CA2728459A1 - Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux - Google Patents

Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux Download PDF

Info

Publication number
CA2728459A1
CA2728459A1 CA2728459A CA2728459A CA2728459A1 CA 2728459 A1 CA2728459 A1 CA 2728459A1 CA 2728459 A CA2728459 A CA 2728459A CA 2728459 A CA2728459 A CA 2728459A CA 2728459 A1 CA2728459 A1 CA 2728459A1
Authority
CA
Canada
Prior art keywords
peptide
midkine
hla
cells
protein
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Abandoned
Application number
CA2728459A
Other languages
English (en)
Inventor
Jerome Kerzerho
Bernard Maillere
Emmanuel Favry
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Original Assignee
Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA filed Critical Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Publication of CA2728459A1 publication Critical patent/CA2728459A1/fr
Abandoned legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464499Undefined tumor antigens, e.g. tumor lysate or antigens targeted by cells isolated from tumor
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/18Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for pancreatic disorders, e.g. pancreatic enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/08Drugs for disorders of the urinary system of the prostate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/10Drugs for disorders of the urinary system of the bladder
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P5/00Drugs for disorders of the endocrine system
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56966Animal cells
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/475Assays involving growth factors

Abstract

Peptide issu de la protéine Midkine comprenant au moins un épitope T CD4+ ou T CD8+ restreint aux molécules HLA prépondérantes dans la population caucasienne ou polynucléotide codant ledit peptide, comme vaccin anticancéreux ou comme réactif pour l'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine au cours d'un cancer ou d'un traitement anticancéreux.

Description

PEPTIDES IMMUNOGENES ISSUS DE LA PROTEINE MIDKINE COMME
VACCIN ANTICANCEREUX
L'invention est relative à l'utilisation comme vaccin anticancéreux, de peptides issus de la protéine Midkine capables d'induire des lymphocytes T
CD4+
et/ou T CD8+ reconnaissant ladite protéine Midkine chez la majorité des individus de la population caucasienne, dans de nombreux types de cancers.
L'invention est également relative à l'utilisation de tels peptides reconnus par des lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la protéine Midkine, chez la majorité des individus de la population caucasienne, dans de nombreux types de cancers, comme réactif pour l'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine au cours d'un cancer ou d'un traitement anticancéreux.
Les cellules tumorales expriment un ensemble de protéines que les cellules saines n'expriment pas ou peu, ou qui ne sont retrouvées que dans quelques types cellulaires. Ces protéines étant préférentiellement exprimées dans les cellules tumorales, peuvent constituer un antigène tumoral, c'est-à-dire une protéine présente dans la tumeur et qui induit une réponse immunitaire capable de reconnaître les tumeurs et idéalement de les éliminer. Cette réponse peut être aussi bien une réponse en anticorps dans la mesure où l'antigène est membranaire qu'une réponse cellulaire impliquant des lymphocytes T CD8+ ou CD4+. La plupart des antigènes tumoraux sont intracellulaires et induisent une réponse cellulaire. Ils constituent des cibles privilé-giées pour le développement de vaccins.
Les lymphocytes T contribuent à la réponse immunitaire cellulaire dirigée contre les tumeurs. Ils peuvent être induits spontanément chez les patients atteints de cancer et infiltrer les tumeurs, donnant dans des cas rares une régression spontanée. Ils peuvent être induits par des vaccins qui sont prévus pour faciliter leur recrutement. Il existe deux sortes de lymphocytes T impliqués dans l'immunité
anti-tumorale. Les lymphocytes T CD8+ sont cytotoxiques (CTL CD8+) et peuvent lyser les cellules tumorales. La lyse de cellules lors de leur reconnaissance fait intervenir la perforine et les granzymes. Les lymphocytes T CD8+ reconnaissent l'antigène tumoral sous la forme de peptides, dénommés épitopes T CD8+, que leur présentent les molé-cules HLA de classe I (HLA-A, HLA-B et HLA-C) présentes à la surface des tumeurs.
Les lymphocytes T CD4+ de type auxiliaire reconnaissent les antigènes de tumeurs
2 sous la forme de peptides, dénommés épitopes T CD4+, que leur présentent les molécules HLA de classe II. La reconnaissance par les lymphocytes T CD4+ des tumeurs peut se faire de manière directe lorsque les tumeurs expriment des molécules de classe II ou de manière indirecte grâce à la capture de débris cellulaires par les cellules dendritiques qui sont des cellules qui possèdent un nombre élevé de molécules HLA de classe II à leur surface. Les lymphocytes T CD4+ impliqués dans l'immunité
anti-tumorale jouent un rôle multiple dans le contrôle des tumeurs et en particulier interviennent dans le recrutement et le maintien des CTL CD8+. Les lymphocytes T
CD4+ jouent un rôle d'activation des cellules dendritiques (DC) via un mécanisme dépendant du CD40. Ils augmentent la sécrétion d'IL-12 par les DC et l'expression à
leur surface de molécules de co-stimulation ou d'adhésion (1-CAM-1, CD80, CD86).
Cette activation permet le recrutement de CTL. En outre, les résultats observés chez des souris n'exprimant pas de molécules de classe I indiquent également que les lymphocytes T auxiliaires exercent un contrôle des tumeurs via des mécanismes indé-pendants des CTL probablement via l'activation de macrophages. Enfin, les lympho-cytes T CD4+ peuvent eux-mêmes être cytotoxiques. Les cellules dendritiques inter-viennent également dans l'immunité anti-tumorale en initiant cette réponse.
Les lymphocytes T naïfs spécifiques des tumeurs sont en effet recrutés et activés par les cellules dendritiques et non par les cellules tumorales.
La découverte des premiers antigènes tumoraux dans les années 1990 a été à l'origine de nombreuses études sur ces protéines exprimées dans les tumeurs.
En fonction de leur mode d'expression, les antigènes tumoraux ont été répartis en plusieurs catégories.
* Les antigènes spécifiques des tumeurs Il s'agit du groupe d'antigènes le plus important, qui a été initialement découvert dans les mélanomes mais qui en fait est exprimé dans de nombreuses tumeurs. Ces antigènes sont également appelés "Cancer Testis" en raison de leur expression dans les testicules qui est le seul tissu sain qui les expriment.
Certains de ces antigènes sont également exprimés dans le placenta ou les ovaires. Les testicules et le placenta étant dépourvus de molécules HLA conventionnelles, ces antigènes ne sont pas visibles pour les lymphocytes T dans les tissus sains. Les principaux anti-gènes sont les antigènes MAGE-A, MAGE-B, MAGE-C, GAGE, LAGE et SSX.
3 PCT/FR2009/000744 *Les antigènes de différenciation Les antigènes de différentiation sont des protéines exprimées par des tumeurs et par le tissu cellulaire qui lui a donné naissance. Les exemples les plus connus sont des antigènes du mélanome qui sont également exprimés dans les mêla-nocytes. Il s'agit des tyrosinases (TYRO, TRP-1 et TRP-2) et des antigènes Gp100 et MELAN-A/MART-1. D'autres antigènes de différenciation sont également connus pour des tumeurs de la prostate (kallikreine-4 et PSA) ou le cancer de l'appareil digestif (CEA).
*Les antigènes surexprimés Les antigènes surexprimés sont des protéines fortement exprimées dans de nombreuses cellules tumorales alors que leur taux d'expression est peu élevé
dans les cellules normales. C'est le cas de l'antigène HER-2/neu qui est retrouvé chez environ 30 % des carcinomes du sein et des ovaires et dans certains carcinomes du colon et du rein. La P53 est également fréquemment surexprimée dans les tumeurs.
Cette protéine qui inhibe la multiplication cellulaire est normalement très rapidement recyclée dans les cellules normales. La télomerase (hTERT) est trouvée chez plus de 80 % des tumeurs, quelle que soit leur origine. tissulaire alors qu'elle est absente ou exprimée à bas bruit dans les cellules normales. L'action de la télomérase sert à
compenser la réduction des télomères qui a lieu lors de la division cellulaire. Le maintien d'une longueur constante des télomères par la télomérase favorise la prolifé-ration cellulaire et donc la tumorigénèse. Les protéines inhibitrices de l'apoptose (IAP) comme la protéine Survivine constituent une famille de protéines qui, en inhibant les caspases, inhibent la mort cellulaire.
*Autres antigènes Les autres catégories d'antigènes sont les antigènes résultant d'une mutation ou d'un arrangement génétique (MUM-1, CDK4, béta-caténine, HLA-A2, BCR-ABL, CASP-8) et les antigènes tumoraux d'origine virale (protéines E6 et des papillomavirus impliqués dans le cancer du col de l'utérus).
Bien que de nombreux antigènes tumoraux aient été déjà découverts, les vaccins pour lutter contre le cancer ne sont pas au point. Les essais de vaccination demeurent assez décevants et les cas de régression provoqués par les vaccins sont rares. Ces échecs résultent d'une faible immunogénicité des antigènes identifiés ou de
4 mécanismes d'échappement qui font que la tumeur n'exprime plus l'antigène cible.
Les antigènes ciblés ne sont souvent pas vitales pour la cellule si bien que l'échappement tumoral peut avoir lieu. Les antigènes identifiés l'ont été
principale-ment sur des mélanomes et ne sont pas adaptés aux nombreux autres cancers. Il y a peu d'antigènes connus ayant un large spectre d'expression et qui permettent de disposer d'un vaccin adapté à de nombreux cancers. Il s'agit principalement des anti-gènes surexprimés tels que la télomérase et la survivine (Demande Internationale PCT
WO 2007/036638).
Pourtant, il existe de nombreuses protéines préférentiellement expri-mées dans les cellules tumorales quelle que soit leur origine et qui donc pourraient constituer des vaccins adaptés à de nombreux cancers. Pour que ces protéines aient un intérêt vaccinal, il est nécessaire de montrer qu'elles induisent des lymphocytes T
capables de reconnaître des. cellules tumorales qui expriment ces protéines.
Il est en effet possible qu'elles ne soient que faiblement immunogènes en raison de méca-nismes de tolérance ou l'absence d'épitopes T dans leur séquence. Il est également possible qu'elles soient capables d'induire une réponse immunitaire mais que les cellules induites ne reconnaissent pas les tumeurs. Les épitopes T issus de ces protéines peuvent en effet ne pas être présentés à la surface des cellules tumorales en raison d'un niveau insuffisant d'expression ou d'un mauvais apprêtement des protéines dans les cellules tumorales.
La protéine Midkine (MDK), également dénommée NEGF2 (Neurite outgrowth promoting factor 2), a été mise en évidence en 1988, en tant que protéine de cellules de carcinome embryonnaire induite par l'acide rétinoïque (Kadomatsu et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 1988, 151, 1312-1318; pour une revue voir http://www.midkine.org). Chez l'homme, le gène de la Midkine est localisé sur le chromosome 11 en position l lpl 1.2. Il comporte 4 exons et a une taille de 3,5kb ; la séquence codante correspond au numéro d'accès NCBI M69148 (SEQ ID NO : 1 dans la liste de séquences en annexe). La région 5' régulatrice contient un site de réponse à
l'acide rétinoïque et deux sites de réponses au suppresseur de tumeur WT1 (Wilms Tumor Suppressor 1). Le site de réponse à l'acide rétinoïque est responsable de l'induction de l'expression de la Midkine par l'acide rétinoïque, alors que les sites de réponses à WT1 interviennent dans la diminution de l'expression par WT1. Un variant d'épissage de la protéine Midkine humaine, dénommé INSP106, a également été
décrit (Demande Internationale PCT WO 2004/052928).
La Midkine est une protéine de 143 acides aminés riche en résidus basiques et qui possède cinq ponts disulfure [(37,61) ; (45,70) ; (52,74) ;
(84,116) ;
5 (94,126)]. La séquence humaine correspond au numéro d'accès SwissProt P21741 (Figure 1 et SEQ ID NO: 2 dans la liste des séquences en annexe). Elle est exprimée sous la forme d'un précurseur comportant un peptide signal de 22 acides aminés (Figure 1). Elle présente environ 50 % d'homologie avec la protéine Pleiotrophine. La structure de la Midkine a été résolue par RMN en 1997. La protéine comporte deux domaines différents, chacun constitué par trois feuillets béta anti-parallèles maintenus par des ponts disulfure; les deux domaines sont reliés par une région flexible.
L'activité biologique (croissance des neurites, fibrinolyse et migration des cellules nerveuses) ne nécessite que le domaine C- terminal. Ce domaine est conservé et est retrouvé depuis la drosophile jusqu'à l'homme, ce qui confirme son rôle fonctionnel.
Il comporte également deux sites de fixation de l'héparine. On connaît au moins quatre récepteurs capables de lier la Midkine ce qui lui confère de nombreuses activités: les membres de la famille Syndecan qui sont des protéoglycanes comportant des héparine sulfates; PTP~ qui est un protéoglycane comportant des chondroïtine sulfate; ALK (Anaplastic Lymphoma Kinase); LRP qui est un membre de la famille des récepteurs des LDL.
Chez un individu normal, la Midkine est principalement exprimée lors de l'embryogénèse avec un pic d'expression en milieu de gestation. La Midkine intervient dans le développement des neurones. Elle provoque la croissance des neurites et la migration des cellules nerveuses. Elle intervient dans le développement de la jonction neuromusculaire et la protection des neurones. Lors de l'embryogénèse, la Midkine intervient dans le développement des dents, des poumons, des reins et des os. Les souris déficientes pour le gène de la Midkine sont viables et elles ne sont affectées que dans des fonctions neuronales en accord avec le rôle de la Midkine dans le développement du système nerveux. Il a également été observé que les souris rendues déficientes pour le gène de la Midkine sont moins affectées que les souris témoin par l'induction de néphrites. Elles sont également moins sujettes à la restenose (rétrécissement des artères du à la prolifération des tissus artériels endommagés).
6 La Midkine est surexprimée dans de nombreuses tumeurs alors que chez des individus sains et adultes son expression est moindre et locale (intestin grêle, cerveau). La Midkine fait partie des 40 gènes les plus exprimés dans les tumeurs par rapport aux tissus sains (Velculescu et al., Nat. Genet., 1999, 23, 387-388).
La Midkine est surexprimée dans environ 80 % des cas de nombreux cancers humains en particulier de carcinomes. Son expression élevée a été observé notamment dans les cancers de l'cesophage, de l'estomac, du colon, du pancréas, de la thyroïde, des poumons, du sein, de la vessie, de l'utérus, de l'ovaire, de la prostate, les carcinomes hépatocellulaires, les ostéosarcomes, les neuroblastomes, les glioblastomes, les astro-cytomes, les leucémies et les tumeurs de Wilm (Moon et al., Gynecologic Oncology, 2003, 88, 289-297; Hidaka et al., Leukemia Res., 2007, 8, 1045-105 1; Maeda et al., Br. J. Cancer, 2007, 97, 405-411; Ren et al., World J. Gastroenterol., 2006, 12, 2006-2010). Une expression élevée a été corrélée avec un mauvais pronostic dans les cancers de la vessie, les glioblastomes et les neuroblastomes (O' Brien, Cancer Res., 1996, 56, 2515-2518). En outre, la surexpression de la Midkine est corrélée avec une résistance accrue à la chimiothérapie dans des lignées de cellules humaines de cancer gastrique. Son expression n'est pas uniquement tissulaire. Un niveau élevé de Midkine a été observé dans le sérum de plus de 60 % des patients atteints de carcinomes (Muramatsu et al., J. Biochem., 2003, 132, 259-371). Ce niveau diminue lorsque la tumeur est retirée. La présence de Midkine dans le sérum pourrait donc avoir une valeur diagnostique. La Midkine semble posséder de nombreuses activités en relation avec la tumorigénèse. Elle possède en effet une activité transformante, anti-apoptotique, mitogénique, angiogénique, fibrinolytique et chimiotactique (Kadomatsu et al., Cancer Letters, 2004, 127-143). Il a été montré qu'une stratégie antisens ciblant le gène de la Midkine supprime la tumorigénèse d'un carcinome chez la souris (Takei et al., Cancer Research, 2001, 61, 8486-8491).
Du fait de ses nombreuses activités biologiques, la Midkine ou ses modulateurs (inhibiteurs) sont utiles pour stimuler l'angiogénèse, l'hématopoïèse, prévenir l'athérosclérose et la resténose, inhiber l'apoptose, dans la prévention et le traitement de pathologies inflammatoires, cardiaques (infarctus du myocarde), céré-brales, hépatiques, nerveuses, rénales, oculaires (rétinoptahies), neurofibromateuses, respiratoires (asthme et hyperplasie pulmonaire), post-chirurgicales (Demandes
7 américaines US 2003/0072739, US 2003/0185794, US 2004/0077579, US
2005/0079 1 5 1, US 2006/0148738 et US 2005/0130928; Demande européenne EP
1832296, Demandes Internationales PCT WO 2007/055397 et WO 2000/031541 Brevets US 5,629,284 ; US 6,383, 480 ; US 6,572,851).
En outre, du fait de l'expression fréquente de la Midkine dans les tumeurs, associée à la présence de la protéine dans le sang et l'urine, ainsi que de l'existence d'un polymorphisme de la Midkine associé au risque de cancer, la Midkine représente un marqueur pour l'évaluation du risque, le diagnostic et le pronostic du cancer (Brevet US 7,090,983 et Demandes US 2003/0149534 et US 2004/0219614).
La détection de la Midkine est notamment effectuée à l'aide d'anticorps monoclonaux spécifiques d'une Midkine tronquée correspondant aux positions 23 à 25 et 82 à

du précurseur de la Midkine (Demande américaine US 2004/0219614). Le promoteur de la Midkine est également utilisé dans des stratégies de gène-suicide.
En revanche, l'immunogénicité de la protéine Midkine n'a pas été
étudiée.
Les Inventeurs ont montré que la protéine Midkine qui possède une expression préférentielle dans les tumeurs contenait des peptides capables d'induire des lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques reconnaissant la protéine Midkine exprimée par les cellules tumorales dans de nombreux types de cancers, chez la majo-rité des individus de la population caucasienne. Ces peptides représentent des candi-dats potentiels pour la vaccination prophylactique ou thérapeutique contre les cancers, étant donné qu'ils sont susceptibles d'induire une réponse T CD4+ et T CD8+
dirigée contre la tumeur, chez la majorité des patients vaccinés, dans la mesure où :
(i) ils sont issus d'un antigène exprimé par de nombreuses tumeurs, (ii) ils sont aptes à
induire des lymphocytes T CD4+ et T CD8+ spécifiques reconnaissant l'antigène exprimé
par les tumeurs, et (iii) ils sont reconnus par des lymphocytes T CD4+ et T CD8+
chez la majorité des individus de la population caucasienne du fait qu'ils prennent en compte le polymorphisme des molécules HLA et sont restreints aux molécules HLA prépon-dérantes dans la population caucasienne.
En outre, ces peptides qui sont reconnus par des lymphocytes T
CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques d'un antigène tumoral exprimé par la majorité
des tumeurs, sont utiles pour l'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la
8 Midkine au cours de l'évolution d'un cancer et notamment après un traitement anti-cancéreux (chirurgical, chimiothérapie, radiothérapie, immunothérapie).
La présente invention a en conséquence pour objet l'utilisation d'un peptide issu de la protéine Midkine comprenant au moins un épitopè T CD4+ ou T
CD8+ restreint aux molécules HLA prépondérantes dans la population caucasienne ou d'un polynucléotide codant ledit peptide, pour la préparation d'un vaccin anti-cancéreux, destiné au traitement des cancers associés à une surexpression tumorale de ladite protéine Midkine.
Définitions - On entend par "peptide issu de la Midkine" aussi bien la protéine Midkine (précurseur de 143 acides aminés ou protéine mature (positions 23 à
143 du précurseur) qu'un fragment peptidique d'au moins 8 acides aminés consécutifs de ladite protéine. On entend par Midkine , une protéine Midkine issue de n'importe quel mammifère ; de préférence, il s'agit de la protéine humaine. Les positions des peptides issus de la Midkine sont indiquées en référence à la séquence humaine (SwissProt P21741, Figure 1 et SEQ ID NO: 2).
- On entend par molécule HLA prépondérante dans la population caucasienne ou molécule HLA prépondérante , une molécule HLA I (HLA-A
HLA-B ou HLA-C) ou HLA II prépondérante. Il s'agit des molécules HLA-A, HLA-B
et HLA-C comprenant une chaîne alpha codée par un allèle dont la fréquence est supé-rieure à 5 % dans la population caucasienne, comme précisé au Tableau I ci-dessous.
9 Tableau I : Fréquence génique (allélique*)/phénotypique d'HLA I

Allèles Europe USA Afro- Afrique Asie France Allemagne Caucasien américain Sénégal Inde Japon Al 14,6/27,1 17/31,1 16,6/30,4 5,3/10,3 4,9/9,6 11,1/21,0 0,7/1,4 A2 20,9/37,4 26,6/46,1 27,9/48,0 17,3131,6 18,6/33,7 12,1/22,7 24,1/42,4 A3 9,2117,6 14,2/26,4 11,4/21,5 8,9/17,0 5,8/11,3 7,9/15,2 0,6/1,2 Ail 5,7/11,1 5,5/10,7 5,3/10,3 2,6/5,1 15,9/29,3 10,4/19,7 B7 7,4/14,3 11,1/21,0 9,8118,6 8/15,4 4,4/8,6 9,5/18,1 5/9,8 B8 7,6/14,6 9,4/17,9 10/19,0 3,1/6,1 6/11,6 3,8/7,5 B18 5,2/10,1 3,7/7,3 4,7/9,2 3,2/6,3 4,5/8,8 2,5/4,9 B27 3,4/6,7 3,9/7,6 3,9/7,6 1,8/3,6 1,9/3,8 2,8/5,5 0,4/0,8 B35 8,2/15,7 9117,2 8,6/16,5 8,3/15,9 13,9/25,9 12/22,6 8,1/15,5 C2 5,1/9,9 7,7/14,8 5,4/10,5 10,1119,2 7,6/14,6 2,5/4,9 12,2/22,9 C4 10,9/20,6 11,8/22,2 9,6/18,3 21,2/37,9 18,1/32,9 14126,0 4,3/8,4 C7 20,9/37,4 28,6/49,0 21,6/38,5 18,2/33,1 12,5/23,4 11,2/21,1 1,112,2 * les molécules HLA I prépondérantes (fréquence génique> 5 % ) sont indiquées en gras Il s'agit également des molécules HLA II comprenant une chaîne béta codée par un allèle dont la fréquence est supérieure à 5 % dans la population cauca-sienne, comme précisé au Tableau II ci-dessous.
Tableau II : Fréquence génique (allélique*)/phénotypique d'HLA II
Europe USA Afrique Asie Allèles Allemagne Caucasien Afro-France Sénégal Inde Japon américain DRB1*0101 9,3/17,7 6,7113 7,3/14,1 1,9/3,8 0,6/1,2 3,8/7,5 4,9/9,6 DRB1*0401 5,6/10,9 8,1/15,5 6,7/13 1,5/3,0 0/0 0,9/1,8 0/0 DRB1*1101 9,2/17,6 9,2/17,6 4,4/8,6 8,2115,7 9,3117,7 0,9/1,8 2/4 DRB1*0701 14,0/26 12,3/23,1 14,4/26,7 9,8118,6 7,8115 13124,3 0,6/1,2 DRBI*0301 10,9/20,6 9,4117,9 9,5/18,1 7113,5 10,2119,4 5,3110,3 0,4/0,8 DRB1*1301 6,0/11,6 4,5/8,8 5,1/9,9 4,2/8,2 4,7/9,2 6,3112,2 0,7/1,4 DRBI*1501 8,0/14,4 7,8/15 10,3/19,5 8,6116,5 0/0 12,1122,7 9,1117,4 TOTAL 63,0/86,3 58,0182,4 57,7/82,1 41,2/65,4 32,/54,66 42,3/66,7 17,7/32,3 DRB5*0101 7,9/15,2 4,6/9 2,4/4,7 10,4119,7 0/0 010 5,6/10,9 DRB3*0101 9,2/17,6 9,8118,6 10,4/19,7 15,1127,9 6,9/13,3 4,9/9,6 6,5112,6 DRB4*0101 28,0/48,2 21,1/37,7 19,8/35,7 16,5130,3 6,9/13,3 24,8143,4 28,9/49,4 TOTAL 45,1/69,9 35,5/58,4 32,6/54,6 42,0/66,4 13,8/25,7 29,7/50,6 41,0/65,2 DPBI*0101 7,1/13,7 2,2/4,4 3,2/6,3 27,7/47,7 18,2/33,1 0,1/0,2 DPB1*0201 11,9//22,4 8,5/16,3 9,8/18,6 12,9/24,1 13,8/25,7 20,6/37 DPB1*0301 17,0/31,1 3,8/7,5 7,4/14,3 3,3/6,5 3,8/7,5 3/5,9 DPB1*0401 40,0/64 38,1/61,7 25,1/43,9 11/20,8 4,8/9,4 4,7/9,2 DPB1*0402 11,0/20,8 15,4/28,4 12,6/23,6 9/17,2 25,5/44,5 36,8/60,1 TOTAL 87,0/98,3 68,0/89,8 58,1/82,4 63,9/87,0 66,1/88,5 65,2/87,9 DP401+402 51176 53,5/78,4 37,7/61,2 20/36,0 30,3/51,4 41,5/65,8 * les molécules HLA II prépondérantes (fréquence génique> 5 %) sont indiquées en gras Certaines des molécules HLA prépondérantes dans la population caucasienne et notamment les molécules HLA-DP401 et HLA-DP402 sont également prépondérantes dans d'autres populations (Amérique du Sud, Inde, Japon, Afrique ;
Tableau II). En conséquence, les peptides selon l'invention ne sont pas restreints à une 5 utilisation dans la population caucasienne, et ils peuvent également être utilisés pour vacciner des individus de pays autres que ceux d'Amérique du Nord et d'Europe, dans lesquels lesdites molécules HLA sont prépondérantes, comme précisé au Tableau II.
Au sens de la présente invention les termes prévalent ,
10 prédominant et prépondérant sont considérés comme équivalents et utilisés indifféremment.
- On entend par "épitope T CD4+ de la Midkine restreint aux molé-cules HLA II prépondérantes dans la population caucasienne", un peptide de 11 à 15 acides aminés qui lie au moins une molécule HLA II, prépondérante dans la popula-tion caucasienne et est reconnu par des lymphocytes T CD4+ chez les individus de cette population ; le peptide comprend une séquence de 9 acides aminés incluant les résidus d'ancrage aux molécules HLA II, flanquée à l'une de ses extrémités, de préfé-rence aux deux extrémités, par au moins 2 acides aminés, de préférence 3 acides aminés.
- On entend par "épitope T CD8+ de la Midkine restreint aux molécules HLA I prépondérantes dans la population caucasienne", un peptide de 8 à
13 acides aminés qui lie au moins une molécule HLA I prépondérante dans la popula-tion caucasienne et est reconnu par des lymphocytes T CD8+ chez les individus de cette population; le peptide comprend une séquence de 8 à 9 acides aminés incluant les résidus d'ancrage aux molécules HLA I.
- On entend par cancer , un cancer associé à la surexpression de la protéine Midkine par des cellules tumorales tel que de façon non-limitative : les cancers de l'oesophage, de l'estomac, du colon, du pancréas, de la thyroïde, des poumons, du sein, de la vessie, de l'utérus, de l'ovaire, de la prostate, les carcinomes hépatocellulaires, les ostéosarcomes, les neuroblastomes, les glioblastomes, les astro-cytomes, les leucémies et les tumeurs de Wilm.
11 - On entend par acide aminé naturel ou synthétique, les 20 (X-acides aminés naturels communément trouvés dans les protéines (A, R, N, D, C, Q, E, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y et V), certains acides aminés rarement rencontrés dans les protéines (hydroxyproline, hydroxylysine, méthyllysine, diméthyllysine..), les acides aminés qui n'existent pas dans les protéines tels que la (3-alanine, l'acide y-amino-butyrique, l'homocystéine, l'ornithine, la citrulline, la canavanine, la norleucine, la cyclohexylalanine..., les acides aminés D dérivés des acides aminés L et les analogues des acides aminés précédents.
- On entend par acide aminé hydrophobe, un acide aminé sélectionné
parmi (code à une lettre) : A, V, L, I, P, W, F et M.
- On entend par acide aminé aromatique, un acide aminé sélectionné
parmi (code à une lettre) : F, W et Y.
Les peptides selon l'invention sont reconnus par des lymphocytes T
CD4+ et/ou T CD8+ chez la majorité des individus dans la mesure où ils sont présentés par des molécules HLA I et HLA II qui sont prépondérantes dans la population cauca-sienne. Ils sont immunogènes c'est à dire qu'ils sont capables d'induire des lympho-cytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine à partir des précurseurs présents chez la majorité des individus naïfs ou bien de stimuler de tels lymphocytes T
chez la majorité des individus présentant un cancer associé à la surexpression de la Midkine. En outre, les lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ qui sont induits chez la majorité des individus reconnaissent la Midkine exprimée par les tumeurs de ces indi-vidus. L'immunogénicité des peptides peut être déterminée, notamment à partir de cellules mononucléées du sang périphérique (PBMCs), par tout essai approprié
connu de l'Homme du métier comme par exemple : un test de prolifération cellulaire, un test de cytotoxicité, un test ELISPOT (dosage des cellules productrices de cytokines) ou un test de dosage des cytokines (IFN-y, IL-2, IL-4, IL-10, IL-5, TNF-(x et TGF-(3).
L'invention englobe les peptides variants naturels ou synthétiques obtenus par mutation (insertion, délétion, substitution) d'un ou plusieurs acides aminés dans la séquence de la Midkine, dès lors que ledit peptide conserve une bonne affinité pour les molécules HLA prépondérantes et est immunogène. Les variants naturels résultent notamment du polymorphisme de la Midkine. En outre, d'autres variants peuvent être aisément construits étant donné que les résidus d'acides aminés
12 impliqués dans la liaison aux molécules HLA- DR et HLA-DP4 (résidus d'ancrage) et l'effet des modifications de ces résidus sur la liaison aux molécules HLA-DR
et HLA-DP4 sont connus de l'Homme du métier ; la Demande Internationale PCT WO
03/040299 enseigne notamment que pour lier HLA-DP4, le résidu en P6 doit être aromatique ou hydrophobe ou consister en un résidu de cystéine (C), et au moins l'un des résidus Pl, P9 est tel que Pl est aromatique ou hydrophobe et/ou P9 est aroma-tique ou hydrophobe ou consiste en un résidu C, D, Q, S, T ou E, alors que le résidu en P4 peut être n'importe quel résidu d'acide aminé. Le Brevet américain US
6,649,166 décrit une méthode générale permettant de déterminer les résidus d'ancrage aux molécules HLA DR (Pl, P4, P6, P7 et P9) et la nature des mutations de ces rési-dus permettant de modifier l'affinité pour les molécules HLA DR. Des motifs de liaison aux molécules HLA DR sont décrits notamment dans Sturnolio et al., Nat.
Biotech, 1999, 17, 533-534 et Rammensee et al., Immunogenetics, 1995, 41, 178-228.
Les résidus d'acides aminés impliqués dans la liaison aux molécules HLA-I (résidus d'ancrage) et l'effet des modifications de ces résidus sur la liaison aux molécules HLA-I sont connus de l'Homme du métier. Les motifs de liaison des peptides aux molécules HLA de classe I sont décrits dans Rammensee et al., Immunogenetics, 1995, 41, 178-228 et dans le Tableau III ci-dessous.
Tableau III : Motifs de liaison des principaux allèles HLA-A*
positions Allèles 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Al T, S D,E L Y
A2 L,M V V,L
A3 L,V,M F,Y I,M,F,V,L I,M,L,F K,Y,F
Ail V,I,F,Y M,L,F,Y,I L,I,Y,F,V K,R
* les résidus majeurs d'ancrage sont en gras.
Il est également connu que certaines substitutions améliorent l'affinité des peptides pour les molécules HLA I sans perturber leur antigénicité c'est le cas de l'introduction d'une tyrosine en position 1 sur un peptide se liant à HLA-A2 (Tourdot et al., Eur. J.
Immunol., 2000,30,3411-3421).
L'invention englobe également les peptides modifiés dérivés des précédents par introduction de toute modification au niveau de résidu(s) d'acide aminé, de la liaison peptidique ou des extrémités des peptides, dès lors que ledit peptide modifié conserve une bonne affinité les molécules HLA prépondérantes et est
13 immunogène. Ces modifications qui sont introduites dans les peptides par les méthodes classiques connues de l'Homme du métier, incluent de façon non-limita-tive : la substitution d'un acide aminé par un acide aminé non-protéinogénique (acide aminé D ou analogue d'acide aminé) ; l'addition de groupement chimique (lipide, oligo ou polysaccharide) au niveau d'une fonction réactive, notamment de la chaîne latérale R ; la modification de la liaison peptidique (-CO-NH-), notamment par une liaison du type rétro ou rétro-inverso (-NH-CO-) ou une liaison différente de la liaison peptidique ; la cyclisation ; la fusion d'un peptide (épitope d'intérêt pour la vaccina-tion ; étiquette utile pour la purification du peptide, notamment sous forme clivable par une protéase) ; la fusion de la séquence dudit peptide avec celle d'une protéine, notamment une chaîne a d'une molécule HLA I ou HLA II, une chaîne (3 d'une molé-cule HLA II ou le domaine extracellulaire de ladite chaîne ou bien encore une séquence de ciblage dans l'endosome dérivée notamment de la chaîne invariable Ii ou de la protéine LAMP-1 ; le couplage à une molécule appropriée, notamment un marqueur, par exemple un fluorochrome ou la biotine. Ces modifications sont desti-nées en particulier à augmenter la stabilité et plus particulièrement la résistance à la protéolyse, ainsi que la solubilité, l'immunogénicité ou à faciliter la purification ou la détection, soit du peptide selon l'invention, soit de cellules CD4+ et/ou CD8+
spéci-fiques dudit peptide.

Selon un mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide est constitué par la protéine Midkine. De préférence, il s'agit de la protéine humaine de séquence SEQ ID NO : 2.
La présente invention englobe l'utilisation de la protéine Midkine dénaturée par tout moyen approprié connu de l'Homme du métier, et notamment la protéine Midkine réduite.
La présente invention englobe également l'utilisation de variants de la protéine Midkine dans lesquels l'une au moins des cystéines impliquées dans un pont disulfure est remplacée par un autre acide aminé, par exemple une sérine.
La présente invention englobe également l'utilisation de peptides d'au moins 8 acides aminés issus de la protéine Midkine qui comprennent au moins un épitope T CD4+ ou T CD8+ tel que définis ci-dessus. L'invention englobe l'utilisation de peptides qui lient l'une des molécules HLA 1 et/ou l'une des molécules HLA
II les
14 plus fréquentes dans la population caucasienne, notamment la molécule HLA-A2 (Tableau I) et/ou les molécules HLA-DR7, HLA-DRB4, HLA-DP401 ou HLA-DP402 (Tableau II). L'invention englobe également l'utilisation de peptides qui lient plusieurs molécules HLA I et/ou HLA II prépondérantes différentes, de façon à
élargir la couverture vaccinale à la majorité de la population caucasienne.
L'invention englobe également l'utilisation de peptides d'au moins 8 acides aminés du domaine N-terminal de la Midkine (positions 1 à 84 en référence à la séquence du précurseur de la Midkine) qui comprennent au moins un épitope T
CD4+
ou T CD8+ tel que définis ci-dessus.
Conformément à l'invention, ledit fragment présente une longueur de 8 à 100 acides aminés, de préférence de 8 à 50 acides aminés, de manière préférée de 10 à 25 acides aminés (10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 ou 25 acides aminés).
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide est un fragment d'au moins 8 acides aminés de la protéine Midkine comprenant au moins un épitope T CD8+ restreint à la molécule HLA-A2, lequel peptide comprend au moins les positions 14 à 21 ou 114 à 122 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
De préférence, ledit peptide comprend les positions 12 à 21, 13 à 21, 13 à 22, 14 à 22 ou 113 à 122 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
De manière préférée, ledit peptide est constitué par les positions 12 à
21 (MDK 12-21), 13 à 21(MDK 13-21), 13 à 22 (MDK 13-22), 14 à 22 (MDK 14-22), 113 à 122 (MDK 113-122) ou 114 à 122 (MDK 114-122) de la séquence en acides aminés de la protéine Midkine ; ces peptides correspondent, respectivement aux séquences SEQ ID NO : 3 à 8 dans le listage des séquences en annexe.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide est un fragment d'au moins 8 acides aminés de la protéine Midkine comprenant au moins un épitope T CD4+ restreint à au moins une molécule HLA II
prépondérante dans la population caucasienne, lequel peptide comprend au moins les positions 9 à 15, 14 à 28, 52 à 64, 64 à 78, 70 à 84, 74 à 88, 78 à 92, 84 à
98, 99 à 113, 105 à 119, 110 à 124 ou 119 à 133 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine. Des exemples de ces peptides sont les peptides de séquence SEQ ID NO
: 9, 10, 13 à 15, 21 à 26, 28, 29 et 30 (Tableau VII).
De préférence, ladite molécule HLA II prépondérante dans la popu-lation caucasienne est choisie parmi les molécules HLA-DR1, HLA-DR3, HLA-DR4, 5 HLA-DR7, HLA-DR11, HLA-DR13, HLA-DR15, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-DP401 et HLA-DP402. Lesdites molécules HLA II sont avantageuse-ment codées respectivement par les allèles HLA DRB1*0101, DRBI*0301, DRBI*0401, DRB1*0701, DRB1*1101, DRB1*1301, DRB1*1501, DRB3*0101, DRB4*0104, DRB5*0101, DP*0401 et DP*0402.
10 De préférence, ledit peptide lie au moins quatre molécules HLA II
différentes, prépondérantes dans la population caucasienne et comprend au moins les positions 9 à 15, 14 à 28 ou 110 à 124 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine. Ledit peptide comprend avantageusement les positions 1 à 15, 4 à
18, 9 à 21, 9 à 22, 9 à 23 ou 14 à 28 de la séquence en acides aminés de la protéine
15 Midkine.
De manière préférée, ledit peptide est constitué par les positions 1 à
15 (MDK 1-15), 4 à 18 (MDK 4-18), 9 à 21 (MDK 9-21), 9 à 22 (MDK 9-22), 9 à 23 (MDK 9-23), 14 à 28 (MDK 14-28), ou 110 à 124 (MDK 110-124) de la séquence en acides aminés de la protéine Midkine ; ces peptides correspondent, respectivement aux séquences SEQ ID NO : 9 à 15 dans le listage des séquences en annexe.
Conformément à l'invention, ledit peptide comprend avantageuse-ment plusieurs épitopes T CD4+ et/ou CD8+ de la protéine Midkine, éventuellement associés à d'autres épitopes T CD4+, TCD8+ ou B. Les épitopes sont avantageusement des épitopes T CD4+ ou T CD8+ issus d'antigène tumoraux tels que décrits sur le site http://www.cancerimmunity.org/peptidedatabase/tumorspecific.htm, notamment des épitopes T CD4+ ou T CD8+ issus de MAGE, NY-ESO-1 ou de la survivine.
Selon une disposition avantageuse, des modes de réalisation précé-dents ledit peptide est un fragment de la protéine Midkine comprenant au moins un épitope T CD8+ restreint à la molécule HLA-A2 et au moins un épitope T CD4+
restreint à au moins quatre molécules HLA II différentes prépondérantes dans la population caucasienne, lequel peptide comprend les positions 9 à 21, 9 à 22, 9 à 23 ou 110 à 124 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine. De préfé-
16 rence, ledit peptide est constitué par les positions 9 à 21 (MDK 9-21), 9 à 22 (MDK 9-22), 9 à 23 (MDK 9-23) ou 110 à 124 (MDK 110-124) de la séquence en acides aminés de la protéine Midkine.
Un tel peptide permet avantageusement d'induire à la fois des lymphocytes T CD4+ et T CD8+ spécifiques de nombreuses tumeurs chez la majorité
des individus de la population caucasienne présentant ces tumeurs.
Les différents épitopes peuvent être inclus dans la composition vaccinale sous la forme d'un mélange de peptides isolés, d'un peptide multiépi-topique, d'une protéine de fusion ou d'un polynucléotide codant les peptides/protéine précédents. Lesdits peptides/protéine peuvent être modifiés ou associés à des lipo-somes ou des lipides, en particulier sous forme de lipopeptides. De préférence, ledit polynucléotide est inclus dans un vecteur, notamment un vecteur d'expression.
Parmi les épitopes pouvant être incorporés dans la composition vaccinale de l'invention, on peut citer notamment :
- les épitopes T CD8+ de MAGE tels que décrits dans le Brevet US
6,063,900 et la Demande PCT WO 2004/052917, - les épitopes T CD4+ de MAGE tels que MAGE-A3 267-282 restreint à DRl (Demande Internationale PCT WO 02/095051).; MAGE-A3 149-160 restreint à DR4 et DR7 (Kobayashi et al., Cancer Research, 2001, 61, 4773-4778) ;
MAGE-A3 191-205 et 281-295 restreints à DRI 1 (Consogno et al:, Blood, 2003, 101, 1038-1044 ; Manici et al., J. Exp. Med., 1999, 189, 871-876) et MAGE-A3 121-restreint à DR13 (Brevet US 6,716,809) ; MAGE-Al 281-292 restreint à DR15 (Demande Internationale PCT WO 00/78806) ; MAGE-A6 102-116, 121-144, 140-170, 145-160, 150-165 et 246-263 restreints à DR4 (Tatsumi et al., Clinical Cancer Research, 2003, 9, 947-954) MAGE-Al 281-292 restreint à DR15 (Demande Internationale -PCT WO 00/78806) MAGE-A6 102-116, 121-144, 140-170, 145-160, 150-165 et 246-263 restreints à DR4 (Tatsumi et al., Clinical Cancer Research, 2003, 9, 947-954) et les épitopes MAGE restreints à HLA-DP4 tels que décrits dans la Demande Internationale PCT WO 2007/026078, - un épitope T CD8+ de la survivine choisi parmi : survivine 96-104 (LTLGEFLKL, SEQ ID NO: 39) ou 95-104 (ELTLGEFLKL, SEQ ID NO : 40),
17 survivine-2B 80-88 (AYACNTSTL, SEQ ID NO : 41) et les peptides tels que décrits dans le Tableau I de Bachinsky et al., Cancer Immun., 2005, 5, 6-, - un épitope T CD4+ de la survivine tel que décrit dans la Demande Internationale PCT WO 2007/036638 et notamment le peptide 19-33, 90-104 ou 93-107, - un épitope T CD4+ universel naturel ou synthétique tel que le peptide de la toxine tétanique TT 830-846 (O'SULLIVAN et al., J. Immunol., 1991, 147, 2663-2669), le peptide de l'hémagglutinine du virus de la grippe HA 307-(O'Sullivan et al., précité), le peptide PADRE (KXVAAWTLKAA, SEQ ID NO : 16;
Alexander et al., Immunity, 1994, 1, 751-761) et des peptides issus des antigènes de Plasmodium falciparum tels que le peptide CS.T3 (Sinigaglia et al., Nature, 1988, 336, 778-780) et les peptides CSP, SSP2, LSA-1 et EXP-1 (Doolan et al., J.
Immunol., 2000, 165, 1123-1137), - un épitope B constitué par un sucre (Alexander et al., précité), ledit épitope B étant de préférence sous la forme d'un glycopeptide, et - un épitope B de la Midkine reconnu spécifiquement par des anti-corps dirigés contre ledit antigène tumoral.
La combinaison d'épitope(s) T CD4+ et/ou T CD8+ de la Midkine avec l'un au moins des épitopes tels que définis ci-dessus permet avantageusement d'améliorer la réponse immunitaire anti-tumorale et notamment l'établissement d'une mémoire immunitaire de long terme.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide issu de la Midkine est un peptide multi-épitopique comprenant la conca-ténation d'au moins deux épitopes identiques ou différents dont l'un au moins est un épitope T CD4+ et/ou T CD8+ de la Midkine. Le peptide multi-épitopique comprend avantageusement d'autres épitopes (épitope T CD4+ ou T CD8+ d'un autre antigène tumoral), tels que définis ci-dessus. Conformément à l'invention, les séquences des différents épitopes, sont reliées entre elles par une liaison peptidique ou séparées par des séquences hétérologues, c'est-à-dire des séquences différentes de celles naturelle-ment présentes à cette position dans la séquence en acides aminés de la Midkine. De préférence, ledit peptide multiépitopique présente une longueur de 20 à 1000 acides aminés, de manière préférée de 20 à 100 acides aminés.
18 Ledit peptide multiépitopique comprend avantageusement une étiquette fusionnée à l'une de ses extrémités, pour la purification ou la détection dudit fragment. L'étiquette, notamment une séquence polyhistidine ou un épitope B
d'un antigène, est de préférence séparée de la séquence multiépitopique par un site de clivage d'une protéase de façon à isoler la séquence multiépitopique, à partir de la fusion.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide issu de la Midkine est un lipopeptide comprenant ,un peptide ou un fragment multiépitopique, tels que définis ci-dessus.
Ledit lipopeptide est notamment obtenu par addition d'un lipide sur une fonction a-aminée ou sur une fonction réactive de la chaîne latérale d'un acide aminé dudit peptide ou fragment multiépitopique ; il peut comprendre une ou plusieurs chaînes dérivées d'acides gras en C4_20, éventuellement ramifiées ou insatu-rées (acide palmitique, acide oléique, acide linoléique, acide linolénique, acide 2-amino hexadécanoïque, pimélautide, trimétauxide) ou un dérivé d'un stéroïde.
La partie lipidique préférée est notamment représentée par un groupe N"-acétyl-lysine NE(palmitoyl), également dénommé Ac-K(Pam).
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit peptide issu de la Midkine est fusionné avec une protéine ou un fragment de protéine hétérologue (protéine de fusion).
Le peptide ou le fragment multiépitopique peuvent être fusionnés avec l'extrémité NH2 ou COOH de ladite protéine ou insérés dans la séquence de ladite protéine. Selon un mode de réalisation avantageux de ladite protéine de fusion, elle est constituée par un peptide tel que défini ci-dessus, fusionné avec une séquence de ciblage dans l'endosome, dérivée de préférence d'une chaîne invariable humaine Ii ou de la protéine LAMP-1. Les séquences de ciblage dans l'endosome et leur utilisa-tion pour le ciblage d'antigènes dans l'endosome sont notamment décrites dans Sanderson et al. (Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1995, 92, 7217-7222), Wu et al.
(Proc.
Nat. Acad. Sci. USA, 1995, 92, 11671-11675) et Thompson et al. (J. Virol., 1998, 72, 2246-2252).
Selon une disposition avantageuse de ladite protéine de fusion, elle est constituée par un peptide tel que défini ci-dessus, fusionné avec l'une des chaînes
19 d'une molécule HLA, de préférence la chaîne béta d'une molécule HLA II ou la chaîne alpha d'une molécule HLA I, ou bien avec un fragment de celle-ci correspon-dant à une molécule HLA soluble, notamment un fragment correspondant au domaine extracellulaire précédé du peptide signal homologue ou d'un peptide signal hétéro-logue. Ledit peptide est avantageusement inséré entre le peptide signal et l'extrémité
NH2 du domaine extracellulaire de la chaîne a ou (3, comme décrit pour la molécule HLA-DR ( Kolzin et al., PNAS, 2000, 97, 291-296).
Alternativement, ledit peptide ou ledit fragment multiépitopique sont fusionnés avec une protéine facilitant leur purification ou leur détection, connue de l'Homme du métier comme notamment la Glutathione-S- Transférase (GST) et les protéines fluorescentes (GFP et dérivées). Dans ce cas, la séquence du peptide ou du fragment multiépitopique d' intérêt est de préférence séparée du reste de la protéine par un site de clivage d'une protéase, pour faciliter la purification dudit peptide ou dudit fragment multiépitopique.
Selon un autre mode de réalisation avantageux de ladite utilisation, ledit polynucléotide code pour un peptide, un fragment multiépitopique ou une protéine de fusion tels que définis ci-dessus.
Conformément à l'invention, la séquence dudit polynucléotide est celle de l'ADNc codant pour ledit peptide ou fragment multiépitopique ou ladite protéine de fusion. Ladite séquence peut avantageusement être modifiée de façon à ce que l'usage des codons soit optimal chez l'hôte dans lequel elle est exprimée.
En outre, ledit polynucléotide peut être lié à au moins une séquence hétérologue.
Au sens de la présente invention, on entend par séquence hétéro-logue relativement à une séquence d'acide nucléique codant pour la Midkine, toute séquence d'acide nucléique autre que celles qui, dans la nature, sont immédiatement adjacentes à ladite séquence d'acide nucléique codant ledit peptide de la Midkine.
De préférence, ledit polynucléotide est inséré dans un vecteur.
Au sens de la présente invention, on entend par vecteur une molé-cule d'acide nucléique capable de transporter un autre acide nucléique à
laquelle elle est associée. Un type de vecteur qui peut être utilisé dans la présente invention inclut, de façon non-limitative, une molécule d'ADN ou d'ARN linéaire ou circulaire constituée d'acides nucléiques chromosomiques, non-chromosomiques, synthétiques ou semi-synthétiques, tel que notamment un vecteur viral, un plasmide ou un vecteur à
ARN.
De nombreux vecteurs dans lesquels on peut insérer une molécule d'acide nucléique d'intérêt afin de l'introduire et de la maintenir dans une cellule hôte 5 eucaryote ou procaryote, sont connus en eux-mêmes ; le choix d'un vecteur approprié
dépend de l'utilisation envisagée pour ce vecteur (par exemple réplication de la séquence d'intérêt, expression de cette séquence, maintien de cette séquence sous forme extrachromosomique, ou bien intégration 'dans le matériel chromosomique de l'hôte), ainsi que de la nature de la cellule hôte. Par exemple, on peut utiliser des 10 acides nucléiques nus (ADN ou ARN) ou des vecteurs viraux tels que les adénovirus, les rétrovirus, les lentivirus et les AAV dans lesquels a été insérée préalablement la séquence d'intérêt ; on peut également associer ladite séquence (isolée ou insérée dans un vecteur plasmidique) avec une substance lui permettant de franchir la membrane des cellules hôtes, telle qu'un transporteur comme un nanotransporteur ou une prépa-15 ration de liposomes, ou de polymères cationiques, ou bien l'introduire dans ladite cellule hôte en utilisant des méthodes physiques telles que l'électroporation ou la microinjection. En outre, on peut avantageusement combiner ces méthodes, par exemple en utilisant l'électroporation associée à des liposomes.
De préférence, ledit vecteur comprend tous les éléments nécessaires à
20 l'expression du peptide ou de la protéine tels que définis ci-dessus. Par exemple, ledit vecteur comprend une cassette d'expression incluant au moins un polynucléotide tel que défini ci-dessus, sous le contrôle de séquences régulatrices de la transcription et éventuellement de la traduction appropriées (promoteur, activateur, intron, codon d'initiation (ATG), codon stop, signal de polyadénylation, site d'épissage).
La composition vaccinale selon l'invention comprend avantageuse-ment un véhicule pharmaceutiquement acceptable, une substance porteuse et/ou un adjuvant.
Les véhicules pharmaceutiquement acceptables, les substances porteuses et les adjuvants sont ceux classiquement utilisés.
Les adjuvants sont avantageusement choisis dans le groupe constitué
par : les émulsions huileuses, les substances minérales, les extraits bactériens, les
21 oligonucléotides contenant des CpG, la saponine, l'hydroxyde d'alumine, le mono-phosphoryl -lipide A et le squalène.
Les substances porteuses sont avantageusement sélectionnées dans le groupe constitué par : les liposomes unilamellaires ou multilamellaires, les ISCOMS, les virosomes, les pseudoparticules virales, les micelles de saponine, les microsphères solides de nature saccharidique (poly(lactide-co-glycolide)) ou aurifère, et les nano-particules.
La composition vaccinale comprend une dose efficace de peptide/protéine/lipopeptide/vecteur permettant d'obtenir un effet prophy-lactique/thérapeutique sur le cancer associé à une surexpression tumorale de la Midkine tel que défini ci-dessus. Cette dose est déterminée et ajustée en fonction de facteurs tels que Page, le sexe et le poids du sujet. La composition vaccinale est géné-ralement administrée selon les protocoles usuels de vaccination, à des doses et pendant une durée suffisante pour induire une réponse cellulaire dirigée contre la protéine Midkine. L'administration peut être sous-cutanée, intramusculaire, intra-veineuse, intradermique, intrapéritonéale, orale, sublinguale, rectale, vaginale, intra-nasale, par inhalation ou par application transdermique.
La composition se présente sous, une forme galénique adaptée à une administration choisie : solution stérile injectable, poudre, comprimés, gélules, suspension, sirop, suppositoires, qui sont préparés selon les protocoles standard.
Selon un mode de réalisation avantageux de ladite composition, elle comprend au moins un épitope T CD4+ et un épitope T CD8+ de la Midkine, sous forme d'un mélange de peptides, d'un fragment multiépitopique et/ou d'un vecteur d'expression codant lesdits peptides ou ledit fragment, tels que définis ci-dessus.
Selon une disposition avantageuse de ce mode de réalisation de ladite composition, elle comprend au moins le peptide MDK 9-21, MDK 9-22, MDK
9-23 ou MDK 110-124.
De préférence, le peptide MDK 9-21, MDK 9-22 ou MDK 9-23 est combiné au peptide MDK 74-88 ou 78-92, au peptide MDK 14-28 ou 99-113 et au peptide MDK 4-18.
Une telle combinaisons de peptides qui lie la molécule HLA-A2 et l'ensemble des molécules HLA-DR1, HLA-DR3, HLA-DR4, HLA-DR7, HLA-DRI 1,
22 HLA-DR13, HLA-DR15, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-DP401 et HLA-DP402 (Tableau VII) , permet avantageusement d'induire des lymphocytes T
CD4+ et T CD8+ chez la quasi-totalité des individus vaccinés.
Selon encore un autre mode de réalisation avantageux de ladite composition, elle comprend un peptide incluant un épitope T CD4+ universel et/ou un épitope T CD4+ et/ou T CD8+d'un autre antigène tumoral, tel que défini ci-dessus.
Les peptides selon la présente invention et les produits dérivés (peptide multiépitopique, protéine de fusion, lipopeptide, vecteur recombinant) peuvent être utilisés en immunothérapie dans le traitement des tumeurs surexprimant la Midkine. Lesdits peptides ou produits dérivés sont utilisés, soit comme vaccin, soit en thérapie cellulaire, ou bien encore par une combinaison des deux approches.
La thérapie cellulaire comprend, la préparation de cellules présenta-trices d'antigènes (cellules dendritiques) par un protocole classique comprenant l'isolement de cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) d'un patient à
traiter et la mise en culture des cellules dendritiques en présence de peptide(s). Dans une seconde étape les cellules présentatrices d'antigène chargées avec le peptide sont réinjectées au patient.
La présente invention a également pour objet une composition vacci-nale, caractérisée en ce qu'elle comprend au moins un fragment peptidique issu de la Midkine tel que défini ci-dessus, un peptide multiépitopique, une protéine de fusion, un lipopeptide ou un vecteur tels que définis ci-dessus, et un véhicule pharmaceuti-quement acceptable, une substance porteuse ou un adjuvant.
La présente invention a également pour objet une méthode de vacci-nation antitumorale, prophylactique ou thérapeutique, caractérisée en ce qu'elle comprend l'administration d'une composition vaccinale telle que définie ci-dessus, à
un individu, par tout moyen approprié tel que défini ci-dessus.
La présente invention a également pour objet l'utilisation d'au moins un peptide tel que défini ci-dessus pour la préparation d'un réactif d'immunomoni-toring de la réponse cellulaire contre la Midkine, destiné à l'évaluation du pronostic ou au suivi du traitement d'un cancer (chirurgie, radiothérapie, chimiothérapie, immuno-thérapie). De préférence, ledit réactif comprend un peptide ou une protéine de fusion tels que définis ci-dessus, par exemple marqué et/ou complexé à une molécule HLA,
23 sous la forme de complexes multimériques HLA/peptide comme des tétramères de complexes HLA/peptide, marqués.
La présente invention a également pour objet une méthode in vitro, d'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine chez un individu présentant un cancer, caractérisée en ce qu'elle comprend :
- la mise en contact d'un échantillon biologique dudit individu avec un peptide tel que défini ci-dessus, et - la détection de lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine, par tout moyen approprié.
La méthode selon l'invention permet de suivre l'évolution de la réponse T CD4+ et/ou T CD8+ dirigée contre la Midkine au cours d'un cancer ou bien d'un traitement antitumoral, notamment une immunothérapie antitumorale ; les lymphocytes T CD4+ spécifiques de la Midkine peuvent être de type TH 1 (sécrétion d'IFN-y), TH2 (sécrétion d'IL-4) ou T régulateur (sécrétion d'IL-10 ou de TGF-(3) ; il est attendu que la réponse T de type TH1 est signe d'une évolution favorable du cancer alors que la réponse T régulatrice est signe d'une évolution défavorable de ce cancer. La détection est effectuée à partir d'un échantillon biologique contenant des cellules T CD4+ et/ou T CD8+, notamment un échantillon de cellules mononucléées isolées à partir d'un prélèvement de sang périphérique (PBMCs).
Les lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine sont détectés par tous moyens, connus en eux-mêmes. Par exemple, on peut utiliser des moyens directs comme la cytométrie de flux en présence de complexes multi-mériques tels que définis ci-dessus, ou bien des moyens indirects comme les tests de prolifération lymphocytaire, les tests de cytotoxicité cellulaire et les dosages de cyto-kines telles que l'IL-2, l'IL-4, l'IL-5, IL-10 et l'IFN-y, notamment par des techniques immunoenzymatiques (ELISA, RIA, ELISPOT) ou par cytométrie de flux (dosage des cytokines intracellulaires).
De manière plus précise :
Une suspension de cellules (PBMC, PBMC déplétées en cellules CD4+ ou CD8+, lymphocytes T préalablement enrichis par une étape de culture in vitro avec les peptides tels que définis ci-dessus ou des lymphocytes T
clonés) est mise en présence desdits peptides et au besoin de cellules présentatrices appropriées,
24 telles que des cellules dendritiques, des PBMC autologues ou hétérologues, des cellules lymphoblastoïdes telles que celles obtenues après infection par le virus EBV
ou des cellules génétiquement modifiées. La présence de cellules T CD4+ et/ou T
CD8+ spécifiques de la Midkine, dans la suspension initiale est détectée à
l'aide des peptides, selon l'une des méthodes suivantes :
* test de prolifération :
La prolifération des cellules T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine est mesurée par incorporation de thymidine tritiée dans l'ADN des cellules.
* test ELISPOT :
Le test ELISPOT permet de révéler la présence de. cellules T sécré-tant de cytokines (IL-2, IL-4, IL-5, IL-10, IFN-y, TNF-(x et TGF-(3) spécifiques d'un peptide tel que défini ci-dessus. Le principe de ce test est décrit dans Czerkinsky et al., J. Immunol. Methods, 1983, 65, 109-121 et Schmittel et al., J. Immunol.
Methods, 1997, 210, 167-174, et sa mise en oeuvre est illustrée dans la Demande Internationale WO 99/51630 ou Gahéry-Ségard et al., J. Virol., 2000, 74, 1694-1703.
* détection des cytokines :
La présence de cellules T spécifiques de la Midkine, sécrétant des cytokines (IL-2, IL-4, IL-5, IL-10, IFN-y, TNF-a et TGF-(3) est détectée, soit par dosage des cytokines présentes dans le surnageant de culture, par un test immuno-enzymatique, notamment à l'aide d'un kit commercial, soit par détection des cytokines intracellulaires en cytométrie de flux. Le principe de détection des cytokines intracellulaires est décrit dans Goulder et al. , J. Exp. Med., 2000, 192, 1819-1832 et Maecker et al., J. Immunol. Methods, 2001, 255, 27-40 et sa mise en oeuvre est illus-trée dans Draenert et al., J. Immunol. Methods, 2003, 275, 19-29.
* complexes multimériques - un échantillon biologique, de préférence des cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC), est mis en contact avec des complexes multimériques marqués, notamment par un fluorochrome, formés par la liaison entre des molécules HLA solubles et des peptides tels que définis ci-dessus, et - les cellules marquées par lesdits complexes multimériques sont analysées, notamment par cytométrie de flux.

De manière avantageuse, préalablement à la mise en contact de l'échantillon biologique avec lesdits complexes, on l'enrichit en cellules T
CD4+
et/où T CD8+, en le mettant en contact avec des anticorps anti-CD4 ou anti-CD8.
Les complexes multimériques HLA /peptide peuvent être préparés à
5 partir de molécules natives extraites de cellules exprimant une molécule HLA
I et ou HLA II ou de molécules recombinantes produites dans des cellules hôte appropriées comme précisé, par exemple dans NOVAK et al. (J. Clin. Investig., 1999, 104, R67) ou dans KURODA et al. (J. Virol., 2000, 74, 18, 8751-8756). Ces molécules HLA peuvent notamment être tronquées (délétion du domaine transmembranaire) et 10 leur séquence peut-être modifiée afin de les rendre solubles ou bien de faciliter l'appariement des chaînes alpha et béta (Novak et al., précité).
Le chargement de molécules HLA avec le peptide peut se faire par mise en contact d'une préparation de molécules HLA comme ci-dessus, avec le peptide. Par exemple, des molécules HLA solubles et biotinylées sont incubées, 15 pendant 72 heures à 37 C, avec un excès d'un facteur 10 de peptides tels que définis ci-dessus, dans un tampon phosphate-citrate 10 mM, NaCI 0,15 M à un pH compris entre 4,5 et 7.
Alternativement, la séquence du peptide peut être introduite dans l'une des chaînes de la molécule HLA sous forme d'une protéine de fusion qui permet 20 la préparation de complexes multimériques HLA /peptides à partir de cellules hôtes appropriées exprimant ladite protéine de fusion. Lesdits complexes peuvent ensuite être marqués, notamment par la biotine.
Les complexes multimériques de type tétramère sont notamment obtenus en ajoutant aux molécules HLA chargées, de la streptavidine marquée par un
25 fluorochrome en quantité quatre fois moindre (mole à mole) par rapport aux molécules HLA. L'ensemble étant ensuite incubé pendant une durée suffisante, par exemple une nuit à température ambiante.
Les complexes multimériques peuvent également être formés, soit par incubation de monomères HLA /peptides avec des billes magnétiques couplées à
la streptavidine comme décrit pour les molécules HLA I (Bodinier et al., Nature, 2000, 6, 707-710), soit par insertion de monomères HLA /peptides dans des vésicules
26 lipidiques comme décrit pour les molécules du CMH de classe II murines (Prakken, Nature Medicine, 2000,6, 1406-1410).
Pour utiliser ces complexes multimériques HLA /peptide notamment de type tétramère, on met en contact une suspension de cellules (PBMC, PBMC
déplétéés en cellules CD4+ et/ou CD8+, lymphocytes T préalablement enrichis par une étape de culture in vitro avec des peptides tels que définis ci-dessus ou des lymphocytes T clonés) avec des complexes multimériques HLA /peptide à une concentration appropriée (par exemple de l'ordre de 10 à 20 g/ml), pendant une durée suffisante pour permettre la liaison entre les complexes et les lymphocytes T
CD4+ et/ou CD8+ spécifiques de la Midkine (par exemple, de l'ordre de 1 à 3 heures).
Après lavage, la suspension est analysée par cytométrie de flux : on visualise le marquage des cellules par les complexes multimériques qui sont fluorescents.
La cytométrie de flux permet de séparer les cellules marquées par les complexes multi-mériques HLA/peptide des cellules non marquées et d'effectuer ainsi un tri cellulaire.
La présente invention a également pour objet un réactif d'immunomonitoring comprenant au moins un peptide tel que défini ci-dessus. De préférence, ledit réactif est inclus dans un coffret (kit). Ledit réactif d'immunomonitoring comprend avantageusement un peptide ou une protéine de fusion tels que définis ci-dessus, éventuellement marqués ou complexés, notamment complexés à des molécules HLA marquées, par exemple biotinylées, sous la forme de complexes multimériques HLA/peptide comme des tétramères de complexes HLA/peptide, marqués.
La présente invention a ainsi, en outre, pour objet un procédé
d'analyse de lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine, caracté-risé en ce qu'il comprend au moins les étapes suivantes :
- la mise en contact, in vitro, d'un échantillon cellulaire avec des complexes multimériques HLA /peptide marqués, notamment par un fluorochrome, lesdits complexes étant formés par la liaison de molécules HLA solubles avec au moins un peptide tel que défini ci-dessus, et - l'analyse des cellules liées auxdits complexes HLA /peptide, notam-ment en cytométrie de flux.
27 Selon un mode de mise en oeuvre avantageux dudit procédé, l'analyse des cellules (lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+) comprend le tri desdites cellules.
La présente invention a en outre pour objet un fragment peptidique issu de la Midkine, un peptide multiépitopique, une protéine de fusion, un lipopeptide, tels que définis ci-dessus.
La présente invention a également pour objet un polynucléotide, une cassette d'expression, un vecteur recombinant, une cellule hôte procaryote ou euca-ryote modifiée, dérivés des peptides/protéine précédents.
L'invention englobe en particulier :
a) des cassettes d'expression comprenant au moins un poly-nucléotide tel que défini ci-dessus, sous le contrôle de séquences régulatrices de la transcription et éventuellement de la traduction appropriées (promoteur, activateur, intron, codon d'initiation (ATG), codon stop, signal de polyadénylation), et b) des vecteurs recombinants comprenant un polynucléotide conforme à l'invention. Avantageusement ces vecteurs sont des vecteurs d'expression comprenant au moins une cassette d'expression telle que définie ci-dessus.
Les polynucléotides, les vecteurs recombinants et les cellules trans-formées tels que définis ci-dessus, sont utiles notamment pour la production des peptides, fragments multiépitopiques et protéines de fusion selon l'invention.
Les polynucléotides selon l'invention sont obtenus par les méthodes classiques, connues en elles-mêmes, en suivant les protocoles standards tels que ceux décrits dans Current Protocols in Molecular Biology (Frederick M. A USUBEL, 2000, Wiley and son Inc, Library of Congress, USA). Par exemple, ils peuvent être obtenus par amplification d'une séquence nucléique par PCR ou RT-PCR, par criblage de banques d'ADN génomique par hybridation avec une sonde homologue, ou bien par synthèse chimique totale ou partielle. Les vecteurs recombinants sont construits et introduits dans des cellules hôtes par les méthodes classiques d'ADN
recombinant et de génie génétique, qui sont connues en elles-mêmes.
Les peptides et leurs dérivés (variants, peptides modifiés, lipo-peptides, fragments multiépitopiques, protéines de fusion) tels que définis ci-dessus, sont préparés par les techniques classiques connues de l'Homme du métier, notam-
28 ment par synthèse en phase solide ou liquide ou par expression d'un ADN
recombi-nant dans un système cellulaire approprié (eucaryote ou procaryote).
De manière plus précise :
- les peptides et leurs dérivés (variants, peptides multiépitopiques) peuvent être synthétisés en phase solide, selon la technique Fmoc, originellement décrite par Merrifield et al. (J. Am. Chem. Soc., 1964, 85: 2149-) et purifiés par chromatographie liquide haute performance en phase inverse, - les lipopeptides peuvent être notamment préparés selon le procédé
décrit dans les Demandes Internationales WO 99/40113 ou WO 99/51630.
- les peptides et dérivés tels que les variants, les fragments multiépi-topiques et les protéines de fusion peuvent également être produits à partir des ADNc correspondants, obtenus par tout moyen connu de l'homme du métier ; l'ADNc est cloné dans un vecteur d'expression eucaryote ou procaryote et la protéine ou le fragment produits dans les cellules modifiées par le vecteur recombinant sont purifiés par tout moyen approprié, notamment par chromatographie d'affinité.
Outre les dispositions qui précèdent, l'invention comprend encore d'autres dispositions, qui ressortiront de la description qui va suivre, qui se réfère à
des exemples de mise en oeuvre de l'objet de la présente invention, avec référence aux dessins annexés dans lesquels :
- la figure 1 représente la séquence peptidique de la Midkine humaine (SEQ ID NO : 2). La séquence complète correspond au précurseur. Le peptide signal est indiqué en caractères gras et souligné.
- la figure 2 illustre la spécificité peptidique des lymphocytes T
CD8+ induits contre les peptides de la Midkine. Les lignées de lymphocytes T
(267.29A, 278.11 A, 314.28) ont été obtenues par stimulation de lymphocytes T
de trois individus sains exprimant HLA-A2 (267, 278, 314). Après 4 semaines de culture, leur spécificité a été testée par Elispot IFN-y.
- la figure 3 illustre la restriction à HLA-A2 des lymphocytes T
CD8+ spécifiques des peptides de la Midkine. La restriction a été évaluée par Elispot IFN-y, à l'aide de cellules C 1 R et C 1 R-A2 (C 1 R transfectées par HLA-A2).
- la figure 4 illustre la reconnaissance des cellules transfectées par un plasmide d'expression de la Midkine, par des lymphocytes T CD8+ spécifiques des
29 peptides de la Midkine. Les cellules C1R-A2 ont été transfectées par un plasmide pcDNA3.1 recombinant contenant la séquence codante de la Midkine (pMDK).
L'activation des lymphocytes T CD8+ par les cellules C1R-A2 transfectées par pMDK
ou non transfectées a été évaluée par Elispot IFN-y.
- la figure 5 illustre l'expression de la Midkine dans les cellules tumo-rales. L'expression de la Midkine a été évaluée dans les cellules Cl R-A2, DLD-1 et Hep G2 par cytométrie de flux, à l'aide d'un anticorps anti-Midkine. Surface grise:
contrôle négatif. Aire sous le trait noir: expression naturelle de la Midkine.
Surface noire: expression de la Midkine après transfection des cellules par un plasmide d'expression de la Midkine.
- la figure 6 illustre la reconnaissance des lignées tumorales par les lymphocytes T CD8+ spécifiques des peptides de la Midkine. La reconnaissance des tumeurs a été testée par Elispot IFN-y, à l'aide de cellules HLA-A2+ CIR-A2 (MDK"), DLD-1 (MDK-) et Hep G2 (MDK+). Les cellules marquées d'une étoile ont été
cultivées en présence d'IFN-y.
- la figure 7 illustre la détection de lymphocytes T CD8+ spécifiques de la Midkine par marquage avec des tétramères spécifiques. Les lignées de lympho-cytes T 314.7 (A et C) et 314.28 (B et D) sont spécifiques respectivement des peptides MDK 114-122 et MDK 13-21. Chaque lignée a été marquée au moyen d'un anticorps anti-CD8 et des tétramères HLA-A2 / MDKI 14-122 (A et B) et HLA-A2 / MDK13-21 (C et D) et analysée par cytométrie de flux. Le pourcentage de chaque population de cellules est indiqué dans chaque quadrant.
- la figure 8 illustre la restriction à HLA II des lymphocytes T CD4+
spécifiques du peptide 9-23 de la Midkine. La restriction a été évaluée par Elispot IFN-y, à l'aide de cellules L transfectées par une molécule HLA II (HLA DR7, -DR11, -DRI5, -DRB5) et chargées par le peptide 9-23.
- la figure 9 illustre la mise en évidence de la reconnaissance de lysats de tumeur par la lignée T 331.24 de lymphocytes T CD4+ spécifiques du peptide 9-23 de la Midkine. La reconnaissance des tumeurs a été testée par Elispot IFN-y, à l'aide de cellules HeLa (MDK-), HeLa-pMDK (MDK+) et Hep G2 (MDK+).

Exemple 1 : Induction d'une réponse T CD8+ spécifique de peptides de la protéine Midkine 1) Matériels et méthodes a) Peptides 5 Sept peptides représentant des épitopes T CD8+ potentiels restreints à la molécule HLA-A2, l'allèle HLA de classe I le plus représenté dans la population Caucasienne, ont été sélectionnés à l'aide du programme BIMAS (http://www-bimas.cit.nih.gov). Les séquences des peptides sélectionnés sont présentées dans le Tableau IV et la liste de séquences jointe en annexe.
10 Tableau IV: Liste des peptides sélectionnés Peptide Séquence SEQ ID NO:

Les peptides ont été synthétisés selon la stratégie Fmoc en synthèse parallèle sur phase solide, purifiés par HPLC et contrôlés par spectrométrie de masse (ES-MS).
b) Obtention de lignées de lymphocytes T CD8+ spécifiques de peptides de la 15 Midkine et restreintes à HLA-A2 Les cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) de sujets sains possédant la molécule HLA-A2 ont été séparées sur un gradient de Ficoll.
Les PBMCs ont ensuite été mises en culture dans du milieu AIM V (LIFE
TECHNOLOGIES) et incubées pendant une nuit à 37 C, en présence de 5% C02/95%
20 air. Les lymphocytes T CD8+ ont été purifiés à partir des cellules non adhérentes par tri immunomagnétique et congelés. Les cellules adhérentes ont été
différenciées en cellules dendritiques immatures par 5 jours de culture dans du milieu AIM V
conte-nant 1000U/ml de GM-CSF et 1000U/ml d'IL-4 puis en cellules dendritiques matures par 2 jours de culture en présence de 1 g/ml de LPS, 1000 U/ml d'IL-4 et 1000 U/ml 25 de GM-CSF. Les cellules dendritiques matures ont été incubées en présence de g/ml de beta-2-microglobuline et 10 gg/ml de chacun des peptides du Tableau IV.
Apres 4 heures, les cellules ont été lavées puis mises en culture dans des plaques en 96 puits, en présence de lymphocyte T CD8 purifiés, dans du milieu IMDM contenant % de sérum humain de groupe AB, de l'IL-6 (1000U/mL) et de l'IL-12 (5 ng/mL).
5 Chaque semaine, la culture a été re-stimulée par des cellules dendritiques matures, autologues et chargées avec le mélange de peptides précité, dans du milieu contenant U/mL d'IL-2 et 10 ng/mL d'IL-7. Apres 4 semaines de culture, la spécificité
des lignées de cellules T contenues dans chaque puits a été testée par Elispot IFNy.
c) Présentation de la protéine Midkine aux lymphocytes T CD8+ spécifiques des 10 peptides de la Midkine Les lignées de lymphocytes T CD8+ spécifiques du peptide ont été
cultivées en présence de cellules C1R-A2 transfectées avec un plasmide pcDNA3.1 (IN VITROGEN) recombinant comprenant la séquence codante de la Midkine sous le contrôle du promoteur CMV et du signal de polyadénylation de l'hormone de 15 croissance bovine. L'activation des lymphocytes T CD8+ par ces cellules C 1 transfectées a été évaluée par ELISPOT comme précisé ci-dessous.
d) Reconnaissance de cellules tumorales par les lymphocytes T CD8+ spécifiques des peptides de la Midkine Les lignées de lymphocytes T CD8+ spécifiques du peptide ont été
20 cultivées en présence de différentes lignées tumorales : DLD-1 (ATCC # CCL-221) et Hep G2 (ATCC # HB-8065). L'activation des lymphocytes T CD8+ par ces cellules tumorales a été évaluée par ELISPOT comme précisé ci-dessous.
e) ELISPOT

Des anticorps anti-IFN-y (1-D1K, MABTECH) dilués à 2,5 p.g/ml dans du tampon PBS ont été adsorbés sur des plaques de nitrocellulose (MILLIPORE) pendant 1 heure à 37 C. Les plaques ont ensuite été lavées avec du PBS puis saturées avec du milieu ISCOVE contenant 10 % de sérum humain du groupe AB
(100 l/puits), pendant 2 h à 37 C.
Les cellules présentatrices d'antigène sont, soit des cellules de lignée C1R de cellules lymphoblastoïdes B (Hogan et al., J. Immunol., 1988, 141, 2519-), dépourvues de molécules HLA-A et HLA-B, transfectées avec 1'ADNc codant pour HLA-A2 (CI R-A2) et chargées avec un seul peptide (10 g de peptide) ou le mélange de peptides (10 g de chaque peptide), soit des cellules CI R-A2 transfectées avec un plasmide d'expression de la Midkine, ou bien encore des cellules tumorales exprimant la Midkine.
Pour vérifier la spécificité des lignées vis-à-vis de la molécule HLA-A2, les cellules C1R transfectées avec HLA-A2 (30 000 cellules/puits) et lymphocytes à tester ont ensuite été ajoutés dans les plaques et incubées 24 h à 37 C, en présence ou en l'absence d'un seul peptide (10 g de peptide) ou d'un mélange de peptides (10 g de chaque peptide). Pour les analyses dose-réponse, les peptides sont utilisées à différentes concentration variant de 0,001 à 10 g/mL.
Pour analyser la reconnaissance par les lymphocytes T CD8+ spéci-fiques de peptides, des cellules exprimant HLA-A2 transfectées par la Midkine, les cellules C1R transfectées avec HLA-A2 et avec un plasmide d'expression de la Midkine (30 000 cellules/puits) et 5000 lymphocytes à tester ont ensuite été
ajoutés dans les plaques et incubées 24 h à 37 C.
Pour analyser la reconnaissance des cellules tumorales exprimant la Midkine par les lymphocytes T CD8+ spécifiques de peptides, les cellules tumorales (30 000 cellules/puits) et 5000 lymphocytes à tester ont ensuite été ajoutés dans les plaques et incubées 24 h à 37 C.
Après trois lavages successifs avec de l'eau, du tampon PBS Tween 0,05%, et du PBS seul, 100 l d'anticorps secondaire anti-IFN-y biotinylé (7-biotin, MABTECH), dilué à 0,25 g/ml dans du PBS contenant 1% BSA, a été
ajouté
dans chaque puits. Après une heure d'incubation à température ambiante, les plaques ont été lavées à nouveau puis incubées pendant une heure à température ambiante avec 100 l/puits d'Extravidin-AKP (E-2636, SIGMA,), diluée au 1/6000. Après lavage des plaques en tampon PBS, 100 .il de substrat NBT/BCIP (B-5655, SIGMA) dilué dans de l'eau (1 tablette dans 10 ml d'eau) ont été distribués dans chaque puits.
La révélation immunoenzymatique a été arrêtée après environ 10 minutes, par rinçage extensif des plaques dans l'eau. Après" séchage des plaques, les spots colorés ont été
comptés à l'aide d'un lecteur automatique (AID). Les lignées sont considérées posi-tives lorsque le nombre de spots est supérieur à trois fois celui obtenu avec le témoin négatif (témoin sans peptides) avec un minimum de 50 spots. Le témoin sans cellules présentatrices permet de vérifier la spécificité de la réponse pour HLA-A2 (témoin de restriction).
2) Résultats La capacité de la protéine Midkine à induire une réponse immunitaire cellulaire spécifique de cellules tumorales a été évaluée. Pour ce faire, des épitopes T
CD8+ restreints à la molécule HLA-A2, la molécule HLA I la plus fréquente dans la population Caucasienne, ont tout d'abord été identifiés dans la séquence de la Midkine. Ensuite, la capacité des cellules T CD8+ induites par ces épitopes à
reconnaître sélectivement une lignée tumorale exprimant la Midkine a été
analysée.
Les peptides synthétisés ont été testés pour leur capacité à induire une réponse in vitro à partir de cellules collectées chez des sujets sains possédant la molé-cule HLA-A2. Six de ces peptides ont induit des lymphocytes T CD8+: MDK 13-21, MDK 13-22, MDK 12-21, MDK 14-22, MDK 113-122 et MDK 114-122. Comme le montre la figure 2, la lignée de lymphocytes T CD8+ 267.29A est spécifique des peptides 12-21, 13-21, 13-22. La lignée 278.11A est spécifique des peptides 13-21, 13-22 et 14-22. La lignée 314.28 est spécifique de peptide 114-122 et dans une moindre mesure du peptide 113-122. Les peptides 12-21, 13-21, 13-22, 14-22, 122 et 114-122 sont donc immunogènes et induisent des lymphocytes T CD8+ chez des donneurs sains HLA-A2+.
La restriction des lignées de lymphocytes T CD8+ spécifiques de peptides par la molécule HLA-A2 est montrée à la figure 3. Seules les cellules HLA-A2 (Cl R-A2) peuvent présenter les peptides aux lignées de lymphocytes T spéci-fiques. Les cellules C 1 R (HLA-A2") ne les stimulent pas, même en présence des peptides.
Afin de vérifier que les cellules présentatrices étaient capables d'apprêter correctement la Midkine, les cellules C I R-A2 ont été transfectées avec un plasmide pcDNA3.1 recombinant comprenant la séquence codante de la Midkine. La figure 4 montre que les lignées de lymphocytes T CD8+ 278.11A (spécifique des peptides 13-22 et 14-22), 297.58 (spécifique des peptides 12-21, 13-21 et 14-22) et 314.48 (spécifique du peptide 114-122) sont activées par les cellules transfectées et par les cellules CIR-A2 chargées par les peptides mais pas par les cellules non trans-fectées.

La reconnaissance de lignées tumorale exprimant ou n'exprimant pas la Midkine par les lymphocytes T CD8+ spécifiques des peptides de Midkine a égale-ment été étudiée. La figure 6 montre l'expression ou non de la Midkine par les diffé-rentes lignées. Sur la figure 7, on observe que les lignées de lymphocytes T
CD8+ 267.29A (spécifique des peptides 13-22, 12-22 et 13-21), 278.11A
(spécifique des peptides 13-22 et 14-22), et 314.48 (spécifique du peptide 114-122) reconnaissent les cellules Hep G2 qui exprime naturellement la Midkine mais pas les cellules A2 et DLD-1 qui n'expriment pas la Midkine. La reconnaissance est légèrement meilleure lorsque les cellules Hep G2 sont cultivée en présence d'IFN-y, du fait de l'augmentation de l'expression des molécules HLA sur les cellules. La lignée 297.58 (spécifique des peptides 12-21, 13-21 et 14-22) reconnaît les cellules Hep G2 unique-ment lorsqu'elles sont cultivées en présence d'IFN-y.
L'ensemble de ces résultats montrent que la Midkine contient six peptides répartis en deux groupes de peptides chevauchants capables d'induire une activation de lymphocytes T CD8+ restreints à HLA-A2 et qui reconnaissent sélecti-vement des cellules tumorales exprimant la Midkine.
Exemple 2: Détection de lymphocytes T CD8+ spécifiques de peptides de la Midkine par marquage avec des tétramères spécifiques Chaque lignée de lymphocytes (500 000 cellules) obtenue à
l'exemple 1 a été marquée pendant 1 heure à l'obscurité et à 4 C, avec 50 g/mL de tétramère dans 200 L de PBS 2% SVF. Ces tétramères sont des molécules HLA-A2 chargées par le peptide 13-21 ou 114-122, biotinylées et complexées à de la strepta-vidine marquée à la phycoérythrine, préparées selon la technique précédemment décrite dans NOVAK et al. (J. Clin. Investig., 1999, 104, R63-R67) ou dans KURODA et al. (J. Virol., 2000, 74, 18, 8751-8756). Les cellules ont ensuite été
lavées 2 fois en PBS puis marquées pendant 30 min à 4 C à l'aide d'un anticorps anti-CD8 FITC (BD BIOSCIENCES). Après un lavage en PBS, les cellules ont été fixées à
l'aide de 50 L de PBS contenant 1 % de paraformaldehyde (PAF). Les marquages ont été analysés sur un cytomètre de flux FACSCalibur (BD BIOSCIENCES). Les résultats sont présentés à la figure 7.

Exemple 3 : Induction d'une réponse T CD4+ spécifique de peptides de la protéine Midkine 1) Matériels et méthodes a) Peptides 5 Des peptides de 15 acides aminés (15-mères) couvrant la totalité de la séquence de la Midkine humaine (SWISSPROT P21741, SEQ ID NO : 2 et figure 1) ont été sélectionnés en fonction de la présence de résidus aromatiques ou hydro-phobes en position 3 ou 4, pour l'ancrage dans la poche Pl des molécules HLA-DR et HLA-DP4.

10 Les séquences des peptides sélectionnés sont présentées dans le Tableau V et la liste de séquences jointe en annexe.

Les peptides ont été synthétisés selon la stratégie Fmoc en synthèse parallèle sur phase solide, purifiés par HPLC et contrôlés par spectrométrie de masse (ES-MS).

15 Tableau V: Peptides sélectionnés (SEQ ID NO: 9, 10, 13-15 et 18-30) Peptide Positions* Séquence * les positions sont numérotées en référence à la séquence du précurseur de la Midkine humaine de 143 acides aminés (SwissProt P21741, figure 1 et SEQ ID NO: 2).

b) Test de liaison HLA Il/peptide Les tests de liaison aux molécules HLA II sont des tests de liaison en compétition avec une révélation immuno-enzymatique, tels que décrits dans le brevet américain US 6,649,166 et la Demande Internationale PCT WO 03/040299, respectivement pour les molécules HLA-DR et HLA-DP4. La mise ne oeuvre de ces tests pour mesurer l'activité de liaison de peptides issus de différents antigènes, est illustrée dans le brevet américain US 6,649,166 et les Demandes Internationale PCT
WO 02/090382, WO 03/040299 et WO 2004/014936.
De manière plus précise, les peptides : HA 306-318 (PKYVKQNTLKLAT, SEQ ID NO: 31), A3 152-166 (EAEQLRAYLDGTGVE, SEQ ID NO: 32), MT 2-16 (AKTIAYDEEARRGLE, SEQ ID NO: 33), B I 21-36 (TERVRLVTRHIYNREE, SEQ ID NO: 34) YKL (AAYAAAKAAALAA, SEQ ID
NO: 35), LOL 191-210 (ESWGAVWRIDTPDKLTGPFT, SEQ ID NO: 36), Oxy 271-287 (EKKYFAATQFEPLAARL, SEQ ID NO: 37) et E2/E168 (AGDLLAIETDKATI
SEQ ID NO : 38), biotinylés au niveau du résidu NH2 terminal, selon le protocole décrit dans Texier et al., J. Immunol., 2000, 164, 3177-3184), sont utilisés comme traceur dans les conditions telles que précisées dans le ci-après.
TABLEAU VI : Conditions des tests de liaison aux molécules HLA II
Allèles Dilution Traceurs Concentration pH Temps ICso (nM) de HLA Il traceur optimal d'incubation (nM (h) DRB1*0101 1/40 HA 306-318 1 6 24 2 DRB1*0301 1120 MT 2-16 100 4,5 72 239 DRB1*0401 1/60 HA 306-318 10 6 24 6 DRB1*0701 1/80 YKL 10 5 24 4 DRB1*1101 1180 HA306-318 10 5 24 9 DRB1*1301 1140 8121-36 100 4,5 72 39 DRB1*1501 11100 A3152-166 30 4,5 72 19 DRB4*0101 1/30 E2/E168 10 5 72 3 DRB5*0101 1180 HA 306-318 10 5,5 24 5 DRB3*0101 1140 Lol191-120 20 5,5 24 21 DBP1*0401 11100 0xy 271-287 10 5 24 11 DPB1*0402 1/40 Oxy 271-287 10 5 24 10 La sensibilité de chaque test est reflétée par les IC50 observées avec les peptides non-biotinylés qui correspondent aux traceurs. La concentrations (nM) de peptide compétiteur qui inhibe 50% de la liaison maximale du peptide traceur bioti-nylé (IC5o) a été calculée pour chaque peptide. Les résultats sont exprimés sous la forme d'activité relative (rapport de l'1C5o du peptide compétiteur sur celle du peptide de référence (peptides non-biotinylé qui correspond au traceur). Une activité
relative inférieure à 100 caractérise les peptides actifs.
c) Obtention de lignées de lymphocytes T CD4+ spécifiques de peptides de la Midkine et restreintes aux molécules HLA II prépondérantes Les cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) d'individus sains dont le génotype HLA-DR et HLA-DP a été préalablement déterminé par SSP, à
l'aide du kit OLERUP SSPTM HLA-DPB1 et HLA-DRB1, ont été séparées sur un gradient de Ficoll. Les PBMCs ont ensuite été mises en culture dans du milieu AIM V
(LIFE TECHNOLOGIES) et incubées dans des flasques, à l'étuve à 37 C en présence de 5% C02/95 % air. Après une nuit d'incubation, les cellules non adhérentes ont été
récupérées, puis les lymphocytes T CD4+ ont été purifiées à l'aide d'anticorps anti-CD4 couplés à des billes magnétiques (kit MYLTENYI BIOTEC), et congelés. Les cellules adhérentes ont été incubées pendant 5 jours, dans du milieu AIM V
contenant 1000 U/ml de GM-CSF et 1000 U/ml d'IL-4, puis les cellules différenciées en cellules dendritiques (cellules dendritiques immatures) ont ensuite été cultivées pendant 2 jours, en présence de 1 g/ml de LPS, 1000 U/ml d'IL-4 et 1000 U/ml de GM-CSF, de manière à induire leur maturation.
Les cellules dendritiques matures (100 000 cellules/puits) ont alors été incubées avec un mélange de peptides (10 g de chaque peptide dans du milieu IMDN (INVITROGEN) supplémenté avec de la glutamine (24 mM, SIGMA), de l'asparagine (55 mM, SIGMA), de l'arginine (150 mM, SIGMA), de la pénicilline (50UI/ml, INVITROGEN), de la streptomycine (50 mg/ml, INVITROGEN) et 10 %
de sérum humain)), pendant 4 heures à 37 C. Les cellules dendritiques matures ont ensuite été lavées puis incubées, en présence des lymphocytes T CD4+ (100 000 cellules/puits) préalablement décongelés, dans du milieu contenant 1000 U/ml d'IL-6 et 10 ng/ml d'IL-12. Après 7 jours (J7), la culture a été stimulée une première fois, au moyen de cellules dendritiques matures préalablement décongelées et chargées par deux mélanges de peptides couvrant l'intégralité de la séquence de la Midkine (mélange des peptides MDK1 à MDK9 puis mélange des peptides MDK 1 à MDK18), dans du milieu contenant de l'IL-2 (10 U/ml) et de l'IL-7 (5 ng/ml). Après trois stimu-lations supplémentaires (J14, J21, J28) au moyen de cellules dendritiques chargées, dans du milieu contenant uniquement de l'IL-7 (5 ng/ml), les cellules ont été
testées en ELISPOT, 6 jours au moins après la dernière stimulation.
d) ELISPOT
Des anticorps anti-IFN-y (1-D 1 K, MABTECH) dilués à 2,5 p g/ml dans du tampon PBS ont été adsorbés sur des plaques de nitrocellulose (MILLIPORE) pendant 1 heure à 37 C. Les plaques ont ensuite été lavées avec du PBS puis saturées avec du milieu ISCOVE contenant 10 % de sérum humain du groupe AB
(100 l/puits), pendant 2 h à 37 C. Les cellules présentatrices d'antigène sont, soit des cellules dendritiques autologues immatures préparées comme précisé ci-dessus, soit une lignée de fibroblastes de souris (lignée L), transfectée avec l'ADNc codant pour l'une des molécules HLA-DR ou HLA-DP4 à tester (Yu et al., Hum. Immunol., 1990, 27, 132-135), de façon à vérifier la spécificité des lignées vis-à-vis des molécules HLA-DR et HLA-DP4. Les cellules dendritiques (105 cellules/puits) ou des cellules L
transfectées par l'une des molécules HLA-DR ou HLA-DP4 (30 000 cellules/puits) et 5000 lymphocytes à tester ont ensuite été ajoutés dans les plaques et incubées 24 h à
37 C, en présence ou en l'absence d'un seul peptide (10 g) ou d'un mélange de peptides (10 g de chaque peptide). Après trois lavages successifs avec de l'eau, du tampon PBS Tween 0,05%, et du PBS seul, 100 l d'anticorps secondaire anti-IFN-y conjugué à la biotine (7-B6-1-biotin, MABTECH), dilué à 0,25 g/ml dans du PBS
contenant 1% BSA, a été ajouté dans chaque puits. Après une heure d'incubation, les plaques ont été lavées à nouveau et incubées avec 100 l/puits d'Extravidin-AKP (E-2636, SIGMA,), diluée au 1/6000. Après lavage des plaques en tampon PBS, 100 l de substrat NBT/BCIP (B-5655, SIGMA) dilué dans de l'eau (1 tablette dans 10 ml d'eau) ont été distribués dans chaque puits. La révélation immunoenzymatique a été
arrêtée après environ 10 minutes, par rinçage extensif des plaques dans l'eau, et les spots colorés ont été comptés à l'aide d'un lecteur automatique (AID). Les lignées sont considérées positives lorsque le nombre de spots est supérieur à trois fois celui obtenu avec le témoin négatif (témoin sans peptides) avec un minimum de 50 spots.
Le témoin sans cellules présentatrices permet de vérifier la spécificité de la réponse pour HLA-DR ou HLA-DP4 (témoin de restriction).
e) Reconnaissance de cellules tumorales par les lymphocytes T CD4+ spécifiques des peptides de la Midkine Les lignées tumorales testées sont la lignée Hep G2 qui exprime la Midkine, la lignée tumorale Hela qui- n'exprime pas la Midkine et la lignée Hela-pMDK qui correspond aux cellules HeLa transfectées transitoirement par un plasmide d'expression de la Midkine tel que décrit à l'exemple 1. Les cellules collectées ont été
lysées par des cycles de congélation/ décongélation. La lignée 331.24 de lymphocytes T CD4+ spécifiques du peptide 9-23 de la Midkine a été incubée en présence de cellules dendritiques préalablement chargées par les lysats de lignées tumorales et son activation a été évaluée par Elispot comme précisé ci-dessus.
2) Résultats a) Activité de liaison des peptides de la Midkine vis-à-vis des molécules HLA
II
La plupart des sites de liaison aux molécules HLA de classe II se situent dans la partie N-terminale de la Midkine, c'est-à-dire dans le peptide signal (1-22; Tableau VII).
Tableau VII : Activités relative de liaison* des peptides de la Midkine vis-à-vis des 12 molécules HLA II prépondérantes peptides DR1 DR3 DR4 DR7 DR11 DR13 DR15 DRB3 DRB4 DRB5 DP401 DP402 Total MDK 1-15 21 >419 226 49 7 >2537 211 267 204 161 20 19 5 MDK4-18 21 >419 136 20 94 >2537 19 37 65 46 6 18 9 MDK 9-23 0,2 >419 1 13 0,3 >2 537 5 >485 >28 868 2 94 29 8 MDK14-28 34 >419 401 590 48 45 >529 >485 >28 868 0,1 >879 >976 4 MDK 18-32 >5 291 >419 >1 812 >2 479 >1086 132 >529 >485 >28868 >2100 >879 >976 MDK 25-39 1 251 >419 >1 812 >2 479 >1086 >2 537 >529 >485 >28 868 >2100 >879 >976 0 MDK 38-52 1 305 >419 1 859 >2 479 923 >2 537 >529 >485 >28 868 >2100 >879 239 MDK 52-64 32 >419 701 >2 479 833 >2 537 >529 >485 >28 868 >2100 >879 >976 1 MDK 64-78 246 >419 558 2066 504 >2 537 >529 >485 1 155 61 >879 >976 1 MDK 70-84 53 >419 1 562 >2 479 >1086 >2 537 >529 621 >28 868 >2 100 7 >976 2 MDK 74-88 333 2 >1 812 >2 479 1 231 >2 537 >529 877 >28 868 714 >879 >976 1 MDK 78-92 299 1 457 >2 479 800 >2 537 216 226 >28 868 114 167 378 1 MDK 84-98 187 >419 362 >2 479 >1086 >2 537 141 >485 >28 868 292 52 49 2 MDK 89-103 1 460 >419 >1 812 >2 479 >1086 >2 537 >529 2 333 >28 868 >2 100 >879 >976 0 MDK 99-113 3 000 >419 >1 812 >2 479 >1086 74 >529 >485 >28 868 215 >879 >976 1 MDK 105-119 97 >419 492 >2 479 1 008 >2 537 225 >485 >28 868 >2100 >879 >976 1 MDK 110-124 10 >419 6 158 69>2 537 >529 >485 >28 868 15 >879 >976 4`
MDK 119-133 2 >419 1 289 819 763, >2 537 >529 >485 >28 868 26 >879 >976 2 * les valeurs sont les moyennes d'au moins deux expériences indépendantes.

Les peptides de la région N-terminale ont une bonne affinité pour au moins 4 molécules HLA II molécules. En particulier, le peptide 9-23 se lie à 8 molé-cules HLA II différentes avec des affinités relatives traduisant souvent une haute affi-nité (activité relative inférieure à 10). D'autres peptides se lient également à plusieurs 5 molécules HLA II tels que les peptides 1-15, 4-18, 14-28.
En revanche, les peptides issus du reste de la séquence ne présentent pas d'activité de liaison significative pour au moins quatre molécules HLA II
prépon-dérantes dans la population caucasienne, à l'exception d'un peptide de la région C-terminale (110-124) qui se lie avec une bonne affinité à quatre molécules HLA
II.
10 b) Induction d'une réponse T CD4+ spécifique par les peptides de la Midkine La capacité des peptides de la Midkine à induire in vitro une stimula-tion de lymphocytes T CD4+ spécifiques, a été évaluée à partir de prélèvements sanguins d'individus sains (non porteurs de tumeur). Il s'agit d'évaluer la capacité à
recruter des lymphocytes précurseurs CD4+ alors qu'ils sont chez un individu naïf à
15 une très faible fréquence, c'est-à-dire d'effectuer une immunisation in vitro au moyen de ces peptides.
Les lignées de lymphocytes T CD4+ 331.16, 331.24 et 343.1 ont été
obtenues par stimulation in vitro de lymphocytes T au moyen de cellules dendritiques autologues matures chargés par deux pools de peptides couvrant l'intégralité
de la 20 séquence de la Midkine. L'étude de leur spécificité a été faite par Elispot IFN-y et a montré que les trois lignées étaient spécifiques du peptide 9-23. Chaque lignée a été
testée par Elispot IFN-y pour sa capacité à être stimulée par des cellules L
transfectées par une molécule HLA-DR ou HLA-DP4 et chargées par le peptide 9-23. La figure montre que le peptide 9-23 peut être présenté par la molécule DR7 aux lignées du 25 donneur 331 (331. 16 et 331.24) et que la lignée 343.1 est restreinte à
DR11 mais pas à DR15 et DRB5.
La lignée de lymphocytes T CD4+ 331.24 a été incubée en présence de cellules dendritiques préalablement chargées par les lysats de lignées tumorales et son activation a été évaluée par Elispot IFN-y. La figure 9 montre que la lignée 331.24
30 est stimulée par des cellules dendritiques chargées par le lysat de cellules Hela trans-fectées mais pas par les cellules Hela non transfectées. Ceci confirme la spécificité de la lignée de lymphocytes T 331.24 et sa capacité à reconnaître la Midkine présente dans le lysat de cellules transfectée. Elle reconnaît également la Midkine produite naturellement par lignée tumorale Hep G2.
L'ensemble des résultats montre que le peptide 9-23 se lie à 8 molécules HLA II différentes et induit une réponse T CD4+ spécifique in vitro qui est restreinte à des molécules HLA de classe II différentes. De plus les cellules T CD4+
induites contre ce peptide peuvent reconnaître des lysats de tumeurs exprimant la Midkine et présentés par des cellules dendritiques. Comme ce peptide se chevauche avec le peptide signal (1-22), on peut déduire de ces expériences que le peptide 9-22 comporte également des épitopes T CD4+ dans la mesure où le peptide signal de la Midkine est clivé dans la cellule entre les acides aminés 22 et 23. Il est intéressant de noter que les peptides 9-23 et 9-22 incluent les peptides 12-21, 13-21, 13-22 et 14-22 qui comportent des épitopes T CD8+. Les peptides 9-23 et 9-22 peuvent donc induire des réponses T CD4+ et T CD8+ spécifiques de tumeurs exprimant la Midkine.
Ainsi que cela ressort de ce qui précède, l'invention ne se limite nullement à ceux de ses modes de mise en oeuvre, de réalisation et d'application qui viennent d'être décrits de façon plus explicite ; elle en embrasse au contraire toutes les variantes qui peuvent venir à l'esprit du technicien en la matière, sans s'écarter du cadre, ni de la portée, de la présente invention.

Claims (24)

REVENDICATIONS
1~) Utilisation d'un peptide issu de la protéine Midkine comprenant au moins un épitope T CD4+ ou T CD8+ restreint aux molécules HLA prépondérantes dans la population caucasienne ou d'un polynucléotide codant ledit peptide, pour la préparation d'un vaccin anticancéreux.
2~) Utilisation selon la revendication 1, caractérisée en ce que ledit peptide est constitué par la protéine Midkine humaine de séquence SEQ ID NO :
2.
3~) Utilisation selon la revendication 1, caractérisée en ce que ledit peptide est un fragment d'au moins 8 acides aminés de la protéine Midkine compre-nant au moins un épitope T CD8+ restreint à la molécule HLA-A2, lequel peptide comprend au moins les positions 14 à 21 ou 114 à 122 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
4~) Utilisation selon la revendication 3, caractérisée en ce que ledit peptide est constitué par les positions 12 à 21, 13 à 21, 13 à 22, 14 à 22, 113 à 122 ou 114 à 122 de la séquence en acides aminés de la protéine Midkine.
5~) Utilisation selon la revendication 1, caractérisée en ce que ledit peptide est un fragment d'au moins 8 acides aminés de la Midkine comprenant au moins un épitope T CD4+ restreint à au moins quatre molécules HLA II
différentes prépondérantes dans la population caucasienne, lequel peptide comprend au moins les positions 9 à 15, 14 à 28 ou 110 à 124 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
6~) Utilisation selon la revendication 5, caractérisée en ce que ledit peptide est constitué par les positions 1 à 15, 4 à 18 ou 14 à 28 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
7~) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1, 3 et 5, caractérisée en ce que ledit peptide comprend au moins un épitope T CD8+
restreint à
la molécule HLA-A2 et au moins un épitope T CD4+ restreint à au moins quatre molécules HLA II différentes prépondérantes dans la population caucasienne, lequel peptide est constitué par les positions 9 à 21, 9 à 22, 9 à 23 ou 110 à 124 de la séquence en acides aminés de ladite protéine Midkine.
8~) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 7, caractérisée en ce que ledit peptide est un peptide multi-épitopique comprenant la concaténation d'au moins deux épitopes identiques ou différents dont l'un au moins est un épitope T CD4+ et/ou T CD8+ de la Midkine tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 7.
9 ) Utilisation selon la revendication 8, caractérisée en ce que ledit peptide multi-épitopique comprend un épitope T CD4+ ou T CD8+ d'un autre antigène tumoral.
) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 9, caractérisée en ce que ledit peptide est fusionné à une protéine ou un fragment de protéine hétérologue.
11 ) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 9, caractérisé en ce que ledit peptide est un lipopeptide.
12 ) Utilisation selon la revendication 1, caractérisée en ce que ledit polynucléotide code pour un peptide tel que défini à l'une quelconque des revendica-tions 2 à 10.
13 ) Utilisation selon la revendication 12, caractérisée en ce que ledit polynucléotide est inséré dans un vecteur d'expression.
14 ) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 13, caractérisée en ce que ledit vaccin comprend un véhicule pharmaceutiquement accep-table, une substance porteuse et/ou un adjuvant.
) Utilisation d'un peptide tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 10 pour la préparation d'un réactif d'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine, destiné à l'évaluation du pronostic ou au suivi du traitement d'un cancer.
16 ) Utilisation selon la revendication 15, caractérisée en ce que ledit peptide est sous la forme de tétramères de complexes molécule HLA/peptide, marqués.
17 ) Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 16, caractérisée en ce que le cancer est sélectionné dans le groupe constitué par:
les cancers de l'oesophage, de l'estomac, du colon, du pancréas, de la thyroïde, des poumons, du sein, de la vessie, de l'utérus, de l'ovaire, de la prostate, les carcinomes hépatocellulaires, les ostéosarcomes, les neuroblastomes, les glioblastomes, les astro-cytomes, les leucémies et les tumeurs de Wilm.
18 ) Composition vaccinale, caractérisée en ce qu'elle comprend au moins un peptide tel que défini à l'une quelconque des revendications 3 à 11 ou un vecteur tel que défini à la revendication 13, et un véhicule pharmaceutiquement acceptable, une substance porteuse ou un adjuvant.
19 ) Méthode in vitro, d'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine chez un individu présentant un cancer, caractérisée en ce qu'elle comprend :

- la mise en contact d'un échantillon biologique dudit individu avec un peptide tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 10 et 16, et - la détection de lymphocytes T CD4+ et/ou T CD8+ spécifiques de la Midkine, par tout moyen approprié.
20 ) Kit d'immunomonitoring de la réponse cellulaire contre la Midkine, caractérisé en ce qu'il comprend un peptide tel que défini à l'une quelconque des revendications 1 à 10 et 16.
21 ) Peptide issu de la Midkine tel que défini à l'une quelconque des revendications 3 à 11.
22 ) Polynucléotide codant le peptide selon la revendication 21.
23 ) Vecteur d'expression comprenant le polynucléotide selon la revendication 22.
24 ) Cellule hôte modifiée par le polynucléotide selon la revendica-tion 22 ou le vecteur selon la revendication 23.
CA2728459A 2008-06-20 2009-06-19 Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux Abandoned CA2728459A1 (fr)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR0803466A FR2932681B1 (fr) 2008-06-20 2008-06-20 Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux
FR0803466 2008-06-20
PCT/FR2009/000744 WO2009153463A1 (fr) 2008-06-20 2009-06-19 Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CA2728459A1 true CA2728459A1 (fr) 2009-12-23

Family

ID=40297807

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CA2728459A Abandoned CA2728459A1 (fr) 2008-06-20 2009-06-19 Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux

Country Status (8)

Country Link
US (1) US20110159022A1 (fr)
EP (1) EP2296697A1 (fr)
JP (1) JP2011525108A (fr)
CN (1) CN102123731A (fr)
AU (1) AU2009261813A1 (fr)
CA (1) CA2728459A1 (fr)
FR (1) FR2932681B1 (fr)
WO (1) WO2009153463A1 (fr)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011115562A1 (fr) * 2010-03-18 2011-09-22 Egesten Medical Consulting Hb Composé antimicrobien
US9664682B2 (en) 2012-11-20 2017-05-30 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Assay to measure midkine or pleiotrophin level for diagnosing a growth
WO2015002134A1 (fr) * 2013-07-02 2015-01-08 公益財団法人がん研究会 Vaccin induisant une immunité cellulaire
FR3008099B1 (fr) 2013-07-05 2020-08-07 Commissariat Energie Atomique Peptides immunogenes de l'antigene tumoral cycline b1
KR101985300B1 (ko) 2016-07-19 2019-06-03 삼성전자주식회사 미드카인 저해제를 포함하는 뇌종양 치료 또는 예방용 약학 조성물
JP6694220B2 (ja) * 2018-12-21 2020-05-13 国立大学法人福井大学 子宮肉腫検出用血液マーカー、子宮肉腫検出用キット、および、子宮肉腫診断のためのデータの取得方法
FR3090319A1 (fr) 2018-12-21 2020-06-26 Commissariat A L'energie Atomique Et Aux Energies Alternatives Melanges d’epitopes t cd8+ immunogenes de la cycline b1
CN114404601B (zh) * 2022-03-31 2022-06-07 首都医科大学附属北京朝阳医院 MDK抑制剂在制备用于抑制干扰素-γ治疗引起的肿瘤转移的药物中的应用

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0591880A (ja) * 1991-02-28 1993-04-16 Nippon Koutai Kenkyusho:Kk ヒトmk遺伝子
US5734023A (en) * 1991-11-19 1998-03-31 Anergen Inc. MHC class II β chain/peptide complexes useful in ameliorating deleterious immune responses
US6420518B1 (en) * 1997-04-04 2002-07-16 Genetech, Inc. Insulin-like growth factor agonist molecules
JP3920556B2 (ja) * 2000-10-30 2007-05-30 工藤 憲雄 短縮型ミッドカイン(tMK)タンパク質特異的モノクローナル抗体及びその用途
ES2534752T3 (es) * 2004-12-07 2015-04-27 Toray Industries, Inc. Nuevo péptido antigénico contra el cáncer y utilización del mismo
WO2007066423A1 (fr) * 2005-12-08 2007-06-14 Dainippon Sumitomo Pharma Co., Ltd. Peptide d'antigene tumoral derive d'amacr
EP2006377A4 (fr) * 2006-03-28 2009-12-09 Dainippon Sumitomo Pharma Co Nouveaux peptides antigènes tumoraux

Also Published As

Publication number Publication date
AU2009261813A1 (en) 2009-12-23
FR2932681B1 (fr) 2012-08-31
US20110159022A1 (en) 2011-06-30
WO2009153463A1 (fr) 2009-12-23
CN102123731A (zh) 2011-07-13
JP2011525108A (ja) 2011-09-15
FR2932681A1 (fr) 2009-12-25
EP2296697A1 (fr) 2011-03-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP1931377B1 (fr) Epitopes t cd4+ de la survivine et leurs applications
US11707512B2 (en) Cancer vaccine composition
CA2596929C (fr) Epitopes t cd4+ des antigenes de latence de type i et ii du virus epstein-barr aptes a etre reconnus par la majorite des individus de la population caucasienne et leurs applications
CA2728459A1 (fr) Peptides immunogenes issus de la proteine midkine comme vaccin anticancereux
KR20150043234A (ko) 텔로머라제로부터 유래된 보편적 암 펩티드
CA2480696C (fr) Epitopes peptidiques communs a des antigenes d'une meme famille multigenique
WO2007026078A2 (fr) Epitopes t cd4+ des antigenes mage-a restreints a hla-dp4 et leurs applications
EP3016974B1 (fr) Peptides immunogènes de l'antigène tumoral cycline b1
WO2020127996A2 (fr) Melanges d'epitopes t cd8+ immunogenes de la cycline b1
JP3840268B2 (ja) 細胞傷害性tリンパ球
WO2020245433A1 (fr) Melanges d'epitopes t cd8 immunogènes du virus ebola

Legal Events

Date Code Title Description
EEER Examination request

Effective date: 20140521

FZDE Discontinued

Effective date: 20160620