CN101481699A - 链霉亲和素标记的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种链霉亲和素标记的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的制备方法,是通过应用藻胆蛋白beta裂合酶催化藻红胆素(PEB)与链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白共价结合,制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质;本发明的方法应用生物过程生产别藻蓝蛋白类荧光蛋白质,是一种环境友好的生产方法;别藻蓝蛋白类荧光蛋白质能应用于食品、保健与医药功能材料领域,特别是应用为生物和医学分子检测领域的荧光探针。
Description
技术领域
本发明属于生物技术中色素蛋白质材料领域,具体涉及一种链霉亲和素标记的结合藻红胆素(PEB)的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的制备方法。
技术背景
藻胆蛋白(phycobiliprotein)是蓝藻和红藻光合作用捕光复合物的功能组分。根据其吸收光谱和荧光光谱特征,藻胆蛋白可以分为藻红蛋白(phycoerythrin,简称CPE)、藻红蓝蛋白(phycoerythrocyanin,简称PEC)、藻蓝蛋白(phycocyanin,简称CPC)和变藻蓝蛋白(allophycocyanin,简称APC)。藻红蛋白、藻红蓝蛋白、藻蓝蛋白和变藻蓝蛋白含alpha(α)和beta(β)亚基,每个亚基中藻胆色素(phycobilin)通过硫醚键与藻胆蛋白脱辅基蛋白(apo-phycobiliprotein)半胱氨酸残基的巯基共价结合,其种类及其与脱辅基蛋白的相互作用决定藻胆蛋白的光谱性质。藻胆色素与脱辅基蛋白共价结合形成特定的构象,使得藻红蛋白主要吸收约560nm的可见光,发射约580nm的荧光;藻红蓝蛋白吸收约570nm的可见光,发射约630nm的荧光;藻蓝蛋白吸收约620nm的可见光,发射约640nm的荧光;变藻蓝蛋白吸收约650~660nm的可见光,发射约660~670nm的荧光。藻红蛋白结合的辅基色素为藻红胆素(phycoerythrobilin,简称PEB);藻红蓝蛋白的alpha亚基结合的辅基色素为藻紫胆素(phycoviolobilin,简称PVB);藻红蓝蛋白的beta亚基结合的辅基色素为藻蓝胆素(phycocyanobilin,简称PCB);藻蓝蛋白和变藻蓝蛋白结合的辅基色素都为藻蓝胆素PCB。
链霉亲和素可以跟生物素特异结合,通过链霉亲和素-生物素系统,可以实现信号放大作用,提高检测灵敏度。目前链霉亲和素-生物素系统已经广泛应用于生物学检测和医疗检测等领域。目前主要是通过化学交联实现链霉亲和素对目标的标记。
在Anabaena sp.PCC7120中alr0617基因和Synechocystis sp.PCC 6803中slr2049基因分别编码beta裂合酶,在其它蓝藻中也存在同源的beta裂合酶。这些beta裂合酶能催化藻蓝胆素与别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白及其同源蛋白质共价结合,从而生成具有优良荧光性质的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质。我们发现,beta裂合酶还能催化藻红胆素(PEB)与别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白及其同源蛋白质共价结合,生成新型的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质。藻红胆素PEB可由HO1、PebA、PebB协同催化生成(Alvey,R.M.,Karty,J.A.etc.Lesions in Phycoerythrin Chromophore Biosynthesis inFremyella diplosiphon Reveal Coordinated Light Regulation of Apoprotein and PigmentBiosynthetic Enzyme Gene Expression.Plant Cell 15(10),2448-2463(2003))。通过基因工程技术,把链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白基因拼接,可以在大肠杆菌内表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白的融合蛋白,直接实现链霉亲和素和别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白的连接,而不需要通过化学交联等方法来实现链霉亲和素标记。
藻胆蛋白类荧光蛋白质可以应用于食品、化妆品、医药和生物工程领域。别藻蓝蛋白类荧光蛋白质具有优良的荧光性质,通过直接实现链霉亲和素和别藻蓝蛋白亚基脱辅基蛋白的连接,可用于生物学检测以及医疗检测领域。本发明为别藻蓝蛋白类色素蛋白质功能材料应用于医药和生物工程领域,特别是检测领域奠定了基础。
发明内容
本发明的目的在于提供一种链霉亲和素标记的结合藻红胆素(PEB)的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的制备方法,它是应用beta裂合酶催化藻红胆素与链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白共价结合,从而制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质;将含有beta裂合酶基因、链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白拼接的基因、藻红胆素生物合成酶基因的表达质粒依次转入宿主菌,得到相应的工程菌,通过这种方法得到的基因工程菌生产链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质。
本发明的技术方案是这样的:一种链霉亲和素标记的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的制备方法,其特征在于包括下述步骤:
(1)用基因工程的方法,将beta裂合酶基因或其同源基因克隆于表达载体中,得到beta裂合酶表达质粒;
(2)用基因工程的方法,将链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因或其同源基因克隆于第二个表达载体中,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白表达质粒;
(3)用基因工程方法将藻红胆素生物合成酶基因ho1和pebB或其同源基因克隆于第三个表达载体中,得到ho1和pebB表达质粒;
(4)用基因工程方法将藻红胆素生物合成酶基因pebA或其同源基因克隆于第四个表达载体中,得到pebA表达质粒;
(5)将beta裂合酶表达质粒、链霉亲和素标记的脱辅基蛋白表达质粒、ho1和pebB表达质粒及pebA表达质粒依次转入配套的宿主菌,当这些表达质粒都转入宿主菌后,得到相应的工程菌,应用此工程菌通过发酵工程生产结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质;发酵后,按常规蛋白质提纯技术,提纯得到相应的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质。
上述链霉亲和素标记的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的制备方法中,所述的宿主菌为大肠杆菌;所述的beta裂合酶基因是指与Anabaena sp.PCC7120中alr0617基因或Synechocystis sp.PCC 6803中slr2049基因同源的基因;所述的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因是指与Anabaena sp.PCC7120或Synechocystis sp.PCC 6803中别藻蓝蛋白基因同源的基因。
本发明与现有技术相比,具有以下优点:
1、不使用藻类为原料而是利用大肠杆菌生产别藻蓝蛋白类荧光蛋白质,大肠杆菌繁殖快,可以大大缩短周期;
2、与藻类相比,大肠杆菌细胞壁容易破碎,纯化过程中可节省能源;
3、通过大肠杆菌生产,目标蛋白含量高,有His-tag标记,且体系中几乎没有性质类似的蛋白,提取方便;
4、生成结合PEB的新型别藻蓝蛋白,具有与天然别藻蓝蛋白不同的光谱特性,为发展荧光藻胆蛋白类色素蛋白质功能材料提供更多选择。
5、产物中链霉亲和素与荧光藻胆蛋白类色素蛋白质直接结合,不需额外进行处理,有利于发展荧光藻胆蛋白类色素蛋白质在检测领域的应用。
附图说明
图1为本发明制备的链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质ApcA的吸收与荧光光谱;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱;
图2为本发明制备的链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质ApcA2的吸收与荧光光谱;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱;
图3为本发明制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质ApcB的吸收与荧光光谱;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱;
图4为本发明制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质ApcD的吸收与荧光光谱;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱;
图5为本发明制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质ApcF的吸收与荧光光谱;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱;
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步地详细说明,但不构成对本发明的任何限制。
实施例1
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成。Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA在pET30中是在EcoRV和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和Bgl II两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1∶1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcA、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A。其吸收与荧光光谱见图1中所示;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式如下:
从新鲜涂布的平板上挑取大肠杆菌菌株BL21(DE3)单菌落,接种于5mL LB培养基,37℃振荡培养过夜;取100μL饱和培养物,无菌转接至5mL LB培养基,37℃振荡培养至OD600=0.3~0.4时,将菌液转移至5mL无菌离心管中,冰上放置10分钟;离心1分钟(10000g,4℃)弃去上清,收集沉淀菌体;用1mL预冷的0.1mol/L CaCl2无菌溶液重悬菌体,离心30秒(10000g,4℃)去上清,菌体沉淀用100μL预冷的0.1mol/L CaCl2重悬,放置于冰上,加入一定量的构建好的质粒,混匀后冰浴放置30分钟,42℃热休克90秒,冰浴5分钟后加入300μL LB培养基,37℃低速振荡培养45分钟,无菌涂布在含有相应抗生素的LB培养基平板上,倒置于37℃培养箱至形成可见的单克隆菌斑。
提取3个左右菌落,分别接种到5ml含相应抗生素的LB培养基中,振荡培养至饱和;分别从中取100μL转接至5ml含相应抗生素的LB培养基中;37℃振荡培养至OD600=0.5-0.7时,冰浴约30分钟,加入IPTG诱导表达;避光、20℃、150转/分,表达约12小时。离心收集细胞,细胞加入缓冲液重悬;通过光谱仪测其产物荧光量,选取荧光产量高的菌株进行大量表达。
实施例2
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrixsp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA2和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA2,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A2。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA2在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcA2、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A2;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A2。其吸收与荧光光谱见图2中所示;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例3
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcB和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcB,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白B。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcB在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcB、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌,将此工程菌接种于pH7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B。其吸收与荧光光谱见图3所示;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例4
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcD和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcD,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白D。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcD在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcD、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D。其吸收与荧光光谱见图4所示;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例5
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成。Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段。通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcF和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcF,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白F。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcF在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板,经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收,所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcF、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F,离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F。其吸收与荧光光谱见图5所示;其中实线为吸收光谱,而虚线为荧光光谱。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例6
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成,Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板,经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcA、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例7
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成,Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA2和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA2,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A2。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA2在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板,经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcA2、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A2;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A2。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例8
(1)从GeneBank中可以查到;藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcB和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcB,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白B。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcB在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和PstI之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcB、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例9
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcD和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcD,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白D。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcD在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1∶1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcD、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例10
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Anabaena sp.PCC7120中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcF和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcF,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白F。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcF在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcF、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例11
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成。Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和Bgl II两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcA、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例12
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcB和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcB,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白B。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcB在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1∶1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcB、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌,将此工程菌接种于pH7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例13
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcD和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcD,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白D。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcD在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcD、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例14
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成。Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Anabaena sp.PCC7120中的alr0617基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-alr0617,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段。通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcF和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcF,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白F。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcF在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因alr0617在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板,经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收,所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-alr0617、pET30-sa-apcF、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F,离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例15
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成,Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcA和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcA,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白A。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcA在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板,经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcA、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白A。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例16
(1)从GeneBank中可以查到;藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcB和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcB,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白B。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcB在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcB、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白B。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例17
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段;通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcD和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcD,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白D。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcD在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和XhoI;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcD、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白D。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
实施例18
(1)从GeneBank中可以查到,藻种Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803的全序列已经测定完成;Anabaena sp.PCC7120在GeneBank中编号为:BA000019,Synechocystis sp.PCC 6803在GeneBank中编号为:BA000022,可从全序列中找到所需基因;Calothrix sp.PCC7601已经部分测序,所用到基因序列在GeneBank中编号为AY363679,可从所查到序列中找到所需基因(pebA和pebB)。通过基因工程方法,将Synechocystis sp.PCC 6803中的slr2049基因克隆于Novagen公司的pETDuet-1中,所得质粒叫pETDuet-slr2049,在大肠杆菌中能表达beta裂合酶。
根据GeneBank中查到的基因序列,设计了引物,利用相应的藻种提取总DNA作为模板,通过PCR扩增得到所需片段,通过上下游引物中设计的酶切位点,把目标片段转入相应质粒中同样的酶切位点上。
(2)将Synechocystis sp.PCC 6803中的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因apcF和链霉亲和素基因(简称sa)克隆于Novagen公司的表达载体pET30中,所得质粒叫pET30-sa-apcF,链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因拼接后,在大肠杆菌中能表达得到链霉亲和素和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白的融合蛋白,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白别藻蓝蛋白F。
链霉亲和素基因可以从GeneBank中查到,编号为AF283893,通过全基因合成得到。
(3)将藻红胆素生物合成酶基因(ho1和pebB)克隆于Novagen公司的pCDFDuet-1中,所得质粒叫pCDFDuet-ho1-pebB,在大肠杆菌中能同时表达HO1和PebB。
(4)将藻红胆素生物合成酶基因(pebA)克隆于Novagen公司的pACYCDuet-1中,所得质粒叫pACYCDuet-pebA,在大肠杆菌中能表达PebA。
即脱辅基蛋白基因apcF在pET30中是在EcoR V和Xho I两个酶切位点之间,链霉亲和素基因sa在Kpn I和BglII两个酶切位点之间;裂合酶基因slr2049在pETDuet中,处于第二个多克隆位点,酶切位点是Nde I和Xho I;PEB合成酶基因是3个(ho1、pebA和pebB),ho1和pebB在同一个载体pCDFDuet-1中,ho1在第一个多克隆位点Nco I和Pst I之间,pebB在第二个多克隆位点Nde I和Xho I之间,pebA在pACYCDuet-1中第二个多克隆位点BglII和Xho I之间。
基因插入载体的步骤为:根据基因序列设计引物,分上下游,一对;上游下游引物分别带有酶切位点;利用相应的藻种提取总DNA作为模板;经过PCR扩增得到所需基因片段,把所得基因片段进行电泳,回收;所得片段用设计的限制性内切酶进行酶切,同时把载体用同样的限制性内切酶进行酶切,分别回收基因片段和载体;基因片段和载体大致1:1混合,在T4连接酶作用下连接一定时间(一般4-6小时);连接产物转化进入大肠杆菌,利用含抗生素的平板筛选,挑取克隆,验证正确即可。
(5)将pETDuet-slr2049、pET30-sa-apcF、pCDFDuet-ho1-pebB和pACYCDuet-pebA转入大肠杆菌,当这些质粒都转入大肠杆菌后得到大肠杆菌工程菌;将此工程菌接种于pH 7.0的LB培养基中,37℃振荡培养至OD600为0.5至0.8,加入异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isoprophyl thio-β-D-galactoside,简称IPTG)至终浓度为1mmol/L,20℃至37℃振荡表达约12小时,生产链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F;离心收集菌体细胞,加入缓冲液、破碎细胞后,离心收集上清液,通过Ni2+亲和层析,可提纯得到相应的链霉亲和素标记的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质藻红胆素-别藻蓝蛋白F。
将所用到的质粒的组合转入大肠杆菌中的转化方式与实施例1相同。
上述制备方法适用于采用各种蓝藻中的beta裂合酶、别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白、藻红胆素生物合成酶基因或其同源基因以及链霉亲和素基因来制备链霉亲和素标记的结合PEB的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质,但涉及到微生物菌种公开的问题,本发明只选用了GenBank中已公开全序列的蓝藻Anabaena sp.PCC7120和Synechocystis sp.PCC 6803和部分测序的Calothrix sp.PCC7601为例对本发明方法加以说明,本领域的技术人员可以根据上述公开的内容采用其它原料实施本发明。
Claims (4)
1.一种链霉亲和素标记的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质的方法,其特征在于包括下述步骤:
(1)用基因工程的方法,将beta裂合酶基因或其同源基因克隆于表达载体中,得到beta裂合酶表达质粒;
(2)用基因工程的方法,将链霉亲和素基因和别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因或其同源基因克隆于第二个表达载体中,得到链霉亲和素标记的脱辅基蛋白表达质粒;
(3)用基因工程方法,将藻红胆素生物合成酶基因hol和pebB或其同源基因克隆于第三个表达载体中,得到hol和pebB表达质粒;
(4)用基因工程方法,将藻红胆素生物合成酶基因pebA或其同源基因克隆于第四个表达载体中,得到pebA表达质粒;
(5)将beta裂合酶表达质粒、链霉亲和素标记的脱辅基蛋白表达质粒、hol和pebB表达质粒及pebA表达质粒依次转入配套的宿主菌,当这些表达质粒都转入宿主菌后,得到相应的工程菌,应用此工程菌通过发酵工程生产结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质;发酵后,按常规蛋白质提纯技术,提纯得到相应的结合藻红胆素的别藻蓝蛋白类荧光蛋白质。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的宿主菌为大肠杆菌。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的beta裂合酶基因是指与Anabaenasp.PCC7120中alr0617基因或Synechocystis sp.PCC6803中slr 2049基因同源的基因。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的别藻蓝蛋白类脱辅基蛋白基因是指与Anabaena sp.PCC7120或Synechocystis sp.PCC6803中别藻蓝蛋白基因同源的基因。
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2008
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Legal Events
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C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C14 | Grant of patent or utility model | ||
GR01 | Patent grant | ||
PE01 | Entry into force of the registration of the contract for pledge of patent right | ||
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Denomination of invention: Method for labeling allophycocyanin fluorescent proteins with streptavidin binding to phycoerythrin Effective date of registration: 20231130 Granted publication date: 20110420 Pledgee: Societe Generale Bank Limited by Share Ltd. Guangzhou branch Pledgor: GUANGZHOU TEBSUN BIO-TECH DEVELOPMENT Co.,Ltd. Registration number: Y2023980068589 |