BRPI0709202A2 - seqüências de nucleotìdeo que codificam nicotiana beta-1,2-xilosiltransferase - Google Patents

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Abstract

SEQUêNCIAS DE NUCLEOTìDEO QUE CODIFICAM NICOTIANA BETA-1,2-XILOSILTRANSFERASE. A presente invenção refere-se a novas seqúências de nucleotídeo de 1,2-xilosiltransferase e usos das mesmas.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "SEQÜÊNCIASDE NUCLEOTÍDEO QUE CODIFICAM NICOTIANA BETA-1,2-XILOSIL-TRANSFERASE".
A presente invenção refere-se à novas seqüências de nucleotídeode espécies e cultivares de Nicotiana, particularmente de Nicotiana bentha-miana e Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1, que codificam β-1,2-xilo-siltransferase (XyIT) e a seu uso para produzir plantas Nicotiana modifica-das, particularmente plantas Nicotiana Bentamiana e Nicotiana Tabacum vc.Petite Havana SR1, as quais têm um menor nível ou um padrão alterado deN-glicanos ligadas à proteína imunogênicas, particularmente um menor nívelde resíduos de beta-1,2-xiIose sobre as N-glicanos ligadas à proteína, doque a contraparte plantas Nicotiana não-modificadas. Tais plantas Nicotianapodem ser obtidas através de diminuição da expressão do(s) gene(s) de XyIT deNicotiana endógeno, por exemplo, através de modificação da atividade do(s)gene(s) de XyIT de Nicotiana endógeno através de troca o gene de XyIT deNicotiana endógeno por outro alelo do gene de XyIT1 o que proporciona ummenor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre as N-glicanos ligadas àproteína ou através de qualquer combinação dos mesmos.
Descrição da Técnica Relacionada
O uso de plantas transgênicas para a produção de proteínas re-combinantes com valor adicionado, tal como anticorpos, vacinas, produtosde sangue humano, hormônios, reguladores do crescimento e similares, édescrito para oferecer muitas vantagens práticas, econômicas e de seguran-ça comparado com sistemas mais convencionais, tais como culturas de célu-las de inseto e animal, fungos filamentosos e bactérias (revisto por Stoger eoutros, 2002; Twyman e outros, 2003; Fischer e outros, 2004).
Embora a via de síntese de proteína seja grandemente a mesmaem plantas e animais, existem algumas diferenças em modificações pós-traducionais, particularmente com relação às estruturas da cadeia de glica-na. Assim, proteínas humanas recombinantes derivadas de planta tendem ater os grupos carboidrato beta(1-»2)-xilose e alfa(1-»3)-fucose, os quais es-tão ausentes em mamíferos, mas carecem dos resíduos de galactose e ácidosiálico terminais que são encontrados em muitas glicoproteínas humanasnativas (Twyman e outros, 2003).
A enzima que catalisa a transferência de xilose de UDP-xilosepara manose com núcleo beta-ligado da N-glicanos ligadas à proteína é abeta-1,2-xilosiltransferase (XylT). XyIT é uma enzima única à plantas e al-gumas espécies de animais não-vertebrados, por exemplo, em espécies S-chistosoma (Khoo e outros, 1997) e caracol (por exemplo, Mulder e outros,1995) e não ocorre em seres humanos ou em outros vertebrados.
Tezuka e outros (1992) caracterizaram uma XyIT de sycamore(Acer pseudoplatanus L.).
Zeng e outros (1997) descreveram a purificação de uma XyIT demicrossomas de soja. Apenas uma parte do cDNA de XyIT de soja foi isola-da (W099/29835 Al).
Strasser e outros (2000) e o W001/64901 descrevem o isola-mento de um gene de XyIT de Arabidopsis, a seqüência de aminoácido pre-vista da proteína de XyIT codificada e sua atividade enzimática in vitro e invivo.
As seguintes entradas em banco de dados que identificam se-qüências de gene e cDNA de XyIT putativas e experimentalmente demons-tradas, partes das mesmas ou seqüências homólogas, puderam ser identifi-cadas: AJ627182, AJ627183 (Nicotiana tabacumcv. Xanthi), AM179855 (So-Ianum tuberosum), AM179856 (Vitis vinifera), AJ891042 (Populus alba χ Po-pulus tremula), AY302251 (Medicago sativa), AJ864704 (Saccharum officina-rum), AM179857 (Zea mays), AM179853 (Hordeum vulgare), AM179854(,Sorghum b/co/or), BD434535, AJ277603, AJ272121, AF272852, AX236965(Arabidopsis thaliana), AJ621918 (Oryza sativa), AR359783, AR359782,AR123000, AR123001 (Soja), AJ618933 (Physcomitrella patens).
Strasser e outros (2004a) reportam duas abordagens para amodulação da via de N-glicosilação em plantas: primeiro, silenciamento degene pós-transcricional foi usado para realizar bloqueios (knock down) naexpressão de beta-1,2-N-acetil glicosaminil transferase I (GnTI), uma enzimaenvolvida no processamento de resíduos oligomanosídicos em um híbrido eN-glicanos complexas em eucariotas superiores, para avaliar a influência deexpressão de GnTI sobre a formação de N-glicanos complexas em Nicotianabenthamiana. Caracterização de perfil de N-glicano não revelou alteraçõessignificativas do padrão de N-glicano total indicando que, mesmo uma ativi-dade residual mínima de GnTI permite a biossíntese de N-glicanos comple-xas em Nicotiana benthamiana. Eles ainda reportam que uma abordagemsimilar para o knock down de XyIT resultou em uma redução significativa deN-glicanos beta-1,2-xilosiladas. Em segundo, de forma a obter uma elimina-ção completa de resíduos de beta-1,2-xilose e alfa-1,3-fucose de N-glicanos,plantas Arabidopsis com knockout triplo foram geradas usando linhagenscom mutação por inserção. Essas plantas exibem deficiência completa debeta-1,2-xilosil transferase e alfa-1,3-fucosil transferase de núcleo ativas,carecem de N-glicanos ligadas à proteína imunogênica e sintetizam predo-minantemente estruturas humanizadas com resíduos de beta-N-acetil glico-samina terminais (Strasser e outros, 2004b).
Safras de folhas, tal como tabaco, são consideradas como sen-do fortes candidatos para a produção comercial de proteínas recombinantes(vide, por exemplo, Twyman e outros, 2003).
O objetivo da presente invenção é proporcionar seqüências degene e cDNA de XyIT alternativas de espécies e cultivares de Nicotiana, par-ticularmente de Nicotiana benthamiana e Nicotiana tabacum cv. Petite Ha-vana SR1, as quais são melhor adequadas para modificar a expressão deXyIT, em particular espécies e cultivares de Nicotiana.
Sumário da Invenção
Em um aspecto da invenção, é proporcionado um método paraproduzir uma célula de planta ou planta Nicotiana tendo um baixo nível deresíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína compreen-dendo as etapas de introdução de um gene quimérico em células de plantade uma espécie ou cultivar de Nicotiana para gerar células de planta trans-gênica, o gene quimérico compreendendo um promotor expressível em plan-ta operavelmente ligado; uma região de DNA passível de transcrição com-preendendo uma primeira região de sentido de DNA compreendendo umaseqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecuti-vos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteí-na de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, a seqüência de nu-cleotídeo, de preferência, obtenível de espécies ou cultivares de Nicotiana,em que pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelo me-nos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico ouselecionada de uma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nico-tiana ou cDNA de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, a se-qüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível de uma espécie ou cultivarde Nicotiana, em que os pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivoscompreendem pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-específico; uma segunda região de anti-sentido de DNA compreendendouma seqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 nucleotídeos consecutivosos quais têm pelo menos 95% de identidade de seqüência ao complementoda primeira região de DNA; em que uma molécula de RNA transcrita a partirda região de DNA passível de transcrição é capaz de formar uma região deRNA fita simples pelo menos entre uma região de RNA transcrita a partir daprimeira região de sentido de DNA e uma região de RNA transcrita a partirda segunda região de anti-sentido de DNA; e uma região de DNA compre-endendo um sinal de poliadenilação e término de transcrição funcional emplantas; opcionalmente, identificação de uma célula de planta Nicotianatransgênica a qual tem um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobreN-glicanos ligadas à proteína do que uma célula de planta Nicotiana não-transformada; opcionalmente regeneração das células de planta Nicotianatransgênicas para obter plantas Nicotiana transgênicas; e opcionalmente,identificação de uma planta Nicotiana transgênica a qual tem um menor nívelde resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do queuma planta Nicotiana não-transformada. O aminoácido ou nucleotídeo deXyIT espécie ou cultivar de Mcof/ana-específico pode ser um aminoácido ounucleotídeo de XyIT Nicotiana benthamiana-especíUco ou Nicotiana tabacumcv. Petite Havana SR1 -específica e a espécie ou cultivar pode, de preferên-cia, ser Nicotiana benthamiana ou Nicotiana tabacum cv. Petite HavanaSR1, respectivamente. A seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteí-na de XyIT de Nicotiana pode compreender uma seqüência de nucleotídeoque codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:14 ou a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.: 6, SEQ IDNO.: 8 ou SEQ ID NO.: 10 e a seqüência de nucleotídeo do gene de XyIT deNicotiana pode compreender a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.:11, SEQ ID NO.: 13, ou SEQ ID No. 21 ou a seqüência de nucleotídeo deSEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, ou SEQ IDNO.: 17.
É outro objetivo da invenção proporcionar um método para pro-duzir uma célula de planta ou planta Nicotiana tendo um baixo nível de resí-duos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína compreendendoas etapas de fornecimento de uma ou mais moléculas de RNA de filamentoduplo às células de planta ou plantas de uma espécie ou cultivar de Nicotia-na, em que as moléculas de RNA de filamento duplo compreendem duasfitas de RNA, uma fita de RNA consistindo essencialmente em uma seqüên-cia de nucleotídeo de RNA de 19 de 20 a 21 nucleotídeos consecutivos se-lecionada de uma seqüência que codifica uma proteína de XyIT de Nieotianaou o complemento da mesma, a seqüência de nucleotídeo, de preferência,obtenível da espécie ou cultivar de Nieotiana, em que 19 de 20 a 21 nucleo-tídeos consecutivos compreendem pelo menos um aminoácido de XyIT es-pécie ou cultivar de Mcof/ana-específico ou selecionada da seqüência denucleotídeo de um gene de XyIT de Nieotiana ou um cDNA de XyIT de Nieo-tiana ou o complemento do mesmo, a seqüência de nucleotídeo, de prefe-rência, obtenível da espécie ou cultivar de Nieotiana , em que os 19 de 20 a21 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo deXyIT espécie ou cultivar de Mcof/ana-específico; e identificação de uma célu-la de planta ou planta Nieotiana compreendendo a molécula ou moléculas deRNA de filamento duplo as quais têm um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que a mesma célula deplanta ou planta Nieotiana a qual não compreende a molécula ou moléculasde RNA de filamento duplo. O RNA de filamento duplo pode ser fornecido àscélulas de planta ou plantas através de integração de um gene quimérico nogenoma de células de planta da espécie ou cultivar de Nicotiana para gerarcélulas de planta transgênicas e, opcionalmente, regeneração das células deplanta para obter plantas transgênicas, o gene quimérico compreendendouma região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos con-secutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica umaproteína de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, a seqüência denucleotídeo, de preferência, obtenível espécie ou cultivar de Nicotiana1 emque os 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelo menos um ami-noácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-espectíico ou selecionadada seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNAde XyIT de Nieotiana ou o complemento da mesma, a seqüência de nucleo-tídeo, de preferência, obtenível da espécie ou cultivar de Nieotiana, em queos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nucle-otídeo de XyIT espécie de Nieotiana-específico, em uma orientação sentidoe/ou anti-sentido; operavelmente ligado a um promotor expressível em plan-ta e uma região de DNA compreendendo uma sinal de poliadenilação e tér-mino de transcrição funcional em plantas. O aminoácido ou nucleotídeo deXyIT espécie ou cultivar de específico Nieotiana pode, ser um aminoácido ounucleotídeo de XyIT Nieotiana benthamiana-específtco ou Nieotiana tabaeumcv. Petite Havana SR1-específico, e as espécies ou cultivar, de nieotianapodem de preferência, ser nieotiana benthamiana ou nieotiana tabaeum cv.Petite Havana SR1 respectivamente. A seqüência de nitrogênio que codificauma proteína de XyIT de Nieotiana pode compreender uma seqüência denucleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 12 ouSEQ ID NO.: 14 ou a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ IDNO.: 6, SEQ ID NO.: 8 ou SEQ ID NO.: 10 e a seqüência de nucleotídeo dogene de XyIT de Nieotiana pode compreender a seqüência de nucleotídeode SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID No. 21 ou a seqüência denucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.:10 ou SEQ IDNO.: 17.
É ainda outro objetivo da invenção proporcionar um método paraidentificar um fragmento de DNA de XyIT de Nicotiana compreendendo asetapas de fornecimento de DNA genômico ou cDNA obtenível de uma espé-cie ou cultivar de Nicotiana, seleção de um meio do seguinte grupo: umfragmento de DNA compreendendo uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.: 6, SEQ IDNO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14, para uso comouma sonda; um fragmento de DNA compreendendo a seqüência de nucleo-tídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7,SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQID NO.: 21, para uso como uma sonda; um fragmento de DNA ou oligonu-cleotídeo compreendendo uma seqüência de nucleotídeo consistindo ementre 20 a 1513 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüênciade nucleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4 ouSEQ ID NO.: 6 para uso como uma sonda; um fragmento de DNA ou oligo-nucleotídeo compreendendo uma seqüência de nucleotídeo consistindo ementre 20 a 3574 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüênciade nucleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 8,SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14 para uso como umasonda; um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreendendo uma se-qüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotídeos conse-cutivos selecionada de uma seqüência de nucleotídeo de qualquer uma deSEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.:11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21 para uso comouma sonda; uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüência denucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivos sele-cionada de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência de ami-noácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, para uso como um iniciadorem uma reação de PCR; uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma se-qüência de nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos conse-cutivos selecionada de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a se-qüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12ou SEQ ID NO.: 14 , para uso como um iniciador em uma reação de PCR;uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüência de nucleotídeocompreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivos selecionada daseqüência de nucleotídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.:5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ IDNO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21, para uso como um iniciador em uma reação dePCR; ou um oligonucleotídeo tendo a seqüência de nucleotídeo de qualqueruma de SEQ ID NO.: 1, SEQ ID NO.: 2, SEQ ID NO.: 15 ou SEQ ID NO.: 16,SEQ ID NO.: 19 ou SEQ ID NO.: 20 para uso como um iniciador em umareação de PCR; e utilização desse meio para identificar um fragmento deDNA de XyIT da espécie ou cultivar de Nicotiana realizando uma PCR usandoo DNA genômico ou o cDNA e os iniciadores ou realizando hibridização u-sando o DNA genômico ou cDNA e as sondas. O fragmento identificado po-de, subseqüentemente, ser isolado e usado para obter uma célula de plantaou planta Nicotiana tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose so-bre N-glicanos ligadas à proteína.
A invenção também proporciona um método para identificar umalelo de XyIT de Nicotiana correlacionado a um baixo nível de resíduos debeta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína compreendendo as eta-pas de fornecimento de uma população, opcionalmente uma população commutação, de diferentes linhagens de planta de uma espécie ou cultivar deNicotiana-, identificação, em cada linhagem de planta, da população de umalelo de XyIT de Nicotiana de acordo com o método descrito acima; análisedo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteínade cada linhagem de planta da população e identificação daquelas linhagensde planta tendo um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que outras linhagens de planta; e correlaçãodo baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à pro-teína em uma linhagem de planta à presença de um alelo de beta-1,2-xiloseNicotiana-especíüco. O alelo de XyIT de Nicotiana pode ser introduzido emuma célula de planta ou planta Nicotiana de escolha para obter uma célulade planta ou planta Nicotiana com um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína.É ainda outro objetivo da invenção proporcionar: um fragmentode DNA isolado que codifica uma proteína compreendendo a seqüência deaminoácido SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14 ou qualquer parte da mes-ma que codifica pelo menos um aminoácido de XyIT Nicotiana benthamiana-específico; um fragmento de DNA isolado compreendendo a seqüência denucleotídeo of SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID NO.: 21 ou qual-quer parte da'mesma compreendendo pelo menos um nucleotídeo de XyITNicotiana benthamiana-específico; um fragmento de DNA isolado que codifi-ca uma proteína compreendendo a seqüência de aminoácido de SEQ IDNO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10 ou qualquer parteda mesma que codifica pelo menos um aminoácido de XyIT Nicotiana taba-cum cv. Petite Havana SR1-específico; um fragmento de DNA isolado com-preendendo a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3 ou SEQ ID NO.:5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9 ou SEQ ID NO.: 17 ou qualquer parte damesma compreendendo pelo menos um nucleotídeo de XyIT Nieotiana taba-cum cv. Petite Havana SR1 -específico.
A invenção ainda proporciona um gene quimérico compreen-dendo os fragmentos de DNA operavelmente ligados: um promotor expres-sível em planta; uma região de DNA passível de transcrição compreendendouma primeira região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica uma proteína de XyIT de Nieotiana ou o complemento da mesma, emque os 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelo menos um ami-noácido de XyIT espécie ou cultivar de Nieotiana-específico ou selecionadada seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nieotiana ou um cDNAde XyIT de Nieotiana ou o complemento da mesma, em que os 19 de 20 nu-cleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyITespécie de Nieotiana-específico, na orientação anti-sentido; uma segundaregião de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecu-tivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma prote-ína de XyIT de Nieotiana ou o complemento da mesma, em que os 19 de 20nucleotídeos consecutivos codificam peto menos um aminoácido de XyITespécie ou cultivar de Nicotiana-específico ou selecionada da seqüência denucleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nico-tiana ou o complemento da mesma, em que os 19 de 20 nucleotídeos con-secutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Ni-cotiana-específico, na orientação sentido, pelo que uma molécula de RNAproduzida através de transcrição da região de DNA passível de transcrição écapaz de formar uma região de DNA de filamento duplo através de empare-Ihamento de base pelo menos entre uma região de RNA correspondendo àprimeira região de DNA e uma região de RNA correspondendo à segundaregião de DNA; e uma região de DNA compreendendo a um sinal de polia-denilação e término de transcrição funcional em planta. O gene quiméricotambém pode compreender um promotor expressível em planta; uma regiãode DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivosselecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteínade XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, em que os 19 de 20 nu-cleotídeos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espé-cie ou cultivar de Mcof/ana-específico ou selecionada da seqüência de nu-cleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nieotia-na ou o complemento da mesma, em que os 19 de 20 nucleotídeos consecu-tivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nieotia-na-específico, na orientação sentido ou anti-sentido; e uma região de DNAcompreendendo um sinal de poliadenilação e término de transcrição funcio-nal em plantas.
Células de planta Nieotiana compreendendo tais genes quiméri-cos e plantas Nieotiana consistindo essencialmente em tais células de plantaNieotiana, bem como sementes da mesma são também proporcionadas pelainvenção.
A invenção também se refere ao uso de uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica uma proteína compreendendo a seqüência de amino-ácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10,SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14 ou qualquer parte da mesma compreen-dendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos que codificam pelomenos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico,para diminuir o nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadasà proteína em uma planta Nicotiana ou ao uso de uma seqüência de nucleo-tídeo compreendendo a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13,SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21 ou qualquer parte da mesma compreen-dendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendendo pelomenos um nucleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-e specífico,para diminuir o nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadasà proteína em uma planta Nicotiana, para identificar um gene de XyIT oucDNA de XyIT em uma espécie ou cultivar de Nicotiana, para identificar umalelo de um gene XyIT correlacionado a um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma espécie ou cultivar deNicotiana ou para introduzir um alelo de um gene XyiT correlacionado a umbaixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteí-na em uma espécie ou cultivar de Nicotiana.
Com os objetivos precedentes e outros, vantagens e caracterís-ticas da invenção que se tornarão aqui depois evidentes, a natureza da in-venção pode ser mais claramente compreendida através de referência àdescrição detalhada a seguir de diferentes modalidades da invenção, às rei-vindicações em anexo e às figuras.
Breve Descrição das Figuras
A Figura 1 é um alinhamento de DNA global (baseado na matrizde escore linear padrão com os seguintes parâmetros: penalidade por com-binação errônea = 2, penalidade por abertura de gap = 4 e penalidade porextensão de gap = 1) entre uma seqüência de cDNA de Nicotiana tabacumcv. Xanthi que codifica uma proteína de XyIT putativa (número de acessoAJ627182; SEQ ID NO: 23) e duas diferentes seqüências de cDNA de XyITisoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 3 e 5).
Os pontos representam nucleotídeos nas seqüências de cDNA de Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1 que são idênticas aos nucleotídeos corres-pondentes na seqüência de cDNA de Nicotiana tabacum cv. Xanthi; as Ii-nhas tracejadas representam a ausência de nucleotídeos nas seqüências decDNA de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 correspondendo aosnucleotídeos na seqüência de cDNA de Nicotiana tabacum cv. Xanthi.
A Figura 2 é um alinhamento de proteína global (baseado namatriz de escore blossum 62) entre a proteína de XyIT putativa codificadapela seqüência de cDNA de Nicotiana tabacum cv. Xanthi (número de aces-so AJ627182; SEQ ID NO: 24) e por duas seqüências de cDNA de XyIT dife-rentes isoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 4e 6). Os pontos representam aminoácidos nas seqüências de proteína deNicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 que são idênticas aos aminoáci-dos correspondentes na seqüência de proteína de Nicotiana tabacum cv.Xanthi; as linhas tracejadas representam a ausência de aminoácidos nasseqüências de proteína de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 cor-respondendo aos aminoácidos na seqüência de proteína de Nicotiana taba-cum cv. Xanthi.
A Figura 3 é um alinhamento de DNA global (baseado na matrizde escore linear padrão com os seguintes parâmetros: penalidade por com-binação errônea = 2, penalidade por abertura de gap = 4 e penalidade porextensão de gap = 1) entre a seqüência de DNA genômico de Nicotiana ta-bacum cv. Xanthi que codifica uma proteína de XyIT putativa (número deacesso AJ627183; SEQ ID NO: 25) e duas diferentes seqüências de DNAgenômico de XyIT isoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1(SEQ ID NOs: 7 e 9) e duas diferentes seqüências de DNA genômico de X-ylT na isoladas de Nicotiana benthamiana (SEQ ID NO: 11 e 13). Os pontosrepresentam nucleotídeos nas seqüências de DNA genômico de Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1 que são idênticas aos nucleotídeos corres-pondentes na seqüência de DNA genômico de Nicotiana tabacum cv. Xanthi;a linha tracejada representa a ausência de nucleotídeos nas seqüências deDNA genômico de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 corresponden-do aos nucleotídeos na seqüência de DNA genômico de Nicotiana tabacumcv. Xanthi.
A Figura 4 é um alinhamento de proteína global (baseado namatriz de escore blossum 62) entre a proteína de XyIT putativa codificadapela seqüência de DNA genômico de Nicotiana tabacum cv. Xanthi (númerode acesso AJ627183; SEQ ID NO: 26) e por duas diferentes seqüências deDNA genômico de XyIT isoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite HavanaSR1 (SEQ ID NO: 8 e 10) e por duas diferentes seqüências de DNA genômi-co isoladas de Nicotiana benthamiana (SEQ ID NO: 12 e 14). Os pontos re-presentam aminoácidos nas seqüências de proteína de Nieotiana tabacumcv. Xanthi; a linha tracejada representa a ausência de aminoácidos nas se-qüências de proteína de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 corres-pondendo aos aminoácidos na seqüência de proteína de Nicotiana tabacumcv. Xanthi.
Descrição Detalhada de Diferentes Modalidades da Invenção
A presente invenção é baseada na descoberta de que genes deXyIT e cDNAs de XyIT de espécies e cultivares de Nieotiana, particularmenteNicotiana benthamiana e Nieotiana tabacum cv. Petite Havana SR1, são ex-celentes seqüências de nucleotídeo fonte para obter plantas dessas espé-cies e cultivares de Nieotiana, particularmente plantas Nieotiana benthamia-na e plantas Nieotiana tabacum cv. Petite Havana SR1, respectivamente,tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadasà proteína, por exemplo, através de modificação da atividade de gene(s) en-dógeno(s) de XyIT de Nieotiana, através de troca de um gene de XyIT deNieotiana endógeno por outro alelo do gene de XyIT de Nieotiana o qual pro-porciona um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos li-gadas à proteína ou através de qualquer combinação dos mesmos.
Em uma modalidade, a invenção é relacionada a um métodopara obtenção de uma célula de planta ou planta Nieotiana tendo um baixonível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína a-través de redução da expressão do(s) gene(s) de XyIT endógeno na célulade planta ou planta Nieotiana através de fornecimento de uma ou mais mo-léculas de RNA de silenciamento às células de planta ou plantas de umaespécie ou cultivar de Nieotiana, em que as moléculas de RNA de silencia-mento compreendem uma parte de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica uma proteína de XyIT de Nicotiana, de preferência obtida da referidaespécie ou cultivar de Nicotiana, em que a referida parte codifica pelo menosum aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico ou emque as moléculas de RNA de silenciamento compreendem uma parte deuma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cD-NA de XyIT de Nicotiana, de preferência obtida da referida espécie ou culti-var de Nicotiana, em que a referida parte compreende pelo menos um nu-cleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-especlVico.
Conforme usado aqui, "RNA de silenciamento" ou "molécula deRNA de silenciamento" se refere a qualquer molécula de RNA a qual, quan-do de introdução de uma célula de planta, reduz a expressão de um gene-alvo. Tal RNA de silenciamento pode, por exemplo, ser o assim denominado"RNA anti-sentido", pelo que a molécula de RNA compreende uma seqüên-cia de pelo menos 20 nucleotídeos consecutivos tendo 95% de identidade deseqüência ao complemento da seqüência do ácido nucléico alvo, de prefe-rência a seqüência de codificação do gene-alvo. Contudo, RNA anti-sentidotambém pode ser dirigido à seqüências regulatórias de genes alvo, incluindoas seqüências promotoras e sinais de poliadenilação e término de transcri-ção. RNA de silenciamento ainda inclui o assim denominado "RNA sentido",pelo que a molécula de RNA compreende uma seqüência de pelo menos 20nucleotídeos consecutivos tendo 95% de identidade de seqüência à seqüên-cia do ácido nucléico alvo. Outro RNA de silenciamento pode ser "RNA não-poliadenilado" compreendendo pelo menos 20 nucleotídeos consecutivostendo 95% de identidade de seqüência ao complemento da seqüência doácido nucléico alvo, tal como descrito no W001/12824 ou US6423885 (am-bos os documentos sendo aqui incorporados por referência). Ainda outro tipode RNA de silenciamento é uma molécula de RNA conforme descrito noW003/076619 (aqui incorporado por referência) compreendendo pelo menos20 nucleotídeos consecutivos tendo 95% de identidade de seqüência à se-qüência do ácido nucléico alvo ou ao complemento da mesma e ainda com-preendendo uma região grandemente fita dupla conforme descrito noW003/076619 (incluindo regiões grande de fita dupla compreendendo umsinal de localização nuclear de um viróide do tipo viróide do tubérculo de fu-so da batata ou compreendendo repetições de trinucleotídeo CUG). RNA desilenciamento também pode ser RNA de filamento duplo compreendendouma fita sentido e anti-sentido conforme definido aqui, em que a fita sentidoe anti-sentido são capazes de emparelhamento de base uma com a outrapara formar uma região de RNA de filamento duplo (de preferência, os refe-ridos pelo menos 20 nucleotídeos consecutivos do RNA sentido e anti-sentido são complementares uns aos outros). A região sentido e anti-sentidopode também estar presente dentro de uma molécula de RNA, tal como umRNA em gancho, hairpin (hpRNA) pode ser formado quando a região sendoe anti-sentido forma uma região de RNA de filamento duplo. hpRNA é bem-conhecido dentro da técnica (vide, por exemplo, W099/53050, aqui incorpo-rado por referência). O hpRNA pode ser classificado como hpRNA longo,tendo regiões sentido e anti-sentido longas as quais podem ser grandementecomplementares, mas não precisam ser totalmente complementares (tipica-mente, mais longa do que cerca de 200 bp, oscilando entre 200-1000 bp).hpRNA também pode ser menor oscilando, quanto ao tamanho, de cerca de30 a cerca de 42 bp, mas não mais longo do que 94 bp (vide W004/073390,aqui incorporado por referência). RNA de silenciamento pode também podeser molécula de micro-RNA artificiais conforme descrito, por exemplo, noW02005/052170, W02005/047505 ou US 2005/0144667 (todos os docu-mentos incorporados aqui por referência).
Em outra modalidade, as moléculas de RNA de silenciamentosão fornecidas à célula de planta ou planta da espécie ou cultivar de Nicotia-na através de produção de uma célula de planta ou planta transgênica daespécie ou cultivar de Nicotiana compreendendo um gene quimérico capazde produzir uma molécula de RNA de silenciamento, particularmente umamolécula de RNA de filamento duplo ("dsRNA"), em que a fita de RNA com-plementar de tal molécula de dsRNA compreende uma parte de uma se-qüência de nucleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana, depreferência obtida da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que a re-ferida parte codifica pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivarde Nicotiana-específico ou em que a fita de RNA complementar de tal molé-cula de dsRNA compreende uma parte de uma seqüência de nucleotídeo deum gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana, de prefe-rência obtido da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que a referidaparte compreende pelo menos uma nucleotídeo de XyIT espécie ou cultivarde Nicotiana-e specífico.
"Nicotiana", conforme usado aqui, inclui todas as espécies deNicotiana conhecidas tais como, mas não limitado a, Nicotiana acauiis, N.acuminata, N. africana, N. alata, N. ampiexicaulis, N. arentsii, N. attenuata,N. benavidesii, N. benthamiana, N. bigeiovii, N. bonariensis, N. cavicola, N.cievelandii, N. cordifoiia, N. corymbosa, N. debneyi, N. exceisior, N. forgetia-na, N. fragrans, N. glauca, N. glutinosa, N. goodspeedii, N. gossei, N. hybrid,N. inguiba, N. kawakamii, N. knightiana, N. iangsdorffii, N. iinearis, N. Iongi-flora, N. marítima, N. megalosiphon, N. miersii, N. noctiflora, N. nudicaulis, N.obtusifolia, N. occidentalis, N. otophora, N. paniculata, N. pauciflora, N. petu-nioides, N. plumbaginifolia, N. quadrivalvis, N. raimondii, N. repanda, N. ro-sulata, N. rotundifolia, N. rústica, N. setchellii, N. simulans, N. solanifolia, N.spegazzinii, N. stocktonii, N. suaveolens, N. sylvestris, N. tabacum, N. thyrsi-flora, N. tomentosa, N. tomentosiformis, N. trigonophylla, N. umbratica, N.undulata, N. velutina, N. wigandioides e Nicotiana χ sandera e todos os culti-vares conhecidos de Nicotiana tais como, mas não limitado a Nicotiana ta-bacum, tal como cv. Burley21, cv. Delgold, cv. Petit Havana, cv. Petit Hava-na SR1, cv. Samsun e cv. Xanthi.
Nicotiana tabacum, a qual é o tabaco comum, é uma espéciehíbrida tetraplóide, a qual se originou das espécies diplóides Nicotiana syl-vestris e Nicotiana tomentosiformis.
Um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotia-na se refere a uma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT que ocor-re naturalmente em uma espécie ou cultivar de Nicotiana ou a um cDNA cor-respondendo ao mRNA de um gene de XyIT que ocorre naturalmente emuma espécie ou cultivar de Nicotiana . Similarmente, uma proteína de XyITde Nicotiana se refere a uma proteína conforme ela ocorre naturalmente emuma espécie ou cultivar de Nicotiana.
Exemplos de seqüências de nucleotídeo que codificam uma pro-teína de XyIT de Nicotiana incluem aquelas obtidas de Nicotiana benthamia-na que codificam a seqüência de aminoácido apresentada em SEQ ID NO.:12 ou SEQ ID NO.: 14 e aquelas obtidas de Nicotiana tabacum cv. PetiteHavana SR1 que codificam a seqüência de aminoácido apresentada emSEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8 ou SEQ ID NO.: 10.
Exemplos de seqüências de nucleotídeo que codificam um genede XyIT de Nicotiana incluem aquelas obtidas de Nicotiana benthamianacompreendendo a seqüência de nucleotídeo apresentada em SEQ ID NO.:11, SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID NO.: 21 e aquelas obtidas de Nicotiana taba-cum cv. Petite Havana SR1 compreendendo a seqüência de nucleotídeoapresentada em SEQ ID NO.: 7 ou SEQ ID NO.: 9.
Exemplos de seqüências de nucleotídeo de um cDNA de XyITde Nicotiana incluem aquelas obtidas de Nicotiana tabacum cv. Petite Hava-na SR1 compreendendo a seqüência de nucleotídeo apresentada em SEQID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5 ou SEQ ID NO.: 17.
Contudo, será imediatamente claro para aqueles versados natécnica que as seqüências de nucleotídeo exemplificadas ou partes dasmesmas podem ser usadas para identificar outras seqüências de nucleotí-deo de genes de XyIT de Nicotiana ou cDNAs de XyIT de Nicotiana em es-pécies ou cultivares de Nicotiana e que tais seqüências de nucleotídeo oupartes das mesmas podem também ser usadas, por exemplo, para diminuiro nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteínaem plantas Nicotiana . As seqüências de nucleotídeo exemplificadas poderi-am ser usadas para selecionar:
i) um fragmento de DNA compreendendo uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:14, para uso como uma sonda;
ii) um fragmento de DNA compreendendo a seqüência de nucle-otídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7,SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQID NO.: 21, para uso como uma sonda;
iii) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreendendouma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 1513 nucleotídeosconsecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica aseqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, para usocomo uma sonda;
iv) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreendendouma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 to 3574 nucleotídeosconsecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica aseqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.:12 ou SEQ ID NO.: 14 , para uso como uma sonda;
v) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreendendouma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotídeosconsecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo de qualqueruma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21, para usocomo uma sonda;
vi) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüência denucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivos sele-cionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência de a-minoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, para uso como um iniciadorem uma reação de PCR;
vii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüência denucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivos sele-cionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência de a -minoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ IDNO.: 14 , para uso como um iniciador em uma reação de PCR;
viii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüência denucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivos sele-cionada da seqüência de nucleotídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3,SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ IDNO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21, para uso como um iniciadorem uma reação de PCR; ou
ix) um oligonucleotídeo tendo a seqüência de nucleotídeo dequalquer uma de SEQ ID NO.: 1, SEQ ID NO.: 2, SEQ ID NO.: 15 ou SEQ IDNO.: 16, SEQ ID NO.: 19 ou SEQ ID No.20 para uso como um iniciador emuma reação de PCR.
Realizando uma PCR usando DNA genômico ou cDNA de espé-cies ou cultivares de Nicotiana e os oligonucleotídeos mencionados comoiniciadores ou realizando hibridização, de preferência sob condições estri-gentes entre o DNA genômico ou cDNA de espécies e cultivares de Nieotia-na e as sondas mencionadas, esses outros genes de XyIT de Nicotiana oucDNAs de XyIT de Nicotiana ou fragmentos dos mesmos podem ser identifi-cados e/ou isolados.
"Condições de hibridização estringentes", conforme usado aqui,significa que hibridização geralmente ocorrerá se há pelo menos 95% e, depreferência, pelo menos 97% de identidade de seqüência entre a sonda e aseqüência-alvo. exemplos de condições de hibridização estringente são in-cubação durante a noite em uma solução compreendendo formamida a 50%,5 χ SSC (NaCI a 150 mM, citrato trissódico a 15 mM), fosfato de sódio a 50mM (pH de 7,6), 5x solução de Denhardt, sulfato de dextrana a 10% e 20μg/ml de DNA veículo cisalhado, desnaturado, tal como DNA de esperma desalmão, seguido por lavagem do suporte de hibridização em 0,1 χ SSC aaproximadamente 65°C, por exemplo, durante cerca de 10 min. (duas ve-zes). Outras condições de hibridização e lavagem são bem-conhecidas eexemplificadas em Sambrook e outros, Molecular Cloning: A Laboratory Ma-nual, Segunda Edição, Cold Spring Harbor, NY (1989), particularmente capí-tulo 11.
Um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-específico" ou um"nucleotídeo de XyIT cultivar de Mcof/ana-específico" se refere a um nucleo-tídeo de uma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT ou um cDNA deXyIT de uma espécie ou cultivar de Nieotiana que difere de ou não está pre-sente na seqüência de nucleotídeo correspondente do gene de XyIT de Ni-cotiana tabacum cv. Xanthi representada em SEQ ID NO: 25 ou do cDNA deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Xanthi representada em SEQ ID NO: 23, res-pectivamente.
Um "aminoácido de XyIT espécie de Nicotiana-específico" ou um"aminoácido de XyIT cultivar de Nicotiana-especíüco" se refere a um amino-ácido da seqüência de aminoácido de uma proteína de XyIT codificada porum gene de XyIT ou codificada por um cDNA de XyIT de uma espécie oucultivar de Nicotiana que difere de ou não está presente na seqüência deaminoácido da proteína de XyIT codificada pelo gene de XyIT de Nicotianatabacum cv. Xanthi representada em SEQ ID NO: 26 ou codificada pelo cDNAde XyIT de Nicotiana tabacum cv. Xanthi representada em SEQ ID NO: 24,respectivamente.
Para determinar a presença de um nucleotídeo ou aminoácidode XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específtco em uma seqüência denucleotídeo de um gene de XyIT ou um cDNA de XyIT de uma espécie oucultivar de Nicotiana ou na seqüência de aminoácido de uma proteína deXyIT codificada por um gene de XyIT ou codificada por um cDNA de XyIT deuma espécie ou cultivar de Nieotiana, para fins da presente invenção, as se-qüências de nucleotídeo ou aminoácido de XyIT da espécie ou cultivar deNieotiana são comparadas com as seqüências de nucleotídeo ou aminoáci-do de XyIT correspondentes de Nieotiana tabacum cv. Xanthi através de ali-nhamento das seqüências usando um procedimento de alinhamento global(para seqüências de nucleotídeo, a matriz de escore de ausência usada é"linear-padrão" com penalidade por combinação errônea = 2, penalidade porabertura de gap = 4 e penalidade por extensão de gap = 1. Para seqüênciasde proteína, a matriz de escore de ausência é "blossum 62"; Henikoff e He-nikoff, 1992). Para realizar o alinhamento, o programa Align Plus (fornecidopela Scientific & Educational Software, EUA) pode ser usado.
Um exemplo de tal alinhamento de DNA global é o alinhamentode DNA global da seqüência de cDNA de XyIT de Nieotiana tabacum cv.Xanthi representada em SEQ ID NO: 23, com as seqüências de cDNA deXyIT de Nieotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 representadas em SEQID NO: 3 e 5, na Figura 1. exemplos de nucleotídeos de XyIT Nicotiana taba-cum cv. Petite Havana SR1-específicos baseado nesse alinhamento globalde DNA incluem:
- o nucleotídeo nas posições 1041, 1323, 1332 ou 1421 de SEQID NO: 3,
- o nucleotídeo nas posições 62, 76, 87, 104, 117, 122, 139, 140,148, 155, 169, 190, 199, 202, 212, 213, 216, 265, 287, 294, 316, 373, 385,388, 430, 554, 607, 628, 643, 838, 892, 897, 898, 941, 1005, 1021, 1039 ou1495 de SEQ ID NO: 5.
Outro exemplo de tal alinhamento de DNA global é o alinhamen-to de DNA global da seqüência do gene de XyIT de Nicotiana tabacum cv.Xanthi representada em SEQ ID NO: 25 com as seqüências do gene de XyITde Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 representadas em SEQ ID NO:7 e 9 e com as seqüências do gene de XyIT de Nicotiana benthamiana re-presentadas em SEQ ID NO: 11 e 13, na Figura 3. exemplos de nucleotí-deos de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1-específicos de-terminados baseado nesse alinhamento global de DNA incluem:
- o nucleotídeo nas posições 61, 75, 86, 100-120, 124, 137, 142,159, 160, 168, 175, 189, 210, 219, 222, 232, 233, 236, 285, 307, 314, 336,393, 405, 408, 450, 574, 627, 648, 663, 692, 698, 702, 721, 754, 802, 821,842, 852, 856, 901, 903, 906, 907, 908, 917, 927, 928, 930, 931, 960, 961,965, 974, 977, 981, 983, 986, 1001, 1019, 1027, 1029, 1034, 1068, 1073,1099, 1120, 1129, 1144, 1154, 1158, 1181, 1193, 1208, 1212, 1228, 1230,1239, 1275, 1313-1316, 1348, 1353, 1357, 1384, 1386, 1496, 1531, 1571,1601, 1629, 1681, 1696, 1698, 1730, 1754, 1761, 1772, 1789, 1800, 1802,1811, 1814, 1815, 1855-1861, 1929, 2172, 2190, 2322, 2324, 2328, 2353,2354, 2391, 2404, 2419, 2428, 2429, 2433, 2434, 2459, 2464, 2478, 2479,2481, 2484, 2512, 2540-2590, 2595, 2604, 2606, 2630, 2633, 2638, 2670,2673, 2680, 2695, 2698, 2710, 2711, 2752, 2806, 2811, 2812, 2855, 2919,2953, 2966, 3217, 3226, 3229 ou 3232 de SEQ ID NO: 7,
- o nucleotídeo nas posições 553, 606, 627, 642, 671, 677, 681,700, 733, 781, 800, 821, 831, 835, 880, 882, 885, 886, 887, 896, 906, 907,909, 910, 939, 940, 944, 953, 956, 960, 962, 965, 980, 998, 1006, 1008,1013, 1047, 1052, 1078, 1099, 1108, 1123, 1133, 1137, 1160, 1172, 1187,1191, 1207, 1209, 1218, 1254, 1292, 1293, 1294, 1295, 1327, 1332, 1336,1363, 1365, 1475, 1510, 1550, 1580, 1608, 1660, 1675, 1677, 1709, 1733,1740, 1751, 1768, 1779, 1781, 1790, 1793, 1794, 1834-1840, 1908, 2151,2169, 2301, 2303, 2307, 2332, 2333, 2370, 2383, 2398, 2407, 2408, 2412,2413, 2438, 2443, 2457, 2458, 2460, 2463, 2491, 2519-2569, 2574, 2583,2585, 2609, 2612, 2617, 2649, 2652, 2659, 2674, 2677, 2689, 2690, 2731,2785, 2790, 2791, 2834, 2898, 2932, 2945, 3196 ou 3205 de SEQ ID NO: 9.
Exemplos de nucleotídeos de XyIT Nicotiana benthamiana-espe-cíficos determinados baseado nesse alinhamento global de DNA incluem:
- o nucleotídeo nas posições 71, 72, 75, 77, 86, 90, 104, 116,147, 158, 212, 222, 246, 264, 286, 317, 321, 345, 402, 472, 479, 488, 526,552, 612, 637, 668, 669, 670, 701, 726, 734, 742, 747, 773, 785, 795, 796,802, 831, 871, 872, 874, 888, 897, 898, 899, 901, 902, 927, 931, 932, 1039,1044, 1047, 1080, 1091, 1103, 1104, 1113, 1118, 1131, 1134, 1145, 1152,1164, 1179, 1183, 1199, 1201, 1206, 1227, 1286, 1287, 1288, 1289, 1296,1301, 1317, 1328, 1332, 1347, 1376, 1388, 1424, 1429, 1458, 1464, 1510,1517, 1534, 1559, 1672, 1675, 1676, 1677, 1693, 1705, 1719, 1750, 1757,1761, 1765, 1832, 1838, 1862, 1872, 1877, 1978, 2010, 2074, 2111, 2115,2227, 2251, 2259, 2271, 2283, 2296, 2297, 2341, 2348, 2361, 2370, 2371,2375, 2384, 2401, 2404, 2406, 2495, 2497, 2521, 2529, 2561, 2607, 2701,2777, 2822, 2843, 2856, 2867, 3020, 3052, 3053, 3116, 3143 ou 3227 deSEQ ID NO: 11
- o nucleotídeo nas posições 77, 107, 203, 297, 312, 399, 449,469, 489, 492, 496, 529, 538, 566, 573, 633, 661, 662, 666, 671, 683, 690,699, 723, 763, 774, 784, 785, 791, 861, 877, 886, 887, 888, 890, 891, 920,921, 943, 996, 1015, 1034, 1116, 1190, 1226, 1277-1280, 1282, 1287, 1331,1343, 1360, 1386-1651, 1672, 1689, 1738, 1770, 1791, 1813, 1820, 1822,1831, 1832, 1862, 1869, 1874, 1882, 1893, 1906, 1935, 1945, 1956, 1988,2007, 2033, 2034, 2045, 2049, 2050, 2167, 2198, 2280, 2299, 2315, 2355,2392, 2413, 2428, 2442, 2464, 2468, 2477, 2493, 2522, 2544, 2548, 2573,2574, 2639, 2648, 2649, 2653, 2655, 2659, 2679, 2684, 2740, 2773, 2775,2781, 2796, 2799, 2807, 2816, 2839, 2857, 2975, 2977, 2990, 3053, 3071,3083, 3119, 3132, 3265, 3311 ou 3392 de SEQ ID NO: 13.
Um exemplo de tal alinhamento de proteína global é o alinha-mento de proteína global da seqüência de proteína de XyIT codificada pelaseqüência de cDNA de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1representada em SEQ ID NO: 24 com as seqüências de proteína de XyITcodificadas pelas seqüências de cDNA de XyIT de Nicotiana tabacum cv.Petite Havana SB1 representadas em SEQ ID NO: 4 e 6, na Figura 2. exem-plos de aminoácidos de XyIT Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1-específicos determinados baseado nesse alinhamento global de proteínaincluem:
- o aminoácido nas posições 472 ou 502 de SEQ ID NO: 4,
- o aminoácido nas posições 20, 28, 38, 40, 46, 51, 70, 71, 95,97, 184, 213, 298, 313, 334 ou 497 de SEQ ID NO: 6.
Outro exemplo de tal alinhamento global de proteína é o alinha-mento global de proteína das seqüências de proteína de XyIT codificadaspela seqüência do gene de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Xanthi represen-tada em SEQ ID NO: 26 com as seqüências de proteína de XyIT codificadaspelas seqüências do gene de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite HavanaSR1 representadas em SEQ ID NO: 8 e 10 e com as seqüências de proteínade XyIT codificadas pelas seqüências do gene de XyIT de Nicotiana bentha-miana representadas em SEQ ID NO: 12 e 14, na Figura 4. exemplos deaminoácidos de XyIT Nicotiana tabacum cm. Petite Havana SR1 -específicosdeterminado baseado nesse alinhamento global de proteína incluem:
- o aminoácido nas posições 19, 27, 32-38, 44, 46, 52, 57, 76,77, 101, 103, 190, 219, 304, 319, 340 ou 356 de SEQ ID NO: 8,
- o aminoácido nas posições 183, 212, 297, 312, 333 ou 349 deSEQ ID NO: 10.
Exemplos de aminoácidos de XyIT Nicotiana benthamiana-espe-cíficos determinado baseado nesse alinhamento global de proteína incluem:
- o aminoácido nas posições 22, 24, 27, 33, 37, 51, €9, 94, 104,156, 158, 161, 174, 182, 211, 238, 297, 349 ou 414 de SEQ ID NO: 12,
- ο aminoácido nas posições 1, 26, 36, 68, 99, 133, 150, 157,166, 180, 189, 211,218, 245, 257, 296, 327, 348 ou 392 de SEQ ID NO: 14.
A parte de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma pro-teína de XyIT de Nicotiana e a parte de uma seqüência de nucleotídeo deum gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana compreen-dida dentro da molécula de RNA de silenciamento, particularmente dentro deuma fita da molécula de RNA de filamento duplo, deverá ter pelo menos 19nucleotídeos de comprimento, mas pode variar de cerca de 19 nucleotídeos(nt) até um comprimento igual ao comprimento (em nucleotídeos) da se-qüência que codifica proteína de XyIT de Nicotiana ou da seqüência de cDNAou gene de XyIT de Nicotiana. O comprimento total da seqüência de nucleo-tídeo sentido ou anti-sentido pode, assim, ser de pelo menos 25 nt ou pelomenos cerca de 50 nt ou pelo menos cerca de 100 nt ou pelo menos cercade 150 nt ou pelo menos cerca de 200 nt ou pelo menos cerca de 500 nt.Espera-se que não haja limite máximo quanto ao comprimento total da se-qüência de nucleotídeo anti-sentido ou sentido. Contudo, por razões práticas(tais como, por exemplo, estabilidade dos genes quiméricos), espera-se queo comprimento da seqüência de nucleotídeo sentido ou anti-sentido não ex-ceda a 5000 nt, particularmente não exceda a 2500 nt e poderia estar limita-da a cerca de 1000 nt.
Será apreciado que quanto mais longo o comprimento total daparte da seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Ni-cotiana ou a parte de uma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT deNicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana (região sentido ou anti-sentido),menos estringentes são os requisitos para identidade de seqüência entreessas regiões e a seqüência correspondente no gene de XyIT endógeno daespécie ou cultivar de Nicotiana que ela complementa. De preferência, o á-cido nucléico de interesse terá uma identidade de seqüência de pelo menoscerca de 75% com a seqüência-alvo correspondente, particularmente pelomenos cerca de 80%, mais particularmente pelo menos cerca de 85%, muitoparticularmente cerca de 90%, especialmente cerca de 95%, mais especial-mente cerca de 100%, muito especialmente será idêntica à parte correspon-dente da seqüência-alvo ou seu complemento. Contudo, é preferido que oácido nucléico de interesse sempre inclua uma seqüência de cerca de 19nucleotídeos consecutivos, particularmente cerca de 25 nt, mais particular-mente cerca de 50 nt, especialmente cerca de 100 nt, muito especialmentecerca de 150 nt com 100% de identidade de seqüência à parte correspon-dente do ácido nucléico de XyIT alvo, em que os referidos cerca de 19 nu-cleotídeos consecutivos, particularmente cerca de 25 nt, mais particularmen-te cerca de 50 nt, especialmente cerca de 100 nt, muito especialmente cercade 150 nt codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivarde Nicotiana-específico ou compreendem pelo menos um nucleotídeo deXyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-espec\i\co.
Para fins da presente invenção, a "identidade de seqüência" deduas seqüências de nucleotídeo ou aminoácido relacionadas, expressa co-mo um percentual, se refere a um número de posições nas duas seqüênciasotimamente alinhadas as quais têm resíduos idênticos (x100) dividido pelonúmero de posições comparadas. Uma gap, isto é, uma posição em um ali-nhamento onde um resíduo está presente em uma seqüência, mas não naoutra, é considerada como uma posição com resíduos não idênticos. De pre-ferência, para cálculo da identidade de seqüência e designing da seqüênciasentido ou anti-sentido correspondente, o número de gaps deverá ser mini-mizado, particularmente para as seqüências sentido mais curtas.
Será claro que sempre que seqüências de nucleotídeo de molé-culas de RNA são definidas através de referência a uma seqüência de nu-cleotídeo das moléculas de DNA correspondentes, a timina (T) em uma se-qüência de nucleotídeo deverá ser substituída por uracila (U). Se referênciaé à moléculas de RNA ou DNA estará claro a partir do contexto da aplicação.
Foi demonstrado que o requisito mínimo para silenciamento deum gene-alvo particular é a presença, na seqüência de nucleotídeo do genequimérico de silenciamento, de uma seqüência de nucleotídeo de cerca de20-21 nucleotídeos consecutivos de comprimento correspondendo à se-qüência do gene-alvo, na qual pelo menos 19 dos 20-21 nucleotídeos con-secutivos são idênticos à seqüência do gene-alvo correspondente. "19 de 20nucleotídeos consecutivos", conforme usado aqui, se refere a uma seqüên-cia de nucleotídeo de 20 nucleotídeos consecutivos selecionados do gene-alvo tendo um nucleotídeo erroneamente combinado.
Para silenciamento do gene de XyIT endógeno de uma espécieou cultivar de Nicotiana, é preferido que a seqüência de nucleotídeo de genequimérico de silenciamento compreenda pelo menos 19 de 20-21 nucleotí-deos consecutivos de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma prote-ína de XyIT de Nicotiana, em que os referidos pelo menos 19 de 20-21 nu-cleotídeos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espé-cie ou cultivar de /V/cof/ana-específico ou compreenda pelo menos 19 de 20-21 nucleotídeos consecutivos de uma seqüência de nucleotídeo de um genede XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana, em que os referidospelo menos 19 de 20-21 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo me-nos um nucleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico.
Conforme usado aqui, "uma planta Nicotiana tendo um baixonível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína" éuma planta (particularmente uma planta Nicotiana obtida de acordo com ométodo da invenção), na qual a atividade de XyIT é diminuída ou eliminada,resultando em um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que o nível de resíduos de beta-1,2-xiIose so-bre N-glicanos ligadas à proteína em uma planta Nicotiana de controle nãotratada de acordo com os métodos da invenção ou resultando na ausênciade resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína. Uma in-dicação de atividade de XyIT pode ser obtida através de comparação do ní-vel de resíduos de beta-1,2-xilose presentes sobre as glicanas de proteínasda planta Nicotiana obtida de acordo com os métodos da invenção com onível de resíduos de beta-1,2-xilose presentes sobre as glicanas de proteí-nas de uma planta Nicotiana de controle não tratada de acordo com os mé-todos da invenção. O nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanosligadas à proteína de plantas pode ser medido, por exemplo, através de aná-lise de Western blot usando anticorpos xilose-específicos conforme descrito,por exemplo, por Faye e outros (Analytical Biochemistry, 1993, 209: 104-108)ou através de espectrometria de massa sobre glicanas isoladas das glicopro-teínas de planta usando espectronomia de massa por tempo de vôo da Ioni-zação/Dessorção de Matriz assistida por laser (MALDI-TOF-MS) conformedescrito, por exemplo, por Kolarich e Altmann (2000, Anal. Biochem. 285:64-75) ou usando espectronomia de massa Aleatória por Cromatografia deLíquido (LC/MS/MS) conforme descrito, por exemplo, por Henriksson e ou-tros (2003, Biochem. J. 375: 61-73).
dsRNA que codifica genes quiméricos que reduzem a expressãode XyIT de Nicotiana de acordo com a invenção pode compreender um ín-tron, tal como um íntron heterólogo localizado, por exemplo, na seqüênciaespaçadora entre as regiões de RNA sentido e anti-sentido de acordo com adescrição do WO 99/53050 (incorporado aqui por referência).
Se tornou evidente que moléculas de RNA de filamento duplo,tais como aquelas descritas acima, são clivadas em células de planta empequenos fragmentos de RNA de cerca de 20-21 nucleotídeos, os quais ser-vem como seqüência guia na degeneração do mRNA correspondente (revis-to por Baulcombe, 2004). Assim, em outra modalidade, a invenção se referea um método para produção de uma célula de planta de Nicotiana ou plantatendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadasà proteína compreendendo as etapas de:
a) fornecimento de uma ou mais moléculas de RNA de filamentoduplo à células de uma planta de uma espécie ou cultivar de Nicotiana, emque as moléculas de RNA de filamento duplo compreendem pelo menos doisfilamento de RNA, um filamento de RNA consistindo essencialmente emuma seqüência de nucleotídeo de RNA de 20 a 21 nucleotídeos consecuti-vos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteí-na de XyIT de Nicotiana, de preferência obtida da referida espécie ou cultivarde Nicotiana, em que os referidos 20 a 21 nucleotídeos consecutivos codifi-cam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico ou um filamento de RNA consistindo essencialmente de uma se-qüência de RNA de 20 a 21 nucleotídeos consecutivos de uma seqüência denucleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de Nicotiana, depreferência obtida da referida espécie ou cultivar de Nicotiana , em que osreferidos 20 a 21 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menos umnucleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Mcoí/ana-específico; e
b) identificação de uma planta Nicotiana compreendendo essamolécula ou moléculas de RNA de filamento duplo as quais têm um menornível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína doque a mesma planta Nicotiana a qual não compreende a molécula ou molé-culas de RNA de filamento duplo.
As seqüências de dsRNA de 20-21 nt de comprimento mencio-nadas também são geradas no curso de silenciamento RNA anti-sentidomediado ou silenciamento RNA sentido mediado convencional. Assim, emoutra modalidade da invenção, um método é proporcionado para produçãode uma célula de planta ou planta Nicotiana tendo um baixo nível de resí-duos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína, compreendendoa etapa de fornecimento às células de uma planta da espécie ou cultivar deNicotiana, de um gene quimérico compreendendo, operavelmente ligados,os seguintes fragmentos de DNA:
a) um promotor expressível em planta;
b) uma região de DNA compreendendo pelo menos 20 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica uma proteína de XyIT de Nicotiana, de preferência obtida da mesma es-pécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos pelo menos 20 nucleotí-deos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie oucultivar de Nicotiana-específico ou compreendendo pelo menos 20 nucleotí-deos consecutivos de uma seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT deNicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana, de preferência obtida da referi-da espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos pelo menos 20 nu-cleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyITespécie ou cultivar de Nicotiana-espec\í'\co, na orientação anti-sentido ousentido;
c) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
As regiões de nucleotídeo anti-sentido ou sentido mencionadaspodem, assim, ser de cerca de 21 nt a cerca de 5000 nt de comprimento, talcomo 21 nt, 40 nt, 50 nt, 100nt, 200 nt, 300nt, 500nt, 1000 nt ou mesmo cer-ca de 2000 nt ou mais de comprimento. Além disso, não é requerido, parafins da invenção, que a seqüência de nucleotídeo da molécula de gene deXyIT inibitória usada ou a região de codificação do gene quimérico sejacompletamente idêntica ou complementar ao gene de XyIT de Nicotiana en-dógeno, a expressão do qual é objetivada para ser reduzida na célula deplanta Nicotiana. Quanto mais longa a seqüência, menos rigoroso é o requi-sito de identidade global de seqüência. Assim, as regiões sentido ou anti-sentido podem ter uma identidade global de seqüência de cerca de 40 % ou50% ou 60 % ou 70% ou 80% ou 90 % ou 100% a uma seqüência de nu-cleotídeo do gene de Nicotiana endógeno ou o complemento da mesma.Contudo, conforme mencionado, regiões sentido ou anti-sentido compreen-derão, de preferência, uma seqüência de nucleotídeo de 19-20 nucleotídeosconsecutivos tendo cerca de 100% de identidade de seqüência a uma se-qüência de nucleotídeo do gene de XyIT, em que os referidos 19-20 nucleo-tídeos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécieou cultivar de Nicotiana-específico ou compreende pelo menos um nucleotí-deo de XyIT espécie ou cultivar de Mcoí/a/ia-específico. O trecho de cercade 100% de identidade de seqüência pode ter cerca de 50, 75 ou 100 nt.
A eficiência dos genes quiméricos acima mencionados os quais,quando transcritos, proporcionam RNA de silenciamento anti-sentido ou sen-tido, pode ser ainda intensificada através de inclusão de elementos de DNAos quais resultam na expressão de moléculas de RNA inibitórias de XyITanormais, não poliadeniladas. Um de tais elementos de DNA adequadospara essa finalidade é uma região de DNA que codifica uma ribozima de au-to-replicação, conforme descrito no WO 00/01133. A eficiência pode tambémser intensificada através de fornecimento das moléculas de RNA geradascom localização nuclear ou sinais de retenção, conforme descrito no WO03/076619.As seqüências de nucleotídeo de XyIT exemplificadas de Nicoti-ana benthamiana e de Nicotiana tabacum podem também ser usadas paraidentificar alelos de XyIT em uma população de plantas de uma espécie oucultivar de Nicotiana os quais são correlacionados com baixos níveis de re-síduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína. Tais popula-ções de plantas de uma espécie ou cultivar de Nicotiana podem ser popula-ções as quais sofreram mutação prévia. Os alelos de XyIT identificados po-dem, então, ser introduzidos em uma linhagem de planta de uma espécie oucultivar de Nieotiana de escolha usando técnicas de reprodução convencio-nais.
Métodos para transformar plantas Nieotiana também são bem-conhecidos na técnica. Transformação Agrobacterium-med\aóa de Nieotianafoi descrita, por exemplo, em Zambryski e outros (1983, EMBO J. 2:2143-2150), De Block e outros (1984, EMBO J. 3(8): 1681-1689) ou Horsche outros (Science (1985) 227: 1229-1231).
As plantas Nieotiana transformadas obtidas de acordo com ainvenção ou as plantas Nieotiana obtidas tendo um baixo nível de resíduosde beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em que o gene deXyIT endógeno foi substituído por um alelo de XyIT, o qual está correlacio-nado a um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos liga-das à proteína do que o alelo de XyIT original, podem ser usadas em umesquema de reprodução convencional para produzir mais plantas com asmesmas características ou introduzir o gene quimérico de acordo com a in-venção em outros cultivares da mesma ou de uma espécie de planta rela-cionada ou em plantas híbridas. Sementes obtidas das plantas transforma-das contêm os genes quiméricos da invenção como um inserto genômicoestável e também são abrangidas pela invenção.
Além disso, sabe-se que a introdução de um RNA anti-sentido,sentido ou filamento duplo ou genes quiméricos de codificação podem levara uma distribuição de fenótipos, oscilando de quase nenhuma ou muito pou-ca supressão da expressão do gene-alvo a uma supressão muito forte oumesmo de 100% da expressão do gene-alvo. Contudo, aqueles versados natécnica serão capazes de selecionar aquelas células de planta, plantas, e-ventos ou linhagens de planta que levam a graus desejados de silenciamen-to e o fenótipo desejado.
Conforme usado aqui, "compreendendo" deve ser interpretadocomo especificando a presença das características, inteiros, etapas ou com-ponentes estabelecidos conforme mencionado, mas não exclui a presençaou adição de uma ou mais características, inteiros, etapas ou componentesou grupos dos mesmos. Assim, por exemplo, um ácido nucléico ou proteínacompreendendo uma seqüência de nucleotídeos ou aminoácidos pode com-preender mais nucleotídeos ou aminoácidos do que aqueles realmente cita-dos, isto é, ser incrustado em uma proteína ou ácido nucléico maior. Um ge-ne quimérico compreendendo uma região de DNA, a qual é funcional ou es-truturalmente definida, pode compreender regiões de DNA adicionais, etc.
Os exemplos não Iimitativos a seguir descrevem genes quiméri-cos para a alteração do nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em espécies Nicotiana, particularmente em Nico-tiana benthamiana, e em cultivares de Nicotiana, particularmente em Nicoti-ana tabacum cv. Petite Havana SR1 e a usos dos mesmos. A menos que deoutro modo estabelecido nos exemplos, todas as técnicas de DNA recombi-nante são realizadas de acordo com protocolos-padrão conforme descritoem Sambrook e outros (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Se-gunda Edição, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY e nos Volumes 1 e2 de Ausubel e outros (1994) Current Protocols in Molecular Biology, CurrentProtocols, EUA. Materiais-padrão e métodos para trabalho molecular complantas são descritos em Plant Molecular Biology Labfax (1993) por R.D.D.Croy, conjuntamente publicado pela BIOS Scientific Publications Ltda (ReinoUnido) e Blackwell Scientific Publications, Reino Unido.
Por toda a descrição e exemplos, referência é feita às seguintesseqüências representadas na Listagem de Seqüência:SEQ ID NO: 1: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylF4 adequa-do para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotiana.SEQ ID NO: 2: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylR4 ade-quado para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotiana.SEQ ID NO: 3: seqüência de cDNA parcial da variante 1 de gene de XyIT deNicotiana tabacumcv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 4: seqüência de aminoácido parcial da variante 1 de proteína deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 5: seqüência de cDNA parcial da variante 2 do gene de XyIT deNicotiana tabacumcv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 6: seqüência de aminoácido parcial da variante 2 de proteína deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 7: seqüência de nucleotídeo parcial da variante 1 do gene deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 8: seqüência de aminoácido parcial da variante 1 de proteína deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 9: seqüência de nucleotídeo parcial da variante 2 do gene deXyIT de Nicotiana tabacumcv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 10: seqüência de aminoácido parcial da variante 2 de proteínade XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.SEQ ID NO: 11: seqüência de nucleotídeo parcial da variante 1 de gene deXyIT de Nicotiana benthamiana.
SEQ ID NO: 12: seqüência de aminoácido parcial da variante 1 de proteínade XyIT de Nicotiana benthamiana.
SEQ ID NO: 13: seqüência de nucleotídeo parcial da variante 2 do gene deXyIT de Nicotiana benthamiana.
SEQ ID NO: 14: seqüência de aminoácido parcial da variante 2 de proteínade XyIT de Nicotiana benthamiana.
SEQ ID NO: 15: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylF8 ade-quado para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 16: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylR8 ade-quado para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 17: seqüência de cDNA parcial da variante 1 do gene de XyITde Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
SEQ ID NO: 18: seqüência de nucleotídeo da região de T-DNA do vetorpTKW20.
SEQ ID NO: 19: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylF9 ade-quado para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotianabenthamiana.
SEQ ID NO: 20: seqüência de nucleotídeo do oligonucleotídeo XylR9 ade-quado para amplificar uma parte de um gene ou cDNA de XyIT de Nicotianabenthamiana.
SEQ ID NO: 21: seqüência parcial da variante 1 do gene de XyIT de Nicotia-na benthamiana.
SEQ ID NO: 22: seqüência de nucleotídeo da região de T-DNA do vetorpTKW29.
SEQ ID NO: 23: mRNA de Nieotiana tabacum cv. Xanthi para beta-(1,2)-xilosil transferase putativa (número de acesso AJ627182).SEQ ID NO: 24: beta-(1,2)-xilosil transferase putativa codificada por SEQ IDNO: 23.
SEQ ID NO: 25: gene xylt de Nicotiana tabacum cv. Xanthi para beta-(1,2)-
xilosil transferase putativa (número de acesso AJ627183).
SEQ ID NO: 26: beta-(1,2)-xilosil transferase putativa codificada por SEQ ID
NO: 25.
Exemplos
Exemplo 1: Desiqn de iniciadores degenerados para o isolamento de cDNAde XvIT e seqüências de gene de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1e Nicotiana benthamiana
Seqüências de oligonucleotídeo a serem usadas como iniciado-res degenerados em uma amplificação por PCR de cDNA de XyIT e DNAgenômico de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 e Nicotiana bentha-miana foram projetadas baseado nas seqüências de éxon de uma seqüênciade DNA genômico de Nicotiana tabacum cv. Xanthi que codifica uma proteí-na de XyIT putativa (número de acesso AJ627183). O iniciador dianteiro(SEQ ID NO: 1) foi projetado com CACC em sua extremidade 5' para fins declonagem. Dessa forma, os seguintes iniciadores degenerados foram gerados:XylF4: 5'-CACCTTGTTTCTCTCTTCGCTCTCAACTCAATCACTC-3'(SEQ ID NO: 1)
XylR4: 5'-TCGATCACAACTGGAGGATCCGCATAA -3'(SEQ ID NO: 2)
Exemplo 2: Isolamento de seqüências de cDNA de XyIT de Nicotiana tabacumcv. Petite Havana SR1
Os iniciadores degenerados descritos no Exemplo 1 foram gera-dos para isolar seqüências de cDNA de XyIT de Nicotiana tabacum cv. PetiteHavana SR1:
RNA foi extraído de folhas de Nicotiana tabacum cv. Petite Ha-vana SR1 usando o RNeasy Plant Mini Kit (Qiagen) de acordo com o proto-colo do fabricante e usado para síntese de cDNA usando o Sistema de sín-tese SuperScript® First-strand para RT-PCR (Invitrogen Life Technologies)de acordo com as instruções do fabricante.
Usando o cDNA como padrão e um par de iniciador XylF4 / XylR4,amplificação por PCR foi realizada sob as seguintes condições: 15 seg a94°C (desnaturação) e 3 min a 68°C durante 40 ciclos (anelamento e alon-gamento).
Um fragmento de DNA de cerca de 1500 pares de base foi am-plificado, clonado em um vetor pENTR®/D-TOPO® (Invitrogen) e vários clo-nes foram seqüenciados (compreendendo as seqüências de SEQ ID NO: 3 -XylTc2Nt - e SEQ ID NO: 5 - XylTc7Nt).
Um alinhamento entre uma seqüência de mRNA de Nicotianatabacum cv. Xanthi que codifica uma proteína de XyIT putativa (número deacesso AJ627182; SEQ ID NO: 23) e as seqüências de cDNA de XyIT isola-das de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 3 e 5) é mos-trado na Figura 1.
Um alinhamento entre a proteína de XyIT putativa codificada pe-la seqüência de mRNA de Nicotiana tabacum cv. Xanthi (número de acessoAJ627182; SEQ ID NO: 24) e pelas seqüências de cDNA isoladas de Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 4 e 6) é mostrado na Figura 2.Exemplo 3: Isolamento de seqüências de gene de XyIT de Nicotiana taba-cum cv. Petite Havana SR1 e de Nicotiana benthamiana
Os iniciadores degenerados descritos no Exemplo 1 foram usa-dos para isolar seqüências de gene de XyIT de Nicotiana tabacum cv. PetiteHavana SR1 e de Nieotiana benthamiana:
DNA foi extraído de folhas de Nieotiana tabacum cv. Petite Ha-vana SR1 e de Nieotiana benthamiana baseado no protocolo descrito porBernatzky e Tanksley (1986).
Usando o DNA genômico como padrão e um par de iniciadorXylF4 / XylR4, amplificação por PCR foi realizada sob as seguintes condi-ções: 15 seg a 94°C (desnaturação) e 4 min e 30 seg a 68°C durante 40 ci-clos (anelamento e alongamento).
Usando o DNA genômico de Nieotiana tabacum cv. Petite HavanaSR1 como padrão para a amplificação por PCR1 um fragmento de DNA decerca de 3400 pares de base foi amplificado, clonado em um vetor pENTR®/D-TOPO® (Invitrogen) e vários clones foram seqüenciados (compreendendoas seqüências de SEQ ID NO: 7 - XyITgI Nt - e SEQ ID NO: 9 - XylTg3Nt).
As seqüências de DNA genômico de XyIT XyITgINt e XylTg3Ntcompreendem duas seqüências de íntron putativas e três seqüências de é-xon putativas. A localização das seqüências de íntron é:
- para XyITgI Nt: do nucleotídeo na posição 679 ao nucleotídeona posição 1974 e do nucleotídeo na posição 2125 ao nucleotídeo na posi-ção 2722 de SEQ ID NO: 9 e
- para XylTg3Nt: do nucleotídeo na posição 658 ao nucleotídeona posição 1953 e do nucleotídeo na posição 2104 ao nucleotídeo na posi-ção 2701 de SEQ ID NO: 9.
Usando o DNA genômico de Nicotiana benthamiana como pa-drão para a amplificação por PCR, um fragmento de DNA de entre cerca de3300 e cerca de 3600 pares de base foi amplificado, clonado em um vetorpENTR®/D-TOPO® (Invitrogen) e vários clones foram seqüenciados (com-preendendo as seqüências de SEQ ID NO: 11 - XyITgI4Nb - e SEQ ID NO:13 - XyITgI 9Nb).As seqüências de DNA genômico de XyIT XyITgI 4Nb e XyITgI 9Nbcompreendem duas seqüências de íntron putativas e três seqüências de éxonputativas. A localização das seqüências de íntron é:
- XyITgI4Nb do nucleotídeo na posição 658 ao nucleotídeo naposição 1917 e do nucleotídeo na posição 2068 ao nucleotídeo na posição2612 de SEQ ID NO: 11 e
- XyITgI 9Nb do nucleotídeo na posição 649 ao nucleotídeo naposição 2194 e do nucleotídeo na posição 2345 ao nucleotídeo na posição2888 de SEQ ID NO: 13.
Um alinhamento entre a seqüência de DNA genômico de Nicoti-ana tabacum cv. Xanthi que codifica uma proteína de XyIT putativa (númerode acesso AJ627183; SEQ ID NO: 25) e as seqüências de DNA genômico deXyIT isoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 7 e 9)e de Nicotiana benthamiana (SEQ ID NO: 11 e 13) é mostrado na Figura 3.
Um alinhamento entre a proteína de XyIT putativa codificada pe-la seqüência de DNA genômico de Nicotiana tabacum cv. Xanthi (número deacesso AJ627183; SEQ ID NO: 26) e pelas seqüências de DNA genômicoisoladas de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 (SEQ ID NO: 8 e 10) ede Nicotiana benthamiana (SEQ ID NO: 12 e 14) é mostrado na Figura 4.Exemplo 4: Construção de um vetor de T-DNA contendo um gene de silenci-amento de XvIT de Nicotiana
Fragmentos de DNA amplificados de seqüências de XyIT de Ni-cotiana descritas nos exemplos 2 e 3 foram usados para construir vetores deT-DNA compreendendo um gene quimérico o qual, quando de transcrição,proporciona uma molécula de RNA compreendendo uma seqüência de DNAsentido e anti-sentido a partir do fragmento de DNA amplificado e o qual po-deria se emparelhar em bases para formar uma molécula de RNA de fila-mento duplo. Tais genes quiméricos podem ser usados para reduzir a ex-pressão de um gene de XyIT em Nicotiana, particularmente em Nicotianatabacum cv. Petite Havana SR1 e Nicotiana benthamiana.
4.1. Construção de um vetor de T-DNA compreendendo umgene de silenciamento de XyIT com um fragmento de DNA amplificado deuma seqüência de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
Seqüências de oligonucleotídeo a serem usadas como iniciado-res não degenerados em uma amplificação de PCR de um cDNA de XyIT dêNicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 foram projetadas baseado na se-qüência de cDNA de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 isolada noExemplo 2. O iniciador dianteiro (SEQ ID NO: 15) foi projetado com CACCem sua extremidade 5' para fins de clonagem. Dessa forma, os seguintesiniciadores não degenerados foram gerados:
XylF8: 5'-CACCTCTCGCCTTTGGGATATGAAACT -3' (SEQ ID NO: 15)XylR8: 5'-ACAGCTTTGGTGCTGCAGAAACT -3' (SEQ ID NO: 16)
Usando o vetor compreendendo um fragmento de DNA amplifi-cado de uma seqüência de cDNA de XyIT de Nicotiana tabacum cv. PetiteHavana SR1 conforme descrito no Exemplo 2 (SEQ ID NO: 3 - XylTc2Nt)como padrão e o par de iniciador XylF8 / XylR8, uma amplificação por PCRfoi realizada sob as seguintes condições: 15 seg a 94°C (desnaturação), 30seg a 56°C (anelamento) e 45 seg a 68°C (alongamento) durante 25 ciclos.
Um fragmento de DNA de cerca de 470 bp (XylTi4Nt; SEQ IDNO: 17) foi amplificado e clonado em um vetor pENTR®/D-TOPO® (Invitro-gen), proporcionando o plasmídeo pKW19. O plasmídeo pKW19 foi recom-binado com pHellsgate12 (Helliwell e Waterhouse, Methods (2003) 30: 289-295) usando o Gateway® LR Clonase® Il (Invitrogen), proporcionando oplasmídeo pTKW20.
A seqüência de T-DNA do pTKW20 (SEQ ID NO: 18), assim,compreende:
um gene de silenciamento de XyIT quimérico compreendendo:o um fragmento incluindo a região promotora do transcrito 35Sdo Vírus Mosaico da Couve-flor (Odell e outros, 1985) (SEQ ID NO: 18 donucleotídeo 969 ao nucleotídeo 2314)
o um fragmento incluindo uma parte do cDNA de XyIT de Nicoti-ana tabacum cv. Petite Havana SR1 clonada na orientação sentido (SEQ IDNO: 18 do nucleotídeo 2365 ao nucleotídeo 2834)
o um fragmento contendo o íntron do gene de catase-1 de sementede mamona (SEQ ID NO: 18 do nucleotídeo 2893 ao nucleotídeo 3088)
o um fragmento contendo o segundo íntron do gene de diquína-se de ortofosfato de piruvato de Flaveria trinervia conforme descrito por Ros-che e Westhoff (1995) na orientação reversa (SEQ ID NO: 18 do nucleotídeo3130 ao nucleotídeo 3871).
o um fragmento incluindo uma parte da seqüência de cDNA deXyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 clonada na orientaçãoanti-sentido (SEQ ID NO: 18 do nucleotídeo 3957 ao nucleotídeo 4426).
o um fragmento incluindo a região não traduzida 3' do gene desintase de octopina de Agrobacterium tumefaciens conforme descrito por DeGreve e outros (1982) (SEQ ID NO: 18 do nucleotídeo 4479 ao nucleotídeo5244).
• um gene quimérico que codifica um marcador selecionávelcompreendendo:
o um fragmento incluindo a região promotora do gene de sintasede nopalina de T-DNA de Agrobacterium tumefaciens (SEQ ID NO: 18 donucleotídeo 5512 ao nucleotídeo 5744).
o um fragmento incluindo o gene de resistência a antibiótico nptIl(SEQ ID NO: 18 do nucleotídeo 5745 ao nucleotídeo 6690).
o um fragmento incluindo a região não traduzida 3' do gene sin-tase de nopalina de T-DNA de A. tumefaciens (SEQ ID NO: 18 do nucleotí-deo 6691 ao nucleotídeo 7396).
O vetor de T-DNA foi introduzido em Agrobacterium tumefacienscompreendendo um plasmídeo-Ti auxiliar.
4.2. Construção de um vetor de T-DNA compreendendo um ge-ne de silenciamento de XyIT com um fragmento de DNA amplificado de umaseqüência de XyIT de Nicotiana benthamiana
Seqüências de oligonucleotídeo a serem usadas como iniciado-res não degenerados em uma, amplificação por PCR de uma seqüência degene XyIT de Nicotiana benthamiana, foram projetadas baseado na seqüên-cia de gene de Nicotiana benthamiana isolada no Exemplo 3. O iniciadordianteiro (SEQ ID NO: 19) foi projetado com GGCCGGATCCTCG em suaextremidade 5' e o iniciador reservo (SEQ ID NO: 20) foi projetado comGGCCATCGATGGTACC em sua extremidade 5' para fins de clonagem.Dessa forma, os seguintes iniciadores não degenerados foram gerados:XylF9: 5'-GGCCGGATCCTCGAGACACAATTGGAGGAAACATGGAAAGC-3'(SEQ ID NO: 19)
XylR9: 5'-GGCCATCGATGGTACCGGCCCAGCTCTTTATGGAATCAAA -3'(SEQ ID NO: 20)
Usando o vetor compreendendo um fragmento de DNA amplifi-cado de uma seqüência de gene de XyIT de Nicotiana benthamiana confor-me descrito no Exemplo 3 (SEQ ID NO: 11 - XyITgI4Nb) como padrão e opar de iniciador XylF9 / XylR9, uma amplificação por PCR foi realizada sobas seguintes condições: 15 seg a 94°C (desnaturação), 30 seg a 58°C (ane-lamento) e 30 seg a 68°C (alongamento) durante 25 ciclos.
Um fragmento de DNA de cerca de 430 bp (XylTiNb; SEQ IDNO: 21) foi amplificado e digerido com Xhol e Kpnl e com BamHI e Ciai, res-pectivamente. Os fragmentos digeridos com Xhol / Kpnl e BamHI / Clal fo-ram clonados no pHANNIBAL (Helliwell e Waterhouse, 2003), digerido comXhol / Kpnl e BamHI / Ciai, proporcionando o pKW28.
O plasmídeo pKW28, assim, compreende um gene de silencia-mento de XyIT quimérico compreendendo:
o um fragmento incluindo a região promotora do transcrito 35Sdo vírus mosaico da couve-flor (Odell e outros, 1985) (SEQ ID NO: 22 donucleotídeo 3779 ao nucleotídeo 2434)
o um fragmento incluindo uma parte da seqüência do gene XyITde Nicotiana benthamiana clonado na orientação sentido (SEQ ID NO: 22 donucleotídeo 2427 ao nucleotídeo 2023).
o um fragmento contendo o segundo íntron do gene de diquínasede ortofosfato de piruvato de Flaveria trinervia conforme descrito por Rosche eWesthoff (1995) (SEQ ID NO: 22 do nucleotídeo 1991 ao nucleotídeo 1250).
o um fragmento incluindo uma parte da seqüência do gene deXyIT de Nicotiana benthamiana clonado na orientação anti-sentido (SEQ IDNO: 22 do nucleotídeo 1211 ao nucleotídeo 807).o um fragmento incluindo a região não traduzida 3' do gene desintase de octopina de Agrobacterium tumefaciens conforme descrito por DeGreve e outros (1982) (SEQ ID NO: 22 do nucleotídeo 786 ao nucleotídeo76) entre os sítios de restrição Mscl e Pstl.
O plasmídeo pkW28 é digerido com Mscl e Pstl e o gene quimé-rico é introduzido entre as bordas de T-DNA de um vetor de T-DNA cortadocom Pstl e Smal junto com um gene quimérico que codifica um marcadorselecionado compreendendo:
o um fragmento incluindo a região promotora do gene de sintasede nopalina de T-DNA de A. tumefaciens T-DNA (SEQ ID NO: 22 do nucleo-tídeo 3854 ao nucleotídeo 4140).
o um fragmento incluindo o gene de resistência à fosfinotricinabar (De Block e outros, 1987) (SEQ ID NO: 22 do nucleotídeo 4161 ao nu-cleotídeo 4712).
o um fragmento incluindo a região 3' não traduzida do gene desintase de nopalina de T-DNA de A. tumefaciens (SEQ ID NO: 22 do nucleo-tídeo 4731 ao nucleotídeo 4991) para proporcionar o pTKW29 (seqüência doT-DNA de pTKW29 é representada em SEQ ID NO: 22).
O vetor pTKW29 é derivado do pGSC1700 (Cornelissen e Van-dewiele, 1989). A cadeia principal do vetor contém os seguintes elementosgenéticos:
• o núcleo do plasmídeo compreendendo a origem de replicaçãodo plasmídeo pBR322 (Bolívar e outros, 1977) para replicação em Escheri-chia coli (ORI CoIEI) e um fragmento de restrição compreendendo a origemde replicação do plasmídeo pVS1 de Pseudomonas (ltoh e outros, 1984)para replicação em Agrobacterium tumefaciens (ORI pVS1).
• um gene marcador selecionável que confere resistência à es-treptomicina e espectinomicina (aadA) para propagação e seleção do plas-mídeo em Escherichia colie Agrobacterium tumefaciens.
• uma região de DNA consistindo em um fragmento da seqüên-cia de codificação de fosfotransferase de neomicina do gene nptI do trans-poson 7n903 (Oka e outros, 1981).O vetor de T-DNA é introduzido em Agrobacterium tumefacienscompreendendo um plasmídeo-Ti auxiliar.
Exemplo 5: Análise de plantas transqênicas Nicotiana abrigando um gene desilenciamento de XyIT.
Plantas Nicotiana foram transformadas usando as cepas de A-grobacterium tumefaciens descritas no Exemplo 4.
5.1. Análise de plantas transgênicas Nicotiana tabacum oj. Peti-te Havana SR1 abrigando um gene de silenciamento de XyIT
Plantas Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 foram trans-formadas usando a cepa de Agrobacterium tumefaciens descrita no Exemplo4.1. de acordo com o protocolo descrito em Zambryski e outros (1983). Cin-qüenta e duas linhagens transgênicas de Nicotiana tabacum compreenden-do os genes quiméricos conforme descrito no Exemplo 4.1 foram obtidas.
Linhagens de planta transgênicas foram analisadas a nível mo-lecular usando análise de Southern blot. Similarmente, as linhagens de plan-ta foram analisadas com relação à expressão de RNA de XyIT usando análi-se de Northern blot.
Uma indicação de atividade de XyIT pode ser obtida comparan-do o nível de resíduos de beta-1,2-xilose presente sobre as glicanas de pro-teínas das linhagens transgênicas com aquele das plantas não-transforma-das. O nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à prote-ína de plantas pode ser medido, por exemplo, através de análise de Westernblot usando anticorpos xilose-específicos conforme descrito, por exemplo,por Faye e outros (1993) ou através de espectrometria de massa sobre gli-canas isoladas de glicoproteínas de planta usando Espectromoma de massapor tempo de vôo da lonização/Dessorção da matriz assistida por laser(MALDI-TOF-MS) conforme descrito, por exemplo, por Kolarich e Altmann(2000) ou usando espectronomia de massa Aleatória por Cromatografia deLíquido (LC/MS/MS) conforme descrito, por exemplo, por Henriksson e ou-tros (2003).
5.2. Análise das plantas transgênicas Nicotiana benthamianaabrigando um gene de silenciamento de XyITSimilarmente, plantas Nicotiana benthamiana foram transforma-das usando a cepa de Agrobacterium tumefaciens descrita no Exemplo 4.2.e a expressão do XyIT e o nível de resíduos de beta-1,2-xilose presentessobre as glicanas de proteína foram analisados conforme descrito acima.
Cinqüenta e quatro linhagens transgênicas de Nicotiana ben-thamiana compreendendo os genes quiméricos descritos no Exemplo 4.2.foram obtidas após transformação do disco de folha com pTKW29.
Para determinar o nível de resíduos de beta-1,2-xilose presentesobre as glicanas de proteínas endógenas dessas linhagens de planta, pro-teínas de folha solúveis de cada indivíduo foram analisadas através de Wes-tern blot usando um anticorpo beta-1,2-xilose-específico.
Seis amostras mostraram uma reação muito fraca com o anti-corpo e seis amostram não tinham reação detectável com o anticorpo. Paraas outras amostras, o nível de reação com o anticorpo oscilava de um nívelfraco ao tipo silvestre.
Para determinar o número de inserções do gene de silenciamen-to de XyIT quimérico a partir do pTKW29, DNA genômico das linhagens deplanta que mostraram reações muito fracas ou negativas ao anticorpo beta-1,2-xilose-específico foi isolado, digerido com EcoRI e analisado através deSouthern blot usando uma sonda abrangendo a região do promotor 35S euma sonda abrangendo a região de codificação do gene de resistência àfosfinotricina bar.
Nenhuma das doze linhagens de planta mostrou uma única in-serção. Uma linhagem de planta continha duas inserções e era negativa pa-ra xilose usando análise por Western blot.
Para testar se esses dois genes de silenciamento de XyIT qui-méricos inseridos independentemente e obter plantas as quais eram negati-vas para xilose quando de Western blot e as quais contêm um único gene desilenciamento de XyIT quimérico, a prole resultante de autofertilização dalinhagem de planta contendo duas inserções foi plantada e vinte e cinco li-nhagens de planta foram analisadas através de análise por Western blot.Listagem de Referência
Baulcombe (2004). Nature 431: 356-363.
Bernatzky e Tanksley (1986). Theor. Appl. Genet. 72: 314-321.
Bolívar e outros (1977). Gene 2: 95-113.
Cornelissen e Vandewiele (1989). Nucleic Acids Research 17: 19-25.
De Block e outros (1984). EMBO J. 3(8): 1681 -1689
De Block e outros (1987). EMBOJ 6: 2513.
De Greve e outros (1982). J. Mol. Appl Genetics 1 (6): 499-511.
Faye e outros (1993). Analytieal Bioehemistry 209: 104-108.
Fiseher e outros (2004). Curr. Opin. PIantBioI. 7: 152-158.
Helliwell e Waterhouse (2003). Methods 30: 289-295.
Henikoff e Henikoff (1992). Proe NatIAead Sei USA 89(22): 10915-10919.
Henriksson e outros (2003). Bioehem. J. 375: 61-73.
Horseh e outros (1985). Science 227: 1229-1231.
Itoh e outros (1984). Plasmid 11: 206.
Khoo e outros (1997). Glycobiology 7: 663-677.
Kolarieh e Altmann (2000). Anal. Bioehem. 285: 64-75.
Mulder e outros (1995). Eur. J. Bioehem. 232: 272-283.
Odell e outros (1985). Nature 313: 810.
Oka e outros (1981). Journalde MolecuIarBioIogy, 147, 217-226.Rosehe e Westhoff (1995). Plant Molecular Biology 29 (4): 663-678.Stoger e outros (2002). Curr. Opin. Bioteehnol. 13: 161-166.Strasser e outros (2000). FEBS Lett. 472: 105-108.
Strasser e outros. (2004a). 2ã EPSO Conferenee1 Outubro de 2004, Itália,
Abstraet book página 56, S036.
Strasser e outros (2004b). FEBS Lett. 561: 132-136.
Tezuka e outros (1992). Eur J Bioehem. 203(3): 401-413.
Twyman e outros (2003). Trends Bioteehnol. 21: 570-578.
Zambryski e outros (1983). EMBO J. 2: 2143-2150).
Zeng e outros (1997). J. Bioi Chem. 272: 31340-31347.LISTAGEM DE SEQÜENCIA<110> Bayer BioScience N.V.Weterings, Koen
<120> SEQÜÊNCIAS DE NUCLEOTÍDEO QUE CODIFICAM NICOTIANABETA-1,2-XILOSILTRANSFERASE
<130> BCS 06-2005<160> 26
<170> Patentln versão 3.3
<210> 1
<211 >37
<212> DNA
<213> Artificial
<220><223> oligonucleotídeo XylF4<400> 1
caccttgttt ctctcttcgc tctcaactca atcactc 37
<210> 2<211> 27<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> oligonucleotídeo XylR4<400>2
tcgatcacaa ctggaggatc cgcataa 27
<210> 3<211>1513<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> XylTc2Nt
<220>
<221> CDS<222> (7)..(1512)<400>3
cacctt gtt tct ctc ttc gct ctc aac tca ate act ctc tat ctc tacVal Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr15 10
ttc tct tcc cac tct gat cac ttc cgt cac aaa tcc ccc caa aac cacPhe Ser Ser His Ser Asp His Phe Arg His Lys Ser Pro Gln Asn His15 20 25 30
ttt cct aat acc caa aac cac tat tcc ctg tcg gaa aac cac cat gatPhe Pro Asn Thr Gln Asn His Tyr Ser Leu Ser Glu Asn His His Asp
35 40 45
aat ttc cac tct tct gtc act tcc caa tat acc aag cct tgg cca attAsn Phe His Ser Ser Val Thr Ser Gln Tyr Thr Lys Pro Trp Pro Ile
50 55 60
ttg ccc tcc tac ctc ccc tgg tct cag aat cct aat gtt tct ttg agaLeu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn Pro Asn Val Ser Leu Arg
65 70 75
tcg tgc gag ggt tac ttc ggt aat ggg ttt act ctc aaa gtt gat cttSer Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu
80 85 90
ctc aaa act tcg ccg gag ctt cac cag aaa ttc ggc gaa aac acc gtaLeu Lys Thr Ser Pro Glu Leu His Gln Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val95 100 105 110
tcc ggc gac ggc gga tgg ttt agg tgt ttt ttc agt gag act ttg cagSer Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe Sex- Glu Thx Leu Gln
115 120 125
agt tcg att tgc gag gga ggt gct ata cga atg aat ccg gac gag attSer Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile
130 135 140
ttg atg tct cgt gga ggc gag aaa ttg gag tcg gtt att ggt agg agtLeu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser145 150 1S5gaa gat gat gag ctg cccGlu Asp Asp Glu Leu Pro160
gtt act gat aaa ctg aaaVal Thr Asp Lys Leu Lys175 180
ttg aat aaa tac tta ccgLeu Asn Lys Tyr Leu Pro195
gaa tta att gac tct attGlu Leu Ile Asp Ser Ile210
tct gag tgg att gag gagSer Glu Trp Ile Glu Glu225
gca aac ctt ttc cac acaAla Asn Leu Phe His Thr240
tcc agg gtt act ggc ttgSer Arg Val Thr Gly Leu255 260
ggc cat tgt gag aca caaGly His Cys Glu Thr Gln275
age ctc act tat gct aagSer Leu Thr Tyr Ala Lys290
gcc gtt ctc tcg cct ttgAla Val Leu Ser Pro Leu305
aca gaa act ata gat tgtThr Glu Thr Ile Asp Cys
gtg ttc aaa aat gga gctVal Phe Lys Asn Gly Ala165 170
att ggg aaa aaa tta gtgIle Gly Lys Lys Leu Val185
gaa ggt gca att tca aggGlu Gly Ala Ile Ser Arg200
cag tta gtt ggc gcc gatGln Leu Val Gly Ala Asp215
ccg tca ctt ttg att acaPro Ser Leu Leu Ile Thr230
gtt acc gat tgg tat agt
Val Thr Asp Trp Tyr Ser
245 250
ccc agt cgg cca cat ttg
Pro Ser Arg Pro His Leu265
ttg gag gaa aca tgg aaaLeu Glu Glu Thr Trp Lys280
aac ttt agt ggc cca gttAsn Phe Ser Gly Pro Val295
gga tat gaa act gcc ctgGly Tyr Glu Thr Ala Leu310
aat gga gct tct gcc catAsn Gly Ala Ser Ala His
ttt cag att aaa 528
Phe Gln Ile Lys
gat gaa aaa ate 576
Asp Glu Lys Ile190
cac act atg cgt 624
His Thr Met Arg205
gaa ttt cac tgt 672
Glu Phe His Cys220
cga ttt gag tat 720
Arg Phe Glu Tyr
235
gca tac gtg gca 768
Ala Tyr Val Ala
gtt ttt gta gat 816
Val Phe Val Asp270
gca ctc ttt tca 864
Ala Leu Phe Ser285
tgt ttc cgt cac 912
Cys Phe Arg His300
ttt aag gga ctg 960
Phe Lys Gly Leu
315
gat ttg tgg caa 1008
Asp Leu Trp Gln320
aat cct gat gatAsn Pro Asp Asp335
ate agg gea gccIle Arg Ala Ala
aca gtc aca ggcThr Val Thr Gly370
gct cac cca cgtAla His Pro Arg385
gag caa gta tttGlu Gln Val Phe400
tgc aaa tta aatCys Lys Leu Asn415
gag caa gtt cgaGlu Gln Val Arg
gga gea ggt ctaGly Ala Gly Leu450
cta gaa att ataLeu Glu Ile Ile465
gea caa tgg aaaAla Gln Trp Lys480
tat gcg gat cct
325
aag aga act geaLys Arg Thr Ala340
ttt gga ttt cctPhe Gly Phe Pro355
cct aat gtc ctcPro Asn Val Leu
cat ggt gga aagHis Gly Gly Lys390
gat tcc ata aagAsp Ser Ile Lys405
gta att aac ggaVal Ile Asn Gly420
gea ate caa gatAla Ile Gln Asp435
act cac ata gttThr His Ile Val
age age gaa tatSer Ser Glu Tyr470
gga ttg gag tacGly Leu Glu Tyr485
cca gtt gtg atg
330
cgg ttg tcc gagArg Leu Ser Glu345
gtg gat aga cagVal Asp Arg Gln360
ttt gtt aga cgtPhe Val Arg Arg375
gta cag tet aggVal Gln Ser Arg
age tgg gcc ttg
Ser Trp Ala Leu410
ttg ttt gcc cac
Leu Phe Ala His425
gea tet gtc att
Ala Ser Val Ile440
tet gea gea cca
Ser Ala Ala Pro455
agg cac ccc catArg His Pro His
cat ccc ata tatHis Pro Ile Tyr490
a
ttt ggg gag atgPhe Gly Glu Met350
aac ate cca aggAsn Ile Pro Arg365
gag gat tat ttaGlu Asp Tyr Leu380
ctt age aat gaaLeu Ser Asn Glu395
aac cac tcg gagAsn His Ser Glu
atg tcc atg aaaMet Ser Met Lys430
gtt ggt gct catVal Gly Ala His445
aaa gct gta ataLys Ala Val Ile460
ttt gct ctg attPhe Ala Leu Ile475
ttg gag ggg tetLeu Glu Gly SerTyr Ala Asp Pro Pro Val Val Met495 500
<210> 4<211> 502<212> PRT<213> Artificial<220>
<223> Estrutura sintética<400>4
Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser1 5 10 15
Ser His Ser Asp His Phe Arg His Lys Ser Pro Gln Asn His Phe Pro
20 25 30
Asn Thr Gln Asn His Tyr Ser Leu Ser Glu Asn His His Asp Asn Phe
35 40 45
His Ser Ser Val Thr Ser Gln Tyr Thr Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro
50 55 60
Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn Pro Asn Val Ser Leu Arg Ser Cys65 70 75 80
Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys
85 90 95
Thr Ser Pro Glu Leu His Gln Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val Ser Gly
100 105 110
Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser
115 120 125
Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met
130 135 140
Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser Glu Asp145 150 155 160
Asp Glu Leu Pro Val Phe Lys Asn Gly Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr165 170 175Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys Lys Leu Val Asp Glu Lys Ile Leu Asn
180 185 190
Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Ile Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu
195 200 205
Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val Gly Ala Asp Glu Phe His Cys Ser Glu
210 215 220
Trp Ile Glu Glu Pro Ser Leu Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn225 230 235 240
Leu Phe His Thr Val Thr Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg
245 250 255
Val Thr Gly Leu Pro Ser Arg Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His
260 265 270
Cys Glu Thr Gln Leu Glu Glu Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu
275 280 285
Thr Tyr Ala Lys Asn Phe Ser Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Val
290 295 300
Leu Ser Pro Leu Gly Tyr Glu Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Thr Glu305 310 315 320
Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro
325 330 335
Asp Asp Lys Arg Thr Ala Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg
340 345 350
Ala Ala Phe Gly Phe Pro Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val
355 360 365
Thr Gly Pro Asn Val Leu Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His
370 375 380
Pro Arg His Gly Gly Lys Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln385 390 395 400
Val Phe Asp Ser Ile Lys Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys
405 410 415
Leu Asn Val Ile Asn Gly Leu Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln420 425 430Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala
435 440 445
Gly Leu Thr His Ile Val Ser Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu
450 455 460
Ile Ile Ser Ser Glu Tyr Arg His Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln465 470 475 480
Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala
485 490 495
Asp Pro Pro Val Val Met500
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<223> XylTc7Nt<220><221 > CDS<222> (5)..(1495)<400>5
cacc ctt gtt tct ctc ttc gct ctc aac tca ate act ctc tat ctc tac 49
Leu Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr1 5 10 15
ttc tct tcc cac cct gat cac ttc cgc cac aaa tcc cgc caa aac cac 97
Phe Ser Ser His Pro Asp His Phe Arg His Lys Ser Arg Gln Asn His
20 25 30
ttt tcc ttg tcg gaa aac cgc cat cat aat ttc cac tct tca ate act 145
Phe Ser Leu Ser Glu Asn Arg His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr
35 40 45
tct caa tat tcc aag cct tgg cct att ttg ccc tcc tac ctc cct tgg 193
Ser Gln Tyr Ser Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp50 55 60tct caa aac cctSer Gln Asn Pro65
aat ggg ttt actAsn Gly Phe Thr80
cac cgg aaa ttcHis Arg Lys Phe
agg tgt ttt ttcArg Cys Phe Phe115
gca ata cga atgAla Ile Arg Met130
aaa ttg gag tcgLys Leu Glu Ser145
ttc aaa aat ggaPhe Lys Asn Gly160
ggg aaa aaa ttaGly Lys Lys Leu
ggt gca att tcaGly Ala Ile Ser195
ttg gtt ggc gccLeu Val Gly Ala210
tca ctt ttg att
aat gtt gtt tggAsn Val Val Trp70
ctc aaa gtt gacLeu Lys Val Asp85
ggc gaa aac accGly Glu Asn Thr100
agt gag act ttgSer Glu Thr Leu
aat ccg gac gagAsn Pro Asp Glu135
gtt att ggt aggVal Ile Gly Arg150
gct ttt cag attAla Phe Gln Ile165
gtg gat gaa aaaVal Asp Glu Lys180
agg cac act atgArg His Thr Met
gat gat ttt cacAsp Asp Phe His215
aca cga ttt gag
aga tcg tgc gagArg Ser Cys Glu75
ctt ctc aaa actLeu Leu Lys Thr90
gtc tcc ggc gacVal Ser Gly Asp105
cag agt tcg ateGln Ser Ser Ile120
att ttg atg tctIle Leu Met Ser
agt gaa gat gatSer Glu Asp Asp155
aaa gtt act gatLys Val Thr Asp170
ttc ttg aat aaaPhe Leu Asn Lys185
cgt gag tta attArg Glu Leu Ile200
tgt tct gag tggCys Ser Glu Trp
tat gca aac ctt
ggt tac ttc ggtGly Tyr Phe Gly
tcg ccg gag tttSer Pro Glu Phe95
ggc gga tgg tttGly Gly Trp Phe110
tgc gag gga ggcCys Glu Gly Gly125
cgt gga ggt gagArg Gly Gly Glu140
gag ctg ccc gtgGlu Leu Pro Val
aaa ctg aaa attLys Leu Lys Ile175
tac tta ccg gaaTyr Leu Pro Glu190
gac tct att cagAsp Ser Ile Gln205
att gag gag ccgIle Glu Glu Pro220
ttc cac aca gttSer Leu Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Val
225 230 235
acc gat tgg tat agt gca tac gtg gca tcc agg gtt act ggc ttg ccc 769
Thr Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro
240 245 250 255
agt cgg cca cat ttg gtt ttt gta gat ggc cat tgt gag aca caa ttg 817
Ser Arg Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu Thr Gln Leu
260 265 270
gag gaa aca tgg aaa gca ctt ttt tca age ctc act tat gct aag aac 865
Glu Glu Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn
275 280 285
ttt agt ggc cca gtt tgt ttc cgt cat gcc gcc ctc tcg cct ttg gga 913
Phe Ser Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Ala Leu Ser Pro Leu Gly
290 295 300
tat gaa act gcc ctg ttt aag gga ctg tca gaa act ata gat tgt aat 961
Tyr Glu Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn
305 310 315
gga gct tet gcc cat gat ttg tgg caa aat cct gat gat aag aaa act 1009
Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys Lys Thr
320 325 330 335
gca cgg ttg tcc gag ttt ggg gag atg att agg gca gcc ttt gga ttt 1057
Ala Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe
340 345 350
cct gtg gat aga cag aac ate cca agg aca gtc aca ggc cct aat gtc 1105
Pro Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val
355 360 365
ctc ttt gtt aga cgt gag gat tat tta gct cac cca cgt cat ggt gga 1153
Leu Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly
370 375 380
aag gta cag tet agg ctt age aat gaa gag caa gta ttt gat tcc ata 1201
Lys Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp Ser Ile385 390 395aag age tgg gcc ttg aac cac tcg gag tgc aaa tta aat gta att aac 1249
Lys Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn
400 405 410 415
gga ttg ttt gcc cac atg tcc atg aaa gag caa gtt cga gea ate caa 1297
Gly Leu Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln
420 425 430
gat gct tet gtc ata gtt ggt gct cat gga gea ggt cta act cac ata 1345
Asp Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile
435 440 445
gtt tet gea gea cca aaa gct gta ata cta gaa att ata age age gaa 1393
Val Ser Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu
450 455 460
tat agg cgc ccc cat ttt gct ctg att gea caa tgg aaa gga ttg gag 1441
Tyr Arg Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu
465 470 475
tac cat ccc ata tat ttg gag ggg tet tat gcg gat cct cca gtt gtg 1489
Tyr His Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val "vai480 485 490 495
ate gaa 1495
Ile Glu<210> 6<211 >497<212> PRT<213> Artificial<220>
<223> Estrutura sintética<400> 6
Leu Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe15 10 15
Ser Ser His Pro Asp His Phe Arg His Lys Ser Arg Gln Asn His Phe
20 25 30
Ser Leu Ser Glu Asn Arg His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr Ser35 40 45
Gln Tyr Ser Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser
50 55 60
Gln Asn Pro Asn Val Val Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn65 70 75 80
Gly Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Phe His
85 90 95
Arg Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg
100 105 110
Cys Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala
115 120 125
Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys
130 135 140
Leu Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser Glu Asp Asp Glu Leu Pro Val Phe145 150 155 160
Lys Asn Gly Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly
165 170 175
Lys Lys Leu Val Asp Glu Lys Phe Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly
180 185 190
Ala Ile Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu
195 200 205
Val Gly Ala Asp Asp Phe His Cys Ser Glu Trp Ile Glu Glu Pro Ser
210 215 220
Leu Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Val Thr225 230 235 240
Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro Ser
245 250 255
Arg Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu Thr Gln Leu Glu
260 265 270
Glu Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn Phe
275 280 285
Ser Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Ala Leu Ser Pro Leu Gly Tyr290 295 300
Glu Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly305 310 315 320
Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys Lys Thr Ala
325 330 335
Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe Pro
340 345 350
Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val Leu
355 360 365
Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly Lys370 375 380
Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp Ser Ile Lys
385 390 395 400
Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn Gly
405 410 415
Leu Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln Asp
420 425 430
Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile Val
435 440 445
Ser Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu Tyr
450 455 460
Arg Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr465 470 475 480
His Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val Val Ile485 490 495
Glu
<210> 7<211> 3408<212> DNA<213> Artificial<220><223> XyITgINt<220><221 > CDS<222> (7)..(678)<220>
<221 > Intron
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<220>
<221 > CDS
<222> (1975)..(2124)
<220>
<221 > Intron<222> (2125)..(2722)<220><221 > CDS<222> (2723)..(3406)<400>7
cacctt gtt tct ctc ttc gct ctc aac tca ate act ctc tat ctc tacVal Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr1 5 10
ttc tct tcc cac tct gat cac ttc cgt cac aaa tcc ccc caa aac cacPhe Ser Ser His Ser Asp His Phe Arg His Lys Ser Pro Gln Asn His15 20 25 30
ttt cct aat acc caa aac cac tat tcc ctg tcg gaa aac cac cat gatPhe Pro Asn Thr Gln Asn His Tyr Ser Leu Ser Glu Asn His His Asp
35 40 45
aat ttc cac tct tct gtc act tcc caa tat acc aag cct tgg cca attAsn Phe His Ser Ser Val Thr Ser Gln Tyr Thr Lys Pro Trp Pro Ile
50 55 60
ttg ccc tcc tac ctc ccc tgg tct cag aat cct aat gtt tct ttg agaLeu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn Pro Asn Val Ser Leu Arg65 70 75tcg tgc gag ggt tac ttc ggt aat ggg ttt act ctc aaa gtt gat ctt 288
Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu
80 85 90
ctc aaa act tcg ccg gag ctt cac cag aaa ttc ggc gaa aac acc gta 336
Leu Lys Thr Ser Pro Glu Leu His Gln Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val95 100 105 110
tcc ggc gac ggc gga tgg ttt agg tgt ttt ttc agt gag act ttg cag 384
Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln
115 120 125
agt tcg att tgc gag gga ggt gct ata cga atg aat ccg gac gag att 432
Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile
130 135 140
ttg atg tct cgt gga ggc gag aaa ttg gag tcg gtt att ggt agg agt 480
Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser
145 150 155
gaa gat gat gag ctg ccc gtg ttc aaa aat gga gct ttt cag att aaa 528
Glu Asp Asp Glu Leu Pro Val Phe Lys Asn Gly Ala Phe Gln Ile Lys
160 165 170
gtt act gat aaa ctg aaa att ggg aaa aaa tta gtg gat gaa aaa ate 576
Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys Lys Leu Val Asp Glu Lys Ile175 180 185 190
ttg aat aaa tac tta ccg gaa ggt gea att tca agg cac act atg cgt 624
Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Ile Ser Arg His Thr Met Arg
195 200 205
gaa tta att gac tct att cag tta gtt ggc gcc gat gaa ttt cac tgt 672
Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val Gly Ala Asp Glu Phe His Cys
210 215 220
tct gag gttagatttt gaaattttgc ttgatcttta aattaaaggt ttgaactttg 728
Ser Glu
tgaatgttgg cagatatgga atacaataat ggattttgtt tgatctgttt aatgaagattgtctagaacc tcattgttat aaatatggtt tgtttgcttc attaattaaa gagcattcct
788848taaaatctcg actagatgcc agataacacc agttagttga cttttggatt atggattttt 908
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aactgcactt gtactcccca gtcatctggg gaggagcaac agattaaatt caagggttga 1088
aaagtaatac agagtcagaa attaaccaca agttggaaaa tggtaaatgt atgtggtcta 1148
agatgattac tcctataact tttgatgtct aacatggaga aagttagttg atttatgctc 1208
tttacttttc cctttattga ttttggtttt caaattctat caattccttt gtttgattgc 1268
tactcagatt gaaccttaga cggagtagca atagaaaagt gaagaaaagc cattttttct 1328
cctttcatct ctttatttct gttttacaca cagaatatgg tagcatctgt ctgaactagt 1388
taattttatt ccttaaaatt tgcataacta attcgagtaa atgccttttg aagctttagt 1448
tgtacaactg gttgttgcat tttgaggact atcgacttga tttgacagtg tctgatacat 1508
ggcttgtaag ttatgaaaac ttatatctag gaagaaatcc caaccagaga tagggagctg 1568
tcgcttggtt atgagctact ggctcaaagt tcgagtttga ccagttaatt ttagatcttc 1628
ggagtctaat caaattctga agcagtattg tgcactaata agaggaacac atcaaggatg 1688
tagcactgcc aggttatgtt accttattta ctaatgattg agaaccagct taaatgatga 1748
caaatggtct tagatttgtt ttttacattg ctcatgactt tgggatattt ctggatcaac 1808
attttccagt tctttatgta cttatcaaaa aattatccct gctagagcct agatgttagt 1868
gttcaagcaa ccatgctagc ttttaaggaa gctccttctt tgattcatgc catctttccg 1928
taatcgatgc cttacgttac tgtcattttt ctaattttca tttcag tgg att gag 1983
Trp Ile Glu225
gag ccg tca ctt ttg att aca cga ttt gag tat gca aac ctt ttc cac 2031Glu Pro Ser Leu Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His
230 235 240
aca gtt acc gat tgg tat agt gca tac gtg gca tcc agg gtt act ggc 2079Thr Val Thr Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly
245 250 255
ttg ccc agt cgg cca cat ttg gtt ttt gta gat ggc cat tgt gag 2124Leu Pro Ser Arg Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu260 265 270
gtatgtttga aagtattgat aacgatggca tgcattgtac tgtgttatgg atgaaagaaa 2184
tgaaatcagc aattattttc tagcaggcaa tgctcttgag atgcttgtgt caaattggtc 2244agacttaatc ctgagtttcc atttgtttca gctttctgtt tgactgacta caataattgt 2304cccaatacct agttgttccg gttggctcat tcttacttct atttacgtgt cactgtttct 2364ctgaatggtc cctttgtggt gaaaagtgct tttgctatga agaaaaacta gcaaagattt 2424catttctggg acaatttatt tttaccttac atcacgtctc ataaaattgc ttcctattgc 2484atactttaat tcttggagag atgctttaat gtgaagaaag ttctttcact ccacttttaa 2544ttcttggaga gatgctttaa tgtgaagaaa gttctttcac tccactactg taagcttgct 2604gcatgaattt tacttggcca tattgggggc gtgttttgat ttatcttcaa attcattttc 2664ttcatgtaat tcttttgagt aatttttttt tctgttttct gtttgggaaa aaattcag 2722
aca caa ttg gag gaa aca tgg aaa gca ctc ttt tca age ctc act tat 2770
Thr Gln Leu Glu Glu Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr275 280 285 290
gct aag aac ttt agt ggc cca gtt tgt ttc cgt cac gcc gtt ctc tcg 2818
Ala Lys Asn Phe Ser Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Val Leu Ser
295 300 305
cct ttg gga tat gaa act gcc ctg ttt aag gga ctg aca gaa act ata 2866
Pro Leu Gly Tyr Glu Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Thr Glu Thr Ile
310 315 320
gat tgt aat gga gct tet gcc cat gat ttg tgg caa aat cct gat gat 2914
Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp
325 330 335
aag aga act gca cgg ttg tcc gag ttt ggg gag atg ate agg gca gcc 2962Lys Arg Thr Ala Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala
340 345 350
ttt gga ttt cct gtg gat aga cag aac ate cca agg aca gtc aca ggc 3010
Phe Gly Phe Pro Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly355 360 365 370
cct aat gtc ctc ttt gtt aga cgt gag gat tat tta gct cac cca cgt 3058Pro Asn Val Leu Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg
375 380 385
cat ggt gga aag gta cag tet agg ctt age aat gaa gag caa gta ttt 3106His Gly Gly Lys Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe390 395 400gat tcc ata aag age tgg gcc ttg aac cac tcg gag tgc aaa tta aat 3154
Asp Ser Ile Lys Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn
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gta att aac gga ttg ttt gcc cac atg tcc atg aaa gag caa gtt cga 3202
Val Ile Asn Gly Leu Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg
420 425 430
gea ate caa gat gea tet gtc att gtc ggc gct cat gga gea ggt cta 3250
Ala Ile Gln Asp Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu
435 440 445 450
act cac ata gtt tet gea gea cca aaa gct gta ata cta gaa att ata 3298
Thr His Ile Val Ser Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile
455 460 465
age age gaa tat agg cgc ccc cat ttt gct ctg att gea caa tgg aaa 3346
Ser Ser Glu Tyr Arg Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys
470 475 480
gga ttg gag tac cat ccc ata tat ttg gag ggg tet tat gcg gat cct 3394
Gly Leu Glu Tyr His Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro
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cca gtt gtg ate ga 3408
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130 135 140
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260 265 270
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Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro
325 330 335
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405 410 415
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420 425 430
Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala
435 440 445
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ttt tcc ttg tcg gaa aac cgc cat cat aat ttc cac tct tca ate actPhe Ser Leu Ser Glu Asn Arg His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr
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tct caa tat tcc aag cct tgg cct att ttg ccc tcc tac ctc cct tggSer Gln Tyr Ser Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp50 55 60tct caa aac cct aat gtt gtt tgg aga tcg tgc gag ggt tac ttc ggt 240Ser Gln Asn Pro Asn Val Val Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly
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aat ggg ttt act ctc aaa gtt gac ctt ctc aaa act tcg ccg gag ttt 288
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cac cgg aaa ttc ggc gaa aac acc gtc tcc ggc gac ggc gga tgg ttt 336
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agg tgt ttt ttc agt gag act ttg cag agt tcg ate tgc gag gga ggc 384
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Ala Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu
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aaa ttg gag tcg gtt att ggt agg agt gaa gat gat gag ctg ccc gtg 480
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ttc aaa aat gga gct ttt cag att aaa gtt act gat aaa ctg aaa att 528
Phe Lys Asn Gly Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile
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Gly Lys Lys Leu Val Asp Glu Lys Ile Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu
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ggt gea att tca agg cac act atg cgt gaa tta att gac tct att cag 624
Gly Ala Ile Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln
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tta gtt ggc gcc gat gaa ttt cac tgt tct gag gttagatttt gaaattttgc 677
Leu Val Gly Ala Asp Glu Phe His Cys Ser Glu
210 215ttgatcttta aattaaaggt ttgaactttg tgaatgttgg cagatatgga atacaataat 737ggattttgtt tgatctgttt aatgaagatt gtctagaacc tcattgttat aaatatggtt 797tgtttgcttc attaattaaa gagcattcct taaaatctcg actagatgcc agataacacc 857
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ctcatgactt tgggatattt ctggatcaac attttccagt tctttatgta cttatcaaaa 1817
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Phe Lys Gly Leu Thr Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala His
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Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu Tyr Arg Arg Pro His
455 460 465
ttt gct ctg att gea caa tgg aaa gga ttg gag tac cat ccc ata tat 3349
Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His Pro Ile Tyr
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ctttgtggtg aaaagagctt ttgatatgta aaaaaactag caaagatttc atttctggaa 2377caatttcttt ttaccttaca tcacgtgtca taaaattgct tctaactgta tactttaatt 2437cttggagaga tgctttcatg tgaagaaagt tctttcactc cactactgga agcttgctgc 2497atgaatttta cttggccata ttggggccgt gttttgattt atcttcaaat tcattttctt 2557catgtagttc tttcgagtaa ttttttttcc tcttttctgt ttgaaaaaat ttcag aca 2615
Thr
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305 310 315
tgt aat gga gct tet gct cat gat ttg tgg caa aat cct gat gat aag 2807Cys Asn Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys
320 325 330
aaa act gca cgg tta tcc gag ttt ggg gag atg ate agg gca gcc ttt 2855Lys Thr Ala Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe
335 340 345
gga ttt cct gtt gat aga cag aac ate cca agg aca gtc aca ggc cct 2903
Gly Phe Pro Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro
350 355 360
aat gtc ctc ttt gtt aga cgt gag gat tat tta gct cac cca cgt cat 2951Asn Val Leu Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His365 370 375 380
ggt gga aag gta cag tet agg ctt age aat gaa gag caa gta ttt gat 2999Gly Gly Lys Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp
385 390 395
tcc ata aag age tgg gcc tta aac cac tcg gag tgc aaa tta aat gta 3047Ser Ile Lys Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val400
att agt gga ttg ttt gccIle Ser Gly Leu Phe Ala415
ate caa gat gct tet gtcIle Gln Asp Ala Ser Val430
cac ata gtt tet gea geaHis Ile Val Ser Ala Ala445 450
age gaa tat agg cgc cccSer Glu Tyr Arg Arg Pro465
ttg gag tac cat ccc ataLeu Glu Tyr His Pro Ile480
gtt gtgatcgaVal
405
cac atg tcc atg aaa gagHis Met Ser Met Lys Glu420
att gtt ggt gct cat ggaIle Val Gly Ala His Gly435 440
cca aaa gct gta ata ctaPro Lys Ala Val Ile Leu455
cat ttt gct ctg att gctHis Phe Ala Leu Ile Ala470
tat ttg gag ggg tet tatTyr Leu Glu Gly Ser Tyr485
410
caa gtt cga gea 3095
Gln Val Arg Ala
425
gea ggt cta acc 3143Ala Gly Leu Thr
gaa att ata age 3191Glu Ile Ile Ser460
caa tgg aaa gga 323 9Gln Trp Lys Gly475
gcg gat cct cca 3287
Ala Asp Pro Pro490
3298
<210> 12<211 >493<212> PRT<213> Artificial<220>
<223> Estrutura sintética<400> 12
Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser1 5
Ser His Pro Asp His Ser Arg Arg20
Ser Ser Glu Asn His His His Asn35 40
Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser
10 15
Lys Ser Pro Gln Asn His Phe Ser25 30
Phe His Ser Ser Ile Thr Ser Gln .45Tyr Ser Arg Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln
50 55 60
Asn Pro Asn Val Ala Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly65 70 75 80
Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Leu His Arg
85 90 95
Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val Phe Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys
100 105 110
Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile
115 120 125
Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu
130 135 140
Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser Glu Asp Asp Glu Val Pro Ala Phe Lys145 150 155 160
Thr Gly Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr Asp Lys Leu Lys Phe Gly Lys
165 170 175
Lys Leu Val Asp Glu Asn Phe Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala
180 185 190
Ile Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val
195 200 205
Gly Ala Asn Asp Phe His Cys Ser Glu Trp Ile Glu Glu Pro Ser Leu
210 215 220
Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Ile Thr Asp225 230 235 240
Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro Ser Arg
245 250 255
Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu Thr Gln Leu Glu Glu
260 265 270
Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn Phe Ser
275 280 285
Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Val Leu Ser Pro Leu Gly Tyr Glu290 295 300Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala305 310 315 320
Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys Lys Thr Ala Arg
325 330 335
Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe Pro Val
340 345 350
Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val Leu Phe
355 360 365
Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly Lys Val
370 375 380
Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp Ser Ile Lys Ser385 390 395 400
Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Ser Gly Leu
405 410 415
Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala
420 425 430
Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile Val Ser
435 440 445
Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu Tyr Arg
450 455 460
Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His465 470 475 480
Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val485 490
<210> 13<211 >3574<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> XyITgI 9Nb<220><221 > CDS<222> (7)..(648)<220>
<221 > Intron
<222> (649) ..(2194)
<220>
<221 > CDS
<222> (2195)..(2344)
<220>
<221 > Intron<222> (2345)..(2888)<220><221 > CDS<222> (2889)..(3566)<400> 13
cacctt gtt tct ctc ttc gct ctc aac tca ate act ctc tat ctc tacVal Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr1 5 10
ttc tct tcc cac cct gat cac aaa tcc ccc caa aac cac ttt tcc ttgPhe Ser Ser His Pro Asp His Lys Ser Pro Gln Asn His Phe Ser Leu15 20 25 30
tcg gaa aac cac cat cat aat ttc cac tct tca ate act tct caa tatSer Glu Asn His His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr Ser Gln Tyr
35 40 45
tcc aag cct tgg cct att ttg ccc tcc tac ctc cct tgg tct caa aacSer Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn
50 55 60
cct aat gtt gct tgg aga tcg tgc gag ggt tac ttc ggt aat ggg tttPro Asn Val Ala Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe
65 70 75
act ctc aaa gtt gac ctt ctc aaa act tcg ccg gag ttt cac cgg aaaThr Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Phe His Arg Lys80 85 90
ttc ggc gat aac acc gtc tcc ggt gac ggc gga tgg ttt agg tgt ttt 336
Phe Gly Asp Asn Thr Val Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe95 100 105 110
ttc agt gag act ttg cag agt tcg ate tgc gag gga ggc gea ata cga 384
Phe Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg
115 120 125
atg aat ccg gac gat att ttg atg tet cgt gga ggt gag aaa ttg gag 432
Met Asn Pro Asp Asp Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu
130 135 140
tcg gtt att ggt agg aat gaa gat gat gag ctg ccc atg ttc aaa aat 480
Ser Val Ile Gly Arg Asn Glu Asp Asp Glu Leu Pro Met Phe Lys Asn
145 150 155
gga gct ttc caa att gaa gtt act gat aaa ctg aaa att ggg aaa aaa 528
Gly Ala Phe Gln Ile Glu Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys Lys
160 165 170
cta gtg gat aaa aaa ttc ttg aat aaa tac tta ccg gga ggt gcg att 576
Leu Val Asp Lys Lys Phe Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Gly Gly Ala Ile175 180 185 190
tca agg cac act atg cgt gag tta att gac tet att cag ttg gtt ggc 624
Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val Gly
195 200 205
gcc gat gaa ttt cac tgt tet gag gttagatttt gatatttatt tgatctttaa 678Ala Asp Glu Phe His Cys Ser Glu210
attagaggtt tgaactttgt taatgttggc agatatggaa tacaataatg gattttgttt 738gatctgttta atgaagattg tctaaaacct caatgctata aatatttgtt tgtttgcttc 798attaattaaa gagaatatcc cgactagatg ccagataaca ccagttagtt gacttttgga 858ttgggttgca tttcatttaa tcagatatgg tactcattct taaatgtttc actaaagaat 918ttgtcaagat ttcagagttt atatataggt gtatttggaa ttctggattt ggatctagta 978ttgaatggat tactgaattt gtactcccca gtcatcaggg gaggagcaat agategaatt 1038caagggttga aaagtaatac tgagtcagaa at-taaccact ttaacttgga aacggtaaat 1098gtatgtgttc taagatgatt attcctataa cttttgatgt ctaatatgga gaaagtgagt 1158
tgatttatgc tttttccttt tccctttatt gatgttggtt tttaaattct atcaattcct 1218
ttgtttggtt gctactcaaa ttgaacctta gacggagtag caatagcaaa aagtgaagaa 1278
aggacatttt tttctccttt catctcttta tttccgtttg acatacagaa tacggtagca 1338
tctgcctgaa gtggttaatt tcattcctta aaatttgcat aactaatatt tccgtttttg 1398
tttttgttta tcttttccat tggcatgcca tgttattttt ggtttaggtt tacataatta 1458
tttatgtgat ttctgatgga gttactaatg attttttgtt tttgtttttg tttttttctt 1518
ttccttttcc tgagtcgagg gtcgattgga aatagcctct ctgccctttt ggataggggt 1578
aaggcctggg tacgtgtacc atccccagac cccactctgt gggactatac cgggtagttg 1638
ttgttgttgt aattcgagta aatgcctttt gaacctttag ttgaatagtt gtacaactgg 1698
ttgttgcatt ttgaggacta tcgacttgat ttgacacttt acatgaaaac ttttatctag 1758
gaagaaatcc ctaccagaga tagggagctg tcgcttggtt atgagctact ggcttaaagt 1818
ttgagtttga cctattaatt ttagatcttc accaggataa catctagagt ttaattaaat 1878
tctcaagcag tattttgcac taataagggg aacacatgaa ggatgtagca ctactacgtt 1938
atgttcttta tttactattg attgacaacc agcttaaatg atgacaaatg gtcttatatt 1998
tgctttttta cattgctcat gacttgggat atttttgaat caacattttt cggttcttta 2058
tgtacttatc aaaaaattat ccctgctaga tgttagtgtt caagcaacat gctagctttt 2118
aaggaagctc cttctttgat tcatgccatc tttccgaagc cttacgtttc tgtcattttt 2178
ctaattttca tttcag tgg gtt gag gag ccg tca ctt ttg att aca cga ttt 2230Trp Val Glu Glu Pro Ser Leu Leu Ile Thr Arg Phe215 220 225
gag tat gca aac ctt ttc cac aca gtt acc gat tgg tat agt gca tac 2278Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Val Thr Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr
230 235 240
gcg gca tcc agg gtt act ggt ttg ccc agt cgg cca aat ttg gtt ttt 2326Ala Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro Ser Arg Pro Asn Leu Val Phe
245 250 255
gta gat ggc cat tgt gag gtatgtttga cagtattgat aacgatggca 2374Val Asp Gly His Cys Glu260
tgcattgtac tgtgttatgg atgaaagaaa tgaaaccatc aattattttc tagtaggcaa 2434
tgctcttaag atgcttgtgt caaattggtt agagttaatc ctaagtttcc atttgtttga 2494gctttctgtt tgactgacta caatacttgt cccaatacct agttgttgcg gttggctcat 2554tcttacttct atttacgtgt cactgtttct ctgaatggtc cctttgtggt gaaaagagct 2614tttgctatgt agaaaaacta gcaaagattt catttctgga gcaacttatt tttaccttac 2674atcacgtctc ataaaattgc ttctaactgt atactttaat tcttggagag atgctttcat 2734gtgaataaag ttctttcact ccactactgg aagcttgctg catgaaattt acttggccat 2794actggggccg tgttttgatt tgtcttcaaa ttcattttct tcatgtagtt ctttcgagta 2854atattttttc ctcttctgtt tgaaaaaaat tcag aca caa ttg gag gaa aca tgg 2909
Thr Gln Leu Glu Glu Thr Trp265 270
aaa gca ctt ttt tca age ctc act tat gct aag aac ttt agt ggc cca 2957Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn Phe Ser Gly Pro
275 280 285
gtt tgt ttc cgt cat gct gtc ctc tcg cct tta gga tat gaa act gcc 3005
Val Cys Phe Arg His Ala Val Leu Ser Pro Leu Gly Tyr Glu Thr Ala
290 295 300
ctg ttt aag gga ctg tca gaa act ata gat tgt aat gga gct tet gct 3053
Leu Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala
305 310 315
cat gat ttg tgg caa aag cct gat gat aaa aaa act gca cgg ttg tcc 3101
His Asp Leu Trp Gln Lys Pro Asp Asp Lys Lys Thr Ala Arg Leu Ser320 325 330 335
gag ttt ggg gag atg ate agg gca gcc ttt gga ttt cct gtg gat aga 3149Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe Pro Val Asp Arg
340 345 350
cag aac ate cca agg aca gtc aca ggc cct aat gtc ctc ttt gtt aga 3197Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val Leu Phe Val Arg
355 360 365
cgt gag gat tat tta gct cac cca cgt cat ggt gga aag gta cag tet 3245Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly Lys Val Gln Ser
370 375 380
agg ctt age aat gaa gag cta gta ttt gat tcc ata aag age tgg gcc 3293Arg Leu Ser Asn Glu Glu Leu Val Phe Asp Ser Ile Lys Ser Trp Ala385 390 395
ttg aac cac tcg gag tgt aaa tta aat gta att aac gga ttg ttt gccLeu Asn His Ser Glü Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn Gly Leu Phe Ala400 405 410 415
cac atg tcc atg aaa gag caa gtt cga gca ate caa gat gct tet gtcHis Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala Ser Val
420 425 430
att gtt ggt gct cat gga gca ggt cta act cac ata gtt tet gca gcaIle Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile Val Ser Ala Ala
435 440 445
cca aaa gct gta ata cta gaa att ata age age gaa tat agg cgc cccPro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu Tyr Arg Arg Pro
450 455 460
cat ttt gct ctg att gca caa tgg aaa gga ttg gag tac cat ccc ataHis Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His Pro Ile
465 ' 470 475
tat ttg gag ggg tet tat gcg gat cct cca gtt gtgatcgaTyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val480 485 490
<210> 14<211 >490<212> PRT<213> Artificial<220>
<223> Estrutura sintética<400> 14
Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser15 10 15
Ser His Pro Asp His Lys Ser Pro Gln Asn His Phe Ser Leu Ser Glu
20 25 30
Asn His His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr Ser Gln Tyr Ser Lys35 40 45Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn Pro Asn
50 55 60
Val Ala Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Leu65 70 75 80
Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Phe His Arg Lys Phe Gly
85 90 95
Asp Asn Thr Val Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe Ser
100 105 110
Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met Asn
115 120 125
Pro Asp Asp Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser Val
130 135 140
Ile Gly Arg Asn Glu Asp Asp Glu Leu Pro Met Phe Lys Asn Gly Ala145 150 155 160
Phe Gln Ile Glu Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys Lys Leu Val
165 170 175
Asp Lys Lys Phe Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Gly Gly Ala Ile Ser Arg
180 185 190
His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val Gly Ala Asp
195 200 205
Glu Phe His Cys Ser Glu Trp Val Glu Glu Pro Ser Leu Leu Ile Thr
210 215 220
Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Val Thr Asp Trp Tyr Ser225 230 235 240
Ala Tyr Ala Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro Ser Arg Pro Asn Leu
245 250 255
Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu Thr Gln Leu Glu Glu Thr Trp Lys
260 265 270
Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn Phe Ser Gly Pro Val
275 280 285
Cys Phe Arg His Ala Val Leu.Ser Pro Leu Gly Tyr Glu Thr Ala Leu290 295 300Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala Ser Ala His305 310 315 320
Asp Leu Trp Gln Lys Pro Asp Asp Lys Lys Thr Ala Arg Leu Ser Glu
325 330 335
Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe Pro Val Asp Arg Gln
340 345 350
Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val Leu Phe Val Arg Arg
355 360 365
Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly Lys Val Gln Ser Arg
370 375 380
Leu Ser Asn Glu Glu Leu Val Phe Asp Ser Ile Lys Ser Trp Ala Leu385 390 395 400
Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn Gly Leu Phe Ala His
405 410 415
Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala Ser Val Ile
420 425 430
Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile Val Ser Ala Ala Pro
435 440 445
Lys Ala Val Ile Leu Glu 13.6 Ile Sex* Seir Glu Tyr Ajrg Zkjcçj Piro His
450 455 460
Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His Pro Ile Tyr465 470 475 480
Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val485 490
<210> 15<211> 27<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> oligonucleotídeo XylF8<400> 15
cacctctcgc ctttgggata tgaaact<210> 16<211 >24<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> oligonucleotídeo XylR8<400> 16
acagcttttg gtgctgcaga aact 24
<210> 17<211 >473<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> XylTi4Nt<400> 17
cacctctcgc ctttgggata tgaaactgcc ctgtttaagg gactgacaga aactatagat 60tgtaatggag cttctgccca tgatttgtgg caaaatcctg atgataagag aactgcacgg 120ttgtccgagt ttggggagat gatcagggca gcctttggat ttcctgtgga tagacagaac 180atcccaagga cagtcacagg ccctaatgtc ctctttgtta gacgtgagga ttatttagct 240cacccacgtc atggtggaaa ggtacagtct aggcttagca atgaagagca agtatttgat 300tccataaaga gctgggcctt gaaccactcg gagtgcaaat taaatgtaat taacggattg 360tttgcccaca tgtccatgaa agagcaagtt cgagcaatcc aagatgcatc tgtcattgtt 420ggtgctcatg gagcaggtct aactcacata gtttctgcag caccaaaagc tgt 473
<210> 18<211 >7954<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> T-DNA de pTKW20<220>
<221 > misc feature<222> (1)..(619)<223> borda direita<220>
<221 > misc_feature<222> (969)..(2314)
<223> seqüência incluindo a região promotora do transcrito 35S do vírusmosaico de Couve-Flor (Odell e outros, 1985)<220>
<221 > misc_feature<222> (2365)..(2834)
<223> seqüência incluindo uma parte da seqüência de cDNA de XyIT deNicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 clonada na orientação sentido<220>
<221 > misc_feature<222> (2893)..(3088)
<223> seqüência incluindo o íntron do gene de catase-1 de semente demamona<220>
<221 > misc_feature<222> (3130)..(3871)
<223> seqüência contendo o segundo íntron do gene de diquínase de orto-fosfato de Flaveria trinervia conforme descrito por Rosche e Westhoff (1995)na orientação reversa<220>
<221 > misc_feature<222> (3957)..(4426)
<223> seqüência incluindo uma parte da seqüência de cDNA de XyIT deNicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1 clonada na orientação anti-sentido<220>
<221 > m isc_featu re<222> (4479)..(5244)
<223> seqüência incluindo a região não traduzida 3'do gene de sintase deoctopina de Agrobacterium tumefaciens conforme descrito por De Greve eoutros (1982)<220>
<221 > misc_feature<222> (5512)..(5744)
<223> seqüência incluindo a região promotora do gene de sintase de nopali-na de T-DNA de Agrobacterium tumefaciens<220>
<221 > misc_feature<222> (5745)..(6690)
<223> seqüência incluindo o gene de resistência a antibiótico nptll<220>
<221 > misc_feature<222> (6691)..(7396)
<223> seqüência incluindo a região não traduzida 3' do gene de sintase denopalina de T-DNA de A. tumefaciens<220>
<221 > misc_feature<222> (7397)..(7954)<223> borda esquerda<400> 18
tcgacatctt gctgcgttcg gatattttcg tggagttccc gccacagacc cggattgaag 60gcgagatcca gcaactcgcg ccagatcatc ctgtgacgga actttggcgc gtgatgactg 120gccaggacgt cggccgaaag agcgacaagc agatcacgat tttcgacagc gtcggatttg 180cgatcgagga tttttcggcg ctgcgctacg tccgcgaccg cgttgaggga tcaagccaca 240gcagcccact cgaccttcta gccgacccag acgagccaag ggatcttttt ggaatgctgc 300tccgtcgtca ggctttccga cgtttgggtg gttgaacaga agtcattatc gtacggaatg 360ccagcactcc cgaggggaac cctgtggttg gcatgcacat acaaatggac gaacggataa 420accttttcac gcccttttaa atatccgtta ttctaataaa cgctcttttc tcttaggttt 480acccgccaat atatcctgtc aaacactgat agtttaaact gaaggcggga aacgacaatc 540tgatcatgag cggagaatta agggagtcac gttatgaccc ccgccgatga cgcgggacaa 600gccgttttac gtttggaact gacagaaccg caacgattga aggagccact cagccccaat 660acgcaaaccg cctctccccg cgcgttggcc gattcattaa tgcagctggc acgacaggtt 720tcccgactgg aaagcgggca gtgagcgcaa cgcaattaat gtgagttagc tcactcatta 780ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc ggctcgtatg ttgtgtggaa ttgtgagcgg 840ataacaattt cacacaggaa acagctatga ccatgattac gccaagctat ttaggtgaca 900
ctatagaata ctcaagctat gcatccaacg cgttgggagc tctcccatat cgacctgcag 960
gcggccgctc gacgaattaa ttccaatccc acaaaaatct gagcttaaca gcacagttgc 1020
tcctctcaga gcagaatcgg gtattcaaca ccctcatatc aactactacg ttgtgtataa 1080
cggtccacat gccggtatat acgatgactg gggttgtaca aaggcggcaa caaacggcgt 1140
tcccggagtt gcacacaaga aatttgccac tattacagag gcaagagcag cagctgacgc 1200
gtacacaaca agtcagcaaa cagacaggtt gaacttcatc cccaaaggag aagctcaact 1260
caagcccaag agctttgcta aggccctaac aagcccacca aagcaaaaag cccactggct 1320
cacgctagga accaaaaggc ccagcagtga tccagcccca aaagagatct cctttgcccc 1380
ggagattaca atggacgatt tcctctatct ttacgatcta ggaaggaagt tcgaaggtga 1440
aggtgacgac actatgttca ccactgataa tgagaaggtt agcctcttca atttcagaaa 1500
gaatgctgac ccacagatgg ttagagaggc ctacgcagca ggtctcatca agacgatcta 1560
cccgagtaac aatctccagg agatcaaata ccttcccaag aaggttaaag atgcagtcaa 1620
aagattcagg actaattgca tcaagaacac agagaaagac atatttctca agatcagaag 1680
tactattcca gtatggacga ttcaaggctt gcttcataaa ccaaggcaag taatagagat 1740
tggagtctct aaaaaggtag ttcctactga atctaaggcc atgcatggag tctaagattc 1800
aaatcgagga tctaacagaa ctcgccgtga agactggcga acagttcata cagagtcttt 1860
tacgactcaa tgacaagaag aaaatcttcg tcaacatggt ggagcacgac actctggtct 1920
actccaaaaa tgtcaaagat acagtctcag aagaccaaag ggctattgag acttttcaac 1980
aaaggataat ttcgggaaac ctcctcggat tccattgccc agctatctgt cacttcatcg 2040
aaaggacagt agaaaaggaa ggtggctcct acaaatgcca tcattgcgat aaaggaaagg 2100
ctatcattca agatctctct gccgacagtg gtcccaaaga tggaccccca cccacgagga 2160
gcatcgtgga aaaagaagac gttccaacca cgtcttcaaa gcaagtggat tgatgtgaca 2220
tctccactga cgtaagggat gacgcacaat cccactatcc ttcgcaagac ccttcctcta 2280
tataaggaag ttcatttcat ttggagagga cacgctcgag acaagtttgt acaaaaaagc 2340
aggctccgcg gccgccccct tcacctctcg cctttgggat atgaaactgc cctgtttaag 2400
ggactgacag aaactataga"ttgtaatgga gcttctgccc atgatttgtg gcaaaatcct 2460
gatgataaga gaactgcacg gttgtccgag tttggggaga tgatcagggc agcctttgga 2520
tttcctgtgg atagacagaa catcccaagg acagtcacag gccctaatgt cctctttgtt 2580agacgtgagg attatttagc tcacccacgt catggtggaa aggtacagtc taggcttagc 2640
aatgaagagc aagtatttga ttccataaag agctgggcct tgaaccactc ggagtgcaaa 2700
ttaaatgtaa ttaacggatt gtttgcccac atgtccatga aagagcaagt tcgagcaatc 2760
caagatgcat ctgtcattgt tggtgctcat ggagcaggtc taactcacat agtttctgca 2820
gcaccaaaag ctgtaagggt gggcgcgccg acccagcttt cttgtacaaa gtggtctaga 2880
ggatccaagc ttgtgcaggt aaatttctag tttttctcct tcattttctt ggttaggacc 2940
cttttctctt tttatttttt tgagctttga tctttcttta aactgatcta ttttttaatt 3000
gattggttat ggcgcaaata ttacatagct ttaactgata atctgattac tttatttcgt 3060
gtgtctatga tgatgatgat aactgcagcg caagcttatc gatttcgaac ccagcttccc 3120
aactgtaatc aatccaaatg taagatcaat gataacacaa tgacatgatc tatcatgtta 3180
ccttgtttat tcatgttcga ctaattcatt taattaatag tcaatccatt tagaagttaa 3240
taaaactaca agtattattt agaaattaat aagaatgttg attgaaaata atactatata 3300
aaatgataga tcttgcgctt tgttatatta gcattagatt atgttttgtt acattagatt 3360
actgtttcta ttagtttgat attatttgtt actttagctt gttatttaat attttgttta 3420
ttgataaatt acaagcagat tggaatttct aacaaaatat ttattaactt ttaaactaaa 34 80
atatttagta atggtataga tatttaatta tataataaac tattaatcat aaaaaaatat 3540
tattttaatt tatttattct tatttttact atagtatttt atcattgata tttaattcat 3 600
caaaccagct agaattacta ttatgattaa aacaaatatt aatgctagta tatcatctta 3660
catgttcgat caaattcatt aaaaataata tacttactct caacttttat cttcttcgtc 3720
ttacacatca cttgtcatat ttttttacat tactatgttg tttatgtaaa caatatattt 3780
ataaattatt ttttcacaat tataacaact atattattat aatcatacta attaacatca 3840
cttaactatt ttatactaaa aggaaaaaag aaaataatta tttccttacc aagctggggt 3900
accgaattcc tcgagaccac tttgtacaag aaagctgggt cggcgcgccc acccttacag 3960
cttttggtgc tgcagaaact atgtgagtta gacctgctcc atgagcacca acaatgacag 4020
atgcatcttg gattgctcga acttgctctt tcatggacat gtgggcaaac aatccgttaa 4080
ttacatttaa tttgcactcc gagtggttca aggcccagct ctttatggaa tcaaatactt 4140
gctcttcatt gctaagccta gactgtacct ttccaccatg acgtgggtga gctaaataat 4200
cctcacgtct aacaaagagg acattagggc ctgtgactgt ccttgggatg ttctgtctat 4260
ccacaggaaa tccaaaggct gccctgatca tctccccaaa ctcggacaac cgtgcagttc 4320
tcttatcatc aggattttgç cacaaatcat gggcagaagc tccattacaa tctatagttt 4380
ctgtcagtcc cttaaacagg gcagtttcat atcccaaagg cgagaggtga agggggcggc 4440
cgcggagcct gcttttttgt acaaacttgt ctagagtcct gctttaatga gatatgcgag 4500acgcctatga tcgcatgata tttgctttcagcatgtgtag ctcagatcct taccgccggtttactatcgt atttttatga ataatattctttatatgtac aatattaaaa tgaaaacaatctatgataga gcgccacaat aacaaacaataaaaagcggc agaaccggtc aaacctaaaaaaaaggcccc aggggctagt atctacgacaaagggaactc cggttccccg ccggcgcgcaccgtccgctc taccgaaagt tacgggcaccaaccgacttg ctgccccgag aattatgcagaagtgcaggt caaaccttga cagtgacgacgcgacaacat gtcgaggctc agcaggacctcatattctat agtgtcacct aaatctgcgggccgggagca tgcgacgtcg ggcccaattcggccgtcgtt ttacaacgtc gtgactgggatgcagcacat ccccctttcg ccagctggcgttcccaacag ttgcgcagcc tgaatggcgagagtttaatg agctaagcac atacgtcagaaggtcactat cagctagcaa atatttcttgtcccctcggt atccaattag agtctcatataattacctta tccgcaactt ctttacctatcgcttgggtg gagaggctat tcggctatgatgccgccgtg ttccggctgt cagcgcaggggtccggtgcc ctgaatgaac tgcaggacgagggcgttcct tgcgcagctg tgctcgacgtattgggcgaa gtgccggggc aggatctcctatccatcatg gctgatgcaa tgcggcggctcgaccaccaa gcgaaacatc gcatcgagcgcgatcaggat gatctggacg aagagcatcagctcaaggcg cgcatgcccg acggcgaggagccgaatatc atggtggaaa atggccgctttgtggcggac cgctatcagg acatagcgtt
attctgttgt gcacgttgta aaaaacctga 45€0
ttcggttcat tctaatgaat atatcacccg 4620
ccgttcaatt tactgattgt accctactac 4680
atattgtgct gaataggttt atagcgacat 4740
tgcgttttat tattacaaat ccaattttaa 4800
gactgattac ataaatctta ttcaaatttc 4860
caccgagcgg cgaactaata acgttcactg 4920
tgggtgagat tccttgaagt tgagtattgg 4980
attcaacccg gtccagcacg gcggccgggt 5040
catttttttg gtgtatgtgg gccccaaatg 5100
aaatcgttgg gcgggtccag ggcgaatttt 5160
gcaggcatgc aagctagctt actagtgatg 5220
ccgcactagt gatatcccgc ggccatggcg 5280
gccctatagt gagtcgtatt acaattcact 5340
aaaccctggc gttacccaac ttaatcgcct 5400
taatagcgaa gaggcccgca ccgatcgccc 5460
atggaaattg taaacgttaa tgggtttctg 5520
aaccattatt gcgcgttcaa aagtcgccta 5580
tcaaaaatgc tccactgacg ttccataaat 5640
tcactctcaa tccaaataat ctgcaatggc 5700
ttccgcccgg atccgggcag gttctccggc 5760
ctgggcacaa cagacaatcg gctgctctga 5820
gcgcccggtt ctttttgtca agaccgacct 5880
ggcagcgcgg ctatcgtggc tggccacgac 5940
tgtcactgaa gcgggaaggg actggctgct 6000
gtcatctcac cttgctcctg ccgagaaagt 6060
gcatacgctt gatccggcta cctgcccatt 6120
agcacgtact cggatggaag ccggtcttgt 6180
ggggctcgcg ccagccgaac tgttcgccag 6240
tctcgtcgtg acccatggcg atgcctgctt 6300
ttctggattc atcgactgtg gccggctggg 6360
ggctacccgt gatattgctg aagagcttgg 6420cggcgaatgg gctgaccgct tcctcgtgctcatcgccttc tatcgccttc ttgacgagttaccgaccaag cgacgcccaa cctgccatcagaaaggttgg gcttcggaat cgttttccgggatctcatgc tggagttctt cgcccaccccagcaaataga ccacgaacgc cggaaggttgtcttgcagga atgcaatgat gaatatgatatagcaccgtc acctcataac gtgcatcatgtttctgaaga attatgctcg ttggaggatgaactacccct cacgcatgca ttcatcaatacaactggcaa atcatccagc gtgattggtagtgctaccca cgttttcaat aaggacgagaagatcgttca aacatttggc aataaagtttgatgattatc atataatttc tgttgaattacatgacgtta tttatgagat gggtttttatcgcgatagaa aacaaaatat agcgcgcaaatatgttacta gatcgaatta attccaggcgctggtgaaaa gaaaaaccac cccagtacattctaagcgtc aatttgttta caccacaatacgaccggcag ctcggcacaa aatcaccactcgtcagcggg agagccgttg taaggcggcaaagaacggca actaagctgc cgggtttgaatgattgtaac gatgacagag cgttgctgcctccgaattat cagccttctt attcatttctgaactatgcc gacataatag gaaatcgctgtatttcttta gaagtgaacg ttgacgatgt
ttacggtatc gccgctcccg attcgcagcg 6480
cttctgagcg ggactctggg gttcgaaatg 6540
cgagatttcg attccaccgc cgccttctat 6600
gacgccggct ggatgatcct ccagcgcggg 6660
gatccaacac ttacgtttgc aacgtccaag 6720
ccgcagcgtg tggattgcgt ctcaattctc 6780
ctgactatga aactttgagg gaatactgcc 6840
catgccctga caacatggaa catcgctatt 6900
tcgcggcaat tgcagctatt gccaacatcg 6960
ttattcatgc ggggaaaggc aagattaatc 7020
acttcagttc cagcgacttg attcgttttg 7080
tggtggagta aagaaggagt gcgtcgaagc 7140
cttaagattg aatcctgttg ccggtcttgc 7200
cgttaagcat gtaataatta acatgtaatg 7260
gattagagtc ccgcaattat acatttaata 7320
ctaggataaa ttatcgcgcg cggtgtcatc 7380
gtgaagggca atcagctgtt gcccgtctca 7440
taaaaacgtc cgcaatgtgt tattaagttg 7500
tatcctgcca ccagccagcc aacagctccc 7560
cgatacaggc agcccatcag tccgggacgg 7620
gactttgctc atgttaccga tgctattcgg 7680
acacggatga tctcgcggag ggtagcatgt 7740
tgtgatcaaa tatcatctcc ctcgcagaga 7800
cgcttaaccg tgacaggctg tcgatcttga 7860
gataaagccg ctgaggaagc tgagtggcgc 7920
cgac 7954
<210> 19<211 >41<212> DNA<213> Artificial<220><223> oligonucleotídeo XylF9<400> 19
ggccggatcc tcgagacaca attggaggaa acatggaaag c
<210> 20<211> 40<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> oligonucleotídeo XylR9<400> 20
ggccatcgat ggtaccggcc cagctcttta tggaatcaaa<210> 21<211 >436<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> XyITiNb<400> 21
ggccggatcc tcgagacaca attggaggaa acatggaaag cacttttttc aagcctcacttatgctaaga actttagtgg cccagtttgt ttccgtcatg ccgtcctctc gcctttgggatatgaaactg ccctgtttaa gggactgtca gaaactatag attgtaatgg agcttctgctcatgatttgt ggcaaaatcc tgatgataag aaaactgcac ggttatccga gtttggggagatgatcaggg cagcctttgg atttcctgtt gatagacaga acatcccaag gacagtcacaggccctaatg tcctctttgt tagacgtgag gattatttag ctcacccacg tcatggtggaaaggtacagt ctaggcttag caatgaagag caagtatttg attccataaa gagctgggccggtaccatcg atggcc
<210> 22<211 >5093<212> DNA<213> Artificial<220>
<223> T-DNA de pTKW29<220>
<221 > misc_feature<222> (1)..(25)
<223> repetição de borda direita do T-DNA de Agrobacterium tumefaciens(Zambryski, 1988)<220>
<221 > misc_feature<222> (76)..(786)
<223> seqüência incluindo a região não traduzida 3' do gene de sintase deoctopina de Agrobacterium tumefaciens conforme descrito por De Greve eoutros(1982) (complemento)<220>
<221 > misc_feature<222> (807)..(1211)
<223> seqüência incluindo uma parte do gene de XyITde Nicotiana bentha-miana clonado na orientação anti-sentido (complemento)<220>
<221 > misc_feature<222> (1250)..(1991)
<223> seqüência contendo o segundo íntron do gene de diquínase de orto-fosfato de piruvato de Flaveria trinervia conforme descrito por Rosche eWesthoff (1995) (complemento)<220>
<221 > misc_feature<222> (2023) (2427)
<223> seqüência incluindo uma parte do gene XyIT de Nicotiana benthamia-na clonado na oriientação sentido (complemento)<220>
<221 > misc_feature<222> (2434)..(3779)<223> seqüência incluindo a região promotora do transcrito 35S do vírusmosaico da couve-flor (Odell e outros, 1985) (complemento)<220>
<221 > misc_feature<222> (3854)..(4140)
<223> seqüência incluindo a região promotora do gene de sintase de nopali-na de T-DNA de A. tumefaciens<220>
<221 > misc_feature<222> (4161)..(4712)
<223> seqüência incluindo o gene de resistência à fosfinotricina bar [DeBlock e outros (1987) EMBO J 6:2513]<220>
<221 > misc_feature<222> (4731)..(4991)
<223> seqüência incluindo a região não traduzida 3' do gene de sintase denopalina de T-DNA de A. tumefaciens<220>
<221 > m isc_featu re<222> (5069)..(5093)
<223> repetição de borda esquerda do T-DNA de Agrobacterium tumefaci-ens (Zambryski, 1988)<400> 22
aattacaacg gtatatatcc tgccagtact cggccgtcga ccgcggtacc ccggaattaa 60
gcttgcatgc ctgcaggtcc tgctgagcct cgacatgttg tcgcaaaatt cgccctggac 120ccgcccaacg atttgtcgtc actgtcaagg tttgacctgc acttcatttg gggcccacat 180acaccaaaaa aatgctgcat aattctcggg gcagcaagtc ggttacccgg ccgccgtgct 240ggaccgggtt gaatggtgcc cgtaactttc ggtagagcgg acggccaata ctcaacttca 300aggaatctca cccatgcgcg ccggcgggga accggagttc ccttcagtga acgttattag 360ttcgccgctc ggtgtgtcgt agatactagc ccctggggcc ttttgaaatt tgaataagat 420ttatgtaatc agtcttttag gtttgaccgg ttctgccgct ttttttaaaa ttggatttgt 480aataataaaa cgcaattgtt tgttattgtg gcgctctatc atagatgtcg ctataaacct 540attcagcaca atatattgtt ttcattttaa tattgtacat ataagtagta gggtacaatc 600
agtaaattga acggagaata ttattcataa aaatacgata gtaacgggtg atatattcat 660
tagaatgaac cgaaaccggc ggtaaggatc tgagctacac atgctcaggt tttttacaac 720
gtgcacaaca gaattgaaag caaatatcat gcgatcatag gcgtctcgca tatctcatta 780
aagcaggact ctagaggatc ctcgagacac aattggagga aacatggaaa gcactttttt 840
caagcctcac ttatgctaag aactttagtg gcccagtttg tttccgtcat gccgtcctct 900
cgcctttggg atatgaaact gccctgttta agggactgtc agaaactata gattgtaatg 960
gagcttctgc tcatgatttg tggcaaaatc ctgatgataa gaaaactgca cggttatccg 1020
agtttgggga gatgatcagg gcagcctttg gatttcctgt tgatagacag aacatcccaa 1080
ggacagtcac aggccctaat gtcctctttg ttagacgtga ggattattta gctcacccac 1140
gtcatggtgg aaaggtacag tctaggctta gcaatgaaga gcaagtattt gattccataa 1200
agagctgggc cggtaccatc gatttcgaac ccaatttccc aactgtaatc aatccaaatg 1260
taagatcaat gataacacaa tgacatgatc tatcatgtta ccttgtttat tcatgttcga 1320
ctaattcatt taattaatag tcaatccatt tagaagttaa taaaactaca agtattattt 1380
agaaattaat aagaatgttg attgaaaata atactatata aaatgataga tcttgcgctt 1440
tgttacatta gcattagatt atgttttgtt acattagatt actgtttcta ttagtttgat 1500
attatttgtt actttagctt gttatttaat attttgttta ttgataaatt acaagcagat 1560
tggaatttct aacaaaatat ttattaactt ttaaactaaa atatttagta atggtataga 1620
tatttaatta tataataaac tattaatcat aaaaaaatat tattttaatt tatttattct 1680
tatttttact atagtatttt atcattgata tttaattcat caaaccagct agaattacta 1740
ttatgattaa aacaaatatt aatgctagta tatcatctta catgttcgat caaattcatt 1800
aaaaataata tacttactct caacttttat cttcttcgtc ttacacatca cttgtcatat 1860
ttttttacat tactatgttg tttatgtaaa caatatattt ataaattatt ttttcacaat 1920
tataacaact atattattat aatcatacta attaacatca cttaactatt ttatactaaa 1980
aggaaaaaag aaaataatta tttccttacc aattggggta ccggcccagc tctttatgga 2040
atcaaatact tgctcttcat tgctaagcct agactgtacc tttccaccat gacgtgggtg 2100
agctaaataa tcctcacgtc taacaaagag gacattaggg cctgtgactg tccttgggat 2160
gttctgtcta tcaacaggaa atccaaaggc tgccctgatc atctccccaa actcggataa 2220
ccgtgcagtt ttcttatcat caggattttg ccacaaatca tgagcagaag ctccattaca 2280
atctatagtt tctgacagtc ccttaaacag ggcagtttca tatcccaaag gcgagaggac 2340
ggcatgacgg aaacaaactg ggccactaáa gttcttagca taagtgaggc ttgaaaaaag 2400
tgctttccat gtttcctcca attgtgtctc gagcgtgtcc tctccaaatg aaatgaactt 2460ccttatatag aggaagggtc ttgcgaagga tagtgggatt gtgcgtcatc ccttacgtca 2520
gtggagatgt cacatcaatc cacttgcttt gaagacgtgg ttggaacgtc ttctttttcc 2580
acgatgctcc tcgtgggtgg gggtccatct ttgggaccac tgtcggcaga gagatcttga 2640
atgatagcct ttcctttatc gcaatgatgg catttgtagg agccaccttc cttttctact 2700
gtcctttcga tgaagtgaca gatagctggg caatggaatc cgaggaggtt tcccgaaatt 2760
atcctttgtt gaaaagtctc aatagccctt tggtcttctg agactgtatc tttgacattt 2820
ttggagtaga ccagagtgtc gtgctccacc atgttgacga agattttctt cttgtcattg 2880
agtcgtaaaa gactctgtat gaactgttcg ccagtcttca cggcgagttc tgttagatcc 2940
tcgatttgaa tcttagactc catgcatggc cttagattca gtaggaacta cctttttaga 3000
gactccaatc tctattactt gccttggttt atgaagcaag ccttgaatcg tccatactgg 3060
aatagtactt ctgatcttga gaaatatgtc tttctctgtg ttcttgatgc aattagtcct 3120
gaatcttttg actgcatctt taaccttctt gggaaggtat ttgatctcct ggagattgtt 3180
actcgggtag atcgtcttga tgagacctgc tgcgtaggcc tctctaacca tctgtgggtc 3240
agcattcttt ctgaaattga agaggctaac cttctcatta tcagtggtga acatagtgtc 3300
gtcaccttca ccttcgaact tccttcctag atcgtaaaga tagaggaaat cgtccattgt 3360
aatctccggg gcaaaggaga tctcttttgg ggctggatca ctgctgggcc ttttggttcc 3420
tagcgtgagc cagtgggctt tttgctttgg tgggcttgtt agggccttag caaagctctt 3480
gggcttgagt tgagcttctc ctttggggat gaagttcaac ctgtctgttt gctgacttgt 3540
tgtgtacgcg tcagctgctg ctcttgcctc tgtaatagtg gcaaatttct tgtgtgcaac 3600
tccgggaacg ccgtttgttg ccgcctttgt acaaccccag tcatcgtata taccggcatg 3660
tggaccgtta tacacaacgt agtagttgat atgagggtgt tgaatacccg attctgctct 3720
gagaggagca actgtgctgt taagctcaga tttttgtggg attggaatta attcgtcgag 3780
cggccgctcg acgagctccc tatagtgagt cgtattagag gccgacttgg gggccggcca 3840
tttaaatgaa ttcgatcatg agcggagaat taagggagtc acgttatgac ccccgccgat 3900
gacgcgggac aagccgtttt acgtttggaa ctgacagaac cgcaacgatt gaaggagcca 3960
ctcagccgcg ggtttctgga gtttaatgag ctaagcacat acgtcagaaa ccattattgc 4020
gcgttcaaaa gtcgcctaag gtcactatca gctagcaaat atttcttgtc aaaaatgctc 4080
cactgacgtt ccataaattc ccctcggtat ccaattagag tctcatattc actctcaatc 4140
aaagatccgg cccatgatcc atggacccag aacgacgccc ggccgacatc cgccgtgcca 4200
ccgaggcgga catgccggcg gtctgcacca tcgtcaacca ctacatcgag acaagcacgg 4260
tcaacttccg taccgagccg caggaaccgc aggagtggac ggacgacctc gtccgtctgc 432.0
gggagcgcta tccctggctc gtcgccgagg tggacggcga ggtcgccggc atcgcctacg 4380cgggcccctg gaaggcacgc aacgcctacg actggacggc cgagtcgacc gtgtacgtct 4440ccccccgcca ccagcggacg ggactgggct ccacgctcta cacccacctg ctgaagtccc 4500tggaggcaca gggcttcaag agcgtggtcg ctgtcatcgg gctgcccaac gacccgagcg 4560tgcgcatgca cgaggcgctc ggatatgccc cccgcggcat gctgcgggcg gccggcttca 4620agcacgggaa ctggcatgac gtgggtttct ggcagctgga cttcagcctg ccggtaccgc 4680cccgtccggt cctgcccgtc accgagatct gatctcacgc gtctaggatc cgaagcagat 4740cgttcaaaca tttggcaata aagtttctta agattgaatc ctgttgccgg tcttgcgatg 4800attatcatat aatttctgtt gaattacgtt aagcatgtaa taattaacat gtaatgcatg 4860acgttattta tgagatgggt ttttatgatt agagtcccgc aattatacat ttaatacgcg 4920atagaaaaca aaatatagcg cgcaaactag gataaattat cgcgcgcggt. gtcatctatg 4980ttactagatc gggaagatcc attaattcgg tactcgaggc attacggcat tacggcactc 5040gcgagggtcc caattcgagc atggagccat ttacaattga atatatcctg ccg 5093
<210> 23<211 >2318<212> DNA
<213> Nicotiana tabacum cv. Xanthi<220>
<221 > 5'UTR<222> (1)..(18)<220><221 > CDS<222> (19)..(1590)<220>
<221> 3'UTR<222> (1592)..(2291)<220>
<221 > sinal_poliA<222> (2292)..(2318)<400> 23
agtcagagag agaagaag atg aac aag aaa aag ctg
Met Asn Lys Lys Lys Leu1 5
aaa ttt ctt gtt tctLys Phe Leu Val Ser10
51ctc ttc gct ctcLeu Phe Ala Leu15
tct gat cac ttcSer Asp His Phe30
caa aac cac tatGln Asn His Tyr45
tct gtc act tccSer Val Thr Ser60
ctc ccc tgg tctLeu Pro Trp Ser
tac ttc ggt aatTyr Phe Gly Asn95
ccg gag ctt cacPro Glu Leu His110
gga tgg ttt aggGly Trp Phe Arg125
gag gga ggt gctGlu Gly Gly Ala140
gga ggc gag aaaGly Gly Glu Lys
ctg ccc gtg ttcLeu Pro Val Phe
aac tca ate actAsn Ser Ile Thr
cgt cac aaa tccArg His Lys Ser35
tcc ctg tcg gaaSer Leu Ser Glu50
caa tat acc aagGln Tyr Thr Lys65
cag aat cct aatGln Asn Pro Asn80
ggg ttt act ctcGly Phe Thr Leu
cag aaa ttc ggcGln Lys Phe Gly115
tgt ttt ttc agtCys Phe Phe Ser130
ata cga atg aatIle Arg Met Asn145
ttg gag tcg gttLeu Glu Ser Val160
aaa aat gga gctLys Asn Gly Ala
ctc tat ctc tacLeu Tyr Leu Tyr20
ccc caa aac cacPro Gln Asn His
aac cac cat gatAsn His His Asp55
cct tgg cca attPro Trp Pro Ile70
gtt tct ttg agaVal Ser Leu Arg85
aaa gtt gat cttLys Val Asp Leu100
gaa aac acc gtaGlu Asn Thr Val
gag act ttg cagGlu Thr Leu Gln135
ccg gac gag attPro Asp Glu Ile150
att ggt agg agtIle Gly Arg Ser165
ttt cag att aaaPhe Gln Ile Lys
ttc tct tcc cacPhe Ser Ser His25
ttt cct aat accPhe Pro Asn Thr40
aat ttc cac tctAsn Phe His Ser
ttg ccc tcc tacLeu Pro Ser Tyr75
tcg tgc gag ggtSer Cys Glu Gly90
ctc aaa act tcgLeu Lys Thr Ser105
tcc ggc gac ggcSer Gly Asp Gly120
agt tcg att tgcSer Ser Ile Cys
ttg atg tct cgtLeu Met Ser Arg155
gaa gat gat gagGlu Asp Asp Glu170
gtt act gat aaaVal Thr Asp Lys175
ctg aaa att ggg aaa aaaLeu Lys Ile Gly Lys Lys190
tta ccg gaa ggt gca attLeu Pro Glu Gly Ala Ile205
tct att cag tta gtt ggcSer Ile Gln Leu Val Gly220 225
gag gag ccg tca ctt ttgGlu Glu Pro Ser Leu Leu240
cac aca gtt acc gat tggHis Thr Val Thr Asp Trp255
ggc ttg ccc agt cgg ccaGly Leu Pro Ser Arg Pro270
aca caa ttg gag gaa acaThr Gln Leu Glu Glu Thr285
gct aag aac ttt agt ggcAla Lys Asn Phe Ser Gly300 305
cct ttg gga tat gaa actPro Leu Gly Tyr Glu Thr320
gát tgt aat gga gct tctAsp Cys Asn Gly Ala Ser335
aag aga act gca cgg ttg
180
tta gtg gat gaa aaa ateLeu Val Asp Glu Lys Ile195
tca agg cac act atg cgtSer Arg His Thr Met Arg210 215
gcc gat gaa ttt cac tgtAla Asp Glu Phe His Cys230
att aca cga ttt gag tatIle Thr Arg Phe Glu Tyr245
tat agt gca tac gtg gcaTyr Ser Ala Tyr Val Ala260
cat ttg gtt ttt gta gatHis Leu Val Phe Val Asp275
tgg aaa gca ctc ttt tcaTrp Lys Ala Leu Phe Ser290 295
cca gtt tgt ttc cgt cacPro Val Cys Phe Arg His310
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gcc cat gat ttg tgg caaAla His Asp Leu Trp Gln340
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185
ttg aat aaa tac 627
Leu Asn Lys Tyr
200
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tct gag tgg att 723
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Ala Asn Leu Phe250
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Ser Arg Val Thr265
ggc cat tgt gag 867
Gly His Cys Glu280
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Ala Val Leu Ser315
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ttt gga ttt cctPhe Gly Phe Pro365
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cca gtt gtg atePro Val Val Ile510
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ttt gtt aga cgtPhe Val Arg Arg385
gta cag tet aggVal Gln Ser Arg400
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ttg ttt gcc cac
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Ala Ser Val Ile450
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aca gtc aca ggcThr Val Thr Gly
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caatttccag cagctactaa tttattagcc cgctctgact cggttatgga ctaccagagc 1820
aatcatatca aatggaagca tggaatcctg attgtggaat ggtgagctca ttgaagagca 1880
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ttggtacact tacttacaat tcattgtcaa ttgtttttca ttattctcat taatgatcat 2000
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gtgaagatat ggttgtaact tgtaaccaaa caaaagaaat gagactttga caaaaaaaaa 2300
aaaaaaaaaa aaaaaaaa 2318
<210> 24<211 >523<212> PRT
<213> Nicotiana tabacum cv. Xanthi<400> 24
Met Asn Lys Lys Lys Leu Lys Phe Leu Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn1 5 10 15
Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser Ser His Ser Asp His Phe Arg
20 25 30
His Lys Ser Pro Gln Asn His Phe Pro Asn Thr Gln Asn His Tyr Ser
35 40 45
Leu Ser Glu Asn His His Asp Asn Phe His Ser Ser Val Thr Ser Gln
50 55 60
Tyr Thr Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln65 70 75 80
Asn Pro Asn Val Ser Leu Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly
85 90 95
Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Leu His Gln100 105 110
Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys
115 120 125
Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile
130 135 140
Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu145 150 155 160
Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser Glu Asp Asp Glu Leu Pro Val Phe Lys
165 170 175
Asn Gly Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys
180 185 190
Lys Leu Val Asp Glu Lys Ile Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala
195 200 205
Ile Ser Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val
210 215 220
Gly Ala Asp Glu Phe His Cys Ser Glu Trp Ile Glu Glu Pro Ser Leu225 230 235 240
Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr Val Thr Asp
245 250 255
Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu Pro Ser Arg
260 265 270
Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu Thr Gln Leu Glu Glu
275 280 285
Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn Phe Ser
290 295 300
Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Val Leu Ser Pro Leu Gly Tyr Glu305 310 315 320
Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Thr Glu Thr Ile Asp Cys Asn Gly Ala
325 330 335
Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys Arg Thr Ala Arg
340 345 350
Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Gly Phe Pro Val355 360 365
Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val Leu Phe
370 375 380
Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly Lys Val385 390 395 400
Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp Ser Ile Lys Ser
405 410 415
Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn Gly Leu
420 425 430
Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln Asp Ala
435 440 445
Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile Val Ser
450 455 460
Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu Tyr Arg465 470 475 480
Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu Tyr His
485 490 495
Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val Val Ile Asp
500 505 510
Arg Leu Ser Ser Ile Leu Arg Ser Leu Gly Cys515 520
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<213> Nicotiana tabacum cv. Xanthi<220>
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<221 > 3'UTR<222> (4330)..(4973)<400> 25
agtcagagag agaagaag atg aac aag aaa aag ctg aaa att ctt gtt tct 51
Met Asn Lys Lys Lys Leu Lys Ile Leu Val Ser1 5 10
ctc ttc gct ctc aac tca ate act ctc tat ctc tac ttc tct tcc cac 99
Leu Phe Ala Leu Asn Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser Ser His
15 20 25
cct gat cac ttc cgc cac aaa tcc cgc caa aac cac ttt tcc ttg tcg 147
Pro Asp His Phe Arg His Lys Ser Arg Gln Asn His Phe Ser Leu Ser
30 35 40
gaa aac cgc cat cat aat ttc cac tct tca ate act tct caa tat tcc 195
Glu Asn Arg His His Asn Phe His Ser Ser Ile Thr Ser Gln Tyr Ser
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aag cct tgg cct att ttg ccc tcc tac ctc cct tgg tct caa aac cct 243
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aat gtt gtt tgg aga tcg tgc gag ggt tac ttc ggt aat ggg ttt act 291Asn Val Val Trp Arg Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr
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ctc aaa gtt gac ctt ctc aaa act tcg ccg gag ttt cac cgg aaa ttc 339Leu Lys Val Asp Leu Leu Lys Thr Ser Pro Glu Phe His Arg Lys Phe
95 100 105
ggc gaa aac acc gtc tcc ggc gac ggc gga tgg ttt agg tgt ttt ttc 387
Gly Glu Asn Thr Val Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe
110 115 120
agt gag act ttg cag agt tcg ate tgc gag gga ggc gea ata cga atg 435
Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met
125 130 135
aat ccg gac gag att ttg atg tet cgt gga ggt gag aaa ttg gag tcg 483
Asn Pro Asp Glu Ile Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser
140 145 150 155
gtt att ggt agg agt gaa gat gat gag ctg ccc gtg ttc aaa aat gga 531
Val Ile Gly Arg Ser Glu Asp Asp Glu Leu Pro Val Phe Lys Asn Gly
160 165 170
gct ttt cag att aaa gtt act gat aaa ctg aaa att ggg aaa aaa tta 579
Ala Phe Gln Ile Lys Val Thr Asp Lys Leu Lys Ile Gly Lys Lys Leu
175 180 185
gtg gat gaa aaa ttc ttg aat aaa tac tta ccg gaa ggt gea att tca 627
Val Asp Glu Lys Phe Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Ile Ser
190 195 200
agg cac act atg cgt gag tta att gac tet att cag ttg gtt ggc gcc 675Arg His Thr Met Arg Glu Leu Ile Asp Ser Ile Gln Leu Val Gly Ala
205 210 215
gat gat ttt cac tgt tet gag gttagatttt gaattttgtt tgctctttaa 726Asp Asp Phe His Cys Ser Glu220 225
attaaaggtt tãaactttgt gaatgttggc agatatggaa tacactaatg gatt-ttgttt 786gatctgttta atgaagattg tctagaacct caatgttata aatatggttt ggttgcttca 846ttaattaaag agaattcctt aatatcccga ctagatgoca gataacacca gttagttgac 906ttttggatta ttggttgcat ttcatttgat cagataaatt gttcattctt aaatgtttca 966
ctaaagaatt actcaagatt tcagagttta tatgtaggtg tatgtatttg gaattctgga 1026
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aatagatcaa attcaagggt tgaaaagtaa tactgagtca gaaattaacc actttaactt 1146
ggaaaacggt aaatgtatgt gttctaagat ggttattcct ataacttttg atgtctaata 1206
tggagaaagt gagttgattt atgctttttc cttttccctt tattggtgtt ggtttttaaa 1266
ttctatcaat tcctttgttt gattgctact caaattgaac cttagacgga gtagcaatag 1326
caaaaagtga aggccattct tttctccttt catctcttta tttccgtttg acatacagaa 1386
tatggtagca tctgtctgaa gtggttaatt ttattcctta aaatttgcat aactaattcg 1446
agtaaatgcc ttttgaagct ttagttgaat agttctacaa ctggttgttg cattttgagg 1506
actatcgact tgatttgaca cttgacattg tctgatacat ggcttgtaag ttatgaaaac 1566
ttttatctag gaagaaatcc caaccagaga tagggagctg tcacttggtt atgagctact 1626
ggctcaaagt tcaagtttga ccagttaatt ttagatcttc accaggataa catttagagt 1686
ctaatcaaat tctgaagcag tattgtgcac taataagagg aacacatgaa ggatgtagca 1746
ctactaggtt atgttacctt atttactaat gattgacaac cagcttaaat gatgacaaat 1806
agtcttatat ttgctttttc acattgctca tgacttggga tatttccgaa tcaacatatt 1866
ttagttcttt atgtacttaa ctacttatca aaaaattatc cctgctagat gttagtgttc 1926
aagcaaccat gctagctttt aaggaagctc cttctttgat tcatgccatc tttccgaaat 1986
cgatgcctta cgttactgtc atttttctaa ttttcatttc ag tgg att gag gag 2040
Trp Ile Glu Glu230
ccg tca ctt ttg att aca cga ttt gag tat gca aac ctt ttc cac aca 2088Pro Ser Leu Leu Ile Thr Arg Phe Glu Tyr Ala Asn Leu Phe His Thr
235 240 245
gtt acc gat tgg tat agt gca tac gtg gca tcc agg gtt act ggc ttg 2136Val Thr Asp Trp Tyr Ser Ala Tyr Val Ala Ser Arg Val Thr Gly Leu
250 255 260
ccc agt cgg cca cat ttg gtt ttt gta gat ggc cat tgt gag 2178Pro Ser Arg Pro His Leu Val Phe Val Asp Gly His Cys Glu
265 270 275
gtatgtttga aagtattgat aacgatggca tgcattgtac tgtgttacgg atgaaagaaa 2238
tgaaaccagc aattattttc tagcaggcaa tgctcttgag atgcttgtgt caaattggtc 2298agacttaatc ctgagtttcc atttgtttca gctttctgtt tgactgacta caataattgt 2358
cccaattagg ggtgtcaatg gatattcgaa agccgactaa accgaccgaa ccgtaccgta 2418
ccgattttta ggtttctttt taagaaaccg taggttttta tataaatcta taaccgcacc 2478
gataattagg gtaggttttt tattttataa aaataagccg aaaaaatacc gaaccgtacc 2538
gaataaattt tacatgtgga aaatatattt atttagtaag tttaaaaata ataatgcatt 2598
aaattttctt tgggccatgg aattatgaaa actattacaa gccaacaagt aattagactc 2658
aaaatactaa ttcctaaaac ctattatgtt acttctactt aaactaagtt atttcaagtã 2718
tctttattag caagacacaa agtattctag cgattatgag caaactacaa tgtattgaat 2778
atgtttcctt tcatatattt tagatttatc tttttgaata tttaatcttc tatagactct 2838
attcttgagt cccagcttgg tatatctttc aactcgtgtg atttatattt tctttgcctt 2898
tgtttgattt cttttacgtt gttgtagaat agtcgatgga tctatactct agccatcttt 2958
ctttttcttt ttttaattca tcacctttta aacagtaaaa atgtctaaag aatttttcta 3018
agtcctataa aagaacgtat gttattgcat tctacttcta ctggtgaatt ttacatgata 3078
ttaaaaaatt aaccgaacct taccgctacc gaagagaaac cgacatgatt gggacggttt 3138
cgaaaagtct aattttggtt atacataata gaataaccga aaaattggta tggtacaaat 3198
tttataaaat aaccggccga accgaaccat tgacacccct agtcccaata cctagttgtt 3258
gcagtttgct cattcttact tctatttacg tcactgtttc tctgaatggt ccctttgtgg 3318
tgaaaagagc ttttgctatg tagaaaaact agcaatgatt tcatagctga aacaatttat 3378
ttttacctta catcatgtct tataaaattg cttctaactg tatactttaa ttcttggaga 3438
gatgctttca tgtgaagaaa gttctttcac tccactactg gaagcttgcc gtatgaattt 3498
tacttggcca tattgtggcc gtgctttgat ttatcttcaa attcattttc ttcatatagt 3558
tctttcgagt aattcttttt tcctcttttc tgtttgaaaa aaattcag aca caa ttg 3615
Thr Gln Leu
gag gaa aca tgg aaa gca ctt ttt tca age ctc act tat gct aag aac
3663
Glu Glu Thr Trp Lys Ala Leu Phe Ser Ser Leu Thr Tyr Ala Lys Asn
280
285
290
295
ttt agt ggc cca gtt tgt ttc cgt cat gcc gcc ctc tcg cct ttg gga
3711
Phe Ser Gly Pro Val Cys Phe Arg His Ala Ala Leu Ser Pro Leu Gly
300
305
310
tat.gaa act gcc ctg ttt aag gga ctg tca gaa act ata gat tgt aat
3759
Tyr Glu Thr Ala Leu Phe Lys Gly Leu Ser Glu Thr Ile Asp Cys Asn315 320 325
gga gct tct gcc cat gat ttg tgg caa aat cct gat gat aag aaa act 3807Gly Ala Ser Ala His Asp Leu Trp Gln Asn Pro Asp Asp Lys Lys Thr
330 335 340
gca cgg ttg tcc gag ttt ggg gag atg att agg gca gcc ttt aga ttt 3855Ala Arg Leu Ser Glu Phe Gly Glu Met Ile Arg Ala Ala Phe Arg Phe
345 350 355
cct gtg gat aga cag aac ate cca agg aca gtc aca ggc cct aat gtc 3903Pro Val Asp Arg Gln Asn Ile Pro Arg Thr Val Thr Gly Pro Asn Val360 365 370 375
ctc ttt gtt aga cgt gag gat tat tta gct cac cca cgt cat ggt gga 3951
Leu Phe Val Arg Arg Glu Asp Tyr Leu Ala His Pro Arg His Gly Gly
380 385 390
aag gta cag tct agg ctt age aat gaa gag caa gta ttt gat tcc ata 3999
Lys Val Gln Ser Arg Leu Ser Asn Glu Glu Gln Val Phe Asp Ser Ile
395 400 405
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Lys Ser Trp Ala Leu Asn His Ser Glu Cys Lys Leu Asn Val Ile Asn
410 415 420
gga ttg ttt gcc cac atg tcc atg aaa gag caa gtt cga gca ate caa 4095Gly Leu Phe Ala His Met Ser Met Lys Glu Gln Val Arg Ala Ile Gln
425 430 435
gat gct tct gtc ata gtt ggt gct cat gga gca ggt cta act cac ata 4143Asp Ala Ser Val Ile Val Gly Ala His Gly Ala Gly Leu Thr His Ile440 445 450 455
gtt tct gca gca cca aaa gct gta ata cta gaa att ata age age gaa 4191Val Ser Ala Ala Pro Lys Ala Val Ile Leu Glu Ile Ile Ser Ser Glu
460 465 470
tat agg cgc ccc cat ttt gct ctg att gca caa tgg aaa gga ttg gag 4239Tyr Arg Arg Pro His Phe Ala Leu Ile Ala Gln Trp Lys Gly Leu Glu
475 480 485
tac cat ccc ata tat ttg gag ggg tct tat gcg gat cct cca gtt gtg 4287Tyr His Pro Ile Tyr Leu Glu Gly Ser Tyr Ala Asp Pro Pro Val Val
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ate gac aag ctc age age att ttg agg agt ctt ggg tgc taaatctgct 4336
Ile Asp Lys Leu Ser Ser Ile Leu Arg Ser Leu Gly Cys
505 510 515
cgacagttta gttcgtcttt tctctaaaag actgggaagg atagaggaat tcggggttct 4396ggaacctgga gcctgggaat tgtgtaaaat atgtttcaca cgcagttcta tagtcaattg 4456ctgcaatctg gtgttcataa gcttggaaat ttccagcagc tactaactta ttagcccact 4516ctgactcagt tatggactac cagagcaatc atatcaaatg ggagcatgga atcctgattg 4576tggaatggtg agctcattga agageatatt ctttatggtg ttgaagatta cagttgacga 4636gtaacacgtg tatgtgaaag attaggttgt tacactttct tgcaattcat tgtcaattgt 4696ttttcgtcat tcttattaat gatcatagga taagaacatg agaaaaccat ccatgttctc 4756tgttgttttc ccatcaatct ggccaccctc tttcctcttt atgtagagat gatttcaaca 4816gagtttgttt tgtagttgta atacttgtac tcacagttac tgttttgcat tcatcccatc 4876agatgtcgaa gaagcagatt aacaagaacg tcagtatgat gtttcagtga atatatggtt 4936gtaacttgta accaaacaaa agaaatgaga ctttgac 4973
<210> 26<211> 516<212> PRT
<213> Nicotiana tabacum cv. Xanthi<400> 26
Met Asn Lys Lys Lys Leu Lys Ile Leu Val Ser Leu Phe Ala Leu Asn15 10 15
Ser Ile Thr Leu Tyr Leu Tyr Phe Ser Ser His Pro Asp His Phe Arg
20 25 30
His Lys Ser Arg Gln Asn His Phe Ser Leu Ser Glu Asn Arg His His
35 40 45
Asn Phe His Ser Ser Ile Thr Ser Gln Tyr Ser Lys Pro Trp Pro Ile
50 55 60
Leu Pro Ser Tyr Leu Pro Trp Ser Gln Asn Pro Asn Val Val Trp Arg65 .70 75 80Ser Cys Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Leu Lys Val Asp Leu
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Leu Lys Thr Ser Pro Glu Phe His Arg Lys Phe Gly Glu Asn Thr Val
100 105 110
Ser Gly Asp Gly Gly Trp Phe Arg Cys Phe Phe Ser Glu Thr Leu Gln
115 120 125
Ser Ser Ile Cys Glu Gly Gly Ala Ile Arg Met Asn Pro Asp Glu Ile
130 135 140
Leu Met Ser Arg Gly Gly Glu Lys Leu Glu Ser Val Ile Gly Arg Ser145 150 155 160
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180 185 190
Leu Asn Lys Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Ile Ser Arg His Thr Met Arg
195 200 205
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Ser Leu Gly Cys515

Claims (60)

1. Método para produzir uma célula de planta ou planta Nicotia-na tendo um baixo nível de resíduos de beta^l ,2-xilose sobre N-glicanos li-gadas à proteína compreendendo as etapas de:a) introdução de um gene quimérico em células de planta deuma espécie ou cultivar de Nicotiana para gerar células de planta transgêni-ca, o referido gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos deDNA operavelmente ligados:i) um promotor expressível em planta;ii) uma região de DNA passível de transcrição compreen-dendo:(1) uma primeira região sentido de DNA compreendendouma seqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 de 20 nucleotídeos conse-cutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica umaproteína de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, a referida se-qüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível da referida espécie ou cul-tivar de Nicotiana, em que os referidos pelo menos 19 de 20 nucleotídeosconsecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou culti-var de Nicotiana-específico ou selecionado de uma seqüência de nucleotí-deo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana ouo complemento da mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, de prefe-rência, obtenível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os re-feridos pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelomenos um nucleotídeo de XyIT espécie de Mcoí/ana-específico;(2) uma segunda região de anti-sentido de DNA compreen-dendo uma seqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 nucleotídeos con-secutivos os quais têm pelo menos 95% de identidade de seqüência aocomplemento da referida primeira região de DNA;em que uma molécula de RNA transcrita a partir da referida re-gião de DNA passível de transcrição é capaz de formar uma região de RNAde filamento duplo pelo menos entre uma região de RNA transcrita a partirda referida primeira região de sentido de DNA e uma região de RNA transcritaa partir da referida segunda região de anti-sentido de DNA; eii) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliade-nilação e término de transcrição funcional em plantas;b) opcionalmente, identificação de uma célula de planta Nieotia-na transgênica a qual tem um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilosesobre N-glicanos ligadas à proteína do que uma célula de planta Nicotiananão-transformada;c) opcionalmente, regeneração das referidas células de plantaNicotiana transgênicas para obter plantas Nicotiana transgênicas; ed) opcionalmente, identificação de uma planta Nieotiana trans-gênica a qual tem um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que uma planta Nieotiana não-transformada.
2. Método de acordo com a reivindicação 1 em que o referidoaminoácido de XyIT espécie de Nieotiana-específico é um aminoácido deXyIT Nieotiana benthamiana-específico e a referida espécie Nieotiana é, depreferência, Nieotiana benthamiana.
3. Método de acordo com a reivindicação 1 ou 2 em que a referi-da seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nieotianacompreende uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência de a-mínoácido de SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14.
4. Método de acordo com uma das reivindicações 1 a 3 em queo referido nucleotídeo de Nieotiana espécies de Nieotiana-especíüco é umnucleotídeo de XyIT Nieotiana benthamiana-especíilco e a referida espécieNieotiana é, de preferência, Nieotiana benthamiana.
5. Método de acordo com uma das reivindicações 1 a 4 em quea referida seqüência de nucleotídeo do referido gene de XyIT de Nieotianacompreende a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID NO. 21.
6. Método de acordo com a reivindicação 1, em que o referidoaminoácido de XyIT cultivar de Nieotiana-específico é um aminoácido de X-ylT de Nieotiana tabaeum cv. Petite Havana SR1-específico e o referido cul-tivar de Nieotiana é, de preferência, Nieotiana tabaeum cv. Petite HavanaSR1.
7. Método de acordo com a reivindicação 1 ou 6, em que a refe-rida seqüência de nucleotídeo que codifica a referida proteína de XyIT deNicotiana compreende uma seqüência de nucleotídeo que codifica a se-qüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8 ouSEQ ID NO.: 10.
8. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1, 6ou 7, em que o referido nucleotídeo de XyIT cultivar de Nicotiana-específicoé um nucleotídeo de XyIT de Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1-específico e o referido cultivar de Nicotiana é, de preferência, Nicotiana ta-bacum cv. Petite Havana SR1.
9. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 ou-6 a 8, em que a referida seqüência de nucleotídeo do referido gene de XyITde Nieotiana ou do referido cDNA de XyIT de Nieotiana compreende a se-qüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 8,SEQ ID NO.: 10 ou SEQ ID NO.: 17.
10. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a-9, em que as referidas primeira e segunda regiões de DNA compreendempelo menos 50 nucleotídeos consecutivos.
11. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a-9, em que as referidas primeira e segunda regiões de DNA compreendempelo menos 200 nucleotídeos consecutivos.
12. Método para produzir uma célula de planta ou planta Nieoti-ana tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanosligadas à proteína compreendendo as etapas de:a) fornecimento de uma ou mais moléculas de RNA de filamentoduplo às células de planta ou plantas de uma espécie ou cultivar de Nieotia-na, em que as moléculas de RNA de filamento duplo compreendem dois fi-lamentos de RNA, um filamento de RNA consistindo essencialmente emuma seqüência de núcleo tídeo de RNA de 19 de 20 a 21 nucleotídeos con-secutivos selecionada de uma; seqüência de nucleotídeo que codifica umaproteína de XyIT de Nieotiana, ou o complemento da mesma, a referida se-qüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível da referida espécie ou cul-tivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de 20 a 21 nucleotídeos consecu-tivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar "deNicotiana-específico ou selecionada da seqüência de nucleotídeo de um ge-ne de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana, ou o comple-mento da mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferência, obte-nível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de-20 a 21 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nucleotí-deo de XyIT espécie ou cultivar de Mcoí/ana-específico;b) identificação de uma célula de planta ou planta Nicotianacompreendendo a referida molécula ou moléculas de RNA de filamento du-plo as quais têm um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que a mesma célula de planta ou planta Nico-tiana a qual não compreende a referida molécula ou moléculas de RNA defilamento duplo.
13. Método de acordo com a reivindicação 12, em que o referidoRNA de filamento duplo é fornecido às referidas células de planta ou plantasatravés de integração de um gene quimérico no genoma de células de plantada referida espécie ou cultivar de Nicotiana para gerar células de plantatransgênica e. opcionalmente, regeneração das referidas células de plantapara obter plantas transgênicas, o referido gene quimérico compreendendoos seguintes fragmentos de DNA operavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeoque codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mes-ma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível da referi-da espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de 20 nucleotí-deos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido ou XyIT espécie oucultivar de Mcoí/ana-específico ou selecionada da seqüência de nucleotídeode um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana ou ocomplemento da mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferên-cia, obtenível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referi-dos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menos um nu-cleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-específico,' na orientação anti-sentido;c) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
14. Método de acordo com a reivindicação 12, em que o referidoRNA de filamento duplo é fornecido às referidas células de planta ou plantaatravés de integração de um gene quimérico no genoma das referidas célu-Ias de planta para gerar células de planta transgênica e, opcionalmente, re-generação das referidas células de planta para obter plantas transgênicas, oreferido gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos de DNAoperavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeoque codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mes-ma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível da referi-da espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de 20 nucleotí-deos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie oucultivar de Nicotiana-específico ou seu complemento ou selecionada da se-qüência de nucleotídeo de gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyITde Nicotiana ou o complemento da mesma, a referida seqüência de nucleo-tídeo, de preferência, obtenível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana,em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelomenos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-e specífico, na orienta-ção sentido;c) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
15. Método de acordo com a reivindicação 12, em que o referidoRNA de filamento duplo é fornecido às referidas células de planta ou plantaatravés de integração de um gene quimérico no genoma das referidas célu-las de planta para gerar células de planta transgênica e, opcionalmente, re-generação das referidas células de planta para obter plantas transgênicas, oreferido gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos de DNAoperavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA passível de transcrição compreendendo:i) uma primeira região de DNA compreendendo pelo menos-19 de 20 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complementoda mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível dareferida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de 20 nu-cleotídeos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espé-cie ou cultivar de Nicotiana-específtco ou selecionada da seqüência de nu-cleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotia-na ou o complemento da mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, depreferência, obtenível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em queos referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menosum nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-espectíico, na orientação anti-sentido;ii) uma segunda região de DNA compreendendo pelo menos-19 de 20 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complementoda mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, de preferência, obtenível dareferida espécie ou cultivar de Nicotiana, em que os referidos 19 de 20 nu-cleotídeos consecutivos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espé-cie ou cultivar de Mcof/a/ia-específico ou selecionada da seqüência de nu-cleotídeo de um gene de XyIT de Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotia-na ou o complemento da mesma, a referida seqüência de nucleotídeo, depreferência, obtenível da referida espécie ou cultivar de Nicotiana, em queos referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelo menosum nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-especíüco, na orientação sen-tido, pelo que uma molécula de RNA produzida através de transcrição dareferida região de DNA passível de transcrição é capaz de formar uma regi-ão de RNA de filamento duplo através de emperalhamento de base pelomenos entre uma região de RNA correspondendo à referida primeira regiãode DNA e uma região de RNA correspondendo à referida segunda região deRNA; ec) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
16. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 15, em que o referido aminoácido de XyIT espécie de Nicotiana-espectíicoé um aminoácido de XyIT Nicotiana benthamiana-espectíico e a referida es-pécie de Nicotiana é, de preferência, Nicotiana benthamiana.
17. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 16, em que a referida seqüência de nucleotídeo que codifica uma proteínade XyIT de Nicotiana compreende uma seqüência de nucleotídeo que codifi-ca a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14.
18. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 17, em que o referido nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-espectíicoé um nucleotídeo de XyIT de Nicotiana benthamiana-espectítco e a referidaespécie de Nieotiana é, de preferência, Nieotiana benthamiana.
19. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 18, em que a referida seqüência de nucleotídeo do referido gene de XyITde Nieotiana compreende a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 11,SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID No. 21.
20. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 15 em que o referido aminoácido de XyIT cultiva de Nicotiana-espectíico éum aminoácido de XyIT Nicotiana tabacum cv. Petite Havana SR1-específicoe o referido cultivar de Nicotiana é, de preferência, Nicotiana tabacum cv.Petite Havana SR1.
21. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 15 ou 20 em que a referida seqüência de nucleotídeo que codifica a referi-da proteína de XyIT de Nicotiana compreende uma seqüência de nucleotí-deo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQ ID NO.:- 6, SEQ ID NO.: 8 ou SEQ ID NO.: 10.
22. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 15, 20 ou 21 em que o referido nucleotídeo de XyIT cultivar de Nieotiana-específico é um nucleotídeo de Nicotiana Nicotiana tabacum cv. Petite Ha-vana SR1 -específico e o referido cultivar de Nicotiana é, de preferência, Ni-cotiana tabacum cv. Petite Havana SR1.
23. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 12a 15 ou 20 a 22 em que a referida seqüência de nucleotídeo do referido ge-ne de XyIT de Nicotiana ou o referido cDNA de XyIT de Nicotiana compreen-de a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ IDNO.: 8, SEQ ID NO.: 10 ou SEQ ID NO.: 17.
24. Método para produzir uma célula de planta ou planta 1 Nico-tiana tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanosligadas à proteína compreendendo as etapas de:a) identificação de um fragmento de uma proteína de XyIT quecodifica uma seqüência de DNA obtenível de uma primeira espécie ou culti-var de Nicotiana usando um meio selecionado do seguinte grupo:i) um fragmento de DNA compreendendo uma seqüência denucleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:- 14, para uso como uma sonda;ii) um fragmento de DNA compreendendo a seqüência denucleotídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ IDNO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17ou SEQ ID NO.: 21, para uso como uma sonda;iii) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 1513 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, parauso como uma sonda;iv) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ IDNO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14 para uso como uma sonda;v) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo de qual-quer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9,SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21 parauso como uma sonda;vi) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüênciade nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivosselecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência deaminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, para uso como um inicia-dor em uma reação de PCR;vii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüênciade nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivosselecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência deaminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ IDNO.: 14 , para uso como um iniciador em uma reação de PCR;viii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüên-cia de nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecuti-vos selecionada da seqüência de nucleotídeo de qualquer uma de SEQ IDNO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11,SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21, para uso como uminiciador em uma reação de PCR; ouix) um oligonucleotídeo tendo a seqüência de nucleotídeo dequalquer uma de SEQ ID NO.: 1, SEQ ID NO.: 2, SEQ ID NO.: 15 ou SEQ IDNO.: 16, SEQ ID NO.: 19 ou SEQ ID No.20 para uso como um iniciador emuma reação de PCR;b) fornecimento de uma ou mais moléculas de RNA de filamentoduplo às células de planta ou plantas das referidas primeira ou segunda es-pécie ou cultivar de Nicotiana, em que as referidas moléculas de RNA defilamento duplo compreendem duas fitas de RNA, uma fita de RNA consis-tindo essencialmente em uma seqüência de nucleotídeo de RNA de 20 a 21nucleotídeos consecutivos selecionada de uma seqüência de nucleotídeo dareferida proteína de XyIT que codifica um fragmento de DNA ou o comple-mento da mesma, em que os referidos 20 a 21 nucleotídeos consecutivoscodificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotia-na-específico, respectivamente ou em que os referidos 20 a 21 nucleotídeosconsecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de Nicotiana espé-cie ou cultivar de Mcoí/ana-específico, respectivamente; ec) identificação de uma célula de planta ou planta Nicotianacompreendendo a referida molécula ou moléculas de RNA de filamento du-plo a qual tem um menor nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que a mesma célula de planta ou planta deNicotiana, a qual não compreende a referida molécula ou moléculas de RNAde filamento duplo.
25. Método de acordo com a reivindicação 24, em que o forne-cimento da referida molécula ou moléculas de RNA de filamento duplo é ob-tida através de fornecimento, às referidas células de planta ou plantas, deuma molécula ou moléculas de RNA de filamento duplo compreendendouma primeira seqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 de 20 nucleotí-deos consecutivos selecionada da seqüência de nucleotídeo de a referidaproteína de XyIT que codifica um fragmento de DNA ou o complemento damesma, em que os referidos pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecuti-vos codificam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Ni-cotiana-específico ou em que os referidos pelo menos 19 de 20 nucleotídeosconsecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie oucultivar de Mcoí/ana-específico e uma segunda seqüência de nucleotídeo aqual é o complemento da referida primeira seqüência de nucleotídeo.
26. Método de acordo com a reivindicação 24, em que as referi-das moléculas de RNA de filamento duplo são fornecidas às referidas célu-las de planta ou plantas através de integração de um DNA quimérico no ge-noma das referidas células de planta para gerar células de planta transgêni-ca e, opcionalmente, regeneração das referidas células de planta para obterplantas transgênicas, o referido DNA quimérico compreendendo os seguin-tes fragmentos de DNA operaveimente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA passível de transcrição compreendendo:i) uma primeira região de DNA sentido compreendendo umaseqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecuti-vos selecionada da seqüência de nucleotídeo da referida proteína de XyITque codifica um fragmento de DNA ou o complemento da mesma, em que osreferidos pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelomenos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Mcof/ana-específico,respectivamente ou em que os referidos pelo menos 19 de 20 nucleotídeosconsecutivos compreendem pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie oucultivar de Nicotiana-especitico, respectivamente;ii) uma segunda região de anti-sentido de DNA compreen-dendo uma seqüência de nucleotídeo de pelo menos 19 nucleotídeos con-secutivos a qual têm pelo menos 95% de identidade de seqüência ao com-plemento da referida primeira região de DNA;em que uma molécula de RNA transcrita a partir da referida re-gião passível é transcrição é capaz de formar uma região de RNA de fila-mento duplo pelo menos entre uma região de RNA transcrita a partir da refe-rida primeira região de sentido de DNA e uma região de RNA transcrita apartir da referida segunda região de anti-sentido de DNA; ec) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
27. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a-26, ainda compreendendo a etapa de cruzamento da referida planta Nicotia-na tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos li-gadas à proteína com outra planta Nicotiana para obter plantas de prole Ni-cotiana tendo um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanosligadas à proteína.
28. Método para identificar um fragmento de DNA de XyIT deNicotiana compreendendo as etapas de:a) fornecimento de DNA genômico ou cDNA obtenível de umaespécie ou cultivar de Nicotiana;b) seleção de um meio do seguinte grupo:i) um fragmento de DNA compreendendo uma seqüência denucleotídeo que codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:-14, para uso como uma sonda;ii) um fragmento de DNA compreendendo a seqüência denucleotídeo de qualquer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ IDNO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17ou SEQ ID NO.: 21, para uso como uma sonda;iii) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 1513 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, parauso como uma sonda;iv) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codi-fica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ IDNO.: 12 ou SEQ ID NO.: 14 para uso como uma sonda;v) um fragmento de DNA ou oligonucleotídeo compreenden-do uma seqüência de nucleotídeo consistindo em entre 20 a 3574 nucleotí-deos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeo de qual-quer uma de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9,SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21 parauso como uma sonda;vi) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüênciade nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivosselecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência deaminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.: 6, para uso como um inicia-dor em uma reação de PCR;vii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüênciade nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecutivosselecionados de uma seqüência de nucleotídeo que codifica a seqüência deaminoácido de SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ IDNO.: 14 , para uso como um inicíador em uma reação de PCR;viii) uma seqüência de oligonucleotídeo tendo uma seqüên-cia de nucleotídeo compreendendo entre 20 a 200 nucleotídeos consecuti-vos selecionada da seqüência de nucleotídeo de qualquer uma de SEQ IDNO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11,SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21, para uso como uminiciador em uma reação de PCR; ouix) um oligonucleotídeo tendo a seqüência de nucleotídeo dequalquer uma de SEQ ID NO.: 1, SEQ ID NO.: 2, SEQ ID NO.: 15 ou SEQ IDNO.: 16, SEQ ID NO.: 19 ou SEQ ID No.20 para uso como um iniciador emuma reação de PCR;c) identificação de um fragmento de DNA de XyIT da referidaespécie ou cultivar de Nicotiana realizando uma PCR usando o referido DNAgenômico ou o referido cDNA e os referidos iniciadores ou realizando hibridi-zação usando o referido DNA genômico ou o referido cDNA e as referidassondas.
29. Método para isolar um fragmento de DNA de XyIT de Nieoti-ana compreendendo as etapas de:a) identificação do referido fragmento de DNA de XyIT de Nicoti-ana de acordo com o método como definido na reivindicação 28; eb) isolamento do referido fragmento de DNA de XyIT de Nieotia-na.
30. Método para identificar um alelo de XyIT de Nieotiana corre-lacionado a um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanosligadas à proteína compreendendo as etapas de:(a) fornecimento de uma população, opcionalmente uma popula-ção com mutação, de diferentes linhagens de planta de uma espécie ou cul-tivar de Nicotiana;(b) identificação, em cada linhagem de planta, da referida popu-lação de um alelo de XyIT de Nicotiana de acordo com o método como defi-nido na reivindicação 28;(c) análise do nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína de cada linhagem de planta da referida popula-ção e identificação daquelas linhagens de planta tendo um menor nível deresíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína do que ou-tras linhagens de planta;(d) correlação do baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose so-bre N-glicanos ligadas à proteína na linhagem de planta com relação à pre-sença de um alelo de XyIT de Nicotiana.
31. Método para obter uma célula de planta ou planta Nicotianacom um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadasà proteína compreendendo as etapas de:a) identificação de um alelo de XyIT de Nicotiana correlacionadoa um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas àproteína de acordo com o método como definido na reivindicação 30;b) introdução do referido alelo de XyIT de Nicotiana em uma Ii-nhagem de planta Nicotiana de escolha.
32. Fragmento de DNA isolado que codifica uma proteína com-preendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:ou qualquer parte da mesma que codifica pelo menos um aminoácido deXyIT Nicotiana benthamiana-específico.
33. Fragmento de DNA específico de acordo com a reivindicação-32, compreendendo a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 11, SEQ IDNO.: 13 ou SEQ ID NO.: 21 ou qualquer parte da mesma compreendendopelo menos um nucleotídeo de XyIT Nicotiana benthamiana-especíüco.
34. Fragmento de DNA isolado que codifica uma proteína com-preendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4 ou SEQ ID NO.:-6, SEQ ID NO.: 8,. SEQ ID NO.: 10 ou qualquer parte da mesma que codifi-cam pelo menos um aminoácido de XyIT Nicotiana tabacum cv. Petite Hava-na SR1-específico.
35. Fragmento de DNA isolado de acordo com a reivindicação 34, compreendendo a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3 ou SEQID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.: 9 ou SEQ ID NO.: 17 ou qualquerparte da mesma compreendendo pelo menos um nucleotídeo de XyIT Nico-tiana tabacum cv. Petite Havana SR1 -específico.
36. Fragmento de DNA isolado obtenível através do método co-mo definido na reivindicação 28 que codifica pelo menos um aminoácido deXyIT espécie de Nicotiana- ou cultivar de Nicotiana-específtco.
37. Fragmento de DNA isolado de acordo com a reivindicação 36, compreendendo pelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nieotia-na- ou cultivar de Nicotiana-específico.
38. Gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos deDNA operavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA passível de transcrição compreendendo:i) uma primeira região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complementoda mesma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codifi-cam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específico ou selecionada da seqüência de nucleotídeo de um gene de XyITde Nieotiana ou um cDNA de XyIT de Nieotiana ou o complemento da mes-ma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendempelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-e specífico, na ori-entação de sentido;ii) uma segunda região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica uma proteína de XyIT de Nieotiana ou o complementoda mesma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codifi-cam pelo menos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nieotiana-específico ou selecionada da seqüência de nucleotídeo de um gene de XyITde Nicotiana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mes-ma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendempelo menos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-específico, na ori-entação de sentido, pelo que uma molécula de RNA produzida através detranscrição da referida região de DNA passível de transcrição é capaz deformação de uma região de RNA de filamento duplo através de emparelha-mento de base pelo menos entre uma região de RNA correspondendo à re-ferida primeira região de DNA e uma região de RNA correspondendo à refe-rida segunda região de RNA; ec) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
39. Gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos deDNA operavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeoque codifica uma proteína de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mes-ma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelomenos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específlcoou selecionada da seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nieoti-ana ou um cDNA de XyIT de Nieotiana ou o complemento da mesma, emque os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelomenos um nucleotídeo de XyIT espécie de /V/cof/ana-específico, na orienta-ção de sentido; ec) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
40. Gene quimérico compreendendo os seguintes fragmentos deDNA operavelmente ligados:a) um promotor expressível em planta;b) uma região de DNA compreendendo pelo menos 19 de 20nucleotídeos consecutivos selecionados de uma seqüência de nucleotídeoque codifica uma proteína de XyIT de Nieotiana ou o complemento da mes-ma, em que os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos codificam pelomenos um aminoácido de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-específicoou selecionada da seqüência de nucleotídeo de um gene de XyIT de Nicoti-ana ou um cDNA de XyIT de Nicotiana ou o complemento da mesma, emque os referidos 19 de 20 nucleotídeos consecutivos compreendem pelomenos um nucleotídeo de XyIT espécie de Nicotiana-espec\T\co, na orienta-ção de anti-sentido; ec) uma região de DNA compreendendo um sinal de poliadenila-ção e de término de transcrição funcional em plantas.
41. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 40, em que o referido aminoácido de XyIT espécie de Nieotiana-específico é um aminoácido de XyIT Nicotiana bentamiana-especíilco.
42. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 41, em que a referida seqüência de nucleotídeo que codifica umaproteína de XyIT de Nieotiana compreende uma seqüência de nucleotídeoque codifica a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:14.
43. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 42 em que o referido nucleotídeo de XyIT espécie de Nieotiana-específico é um nucleotídeo de XyIT Nieotiana bentamiana-específico.
44. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 43 em que a referida seqüência de nucleotídeo do referido genede XyIT de Nieotiana compreende a seqüência de nucleotídeo de SEQ IDNO.: 11, SEQ ID NO.: 13 ou SEQ ID No. 21.
45. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 40, em que o referido aminoácido de XyIT cultivar de Nieotiana-específico é um aminoácido de XyIT Nieotiana tabaeum cv. Petite HavanaSR1-específico.
46. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 40 ou 45, em que a referida seqüência de nucleotídeo que codificaa referida proteína de XyIT de Nicotiana compreende uma seqüência de nu-cleotídeo que codifica a seqüência de aminoácidò de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8 ou SEQ ID NO.: 10.
47. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 40, 45 ou 46, em que o referido nucleotídeo de XyIT cultivar deNicotiana-específico é um nucleotídeo de XyIT Nicotiana tabacum cv. PetiteHavana SR1 -específico.
48. Gene quimérico de acordo com qualquer uma das reivindica-ções 38 a 40 ou 45 a 47, em que a referida seqüência de nucleotídeo do re-ferido gene de XyIT de Nicotiana ou o referido cDNA de XyIT de Nicotianacompreende a seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5,SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10 ou SEQ ID NO.: 17.
49. Célula de planta Nicotiana compreendendo o gene quiméricocomo definido em qualquer uma das reivindicações 38 a 48.
50. Planta Nieotiana consistindo essencialmente nas células deplanta Nieotiana como definidas na reivindicação 49.
51. Célula de planta ou planta Nieotiana obtida através do méto-do como definido na reivindicação 31.
52. Semente de uma planta Nieotiana como definida na reivindi-cação 50 ou 51.
53. Uso de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma pro-teína compreendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:-14 ou qualquer parte da mesma compreendendo pelo menos 19 de 20 nu-cleotídeos consecutivos que codificam pelo menos um aminoácido de XyITespécie ou cultivar de Nieotiana-especfílco para diminuir o nível de resíduosde beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma planta Nieotiana.
54. Uso de uma seqüência de nucleotídeo compreendendo aseqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7,SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQID NO.: 21 ou qualquer parte da mesma compreendendo pelo menos 19 de-20 nucleotídeos consecutivos compreendendo pelo menos um nucleotídeode XyIT espécie ou cultivar de Mcof/a/ia-específico, para diminuir o nível deresíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em umaplanta Nicotiana.
55. Uso de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma pro-teína compreendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:-14 ou qualquer parte da mesma que codifica pelo menos um aminoácido deXyIT espécie ou cultivar de Mcof/ana-específico, para identificar um gene deXyIT ou cDNA de XyIT em uma espécie ou cultivar de Nicotiana.
56. Uso de uma seqüência de nucleotídeo compreendendo aseqüência da SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7, SEQ ID NO.:-9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQ ID NO.: 21,ou qualquer parte das mesmas, compreendendo pelo menos um nucleotídeoXyIT espécie ou cultivar-específico de Nicotiana, pra identificar um gene XyITou um CDNA XyIT em uma espécie ou cultivar Nicotiana.
57. Uso de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma pro-teína compreendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEQ ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:-14 ou qualquer parte da mesma que codifica pelo menos um aminoácido deXyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-especíiico, para identificar um alelo deum gene XyIT correlacionado a um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma espécie ou cultivar deNicotiana.
58. Uso de uma seqüência de nucleotídeo compreendendo aseqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7,SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQID NO.: 21 ou qualquer parte da mesma compreendendo pelo menos umnucleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-especíi\co, para identi-ficar um alelo de um gene XyiT correlacionado a um baixo nível de resíduosde beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma espécie oucultivar de Nicotiana.
59. Uso de uma seqüência de nucleotídeo que codifica uma pro-teína compreendendo a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO.: 4, SEQID NO.: 6, SEQ ID NO.: 8, SEO ID NO.: 10, SEQ ID NO.: 12 ou SEQ ID NO.:- 14 ou qualquer parte da mesma que codificam pelo menos um aminoácidode XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-especíüco, para introduzir um alelode um gene XyIT correlacionado a um baixo nível de resíduos de beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma espécie ou cultivar deNicotiana.
60. Uso de uma seqüência de nucleotídeo compreendendo aseqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO.: 3, SEQ ID NO.: 5, SEQ ID NO.: 7,SEQ ID NO.: 9, SEQ ID NO.: 11, SEQ ID NO.: 13, SEQ ID NO.: 17 ou SEQID NO.: 21 ou qualquer parte da mesma compreendendo pelo menos umnucleotídeo de XyIT espécie ou cultivar de Nicotiana-especítico, para intro-duzir um alelo de um gene XyITcorrelacionado a um baixo nível de resíduosde beta-1,2-xilose sobre N-glicanos ligadas à proteína em uma espécie oucultivar de Nicotiana.
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Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20100154081A1 (en) * 2007-05-21 2010-06-17 Bayer Bioscience N.V. Methods and means for producing glycoproteins with altered glycosylation pattern in higher plants
EP2205728A1 (en) * 2007-10-31 2010-07-14 Bayer BioScience N.V. Method to produce modified plants with altered n-glycosylation pattern
CA2765287C (en) * 2009-06-15 2018-12-11 Bayer Bioscience N.V. Nicotiana benthamiana plants deficient in xylosyltransferase activity
WO2011117249A1 (en) * 2010-03-22 2011-09-29 Philip Morris Products S.A. Modifying enzyme activity in plants
EP2551348B1 (en) 2011-07-29 2014-09-24 Icon Genetics GmbH Production of galactosylated N-glycans in plants
JP6104252B2 (ja) 2011-10-04 2017-03-29 アイコン・ジェネティクス・ゲーエムベーハー フコシルトランスフェラーゼ活性が欠損したニコチアナ・ベンサミアナ植物
CN103954701B (zh) * 2014-04-15 2015-12-09 华南农业大学 利用HPLC检测木聚糖合成中β-1,4-木糖转移酶活性的方法
CN103952414A (zh) * 2014-05-22 2014-07-30 中南民族大学 一种烟草糖基转移酶诱导型启动子及其应用
EP3548612A4 (en) 2016-12-01 2020-04-15 Plantform Corporation TRANSGENIC PLANT WITH REDUCED FUCOSYL TRANSFERASE AND XYLOSYL TRANSFERASE ACTIVITY

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AT409381B (de) * 2000-03-03 2002-07-25 Gloessl Josef Dr Xylosyltransferase-gen
WO2005047300A2 (en) * 2003-11-10 2005-05-26 University Of Utah Research Foundation Improved methods and compositions for rna interference
US20050166289A1 (en) * 2003-12-01 2005-07-28 North Carolina State University Small interfering RNA (siRNA)-mediated heritable gene manipulation in plants

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