WO2021051351A1 - 一种分离的抗原结合蛋白及其用途 - Google Patents

一种分离的抗原结合蛋白及其用途 Download PDF

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Abstract

提供了一种分离的抗原结合蛋白，其包括重链可变区VH中的至少一个CDR和轻链可变区VL中的至少一个CDR，其中所述VH包含SEQ ID NO：16所示的氨基酸序列，所述VL包含SEQ ID NO：15所示的氨基酸序列。还提供了编码所述分离的抗原结合蛋白的核酸分子、包含所述分离的抗原结合蛋白的载体、包含所述核酸分子或所述载体的细胞、制备所述分离的抗原结合蛋白的方法、药物组合物以及所述分离的抗原结合蛋白的用途。

Description

一种分离的抗原结合蛋白及其用途 技术领域
本申请涉及生物医药领域，具体的涉及一种分离的抗原结合蛋白及其用途。
背景技术
肿瘤是一种严重威胁人类健康的疾病，近年来，免疫治疗作为一种新疗法，在肿瘤治疗中显示出了巨大的潜力。
T细胞免疫球蛋白及黏蛋白分子3(T cell immunoglobulin and mucin-domain containing molecule 3，Tim-3)是近年来发现的重要免疫检查点分子，不同于其他“免疫检查点”分子，其主要诱导性表达于炎症和肿瘤微环境中的T细胞表面。它是一种Ⅰ型膜表面分子，高表达于Th1细胞，并产生抑制信号从而导致Th1细胞的凋亡。在癌症与慢性病毒感染过程中，Tim-3与其配体半乳糖凝集素9(galectin 9，Gal-9)、磷脂酰丝氨酸(PtdSer)、高迁移率族蛋白1(high mobility group box 1protein，HMGB1)、癌胚抗原相关细胞黏附分子1(carcino-embryonic antigen related cellular adhesion molecule 1，CEACAM1)相结合，继而引起T细胞的衰竭和凋亡，是导致肿瘤细胞发生免疫逃逸的重要原因之一。同时，选择性激活Tim-3从而导致免疫逃逸是PD-1/PD-L1抗体免疫治疗过程中发生耐药的主要机制。
发明内容
一方面，本申请提供一种分离的抗原结合蛋白，其包括重链可变区VH中的至少一个CDR和轻链可变区VL中的至少一个CDR，其中所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白具有Tim-3结合能力。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白，其具有下述性质中的一种或多种：
1)能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，其中所述KD值通过表面等离子体共振法测定；
2)在FACS测定中，能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3；
3)在ELISA测定中，能够抑制Tim-3与PtdSer的结合；和
4)促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌。
根据权利要求1-3中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体或其抗原结合片段。
在某些实施方式中，所述抗体包括人源化和鼠源抗体。
在某些实施方式中，所述抗原结合片段包括Fab，Fab’，F(ab)2，Fv片段，F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
在某些实施方式中，所述VH包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR1包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述HCDR2包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，其中所述LCDR1包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR2包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述LCDR3包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白与参比抗体竞争结合所述Tim-3蛋白，其中所述参比抗体包含轻链可变区和重链可变区，所述参比抗体的轻链可变区包含LCDR1、LCDR2和LCDR3，所述LCDR1包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列；所述LCDR2包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列；所述LCDR3包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述参比抗体的重链可变区包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列；所述HCDR2包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列；所述HCDR3包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
在某些实施方式中，所述L-FR1的C末端与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端直接或间接相连，且所述L-FR4包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区包括人Igκ恒定区。
在某些实施方式中，所述抗体轻链恒定区包含SEQ ID NO:17中所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白包含抗体轻链LC，且所述LC包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VH包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在某些实施方式中，所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端直接或间接相连，且所述H-FR4包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区包括人IgG恒定区。
在某些实施方式中，所述抗体重链恒定区包含SEQ ID NO:18中所示的氨基酸序列。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链HC，且所述HC包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
另一方面，本申请还提供分离的一种或多种核酸分子，其编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白。
另一方面，本申请还提供载体，其包含本申请所述的核酸分子，或，表达本申请所述的抗原结合蛋白。
另一方面，本申请还提供细胞，其包含本申请所述的核酸分子或本申请所述的载体。
另一方面，本申请还提供制备本申请所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法包括在使得本申请所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养本申请所述的细胞。
另一方面，本申请还提供药物组合物，其包含本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞，以及任选地药学上可接受的载体。
另一方面，本申请还提供所述的分离的抗原结合蛋白、所述的核酸分子、所述的载体、所述的细胞和/或所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗肿瘤。
在某些实施方式中，所述肿瘤包括实体瘤和/或血液肿瘤。
另一方面，本申请还提供所述分离的抗原结合蛋白、所述的核酸分子、所述的载体、所述的细胞和/或所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗Tim-3相关的疾病。
另一方面，本申请还提供抑制Tim-3与PtdSer结合的方法，所述方法包括施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白。
另一方面，本申请还提供预防、缓解和/或治疗肿瘤的方法，所述方法包括向有需要的受试者施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白或本申请所述的药物组合物。
在某些实施方式中，所述肿瘤包括实体瘤和/或血液肿瘤。
本领域技术人员能够从下文的详细描述中容易地洞察到本申请的其它方面和优势。下文的详细描述中仅显示和描述了本申请的示例性实施方式。如本领域技术人员将认识到的，本申请的内容使得本领域技术人员能够对所公开的具体实施方式进行改动而不脱离本申请所涉及发明的精神和范围。相应地，本申请的附图和说明书中的描述仅仅是示例性的，而非为限制性的。
附图说明
本申请所涉及的发明的具体特征如所附权利要求书所显示。通过参考下文中详细描述的示例性实施方式和附图能够更好地理解本申请所涉及发明的特点和优势。对附图简要说明书如下：
图1显示本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与表达人Tim-3细胞株的结合情况；
图2显示本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与表达小鼠Tim-3细胞株的结合情况；
图3显示对比例抗体与表达小鼠Tim-3细胞株的结合情况；
图4A-4C显示本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1阻断人Tim-3与配体PtdSer的结合情况。
具体实施方式
本发明首次提供了一种分离的抗原结合蛋白，其包括重链可变区VH中的至少一个CDR和轻链可变区VL中的至少一个CDR，其中所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。本申请所述分离的抗原结合蛋白能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，此外，其还能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3。另外，本申请所述分离的抗原结合蛋白能够抑制Tim-3与PtdSer的结合，还可以促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌。
以下由特定的具体实施例说明本申请发明的实施方式，熟悉此技术的人士可由本说明书所公开的内容容易地了解本申请发明的其他优点及效果。
以下对本申请做进一步描述：在本发明中，除非另有说明，否则本文中使用的科学和技术名词具有本领域技术人员所通常理解的含义。并且，本文中所用的蛋白质和核酸化学、分子生物学、细胞和组织培养、微生物学、免疫学相关术语和实验室操作步骤均为相应领域内广泛使用的术语和常规步骤。同时，为了更好地理解本发明，下面提供相关术语的定义和解释。
在本申请中，术语“分离的”通常指从天然状态下经人工手段获得的。如果自然界中出现某一种“分离”的物质或成分，那么可能是其所处的天然环境发生了改变，或从天然环境下分离出该物质，或二者情况均有发生。例如，某一活体动物体内天然存在某种未被分离的多聚核苷酸或多肽，而从这种天然状态下分离出来的高纯度的相同的多聚核苷酸或多肽即称之为分离的。术语“分离的”不排除混有人工或合成的物质，也不排除存在不影响物质活性的其它不纯物质。
在本申请中，术语“分离的抗原结合蛋白”通常指从天然状态下经人工手段获得的具有抗原结合能力的蛋白。该“分离的抗原结合蛋白”可以包含结合抗原的部分和任选地，允许抗原结合部分采用促进所述抗原结合部分结合抗原的构象的支架或构架部分。抗原结合蛋白可以包含例如抗体来源的蛋白支架或具有移植的CDR或CDR衍生物的备选蛋白支架或人工支架。此类支架包括，但不限于包含被引入例如以稳定抗原结合蛋白的三维结构的突变的抗体来源的支架以及包含例如生物相容性聚合物的完全合成的支架。参见例如Korndorfer等,2003,Proteins:Structure,Function,andBioinformatics,53(1):121-129(2003)；Roque等,Biotechnol.Prog.20:639-654(2004)。此外，肽抗体模拟物("PAMs")以及利用纤连蛋白组分基于抗体模拟物的支架可以用作支架。
在本申请中，术语“KD”(同样地，“K D”或“K D”)通常指“亲和常数”或“平衡解离常数”，并指在滴定测量中在平衡时、或者通过将解离速率常数(K dissoc)除以结合速率常数(K assoc)所获得的值。使用结合速率常数(K assoc)、解离速率常数(K dissoc)和平衡解离常数(KD)表示结合蛋白(例如本申请所述的分离的抗原结合蛋白)对抗原(例如Tim-3)的结合亲和力。确定结合和解离速率常数的方法为本领域熟知。使用基于荧光的技术提供了高灵敏度以及在生理缓冲液中在平衡时检查样品的能力。例如，可以通过表面等离子体共振法测定所述K D值，也可以通过Octet测定所述K D值，也可以使用其他实验途径和仪器例如BIAcore(生物分子相互作用分析)测定(例如，可以从BIAcoreInternationalAB，aGEHealthcarecompany，Uppsala，瑞典获得的仪器)。另外，也可以使用可以从SapidyneInstruments(Boise，Idaho) 获得的KinExA(动态排阻测定(KineticExclusionAssay))测定所述K D值。
在本申请中，氨基酸或核苷酸序列的同源性可与术语“同一性”相互交换地使用。术语“同一性”通常是指配对的相同残基的百分比。“序列同一性百分数”是这样计算的：将两个进行最佳比对的序列在特定区域范围内进行比较；确定两个序列中出现相同碱基或氨基酸的位置的数量，以得到相匹配位置的数量；将这种位置的数量除以被比较区段中的位置总数，所得的商再乘以100。如上所述，用于确定同源性(或同一性)的程序在氨基酸-对-氨基酸的基础上比较被比对的序列，并且所述程序可对该比较设定严格性的不同水平(例如相同氨基酸、保守氨基酸置换等)。如本文中所使用的术语，如果所讨论的两个氨基酸各自属于相同的化学类别(即酸性、非极性/疏水性、不带电荷的极性和碱性)，则被认为是彼此的“保守置换”。非限制实例为，属于非极性氨基酸的两个不同的氨基酸将被认定是彼此的“保守置换”，即使这两个氨基酸不相同，而一方面为非极性氨基酸、与另一方面为碱性氨基酸时将不被认为是彼此的“保守置换”。Alberts、Johnson、Lewis、Raff、Roberts和Walter的《MolecularBi ology of the Cell》第4版(2002)第3.1栏，将氨基酸分成四个主要组别：酸性、非极性、不带电荷的极性和碱性。此分组在本发明的上下文中可用于确定特定氨基酸对所讨论的另一个氨基酸是否为保守取代的目的。上述主要组别可进一步再分类为例如小的非极性和大的非极性氨基酸、大的芳香族氨基酸等。术语“保守的氨基酸置换”还指对给定氨基酸残基的任一个氨基酸置换，其中该置换残基与给定的残基在化学上是如此的相近而在多肽功能(例如结合)结果方面无实质减少。
在本申请中，术语“Tim-3”是“T细胞免疫球蛋白及黏蛋白分子3(T cell immunoglobulin and mucin-domain containing molecule 3)”的缩写，也称作TIM-3，HAVCR2，KIM-3，TIMD3，和FLJ14428，其通常是指一种T辅助细胞Ⅰ型特异性细胞表面蛋白，其调节巨噬细胞活化和炎性状况的严重程度。Tim-3还与癌症，特别是癌干细胞有关，其主要诱导性表达于炎症和肿瘤微环境中的T细胞表面，高表达于Th1细胞，并产生抑制信号从而导致Th1细胞的凋亡。在癌症与慢性病毒感染过程中，Tim-3与其配体半乳糖凝集素9(galectin 9，Gal-9)、磷脂酰丝氨酸(PtdSer)、高迁移率族蛋白1(high mobility group box 1protein，HMGB1)、癌胚抗原相关细胞黏附分子1(carcino-embryonic antigen related cellular adhesion molecule 1，CEACAM1)相结合，继而引起T细胞的衰竭和凋亡，是导致肿瘤细胞发生免疫逃逸的重要原因之一。同时，选择性激活Tim-3从而导致免疫逃逸是PD-1/PD-L1抗体免疫治疗过程中发生耐药的主要机制。Tim-3可以包括人Tim-3的变体，同等型，物种同系物，和与Tim-3具有至少一个共同表位的类似物。例如，源自人的Tim-3的氨基酸序列如SEQ ID NO:25所示，源自小鼠的Tim-3的氨基酸序列如SEQ ID NO:26所示。
在本申请中，术语“PtdSer”通常是指磷脂酰丝氨酸，为Tim-3的配体。Tim-3与PtdSer结合，会导致细胞凋亡或者引发自身免疫性疾病、过敏性疾病和病毒感染相关性疾病。
在本申请中，术语“特异性结合”或“特异性的”通常指可测量的和可再现的相互作用，比如靶标和抗体之间的结合，可在分子(包括生物分子)的异质群体存在的情况可决定靶标的存在。例如，特异性结合靶标(其可以为表位)的抗体是以比它结合其它靶标更大的亲和性、亲合力、更容易、和/或以更大的持续时间结合该靶标的抗体。在一个实施方案中，抗体结合无关靶标的程度小于抗体对靶标的结合的约10％，如例如通过放射免疫分析(RIA)测量的。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够以10nM或更低的KD值与源自人的Tim-3相结合。又例如，所述分离的抗原结合蛋白能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3。在某些实施方案中，抗体特异性结合蛋白质上的表位，所述表位在不同种属的蛋白质中是保守的。在另一个实施方案中，特异性结合可以包括但不要求排他性地结合。
在本申请中，术语“抑制”通常指降低细胞的生长速率或者细胞的数量。例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白，其能够抑制肿瘤生长和/或肿瘤细胞增殖。又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白能够抑制Tim-3与PtdSer的结合。
在本申请中，术语“IFN-γ”是干扰素(IFN)的一种类型，IFN-γ是II型干扰素并且结合II型干扰素抗体。IFN-γ调控多种生物学功能，如抗病毒反应、细胞生长、免疫反应和肿瘤抑制。
在本申请中，术语“TNF-α”通常是指肿瘤坏死因子α(也称为恶病质素)，其是由许多细胞类型(包括应答内毒素或其他刺激的单核细胞和巨噬细胞)产生的天然存在的哺乳动物细胞因子。TNF-α是炎症性、免疫学和病理生理反应的主要介质(Grell,M.等人，(1995)Cell[细胞]，83:793-802)。在本申请中，TNF-α可以包括来自各种物种(例如人、小鼠和猴)的野生型TNF-α、TNF-α的多态性变体和TNF-α的功能等效物。
在本申请中，术语“肿瘤”通常指由异常细胞生长形成的赘生物或实体病变。在本申请中，肿瘤可以是实体瘤或血液瘤肿瘤。
在本申请中，术语“可变结构域”通常指抗体重链或轻链的氨基末端结构域。重链和轻链的可变结构域可以分别称为“VH”和“VL”。这些结构域通常是抗体的变化最大的部分(相对于相同类型的其它抗体)，且包含抗原结合位点。
在本申请中，术语“可变”通常指在抗体之间可变结构域的某些区段在序列上存在很大差异的事实。V结构域介导抗原结合并决定特定抗体对其特定抗原的特异性。然而，可变性并非在整个可变结构域范围内均匀分布。相反，它集中在轻链和重链可变结构域中称为高变区(CDR或HVR)的三个区段中。可变结构域的更高度保守的部分称为框架区(FR)。天然重链 和轻链的可变结构域各自包含四个FR区，大多数采用β-折叠构型，通过三个CDR连接，其形成环形连接，并且在一些情况下形成β-折叠结构的一部分。每条链中的CDR通过FR区紧密靠近地保持在一起，并且来自另一条链的CDR一同促进抗体的抗原结合位点的形成(参见Kabat et al,Sequences of Immunological Interest,Fifth Edition,National Institute of Health,Bethesda,Md.(1991))。恒定结构域不直接参与抗体与抗原的结合，但显示出各种效应子功能，例如抗体参与抗体依赖性细胞毒性。
在本申请中，术语“抗体”通常指免疫球蛋白或其片段或其衍生物，涵盖包括抗原结合位点的任何多肽，无论其是在体外还是体内产生的。该术语包括但不限于多克隆的、单克隆的、单特异性的、多特异性的、非特异性的、人源化的、单链的、嵌合的、合成的、重组的、杂化的、突变的和移植的抗体。除非另外被术语“完整的”修饰，如在“完整的抗体”中，为了本发明的目的，术语“抗体”也包括抗体片段，比如Fab、F(ab') 2、Fv、scFv、Fd、dAb和保持抗原结合功能(例如，特异性结合Tim-3)的其它抗体片段。通常，这样的片段应当包括抗原结合结构域。基本的4链抗体单元是由两个相同的轻(L)链和两个相同的重(H)链组成的异四聚体糖蛋白。IgM抗体由5个基本的异四聚体单元与另外一个称为J链的多肽组成，且含有10个抗原结合位点，而IgA抗体包括2-5个可以与J链相结合聚合形成多价组合的基本4链单元。就IgG而言，4链单元一般为约150,000道尔顿。每个L链通过一个共价二硫键与H链连接，而两个H链通过一个或多个取决于H链同种型的二硫键相互连接。每个H和L链还具有规则间隔的链内二硫化桥键。每个H链在N末端具有可变结构域(VH)，对于α和γ链各自继之以三个恒定结构域(CH)、对于μ和ε同种型继之以四个CH结构域。每个L链在N末端具有可变结构域(VL)，在其另一端具有恒定结构域。VL与VH对应，且CL与重链的第一恒定结构域(CH1)相对应。特定的氨基酸残基被认为在轻链和重链可变结构域之间形成界面。VH和VL配对一起形成单个抗原结合位点。对于不同类别抗体的结构和性质，参见例如Basic and Clinical Immunology,8th Edition,Daniel P.Sties,Abba I.Terr and Tristram G.Parsolw(eds),Appleton & Lange,Norwalk,Conn.,1994，第71页和第6章。来自任何脊椎动物物种的L链可以基于其恒定结构域的氨基酸序列被分为两种明显不同的类型中的一种，称为κ和λ。取决于其重链(CH)恒定结构域的氨基酸序列，可以将免疫球蛋白分为不同的类别或同种型。存在五类免疫球蛋白：IgA、IgD、IgE、IgG和IgM，具有分别被命名为α、δ、ε、γ和μ的重链。基于CH序列和功能方面的相对小的差异，将γ和α类进一步分成亚类，例如，人表达下述亚类：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3、IgG4、IgA1和IgK1。
在本申请中，术语“CDR”通常指抗体可变结构域的区域，其序列是高度可变的和/或形成结构定义环。通常，抗体包括六个CDR；在VH中三个(HCDR1、HCDR2、HCDR3)，和 在VL中三个(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。在天然抗体中，HCDR3和LCDR3显示所述六个CDR的大多数多样性，并且特别地HCDR3被认为在赋予抗体的精细特异性方面起独特作用。参见，例如Xu et al,Immunity 13:37-45(2000)；Johnson and Wu,in Methods in Molecular Biology248:1-25(Lo,ed.,Human Press,Totowa,N.J.,2003)。实际上，仅由重链组成的天然存在的骆驼抗体在缺乏轻链的情况功能正常且稳定。参见，例如,Hamers-Casterman et al.,Nature363:446-448(1993)；Sheriff et al,Nature Struct.Biol.3:733-736(1996)。
在本申请中，术语“FR”通常指抗体可变结构域的更高度保守的部分，其被称为框架区。通常，天然重链和轻链的可变结构域各自包含四个FR区，即在VH中四个(H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4)，和在VL中四个(L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4)。例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的VL可以包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。本申请所述的分离的抗原结合蛋白的VH可以包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在本申请中，术语“抗原结合片段”通常指具有抗原结合活性的片段。在本申请中，所述抗原结合片段可以包括Fab，Fab’，F(ab) 2、Fv片段、F(ab’) 2，scFv，di-scFv和/或dAb。
在本申请中，术语“竞争结合”通常指抗体或其片段通过对另一种抗体(例如，参比抗体)进行变构调节，干扰另一种抗体直接地或间接地结合靶标/抗原(例如，Tim-3)的能力。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以与参比抗体竞争结合Tim-3。此外，抗体或其片段能够干扰另一个抗体或其片段结合靶标的程度，且因此无论其是否可以被认为是根据本发明的阻断或竞争，都可以使用竞争性结合试验来确定。一种特别合适的定量竞争试验使用基于FACS或基于AlphaScreen方法测量标记的(例如，His标记的、生物素化的或放射性标记的)抗体或其片段和另一抗体或其片段之间在结合靶标方面的竞争。通常，竞争抗体或其片段为例如一种下述的：在竞争试验中结合靶标，使得在试验期间和在第二抗体或其片段的存在下，本发明的分离的抗原结合蛋白的所记录的取代达到由以给定量存在的所检测的潜在阻断抗体或其片段得到的最大理论取代(例如，由需要被阻断的冷(例如，未标记的)抗体或其片段取代)的至多100％(例如，在基于FACS的竞争试验中)。优选地，竞争抗体或其片段具有在10％至100％之间，比如在50％至100％之间的所记录的取代。
在本申请中，术语“直接相连”与术语“间接相连”相对，术语“直接相连”通常是指直接连接。例如，所述直接相连可以为物质间没有间隔子而直接相连的情况。所述间隔子可以是连接子。例如，所述连接子可以为肽连接子。术语“间接相连”通常是指物质间不直接相连的情况。例如，所述间接相连可以为通过间隔子而连接的情况。例如，在本申请所述的分离的抗原结合蛋白中，所述L-FR1的C末端与所述LCDR1的N末端可以直接或间接相连。
在本申请中，术语“分离的核酸分子”通常指任何长度的分离形式的核苷酸，脱氧核糖 核苷酸或核糖核苷酸，或从其天然环境分离的或人工合成的类似物。
在本申请中，术语“载体”通常指可将编码某蛋白的多聚核苷酸插入其中并使蛋白获得表达的一种核酸运载工具。载体可通过转化、转导或转染宿主细胞，使其携带的遗传物质元件在宿主细胞内表达得以表达。举例来说，载体包括：质粒；噬菌粒；柯斯质粒；人工染色体如酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)或P1来源的人工染色体(PAC)；噬菌体如λ噬菌体或M13噬菌体及动物病毒等。用作载体的动物病毒种类有逆转录酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相关病毒、疱疹病毒(如单纯疱疹病毒)、痘病毒、杆状病毒、乳头瘤病毒、乳头多瘤空泡病毒(如SV40)。一种载体可能含有多种控制表达的元件，包括启动子序列、转录起始序列、增强子序列、选择元件及报告基因。另外，载体还可含有复制起始位点。载体还有可能包括有协助其进入细胞的成分，如病毒颗粒、脂质体或蛋白外壳，但不仅仅只有这些物质。
在本申请中，术语“细胞”通常指可以是或已经是受试者质粒或载体的接受者的单个细胞、细胞系或细胞培养物，其包括本发明所述的核酸分子或本发明所述的载体。细胞可以包括单个细胞的后代。由于天然、偶然或有意的突变，后代可以不一定与原始母细胞完全相同(在总DNA互补体的形态上或在基因组上)。细胞可包括用本发明所述的载体在体外转染的细胞。细胞可以是细菌细胞(例如，大肠杆菌)、酵母细胞或其它真核细胞，例如COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、HEK293细胞、COS-1细胞、NS0细胞或骨髓瘤细胞。在某些实施方案中，细胞为哺乳动物细胞。在某些实施方案中，哺乳动物细胞为HEK293细胞。
在本申请中，术语“药物组合物”通常指涉及适合施用于患者、优选人患者的组合物。例如，本申请所述的药物组合物，其可以包含本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞，以及任选地药学上可接受的载体。此外，所述药物组合物还可以包含一种或多种(药学上有效的)载剂、稳定剂、赋形剂、稀释剂、增溶剂、表面活性剂、乳化剂和/或防腐剂的合适的制剂。组合物的可接受成分在所用剂量和浓度下优选地对接受者无毒。本发明的药物组合物包括但不限于液体、冷冻和冻干组合物。
在本申请中，术语“药学上可接受的载体”通常指与药物给药相容的任何和所有的溶剂、分散介质、包衣、等渗剂和吸收延迟剂等，通常安全、无毒，且既不是生物学上也非其它方面不合需要的。
在本申请中，术语“Tim-3相关的疾病”通常是指与表达Tim-3的细胞相关的疾病。例如癌症、自体免疫性疾病和过敏性疾病。在本申请中，Tim-3相关的疾病可以是肿瘤和/或白血病。
在本申请中，术语“受试者”通常指人类或非人类动物，包括但不限于猫、狗、马、猪、奶牛、羊、兔、小鼠、大鼠或猴。
在本申请中，术语“包含”通常是指包括明确指定的特征，但不排除其他要素。
在本申请中，术语“约”通常是指在指定数值以上或以下0.5％-10％的范围内变动，例如在指定数值以上或以下0.5％、1％、1.5％、2％、2.5％、3％、3.5％、4％、4.5％、5％、5.5％、6％、6.5％、7％、7.5％、8％、8.5％、9％、9.5％、或10％的范围内变动。
分离的抗原结合蛋白
一方面，本申请提供一种分离的抗原结合蛋白，其包括重链可变区VH中的至少一个CDR和轻链可变区VL中的至少一个CDR，其中所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。
例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:16所示的VH中的HCDR1。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:16所示的VH中的HCDR2。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:16所示的VH中的HCDR3。又例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:15所示的VL中的LCDR1。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:15所示的VL中的LCDR2。例如，在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含氨基酸序列如SEQ ID NO:15所示的VL中的LCDR3。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白还包括与SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的重链可变区VH中的至少一个CDR，以及与SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的轻链可变区VL中的至少一个CDR。在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白具有Tim-3结合能力。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以结合与SEQ ID NO:25所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的Tim-3片段内的表位。
所述分离的抗原结合蛋白的性质
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以具有下述性质中的一种或多种：
1)能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，其中所述KD值通过表面等离子体共振法测定；
2)在FACS测定中，能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3；
3)在ELISA测定中，能够抑制Tim-3与PtdSer的结合；和
4)促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，其中所述KD值可以通过表面等离子体共振法测定。例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白结合源自人的Tim-3的KD值可以为≤10nM、≤9.5nM、≤9nM、≤8.9nM、≤8.8nM、≤8.7nM、≤8.6nM、≤8.5nM、≤8.4nM、≤8.3nM、≤8.2nM、≤8.1nM、≤8nM、≤7.9nM、≤7.8nM、≤7.7nM、≤7.6nM、≤7.5nM、≤7.4nM、≤7.3nM、≤7.2nM、≤7.1nM、≤7nM、≤6.9nM、≤6.5nM、≤6nM、≤5.5nM、≤5nM、≤4.5nM、≤4nM、≤3.5nM、≤3nM、≤2.9nM、≤2.8nM、≤2.7nM、≤2.6nM、≤2.5nM、≤2.4nM、≤2.3nM、≤2.2nM、≤2.1nM、≤2Nm、≤1.5nM、≤1nM。
在本申请中，所述KD值还可以通过FACS、ELISA、竞争ELISA或BIACORE或KINEXA进行测定。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3，所述特异性结合可以通过FACS测定。例如，可以通过FACS测定中的半最大效应浓度(EC50)来反映本申请所述分离的抗原结合蛋白特异性结合人的Tim-3的情况，例如，半最大效应浓度(EC50)越低说明特异性结合越好。
在本申请中，所述人的Tim-3可以包含如SEQ ID NO:25所示的氨基酸序列，所述小鼠的Tim-3可以包含如SEQ ID NO:26所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够抑制Tim-3与PtdSer的结合，所述抑制情况可以通过流式细胞仪来测定。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白能够促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌。例如，本申请所述分离的抗原结合蛋白使IFN-γ和/或TNF-α的数量增加。
所述分离的抗原结合蛋白的种类
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体或其抗原结合片段。例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包括但不限于重组抗体、单克隆抗体、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、双特异性抗体、单链抗体、双抗体、三抗体、四抗体、Fv片段、scFv片段、Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段和骆驼化单结构域抗体。
在本申请中，所述抗体可以包括鼠源抗体。例如，制备所述鼠源抗体时可以用Tim-3注射试验对象(例如小鼠)，然后分离表达具有所需序列或功能特性的抗体的杂交瘤。在某些实施方案中，所述鼠源抗体或其抗原结合片段，还可以包含鼠源κ、λ链或其变体的轻链恒定区，或包含鼠源IgGl，IgG2，IgG3或IgG4或其变体的重链恒定区。
在本申请中，所述抗体可以为人源化抗体。换句话说，本申请所述的分离的抗原结合蛋 白，其可以为免疫特异性结合至相关抗原(例如人类Tim-3)且包含基本上具有人类抗体的氨基酸序列的框架(FR)区及基本上具有非人类抗体的氨基酸序列的互补决定区(CDR)的抗体或其变异体、衍生物、类似物或片段。此处的“基本上”在CDR的情况下是指CDR的氨基酸序列与非人类抗体CDR的氨基酸序列至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％或至少99％同一。所述人源化抗体基本上可以包含所有至少一个且通常两个可变域(Fab、Fab′、F(ab′)2、FabC、Fv)，其中所有或基本上所有CDR区对应于非人类免疫球蛋白(即抗体)的CDR区且所有或基本上所有框架区为具有人类免疫球蛋白共有序列的框架区。优选地，人源化抗体还包含至少一部分免疫球蛋白恒定区(例如，Fc)，通常为人类免疫球蛋白的恒定区。在一些实施例中，人源化抗体含有轻链以及重链的至少可变域。抗体还可包括重链的CH1、铰链、CH2、CH3及CH4区。在一些实施例中，人源化抗体仅含人源化轻链。在一些实施例中，人源化抗体仅含人源化重链。在特定实施例中，人源化抗体仅含轻链和/或人源化重链的人源化可变域。
在本申请中，所述抗原结合片段可以包括Fab，Fab’，F(ab) 2、Fv片段、F(ab’) 2，scFv，di-scFv和/或dAb。
参比抗体
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以与参比抗体竞争结合所述Tim-3蛋白，其中所述参比抗体可以包含轻链可变区和重链可变区，所述参比抗体的轻链可变区可以包含LCDR1、LCDR2和LCDR3，所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列；所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列；所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述参比抗体的重链可变区可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列；所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列；所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
CDR
在本申请中，对于所述分离的抗原结合蛋白的可变区序列(即所述VH或VL的序列)，可以根据Kabat定义或者Chothia定义来确定VH和VL序列中CDR区序列(参阅例如Kabat,“Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest”，National Institutes of Health,Bethesda，Md.(1991)；A1-Lazikani etal.，J.Mol.Biol.273:927-948(1997)；以及Martin et al.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:9268-9272(1989))。
在本申请中，对于所述分离的抗原结合蛋白的可变区序列(即所述VH或VL的序列)，还可以根据包含了Kabat定义和Chothia定义的Combined定义规则来确定VH和VL序列中CDR区序列。
在本申请中，所述VH可以包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，其中所述HCDR3可以包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR3可以包含与SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR1可以包含与SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR2可以包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HCDR2可以包含与SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述VL可以包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，其中所述LCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR1可以包含与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR2可以包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR2可以包含与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR3可以包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LCDR3可以包含与SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的LCDR1可包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。
FR
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白的VL可以包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
在本申请中，所述L-FR1可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR1可以包含与SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述L-FR1的C末端可以与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1可以包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR2可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR2可以包含与SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2可以包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR3可以包含与SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3可以包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR4可以包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述L-FR4可以包含与SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端相连，且所述L-FR4可以包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白的所述VH可以包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在本申请中，所述H-FR1可以包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR1可以包含与SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1 可以包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR2可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR2可以包含与SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR3可以包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR3可以包含与SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3可以包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR4可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述H-FR4可以包含与SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
例如，所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端相连，且所述H-FR4可以包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。
例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。
又例如，本申请所述的分离的抗原结合蛋白的L-FR1可包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列，且H-FR1可包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。
VL和VH
本申请所述的分离的抗原结合蛋白可包含抗体轻链可变区VL和抗体重链可变区VH。例如，所述VL可包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，所述VH可包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。
例如，所述VL可包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述VH可包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。
轻链和重链
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区可以包括人Igκ恒定区。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区可以包括人Igλ恒定区。
在本申请中，所述抗体轻链恒定区可以包含SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述抗体轻链恒定区可以包含与SEQ ID NO:17所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区可以源自人IgG重链恒定区。在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区可以源自人IgG1重链恒定区。在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区可以源自人IgG2重链恒定区。在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区可以源自人IgG3重链恒定区。在某些实施方式中，所述分离的抗原结合蛋白可以包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区可以源自人IgG4重链恒定区。
在本申请中，所述抗体重链恒定区可以包含SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述抗体重链恒定区可以包含与SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含抗体轻链LC，且所述LC可以包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述LC可以包含与SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白可以包含抗体重链HC，且所述HC可以包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述HC可以包含与SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的氨基酸序列。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白可以包含抗体轻链和抗体重链。
例如，所述轻链可包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列，且所述重链可包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
在本申请中，所述分离的抗原结合蛋白的轻链可包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列， 且重链可包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。其中，所述分离的抗原结合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。其中，所述分离的抗原结合蛋白的L-FR1可包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列，且H-FR1可包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。所述VL可包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且所述VH可包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。例如，所述分离的抗原结合蛋白可以为Z1。
核酸分子、载体、细胞、制备方法和药物组合物
另一方面，本申请还提供了分离的一种或多种核酸分子，其可以编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白。本申请所述的分离的一种或多种核酸分子可以为任何长度的分离形式的核苷酸，脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸，或从其天然环境分离的或人工合成的类似物，但可以编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白。此外，考虑到同一种氨基酸具有两个或更多个密码子，即密码子的简并性，因此，编码同一种本申请所述的分离的抗原结合蛋白的核酸分子不是唯一的。
另一方面，本申请还提供了载体，其可以包含本申请所述的核酸分子，或，表达本申请所述的抗原结合蛋白。所述载体可通过转化、转导或转染宿主细胞，使其携带的遗传物质元件在宿主细胞内表达得以表达。例如，载体可以包括：质粒；噬菌粒；柯斯质粒；人工染色体如酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)或P1来源的人工染色体(PAC)；噬菌体如λ噬菌体或M13噬菌体及动物病毒等。用作载体的动物病毒种类有逆转录酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相关病毒、疱疹病毒(如单纯疱疹病毒)、痘病毒、杆状病毒、乳头瘤病毒、乳头多瘤空泡病毒(如SV40)。又例如，所述载体可以含有多种控制表达的元件，包括启动子序列、转录起始序列、增强子序列、选择元件及报告基因。另外，所述载体还可以含有复制起始位点。此外，所述载体还可以包括有协助其进入细胞的成分，如病毒颗粒、脂质体或蛋白外壳，但不仅仅只有这些物质。
另一方面，本申请还提供了细胞，其可以包含本申请所述的核酸分子或本申请所述的载体。所述细胞可以包括单个细胞的后代。由于天然、偶然或有意的突变，后代可以不一定与原始母细胞完全相同(在总DNA互补体的形态上或在基因组上)。在某些实施方式中，所 述细胞还可以包括用本发明所述的载体在体外转染的细胞。在某些实施方式中，所述细胞可以是细菌细胞(例如，大肠杆菌)、酵母细胞或其它真核细胞，例如COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、HEK293细胞、COS-1细胞、NS0细胞或骨髓瘤细胞。在某些实施方案中，所述细胞可以为哺乳动物细胞。在某些实施方案中，所述哺乳动物细胞可以为HEK293细胞。蛋白质的纯化分离方法可以为盐析法、等电点沉淀法、低温有机溶剂沉淀法、透析与超滤、凝胶过滤法、电泳法、离子交换层析法或亲和色谱法。
另一方面，本申请还提供了制备本申请所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法可以包括在使得本申请所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养本申请所述的细胞。
在某些实施方式中，可以通过外源基因的诱导(例如IPTG诱导)，使本申请所述的分离的抗原结合蛋白进行表达。
另一方面，本申请还提供了药物组合物，其可以包含本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞，以及任选地药学上可接受的载体。
在某些实施方案中，所述药物组合物还可以包含一种或多种(安全有效量的)药学上可接受的载体，例如稳定剂、赋形剂、稀释剂、增溶剂、表面活性剂、乳化剂和/或防腐剂的合适的制剂。组合物的可接受成分在所用剂量和浓度下优选地对接受者无毒。本发明的药物组合物包括但不限于液体、冷冻和冻干组合物。
在某些实施方案中，所述药学上可接受的载体可以包括与药物给药相容的任何和所有的溶剂、分散介质、包衣、等渗剂和吸收延迟剂，通常安全、无毒，且既不是生物学上也非其它方面不合需要的。
在某些实施方案中，所述药物组合物可以包含胃肠内施用和/或肠胃外施用途径，例如皮下、透皮、腔内、静脉内、动脉内、鞘内、瘤内、腹膜内、和/或鼻内施用或直接注射到组织中。例如，所述药物组合物可以通过输注或注射施用于患者或者受试者。在某些实施方案中，所述药物组合物的施用可以通过不同的方式进行，例如静脉内、腹膜内、皮下、肌肉内、局部或真皮内施用。在某些实施方案中，所述药物组合物可以不间断施用。所述不间断(或连续)施用可以通过患者佩戴的小泵系统来实现，以测量流入患者体内的治疗剂，如WO2015/036583所述。
用途和应用
另一方面，本申请还提供了本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物可以用于预防、缓解和/或治疗肿瘤。
另一方面，本申请还提供了本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物可以用于预防、缓解和/或治疗Tim-3相关的疾病。
另一方面，本申请还提供了预防、缓解和/或治疗肿瘤的方法，所述方法可以包括向有需要的受试者施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白。在本申请中，所述施用可以通过不同的方式进行，例如静脉内、瘤内、腹膜内、皮下、肌肉内、局部或真皮内施用。
另一方面，本申请还提供了预防、缓解和/或治疗Tim-3相关的疾病的方法，所述方法可以包括向有需要的受试者施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白。在本申请中，所述施用可以通过不同的方式进行，例如静脉内、瘤内、腹膜内、皮下、肌肉内、局部或真皮内施用。
另一方面，本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物，其可以用于预防、缓解或治疗肿瘤。
另一方面，本申请所述的分离的抗原结合蛋白、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体、本申请所述的细胞和/或本申请所述的药物组合物，其可以用于预防、缓解或治疗Tim-3相关的疾病。
在本申请中，所述肿瘤可以包括实体瘤和/或血液肿瘤。例如，所述肿瘤可以为白血病。
在本申请中，所述Tim-3相关的疾病可以包括与表达Tim-3的细胞相关的疾病。例如癌症、自体免疫性疾病和过敏性疾病。在本申请中，Tim-3相关的疾病可以是白血病和/或肿瘤。
在本申请中，所述受试者可以包括人类和非人类动物。例如，所述受试者可以包括但不限于猫、狗、马、猪、牛、羊、兔、小鼠、大鼠或猴。
另一方面，本申请还提供了抑制Tim-3与PtdSer结合的方法，所述方法包括施用本申请所述的分离的抗原结合蛋白。在本申请中，所述施用可以通过不同的方式进行，例如静脉内、瘤内、腹膜内、皮下、肌肉内、局部或真皮内施用。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白还可以与一种或多种有效量的治疗剂给与所需要的对象，所述一种或多种有效量的治疗剂可以包括化疗剂、细胞毒制剂、免疫抑制剂、类固醇、止吐药、癌症疫苗、镇痛药或另一种抗体。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白还可以与毒素融合，以产生免疫缀合物，从而在特异性结合表达Tim-3蛋白的细胞后，在该细胞上发挥细胞毒性活性，特异性杀死癌细胞。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白还可以制成溶瘤病毒，从而通过细胞表面分子入侵到肿瘤细胞中，然后以在肿瘤细胞中过度表达的特异性受体为靶向，将病毒入侵到肿瘤细胞中并行使后续的各项功能。
在某些实施方式中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白还可以与能够特异性结合其他抗原(即除了Tim-3之外)的抗体融合，以产生双特异性抗体，从而同时特异性结合两种不同的抗原，以达到更好的肿瘤治疗效果。
本申请所述的分离的抗原结合蛋白至少具有一种下述的有益效果：
1)本申请所述的分离的抗原结合蛋白能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，其中所述KD值通过表面等离子体共振法测定；
2)在FACS测定中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3，从而具有种属特异性；
3)在ELISA测定中，本申请所述的分离的抗原结合蛋白能够抑制Tim-3与PtdSer的结合，阻断Tim-3信号通路，从而抑制肿瘤细胞生长；
4)本申请所述的分离的抗原结合蛋白能够促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌，从而可以产生免疫刺激，进而抑制或消除肿瘤。
不欲被任何理论所限，下文中的实施例仅仅是为了阐释本申请的蛋白质分子、制备方法和用途等，而不用于限制本申请发明的范围。实施例不包括对传统方法的详细描述，如那些用于构建载体和质粒的方法，将编码蛋白的基因插入到这样的载体和质粒的方法或将质粒引入宿主细胞的方法。
实施例
实施例1.本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的结构
本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的轻链包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列，且重链包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。其中，所述分离的抗原结合蛋白Z1的HCDR1包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列，HCDR2包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列，HCDR3包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列，且LCDR1包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，LCDR2包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列，LCDR3包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。此外，所述分离的抗原结合蛋白Z1的L-FR1包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列，L-FR2包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列，L-FR3包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列，L-FR4包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列，且H-FR1包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，H-FR2包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，H-FR3包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，H-FR4包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序列。此外，所述分离的抗原结合蛋白Z1的VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列，且VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。
编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的VL的核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示， 编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的VH的核苷酸序列如SEQ ID NO:22所示，编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的轻链恒定区的核苷酸序列如SEQ ID NO:23所示，编码本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1的重链恒定区的核苷酸序列如SEQ ID NO:24所示。
实施例2.本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与人Tim-3的结合亲和力检测
2.1Protein A的偶联
以1x HBS-EP+(GE Healthcare#BR-1006-69)为运行缓冲液，流速10μl/min,在CM5的4个通道上偶联Protein A(Thermo Fisher#21181)：1)设置注入时间800s，将50mM NHS和200mM EDC以1：1体积比混合后注入4个通道；2)用pH4.5的醋酸钠将Protein A稀释至20μg/ml，注入800s；3)注入1M乙醇胺800s，以封闭芯片表面剩余的活性羧基。封闭后继续用1x HBS-EP+缓冲液平衡仪器两小时，Protein A最终偶联量约为2000RU。
2.2动力学测试
设置多循环动力学模式，每个循环包括抗体的捕获、分析物的结合以及芯片的再生。将抗体均稀释至1μg/ml，以10μl/min的流速注入2、3、4通道40s，由预先偶联的Protein A捕获各抗体，捕获量约为200RU。分别将人Tim-3-hIg Fc融合蛋白(即人的Tim-3蛋白，美国R&D system公司,货号2365-TM-050)依次按照0nM、1.25nM、2.5nM、5nM、10nM、20nM、40nM的浓度梯度注入四个通道，流速为30ul/min，设置注入时间180s，解离时间900s。其中，人的Tim-3蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:25所示。最后以同样流速注入甘氨酸(10mM，pH1.5)30s，以再生芯片。
2.3数据分析
用Biacore T200分析软件2.0对实验结果进行分析，1通道作为参比通道扣除，分析模型选用1：1动力学拟合模型。
结果如表1所示。实验结果表明，本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与人Tim-3有较好的结合。
表1 抗原结合蛋白Z1与人Tim-3结合的结合亲和力
抗原结合蛋白 K assoc(1/Ms) K dissoc(1/s) KD(nM) 同种型(Isotype)
Z1 2.3×10 4 1.9×10 -4 8.1 IgG2b,κ
表1中，K assoc：结合速率常数；K dissoc：解离速率常数；KD：亲和常数，等于K dissoc/K assoc。
实施例3.本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与细胞表面Tim-3的结合检测
通过流式细胞荧光分选技术(FACS)，使用iQue Screener流式仪(购自IntelliCyt公司)，用含有0.1％BSA的PBS作为缓冲液进行细胞表面靶抗原(Tim-3，包括源自人的Tim-3和源自小鼠的Tim-3)与抗体(即本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1或对比例抗体)结合亲和力检测，其中，人的Tim-3的氨基酸序列如SEQ ID NO:25所示，小鼠的Tim-3的氨基酸序列如SEQ ID NO:26所示。对比例抗体用Anti-mTim-3Ab表示，其为商用抗体(Rat IgG2a Clone#215008，购自R&D)。具体检测过程如下：
1.使用缓冲液配置浓度为1*10 6cells/ml的靶细胞(即表达人Tim-3的转基因K562细胞，或表达小鼠Tim-3的转基因K562细胞)，加入96孔尖底板(corning 3894)，每孔30μl；
2.使用缓冲液配置检测抗体浓度为3μg/ml，并按3倍比稀释抗体，形成8个浓度梯度；
3.将配置好的不同浓度的抗体按30μl/孔加入已铺好的靶细胞中混匀；
4. 4℃冰箱孵育1小时；
5.每孔加150μl缓冲液，300g离心5分钟，弃上清后将细胞震松散；
6.重复步骤5；
7.使用缓冲液按1:200配比配置荧光二抗(ab98593)，每孔30μl加入细胞中混匀，4°冰箱孵育30分钟；
8.每孔加150μl缓冲液，300g离心5分钟，弃上清后将细胞震松散；
9.重复步骤8；
10.每孔加35μl缓冲液混匀后用流式仪器检测；
11.用Graphpad软件对数据进行分析。
流式亲和力结合实验的分析结果如图1-图3所示，其中，图1显示本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与表达人Tim-3细胞株的结合情况，图2显示本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1与表达小鼠Tim-3细胞株的结合情况，图3显示对比例抗体与表达小鼠Tim-3细胞株的结合情况。此外，图1-图3中的IgG表示实验中的同种型对照抗体小鼠IgG2b，其为商用抗体(Mouse IgG2b Clone#133303，购自R&D)。
从图1-图3可以看出，抗原结合蛋白Z1具有特异性结合人Tim-3的生物学活性。
实施例4.本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1阻断人Tim-3与PtdSer的结合检测
磷脂酰丝氨酸(PtdSer)是Tim-3的另一配体，通常暴露于凋亡细胞胞膜表面，与Tim-3IgV结构域结合，介导凋亡细胞吞噬，促进凋亡小体清除和树突状细胞(DCs)抗原交叉提呈。本申请将Jurkat细胞稀释成5×10 5细胞/ml并加入5μM Camptothecin,在37℃共培养5小时以诱导细胞凋亡，表达磷脂酰丝氨酸。之后，用PBS加2％FSA洗涤2次。最后将凋亡的 Jurkat细胞以每孔1×10 5个加入96孔板。将本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1和同种型对照抗体小鼠IgG2b(Mouse IgG2b Clone#133303，购自R&D)用PBS稀释成20μg/ml，或T im-3-hIg Fc融合蛋白(即人的Tim-3蛋白，美国R&D system公司,货号2365-TM-050)用PBS稀释成4μg/ml，并分别让Tim-3-hIg Fc融合蛋白单独或Z1和Tim-3-hIg Fc融合蛋白共同混合与上述细胞在室温中共培养30分钟。培养结束后，离心，再用PBS加2％FSA洗涤2次。加入二抗APC-Conjugated anti-hIgG Fc Ab(R&D系统，#FAB110A)100μl，洗涤3次后进行流式细胞上机测试。检测结果如图4A-4C所示，从图4A-4C可以看出，只有在本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1存在的情况下，Tim-3-hIg Fc融合蛋白(即人的Tim-3蛋白)测不到凋亡细胞表达的相应受体磷脂酰丝氨酸(PtdSer)，而同种型对照小鼠抗体则无此效果。故本申请所述的分离的抗原结合蛋白Z1可以阻断人Tim-3与PtdSer的结合。
前述详细说明是以解释和举例的方式提供的，并非要限制所附权利要求的范围。目前本申请所列举的实施方式的多种变化对本领域普通技术人员来说是显而易见的，且保留在所附的权利要求和其等同方案的范围内。

Claims (42)

  1. 分离的抗原结合蛋白，其包括重链可变区VH中的至少一个CDR和轻链可变区VL中的至少一个CDR，其中所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。
  2. 根据权利要求1所述的分离的抗原结合蛋白，其具有Tim-3结合能力。
  3. 根据权利要求1-2中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其具有下述性质中的一种或多种：
    1)能够以10nM或更低的KD值结合源自人的Tim-3，其中所述KD值通过表面等离子体共振法测定；
    2)在FACS测定中，能够特异性结合人的Tim-3而不结合小鼠的Tim-3；
    3)在ELISA测定中，能够抑制Tim-3与PtdSer的结合；和
    4)促进IFN-γ和/或TNF-α的分泌。
  4. 根据权利要求1-3中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体或其抗原结合片段。
  5. 根据权利要求4所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗体包括人源化和鼠源抗体。
  6. 根据权利要求4-5中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗原结合片段包括Fab，Fab’，F(ab)2，Fv片段，F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
  7. 根据权利要求1-6中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包含HCDR1，HCDR2和HCDR3，其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
  8. 根据权利要求7所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR1包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。
  9. 根据权利要求7-8中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列。
  10. 根据权利要求1-9中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包含LCDR1，LCDR2和LCDR3，其中所述LCDR1包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。
  11. 根据权利要求10所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR2包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列。
  12. 根据权利要求10-11中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述LCDR3包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。
  13. 根据权利要求1-12中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其与参比抗体竞争结合所述Tim-3蛋白，其中所述参比抗体包含轻链可变区和重链可变区，所述参比抗体的轻链可变区包含LCDR1、LCDR2和LCDR3，所述LCDR1包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列；所述LCDR2包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列；所述LCDR3包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述参比抗体的重链可变区包含HCDR1、HCDR2和HCDR3，所述HCDR1包含SEQ  ID NO:4所示的氨基酸序列；所述HCDR2包含SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列；所述HCDR3包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
  14. 根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包括框架区L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
  15. 根据权利要求14所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR1的C末端与所述LCDR1的N末端直接或间接相连，且所述L-FR1包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列。
  16. 根据权利要求14-15中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR2位于所述LCDR1与所述LCDR2之间，且所述L-FR2包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
  17. 根据权利要求14-16中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR3位于所述LCDR2与所述LCDR3之间，且所述L-FR3包含SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列。
  18. 根据权利要求14-17中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述L-FR4的N末端与所述LCDR3的C末端直接或间接相连，且所述L-FR4包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
  19. 根据权利要求1-18中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VL包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列。
  20. 根据权利要求1-19中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体轻链恒定区，且所述抗体轻链恒定区包括人Igκ恒定区。
  21. 根据权利要求20所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗体轻链恒定区包含SEQ ID NO:17中所示的氨基酸序列。
  22. 根据权利要求1-21中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包含抗体轻链LC，且所述LC包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列。
  23. 根据权利要求1-22中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包括框架区H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
  24. 根据权利要求23所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR1的C末端与所述HCDR1的N末端直接或间接相连，且所述H-FR1包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列。
  25. 根据权利要求23-24中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR2位于所述HCDR1与所述HCDR2之间，且所述H-FR2包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
  26. 根据权利要求23-25中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR3位于所述HCDR2与所述HCDR3之间，且所述H-FR3包含SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列。
  27. 根据权利要求23-26中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述H-FR4的N末端与所述HCDR3的C末端直接或间接相连，且所述H-FR4包含SEQ ID NO:14所示的氨基酸序 列。
  28. 根据权利要求1-27中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述VH包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列。
  29. 根据权利要求1-28中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包括抗体重链恒定区，且所述抗体重链恒定区包括人IgG恒定区。
  30. 根据权利要求29所述的分离的抗原结合蛋白，其中所述抗体重链恒定区包含SEQ ID NO:18中所示的氨基酸序列。
  31. 根据权利要求1-30中任一项所述的分离的抗原结合蛋白，其包含抗体重链HC，且所述HC包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
  32. 分离的一种或多种核酸分子，其编码权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
  33. 载体，其包含根据权利要求32所述的核酸分子，或，表达权利要求1-31中任一项所述的抗原结合蛋白。
  34. 细胞，其包含根据权利要求32所述的核酸分子或根据权利要求33所述的载体。
  35. 制备权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白的方法，所述方法包括在使得权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白表达的条件下，培养根据权利要求34所述的细胞。
  36. 药物组合物，其包含权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体和/或权利要求34所述的细胞，以及任选地药学上可接受的载体。
  37. 权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体、权利要求34所述的细胞和/或权利要求36所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗肿瘤。
  38. 根据权利要求37所述的用途，其中所述肿瘤包括实体瘤和/或血液肿瘤。
  39. 权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、权利要求32所述的核酸分子、权利要求33所述的载体、权利要求34所述的细胞和/或权利要求36所述的药物组合物在制备药物中的用途，所述药物用于预防、缓解和/或治疗Tim-3相关的疾病。
  40. 抑制Tim-3与PtdSer结合的方法，所述方法包括施用权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
  41. 预防、缓解和/或治疗肿瘤的方法，所述方法包括向有需要的受试者施用权利要求1-31中任一项所述的分离的抗原结合蛋白或权利要求36所述的药物组合物。
  42. 根据权利要求41所述的方法，其中所述肿瘤包括实体瘤和/或血液肿瘤。
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