CN101489565A - 调节pcsk9表达的化合物和方法 - Google Patents

Abstract

本公开描述了短反义化合物，包括含有长度为8－16个经化学修饰的高亲和性单体的此类化合物。特定的此类短反义化合物可用于以更高的效力和更好的治疗指标减少细胞、组织和动物中的靶核酸和/或蛋白质。由此，本文提供了这样的短反义化合物，它们包含高亲和性的核苷酸修饰，可用于在体内减少靶RNA。这样的短反义化合物与先前描述的反义化合物相比在更低的剂量上有效，从而为降低毒性和治疗花费提供了可能。此外，本文描述的短反义化合物具有更大的口服给药的潜力。

Description

调节PCSK9表达的化合物和方法

序列表

本发明与电子格式的序列表共同提交。提供的序列表是2007年5月7日生成的名为CORE0061WO10SEQ.TXT的文件，大小为700Kb。电子格式的序列表信息通过提述整体并入本文。

发明背景

近40年前首次提出靶向导致疾病的基因序列(Belikova等，Tet.Lett.，1967，37，3557-3562)，而十年之后在细胞培养物中证明了反义活性(antisenseactivity)(Zamecnik等，Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  U.S.A.，1978，75，280-284)。在治疗由导致疾病的基因形成的疾病或状况方面反义技术的一个优点是：它是直接的遗传学方法，具有调节特定的导致疾病的基因表达的能力。

通常反义技术的机理是反义化合物与靶核酸杂交并实现对基因表达活性或功能(如转录、翻译或剪接)的调节。基因表达的调节可以通过例如靶向降解或基于占位的抑制来实现。一个通过降解调节RNA靶功能的实例是所述靶RNA与DNA样的反义化合物杂交时基于RNase H的降解。另一个通过靶降解调节基因表达的实例是RNA干扰(RNAi)。RNAi是反义介导的涉及dsRNA引入的基因沉默形式，其导致靶向的内源性mRNA水平的序列特异性降低。序列特异性使反义化合物用作下列目的极具吸引力：作为靶确认和基因功能化的工具，以及作为鉴定和表征核酸酶的研究工具和作为选择性调节涉及多种疾病中任一种的病理发生的基因表达的治疗剂。

反义技术是降低一种或多种特定基因产物表达的有效方法，因而可证明在多种治疗、诊断和研究应用中有独特的用处。化学修饰的核苷常规地用于掺入反义化合物以增强一种或多种性质，如核酶耐受性、药代动力学或对靶RNA的亲和性。

反义技术发现以来，尽管知识扩展，还是有对具有更高效力、降低的毒性和更低价格的反义化合物的未满足的需求。直到本公开内容，高亲和性修饰还未用于设计在体内减少靶RNA的短反义化合物。这是由于针对15个核苷酸或更短的序列用于在生命系统中减少标靶时靶向特异性的程度这一问题的考虑。以前的研究描述过的特异性越强因而潜在的效力越强是由长度为16-20个核碱基的反义化合物获得的。

本公开内容描述的是将化学修饰的高亲和性核苷酸掺入反义化合物，使长度为约8-16个核碱基的短反义化合物在降低动物中的靶RNA时有用，并具有增强的效力和提高的治疗指标(therapeutic index)。因此，本文提供的是用于降低体内靶RNA、含有高亲和性核苷酸修饰的短反义化合物。与以前描述过的反义化合物相比，此类短反义化合物在更低剂量时是有效的，实现了毒性和治疗费用的降低。

发明概述

本文公开的是短反义化合物和使用所述化合物降低细胞或组织中靶RNA表达的方法。在某些实施方案中，本文提供的是降低动物中靶表达的方法，包括对动物施用靶向于此类标靶的核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，短反义化合物是寡核苷酸化合物。在某些实施方案中，短反义寡核苷酸的长度约8-16，优选9-15，更优选9-14，更优选10-14个核苷酸，并包含有翼位于每边侧面的缺口区，而每个翼独立地由1-3个核苷酸组成。优选的基序包括但不限于选自3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的翼-脱氧缺口-翼基序。在一个优选的实施方案中，短反义寡核苷酸包含至少一个高亲和性修饰。在另一个实施方案中，高亲和性修饰包括化学修饰的高亲和性核苷酸。在一个优选的实施方案中，每个翼独立地由1-3个高亲和性修饰的核苷酸组成。在一个实施方案中，高亲和性修饰的核苷酸是糖修饰的核苷酸。

在某些实施方案中，与更长的反义化合物相比，短反义化合物在消化道(gut)中表现出更强的摄取。因此，本文也提供在动物中降低标靶的方法，包括口服本发明的短反义化合物。

在某些实施方案中，短反义化合物靶向于编码蛋白质的核酸，所述蛋白质选自ApoB、SGLT2、PCSK9、SOD1、CRP、GCCR、GCGR、DGAT2、PTP1B和PTEN。

本发明也提供治疗动物代谢病症的方法，包括对需要这样的治疗的动物施用短反义化合物，其靶向于涉及调控葡萄糖代谢或清除(clearance)、脂质代谢、胆固醇代谢或胰岛素信号传导的核酸。

本发明也提供提高动物中胰岛素敏感性、降低血糖或降低HbA_1c的方法，  包括对所述动物施用靶向于编码标靶的核酸的短反义化合物，所述标靶涉及葡萄糖代谢或清除、脂质代谢、胆固醇代谢或胰岛素信号传导的调控。

本发明也提供降低动物中总血清胆固醇、血清LDL、血清VLDL、血清HDL、血清甘油三酯、血清载脂蛋白(a)或游离脂肪酸的方法，包括对所述动物施用靶向于编码标靶的核酸的短反义化合物，所述标靶涉及葡萄糖代谢或清除、脂质代谢、胆固醇代谢或胰岛素信号传导的调节，其中所述短反义化合物长度为8-16个核苷酸并含有有翼位于每边侧面的缺口区，而每个翼独立地由1-3个高亲和性修饰的核苷酸组成。

涉及对葡萄糖代谢或清除、脂质代谢、胆固醇代谢或胰岛素信号传导的调节的特定靶包括但不限于GCGR和ApoB-100。因此，本发明提供的是靶向于编码GCGR和ApoB-100的核酸的短反义化合物和降低动物中所述靶和/或靶核酸的表达的方法。此外，本发明提供的是靶向于编码GCGR和ApoB-100的核酸的短反义化合物用于治疗代谢或心血管疾病或状况的用途。

在某些实施方案中，短反义化合物还包含缀合基团。缀合基团包括但不限于C₁₆和胆固醇。

在某些实施方案中，短反义化合物包含至少一个修饰的核碱基、核苷间连接或糖模块(moiety)。在某些实施方案中，此类修饰的核苷间连接是硫代磷酸酯核苷间连接。在某些实施方案中，每个核苷间连接是硫代磷酸酯核苷间连接。

在某些实施方案中，短反义化合物包含至少一个高亲和性修饰。在某些此类的实施方案中，高亲和性修饰是化学修饰的高亲和性核苷酸。在某些实施方案中，化学修饰的高亲和性核苷酸是糖修饰的核苷酸。在某些实施方案中，至少一个糖修饰的核苷酸在糖的4’和2’位置间包含桥接(bridge)。每个糖修饰的核苷酸独立地为β-D或α-L糖构象。在某些实施方案中，每个所述高亲和性修饰的核苷酸为T_m值贡献每核苷酸至少1到4度。在某些实施方案中，每个所述糖修饰的核苷酸包含非H或OH的2’取代基。此类糖修饰的核苷酸包括那些具有4’到2’桥接的双环糖模块的核苷酸。在某些实施方案中，  2’取代基独立地为烷氧基、取代的烷氧基或卤素。在某些实施方案中，每个2’取代基为OCH₂CH₂OCH₃(2′-MOE)。

在某些实施方案中，短反义化合物具有一个或多个在糖的4’和2’位置之间含有桥接的糖修饰的核苷酸，其中所述每个桥接独立地包含2到4个独立地选自下组的连接基团：-[C(R₁)(R₂)]_n-、-C(R₁)＝C(R₂)-、-C(R₁)＝N-、-C(＝NR₁)-、-C(＝O)-、-C(＝S)-、-O-、-Si(R₁)₂-、-S(＝O)_x-和-N(R₁)-；

其中

x为0、1或2；

n为1、2、3或4；

R₁和R₂独立地为H、保护基团、羟基、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₂-C₁₂炔基、取代的C₂-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C₅-C₇脂环基、取代的C₅-C₇脂环基、卤素、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、COOJ₁、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(＝O)₂-J₁)或亚磺酰基(S(＝O)-J₁)；并且

每个J₁和J₂独立地为H、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₂-C₁₂炔基、取代的C₂-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C₁-C₁₂氨基烷基、取代的C₁-C₁₂氨基烷基或保护基团。

一方面，每个所述的桥接独立地为-[C(R₁)(R₂)]_n-、-[C(R₁)(R₂)]_n-O-、-C(R₁R₂)-N(R₁)-O-或-C(R₁R₂)-O-N(R₁)-。另一方面，每个所述的桥接独立地为4′-(CH₂)₃-2′、4′-(CH₂)₂-2′、4′-CH₂-O-2′、4′-(CH₂)₂-O-2′、4′-CH₂-O-N(R₁)-2′和4′-CH₂-N(R₁)-O-2′-，其中每个R₁独立地为H、保护基团或C₁-C₁₂烷基。

在某些实施方案中，本文提供的是用于降低动物中与疾病状态相关的靶和/或靶RNA的短反义化合物。在某些实施方案中，本文提供的是使用短反义化合物降低动物中靶RNA表达的方法。在某些实施方案中，本文提供的是短反义化合物在制备治疗动物代谢病症的药物中的用途。在某些实施方案中，本文提供的是短反义化合物在制备用于在动物中增加胰岛素敏感性、降低血糖或降低HbA_1c的药物中的用途。本文还提供的是短反义化合物在制备用于在动物中降低总血清胆固醇、血清LDL、血清VLDL、血清HDL、血清甘油三酯、血清载脂蛋白(a)或游离脂肪酸的药物中的用途。

在某些实施方案中，本文提供的短反义化合物与长度为至少20个核苷酸的更长亲本反义寡核苷酸相比，在靶RNA敲低方面表现出同等的或增强的效力。在某些实施方案中，短反义化合物与亲本反义寡核苷酸相比表现出更快的作用(靶RNA减少)启动。在某些实施方案中，增强的效力在肾脏中。在某些实施方案中，靶RNA主要在肾脏中表达。在某些实施方案中，增强的效力在肝脏中。在某些实施方案中，靶RNA主要在肝脏中表达。

发明详述

如此处申明的，应当理解，前面的综述和以下的详述仅是示例性和阐述性的，并不作为本发明的限制。除非特别地另作说明，此处单数形式的使用包括复数形式。除非另作说明，本文使用的“或”意为“和/或”。此外，术语“包括(including)”和其他形式，如“包括(includes)”或“包括(included)”的使用是非限制性的。另外，除非特别地另作说明，术语如“元件”或“组分”既包括含有-个单位的元件和组分，也包括含有多于一个亚单位的元件和组分。

本文使用的章节标题仅为了有条理的目的而不应当理解为限制所述主题的目的。本发明所引用的所有的文件或文件的部分(包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍和专题论文)明确地为了任何目的通过提述整体并入本文。美国专利申请流水号10/712,795和10/200,710在此明确地为了任何目的通过提述整体并入本文。

A.定义

除非提供特定的定义，使用的关于本文描述的如下领域的流程和技术的术语是本领域公知的和普遍使用的：分析化学、合成有机化学、和药物与制药化学的流程和技术。标准技术可以用于化学合成、化学分析、药物制备、配制与递送、和对受试者的治疗。某些此类的技术和流程可以在下列文献中找到，例如“Carbohydrate Modifications in Antisense Research”Sangvi andCook编辑，American Chemical Society，Washington D.C.，1994；和″Remington′s Pharmaceutical Sciences，″Mack Publishing Co.，Easton，Pa.，18thedition，1990；和为任何目的通过提述并入本文的文献。在允许的情况下(where permitted)，本公开内容全文中提到的所有专利、申请、公布的申请和其他出版物和来自GenBank和其他数据库的序列均通过提述整体并入本文。

除非另外说明，下列术语具有以下含义：

本文使用的术语“核苷”是指含有核碱基和糖的葡基胺(glycosylamine)。核苷包括但不限于天然存在的核苷、脱碱基核苷(abasic nucleoside)、修饰的核苷和具有相似碱基和/或糖基的核苷。

本文使用的术语“核苷酸”是指含有核碱基和糖(其含有与糖共价连接的磷酸基团)的葡糖胺(glycosomine)。核苷酸可以由多种取代基中的任一种进行修饰。

本文使用的术语“核碱基”是指核苷或核苷酸的碱基部分。核碱基可含有能够与另一个核酸的碱基形成氢键的任何原子或原子组合。

本文使用的术语“杂环碱基模块”是指含有杂环的核碱基。

本文使用的术语“脱氧核糖核苷酸”是指在核苷酸糖模块的2’位置具有氢的核苷酸。脱氧核糖核苷酸可以由多种取代基中的任一种进行修饰。

本文使用的术语“核糖核苷酸”是指在核苷酸糖模块的2’位置具有羟基的核苷酸。核糖核苷酸可以由多种取代基中的任一种进行修饰。

本文使用的术语“寡聚化合物”是指包含两个或更多个亚结构并能够与核酸分子的区域杂交的多聚结构。在某些实施方案中，寡聚化合物是寡聚核苷。在某些实施方案中，寡聚化合物是寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物是反义化合物。在某些实施方案中，寡聚化合物是反义寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物是短反义化合物。在某些实施方案中，寡聚化合物是短反义寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物是嵌合寡核苷酸。

本文使用的术语“单体”是指寡聚物的单个单元。单体包括但不限于无论是天然存在的还是修饰的核苷和核苷酸。

本文所使用的“寡聚核苷”是指核苷间连接不含有磷原子的寡核苷酸。

本文使用的术语“寡核苷酸”是指含有多个连接的核苷酸的寡聚化合物。在某些实施方案中，寡核苷酸的一个或多个核苷酸是修饰的。在某些实施方案中，寡核苷酸包含核糖核酸(RNA)或脱氧核糖核酸(DNA)。在某些实施方案中，寡核苷酸由天然和/或非天然存在的核碱基、糖和共价核苷酸间连接组成，并还可包括非核酸缀合物。

本文所使用的“核苷酸间连接”是指相邻核苷酸之间的共价连接。

本文使用的术语“单体连接”是指两个单体之间的共价连接。单体连接包括但不限于核苷酸间连接和核苷间连接。

本文所使用“天然存在的核苷酸间连接”是指3’到5’的磷酸二酯连接。

本文使用的术语“反义化合物”是指同与其可杂交的靶核酸分子至少部分地互补的寡聚化合物。在某些实施方案中，反义化合物调节(增强或降低)靶核酸的表达。反义化合物包括但不限于寡核苷酸、寡聚核苷、寡核苷酸类似物、寡核苷酸模拟物(mimetic)等化合物和这些化合物的嵌合组合物。因此，尽管所有反义化合物都是寡聚化合物，但并非所有的寡聚化合物都是反义化合物。

本文使用的术语“反义寡核苷酸”是指为寡核苷酸的反义化合物。

本文使用的术语“亲本反义寡核苷酸”是指长度为20个核苷酸的寡核苷酸，其具有10个2′-脱氧核糖核苷酸的脱氧缺口区，该缺口区侧翼是各自具有5个2’-O-(2-甲氧乙基)核糖核苷酸的第一和第二翼区(5-10-5MOE缺口聚物)，并且所述长度为20个核苷酸的寡核苷酸包含将其作为亲本的短反义化合物对应的序列。

本文使用的术语“短反义化合物”是指长度约为8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的反义化合物。在某些实施方案中，短反义化合物具有至少一个高亲和性修饰。

本文使用的术语“短反义寡核苷酸”是指长度约为8、9、10、11、12、13、14、15或16个核苷酸的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，短反义寡核苷酸具有至少一个高亲和性修饰。

本文使用的术语“短缺口聚物”是指具有第一和第二翼区和长度为2到14个核碱基的缺口区的短反义寡核苷酸，其中每个翼区独立地为1到3个核苷酸长。

本文使用的术语“基序”是指短反义化合物中未修饰的和修饰的核苷酸的模式。

本文使用的术语“嵌合反义寡聚物”是指至少一个糖、核碱基或核苷间连接与同一反义寡聚化合物内至少一个其它的糖、核碱基或核苷间连接相比时有不同修饰的反义多聚化合物。其余的糖、核碱基和核苷间连接可以独立地为修饰的或未修饰的、相同的或不同的。

本文使用的术语“嵌合反义寡核苷酸”是指至少一个糖、核碱基或核苷间连接与同一反义寡核苷酸内至少一个其它的糖、核碱基或核苷间连接相比时有不同修饰的反义寡核苷酸。其余的糖、核碱基和核苷间连接可以独立地为修饰的或未修饰的、相同的或不同的。

本文使用的术语“混合主链反义寡核苷酸”是指反义寡核苷酸中至少一个核苷间连接与反义寡核苷酸中至少一个其它核苷间连接不同的反义寡核苷酸。

本文使用的术语“靶”是指期望对其进行调节的蛋白质。

本文使用的术语“靶基因”是指编码靶的基因。

本文使用的术语“靶核酸”和“编码靶的核酸分子”是指其表达和活性是能够通过反义化合物来调节的任何核酸分子。靶核酸包括但不限于从编码靶的DNA转录的RNA(包括但不限于前mRNA和mRNA或其部分)，和从此类RNA衍生的cDNA，和miRNA。例如，靶核酸可以是其表达与特定病症或疾病状态相关的细胞基因(或由此基因转录的mRNA)或来自感染剂的核酸分子。

本文使用的术语“靶向(targeting)”或“靶向于(targeted to)”是指反义化合物与特定靶核酸分子或靶核酸分子内核苷酸的特定区域的结合。

本文使用的术语“5’靶位点”是指与特定反义化合物最5’端核苷酸互补的靶核酸上的核苷酸。

本文使用的术语“3’靶位点”是指与特定反义化合物最3’端核苷酸互补的靶核酸上的核苷酸。

本文使用的术语“靶区”是指靶核酸上与一个或多个反义化合物互补的部分。

本文使用的术语“靶区段”是指靶核酸内更小的区域或区域的亚部分。

本文使用的术语“核碱基互补性”是指一个核碱基能够与另一个核碱基进行碱基配对。例如，在DNA中，腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)互补。例如，在RNA中腺嘌呤(A)与尿嘧啶(U)互补。在某些实施方案中，互补核碱基是指反义化合物中能够与其靶核酸上的核碱基进行碱基配对的核碱基。例如，如果反义化合物特定位置上的核碱基能够与靶核酸特定位置上的核碱基形成氢键，那么在所述寡核苷酸与所述靶核酸之间形成氢键的位置则被认为在那一对核碱基对处是互补的。

本文使用的术语“非互补核碱基”是指不彼此形成氢键或以其它方式(otherwise)支持杂交的核碱基对。

本文使用的术语“互补”是指多聚化合物与另一多聚化合物或核酸通过核碱基互补性进行杂交的能力。在某些实施方案中，当反义化合物和靶分子中各有足够数量的相应位置由能够相互成键以允许反义化合物和靶之间稳定结合的碱基对占据时，则反义化合物与其靶是互补的。本领域技术人员可以认识到的是，包含错配而不消除寡聚化合物保持结合的能力是可能的。因此，本文描述的是可以包含多至约20％错配核苷酸(即不是与靶的相应核苷酸互补的核碱基)的反义化合物。优选地，反义化合物包含不超过约15％、更优选地不超过约10％、最优选地不超过5％错配或没有错配。其余的核苷酸是互补的或不影响杂交的核碱基(如通用碱基)。本领域普通技术人员会认识到本文提供的化合物与靶核酸至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或至少100％互补。

本文使用的术语“错配”是指互补寡聚化合物内非互补的核碱基。

本文所使用的“杂交”是指互补寡聚化合物(如反义化合物及其靶核酸)的配对。尽管不局限于特定的机理，但是最普通的配对机理涉及氢键的形成，其可以是互补核苷或核苷酸碱基(核碱基)之间的Watson-Crick、Hoogsteen或反Hoogsteen氢键键合。例如，天然碱基腺嘌呤是与天然核碱基胸腺嘧啶和尿嘧啶通过氢键形成配对的核碱基。天然碱基鸟嘌呤是与天然碱基胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶互补的核碱基。杂交可以在不同的情况下发生。

本文使用的术语“特异地杂交”是指寡聚化合物与一个核酸位点以比与另一个核酸位点杂交更强的亲和力杂交的能力。在某些实施方案中，反义寡核苷酸特异地与多于一个的靶位点杂交。

本文所使用的“设计(designing)”或“设计为(designed to)”是指设计特异地与所选核酸分子杂交的寡聚化合物的过程。

本文使用的术语“调节”是指当与调节前的功能或活性水平相比时功能或活性的扰动(perturbation)。例如，调节包括基因表达或增加(刺激或诱导)或降低(抑制或减少)的改变。作为另一个实例，表达的调节可包括前mRNA加工时对剪接位点选择的扰动。

本文使用的术语“表达”是指使基因的编码信息转化为在细胞中存在并行使功能的结构的所有功能和步骤。此类结构包括但不限于转录和翻译的产物。

本文所使用的“变体”是指可由DNA的同一基因组区域产生的可供选择的RNA转录物。变体包括但不限于“前mRNA变体”，其是由相同基因组DNA产生的转录物，该转录物不同于由相同基因组DNA产生的其他转录物之处在于它们的起始或终止位置，并且所述转录物包含内含与外显序列。变体也包括但不限于那些具有替代的剪接点(splice junction)或替代的起始与终止密码子的变体。

本文所使用的“高亲和性修饰的单体”是指与天然存在的单体相比，具有至少一个修饰的核碱基、核苷间连接或糖模块的单体，而所述修饰增强了包含此高亲和性修饰单体的反义化合物对其靶核酸的亲和性。高亲和性修饰包括但不限于含有2’修饰糖的单体(如核苷和核苷酸)。

本文使用的术语“2’修饰的(2’-modified)”或“2’取代的(2’-substituted)”是指在2’位置含有非H或OH取代基的糖。2’修饰的单体包括但不限于BNA和具有如下2’取代基的单体(如核苷和核苷酸)：如烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)或O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)，其中R_m和R_n独立地为H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基)。在某些实施方案中，短反义化合物包含不具有2’-O(CH₂)_nH分子式的2’修饰单体，其中n为1-6。在某些实施方案中，短反义化合物包含不具有2’-OCH₃分子式的2’修饰单体。在某些实施方案中，短反义化合物包含不具有所述分子式，或可供选择的2’-O(CH₂)₂OCH₃分子式的2’修饰单体。

本文使用的术语“双环核酸”或“BNA”或“双环核苷”或“双环核苷酸”是指核苷的呋喃糖模块包含连接呋喃糖环上两个碳原子的桥接，因而形成双环系统的核苷或核苷酸。

除非另作说明，本文所使用的术语“亚甲氧基BNA”单独使用是指β-D-亚甲氧基BNA。

本文使用的术语“MOE”是指2’-甲氧乙基取代基。

本文使用的术语“缺口聚物”是指含有中心区域(“缺口”)和在中心区域每一侧的区域(“翼”)的嵌合寡聚化合物，其中所述缺口包含至少一个与每个翼中的修饰不同的修饰。这些修饰包括核碱基、单体连接和糖修饰，以及修饰的缺失(未修饰的)。因此，在某些实施方案中，每个翼中的核苷酸连接与缺口中的核苷酸连接是不同的。在某些实施方案中，每个翼含有具高亲和性修饰的核苷酸而缺口含有不具有那种修饰的核苷酸。在某些实施方案中，缺口中的核苷酸与翼中的核苷酸都含有高亲和性修饰，但是缺口中的高亲和性修饰与翼中的高亲和性修饰是不同的。在某些实施方案中，每个翼中的修饰是彼此相同的。在某些实施方案中，翼中的修饰彼此不同。在某些实施方案中，缺口中的核苷酸是未修饰的而翼中的核苷酸是修饰的。在某些实施方案中，每个翼中的修饰是相同的。在某些实施方案中，一个翼中的修饰与另一个翼中的修饰不同。在某些实施方案中，短反义化合物是缺口中含有2’-脱氧核苷酸并且翼中含有具高亲和性修饰的核苷酸的缺口聚物。

本文使用的术语“前体药物”是指制备为非活性形式而在体内或胞内通过内源性酶或其他化学物质和/或条件转化为其活性形式(即药物)的治疗剂。

本文使用的术语“药学可接受的盐”是指活性化合物的盐，其保留了活性化合物期望的生物活性而没有赋予不期望的对其的毒理作用。

本文使用的术语“帽状结构”或“末端帽模块”是指已经掺入在反义化合物任一末端的化学修饰。

本文使用的术语“防止”是指延迟或预防(forestall)状况或疾病的启动或发展一段时间，从几小时到几天，优选地从几周到几个月。

本文使用的术语“改进”是指状况或疾病严重程度的至少一个指标的减弱。指标的严重程度可以用本领域技术人员公知的主观的或客观的测量来确定。

本文使用的术语“治疗”是指施用本发明的组合物以实现疾病或状况的改变或改善。阻止、改进和/或治疗可能需要在常规间隔或在疾病或状况发作之前施用多次剂量以改变疾病或状况的进程。此外，在单个个体中可以相继使用或同时使用单一作用剂用于对状况或疾病的每次阻止、改进和治疗。

本文使用的术语“药剂”是指当为受试者施用时可提供治疗益处的物质。

本文使用的术语“治疗有效量”是指给动物提供治疗益处的治疗剂的量。

如本文使用的，“施用”是指对动物提供药剂，包括但不限于由医务专业人员施用和自行施用。

本文使用的术语“共施用”是指对动物施用两种或更多种药剂。两种或更多种药剂可以在单个药物组合物或可以在分别的药物组合物中。两个或更多个药剂中的每一个可以通过相同或不同的施用途径施用。共施用包括平行或相继施用。

本文使用的术语“药物组合物”是指适合对个体施用的物质的混合物。例如，药物组合物可以包含反义寡核苷酸和无菌水溶液。

本文使用的术语“个体”是指选择的接受治疗或疗法的人或非人的动物。

本文使用的术语“动物”是指人或非人的动物，包括但不限于小鼠、大鼠、兔子、犬、猫、猪和非人的灵长类，包括但不限于猴子和黑猩猩。

本文使用的术语“受试者”是指药物组合物施用给的动物，包括但不限于人。

本文使用的术语“持续期”是指活性或事件持续的时间段。在某些实施方案中，治疗的持续期是施用药剂剂量的持续的时间段。

本文使用的术语“非消化道施用”是指通过注射或灌注施用。非消化道施用包括但不限于皮下施用、静脉内施用或肌内施用。

本文使用的术语“皮下施用”是指皮肤下的施用。“静脉内施用”是指施用到静脉内。

本文使用的术语“剂量”是指单次施用提供的药剂的特定量。在某些实施方案中，一次剂量可以通过两个或更多个丸剂(boluses)、片剂或注射剂施用。例如，在某些实施方案中，当需要皮下施用时，需要的剂量要求单次注射不容易实现的体积。在这样的实施方案中，两次或更多次注射可以用来获得需要的剂量。在某些实施方案中，一次剂量可以通过两次或更多次注射施用以使个体的注射位点反应最小化。

本文所使用的术语“剂量单元”是指提供药剂的形式。在某些实施方案中，剂量单元是含有冻干的反义寡核苷酸的小管。在某些实施方案中，剂量单元是含有重组(reconsituted)反义寡核苷酸的小管。

本文使用的术语“药剂”是指对个体施用时提供治疗益处的物质。例如，在某些实施方案中，反义寡核苷酸是药剂。

本文使用的术语“活性药物成分”是指药物组合物中提供期望效果的物质。

本文使用的术语“治疗有效量”是指对个体提供治疗益处的药剂量。在某些实施方案中，反义化合物的治疗有效量是需要施用以获得可观察到的益处的量。

本文使用的术语“高胆固醇血症”是指以增高的血清胆固醇为特征的状况。

本文使用的术语“高脂血症”是指以增高的血清脂质为特征的状况。

本文使用的术语“高甘油三酯血症”是指以增高的甘油三酯水平为特征的状况。

本文使用的术语“非家族性高胆固醇血症”是指不是由单一遗传性基因突变导致的以增高的胆固醇为特征的状况。

本文使用的术语“多基因高胆固醇血症”是指由多种遗传因子的影响导致的、以增高的胆固醇为特征的状况。在某些实施方案中，多基因高胆固醇血症可能因饮食摄入的脂质而恶化。

本文使用的术语“家族性高胆固醇血症(familial hypercholesterolemia)(FH)”是指以LDL-受体(LDL-R)中的突变、显著增高的LDL-C和动脉粥样硬化的过早发作(premature onset)为特征的常染色体显性代谢病症。当个体符合下列标准的一条或多条时可将其诊断为家族性高胆固醇血症：遗传检测确认2个突变的LDL-受体基因、遗传检测确认一个突变的LDL-受体基因、未治疗的血清LDL-胆固醇高于500 mg/dL的病史、10岁前的腱和/或皮肤的黄瘤病(xanthoma)或父母双方在降低脂质的治疗之前均有记录的与杂合性家族性高胆固醇血症吻合的增高的血清LDL-胆固醇水平。

本文使用的术语“纯合性家族性高胆固醇血症(homozygous familialhypercholesterolemia)”或“HoFH”是指以母体和父体LDL-R基因的突变为特征的状况。

本文使用的术语“杂合性家族性高胆固醇血症(heterozygous familialhypercholesterolemia)”或“HoFH”是指以母体或父体LDL-R基因的突变为特征的状况。

本文使用的术语“混合性血脂障碍”是指以增高的血清胆固醇和增高的血清甘油三酯为特征的状况。

本文使用的术语“糖尿病血脂障碍(diabetic dyslipidemia)”或“伴有血脂障碍的II型糖尿病(Type II diabetes with dyslipidemia)”是指以II型糖尿病、降低的HDL-C、增高的血清甘油三酯和增高的小致密LDL颗粒为特征的状况。

本文使用的术语“冠心病等危症(CHD risk equivalents)”是指表示存在高冠心病风险的临床动脉硬化疾病的指征。例如，在某些实施方案中，冠心病等危症包括但不限于临床冠心病、症状性颈动脉疾病、外周动脉疾病和/或腹主动脉瘤。

本文使用的术语“非酒精性脂肪肝病(non-alcoholic fatty liver disease)(NAFLD)”是指以不因过量酒精使用(如酒精消费量超过20g/day)导致的肝脏脂肪炎症为特征的状况。在某些实施方案中，NAFLD与胰岛素耐受和代谢综合症有关。

本文使用的术语“非酒精性脂肪肝炎(non-alcoholic steatohepatitis)(NASH)”是指以肝脏炎症和脂肪与纤维组织的积累为特征，而非由于过量酒精使用引起的状况。NASH是NAFLD的极端形式。

本文使用的术语“主要风险因子(majorrisk factors)”是指对特定疾病或状况的高风险有贡献的因子。在某些实施方案中，冠心病的主要风险因子包括但不限于吸烟、高度紧张、低HDL-C、冠心病家族史和年龄。

本文使用的术语“冠心病风险因子(CHD risk factors)”是指冠心病等危症和主要风险因子。

本文使用的术语“冠心病(coronary heart disease)(CHD)”是指为心脏供血和氧气的血管的窄化，其经常导致动脉粥样硬化。

本文使用的术语“降低的冠心病风险”是指个体发生冠心病的可能性降低。在某些实施方案中，冠心病风险的降低是通过一个或多个CHD风险因子的改善来测量的，例如LDL-C水平的降低。

本文使用的术语“动脉粥样硬化(atherosclerosis)”是指影响大动脉和中等大小动脉的动脉硬化并以脂肪沉积的出现为特征。所述脂肪沉积称为“粉瘤(atheromas)”或“蚀斑(plaques)”，其主要由胆固醇与其他脂肪、钙和疤痕组织组成并损害动脉的铺陈(lining)。

本文使用的术语“冠心病史(history of coronary heart disease)”是指在个体或个体的家族成员的医疗史上临床上明显的冠心病的出现。

本文使用的术语“冠心病的早发(Early onset coronary heart disease)”是指50岁之前冠心病的确诊。

本文使用的术语“抑制素不容许个体(statin intolerant individual)”是指作为抑制素治疗的结果，经历胰腺激酶增加、肝功能测试异常、肌肉疼痛或中枢神经系统副作用中的一种或多种的个体。

本文使用的术语“效力(efficacy)”是指产生期望的效果的能力。例如，降脂治疗的效力可以是一种或多种下列物质浓度的降低：LDL-C、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、ApoB、脂蛋白(a)或甘油三酯。

本文使用的术语“可接受的安全谱(acceptable safety profile)”是指临床上可接受限度内的副作用的模式。

本文使用的术语“副作用”是指由治疗引起的除期望的作用之外的生理反应。在某些实施方案中，副作用包括但不限于注射位点反应、肝功能测试异常、视网膜功能异常、肝中毒、视网膜中毒、中枢神经系统异常和肌病(myopathies)。例如，血清中提高的转氨酶水平可以指示肝中毒或肝功能异常。例如，提高的胆红素可以指示肝中毒或肝功能异常。

本文使用的术语“注射位点反应(iniection site reaction)”是指个体中注射位点的皮肤发炎或异常发红。

本文使用的术语“个体遵从(individual compliance)”是指个体对推荐的或处方的治疗方法的遵守。

本文使用的术语“降脂治疗(lipid-lowering therapy)”是指提供给个体的降低个体中一种或多种脂质的治疗之道。在某些实施方案中，提供降脂治疗以降低个体中ApoB、总胆固醇、LDL-C、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、甘油三酯、小致密LDL颗粒、和Lp(a)中的一种或多种。

本文使用的术语“降脂剂(lipid-lowering agent)”是指提供给个体以获得个体中脂质降低的治疗剂。例如，在某些实施方案中，为个体提供降脂剂以降低ApoB、LDL-C、总胆固醇和甘油三酯中的一种或多种。

本文使用的术语“LDL-C目标(LDL-C target)”是指降脂治疗之后期望的LDL-C水平。

本文使用的术语“遵从”是指个体对推荐的治疗方法的遵守。

本文使用的术语“推荐的治疗”是指由医务专业人员推荐的治疗、改善或防止疾病的治疗之道。

本文使用的术语“低LDL-受体活性(low LDL-receptor activity)”是指没有足够的高到维持血流中临床可接受的LDL-C水平的LDL-受体活性。

本文使用的术语“心血管后果(cardiovascular outcome)”是指重大的不利心血管事件的发生。

本文使用的术语“改善的心血管后果”是指重大的不利心血管事件发生或其风险的减少。重大的不利心血管事件的实例包括但不限于死亡、再梗塞、中风、心源性休克、肺水肿、心搏停止和心房节律紊乱。

本文使用的术语“心血管后果的替代标志物(surrogate markers ofcardiovascular outcome)”是指心血管事件或其风险的间接指示物。例如心血管后果的替代标志物包括颈动脉中膜厚度(CIMT)。心血管后果的替代标志物的另一个实例包括粉瘤大小。粉瘤大小可以由血管内超声(IVUS)确定。

本文使用的术语“增高的HDL-C(increased HDL-C)”是指个体的血清HDL-C随时间的增加。

本文使用的术语“降脂(lipid-lowering)”是指个体的一种或多种血清脂质随时间的减少。

本文使用的术语“代谢病症”是指以代谢功能的改变或扰乱为特征的状况。“代谢的(metabolic)”或“代谢(metabolism)”是本领域公知的术语，通常包括生命体内发生的生化过程的全部范畴。代谢病症包括但不限于高血糖、前期糖尿病、糖尿病(I型和II型)、肥胖、胰岛素耐受和代谢综合症。

本文使用的术语“代谢综合症(metabolic syndrome)”是指代谢起始的脂质和非脂质心血管风险因子的集合。它与称为胰岛素耐受的广义代谢病症紧密地联系。全国胆固醇教育计划(The National Cholesterol Education Program)(NCEP)成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III)(ATPIII)建立了诊断代谢综合症的标准，即当五个风险决定因素中的三个或更多个出现时。所述五个风险决定因素是以男性腰围大于102cm和女性腰围大于88cm定义的腹部肥胖、大于或等于150mg/dL的甘油三酯水平、男性小于40mg/dL和女性小于50mg/dL的HDL胆固醇水平、大于或等于130/85mm Hg的血压和大于或等于110mg/dL的禁食葡萄糖水平。这些决定因素可以容易地在临床实践中测量(JAMA，2001，285：2486-2497)。

本文使用的术语“烷基”是指包含多至24个碳原子的饱和直链或支链碳氢自由基。烷基的实例包括但不限于甲基、乙基、丙基、丁基、异丙基、正己基、辛基、癸基、十二烷基等。烷基通常包括1到约24个碳原子，更通常的是1到约12个碳原子(C₁-C₁₂烷基)，而1到6个碳原子是更优选的。本文使用的术语“低级烷基”包括1到约6个碳原子。本文使用的烷基可以任选地包含一个或多个其他取代基。

本文使用的术语“烯基”是指含有多至24个碳原子并具有至少一个碳-碳双键的直链或支链碳氢链自由基。烯基的实例包括但不限于乙烯基、丙烯基、丁烯基、1-甲基-2-丁-1-酰基(1-methyl-2-buten-1-yl)、双烯(如1，3-双丁烯)等。烯基通常包括2到约24个碳原子，更通常2到约12个碳原子，而2到约6个碳原子是更优选的。本文使用的烯基可以任选地包含一个或多个其他取代基。

本文使用的术语“炔基”是指含有多至24个碳原子并具有至少一个碳-碳三键的直链或支链碳氢链自由基。炔基的实例包括但不限于乙炔基、1-丙炔基、1-丁炔基等。炔基通常包括2到约24个碳原子，更通常2到约12个碳原子，而2到约6个碳原子是更优选的。本文使用的炔基可以任选地包含一个或多个其他取代基。

本文使用的术语“氨基烷基”是指氨基取代的烷基自由基。此术语意在包括在任何位置具有氨基取代基的C₁-C₁₂烷基基团，并且其中所述烷基基团将氨基烷基附接到母分子上。氨基烷基的烷基和/或氨基部分可以进一步地由取代基取代。

本文使用的术语“脂肪基”是指包括多至24个碳原子的直链或支链碳氢自由基，其中任意两个碳原子之间的饱和状态是单键、双键或三键。脂肪基优选地包含1到约24个碳原子，更通常为1到约12个碳原子，而1到约6个碳原子是更优选的。脂肪基的直链或支链可以被一个或多个包括氮、氧、硫和磷在内的杂原子打断。此类被杂原子打断的脂肪基包括但不限于多聚烷氧基，例如聚亚烷基二醇(polyalkylene glycols)、聚胺(polyamines)和聚亚胺(polyimines)。本文使用的脂肪基也可任选择地包含其他的取代基。

术语“脂环的(alicyclic)”或“脂环基(alicyclyl)”’是指其中的环是脂肪性的环状系统。所述环系统可以包含一个或多个环，其中至少一个环是脂肪性的。优选的脂环包括环上具有约5个到约9个碳原子的环。本文使用的脂环可以任选地包含其他取代基。

本文使用的术语“烷氧基”是指烷基与氧原子之间形成的自由基，其中的氧原子用以将此烷氧基结合到母分子上。烷氧基的实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基(sec-butoxy)、叔丁氧基(tert-butoxy)、正戊氧基、新戊氧基(neopentoxy)、正己氧基等。本文使用的烷氧基可以任选地包含其他取代基。

本文使用的术语“卤(halo)”和“卤素(halogen)”是指选自氟、氯、溴和碘的原子。

本文使用的术语“芳基(aryl)”’或“芳香的(aromatic)”是指具有一个或多个芳香环的单环或多环碳环的环状系统自由基。芳香基的实例包括但不限于苯基、萘基(naphthyl)、四氢化萘(tetrahydronaphthyl)、茚满基(indanyl)、茚基(idenyl)等。优选的芳香环系统的一个或多个环含有约5到约20个碳原子。本文使用的芳基可以任选地包含其他取代基。

本文使用的术语“芳烷基(aralkyl)”或“芳基烷基(arylalkyl)”是指烷基和芳基之间形成的自由基，其中所述烷基用以将芳烷基附接到母分子。实例包括但不限于苯甲基(benzyl)、苯乙基(phenethyl)等。本文使用的芳烷基可以任选地包含其他附接到烷基、芳基或形成所述自由基的两个基团上的取代基。

本文使用的术语“杂环基”是指包括至少一个杂原子的自由基单环或多环环状系统，其可以是不饱和的、部分饱和的或完全饱和的，因而包括杂环芳基。杂环基也意在包括融合的环系统，其中一个或多个融合环包含至少一个杂原子而其他环可以包括一个或多个杂原子或任选地不包含杂原子。杂环基通常包括至少一个选自硫、氮或氧的原子。杂环基的实例包括[1，3]二氧戊环([1，3]dioxolane)、吡咯烷基(pyrrolidinyl)、吡唑啉基(pyrazolinyl)、吡唑烷基(pyrazolidinyl)、咪唑啉基(imidazolinyl)、咪唑烷基(imidazolidinyl)、哌啶基(piperidinyl)、哌嗪基(piperazinyl)、噁唑烷基(oxazolidinyl)、异噁唑烷基(isoxazolidinyl)、吗啉基(morpholinyl)、噻唑烷基(thiazolidinyl)、异噻唑烷基(isothiazolidinyl)、喹喔啉基(quinoxalinyl)、哒嗪酮基(pyridazinonyl)、四氢呋喃基(tetrahydrofuryl)等。本文使用的杂环基可以任选地包含其他取代基。

本文所使用的“杂芳基(heteroaryl)”和“杂芳香基(heteroaromatic)”是指含有单环或多环的芳香环、环系统或融合环系统的自由基，其中至少一个环是芳香环并包含一个或多个杂原子。杂芳环也意在包括融合环系统(包括其中一个或多个融合环不合杂原子的系统)。杂芳基通常包含一个选自硫、氮或氧的环上原子。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基(pyridinyl)、吡嗪基(pyrazinyl)、嘧啶基(pyrimidinyl)、吡咯基(pyrrolyl)、吡唑基(pyrazolyl)、咪唑基(imidazolyl)、噻唑基(thiazolyl)、噁唑基(oxazolyl)、异噁唑基(isooxazolyl)、噻二唑基(thiadiazolyl)、噁二唑基(oxadiazolyl)、苯硫基(thiophenyl)、呋喃基(furanyl)、四氢喹啉基(quinolinyl)、异四氢喹啉基(isoquinolinyl)、苯并咪唑基(benzimidazolyl)、苯并噁唑基(benzooxazolyl)、喹喔啉基(quinoxalinyl)等。杂芳自由基可以直接地或通过例如脂肪基或杂原子的连接性部分附接到母分子。本文使用的杂芳基可以任选地包含其他取代基。

本文使用的术语“杂芳基烷基(heteroarylalkyl)”是指具有可以将杂芳基烷基附接到母分子的烷基自由基的如前定义的杂芳基。实例包括但不限于吡啶甲基(pyridinylmethyl)、  嘧啶乙基(pyrimidinylethyl)、  萘啶丙基(napthyridinylpropyl)等。在杂芳基或烷基部分的一个或两个上，本文使用的杂芳基烷基可以任选地包含其他取代基。

本发明使用的术语“单环或多环结构”包括具有融合环或连接环的单环或多环的所有环系统，其意在包括单独选自以下的单环或混合环系统：脂肪基、脂环基、芳基、杂环芳基、芳烷基、芳基烷基、杂环基、杂芳基、杂环芳香基和杂芳基烷基。这些单环和多环结构可以包括均一的或具有不同饱和度(包括完全饱和、部分饱和或完全不饱和)的环。每个环可以包括选自C、N、O和S的原子以产生杂环的环和仅包括C环的环，它们可以用混合的基序来表示，例如苯并咪唑(benzimidazole)，其中一个环仅含碳环原子而融合的环含有2个氮原子。单环或多环结构还可以由取代基取代，例如有两个＝O基团附接到其中一个环上的酞亚胺(phthalimide)。另一方面，单环或多环结构可以直接通过环上原子、通过取代基或双功能的连接性模块附接到母分子上。

本文使用的术语“酰基(acyl)”是指由有机酸除去羟基形成的并具有通式-C(O)-X的自由基，其中X通常是脂肪基、脂环基或芳香基。实例包括脂肪羰基(aliphatic carbonyls)、芳香羰基(aromatic carbonyls)、脂肪硫酰基(aliphaticsulfonyl)、芳香亚硫酰基(aromatic sulfinyls)、脂肪亚硫酰基(aliphaticsulfinyls)、芳香磷酸酯(aromatic phosphates)、脂肪磷酸酯(aliphatic phosphates)等。本文使用的酰基可以任选地包含其他取代基。

术语“烃基(hydrocarbyl)”包括含有C、O和H的基团。其包括具有任意饱和度的直链、支链和环状基团。这些烃基基团可以包含一个或多个选自N、O和S的杂原子并可由一个或多个取代基单取代或多取代。

本文使用的术语“取代基(substituent)”或“取代基团(substituent group)”包括通常加到其他基团或母化合物上以增强期望的特性或提供期望的作用的基团。取代基可以是受到保护的或未受到保护的，并可以加到母化合物的一个可用位点或多个可用位点。取代基也可以由其他取代基进一步取代并可直接地或通过连接性基团(如烷基或烃基)附接到母化合物。这些基团包括但不限于卤素、羟基、烷基、烯基、炔基、酰基(-C(O)R_aa)、羧基(-C(O)O-R_aa)、脂肪基、脂环基、烷氧基、取代的氧基(-O-R_aa)、芳基、芳烷基、杂环基、杂芳基、杂环芳基烷基、氨基(-NR_bbR_cc)、亚胺基(＝NR_bb)、酰胺基(-C(O)NR_bbR_cc或-N(R_bb)C(O)R_aa)、叠氮基(-N₃)、硝基(-NO₂)、氰基(-CN)、脲基(carbamido)(-OC(O)NR_bbR_cc或-N(R_bb)C(O)OR_aa)、脲基(ureido)(-N(R_bb)C(O)NR_bbR_cc)、硫脲基(thioureido)(-N(R_bb)C(S)NR_bbR_cc)、胍基(-N(R_bb)C(＝NR_bb)NR_bbR_cc)、脒基(-C(＝NR_bb)NR_bbR_cc或-N(R_bb)C(NR_bb)R_aa)、硫醇基(-SR_bb)、亚磺酰基(-S(O)R_bb)、磺酰基(-S(O)₂R_bb)、磺胺基(-S(O)₂NR_bbR_cc或-N(R_bb)S(O)₂R_bb)和缀合基团。其中每个R_aa、R_bb和R_cc独立地为H、任选地连接的化学官能团或另外的取代基(其优选的列表包括但不限于H、烷基、烯基、炔基、脂肪基、烷氧基、酰基、芳基、芳烷基、杂芳基、脂环基、杂环基和杂芳基烷基)。

B.特定寡聚化合物

在某些实施方案中，与天然存在的寡聚体例如DNA或RNA相比较，以化学方法修饰寡聚化合物是理想的。某些此类的修饰改变寡聚化合物的活性。某些此类化学修饰可以通过下列途径改变活性，例如：增强反义化合物对其靶核酸的亲和性，提高其对一种或多种核酶的耐受性，和/或改变寡聚化合物的药代动力学或组织分布。在某些情况下，增强寡聚化合物对其靶亲和性的化学方法的使用使更短寡聚化合物的使用成为可能。

1.某些单体

在某些实施方案中，寡聚化合物包含一个或多个修饰的单体。在某些此类的实施方案中，寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体。在某些实施方案中，这样的高亲和性单体选自含有2’-修饰糖的单体(如核苷与核苷酸)，包括但不限于BNA和具有如以下2’-取代基的单体(如核苷与核苷酸)：烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、或O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)，其中每个R_m和R_n独立地为H或者取代或未取代的C₁-C₁₀烷基。

在某些实施方案中，包括但不限于本发明的短反义化合物的寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体，条件是所述寡聚化合物不包含含有2’-O(CH₂)_nH的核苷酸，其中n为1到6。

在某些实施方案中，包括但不限于本发明的短反义化合物的寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体，条件是所述寡聚化合物不包含含有2’-OCH₃或2’-O(CH₂)₂OCH₃的核苷酸。

在某些实施方案中，包括但不限于本发明的短反义化合物的寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体，条件是所述寡聚化合物不包含α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA。

在某些实施方案中，包括但不限于本发明的短反义化合物的寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体，条件是所述寡聚化合物不包含β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA。

在某些实施方案中，包括但不限于本发明的短反义化合物的寡聚化合物包含一个或多个高亲和性单体，条件是所述寡聚化合物不包含α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA或β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA。

a.某些核碱基

核苷天然存在的碱基部分通常是杂环碱基。这些杂环碱基中最普通的两类是嘌呤和嘧啶。对于包含五元呋喃糖的那些核苷，磷酸基团可以连接到糖的2’、3’或5’羟基部分。为了形成寡核苷酸，那些磷酸基团彼此共价连接相邻的核苷形成线性的多聚化合物。在寡核苷酸内，通常认为磷酸基团形成了寡核苷酸的核苷酸间主链。天然存在的DNA的或RNA的连接或主链是3’到5’的磷酸二酯连接。

除“未修饰的”或“天然的”核碱基(例如嘌呤核碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)，和嘧啶核碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U))之外，本领域技术人员公知的许多修饰的核碱基或核碱基模拟物也适用于本文描述的化合物。在某些实施方案中，修饰的核碱基是结构上与母核碱基非常相似的核碱基，例如7-脱氮杂嘌呤、5-甲基胞嘧啶或G-夹(G-clamp)。在某些实施方案中，核碱基模拟物包括更复杂的结构，例如三环吩噁嗪(phenoxazine)核碱基模拟物。制备上述修饰核碱基的方法是本领域技术人员公知的。

b.某些糖

本文提供的寡聚化合物可以包含一个或多个含有修饰的糖模块的单体，包括核苷或核苷酸。例如，核苷的呋喃糖环可以通过许多方法修饰，包括但不限于添加取代基，桥接两个非双取代的(geminal)环上原子以形成双环核酸(BNA)。

在某些实施方案中，寡聚化合物包括一个或多个BNA单体。在某些此类的实施方案中，BNA包括但不限于如图1所示的(A)α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA，(B)β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA，(C)亚乙基氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA，(D)氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和(E)氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。

图1.某些BNA结构

在某些实施方案中，BNA化合物包括但不限于在糖的4’和2’位置之间具有至少一个桥接的化合物，其中每个桥接独立地含有1个或2到4个独立地选自下组的连接基团：-[C(R₁)(R₂)]_n-、-C(R₁)＝C(R₂)-、-C(R₁)＝N-、-C(＝NR₁)-、-C(＝O)-、-C(＝S)-、-O-、-Si(R₁)₂-、-S(＝O)_x-和-N(R₁)-；

其中：

x为0、1或2；

n为1、2、3或4；

每个R₁和R₂独立地为H、保护基团、羟基、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₁-C₁₂炔基、取代的C₁-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C₅-C₇脂环自由基、取代的C₅-C₇脂环自由基、卤素、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、COOJ₁、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(＝O)₂-J₁)或亚磺酰基(S(＝O)-J₁)；并且

每个J₁和J₂独立地为H、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₂-C₁₂炔基、取代的C₂-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C₁-C₁₂氨基烷基、取代的C₁-C₁₂氨基烷基或保护基团。

在一个实施方案中，BNA化合物的每个桥接独立地为-[C(R₁)(R₂)]_n-、-[C(R₁)(R₂)]_n-O-、-C(R₁R₂)-N(R₁)-O-或-C(R₁R₂)-O-N(R₁)-。在另一个实施方案中，每个所述的桥接独立地为4′-CH₂-2′、4′-(CH₂)₂-2′、4′-(CH₂)₃-2′、4′-CH₂-O-2′、4′-(CH₂)₂-O-2′、4′-CH₂-O-N(R₁)-2′和4′-CH₂-N(R₁)-O-2′-，其中每个R₁独立地为H、保护基团或C₁-C₁₂烷基。

某些BNA已经制备并在专利文献和科学文献中(Singh等，Chem.Commun.，1998，4，455-456；Koshkin等，Tetrahedron，1998，54，3607-3630；Wahlestedt等，ProC.  Natl. Acad. Sci. U. S. A.，2000，97，5633-5638；Kumar等，Bioorg.  Med.  Chem.  Lett.，1998，8，2219-2222；WO 94/14226；WO 2005/021570；Singh等，J.Org.Chem.，1998，63，10035-10039)公开，公开BNA的授权的美国专利和发表的申请的实例包括例如：美国专利号7,053,207；6,268,490；6,770,748；6,794,499；7,034,133和6,525,191；和美国授权前公开号(U.S.Pre-Grant Publication Nos.)2004-0171570；2004-0219565；2004-0014959；2003-0207841；2004-0143114和20030082807。

本文也提供BNA，其中核糖基糖环的2’羟基连接到糖环的4’碳原子因而形成亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)连接以构成双环糖模块(由以下文献综述：Elayadi等，Curr. Opinion Invens. Drugs，2001，2，558-561；Braasch等，Chem. Biol.，2001，81-7；和Orum等，Curr. Opinion Mol.Ther.，2001，3，239-243；另见美国专利：6,268,490和6,670,461)。当术语亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA用于双环部分时，连接可以是桥接2’氧原子和4’碳原子的亚甲基(-CH₂-)基团；在亚乙基处于此位置的情况下，使用术语亚乙基氧基(4’-CH₂CH₂-O-2’)BNA(Singh等，Chem. Commun.，1998，4，455-456：Morita等，Bioorganic Medicinal Chemistry，2003，11，2211-2226)。亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA和其他双环糖类似物与互补的DNA和RNA显示非常高的双链热稳定性(Tm＝+3到+10℃)、对3’核酸外切降解的稳定性和优秀的溶解性。已经描述了含有BNA的高效力并无毒的反义寡核苷酸(Wahlestedt等，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.，2000，97，5633-5638)。

已经讨论过的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA的异构体是α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA，已经显示，其具有抗3’核酸外切酶的超强稳定性。将所述α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA引入显示强反义活性的反义缺口聚物和嵌合体(Frieden等，Nucleic Acids Research，2003，21，6365-6372)。

已经描述了亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA单体腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、5-甲基-胞嘧啶、胸腺嘧啶和鸟嘌呤的合成和制备，以及它们的寡聚化和核酸识别(recogntion)性质(Koshkin等，Tetrahedron，1998，54，3607-3630)。BNA及其制备也在WO 98/39352和WO 99/14226中进行了描述。

已经制备了亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA的类似物硫代磷酸酯-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA和2′-硫代-BNA(Kumar等，Bioorg.Med.Chem.Lett.，1998，8，2219-2222)。也描述了含有寡聚脱氧核糖核苷酸双链、作为核酸聚合酶底物的锁核苷类似物(locked nucleoside analog)的制备(Wengel等，WO99/14226)。更进一步地，本领域中也描述了2′-氨基-BNA，一个新的构象上受到限制的高亲和性寡核苷酸类似物(Singh等，J.Org.Chem.，1998，63，10035-10039)。另外，已经制备了2′-氨基-和2′-甲基氨基-BNA并且已经报道了它们与互补的RNA和DNA链所形成双链的热稳定性。

修饰的糖模块是公知的并可以用以改变、通常是增强反义化合物对其靶的亲和力和/或增强核酶抗性。优选的修饰糖的代表名单包括但不限于双环修饰糖(BNA)(包括亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA和亚乙基氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’桥接)BNA)；取代的糖，特别是具有2′-F、2′-OCH₃或2′-O(CH₂)₂-OCH₃取代基的2’-取代糖；和4’-硫代修饰的糖。糖也可用其他化合物中的糖模拟基团来代替。制备修饰糖的方法是本领域技术人员公知的。一些教授此类修饰糖制备的代表性专利和出版物包括但不限于美国专利4,981,957；5,118,800；5,319,080；5,359,044；5,393,878；5,446,137；5,466,786；5,514,785；5,519,134；5,567,811；5,576,427；5,591,722；5,597,909；5,610,300；5,627,053；5,639,873；5,646,265；5,658,873；5,670,633；5,792,747；5,700,920；6,531,584与6,600,032；和WO 2005/121371。

在某些实施方案中，BNA包括具有如下分子式的双环核苷：

其中：

Bx是杂环碱基模块；

T₁是H或羟基保护基团；

T₂是H、羟基保护基团或活性(reactive)磷基团；

Z是C₁-C₆烷基、C₂-C₆烯基、C₂-C₆炔基、取代的C₁-C₆烷基、取代的C₂-C₆烯基、取代的C₂-C₆炔基、酰基、取代的酰基或取代的酰胺。

在一个实施方案中，每个取代基独立地由任选地受保护的取代基单取代或多取代，所述任选地受保护的取代基选自卤素、氧(oxo)、羟基、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁，N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂和CN，其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X是O、S或NJ₁。

在某些此类的实施方案中，每个取代基由独立地选自下组的取代基独立地单取代或多取代：卤素、氧(oxo)、羟基、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁，N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)J₁和NJ₃C(＝X)NJ₁J₂，其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H、C₁-C₆烷基或取代的C₁-C₆烷基，而X是O或NJ₁。

在某些实施方案中，Z基团是由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个X^x独立地为OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X是O、S或NJ₁。在另一个实施例中，Z基团是由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个Xx独立地为卤代(halo)(如氟代)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)、取代的烷氧基或叠氮基。

在某些实施例中，Z基团是-CH₂X^x，其中X^x是OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X是O、S或NJ₁。在另一个实施例中，Z基团是-CH₂X^x，其中X^x为卤代(如氟代)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)或叠氮基。

在某些此类的实施方案中，Z基团具有如下(R)-构型：

在某些此类的实施方案中，Z基团具有如下(S)-构型：

在某些实施方案中，T₁和T₂各自为羟基保护基团。羟基保护基团的优选列表包括但不限于苄基(benzyl)、苯甲酰(benzoyl)、2，6-二氯苄基(2，6-dichlorobenzyl)、叔丁基二甲基硅烷基(t-butyldimethylsilyl)、叔丁基联苯甲硅烷基(t-butyldiphenylsilyl)、甲磺酸盐(mesylate)、甲苯磺酸盐(tosylate)、二甲氧三苯甲基(dimethoxytrityl)(DMT)、9-苯基黄嘌呤-9-基(9-phenylxanthine-9-yl)(Pixyl)和9-(对-甲氧基苯基)黄嘌呤-9-基(9-(p-methoxyphenyl)xanthine-9-yl)(MOX)。在某些实施方案中，T₁是选自乙酰基、苄基、叔丁基二甲基硅基、叔丁基联苯甲硅烷基和二甲氧三苯甲基的羟基保护基团，而更优选的羟基保护基团是T₁是4，4′-二甲氧三苯甲基。

在某些实施方案中，T₂为活性磷基团，其中优选的活性磷基团包括二异丙基氰乙氧基亚磷酰胺(diisopropyl phosphoramidite)和H-膦酸酯(H-phosphonate)。在某些实施方案中，T₁是4，4′-二甲氧三苯甲基而T₂是二异丙基氰乙氧基亚磷酰胺。

在某些实施方案中，寡聚化合物具有至少一个具有如下分子式的单体：

或分子式：

或分子式：

其中

Bx是杂环碱基部分；

T₃是H、羟基保护基团、附接到核苷、核苷酸、寡聚核苷、寡核苷酸、单体亚基或寡聚化合物的连接缀合基团或核苷间连接性基团；

T₄是H、羟基保护基团、附接到核苷、核苷酸、寡聚核苷、寡核苷酸、单体亚基或寡聚化合物的连接的缀合基团或核苷间连接基团；

其中是T₃和T₄中至少一个是附接到核苷、核苷酸、寡聚核苷、寡核苷酸、单体亚基或寡聚化合物的核苷间连接性基团；并且

Z是C₁-C₆烷基、C₂-C₆烯基、C₂-C₆炔基、取代的C₁-C₆烷基、取代的C₂-C₆烯基、取代的C₂-C₆炔基、酰基、取代的酰基或取代的酰胺。

在一个实施方案中，每个取代基独立地由任选地保护的取代基单取代或多取代，所述任选地保护的取代基独立地选自卤素、氧(oxo)、羟基、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂和CN，其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O、S或NJ₁。

在一个实施方案中，每个取代基独立地由任选地保护的取代基单取代或多取代，所述任选地保护的取代基独立地选自卤素、氧(oxo)、羟基、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁和NJ₃C(＝X)NJ₁J₂，其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O或NJ₁。

在某些此类的实施方案中，至少一个Z为C₁-C₆烷基或取代的C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，每个Z独立地为C₁-C₆烷基或取代的C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，至少一个Z为C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，每个Z独立地为C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，至少一个Z为甲基。在某些实施方案中，每个Z为甲基。在某些实施方案中，至少一个Z为乙基。在某些实施方案中，每个Z为乙基。在某些实施方案中，至少一个Z是取代的C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，每个Z独立地为取代的C₁-C₆烷基。在某些实施方案中，至少一个Z为取代的甲基。在某些实施方案中，每个Z为取代的甲基。在某些实施方案中，至少一个Z为取代的乙基。在某些实施方案中，每个Z是取代的乙基。

在某些实施方案中，至少一个取代基为C₁-C₆烷氧基(如，至少一个Z是由一个或多个C₁-C₆烷氧基取代的C₁-C₆烷基)。在另一个实施方案中，每个取代基独立地为C₁-C₆烷氧基(如，每个Z是独立地由一个或多个C₁-C₆烷氧基取代的C₁-C₆烷基)。

在某些实施方案中，至少一个C₁-C₆烷氧基取代基为CH₃O-(如，至少一个Z为CH₃OCH₂-)。在另一个实施方案中，每个C₁-C₆烷氧基取代基为CH₃O-(如，每个Z为CH₃OCH₂-)。

在某些实施方案中，至少一个取代基为卤素(如，至少一个Z为由一个或多个卤素取代的C₁-C₆烷基)。在某些实施方案中，每个取代基独立地为卤素(如，每个Z独立地是由一个或多个卤素取代的C₁-C₆烷基)。在某些实施方案中，至少一个卤素取代基为氟代基(如，至少一个Z为CH₂FCH₂-、CHF₂CH₂-或CF₃CH₂-)。在某些实施方案中，每个卤素取代基为氟代基(如，每个Z独立地为CH₂FCH₂-、CHF₂CH₂-或CF₃CH₂-)。

在某些实施方案中，至少一个取代基为羟基(如，至少一个Z是由一个或多个羟基取代的C₁-C₆烷基)。在某些实施方案中，每个取代基独立地为羟基(如，每个Z是独立地由一个或多个羟基取代的C₁-C₆烷基)。在某些实施方案中，至少一个Z为HOCH₂-。在另一个实施方案中，每个Z为HOCH₂-。

在某些实施方案中，至少一个Z为CH₃-、CH₃CH₂-、CH₂OCH₃-、CH₂F-或HOCH₂-。在某些实施方案中，每个Z独立地为CH₃-、CH₃CH₂-、CH₂OCH₃-、CH₂F-或HOCH₂-。

在某些实施方案中，至少一个Z基团是由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个X^x独立地为OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O、S或NJ₁。在另一个实施方案中，至少一个Z基团为由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个X^x独立地为卤素基(如氟代基)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)或叠氮基。

在某些实施方案中，每个Z基团独立地为由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个X^x独立地为OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O、S或NJ₁。在另一个实施方案中，每个Z基团独立地为由一个或多个X^x取代的C₁-C₆烷基，其中每个X^x独立地为卤代基(如氟代基)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)或叠氮基。

在某些实施方案中，至少一个Z基团为-CH₂X^x，其中X^x为OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O、S或NJ₁。在某些实施方案中，至少一个Z基团为-CH₂X^x，其中X^x为卤代基(如氟代基)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)或叠氮基。

在某些实施方案中，每个Z基团独立地为-CH₂X^x，其中每个X^x独立地为OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、OC(＝X)J₁、OC(＝X)NJ₁J₂、NJ₃C(＝X)NJ₁J₂或CN；其中每个J₁、J₂和J₃独立地为H或C₁-C₆烷基，而X为O、S或NJ₁。在另一个实施方案中，每个Z基团独立地为-CH₂X^x，其中每个X^x独立地为卤代基(如氟代基)、羟基、烷氧基(如CH₃O-)或叠氮基。

在某些实施方案中，至少一个Z为CH₃-。在另一个实施方案中，每个Z都为CH₃-。

在某些实施方案中，至少一个单体的Z基团是由如下分子式代表的(R)-构型：

或分子式：

或分子式：

在某些实施方案中，至少一个单体的Z基团是所述(R)-构型。

在某些实施方案中，至少一个单体的Z基团是由如下分子式代表的(S)-构型：

或分子式：

或分子式：

在某些实施方案中，每个单体的Z基团的分子式均是(S)-构型。

在某些实施方案中，T₃为H或羟基保护基团。在某些实施方案中，T₄为H或羟基保护基团。在另一个实施方案中，T₃为附接到核苷、核苷酸或单体亚基的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₄为附接到核苷、核苷酸或单体亚基的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₃为附接到寡聚核苷或寡核苷酸的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₄为附接到寡聚核苷或寡核苷酸的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₃为附接到寡聚化合物的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₄为连接到寡聚化合物的核苷间连接性基团。在某些实施方案中，T₃和T₄中至少一个含有选自磷酸二酯或硫代磷酸酯的核苷间连接性基团。

在某些实施方案中，寡聚化合物具有至少一个这样的区域：其有至少两个连续的如下分子式的单体：

或分子式：

或分子式：

在某些实施方案中，寡聚化合物含有至少两个这样的区域：具有至少两个连续的如上分子式的单体。在某些实施方案中，寡聚化合物含有有缺口的寡聚化合物。在某些实施方案中，寡聚化合物含有至少一个约8到约14个连续的β-D-2′-脱氧呋喃核糖核苷(β-D-2′-deoxyribofuranosyl nucleoside)的区域。在某些实施方案中，寡聚化合物含有至少一个约9到约12个连续的β-D-2′-脱氧呋喃核糖核苷的区域。

在某些实施方案中，单体包括糖模拟物。在某些此类的实施方案中，模拟物用以代替糖基或糖-核苷间连接组合，而保留核碱基用于与选择的靶杂交。糖模拟物的代表性实例包括但不限于环己烯基(cyclohexenyl)或吗啉基(morpholino)。糖-核苷间连接组合的模拟物的代表性实例包括但不限于肽核酸(peptide nucleic acids)(PNA)和由不带电的手性连接所连接的吗啉基。在一些情况下模拟物用以代替核碱基。代表性核碱基模拟物是本领域公知的，包括但不限于三环吩噁嗪同系物和通用碱基(Berger等，Nuc Acid Res.2000，28：2911-14，通过引用并入本文)。合成糖、核苷和核碱基模拟物的方法是本领域技术人员公知的。

3.单体连接

本文描述的是将单体(包括但不限于修饰的和未修饰的核苷和核苷酸)连接在一起因而形成寡聚化合物的连接性基团。连接性基团的两个主要种类是由有无磷原子定义的。代表性的含磷连接包括但不限于磷酸二酯(P＝O)、磷酸三酯(phosphotriesters)、甲基膦酸酯(methylphosphonates)、氨基磷酸酯(phosphoramidate)和硫代磷酸酯(P＝S)。代表性的含非磷原子的连接性基团包括但不限于亚甲基甲基亚胺(methylenemethylimino)(-CH₂-N(CH₃)-O-CH₂-)、硫二酯(thiodiester)(-O-C(O)-S-)、硫代氨基甲酸酯(thionocarbamate)(-O-C(O)(NH)-S-)；硅氧烷(siloxane)(-O-Si(H)2-O-)；和N，N′-二甲基肼(N，N′-dimethylhydrazine)(-CH₂-N(CH₃)-N(CH₃)-)。具有非磷连接性基团的寡聚化合物称为寡聚核苷。与天然的磷酸二酯连接相比，修饰的连接可用以改变，通常是增强，寡聚化合物的核酶抗性。在某些实施方案中，具有手性原子的连接作为分别的对映体(enantomer)，可制备为外消旋混合物(racemicmixture)。代表性的手性连接包括但不限于烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。制备含磷和含非磷的连接的方法是本领域技术人员公知的。

本文描述的寡聚化合物包括一个或多个不对称中心因而可以产生对映体、非对映体(diastereomer)和其他立体异构(stereoisomeric)构型，其可以用绝对立体异构化学符号(R)或(S)、糖异构体(anomer)的α或β或者氨基酸的(D)或(L)等来定义。本文提供的反义化合物包括的是所有的此类可能的异构体，以及他们的外消旋的和光学上纯的形式。

4.寡聚化合物

在某些实施方案中，本文提供的是具有活性磷基团的可用以形成连接的寡聚化合物，所述连接包括例如磷酸二酯和硫代磷酸酯的核苷间连接。前体或寡聚化合物的制备和/或纯化方法并不限于本文提供的组合物或方法。合成和纯化包括DNA、RNA、寡核苷酸、寡聚核苷和反义化合物在内的寡聚化合物的方法是本领域技术人员公知的。

寡聚化合物通常包含由连接性基团连接起来的多个单体亚基。寡聚化合物的非限制性实例包括引物、探针、反义化合物、反义寡核苷酸、外部指导序列(external guide sequence)(EGS)寡核苷酸、可变剪接子(alternate splicer)和siRNA。如此，这些化合物可以以单链、双链、环状、分支或发夹形式引入并可含有如内部或末端突出(bulge)或环(loop)的结构元素。寡聚双链化合物可以是杂交以形成双链化合物的两条链或具有足够允许杂交并形成完全或部分双链化合物的自身互补性的单链。

在某些实施方案中，本发明提供嵌合寡聚化合物。在某些此类实施方案中，嵌合寡聚化合物是嵌合寡核苷酸。在某些此类的实施方案中，嵌合寡核苷酸包含不同修饰的核苷酸。在某些实施方案中，嵌合寡核苷酸是混合主链反义寡核苷酸。

嵌合寡聚化合物通常会具有修饰的核苷，其可在单独位置(isolateaposition)出现或集合出现在将会定义特定基序的区域。修饰和/或模拟基团的任意组合都可以包含本文描述的嵌合寡聚化合物。

在某些实施方案中，嵌合寡聚化合物通常包含至少一个修饰的区域以实现对核酶降解增强的抗性、增强的细胞摄取和/或对靶核酸增强的结合亲和性。在某些实施方案中，寡聚化合物的额外的区域可充当能够切割RNA:DNA或RNA:RNA杂交体的酶的底物。例如，RNase H是切割RNA:DNA双链中的RNA链的细胞内切核酸酶。而RNase H的激活导致RNA靶的切割，因而极大提高对基因表达的抑制效率。因此，以硫代磷酸酯脱氧寡核苷酸与相同的靶区域杂交为例，与此相比，当使用嵌合体时用更短的寡聚化合物通常可以获得类似的效果。可以用凝胶电泳常规地检测对RNA靶的切割，如果需要，可辅以本领域公知的核酸杂交技术。

在某些实施方案中，嵌合寡聚化合物是缺口聚物。在某些实施方案中，嵌合化合物是短反义化合物。在某些实施方案中，短反义化合物是缺口聚物。在某些此类的实施方案中，混合主链反义寡聚物在一个或两个翼中具有一种核苷酸间连接而在缺口中具有不同种类的核苷酸间连接。在某些此类的实施方案中，混合主链反义寡核苷酸在翼中具有磷酸二酯连接而在缺口中具有硫代磷酸酯连接。在某些翼中的核苷酸间连接与缺口中的核苷酸间连接不同的实施方案中，桥接翼和缺口的核苷酸间连接与翼中的核苷酸间连接是相同的。在某些翼中的核苷酸间连接与缺口中的核苷酸间连接不同的实施方案中，桥接翼和缺口的核苷酸间连接与缺口中的核苷酸间连接是相同的。

C.某些短反义化合物

本文公开的是8-16，优选地9-15，更优选地9-14，更优选地10-14个核苷酸长的短反义化合物。在某些实施方案中，短反义化合物为9-14个核苷酸长。在某些实施方案中，短反义化合物为10-14个核苷酸长。在某些实施方案中，这些短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，短反义化合物含有一个或多个化学修饰。在某些此类的实施方案中，短反义化合物含有至少一个修饰的核苷酸。在某些实施方案中，短反义化合物含有至少两个或更多个修饰的核苷酸。在某些实施方案中，短反义化合物含有至少一个修饰的核苷酸间连接。在某些实施方案中，短反义化合物为混合主链寡核苷酸。在某些实施方案中，短反义化合物为嵌合寡核苷酸。在某些实施方案中，短反义寡核苷酸是均一修饰的。在某些实施方案中，短反义寡核苷酸含有在每个核碱基和每个连接上都独立选择的修饰。

在某些实施方案中，短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类的实施方案中，短缺口聚物在化合物的一个或多个翼中含有至少一个高亲和性修饰。在某些实施方案中，短反义化合物在每个翼中包含1-3个高亲和性修饰。在某些实施方案中，短反义化合物的高亲和性修饰使其具有与更长的反义化合物的靶亲和性相似或甚至更强的靶亲和性。在某些实施方案中，所述高亲和性修饰的核苷酸是糖修饰的核苷酸。这些糖修饰的核苷酸包括那些在糖的4’和2’位置含有桥接的核苷酸。示例性的高亲和性糖修饰包括但不限于BNA和其他2’-修饰例如2’-MOE。在本发明的另一个实施方案中，所述高亲和性修饰不是2’-O-(CH₂)_nH(n＝1-6)糖修饰的核苷酸。在其它可供选择的实施方案中，所述高亲和性修饰的核苷酸不是2’-OCH₃也不是2’-OCH₂CH₂OCH₃核苷酸。在某些实施方案中，高亲和性修饰的核苷酸为T_m贡献至少1、至少1.5、至少2、至少2.5、至少3.0、至少3.5或至少4.0度/核苷酸。一些高亲和性核苷酸修饰在本领域中公知是增强毒性的。如本文所示，具有有限数目(通常2-6个)高亲和性修饰的短反义化合物显示很少至没有毒性的增加，但保持或增强对靶RNA的亲和性，同时也显著地减弱RNA靶的表达。本发明的短反义化合物可任选地包含缀合基团，例如胆固醇或C₁₆。

1.某些翼

在某些实施方案中，短反义化合物包含5’翼和/或3’翼。在此类的实施方案中，3’翼的特性和5’翼的特性是独立选择的。因此，在此类的实施方案中，5’翼中单体的数目与3’翼中单体(长度)的数目可相同或可不同；位于5’翼中的修饰(如有)与位于3’翼中的修饰(如有)可以是相同的，或此类修饰(如有)可以是不同的；5’翼中的单体连接与3’翼中的单体连接可以是相同的或它们可以是不同的。

在某些实施方案中，翼包含一个、两个或三个单体(即长度为1、2或3)。在某些实施方案中，翼中的单体是修饰的。在某些此类的实施方案中，翼中的单体是经修饰的以增强反义化合物对其靶核酸的亲和性。在某些实施方案中，翼中的单体是核苷或核苷酸。在某些此类的实施方案中，翼的核苷或核苷酸含有2’修饰。在某些此类的实施方案中，翼的单体(核苷或核苷酸)是BNA。在某些此类的实施方案中，翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙基氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、氨氧基(aminooxy)(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(Oxyamino)(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼中的单体包含选自下组的2’位置的取代基：烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)，其中每个R_m和R_n独立地为H或取代或非取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼中的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，翼中的单体连接是天然存在的核苷酸间连接。在某些实施方案中，翼中的单体连接是非天然存在的核苷酸间或核苷间连接。在某些此类的实施方案中，翼中的单体连接与天然存在的核苷酸间连接相比，其对于一种或多种核酶更具有抗性。在某些此类的实施方案中，翼中的单体连接是硫代磷酸酯连接(P＝S)。在某些实施方案中，翼具有多于一个单体连接，且所述单体连接是彼此相同的。在某些实施方案中，翼具有多于一个单体连接，而所述单体连接是彼此不同的。

本领域普通技术人员将认识到，以上讨论的特性和修饰可任意组合使用以制备翼。下面的表格提供了非限制性的实例，其显示技术人员如何通过选择两个翼内特定数量的单体、单体修饰(如有)和单体连接来制备翼。

 

长度	单体类型/修饰	翼内的单体连接
			1	2’MOE	无

 

1	BNA	无
			1	亚甲氧基BNA	无
1	ENA	无
			2	2’MOE	P＝S
2	BNA	P＝S
			2	亚甲氧基BNA	P＝S
2	ENA	P＝S
			2	2’MOE	P＝O
2	BNA	P＝O
			2	亚甲氧基BNA	P＝O
2	ENA	P＝O
			3	2’MOE	P＝S
3	BNA	P＝S
			3	亚甲氧基BNA	P＝S
3	ENA	P＝S
			3	2’MOE	P＝O
3	BNA	P＝O
			3	亚甲氧基BNA	P＝O
3	ENA	P＝O

在某些实施方案中，翼含有两个、三个或四个单体，那些两个、三个或四个单体都包含同样的修饰(如有)。在某些实施方案中，翼含有两个、三个或四个单体，那些两个、三个或四个核碱基中的一个或多个包含一个或多个与一个或多个其余单体的一个或多个修饰不同的修饰。

2.某些缺口

在某些实施方案中，短反义化合物在5’翼和3’翼之间含有缺口。在某些实施方案中，缺口含有五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个、十二个、十三个或十四个单体。在某些实施方案中，缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如有)形成一种反义化合物，当与其靶核酸结合时支持RmA酶(包括但不限于RNA酶H)的切割。

在某些实施方案中，缺口中的单体连接是天然存在的核苷酸间连接。在某些实施方案中，缺口中的单体连接是非天然存在的核苷酸间连接。在某些此类的实施方案中，缺口中的单体连接与天然存在的核苷酸间连接相比，对一种或多种核酶更耐受。在某些此类的实施方案中，缺口中的单体连接是硫代磷酸酯连接(P＝S)。在某些实施方案中，缺口中的单体连接都是彼此相同的。在某些实施方案中，缺口内的单体连接不都是相同的。

本领域普通技术人员将认识到，以上讨论的特性和修饰可任意组合用以制备缺口。下面的表格提供了非限制性的实例，其显示技术人员如何通过选择缺口内的特定数量的单体、单体修饰(如有)和单体连接来制备缺口。

长度  单体类型/修饰  缺口内单体连接

5     DNA            P＝S

6     DNA            P＝S

7     DNA            P＝S

8     DNA            P＝S

9     DNA            P＝S

10    DNA            P＝S

11    DNA            P＝S

12    DNA            P＝S

13    DNA            P＝S

14    DNA            P＝S

6     DNA            P＝O

7     DNA            P＝O

8     DNA            P＝O

9     DNA            P＝O

10    DNA            P＝O

11    DNA            P＝O

12    DNA            P＝O

8     RNA            P＝S

9     RNA            P＝S

10    RNA      P＝S

11    RNA      P＝S

12    RNA      P＝S

3.某些有缺口的反义寡聚化合物

本领域普通技术人员将认识到，可以选择以上讨论的翼和缺口而后以多种组合方式组合以生成有缺口的寡聚化合物，其包括但不限于有缺口的反义寡聚化合物和有缺口的反义寡核苷酸。5’翼和3’翼的特性(长度、修饰、连接)可以彼此独立地选择。缺口的特性与5’翼的特性相比包含至少一个修饰上的不同，且与3’翼的特性相比包含至少一个修饰上的不同(即相邻区域的修饰之间必须有至少一个不同以彼此区分那些相邻区域)。而缺口的特性可以独立地选择。

.在某些实施方案中，翼内的单体连接与缺口内的单体连接是相同的。在某些实施方案中，翼内的单体连接与缺口内的单体连接是不同的。在某些此类的实施方案中，桥接翼与缺口的单体连接与翼内的单体连接是相同的。在某些实施方案中，桥接翼与缺口的单体连接与缺口内的单体连接是相同的。在某些实施方案中，短反义化合物在整个化合物内具有均一的连接。在某些此类的实施方案中，所有的连接都是硫代磷酸酯(P＝S)连接。

本领域普通技术人员将认识到，可以任意组合以上讨论的3’翼、5’翼、缺口和连接用以制备缺口聚物。下面的表格提供了非限制性的实例，其显示如何通过选择特定5’翼、缺口、3’翼和特定桥接缺口与每个翼的连接以制备缺口聚物。

在某些实施方案中，本文公开的寡聚化合物可以包含约8-约16，优选地9-15，更优选地9-14，更优选地10-14个单体(即约8-约16个连接的单体)。本领域的普通技术人员将理解，这包括8、9、10、11、12、13、14、15或16个核碱基的化合物。在某些实施方案中，寡聚化合物是反义化合物。

在某些实施方案中，短反义化合物为8个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为9个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为10个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为11个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为12个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为13个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为14个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为15个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为16个核碱基长。

在某些实施方案中，短反义化合物为8个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为9个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为10个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为11个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为12个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为13个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为14个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为15个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物为16个单体长。在某些实施方案中，短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

了解了本文阐述的短反义化合物，本领域技术人员将能够在不实施不当过度实验(undue experimentation)的情况下鉴定其他的短反义化合物。

在某些实施方案中，短反义化合物含有在一侧或两侧由多于一个翼包围的缺口。因此，在某些实施方案中，短反义化合物包含两个或多个5’翼和两个或多个3’翼。在某些实施方案中，短反义化合物包含一个5’翼和两个或多个3’翼。在某些实施方案中，短反义化合物包含一个3’翼和两个或多个5’翼。某些此类的实施方案包括下列区域：例如第一个5’翼-桥接-第二个5’翼-桥接-缺口-桥接-第二个3’翼-桥接-第一个3’翼。在此类的实施方案中，每个区域与其相邻区域相比至少具有一个修饰上的不同。因此，在此类的实施方案中，与缺口相比，与第一个5’翼相比，与第一个3’翼相比，第二个5’翼和第二个3’翼独立地包含一个或多个修饰上的不同。在此类的实施方案中，第一个3’翼中的修饰和第一个5’翼中的修饰之一或二者可与缺口中的修饰(如有)相同或不同。

4.其些缀合基团

一方面，寡聚化合物通过一个或多个缀合基团的共价附接来修饰。通常缀合基团修饰所附接寡聚化合物的一种或多种性质，包括但不限于药效动力学(pharmacodynamic)、药代动力学、结合、吸收、细胞分布、细胞摄取、带电和清除。缀合基团在化学领域常规使用并直接地或通过可选的连接性部分或连接性基团连接到母化合物，例如寡聚化合物。缀合基团的优选列表包括但不限于嵌入剂(intercalator)、报告分子、多胺(polyamine)、聚酰胺(polyamide)、聚乙二醇(polyethylene glycol)、硫醚(thioether)、聚醚(polyether)、胆固醇、硫胆固醇(thiocholesterol)、胆酸部分、叶酸盐(folate)、脂质、磷酸脂、生物素、吩嗪(phenazine)、菲啶(phenanthridine)、蒽醌(anthraquinone)、金刚烷(adamantane)、吖啶(acridine)、荧光素(fluorescein)、若丹明(rhodamine)、香豆素(coumarin)和染料。

适合本发明的优选缀合基团包括如胆固醇部分的脂质部分(Letsinger等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，1989，86，6553)；胆酸(Manoharan等，Bioorg.Med.Chem.Lett.，1994，4，1053)；硫醚，如己基-S-三苯甲基硫醇(hexyl-S-tritylthiol)(Manoharan等，Ann.N.Y.Acad.Sci.，1992，660，306；Manoharan等，Bioorg.Med.Chem.Let.，1993，3，2765)；硫胆固醇(Oberhauser等，Nucl.Acids Res.，1992，20，533)；脂肪链，如十二烷二醇(dodecandiol)或十一烷基(undecyl)残基(Saison-Behmoaras等，EMBO J.，1991，10，111；Kabanov等，FEBS Lett.，1990，259，327；Svinarchuk等，Biochimie，1993，75，49)；磷脂，如二-十六烷基甘油酯(di-hexadecyl-rac-glycerol)或三乙基铵-1，2-二-O-十六烷基甘油-3-H-磷酸酯(triethylammonium-1，2-di-O-hexadecyl-rac-glycero-3-H-phosphonate)(Manoharan等，Tetrahedron Lett.，1995，36，3651；Shea等，Nucl.Acids Res.，1990，18，3777)；多胺或聚乙二醇(polyethylene glycol)链(Manoharan等，Nucleosides & Nucleotides，1995，14，969)；金刚烷乙酸(Manoharan等，Tetrahedron Lett.，1995，36，3651)；棕榈基(palmityl)部分(Mishra等，Biochim.Biophys.Acta，1995，1264，229)或十八基胺(octadecylamine)或己胺-羰基-氧胆固醇(hexylamino-carbonyl-oxycholesterol)部分(Crooke等，J.Pharmacol.Exp.Ther.，1996，277，923)。

连接性基团或双官能的连接性部分(如那些本领域公知的)对本文提供的化合物是合适的。连接性基团对于化学官能团、缀合基团、报告基团和其他基团附接到母化合物(如寡聚化合物)的选择性位点是有用的。通常双官能的连接性部分包含具有两个官能团的烃基部分。将一个官能团选作结合母分子或感兴趣的化合物而另一个选作基本上结合任何所选基团例如化学官能团或缀合基团。在一些实施方案中，所述接头包含链状结构或重复单元(如乙二醇或氨基酸单元)组成的寡聚物。在双官能的连接性部分常规使用的官能团的实例包括但不限于用于与亲核基团反应的亲电试剂和与亲电基团反应的亲核试剂。在一些实施方案中，双官能的连接性部分包括氨基、羟基、羧酸(carboxylic acid)、硫醇、不饱和结构(unsaturation)(如双键和三键)等。一些双官能的连接性部分的非限制性实例包括8-氨基-3，6-二噁辛酸(8-amino-3，6-dioxaoctanoic acid)(ADO)、琥珀酰亚胺-4-(N-马来酰亚胺甲基)环己-1-羧酸酯(succinimidyl 4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate)(SMCC)和6-氨基已酸(6-aminohexanoic acid)(AHEX或AHA)。其他连接性基团包括但不限于取代的C₁-C₁₀烷基、取代的或未取代的C₂-C₁₀烯基或取代的或未取代的C₂-C₁₀炔基，其中优选取代基的非限制性列表包括羟基、氨基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基、硫醇、硫代烷氧基、卤素、烷基、芳基、烯基和炔基。

5.合成、纯化与分析

可以根据有关DNA(Protocols for Oligonucleotides and Analogs，Ed.Agrawal(1993)，Humana Press)和/或RNA(Scaringe，Methods(2001)，23，206-217.Gait等，Applications of Chemically synthesized RNA in RNA：ProteinInteractions，Ed.Smith(1998)，1-36.Gallo等，Tetrahedron(2001)，57，5707-5713)的文献步骤常规地对修饰的和未修饰的核苷和核苷酸实施寡聚化。

本文提供的寡聚化合物可以通过公知的固相合成技术方便地和常规地制备。此类合成的设备由包括例如Applied Biosystems(Foster City，CA)在内的几个经销商出售。本领域公知的此类合成的任何其他方法可以附加地或可供选择地应用。用相似的技术制备寡核苷酸，例如硫代磷酸酯和烷基化衍生物是公知的。本发明不受反义化合物合成方法的限制。

纯化与分析寡聚化合物的方法是本领域技术人员公知的。分析方法包括毛细管电泳(capillary electrophoresis)(CE)和电喷射质谱(electrospray-massspectroscopy)。这些合成与分析方法可在多孔平板上实施。本发明的方法不受寡聚体纯化方法的限制。

D.反义物(antisense)

反义机理是所有那些涉及化合物与靶核酸的杂交的机理，其中杂交的结果或影响是靶降解或伴随细胞系统(cellular machinery)(包括例如转录或剪接)阻滞的靶占据。

一种涉及靶降解的反义机理包括RNA酶H。RNA酶H是切割RNA：DNA双链中RNA链的细胞内切核酶。本领域公知，“DNA类似”的单链反义化合物在哺乳动物细胞中消除RNA酶H活性。RNA酶H的激活因此导致对RNA靶的切割，因而极大地提高对DNA样寡核苷酸介导的基因表达的抑制的效率。

在某些实施方案中，化学修饰的反义化合物比未修饰的DNA具有更高的靶RNA亲和性。在某些此类的实施方案中，所述更高亲和性因此提供了允许此类化合物在更低剂量施用时增强的效力，降低的潜在毒性和治疗指标的提高和治疗总体费用的降低。

本发明证明，反义化合物中化学修饰的高亲和性核苷酸与核苷的掺入允许设计出8-16个核碱基长的短反义化合物，这样的短反义化合物以增强的效力和提高的治疗指标用于降低细胞、组织和动物(包括但不限于人)中的靶RNA和/或靶蛋白质。因此，在某些实施方案中，本文提供的是包含高亲和性核苷酸修饰，用于降低体内靶RNA的短反义化合物。某些此类的短反义化合物在更低的剂量比以前描述的反义化合物有效，这使毒性和治疗费用的降低成为可能。此外，某些短反义化合物在口服时有更高的效能(potential)。

为了满足对更有效力的反义化合物的需要，本文提供了与更长的化合物相比在体内有增强的活性的短反义化合物(8-16，优选地9-15，更优选地9-14，更优选地10-14个核苷酸长)。某些短反义化合物是在化合物的3’和5’末端(翼)含有高亲和性化学修饰的核苷酸的缺口聚物化合物。在某些实施方案中，高亲和性修饰的核苷酸的添加使反义化合物针对，并特异地针对其体内预期的靶RNA有活性，尽管它长度更短。本文考虑的是每个翼独立地包含1-3个高亲和性修饰的核苷酸的短反义化合物。在某些实施方案中，所述高亲和性修饰是糖修饰。高亲和性修饰的核苷酸包括但不限于BNA或其他2’-修饰的核苷酸，例如2’-MOE核苷酸。同样考虑的是具有至少一个修饰的核苷酸间连接(例如硫代磷酸酯核苷酸间连接)的短反义化合物。在某些实施方案中，本发明的短反义化合物可以具有所有的硫代磷酸酯核苷间连接。短反义化合物任选地含有缀合基团。如本文所示，短反义化合物在体内对靶RNA具有比对DNA更强的亲和性并明显地更有效力，其显示为靶mRNA的减少以及多种病征的改善。

如本文使用的，涉及调节葡萄糖代谢或清除、脂质代谢、胆固醇代谢或胰岛素代谢的RNA是调节这些过程的生化途径中涉及的任何RNA。这些RNA是本领域公知的。靶基因的实例包括但不限于ApoB-100(也作APOB；Ag(x)抗原；apoB-48；载脂蛋白B(apolipoprotein B)；载脂蛋白B-100(apolipoprotein B-100)；载脂蛋白B-48(apolipoprotein B-48))和GCGR(也作糖原受体(glucagon receptor)；GR)、CRP、DGAT2、GCCR、PCSK9、PTEN、PTP1B、SGLT2和SOD1。

1.对靶的表达的调节

在某些实施方案中，对靶进行了鉴定并设计了调节那个靶或其表达的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，设计针对靶核酸分子的寡聚化合物可以是多步骤的过程。通常该过程以鉴定要调节其活性的靶蛋白质开始，然后鉴定表达产生所述靶蛋白质的核酸。在某些实施方案中，反义化合物的设计产生可与靶核酸分子杂交的反义化合物。在某些实施方案中，反义化合物是反义寡核苷酸或反义寡核苷。在某些实施方案中，反义化合物和靶核酸彼此互补。在某些此类的实施方案中，反义化合物与靶核酸完美地互补。在某些实施方案中，反义化合物包含一个错配。在某些实施方案中，反义化合物包含两个错配。在某些实施方案中，反义化合物包含三个或更多个错配。

对靶核酸表达的调节可以通过任何数目的核酸功能的改变来获得。在某些实施方案中，要调节的RNA功能包括但不限于易位功能(包括但不限于RNA易位到蛋白质翻译位点，RNA的易位到细胞内远离RNA合成位点的位点)和从RNA翻译蛋白质。可调节的RNA处理功能包括但不限于产生一个或多个RNA种类的RNA剪接，RNA的加帽(capping)，RNA的3’成熟和涉及RNA的催化活性或复合物形成(可能由RNA完成或协助)。表达调节可以或者暂时地或者就净稳态水平导致一种或多种核酸种类的水平增高或一种或多种核酸种类的水平降低。因此，在一个实施方案中，表达的调节可以意味着靶RNA或蛋白质水平的增高或降低。在另一个实施方案中，表达的调节可以意味着一个或多个RNA剪接产物的增多或减少，或者两个或更多个剪接产物比率的变化。

在某些实施方案中，靶基因的表达是用寡聚化合物调节的，所述寡聚化合物包含约8-约16，优选地9-15，更优选地9-14，更优选地10-14个单体(即从约8-约16个连接的单体)。本领域普通技术人员将会理解，这包括使用一个或多个8、9、10、11、12、13、14、15或16个核碱基的反义化合物调节靶基因表达的方法。

在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用8个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用9个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用8个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用10个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用11个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用12个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用13个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用14个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用15个核碱基长的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因的方法包括使用16个核碱基长的短反义化合物。

在某些实施方案中，调节靶基因表达的方法包括使用含有9-15个单体的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因表达的方法包括使用含有10-15个单体的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因表达的方法包括使用含有12-14个单体的短反义化合物。在某些实施方案中，调节靶基因表达的方法包括使用含有12-14个核苷酸或核苷的短反义化合物。

2.杂交

在某些实施方案中，当具有足够的互补性程度以避免反义化合物与非靶核酸序列在期望特异性结合的条件下(即：体内测定或治疗时是生理条件下，而体外测定时是进行实验的条件下)非特异性结合时，反义化合物特异性地杂交。

本文使用的“严紧杂交条件”或“严紧条件”是指在此条件之下反义化合物将与其靶序列杂交且与最少数量的其他序列杂交的条件。严紧条件是序列依赖的并且在不同的情况下会不同，反义化合物与靶序列杂交的“严紧条件”是由反义化合物的性质与组成和研究它们的测定法决定的。

3.互补性

本领域公知，与未修饰的化合物相比，核苷酸亲和性修饰的掺入可允许更多数量的错配。相似地，与其他寡核苷酸序列相比，某些寡核苷酸序列可能对错配更耐受。本领域普通技术人员可以决定寡核苷酸之间或寡核苷酸与靶核酸之间错配的合适数量，例如通过确定熔解温度(T_m)。T_m或ΔT_m可以通过本领域普通技术人员熟悉的技术进行计算。例如Freier等(Nucleic AcidsResearch，1997，25，22：4429-4443)描述的技术允许本领域技术人员评估核酸修饰增强RNA:DNA双螺旋熔解温度的能力。

4.同一性

反义化合物或其部分可拥有定义的百分比同一性，这一同一性是针对一个SEQ ID NO或具有特定Isis序号的化合物。如本文使用的，如果一个序列具有与本文公开的序列同样的核碱基配对能力，则其与本文公开的序列是相同的(identical)。例如，在本文描述的化合物的公开序列中的胸腺嘧啶位置含有尿嘧啶的RNA将会认为是相同的，因为它们均与腺嘌呤配对。这一相同性可贯穿寡聚化合物的全长或反义化合物的部分长度(如一个27聚体的核碱基1-20可与一个20聚体相比以决定寡聚化合物与SEQ ID NO的百分比同一性)。本领域技术人员理解，反义化合物不需要具有与本文描述的那些反义化合物相同的序列以与本文描述的反义化合物相似地发挥作用。本文也提供了本文教授的反义化合物的截短版本或本文教授的反义化合物的非相同版本。非相同版本是其中并非每个碱基都具有与本文公开的反义化合物相同的配对活性的那些化合物。碱基由于较短或含有至少一个脱碱基位点而不具有相同的配对活性。可供选择地，非相同版本可包含至少一个由具有不同配对活性的不同碱基替代的碱基(如G可以由C、A或T代替)。百分比同一性是根据具有相同碱基配对(对应于其与之比较的SEQ ID NO或反义化合物)的碱基数目计算的。非相同碱基可以是彼此相邻的、在整个核苷酸上散布的或两者兼有。

例如，一个具有与20聚体的碱基2-17相同序列的16聚体与所述20聚体80％相同。或者，一个有4个核碱基与所述20聚体不相同的20聚体与所述20聚体也是80％相同。一个具有与18聚体的核碱基1-14相同序列的14聚体与所述18聚体78％相同。这些计算是完全在本领域技术人员能力范围之内的。

百分比同一性是基于原始序列中的核碱基出现在修饰的序列部分内的百分比。因此，含有20个核碱基活性靶区段的互补体全序列的30个核碱基反义化合物将含有一个与20个核碱基活性靶区段的互补体有100％同一性的部分，还包含额外的10个核碱基的部分。在一致描述的上下文中，活性靶区段的互补体可构成单个部分。在优选的实施方案中，本文提供的寡核苷酸与本文展示的活性靶区段互补体的至少一个部分至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％相同。

E.靶核酸、区域和区段

在某些实施方案中，短反义化合物可设计为靶向任何靶核酸。在某些实施方案中，靶核酸编码有临床意义的靶。在此类的实施方案中，对靶核酸的调节产生临床益处。特定靶核酸包括但不限于表1中阐述的靶核酸。

在某些实施方案中，靶核酸是编码ApoB的核酸分子。编码ApoB的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2。

在某些实施方案中，靶核酸是编码SGLT2的核酸分子。编码SGLT2的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：3。

在某些实施方案中，靶核酸是编码PCSK9的核酸分子。编码PCSK9的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：4。

在某些实施方案中，靶核酸是编码SOD1的核酸分子。编码SOD1的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：5。

在某些实施方案中，靶核酸是编码CRP的核酸分子。编码CRP的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：6。

在某些实施方案中，靶核酸是编码GCCR的核酸分子。编码GCCR的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8。

在某些实施方案中，靶核酸是编码GCGR的核酸分子。编码GCGR的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：9。

在某些实施方案中，靶核酸是编码DGAT2的核酸分子。编码DGAT2的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：10。

在某些实施方案中，靶核酸是编码PTP1B的核酸分子。编码PTP1B的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：11或SEQ ID NO：12。

在某些实施方案中，靶核酸是编码PTEN的核酸分子。编码PTEN的核酸分子包括但不限于SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：15。

表1：特定靶核酸

靶向过程通常包括确定靶核酸内使反义相互作用发生以使实现期待的效果的至少一个靶区域、区段或位点。

在某些实施方案中，靶区域的最5’端核苷酸为短反义化合物的5’端靶位点，而靶区域的最3’端核苷酸为同一短反义化合物的3’端靶位点。在某些实施方案中，靶区域的最5’端核苷酸为短反义化合物的5’端靶位点，而靶区域的最3’端核苷酸为不同短反义化合物的3’端靶位点。在某些实施方案中，靶区域包含在5’端靶位点或3’端靶位点的10、15或20个核苷酸内的核苷酸序列。

在某些实施方案中，靶区域是核酸的结构上定义的区域。例如，在某些此类的实施方案中，靶区域可包括3’UTR、5’UTR、外显子、内含子、编码区、翻译起始区、翻译终止区或其他定义的核酸区。

因作为一个或多个活性短反义化合物的靶而定义的靶核酸上的位置称为“活性靶区段”。在某些实施方案中，作为一个或多个活性短反义化合物的靶的靶核酸为靶RNA。当活性靶区段由多个短反义化合物定义时，所述化合物优选地由靶序列上不多于约10个核苷酸，更优选地由不多于约5个核苷酸分隔，甚至更优选地所述短反义化合物是连续的，最优选地所述短反义化合物是重叠的。在活性靶区段内，可以存在短反义化合物活性的实质性变异(如由百分比抑制定义的)。活性短反义化合物是那些调节其靶核酸(包括但不限于靶RNA)表达的短反义化合物。活性短反义化合物抑制其靶RNA的表达的至少10％，更优选地20％。在一个优选的实施方案中，至少约50％，优选地约70％靶向于活性靶区段的短反义化合物调节其靶RNA的表达至少40％。在一个更优选的实施方案中，定义活性短反义化合物要求的抑制水平是基于用以定义活性靶区段的筛选的结果来定义的。

合适的靶区段是活性短反义化合物靶向的靶区域的至少约8个核碱基的部分。靶区段可包括含有来自阐释性的靶区段其中之一的5’末端的至少8个连续核碱基的DNA或RNA序列(其余核碱基为同一DNA或RNA上从靶区段紧邻的5’末端上游开始的连续序列串(stretch)并持续到DNA或RNA含有约8-约16个核碱基)。靶区段也可以用来自阐释性的靶区段其中之一的3’末端的至少8个连续核碱基的DNA或RNA序列表示(其余核碱基为同一DNA或RNA上从靶区段紧邻的3’末端下游开始的连续碱基串并持续到DNA或RNA含有约8到约16个核碱基)。同样可以理解的是，反义靶区段可以由含有阐释性靶区段序列中间部分的至少8个连续核碱基的DNA或RNA序列表示，并可向一个或两个方向延伸直到短反义化合物包含约8-约16个核碱基。结合本文阐述的靶区段，本领域技术人员将能够在不实施不当过度实验的情况下鉴定更多的靶区段。

一旦鉴定了一个或多个靶区域、区段或位点，可选择与靶充分互补(即足够好地杂交并具有足够的特异性)的短反义化合物以实现期望的效果。

短反义化合物也可以靶向于靶核碱基序列中这样的区域，该区域包含顺着靶核酸分子的任何8-16核碱基长的连续核碱基。

包含选自阐释性靶区段内至少8个连续碱基的序列串的8-16个核碱基长的靶区段也可认为是适合靶向过程的。因此，短反义化合物也可包含本文鉴定的那些区段内的从特定5’端靶位点开始的8-16个核碱基。这些区域周边50，优选地25，更优选地16个核碱基界限内的任何8、9、10、11，或更优选地12、13、14、15、16个连续核碱基的区段也可认为是适合靶向过程的。

在另一个实施方案中，本文鉴定的“合适靶区段”可应用于筛选其他的调节靶核酸表达的短反义化合物。“调节物”是降低或增强靶核酸表达并含有与靶区段互补的至少8-核碱基部分的那些化合物。筛选方法包括的步骤是将核酸的靶区段与一种或多种候选调节物接触，和选择降低或增强靶核酸表达的一个或多个候选调节物。一旦显示一种或多种候选体调节物能够调节(如或者降低或者增强)靶核酸的表达，则可将调节物用于对靶功能的进一步探索性的研究或依照本发明作为研究、诊断或治疗剂。

对于本文讨论的所有短反义化合物，序列、单体、单体修饰和单体连接各自都可独立地选择。在某些实施方案中，短反义化合物是由基序描述的。在此类的实施方案中，任何基序都可以与任何序列使用，不论所述序列和/或所述基序是否在本文特别地公开。在某些实施方案中，短反义化合物含有不适合用基序描述的修饰(例如，在整个化合物的不同位置包含几个不同修饰和/或连接的短反义化合物)。这些组合可以掺入任何序列，不论其是否在本文公开。伴随本提交文件的序列表提供某些无化学修饰的核酸序列。虽然所述列表按照要求表明每个序列为或者“RNA”或者“DNA”，实际上那些序列可由化学修饰和/或基序的任意组合来修饰。

在某些实施方案中，短反义化合物含有至少一个高亲和性修饰的单体。在某些实施方案中，提供的是靶向于编码靶的核酸分子的短反义化合物，所述靶包括但不限于ApoB-100(也作APOB；Ag(x)抗原；apoB-48；载脂蛋白B；载脂蛋白B-100；载脂蛋白B-48)、GCGR(也作糖原受体；GR)、CRP、DGAT2、GCCR、PCSK9、PTEN、PTP1B、SGLT2和SOD1。在某些此类的实施方案中，这些短反义化合物靶向于编码那些标靶中任何一个的核酸分子。

F.某些靶

在某些实施方案中，短反义化合物可以设计成调控任何靶。在某些实施方案中，所述靶是)临床上重要的(clinically relevant)。在此类实施方案中，对所述靶的调控导致临床上的好处。某些靶在肾中优先表达。某些靶在肝中优先表达。某些靶与代谢紊乱有关。某些靶与心血管病症有关。在某些实施方案中，靶选自：ApoB、SGLT2、PCSK9、SOD1、CRP、GCCR、GCGR、DGAT2、PTP1B、和PTEN。在某些实施方案中，靶选自：ApoB、SGLT2、PCSK9、SOD1、CRP、GCCR、GCGR、DGAT2、和PTP1B。在某些实施方案中，靶是SGLT2以外的任何蛋白质。

在某些实施方案中，短反义化合物展现出体内肝和肾特异性靶RNA降低。此类特性使得那些短反义化合物对于抑制牵涉代谢和心血管疾病的许多靶RNA特别有用。如此，本文提供了治疗心血管或代谢紊乱的方法，其通过使所述肾或肝组织接触靶向所述病症相关RNA的短反义化合物来实现。如此，还提供了用于用本发明的短反义化合物改善多种代谢或心血管疾病适应症中任一种的方法。

1.ApoB

ApoB(也称作载脂蛋白B-100；ApoB-100；载脂蛋白B-48；ApoB-48和Ag(x)抗原)是在脂质的装配和分泌中及在不同类别脂蛋白的转运和受体介导之摄取和递送中扮演必不可少的角色的大型糖蛋白。ApoB发挥多种活性，从饮食脂质的吸收和加工至循环中脂蛋白水平的调节(Davidson and Shelness，Annu.Rev.Nutr.，2000，20，169-193)。这后一种特性构成其在动脉粥样硬化易感性方面的重要性的基础，该动脉粥样硬化易感性与含ApoB脂蛋白的环境浓度高度相关(Davidson and Shelness，Annu.Rev.Nutr.，2000，20，169-193)。ApoB-100是LDL-C的主要蛋白质成分，且包含此脂蛋白种类与LDL受体相互作用所需要的结构域。LDL-C水平升高是心血管疾病(包括动脉粥样硬化)的风险因子。

定义

“ApoB”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。

“ApoB核酸”指编码ApoB的任何核酸。例如，在某些实施方案中，ApoB核酸包括但不限于编码ApoB的DNA序列、自编码ApoB的DNA转录得到的RNA序列、和编码ApoB的mRNA序列。

“ApoB mRNA”指编码ApoB的mRNA。

ApoB 治疗适应症

在某些实施方案中，本发明提供了调控个体中的ApoB表达的方法，包括施用靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，本发明提供了治疗个体的方法，包括施用一种或多种包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物。在某些实施方案中，所述个体具有高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病。

国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立了并在2004年更新了降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)。该指导方针包括获取LDL-C、总胆固醇、和HDL-C水平测定的完全脂蛋白序型，通常在禁食9-12小时后。依照最近建立的指导方针，认为130-159 mg/dL、160-189mg/dL、和大于等于190mg/dL的LDL-C水平分别是临界高的、高的、和很高的。认为200-239和大于等于240mg/dL的总胆固醇水平分别是临界高的和高的。认为小于40mg/dL的HDL-C水平是低的。

在某些实施方案中，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，依照国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立的并在2004年更新的降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过190mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过160mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过130mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过100mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于160mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于130mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于100mg/dL。在某些此类实施方案中，所述个体应当维持LDL-C低于70mg/dL。

在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的ApoB的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的含ApoB脂蛋白的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的LDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的VLDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的IDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的非HDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的Lp(a)的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的血清甘油三酯的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的肝甘油三酯的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的Ox-LDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的小LDL颗粒的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的小VLDL颗粒的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的磷脂的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的氧化磷脂的方法。

在某些实施方案中，本发明提供了用于降低受试者中的Ox-LDL-C浓度的方法。在某些此类实施方案中，ApoB、LDL-C、VLDL-C、IDL-C、总胆固醇、非HDL-C、Lp(a)、甘油三酯、或Ox-LDL-C的降低独立地选自至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、和至少100％。在某些此类实施方案中，ApoB、LDL-C、VLDL-C、IDL-C、总胆固醇、非HDL-C、Lp(a)、甘油三酯、或Ox-LDL-C的降低独立地选自至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、和至少70％。在某些此类实施方案中，ApoB、LDL-C、VLDL-C、IDL-C、总胆固醇、非HDL-C、Lp(a)、甘油三酯、或Ox-LDL-C的降低独立地选自至少40％、至少50％、至少60％、和至少70％。

在某些实施方案中，本发明提供了提高受试者中的HDL-C浓度的方法。

在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会降低HDL-C。在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会导致脂质在肝中积累。在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会引起肝的脂肪变性。

在某些实施方案中，本发明提供了降低受试者中的ApoB浓度同时降低与治疗有关的副作用的方法。在某些此类实施方案中，副作用是肝毒性。在某些此类实施方案中，副作用是异常肝功能。在某些此类实施方案中，副作用是丙氨酸氨基转移酶(ALT)升高。在某些此类实施方案中，副作用是天冬氨酸氨基转移酶(AST)升高。

在某些实施方案中，本发明提供了降低下述受试者中的ApoB浓度的方法，该受试者由于降脂疗法而达到目标LDL-C水平。在某些此类实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物是施用于受试者的唯一降脂剂。在某些此类实施方案中，所述受试者没有遵照推荐的降脂疗法。在某些此类实施方案中，本发明的药物组合物与另一不同降脂疗法共施用。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是LDL-血浆清除(apheresis)。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是抑制素(statin)。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是依泽替米贝(ezetimibe)。

在某些实施方案中，本发明提供了降低抑制素耐受性受试者中的ApoB浓度的方法。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肌酸激酶浓度升高。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肝功能异常。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肌肉疼痛。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有中枢神经系统副作用。在某些实施方案中，所述受试者没有遵照推荐的抑制素施用。

在某些实施方案中，本发明提供了降低受试者中的肝甘油三酯的方法。在某些此类实施方案中，所述受试者具有升高的肝甘油三酯。在某些此类实施方案中，所述受试者具有脂肪肝炎。在某些此类实施方案中，所述受试者具有脂肪变性。在某些此类实施方案中，肝甘油三酯水平是通过磁共振成像来测量的。

在某些实施方案中，本发明提供了降低受试者中的冠心病风险的方法。在某些实施方案中，本发明提供了减缓受试者中的动脉粥样硬化进展的方法。在某些此类实施方案中，本发明提供了阻止受试者中的动脉粥样硬化进展的方法。在某些此类实施方案中，本发明提供了降低受试者中的动脉粥样硬化斑大小和/或普及性(prevalence)的方法。在某些实施方案中，所提供的方法降低受试者发生动脉粥样硬化的风险。

在某些实施方案中，所提供的方法改进了受试者中的心血管结果(cardiovascular outcome)。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是发生冠心病的风险降低。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是一项或多项下列心血管事件的发生率降低，所述心血管事件包括但不限于死亡、心肌梗死、再梗塞、中风、心源性休克、肺水肿、心脏停搏、和心房节律障碍。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是表现为改进的颈动脉内层介质厚度(carotid intimal media thickness)。在某些此类实施方案中，改进的颈动脉内层介质厚度是厚度降低。在某些此类实施方案中，改进的颈动脉内层介质厚度是预防内层介质厚度升高。

在某些实施方案中，包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物是用于治疗的。在某些实施方案中，所述治疗是降低个体中的LDL-C、ApoB、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、Lp(a)、血清甘油三酯、肝甘油三酯、Ox-LDL-C、小LDL颗粒、小VLDL、磷脂、或氧化磷脂。在某些实施方案中，所述治疗是治疗高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病。在另一个实施方案中，所述治疗是降低CHD风险。在某些实施方案中，所述治疗是预防动脉粥样硬化。在某些实施方案中，所述治疗是预防冠心病。

在某些实施方案中，包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低受试者中的LDL-C、ApoB、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、Lp(a)、血清甘油三酯、肝甘油三酯、Ox-LDL-C、小LDL颗粒、小VLDL、磷脂、或氧化磷脂的药物。在某些实施方案中，包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低冠心病风险的药物。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物用于制备用于治疗高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病的药物。

ApoB联合疗法

在某些实施方案中，一种或多种包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗相同疾病或疾患。在某些此类实施方案中，所述一种或多种其它药剂是降脂剂。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同疾病或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与另一药剂共施用以治疗所述另一药剂的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在相同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在不同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在单一配制剂中一起制备。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂分开制备。

在某些实施方案中，可以与包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂包括降脂剂。在某些此类实施方案中，可以与本发明的药物组合物共施用的药剂包括但不限于阿托伐他汀(atorvastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)、和依泽替米贝(ezetimibe)。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之前施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之后施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂与本发明的药物组合物同时施用。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量与单独施用该降脂剂时会施用的剂量相同。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量低于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量大于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是HMG-CoA还原酶抑制剂。在某些此类实施方案中，所述HMG-CoA还原酶抑制剂是抑制素。在某些此类实施方案中，所述抑制素选自阿托伐他汀、辛伐他汀、普伐他汀(pravastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、和罗苏伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述胆固醇吸收抑制剂是依泽替米贝。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是共配制的HMG-CoA还原酶抑制剂和胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述共配制的降脂剂是依泽替米贝/辛伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是微粒体甘油三酯转移蛋白抑制剂(MTP抑制剂)。

在某些实施方案中，共施用的药剂是胆汁酸多价螯合剂(sequestrant)。在某些此类实施方案中，所述胆汁酸多价螯合剂选自考来烯胺(cholestyramine)、考来替泊(colestipol)、和考来维仑(colesevelam)。

在某些实施方案中，共施用的药剂是烟酸。在某些此类实施方案中，所述烟酸选自即时释放烟酸、延长释放烟酸、和持续释放烟酸。

在某些实施方案中，共施用的药剂是纤维酸(fibric acid)。在某些此类实施方案中，所述纤维酸选自吉非贝齐(gemfibrozil)、非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、苯扎贝特(bezafibrate)、和环丙贝特(ciprofibrate)。

可以与包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂的其它例子包括但不限于：皮质类固醇，包括但不限于泼尼松(prednisone)；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白(IVIg)；镇痛药(例如扑热息痛(acetaminophen))；抗炎剂，包括但不限于非类固醇抗炎药(例如布洛芬(ibuprofen)、COX-1抑制剂、和COX-2抑制剂)；水杨酸盐或酯(salicylates)；抗生素；抗病毒剂；抗真菌剂；抗糖尿病剂(例如双胍、糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲、和噻唑烷二酮)；肾上腺素能药改性剂(adrenergic modifier)；利尿剂；激素(例如促蛋白合成类固醇、雄激素、雌激素、降钙素、孕激素(progestin)、促生长素抑制素(somatostan)、和甲状腺激素)；免疫调节剂；肌肉松弛剂；抗组胺剂；骨质疏松药(例如双膦酸盐、降钙素、和雌激素)；前列腺素；抗肿瘤剂；精神治疗药；镇静剂；毒橡树(poison oak)或毒漆树(poisonsumac)产品；抗体；及疫苗。

在某些实施方案中，包含靶向ApoB核酸的短反义化合物的药物组合物可以与降脂疗法联合施用。在某些此类实施方案中，降脂疗法是治疗性生活方式改变。在某些此类实施方案中，降脂疗法是LDL血浆清除。

在一个实施方案中，本文中所提供的反义化合物可用于降低人类受试者中的含载脂蛋白B的脂蛋白的水平。在用于本文时，“含载脂蛋白B的脂蛋白”指具有载脂蛋白B作为其蛋白质成分的任何脂蛋白，而且应当理解为包括LDL、VLDL、IDL、和脂蛋白(a)。LDL、VLDL、IDL和脂蛋白(a)各包含一分子载脂蛋白B，如此，血清载脂蛋白B测量反映了这些脂蛋白的总数。正如本领域所知道的，每一种上述脂蛋白都是导致动脉粥样硬化的。如此，降低血清中的一种或多种含载脂蛋白B的脂蛋白可以给人类受试者提供治疗好处。认为小LDL颗粒相对于大LDL颗粒特别导致动脉粥样硬化，如此，降低小LDL颗粒可以给人类受试者提供治疗好处。还可以测定受试者的别的脂质参数。总胆固醇:HDL比或LDL:HDL比降低是临床上想要的胆固醇比改进。类似地，临床上想要降低展现出脂质水平升高的人中的血清甘油三酯。

受试者中可测量的心血管疾病其它指标包括血清LDL颗粒大小；血清LDL胆固醇酯浓度；血清LDL胆固醇酯组成；血清LDL胆固醇酯的多不饱和程度；和血清HDL胆固醇水平。在用于本文时，“血清LDL颗粒大小”指血清LDL颗粒大小的分级，其可以是非常小的、小的、中等的、或大的，而且通常以g/μmol为单位表述。在本发明的内容中，“血清LDL胆固醇酯浓度”指LDL颗粒中所存在的胆固醇酯的量，而且通常以mg/dL为单位测量。在本发明的内容中，“血清LDL胆固醇酯组成”是血清LDL颗粒中所存在的饱和的、单不饱和的和多不饱和的胆固醇酯脂肪酸的百分比的度量。“血清LDL胆固醇酯的多不饱和程度”指血清LDL颗粒中的多不饱和胆固醇酯脂肪酸的百分比。

获取供分析用的血清或血浆样品的方法和制备血清样品以容许分析的方法是本领域技术人员所公知的。关于脂蛋白、胆固醇、甘油三酯和胆固醇酯的测量，术语“血清”和“血浆”在本文中可互换使用。

在另一个实施方案中，本文中所提供的反义化合物可用于治疗代谢紊乱。多种生物标志物可用于评估代谢疾病。例如，医师或甚至患者可使用商品化测试试剂盒或测糖仪(例如Ascensia ELITE^TM试剂盒，Ascensia(Bayer)，Tarrytown NY或Accucheck，Roche Diagnostics)测定血液葡萄糖水平。也可测量糖化血红蛋白(HbA_1c)。HbA_1c是体内经葡萄糖进行的翻译后修饰形成的稳定的次要血红蛋白变体，而且它包含主要为糖化的NH₂-末端β链。在之前的3个月里在HbA_1c水平与平均血液葡萄糖水平之间存在强相关性。如此，HbA_1c常常视为测量血液葡萄糖控制(control)的“黄金标准”(Bunn，H.F.等，1978，Science.200，21-7)。HbA_1c可以通过离子交换HPLC或免疫测定法来测量；供HbA_1c测量用的家用血液收集和邮寄试剂盒现在可广泛获得。血清果糖胺是稳定葡萄糖控制的另一度量，而且可以通过比色法(Cobas Integra，RocheDiagnostics)来测量。

某些靶向ApoB核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_000384.1之序列(收入本文作为SEQ ID NO：1)的ApoB核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物与SEQ ID NO：1至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物与SEQ IDNO：1至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物与SEQ ID NO：1 100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物包含选自表2和表3所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表2和表3的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、单体连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表2和表3列举了靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物的例子。表2列举了与SEQ ID NO：1100％互补的短反义化合物。表3列举了相对于SEQ ID NO：1具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表2：靶向SEQ ID NO：1的短反义化合物

 

ISIS No	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
						372816	263	278	CCGGAGGTGCTTGAAT	3-10-3 MOE	16
372894	264	277	CGGAGGTGCTTGAA	2-10-2 MOE	17
						372817	428	443	GAAGCCATACACCTCT	3-10-3 MOE	18
372895	429	442	AAGCCATACACCTC	2-10-2 MOE	19
						372818	431	446	GTTGAAGCCATACACC	3-10-3 MOE	20
372896	432	445	TTGAAGCCATACAC	2-10-2 MOE	21
						372819	438	453	CCTCAGGGTTGAAGCC	3-10-3 MOE	22
372897	439	452	CTCAGGGTTGAAGC	2-10-2 MOE	23
						372820	443	458	TTTGCCCTCAGGGTTG	3-10-3 MOE	24
372898	444	457	TTGCCCTCAGGGTT	2-10-2 MOE	25
						372821	468	483	AGTTCTTGGTTTTCTT	3-10-3 MOE	26
372899	469	482	GTTCTTGGTTTTCT	2-10-2 MOE	27
						372822	587	602	CCTCTTGATGTTCAGG	3-10-3 MOE	28
372900	588	601	CTCTTGATGTTCAG	2-10-2 MOE	29
						372823	592	607	ATGCCCCTCTTGATGT	3-10-3 MOE	30
372901	593	606	TGCCCCTCTTGATG	2-10-2MOE	31
						346583	715	728	TGCCACATTGCCCT	3-8-3 MOE	32
346584	716	729	TTGCCACATTGCCC	3-8-3 MOE	33
						346585	717	730	GTTGCCACATTGCC	3-8-3 MOE	34
346586	718	731	TGTTGCCACATTGC	3-8-3 MOE	35
						346587	719	732	CTGTTGCCACATTG	3-8-3 MOE	36
346588	720	733	TCTGTTGCCACATT	3-8-3 MOE	37
						346589	721	734	TTCTGTTGCCACAT	3-8-3 MOE	38
346590	722	735	TTTCTGTTGCCACA	3-8-3 MOE	39

 

346591	723	736	ATTTCTGTTGCCAC	3-8-3 MOE	40
						372824	929	944	GTAGGAGAAAGGCAGG	3-10-3 MOE	41
372902	930	943	TAGGAGAAAGGCAG	2-10-2 MOE	42
						372825	1256	1271	GGCTTGTAAAGTGATG	3-10-3 MOE	43
372903	1257	1270	GCTTGTAAAGTGAT	2-10-2 MOE	44
						372826	1304	1319	CCACTGGAGGATGTGA	3-10-3 MOE	45
372904	1305	1318	CACTGGAGGATGTG	2-10-2 MOE	46
						372829	2135	2150	TTTCAGCATGCTTTCT	3-10-3 MOE	47
372907	2136	2149	TTCAGCATGCTTTC	2-10-2 MOE	48
						372832	2774	2789	CATATTTGTCACAAAC	3-10-3 MOE	49
372910	2775	2788	ATATTTGTCACAAA	2-10-2 MOE	50
						372833	2779	2794	ATGCCCATATTTGTCA	3-10-3 MOE	51
372911	2780	2793	TGCCCATATTTGTC	2-10-2 MOE	52
						372835	2961	2976	TTTTGGTGGTAGAGAC	3-10-3 MOE	53
372913	2962	2975	TTTGGTGGTAGAGA	2-10-2 MOE	54
						346592	3248	3261	TCTGCTTCGCACCT	3-8-3 MOE	55
346593	3249	3262	GTCTGCTTCGCACC	3-8-3 MOE	56
						346594	3250	3263	AGTCTGCTTCGCAC	3-8-3 MOE	57
346595	3251	3264	CAGTCTGCTTCGCA	3-8-3 MOE	58
						346596	3252	3265	TCAGTCTGCTTCGC	3-8-3 MOE	59
346597	3253	3266	CTCAGTCTGCTTCG	3-8-3 MOE	60
						346598	3254	3267	CCTCAGTCTGCTTC	3-8-3 MOE	61
346599	3255	3268	GCCTCAGTCTGCTT	3-8-3 MOE	62
						346600	3256	3269	AGCCTCAGTCTGCT	3-8-3 MOE	63
372836	3350	3365	AACTCTGAGGATTGTT	3-10-3 MOE	64
						372914	3351	3364	ACTCTGAGGATTGT	2-10-2 MOE	65
372837	3355	3370	TCATTAACTCTGAGGA	3-10-3 MOE	66
						372915	3356	3369	CATTAACTCTGAGG	2-10-2 MOE	67
372838	3360	3375	ATTCATCATTAACTCT	3-10-3 MOE	68
						372916	3361	3374	TTCATCATTAACTC	2-10-2 MOE	69
372839	3409	3424	TTGTTCTGAATGTCCA	3-10-3 MOE	70
						387461	3409	3424	TTGTTCTGAATGTCCA	3-10-3亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	70

 

380147	3409	3424	TTGTTCTGAATGTCCA	3-10-3亚甲氧基BNA	70
						372917	3410	3423	TGTTCTGAATGTCC	2-10-2 MOE	73
372840	3573	3588	CAGATGAGTCCATTTG	3-10-3 MOE	74
						372918	3574	3587	AGATGAGTCCATTT	2-10-2 MOE	75
372841	3701	3716	ATCCACAGGGAAATTG	3-10-3 MOE	76
						372919	3702	3715	TCCACAGGGAAATT	2-10-2 MOE	77
372843	4219	4234	CAGTTGTACAAGTTGC	3-10-3 MOE	78
						372921	4220	4233	AGTTGTACAAGTTG	2-10-2 MOE	79
372844	4301	4316	CACAGAGTCAGCCTTC	3-10-3 MOE	80
						372922	4302	4315	ACAGAGTCAGCCTT	2-10-2 MOE	81
372845	4308	4323	GGTCAACCACAGAGTC	3-10-3 MOE	82
						372923	4309	4322	GTCAACCACAGAGT	2-10-2 MOE	83
346601	5588	5601	CAGCCACATGCAGC	3-8-3 MOE	84
						346602	5589	5602	CCAGCCACATGCAG	3-8-3 MOE	85
346603	5590	5603	ACCAGCCACATGCA	3-8-3 MOE	86
						346604	5591	5604	TACCAGCCACATGC	3-8-3 MOE	87
346605	5592	5605	TTACCAGCCACATG	3-8-3 MOE	88
						346606	5593	5606	GTTACCAGCCACAT	3-8-3 MOE	89
346607	5594	5607	GGTTACCAGCCACA	3-8-3 MOE	90
						346608	5595	5608	AGGTTACCAGCCAC	3-8-3 MOE	91
346609	5596	5609	TAGGTTACCAGCCA	3-8-3 MOE	92
						372851	5924	5939	AGGTTCTGCTTTCAAC	3-10-3 MOE	93
372929	5925	5938	GGTTCTGCTTTCAA	2-10-2 MOE	94
						372854	6664	6679	TACTGATCAAATTGTA	3-10-3 MOE	95
372932	6665	6678	ACTGATCAAATTGT	2-10-2 MOE	96
						372855	6908	6923	TTTTTCTTGTATCTGG	3-10-3 MOE	97
372933	6909	6922	TTTTCTTGTATCTG	2-10-2 MOE	98
						372856	7190	7205	ATCCATTAAAACCTGG	3-10-3 MOE	99
372934	7191	7204	TCCATTAAAACCTG	2-10-2 MOE	100
						372858	7817	7832	ATATTGCTCTGCAAAG	3-10-3 MOE	101
372936	7818	7831	TATTGCTCTGCAAA	2-10-2 MOE	102
						346610	7818	7831	TATTGCTCTGCAAA	3-8-3 MOE	102
346611	7819	7832	ATATTGCTCTGCAA	3-8-3 MOE	104
						346612	7820	7833	AATATTGCTCTGCA	3-8-3 MOE	105

 

346613	7821	7834	GAATATTGCTCTGC	3-8-3 MOE	106
						346614	7822	7835	AGAATATTGCTCTG	3-8-3 MOE	107
346615	7823	7836	TAGAATATTGCTCT	3-8-3 MOE	108
						346616	7824	7837	ATAGAATATTGCTC	3-8-3 MOE	109
346617	7825	7838	GATAGAATATTGCT	3-8-3 MOE	110
						346618	7826	7839	GGATAGAATATTGC	3-8-3 MOE	111
372859	7995	8010	ATGGAATCCTCAAATC	3-10-3 MOE	112
						372937	7996	8009	TGGAATCCTCAAAT	2-10-2 MOE	113
372861	8336	8351	GAATTCTGGTATGTGA	3-10-3 MOE	114
						372939	8337	8350	AATTCTGGTATGTG	2-10-2 MOE	115
372862	8341	8356	AGCTGGAATTCTGGTA	3-10-3 MOE	116
						372940	8342	8355	GCTGGAATTCTGGT	2-10-2 MOE	117
372863	8539	8554	TGAAAATCAAAATTGA	3-10-3 MOE	118
						372941	8540	8553	GAAAATCAAAATTG	2-10-2 MOE	119
372871	9344	9359	AAACAGTGCATAGTTA	3-10-3 MOE	120
						372949	9345	9358	AACAGTGCATAGTT	2-10-2 MOE	121
372872	9515	9530	TTCAGGAATTGTTAAA	3-10-3 MOE	122
						372950	9516	9529	TCAGGAATTGTTAA	2-10-2 MOE	123
372875	9794	9809	TTTTGTTTCATTATAG	3-10-3 MOE	124
						372953	9795	9808	TTTGTTTCATTATA	2-10-2 MOE	125
372877	10157	10172	GATGACACTTGATTTA	3-10-3 MOE	126
						372955	10158	10171	ATGACACTTGATTT	2-10-2 MOE	127
372878	10161	10176	GTGTGATGACACTTGA	3-10-3 MOE	128
						372956	10162	10175	TGTGATGACACTTG	2-10-2 MOE	129
372879	10167	10182	TATTCAGTGTGATGAC	3-10-3 MOE	130
						372957	10168	10181	ATTCAGTGTGATGA	2-10-2 MOE	131
372880	10172	10187	ATTGGTATTCAGTGTG	3-10-3 MOE	132
						372958	10173	10186	TTGGTATTCAGTGT	2-10-2 MOE	133
346619	10838	10851	CCTCTAGCTGTAAG	3-8-3 MOE	134
						346620	10839	10852	CCCTCTAGCTGTAA	3-8-3 MOE	135
346621	10840	10853	GCCCTCTAGCTGTA	3-8-3 MOE	136
						346622	10841	10854	GGCCCTCTAGCTGT	3-8-3 MOE	137
346623	10842	10855	AGGCCCTCTAGCTG	3-8-3 MOE	138
						346624	10843	10856	GAGGCCCTCTAGCT	3-8-3 MOE	139
346625	10844	10857	AGAGGCCCTCTAGC	3-8-3 MOE	140

 

346626	10845	10858	AAGAGGCCCTCTAG	3-8-3 MOE	141
						346627	10846	10859	AAAGAGGCCCTCTA	3-8-3 MOE	142
372890	13689	13704	GAATGGACAGGTCAAT	3-10-3 MOE	143
						372968	13690	13703	AATGGACAGGTCAA	2-10-2 MOE	144
372891	13694	13709	GTTTTGAATGGACAGG	3-10-3 MOE	145
						372969	13695	13708	TTTTGAATGGACAG	2-10-2 MOE	146
372892	13699	13714	TGGTAGTTTTGAATGG	3-10-3 MOE	147
						372970	13700	13713	GGTAGTTTTGAATG	2-10-2 MOE	148
346628	13907	13920	TCACTGTATGGTTT	3-8-3 MOE	149
						346629	13908	13921	CTCACTGTATGGTT	3-8-3 MOE	150
346630	13909	13922	GCTCACTGTATGGT	3-8-3 MOE	151
						346631	13910	13923	GGCTCACTGTATGG	3-8-3 MOE	152
346632	13911	13924	TGGCTCACTGTATG	3-8-3 MOE	153
						346633	13912	13925	CTGGCTCACTGTAT	3-8-3 MOE	154
346634	13913	13926	GCTGGCTCACTGTA	3-8-3 MOE	155
						346635	13914	13927	GGCTGGCTCACTGT	3-8-3 MOE	156
346636	13915	13928	AGGCTGGCTCACTG	3-8-3 MOE	157
						346637	13963	13976	CAGGTCCAGTTCAT	3-8-3 MOE	158
346638	13964	13977	GCAGGTCCAGTTCA	3-8-3 MOE	159
						346639	13965	13978	TGCAGGTCCAGTTC	3-8-3 MOE	160
346640	13966	13979	GTGCAGGTCCAGTT	3-8-3 MOE	161
						346641	13967	13980	GGTGCAGGTCCAGT	3-8-3 MOE	162
346642	13968	13981	TGGTGCAGGTCCAG	3-8-3 MOE	163
						346643	13969	13982	TTGGTGCAGGTCCA	3-8-3 MOE	164
346644	13970	13983	TTTGGTGCAGGTCC	3-8-3 MOE	165
						346645	13971	13984	CTTTGGTGCAGGTC	3-8-3 MOE	166
346646	14051	14064	TAACTCAGATCCTG	3-8-3 MOE	167
						346647	14052	14065	ATAACTCAGATCCT	3-8-3 MOE	168
346648	14053	14066	AATAACTCAGATCC	3-8-3 MOE	169
						346649	14054	14067	AAATAACTCAGATC	3-8-3 MOE	170
346650	14055	14068	AAAATAACTCAGAT	3-8-3 MOE	171
						346651	14056	14069	CAAAATAACTCAGA	3-8-3 MOE	172
346652	14057	14070	GCAAAATAACTCAG	3-8-3 MOE	173
						346653	14058	14071	AGCAAAATAACTCA	3-8-3 MOE	174
346654	14059	14072	TAGCAAAATAACTC	3-8-3 MOE	175

表3：靶向SEQ ID NO：1且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

IsisNO.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						372894	771	784	CGGAGGTGCTTGAA	2-10-2 MOE	17
372905	1111	1124	CAGGGCCTGGAGAG	2-10-2 MOE	176
						346628	1493	1506	TCACTGTATGGTTT	3-8-3 MOE	149
372828	2006	2021	TCTGAAGTCCATGATC	3-10-3 MOE	177
						372906	2007	2020	CTGAAGTCCATGAT	2-10-2 MOE	178
372830	2382	2397	TGGGCATGATTCCATT	3-10-3 MOE	179
						372908	2383	2396	GGGCATGATTCCAT	2-10-2 MOE	180
346616	3162	3175	ATAGAATATTGCTC	3-8-3 MOE	109
						346617	3163	3176	GATAGAATATTGCT	3-8-3 MOE	110
372929	3513	3526	GGTTCTGCTTTCAA	2-10-2 MOE	94
						372946	3800	3813	TGGAGCCCACGTGC	2-10-2 MOE	181
372904	4040	4053	CACTGGAGGATGTG	2-10-2 MOE	46
						372842	4084	4099	TTGAAGTTGAGGGCTG	3-10-3 MOE	182
372920	4085	4098	TGAAGTTGAGGGCT	2-10-2 MOE	183
						346586	4778	4791	TGTTGCCACATTGC	3-8-3 MOE	35
372847	5030	5045	ACCAGTATTAATTTTG	3-10-3 MOE	184
						372925	5031	5044	CCAGTATTAATTTT	2-10-2 MOE	185
372848	5192	5207	GTGTTCTTTGAAGCGG	3-10-3 MOE	186
						372926	5193	5206	TGTTCTTTGAAGCG	2-10-2 MOE	187
372953	5625	5638	TTTGTTTCATTATA	2-10-2 MOE	125
						372935	7585	7598	AGTTACTTTGGTGT	2-10-2 MOE	188
372860	8255	8270	TGGTACATGGAAGTCT	3-10-3 MOE	189
						372938	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2 MOE	190
391260	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2 MOE	190
						392068	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2 MOE	190
387462	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2亚甲氧基BNA	190
						391872	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	1-1-10-2 2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺亚甲氧基BNA/亚甲氧	190

 

				基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶
						380148	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2亚甲氧基BNA	190
391871	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	1-1-10-2 2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸    酰    胺/MOE/MOE缺口中的未修饰胞嘧啶	190
						391755	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2 ENA仅翼中的mC	190
398296	8256	8269	GGTACATGGAAGTC	2-10-2    (6’S)-6’-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	190
						372942	8455	8468	TCCATGCCATATGT	2-10-2 MOE	200
372865	8888	8903	CCCTGAAGAAGTCCAT	3-10-3 MOE	201
						372943	8889	8902	CCTGAAGAAGTCCA	2-10-2 MOE	202
372866	8908	8923	GCCCAGTTCCATGACC	3-10-3 MOE	203
						372944	8909	8922	CCCAGTTCCATGAC	2-10-2 MOE	204
372867	9058	9073	TTGAGGAAGCCAGATT	3-10-3 MOE	205
						372945	9059	9072	TGAGGAAGCCAGAT	2-10-2 MOE	206
372870	9261	9276	TGGATGCAGTAATCTC	3-10-3 MOE	207
						372948	9262	9275	GGATGCAGTAATCT	2-10-2 MOE	208
372881	10185	10200	TATAAAGTCCAGCATT	3-10-3 MOE	209
						372959	10186	10199	ATAAAGTCCAGCAT	2-10-2 MOE	210
372882	10445	10460	AAGTTCCTGCTTGAAG	3-10-3 MOE	211
						372960	10446	10459	AGTTCCTGCTTGAA	2-10-2 MOE	212
372964	11451	11464	AATGGTGAAGTACT	2-10-2 MOE	213
						346612	13459	13472	AATATTGCTCTGCA	3-8-3 MOE	105
346613	13460	13473	GAATATTGCTCTGC	3-8-3 MOE	106

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸263-278。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸263-278的短反义化合物包含选自SEQID NO：16或17的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸263-278的短反义化合物选自Isis NO.372816或372894。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸428-483。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸428-483的短反义化合物包含选自SEQID NO 18、19、20、21、22、23、24、25、26、或27的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸428-483的短反义化合物选自IsisNO.372817、372895、372818、372896、372819、372897、372820、372898、372821、或372899。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸428-458。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸428-458的短反义化合物包含选自SEQID NO 18、19、20、21、22、23、24、或25的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸428-458的短反义化合物选自Isis NO.372817、372895、372818、372896、372819、372897、372820、或372898。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸468-483。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸468-483的短反义化合物包含选自SEQID NO 26或27的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸468-483的短反义化合物选自Isis NO.372821或372899。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸587-607。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸587-607的短反义化合物包含选自SEQID NO 28、29、30、或31的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQID NO：1核苷酸587-607的短反义化合物选自ISIS NO.372822、372900、372823、或372901。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸715-736。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸715-736的短反义化合物包含选自SEQID NO 32、33、34、35、36、37、38、39、或40的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸715-736的短反义化合物选自Isis NO.346583、346584、346585、346586、346587、346588、346589、346590、或346591。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸929-944。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸929-944的短反义化合物包含选自SEQID NO 41或42的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸929-944的短反义化合物选自Isis NO.372824或372902。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸1256-1319。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1256-1319的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 43、44、45、或46的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1256-1319的短反义化合物选自Isis NO.372825、372903、372826、或372904。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸1256-1271。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1256-1271的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 43或44的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1256-1271的短反义化合物选自Isis NO.372825或372903。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸1304-1319。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1304-1319的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 45或46的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸1304-1319的短反义化合物选自Isis NO.372826或372904。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸2135-2150。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2135-2150的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 47或48的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2135-2150的短反义化合物选自ISIS NO.372829或372907。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸2774-2794。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2774-2794的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 49、50、51、或52的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2774-2794的短反义化合物选自ISIS NO.372832、372910、372833、或372911。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸2961-2976。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2961-2976的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 53或54的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸2961-2976的短反义化合物选自ISIS NO.372835或372913。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸3248-3269。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3248-3269的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 55、56、57、58、59、60、61、62、或63的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3248-3269的短反义化合物选自ISIS NO.346592、346593、346594、346595、346596、346597、346598、346599、或346600。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸3350-3375。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3350-3375的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 64、65、66、67、68、或69的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3350-3375的短反义化合物选自ISIS NO.372836、372914、372837、372915、372838、或372916。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸3409-3424。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3409-3424的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 70或73的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3409-3424的短反义化合物选自ISIS NO.372839、387461、380147、或372917。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸3573-3588。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3573-3588的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 74或75的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3573-3588的短反义化合物选自ISIS NO.372840或372918。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸3701-3716。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3701-3716的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 76或77的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸3701-3716的短反义化合物选自ISIS NO.372841或372919。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸4219-4234。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸4219-4234的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 78或79的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸4219-4234的短反义化合物选自ISIS NO.372843或372921。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸4301-4323。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸4301-4323的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 80、81、82、或83的核苷酸序列。在某些实施方案中，靶向SEQID NO：1核苷酸4301-4323的短反义化合物选自ISIS NO.372844、372922、372845、或372923。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸5588-5609。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸5588-5609的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 84、85、86、87、88、89、90、91、或92的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸5588-5609的短反义化合物选自ISIS NO.346601、346602、346603、346604、346605、346606、346607、346608、或346609。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸5924-5939。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸5924-5939的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 93或94的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸5924-5939的短反义化合物选自ISIS NO.372851或372929。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸6664-6679。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸6664-6679的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 95或96的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸6664-6679的短反义化合物选自ISIS NO.372854或372932。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸6908-6923。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸6908-6923的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 97或98的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸6908-6923的短反义化合物选自ISIS NO.372855或372933。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸7190-7205。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸7190-7205的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 99或100的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸7190-7205的短反义化合物选自ISIS NO.372856或372934。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸7817-7839。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸7817-7839的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 101、102、104、105、106、107、108、109、110、或111的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸7817-7839的短反义化合物选自ISIS NO.372858、372936、346610、346611、346612、346613、346614、346615、346616、346617、或346618。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸7995-8010。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸7995-8010的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 112或113的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：1核苷酸7995-8010的短反义化合物选自ISIS NO.372859或372937。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸8336-8356。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸8336-8356的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 114、115、116、或117的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸8336-8356的短反义化合物选自ISIS NO.372861、372939、372862、或372940。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸8539-8554。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸8539-8554的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 118或119的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：1核苷酸8539-8554的短反义化合物选自ISIS NO.372863或372941。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸9344-9359。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸9344-9359的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 120或121的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：1核苷酸9344-9359的短反义化合物选自ISIS NO.372871或372949。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸9515-9530。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸9515-9530的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 122或123的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：1核苷酸9515-9530的短反义化合物选自ISIS NO.372872或372950。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸9794-9809。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸9794-9809的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 124或125的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：1核苷酸9794-9809的短反义化合物选自ISIS NO.372875或372953。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸10157-10187。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸10157-10187的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 126、127、128、129、130、131、132、或133的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸10157-10187的短反义化合物选自ISIS NO.372877、372955、372878、372956、372879、372957、372880、或372958。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸10838-10859。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸10838-10859的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 134、135、136、137、138、139、140、141、或142的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸10838-10859的短反义化合物选自ISIS NO.346619、346620、346621、346622、346623、346624、346625、346626、或346627。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸13689-13714。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13689-13714的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 143、144、145、146、147、或148的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13689-13714的短反义化合物选自ISIS NO.372890、372968、372891、372969、372892、或372970。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸13907-13928。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13907-13928的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 149、150、151、152、153、154、155、156、或157的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13907-13928的短反义化合物选自ISIS NO.346628、346629、346630、346631、346632、346633、346634、346635、或346636。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸13963-13984。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13963-13984的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 158、159、160、161、162、163、164、165、或166的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸13963-13984的短反义化合物选自ISIS NO.346637、346638、346639、346640、346641、346642、346643、346644、或346645。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：1的核苷酸14051-14072。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸14051-14072的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 167、168、169、170、171、172、173、174、或175的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：1核苷酸14051-14072的短反义化合物选自ISIS NO.346646、346647、346648、346649、346650、346651、346652、346653、或346654。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向ApoB核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控ApoB表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向ApoB核酸的短反义化合物，其中所述靶向ApoB核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物来调控ApoB表达的方法。

在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长8个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长9个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长10个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长11个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长12个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长13个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长14个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长15个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB的方法包括使用长16个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控ApoB表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向ApoB核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控ApoB表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向ApoB核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向ApoB核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1，1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)

2.SGLT-2

钠依赖性葡萄糖转运蛋白2(SGLT-2)在肾近曲小管上皮细胞中表达，而且发挥重吸收葡萄糖以防止尿液中的葡萄糖损失的功能。对于人类基因组，SGLT-2是11个成员的钠底物协同转运蛋白家族的成员。这个家族的许多成员共享序列同源性，例如SGLT-1与SGLT-2共享大约59％序列同一性而与SGLT-3共享大约70％序列同一性。SGLT-1是在心脏和CNS中找到的葡萄糖转运蛋白。SGLT-3是小肠中的葡萄糖敏感性钠通道(glucose sensing sodium channel)。这些SGLT的不同定位样式是同源家族成员间的一个区别点(Handlon，A.L.，Expert Opin.Ther.Patents(2005)15(11)：1532-1540；Kanai等，J.Clin.Invest.，1994，93，397-404；Wells等，Am.J.Physiol.Endocrinol.Metab.，1992，263，F459-465)。

关于将人类SGLT2注射入爪蟾卵母细胞的研究证明了此蛋白质介导D-葡萄糖和α-甲基-D-吡喃葡萄糖苷(α-MeGlc；葡萄糖类似物)的钠依赖性转运，对α-MeGlc的Km值为1.6 mM而钠与葡萄糖的偶联比为1:1(Kanai等，J.Clin.Invest.，1994，93，397-404；You等，J.Biol.Chem.，1995，270，29365-29371)。此转运活性受到根皮苷(phlorizin)(一种能结合SGLT的葡萄糖位点但不被转运因而抑制SGLT作用的植物糖苷)的抑制(You等，J.Biol.Chem.，1995，270，29365-29371)。

糖尿病是特征为由于胰岛素作用不足而高血糖的病症。慢性高血糖是糖尿病相关并发症(包括心脏病、视网膜病、肾病和神经病)的主要风险因子。由于肾在调节血浆葡萄糖水平中发挥主要作用，肾葡萄糖转运蛋白正在成为诱人的药物靶(Wright，Am.J.Physiol.Renal Physiol.，2001，280，F10-18)。糖尿病性肾病是许多具有糖尿病的患者中发生的末期肾病的最常见原因。源自长期高血糖的葡萄糖毒性在糖尿病患者中诱发组织依赖性胰岛素耐受(Nawano等，Am.J.Physiol.Endocrinol.Metab.，2000，278，E535-543)。

定义

“钠依赖性葡萄糖转运蛋白2”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。钠依赖性葡萄糖转运蛋白2一般可称为SGLT2，但也可称为SLC5A2；钠-葡萄糖转运蛋白2；钠-葡萄糖协同转运蛋白，肾低亲和力的；钠-葡萄糖协同转运蛋白，肾的；溶质载体家族5(钠/葡萄糖协同转运蛋白)，成员2；SL52。

“SGLT2核酸”指编码SGLT2的任何核酸。例如，在某些实施方案中，SGLT2核酸包括但不限于编码SGLT2的DNA序列、自编码SGLT2的DNA转录得到的RNA序列、和编码SGLT2的mRNA序列。“SGLT2 mRNA”指编码SGLT2蛋白的mRNA。

治疗适应症

在某些实施方案中，短反义化合物用于调控SGLT-2及相关蛋白质的表达。在某些实施方案中，此类调控是通过提供能与一种或多种编码SGLT-2的靶核酸分子杂交的短反义化合物来实现的，所述SGLT-2包括但不限于SGLT2、SL52、SLC5A2、钠-葡萄糖协同转运蛋白、肾低亲和力钠-葡萄糖协同转运蛋白、肾钠-葡萄糖协同转运蛋白2和溶质载体家族5钠/葡萄糖协同转运蛋白成员2。还提供了治疗代谢和/或心血管疾病和疾患的方法，如本文所述。在具体的实施方案中，能抑制SGLT2表达的短反义化合物用于降低动物中的血液葡萄糖水平的方法和延迟或预防2型糖尿病发作的方法。此类方法包括给可能需要治疗的动物施用治疗或预防有效量的一种或多种本发明化合物。所述一种或多种化合物可以是靶向编码SGLT2的核酸的短反义化合物。本文提供了增强对肾细胞或肾组织中SGLT2表达的抑制的方法，包括使所述细胞或组织接触一种或多种本发明化合物，诸如靶向编码SGLT2的核酸的短反义化合物。

虽然已经依照某些实施方案具体描述了某些化合物、组合物和方法，但是以下例子仅用于例示本发明的化合物而非意图限制本发明的化合物。

在某些实施方案中，短反义化合物是具有混合的硫代磷酸酯和磷酸二酯主链(backbone)的嵌合寡聚化合物。某些混合主链短反义化合物具有包含至少5个连续的2′-脱氧核苷的中央缺口，其侧翼为两个各包含至少1个2′-O-甲氧乙基核苷的翼。在某些实施方案中，所述混合主链化合物的核苷间连接在缺口中是硫代磷酸酯连接，而在两翼中是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，混合主链化合物在翼中具有硫代磷酸酯连接，只是在寡核苷酸的5′和3′两个末端中的一个或两个的尽头具有一个磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向SGLT2的短反义化合物具有选自3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、2-8-2、1-9-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的基序(翼-脱氧缺口-翼)。在某些实施方案中，靶向SGLT2的短反义化合物具有选自1-10-1、1-10-2、2-8-2、1-9-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸且具有混合主链的短反义化合物有效递送至肾。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸且具有混合主链的短反义化合物的施用导致对肾中靶基因表达的调控。在某些此类实施方案中，没有或有很小的肝或肾毒性。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸且具有混合主链的短反义化合物与没有混合主链但在其它方面相同的短反义化合物相比降低SGLT-2 mRNA更有力且作用发生更快。在某些此类实施方案中，此类升高的效力和/或降低的毒性是在小鼠和/或大鼠中的。在某些此类实施方案中，此类升高的效力和/或降低的毒性是在人类中的。

举例而言且仅出于例示目的，包含统一的硫代磷酸酯连接的ISIS 145733和在翼中包含磷酸二酯连接而在缺口中包含硫代磷酸酯连接的ISIS 257016在其它方面是相同的。二者都包含序列GAAGTAGCCACCAACTGTGC(SEQID NO.1572)。这两种寡核苷酸都进一步包含由10个2′-脱氧核苷酸组成的缺口，其两侧翼各为5个核苷酸，2′-甲氧乙基，(2′-MOE)核苷酸。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。混合主链化合物ISIS 257016与非混合的亲本化合物ISIS145733相比在降低SGLT-2 mRNA方面强大约50倍(见实施例9)。

关于某些混合主链化合物ISIS 257016的药动学研究指出了，在某些实施方案中，所述化合物起药物前体的作用，代谢成12个核碱基的药效团。使用ISIS 370717(与ISIS 257016对应的12个核碱基的短反义化合物)进行的研究显示出，所述化合物具有与ISIS 257016相似的药理学特性，但是作用发生更快。ISIS 370717是靶向SGLT-2的12个核碱基的反义寡核苷酸，其包含序列TAGCCACCAACT(SEQ ID NO.1554)，进一步包含由10个2′-脱氧核苷酸组成的缺口，其两侧翼各有一个核苷酸的翼。所述翼由2′-甲氧乙基(2′-MOE)核苷酸构成。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。贯穿整个寡核苷酸的核苷间连接都是硫代磷酸酯(P＝S)。ISIS 257016与ISIS 370717药理学活性的相似性支持了指出ISIS 257016是具有12个核苷酸的药效团的药物前体的药动学研究(参见实施例10)。另外，使用稳定化(末端加帽的)形式ISIS 257016进行的研究显示出剧烈的活性损失。

在某些实施方案中，在翼中包含2’MOE单体的短反义化合物有效递送至肾，而且使用此类化合物进行的治疗导致对肾中靶基因表达的有效调控而没有肝或肾毒性。本文中进一步显示了，在某些实施方案中，短反义化合物与靶向SGLT-2 mRNA的亲本寡核苷酸相比在小鼠和大鼠中降低SGLT-2 mRNA更有力且作用发生更快。2’MOE缺口短聚物(shortmer)在本文中显示出胜过亲本化合物改进效力和生物利用度。

举例而言且仅出于例示目的，使用ISIS 370717进行的研究揭示了所述短反义化合物与更长的亲本相比在肾组织中有显著更高的积累(大约500微克每克组织)。此外，SGLT-2 mRNA相对于对照降低了超过80％(参见实施例11)。ISIS 3707171-10-1缺口聚物作为模板用于制备具有不同序列的序列相关寡聚物。在ISIS 370717 12聚物寡核苷酸附近评估翼、缺口和总长度变化的研究见实施例12。所评估的某些基序包括1-10-1、2-8-2、1-8-1、3-6-3、和1-6-1(见实施例12表60)。对化合物分析了它们对SGLT2 mRNA水平的效果。所有基序都在体内以剂量依赖性方式抑制SGLT2表达。发现1-10-1、2-8-2和1-8-1缺口聚物特别有力。使用这些基序时，SGLT-2 mRNA相对于对照降低了超过80％。

在某些实施方案中，本发明提供了靶向SGLT2核酸且具有选自1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物的基序的短反义化合物(见实施例13表62)。对某些此类化合物分析了它们对大鼠SGLT2 mRNA的效果。表63中的结果表明1-10-1和1-10-2 MOE这两种缺口聚物都在体内以剂量依赖性方式抑制SGLT2表达，而且SGLT-2 mRNA降低超过80％是可以实现的。

对某些别的1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物在小鼠和大鼠体内模型中都进行了评估(见例如实施例14和15)。许多1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物在相对低浓度的寡聚物实现了SGLT-2 mRNA超过80％的降低，而且没有任何毒性效应。

在另一个非限制性实施例中，还分析了ISIS 388625对犬SGLT2 mRNA水平的效果。犬研究表明，在1mg/kg/wk剂量可以实现SGLT2表达超过80％的抑制。在略微更高的剂量可以实现甚至更大的抑制。在犬中施用ISIS 388625还显示出改进的葡萄糖耐受。在标准葡萄糖耐受测试中，与盐水对照相比，血浆葡萄糖峰水平平均降低了超过50％，而且后续葡萄糖降低减弱(见实施例17)。同样，在大鼠糖尿病模型中，短反义化合物显示出与PBS和对照治疗小鼠相比随时间显著降低血浆葡萄糖水平和HbA1C(见实施例16)。

对所有研究中的动物进一步评估毒性。例如，评估总体重、肝重、脾重和肾重。脾重、肝重或体重的显著变化指示了特定化合物引起毒性效应。发现所有变化在误差范围内。在治疗期间或在研究结束时没有观察到显著的体重变化。没有观察到肝重或脾重的显著变化。

某些靶向SGLT2核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_003041.1之序列(收入本文作为SEQ ID NO：2)的SGLT2核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物与SEQ ID NO：3至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物与SEQ IDNO：3至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物与SEQ ID NO：1100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物包含选自表4和表5所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表4和表5的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块、单体连接、或核碱基的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表4和表5列举了靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物的例子。表4列举了与SEQ ID NO：3 100％互补的短反义化合物。表5列举了相对于SEQ ID NO：3具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表4：靶向SEQ ID NO：3的短反义化合物

 

ISIS No	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
						379684	84	95	TGTCAGCAGGAT	1-10-1 MOE	214
405193	113	124	CAGCAGGAAATA	2-8-2 MOE	215
						405194	114	125	CCAGCAGGAAAT	2-8-2 MOE	216
405195	115	126	ACCAGCAGGAAA	2-8-2 MOE	217
						405196	116	127	GACCAGCAGGAA	2-8-2 MOE	218
405197	117	128	TGACCAGCAGGA	2-8-2 MOE	219
						379685	117	128	TGACCAGCAGGA	1-10-1 MOE	219
405198	118	129	ATGACCAGCAGG	2-8-2 MOE	221
						405199	119	130	AATGACCAGCAG	2-8-2 MOE	222
405200	120	131	CAATGACCAGCA	2-8-2 MOE	223
						405201	121	132	CCAATGACCAGC	2-8-2 MOE	224
379686	135	146	ACCACAAGCCAA	1-10-1 MOE	225
						379711	172	183	TAGCCGCCCACA	1-10-1 MOE	226
388628	172	183	TAGCCGCCCACA	2-8-2 MOE	226
						405202	207	218	CCGGCCACCACA	2-8-2 MOE	228
405203	208	219	ACCGGCCACCAC	2-8-2 MOE	229
						405204	236	247	GATGTTGCTGGC	2-8-2 MOE	230
379687	236	247	GATGTTGCTGGC	1-10-1 MOE	230
						405205	237	248	CGATGTTGCTGG	2-8-2 MOE	232
405206	238	249	CCGATGTTGCTG	2-8-2 MOE	233
						405207	239	250	GCCGATGTTGCT	2-8-2 MOE	234
405208	240	251	TGCCGATGTTGC	2-8-2 MOE	235
						405209	241	252	CTGCCGATGTTG	2-8-2 MOE	236
405210	260	271	CAGGCCCACAAA	2-8-2 MOE	237
						405211	261	272	CCAGGCCCACAA	2-8-2 MOE	238
405212	262	273	GCCAGGCCCACA	2-8-2 MOE	239
						379688	288	299	CAAGCCACTTG	1-10-1 MOE	240
379689	318	329	AGAGCGCATTCC	1-10-1 MOE	241
						379690	435	446	ACAGGTAGAGGC	1-10-1 MOE	242
405248	474	485	AGATCTTGGTGA	2-8-2 MOE	243

 

379691	474	485	AGATCTTGGTGA	1-10-1 MOE	243
						382676	527	539	TGTTCCAGCCCAG	1-10-2 MOE	245
388625	528	539	TGTTCCAGCCCA	2-8-2 MOE	246
						389780	528	539	TGTTCCAGCCCA	1-9-2 MOE	246
379692	528	539	TGTTCCAGCCCA	1-10-1 MOE	246
						392170	528	539	TGTTCCAGCCCA	1-10-1  亚甲氧基BNA	246
392173	528	539	TGTTCCAGCCCA	2-8-2亚甲氧基BNA	246
						405213	529	540	ATGTTCCAGCCC	2-8-2 MOE	251
405214	564	575	TGGTGATGCCCA	2-8-2 MOE	252
						405215	565	576	ATGGTGATGCCC	2-8-2 MOE	253
405216	566	577	CATGGTGATGCC	2-8-2 MOE	254
						379693	566	577	CATGGTGATGCC	1-10-1 MOE	254
405217	567	578	TCATGGTGATGC	2-8-2 MOE	256
						405218	568	579	ATCATGGTGATG	2-8-2 MOE	257
405219	587	598	CCCTCCTGTCAC	2-8-2 MOE	258
						405220	588	599	GCCCTCCTGTCA	2-8-2 MOE	259
405221	589	600	AGCCCTCCTGTC	2-8-2 MOE	260
						405222	590	601	CAGCCCTCCTGT	2-8-2 MOE	261
405223	591	602	CCAGCCCTCCTG	2-8-2 MOE	262
						405224	592	603	GCCAGCCCTCCT	2-8-2 MOE	263
379694	629	640	GACGAAGGTCTG	1-10-1 MOE	264
						405225	707	718	GTATTTGTCGAA	2-8-2 MOE	265
379695	737	748	GGACACCGTCAG	1-10-1 MOE	266
						379696	974	985	CAGCTTCAGGTA	1-10-1 MOE	267
405226	998	1009	CATGACCATGAG	2-8-2 MOE	268
						405227	999	1010	GCATGACCATGA	2-8-2 MOE	269
405228	1000	1011	GGCATGACCATG	2-8-2 MOE	270
						405229	1001	1012	TGGCATGACCAT	2-8-2 MOE	271
405230	1002	1013	CTGGCATGACCA	2-8-2 MOE	272
						379697	1002	1013	CTGGCATGACCA	1-10-1 MOE	272
405231	1003	1014	CCTGGCATGACC	2-8-2 MOE	274
						379698	1091	1102	GCAGCCCACCTC	1-10-1 MOE	275
405232	1092	1103	AGCAGCCCACCT	2-8-2 MOE	276

 

405233	1093	1104	GAGCAGCCCACC	2-8-2 MOE	277
						405234	1130	1141	CATGAGCTTCAC	2-8-2 MOE	278
405235	1131	1142	GCATGAGCTTCA	2-8-2 MOE	279
						382677	1131	1143	GGCATGAGCTTCA	1-10-2 MOE	280
388626	1132	1143	GGCATGAGCTTC	2-8-2 MOE	281
						379699	1132	1143	GGCATGAGCTTC	1-10-1 MOE	281
405236	1133	1144	GGGCATGAGCTT	2-8-2 MOE	283
						405237	1157	1168	CAGCATGAGTCC	2-8-2 MOE	284
405238	1158	1169	CCAGCATGAGTC	2-8-2 MOE	285
						379700	1158	1169	CCAGCATGAGTC	1-10-1 MOE	285
405239	1159	1170	GCCAGCATGAGT	2-8-2 MOE	287
						379701	1230	1241	CCATGGTGAAGA	1-10-1 MOE	288
405240	1542	1553	CACAGCTGCCCG	2-8-2 MOE	289
						405241	1543	1554	ACACAGCTGCCC	2-8-2 MOE	290
405242	1544	1555	CACACAGCTGCC	2-8-2 MOE	291
						382678	1544	1556	GCACACAGCTGCC	1-10-2 MOE	292
388627	1545	1556	GCACACAGCTGC	2-8-2 MOE	293
						379702	1545	1556	GCACACAGCTGC	1-10-1 MOE	293
379703	1701	1712	GCCGGAGACTGA	1-10-1 MOE	295
						405243	1976	1987	ATTGAGGTTGAC	2-8-2 MOE	296
405244	1977	1988	CATTGAGGTTGA	2-8-2 MOE	297
						405245	1978	1989	GCATTGAGGTTG	2-8-2 MOE	298
405246	1979	1990	GGCATTGAGGTT	2-8-2 MOE	299
						405247	1980	1991	GGGCATTGAGGT	2-8-2 MOE	300

表5：靶向SEQ ID NO：3且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISISNo	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
						405200	96	107	CAATGACCAGCA	2-8-2 MOE	223
405215	382	393	ATGGTGATGCCC	2-8-2 MOE	253
						405216	383	394	CATGGTGATGCC	2-8-2 MOE	254
379693	383	394	CATGGTGATGCC	1-10-1 MOE	254
						379701	471	482	CCATGGTGAAGA	1-10-1 MOE	288
405218	472	483	ATCATGGTGATG	2-8-2 MOE	257

 

405246	536	547	GGCATTGAGGTT	2-8-2 MOE	299
						405248	570	581	AGATCTTGGTGA	2-8-2 MOE	243
379691	570	581	AGATCTTGGTGA	1-10-1 MOE	243
						379698	683	694	GCAGCCCACCTC	1-10-1 MOE	275
405232	684	695	AGCAGCCCACCT	2-8-2 MOE	276
						379711	685	696	TAGCCGCCCACA	1-10-1 MOE	226
388628	685	696	TAGCCGCCCACA	2-8-2 MOE	226
						379698	950	961	GCAGCCCACCTC	1-10-1 MOE	275
405232	951	962	AGCAGCCCACCT	2-8-2 MOE	276
						405235	978	989	GCATGAGCTTCA	2-8-2 MOE	279
382677	978	990	GGCATGAGCTTCA	1-10-2 MOE	280
						388626	979	990	GGCATGAGCTTC	2-8-2 MOE	281
379699	979	990	GGCATGAGCTTC	1-10-1 MOE	281
						405236	980	991	GGGCATGAGCTT	2-8-2 MOE	283
379698	1043	1054	GCAGCCCACCTC	1-10-1 MOE	275
						405239	1171	1182	GCCAGCATGAGT	2-8-2 MOE	287
405209	1213	1224	CTGCCGATGTTG	2-8-2 MOE	236
						405233	1364	1375	GAGCAGCCCACC	2-8-2 MOE	277
405240	1366	1377	CACAGCTGCCCG	2-8-2 MOE	289
						405211	1500	1511	CCAGGCCCACAA	2-8-2 MOE	238
405212	1501	1512	GCCAGGCCCACA	2-8-2 MOE	239
						379695	1643	1654	GGACACCGTCAG	1-10-1 MOE	266
379698	1875	1886	GCAGCCCACCTC	1-10-1 MOE	275
						405239	1993	2004	GCCAGCATGAGT	2-8-2 MOE	287
405211	2210	2221	CCAGGCCCACAA	2-8-2 MOE	238
						405212	2211	2222	GCCAGGCCCACA	2-8-2 MOE	239

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸85-184。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸85-184。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸85-184的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 214、215、216、217、218、219、221、222、223、224、225、或227的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸85-184的短反义化合物选自Isis No 379684、405193、405194、405195、405196、405197、379685、405198、405199、405200、405201、379686、379711或388628。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸儿3-132。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸113-132。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸113-132的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 215、216、217、218、219、221、222、223、或224的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸113-132的短反义化合物选自Isis No 405193、405194、405195、405196、405197、379685、405198、405199、405200、或405201。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸207-329。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸207-329。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸207-329的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 228、229、230、232、233、234、235、236、237、238、239、240、或241的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸207-329的短反义化合物选自Isis No 405202、405203、405204、379687、405205、405206、405207、405208、405209、405210、405211、405212、379688、或379689。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸207-273。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸207-273。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸207-273的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 228、229、230、232、233、234、235、236、237、238、或239的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸207-273的短反义化合物选自IsisNo 405202、405203、405204、379687、405205、405206、405207、405208、405209、405210、405211、或405212。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸207-219。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸207-219。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸207-219的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 228或229的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸207-219的短反义化合物选自Isis NO.405202或405203。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸236-252。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸236-252。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸236-252的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 230、232、233、234、235、或236的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：3核苷酸236-252的短反义化合物选自Isis NO.405204、379687、405205、405206、405207、405208、或405209。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸260-273。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸260-273。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸260-273的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 237、238、或239的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸260-273的短反义化合物选自Isis NO.405210、405211、或405212。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸435-640。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸435-640。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸435-640的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 242、243、245、246、251、252、253、254、256、257、258、259、260、261、262、263、或264的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸435-640的短反义化合物选自Isis NO.379690、405248、379691、389780、379692、382676、388625、392170、392173、405213、405214、405215、405216、379693、405217、405218、405219、405220、405221、405222、405223、405224、或379694。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸527-540。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸527-540。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸527-540的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 245、246、或251的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸527-540的短反义化合物选自Isis NO.389780、379692、382676、388626、392170、392173、或405213。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸564-603。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸564-603。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸564-603的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 252、253、254、256、257、258、259、260、261、262、或263的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸564-603的短反义化合物选自IsisNO.405214、405215、405216、379693、405217、405218、405219、405220、405221、405222、405223、或405224。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸564-579。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸564-579。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸564-579的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 252、253、254、256、或257的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸564-579的短反义化合物选自Isis NO.405214、405215、405216、379693、405217、或405218。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸587-603。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸587-603。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸587-603的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 258、259、260、261、262、或263的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：3核苷酸587-603的短反义化合物选自Isis NO.405219、405220、405221、405222、405223、或405224。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸974-1014。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸974-1014。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸974-1014的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 267、268、269、270、271、272、或274的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸974-1014的短反义化合物选自Isis NO.379696、405226、405227、405228、405229、405230、379697、或405231。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸998-1014。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸998-1014。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸998-1014的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 268、269、270、271、272、或274的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸998-1014的短反义化合物选自Isis NO.405226、405227、405228、405229、405230、379697、或405231。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1091-1170。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1091-1170。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1091-1170的短反义化合物包含选自SEQ ID NO275、276、277、278、279、280、281、283、284、285、286、或287的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1091-1170的短反义化合物选自Isis NO.379698、405232、405233、405234、405235、388626、379699、382677、405236、405237、405238、379700、或405239。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1091-1104。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1091-1104。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1091-1104的短反义化合物包含选自SEQ ID NO275、276、或277的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1091-1104的短反义化合物选自Isis NO.379698、405232、或405233。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1130-1144。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1130-1144。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1130-1144的短反义化合物包含选自SEQ ID NO278、279、280、281、或283的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1130-1144的短反义化合物选自Isis NO.405234、405235、388626、379699、382677、或405236。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1157-1170。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1157-1170。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1157-1170的短反义化合物包含选自SEQ ID NO284、285、或287的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1157-1170的短反义化合物选自Isis NO.405237、405238、379700、或405239。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1542-1556。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1542-1556。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1542-1556的短反义化合物包含选自SEQ ID NO289、290、291、292、或293的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1542-1556的短反义化合物选自Isis NO.405240、405241、405242、388629、379702、或382678。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：3的核苷酸1976-1991。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：3的核苷酸1976-1991。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1976-1991的短反义化合物包含选自SEQ ID NO296、297、298、299、或300的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：3核苷酸1976-1991的短反义化合物选自Isis NO.405243、405244、405245、405246、或405247。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向SGLT2核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向SGLT2核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控SGLT2表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向SGLT2核酸的短反义化合物，其中所述靶向SGLT2核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物来调控SGLT2表达的方法。

在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长8个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长9个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长10个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长11个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长12个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长13个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长14个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长15个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2的方法包括使用长16个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控SGLT2表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SGLT2表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向SGLT2核酸的短反义化合物。

3.PCSK9

在具有常染色体显性高胆固醇血症(ADH)的个体中，已经将升高的LDL-C水平与编码LDL受体(LDL-R)、载脂蛋白B(apoB)、或原蛋白(proprotein)转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin型9(PCSK9)的基因中的突变联系起来(Abifadel等，Nat.Genet.，2003，34：154-156)。在发现PCSK9中的获功能突变与升高的LDL-C水平有关后，PCSK9鉴定为与ADH有关的第三基因座。ApoB参与富含甘油三酯的脂蛋白的胞内装配和分泌，而且是LDL-R的配体。PCSK9建议用于降低肝中的LDL-R表达水平。LDL-R表达降低导致肝对循环中含ApoB的脂蛋白摄取降低，继而导致胆固醇升高。

定义

“PCSK9”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。

“PCSK9核酸”指编码PCSK9的任何核酸。例如，在某些实施方案中，PCSK9核酸包括但不限于编码PCSK9的DNA序列、自编码PCSK9的DNA转录得到的RNA序列、和编码PCSK9的mRNA序列。

“PCSK9 mRNA”指编码PCSK9的mRNA。

PCSK9治疗适应症

在某些实施方案中，本发明提供了调控个体中的PCSK9表达的方法，包括施用靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，本发明提供了治疗个体的方法，包括施用一种或多种本发明的药物组合物。在某些实施方案中，所述个体具有高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病。

国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立了并在2004年更新了降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)。该指导方针包括获取用于测定LDL-C、总胆固醇、和HDL-C水平的完全脂蛋白序型，通常在禁食9-12小时后。依照最近建立的指导方针，认为130-159mg/dL、160-189mg/dL、和大于等于190mg/dL的LDL-C水平分别是临界高的、高的、和很高的。认为200-239和大于等于240mg/dL的总胆固醇水平分别是临界高的和高的。认为小于40mg/dL的HDL-C水平是低的。

在某些实施方案中，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，依照国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立的并在2004年更新的降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过190mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过160mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过130mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过100mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于160mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于130mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于100mg/dL。在某些此类实施方案中，所述个体应当维持LDL-C低于70mg/dL。

在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的ApoB的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的含ApoB脂蛋白的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的LDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的VLDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的IDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的非HDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的Lp(a)的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的血清甘油三酯的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的肝甘油三酯的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的Ox-LDL-C的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的小LDL颗粒的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的小VLDL颗粒的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的磷脂的方法。在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的氧化磷脂的方法。

在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会降低HDL-C。在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会导致脂质在肝中积累。

在某些实施方案中，包含靶向PCSK9核酸的短反义化合物的药物组合物用于治疗。在某些实施方案中，所述治疗是降低个体中的LDL-C、ApoB、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、Lp(a)、血清甘油三酯、肝甘油三酯、Ox-LDL-C、小LDL颗粒、小VLDL、磷脂、或氧化磷脂。在某些实施方案中，所述治疗是治疗高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病。在另一个实施方案中，所述治疗是降低CHD风险。在某些实施方案中，所述治疗是预防动脉粥样硬化。在某些实施方案中，所述治疗是预防冠心病。

在某些实施方案中，包含靶向PCSK9核酸的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低受试者中的LDL-C、ApoB、VLDL-C、IDL-C、非HDL-C、Lp(a)、血清甘油三酯、肝甘油三酯、Ox-LDL-C、小LDL颗粒、小VLDL、磷脂、或氧化磷脂的药物。在某些实施方案中，包含靶向PCSK9的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低冠心病风险的药物。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物用于制备用于治疗高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子、II型糖尿病、伴有血脂障碍的II型糖尿病、血脂障碍、高甘油三酯血症、高脂血症、高脂肪酸血症、肝的脂肪变性、非酒精性脂肪肝炎、或非酒精性脂肪肝病的药物。

PCSK9联合疗法

在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗相同疾病或疾患。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同疾病或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与另一药剂共施用以治疗所述另一药剂的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在相同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在不同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在单一配制剂中一起制备。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂分开制备。

在某些实施方案中，可以与本发明的药物组合物共施用的药剂包括降脂剂。在某些此类实施方案中，可以与本发明的药物组合物共施用的药剂包括但不限于阿托伐他汀(atorvastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)、和依泽替米贝(ezetimibe)。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之前施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之后施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂与本发明的药物组合物同时施用。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量与单独施用该降脂剂时会施用的剂量相同。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量低于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量大于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是HMG-CoA还原酶抑制剂。在某些此类实施方案中，所述HMG-CoA还原酶抑制剂是抑制素。在某些此类实施方案中，所述抑制素选自阿托伐他汀、辛伐他汀、普伐他汀(pravastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、和罗苏伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述胆固醇吸收抑制剂是依泽替米贝。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是共配制的HMG-CoA还原酶抑制剂和胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述共配制的降脂剂是依泽替米贝/辛伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是微粒体甘油三酯转移蛋白抑制剂(MTP抑制剂)。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是靶向ApoB核酸的寡核苷酸。

在某些实施方案中，共施用的药剂是胆汁酸多价螯合剂(sequestrant)。在某些此类实施方案中，所述胆汁酸多价螯合剂选自考来烯胺(cholestyramine)、考来替泊(colestipol)、和考来维仑(colesevelam)。

在某些实施方案中，共施用的药剂是烟酸。在某些此类实施方案中，所述烟酸选自即时释放烟酸、延长释放烟酸、和持续释放烟酸。

在某些实施方案中，共施用的药剂是纤维酸(fibric acid)。在某些此类实施方案中，所述纤维酸选自吉非贝齐(gemfibrozil)、非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、苯扎贝特(bezafibrate)、和环丙贝特(ciprofibrate)。

可以与本发明的药物组合物共施用的药剂的其它例子包括但不限于：皮质类固醇，包括但不限于泼尼松(prednisone)；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白(IVIg)；镇痛药(例如扑热息痛(acetaminophen))；抗炎药，包括但不限于非类固醇抗炎药(例如布洛芬(ibuprofen)、COX-1抑制剂、和COX-2抑制剂)；水杨酸盐或酯(salicylates)；抗生素；抗病毒药；抗真菌药；抗糖尿病药(例如双胍、糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲、和噻唑烷二酮)；肾上腺素能药改性剂(adrenergic modmer)；利尿剂；激素(例如促蛋白合成类固醇、雄激素、雌激素、降钙素、孕激素(progestin)、促生长素抑制素、和甲状腺激素)；免疫调节药；肌肉松弛药；抗组胺药；骨质疏松药(例如双膦酸盐、降钙素、和雌激素)；前列腺素；抗肿瘤药；精神治疗药；镇静药；毒橡树(poisonoak)或毒漆树(poison sumac)产品；抗体；及疫苗。

在某些实施方案中，本发明的药物组合物可以与降脂疗法联合施用。在某些此类实施方案中，降脂疗法是治疗性生活方式改变。在某些此类实施方案中，降脂疗法是LDL血浆清除。

某些靶向PCSK9核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_174936.2之序列(收入本文作为SEQ ID NO：4)的PCSK9核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物与SEQ ID NO：4至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物与SEQ IDNO：4至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物与SEQ ID NO：4 100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物包含选自表6或表7所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表6和表7的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的短反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表6和表7列举了靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物的例子。表6列举了与SEQ ID NO：4 100％互补的短反义化合物。表7列举了相对于SEQ ID NO：4具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表6：靶向SEQ ID NO：4的短反义化合物

 

ISISNO.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						400297	695	708	ATGGGGCAACTTCA	2-10-2 MOE	329
400298	696	709	CATGGGGCAACTTC	2-10-2 MOE	330
						400299	697	710	ACATGGGGCAACTT	2-10-2 MOE	331
400300	742	755	GGGATGCTCTGGGC	2-10-2 MOE	332
						400301	757	770	CGCTCCAGGTTCCA	2-10-2 MOE	333
400302	828	841	GATACACCTCCACC	2-10-2 MOE	334
						400303	829	842	AGATACACCTCCAC	2-10-2 MOE	335
400304	830	843	GAGATACACCTCCA	2-10-2 MOE	336
						400305	937	950	GCCTGTCTGTGGAA	2-10-2 MOE	337
400306	952	965	CTGTCACACTTGCT	2-10-2 MOE	338
						400307	988	1001	CGGCCGCTGACCAC	2-10-2 MOE	339
400308	989	1002	CCGGCCGCTGACCA	2-10-2 MOE	340
						400309	990	1003	CCCGGCCGCTGACC	2-10-2 MOE	341
400310	991	1004	TCCCGGCCGCTGAC	2-10-2 MOE	342
						400311	992	1005	ATCCCGGCCGCTGA	2-10-2 MOE	343

 

400312	993	1006	CATCCCGGCCGCTG	2-10-2 MOE	344
						400313	994	1007	GCATCCCGGCCGCT	2-10-2 MOE	345
400314	1057	1070	GTGCCCTTCCCTTG	2-10-2 MOE	346
						400315	1075	1088	ATGAGGGTGCCGCT	2-10-2 MOE	347
400316	1076	1089	TATGAGGGTGCCGC	2-10-2 MOE	348
						400317	1077	1090	CTATGAGGGTGCCG	2-10-2 MOE	349
400318	1078	1091	CCTATGAGGGTGCC	2-10-2 MOE	350
						400319	1093	1106	CGAATAAACTCCAG	2-10-2 MOE	351
400320	1094	1107	CCGAATAAACTCCA	2-10-2 MOE	352
						400321	1095	1108	TCCGAATAAACTCC	2-10-2 MOE	353
400322	1096	1109	TTCCGAATAAACTC	2-10-2 MOE	354
						400323	1147	1160	GCCAGGGGCAGCAG	2-10-2 MOE	355
400324	1255	1268	GAGTAGAGGCAGGC	2-10-2 MOE	356
						400325	1334	1347	CCCCAAAGTCCCCA	2-10-2 MOE	357
400326	1335	1348	TCCCCAAAGTCCCC	2-10-2 MOE	358
						400327	1336	1349	GTCCCCAAAGTCCC	2-10-2 MOE	359
400328	1453	1466	ACGTGGGCAGCAGC	2-10-2 MOE	360
						400329	1454	1467	CACGTGGGCAGCAG	2-10-2 MOE	361
400330	1455	1468	CCACGTGGGCAGCA	2-10-2 MOE	362
						400331	1456	1469	GCCACGTGGGCAGC	2-10-2 MOE	363
400332	1569	1582	CAGGGAACCAGGCC	2-10-2 MOE	364
						400333	1570	1583	TCAGGGAACCAGGC	2-10-2 MOE	365
400334	1571	1584	CTCAGGGAACCAGG	2-10-2 MOE	366
						400335	1572	1585	CCTCAGGGAACCAG	2-10-2 MOE	367
400336	1573	1586	TCCTCAGGGAACCA	2-10-2 MOE	368
						400337	1574	1587	GTCCTCAGGGAACC	2-10-2 MOE	369
400338	1575	1588	GGTCCTCAGGGAAC	2-10-2 MOE	370
						400339	1576	1589	TGGTCCTCAGGGAA	2-10-2 MOE	371
400340	1577	1590	CTGGTCCTCAGGGA	2-10-2 MOE	372
						400341	1578	1591	GCTGGTCCTCAGGG	2-10-2 MOE	373
400342	1621	1634	GTGCTGGGGGGCAG	2-10-2 MOE	374
						400343	1622	1635	GGTGCTGGGGGGCA	2-10-2 MOE	375
400344	1623	1636	GGGTGCTGGGGGGC	2-10-2 MOE	376
						400345	1624	1637	TGGGTGCTGGGGGG	2-10-2 MOE	377
400346	1738	1751	GAGCAGCTCAGCAG	2-10-2 MOE	378

 

400347	1739	1752	GGAGCAGCTCAGCA	2-10-2 MOE	379
						400348	1740	1753	TGGAGCAGCTCAGC	2-10-2 MOE	380
400349	1741	1754	CTGGAGCAGCTCAG	2-10-2 MOE	381
						400350	1834	1847	CCCTCACCCCCAAA	2-10-2 MOE	382
400351	1835	1848	ACCCTCACCCCCAA	2-10-2 MOE	383
						400352	1836	1849	CACCCTCACCCCCA	2-10-2 MOE	384
400353	1837	1850	ACACCCTCACCCCC	2-10-2 MOE	385
						400354	1838	1851	GACACCCTCACCCC	2-10-2 MOE	386
400355	1839	1852	AGACACCCTCACCC	2-10-2 MOE	387
						400356	1840	1853	TAGACACCCTCACC	2-10-2 MOE	388
400357	2083	2096	TGGCAGCAGGAAGC	2-10-2 MOE	389
						400358	2084	2097	ATGGCAGCAGGAAG	2-10-2 MOE	390
400359	2085	2098	CATGGCAGCAGGAA	2-10-2 MOE	391
						400360	2086	2099	GCATGGCAGCAGGA	2-10-2 MOE	392
400361	2316	2329	GGCAGCAGATGGCA	2-10-2 MOE	393
						400362	2317	2330	CGGCAGCAGATGGC	2-10-2 MOE	394
400363	2318	2331	CCGGCAGCAGATGG	2-10-2 MOE	395
						400364	2319	2332	TCCGGCAGCAGATG	2-10-2 MOE	396
400365	2320	2333	CTCCGGCAGCAGAT	2-10-2 MOE	397
						400366	2321	2334	GCTCCGGCAGCAGA	2-10-2 MOE	398
400367	2322	2335	GGCTCCGGCAGCAG	2-10-2 MOE	399
						400368	2323	2336	CGGCTCCGGCAGCA	2-10-2 MOE	400
400369	2324	2337	CCGGCTCCGGCAGC	2-10-2 MOE	401
						400370	2325	2338	GCCGGCTCCGGCAG	2-10-2 MOE	402
400371	3543	3556	AGTTACAAAAGCAA	2-10-2 MOE	403
						403739	988	1001	CGGCCGCTGACCAC	2-10-2(6′S)-6′-甲基-亚甲氧基BNA	339
403740	1455	1468	CCACGTGGGCAGCA	2-10-2(6′S)-6′-甲基-亚甲氧基BNA	362

表7：靶向SEQ ID NO：4且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISISNO.

5′靶位点

3′靶位点

序列(5’-3’)

缺口聚物基序

SEQID NO

 

400323	349	362	GCCAGGGGCAGCAG	2-10-2 MOE	355
						400370	679	692	GCCGGCTCCGGCAG	2-10-2 MOE	402
400361	1860	1873	GGCAGCAGATGGCA	2-10-2 MOE	393
						400323	1873	1886	GCCAGGGGCAGCAG	2-10-2 MOE	355
400310	2257	2270	TCCCGGCCGCTGAC	2-10-2 MOE	342
						400361	2653	2666	GGCAGCAGATGGCA	2-10-2 MOE	393
400350	2811	2824	CCCTCACCCCCAAA	2-10-2 MOE	382
						400351	2812	2825	ACCCTCACCCCCAA	2-10-2 MOE	383
400352	2813	2826	CACCCTCACCCCCA	2-10-2 MOE	384
						400353	2814	2827	ACACCCTCACCCCC	2-10-2 MOE	385
400334	2966	2979	CTCAGGGAACCAGG	2-10-2 MOE	366
						400332	3379	3392	CAGGGAACCAGGCC	2-10-2 MOE	364
400340	3448	3461	CTGGTCCTCAGGGA	2-10-2 MOE	372
						400341	3449	3462	GCTGGTCCTCAGGG	2-10-2 MOE	373

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸695-710。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸695-710的短反义化合物包含选自SEQID NO：329、330、或331的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：4核苷酸695-710的短反义化合物选自Isis NO.400297、400298、或400299。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸742-770。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸742-770的短反义化合物包含选自SEQID NO 332或333的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸742-770的短反义化合物选自Isis NO.400300或400301。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸828-843。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸828-843的短反义化合物包含选自SEQID NO 334、335、或336的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：4核苷酸828-843的短反义化合物选自ISIS No.400302、400303、或400304。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸937-1007。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸937-1007的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 337、338、339、340、341、342、343、344、或345的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸937-1007的短反义化合物选自Isis NO.400305、400306、400307、400308、400309400310、400311、400312、400313、或403739。

在某些实施方案中，靶区是的SEQ ID NO：4核苷酸937-965。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸937-965的短反义化合物包含选自SEQID NO 337或338的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸937-965的短反义化合物选自Isis NO.400305或400306。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸988-1007。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸988-1007的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 339、340、341、342、343、344、或345的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸937-1007的短反义化合物选自IsisNO.400307、400308、400309、400310、400311、400312、4003313、或403739。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1057-1160。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1160的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 346、347、348、349、350、351、352、353、354、或355的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1160的短反义化合物选自ISIS NO.400314、400315、400316、400317、400318、400319、400320、400321、400322、或400323。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1057-1109。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1109的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 346、347、348、349、350、351、352、353、或354的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1109的短反义化合物选自ISIS NO.400314、400315、400316、400317、400318、400319、400320、400321、或400322。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1057-1091。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1091的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 346、347、348、349、或350的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1091的短反义化合物选自ISIS NO.400314、400315、400316、400317、或400318。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1093-1109。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1093-1109的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 351、352、353、或354的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1057-1109的短反义化合物选自ISIS NO.400319、400320、400321、或400322。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1334-1349。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1334-1349的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 357、358、或359的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1334-1349的短反义化合物选自ISIS NO 400325、400326、或400327。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1453-1469。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1453-1469的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 360、361、362、或363的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1453-1469的短反义化合物选自ISIS NO 400328、400329、400330、400331、或403470。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1569-1591。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1569-1591的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 364、365、366、367、368、369、370、371、372、或373的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1569-1591的短反义化合物选自ISIS NO 400332、400333、400334、400335、400336、400337、400338、400339、400340、或400341。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1621-1637。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1621-1637的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 374、375、376、或377的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1621-1637的短反义化合物选自ISIS NO 400342、400343、400344、或400345。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1738-1754。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1738-1754的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 378、379、380、或381的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1738-1754的短反义化合物选自ISIS NO 400346、400347、400348、或400349。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸1834-1853。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1834-1853的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 382、383、384、385、386、387、或388的核苷酸序列。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸1834-1853的短反义化合物选自ISISNO 400350、400351、400352、400353、400354、400355、或400356。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸2083-2099。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸2083-2099的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 389、390、391、或392的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸2083-2099的短反义化合物选自ISIS NO 400357、400358、400359、或400360。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：4的核苷酸2316-2338。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸2316-2338的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 393、394、395、396、397、398、399、400、401、或402的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：4核苷酸2316-2338的短反义化合物选自ISIS NO 400361、400362、400363、400364、400365、400366、400367、400368、400369、或400370。

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向PCSK9核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物具有选自1-12小1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1，1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向PCSK9核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控PCSK9表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向PCSK9核酸的短反义化合物，其中所述靶向PCSK9核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物来调控PCSK9表达的方法。

在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长8个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长9个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长10个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长11个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长12个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长13个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长14个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长15个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9的方法包括使用长16个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控PCSK9表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PCSK9表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向PCSK9核酸的短反义化合物。

4.超氧化物歧化酶1(SOD1)

称为超氧化物歧化酶(SOD)的酶通过催化超氧化物歧化为过氧化氢(H₂O₂)而提供了针对生物分子氧化性损伤的防御作用(Fridovich，Annu.Rev.Biochem.，1995，64，97-112)。超氧化物歧化酶有两大类。一类由一组具有含铜和锌的活性位点的酶组成，另一类在活性位点具有锰或铁(Fridovich，Annu.Rev.Biochem.，1995，64，97-112)。

超氧化物歧化酶1基因中的突变与显性遗传形式的肌萎缩侧索硬化(ALS，也称为Lou Gehrig氏病)(一种特征为上运动神经元和下运动神经元选择性变性(degeneration)的病症)有关(Cleveland and Liu，Nat.Med.，2000，6，1320-1321)。超氧化物歧化酶1上各种突变的有害效应最有可能通过获得有毒功能而非超氧化物歧化酶1活性丧失介导，因为小鼠中超氧化物歧化酶1的完全缺失既不缩短寿命也不引起明显疾病(Al-Chalabi和Leigh，Curr.Opin.Neurol.，2000，13，397-405；Alisky和Davidson，Hum.Gene Ther.，2000，11，2315-2329)。

已经鉴定了人类SOD1基因的超过100种突变，总共占到家族性肌萎缩侧索硬化(ALS)病例的大约20％。有些突变(诸如在美国最常见的A4V突变)是高度致命的，而且导致自疾病症状发作起只存活九个月。SOD1的其它突变表现出较慢的疾病过程。

定义

“SOD1”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。

“SOD1核酸”指编码SOD1的任何核酸。例如，在某些实施方案中，SOD1核酸包括但不限于编码SOD1的DNA序列、自编码SOD1的DNA转录得到的RNA序列、和编码SOD1的mRNA序列。

“SOD1 mRNA”指编码SOD1的mRNA。

SOD1治疗适应症

已经发现，家族性ALS的动物模型中对超氧化物歧化酶1(SOD1)的反义抑制降低SOD1 mRNA和蛋白二者，而且进一步导致疾病进展减缓和(重要的是)存活时间延长。因而，在某些实施方案中，本发明提供了减缓患有家族性ALS的个体中疾病进展的方法，其通过给此类受试者施用靶向SOD1核酸的短反义化合物来实现。在某些此类实施方案中，将靶向SOD1的短反义化合物直接递送到个体的脑脊液。在某些此类实施方案中，所述方法进一步包括延长患有家族性ALS的个体的存活时间。疾病进展减缓表现为ALS疾病进展的一项或多项指标的改进，包括但不限于修订版ALS功能评级尺度(functional rating scale)、肺功能检查、和肌肉强度测量。

SOD1联合疗法

在某些实施方案中，一种或多种包含靶向SOD1核酸的短反义化合物的药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗相同疾病或疾患。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同疾病或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与另一药剂共施用以治疗所述另一药剂的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在相同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在不同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在单一配制剂中一起制备。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂分开制备。

在某些实施方案中，共施用的药剂是烟酸。在某些此类实施方案中，所述烟酸选自即时释放烟酸、延长释放烟酸、和持续释放烟酸。

在某些实施方案中，共施用的药剂是纤维酸(fibric acid)。在某些此类实施方案中，所述纤维酸选自吉非贝齐(gemfibrozil)、非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、苯扎贝特(bezafibrate)、和环丙贝特(ciprofibrate)。

可以与包含靶向SOD1的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂的其它例子包括但不限于皮质类固醇，包括但不限于泼尼松(prednisone)；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白(IVIg)；镇痛药(例如扑热息痛(acetaminophen))；抗炎药，包括但不限于非类固醇抗炎药(例如布洛芬(ibuprofen)、COX-1抑制剂、和COX-2抑制剂)；水杨酸；抗生素；抗病毒药；抗真菌药；抗糖尿病药(例如双胍、糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲、和噻唑烷二酮)；肾上腺素能药改性剂(adrenergic modifier)；利尿剂；激素(例如促蛋白合成类固醇、雄激素、雌激素、降钙素、孕激素(progestin)、促生长素抑制素、和甲状腺激素)；免疫调节药；肌肉松弛药；抗组胺药；骨质疏松药(例如双膦酸盐、降钙素、和雌激素)；前列腺素；抗肿瘤药；精神治疗药；镇静药；毒橡树(poison oak)或毒漆树(poison sumac)产品；抗体；及疫苗。

某些靶向SOD1核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_X02317.1之序列(收入本文作为SEQ ID NO：5)的SOD1核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物与SEQ ID NO：5至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物与SEQ IDNO：5至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物与SEQ ID NO：5100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物包含选自表8或表9所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表8和表9的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的短反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表8列举了靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物的例子。表8列举了与SEQID NO：5 100％互补的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”’指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

表8：靶向SEQ ID NO：5的短反义化合物

 

ISIS

5’靶

3’靶

序列(5’-3’)

缺口聚物

SEQ  ID

 

NO.	位点	位点		基序	NO
						387541	85	100	GTCGCCCTTCAGCACG	3-10-3 MOE	406
387540	86	99	TCGCCCTTCAGCAC	2-10-2 MOE	407
						387539	87	98	CGCCCTTCAGCA	1-10-1 MOE	408

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：5的核苷酸85-100。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：5核苷酸85-100的短反义化合物包含选自SEQID NO：406、407、或408的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：5核苷酸85-100的短反义化合物选自Isis No.387541、387540、或387539。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向SOD1核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向SOD1核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控SOD1表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向SOD1核酸的短反义化合物，其中所述靶向SOD1核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物来调控SOD1表达的方法。

在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长8个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长9个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长10个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长11个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长12个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长13个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长14个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长15个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1的方法包括使用长16个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控SOD1表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向SOD1核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控SOD1表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向SOD1核酸的短反义化合物。

5.CRP

CRP(也称为C-反应性蛋白质和PTX1)是应答多种炎性细胞因子而在肝中生成的重要人类急性期反应物。该蛋白质(最初鉴定于1930年)是高度保守的，而且认为是感染性或炎性疾患的早期指示物。血浆CRP水平应答感染、缺血、外伤、烧伤、和炎性疾患而升高1,000倍。在患者接受降脂疗法(诸如抑制素疗法)的临床试验中，已经证明了LDL-C和CRP都降低的患者相对于只发生LDL-C降低的患者而言未来发生冠状动脉事件的风险降低。

定义

“CRP”指其表达将要通过短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。

“CRP核酸”指编码CRP的任何核酸。例如，在某些实施方案中，CRP核酸包括但不限于编码CRP的DNA序列、自编码CRP的DNA转录得到的RNA序列、和编码CRP的mRNA序列。

“CRP mRNA”指编码CRP的mRNA。

CRP治疗适应症

在某些实施方案中，本发明提供了调控个体中的CRP表达的方法，包括给所述个体施用靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，本发明提供了治疗个体的方法，包括施用一种或多种包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物。在某些实施方案中，所述个体具有高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、冠心病的一种或多种风险因子。在某些实施方案中，所述个体具有急性冠状动脉综合征、血管损伤、动脉闭塞、不稳定心绞痛、后外周血管病(post peripheral vascular disease)、后心肌梗死(post myocardial infarction)(MI)、血栓形成、深静脉血栓、末期肾病(ESRD)、慢性肾衰竭、补体活化、充血性心力衰竭、或系统性血管炎。在某些实施方案中，所述个体已经有过中风。

在某些实施方案中，所述个体已经接受了选自选择性支架放置(electivestent placement)、血管成形术、后经皮腔内血管成形术(post percutaneoustransluminal angioplasty)(PTCA)、心脏移植、肾透析或心肺转流术的规程。

在某些实施方案中，所述个体具有炎性疾病。在某些此类实施方案中，所述炎性疾病选自炎性肠病、溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎、或骨关节炎。

国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立了并在2004年更新了降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)。该指导方针包括获取用于LDL-C、总胆固醇、和HDL-C水平测定的完全脂蛋白序型，通常在禁食9-12小时后。依照最近建立的指导方针，认为130-159mg/dL、160-189mg/dL、和大于等于190mg/dL的LDL-C水平分别是临界高的、高的、和很高的。认为200-239和大于等于240mg/dL的总胆固醇水平分别是临界高的和高的。认为小于40mg/dL的HDL-C水平是低的。

在某些实施方案中，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，依照国家胆固醇教育计划(National Cholesterol Education Program，NCEP)的成人治疗小组III(Adult Treatment Panel III，ATP III)在2001年建立的并在2004年更新的降脂疗法的指导方针(Grundy等，Circulation，2004，110，227-239)，所述个体已经鉴定为需要降脂疗法。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过190mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过160mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过130mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体具有超过100mg/dL的LDL-C。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于160mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于130mg/dL。在某些此类实施方案中，需要降脂疗法的所述个体应当维持LDL-C低于100mg/dL。在某些此类实施方案中，所述个体应当维持LDL-C低于70mg/dL。

在某些实施方案中，本发明提供了用于降低个体中的CRP的方法。在某些此类实施方案中，CRP的降低为至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、和至少100％。

在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会降低HDL-C。在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会导致脂质在肝中积累。在某些实施方案中，本发明所提供的方法不会引起肝的脂肪变性。

在某些实施方案中，本发明提供了降低受试者中的CRP浓度同时降低与治疗有关的副作用的方法。在某些此类实施方案中，副作用是肝毒性。在某些此类实施方案中，副作用是异常肝功能。在某些此类实施方案中，副作用是丙氨酸氨基转移酶(ALT)升高。在某些此类实施方案中，副作用是天冬氨酸氨基转移酶(AST)升高。

在某些实施方案中，本发明提供了降低下述受试者中的CRP浓度的方法，该受试者由于降脂疗法而达到目标LDL-C水平。在某些此类实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物是施用于受试者的唯一药剂。在某些此类实施方案中，所述受试者没有遵照推荐的降脂疗法。在某些此类实施方案中，本发明的药物组合物与另一不同降脂疗法共施用。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是LDL-血浆清除(apheresis)。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是抑制素(statin)。在某些此类实施方案中，另一降脂疗法是依泽替米贝(ezetimibe)。

在某些实施方案中，本发明提供了降低抑制素耐受性受试者中的CRP浓度的方法。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肌酸激酶浓度升高。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肝功能异常。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有肌肉疼痛。在某些此类实施方案中，所述受试者由于抑制素施用而具有中枢神经系统副作用。在某些实施方案中，所述受试者没有遵照推荐的抑制素施用。

在某些实施方案中，本发明提供了降低受试者中的冠心病风险的方法。在某些实施方案中，本发明提供了减缓受试者中的动脉粥样硬化进展的方法。在某些此类实施方案中，本发明提供了阻止受试者中的动脉粥样硬化进展的方法。在某些此类实施方案中，本发明提供了降低受试者中的动脉粥样硬化斑大小和/或普及性(prevalence)的方法。在某些实施方案中，所提供的方法降低受试者发生动脉粥样硬化的风险。

在某些实施方案中，所提供的方法改进了受试者中的心血管结果。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是发生冠心病的风险降低。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是一项或多项下列主要心血管事件的发生率降低，所述心血管事件包括但不限于死亡、心肌梗死、再梗塞、中风、心源性休克、肺水肿、心脏停搏、和心房节律障碍。在某些此类实施方案中，改进的心血管结果是表现为改进的颈动脉内层介质厚度(carotid intimalmedia thickness)。在某些此类实施方案中，改进的颈动脉内层介质厚度是厚度降低。在某些此类实施方案中，改进的颈动脉内层介质厚度是预防内层介质厚度升高。

在某些实施方案中，包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物用于治疗。在某些实施方案中，所述治疗是降低个体中的CRP。在某些实施方案中，所述治疗是治疗高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、或早发性冠心病。在另一个实施方案中，所述治疗是降低CHD风险。在某些实施方案中，所述治疗是预防动脉粥样硬化。在某些实施方案中，所述治疗是预防冠心病。在某些实施方案中，所述治疗是治疗急性冠状动脉综合征、慢性肾衰竭、血管损伤、动脉闭塞、动脉血栓形成(atherothrombosis)、不稳定心绞痛、后外周血管病(post peripheral vascular disease)、后心肌梗死(postmyocardial infarction)(MI)、血栓形成、深静脉血栓、末期肾病(ESRD)、补体活化、充血性心力衰竭、或系统性血管炎。在某些实施方案中，所述治疗是治疗已经接受了选自选择性支架放置(elective stent placement)、血管成形术、后经皮腔内血管成形术(post percutaneous transluminal angioplasty)(PTCA)、心脏移植、肾透析或心肺转流术的规程的个体。在某些实施方案中，所述治疗是治疗炎性病症。

在某些实施方案中，包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低受试者中的CRP的药物。在某些实施方案中，包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物用于制备用于降低冠心病风险的药物。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗高胆固醇血症、非家族性高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、杂合性家族性高胆固醇血症、纯合性家族性高胆固醇血症、混合性血脂障碍、动脉粥样硬化、发生动脉粥样硬化的风险、冠心病、冠心病史、早发性冠心病、或冠心病的一种或多种风险因子的药物。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗急性冠状动脉综合征、慢性肾衰竭、血管损伤、动脉闭塞、动脉血栓形成(atherothrombosis)、不稳定心绞痛、后外周血管病(postperipheral vasculardisease)、后心肌梗死(post myocardial infarction)(MI)、血栓形成、深静脉血栓、末期肾病(ESRD)、补体活化、充血性心力衰竭、或系统性血管炎的药物。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗已经有过中风的个体的药物。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗已经接受了选自选择性支架放置(elective stent placement)、血管成形术、后经皮腔内血管成形术(post percutaneous transluminal angioplasty)(PTCA)、心脏移植、肾透析或心肺转流术的规程的个体的药物。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗炎性疾病的药物。在某些此类实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物用于制备用于治疗炎性肠病、溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎、或骨关节炎的药物。

CRP联合疗法

在某些实施方案中，一种或多种包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些此类实施方案中，所述一种或多种其它药剂是降脂剂。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗相同疾病或疾患。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同疾病或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与另一药剂共施用以治疗所述另一药剂的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在相同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在不同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在单一配制剂中一起制备。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂分开制备。

在某些实施方案中，可以与包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂包括降脂剂。在某些此类实施方案中，可以与本发明的药物组合物共施用的药剂包括但不限于阿托伐他汀(atorvastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)、和依泽替米贝(ezetimibe)。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之前施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂在施用本发明的药物组合物之后施用。在某些此类实施方案中，所述降脂剂与本发明的药物组合物同时施用。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量与单独施用该降脂剂时会施用的剂量相同。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量低于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。在某些此类实施方案中，降脂剂的共施用剂量大于单独施用该降脂剂时会施用的剂量。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是HMG-CoA还原酶抑制剂。在某些此类实施方案中，所述HMG-CoA还原酶抑制剂是抑制素。在某些此类实施方案中，所述抑制素选自阿托伐他汀、辛伐他汀、普伐他汀(pravastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、和罗苏伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是ISIS 301012。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述胆固醇吸收抑制剂是依泽替米贝。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是共配制的HMG-CoA还原酶抑制剂和胆固醇吸收抑制剂。在某些此类实施方案中，所述共配制的降脂剂是依泽替米贝/辛伐他汀。

在某些实施方案中，共施用的降脂剂是微粒体甘油三酯转移蛋白抑制剂(MTP抑制剂)。

在某些实施方案中，共施用的药剂是胆汁酸多价螯合剂(sequestrant)。在某些此类实施方案中，所述胆汁酸多价螯合剂选自考来烯胺(cholestyramine)、考来替泊(colestipol)、和考来维仑(colesevelam)。

在某些实施方案中，共施用的药剂是烟酸。在某些此类实施方案中，所述烟酸选自即时释放烟酸、延长释放烟酸、和持续释放烟酸。

在某些实施方案中，共施用的药剂是纤维酸(fibric acid)。在某些此类实施方案中，所述纤维酸选自吉非贝齐(gemfibrozil)、非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、苯扎贝特(bezafibrate)、和环丙贝特(ciprofibrate)。

可以与包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂的其它例子包括但不限于皮质类固醇，包括但不限于泼尼松(prednisone)；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白(IVIg)；镇痛药(例如扑热息痛(acetaminophen))；抗炎药，包括但不限于非类固醇抗炎药(例如布洛芬(ibuprofen)、COX-1抑制剂、和COX-2抑制剂)；水杨酸盐或酯；抗生素；抗病毒药；抗真菌药；抗糖尿病药(例如双胍、糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲、和噻唑烷二酮)；肾上腺素能药改性剂(adrenergic modifier)；利尿剂；激素(例如促蛋白合成类固醇、雄激素、雌激素、降钙素、孕激素(progestin)、促生长素抑制素、和甲状腺激素)；免疫调节药；肌肉松弛药；抗组胺药；骨质疏松药(例如双膦酸盐、降钙素、和雌激素)；前列腺素；抗肿瘤药；精神治疗药；镇静药；毒橡树(poison oak)或毒漆树(poison sumac)产品；抗体；及疫苗。

在某些实施方案中，包含靶向CRP核酸的短反义化合物的药物组合物可以与降脂疗法联合施用。在某些此类实施方案中，降脂疗法是治疗性生活方式改变。在某些此类实施方案中，降脂疗法是LDL血浆清除。

某些靶向CRP核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_000567.1之序列(收入本文作为SEQ ID NO：6)的CRP核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物与SEQ ID NO：6至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物与SEQ IDNO：6至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物与SEQ ID NO：6100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物包含选自表9所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表9的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的短反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表9列举了靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物的例子。表9列举了与SEQID NO：6 100％互补的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-缺氧缺口-翼)

表9：靶向SEQ ID NO：6的短反义化合物

 

ISISNO.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	Seq IDNO
						353506	1257	1272	ACTCTGGACCCAAACC	3-10-3 MOE	409
353507	1258	1271	CTCTGGACCCAAAC	2-10-2 MOE	410
						353484	1305	1320	CCATTTCAGGAGACCT	3-10-3 MOE	411
353485	1306	1319	CATTTCAGGAGACC	2-10-2 MOE	412

在某些实施方案中，靶区是NM_000567.1的核苷酸1305-1320。在某些此类实施方案中，靶向NM_000567.1核苷酸1305-1320的短反义化合物包含选自SEQ ID NO：1305或1306的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向NM_000567.1核苷酸263-278的短反义化合物选自Isis NO.353484或353485。

在某些实施方案中，靶区是NM_000567.1的核苷酸1257-1272。在某些此类实施方案中，靶向NM_000567.1核苷酸1257-1272的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 1257或1258的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向NM_000567.1核苷酸428-483的短反义化合物选自Isis NO.353506或353507。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向CRP核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向CRP核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控CRP表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向CRP核酸的短反义化合物，其中所述靶向CRP核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物来调控CRP表达的方法。

在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长8个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长9个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长10个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长11个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长12个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长13个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长14个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长15个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP的方法包括使用长16个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控CRP表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向CRP核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控CRP表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向CRP核酸的短反义化合物。

6.糖皮质激素受体(GCCR)

糖皮质激素是最早鉴定的类固醇激素之一，而且负责多种生理功能，包括刺激糖异生、降低外周组织中的葡萄糖摄取和利用、提高糖原沉积、遏制免疫和炎性应答、抑制细胞因子合成及加速多种发育事件。糖皮质激素对于抗击应激(stress)也是尤其重要的。应激诱导的糖皮质激素合成和释放升高导致增加心室工作负荷、抑制炎性介质、抑制细胞因子合成和增加葡萄糖生成等应答(Karin，Cell，1998，93，487-490)。

天然糖皮质激素及其合成衍生物都通过糖皮质激素受体(核激素受体超家族的普遍表达的细胞质成员)而发挥其作用。人类糖皮质激素受体也称为核受体亚家族3，C组，成员1；NR3C1；GCCR；GCR；GRL；糖皮质激素受体，淋巴细胞的。该基因位于人类染色体5q11-q13，而且由9个外显子组成(Encio和Detera-Wadleigh，J Biol Chem，1991，266，7182-7188；Gehring等，ProcNatl Acad Sci USA，1985，82，3751-3755)。有多种形式的人类糖皮质激素受体mRNA：5.5kb人类糖皮质激素受体α cDNA，其包含外显子1-8和外显子9α；4.3kb人类糖皮质激素受体β cDNA，其包含外显子1-8和外显子9β；及7.0kb人类糖皮质激素受体α cDNA，其包含外显子1-8和完整外显子9，完整外显子9包含外显子9α、外显子9β和“J区”，J区的侧翼为外显子9α和9β(Hollenberg等，Nature，1985，318，635-641；Oakley等，J Biol Chem，1996，271，9550-9559)。人类糖皮质激素受体α是该受体的主要同等型(isoform)，而且展现出类固醇结合活性(Hollenberg等，Nature，1985，318，635-641)。因而，通过使用三种不同启动子，三种不同外显子1变体可得以转录，而且一种外显子1变体的可变剪接可导致此外显子的三种不同形式。如此，人类糖皮质激素受体mRNA可包含5种不同形式的外显子1(Breslin等，Mol Endocrinol，2001，15，1381-1395)。

对α和β同等型人类糖皮质激素受体mRNA的表达样式的检查揭示了α同等型更加丰富地表达。这两种同等型都在相似的组织和细胞类型中表达，包括肺、肾、心、肝、骨骼肌、巨噬细胞、嗜中性细胞和外周血单核细胞。只有人类糖皮质激素受体α在结肠中表达。在蛋白质水平，虽然在所检查的所有组织中检测到α同等型，但是检测不到β同等型，表明在生理条件下是默认剪接途径生成了α同等型(Pujols等，Am J Physiol Cell Physiol，2002，283，C1324-1331)。β同等型糖皮质激素受体既不结合糖皮质激素激动剂也不结合拮抗剂。此外，β同等型主要定位于受转染细胞的细胞核，与激素刺激无关。当两种同等型都在同一细胞中表达时，糖皮质激素受体β抑制激素诱导的、糖皮质激素受体α介导的对基因表达的刺激作用，表明β同等型发挥糖皮质激素受体α活性的抑制剂的功能(Oakley等，J Biol Chem，1996，271，9550-9559)。除非另有说明，本文所述人类糖皮质激素受体定义为位于染色体5q11-q13的基因的普遍存在产物。

经互补糖皮质激素受体反义RNA链转染的细胞系展现出糖皮质激素受体mRNA水平降低和对糖皮质激素受体激动剂地塞米松的响应降低(Pepin和Barden，Mol Cell Biol，1991，11，1647-1653)。使用携带反义糖皮质激素受体基因构建物的转基因小鼠来研究对下丘脑-垂体-肾上腺轴的糖皮质激素反馈效应(Pepin等，Nature，1992，355，725-728)。在类似的遗传工程小鼠中进行的另一项研究中，能量摄取和消耗、心和股外侧肌脂蛋白脂肪酶活性、及心和棕色脂肪组织去甲肾上腺素低于对照动物的。相反，脂肪含量和总体身体能量显著高于对照动物的。这些结果表明缺陷型糖皮质激素受体系统可通过提高能效(energetic efficiency)而影响能量平衡，而且它们加强了下丘脑-垂体-肾上腺轴变化对肌肉脂蛋白脂肪酶活性的调控效应(Richard等，Am J Physiol，1993，265，R146-150)。

已经在设计用于评估焦虑、学习和记忆的动物模型中测量了糖皮质激素受体拮抗剂的行为效应。长期脑室内输注靶向糖皮质激素受体mRNA的反义寡核苷酸的大鼠中糖皮质激素受体表达的降低在Morris水迷宫测试中不干扰空间导航(Engelmann等，Eur J Pharmacol，1998，361，17-26)。双侧输注靶向糖皮质激素受体mRNA的反义寡核苷酸入大鼠海马的齿状回在Porsolt受迫游泳测试中降低大鼠的不动性(Korte等，Eur J Pharmacol，1996，301，19-25)。

糖皮质激素因其免疫抑制、抗炎效应而频繁用于治疗疾病，诸如变态反应、哮喘、类风湿性关节炎、AIDS、系统性红斑狼疮、和退行性骨关节炎(degenerative osteoarthritis)。对基因表达的负调节(诸如由糖皮质激素受体与NF-kB的相互作用所引起的)提议为至少是部分负责糖皮质激素在体内的抗炎作用。白介素-6、肿瘤坏死因子α和白介素-1是在炎症应激期间占下丘脑-垂体-肾上腺(HPA)轴刺激作用大部分的三种细胞因子。HPA轴及系统性交感性和肾上腺髓质素系统(systemic sympathetic and adrenomedullary system)是应激系统的外周构件，负责维持基础的和应激相关的体内稳态。糖皮质激素(HPA轴的终产物)抑制所有三种炎性细胞因子的生成，而且还抑制它们对靶组织的效应，除了白介素-6，它与糖皮质激素协同作用而刺激急性期反应物的生成。糖皮质激素治疗降低HPA轴的活性(Chrousos，N Engl J Med，1995，332，1351-1362)。

在有些情况中，患者耐受糖皮质激素治疗。针对类固醇的这种抗性的一个原因在于糖皮质激素受体基因中所存在的突变或多态性。与糖皮质激素抗性有关的NR3C1基因中已经报告了总共15种错义突变、3种无义突变、3种移码突变、1种剪接位点突变、和2种可变剪接突变、以及16种多态性(Bray和Cotton，Hum Mutat，2003，21，557-568)。在人类中进行的别的研究已经表明代谢综合征发生和进展与糖皮质激素受体(GR)基因的等位基因间存在正关联(Rosmond，Obes Res，2002，10，1078-1086)。

糖皮质激素不敏感性的其它情况与糖皮质激素受体同等型表达改变有关。关于糖皮质激素抗性溃疡性结肠炎患者中人类糖皮质激素受体β同等型mRNA表达的一项研究揭示了此mRNA的存在显著高于糖皮质激素敏感性患者中的，表明外周血单核细胞中的人类糖皮质激素受体β mRNA表达可充当溃疡性结肠炎中糖皮质激素应答的预测物(Honda等，Gastroenterology，2000，118，859-866)。在很大数目的糖皮质激素不敏感性哮喘中也观察到糖皮质激素受体β表达升高。另外，糖皮质激素受体的DNA结合能力方面细胞因子诱导的异常见于来自糖皮质激素不敏感性患者的外周血单核细胞，而且用糖皮质激素受体β基因转染HepG2细胞导致糖皮质激素受体α DNA结合能力显著降低(Leung等，J Exp Med，1997，186，1567-1574)。地塞米松结合研究证明了人类糖皮质激素受体β不改变糖皮质激素受体α对激素配体的亲和力，但是改变其结合GRE的能力(Bamberger等，J Clin Invest，1995，95，2435-2441)。综上所述，这些结果说明糖皮质激素受体β通过与糖皮质激素受体α竞争GRE靶位点而可发挥糖皮质激素作用的生理和病理生理相关(relevant)内源抑制剂的功能。

在肝中，糖皮质激素激动剂增加肝的葡萄糖生成，其通过活化糖皮质激素受体，随后导致葡萄糖异生酶即磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(PEPCK)和葡萄糖-6-磷酸酶的表达升高来实现。通过葡萄糖异生，经非己糖前体(诸如乳酸根、丙酮酸根和丙氨酸)形成葡萄糖(Link，Curr Opin Investig Drugs，2003，4，421-429)。类固醇糖皮质激素受体拮抗剂(诸如RU 486)已经在糖尿病的啮齿类动物模型中进行了测试。瘦蛋白(leptin)受体基因缺陷的小鼠(称为db/db小鼠)在遗传上是肥胖的、糖尿病的和高胰岛素血症的。用RU 486治疗高血糖db/db小鼠将血液葡萄糖水平降低大约49％，且不影响血浆胰岛素水平。另外，与未治疗的动物相比，RU 486治疗降低db/db小鼠中的糖皮质激素受体响应性基因PEPCK、葡萄糖-6-磷酸酶、葡萄糖转运蛋白2型和酪氨酸氨基转移酶的表达(Friedman等，J Biol Chem，1997，272，31475-31481)。RU 486在糖尿病、肥胖症和高胰岛素血症的ob/ob小鼠模型中还改善糖尿病，其通过降低血清胰岛素和血液葡萄糖水平(Gettys等，Int J Obes Relat Metab Disord，1997，21，865-873)。

由于认为葡萄糖异生增加是糖尿病中葡萄糖生成增加的主要来源，已经为肝的葡萄糖生成的抑制调查了许多治疗靶。由于糖皮质激素受体的拮抗作用在动物模型中改善糖尿病的能力，此类化合物成为正在探索的潜在疗法之一。然而，糖皮质激素受体拮抗剂存在有害系统效应，包括活化HPA轴(Link，Curr Opin Investig Drugs，2003，4，421-429)。HPA轴活性升高与免疫相关炎性作用抑制有关，后者可提高对传染剂和赘生物的易感性。与经由HPA轴或其靶组织缺陷的免疫介导炎症抑制有关的疾患包括库欣综合征(Cushing’ssyndrome)、慢性应激(chronic stress)、慢性酒精中毒和忧郁症抑郁(melancholicdepression)(Chrousos，N Engl J Med，1995，332，1351-1362)。如此，开发肝特异性糖皮质激素受体拮抗剂极有价值。已经将类固醇糖皮质激素受体拮抗剂与胆汁酸缀合，目的是将它们靶向肝(Apelqvist等，2000)。当前，没有已知的治疗剂靶向糖皮质激素受体且没有不良外周效应(Link，Curr Opin InvestigDrugs，2003，4，421-429)。因此，仍然存在长期感觉到的对能够有效抑制肝的糖皮质激素受体的药剂的需要。

定义

“糖皮质激素受体”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。糖皮质激素受体一般称为GCCR。

“GCCR核酸”指编码GCCR的任何核酸。例如，在某些实施方案中，GCCR核酸包括但不限于编码GCCR的DNA序列、自编码GCCR的DNA转录得到的RNA序列、和编码GCCR的mRNA序列。

“GCCR mRNA”指编码GCCR的mRNA。

治疗适应症

反义技术是降低特定基因产物表达的有效手段，因此可在多种治疗、诊断和研究应用中用于调控糖皮质激素受体表达。此外，在某些实施方案中，肝是在施用反义寡核苷酸后发现最高浓度的该反义寡核苷酸的组织之一(Geary等，Curr.Opin.Investig.Drugs，2001，2，562-573)。因此，在此类实施方案中，反义技术代表了肝特异性抑制糖皮质激素受体的诱人方法。

在某些实施方案中，靶向编码糖皮质激素受体的核酸的短反义化合物优先分布至肝。在某些实施方案中，与更长的亲本化合物相比，短反义化合物在肝中具有升高的效力。在某些实施方案中，靶RNA主要在肝中表达。

对于治疗，怀疑具有可通过调控GCCR表达来治疗的疾病或病症的受试者通过施用一种或多种短反义化合物来治疗。在一个非限制性例子中，所述方法包括给动物施用治疗有效量的短反义化合物的步骤。某些短反义化合物抑制GCCR的活性和/或抑制GCCR的表达。在某些实施方案中，受试者中GCCR的活性或表达抑制了至少10％、至少20％、至少25％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％、或100％。在某些实施方案中，受试者中GCCR的活性或表达抑制了至少30％。在某些实施方案中，受试者中GCCR的活性或表达抑制了至少50％或更多。

GCCR表达的降低可例如在动物的血液、血浆、血清、脂肪组织、肝或任何其它体液、组织、或器官中测量。在某些实施方案中，所分析的此类体液、组织或器官中所包含的细胞包含编码GCCR的核酸和/或包含GCCR蛋白本身。

还提供了包含短反义化合物的某些药物组合物和其它组合物。在某些实施方案中，短反义化合物用于药物组合物，即将有效量的化合物添加至合适的药学可接受稀释剂或载体。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的基序(翼-脱氧缺口-翼)。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物具有选自1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物具有选自3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选2-10-2和2-8-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

在某些实施方案中，本文提供了通过施用一种或多种靶向GCCR核酸的短反义化合物或包含此类化合物的药物组合物来治疗个体的方法。还提供了通过施用靶向GCCR核酸的短反义化合物来治疗具有与GCCR活性有关的疾病或疾患的受试者的方法。在糖尿病(特别是2型糖尿病)以外，与GCCR有关的疾病和疾患包括但不限于肥胖症、代谢综合征X、库欣综合征(Cushing′sSyndrome)、阿狄森氏病(Addison′s disease)、炎性疾病(诸如哮喘、鼻炎和关节炎)、变态反应、自身免疫病、免疫缺陷、食欲缺乏、恶病质、骨丢失或骨脆弱(bone frailty)、和伤口愈合。代谢综合征、代谢综合征X或仅仅是综合征X指一组风险因子，包括肥胖症、血脂障碍(特别是高血液甘油三酯)、葡萄糖不耐受、高血糖和高血压。在某些实施方案中，靶向GCCR的短反义化合物用于改善由系统性类固醇疗法诱发的高血糖。此外，反义技术提供了在对糖皮质激素治疗耐受的患者中抑制糖皮质激素受体β同等型表达(证明是过表达)的手段。

在某些实施方案中，本发明提供了靶向编码GCGR的核酸且调控糖皮质激素受体表达的短反义化合物。还提供了包含本发明化合物的药物组合物和其它组合物。还提供了筛选糖皮质激素受体调控剂的方法及调控细胞、组织或动物中的糖皮质激素受体表达的方法，包括使所述细胞、组织或动物接触一种或多种本发明化合物或组合物。本文还列出了治疗怀疑具有或倾向于与糖皮质激素受体表达有关的疾病或疾患的动物(特别是人类)的方法。此类方法包括给需要治疗的个人施用治疗或预防有效量的一种或多种本发明化合物或组合物。

某些靶向GCCR核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号AC012634核苷酸1至106000之序列(收入本文作为SEQ ID NO：8)的GCCR核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物与SEQ ID NO：8至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物与SEQID NO：8至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物与SEQ ID NO：8 100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物包含选自表10和表11所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表10和表11的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的短反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向的GCCR核酸的短反义聚合物包含2-10-2缺口聚物基序。

表10和表11列举了靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物的例子。表10列举了与SEQ ID NO：8 100％互补的短反义化合物。表11列举了相对于SEQ IDNO：8具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表10：靶向SEQ ID NO：8的短反义化合物

 

ISISNO.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						371644	88142	88155	TTTGGGAGGTGGTC	2-10-2 MOE	413
371645	88156	88169	CACACCAGGCAGAG	2-10-2 MOE	414
						371649	88212	88225	CTTTACAGCTTCCA	2-10-2 MOE	415
371651	88242	88255	CACTACCTTCCACT	2-10-2 MOE	416
						371652	88248	88261	AACACACACTACCT	2-10-2 MOE	417
371653	88256	88269	CTCTTCAAAACACA	2-10-2 MOE	418
						371665	92037	92050	GTAATTGTGCTGTC	2-10-2 MOE	419
371669	92086	92099	TTTTTCTTCGAATT	2-10-2 MOE	420
						371671	92114	92127	CATTTTCGATAGCG	2-10-2 MOE	421
371673	92142	92155	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422

表11：靶向SEQ ID NO：8且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISISNO	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						371638	2039	2052	ATAGGAAGCATAAA	2-10-2 MOE	423
371650	4949	4962	TCTTTTAAAGAAGA	2-10-2 MOE	424
						371673	10187	10200	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
371660	13465	13478	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
						371660	14428	14441	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
371654	15486	15499	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
						371661	16638	16651	TTCCACAGATCTGT	2-10-2 MOE	428
371653	17892	17905	CTCTTCAAAACACA	2-10-2 MOE	418
						371679	18444	18457	TTTATAAAGTAAAG	2-10-2 MOE	429
371645	19816	19829	CACACCAGGCAGAG	2-10-2 MOE	414

 

371638	21555	21568	ATAGGAAGCATAAA	2-10-2 MOE	423
						371650	21775	21788	TCTTTTAAAGAAGA	2-10-2 MOE	424
371679	21902	21915	TTTATAAAGTAAAG	2-10-2 MOE	429
						371655	22507	22520	TACTGTGAGAAATA	2-10-2 MOE	433
371655	22722	22735	TACTGTGAGAAATA	2-10-2 MOE	433
						371672	25662	25675	TTCCAGCTTGAAGA	2-10-2 MOE	435
371678	25926	25939	GATCAGTTCTCATG	2-10-2 MOE	436
						371655	26041	26054	TACTGTGAGAAATA	2-10-2 MOE	433
371638	29770	29783	ATAGGAAGCATAAA	2-10-2 MOE	423
						371668	30551	30564	TTATCAATGATGCA	2-10-2 MOE	439
371670	40584	40597	GCATGCTGGACAGT	2-10-2 MOE	440
						371654	43331	43344	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
371650	46024	46037	TCTTTTAAAGAAGA	2-10-2 MOE	424
						371659	50372	50385	TTGCACCTGAACTA	2-10-2 MOE	443
371634	50565	50578	CAGAATATATTTCT	2-10-2 MOE	444
						371673	56942	56955	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
371654	62372	62385	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
						371679	63537	63550	TTTATAAAGTAAAG	2-10-2 MOE	429
371654	64908	64921	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
						371661	65795	65808	TTCCACAGATCTGT	2-10-2 MOE	428
371645	70997	71010	CACACCAGGCAGAG	2-10-2 MOE	414
						371661	77400	77413	TTCCACAGATCTGT	2-10-2 MOE	428
371663	82329	82342	ATAAGAGATTAAAA	2-10-2 MOE	450
						371633	83426	83439	TCCCCCTTCTCATT	2-10-2 MOE	451
371662	85873	85886	GGGCATTGTTAAAA	2-10-2 MOE	452
						371654	86476	86489	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
371679	86516	86529	TTTATAAAGTAAAG	2-10-2 MOE	429
						371641	88097	88110	AGAACTCACATCTG	2-10-2 MOE	455
371642	88111	88124	GAGCTGGACGGAGG	2-10-2 MOE	456
						371646	88170	88183	AAGCTTCATCGGAG	2-10-2 MOE	457
371647	88184	88197	ATAATGGCATCCCG	2-10-2 MOE	458
						371650	88226	88239	TCTTTTAAAGAAGA	2-10-2 MOE	424
371673	91493	91506	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
						371664	92030	92043	TGCTGTCCTATAAG	2-10-2 MOE	460
371666	92044	92057	CACAAAGGTAATTG	2-10-2 MOE	461

 

371667	92058	92071	ATCATTTCTTCCAG	2-10-2 MOE	462
						371668	92072	92085	TTATCAATGATGCA	2-10-2 MOE	463
371670	92100	92113	GCATGCTGGACAGT	2-10-2 MOE	440
						371672	92128	92141	TTCCAGCTTGAAGA	2-10-2 MOE	435
371674	92147	92160	CCATTACCTTCCAG	2-10-2 MOE	466
						371637	92983	92996	GCATAAACAGGGTT	2-10-2 MOE	467
371654	93928	93941	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
						371641	99772	99785	AGAACTCACATCTG	2-10-2 MOE	455
371679	99883	99896	TTTATAAAGTAAAG	2-10-2 MOE	429
						371660	99933	99946	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
371635	105004	105017	TATGAAAGGAATGT	2-10-2 MOE	472
						371654	105028	105041	GAACAAAAATTAAA	2-10-2 MOE	427
371676	106482	106495	TTCCTTAAGCTTCC	2-10-2 MOE	474
						371650	107838	107851	TCTTTTAAAGAAGA	2-10-2 MOE	424
371673	110922	110935	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
						371673	111580	111593	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
371634	114608	114621	CAGAATATATTTCT	2-10-2 MOE	444
						371638	115040	115053	ATAGGAAGCATAAA	2-10-2 MOE	423
371660	116244	116257	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
						371663	116657	116670	ATAAGAGATTAAAA	2-10-2 MOE	450
371673	118068	118081	ACCTTCCAGGTTCA	2-10-2 MOE	422
						371666	118834	118847	CACAAAGGTAATTG	2-10-2 MOE	461
371660	119858	119871	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
						371660	120210	120223	AAGGATATTTTAAA	2-10-2 MOE	425
371662	120876	120889	GGGCATTGTTAAAA	2-10-2 MOE	452
						371655	124004	124017	TACTGTGAGAAATA	2-10-2 MOE	433
371656	124170	124183	GAACAGTTAAACAT	2-10-2 MOE	485

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：8的核苷酸88142-88269。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：8的核苷酸88142-88269。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸88142-88269的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 413、414、415、416、417、或418的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8核苷酸88142-88269的反义化合物选自Isis NO.371644、371645、371649、371651、371652、或371653。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：8的核苷酸88142-88169。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：8的核苷酸88142-88169。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸88142-88169的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 413或414的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8核苷酸88142-88169的反义化合物选自Isis NO.371644或371645。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：8的核苷酸88242-88269。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：8的核苷酸88242-88269。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸88242-88269的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 416、417、或418的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8核苷酸88242-88269的反义化合物选自Isis NO.371651、371652、或371653。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：8的核苷酸92037-92155。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：8的核苷酸92037-92155。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸92037-92155的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 419、420、421、或422的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQID NO：8核苷酸92037-92155的反义化合物选自Isis NO.371665、371669、371671、或171673。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：8的核苷酸92114-92155。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：8的核苷酸92114-92155。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸92114-92155的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 421或422的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：8核苷酸92114-92155的反义化合物选自Isis NO.371671或171673。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向GCCR核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控GCCR表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向GCCR核酸的短反义化合物，其中所述靶向GCCR核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物来调控GCCR表达的方法。

在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长8个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长9个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长10个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长11个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长12个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长13个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长14个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长15个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR的方法包括使用长16个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控GCCR表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向GCCR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCCR表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向GCCR核酸的短反义化合物。

7.高血糖素受体(GCGR)

维持正常血糖是受到小心调节的代谢事件。高血糖素(负责在吸收后状态维持血液葡萄糖水平的29个氨基酸的肽)通过活化肝的糖原分解、葡萄糖异生，刺激脂肪组织中的脂肪分解，和刺激胰岛素分泌而提高葡萄糖自肝的释放。在高血液葡萄糖水平期间，胰岛素逆转高血糖素介导的对糖原分解和葡萄糖异生的增强作用。在具有糖尿病的患者中，胰岛素或是不可得或是并非完全有效。虽然针对糖尿病的治疗在传统上聚焦于提高胰岛素水平，但是已经将高血糖素功能的拮抗作用作为可选疗法。由于高血糖素通过经高血糖素受体发信号而发挥其生理作用，因此高血糖素受体已经建议用作糖尿病的潜在治疗靶(Madsen等，Curr.Pharm.Des.，1999，5，683-691)。

高血糖素受体属于具有七个跨膜结构域的G蛋白偶联受体超家族。它也是结合在结构域上与高血糖素相似的肽的同源受体较小亚家族的成员。编码人类高血糖素受体的基因在1994年得到克隆，而且对基因组序列的分析揭示了多个内含子及与大鼠高血糖素受体基因的82％同一性(Lok等，Gene，1994，140，203-209；MacNeil等，Biochem.Biophys.Res.Commun.，1994，198，328-334)。大鼠高血糖素受体基因的克隆还导致对多种可变剪接变体的描述(Maget等，FEBS Lett.，1994，351，271-275)。人类高血糖素受体基因位于染色体17q25(Menzel等，Genomics，1994，20，327-328)。高血糖素受体基因中密码子40由Gly变成Ser的错义突变导致对高血糖素的亲和力降低3倍(Fujisawa等，Diabetologia，1995，38，983-985)，而且已经将此突变与数种疾病状态联系起来，包括非胰岛素依赖性糖尿病(Fujisawa等，Diabetologia，1995，38，983-985)、高血压(Chambers和Morris，Nat.Genet.，1996，12，122)、和中枢性肥胖(centraladiposity)(Siani等，Obes.Res.，2001，9，722-726)。

定义

“高血糖素受体”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。高血糖素受体一般称为GCGR，但也可称为GR、GGR、MGC138246、MGC93090。

“GCGR核酸”指编码GCGR的任何核酸。例如，在某些实施方案中，GCGR核酸包括但不限于编码GCGR的GCGR序列、自编码GCGR的DNA转录得到的RNA序列、和编码GCGR的mRNA序列。“GCGR mRNA”指编码GCGR蛋白的mRNA。

治疗适应症

反义技术是降低高血糖素受体(GCGR)表达的有效手段，而且已经证明在许多治疗、诊断、和研究应用中独特地有效。因此，在某些实施方案中，本发明提供了靶向编码高血糖素受体的核酸且调控高血糖素受体表达的短反义化合物。本文还提供了能够抑制GCGR表达的短反义化合物。本文还提供了治疗个体的方法，包括施用一种或多种包含靶向GCCR核酸的短反义化合物的药物组合物。在某些实施方案中，因为靶向GCGR核酸的短反义化合物抑制GCGR表达，所以本文提供了通过施用一种或多种包含靶向GCGR核酸的短反义化合物的药物组合物来治疗具有与GCGR活性有关的疾病或疾患的受试者的方法。例如，本文提供了治疗具有高血液葡萄糖、高血糖症、前驱糖尿病、糖尿病、2型糖尿病、代谢综合征、肥胖症和/或胰岛素抗性的受试者的方法。

本文还涵盖包含一种或多种靶向GCGR的短反义化合物和任选的药学可接受载体、稀释剂、增强剂或赋形剂的药物组合物。本发明的某些化合物还可用于制备用于治疗与GCGR介导的高血糖素效应有关的疾病和病症的药物。

本发明的某些实施方案包括降低组织或细胞中的GCGR表达的方法，包括使所述细胞或组织接触靶向编码GCGR的核酸的短反义化合物或包含此类化合物的药物组合物。在某些此类实施方案中，本发明提供了降低受试者中的血液葡萄糖水平、血液甘油三酯水平、或血液胆固醇水平的方法，包括给受试者施用短反义化合物或药物组合物。血液水平可以是血浆水平或血清水平。还涵盖在动物中改进胰岛素敏感性的方法、提高GLP-1水平的方法、和抑制肝的葡萄糖输出的方法，包括给所述动物施用本发明的反义寡核苷酸或药物组合物。胰岛素敏感性的改进可以表现为循环中胰岛素水平的降低。

在某些实施方案中，本发明提供了经GCGR治疗具有与高血糖素活性有关的疾病或疾患的受试者的方法，包括给受试者施用治疗或预防有效量的短反义化合物或药物组合物。在某些实施方案中，此类疾病或疾患可以是代谢疾病或疾患。在某些实施方案中，所述代谢疾病或疾患是糖尿病、高血糖症、高脂血症、代谢综合征X、肥胖症、原发性高血糖素血症、胰岛素缺陷、或胰岛素抗性。在有些实施方案中，所述糖尿病是2型糖尿病。在有些实施方案中，所述肥胖症是饮食诱导的。在有些实施方案中，高脂血症与血液脂质水平升高有关。脂质包括胆固醇和甘油三酯。在一个实施方案中，所述疾患是肝脂肪变性。在有些实施方案中，所述脂肪变性是脂肪肝炎或非酒精性脂肪肝炎。

在某些实施方案中，本发明提供了在动物中预防或延迟血液葡萄糖水平升高发作的方法以及在动物中预防β-细胞功能的方法，其中使用本文所述寡聚化合物。

某些靶向GCGR的短反义化合物可用于调控有此需要的受试者(诸如动物，包括但不限于人类)中的GCGR表达。在某些实施方案中，此类方法包括给所述动物施用有效量的、降低GCGR RNA表达的短反义化合物的步骤。在某些实施方案中，短反义化合物有效降低GCGR RNA的水平或功能。因为GCGR mRNA水平的降低也可导致所表达GCGR蛋白质产物的改变，此类所得改变也可测量。认为某些有效降低GCGR RNA或所表达蛋白质产物的水平或功能的反义化合物是有活性的反义化合物。在某些实施方案中，短反义化合物降低GCGR的表达，引起RNA降低至少10％、至少20％、至少25％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％、或100％。

还提供了筛选高血糖素受体调控剂的方法及调控细胞、组织或动物中的高血糖素受体的方法，包括使所述细胞、组织或动物接触一种或多种靶向GCGR的短反义化合物或包含此类化合物的组合物。本文还列出了治疗怀疑具有或倾向于与高血糖素受体表达有关的疾病或疾患的动物(特别是人类)的方法。某些此类方法包括给需要治疗的个人施用治疗或预防有效量的一种或多种本发明化合物或组合物。

高血糖素受体表达的降低可例如在动物的血液、血浆、血清、脂肪组织、肝或任何其它体液、组织、或器官中测量。优选地，所分析的此类体液、组织或器官中所包含的细胞包含编码高血糖素受体蛋白的核酸分子和/或高血糖素受体蛋白本身。

还提供了包含短反义化合物的某些药物组合物和其它组合物。在某些实施方案中，靶向编码GCGR的核酸的短反义化合物用于药物组合物，即将有效量的化合物添加至合适的药学可接受稀释剂或载体。

靶向GCGR核酸的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的基序(翼-脱氧缺口-翼)。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、2-10-2、3-10-3、3-8-3、1-1-10-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

某些靶向GCGR核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_000160.1之序列(收入本文作为SEQ ID NO：9)的GCGR核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物与SEQ ID NO：9至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物与SEQ IDNO：9至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物与SEQ ID NO：9 100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物包含选自表12和表13所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表12和表13的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，由SEQ ID NO限定的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的短反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向的GCCR核酸的短反义聚合物包含3-10-3缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向的GCCR核酸的短反义聚合物包含3-8-3缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向GCCR核酸的短反义化合物包含缺口聚物基序。在某些实施方案中，靶向的GCCR核酸的短反义聚合物包含2-10-2缺口聚物基序。

表12和表13列举了靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物的例子。表12列举了与SEQ ID NO：9 100％互补的短反义化合物。表13列举了相对于SEQ IDNO：9具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE’指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表12：靶向SEQ ID NO：9的短反义化合物

 

ISISNO.	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						338463	378	393	TAGAGCTTCCACTTCT	3-10-3 MOE	486
338534	378	391	GAGCTTCCACTTCT	3-8-3 MOE	487
						327130	499	512	TGTTGGCCGTGGTA	3-8-3 MOE	488
327131	500	513	ATGTTGGCCGTGGT	3-8-3 MOE	489
						327132	501	514	GATGTTGGCCGTGG	3-8-3 MOE	490
327133	502	515	AGATGTTGGCCGTG	3-8-3 MOE	491
						327134	503	516	GAGATGTTGGCCGT	3-8-3 MOE	492
327135	504	517	GGAGATGTTGGCCG	3-8-3 MOE	493
						327136	505	518	AGGAGATGTTGGCC	3-8-3 MOE	494
327137	506	519	CAGGAGATGTTGGC	3-8-3 MOE	495
						327138	507	520	GCAGGAGATGTTGG	3-8-3 MOE	496
327139	508	521	GGCAGGAGATGTTG	3-8-3 MOE	497
						327140	531	544	GTGGTGCCAAGGCA	3-8-3 MOE	498
327141	532	545	TGTGGTGCCAAGGC	3-8-3 MOE	499
						327142	533	546	TTGTGGTGCCAAGG	3-8-3 MOE	500
327143	534	547	TTTGTGGTGCCAAG	3-8-3 MOE	501
						327144	535	548	CTTTGTGGTGCCAA	3-8-3 MOE	502
327145	536	549	ACTTTGTGGTGCCA	3-8-3 MOE	503
						327146	537	550	CACTTTGTGGTGCC	3-8-3 MOE	504
327147	538	551	GCACTTTGTGGTGC	3-8-3 MOE	505
						327148	539	552	TGCACTTTGTGGTG	3-8-3 MOE	506
327149	540	553	TTGCACTTTGTGGT	3-8-3 MOE	507
						327150	545	558	CGGTGTTGCACTTT	3-8-3 MOE	508
327151	546	559	GCGGTGTTGCACTT	3-8-3 MOE	509
						327152	547	560	AGCGGTGTTGCACT	3-8-3 MOE	510
327153	548	561	AAGCGGTGTTGCAC	3-8-3 MOE	511
						327154	549	562	GAAGCGGTGTTGCA	3-8-3 MOE	512

 

327155	550	563	CGAAGCGGTGTTGC	3-8-3 MOE	513
						327156	551	564	ACGAAGCGGTGTTG	3-8-3 MOE	514
327157	552	565	CACGAAGCGGTGTT	3-8-3 MOE	515
						327158	553	566	ACACGAAGCGGTGT	3-8-3 MOE	516
327159	554	567	AACACGAAGCGGTG	3-8-3 MOE	517
						345897	684	697	GCTGCTGTACATCT	2-10-2 MOE	518
327160	684	697	GCTGCTGTACATCT	3-8-3 MOE	518
						327161	685	698	AGCTGCTGTACATC	3-8-3 MOE	520
327162	686	699	AAGCTGCTGTACAT	3-8-3 MOE	521
						327163	687	700	GAAGCTGCTGTACA	3-8-3 MOE	522
327164	688	701	GGAAGCTGCTGTAC	3-8-3 MOE	523
						327165	689	702	TGGAAGCTGCTGTA	3-8-3 MOE	524
327166	690	703	CTGGAAGCTGCTGT	3-8-3 MOE	525
						327167	691	704	CCTGGAAGCTGCTG	3-8-3 MOE	526
327168	692	705	ACCTGGAAGCTGCT	3-8-3 MOE	527
						327169	693	706	CACCTGGAAGCTGC	3-8-3 MOE	528
327170	694	707	TCACCTGGAAGCTG	3-8-3 MOE	529
						327171	695	708	ATCACCTGGAAGCT	3-8-3 MOE	530
327172	696	709	CATCACCTGGAAGC	3-8-3 MOE	531
						327173	697	710	ACATCACCTGGAAG	3-8-3 MOE	532
327174	698	711	TACATCACCTGGAA	3-8-3 MOE	533
						327175	699	712	GTACATCACCTGGA	3-8-3 MOE	534
327176	700	713	TGTACATCACCTGG	3-8-3 MOE	535
						327177	701	714	GTGTACATCACCTG	3-8-3 MOE	536
327178	869	882	TAGCGGGTCCTGAG	3-8-3 MOE	537
						327179	870	883	GTAGCGGGTCCTGA	3-8-3 MOE	538
327180	871	884	TGTAGCGGGTCCTG	3-8-3 MOE	539
						327181	872	885	CTGTAGCGGGTCCT	3-8-3 MOE	540
327182	873	886	GCTGTAGCGGGTCC	3-8-3 MOE	541
						327183	874	887	GGCTGTAGCGGGTC	3-8-3 MOE	542
327184	875	888	TGGCTGTAGCGGGT	3-8-3 MOE	543
						327185	876	889	CTGGCTGTAGCGGG	3-8-3 MOE	544
327186	877	890	TCTGGCTGTAGCGG	3-8-3 MOE	545
						327187	878	891	TTCTGGCTGTAGCG	3-8-3 MOE	546
327188	955	968	TGAACACCGCGGCC	3-8-3 MOE	547

 

327189	956	969	ATGAACACCGCGGC	3-8-3 MOE	548
						327190	957	970	CATGAACACCGCGG	3-8-3 MOE	549
327191	958	971	GCATGAACACCGCG	3-8-3 MOE	550
						327192	959	972	TGCATGAACACCGC	3-8-3 MOE	551
327193	960	973	TTGCATGAACACCG	3-8-3 MOE	552
						327194	961	974	ATTGCATGAACACC	3-8-3 MOE	553
327195	962	975	TATTGCATGAACAC	3-8-3 MOE	554
						327196	963	976	ATATTGCATGAACA	3-8-3 MOE	555
327197	964	977	CATATTGCATGAAC	3-8-3 MOE	556
						327198	1019	1032	AGGTTGTGCAGGTA	3-8-3 MOE	557
327199	1020	1033	CAGGTTGTGCAGGT	3-8-3 MOE	558
						327200	1021	1034	GCAGGTTGTGCAGG	3-8-3 MOE	559
327201	1022	1035	AGCAGGTTGTGCAG	3-8-3 MOE	560
						327202	1023	1036	CAGCAGGTTGTGCA	3-8-3 MOE	561
327203	1024	1037	CCAGCAGGTTGTGC	3-8-3 MOE	562
						327204	1025	1038	CCCAGCAGGTTGTG	3-8-3 MOE	563
327205	1026	1039	GCCCAGCAGGTTGT	3-8-3 MOE	564
						327206	1027	1040	GGCCCAGCAGGTTG	3-8-3 MOE	565
327207	1028	1041	AGGCCCAGCAGGTT	3-8-3 MOE	566
						338491	1160	1175	TGTCATTGCTGGTCCA	3-10-3 MOE	567
338562	1160	1173	TCATTGCTGGTCCA	3-8-3 MOE	568
						338498	1307	1322	TGGCCAGCCGGAACTT	3-10-3 MOE	569
338569	1307	1320	GCCAGCCGGAACTT	3-8-3 MOE	570
						338499	1329	1344	GGGATGAGGGTCAGCG	3-10-3 MOE	571
338570	1329	1342	GATGAGGGTCAGCG	3-8-3 MOE	572
						385067	1364	1377	AAGGCAAAGACCAC	3-8-3 MOE	573
338573	1401	1414	GGAGCGCAGGGTGC	3-8-3MOE	574
						338580	1487	1500	TGCACCTCCTTGTT	3-8-3 MOE	575

表13：靶向SEQ ID NO：1且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISIS NO.	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						338577	158	171	CAGCAGACCCTGGA	3-8-3 MOE	576
338458	237	252	ACATCTGGCAGAGGTT	3-10-3 MOE	577

 

338529	237	250	ATCTGGCAGAGGTT	3-8-3 MOE	578
						338466	318	333	CAGGCCAGCAGGAGTA	3-10-3 MOE	579
338537	318	331	GGCCAGCAGGAGTA	3-8-3 MOE	580
						338533	364	377	CAAACAAAAAGTCC	3-8-3 MOE	582
338462	364	379	CTCAAACAAAAAGTCC	3-10-3 MOE	581
						338535	397	410	GGTGACATTGGTCA	3-8-3 MOE	584
338464	397	412	GTGGTGACATTGGTCA	3-10-3 MOE	583
						338466	470	485	CAGGCCAGCAGGAGTA	3-10-3 MOE	579
338537	470	483	GGCCAGCAGGAGTA	3-8-3 MOE	580
						385048	497	510	TTGGCAGTGGTGTT	3-8-3 MOE	587
385049	500	513	ATGTTGGCAGTGGT	3-8-3 MOE	588
						338467	503	518	AGGAAATGTTGGCAGT	3-10-3 MOE	589
338538	503	516	GAAATGTTGGCAGT	3-8-3 MOE	590
						385050	506	519	CAGGAAATGTTGGC	3-8-3 MOE	591
385051	509	522	GGGCAGGAAATGTT	3-8-3 MOE	592
						385052	523	536	AAGGTAGGTACCAG	3-8-3 MOE	593
385053	526	539	ACCAAGGTAGGTAC	3-8-3 MOE	594
						385056	535	548	CTTTGTGGCACCAA	3-8-3 MOE	595
385057	538	551	GCACTTTGTGGCAC	3-8-3 MOE	596
						338539	539	552	TGCACTTTGTGGCA	3-8-3 MOE	597
385058	541	554	GCTGCACTTTGTGG	3-8-3 MOE	598
						385059	544	557	GGTGCTGCACTTTG	3-8-3 MOE	599
385060	547	560	GGCGGTGCTGCACT	3-8-3 MOE	600
						385063	556	569	TGAACACTAGGCGG	3-8-3 MOE	601
385064	559	572	TCTTGAACACTAGG	3-8-3 MOE	602
						338469	561	576	CACCTCTTGAACACTA	3-10-3 MOE	603
338540	561	574	CCTCTTGAACACTA	3-8-3 MOE	604
						385065	562	575	ACCTCTTGAACACT	3-8-3 MOE	605
385066	565	578	CACACCTCTTGAAC	3-8-3 MOE	606
						338541	590	603	CCTCGAACCCACTG	3-8-3 MOE	607
338473	658	673	CTTCTGGACCTCGATC	3-10-3 MOE	608
						338544	658	671	TCTGGACCTCGATC	3-8-3 MOE	609
338474	681	696	CTGCTATACATCTTGG	3-10-3 MOE	610
						338545	681	694	GCTATACATCTTGG	3-8-3 MOE	611
338475	703	718	CACGGTGTACATCACC	3-10-3 MOE	612

 

338546	703	716	CGGTGTACATCACC	3-8-3 MOE	613
						338547	718	731	ACAGACTGTAGCCC	3-8-3 MOE	615
338476	718	733	GGACAGACTGTAGCCC	3-10-3 MOE	614
						338550	889	902	CATCGCCAATCTTC	3-8-3 MOE	617
338479	889	904	GTCATCGCCAATCTTC	3-10-3 MOE	616
						338551	899	912	ACACTGAGGTCATC	3-8-3 MOE	619
338480	899	914	TCACACTGAGGTCATC	3-10-3 MOE	618
						338552	924	937	CGCCCCGTCACTGA	3-8-3 MOE	620
338555	992	1005	AGCAACCAGCAATA	3-8-3 MOE	622
						338484	992	1007	CCAGCAACCAGCAATA	3-10-3 MOE	621
338485	1018	1033	CAGGCTGTACAGGTAC	3-10-3 MOE	623
						338556	1018	1031	GGCTGTACAGGTAC	3-8-3 MOE	624
338558	1051	1064	AGCTCCTCTCAGAG	3-8-3 MOE	626
						338487	1051	1066	GAAGCTCCTCTCAGAG	3-10-3 MOE	625
338559	1079	1092	CAGCCAATGCCCAG	3-8-3 MOE	628
						338488	1079	1094	CCCAGCCAATGCCCAG	3-10-3 MOE	627
338560	1131	1144	AAACAGACACTTGA	3-8-3 MOE	630
						338489	1131	1146	TCAAACAGACACTTGA	3-10-3 MOE	629
338490	1145	1160	AGCACTGAACATTCTC	3-10-3 MOE	631
						338561	1145	1158	CACTGAACATTCTC	3-8-3 MOE	632
338563	1181	1194	ATCCACCAGAATCC	3-8-3 MOE	634
						338492	1181	1196	GGATCCACCAGAATCC	3-10-3 MOE	633
338564	1216	1229	TGATCAGTAAGGCC	3-8-3 MOE	635
						338565	1232	1245	ACAAAGATGAAAAA	3-8-3 MOE	637
338494	1232	1247	GGACAAAGATGAAAAA	3-10-3 MOE	636
						338566	1267	1280	CACGCAGCTTGGCC	3-8-3 MOE	639
338495	1267	1282	GGCACGCAGCTTGGCC	3-10-3 MOE	638
						338571	1344	1357	GACCCCCAGCAGAG	3-8-3 MOE	641
338500	1344	1359	TGGACCCCCAGCAGAG	3-10-3 MOE	640
						385068	1366	1379	CAAAGGCAAAGACC	3-8-3 MOE	642
385069	1369	1382	TCACAAAGGCAAAG	3-8-3 MOE	643
						385070	1372	1385	CAGTCACAAAGGCA	3-8-3 MOE	644
385071	1375	1388	CGTCAGTCACAAAG	3-8-3 MOE	645
						385072	1378	1391	GCTCGTCAGTCACA	3-8-3 MOE	646
385073	1381	1394	CATGCTCGTCAGTC	3-8-3 MOE	647

 

386608	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	1-12-1 MOE	648
						386593	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2 MOE	648
396146	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2 MOE	648
						338572	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	3-8-3 MOE	648
396149	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	1-1-10-2 2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/OMe/OMe	648
						386627	1384	1397	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2亚甲氧基BNA	648
386610	1387	1400	CTTGGGCATGCTCG	1-12-1 MOE	654
						386595	1387	1400	CTTGGGCATGCTCG	2-10-2 MOE	654
385074	1387	1400	CTTGGGCATGCTCG	3-8-3 MOE	654
						385075	1390	1403	TGCCTTGGGCATGC	3-8-3 MOE	657
385076	1393	1406	GGGTGCCTTGGGCA	3-8-3 MOE	648
						385077	1396	1409	GCAGGGTGCCTTGG	3-8-3 MOE	659
385078	1399	1412	AGCGCAGGGTGCCT	3-8-3 MOE	660
						338502	1401	1416	GTGGAGCGCAGGGTGC	3-10-3 MOE	661
385079	1402	1415	TGGAGCGCAGGGTG	3-8-3 MOE	662
						385080	1405	1418	TGGTGGAGCGCAGG	3-8-3 MOE	663
385081	1408	1421	GCTTGGTGGAGCGC	3-8-3 MOE	664
						385082	1411	1424	AGAGCTTGGTGGAG	3-8-3 MOE	665
338503	1412	1427	AAAAGAGCTTGGTGGA	3-10-3 MOE	666
						338574	1412	1425	AAGAGCTTGGTGGA	3-8-3 MOE	667
385083	1414	1427	AAAAGAGCTTGGTG	3-8-3 MOE	668
						385084	1417	1430	CAAAAAAGAGCTTG	3-8-3 MOE	669
338504	1434	1449	AAGGAGCTGAGGAACA	3-10-3 MOE	670
						338575	1434	1447	GGAGCTGAGGAACA	3-8-3 MOE	671
327167	1441	1454	CCTGGAAGCTGCTG	3-8-3 MOE	526
						338576	1445	1458	AGACCCTGGAAGGA	3-8-3 MOE	673
338505	1445	1460	GCAGACCCTGGAAGGA	3-10-3 MOE	672
						338506	1449	1464	ACCAGCAGACCCTGGA	3-10-3 MOE	674
338577	1449	1462	CAGCAGACCCTGGA	3-8-3 MOE	576
						338507	1464	1479	CAGTAGAGAACAGCCA	3-10-3 MOE	676
338578	1464	1477	GTAGAGAACAGCCA	3-8-3 MOE	677
						338508	1475	1490	TGTTGAGGAAACAGTA	3-10-3 MOE	678

 

338579	1475	1488	TTGAGGAAACAGTA	3-8-3 MOE	679
						338509	1487	1502	CCTGCACCTCCTTGTT	3-10-3 MOE	680
338580	1610	1623	TGCACCTCCTTGTT	3-8-3 MOE	575

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸378-391。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸378-391。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸378-391的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 486或487的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸378-391的短反义化合物选自Isis No 338463或338534。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸499-521。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸499-521。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸499-521的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 488、489、490、491、492、493、494、495、496、或497的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸499-521的短反义化合物选自Isis No327130、327131、327132、327133、327134、327135、327136、327137、327138、或327139。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸531-553。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸531-553。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸531-553的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 498、499、500、501、502、503、504、505、506、或507的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸531-553的短反义化合物选自Isis No327140、327141、327142、327143、327144、327145、327146、327147、327148、或327149。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸545-567。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸545-567。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸545-567的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 508、509、510、511、512、513、514、515、516、或517的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸545-567的短反义化合物选自Isis No327150、327151、327152、327153、327154、327155、327156、327157、327158、或327159。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸531-567。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸531-567。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸531-567的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 498、499、500、501、502、503、504、505、506、507、508、509、510、511、512、513、514、515、516、或517的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸531-567的短反义化合物选自Isis No 327140、327141、327142、327143、327144、327145、327146、327147、327148、327149、327150、327151、327152、327153、327154、327155、327156、327157、327158、或327159。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸684-714。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸684-714。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸684-714的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 518、520、521、522、523、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、534、535、或536的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸684-714的短反义化合物选自Isis No 345897、327160、327161、327162、327163、327164、327165、327166、327167、327168、327169、327170、327171、327172、327173、327174、327175、327176、或327177。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸869-891。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸869-891。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸869-891的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 537、538、539、540、541、542、543、544、545、或546的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸869-891的短反义化合物选自Isis No327178、327179、327180、327181、327182、327183、327184、327185、327186、或327187。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸955-977。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸955-977。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸955-977的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 547、548、549、550、551、552、553、554、555、或556的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸955-977的短反义化合物选自Isis No327188、327189、327190、327191、327192、327193、327194、327195、327196、或327197。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸1019-1041。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸1019-1041。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1019-1041的短反义化合物包含选自SEQ ID NO557、558、559、560、561、562、563、564、565、或566的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸1019-1041的短反义化合物选自Isis No 327198、327199、327200、327201、327202、327203、327204、327205、327206、或327207。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸1160-1175。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸1160-1175。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1160-1175的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 567或568的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸1160-1175的短反义化合物选自Isis No 338491或338562。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸1307-1377。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸1307-1377。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1307-1377的短反义化合物包含选自SEQ ID NO569、570、571、572、或573的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸1307-1377的短反义化合物选自Isis No 338498、338569、338499、338570、或385067。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：9的核苷酸1307-1414。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：9的核苷酸1307-1414。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1307-1414的短反义化合物包含选自SEQ ID NO569、570、571、572、573、或574的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：9核苷酸1307-1414的短反义化合物选自Isis No 338498、338569、338499、338570、385067、或338573。

在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向GCGR核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、  亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向GCGR核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控GCGR表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向GCGR核酸的短反义化合物，其中所述靶向GCGR核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物来调控GCGR表达的方法。

在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长8个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长9个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长10个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长11个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长12个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长13个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长14个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长15个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR的方法包括使用长16个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控GCGR表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向GCGR核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控GCGR表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向GCGR核酸的短反义化合物。

8.DGAT2

二酰甘油转移酶2(也称为DGAT2、二酰甘油O-转移酶2、酰基-CoA：二酰甘油酰基转移酶2)已经显示出参与自食物吸收甘油三酯(也称为三酰甘油)的过程。

自食物吸收甘油三酯是通过一系列步骤而发生的非常高效的过程，其中饮食三酰甘油在肠腔中水解，然后在肠细胞内再合成。三酰甘油的再合成可以经单酰甘油途径来发生，开始是单酰甘油酰基转移酶(MGAT)催化自单酰甘油和脂肪酰基-CoA合成二酰甘油。二酰甘油的可选合成由甘油-磷酸途径提供，其描述了将两分子的脂肪酰基-CoA偶联至甘油-3-磷酸。在这两种情况中，然后，二酰甘油在由一种或两种二酰甘油酰基转移酶催化的反应中被另一分子的脂肪酰基-CoA酰化而形成甘油三酯(Farese等，Curr.Opin.Lipidol.，2000，11，229-234)。

由二酰甘油酰基转移酶催化的反应是甘油三酯合成中最后的和唯一关键的步骤(committed step)。因此，二酰甘油酰基转移酶牵涉肠的脂肪吸收、脂蛋白装配、调节血浆甘油三酯浓度、和脂肪细胞中的脂肪贮存。第一种二酰甘油酰基转移酶(即二酰甘油转移酶1)在1960年得到鉴定，而且编码此蛋白质的人类和小鼠基因在1998年得到分离(Cases等，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.，1998，95，13018-13023；Oelkers等，J.Biol.Chem.，1998，273，26765-26771)。缺乏二酰甘油酰基转移酶1的小鼠可存活且仍可通过其它生物学路径来合成甘油三酯，表明甘油三酯合成存在多种机制(Smith等，Nat.Genet.，2000，25，87-90)。

第二种二酰甘油转移酶(即二酰甘油转移酶2)(也称为DGAT2、二酰甘油O-转移酶2、酰基-CoA：二酰甘油酰基转移酶2)随后在真菌被孢霉属(Mortierella)、人类和小鼠中得到鉴定(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876；Lardizabal等，J.Biol.Chem.，2001，276，38862-38869)。酶测定法指出这种新近鉴定的蛋白质确实拥有二酰甘油转移酶活性，其利用广泛的长链脂肪酰基-CoA底物(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876)。

二酰甘油转移酶是其序列与二酰甘油转移酶1无关的基因家族的成员。在序列与二酰甘油转移酶1相比不同外，体外测定法说明了二酰甘油转移酶2在更低浓度的氯化镁和油酰-CoA具有更高活性(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876)。二酰甘油转移酶2的预测蛋白质序列包含至少一个假定跨膜结构域、三个潜在N-连接的糖基化位点、六个潜在蛋白激酶C磷酸化共有位点、以及与酰基转移酶中找到的假定甘油磷酸化位点一样的序列(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876)。国际放射杂交定位协会(InternationalRadiation Hybrid Mapping Consortium)已经将人类二酰甘油转移酶2定位至染色体11q13.3。

在人类组织中，在肝和白色脂肪组织中检测到最高水平的二酰甘油转移酶2，在乳腺、睾丸和外周血白细胞中找到更低的水平(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876)。在人类组织中检测到2.4和1.8千碱基的两种mRNA种类，而小鼠组织中的主要二酰甘油转移酶2mRNA种类是2.4千碱基。在肝和白色脂肪组织以外，二酰甘油转移酶2在小鼠小肠的所有区段中表达，在近侧小肠中表达较高而在远侧小肠中表达较低(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876)。

二酰甘油转移酶活性在大鼠肝的出生后发育期间展现出独特(distinct)样式。由于在mRNA表达和活性样式之间没有相关性，翻译后修饰可能参与大鼠发育期间对二酰甘油转移酶2活性的调节(Waterman等，J.Lipid.Res.，2002，43，1555-1562)。

二酰甘油转移酶2mRNA受到胰岛素治疗而优先上调，正如测量来自培养的小鼠脂肪细胞的膜级分的二酰甘油活性的体外测定法所示(Meegalla等，Biochem.Biophys.Res.Commun.，2002，298，317-323)。在禁食的小鼠中，二酰甘油转移酶2表达大大降低，而且在再进食后显著升高。参与脂肪酸合成的两种酶(即乙酰-CoA羧化酶和脂肪酸核酶)的表达样式以相似的方式来应答禁食和再进食。这些结果联合二酰甘油转移酶2在肝中丰富表达的观察结果说明，二酰甘油转移酶2与内源脂肪酸合成途径有紧密联系(Meegalla等，Biochem.Biophys.Res.Commun.，2002，298，317-323)。

二酰甘油酰基转移酶1基因中包含破坏的小鼠的研究提供了二酰甘油酰基转移酶2促进甘油三酯合成的证据。二酰甘油转移酶2mRNA表达水平在来自野生型和二酰甘油转移酶1缺陷小鼠二者的肠区段中是相似的(Buhman等，J.Biol.Chem.，2002，277，25474-25479)。使用氯化镁来辨别二酰甘油转移酶1和2活性，Buhman等观察到在二酰甘油转移酶1缺陷小鼠中，二酰甘油转移酶活性在近侧小肠中降至50％而在远侧小肠中降至10-15％(Buhman等，J.Biol.Chem.，2002，277，25474-25479)。

另外，二酰甘油转移酶2mRNA水平在二酰甘油转移酶1缺陷小鼠的肝或脂肪组织中不上调，甚至在数周高脂肪饮食后(Cases等，J.Biol.Chem.，2001，276，38870-38876；Chen等，J.Clin.Invest.，2002，109，1049-1055)。然而，在瘦蛋白基因中具有导致肥胖症的突变的ob/ob小鼠中，二酰甘油转移酶2比在野生型小鼠中更高度地表达，说明二酰甘油转移酶2可能部分负责在这些小鼠中看到的高度积累的脂肪量。此外，瘦蛋白与二酰甘油转移酶1的联合突变导致白色脂肪组织中的二酰甘油转移酶2表达与来自二酰甘油转移酶1缺陷小鼠的相同组织中的水平相比升高了3倍(Chen等，J.Clin.Invest.，2002，109，1049-1055)。二酰甘油转移酶2mRNA还在这些小鼠的皮肤中上调(Chen等，J.Clin.Invest.，2002，109，175-181)。这些数据说明瘦蛋白在正常情况中下调二酰甘油转移酶2表达，而且这些小鼠的白色脂肪组织中二酰甘油转移酶2的上调可提供甘油三酯合成的可选途径，其在瘦蛋白缺陷/二酰甘油转移酶1缺陷小鼠中仍然存在(Chen等，J.Clin.Invest.，2002，109，1049-1055)。

二酰甘油酰基转移酶1敲除小鼠展现出有趣的表型，即它们是瘦的，对饮食诱导的肥胖有抗性，具有降低的组织甘油三酯水平及升高的胰岛素和瘦蛋白(leptin)敏感性(Chen等，J.Clin.Invest.，2002，109，1049-1055；Smith等，Nat.Genet.，2000，25，87-90)。由于二酰甘油转移酶2也参与甘油三酯合成，因此干扰二酰甘油转移酶2可类似地导致身体脂肪含量降低。

定义

“DGAT2”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。

“DGAT2核酸”指编码DGAT2的任何核酸。例如，在某些实施方案中，DGAT2核酸包括但不限于编码DGAT2的DNA序列、自编码DGAT2的DNA转录得到的RNA序列、和编码DGAT2的mRNA序列。

“DGAT2 mRNA”指编码DGAT2的mRNA。

治疗适应症

反义技术是降低DGAT2表达的有效手段，而且已经证明在许多治疗、诊断、和研究应用中独特地有效。因此，在某些实施方案中，本发明提供了靶向编码DGAT2的核酸且调控DGAT2表达的化合物。本文还提供了能够有效抑制DGAT2表达的短反义化合物。

在某些实施方案中，怀疑具有与DGAT2有关的疾病的受试者通过施用一种或多种靶向编码DGAT2的核酸的短反义化合物来治疗。例如，在一个非限制性实施方案中，此类方法包括给动物施用治疗有效量的短反义化合物的步骤。在某些此类实施方案中，短反义化合物有效抑制DGAT2的活性或抑制DGAT2的表达。在一个实施方案中，受试者中DGAT2的活性或表达抑制了至少10％、至少20％、至少25％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％、或100％。在某些实施方案中，受试者中DGAT2的活性或表达抑制了大约30％。更优选地，受试者中DGAT2的活性或表达抑制了大约50％或更多。

DGAT2表达的降低可例如在动物的血液、血浆、血清、脂肪组织、肝或任何其它体液、组织、或器官中测量。优选地，所分析的所述体液、组织或器官中所包含的细胞包含编码DGAT2的核酸和/或DGAT2蛋白本身。

在某些实施方案中，还提供了包含本发明化合物的药物组合物和其它组合物。例如，靶向DGAT2核酸的短反义化合物可用于药物组合物，即将有效量的化合物添加至合适的药学可接受稀释剂或载体。

某些靶向DGAT2的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1的基序(翼-脱氧缺口-翼)。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物具有选自1-10-1、2-10-2和3-10-3的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

本文提供了通过施用一种或多种靶向DGAT2核酸的短反义化合物或包含此类化合物的药物组合物来治疗个体的方法。还提供了通过施用靶向DGAT2核酸的短反义化合物来治疗具有与DGAT2活性有关的疾病或疾患的受试者的方法。与DGAT2有关的疾病和疾患包括但不限于心血管病症、肥胖症、糖尿病、胆固醇血症、和肝脂肪变性。

某些靶向DGAT2核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_032564.2之序列(收入本文作为SEQ ID NO：10)的DGAT2核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10的短反义化合物与SEQ ID NO：10至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10的短反义化合物与SEQ ID NO：10至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10的短反义化合物与SEQ ID NO：10 100％互补。在某些实施方案中，靶向SEQID NO：10的短反义化合物包含选自表14和表15所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表14和表15的各SEQ ID NO所列核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，包含表14和表15所列核苷酸序列的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表14和表15列举了靶向SEQ ID NO：10的短反义化合物的例子。表14列举了与SEQ ID NO：10 100％互补的短反义化合物。表15列举了相对于SEQ IDNO：10具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表14：靶向SEQ ID NO：10的短反义化合物

 

ISIS NO.	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						372556	231	244	ATGAGGGTCTTCAT	2-10-2 MOE	681
372557	249	262	ACCCCGGAGTAGGC	2-10-2 MOE	682
						382601	249	260	CCCGGAGTAGGC	1-10-1 MOE	683
372480	251	266	CAGGACCCCGGAGTAG	3-10-3 MOE	684
						372481	252	267	GCAGGACCCCGGAGTA	3-10-3 MOE	685
372558	252	265	AGGACCCCGGAGTA	2-10-2 MOE	686
						372559	253	266	CAGGACCCCGGAGT	2-10-2 MOE	687
382603	331	342	CAGACCCCTCGC	1-10-1 MOE	688

 

382604	361	372	AGAGGATGCTGG	1-10-1 MOE	689
						372485	392	407	GAGCCAGGTGACAGAG	3-10-3 MOE	690
372563	393	406	AGCCAGGTGACAGA	2-10-2 MOE	691
						382605	397	408	TGAGCCAGGTGA	1-10-1 MOE	692
372565	414	427	TTTTCCACCTTGGA	2-10-2 MOE	693
						382606	482	493	CTGCAGGCCACT	1-10-1 MOE	694
372497	651	666	TCACCAGCTGGATGGG	3-10-3 MOE	695
						372498	652	667	TTCACCAGCTGGATGG	3-10-3 MOE	696
372575	652	665	CACCAGCTGGATGG	2-10-2 MOE	697
						372576	653	666	TCACCAGCTGGATG	2-10-2 MOE	698
382607	655	666	TCACCAGCTGGA	1-10-1 MOE	699
						372499	656	671	TGTCTTCACCAGCTGG	3-10-3 MOE	700
372577	657	670	GTCTTCACCAGCTG	2-10-2 MOE	701
						372500	659	674	GTGTGTCTTCACCAGC	3-10-3 MOE	702
372578	660	673	TGTGTCTTCACCAG	2-10-2 MOE	703
						372501	661	676	TTGTGTGTCTTCACCA	3-10-3 MOE	704
372579	662	675	TGTGTGTCTTCACC	2-10-2 MOE	705
						372502	664	679	AGGTTGTGTGTCTTCA	3-10-3 MOE	706
372580	665	678	GGTTGTGTGTCTTC	2-10-2 MOE	707
						372503	666	681	GCAGGTTGTGTGTCTT	3-10-3 MOE	708
372581	667	680	CAGGTTGTGTGTCT	2-10-2 MOE	709
						372504	669	684	TCAGCAGGTTGTGTGT	3-10-3 MOE	710
372582	670	683	CAGCAGGTTGTGTG	2-10-2 MOE	711
						372505	671	686	GGTCAGCAGGTTGTGT	3-10-3 MOE	712
372506	672	687	TGGTCAGCAGGTTGTG	3-10-3 MOE	713
						372583	672	685	GTCAGCAGGTTGTG	2-10-2 MOE	714
372584	673	686	GGTCAGCAGGTTGT	2-10-2 MOE	715
						372507	676	691	CTGGTGGTCAGCAGGT	3-10-3 MOE	716
372585	677	690	TGGTGGTCAGCAGG	2-10-2 MOF	717
						382608	680	691	CTGGTGGTCAGC	1-10-1 MOE	718
372508	681	696	AGTTCCTGGTGGTCAG	3-10-3 MOE	719
						372586	682	695	GTTCCTGGTGGTCA	2-10-2 MOE	720
372509	684	699	TATAGTTCCTGGTGGT	3-10-3 MOE	721
						372587	685	698	ATAGTTCCTGGTGG	2-10-2 MOE	722
372510	686	70I	GATATAGTTCCTGGTG	3-10-3 MOE	723

 

372588	687	700	ATATAGTTCCTGGT	2-10-2 MOE	724
						372511	691	706	CCAAAGATATAGTTCC	3-10-3 MOE	725
372512	692	707	TCCAAAGATATAGTTC	3-10-3 MOE	726
						372589	692	705	CAAAGATATAGTTC	2-10-2 MOE	727
372590	693	706	CCAAAGATATAGTT	2-10-2 MOE	728
						382609	724	735	CCAGGCCCATGA	1-10-1 MOE	729
372514	725	740	GGCACCCAGGCCCATG	3-10-3 MOE	730
						372592	726	739	GCACCCAGGCCCAT	2-10-2 MOE	731
372515	730	745	CAGAAGGCACCCAGGC	3-10-3 MOE	732
						372593	731	744	AGAAGGCACCCAGG	2-10-2 MOE	733
382610	851	862	CCAGACATCAGG	1-10-1 MOE	734
						382611	867	878	GACAGGGCAGAT	1-10-1 MOE	735
382602	868	879	TGACAGGGCAGA	1-10-1 MOE	736
						382612	911	922	CCACTCCCATTC	1-10-1 MOE	737
372524	965	980	GCCAGGCATGGAGCTC	3-10-3 MOE	738
						372602	966	979	CCAGGCATGGAGCT	2-10-2 MOE	739
382613	968	979	CCAGGCATGGAG	1-10-1 MOE	740
						382614	987	998	CAGGGTGACTGC	1-10-1 MOE	741
372525	989	1004	GTTCCGCAGGGTGACT	3-10-3 MOE	742
						372603	990	1003	TTCCGCAGGGTGAC	2-10-2 MOE	743
372526	992	1007	GCGGTTCCGCAGGGTG	3-10-3 MOE	744
						372604	993	1006	CGGTTCCGCAGGGT	2-10-2 MOE	745
372530	1106	1121	TCGGCCCCAGGAGCCC	3-10-3 MOE	746
						372608	1107	1120	CGGCCCCAGGAGCC	2-10-2 MOE	747
372531	1109	1124	CCATCGGCCCCAGGAG	3-10-3 MOE	748
						372609	1110	1123	CATCGGCCCCAGGA	2-10-2 MOE	749
372532	1112	1127	GACCCATCGGCCCCAG	3-10-3 MOE	750
						372610	1113	1126	ACCCATCGGCCCCA	2-10-2 MOE	751
372533	1117	1132	TTCTGGACCCATCGGC	3-10-3 MOE	752
						382615	1117	1128	GGACCCATCGGC	1-10-1 MOE	753
372611	1118	1131	TCTGGACCCATCGG	2-10-2 MOE	754
						372536	1199	1214	CACCAGCCCCCAGGTG	3-10-3 MOE	755
372614	1200	1213	ACCAGCCCCCAGGT	2-10-2 MOE	756
						372537	1204	1219	TAGGGCACCAGCCCCC	3-10-3 MOE	757
372615	1205	1218	AGGGCACCAGCCCC	2-10-2 MOE	758

 

372538	1209	1224	TGGAGTAGGGCACCAG	3-10-3 MOE	759
						372616	1210	1223	GGAGTAGGGCACCA	2-10-2 MOE	760
382616	1215	1226	CTTGGAGTAGGG	1-10-1 MOE	761
						372539	1218	1233	TGATGGGCTTGGAGTA	3-10-3 MOE	762
372617	1219	1232	GATGGGCTTGGAGT	2-10-2 MOE	763
						372540	1293	1308	TGTGGTACAGGTCGAT	3-10-3 MOE	764
372618	1294	1307	GTGGTACAGGTCGA	2-10-2 MOE	765
						382617	1294	1305	GGTACAGGTCGA	1-10-1 MOE	766
372541	1295	1310	GGTGTGGTACAGGTCG	3-10-3 MOE	767
						372619	1296	1309	GTGTGGTACAGGTC	2-10-2 MOE	768
372542	1298	1313	CATGGTGTGGTACAGG	3-10-3 MOE	769
						372620	1299	1312	ATGGTGTGGTACAG	2-10-2 MOE	770
372543	1300	1315	TACATGGTGTGGTACA	3-10-3 MOE	771
						372621	1301	1314	ACATGGTGTGGTAC	2-10-2 MOE	772
372544	1303	1318	ATGTACATGGTGTGGT	3-10-3 MOE	773
						372622	1304	1317	TGTACATGGTGTGG	2-10-2 MOE	774
382618	1313	1324	GCCTCCATGTAC	1-10-1 MOE	775
						382619	1325	1336	AGCTTCACCAGG	1-10-1 MOE	776
382620	1383	1394	GTTCACCTCCAG	1-10-1 MOE	777

表15：靶向SEQ ID NO：10且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISIS NO	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						372608	151	164	CGGCCCCAGGAGCC	2-10-2 MOE	747
372474	156	171	CATGCCCCAGCCGCCG	3-10-3 MOE	778
						372552	157	170	ATGCCCCAGCCGCC	2-10-2 MOE	779
382609	167	178	CCAGGCCCATGA	1-10-1 MOE	729
						372478	230	245	GATGAGGGTCTTCATG	3-10-3 MOE	780
372479	248	263	GACCCCGGAGTAGGCA	3-10-3 MOE	781
						382611	317	328	GACAGGGCAGAT	1-10-1 MOE	735
372483	352	367	ATGCTGGAGCCAGTGC	3-10-3 MOE	782
						372561	353	366	TGCTGGAGCCAGTG	2-10-2 MOE	783
372562	373	386	GTCTTGGAGGGCCG	2-10-2 MOE	784
						382602	388	399	TGACAGGGCAGA	1-10-1 MOE	736

 

372613	392	405	CCCAGGTGTCAGAG	2-10-2 MOE	785
						372486	412	427	TTTTCCACCTTGGATC	3-10-3 MOE	786
372564	413	426	TTTCCACCTTGGAT	2-10-2 MOE	787
						372487	413	428	TTTTTCCACCTTGGAT	3-10-3 MOE	788
372488	418	433	AGGTGTTTTTCCACCT	3-10-3 MOE	789
						372566	419	432	GGTGTTTTTCCACC	2-10-2 MOE	790
372489	459	474	CCAGGAAGGATAGGAC	3-10-3 MOE	791
						372567	460	473	CAGGAAGGATAGGA	2-10-2 MOE	792
382612	475	486	CCACTCCCATTC	1-10-1 MOE	737
						372490	483	498	TGACACTGCAGGCCAC	3-10-3 MOE	793
372568	484	497	GACACTGCAGGCCA	2-10-2 MOE	794
						372491	492	507	ACATGAGGATGACACT	3-10-3 MOE	795
372569	493	506	CATGAGGATGACAC	2-10-2 MOE	796
						372492	503	518	GCAGAAGGTGTACATG	3-10-3 MOE	797
372570	504	517	CAGAAGGTGTACAT	2-10-2 MOE	798
						372493	512	527	GCAGTCAGTGCAGAAG	3-10-3 MOE	799
372571	513	526	CAGTCAGTGCAGAA	2-10-2 MOE	800
						372496	612	627	ACACGGCCCAGTTTCG	3-10-3 MOE	801
372574	613	626	CACGGCCCAGTTTC	2-10-2 MOE	802
						372513	717	732	GGCCCATGATGCCATG	3-10-3 MOE	803
372591	718	731	GCCCATGATGCCAT	2-10-2 MOE	804
						372516	732	747	TACAGAAGGCACCCAG	3-10-3 MOE	805
372594	733	746	ACAGAAGGCACCCA	2-10-2 MOE	806
						372518	812	827	GAAGTTGCCAGCCAAT	3-10-3 MOE	807
372596	813	826	AAGTTGCCAGCCAA	2-10-2 MOE	808
						372560	863	876	CAGGGCAGATCCTT	2-10-2 MOE	809
372519	887	902	CAAGTAGTCTATGGTG	3-10-3 MOE	810
						372597	888	901	AAGTAGTCTATGGT	2-10-2 MOE	811
372520	894	909	TGGAAAGCAAGTAGTC	3-10-3 MOE	812
						372598	895	908	GGAAAGCAAGTAGT	2-10-2 MOE	813
372527	1013	1028	GGCCAGCTTTACAAAG	3-10-3 MOE	814
						372605	1014	1027	GCCAGCTTTACAAA	2-10-2 MOE	815
372606	1020	1033	CGCAGGGCCAGCTT	2-10-2 MOE	816
						372529	1052	1067	AAAGGAATAGGTGGGA	3-10-3 MOE	817
372607	1053	1066	AAGGAATAGGTGGG	2-10-2 MOE	818

 

372534	1144	1159	GCGAAACCAATATACT	3-10-3 MOE	819
						372612	1145	1158	CGAAACCAATATAC	2-10-2 MOE	820
372535	1192	1207	CCCCAGGTGTCAGAGG	3-10-3 MOE	821
						372613	1193	1206	CCCAGGTGTCAGAG	2-10-2 MOE	822
372545	1332	1347	GATTGTCAAAGAGCTT	3-10-3 MOE	823
						372623	1333	1346	ATTGTCAAAGAGCT	2-10-2 MOE	824
372546	1342	1357	TTGGTCTTGTGATTGT	3-10-3 MOE	825
						372624	1343	1356	TGGTCTTGTGATTG	2-10-2 MOE	826
372547	1352	1367	AAGGCCGAATTTGGTC	3-10-3 MOE	827
						372625	1353	1366	AGGCCGAATTTGGT	2-10-2 MOE	828
382601	1617	1628	CCCGGAGTAGGC	1-10-1 MOE	683
						382606	1971	1982	CTGCAGGCCACT	1-10-1 MOE	694
382612	1988	1999	CCACTCCCATTC	1-10-1 MOE	737

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸231-267。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸231-267。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸231-267的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 681、682、683、684、685、686、或687的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸231-267的短反义化合物选自Isis No 372556、372557、382601、372480、372481、372558、或372559。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸249-267。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸249-267。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸249-267的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 683、684、685、686、或687的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：10核苷酸249-267的短反义化合物选自Isis No 382601、372480、372481、372558、或372559。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸331-493。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸331-493。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸331-493的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 688、689、690、691、692、693、或694的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸331-493的短反义化合物选自Isis No 382603、382604、372485、372563、382605、372565、或382606。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸331-427。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸331-427。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸331-427的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 688、689、690、691、692、或693的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸331-427的短反义化合物选自Isis No 382603、382604、372485、372563、382605、或372565。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸392-408。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸392-408。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸392-408的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 690、691、或692的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸392-408的短反义化合物选自Isis No 372485、372563、或382605。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸651-707。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸651-707。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸651-707的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 695、696、697、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、或728的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸651-707的短反义化合物选自Isis No372497、372498、372575、372576、382607、372499、372577、372500、372578、372501、372579、372502、372580、372503、372581、372504、372582、372505、372506、372583、372584、372507、372585、382608、372508、372586、372509、372587、372510、372588、372511、372512、372589、或372590。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸724-745。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸724-745。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸724-745的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 729、730、731、732、或733的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：10核苷酸724-745的短反义化合物选自Isis No 382609、372514、372592、372515、或372593。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸651-745。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸651-745。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸651-745的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 695、696、697、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、728、729、730、731、732、或733的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸651-745的短反义化合物选自Isis No 372497、372498、372575、372576、382607、372499、372577、372500、372578、372501、372579、372502、372580、372503、372581、372504、372582、372505、372506、372583、372584、372507、372585、382608、372508、372586、372509、372587、372510、372588、372511、372512、372589、372590、382609、372514、372592、372515、或372593。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸851-922。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸851-922。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸的短反义化合物851-922包含选自SEQ ID NO 734、735、736、或737的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸851-922的短反义化合物选自Isis No 382610、382611、382602、或382612。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸851-879。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸851-879。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸851-879的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 734、735、或736的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸851-879的短反义化合物选自Isis No 382610、382611、或382602。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸965-1007。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸965-1007。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸965-1007的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 738、739、740、741、742、743、744、或745的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸965-1007的短反义化合物选自Isis No372524、372602、382613、382614、372525、372603、372526、或372604。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸965-979。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸965-979。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸965-979的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 738、739、或740的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸965-979的短反义化合物选自Isis No 372524、372602、或382613。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸987-1007。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸987-1007。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸987-1007的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 741、742、743、744、或745的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：10核苷酸987-1007的短反义化合物选自Isis No 382614、372525、372603、372526、或372604。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸1106-1132。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸1106-1132。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1106-1132的短反义化合物包含选自SEQ ID NO746、747、748、749、750、751、752、753、或754的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸1106-1132的短反义化合物选自Isis No 372530、372608、372531、372609、372532、372610、372533、382615、或372611。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸1199-1233。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸1199-1233。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1199-1233的短反义化合物包含选自SEQ ID NO755、756、757、758、759、760、761、762、或763的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸1199-1233的短反义化合物选自Isis No 372536、372614、372537、372615、372538、372616、382616、372539、或372617。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1394。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1394。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1293-1394的短反义化合物包含选自SEQ ID NO764、765、766、767、768、769、770、771、772、773、774、775、776、或777的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸1293-1394的短反义化合物选自Isis No 372540、372618、382617、372541、372619、372542、372620、372543、372621、372544、372622、382618、382619、或382620。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1336。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1336。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1293-1336的短反义化合物包含选自SEQ ID NO764、765、766、767、768、769、770、771、772、773、774、775、或776的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸1293-1336的短反义化合物选自Isis No 372540、372618、382617、372541、372619、372542、372620、372543、372621、372544、372622、382618、或382619。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1324。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：10的核苷酸1293-1324。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1293-1324的短反义化合物包含选自SEQ ID NO764、765、766、767、768、769、770、771、772、773、774、或775的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：10核苷酸1293-1324的短反义化合物选自Isis No 372540、372618、382617、372541、372619、372542、372620、372543、372621、372544、372622、或382618。

在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向DGAT2核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致短反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控DGAT2表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向DGAT2核酸的短反义化合物，其中所述靶向DGAT2核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物来调控DGAT2表达的方法。

在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长8个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长9个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长10个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长11个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长12个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长13个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长14个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长15个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2的方法包括使用长16个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控DGAT2表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控DGAT2表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向DGAT2核酸的短反义化合物。

9.PTP1B

PTP1B(也称为蛋白质磷酸酶1B和PTPN1)是一种内质网(ER)相关酶，最初作为人类胎盘的主要蛋白质酪氨酸磷酸酶得到分离(Tonks等，J.Biol.Chem.，1988，263，6731-6737；Tonks等，J.Biol.Chem.，1988，263，6722-6730)。

已经为PTP1B建立了由胰岛素受体介导的信号传导中的重要调节作用。在某些情况中，PTP1B在体外和在完整细胞中与活化的胰岛素受体相互作用和将活化的胰岛素受体去磷酸化，导致信号传导途径的下调(Goldstein等，Mol.Cell.Biochem.，1998，182，91-99；Seely等，Diabetes，1996，45，1379-1385)。另外，PTP1B调控胰岛素的促有丝分裂作用(Goldstein等，Mol.Cell.Biochem.，1998，182，91-99)。在过表达PTP1B的大鼠脂肪细胞中，GLUT4葡萄糖转运蛋白的易位受到抑制，暗示PTP1B也作为葡萄糖转运的负调节物(Chen等，J.Biol.Chem.，1997，272，8026-8031)。

缺乏PTP1B基因的小鼠敲除模型也指向PTP1B对胰岛素信号传导的负调节。包含遭到破坏的PTP1B基因的小鼠显示出胰岛素敏感性升高和胰岛素受体磷酸化升高。在接受高脂肪饮食时，PTP1B-/-小鼠对体重增加有抗性，而且维持胰岛素敏感(Elchebly等，Science，1999，283，1544-1548)。这些研究清楚地确立了PTP1B在糖尿病和肥胖症的治疗中作为治疗靶。

糖尿病和肥胖症(现在有时统称为“糖尿-肥胖”(diabesity))是相关的。大多数人类肥胖与胰岛素抗性和来普汀(leptin)抗性有关。事实上，肥胖症甚至可具有比糖尿病本身更大的对胰岛素作用的影响(Sindelka等，Physiol Res.，2002，51，85-91)。综合征X或代谢综合征是如下一组状况的新术语，该组状况在一起发生时可指示对糖尿病和心血管疾病的素因(predisposition)。这些症状(包括高血压、高甘油三酯、HDL降低和肥胖)在有些个体中趋向于一起出现。由于它在糖尿病和肥胖症二者中的作用，认为PTP1B是一系列代谢疾患(包括糖尿病、肥胖症和代谢综合征)的治疗靶。通过改进血液葡萄糖控制，PTP1B的抑制剂也可用于减缓、预防、延迟或改善糖尿病的后遗症(sequelae)，包括视网膜病、神经病、心血管并发症和肾病。

PTP1B(其在细胞周期期间受到差异调节)(Schievella等，Cell.GrowthDiffer.，1993，4，239-246)在胰岛素敏感性组织中表达，其形式为源自前mRNA可变剪接的两种不同同等型(isoform)(Shifrin and Neel，J.Biol.Chem.，1993，268，25376-25384)。可变剪接产物的比例受到生长因子(诸如胰岛素)的影响，而且在所检查的各种组织中不同(Sell和Reese，Mol.Genet.Metab.，1999，66，189-192)。在这些研究中，变体的水平与血浆胰岛素浓度和百分比身体脂肪有关。这些变体因此可用作具有慢性高胰岛素血症或2型糖尿病的患者的生物标志物。

定义

“蛋白质酪氨酸磷酸酶1B”指其表达将要通过施用短反义化合物来调控的基因产物或蛋白质。蛋白质酪氨酸磷酸酶1B一般称为PTP1B，但是也可称为蛋白质酪氨酸磷酸酶；PTPN1；RKPTP；蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体1型。

“PTP1B核酸”指编码PTP1B的任何核酸。例如，在某些实施方案中，PTP1B核酸包括但不限于编码PTP1B的DNA序列、自编码PTP1B的DNA转录得到的RNA序列、和编码PTP1B的mRNA序列。“PTP1B mRNA”指编码PTP1B蛋白的mRNA。

治疗适应症

反义技术是降低PTP1B表达的有效手段，而且已经证明在许多治疗、诊断、和研究应用中独特地有效。因此，在某些实施方案中，本发明提供了靶向编码PTP1B的核酸且调控PTP1B表达的化合物。本文还提供了能够有效抑制PTP1B表达的短反义化合物。

在某些治疗中，怀疑具有可通过调控PTP1B表达来治疗的疾病或病症的受试者通过施用一种或多种靶向编码PTP1B的核酸的短反义化合物来治疗。例如，在一个非限制性实施方案中，所述方法包括给动物施用治疗有效量的短反义化合物的步骤。本发明的短反义化合物有效抑制PTP1B的活性或抑制PTP1B的表达。在一个实施方案中，受试者中PTP1B的活性或表达抑制了至少10％、至少20％、至少25％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％、或100％。在某些实施方案中，受试者中PTP1B的活性或表达抑制了大约30％。在某些实施方案中，受试者中PTP1B的活性或表达抑制了大约50％或更多。

PTP1B表达的降低可例如在动物的血液、血浆、血清、脂肪组织、肝或任何其它体液、组织、或器官中测量。优选地，所分析的所述体液、组织或器官中所包含的细胞包含编码PTP1B的核酸和/或PTP1B蛋白本身。

还提供了包含本发明化合物的某些药物组合物和其它组合物。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物用于药物组合物，即将有效量的化合物添加至合适的药学可接受稀释剂或载体。

靶向PTP1B的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的任一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

在某些实施方案中，本文提供了通过施用一种或多种靶向PTP1B核酸的短反义化合物或包含此类化合物的药物组合物来治疗个体的方法。还提供了通过施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来治疗具有与PTP1B活性有关的疾病或疾患的受试者的方法。与PTP1B有关的疾病和疾患包括但不限于高血液葡萄糖或高血糖症、前驱糖尿病、糖尿病、2型糖尿病、代谢综合征、肥胖症和胰岛素抗性。因此，本文提供了通过施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来治疗高血液葡萄糖或高血糖症、前驱糖尿病、糖尿病、2型糖尿病、代谢综合征、肥胖症和胰岛素抗性的方法。

在某些实施方案中，本发明提供了用于降低受试者中的血液葡萄糖水平或者用于预防或延迟受试者中血液葡萄糖水平升高发作的组合物和方法，其通过给受试者施用PTP1B表达的短反义抑制剂来实现。

在某些实施方案中，本发明提供了用于改进受试者中的胰岛素敏感性或者用于预防或延迟受试者中胰岛素抗性发作的组合物和方法，其通过给受试者施用PTP1B表达的短反义抑制剂来实现。

在某些实施方案中，本发明提供了用于治疗受试者中的代谢疾患或者用于预防或延迟受试者中代谢病症发作的组合物和方法，其通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来实现。此类代谢疾患可以是任何与PTP1B表达有关的代谢疾患，包括但不限于糖尿病和肥胖症。还提供了减轻肥胖的方法。还提供了治疗肥胖症的方法，其中代谢速率提高了。

在某些实施方案中，所述受试者具有2型糖尿病。在某些实施方案中，所述受试者展现出HbA1c水平升高。在某些实施方案中，HbA1c水平是至少大约6％、至少大约7％、至少大约8％、至少大约9％、至少大约10％或至少大约11％。在优选的实施方案中，HbA1c水平降低至大约7％或低于大约7％。在某些实施方案中，所述受试者展现出体重指数升高。在某些实施方案中，所述升高的体重指数大于25kg/m²。在某些实施方案中，所述受试者展现出高血糖症或升高的血液葡萄糖水平。在一个具体的实施方案中，所述血液葡萄糖水平是禁食血液葡萄糖水平。在某些实施方案中，所述升高的禁食血液葡萄糖水平是至少130mg/dL。在某些实施方案中，所述受试者在开始治疗之前展现出高血糖症或者展现出禁食血液葡萄糖水平大于大约130mg/dL、基线HbA_1c水平为至少大约7％、或体重指数大于25kg/m²或其任何组合。

在某些实施方案中，提供了通过施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来降低一种或多种此类水平的方法。例如，提供了通过给受试者施用靶向PTP1B的短反义化合物来降低受试者中的禁食葡萄糖水平、HbA_1c水平、或体重指数水平或其任何组合的方法。禁食葡萄糖可以是禁食血液葡萄糖、禁食血清葡萄糖、或禁食血浆葡萄糖。在有些实施方案中，禁食血浆葡萄糖水平降低了至少大约25mg/dL或至少大约10mg/dL。在某一个实施方案中，所述受试者在接受降葡萄糖剂(诸如胰岛素、磺酰脲、或二甲双胍)的治疗方案时没有实现正常葡萄糖水平。

在某些实施方案中，本发明提供了改变脂质水平的方法。某些此类方法通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来降低受试者中的胆固醇、LDL和/或VLDL水平或其任何组合。在某些实施方案中，通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来提高受试者中的HDL水平。在某些实施方案中，通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来降低受试者中的LDL:HDL比和/或总胆固醇:HDL比。在某些实施方案中，通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来提高受试者中的HDL:LDL比和/或HDL:总胆固醇比。在某些实施方案中，通过给受试者施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物来提高HDL、降低LDL、降低VLDL、降低甘油三酯、降低载脂蛋白B水平、或降低总胆固醇水平或其组合，从而改进脂质序型。在此类实施方案中，所述受试者是动物，包括人类。

联合疗法

在某些实施方案中，一种或多种包含靶向PTP1B核酸的短反义化合物的药物组合物与一种或多种其它药剂共施用。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗相同疾病或疾患。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同疾病或病症。在某些实施方案中，所述一种或多种其它药剂设计用于治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物与另一药剂共施用以治疗所述另一药剂的不良效应。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在相同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在不同时间施用。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂在单一配制剂中一起制备。在某些实施方案中，一种或多种本发明的药物组合物和一种或多种其它药剂分开制备。

在某些实施方案中，可以与包含靶向PTP1B核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂包括降葡萄糖药剂和疗法。在有些实施方案中，所述降葡萄糖剂是PPAR激动剂(γ、双重、或泛)、二肽基肽酶(IV)抑制剂、GLP-1类似物、胰岛素或胰岛素类似物、胰岛素促分泌剂(secretagogue)、SGLT2抑制剂、人类胰淀素(amylin)类似物、双胍、α-葡萄糖苷酶抑制剂、氨茴苯酸(meglitinide)、噻唑烷二酮、或磺酰脲。

在有些实施方案中，所述降葡萄糖治疗是GLP-1类似物。在有些实施方案中，所述GLP-1类似物是Exendin-4或利拉鲁肽(liraglutide)。

在其它实施方案中，所述降葡萄糖治疗是磺酰脲。在有些实施方案中，所述磺酰脲是醋磺己脲(acetohexamide)、氯磺丙脲(chlorpropamide)、甲苯磺丁脲(tolbutamide)、妥拉磺脲(tolazamide)、格列美脲(glimepiride)、格列吡嗪(glipizide)、格列本脲(glyburide)、或格列奇特(gliclazide)。

在有些实施方案中，所述降葡萄糖药物是双胍。在有些实施方案中，所述双胍是二甲双胍(metformin)，而在有些实施方案中，血液葡萄糖水平降低且乳酸性酸中毒与单独用二甲双胍治疗后观察到的乳酸性酸中毒相比没有增加。

在有些实施方案中，所述降葡萄糖药物是氨茴苯酸。在有些实施方案中，所述氨茴苯酸是那格列奈(nateglinide)或瑞格列奈(repaglinide)。

在有些实施方案中，所述降葡萄糖药物是噻唑烷二酮。在有些实施方案中，所述噻唑烷二酮是吡格列酮(pioglitazone)、罗西格列酮(rosiglitazone)、或曲格列酮(troglitazone)。在有些实施方案中，血液葡萄糖水平降低且没有比单独用罗西格列酮治疗时所观察到的更大的体重增加。

在有些实施方案中，所述降葡萄糖药物是α-葡萄糖苷酶抑制剂。在有些实施方案中，所述α-葡萄糖苷酶抑制剂是阿卡波糖(acarbose)或米格列醇(miglitol)。

在某一个实施方案中，共施用的降葡萄糖剂是ISIS 113715。

在某一个实施方案中，降葡萄糖疗法是治疗性生活方式改变。

在某些此类实施方案中，所述降葡萄糖剂在施用本发明的药物组合物之前施用。在某些此类实施方案中，所述降葡萄糖剂在施用本发明的药物组合物之后施用。在某些此类实施方案中，所述降葡萄糖剂与本发明的药物组合物同时施用。在某些此类实施方案中，降葡萄糖剂的共施用剂量与单独施用该降葡萄糖剂时会施用的剂量相同。在某些此类实施方案中，降葡萄糖剂的共施用剂量低于单独施用该降葡萄糖剂时会施用的剂量。在某些此类实施方案中，降葡萄糖剂的共施用剂量大于单独施用该降葡萄糖剂时会施用的剂量。

在某些实施方案中，可以与包含靶向PTP1B核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂包括降脂剂。此类降脂剂在本申请的其它部分讨论，而且在此处在PTP1B方面是包括在内的。此类降脂剂可以像上文关于降葡萄糖剂所述那样施用。

在某些实施方案中，可以与包含靶向PTP1B核酸的短反义化合物的药物组合物共施用的药剂包括减肥药治疗剂。此类减肥药治疗剂可以像上文关于降葡萄糖剂所述那样施用。

还提供了经注射施用靶向PTP1B核酸的短反义化合物的方法，进一步包括在注射部位施用表面类固醇。

药物

本文中还提供了靶向PTP1B核酸的短反义化合物用于制备用于降低血液葡萄糖水平(包括禁食葡萄糖水平)、和HbA_1c水平、体重指数水平或其任意组合的药物的用途。所述药物可以在加载期(loading period)和维持期(maintenance period)期间施用。在有些实施方案中，所述药物皮下或静脉内施用。在其它实施方案中，所述药物的施用至少每天一次、至少每周一次、或至少每月一次。在一个具体的实施方案中，所述药物中所存在的短反义化合物以低于具有更长序列(特别是20个或更多个核碱基的序列)的短反义化合物的剂量施用。所述药物可以施用于展现出高血液葡萄糖或高血糖症、前驱糖尿病、糖尿病、2型糖尿病、代谢综合征、肥胖症和胰岛素抗性的受试者。

本文提供了短反义化合物的其它方面和优点。本文中所披露的和特别是关于其它靶的所有方面和优点在包含靶向PTP1B核酸的短反义化合物的组合物及其使用方法方面是适用的。

某些靶向PTP1B核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_002827.2之序列(收入本文作为SEQ ID NO：11)或

编号NT_011362.9之序列的核苷酸14178000至1425600(收入本文作为SEQ ID NO：12)的PTP1B核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物与SEQ ID NO：11至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11的短反义化合物与SEQ ID NO：11至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物与SEQ ID NO：11 100％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：12的短反义化合物与SEQ ID NO：12至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：12的短反义化合物与SEQ ID NO：12至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：12的短反义化合物与SEQ ID NO：12 100％互补。

在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物包含选自表16和表17所列核苷酸序列的核苷酸序列。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：12的短反义化合物包含选自表18和表19所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表16、表17、表18和表19各自所列各核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，包含表16、表17、表18和表19所列核苷酸序列的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表16和表17列举了靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物的例子。表16列举了与SEQ ID NO：11 100％互补的短反义化合物。表17列举了相对于SEQ IDNO：11具有一处或两处错配的短反义化合物。表18列举了与SEQ ID NO：12100％互补的短反义化合物。表19列举了相对于SEQ ID NO：12具有一处或两处错配的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”’指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

表16：靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物

 

ISISNO.

5’靶位点

3’靶位点

序列(5’-3’)

缺口聚物基序

SEQ IDNO

 

147022	177	188	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147023	178	189	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147024	179	190	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147019	195	206	TCGATCTCCTCG	1-10-1 MOE	877
147020	196	207	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
						147021	197	208	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
147022	198	209	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147023	199	210	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147024	200	211	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147025	201	212	GCCTTGTCGATC	1-10-1 MOE	865
147026	202	213	AGCCTTGTCGAT	1-10-1 MOE	835
						147027	203	214	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
147028	204	215	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
						147073	204	215	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147029	205	216	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
						147030	206	217	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147036	212	223	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147037	213	224	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
147038	214	225	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
						147039	215	226	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
147040	216	227	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
						147041	217	228	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
147073	311	322	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147042	323	334	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
147043	324	335	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
						147044	325	336	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
147045	326	337	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147046	327	338	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147047	328	339	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147051	332	343	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147052	333	344	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147053	334	345	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147054	335	346	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
						147055	336	347	TTAATCCGACTG	1-10-1 MOE	884
147056	337	348	TTTAATCCGACT	1-10-1 MOE	887

 

147057	338	349	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147058	339	350	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147059	340	351	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
						147060	341	352	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
147061	342	353	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147045	679	690	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147046	680	691	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147045	787	798	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147046	788	799	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147066	816	827	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
404131	992	1005	ACCTTCGATCACAG	2-10-2 MOE	831
						147062	1024	1035	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
147063	1025	1036	GCACTGACGAGT	1-10-1 MOE	862
						147064	1026	1037	TGCACTGACGAG	1-10-1 MOE	880
147065	1027	1038	CTGCACTGACGA	1-10-1 MOE	857
						147066	1028	1039	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
147067	1029	1040	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
						147068	1030	1041	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147069	1031	1042	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147070	1032	1043	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
147071	1033	1044	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147072	1034	1045	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147073	1035	1046	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147067	1199	1210	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
147040	1288	1299	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
						147040	1396	1407	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147022	1868	1879	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147023	1869	1880	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147024	1870	1881	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147019	1886	1897	TCGATCTCCTCG	1-10-1 MOE	877
147020	1887	1898	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
						147021	1888	1899	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
147022	1889	1900	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147023	1890	1901	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147025	1892	1903	GCCTTGTCGATC	1-10-1 MOE	865

 

147027	1894	1905	CAGCCTTGTCGA	1-10-1MOE	843
						147028	1895	1906	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147030	1897	1908	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147037	1904	1915	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
147038	1905	1916	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
						147040	1907	1918	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147041	1908	1919	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
						147022	1976	1987	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
147023	1977	1988	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
						147024	1978	1989	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
147020	1995	2006	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
						147021	1996	2007	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
147022	1997	2008	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147023	1998	2009	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147024	1999	2010	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147025	2000	2011	GCCTTGTCGATC	1-10-1 MOE	865
147026	2001	2012	AGCCTTGTCGAT	1-10-1 MOE	835
						147027	2002	2013	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
147028	2003	2014	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
						147029	2004	2015	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
147030	2005	2016	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147036	2011	2022	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147037	2012	2023	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
						147038	2013	2024	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
147039	2014	2025	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
						147040	2015	2026	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147041	2016	2027	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
						404199	2366	2379	GGTCATGCACAGGC	2-10-2 MOE	867
404134	2369	2382	TCAGGTCATGCACA	2-10-2 MOE	873
						404132	2548	2561	CCTTGGAATGTCTG	2-10-2 MOE	852
147020	2613	2624	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
						147020	2721	2732	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
404133	3289	3302	TATTCCATGGCCAT	2-10-2 MOE	872
						147032	6220	6231	GTTCCCAGCCTT	1-10-1 MOE	870
147033	6221	6232	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836

 

147034	6222	6233	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
						147044	6288	6299	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
147045	6289	6300	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147032	6329	6340	GTTCCCAGCCTT	1-10-1 MOE	870
147033	6330	6341	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836
						147034	6331	6342	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
147044	6397	6408	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147045	6398	6409	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147058	7057	7068	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147059	7058	7069	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
147060	7059	7070	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
						147058	7166	7177	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147059	7167	7178	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
						147041	8084	8095	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
147041	8192	8203	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
						147027	8630	8641	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
147028	8631	8642	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
						147027	8738	8749	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
147028	8739	8750	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
						147043	10957	10968	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147044	10958	10969	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147043	11065	11076	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147044	11066	11077	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147071	11605	11616	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147070	11611	11622	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
						147071	11612	11623	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147072	12294	12305	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
						147072	12299	12310	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147030	12805	12816	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147031	12806	12817	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
147053	12939	12950	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
						147030	12986	12997	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147031	12987	12998	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
						147053	13120	13131	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147051	13162	13173	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875

 

147061	13316	13327	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147047	13339	13350	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147029	14058	14069	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
						147029	14239	14250	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
147067	15560	15571	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
						147068	15561	15572	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147067	15742	15753	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
						147069	15744	15755	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
147042	16561	16572	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
						147042	16727	16738	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
147030	17619	17630	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147064	17762	17773	TGCACTGACGAG	1-10-1 MOE	880
147030	17787	17798	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147064	17930	17941	TGCACTGACGAG	1-10-1 MOE	880
147042	19201	19212	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
						147042	19369	19380	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
147027	21190	21201	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
						147028	21191	21202	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147027	21358	21369	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
						147028	21359	21370	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147070	22021	22032	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
						147070	22189	22200	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
147047	22606	22617	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147043	24318	24329	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147044	24319	24330	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147045	24320	24331	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147046	24321	24332	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147043	24486	24497	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147044	24487	24498	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147046	24489	24500	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147047	24490	24501	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147040	25065	25076	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147041	25066	25077	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
						147046	25160	25171	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147039	25232	25243	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850

 

147040	25233	25244	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
						147041	25234	25245	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
147046	25328	25339	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147057	25508	25519	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147061	25512	25523	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147057	25676	25687	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147069	28878	28889	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147070	28879	28890	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
147053	30133	30144	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
						147053	30278	30289	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147054	30864	30875	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
						147043	30985	30996	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147054	31011	31022	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
						147043	31133	31144	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147036	32233	32244	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147072	32372	32383	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147072	32520	32531	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
						147069	33056	33067	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
147070	33057	33068	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
						147071	33058	33069	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147051	33126	33137	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
						147070	33205	33216	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
147071	33206	33217	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147051	33274	33285	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147046	33318	33329	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147049	33321	33332	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147051	33323	33334	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
						147046	33466	33477	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147047	33467	33478	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147051	33471	33482	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147046	33640	33651	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147051	33645	33656	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147046	33788	33799	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147051	33793	33804	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147059	35437	35448	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840

 

147060	35438	35449	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
						147060	35586	35597	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
147021	36093	36104	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
						147061	36250	36261	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
147061	36398	36409	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147073	37485	37496	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147073	37633	37644	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147043	40214	40225	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147061	40353	40364	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147043	40362	40373	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147061	40501	40512	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147031	42527	42538	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
147032	42528	42539	GTTCCCAGCCTT	1-10-1 MOE	870
						147034	42530	42541	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
147031	42675	42686	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
						147032	42676	42687	GTTCCCAGCCTT	1-10-1 MOE	870
147033	42677	42688	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836
						147034	42678	42689	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
147074	43848	43859	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
						147074	43996	44007	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147051	45402	45413	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
						147051	45550	45561	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147074	46125	46136	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
						147057	46313	46324	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147058	46314	46325	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147059	46315	46326	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
147061	46317	46328	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147057	46461	46472	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147059	46463	46474	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
						147061	46465	46476	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
147058	47413	47424	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147073	48221	48232	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147073	48369	48380	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147074	48370	48381	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147027	48566	48577	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843

 

147027	48714	48725	CAGCCTTGTCGA	1-10-1 MOE	843
						147028	48715	48726	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147067	49050	49061	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
						147068	49051	49062	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147067	49198	49209	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
						147073	49524	49535	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147073	49672	49683	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147074	49673	49684	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147036	50421	50432	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147036	52292	52303	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147037	52293	52304	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
						147036	52438	52449	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147037	52439	52450	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
						147034	53148	53159	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
147034	53294	53305	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
						147042	53445	53456	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
147043	53446	53457	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
						147044	53447	53458	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
147042	53591	53602	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
						147030	53592	53603	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147043	53592	53603	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
						147031	53593	53604	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
147044	53593	53604	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147030	53738	53749	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147031	53739	53750	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
						147040	53783	53794	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147041	53784	53795	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
						147041	53930	53941	AGCCGCCCAGTT	1-10-1 MOE	834
147042	55008	55019	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
						147043	55009	55020	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147042	55154	55165	GGTCAAAAGGGC	1-10-1 MOE	866
						147043	55155	55166	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147058	55281	55292	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147058	55427	55438	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147019	55682	55693	TCGATCTCCTCG	1-10-1 MOE	877

 

147021	55684	55695	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
						147021	55830	55841	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
147054	56275	56286	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
						147055	56276	56287	TTAATCCGACTG	1-10-1 MOE	884
147056	56277	56288	TTTAATCCGACT	1-10-1 MOE	887
						147058	56279	56290	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147059	56280	56291	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
						147060	56281	56292	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
147061	56282	56293	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147051	56418	56429	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147053	56420	56431	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
						147054	56421	56432	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
147055	56422	56433	TTAATCCGACTG	1-10-1 MOE	884
						147056	56423	56434	TTTAATCCGACT	1-10-1 MOE	887
147057	56424	56435	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147058	56425	56436	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147061	56428	56439	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147045	57118	57129	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147045	57264	57275	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147046	57265	57276	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147071	58028	58039	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147071	58174	58185	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147043	61111	61122	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
						147071	61130	61141	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147020	61226	61237	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
						147043	61257	61268	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147071	61276	61287	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147035	61277	61288	CCAGTTCCCAGC	1-10-1 MOE	847
147036	61278	61289	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147037	61279	61290	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
147038	61280	61291	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
						147039	61281	61292	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
147040	61282	61293	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
						147071	61309	61320	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147020	61372	61383	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868

 

147034	61422	61433	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
						147035	61423	61434	CCAGTTCCCAGC	1-10-1 MOE	847
147036	61424	61435	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147037	61425	61436	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
147038	61426	61437	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
						147040	61428	61439	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147071	61455	61466	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147073	62003	62014	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147073	62149	62160	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147066	63065	63076	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
147068	63067	63078	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
						147069	63146	63157	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
147062	63207	63218	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
						147066	63211	63222	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
147057	64054	64065	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147036	64538	64549	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147037	64539	64550	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
						147037	64685	64696	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
147066	64864	64875	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
						147067	64865	64876	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
147066	65010	65021	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
						147067	65011	65022	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
147045	65017	65028	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147045	65163	65174	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147046	65164	65175	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147068	65408	65419	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147071	65411	65422	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147069	65549	65560	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
147068	65554	65565	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
						147071	65557	65568	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147029	67741	67752	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
						147030	67742	67753	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147031	67743	67754	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
						147028	67886	67897	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147029	67887	67898	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848

 

147030	67888	67899	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
						147031	67889	67900	TTCCCAGCCTTG	1-10-1 MOE	885
147043	68867	68878	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
						147044	68868	68879	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
147045	68869	68880	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147043	69013	69024	TGGTCAAAAGGG	1-10-1 MOE	881
147044	69014	69025	GTGGTCAAAAGG	1-10-1 MOE	869
						147045	69015	69026	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
147046	69016	69027	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147071	69519	69530	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147072	69520	69531	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
						147073	69521	69532	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147071	69665	69676	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147072	69666	69677	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147073	69667	69678	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147074	69668	69679	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147066	69869	69880	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
						147066	70015	70026	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
147023	70465	70476	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
						147023	70611	70622	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
147062	70615	70626	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
						147063	70616	70627	GCACTGACGAGT	1-10-1 MOE	862
147064	70617	70628	TGCACTGACGAG	1-10-1 MOE	880
						147065	70618	70629	CTGCACTGACGA	1-10-1 MOE	857
147066	70619	70630	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
						147063	70762	70773	GCACTGACGAGT	1-10-1 MOE	862
147064	70763	70774	TGCACTGACGAG	1-10-1 MOE	880
						147065	70764	70775	CTGCACTGACGA	1-10-1 MOE	857
147066	70765	70776	CCTGCACTGACG	1-10-1 MOE	851
						147072	70998	71009	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147073	70999	71010	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147072	71144	71155	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147073	71145	71156	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147074	71146	71157	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147037	71351	71362	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863

 

147038	71352	71363	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
						147039	71353	71364	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
147037	71497	71508	GCCCAGTTCCCA	1-10-1 MOE	863
						147038	71498	71509	CGCCCAGTTCCC	1-10-1 MOE	855
147039	71499	71510	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
						147061	71641	71652	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
147061	71787	71798	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879

表17：靶向SEQ ID NO：11且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISISNO.	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQID NO
						147022	177	188	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
147023	178	189	CTTGTCGATCTC	1-10-1 MOE	859
						147020	196	207	GTCGATCTCCTC	1-10-1 MOE	868
147022	198	209	TTGTCGATCTCC	1-10-1 MOE	886
						147024	200	211	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
147026	202	213	AGCCTTGTCGAT	1-10-1 MOE	835
						147028	204	215	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147029	205	216	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
						147030	206	217	TCCCAGCCTTGT	1-10-1 MOE	874
147036	212	223	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147073	311	322	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147046	327	338	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147047	328	339	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147048	329	340	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
						147049	330	341	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147050	331	342	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
						147051	332	343	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147052	333	344	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147053	334	345	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147054	335	346	TAATCCGACTGT	1-10-1 MOE	871
						147055	336	347	TTAATCCGACTG	1-10-1 MOE	884
147056	337	348	TTTAATCCGACT	1-10-1 MOE	887
						147057	338	349	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839

 

147058	339	350	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147060	341	352	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
147061	342	353	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147062	1024	1035	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
147063	1025	1036	GCACTGACGAGT	1-10-1 MOE	862
						147068	1030	1041	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147071	1033	1044	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147073	1035	1046	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147074	1036	1047	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
						147067	1091	1102	TCCTGCACTGAC	1-10-1 MOE	876
147024	1891	1902	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147026	1893	1904	AGCCTTGTCGAT	1-10-1 MOE	835
147029	1896	1907	CCCAGCCTTGTC	1-10-1 MOE	848
						147036	1903	1914	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147039	1906	1917	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
						147019	1994	2005	TCGATCTCCTCG	1-10-1 MOE	877
401385	2815	2828	CCCAGTGGGTTTGA	2-10-2 MOE	890
						147033	5265	5276	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836
147033	5373	5384	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836
						147060	7168	7179	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
147053	10527	10538	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
						147053	10635	10646	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147070	11604	11615	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
						147071	11612	11623	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147072	12294	12305	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
						147072	12299	12310	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147052	12938	12949	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147052	13119	13130	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
147047	13158	13169	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147048	13159	13170	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147049	13160	13171	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
						147048	13340	13351	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147049	13341	13352	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
						147051	13343	13354	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147061	13497	13508	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879

 

147069	15562	15573	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147068	15743	15754	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147049	17181	17192	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
						147049	17349	17360	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147047	22438	22449	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147047	24322	24333	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147045	24488	24499	TGTGGTCAAAAG	1-10-1 MOE	883
						147039	25064	25075	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
147057	25508	25519	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147057	25676	25687	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147061	25680	25691	TGCAATTTAATC	1-10-1 MOE	879
						147069	28731	28742	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
147052	30132	30143	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147052	30277	30288	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
147036	32085	32096	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147072	32520	32531	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147071	33058	33069	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147050	33125	33136	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
147069	33204	33215	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147050	33273	33284	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
147047	33319	33330	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147050	33322	33333	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
147052	33324	33335	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147049	33469	33480	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147050	33470	33481	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
						147052	33472	33483	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
147047	33641	33652	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147047	33789	33800	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147059	35585	35596	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
						147021	36241	36252	TGTCGATCTCCT	1-10-1 MOE	882
147073	37633	37644	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147033	42529	42540	AGTTCCCAGCCT	1-10-1 MOE	836
147050	45401	45412	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
						147050	45549	45560	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
147074	46125	46136	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845

 

147057	46313	46324	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147058	46462	46473	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147058	47413	47424	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147058	47561	47572	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
147073	48221	48232	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147073	48369	48380	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147028	48567	48578	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
						147068	49199	49210	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147036	50273	50284	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
						147040	53929	53940	GCCGCCCAGTTC	1-10-1 MOE	864
147047	54769	54780	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147048	54770	54781	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147047	54915	54926	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147048	54916	54927	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147019	55828	55839	TCGATCTCCTCG	1-10-1 MOE	877
						147047	56268	56279	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147048	56269	56280	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
						147049	56270	56281	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147050	56271	56282	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
						147051	56272	56283	TCCGACTGTGGT	1-10-1 MOE	875
147052	56273	56284	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147053	56274	56285	AATCCGACTGTG	1-10-1 MOE	829
147056	56277	56288	TTTAATCCGACT	1-10-1 MOE	887
						147057	56278	56289	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147047	56414	56425	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147048	56415	56426	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147049	56416	56427	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
						147050	56417	56428	CCGACTGTGGTC	1-10-1 MOE	889
147052	56419	56430	ATCCGACTGTGG	1-10-1 MOE	837
						147057	56424	56435	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147058	56425	56436	AATTTAATCCGA	1-10-1 MOE	830
						147059	56426	56437	CAATTTAATCCG	1-10-1 MOE	840
147060	56427	56438	GCAATTTAATCC	1-10-1 MOE	861
						147046	57119	57130	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
147071	58174	58185	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856

 

147071	61130	61141	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147034	61276	61287	CAGTTCCCAGCC	1-10-1 MOE	844
147071	61309	61320	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147039	61427	61438	CCGCCCAGTTCC	1-10-1 MOE	850
147071	61455	61466	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
						147073	62003	62014	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
147062	63061	63072	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
						147068	63213	63224	ATCCTGCACTGA	1-10-1 MOE	838
147069	63292	63303	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147057	64054	64065	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
147057	64200	64211	ATTTAATCCGAC	1-10-1 MOE	839
						147070	64427	64438	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
147070	64573	64584	TGATCCTGCACT	1-10-1 MOE	878
						147036	64684	64695	CCCAGTTCCCAG	1-10-1 MOE	849
147046	65018	65029	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147071	65557	65568	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147069	65695	65706	GATCCTGCACTG	1-10-1 MOE	860
						147047	66163	66174	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147047	66309	66320	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147028	67740	67751	CCAGCCTTGTCG	1-10-1 MOE	846
147046	68870	68881	CTGTGGTCAAAA	1-10-1 MOE	858
						147047	68871	68882	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
147048	68872	68883	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
						147049	68873	68884	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
147047	69017	69028	ACTGTGGTCAAA	1-10-1 MOE	833
						147048	69018	69029	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147049	69019	69030	CGACTGTGGTCA	1-10-1 MOE	854
						147071	69519	69530	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147073	69521	69532	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147071	69665	69676	CTGATCCTGCAC	1-10-1 MOE	856
147072	69666	69677	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
						147024	70466	70477	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
147024	70612	70623	CCTTGTCGATCT	1-10-1 MOE	853
						147062	70761	70772	CACTGACGAGTC	1-10-1 MOE	841
147072	70998	71009	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832

 

147073	70999	71010	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147072	71144	71155	ACTGATCCTGCA	1-10-1 MOE	832
147073	71145	71156	CACTGATCCTGC	1-10-1 MOE	842
						147048	71366	71377	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888
147048	71512	71523	GACTGTGGTCAA	1-10-1 MOE	888

表18：靶向SEQ ID NO：11的短反义化合物

 

ISISNO.	5’靶位点	3’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	Seq IDNO
						398163	20	31	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
384545	23	34	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147705	159	170	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147703	245	256	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						398090	283	296	TTGTTCTTAGGAAG	2-10-2 MOE	972
147704	285	296	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147705	291	302	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147709	311	322	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
						147733	349	360	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147707	360	371	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147708	366	377	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
390030	381	392	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147709	386	397	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147081	393	404	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						398091	393	406	GGGCTTCTTCCATT	2-10-2 MOE	979
398166	395	406	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147709	418	429	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147711	425	436	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147712	461	472	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147713	466	477	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						147714	471	482	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
147715	496	507	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
						147716	521	532	TTAACGAGCCTT	1-10-1 MOE	949
147717	574	585	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	607	618	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996

 

147708	612	623	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
						147718	621	632	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
147746	625	636	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398167	704	715	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398092	705	718	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
						147723	715	726	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
398093	758	771	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398168	760	771	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
147738	780	791	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						398094	848	861	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
398169	849	860	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
						398164	873	884	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
147735	973	984	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147737	984	995	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
368369	1025	1040	TCCTGCACTGACGAGT	3-10-3 MOE	893
						368372	1031	1046	CACTGATCCTGCACTG	3-10-3 MOE	894
368353	1033	1046	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
						368354	1035	1048	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
368388	1035	1050	CTTCCACTGATCCTTA	3-10-3 MOE	895
						368355	1036	1049	TTCCACTGATCCTG	2-10-2 MOE	1025
368356	1037	1050	CTTCCACTGATCCT	2-10-2 MOE	1027
						368376	1037	1052	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
147076	1038	1049	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						368357	1038	1051	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
147077	1039	1050	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						368358	1039	1052	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
368378	1039	1054	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
						368359	1041	1054	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
147080	1042	1053	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147081	1043	1054	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	1043	1056	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						368380	1043	1058	GAAAGCTCCTTCCACT	3-10-3 MOE	896
147082	1044	1055	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						368381	1045	1060	GGGAAAGCTCCTTCCA	3-10-3 MOE	1037
147739	1107	1118	CGTTTGGGTGGC	1-10-1 MOE	1023

 

147741	1165	1176	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398097	1194	1207	GGCAGTCTTTATCC	2-10-2 MOE	897
147742	1273	1284	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147743	1388	1399	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147744	1392	1403	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						147745	1398	1409	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398157	1455	1468	GGAAACATACCCTG	2-10-2 MOE	1045
						398167	1475	1486	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398092	1476	1489	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
						368357	1596	1609	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
398160	1691	1704	GAATAGGTTAAGGC	2-10-2 MOE	1048
						398163	1711	1722	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
147746	1750	1761	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						389949	1777	1788	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
398161	1790	1803	AACAATGTGTTGTA	2-10-2 MOE	1049
						147746	1799	1810	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398163	1819	1830	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						389950	1848	1859	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
398164	1889	1900	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147702	1917	1928	CTGGTAAATAGC	1-10-1 MOE	898
147088	1971	1982	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						398102	2003	2016	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
398103	2010	2023	CCCAGTACTACCTG	2-10-2 MOE	900
						147737	2386	2397	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	106
398095	2407	2420	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
						398106	2441	2454	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
147745	2497	2508	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						147712	2499	2510	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147712	2607	2618	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147745	2689	2700	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398167	2706	2717	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	2707	2720	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
398166	2966	2977	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147091	2992	3003	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147092	2993	3004	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901

 

389949	3008	3019	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
						147087	3149	3160	CCTCTACACCAG	1-10-1 MOE	982
147088	3150	3161	CCCTCTACACCA	I-10-1 MOE	1050
						398113	3160	3173	AGGAGGTTAAACCA	2-10-2 MOE	905
147087	3257	3268	CCTCTACACCAG	1-10-1 MOE	982
						147088	3258	3269	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
147737	3591	3602	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						147737	3617	3628	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147079	3637	3648	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	3638	3649	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
398095	3638	3651	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
						398106	3672	3685	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
398107	3678	3691	TATTCCTGGAAAAC	2-10-2 MOE	902
						147691	3806	3817	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147683	3848	3859	GCTTACGATTGT	1-10-1 MOE	922
						147738	3853	3864	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
398167	3926	3937	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398109	3945	3958	CAAGAAGTGTGGTT	2-10-2 MOE	903
398167	4034	4045	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398110	4083	4096	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
398111	4168	4181	GTGAAAATGCTGGC	2-10-2 MOE	904
						147706	4238	4249	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
398112	4282	4295	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
						147746	4315	4326	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398113	4391	4404	AGGAGGTTAAACCA	2-10-2 MOE	905
						398115	4484	4497	AGTAAATATTGGCT	2-10-2 MOE	1076
390030	4491	4502	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						390030	4537	4548	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147703	5034	5045	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						147684	5035	5046	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
398125	5075	5088	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
						147696	5083	5094	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
147684	5143	5154	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						147712	5366	5377	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147714	5416	5427	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986

 

398128	5443	5456	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
						147712	5474	5485	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147746	5498	5509	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147714	5524	5535	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
147736	5600	5611	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147085	5762	5773	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
147679	5825	5836	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
						390030	6803	6814	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
398142	6885	6898	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
						398142	6994	7007	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
398166	7306	7317	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147684	7551	7562	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
147085	8308	8319	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
						147085	8416	8427	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
398163	8473	8484	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						147718	8523	8534	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
147718	8631	8642	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147691	8806	8817	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147728	8835	8846	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147728	8943	8954	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398169	8946	8957	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
						147742	9060	9071	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
404136	9162	9175	TAAGTGTCCCTTTG	2-10-2 MOE	910
						147746	9963	9974	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	9966	9977	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	9969	9980	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	9991	10002	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	10071	10082	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	10074	10085	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	10077	10088	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
390030	10170	10181	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147084	10220	10231	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
390030	10278	10289	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147085	10329	10340	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
147711	10684	10695	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040

 

147711	10792	10803	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						398128	11333	11346	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
147707	11960	11971	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147707	11965	11976	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
147090	12013	12024	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
						398096	12146	12159	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
398166	12214	12225	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						398135	12308	12321	GACTACATTTTACA	2-10-2 MOE	912
147741	12389	12400	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398125	12431	12444	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
147714	12585	12596	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147718	12594	12605	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
398125	12612	12625	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
						147737	12803	12814	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147746	12876	12887	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147691	12900	12911	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
398137	13111	13124	TGTGTCCCTCAGTC	2-10-2 MOE	914
						398138	13254	13267	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
398137	13292	13305	TGTGTCCCTCAGTC	2-10-2 MOE	914
						398138	13435	13448	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
389764	14020	14031	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389948	14067	14078	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
389948	14248	14259	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
						147738	14279	14290	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147698	14572	14583	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						147717	14750	14761	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147717	14932	14943	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						398167	15374	15385	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147736	16444	16455	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147746	16510	16521	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147738	16590	16601	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147746	16676	16687	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398167	16797	16808	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398144	16911	16924	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
389764	17096	17107	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018

 

147709	17238	17249	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
						147709	17406	17417	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147695	17466	17477	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
						147746	17497	17508	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147088	17539	17550	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						147711	17808	17819	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147711	17976	17987	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						398139	18049	18062	AGTGACTGACCACA	2-10-2 MOE	917
398139	18217	18230	AGTGACTGACCACA	2-10-2 MOE	917
						398140	18596	18609	GTAGCATAGAGCCT	2-10-2 MOE	918
398140	18764	18777	GTAGCATAGAGCCT	2-10-2 MOE	918
						398167	18927	18938	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398141	18947	18960	CAGATCTTGTCAAG	2-10-2 MOE	919
						398167	19095	19106	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398141	19115	19128	CAGATCTTGTCAAG	2-10-2 MOE	919
						147746	19207	19218	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147711	19508	19519	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147729	19554	19565	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
147718	19617	19628	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						390030	19618	19629	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
14770I	19671	19682	CCATGGCGGGAC	1-10-1 MOE	921
						147711	19676	19687	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147718	19785	19796	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147079	20515	20526	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
389764	20620	20631	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						398142	20653	20666	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
147078	20682	20693	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	20683	20694	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	20704	20715	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147081	20705	20716	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
389965	20788	20799	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						147746	20870	20881	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	21038	21049	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147717	21080	21091	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147076	21222	21233	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029

 

398094	21441	21454	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
						147746	21633	21644	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147738	21884	21895	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147683	21939	21950	GCTTACGATTGT	1-10-1 MOE	922
147743	22213	22224	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						147736	22759	22770	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147736	22927	22938	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						398142	23008	23021	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
398147	23784	23797	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
						398147	23952	23965	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
147713	24434	24445	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						389965	24543	24554	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
147713	24602	24613	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						389965	24711	24722	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
147746	25384	25395	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398143	25505	25518	GTCAGTCCCAGCTA	2-10-2 MOE	924
147691	25610	25621	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398130	25672	25685	TTAGTATGACAGCT	2-10-2 MOE	925
147746	25810	25821	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	25978	25989	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	26172	26183	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398151	26718	26731	TCAGTGTAGGAAGA	2-10-2 MOE	926
147728	26917	26928	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						398152	27708	27721	TGAATATACAGATG	2-10-2 MOE	927
147698	28629	28640	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						389965	28714	28725	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	28714	28725	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389764	28861	28872	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
390030	29945	29956	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147744	30654	30665	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
147093	30836	30847	TTGTTCCCTCTA	1-10-1 MOE	929
						147746	30957	30968	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	31105	31116	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						390030	31477	31488	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
384545	31829	31840	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951

 

384545	31977	31988	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						401382	32094	32107	TCTACCTGAGTCCA	2-10-2 MOE	930
147089	32387	32398	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						389950	32949	32960	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
398165	33002	33013	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
						147081	33073	33084	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	33074	33085	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						389950	33097	33108	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
147736	33160	33171	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147081	33221	33232	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	33221	33234	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						147082	33222	33233	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
398138	33244	33257	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
						147746	33250	33261	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398138	33392	33405	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
						401383	33588	33601	GATCACCTTCAGAG	2-10-2 MOE	932
147746	33886	33897	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	34606	34617	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398165	34704	34715	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
						147717	34745	34756	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147746	34754	34765	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398165	34852	34863	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147717	34893	34904	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						401384	34905	34918	TGAACACATCACTA	2-10-2 MOE	933
147738	35391	35402	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147736	35396	35407	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147738	35539	35550	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147691	35554	35565	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147691	35702	35713	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147746	35814	35825	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
401385	36109	36122	CCCAGTGGGTTTGA	2-10-2 MOE	890
						147691	36360	36371	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147746	36416	36427	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147731	36620	36631	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147714	37881	37892	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986

 

147714	38029	38040	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147681	38512	38523	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
401386	38516	38529	TAATTGATGTCAAT	2-10-2 MOE	935
						401387	38518	38531	AGTAATTGATGTCA	2-10-2 MOE	936
401388	38520	38533	ACAGTAATTGATGT	2-10-2 MOE	937
						401389	38522	38535	TTACAGTAATTGAT	2-10-2 MOE	938
401390	38524	38537	ACTTACAGTAATTG	2-10-2 MOE	939
						401391	38526	38539	AGACTTACAGTAAT	2-10-2 MOE	940
401392	38528	38541	TCAGACTTACAGTA	2-10-2 MOE	941
						401393	38530	38543	AATCAGACTTACAG	2-10-2 MOE	942
401394	38532	38545	TGAATCAGACTTAC	2-10-2 MOE	943
						401395	38534	38547	AATGAATCAGACTT	2-10-2 MOE	944
147738	38909	38920	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147738	39057	39068	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
390030	39249	39260	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						390030	39397	39408	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
401396	39488	39501	TGCAGGATGTTGAG	2-10-2 MOE	945
						147717	39545	39556	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147746	39641	39652	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147717	39693	39704	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147746	39729	39740	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	39877	39888	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	40185	40196	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	40478	40489	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398166	40589	40600	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147735	40662	40673	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
147746	40706	40717	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398166	40737	40748	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
147746	40854	40865	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						401397	41012	41025	CTGGTCAGCATTGA	2-10-2 MOE	946
147718	41070	41081	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147718	41218	41229	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
147717	41221	41232	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	41369	41380	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147717	41599	41610	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996

 

147717	41747	41758	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						401398	41768	41781	CAAAGTCCCTTAGC	2-10-2 MOE	947
390030	42056	42067	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398153	42157	42170	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
398153	42305	42318	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
						147710	42691	42702	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994
147079	43322	43333	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	43323	43334	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147716	43477	43488	TTAACGAGCCTT	1-10-1 MOE	949
						147746	43992	44003	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147736	44137	44148	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						384545	44242	44253	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
147687	44354	44365	CGACACGGGAAC	1-10-1 MOE	950
						384545	44390	44401	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
398110	44713	44726	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
						147705	45092	45103	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147705	45240	45251	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147074	45977	45988	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147075	45978	45989	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						147076	45979	45990	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
147076	46127	46138	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						401399	46247	46260	ATTAGCCATATCTC	2-10-2 MOE	953
147705	46555	46566	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147714	46685	46696	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
147705	46703	46714	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						390030	46859	46870	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
390030	46933	46944	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147681	46984	46995	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
390030	47007	47018	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147746	47023	47034	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
390030	47081	47092	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147681	47132	47143	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
147746	47171	47182	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						401400	47411	47424	AGCATTCAGCAGTG	2-10-2 MOE	954
147746	47461	47472	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073

 

147086	47608	47619	CTCTACACCAGG	1-10-1 MOE	969
						147087	47609	47620	CCTCTACACCAG	1-10-1 MOE	982
147088	47610	47621	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						147090	47612	47623	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
147691	47729	47740	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147086	47756	47767	CTCTACACCAGG	1-10-1 MOE	969
147088	47758	47769	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						147089	47759	47770	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
390030	47847	47858	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						390030	47995	48006	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147691	48393	48404	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398147	48887	48900	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
147706	49133	49144	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
						147706	49281	49292	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
398168	49742	49753	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						401401	49791	49804	AACTGGGTTAAGTA	2-10-2 MOE	958
147689	49936	49947	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						401402	50192	50205	TGAACACGCTATCC	2-10-2 MOE	959
398117	50241	50254	TTTCCACTTGGGTG	2-10-2 MOE	960
						147736	50582	50593	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
398168	50703	50714	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						398168	50849	50860	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
147746	51019	51030	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147708	51101	51112	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
147746	51178	51189	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147708	51247	51258	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
147083	51281	51292	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
						147081	51287	51298	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	51288	51299	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						147746	51331	51342	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147085	51416	51427	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
						147083	51427	51438	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
147081	51433	51444	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						147082	51434	51445	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
147728	51522	51533	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013

 

147085	51562	51573	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
						147081	51633	51644	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	51633	51646	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						147082	51634	51645	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
368361	51635	51648	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
						368360	51779	51792	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
147082	51780	51791	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						147736	51859	51870	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147684	51867	51878	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						147746	51918	51929	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147077	51988	51999	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						147746	52064	52075	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147084	52125	52136	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
						147079	52136	52147	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147681	52231	52242	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147084	52271	52282	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
147691	52312	52323	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						401403	52318	52331	TTTCCTAGGAGGTG	2-10-2 MOE	967
398167	52527	52538	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147703	52670	52681	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
398167	52673	52684	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398165	52708	52719	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
398090	52708	52721	TTGTTCTTAGGAAG	2-10-2 MOE	972
						147705	52716	52727	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147682	52717	52728	CGGGTACTATGG	1-10-1 MOE	992
						398167	52762	52773	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147703	52816	52827	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						398090	52854	52867	TTGTTCTTAGGAAG	2-10-2 MOE	972
147704	52856	52867	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147705	52862	52873	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
398167	52908	52919	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147084	53704	53715	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
147088	53708	53719	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						147083	53849	53860	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
147084	53850	53861	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993

 

147086	53852	53863	CTCTACACCAGG	1-10-1 MOE	969
						147088	53854	53865	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
398167	53870	53881	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147703	54137	54148	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
398155	54172	54185	TGTTTTTACACAGA	2-10-2 MOE	970
						390030	54263	54274	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147705	54275	54286	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147703	54283	54294	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
390030	54409	54420	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147704	54965	54976	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
147705	54971	54982	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						398090	55109	55122	TTGTTCTTAGGAAG	2-10-2 MOE	972
147705	55117	55128	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147083	55206	55217	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
147084	55207	55218	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
						147084	55353	55364	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
147705	55524	55535	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147685	55602	55613	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
401404	55638	55651	TGAGCTACAGTAGG	2-10-2 MOE	974
						147685	55748	55759	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
147712	55819	55830	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147712	55965	55976	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147707	56300	56311	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147708	56306	56317	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
390030	56321	56332	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147709	56326	56337	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
398091	56333	56346	GGGCTTCTTCCATT	2-10-2 MOE	979
						401405	56408	56421	TGGTCAACTGAAAG	2-10-2 MOE	976
147707	56446	56457	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147708	56452	56463	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
147709	56472	56483	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
						398091	56479	56492	GGGCTTCTTCCATT	2-10-2 MOE	979
401406	56570	56583	GGTGTGGATAACAG	2-10-2 MOE	980
						368366	56664	56677	CTGATCCTTAGAAG	2-10-2 MOE	1019
398148	57157	57170	TCATAACTATTAAG	2-10-2 MOE	981

 

147082	57220	57231	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						398148	57303	57316	TCATAACTATTAAG	2-10-2 MOE	981
147082	57366	57377	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						147743	57758	57769	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
398093	57963	57976	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398093	58109	58122	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
147735	58279	58290	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147087	58821	58832	CCTCTACACCAG	1-10-1 MOE	982
147087	58967	58978	CCTCTACACCAG	1-10-1 MOE	982
						390030	59180	59191	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
390030	59326	59337	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147711	59357	59368	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147743	59382	59393	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						147711	59503	59514	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147711	59675	59686	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						401407	59710	59723	CAGCTTAGGCAGAG	2-10-2 MOE	983
147712	59711	59722	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147713	59716	59727	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
147714	59721	59732	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147695	59722	59733	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
147715	59746	59757	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
						147711	59821	59832	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
390030	59847	59858	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147712	59857	59868	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147713	59862	59873	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						147714	59867	59878	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
390030	59993	60004	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						389949	60471	60482	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
147746	60619	60630	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147689	61113	61124	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
398105	61267	61280	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
						147680	61473	61484	GTATGCACTGCT	1-10-1 MOE	988
147080	61757	61768	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147078	61901	61912	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
147079	61902	61913	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001

 

147088	62215	62226	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						401408	62600	62613	CAATGAAGCACAGG	2-10-2 MOE	989
147688	62843	62854	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
						147746	63102	63113	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	63248	63259	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						401409	63430	63443	ATTCTTAACACAGA	2-10-2 MOE	991
147682	63483	63494	CGGGTACTATGG	1-10-1 MOE	992
						147084	63677	63688	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
147710	64847	64858	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994
						147710	64993	65004	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994
147746	65151	65162	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						401410	65263	65276	CATTTAGGGTCTAA	2-10-2 MOE	995
147717	65862	65873	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	65895	65906	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147708	65900	65911	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
						147718	65909	65920	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
147717	66008	66019	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	66041	66052	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147708	66046	66057	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
						147718	66055	66066	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
401411	66123	66136	AGCCGCCTGAAGTG	2-10-2 MOE	999
						147697	66497	66508	CCCCAGCAGCGG	1-I0-1 MOE	1000
368377	66562	66577	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
						147077	66563	66574	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
368358	66563	66576	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
						147078	66564	66575	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
147079	66565	66576	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	66566	66577	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147697	66643	66654	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000
						368358	66709	66722	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
147078	66710	66721	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	66711	66722	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147075	66999	67010	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						147705	67067	67078	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147088	67409	67420	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050

 

147080	67430	67441	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147082	67432	67443	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
147737	67455	67466	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						147088	67555	67566	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
147082	67578	67589	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						401412	67637	67650	TAAATCCTCTAGCA	2-10-2 MOE	1003
147091	67729	67740	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
						147742	67737	67748	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
147712	68527	68538	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147712	68673	68684	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147711	68760	68771	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147711	68906	68917	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
389965	69271	69282	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						389965	69417	69428	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
368353	69519	69532	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
						147080	69630	69641	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147081	69631	69642	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						368353	69665	69678	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
398167	69757	69768	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	69758	69771	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
398093	69811	69824	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398168	69813	69824	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
398167	69903	69914	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398093	69957	69970	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
398094	70047	70060	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
						398095	70065	70078	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
147704	70137	70148	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147728	70450	70461	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398164	70464	70475	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						398096	70562	70575	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
147735	70564	70575	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147737	70575	70586	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147735	70710	70721	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147737	70721	70732	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
404131	70729	70742	ACCTTCGATCACAG	2-10-2 MOE	831

 

368349	70762	70775	CTGCACTGACGAGT	2-10-2 MOE	1017
						389965	70930	70941	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
368366	70995	71008	CTGATCCTTAGAAG	2-10-2 MOE	1019
						368354	70999	71012	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
368375	71000	71015	CCTTCCACTGATCCTG	3-10-3 MOE	1020
						368356	71001	71014	CTTCCACTGATCCT	2-10-2 MOE	1027
368376	71001	71016	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
						368357	71002	71015	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
368377	71002	71017	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
						147077	71003	71014	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
368358	71003	71016	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
						368378	71003	71018	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
147078	71004	71015	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						368359	71005	71018	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
368379	71005	71020	AAGCTCCTTCCACTGA	3-10-3 MOE	1034
						147080	71006	71017	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147082	71008	71019	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						401413	71019	71032	TGCAGCCATGTACT	2-10-2 MOE	1022
147738	71067	71078	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147739	71071	71082	CGTTTGGGTGGC	1-10-1 MOE	1023
147741	71129	71140	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						368354	71145	71158	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
368355	71146	71159	TTCCACTGATCCTG	2-10-2 MOE	1025
						147075	71147	71158	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
368356	71147	71160	CTTCCACTGATCCT	2-10-2 MOE	1027
						368376	71147	71162	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
147076	71148	71159	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						368357	71148	71161	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
368377	71148	71163	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
						147077	71149	71160	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
368358	71149	71162	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
						368378	71149	71164	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
147078	71150	71161	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						368359	71151	71164	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
368379	71151	71166	AAGCTCCTTCCACTGA	3-10-3 MOE	1034

 

368360	71153	71166	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						147082	71154	71165	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
368381	71155	71170	GGGAAAGCTCCTTCCA	3-10-3 MOE	1037
						390030	71986	71997	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
390030	72132	72143	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147711	72300	72311	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
401414	72347	72360	TTGCAATGTCTGGC	2-10-2 MOE	1038
						147741	72400	72411	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
401415	72415	72428	GATTTATCTGGCTG	2-10-2 MOE	1039
						147711	72446	72457	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147742	72575	72586	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147743	72690	72701	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147744	72694	72705	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						147745	72700	72711	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
147742	72721	72732	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147743	72836	72847	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147744	72840	72851	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						368357	72898	72911	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
147078	72900	72911	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						398157	72903	72916	GGAAACATACCCTG	2-10-2 MOE	1045
368357	73044	73057	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						147077	73045	73056	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
147746	73052	73063	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	73101	73112	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398160	73139	73152	GAATAGGTTAAGGC	2-10-2 MOE	1048
						147746	73198	73209	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398161	73238	73251	AACAATGTGTTGTA	2-10-2 MOE	1049
						147088	73419	73430	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
404140	73457	73470	GCACACAGCTGAGG	2-10-2 MOE	1051
						404139	73459	73472	GTGCACACAGCTGA	2-10-2MOE	1052
399301	73461	73474	GTGTGCACACAGCT	2-10-2 MOE	1542
						404137	73463	73476	CAGTGTGCACACAG	2-10-2 MOE	1053
404138	73465	73478	CTCAGTGTGCACAC	2-10-2 MOE	1054
						147741	73705	73716	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
404135	73858	73871	CATTTCCATGGCCA	2-10-2 MOE	1056

 

398167	74008	74019	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	74009	74022	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
398162	74114	74127	ACCAAACAGTTCAG	2-10-2 MOE	1057
						147745	74137	74148	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398167	74154	74165	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	74155	74168	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
389949	74310	74321	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
						147740	74485	74496	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
389950	74527	74538	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
						398101	74656	74669	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064
398104	74805	74818	CAAGAAGACCTTAC	2-10-2 MOE	1065
						147737	74893	74904	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
398105	74894	74907	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
						147737	74919	74930	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
398106	74974	74987	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
						404199	75045	75058	GGTCATGCACAGGC	2-10-2 MOE	867
404134	75048	75061	TCAGGTCATGCACA	2-10-2 MOE	873
						398106	75120	75133	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
147738	75155	75166	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						404132	75227	75240	CCTTGGAATGTCTG	2-10-2 MOE	852
147738	75301	75312	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						398166	75499	75510	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
147746	75617	75628	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147706	75686	75697	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
398112	75730	75743	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
						147746	75763	75774	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398115	75786	75799	AGTAAATATTGGCT	2-10-2 MOE	1076
						390030	75839	75850	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
398114	75916	75929	AGGCATATAGCAGA	2-10-2 MOE	1075
						398115	75932	75945	AGTAAATATTGGCT	2-10-2 MOE	1076
404133	75968	75981	TATTCCATGGCCAT	2-10-2 MOE	872
						147715	77045	77056	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
147715	77190	77201	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
						147693	77385	77396	GTGCGCTCCCAT	1-10-1 MOE	1078
398173	40201	40212	CAGCCTGGGCAC	1-10-1 MOE	1543

 

398173	72764	72775	CAGCCTGGGCAC	1-10-1 MOE	1543
						399096	1986	1999	TGCTCGAACTCCTT	2-10-2 MOE	1544
399102	52822	52835	GAAGTCACTGGCTT	2-10-2 MOE	1545
						399103	52824	52837	GGGAAGTCACTGGC	2-10-2 MOE	1546
399113	59827	59840	GTTAGGCAAAGGGC	2-10-2 MOE	1547
						399132	69977	69990	GGGCTGAGTGACCC	2-10-2 MOE	1548
399173	74592	74605	ATGCTAGTGCACTA	2-10-2 MOE	1549
						399208	75900	75913	AGCTCGCTACCTCT	2-10-2 MOE	1550
399276	27559	27572	GAGGTATCCCATCT	2-10-2 MOE	1551
						399315	74039	74052	GGCAACTTCAACCT	2-10-2 MOE	1552

表19：靶向SEQ ID NO：12且具有一处或两处错配的短反义化合物

 

ISISNO.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	Seq ID N0
						398163	20	31	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
384545	23	34	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147733	26	37	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147721	59	70	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
						147700	110	121	GCGCTAGGCCGC	1-10-1 MOE	1110
384545	130	141	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147705	159	170	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147701	167	178	CCATGGCGGGAC	1-10-1 MOE	921
						398164	198	209	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
147730	199	210	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
						147702	226	237	CTGGTAAATAGC	1-10-1 MOE	898
147703	245	256	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						147705	266	277	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
398165	283	294	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
						147704	285	296	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
147705	291	302	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147709	311	322	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147733	349	360	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						147707	360	371	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
147708	366	377	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997

 

390030	381	392	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147709	386	397	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147081	393	404	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						398091	393	406	GGGCTTCTTCCATT	2-10-2 MOE	979
398166	395	406	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147712	461	472	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147713	466	477	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						147714	471	482	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
147710	502	513	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994
						147736	551	562	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147717	574	585	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	607	618	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147710	609	620	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994
						147708	612	623	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
147718	621	632	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147746	625	636	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147736	658	669	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147720	676	687	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
147721	683	694	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
						398167	704	715	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398092	705	718	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
						147722	709	720	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
147723	715	726	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						147746	733	744	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398093	758	771	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398168	760	771	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
147725	761	772	CTCGGACTTTGA	1-10-1 MOE	1119
						147726	766	777	TGACTCTCGGAC	1-10-1 MOE	1120
147738	780	791	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147727	807	818	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147728	846	857	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						398094	848	861	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
398169	849	860	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
						147729	863	874	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
398095	866	879	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011

 

398164	873	884	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147730	874	885	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
147731	880	891	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						147732	885	896	GGGTCTTTCCTC	1-10-1 MOE	1122
147738	888	899	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147733	906	917	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
398096	971	984	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
						147735	973	984	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
147736	978	989	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147729	979	990	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
147737	984	995	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						368349	1025	1038	CTGCACTGACGAGT	2-10-2 MOE	1017
368369	1025	1040	TCCTGCACTGACGAGT	3-10-3 MOE	893
						368350	1027	1040	TCCTGCACTGACGA	2-10-2 MOE	1079
368370	1027	1042	GATCCTGCACTGACGA	3-10-3 MOE	1080
						368351	1029	1042	GATCCTGCACTGAC	2-10-2 MOE	1081
368371	1029	1044	CTGATCCTGCACTGAC	3-10-3 MOE	1082
						368352	1031	1044	CTGATCCTGCACTG	2-10-2 MOE	1105
368372	1031	1046	CACTGATCCTGCACTG	3-10-3 MOE	894
						368353	1033	1046	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
368373	1033	1048	TCCACTGATCCTGCAC	3-10-3 MOE	1083
						368354	1035	1048	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
368368	1035	1048	TCCACTGATCCTTA	2-10-2 MOE	1127
						368374	1035	1050	CTTCCACTGATCCTGC	3-10-3 MOE	1126
368388	1035	1050	CTTCCACTGATCCTTA	3-10-3 MOE	895
						147074	1036	1047	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
368355	1036	1049	TTCCACTGATCCTG	2-10-2 MOE	1025
						368375	1036	1051	CCTTCCACTGATCCTG	3-10-3 MOE	1020
147075	1037	1048	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						368356	1037	1050	CTTCCACTGATCCT	2-10-2 MOE	1027
368376	1037	1052	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
						147076	1038	1049	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368357	1038	1051	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						368377	1038	1053	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
147077	1039	1050	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047

 

368358	1039	1052	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
						368378	1039	1054	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
147078	1040	1051	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	1041	1052	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
368359	1041	1054	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
						368379	1041	1056	AAGCTCCTTCCACTGA	3-10-3 MOE	1034
147080	1042	1053	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147081	1043	1054	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	1043	1056	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						368380	1043	1058	GAAAGCTCCTTCCACT	3-10-3 MOE	896
147082	1044	1055	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						368361	1045	1058	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
368381	1045	1060	GGGAAAGCTCCTTCCA	3-10-3 MOE	1037
						147729	1087	1098	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
147738	1103	1114	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147739	1107	1118	CGTTTGGGTGGC	1-10-1 MOE	1023
147740	1124	1135	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
						398117	1164	1177	TTTCCACTTGGGTG	2-10-2 MOE	960
147741	1165	1176	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398097	1194	1207	GGCAGTCTTTATCC	2-10-2 MOE	897
398098	1272	1285	TAACTTCAGTGTCT	2-10-2 MOE	1131
						398117	1272	1285	TTTCCACTTGGGTG	2-10-2 MOE	960
147742	1273	1284	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147698	1293	1304	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
147743	1388	1399	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						398099	1388	1401	GAAGGGCTTCCAGT	2-10-2 MOE	1132
147744	1392	1403	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						398100	1395	1408	TGACCAGGAAGGGC	2-10-2 MOE	1133
147745	1398	1409	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						398157	1455	1468	GGAAACATACCCTG	2-10-2 MOE	1045
147745	1458	1469	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						398167	1475	1486	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398118	1564	1577	CGCGAGATATCTAA	2-10-2 MOE	1084
						147697	1575	1586	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000
147076	1596	1607	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029

 

368357	1596	1609	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						147077	1597	1608	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
147078	1598	1609	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						398118	1672	1685	CGCGAGATATCTAA	2-10-2 MOE	1084
398158	1681	1694	AGGCCCTGAGATTA	2-10-2 MOE	1134
						147697	1683	1694	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000
398159	1686	1699	GGTTAAGGCCCTGA	2-10-2 MOE	1135
						398160	1691	1704	GAATAGGTTAAGGC	2-10-2 MOE	1048
398163	1711	1722	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						147733	1717	1728	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147089	1747	1758	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						147090	1748	1759	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
147746	1750	1761	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						389949	1777	1788	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
398161	1790	1803	AACAATGTGTTGTA	2-10-2 MOE	1049
						147746	1799	1810	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147700	1801	1812	GCGCTAGGCCGC	1-10-1 MOE	1110
						147740	1806	1817	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
398163	1819	1830	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						147733	1825	1836	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
389950	1848	1859	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
						147701	1858	1869	CCATGGCGGGAC	1-10-1 MOE	921
398164	1889	1900	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147730	1890	1901	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
147700	1909	1920	GCGCTAGGCCGC	1-10-1 MOE	1110
						398119	1920	1933	CGCACCTGGTAAAT	2-10-2 MOE	1085
147685	1957	1968	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
						147701	1966	1977	CCATGGCGGGAC	1-10-1 MOE	921
398120	1966	1979	GTTCAAGCGGCCTA	2-10-2 MOE	1086
						398101	1977	1990	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064
398164	1997	2008	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147730	1998	2009	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
147702	2025	2036	CTGGTAAATAGC	1-10-1 MOE	898
						398119	2028	2041	CGCACCTGGTAAAT	2-10-2 MOE	1085
398120	2074	2087	GTTCAAGCGGCCTA	2-10-2 MOE	1086

 

398105	2099	2112	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
						147736	2204	2215	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147741	2257	2268	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398104	2272	2285	CAAGAAGACCTTAC	2-10-2 MOE	1065
147737	2360	2371	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398105	2361	2374	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147737	2386	2397	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398095	2407	2420	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
398106	2441	2454	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
						398107	2447	2460	TATTCCTGGAAAAC	2-10-2 MOE	902
398121	2474	2487	GTGCCTAGCACAGA	2-10-2 MOE	1097
						147745	2497	2508	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
147712	2499	2510	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						398108	2544	2557	GGAATGTCTGAGTT	2-10-2 MOE	1136
147691	2575	2586	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398121	2582	2595	GTGCCTAGCACAGA	2-10-2 MOE	1097
147738	2622	2633	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						398162	2666	2679	ACCAAACAGTTCAG	2-10-2 MOE	1057
147745	2689	2700	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						398167	2706	2717	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398092	2707	2720	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
						398109	2714	2727	CAAGAAGTGTGGTT	2-10-2 MOE	903
398110	2852	2865	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
						147091	2854	2865	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147723	2924	2935	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						398111	2937	2950	GTGAAAATGCTGGC	2-10-2 MOE	904
398166	2966	2977	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147089	2978	2989	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
147090	2979	2990	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
						147706	3007	3018	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
389949	3008	3019	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
						147723	3032	3043	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147740	3037	3048	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
						398112	3051	3064	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
389950	3079	3090	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063

 

147746	3084	3095	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398122	3148	3161	CCCTTTACACAAGT	2-10-2 MOE	1087
147089	3151	3162	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						147090	3152	3163	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
398113	3160	3173	AGGAGGTTAAACCA	2-10-2 MOE	905
						147685	3188	3199	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
398101	3208	3221	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064
						398102	3234	3247	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
398123	3235	3248	CTCAAAATAGATTT	2-10-2 MOE	1088
						398114	3237	3250	AGGCATATAGCAGA	2-10-2 MOE	1075
398103	3241	3254	CCCAGTACTACCTG	2-10-2 MOE	900
						398115	3253	3266	AGTAAATATTGGCT	2-10-2 MOE	1076
398122	3256	3269	CCCTTTACACAAGT	2-10-2 MOE	1087
						147089	3259	3270	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
147090	3260	3271	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
						398116	3266	3279	TAATGACCTGATGA	2-10-2 MOE	1137
390030	3306	3317	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398123	3343	3356	CTCAAAATAGATTT	2-10-2 MOE	1088
147736	3435	3446	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						398104	3503	3516	CAAGAAGACCTTAC	2-10-2 MOE	1065
147737	3591	3602	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398105	3592	3605	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147719	3608	3619	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
						147737	3617	3628	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
401398	3621	3634	CAAAGTCCCTTAGC	2-10-2 MOE	947
						147079	3637	3648	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	3638	3649	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						398095	3638	3651	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
398106	3672	3685	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
						147733	3687	3698	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147731	3688	3699	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						147719	3716	3727	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147745	3728	3739	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						147683	3740	3751	GCTTACGATTGT	1-10-1 MOE	922
147079	3745	3756	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001

 

147080	3746	3757	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						398108	3775	3788	GGAATGTCTGAGTT	2-10-2 MOE	1136
147733	3795	3806	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						147731	3796	3807	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147691	3806	3817	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147738	3853	3864	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
398167	3926	3937	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147691	3978	3989	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
398167	4034	4045	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147091	4085	4096	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147691	4086	4097	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398111	4168	4181	GTGAAAATGCTGGC	2-10-2 MOE	904
398166	4197	4208	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147091	4223	4234	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147092	4224	4235	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901
						398112	4282	4295	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
147746	4315	4326	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398113	4391	4404	AGGAGGTTAAACCA	2-10-2 MOE	905
147723	4422	4433	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						398114	4468	4481	AGGCATATAGCAGA	2-10-2 MOE	1075
398I15	4484	4497	AGTAAATATTGGCT	2-10-2 MOE	1076
						390030	4491	4502	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
398116	4497	4510	TAATGACCTGATGA	2-10-2 MOE	1137
						147723	4530	4541	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
390030	4599	4610	TTTATAAAACTG	1-10-1MOE	1074
						398124	4761	4774	CACATGAGCTATTC	2-10-2 MOE	1089
398124	4869	4882	CACATGAGCTATTC	2-10-2 MOE	1089
						147703	4926	4937	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
147692	4928	4939	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147696	4975	4986	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
147703	5034	5045	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						147692	5036	5047	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
147098	5173	5184	AGTTGTTGTTCC	1-10-1 MOE	1112
						398125	5183	5196	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
398126	5216	5229	GTGAAGTGAGTCAT	2-10-2 MOE	1090

 

147098	5281	5292	AGTTGTTGTTCC	1-10-1 MOE	1112
						398127	5283	5296	GGTCACTCAAGATG	2-10-2 MOE	1091
398126	5324	5337	GTGAAGTGAGTCAT	2-10-2 MOE	1090
						398128	5335	5348	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
398127	5391	5404	GGTCACTCAAGATG	2-10-2 MOE	1091
						398128	5443	5456	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
147712	5474	5485	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147736	5600	5611	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147746	5606	5617	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398129	5628	5641	TTTGAGGAGCTATT	2-10-2 MOE	1106
147085	5654	5665	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
						147736	5708	5719	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
398129	5736	5749	TTTGAGGAGCTATT	2-10-2 MOE	1106
						147679	5934	5945	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
147723	6229	6240	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						147723	6338	6349	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
390030	6803	6814	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398142	6885	6898	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
390030	6912	6923	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398142	6994	7007	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
147695	7054	7065	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
						147695	7163	7174	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
398166	7197	7208	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						398166	7306	7317	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
147684	7442	7453	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						398130	7694	7707	TTAGTATGACAGCT	2-10-2 MOE	925
398131	7711	7724	GGACTCACTCAGCA	2-10-2 MOE	1092
						398130	7802	7815	TTAGTATGACAGCT	2-10-2 MOE	925
398125	7804	7817	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
						398131	7819	7832	GGACTCACTCAGCA	2-10-2 MOE	1092
390030	7877	7888	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398125	7912	7925	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
390030	7985	7996	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398132	8031	8044	TCAGGGCTACTCAT	2-10-2 MOE	1093
398132	8139	8152	TCAGGGCTACTCAT	2-10-2 MOE	1093

 

147684	8148	8159	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						147684	8256	8267	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
398163	8365	8376	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						398166	8447	8458	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
398163	8473	8484	ATGTCAACCGGC	1-10-1 MOE	908
						398166	8555	8566	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
147718	8631	8642	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147691	8698	8709	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147691	8806	8817	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147728	8835	8846	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
147727	8876	8887	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147728	8943	8954	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398169	8946	8957	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
						147727	8984	8995	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147742	9060	9071	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						398133	9112	9125	CAGCACTAGATTCA	2-10-2 MOE	1094
384545	9135	9146	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147742	9168	9179	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
398133	9220	9233	CAGCACTAGATTCA	2-10-2 MOE	1094
						384545	9243	9254	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
398125	9368	9381	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
						398125	9476	9489	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
401409	9516	9529	ATTCTTAACACAGA	2-10-2 MOE	991
						147096	9594	9605	TTGTTGTTCCCT	1-10-1 MOE	1107
147733	9597	9608	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						147720	9689	9700	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
147096	9702	9713	TTGTTGTTCCCT	1-10-1 MOE	1107
						147733	9705	9716	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147720	9797	9808	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						147746	9963	9974	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	9966	9977	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	9969	9980	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	9991	10002	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	10071	10082	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	10074	10085	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073

 

147746	10077	10088	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	10099	10110	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398134	10153	10166	TAGCTTAATGTAAC	2-10-2 MOE	1095
						147085	10221	10232	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
398134	10261	10274	TAGCTTAATGTAAC	2-10-2 MOE	1095
						390030	10278	10289	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147084	10328	10339	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
						147711	10684	10695	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
398128	11333	11346	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
						398128	11340	11353	CTAAATTTAGTTCA	2-10-2 MOE	911
147730	11783	11794	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
						147731	11789	11800	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147730	11790	11801	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
						147731	11796	11807	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147707	11960	11971	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147090	12008	12019	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
147091	12009	12020	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
						147091	12014	12025	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
398096	12141	12154	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
						147735	12143	12154	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
398096	12146	12159	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
						147735	12148	12159	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
398166	12209	12220	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						398166	12214	12225	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
398135	12303	12316	GACTACATTTTACA	2-10-2 MOE	912
						147741	12389	12400	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
147741	12394	12405	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398125	12431	12444	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
147714	12585	12596	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147718	12594	12605	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
398125	12612	12625	CAGTAAGGAATTTT	2-10-2 MOE	913
						147737	12803	12814	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147746	12876	12887	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147691	12900	12911	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
398136	12915	12928	TTGTGACATCTAGG	2-10-2 MOE	1096

 

147737	12984	12995	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						147746	13057	13068	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147691	13081	13092	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398136	13096	13109	TTGTGACATCTAGG	2-10-2 MOE	1096
398138	13254	13267	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
						398138	13435	13448	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
147691	13488	13499	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147681	13659	13670	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
147691	13669	13680	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						389965	13839	13850	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	13839	13850	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						147681	13840	13851	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
389965	14020	14031	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						389764	14020	14031	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
389948	14067	14078	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
						147736	14123	14134	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
389948	14248	14259	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
						147738	14279	14290	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147736	14304	14315	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147731	14411	14422	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147738	14461	14472	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147692	14475	14486	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
147731	14593	14604	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						389950	14614	14625	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
147692	14657	14668	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147717	14750	14761	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147698	14754	14765	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						389950	14796	14807	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
398112	14863	14876	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
						398121	14875	14888	GTGCCTAGCACAGA	2-10-2MOE	1097
147717	14932	14943	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						398112	15045	15058	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
398121	15057	15070	GTGCCTAGCACAGA	2-10-2 MOE	1097
						147730	15117	15128	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
147730	15299	15310	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121

 

401407	15339	15352	CAGCTTAGGCAGAG	2-10-2 MOE	983
						398167	15556	15567	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147736	16444	16455	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147746	16510	16521	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147738	16590	16601	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147736	16610	16621	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
398167	16631	16642	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						401411	16657	16670	AGCCGCCTGAAGTG	2-10-2 MOE	999
147746	16676	16687	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398144	16745	16758	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
147738	16756	16767	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						398167	16797	16808	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
398144	16911	16924	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
						389965	17096	17107	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	17096	17107	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389965	17264	17275	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	17264	17275	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						147709	17406	17417	CCATTTTTATCA	1-10-1 MOE	978
147745	17443	17454	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						147746	17497	17508	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147720	17589	17600	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						147745	17611	17622	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
147695	17634	17645	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
						147746	17665	17676	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147088	17707	17718	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
						147720	17757	17768	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
147711	17808	17819	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147711	17976	17987	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
398139	18049	18062	AGTGACTGACCACA	2-10-2 MOE	917
						398139	18217	18230	AGTGACTGACCACA	2-10-2 MOE	917
398140	18596	18609	GTAGCATAGAGCCT	2-10-2 MOE	918
						398140	18764	18777	GTAGCATAGAGCCT	2-10-2 MOE	918
398167	18927	18938	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398167	19095	19106	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147724	19147	19158	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139

 

147746	19207	19218	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147724	19315	19326	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139
147740	19348	19359	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
						147746	19375	19386	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147729	19386	19397	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						147701	19503	19514	CCATGGCGGGAC	1-10-1 MOE	921
147711	19508	19519	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147740	19516	19527	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
147718	19617	19628	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						390030	19618	19629	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147679	19635	19646	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
						147711	19676	19687	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147694	19747	19758	CAGCCTACCAGT	1-10-1 MOE	1098
						147718	19785	19796	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
390030	19786	19797	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147679	19803	19814	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
147698	19852	19863	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						147694	19915	19926	CAGCCTACCAGT	1-10-1 MOE	1098
147704	20011	20022	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147698	20020	20031	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
398142	20485	20498	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
						147078	20514	20525	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
147079	20515	20526	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	20516	20527	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
398143	20561	20574	GTCAGTCCCAGCTA	2-10-2 MOE	924
						389965	20620	20631	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	20620	20631	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						398142	20653	20666	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
147078	20682	20693	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	20683	20694	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	20684	20695	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147080	20704	20715	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147081	20705	20716	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						398143	20729	20742	GTCAGTCCCAGCTA	2-10-2 MOE	924
389965	20788	20799	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018

 

389764	20788	20799	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						147746	20870	20881	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147080	20872	20883	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147081	20873	20884	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147746	21038	21049	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147717	21080	21091	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147076	21222	21233	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						147076	21390	21401	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
398094	21441	21454	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
						147746	21465	21476	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398094	21609	21622	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
						398169	21610	21621	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
147746	21633	21644	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147738	21884	21895	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147743	22045	22056	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						147738	22052	22063	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147683	22107	22118	GCTTACGATTGT	1-10-1 MOE	922
						147743	22213	22224	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147681	22566	22577	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						389950	22619	22630	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
147681	22734	22745	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147736	22759	22770	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
389950	22787	22798	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
						389949	22794	22805	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
147736	22927	22938	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						389949	22962	22973	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
398144	22962	22975	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
						398142	23008	23021	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
147727	23019	23030	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						398169	23064	23075	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
398144	23130	23143	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
						398145	23154	23167	ACATGTCAGTAATT	2-10-2 MOE	1099
398142	23176	23189	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
						147727	23187	23198	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147735	23243	23254	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016

 

398145	23322	23335	ACATGTCAGTAATT	2-10-2 MOE	1099
						147735	23411	23422	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
398146	23478	23491	CTCATGGACACAAA	2-10-2 MOE	1100
						398146	23646	23659	CTCATGGACACAAA	2-10-2 MOE	1100
398147	23784	23797	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
						398114	23853	23866	AGGCATATAGCAGA	2-10-2 MOE	1075
398147	23952	23965	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
						398114	24021	24034	AGGCATATAGCAGA	2-10-2 MOE	1075
147702	24319	24330	CTGGTAAATAGC	1-10-1 MOE	898
						147702	24487	24498	CTGGTAAATAGC	1-10-1 MOE	898
389965	24543	24554	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						389764	24543	24554	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
147713	24602	24613	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
						389965	24711	24722	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	24711	24722	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						147684	24918	24929	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
147684	25086	25097	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						398148	25152	25165	TCATAACTATTAAG	2-10-2 MOE	981
398144	25192	25205	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
						147746	25216	25227	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147736	25313	25324	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						398148	25320	25333	TCATAACTATTAAG	2-10-2 MOE	981
398143	25337	25350	GTCAGTCCCAGCTA	2-10-2 MOE	924
						398144	25360	25373	GACAGCTTCTATAA	2-10-2 MOE	916
147746	25384	25395	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147691	25442	25453	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147736	25481	25492	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						398130	25504	25517	TTAGTATGACAGCT	2-10-2 MOE	925
147691	25610	25621	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147721	25662	25673	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
398130	25672	25685	TTAGTATGACAGCT	2-10-2 MOE	925
						147688	25750	25761	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
147746	25810	25821	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147721	25830	25841	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147688	25918	25929	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990

 

147746	25978	25989	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	26172	26183	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	26340	26351	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398149	26492	26505	GGAAGTTTTCAAGT	2-10-2 MOE	1101
398150	26526	26539	GAATCTGGAGGTAA	2-10-2 MOE	1102
						398149	26641	26654	GGAAGTTTTCAAGT	2-10-2 MOE	1101
398150	26675	26688	GAATCTGGAGGTAA	2-10-2 MOE	1102
						147729	26712	26723	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
398151	26718	26731	TCAGTGTAGGAAGA	2-10-2 MOE	926
						147729	26861	26872	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
398151	26867	26880	TCAGTGTAGGAAGA	2-10-2 MOE	926
						147728	26917	26928	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
147728	27066	27077	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147076	27258	27269	TTCCACTGATCC	1-10-1MOE	1029
147731	27267	27278	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						147076	27407	27418	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
147731	27416	27427	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						398152	27559	27572	TGAATATACAGATG	2-10-2 MOE	927
398152	27708	27721	TGAATATACAGATG	2-10-2 MOE	927
						147696	28265	28276	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
147696	28414	28425	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
						147698	28481	28492	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
147720	28662	28673	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						389965	28714	28725	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	28714	28725	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389965	28861	28872	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	28861	28872	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						398153	28980	28993	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
398153	29126	29139	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
						147719	29570	29581	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
398154	29692	29705	AGCCCCTTGGCCGT	2-10-2 MOE	1103
						147719	29715	29726	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
398155	29785	29798	TGTTTTTACACAGA	2-10-2 MOE	970
						398154	29837	29850	AGCCCCTTGGCCGT	2-10-2 MOE	1103
401384	29905	29918	TGAACACATCACTA	2-10-2 MOE	933

 

398155	29930	29943	TGTTTTTACACAGA	2-10-2 MOE	970
						390030	29945	29956	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
390030	30090	30101	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						398156	30141	30154	GAATACTTCAAATC	2-10-2 MOE	1104
398156	30286	30299	GAATACTTCAAATC	2-10-2 MOE	1104
						389948	30384	30395	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
389948	30530	30541	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
						398142	30591	30604	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
147744	30654	30665	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						147093	30689	30700	TTGTTCCCTCTA	1-10-1 MOE	929
398142	30738	30751	CCAGCACACTGGAA	2-10-2 MOE	923
						147744	30801	30812	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
398168	31082	31093	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						147746	31105	31116	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
398168	31230	31241	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						390030	31329	31340	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147736	31458	31469	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						390030	31477	31488	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147736	31606	31617	AGGTAGGAGAAG	1-1O-1 MOE	963
						147698	31713	31724	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
384545	31829	31840	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147698	31861	31872	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
147723	31941	31952	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						384545	31977	31988	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
147692	32061	32072	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147723	32089	32100	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147692	32209	32220	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147089	32535	32546	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
401396	32569	32582	TGCAGGATGTTGAG	2-10-2 MOE	945
						147730	32714	32725	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
398165	32854	32865	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
						147730	32862	32873	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
389950	32949	32960	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
						398165	33002	33013	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147736	33012	33023	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963

 

368352	33056	33069	CTGATCCTGCACTG	2-10-2 MOE	1105
						147081	33073	33084	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	33073	33086	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						147082	33074	33085	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
389950	33097	33108	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
						147736	33160	33171	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
368352	33204	33217	CTGATCCTGCACTG	2-10-2 MOE	1105
						147081	33221	33232	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	33222	33233	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						398138	33244	33257	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
147746	33250	33261	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398138	33392	33405	AACATCAAGCTTGA	2-10-2 MOE	931
147746	33398	33409	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147732	33652	33663	GGGTCTTTCCTC	1-10-1MOE	1122
147724	33733	33744	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139
						147732	33800	33811	GGGTCTTTCCTC	1-10-1 MOE	1122
147724	33881	33892	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139
						147719	33976	33987	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147746	34034	34045	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398129	34045	34058	TTTGAGGAGCTATT	2-10-2 MOE	1106
147719	34124	34135	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
						147721	34156	34167	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
398129	34193	34206	TTTGAGGAGCTATT	2-10-2 MOE	1106
						147721	34304	34315	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147746	34606	34617	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398165	34704	34715	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147746	34754	34765	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398165	34852	34863	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147717	34893	34904	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147719	34976	34987	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147092	34987	34998	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901
						147719	35124	35135	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147092	35135	35146	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901
						147736	35248	35259	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147738	35391	35402	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069

 

147736	35396	35407	AGGTAGGAGAAG	1-10-1  MOE	963
						147738	35539	35550	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147691	35554	35565	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147691	35702	35713	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147746	35814	35825	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147733	35889	35900	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147733	35923	35934	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						147746	35962	35973	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147726	35978	35989	TGACTCTCGGAC	1-10-1 MOE	1120
						147733	36037	36048	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147733	36071	36082	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						147726	36126	36137	TGACTCTCGGAC	1-10-1 MOE	1120
147736	36359	36370	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147691	36360	36371	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147736	36507	36518	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147691	36508	36519	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
147746	36564	36575	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147723	36575	36586	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147731	36620	36631	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						147723	36723	36734	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147731	36768	36779	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						398169	37174	37185	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
147688	37380	37391	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
						147688	37528	37539	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
147714	37881	37892	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147714	38029	38040	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
147681	38364	38375	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147736	38766	38777	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147738	38909	38920	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147736	38914	38925	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147738	39057	39068	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						390030	39249	39260	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
390030	39397	39408	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147717	39545	39556	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147717	39693	39704	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996

 

147746	39729	39740	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	39789	39800	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147691	39829	39840	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147746	39877	39888	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147691	39977	39988	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147727	39983	39994	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147727	40131	40142	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147746	40333	40344	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147719	40457	40468	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
						147679	40467	40478	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
147746	40478	40489	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147741	40565	40576	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
398166	40589	40600	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147719	40605	40616	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147679	40615	40626	CAAAAGGATCCC	1-10-1 MOE	907
						147746	40626	40637	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147735	40662	40673	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147746	40706	40717	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147741	40713	40724	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398166	40737	40748	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
147735	40810	40821	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147746	40854	40865	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147718	41218	41229	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
						147717	41221	41232	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147717	41369	41380	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147723	41627	41638	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147717	41747	41758	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147723	41775	41786	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
390030	41908	41919	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						390030	42056	42067	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
398153	42157	42170	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
						398153	42305	42318	ATTTCTCTTACAGG	2-10-2 MOE	948
147690	42423	42434	TGAAGTTAATTC	1-10-1 MOE	1138
						147695	42521	42532	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
147710	42543	42554	TATAGCTCCTCT	1-10-1 MOE	994

 

147690	42571	42582	TGAAGTTAATTC	1-10-1 MOE	1138
						147695	42669	42680	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
147078	43321	43332	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	43322	43333	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147716	43329	43340	TTAACGAGCCTT	1-10-1 MOE	949
						147078	43469	43480	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
147079	43470	43481	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	43471	43482	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
398102	43837	43850	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
						147074	43848	43859	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
401408	43871	43884	CAATGAAGCACAGG	2-10-2 MOE	989
						398102	43985	43998	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
147736	44137	44148	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147746	44140	44151	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147687	44206	44217	CGACACGGGAAC	1-10-1 MOE	950
						147743	44223	44234	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
384545	44242	44253	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
						147736	44285	44296	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147743	44371	44382	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						384545	44390	44401	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
147728	44589	44600	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						389948	44628	44639	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
147720	44703	44714	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						147728	44729	44740	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
147728	44737	44748	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						389948	44776	44787	CCGTTGGACCCC	1-10-1 MOE	915
147720	44851	44862	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						398110	44861	44874	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
147728	44877	44888	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147705	45092	45103	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147705	45240	45251	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147681	45337	45348	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
147681	45485	45496	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147096	45660	45671	TTGTTGTTCCCT	1-10-1 MOE	1107
147096	45808	45819	TTGTTGTTCCCT	1-10-1 MOE	1107

 

368368	45976	45989	TCCACTGATCCTTA	2-10-2 MOE	1127
						147074	45977	45988	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147075	45978	45989	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						147076	45979	45990	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368368	46124	46137	TCCACTGATCCTTA	2-10-2 MOE	1127
						147075	46126	46137	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
147076	46127	46138	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						147705	46555	46566	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147714	46685	46696	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147705	46703	46714	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147714	46833	46844	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						390030	47007	47018	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147746	47023	47034	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	47171	47182	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147085	47607	47618	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
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147089	47611	47622	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						147091	47613	47624	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
401384	47689	47702	TGAACACATCACTA	2-10-2 MOE	933
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147085	47755	47766	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
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147090	47760	47771	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
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390030	47847	47858	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147691	47877	47888	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
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390030	47995	48006	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147074	48222	48233	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
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147691	48541	48552	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						398147	48887	48900	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
398147	49035	49048	CTACAGGACAATAC	2-10-2 MOE	957
						147074	49525	49536	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
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147687	50250	50261	CGACACGGGAAC	1-10-1 MOE	950
						398117	50389	50402	TTTCCACTTGGGTG	2-10-2 MOE	960
147736	50436	50447	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147736	50582	50593	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
398168	50703	50714	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						401397	50822	50835	CTGGTCAGCATTGA	2-10-2 MOE	946
147746	51019	51030	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147708	51101	51112	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
147746	51165	51176	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	51185	51196	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147708	51247	51258	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
						147081	51287	51298	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	51288	51299	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						147746	51324	51335	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147746	51331	51342	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147728	51376	51387	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
147729	51406	51417	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						147081	51433	51444	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	51434	51445	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						147728	51492	51503	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
147728	51522	51533	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147729	51552	51563	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
368360	51633	51646	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035

 

147082	51634	51645	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						368361	51635	51648	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
147728	51638	51649	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147695	51644	51655	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
147736	51713	51724	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147684	51721	51732	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
147081	51779	51790	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						368360	51779	51792	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
147082	51780	51791	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						368361	51781	51794	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
147695	51790	51801	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
						147736	51859	51870	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147077	51988	51999	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						147079	51990	52001	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147746	52064	52075	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147681	52085	52096	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
147077	52134	52145	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						147079	52136	52147	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147691	52166	52177	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147719	52252	52263	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147691	52312	52323	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147719	52398	52409	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147728	52428	52439	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147729	52483	52494	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
398167	52527	52538	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147682	52571	52582	CGGGTACTATGG	1-10-1 MOE	992
147728	52574	52585	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						147724	52615	52626	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139
147729	52629	52640	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						147703	52670	52681	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
398167	52673	52684	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398165	52708	52719	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147704	52710	52721	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147705	52716	52727	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147724	52761	52772	GAAATTGAGGAA	1-10-1 MOE	1139

 

398167	52762	52773	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147703	52816	52827	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
398165	52854	52865	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
						147704	52856	52867	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
147705	52862	52873	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						398167	52908	52919	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147689	53063	53074	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						147727	53111	53122	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147727	53158	53169	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147689	53209	53220	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
147727	53257	53268	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147727	53304	53315	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147680	53638	53649	GTATGCACTGCT	1-10-1 MOE	988
						147722	53650	53661	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
147083	53703	53714	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
						147085	53705	53716	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
147086	53706	53717	CTCTACACCAGG	1-10-1 MOE	969
						398167	53724	53735	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
147684	53747	53758	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
						147680	53784	53795	GTATGCACTGCT	1-10-1 MOE	988
147722	53796	53807	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
						147085	53851	53862	TCTACACCAGGT	1-10-1 MOE	961
398167	53870	53881	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147684	53893	53904	ACCCAGTCAGGG	1-10-1 MOE	964
398155	54026	54039	TGTTTTTACACAGA	2-10-2 MOE	970
						147703	54137	54148	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
398155	54172	54185	TGTTTTTACACAGA	2-10-2 MOE	970
						147705	54275	54286	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147703	54283	54294	TGGCTTCATGTC	1-10-1 MOE	971
						147705	54421	54432	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147727	54853	54864	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						398165	54963	54974	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
398090	54963	54976	TTGTTCTTAGGAAG	2-10-2 MOE	972
						147704	54965	54976	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
147705	54971	54982	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002

 

147727	54999	55010	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						398165	55109	55120	GTTCTTAGGAAG	1-10-1 MOE	968
147704	55111	55122	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147705	55117	55128	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147083	55352	55363	TACACCAGGTCA	1-10-1 MOE	973
						147705	55378	55389	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
147705	55524	55535	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
						147712	55819	55830	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147712	55965	55976	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
						147733	56289	56300	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147707	56300	56311	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147708	56306	56317	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
390030	56321	56332	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147081	56333	56344	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
398166	56335	56346	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147733	56435	56446	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
147707	56446	56457	TAGTCATTATCT	1-10-1 MOE	977
						147708	56452	56463	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
390030	56467	56478	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
						147081	56479	56490	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
398091	56479	56492	GGGCTTCTTCCATT	2-10-2 MOE	979
						398166	56481	56492	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
368366	56518	56531	CTGATCCTTAGAAG	2-10-2 MOE	1019
						147743	57612	57623	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147700	57709	57720	GCGCTAGGCCGC	1-10-1 MOE	1110
						147743	57758	57769	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147700	57855	57866	GCGCTAGGCCGC	1-10-1 MOE	1110
						398093	57963	57976	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
398168	57965	57976	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						147698	58105	58116	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
398093	58109	58122	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398168	58111	58122	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
147698	58251	58262	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						147735	58279	58290	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
147735	58425	58436	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016

 

404135	58946	58959	CATTTCCATGGCCA	2-10-2 MOE	1056
						390030	59326	59337	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147711	59357	59368	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147743	59382	59393	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147711	59503	59514	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147743	59528	59539	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
147695	59576	59587	TCATTCCCCACT	1-10-1 MOE	984
						147713	59716	59727	CTCCCACACCAT	1-10-1 MOE	985
147714	59721	59732	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147715	59746	59757	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
147716	59771	59782	TTAACGAGCCTT	1-10-1 MOE	949
						147712	59857	59868	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147714	59867	59878	TTCTGCTCCCAC	1-10-1 MOE	986
						147715	59892	59903	GTTGAGCATGAC	1-10-1 MOE	1077
147716	59917	59928	TTAACGAGCCTT	1-10-1 MOE	949
						390030	59993	60004	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147690	60270	60281	TGAAGTTAATTC	1-10-1 MOE	1138
						389949	60325	60336	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
147690	60416	60427	TGAAGTTAATTC	1-10-1 MOE	1138
						389949	60471	60482	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
147746	60619	60630	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						384545	60676	60687	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
147746	60765	60776	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						384545	60822	60833	CAAGTAGGATGT	1-10-1 MOE	951
147689	60967	60978	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						147689	61008	61019	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
147689	61049	61060	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						398105	61121	61134	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147689	61154	61165	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						147689	61195	61206	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
398105	61267	61280	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
						147692	61365	61376	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
147692	61511	61522	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147680	61619	61630	GTATGCACTGCT	1-10-1 MOE	988
147078	61755	61766	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044

 

147079	61756	61767	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	61757	61768	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147078	61901	61912	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	61902	61913	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	61903	61914	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147088	62361	62372	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
401384	62573	62586	TGAACACATCACTA	2-10-2 MOE	933
						147688	62697	62708	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
147746	63102	63113	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147721	63225	63236	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147742	63226	63237	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147746	63248	63259	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147682	63337	63348	CGGGTACTATGG	1-10-1 MOE	992
						147721	63371	63382	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147742	63372	63383	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147688	63401	63412	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
147097	63449	63460	GTTGTTGTTCCC	1-10-1 MOE	1111
						147098	63450	63461	AGTTGTTGTTCC	1-10-1 MOE	1112
401409	63458	63471	ATTCTTAACACAGA	2-10-2 MOE	991
						147084	63531	63542	CTACACCAGGTC	1-10-1 MOE	993
147688	63547	63558	TCCCAAACAAAT	1-10-1 MOE	990
						147097	63595	63606	GTTGTTGTTCCC	1-10-1 MOE	1111
147098	63596	63607	AGTTGTTGTTCC	1-10-1 MOE	1112
						147721	64086	64097	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147721	64232	64243	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
						147692	64233	64244	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
147692	64379	64390	CTCACCTTCATG	1-10-1 MOE	1113
						147729	64633	64644	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
401403	64746	64759	TTTCCTAGGAGGTG	2-10-2 MOE	967
						147729	64779	64790	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
147746	65151	65162	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147746	65297	65308	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
147689	65302	65313	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
						147689	65448	65459	CAGAGAAGGTCT	1-10-1 MOE	987
147717	65862	65873	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996

 

147717	65895	65906	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147729	66000	66011	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
147717	66008	66019	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
						147717	66041	66052	ATCTTCAGAGAT	1-10-1 MOE	996
147708	66046	66057	TTGATATAGTCA	1-10-1 MOE	997
						147718	66055	66066	TAATATGACTTG	1-10-1 MOE	998
147729	66146	66157	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						147089	66236	66247	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
368363	66281	66294	CTTAGAAGGCAGCA	2-10-2 MOE	1114
						147727	66293	66304	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147093	66319	66330	TTGTTCCCTCTA	1-10-1 MOE	929
						147094	66320	66331	GTTGTTCCCTCT	1-10-1 MOE	1115
147089	66382	66393	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						368363	66427	66440	CTTAGAAGGCAGCA	2-10-2 MOE	1114
147727	66439	66450	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147719	66441	66452	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
147093	66465	66476	TTGTTCCCTCTA	1-10-1 MOE	929
						147094	66466	66477	GTTGTTCCCTCT	1-10-1 MOE	1115
147075	66561	66572	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						368357	66562	66575	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
147076	66562	66573	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						368377	66562	66577	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
147077	66563	66574	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						368358	66563	66576	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
147078	66564	66575	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						147079	66565	66576	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	66566	66577	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147081	66567	66578	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147719	66587	66598	CCAACTCCAACT	1-10-1 MOE	1116
						147075	66707	66718	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
368377	66708	66723	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
						147076	66708	66719	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368357	66708	66721	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						147077	66709	66720	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
147078	66710	66721	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044

 

147079	66711	66722	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
						147080	66712	66723	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147081	66713	66724	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						147089	66842	66853	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
147089	66988	66999	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						147075	66999	67010	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
147075	67145	67156	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						147705	67213	67224	CGGTTTTTGTTC	1-10-1 MOE	1002
401413	67301	67314	TGCAGCCATGTACT	2-10-2 MOE	1022
						147737	67309	67320	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147080	67430	67441	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147737	67455	67466	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
147080	67576	67587	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						147082	67578	67589	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
147090	67582	67593	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
						147091	67583	67594	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147742	67591	67602	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
						147090	67728	67739	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
147698	68036	68047	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						147698	68182	68193	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
147681	68267	68278	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147721	68386	68397	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147681	68413	68424	ATGTCATTAAAC	1-10-1 MOE	965
						147712	68527	68538	ACACCATCTCCC	1-10-1 MOE	1005
147721	68532	68543	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
						147711	68760	68771	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
147711	68906	68917	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
						147696	69045	69056	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
147696	69191	69202	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
						147723	69194	69205	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147723	69210	69221	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						389965	69271	69282	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	69271	69282	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						147723	69340	69351	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147723	69356	69367	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892

 

398101	69357	69370	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064
						389965	69417	69428	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389764	69417	69428	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						398101	69503	69516	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064
368353	69519	69532	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
						147074	69522	69533	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
147081	69631	69642	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						368353	69665	69678	CACTGATCCTGCAC	2-10-2 MOE	1007
147720	69729	69740	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						147721	69736	69747	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
398167	69757	69768	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147722	69762	69773	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
147723	69768	69779	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
						147080	69776	69787	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
147081	69777	69788	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
						398093	69811	69824	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
398168	69813	69824	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
						147725	69814	69825	CTCGGACTTTGA	1-10-1 MOE	1119
147726	69819	69830	TGACTCTCGGAC	1-10-1 MOE	1120
						147727	69860	69871	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
147720	69875	69886	GATCTCTCGAGT	1-10-1 MOE	1117
						147721	69882	69893	AATGCAGGATCT	1-10-1 MOE	1118
147728	69899	69910	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
						398094	69901	69914	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
398167	69903	69914	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	69904	69917	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
147722	69908	69919	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
						147723	69914	69925	GACTCCAAAGTC	1-10-1 MOE	892
147729	69916	69927	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						398095	69919	69932	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
398093	69957	69970	TCGGACTTTGAAAA	2-10-2 MOE	1009
						398168	69959	69970	TCGGACTTTGAA	1-10-1 MOE	1008
147725	69960	69971	CTCGGACTTTGA	1-10-1 MOE	1119
						147726	69965	69976	TGACTCTCGGAC	1-10-1 MOE	1120
147704	69991	70002	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012

 

147727	70006	70017	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147728	70045	70056	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398094	70047	70060	ATCAGCCAGACAGA	2-10-2 MOE	1010
						398169	70048	70059	TCAGCCAGACAG	1-10-1 MOE	909
147729	70062	70073	GTAAGAGGCAGG	1-10-1 MOE	920
						398095	70065	70078	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
147704	70137	70148	TTGTTCTTAGGA	1-10-1 MOE	1012
						147697	70161	70172	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000
147697	70307	70318	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000
						147728	70450	70461	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398164	70464	70475	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147730	70465	70476	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
147731	70471	70482	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
						147732	70476	70487	GGGTCTTTCCTC	1-10-1 MOE	1122
147733	70497	70508	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
						398096	70562	70575	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
147735	70564	70575	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
						147736	70569	70580	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147737	70575	70586	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						147728	70596	70607	GCCAGACAGAAG	1-10-1 MOE	1013
398164	70610	70621	TTGTCGATCTGC	1-10-1 MOE	1014
						147730	70611	70622	CTTGTCCATCAG	1-10-1 MOE	1121
368349	70616	70629	CTGCACTGACGAGT	2-10-2 MOE	1017
						147731	70617	70628	TTTCCTCTTGTC	1-10-1 MOE	934
147732	70622	70633	GGGTCTTTCCTC	1-10-1 MOE	1122
						147733	70643	70654	TTCTTGATGTCC	1-10-1 MOE	891
398096	70708	70721	GGAGAAGCGCAGCT	2-10-2 MOE	1015
						147735	70710	70721	GGAGAAGCGCAG	1-10-1 MOE	1016
147736	70715	70726	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
						147737	70721	70732	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
389764	70784	70795	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389965	70784	70795	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
389965	70930	70941	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						389764	70930	70941	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
368386	70995	71010	CACTGATCCTTAGAAG	3-10-3 MOE	1123

 

368367	70997	71010	CACTGATCCTTAGA	2-10-2 MOE	1124
						368387	70997	71012	TCCACTGATCCTTAGA	3-10-3 MOE	1125
368354	70999	71012	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
						368374	70999	71014	CTTCCACTGATCCTGC	3-10-3 MOE	1126
368368	70999	71012	TCCACTGATCCTTA	2-10-2 MOE	1127
						368388	70999	71014	CTTCCACTGATCCTTA	3-10-3 MOE	895
368355	71000	71013	TTCCACTGATCCTG	2-10-2 MOE	1025
						147074	71000	71011	CCACTGATCCTG	1-10-1 MOE	845
368375	71000	71015	CCTTCCACTGATCCTG	3-10-3 MOE	1020
						147075	71001	71012	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
368376	71001	71016	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
						147076	71002	71013	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368357	71002	71015	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						368377	71002	71017	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
147077	71003	71014	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						368378	71003	71018	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
147078	71004	71015	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						368359	71005	71018	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
368379	71005	71020	AAGCTCCTTCCACTGA	3-10-3 MOE	1034
						147079	71005	71016	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
147080	71006	71017	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
						368360	71007	71020	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
368380	71007	71022	GAAAGCTCCTTCCACT	3-10-3 MOE	896
						147081	71007	71018	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
147082	71008	71019	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
						368361	71009	71022	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
368381	71009	71024	GGGAAAGCTCCTTCCA	3-10-3 MOE	1037
						147738	71067	71078	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147739	71071	71082	CGTTTGGGTGGC	1-10-1 MOE	1023
						147740	71088	71099	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
147741	71129	71140	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						368366	71141	71154	CTGATCCTTAGAAG	2-10-2 MOE	1019
368386	71141	71156	CACTGATCCTTAGAAG	3-10-3 MOE	1123
						368367	71143	71156	CACTGATCCTTAGA	2-10-2 MOE	1124
368387	71143	71158	TCCACTGATCCTTAGA	3-10-3 MOE	1125

 

368374	71145	71160	CTTCCACTGATCCTGC	3-10-3 MOE	1126
						368354	71145	71158	TCCACTGATCCTGC	2-10-2 MOE	1024
368368	71145	71158	TCCACTGATCCTTA	2-10-2 MOE	1127
						368388	71145	71160	CTTCCACTGATCCTTA	3-10-3 MOE	895
368355	71146	71159	TTCCACTGATCCTG	2-10-2 MOE	1025
						368375	71146	71161	CCTTCCACTGATCCTG	3-10-3 MOE	1020
147075	71147	71158	TCCACTGATCCT	1-10-1 MOE	1026
						368356	71147	71160	CTTCCACTGATCCT	2-10-2 MOE	1027
368376	71147	71162	TCCTTCCACTGATCCT	3-10-3 MOE	1028
						147076	71148	71159	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368357	71148	71161	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						368377	71148	71163	CTCCTTCCACTGATCC	3-10-3 MOE	1030
147077	71149	71160	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						368358	71149	71162	TCCTTCCACTGATC	2-10-2 MOE	1031
368378	71149	71164	GCTCCTTCCACTGATC	3-10-3 MOE	1032
						147078	71150	71161	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
368359	71151	71164	GCTCCTTCCACTGA	2-10-2 MOE	1033
						147079	71151	71162	TCCTTCCACTGA	1-10-1 MOE	1001
368379	71151	71166	AAGCTCCTTCCACTGA	3-10-3 MOE	1034
						147080	71152	71163	CTCCTTCCACTG	1-10-1 MOE	1021
368380	71153	71168	GAAAGCTCCTTCCACT	3-10-3 MOE	896
						147081	71153	71164	GCTCCTTCCACT	1-10-1 MOE	1006
368360	71153	71166	AAGCTCCTTCCACT	2-10-2 MOE	1035
						147082	71154	71165	AGCTCCTTCCAC	1-10-1 MOE	1036
368381	71155	71170	GGGAAAGCTCCTTCCA	3-10-3 MOE	1037
						368361	71155	71168	GAAAGCTCCTTCCA	2-10-2 MOE	962
398097	71158	71171	GGCAGTCTTTATCC	2-10-2 MOE	897
						147738	71213	71224	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
147739	71217	71228	CGTTTGGGTGGC	1-10-1 MOE	1023
						147740	71234	71245	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
147741	71275	71286	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						398097	71304	71317	GGCAGTCTTTATCC	2-10-2 MOE	897
147727	71702	71713	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
						147727	71848	71859	CAGTGGACCACA	1-10-1 MOE	1128
390030	71986	71997	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074

 

147102	72015	72026	TGCGAGTTGTTG	1-10-1 MOE	1129
						390030	72132	72143	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
147102	72161	72172	TGCGAGTTGTTG	1-10-1 MOE	1129
						147722	72199	72210	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
147696	72232	72243	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
						147741	72254	72265	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
147722	72345	72356	AAAGTCAGGCCA	1-10-1 MOE	1130
						147696	72378	72389	TGGATGATTGGC	1-10-1 MOE	906
147741	72400	72411	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						147711	72446	72457	AAGGGCCCTGGG	1-10-1 MOE	1040
398098	72574	72587	TAACTTCAGTGTCT	2-10-2 MOE	1131
						147742	72575	72586	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
147698	72595	72606	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						147743	72690	72701	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
398099	72690	72703	GAAGGGCTTCCAGT	2-10-2 MOE	1132
						147744	72694	72705	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
398100	72697	72710	TGACCAGGAAGGGC	2-10-2 MOE	1133
						147745	72700	72711	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398098	72720	72733	TAACTTCAGTGTCT	2-10-2 MOE	1131
						147742	72721	72732	AACTTCAGTGTC	1-10-1 MOE	1041
147698	72741	72752	CCCGCCACCACC	1-10-1 MOE	928
						398157	72757	72770	GGAAACATACCCTG	2-10-2 MOE	1045
147743	72836	72847	AGGGCTTCCAGT	1-10-1 MOE	1042
						398099	72836	72849	GAAGGGCTTCCAGT	2-10-2 MOE	1132
147744	72840	72851	AGGAAGGGCTTC	1-10-1 MOE	1043
						398100	72843	72856	TGACCAGGAAGGGC	2-10-2 MOE	1133
147745	72846	72857	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
						147076	72898	72909	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
368357	72898	72911	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
						147077	72899	72910	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
147078	72900	72911	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
						398157	72903	72916	GGAAACATACCCTG	2-10-2 MOE	1045
398158	72983	72996	AGGCCCTGAGATTA	2-10-2 MOE	1134
						398159	72988	73001	GGTTAAGGCCCTGA	2-10-2 MOE	1135
398160	72993	73006	GAATAGGTTAAGGC	2-10-2 MOE	1048

 

147076	73044	73055	TTCCACTGATCC	1-10-1 MOE	1029
						368357	73044	73057	CCTTCCACTGATCC	2-10-2 MOE	1046
147077	73045	73056	CTTCCACTGATC	1-10-1 MOE	1047
						147078	73046	73057	CCTTCCACTGAT	1-10-1 MOE	1044
147746	73052	73063	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398161	73092	73105	AACAATGTGTTGTA	2-10-2 MOE	1049
147746	73101	73112	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398158	73129	73142	AGGCCCTGAGATTA	2-10-2 MOE	1134
398159	73134	73147	GGTTAAGGCCCTGA	2-10-2 MOE	1135
						398160	73139	73152	GAATAGGTTAAGGC	2-10-2 MOE	1048
147746	73198	73209	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						398161	73238	73251	AACAATGTGTTGTA	2-10-2 MOE	1049
147746	73247	73258	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
						147088	73273	73284	CCCTCTACACCA	1-10-1 MOE	1050
398105	73401	73414	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
						398105	73547	73560	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147741	73559	73570	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
						147741	73705	73716	CACCCACTGGTG	1-10-1 MOE	1055
398162	73968	73981	ACCAAACAGTTCAG	2-10-2 MOE	1057
						147745	73991	74002	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398167	74008	74019	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						398092	74009	74022	AGTCAGGCCATGTG	2-10-2 MOE	1060
398162	74114	74127	ACCAAACAGTTCAG	2-10-2 MOE	1057
						147745	74137	74148	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398167	74154	74165	CAGGCCATGTGG	1-10-1 MOE	1059
						147089	74280	74291	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
147090	74281	74292	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
						389949	74310	74321	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
147740	74339	74350	TGTGAGGCTCCA	1-10-1 MOE	1062
						389950	74381	74392	CCCTGAAGGTTC	1-10-1 MOE	1063
147089	74426	74437	TCCCTCTACACC	1-10-1 MOE	956
						147090	74427	74438	TTCCCTCTACAC	1-10-1 MOE	955
389949	74456	74467	GCGCGAGCCCGA	1-10-1 MOE	1061
						147685	74490	74501	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
398101	74510	74523	TTTGATAAAGCCCT	2-10-2 MOE	1064

 

398102	74536	74549	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
						398103	74543	74556	CCCAGTACTACCTG	2-10-2 MOE	900
147685	74636	74647	GGCTGACATTCA	1-10-1 MOE	975
						398102	74682	74695	CTACCTGAGGATTT	2-10-2 MOE	899
398103	74689	74702	CCCAGTACTACCTG	2-10-2 MOE	900
						147736	74737	74748	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
398104	74805	74818	CAAGAAGACCTTAC	2-10-2 MOE	1065
						147736	74883	74894	AGGTAGGAGAAG	1-10-1 MOE	963
147737	74893	74904	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398105	74894	74907	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147737	74919	74930	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398095	74940	74953	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
398104	74951	74964	CAAGAAGACCTTAC	2-10-2 MOE	1065
						398106	74974	74987	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
398107	74980	74993	TATTCCTGGAAAAC	2-10-2 MOE	902
						147745	75030	75041	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
147737	75039	75050	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398105	75040	75053	TGCACAGGCAGGTT	2-10-2 MOE	1066
147737	75065	75076	ACAGCCAGGTAG	1-10-1 MOE	1067
						398108	75077	75090	GGAATGTCTGAGTT	2-10-2 MOE	1136
398095	75086	75099	CATCAGCAAGAGGC	2-10-2 MOE	1011
						147691	75108	75119	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
398106	75120	75133	TGGAAAACTGCACC	2-10-2 MOE	1068
						398107	75126	75139	TATTCCTGGAAAAC	2-10-2 MOE	902
147738	75155	75166	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
						147745	75176	75187	TTGACCAGGAAG	1-10-1 MOE	1058
398108	75223	75236	GGAATGTCTGAGTT	2-10-2 MOE	1136
						398109	75247	75260	CAAGAAGTGTGGTT	2-10-2 MOE	903
147691	75254	75265	GAGGTGGGAAAA	1-10-1 MOE	966
						147738	75301	75312	TGGGTGGCCGGG	1-10-1 MOE	1069
398110	75385	75398	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
						147091	75387	75398	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
398109	75393	75406	CAAGAAGTGTGGTT	2-10-2 MOE	903
						398111	75470	75483	GTGAAAATGCTGGC	2-10-2 MOE	904
401385	75494	75507	CCCAGTGGGTTTGA	2-10-2 MOE	890

 

398166	75499	75510	GGGCTTCTTCCA	1-10-1 MOE	1070
						147091	75525	75536	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
147092	75526	75537	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901
						398110	75531	75544	GTTCCCTTTGCAGG	2-10-2 MOE	952
147091	75533	75544	GTTCCCTCTACA	1-10-1 MOE	1004
						147706	75540	75551	GCTGACATCTCG	1-10-1 MOE	1071
398112	75584	75597	CAGCCTGGCACCTA	2-10-2 MOE	1072
						398111	75616	75629	GTGAAAATGCTGGC	2-10-2 MOE	904
147746	75617	75628	TAAAAACAACAA	1-10-1 MOE	1073
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						147092	75672	75683	TGTTCCCTCTAC	1-10-1 MOE	901
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147697	77759	77770	CCCCAGCAGCGG	1-10-1 MOE	1000

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸177-190。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸177-190。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸177-190的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 886、859、或853的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸177-190的短反义化合物选自Isis No 147022、147023、或147024。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸195-228。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸195-228。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸195-228的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 877、868、882、886、859、853、865、835、843、846、842、848、874、849、863、855、850、864、或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸195-228的短反义化合物选自Isis No 147019、147020、147021、147022、147023、147024、147025、147026、147027、147028、147073、147029、147030、147036、147037、147038、147039、147040、或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸323-353。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸323-353。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸323-353的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 866、881、869、883、858、833、875、837、829、871、884、887、839、830、840、861、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸323-353的短反义化合物选自Isis No 147042、147043、147044、147045、147046、147047、147051、147052、147053、147054、147055、147056、147057、147058、147059、147060、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸322-353。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸322-353。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸322-353的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 842、866、881、869、883、858、833、875、837、829、871、884、887、839、830、840、861、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸322-353的短反义化合物选自Isis No 147073、147042、147043、147044、147045、147046、147047、147051、147052、147053、147054、147055、147056、147057、147058、147059、147060、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸679-799。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸679-799。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸679-799的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 883、858、883、或858的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸679-799的短反义化合物选自Isis No 147045、147046、147045、或147046。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸679-827。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸679-827。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸679-827的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 883、858、883、858、或851的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸679-827的短反义化合物选自Isis No 147045、147046、147045、147046、或147066。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1024-1046。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1024-1046。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1024-1046的短反义化合物包含选自SEQ ID NO841、862、880、857、851、876、838、860、878、856、832、或842的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸1024-1046的短反义化合物选自Isis No 147062、147063、147064、147065、147066、147067、147068、147069、147070、147071、147072、或147073。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸992-1046。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸992-1046。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸992-1046的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 831、841、862、880、857、851、876、838、860、878、856、832、或842的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸992-1046的短反义化合物选自Isis No 404131、147062、147063、147064、147065、147066、147067、147068、147069、147070、147071、147072、或147073。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1868-1881。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1868-1881。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1868-1881的短反义化合物包含选自SEQ ID NO886、859、或853的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸1868-1881的短反义化合物选自Isis No 147022、147023、或147024。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1886-1919。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1886-1919。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1886-1919的短反义化合物包含选自SEQ ID NO877、868、882、886、859、865、843、846、874、863、855、864、或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸1886-1919的短反义化合物选自Isis No 147019、147020、147021、147022、147023、147025、147027、147028、147030、147037、147038、147040、或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1869-1919。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1869-1919。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1869-1919的短反义化合物包含选自SEQ ID NO859、853、877、868、882、886、859、865、843、846、874、863、855、864、或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸1869-1919的短反义化合物选自Isis No 147023、147024、147019、147020、147021、147022、147023、147025、147027、147028、147030、147037、147038、147040、或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1976-1989。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1976-1989。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1976-1989的短反义化合物包含选自SEQ ID NO886、859、或853的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸1976-1989的短反义化合物选自Isis No 147022、147023、或147024。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸1995-2027。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸1995-2027。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸1995-2027的短反义化合物包含选自SEQ ID NO868、882、886、859、853、865、835、843、846、848、874、849、863、855、850、864、或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸1995-2027的短反义化合物选自Isis No 147020、147021、147022、147023、147024、147025、147026、147027、147028、147029、147030、147036、147037、147038、147039、147040、或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸2366-2382。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸2366-2382。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸2366-2382的短反义化合物包含选自SEQ ID NO867或873的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸2366-2382的短反义化合物选自Isis No 404199或404134。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸6220-6233。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸6220-6233。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸6220-6233的短反义化合物包含选自SEQ ID NO870、836、或844的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸6220-6233的短反义化合物选自Isis No 147032、147033、或147034。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸6288-6300。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸6288-6300。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸6288-6300的短反义化合物包含选自SEQ ID NO869或883的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸6288-6300的短反义化合物选自Isis No 147044或147045。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸6329-6342。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸6329-6342。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸6329-6342的短反义化合物包含选自SEQ ID NO870、836、或844的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸6329-6342的短反义化合物选自Isis No 147032、147033、或147034。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸6397-6409。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸6397-6409。在某些此类实施方案中，靶向核苷酸6397-6409的短反义化合物包含选自SEQ ID NO869或883的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸6397-6409的短反义化合物选自Isis No 147044或147045。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸7057-7178。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸7057-7178。在某些此类实施方案中，靶向7057-7178的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 830、840、861、830、或840的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸7057-7178的短反义化合物选自Isis No 147058、147059、147060、147058、或147059。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸8630-8750。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸8630-8750。在某些此类实施方案中，靶向8630-8750的短反义化合物包含选自SEQ ID NO 843、846、843、或846的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸8630-8750的短反义化合物选自Isis No 147027、147028、147027、或147028。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸10957-11077。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸10957-11077。在某些此类实施方案中，靶向10957-11077的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、869、881、或869的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸10957-11077的短反义化合物选自Isis No 147043、147044、147043、或147044。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸11605-11623。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸11605-11623。在某些此类实施方案中，靶向11605-11623的短反义化合物包含选自SEQ ID NO856、878、或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸11605-11623的短反义化合物选自Isis No 147071、147070、或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸12805-12817。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸12805-12817。在某些此类实施方案中，靶向12805-12817的短反义化合物包含选自SEQ ID NO874或885的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸12805-12817的短反义化合物选自Isis No 147030或147031。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸12986-12998。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸12986-12998。在某些此类实施方案中，靶向12986-12998的短反义化合物包含选自SEQ ID NO874或885的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸12986-12998的短反义化合物选自Isis No 147030或147031。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸15560-15572。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸15560-15572。在某些此类实施方案中，靶向15560-15572的短反义化合物包含选自SEQ ID NO876或838的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸15560-15572的短反义化合物选自Isis No 147067或147068。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸17787-17941。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸17787-17941。在某些此类实施方案中，靶向17787-17941的短反义化合物包含选自SEQ ID NO874或880的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸17787-17941的短反义化合物选自Isis No 147030或147064。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸21190-21202。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸21190-21202。在某些此类实施方案中，靶向21190-21202的短反义化合物包含选自SEQ ID NO843或846的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸21190-21202的短反义化合物选自Isis No 147027或147028。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸21358-21370。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸21358-21370。在某些此类实施方案中，靶向21358-21370的短反义化合物包含选自SEQ ID NO843或846的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸21358-21370的短反义化合物选自Isis No 017027或147028。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸24318-24332。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸24318-24332。在某些此类实施方案中，靶向24318-24332的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、869、883、或858的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸24318-24332的短反义化合物选自Isis No 147043、147044、147045、或147046。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸24486-24501。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸24486-24501。在某些此类实施方案中，靶向24486-24501的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、869、858、或833的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸24486-24501的短反义化合物选自Isis No 147043、147044、147046、或147047。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸25065-25077。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸25065-25077。在某些此类实施方案中，靶向25065-25077的短反义化合物包含选自SEQ ID NO864或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸25065-25077的短反义化合物选自Isis No 147040或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸25232-25245。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸25232-25245。在某些此类实施方案中，靶向25232-25245的短反义化合物包含选自SEQ ID NO850、864、或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸25232-25245的短反义化合物选自Isis No 147039、147040、或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸25508-25523。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸25508-25523。在某些此类实施方案中，靶向25508-25523的短反义化合物包含选自SEQ ID NO839或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸25508-25523的短反义化合物选自Isis No 147057或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸25676-28890。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸25676-28890。在某些此类实施方案中，靶向25676-28890的短反义化合物包含选自SEQ ID NO839、860、或878的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸25676-28890的短反义化合物选自Isis No 147057、147069、或147070。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33056-33069。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33056-33069。在某些此类实施方案中，靶向33056-33069的短反义化合物包含选自SEQ ID NO860、878、或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33056-33069的短反义化合物选自Isis No 147069、147070、或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33205-33217。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33205-33217。在某些此类实施方案中，靶向33205-33217的短反义化合物包含选自SEQ ID NO878或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33205-33217的短反义化合物选自Isis No 14707或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33318-33334。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33318-33334。在某些此类实施方案中，靶向33318-33334的短反义化合物包含选自SEQ ID NO858、854、或875的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33318-33334的短反义化合物选自Isis No 147046、147049、或147051。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33466-33482。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33466-33482。在某些此类实施方案中，靶向33466-33482的短反义化合物包含选自SEQ ID NO858、833、或875的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33466-33482的短反义化合物选自Isis No 147046、147047、或147051。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33640-33656。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33640-33656。在某些此类实施方案中，靶向33640-33656的短反义化合物包含选自SEQ ID NO858或875的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33640-33656的短反义化合物选自Isis No 147046或147051。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸33788-33804。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸33788-33804。在某些此类实施方案中，靶向33788-33804的短反义化合物包含选自SEQ ID NO858或875的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸33788-33804的短反义化合物选自Isis No 147046或147051。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸35437-35449。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸35437-35449。在某些此类实施方案中，靶向35437-35449的短反义化合物包含选自SEQ ID NO840或861的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸35437-35449的短反义化合物选自Isis No 147059或147060。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸40353-40373。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸40353-40373。在某些此类实施方案中，靶向40353-40373的短反义化合物包含选自SEQ ID NO879或881的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸40353-40373的短反义化合物选自Isis No 147061或147043。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸42527-42541。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸42527-42541。在某些此类实施方案中，靶向42527-42541的短反义化合物包含选自SEQ ID NO885、870、或844的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸42527-42541的短反义化合物选自Isis No 147031、147032、或147034。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸42675-42689。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸42675-42689。在某些此类实施方案中，靶向42675-42689的短反义化合物包含选自SEQ ID NO885、870、836、或844的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸42675-42689的短反义化合物选自Isis No 147031、147032、147033、或147034。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸46313-46328。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸46313-46328。在某些此类实施方案中，靶向46313-46328的短反义化合物包含选自SEQ ID NO839、830、840、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸46313-46328的短反义化合物选自Isis No 147057、147058、147059、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸46461-46476。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸46461-46476。在某些此类实施方案中，靶向46461-46476的短反义化合物包含选自SEQ ID NO839、840、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸46461-46476的短反义化合物选自Isis No 147057、147059、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸48369-48381。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸48369-48381。在某些此类实施方案中，靶向48369-48381的短反义化合物包含选自SEQ ID NO842或845的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸48369-48381的短反义化合物选自Isis No 147073或147074。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸48714-48726。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸48714-48726。在某些此类实施方案中，靶向48714-48726的短反义化合物包含选自SEQ ID NO843或846的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸48714-48726的短反义化合物选自Isis No 147027或147028。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸49050-49062。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸49050-49062。在某些此类实施方案中，靶向49050-49062的短反义化合物包含选自SEQ ID NO876或838的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸49050-49062的短反义化合物选自Isis No 147067或147068。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸49672-49684。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸49672-49684。在某些此类实施方案中，靶向49672-49684的短反义化合物包含选自SEQ ID NO842或845的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸49672-49684的短反义化合物选自Isis No 147073或147074。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸52292-52304。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸52292-52304。在某些此类实施方案中，靶向52292-52304的短反义化合物包含选自SEQ ID NO849或863的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸52292-52304的短反义化合物选自Isis No 147036或147037。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸52438-52450。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸52438-52450。在某些此类实施方案中，靶向52438-52450的短反义化合物包含选自SEQ ID NO849或863的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸52438-52450的短反义化合物选自Isis No 147036或147037。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸53445-53458。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸53445-53458。在某些此类实施方案中，靶向53445-53458的短反义化合物包含选自SEQ ID NO866、881、或869的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸53445-53458的短反义化合物选自Isis No 147042、147043、或147044。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸53591-53604。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸53591-53604。在某些此类实施方案中，靶向53591-53604的短反义化合物包含选自SEQ ID NO866、874、881、885、或869的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸53591-53604的短反义化合物选自Isis No 147042、147030、147043、147031、或147044。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸53738-53750。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸53738-53750。在某些此类实施方案中，靶向53738-53750的短反义化合物包含选自SEQ ID NO874或885的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸53738-53750的短反义化合物选自Isis No 147030或147031。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸53783-53795。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸53783-53795。在某些此类实施方案中，靶向53783-53795的短反义化合物包含选自SEQ ID NO864或834的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸53783-53795的短反义化合物选自Isis No 147040或147041。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸55008-55020。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸55008-55020。在某些此类实施方案中，靶向55008-55020的短反义化合物包含选自SEQ ID NO866或881的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸55008-55020的短反义化合物选自Isis No 147042或147043。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸55154-55166。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸55154-55166。在某些此类实施方案中，靶向55154-55166的短反义化合物包含选自SEQ ID NO866或881的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸55154-55166的短反义化合物选自Isis No 147042或147043。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸55682-55695。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸55682-55695。在某些此类实施方案中，靶向55682-55695的短反义化合物包含选自SEQ ID NO877或882的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸55682-55695的短反义化合物选自Isis No 147019或147021。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸56275-56293。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸56275-56293。在某些此类实施方案中，靶向56275-56293的短反义化合物包含选自SEQ ID NO871、884、887、830、840、861、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸56275-56293的短反义化合物选自Isis No147054、147055、147056、147058、147059、147060、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸56418-56439。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸56418-56439。在某些此类实施方案中，靶向56418-56439的短反义化合物包含选自SEQ ID NO875、829、871、884、887、839、830、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸56418-56439的短反义化合物选自IsisNo 147051、147053、147054、147055、147056、147057、147058、或147061。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸57264-57276。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸57264-57276。在某些此类实施方案中，靶向57264-57276的短反义化合物包含选自SEQ ID NO883或858的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸57264-57276的短反义化合物选自Isis No 147045或147046。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸61276-61293。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸61276-61293。在某些此类实施方案中，靶向61276-61293的短反义化合物包含选自SEQ ID NO856、847、849、863、855、850、或864的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸61276-61293的短反义化合物选自Isis No147071、147035、147036、147037、147038、147039、或147040。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸61257-61320。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸61257-61320。在某些此类实施方案中，靶向61257-61320的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、856、847、849、863、855、850、864、或886的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸61257-61320的短反义化合物选自Isis No 147043、147071、147035、147036、147037、147038、147039、147040、或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸61422-61439。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸61422-61439。在某些此类实施方案中，靶向61422-61439的短反义化合物包含选自SEQ ID NO844、847、849、863、855、或864的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸61422-61439的短反义化合物选自Isis No 147034、147035、147036、147037、147038、或147040。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸61422-61466。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸61422-61466。在某些此类实施方案中，靶向61422-61466的短反义化合物包含选自SEQ ID NO844、847、849、863、855、864、或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸61422-61466的短反义化合物选自Isis No147034、147035、147036、147037、147038、147040、或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸63065-63078。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸63065-63078。在某些此类实施方案中，靶向63065-63078的短反义化合物包含选自SEQ ID NO851或838的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸63065-63078的短反义化合物选自Isis No 147066或147068。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸63207-63222。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸63207-63222。在某些此类实施方案中，靶向63207-63222的短反义化合物包含选自SEQ ID NO841或851的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸63207-63222的短反义化合物选自Isis No 147062或147066。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸64538-64550。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸64538-64550。在某些此类实施方案中，靶向64538-64550的短反义化合物包含选自SEQ ID NO849或863的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸64538-64550的短反义化合物选自Isis No 147036或147037。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸64864-64876。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸64864-64876。在某些此类实施方案中，靶向64864-64876的短反义化合物包含选自SEQ ID NO851或876的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸64864-64876的短反义化合物选自Isis No 147066或147067。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸65010-65028。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸65010-65028。在某些此类实施方案中，靶向65010-65028的短反义化合物包含选自SEQ ID NO851、876、或883的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸65010-65028的短反义化合物选自Isis No 147066、147067、或147045。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸65163-65175。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸65163-65175。在某些此类实施方案中，靶向65163-65175的短反义化合物包含选自SEQ ID NO883或858的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸65163-65175的短反义化合物选自Isis No 147045或147046。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸65408-65422。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸65408-65422。在某些此类实施方案中，靶向65408-65422的短反义化合物包含选自SEQ ID NO883或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸65408-65422的短反义化合物选自Isis No 147068或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸65549-65568。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸65549-65568。在某些此类实施方案中，靶向65549-65568的短反义化合物包含选自SEQ ID NO860、838、或856的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸65549-65568的短反义化合物选自Isis No 147069、147068、或147071。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸67741-67754。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸67741-67754。在某些此类实施方案中，靶向67741-67754的短反义化合物包含选自SEQ ID NO848、874、或885的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸67741-67754的短反义化合物选自Isis No 147029、147030、或147031。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸67886-67900。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸67886-67900。在某些此类实施方案中，靶向67886-67900的短反义化合物包含选自SEQ ID NO846、848、874、或885的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸67886-67900的短反义化合物选自Isis No 147028、147029、147030、或147031。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸68867-68880。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸68867-68880。在某些此类实施方案中，靶向68867-68880的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、869、或883的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸68867-68880的短反义化合物选自Isis No 147043、147044、或147045。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸69013-69532。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸69013-69532。在某些此类实施方案中，靶向69013-69532的短反义化合物包含选自SEQ ID NO881、869、883、858、856、832、或842的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸69013-69532的短反义化合物选自Isis No147043、147044、147045、147046、147071、147072、-或147073。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸69665-69880。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸69665-69880。在某些此类实施方案中，靶向69665-69880的短反义化合物包含选自SEQ ID NO856、832、842、845、或851的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸69665-69880的短反义化合物选自Isis No 147071、147072、147073、147074、或147066。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸70611-70630。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸70611-70630。在某些此类实施方案中，靶向70611-70630的短反义化合物包含选自SEQ ID NO859、841、862、880、857、或851的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸70611-70630的短反义化合物选自Isis No 147023、147062、147063、147064、147065、或147066。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸70762-70776。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸70762-70776。在某些此类实施方案中，靶向70762-70776的短反义化合物包含选自SEQ ID NO862、880、857、或851的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸70762-70776的短反义化合物选自Isis No 147063、147064、147065、或147066。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸70998-71010。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸70998-71010。在某些此类实施方案中，靶向70998-71010的短反义化合物包含选自SEQ ID NO832或842的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸70998-71010的短反义化合物选自Isis No 147072或147073。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸71144-714364。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸71144-714364。在某些此类实施方案中，靶向71144-714364的短反义化合物包含选自SEQ IDNO 832、842、845、863、855、或850的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：11核苷酸71144-714364的短反义化合物选自Isis No147072、147073、147074、147037、147038、或147039。

在某些实施方案中，靶区是SEQ ID NO：11的核苷酸71497-71652。在某些实施方案中，短反义化合物靶向SEQ ID NO：11的核苷酸71497-71652。在某些此类实施方案中，靶向71497-71652的短反义化合物包含选自SEQ ID NO863、855、850、或879的核苷酸序列。在某些此类实施方案中，靶向SEQ IDNO：11核苷酸71497-71652的短反义化合物选自Isis No 147037、147038、147039、或147061。

在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长8-16个、优选9-15个、更优选9-14个、更优选10-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长9-14个核苷酸。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长10-14个核苷酸。在某些实施方案中，此类短反义化合物是短反义寡核苷酸。

在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物是短缺口聚物。在某些此类实施方案中，靶向PTP1B核酸的短缺口聚物在该化合物的一个或多个翼中包含至少一处高亲和性修饰。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物在各翼中包含1-3处高亲和性修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的核苷或核苷酸包含2’修饰。在某些此类实施方案中，所述翼的单体是BNA的。在某些此类实施方案中，所述翼的单体选自α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA、亚乙氧基(4’-(CH₂)₂-O-2’)BNA、  氨氧基(4’-CH₂-O-N(R)-2’)BNA和氧氨基(4’-CH₂-N(R)-O-2’)BNA。在某些实施方案中，翼的单体在2’位置包含选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)、和O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)的取代基，其中各R_m和R_n独立地是H或取代的或未取代的C₁-C₁₀烷基。在某些实施方案中，翼的单体是2’MOE核苷酸。

在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物在5’翼与3’翼之间包含缺口。在某些实施方案中，所述缺口包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、或14个单体。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的脱氧核糖核苷酸。在某些实施方案中，所述缺口的单体是未修饰的核糖核苷酸。在某些实施方案中，缺口修饰(如果有的话)导致反义化合物在结合至其靶核酸时支持RNA酶(包括但不限于RNA酶H)进行的切割。

在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物具有统一的单体连接。在某些此类实施方案中，那些连接都是硫代磷酸酯连接。在某些实施方案中，所述连接都是磷酸二酯连接。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物具有混合的主链。

在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长8个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长9个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长10个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长11个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长12个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长13个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长14个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长15个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物长16个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物包含9-15个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物包含10-15个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物包含12-14个单体。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物包含12-14个核苷酸或核苷。

在某些实施方案中，本发明提供了调控PTP1B表达的方法。在某些实施方案中，此类方法包括使用一种或多种靶向PTP1B核酸的短反义化合物，其中所述靶向PTP1B核酸的短反义化合物为大约8-大约16、优选9-15、更优选9-14、更优选10-14个单体(即自大约8至大约16个连接在一起的单体)。本领域普通技术人员应当领会，这包括使用一种或多种8、9、10、11、12、13、14、15或16个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物来调控PTP1B表达的方法。

在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长8个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长9个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长10个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长11个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长12个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长13个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长14个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长15个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B的方法包括使用长16个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。

在某些实施方案中，调控PTP1B表达的方法包括使用包含9-15个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B表达的方法包括使用包含10-15个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B表达的方法包括使用包含12-14个单体的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，调控PTP1B表达的方法包括使用包含12-14个核苷酸或核苷的靶向PTP1B核酸的短反义化合物。

10.PTEN

在某些实施方案中，本发明提供了靶向编码PTEN的核酸的短反义化合物。在某些实施方案中，此类化合物用于调控细胞中的PTEN表达。在某些此类实施方案中，靶向PTEN核酸的短反义化合物施用于动物。在某些实施方案中，靶向PTEN核酸的短反义化合物用于研究PETN、用于研究某些核酸酶和/或用于评估反义活性。在某些此类实施方案中，靶向PTEN核酸的短反义化合物用于评估某些基序和/或化学修饰。在某些实施方案中，给动物施用靶向PTEN核酸的短反义化合物导致可测量的表型变化。

靶向PTEN的短反义化合物可具有本文中一般性描述的短反义化合物的任何一项或多项特性或特征。在某些实施方案中，靶向PTP1B核酸的短反义化合物具有选自1-12-1、1-1-10-2、2-10-1-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3或1-6-1，更优选1-10-1、2-10-2、3-10-3、和1-9-2的基序(翼-脱氧缺口-翼)。

某些靶向PTEN核酸的短反义化合物

在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NM_000314.4之序列(收入本文作为SEQ ID NO：14)的PTEN核酸。在某些实施方案中，短反义化合物靶向具有

编号NT_033890.3核苷酸8063255至8167140之序列(收入本文作为SEQ ID NO：15)的PTEN核酸。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：14的短反义化合物与SEQ ID NO：14至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：14的短反义化合物与SEQ ID NO：14至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物与SEQ ID NO：15100％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物与SEQ ID NO：15至少90％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物与SEQ ID NO：15至少95％互补。在某些此类实施方案中，靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物与SEQ IDNO：15 100％互补。

在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：14的短反义化合物包含选自表20和表21所列核苷酸序列的核苷酸序列。在某些实施方案中，靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物包含选自表22和表23所列核苷酸序列的核苷酸序列。

表20、表21、表22和表23各自所列各核苷酸序列独立于对糖模块(moiety)、核苷间连接、或核碱基(nucleobase)的任何修饰。同样地，包含表20、表21、表22和表23所列核苷酸序列的短反义化合物可独立地包含一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰。Isis编号(Isis NO.)所描述的反义化合物指明了核碱基序列与一种或多种对糖模块、核苷间连接、或核碱基的修饰的组合。

表20列举了与SEQ ID NO：14 100％互补的短反义化合物。表22列举了与SEQ ID NO：15 100％互补的短反义化合物。标有“缺口聚物基序”的栏指明了各短反义化合物的翼-缺口-翼基序。所述缺口区段包含2’-脱氧核苷酸，而且各翼区段的各核苷酸包含2’-修饰的糖。“缺口聚物基序”栏还指明了具体的2’-修饰的糖。例如，“2-10-2 MOE”指2-10-2缺口聚物(gapmer)基序，其中10个2’-脱氧核苷酸的缺口区段侧翼为2个核苷酸的翼区段，其中所述翼区段的核苷酸是2’-MOE核苷酸。核苷间连接是硫代磷酸酯。所述短反义化合物包含5-甲基胞苷，以替换未修饰的胞嘧啶，除非缺口聚物基序栏中列出了“未修饰的胞嘧啶”(在这种情况中，所指胞嘧啶是未修饰的胞嘧啶)。例如，“仅缺口中5-mC”指明了所述缺口区段具有5-甲基胞嘧啶，而所述翼区段具有未修饰的胞嘧啶。

2’-修饰的核苷酸和缩写包括：2′-O-甲氧乙基(MOE)；2′-O-甲基(OMe)；2′-O-(2，2，3，3，3-五氟丙基)(五F)；2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4’-硫代(2’-MOE-4’-硫代)；(R)-CMOE-BNA。如表20和22所示，翼可包含含有超过一种2’取代基的单体。例如，1-2-10-2 MOE/五F/MOE代表一个MOE修饰的核苷酸，接着是两个五F修饰的核苷酸，接着是十个脱氧核苷酸的缺口，接着是两个五F修饰的核苷酸。例如，1-1-10-22’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA代表最5’端的核苷酸是2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺，第二个核苷酸是亚甲氧基BNA核苷酸，而3’翼是亚甲氧基BNA。除非另有说明，胞嘧啶指5-甲基胞嘧啶，而核苷间连接是硫代磷酸酯。

表20：靶向SEQ ID NO：14的短反义化合物

 

ISIS No	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						390092	5530	5541	AGAATGAGACTT	1-10-1 MOE	1514
390091	5435	5446	TGAGGCATTATC	1-10-1 MOE	1522
						390090	5346	5357	AGAGTATCTGAA	1-10-1 MOE	1227
390088	5162	5173	CACATTAACAGT	1-10-1 MOE	1511
						390087	5126	5137	GTGGCAACCACA	1-10-1 MOE	1501
390085	5031	5042	ATTTGATGCTGC	1-10-1 MOE	1505
						390084	4982	4993	CAAAGAATGGTG	1-10-1 MOE	1215
390082	4910	4921	AGGACTTGGGAT	1-10-1 MOE	1503
						390080	4833	4844	TGCTGCACATCC	1-10-1 MOE	1150
392067	4832	4845	CTGCTGCACATCCA	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1510
						390078	4714	4725	CTTTCAGTCATA	1-10-1 MOE	1520
390077	4693	4704	GTCAAATTCTAT	1-10-1 MOE	1252
						390076	4599	4610	TTCCAATGACTA	1-10-1 MOE	1506
390075	4576	4587	GTAAGCAAGGCT	1-10-1 MOE	#N/A
						390074	4533	4544	ACCCTCATTCAG	1-10-1 MOE	1513
390068	4191	4202	GTAAATCCTAAG	1-10-1 MOE	1515
						390064	4001	4012	ACCACAGCTAGT	1-10-1 MOE	1498
390063	3977	3988	CACCAATAAGTT	1-10-1 MOE	1219
						390058	3828	3839	AGTAGTTGTACT	1-10-1 MOE	1192
390056	3793	3804	GGGCATATCAAA	1-10-1 MOE	1521
						390054	3705	3716	AACACTGCACAT	1-10-1 MOE	1493
390052	3623	3634	GACAATTTCTAC	1-10-1 MOE	1492
						390050	3503	3514	GTATTCAAGTAA	1-10-1 MOE	1140
390049	3479	3490	GTTAATGACATT	1-10-1 MOE	1491
						390047	3428	3439	TGTGTAAGGTCA	1-10-1 MOE	1490
390041	3175	3186	TTAGCACTGGCC	1-10-1 MOE	1489
						398076	3171	3182	CACTGGCCTTGA	1-10-1 MOE	1488
398009	3170	3183	GCACTGGCCTTGAT	2-10-2 MOE	1487

 

398075	3111	3122	AAATCATTGTCA	1-10-1 MOE	1233
						398008	3110	3123	TAAATCATTGTCAA	2-10-2 MOE	1486
398074	2913	2924	GCACCAATATGC	1-10-1 MOE	1248
						398007	2912	2925	AGCACCAATATGCT	2-10-2 MOE	1247
398073	2681	2692	TTAGCCAACTGC	1-10-1 MOE	1485
						398006	2680	2693	CTTAGCCAACTGCA	2-10-2 MOE	1484
390033	2679	2690	AGCCAACTGCAA	1-10-1 MOE	1483
						398072	2671	2682	GCAAACTTATCT	1-10-1 MOE	1482
398005	2670	2683	TGCAAACTTATCTG	2-10-2 MOE	1481
						390030	2534	2545	TTTATAAAACTG	1-10-1 MOE	1074
398071	2533	2544	TTATAAAACTGG	1-10-1 MOE	1480
						398004	2532	2545	TTTATAAAACTGGA	2-10-2 MOE	1479
390029	2510	2521	AAAGTGCCATCT	1-10-1 MOE	1478
						390028	2491	2502	TCCTAATTGAAT	1-10-1 MOE	1477
398070	2481	2492	ATTTTAAATGTC	1-10-1 MOE	1476
						398003	2480	2493	AATTTTAAATGTCC	2-10-2 MOE	1475
390027	2455	2466	AGGTATATACAT	1-10-1 MOE	1206
						398069	2451	2462	ATATACATGACA	1-10-1 MOE	1474
398002	2450	2463	TATATACATGACAC	2-10-2 MOE	1473
						398068	2440	2451	ACAGCTACACAA	1-10-1 MOE	1472
398001	2439	2452	CACAGCTACACAAC	2-10-2 MOE	1471
						390026	2438	2449	AGCTACACAACC	1-10-1 MOE	1470
390025	2406	2417	GTGTCAAAACCC	1-10-1 MOE	1211
						398067	2405	2416	TGTCAAAACCCT	1-10-1 MOE	1210
398000	2404	2417	GTGTCAAAACCCTG	2-10-2 MOE	1469
						398066	2372	2383	AGATTGGTCAGG	1-10-1 MOE	1468
397999	2371	2384	AAGATTGGTCAGGA	2-10-2 MOE	1467
						398065	2349	2360	GTTCCTATAACT	1-10-1 MOE	1466
397998	2348	2361	TGTTCCTATAACTG	2-10-2 MOE	1465
						398064	2331	2342	CTGACACAATGT	1-10-1 MOE	1464
397997	2330	2343	TCTGACACAATGTC	2-10-2 MOE	1463
						398063	2321	2332	GTCCTATTGCCA	1-10-1 MOE	1205
397996	2320	2333	TGTCCTATTGCCAT	2-10-2 MOE	1462
						390022	2286	2297	CAGTTTATTCAA	1-10-1 MOE	1142
336221	2230	2243	TCAGACTTTTGTAA	3-8-3 MOE	1461

 

336220	2224	2237	TTTTGTAATTTGTG	3-8-3 MOE	1460
						336219	2209	2222	ATGCTGATCTTCAT	3-8-3 MOE	1459
390021	2203	2214	CTTCATCAAAAG	1-10-1 MOE	1458
						336218	2201	2214	CTTCATCAAAAGGT	3-8-3 MOE	1457
389779	2201	2212	TCATCAAAAGGT	1-9-2 MOE	1176
						389979	2201	2212	TCATCAAAAGGT	1-10-1 MOE	1176
397995	2200	2213	TTCATCAAAAGGTT	2-10-2 MOE	1456
						336217	2192	2205	AAGGTTCATTCTCT	3-8-3 MOE	1455
390020	2183	2194	TCTGGATCAGAG	1-10-1 MOE	1149
						336216	2182	2195	CTCTGGATCAGAGT	3-8-3 MOE	1454
336215	2169	2182	TCAGTGGTGTCAGA	3-8-3 MOE	1453
						398062	2166	2177	GGTGTCAGAATA	1-10-1 MOE	1255
397994	2165	2178	TGGTGTCAGAATAT	2-10-2 MOE	1452
						390019	2163	2174	GTCAGAATATCT	1-10-1 MOE	1173
336214	2157	2170	GAATATCTATAATG	3-8-3 MOE	1573
						398061	2151	2162	ATAATGATCAGG	1-10-1 MOE	1451
397993	2150	2163	TATAATGATCAGGT	2-10-2 MOE	1450
						336213	2146	2159	ATGATCAGGTTCAT	3-8-3 MOE	1449
389778	2144	2155	TCAGGTTCATTG	1-9-2 MOE	1448
						389978	2144	2155	TCAGGTTCATTG	1-10-1 MOE	1448
398060	2137	2148	CATTGTCACTAA	1-10-1 MOE	1447
						336212	2136	2149	TCATTGTCACTAAC	3-8-3 MOE	1446
397992	2136	2149	TCATTGTCACTAAC	2-10-2 MOE	1446
						336211	2112	2125	ACAGAAGTTGAACT	3-8-3 MOE	1445
390017	2111	2122	GAAGTTGAACTG	1-10-1 MOE	1444
						398059	2108	2119	GTTGAACTGCTA	1-10-1 MOE	1443
397991	2107	2120	AGTTGAACTGCTAG	2-10-2 MOE	1442
						336210	2104	2117	TGAACTGCTAGCCT	3-8-3 MOE	1441
335340	2104	2118	TTGAACTGCTAGCCT	1-10-4 MOE	1440
						335339	2103	2117	TGAACTGCTAGCCTC	1-10-4 MOE	1439
335338	2102	2116	GAACTGCTAGCCTCT	1-10-4 MOE	1438
						335337	2101	2115	AACTGCTAGCCTCTG	1-10-4 MOE	1437
335336	2100	2114	ACTGCTAGCCTCTGG	1-10-4 MOE	1436
						390430	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶	1163

 

390431	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						390432	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE	1163
390433	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶Nt 6是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						390434	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶Nt 7是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
390435	2099	2111	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶Nt 9是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						335335	2099	2113	CTGCTAGCCTCTGGA	1-10-4 MOE	1435
389777	2098	2109	TAGCCTCTGGAT	1-9-2 MOE	1434
						389954	2098	2109	TAGCCTCTGGAT	1-10-1 MOE	1434
335334	2098	2112	TGCTAGCCTCTGGAT	1-10-4 MOE	1433
						331429	2097	2110	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2 MOE	1431
335349	2097	2110	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2 MOE	1431
						335367	2097	2110	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA	1431
335378	2097	2110	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA	1431
						392061	2097	2110	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1431
383991	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-22′-(乙酰氨基-丁基-乙酰氨基)-胆固醇/MOE	1432
						383992	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-22′-(乙酰氨基-丁基-乙酰氨基)-胆酸/MOE	1432
386970	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-2 MOE	1432
						390578	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-2 MOE	1432

 

				未修饰的胞嘧啶翼中的Ts是2-硫代胸嘧啶
						390614	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-2五F	1432
335333	2097	2111	GCTAGCCTCTGGATT	1-10-4 MOE	1430
						386683	2097	2109	TAGCCTCTGGATT	1-10-22′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/MOE	1432
371975	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	3-10-2 MOE	1429
						335341	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
335350	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
						335368	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1428
335379	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA	1428
						383739	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
384071	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 OMe缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
						384073	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
390576	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的5-甲基胞嘧啶翼中的T’s是2-硫代胸嘧啶	1428
						390580	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE翼中的嘧啶是5-噻唑缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
390581	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
						391863	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶	1428
391864	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
						391865	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
375560	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE	1429
						391172	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-2亚甲氧基BNA	1429

 

				未修饰的胞嘧啶
						391175	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3亚甲氧基BNA	1429
391449	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶	1429
						392054	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1429
392055	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE缺口中的未修饰胞嘧啶	1429
						362977	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	2-12-2 MOE	1428
386770	2096	2109	TAGCCTCTGGATTT	1-11-2 MOE	1427
						390577	2096	2109	TAGCCTCTGGATTT	1-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶翼中的T’s是2-硫代胸嘧啶	1427
335332	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	1-10-4 MOE	1429
						390579	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-1-1-10-3 MOE/4’-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶翼中的磷酸二酯连接	1428
391173	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3(5′R)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1429
						391174	2096	2110	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1429
390607	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						390609	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-2-1 MOE/MOE/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
384072	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						390606	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428

 

390608	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						391869	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3亚甲氧基BNA/(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA/(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
385036	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 OMe/2′-O-甲基-4′-硫代/2′-O-甲基-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						385871	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 OMe/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶	1428
386682	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/MOE/MOE	1428
						390582	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶翼中的磷酸二酯连接	1428
391868	2096	2111	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3(5′R)-5′-甲基-亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA/(5′R)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
						336209	2095	2108	AGCCTCTGGATTTG	3-8-3 MOE	1425
335331	2095	2109	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4 MOE	1426
						335376	2095	2109	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4亚甲氧基BNA	1426
335377	2095	2109	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4亚甲氧基BNA3’翼中的磷酸二酯	1426
						335330	2094	2108	AGCCTCTGGATTTGA	1-10-4 MOE	1424

 

336208	2079	2092	GGCTCCTCTACTGT	3-8-3 MOE	1423
						336207	2073	2086	TCTACTGTTTTTGT	3-8-3 MOE	1422
336206	2047	2060	CACCTTAAAATTTG	3-8-3 MOE	1518
						389776	2046	2057	CTTAAAATTTGG	1-9-2 MOE	1421
389977	2046	2057	CTTAAAATTTGG	1-10-1 MOE	1421
						397990	2045	2058	CCTTAAAATTTGGA	2-10-2 MOE	1420
336205	2043	2056	TTAAAATTTGGAGA	3-8-3 MOE	1419
						398058	2029	2040	AGTATCGGTTGG	1-10-1 MOE	1418
336204	2028	2041	AAGTATCGGTTGGC	3-8-3 MOE	1417
						397989	2028	2041	AAGTATCGGTTGGC	2-10-2 MOE	1417
336203	2002	2015	TGCTTTGTCAAGAT	3-8-3 MOE	1416
						389775	2002	2013	CTTTGTCAAGAT	1-9-2 MOE	1177
389976	2002	2013	CTTTGTCAAGAT	1-10-1 MOE	1177
						397988	2001	2014	GCTTTGTCAAGATC	2-10-2 MOE	1415
336202	1959	1972	TCCTTGTCATTATC	3-8-3 MOE	1414
						389774	1945	1956	CACGCTCTATAC	1-9-2 MOE	1413
389975	1945	1956	CACGCTCTATAC	1-10-1 MOE	1413
						336201	1944	1957	GCACGCTCTATACT	3-8-3 MOE	1412
336200	1929	1942	CAAATGCTATCGAT	3-8-3 MOE	1411
						389773	1904	1915	AGACTTCCATTT	1-9-2 MOE	1410
389974	1904	1915	AGACTTCCATTT	1-10-1 MOE	1410
						336199	1902	1915	AGACTTCCATTTTC	3-8-3 MOE	1409
336198	1884	1897	TTTTCTGAGGTTTC	3-8-3 MOE	1408
						398057	1878	1889	GGTTTCCTCTGG	1-10-1 MOE	1407
397987	1877	1890	AGGTTTCCTCTGGT	2-10-2 MOE	1406
						336197	1873	1886	TTCCTCTGGTCCTG	3-8-3 MOE	1405
390015	1868	1879	GGTCCTGGTATG	1-10-1 MOE	1404
						398056	1865	1876	CCTGGTATGAAG	1-10-1 MOE	1403
336196	1864	1877	TCCTGGTATGAAGA	3-8-3 MOE	1402
						397986	1864	1877	TCCTGGTATGAAGA	2-10-2 MOE	1402
398055	1849	1860	TATTTACCCAAA	1-10-1 MOE	1401
						397985	1848	1861	GTATTTACCCAAAA	2-10-2 MOE	1400
336195	1847	1860	TATTTACCCAAAAG	3-8-3 MOE	1399
						389772	1846	1857	TTACCCAAAAGT	1-9-2 MOE	1398
389973	1846	1857	TTACCCAAAAGT	1-10-1 MOE	1398

 

336194	1838	1851	AAAAGTGAAACATT	3-8-3 MOE	1145
						398054	1836	1847	GTGAAACATTTT	1-10-1 MOE	1144
397984	1835	1848	AGTGAAACATTTTG	2-10-2 MOE	1397
						336193	1828	1841	CATTTTGTCCTTTT	3-8-3 MOE	1182
336192	1810	1823	CATCTTGTTCTGTT	3-8-3 MOE	1396
						336191	1800	1813	TGTTTGTGGAAGAA	3-8-3 MOE	1395
398053	1796	1807	TGGAAGAACTCT	1-10-1 MOE	1394
						397983	1795	1808	GTGGAAGAACTCTA	2-10-2 MOE	1393
389771	1794	1805	GAAGAACTCTAC	1-9-2 MOE	1392
						389972	1794	1805	GAAGAACTCTAC	1-10-1 MOE	1392
336190	1789	1802	GAACTCTACTTTGA	3-8-3 MOE	1391
						336189	1773	1786	TCACCACACACAGG	3-8-3 MOE	1390
336188	1754	1767	GCTGAGGGAACTCA	3-8-3 MOE	1389
						398052	1751	1762	GGGAACTCAAAG	1-10-1 MOE	1388
389770	1750	1761	GGAACTCAAAGT	1-9-2 MOE	1386
						389971	1750	1761	GGAACTCAAAGT	1-10-1 MOE	1386
397982	1750	1763	AGGGAACTCAAAGT	2-10-2 MOE	1387
						336187	1747	1760	GAACTCAAAGTACA	3-8-3 MOE	1385
390012	1745	1756	TCAAAGTACATG	1-10-1 MOE	1384
						336186	1688	1701	TCTTCACCTTTAGC	3-8-3 MOE	1383
398051	1684	1695	CCTTTAGCTGGC	1-10-1 MOE	1220
						397981	1683	1696	ACCTTTAGCTGGCA	2-10-2 MOE	1382
336185	1677	1690	AGCTGGCAGACCAC	3-8-3 MOE	1381
						389769	1676	1687	TGGCAGACCACA	1-9-2 MOE	1249
389970	1676	1687	TGGCAGACCACA	1-10-1 MOE	1249
						392060	1675	1688	CTGGCAGACCACAA	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1380
398050	1672	1683	AGACCACAAACT	1-10-1 MOE	1379
						397980	1671	1684	CAGACCACAAACTG	2-10-2 MOE	1378
390011	1658	1669	GGATTGCAAGTT	1-10-1 MOE	1238
						336184	1655	1668	GATTGCAAGTTCCG	3-8-3 MOE	1508
336183	1644	1657	CCGCCACTGAACAT	3-8-3 MOE	1377
						390010	1643	1654	CCACTGAACATT	1-10-1 MOE	1240
398049	1641	1652	ACTGAACATTGG	1-10-1 MOE	1376
						397979	1640	1653	CACTGAACATTGGA	2-10-2 MOE	1375

 

336182	1633	1646	CATTGGAATAGTTT	3-8-3 MOE	1374
						389768	1630	1641	GAATAGTTTCAA	1-9-2 MOE	1373
389969	1630	1641	GAATAGTTTCAA	1-10-1 MOE	1373
						398048	1626	1637	AGTTTCAAACAT	1-10-1 MOE	1372
397978	1625	1638	TAGTTTCAAACATC	2-10-2 MOE	1371
						336181	1623	1636	GTTTCAAACATCAT	3-8-3 MOE	1370
398047	1614	1625	CATCTTGTGAAA	1-10-1 MOE	1369
						336180	1613	1626	TCATCTTGTGAAAC	3-8-3 MOE	1368
390009	1613	1624	ATCTTGTGAAAC	1-10-1 MOE	1175
						397977	1613	1626	TCATCTTGTGAAAC	2-10-2 MOE	1368
390007	1563	1574	CAGGTAGCTATA	1-10-1 MOE	1367
						336179	1561	1574	CAGGTAGCTATAAT	3-8-3 MOE	1366
336178	1541	1554	CATAGCGCCTCTGA	3-8-3 MOE	1365
						336177	1534	1547	CCTCTGACTGGGAA	3-8-3 MOE	1364
389767	1534	1545	TCTGACTGGGAA	1-9-2 MOE	1151
						389968	1534	1545	TCTGACTGGGAA	1-10-1 MOE	1151
335344	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE	1363
						335355	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE翼中的磷酸二酯连接	1363
335370	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1363
						335381	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2亚甲氧基BNA	1363
335411	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE3’C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1363
						335412	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE5’翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1363
335413	1503	1516	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE翼中的C9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1363
						336176	1502	1515	CTCTGGTCCTTACT	3-8-3 MOE	1361
335345	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE	1362
						335356	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE翼中的磷酸二酯连接	1362

 

335371	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1362
						335382	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3亚甲氧基BNA	1362
335414	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE3’翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
						335415	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE5’翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
335416	1502	1517	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
						336175	1495	1508	CCTTACTTCCCCAT	3-8-3 MOE	1360
336174	1472	1485	GGGCCTCTTGTGCC	3-8-3 MOE	1359
						336173	1465	1478	TTGTGCCTTTAAAA	3-8-3 MOE	1358
398046	1465	1476	GTGCCTTTAAAA	1-10-1 MOE	1199
						389766	1464	1475	TGCCTTTAAAAA	1-9-2 MOE	1217
389967	1464	1475	TGCCTTTAAAAA	1-10-1 MOE	1217
						397976	1464	1477	TGTGCCTTTAAAAA	2-10-2 MOE	1357
336172	1437	1450	AATAAATATGCACA	3-8-3 MOE	1356
						398045	1423	1434	TCATTACACCAG	1-10-1 MOE	1355
336171	1422	1435	ATCATTACACCAGT	3-8-3 MOE	1354
						389765	1422	1433	CATTACACCAGT	1-9-2 MOE	1353
389966	1422	1433	CATTACACCAGT	1-10-1 MOE	1353
						397975	1422	1435	ATCATTACACCAGT	2-10-2 MOE	1354
390005	1400	1411	CCAGCTTTACAG	1-10-1 MOE	1352
						336170	1392	1405	TTACAGTGAATTGC	3-8-3 MOE	1351
398044	1382	1393	GCTGCAACATGA	1-10-1 MOE	1350
						336169	1381	1394	TGCTGCAACATGAT	3-8-3 MOE	1349
389764	1381	1392	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
						389965	1381	1392	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
397974	1381	1394	TGCTGCAACATGAT	2-10-2 MOE	1349
						336168	1362	1375	TCTTCACTTAGCCA	3-8-3 MOE	1348
390004	1362	1373	TTCACTTAGCCA	1-10-1 MOE	1208
						336167	1353	1366	AGCCATTGGTCAAG	3-8-3 MOE	1347

 

398043	1345	1356	CAAGATCTTCAC	1-10-1 MOE	1244
						336166	1344	1357	TCAAGATCTTCACA	3-8-3 MOE	1346
390003	1344	1355	AAGATCTTCACA	1-10-1 MOE	1243
						397973	1344	1357	TCAAGATCTTCACA	2-10-2 MOE	1346
336165	1329	1342	AAGGGTTTGATAAG	3-8-3 MOE	1345
						390002	1322	1333	ATAAGTTCTAGC	1-10-1 MOE	1344
336164	1318	1331	AAGTTCTAGCTGTG	3-8-3 MOE	1343
						398042	1305	1316	TGGGTTATGGTC	1-10-1 MOE	1214
336163	1304	1317	GTGGGTTATGGTCT	3-8-3 MOE	1342
						397972	1304	1317	GTGGGTTATGGTCT	2-10-2 MOE	1342
398089	1298	1309	TGGTCTTCAAAA	1-10-1 MOE	1341
						389763	1296	1307	GTCTTCAAAAGG	1-9-2 MOE	1197
389964	1296	1307	GTCTTCAAAAGG	1-10-1 MOE	1197
						398041	1294	1305	CTTCAAAAGGAT	1-10-1 MOE	1196
336162	1293	1306	TCTTCAAAAGGATA	3-8-3 MOE	1340
						397971	1293	1306	TCTTCAAAAGGATA	2-10-2 MOE	1340
398040	1279	1290	GTGCAACTCTGC	1-10-1 MOE	1236
						336161	1278	1291	TGTGCAACTCTGCA	3-8-3 MOE	1235
397970	1278	1291	TGTGCAACTCTGCA	2-10-2 MOE	1235
						398039	1264	1275	TAAATTTGGCGG	1-10-1 MOE	1339
397969	1263	1276	TTAAATTTGGCGGT	2-10-2 MOE	1338
						336160	1261	1274	AAATTTGGCGGTGT	3-8-3 MOE	1337
336159	1253	1266	CGGTGTCATAATGT	3-8-3 MOE	1336
						398038	1252	1263	TGTCATAATGTC	1-10-1 MOE	1200
390000	1251	1262	GTCATAATGTCT	1-10-1 MOE	1194
						397968	1251	1264	GTGTCATAATGTCT	2-10-2 MOE	1195
336158	1227	1240	AGATTGTATATCTT	3-8-3 MOE	1335
						389762	1220	1231	ATCTTGTAATGG	1-9-2 MOE	1334
389963	1220	1231	ATCTTGTAATGG	1-10-1 MOE	1334
						336157	1215	1228	TTGTAATGGTTTTT	3-8-3 MOE	1333
336156	1202	1215	TATGCTTTGAATCC	3-8-3 MOE	1332
						389998	1199	1210	TTTGAATCCAAA	1-10-1 MOE	1331
397967	1198	1211	CTTTGAATCCAAAA	2-10-2 MOE	1330
						336155	1190	1203	CCAAAAACCTTACT	3-8-3 MOE	1500
336154	1176	1189	ACATCATCAATATT	3-8-3 MOE	1329

 

389761	1171	1182	CAATATTGTTCC	1-9-2 MOE	1328
						389962	1171	1182	CAATATTGTTCC	1-10-1 MOE	1328
398037	1170	1181	AATATTGTTCCT	1-10-1 MOE	1202
						397966	1169	1182	CAATATTGTTCCTG	2-10-2 MOE	1327
336153	1164	1177	TTGTTCCTGTATAC	3-8-3 MOE	1326
						336152	1149	1162	CCTTCAAGTCTTTC	3-8-3 MOE	1325
389996	1141	1152	TTTCTGCAGGAA	1-10-1 MOE	1165
						336151	1138	1151	TTCTGCAGGAAATC	3-8-3 MOE	1324
398036	1138	1149	CTGCAGGAAATC	1-10-1 MOE	1323
						397965	1137	1150	TCTGCAGGAAATCC	2-10-2 MOE	1322
389760	1129	1140	ATCCCATAGCAA	1-9-2 MOE	1321
						389961	1129	1140	ATCCCATAGCAA	1-10-1 MOE	1321
398035	1126	1137	CCATAGCAATAA	1-10-1  MOE	1320
						336150	1125	1138	CCCATAGCAATAAT	3-8-3 MOE	1319
397964	1125	1138	CCCATAGCAATAAT	2-10-2 MOE	1319
						336149	1110	1123	TTTGGATAAATATA	3-8-3 MOE	1496
389995	1106	1117	TAAATATAGGTC	1-10-1 MOE	1516
						336148	1100	1113	TATAGGTCAAGTCT	3-8-3 MOE	1495
398034	1099	1110	AGGTCAAGTCTA	1-10-1 MOE	1300
						397963	1098	1111	TAGGTCAAGTCTAA	2-10-2 MOE	1494
389994	1095	1106	CAAGTCTAAGTC	1-10-1 MOE	1299
						336147	1090	1103	GTCTAAGTCGAATC	3-8-3 MOE	1298
389993	1083	1094	GAATCCATCCTC	1-10-1 MOE	1297
						336146	1080	1093	ATCCATCCTCTTG	3-8-3 MOE	1296
398033	1077	1088	ATCCTCTTGATA	1-10-1 MOE	1198
						397962	1076	1089	CATCCTCTTGATAT	2-10-2 MOE	1295
336145	1070	1083	CTTGATATCTCCTT	3-8-3 MOE	1294
						336144	1057	1070	TTTGTTTCTGCTAA	3-8-3 MOE	1293
389759	1056	1067	GTTTCTGCTAAC	1-9-2 MOE	1292
						389960	1056	1067	GTTTCTGCTAAC	1-10-1 MOE	1292
392059	1055	1068	TGTTTCTGCTAACG	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1291
						336143	1044	1057	ACGATCTCTTTGAT	3-8-3 MOE	1290
398032	1038	1049	TTTGATGATGGC	1-10-1 MOE	1222
						397961	1037	1050	CTTTGATGATGGCT	2-10-2 MOE	1289

 

389992	1036	1047	TGATGATGGCTG	1-10-1 MOE	1288
						336142	1032	1045	ATGATGGCTGTCAT	3-8-3 MOE	1287
389991	1021	1032	TGTCTGGGAGCC	1-10-1 MOE	1286
						392058	1020	1033	ATGTCTGGGAGCCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1285
397960	1020	1033	ATGTCTGGGAGCCT	2-10-2 MOE	1285
						389990	1007	1018	TGGCTGAAGAAA	1-10-1 MOE	1284
397959	1006	1019	GTGGCTGAAGAAAA	2-10-2 MOE	1283
						398031	987	998	GAGAGATGGCAG	1-10-1 MOE	1282
397958	986	999	AGAGAGATGGCAGA	2-10-2 MOE	1281
						389758	983	994	GATGGCAGAAGC	1-9-2 MOE	1280
389959	983	994	GATGGCAGAAGC	1-10-1 MOE	1280
						398030	976	987	GAAGCTGCTGGT	1-10-1 MOE	1143
397957	975	988	AGAAGCTGCTGGTG	2-10-2 MOE	1279
						389989	953	964	TTCTGCAGGATG	1-10-1 MOE	1170
389757	941	952	GAAATGGCTCTG	1-9-2 MOE	1278
						389958	941	952	GAAATGGCTCTG	1-10-1 MOE	1278
397956	940	953	GGAAATGGCTCTGG	2-10-2 MOE	1277
						398029	931	942	TGGACTTGGCGG	1-10-1 MOE	1186
397955	930	943	CTGGACTTGGCGGT	2-10-2 MOE	1276
						398028	914	925	GATGCCCCTCGC	1-10-1 MOE	1275
397954	913	926	TGATGCCCCTCGCT	2-10-2 MOE	1274
						398027	883	894	GGACCGCAGCCG	1-10-1 MOE	1155
397953	882	895	TGGACCGCAGCCGG	2-10-2 MOE	1273
						389756	874	885	CCGGGTAATGGC	1-9-2 MOE	1272
389957	874	885	CCGGGTAATGGC	1-10-1 MOE	1272
						398026	867	878	ATGGCTGCTGCG	1-10-1 MOE	1160
397952	866	879	AATGGCTGCTGCGG	2-10-2 MOE	1271
						389987	848	859	CTGGATGGTTGC	1-10-1 MOE	1270
389755	806	817	AGAGGCCTGGCA	1-9-2 MOE	1269
						389956	806	817	AGAGGCCTGGCA	1-10-1 MOE	1269
389985	584	595	ATGGTGACAGGC	1-10-1 MOE	1268
						398025	581	592	GTGACAGGCGAC	1-10-1 MOE	1267
397951	580	593	GGTGACAGGCGACT	2-10-2 MOE	1266
						389754	312	323	TGCTCACAGGCG	1-9-2 MOE	1158

 

389955	312	323	TGCTCACAGGCG	1-10-1 MOE	1158
						398024	231	242	CAGCGGCTCAAC	1-10-1 MOE	1265
397950	230	243	ACAGCGGCTCAACT	2-10-2 MOE	1264
						389982	205	216	CATGGCTGCAGC	1-10-1 MOE	1161
392056	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA	1263
						394424	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 MOE	1263
396007	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(R)-CMOE BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396008	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(S)-CMOE BNA未修饰的胞嘧啶	1263
396009	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 α-L-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396566	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2氧氨基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
396567	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 N-甲基-氧氨基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396568	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(6R)-6-甲基亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
397913	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 OMe缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
						401974	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 OMe未修饰的胞嘧啶	1263
403737	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的5-噻唑核碱基	1263
						404121	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶3’末端THF硫代磷酸酯	1263
404228	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶5’-末端颠倒脱碱基的	1263
						396024	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(6’S)-6’-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263

 

396569	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396577	204	217	TCATGGCTGCAGCT	2-10-1-1亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA/2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
396576	204	217	TCATGGCTGCAGCT	1-1-10-2 2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
						398023	191	202	CCGAGAGGAGAG	1-10-1 MOE	1262
397949	190	203	TCCGAGAGGAGAGA	2-10-2 MOE	1261
						398022	126	137	AAGAGTCCCGCC	1-10-1 MOE	1260
397948	125	138	AAAGAGTCCCGCCA	2-10-2 MOE	1259

表22：靶向SEQ ID NO：15的短反义化合物

 

ISISNo.	5′靶位点	3′靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						397948	525	538	AAAGAGTCCCGCCA	2-10-2 MOE	1259
398022	526	537	AAGAGTCCCGCC	1-10-1 MOE	1260
						397949	590	603	TCCGAGAGGAGAGA	2-10-2 MOE	1261
398023	591	602	CCGAGAGGAGAG	1-10-1 MOE	1262
						394424	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 MOE	1263
397913	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 OMe缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
						401974	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 Ome未修饰的胞嘧啶	1263
403737	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的5-噻唑核碱基	1263
						392056	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1263

 

396576	604	617	TCATGGCTGCAGCT	1-1-10-2 2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
						396577	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-1-2亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA/2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/缺口中的未修饰胞嘧啶	1263
404121	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶3’末端THF硫代磷酸酯	1263
						404228	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶5’-末端颠倒脱碱基的	1263
396007	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(R)-CMOE BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396008	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(S)-CMOE BNA未修饰的胞嘧啶	1263
396009	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2 α-L-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396024	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(6’S)-6’-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
396566	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2氧氨基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
						396567	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2N-甲基-氧氨基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
396568	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(6R)-6-甲基亚甲氧基BNA	1263

 

				未修饰的胞嘧啶
						396569	604	617	TCATGGCTGCAGCT	2-10-2(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1263
389982	605	616	CATGGCTGCAGC	1-10-1 MOE	1161
						397950	630	643	ACAGCGGCTCAACT	2-10-2 MOE	1264
398024	631	642	CAGCGGCTCAAC	1-10-1 MOE	1265
						389955	712	723	TGCTCACAGGCG	1-10-1 MOE	1158
389754	712	723	TGCTCACAGGCG	1-9-2 MOE	1158
						397951	980	993	GGTGACAGGCGACT	2-10-2 MOE	1266
398025	981	992	GTGACAGGCGAC	1-10-1 MOE	1267
						389985	984	995	ATGGTGACAGGC	1-10-1 MOE	1268
389956	1206	1217	AGAGGCCTGGCA	1-10-1 MOE	1269
						389755	1206	1217	AGAGGCCTGGCA	1-9-2 MOE	1269
389987	1248	1259	CTGGATGGTTGC	1-10-1 MOE	1270
						397952	1266	1279	AATGGCTGCTGCGG	2-10-2 MOE	1271
398026	1267	1278	ATGGCTGCTGCG	1-10-1 MOE	1160
						389957	1274	1285	CCGGGTAATGGC	1-10-1 MOE	1272
389756	1274	1285	CCGGGTAATGGC	1-9-2 MOE	1272
						397953	1282	1295	TGGACCGCAGCCGG	2-10-2 MOE	1273
398027	1283	1294	GGACCGCAGCCG	1-10-1 MOE	1155
						397954	1313	1326	TGATGCCCCTCGCT	2-10-2 MOE	1274
398028	1314	1325	GATGCCCCTCGC	1-10-1 MOE	1275
						397955	1330	1343	CTGGACTTGGCGGT	2-10-2 MOE	1276
398029	1331	1342	TGGACTTGGCGG	1-10-1 MOE	1186
						397956	1340	1353	GGAAATGGCTCTGG	2-10-2 MOE	1277
389958	1341	1352	GAAATGGCTCTG	1-10-1 MOE	1278
						389757	1341	1352	GAAATGGCTCTG	1-9-2 MOE	1278
389989	1353	1364	TTCTGCAGGATG	1-10-1 MOE	1170
						397957	1375	1388	AGAAGCTGCTGGTG	2-10-2 MOE	1279
398030	1376	1387	GAAGCTGCTGGT	1-10-1 MOE	1143
						389959	1383	1394	GATGGCAGAAGC	1-10-1 MOE	1280
389758	1383	1394	GATGGCAGAAGC	1-9-2 MOE	1280
						397958	1386	1399	AGAGAGATGGCAGA	2-10-2 MOE	1281
398031	1387	1398	GAGAGATGGCAG	1-10-1 MOE	1282

 

397959	1406	1419	GTGGCTGAAGAAAA	2-10-2 MOE	1283
						389990	1407	1418	TGGCTGAAGAAA	1-10-1 MOE	1284
397960	1420	1433	ATGTCTGGGAGCCT	2-10-2 MOE	1285
						392058	1420	1433	ATGTCTGGGAGCCT	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的5-甲基胞嘧啶	1285
389991	1421	1432	TGTCTGGGAGCC	1-10-1 MOE	1286
						336142	1432	1445	ATGATGGCTGTCAT	3-8-3 MOE	1287
389992	1436	1447	TGATGATGGCTG	1-10-1 MOE	1288
						397961	1437	1450	CTTTGATGATGGCT	2-10-2 MOE	1289
398032	1438	1449	TTTGATGATGGC	1-10-1 MOE	1222
						336143	1444	1457	ACGATCTCTTTGAT	3-8-3 MOE	1290
392059	1455	1468	TGTTTCTGCTAACG	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的5-甲基胞嘧啶	1291
						389960	1456	1467	GTTTCTGCTAAC	1-10-1 MOE	1292
389759	1456	1467	GTTTCTGCTAAC	1-9-2 MOE	1292
						336144	1457	1470	TTTGTTTCTGCTAA	3-8-3 MOE	1293
336145	1470	1483	CTTGATATCTCCTT	3-8-3 MOE	1294
						397962	1476	1489	CATCCTCTTGATAT	2-10-2 MOE	1295
398033	1477	1488	ATCCTCTTGATA	1-10-1 MOE	1198
						336146	1480	1493	AATCCATCCTCTTG	3-8-3 MOE	1296
389993	1483	1494	GAATCCATCCTC	1-10-1 MOE	1297
						336147	1490	1503	GTCTAAGTCGAATC	3-8-3 MOE	1298
389994	1495	1506	CAAGTCTAAGTC	1-10-1 MOE	1299
						398034	1499	1510	AGGTCAAGTCTA	1-10-1 MOE	1300
398010	1500	1513	TACAGGTCAAGTCT	2-10-2 MOE	1166
						398077	1501	1512	ACAGGTCAAGTC	1-10-1 MOE	1167
398011	1512	1525	CGCAGAAATGGATA	2-10-2 MOE	1301
						398078	1513	1524	GCAGAAATGGAT	1-10-1 MOE	1302
398012	1570	1583	TTCGCATCCGTCTA	2-10-2 MOE	1303
						398079	1571	1582	TCGCATCCGTCT	1-10-1 MOE	1304
398013	1663	1676	CCCTAGGTTGAATA	2-10-2 MOE	1305
						398080	1664	1675	CCTAGGTTGAAT	1-10-1 MOE	1306
398014	2025	2038	GTTATGCAAATCAG	2-10-2 MOE	1307
						398081	2026	2037	TTATGCAAATCA	1-10-1 MOE	1308
398015	2620	2633	TGACTCAGTAAATT	2-10-2 MOE	1309

 

398082	2621	2632	GACTCAGTAAAT	1-10-1 MOE	1310
						398016	2655	2668	TTAAAATTCTTGGG	2-10-2 MOE	1311
398083	2656	2667	TAAAATTCTTGG	1-10-1 MOE	1312
						398017	2687	2700	CCTAACTTTTAGAC	2-10-2 MOE	1313
398084	2688	2699	CTAACTTTTAGA	1-10-1 MOE	1314
						398018	2745	2758	ACCTGAAACTGCAA	2-10-2 MOE	1315
398085	2746	2757	CCTGAAACTGCA	1-10-1 MOE	1157
						398019	13166	13179	GTGTCAAAACCACT	2-10-2 MOE	1316
398086	13167	13178	TGTCAAAACCAC	1-10-1 MOE	1204
						398020	14675	14688	CCTATTCCCACTGA	2-10-2 MOE	1317
398087	14676	14687	CTATTCCCACTG	1-10-1 MOE	1318
						390033	15351	15362	AGCCAACTGCAA	1-10-1 MOE	1483
398021	30985	30998	TTGGATAAATATCT	2-10-2 MOE	1168
						398088	30986	30997	TGGATAAATATC	1-10-1 MOE	1169
397964	31001	31014	CCCATAGCAATAAT	2-10-2 MOE	1319
						336150	31001	31014	CCCATAGCAATAAT	3-8-3 MOE	1319
398035	31002	31013	CCATAGCAATAA	1-10-1 MOE	1320
						389961	31005	31016	ATCCCATAGCAA	1-10-1 MOE	1321
389760	31005	31016	ATCCCATAGCAA	1-9-2 MOE	1321
						397965	31013	31026	TCTGCAGGAAATCC	2-10-2 MOE	1322
398036	31014	31025	CTGCAGGAAATC	1-10-1 MOE	1323
						336151	31014	31027	TTCTGCAGGAAATC	3-8-3 MOE	1324
389996	31017	31028	TTTCTGCAGGAA	1-10-1 MOE	1165
						336152	31025	31038	CCTTCAAGTCTTTC	3-8-3 MOE	1325
336153	31040	31053	TTGTTCCTGTATAC	3-8-3 MOE	1326
						397966	31045	31058	CAATATTGTTCCTG	2-10-2 MOE	1327
398037	31046	31057	AATATTGTTCCT	1-10-1 MOE	1202
						389962	31047	31058	CAATATTGTTCC	1-10-1 MOE	1328
389761	31047	31058	CAATATTGTTCC	1-9-2 MOE	1328
						336154	31052	31065	ACATCATCAATATT	3-8-3 MOE	1329
389977	31480	31491	CTTAAAATTTGG	1-10-1 MOE	1421
						389776	31480	31491	CTTAAAATTTGG	1-9-2 MOE	1421
397967	62446	62459	CTTTGAATCCAAAA	2-10-2 MOE	1330
						389998	62447	62458	TTTGAATCCAAA	1-10-1 MOE	1331
336156	62450	62463	TATGCTTTGAATCC	3-8-3 MOE	1332

 

336157	62463	62476	TTGTAATGGTTTTT	3-8-3 MOE	1333
						389963	62468	62479	ATCTTGTAATGG	1-10-1 MOE	1334
389762	62468	62479	ATCTTGTAATGG	1-9-2 MOE	1334
						336158	62475	62488	AGATTGTATATCTT	3-8-3 MOE	1335
390000	67987	67998	GTCATAATGTCT	1-10-1 MOE	1194
						397968	67987	68000	GTGTCATAATGTCT	2-10-2 MOE	1195
398038	67988	67999	TGTCATAATGTC	1-10-1 MOE	1200
						336159	67989	68002	CGGTGTCATAATGT	3-8-3 MOE	1336
336160	67997	68010	AAATTTGGCGGTGT	3-8-3 MOE	1337
						397969	67999	68012	TTAAATTTGGCGGT	2-10-2 MOE	1338
398039	68000	68011	TAAATTTGGCGG	1-10-1 MOE	1339
						397971	69952	69965	TCTTCAAAAGGATA	2-10-2 MOE	1340
336162	69952	69965	TCTTCAAAAGGATA	3-8-3 MOE	1340
						398041	69953	69964	CTTCAAAAGGAT	1-10-1 MOE	1196
389964	69955	69966	GTCTTCAAAAGG	1-10-1 MOE	1197
						389763	69955	69966	GTCTTCAAAAGG	1-9-2 MOE	1197
398089	69957	69968	TGGTCTTCAAAA	1-10-1 MOE	1341
						397972	69963	69976	GTGGGTTATGGTCT	2-10-2 MOE	1342
336163	69963	69976	GTGGGTTATGGTCT	3-8-3 MOE	1342
						398042	69964	69975	TGGGTTATGGTC	1-10-1 MOE	1214
336164	69977	69990	AAGTTCTAGCTGTG	3-8-3 MOE	1343
						390002	69981	69992	ATAAGTTCTAGC	1-10-1 MOE	1344
336165	69988	70001	AAGGGTTTGATAAG	3-8-3 MOE	1345
						390003	70003	70014	AAGATCTTCACA	1-10-1 MOE	1243
397973	70003	70016	TCAAGATCTTCACA	2-10-2 MOE	1346
						336166	70003	70016	TCAAGATCTTCACA	3-8-3 MOE	1346
398043	70004	70015	CAAGATCTTCAC	1-10-1 MOE	1244
						336167	70012	70025	AGCCATTGGTCAAG	3-8-3 MOE	1347
390004	70021	70032	TTCACTTAGCCA	1-10-1 MOE	1208
						336168	70021	70034	TCTTCACTTAGCCA	3-8-3 MOE	1348
389965	70040	70051	CTGCAACATGAT	1-10-1 MOE	1018
						389764	70040	70051	CTGCAACATGAT	1-9-2 MOE	1018
397974	70040	70053	TGCTGCAACATGAT	2-10-2 MOE	1349
						336169	70040	70053	TGCTGCAACATGAT	3-8-3 MOE	1349
398044	70041	70052	GCTGCAACATGA	1-10-1 MOE	1350

 

336170	70051	70064	TTACAGTGAATTGC	3-8-3 MOE	1351
						390005	70059	70070	CCAGCTTTACAG	1-10-1 MOE	1352
389966	70081	70092	CATTACACCAGT	1-10-1 MOE	1353
						389765	70081	70092	CATTACACCAGT	1-9-2 MOE	1353
397975	70081	70094	ATCATTACACCAGT	2-10-2 MOE	1354
						336171	70081	70094	ATCATTACACCAGT	3-8-3 MOE	1354
398045	70082	70093	TCATTACACCAG	1-10-1 MOE	1355
						336172	70096	70109	AATAAATATGCACA	3-8-3 MOE	1356
389967	70123	70134	TGCCTTTAAAAA	1-10-1 MOE	1217
						389766	70123	70134	TGCCTTTAAAAA	1-9-2 MOE	1217
397976	70123	70136	TGTGCCTTTAAAAA	2-10-2 MOE	1357
						398046	70124	70135	GTGCCTTTAAAA	1-10-1 MOE	1199
336173	70124	70137	TTGTGCCTTTAAAA	3-8-3 MOE	1358
						336174	70131	70144	GGGCCTCTTGTGCC	3-8-3 MOE	1359
336175	70154	70167	CCTTACTTCCCCAT	3-8-3 MOE	1360
						335345	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE	1362
335356	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE翼中的磷酸二酯连接	1362
						335414	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE3’翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
335415	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE5’翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
						335416	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3 MOE翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1362
336176	70161	70174	CTCTGGTCCTTACT	3-8-3 MOE	1361
						335371	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1362
335382	70161	70176	GTCTCTGGTCCTTACT	3-10-3亚甲氧基BNA	1362
						335344	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE	1363
335355	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE翼中的磷酸二酯连接	1363
						335411	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE	1363

 

				3’C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪
						335412	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE第2个C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1363
335413	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2 MOE第2个和3’末端C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1363
						335370	70162	70175	CTCTGGTCCTTAC	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1363
335381	70162	70175	TCTCTGGTCCTTAC	2-10-2亚甲氧基BNA	1363
						398068	79799	79810	ACAGCTACACAA	1-10-1 MOE	1472
389968	89056	89067	TCTGACTGGGAA	1-10-1 MOE	1151
						389767	89056	89067	TCTGACTGGGAA	1-9-2 MOE	1151
336177	89056	89069	CCTCTGACTGGGAA	3-8-3 MOE	1364
						336178	89063	89076	CATAGCGCCTCTGA	3-8-3 MOE	1365
336179	89083	89096	CAGGTAGCTATAAT	3-8-3 MOE	1366
						390007	89085	89096	CAGGTAGCTATA	1-10-1 MOE	1367
390009	89135	89146	ATCTTGTGAAAC	1-10-1 MOE	1175
						397977	89135	89148	TCATCTTGTGAAAC	2-10-2 MOE	1368
336180	89135	89148	TCATCTTGTGAAAC	3-8-3 MOE	1368
						398047	89136	89147	CATCTTGTGAAA	1-10-1 MOE	1369
336181	89145	89158	GTTTCAAACATCAT	3-8-3 MOE	1370
						397978	89147	89160	TAGTTTCAAACATC	2-10-2 MOE	1371
398048	89148	89159	AGTTTCAAACAT	1-10-1 MOE	1372
						389969	89152	89163	GAATAGTTTCAA	1-10-1 MOE	1373
389768	89152	89163	AATAGTTTCAA	1-9-2 MOE	1373
						336182	89155	89168	CATTGGAATAGTTT	3-8-3 MOE	1374
397979	89162	89175	CACTGAACATTGGA	2-10-2 MOE	1375
						398049	89163	89174	ACTGAACATTGG	1-10-1 MOE	1376
390010	89165	89176	CCACTGAACATT	1-10-1 MOE	1240
						336183	89166	89179	CCGCCACTGAACAT	3-8-3 MOE	1377
397980	94786	94799	CAGACCACAAACTG	2-10-2 MOE	1378
						398050	94787	94798	AGACCACAAACT	1-10-1 MOE	1379
392060	94790	94803	CTGGCAGACCACAA	2-10-2亚甲氧基BNA	1380

 

				缺口中的未修饰胞嘧啶
						389970	94791	94802	TGGCAGACCACA	1-10-1 MOE	1249
389769	94791	94802	TGGCAGACCACA	1-9-2 MOE	1249
						336185	94792	94805	AGCTGGCAGACCAC	3-8-3 MOE	1381
397981	94798	94811	ACCTTTAGCTGGCA	2-10-2 MOE	1382
						398051	94799	94810	CCTTTAGCTGGC	1-10-1 MOE	1220
336186	94803	94816	TCTTCACCTTTAGC	3-8-3 MOE	1383
						390012	94860	94871	TCAAAGTACATG	1-10-1 MOE	1384
336187	94862	94875	GAACTCAAAGTACA	3-8-3 MOE	1385
						389971	94865	94876	GGAACTCAAAGT	1-10-1 MOE	1386
389770	94865	94876	GGAACTCAAAGT	1-9-2 MOE	1386
						397982	94865	94878	AGGGAACTCAAAGT	2-10-2 MOE	1387
398052	94866	94877	GGGAACTCAAAG	1-10-1 MOE	1388
						336188	94869	94882	GCTGAGGGAACTCA	3-8-3 MOE	1389
336189	94888	94901	TCACCACACACAGG	3-8-3 MOE	1390
						336190	94904	94917	GAACTCTACTTTGA	3-8-3 MOE	1391
389972	94909	94920	GAAGAACTCTAC	1-10-1 MOE	1392
						389771	94909	94920	GAAGAACTCTAC	1-9-2 MOE	1392
397983	94910	94923	GTGGAAGAACTCTA	2-10-2 MOE	1393
						398053	94911	94922	TGGAAGAACTCT	1-10-1 MOE	1394
336191	94915	94928	TGTTTGTGGAAGAA	3-8-3 MOE	1395
						336192	94925	94938	CATCTTGTTCTGTT	3-8-3 MOE	1396
397984	97824	97837	AGTGAAACATTTTG	2-10-2 MOE	1397
						398054	97825	97836	GTGAAACATTTT	1-10-1 MOE	1144
336194	97827	97840	AAAAGTGAAACATT	3-8-3 MOE	1145
						389973	97835	97846	TTACCCAAAAGT	1-10-1 MOE	1398
389772	97835	97846	TTACCCAAAAGT	1-9-2 MOE	1398
						336195	97836	97849	TATTTACCCAAAAG	3-8-3 MOE	1399
397985	97837	97850	GTATTTACCCAAAA	2-10-2 MOE	1400
						398055	97838	97849	TATTTACCCAAA	1-10-1 MOE	1401
397986	97853	97866	TCCTGGTATGAAGA	2-10-2 MOE	1402
						336196	97853	97866	TCCTGGTATGAAGA	3-8-3 MOE	1402
398056	97854	97865	CCTGGTATGAAG	1-10-1 MOE	1403
						390015	97857	97868	GGTCCTGGTATG	1-10-1 MOE	1404

 

336197	97862	97875	TTCCTCTGGTCCTG	3-8-3 MOE	1405
						397987	97866	97879	AGGTTTCCTCTGGT	2-10-2 MOE	1406
398057	97867	97878	GGTTTCCTCTGG	1-10-1 MOE	1407
						336198	97873	97886	TTTTCTGAGGTTTC	3-8-3 MOE	1408
336199	97891	97904	AGACTTCCATTTTC	3-8-3 MOE	1409
						389974	97893	97904	AGACTTCCATTT	1-10-1 MOE	1410
389773	97893	97904	AGACTTCCATTT	1-9-2 MOE	1410
						336200	97918	97931	CAAATGCTATCGAT	3-8-3 MOE	1411
336201	97933	97946	GCACGCTCTATACT	3-8-3 MOE	1412
						389975	97934	97945	CACGCTCTATAC	1-10-1 MOE	1413
389774	97934	97945	CACGCTCTATAC	1-9-2 MOE	1413
						336202	97948	97961	TCCTTGTCATTATC	3-8-3 MOE	1414
397988	97990	98003	GCTTTGTCAAGATC	2-10-2 MOE	1415
						389976	97991	98002	CTTTGTCAAGAT	1-10-1 MOE	1177
389775	97991	98002	CTTTGTCAAGAT	1-9-2 MOE	1177
						336203	97991	98004	TGCTTTGTCAAGAT	3-8-3 MOE	1416
397989	98017	98030	AAGTATCGGTTGGC	2-10-2 MOE	1417
						336204	98017	98030	AAGTATCGGTTGGC	3-8-3 MOE	1417
398058	98018	98029	AGTATCGGTTGG	1-10-1 MOE	1418
						336205	98032	98045	TTAAAATTTGGAGA	3-8-3 MOE	1419
397990	98034	98047	CCTTAAAATTTGGA	2-10-2 MOE	1420
						389977	98035	98046	CTTAAAATTTGG	1-10-1 MOE	1421
389776	98035	98046	CTTAAAATTTGG	1-9-2 MOE	1421
						336207	102230	102243	TCTACTGTTTTTGT	3-8-3 MOE	1422
336208	102236	102249	GGCTCCTCTACTGT	3-8-3 MOE	1423
						335330	102251	102265	AGCCTCTGGATTTGA	1-10-4 MOE	1424
335331	102252	102266	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4 MOE	1426
						336209	102252	102265	AGCCTCTGGATTTG	3-8-3 MOE	1425
335377	102252	102266	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4亚甲氧基BNA3’翼中的磷酸二酯	1426
						335376	102252	102266	TAGCCTCTGGATTTG	1-10-4亚甲氧基BNA	1426
390577	102253	102266	TAGCCTCTGGATTT	1-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶翼中的T’s是2-硫代胸嘧啶	1427

 

335332	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	1-10-4 MOE	1429
						386770	102253	102266	TAGCCTCTGGATTT	1-11-2 MOE	1427
375560	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE	1429
						391449	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶	1429
392055	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3 MOE缺口中的未修饰胞嘧啶	1429
						362977	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	2-12-2 MOE	1428
371975	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	3-10-2 MOE	1429
						386556	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
335341	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
						335350	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
383739	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
						390576	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的5-甲基胞嘧啶翼中的T’s是2-硫代胸嘧啶	1428
390580	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE翼中的嘧啶是5-噻唑缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
						390581	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
391096	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
						391098	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE	1428
391863	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE未修饰的胞嘧啶	1428
						384071	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 OMe缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
385036	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 OMe/2′-O-甲基-4′-硫代/2′-O-甲基-4′-硫代	1428

 

				翼中的未修饰胞嘧啶
						335368	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1428
391864	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1428
						392054	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1429
391172	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1429
						391865	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
391868	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3(5′R)-5′-甲基-亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA/(5′R)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
						391869	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3亚甲氧基BNA/(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA/(5′S)-5′-甲基-亚甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1428
384073	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA缺口中的5-甲基胞嘧啶	1428
						335379	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3亚甲氧基BNA	1428
390579	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-1-1-10-3 MOE/4’硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶翼中的磷酸二酯连接	1428
						390582	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/4’硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代	1428

 

				翼中的未修饰胞嘧啶翼中的磷酸二酯连接
						390606	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶翼中的磷酸二酯连接	1428
384072	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						385871	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3    OMe/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代/2′-O-[(2-甲氧基)乙基]-4′-硫代翼中的未修饰胞嘧啶	1428
390607	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-3 MOE/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						390608	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 MOE/五F/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
390609	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	3-10-2-1 MOE/MOE/五F翼中的未修饰胞嘧啶	1428
						386682	102253	102268	GCTAGCCTCTGGATTT	1-2-10-3 2′-(丁-基乙酰 氨基)-棕桐酸酰胺/MOE/MOE	1428
391173	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3(5′R)-5′-甲基-亚 甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1429
						391174	102253	102267	CTAGCCTCTGGATTT	2-10-3(5′S)-5′-甲基-亚 甲氧基BNA未修饰的胞嘧啶	1429
386970	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-2 MOE	1432
						390578	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶翼中的Ts是2-硫代胸嘧啶	1432
335333	102254	102268	GCTAGCCTCTGGATT	1-10-4 MOE	1430
						331429	102254	102267	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2 MOE	1431

 

335349	102254	102267	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2 MOE	1431
						335367	102254	102267	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA翼中的磷酸二酯连接	1431
392061	102254	102267	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA缺口中的未修饰胞嘧啶	1431
						335378	102254	102267	CTAGCCTCTGGATT	2-10-2亚甲氧基BNA	1431
383991	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-22′-(乙酰氨基-丁基-乙酰氨基)-胆固醇/MOE	1432
						383992	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-22′-(乙酰氨基-丁基-乙酰氨基)-胆酸/MOE	0432
386683	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-25’末端2′-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺/MOE	1432
						390614	102254	102266	TAGCCTCTGGATT	1-10-2五F	1432
389954	102255	102266	TAGCCTCTGGAT	1-10-1 MOE	1434
						335334	102255	102269	TGCTAGCCTCTGGAT	1-10-4 MOE	1433
389777	102255	102266	TAGCCTCTGGAT	1-9-2 MOE	1434
						390430	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶	1163
390431	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2MOE未修饰的胞嘧啶翼中的C是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						390432	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE	1163
390433	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2MOE未修饰的胞嘧啶Nt 6是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						390434	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶Nt7是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163

 

390435	102256	102268	GCTAGCCTCTGGA	1-10-2 MOE未修饰的胞嘧啶Nt 9是9-(氨乙氧基)酚噁嗪	1163
						335335	102256	102270	CTGCTAGCCTCTGGA	1-10-4 MOE	1435
335336	102257	102271	ACTGCTAGCCTCTGG	1-10-4 MOE	1436
						335337	102258	102272	AACTGCTAGCCTCTG	1-10-4 MOE	1437
335338	102259	102273	GAACTGCTAGCCTCT	1-10-4 MOE	1438
						335339	102260	102274	TGAACTGCTAGCCTC	1-10-4 MOE	1439
335340	102261	102275	TTGAACTGCTAGCCT	1-10-4 MOE	1440
						336210	102261	102274	TGAACTGCTAGCCT	3-8-3 MOE	1441
397991	102264	102277	AGTTGAACTGCTAG	2-10-2 MOE	1442
						398059	102265	102276	GTTGAACTGCTA	1-10-1 MOE	1443
390017	102268	102279	GAAGTTGAACTG	1-10-1 MOE	1444
						336211	102269	102282	ACAGAAGTTGAACT	3-8-3 MOE	1445
397992	102293	102306	TCATTGTCACTAAC	2-10-2 MOE	1446
						336212	102293	102306	TCATTGTCACTAAC	3-8-3 MOE	1446
398060	102294	102305	CATTGTCACTAA	1-10-1 MOE	1447
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389778	102301	102312	TCAGGTTCATTG	1-9-2 MOE	1448
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398072	102828	102839	GCAAACTTATCT	1-10-1 MOE	1482
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398074	103070	103081	GCACCAATATGC	1-10-1 MOE	1248
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390054	103862	103873	AACACTGCACAT	1-10-1 MOE	1493

盐、药物前体和生物等同物(bioequiva1ent)

本文中所提供的反义化合物包括任何药学可接受的盐、酯、或此类酯的盐、或任何其它功能性化学等同物，其在施用于动物(包括人类)后能够(直接地或间接地)提供生物学活性代谢物或其残基。因而，例如，公开内容还涵盖反义化合物的药物前体和药学可接受盐、此类药物前体的药学可接受盐、及其它生物等同物。

术语“药物前体”(prodrug)”指以没有活性或活性较低的形式制备但在身体或其细胞内通过内源酶、化学物质、和/或调节的作用而转变成活性形式(即药物)的治疗剂。具体而言，药物前体形式的寡核苷酸依照WO 93/24510或WO 94/26764中披露的方法制备成SATE((S-乙酰基-2-硫代乙基)磷酸根)衍生物。药物前体还可包括如下反义化合物，其中一个或两个末端包含将要被切割以生成活性化合物的核碱基(例如通过在末端掺入磷酸二酯主链连接)。在某些实施方案中，自药物前体切除一个或多个非药物模块以生成活性形式。在某些此类实施方案中，此类非药物模块不是核苷酸或寡核苷酸。

术语“药学可接受盐”指本文所述化合物的生理学和药学可接受的盐，即保留亲本化合物的期望生物学活性且不授予不良毒理学效应的盐。反义寡核苷酸的钠盐对于人类治疗性施用是有用的且普遍接受的。

在某些实施方案中，还提供了双链核酸(包括但不限于dsRNA化合物)的盐(包括但不限于钠盐)。

G.特定的药物组合物

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含一种或多种短反义化合物和一种或多种赋形剂。在某些这样的实施方案中，赋形剂选自水、盐溶液、醇(alcohol)、聚乙二醇(polyethylene glycols)、明胶、乳糖、直链淀粉(amylase)、硬脂酸镁、滑石、硅酸、粘性石蜡(viscous paraffin)、羟甲基纤维素和聚乙烯吡咯烷酮。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物是使用已知技术制备的，所述已知技术包括但不限于混合、溶解、制粒、制糖衣丸(dragee-making)、研末(levigating)、乳化、包囊(encapsulating)、包埋(entrapping)或者压片过程。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物是液物(例如悬液、酏剂和/或溶液)。在某些这样的实施方案中，液态的药物组合物是使用本领域已知的成分制备的，所述成分包括但不限于水、二醇(glycols)、油(oils)、醇(alcohols)、调味剂、防腐剂和着色剂。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物是固体(例如粉末、片剂和/或胶囊)。在某些这样的实施方案中，包含一种或多种寡核苷酸的固态药物组合物是使用本领域已知的成分制备的，所述成分包括但不限于淀粉(starches)、糖(sugars)、稀释剂、粒化剂(granulating agents)、润滑剂、粘合剂和崩解剂。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物配制为长效制剂(depotpreparation)。某些这样的长效制剂通常比非长效试剂的作用时间长。在某些实施方案中，这样的制剂是通过植入(例如皮下或肌肉内植入)或肌肉内注射来施用的。在某些实施方案中，长效制剂是使用合适的聚合材料或疏水性材料(例如在可接受的油中的乳液)或离子交换树脂制备的，或制备为微溶性的衍生物，例如作为微溶性的盐。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含递送系统。递送系统的例子包括但不限于脂质体和乳液。特定的递送系统可用于制备特定的药物组合物，包括那些包含疏水性化合物的药物组合物。在特定的实施方案中，使用特定的有机溶剂，例如二甲亚砜。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含一种或多种组织特异性递送分子，这些分子被设计用于将一种或多种本发明的药物递送到特定的组织或细胞类型。例如，在特定的实施方案中，药物组合物包括用组织特异性抗体包被的脂质体。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含共溶剂系统。某些这样的共溶剂系统包括，例如，苯甲醇、非极性表面活性剂、可与水混溶的有机聚合物、和水相。在特定的实施方案中，将这样的共溶剂系统用于疏水性化合物。这样的共溶剂系统的一个非限制性实例是VPD共溶剂系统，其是包含3％w/v的苯甲醇、8％w/v的非极性表面活性剂聚山梨醇酯80(Polysorbate80.)TM和65％w/v的聚乙二醇300的无水乙醇溶液。可以对这样的共溶剂系统的比例进行较大的变化而不显著改变它们的溶解性和毒性特征。此外，可以改变共溶剂组分的身份(identity)：例如，可以使用其它表面活性剂代替聚山梨醇酯80TM，可以改变聚乙二醇的分级大小(fraction size)，可以用其它生物相容性聚合物例如聚乙烯吡咯烷酮来代替聚乙二醇；可以用其它糖或多糖来替换右旋糖(dextrose)。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含持续释放系统。这样的持续释放系统的一个非限制性实例是固态疏水聚合物的半透性基质。在特定的实施方案中，取决于它们的化学性质，持续释放系统可能在以小时计、以日计、以周计或以月计的时间内释放药物。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物制备用于口服施用。在某些这样的实施方案中，药物组合物是通过将一种或多种寡核苷酸与一种或多种药学可接受的载体混合而配制的。某些这样的载体使得药物组合物能够配制为片剂、丸剂、糖衣丸、胶囊、液体、凝胶、糖浆、浆液(slurries)、悬液等等，供受试者口服摄取。在特定的实施方案中，供口服的药物组合物是通过将寡核苷酸和一种或多种固态赋形剂混合而获得的。合适的赋形剂包括但不限于：填充剂，如糖，包括乳糖、蔗糖、甘露醇或山梨醇；纤维素制备物，例如玉米淀粉、小麦淀粉、大米淀粉、马铃薯淀粉、明胶、西黄蓍胶、甲基纤维素、羟丙基甲基-纤维素、羧甲基纤维素钠、和/或聚乙烯吡咯烷酮(PVP)。在特定的实施方案中，任选地将这样的混合物粉碎并任选添加辅料(auxiliaries)。在特定的实施方案中，将药物组合物成型以获得片剂或糖衣丸核心。在特定的实施方案中，添加崩解剂(例如交联的聚乙烯吡咯烷酮、琼脂、或海藻酸或其盐例如海藻酸钠)。

在特定的实施方案中，糖衣丸核心具有包衣。在某些这样的实施方案中，可以使用浓的糖溶液，其可任选地包含阿拉伯胶、滑石、聚乙烯吡咯烷酮、卡巴普(carbopol)凝胶、聚乙二醇、和/或二氧化钛、漆溶液、和合适的有机溶剂或溶剂混合物。可向片剂或糖衣丸包衣中加入染料或色素。

在特定的实施方案中，供口服施用的药物组合物是用明胶制成的推入配合式(push-fit)胶囊。某些这样的推入配合式胶囊包括一种或多种本发明的药物以及与之掺合的一种或多种填充剂(例如乳糖)、粘合剂(例如淀粉)、和/或润滑剂(例如滑石或硬脂酸镁)，以及任选的稳定剂。在特定的实施方案中，供口服施用的药物组合物是密封的软胶囊，用明胶和增塑剂(例如甘油或山梨醇)制成。在某些软胶囊中，一种或多种本发明的药物溶解于或悬浮于合适的液体中，这些液体例如脂肪油、液态石蜡、或液态聚乙二醇。此外，可以添加稳定剂。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于含服施用。某些这样的药物组合物是以常规方式配制的片剂或锭剂。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于注射(例如静脉内、皮下或者肌肉内注射，等等)施用。在某些这样的实施方案中，药物组合物包含载体，并配制在水溶液中，例如水或生理相容性缓冲液如汉克斯氏溶液、林格溶液、或生理盐水缓冲液。在特定的实施方案中，包含其它成分(例如有助于溶解性或充当防腐剂的成分)。在特定的实施方案中，使用合适的液体载体、悬浮剂等来制备注射用悬液。特定的注射用药物组合物以单位剂型提供，例如在安瓿或多剂量容器中。特定的注射用药物组合物是油性或水性溶媒(vehicles)中的悬液、溶液或乳液，可包含配制用试剂(formulatory agents)例如悬浮剂、稳定剂和/或分散剂。适用于注射用药物组合物的特定溶剂包括但不限于：亲脂溶剂和脂肪油，如芝麻油；合成脂肪酸酯，如油酸乙酯或甘油三酯；以及脂质体。含水的注射用悬液可包含能增加悬液粘度的物质，例如羧甲基纤维素钠、山梨醇或右旋糖酐。任选地，这样的悬液还可包含合适的稳定剂或能增加药物溶解性的作用剂，来为制备高浓度的溶液提供可能。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于穿粘膜施用。在某些这样的实施方案中，在配制剂中使用适于要穿透的屏障的穿透剂。这样的穿透剂在本领域中是公知的。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于吸入施用。某些这样的吸入用药物组合物制备为装在加压包装或雾化器中的喷雾剂(aerosol spray)的形式。某些这样的药物组合物包含推进剂，例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其它合适的气体。在特定的使用加压气溶胶的实施方案中，可以利用计量递送的阀门来确定剂量单位。在特定的实施方案中，可以配制用于吸入器或吹入器的胶囊或药筒(cartridges)。某些这样的配制剂包含本发明药物与合适的粉末基质(例如乳糖或淀粉)所成的粉末混合物。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于直肠施用，例如栓剂或保留灌肠剂。某些这样的药物组合物包含已知的组分，例如可可脂和/或其它甘油酯。

在特定的实施方案中，将药物组合物制备为用于局部施用。某些这样的药物组合物包含温和的增湿基质，例如软膏剂或乳膏。示例性的合适的软膏剂基质包括但不限于矿脂、矿脂加挥发性有机硅(volatile silicones)、羊毛脂、和油包水乳液，例如Eucerin.TM(优色林^TM)，可购自Beiersdorf(Cincinnati，Ohio)。示例性的合适的乳膏基质包括但不限于Nivea.TM(妮维雅^TM)乳膏，可购自Beiersdorf(Cincinnati.Ohio)，冷霜(USP)，Purpose Cream.TM.，可购自Johnson & Johnson(New Brunswick，N.J.)，  亲水软膏剂(USP)和Lubriderm.TM.，可购自Pfizer(Morris Plains，N.J.)。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物包含治疗有效量的寡核苷酸。在特定的实施方案中，治疗有效量足以防止、减轻或改善疾病的症状或延长被治疗的受试者的生存。治疗有效量的确定完全在本领域技术人员的能力范围之内。

在特定的实施方案中，一种或多种本发明的短反义化合物配制为前体药物。在特定的实施方案中，当体内施用时，前体药物被化学转化为所述短反义化合物的生物学上、药学上或治疗上更有活性的形式。在特定的实施方案中，前体药物之所以有用，是因为它们比相应的活性形式更容易施用。例如，在特性情形下，前体药物可能比相应的活性形式更易于生物利用(例如通过口服施用)。在特定情形下，前体药物与相应的活性形式相比可能具有更好的溶解性。在特定的实施方案中，前体药物比相应的活性形式的水溶性低。在特定的情形下，这样的前体药物具有优良的跨细胞膜传递性(此处水溶性对运动性是有害的)。在特定的实施方案中，前体药物是酯。在特定的实施方案中，所述酯在施用时被代谢水解成羧酸。在某些情况下含有羧酸的化合物是对应的活性形式。在特定的实施方案中，前体药物包含结合于酸基团的短肽(聚氨基酸)。在某些这样的实施方案中，所述肽在施用时被切割，形成相应的活性形式。

在特定的实施方案中，前体药物的产生是通过修饰药学活性的化合物，使得在体内施用时该活性化合物会被再生。可以对前体药物进行设计，以改变药物的代谢稳定性或转运特征、掩蔽副作用(mask side effect)或毒性、改善药物的口味或改变药物的其它特征或性质。借助对体内药效学过程和药物代谢的知识，一旦知道了某种药物活性化合物，本领域技术人员就能够设计该化合物的前体药物(参见例如Nogrady(1985)Medicinal Chemistry ABiochemical Approach，Oxford University Press，New York，第388-392页)。

在特定的实施方案中，包含一种或多种本发明药物的药物组合物可用于在哺乳动物受试者，尤其是人类受试者中治疗症候或病症。合适的施用途径包括但不限于口服、直肠、穿粘膜、肠(intestinal)、肠道(enteral)、局部、栓剂、通过吸入、鞘内、室内、腹膜内、鼻内、眼内和非消化道(例如静脉内、肌肉内、髓内和皮下)。在特定的实施方案中，鞘内施用药物(pharmaceuticalintrathecals are administered)以实现局部而不是全身的暴露。例如，可以将药物组合物直接注射到期待起作用的区域中(例如肾或心脏区域)。

在特定的实施方案中，短反义化合物与它们的亲本寡核苷酸相比，使它们特别适于口服施用。在特定的实施方案中，短反义化合物比它们的亲本寡核苷酸相比更适于口服施用，是因为它们与那些亲本寡核苷酸相比具有更高的效力。在特定的实施方案中，短反义化合物比它们的亲本寡核苷酸相比更适于口服施用，是因为它们与那些亲本寡核苷酸相比具有更好的稳定性、可利用性或溶解性质。

在一个进一步的方面中，药物是无菌冻干的寡核苷酸，用合适的稀释剂(例如注射用无菌水)加以重建。将重建的产物稀释到盐水中后，作为皮下注射或静脉内输注施用。构成所述冻干的药物产品的寡核苷酸已在注射用水中制备，在制备过程中用酸或碱调节到pH7.0-9.0，然后冻干。冻干的寡核苷酸可以是25-800mg的寡核苷酸。应理解这涵盖了25、50、75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375、425、450、475、500、525、550、575、600、625、650、675、700、725、750、775和800mg的冻干寡核苷酸。冻干的药物产品可以包装在2ml的I型透明玻璃小瓶(硫酸铵处理过的)中，塞上溴化丁基橡胶塞，并用铝制

顶封(overseal)加以密封。

本发明的组合物可进一步包含常规存在于药物组合物中的其它辅助组分，这些组分采用它们在本领域公用的剂量水平(art-established usage level)。由此，例如，所述组合物可包含其它相容的药学活性材料，例如止痒剂、收敛剂、局部麻醉剂或抗炎剂，或者可包含其它可用来物理地配制本发明组合物的不同剂型的材料，例如染料、调味剂、防腐剂、抗氧化剂、遮光剂、增稠剂和稳定剂。但是，这些材料当被添加时不应给本发明组合物的组分的生物学活性带来不当的干扰。可以将所述配制剂灭菌，并且如果期望的话，可以将它们与不会与所述配制剂的寡核苷酸发生有害相互作用的辅剂混合，所述辅剂例如润滑剂、防腐剂、稳定剂、润湿剂、乳化剂、用于影响渗透压的盐、缓冲剂、着色剂、调味剂和/或香料等等。

本文提供的反义化合物还可以与其它分子、分子结构或化合物的混合物进行掺合(admix)、包囊(encapsulate)、缀合(conjugate)或者其它方式结合。

本文还描述了包含本文所提供的反义化合物的药物组合物和配制剂。所述药物组合物可以通过若干方式施用，这取决于期望局部还是全身治疗，以及要治疗的区域。在优选的实施方案中，施用是针对呼吸道尤其是肺的表面来局部进行，例如通过粉末或气溶胶的口和/或鼻喷雾、吸入或吹入。

本文描述的药物组合物(其可视情况以单位剂型提供)可以根据制药工业上熟知的常规技术加以制备。这样的技术包括使活性成分与药物载体或赋形剂结合[bring into association the active ingredients with the pharmaceuticalcarrier(s)or excipient(s)]。一般而言，通过使活性成分与液体载体和/或细碎(finely divided)的固体载体均匀而密切地(uniformly and intimately)结合，然后视需要使产物成形(例如成为用于递送的特定颗粒大小)，来制备配制剂。在优选的实施方案中，将药物配制剂在合适的溶剂(例如水或生理盐水)中，有可能在无菌配制剂中，与载体或其它试剂一起制备以供肺部施用，其中所述载体或其它试剂容许形成具有期望大小的小滴以供利用吸入器、鼻部递送装置、喷雾器和其它肺部递送装置加以施用。或者，可以将药物配制剂配制为干粉以供干粉吸入器使用。

“药学载体”或“赋形剂”可以是药学可接受的溶剂、悬浮剂或任何其它药理学惰性的媒质(vehicle)，用于对个体递送一种或多种核酸，它们是本领域已知的。赋形剂可以是液体或者固体，并且在考虑预定的施用方式的前提下加以选择，以便在与给定药物组合物的核酸和其它组分混合时能提供期望的体积(bulk)、稠度(consistency)等等。

H.特定的治疗用途

在特定的实施方案中，使用反义化合物来调节动物(例如人)中靶基因的表达。在特定的实施方案中，可以使用这样的化合物来治疗代谢病症或调节一种或多种病征(disease indication)。例如，这些方法包括对需要治疗与靶基因相关的疾病或病症的动物施用有效量的能调节所述靶基因表达的反义化合物的步骤。本文提供的能有效调节靶RNA表达或表达的蛋白产物的反义化合物被认为是活性反义化合物。活性反义化合物还包括能有效调节若干病征(包括代谢和心血管病征)中的一种或多种的化合物，这些病征的例子下文有描述。

靶基因表达的调节可以在动物的体液(其可以包含或不包含细胞)、组织或器官中测量。获得用于分析的样品的方法和制备这些样品以备分析的方法都是本领域熟知的，所述样品例如体液(如痰(sputum)、血清、尿)、组织(如活检)或器官。用于分析RNA和蛋白质水平的方法在上文有讨论，而且是本领域技术人员熟知的。治疗效果可以通过如下方式来评估：从已接触过一种或多种本文所述的化合物的动物采集如上所述的液体、组织或器官，并使用本领域已知的常规临床方法测量与所述液体、组织或器官中靶基因表达相关的生物标志物或病征。这些生物标志物包括但不限于：肝转氨酶、胆红素、白蛋白、血尿素氮、肌酸以及肾和肝功能的其它标志物；白介素、肿瘤坏死因子、细胞内粘附分子、C反应蛋白、趋化因子、细胞因子、以及其它炎症标志物。

可以通过将有效量的化合物添加到合适的药学可接受的稀释剂或载体中来在药物组合物中应用本文提供的反义化合物。可接受的载体和稀释剂是本领域技术人员熟知的。稀释剂或载体的选择是基于若干因素，包括但不限于化合物的溶解性和施用途径。本领域技术人员非常了解这些考虑因素。在一个方面中，本文描述的反义化合物抑制靶基因的表达。所述化合物也可以用于制备治疗与靶基因相关的疾病和病症的药物。

还考虑了使体液、器官或组织接触有效量的一种或多种本文提供的反义化合物或组合物的方法。可以使体液、器官或组织接触一种或多种所述化合物从而调节体液、器官或组织的细胞中的靶基因表达。有效量可以利用本领域技术人员的常规方法监测反义化合物或组合物对靶核酸或它们的产物的调节作用来确定。

共同施用

在特定的实施方案中，将两种或更多种反义化合物共同施用。在特定的实施方案中，药物组合物包括靶向第一核酸的一种或多种反义化合物，尤其是寡核苷酸，和靶向第二核酸靶的一种或多种反义化合物。那些反义化合物中的一种或多种可以是短反义化合物。在特定的实施方案中，药物组合物包括靶向同一核酸靶的不同区域的两种或更多种反义化合物。这样的反义化合物中的一种或多种可以是短反义化合物。组合的两种或更多种化合物可以一起使用或顺序使用。

在特定的实施方案中，将一种或多种药物组合物与一种或多种其它药物共同施用。在特定的实施方案中，将这样的一种或多种其它药物设计为与一种或多种本发明的药物组合物治疗同样的疾病或病症。在特定的实施方案中，将这样的一种或多种其它药物设计为与一种或多种本发明的药物组合物治疗不同的疾病或病症。在特定的实施方案中，将这样的一种或多种其它药物设计为治疗一种或多种本发明的药物组合物的不良作用。在特定的实施方案中，将一种或多种本发明的药物组合物与另一种药物共同施用以治疗该药物的不良作用。在特定的实施方案中，将一种或多种本发明的药物组合物与一种或多种其它药物同时施用。在特定的实施方案中，将一种或多种本发明的药物组合物与一种或多种其它药物在不同的时间施用。在特定的实施方案中，将一种或多种本发明的药物组合物与一种或多种其它药物一起制备在单一配制剂中。在特定的实施方案中，将一种或多种本发明的药物组合物与一种或多种其它药物分别配制。

在特定的实施方案中，可以与本发明的药物组合物共同施用的药物包括降脂剂(lipid-lowering agents)。在某些这样的实施方案中，可以与本发明的药物组合物共同施用的药物包括但不限于阿托伐他汀(atorvastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)和依泽替米贝(ezetimibe)。在某些这样的实施方案中，降脂剂在施用本发明的药物组合物之前施用。在某些这样的实施方案中，降脂剂在施用本发明的药物组合物之后施用。在某些这样的实施方案中，降脂剂与本发明的药物组合物同时施用。在某些这样的实施方案中，共同施用的降脂剂的剂量与单独施用该降脂剂时要施用的剂量相同。在某些这样的实施方案中，共同施用的降脂剂的剂量比单独施用该降脂剂时要施用的剂量更低。在某些这样的实施方案中，共同施用的降脂剂的剂量比单独施用该降脂剂时要施用的剂量更高。

在特定的实施方案中，共同施用的降脂剂是HMG-CoA还原酶抑制剂。在某些这样的实施方案中，HMG-CoA还原酶抑制剂是他汀(抑制素；statin)。在某些这样的实施方案中，他汀选自阿托伐他汀、辛伐他汀、普伐他汀(pravastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)和罗苏伐他汀。在特定的实施方案中，共同施用的降脂剂是胆固醇吸收抑制剂。在某些这样的实施方案中，胆固醇吸收抑制剂是依泽替米贝。在特定的实施方案中，共同施用的降脂剂是共同配制的HMG-CoA还原酶抑制剂和胆固醇吸收抑制剂。在某些这样的实施方案中，共同施用的降脂剂是依泽替米贝/辛伐他汀。在特定的实施方案中，共同施用的降脂剂是微粒体甘油三酯转移蛋白抑制剂。

在特定的实施方案中，共同施用的药物是胆汁酸多价螯合剂(bile acidsequestrant)。在某些这样的实施方案中，胆汁酸多价螯合剂选自考来烯胺(cholestyramine)、考来替泊(colestipol)和考来维仑(colesevelam)。

在特定的实施方案中，共同施用的药物是烟酸。在某些这样的实施方案中，烟酸选自即时释放的烟酸(immediate release nicotinic acid)、延长释放的烟酸(extended release nicotinic acid)和持续释放的烟酸(sustained releasenicotinic acid)。

在特定的实施方案中，共同施用的药物是纤维酸(fibric acid)。在某些这样的实施方案中，纤维酸选自吉非贝齐(gemfibrozil)、非诺贝特(fenofibrate)、氯贝丁酯(clofibrate)、苯扎贝特(bezafibrate)和环丙贝特(ciprofibrate)。

可以与本发明的药物组合物共同施用的药物的进一步的例子包括但不限于：皮质类固醇，包括但不限于泼尼松；免疫球蛋白，包括但不限于静脉内免疫球蛋白(IVIg)；镇痛药(例如扑热息痛)；抗炎剂，包括但不限于非类固醇抗炎药(例如布洛芬、COX-1抑制剂，和COX-2抑制剂)；水杨酸盐或酯；抗生素；抗病毒剂；抗真菌剂；抗糖尿病剂(例如双胍、糖苷酶抑制剂、胰岛素、磺酰脲和噻唑烷二酮(thiazolidenediones))；肾上腺素能药改性剂(adrenergic modifiers)；利尿剂；激素(例如促蛋白合成类固醇、雄激素、雌激素、降钙素、孕激素、促生长素抑制素(somatostan)和甲状腺激素)；免疫调节剂；肌肉松弛剂；抗组胺剂；骨质疏松药(例如双膦酸盐、降钙素和雌激素)；前列腺素；抗肿瘤剂；精神治疗药、镇静剂、毒橡树(poison oak)或毒漆树(poison sumac)产物；抗体；和疫苗。

在特定的实施方案中，本发明的药物组合物可以与降脂疗法结合施用。在某些这样的实施方案中，降脂疗法是治疗性的生活方式改变。在某些这样的实施方案中，降脂疗法是LDL血浆清除。

I.试剂盒、研究试剂和诊断学(diagnostics)

本文提供的反义化合物可以用于诊断学，以及用作研究试剂和试剂盒。此外，反义化合物能够特异性地抑制基因表达或调节基因表达，本领域普通技术人员常常利用它们来阐明特定基因的功能或者区分生物途径中不同组分的功能。

为了用于试剂盒和诊断学，可以在差异分析和/或组合分析中单独使用或与其他化合物或治疗剂组合使用本文描述的反义化合物作为工具，来阐明细胞和组织内表达的基因的一部分或其整个互补体的表达模式。基因表达分析的方法是本领域技术人员公知的。

J短反义化合物的某些优点

在特定的实施方案中，短反义化合物与它们的亲本寡核苷酸相比具有优点。例如，在特定的实施方案中，短反义化合物对靶核酸的亲和力比它们的亲本寡核苷酸大。在特定的实施方案中，短反义化合物的体外效力比它们的亲本寡核苷酸大。在某些这样的实施方案中，这种体外效力的增加并不完全为亲和力的增加所解释。在特定的实施方案中，这样的体外效力的增加可以归因于短反义化合物穿透细胞能力的增加和/或达到细胞中靶核酸的能力的增加。在特定的实施方案中，短反义化合物的体内效力比它们的亲本寡核苷酸大。在特定的实施方案中，这种更大的体内效力不能归因于体外效力的增加或亲和力的增加。在特定的实施方案中，短反义化合物与其亲本寡核苷酸相比的体内效力，比基于体外效力或亲和力所预测的还要高。在特定的实施方案中，这种体内效力的增加可以归因于生物利用率的增加、更好地穿入细胞、进入细胞后更好地到达靶核酸，或其他因素。

在特定的实施方案中，可能期待短反义化合物与它们的亲本寡核苷酸相比对它们的靶核酸的特异性较低。在某些这样的实施方案中，可能期待来自短反义化合物的副作用(包括毒性作用的潜力)增加。在特定的实施方案中，没有观察到这样的额外副作用。在特定的实施方案中，特定的短反义化合物可能结合的非靶核酸对该短反义化合物而言是不可用的(not available)。在这样的实施方案中，副作用(包括毒性)不如预计的那样成问题。

在特定的实施方案中，由于短反义化合物较小，它们结合蛋白的可能性较小。在某些这样的实施方案中，较少的蛋白结合导致较低的毒性，这是因为蛋白结合可能造成不利的后果。在特定的实施方案中，这样的较少的蛋白结合导致更大的效力，因为这样能留下更多的反义化合物用于治疗作用。在特定的实施方案中，较少的蛋白结合导致药物-药物相互作用毒性的减少。

非限制性公开和提述并入

本文所述的特定化合物、组合物和方法已经依照特定的实施方案进行了具体地叙述，但下面的实施例仅用于举例说明本文中描述的化合物而非意在限定它们。本申请中记载的每个参考文献、Genbank登录号等均以提述方式完整并入。

实施例1

细胞培养和短反义化合物处理

短反义化合物对靶核酸表达的作用可以在多种培养细胞系或原代细胞系中的任一种中加以测试。细胞系可以获自公众可获取的来源，例如美国典型培养物保藏中心(Manassas，VA)。细胞依照本领域普通技术人员公知的方法来培养。

当细胞达到合适的汇合度时，利用

如所述地用寡核苷酸处理细胞。当细胞达到65-75％汇合度时，用寡核苷酸处理它们。在

减血清培养基(reduced serum medium)(Invitrogen LifeTechnologies，Carlsbad，CA)中将寡核苷酸与(Invitrogen LifeTechnologies，Carlsbad，CA)混合以达到期望的寡核苷酸浓度和每100nM寡核苷酸2.5或3μg/mL的

浓度。将这种转染组合物在室温温育约0.5小时。对于在96孔平板中生长的细胞，用100μL 

-1将孔洗一次，然后用130μL转染混合物处理孔。在24孔平板或其它标准组织培养板中生长的细胞以类似的方式处理，使用合适体积的培养基和寡核苷酸。一式二份或一式三份地进行细胞处理和数据获取。37℃处理大约4-7小时后，用新鲜的组织培养基替换含有转染混合物的培养基。在寡核苷酸处理16-24小时后收集细胞。

使用对照寡核苷酸来确定特定细胞系的最佳寡聚化合物浓度。此外，当在寡聚化合物筛选实验或表型测定中测试寡聚化合物时，平行地测试对照寡核苷酸。

使用的寡核苷酸浓度因细胞系而异。为确定特定细胞系的最佳寡核苷酸浓度，以一定浓度范围的阳性对照寡核苷酸来处理细胞。然后将导致靶mRNA 80％抑制的阳性对照寡核苷酸的浓度作为该细胞系针对新的寡核苷酸的后续实验中的筛选浓度。如果没有达到80％抑制，则使用导致靶mRNA60％抑制的阳性对照寡核苷酸的最低浓度作为该细胞系后续实验中的寡核苷酸筛选浓度。如果没有达到60％抑制，则认为该细胞系不适于进行寡核苷酸转染实验。本文中所用的反义寡核苷酸浓度当使用脂质体试剂转染反义寡核苷酸时为50nM到300nM，当通过电穿孔转染寡核苷酸时为1nM到40nM。

实施例2靶mRNA水平的实时定量PCR分析

使用

7600、7700或7900 Sequence Detection System(序列检测系统)(PE-Applied Biosystems，Foster City，CA)依照制造商的指示进行实时定量PCR来对靶mRNA水平定量。

在定量PCR分析之前，使用GAPDH扩增反应评估对受测靶基因特异性的引物-探针组的多重体化能力(ability to be”multiplexed”)。分离后，对RNA顺序进行逆转录酶(RT)反应和实时PCR，两个反应在相同的孔中进行。RT和PCR试剂获自Invitrogen Life Technologies(Carlsbad，CA)。RT，实时PCR在同一孔中进行，将20μL PCR合剂(cocktail)(无MgCl₂的2.5x PCR缓冲液、6.6mM MgCl₂、dATP、dCTP、dCTP和dGTP各375μM、正向和反向引物各375nM、125nM探针、4单位的RNA酶抑制剂、1.25单位的 Taq、5单位的MuLV逆转录酶、和2.5x ROX染料)添加到含30μL总RNA溶液(20-200ng)的96孔板中。在48℃温育30分钟进行RT反应。在95℃温育10分钟活化 Taq后，进行40个循环的二步PCR程序：95℃ 15秒(变性)，然后60℃ 1.5分钟(退火/延伸)。

对于通过RT，实时PCR所得到的基因靶的量，利用GAPDH(一种表达恒定的基因)的表达水平或者通过用

(Molecular Probes，Inc.Eugene，OR)对总RNA定量来加以标准化。用RT，实时PCR对GAPDH表达定量，定量是通过与靶同时进行反应、多重体化，或分别进行。用

 RNA定量试剂(Molecular Probes，Inc.  Eugene，OR)对总RNA定量。

用移液器将170μL 

工作试剂(1:350稀释于10mM Tris-HCl、1mM EDTA，pH7.5中的

试剂)加入含30μL纯化的细胞RNA的96孔板中。用

4000(PE Applied Biosystems)以485nm激发和530nm发射读取平板。

GAPDH PCR探针5’端共价连接有JOE，3’端共价连接有TAMRA或MGB，其中JOE是荧光报道染料，TAMRA或MGB是淬灭染料。在一些细胞类型中，使用针对来自不同物种的GAPDH序列设计的引物和探针来测量GAPDH表达。例如，使用人GAPDH引物和探针组来测量源自猴的细胞和细胞系中的GAPDH表达。

使用常规方法设计用于实时PCR的探针和引物使之与靶核酸杂交。例如，通常使用

(Applied Biosystems，Foster City，CA)软件来设计用于实时PCR的探针和引物。表24给出了引物和探针序列及它们所杂交的靶核酸的例子。靶特异性PCR探针在5’端共价连接有FAM，在3’端共价连接有TAMRA或MGB，其中FAM是荧光染料，TAMRA或MGB是淬灭染料。

表24 用于实时PCR的靶特异性引物和探针

 

靶名称	物种	序列说明	序列(5′至3′)	SEQIDNO
					ApoB	小鼠	正向引物	CGTGGGCTCCAGCATTCTA	1524
ApoB	小鼠	反向引物	AGTCATTTCTGCCTTTGCGTC	1525
					ApoB	小鼠	探针	CCAATGGTCGGGCACTGCTCAA	1526
ApoB	小鼠	正向引物	GAAAATAGACTTCCTGAATAACTATGCATT	1527

 

靶名称	物种	序列说明	序列(5′至3′)	SEQID NO
					ApoB	小鼠	反向引物	ACTCGCTTGCCAGCTTGC	1528
ApoB	小鼠	探针	TTTCTGAGTCCCCGTGCCCAACA	1529
					GCGR	小鼠	正向引物	TGAGCCTTGCCACCTTCTCT	1530
GCGR	小鼠	反向引物	GCGCACCCCAGCCAA	1531
					GCGR	小鼠	探针	AGAGGAGCTTCTTTTCCCTCTACCTGGGC	1532
GCGR	小鼠	正向引物	ATTTCCTGCCCCTGGTACCT	1533
					GCGR	小鼠	反向引物	CGGGCCCACACCTCTTG	1534
GCGR	小鼠	探针	CCACAAAGTGCAGCACCGCCTAGTGT	1535
					PTEN	小鼠	正向引物	GCCACAGGCTCCCAGACAT	1536
PTEN	小鼠	反向引物	TCCATCCTCTTGATATCTCCTTTTG	1537
					PTEN	小鼠	探针	ACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAA	1538
PTEN	小鼠	正向引物	ATGACAATCATGTTGCAGCAATTC	1539
					PTEN	小鼠	反向引物	CGATGCAATAAATATGCACAAATCA	1540
PTEN	小鼠	探针	CTGTAAAGCTGGAAAGGGACGGACTGGT	1541

实施例3：靶向ApoB核酸并具有2’-MOE或亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物

给6周龄雄性Ba1b/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)腹膜内(i.p.)注射靶向ApoB的反义化合物，频率为每周二次，历时三周。反义化合物剂量包括2.4、1.2、0.6、0.3和0.15μmol/kg。对于14个核苷酸长的反义化合物，这些剂量分别等于大约12、6、3、1.5或0.75mg/kg。表25中所示的是这项研究中使用的反义化合物的序列和基序。反义化合物长度为20或14个核苷酸，并具有一个由10个2’-脱氧核苷酸组成的中心“缺口”区，该区的两侧存在着具有2’-O-甲氧乙基(2’-MOE)的翼或BNA修饰的“翼”。例如，2-10-2 MOE缺口聚物基序(gapmer motif)表示这样的反义化合物，其具有10个核苷酸的缺口，缺口两侧有2个具有2’-MOE修饰的核苷酸翼。粗体字的残基表示2’-O-甲氧乙基模块，斜体字残基表示亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA。每个化合物的核苷间连接全都是硫代磷酸酯。ISIS 147764和ISIS 372938的所有胞嘧啶残基均被替换为5’-甲基胞嘧啶。对ISIS 387462，只有该化合物的翼中的胞嘧啶残基才被替换为5’-甲基胞嘧啶。ApoB反义化合物靶向公众可获得的ApoB-100序列，包括Genbank登录号XM_137955.5(SEQ ID NO：2)。

表25：靶向ApoB核酸的反义化合物

 

ISISNO	靶SEQIDNO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						147764	2	8865	GTCCCTGAAGATGTCAATGC	5-10-5 MOE	1561
372938	2	8235	GGTACATGGAAGTC	2-10-2 MOE	190
						387462	2	8235	GGTACATGGAAGTC	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	190

最后一次注射48小时后，处死小鼠以评估：转氨酶(表26)；肝脏和肾脏重量(表27)；甘油三酯、LDL、HDL和游离脂肪酸水平(表28)；肝脏中靶mRNA水平(表29)；血浆中靶蛋白水平；和寡核苷酸组织浓度(表30)。使用本文记载且为本领域普通技术人员熟知的方法来确定这些终点。

表26：ALT和AST水平(IU/L)

 

ISIS NO	剂量μmol/kg	ALT	AST
				盐水	N/A	27.8	46.3
147764	2.4	29.5	64.0
				372938	2.4	26.0	49.0
372938	1.2	24.8	49.5
				372938	0.6	28.0	79.3
372938	0.3	28.3	60.0
				372938	0.15	28.3	50.3
387462	2.4	41.3	84.0
				387462	1.2	35.3	63.5
387462	0.6	32.0	77.3
				387462	0.3	27.8	55.0
387462	0.15	29.3	68.3

表27：肝脏和肾脏重量(盐水对照的％)

 

ISIS NO	剂量μmol/kg	肝脏	肾脏
				盐水	N/A	100	100
147764	2.4	102	105
				372938	2.4	100	100
372938	1.2	90	101

 

ISIS NO	剂量μmol/kg	肝脏	肾脏
				372938	0.6	96	112
372938	0.3	91	107
				372938	0.15	96	98
387462	2.4	116	90
				387462	1.2	113	90
387462	0.6	106	97
				387462	0.3	101	126
387462	0.15	95	100

总体重和食物消耗在盐水处理或寡核苷酸处理的动物之间没有显著差异。葡萄糖水平在所有处理组中也是相似的。

表28：甘油三酯(TRIG)、总胆固醇(CHOL)、HDL、LDL和游离脂肪酸(FFA)水平

 

ISIS NO	剂量μmol/kg	TRIG(mg/dL)	CHOL(mg/dL)	HDL(mg/dL)	LDL(mg/dL)	FFA(mg/dL)
							盐水	N/A	167	107	81.8	11.0	1.76
147764	2.4	167	107	81.3	10.3	1.29
							372938	2.4	153	104	79.0	10.3	1.28
372938	1.2	136	101	77.8	9.5	1.70
							372938	0.6	184	110	83.3	10.8	1.66
372938	0.3	138	109	84.3	11.0	1.53
							372938	0.15	151	106	82.8	10.8	1.57
387462	2.4	49	14	9.0	1.5	0.74
							387462	1.2	71	23	16.5	2.0	0.76
387462	0.6	150	55	39.3	3.7	1.43
							387462	0.3	136	92	72.8	7.5	1.14
387462	0.15	163	104	81.5	9.3	1.47

表29：％ApoB mRNA水平(相对于盐水对照)

 

ISIS NO	2.4μmol/kg	1.2μmol/kg	0.6μmol/kg	0.3μmol/kg	0.15μmol/kg
						147764	57.7	ND	ND	ND	ND
372938	77.0	90.0	87.3	92.6	93.1
						387462	1.5	8.5	27.4	58.9	75.8

用ISIS 387462处理导致甘油三酯、总胆固醇、HDL、LDL和游离脂肪酸发生显著的、剂量依赖的减少。与这些表型上的发现一致的是，用ISIS387462处理还导致小鼠血浆中ApoB mRNA(表29)和蛋白(未显示)水平发生剂量依赖的降低。为了确定亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA缺口聚物所见的这种效率增加是否由于寡核苷酸积累的增加所致，测定了肝脏和肾脏中的全长和总寡核苷酸浓度。

表30相对于ApoB mRNA水平的全长和总反义化合物组织浓度(μM)(盐水对照的％)

 

ISIS NO	剂  量μmol/kg	肾脏全长	肝脏全长	肾脏总	肝脏总	ApoBmRNA
							147764	2.4	28.6	22.9	33.5	31.3	58
372938	24	32.0	5.49	34.0	7.76	77
							387462	2.4	37.2	5.69	38.9	7.31	1.5
387462	1.2	29.8	3.71	31.3	4.91	8.5
							387462	0.6	18.9	1.97	20.0	2.57	27
387462	0.3	9.11	0.73	9.49	0.78	59
							387462	0.15	6.97	0.19	7.43	0.24	76

2-10-2亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA缺口聚物的水平在肾脏中与5-10-5和2-10-2 MOE缺口聚物相似，但在肝脏中显著降低。ISIS 387462在肝脏中的EC₅₀通过比较肝脏中寡核苷酸浓度与ApoB mRNA的抑制来确定。ISIS387462的大致EC₅₀为1μM。与之相对的是，有效的5-10-5 MOE缺口聚物化合物在肝脏中的EC₅₀通常为大约15μM。

总而言之，这些结果显示，在翼中具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)的ApoB短缺口聚物是靶mRNA表达的强力抑制剂，并能有效地降低甘油三酯、胆固醇和游离脂肪酸。短反应化合物的效力似乎不是组织积累增加的结果，因为相对于5-10-5 MOE缺口聚物，在肾脏中观察到相似水平的该化合物，而在肝脏中发现水平降低。此外，亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA缺口聚物显示很少乃至没有不良副作用。

实施例4：靶向GCGR核酸且具有2’-MOE修饰的短反义化合物

对8周龄的雄性C57/BL6小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过以6.25、12.5、25或50mg的浓度腹膜内注射施用单个剂量的GCGR寡核苷酸。每个剂量组由四只动物组成。表31中显示了这项研究中使用的GCGR反义化合物的序列、基序和缀合物。粗体字的残基表示2’-O-甲氧乙基(2’-MOE)模块。所有的化合物全部包含硫代磷酸酯核苷间连接，并且每个胞嘧啶均被替换为5-甲基胞嘧啶。ISIS 386626、ISIS 386627和ISIS 386628还包含通过二酰胺连接而附着于糖的2’-O位上的C₁₆缀合基团(conjugate group)(2′-OCH₂C(＝O)N(H)(CH₂)₄N(H)C(＝O)-(CH₂)₁₅CH₃)。GCGR反义化合物靶向已公布的GCGR序列，包括

登录号BC031885.1(SEQ ID NO：7)。

表31：靶向GCGR核酸的短反义化合物

 

ISISNO	靶SEQIDNO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	缀合物	SEQIDNO
							148364	7	393	TGCACTTTGTGGTACCAAGG	5-10-5MOE	无	1562
386626	7	1768	GC16CTTCTCCATCATA	2-10-2MOE	C16	1563
							386627	7	1244	GC16GGCATGCTCGTCA	2-10-2MOE	C16	653
386593	7	1244	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2MOE	无	649
							386628	7	1680	TC16GTCTTGCTGCTTT	2-10-2MOE	C16	1564
386594	7	1680	TGTCTTGCTGCTTT	2-10-2MOE	无	1565

注射48小时后处死小鼠以测定：血清转氨酶水平(表32)；肝脏、白脂肪组织(white adipose tissue，WAT)、脾脏和肾脏重量(表33)；胆固醇、甘油三酯和葡萄糖水平(表34)；GCGR mRNA水平(表35-41)；和肝脏及肾脏中全长和总寡核苷酸的浓度(表42)。用本文描述的和本领域普通技术人员熟知的方法评估终点。数据从处理前的血液(前-血)和处理后的血液(后-血)取得。

表32.ALT和AST水平(IU/L)

 

ISIS NO	剂量(mg/kg)	ALT前-血	ALT后-血	AST前-血	AST后-血
						盐水	N/A	36	51	55	85
148364	50	24	40	40	115
						148364	25	26	35	42	87
148364	12.5	23	32	44	69
						148364	6.25	28	34	47	76
386626	50	28	40	48	120
						386626	25	30	36	44	92
386626	12.5	28	34	44	90

 

ISIS NO	剂量(mg/kg)	ALT前-血	ALT后-血	AST前-血	AST后-血
						386626	6.25	26	42	46	69
386627	50	27	457	42	451
						386627	25	29	97	45	142
386627	12.5	29	62	46	81
						386627	6.25	23	87	38	96
386593	50	23	33	46	58
						386593	25	25	32	41	95
386593	12.5	26	33	43	74
						386593	6.25	28	31	43	53
386628	50	28	68	44	76
						386628	25	24	32	40	57
386628	12.5	28	35	42	75
						386628	6.25	22	29	40	59
386594	50	29	34	46	92
						386594	25	27	31	47	82
386594	12.5	28	33	45	74
						386594	6.25	23	48	42	67

表33：器官重量(盐水对照的％)

 

ISIS NO	剂量(mg/kg)	肝脏	WAT	肾脏	脾脏
						盐水	N/A	100	100	100	100
148364	50	103	80	108	123
						148364	25	103	75	112	115
148364	12.5	100	84	108	96
						148364	6.25	101	89	104	113
386626	50	112	77	104	130
						386626	25	109	97	103	120
386626	12.5	96	73	97	114
						386626	6.25	100	90	100	95
386627	50	90	113	102	165
						386627	25	99	87	99	143
386627	12.5	109	93	102	136
						386627	6.25	103	96	102	131
386593	50	96	98	102	118
						386593	25	83	94	100	104
386593	12.5	99	82	101	129
						386593	6.25	96	77	98	144
386628	50	104	100	99	126
						386628	25	102	97	109	113
386628	12.5	101	111	99	114
						386628	6.25	98	106	102	151
386594	50	90	80	99	131
						386594	25	93	76	99	128
386594	12.5	94	98	100	113
						386594	6.25	102	85	101	119

总的来说，GCGR反义化合物显示很少乃至没有不良副作用

表34：甘油三酯(TRIG)、胆固醇(CHOL)和葡萄糖水平(IU/L)

 

ISIS NO	剂量(mg/kg)	TRIG前-血	TRIG后-血	CHOL前-血	CHOL后-血	葡萄糖前-血	葡萄糖后-血
								盐水	N/A	132	181	91	96	208	285
148364	50	110	177	81	94	207	228
								148364	25	115	200	83	96	219	239
148364	12.5	106	179	85	89	198	256
								148364	6.25	86	162	86	89	226	215
386626	50	87	163	79	57	239	179
								386626	25	100	187	87	72	235	186
386626	12.5	100	148	82	76	232	185
								386626	6.25	86	162	85	90	222	221
386627	50	106	120	83	126	227	150
								386627	25	101	148	90	115	218	203
386627	12.5	99	203	86	98	237	219
								386627	6.25	111	165	88	104	238	228
386593	50	130	128	100	95	244	213
								386593	25	119	135	83	77	206	208
386593	12.5	122	128	83	79	999	233
								386593	6.25	120	138	84	78	214	219
386628	50	102	98	88	95	209	232
								386628	25	102	129	84	85	210	223
386628	12.5	90	123	90	94	231	240
								386628	6.25	117	121	83	85	228	229
386594	50	93	99	84	85	203	274
								386594	25	106	94	90	86	219	272
386594	12.5	118	133	85	95	200	292
								386594	6.25	112	146	78	94	222	275

相对于5-10-5 MOE缺口聚物，GCGR 2-10-2 MOE缺口聚物显示出较低的后-血甘油三酯水平的倾向，其中ISIS 386628和ISIS 386594具有最大的剂量依赖作用。葡萄糖水平也在ISIS 386626和ISIS 386627处理后以剂量依赖的方式减少。ISIS 386628、ISIS 386593和ISIS 386594处理一般也导致后-血葡萄糖水平的减少。胆固醇水平在处理组之间似乎没有显著差异。

为了确定上面显示的表型变化是否与GCGR mRNA的减少相关，根据本文描述的方法，通过实时PCR评估了经过处理的动物肝脏中靶mRNA的水平。表35至41显示了对靶向GCGR核酸的反义化合物针对靶表达的作用进行直接比较的结果。结果表示为盐水对照的百分数。

表35：ISIS 148364和ISIS 386626处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					148364	36	79	87	62
386626	0	8	3	7

表36：ISIS 148364和ISIS 386626处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					148364	63	87	105	86
386627	3	30	57	74

表37：ISIS 148364和ISIS 386593处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					148364	56	74	105	86
386593	9	38	74	90

表38：ISIS 148364和ISIS 386628处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					148364	42	77	98	101
386628	2	18	53	77

表39：ISIS 148364和ISIS 386594处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					148364	59	98	102	96
386594	25	47	50	96

表40：ISIS 386627和ISIS 386593处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					386627	5	40	58	42
386593	10	29	34	71

表41：ISIS 386628和ISIS 386594处理后的GCGR mRNA水平

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					386628	4	13	38	97

 

ISIS NO	50mg/kg	25mg/kg	12.5mg/kg	6.25mg/kg
					386594	19	50	56	99

用2-10-2 MOE缺口聚物处理导致GCGR mRNA表达发生显著的、剂量依赖性的减少。ISIS 386626显示最大的靶mRNA减少。为了确定使用短反义化合物所见到的效率增加是否由于反义化合物积累所致，测定了肝脏和肾脏中的全长和总反义化合物浓度。

表42：肝脏和肾脏中总反义化合物和全长反义化合物浓度(μg/g)

 

ISIS NO	总肾脏	总肝脏	全长肾脏	全长肝脏
					148364	90	54	58	46
386626	757	274	355	125
					386593	91	12	77	12
386628	496	286	305	202

表42中所示的结果表明，包含C₁₆缀合物的短反义化合物在肝脏和肾脏中均显示反义化合物积累的显著增加。但是，对降低靶mRNA、甘油三酯和葡萄糖水平有效的ISIS 386593在肝脏中积累的水平与5-10-5 MOE缺口聚物相似，在肾脏中的水平则较低。这些结果提示，尽管与C₁₆的缀合能够增加肝脏和肾脏的反义化合物浓度，但它并不能完全解释短反义化合物的有效性。

总的来看，这些结果表明，GCGR端反义化合物能够显著地抑制靶mRNA表达，同时还能降低甘油三酯和葡萄糖水平。此外，除了ISIS 386627之外，短MOE缺口聚物显示很少乃至没有毒性作用。

实施例5：靶向GCGR核酸并具有2’-MOE和亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的反义化合物

对8周龄的C57/BL6雄性小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过以10、3.2、1和0.32μmol.kg的浓度腹膜内(i.p.)注射施用单个剂量的GCGR反义化合物。每个组由4只动物组成。表43中显示了这项研究中使用的GCGR反义化合物的序列、基序和缀合物。粗体字的残基表示2’-O-甲氧乙基(2’-MOE)修饰，斜体字的残基表示亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰。所有的反义化合物全部包含硫代磷酸酯核苷间连接，并且每个胞嘧啶均被替换为5-甲基胞嘧啶。GCGR反义化合物靶向已公布的GCGR核酸，包括

登录号BC031885.1(SEQ ID NO：7)。

表43：靶向GCGR核酸的反义化合物

 

ISISNO	靶SEQIDNO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						148364	7	393	TGCACTTTGTGGTACCAAGG	5-10-5 MOE	1562
396144	7	1768	GCTTCTCCATCATA	2-10-2 MOE	1566
						396148	7	1768	GCTTCTCCATCATA	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1567
396145	7	1765	ATGGCTTCTCCATCATATCC	5-10-5 MOE	1568
						396146	7	1244	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2 MOE	650
396149	7	1244	GGGCATGCTCGTCA	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	652
						396147	7	1241	CTTGGGCATGCTCGTCAGTC	5-10-5 MOE	1569

为了确定上文显示的表型变化是否与GCGR mRNA的减少相关，根据本文描述的方法，通过RT，实时PCR评估了经过处理的动物肝脏中靶mRNA的水平。表44显示了对靶向GCGR核酸的反义化合物针对靶表达的作用进行直接比较的结果。结果表示为盐水对照的百分数。

表44：GCGR mRNA水平

 

ISIS NO.	0.32μmol/kg	1μmol/kg	3.2μmol/kg	10μmol/kg
					148364	105	106	73	38
396144	122	117	40	35
					396148	20	6	2	1
396145	nd	Nd	33	8
					396146	98	135	95	35
396149	91	41	30	7
					396147	nd	Nd	68	28

如表44中所示，每种具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物均显示了剂量依赖的GCGR mRNA水平降低。此外，这些反义化合物对靶的降低比5-10-5 MOE缺口聚物更有效。相对于盐水对照和ISIS 148364处理，每种在翼中具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA的短反义化合物均导致GCGR蛋白发生显著降低。接着，用Graphpad Prism计算了每种反义化合物的估计ED₅₀浓度；ED₅₀是观察到50％的mRNA降低时的剂量。结果显示于下面的表45。

表45：估计的ED50浓度

 

缺口聚物基序	ISIS NO	ED50(μmole/kg)	ED50(mg/kg)
				5-10-5 MOE	148364	7	50.6
2-10-2 MOE	396144	4	18.1
				2-10-2亚甲氧基BNA	396148	0.1	0.4
5-10-5 MOE	396145	2.1	9.3
				2-10-2 MOE	396146	8.3	40
2-10-2亚甲氧基BNA	396149	1.1	5
				5-10-5 MOE	396147	5.2	37.5

实施例6：靶向PTEN核酸并具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物

对6周龄的Balb/c雄性小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过以8μmol/kg的剂量单次腹膜内(i.p.)注射施用PTEN反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。表46中显示了这项研究中使用的PTEN反义化合物的序列和基序。粗体字的残基表示2’-O-甲氧乙基(2’-MOE)模块，斜体字的残基表示亚甲氧基BNA核苷酸。每种反义化合物均全部包含硫代磷酸酯连接。此外，ISIS 384073的缺口中、以及ISIS 392056、ISIS 392057、ISIS 392061和ISIS 392063的翼中的胞嘧啶残基被替换为5-甲基胞嘧啶。反义化合物靶向已公布的PTEN核酸，包括Genbank登录号U92437.1(SEQ ID NO：13)。

表46：靶向PTEN核酸的反义化合物

 

ISISNO	靶SEQIDNO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						141923	对照	N/A	CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC	5-10-5 MOE	1570
116847	29	2011	TCAAATCCAGAGGCTAGCAG	5-10-5 MOE	1571
						384073	29	2013	AAATCCAGAGGCTAGC	3-10-3亚甲氧基	1428

 

ISISNO	靶SEQIDNO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
										(4’-CH2-O-2’)BNA
391172	29	2013	AAATCCAGAGGCTAG	2-10-3亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1429
						392056	29	140	AGCTGCAGCCATGA	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1263
392057	29	807	GGTCCAGGGCCAAG	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1162
						392061	29	2014	AATCCAGAGGCTAG	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1431
392063	29	3099	AGGCCAGTGCTAAG	2-10-2亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA	1226

注射72小时后处死小鼠，根据本文中描述的和本领域普通技术人员熟知的程序测定：血清转氨酶水平(表47)、肝脏和脾脏重量(表47)，以及肝脏、肾脏和脂肪中的PTEN mRNA水平(表48)。

表47：转氨酶水平和器官重量

 

ISIS NO	AST(IU/L)	ALT(IU/L)	肝重量％盐水	脾重量％盐水
					盐水	98.5	37.5	100	100
141923	89.5	34.8	101	108
					116847	59.8	29.5	109	108
384073	57.8	29.3	115	111
					391172	48.5	32.8	120	112
392056	516	892	125	167
					392057	63.8	34.5	125	101
392061	189	42.0	123	111
					392063	67.3	21.8	127	134

总的来说，具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物显示了很少乃至没有不良作用。此外，总体重在不同处理组间没有显著差异。

表48：肝脏、肾脏和脂肪中的％PTEN mRNA水平

 

ISIS NO	肝脏	肾脏	脂肪
				盐水	100	100	100
141923	102	133	118
				116847	37	96	85
384073	24	74	77
				391172	18	63	101
392056	27	88	74
				392057	33	79	96
392061	24	61	85
				392063	6.5	52	72

如表48显示的，与盐水处理和对照处理的动物相比，每种靶向PTEN核酸的反义化合物均导致肝脏中靶mRNA水平的显著降低。这些反义化合物对肾脏和脂肪中靶mRNA水平的影响各异。

实施例7：靶向PTEN核酸并具有BNA修饰的短反义化合物

对6周龄的Balb/c雄性小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过以8、4、2或1μmol/kg的剂量单次腹膜内(i.p.)注射施用靶向PTEN核酸的反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。表49中显示了这项研究中使用的每种反义化合物的序列、翼化学(wing chemistry)和基序。粗体字的残基表示2’-MOE修饰的核苷酸，斜体字的残基表示亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰。所有反义化合物在每个位置上均包含硫代磷酸酯连接。ISIS 116847的每个胞嘧啶、以及ISIS 392063的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA翼中的胞嘧啶残基被替换为5-甲基胞嘧啶，而ISIS 392745的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA翼中的胸腺嘧啶残基被替换为5-甲基胸腺嘧啶。反义化合物靶向已公布的PTEN核酸，包括Genbank登录号U92437.1(SEQ ID NO：13)。

表49：靶向PTEN核酸的反义化合物

 

ISISNO	靶SEQID NO	靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						116847	13	2011	TCAAATCCAGAGGCTAGCAG	5-10-5MOE	1571

 

ISISNO	靶SEQID NO	靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						392063	13	3099	CTTAGCACTGGCCT	2-10-2亚甲基氧BNA	1226
392745	13	3099	CTTAGCACTGGCCT	2-10-2亚甲基氧BNA	1226

注射72小时后处死小鼠以测定：血清转氨酶水平(表50)；肝脏、肾脏和脾脏重量(表50)；肝脏中的PTEN mRNA水平(表51)；和估计的ED₅₀寡核苷酸浓度(表52)。这些终点根据本文中描述的和本领域普通技术人员熟知的方法测定。

表50：AST、ALT和胆红素水平和器官重量

 

ISIS NO	剂量μmol/kg	AST(IU/L)	ALT(IU/L)	胆红素(mg/dL)	肝重量％盐水	肾重量％盐水	脾重量％盐水
								盐水	N/A	64.0	31.8	0.15	100	100	100
116847	8	73.0	32.0	0.1	114	92	106
								392063	8	50.3	17.3	0.1	115	98	115
392063	4	100.8	31.3	0.15	122	94	116
								392063	2	60.5	32.8	0.1	112	99	106
392063	1	57.5	29.3	0.1	104	95	107
								392745	8	75.5	23.5	0.13	125	99	100
392745	4	77.0	29.3	0.13	121	100	96
								392745	2	69.0	32.0	0.13	110	98	103
392745	1	52.0	27.3	0.1	109	97	104

总的说来，PTEN反义化合物没有显示显著的毒性征象。肾脏、肝脏和脾脏重量都在正常范围内。总体重在处理组之间没有显著差异。

表51：肝脏中％PTEN mRNA水平(相对于盐水对照)

 

ISIS NO	8μmol/kg	4μmol/kg	2μmol/kg	1μmol/kg
					116847	36	ND	ND	ND
392063	7.4	16	32	60
					392745	5.2	11	31	60

如表51所示，每种具有亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物均显示PTEN mRNA水平的剂量依赖的降低。另外，这些短反义化合物比5-10-5 MOE缺口聚物对靶的降低更有效。还在以8μmol/kg的剂量施用每种反义化合物之后测定了肝中PTEN蛋白的水平。相对于盐水对照和ISIS116847处理，每种在翼中包含亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA的短反义化合物都导致了PTEN蛋白的显著降低。接着，使用Graphpad Prism计算了每种寡核苷酸的估计ED₅₀浓度。结果显示于下面的表52。

表52：估计的ED₅₀浓度

 

翼化学	ISISNO	ED50(μmole/kg)	ED50(mg/kg)
				MOE(具有5-MeC)	116847	6.3	45.2
亚甲氧基BNA(具有5-MeC)	392063	1.3	5.8
				亚甲氧基BNA	392745	1.2	5.6

为了进一步考察不同类型的双环核酸化合物，设计并测试了另外一组靶向PTEN核酸的短反义化合物。对6周龄的Balb/c雄性小鼠(JacksonLaboratory，Bar Harbor，ME)通过以8、4、2或1μmol/kg的剂量单次腹膜内(i.p.)注射施用反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。表53中显示了这项研究中使用的每种反义化合物的序列、翼化学和基序。所有反义化合物在每个位置上均包含硫代磷酸酯连接。ISIS 392063的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA翼中的胞嘧啶残基被替换为5-甲基胞嘧啶。反义化合物靶向已公布的PTEN核酸，包括Genbank登录号U92437.1(SEQ ID NO：13)。

表53：靶向PTEN核酸的反义化合物

 

ISISNO	靶SEQID NO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
						392063	29	3099	CTTAGCACTGGCCT	2-10-2亚甲氧基BNA	1226
396564	29	3099	CTTAGCACTGGCCT	2-10-2氧代氨基(4’-CH2-N(R)-O-2’)	1226

 

ISISNO	靶SEQID NO	5’靶位点	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
										BNA
396006	29	3099	CTTAGCACTGGCCT	2-10-2 α-L-亚甲基氧BNA	1226

注射72小时后处死小鼠，根据本文中描述的和本领域普通技术人员熟知的方法测定：血清转氨酶水平(表54)、肝脏和脾脏重量(表54)，以及肝脏中的PTEN mRNA水平(表55)。

表54：AST和ALT水平和器官重量

 

ISISNO	剂量μmol/kg	AST(IU/L)	ALT(IU/L)	肝重量	脾重量
						盐水	N/A	71	33	100	100
392063	8	97	38	118	103
						392063	4	179	36	115	107
392063	2	67	32	109	116
						392063	1	68	27	102	105
396564	8	67	25	100	104
						396564	4	96	30	102	106
396564	2	68	27	100	119
						396564	1	79	39	97	109
396006	8	56	28	110	104
						396006	2	139	36	97	105

表55：肝脏中％PTEN mRNA水平(相对于盐水对照)

 

ISIS NO	8μmol/kg	4μmol/kg	2μmol/kg	1μmol/kg
					392063	6.9	18	39	71
396564	86	97	100	96
					396006	6.5	ND	ND	70

如上所示，具有α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰的短反义化合物导致靶mRNA水平的剂量依赖性降低。用具有氧代氨基BNA修饰的短反义化合物处理导致靶表达略有降低。

实施例8.用靶向ApoB和PTEN核酸的短反义化合物进行的单剂量施用剂量应答研究

对6周龄的Balb/c雄性小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过以8、4、2或1μmol/kg的剂量单次腹膜内(i.p.)注射施用反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。表56中显示了这项研究中使用的每种反义化合物的序列、翼化学和基序。斜体字的残基表示亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰，有下划线的残基表示N-甲基-氧代氨基(4’-CH₂-N(CH₃)-O-2’)BNA修饰，带框的残基表示α-L-亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA修饰。所有反义化合物在每个位置上均包含硫代磷酸酯连接。ISIS 116847的每个胞嘧啶、以及ISIS392063的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA翼中的胞嘧啶残基被替换为5-甲基胞嘧啶，而ISIS 392745的亚甲氧基(4’-CH₂-O-2’)BNA翼中的胸腺嘧啶残基被替换为5-甲基胸腺嘧啶。PTEN反义化合物靶向已公布的PTEN核酸，包括Genbank登录号U92437.1(SEQ ID NO：13)。ApoB反义化合物靶向已公布的ApoB核酸，包括Genbank登录号XM_137955.5(SEQ ID NO：2)。

表56：靶向ApoB和PTEN核酸的短反义化合物

表57：％ApoB和PTEN mRNA降低(相对于盐水对照)

 

ISIS NO	剂量(μmol/kg)	％ApoB mRNA降低(相对于盐水)	％PTEN mRNA降低(相对于盐水)
				387462	8	0.62	92.8
	4	6.55	103
					2	18.6	105
	1	42.0	98.0
				392063	8	126	6.79
	4	111	18.1
					2	112	42.4
	1	114	62.3
				396565	8	116	23.8

 

	4	1.04	46.6
					2	94.4	76.1
	1	115	89.5
				396006	8	94.3	62.9
	4	101	18.2
					2	79.7	52.4
	1	111	82.4

如表57中所示，每种具有亚甲氧基BNA修饰的短反义化合物均显示了靶mRNA水平的剂量依赖的降低。值得注意的是，具有N-甲基-氧代氨基BNA翼的短反义化合物(ISIS 396565)也显示了与β-D-亚甲氧基BNA和α-L-亚甲氧基BNA短反义化合物都相似的剂量依赖性PTEN表达降低。接着，使用Graphpad Prism计算了每种反义化合物的估计ED₅₀浓度。结果显示于下面的表58。

表58：估计的ED₅₀浓度

 

翼化学	ISISNO	ED50(μmole/kg)	ED50(mg/kg)
				亚甲氧基BNA	387462	0.8	3.9
亚甲氧基BNA	392063	1.5	7
				N-Me-氧代氨基BNA	396565	3.8	17.4
α-L-亚甲氧基BNA	396006	2.1	9.3

实施例9：靶向SGLT-2 mRNA的亲本和亲本混合主链反义化合物的施用

以1、7.5、14或17mg/kg的剂量每周两次对db/db小鼠(Charles RiverLaboratories，Wilmington，MA)腹膜内施用ISIS 257016。对照组包括一个以同样的给药方案接受盐水的组和一个接受ISIS 145733的组。ISIS 257016和ISIS 145733都包含序列  GAAGTAGCCACCAACTGTGC(SEQ ID NO：1572)，该序列进一步包含一个由10个2’-脱氧核苷酸组成的中心“缺口”区，该区的两侧(5’和3’方向上)都存在着5个核苷酸的“翼”。这些翼是由2’-甲氧乙基(2’-MOE)核苷酸构成的。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。ISIS145733的整个寡核苷酸的核苷间(主链)连接都是硫代磷酸酯(P＝S)，而ISIS257016具有混合的主链。ISIS 257016在翼中的核苷间连接是磷酸二酯(P＝O)，在缺口中的核苷间连接是硫代磷酸酯。在最后一剂施用后48小时处死小鼠，并分析肾组织的SGLT-2 mRNA水平。结果显示在下面的表59中。

表59：5-10-5 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA表达的体内反义抑制

ISIS 257016和ISIS 145733与盐水对照相比均显著地降低了SGLT-2的水平。(mRNA水平系如上所述使用RT，实时PCR测定)。但是，已证明ISIS257016与ISIS 145733相比，降低SGLT-2 mRNA的效力强大约20-50倍。处理组可见相关联的血浆葡萄糖水平降低(盐水组661±14，相比之下接受ISIS 257016的组为470±23)。肾脏中ISIS 257016和ISIS 145733的积累在整个剂量范围内都是相似的，但是在肾脏中几乎未检出全长257016反义化合物，这一点支持了降解产物是活性增加的原因的理论。此外，给予单个25mg/kg剂量之后作用的起始与一个时间点相关，在该时间点处完整257016反义化合物几乎没有残留。

在瘦小鼠(lean mice)、ob/ob小鼠和ZDF大鼠(Charles Rivers Laboratories)中进行了类似的研究，使用ISIS 257016、ISIS 145733或盐水，给药方案与上文所述相似。ISIS 145733和ISIS 257016结合位点的序列在小鼠和大鼠之间是保守的(见表60)。肾脏中SGLT-2 mRNA的降低与上文所见的相似。在使用大鼠的研究中，在每周给予两次10 mg/kg剂量经过两周的条件下，显示ISIS 145733将SGLT-2 mRNA水平降低了约40％，而用ISIS 257016实现的降低大于80％。ISIS 257016在12.5mg/kg的低剂量下最大地降低SGLT2表达。在更低的剂量范围进行的进一步实验显示，使用混合主链反义化合物，在低于1mg/kg/周的剂量下SGLT2 mRNA水平显著降低。

实施例10：靶向SGLT-2 mRNA的亲本和短反义化合物的施用

药动学研究表明，ISIS 257016起前体药物的作用，被代谢成12个核碱基的药效团。在一项进一步的研究中，对ZDF大鼠每周两次腹膜内给予1.5mg/kg的ISIS 257016或ISIS 370717，或以类似的给药方案给予盐水。ISIS370717是一种12个核碱基的靶向SGLF-2核酸的反义化合物，包含序列TAGCCACCAACT(SEQ ID NO：154)，该序列进一步包含一个由10个2’-脱氧核苷酸组成的中心“缺口”区，该区的两侧(5’和3’方向上)都存在一个核苷酸的“翼”。这些翼由2’-甲氧乙基(2’-MOE)核苷酸组成。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。整个寡核苷酸中的核苷间(主链)连接都是硫代磷酸酯(P＝S)。

5周的给药之后，处死动物，并分析肾组织的SGLT-2 mRNA水平。ISIS257016和ISIS 370717的药理学活性相似，但12个核苷酸的反义化合物显示更快的作用起始。ISIS 370717在给予单个2.8微摩尔/kg的剂量后第二天显示对肾中SGLT2表达的接近80％的抑制，而ISIS 257016在相同的单剂量施用后的第二天仅显示大约25％的抑制。该数据支持了ISIS 257016是具有12个核苷酸的药效团的前体药物。

实施例11：一种短反义化合物的效力和生物利用率

ISIS 370717所显示的更高的效力和这些短反义化合物的更好的口服生物利用率使得这些这些化合物可用于口服施用。正常大鼠每周两次通过空肠内(intrajejunal)施用接受100mg/kg的ISIS 370717、ISIS 145733或盐水。最后一个剂量大约48小时后，处死动物，并分析肾组织的反义化合物浓度和SGLT-2 mRNA水平。与对照相比，在肾组织中有明显更高的ISIS 370717积累(每克组织约500微克)。另外，SGLT-2 mRNA较之对照降低了超过80％。

实施例12：围绕一种12个核苷酸的短反义化合物进行的翼、缺口和总长度变化

利用ISIS 370717 1-10-1 MOE缺口聚物作为模板制备具有不同基序的序列上相关的寡核苷酸(oligos)。在表60中提供了这些变化形式。使用已公布的序列(分别是：GenBank登录号U29881.1，并入本文作为SEQ ID NO：1575；和GenBank登录号AJ292928.1，并入本文作为SEQ ID NO：1576)，将这些反义化合物设计为靶向小鼠或大鼠SGLT2核酸的不同区域。

表60：靶向SGLT2核酸的短反义化合物

 

ISISNO	小鼠SEQ IDNO：1575上的5’靶位点	大鼠SEQ IDNO：1576上的5’靶位点	缺口聚物基序	序列(5’-3’)	SEQIDNO
						257016	2680	148	5-10-5MOE	GAAGTAGCCACCAACTGTG C	1553
370717	2684	152	1-10-1MOE	TAGCCACCAACT	1554
						386169	2684	152	2-8-2MOE	TAGCCACCAACT	1555
386176	2685	153	1-8-1MOE	AGCCACCAAC	1556
						386196	2684	152	3-6-3MOE	TAGCCACCAACT	1557

分析了这些反义化合物对小鼠SGLT2 mRNA水平的作用。数据是取自3次实验的范围，这些实验中，对小鼠通过腹膜内注射给予2.5、0.5或0.1umol/kg的上述MOE缺口聚物，每周两次经过3周。最后一次施用后48小时处死小鼠，评估肾脏中的SGLT2水平。SGLT2 mRNA水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照进行标准化。结果显示于下面的表61。

表61：1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物对SGLT2的体内反义抑制

这些结果说明，所有这些被测的不同基序都以剂量依赖的方式体内抑制SGLT2的表达。发现1-10-1、2-8-2和1-8-1缺口聚物的效力特别强。

实施例13：1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物对大鼠SGLT-2的反义抑制

表62中提供的1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物反义化合物被设计为靶向小鼠或大鼠SGLT2 RNA的不同区域。表62中所示的所有短反义化合物都是嵌合寡核苷酸(“缺口聚物”)，长度为12或13个核苷酸，其由以下部分构成：一个由10个2’-脱氧核苷酸组成的中心“缺口”区段，该区段的5’一侧有一个包含一个核苷酸的“翼”，在3’一侧有一个包含一个或两个核苷酸的“翼”。这些翼由2’-甲氧乙基(2’-MOE)核苷酸构成。整个寡核苷酸中的核苷间(主链)连接都是硫代磷酸酯(P＝S)。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。

表62：靶向SGLT2核酸的反义化合物

 

ISISNO	SEQ IDNO：XXX(小鼠)上的5’靶位点	SEQ IDNO：XXX(大鼠)上的5’靶位点	缺口聚物基序	序列(5’-3’)	SEQIDNO
						370717	2684	152	1-10-1 MOE	TAGCCACCAACT	1554
382675	2683	151	1-10-1 MOE	TAGCCACCAACTG	1559
						379692		508	1-10-1 MOE	TGTTCCAGCCCA	246
382676		507	1-10-2 MOE	TGTTCCAGCCCAG	246
						379699		1112	1-10-2 MOE	GGCATGAGCTTC	281
382677		1111	1-10-2 MOE	GGCATGAGCTTCA	281
						382677		958	1-10-2 MOE	GGCATGAGCTTCA	281

分析了这些短反义化合物对大鼠SGLT2 mRNA水平的作用。数据是取自3次实验的范围，所述实验中对雄性Sprague-Dawley大鼠(170-200g)通过腹膜内注射给予450、150或50nmol/kg的1-10-1或1-10-2 MOE缺口聚物，每周两次经过3周。最后一次施用后48小时处死大鼠，并评估肾脏中SGLT2mRNA水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照进行标准化。结果显示于下面的表63。

表63：1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果显示1-10-1和1-10-2 MOE缺口聚物都以剂量依赖的方式体内降低SGLT2 mRNA。

进一步评估了大鼠的总体重、肝脏、脾脏和肾脏重量。脾脏、肝脏和肾脏重量的显著变化可表明特定化合物引起毒性作用。所有的变化都在实验的误差范围之内。在处理过程中或研究终止时没有观察到体重的显著变化。没有观察到肝脏或脾脏重量的显著变化。

体内施用的短反义化合物的毒性作用还可以通过测量与肝或肾的疾病或损伤相关的酶和蛋白的水平来评估。血清转氨酶天冬氨酸氨基转移酶(AST)和丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平的提高常常是肝脏疾病或损伤的指征。血清总胆红素是肝和胆功能的指征，白蛋白和血尿素氮(BUN)是肾功能的指征。葡萄糖和甘油三酯水平有时由于治疗的毒性而发生改变。血清葡萄糖也部分依赖于SGLT2的活性。测量了用所述短反义化合物处理过的大鼠中ALT、AST、总胆红素、白蛋白、BUN、葡萄糖和甘油三酯的水平。肝和肾损伤和疾病的常规临床指征的水平都在正常范围内，相对于盐水处理的动物没有显著变化，表明这些短反义化合物并不显著影响肾或肝功能。甘油三酯和葡萄糖水平相对于盐水处理的动物没有显著上升。

实施例14：1-10-1 MOE缺口聚物对小鼠和大鼠SGLT2的反义抑制

表64显示了设计为靶向小鼠SGLT2 mRNA不同区域的1-10-1 MOE缺口聚物反义化合物。

表64：靶向SGLT2 mRNA的反义化合物的组成

ISISNO	on SEQ IDNO：XXX(小鼠)上的5’靶位点	SEQ IDNO：XXX(大鼠)上的5’靶位点	基序	序列(5’-3’)	SEQIDNO
						370717	2684	152	1-10-1 MOE	TAGCCACCAACT	1554
379692		508	1-10-1 MOE	TGTTCCAGCCCA	246
						379699		1112	1-10-1 MOE	GGCATGAGCTTC	281
379702		1525	1-10-1 MOE	GCACACAGCTGC	293
						381408	3034**		1-10-1 MOE	TACCGAACACCT	1560

^**表示对靶序列有3个错配

分析了这些短反义化合物对小鼠SGLT2 mRNA水平的作用。数据取自3次实验，所述实验中对雄性6周龄Balb/c小鼠通过腹膜内注射给予450、150或50nmol/kg的一种上述的1-10-1 MOE缺口聚物，每周两次经过两周。最后一次施用48小时后处死小鼠并评估肾中SGLT2 mRNA水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。结果示于下面表65。

表65：1-10-1 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果显示，所有的1-10-1 MOE缺口聚物，除了ISIS 381408之外，均在小鼠中以剂量依赖的方式体内抑制SGLT2表达。在大鼠研究中已经显示了ISIS 381408的活性(见表65)。

大鼠中1-10-1缺口聚物的评估

上述1-10-1缺口聚物(见上文表64)对大鼠SGLT2 mRNA水平的作用。数据取自4次实验，所述实验中对雄性Sprague-Dawley大鼠(170-200g)通过腹膜内注射给予250nmol/kg，每周两次历时4周。最后一次施用后48小时处死大鼠，并评估肾脏中SGLT2 mRNA水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。结果示于下面表66。

表66：1-10-1 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果显示，所有1-10-1 MOE缺口聚物在体内大鼠研究中均能抑制SGLT2表达。

实施例15：其它1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物对小鼠和大鼠SGLT2表达的反义抑制

将1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物短反义化合物设计为靶向小鼠SGLT2RNA的不同区域但在种类(species)之间具有互补性。这些反义化合物显示于表67。表67中所示的所有短反义化合物都是12个核苷酸长的缺口聚物，由以下部分构成：一个由2’-脱氧核苷酸组成的中心“缺口”区段，该区段的两侧(5’和3’方向)均存在具有2’-修饰的翼区段。这些翼由2’-甲氧乙基(2’-MOE)核苷酸构成。整个寡核苷酸中的核苷间(主链)连接都是硫代磷酸酯(P＝S)。所有胞苷残基都是5-甲基胞苷。

表67：靶向SGLT2核酸的短反义化合物

 

ISIS NO	5’靶位点(大鼠)	靶SEQ ID(大鼠)	缺口聚物基序	序列(5’-3’)	SEQ ID NO
						379692	508		1-10-1 MOE	TGTTCCAGCCCA	246
388625	508		1-10-1 MOE	TGTTCCAGCCCA	246
						379699	1112		1-10-1 MOE	GGCATGAGCTTC	281
388626	1112		2-8-2 MOE	GGCATGAGCTTC	281
						379702	1525		2-8-2 MOE	GCACACAGCTGC	293
388627	1525		2-8-2 MOE	GCACACAGCTGC	293

分析了这些短反义化合物在体内对小鼠SGLT2 mRNA水平的影响。数据取自三次实验，所述实验中对雄性6周龄Balb/c小鼠通过腹膜内注射给予0.5、0.1或0.02umol/kg的1-10-1或2-8-2 MOE缺口聚物，每周两次历时3周。最后一次施用的48小时后处死小鼠并评估肾脏中的SGLT2水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。结果示于下面表68.

表68：1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果显示，1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物均能在体内以剂量依赖的方式抑制SGLT2表达。

进一步评估了小鼠的总体重、肝脏、脾脏和肾脏重量。所有变化均在实验的误差范围内。在处理过程中或研究终止时没有观察到体重的显著变化。没有观察到肝脏或脾脏重量的显著变化。

测量了经短反义化合物处理过的小鼠中的ALT、AST、BUN、转氨酶、血浆肌酸酐、葡萄糖和甘油三酯水平。肝和肾损伤和疾病的常规临床指征的水平都在正常范围内，并且相对盐水处理的动物没有显著变化，表明所述短反义化合物不会显著影响肾或肝功能。甘油三酯和葡萄糖水平相对于盐水处理的动物没有显著升高。

小鼠中ISIS 379692 1-10-1 MOE缺口聚物、ISIS 392170 1-10-1亚甲氧基BNA缺口聚物、ISIS 388625 2-8-2 MOE缺口聚物和ISIS 392173 2-8-2亚甲氧基BNA缺口聚物的评估

比较了ISIS 379692 1-10-1 MOE缺口聚物和ISIS 388625 2-8-2 MOE缺口聚物与ISIS 392170 1-10-1亚甲氧基BNA缺口聚物和ISIS 392173 2-8-2亚甲氧基BNA缺口聚物在体内对小鼠SGLT2 mRNA水平的作用(见表69)。数据取自3次实验，所述实验中对雄性6周龄Balb/c小鼠通过腹膜内注射给予5、25和125nmol/kg的ISIS 379692 1-10-1 MOE缺口聚物或ISIS 388625 2-8-2MOE缺口聚物，每周两次，历时3周。最后一次施用的48小时后处死小鼠并评估肾脏中的SGLT2 mRNA水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。数据表示为相对于盐水处理的动物的百分比变化(“+”表示增加，  “-”表示减少)，并显示在表69中。

表69：1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

 

寡核苷酸剂量nmol/kg

ISIS3796921-10-1 MOE

ISIS3921701-10-1亚甲

ISIS3886252-8-2

ISIS3921732-8-2亚甲氧基

 

		氧基BNA	MOE	BNA
					125	-58	-69	-70	-75
25	-46	-54	-47	-57
					5	-7	-23	-18	-44

这些结果显示，1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物都在最高的3个剂量范围中以剂量依赖的方式体内抑制SGLT2表达。这些结果还显示，亚甲氧基BNA构建体比MOE构建体更有效力。在处理过程中或研究终止时没有观察到体重的显著变化。没有观察到肝脏或脾脏重量的显著变化。包括ALT、AST、BUN和肌酸酐在内的毒性参数均在正常范围内，并且相对盐水处理的动物没有显著变化，表明所述这些化合物不会显著影响肾或肝功能。

大鼠中ISIS 379692 1-10-1 MOE缺口聚物和ISIS 388625 2-8-2 MOE缺口聚物的评估

ISIS 379692 1-10-1 MOE缺口聚物和ISIS 388625 MOE 2-8-2缺口聚物对大鼠体内SGLT2 mRNA水平的作用(见表70)。数据取自4次实验，所述实验中对雄性Sprague-Dawley大鼠(170-200g)通过腹膜内注射给予200、50、12.5或3.125nmol/kg的ISIS 3796921-10-1 MOE缺口聚物或ISIS 3886252-8-2 MOE缺口聚物，每周两次历时3周。最后一次施用后48小时处死大鼠，并评估肾脏中SGLT2水平。靶水平通过RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。结果示于下面表70.

表70：1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果显示，1-10-1和2-8-2 MOE缺口聚物在最高的3个剂量范围中均能以剂量依赖方式体内抑制SGLT2表达。

进一步评估了大鼠的总体重、肝脏、脾脏和肾脏重量。所有变化均在实验的误差范围内。在处理过程中或研究终止时没有观察到体重的显著变化。没有观察到肝脏或脾脏重量的显著变化。

测量了经所述短反义化合物处理过的大鼠中的ALT、AST、BUN、胆固醇、血浆肌酸酐和甘油三酯水平。肝和肾损伤和疾病的常规临床指征的水平都在正常范围内，并且相对盐水处理的动物没有显著变化，表明所述短反义化合物不会显著影响肾或肝功能。

实施例16：ZDF大鼠中SGLT2表达的反义抑制

分析了ISIS 388625、388626和对照寡核苷酸ISIS 388628对ZDF大鼠血浆葡萄糖水平和HbAlc的作用。来普汀(Leptin)受体缺陷的Zucker糖尿病肥胖(Zucker diabetic fatty，ZDF)大鼠是研究2型糖尿病的有用模型。在这些雄性大鼠中于8-10周龄时自发产生糖尿病，并伴有饮食过多(hyperphagia)、多尿、多饮和体重增加不良，这些症状与糖尿病的临床症状并行发生(PhillipsMS等，1996，Nat Genet 13，18-19)。对六周龄的ZDF大鼠腹膜内注射400nM/kg剂量的短反义化合物，每周一次历时12周。数据列于表71和72。

表71：血浆葡萄糖

表72：HbA1c状况

与PBS和对照处理的动物相比，ISIS 388625和388626显著降低了血浆葡萄糖水平。

实施例17：犬肾中SGLT2表达的反义抑制(ISIS 388625)

ISIS 388625是一种2-8-2 MOE缺口聚物，序列为TGTTCCAGCCCA(SEQ ID NO：246)(例如参见表71)。ISIS 388625对犬SGLT2 mRNA水平的作用。数据取自两个剂量组，其中给总共9只雄性毕尔格猎犬(beagle dog)通过每周两次皮下注射给予1或10mg/kg/周的ISIS 388625或盐水。在研究的第46天处死所有的犬并评估其肾脏中SGLT2水平。靶水平通过定量RT，实时PCR如本文其它实施例中所述方式加以测定。将PCR结果对内部ISIS对照标准化。结果示于下面表73。

表73：ISIS 388625对SGLT2 mRNA的体内反义抑制

这些结果表明，以1mg/kg/周的ISIS 388625剂量可以实现SGLT2 mRNA的大于80％的降低。用稍微更高的剂量能实现更大的降低。犬中ISIS 388625的施用还显示能改善葡萄糖耐受。在标准葡萄糖耐受测试中，相比于盐水对照，峰值血浆葡萄糖水平平均下降了超过50％，且随后的葡萄糖降低有所减少。尿葡萄糖排出也有所增多。

实施例18：靶向SGLT2核酸的短反义化合物的体内测试

设计并合成了20种与人/猴/小鼠/大鼠SGLT2互补的1-10-1 MOE缺口聚物，并体内测了试它们在肾脏中对SGLT2 mRNA水平的抑制。小鼠和大鼠的靶位点示于表74。人的靶位点示于表4和表5。数据是来自两次实验的平均值，所述实验中对雄性6周龄Balb/c小鼠腹膜内注射施用350nmol/kg的寡核苷酸，每周两次经过两周时间(共4次注射)。在最后一次施用后48小时处死小鼠并评估其肾中SGLT2 mRNA水平。SGLT2 mRNA水平通过定量实时PCR分析根据标准程序来测定，使用两个不同的PCR引物探针组：引物探针组(PPS)534和PPS 553。将SGLT2 mRNA水平对亲环蛋白mRNA水平标准化，后者也是用定量实时PCR测量的。结果示于下面表74.

表74：SGLT2的体内反义抑制

 

ISISNO	SEQ IDNO：XXX上的5’靶位点(小鼠)	SEQ IDNO：XXX上的5’靶位点(大鼠)	序列(5’-3’)	基序	PPS534％盐水	PPS553％盐水	SEQIDNO
								PBS			N/A		---	---
370717	2684	152	TAGCCACCAACT	1-10-1MOE	-84.4	-84.3	1554
								379684	2070	64	TGTCAGCAGGAT	1-10-1MOE	-45.0	-43.2	214
379685	2103	97	TGACCAGCAGGA	1-10-1MOE	-10j	-20.5	219
								379686	2121*	115	ACCACAAGCCAA	1-10-1MOE	-71.9	-75.1	225
379687	2824	216	GATGTTGCTGGC	1-10-1MOE	-47.1	-52.1	230
								379688	2876	268	CCAAGCCACTTG	1-10-1MOE	-62.6	-70.4	240
379689		298	AGAGCGCATTCC	1-10-1MOE	-17.5	-30.4	241
								379690		415	ACAGGTAGAGGC	1-10-1MOE	-18.9	-22.5	242
379691		454	AGATCTTGGTGA	1-10-1MOE	-35.0	-48.6	243
								379692		508	TGTTCCAGCCCA	1-10-1MOE	-88.1	-88.5	246
379693		546	CATGGTGATGCC	1-10-1MOE	-51.6	-59.9	254
								379694		609	GACGAAGGTCTG	1-10-1MOE	-42.1	-54.4	264
379695		717	GGACACCGTCAG	1-10-1MOE	-52.5	-64.1	266
								379696		954	CAGCTTCAGGTA	1-10-1MOE	-24.6	-36.2	267
379697		982	CTGGCATGACCA	1-10-1MOE	-32.0	-46.3	272
								379698		1071	GCAGCCCACCTC	1-10-1MOE	-11.8	-27.0	275
379699		1112	GGCATGAGCTTC	1-10-1MOE	-83.5	-85.8	281
								379700		1138	CCAGCATGAGTC	1-10-1MOE	-2.8	-16.4	285

 

379701		1210	CCATGGTGAAGA	1-10-1MOE	-0.3	-11.9	288
								379702		1525	GCACACAGCTGC	1-10-1MOE	-87.8	-89.5	293
379703		1681	GCCGGAGACTGA	1-10-1MOE	-44.2	-45.9	295

^*表示相对靶序列的1或2个错配

实施例19：Hep3B细胞中人PCSK9的反义抑制

测试了靶向PCSK9核酸的短反义化合物对于PCSK9 mRNA的体外作用。所述短反义化合物示于表6。表75再次列出了每种短反义化合物的IsisNO、缺口聚物基序和SEQ ID NO。经培养的Hep3B细胞用100nM短反义化合物处理。用靶向PCSK9核酸的5-10-5 MOE缺口聚物作为阳性对照。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PCSK9mRNA水平。根据

所测得的总RNA含量调整PCSK9 mRNA水平。结果在表75中给出，表示为相对于未处理对照细胞的PCSK9百分比抑制(％抑制)。在“％抑制”列中，“0”表示对于该种短反义化合物没有观察到PCSK9 mRNA的降低。

表75：短反义化合物对PCSK9的反义抑制

 

ISISNo.	SEQ IDNO	SEQ IDNO：4上的5′靶位点	SEQ IDNO：4上的3′靶位点	缺口聚物基序	％抑制范围	％抑制
							400297	329	695	708	2-10-2 MOE		0
400298	330	696	709	2-10-2 MOE		0
							400299	331	697	710	2-10-2 MOE		0
400300	332	742	755	2-10-2 MOE		9
							400301	333	757	770	2-10-2 MOE	20-30％	27
400302	334	828	841	2-10-2 MOE		0
							400303	335	829	842	2-10-2 MOE		0
400304	336	830	843	2-10-2 MOE	10-20％	11
							400305	337	937	950	2-10-2 MOE	30-40％	38
400306	338	952	965	2-10-2 MOE	40-50％	40
							400307	339	988	1001	2-10-2 MOE	70-80％	76
400308	340	989	1002	2-10-2 MOE	50-60％	55
							400309	341	990	1003	2-10-2 MOE	40-50％	44
400310	342	991	1004	2-10-2 MOE		8
							400311	343	992	1005	2-10-2 MOE	10-20％	18
400312	344	993	1006	2-10-2 MOE	20-30％	28

 

400313	345	994	1007	2-10-2 MOE	10-20％	10
							400314	346	1057	1070	2-10-2 MOE	20-30％	26
400315	347	1075	1088	2-10-2 MOE		0
							400316	348	1076	1089	2-10-2 MOE		8
400317	349	1077	1090	2-10-2 MOE		7
							400318	350	1078	1091	2-10-2 MOE	20-30％	26
400319	351	1093	1106	2-10-2 MOE		0
							400320	352	1094	1107	2-10-2 MOE		0
400321	353	1095	1108	2-10-2 MOE		0
							400322	354	1096	1109	2-10-2 MOE		0
400323	355	1147	1160	2-10-2 MOE		0
							400324	356	1255	1268	2-10-2 MOE		7
400325	357	1334	1347	2-10-2 MOE		4
							400326	358	1335	1348	2-10-2 MOE		0
400327	359	1336	1349	2-10-2 MOE	30-40％	36
							400328	360	1453	1466	2-10-2 MOE	10-20％	13
400329	361	1454	1467	2-10-2 MOE	10-20％	14
							400330	362	1455	1468	2-10-2 MOE	40-50％	43
400331	363	1456	1469	2-10-2 MOE	30-40％	35
							400332	364	1569	1582	2-10-2 MOE		0
400333	365	1570	1583	2-10-2 MOE		0
							400334	366	1571	1584	2-10-2 MOE		0
400335	367	1572	1585	2-10-2 MOE		0
							400336	368	1573	1586	2-10-2 MOE		4
400337	369	1574	1587	2-10-2 MOE		0
							400338	370	1575	1588	2-10-2 MOE		9
400339	371	1576	1589	2-10-2 MOE		0
							400340	372	1577	1590	2-10-2 MOE		0
400341	373	1578	1591	2-10-2 MOE		0
							400342	374	1621	1634	2-10-2 MOE		0
400343	375	1622	1635	2-10-2 MOE		0
							400344	376	1623	1636	2-10-2 MOE		0
400345	377	1624	1637	2-10-2 MOE		0
							400346	378	1738	1751	2-10-2 MOE		5
400347	379	1739	1752	2-10-2 MOE		0
							400348	380	1740	1753	2-10-2 MOE		0
400349	381	1741	1754	2-10-2 MOE	10-20％	13
							400350	382	1834	1847	2-10-2 MOE	10-20％	15
400351	383	1835	1848	2-10-2 MOE	10-20％	14
							400352	384	1836	1849	2-10-2 MOE	20-30％	29
400353	385	1837	1850	2-10-2 MOE	10-20％	19
							400354	386	1838	1851	2-10-2 MOE	10-20％	19
400355	387	1839	1852	2-10-2 MOE		0
							400356	388	1840	1853	2-10-2 MOE		0

 

400357	389	2083	2096	2-10-2 MOE		0
							400358	390	2084	2097	2-10-2 MOE	10-20％	12
400359	391	2085	2098	2-10-2 MOE		0
							400360	392	2086	2099	2-10-2 MOE	30-40％	38
400361	393	2316	2329	2-10-2 MOE		2
							400362	394	2317	2330	2-10-2 MOE	10-20％	16
400363	395	2318	2331	2-10-2 MOE		8
							400364	396	2319	2332	2-10-2 MOE		0
400365	397	2320	2333	2-10-2 MOE	20-30％	25
							400366	398	2321	2334	2-10-2 MOE	10-20％	15
400367	399	2322	2335	2-10-2 MOE	10-20％	12
							400368	400	2323	2336	2-10-2 MOE	10-20％	11
400369	401	2324	2337	2-10-2 MOE		0
							400370	402	2325	2338	2-10-2 MOE	10-20％	13
400371	403	3543	3556	2-10-2 MOE		0

如表75所示，靶向PCSK9核酸并具有2-10-2 MOE缺口聚物基序的短反义化合物在培养细胞中降低了PCSK9 mRNA。

在Hep3B细胞的剂量应答实验中测试了靶向PCSK9核酸的短反义化合物。使用如表76所示的nM浓度的短反义化合物按本文所述的方式处理细胞。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PCSK9 mRNA水平。将PCSK9 mRNA水平对亲环蛋白mRNA水平标准化，后者是利用亲环蛋白特异性引物探针组通过实时PCR测定的。结果表示为相对未处理对照细胞的PCSK9百分比抑制。还显示了剂量应答实验中测试的每种短反义化合物的EC₅₀(观察到mRNA的50％抑制时的浓度)，其是利用Graphpad Prism计算的。如下表中所示，PCSK9 mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。

表76：短反义化合物对PCSK9的剂量依赖性反义抑制

实施例20：包含BNA的短反义化合物对PCSK9的反义抑制

在小鼠和人的培养细胞中用剂量应答实验测试了靶向PCSK9核酸的短反义化合物。被测试的化合物包括ISIS 403739和ISIS 403740。ISIS 403739是一种由SEQ ID NO：404的核苷酸序列组成并具有2-10-2缺口聚物基序的短反义化合物，其中翼中的核苷酸包含(6’S)-6’甲基BNA。ISIS 403740是一种由SEQ ID NO：405的核苷酸序列组成并具有2-10-2缺口聚物基序的短反义化合物，其中翼中的核苷酸包含(6’S)-6’甲基BNA。还测试了一种靶向PCSK9核酸的5-10-5 MOE缺口聚物。

将小鼠肝细胞铺板并如本文所述以如表77中所示的nM浓度的短反义化合物对其进行处理。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PCSK9 mRNA水平。将PCSK9 mRNA水平对亲环蛋白mRNA水平标准化，后者是利用亲环蛋白特异性引物探针组通过实时PCR测定的。结果表示为相对未处理对照细胞的PCSK9百分比抑制。出现的“0”表示PCSK9 mRNA无观察到的降低。ISIS 403739在30nM和更高的剂量下显示对小鼠PCSK9 mRNA的剂量依赖性降低。ISIS 403740在该短反义化合物的两个最高的剂量下显示对小鼠PCSK9 mRNA的剂量依赖性降低。

表77：包含BNA的短反义化合物对小鼠PCSK9的反义抑制

如本文所述用nM浓度的短反义化合物处理人Hep3B细胞。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PCSK9 mRNA水平。将PCSK9 mRNA水平对亲环蛋白mRNA水平标准化，后者是利用亲环蛋白特异性引物探针组通过实时PCR测定的。结果表示为相对未处理对照细胞的PCSK9百分比抑制。数据如表78所示，显示ISIS 403740处理后人PCSK9mRNA的剂量依赖性降低。ISIS 403739在更高的剂量下显示剂量依赖性降低。

表78：包含BNA的短反义化合物对小鼠PCSK9的反义抑制

实施例21：HepG2细胞中GCGR的反义抑制

测试了靶向GCGR核酸的短反义化合物在体外对GCGR mRNA的作用。

HepG2细胞

按本文所述的方式，在96孔板中用25、50、100或200nM的反义寡核苷酸对密度为10000细胞/孔的培养HepG2细胞进行处理。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量GCGR mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整GCGR mRNA水平。结果表示为相对未处理对照细胞的GCGR mRNA降低。

表79列出了用所示剂量的ISIS 327161(一种3-10-3 MOE缺口聚物)处理之后的数据。ISIS 327161以剂量依赖的方式降低了GCGR mRNA。

表79：HepG2细胞中短反义化合物对GCGR的反义抑制

 

ISISNO.	Seq IDNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	25nM	50nM	100nM	200nM
								327161	520	AGCTGCTGTACATC	3-8-3MOE	-36	-30	-33	-64

猴肝细胞

测试了另外一些靶向GCGR核酸的短反义化合物在体外对猴GCGRmRNA的作用。如本文所述用25、50、100或200 nM短反义化合物处理经培养的原代猴肝细胞。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量GCGR mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整GCGR mRNA水平。结果在表80中给出，表示为相对未处理对照细胞的GCGR mRNA降低。

表80：在原代猴肝细胞中短反义化合物对GCGR的反义抑制

 

ISISNO.	Seq IDNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	25nM	50nM	100nM	200nM
								327131	489	ATGTTGGCCGTGGT	3-8-3MOE	0	-8	-36	-36
327161	520	AGCTGCTGTACATC	3-8-3MOE	-19	-33	-55	-54

实施例22：短反义化合物对DGTA2的反义抑制

测试了靶向DGTA2核酸的短反义化合物在体外对DGTA2 mRNA的作用。在96孔板中用75nM的短反义化合物处理经培养的A10细胞。经过大约24小时的培养期后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果在表81中给出，表示为相对未处理对照细胞的DGAT2的百分比抑制。

表81：A10细胞中DGTA2的反义抑制

 

ISIS NO.	Seq IDNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	％对照
					372491	795	ACATGAGGATGACACT	3-10-3 MOE	80
372500	702	GTGTGTCTTCACCAGC	3-10-3 MOE	16
					372501	704	TTGTGTGTCTTCACCA	3-10-3 MOE	28
372503	708	GCAGGTTGTGTGTCTT	3-10-3 MOE	35
					372508	719	AGTTCCTGGTGGTCAG	3-10-3 MOE	35
372516	805	TACAGAAGGCACCCAG	3-10-3 MOE	27
					372524	738	GCCAGGCATGGAGCTC	3-10-3 MOE	21
372530	746	TCGGCCCCAGGAGCCC	3-10-3 MOE	35
					372546	825	TTGGTCTTGTGATTGT	3-10-3 MOE	34
372563	691	AGCCAGGTGACAGA	2-10-2 MOE	48
					372569	796	CATGAGGATGACAC	2-10-2 MOE	104
372578	703	TGTGTCTTCACCAG	2-10-2 MOE	59
					372580	707	GGTTGTGTGTCTTC	2-10-2 MOE	48
372586	720	GTTCCTGGTGGTCA	2-10-2 MOE	40
					372594	806	ACAGAAGGCACCCA	2-10-2 MOE	77
372602	739	CCAGGCATGGAGCT	2-10-2 MOE	39
					372618	765	GTGGTACAGGTCGA	2-10-2 MOE	29
372624	826	TGGTCTTGTGATTG	2-10-2 MOE	56

在剂量应答实验中体外测试了另外一些靶向DGTA2 mRNA的短反义化合物。如上所述制备A10细胞并以6.25、12.5、25.0、50.0、100.0和200.0nM短反义化合物加以处理，以确定DGTA2抑制是否以剂量依赖的方式发生。数据表明表82中所示的每种短反义化合物均以剂量依赖的方式降低大鼠DGTA2 mRNA。结果表示为相对未处理对照细胞的百分比抑制。  “0”表示DGTA2 mRNA没有降低。

表82：A10细胞中DGTA2的剂量依赖性抑制

 

ISIS NO.	Seq IDNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	6.25nM	12.5nM	25.0nM	50.0nM	100.0nM	200.0nM
										372562	784	GTCTTGGAGGGCCG	2-10-2MOE	0	0	0	36	48	75
372568	794	GACACTGCAGGCCA	2-10-2MOE	0	0	15	26	72	69
										372586	720	GTTCCTGGTGGTCA	2-10-2MOE	19	0	7	22	45	77
372602	739	CCAGGCATGGAGCT	2-10-2MOE	0	0	0	18	47	76
										372618	765	GTGGTACAGGTCGA	2-10-2MOE	0	5	0	27	65	80

体外测试了另外一些靶向DGTA2 mRNA的短反义化合物。如上所述制备A10细胞并以0.62、1.85、5.56、16.67、50.0和150.0nM的短反义化合物加以处理，以确定DGTA2抑制是否以剂量依赖的方式发生。如本文所述使用定量实时PCR测量DGTA2 mRNA。数据表明，下面的表83中所示的每种短反义化合物均以剂量依赖的方式抑制大鼠DGTA2 mRNA。结果表示为相对未处理对照细胞的大鼠DGAT2百分比抑制。出现的“0”表示没有观察到DGTA2 mRNA的降低。

表83：A10细胞中DGTA2的剂量依赖性抑制

 

ISISNO.	SeqIDNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	0.62nM	1.85nM	5.56nM	16.67nM	50nM	150nM
										372500	702	GTGTGTCTTCACCAGC	3-10-3MOE	0	0	0	18	64	88
372501	704	TTGTGTGTCTTCACCA	3-10-3MOE	1	5	10	11	25	68
										372503	708	GCAGGTTGTGTGTCTT	3-10-3MOE	7	10	4	25	54	80
372508	719	AGTTCCTGGTGGTCAG	3-10-3MOE	0	0	6	14	39	71
										372516	805	TACAGAAGGCACCCAG	3-10-3MOE	1	10	0	4	35	81
372524	738	GCCAGGCATGGAGCTC	3-10-3MOE	7	0	5	30	68	91
										372530	746	TCGGCCCCAGGAGCCC	3-10-3MOE	0	2	0	10	38	78
372546	825	TTGGTCTTGTGATTGT	3-10-3	0	2	11	4	48	78

 

			MOE
										372563	691	AGCCAGGTGACAGA	2-10-2MOE	0	0	0	1	4	46
372578	703	TGTGTCTTCACCAG	2-10-2MOE	0	0	0	2	7	42
										372580	707	GGTTGTGTGTCTTC	2-10-2MOE	0	5	5	3	16	42
372586	720	GTTCCTGGTGGTCA	2-10-2MOE	0	0	0	0	7	55
										372594	806	ACAGAAGGCACCCA	2-10-2MOE	0	0	0	0	2	15
372602	739	CCAGGCATGGAGCT	2-10-2MOE	0	0	10	0	19	51
										372618	765	GTGGTACAGGTCGA	2-10-2MOE	0	0	0	0	30	60
372624	826	TGGTCTTGTGATTG	2-10-2MOE	0	0	0	1	16	38

实施例23：HuVEC细胞中人PTP1B的反义抑制

测试了靶向PTP1B核酸的短反义化合物在体外对PTP1B mRNA的作用。按本文所述的方式，在96孔板中用3nM的短反义化合物对密度为5000细胞/孔的培养HuVEC细胞进行处理。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PTP1B mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整PTP1B mRNA水平。结果表示为相对于未处理对照细胞的PTP1B百分比抑制(％抑制)。表84中的数据表明，靶向PTP1B核酸并具有2-10-2缺口聚物基序的短反义化合物能够在HuVEC细胞中抑制PTP1B。

表84：短反义化合物在HuVEC细胞中对PTP1B的反义抑制

 

ISIS NO.	SEQ ID NO	缺口聚物基序	％抑制
				399301	1542	2-10-2 OMe	55
404137	1053	2-10-2 MOE	76
				404138	1054	2-10-2 MOE	76
404139	1052	2-10-2 MOE	80
				404140	1051	2-10-2 MOE	73

实施例24：HepG2细胞中人PTP1B的反义抑制

测试了靶向PTP1B核酸的短反义化合物在体外对PTP1B mRNA的作用。在96孔板中用25nM的反义寡核苷酸对密度为10000细胞/孔的培养HepG2细胞进行处理。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PTP1B mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整PTP1B mRNA水平。结果表示为相对于未处理对照细胞的PTP1B百分比抑制(％抑制)。表85中的数据表明，靶向PTP1B核酸并具有2-10-2缺口聚物基序的短反义化合物能够在HepG2细胞中抑制PTP1B。

表85：短反义化合物在HepG2细胞中对PTP1B的反义抑制

 

ISIS NO.	SEQ ID NO	缺口聚物基序	％抑制
				399301	1542	2-10-2 OMe	43
404137	1053	2-10-2 MOE	71
				404138	1054	2-10-2 MOE	86
404139	1052	2-10-2 MOE	45
				404140	1051	2-10-2 MOE	93

实施例25：HuVEC细胞中PTP1B的反义抑制：剂量应答实验

将人血管内皮(Hu VEC)细胞以5000细胞/孔的密度铺板并如本文所述以如表86中所示的nM浓度的短反义化合物对其进行处理。处理期之后，从细胞分离RNA并如本文所述通过定量实时PCR测量PTP1B mRNA水平。根据用

测得的总RNA含量调整PTP1B mRNA水平。使用两种不同的人PTP1B引物探针组来测量mRNA水平。引物探针组(PPS)198的结果示于表86，引物探针组(PPS)3000的结果示于表87。结果表示为相对未处理对照细胞的PTP1B mRNA百分比抑制。出现的“0”表示未观察到PTP1B mRNA降低。如表86和87所示，PTP1B mRNA水平被剂量依赖性地降低。

表86：HuVEC细胞中人PTP1B的剂量应答，使用PPS198

表87：HuvEC细胞中人PTP1B的剂量应答，使用PPS3000

实施例26：短反义化合物对ApoB的反义抑制

测试了表88所示短反义化合物的体内作用。对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)给予3.2、1、0.32或1umol/kg的腹膜内剂量，每周2次，历时3周。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物进行对照处理。最后一剂之后大约48小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量ApoB mRNA水平。将ApoB mRNA水平对用RIBOGREEN测定的RNA水平标准化，并在表89中给出，表示为相对于盐水处理的对照动物中ApoB mRNA水平的百分比抑制。

表88：靶向ApoB核酸的短反义化合物

 

ISISNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
				387462	GGTACATGGAAGTC	2-10-2亚甲氧基BNA	190
398296	GGTACATGGAAGTC	2-10-26’-(S)-甲基亚甲氧基BNA	190

表89：包含BNA的短反义化合物对ApoB的反义抑制

 

Isis NO

剂量

％抑制

 

	(umol/kg)
			379818	1	56
387462	0.1	33
				0.32	57
	1	93
				3.2	99
398296	0.1	17
				0.32	35
	1	80
				3.2	98

表89显示，在使用具有2-10-2缺口聚物基序和翼中BNA修饰的短反义化合物进行处理之后，ApoB mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。在1umol/kg的剂量，短反义化合物的ApoB抑制比用同等剂量的5-10-5 MOE缺口聚物观察到的更大。在1和3.2umol/kg的短反义化合物剂量胆固醇被降低。

根据器官和身体重量、血清转氨酶、胆红素、血尿素氮和肌酸酐判断，所述短反义化合物显示极少乃至没有不良副作用。

实施例27：短反义化合物对PTEN的反义抑制

测试了表90所示短反义化合物的体内作用。对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)给予3.2、1、0.32或1 umol/kg的腹膜内剂量，每周2次，历时3周。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物作为对照处理。最后一剂之后大约48小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量PTEN mRNA水平。将PTEN mRNA水平对用RIBOGREEN测定的RNA水平标准化，并在表91中给出，表示为相对于盐水处理的对照动物中PTEN mRNA水平的百分比抑制。

表90：靶向PTEN核酸的短反义化合物

 

ISISNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
				392063	AGGCCAGTGCTAAG	2-10-2亚甲氧基BNA	1226
392749	AGGCCAGTGCTAAG	2-10-2(6’S)-6’-甲基亚甲氧基BNA	1226
				396006	AGGCCAGTGCTAAG	2-10-2	1226

 

ISISNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQ IDNO
						α-L-亚甲氧基BNA

表91：包含BNA修饰的短反义化合物对PTEN的反义抑制

 

Isis No	剂量(umol/kg)	％抑制
			116847	1	47
392063	0.1	26
				0.32	43
	1	74
				3.2	96
392749	0.1	17
				0.32	34
	1	64
				3.2	96
396006	0.1	20
				0.32	32
	1	67
				3.2	88

表91显示，在使用具有2-10-2缺口聚物基序和翼中BNA修饰的短反义化合物进行单次施用之后，PTEN mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。在1umol/kg的剂量，短反义化合物的PTEN抑制比用同等剂量的5-10-5MOE缺口聚物观察到的更大。

除了最高剂量的ISIS 392063之外，没有观察到血清转氨酶的显著增加。总的来说，这些短反义化合物显示极少乃至没有不良副作用。

实施例28：包含BNA修饰的短反义化合物的单剂量施用

对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过单次腹膜内注射给予8、4、2或1μmol/kg的短反义化合物。所测试的短反义化合物是ISIS 387462和ISIS 398296。每个剂量组由4只动物组成。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物用于对照处理。最后一剂之后大约48小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量ApoB mRNA水平。将ApoB mRNA水平对用RIBOGREEN测定的RNA水平标准化，并在表92中给出，表示为相对于盐水处理的对照动物中ApoB mRNA水平的百分比抑制。

表92：包含BNA的短反义化合物对ApoB的反义抑制

 

Isis No	剂量(umol/kg)	％抑制
			379818	8	77
387462	8	99
				4	93
	2	81
				1	58
398296	8	97
				4	81
	2	54
				1	19

表92显示，在使用具有2-10-2缺口聚物基序和翼中BNA修饰的短反义化合物进行处理之后，ApoB mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。在8umol/kg的剂量，短反义化合物的ApoB抑制比用同等剂量的5-10-5 MOE缺口聚物观察到的更大。ISIS 387462的ED₅₀是3.9mg/kg，而ISIS 398296的ED₅₀为8.7mg/kg。胆固醇也以剂量依赖的方式被降低。甘油三酯在最高的剂量下被降低。

根据器官和身体重量、血清转氨酶、胆红素、血尿素氮和肌酸酐判断，所述短反义化合物显示极少乃至没有不良副作用。

在一项类似的单剂量施用研究中，ISIS 392748以剂量依赖的方式降低了PTEN mRNA，ISIS 392748具有2-10-2缺口聚物基序SEQ ID NO：1226，其中翼的核苷酸包含(6’S)-6’-甲基亚甲氧基BNA修饰。此外，ISIS 392749以剂量依赖的方式降低了PTEN mRNA，ISIS 392749具有2-10-2缺口聚物基序SEQ ID NO：1226，其中翼的核苷酸包含(6’S)-6’-甲基亚甲氧基BNA修饰。在一项类似的体内研究中，一种具有2-10-2缺口聚物基序，即SEQ ID NO：1226的序列，以及6-(S)-CH2-O-CH3-BNA修饰的短反义化合物也降低了PTEN mRNA。在一项类似的体内研究中，一种具有2-10-2缺口聚物基序，即SEQ ID NO：1226的序列，以及6-(R)-CH2-O-CH3-BNA修饰的短反义化合物也降低了PTEN mRNA。

实施例29：包含BNA修饰的短反义化合物的单剂量施用

对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过单次腹膜内注射以8、4、2或1μmol/kg的剂量给予反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。所测试的化合物是ISIS 392063、ISIS 392749和ISIS 366006。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物进行对照处理。最后一剂之后大约48小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量ApoB mRNA水平。将ApoB mRNA水平对用RIBOGREEN测定的RNA水平标准化，并在表93中给出，表示为相对于盐水处理的对照动物中ApoB mRNA水平的百分比抑制。

表93：包含BNA修饰的短反义化合物对PTEN的反义抑制

 

Isis No	剂量(umol/kg)	％抑制
			116847	8	62
392063	8	92
				4	82
	2	58
				1	38
396565	8	76
				4	38
	2	24
				1	11
396006	8	94
				4	82
	2	48
				1	18

表93显示，在使用具有2-10-2缺口聚物基序和翼中BNA修饰的短反义化合物进行处理之后，PTEN mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。在8umol/kg的剂量，短反义化合物的PTEN抑制比用同等剂量的5-10-5 MOE缺口聚物观察到的更大。ISIS 392063的估计ED₅₀为7mg/kg，ISIS 396565为17.4mg/kg，而ISIS 396006为9.3mg/kg。

除了最高剂量的ISIS 392063之外，没有观察到血清转氨酶的显著增加。总的来说，短反义化合物显示很少乃至没有不良副作用。

实施例30：包含棕榈酸缀合物的短反义化合物对ApoB的反义抑制

对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过单次腹膜内注射以2.5、1.0、0.4和0.16umol/kg的剂量给予反义化合物。每个剂量组由4只动物组成。所测试的化合物示于表94。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物进行对照处理。最后一剂之后大约48小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量ApoB mRNA水平。将ApoB mRNA水平对用RIBOGREEN测定的RNA水平标准化，并在表95中给出，表示为相对于盐水处理的对照动物中ApoBmRNA水平的百分比抑制。

表94：包含棕榈酸缀合物的短反义化合物

 

ISISNO	序列(5’-3’)	缺口聚物基序	SEQIDNO
				387462	GGTACATGGAAGTC	2-10-2亚甲氧基BNA	190
391871	GGTACATGGAAGTC	1-1-10-22’-(丁基乙酰氨基(butyIacetomido))-棕榈酸酰胺/MOE/MOE缺口中胞嘧啶未修饰(即5’核苷酸被2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺取代的2-10-2 MOE)	190
				391872	GGTACATGGAAGTC	1-1-10-2 2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺亚甲氧基BNA/亚甲氧基BNA缺口中胞嘧啶未修饰(即5’核苷酸被2’-(丁基乙酰氨基)-棕榈酸酰胺取代的2-10-2亚甲氧基BNA)	190

表95：包含棕榈酸缀合物的短反义化合物的反义抑制

 

Isis No	剂量(umol/kg)	％抑制
			5-10-5	2.5	54
387462	2.5	99
				1.0	91
	0.4	65
				0.16	16
391871	2.5	49
				1.0	18
	0.4	5
				0.16	0
391872	2.5	99
				1.0	92
	0.4	50
				0.16	18

表95显示，在使用具有棕榈酸(C16)缀合物的短反义化合物进行处理之后，ApoB mRNA水平以剂量依赖的方式被降低。在2.5umol/kg的剂量，短反义化合物的ApoB抑制比用同等剂量的5-10-5 MOE缺口聚物观察到的更大。在此项研究中，ISIS 387462的估计ED₅₀为1.5mg/kg，ISIS 391871的估计ED₅₀为13.1mg/kg，而ISIS 391872的估计ED₅₀为1.9mg/kg。所述5-10-5MOE缺口聚物的估计ED₅₀为17.4mg/kg。在2.5和1.0mg/kg剂量的ISIS387462和ISIS 391872条件下甘油三酯被降低。ISIS 387462和ISIS 391872也以剂量依赖的方式明显地降低了总胆固醇、HDL-C和LDL-C；LDL-C降低得如此明显，以至于其降到了检测限以下。总的来说，短反义化合物显示很少乃至没有不良副作用。

实施例31：包含BNA修饰的短反义化合物对PCSK9的体内反义抑制

对6周龄的雄性Balb/c小鼠(Jackson Laboratory，Bar Harbor，ME)通过单次腹膜内注射给予15、4.7、1.5和.47umol/kg剂量的ISIS 403739或403740。每个剂量组由4只动物组成。使用一种5-10-5 MOE缺口聚物进行对照处理。最后一剂之后大约72小时处死小鼠。采集肝组织进行RNA分离，并采集血液进行血清化学分析。如本文所述通过实时PCR测量PCSK9 mRNA水平。将PCSK9 mRNA水平对通过实时PCR测定的亲环蛋白mRNA水平标准化。ISIS 403739相对于盐水对照将PCSK9 mRNA降低了大约70％。ISIS 403740相对于盐水对照将PCSK9降低了大约13％，但该降低在统计学上不显著。较低的剂量没有显著降低PCSK9 mRNA。总的来说，短反义化合物显示很少乃至没有不良副作用。

Claims (51)

1.一种长度为8至16个单体的短反义化合物，其包含2’-脱氧核糖核苷酸缺口区，所述缺口区的每一侧存在翼，其中每个翼独立地包含1至3个高亲和性修饰单体，并且其中该短反义化合物靶向编码PCSK9的核苷酸。

2.权利要求1的短反义化合物，其中所述高亲和性修饰单体是糖修饰的核苷酸。

3.权利要求2的短反义化合物，其中至少一个所述糖修饰的核苷酸包含位于所述糖的4’位和2’位之间的桥。

4.权利要求2的短反义化合物，其中每个所述高亲和性修饰核苷酸提供1-4度/核苷酸的T_m。

5.权利要求2的短反义化合物，其中每个所述糖修饰的核苷酸包含不同于H或OH的2’-取代基。

6.权利要求5的短反义化合物，其中至少一个所述糖修饰的核苷酸是4’-2’桥联的双环核苷酸。

7.权利要求5的短反义化合物，其中每个所述2’-取代基独立地是烷氧基、取代的烷氧基或卤素。

8.权利要求7的短反义化合物，其中每个所述2’-取代基是OCH₂CH₂OCH₃。

9.权利要求3的短反义化合物，其中每个所述糖修饰的核苷酸的构象独立地为β-D或α-L。

10.权利要求5的短反义化合物，其中每个所述的桥独立地包含1个或2至4个连接基团，所述连接基团独立地选自-[C(R₁)(R₂)]_n-、-C(R₁)＝C(R₂)-、-C(R₁)＝N-、-C(＝NR₁)-、-C(＝O)-、-C(＝S)-、-O-、-Si(R₁)₂-、-S(＝O)_x-和-N(R₁)-；

其中

x为0、1或2；

n为1、2、3或4；

每个R₁和R₂独立地为：H、保护基团、羟基、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₂-C₁₂炔基、取代的C₂-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C₅-C₇脂环基、取代的C₅-C₇脂环基、卤素、OJ₁、NJ₁J₂、SJ₁、N₃、COOJ₁、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(＝O)₂-J₁)或亚磺酰基(S(＝O)-J₁)；和

每个J₁和J₂独立地为：H、C₁-C₁₂烷基、取代的C₁-C₁₂烷基、C₂-C₁₂烯基、取代的C₂-C₁₂烯基、C₂-C₁₂炔基、取代的C₂-C₁₂炔基、C₅-C₂₀芳基、取代的C₅-C₂₀芳基、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C₁-C₁₂氨基烷基、取代的C₁-C₁₂氨基烷基或保护基团。

11.权利要求10的短反义化合物，其中每个所述桥独立地为4′-CH₂-2′、4′-(CH₂)₂-2′、4′-CH₂-O-2′、4′-(CH₂)₂-O-2′、4′-CH₂-O-N(R₁)-2′和4′-CH₂-N(R₁)-O-2′-，其中每个R₁独立地为H、保护基团或C₁-C₁₂烷基。

12.权利要求1的短反义化合物，其中每个所述高亲和性修饰单体独立地选自双环核苷酸或其它2’-修饰核苷酸。

13.权利要求12的短反义化合物，其中所述2’-修饰核苷酸选自卤素、烯丙基、氨基、叠氮基、硫、O-烯丙基、O-C₁-C₁₀烷基、-OCF₃、O-(CH₂)₂-O-CH₃、2′-O(CH₂)₂SCH₃、O-(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n)或O-CH₂-C(＝O)-N(R_m)(R_n)，其中每个R_m和R_n独立地为H或者取代或未取代的C₁-C₁₀烷基。

14.权利要求13的短反义化合物，其中所述2’-修饰核苷酸是2’-OCH₂CH₂OCH₃核苷酸。

15.权利要求1的反义化合物，其中至少一个单体连接是修饰的单体连接。

16.权利要求15的短反义化合物，其中所述修饰的单体连接是硫代磷酸酯连接。

17.权利要求1的短反义化合物，其中每个单体连接是硫代磷酸酯核苷间连接。

18.权利要求1-17中任一项的短反义化合物，其长度为8-15个单体。

19.权利要求18的短反义化合物，其长度为9-15个单体。

20.权利要求18的短反义化合物，其长度为10-15个单体。

21.权利要求18的短反义化合物，其长度为9-14个单体。

22.权利要求18的短反义化合物，其长度为10-14个单体。

23.权利要求18的短反义化合物，其长度为9-13个单体。

24.权利要求18的短反义化合物，其长度为10-13个单体。

25.权利要求18的短反义化合物，其长度为9-12个单体。

26.权利要求18的短反义化合物，其长度为10-12个单体。

27.权利要求18的短反义化合物，其长度为9-11个单体。

28.权利要求18的短反义化合物，其长度为10-11个单体。

29.权利要求18的短反义化合物，其长度为8个单体。

30.权利要求18的短反义化合物，其长度为9个单体。

31.权利要求18的短反义化合物，其长度为10个单体。

32.权利要求18的短反义化合物，其长度为11个单体。

33.权利要求18的短反义化合物，其长度为12个单体。

34.权利要求18的短反义化合物，其长度为13个单体。

35.权利要求18的短反义化合物，其长度为14个单体。

36.权利要求18的短反义化合物，其长度为15个单体。

37.权利要求18的短反义化合物，其长度为16个单体。

38.权利要求1-18中任一项的短反义化合物，其具有选自1-12-1、3-10-3、2-10-3、2-10-2、1-10-1、1-10-2、3-8-3、2-8-2、1-8-1、3-6-3和1-6-11的基序，其中，第一个数字代表5’-翼中单体的数目，第二个数字代表缺口中单体的数目，第三个数字代表3’-翼中单体的数目。

39.权利要求38的短反义化合物，其中所述基序选自1-10-1、2-10-2、3-10-3和1-9-2。

40.权利要求1-18中任一项的短反义化合物，其具有选自1-1-10-2、1-1-8-2、1-1-6-3和1-2-8-2的基序，其中第一个数字代表第一5’-翼中单体的数目，第二个数字代表第二5’-翼中单体的数目，第三个数字代表缺口中单体的数目，第四个数字代表3’-翼中单体的数目。

41.权利要求1-18中任一项的短反义化合物，其具有选自2-10-1-1、2-8-1-1、3-6-1-1和2-8-2-1的基序，其中第一个数字代表5’-翼中单体的数目，第二个数字代表缺口中单体的数目，第三个数字代表第一3’-翼中单体的数目，第四个数字代表第二3’-翼中单体的数目。

42.权利要求1-18中任一项的短反义化合物，其具有选自1-2-10-1-1、1-1-8-1-1、2-1-6-1-1和1-2-8-2-1的基序，其中第一个数字代表第一5’-翼中单体的数目，第二个数字代表第二5’-翼中单体的数目，第三个数字代表缺口中单体的数目，第四个数字代表第一3’-翼中单体的数目，第五个数字代表第二3’-翼中单体的数目。

43.一种通过使编码PCSK9的核酸接触短反义化合物来调节PCSK9表达的方法。

44.权利要求43的方法，其中所述PCSK9核酸在细胞中。

45.权利要求44的方法，其中所述PCSK9核酸在动物中。

46.权利要求45的方法，其中所述动物是人。

47.权利要求43-48中任一项的方法，其中所述短反义化合物是权利要求1-38中任一项的短反义化合物。

48.权利要求1-42中任一项的短反义化合物用于制备在动物中降低PCSK9RNA表达的药物的用途。

49.权利要求48的用途，其中所述药物减少动物中的总血清胆固醇、血清LDL、血清VLDL、血清HDL、血清甘油三酯、血清载脂蛋白(a)和/或游离脂肪酸。

50.一种抑制动物中的PCSK9RNA表达的方法，其包括对所述动物施用权利要求1-42中任一项的短反义化合物。

51.一种治疗动物中的心血管病症的方法，其包括对需要该治疗的动物施用权利要求1-42中任一项的短反义化合物。