WO2024075813A1 - ジケトピペラジン化合物を用いるポリペプチド合成 - Google Patents
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Classifications
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- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
Definitions
- the present invention relates to a novel diketopiperazine compound and a method for producing the same, as well as a method for producing a polypeptide using the novel diketopiperazine compound.
- polypeptides have been considered important as an innovative drug discovery modality for next-generation pharmaceuticals. Therefore, there is an urgent need to develop technology and establish a supply system to quickly and cheaply synthesize polypeptides with specific sequences and supply them to drug discovery and medical facilities.
- polypeptides are synthesized by organic synthetic chemistry techniques, using methods known as liquid phase synthesis or solid phase synthesis.
- amino acids with protected amino groups are used as raw materials, and after activating the protected amino acids, they are condensed with another amino acid or a peptide compound, the protecting group of the amino group is removed, and condensation with the next amino acid is initiated.
- This is an extremely complicated method of extending the peptide chain one by one (Non-Patent Documents 1, 2, 3, 4).
- this series of processes includes operations such as acid treatment, base treatment, solvent extraction, and solvent washing, and the large amount of waste generated during this process not only increases production costs, but also poses a major problem from the perspective of protecting the global environment.
- Non-Patent Documents 7, 8, 9 disclose a process for breeding a host that produces the target polypeptide and for obtaining the pure target product from the large amount of biological impurities contained in the culture solution.
- Patent Document 1 a method of amidating a carboxylic acid/ester compound having a hydroxy group at the ⁇ -position in the presence of a specific metal catalyst
- Patent Document 2 a method of using a hydroxyamino/imino compound as an amino acid precursor, amidating this in the presence of a specific metal catalyst, and then reducing it in the presence of a specific metal catalyst
- Patent Document 3 a method of amidating a carboxylic acid/ester compound in the presence of a specific metal catalyst
- Patent Document 4 a technique for synthesizing peptides consisting of various amino acid residues with high efficiency and high selectivity by amidating the carboxyl group of an N-terminal protected amino acid/peptide with the amino group of a C-terminal protected amino acid/peptide in the presence of a specific silylating agent (and a Lewis acid catalyst optionally used in combination), followed by deprotection
- Patent Document 4 a technique for synthesizing peptides consisting of various amino acid residues with high efficiency and high selectivity by amidating the carboxyl group of an N-terminal protected or unprotected amino acid/peptide with the amino group of a C-terminal protected or unprotected amino acid/peptide in the presence of a specific silylating agent, followed by deprotection
- Patent Documents 5 and 6 a technique for performing an amidation reaction using a Brönsted acid as a catalyst
- Patent Document 7 a novel silane-containing condensed ring dipeptide compound and
- the present invention was made in consideration of the above background, and its purpose is to provide a method for quickly and easily synthesizing a polypeptide having any sequence.
- the gist of the present invention relates to, for example, the following.
- [Item 1] General formula (1): (In the formula, R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , and R 5 each independently represent a hydrogen atom, an unsubstituted or substituted hydrocarbon group, or an unsubstituted or substituted heterocyclic group. However, R 1 and R 2 , R 1 and R 5 , R 2 and R 5 , and/or R 3 and R 4 may be linked to form a ring.
- PGE represents an electron-withdrawing protecting group.
- PGE represents an electron-withdrawing protecting group.
- a method for producing a diketopiperazine compound represented by the following formula: (a) General formula (2): (In the formula, R 1 , R 2 , R 3 , and R 4 have the same definitions as in formula (1′), and PGA represents an alkyl-type protecting group.)
- a diketopiperazine compound having two different protecting groups PGE and PGA introduced therein is obtained, (b) removing only the alkyl-type protecting group PGA from the compound of formula (3) obtained in the step (a).
- the manufacturing method further comprises: (c) General formula (4): (In the formula, R 1 , R 2 , R 3 , and R 4 are defined the same as in formula (1′), PGA is defined the same as in formula (2), R 6 is independent of R 1 to R 4 and represents a hydrogen atom, an unsubstituted or substituted hydrocarbon group, or an unsubstituted or substituted heterocyclic group, and R 7 represents hydrogen or an amino-protecting group which can be removed under acidic conditions.)
- the method includes treating a dipeptide compound represented by the following general formula (3) under acidic conditions to obtain the compound represented by the following general formula (3): Item 7.
- the manufacturing method further comprises: (d) General formula (5): (In the formula, R 1 and R 2 have the same definition as in formula (1'), PGA has the same definition as in formula (2), and R 7 has the same definition as in formula (4).) and an amino acid protected with an alkyl-type substituent represented by general formula (6): (In the formula, R3 and R4 have the same definition as in formula (1'), and R6 has the same definition as in formula (4).) and an amino acid ester represented by the general formula (4) to obtain a compound represented by the general formula (4), Item 8.
- step (d) The method according to Item 7, wherein the compound of formula (4) obtained in step (d) is used as a raw material in step (c).
- step (d) The method according to any one of Items 6 to 8, wherein PGA is a benzyl group or a substituted benzyl group.
- step 10 The method according to any one of Items 6 to 9, wherein PGE is a tert-butoxycarbonyl group.
- item 11 The method according to any one of items 7 to 10, wherein R 6 is a methyl group or an ethyl group.
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 8 , R 9 , R 10 , R 11 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, an unsubstituted or substituted hydrocarbon group, or an unsubstituted or substituted heterocyclic group.
- R 1 and R 2 , R 1 and R 5 , R 2 and R 5 , R 3 and R 4 , R 8 and R 9 , and/or R 10 and R 11 may be linked to form a ring.
- X represents a hydroxyl group, an alkoxyl group, an alkylthio group, an amino group, or a substituted amino group.
- n represents 0 or 1
- p represents an integer of 2 or more.
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , and R 5 each may be 2 or more. and when m is 2 or more, each of two or more R 8 , R 9 , and R 13 may be the same or different.
- PGE represents an electron-withdrawing protecting group.
- novel diketopiperazine compounds of the present invention can be used as versatile building blocks for polypeptide synthesis. This makes it possible to rapidly and easily synthesize polypeptides with any sequence.
- amino acid refers to a compound having a carboxyl group and an amino group.
- the type of amino acid is not particularly limited.
- it may be D-form, L-form, or racemic.
- it may be any of ⁇ -amino acid, ⁇ -amino acid, ⁇ -amino acid, ⁇ -amino acid, ⁇ -amino acid, etc.
- amino acids include, but are not limited to, natural amino acids that constitute proteins, and specific examples include valine, leucine, isoleucine, alanine, arginine, glutamine, lysine, aspartic acid, glutamic acid, proline, cysteine, threonine, methionine, histidine, phenylalanine, tyrosine, tryptophan, asparagine, glycine, serine, etc.
- peptide refers to a compound in which multiple amino acids are linked via peptide bonds.
- the multiple amino acid units constituting a peptide may be the same type of amino acid unit, or may be two or more different types of amino acid units.
- the number of amino acids constituting a peptide is not particularly limited as long as it is two or more. Examples include 2 (also called “dipeptides”), 3 (also called “tripeptides”), 4 (also called “tetrapeptides”), 5 (also called “pentapeptides”), 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30, 40, 50, 100, or more.
- polypeptide may refer to a peptide that is tripeptide or more.
- an "amino group” refers to a functional group represented by the formula -NH 2 , -NRH, or -NRR' (wherein R and R' each represent a substituent) obtained by removing hydrogen from ammonia, a primary amine, or a secondary amine, respectively.
- the hydrocarbon group may be aliphatic or aromatic.
- the aliphatic hydrocarbon group may be linear or cyclic.
- the linear hydrocarbon group may be linear or branched.
- the cyclic hydrocarbon group may be monocyclic, bridged, or spirocyclic.
- the hydrocarbon group may be saturated or unsaturated, in other words, may contain one or more carbon-carbon double bonds and/or triple bonds. That is, the concept of the hydrocarbon group includes alkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, cycloalkyl groups, cycloalkenyl groups, cycloalkynyl groups, aryl groups, and the like.
- one or more hydrogen atoms of the hydrocarbon group may be replaced with any substituent, and one or more carbon atoms of the hydrocarbon group may be replaced with any heteroatom depending on the valence.
- hydrocarbon oxy group refers to a group in which a hydrocarbon group as defined above is linked to one bond of an oxy group (-O-).
- a heterocyclic group may be saturated or unsaturated, in other words, may contain one or more carbon-carbon double bonds and/or triple bonds.
- a heterocyclic group may be monocyclic, bridged, or spirocyclic.
- the heteroatoms contained in the heterocyclic rings of a heterocyclic group are not limited, but examples include nitrogen, oxygen, sulfur, phosphorus, silicon, etc.
- heterocyclic oxy group refers to a group in which a heterocyclic group as defined above is linked to one bond of an oxy group (-O-).
- substituteduents refer to any substituent, each independently and unless otherwise specified, without any particular limitation as long as the amidation step in the production method of the present invention proceeds.
- alkyl group include, but are not limited to, a halogen atom, a hydroxyl group, a carboxyl group, a nitro group, a cyano group, a thiol group, a sulfonic acid group, an amino group, an amido group, an imino group, an imido group, a hydrocarbon group, a heterocyclic group, a hydrocarbonoxy group, a hydrocarboncarbonyl group (acyl group), a hydrocarbonoxycarbonyl group, a hydrocarboncarbonyloxy group, a hydrocarbon-substituted amino group, a hydrocarbon-substituted aminocarbonyl group, a hydrocarboncarbonyl-substituted amino group, a hydrocarbon-substituted thiol group, a hydrocarbons
- amino acids and their residues may be represented by three-letter abbreviations well known to those skilled in the art.
- the three-letter abbreviations of the main amino acids used in this disclosure are shown in the following table.
- ⁇ -homo amino acids and their residues may be represented by adding "Ho" before the three-letter abbreviation of the corresponding ⁇ -amino acid.
- protecting group refers to a functional group that can be introduced onto the nitrogen atom of an amino or amide group under specific reaction conditions and can be removed under specific reaction conditions. Representative protecting groups are described in detail in several textbooks, such as Peter G. M. Wuts, Greene's Protective Groups in Organic Synthesis, 5th Edition, Wiley, 2014.
- alkyl-type protecting group refers to a hydrocarbon group that can be easily attached to and detached from the nitrogen atom of an amino group or an amide group. Examples include an unsubstituted or substituted benzyl group, an unsubstituted or substituted allyl group, etc.
- the term "electron-withdrawing protecting group” refers to a protecting group that acts as a protecting group for an amino group or an amide group, and that attracts electrons on the nitrogen atom toward the protecting group.
- examples include acyl groups, alkyloxycarbonyl groups, alkylsulfonyl groups, and arylsulfonyl groups.
- One aspect of the present invention relates to a novel diketopiperazine compound represented by general formula (1) (hereinafter referred to as "the diketopiperazine compound of the present invention” or “the compound of the present invention” as appropriate).
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , and R 5 each independently represent a hydrogen atom, a hydrocarbon group which is unsubstituted or substituted with one or more substituents, or a heterocyclic group which is unsubstituted or substituted with one or more substituents.
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , and R 5 include, but are not limited to, a hydrogen atom, a methyl group, an ethyl group, an allyl group, an isopropyl group, an isobutyl group, a sec-butyl group, a phenyl group, a benzyl group, a 4-methoxybenzyl group, a 2,4-dimethoxybenzyl group, a 3,4-dimethoxybenzyl group, a 4-hydroxybenzyl group, a 2,4-hydroxybenzyl group, a 3,4-hydroxybenzyl group, a hydroxymethyl group, a 1-hydroxypropyl group, an indole group, a mercaptomethyl group, a methylthioethyl group, an aminobutyl group, a methoxycarbonylmethyl group, a methoxycarbonylethyl group, an imidazolylmethyl group, an amidomethyl
- R1 and R2 , R1 and R5 , R2 and R5 , and/or R3 and R4 may be linked together to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group). These rings may be further substituted with one or more substituents. When these rings have a substituent, the type of the substituent is as described above. When these rings have two or more substituents, they may be the same or different.
- R 1 to R 5 are each a hydrocarbon group or a heterocyclic group
- a linking group may be present between the hydrocarbon group or heterocyclic group and the carbon atom or nitrogen atom to which it is bonded.
- Such linking groups are not limited, but may each be independently selected from the structures shown below (note that in the chemical formula below, each A independently represents a hydrocarbon group or a heterocyclic group of R 1 to R 5. When there are two A in the same group, they may be the same or different).
- PGE represents an electron-withdrawing protecting group.
- Specific examples include carbamate-type protecting groups such as tert-butoxycarbonyl, 9-fluorenylmethoxycarbonyl, and benzyloxycarbonyl groups, sulfonyl-type protecting groups such as methanesulfonyl, benzenesulfonyl, and p-benzenesulfonyl groups, and bulky acyl groups such as benzoyl and pivaloyl groups.
- the electron-withdrawing protecting group a carbamate-type protecting group is preferred, and a tert-butoxycarbonyl group is more preferred.
- the diketopiperazine compounds of the present invention can be used as versatile building blocks for polypeptide synthesis. This makes it possible to rapidly and easily synthesize polypeptides having any sequence. A method for producing such polypeptides will be described later.
- the method for producing the diketopiperazine compound of the present invention is not limited, and it can be produced by any method.
- the compound in which R 5 of general formula (1) is a hydrogen atom that is, the diketopiperazine compound represented by the following general formula (1')
- the present invention also provides a method for producing the diketopiperazine compound of general formula (1').
- R1 , R2 , R3 , R4 , and PGE are the same as those in general formula (1).
- R1 and R2 , and/or R3 and R4 may be linked to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group), and such a ring may further have one or more substituents.
- the diketopiperazine compound of formula (1') is preferably produced by the synthesis route shown in Scheme 1 below.
- Such a production method for the diketopiperazine compound of formula (1') (hereinafter referred to as the "production method for the diketopiperazine compound of the present invention” or the “production method for compound (1') of the present invention” as appropriate) also constitutes one aspect of the present invention.
- the method for producing a diketopiperazine compound of the present invention may include at least step (a) of obtaining a compound of general formula (3) by adding an electron-withdrawing protecting group PGE to a compound of general formula (2), and step (b) of obtaining a compound of general formula (1') by removing an alkyl-type protecting group PGA from a compound of general formula (3).
- Step (c) of synthesizing a compound of general formula (2) from a compound of general formula (4), and step (d) of synthesizing a compound of general formula (4) by reacting a compound of general formula (5) with a compound of general formula (6) are not essential but are optional. In light of this, steps (a), (b), (c), and (d) will be described below in this order.
- a diketopiperazine compound represented by the following general formula (2) in which one nitrogen atom in a 6-membered ring is protected with an alkyl-type protecting group
- a diketopiperazine compound represented by the following general formula (3) in which two different protecting groups PGE and PGA have been introduced, by protecting the other unprotected nitrogen atom in the 6-membered ring with an electron-withdrawing protecting group.
- R 1 , R 2 , R 3 , and R 4 have the same definitions as in general formulas (1) and (1').
- R 1 and R 2 and/or R 3 and R 4 may be linked to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group), and such a ring may further have one or more substituents.
- PGA represents an alkyl-type protecting group.
- examples include a benzyl group, a substituted benzyl group, an allyl group, and a substituted allyl group. More specifically, examples include a benzyl group, a 4-methoxybenzyl group, a 3,4-dimethoxybenzyl group, and a 2,4-dimethoxybenzyl group. Of these, the 4-methoxybenzyl group is preferred.
- PGE represents an electron-withdrawing protecting group. Details are as explained for general formula (1).
- step (a) the reaction conditions for protecting the nitrogen atom in the six-membered ring with an electron-withdrawing protecting group are not particularly limited and can be selected appropriately.
- the conditions for introducing individual protecting groups are widely known to those skilled in the art and are also described in detail in the aforementioned textbook (Greene's Protective Groups in Organic Synthesis).
- reaction conditions for removing the electron-withdrawing protecting group in step (b) are not particularly limited and can be selected appropriately.
- the reaction conditions for removing each protecting group are widely known to those skilled in the art and are described in detail in the aforementioned textbook (Greene's Protective Groups in Organic Synthesis).
- the compound of general formula (3) used in step (a) may be an existing compound or may be synthesized.
- the method for synthesizing the compound of general formula (3) is not particularly limited, but it is preferable to synthesize the compound by treating a dipeptide compound represented by the following general formula (4) under acidic conditions.
- a step (c) of synthesizing a dipeptide compound of general formula (3) by such a method may be provided before step (a) in the method for producing a diketopiperazine compound of the present invention.
- R 1 , R 2 , R 3 , and R 4 have the same definitions as in general formulas (1) and (1').
- R 1 and R 2 and/or R 3 and R 4 may be linked to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group), and such a ring may further have one or more substituents.
- PGA represents an alkyl-type protecting group. Details are as explained for general formulas (2) and (3).
- R6 represents, independently of R1 to R4 , a hydrogen atom, an unsubstituted or substituted hydrocarbon group, or an unsubstituted or substituted heterocyclic group.
- Preferred examples of R6 include, but are not limited to, a methyl group or an ethyl group.
- R7 represents a hydrogen atom or an amino-protecting group that is removable under acidic conditions.
- Specific examples include a hydrogen atom, a methoxycarbonyl group, and a tert-butoxycarbonyl group. Of these, a hydrogen atom or a tert-butoxycarbonyl group is preferable.
- Bronsted acids and Lewis acids can be used as the acidic conditions for the reaction in step (c).
- Bronsted acids are preferred. Specific examples include formic acid, acetic acid, propionic acid, benzoic acid, trichloroacetic acid, trifluoroacetic acid, methanesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid, phosphoric acid, hydrochloric acid, sulfuric acid, and nitric acid.
- carboxylic acids such as formic acid and acetic acid are preferred.
- the amount of acid used in the reaction of step (c) is 0.1 to 10 molar equivalents, preferably 1 to 5 molar equivalents, relative to the dipeptide compound of general formula (4).
- the reaction solvent used in this reaction can be an alcohol solvent such as methanol or ethanol, a hydrocarbon solvent such as toluene, an ether solvent such as tetrahydrofuran, an ester solvent such as ethyl acetate, a nitrogen-containing solvent such as acetonitrile, an aprotic polar solvent such as dimethyl sulfoxide, a halogenated solvent such as dichloromethane, or a mixture of these.
- an alcohol solvent such as methanol or ethanol
- a hydrocarbon solvent such as toluene
- an ether solvent such as tetrahydrofuran
- an ester solvent such as ethyl acetate
- a nitrogen-containing solvent such as acetonitrile
- an aprotic polar solvent such as dimethyl sulfoxide
- a halogenated solvent such as dichloromethane, or a mixture of these.
- the reaction proceeds at temperatures between 20 and 120°C, but may be heated further to increase the rate.
- the reaction time is 1 to 12 hours, and if the amount of acid used and the reaction temperature are appropriately selected, the reaction will be completed within 1 to 5 hours.
- the dipeptide compound of general formula (4) used in step (c) may be an existing compound or may be synthesized.
- the method for synthesizing the dipeptide compound of general formula (4) is not particularly limited, but it is preferable to synthesize the compound by condensing an amino acid protected with an alkyl-type substituent represented by the following general formula (5) with an amino acid ester represented by the following general formula (6).
- a step (d) of synthesizing the dipeptide compound of general formula (4) by such a method may be provided before step (c) in the method for producing a diketopiperazine compound of the present invention.
- R 1 , R 2 , R 3 , and R 4 have the same definitions as in general formulas (1) and (1').
- R 1 and R 2 and/or R 3 and R 4 may be linked to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group), and such a ring may further have one or more substituents.
- R6 and R7 have the same definitions as in formula (4).
- PGA has the same definition as in general formula (2).
- the type and conditions of the condensation reaction in step (d) are not particularly limited and can be selected as appropriate.
- the synthesis can be performed using the reaction conditions of the method described in the literature (e.g., T. Hattori et al., J. Am. Chem. Soc., (2022), vol. 144, No. 4, pp. 1758-1765, etc.).
- a conventional peptide synthesis reaction using a condensation agent and an activator can also be used.
- the above-described method for producing a diketopiperazine compound of the present invention makes it possible to efficiently synthesize a diketopiperazine compound of the present invention having any structure composed of any natural or unnatural amino acid.
- Another aspect of the present invention relates to a method for producing a polypeptide having a chain length of tetrapeptide or longer by using a diketopiperazine compound of the present invention as a building block (hereinafter appropriately referred to as "method for producing the polypeptide of the present invention").
- the method for producing a polypeptide of the present invention uses a nitrogen nucleophile compound represented by general formula (8) and p types of diketopiperazine compounds of general formula (1) (the compounds of the present invention) to produce a polypeptide represented by general formula (7).
- a nitrogen nucleophile compound represented by general formula (8) and p types of diketopiperazine compounds of general formula (1) (the compounds of the present invention) to produce a polypeptide represented by general formula (7).
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 and PGE have the same definitions as in general formula (1).
- R 1 and R 2 , R 1 and R 5 , R 2 and R 5 , and/or R 3 and R 4 may be linked to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group), and such a ring may further have one or more substituents.
- R 8 , R 9 , R 10 , R 11 , R 12 , and R 13 each independently represent a hydrogen atom, a hydrocarbon group which is unsubstituted or substituted with one or more substituents, or a heterocyclic group which is unsubstituted or substituted with one or more substituents.
- R 8 , R 9 , R 10 , R 11 , R 12 , and R 13 include, but are not limited to, a hydrogen atom, a methyl group, an ethyl group, an allyl group, an isopropyl group, an isobutyl group, a sec-butyl group, a phenyl group, a benzyl group, a 4-methoxybenzyl group, a 2,4-dimethoxybenzyl group, a 3,4-dimethoxybenzyl group, a 4-hydroxybenzyl group, a 2,4-hydroxybenzyl group, a 3,4-hydroxybenzyl group, a hydroxymethyl group, a 1-hydroxypropyl group, an indole group, a mercaptomethyl group, a methylthioethyl group, an aminobutyl group, a methoxycarbonylmethyl group, a methoxycarbonylethyl group, an imidazolylmethyl group,
- R8 and R9 , and/or R10 and R11 may be linked together to form a ring (e.g., a cyclic aliphatic hydrocarbon group, an aromatic hydrocarbon group, or a heterocyclic group). These rings may be further substituted with one or more substituents. When these rings have a substituent, the type of the substituent is as described above. When these rings have two or more substituents, they may be the same or different.
- R 8 to R 13 are each a hydrocarbon group or a heterocyclic group
- a linking group may be present between the hydrocarbon group or heterocyclic group and the carbon atom or nitrogen atom to which it is bonded.
- Such linking groups are not limited, but may each be independently selected from the structures shown below (note that in the chemical formula below, each A independently represents a hydrocarbon group or heterocyclic group of R 1 to R 5. When there are two A in the same group, they may be the same or different).
- X represents a hydroxyl group, an alkoxyl group, an alkylthio group, an amino group, or a substituted amino group having one or two substituents.
- a substituted amino group the type of the substituent is as described above.
- X include, but are not limited to, a hydroxyl group, a methoxy group, an ethoxy group, an isopropoxy group, a tert-butoxy group, a phenoxy group, a benzyloxy group, a methylthio group, an ethylthio group, a tert-butylthio group, a phenylthio group, an amino group, a methylamino group, a dimethylamino group, a benzylamino group, a dibenzylamino group, and a 4-methoxybenzylamino group.
- m represents an integer of 0 or more, and n represents 0 or 1.
- R8 , R9 , and R13 each of which is 2 or more, may be the same or different.
- the m structural units (amino acid residues) in the parentheses with m in general formulas (7) and (8) may be the same or different from each other.
- p represents an integer of 2 or more.
- R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , and R 5 each of which is 2 or more, may be the same or different.
- the p structural units (dipeptide residues) in the parentheses with p in general formula (7) may be the same or different.
- the method for producing the polypeptide of the present invention includes the following steps (x) and (y).
- a nitrogen nucleophile compound represented by general formula (8) is used as a nitrogen nucleophile to react with a diketopiperazine compound represented by general formula (1) (the compound of the present invention) to open the lactam group containing a nitrogen atom to which the electron-withdrawing protecting group PGE of the compound of general formula (1) is bonded, and the resulting dipeptide is linked to the N-terminal amino group of the compound of general formula (8), thereby obtaining a reaction product (a compound represented by general formula (7') in the above scheme 2).
- reaction conditions in step (x) are not particularly limited and can be selected arbitrarily.
- hydrocarbon solvents such as toluene
- ether solvents such as tetrahydrofuran
- ester solvents such as ethyl acetate
- nitrogen-containing solvents such as acetonitrile
- aprotic polar solvents such as dimethylsulfoxide
- halogenated solvents such as dichloromethane
- step (x) can be carried out under mild, neutral conditions at 0 to 60°C, but the reaction may be accelerated, if necessary, by heating or adding a base catalyst.
- a new diketopiperazine compound of general formula (1) the compound of the present invention
- step (y) the reaction product obtained in step (y) from which the electron-withdrawing protecting group has been removed can be used as a new nitrogen nucleophile to react with a new diketopiperazine compound of general formula (1) (the compound of the present invention), a simple routine operation, i.e., step (y), can be repeatedly carried out. In this way, by repeating step (y) p-1 times, it is possible to obtain a polypeptide of general formula (7).
- the total p kinds of diketopiperazine compounds of general formula (1) (compounds of the present invention) used in step (x) and p-1 times of step (y) may be the same or different.
- the type and order of the diketopiperazine compounds of general formula (1) (compounds of the present invention) used it is possible to obtain a polypeptide of general formula (7) having any amino acid sequence.
- the conditions for the deprotection reaction of the electron-withdrawing protecting group PGE are not particularly limited and can be selected appropriately.
- the conditions for removing individual protecting groups are widely known to those skilled in the art and are also described in detail in the aforementioned textbook (Greene's Protective Groups in Organic Synthesis).
- step (x) and/or step (y) may be performed under microwave irradiation.
- the reaction rate may be accelerated.
- the conditions are as follows.
- a commercially available microwave generator for example, Discover SP Microwave Synthesizer from CEM
- the power used for generating microwaves but it may be, for example, 100 to 1600 W.
- the microwave irradiation time but it may be, for example, 0.5 to 12 hours.
- steps (x) and (y) can be carried out consecutively in the same reaction solvent as exemplified above, but the reaction products obtained in each step can be isolated and purified by conventional methods before being used in the next step.
- the polypeptide of general formula (7) obtained by the method for producing a polypeptide of the present invention may be subjected to various post-treatments.
- the produced polypeptide of general formula (7) may be isolated and purified by conventional methods such as column chromatography and recrystallization.
- the produced polypeptide of general formula (7) has an amino group and/or a carboxyl group protected by a protecting group or the like, it may be deprotected by the method described below.
- the method for producing a polypeptide of the present invention using the diketopiperazine compound of the present invention described above differs from conventional peptide synthesis methods in that it allows two amino acids to be elongated at once in one step. Furthermore, it does not require specialized knowledge or experience specific to peptide chemistry and can be easily carried out. Furthermore, even in the case of peptide synthesis containing a non-natural amino acid that is known to be difficult to synthesize, synthesis of a polypeptide containing this can be easily carried out by using the diketopiperazine compound of the present invention that already contains this amino acid.
- the present invention provides a completely new methodology for peptide synthesis that allows anyone to quickly obtain a desired polypeptide with simple routine operations.
- diketopiperazine compounds of the present invention that are used as versatile building blocks, which are key raw materials in the method for producing the polypeptides of the present invention
- diketopiperazine compounds composed of any natural or unnatural amino acid can be efficiently synthesized by using the method for producing diketopiperazine compounds of the present invention described above.
- the present invention provides a new methodology for polypeptide synthesis, and it may be particularly preferable to carry out the method for producing the polypeptide of the present invention using a diketopiperazine compound of the present invention having a specific structure.
- a polypeptide in which an unsubstituted or substituted hydrocarbon group is introduced as R 5 in general formula (7) can be produced.
- a polypeptide in which an unsubstituted or substituted hydrocarbon group is introduced on the amide nitrogen instead of a hydrogen atom in R 5 is less susceptible to degradation by enzymes such as peptidase in vivo, and is therefore frequently used in partial structures aimed at improving the pharmacokinetics of peptide drugs.
- a polypeptide in which R 1 and R 2 are not both hydrogen atoms and/or R 3 and R 4 are not both hydrogen atoms has the effect of increasing absorbability in the body, and is therefore frequently used in partial structures aimed at improving the bioavailability of peptide pharmaceuticals.
- R 1 and R 2 are not both hydrogen atoms and/or R 3 and R 4 are not both hydrogen atoms
- R 1 and R 2 are not both hydrogen atoms and/or R 3 and R 4 are not both hydrogen atoms
- the method for producing a polypeptide of the present invention using the diketopiperazine compound of the present invention may be combined with other conventionally known amidation methods or peptide production methods to further extend the amino acid residues. In principle, this makes it possible to synthesize a polypeptide with any number of amino acid residues and any amino acid sequence.
- Patent Document 3 2018/199147 (Patent Document 3) (4) International Publication No. 2019/208731 (Patent Document 4) (5) International Publication No. 2021/085635 (Patent Document 5) (6) International Publication No. 2021/085636 (Patent Document 6) (7) International Publication No. 2021/149814 (Patent Document 7) (8) International Publication No. 2022/190486 (Patent Document 8)
- the present inventors have also disclosed a method for producing a polypeptide compound by an amide-forming reaction between an amino-protected lactam compound of a specific structure and an amino acid ester or peptide ester compound of a specific structure (W. Muramatsu et al., Chem. Sci., (2022), Vol. 13, pp. 6309-6315; Non-Patent Document 8 mentioned above), and have filed a separate prior patent application (International Patent Application PCT/JP2022/024418; unpublished at the time of filing this application).
- the method for producing a polypeptide of the present invention can be carried out in appropriate combination with the amidation reaction and the method for producing a polypeptide described in the non-patent document and the prior patent application, and/or can be appropriately modified in consideration of the conditions of the amidation reaction and the method for producing a polypeptide described in these prior patent applications.
- the descriptions in the non-patent document and the prior patent application are also incorporated herein in their entirety by reference.
- Boc-Gly-Gly-Phe-OBzl 7a, 375 mg, 0.8 mmol was added to a dry 50 mL flask together with a magnetic stirring bar, and 4N HCl/1,4-dioxane (15 mL) was added under cooling at 0° C., followed by stirring at room temperature for 15 minutes. After confirming the completion of the reaction by TLC, the reaction was quenched with saturated aqueous sodium bicarbonate (20 mL).
- reaction mixture was transferred to a separatory funnel and extracted three times with chloroform (30 mL).
- the organic layer was then dried over anhydrous magnesium sulfate, and the residue obtained by concentrating the solvent was purified by flash silica gel column chromatography (0 to 10% MeOH in CHCl 3 ) to obtain H-Gly-Gly-Phe-OBzl (9a) in which the terminal amino group was deprotected as a colorless oil (160 mg, yield 54%).
- a flame-dried 5.0 mL screw-cap vial containing a magnetic stir bar was charged with ⁇ -Me-N-AA1-OH of formula 1 (0.50 mmol), bis(1-imidazolyl)dimethylsilane (105 mg, 0.55 mmol), and dry dichloromethane (200 ⁇ L).
- the reaction mixture was stirred vigorously at room temperature for 5 min, followed by addition of 1-(trimethylsilyl)imidazole (110.2 ⁇ L, 0.75 mmol), Ta(OEt) 5 (13 ⁇ L, 0.050 mmol), and H-L-AA2-OMe of formula 2 (1 mmol, 2 equiv.).
- the vial was sealed under an argon atmosphere and removed from the glove box.
- the reaction mixture was stirred vigorously at 60° C. for 24 h, after which the reaction mixture was purified by flash column chromatography (0-5% methanol in chloroform) to give cyclo(-L-AA1-Me-AA2-) of formula 3.
- reaction mixture was transferred to a separatory funnel with chloroform (20 mL) and saturated aqueous ammonium chloride (NH 4 Cl) solution (15 mL) was added.
- NH 4 Cl saturated aqueous ammonium chloride
- the phases were separated and the aqueous phase was extracted with chloroform (2 ⁇ 20 mL).
- the organic phase was washed with water (10 mL) and brine ( 10 mL), dried over sodium sulfate ( Na2SO4 ), filtered, and concentrated in vacuo using a rotary evaporator and water bath without heat.
- the resulting crude product was purified by flash column chromatography (0-60% ethyl acetate in hexanes) to give the compound of formula 4.
- Example 2a By using alanine (Me as R and R1 ) as AA1 and AA2, compounds of formula 3a and formula 4a below were obtained.
- Example 2b By using alanine (-R is -Me) as AA1 and phenylalanine (-R 1 is -Me-Ph) as AA2, the compounds of the following formulae 3b and 4b were obtained.
- H-Phe-OMe.HCl (15.0 mmol) and dry methanol (20 mL) were placed in a flame-dried 100 mL flask containing a magnetic stir bar under nitrogen and sealed with a rubber septum.
- the reaction mixture was cooled to 0° C. and triethylamine (2 mL, 1 equiv.) was added via syringe and stirred at 0° C. for 5 min followed by 10 min at room temperature.
- p-Methoxybenzaldehyde (2.2 mL, 1.2 equiv.) was then added via syringe to the reaction mixture and stirred at room temperature for 2 h before being cooled to 0° C.
- the dipeptide of formula 3 PMB-NH-Phe-Leu-OMe (413 mg, 1.0 mmol) synthesized above, toluene and acetic acid (182 mg, 3 equiv.) were placed in a flame-dried 5.0 mL screw-cap vial containing a magnetic stir bar.
- the reaction vial was sealed with a screw cap and vinyl tape, and the reaction mixture was stirred in a preheated oil bath at 120° C. for 2 h. After completion of the reaction, the reaction mixture was diluted with ethyl acetate (5 mL).
- reaction mixture was transferred to a separatory funnel with chloroform (15 mL) and saturated aqueous ammonium chloride (NH 4 Cl) solution (10 mL) was added.
- NH 4 Cl saturated aqueous ammonium chloride
- the phases were separated and the aqueous phase was extracted with chloroform (chloroform, 2 ⁇ 20 mL).
- the organic phase was washed with water (10 mL) and brine (10 mL), dried over sodium sulfate (Na 2 SO 4 ), filtered, and concentrated in vacuo using a rotary evaporator and water bath without heat.
- the resulting crude product was purified by flash column chromatography (0-20% ethyl acetate in hexanes) to give the compound of formula 4 as a sticky solid (yield 0.455 g, 94%).
- the tripeptide of formula 3 obtained above (0.177 mg, 0.41 mmol) was placed in a 50 mL flask equipped with a magnetic stir bar and a rubber septum and cooled to 0° C. 10 mL of 4N hydrochloric acid in dioxane was added at 0° C. and the reaction mixture was allowed to stand at 0° C. for 15 min. The progress of the reaction was monitored by thin layer chromatography (TLC) and after the starting material of formula 3 was completely consumed, 20 mL of saturated aqueous sodium bicarbonate (NaHCO 3 ) was added. The reaction mixture was transferred to a separatory funnel and extracted with chloroform (3 ⁇ 50 mL).
- TLC thin layer chromatography
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Abstract
種々のポリペプチドを迅速かつ簡便に合成するための新規ジケトピペラジン化合物およびその製造法を提供する。斯かるジケトピペラジン化合物は、一般式(1)で表される。 (式中、R1、R2、R3、R4、及びR5は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表す。但し、R1とR2、R1とR5、R2とR5、及び/又は、R3とR4は、連結して環を形成していてもよい。PGEは、電子求引性保護基を表す。)
Description
本発明は、新規ジケトピペラジン化合物及びその製造方法、並びに斯かる新規ジケトピペラジン化合物を用いたポリペプチドの製造方法に関する。
近年、次世代医薬品のための革新的創薬モダリティとして、ポリペプチドが重要視されている。それゆえ特定の配列を有するポリペプチドを安価かつ迅速に合成し、創薬現場や医療現場に供給するための技術開発や供給体制の構築が急務となっている。
しかしながら、従来のペプチド合成技術でポリペプチドを製造するには、煩雑で非効率的な手法に頼らざるを得ないため、必要とされるポリペプチドを市場が求めるスピードと価格で供給することが極めて困難であった。
一般的に、ポリペプチドは、液相合成法又は固相合成法と呼ばれる方法により、有機合成化学的手法により合成されている。何れもアミノ基を保護したアミノ酸を原料に用い、保護アミノ酸を活性化した後に、別のアミノ酸又はペプチド化合物と縮合させ、アミノ基の保護基を除去して、次のアミノ酸との縮合を開始するという極めて煩雑な手法によりペプチド鎖をひとつずつ伸長させる必要がある(非特許文献1,2,3,4)。
また、この一連のプロセスには、酸処理、塩基処理、溶媒抽出、溶媒洗浄などの操作を含んでおり、その際の発生する大量の廃棄物処理が、製造コストを高めているのみならず、地球環境保護の観点からも大きな問題となっている。
さらに用いるアミノ酸の種類やその組み合わせによっては、極めて反応速度が遅いもの、低収率となるもの、生成物のラセミ化やエピメリ化をまねきやすいものなどの不具合が存在することは当業者のよく知るところである。このような不具合を避けるためにポリペプチド合成には豊富な経験と技術の熟練を必要としていた。
特に、α-アミノ基上に炭化水素基を有するアミノ酸やα-位に2つの側鎖を有するアミノ酸などの非天然アミノ酸は、従来のペプチド合成法による反応が低調であり低収率に終わることが多い(非特許文献5,6)。
尚、化学合成以外の製造手段として、大腸菌や酵母などの微生物を使ってポリペプチドを製造する方法の研究開発が進められているが、目的とするポリペプチドを生産する宿主の育種や培養液に含まれる大量の生体由来夾雑物の中から純粋な目的物を取得するためのプロセス開発には高度な技術と長い年月を必要とするため実用化が極めて困難である(非特許文献7,8,9)。
本発明者等は、β位にヒドロキシ基を有するカルボン酸/エステル化合物を特定の金属触媒の存在下でアミド化する方法(特許文献1)、アミノ酸前駆体としてヒドロキシアミノ/イミノ化合物を用い、これを特定の金属触媒の存在下でアミド化した後、特定の金属触媒の存在下で還元する方法(特許文献2)、カルボン酸/エステル化合物を特定の金属触媒の存在下でアミド化する方法(特許文献3)等により、高化学選択的にアミド化合物を合成する技術を開発している。更には、N末端保護アミノ酸・ペプチドのカルボキシル基と、C末端保護アミノ酸・ペプチドのアミノ基を、特定のシリル化剤(及び任意により併用されるルイス酸触媒)の存在下でアミド反応させた後、脱保護することにより、種々のアミノ酸残基からなるペプチドを高効率・高選択的に合成する技術(特許文献4)や、、N末端保護若しくは無保護アミノ酸・ペプチドのカルボキシル基と、C末端保護若しくは無保護アミノ酸・ペプチドのアミノ基を、特定のシリル化剤の存在下でアミド反応させた後、脱保護することにより、種々のアミノ酸残基からなるペプチドを高効率・高選択的に合成する技術(特許文献5、6)、ブレンステッド酸を触媒として用いてアミド化反応を行う技術(特許文献7)、新規のシラン含有縮合環ジペプチド化合物と、それを用いたペプチドの新規な合成方法(特許文献8)、更にはラクタムの位置選択的C-N結合開裂による新規なペプチド合成法(非特許文献10)も開発している。
John Howl, "Peptide synthesis and applications", Humana Press, 2005
Gregg B. Fields, "Solid-phase peptide synthesis", Academic Press, 1997
Miklos Bodanszky, "The Practice of Peptide Synthesis", 2nd ed., Springer, 1994
A. El-Faham et al., Chem. Rev., (2011), Vol.111, No.11, pp.6557-6602
Y. Otake et al., Angew. Chem. Int. Ed., (2020), Vol.59, No.31, pp.12925-12930
H. Kurasaki et al., Org. Lett., (2020), Vol.22, No.20, pp.8039-8043
"Production of Recombinant Proteins: Novel Microbial and Eukaryotic Expression Systems", Gerd Gellissen, Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 2004
"Expression systems for heterologous production of antimicrobial peptides", Nadia Skorupa Parachin, Kelly Cristina Mulder, Antonio Americo Barbosa Viana, Simoni Campos Dias, Octavio Luiz Franco, Peptides, 2012, 38(2), 446-456
"The purification of eukaryotic polypeptides synthesized in Escherichia coli.", Fiona A Marston, Biochem J. 1986, 240(1), 1-12.
W. Muramatsu et al., Chem. Sci., (2022), Vol.13, pp.6309-6315
以上の背景から、任意の配列を有するポリペプチドを迅速かつ簡便に合成する手法の開発が求められている。特に、専門的な知識や経験を必要とせず、一般に困難とされている非天然アミノ酸を含んだペプチド合成であっても、誰もが簡単なルーチン操作で所望のポリペプチドを迅速に取得できる方法論の確立が必要とされている。
本発明は、以上の背景に鑑みてなされたもので、その目的は、任意の配列を有するポリペプチドを迅速かつ簡便に合成する手法を提供することである。
本発明者らは鋭意検討の結果、適切にデザインされた新規のジケトピペラジン化合物を開発した。このジケトピペラジン化合物を汎用ビルディングブロックとして使用することにより、所望する任意の配列を有したポリペプチドを簡単なルーチン操作を繰り返すだけで、迅速かつ簡便に合成できる、従来にない全く新しいペプチド合成の方法論を確立するに至った。
即ち、本発明の趣旨は、例えば以下に関する。
[項1]一般式(1):
(式中、R1、R2、R3、R4、及びR5は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表す。但し、R1とR2、R1とR5、R2とR5、及び/又は、R3とR4は、連結して環を形成していてもよい。PGEは、電子求引性保護基を表す。)
で表されるジケトピペラジン化合物。
[項2]PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、項1に記載のジケトピペラジン化合物。
[項3]R5が、無置換又は置換基で置換された炭化水素基である、項1又は2に記載のジケトピペラジン化合物。
[項4]R1及びR2が、何れも水素原子ではない、項1から3の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
[項5]R3及びR4が、何れも水素原子ではない、項1から4の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
[項6]一般式(1’):
(式中、R1、R2、R3、及びR4は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表す。但し、R1とR2、及び/又は、R3とR4は、連結して環を形成していてもよい。PGEは、電子求引性保護基を表す。)
で表されるジケトピペラジン化合物を製造するための方法であって、
(a)一般式(2):
(式中、R1、R2、R3、及びR4は、式(1’)と同じ定義を表し、PGAは、アルキル型保護基を表す。)
で表される、6員環内窒素原子の一方がアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジン化合物に対し、保護されていないもう一方の6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護することにより、一般式(3):
(式中、R1、R2、R3、R4、及びPGEは、式(1’)と同じ定義を表し、PGAは、式(2)と同じ定義を表す。)
で表される、異なる2つの保護基PGE及びPGAが導入されたジケトピペラジン化合物を取得し、
(b)前記工程(a)で取得された式(3)の化合物から、アルキル型保護基PGAのみを除去する
ことを含む製造方法。
[項7]当該製造方法が更に、
(c)一般式(4):
(式中、R1、R2、R3、及びR4は、式(1’)と同じ定義を表し、PGAは、式(2)と同じ定義を表し、R6は、R1~R4とは独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表し、R7は、水素、又は酸性条件下で除去されるアミノ基保護基を表す。)
で表されるジペプチド化合物を酸性条件下で処理することによって、前記一般式(3)の化合物を取得することを含み、
前記工程(c)で取得された前記一般式(3)の化合物を、前記工程(a)の原料として使用する、項6に記載の製造方法。
[項8]当該製造方法が更に、
(d)一般式(5):
(式中、R1及びR2は、式(1’)と同じ定義を表し、PGAは、式(2)と同じ定義を表し、R7は、式(4)と同じ定義を表す。)
で表されるアルキル型置換基で保護されたアミノ酸と、一般式(6):
(式中、R3及びR4は、式(1’)と同じ定義を表し、R6は、式(4)と同じ定義を表す。)
で表されるアミノ酸エステルとを縮合させて、前記一般式(4)の化合物を取得することを含み、
前記工程(d)で取得された前記一般式(4)の化合物を、前記工程(c)の原料として使用する、項7に記載の製造方法。
[項9]PGAが、ベンジル基または置換ベンジル基である、項6から8の何れか一項に記載の製造方法。
[項10]PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、項6から9の何れか一項に記載の製造方法。
[項11]R6が、メチル基又はエチル基である、項7から10の何れか一項に記載の製造方法。
[項12]一般式(7):
(式中、R1、R2、R3、R4、R5、R8、R9、R10、R11、R12、及びR13は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表す。但し、R1とR2、R1とR5、R2とR5、R3とR4、R8とR9、及び/又は、R10とR11は、連結して環を形成していてもよい。Xは、水酸基、アルコキシル基、アルキルチオ基、アミノ基、又は置換アミノ基を表す。mは、0以上の整数を表し、nは、0又は1を表し、pは、2以上の整数を表す。但し、各々2以上のR1、R2、R3、R4、及びR5、並びに、mが2以上の場合における各々2以上のR8、R9、及びR13は、それぞれ同一であってもよく、異なっていてもよい。PGEは、電子求引性保護基を表す。)
で表されるテトラペプチド以上の鎖長を有するポリペプチドを製造する方法であって、
(x)一般式(8):
(式中、R8、R9、R10、R11、R12、R13、X、m、及びnは、式(7)と同じ定義を表す。)
で表される窒素求核種化合物を、一般式(1):
(式中、R1、R2、R3、R4、R5、及びPGEは前記と同じ定義を表す。)
で表されるジケトピペラジン化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環させて、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させ、
(y)当該電子求引性保護基PGEを除去して得られる反応生成物に、さらに前記工程(x)の前記一般式(1)の化合物と同一又は異なる、前記一般式(1)の化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環し、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させて反応生成物を取得し、
ここで前記工程(y)を、同一又は異なる前記一般式(1)の化合物を用いてp-1回繰り返すことにより、前記一般式(7)のポリペプチドを取得する、製造方法。
[項13]PGEが、tert-ブチルカルボニル基である、項12に記載の製造方法。
[項1]一般式(1):
で表されるジケトピペラジン化合物。
[項2]PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、項1に記載のジケトピペラジン化合物。
[項3]R5が、無置換又は置換基で置換された炭化水素基である、項1又は2に記載のジケトピペラジン化合物。
[項4]R1及びR2が、何れも水素原子ではない、項1から3の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
[項5]R3及びR4が、何れも水素原子ではない、項1から4の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
[項6]一般式(1’):
で表されるジケトピペラジン化合物を製造するための方法であって、
(a)一般式(2):
で表される、6員環内窒素原子の一方がアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジン化合物に対し、保護されていないもう一方の6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護することにより、一般式(3):
で表される、異なる2つの保護基PGE及びPGAが導入されたジケトピペラジン化合物を取得し、
(b)前記工程(a)で取得された式(3)の化合物から、アルキル型保護基PGAのみを除去する
ことを含む製造方法。
[項7]当該製造方法が更に、
(c)一般式(4):
で表されるジペプチド化合物を酸性条件下で処理することによって、前記一般式(3)の化合物を取得することを含み、
前記工程(c)で取得された前記一般式(3)の化合物を、前記工程(a)の原料として使用する、項6に記載の製造方法。
[項8]当該製造方法が更に、
(d)一般式(5):
で表されるアルキル型置換基で保護されたアミノ酸と、一般式(6):
で表されるアミノ酸エステルとを縮合させて、前記一般式(4)の化合物を取得することを含み、
前記工程(d)で取得された前記一般式(4)の化合物を、前記工程(c)の原料として使用する、項7に記載の製造方法。
[項9]PGAが、ベンジル基または置換ベンジル基である、項6から8の何れか一項に記載の製造方法。
[項10]PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、項6から9の何れか一項に記載の製造方法。
[項11]R6が、メチル基又はエチル基である、項7から10の何れか一項に記載の製造方法。
[項12]一般式(7):
で表されるテトラペプチド以上の鎖長を有するポリペプチドを製造する方法であって、
(x)一般式(8):
で表される窒素求核種化合物を、一般式(1):
で表されるジケトピペラジン化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環させて、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させ、
(y)当該電子求引性保護基PGEを除去して得られる反応生成物に、さらに前記工程(x)の前記一般式(1)の化合物と同一又は異なる、前記一般式(1)の化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環し、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させて反応生成物を取得し、
ここで前記工程(y)を、同一又は異なる前記一般式(1)の化合物を用いてp-1回繰り返すことにより、前記一般式(7)のポリペプチドを取得する、製造方法。
[項13]PGEが、tert-ブチルカルボニル基である、項12に記載の製造方法。
本発明の新規なジケトピペラジン化合物は、ポリペプチド合成の汎用ビルディングブロックとして使用できる。これにより、任意の配列を有するポリペプチドを迅速かつ簡便に合成することが可能となる。
以下、本発明を具体的な実施の形態に即して詳細に説明する。但し、本発明は以下の実施の形態に束縛されるものではなく、本発明の趣旨を逸脱しない範囲において、任意の形態で実施することが可能である。
[I.用語の定義]
本開示において「アミノ酸」とは、カルボキシル基及びアミノ基を有する化合物を意味する。別途明示しない限り、アミノ酸の種類は特に限定されない。例えば、光学異性の観点からは、D体でもL体でもラセミ体でもよい。また、カルボキシル基とアミノ基との相対位置の観点からは、α-アミノ酸、β-アミノ酸、γ-アミノ酸、δ-アミノ酸、ω-アミノ酸等の何れであってもよい。アミノ酸の例としては、これらに限定されるものではないが、タンパク質を構成する天然アミノ酸等が挙げられ、具体例としては、バリン、ロイシン、イソロイシン、アラニン、アルギニン、グルタミン、リシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、プロリン、システイン、トレオニン、メチオニン、ヒスチジン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、アスパラギン、グリシン、セリン等が挙げられる。
本開示において「アミノ酸」とは、カルボキシル基及びアミノ基を有する化合物を意味する。別途明示しない限り、アミノ酸の種類は特に限定されない。例えば、光学異性の観点からは、D体でもL体でもラセミ体でもよい。また、カルボキシル基とアミノ基との相対位置の観点からは、α-アミノ酸、β-アミノ酸、γ-アミノ酸、δ-アミノ酸、ω-アミノ酸等の何れであってもよい。アミノ酸の例としては、これらに限定されるものではないが、タンパク質を構成する天然アミノ酸等が挙げられ、具体例としては、バリン、ロイシン、イソロイシン、アラニン、アルギニン、グルタミン、リシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、プロリン、システイン、トレオニン、メチオニン、ヒスチジン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、アスパラギン、グリシン、セリン等が挙げられる。
本開示において「ペプチド」とは、複数のアミノ酸がペプチド結合を介して連結された化合物を意味する。別途明示しない限り、ペプチドを構成する複数のアミノ酸単位は、互いに同じ種類のアミノ酸単位であってもよく、二種類以上の異なるアミノ酸単位であってもよい。ペプチドを構成するアミノ酸の数は、2以上であれば特に制限されない。例としては、2(「ジペプチド」ともいう)、3(「トリペプチド」ともいう)、4(「テトラペプチド」ともいう)、5(「ペンタペプチド」ともいう)、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、100、又はそれ以上が挙げられる。また、トリペプチド以上のペプチドを指して「ポリペプチド」という場合もある。
本開示において「アミノ基」とは、アンモニア、第一級アミン、又は第二級アミンから水素を除去して得られる、それぞれ式-NH2、-NRH、又は-NRR’(但しR及びR’はそれぞれ置換基を意味する。)で表される官能基を意味する。
本開示において、別途明示しない限り、炭化水素基は、脂肪族でも芳香族でもよい。脂肪族炭化水素基は鎖状でも環状でもよい。鎖状炭化水素基は直鎖状でも分岐鎖状でもよい。環状炭化水素基は、単環式でも橋かけ環式でもスピロ環式でもよい。炭化水素基は、飽和でもよいが、不飽和でもよく、言い換えれば、一又は二以上の炭素-炭素二重結合及び/又は三重結合を含んでいてもよい。即ち、炭化水素基は、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、シクロアルケニル基、シクロアルキニル基、アリール基等を含む概念である。なお、別途明示しない限り、炭化水素基の一又は二以上の水素原子が、任意の置換基で置換されていてもよく、炭化水素基の一又は二以上の炭素原子が、価数に応じた任意のヘテロ原子に置き換えられていてもよい。
本開示において「炭化水素オキシ基」とは、前記定義の炭化水素基がオキシ基(-O-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において「炭化水素カルボニル基」とは、前記定義の炭化水素基がカルボニル基(-C(=O)-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において「炭化水素スルホニル基」とは、前記定義の炭化水素基がスルホニル基(-S(=O)2-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において、複素環式基は、飽和でもよいが、不飽和でもよく、言い換えれば、一又は二以上の炭素-炭素二重結合及び/又は三重結合を含んでいてもよい。また、複素環式基は単環式でも橋かけ環式でもスピロ環式でもよい。また、複素環式基の複素環構成原子に含まれるヘテロ原子は制限されないが、例としては窒素、酸素、硫黄、リン、ケイ素等が挙げられる。
本開示において「複素環オキシ基」とは、前記定義の複素環式基がオキシ基(-O-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において「複素環カルボニル基」とは、前記定義の複素環式基がカルボニル基(-C(=O)-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において「複素環スルホニル基」とは、前記定義の複素環式基がスルホニル基(-S(=O)2-)の一方の結合手に連結された基を意味する。
本開示において「置換基」とは、各々独立に、別途明示しない限り、本発明の製造方法におけるアミド化工程が進行すれば特に制限されず、任意の置換基を意味する。例としては、これらに限定されるものではないが、ハロゲン原子、水酸基、カルボキシル基、ニトロ基、シアノ基、チオール基、スルホン酸基、アミノ基、アミド基、イミノ基、イミド基、炭化水素基、複素環式基、炭化水素オキシ基、炭化水素カルボニル基(アシル基)、炭化水素オキシカルボニル基、炭化水素カルボニルオキシ基、炭化水素置換アミノ基、炭化水素置換アミノカルボニル基、炭化水素カルボニル置換アミノ基、炭化水素置換チオール基、炭化水素スルホニル基、炭化水素オキシスルホニル基、炭化水素スルホニルオキシ基、複素環オキシ基、複素環カルボニル基、複素環オキシカルボニル基、複素環カルボニルオキシ基、複素環アミノ基、複素環アミノカルボニル基、複素環カルボニル置換アミノ基、複素環置換チオール基、複素環スルホニル基、複素環オキシスルホニル基、複素環スルホニルオキシ基等が挙げられる。また、これらの官能基が、その価数及び物理化学的性質が許容する限りにおいて、更にこれらの官能基により置換された官能基も、本開示における「置換基」に含まれるものとする。なお、ある官能基が置換基を有する場合、その個数は、その価数及び物理化学的性質が許容する限りにおいて、特に限定されない。また、複数の置換基が存在する場合、これらの置換基は互いに同一であってもよく、異なっていてもよい。
本開示において使用する主な略語を以下の表1-1及び表1-2に示す。
本開示において、アミノ酸及びその残基は、当業者に周知の三文字略称で表す場合がある。本開示において使用する主なアミノ酸の三文字略称を以下の表に示す。
本開示において、β-ホモアミノ酸及びその残基は、対応するα-アミノ酸の三文字略称の前に「Ho」を付して表す場合がある。
本開示において、「保護基」とは、特定の反応条件下にアミノ基又はアミド基窒素原子上に導入することができ、且つ、特定の反応条件下にこれを除去することが可能な官能基を意味する。代表的な保護基は、幾つかの成書、例えばPeter G. M. Wuts, Greene's Protective Groups in Organic Synthesis, 5th Edition, Wiley, 2014等に詳しく記載されている。
本開示において、「アルキル型保護基」とは、アミノ基又はアミド基窒素原子上に着脱容易な炭化水素基を意味する。例としては、無置換又は置換基で置換されたベンジル基や、無置換又は置換基で置換されたアリル基等が挙げられる。
本開示において、「電子求引性保護基」とは、アミノ基又はアミド基の保護基として窒素原子上の電子を保護基の方向に引き込む役割を持つ保護基を意味する。例としては、アシル基、アルキルオキシカルボニル基、アルキルスルホニル基、アリールスルホニル基等が挙げられる。
[II.ジケトピペラジン化合物]
本発明の一側面は、一般式(1)で表される新規のジケトピペラジン化合物(以下適宜「本発明のジケトピペラジン化合物」又は「本発明の化合物」と称する。)に関する。
本発明の一側面は、一般式(1)で表される新規のジケトピペラジン化合物(以下適宜「本発明のジケトピペラジン化合物」又は「本発明の化合物」と称する。)に関する。
一般式(1)中、R1、R2、R3、R4、及びR5は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは1若しくは2以上の置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは1若しくは2以上の置換基で置換された複素環式基を表す。R1、R2、R3、R4、及びR5の具体例としては、これらに限定されるものではないが、水素原子、メチル基、エチル基、アリル基、イソプロピル基、イソブチル基、sec-ブチル基、フェニル基、ベンジル基、4-メトキシベンジル基、2,4-ジメトキシベンジル基、3,4-ジメトキシベンジル基、4-ヒドロキシベンジル基、2,4-ヒドロキシベンジル基、3,4-ヒドロキシベンジル基、ヒドロキシメチル基、1-ヒドロキシプロピル基、インドール基、メルカプトメチル基、メチルチオエチル基、アミノブチル基、メトキシカルボニルメチル基、メトキシカルボニルエチル基、イミダゾリルメチル基、アミドメチル基、アミドエチル基、イミダゾリルメチル基、グアニジノプロピル基等が挙げられる。これらの基が置換基を有する場合、その種類については先に記載したとおりである。これらの基が2以上の置換基を有する場合、これらは同一でもよく、異なっていてもよい。
一般式(1)中、R1とR2、R1とR5、R2とR5、及び/又は、R3とR4は、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい。これらの環は、更に1又は2以上の置換基で置換されていてもよい。これらの環が置換基を有する場合、その種類については先に記載したとおりである。これらの環が2以上の置換基を有する場合、これらは同一でもよく、異なっていてもよい。
一般式(1)中、R1~R5がそれぞれ炭化水素基又は複素環式基である場合は、斯かる炭化水素基又は複素環式基とそれが結合する炭素原子又は窒素原子との間に、連結基が介在していてもよい。斯かる連結基は、限定されるものではないが、各々独立に、例えば以下に示す構造から選択される(なお、下記化学式中、Aは各々独立に、R1~R5の炭化水素基又は複素環式基を表す。同一の基の中にAが二つ存在する場合、それらは互いに同一でもよく、異なっていてもよい。)。
一般式(1)中、PGEは電子求引性保護基を表す。具体例としては、tert-ブトキシカルボニル基、9-フルオレニルメトキシカルボニル基、ベンジルオキシカルボニル基などのカルバメート型保護基、メタンスルホニル基、ベンゼンスルホニル基、p-ベンゼンスルホニル基などのスルホニル型保護基、ベンゾイル基、ピバロイル基などの嵩高いアシル基等が挙げられる。電子求引性保護基として、好ましくはカルバメート型保護基が挙げられ、より好ましくはtert-ブトキシカルボニル基が挙げられる。
本発明のジケトピペラジン化合物は、ポリペプチド合成の汎用ビルディングブロックとして使用できる。これにより、任意の配列を有するポリペプチドを迅速かつ簡便に合成することが可能となる。斯かるポリペプチドの製造方法については後述する。
[III.ジケトピペラジン化合物の製造方法]
本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法は限定されず、任意の手法で製造することが可能である。但し、本発明のジケトピペラジン化合物の中でも、一般式(1)のR5が水素原子である化合物、すなわち以下の一般式(1’)で表されるジケトピペラジン化合物は、特に製造が困難であるところ、本発明では、斯かる一般式(1’)のジケトピペラジン化合物を製造するための方法も提供する。
本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法は限定されず、任意の手法で製造することが可能である。但し、本発明のジケトピペラジン化合物の中でも、一般式(1)のR5が水素原子である化合物、すなわち以下の一般式(1’)で表されるジケトピペラジン化合物は、特に製造が困難であるところ、本発明では、斯かる一般式(1’)のジケトピペラジン化合物を製造するための方法も提供する。
一般式(1’)中、R1、R2、R3、R4、及びPGEの定義は、一般式(1)に於ける定義と同じである。R1とR2、及び/又は、R3とR4が、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい点、斯かる環が更に1又は2以上の置換基を有していてもよい点も、一般式(1)と同様である。
本発明において、式(1’)のジケトピペラジン化合物は、下記のスキーム1に示される合成ルートによって製造することが好ましい。斯かる式(1’)のジケトピペラジン化合物の製造方法(以下適宜「本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法」又は「本発明の化合物(1’)の製造方法」等と称する)も、本発明の一側面を構成する。
なお、本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法は少なくとも、一般式(2)の化合物に電子求引性保護基PGEを付与して一般式(3)の化合物を取得する工程(a)、及び、一般式(3)の化合物からアルキル型保護基PGAを除去して一般式(1’)の化合物を取得する工程(b)を有していればよい。一般式(2)の化合物を一般式(4)の化合物から合成する工程(c)、及び、一般式(4)の化合物を一般式(5)の化合物と一般式(6)の化合物との反応により合成する工程(d)は、必須ではなく任意である。この点を踏まえ、以下、工程(a)、(b)、(c)、及び(d)の順に説明する。
・工程(a):
工程(a)では、下記の一般式(2)で表される、6員環内窒素原子の一方がアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジン化合物に対し、保護されていないもう一方の6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護することにより、下記の一般式(3)で表される、異なる2つの保護基PGE及びPGAが導入されたジケトピペラジン化合物を取得する。
工程(a)では、下記の一般式(2)で表される、6員環内窒素原子の一方がアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジン化合物に対し、保護されていないもう一方の6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護することにより、下記の一般式(3)で表される、異なる2つの保護基PGE及びPGAが導入されたジケトピペラジン化合物を取得する。
一般式(2)及び(3)中、R1、R2、R3、及びR4は、一般式(1)及び(1’)と同じ定義を表す。R1とR2、及び/又は、R3とR4が、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい点、斯かる環が更に1又は2以上の置換基を有していてもよい点も、一般式(1)及び(1’)と同様である。
一般式(2)及び(3)中、PGAは、アルキル型保護基を表す。例としては、ベンジル基、置換ベンジル基、アリル基、置換アリル基等が挙げられる。より具体的には、ベンジル基、4-メトキシベンジル基、3,4-ジメトキシベンジル基、2,4-ジメトキシベンジル基等が挙げられる。中でも4-メトキシベンジル基が好ましい。
一般式(3)中、PGEは、電子求引性保護基を表す。その詳細は、一般式(1)について説明した通りである。
工程(a)において、6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護する際の反応条件は、特に限定されるものではなく、適宜選択することができる。個々の保護基導入条件は当業者に広く知られているところであり、先に挙げた成書(Greene's Protective Groups in Organic Synthesis)にも詳述されている。
・工程(b):
工程(b)では、前記工程(a)で取得された一般式(3)の化合物から、アルキル型保護基PGAのみを除去することにより、一般式(1‘)のジケトピペラジン化合物を取得する。
工程(b)では、前記工程(a)で取得された一般式(3)の化合物から、アルキル型保護基PGAのみを除去することにより、一般式(1‘)のジケトピペラジン化合物を取得する。
工程(b)において電子求引性保護基を除去する際の反応条件は、特に限定されるものではなく、適宜選択することができる。個々の保護基除去反応条件は当業者に広く知られているところであり、先に挙げた成書(Greene's Protective Groups in Organic Synthesis)にも詳述されている。
・工程(c):
工程(a)に使用される一般式(3)の化合物としては、既存の化合物を用いてもよいが、合成して用いてもよい。一般式(3)の化合物を合成する方法は特に限定されないが、下記の一般式(4)で表されるジペプチド化合物を酸性条件下で処理することによって合成することが好ましい。惹いては、本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法において、工程(a)の前に、斯かる方法により一般式(3)のジペプチド化合物を合成する工程(c)を設けてもよい。
工程(a)に使用される一般式(3)の化合物としては、既存の化合物を用いてもよいが、合成して用いてもよい。一般式(3)の化合物を合成する方法は特に限定されないが、下記の一般式(4)で表されるジペプチド化合物を酸性条件下で処理することによって合成することが好ましい。惹いては、本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法において、工程(a)の前に、斯かる方法により一般式(3)のジペプチド化合物を合成する工程(c)を設けてもよい。
一般式(4)中、R1、R2、R3、及びR4は、一般式(1)及び(1’)と同じ定義を表す。R1とR2、及び/又は、R3とR4が、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい点、斯かる環が更に1又は2以上の置換基を有していてもよい点も、一般式(1)及び(1’)と同様である。
一般式(4)中、PGAは、アルキル型保護基を表す。その詳細は、一般式(2)及び(3)について説明した通りである。
一般式(4)中、R6は、R1~R4とは独立して、水素原子、無置換若しくは置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは置換基で置換された複素環式基を表す。R6の好ましい形態としては、限定されるものではないが、メチル基又はエチル基等を挙げることができる。
一般式(4)中、R7は、水素原子、又は、酸性条件下で除去されるアミノ基保護基を表す。具体例としては、水素原子、メトキシカルボニル基、tert-ブトキシカルボニル基等を挙げることができる。中でも好ましくは、水素又はtert-ブトキシカルボニル基等を挙げることができる。
工程(c)の反応における酸性条件としては、ブレンステッド(Bronsted)酸とルイス酸が使用できる。中でも好ましくはブレンステッド酸である。具体例としては、ギ酸、酢酸、プロピオン酸、安息香酸、トリクロロ酢酸、トリフルオロ酢酸、メタンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸、リン酸、塩酸、硫酸、硝酸、等を挙げることができる。中でも好ましくは、ギ酸、酢酸等のカルボン酸等を挙げることができる。
工程(c)の反応における酸の使用量は、一般式(4)のジペプチド化合物に対し、0.1~10モル当量であり、好ましくは1~5モル当量である。
本反応に使用する反応溶媒は、メタノール、エタノール等のアルコール系溶媒やトルエン等の炭化水素系溶媒、テトラヒドロフラン等のエーテル系溶媒、酢酸エチル等のエステル系溶媒、アセトニトリル等の含窒素系溶媒、ジメチルスルホキシド等の非プロトン性極性溶媒、ジクロロメタン等のハロゲン系溶媒、あるいはこれらの混合溶媒などを使用することができる。
反応温度は20~120℃で反応が進行するが、速度を高めるためにさらに加熱してもよい。
反応時間は1~12時間、酸使用量と反応温度を適切に選択すれば1~5時間内に完結する。
反応終了後、必要に応じ有機溶媒に希釈し、有機層をアルカリ洗浄など通常の後処理を行い、有機溶媒を濃縮すれば目的とする6員環内窒素原子のひとつがアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジンが得られる。このまま次工程に供してもよいが、晶析などにより純度を高めてもよい。
・工程(d):
工程(c)に使用される一般式(4)のジペプチド化合物としては、既存の化合物を用いてもよいが、合成して用いてもよい。一般式(4)のジペプチド化合物を合成する方法は特に限定されないが、下記の一般式(5)で表されるアルキル型置換基で保護されたアミノ酸と、下記の一般式(6)で表されるアミノ酸エステルとを縮合させることによって合成することが好ましい。惹いては、本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法において、工程(c)の前に、斯かる方法により一般式(4)のジペプチド化合物を合成する工程(d)を設けてもよい。
工程(c)に使用される一般式(4)のジペプチド化合物としては、既存の化合物を用いてもよいが、合成して用いてもよい。一般式(4)のジペプチド化合物を合成する方法は特に限定されないが、下記の一般式(5)で表されるアルキル型置換基で保護されたアミノ酸と、下記の一般式(6)で表されるアミノ酸エステルとを縮合させることによって合成することが好ましい。惹いては、本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法において、工程(c)の前に、斯かる方法により一般式(4)のジペプチド化合物を合成する工程(d)を設けてもよい。
一般式(5)及び(6)中、R1、R2、R3、及びR4は、一般式(1)及び(1’)と同じ定義を表す。R1とR2、及び/又は、R3とR4が、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい点、斯かる環が更に1又は2以上の置換基を有していてもよい点も、一般式(1)及び(1’)と同様である。
一般式(5)及び(6)中、R6及びR7は、一般式(4)と同じ定義を表す。
一般式(5)中、PGAは、一般式(2)と同じ定義を表す。
工程(d)の縮合反応の種類及び条件は、特に限定されるものではなく、適宜選択することができる。例えば、文献(例えばT. Hattori et al., J. Am. Chem. Soc., (2022), vol.144, No.4, pp.1758-1765等)に記載される方法の反応条件を用いて合成することができる。或いは、縮合剤と活性化剤を使用する通常のペプチド合成反応も利用可能である。
以上説明した本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法によれば、天然又は非天然のあらゆるアミノ酸から構成される任意の構造の本発明のジケトピペラジン化合物を、効率よく合成することができる。
[IV.ポリペプチドの製造方法]
本発明の別の側面は、本発明のジケトピペラジン化合物をビルディングブロックとして用いることにより、テトラペプチド以上の鎖長を有するポリペプチドを製造する方法(以下適宜「本発明のポリペプチドの製造方法」と称する。)に関する。
本発明の別の側面は、本発明のジケトピペラジン化合物をビルディングブロックとして用いることにより、テトラペプチド以上の鎖長を有するポリペプチドを製造する方法(以下適宜「本発明のポリペプチドの製造方法」と称する。)に関する。
本発明のポリペプチドの製造方法の概要は、以下のスキーム2に示すとおりである。
(スキーム2) ポリペプチドの合成ルート
すなわち、本発明のポリペプチドの製造方法は、一般式(8)で表される窒素求核種化合物と、p種の一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)とを用い、一般式(7)で表されるポリペプチドを製造するものである。以下、まずは目的化合物である一般式(7)のポリペプチドと、原料化合物である一般式(8)の窒素求核種化合物について説明する。
一般式(7)中、R1、R2、R3、R4、R5及びPGEは、一般式(1)と同じ定義を表す。R1とR2、R1とR5、R2とR5、及び/又は、R3とR4が、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい点、斯かる環が更に1又は2以上の置換基を有していてもよい点も、一般式(1)と同様である。
一般式(7)及び(8)中、R8、R9、R10、R11、R12、及びR13は、それぞれ独立して、水素原子、無置換若しくは1若しくは2以上の置換基で置換された炭化水素基、又は、無置換若しくは1若しくは2以上の置換基で置換された複素環式基を表す。R8、R9、R10、R11、R12、及びR13の具体例としては、これらに限定されるものではないが、水素原子、メチル基、エチル基、アリル基、イソプロピル基、イソブチル基、sec-ブチル基、フェニル基、ベンジル基、4-メトキシベンジル基、2,4-ジメトキシベンジル基、3,4-ジメトキシベンジル基、4-ヒドロキシベンジル基、2,4-ヒドロキシベンジル基、3,4-ヒドロキシベンジル基、ヒドロキシメチル基、1-ヒドロキシプロピル基、インドール基、メルカプトメチル基、メチルチオエチル基、アミノブチル基、メトキシカルボニルメチル基、メトキシカルボニルエチル基、イミダゾリルメチル基、アミドメチル基、アミドエチル基、イミダゾリルメチル基、グアニジノプロピル基等を挙げることができる。これらの基が置換基を有する場合、その種類については先に記載したとおりである。これらの基が2以上の置換基を有する場合、これらは同一でもよく、異なっていてもよい。
一般式(7)及び(8)中、R8とR9、及び/又は、R10とR11は、連結して環(例えば環状脂肪族炭化水素基、芳香族炭化水素基、又は複素環式基)を形成していてもよい。これらの環は、更に1又は2以上の置換基で置換されていてもよい。これらの環が置換基を有する場合、その種類については先に記載したとおりである。これらの環が2以上の置換基を有する場合、これらは同一でもよく、異なっていてもよい。
一般式(1)中、R8~R13がそれぞれ炭化水素基又は複素環式基である場合は、斯かる炭化水素基又は複素環式基とそれが結合する炭素原子又は窒素原子との間に、連結基が介在していてもよい。斯かる連結基は、限定されるものではないが、各々独立に、例えば以下に示す構造から選択される(なお、下記化学式中、Aは各々独立に、R1~R5の炭化水素基又は複素環式基を表す。同一の基の中にAが二つ存在する場合、それらは互いに同一でもよく、異なっていてもよい。)。
一般式(7)及び(8)中、Xは、水酸基、アルコキシル基、アルキルチオ基、アミノ基、又は1若しくは2の置換基を有する置換アミノ基を表す。置換アミノ基の場合、置換基の種類については先に記載したとおりである。Xの具体例としては、これらに限定されるものではないが、水酸基、メトキシ基、エトキシ基、イソプロポキシ基、tert-ブトキシ基、フェノキシ基、ベンジロキシ基、メチルチオ基、エチルチオ基、tert-ブチルチオ基、フェニルチオ基、アミノ基、メチルアミノ基、ジメチルアミノ基、ベンジルアミノ基、ジベンジルアミノ基、4-メトキシベンジルアミノ基等を挙げることができる。
一般式(7)及び(8)中、mは0以上の整数を表し、nは0又は1を表す。但し、mが2以上の場合における各々2以上のR8、R9、及びR13は、それぞれ同一であってもよく、異なっていてもよい。言い換えれば、一般式(7)及び(8)中のmを付した括弧内のm個の構造単位(アミノ酸残基)は、mが2以上の場合、互いに同一であってもよく、異なっていてもよい。
一般式(7)中、pは、2以上の整数を表す。但し、各々2以上のR1、R2、R3、R4、及びR5は、それぞれ同一であってもよく、異なっていてもよい。言い換えれば、一般式(7)中のpを付した括弧内のp個の構造単位(ジペプチド残基)は、互いに同一であってもよく、異なっていてもよい。
具体的に、本発明のポリペプチドの製造方法は、以下の工程(x)及び(y)を含む。
・工程(x):
工程(x)では、一般式(8)で表される窒素求核種化合物を窒素求核剤として用い、一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)と反応させることにより、一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環させ、生成するジペプチドを一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させることにより、反応生成物(上記スキーム2の一般式(7’)で表される化合物)を取得する。
工程(x)では、一般式(8)で表される窒素求核種化合物を窒素求核剤として用い、一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)と反応させることにより、一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環させ、生成するジペプチドを一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させることにより、反応生成物(上記スキーム2の一般式(7’)で表される化合物)を取得する。
前記工程(x)における反応条件は、特に限定されるものではなく、任意に選択することが可能である。
具体的に、前記工程(x)の反応溶媒としては、トルエン等の炭化水素系溶媒、テトラヒドロフラン等のエーテル系溶媒、酢酸エチル等のエステル系溶媒、アセトニトリル等の含窒素系溶媒、ジメチルスルホキシド等の非プロトン性極性溶媒、ジクロロメタン等のハロゲン系溶媒、あるいはこれらの混合溶媒などを使用することができる。
前記工程(x)の反応は、0~60℃の温和な中性条件下で実施できるが、必要に応じて、加熱又は塩基触媒を加えるなどして、反応を加速してもよい。
・工程(y):
工程(y)では、前段で得られた反応生成物から電子求引性保護基を除去したものを窒素求核剤として用い、新たな一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)と反応させることにより、一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環し、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させて反応生成物を取得する。
工程(y)では、前段で得られた反応生成物から電子求引性保護基を除去したものを窒素求核剤として用い、新たな一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)と反応させることにより、一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環し、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させて反応生成物を取得する。
その後、工程(y)で得られた反応生成物から電子求引性保護基を除去したものを新たな窒素求核剤として用い、新たな一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)と反応させるという単純なルーチン操作、すなわち工程(y)を繰り返し実施することができる。こうして、工程(y)をp-1回繰り返すことにより、一般式(7)のポリペプチドを取得することが可能となる。
なお、工程(x)及びp-1回の工程(y)に使用される計p種の一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)は、互いに同一であってもよく、異なっていてもよい。ここで、使用する一般式(1)のジケトピペラジン化合物(本発明の化合物)の種類及び順序を適切に調整することにより、任意のアミノ酸配列を有する一般式(7)のポリペプチドを取得することが可能となる。
当該電子求引性保護基PGEの脱保護反応の条件は、特に限定されるものではなく、適宜選択することができる。個々の保護基除去反応条件は当業者に広く知られているところであり、先に挙げた成書(Greene's Protective Groups in Organic Synthesis)にも詳述されている。
なお、前記の工程(x)及び/又は工程(y)を、マイクロ波の照射下で実施してもよい。マイクロ波の照射下でこれらの工程を実施することにより、反応速度を加速する効果が得られる場合がある。マイクロ波の照射下で各工程を実施する場合、その条件は以下の通りである。マイクロ波の照射方式は特に制限されないが、例えば市販のマイクロ波発生装置(例えばCEM社Discover SP Microwave Synthesizer)を用いて反応系に照射することができる。マイクロ波発生時の電力は特に制限されないが、例えば100~1600Wとすることができる。マイクロ波の照射時間は特に制限されないが、例えば0.5~12時間とすることができる。
また、工程(x)及び(y)の一連の反応を、前記に例示した同一反応溶媒中で連続して行うことができるが、各段階で得られた反応生成物を常法によりいったん単離・精製してから、次の段階に用いてもよい。
また、本発明のポリペプチドの製造方法により得られた一般式(7)のポリペプチドに対して、更に種々の後処理を施してもよい。例えば、生成された一般式(7)のポリペプチドを、カラムクロマトグラフィー、再結晶等の常法に従って単離・精製することができる。また、生成された一般式(7)のポリペプチドが、保護基等により保護されたアミノ基及び/又はカルボキシル基を有する場合には、後述する手法に従って脱保護を行うことができる。
以上説明した、本発明のジケトピペラジン化合物を用いた本発明のポリペプチドの製造方法によれば、従来のペプチド合成法と異なり、一段階で2つのアミノ酸を一気に伸長できる。また、ペプチド化学特有の専門知識や経験を必要とせず、容易に実施することが可能である。また、合成困難であることが知られている非天然アミノ酸を含んだペプチド合成であっても、あらかじめこれを内包した本発明のジケトピペラジン化合物を用いれば、これを含むポリペプチドの合成を簡便に実施することができる。本発明により、誰もが簡単なルーチン操作で所望のポリペプチドを迅速に取得できるという全く新しいペプチド合成の方法論が提供された。
また、本発明のポリペプチドの製造方法における鍵原料である、汎用ビルディングブロックとして用いられる本発明のジケトピペラジン化合物については、前述した本発明のジケトピペラジン化合物の製造方法を用いることによって、天然又は非天然のあらゆるアミノ酸から構成されるジケトピペラジン化合物を効率よく合成することができる。
[V.その他]
以上詳述したように、本発明はポリペプチド合成における新しい方法論を提供するものであるが、特定の構造を有する本発明のジケトピペラジン化合物を用いて本発明のポリペプチドの製造方法を実施することが、とりわけ好ましい場合がある。
以上詳述したように、本発明はポリペプチド合成における新しい方法論を提供するものであるが、特定の構造を有する本発明のジケトピペラジン化合物を用いて本発明のポリペプチドの製造方法を実施することが、とりわけ好ましい場合がある。
例えば、一般式(1)において、R5が無置換又は置換基で置換された炭化水素基である本発明のジケトピペラジン化合物を使用して、本発明のポリペプチドの製造方法を実施すれば、一般式(7)において、R5として無置換又は置換基で置換された炭化水素基が導入されたポリペプチドを製造することができる。このように、R5が水素原子ではなくアミド窒素上に無置換又は置換基で置換された炭化水素基が導入されたポリペプチドは、通常の天然型ポリペプチドとは異なり、生体内においてペプチダーゼ等の酵素による分解を受けにくくなるため、ペプチド医薬品の体内動態改善を目的とした部分構造に頻繁に用いられる。しかし、従来法によってこのようなポリペプチドを得るためには、あらかじめアミノ基に無置換又は置換基で置換された炭化水素基が導入された非天然アミノ酸を縮合して製造する必要があるところ、従来の合成法によるとこのような非天然アミノ酸を用いるペプチド合成は極めて低調であり、低収率に終わることが多い。本発明のポリペプチドの製造方法により、アミド窒素上の置換基R5として、無置換又は置換基で置換された炭化水素基を導入した本発明のジケトピペラジン化合物を使用することで、アミド窒素上に無置換又は置換基で置換された炭化水素基が導入されたポリペプチドを高効率的に製造することが可能となる。
また、例えば、一般式(1)において、R1とR2の両方が水素原子ではなく、及び/又は、R3とR4の両方が水素原子ではない本発明のジケトピペラジン化合物を使用して、本発明のポリペプチドの製造方法を実施すれば、一般式(7)において、R1とR2の両方が水素原子ではなく、及び/又は、R3とR4の両方が水素原子ではないポリペプチドを製造することができる。このように、R1とR2の両方が水素原子ではなく、及び/又は、R3とR4の両方が水素原子ではないポリペプチドは、通常の天然型ポリペプチドとは異なり、生体内における吸収性を高めるなどの効果があるため、ペプチド医薬品のバイオアベイラビリティ改善を目的とした部分構造に頻繁に用いられる。しかし、従来法によってこのようなポリペプチドを得るためには、α-位に2つの側鎖を有する非天然アミノ酸を縮合して製造する必要があるところ、従来の合成法によるとこのような非天然アミノ酸を用いるペプチド合成は極めて低調であり、低収率に終わることが多い。本発明のポリペプチドの製造方法により、R1とR2の両方が水素原子ではなく、及び/又は、R3とR4の両方が水素原子ではない本発明のジケトピペラジン化合物を使用することで、R1とR2の両方が水素原子ではなく、及び/又は、R3とR4の両方が水素原子ではないポリペプチドを高効率的に製造することが可能となる。
なお、本発明のジケトピペラジン化合物を用いた本発明のポリペプチドの製造方法と、従来公知の他のアミド化方法又はペプチド製造方法とを組み合わせて実施し、更なるアミノ酸残基の伸長を行ってもよい。これにより、原理的には任意のアミノ酸残基数及びアミノ酸配列のポリペプチドを合成することが可能となる。
本発明者等はアミノ酸又はペプチドを連結するためのアミド化反応やそれによるポリペプチドの製造方法に関し、以下の先行特許出願を行っているところ、本発明のポリペプチドの製造方法を、これらの先行特許出願に記載のアミド化反応やポリペプチドの製造方法と適宜組み合わせて実施し、及び/又は、これらの先行特許出願に記載のアミド化反応やポリペプチドの製造方法の条件を考慮して適宜改変することも可能である。なお、これらの先行特許出願の記載は、その全体が援用により本明細書に組み込まれる。
(1)国際公開第2017/204144号(前記の特許文献1)
(2)国際公開第2018/199146号(前記の特許文献2)
(3)国際公開第2018/199147号(前記の特許文献3)
(4)国際公開第2019/208731号(前記の特許文献4)
(5)国際公開第2021/085635号(前記の特許文献5)
(6)国際公開第2021/085636号(前記の特許文献6)
(7)国際公開第2021/149814号(前記の特許文献7)
(8)国際公開第2022/190486号(前記の特許文献8)
(1)国際公開第2017/204144号(前記の特許文献1)
(2)国際公開第2018/199146号(前記の特許文献2)
(3)国際公開第2018/199147号(前記の特許文献3)
(4)国際公開第2019/208731号(前記の特許文献4)
(5)国際公開第2021/085635号(前記の特許文献5)
(6)国際公開第2021/085636号(前記の特許文献6)
(7)国際公開第2021/149814号(前記の特許文献7)
(8)国際公開第2022/190486号(前記の特許文献8)
また、本発明者等は、特定構造のアミノ保護ラクタム化合物と、特定構造のアミノ酸エステル又はペプチドエステル化合物とをアミド形成反応させることによるポリペプチド化合物の製造方法についても発表すると共に(W. Muramatsu et al., Chem. Sci., (2022), Vol.13, pp.6309-6315;前記の非特許文献8)、別途先行特許出願を行っている(国際特許出願PCT/JP2022/024418;本出願時点で未公開)。本発明のポリペプチドの製造方法を、当該非特許文献及び先行特許出願に記載のアミド化反応やポリペプチドの製造方法と適宜組み合わせて実施し、及び/又は、これらの先行特許出願に記載のアミド化反応やポリペプチドの製造方法の条件を考慮して適宜改変することも可能である。なお、当該非特許文献及び先行特許出願の記載も、その全体が援用により本明細書に組み込まれる。
以下、本発明を実施例に則して更に詳細に説明するが、これらの実施例はあくまでも説明のために便宜的に示す例に過ぎず、本発明は如何なる意味でもこれらの実施例に限定されるものではない。
なお、以下の記載中の%値は、特に断らない限り質量%で表す。また、収率は、オクタンを内部標準としたGC(ガスクロマトグラフィー)分析法、又は、クロマトグラフィーを用いて単離することにより求めた値である。ジアステレオ選択性は、1H NMR分析法により求めた値である。生成物の同定は、1H NMR分析法及び液体クロマグラム質量分析法(LC/MS)により行った。
[実施例1]
(A)シクロ(-Boc-Gly-Gly-)とH-Phe-OBzlからのBoc-Gly-Gly-Phe-OBzlの合成
(A)シクロ(-Boc-Gly-Gly-)とH-Phe-OBzlからのBoc-Gly-Gly-Phe-OBzlの合成
シクロ(-Boc-Gly-Gly-)(1a、107mg、0.5mmol)、フェニルアラニンベンジルエステル(7a、255mg、1.0mmol)、及びシクロペンチルエチルエーテル(0.25mL)を、マグネティックスターリングバーと共に乾燥した5mLのスクリューキャップバイアルに加え、30℃で40時間攪拌した。反応混合物全量をそのままフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl3中0~5%MeOH)にて精製し、純粋なBoc-Gly-Gly-Phe-OBzl(9a)を固体として得た(197mg、収率84%)
TLC: Rf = 0.47 (5% MeOH in CHCl3). M.P: 58-60 oC. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): 7.39- 7.31(m, 3H, C6
H
5), 7.31- 7.24(m, 2H, C6
H
5), 7.23- 7.19 (m, 3H, C6
H
5), 7.06- 6.99 (m, 2H, C6
H
5), 6.86 (br s, 1H, NH), 6.67 (br d, 1H, J = 4.1 Hz, NH), 5.20 (br, 1H, BocNH), 5.12 (q, J = 10.3, 2H, OCH
2Ph), 4.88 (q, J = 7.8, 1H, NHCHCH2Ph), 3.91 (qd, 2H, J = 16.7, 5.3, BocNHCH
2 CO), 3.82-3.72 (m, 2H, NHCH
2 CONH), 3.10 (qd, 2H, J = 13.7, 5.9 Hz, NHCHCH
2 Ph), 1.45 (s, 9H, NHCO2C(CH3)3). 13C NMR (100 MHz, CDCl3): 171.3, 170.1, 168.5, 156.2, 135.7, 135,1, 129.4, 128.8 (2C), 128.7 (2C), 128.6 (2C), 127.2. 80.5, 67.5, 53.5, 44.3, 42.9, 37.8, 28.4 (3C).
(B)Boc-Gly-Gly-Phe-OBzlのBoc化末端アミノ基の脱保護
前記(A)で得たBoc-Gly-Gly-Phe-OBzlについて、以下の手順で末端アミノ基の電子求引性保護基Bocを脱保護した。すなわち、Boc-Gly-Gly-Phe-OBzl(7a、375mg、0.8mmol)を、マグネティックスターリングバーと共に、乾燥した50mLフラスコに加え、0℃冷却下に4N HCl/1,4-ジオキサン(15mL)を加え、さらに室温で15分攪拌した。TLCで反応の終了を確認後、飽和重曹水(20mL)でクエンチした。反応混合物を分液ロートに移し、クロロホルム(30mL)で3回抽出後、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を濃縮した残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3中0~10%MeOH)にて精製し、末端アミノ基が脱保護されたH-Gly-Gly-Phe-OBzl(9a)を無色油状物として得た(160mg、収率54%)。
TLC: Rf = 0.28 (10% MeOH in CHCl3). 1H NMR (400 MHz, CDCl3): 7.78 (br s, 1H, NH), 7.47- 7.10 (m, 8H, NHCHCH2C6
H
5, OCH2 C6
H
5), 7.02- 7.01 (m, 2H, NHCHCH2C6
H
5), 6.90- 6.69 (m, 1H, NH2CH2CONH), 5.11 (q, J = 9.6, 2H, OCH
2Ph), 4.89 (q, J = 7.56, 1H, NHCHCH2Ph), 4.04-3.84 (m, 2H, NHCH
2 CONH), 3.31 (s, 2H, NH2CH
2 CONH),3.20 (m, 2H, NHCHCH
2 Ph), 1.77 (s, 2H, NH
2 CH2CO).
(C)シクロ(-Boc-Gly-Gly-)とH-Gly-Gly-Phe-OBzlからのBoc-Gly-Gly-Gly-Gly-Phe-OBzlの合成
シクロ(-Boc-Gly-Gly-)(1a、53.5mg、0.25mmol)、前記(B)で得たH-Gly-Gly-Phe-OBzl(9a、160mg、0.5mmol)、及びシクロペンチルエチルエーテル(0.6mL)を、マグネティックスターリングバーと共に、乾燥した5mLのスクリューキャップバイアルに加え、50℃で36時間攪拌した。反応混合物全量をそのままフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl3中0~10%MeOH)にて精製し、純粋なBoc-Gly-Gly-Gly-Gly-Phe-OBzl(7b)を固体として得た(127mg、収率87%)。
TLC: Rf = 0.47 (5% MeOH in CHCl3). M.P: 178-180 oC. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): 7.42- 7.14 (m, 10 H, OCH2C6
H
5 and NHCHCH2 C6
H
5 ), 5.14 (s, 2H, OCH
2C6H5), 4.73 (q, J = 1.8, 1H, NHCHCH2 C6H5), 3.97-3.82 (m, 6H, NHCH
2 CONHCH2CONHCH2CONH), 3.77 (s, 2H, BocNHCH
2 CO), 3.11 (qd, 2H, J = 24.7, 6.2 Hz, NHCHCH
2 Ph), 1.46 (s, 9H, NHCO2C(CH3)3). 13C NMR (100 MHz, CD3OD): d 173.5, 172.6,172.5, 172.0, 173.3, 168.4, 137.9, 137.0, 130.3, 129.5, (2C), 129.4, (2C), 129.3 (2C), 127.9. 80.94, 68.03, 54.8, 45.6, 44.2 (2C), 43.5, 38.2, 28.7 (3C).
[実施例2]
N-Me及びBocで保護されたジケトピペラジンの合成:
・一般反応手順:
以下の一般式に従って、片方のアミド窒素原子上に炭化水素基(メチル基)を有する式3のジケトピペラジン化合物、及び、片方のアミド窒素原子上に炭化水素基(メチル基)を有し、もう片方のアミド窒素原子がBocで保護された式4のジケトピペラジンを合成した。なお、以下の一般式中「AA1」及び「AA2」は各々任意のアミノ酸残基を表し、「R」及び「R1」はそれぞれ「AA1」及び「AA2」が有する側鎖を表す。
N-Me及びBocで保護されたジケトピペラジンの合成:
・一般反応手順:
以下の一般式に従って、片方のアミド窒素原子上に炭化水素基(メチル基)を有する式3のジケトピペラジン化合物、及び、片方のアミド窒素原子上に炭化水素基(メチル基)を有し、もう片方のアミド窒素原子がBocで保護された式4のジケトピペラジンを合成した。なお、以下の一般式中「AA1」及び「AA2」は各々任意のアミノ酸残基を表し、「R」及び「R1」はそれぞれ「AA1」及び「AA2」が有する側鎖を表す。
グローブボックス内で、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥5.0mLスクリューキャップバイアルに、式1のα-Me-N-AA1-OH(0.50mmol)、ビス(1-イミダゾリル)ジメチルシラン(105mg、0.55mmol)、及び乾燥ジクロロメタン(200μL)を入れた。反応混合物を室温で5分間激しく攪拌した後、1-(トリメチルシリル)イミダゾール(110.2μL、0.75mmol)、Ta(OEt)5(13μL、0.050mmol)、及び式2のH-L-AA2-OMe(1mmol、2当量)を加えた。アルゴン雰囲気下でバイアルを密閉し、グローブボックスから取り出した。反応混合物を60℃で24時間激しく撹拌した後、反応混合物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(クロロホルム中0~5%メタノール)で精製することにより、式3のシクロ(-L-AA1-Me-AA2-)を得た。
磁気攪拌棒(Sm-Co)及び窒素バルーンを入れた火炎乾燥30mL丸底フラスコに、式3のシクロ(-L-AA1-Me-AA2-)(1.0mmol)、4-ジメチルアミノピリジン(DMAP、0.224g、1.54mmol、2当量)、二炭酸ジ-tert-ブチル(Boc2O、0.460mL、2.0mmol)、及びジクロロメタン(10mL)を入れて混合した。この混合物を0℃に冷却し、トリエチルアミン(0.139mL、1.0mmol)を加えた。得られた混合物を窒素雰囲気下、室温で一晩撹拌した。完了後、反応混合物をクロロホルム(20mL)で分液漏斗に移し、飽和塩化アンモニウム(NH4Cl)水溶液(15mL)を加えた。相分離し、水相をクロロホルム(2×20mL)で抽出した。有機相を水(10mL)及び塩水(10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム(Na2SO4)で乾燥させ、濾過した後、ロータリーエバポレーター及び水浴を用い、加熱せずに真空中で濃縮した。得られた粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0~60%酢酸エチル)で精製し、式4の化合物を得た。
・実施例2a:
AA1及びAA2としてアラニン(R及びR1としてMe)を用いることにより、下記式3a及び式4aの化合物を得た。
AA1及びAA2としてアラニン(R及びR1としてMe)を用いることにより、下記式3a及び式4aの化合物を得た。
Rf = 0.28 (5% MeOH in CHCl3). 80% yield, dr >20:1. 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.16 (s, 1H), 4.07 (qd, J = 7.1, 3.1 Hz, 1H), 3.87 (q, J = 7.0 Hz, 1H), 2.96 (s, 3H), 1.52 (dd, J = 15.6, 7.1 Hz, 6H). 13C NMR (100 MHz, CDCl3) 169.0, 166.8, 57.9, 51.6, 32.5, 22.5, 19.2.
Rf = 0.5 (80% EtOAc in Hexane). 88% yield, dr >20:1. 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 4.72 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.03 (q, J = 7.3 Hz, 1H), 2.96 (s, 3H), 1.57 (dd, J = 7.1, 1.6 Hz, 6H), 1.54 (s, 9H). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 168.0, 167.1, 150.1, 84.7, 59.5, 55.1, 32.0, 28.0 (3C), 20.9, 18.7.
・実施例2b:
AA1としてアラニン(-Rとして-Me)、AA2としてフェニルアラニン(-R1として-Me-Ph)を用いることにより、下記式3b及び式4bの化合物を得た。
AA1としてアラニン(-Rとして-Me)、AA2としてフェニルアラニン(-R1として-Me-Ph)を用いることにより、下記式3b及び式4bの化合物を得た。
[実施例3]
Bocで保護されたジケトピペラジンの合成:
Bocで保護されたジケトピペラジンの合成:
窒素雰囲気下、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥100mLフラスコに、H-Phe-OMe.HCl(15.0mmol)及び乾燥メタノール(20mL)を入れ、フラスコをゴム製セプタムで密閉した。反応混合物を0℃に冷却し、トリエチルアミン(2mL、1当量)をシリンジで加え、0℃で5分間撹拌した後、室温で10分間撹拌した。その後、反応混合物にp-メトキシベンズアルデヒド(2.2.mL、1.2当量)をシリンジで加え、室温で2時間撹拌した後、0℃まで冷却し、水素化ホウ素ナトリウム(NaBH4、1.13g、2当量)を少しずつ加えた(約10~15分)。反応混合物を0℃で30分間撹拌した後、10℃未満の温度で2時間撹拌し、更に室温で1時間撹拌した。反応終了後、溶媒を減圧下で蒸発させることにより、式0の粗生成物を得た。
窒素雰囲気下、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥100mLフラスコに、式0の粗生成物、水酸化リチウム(LiOH、0.755g、1.2当量)及びTHF/メタノール/水(10/20/3mL)混合溶媒を入れ、フラスコをゴム栓で密閉した。反応混合物を窒素雰囲気下、50℃で2時間撹拌した。反応の進行を薄層クロマトグラフィー(TLC)でモニターし、反応終了後、反応混合物を室温まで冷却した。反応混合物に1N塩酸を加え、室温で激しく撹拌し、pHを5~7に調整した。白色固体の生成を観察し、吸引ポンプを使用して白色固体をワットマン濾紙と漏斗で濾過した。白色固体を200mLのジエチルエーテルで洗浄した。白色固体を高真空下、70℃で24時間加熱して乾燥することにより、式1の化合物を白色固体として得た(収量約4.1g、収率94%)。
1H NMR (400 MHz, DMSO-D6) δ 7.38 - 7.05 (m, 7H), 7.03 - 6.76 (m, 2H), 3.79 - 3.68 (m, 4H), 3.63 (d, J = 13.1 Hz, 1H), 3.32 (t, J = 6.6 Hz, 1H), 3.09 - 2.77 (m, 2H).
グローブボックス内で、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥5.0mLスクリューキャップバイアルに、式1のPMBNH-Phe-OH(0.285g、1.0mmol)、ビス(1-イミダゾリル)ジメチルシラン(211mg、1.1当量)、及び乾燥ジクロロメタン(4μL)を入れ、密閉した後、グローブボックスから取り出した。反応混合物を室温で1時間激しく撹拌した。1時間後、バイアルをグローブボックス内に入れ、バイアル内の反応溶液に、1-(トリメチルシリル)イミダゾール(220μL、1.5mmol)、Ta(OEt)5(26μL、0.050mmol)、及びL-ロイシン・メチルエステル(0.290mL、2mmol、2当量)を加えた。反応混合物全体をそのままフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0~50%酢酸エチル)で精製することにより、式3の化合物を粘着性の固体として得た(収量345mg、収率83%)。
Rf = 0.50 (50% EtOAc in Hexane). 83% yield, dr >20:1. 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.76 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 7.36 - 7.21 (m, 3H), 7.23 - 7.11 (m, 2H), 7.09 - 6.97 (m, 2H), 6.89 - 6.71 (m, 2H), 4.69 (td, J = 9.1, 4.8 Hz, 1H), 3.78 (s, 3H), 3.74 (s, 4H), 3.48 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 3.40 (dd, J = 9.7, 3.9 Hz, 1H), 3.20 (dd, J = 13.9, 3.9 Hz, 1H), 2.70 (dd, J = 13.9, 9.7 Hz, 1H), 1.75 - 1.45 (m, 4H), 0.95 (dd, J = 7.5, 6.1 Hz, 6H). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 173.6, 158.9, 137.4, 131.5, 129.46 (2C), 129.2 (2C), 128.9 (2C), 127.0 (2C), 114.0 (2C), 63.1, 55.4, 52.3, 52.1, 50.2, 41.7, 39.3, 29.8, 25.0, 23.1, 22.0.
上記で合成した式3のジペプチドPMB-NH-Phe-Leu-OMe(413mg、1.0mmol)とトルエン及び酢酸(182mg、3当量)を、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥した5.0mLスクリューキャップバイアルに入れた。反応バイアルをスクリューキャップとビニールテープで密封し、反応混合物を予熱したオイルバス内で120℃で2時間撹拌した。反応終了後、反応混合物を酢酸エチル(5mL)で希釈した。反応混合物全体を分液漏斗に移し、10mLの飽和炭酸水素ナトリウム(NaHCO3)水溶液を加え、酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、合わせた有機相を硫酸ナトリウム(Na2SO4)で乾燥させた。溶媒を減圧下で蒸発させた。得られた粗生成物を更に精製することなく、そのまま次の工程に使用した。
磁気攪拌棒(Sm-Co)及び窒素バルーンを入れた火炎乾燥30mL丸底フラスコに、上記で得られた粗生成物、4-ジメチルアミノピリジン(DMAP、25mg、20mol%)、二炭酸ジ-tert-ブチル(Boc2O、0.460mL、2.0mmol)、及びジクロロメタン(20mL)を入れた。0℃に冷却し、トリエチルアミン(0.140mL、1.0mmol)を加えた後、得られた混合物を窒素雰囲気下、周囲温度で(氷浴を除去せずに)撹拌した。完了後、反応混合物をクロロホルム(15mL)で分液漏斗に移し、飽和塩化アンモニウム(NH4Cl)水溶液(10mL)を加えた。相を分離し、水相をクロロホルム(クロロホルム、2×20mL)で抽出した。有機相を水(10mL)及び塩水(10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム(Na2SO4)で乾燥させ、濾過し、ロータリーエバポレーター及び水浴を用い、加熱せずに真空中で濃縮した。得られた粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0~20%酢酸エチル)で精製することにより、式4の化合物を粘着性固体として得た(収量0.455g、収率94%)。
Rf = 0.53 (30% EtOAc in Hexane). 94% yield, dr >20:1. 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.41 - 7.27 (m, 3H), 7.22 - 7.11 (m, 2H), 7.09 - 6.96 (m, 2H), 6.89 - 6.75 (m, 2H), 5.35 (d, J = 14.6 Hz, 1H), 4.69 (dd, J = 9.7, 5.5 Hz, 1H), 4.24 (dd, J = 6.3, 4.5 Hz, 1H), 3.79 (s, 3H), 3.44 (d, J = 14.6 Hz, 1H), 3.34 (dd, J = 14.1, 4.5 Hz, 1H), 3.21 (dd, J = 14.2, 6.4 Hz, 1H), 1.83 - 1.63 (m, 1H), 1.52 (s, 9H), 1.20 - 1.06 (m, 1H), 0.95 (d, J = 6.5 Hz, 3H), 0.96 - 0.78 (m, 4H). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 167.3, 166.4, 159.6, 150.1, 136.3, 130.16 (2C), 130.02 (2C), 129.2 (2C), 127.84, 127.23, 114.4 (2C), 84.65, 61.5, 57.2, 55.4, 46.6, 44.8, 38.6, 28.0 (3C), 23.0, 23.1, 21.6.
磁気攪拌棒(Sm-Co)及び窒素バルーンとセプタムを入れた火炎乾燥20mLフラスコに、上記で得られた式4のシクロ(-Phe-PMB-Leu-Boc-)(481mg、1mmol)及びアセトニトリル(9mL)を入れた。フラスコを-20℃に冷却し、CAN(ヘキサニトラトセリウム(IV)酸アンモニウム)2.75gを水3mLに溶解させた冷却済みの溶液を約10時間かけてゆっくりと滴下した。反応混合物を-20℃で5時間撹拌させた後、10mLの氷冷水を加え、反応混合物を分液漏斗に移し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、合わせた有機相を硫酸ナトリウム(Na2SO4)で乾燥させた。溶媒を減圧下で蒸発させて得た粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0~80%、酢酸エチル)で精製し、表題化合物を白色固体として得た(収量250mg、収率70%)。
Rf = 0.37 (50% EtOAc in Hexane). 70% yield, dr >20:1. 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.47 - 7.24 (m, 3H), 7.26 - 7.12 (m, 2H), 6.56 (s, 1H), 4.81 - 4.53 (m, 1H), 4.44 - 4.20 (m, 1H), 3.47 - 3.21 (m, 1H), 3.18 - 2.92 (m, 1H), 1.84 - 1.65 (m, 1H), 1.54 (s, 9H), 1.45 - 1.28 (m, 1H), 1.28 - 1.11 (m, 1H), 0.96 (dd, J = 6.6, 1.1 Hz, 3H), 0.94 - 0.83 (m, 3H). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 168.2, 167.2, 150.4, 135.7, 129.9 (2C), 129.2 (2C), 127.7, 84.7, 58.9, 56.9, 45.2, 41.1, 28.0, 24.8, 23.1, 21.9.
[実施例4]
ペンタペプチドの合成:
ペンタペプチドの合成:
磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥15.0mLマイクロ波反応管に、式1のシクロ(-L-Val-Boc-Gly-)(256mg、2当量、1.0mmol)、式2のH-L-Val-Ot-Bu(87mg,0.50mmol)、及び0.1mLのシクロペンチルメチルエーテル(CPME)を入れた。バイアルをキャップで密閉し、80℃(250Psi、300W)のマイクロ波条件下で4時間反応させた。4時間後、反応混合物をクロロホルムで希釈した上で、フラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中10~60%酢酸エチル)で直接精製し、式3のN末端保護トリペプチドBoc-L-Val-Gly-L-Val-OtBuを粘着性固体として得た(収量190.5mg、収率87%、>20:1dr)。
上記で得られた式3のトリペプチド(0.177mg,0.41mmol)を、マグネチックスターラーバーとゴム製セプタムを取り付けた50mLフラスコに入れ、0℃に冷却した。0℃でジオキサン中の10mLの4N塩酸を加え、反応混合物を0℃で15分間静置した。反応の進行を薄層クロマトグラフィー(TLC)でモニターし、式3の出発物質が完全に消費された後、20mLの飽和炭酸水素ナトリウム(NaHCO3)水溶液を加えた。反応混合物を分液漏斗に移し、クロロホルム(3×50mL)で抽出した。合わせた有機相を硫酸ナトリウム(Na2SO4)で乾燥させ、溶媒を減圧下で蒸発させ、粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(クロロホルム中0~5%メタノール)で精製して、式4のトリペプチドL-Val-Gly-L-Val-OtBuを無色オイルとして得た(収量100mg、収率74%、>20:1dr)。
式4のトリペプチドL-Val-Gly-L-Val-OtBu(83mg、0.25mmol)、式1のシクロ(-L-Val-Boc-Gly-)(127mg、2当量、0.5mmol)、及びシクロペンチルメチルエーテル(CPME、0.25mL)を、磁気攪拌棒を入れた火炎乾燥15.0mLマイクロ波反応管に入れた。バイアルをキャップで密封し、80℃(250Psi、300W)のマイクロ波条件下で4時間静置した。4時間後、反応混合物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(クロロホルム中0~3%メタノール)で直接精製することにより、式5のペンタペプチドを無色結晶固体として得た(収量115mg、収率77%、>20:1dr)。
Rf = 0.4 (50% AcOEt in hexane). [α]D
26.3 = +10.0 (c 0.7, CHCl3). 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.11 (t, J = 5.2 Hz, 1H, NH), 6.98 (d, J = 8.7 Hz, 1H, NH), 5.31 (d, J = 8.8 Hz, 1H, Boc-NH-), 4.41 (dd, J = 8.7, 4.6 Hz, 1H, NH-CH(CH(CH3)2CO2C(CH3)3), 4.01 (d, J = 5.3 Hz, 3H, Boc-NH-CH(CH(CH3)2CONHCH
2-CO-), 2.11-2.03 (m, 2H, Boc-NH-CH(CH(CH3)2CONHCH2-CO- NH-CH(CH(CH3)2CO2C(CH3)3), 1.42 (d, J = 12.4 Hz, 18H, (CH
3)3COCONH- and -CO2C(CH
3)3), 1.13 - 0.79 (m, 12H, Boc-NH-CH(CH(CH
3)2CONHCH2-CO- NH-CH(CH(CH
3)2CO2C(CH3)3). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 172.5, 170.9, 168.8, 156.0, 82.1, 79.9, 60.0, 57.7, 43.3, 31.4, 31.1, 28.4, 28.1, 19.4, 19.0, 17.8, 17.8 IR (thin film, cm-1) 3282, 2964, 1690, 1629, 1520, 1391, 1366, 1228, 1154, 17, 846, 682. HRMS (ESI) calculated for C21H39N3O6Na [M+Na]+ m/z 452.2737, found 452.2696.
Rf = 0.3 (5% MeOH in CHCl3). 1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-D) δ 7.92 (s, 1H, NH), 6.55 (d, J = 8.8 Hz, 1H, NH), 4.42 (dd, J = 8.6, 4.5 Hz, 1H, -CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3) 4.16 - 3.83 (m, 2H, NH2-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 3.30 (d, J = 3.9 Hz, 1H, NH2-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-), 2.33 (td, J = 7.0, 3.9 Hz, 1H, -CONH-CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 2.23 - 2.11 (m, 1H, NH2-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-), 1.61 (s, 2H, NH
2-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-), 1.46 (s, 9H, -CONH-CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH
3)3), 1.09 - 0.73 (m, 12H, NH2-CH(CH(CH
3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH
3)2)-CO2C(CH3)3). 13C NMR (100 MHz, CHLOROFORM-D) δ 175.4, 170.9, 169.1, 82.2, 60.3, 57.6, 43.3, 31.5, 31.0, 28.1, 19.8, 19.0, 17.8, 16.3. HRMS (ESI) calculated for C16H32N3O4Na [M+Na]+ m/z 330.2392, found 330.2394.
Rf = 0.36 (5% MeOH in CHCl3). M.p. 161-164 °C. [α]D
26.7 = +19.7 (c 1.05, CHCl3). 1H NMR (400 MHz, DMSO-D6) δ 8.24 (t, J = 5.9 Hz, 1H, NH), 8.04 (t, J = 5.7 Hz, 1H, NH), 7.85 (d, J = 8.4 Hz, 1H, NH), 7.77 (d, J = 8.6 Hz, 1H, NH), 6.69 (d, J = 8.8 Hz, 1H, (CH3)3COCO-NH-), 4.17 (dd, J = 8.7, 6.6 Hz, 1H, (CH3)3COCO NH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 4.08 (dd, J = 8.4, 5.8 Hz, 1H, (CH3)3COCO NH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 3.94 - 3.60 (m, 5H, (CH3)3COCO NH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH
2-CONH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH
2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 2.11 - 1.83 (m, 3H, (CH3)3COCO NH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH3)3), 1.39 (d, J = 10.7 Hz, 18H, (CH
3)3COCO NH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH-CH(CH(CH3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH3)2)-CO2C(CH
3)3), 1.04 - 0.75 (m, 18H, CH3)3COCO NH-CH(CH(CH
3)2)-CO-NH-CH2-CONH-CH(CH(CH
3)2)-CO-NH-CH2-CONH- CH(CH(CH
3)2)-CO2C(CH3)3)). 13C NMR (100 MHz, DMSO-D6) δ 171.7, 171.1, 170.5, 168.8, 168.7, 155.5, 80.7, 78.0, 59.6, 57.7, 41.9, 41.6, 30.4, 30.3, 30.1, 28.1, 27.6, 19.2, 19.2, 18.9, 18.1, 18.0, 17.9. IR (thin film, cm-1) 3285, 3082, 2964, 2934, 1691, 1629, 1520, 1468, 1391, 1366, 1312, 1292, 1227, 1158, 1042, 1018, 924, 847, 799, 751, 683, 656, 614. HRMS (ESI) calculated for C28H51N5O8Na [M+Na]+ m/z 608.3635, found 608.3661.
Claims (13)
- 一般式(1):
で表されるジケトピペラジン化合物。 - PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、請求項1に記載のジケトピペラジン化合物。
- R5が、無置換又は置換基で置換された炭化水素基である、請求項1又は2に記載のジケトピペラジン化合物。
- R1及びR2が、何れも水素原子ではない、請求項1から3の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
- R3及びR4が、何れも水素原子ではない、請求項1から4の何れか一項に記載のジケトピペラジン化合物。
- 一般式(1’):
で表されるジケトピペラジン化合物を製造するための方法であって、
(a)一般式(2):
で表される、6員環内窒素原子の一方がアルキル型保護基で保護されたジケトピペラジン化合物に対し、保護されていないもう一方の6員環内窒素原子を電子求引性保護基で保護することにより、一般式(3):
で表される、異なる2つの保護基PGE及びPGAが導入されたジケトピペラジン化合物を取得し、
(b)前記工程(a)で取得された式(3)の化合物から、アルキル型保護基PGAのみを除去する
ことを含む製造方法。 - 当該製造方法が更に、
(c)一般式(4):
で表されるジペプチド化合物を酸性条件下で処理することによって、前記一般式(3)の化合物を取得することを含み、
前記工程(c)で取得された前記一般式(3)の化合物を、前記工程(a)の原料として使用する、請求項6に記載の製造方法。 - 当該製造方法が更に、
(d)一般式(5):
で表されるアルキル型置換基で保護されたアミノ酸と、一般式(6):
で表されるアミノ酸エステルとを縮合させて、前記一般式(4)の化合物を取得することを含み、
前記工程(d)で取得された前記一般式(4)の化合物を、前記工程(c)の原料として使用する、請求項7に記載の製造方法。 - PGAが、ベンジル基または置換ベンジル基である、請求項6から8の何れか一項に記載の製造方法。
- PGEが、tert-ブトキシカルボニル基である、請求項6から9の何れか一項に記載の製造方法。
- R6が、メチル基又はエチル基である、請求項7から10の何れか一項に記載の製造方法。
- 一般式(7):
で表されるテトラペプチド以上の鎖長を有するポリペプチドを製造する方法であって、
(x)一般式(8):
で表される窒素求核種化合物を、一般式(1):
で表されるジケトピペラジン化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環させて、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させ、
(y)当該電子求引性保護基PGEを除去して得られる反応生成物に、さらに前記工程(x)の前記一般式(1)の化合物と同一又は異なる、前記一般式(1)の化合物と反応させることにより、前記一般式(1)の化合物の電子求引性保護基PGEが結合する窒素原子を含むラクタム基を開環し、生成するジペプチドを前記一般式(8)の化合物のN末端アミノ基に連結させて反応生成物を取得し、
ここで前記工程(y)を、同一又は異なる前記一般式(1)の化合物を用いてp-1回繰り返すことにより、前記一般式(7)のポリペプチドを取得する、製造方法。 - PGEが、tert-ブチルカルボニル基である、請求項12に記載の製造方法。
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