   二氢乳清酸脱氢酶(pyrD)[1.3.3.1]
  1485   保守性假拟蛋白
  1486   Eag0005
  1487   Eag0003
  1488   保守性假拟蛋白
  1489   保守性假拟蛋白
  1490   保守性假拟蛋白
  1491   保守性假拟蛋白
  1492   保守性假拟蛋白
  1493   假拟基板蛋白
  1404   保守性假拟蛋白
  1495   保守性假拟蛋白
  1496   假拟蛋白
  1497   保守性假拟蛋白
  1498   保守性假拟蛋白
  1499   假拟尾长卷尺测量蛋白
  1500   保守性假拟蛋白
  1501   保守性假拟蛋白
  1502   保守性假拟蛋白
  1503   保守性假拟蛋白
  1504   保守性假拟蛋白
  1505   保守性假拟蛋白
  1506   保守性假拟蛋白
  1507   保守性假拟蛋白
  1508   保守性假拟蛋白
  1509   保守性假拟蛋白
  1510   保守性假拟蛋白
  1511   蛋白traN
  1512   噬菌体-相关蛋白,HI1409家族
  1513   噬菌体末端酶,大亚基,PBSX家族
  1514   末端酶小亚基超家族
  1515   未知功能的蛋白质超家族
  1516   DNA-结合蛋白
  1517   保守性假拟蛋白
  1518   裂解酶
  1519   噬菌体穴蛋白,λ家族
  1520   保守性假拟蛋白
  1521   保守性假拟蛋白
  1522   整合酶
  1523   保守性假拟蛋白
  1524   厌氧性调节蛋白(fnr)
  1525   遍在应激蛋白E同源物
  1526   蛋白HI1427前体
  1527   磷酸核糖基甘氨酰胺甲酰转移酶(purN)[2.1.2.2]
  1528   磷酸核糖基甲酰基甘氨脒环-连接酶(purM)[6.3.3.1]
  1529   YdfG(AB032242)[1.-.-.-]
  1530   色氨酸合酶,β亚基(trpB)[4.2.1.20]
  1531   色氨酸合酶,α亚基(trpA)[4.2.1.20]
  1532   USG-1蛋白同源物(usg1)[1.2.1.-]
  1533   ybaK/ebsC蛋白(ybaK)
  1534   冷激样蛋白cspD(cspD)
  1535   未表征的蛋白家族(UPF0181)超家族
  1536   tRNA假尿苷合酶C(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)(orfx)[4.2.1.70]
  1537   tRNA假尿苷合酶C(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶水解酶)[4.2.1.70]
  1538   硫胺生物合成蛋白thil(thil)
  1539   外切脱氧核糖核酸酶VII,小亚基(xseB)[3.1.11.6]
  1540   牻牛儿基转移酶(法尼基-二磷酸合酶)(FPP合酶)(ispA)[2.5.1.10]
  1541   1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(dxs)[2.2.1.7]
  1542   转录调节物
  1543   严格性饥饿蛋白B同源物(sspB)
  1544   严格性饥饿蛋白A同源物(sspA)
  1545   核糖体蛋白S9(rpsl)
  1546   核糖体蛋白L13(rplM)
  1547   5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(metF)[1.7.99.5]
  1548   脱硫生物素合成酶(bioD)[6.3.3.3]
  1549   在细菌中保守的未表征的蛋白
  1550   GTP环式水解酶I(folE)[3.5.4.16]
  1551   钼蛋白生物合成蛋白moeA(moeA)
  1552   钼蛋白生物合成蛋白moeB(moeB)
  1553   假拟UPF0263蛋白
  1554   蛋白HI1453前体(硫氧还蛋白)[1.8.4.6]
  1555   细胞色素c-型生源蛋白ccdA(ccdA)[4.4.1.17]
  1556   肽甲硫氨酸亚砜还原酶msrA/msrB[包括:肽甲硫氨酸亚砜还原酶msrA(蛋白-甲硫氨酸-S-氧化物还原酶)(肽Met(O)还原酶);肽甲硫氨酸亚砜还原酶msrB](msrA)[1.8.4.5]
  1557   脂蛋白,推定的
  1558   HI1457前体
  1559   Eag0009
  1560   未命名的蛋白质产物;类似于转录起始因子σ同源物(σ-W)
  1561   侵袭素前体(外膜粘附素)
  1562   假拟蛋白
  1563   假拟蛋白
  1564   RND流出系统,外膜脂蛋白,NodT家族亚家族
  1565   流感嗜血杆菌的预测编码区HI1462.1(LEA)
  1566   铁色素-铁外膜受体蛋白
  1567   细胞分裂蛋白ftsH同源物1(ftsH)[3.4.24-]
  1568   细胞分裂蛋白ftsH同源物1(ftsH)[3.4.24.-]
  1569   二氢蝶酸合酶(folP)[2.5.1.15]
  1570   磷酸葡糖胺变位酶(glmM)[5.4.2.-]
  1571   磷酸组氨酸磷酸酶SixA(sixA)[3.1.3.-]
  1572   假拟tonB-依赖性受体HI1466.1
  1573   假拟ABC转运蛋白ATP-结合蛋白
  1574   ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(ALD)
  1575   核糖体蛋白S15(rpsO)
  1576   钼-结合周质蛋白
  1577   铁(III)
  1578   ABC-型铁转运系统,通透酶组件CAC1990(III)
  1579   蛋白HI1472前体(III)
  1580   modD蛋白(modD)
  1581   FbpC(III)[3.6.325]
  1582   NifC-样ABC-型门蛋白(porter)
  1583   钼ABC转运蛋白,周质钼酸-结合蛋白(modA)
  1584   ADP-庚糖合酶(rfaE)[2.7.-.-]
  1585   假拟蛋白
  1586   脂质A生物合成月桂酰酰基转移酶(htrB)[2.3.1.-]
  1587   DNA拓扑异构酶IV,B亚基(parE)[5.99.1.-]
  1588   DNA拓扑异构酶IV,A亚基(parC)[5.99.1.-]
  1589   钠/谷氨酸同向转运蛋白(gltS)
  1590   RimK(rimK)[6.3.2.-]
  1591   谷氧还蛋白,GrxA家族(grxA)
  1592   3-氧酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶I(β-酮酰基-ACP合酶I)(KAS I)(fabB)[2.3.1.41]
  1593   未知功能的蛋白质(DUF752)家族
  1594   LicA蛋白(licA)
  1595   lic-1蛋白B(iicB)
  1596   蛋白licC(licC)
  1597   lic-1蛋白D(licD)
  1598   lic-1蛋白D(licD)
  1599   信号肽肽酶SppA,67K型(sppA)[3.4.-.-]
  1600   蛋白y djA[1.-.-.-]
  1601   保守性假拟蛋白
  1602   NAD(P)H氧化还原酶BH2748[1.6.99.-]
  1603   Na/二羧酸同向转运蛋白
  1604   ImpA(R391)[3.4.21.-]
  1605   磷酸-2-脱氢~3-脱氧庚酸醛缩酶[2.5.1.54]
  1606   脂蛋白释放系统,跨膜蛋白LolE(LolE)
  1607   脂蛋白释放系统,ATP-结合蛋白(lolD)
  1608   脱硫生物素合酶(bioD)[6.3.3.3]
  1609   生物素生物合成蛋白BioC(bioC)
  1610   未知功能的蛋白质(DUF452)超家族
  1611   8-氨基-7-氧代壬酸合酶(bioF)[2.3.1.47]
  1612   腺苷甲硫氨酸-8-氨基-7-氧代壬酸氨基转移酶(bioA)[2.6.1.62]
  1613   脂蛋白释放系统跨膜蛋白lolC
  1614   乳酸脱氢酶[1.1.1.29]
  1615   3-脱氧-8-磷酸辛酮酸合酶(kdsA)[2.5.1.55]
  1616   蛋白sirB1
  1617   HemK蛋白同源物(M.HindHemKP)(hemK)[2.1.1.-]
  1618   RDD家族超家族
  1619   肽链释放因子1(prfA)
  1620   蛋白-相关蛋白
  1621   在细菌中保守的未表征的蛋白
  1622   保守性假拟蛋白
  1623   保守性假拟蛋白
  1624   可能的尾丝蛋白(ORF31)
  1625   Eag0003
  1626   保守性假拟蛋白
  1627   保守性假拟蛋白
  1628   Mu-样原噬菌体FluMu蛋白gp46
  1629   基板装配蛋白V,可能是NMB1111
  1630   噬菌体Mu P蛋白
  1631   噬菌体病毒体蛋白,可能是NMB1109,假拟
  1632   假拟蛋白
  1633   保守性假拟蛋白
  1634   可能的转座酶蛋白
  1635   复制蛋白,推定的
  1636   复制蛋白
  1637   保守性假拟蛋白
  1638   调节蛋白
  1639   类似于噬菌体λ的CI阻抑物
  1640   假拟蛋白
  1641   假拟蛋白
  1642   假拟蛋白
  1643   假拟蛋白
  1644   丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PK-1(stoPK-1)[2.7.1.37]
  1645   蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶[3.1.3.-]
  1646   KilA-N结构域家族
  1647   原噬菌体CP4-57整合酶
  1648   假拟蛋白
  1649   丙酮酸激酶(pyk)[2.7.1.40]
  1650   假拟蛋白
  1651   复制性DNA解旋酶(dnaB)[3.6.1.-]
  1652   丙氨酸消旋酶(air)[5.1.1.1]
  1653   葡萄糖-6-磷酸异构酶(pgi)[5.3.1.9]
  1654   15kd肽聚糖-相关外膜脂蛋白前体(lpp)
  1656   假拟脂蛋白PM0553前体
  1656   蛋白yecM
  1657   精氨酰-tRNA合成酶(argS)[6.1.1.19]
  1658   乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN)[2.2.1.6]
  1659   乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成型(iivB)[2.2.1.6]
  1660   Na+/H+反向转运蛋白
  1661   DNA-结合蛋白H-NS同源物(hns)
  1662   甲酰四氢叶酸脱甲基酶(purU)[3.5.1.10]
  1663   3-磷酸莽草酸1-羧基乙烯基转移酶(aroA)[2.5.1.19]
  1664   ATP酶-样蛋白(假拟)
  1665   外膜脂蛋白载体蛋白LolA(lolA)
  1666   DNA易位酶ftsK
  1667   亮氨酸-反应性调节蛋白(ftp)
  1668   DNA修复蛋白RadA(radA)
  1669   Rd1598
  1670   保守性假拟蛋白
  1671   未知功能的蛋白质(DUF692)超家族
  1672   EF手结构域蛋白
  1673   假拟蛋白
  1674   未表征的保守性膜蛋白(COG2259)
  1675   保守性假拟蛋白TIGR00153
  1676   pho4家族蛋白VC2442
  1677   保守性假拟蛋白
  1678   tRNA核苷酸转移酶(tRNA腺苷酰转移酶)(tRNA CCA-焦磷酸化酶)(CCA-加成酶)(cca)[2.7.7.25]
  1679   外膜脂蛋白LolB(lolB)
  1680   4-二磷酸胞苷酰-2C-甲基-D-赤藓醇激酶(ispE)[2.7.1.148]
  1681   核糖-磷酸焦磷酸激酶(RPPK)(磷酸核糖基焦磷酸合成酶)(P-Rib-PP合成酶)(PRPP合成酶)(prsA)[2.7.6.1]
  1682   酪氨酰-tRNA合成酶(tyrS)[6.1.1.1]
  1683   糖发酵刺激蛋白(sfsA)
  1684   多药物抗性蛋白NorM
  1685   核黄素合酶,α亚基(ribE)[2.5.1.9]
  1686   氨基肽酶N(α-氨基酰基肽水解酶)(pepN)[3.4.11.2]
  1687   大菌毛亚基前体(大菌毛蛋白)
  1688   磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,催化亚基(purE)[4.1.1.21]
  1689   磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,ATP酶亚基(purK)[4.1.1.21]
  1690   天冬氨酸氨基转移酶(转氨酶A)(ASPAT)(aspC)[2.6.1.1]
  1691   钴转运ATP-结合蛋白CbiO(cbiO)
  1692   钴膜转运蛋白CbiQ
  1693   CbiM
  1694   保守性假拟蛋白
  1695   蛋白HI1624前体
  1696   HTH-型转录调节物zntR同源物(merR2)
  1697   29kDa蛋白
  1698   膜蛋白,推定的
  1699   翻译起始抑制物
  1700   未知功能的蛋白质(DUF1043)超家族
  1701   可能的DedA家族的完整膜蛋白(dedA)
  1702   核糖体L25p家族
  1703   赖氨酸-敏感性天冬氨酸激酶III[2.7.2.4]
  1704   腺苷酸琥珀酸合成酶(purA)[6.3.4.4]
  1705   2,3,4,5-四氢吡啶-2,6-二羧酸N-琥珀酰转移酶(dapD)[2.3.1.117]
  1706   HTH-型转录阻抑物purR(嘌呤核苷酸合成阻抑物)(purR)
  1707   磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)[4.1.1.31]
  1708   YcjX
  1709   肽转运周质蛋白sapA前体(sapA)
  1710   肽转运系统通透酶蛋白sapB(sapB)
  1711   肽转运系统通透酶蛋白sapC(sapC)
  1712   肽转运系统ATP-结合蛋白sapD(sapD)
  1713   肽转运系统ATP-结合蛋白sapF(sapF)
  1714   膜蛋白,推定的
  1715   tRNA假尿苷合酶A(truA)[4.2.1.70]
  1716   果糖-1,6-双磷酸酶(fbp)[3.1.3.11]
  1717   吡哆醇生物合成蛋白
  1718   2-脱氧-鲨肌醇-肌醇单酮合酶20kDa亚基
  1719   D-乳酸脱氢酶(dld)[1.1.1.28]
  1720   I型位点-特异性脱氧核糖核酸酶HsdR[3.1.21.3]
  1721   需氧呼吸控制传感蛋白[2.7.3.-]
  1722   脂蛋白spr前体(spr)
  1723   TldD(CSRA)
  1724   保守性假拟蛋白TIGR00096
  1725   LppC
  1726   保守性假拟蛋白TIGR00252
  1727   保守性可能的磷酸庚糖异构酶(gmhA)[5.-.-.-]
  1728   21kDa溶血素前体
  1729   核糖核苷-二磷酸还原酶α链(nrdA)[1.17.4.1]
  1730   核糖核苷-二磷酸还原酶,β亚基[1.17.4.1]
  1731   2-酮戊二酸脱氢酶,E2组件,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(sucB)[2.3.1.61]
  1732   2-酮戊二酸脱氢酶,E1组件(sucA)[1.2.4.2]
  1733   金属-β-内酰胺酶超家族蛋白[3.-.-.-]
  1734   3.1.21.-[3.1.21-]
  1735   细菌未知功能的蛋白质(DUF882)超家族
  1736   细胞壁降解蛋白(AE005282)
  1737   尾-特异性蛋白酶前体(蛋白酶Re)-(C-末端-加工肽酶)(prc)[3.4.21.102]
  1738   ProQ
  1739   百草枯-可诱导的蛋白A
  1740   蛋白(片段)
  1741   钼蛋白转换因子亚基2(MPT合酶亚基2)(钼蛋白合酶亚基2)(钼辅因子生物合成蛋白E)(钼蛋白转换因子大亚基)(moaE)
  1742   钼蛋白转换因子,亚基1(moaD)
  1743   钼辅因子生物合成蛋白C(moaC)
  1744   钼辅因子生物合成蛋白A(moaA)
  1745   NorA
  1746   KpsF(kpsF)[5.-.-.-]
  1747   3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸8-磷酸磷酸酶(KDO 8-P磷酸酶)[3.1.3.45]
  1748   假拟膜蛋白,TIGR01666(yccS)
  1749   蛋白HI1681前体
  1750   可能的蛋白酶sohB(sohB)[3.4.21.-]
  1751   电子转运复合物蛋白rnfA[1.6.5.-]
  1752   电子转运复合物蛋白rnfB
  1753   电子转运复合物蛋白rnfC
  1754   电子转运复合物蛋白rnfD[1.6.5.-]
  1755   电子转运复合物蛋白rnfG(rnfG)
  1756   电子转运复合物蛋白rnfE[1.6.5.-]
  1757   内切核酸酶III(nth)[4.2.99.18]
  1758   钠-依赖性转运蛋白(SNF家族)
  1759   钼ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(modC)[3.6.3.29]
  1760   钼酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(modB)
  1761   钼ABC转运蛋白,周质钼酸-结合蛋白(modA)
  1762   转录调节物modE(modE)
  1763   未命名的蛋白质产物[2.-.-.-]
  1764   糖基转移酶[2.-.-.-]
  1765   未命名的蛋白质产物[2.-.-.-]
  1766   糖基转移酶(假拟)[2.-.-.-]
  1767   2.4.99.-[2.4.99.-]
  1768   多糖生物合成蛋白结构域蛋白
  1769   未表征的ACR,COG1434家族
  1770   5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-高半胱氨酸S-甲基转移酶(metE)[2.1.1.14]
  1771   预测的通透酶
  1772   预测的通透酶
  1773   胞质溶胶氨基肽酶(亮氨酸氨基肽酶)(LAP)(亮氨酰氨基肽酶)(pepA)[3.4.11.1]
  1774   转运蛋白,BCCT家族NMB1277(betT)
  1775   传感蛋白qseC[2.7.3.-]
  1776   转录调节蛋白qseB
  1777   保守性假拟蛋白TIGR00156
  1778   Pmi
  1779   Pmi(PMI)[5.3.1.8]
  1780   磷酸转移酶系统酶II,葡萄糖-特异性,因子III(crr)[2.7.1.69]
  1781   磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶(ptsl)[2.7.3.9]
  1782   磷酸载体蛋白HPr(含有组氨酸的蛋白)(ptsH)[2.7.1.69]
  1783   3.6.1.-[3.6.1.-]
  1784   寡核糖核酸酶[3.1.-.-]
  1785   十一异戊二烯基-磷酸α-N-乙酰葡糖胺基转移酶(rfe)[2.7.8.-]
  1786   蛋白-P-II尿苷酰基转移酶(glnD)[2.7.7.59]
  1787   甲硫氨酸氨基肽酶,I型(map)[3.4.11.18]
  1788   蛋白
  1789   未表征的蛋白家族(UPF0231)超家族
  1790   青霉素-结合蛋白1B(mrcB)
  1791   假拟蛋白
  1792   磷酸核糖基氨基咪唑-琥珀酸羧酰胺合酶(purC)[6.3.2.6]
  1793   精氨琥珀酸合酶(argG)[6.3.4.5]
  1794   转运蛋白蛋白
  1795   蛋白(lamB)
  1706   脲酰氨基裂合酶-相关蛋白
  1797   保守性假拟蛋白TIGR00370
  1798   hsf
  1799   外切核糖核酸酶H(rnb)[3.1.13.1]
  1800   烯酰-[酰基-载体-蛋白]还原酶(NADH2)(fabl)[1.3.1.9]
  1801   肽链释放因子3(prfC)
  1802   保守性假拟蛋白
  1803   支链氨基酸转运蛋白azlD(braE)
  1804   支链氨基酸转运蛋白AzlC(azlC)
  1805   HTH-型转录调节物metR(metR)
  1806   L-乳酸脱氢酶(细胞色素)(lctD)[1.1.2.3]
  1807   谷氨酸消旋酶(murl)[5.1.1.3]
  1808   ATP-依赖性DNA解旋酶RecG(recG)[3.6.1.-]
  1809   尿苷-3’,5’-双(二磷酸)3’-焦磷酸水解酶((ppGpp)酶)(五-磷酸鸟苷-3’-)焦磷酸水解酶)(spoT)[3.1.7.2]
  1810   DNA-指导的RNA聚合酶ω链(RNAPω亚基)(转录酶ω链)(RNA聚合酶ω亚基)(rpoZ)[2.7.7.6]
  1811   鸟苷酸激酶(GMP激酶)(gmk)[2.7.4.8]
  1812   甘油醛3-磷酸脱氢酶(GAPDH)(gapdH)[1.2.1.12]
  1813   保守性假拟蛋白
  1814   保守性假拟蛋白
  1815   保守性假拟蛋白
  1816   菌毛蛋白hifB
  1817   噬菌体整合酶家族结构域蛋白
  1818   噬菌体整合酶家族结构域蛋白
  1819   保守性假拟蛋白
  1820   AcrB/AcrD/AcrF家族蛋白(AP001520)
  1821   苯醌氧化还原酶(人)[1.1.1.-]
  1822   砷-抗性蛋白acr3
  1823   调节蛋白(merR2)
  1824   阳离子流出家族蛋白超家族
  1825   类似于可能的砷抗性膜蛋白ArsB(ArsB)
  1826   砷酸还原酶(arsC)[1.20.4.1]
  1827   ArsR样蛋白(AF173880)
  1828   RC180
  1829   ParB-相关蛋白
  1830   保守性假拟蛋白
  1831   预测的蛋白
  1832   保守性假拟蛋白
  1833   小菌毛亚基hifE前体
  1834   小菌毛亚基hifD前体(piCA)
  1835   外膜引导蛋白hifC前体
  1836   假拟蛋白
  1837   araC-型糖代谢调节物
  1838   gp15
  1839   假拟蛋白
  1840   假拟蛋白
  1841   KIAA0853蛋白,推定的
  1842   原噬菌体π1蛋白11,重组酶(P33)
  1843   假拟蛋白
  1844   单链DNA-结合蛋白(SSB)
  1845   转录调节物,Cro/CI家族
  1846   假拟蛋白
  1847   重组内切核酸酶
  1848   延伸因子Tu(EF-Tu)
  1849   基因50蛋白
  1850   P蛋白,推定的
  1851   Sb42
  1852   Roi
  1853   噬菌体调节蛋白YPO2100
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[150]Erdile等,(1993)Infect Immun 61:81-90。

Claims (17)

1.一种多肽,其包含与以下一种或多种序列有至少75%序列相同性的氨基酸序列:SEQ ID NOS:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、220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2.如权利要求1所述的多肽,其包含以下一种或多种氨基酸序列:SEQ ID NOS:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2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3.一种多肽,其包含由以下一种或多种序列中的至少7个连续氨基酸构成的片段:SEQ ID NOS:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1050、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202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4.如权利要求3所述的多肽,其特征在于,所述片段包含SEQ ID NO:氨基酸序列的T细胞或B细胞表位。
5.结合上述权利要求中任一项所述多肽的抗体。
6.如权利要求5所述的抗体,其为单克隆抗体。
7.一种核酸,其包含与以下一种或多种序列有至少75%序列相同性的核苷酸序列:SEQ ID NOS:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243.245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、-1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、J927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、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8.如权利要求7所述的核酸,其包含选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NOS:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、17I5173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、2205、2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9.可在高严格性条件下与权利要求8所述核酸杂交的核酸。
10.一种核酸,其包含由以下一种或多种序列中的10个或更多连续核苷酸构成的片段:SEQ ID NOS:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、 313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、66%671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201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11.编码如权利要求1-4中任一项所述多肽的核酸。
12.一种组合物,其包含:(a)如上述任一权利要求所述的多肽、抗体和/或核酸;和(b)药学上可接受的载体。
13.如权利要求12所述的组合物,其还包含疫苗佐剂。
14.如权利要求1-11中任一项所述的核酸、多肽或抗体,其被用作药物。
15.一种治疗患者的方法,所述方法包括给予所述患者治疗有效量的如权利要求12所述的组合物。
16.如权利要求1-11中任一项所述的核酸、多肽或抗体在制造用于治疗或预防由流感嗜血杆菌造成的疾病和/或感染的药物中的应用。
17.如权利要求15所述的方法或如权利要求16所述的应用,用于预防细菌性脑膜炎。
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