CN101203743A - 使用亚波长孔径或狭缝的发光传感器 - Google Patents
使用亚波长孔径或狭缝的发光传感器 Download PDFInfo
- Publication number
- CN101203743A CN101203743A CNA2006800224970A CN200680022497A CN101203743A CN 101203743 A CN101203743 A CN 101203743A CN A2006800224970 A CNA2006800224970 A CN A2006800224970A CN 200680022497 A CN200680022497 A CN 200680022497A CN 101203743 A CN101203743 A CN 101203743A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- slit
- aperture
- substrate
- radiation
- excitation
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B82—NANOTECHNOLOGY
- B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
- B82Y15/00—Nanotechnology for interacting, sensing or actuating, e.g. quantum dots as markers in protein assays or molecular motors
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
- G01N21/648—Specially adapted constructive features of fluorimeters using evanescent coupling or surface plasmon coupling for the excitation of fluorescence
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54366—Apparatus specially adapted for solid-phase testing
- G01N33/54373—Apparatus specially adapted for solid-phase testing involving physiochemical end-point determination, e.g. wave-guides, FETS, gratings
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Hematology (AREA)
- Nanotechnology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Abstract
本发明提供一种使用亚波长孔径或狭缝结构,即使用最小维度小于填充孔径或狭缝结构的介质中激励辐射波长的孔径或狭缝结构的定性或定量发光传感器,例如生物传感器或化学传感器。本发明还提供用于检测这种发光传感器中孔径或狭缝结构中存在的一个或更多个发光体所产生的发光辐射的方法。
Description
本发明涉及定性或定量发光传感器,例如生物传感器,并且尤其涉及使用亚波长孔径或狭缝结构的发光传感器。本发明还涉及由这种发光传感器中的孔径或狭缝结构中存在的一个或更多个发光体产生的发光辐射的检测方法。
传感器广泛地用于测量物理属性或物理现象。它们将测量值的功能读数作为电、光或数字信号输出。该信号是可通过其他设备转换成信息的数据。传感器的一个特定示例为生物传感器。生物传感器是检测(即定性)或测量(即定量)诸如血液、血清、血浆、唾液......的流体中诸如(例如,但不限于)蛋白质、病毒、细菌、细胞成分、细胞膜、孢子、DNA、RNA等目标分子的特定量的设备。目标分子也称作“被分析物”。几乎在所有的情形中,生物传感器都使用包括特异性识别元素的表面来俘获被分析物。因此,通过将特异性分子附着到传感器的表面,来对传感器的表面进行改性,其中,传感器的表面适于结合流体中存在的目标分子。
为了使被分析物与特异性分子的结合效率最优,优选大表面面积和短扩散长度。因此,已经提出了微孔或毫微孔衬底(薄膜)作为兼具大面积与快速结合动力的生物传感器衬底。特别是,当被分析物的浓度较低(例如,低于1nM或低于1pM)时,扩散动力在生物传感器化验中起重要的作用。
可通过荧光来检测所结合的被分析物的量。在此情形中,被分析物本身可携带荧光标记,或者可替换地,可执行具有用荧光标记的第二识别元素的附加培养。
对所结合的被分析物的量的检测可能受若干因素的限制,诸如散射,发光体的漂白,衬底的背景荧光以及激发光的不完全去除。此外,为了能够区分被结合的标记和溶液中的标记,必须进行洗涤步骤(一个或多个)以去除未结合的标记。
US2003/0174992A1涉及零模波导以及它们用于限制小于正常衍射极限的有效观察体积的应用。零模波导包括部分或完全包围芯的包层,其中,将芯配置成阻止频率小于截止频率的电磁能量通过零模波导纵向传播。照明源将激励辐射引导向零模波导中存在的目标材料。然后,所发射出的辐射通过检测器,检测器识别发射的类型,并且与照明源相同地定位在零模波导的同一侧。
在分离激励辐射和发光辐射,例如荧光辐射时是存在问题的,因为这些辐射具有类似的波长。此外,所发射的辐射由于其可以通过零模波导致其一部分发生损失,从而被引导到波导设有检测器的一侧之外的另一侧。
本发明的目的在于提供改进的定性或定量发光传感器,例如生物传感器,更具体而言,涉及使用亚波长孔径或狭缝结构的改进的发光传感器,并提供这种发光传感器中孔径或狭缝结构中存在的一个或更多个发光体所产生的发光辐射的检测方法。
本发明的优点在于提供了一种具有良好信号-背景比的发光传感器,诸如生物传感器或化学传感器。本发明的另一优点是分离激励辐射和发光辐射,例如荧光辐射的能力。
通过根据本发明的方法和设备来实现上述目的。
在所附的独立和从属权利要求中给出了本发明的特定和优选方面。可以将来自从属权利要求的特征与独立权利要求以及其他从属权利要求的特征适当结合,而不仅是权利要求中明确给出的。
在本发明的第一方面,提供一种发光传感器系统。该发光传感器系统包括发光传感器,激励辐射源和检测器。发光传感器包括设有至少一个孔径或狭缝的衬底,并且在所述至少一个孔径中设有至少一个发光体,以被具有某一波长的激励辐射激励,所述孔径或狭缝具有最小维度。所述至少一个孔径或狭缝被填充有某种介质。该介质可以为液体或气体,不过也可以是包括至少一种要检测的发光粒子的真空。在使用时,可以将传感器浸入介质中,例如液体介质中,或者按照任何其他适当方式,例如,在液体介质情况下借助于微量吸管,或者通过将气体喷射到传感器上以及至少一个孔径或狭缝中,用介质填充至少一个孔径或狭缝。至少一个孔径或狭缝的最小维度小于填充所述至少一个孔径的介质中激励辐射的波长。发光传感器具有彼此相对的第一和第二侧。根据本发明,将激励辐射源定位在发光传感器的第一侧,将检测器定位在第二侧。
根据本发明的发光传感器能够分离激励辐射和发光辐射。此外,该发光传感器相对于现有技术传感器能够更好地分离测量信号与背景信号。因此,可省略已知的使用现有技术时检测过程中的冲洗步骤。
根据本发明的实施例,孔径可具有正方形,圆形,椭圆形,矩形,多边形等形状。此外,孔径可具有不止一个维度,典型的是,孔径可具有两个或三个维度。因此,根据本发明的实施例,当提到孔径的维度时,考虑最小的维度。
根据本发明一个实施例,至少一个孔径或狭缝的最小维度可小于用于填充所述至少一个孔径的介质的衍射极限。‘填充所述至少一个孔径的介质’是浸液,其可以为其中浸入传感器的液体或气体。所述至少一个孔径或狭缝的最小维度可小于填充所述至少一个孔径或狭缝的介质中的激励辐射波长的50%,优选小于填充所述至少一个孔径或狭缝的介质中的激励辐射波长的40%。
在本发明的一个特定实施例中,所述浸液可以是水。在此情形中,所述至少一个孔径或狭缝的最小维度可小于激励波长下水的衍射极限。衍射极限是激励波长或频率与周围介质的折射率这两者的函数。
在根据本发明的实施例中,衬底可包括至少一个孔。在特定实施例中,所述至少一个孔可具有倾斜的侧壁。
在其他实施例中,衬底可包括至少一个狭缝。
在根据本发明的实施例中,衬底可包括孔径或狭缝的阵列。该阵列可以是孔径或狭缝的周期性阵列,即,可以以一或二维彼此等距离地定位孔径或狭缝。
在根据本发明的一个实施例中,可以将设有至少一个孔径或狭缝的衬底定位在另一衬底的顶部上。所述的另一衬底可支撑设有至少一个孔径或狭缝的衬底。这就导致机械强度的加强。另一衬底对于激励辐射和/或发光辐射可以是透明的。
在根据本发明的实施例中,可以将设有至少一个孔径或狭缝的衬底定位在第一或上板与第二或下板之间。根据某些实施例,可以将第一或上板和第二或下板图案化。
根据本发明的实施例,辐射检测器可以为例如CCD或CMOS检测器。
在根据本发明的实施例中,发光传感器可以例如为发光生物传感器或发光化学传感器。
在根据本发明的实施例中,可以按照这样一种方式来构造孔径,即使得当发光辐射朝向检测器发送时,发光信号集中在更小的立体角中。这是例如孔径具有三角形形状的情形。
所述至少一个孔径或狭缝可包括内表面壁。根据本发明的实施例,所述至少一个孔径或狭缝的内表面壁可包括固定有能够识别一个或多个感兴趣目标(也称作被分析物)的配体的表面。这改善了传感器,例如生物传感器或化学传感器的选择性。在必须检测不止一种被分析物的情形中,传感器可包括不同配体的阵列。适当配体的例子有蛋白质,抗体,核酸适配体,缩氨酸,低(聚)核苷酸,糖,植物凝血素等。可以通过适当的表面化学性质将配体固定到至少一个孔径或狭缝的内表面壁。表面化学性质的选择仅取决于内表面壁的化学成分。
在本发明的第二方面,提供一种用于检测衬底中的至少一个孔径或狭缝中至少一个发光体所产生的发光辐射的方法,所述至少一个孔径或狭缝具有最小的维度,并且被填充有诸如液体或气体的介质。该方法包括:
-利用处于衬底第一侧的激励辐射激励至少一个发光体,所述激励辐射在填充孔径或狭缝的介质中具有的波长大于所述至少一个孔径或狭缝的最小维度,并且
-检测处于衬底第二侧的至少一个受激励的发光体发出的发光辐射,所述第二侧与第一侧相对。
在填充孔径或狭缝的介质中激励辐射的波长可以至少比所述至少一个孔径或狭缝的最小维度大2倍。
根据本发明的实施例,其中,所述衬底包括至少一个狭缝,激励辐射由偏振光,例如TE偏振光(沿例如狭缝的维度的方向指向的电场)组成。然而,在其他实施例中,该偏振光也可以是TM偏振光。在此情形中,更容易收集发射出的光。例如,对圆形孔径来说,与偏振的类型无关。对于矩形孔径来说,也可以是偏振相关的,这是因为其影响渐逝场的衰减长度。
根据本发明的实施例,根据本发明的方法还包括将配体固定到至少一个孔径或狭缝的内表面壁上。这可以例如通过合适的表面化学性质来进行。表面化学性质的选择仅依赖于内表面壁的化学成分。
根据本发明,还可以使用偏振滤光器来改善对激励波长的抑制作用。或者,可使用其他类型的滤光器,诸如阻挡(或者部分阻挡,即衰减)或改变激励光的方向(如同二向色滤光器)同时基本不影响荧光的波长滤光器。
通过下面结合附图进行的详细描述,本发明的这些和其他性质,特征和优点将变得很清楚,附图通过示例说明了本发明的原理。该描述仅作为示例给出,并不限定本发明的范围。下面引用的附图标记涉及附图。
图1示出使用具有200nm宽度w和300nm深度d的孔径结构并通过平面波进行激励的FEMLAB有限元模拟的强度分布;
图2为沿通过图1中所示孔径的中心的传播方向的平面波所产生的辐射的强度曲线;
图3为针对图1的狭缝并且用高斯光束激励时,在x-y平面中的强度分布;
图4为沿通过孔径中心的图3的y-方向的直线的强度曲线;
图5为沿通过孔径中心的y-方向的直线的强度的归一化(y=0)曲线,与图2和图4的情形相应;
图6说明增加孔径宽度对强度分布的影响;
图7示出对于宽度w=0.2μm的针孔的强度分布;
图8示出对于宽度w=0.26μm的针孔的强度分布;
图9示出对宽度w=1μm的针孔的强度分布;
图10说明在存在孔径或狭缝时用于荧光体的辐射发射的2D计算的几何结构;
图11示出由位于0.2μm宽孔径的出射侧的荧光体所产生的辐射图案;
图12示出在不存在孔径时所产生的辐射图案;
图13示出由设置在孔径前面1μm处的针孔所产生的辐射图案;
图14示出由设置在孔径前面2μm处的针孔所产生的辐射图案;
图15示意性地说明具有贯通整个衬底的孔的孔阵列滤光器;
图16说明根据本发明实施例,涂有Al的针孔箔片的透光率;
图17说明根据本发明实施例的孔结构;
图18更详细地说明发射出的荧光在图17的孔结构中的反射;
图19说明根据本发明实施例的孔结构;
图20说明通过狭缝传播的辐射的基模的衰减长度(1/e)^2强度;
图21示出对于300nm厚狭缝和TE偏振光的强度分布;
图22示出对于300nm厚狭缝和TM偏振光的强度分布;
图23示出对于600nm厚狭缝和TM偏振光的强度分布;
图24示出对于1000nm厚狭缝和TM偏振光的强度分布;
图25示出对于1000nm厚狭缝和TE偏振光的强度分布;
图26示出对于TE和TM偏振以及不同的孔径厚度,沿狭缝的中心线的归一化强度(关于x=y=0处的强度进行归一化);
图27示出对于TM偏振,沿狭缝中心线的归一化强度(关于x=y=0处的强度进行归一化);
图28示出TE偏振光,在金属衬底(宽度为200nm,狭缝之间的距离为2.5μm)中形成的狭缝阵列中的透射和反射;
图29示出TM偏振光,在金属衬底(宽度为200nm,狭缝之间的距离为2.5μm)中形成的狭缝阵列中的透射和反射;
图30和图31示出作为金衬底层的厚度的函数的TM偏振光在周期性狭缝阵列(周期为0.4μm)中的透射;
图32示出作为金衬底层的厚度的函数的TE偏振光在周期性狭缝阵列(周期为0.4μm)中的透射;
图33说明在根据本发明另一实施例的狭缝结构中的激励辐射和发光辐射;
图34为根据本发明又一实施例的纳米流体通道的横截面;
图35说明在通过图34的流体通道的上板的流体中溶解的荧光体的激励;
图36示出经过图案化的板;
图37说明在流体中溶解并且沿平行于板的方向引导的荧光体的激励。
在不同附图中,相同附图标记表示相同或相似元件。
将参照具体实施例并参照某些附图描述本发明,但是,本发明不限于此,而仅由权利要求限定。权利要求中的任何附图标记都不应当被解释为限制其范围。所描绘的附图仅是示意性的,而非限制性的。在附图中,夸大了某些元件的尺寸,并且为了说明的目的而并未按照比例绘出。在说明书和权利要求中使用术语“包括”,并不排除其他元件或步骤。当提到单个名词时,使用不定冠词或者定冠词,例如“一”或者“一个”,除非特别说明,其包括多个所述名词。
注意,权利要求中使用的术语“包括”,不应当被解释为局限于后面列出的装置;不排除其他元件或步骤。从而,将其解释为指定所述特征,整体,步骤或部件的存在,但是并不排除存在或增加一个或多个其他特征,整体,步骤或部件,或者其组合。因此,语句“包括装置A和B的设备”应当不局限于仅由部件A和B组成的设备。这对于本发明来说,意味着设备唯一重要的部件为A和B。
此外,在说明书和权利要求中,术语第一,第二,第三等等用于区分相似元件,并非必然描述顺序或时序。应当理解,所使用的术语在适当情况下是可互换的,此处所描述的本发明的实施例能够按照除此处所述或说明的其他顺序进行操作。
此外,在说明书和权利要求书中,术语顶部,底部,上,下等用于说明的目的,并非必然描述相对位置。应当理解,所使用的术语在适当情况下是可互换的,此处所描述的本发明的实施例能够按照除此处所述或说明的其他定向进行操作。
本发明提供定性或定量传感器系统,更具体而言,提供发光传感器系统,其例如可以为表现出良好的信号背景比的发光生物传感器系统或发光化学传感器系统。下面,将主要参照发光生物传感器系统来描述本发明,但是,这仅用于简化说明,不限制本发明。
根据本发明实施例的发光传感器系统能够分离激励辐射和发光辐射,例如荧光辐射。
将参照包括浸入流体中的传感器,激励辐射源和检测器的传感器系统来描述本发明。然而,这并不限制本发明。根据本发明的传感器包括至少一个填充有介质的孔径或狭缝。传感器不需要浸入介质中;所述介质也可以例如被喷射到传感器上,或者被喷射到至少一个孔径或狭缝中。
根据本发明的发光传感器包括设有至少一个孔径,诸如孔,间隙或任何其他类型的开口(诸如至少一个狭缝)的衬底。根据本发明,所述至少一个孔径可具有任何适当的形状,诸如正方形,圆形,椭圆形,矩形,多边形等形状。此外,孔径可具有两个或三个维度。因此,当在进一步描述中谈到孔径的维度时,考虑孔径的最小维度。衬底中的孔径或狭缝结构优选与渐逝激励(evanescent excitation)一起使用。可以在溶液中或衬底上得到发光辐射。使用根据本发明的孔径或狭缝结构,无需滤光器来分离激励辐射和发光辐射。另外,相同的孔径或狭缝结构适于用于不同的或多个激励波长。然而,不同的波长也暗示着对于渐逝场具有不同衰减常数。对于给定的宽度,通过减小波长,会达到孔径或狭缝大于传感器所浸入的或用于填充孔径或狭缝的流体中该波长的衍射极限的点。这表明必须选择孔径或狭缝的宽度,使其适合所有波长,并且这还表明可能波长的范围稍稍受限。
首先,将解释在孔径或狭缝结构上反射的渐逝场的工作原理,并且将给出对渐逝场更详细的说明。然而,必须了解的是,本发明不局限于渐逝激励。为了解释渐逝场的工作原理,进行若干次有限元件模拟,以解释根据本发明用于激励发光体(例如荧光体)的渐逝场。
在下面的讨论中,在透射模式下检测发光辐射,这表明用处于传感器第一侧的激励辐射源发出的激励辐射照射传感器,并在传感器的第二侧处检测发光辐射,所述第二侧与第一侧相对。
参照图1-3,参照包括狭缝结构11的衬底10进行讨论,从而形成多孔性衬底10。然而,应该理解本发明不限于此,而可以在孔径结构的情形下使用,诸如孔,间隙或在衬底10中形成的其他开口。图1和3示出包括狭缝结构11的衬底10的有限元模拟的强度分布,所述衬底例如金属衬底(如金衬底)或半导体衬底(如硅衬底)。对衬底材料的主要要求是,其对于激励辐射不透明,即,孔径之间的材料对于激励辐射不透明。利用FEMLAB进行有限元模拟,FEMLAB是一种基于偏微分方程(PDE)来对单个和偶联现象建模的交互式软件,可从Comsol Group获得。
除非另有说明,对于狭缝11,针对TE偏振光,以2D进行模拟。然而,通过执行这些模拟得到的结论对于3D孔径(例如,针孔)也是有效的,对针孔来说,由于对称性,是偏振无关的。
在第一模拟中,如图1中所示,在作为衬底10的300nm厚金层(折射率n=0.038361519-j*5.074565)中形成宽度w为200nm的狭缝11的阵列,从而狭缝阵列11的每个狭缝11的深度d为300nm,用波长λ为700nm的平面波照射狭缝阵列,以便看到狭缝11内部的渐逝场。为了简化附图,在图1中仅示出狭缝阵列11的一个狭缝11。其不限制本发明。狭缝11的阵列可以是狭缝11的周期性阵列,即,相邻狭缝11之间具有相等距离的阵列。然而,并非必须如此;相邻狭缝11之间的距离也可以不同。在所给出的示例中,狭缝11的阵列是周期性阵列,其中在衬底10中相邻狭缝11的中心之间的距离为2.5μm。将具有狭缝11的多孔性衬底10浸入诸如水或空气的浸液12中。在此示例中,考虑光的TE偏振态,即电分量。
从图1可以看出,并且从下面的模拟可以看出,当狭缝结构11的维度小于入射辐射的波长的一半时,几乎没有光被狭缝结构11透射。通常,为了使辐射不进入孔径或狭缝11,需要渐逝波,渐逝波是空间频率超出衍射极限的光波。这表明,对于给定的波长λ和填充孔径或狭缝11的介质(例如,传感器所浸入的介质)的折射率n,孔径或狭缝结构11的最小维度应当小于λ/(2*n)。因而,如果使用包括宽度小于浸液12中的衍射极限的孔径或狭缝11的孔径或狭缝结构11(例如,如果将该结构浸入水中,则对水来说小于270nm(在700nm激励波长下),则渐逝场能够穿透到孔径或狭缝11中。图2示出光(沿图1中附图标记13所示的直线)通过狭缝11传行进时的强度分布。
在图2中,可以看到图1中所示的狭缝11的入口14与出口15之间的渐逝场。当沿图1中附图标记13所示的直线通过狭缝11行进时,强度在大约~180nm范围内下降1/e2。例如,在紧邻狭缝11后面,强度下降到入口14处强度的3.1%,而在狭缝11后面1μm的距离处,强度下降到仅为狭缝11的入口14处强度的0.3%。应当注意,可通过改变狭缝11的宽度w和深度d,或者更普遍而言,通过改变孔径11的宽度w和深度d来调节渐逝场的形状。
为了使传感器的结合能力(即,最高表面面积)最佳,优选具有大的深度d和小的间距,即孔径或狭缝11之间的距离较小,这决定了滤光器的空隙率。例如,对于200nm正方形和300nm深的孔11的情形,滤光器的空隙率为50%,得出每个孔径11的有效表面面积为4*200*150=120000nm2。在孔径11的内部,强度急剧下降,因此,考虑的有效深度为0.5*300=150nm。在测量有效深度时,也可以取1/e^2强度(相对于输入强度),在此情形中,有效深度为180nm。在滤光器的输入端面,每个孔径11具有200nm*200nm=40000nm2的平面面积。考虑滤光器的空隙率为50%,则得出等效平面面积为80000nm2。由此,周长为4*200nm=800nm,并且有效深度为150nm,则得出每个孔11的面积为800nm*150nm=120000nm2。总计将有效面积增加120000nm2/80000nm2=1.5倍。通过优化孔径或狭缝11的直径,可调整渐逝场的形状,即在孔径或狭缝11中的穿透深度,并且可改变和/或优化有效表面面积。
使用渐逝场来激励发光体,例如荧光体,导致局限于孔径或狭缝11位置周围的小激励体积。实践中,小激励体积意味着,孔径或狭缝11仅将激励辐射透射到局限于孔径或狭缝11的位置周围的小体积内。可利用这一点对发光辐射进行有限的探测,并且使孔径或狭缝11后面产生的发光辐射与孔径或狭缝11内部产生的发光辐射的比值最小。发光辐射例如可以为荧光辐射。
在第二模拟中,为了表明也可以使用聚焦的高斯光束来照明如图1中所示的狭缝11,使用与第一模拟中完全相同的参数进行计算,不过此时使用具有腰部的高斯光束,即到与1/e振幅相应的最大值的距离为0.5μm。图3和4中示出计算结果。
为了比较第一与第二模拟,图5示出图2和4中给出的强度分布,针对狭缝11的入口14处的强度进行归一化。从图5可以看出,对于平面波(模拟1)和高斯光束(模拟2)而言,狭缝11的入口14后面的渐逝波几乎相同。考虑到优选具有高激励功率,随后优选用高斯光束或具有另外形状的聚焦光斑进行激励。聚焦光斑激励产生几乎相同形状的渐逝场这一事实也表明,该方法对于入射光的角度和形状并不是非常敏感。
在第三模拟中,说明孔径或狭缝11的宽度w对孔径或狭缝11后面的光强度的影响。将以狭缝11作为孔径讨论第三模拟。在该模拟中,使用波长λ为700nm的光,以及深度为300nm的狭缝11。图6示出宽度w为0.1μm(曲线16),0.2μm(曲线17),0.26μm(曲线18),0.3μm(曲线19),0.4μm(曲线20)和1μm(曲线21)的狭缝11的归一化强度曲线。从该模拟可以得出,狭缝11增宽(增加孔径或狭缝11的宽度w),导致光在狭缝11中的穿透深度越大,狭缝11后面的强度越高(y>0.3μm),狭缝11的输出或出口15处的强度越低,狭缝11后面的强度越低。为了进行说明,假设浸液是衍射极限为大约270nm的水,对于充分小于浸液12中的衍射极限的宽度w,即所示模拟中的曲线16,17,18,在狭缝11的入口后面(y>0μm),狭缝11内部的强度呈指数减小。从而,可以得出,为了在狭缝11后面,或者通常在孔或狭缝11后面得到充分低的激励强度,这些孔径或狭缝11应当具有低于浸液12中的衍射极限的宽度,或者通常应当具有最小维度。
如所示,在图7,图8和图9中分别示出具有不同宽度w,即w=0.2μm,w=0.26μm和w=1μm的孔径,特别是孔11的强度分布。
除了用于对发光体,例如荧光体进行渐逝激励以外,孔径或狭缝11还具有将所产生的荧光朝向检测器引导的功能,并且能大大减少从孔径或狭缝11以外的位置产生的发光的透射。图10示出在存在孔径或狭缝11的情况下,当激励光来自底部时,用于对发光体例如荧光体的辐射发射进行2D计算的几何结构。在计算过程中,用点(电流)源PT1表示发光体,例如荧光体。计算中所用的波长为700nm,并且使用光的TE偏振。
图11示出由定位在针孔11的出射侧15处的用PT1指示的荧光体产生的辐射图案的具体示例,针孔15具有200nm的宽度。该附图示出在基本垂直于纸张平面方向上的电场的实部,与平面波类似,电场的实部从正变为负。因而,图中的刻度从较大负值(箭头22所示)延续到较大正值(箭头23所示)。用孔11下面的辐射源来激励荧光体PT1。从该附图可以看出,假定被TE偏振的辐射在孔11平面的法线方向聚集。这样能够使用低数值孔径(NA)光学装置来收集发光,在该示例中假定为荧光发射。流过该附图上部的总功率流为96.6%,而流过该附图下部的总功率流为3.4%。这表明,荧光体PT1向下发射的所有光此时几乎都向上发射。由此,发现荧光功率增强1.93(96.6%/0.5)倍。
图12示出类似计算,不过此时是在自由空间中,不存在(图案化的)狭缝11。正如所预计的,在此情形中,被激励的荧光体PT1所产生的功率的50%向上流动,50%向下流动。
实际上,不仅定位在孔径或狭缝11处的发光体,如荧光体将发光,而且在孔径或狭缝11外部以及激励光束内部的诸如荧光体的发光体也将发光。在本段落中,将估计孔径或狭缝11外部产生的发光(例如荧光)的影响。图13示出背景荧光体PT1,即离开位于孔11的激励侧的狭缝11的距离为1μm处的荧光体PT1的具体示例的强度分布。该模拟表明,通过孔11可进行很好的抑制,因为仅有0.285%的荧光功率通过孔11透射到检测侧,比位于孔11入口14处的荧光体PT1的振幅低一个量级。这相当于与没有狭缝11的情形相比,将狭缝11后面的荧光功率抑制0.5/0.00285=175倍。类似地,图14示出位于距孔11的距离为2μm处的荧光体PT1的强度分布。在此情形中,仅有0.149%的荧光功率透过孔11,与没有狭缝11的情形相比,相当于将荧光功率抑制0.5/0.00149=336倍。在图13和图14中都可以看出,荧光基本上没有到达检测侧。
从上面所述的有限元模拟,一般可以得出:
1.照明具有小于浸液12的衍射极限的宽度或最小维度的孔径或狭缝11,或孔径或狭缝11的阵列,导致也处于衍射极限维度以下的小激励体积被局限于孔径或狭缝的邻近。
2.孔径或狭缝11几乎仅透射孔径或狭缝11的邻近或内部所产生的发光辐射,例如荧光辐射:对远离孔径或狭缝11的发光体辐射,例如荧光体辐射的典型抑制的幅值要优两个量级。
3.孔径或狭缝11将发光,例如荧光聚集在孔径或狭缝11平面的法线方向上。
下面,将说明对于通过小孔径或狭缝11行进的波,明显地抑制发光辐射的透射,即对于比狭缝或孔径维度的20%大的波长,显著抑制发光辐射的透射。为了研究深孔径或狭缝11对光透射的影响,使用如图15中所示的具有微孔或孔径11的100μm厚的硅箔片。测量针孔箔片的光透射率,并在图16中示出结果。从该附图可以看出,对于更长波长,即对于350nm以上的波长,光透射率保持较低(~0.5%,如对于Al层所预期的),但是对于小于300nm的UV波长,在200nm处透射率增加到4.5%,此时,密封的Al层,即没有孔径或狭缝11的层,将不具有任何UV透射率。注意,这些结果是针对相当大的孔(~1.5μm)的。对于较小的孔,最小透射率将低于此处的测量值。
下面,将描述本发明的实施例。
在本发明的第一实施例中,提供诸如生物传感器的传感器,其包括设有孔径11(在本实施例中可以为孔11)的晶片衬底10,因而形成多孔性衬底10。在本发明的实施例中,术语“衬底”可包括任何潜在材料,或者可使用或者在其上可形成设备、电路或外延层的材料,只要其至少一部分对激励光不透明即可。在其他可选实施例中,所述“衬底”可包括半导体衬底,诸如掺杂硅,砷化镓(GaAs),镓砷磷(GaAsP),磷化铟(InP),锗(Ge)或锗化硅(SiGe)衬底。除半导体衬底部分以外,所述“衬底”可包括例如诸如SiO2或Si3N4层的绝缘层。因而,术语衬底也包括玻璃上硅,蓝宝石上硅衬底。因此,一般使用术语“衬底”来定义用于处于感兴趣的层或部分下面的层的元件。此外,“衬底”可以是在其上可形成层的任何其他基底,例如玻璃,塑料或金属层。主要限制是与孔径11相邻的衬底10的材料对于激励光不透明,即具有较大衰减。这表明,孔径11延伸进去的叠层(stack)的至少一部分应当对于激励光不透明。
衬底10中的孔11可具有小于激励辐射波长的维度,优选比填充孔径11的介质(浸液12)中激励辐射的波长的50%更小,以便具有渐逝波激励,更优选小于填充孔径11的介质中波长的40%,这也可以表达为孔11可以具有亚波长尺寸的事实。衬底10可包括孔11的阵列。孔11的阵列可以是孔11的周期性阵列,即相邻孔11的中心之间的距离是相同的。然而,并非必须如此。相邻孔11之间的距离也可以不同,从而不形成周期性阵列。
在使用中,可以将具有孔结构11的多孔性衬底10浸入介质12中,例如诸如水或空气的液体或气体中。液体或气体可包括被传感器感测或检测衬底,例如小珠/分子或被标记的目标分子。
在下面的描述中,将用术语孔和孔结构来表示同一样东西,即在晶片衬底10中形成的孔径11。根据第一实施例,孔11可具有倾斜的侧壁24。然而,本发明不限于此,孔11也可以具有其他形状。正如从图17可以看出的,在本实施例中例如可以为荧光体25的发光体25,存在于孔11的内部,例如每个孔11有一个发光体25。将利用荧光体25和荧光对本实施例进行进一步描述,不过应当理解的是,这仅仅为了便于说明,而不限制本发明。本发明也可以应用于其他任何种类的发光体25和发光。
通过激励光从上部照明衬底10中形成的孔结构11(箭头26所示)。根据本发明,衬底10中的孔11可以具有亚波长尺寸,即低于激励辐射波长的维度,其最好低于传感器所浸入的,或者填充孔径或狭缝的浸液12的衍射极限。为了低于可以为液体或气体的浸液12的衍射极限,孔径11具有的维度应当小于填充孔径11的介质内部的波长的一半,即<λ/(2*n);其中,n为填充孔径11的介质的折射率,λ为真空波长。
如前面已经讨论的,如果孔11的尺寸低于衍射极限,并且更普遍来说,如果孔11的最小维度小于填充孔11的介质中激励光26的波长的一半,则激励光26不能通过孔11传播,以便具有渐逝波,即不能传播的波。因而,在孔结构11的入口14处,因为孔11的维度较小,激励光26将被反射。从而,在孔11的内部产生渐逝场,并且该渐逝场被反射,在孔11内部和后面留下渐逝场。存在于孔11中某一位置处,因而处于渐逝场中的荧光体25将被激励,并将发射荧光辐射(箭头27所示)。由于该荧光辐射27基本上不能通过孔11,基本上所有的荧光辐射27都将向下发射,然后被发送到用于测量荧光信号的检测单元(附图中未示出)。可通过任何适当的检测器,例如使用电荷耦合设备(CCD)或互补金属氧化物半导体(CMOS)检测器对荧光辐射27,或者更通常而言对发光辐射的强度进行检测。或者,可以使用仅得到小成像视图(imaging view)的扫描方法。可按照获得最佳信噪比的方式在光电二极管上采集某一时间的光。这样可充分增加传感器的灵敏度。
注意,任何向上行进的荧光辐射27,即受激励的荧光体25所产生的通常不会到达检测单元的辐射,将遇到孔结构11,而如上所述,孔结构11基本上不透射光。结果,向上的荧光辐射27被反射,这导致朝向检测单元引导的总荧光功率大体上被增加2倍,然后荧光辐射向下指向检测单元。与没有倾斜侧壁24的情形相比,由于孔11的侧壁24倾斜,荧光辐射27被集中在更小的空间角中。这表明,对于具有检测器和用于对在检测器上的荧光成像的光学装置(数值孔径)的给定接收角(即空间角)的光学系统,收集额外的荧光辐射28,与基于WO02/059583中所述的检测器的结果相比,将生物传感器的灵敏度增加大约10倍。或者,检测器可用于更低功率的接收角和/或具有更低数值孔径(NA)的光学装置。图18示出这如何工作。在该附图中,附图标记28所示的箭头表示荧光体25发射出的荧光。正如可以看出的,荧光28沿所有方向发射。在与朝向检测器的方向相反的方向引导的荧光28,在本例中为向上方向,将被反射到三角形侧壁24上,并改为朝向检测器的方向引导。朝向检测器引导的总荧光用箭头27来表示。
此外,处于孔结构11上面,即处于激励光26之内但并不处于孔11内部的荧光体25,也被激励光26激励。然而,这些荧光体25产生的荧光27不能通过孔11,从而不会被检测到。因此,在孔结构11上面产生的任何荧光27,基本上对背景信号没有作出贡献。对于远离孔11的荧光体25发出的辐射的抑制的幅值要优两个量级。
优点在于,激励光束26不必被聚焦-其渐逝场将到达孔或狭缝结构11内部的发光体25-并且无需采取特殊措施来实现多光斑激励。用多光斑激励意味着,用一个或多个激励光斑,例如用激励光斑阵列照明孔径或狭缝结构11。例如,可以使光斑的位置与孔11的位置相匹配,在孔/光斑中产生更有效的激励强度。从图17中可以看出三角形,即具有倾斜侧壁24的孔或孔径11的存在,导致射线按照这样一种方式被重新定向,即使荧光27的更多功率被聚集到给定空间角度中;这导致对于给定数值孔径的采集光学装置和给定接收角度的检测器,增加了所采集功率的量。
根据第一实施例,照明宽度或最小维度小于填充孔或孔径11的介质中激励波长的50%,优选小于填充孔或孔径11的介质中激励波长的40%的孔11(的阵列),导致激励体积小于衍射极限:
1.对于宽度或最小维度小于衍射极限并且被TE偏振光照明的狭缝11的阵列,这意味着在狭缝11平面的法线方向以及狭缝11的深度方向,狭缝内部和后面的激励体积的维度小于衍射极限,所述衍射极限为填充狭缝11的介质中波长的一半:2D渐逝体积。用TM偏振光照明时并非如此,狭缝11的阵列主要透射激励光。
2.对于维度小于衍射极限的孔径11的阵列,狭缝内部和后面的激励体积的维度在所有三个方向都小于衍射极限:3D渐逝体积。
多孔性衬底10的厚度无需具有渐逝场穿透深度(penetration depth)的量级,但是,多孔性衬底10越厚,则孔11的阵列透射的功率越少。可以将第二衬底安装到孔结构11上,反之亦然,可以为现有衬底增加多孔性结构11。这可以改变衬底10的机械稳定性。该方法的先决条件是第二衬底对于激励波长或发射波长中至少之一是透明的。可参照本发明的第二实施例对此进行说明。
图19中说明了本发明的第二实施例。第一衬底10设有具有亚波长维度的孔11,即维度小于填充孔径或狭缝11的介质中激励辐射的波长,例如小于填充孔径或狭缝11的介质中激励波长的50%,优选小于填充孔径或狭缝11的介质中激励波长的40%,因此形成多孔性衬底10。在图19中所示的示例中,多孔性衬底10被安装到第二衬底29的顶部上。然而,应当理解的是,这仅是一个示例,并不限制本发明。也可以将第二衬底29安装到多孔性衬底10的顶部上。
如果将第二衬底29定位在多孔性结构10与检测器30之间,则第二衬底29对于发射波长应当是透明的。在其他实施例中,将第二衬底29定位在多孔性结构10与激励光源之间,第二衬底29对于激励波长应当是透明的。对于例如可见光范围内的激励波长,第二衬底24可包括诸如石英、氟化钙、硼硅酸盐等的玻璃状材料。
正如从图19可以看出,在所示实施例中,箭头26所示的激励光从上面照明多孔性衬底10。在孔11的入口21a处,由于孔11的小宽度或最小维度(其小于针对填充孔径或狭缝11的介质的衍射极限),激励光20被反射。从而,在孔11的内部产生渐逝场。存在于孔11中的发光体,在本实施例中可以为荧光体25,将被激励,并发射荧光辐射27。由于该荧光辐射27不能穿过孔11,实践中,仅靠近孔11的出口21b产生的荧光辐射27(在给出的示例中处于第二衬底24一侧)将被检测器30检测到,条件是多孔性衬底10的厚度足够厚,即比渐逝场的衰减长度稍厚。检测器30可以是电荷耦合设备(CCD)或互补金属氧化物半导体(CMOS)检测器。或者,可使用仅能得到小的成像视图的扫描方法。在某一时刻,按照获得最佳信噪比的方式在光电二极管上采集光。这样可以充分增加传感器的灵敏度。
如上面实施例中所述,在使用具有亚波长宽度或最小维度的孔径或孔11的多孔性衬底10的生物传感器中,问题在于在孔径或孔11内部产生的发光,例如荧光辐射,在射出孔径或孔11之前被强烈地抑制。
在本发明的实施例中,由圆孔11形成孔径11,对光的抑制并不取决于偏振态。然而,当使用狭缝结构11取代圆孔结构11时,偏振态变得很重要。下面,将讨论偏振态对抑制辐射的影响。下述讨论的目的是分析狭缝11的透射的偏振依赖性,并估计在根据本发明实施例的发光生物传感器中如何对此加以利用。
在折射率n=1.3的水环境中,对于电和磁分量,即对TE和TM偏振,对单狭缝生物传感器进行分析。在此分析中,在折射率n=0.038361519-j*5.074565且宽度为200nm的金衬底10中制造狭缝11。激励辐射的波长λ为700nm。在模拟中,假设狭缝11无限延伸到与模拟平面垂直的方向。这无意于将本发明限制为上述的模拟值。
通过解出通过狭缝11传播的基模,可确定衰减长度。在图20中对此加以说明,其中,将TE(曲线31)和TM(曲线32)偏振光在衬底10中的狭缝11中的衰减长度给定为狭缝11的宽度的函数。该附图清楚地示出,对于宽度小于水的衍射极限,即低于270nm的狭缝11的情形,TE偏振基模的传播的衰减长度明显小于TM偏振模的衰减长度。
图21到25示出对于300nm厚狭缝11及TE偏振光(图21)和TM偏振光(图22),对于600nm厚狭缝11和TM偏振光(图23),以及1000nm厚狭缝11和TM偏振光(图24),以及1000nm厚狭缝11和TE偏振光(图25)的强度分布。
图26和27示出沿狭缝11的中心(x=0)的归一化强度(相对于x=y=0处的强度进行归一化)。图26示出针对宽度为200nm,深度为1000nm(曲线33)和300nm(曲线34)的狭缝11,利用TE偏振光时透射率对于对数刻度[dB]的偏振依赖性;以及针对宽度为200nm、深度为300nm(曲线35),600nm(曲线36)和1000nm(曲线37)的狭缝11,用TM偏振光时透射率对于对数刻度的偏振依赖性。图27示出对于TM偏振光以及深度为300nm(曲线38),600nm(曲线39)和1000nm(曲线40)的狭缝11,沿狭缝11中心线的强度。
从图21到27可以得出:
1.对于TM的透射明显大于对TE偏振的透射。
2.对TM偏振光的强度图案看似为驻波(在y方向的干涉图案)。
3.对于更长的长度也具有驻波图案(对于TM偏振)。
4.看似某种谐振效应(对于600nm厚金层来说狭缝11内部的归一化强度高于对于300,1000nm厚金层的归一化强度)。
辐射通过单个狭缝11的透射表现出很强的偏振依赖性:对于TE偏振态(平行于狭缝11的E场)的透射明显低于对TM偏振态的透射。狭缝11内部的TM偏振辐射的强度分布为驻波图案,这表明Fabry-Perot效应;这也得到针对狭缝高度600nm的更强的最大归一化强度,即谐振效应的支持。在狭缝11的后面,强度迅速地下降,这有助于在狭缝11后面的自由空间中发散(如同TE偏振)。
下面,观察在所给出的金层的示例中衬底10的厚度的影响,该衬底10包括与上面的分析具有相同宽度即200nm的狭缝11的阵列,并且两相邻狭缝11之间的距离为2.5μm。狭缝11的厚度取决于衬底10的厚度,并且与衬底10的厚度相同。图28示出对于具有700nm波长的TE偏振光,狭缝11阵列的透射(曲线41)和总反射(曲线42)。图29示出对于具有700nm波长的TM偏振光,金衬底10中狭缝11阵列的总透射(曲线41)和总反射(曲线42)。图29中的曲线43表示透射+反射。所使用的模拟工具为GSOLVER420c工具。
正如前面已经观察到的,在所给出的金衬底10的示例中,对于TM偏振光可以得出(从图28和29),狭缝11的透射(曲线41)和反射(曲线42)按照周期的方式随衬底10的厚度而定:对于厚度为860nm的衬底10产生最大透射,其相当于透射9.7%,对于厚度为740nm的衬底10产生最小透射,其相当于透射3.9%。注意,在这些计算中,对于TE偏振包括+/-11衍射级(diffraction order),对于TM偏振包括+/-51衍射级。对于TE偏振光,随着衬底厚度的增加,透射减小,并且直到某一衬底厚度反射都增加,此后反射恒定。
作为狭缝11的密集阵列的一个示例,考虑相邻狭缝11的中心之间距离为0.4μm的阵列的情形,狭缝11具有的宽度为0.2μm。图30和31示出在给出厚度的金层示例中,对于TM偏振光,狭缝11的周期性阵列以衬底10的厚度为函数的透射,透射随金层或衬底10的厚度周期性地改变。透射曲线的包络线随金层的厚度呈指数下降,这是因为在金层中发生了损失。TM偏振光具有~62μm的穿透((1/e)^2透射)深度,其明显大于对于TE偏振光(大约150nm)的穿透深度。图32示出对于TE偏振光,狭缝11的周期性阵列以金层或衬底11的厚度为函数的透射。
应当注意,本发明不限于上面所述的狭缝11的周期性阵列。
从上面的讨论,以及从分别针对TE偏振光和TM偏振光示出对于300nm厚狭缝11的强度分布的图21和22可以看出,TE偏振光得到很强的抑制,并且基本上不会到达狭缝11的出口15,而TM偏振光能透射狭缝11。必须注意,一小部分TE偏振光依然能到达狭缝11的出口15,如模拟所示。由于狭缝11内部的TE偏振光呈指数衰减,狭缝11后面的部分随狭缝11的深度增加而减小。TE偏振光的衰减常数随狭缝11宽度的减小而增加。
在图33中,描述根据本发明的传感器的第三实施例的基本原理。根据第三实施例的传感器包括至少具有一个狭缝11的衬底10,在狭缝11中具有至少一个发光体25,例如荧光体。在该实施例中,使用TE偏振激励光44来激励发光体25,例如荧光体,其存在于衬底10中狭缝11的内部,其中衬底10可以由不透明材料,即由对于激励辐射不透明的材料制造而成。由于激励光44具有TE偏振,其不会透过狭缝11,仅利用渐逝场激励发光体25,例如荧光体。
在激励之后,发光体25,例如荧光体发射包括TE和TM偏振的非偏振的发光辐射45。如果狭缝11较深,即如果狭缝11具有的深度大于衰减长度的两倍,则实际上仅TM偏振的发光辐射46能够射出狭缝11(大约为发射出的荧光辐射的50%)。TE偏振的发光受到很强的抑制。对于深度为衰减长度两倍的狭缝11,在狭缝11的中心中荧光体25发射出的TE偏振辐射得到衰减:狭缝11底部的强度仅为荧光体25的中心处强度的13%。
第三实施例相对于本发明的第一和第二实施例来说具有优点和缺点。
一个优点是更容易采集发射出的发光,例如荧光。如果狭缝11较深,这表明大约50%的发光,例如荧光能够射出狭缝11,而具有相同深度的孔或间隙或其他孔径11将不允许发光(例如荧光)射出。这样能够产生被测量的额外的发光,例如荧光,因而产生更好的信号背景比。
另一优点是狭缝11中受激励发光体25,例如荧光体的数量可能更高,这是因为在狭缝11的方向该结构本质上是开放的,从而预期可发射出更多的荧光。
第三实施例的缺点在于,在发射出的发光例如荧光中,仅有50%是TM偏振的,并且在该TM发光例如荧光中,仅有50%被朝向狭缝11的出口指向,其他50%向后朝向激励光束的起点。这意味着所发射的发光例如荧光中仅有25%最终被检测。这表明对于存在的相同量的发光体25,检测到更低功率。因此,必须将这一缺点与更容易采集的优点的效应进行权衡,以便确定对于特定的应用,是否需要例如孔的孔径或狭缝11。这至少取决于孔径或狭缝11的深度。
与第一和第二实施例类似,第三实施例也能够通过使用改变辐射方向的倾斜壁24,对于给定的光学装置的数值孔径和检测器30的接收角采集额外的发光,例如荧光,因此将辐射聚集到狭缝11的更小空间角度内。
在狭缝11的激励侧产生的TM偏振的背景发光,例如荧光,能够透射过狭缝11,并且有助于形成背景信号。这导致背景信号增加,除非采取抑制该背景发光例如荧光的步骤。这可通过将激励光束聚焦到狭缝11上来进行。或者,正如现有技术,可进行洗涤步骤,通过洗掉未结合的发光体25,来减小背景发光的量。这两种选项都使第三实施例与第一和第二实施例相比更加复杂,而并非必须如此。
本发明的所有实施例表现出非常小的激励体积。然而,在第一和第二实施例中这是以三维进行的,而在当前的实施例中,仅以二维进行。不过,第三实施例允许使用深狭缝11,与第一和第二实施例中的结构相比,其具有的优点是激励表面(或体积)明显更大。
取决于必须使用传感器,例如生物传感器或化学传感器的应用的种类,必须考虑优点和缺点,以便确定上述哪个实施例最适于执行该特定应用。
在上述实施例中,通过使用聚焦到孔径或狭缝11上的多光斑光束,能够更有效地实现对发光体25,例如荧光体的照明或激励。此外,上述实施例可同时用于不同波长。为了使用不同波长,如果孔尺寸足够小,即如果例如孔的孔径或狭缝11的最小维度小于激励辐射的波长,例如小于波长的50%,优选小于激励辐射波长的40%,或者如果孔径或狭缝11的最小维度小于填充孔径或狭缝11的介质的衍射极限,则仅需要改变激励频率或波长。例如,当用折射率为1.3的水填充孔径或狭缝11时,这表明对于真空中700nm的波长,衍射极限为269nm(即真空中波长/2*水的折射率)。在根据本发明的其他实施例中,可使用尺寸从1到10nm的荧光纳米粒子(量子点)。通常,介于200和400nm之间的激励波长将导致多色发射,发射波长取决于粒子直径。
在另外的实施例中,可使用电化学或化学发光标记。在此情形中,可通过电化学或化学进行激励。
所有上述实施例都提供了在诸如水或空气的流体内部工作的具有3D(孔径11,例如孔的阵列)或2D(狭缝11的阵列)激励体积的传感器,特别是生物传感器。在这些实施例中,流体通道可包括薄膜,例如薄金属薄膜。然而,包括薄薄膜的结构特别易碎。这可以通过将狭缝或孔径11的阵列或多孔性衬底10‘夹在’第一或上板47与第二或下板48(看起来更远)之间来克服。第一和第二板47,48优选由透明材料制造而成。此外,对于较深狭缝或孔径11,即对于深度为几个,例如≥3个衰减长度的狭缝或孔径11,为了检测狭缝或孔径11后面或前面的发光,例如荧光,所产生的发光例如荧光当通过第一或第二板47,48传播时得到抑制,这导致与狭缝或孔径11的后面或前面相比荧光信号明显更低。例如,在孔径或狭缝深度为3个衰减长度的情形中,可以抑制成初始强度的0.002。其解决方法是检测通过上和/下板47,48的发光,例如荧光,这导致板47,48后面的发光(例如荧光)信号明显大于狭缝或孔径11后面或前面的发光(例如荧光)信号。
在根据本发明的第四实施例中,提供纳米流体通道以及形成这种纳米流体通道的方法。图34示出了纳米流体通道阵列的横截面。根据该示例,通道长度在y方向是均匀的。纳米流体通道可包括夹在第一或上板42与第二或下板43之间的、具有狭缝或孔径11的多孔性衬底10。上和下板优选由透明材料形成。衬底10可以是半导体例如Si,或例如金的金属衬底,只要其对于激励辐射不透明即可。在狭缝11中可存在流体,例如水。
下面,将讨论这种纳米流体通道的制造方法。在第一步骤中,可以将衬底材料10沉积到第一或上板47上(或者沉积到第二或下板48上)。然后,将衬底材料10图案化,以在板47或48的顶部形成孔径或狭缝11的阵列。可利用本领域技术人员公知的技术,例如显微光刻法对衬底材料10进行图案化。在下一步骤,可以将第二或下板48(或第一或上板47)结合或粘接到狭缝或孔径11的阵列的顶部上。在粘接的情形中,胶水可能渗透到纳米通道中。应当防止发生这种情形。因此,优选在透明度,润湿性和粘度的基础上选择所使用的胶水。
可通过上板47或通过下板48实现对溶解在存在于狭缝或孔径11中的流体中的发光体25(例如荧光体)的激励。图35说明通过上板47激励溶解在狭缝或孔径11中的流体中的发光体25,例如荧光体。该示例不限制本发明,也可以通过下板48来进行激励。在图35中,附图标记49表示可通过上板47发送的激励光。激励辐射49可以是TM或TE偏振的。在激励辐射49是TM偏振的情形中,不产生渐逝场,且激励辐射49通过狭缝11传播到下板48。如果激励辐射49是TE偏振的,则可产生渐逝场,且激励辐射49基本上不会通过狭缝11传播,条件是狭缝11足够深,即具有几个衰减长度,例如3个衰减长度的深度。从而,可通过上板47(箭头50所示)和通过下板48(箭头51所示)来检测所产生的发光50,51,例如荧光。发光辐射50,51,例如荧光辐射,主要是TM偏振的。
可以将板47,48制造成,使发光辐射50,51,例如荧光辐射,被更好地准直,并且使更大部分(更大视角)可到达检测器(未示出)。为此,如图36所示,可分别将板47,48图案化。图案化可使得得到具有倾斜侧壁52的板47,48,这能够将发光辐射50,51采集到更小立体角内。
在使用狭缝11和渐逝激励体积(evanescent excitation volume)的情形中,TE偏振激励光优于TM偏振光,这是因为其在狭缝11内的穿透深度明显更小。另一方面,在具有圆形针孔11的情形中,TE偏振与TM偏振等效。因此,在其他实施例中,利用足够小的穿透深度,通过经由一个板47,48激励并通过另一个板47,48检测发光(例如荧光),可以将激励光与发光(例如荧光)分离。
第四实施例的一个可能的缺点是,激励和发光路经,例如荧光路经沿相同方向。在长穿透深度的情况下,这意味着通过狭缝或孔径11不能分离激励辐射49和发光辐射50,51,例如荧光辐射,正如从图35可以看出的。在另一实施例中,可通过沿平行于板47,48(即y方向)的方向进行激励来避免该情况。因此,在狭缝或孔径11中,可提供沿基本平行于板47,48,即沿y方向引导的光斑53。在图37中表示出此情形。光斑35也可以是沿y方向传播的平面波。优选地,使通过上和下板47,48的激励光的量最小。本实施例的原理是,在假设狭缝或孔径11例如延伸到纸张中时,使用沿垂直于纸张平面的方向引导的激励辐射49。由此,可以将激励辐射49(图37中未示出)与发光辐射50,51(例如荧光辐射)分离。
从而,第四和第五实施例示出,可使用如上在第一和第二实施例中所述的狭缝或孔径结构11来制造具有改进机械强度和发光(例如荧光)激励的纳米流体通道。此外,根据本发明形成纳米流体通道的方法廉价、简单。
在根据本发明的实施例中,通过使用可识别一个或多个感兴趣目标(也称作被分析物)的表面固定配体,可改善传感器,例如生物传感器或化学传感器的选择性。在需要检测不止一个被分析物的情形中,传感器可包括不同配体的阵列。适当配体的例子可以为蛋白质,抗体,核酸适配体,缩氨酸,低(聚)核苷酸,糖,植物凝血素等。例如,可通过适当的表面化学性质将配体固定到孔径或狭缝11的内表面壁(图19中由附图标记58所示)上。表面化学性质的选择仅取决于内表面壁58的化学成分。
例如,当以诸如金,银,Cu或Al的金属形成孔径或狭缝11时,可以例如使用包括第一反应基团的反应物将自组装的单体沉积到内表面壁58上,所述的第一反应基团例如适于结合到孔径或狭缝11的内表面壁58上的硫氢(sulfurhydryl)基团和/或羧基基团。此外,反应物应当包括可用于固定配体的第二反应基团。例如,第二反应基团可以是能够被化学激活以结合到水溶液中的配体的主氨基的羧基基团。对于多种不同化学表面的其它固定策略在本领域中是公知的。
在本发明的实施例中,可以将包括被分析物的溶解挤压通过孔径或狭缝11,以便于例如通过泵送将被分析物结合到配体。这种泵送可以被重复若干次。或者,可使用横向流动,使一部分流体通过孔径或狭缝11。
应当理解的是,尽管此处针对根据本发明的传感器系统已经讨论了优选实施例,特定结构和配置以及材料,不过在不偏离本发明范围和精神的条件下可对形式和细节作出多种改变或变更。例如,本发明也可以采用不使用光学激励的方法,而是例如使用电激励。在此情形中,该方法并没有得益于小激励体积的优点,而得益于传感器前面所产生的发光与传感器内部或后面产生的辐射之间的分离。此外,本发明还应用于非渐逝激励。在此情形中,依然具有小激励体积的优点(例如,对于孔而言,孔平面内的感测体积依然受孔维度的限制)。此外,该结构依然相对封闭(仅在孔径11处开口,因而通常可封闭该结构的至少50%)的事实,依然导致生物传感器前面产生的发光与其他位置产生的发光之间的‘一些’分离。
Claims (21)
1.一种发光传感器系统,包括激励辐射源,检测器和具有彼此相对的第一和第二侧的传感器,以及设有以下部件的衬底(10):
-至少一个具有最小维度的孔径或狭缝(11),和
-在所述至少一个孔径或狭缝(11)中由具有某一波长的激励辐射激励的至少一个发光体(25),
所述至少一个孔径或狭缝(11)填充有介质,并且所述至少一个孔径或狭缝(11)的最小维度小于所述介质中所述激励辐射的波长,
其中,所述激励辐射源定位在所述第一侧,且所述检测器定位在所述第二侧。
2.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,所述至少一个孔径或狭缝(11)的最小维度小于所述介质的衍射极限。
3.根据权利要求2所述的发光传感器系统,其中,所述至少一个孔径或狭缝(11)的最小维度小于填充所述至少一个孔径或狭缝(11)的介质中所述激励辐射波长的50%,优选小于填充所述至少一个孔径或狭缝(11)的介质中所述激励辐射波长的40%。
4.根据权利要求2所述的发光传感器系统,其中,所述的最小维度小于水的衍射极限。
5.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,所述衬底(10)包括至少一个孔(11)。
6.根据权利要求5所述的发光传感器系统,其中,所述至少一个孔(11)具有倾斜的侧壁(24)。
7.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,所述衬底(10)包括至少一个狭缝(11)。
8.根据权利要求1所述的发光传感器系统,包括孔径或狭缝(11)的阵列。
9.根据权利要求8所述的发光传感器系统,其中,所述孔径或狭缝(11)的阵列是周期性阵列。
10.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,将设有至少一个孔径或狭缝(11)的所述衬底(10)定位在另一衬底(29)上。
11.根据权利要求10所述的发光传感器系统,其中,所述另一衬底(29)对激励辐射(26)和/或发光辐射(27)是透明的。
12.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,将设有至少一个孔径或狭缝(11)的所述衬底(10)定位在第一或上板(47)与第二或下板(48)之间。
13.根据权利要求12所述的发光传感器系统,其中,将所述第一或上板(47)和/或第二或下板(48)图案化。
14.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,所述检测器(30)是CCD或CMOS检测器。
15.根据权利要求1所述的发光传感器系统,所述至少一个孔径或狭缝(11)包括内表面壁(58),其中,将配体固定在所述至少一个孔径或狭缝(11)的内表面壁(58)上。
16.根据权利要求1所述的发光传感器系统,其中,所述发光传感器系统是发光生物传感器系统。
17.根据权利要求16所述的发光传感器系统,其中,所述发光生物传感器系统是荧光生物传感器系统。
18.一种用于检测衬底(10)中至少一个孔径或狭缝(11)中至少一个荧光体(25)所产生的发光辐射的方法,所述至少一个孔径或狭缝(11)具有最小维度,所述至少一个孔径或狭缝(11)填充有介质,该方法包括:
-利用处于所述衬底(10)的第一侧的激励辐射激励所述至少一个发光体(25),在填充所述孔径或狭缝(11)的介质中,所述激励辐射具有的波长大于所述至少一个孔径或狭缝(11)的最小维度,并且
-检测来自处于所述衬底(10)的第二侧的至少一个受激励的发光体(25)的发光辐射,所述第二侧与第一侧相对。
19.根据权利要求18所述的方法,其中,在填充所述孔径或狭缝(11)的介质中激励辐射的波长至少比所述至少一个孔径或狭缝(11)的最小维度大2倍。
20.根据权利要求19所述的方法,其中,所述激励辐射包括TE偏振光。
21.根据权利要求18所述的方法,所述至少一个孔径或狭缝(11)包括内表面壁(58),其中,该方法还包括将配体固定到所述至少一个孔径或狭缝(11)的内表面壁(28)上。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP05105599.4 | 2005-06-23 | ||
EP05105599 | 2005-06-23 | ||
PCT/IB2006/051942 WO2006136991A1 (en) | 2005-06-23 | 2006-06-16 | Luminescence sensors using sub-wavelength apertures or slits |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN101203743A true CN101203743A (zh) | 2008-06-18 |
CN101203743B CN101203743B (zh) | 2011-04-06 |
Family
ID=37398646
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN2006800224970A Expired - Fee Related CN101203743B (zh) | 2005-06-23 | 2006-06-16 | 使用亚波长孔径或狭缝的发光传感器 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20100019155A1 (zh) |
EP (1) | EP1896830A1 (zh) |
JP (1) | JP2008544276A (zh) |
CN (1) | CN101203743B (zh) |
BR (1) | BRPI0612267A2 (zh) |
WO (1) | WO2006136991A1 (zh) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104004650A (zh) * | 2014-05-28 | 2014-08-27 | 上海丽恒光微电子科技有限公司 | 生物流体高分子探测装置以及探测方法 |
CN108594595A (zh) * | 2018-03-12 | 2018-09-28 | 中山大学 | 一种具有微纳图形结构的掩膜板制作方法和纳米光刻方法 |
Families Citing this family (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ATE479088T1 (de) * | 2005-12-20 | 2010-09-15 | Koninkl Philips Electronics Nv | Aus einem gitter und einem polarisator zusammengesetzter biosensor mit eindimensionalen sub-diffraktions-begrenzten öffnungen |
CN101346621B (zh) * | 2005-12-22 | 2010-12-29 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 在反射模式下工作的发光传感器 |
US8207509B2 (en) | 2006-09-01 | 2012-06-26 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Substrates, systems and methods for analyzing materials |
US20100044585A1 (en) * | 2006-10-31 | 2010-02-25 | Klunder Derk J W | Biosensor using wire-grids for increasing cavity energy |
DE102006056949B4 (de) * | 2006-11-30 | 2011-12-22 | Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg | Verfahren und Vorrichtung zur Detektion mindestens einer Eigenschaft von mindestens einem Objekt mit einem Mikrochip |
WO2008078264A1 (en) * | 2006-12-21 | 2008-07-03 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Wiregrid waveguide |
EP2097738B1 (en) | 2006-12-21 | 2013-11-20 | Koninklijke Philips N.V. | Aperture biosensor with trenches |
US9134244B2 (en) | 2007-02-12 | 2015-09-15 | Koninklijke Philips N.V. | Wiregrid monitor device |
DE102007016699A1 (de) * | 2007-04-04 | 2008-10-09 | Synentec Gmbh | Biochip für die Fluoreszenzanalyse von einzelnen Transportern |
US20080280374A1 (en) * | 2007-05-08 | 2008-11-13 | General Electric Company | Methods and systems for detecting biological and chemical materials on a submicron structured substrate |
WO2009001245A1 (en) * | 2007-06-27 | 2008-12-31 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Improved sensors using sub-wavelength apertures or slits. |
WO2009040746A1 (en) * | 2007-09-28 | 2009-04-02 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Sensor device for the detection of target components |
JP2009098009A (ja) * | 2007-10-17 | 2009-05-07 | Fujifilm Corp | 蛍光検出装置およびその装置に使用される微小開孔金属薄膜の作製方法 |
US7767441B2 (en) * | 2007-10-25 | 2010-08-03 | Industrial Technology Research Institute | Bioassay system including optical detection apparatuses, and method for detecting biomolecules |
WO2009060360A2 (en) * | 2007-11-05 | 2009-05-14 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Microelectronic opiacal evanescent field sensor |
WO2009060350A1 (en) * | 2007-11-09 | 2009-05-14 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Microelectronic sensor device |
CN101910827B (zh) * | 2007-12-26 | 2012-09-05 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 微电子传感器设备 |
AU2009292629B2 (en) * | 2008-09-16 | 2014-03-20 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Substrates and optical systems and methods of use thereof |
EP2198965A1 (en) | 2008-12-19 | 2010-06-23 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Integrated device for automated simultaneous detection of multiple specific targets using nucleic acid amplification |
EP2221605A1 (en) | 2009-02-12 | 2010-08-25 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | A wire grid sensor |
CN102576194A (zh) * | 2009-09-23 | 2012-07-11 | Asml荷兰有限公司 | 光谱纯度滤光片、光刻设备以及器件制造方法 |
WO2011058488A1 (en) | 2009-11-12 | 2011-05-19 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | A chip holder kit for a wire-gird sensor. |
US8711356B2 (en) * | 2010-02-25 | 2014-04-29 | Stichting Imec Nederland | Gas sensor with a porous layer that detectably affects a surface lattice resonant condition of a nanoparticle array |
US9753028B2 (en) * | 2015-05-05 | 2017-09-05 | Maxim Integrated Products, Inc. | Electric-field imager for assays |
US10107790B1 (en) * | 2015-05-05 | 2018-10-23 | Maxim Integrated Products, Inc. | Electric-field imager for assays |
US10605816B1 (en) | 2015-08-11 | 2020-03-31 | Maxim Integrated Products, Inc. | H-field imager for assays |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1105535A1 (en) * | 1998-08-13 | 2001-06-13 | U.S. Genomics | Optically characterizing polymers |
US6356389B1 (en) * | 1999-11-12 | 2002-03-12 | Reflexite Corporation | Subwavelength optical microstructure light collimating films |
US6917726B2 (en) * | 2001-09-27 | 2005-07-12 | Cornell Research Foundation, Inc. | Zero-mode clad waveguides for performing spectroscopy with confined effective observation volumes |
US6503409B1 (en) * | 2000-05-25 | 2003-01-07 | Sandia Corporation | Lithographic fabrication of nanoapertures |
US7399445B2 (en) * | 2002-01-11 | 2008-07-15 | Canon Kabushiki Kaisha | Chemical sensor |
US6858436B2 (en) * | 2002-04-30 | 2005-02-22 | Motorola, Inc. | Near-field transform spectroscopy |
EP1535106A4 (en) * | 2002-08-01 | 2009-01-07 | Api Nanofabrication And Res Co | PHASE DELAY PRECISION DEVICES AND METHOD FOR MANUFACTURING THE SAME |
EP1445601A3 (en) * | 2003-01-30 | 2004-09-22 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Localized surface plasmon sensor chips, processes for producing the same, and sensors using the same |
-
2006
- 2006-06-16 JP JP2008517655A patent/JP2008544276A/ja not_active Withdrawn
- 2006-06-16 US US11/917,947 patent/US20100019155A1/en not_active Abandoned
- 2006-06-16 WO PCT/IB2006/051942 patent/WO2006136991A1/en not_active Application Discontinuation
- 2006-06-16 EP EP06765772A patent/EP1896830A1/en not_active Withdrawn
- 2006-06-16 BR BRPI0612267A patent/BRPI0612267A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2006-06-16 CN CN2006800224970A patent/CN101203743B/zh not_active Expired - Fee Related
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104004650A (zh) * | 2014-05-28 | 2014-08-27 | 上海丽恒光微电子科技有限公司 | 生物流体高分子探测装置以及探测方法 |
CN104004650B (zh) * | 2014-05-28 | 2016-03-02 | 上海珏芯光电科技有限公司 | 生物流体高分子探测装置以及探测方法 |
CN108594595A (zh) * | 2018-03-12 | 2018-09-28 | 中山大学 | 一种具有微纳图形结构的掩膜板制作方法和纳米光刻方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BRPI0612267A2 (pt) | 2019-03-19 |
WO2006136991A1 (en) | 2006-12-28 |
US20100019155A1 (en) | 2010-01-28 |
CN101203743B (zh) | 2011-04-06 |
JP2008544276A (ja) | 2008-12-04 |
EP1896830A1 (en) | 2008-03-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101203743B (zh) | 使用亚波长孔径或狭缝的发光传感器 | |
US8039814B2 (en) | Luminescence sensor operating in reflection mode | |
EP1938049B1 (en) | Luminescence sensor comprising at least two wire grids | |
RU2502985C2 (ru) | Носитель для оптического детектирования в малых объемах образца | |
US20190369092A1 (en) | Method for the topographically-selective passivation of micro- and nanoscale devices | |
CN101583864A (zh) | 线栅波导 | |
US20100252751A1 (en) | Microelectronic opiacal evanescent field sensor | |
KR20050084016A (ko) | 전자기장 분포 발생 방법 | |
CN101223425B (zh) | 使用多层衬底结构的发光传感器 | |
JP4463610B2 (ja) | 表面プラズモン共鳴センサ装置 | |
US20100221842A1 (en) | Sensor device for the detection of target components | |
CN103293127A (zh) | 基于soi的多狭缝光波导光栅fp腔光学生化传感芯片 | |
TWI653449B (zh) | 光子晶體與磁珠結合的螢光免疫檢測裝置和方法 | |
CN101910827B (zh) | 微电子传感器设备 | |
WO2008078263A1 (en) | Aperture biosensor with trenches | |
CN114729889A (zh) | 荧光检测用生物分子检查芯片 | |
CN103293129B (zh) | 基于狭缝光波导外延型光栅fp腔光学生化传感芯片 | |
CN203324181U (zh) | 基于soi的狭缝光波导光栅fp腔光学生化传感芯片 | |
JP2009020093A (ja) | 小型化表面プラズマ共振感知チップ | |
Zempoaltecatl et al. | Design and fabrication of silicon-based optofluidic waveguide platforms | |
CN103293104A (zh) | 多狭缝光波导外延型光栅fp腔光学生化传感芯片 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C14 | Grant of patent or utility model | ||
GR01 | Patent grant | ||
C17 | Cessation of patent right | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20110406 Termination date: 20120616 |