CN101373186B - 癌症辅助诊断系统、信息提供方法及控制系统 - Google Patents
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Abstract
本发明提供一种包括以下结构的癌症辅助诊断系统:获取第一癌症患者相关测定值的测定值获取单元,存储非上述第一癌症患者的若干其他癌症患者的样品数据的样品数据存储器,根据上述测定值获取单元获取的上述第一癌症患者的相关测定值决定参照范围的范围决定单元,显示器,控制上述显示器显示辅助诊断画面的显示控制单元。本发明还提供一种癌症辅助诊断信息提供方法,包括以下步骤:测定值获取步骤,样品数据存储步骤,范围决定步骤,显示步骤。此外,本发明还提供一种计算机的控制系统。
Description
技术领域:
本发明涉及癌症辅助诊断系统、癌症辅助诊断信息提供方法及计算机的控制系统。
背景技术:
过去,提到癌症诊断,人们只知道检查血清中的肿瘤标记物的血清诊断方法和活检等组织诊断、细胞诊断。但是,这些方法可靠性很低,或各人的判断和医疗机构的判断有很大差异。因此,近年来,作为医生诊断差异很少的癌症的统一诊断方法,出现了一种基于在生物内表达的基因和蛋白质的分子诊断法。作为上述基于蛋白质的分子诊断,比如提出了各种利用周期素依赖性激酶等的方法(参照如国际公开第2005/116241号手册和国际公开第2003/078662号手册)。
根据国际公开第2005/116241号手册中记述的方法,测定由CDK1的活性值和表达量得出的比(CDK1比活性)和由CDK2的活性值和表达量得出的比(CDK2比活性),将CDK2比活性/CDK1比活性与预先设定的阈值比较,根据比较结果判断癌的恶性度。国际公开第2003/078662号手册上记述的方法则是:对照调控基因规范p53BP2基因、组织朊酶B基因、组织朊酶L基因、Ki67/MiB1基因、胸腺啶激酶基因、p27基因等一定基因或其表达产物的表达水平,预测与基准癌组织中发现的量比较的患者的临床结果。
在上述方法中,比较预设的一定阈值和参数的测定值,根据其比较结果预测癌症状态和临床结果。然而,这种方法即使在参数的测定值与阈值非常接近时也以阈值为基准进行判断。因此,比如实际上是复发性很高的临床标本,但因从临床标本获得的参数测定值仅比阈值低一点或高一点,有可能得出与实际不同的判断结果。在这种情况下,不能说用上述方法能够进行正确的判断,在癌症诊断中使用了这种判断结果,有可能无法做出正确的诊断。
发明内容:
本发明包括以下系统、方法和/或计算机的控制系统:
本发明提供一种癌症辅助诊断系统,包括:
获取第一癌症患者的测定值的测定值获取单元,其中该测定值是用采自上述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本,测定一定测定项目生成的测定值;
存储与上述第一癌症患者不同的若干癌症患者的相关样品数据的样品数据存储器,其中,该样品数据存储器包含用采自上述若干癌症患者的恶性肿瘤制备的各个标本测定上述一定测定项目生成的测定值和上述若干癌症患者分别摘除恶性肿瘤后的临床信息;
根据上述测定值获取单元获取的关于上述第一癌症患者的测定值决定参照范围的范围决定单元,其中,上述第一癌症患者的相关测定值在上述参照范围内;
显示器;及
控制上述显示器显示辅助诊断画面的显示控制单元,其中,辅助诊断画面中显示包括在上述参照范围内的测定值在内的样品数据中所包含的临床信息。
其中所述显示控制单元控制所述显示器将上述样品数据存储器中存储的样品数据中所含测定值和所述第一癌症患者的相关测定值与所述范围决定单元决定的参照范围一起显示在所述辅助诊断画面。
其中所述显示控制单元控制上述显示器在上述辅助诊断画面显示表现上述样品数据存储器中存储的样品数据所含测定值和所述第一癌症患者相关测定值的图形,并将所述范围决定单元决定的参照范围显示在上述图形上。
其中,前述一定测定项目至少含二种测定项目,所述图形是至少以二种测定项目为坐标的分布图。
所述系统,还包括:从所述样品数据存储器存储的样品数据中指定具有所述参照范围内的测定值的样品数据的样品数据指定单元;和分析所指定的样品数据的临床信息,生成分析结果的分析单元,其中,所述显示控制单元控制所述显示器显示上述分析结果。
其中所述分析结果包含癌症的复发率和/或癌症的复发风险和/或无病生存率。
其中,所述测定值含关于细胞周期蛋白质的表达和/或该细胞周期蛋白质活性的值。
其中所述细胞周期蛋白质为周期素依赖性激酶。
其中所述测定值为第一周期素依赖性激酶(第一CDK)的活性值与表达量之比和第二周期素依赖性激酶(第二CDK)的活性值与表达量之比。
所述系统中所述测定值获取单元还包括:获取第一CDK的活性值和表达量及第二CDK的活性值和表达量的活性值和表达量获取单元;及根据上述活性值和表达量获取单元获取的第一CDK的活性值和表达量算出第一CDK的活性值和表达量之比、根据上述活性值和表达量获取单元获取的第二CDK的活性值和表达量算出第二CDK的活性值和表达量之比的计算单元。
其中所述临床信息为关于癌症复发的信息。其中所述临床信息还包括有关术后治疗的信息和有关是否生存的信息。
所述系统,还包括测定装置,该装置用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本测定所述一定测定项目,获得该第一癌症患者相关的测定值。
本发明还提供一种癌症辅助诊断信息的提供方法,包括以下步骤:
获取关于第一癌症患者的测定值的测定值获取步骤,其中,该测定值为用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本测定所述一定测定项目生成的测定值;
存储关于与上述第一癌症患者不同的若干癌症患者的样品数据的样品数据存储步骤,其中,该样品数据包含:用采自上述若干癌症患者的恶性肿瘤制备的各标本测定所述一定测定项目生成的测定值和上述若干癌症患者分别摘除恶性肿瘤后的临床信息;
根据上述测定值获取单元获取的上述第一癌症患者相关的测定值决定参照范围的范围决定步骤,其中,上述有关第一癌症患者的测定值在该参照范围内;
在显示器上显示辅助诊断画面的显示步骤,其中,该辅助诊断画面上显示具有上述参照范围内测定值的样品数据中所含临床信息。
所述方法中在上述显示步骤中,将存储的样品数据中所含测定值和上述第一癌症患者相关测定值与上述参照范围一起显示在上述辅助诊断画面上。
其中,在上述显示步骤中,所述辅助诊断画面包含表现存储的样品数据中所含测定值和上述第一癌症患者相关测定值的图形,并且所述参照范围显示在该图上。
所述方法,还包括:样品数据指定步骤,即从所述存储的样品数据中指定有在所述参照范围内的测定值的样品数据;及分析步骤,分析上述指定样品数据的临床信息,生成分析结果,其中在所述显示步骤中显示该分析结果。
所述方法中所述临床信息为关于癌症复发的信息。其中所述临床信息还包括术后治疗的有关信息和是否生存的有关信息。
本发明再提供一种计算机的控制系统,包括:
一个计算机可读媒介;
在该计算机可读媒介上的一段指令,用于使计算机能够执行操作,包括:
获取关于第一癌症患者的测定值的测定值获取步骤,其中,该测定值为用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本测定所述一定测定项目生成的测定值;
存储关于与上述第一癌症患者不同的若干癌症患者的样品数据的样品数据存储步骤,其中,该样品数据包含:用采自上述若干癌症患者的恶性肿瘤制备的各标本测定所述一定测定项目生成的测定值和上述若干癌症患者分别摘除恶性肿瘤后的临床信息;
根据上述测定值获取单元获取的有关上述第一癌症患者的测定值决定参照范围的范围决定步骤,其中,上述第一癌症患者的相关测定值在该参照范围内;
在显示器上显示辅助诊断画面的显示步骤,其中,该辅助诊断画面上显示具有上述参照范围内测定值的样品数据中所含临床信息。
附图说明:
图1为本发明辅助诊断系统一实施方式的斜视示意图。
图2为图1所示辅助诊断系统中芯片放置器及固相蛋白质芯片的斜视示意图。
图3为图1所示辅助诊断系统中芯片放置器及固相蛋白质芯片的说明截面图。
图4为固相蛋白质芯片的上板条和下板条的分解示意图。
图5为将上板条装在下板条上的固相蛋白质芯片的斜视示意图。
图6为图1所示辅助诊断系统中活性测定单元的制样器的柱的截面示意图。
图7为图1所示辅助诊断系统中活性测定单元的制样器的斜视图。
图8为图7所示制样器的集流腔俯视图。
图9为图8D-D箭头方向的截面视图。
图10为图7所示制样器的液体流路图。
图11为辅助诊断系统的部分结构(控制辅助诊断系统的控制系统)的框图。
图12为数据处理装置的硬件结构框图。
图13为主机控制器的硬件结构框图。
图14为细胞周期的概要示意图。
图15为辅助诊断系统处理过程一例的全部流程图。
图16为辅助诊断系统处理过程一例的全部流程图。
图17为表达量测定用试样制备过程一例的流程图。
图18为活性测定用试样制备过程一例的流程图。
图19为辅助诊断系统分析处理过程一例的全部流程图。
图20为辅助诊断系统分析处理过程一例的全部流程图。
图21为辅助诊断信息显示画面的例示图。
图22为辅助诊断信息显示画面的例示图。
图23为辅助诊断系统中标本等使用顺序的示意图。
图24为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图25为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图26为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图27为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图28为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图29为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图30为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
图31为辅助诊断系统提供的辅助诊断信息的例示图。
具体实施方式:
下面,参照附图详细说明本发明的癌症辅助诊断系统(以下也简称为“辅助诊断系统”)的实施方式。本实施方式的辅助诊断系统可以根据待诊断癌症患者的恶性肿瘤的一定测定项目的测定值、以及其他癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值与这些其他癌症患者恶性肿瘤摘除后的临床信息相对应的样品数据,提供帮助癌症诊断的信息。
所谓恶性肿瘤指浸润或转移到其他组织、在身体各处增大从而威胁生命的肿瘤。恶性肿瘤中包含来源于上皮组织的恶性肿瘤—癌和来源于非上皮组织的恶性肿瘤—肉瘤。上述恶性肿瘤具体来说有在乳房、肺、肝脏、胃、大肠、胰脏、子宫、精巢、卵巢、甲状腺、副甲状腺、淋巴系统等位置出现的恶性肿瘤。另外,恶性肿瘤可以从患有乳腺癌、肺癌、肝癌、胃癌、大肠癌、胰腺癌、前列腺癌等癌症患者身上采集。
本实施方式的辅助诊断系统可以提供测定值与待诊断癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值近似的其他癌症患者的临床信息作为对上述待诊断癌症患者进行诊断的辅助信息(以下也称“癌症辅助诊断信息”)。辅助诊断系统提供的临床信息包括比如具有上述参照范围内测定值的其他癌症患者有无复发的信息。辅助诊断系统还可以提供根据具有上述参照范围内测定值的其他癌症患者有无复发的信息计算出的复发率和无病生存率等信息作为上述临床信息。
本实施方式的辅助诊断系统还可根据对待诊癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值判断癌症的恶性度,并将该判断结果与上述其他癌症患者的临床信息一起作为癌症辅助诊断信息提供。作为癌症恶性度,具体而言有转移机率、复发机率及预后情况等。
在本实施方式的辅助诊断系统中测定的上述一定测定项目无特别限定,只要是关于恶性肿瘤中基因和/或蛋白质的测定项目均可,基因和蛋白质的的种类以及测定项目种类可根据癌症的种类和提供的辅助诊断信息等适当选择。
作为上述一定测定项目,比如有国际公开第1999/042821号手册、国际公开第2000/001845号手册、美国专利申请公开第2002-164673号公报、国际公开第2005/116241号手册等记述的关于CDK的测定值。作为该关于CDK的测定值,具体而言比如有CDK表达量、CDK活性值、CDK活性值与表达量之比(如比活性、上述比活性的倒数等)等。除CDK外,也可以将专利公开2005-58113号公报、专利公开2006-223303号公报和国际公开第2003/078662号手册等用于预测癌症复发风险的基因表达量作为一定测定项目。
下面,以测定采自癌症患者的恶性肿瘤中CDK表达量和活性值,根据所得测定值提供有关癌症恶性度(复发率)信息的辅助诊断系统为例,就本实施方式的辅助诊断系统进行说明。
在说明该辅助诊断系统之前,首先就[1]CDK在癌症诊断中的作用进行说明。
[1]CDK在癌症诊断中的作用
关于周期素依赖性激酶(CDK)的测定值能正确反映恶性肿瘤在癌症患者的状态。因此,测定含有恶性肿瘤的组织中的二种以上周期素依赖性激酶的表达量和活性值,就可根据比如第一周期素依赖性激酶(第一CDK)的活性值和表达量之比及第一周期素依赖性激酶(第二CDK)的活性值和表达量之比评价含有该恶性肿瘤的组织的性质、癌症复发率等。关于CDK的测定值在患有类似状态的恶性肿瘤的癌症患者中,分别显示类似的测定值。因此,测定含有恶性肿瘤的组织中的二种以上周期素依赖性激酶的表达量和活性值,就可根据比如第一周期素依赖性激酶的活性值和表达量之比及第二周期素依赖性激酶的活性值和表达量之比诊断含有该恶性肿瘤的组织的性质、癌症复发率等。
如此,作为有关CDK的测定值,比如可以使用某组织具有的至少一种CDK的活性值和表达量之比(如比活性等)和/或用若干CDK活性值和表达量算出的数值[比如:第一CDK的活性值和表达量之比(A1)与第二CDK的活性值和表达量之比(A2)的比(如“A1/A2”或“A2/A1”)等]。
在此,所谓复发是指为了摘除恶性肿瘤而部分切除脏器后,残存脏器再次出现同样的恶性肿瘤;以及肿瘤细胞从原病灶分离到远处组织(远处脏器),在那里自立增殖(转移复发)。一般摘除手术后五年内可能复发的癌症视为“易复发”。因为5年内被确认复发的患者的死亡率很高,因此,预测摘除手术后五年内的复发具有临床意义。比如,若按期分类的话,III期复发率为50%,比II期(复发率20%)易复发。
所谓周期素依赖性激酶是与周期素结合被激活的磷酸化酶群的总称,根据不同种类在细胞周期的不同时期发挥作用。所谓CDK抑制剂是结合到周期素和CDK复合物中抑制周期素和CDK复合物活性的因子群总称。
在此,所谓细胞周期是细胞从开始增殖,经过DNA复制、染色体分配、核分裂、细胞质分裂等过程到分裂成二个子细胞回到起点的循环周期,细胞周期如图14所示,分为G1期、S期、G2期和M期四期。S期为DNA的复制期,M期为分裂期。G1期是从有丝分裂完成到DNA合成开始的一段时间,是细胞进入S期的准备检查期。一过G1期的临界点(在动物细胞中为R点),细胞周期即启动,通常途中不停顿地进行一周。G2期是DNA合成结束到有丝分裂开始的一段时间,是细胞进入M期的准备检查期。细胞周期的主要检验点是从G1期进入S期的前一刻(G1检验点)和从G2期向有丝分裂的过渡期(G2/M检验点)。特别是G1检验点关系到S期的开始,因此至关重要。因为一过G1期的某一点,细胞即使没有增殖信号也会不停顿地增殖,S期→G2期→M期→G1期进行细胞周期。另外,停止增殖的细胞会进入一个保持G1期的DNA含量的休眠期(G0期),处于脱离细胞周期的状态,在G0期的增殖诱导的作用下可比细胞周期内的G1期略长一点时间后进入S期。
在上述判断方法中使用的周期素依赖性激酶(CDK)无特别限定,比如有CDK1、CDK2、CDK4、CDK6等。上述CDK还包含属于周期素A依赖性激酶的CDK、属于周期素B依赖性激酶的CDK、属于周期素D依赖性激酶的CDK和属于周期素E依赖性激酶的CDK等。周期素A依赖性激酶只要是与周期素A结合显示活性的CDK即可,无特别限定,如有CDK1和CDK2等。周期素B依赖性激酶只要是与周期素B结合显示活性的CDK即可,无特别限定,如有CDK1等。周期素D依赖性激酶只要是与周期素D结合显示活性的CDK即可,无特别限定,如有CDK4、CDK6等。周期素E依赖性激酶只要是与周期素E结合显示活性的CDK即可,无特别限定,如有CDK2等。
这些CDK如表1所示,与各自对应的周期素结合形成周期素·CDK复合物(以下也称“活性型CDK”),激活表1所列细胞周期的一定时期。例如,CDK1与周期素A或B、CDK2与周期素A或E、CDK4和CDK6与周期素D1、周期素D2或周期素D3结合,生成活性型CDK。另一方面,CDK的活性有时会受到表1所列CDK抑制剂的抑制。例如,p21抑制CDK1和CDK2,p27抑制CDK2、CDK4、CDK6,p16抑制CDK4和CDK6。
[表1]
CDK | 结合的周期素 | 结合的CDK抑制剂 | 活性型CDK的作用期 |
CDK4CDK6 | 周期素D1周期素D2周期素D3 | P27、P16 | G1期 |
CDK2 | 周期素E | P27 | G1期→S期 |
CDK2 | 周期素A | P21、P27 | 激活S期 |
CDK1 | 周期素A周期素B | P21 | G2期→M期 |
周期素A依赖性激酶 | 周期素A | P21、P27 | CDK1:G2期→M期CDK2:S期中期 |
周期素B依赖性激酶 | 周期素B | P21 | CDK1:G2期→M期 |
周期素D依赖性激酶 | 周期素D | P27、P16 | CDK4、CDK6:G1期 |
在上述CDK中,分别测定二种以上CDK的表达量和活性值,求在各种CDK中表达量和活性值的比(即下面式子中表示的CDK比活性或其倒数)。
CDK比活性=CDK活性值/CDK表达量
所谓CDK活性值指与特定周期素结合使多少底物磷酸化这一激酶活性的水平(单位以U(Unit)表示)。作为上述CDK磷酸化的底物,比如对于活性型CDK1和活性型CDK2来说,有组蛋白H1,对于活性型CDK4和活性型CDK6来说,有Rb(视网膜母细胞瘤)。上述CDK活性值可以用历来为人所知的酶活性测定法进行测定。具体而言,可以从测定试样的细胞溶液中制备含活性型CDK的试样,使用该试样和32P标记ATP(〔γ-32P〕ATP)将32P放入底物蛋白质中测定被32P标记的磷酸化底物的标记量,以标准品绘制的校准曲线为基准进行定量。作为不使用放射性物质标记的方法,如有专利公开2002-335997号公报上公开的方法等。此方法为,从测定试样的细胞溶液制备含目标活性型CDK的试样,使腺甙5’-O-(3-硫代磷酸三甲酚酯)(ATPγS)与底物蛋白质反应,将一元硫代磷酸基加入该底物蛋白质的丝氨酸残基或苏氨酸残基,让标记荧光物质或标记酶与加入的一元硫代磷酸基中的硫磺原子结合,从而标记底物蛋白质,测定基于被标记的硫代磷酸基的标记量(用标记荧光物质时为荧光量),根据以标准品绘制的校准曲线加以定量。
供测定活性的试样通过从被测恶性肿瘤的组织溶解液特异性采集目标CDK来制备。此时,也可用对目标CDK有特异性的抗CDK抗体制备,因此,测定一定周期素依赖性激酶(比如:周期素A依赖性激酶、周期素B依赖性激酶和周期素E依赖性激酶)的活性时,可用抗CDK抗体制备。无论什么情况下都会有活性型CDK以外的CDK含在试样中。比如还含有CDK抑制剂与周期素·CDK复合物结合形成的复合物。在使用抗CDK抗体的情况下,会包含CDK单体、CDK与周期素及/或CDK抑制剂的复合物、CDK与其他化合物的复合物等。因此,活性值是在活性型、非活性型、各种竞争反应混在的状态下作为磷酸化的底物单位(U)来测定的。
所谓CDK表达量是从细胞溶液测定的目标CDK量(对应于分子个数的单位),可以通过众所周知的从蛋白质混合物测定目标蛋白质量的方法测定。比如,可以使用酶联免疫吸附剂测定法(ELISA法)和免疫印迹法(Westernblot),也可以用专利公开2003-130871号公开的方法测定。目标蛋白质(CDK)用特异抗体捕捉即可。比如,用抗CDK1抗体可以捕捉到存在于细胞内的CDK1全部(包括CDK单体、CDK与周期素及/或CDK抑制剂的复合物、CDK与其他化合物的复合物)。
因此,用上述算式计算出的比活性相当于细胞内的CDK中显示活性的CDK比率,可以说是基于待鉴定恶性肿瘤细胞的增殖状态的CDK活性水平。如此求得的CDK比活性不依赖测定试样制备方法。特别是从活检材料制备的测定试样(细胞液)易受实际采集的组织中所含非细胞性组织、比如细胞外底物的多寡的影响,因此使用消除了这种影响的比活性或其倒数的意义重大,比起过去的单纯活性值来说,与临床性质相关性更高。
通过了解含有二种以上的CDK比活性或其倒数,就可知道哪个CDK活性更活跃,从而得知哪个时期的细胞比例为多少或哪个时期的细胞比例更占优势等。
测定比活性的CDK种类无特别限定,适当选择即可。癌细胞往往逃避正常增殖控制而增殖活跃,因此,可设想在S期和G2期的细胞比例较高。此时可认为组织正在癌变。这种癌症进行快可以说为恶性。还有,非整倍性一般认为在经过异常的M期或未经M期直接经G1期进入S期时发生,因此存在于M期的细胞比例少也可以说表示上述癌症为恶性。因此,使用CDK1为第一周期素依赖性激酶,用CDK2为第二周期素依赖性激酶,按CDK1比活性的大小分群,在具有类似CDK1比活性的群中,CDK2比活性的值即为反映S期细胞比率的值。S期内的细胞多,则可鉴定该细胞构成的组织临床上为恶性,即为易转移、预后不良的恶性癌。
从上述得知,在本实施方式的辅助诊断系统中,可以通过对待诊癌症患者求二种以上CDK比活性,提供具有与该癌症患者的CDK比活性近似的CDK比活性的其他癌症患者的临床信息,从而提供有助于对上述待诊断癌症患者做出诊断的信息。
[2]辅助诊断系统
下面就本发明一实施方式的辅助诊断系统进行说明。本实施方式的辅助诊断系统使用上述CDK1比活性和CDK2比活性作为一定测定项目的测定值。具体而言,本实施方式的辅助诊断系统获取受检癌症患者的CDK1和CDK2的表达量和活性值。从获取的CDK1和CDK2的表达量和活性值算出CDK1比活性和CDK2比活性。再根据算出的CDK1比活性和CDK2比活性决定参照范围。从预先存储的其他癌症患者的样品数据中,检索并指定具有在上述参照范围内的CDK1比活性和CDK2比活性的其他癌症患者的样品数据。然后,根据指定的样品数据计算出复发率,再根据算出的复发率判断复发风险。最后,生成包含算出的复发率结果和复发风险的判断结果的画面,将生成的画面显示在显示器上。
图1为本发明一实施方式的辅助诊断系统的斜视示意图。本实施方式的辅助诊断系统由测定装置A和增溶装置B构成。测定装置A由测定装置501和数据处理装置12构成。测定装置501用于测定CDK1的活性值和表达量及CDK2的活性值和表达量,主要由以下部分构成:配置在装置主体20前面的检测器4、芯片放置器1、第一试样设置器5及第二试剂设置器6、配置于装置主体20后面的活性测定单元2、回收废液的废液槽7和清洗吸移管的吸移管清洗槽8、配置于装置主体20上方可以向3个方向(X方向、Y方向和Z方向)移动吸移管的分装设备3、配置于装置主体20背面的流动室9及主机控制器10。上述数据处理装置12与主机控制器10可进行通信连接。测定装置A还设有纯水箱13、清洗剂箱14、废液箱15和真空气压源11。纯水箱13存储有测定结束时清洗流路用纯水,通过配管21连接到流动室9,清洗剂箱14存储有清洗吸移管的清洗剂,通过配管22连接到吸移管清洗槽8,回收废液的废液箱15通过配管23与废液槽7连接。在本实施方式的辅助诊断系统中,测定装置A同时设有增溶装置B,用来从生物试样获取上述测定装置A能处理的标本。
下面按顺序说明增溶装置B和测定装置A。
[增溶装置]
增溶装置B先于测定装置A处理,从采集自患者切除的组织等生物试样制备测定装置A可处理的液态标本,它主要由机箱30、配置在机箱30前上方的操作部分31、具有一对杵34用来推挤、碾碎上述生物试样的驱动器32和用于放置装上述生物试样的容器35的标本放置器33构成。
上述驱动器32可以上下驱动杵34同时作旋转运动,以此推挤、碾碎装在容器35内的生物试样。上述机箱30内内置控制上述驱动器32动作的控制器(无图示)。
上述操作部分31配置有操作按钮31a、运转灯31b、显示装置状态和故障信息的显示屏31c。标本放置器33内设有无图示的冷却设备,使设置在该标本放置器33上面凹处的容器内的生物试样保持一定的温度。
通过增溶装置B溶解、再经无图示的离心分离器离心分离处理的生物试样的上清液被采集到一定标本容器,放置到测定装置A的第一试剂放置器5。
[第一试剂放置器]
第一试剂放置器5内置有与上述标本放置器33一样的无图示的冷却设备,使放置在该第一试剂放置器5上面凹处的容器内的标本、CDK1抗原(校准品1)和CDK2抗原(校准品2)、荧光标记CDK1抗体和荧光标记CDK2抗体等保持一定温度。在本实施方式中,设有纵5列、横4行共计20个凹处,能够放置最多20个容器。
[第二试剂放置器]
紧挨上述第一试剂放置器5设有第二试剂放置器6。此第二试剂放置器6与上述第一试剂放置器5一样,有若干凹处,这些凹处内用于放置添加了缓冲液、底物溶液、荧光增强剂等溶液的容器。
在测定装置A进行处理前,先将固相蛋白质芯片置于芯片放置器1,同时将柱放于活性测定单元2。
[芯片放置器]
芯片放置器1由铝制印版构成,如图2~3所示,上面有承载固相蛋白质芯片101用的第一凹部102,底部有三个吸移口103。更详细地说,芯片放置器1上面有长方形的第一凹部102、此第一凹部102底部有三个同样长方形的第二凹部104。此第二凹部104由隔壁105间隔,彼此独立,当上述固相蛋白质芯片101放在芯片放置器1上时,互相为不连通的状态。上述第一凹部102底部上述第二凹部104的边缘处铺设有长方框形的橡胶制弹性垫圈106。
上述第二凹部104其底部有十字形槽107,底部中心有吸移口103。该槽107的槽底由第二凹部104四周向中心倾斜,越来越深。吸移口103与用于连接外部吸移用真空气压源11的管接头108连通。一端接上述吸移用真空气压源11的软管109,其另一端连接在此管接头108上。软管109配置有开关阀110。
后面有待详述的固相蛋白质芯片101通过第一凹部102的底部垫圈106找平。当含有蛋白质的试样溶液注入或滴入固相蛋白质芯片101的各池后,吸移泵开始工作。
如此,固相蛋白质芯片101通过垫圈106气密性地吸附在第一凹部102的底面,同时各池内的试样溶液通过后述多孔质膜被吸移,待测蛋白质即在该多孔质膜形成固相。另外,在图2~3,130为推压器件,用于将固相蛋白质芯片101推到第一凹部102的底部加以固定。此推压器件130在固相蛋白质芯片101放置到第一凹部102上后,向图中箭头方向滑动,其上部从上面推压固相蛋白质芯片101,将其固定于第一凹部102。
上述固相蛋白质芯片101如图4~5所示,由多孔质膜111和滤纸112、夹持这些多孔质膜111和滤纸112的上板条113和下板条114构成。此固相蛋白质芯片101有让含周期素依赖性激酶抗体的抗体溶液与生物试样(标本)接触的功能。
如图4~5所示,上板条113由三个互相独立的板条、即第一上板条113a、第二上板条113b、第三上板条113c构成。各上板条呈长方平板形,第一上板条113a和第二上板条113b均开有12个排列成4行3列矩阵的长圆形贯通孔115,第三上板条113c开有16个长圆形贯通孔115,同样排列成4行4列矩阵。各上板条有数个贯通孔组成的相互独立的区域,用于处理试样。各上板条底面沿短边有槽116。
另一方面,长方形板的下板条114在与上述上板条113a、113b和113c的各贯通孔115对应的位置分别开有排列成矩阵的共计40个长圆形贯通孔117。贯通孔117有与贯通孔115同样的形状和截面积。下板条114有与上述上板条113a、113b和113c各区域对应的数个贯通孔组成的区域。
下板条114的上面有绕40个贯通孔117一周的垄形凸部118和与上板条113a、113b和113c各区域对应将贯通孔117划分为三个区域的间隔壁119。由上述凸部118和间隔壁119在其内侧划分出三个长方形多孔质膜设置区。上述上板条113和下板条114可用比如氯乙烯树脂等制作。
如图2~5所示,下板条114的多孔质膜设置区域可以放置多孔质膜111和滤纸(过滤膜)112的叠层板,然后将各上板条113a、113b和113c的槽116嵌入逐一对应的下板条114的凸部118,使上板条113a、113b和113c装配于下板条114,即可形成固相蛋白质芯片101。这样,各贯通孔115与各贯通孔117为同轴配置。
上述固相蛋白质芯片其上板条113被划分为三个区域,可分别吸移三个区域,但上板条的数量可以是二个,也可以是四个以上,本发明无特别限定。可考虑测定项目数和标本数量适当选定。
[活性测定单元]
活性测定单元2如图6~10所示,由分别具有柱201和集流腔213的数个制样器211组成,用于测定CDK活性值。
图6所示柱201为氯乙烯树脂制圆筒结构,内部有固定用于萃取液体试样中的目标物的载体206的载体固定器202和用于盛放导入该载体固定器202的液体试样的贮液器204。上述柱201其贮液器204上方有一可从外部注入或抽取液体试样的开口205,载体固定器202下端有连接流路203,可以向集流腔213导入液体试样,同时从集流腔213吸入液体试样。上述柱201构成了让含有一定底物的底物溶液与生物试样(标本)接触的手段。
载体206由圆柱形单硅胶构成,该单硅胶与粒子载体不同,结构为三维网络状框架及其空隙交织为一体。单硅胶上固定有一定CDK抗体。载体206从柱201下端开口处插入载体固定器202,通过O环207靠固定用管208的弹力挤压支撑。上述固定用管208从柱201下端开口处挤入,固定用管208与O环207的孔形成连接流路203。
柱201下端有装填用法兰盘209,用于将该柱201装填到上述制样器211加以固定。此法兰盘209为将直径D的圆盘状法兰盘两侧平行切削宽度W(W<D)形成的长圆形法兰盘。
图7为制样器211的斜视图,如该图所示,制样器211有一L字形支板212,此支板212上固定有集流腔213、注射泵214和带减速器的步进式电机215。
步进式电机215的输出轴上接有螺旋轴216,拧在此螺旋轴216上的驱动臂217连在注射泵214的活塞218前端。螺旋轴216在步进式电机215的驱动下旋转,则活塞218上下运动。注射泵214和集流腔213由送液管250通过连接器219和220连接。注射泵214通过连接器220a由送液管220b与盛放着用于注满流路的液体(清洗液)的容器234(参照图10)连接。
如图8~9所示,集流腔213有一连接上述柱201下开口的柱连接器221。
集流腔213内部有流路223,下面有负责流路223和柱连接器221之间开关的电磁阀225。集流腔213侧面有用于连接连接器220的连接器连接用螺芯池226,此螺芯池226接到流路223上。
图10为制样器211的液体流路图,显示了注射泵214通过连接器220连接到集流腔213的状态。注射泵214上还通过电磁阀233连接容器234,该容器234由正压源235施加正压。
在此,就将柱201填充到集流腔213的方法进行说明。
如图8~10所示,集流腔213的上面有嵌入柱201下端的填柱用凹部227,此凹部227的底部中央直通柱连接器221,同时底部四周装有O环228。集流腔213上面以填柱用凹部227为中心,以宽于上述幅宽W、窄于D的间隔平行固定有二片截面呈L字形的压板229、230。
为防止从固定在集流腔213的柱201内的载体206通过的标本或试剂与冲灌集流腔213内流路223的液体(清洗剂)接触而被稀释,在将柱201固定于填柱用凹部227之前先打开电磁阀225(电磁阀233为关闭),仅让注射泵214吸移约16μL。由此,柱连接器221的液面下降,形成气隙。
此后再将柱201装填到填柱用凹部227,使法兰盘209从压板229、230之间通过,顺时针或逆时针旋转90度。则法兰盘209直径D的部分触及到压板229、230,靠O环228的弹性,法兰盘209被压板229、230固定。拆除柱201时,只要按着柱201向左右任一方向旋转90度即可。
柱201装填到制样器211的集流腔213时,为防止气泡混入,该集流腔213的凹部227被手动或自动分装的液体充满,但是只要将柱201的前端插入凹部227,其体积就会使液体溢出。为防止此液体流向四周,填柱用凹部227的周围设有溢液存储凹部231,溢液存储凹部231的一部分设有用吸移器吸排溢液的溢液排出凹部232。
各种标本或试剂通过装有吸移管的分装设备3向指定地方或从指定地方吸入或排出。
在此,就从柱201上开口205注入标本或试剂时的操作进行说明。向开口205注入标本或试剂时,首先电磁阀225打开(电磁阀233关闭),注射泵开始吸移操作。这样,气隙和标本或试剂就通过电磁阀225吸移到注射泵一侧。然后注射泵开始排出操作。这样,标本或试剂就通过电磁阀225被送到柱201内。
[分装设备]
分装设备3如图1所示,包括吸移管向X方向移动用框架352、吸移管向Y方向移动用框架353和吸移管向Z方向移动用移动板354。
框架352有向箭头X方向移动移动板354的螺旋杆355、支撑并振动移动板354的导向横杆356和旋转螺旋杆355的步进式电机357。
框架353有向箭头Y方向移动框架352的螺旋杆358、支撑并振动框架352的导向横杆359和旋转螺旋杆358的步进式电机361。
移动板354有向箭头Z方向移动固定吸移管362的臂368的螺旋杆367、支撑并振动臂368的导向横杆及旋转螺旋杆367的步进式电机370。
在本实施方式中,因分装设备3具有一对吸移管362,故可以同时向二个标本容器中注入试剂等,或同时从二个标本容器中吸移其中内容,从而可以高效进行测定处理。
[流体部分]
装置主体20的背面如图1所示,配置有清洗上述吸移管362的吸移管清洗槽8和连接各制样器211对流体进行操作的流动室9。此流动室9如图10所示,包含:各制样器211的电磁阀225、从清洗剂舱向注射器214填充液体时控制液体的电磁阀233、吸移管362吸排液体时控制液体的电磁阀、从废液槽7吸移被吸移管362废弃的液体时控制液体的电磁阀以及在清洗槽8清洗吸移管362时控制液体的电磁阀。
[检测器]
检测器4用于测定反映被固相蛋白质芯片101的多孔质膜111捕捉到的蛋白质量的基于所结合的荧光标记物的荧光量以及反映磷酸基量的基于荧光标记物的荧光量,向上述固相蛋白质芯片101照射励起光,检测发出的荧光,向主机控制器10输出与检出的荧光强度相应大小的电子信号。作为检测器4可以适当采用由通用的光源、照明系统和集光系统构成的仪器。
[数据处理装置]
图11为本实施方式的辅助诊断系统的部分结构(控制辅助诊断系统的控制系统)的框图。电脑数据处理装置12如图11所示,有控制器77、输入设备78及显示器79。
控制器77具有后述向主机控制器10传输装置开始运行信号的功能。当运行开始指令由控制器77传出时,主机控制器10发出驱动各制样器211的步进式电机215的驱动信号、第一试剂放置器5调温的驱动信号、驱动步进式电机357、361和370的驱动信号以及驱动在流动室9的电磁阀的驱动信号。控制器77具有分析检测器4得出的检测结果的功能。检测器4得出的检测结果被输送到主机控制器10。主机控制器10向控制器77输送检测器4得出的检测结果。
显示器79用于显示控制器77得出的分析结果等。
下面,就作为数据处理装置12使用的个人电脑结构进行详细说明。控制器77如图12所示,主要由CPU91a、ROM91b、RAM91c、输出输入接口91d、图像输出接口91e、通信接口91f和硬盘91g构成。CPU91a、ROM91b、RAM91c、输出输入接口91d、图像输出接口91e和通信接口91f、硬盘91g用电信号线(总线)连接,可输送电信号。
CPU91a可执行存储在ROM91b的计算机程序和读到RAM91c中的计算机程序。CPU91a通过执行后述应用程序91h,实行后述操作,让电脑发挥数据处理装置12的功能。
ROM91b由掩膜ROM、PROM、EPROM、EEPROM等构成,存储由CPU91a执行的计算机程序及其所用数据等。
RAM91c由SRAM或DRAM等构成,用于读取存储在ROM91b和硬盘91g的计算机程序。还可以作为CPU91a执行这些计算机程序时的工作空间。
硬盘91g装有操作系统和应用程序等供CPU91a执行的各种计算机程序以及执行计算机程序所需的数据。应用程序91h也装在这个硬盘91g中。此应用程序91h用于取得CDK1和CDK2的表达量和活性值,从取得的CDK1和CDK2的表达量和活性值算出CDK1比活性和CDK2比活性,根据算出的CDK1比活性和CDK2比活性决定参照范围,指定具有在所定参照范围内的CDK1比活性和CDK2比活性的其他癌症患者的样品数据,根据指定的样品数据算出复发率,根据算出的复发率判断复发风险,生成包含算出的复发率结果和复发风险的判断结果的画面,将生成的画面显示在显示器79。
为了获取上述表达量和活性值,上述硬盘91g还含有第一数据库91i,用于存储作为将荧光强度转换为表达量或活性值用的转换数据的校准曲线。校准曲线也可以在每次测定表达量或活性值时求得。硬盘91g的第一数据库91i存储有决定上述参照范围时计算用的数据、参照范围的默认值的数据和过去输入使用的参照范围设定值的数据。硬盘91g的第一数据库91i还存储有用于通过与算出的复发率比较判断复发风险的基准值。
硬盘91g含有用于存储样品数据的第二数据库91j,样品数据中癌症患者的上述活性值和表达量等测定值与该患者的有无复发、术后治疗等信息、有关生存的信息等临床信息是对应的。
硬盘91g比如装有美国微软公司生产的windows(注册商标)等提供图形用户界面的操作系统。在以下说明中,本实施方式的应用程序91h均在上述操作系统上执行。
输出输入接口91d由比如USB、IEEE1394、RS-232C等串行接口、SCSI、IDE、IEEE1284等并行接口和由D/A转换器和A/D转换器等组成的模拟信号接口构成。输出输入接口91d连接有输入设备78,用户可以用输入设备78直接向数据处理装置12输入数据。
通信接口91f比如可以是以太网(Ethernet(注册商标))接口。数据处理装置12通过该通信接口91f可以使用一定的通信协议与主机控制器10之间进行数据传输。
图像输出接口91e与由LCD或CRT等构成的显示器79连接,将与从CPU91a接收的图像数据相应的映象信号输出到显示器79。显示器79按照输入的映像信号显示图像(画面)。
[主机控制器]
装置主体20的背部配置有连接并控制各制样器211、检测器4、步进式电机357、361、370和流动室9等的主机控制器10。
主机控制器10如图13所示,有CPU301a、ROM301b、RAM301c、通信接口301d、电路301e。
CPU301a可以执行存储于ROM301b的计算机程序和读到RAM301c的计算机程序。
ROM301b用于存储由CPU301a执行的计算机程序及其所用数据等。
RAM301c用于读取存储在ROM301b的计算机程序。还可以作为CPU301a执行这些计算机程序时的工作空间。
通信接口301d比如是以太网(Ethernet(注册商标))接口。主机控制器10通过该通信接口301d可以使用一定的通信协议与数据处理装置12之间进行数据传输。
电路301e有若干驱动电路和信号处理线路(无图示)。驱动电路分别与各制样器211、检测器4、步进式电机357、361、370和流动室9等对应设置。各驱动电路根据CPU301a传输的指示数据,生成控制相应单元(如果是对应于制样器211的驱动电路,则为制样器211)的控制信号(驱动信号),向上述单元发送控制信号。设于单元的传感器的输出信号传送至驱动电路,驱动电路将此输出信号转换成数字信号,向CPU301a传输。CPU301a根据收到的传感器输出信号,生成上述指示数据。
信号处理线路连接检测器4。检测器4输出表示荧光强度的检测信号,此检测信号传送到信号处理线路。信号处理线路对检测信号进行除噪处理、放大处理和A/D转换处理等信号处理。信号处理后得出的检测结果数据传送至CPU301a。
[3]癌症的辅助诊断
下面说明本实施方式的辅助诊断系统的运行过程。
(1)用增溶装置B进行前处理
在用测定装置A处理之前,先用增溶装置B从采自癌症患者的含恶性肿瘤的切除组织中采集液体标本。其顺序是:先用镊子将上述组织放入容器。再将该容器置于图1所示增溶装置B的标本放置器33,按操作部分31的开始按钮,则杵34下降到规定位置,将容器内的组织推到该容器底部。
在这种状态下,自动或手动向容器内注入(含有表面活性剂和蛋白质分解酶抑制剂等的缓冲液等)增溶剂。然后,转动杵34将上述组织捣烂。经过一定时间后停止转动杵34,提起该杵34,从标本放置器33取出容器。再将容器内增溶过的物质用离心分离机分离,手动采集所得上清液作为试样。
(2)标本等安置到测定装置A
将上述上清液装入二个标本容器,以不同的稀释倍率稀释后将该标本容器放置到第一试剂放置器5的规定位置。二个试样中,一个是测定表达量用试样,另一个是测定活性值用试样。
将上述固相蛋白质芯片101置于芯片放置器1上,同时将八个柱201分别放置到活性测定单元2的制样器211上。
(3)辅助诊断系统的处理全流程
辅助诊断系统处理的全部流程如图15~图20所示。在以下流程图的判断中,无图示“是”和“否”时,下为是,右(左)为否。以下说明的处理全部为受控制器77和主机控制器10控制的处理。
首先,一接通装置主体20的电源,则进行主机控制器10的初始化处理(步骤S1)。在此初始化处理中,进行程序的初始化和装置主体20的驱动部分复位等。
接通电脑数据处理装置12的电源,进行控制器77的初始化(步骤S201)。在此初始化处理中,进行程序的初始化等。初始化完成后,显示器79出现包括用于下达显示输入画面指示的输入画面显示按钮在内的菜单窗口(无图示)。用户可操作输入设备78选择菜单窗口的指示显示输入画面的输入画面按钮。
然后,在步骤S202,数据处理装置12的控制器77判断是否显示出输入用画面。控制器77如果判断输入画面已显示(是),则进行步骤S205的处理,如果判断尚未显示输入画面(否),则进行步骤S203的处理。
在步骤S203,数据处理装置12的控制器77判断是否有显示输入画面的指示(即是否在菜单窗口选择了用于下达显示输入画面指示的输入画面按钮)。控制器77如果判断有显示输入画面的指示(是),则进行步骤S204的处理,如果判断没有显示输入画面的指示(否),则进行S301的处理。
在步骤S204,数据处理装置12的控制器77在显示器79显示输入画面。
在步骤S205,用户操作输入设备78输入受检癌症患者的ID号和年龄等标本信息。然后在步骤S206,输入设备78输入的信息存入硬盘91g。用户操作数据处理装置12的输入设备78选择显示在输入画面上的开始按钮,下达开始测定指示。
接着,在步骤S207,控制器77判断是否有开始测定的指示。控制器77如果判断有开始测定的指示(是),则进行步骤S208的处理,如果判断没有开始测定的指示(否),则进行S301的处理。在步骤S208,测定开始信号由控制器77送往主机控制器10。
接下来,在步骤S2,主机控制器10判断是否收到测定开始信号。主机控制器10如果判断收到测定开始信号(是),则进行步骤S3的处理,如果判断未收到测定开始信号(否),则进行S8的处理。
步骤S3进行表达量测定用试样的制备处理。在此步骤S3,从放置在第一试剂放置器5的标本容器中吸移标本。对所吸标本进行一定的处理,制备表达量测定用试样。
步骤S4进行活性测定用试样的制备处理。在此,从放置在第一试剂放置器5的标本容器中吸移标本。对所吸标本进行一定的处理,制备活性测定用试样。
在步骤S5,放置有含表达量测定用试样和活性测定用试样的固相蛋白质芯片101的芯片放置器1从图1所示位置移动到检测器4中。
在步骤S6,向固相蛋白质芯片101各池照射励起光,检测上述各试样发出的荧光。
在步骤S7,检出的检测结果由主机控制器10输送到数据处理装置12的控制器77。
接下来,在步骤S209,由控制器77判断是否收到检测结果。控制器77如果判断收到检测结果(是),则进行步骤S210的处理。另一方面,如果没有收到检测结果,控制器77则再次进行步骤S209的处理。
在步骤S210,由控制器77根据取得的检测结果进行分析处理。
在步骤S211,步骤S210算出的复发率的结果和判断的复发风险的结果等由控制器77输出,并显示在显示器79。
辅助诊断信息的显示画面如图21和图22所示。
在图21所例示的显示画面上,显示区401用于显示作为诊断对象的癌症患者的ID号、年龄等。信息显示区402用于显示CDK1比活性和CDK2比活性的值,作为待诊断癌症患者的恶性肿瘤的一定测定项目的测定值。显示按钮图标403用于切换到无治疗、激素疗法和化疗等恶性肿瘤摘除后的各治疗群信息的显示画面(图22)。恶性肿瘤摘除后的各治疗群信息的显示画面(图22),当用户点击显示按钮图标403时,显示在与显示图21的画面的窗口不同的另一窗口。也可以不作为另一个窗口显示,而由图21的画面切换到图22的画面显示。分布图显示区404显示CDK1比活性值和CDK2比活性值的分布图,作为关于其他癌症患者的恶性肿瘤的一定测定项目的测定值。此分布图绘有对应于待诊断癌症患者的恶性肿瘤的CDK1比活性值和CDK2比活性值的点。分布图还画有根据受检癌症患者的测定值601(恶性肿瘤的CDK1比活性值和CDK2比活性值)决定的参照范围602。
在图21所示显示画面,分布图显示区404也可以显示三维分布图取代CDK1比活性值和CDK2比活性值的二维分布图。此时,除CDK1比活性值和CDK2比活性值外,还有其他参数作为座标轴。
图22例示了恶性肿瘤摘除后激素治疗群的信息显示画面。信息显示区405显示有复发率、复发风险等信息。
本实施方式的辅助诊断系统可以根据显示近似比活性的其他癌症患者的有无复发的信息,计算出复发率。在此算出的复发率可以作为待诊癌症患者的预想复发率显示。因此,用户通过本实施方式的辅助诊断系统,可以获得更精确的辅助诊断信息。信息显示区406显示无病生存率等信息。
接下来,在步骤S301,控制器77判断是否出现用于判断复发风险的基准值和用于决定参照范围的值(半径)等设定值的输入画面。控制器77如果判断出现了设定值的输入画面(是),则进行步骤S305的处理,如果判断未出现设定值的输入画面(否),则进行步骤S302的处理。
在步骤S302,控制器77判断是否有显示设定值输入画面的指示。控制器77如果判断有显示设定值输入画面的指示(是),则进行步骤S303的处理,如果判断没有显示设定值输入画面的指示(否),则进行步骤S307的处理。
在步骤S303,控制器77的RAM91c读取存储在硬盘91g的第一数据库91i的判断复发风险用的基准值和决定参照范围用的值(半径)等数据。
在步骤S304,设定值输入画面由控制器77显示在显示器79。在此,用户通过操作输入设备78,输入基准值和参照范围的决定值(半径)等新的设定值。
在步骤S305,控制器77判断是否输入了设定值。控制器77如果判断输入了设定值(是),则进行步骤S306的处理,如果判断未输入设定值(否),则进行步骤S307的处理。
在步骤S306,输入的新设定值存入硬盘91g的第一数据库91i。
在步骤S307,控制器77判断是否接到关机指示。控制器77如果判断收到关机指示(是),则进行步骤S308的处理,如果判断未收到关机指示(否),则返回步骤S202。在步骤S308,关机信号由控制器77输送到主机控制器10。在步骤S309,控制器77对数据处理装置12实行关机处理,并结束处理。
在步骤S8,主机控制器10判断是否收到关机信号。主机控制器10如果判断收到关机信号(是),则进行步骤S9的处理,如果判断未收到关机信号(否),则返回步骤S2。在步骤S9主机控制器10实施对装置主体20的关机,并结束处理。
(4)表达量测定用试样的制备处理
图17所示为上述步骤S3制备表达量测定用试样的处理流程一例。
首先,在步骤S21排出预留在固相蛋白质芯片各池中的保存液,洗净各池。清洗即用分装设备3的吸移管从上方向各池注入清洗剂,再从固相蛋白质芯片下方用负压穿过多孔质膜吸出注入的清洗剂。以下的清洗工序也同样。
接下来,用吸移管从放置在第一试剂放置器5的标本容器中吸移表达量测定用标本,将该标本注入数个所定芯池,再从固相蛋白质芯片下方负压吸出该标本。如此,蛋白质便固定在固相蛋白质芯片的多孔质膜上(步骤S22)。
然后,同步骤S21一样,用清洗剂清洗上述所定芯池。以此从固相蛋白质芯片的多孔质膜除去蛋白质以外的成份(步骤S23)。
再将包被液注入上述所定芯池内,静置15分钟以上(比如30分钟)后,排出残留在池内的包被液(步骤S24)。如此可以防止被荧光标记的CDK1抗体(荧光标记CDK1抗体)和被荧光标记的CDK2抗体(荧光标记CDK2抗体)固定在多孔质膜没有固相蛋白质的部位。荧光标记CDK1抗体和荧光标记CDK2抗体可以使用市场销售产品。
分别向所定芯池内注入荧光标记CDK1抗体和荧光标记CDK2抗体。此时,各荧光标记抗体注入二个芯池。经过20~30分钟,待荧光标记抗体与固相化在多孔质膜上的蛋白质(CDK1或CDK2)反应结束后,排出注入的荧光标记(步骤S25)。
最后,同步骤S23一样,用清洗剂洗净上述所定芯池(步骤S26)。然后,主机控制器10返回图15所示主流程的步骤S4进行处理。
(5)活性值测定用试样的制备处理
在上述步骤S4中的活性值测定用试样的制备处理流程如图18所示。在此活性值测定用试样的制备处理中,作为图1所示活性测定单元2,使用的是图中眼前处有四个制样器211、图里面也有四个制样器211的测定单元。此活性测定单元2的各制样器211从图里面左起依次设为第一制样器(Ac1)、第二制样器(Ac2)、第三制样器(Ac3)、第四制样器(Ac4),从图眼前左起依次设为第五制样器(Ac5)、第六制样器(Ac6)、第七制样器(Ac7)、第八制样器(Ac8)。
先用分装设备3的吸移管从开口205分别向第一~第八制样器(Ac1~Ac8)注入清洗用试剂缓冲剂。关于第一~第八制样器(Ac1~Ac8)各制样器,由于注射泵214和电磁阀225如前所述运行,贮液器204的缓冲剂经过载体206被引入流路223,又经过载体206回流到贮液器204。全部柱201中回流到贮液器204的缓冲剂由分装设备3的吸移管吸移、废弃(步骤S31)。
接下来进行免疫沉降(抗体与CDK的免疫反应)(步骤S32)。先从放在第一试剂放置器5上的一个标本容器中用一个吸移管吸移活性值测定用标本1,用另一个吸移管吸移活性值测定用标本2。
从标本容器中吸移的活性值测定用标本1如图23所示,首先注入第一制样器(Ac1)的贮液器204。标本1通过注射泵214和电磁阀225如前所述动作,被输送到第一制样器(Ac1)的载体206。此时,上下移动活塞218一个来回(吸入→排出),则标本1在柱201的载体206中往返一次。
另一方面,从标本容器中吸移的活性值测定用标本2注入第五制样器(Ac5)的贮液器204。标本2同上述一样被送往第五制样器(Ac5)的载体206。
第一制样器(Ac1)和第五制样器(Ac5)的柱201的载体206中既没有固定CDK1抗体也没有固定CDK2抗体。因此,在第一制样器(Ac1)和第五制样器(Ac5),CDK1和CDK2不固相化,第一制样器(Ac1)的柱201中存留含CDK1和CDK2的标本1,第五制样器(Ac5)的柱201中存留含CDK1和CDK2的标本2。
然后,存留在第一制样器(Ac1)的柱201中的标本1被吸移管吸移到第三制样器(Ac3)的贮液器204。于是,标本1同上述一样,被送到第三制样器(Ac3)的载体206。
而存留在第五制样器(Ac5)的柱201中的标本2被吸移管吸移到第四制样器(Ac4)的贮液器204。于是,标本2同上述一样,被送到第四制样器(Ac4)的载体206。
第三制样器(Ac3)和第四制样器(Ac4)的柱201中的载体206中固定有CDK1的抗体。因此,在第三制样器(Ac3)和第四制样器(Ac4),CDK1被固相化,但CDK2未固相化,第三制样器(Ac3)的柱201中存留不含CDK1含CDK2的标本1,第四制样器(Ac4)的柱201中存留不含CDK1含CDK2的标本2。
然后,存留在第三制样器(Ac3)的柱201中的标本1被吸移管吸移到第七制样器(Ac7)的贮液器204。于是,标本1同上述一样,被送到第七制样器(Ac7)的载体206。
而存留在第四制样器(Ac4)的柱201中的标本2被吸移管吸移到第八制样器(Ac8)的贮液器204。于是,标本2同上述一样,被送到第八制样器(Ac8)的载体206。
第七制样器(Ac7)和第八制样器(Ac8)的柱201中的载体206中固定有CDK2抗体。因此,在第七制样器(Ac7)和第八制样器(Ac8),CDK2被固相化,第七制样器(Ac7)的柱201中存留既不含CDK1又不含CDK2的标本1,第八制样器(Ac8)的柱201中存留既不含CDK1又不含CDK2的标本2。
第七制样器(Ac7)和第八制样器(Ac8)的柱201中存留的标本1和标本2分别被吸移管吸出,废弃到废液槽7。
第一制样器(Ac1)和第五制样器(Ac5)用于背景的活性测定,第三制样器(Ac3)和第四制样器(Ac4)用于CDK1的活性测定,第七制样器(Ac7)和第八制样器(Ac8)用于CDK2的活性测定。
如此,通过向其他柱注入柱内残留的标本,用少量标本即可测定背景活性、CDK1活性和CDK2活性。
接下来,将缓冲剂1输送到柱201内(步骤S33),以洗掉标本中的不要成份。
由于此缓冲剂1对步骤S25实施的酶反应产生影响,因此主要为了创造这种酶反应的条件,向柱201输送缓冲剂2,冲洗掉上述缓冲剂1的成份(步骤S34)。
向柱201注入含基质HistonH1和ATPγs的基质反应液,来回抽动一次活塞218(步骤S35)。从柱201下侧挤到柱201的溶液静置不动。通过此步骤,在CDK1或CDK2作为酶的作用下,磷酸基被导入HistonH1。此磷酸基的量受CDK1或CDK2发挥酶的功能的强弱(即活性)所左右,因此,测定上述磷酸基的量即可求出CDK1或CDK2的活性值。另外,使用图23所示第一制样器(Ac1)和第五制样器(Ac5)求出的背景活性值如后所述,用于背景校正。
下一步用吸移管将荧光标记试剂从柱201上方直接分装到柱201内,让荧光标记与导入到HistonH1的磷酸基结合(步骤S36)。其时,吸移管通过反复吸排柱内液体一定时间来搅拌柱201内的液体。
从步骤S36开始经过一定时间(如20分钟)后,同上述荧光标记试剂一样直接向柱201分装反应停止液,再同步骤S36一样,反复吸排柱内液体一定时间来搅拌柱201内的液体(步骤S37)。以此停止荧光标记的结合。
再将第一制样器(Ac1)、第三制样器(Ac3)、第四制样器(Ac4)、第五制样器(Ac5)、第七制样器(Ac7)和第八制样器(Ac8)的柱201内液体分别注入固相蛋白质芯片101的六个芯池,从此固相蛋白质芯片下方吸移此液体(步骤S38)。由此,有荧光标记物结合的磷酸基的HistonH1就被固相化在固相蛋白质芯片101的多孔质膜上。
接下来同上述表达量测定用试样的制备处理中的步骤S21一样清洗芯池(步骤S39)。
最后,反复向芯池内注入、排出消光用试剂六次(步骤S40),以消除未与导入HistonH1的磷酸基结合的荧光标记物的荧光(背景消光)。然后,主机控制器10返回图15所示主流程的步骤S5。
(6)分析处理
在分析处理步骤(步骤S210),如图19和图20所示,根据检测器检测的荧光强度进行分析,分析结果输出到显示器79。
首先,在步骤S401,控制器77通过主机控制器10从检测器4的集光系统分别就CDK1的活性、CDK1的表达、CDK2的活性、CDK2的表达、背景的活性和背景的表达,各获得二个荧光强度。
在步骤S402,控制器77再计算针对各项目获取的二个荧光强度的平均值。
在步骤S403,从CDK1活性的荧光强度(平均值)减去背景活性(平均值),同时,从CDK2活性的荧光强度(平均值)减去背景活性(平均值),对CDK1活性和CDK2活性进行背景校正。对CDK1表达和CDK2表达也同样进行背景校正。
在步骤S404,控制器77针对各个项目,用校准曲线取得表达量和活性值。此校准曲线是用于将荧光强度转换成表达量或活性值的数据,当试剂批次变更时,用两种以上已知表达量或活性值的标本预先绘制,存入控制器77的硬盘91g。
在步骤S405,控制器77根据以下算式算出CDK1比活性和CDK2比活性:
CDK1比活性=CDK1活性值/CDK1表达量
CDK2比活性=CDK2活性值/CDK2表达量
在步骤S405,控制器77也可以根据以下算式算出CDK1比活性的倒数和CDK2比活性的倒数取代CDK1比活性和CDK2比活性:
CDK1比活性的倒数=CDK1表达量/CDK1活性值
CDK2比活性的倒数=CDK2表达量/CDK2活性值
然后,在步骤S406,控制器77决定参照范围。此参照范围是含具有与待诊癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值(CDK1比活性和CDK2比活性)近似测定值(CDK1比活性和CDK2比活性)的样品数据的区域。在此,参照范围以测定值为中心划定预设半径的圆。
在步骤S407,控制器77从硬盘91g的第二数据库91j读取其他癌症患者的上述活性值和表达量等测定值与该癌症患者的临床信息相对应的样品数据。
在步骤S408,控制器77检索、指定在步骤S406决定的参照范围内有测定值(CDK1比活性和CDK2比活性)的样品数据。
在步骤S409,控制器77根据步骤S408指定的样品数据,算出复发率。具体而言,根据步骤S408指定的其他癌症患者的样品数据,统计在参照范围内有测定值的其他癌症患者的总数,再计算其中所含复发癌症患者的比例,即可算出复发率。在此,复发率用设在参照范围内有测定值的其他癌症患者的总数为100时的百分比(%)来表示。
然后,在步骤S410和步骤S411,通过比较算出的复发率和预设的基准值,判断复发风险。
首先,在步骤S410,控制器77判断复发率是否低于第一基准值,“是”时进入步骤S411,“否”时判断复发风险“高”。在此第一基准值为14%。
在步骤S411,控制器77判断复发率是否低于第二基准值,“是”时判断复发风险“低”,而“否”时,则判断将中止判断。在此第二基准值为5%。
上述基准值可以是一个,也可以是三个。复发风险既可以如上所述,以“高”“低”二级判断,也可以进一步细化,以三级以上判断,如复发风险“高”、“中”、“低”等。
然后,在步骤S211,控制器77在显示器的显示画面如图21和图22所示,在分布图上点划、显示出作为判断复发率和复发风险等根据的CDK1比活性和CDK2比活性,且在此分布图上显示参照范围,同时,显示个体编号、年龄等待诊癌症患者的个体信息和恶性肿瘤相关项目的测定值、复发率和复发风险的判断结果等(步骤S211)。图21例示的显示画面上的分布图在横轴上对数(log)显示CDK1比活性,在纵轴上对数(log)显示CDK2比活性。图22例示的显示画面上显示无病生存率、复发率和复发风险的判断结果(图中为“风险判断”)等。然后,控制器77返回图15所示主流程的步骤S211。
在上述实施方式中,在步骤S401,控制器77分别就CDK1的活性、CDK1的表达、CDK2的活性、CDK2的表达、背景的活性和背景的表达,各获得二个荧光强度,并算出就各项目分别获得的二个荧光强度的平均值。本发明不限于此,也可以分别就CDK1的活性、CDK1的表达、CDK2的活性、CDK2的表达、背景的活性和背景的表达,各获取三次以上荧光强度,并算出各项目的荧光强度的平均值。也可以分别就CDK1的活性、CDK1的表达、CDK2的活性、CDK2的表达、背景的活性和背景的表达,各获取一次荧光强度。此时,在步骤S403,CDK1活性和表达及CDK2活性和表达的背景校正不是用各项目的平均值,而且用就各项目逐一获取的荧光强度进行。
在本实施方式中,医生等使用者适当设定参照范围半径,参照范围定在所设半径圆内。参照范围的大小最好能确保在统计学上能确保可靠性的最低样品数。因此,从能确保可靠性的角度出发,也可以在显示画面显示参照范围的同时,显示该参照范围内所含的样品数量信息,以便能在参照范围内确保所需最低限样品数量。这样,使用者可以参照显示在画面的此样品数量信息,轻松地重新将参照范围的半径设定为能确保适当样品数量的大小。
辅助诊断系统也可以自动决定参照范围的半径。当辅助诊断系统自动决定参照范围的半径时,最好设定的半径比如能够:
(I)以待诊癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值为中心,设定具有一定大小的区域,这个区域包含医疗上和统计学上有意义的数量的癌症患者数据;
(II)设定具有一定大小的区域,该区域含待诊断癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值,且包含系统测定误差和标准偏差;或
(III)设定具有一定大小的区域,该区域含待诊断癌症患者恶性肿瘤的一定测定项目的测定值,且包含对一个试样就一个所定测定项目进行一次以上测定所获得的测定值的测定误差和标准偏差。
控制器77通过如前(I)所述决定参照范围,可提供医疗上有意义的更精确的辅助诊断信息。控制器77通过如前(II)所述决定参照范围,可防止由于系统测定误差造成的精确度下降。控制器77通过如前(III)所述决定参照范围,可防止由于测定方法的不同而导致测定值出现差异,从而造成精度下降。在步骤S406,由于参照范围是如此决定的,故能够提供精确的辅助诊断信息。
在本实施方式中,参照范围是以测定值为中心的圆形结构,也可以采取以测定值为中心的方形、椭圆等其他形状。
下面显示的结果为用上述诊断系统分析采自作为诊断对象的五名癌症患者(癌症患者1~5)的恶性肿瘤所得。
[实施例]
(参考例)
测定乳癌患者的恶性肿瘤中CDK1和CDK2各自的活性值和表达量。从所得活性值和表达量算出CDK1的比活性、CDK2的比活性和CDK1的比活性与CDK2的比活性之比。然后以纵轴为CDK2的比活性log值,以横轴为CDK1的比活性log值,绘制分布图。
作为风险判断使用的基准值,设定了如下基准值。
1)CDK1的比活性与CDK2的比活性之比(比活性比)为5.0
2)低位基准值:CDK1的比活性为6
3)中位基准值:CDK1的比活性为20
4)高位基准值:CDK1的比活性为90
将上述四个基准值划分的八个区域设定为复发风险“高”(H)、复发风险“中”(I)或复发风险“低”(L)的某一个。具体而言,比上述比活性比基准值大、且比中位基准值大的区域为“高”(H)区。比上述比活性比基准值大、且比低位基准值小的区域为“低”(L)区。而比上述比活性比基准值小的区域,以大于高位基准值的区域为“高”(H)区,以小于该高位基准值的区域为“低”(L)区。
(实施例1)
分别测定癌症患者1的恶性肿瘤中CDK1和CDK2的活性值和表达量,算出CDK1和CDK2各自的比活性的对数(log)值。其结果,CDK1的比活性对数(log)值为1.7,CDK2的比活性对数(log)值为1.8。以无治疗群+激素疗法群+蒽环类抗生素化疗群标本的大规模临床试验结果为参照数据组,按照参考例判断癌症患者1的复发风险得知,其属于“低”(L)区。
再根据算出的比活性对数(log)值,以无治疗群+激素疗法群+蒽环类抗生素化疗群标本的大规模临床试验结果为参照数据组,用本发明的辅助诊断系统如参考例绘制分布图,计算出复发率。
关于癌症患者1的测定值的参照范围大小(半径)设为0.3。本发明辅助诊断系统提供的辅助诊断信息例示见图24~图27。图24显示了恶性肿瘤中CDK1和CDK2的测定值分布图。图24中根据参考例的阈值701一并显示了“高”(H)区、“中”(I)区和“低”(L)区。图25~图27显示了在进行各种治疗的情况下所预测的生存曲线的结果。在图25~图27中显示的各生存曲线图形中,纵轴为无病生存率,横轴为观察时间(日)。复发风险的判断基准,当复发率为14%以上时,为“高风险”,当复发率不到5%时,为“低风险”。
在图24所示分布图中,显示了癌症患者1的测定值601,还显示有参照范围602。如图24所示,癌症患者1的测定值601按照参考例的复发风险判断,属于“低”(L)区,但应用本实施方式的辅助诊断系统,作为辅助诊断信息提供的有近似测定值的其他癌症患者则属于阈值附近和“高”(H)区。因此,能够作出更恰当的判断。根据本实施方式的辅助诊断系统提供的有与癌症患者1近似测定值的其他癌症患者的信息预测,当不对癌症患者1实施治疗时,复发率为9.1%。同样,如果对癌症患者1实施激素疗法,则预测复发率为3.8%。如果对癌症患者1实施蒽环类抗生素化疗法,则预测复发率为75%,预测到对于癌症患者1来说,蒽环类抗生素化疗法可能不是有效方法。
分别如图25和图26所示,对癌症患者1不实施治疗时,在大约800天内预计无病生存率很低,但实施激素疗法时,预计无病生存率至少可以维持到大约2200天。如此,用本实施方式的辅助诊断系统可以提供作出对癌症患者1来说激素疗法是有效手段之一这一判断的指标性信息。另一方面,分别如图25和图27所示,对癌症患者1不实施治疗时,预计无病生存率很低大约在800天内,而实施蒽环类抗生素化疗法的话,预计无病生存率更低,大约在100天内。如此,应用本实施方式的辅助诊断系统可以提供作出对癌症患者1来说蒽环类抗生素化疗法可能不是有效方法的指标性信息。
由这些结果可知,应用本实施方式的辅助诊断系统可以提供适应各个患者的辅助诊断信息,比如可以精确地预测将来所采用的治疗方法的复发率,还可以针对每个患者提供选择更适合的治疗方法的信息。
上述生存曲线也可以是根据其他癌症患者的临床资料中生存和死亡信息绘制的生存曲线。
(实施例2)
测定癌症患者2的恶性肿瘤的CDK1和CDK2各自的活性值和表达量,计算出CDK1和CDK2各自的比活性对数(log)。其结果,CDK1的比活性对数(log)值为1.5,CDK2的比活性对数(log)值为2.5。以无治疗+激素治疗群标本的大量临床试验结果(332个标本)为参照数据组,按照参考例判断癌症患者2的复发风险得知,其属于“高”(H)区。
再根据算出的比活性对数(log)值,以无治疗群+激素疗法群标本的大量临床试验结果(332个标本)为参照数据组,用本发明的辅助诊断系统绘制分布图,计算出复发率。癌症患者2的测定值的参照范围大小(半径)为0.15。
图28例示了本实施方式的辅助诊断系统提供的辅助诊断信息。运用本实施方式的辅助诊断系统,如图28所示,本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者2近似测定值的其他癌症患者的信息显示在参照范围内,可以提供有助于对癌症患者2做出更恰当诊断的信息。
关于癌症患者2,根据本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者2近似测定值的其他癌症患者的信息,参照范围内有2名复发患者,9名未复发的患者。据此推断,则复发率预计为18.2%。
(实施例3)
与上述实施例2一样,测定癌症患者3的恶性肿瘤的CDK1和CDK2各自的活性值和表达量。其结果,CDK1的比活性对数(log)值为1.5,CDK2的比活性对数(log)值为2。按照参考例判断受检癌症患者的复发风险得知,其属于“高”(H)区。
图29例示了本实施方式的辅助诊断系统提供的辅助诊断信息。运用本实施方式的辅助诊断系统,如图29所示,本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者3近似测定值的其他癌症患者的信息显示在参照范围内,可以提供有助于对癌症患者3做出更恰当诊断的信息。
根据本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者3近似测定值的其他癌症患者的信息,预测复发率。其结果,参照范围内有4名患者复发,21名患者未复发。据此推断,复发率为16.0%。如此,按照参考例判断,则癌症患者3与上述实施例2的癌症患者2同属“高”(H)区,但用本实施方式的辅助诊断系统,则本实施例的癌症患者3与实施例2的癌症患者2预测的复发率是不同的。进一步说,实施例2的癌症患者2的测定值(CDK1的比活性和CDK2的比活性)尽管按参考例属于“高”(H)区,但处于远离“低”(L)区和“中”(I)区的边缘的位置,本实施例的癌症患者3的测定值尽管属于参考例的“高”(H)区,但位于与“低”(L)区临界附近。
关于实施例2的癌症患者2,本实施方式的辅助诊断系统得出的复发率为18.2%,而关于本实施例的癌症患者3,本实施方式的辅助诊断系统得出的复发率为16%。由此得知,用上述实施方式的辅助诊断系统可以获得与癌症患者的测定值对应的复发率,即,可以预测正确反映癌症患者恶性肿瘤状态的复发率。
(实施例4)
与上述实施例2一样,测定癌症患者4的恶性肿瘤的CDK1和CDK2各自的活性值和表达量。其结果,CDK1的比活性对数(log)值为0.5,CDK2的比活性对数(log)值为1。按照参考例判断癌症患者4的复发风险得知,其属于“低”(L)区。
图30例示了本实施方式的辅助诊断系统提供的辅助诊断信息。如图30所示,本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者4近似测定值的其他癌症患者的信息显示在参照范围内,可以作为有助于对癌症患者4做出更准确地诊断的信息。
根据本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者4近似测定值的其他癌症患者的信息,预测复发率。其结果,参照范围内有0名复发的患者,8名未复发的患者。据此推断复发率为0%。
(实施例5)
与上述实施例2一样,测定癌症患者5的恶性肿瘤的CDK1和CDK2各自的活性值和表达量。其结果,CDK1的比活性对数(log)值为1.2,CDK2的比活性对数(log)值为1.5。按照参考例判断癌症患者5的复发风险得知,其属于“低”(L)区。
图31例示了本实施方式的辅助诊断系统提供的辅助诊断信息。如图31所示,本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者5近似测定值的其他癌症患者的信息显示在参照范围内,可以作为有助于对癌症患者5做出更恰当诊断的信息。
根据本实施方式的辅助诊断系统提供的具有与癌症患者5近似测定值的其他癌症患者的信息,预测复发率。其结果,参照范围内有1名复发的患者,10名未复发的患者。据此推断,复发率为9.1%。如此,按照参考例判断,则本实施例5的受检癌症患者与上述实施例4的受检癌症患者同属“低”(L)区,但运用本实施方式的辅助诊断系统,则本实施例的癌症患者5与实施例4的癌症患者4预测的复发率是不同的。具体而言,实施例4的癌症患者4的测定值虽说按参考例属“低”(L)区,但也是处于远离与“高”(H)区和“中”(I)区的边界的位置,而本实施例的癌症患者5的测定值虽说按参考例属“低”(L)区,但处于与“中”(I)区的边界附近。实施例4的癌症患者4用上述实施方式的辅助诊断系统预测的复发率为0%,而用上述实施方式的辅助诊断系统预测的本实施例的癌症患者5的复发率为9.1%。由此可以知道,运用上述实施方式的辅助诊断系统可以获得与癌症患者测定值相应的复发率,即能够预测正确反映癌症患者恶性肿瘤状态的复发率。
运用本实施方式的辅助诊断系统可以提供具有与测定癌症患者恶性肿瘤相关测定项目所获得的测定值近似的其他癌症患者的临床信息,可以提供帮助医生做出精确癌症诊断的信息。
Claims (14)
1.一种癌症辅助诊断系统,包括:
测定值获取单元,用于获取第一癌症患者的相关测定值,其中所述测定值是用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本,测定一定测定项目生成的测定值;
样品数据存储器,用于存储非所述第一癌症患者的若干其他癌症患者的相关样品数据,其中所述样品数据存储器包含用采自所述若干癌症患者的恶性肿瘤制备的各个标本测定所述一定测定项目生成的测定值和所述若干癌症患者分别摘除恶性肿瘤后的临床信息;
参照范围存储器,用于存储参照范围的设定值;
范围决定单元,用于根据所述测定值获取单元获取的所述第一癌症患者相关测定值和所述参照范围存储器存储的设定值决定参照范围,其中所述第一癌症患者的相关测定值在所述参照范围内;
显示器;及
显示控制单元,用于控制所述显示器显示辅助诊断画面,其中辅助诊断画面中显示测定值在所述参照范围内的样品数据中所包含的临床信息。
2.权利要求1所述系统,其特征在于:所述显示控制单元控制所述显示器,将所述样品数据存储器中存储的样品数据中所含测定值和所述第一癌症患者的相关测定值与所述范围决定单元决定的参照范围一起显示在所述辅助诊断画面。
3.权利要求2所述系统,其特征在于:所述显示控制单元控制所述显示器在所述辅助诊断画面显示表现所述样品数据存储器中存储的样品数据中所含测定值和所述第一癌症患者相关测定值的图形,并将所述范围决定单元决定的参照范围显示在所述图形上。
4.权利要求3所述系统,其特征在于:所述一定测定项目至少含二种测定项目,所述图形是以至少二种测定项目为坐标的分布图。
5.权利要求1~4其中任一项所述系统,还包括:
从所述样品数据存储器存储的样品数据指定具有所述参照范围内测定值的样品数据的样品数据指定单元;及
分析所指定的样品数据的临床信息,生成分析结果的分析单元,其中所述显示控制单元控制所述显示器显示所述分析结果。
6.权利要求5所述系统,其特征在于:所述分析结果包含癌症的复发率和/或癌症的复发风险和/或无病生存率。
7.权利要求1~4其中任一项所述系统,其特征在于:所述测定值含关于细胞周期蛋白质的表达和/或该细胞周期蛋白质活性的值。
8.权利要求7所述系统,其特征在于:所述细胞周期蛋白质为周期素依赖性激酶。
9.权利要求8所述系统,其特征在于:所述测定值为第一CDK的活性值与表达量之比和第二CDK的活性值与表达量之比。
10.权利要求9所述系统,其特征在于:所述测定值获取单元还包括:
获取第一CDK的活性值和表达量及第二CDK的活性值和表达量的活性值和表达量获取单元;及
根据所述活性值和表达量获取单元获取的第一CDK的活性值和表达量算出第一CDK的活性值与表达量之比、根据所述活性值和表达量获取单元获取的第二CDK的活性值和表达量算出第二CDK的活性值与表达量之比的计算单元。
11.权利要求1~4其中任一项所述系统,其特征在于:所述临床信息为关于癌症复发的信息。
12.权利要求11所述系统,其特征在于:所述临床信息还包括有关术后治疗的信息和有关是否生存的信息。
13.权利要求1~4其中任一项所述系统,还包括测定装置,该装置用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本测定所述一定测定项目,获得该第一癌症患者相关的测定值。
14.一种计算机的控制系统,包括:
测定值获取单元,用于获取第一癌症患者相关测定值,其中,所述测定值为用采自所述第一癌症患者的恶性肿瘤制备的标本测定所述一定测定项目生成的测定值;
样品数据存单元,用于存储非所述第一癌症患者的若干其他癌症患者的样品数据,其中所述样品数据包含:用从所述若干癌症患者采集的恶性肿瘤制备的各标本测定所述一定测定项目生成的测定值和所述若干癌症患者分别摘除恶性肿瘤后的临床信息;
参照范围存单元,用于存储参照范围的设定值;
范围决定单元,用于根据所述测定值获取单元中获取的所述第一癌症患者的测定值和所述参照范围存储单元中存储的设定值决定参照范围,其中所述第一癌症患者的测定值在该参照范围内;
显示器单元,用于显示辅助诊断画面,其中所述辅助诊断画面上显示测定值在所述参照范围内的样品数据中所含的临床信息。
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SINHA A K.Power system security assessment using pattern recognition and fuzzy estimation.《INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTRICAL POWER AND ENERGY SYSTEM》.1995,第17卷(第1期),第11-19页. * |
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