BE1030647A1 - Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires - Google Patents
Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires Download PDFInfo
- Publication number
- BE1030647A1 BE1030647A1 BE20225483A BE202205483A BE1030647A1 BE 1030647 A1 BE1030647 A1 BE 1030647A1 BE 20225483 A BE20225483 A BE 20225483A BE 202205483 A BE202205483 A BE 202205483A BE 1030647 A1 BE1030647 A1 BE 1030647A1
- Authority
- BE
- Belgium
- Prior art keywords
- composition
- microorganisms
- sampling
- content
- weight
- Prior art date
Links
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 94
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 60
- 238000005070 sampling Methods 0.000 title claims description 82
- 230000008569 process Effects 0.000 claims abstract description 20
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 13
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 124
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 35
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 35
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 claims description 35
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 31
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims description 17
- 239000003761 preservation solution Substances 0.000 claims description 16
- 239000003352 sequestering agent Substances 0.000 claims description 16
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims description 12
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims description 10
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 10
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 claims description 10
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 9
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 9
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 claims description 8
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 8
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 claims description 7
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 claims description 7
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 claims description 7
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 claims description 7
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 claims description 7
- 108010059892 Cellulase Proteins 0.000 claims description 6
- 239000003945 anionic surfactant Substances 0.000 claims description 6
- 229940106157 cellulase Drugs 0.000 claims description 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 6
- 102100032487 Beta-mannosidase Human genes 0.000 claims description 5
- 229920001214 Polysorbate 60 Polymers 0.000 claims description 5
- 108010055059 beta-Mannosidase Proteins 0.000 claims description 5
- 238000010876 biochemical test Methods 0.000 claims description 5
- 150000002327 glycerophospholipids Chemical class 0.000 claims description 5
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims description 5
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 5
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 5
- JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N (2r,3r,4s)-2-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-3,4-diol Chemical class OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N 0.000 claims description 4
- 108010029541 Laccase Proteins 0.000 claims description 4
- 238000004321 preservation Methods 0.000 claims description 4
- 229940023144 sodium glycolate Drugs 0.000 claims description 4
- 239000007921 spray Substances 0.000 claims description 4
- JEJAMASKDTUEBZ-UHFFFAOYSA-N tris(1,1,3-tribromo-2,2-dimethylpropyl) phosphate Chemical compound BrCC(C)(C)C(Br)(Br)OP(=O)(OC(Br)(Br)C(C)(C)CBr)OC(Br)(Br)C(C)(C)CBr JEJAMASKDTUEBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 3
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 claims description 3
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 claims description 3
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 claims description 2
- 241001084338 Listeria sp. Species 0.000 claims description 2
- 241000607149 Salmonella sp. Species 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 238000010894 electron beam technology Methods 0.000 claims description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 claims description 2
- 230000005251 gamma ray Effects 0.000 claims description 2
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 claims description 2
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 claims description 2
- BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N nicotinamide-adenine dinucleotide Chemical compound C1=CCC(C(=O)N)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)O)O1 BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N 0.000 claims description 2
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 claims description 2
- 102000016938 Catalase Human genes 0.000 claims 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 35
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 19
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 15
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 10
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 10
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 9
- 108090000787 Subtilisin Proteins 0.000 description 9
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 9
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 8
- -1 carboxymethyl inulin Chemical compound 0.000 description 7
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 7
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 7
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 7
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 6
- QCDWFXQBSFUVSP-UHFFFAOYSA-N 2-phenoxyethanol Chemical compound OCCOC1=CC=CC=C1 QCDWFXQBSFUVSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 5
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 5
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 5
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 5
- 229960005323 phenoxyethanol Drugs 0.000 description 5
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 5
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 5
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 4
- MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N aebsf Chemical compound NCCC1=CC=C(S(F)(=O)=O)C=C1 MGSKVZWGBWPBTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003139 biocide Substances 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 4
- 238000012009 microbiological test Methods 0.000 description 4
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 3
- 239000004744 fabric Substances 0.000 description 3
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 3
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 3
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 3
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- CHHHXKFHOYLYRE-UHFFFAOYSA-M 2,4-Hexadienoic acid, potassium salt (1:1), (2E,4E)- Chemical compound [K+].CC=CC=CC([O-])=O CHHHXKFHOYLYRE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 2
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 2
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 2
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 2
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M Fluoride anion Chemical compound [F-] KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 2
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- LLEMOWNGBBNAJR-UHFFFAOYSA-N biphenyl-2-ol Chemical group OC1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 LLEMOWNGBBNAJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- PGRHXDWITVMQBC-UHFFFAOYSA-N dehydroacetic acid Chemical compound CC(=O)C1C(=O)OC(C)=CC1=O PGRHXDWITVMQBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N methylparaben Chemical compound COC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 2
- 235000010241 potassium sorbate Nutrition 0.000 description 2
- 239000004302 potassium sorbate Substances 0.000 description 2
- 229940069338 potassium sorbate Drugs 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- YPFDHNVEDLHUCE-UHFFFAOYSA-N propane-1,3-diol Chemical compound OCCCO YPFDHNVEDLHUCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004063 propylene glycol Drugs 0.000 description 2
- 235000013772 propylene glycol Nutrition 0.000 description 2
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003001 serine protease inhibitor Substances 0.000 description 2
- ASEFUFIKYOCPIJ-UHFFFAOYSA-M sodium;2-dodecoxyethyl sulfate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOCCOS([O-])(=O)=O ASEFUFIKYOCPIJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- IBLKWZIFZMJLFL-UHFFFAOYSA-N 1-phenoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COC1=CC=CC=C1 IBLKWZIFZMJLFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 2,3,9,10-tetramethoxy-6,8,13,13a-tetrahydro-5H-isoquinolino[2,1-b]isoquinoline Chemical compound C1CN2CC(C(=C(OC)C=C3)OC)=C3CC2C2=C1C=C(OC)C(OC)=C2 AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHVLDKHFGIVEIP-UHFFFAOYSA-N 2-bromo-2-(bromomethyl)pentanedinitrile Chemical compound BrCC(Br)(C#N)CCC#N DHVLDKHFGIVEIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PORQOHRXAJJKGK-UHFFFAOYSA-N 4,5-dichloro-2-n-octyl-3(2H)-isothiazolone Chemical compound CCCCCCCCN1SC(Cl)=C(Cl)C1=O PORQOHRXAJJKGK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940090248 4-hydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- LVDKZNITIUWNER-UHFFFAOYSA-N Bronopol Chemical compound OCC(Br)(CO)[N+]([O-])=O LVDKZNITIUWNER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009631 Broth culture Methods 0.000 description 1
- 102100035882 Catalase Human genes 0.000 description 1
- GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N Chlorhexidine Chemical compound C=1C=C(Cl)C=CC=1NC(N)=NC(N)=NCCCCCCN=C(N)N=C(N)NC1=CC=C(Cl)C=C1 GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- PHOQVHQSTUBQQK-SQOUGZDYSA-N D-glucono-1,5-lactone Chemical group OC[C@H]1OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O PHOQVHQSTUBQQK-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 1
- 239000004287 Dehydroacetic acid Substances 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 108090000371 Esterases Proteins 0.000 description 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010000540 Hexosaminidases Proteins 0.000 description 1
- 102000002268 Hexosaminidases Human genes 0.000 description 1
- 101001111742 Homo sapiens Rhombotin-2 Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 229920001202 Inulin Polymers 0.000 description 1
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 description 1
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 1
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 1
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 1
- 241000231286 Neottia Species 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- HLCFGWHYROZGBI-JJKGCWMISA-M Potassium gluconate Chemical compound [K+].OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O HLCFGWHYROZGBI-JJKGCWMISA-M 0.000 description 1
- 239000004146 Propane-1,2-diol Substances 0.000 description 1
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 1
- 102100023876 Rhombotin-2 Human genes 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- XEFQLINVKFYRCS-UHFFFAOYSA-N Triclosan Chemical compound OC1=CC(Cl)=CC=C1OC1=CC=C(Cl)C=C1Cl XEFQLINVKFYRCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 229940100198 alkylating agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 150000001541 aziridines Chemical class 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 235000015278 beef Nutrition 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960004365 benzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000013361 beverage Nutrition 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229960003168 bronopol Drugs 0.000 description 1
- 239000004227 calcium gluconate Substances 0.000 description 1
- 235000013927 calcium gluconate Nutrition 0.000 description 1
- 229960004494 calcium gluconate Drugs 0.000 description 1
- NEEHYRZPVYRGPP-UHFFFAOYSA-L calcium;2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanoate Chemical compound [Ca+2].OCC(O)C(O)C(O)C(O)C([O-])=O.OCC(O)C(O)C(O)C(O)C([O-])=O NEEHYRZPVYRGPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 229960003260 chlorhexidine Drugs 0.000 description 1
- 125000004218 chloromethyl group Chemical group [H]C([H])(Cl)* 0.000 description 1
- MXOAEAUPQDYUQM-UHFFFAOYSA-N chlorphenesin Chemical compound OCC(O)COC1=CC=C(Cl)C=C1 MXOAEAUPQDYUQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004106 citric acid Drugs 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000019258 dehydroacetic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940061632 dehydroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000000151 deposition Methods 0.000 description 1
- 239000000645 desinfectant Substances 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- MUCZHBLJLSDCSD-UHFFFAOYSA-N diisopropyl fluorophosphate Chemical compound CC(C)OP(F)(=O)OC(C)C MUCZHBLJLSDCSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- AFOSIXZFDONLBT-UHFFFAOYSA-N divinyl sulfone Chemical class C=CS(=O)(=O)C=C AFOSIXZFDONLBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 150000002118 epoxides Chemical class 0.000 description 1
- 230000003628 erosive effect Effects 0.000 description 1
- BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N ethenylcyclopentane Chemical compound C=CC1CCCC1 BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001617 ethyl hydroxybenzoate Drugs 0.000 description 1
- 235000010228 ethyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 239000004403 ethyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- SFNALCNOMXIBKG-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol monododecyl ether Chemical compound CCCCCCCCCCCCOCCO SFNALCNOMXIBKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NUVBSKCKDOMJSU-UHFFFAOYSA-N ethylparaben Chemical compound CCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 NUVBSKCKDOMJSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010408 film Substances 0.000 description 1
- 125000004216 fluoromethyl group Chemical group [H]C([H])(F)* 0.000 description 1
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 1
- 235000012209 glucono delta-lactone Nutrition 0.000 description 1
- 239000000182 glucono-delta-lactone Substances 0.000 description 1
- 229960003681 gluconolactone Drugs 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 125000000623 heterocyclic group Chemical class 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 229940029339 inulin Drugs 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 description 1
- 150000002596 lactones Chemical class 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 235000010270 methyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 239000004292 methyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 229960002216 methylparaben Drugs 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 239000010813 municipal solid waste Substances 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 231100001160 nonlethal Toxicity 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 235000010292 orthophenyl phenol Nutrition 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- GJLNWLVPAHNBQN-UHFFFAOYSA-N phenyl 4-hydroxybenzoate Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C(=O)OC1=CC=CC=C1 GJLNWLVPAHNBQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N phosphatidylcholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N 0.000 description 1
- 125000005499 phosphonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000005954 phosphonylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 229940068968 polysorbate 80 Drugs 0.000 description 1
- 239000004224 potassium gluconate Substances 0.000 description 1
- 235000013926 potassium gluconate Nutrition 0.000 description 1
- 229960003189 potassium gluconate Drugs 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 235000010232 propyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 239000004405 propyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 239000011241 protective layer Substances 0.000 description 1
- 239000003531 protein hydrolysate Substances 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000008261 resistance mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000000176 sodium gluconate Substances 0.000 description 1
- 235000012207 sodium gluconate Nutrition 0.000 description 1
- 229940005574 sodium gluconate Drugs 0.000 description 1
- 229940057950 sodium laureth sulfate Drugs 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 235000010199 sorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004334 sorbic acid Substances 0.000 description 1
- 229940075582 sorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 229910001220 stainless steel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010935 stainless steel Substances 0.000 description 1
- 230000006103 sulfonylation Effects 0.000 description 1
- 238000005694 sulfonylation reaction Methods 0.000 description 1
- OBTWBSRJZRCYQV-UHFFFAOYSA-N sulfuryl difluoride Chemical class FS(F)(=O)=O OBTWBSRJZRCYQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940095064 tartrate Drugs 0.000 description 1
- 150000004867 thiadiazoles Chemical class 0.000 description 1
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 229960003500 triclosan Drugs 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/25—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving enzymes not classifiable in groups C12Q1/26 - C12Q1/66
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/02—Devices for withdrawing samples
- G01N2001/028—Sampling from a surface, swabbing, vaporising
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Procédé de prélèvement de microorganismes sur des surfaces, pour la détection et l'analyse en laboratoire ultérieures.
Description
PROCEDE D'ECHANTILLONNAGE DE MICROORGANISMES SUR DES SURFACES
INDUSTRIELLES AGRO-ALIMENTAIRES
Domaine technique
La présente invention se rapporte à un procédé d'échantillonnage, de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes sur des surfaces (industrielles et/ou agro-alimentaires et/ou de collectivités), qui soit non létal et compatible avec plusieurs tests ultérieurs, pour la détection et l'analyse en laboratoire ultérieures.
L'art antérieur
Dans de nombreux domaines d'activités comme les secteurs agroalimentaires, les collectivités, les secteurs médicaux et vétérinaires, des contaminations problématiques dues à la présence de microorganismes sont observées très fréquemment.
Classiquement, dans les hôpitaux et dans les cabinets médicaux ou vétérinaires, la présence de microorganismes est responsable de maladies nosocomiales tandis qu'en agroalimentaire et en collectivité, ces microorganismes sont responsables de la dégradation de denrées périssables mais aussi du transfert de contaminants vers les consommateurs des produits issus par exemple d'une chaîne de production de viande, de fruits, de légumes ou autres.
Or, de nos jours, des normes strictes en matière d'hygiène sont imposées et il convient donc de s'assurer que le nombre de microorganismes responsables de telles contaminations soit maintenu sous une valeur seuil acceptable, cette valeur seuil acceptable étant propre à chaque domaine d'activité.
Les bactéries planctoniques sont un premier exemple de microorganismes contaminants, ces bactéries sont libres au niveau d'un substrat liquide ou solide et posent un problème en soi car elles sont à même de contaminer directement tout type de surface comme les denrées alimentaires, les outils médicaux, les bandes transporteuses, les réservoirs de stockage ou encore les patients humains ou les animaux eux- mêmes.
Toutefois, aujourd'hui, il est largement reconnu que les problématiques liés à la contamination par des microorganismes sont d'autant plus importants que ces derniers forment des biofilms.
En effet, dans tout type d'industrie et plus particulièrement dans le domaine de l'industrie agroalimentaire, les biofilms se forment de manière inévitable, cela au vu de la richesse du milieu environnant.
Les biofims sont définis comme un consortium de
Mmicroorganismes enchâssés dans une matrice de substances polymériques extracellulaires. Autrement dit, les biofilms sont des pellicules visqueuses qui se développent sur toutes les surfaces, suite à l'adhésion de microorganismes sur ces surfaces et à la sécrétion par ceux-ci de polymères les recouvrant, facilitant leur adhésion à la surface et formant ainsi Ia matrice extracellulaire. Les biofilms constituent ainsi une couche de protection autour des microorganismes très résistante aux agressions chimiques et thermiques ce qui rend ainsi leur élimination très difficile au moyen des biocides conventionnels et représentent de plus une source récurrente et important de contamination du milieu environnant.
Cette résistance est expliquée d'une part par la matrice de substances polymériques extracellulaires qui forme une barrière physique à la diffusion des molécules biocides dans le biofilm et, d'autre part, à l'état sessile des microorganismes et à leur capacité à s'échanger entre eux très rapidement des gènes responsables de certains mécanismes de résistance aux biocides.
Dès lors, on comprend aisément que les biofilms sont des structures très résistantes et extrêmement variées, par exemple des souches différentes d'une même bactérie peuvent former des biofilms différents, ces biofilms étant encore plus variés qu'ils sont composés de plusieurs bactéries différentes. De plus, les bactéries s'échangeant entre elles des gènes de résistance et l'environnement influe également sur le biofilm, accentuant encore leur complexité et leur résistance.
En outre, la matrice extracellulaire des biofims peut être identifiée lorsqu'elle est fortement développée mais dans la majorité des cas, le biofiim se développe insidieusement dans les installations et sa présence sera détectée que lors de l'analyse de Ia qualité du produit fini.
Concernant la croissance du biofilm, celle-ci a leu de manière cyclique en comprenant une phase de croissance durant laquelle se produit l'accumulation des microorganismes et une phase de détachement durant laquelle des morceaux entiers de biofilms et des microorganismes se détachent par érosion et sous l'effet de leur poids pour contaminer les surfaces, les denrées alimentaires, les outils médicaux, les bandes transporteuses, les réservoirs de stockage ou encore les patients humains, consommateurs ou les animaux eux-mêmes.
Cela devant entraîner pour l'industriel, l'arrêt de sa chaîne de production, effectuer un cycle de nettoyage pour éliminer le biofilm, représentant de nombreuses heures de travail, ressources déployées et de perte de rendement.
De tout ceci, il ressort que les microorganismes contaminants et/ou les biofilms constituent une reelle problématique, tout particulièrement dans le domaine des soins de santé (hôpitaux, cabinets dentaires ou médicaux), des soins vétérinaires et de l'agroalimentaire.
Cette problématique est d'autant plus critique que les microorganismes et/ou les biofilms peuvent impliquer des bactéries responsables d'infections potentiellement mortelles chez les individus, que ces bactéries soient présentes dans les hôpitaux, les cabinets vétérinaires ou encore dans l'industrie agroalimentaire et se retrouvent au final sur les produits alimentaires destinés à la consommation.
Comme cela a été indiqué plus haut, la problématique des microorganismes et plus particulièrement des biofilms est double. D'une part, les désinfectants et biocides classiques sont très souvent inefficaces car ils ne parviennent pas à atteindre les microorganismes protégés par la matrice extracellulaire du biofilm, cette matrice étant de structure et de composition complexe et très variable. D'autre part, un biofilm étant généralement mixte, c'est-à-dire qu'il contient une multitude de bactéries différentes ou de mêmes bactéries mais qui sont de souches différentes, ce qui favorise la propagation des gènes de résistance entre les bactéries du biofilm et rend ainsi leur traitement très difficile voire inefficace.
Par conséquent, d'un environnement à l'autre ou d'un secteur d'activité à l'autre, il est plutôt fréquent que les biofilms détectés soient totalement différents. Afin de détecter les biofilms, il existe des kits de détection de la présence de biofilms sur des surfaces ou dans des installation plus spécifiques (circuits d'eau, etc...), ces kits (tel que lui divulgué dans le document EP2537601) permettent de réaliser une coloration sélective des biofilms. II est donc actuellement possible de déterminer des zones où sont présents des biofilms afin de procéder à une élimination de ces derniers sans toutefois connaître la nature précise des microorganismes (bactéries) à l'origine du biofilm ciblé. en résulte que des compositions d'élimination des biofilms comprenant plusieurs enzymes sont employées sans toutefois savoir si les enzymes utilisées et éventuellement formulées dans une base détergente (voir par exemple le document EP2243821) sont réellement adéquates pour agir sur un biofilm donné. Pour cette raison, les traitements actuels sont plutôt aléatoires et non spécifiques, ce qui est économiquement non rentable et peut entraîner une perte de temps et un arrêt considérable des installations. 5 Par aileurs, des techniques de prélèvement de microorganismes au départ de surfaces ont été développées afin de caractériser et/ou de quantifier les populations de microorganismes présentes sur des surfaces et responsables de contaminations. Ces méthodes de prélèvement permettent donc de déterminer, sur une surface, les différents types (de souches) de bactéries et de microorganismes présents.
Parmi les méthodes de prélèvement de microorganismes présents sur une surface, l'une des références en la matière est la Norme
ISO 18593 :2004(F) qui prévoit et définit des méthodes horizontales pour des techniques de prélèvement sur des surfaces (plus spécifiquement sur des surfaces se rencontrant dans l'environnement des industries agroalimentaire). La méthode à «l'étoffe/éponge » est un exemple de techniques de prélèvement cité dans cette Norme, cette méthode permettant de rechercher et/ou de dénombrer des microorganismes présents sur une surface. Brièvement, selon cette méthode de prélèvement, il s'agit de mouiller l'étoffe/éponge avec une quantité de diluant qui est du sérum physiologique stérile, d'échantillonner la surface dans deux directions perpendiculaires avant d'introduire l'étoffe/éponge dans un récipient stérile avec le diluant. Par la suite, après un éventuel stockage du prélèvement, ce dernier est analysé quantitativement et/ou qualitativement.
Malheureusement, si une telle méthode permet d'assurer un prélèvement de microorganismes libres à Ia surface d'un substrat, c'est- d-dire un prélèvement de microorganismes planctoniques, elle se relève être inefficace lorsque la surface est contaminée por des microorganismes ayant formé un biofilm. En effet, comme expliqué plus haut, les microorganismes protégés par la matrice extracellulaire du biofilm, cette matrice étant de structure et de composition complexe et très variable et les biofilms étant mixtes, ils sont encore plus variés et complexes qu'ils sont composés de plusieurs bactéries différentes ou de souches différentes.
De plus, il s'avère que les techniques de prélèvement reposant sur un support imprégné d'eau peuvent avoir un effet bénéfique sur le développement des microorganismes, même lors de la réalisation d'un prélèvement au départ d'une surface. En effet, il est reconnu que certaines bactéries présentent une croissance accrue en présence d'eau, le support imbibé d'eau favorisant donc cette croissance pendant le prélèvement mais également après celui-ci puisqu'une fine pellicule d'eau subsiste sur le support traité où a eu lieu le prélèvement. Ceci peut donc favoriser le développement de certains microorganismes non prélevés ou encore car ils sont protégés par un biofilm.
Afin de pallier aux inconvénients des supports de prélèvement imprégnés d'eau, on connait de l'état de la technique le document DE10304331 qui divulgue une préparation enzymatique qui peut être utilisée pour éliminer les biofilms des surfaces en l'absence de biocides. Cette préparation enzymatique comprend une ou plusieurs enzymes du groupe des polysaccharidase et/ou protéases et éventuellement des nucléases.
Malheureusement, même si les compositions selon le document DE10304331 présentent une certaine efficacité en terme de prélèvement des microorganismes, il apparaît qu'elles sont insuffisantes compte tenu de la diversité et de la complexité des microorganismes et des biofilms qui peuvent être présents sur une surface d'une installation et qu'elles ne permettent pas un prélèvement représentatif des populations bactériennes y étant pourtant bien présentes, c'est-à-dire qu'elles ne permettent qu'un faible recouvrement des microorganismes.
En effet, les biofilms et/ou les microorganismes présents sur une surface d'une installation sont d'une part composés d'une population de microorganismes variée et complexe, c'est-à-dire différents microorganismes mais également ces différents microorganismes pouvant encore être de souches différents, cela entraînant des résistances différentes mais également la formation de matrices extracellulaires de biofilms variées, complexes et différentes, parfois au sein d'une même surface d'une installation.
Bref résumé de l'invention
Un premier objet de la présente invention porte sur un procédé d'échantilonnage, de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes sur des surfaces, pour la détection et l'analyse en laboratoire ultérieures comprenant les étapes suivantes : - appliquer stérilement et de manière caliprée une composition de prélèvement des microorganismes comprenant un ou plusieurs tensioactif(s), et au moins deux enzymes choisies dans le groupe comprenant une protéase, une polysaccharidase, une laccase, une lipase, une cellulase et une mannanase, et un agent séquestrant sur une surface à prélever, - laisser agir ladite composition sur ladite surface à prélever pendant une période de temps prédéterminée de manière à récupérer un échantillonnage des microorganismes, - prélever stérilement ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes,
- déposer ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes dans au moins un conteneur stérile, de préférence comprenant une solution de conservation de ladite solution de prélèvement, ledit conteneur stérile contenant ledit échantillon de microorganismes, pour la conservation dudit échantillon en vue de la détection et analyse en laboratoire ultérieures, ledit procédé est caractérisé en ce que ledit ou lesdits tensioactifs présents dans ladite composition de prélèvement comprenne(nt) un tensioactif anionique, ou consiste (essentiellement) en un ou plusieurs tensioactifs anioniques, et en ce que la teneur globale desdits tensioactifs (anionique) est comprise entre 0,01% et 10% en poids (poids du ou des tensioactifs : poids de Ia composition de prélèvement).
Avantageusement, ladite application calibrée de ladite composition de prélèvement est une application calibrée d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement, de préférence une pulvérisation caliorée d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement.
De préférence, ladite application calibrée d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement est une application d'une teneur comprise entre 0,5 et 5 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, de préférence d'une teneur comprise entre 0,7 et 3 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, préférentiellement entre 0,9 et 2 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, avantageusement entre 1 et 1,5 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm2.
De préférence, dans ce procédé, l'étape de laisser agir ladite composition de prélèvement a lieu pendant une durée d'au moins 10 secondes, au moins 20 secondes, au moins 30 secondes, au moins Imn, de préférence d'au moins 2mn, préférentiellement d'au moins 3mn,
avantageusement d'au moins 4mn, de manière particulièrement avantageuse d'au moins 5mn et au maximum de 15 mn, de préférence au maximum de 10 mn, de préférence le temps est d'environ 5 minutes.
Avantageusement, l'étape de prélèvement stérile de ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes comprend une première étape de contact d'au moins un moyen de récolte stérile desdits microorganismes sur ladite surface à prélever.
De préférence, le moyen de récolte stérile est choisi dans le groupe constitué d'un tissu, une lingette, un swap, une éponge, un racloir etunécouvillon.
Avantageusement, une étape de stockage dudit conteneur stérile contenant ledit échantillon de microorganismes est réalisée à une température inférieure à 15 °C, de préférence inférieure à 10 °C, avantageusement inférieure à 5 °C entre 4 et 8°C.
De préférence, les tensioactifs (présents dans la composition de prélèvement utilisée dans le procédé de l'invention} sont présents à une teneur d'au moins 0,15% en poids par rapport au poids de ladite composition, de préférence à une teneur d'au moins 0,02% en poids et, de préférence à une teneur d'au plus 5% en poids, de préférence au plus 1% en poids, de préférence d'au plus 0,5% en poids, voire au plus 0,1%.
De préférence, la composition de prélèvement (utilisée dans le procédé de l'invention) comprend au moins trois enzymes, de préférence au moins quatre enzymes, préférentiellement au moins cinq enzymes et de manière avantageuse au moins six enzymes.
De préférence, la composition de prélèvement (utilisée dans le procédé de l'invention) comprend en outre au moins un agent stabilisant présent à Une teneur d'au moins 15% par rapport au poids de ladite composition, ledit stabilisant étant choisi dans le groupe des polyols (glycérol) et du propylène glycol.
De préférence, la composition de prélèvement (utilisée dans le procédé de l'invention) comprend en outre au moins un agent séquestrant à une teneur d'au moins 0,1% en poids par rapport au poids de ladite composition, de préférence à une teneur d'au moins 0,2%, préférentielement à une teneur comprise entre 0,3% et 3% en poids, avantageusement comprise entre 0,3% et 1% en poids, et de manière particulièrement avantageuse comprise entre 0,3% et 0,8% en poids, ledit agent séquestrant étant de préférence un carboxyméthylinuline, un phosphonate, le glycolate de sodium et leurs mélanges.
De préférence, la composition de prélèvement (utilisée dans le procédé de l'invention) a préalablement été stérilisée par un traiîtement physique choisi parmi l'iradiation par faisceau d'électrons, l'iradiation aux rayons gamma et la filtration stérilisante.
Dans ce procédé, optionnellement, la composition de prélèvement comprend une (sérine) protéase et la solution de conservation comprend au moins un inhibiteur de (sérine) protéase, de préférence le PMSF.
De préférence, la solution de conservation (utilisée dans le procédé de l'invention) comprend au moins un dérivé de polyoxyéthylène sorbitane et/ou au moins un dérivé de phosphoglycéride.
Avantageusement, ce dérivé de polyoxyéthylène sorbitane est présent à une teneur d'au moins 4 g/L, de préférence à une teneur d'au moins 4,3 g/L, préférentiellement à une teneur d'au moins 4,6 g/L, avantageusement à une teneur d'au moins 4,9 g/L et/ou ce dérivé de phosphoglycéride est présent à une teneur comprise entre 0,5 et 3 g/L, de préférence à une teneur comprise entre 0,5 et 2,5 g/L, préférentiellement entre 0,5 et 2 g/L, avantageusement entre 0,5 et 1,5 g/L.
De préférence, la solution de conservation (utilisée dans le procédé de l'invention) comprend en outre au moins un extrait de nutriments, comprenant de préférence un mélange de peptides.
Avantageusement, cet extrait de nutriments (mélange de peptides) est présent à une teneur d'au moins 1 g/L, de préférence d'au moins 2 g/L, préférentiellement d'au moins 3 g/L, avantageusement d'au moins 4 g/L et de manière particulièrement avantageuse d'au moins 5 g/L.
Avantageusement, ce procédé permet, et donc comprend en outre, l'étape de culture des microorganismes (Ex. Listeria et/ou
Salmonella) prélevés et/ou conservés.
Avantageusement, ce procédé permet, et donc comprend (en outre), l'étape de détection spécifique des microorganismes prélevés, conservés et/ou cultivés.
La détection spécifique est réalsée de préférence par immunologie.
Alternativement, ou en outre, la détection spécifique est réalisée par analyse génétique.
Alternativement, ou en outre le procédé selon l'invention permet et donc comprend un test biochimique, ledit test biochimique étant un test enzymatique, ou impliquant des protéines ou des enzymes, de préférence l'ATP métrie, Ia mesure du NADH, la mesure de l'activité catalase et la Mesure de résidus de protéines.
Description détaillée de l'invention
Il existe donc un réel besoin de fournir un procédé qui a pour but de pallier les inconvénients de l'état de la technique en permettant un prélèvement efficace, représentatif et de manière adéquate des populations de microorganismes, qu'ils soient libres mais également sous la forme d'un biofilm de structure complexe qui peut varier considérablement d'un prélèvement à un autre. En outre, il existe un besoin de fournir une composition permettant le prélèvement des
Mmicroorganismes sur différents types de surfaces, dans différents environnements, stable dans le temps et qui soit compatible avec les
Utilisateurs ou encore avec la chaîne de production, por exemple les aliments dans une industrie agroalimentaire.
Pour résoudre ce problème, il est prévu suivant l'invention l’utilisation d'une composition de prélèvement (et de décrochage) de microorganismes comprenant : - QU moins un tensioactif représentant au moins 0,01% en poids par rapport au poids de ladite composition et au plus 10% en poids (somme des poids des tensioactifs : poids total de la composition), ce tensioactif comprenant, voire consistant (essentiellement) en un tensioactit anionique, - Qu moins un agent stabilisant (glycérol) représentant au moins 15%, de préférence au moins 18%, préférentiellement au moins 20% en poids par rapport au poids de ladite composition, et/ou de préférence moins de 30%, voire moins de 25%, en poids par rapport au poids de ladite composition, - Au moins un agent séquestrant, - QU moins deux enzymes choisies dans le groupe constitué d'une protéase, une polysaccharidase, une laccase, une lipase, une cellulase et une mannanose.
Les caractéristiques de la composition de prélèvement selon la présente invention présentent l'avantage de permettre le prélèvement de microorganismes, qu'ils soient sous forme planctoniques ou bien sous forme de biofilms complexes et variés.
La composition de prélèvement, en comprenant au moins deux enzymes choisies dans le groupe comprenant une protéase, une polysaccharidase, une laccase, une lipase, une cellulase, et une mannanase permet avantageusement de dégrader et de déstructurer efficacement la matrice extracellulaire des biofilms et notamment d'une population variée et complexe de biofims ayant des matrices extracellulaires différentes permettant ainsi de libérer les bactéries afin de les prélever.
Avantageusement, l'agent séquestrant (les cations di- ou multi-valents), est présent en une teneur pondérale d'au moins 0,2%, de préférence au moins 0,3%, voire au moins 0,4%.
L'agent séquestrant est de préférence le glucono-delta- lactone, le gluconate de sodium, le gluconate de potassium, le gluconate de calcium, le glycolate de sodium l'acide citrique (un citrate), l'acide phosphorigue (un phosphate), l'acide tartrique (un tartrate), l'acétate de sodium, le sorbitol, Ia carboxyméthyl inuline (le sel sodique) un phosphonate et les mélanges de ceux-ci. Les agents séquestrants dits « doux » sont préférés : les inventeurs ont remarqué que ces séquestrants « doux» permettaient une meilleure activité enzymatique au niveau du prélèvement et/ou pour les tests microbiologigves en aval impliquant des enzymes (ex. les inventeurs ont noté des interférences avec les tests PCR en aval lorsque trop d'agent séquestrants et/ou des agents séquestrants trop puissants étaient présents).
En outre, l'agent séquestrant ainsi que le pH compris entre 5 et 11 de la composition de prélèvement permet avantageusement de former des complexes avec des ions minéraux qui vont être fixés sous une forme empêchant leur précipitation par les réactions habituelles et ainsi de stabiliser dans le temps la composition, notamment au vu des enzymes présentes dans de telles proportions.
Dans le cadre de la présente invention, il a été déterminé que la composition de prélèvement en comprenant au moins un tensioactif anionique qui représente au moins 0,01% en poids par rapport au poids de ladite composition et, de préférence moins de 10%, voire moins de 5%, voire moins de 1,5%, voire mouis de 1% ou même moins de 0,1%, permet de manière particulièrement avantageuse de décrocher et de prélever une proportion représentative et complète d'une population de microorganismes présents sur une surface, qu'ils soient planctoniques ou bien sous la forme de bDiofilms puisque les enzymes de Ia composition selon l'invention permettent leur libération. Il s'agit, de manière surprenante, de teneurs faibles en tensioactifs.
De préférence les tensioactifs sont choisis de manière à ce que, globalement, ils aient une valeur HLB comprise entre 10 et 16.
Avantageusement, les tensioactifs comprennent des tensioactifs moussants, cela présentant l'avantage d'une part de décrocher et prélever les microorganismes et d'autre part d'emprisonner les microorganismes prélevés dans la composition selon l'invention afin de réaliser un prélèvement efficace et représentatif de la population de contaminants d'une surface.
La composition de prélèvement est avantageusement capable d'adhérer correctement sur différents types de surfaces et dans différents environnements et donc de permettre un prélèvement efficace, représentatif et de manière adéquate des populations de microorganismes, qu'ils soient llores mais également sous la forme d'un biofilm de structure complexe et variable.
en résulte que la composition de prélèvement, au contraire des compositions actuelles, permet d'obtenir un prélèvement réellement représentatif et complet des contaminants présents sur une surface, pour différents types de surfaces et pour différents environnements. Cela est particulièrement avantageux car en ayant un prélèvement représentatif et complet des microorganismes, ceux-ci pourront par la suite être identifiés et un traitement d'élimination ciblé et efficace, en utilisant les composés adéquats et non plus un cocktail de composés bien souvent inefficace pourra être appliqué sur la surface. Ceci représente bien entendu un avantage économique et de temps considérable.
L'intérêt de la composition de prélèvement est donc double en ce sens qu'elle permet d'une part de prélever et d'échantillonner l'ensemble des contaminants d'une surface qu'ils soient planctoniques ou sous forme de biofilms en vue de leur analyse et qu'elle permet ensuite de déterminer précisément quel traitement d'élimination de ces contaminants sera à appliquer.
De préférence, l'au moins un tensioactif anionique de la composition de prélèvement est le laureth sulfate de sodium (CAS 9004- 82-4).
De préférence, l'au moins un agent stabilisant et/ou agent viscosant est choisi dans le groupe comprenant un polyol ou le propane 1,2-diol ou le propane 1,3-diol. De préférence, l'agent stabilisant est le glycérol.
De préférence, la composition de prélèvement présente un pH compris entre 6 et 10, de préférence entre 7 et 9, préférentiellement entre 8 et 9, de manière particulièrement avantageuse entre 8,2 et 8,6.
De préférence, la composition de prélèvement est sous forme liquide, de préférence sous forme liquide pulvérisable, ce qui permet une application aisée et reproductible.
De préférence, la composition de prélèvement comprend en outre au moins une enzyme additionnelle choisie dans le groupe constitué des oxydo-réductases, des lyases, des transférases, des peptidases, des lipases, des estérases, et des glucosaminidases.
D'autres formes de réalisation de la composition de prélèvement suivant l'invention sont indiquées dans les revendications annexées.
L'invention se rapporte également à l'utilisation d'un kit de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes à l'état vivant ou revivifiable en vue d'analyses de laboratoire ultérieures.
Comme expliqué ci-avant, l'intérêt de la composition de prélèvement est double en ce sens qu'elle permet d'une part de prélever et d'échontilonner l'ensemble des contaminants d'une surface qu'ils soient planctoniques ou sous forme de biofilms et qu'elle permet ensuite de déterminer précisément quel traitement d'élimination de ces contaminants sera à appliquer après que des analyses aient été réalisées pour identifier et caractériser précisément les contaminants.
Par conséquent, il est important que la composition de prélèvement, qui contient les contaminants, microorganismes et biofilms, suite au prélèvement, puisse permettre une analyse fiable, correcte et représentative de la population prélevée sans que ladite composition après prélèvement n'interfère avec les analyses ultérieures.
Pour résoudre ce problème, il est prévu par la présente invention l'utilisation d'un kit de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes à l'état vivant ou revivifiable en vue d'analyses de laboratoire ultérieures comprenant : - Une composition de décrochage et de prélèvement de microorganismes telle que décrite ci-dessus, - QU moins un moyen de récolte stérile desdits microorganismes, - QU moins un récipient stérile, par exemple un sachet stérile, comprenant une solution de conservation pour la collecte et la conservation de microorganismes à l'état vivant ou revivifiable en vue d'analyses de laboratoire ultérieures.
Avantageusement, l'au moins un moyen de récolte stérile des microorganismes du kit est un tissu, une lingette, une éponge.
L'invention se rapporte donc à un procédé de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes à l'état vivant ou revivifiable en vue d'analyses de laboratoire ultérieures comprenant les étapes suivantes : a) au moins une application contrôlée (calibrée) (et stérile) d'une composition de prélèvement (et de décrochage) de microorganismes telle que décrite ci-dessus, b) laisser agir ladite composition de prélèvement sur ladite surface à prélever, c) déposer au moins un moyen de récolte desdits microorganismes sur ladite surface à prélever, d) laisser imbiber ledit au moins un moyen de récolte par ladite composition de décrochage, e) prélever stérilement ledit au moins un moyen de récolte des microorganismes imbibé et le déposer dans au moins un récipient stérile, par exemple un sachet stérile, comprenant de préférence une solution de conservation pour la collecte et lo conservation de microorganismes à l'état vivant ou revivifiable en vue d'analyses de laboratoire ultérieures.
Avantageusement, l'étape b) a lieu pendant une durée d'au moins 10 secondes, au moins 20 secondes, au moins 30 secondes, au moins 1 mn, de préférence d'au moins 2mn, préférentiellement d'au moins 3mn, avantageusement d'au moins 4mn, de manière particulièrement avantageuse d'au moins 5 mn.
Optionnellement, le procédé selon l'invention comprend en outre au moins une étape préliminaire de préchauffage de ladite composition de décrochage, de préférence à une température comprise entre 20 et 60 °C, préférentiellement entre 30 et 50 °C, avantageusement entre 40 et 50 °C.
Avantageusement, le procédé selon l'invention comprend en outre au moins une étape de stockage dudit récipient stérile contenant ledit moyen de récolte imbibé, à une température inférieure à 15 °C, de préférence inférieure à 10°C, avantageusement inférieure à 5°C.
Avontageusement, la composition de conservation comprend un ou 2 ou les 3 composés choisis parmi le groupe des inhibiteurs de protéases, un nutriment (ex. des hydrolysats de protéines et/ou un mélange de peptides) et d'inhibiteurs de conservateurs choisis parmi un dérivé de polyoxyéthylène sorbitane (ex. le monooléate de polyoxyéthylène sorbitane) et/ou au moins un dérivé de phosphoglycéride (ex. phosphatidyl choline).
De préférence les inhibiteurs de conservateurs sont présents à une teneur d'au moins 4g/litre, de préférence à une teneur d'au moins 4,3 g/L, préférentielement à une teneur d'au moins 46 g/L, avantageusement à une teneur d'au moins 4,9 g/L.
Les inhibiteurs de protéases sont, de préférence, absents.
Lorsqu'ils sont présents, ils sont de préférence choisis dans le groupe constitué des agents de sulfonylation (ex. AEBSF, PMSF, DFP), des agents chélatants (ex. EDTA), des agents alkylants (ex. fluoromethyl, chloromethyl et acyloxymethyl cétones, époxides, aziridines, vinyl sulfones, and autres
Accepteur Michael), des agents acylants (ex. B-lactames, lactones, aza- peptides, dérivés heterocycligues}, des agents de phosphonylation (ex.
DFP), des fluorures de phosphonyles, ou de sulfonyle, les thiadiazoles, les sels de sulfate d'acides aminés et les inhibiteurs tissulaires de métalloprotéinases matricielles (TIMP).
Lorsque la composition de prélèvement comprend une sérine protéase, le PMSF (PhenylMethylFulfonyl Fluoride ; en français, fluorure de
Phenylmethylsulfonyle) est l'inhibiteur de protéase préféré, malgré les contraintes associées à son utilisation.
Ce procédé permet avantageusement de réaliser une étape de culture des microorganismes récoltés (prélevés) et/ou conservés, et/ou de réaliser un test biochimique, impliquant des enzymes et/ou des protéines.
En outre, ou en alternative, ce procédé permet de réaliser une étape de marquage spécifique des microorganismes récoltés (prélevés) et/ou cultivés, y compris de Listeria sp. et/ou de Salmonella sp.
Ce marquage spécifique est avantageusement réalisé par un test immunologique et/ou par un test génétique.
Dons le contexte de la présente invention, un test immunologique s'entend, de préférence, par tout test comprenant un ou plusieurs anticorps capables de se lier spécifiquement à un composant d'une bactérie déterminée. Un tel test immunologique est donc qualitatif (identité de la souche bactérienne, présence d'un facteur donné) et/ou quantitatif. Ce test peut comprendre des moyens de marquage secondaires, tels que fluorescents, qui permettent une analyse rapide et précise.
Dans le contexte de la présente invention, un test génétique s'entend, de préférence, par tout test où la présence, voire l'abondance, d'une molécule d'acide nucléique cible dans l'échantillon est analysée.
Les tests génétiques préférés sont le séquençage et Ia PCR (Polymerase
Chain Reaction} ou d'autres types d'amplification génétique (y compris les techniques d'amplifications isothermes) impliquant des sondes et/ou des amorces spécifiques du ou des microorganismes à identifier (ex.
Listeria et/ou Salmonella, y compris la détection spécifique des souches pathogènes de Listeria ou Salmonella, ou la détection spécifique de souches problématiques, par rapport à d'autres microorganismes présents, mais non problématiques).
Description détaillée d'une réalisation de l'invention
D'autres caractéristiques et avantages de la présente invention seront tirés de la description non limitative qui suit, et en faisant référence aux dessins et aux exemples.
Exemples.-
Il est bien entendu que la présente invention n'est en aucune façon limitée aux formes de réalisations décrites ci-dessus et que bien des modifications peuvent y être apportées sans sorti du cadre des revendications annexées
Example 1
Une société de transformation de viande située en Belgique a été sélectionnée pour cette étude. Toutes les installations ont été préalablement nettoyées et désinfectées avant de réaliser les prélèvements.
Le protocole de décrochage est appliqué avec une limitation des actions mécaniques pouvant introduire une erreur de reproductibilité ; il comporte les étapes suivantes :
Parcourir rapidement (screener) les zones à prélever avec la lampe UV et kit de détection BDK (Realco) ;
Préchauffer Ia solution de prélèvement à 45°C ;
Déposer deux gabarits sur les surfaces à prélever (afin de délimiter une surface de 10cm sur 10 cm): eau physiologue vs composition de prélèvement (14 sprays pour couvrir la zone ;1,2 g /spray) ;
Laisser agir 5 minutes la solution de prélèvement ;
Déposer la lingette stérile sur les deux zones de prélèvement et laisser imbiber ;
Prélever stérilement à l'aide de pince et déposé dans un sachet stérile de transport ;
Stocker les échantillons dans des bacs frigos à 4°C ;
Évaluer après les deux zones avec la lampe et le BDK.
Au total 6 zones de prélèvements ont été incluses dans cette étude : Zone 1 table ronde ; Zone 2 couvercle pour table poubelle ; Zone 3 bac inox; Zone 4 table scie; Zone 5 surface plastique ; Zone 6 découenneuse.
Dons ces 6 zones, la composition de prélèvement comprenant des enzymes (dont une subtilisine, activité équivalente à 10
Unités Anson/kg} et des détergents (environ 10% en poids) permet une bien meilleure récupération des microorganismes, tant en microbiologie classique que par mesure ATP (2G) ou par culture. Réciproquement, il ne resta plus de microorganismes sur les surfaces où la solution de prélèvement a été placée, contrairement à la surface traitée par l’eau physiologique. La différence est surtout marquée au niveau de la microbiologie classique, par rapport à l'ATP 2G ou par test impliquent une étape de culture (peu de différence remarquées).
Les inventeurs ont reproduit l'exemple, pour y inclure des analyses métagénomiques, tout en variant le temps de contact de la composition de prélèvement sur la surface (30 secondes et 5 minutes). A nouveau, la composition enzymatique permet un bien meilleur prélèvement (ex. 100 fois mieux en microbiologie classique et 14 fois mieux en aPCR). Les bactéries retrouvées montrent une proportion accrue en
Pseudomonas.
Exemple 2 — addition d'une solution de conservation ;
Salmonella
Les inventeurs, suspectant des effets délétères associés à Ia composition de prélèvement, ont cherché à déterminer dans quelle mesure une solution adjuvante pouvait contrecarrer ceux-ci, dans le cadre de tests visant à déterminer la présence de Salmonella et/ou de Listeria, soit par
PCR ou qPCR, soit en utilisant des kits de détection commerciaux, par exemple ceux de BioMérieux. Pour ce faire, une solution dite ‘de conservation a été testée (en g/l) : Protéines (extrait de viande de bœuf ;
5) ; Peptone, 10 ; Polysorbate 80 (Tween 80 ; 5) ; Lecithin 0,7 ; NaCl, 5. En outre, divers inhibiteurs de sérine protéase ont été utilisés, dans le but de neutraliser l'activité de la subtilisine de la solution de prélèvement.
La première série de tests a été réalisée en laboratoire, où des quantités connues des bactéries (0,1 ml de 107 UFC/ml de Salmonella) ont été incubées soit dans une solution physiologique (100 ml), soit dans la composition de prélèvement de l'exemple 1 (6m! + 94 ml eau physiologique), soit dans la composition de l'exemple 1, avant que lo solution de conservation ne soit ajoutée (6 ml composition de prélèvement, 90 ml eau, 4 ml de la solution de conservation).
Lorsque 107 UFC/ml de Salmonella sont analysés (donc 104
UFC/ml dans le mélange final), les différentes situations sont compatibles avec l'identification du microorganisme ou moyen d'analyses PCR ou du test Vidas® Salmonella. Cependant, une mise en évidence par le test
Vidas SLM® (bouillon culture, puis mesure spécifique par test antigénique et fluorescence ; ce test renseigne quant à l'absence ou à la présence de Salmonella) échoue lorsque la composition de prélèvement est présente, alors qu'il fonctionne lorsque les bactéries sont diluées dans l'eau physiologique ou lorsque la solution de conservation a été ajoutée.
En outre, dans cet exemple, les inventeurs considèrent que les concentrations en Salmonella sont élevées, ce qui ne représente pas nécessairement, voire rarement, la situation sur le terrain, où même 1 CFU doit être détecté.
Exemple 3 - addition d'une solution de conservation ; Listeria
Dans ce cas, la solution enzymatique cause des problèmes au niveau de la détection (dénombrement et gPCR) ; ces problèmes sont réduits grâce à la solution de conservation, cependant le kit commercial Vidas® (LMX) ne fonctionne toujours pas.
En outre, lorsque la quantité de Listera ensemencée est réduite, le microorganisme n'est généralement plus détecté suite au mélange (Vidas LMX®, jamais ; Vidas LMO2®, pas à chaque fois) avec lo composition de prélèvement, alors que la détection reste robuste lorsque le mélange a été effectué uniquement dans l'eau physiologique. Dans ce cas (volontairement extrême), Ia composition de conservation n'a pas amélioré la détection. Par prudence, les tests ont été reproduits et trois souches de Listeria ont été testée avec toujours les mêmes résultats ; il s'agit des souches ATCC 19114, NCTC 11994 et ATCC 13932.
En comparant tous les résultats, les inventeurs concluent que la composition de prélèvement ralentit Ia croissance de microorganismes (Listeria), problème qui est partiellement résolu par la composition de conservation. Par contre, la composition de prélèvement interfère avec certains tests microbiologiques en aval. Vu que la nature et l'apondance des microorganismes sur une surface à tester est inconnue à l'avance, les inventeurs concluent donc que les compositions des exemples 1 à 3 sont utiles, mais gagneraient à être encore améliorées.
Exemple 4 - Identifications des composés délétères
Les inventeurs ont recherché dans les différentes enzymes commerciales si certains composés interféraient avec les tests microbiologiques en aval.
Les inventeurs ont remarqué que la présence de composés tels que le phénoxyéthanol, le sorbate de potassium ou des dérivés de thiazolinone est assez répandue. Ainsi, les inventeurs ont sélectionné des compositions enzymatiques qui sont dépourvues de tels composés, ou les plus pauvres possibles, même si les inventeurs ont retrouvé des concentrations importantes de 2-phénoxyéthanol dans de nombreuses compositions enzymatiques commerciales. Parmi les composés recherchés se retrouvent le Bronopol, le triclosan, l'idocarb, le chlorhexidine, le DCOIT, le
BIT le OT, le CI, le MIT, l'éthyl-parabène, le méthylparabène, le butythylparabène, le phénylparabène, l'isoproylparabène, l'sobutylparabène, le propylparabène, l'acide salisylique, l'acide 4- hydroxybenzoïque, l'acide 4-méthyloenzoïque, l'acide benzoïque, l'acide sorbique, l'acide déhydroacétique, le 1-phénoxypropane-2-ol, le 1,2-dibromo-2,4-dicyanobutane, le 2-hydroxybiphényle, le 2- phénoxyéthanol (le plus abondamment retrouvé, parfois jusqu'à 0,4% en poids), l'alcool bensylique et le chlorophenesin.
Exemple comparatif 1
Suspectant une interférence entre les protéases de la composition de prélèvement et les enzymes ou les anticorps des tests en aval, les inventeurs ont testé l'effet de l'addition d'inhibiteurs de protéases dans la solution de conservation (cfr exemple 3), tout en évitant au maximum les compositions enzymatiques commerciales comprenant des composés identifiés comme délétères (cfr. exemple 4).
Différentes manières d'appliquer l'inhibiteur de protéase ont été testées. La protéase choisie étant une subtilisine ou la trypsine, deux inhibiteurs de serine-protéase ont été testés : le PMSF et l'AEBSF.
Le PMSF a permis une bonne inhibition des activités protéolytiques des sérine-protéases testées. Par contre, l'AEBSF n'a inhibé quellatrypsine. Des tests de mesure où Listeria (les 3 souches ci-dessus ont été testées) est mise en contact avec une composition comprenant une subtilisine, puis l'AEBSF en concentration suffisante pour causer l'inhibition complète de la subtilisine ont montré que différents tests microbiologiques donnaient des valeurs plus basses, voire même ne détectaient pas Listeria dans les conditions du test, au contraire du contrôle sans les enzymes ou lorsque le PMSF est ajouté.
Ainsi, les inventeurs ont choisi d'incorporer le PMSF dans la solution de conservation à tester, malgré les inconvénients de cette molécule.
Malheureusement, même dans ces conditions, le test Vidas®
LMX ne permet pas de mettre en évidence la présence de Listeria monocytogenes.
Exemple 5 - Optimisation de Ia composition de prélèvement
Les inventeurs ont alors décidé de tester l'efficacité d'une composition de prélèvement fortement diluée et évitant autant que possible Ies composés identifiés comme délétères. En outre, les activités enzymatigues sont réduites, tout comme la teneur en détergent. Les détergents sont choisis après des tests au laboratoire pour leur compatibilité avec la vie des microorganismes, y compris de Listeria, qui a été identifiée comme plus sensible.
Tout d'abord, avec des concentrations en détergent de 10% en poids, même en présence d'activité enzymatique faible, en présence de teneur minimales en agents conservateurs (ex. non-détectables pour la quasi-totalité ; phénoxyéthanol inférieur à 4 ppm) et en absence de
PMSF, les tests de détection de Listeria, de type Vidas®, ne fonctionnent pas bien (sous-quantification massive), ou pas de manière reproductible.
Même des tests moins spécifiques ne fonctionnent pas lorsqu'une culture de Listeria est soumise à ces différents traitements.
Ainsi, tous les paramètres de la composition doivent être vérifiés, avec le problème qu'une trop forte dilution des activités enzymatiques risque de ne plus permettre le décrochage des microorganismes, alors qu'une trop forte dilution des détergents risque de ne plus permettre une application homogène de la composition ou un bon contact avec le biofilm. Ainsi, les inventeurs ont remarqué que, outre la quantité des composants, leur nature devait être reconsidérée.
Une formulation diluée a été testée comprenant environ 20% en poids de glycérol, environ 0,03% en poids d'un détergent anionique de type laureth sulfate (de sodium), 0,4% en poids de séquestrant (carboxyméthylinuline) ; 0,4% en poids de glycolate de sodium; 0,04 % en poids d'une subtilisine (activité 1 Unité Anson), ainsi qu'une lipase ; une amylase, une cellulase et une mannanase. Les inventeurs ont sélectionné des enzymes, ici des enzymes commerciales, dépourvues d'agents conservateurs tels que le sorbate de potassium, le MIT, l'OIT, le BIT et le CIT.
Lorsque c'était possible, les inventeurs ont utilisé des enzymes commerciales dépourvues de phénoxyéthanol (cellulase et mannanase), ou à faible teneur en cette molécule (subtilisine ; 4 g/kg de la formulation enzymatique, lipase ; 0,249 g/kg et amylase ; 0,233 g/kg). Les enzymes autres que la subtilisine ont été ajoutées dans des teneurs pondérales comprises entre 0,1 et 0,5% (poids de la composition enzymatique :poids total) et la quantité d'enzyme est typiquement de 1 à 10% en poids par rapport à la formulation commerciale.
Suite à l'utilisation de cette composition, la présence de
Listeria est détectée, et le test Vidas® LMX pour Listeria est, enfin, positif et reproductible. Les inventeurs ont remarqué en outre que, dans ces conditions diluées, l'ajout de l'inhibiteur de protéase PMSF n'est pas nécessaire, et même réduit Ia propagation de Listeria.
Les inventeurs considèrent que la concentration des enzymes autres que les protéases (ici, une subtilisine) peuvent encore être quelque peu réduites, ex. la concentration la plus faible qui permet le détachement, tout comme celles de l'agent séquestrant. A la lumière de la présente invention, ceci peut se tester au laboratoire sur les 3 souches de Listerig ou dans d'autres modèles, y compris, de préférence, plus complexes.
Les inventeurs ont ensuite testé une éventuelle synergie avec la solution de conservation (cfr. exemples 2 et 3) : vu que les résultats sont déjà très bons, l'amélioration associée à l'ajout de la solution de conservation est marginale, mais elle a été cependant intéressante dans le cas d'un test qui comprend une propagation suivie d'une détection par PCR.
Claims (23)
1. Procédé d'échantilonnage, de décrochage, de prélèvement et de conservation de microorganismes sur des surfaces, pour la détection et l'analyse en laboratoire ultérieures comprenant les étapes suivantes : - appliquer stérilement et de manière caliorée une composition de prélèvement des microorganismes comprenant un ou plusieurs tensioactif(s), et au moins deux enzymes choisies dans le groupe constitué d'une protéase, une polysaccharidase, une laccase, une lipase, une cellulase et une mannanase, et un agent séquestrant sur une surface à prélever, - laisser agir ladite composition sur ladite surface à prélever pendant une période de temps prédéterminée de manière à récupérer un échantillonnage des microorganismes, - prélever stérilement ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes, - déposer ladite composition contenant ledit échantilon de microorganismes dans au moins un conteneur stérile, ledit procédé est caractérisé en ce que lesdits tensioactifs présents dans ladite composition de prélèvement comprenne un tensioactif anionique et en ce que la teneur globale desdits tensioactifs est comprise entre 0,01% et 10% en poids (poids du ou des tensioactifs : poids de la composition de prélèvement).
2. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ladite application colibrée de ladite composition de prélèvement est une application calibree d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement, de préférence une pulvérisation calibrée d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement.
3. Procédé selon la revendication 2, dans lequel ladite application caliorée d'un volume contrôlé de ladite composition de prélèvement est une application d'une teneur comprise entre 0,5 et 5 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, de préférence d'une teneur comprise entre 0,7 et 3 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, préférentiellement entre 0,9 et 2 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm”, avantageusement entre 1 et 1,5 millilitres de composition par application sur une surface de 100 cm2.
4. Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, dans lequel ladite étape de laisser agir ladite composition de prélèvement a lieu pendant une durée d'au moins 10 secondes, au moins 20 secondes, au moins 30 secondes, au moins Imn, de préférence d'au moins 2mn, préférentiellement d'au moins 3mn, avantageusement d'au moins 4mn, de manière particulièrement avantageuse d'au moins 5mn et au maximum de 15 mn, de préférence au maximum de 10 mn, de préférence le temps est d'environ 5 minutes.
5. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ladite étape de prélèvement stérile de ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes comprend une première étape de contact d'au moins un moyen de récolte stérile desdits microorganismes sur ladite surface à prélever.
6. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ladite étape de prélèvement stérile de ladite composition contenant ledit échantillon de microorganismes est réalisée via un moyen de récolte stérile, de préférence choisi dans le groupe constitué d'un tissu, une lingette, un swap, une éponge, Un racloir et un écouvillon.
7. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, comprenant en outre au moins une étape de stockage dudit conteneur stérile contenant ledit échantillon de microorganismes à une température inférieure à 15 °C, de préférence inférieure à 10 °C, avantageusement inférieure à 5 °C entre 4 et 8 °C.
8. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à7, danslequel les tensioactifs de ladite composition de prélèvement sont présents à une teneur d'au moins 0,02% en poids et, de préférence à une teneur d'au plus 5% en poids, de préférence au plus 1% en poids, de préférence d'au plus 0,5% en poids.
9. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à8, dans lequel ladite composition de prélèvement comprend au moins trois enzymes, de préférence au moins quatre enzymes, préférentiellement au moins cinq enzymes et de manière avantageuse au moins six enzymes.
10. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 9, dans lequel ladite composition de prélèvement comprend en outre au moins un agent stabilisant présent à une teneur d'au moins 15% par rapport au poids de ladite composition, ledit stabilisant étant choisi dans le groupe des polyols (glycérol) et du propylène glycol.
11. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 10, dans lequel ladite composition de prélèvement comprend en outre au moins un agent séquestrant à une teneur d'au moins 0,1% en poids par rapport au poids de ladite composition, de préférence à une teneur d'au moins 0,2%, préférentiellement à une teneur comprise entre 0,3% et 3% en poids, avantageusement comprise entre 0,3% et 1% en poids, et de manière particulièrement avantageuse comprise entre 0,3% et 0,8% en poids, ledit agent séquestrant étant de préférence un carboxyméthylinuline, un phosphonate, le glycolate de sodium et leurs mélanges.
12. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à11, dans lequel ladite composition de prélèvement a préalablement été stérilisée par un traitement physique choisi parmi l'iradiation par faisceau d'électrons, l'iradiation aux rayons gamma et la filtration stérilisante.
13. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 12, comprenant en outre une application d'une solution de conservation audit échantillon de microorganismes prélevé ou déposé, pour la conservation dudit échantillon en vue de la détection et analyse en laboratoire ultérieures.
14. Procédé selon la revendication 13, dans lequel ladite solution de conservation comprend au moins un dérivé de polyoxyéthylène sorbitane et/ou au moins un dérivé de phosphoglycéride.
15. Procédé selon la revendication 14, dans lequel ledit au moins un dérivé de polyoxyéthylène sorbitane est présent à une teneur d'au moins 4 g/L, de préférence à une teneur d'au moins 4,3 g/L, préférentiellement à une teneur d'au moins 4,6 g/L, avantageusement à une teneur d'au moins 4,9 g/L et/ou ledit au moins un dérivé de phosphoglycéride est présent à une teneur comprise entre 0,5 et 3 g/L, de préférence à une teneur comprise entre 0,5 et 2,5 g/L, préférentiellement entre 0,5 et 2 g/L, avantageusement entre 0,5 et 1,5 g/L.
16. Procédé selon l'une quelconque des revendications 13 à 15, dans lequel ladite solution de conservation comprend en outre au moins un extrait de nutriments, comprenant de préférence un mélange de peptides.
17. Procédé selon la revendication 16, dans lequel ledit au moins un extrait de nutriments (mélange de peptides) est présent à une teneur d'au moins 1 g/L, de préférence d'au moins 2 g/L, préférentiellement d'au moins 3 g/L, avantageusement d'au moins 4 g/L et de manière particulièrement avantageuse d'au moins 5 g/L.
18. Le procédé selon une quelconque des revendications précédentes 1 à 17 comprenant en outre l'étape de culture des microorganismes prélevés et/ou conservés.
19. Le procédé selon une quelconque des revendications précédentes 1 à 18 comprenant en outre l'étape de détection spécifique des microorganismes prélevés, conservés et/ou cultivés.
20. Le procédé selon la revendication 19 dans lequel la détection spécifique est réalisée par immunologie.
21. Le procédé selon la revendication 19 ou 20 dans lequel la détection spécifique est réalisée (en outre) par analyse génétique.
22. Le procédé selon une quelconque des revendications 19 à 21, dans lequel un test biochimique est (en outre) réalisé, ledit test biochimique étant un test enzymatique, ou impliquant des protéines ou des enzymes, de préférence l'ATP métrie, la mesure du NADH, la mesure de l'activité catalase et la mesure de résidus de protéines.
23. Le procédé selon une quelconque des revendications 18 à 22 dans lequel le microorganisme est Salmonella sp. et/ou Listeria sp.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
BE20225483A BE1030647B1 (fr) | 2022-06-20 | 2022-06-20 | Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires |
PCT/EP2023/066576 WO2023247500A1 (fr) | 2022-06-20 | 2023-06-20 | Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro- alimentaires |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
BE20225483A BE1030647B1 (fr) | 2022-06-20 | 2022-06-20 | Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
BE1030647A1 true BE1030647A1 (fr) | 2024-01-22 |
BE1030647B1 BE1030647B1 (fr) | 2024-01-29 |
Family
ID=82403625
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
BE20225483A BE1030647B1 (fr) | 2022-06-20 | 2022-06-20 | Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
BE (1) | BE1030647B1 (fr) |
WO (1) | WO2023247500A1 (fr) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE10304331A1 (de) | 2003-02-04 | 2004-08-12 | Henkel Kgaa | Enzymatische Entfernung von Biofilmen auf Haushaltsoberflächen |
EP2243821A1 (fr) | 2009-04-20 | 2010-10-27 | Realco SA | Produit et procédé d'élimination des biofilms |
EP2537601A1 (fr) | 2011-06-24 | 2012-12-26 | Realco | Trousse et procédé de détection de biofilms |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101040052A (zh) * | 2004-09-10 | 2007-09-19 | 诺维信北美公司 | 防止、去除、减少或破坏生物膜的方法 |
BE1023885B1 (fr) * | 2016-06-29 | 2017-09-04 | Realco | Support imprégné d'au moins une composition pour le prélèvement de microorganismes présents sur une surface |
-
2022
- 2022-06-20 BE BE20225483A patent/BE1030647B1/fr active IP Right Grant
-
2023
- 2023-06-20 WO PCT/EP2023/066576 patent/WO2023247500A1/fr unknown
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE10304331A1 (de) | 2003-02-04 | 2004-08-12 | Henkel Kgaa | Enzymatische Entfernung von Biofilmen auf Haushaltsoberflächen |
EP2243821A1 (fr) | 2009-04-20 | 2010-10-27 | Realco SA | Produit et procédé d'élimination des biofilms |
EP2537601A1 (fr) | 2011-06-24 | 2012-12-26 | Realco | Trousse et procédé de détection de biofilms |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2023247500A1 (fr) | 2023-12-28 |
BE1030647B1 (fr) | 2024-01-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP2537601B1 (fr) | Trousse et procédé de détection de biofilms | |
EP3341461B1 (fr) | Support imprégné d'au moins une composition pour le prélèvement de microorganismes présents sur une surface | |
Macarisin et al. | Survival of outbreak, food, and environmental strains of Listeria monocytogenes on whole apples as affected by cultivar and wax coating | |
Madden et al. | The emerging contribution of social wasps to grape rot disease ecology | |
FR2732037A1 (fr) | Procede de detection de microorganismes par separation et culture sur un systeme gelifie, systeme gelifie et necessaire de dosage pour mettre en oeuvre ce procede, utilisation en microbiologie | |
JP5960421B2 (ja) | 細胞の測定方法及び細胞の測定用試薬 | |
BE1030647B1 (fr) | Procede d'echantillonnage de microorganismes sur des surfaces industrielles agro-alimentaires | |
BE1023894B1 (fr) | Composition comprenant au moins un composant détergent et au moins un composant enzymatique pour l'élimination de biofilms | |
BE1030645B1 (fr) | Methode de detection de microorganismes | |
BE1030650A1 (fr) | Composition de decrochage et de prelevement de microorganismes | |
BE1030646A1 (fr) | Kit de prélèvement comprenant une solution de conservation pour la collecte de microorganismes | |
WO2023247502A1 (fr) | Composition de decrochage et de prelevement de microorganismes | |
Holah et al. | Food industry biofilms | |
EP2348867B1 (fr) | Composition et procede pour le traitement de la cercosporiose du bananier | |
Ng et al. | Antibacterial effects of effective ecoproduce on Enterococcus faecalis: An in vitro Study | |
CA2711264C (fr) | Utilisation d'acide alcane-sulfonique pour le detartrage dans l'industrie agro-alimentaire | |
Wirtanen et al. | Sanitation in dairies | |
CA3134894A1 (fr) | Billes de verre fonctionnalisees, leur utilisation pour capter des micro-organismes et les dispositifs correspondants | |
EP2789682A1 (fr) | Procédé d'élimination de biofilms pour le nettoyage d'instruments médicaux, en particulier pour lutter contre les maladies nosocomiales | |
Jay et al. | Culture, microscopic, and sampling methods | |
WO2019081744A1 (fr) | Kit de detection des contaminations residuelles sur des dispositifs medicaux | |
BE1021388B1 (fr) | Procede d'aumentation de la duree de vie de denrees perissables. | |
Karaca et al. | Evaluation of Clean-in-Place Agents on the Removal of Thermophilic Biofilms Formed under Partially Simulated Conditions Associated with the Dairy Industry. | |
WO2023021119A1 (fr) | Methode de controle d'un procede de decontamination | |
FR2677373A1 (fr) | Detection de pesticides de la famille des organophosphores et/ou des carbamates, en milieu aqueux. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FG | Patent granted |
Effective date: 20240129 |