WO2022095045A1 - SARS-CoV-2抗体及其应用 - Google Patents
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Abstract
一种SARS-CoV-2抗体及其应用。该SARS-CoV-2抗体具有下述性质中的一种或多种：阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合；以极低的KD值特异性结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体；具有中和SARS-CoV-2的活性。还提供了该SARS-CoV-2抗体相关的制备方法和应用。
Description
本申请涉及生物医药领域，具体的涉及一种SARS-CoV-2抗体及其应用。
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)为阳性RNA基因组的含包膜病毒，属于冠状病毒科Nidovirales亚目β属。目前，已有多个利用康复者特异血浆临床治疗危重病人且效果显著的案例。但毕竟血浆制品来源有限，且必须经过严格的血液生物安全性检测方能用于临床，尚未充分满足当前疫情防治的需求,因此开发出用于新型冠状病毒疫情防治的特效抗体药物显得极为迫切。
发明内容
本申请提供了一种SARS-CoV-2抗体及其应用。本申请所述的SARS-CoV-2抗体可具有下述性质中的一种或多种：阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合；以极低的KD值特异性结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体；具有亲水性；有利于制备和纯化；稳定性，尤其是热稳定性佳；具有中和SARS-CoV-2的活性。本申请还提供了所述SARS-CoV-2抗体相关的制备方法和应用。
一方面，本申请提供一种分离的抗原结合蛋白，其包含轻链可变区VL中的至少一个CDR，所述VL包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白包含重链可变区VH中的至少一个CDR，所述VH包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白具有下述性质中的一种或多种：
1)阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合；
2)在Octet测定中，以约3.0×10
-10M以下的K
D值特异性结合SARS-CoV-2的S1蛋白的RBD或其突变体；
3)在PRNT测定中具有中和SARS-CoV-2的活性。
在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白包括抗体或其抗原结合片段。
在某些实施方式中，其中所述抗原结合片段包括Fab，Fab’，F(ab)2，Fv片段，F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
在某些实施方式中，所述抗体为全人源抗体。
在某些实施方式中，所述VL包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，所述LCDR3包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:65所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR3包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63和SEQ ID NO:64中任一项所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR1包含SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:58所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR1包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56中任一项所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR2包含SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VH包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1包含SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR2包含SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:75所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR2包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:72和SEQ ID NO:73中任一项所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR3包含SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR3包含SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:76中任一项所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3和L-FR4，其中所述L-FR1的C末端与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1包含SEQ ID NO:26或SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2包含SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3包含SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端直接或间接相连，且所述L-FR4包含SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包含SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:93中任一项所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述的分离的抗原结合蛋白包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区包括人Igκ恒定区或人Igλ恒定区。
在某些实施方式中，所述VH包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3和H-FR4，其中所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1包含SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2包含SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3包含SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端直接或间接相连，且所述H-FR4包含SEQ ID NO:33H所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VH包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VH包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101和SEQ ID NO:102中任一项所述的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述的分离的抗原结合蛋白包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区包括人IgG恒定区。
在某些实施方式中，所述的分离的抗原结合蛋白包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链 恒定区包括人IgG1恒定区。
另一方面，本申请提供一种分离的一种或多种核酸分子，其编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白。
另一方面，本申请提供一种载体，其包含本申请所述的核酸分子。
另一方面，本申请提供一种细胞，其包含本申请所述的核酸分子或本申请所述的载体。
另一方面，本申请提供一种制备本申请所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法包括在使得本申请所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养本申请所述的细胞。
另一方面，本申请提供一种药物组合物，其包含本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞，以及任选地药学上可接受的佐剂。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗冠状病毒的感染。
在某些实施方式中，所述冠状病毒的感染包括COVID-19。
在某些实施方式中，所述药物包括抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
另一方面，本申请提供一种抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)，其包含经由接头与药物偶联的本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体。
另一方面，本申请提供一种针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物，其包含本申请所述的核酸分子。
另一方面，本申请提供一种阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合的方法，其包括以下的步骤，施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞、本申请所述的药物组合物、本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物和/或本申请所述的针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
本领域技术人员能够从下文的详细描述中容易地洞察到本申请的其它方面和优势。下文的详细描述中仅显示和描述了本申请的示例性实施方式。如本领域技术人员将认识到的，本申请的内容使得本领域技术人员能够对所公开的具体实施方式进行改动而不脱离本申请所涉及发明的精神和范围。相应地，本申请的附图和说明书中的描述仅仅是示例性的，而非为限制性的。
本申请所涉及的发明的具体特征如所附权利要求书所显示。通过参考下文中详细描述的示例性实施方式和附图能够更好地理解本申请所涉及发明的特点和优势。对附图简要说明书如下：
图1显示的是本申请所述候选抗体阻断SARS-CoV-2 RBD蛋白与HEK293/ACE2细胞结合的情况；
图2显示的是本申请所述抗体对SARS-CoV-2假病毒的中和活性结果；
图3显示的是本申请所述抗体对SARS-CoV-2真病毒的中和活性结果。
以下由特定的具体实施例说明本申请发明的实施方式，熟悉此技术的人士可由本说明书所公开的内容容易地了解本申请发明的其他优点及效果。
术语定义
在本申请中，术语“SARS-CoV”通常是指SARS冠状病毒，即严重急性呼吸道综合征冠状病毒(英文全称为Severe acute respiratory syndrome coronavirus)，其属于冠状病毒科(Coronaviridae)乙型冠状病毒属(Betacoronavirus)沙贝病毒亚属(Sarbecovirus)。
在本申请中，术语“SARS-CoV-2”通常是指严重急性呼吸道综合征冠状病毒2型，英文全称为Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2。SARS-CoV-2属于冠状病毒科(Coronaviridae)乙型冠状病毒属(Betacoronavirus)沙贝病毒亚属(Sarbecovirus)。SARS-CoV-2是一种具有包膜的、不分节段的正链单股RNA病毒。SARS-CoV-2可以引发新型冠状病毒肺炎(COVID-19)。在本申请中，所述SARS-CoV-2可以包括S蛋白(刺突蛋白，spike蛋白)。
在本申请中，术语“冠状病毒的S蛋白”通常是指冠状蛋白的刺突蛋白(spike蛋白)。所述S蛋白可以组合成三聚体，其约含有1300个氨基酸。所述S蛋白可以属于第一类膜融合蛋白(Class I viral fusion protein)。所述S蛋白通常可以含有两个亚基(subunit)，S1和S2。S1主要包含有受体结合区(receptor binding domain RBD)，其可以负责识别细胞的受体。S2含有膜融合过程所需的基本元件，包括一个内在的膜融合肽(fusion peptide)，两个7肽重复 序列(heptad repeat，HR)，一个富含芳香族氨基酸的膜临近区域(membrane proximal external region，MPER)，以及跨膜区(transmembrane，TM)。S1蛋白可进一步分成两个区域(domain)，即N-端区域(N-terminal domain，NTD)和C-端区域(C-terminal domain，CTD)。S蛋白可以决定病毒(例如冠状病毒SARS-CoV-2)的宿主范围和特异性，也可以为宿主中和抗体的而重要作用位点，和/或疫苗设计的关键靶点。所述S蛋白可以为SARS-CoV-2的S蛋白，例如，其结构可以参见Daniel Wrapp等，Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation,Science。
在本申请中，术语“ACE2”通常是指血管紧张素转化酶II(Angiotensin-converting enzyme2)或其功能片段。所述血管紧张素转化酶II可以催化血管紧张素I转化为血管紧张素-(1-9)或血管紧张素II转化为血管紧张素-(1-7)的外肽酶。所述ACE2可以包括N端的PD区(peptidase domain，肽酶结构域)和C端CLD区(Collectrin-like domain)。所述血管紧张素转化酶II可以为SARS冠状病毒(SARS-CoV)或严重急性呼吸道综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)的受体，例如，所述ACE2的胞外结构域(例如，所述ACE2的PD区)可以结合冠状病毒的S蛋白的RBD。人血管紧张素转化酶II在UniProt数据库的登录号为Q9BYF1。人ACE2基因可以包含18个外显子，参见Tipnis,S.R.,Hooper,N.M.,Hyde,R.,Karran,E.,Christie,G.,Turner,A.J.A human homolog of angiotensin-converting enzyme:cloning and functional expression as a captopril-insensitive carboxypeptidase.J.Biol.Chem.275:33238-33243,2000的表1。在本申请中，所述ACE2蛋白的功能性片段可以包括所述完整ACE2蛋白的截短体或变体，只要所述功能性片段仍具备作为冠状病毒(例如SARS-CoV和/或SARS-CoV-2)受体的功能。
在本申请中，术语“ACE2-Fc”通常是指包含本申请所述S蛋白的结合蛋白或其功能性片段以及IgG抗体的Fc区域的融合蛋白。在本申请中，所述S蛋白的结合蛋白或其功能性片段与所述IgG抗体的Fc区域直接或间接连接。例如，所述IgG抗体的Fc区域可以位于所述ACE2-Fc融合蛋白的C端。在本申请中，所述IgG可以为IgG1，例如可以为人IgG1。
在本申请中，术语“冠状病毒”通常是指属于套式病毒目(Nidovirales)冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus)中的病毒。所述冠状病毒为线性单股正链的RNA病毒。所述冠状病毒可以包括具有棘突的包膜。所述冠状病毒的基因组可以5’端具有甲基化的帽状结构，3’端具有poly(A)尾，基因组全长约为27-32kb。在本申请中，所述冠状病毒包括严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒，即Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus，其是冠状病毒科乙型冠状病毒属的一个种。在本申请中，所述冠状病毒可引起感 冒以及中东呼吸综合征(MERS)、严重急性呼吸综合征(SARS)和/或新型冠状病毒肺炎(COVID-19)。
在本申请中，术语“突变体”通常是指通过一种或多种选择的氨基酸的缺失、插入或替换的突变的氨基酸序列。在本申请中，所述突变体可以包含与SARS-CoV-2的S蛋白的RBD的氨基酸序列相比，具有至少约90％(例如，至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或更多)的同一性的氨基酸序列。例如，SARS-CoV-2的S蛋白的RBD突变体的氨基酸序列可以参见RBD mutations from circulating SARS-CoV-2strains enhance the structure stability and infectivity of the spike protein，bioRxiv，2020。
在本申请中，术语“COVID-19”通常是指冠状病毒病2019，其是由SARS-CoV-2病毒引起的呼吸道疾病。COVID-19的常见症状包括发烧，咳嗽，疲劳，呼吸急促以及气味和味觉丧失，某些症状会发展为病毒性肺炎，多器官功能衰竭或细胞因子风暴。该疾病主要在人与人之间密切接触时传播，例如可以通过咳嗽，打喷嚏和说话产生的小液滴传播。世界卫生组织于2020年3月11日宣布COVID-19的爆发是大流行病(pandemic)。目前没有针对COVID-19的可用的疫苗或特异性的治疗方法。
在本申请中，术语“抗原结合蛋白”通常是指包含结合抗原的部分的蛋白质，以及任选地允许结合抗原的部分采用促进抗原结合蛋白与抗原结合的构象的支架或骨架部分。抗原结合蛋白的实例包括但不限于抗体、抗原结合片段(Fab，Fab’，F(ab)2，Fv片段，F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb)、免疫缀合物、多特异性抗体(例如双特异性抗体)、抗体片段、抗体衍生物、抗体类似物或融合蛋白等，只要它们显示出所需的抗原结合活性即可。
在本申请中，术语“Fab”通常是指含有重链可变结构域和轻链可变结构域的片段，并且还含有轻链的恒定结构域和重链的第一恒定结构域(CH1)；术语“Fab’”通常是指在重链CH1结构域的羧基端添加少量残基(包括一个或多个来自抗体铰链区的半胱氨酸)而不同于Fab的片段；术语“F(ab')2”通常是指Fab’的二聚体，包含通过铰链区上的二硫桥连接的两个Fab片段的抗体片段。术语“Fv”通常是指含有完整抗原识别与结合位点的最小抗体片段。在某些情形中，该片段可以由一个重链可变区和一个轻链可变区以紧密非共价结合的二聚体组成；术语“dsFv”通常是指二硫键稳定的Fv片段，其单个轻链可变区与单个重链可变区之间的键是二硫键。术语“dAb片段”通常是指由VH结构域组成的抗体片段。在本申请中，术语“scFv”通常是指抗体的一个重链可变结构域和一个轻链可变结构域通过柔性肽连接子共价连接配对形成的单价分子；此类scFv分子可具有一般结构：NH2-VL-连接子-VH-COOH或NH2-VH-连接子-VL-COOH。
在本申请中，术语“抗体”其以最广泛意义使用，且具体涵盖，但不限于，单克隆抗体(包括包含两条轻链和两条重链的全长单克隆抗体)、多克隆抗体、多特异性抗体(例如双特异性抗体)、人源化抗体、完全人类抗体、嵌合抗体和骆驼化单结构域抗体。“抗体”通常可以包含通过二硫键互相连接的至少两条重链(HC)和两条轻链(LC)的蛋白，或其抗原结合片段。每条重链包含重链可变区(VH)和重链恒定区。在某些天然存在的IgG、IgD和IgA抗体中，重链恒定区包含三个结构域，CH1、CH2和CH3。在某些天然存在的抗体中，各轻链包含轻链可变区(VL)和轻链恒定区。轻链恒定区包含一个结构域，CL。VH和VL区可进一步细分为超变性的区域，称为互补决定区(CDR)，其与称为框架区(FR)的较保守的区域交替。各VH和VL包含三个CDR和四个框架区(FR)，从氨基端至羧基端按以下顺序排列：FR1，CDR1，FR2，CDR2，FR3，CDR3和FR4。天然重链和轻链的可变结构域各自包含四个FR区(H-FR1，H-FR2，H-FR3，H-FR4，L-FR1，L-FR2，L-FR3，L-FR4)，大部分采用β-折叠构型，通过三个CDRs连接，形成环连接，并且在一些情况下形成β-折叠结构的一部分。每条链中的CDRs通过FR区紧密靠近在一起，并与来自另一条链的CDR一起形成抗体的抗原结合位点。抗体的恒定区可介导免疫球蛋白与宿主组织或因子，包括免疫系统的各种细胞(例如，效应细胞)和经典补体系统的第一组分(Clq)结合。
在本申请中，术语“可变”通常是指这样的事实，即抗体的可变结构域的序列的某些部分变化强烈，它形成各种特定抗体对其特定抗原的结合和特异性。然而，变异性并非均匀地分布在抗体的整个可变区中。它集中在轻链和重链可变区中的三个区段，被称为互补决定区(CDR)或高变区(HVR)。可变域中更高度保守的部分被称为框架(FR)。在本领域中，可以通过多种方法来定义抗体的CDR，例如基于序列可变性的Kabat定义规则(参见，Kabat等人，免疫学的蛋白质序列，第五版，美国国立卫生研究院，贝塞斯达，马里兰州(1991))、基于结构环区域位置的Chothia定义规则(参见，A1-Lazikani等人，JMol Biol 273:927-48,1997)和基于IMGT本体论(IMGT-ONTOLOGY)的概念和IMGT Scientific图表规则的KABAT定义规则。
IMGT指国际ImMunoGeneTics信息系统，一种免疫遗传学和免疫信息学的全球参考数据库(http://www.imgt.org)。IMGT专门研究来自人类和其他脊椎动物的免疫球蛋白(IG)或抗体、T细胞受体(TR)、主要组织相容性(MH)，以及来自脊椎动物和非脊椎动物的免疫球蛋白超家族(IgSF)、MH超家族(MhSF)和免疫系统相关蛋白(RPI)。
在本申请中，术语“分离的”抗原结合蛋白通常是指已经从其产生环境(例如，天然的或重组的)的组分中识别，分离和/或回收的抗原结合蛋白。其产生环境的污染组分通常是干扰 其研究、诊断或治疗用途的物质，可以包括酶、激素和其他蛋白质或非蛋白质溶质。分离的抗原结合蛋白或抗体通常将通过至少一个纯化步骤来制备。
在本申请中，术语“单克隆抗体”通常是指从一群基本上同质的抗体获得的抗体，即集群中的个别抗体是相同的，除了可能存在的少量的自然突变。单克隆抗体通常针对单个抗原位点具有高度特异性。而且，与常规多克隆抗体制剂(通常具有针对不同决定簇的不同抗体)不同，各单克隆抗体是针对抗原上的单个决定簇。除了它们的特异性之外，单克隆抗体的优点在于它们可以通过杂交瘤培养合成，不受其他免疫球蛋白污染。修饰语“单克隆”表示从基本上同质的抗体群体获得的抗体的特征，并且不被解释为需要通过任何特定方法产生抗体。例如，本申请使用的单克隆抗体可以在杂交瘤细胞中制备，或者可以通过重组DNA方法制备。
在本申请中，术语“嵌合抗体”通常是指其中可变区源自一个物种，而恒定区源自另一个物种的抗体。通常，可变区源自实验动物诸如啮齿动物的抗体(“亲本抗体”)，且恒定区源自人类抗体，使得所得嵌合抗体与亲本(例如小鼠来源)抗体相比，在人类个体中引发不良免疫反应的可能性降低。
在本申请中，术语“人源化抗体”通常是指非人抗体(例如小鼠抗体)的CDR区以外的部分或全部有的氨基酸被源自人免疫球蛋白的相应的氨基酸置换的抗体。在CDR区中，氨基酸的小的添加、缺失、插入、置换或修饰也可以是允许的，只要它们仍保留抗体结合特定抗原的能力。人源化抗体可任选地包含人类免疫球蛋白恒定区的至少一部分。“人源化抗体”保留类似于原始抗体的抗原特异性。非人(例如鼠)抗体的“人源化”形式可以最低限度地包含衍生自非人免疫球蛋白的序列的嵌合抗体。在某些情形中，可以将人免疫球蛋白(受体抗体)中的CDR区残基用具有所期望性质、亲和力和/或能力的非人物种(供体抗体)(诸如小鼠，大鼠，家兔或非人灵长类动物)的CDR区残基替换。在某些情形中，可以将人免疫球蛋白的FR区残基用相应的非人残基替换。此外，人源化抗体可以包含在受体抗体中或在供体抗体中没有的氨基酸修饰。进行这些修饰可以是为了进一步改进抗体的性能，诸如结合亲和力。
在本申请中，术语“全人源抗体”通常是指将人类编码抗体的基因转移至基因工程改造的抗体基因缺失动物中，使动物表达的抗体。抗体所有部分(包括抗体的可变区和恒定区)均由人类来源的基因所编码。全人源抗体可以大大减少异源抗体对人体造成的免疫副反应。本领域获得全人源抗体的方法可以有噬菌体展示技术、转基因小鼠技术、核糖体展示技术和RNA-多肽技术等。
在本申请中，术语“结合”、“特异性结合”或“对…特异性的”通常是指可测量且可再现的相互作用，诸如抗原和抗体之间的结合，其可以确定在存在分子(包括生物学分子)的异质群体的情况中靶物的存在。例如，抗体通过其抗原结合域与表位结合，并且该结合需要抗原结合域和表位之间的一些互补性。例如，特异性结合靶物(其可以是表位)的抗体是以比其结合其它靶物更大的亲和力、亲合力、更容易和/或以更大的持续时间结合此靶物的抗体。当抗体相比于其将结合随机的、不相关的表位而言更容易通过其抗原结合域与表位结合时，抗体被称为“特异性结合”该抗原。“表位”是指抗原上与抗原结合蛋白(如抗体)结合的特定的原子单击或点击此处输入文字。单击或点击此处输入文字。单击或点击此处输入文字。基团(例如，糖侧链、磷酰基、磺酰基)或氨基酸。
在本申请中，术语“KD”、“K
D”可互换地使用，通常是指平衡解离常数，“KD”是解离速率常数(kdis，也称为“解离率(off-rate)(koff)”或“kd”)与结合速率常数(kon，也称为“结合率(kon)”或“ka”)的比值。可使用结合速率常数(kon)、解离速率常数(kdis)和平衡解离常数(KD)表示抗原结合蛋白(例如抗体)对抗原的结合亲和力。确定结合和解离速率常数的方法为本领域熟知，包括但不限于生物膜干涉技术(BLI)、放射免疫法(RIA)、平衡透析法、表面等离子共振(SPR)、荧光共振能量迁移(FRET)、免疫共沉淀(Co-IP)以及蛋白质芯片技术。如果在不同的条件(例如盐浓度、pH)下测量，则所测得的某种特定蛋白-蛋白相互作用的亲和力可不同。
在本申请中，术语“参比抗体”通常是指本申请所述抗原结合蛋白与之竞争结合抗原(例如SARS-CoV-2的S蛋白的RBD)的抗体。
在本申请中，术语“CDC”通常是指由补体因子C1q与大多数IgG抗体亚类的Fc部分结合而起始的过程。C1q与抗体的结合可以由Fc部分的结合位点的限定的蛋白-蛋白相互作用所导致。这些Fc部分的结合位点可以包含氨基酸L234，L235，D270，N297，E318，K320，K322，P331，和P329(根据Kabat的EU索引编号)。IgG1，IgG2，和IgG3亚型的抗体通常可以显示包括C1q和C3结合的补体激活，而IgG4不激活补体系统并且可以不结合C1q和/或C3。
在本申请中，术语“ADCC”或“抗体依赖性细胞介导的细胞毒性”通常是指这样一种细胞毒性形式，一些分泌型免疫球蛋白结合到某些细胞毒性效应细胞(例如，NK细胞、嗜中性粒细胞和巨噬细胞)上的Fc受体(FcR)上，使得这些细胞毒性效应细胞能够特异性结合携带抗原的靶细胞，随后用细胞毒素杀死靶细胞。介导ADCC的主要细胞(例如NK细胞)只表达FcγRIII，而单核细胞表达FcγRI、FcγRII和FeγRIII(可参见Ravetch and Kinet,Annu.Rev. Immunol.9:457-92(1991)第464页表3)。可以进行体外和/或体内细胞毒性测定法以评估目的分子的ADCC活性，例如，可进行体外ADCC测定法，可参见美国专利No.5,500,362或No.5,821,337或美国专利No.6,737,056(Presta)中所记载的。可用于此类测定法的效应细胞包括PBMC和NK细胞。或者/另外，可在体内评估目的分子的ADCC活性，例如在动物模型中，诸如Clynes et al.，PNAS(USA)95:652-656(1998)中所披露的。例如，可以进行Fc受体(FcR)结合测定法以确保抗体缺乏FcγR结合(因此有可能缺乏ADCC活性)，但是保留FcRn结合能力。
ADCC活性可通过修饰Fc区而减少。在某些情形中，影响与Fc受体结合的位点可被除去，例如，除去并非补救受体结合位点的位点。在某些情形中，Fc区可经修饰以除去ADCC位点。ADCC位点是本领域已知的，关于IgG1的ADCC位点，参见例如，Sarmay et al.(1992)Molec.Immunol.29(5):633-9。
在本申请中，术语“在……之间”通常是指某种氨基酸片段的C端与第一氨基酸片段的N端直接或间接连接，并且其N端与第二氨基酸片段的C端直接或间接连接。在轻链中，例如，所述L-FR2的N末端与所述LCDR1的C末端直接或间接相连，且所述L-FR2的C末端与所述LCDR2的N末端直接或间接相连。又例如，所述L-FR3的N末端与所述LCDR2的C末端直接或间接相连，且所述L-FR3的C末端与所述LCDR3的N末端直接或间接相连。在重链中，例如，所述H-FR2的N末端与所述HCDR1的C末端直接或间接相连，且所述H-FR2的C末端与所述HCDR2的N末端直接或间接相连。又例如，所述H-FR3的N末端与所述HCDR2的C末端直接或间接相连，且所述H-FR3的C末端与所述HCDR3的N末端直接或间接相连。在本申请中，“第一氨基酸片段”和“第二氨基酸片段”可以为相同或不同的任意一段氨基酸片段。
在本申请中，术语“分离的”抗原结合蛋白通常是指已经从其产生环境(例如，天然的或重组的)的组分中识别，分离和/或回收的抗原结合蛋白。其产生环境的污染组分通常是干扰其研究、诊断或治疗用途的物质，可以包括酶、激素和其他蛋白质或非蛋白质溶质。分离的抗原结合蛋白或抗体通常将通过至少一个纯化步骤来制备。
在本申请中，术语“分离的核酸分子”或“分离的多核苷酸”通产是指基因组、mRNA、cDNA或合成来源的DNA或RNA或其一定组合，其不与在自然界中发现的多核苷酸的全部或一部分缔合，或连接至其在自然界中不连接的多核苷酸。
在本申请中，术语“载体”通常是指能够在合适的宿主中自我复制的核酸分子，其将插入的核酸分子转移到宿主细胞中和/或宿主细胞之间。所述载体可包括主要用于将DNA或RNA 插入细胞中的载体、主要用于复制DNA或RNA的载体，以及主要用于DNA或RNA的转录和/或翻译的表达的载体。所述载体还包括具有多种上述功能的载体。所述载体可以是当引入合适的宿主细胞时能够转录并翻译成多肽的多核苷酸。通常，通过培养包含所述载体的合适的宿主细胞，所述载体可以产生期望的表达产物。
在本申请中，术语“细胞”通常是指可以或已经含有包括本申请所述的核酸分子的质粒或载体，或者能够表达本申请所述的抗体或其抗原结合片段的个体细胞、细胞系或细胞培养物。所述细胞可以包括单个宿主细胞的子代。由于天然的、意外的或故意的突变，子代细胞与原始亲本细胞在形态上或在基因组上可能不一定完全相同，但能够表达本申请所述的抗体或其抗原结合片段即可。所述细胞可以通过使用本申请所述的载体体外转染细胞而得到。所述细胞可以是原核细胞(例如大肠杆菌)，也可以是真核细胞(例如酵母细胞，例如COS细胞，中国仓鼠卵巢(CHO)细胞，HeLa细胞，HEK293细胞，COS-1细胞，NS0细胞或骨髓瘤细胞)。在某些情形中，所述细胞可以是哺乳动物细胞。例如，所述哺乳动物细胞可以是CHO-K1细胞。在本申请中，术语“重组细胞”通常是指在其中引入了重组表达载体的细胞。所述重组宿主细胞不仅包括某种特定的细胞，还包括这些细胞的后代。
在本申请中，术语“药学上可接受的佐剂”通常包括药剂学可接受的载体、赋形剂或稳定剂，它们在所采用的剂量和浓度对暴露于其的细胞或哺乳动物是无毒的。通常，生理学可接受的载体是pH缓冲水溶液。生理学可接受载体的例子可包括缓冲剂，抗氧化剂，亲水性聚合物，氨基酸，单糖，二糖和其它碳水化合物，螯合剂，糖醇，成盐反荷离子和/或非离子表面活性剂。
术语“抗体药物偶联物”或“ADC”是指与一个或多个化学药物(也称为一种或多种试剂、一种或多种弹头、和有效负载)化学连接的结合蛋白(如抗体或其抗原结合片段)，其可以任选地为治疗剂或细胞毒性剂。在某些实施方式中，ADC包括抗体，药物(例如细胞毒性药物)和能够使药物与抗体附接或偶联的接头。ADC通常在任何地方都具有与抗体偶联的1至8种药物，包括2、4、6、或8的载药种类(drug loaded species)。可包含在ADC中的药物的非限制性实例是有丝分裂抑制剂、抗肿瘤抗生素、免疫调节剂、用于基因治疗的载体、烷化剂、抗血管生成剂、抗代谢物、含硼剂、化学保护剂、激素、抗激素剂、皮质类固醇、光活性治疗剂、寡核苷酸、放射性核素剂、拓扑异构酶抑制剂、激酶抑制剂(例如，TEC-家族激酶抑制剂和丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂)和放射增敏剂。
如本文所用，术语“给予”和“处理”是指外源性药物、治疗剂、诊断剂或组合物应用于动物、人、受试者、细胞、组织、器官或生物流体。“给予”和“处理”可以指治疗、药物代谢动力 学、诊断、研究和实验方法。细胞的处理包括试剂与细胞的接触、以及试剂与流体的接触、流体与细胞的接触。“给予”和“处理”还意指通过试剂、诊断、结合组合物或通过另一种细胞体外和离体处理。“处理”当应用于人、动物或研究受试者时，是指治疗处理、预防或预防性措施，研究和诊断；包括冠状病毒(例如SARS-CoV-2)与人或动物、受试者、细胞、组织、生理区室或生理流体的接触。
如本文所用，术语“治疗”指给予患者内用或外用治疗剂，包含本申请的任何一种SARS-CoV-2抗原结合蛋白及其组合物，所述患者具有一种或多种疾病症状，而已知所述治疗剂对这些症状具有治疗作用。通常，以有效缓解一种或多种疾病症状的治疗剂的量(治疗有效量)给予患者。治疗的期望效果包括降低疾病进展速率，改善或减轻疾病状态，和消退或改善的预后。例如，若一种或多种与癌症有关的症状是减轻或消除的，包括但不限于，降低(或破坏)癌细胞增殖，减少源自疾病的症状，提高那些患有疾病的个体的生命质量，降低治疗疾病需要的其它药物的剂量，延迟疾病的进展，和/或延长个体存活，则个体得到成功“治疗”。
在本申请中，术语“包括”通常是指包含、总括、含有或包涵的含义。在某些情况下，也表示“为”、“由……组成”的含义。
在本申请中，术语“约”通常是指在指定数值以上或以下0.5％-10％的范围内变动，例如在指定数值以上或以下0.5％、1％、1.5％、2％、2.5％、3％、3.5％、4％、4.5％、5％、5.5％、6％、6.5％、7％、7.5％、8％、8.5％、9％、9.5％、或10％的范围内变动。
发明详述
抗原结合蛋白
一方面，本申请提供了分离的抗原结合蛋白，其可以包含轻链可变区VL中的至少一个CDR，所述VL包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
例如，所述VL包含SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:93中任一项所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH中的至少一个CDR，所述VH包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
例如，所述VH包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101和SEQ ID NO:102中任一项所述的氨基酸序列。
例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的VL中的LCDR1。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的VL中的LCDR2。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的VL中的LCDR3。又例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的VH中的HCDR1。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的VH中的HCDR2。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的VH中的HCDR3。
所述分离的抗原结合蛋白的性质
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以具有下述性质中的一种或多种：
1)阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合；
2)在Octet测定中，以约3.0×10-10M以下的K
D值特异性结合SARS-CoV-2的S1蛋白的RBD或其突变体；
3)在PRNT测定中，具有中和SARS-CoV-2的活性。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够以约3×10
-10M或更低的K
D与SARS-CoV-2的S1蛋白的RBD或其突变体相结合，其中所述K
D值可以通过Octet测定。例如，可以为约约2.5×10
-10M以下、约2.0×10
-10M以下、约1.5×10
-10M以下、约1.0×10
-10M以下、约5×10
-
11M以下、约4.5×10
-11M以下、约4.0×10
-11M以下、约3.5×10
-11M以下、约3.0×10
-11M以下、约2.5×10
-11M以下、约2.0×10
-11M以下、约1.5×10
-11M以下、约1.0×10
-11M以下、约5.0×10
-12M以下、约4.5×10
-12M以下、约4.0×10
-12M以下、约3.5×10
-12M以下、约3.0×10
-
12M以下、约2.5×10
-12M以下、约2.0×10
-12M以下或约1.5×10
-12M以下的K
D值与SARS-CoV-2的S1蛋白的RBD或其突变体相结合。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7 所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:22所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:24所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的 RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:67所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:49所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:60所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:68所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:50所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:61所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:51所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序 列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:70所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:71所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:53所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:72所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:54所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:73所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所 述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:64所示的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白，能够与参比抗体竞争结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，其中所述参比抗体可以包含重链可变区和轻链可变区，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:56所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，且所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
所述分离的抗原结合蛋白的种类
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体或其抗原结合片段。例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包括但不限于重组抗体、单克隆抗体、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、双特异性抗体、单链抗体、双抗体、三抗体、四抗体、Fv片段、scFv片段、Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段和骆驼化单结构域抗体。
在本申请中，所述抗原结合片段可以包括Fab，Fab’，F(ab)2、Fv片段、F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
在本申请中，所述抗体可以为人源化抗体。换句话说，本申请所述的分离的抗原结合蛋白，其可以为免疫特异性结合至相关抗原且包含基本上具有人类抗体的氨基酸序列的框架(FR)区及基本上具有非人类抗体的氨基酸序列的互补决定区(CDR)的抗体或其变异体、衍生物、类似物或片段。此处的“基本上”在CDR的情况下是指CDR的氨基酸序列与非人类抗体CDR的氨基酸序列至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％或至少99％同一。所述人源化抗体基本上可以包含所有至少一个且通常两个可变域(Fab、Fab′、F(ab′)2、FabC、 Fv)，其中所有或基本上所有CDR区对应于非人类免疫球蛋白(即抗体)的CDR区且所有或基本上所有框架区为具有人类免疫球蛋白共有序列的框架区。在一些实施例中，人源化抗体还包含至少一部分免疫球蛋白恒定区(例如，Fc)，通常为人类免疫球蛋白的恒定区。在一些实施例中，人源化抗体含有轻链以及重链的至少可变域。抗体还可包括重链的CH1、铰链、CH2、CH3及CH4区。在一些实施例中，人源化抗体仅含人源化轻链。在一些实施例中，人源化抗体仅含人源化重链。在特定实施例中，人源化抗体仅含轻链和/或人源化重链的人源化可变域。
在本申请中，所述抗体可以为全人源抗体(人抗体)。换句话说，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以为指仅包含人类免疫球蛋白蛋白质序列的抗体。如果其是在小鼠中、在小鼠细胞中或在衍生自小鼠细胞的杂交瘤中生产，那么全人源抗体可能含有鼠糖链。类似地，“小鼠抗体”或“大鼠抗体”分别指仅包含小鼠或大鼠免疫球蛋白序列的抗体。可通过噬菌体展示或其它分子生物学方法，在人体内、在具有人类免疫球蛋白种系序列的转基因动物体内生成全人源抗体。可用于制造抗体的示例性技术在美国专利：6,150,584、6,458,592、6,420,140中描述。其它技术，如使用文库，是本领域已知的。
CDR
在本申请中，所述VL可以包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:65所示的氨基酸序列。
例如，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63和SEQ ID NO:64中任一项所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:58所示的氨基酸序列。
例如，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56中任一项所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列，LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，LCDR3可以包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨 基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:58所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:65所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:49所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:60所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:50所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:61所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:51所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的 氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:53所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:54所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:64所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:56所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述VH可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:74所示的氨基酸序列。
例如，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:72和SEQ ID NO:73中任一项所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
例如，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:76中任一项所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:25所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:22所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:24所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:75所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:67所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述 HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:68所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:70所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:71所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:72所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:73所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含 SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:22所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:24所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含 SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:49所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:60所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:67所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:50所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:61所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:68所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:51所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含 SEQ ID NO:70所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:53所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:71所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:54所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:72所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:73所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:64所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述的分离的抗原结合蛋白可以包含LCDR1、LCDR2、LCDR3、HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:56所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包 含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
FR
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白的VL可以包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3和L-FR4。
在本申请中，所述L-FR1可以包含SEQ ID NO:26或SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列。
例如，所述L-FR1的C末端可以与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1可以包含SEQ ID NO:26或SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR2可以包含SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列。
例如，所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2可以包含SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR3可以包含SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列。
例如，所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3可以包含SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR4可以包含SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列。
例如，所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端相连，且所述L-FR4可以包含SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白的所述VH可以包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3和H-FR4。
在本申请中，所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列。
例如，所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR2可以包含SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列。
例如，所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2可以包含SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR3可以包含SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列。
例如，所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3可以包含SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
例如，所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端相连，且所述H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。
VL和VH
本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含抗体轻链可变区VL和抗体重链可变区VH。
例如，所述VL可以包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
又例如，所述VL可以包含SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:93中任一项所述的氨基酸序列。
例如，所述VH可以包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
又例如，所述VH可以包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101和SEQ ID NO:102中任一项所述的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:41所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:34所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:42所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:35所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:36所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:44所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:37所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:45所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:37所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:46所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:38所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:96所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:84所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:97所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:85所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:86所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:99所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:88所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:100所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:89所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:101所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:90所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:102所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:91所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列。
例如，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:41所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:34所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨 基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am01。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:42所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:35所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:22所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am02。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:36所示的氨基酸序列；其中，所述分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H- FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am03。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:44所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:37所示的氨基酸序列；其中，所述分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am04。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:45所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:37所示的氨基酸序列；其中，所述分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:24所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am05。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:46所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:38所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨 基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列，且所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:29所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:30所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.08Am06。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:96所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:84所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:49所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:60所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:67所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am01。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:97所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:85所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:50所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:61所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:68所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列， 且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am02。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:86所示的氨基酸序列；其中，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:51所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am03。
本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am04。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:99所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:88所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:52所示的氨 基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:70所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am05。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:100所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:89所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:53所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:71所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am06。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:101所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:90所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:54所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:72所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列， 且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am07。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:102所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:91所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:73所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am08。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:64所示的氨基酸序列，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am09。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含重链可变区VH和轻链可变区VL，所述VH可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列，且所述VL可以包含SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可以包含SEQ ID NO:56所示的氨 基酸序列，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:62所示的氨基酸序列，，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:69所示的氨基酸序列，所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列；其中，所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可以包含SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列，L-FR2可以包含SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列，L-FR3可以包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列，L-FR4可以包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列，且所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列，H-FR2可以包含SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列，H-FR3可以包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列，H-FR4可以包含SEQ ID NO:33所示的氨基酸序列。该分离的抗原结合蛋白可称为Ab2002.10Am10。
本申请所述的抗原结合蛋白(例如，SARS-CoV-2抗体)能够特异性结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD。“特异性结合”SARS-CoV-2抗原(例如SARS-CoV-2的S蛋白的RBD)的抗原结合蛋白(例如，抗体)通常可以以约3.0×10
-10M的K
D值或更高亲和力(例如，约2.5×10
-
10M以下、约2.0×10
-10M以下、约1.5×10
-10M以下、约1.0×10
-10M以下、约5×10
-11M以下、约4.5×10
-11M以下、约4.0×10
-11M以下、约3.5×10
-11M以下、约3.0×10
-11M以下、约2.5×10
-11M以下、约2.0×10
-11M以下、约1.5×10
-11M以下、约1.0×10
-11M以下、约5.0×10
-12M以下、约4.5×10
-12M以下、约4.0×10
-12M以下、约3.5×10
-12M以下、约3.0×10
-12M以下、约2.5×10
-12M以下、约2.0×10
-12M以下或约1.5×10
-12M以下)结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，但不结合缺乏SARS-CoV-2序列的其它蛋白。
抗原结合蛋白(例如，抗体)是否结合SARS-CoV-2抗原(例如SARS-CoV-2的S蛋白的RBD)可使用本领域中已知的任何测定法确定。本领域中已知测定结合亲和力的分析的实例包括表面等离子共振(例如，BIACORE)或类似技术(例如，KinExa或OCTET)。
本申请所述的抗原结合蛋白(例如，SARS-CoV-2抗体)能够阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合。阻断实验可以使用竞争法进行检测，例如，将所述的抗原结合蛋白(例如，SARS-CoV-2抗体)与抗原(或，可表达抗原的细胞)和抗原的配体(或，表达配体的细胞)混合，根据可检测标记的强度(例如，荧光强度或浓度)反应抗原结合蛋白与抗原的配体竞争性结合抗原的能力。
本申请中涉及的蛋白质、多肽和/或氨基酸序列，还应理解为至少包含以下的范围：与该所述蛋白质或多肽具备相同或类似功能的变体或同源物。
在本申请中，所述变体可以为，在所述蛋白质和/或所述多肽(例如，本申请所述的抗原结合蛋白)的氨基酸序列中经过取代、缺失或添加一个或多个氨基酸的蛋白质或多肽。例如， 所述功能性变体可包含已经通过至少1个，例如1-30个、1-20个或1-10个，又例如1个、2个、3个、4个或5个氨基酸取代、缺失和/或插入而具有氨基酸改变的蛋白质或多肽。所述功能性变体可基本上保持改变(例如取代、缺失或添加)之前的所述蛋白质或所述多肽的生物学特性。例如，所述功能性变体可保持改变之前的所述蛋白质或所述多肽的至少60％，70％，80％，90％，或100％的生物学活性(例如抗原结合能力)。例如，所述取代可以为保守取代。
在本申请中，所述抗原结合蛋白的氨基酸序列的一部分可以与来自特定物种的抗体中相应的氨基酸序列同源，或者属于特定的类别。例如，抗体的可变区及恒定部分均可以来自一个动物物种(如人)的抗体的可变区及恒定区。在本申请中，所述同源物可以为，与所述蛋白质和/或所述多肽(例如，本申请所述的抗原结合蛋白)的氨基酸序列具有至少约85％(例如，具有至少约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或更高的)序列同源性的蛋白质或多肽。
在本申请中，所述同源性通常是指两个或多个序列之间的相似性、类似或关联。可以通过以下方式计算“序列同源性百分比”：将两条待比对的序列在比较窗中进行比较，确定两条序列中存在相同核酸碱基(例如，A、T、C、G)或相同氨基酸残基(例如，Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys和Met)的位置的数目以得到匹配位置的数目，将匹配位置的数目除以比较窗中的总位置数(即，窗大小)，并且将结果乘以100，以产生序列同源性百分比。为了确定序列同源性百分数而进行的比对，可以按本领域已知的多种方式实现，例如，使用可公开获得的计算机软件如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。本领域技术人员可以确定用于比对序列的适宜参数，包括为实现正在比较的全长序列范围内或目标序列区域内最大比对所需要的任何算法。所述同源性也可以通过以下的方法测定：FASTA和BLAST。对FASTA算法的描述可以参见W.R.Pearson和D.J.Lipman的“用于生物学序列比较的改进的工具”，美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.)，85：2444-2448，1988；和D.J.Lipman和W.R.Pearson的“快速灵敏的蛋白质相似性搜索”，Science，227：1435-1441，1989。对BLAST算法的描述可参见S.Altschul、W.Gish、W.Miller、E.W.Myers和D.Lipman的“一种基本的局部对比(alignment)搜索工具”，分子生物学杂志，215：403-410，1990。
核酸、载体、细胞和制备方法
另一方面，本申请提供一种分离的一种或多种核酸分子，其编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白。
另一方面，本申请提供一种载体，其可以包含本申请所述的核酸分子。
另一方面，本申请提供一种细胞，其可以包含本申请所述的核酸分子或本申请所述的载体。
本申请所述的核酸分子可以为分离的。例如，其可以是通过以下方法产生或合成的：(i)在体外扩增的，例如通过聚合酶链式反应(PCR)扩增产生的，(ii)通过克隆重组产生的，(iii)纯化的，例如通过酶切和凝胶电泳分级分离，或者(iv)合成的，例如通过化学合成。在某些实施方式中，所述分离的核酸是通过重组DNA技术制备的核酸分子。
在本申请中，可以通过本领域已知的多种方法来制备编码所述抗体、其抗原结合片段的核酸，这些方法包括但不限于，采用限制性片段操作或采用合成性寡核苷酸的重叠延伸PCR，具体操作可参见Sambrook等人，Molecular Cloning，A Laboratory Manual，Cold Spring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，N.Y.，1989；和Ausube等人Current Protocols in Molecular Biology，Greene Publishing and Wiley-Interscience，New York N.Y.，1993。
在另一个方面，本申请提供了一种或多种载体，其包含本申请所述的一种或多种核酸分子。每种载体中可包含一种或多种所述核酸分子。此外，所述载体中还可包含其他基因，例如允许在适当的宿主细胞中和在适当的条件下选择该载体的标记基因。此外，所述载体还可包含允许编码区在适当宿主中正确表达的表达控制元件。这样的控制元件为本领域技术人员所熟知的，例如，可包括启动子、核糖体结合位点、增强子和调节基因转录或mRNA翻译的其他控制元件等。在某些实施方式中，所述表达控制序列为可调的元件。所述表达控制序列的具体结构可根据物种或细胞类型的功能而变化，但通常包含分别参与转录和翻译起始的5’非转录序列和5’及3’非翻译序列，例如TATA盒、加帽序列、CAAT序列等。例如，5’非转录表达控制序列可包含启动子区，启动子区可包含用于转录控制功能性连接核酸的启动子序列。所述表达控制序列还可包括增强子序列或上游活化子序列。在本申请中，适当的启动子可包括，例如用于SP6、T3和T7聚合酶的启动子、人U6RNA启动子、CMV启动子及其人工杂合启动子(如CMV)，其中启动子的某部分可与其他细胞蛋白(如人GAPDH，甘油醛-3-磷酸脱氢酶)基因启动子的某部分融合，其可包含或不包含另外的内含子。本申请所述的一种或多种核酸分子可以与所述表达控制元件可操作地连接。所述载体可以包括，例如质粒、粘粒、病毒、噬菌体或者在例如遗传工程中通常使用的其他载体。例如，所述载体为表达载体。
在另一个方面，本申请提供了宿主细胞，所述宿主细胞可包含本申请所述的一种或多种核酸分子和/或本申请所述的一种或多种载体。在某些实施方式中，每种或每个宿主细胞可包含一个或一种本申请所述的核酸分子或载体。在某些实施方式中，每种或每个宿主细胞可包 含多个(例如，2个或以上)或多种(例如，2种或以上)本申请所述的核酸分子或载体。例如，可将本申请所述的载体引入所述宿主细胞中，例如真核细胞，如来自植物的细胞、真菌或酵母细胞等。可通过本领域已知的方法将本申请所述的载体引入所述宿主细胞中，例如电穿孔、lipofectine转染、lipofectamin转染等。
另一方面，本申请提供一种制备本申请所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法包括在使得本申请所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养本申请所述的细胞。
所述方法可包括，在使得所述的抗原结合蛋白表达的条件下，培养所述本申请所述的宿主细胞。例如，可通过使用适当的培养基、适当的温度和培养时间等，这些方法是本领域普通技术人员所了解的。
任何适于产生单克隆抗体的方法都可用于产生本申请的抗原结合蛋白(例如，SARS-CoV-2抗体)。
任何合适形式的SARS-CoV-2(例如SARS-CoV-2的S蛋白的RBD)都可以作为免疫原(抗原)，用于产生对SARS-CoV-2特异的抗体，筛选所述抗体的生物学活性。免疫原可以单独使用，或与本领域已知的一种或多种免疫原性增强剂组合使用。可以使用合适的遗传载体表达编码免疫原的DNA，所述载体包括但不限于腺病毒载体、腺相关病毒载体、杆状病毒载体、质料和非病毒载体。
人源化抗体可以选自任何种类的免疫球蛋白，包括IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。在本申请中，抗体是IgG抗体，使用IgG1亚型。同样，任一类轻链都可以在本文的化合物和方法中使用。例如，κ、λ链或其变体在本申请中是适用的。
本申请的抗原结合蛋白或其片段的DNA分子的序列可以用常规技术，比如利用PCR扩增或基因组文库筛选等方法获得。此外，还可将轻链和重链的编码序列融合在一起，形成单链抗体。
一旦获得了有关的序列，就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体，再转入细胞，然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外，还可用人工合成的方法来合成有关序列，尤其是片段长度较短时。通常，通过先合成多个小片段，然后再进行连接可获得序列很长的片段。然后可将该核酸分子引入本领域中已知的各种现有的DNA分子(或如载体)和细胞中。
本申请还涉及包含上述的适当核酸分子以及适当启动子或者控制序列的载体。这些载体可以用于转化适当的宿主细胞，以使其能够表达蛋白质。宿主细胞可以是原核细胞，如细菌细胞；或是低等真核细胞，如酵母细胞；或是高等真核细胞，如哺乳动物细胞。例如，动物 细胞可以包括：CHO-S、CHO-K1和/或HEK-293细胞。
本申请中所述的用重组DNA转化宿主细胞的步骤可用本领域熟知的技术进行。获得的转化子可用常规方法培养，转化子表达本申请的核酸分子所编码的多肽。根据所用的宿主细胞，用常规培养基在合适的条件下培养。通常，在适合本申请抗原结合蛋白表达的条件下，培养转化所得的宿主细胞。然后用常规的免疫球蛋白纯化步骤，如蛋白A-Sepharose、羟基磷灰石层析、凝胶电泳、透析、离子交换层析、疏水层析、分子筛层析或亲和层析等本领域技术人员熟知的常规分离纯化手段纯化得到本申请的抗原结合蛋白。
所得单克隆抗体可用常规手段来鉴定。比如，单克隆抗体的结合特异性可用免疫沉淀或体外结合试验(如流式细胞分选技术(FACS)、放射性免疫测定(RIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA))来测定。
药物组合物
另一方面，本申请提供一种药物组合物，其可以包含本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞，以及任选地药学上可接受的佐剂。
本申请所述的药物组合物可直接用于结合SARS-CoV-2的S蛋白的RBD，因而可用于预防和治疗冠状病毒感染相关的疾病(例如，COVID-19)。此外，还可同时使用其他治疗剂。
本申请的药物组合物可以含有安全有效量(如0.001-99wt％，0.01-90wt％，或0.1-80wt％)的本申请所述的抗原结合蛋白以及药学上可接受的佐剂(可包括载体或赋形剂)。这类载体可以包括(但并不限于)：盐水、缓冲液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其组合。药物制剂应与给药方式匹配。本申请所述的药物组合物可以被制成针剂形式，例如用生理盐水或含有葡萄糖和其他辅剂的水溶液通过常规方法进行制备。药物组合物如针剂、溶液宜在无菌条件下制造。活性成分的给药量是治疗有效量。此外，本申请所述的抗原结合蛋白还可与其他治疗剂一起使用。
本文所述的抗原结合蛋白或药物组合物可以符合良好医疗实践的方式配制、给药和施用。在此情形下的考虑因素包括所治疗的特定病症、所治疗的特定哺乳动物、单个患者的临床病状、病症的病因、药剂递送部位、施用方法和医学从业者已知的其他因素。治疗剂(例如，SARS-CoV-2抗体)无需但任选地与一种或多种当前用来预防或治疗所考虑的病症的药剂一起配制和/或同时施用。此类其他药剂的有效量取决于制剂中存在的治疗剂(例如，SARS-CoV-2抗体)的量、病症或治疗的类型以及以上论述的其他因素。这些药剂通常可以凭经验/临床 上确定为适当的任何剂量且通过凭经验/临床上确定为适当的任何途径加以使用。与单个治疗相比，可减少组合治疗中施用的抗体的剂量。通过常规技术易于监测此疗法的进展。
用途
另一方面，本申请提供一种本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗冠状病毒的感染。
在本申请中，所述冠状病毒的感染包括COVID-19。
在本申请中，所述药物包括抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
另一方面，本申请提供一种抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)，其包含经由接头与药物偶联的本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体。
另一方面，本申请提供一种针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物，其包含本申请所述的核酸分子。
本申请提供一种预防、缓解和/或治疗冠状病毒的感染的方法，其包括向有需要的受试者施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞、本申请所述的药物组合物、本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
本申请提供了分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞、本申请所述的药物组合物、本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物，其可以预防、缓解和/或治疗冠状病毒的感染。
在本申请中，所述冠状病毒的感染可以包括COVID-19。
另一方面，本申请提供一种阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合的方法，其包括以下的步骤，施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞、本申请所述的药物组合物、本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
本申请的抗原结合蛋白可用于检测应用，例如用于检测样本，从而提供诊断信息。例如，本申请所述的抗体和/或方法，可以用于对受试者(例如疑似被SARS-CoV-2或已经被SARS-CoV-2感染的患者)的标本(例如，咽拭子检测样品，例如血清、全血、痰液、口腔/鼻咽分 泌物或洗液、尿液、粪便、胸腹腔积液、脑脊液和组织标本)进行检测，作为疗效观察的指标及是否具有传染性和是否需要隔离的指标。例如，本申请所述的抗体和/或方法，可以为治疗性干预提供监测方案。
在本申请中，所采用的样本(样品)包括细胞、组织样本和活检标本。本申请使用的术语“活检”应包括本领域技术人员已知的所有种类的活检。因此本申请中使用的活检可以包括例如通过内窥镜方法或器官的穿刺或针刺活检制备的组织样本。例如，所述样本可以包括固定的或保存的细胞或组织样本。
本申请还提供了一种指含有本申请的抗原结合蛋白的试剂盒。在某些情形中，所述的试剂盒还可以包括容器、使用说明书、缓冲剂等。例如，本申请的原结合蛋白可以固定于检测板。
不欲被任何理论所限，下文中的实施例仅仅是为了阐释本申请的分离的抗原结合蛋白、制备方法和用途等，而不用于限制本申请发明的范围。
实施例
实施例1 酵母展示突变文库的构建、筛选与单克隆鉴定
1.1酵母展示突变文库的构建
基于SARS-CoV-2中和抗体Ab2001.08、Ab2001.10(专利PCT/CN2020/092634)，对其抗原结合决定簇(CDR)位点的氨基酸进行随机突变，构建各CDR区的突变文库，利用酵母展示技术高通量筛选与抗原特异性结合力强的序列。将Ab2001.8和Ab2001.10的轻链、重链可变区氨基酸序列按Chothia编码规则进行编码，CDR区按Chothia定义。对各分子轻链可变区CDR1、CDR3，重链可变区CDR2、CDR3，设计NNK突变引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增各CDR突变文库基因片段。根据文献所述方法，将各CDR突变文库基因片段与酵母展示质粒分别转入酿酒酵母菌株EBY100(购自ATCC)，使各CDR突变文库以Fab形式展示于酵母表面。同时将Ab2001.8和Ab2001.10的亲本序列以Fab形式展示于酵母表面，作为对照使用。
文库经过培养、诱导后，按1OD为1.0×10
7细胞数计算，各取1.5×10
9细胞，用磁珠分选系统进行第一轮富集。各文库细胞重悬于含1nM SARS-CoV-2 S1 RBD-Biotin(Kactus，货号：COV-VM4BD)的1×PBSA(1×PBS+1％BSA)中孵育30分钟，洗涤后加入Anti biotin beads(miltenyi，货号：130-090-485)混匀孵育10分钟，过磁力柱(Quadro MACS Starting Kit)收集阳性细胞。阳性细胞经过再次培养、诱导后，各取2.0×10
7细胞，用1nM SARS-CoV-2 S1 RBD-Biotin进行第二轮流式分选，收集展示水平高且与抗原结合力强的细胞群；分选后取细胞测序分析，获得轻、重链各个CDR区突变的单一序列。
1.2组合突变文库的构建与筛选
将实施例1.1中Ab2001.8获得的各CDR突变质粒分别与亲本质粒混合，设计引物将不同CDR区的突变序列进行组合，电转入酵母菌株，构建轻、重链包含各CDR区突变的组合文库，编号JYYDL088；同理构建Ab2001.10的各CDR区突变的组合文库，编号JYYDL089。
文库JYYDL088-089经过培养、诱导后，各取2.0×10
7细胞，用0.3nM SARS-CoV-2 S1 RBD-Biotin进行流式分选，收集展示水平高且与抗原结合力强的细胞群；分选后取细胞涂板生长，挑取单克隆测序分析。
1.3组合突变单克隆的鉴定
经测序分析，对获得的单克隆进行流式染色鉴定，分别与1nM生物素标记的SARS-CoV-2 S1 RBD、SARS-CoV-2 S1 RBD V357F(Acro，货号：SPD-S52H4)、SARS-CoV-2 S1 RBD N354D(Acro，货号：SPD-S52H5)、SARS-CoV-2 S1 RBD W436R(Acro,货号：SPD-S52H7)、SARS-CoV-2 S1 RBD R408I(Acro，货号：SPD-S52H8)、SARS-CoV-2 S1 RBD N354D,D304Y(Acro，货号：SPD-S52H3)孵育染色，比较不同克隆与抗原结合的平均荧光信号强度(MFI)。根据荧光信号的强度，Ab2001.8选取6个新的突变序列进行后续体外评估；Ab2001.10选取10个新的突变序列进行后续体外评估，具体见表1。由表1可知，获得的新突变序列与不同SARS-CoV-2 S1 RBD及突变株RBD蛋白的结合强度均显著提高，需进一步评估，抗体编号命名为Ab2002.08Am01-06，Ab2002.10Am01-10。
表1 单克隆菌落流式染色结果与抗体编号
实施例2 候选抗体表达
将表1中Ab2002.08Am01-06、Ab2002.10Am01-10的抗体全长轻、重链蛋白质序列的分别进行密码子优化，基因合成密码子优化后DNA片段(金唯智)，克隆合成后基因片段以IgG1N297A形式装入表达载体pcDNA3.4(Life Technologies)。表达质粒扩增和质粒抽提后双质粒共转ExpiCHO细胞(ThermoFisher Scientific，A29133)，根据供应商ExpiCHO表达系统方法进行抗体瞬转表达，过程如下：在培养总体积25mL培养基中，36.5℃，8％二氧化碳浓度下培养Expi CHO细胞到密度6×10
6/mL，使用ExpiFectamine转染试剂化转各10μg抗体轻重链表达质粒到细胞；转染一天后，各取150μL和4mL ExpiCHO增强剂和ExpiCHO辅料添加到培养细胞中，继续培养至9天，4度，3500转离心取上清。混合AmMagTM Protein A磁珠(Genscript，L00695)和抗体表达上清，室温孵育2小时，PBS洗涤两次弃上清，加入适量洗脱缓冲液Protein G or A SefinoseTM Elution buffer(Sangon,C600481)，充分混匀后置于试管架上静止孵育5分钟，孵育期间重悬磁珠2-3次，重复洗脱2次，洗脱后，立即加入适量中和液1M Tris-HCl，pH7.5(Sangon,B548124)中和备用，得到纯化的抗体见表2。
表2 候选抗体表达、纯化数据
| 抗体编号 | 理论等电点 | 产量mg | 表达量mg/L | 体积mL | 浓度mg/mL |
| Ab2002.08Am01 | 7.6 | 6.90 | 276.0 | 1.5 | 4.6 |
| Ab2002.08Am02 | 7.6 | 0.57 | 22.8 | 1 | 0.6 |
| Ab2002.08Am03 | 7.8 | 7.20 | 288.0 | 1.5 | 4.8 |
| Ab2002.08Am04 | 7.8 | 5.70 | 228.0 | 1.5 | 3.8 |
| Ab2002.08Am05 | 7.8 | 4.79 | 191.4 | 1.5 | 3.2 |
| Ab2002.08Am06 | 7.8 | 6.20 | 247.8 | 1.5 | 4.1 |
| Ab2002.10Am01 | 7.8 | 7.94 | 317.4 | 1.5 | 5.3 |
| Ab2002.10Am02 | 7.9 | 2.34 | 93.6 | 1.5 | 1.6 |
| Ab2002.10Am03 | 7.8 | 2.15 | 85.8 | 1.5 | 1.4 |
| Ab2002.10Am04 | 7.9 | 3.42 | 136.8 | 1.5 | 2.3 |
| Ab2002.10Am05 | 7.9 | 2.78 | 111.0 | 1.5 | 1.9 |
| Ab2002.10Am06 | 8 | 5.28 | 211.2 | 1.5 | 3.5 |
| Ab2002.10Am07 | 7.9 | 6.39 | 255.6 | 1.5 | 4.3 |
| Ab2002.10Am08 | 7.9 | 2.60 | 103.8 | 1.5 | 1.7 |
| Ab2002.10Am09 | 8 | 3.63 | 145.2 | 1.5 | 2.4 |
| Ab2002.10Am10 | 7.9 | 2.72 | 108.6 | 1.5 | 1.8 |
实施例3 候选抗体评估
3.1候选抗体与SARS-CoV-2 S1的结合解离速率
将候选抗体分别固化到AHC传感器上(Fortébio,货号：18-0015)，测定其与人SARS-CoV-2 S1(Sino Biological,货号：40591-V08H)的亲和力。每个循环包含以下步骤：1)传感器再生；2)浸入缓冲液(PBST，50mL PBS中加入10μL吐温20)60s；3)5μg/mL的候选抗体固化在AHC传感器上，时间为40s；4)传感器浸入缓冲液180s；5)100nM的人SARS-Cov-2 S1与抗体结合，时间180s；6)抗原抗体的解离，时间10分钟。亲和力的结果通过Octet Data Analysis Software(Fortébio)进行分析，结果如下表3。由表3可知，相比于亲本抗体Ab2001.08和Ab2001.10，亲和力成熟后的抗体与SARS-CoV-2 S1的亲和力提高约10-1000倍。
表3 候选抗体与SARS-CoV-2 S1的结合解离速率
3.2理化成药性评估
综合实施例2及3.1，选取候选抗体Ab2002.08Am03、Ab2002.08Am04、Ab2002.08Am06、Ab2002.10Am01、Ab2002.10Am06、Ab2002.10Am07，继续评估候选抗体及亲本抗体的理化成药性。包含候选抗体的单体率、亲水性、熔解温度值(Tm)、电荷异质性(iCIEF)等各项指标评价，具体方法简述如下。
一、单体率纯度分析
(1)将样品稀释至1mg/mL，混匀，12000转离心5分钟，取上清转至样品瓶，放入HPLC样品盘。设置色谱条件如下：
(2)色谱柱采用流动相(200mM磷酸盐缓冲液，pH6.8)平衡后，进样分析，用色谱软件进行数据分析，峰面积归一化法计算各个峰的峰面积百分比。
二、亲水性分析
(1)将样品稀释至1mg/mL，离心取上清待测。设置色谱条件如下：
(3)用流动相A(50mM磷酸盐缓冲液/1M硫酸铵，pH 7.0)和流动相B(50mM磷酸盐缓冲液，pH 7.0)进行梯度洗脱，记录主峰保留时间，出峰时间越短说明候选抗体亲水性越好。
三、熔解温度值测定
将供试品用样品缓冲液稀释至1mg/mL，然后按照Protein Thermal Shift
TM Starter Kit说明书，取供试品溶液13μL加入至PCR管内，加入5μL Protein Thermal shift
TM Buffer，加入2μL10×染色液，使反应体积为20μL，混匀后，12000转离心5分钟除气泡。将检测样品置于PCR仪内，进行样品分析，记录样品的Tm值。
四、iCIEF分析
取样品溶液加入到已经充分混匀的以下体系中：1％的甲基纤维素(MC)70μL，尿素5M80μL，两性电解质Pharmalyte pH 3-10 8μL，pI marker 5.5和9.5各2μL。补加适当体积超纯水至200μL，混匀。离心取上清进样分析。分析结束后，将结果文件导入ChromPerfect软件进行图谱积分处理并计算各峰的等电点以及各峰百分比。
根据实验结果，候选抗体及亲本抗体的单体率、亲水性、Tm值、电荷异质性等各项指标结果汇总如表4。由表4可知，候选抗体Ab2002.10Am01、Ab2002.10Am06的单体率均低于95％，单体率较低；Ab2002.08Am03的疏水柱出峰时间为24.3分钟，疏水性较强，均淘汰。进一步评价候选抗体Ab2002.08Am04、Ab2002.08Am06、Ab2002.10Am07。
表4 候选抗体理化成药性指标汇总表
3.3候选抗体与SARS-CoV-2 RBD及其变异蛋白的结合解离速率
将候选抗体Ab2002.08Am04、Ab2002.08Am06、Ab2002.10Am07及其亲本抗体分别固化到AHC传感器上，测定其与人SARS-CoV-2 RBD His及其5个变异蛋白{分别为：SARS-CoV-2 RBD[N354D]His；SARS-CoV-2 RBD[R408I]His；SARS-CoV-2 RBD[W436R]His；SARS-CoV-2 RBD[V367F]His；SARS-CoV-2 RBD[N354D，D364Y]His}的亲和力。每个循环包含步骤及数据分析同实施例3.1。测定结果汇总如表5，由表5可知，候选抗体Ab2002.08Am04，Ab2002.08Am06，Ab2002.10Am07与SARS-CoV-2 RBD及其变异蛋白的亲和力提高10-1000倍之多。
表5 候选抗体与SARS-CoV-2 RBD及其变异蛋白的结合解离速率
3.4候选抗体阻断SARS-CoV-2 RBD蛋白与HEK293/ACE2细胞结合
进一步评估候选抗体Ab2002.08Am04、Ab2002.08Am06、Ab2002.10Am07及其亲本阻断SARS-CoV-2 RBD蛋白与HEK293/ACE2细胞的阻断能力。通过流式细胞荧光分选技术(Fluorescence Activated Cell Sorting，简称FACS)方法，检测候选抗体阻断SARS-CoV-2 RBD蛋白与HEK293/ACE2细胞表面ACE2的结合，同型对照抗体hIgG1(N297A)作为阴性对照。TrypLETM Express(Thermo Fisher，货号：12604-021)消化收集HEK293/ACE2细胞(Gen Script,货号：SC1394)，用PBS+2％FBS清洗一遍，随后用PBS+2％FBS重悬至2.67×10
6cell/mL，置于4度冰箱预冷30分钟。然后稀释抗体：抗体的最高终浓度为50μg/mL(配制浓度为150μg/mL)，2倍梯度稀释(共11个浓度梯度及1个0μg/mL的浓度点)；相应孔中先加入30μL1.5μg/mL生物素标记的SARS-CoV-2 RBD His(恺佧生物，货号：COV-VM4BD)，然后加入30μL相应浓度的抗体，再加入30μL密度为2.67×10
6cell/mL HEK293/ACE2细胞(即每孔细胞数为8×10
4个)，4度冰箱孵育1小时后，2000转离心5分钟，弃上清，每孔加入250μL PBS+2％FBS洗3次。继而稀释二抗：Streptavidin,Alexa Fluor
TM 633conjugate(Thermo Fisher，货号：S21375)1：400稀释后，每孔加入100μL，4度孵育1小时后，2000转离心5分钟，弃上清，每孔加入250μL PBS+2％FBS洗3次；随后每孔加入200μL PBS+2％FBS重悬，用Guava easyCyte HT System上机检测。数据用GraphPad Prism软件来进行处理，结果如图1。由图1可知，候选抗体Ab2002.08Am04、Ab2002.08Am06、Ab2002.10Am07相较于其亲本，IC
50数值相近，IC
90数值降低2-5倍，阻断SARS-CoV-2 RBD蛋白与HEK293/ACE2细胞结合的阻断能力有所提高。
3.5假病毒中和活性
综合实施例3.1-3.4的结果，挑选抗体Ab2001.08、Ab2002.10Am07评估其对SARS-CoV-2假病毒的中和活性。将表达全序列SARS-CoV-2 Spike蛋白和萤光素酶报告基因的假病毒(慢病毒)感染表达人ACE2受体的ACE2-CHOK1工程细胞株，考察抗体Ab2001.08、Ab2002.10Am07对假病毒侵染靶细胞ACE2-CHOK1的中和作用。
实验中，ACE2-CHOK1的细胞密度是5×10
4/孔，SARS-CoV-2假病毒的浓度是650TCID
50/孔，样品的终浓度范围为10000～0.003ng/mL，双复孔；实验步骤：先将假病毒与样品进行稀释后，将两者预孵育1小时，再将ACE2-CHOK1细胞悬液离心并计数后，将细胞以100μL/孔加入到96孔板中，假病毒与样品的混合物以100μL/孔加入到96孔板中，在37℃二氧化碳培养箱中共培养20～28小时；孵育结束后用PE britelite-plus(PerkinElmer，货号：6066769) 显色液进行显色并读板。
假病毒中和抑制率的计算：抑制率＝[1－(样品组的发光强度均值－空白对照均值)/(阴性对照组的发光强度均值－空白对照值均值)]×100％。数据通过GraphPad prism软件，计算IC
50值、IC
90值，结果见图2。
由图2可知，抗体Ab2001.08、Ab2002.10Am07具有很强的SARS-CoV-2假病毒中和活性，其IC
50浓度分别为：0.004μg/mL、0.001μg/mL；其IC
90浓度分别为：0.063μg/mL、0.011μg/mL。Ab2002.10Am07相较于亲本抗体Ab2001.08的假病毒中和活性提高4-5倍。
3.6真病毒中和活性
进一步评估Ab2001.08、Ab2002.10Am07对SARS-CoV-2真病毒侵染猴肾细胞(Vero E6细胞)的中和活性。由于使用活病毒，实验委托有生物安全三级实验室(BSL3)的中国科学院武汉病毒所进行，具体实验步骤如下：
试剂与耗材：
试剂：DMEM(Thermo Fisher)，FBS(Gibco)，甲基纤维素(Millipore)抗体稀释剂：PBS(Thermo Fisher)
病毒RNA提取：QIAamp 96 Virus QIAcube HT Kit，Qiagen公司，CAT#57731；
病毒核酸检测(荧光定量PCR)试剂盒：武汉病毒研究所诊断微生物学科组研制，针对RBD2基因。
主要仪器：
高通量核酸自动纯化仪：QIAcube HT 9001793(Qiagen)
荧光定量PCR仪：CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System(Bio-rad)
实验设计：
(1)SARS-CoV-2病毒(WIV04，GenBank:MN996528.1)扩增、滴度测定：P6代SARS-CoV-2病毒接种Vero-E6细胞，于37℃、5％CO
2培养箱中培养48h，收取培养的病毒上清，离心后分装，-80℃冰箱冻存。在Vero-E6细胞中采用经典噬菌斑法测定病毒滴度。
(2)噬菌斑减少中和实验(Plaque reduction neutralization test,PRNT)
待测抗体加入含2％FBS的DMEM培养基中，进行3倍梯度稀释，稀释后的抗体加入96孔板中，每孔100μL；病毒稀释为2000PFU/mL，分别取100μL与不同浓度的抗体进行混合；(抗体终浓度分别为30μg/mL、10μg/mL、3.33μg/mL、1.11μg/mL、0.37μg/mL、0.12μg/mL、0.04μg/mL、0.014μg/mL、0.005μg/mL)，37℃孵育30分钟，再将抗体、病毒混合液加入细胞培养，病毒感染细胞96小时后进行经典噬菌斑实验，计算抗体的PRNT
50、PRNT
90值。
数据处理及统计分析：
PRNT
50、PRNT
90数值利用GraphPad prism软件计算。
实验结果：
对抗体Ab2001.08、Ab2002.10Am07进行噬菌斑减少中和浓度的测定，结果如图3所示。由图3可知，抗体Ab2001.08、Ab2002.10Am07具有很强的SARS-CoV-2中和活性，其PRNT
50浓度分别为：0.099μg/mL、0.021μg/mL；其PRNT
90浓度分别为：3.483μg/mL、0.741μg/mL。Ab2002.10Am07相较于亲本抗体Ab2001.08的真/活病毒中和活性提高4-5倍，有望在新冠病毒感染患者中显示出更优的治疗效果。
Claims (42)
- 分离的抗原结合蛋白，其包含轻链可变区VL中的至少一个CDR，所述VL包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1所述的分离的抗原结合蛋白，其包含重链可变区VH中的至少一个CDR，所述VH包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1-2中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其具有下述性质中的一种或多种：1)阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合；2)在Octet测定中，以约3.0×10 -10M以下的KD值特异性结合SARS-CoV-2的S1蛋白的RBD或其突变体；3)在PRNT测定中，具有中和SARS-CoV-2的活性。
- 根据权利要求1-3中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体或其抗原结合片段。
- 根据权利要求4所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗原结合片段包括Fab，Fab’，F(ab)2，Fv片段，F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
- 根据权利要求4-5中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗体为全人源抗体。
- 根据权利要求1-6中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，所述LCDR3包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:65所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求7所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR3包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63和SEQ ID NO:64中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求7-8中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR1包含SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:58所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求7-9中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR1包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求7-10中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR2包含SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求2-11中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，所述HCDR1包含SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:66所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求12所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:75所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求12-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:72和SEQ ID NO:73中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求12-14中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求12-15中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:76中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1-16中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3和L-FR4，其中所述L-FR1的C末端与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1包含SEQ ID NO:26或SEQ ID NO:77所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求17中所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2包含SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:78所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求17-18中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3包含SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求17-19中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端直接或间接相连，且所述L-FR4包含SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1-20中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包含SEQ ID NO:40或SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1-21中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包含SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92和SEQ ID NO:93中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求4-22中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区包括人Igκ恒定区或人Igλ恒定区。
- 根据权利要求2-23中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3和H-FR4，其中所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1包含SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:81所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求24所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2包含SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:82所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求24-25中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3包含SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求24-26中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端直接或间接相连，且所述H-FR4包含SEQ ID NO:33H所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求2-27中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包含SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求2-27中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101和SEQ ID NO:102中任一项所述的氨基酸序列。
- 根据权利要求4-29中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区包括人IgG恒定区。
- 根据权利要求4-30中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区包括人IgG1恒定区。
- 分离的一种或多种核酸分子，其编码权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
- 载体，其包含根据权利要求32所述的核酸分子。
- 细胞，其包含根据权利要求32所述的核酸分子或根据权利要求33所述的载体。
- 制备权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法包括在使得权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养根据权利要求34所述的细胞。
- 药物组合物，其包含权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体和/或权利要求34所述的细胞，以及任选地药学上可接受的佐剂。
- 权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体、权利要求34所述的细胞和/或权利要求36所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗冠状病毒的感染。
- 根据权利要求37所述的用途，其中所述冠状病毒的感染包括COVID-19。
- 根据权利要求37-38中任一项所述的用途，其中所述药物包括抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)和/或针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
- 抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物(ADC)，其包含经由接头与药物偶联的本申请所述的抗SARS-Cov-2抗体。
- 针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物，其包含本申请所述的核酸分子。
- 阻断SARS-CoV-2的S蛋白的RBD或其突变体与人ACE2的结合的方法，其包括以下的步骤，施用权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体、权利要求34所述的细胞、权利要求36所述的药物组合物、权利要求40所述的抗SARS-Cov-2抗体药物偶联物和/或权利要求41所述的针对SARS-Cov-2的S蛋白RBD靶点的基因治疗药物。
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