WO2017211644A1 - Supporting membrane for the laser microdissection of a sample deposited on the supporting membrane, laser microdissection device and method for laser microdissection using such a supporting membrane - Google Patents

Supporting membrane for the laser microdissection of a sample deposited on the supporting membrane, laser microdissection device and method for laser microdissection using such a supporting membrane Download PDF

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WO2017211644A1
WO2017211644A1 PCT/EP2017/063167 EP2017063167W WO2017211644A1 WO 2017211644 A1 WO2017211644 A1 WO 2017211644A1 EP 2017063167 W EP2017063167 W EP 2017063167W WO 2017211644 A1 WO2017211644 A1 WO 2017211644A1
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label
sample
carrier membrane
laser
laser microdissection
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PCT/EP2017/063167
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Falk Schlaudraff
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Leica Microsystems Cms Gmbh
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    • G01N1/2813Producing thin layers of samples on a substrate, e.g. smearing, spinning-on
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    • G01N2001/2833Collecting samples on a sticky, tacky, adhesive surface
    • G01N2001/284Collecting samples on a sticky, tacky, adhesive surface using local activation of adhesive, i.e. Laser Capture Microdissection

Definitions

  • the present invention relates to a support membrane for applying a sample to be excised at least in part by laser microdissection together with a corresponding part of the support membrane, a use of such a support membrane, a laser microdissection device having such a support membrane, and a laser microdissection method using such a support membrane.
  • a dissectate can be isolated from a sample by means of an infrared or ultraviolet laser beam, which falls under the influence of gravity into a suitable dissektate collecting container.
  • the dissectate may also be taken from the sample together with a membrane attached to the sample be cut out.
  • laser capture microdissection a thermoplastic membrane is heated by means of a corresponding laser beam. The membrane fuses with the desired area of the sample and can be removed by tearing in a subsequent step.
  • Another alternative is to attach the dissectate by means of the laser beam to a lid of a Dissektatauffang practicers.
  • upwardly transported dissectates may also be attached to the bottom of a dissectate collection container provided with an adhesive coating.
  • laser microdissection systems which have laser deflection or laser scanning devices which are set up to move the laser beam or its point of impact on the stationary sample to be dissected are more advantageous.
  • Such laser microdissection systems which are also to be used in the context of the present invention and offer special advantages there, are explained in detail below.
  • a particularly advantageous laser microscope system which has a laser deflection device with mutually adjustable glass wedges in the laser beam path is described, for example, in EP 1 276 586 B1.
  • pulsed lasers are generally used, a hole or depression being produced in the sample by each laser pulse.
  • a cutting line is created by a juxtaposition of such holes or depressions, optionally with overlap.
  • the laser microdissection can be used for obtaining individual cells or defined tissue areas with diameters of typically less than 250 ⁇ , but usually only 20 ⁇ ) or less, which are separated by a laser beam from the surrounding tissue and then subjected to different diagnostic analysis methods, for example. In oncology, for example, laser microdissection can be used to isolate specific (tumor) cells from a microscopic section and to examine them for specific metabolites or proteins.
  • the case of a sample adhered to a support membrane is to be considered, wherein in the laser microdissection at least a portion of this sample is cut out together with a corresponding part of the support membrane.
  • DE 101 35 091 A1 discloses a slide, which is formed from at least two layers of carrier materials, wherein a layer is a carrier film with magnetic properties. A microdissectate can then be taken up into a collecting vessel by means of magnetic attraction from the magnet located below the bottom of the collecting vessel.
  • DE 103 22 348 B4 discloses a device for non-contact transfer of a dissectate into a receptacle, wherein the dissectate electrostatically charged by the cutting process is transferred into the receptacle by means of an electric field generated by an electrode.
  • a microdissectate can be selectively displaced by means of a mobilizing means, which in turn is a magnetic or magnetizable connection, via an electromagnetic force as a result of the force interaction. This is intended to solve the prior art problem of inefficient mobilization of the microdissect to release the remainder of the specimen or slide.
  • DE 198 04 800 C2 discloses a collecting device for membrane-supported micro dissectates, wherein an electrostatic recovery force or a magnetic recovery force is proposed to support the gravitational trapping force.
  • the present invention therefore has the task of making the process of the laser microdissection simpler, in particular without the disadvantages mentioned, while maintaining the same level of reliability.
  • the present invention provides a support membrane, a use of such a support membrane, a laser microdissection device comprising such a support membrane, and finally a laser microdissection method using such a support membrane according to the independent claims.
  • Advantageous embodiments are the subject of the respective subclaims and the following description.
  • a carrier membrane according to the invention for applying a sample to be excised by means of laser microdissection, at least in part together with a corresponding part of the carrier membrane, is characterized by at least one biologically and / or chemically and / or physically effective label, wherein At least one corresponding, biologically and / or chemically and / or physically effective specific binding partner exists which can form a corresponding biological and / or chemical and / or physical bond with the label.
  • the label is a biologically and / or chemically and / or physically effective substance (substance).
  • the label can bind to a specific binding partner, which also includes the label being able to interact with such a binding partner that is biologically and / or chemically (also “biochemically") and / or physically conditioned
  • a binding partner that is biologically and / or chemically (also “biochemically") and / or physically conditioned
  • biologically and / or chemically also “biochemically”
  • biochemically also “biochemically”
  • physically conditioned includes electrostatic, magnetic, chemical or biochemical interactions. Further examples are explained below.
  • a sample of patient A is assigned a label A 'and a sample of patient B has a label B', in particular on the same carrier membrane.
  • the respectively cut microdissectates contain the label A 'for the piece of tissue of patient A and the label B' for the piece of tissue of patient B.
  • the microdissectates can be collected in the same collecting vessel dry or in a collecting solution (eg PBS), so that no change of a collecting vessel is necessary.
  • the collecting solution must not have a lysing effect on the microdissectate, since otherwise sample and membrane would be separated from each other with a label.
  • different or different labels is meant that they are biologically and / or chemically and / or physically effective in different ways and thus can be separated from each other by interaction or binding with a corresponding different corresponding binding partner or a corresponding complementary structure.
  • the label A ' can form a bond (comprising any specific interaction) with a binding partner A "
  • the label B' can bind with a binding partner B" so that, for example, in spatially separated locations, in each case one of these binding partners exists, the corresponding labels can be collected and thus be separated from other labels.
  • the microdissection of only one sample is provided with a label that specifically binds with a corresponding binding partner (eg at a certain separation site), whereas the microdissectate of the other sample that does not provided with a label, does not undergo such binding and thus can be separated from the microdissectate of the other sample (after it has passed the separation site).
  • This principle also applies to more than two different samples, so that it is sufficient if there is no label on the carrier membrane for (at most) one sample.
  • n with n being a natural number greater than or equal to 2
  • different samples n-1 or n different specific labels must be present in order to allow a clear separation of the microdissectates.
  • the present invention allows the use of a laser microdissection device with a single sample collector or collecting vessel, through which or different laser microdissectants consisting of a cut-out sample part with carrier membrane part are collected. Since each microdissectat is replaced by a corresponding of the label - with the above-described possible restriction of the number of labels - can then be sorted or separated according to corresponding labels. This allows all microdissectates to be collected in a single receptacle during a laser microdissection. As a result, the method of laser microdissection is significantly simplified and accelerated.
  • the support membrane has the at least one label on a back side, wherein a front side of the support membrane facing away from the rear side is designed for applying the sample.
  • a sample is applied to the front side of the support membrane and the corresponding label is applied to the back side of this support membrane in the same region of the sample, so that sample and label are cut out together.
  • the label used is in particular a nucleic acid, a protein, a peptide, a lipid and / or a sugar.
  • the labels may thus be spotted nucleic acids (DNA), for example, which differ in their sequence.
  • DNA nucleic acids
  • proteins, peptides, lipids or sugars which differ in their surface structures with respect to respective binding partners, are conceivable.
  • antibodies are suitable as proteins which bind specific binding partners (antigens). From immunology many different antibodies with specific binding partners are known.
  • Binding partners may be, for example, other proteins (including other antibodies), peptides, lipids, or sugars.
  • antigens can also be used as labels and antibodies for later binding of the specific label.
  • biological molecules that form covalent bonds upon specific contact are good labels and binding partners for later sorting.
  • poly-dT for site 1, which later binds specifically to poly-dA
  • poly-dA for site 2, which later specifically binds to poly-dT
  • poly-dG for site 3, which later specifically binds to poly-dC
  • poly-dC for site 4, which later specifically binds to poly-dG
  • poly at least 1 base
  • dA deoxyribonucleic adenine
  • dT deoxyribonucleic thymine
  • dC deoxyribonucleic cytosine
  • dG deoxyribonucleic guanine
  • the binding properties of the bases are well known: adenine and thymine bind to each other by means of two hydrogen bonds and guanine and cytosine by means of three hydrogen bonds. Combinations of the bases allow a wide spectrum for a wide variety of specific binding sequences.
  • Monoclonal antibodies usually bind specifically a so-called antigen, which is usually a peptide or protein, but also a sugar, lipid or the like. Molecule can be. Also disjointed pairs of specific antibodies and corresponding binding partners can be found here which can be applied to the membrane on the one hand and can be used for sorting the dissectates following the laser microdissection on the other hand.
  • antigen usually a peptide or protein, but also a sugar, lipid or the like.
  • Molecule can be.
  • disjointed pairs of specific antibodies and corresponding binding partners can be found here which can be applied to the membrane on the one hand and can be used for sorting the dissectates following the laser microdissection on the other hand.
  • the associated label of one sample may be magnetic, while for the other sample a non-magnetic label or no label (if the carrier membrane is non-magnetic) is used. It is assumed that the sample itself is not magnetic. By “magnetic” should also fall magnetizable. For example, magnetic labels would be magnetic metal coated membranes, while nonmagnetic ones would be those without such a magnetic metal. The same applies to a hydrophilic label, the other sample then having a hydrophobic label (or no label if the support membrane and the microdissectate are hydrophobic). Because of its magnetic or hydrophilic nature, such a label can be clearly distinguished and separated from another label (or only the microdissectate support membrane) with a non-magnetic or hydrophobic property.
  • the label is spotted or printed (e.g., via bioprinting) on the support membrane by a chemical or biochemical reaction, that is, physically and / or chemically and / or biologically bonded to the support membrane.
  • the invention further relates to the use of an above-described carrier membrane for the laser microdissection of a sample applied to the carrier membrane. Reference is made to the above explanations.
  • the invention further relates to a laser microdissection device in which the sample to be dissected is applied to a carrier membrane according to the invention. Also in this regard, reference is made to the above statements.
  • a laser microdissection device is based on a laser microdissection system known per se with a microscope, which has a laser light source for generating a laser beam, a deflection device for deflecting the laser beam, an incident light device for focusing the laser beam through a microlaser. Roskop Acceptiv on a sample, a microscope stage with a slide with a dissected on the support membrane applied to dissecting sample and finally a sample side of the slide arranged Lasermikrodissektat-Probenfnatureer encompassed.
  • the laser beam from a laser light source is coupled into the observation beam path of the microscope in such a laser microdissection system.
  • the laser beam is focused on through the microscope objective, which is also used to view the sample.
  • the laser microdissection system used in the context of the present invention is used with samples that have already been prepared for microscopy. These may be, for example, tissue thin sections which have been separated out of a larger tissue block by means of a microtome. Such a tissue block may be, for example, a fixed organ or a biopsy of a corresponding organ.
  • the laser microdissection system according to the invention therefore does not serve to obtain samples but to process them and to isolate certain areas thereof.
  • the present invention may also be used with samples that are not obtained by means of a microtome, e.g. with smears, macerates, etc. As mentioned, however, the invention is also suitable for processing thicker samples which have not been prepared by means of a microtome.
  • Microtomes are used exclusively in the preparation of microscopic samples. Microtomes can also have lasers for this purpose. The sections obtained by means of a microtome are applied to a microscope slide as mentioned above, optionally attached there, stained, etc. Only then are these available for use in the laser microdissection system.
  • a microtome distinguishes Among other things, his company is fundamentally influenced by a laser micro dissection system, which produces cuts with as homogeneous a cutting force as possible. Microtomes are therefore designed to produce a large number of identical cuts with parallel cut surfaces, whereas laser microdissection systems are set up for separating dissectates according to sample-dependent criteria, for example according to visual morphological criteria.
  • the laser microdissection system is used in particular for separating out sample parts, which are subsequently taken up in a suspending fluid.
  • the person skilled in the art would therefore not transfer technical solutions used in microtomes to such laser microdissection systems due to the completely different objectives.
  • the present invention relates to a laser microdissection method for cutting at least a portion of a first sample deposited on a first support membrane together with a corresponding portion of the first support membrane, wherein at least one first biologically and / or chemically and / or physically effective label is such is present on or applied to the first support membrane, that part of the first support membrane cut out together with the part of the first sample contains this first label, and wherein the cut-out part of the first sample together with the corresponding part of the first support membrane of a laser microdissectate At least a first, corresponding, biologically and / or chemically and / or physically effective specific binding partner exists with the first label, a biological and / or chemical and / or ph can enter ysikalische bond.
  • a second sample in addition to the first sample, at least a portion of a second sample, which is different from the first sample, is cut out simultaneously or with a time offset.
  • the second sample is applied to the first or to a second carrier membrane.
  • no label on the support membrane is present (see the above comments on the possible limitation of the number of labels) or at least a second label such on this first support membrane or on this second support membrane or is applied there that together with the part of the second sample cut out part the carrier membrane contains this second label.
  • there is a second, corresponding specific binding partner to the second label is different to the first label.
  • the microdissectate which contains the second label, as possible no components or specific binding properties of the first label included in order to perform a later sorting and / or separation optimally.
  • the first sample can be recorded in a first sample catcher and the second sample in a second sample catcher.
  • the actual advantage of the invention is that the cut-out parts of the first sample and the second sample are taken up together by a single laser microsiectatic sample catcher.
  • no change of the sample catcher (collection vessels) is necessary, so that the laser microdissection can be performed with little effort.
  • the cut-out portions of the first and second samples may be separated from one another by being supplied to at least two spatially separated separation sites, wherein a first separation site comprises the at least one first specific binding partner corresponding to the first label, and a second separation site Separation point having at least a second, corresponding to the second label specific binding partner.
  • the microdissectate labeled with the first label can in this way interact with the corresponding first binding partner and in this connection enter into a binding according to the key-lock principle.
  • a separation can, as already explained in detail above, also take place if (at most) one sample does not carry a label, since then all label-labeled sample microdissectates remain at the associated separation sites, while the unlabeled microdissectates are transported separately from the others , Preferably, after separating the cut-out portions of the first and second samples, that is, after separating the microdissectates, these portions are separately supplied to an analyzing device.
  • first and the second sample are applied to a front side of the first carrier membrane.
  • a first label is applied in such a way or is applied in such a way that the part of the first carrier membrane cut out together with the part of the first sample contains this first label.
  • a second label is applied to the back of the first support membrane or applied in such a way that the part of the first support membrane cut out together with the part of the second sample contains this second label.
  • first support membranes may also be used, with the first sample applied to a front side of the first support membrane and the second sample applied to the front side of the second support membrane. It is particularly advantageous if the first label is applied to a rear side of the first carrier membrane facing away from the front side, and the second label (if necessary) is applied or applied (if necessary) on a rear side of the second carrier membrane facing away from the front side.
  • Figure 1 shows a laser microdissection system, which preferably represents the starting point of the present invention, in a schematic Dar position.
  • FIG. 2 schematically shows a situation in laser microdissection in one
  • Figure 3 shows schematically the situation after completion of a laser microdissection with microdissect produced.
  • Figures 4 and 5 show the analogous representations of Figures 2 and 3 with another sample.
  • FIG. 6 shows a sampler with various microdissectates.
  • FIG. 7 shows the microdissectates from FIG. 6 with their labels on the way to the corresponding binding partners.
  • Figure 8 shows the samples with their labein bound to the corresponding specific binding partner.
  • a laser microdissection system or an abovementioned laser microdissection device which can be used to carry out the invention, is shown schematically and designated by 100 as a whole.
  • the laser microdissection system 100 corresponds in substantial parts to that disclosed in EP 1 276 586 B1, to which reference is expressly made.
  • the laser microdissection system 100 comprises a microscope 10.
  • an illumination device 12 which is only partially illustrated here, can be provided.
  • This may, for example, comprise a light source (not shown) and suitable means for influencing the illumination light provided by the light source, for example filters and / or diaphragms.
  • a condenser unit 90 can be provided for transmitted light illumination and for setting suitable contrast or observation methods.
  • the microscope 10 may be designed as a confocal, in particular as a spinning disk microscope and in this case has corresponding further or alternative means (not shown in FIG. 1).
  • a user input and / or user information unit 13 may be arranged, which may be formed, for example, as a touch screen, and via which the user can input and / or read, for example, viewing and / or processing parameters.
  • a drive knob 14 is provided. This serves to operate a coarse and a fine drive for adjusting a height of a microscope stage 30.
  • a sample 51 for example a tissue sample attached in a corresponding slide or holder 52, can thereby be brought into an object plane of an objective 41.
  • the objective 41 is fastened next to other objectives 42 in a nosepiece 40.
  • a protective cover 15 may be provided.
  • Observation light emanating from the sample 51 runs along an observation beam path a.
  • a preferably variable portion of the observation light for example by 60 °, can be coupled out and presented to a user by means of an eyepiece pair 62.
  • Another portion of the observation light can be coupled into a digital image acquisition unit 63 and detected by imaging.
  • the image acquisition unit 63 can, on site, in a control unit 82 or a control computer 81 (see below), or in a different spatial arrangement, be associated with an image evaluation module 64.
  • the necessary connections to the control computer are designated 83.
  • the laser microdissection system 100 has a laser unit 70 with a laser light source 75.
  • a provided by the laser light source 75 which may be, for example, a UV laser light source
  • laser beam 77 with laser beam axis b is deflected in a Auflicht driving, which is indicated here at 76 as a whole, at a first deflecting mirror 71 and a second deflecting mirror 72 and focused by the lens 41 on the sample 51.
  • the location at which the laser beam 77 impinges on the sample 51 in the object plane, and thus also in the sample area, can basically be set in different ways.
  • a manual adjusting device 31 can be provided, by means of which the microscope stage 30 designed as a cross table can be adjusted in the x and y directions (that is to say, perpendicular to or parallel to the plane of the paper).
  • electromechanical actuating means which can be actuated, for example, by a control unit 82 or whose position can be detected by the control unit 82.
  • the control unit 82 may also control any other motorized functions of the laser microdissection system 100, and in particular provide an interface to an external control computer 81, which may be connected via corresponding connections 83.
  • the control unit 82 or the control computer 81 can also evaluate data obtained, for example, by the image evaluation module 64. By way of example, a sequence of tissue layers or other structures of the sample 51 can thereby be recognized.
  • a laser deflection device 73 can be provided.
  • the laser beam 77 can be deflected relative to an optical axis c extending between the first deflection mirror 71 and the second deflection mirror 72.
  • the laser beam can therefore impinge on the second deflection mirror 72 at different positions, which can be embodied, for example, as a dichromatic divider, and thus also becomes active different positions focused on the sample 51 in the object level.
  • a deflection by means of a laser deflection device 73 is shown in detail in EP 1 276 586 B1. It should be emphasized that different possibilities for deflecting a laser beam 77 or for positioning the sample 51 in the object plane relative to the laser beam 77 can be used here. The invention is not limited to the illustrated example.
  • the laser deflection device 73 has two solid glass wedge plates 731, which are inclined relative to the optical axis c and are rotatable independently of each other about the optical axis c.
  • the wedge plates 731 are mounted with ball bearings 732.
  • Each of the wedge plates is connected to a gear 733.
  • the gears 733 can each be rotated by means of actuators 734, which can be acted upon by corresponding drive signals and accordingly drive the gears 733.
  • the rotators may have position sensors 735 (shown here only on the right actuator 734). A position detected by the position sensors 735 may be transmitted to the control unit 82.
  • the sample 51 is visualized or the corresponding image of the sample 51 is fed to an image processing system for automatic processing.
  • a sample region of interest may be made visible for example by staining or made usable for image processing.
  • This sample area should be made available as a dissectate for further analysis.
  • the sample area is surrounded, for example, with an individual cutting line, this cutting line imaging the object contour of the sample area.
  • the cutting line will be spaced from the actual sample area by a certain ⁇ to not destroy the sample area in the edge area due to the finite diameter of the laser focus during cutting.
  • the laser beam 77 is displaced by means of the deflection device 73 according to the predetermined individual cutting line by means of the laser microdissection device 100 shown in FIG. 1, so that the laser beam focus describes the cutting line.
  • the laser deflection device 73 is controlled accordingly by means of the control unit 82 (compare the above explanations).
  • the cut microdissect falls by gravity into a laser microdissect sampler 53 (not shown in FIG. 1).
  • FIG. 2 very schematically shows the situation at the beginning of a laser microdissection process. Shown are only the essential components of the laser microdissection device 100 from FIG. 1, namely the microscope objective 41 used for focusing the laser beam 77 and the focused laser beam 77, the focus of which is directed essentially onto the sample 51.
  • the slide is indicated at 52.
  • the laser microdissects sampler is located below sample 51 and designated 53. This sampler 53 is also shown very schematically in order to clarify the basic principles of the present invention.
  • the sample 51 is located on a support membrane 54, which in turn is held by the slide or the holder 52.
  • the support membrane 54 as a whole, or at least in the region of the microdissection to be produced, contains a biologically and / or chemically and / or physically effective label 55.
  • FIG. 3 shows the situation immediately after the laser beam focus has described the cutting line explained above to cut out a part 510 of the sample 51.
  • a corresponding part 540 of the support membrane 54 which is firmly connected to the sample 51, cut out.
  • the microdissect produced in this way consisting of part 540 of the support membrane 54 and part 510 of the sample 51, falls gravitationally into the sample catcher 53.
  • FIGS. 4 and 5 show analogous situations to FIGS. 2 and 3, wherein a second sample 51 'is to be laser microdissected, which is located on a second carrier membrane 54'.
  • the sampler is again denoted by 53. In particular, this is the same sampler used in FIGS. 2 and 3. Since the situations in FIGS. 4 and 5 are completely analogous to those in FIGS.
  • FIG. 6 shows the sample catcher 53 after laser microdissection of a number of (in this case four) samples (indicated by different hatching), with several dissectates being cut out for each sample. Dissectates for a given sample are labeled with the same label. The dissectates to different samples are labeled with different labels. The different labels are identified in Figure 6 by different hatching. In Figure 6, the various microdissectates are solubilized and then transferred to a prepared support 57 with spiked corresponding binding partners.
  • the corresponding specific binding partners to the labels 55, 55 ', 55 “, 55”' are denoted by 56, 56 ', 56 “, 56”' in FIG.
  • the microdissectates will find their corresponding specific binding partners 56, 56 ', 56 “, 56”' by means of the support membrane labels 55, 55 ', 55 “, 55” and thus sorted on the support 57, as shown in FIG ,
  • the microdissects sorted in this way can now be supplied to follow-up analyzes, whereby it is known which sample is at which position of the support 57, which contributes to a suitable selection of the analysis method or objective of the analysis.
  • the procedure proposed here requires significantly fewer sample preparation and separation steps as well as fewer collecting containers; in particular, it comes with a single sampler 53.
  • the membrane areas with the associated sample sections 55, 55 ', 55 "and 55"' are different in antigen and the antibody 56 (specifically binding only 55) 56 '(which specifically binds only) 55 '), 56 "(which specifically binds only 55") and 56 "' (which specifically binds only 55"') are spotted on support 57 (see Figure 7), then only the mixture of the dissectates of Figure 6 has to be spotted in solution (for example PBS) and applied to the support 57 and incubated. Due to the key-lock principle, the antigens bind to the appropriate antibodies and thus the separation and sorting process is accomplished.
  • ELISA enzyme-linked immunosorbent assay
  • EIA enzyme immunoassay
  • murine monoclonal antibodies can be used as "antigens" for rabbit or horse anti-mouse antibodies, unlike ELISA or EIA, specific binding of antigen and antibody is sufficient here.
  • EIA enzyme immunoassay
  • capillary sample catchers instead of the laser microdissection sample catcher 53 explained here with transfer into the planar support 57, it is also possible with advantage to use capillary sample catchers, as are known from the applicant's patent application DE 10 2013 209 455.8.
  • the different capillary chambers and / or different collection spots for example, at branch lines containing the corresponding binding partner of the membrane label to achieve a separation of the different sample parts.
  • Another alternative possibility of separating the different membrane labels by the corresponding binding partners is the so-called Microfluidics Device from Fluidigm.
  • the various carrier membrane parts with the various labein can be distributed by such a Microfluidic equal on different chambers, wherein the collecting spots respectively corresponding binding partners are included.

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Abstract

The present invention relates to a supporting membrane (54) for the deposition thereon of a sample (51), of which at least a part (510) is to be cut out by laser microdissection together with a corresponding part (540) of the supporting membrane (54), wherein the supporting membrane (54) is marked by at least one biologically and/or chemically and/or physically active label (55), wherein at least one corresponding biologically and/or chemically and/or physically active specific bonding partner (56) exists for a specific label (55), which can form a corresponding biological and/or chemical and/or physical bond with the label (55), wherein, for a specific sample (51) to be cut out, at least one label (55) is present on the supporting membrane (54), such that the cut out part (540) of the supporting membrane (54), together with the part (510) of the sample (51), includes this at least one label (55), and wherein for different samples (51, 51') to be cut out, which are deposited on the supporting membrane (54), different labels (55, 55') are present on the supporting membrane (54), wherein for at most one of the specific different samples (51, 51') there is no label present on the supporting membrane (54).

Description

Trägermembran für die Lasermikrodissektion einer auf die Trägermembran aufgebrachten Probe, Lasermikrodissektionseinrichtung und Lasermikrodissektionsverfahren unter Verwendung einer solchen  Support membrane for the laser microdissection of a sample applied to the support membrane, laser microdissection device and laser microdissection method using the same
Trägermembran  support membrane
Beschreibung description
Die vorliegende Erfindung betrifft eine Trägermembran für das Aufbringen einer mittels Lasermikrodissektion zumindest zum Teil zusammen mit einem entsprechenden Teil der Trägermembran auszuschneidenden Probe, eine Verwendung einer solchen Trägermembran, eine Lasermikrodissektionseinrichtung mit einer solchen Trägermembran sowie ein Lasermikrodissektionsverfahren unter Verwendung einer solchen Trägermembran. The present invention relates to a support membrane for applying a sample to be excised at least in part by laser microdissection together with a corresponding part of the support membrane, a use of such a support membrane, a laser microdissection device having such a support membrane, and a laser microdissection method using such a support membrane.
Stand der Technik State of the art
Verfahren zur Bearbeitung biologischer Proben durch Lasermikrodissektion existieren bereits seit Mitte der 1970er Jahre und wurden seitdem kontinuierlich weiterentwickelt. Bei der Lasermikrodissektion können Zellen, Geweberegionen usw. aus einer biologischen Probe ("Objekt") isoliert und als sogenannte Dissektate gewonnen werden. Ein besonderer Vorteil der Lasermikrodissektion ist der kurze Kontakt der Probe mit dem Laserstrahl, durch den diese kaum verändert wird. Die Gewinnung der Dissektate kann auf unterschiedliche Weise erfolgen. Methods for processing biological samples by laser microdissection have existed since the mid-1970s and have been continuously developed since then. In laser microdissection, cells, tissue regions, etc., can be isolated from a biological sample ("object") and recovered as so-called dissectates. A particular advantage of laser microdissection is the short contact of the sample with the laser beam, by which it is hardly changed. The recovery of the dissectates can be done in different ways.
Beispielsweise kann in bekannten Verfahren aus einer Probe mittels eines Infrarotoder Ultraviolettlaserstrahls ein Dissektat isoliert werden, das unter dem Einfluss der Schwerkraft in einen geeigneten Dissektatauffangbehälter fällt. Das Dissektat kann dabei aus der Probe auch zusammen mit einer an der Probe anheftenden Membran ausgeschnitten werden. Bei der sogenannten "Laser Capture Microdissection" wird hingegen eine thermoplastische Membran mittels eines entsprechenden Laserstrahls erwärmt. Dabei verschmilzt die Membran mit dem gewünschten Bereich der Probe und kann in einem darauffolgenden Schritt durch Reißen entfernt werden. Eine weitere Alternative besteht darin, das Dissektat mittels des Laserstrahls an einen Deckel eines Dissektatauffangbehälters anzuheften. Bei bekannten inversen Mikroskopsystemen zur Lasermikrodissektion können nach oben transportierte Dissektate auch an den Boden eines Dissektatauffangbehälters, der mit einer adhäsiven Beschichtung versehen ist, angeheftet werden. For example, in known methods, a dissectate can be isolated from a sample by means of an infrared or ultraviolet laser beam, which falls under the influence of gravity into a suitable dissektate collecting container. The dissectate may also be taken from the sample together with a membrane attached to the sample be cut out. In the so-called "laser capture microdissection", however, a thermoplastic membrane is heated by means of a corresponding laser beam. The membrane fuses with the desired area of the sample and can be removed by tearing in a subsequent step. Another alternative is to attach the dissectate by means of the laser beam to a lid of a Dissektatauffangbehälters. In known inverse microscopy systems for laser microdissection, upwardly transported dissectates may also be attached to the bottom of a dissectate collection container provided with an adhesive coating.
Bekannte Mikroskopsysteme zur Lasermikrodissektion weisen eine Auflichteinrichtung auf, in deren Strahlengang ein Laserstrahl eingekoppelt wird. Der Laserstrahl wird durch das jeweils verwendete Mikroskopobjektiv auf die Probe fokussiert, die auf einem motorisch-automatisch verfahrbaren Mikroskoptisch aufliegt. Eine Schnittlinie kann dadurch erzeugt werden, dass der Mikroskoptisch beim Schneiden verfahren wird, um die Probe relativ zu dem feststehenden Laserstrahl zu bewegen. Dies hat jedoch unter Anderem den Nachteil, dass die Probe während des Erzeugens der Schnittlinie nicht ohne weiteres betrachtet werden kann, da sich die Probe im Gesichtsfeld bewegt und das Bild ohne weitere Kompensationsmaßnahmen verschwommen bzw. verschmiert erscheint. Known microscope systems for laser microdissection have a Auflichteinrichtung, in the beam path of a laser beam is coupled. The laser beam is focused by the particular microscope objective used on the sample, which rests on a motor-automatically movable microscope stage. A cutting line can be created by moving the microscope stage during cutting to move the sample relative to the fixed laser beam. However, this has, inter alia, the disadvantage that the sample can not be readily observed during the generation of the cutting line, since the sample moves in the field of vision and the image appears blurred or blurred without further compensation measures.
Vorteilhafter sind daher Lasermikrodissektionssysteme, die Laserablenk- bzw. Laserscaneinrichtungen aufweisen, die dazu eingerichtet sind, den Laserstrahl bzw. dessen Auftreffpunkt auf der zu dissektierenden feststehenden Probe zu bewegen. Derartige Lasermikrodissektionssysteme, die auch im Rahmen der vorliegenden Erfindung zum Einsatz kommen sollen und dort besondere Vorteile bieten, werden unten im Detail erläutert. Ein besonders vorteilhaftes Lasermikroskopsystem, das eine Laserablenkeinrichtung mit gegeneinander verstellbaren Glaskeilen im Laserstrahlengang aufweist, ist beispielsweise in der EP 1 276 586 B1 beschrieben. Therefore, laser microdissection systems which have laser deflection or laser scanning devices which are set up to move the laser beam or its point of impact on the stationary sample to be dissected are more advantageous. Such laser microdissection systems, which are also to be used in the context of the present invention and offer special advantages there, are explained in detail below. A particularly advantageous laser microscope system which has a laser deflection device with mutually adjustable glass wedges in the laser beam path is described, for example, in EP 1 276 586 B1.
In beiden Fällen, also in Systemen mit bewegter oder feststehender Probe, wird in der Regel mit gepulsten Lasern gearbeitet, wobei durch jeden Laserpuls ein Loch bzw. eine Vertiefung in der Probe erzeugt wird. Eine Schnittlinie entsteht durch eine Aneinanderreihung derartiger Löcher bzw. Vertiefungen, gegebenenfalls mit Überlappung. Die Lasermikrodissektion kann zur Gewinnung von Einzelzellen oder definierten Gewebebereichen mit Durchmessern von typischerweise unter 250 μηι, in der Regel jedoch nur 20 μιτ) oder darunter, verwendet werden, die mit einem Laserstrahl vom umliegenden Gewebe separiert und anschließend beispielsweise unterschiedlichen diagnostischen Analyseverfahren unterworfen werden. In der Onkologie kann die Lasermikrodissektion beispielsweise dafür eingesetzt werden, um spezifisch (Tumor-) Zellen aus einem mikroskopischen Schnitt zu isolieren und diese auf spezifische Metaboliten oder Proteine zu untersuchen. In both cases, that is to say in systems with a moving or stationary sample, pulsed lasers are generally used, a hole or depression being produced in the sample by each laser pulse. A cutting line is created by a juxtaposition of such holes or depressions, optionally with overlap. The laser microdissection can be used for obtaining individual cells or defined tissue areas with diameters of typically less than 250 μηι, but usually only 20 μιτ) or less, which are separated by a laser beam from the surrounding tissue and then subjected to different diagnostic analysis methods, for example. In oncology, for example, laser microdissection can be used to isolate specific (tumor) cells from a microscopic section and to examine them for specific metabolites or proteins.
Vorliegend soll der Fall einer auf einer Trägermembran haftenden Probe betrachtet werden, wobei bei der Lasermikrodissektion zumindest ein Teil dieser Probe zusammen mit einem entsprechenden Teil der Trägermembran ausgeschnitten wird. In the present case, the case of a sample adhered to a support membrane is to be considered, wherein in the laser microdissection at least a portion of this sample is cut out together with a corresponding part of the support membrane.
Verschiedene Proben bzw. Probenteile, die mittels Lasermikrodissektion gewonnen werden, müssen für die nachfolgende Analyse eindeutig der ursprünglichen Probe bzw. der Herkunft dieser Probe zugeordnet werden können. Hierzu werden die Dissek- tate verschiedener Proben in verschiedenen Auffangbehältern oder Probenfängern gesammelt, um Kontaminationen mit Fremdproben zu vermeiden, und um die Dissek- tate anschließend in verschiedene Behältnisse sortiert den weiteren Analysen zuführen zu können. Es existiert bislang keine Möglichkeit, die Dissektate für verschiedene Proben in derselben Lösung bzw. in demselben Puffer ein- und desselben Auffanggefäßes zu sammeln und nach der Lasermikrodissektion probenspezifisch zu trennen und einem oder mehreren unterschiedlichen Analyseverfahren zuzuführen. Somit muss je nach Probe und Analyseverfahren ein unterschiedliches Auffanggefäß eingesetzt werden. Dies ist umständlich und bedingt die Verwendung mehrere Auffanggefäße während der Lasermikrodissektion einer Probe, zumindest aber während der Lasermikrodissektion mehrerer verschiedener Proben. Different samples or sample parts, which are obtained by means of laser microdissection, must be clearly assigned to the original sample or the source of this sample for subsequent analysis. For this purpose, the dissections of different samples are collected in different collection containers or sample catchers in order to avoid contaminations with foreign samples and to be able to subsequently sort the dissections into different containers for further analysis. So far, there is no way to collect the dissections for different samples in the same solution or in the same buffer one and the same receptacle and after sample microdissection sample specific to separate and supply one or more different analytical methods. Thus, depending on the sample and analysis method, a different collection vessel must be used. This is cumbersome and requires the use of multiple collection vessels during the laser microdissection of a sample, or at least during the laser microdissection of several different samples.
Die DE 101 35 091 A1 offenbart einen Objektträger, der aus mindestens zwei Schichten von Trägermaterialien gebildet ist, wobei eine Schicht eine Trägerfolie mit magnetischen Eigenschaften darstellt. Ein Mikrodissektat kann dann in ein Auffanggefäß mittels magnetischer Anziehung ausgehend von unter dem Boden des Auffanggefäßes lokalisierten Magneten aufgenommen werden. Die DE 103 22 348 B4 offenbart eine Vorrichtung zum berührungsfreien Transfer eines Dissektats in ein Aufnahmegefäß, wobei das durch den Ausschneideprozess elektrostatisch aufgeladene Dissektat mittels eines von einer Elektrode erzeugten elektrischen Feldes in das Aufnahmegefäß transferiert wird. DE 101 35 091 A1 discloses a slide, which is formed from at least two layers of carrier materials, wherein a layer is a carrier film with magnetic properties. A microdissectate can then be taken up into a collecting vessel by means of magnetic attraction from the magnet located below the bottom of the collecting vessel. DE 103 22 348 B4 discloses a device for non-contact transfer of a dissectate into a receptacle, wherein the dissectate electrostatically charged by the cutting process is transferred into the receptacle by means of an electric field generated by an electrode.
Gemäß WO 03/008934 A1 kann ein Mikrodissektat mittels eines Mobilisierungsmittels, bei dem es sich wiederum um eine magnetische bzw. magnetisierbare Verbindung handelt, über eine elektro-magnetische Kraft als Folge der Kraftwechselwirkung gezielt verlagert werden. Hierdurch soll das im Stand der Technik bestehende Problem der ineffizienten Mobilisierung des Mikrodissektats zum Lösen von dem übrigen Präparat bzw. von dem Objektträger gelöst werden. According to WO 03/008934 A1, a microdissectate can be selectively displaced by means of a mobilizing means, which in turn is a magnetic or magnetizable connection, via an electromagnetic force as a result of the force interaction. This is intended to solve the prior art problem of inefficient mobilization of the microdissect to release the remainder of the specimen or slide.
Die DE 198 04 800 C2 offenbart eine Auffangvorrichtung für membrangestützte Mikro- dissektate, wobei zur Unterstützung der Gravitations-Auffangkraft eine elektrostatische Bergekraft oder eine magnetische Bergekraft vorgeschlagen wird. DE 198 04 800 C2 discloses a collecting device for membrane-supported micro dissectates, wherein an electrostatic recovery force or a magnetic recovery force is proposed to support the gravitational trapping force.
Die vorliegende Erfindung stellt sich daher die Aufgabe, den Prozess der Lasermikro- dissektion einfacher, insbesondere ohne die genannten Nachteile, bei gleichbleibender Zuverlässigkeit zu gestalten. The present invention therefore has the task of making the process of the laser microdissection simpler, in particular without the disadvantages mentioned, while maintaining the same level of reliability.
Offenbarung der Erfindung Disclosure of the invention
Zur Lösung der genannten Aufgabe stellt die vorliegende Erfindung eine Trägermembran, eine Verwendung einer solchen Trägermembran, eine Lasermikrodissektionsein- richtung umfassend eine solche Trägermembran sowie schließlich ein Lasermikro- dissektionsverfahren unter Verwendung einer solchen Trägermembran gemäß den unabhängigen Patentansprüchen vor. Vorteilhafte Ausgestaltungen sind Gegenstand der jeweiligen Unteransprüche sowie der nachfolgenden Beschreibung. To achieve the stated object, the present invention provides a support membrane, a use of such a support membrane, a laser microdissection device comprising such a support membrane, and finally a laser microdissection method using such a support membrane according to the independent claims. Advantageous embodiments are the subject of the respective subclaims and the following description.
Eine erfindungsgemäße Trägermembran für das Aufbringen einer mittels Lasermikro- dissektion zumindest zum Teil zusammen mit einem entsprechenden Teil der Trägermembran auszuschneidenden Probe ist mittels mindestens eines biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamen Labels gekennzeichnet, wobei zu einem bestimmten Label zumindest ein korrespondierender, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer spezifischer Bindungspartner existiert, der mit dem Label eine entsprechende biologische und/oder chemische und/oder physikalische Bindung eingehen kann. Auf diese Weise wird ein eindeutiger Zusammenhang von Probe und Label hergestellt, der später mit Hilfe eines eingesetzten Bindungspartners für das Label eine Zuordnung eines Mikrodissektats zu der ursprünglichen Probe erlaubt. Um diese Zuordnung bewerkstelligen zu können, ist das Label ein biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer Stoff (Substanz). Dies bedeutet, dass das Label eine Bindung mit einem spezifischen Bindungspartner eingehen kann, wozu auch gehört, dass das Label mit einem solchen Bindungspartner in Interaktion treten kann, die biologisch und/oder chemisch (auch "biochemisch") und/oder auch physikalisch bedingt ist, also beispielsweise elektrostatische, magnetische, chemische oder biochemische Wechselwirkungen umfasst. Nähere Beispiele werden weiter unten erläutert. A carrier membrane according to the invention for applying a sample to be excised by means of laser microdissection, at least in part together with a corresponding part of the carrier membrane, is characterized by at least one biologically and / or chemically and / or physically effective label, wherein At least one corresponding, biologically and / or chemically and / or physically effective specific binding partner exists which can form a corresponding biological and / or chemical and / or physical bond with the label. In this way, a clear relationship of sample and label is produced, which later allows an assignment of a microdissectate to the original sample with the help of an inserted binding partner for the label. In order to accomplish this assignment, the label is a biologically and / or chemically and / or physically effective substance (substance). This means that the label can bind to a specific binding partner, which also includes the label being able to interact with such a binding partner that is biologically and / or chemically (also "biochemically") and / or physically conditioned Thus, for example, includes electrostatic, magnetic, chemical or biochemical interactions. Further examples are explained below.
Für die vorliegende Erfindung ist es nicht zwingend notwendig, die gesamte Trägermembran mit dem Label zu kennzeichnen, vielmehr ist es ausreichend, wenn für eine bestimmte auszuschneidende Probe mindestens ein Label derart auf der Trägermembran vorhanden ist, dass der zusammen mit dem Teil der Probe ausgeschnittene Teil der Trägermembran dieses mindestens eine Label enthält. Auf diese Weise können mehrere Proben mit mehreren zugehörigen, also probenspezifischen Labein auf ein und dieselbe Trägermembran (oder, wie weiter unten ausgeführt, auch auf jeweils verschiedene Trägermembrane) aufgebracht werden. Somit sind für bestimmte (oder auch alle) verschiedene auszuschneidende Proben, die auf der Trägermembran aufgebracht sind, jeweils verschiedene Label auf der Trägermembran und somit auch auf dem späteren Mikrodissektat vorhanden. Somit ist beispielsweise einer Probe von Patient A ein Label A' und einer Probe von Patient B insbesondere auf derselben Trägermembran ein Label B' zugeordnet. Die jeweils ausgeschnittenen Mikrodissektate enthalten zum Gewebestück von Patient A das Label A' bzw. zum Gewebestück von Patient B das Label B'. Die Mikrodissektate können in demselben Auffanggefäß trocken oder in einer Auffanglösung (z.B. PBS) gesammelt werden, so dass kein Wechsel eines Auffanggefäßes notwendig ist. Die Auffanglösung darf selbstverständlich nicht lysierend auf das Mikrodissektat einwirken, da sonst Probe und Membran mit Label voneinander getrennt würden. Mit jeweils verschiedenen bzw. unterschiedlichen Labels ist gemeint, dass diese in unterschiedlicher weise biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksam sind und somit auch durch Interaktion bzw. Bindung mit einem entsprechenden verschiedenen korrespondierenden Bindungspartner bzw. einer entsprechenden Komplementärstruktur voneinander getrennt werden können. Während beispielsweise das Label A' mit einem Bindungspartner A" eine Bindung (umfassend jedwede spezifische Interaktion) eingehen kann, kann das Label B' mit einem Bindungspartner B" eine Bindung eingehen, so dass beispielsweise an räumlich getrennten Stellen, an denen jeweils einer dieser Bindungspartner vorhanden ist, die entsprechenden Label gesammelt werden können und somit von anderen Label getrennt werden können. For the present invention, it is not absolutely necessary to mark the entire support membrane with the label, but it is sufficient if at least one label is present on the support membrane for a particular sample to be cut out, that the part cut out together with the part of the sample the carrier membrane contains this at least one label. In this way, several samples with several associated, so sample-specific labein on one and the same support membrane (or, as explained below, also on each different support membrane) are applied. Thus, for certain (or even all) different auszuschneidende samples that are applied to the support membrane, each different label on the support membrane and thus also on the subsequent microdissectat available. Thus, for example, a sample of patient A is assigned a label A 'and a sample of patient B has a label B', in particular on the same carrier membrane. The respectively cut microdissectates contain the label A 'for the piece of tissue of patient A and the label B' for the piece of tissue of patient B. The microdissectates can be collected in the same collecting vessel dry or in a collecting solution (eg PBS), so that no change of a collecting vessel is necessary. Of course, the collecting solution must not have a lysing effect on the microdissectate, since otherwise sample and membrane would be separated from each other with a label. By different or different labels is meant that they are biologically and / or chemically and / or physically effective in different ways and thus can be separated from each other by interaction or binding with a corresponding different corresponding binding partner or a corresponding complementary structure. For example, while the label A 'can form a bond (comprising any specific interaction) with a binding partner A ", the label B' can bind with a binding partner B", so that, for example, in spatially separated locations, in each case one of these binding partners exists, the corresponding labels can be collected and thus be separated from other labels.
Für beispielsweise zwei unterschiedliche Proben reicht es aus, wenn das Mikrodissek- tat nur einer Probe mit einem Label versehen ist, das mit einem korrespondierenden Bindungspartner (z.B. an einer bestimmten Trennstelle) spezifisch eine Bindung eingeht, während das Mikrodissektat der anderen Probe, das nicht mit einem Label versehen ist, keine solche Bindung eingeht und somit von dem Mikrodissektat der anderen Probe getrennt werden kann (nachdem es die Trennstelle passiert hat). Dieses Prinzip gilt auch für mehr als zwei unterschiedliche Proben, so dass es ausreichend ist, wenn immer für (höchstens) eine Probe kein Label auf der Trägermembran vorhanden ist. Mit anderen Worten müssen für n (mit n eine natürliche Zahl größer gleich 2) verschiedene Proben n-1 oder n verschiedene spezifische Label vorhanden sein, damit eine eindeutige Trennung der Mikrodissektate möglich ist. For example, for two different samples, it is sufficient if the microdissection of only one sample is provided with a label that specifically binds with a corresponding binding partner (eg at a certain separation site), whereas the microdissectate of the other sample that does not provided with a label, does not undergo such binding and thus can be separated from the microdissectate of the other sample (after it has passed the separation site). This principle also applies to more than two different samples, so that it is sufficient if there is no label on the carrier membrane for (at most) one sample. In other words, for n (with n being a natural number greater than or equal to 2) different samples n-1 or n different specific labels must be present in order to allow a clear separation of the microdissectates.
Zur Klarstellung sei noch ergänzt, dass nicht zwingend alle verschiedenen auszuschneidenden Proben jeweils mit unterschiedlichen Labels gekennzeichnet sein müssen, sondern dass es möglich ist, eine Auswahl an bestimmten Proben vorzunehmen, die später eindeutig voneinander getrennt werden sollen und die somit mit jeweils verschiedenen Labels markiert werden. For clarification, it should be added that not all different samples to be excised must each be labeled with different labels, but that it is possible to make a selection of specific samples which are to be clearly separated later on and which are thus marked with different labels ,
Die vorliegende Erfindung erlaubt den Einsatz einer Lasermikrodissektionseinrichtung mit einem einzigen Probenfänger bzw. Auffanggefäß, durch den bzw. das verschiedene Lasermikrodissektate bestehend aus ausgeschnittenem Probenteil mit Trägermembranteil aufgefangen werden. Da jedes Mikrodissektat durch ein entsprechen- des Label - mit der oben beschriebenen möglichen Einschränkung der Anzahl der Label - gekennzeichnet ist, kann anschließend eine Sortierung oder Trennung nach entsprechenden Labels erfolgen. Dies ermöglicht, dass während der Lasermikrodissektion alle Mikrodissektate in einem einzigen Auffanggefäß bzw. einem einzigen Probenfänger gesammelt werden. Hierdurch wird dass Verfahren der Lasermikrodissektion deutlich vereinfacht und beschleunigt. The present invention allows the use of a laser microdissection device with a single sample collector or collecting vessel, through which or different laser microdissectants consisting of a cut-out sample part with carrier membrane part are collected. Since each microdissectat is replaced by a corresponding of the label - with the above-described possible restriction of the number of labels - can then be sorted or separated according to corresponding labels. This allows all microdissectates to be collected in a single receptacle during a laser microdissection. As a result, the method of laser microdissection is significantly simplified and accelerated.
Es ist weiterhin vorteilhaft, wenn die Trägermembran auf einer Rückseite das mindestens eine Label aufweist, wobei eine der Rückseite abgewandte Vorderseite der Trägermembran zum Aufbringen der Probe ausgebildet ist. Mit anderen Worten wird eine Probe auf die Vorderseite der Trägermembran aufgebracht und das entsprechende Label auf die Rückseite dieser Trägermembran in demselben Bereich der Probe, so dass Probe und Label zusammen ausgeschnitten werden. It is furthermore advantageous if the support membrane has the at least one label on a back side, wherein a front side of the support membrane facing away from the rear side is designed for applying the sample. In other words, a sample is applied to the front side of the support membrane and the corresponding label is applied to the back side of this support membrane in the same region of the sample, so that sample and label are cut out together.
Als Label wird insbesondere eine Nukleinsäure, ein Protein, ein Peptid, ein Lipid und/oder ein Zucker eingesetzt. Die Label können also beispielsweise aufgespottete Nukleinsäuren (DNA) sein, welche sich in ihrer Sequenz unterscheiden. Der Vorteil von Nukleinsäuren bei einer Länge von nur 10 Basen liegt in der großen Kombinationsmöglichkeit. Zu jeder Nukleinsäure gibt es hierbei einen korrespondierenden spezifischen Bindungspartner (Komplementärstruktur). Neben Nukleinsäuren sind auch Proteine, Peptide, Lipide oder Zucker, die sich in ihren Oberflächenstrukturen bezüglich jeweiliger Bindungspartner unterscheiden, denkbar. Als Proteine bieten sich insbesondere Antikörper an, die spezifische Bindungspartner (Antigene) binden. Aus der Immunologie sind viele verschiedene Antikörper mit spezifischen Bindungspartnern bekannt. Bindungspartner können beispielsweise andere Proteine (inklusive andere Antikörper), Peptide, Lipide, oder Zucker sein. Selbstverständlich können auch Antigene als Label und Antikörper zur späteren Bindung der spezifischen Label genutzt werden. Weiterhin sind biologische Moleküle, die bei spezifischem Kontakt kovalente Bindungen eingehen, gute Label und Bindungspartner für das spätere Sortieren. The label used is in particular a nucleic acid, a protein, a peptide, a lipid and / or a sugar. The labels may thus be spotted nucleic acids (DNA), for example, which differ in their sequence. The advantage of nucleic acids with a length of only 10 bases lies in the great possibility of combination. For each nucleic acid there is a corresponding specific binding partner (complementary structure). In addition to nucleic acids, proteins, peptides, lipids or sugars, which differ in their surface structures with respect to respective binding partners, are conceivable. In particular, antibodies are suitable as proteins which bind specific binding partners (antigens). From immunology many different antibodies with specific binding partners are known. Binding partners may be, for example, other proteins (including other antibodies), peptides, lipids, or sugars. Of course, antigens can also be used as labels and antibodies for later binding of the specific label. Furthermore, biological molecules that form covalent bonds upon specific contact are good labels and binding partners for later sorting.
Beispiel für Nukleinsäuren (DNA)-Label: Example of nucleic acid (DNA) label:
Beispielsweise kann als Label für eine spätere Vierfachtrennung vier verschiedene Sequenzen verwendet werden, z.B. poly-dT für Stelle 1 , welches später spezifisch an poly-dA bindet; poly-dA für Stelle 2, welches später spezifisch an poly-dT bindet; poly- dG für Stelle 3, welches später spezifisch an poly-dC bindet; poly-dC für Stelle 4, welches später spezifisch an poly-dG bindet (poly = mind. 1 Basen, dA = desoxyribonukle- in-Adenin, dT = desoxyribonuklein-Thymin, dC = desoxyribonuklein-Cytosin und dG = desoxyribonuklein-Guanin). Aus der Molekularbiologie sind die Bindungseigenschaften der Basen hinlänglich bekannt: Adenin und Thymin binden aneinander mittels zwei Wasserstoffbrücken und Guanin und Cytosin mittels drei Wasserstoffbrücken. Kombinationen der Basen ermöglichen ein großen Spektrum für verschiedenste Anzahlen an spezifische Bindungssequenzen. For example, as a label for a later quadruple separation four different sequences can be used, for example poly-dT for site 1, which later binds specifically to poly-dA; poly-dA for site 2, which later specifically binds to poly-dT; poly- dG for site 3, which later specifically binds to poly-dC; poly-dC for site 4, which later specifically binds to poly-dG (poly = at least 1 base, dA = deoxyribonucleic adenine, dT = deoxyribonucleic thymine, dC = deoxyribonucleic cytosine and dG = deoxyribonucleic guanine). From the molecular biology, the binding properties of the bases are well known: adenine and thymine bind to each other by means of two hydrogen bonds and guanine and cytosine by means of three hydrogen bonds. Combinations of the bases allow a wide spectrum for a wide variety of specific binding sequences.
Der aktuelle Aufspottungs- bzw. Bindungsprozess erfolgt analog wie für gängige Microarray-Manufaktur und -Hybridisierung bekannt (vgl. youtube Videos: The current Aufpottungs- or binding process is analogous as for common microarray manufactory and hybridization known (see youtube videos:
https://www. youtube. com/watch?v=QnqdFFF1 eow https: // www. youtube. com / watch? v = QnqdFFF1 eow
https://www. youtube. com/watch?v=VNsThMNjKhM). https: // www. youtube. com / watch? v = VNsThMNjKhM).
Die Verwendung verschiedener spezifischer monoklonaler Antikörper ist hinlänglich aus der Immunologie bekannt, Anwendungsbeispiele, wie sie für die hier vorgeschlagene Erfindung brauchbar wären, finden sich hier: The use of various specific monoclonal antibodies is well known in the field of immunology. Use examples, as would be useful for the invention proposed here, can be found here:
http://www.retrogenix.com/the4echnoloqv/. http://www.retrogenix.com/the4echnoloqv/.
Monoklonale Antikörper binden in der Regel spezifisch ein sogenanntes Antigen, welche in der Regel ein Peptid oder Protein ist, jedoch auch ein Zucker, Lipid o.ä. Molekül sein kann. Hier finden sich ebenfalls disjunkte Pärchen aus spezifischen Antikörpern und entsprechenden Bindungspartnern, die zum einen auf die Membran aufgebracht werden können und zum anderen zur auf die Lasermikrodissektion folgenden Sortierung der Dissektate genutzt werden können. Monoclonal antibodies usually bind specifically a so-called antigen, which is usually a peptide or protein, but also a sugar, lipid or the like. Molecule can be. Also disjointed pairs of specific antibodies and corresponding binding partners can be found here which can be applied to the membrane on the one hand and can be used for sorting the dissectates following the laser microdissection on the other hand.
Ggf. lassen sich sogar Antikörper designen, die spezifisch die derzeit verschiedenen LMD-Trägermembrane (PEN, PET, PPS, POL) binden, so dass an der Membran nichts geändert werden muss, sondern nur der auf die Lasermikrodissektion folgende Sortierschritt mittels solcher Antikörper für die Proben von verschiedenen Membranen erfolgen kann. Die Label sind dann der LMD Membran inhärent. Diese Möglichkeit soll ausdrücklich von der vorliegend beanspruchten Erfindung ("Trägermembran mit Label gekennzeichnet" oder "Label auf Trägermembran vorhanden") umfasst sein. Hierbei kann auch zur Verifizierung der spezifischen Bindung das LMD System (oder jedes andere Fluoreszenzmikroskop) verwendet werden und die Autofluoreszenz der Membran zur Identifikation verwendet werden. Possibly. can even design antibodies that specifically bind the currently different LMD carrier membrane (PEN, PET, PPS, POL), so that nothing has to be changed on the membrane, but only following the laser microdissection sorting step using such antibodies for the samples of different membranes can be done. The labels are then inherent to the LMD membrane. This possibility is expressly to be encompassed by the presently claimed invention ("carrier membrane labeled" or "label on carrier membrane present"). In this case, the LMD system (or any other fluorescence microscope) can also be used to verify the specific binding and the autofluorescence of the membrane can be used for identification.
Für lediglich zwei zu unterscheidende Proben kann das zugehörige Label einer Probe magnetisch sein, während für die andere Probe ein nicht magnetisches Label oder gar kein Label (wenn die Trägermembran nicht magnetisch ist) verwendet wird. Hierbei wird vorausgesetzt, dass die Probe selbst nicht magnetisch ist. Unter "magnetisch" soll auch magnetisierbar fallen. Magnetische Label wären hier beispielsweise mit magnetischem Metall beschichtete Membrane, während nicht magnetische ohne ein solches magnetisches Metall wären. Analoges gilt für ein hydrophiles Label, wobei die andere Probe dann ein hydrophobes Label (oder gar kein Label, wenn die Trägermembran und das Mikrodissektat hydrophob sind) aufweist. Aufgrund der magnetischen oder hydrophilen Eigenschaft lässt sich ein solches Label eindeutig von einem anderen Label (oder nur der Trägermembran mit Mikrodissektat) mit einer nicht magnetischen oder hydrophoben Eigenschaft unterscheiden und trennen. For only two samples to be discriminated, the associated label of one sample may be magnetic, while for the other sample a non-magnetic label or no label (if the carrier membrane is non-magnetic) is used. It is assumed that the sample itself is not magnetic. By "magnetic" should also fall magnetizable. For example, magnetic labels would be magnetic metal coated membranes, while nonmagnetic ones would be those without such a magnetic metal. The same applies to a hydrophilic label, the other sample then having a hydrophobic label (or no label if the support membrane and the microdissectate are hydrophobic). Because of its magnetic or hydrophilic nature, such a label can be clearly distinguished and separated from another label (or only the microdissectate support membrane) with a non-magnetic or hydrophobic property.
Zweckmäßigerweise ist das Label auf die Trägermembran aufgespottet oder aufgedruckt (z.B. via Bioprinting) durch eine chemische oder biochemische Reaktion aufgebracht, also physikalisch und/oder chemisch und/oder biologisch mit der Trägermembran verbunden. Conveniently, the label is spotted or printed (e.g., via bioprinting) on the support membrane by a chemical or biochemical reaction, that is, physically and / or chemically and / or biologically bonded to the support membrane.
Die Erfindung betrifft weiterhin die Verwendung einer oben geschilderten Trägermembran für die Lasermikrodissektion einer auf die Trägermembran aufgebrachten Probe. Hierzu wird auf die obigen Erläuterungen verwiesen. The invention further relates to the use of an above-described carrier membrane for the laser microdissection of a sample applied to the carrier membrane. Reference is made to the above explanations.
Die Erfindung betrifft weiterhin eine Lasermikrodissektionseinrichtung, bei der die zu dissektierende Probe auf eine erfindungsgemäße Trägermembran aufgebracht ist. Auch diesbezüglich sei auf die obigen Ausführungen verwiesen. The invention further relates to a laser microdissection device in which the sample to be dissected is applied to a carrier membrane according to the invention. Also in this regard, reference is made to the above statements.
Eine erfindungsgemäße Lasermikrodissektionseinrichtung geht von einem an sich bekannten Lasermikrodissektionssystem mit einem Mikroskop aus, das eine Laserlichtquelle zur Erzeugung eines Laserstrahls, eine Ablenkvorrichtung zur Ablenkung des Laserstrahls, eine Auflichteinrichtung zum Fokussieren des Laserstrahls durch ein Mik- roskopobjektiv auf eine Probe, einen Mikroskoptisch mit einem Objektträger mit einer auf der Trägermembran aufgebrachten zu dissektierenden Probe und schließlich einen probenseitig des Objektträgers angeordneten Lasermikrodissektat-Probenfänger um- fasst. A laser microdissection device according to the invention is based on a laser microdissection system known per se with a microscope, which has a laser light source for generating a laser beam, a deflection device for deflecting the laser beam, an incident light device for focusing the laser beam through a microlaser. Roskopobjektiv on a sample, a microscope stage with a slide with a dissected on the support membrane applied to dissecting sample and finally a sample side of the slide arranged Lasermikrodissektat-Probenfänger encompassed.
Ein entsprechendes Lasermikrodissektionssystem ist unten ausführlich unter Bezugnahme auf die Figur 1 erläutert. Mittels der Auflichteinrichtung wird in einem solchen Lasermikrodissektionssystem der Laserstrahl aus einer Laserlichtquelle in den Beobachtungsstrahlengang des Mikroskops eingekoppelt. Der Laserstrahl wird durch das Mikroskopobjektiv, das auch zum Betrachten der Probe verwendet wird, auf diese fo- kussiert. Somit verläuft, mit anderen Worten, der Strahlengang des Laserstrahls der Lasereinheit durch die Auflichteinrichtung und durch das Mikroskopobjektiv und schneidet eine Objektebene des Mikroskopobjektivs an einem einstellbaren Schnittpunkt, der mittels Ansteuersignalen an die Laserablenkeinrichtung vorgegeben wird. A corresponding laser microdissection system is explained in detail below with reference to FIG. By means of the incident light device, the laser beam from a laser light source is coupled into the observation beam path of the microscope in such a laser microdissection system. The laser beam is focused on through the microscope objective, which is also used to view the sample. Thus, in other words, runs the beam path of the laser beam of the laser unit through the Auflichteinrichtung and through the microscope objective and intersects an object plane of the microscope objective at an adjustable intersection, which is predetermined by means of control signals to the laser deflection.
Zur Vermeidung von Missverständnissen sei an dieser Stelle betont, dass das im Rahmen der vorliegenden Erfindung eingesetzte Lasermikrodissektionssystem mit Proben verwendet wird, die bereits mikroskopietauglich vorbereitet sind. Hierbei kann es sich beispielsweise um Gewebe-Dünnschnitte handeln, die mittels eines Mikrotoms aus einem größeren Gewebeblock herausgetrennt wurden. Bei einem solchen Gewebeblock kann es sich beispielsweise um ein fixiertes Organ oder eine Biopsie eines entsprechenden Organs handeln. Das erfindungsgemäße Lasermikrodissektionssystem dient daher nicht zur Gewinnung von Proben, sondern zu deren Bearbeitung sowie zur Isolation von bestimmten Bereichen hiervon. Es versteht sich, dass die vorliegende Erfindung auch mit Proben, die nicht mittels eines Mikrotoms gewonnen werden, zum Einsatz kommen kann, z.B. mit Ausstrichen, Mazeraten usw. Wie erwähnt, eignet sich die Erfindung jedoch auch zur Verarbeitung dickerer Proben, die nicht mittels eines Mikrotoms vorbereitet wurden. To avoid misunderstandings, it should be emphasized here that the laser microdissection system used in the context of the present invention is used with samples that have already been prepared for microscopy. These may be, for example, tissue thin sections which have been separated out of a larger tissue block by means of a microtome. Such a tissue block may be, for example, a fixed organ or a biopsy of a corresponding organ. The laser microdissection system according to the invention therefore does not serve to obtain samples but to process them and to isolate certain areas thereof. It is understood that the present invention may also be used with samples that are not obtained by means of a microtome, e.g. with smears, macerates, etc. As mentioned, however, the invention is also suitable for processing thicker samples which have not been prepared by means of a microtome.
Mikrotome werden ausschließlich bei der Vorbereitung von mikroskopischen Proben eingesetzt. Mikrotome können hierzu auch Laser aufweisen. Die mittels eines Mikrotoms erhaltenen Schnitte werden auf einen Objektträger, wie oben erwähnt, aufgebracht, gegebenenfalls dort befestigt, angefärbt usw. Erst dann stehen diese für einen Einsatz in dem Lasermikrodissektionssystem zur Verfügung. Ein Mikrotom unterschei- det sich in seinem Betrieb unter anderem dadurch fundamental von einem Lasermikro- dissektionssystem, dass dort Schnitte mit möglichst homogener Schnittstärke gewonnen werden. Mikrotome sind daher dazu ausgebildet, eine große Anzahl an identischen Schnitten mit parallelen Schnittflächen zu erzeugen, wohingegen Lasermikrodissekti- onssysteme zum Heraustrennen von Dissektaten nach probenabhängigen Kriterien, beispielsweise nach visuellen morphologischen Kriterien, eingerichtet sind. Im vorliegenden Fall dient das Lasermikrodissektionssystem insbesondere zum Heraustrennen von Probenteilen, die anschließend in einem Suspendierfluid aufgenommen werden. Der Fachmann würde daher bei Mikrotomen eingesetzte technische Lösungen aufgrund der völlig unterschiedlichen Zielsetzung nicht auf derartige Lasermikrodissekti- onssysteme übertragen. Microtomes are used exclusively in the preparation of microscopic samples. Microtomes can also have lasers for this purpose. The sections obtained by means of a microtome are applied to a microscope slide as mentioned above, optionally attached there, stained, etc. Only then are these available for use in the laser microdissection system. A microtome distinguishes Among other things, his company is fundamentally influenced by a laser micro dissection system, which produces cuts with as homogeneous a cutting force as possible. Microtomes are therefore designed to produce a large number of identical cuts with parallel cut surfaces, whereas laser microdissection systems are set up for separating dissectates according to sample-dependent criteria, for example according to visual morphological criteria. In the present case, the laser microdissection system is used in particular for separating out sample parts, which are subsequently taken up in a suspending fluid. The person skilled in the art would therefore not transfer technical solutions used in microtomes to such laser microdissection systems due to the completely different objectives.
Schließlich betrifft die vorliegende Erfindung ein Lasermikrodissektionsverfahren zum Ausschneiden zumindest eines Teils einer ersten Probe, die auf einer ersten Trägermembran aufgebracht ist, zusammen mit einem entsprechenden Teil der ersten Trägermembran, wobei mindestens ein erstes, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksames Label derart auf der ersten Trägermembran vorhanden ist oder auf diese aufgebracht wird, dass der zusammen mit dem Teil der ersten Probe ausgeschnittene Teil der ersten Trägermembran dieses erste Label enthält, und wobei der ausgeschnittene Teil der ersten Probe zusammen mit dem entsprechenden Teil der ersten Trägermembran von einem Lasermikrodissektat-Probenfänger (Auffanggefäß) aufgenommen wird, wobei zu dem ersten Label zumindest ein erster, korrespondierender, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer spezifischer Bindungspartner existiert, der mit dem ersten Label eine biologische und/oder chemische und/oder physikalische Bindung eingehen kann. Finally, the present invention relates to a laser microdissection method for cutting at least a portion of a first sample deposited on a first support membrane together with a corresponding portion of the first support membrane, wherein at least one first biologically and / or chemically and / or physically effective label is such is present on or applied to the first support membrane, that part of the first support membrane cut out together with the part of the first sample contains this first label, and wherein the cut-out part of the first sample together with the corresponding part of the first support membrane of a laser microdissectate At least a first, corresponding, biologically and / or chemically and / or physically effective specific binding partner exists with the first label, a biological and / or chemical and / or ph can enter ysikalische bond.
Bei dem erfindungsgemäßen Verfahren wird neben der ersten Probe gleichzeitig oder zeitlich versetzt zumindest ein Teil einer zweiten, von der ersten unterschiedlichen Probe ausgeschnitten. Hierzu wird die zweite Probe auf die erste oder auf eine zweite Trägermembran aufgebracht. Für diese zweite Probe ist entweder kein Label auf der Trägermembran vorhanden (siehe die obigen Ausführungen zur möglichen Einschränkung der Anzahl der Label) oder mindestens ein zweites Label derart auf dieser ersten Trägermembran oder auf dieser zweiten Trägermembran vorhanden oder wird dort aufgebracht, dass der zusammen mit dem Teil der zweiten Probe ausgeschnittene Teil der Trägermembran dieses zweite Label enthält. Wiederum existiert zu dem zweiten Label ein zweiter, korrespondierender spezifischer Bindungspartner. Das zweite Label ist hierbei unterschiedlich zu dem ersten Label. Außerdem darf das Mikrodissektat, das das zweite Label enthält, möglichst keine Bestandteile bzw. spezifische Bindungseigenschaften des ersten Labels enthalten, um eine spätere Sortierung und/oder Trennung optimal ausführen zu können. In the method according to the invention, in addition to the first sample, at least a portion of a second sample, which is different from the first sample, is cut out simultaneously or with a time offset. For this purpose, the second sample is applied to the first or to a second carrier membrane. For this second sample either no label on the support membrane is present (see the above comments on the possible limitation of the number of labels) or at least a second label such on this first support membrane or on this second support membrane or is applied there that together with the part of the second sample cut out part the carrier membrane contains this second label. Again, there is a second, corresponding specific binding partner to the second label. The second label is different to the first label. In addition, the microdissectate, which contains the second label, as possible no components or specific binding properties of the first label included in order to perform a later sorting and / or separation optimally.
Bezüglich weiterer Einzelheiten und Vorteile dieses Verfahrens sei auf die obigen Ausführungen verwiesen. For further details and advantages of this method, reference is made to the above statements.
Selbstverständlich kann prinzipiell - wie bisher - die erste Probe in einen ersten Probenfänger und die zweite Probe in einem zweiten Probenfänger aufgenommen werden. Der eigentliche Vorteil der Erfindung ist jedoch, dass die ausgeschnittenen Teile der ersten Probe und der zweiten Probe gemeinsam von einem einzigen Lasermikro- dissektat-Probenfänger aufgenommen werden. Somit ist kein Wechsel der Probenfänger (Auffanggefäße) notwendig, so dass die Lasermikrodissektion mit geringem Aufwand ausgeführt werden kann. Of course, in principle - as before - the first sample can be recorded in a first sample catcher and the second sample in a second sample catcher. The actual advantage of the invention, however, is that the cut-out parts of the first sample and the second sample are taken up together by a single laser microsiectatic sample catcher. Thus, no change of the sample catcher (collection vessels) is necessary, so that the laser microdissection can be performed with little effort.
In diesem Fall können die ausgeschnittenen Teile der ersten und der zweiten Probe dadurch voneinander getrennt werden, dass sie zumindest zwei räumlich getrennten Trennstellen zugeführt werden, wobei eine erste Trennstelle den zumindest einen ersten, zu dem ersten Label korrespondierenden spezifischen Bindungspartner aufweist, und wobei eine zweite Trennstelle den zumindest einen zweiten, zum zweiten Label korrespondierenden spezifischen Bindungspartner aufweist. Das mit dem ersten Label gekennzeichnete Mikrodissektat kann auf diese Weise mit dem korrespondierenden ersten Bindungspartner in Interaktion treten und hierbei nach dem Schlüssel-Schloss- Prinzip eine Bindung eingehen. Analoges gilt für das zweite Label und seinen korrespondierenden zweiten Bindungspartner. Da die beiden Bindungspartner an räumlich getrennten Stellen in Interaktion treten, kann auf diese Weise eine Separation der Mikrodissektate erfolgen. Eine Trennung kann, wie bereits oben ausführlich erläutert, auch dann stattfinden, wenn (höchstens) eine Probe kein Label trägt, da dann alle mit Label gekennzeichneten Proben-Mikrodissektate an den zugehörigen Trennstellen verbleiben, während die nicht gekennzeichneten Mikrodissektate getrennt von den anderen weitertransportiert werden. Vorzugsweise werden nach dem Trennen der ausgeschnittenen Teile der ersten und der zweiten Probe, also nach dem Trennen der Mikrodissektate, diese Teile getrennt voneinander einer Analyseeinrichtung zugeführt. In this case, the cut-out portions of the first and second samples may be separated from one another by being supplied to at least two spatially separated separation sites, wherein a first separation site comprises the at least one first specific binding partner corresponding to the first label, and a second separation site Separation point having at least a second, corresponding to the second label specific binding partner. The microdissectate labeled with the first label can in this way interact with the corresponding first binding partner and in this connection enter into a binding according to the key-lock principle. The same applies to the second label and its corresponding second binding partner. Since the two binding partners interact in spatially separated locations, a separation of the microdissectates can take place in this way. A separation can, as already explained in detail above, also take place if (at most) one sample does not carry a label, since then all label-labeled sample microdissectates remain at the associated separation sites, while the unlabeled microdissectates are transported separately from the others , Preferably, after separating the cut-out portions of the first and second samples, that is, after separating the microdissectates, these portions are separately supplied to an analyzing device.
Es ist insbesondere vorteilhaft, wenn die erste und die zweite Probe auf einer Vorderseite der ersten Trägermembran aufgebracht werden. Auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der ersten Trägermembran ist insbesondere ein erstes Label derart aufgebracht oder wird in einer Weise aufgebracht, dass der zusammen mit dem Teil der ersten Probe ausgeschnittene Teil der ersten Trägermembran dieses erste Label enthält. Weiterhin ist insbesondere ein zweites Label (sofern notwendig) auf der Rückseite der ersten Trägermembran derart aufgebracht oder wird in einer Weise aufgebracht, dass der zusammen mit dem Teil der zweiten Probe ausgeschnittene Teil der ersten Trägermembran dieses zweite Label enthält. Auf diese Weise kann durch die oben beschriebene Art der Separation das Mikrodissektat der ersten Probe in einfacher Weise von dem Mikrodissektat der zweiten Probe getrennt werden. It is particularly advantageous if the first and the second sample are applied to a front side of the first carrier membrane. On a rear side of the first carrier membrane facing away from the front side, in particular, a first label is applied in such a way or is applied in such a way that the part of the first carrier membrane cut out together with the part of the first sample contains this first label. Furthermore, in particular a second label (if necessary) is applied to the back of the first support membrane or applied in such a way that the part of the first support membrane cut out together with the part of the second sample contains this second label. In this way, by the manner of separation described above, the microdissectate of the first sample can be easily separated from the microdissectate of the second sample.
Selbstverständlich können auch zwei Trägermembrane verwendet werden, wobei die erste Probe auf einer Vorderseite der ersten Trägermembran und die zweite Probe auf der Vorderseite der zweiten Trägermembran aufgebracht wird. Es ist dann insbesondere vorteilhaft, wenn auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der ersten Trägermembran das erste Label und auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der zweiten Trägermembran das zweite Label (sofern notwendig) aufgebracht ist oder aufgebracht wird. Of course, two support membranes may also be used, with the first sample applied to a front side of the first support membrane and the second sample applied to the front side of the second support membrane. It is particularly advantageous if the first label is applied to a rear side of the first carrier membrane facing away from the front side, and the second label (if necessary) is applied or applied (if necessary) on a rear side of the second carrier membrane facing away from the front side.
Es versteht sich, dass die vorstehend genannten und die nachfolgend noch zu erläuternden Merkmale nicht nur in der jeweils angegebenen Kombination, sondern auch in anderen Kombinationen oder in Alleinstellung verwendbar sind, ohne den Rahmen der vorliegenden Erfindung zu verlassen. It is understood that the features mentioned above and those yet to be explained below can be used not only in the particular combination indicated, but also in other combinations or in isolation, without departing from the scope of the present invention.
Die Erfindung ist anhand eines Ausführungsbeispiels in der Zeichnung schematisch dargestellt und wird im Folgenden unter Bezugnahme auf die Zeichnung ausführlich beschrieben. Figurenbeschreibung The invention is illustrated schematically with reference to an embodiment in the drawing and will be described in detail below with reference to the drawing. figure description
Figur 1 zeigt ein Lasermikrodissektionssystem, das vorzugsweise den Ausgangspunkt der vorliegenden Erfindung darstellt, in schematischer Dar Stellung. Figure 1 shows a laser microdissection system, which preferably represents the starting point of the present invention, in a schematic Dar position.
Figur 2 zeigt schematisch eine Situation bei der Lasermikrodissektion in einem FIG. 2 schematically shows a situation in laser microdissection in one
Lasermikrodissektionsverfahren.  Lasermikrodissektionsverfahren.
Figur 3 zeigt schematisch die Situation nach Abschluss einer Lasermikrodissek tion mit erzeugtem Mikrodissektat. Figure 3 shows schematically the situation after completion of a laser microdissection with microdissect produced.
Figuren 4 und 5 zeigen die analogen Darstellungen der Figuren 2 und 3 mit einer anderen Probe. Figures 4 and 5 show the analogous representations of Figures 2 and 3 with another sample.
Figur 6 zeigt einen Probenfänger mit verschiedenen Mikrodissektaten. FIG. 6 shows a sampler with various microdissectates.
Figur 7 zeigt die Mikrodissektate aus Figur 6 mit ihren Labels auf dem Weg zu den entsprechenden Bindungspartnern. FIG. 7 shows the microdissectates from FIG. 6 with their labels on the way to the corresponding binding partners.
Figur 8 zeigt die Proben mit ihren Labein gebunden an die entsprechenden spezifischen Bindungspartner. Figure 8 shows the samples with their labein bound to the corresponding specific binding partner.
In den Figuren sind einander entsprechende Elemente mit identischen Bezugszeichen angegeben und werden nicht wiederholt erläutert. In the figures, corresponding elements are given identical reference numerals and will not be explained repeatedly.
In Figur 1 ist ein Lasermikrodissektionssystem bzw. eine oben genannte Lasermikro- dissektionseinrichtung, das bzw. die zur Durchführung der Erfindung verwendet werden kann, schematisch dargestellt und insgesamt mit 100 bezeichnet. Das Lasermikrodissektionssystem 100 entspricht in wesentlichen Teilen jenem, das in der EP 1 276 586 B1 offenbart ist, auf die hier ausdrücklich Bezug genommen wird. Ein Koordinatensystem, anhand dessen die nachfolgend erwähnten Achsen bzw. Richtungen x, y und z veranschaulicht sind, ist in der Figur 1 mit 200 bezeichnet. Das Lasermikrodissektionssystem 100 umfasst ein Mikroskop 10. In einem Mikroskopfuß 1 1 des Mikroskops 10 kann eine hier nur teilweise dargestellte Beleuchtungseinrichtung 12 vorgesehen sein. Diese kann beispielsweise eine (nicht dargestellte) Lichtquelle und geeignete Mittel zur Beeinflussung des durch die Lichtquelle bereitgestellten Beleuchtungslichts umfassen, beispielsweise Filter und/oder Blenden. Zur Durchlichtbeleuchtung und zur Einstellung geeigneter Kontrast- bzw. Beobachtungsverfahren kann eine Kondensoreinheit 90 vorgesehen sein. In FIG. 1, a laser microdissection system or an abovementioned laser microdissection device, which can be used to carry out the invention, is shown schematically and designated by 100 as a whole. The laser microdissection system 100 corresponds in substantial parts to that disclosed in EP 1 276 586 B1, to which reference is expressly made. A coordinate system, by means of which the axes or directions x, y and z mentioned below are illustrated, is denoted by 200 in FIG. The laser microdissection system 100 comprises a microscope 10. In a microscope head 1 1 of the microscope 10, an illumination device 12, which is only partially illustrated here, can be provided. This may, for example, comprise a light source (not shown) and suitable means for influencing the illumination light provided by the light source, for example filters and / or diaphragms. For transmitted light illumination and for setting suitable contrast or observation methods, a condenser unit 90 can be provided.
Das Mikroskop 10 kann als Konfokal-, insbesondere als Spinning-Disk-Mikroskop ausgebildet sein und verfügt in diesem Fall über entsprechende weitere oder al-temative Mittel (in Figur 1 nicht dargestellt). The microscope 10 may be designed as a confocal, in particular as a spinning disk microscope and in this case has corresponding further or alternative means (not shown in FIG. 1).
Am Mikroskopfuß 1 1 kann beispielsweise auch eine Benutzereingabe- und/oder Benutzerinformationseinheit 13 angeordnet sein, die beispielsweise als Touch-screen ausgebildet sein kann, und über die der Benutzer beispielsweise Betrach-tungs- und/oder Bearbeitungsparameter eingeben und/oder auslesen kann. At the microscope head 1 1, for example, a user input and / or user information unit 13 may be arranged, which may be formed, for example, as a touch screen, and via which the user can input and / or read, for example, viewing and / or processing parameters.
Ferner ist ein Triebknopf 14 vorgesehen. Dieser dient zur Bedienung eines Grob- und eines Feintriebs zur Einstellung einer Höhe eines Mikroskoptischs 30. Eine Probe 51 , beispielsweise eine in einem entsprechenden Objektträger bzw. einer Halterung 52 angebrachte Gewebeprobe, kann hierdurch in eine Objektebene eines Objektivs 41 gebracht werden. Das Objektiv 41 ist neben weiteren Objektiven 42 in einem Objektivrevolver 40 befestigt. Zum Schutz vor Laserstrahlung kann eine Schutzhaube 15 vorgesehen sein. Furthermore, a drive knob 14 is provided. This serves to operate a coarse and a fine drive for adjusting a height of a microscope stage 30. A sample 51, for example a tissue sample attached in a corresponding slide or holder 52, can thereby be brought into an object plane of an objective 41. The objective 41 is fastened next to other objectives 42 in a nosepiece 40. To protect against laser radiation, a protective cover 15 may be provided.
Von der Probe 51 ausgehendes Beobachtungslicht verläuft entlang eines Beobachtungsstrahlengangs a. In einer Tubuseinheit 60 mit geeigneten Auskoppeleinrichtungen 61 kann ein vorzugsweise variabler Anteil des Beobachtungslichts, beispielsweise um 60°, ausgekoppelt und mittels eines Okularpaares 62 einem Benutzer dargeboten werden. Ein weiterer Anteil des Beobachtungslichts kann in eine digitale Bilderfassungseinheit 63 eingekoppelt und bildgebend erfasst werden. Der Bilderfassungseinheit 63 kann, vor Ort, in einer Steuereinheit 82 oder einem Steuerrechner 81 (siehe unten), oder in anderer räumlicher Anordnung, ein Bildauswertungsmodul 64 zugeordnet sein. Die dazu notwendigen Verbindungen zum Steuerrechner sind mit 83 bezeichnet. Observation light emanating from the sample 51 runs along an observation beam path a. In a tube unit 60 with suitable coupling-out devices 61, a preferably variable portion of the observation light, for example by 60 °, can be coupled out and presented to a user by means of an eyepiece pair 62. Another portion of the observation light can be coupled into a digital image acquisition unit 63 and detected by imaging. The image acquisition unit 63 can, on site, in a control unit 82 or a control computer 81 (see below), or in a different spatial arrangement, be associated with an image evaluation module 64. The necessary connections to the control computer are designated 83.
Das Lasermikrodissektionssystem 100 weist eine Lasereinheit 70 mit einer Laserlichtquelle 75 auf. Ein durch die Laserlichtquelle 75, bei der es sich beispielsweise um eine UV-Laserlichtquelle handeln kann, bereitgestellter Laserstrahl 77 mit Laserstrahlachse b wird in einer Auflichteinrichtung, die hier insgesamt mit 76 angegeben ist, an einem ersten Umlenkspiegel 71 und einem zweiten Umlenkspiegel 72 umgelenkt und durch das Objektiv 41 auf die Probe 51 fokussiert. The laser microdissection system 100 has a laser unit 70 with a laser light source 75. A provided by the laser light source 75, which may be, for example, a UV laser light source, laser beam 77 with laser beam axis b is deflected in a Auflichteinrichtung, which is indicated here at 76 as a whole, at a first deflecting mirror 71 and a second deflecting mirror 72 and focused by the lens 41 on the sample 51.
Bei dem Lasermikrodissektionssystem 100 kann der Ort, an dem der Laserstrahl 77 auf die Probe 51 in der Objektebene, und damit auch in dem Probenbereich auftrifft, grundsätzlich auf unterschiedliche Weise eingestellt werden. Einerseits kann eine manuelle VerStelleinrichtung 31 vorgesehen sein, mittels derer der als Kreuztisch ausgebildete Mikroskoptisch 30 in x- und y-Richtung (also hier senkrecht bzw. parallel zur Papierebene) verstellt werden kann. Neben der VerStelleinrichtung 31 können auch eiektromechanische Stellmittel vorgesehen sein, die beispielsweise durch eine Steuereinheit 82 angesteuert bzw. deren Position durch die Steuereinheit 82 erfasst werden kann. In the laser microdissection system 100, the location at which the laser beam 77 impinges on the sample 51 in the object plane, and thus also in the sample area, can basically be set in different ways. On the one hand, a manual adjusting device 31 can be provided, by means of which the microscope stage 30 designed as a cross table can be adjusted in the x and y directions (that is to say, perpendicular to or parallel to the plane of the paper). In addition to the adjusting device 31, it is also possible to provide electromechanical actuating means which can be actuated, for example, by a control unit 82 or whose position can be detected by the control unit 82.
Die Steuereinheit 82 kann auch beliebige weitere motorisierte Funktionen des Laser- mikrodissektionssystems 100 steuern und insbesondere eine Schnittstelle zu einem externen Steuerrechner 81 , der über entsprechende Verbindungen 83 angebunden sein kann, bereitstellen. Die Steuereinheit 82 oder der Steuerrechner 81 kann auch beispielsweise mittels des Bildauswertungsmoduls 64 erhaltene Daten auswerten. Beispielsweise kann hierdurch eine Abfolge von Gewebeschichten oder anderer Strukturen der Probe 51 erkannt werden. The control unit 82 may also control any other motorized functions of the laser microdissection system 100, and in particular provide an interface to an external control computer 81, which may be connected via corresponding connections 83. The control unit 82 or the control computer 81 can also evaluate data obtained, for example, by the image evaluation module 64. By way of example, a sequence of tissue layers or other structures of the sample 51 can thereby be recognized.
Für die Lasermikrodissektion kann insbesondere eine Laserablenkvorrichtung 73 vorgesehen sein. Mittels der Laserablenkvorrichtung 73 kann der Laserstrahl 77 gegenüber einer zwischen dem ersten Umlenkspiegel 71 und dem zweiten Um-Ienkspiegel 72 verlaufenden optischen Achse c abgelenkt werden. Der Laserstrahl kann daher an unterschiedlichen Positionen auf den zweiten Umlenkspiegel 72 auftreffen, der beispielsweise als dichromatischer Teiler ausgebildet sein kann, und wird damit auch an unterschiedlichen Positionen auf die Probe 51 in der Ob-jektebene fokussiert. Eine Ablenkung mittels einer Laserablenkvorrichtung 73 ist im Detail in der EP 1 276 586 B1 gezeigt. Es sei betont, dass hier unterschiedliche Möglichkeiten zur Ablenkung eines Laserstrahls 77 bzw. zur Positionierung der Probe 51 in der Objektebene gegenüber dem Laserstrahl 77 zum Einsatz kommen können. Die Erfindung ist nicht auf das dargestellte Beispiel beschränkt. For laser microdissection, in particular a laser deflection device 73 can be provided. By means of the laser deflection device 73, the laser beam 77 can be deflected relative to an optical axis c extending between the first deflection mirror 71 and the second deflection mirror 72. The laser beam can therefore impinge on the second deflection mirror 72 at different positions, which can be embodied, for example, as a dichromatic divider, and thus also becomes active different positions focused on the sample 51 in the object level. A deflection by means of a laser deflection device 73 is shown in detail in EP 1 276 586 B1. It should be emphasized that different possibilities for deflecting a laser beam 77 or for positioning the sample 51 in the object plane relative to the laser beam 77 can be used here. The invention is not limited to the illustrated example.
Im dargestellten Beispiel weist die Laserablenkvorrichtung 73 zwei massive glä-serne Keilplatten 731 auf, die gegen die optische Achse c geneigt und unabhängig voneinander um die optische Achse c drehbar sind. Hierzu sind die Keilplatten 731 mit Kugellagern 732 gelagert. Jede der Keilplatten ist mit einem Zahnrad 733 verbunden. Die Zahnräder 733 können jeweils mittels Aktoren 734 gedreht werden, die mit entsprechenden Ansteuersignalen beaufschlagt werden können und entsprechend die Zahnräder 733 antreiben. Die Rotationseinrichtungen können über Positonsgeber 735 verfügen (hier nur an dem rechten Aktor 734 gezeigt). Eine durch die Positonsgeber 735 erfasste Position kann an die Steuereinheit 82 übermittelt werden. In the example shown, the laser deflection device 73 has two solid glass wedge plates 731, which are inclined relative to the optical axis c and are rotatable independently of each other about the optical axis c. For this purpose, the wedge plates 731 are mounted with ball bearings 732. Each of the wedge plates is connected to a gear 733. The gears 733 can each be rotated by means of actuators 734, which can be acted upon by corresponding drive signals and accordingly drive the gears 733. The rotators may have position sensors 735 (shown here only on the right actuator 734). A position detected by the position sensors 735 may be transmitted to the control unit 82.
Mit der hier beschriebenen Lasermikrodissektionseinrichtung 100 kann mittels eines Lasermikrodissektionsverfahrens zumindest ein Teil einer auf dem Objetträger 52 befindlichen Probe 51 ausgeschnitten werden. Dies sei beispielhaft wie folgt anhand der Figuren 2 und 3 erläutert: With the laser microdissection device 100 described here, at least part of a sample 51 located on the object carrier 52 can be cut out by means of a laser microdissection method. This is explained by way of example as follows with reference to FIGS. 2 and 3:
In an sich bekannter Weise wird beispielsweise die Probe 51 visualisiert oder das entsprechende Bild der Probe 51 einem Bildverarbeitungssystem zur automatischen Verarbeitung zugeführt. Ein interessierender Probenbereich kann hierbei beispielsweise durch Färbung sichtbar gemacht oder für die Bildverarbeitung verwertbar gemacht sein. Dieser Probenbereich soll als Dissektat einer weiteren Analyse zur Verfügung gestellt werden. Hierzu wird der Probenbereich beispielsweise mit einer individuellen Schnittlinie umgeben, wobei diese Schnittlinie die Objektkontur des Probenbereichs abbildet. In der Praxis wird die Schnittlinie vom eigentlichen Probenbereich um ein gewisses Δ beabstandet sein, um auf Grund des endlichen Durchmessers des Laserfokus beim Schneiden den Probenbereich im Randbereich nicht zu zerstören. In an sich bekannter Weise wird mittels der in Figur 1 dargestellten Lasermikrodissekti- onseinrichtung 100 der Laserstrahl 77 mittels der Ablenkungsvorrichtung 73 entsprechend der vorgegebenen individuellen Schnittlinie verschoben, so dass der Laserstrahlfokus die Schnittlinie beschreibt. Hierzu wird die Laserablenkvorrichtung 73 mittels der Steuereinheit 82 entsprechend angesteuert (vergleiche die obigen Erläuterungen). Nach Beschreiben der Schnittlinie durch den Laserstrahlfokus fällt das ausgeschnittene Mikrodissektat veranlasst durch Schwerkraft in einen (in Figur 1 nicht dargestellten) Lasermikrodissektat-Probenfänger 53. In a manner known per se, for example, the sample 51 is visualized or the corresponding image of the sample 51 is fed to an image processing system for automatic processing. A sample region of interest may be made visible for example by staining or made usable for image processing. This sample area should be made available as a dissectate for further analysis. For this purpose, the sample area is surrounded, for example, with an individual cutting line, this cutting line imaging the object contour of the sample area. In practice, the cutting line will be spaced from the actual sample area by a certain Δ to not destroy the sample area in the edge area due to the finite diameter of the laser focus during cutting. In a manner known per se, the laser beam 77 is displaced by means of the deflection device 73 according to the predetermined individual cutting line by means of the laser microdissection device 100 shown in FIG. 1, so that the laser beam focus describes the cutting line. For this purpose, the laser deflection device 73 is controlled accordingly by means of the control unit 82 (compare the above explanations). After describing the line of intersection through the laser beam focus, the cut microdissect falls by gravity into a laser microdissect sampler 53 (not shown in FIG. 1).
Figur 2 zeigt sehr schematisch die Situation zu Beginn eines Lasermikrodissektionsver- fahrens. Dargestellt sind nur die wesentlichen Bestandteile der Lasermikrodissektions- einrichtung 100 aus Figur 1 , nämlich das zum Fokussieren des Laserstrahls 77 verwendete Mikroskopobjektiv 41 und den fokussierten Laserstrahl 77, dessen Fokus im Wesentlichen auf die Probe 51 gerichtet ist. Der Objektträger ist mit 52 angedeutet. Der Lasermikrodissektat-Probenfänger ist unterhalb der Probe 51 angeordnet und mit 53 bezeichnet. Auch dieser Probenfänger 53 ist nur sehr schematisch dargestellt, um die Grundprinzipien der vorliegenden Erfindung zu verdeutlichen. Die Probe 51 befindet sich auf einer Trägermembran 54, die ihrerseits von dem Objektträger beziehungsweise der Halterung 52 gehalten wird. In diesem Ausführungsbeispiel beinhaltet die Trägermembran 54 insgesamt, zumindest aber in dem Bereich des zu erzeugenden Mikrodissektats ein biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksames Label 55. FIG. 2 very schematically shows the situation at the beginning of a laser microdissection process. Shown are only the essential components of the laser microdissection device 100 from FIG. 1, namely the microscope objective 41 used for focusing the laser beam 77 and the focused laser beam 77, the focus of which is directed essentially onto the sample 51. The slide is indicated at 52. The laser microdissects sampler is located below sample 51 and designated 53. This sampler 53 is also shown very schematically in order to clarify the basic principles of the present invention. The sample 51 is located on a support membrane 54, which in turn is held by the slide or the holder 52. In this exemplary embodiment, the support membrane 54 as a whole, or at least in the region of the microdissection to be produced, contains a biologically and / or chemically and / or physically effective label 55.
Figur 3 zeigt die Situation unmittelbar, nachdem der Laserstrahlfokus die oben erläuterte Schnittlinie beschrieben hat, um einen Teil 510 der Probe 51 auszuschneiden. Hierdurch wird ein entsprechender Teil 540 der Trägermembran 54, die mit der Probe 51 fest verbunden ist, ausgeschnitten. Das auf diese Weise erzeugte Mikrodissektat bestehend aus Teil 540 der Trägermembran 54 und Teil 510 der Probe 51 fällt gravitationsbedingt in den Probenfänger 53. FIG. 3 shows the situation immediately after the laser beam focus has described the cutting line explained above to cut out a part 510 of the sample 51. In this way, a corresponding part 540 of the support membrane 54, which is firmly connected to the sample 51, cut out. The microdissect produced in this way, consisting of part 540 of the support membrane 54 and part 510 of the sample 51, falls gravitationally into the sample catcher 53.
Als Trägermembran 54 kommen die an sich bekannten Materialien PEN, PET, POL oder PPS in Frage. Der Probenfänger 53 kann bereits ein Liquid enthalten oder trocken sein. In Falle eines Liquids darf dieses nicht lysierend auf das Mikrodissektat einwirken, da sonst Probenteil 510 und Trägermembranteil 540 mit Label 55 getrennt würden. Die Figuren 4 und 5 zeigen analoge Situationen zu den Figuren 2 und 3, wobei eine zweite Probe 51 ' lasermikrodissektiert werden soll, die sich auf einer zweiten Trägermembran 54' befindet. Der Probenfänger ist wiederum mit 53 bezeichnet. Insbesondere handelt es sich hier um denselben Probenfänger, der in den Figuren 2 und 3 verwendet wurde. Da die Situationen in den Figuren 4 und 5 denen aus den bereits behandelten Figuren 2 und 3 völlig analog entsprechen, wird auf nähere Erläuterung verzichtet, um Wiederholungen zu vermeiden. Das aus der zweiten Probe 51 ' ausgeschnittene Probenteil 510' fällt zusammen mit dem entsprechenden ausgeschnittenen Trägermembranteil 540' in den Probenfänger 53, wobei das Membranteil 540' ein zweites Label 55' aufweist. Vorteilhafterweise werden die Mikrodissektate mit dem Probenteil 510 und den Probenteil 510' in demselben Probenfänger 53 gesammelt. As support membrane 54, the known materials PEN, PET, POL or PPS come into question. The sampler 53 may already contain a liquid or be dry. In the case of a liquid, this must not have a lysing effect on the microdissectate, otherwise sample part 510 and carrier membrane part 540 would be separated with label 55. FIGS. 4 and 5 show analogous situations to FIGS. 2 and 3, wherein a second sample 51 'is to be laser microdissected, which is located on a second carrier membrane 54'. The sampler is again denoted by 53. In particular, this is the same sampler used in FIGS. 2 and 3. Since the situations in FIGS. 4 and 5 are completely analogous to those in FIGS. 2 and 3 already discussed, further explanation is omitted in order to avoid repetition. The sample part 510 'cut out of the second sample 51', together with the corresponding cut-out carrier membrane part 540 ', falls into the sample catcher 53, the membrane part 540' having a second label 55 '. Advantageously, the microdissectates with the sample part 510 and the sample part 510 'are collected in the same sampler 53.
Figur 6 zeigt den Probenfänger 53 nach Lasermikrodissektion einer Anzahl von (hier vier) Proben (durch verschiedene Schraffuren kenntlich gemacht), wobei zu jeder Probe mehrere Dissektate ausgeschnitten wurden. Die Dissektate zu einer bestimmten Probe sind mit demselben Label gekennzeichnet. Die Dissektate zu unterschiedlichen Proben sind mit unterschiedlichen Label gekennzeichnet. Die verschiedenen Label sind in Figur 6 durch unterschiedliche Schraffuren kenntlich gemacht. In Figur 6 sind die verschiedenen Mikrodissektate in Lösung gebracht und werden anschließend zu einem vorbereiteten Träger 57 mit aufgespotteten korrespondierenden Bindungspartnern überführt. FIG. 6 shows the sample catcher 53 after laser microdissection of a number of (in this case four) samples (indicated by different hatching), with several dissectates being cut out for each sample. Dissectates for a given sample are labeled with the same label. The dissectates to different samples are labeled with different labels. The different labels are identified in Figure 6 by different hatching. In Figure 6, the various microdissectates are solubilized and then transferred to a prepared support 57 with spiked corresponding binding partners.
Die korrespondierenden spezifischen Bindungspartner zu den Label 55, 55', 55", 55"' sind in Figur 7 mit 56, 56', 56", 56"' bezeichnet. Nach kurzer Inkubation werden die Mikrodissektate mittels der Trägermembranlabel 55, 55', 55", 55"' ihre korrespondierenden spezifischen Bindungspartner 56, 56', 56", 56"' finden und somit auf dem Träger 57 sortiert werden, wie in Figur 8 dargestellt. Die auf diese Weise sortierten Mikrodissektate können nun Nachfolgeanalysen zugeführt werden, wobei bekannt ist, welche Probe sich an welcher Stelle des Trägers 57 befindet, was zur geeigneten Auswahl der Analysemethode oder Zielsetzung der Analyse beiträgt. Das hier vorgeschlagene Vorgehen benötigt deutlich weniger Probenaufbereitungs- und Trennungsschritte wie auch weniger Auffangbehältnisse, insbesondere kommt es mit einem einzigen Probenfänger 53 aus. Sind zum Beispiel die Membranareale mit den zugehörigen Probenabschnitten 55, 55', 55" und 55"' (vgl. Figur 6) mit unterschiedlichen Antigenen ausgeprägt und die daran anbindenden Antikörper 56 (welches spezifisch nur 55 bindet), 56' (welches spezifisch nur 55' bindet), 56" (welches spezifisch nur 55" bindet) und 56"' (welches spezifisch nur 55"' bindet) auf dem Träger 57 aufgespottet (vgl. Figur 7), so muss lediglich das Gemenge der Dissektate von Figur 6 in Lösung (zum Beispiel PBS) gebracht werden und auf den Träger 57 aufgebracht und inkubiert werden. Durch das Schlüssel-Schloss- Prinzip werden die Antigene an die passenden Antikörper binden und somit wird der Trenn-und Sortiervorgang bewerkstelligt. The corresponding specific binding partners to the labels 55, 55 ', 55 ", 55"' are denoted by 56, 56 ', 56 ", 56"' in FIG. After a short incubation, the microdissectates will find their corresponding specific binding partners 56, 56 ', 56 ", 56"' by means of the support membrane labels 55, 55 ', 55 ", 55" and thus sorted on the support 57, as shown in FIG , The microdissects sorted in this way can now be supplied to follow-up analyzes, whereby it is known which sample is at which position of the support 57, which contributes to a suitable selection of the analysis method or objective of the analysis. The procedure proposed here requires significantly fewer sample preparation and separation steps as well as fewer collecting containers; in particular, it comes with a single sampler 53. For example, the membrane areas with the associated sample sections 55, 55 ', 55 "and 55"' (see Figure 6) are different in antigen and the antibody 56 (specifically binding only 55) 56 '(which specifically binds only) 55 '), 56 "(which specifically binds only 55") and 56 "' (which specifically binds only 55"') are spotted on support 57 (see Figure 7), then only the mixture of the dissectates of Figure 6 has to be spotted in solution (for example PBS) and applied to the support 57 and incubated. Due to the key-lock principle, the antigens bind to the appropriate antibodies and thus the separation and sorting process is accomplished.
Die Methode der Nutzung spezifischer Antikörper bzw. Antigene ist hinlänglich aus ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) oder EIA (enzyme immunoassay) bekannt. Beispielsweise können monoklonale Antikörper aus der Maus als„Antigene" für anti-Maus Antikörper aus dem Kaninchen oder Pferd verwendet werden. Anders als beim ELISA oder EIA reicht die spezifische Bindung von Antigen und Antikörper hier aus. Wie bereits oben erwähnt, ist auch vorstellbar, spezielle Antikörper für die verschiedenen Plastiksorten der LMD Membranen zu designen, um die spezifische Bindung nach der Lasermikrodissektion im Trennschritt zu gewährleisten. Die Label sind dann der LMD Membran inhärent. The method of using specific antibodies or antigens is well known from ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) or EIA (enzyme immunoassay). For example, murine monoclonal antibodies can be used as "antigens" for rabbit or horse anti-mouse antibodies, unlike ELISA or EIA, specific binding of antigen and antibody is sufficient here. To design specific antibodies for the various plastic types of the LMD membranes to ensure specific binding after laser microdissection in the separation step, the labels are then inherent in the LMD membrane.
Das Spotten von Antikörpern oder Proteinen, sowie die Verwendung von antibody ar- rays ist bekannt, wie z.B. hier ersichtlich: The spotting of antibodies or proteins, as well as the use of antibody arrays is known, e.g. visible here:
httpsi//www.youtube.com/watch?v=-CM5rABib60 httpsi // www.youtube.com / watch? v = -CM5rABib60
https://www.youtube.com/watch?v=o1 BDvYEfTFA https://www.youtube.com/watch?v=o1 BDvYEfTFA
An Stelle des hier erläuterten Lasermikrodissektat-Probenfängers 53 mit Überführung in den planaren Träger 57 können auch Kapillar-Probenfänger mit Vorteil eingesetzt werden, wie sie aus der Patentanmeldung DE 10 2013 209 455.8 der Anmelderin bekannt sind. Dort können die unterschiedlichen Kapillarkammern und/oder unterschiedliche Auffangspots, beispielsweise an Leitungsverzweigungen, die korrespondierenden Bindungspartner der Membranlabel enthalten, um eine Trennung der unterschiedlichen Probenteile zu erreichen. Bezüglich des Aufbaus eines solchen Kapillar-Probenfängers sei ausdrücklich auf die genannte deutsche Patentanmeldung verwiesen. Eine weitere alternative Möglichkeit der Trennung der verschiedenen Membranlabel durch die korrespondierenden Bindungspartner bietet das sogenannte Microfluidics Device der Firma Fluidigm. Die verschiedenen Trägermembranteile mit den verschiedenen Labein können durch einen solchen Microfluidicaufbau auf verschiedene Kammern verteilt werden, wobei an den Auffangspots jeweils entsprechende Bindungspartner enthalten sind. Zu näheren Einzelheiten solcher Microfluidics Devices sei auf den durch die Firma Fluidigm diesbezüglich veröffentlichten Stand der Technik verwiesen. Instead of the laser microdissection sample catcher 53 explained here with transfer into the planar support 57, it is also possible with advantage to use capillary sample catchers, as are known from the applicant's patent application DE 10 2013 209 455.8. There, the different capillary chambers and / or different collection spots, for example, at branch lines containing the corresponding binding partner of the membrane label to achieve a separation of the different sample parts. With regard to the construction of such a capillary sampler, reference is expressly made to the said German patent application. Another alternative possibility of separating the different membrane labels by the corresponding binding partners is the so-called Microfluidics Device from Fluidigm. The various carrier membrane parts with the various labein can be distributed by such a Microfluidicaufbau on different chambers, wherein the collecting spots respectively corresponding binding partners are included. For further details of such microfluidics devices, reference is made to the state of the art published by Fluidigm in this regard.
Bezugszeichenliste LIST OF REFERENCE NUMBERS
10 Mikroskop 10 microscope
1 1 Mikroskopfuß  1 1 microscope head
12 Beleuchtungseinrichtung  12 lighting device
13 Benutzereingabe-/informationseinheit  13 User input / information unit
14 Triebknopf  14 drive button
15 Schutzhaube  15 protective cover
30 Mikroskoptisch 30 microscope stage
31 manuelle Versteileinrichtung  31 manual adjusting device
40 Objektivrevolver40 nosepiece
1 Objektiv  1 lens
42 Objektiv 1 , 51 ' Probe 42 objective 1, 51 'sample
2 Objektträger, Halterung 2 slides, holder
3 Probenfänger 3 sample catchers
4, 54' Trägermembran 4, 54 'carrier membrane
5, 55', 55", 55'" Label 5, 55 ', 55 ", 55'" label
6, 56', 56", 56"' Bindungspartner 6, 56 ', 56 ", 56"' binding partner
7 Träger 7 carriers
10, 510' Teil der Probe 540, 540' Teil der Trägermembran 10, 510 'part of the sample 540, 540 'part of the support membrane
60 Tubuseinheit 60 tube unit
61 Auskoppeleinrichtungen  61 decoupling devices
62 Okularpaar  62 eyepiece pair
63 Bilderfassungseinheit  63 image capture unit
64 Bildauswertungsmodul  64 image evaluation module
70 Lasereinheit 70 laser unit
71 Umlenkspiegel  71 deflecting mirror
72 Umlenkspiegel  72 deflection mirror
73 Laserablenkvorrichtung  73 laser deflecting device
75 Laserlichtquelle  75 laser light source
76 Auflichteinrichtung  76 incident light device
77 Laserstrahl  77 laser beam
731 Keilplatten 731 wedge plates
732 Kugellager  732 ball bearings
733 Zahnrad  733 gear
734 Aktor  734 actuator
735 Positionsgeber  735 position transmitter
81 Steuerrechner 81 control computer
82 Steuereinheit  82 control unit
83 Verbindungen  83 connections
90 Kondensoreinheit 90 condenser unit
100 Lasermikrodissektionssystem, -einrichtung100 laser microdissection system, device
200 Koordinatensystem 200 coordinate system
a Beobachtungsstrahlengangachse b Laserstrahlachse a observation beam axis b laser beam axis
c optische Achse c optical axis

Claims

Patentansprüche Patent claims
1. Trägermembran (54) für das Aufbringen einer mittels Lasermikrodissektion zumindest zum Teil (510) zusammen mit einem entsprechenden Teil (540) der Trägermembran (54) auszuschneidenden Probe (51 ), wobei die Trägermembran (54) mittels mindestens eines biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamen Labels (55) gekennzeichnet ist, wobei zu einem bestimmten Label (55) zumindest ein korrespondierender, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer spezifischer Bindungspartner (56) existiert, der mit dem Label (55) eine entsprechende biologische und/oder chemische und/oder physikalische Bindung eingehen kann, wobei 1. Carrier membrane (54) for applying a sample (51) to be cut out at least in part (510) together with a corresponding part (540) of the carrier membrane (54) by means of laser microdissection, the carrier membrane (54) being cut out by means of at least one biological and/or chemically and/or physically active label (55), whereby for a specific label (55) there is at least one corresponding, biologically and/or chemically and/or physically active specific binding partner (56), which is linked to the label (55). corresponding biological and/or chemical and/or physical bond can form, whereby
für eine bestimmte auszuschneidende Probe (51 ) mindestens ein Label (55) derart auf der Trägermembran (54) vorhanden ist, dass der zusammen mit dem Teil (510) der Probe (51 ) ausgeschnittene Teil (540) der Trägermembran (54) dieses mindestens eine Label (55) enthält und wobei For a specific sample (51) to be cut out, at least one label (55) is present on the carrier membrane (54) in such a way that the part (540) of the carrier membrane (54) cut out together with the part (510) of the sample (51) has this at least contains a label (55) and where
für bestimmte verschiedene auszuschneidende Proben (51 , 51 '), die auf der Trägermembran (54) aufgebracht sind, jeweils verschiedene Label (55, 55') auf der Trägermembran (54) vorhanden sind, wobei für höchstens eine der bestimmten verschiedenen Proben (51 , 51 ') kein Label auf der Trägermembran (54) vorhanden ist. For certain different samples (51, 51') to be cut out which are applied to the carrier membrane (54), different labels (55, 55') are present on the carrier membrane (54), with at most one of the certain different samples (51 , 51 ') there is no label on the carrier membrane (54).
2. Trägermembran (54) nach Anspruch 1 , dadurch gekennzeichnet, dass die Trägermembran (54) auf einer Rückseite das mindestens eine Label (55) aufweist, wobei eine der Rückseite abgewandte Vorderseite der Trägermembran (54) zum Aufbringen der Probe (51 ) ausgebildet ist. 2. Carrier membrane (54) according to claim 1, characterized in that the carrier membrane (54) has the at least one label (55) on a back, a front side of the carrier membrane (54) facing away from the back being designed for applying the sample (51). is.
3. Trägermembran (54) nach einem der vorangehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass das mindestens eine Label (55) eine Nukleinsäure, ein Protein, ein Peptid, ein Lipid und/oder ein Zucker ist. 3. Carrier membrane (54) according to one of the preceding claims, characterized in that the at least one label (55) is a nucleic acid, a protein, a peptide, a lipid and / or a sugar.
4. Trägermembran (54) nach einem der Ansprüche 1 bis 2, dadurch gekennzeichnet, dass das mindestens eine Label (55) einen magnetischen oder nicht magnetischen Bestandteil und/oder einen hydrophilen oder hydrophoben Bestandteil aufweist. 4. Carrier membrane (54) according to one of claims 1 to 2, characterized in that the at least one label (55) has a magnetic or non-magnetic component and / or a hydrophilic or hydrophobic component.
5. Trägermembran (54) nach einem der vorangehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass das Label (55) auf die Tägermembran aufgespottet ist. 5. Carrier membrane (54) according to one of the preceding claims, characterized in that the label (55) is spotted onto the carrier membrane.
6. Verwendung einer Trägermembran (54) nach einem der Ansprüche 1 bis 5 für die Lasermikrodissektion einer auf die Trägermembran (54) aufgebrachten Probe (51 ). 6. Use of a carrier membrane (54) according to one of claims 1 to 5 for the laser microdissection of a sample (51) applied to the carrier membrane (54).
7. Lasermikrodissektionseinrichtung (100), die eine Laserlichtquelle (75) zur Erzeugung eines Laserstrahls (77), eine Ablenkvorrichtung (73) zur Ablenkung des Laserstrahls (77), eine Auflichteinrichtung (76) zum Fokussieren des Laserstrahls (77) durch ein Mikroskopobjektiv (41 ) auf eine Probe (51 ), einen Mikroskoptisch (30) mit einem Objektträger (52) mit einer auf einer Trägermembran (54) aufgebrachten zu dissektierenden Probe (51 ) und einen probenseitig des Objektträgers (52) angeordneten Lasermikrodissektat-Probenfänger (53) umfasst, wobei die Trägermembran (54) gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5 ausgebildet ist. 7. Laser microdissection device (100), which has a laser light source (75) for generating a laser beam (77), a deflection device (73) for deflecting the laser beam (77), an incident light device (76) for focusing the laser beam (77) through a microscope objective ( 41) on a sample (51), a microscope table (30) with a microscope slide (52) with a sample to be dissected (51) applied to a carrier membrane (54) and a laser microdissectate sample catcher (53) arranged on the sample side of the microscope slide (52) comprises, wherein the carrier membrane (54) is designed according to one of claims 1 to 5.
8. Lasermikrodissektionsverfahren zum Ausschneiden zumindest eines Teils (510) einer ersten Probe (51 ), die auf einer ersten Trägermembran (54) aufgebracht ist, zusammen mit einem entsprechenden Teil (540) der ersten Trägermembran (54), wobei mindestens ein erstes, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksames Label (55) derart auf der ersten Trägermembran (54) vorhanden ist oder aufgebracht wird, dass der zusammen mit dem Teil (510) der ersten Probe (51 ) ausgeschnittene Teil (540) der ersten Trägermembran (54) dieses erste Label (55) enthält, und wobei der ausgeschnittene Teil (510) der ersten Probe (51 ) zusammen mit dem entsprechenden Teil (540) der ersten Trägermembran (54) von einem Lasermikrodissektat- Probenfänger (53) aufgenommen wird, wobei zu dem ersten Label (55) zumindest ein erster, korrespondierender, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer spezifischer Bindungspartner existiert, der mit dem ersten Label (55) eine biologische und/oder chemische und/oder physikalische Bindung eingehen kann, wobei neben der ersten Probe (51 ) gleichzeitig oder zeitlich versetzt zumindest ein Teil (510') einer zweiten, von der ersten unterschiedlichen Probe (51 '), die auf der ersten (54) oder einer zweiten (54') Trägermembran aufgebracht ist, ausgeschnitten wird, wobei für diese zweite Probe (51 ') entweder kein Label auf der Trägermembran vorhan- den ist oder mindestens ein zweites, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksames und von dem ersten Label (55) unterschiedliches Label (55') derart auf dieser ersten Trägermembran (54) oder dieser zweiten Trägermembran (54') vorhanden ist oder aufgebracht wird, dass der zusammen mit dem Teil (510') der zweiten Probe (51 ') ausgeschnittene Teil (540, 540') der Trägermembran (54, 54') dieses zweite Label (55') enthält, wobei zu dem zweiten Label (55') zumindest ein zweiter, korrespondierender, biologisch und/oder chemisch und/oder physikalisch wirksamer spezifischer Bindungspartner (56') existiert, der mit dem zweiten Label (55') eine biologische und/oder chemische und/oder physikalische Bindung eingehen kann, und wobei die ausgeschnittenen Teile (510, 510') der ersten und der zweiten Probe gemeinsam von dem einen Lasermikrodissektat-Probenfänger (53) aufgenommen werden. 8. Laser microdissection method for cutting out at least a part (510) of a first sample (51) which is applied to a first carrier membrane (54), together with a corresponding part (540) of the first carrier membrane (54), wherein at least a first, biological and/or chemically and/or physically active label (55) is present or applied to the first carrier membrane (54) in such a way that the part (540) of the first carrier membrane cut out together with the part (510) of the first sample (51). (54) contains this first label (55), and wherein the cut out part (510) of the first sample (51) is picked up together with the corresponding part (540) of the first carrier membrane (54) by a laser microdissect sample catcher (53), wherein at least one first, corresponding, biologically and/or chemically and/or physically active specific binding partner exists for the first label (55), which can form a biological and/or chemical and/or physical bond with the first label (55), wherein in addition to the first sample (51), at the same time or with a time offset, at least a part (510 ') of a second sample (51 ') different from the first, which is applied to the first (54) or a second (54') carrier membrane, is cut out, with either no label being present on the carrier membrane for this second sample (51 '). which is or at least a second, biologically and/or chemically and/or physically active label (55') which is different from the first label (55) is present on this first carrier membrane (54) or this second carrier membrane (54') or is applied that the part (540, 540') of the carrier membrane (54, 54') cut out together with the part (510 ') of the second sample (51 ') contains this second label (55'), being to the second label (55') at least one second, corresponding, biologically and/or chemically and/or physically active specific binding partner (56') exists, which can enter into a biological and/or chemical and/or physical bond with the second label (55'). , and wherein the cut out parts (510, 510') of the first and second samples are picked up together by the one laser microdissect sample catcher (53).
9. Lasermikrodissektionsverfahren nach Anspruch 8, wobei die ausgeschnittenen Teile (510, 510') der ersten und der zweiten Probe dadurch voneinander getrennt werden, dass sie einer ersten Trennstelle zugeführt werden, wobei die erste Trennstelle den zumindest einen ersten, zu dem ersten Label (55) korrespondierenden spezifischen Bindungspartner (56) aufweist. 9. Laser microdissection method according to claim 8, wherein the cut parts (510, 510 ') of the first and second samples are separated from one another by being fed to a first separation point, the first separation point containing the at least one first label ( 55) has corresponding specific binding partner (56).
10. Lasermikrodissektionsverfahren nach Anspruch 9, wobei die ausgeschnittenen Teile (510, 510') der ersten und der zweiten Probe dadurch voneinander getrennt werden, dass sie zusätzlich einer zweiten, von der ersten Trennstelle räumlich getrennten Trennstelle zugeführt werden, wobei die zweite Trennstelle den zumindest einen zweiten, zum zweiten Label (55') korrespondierenden spezifischen Bindungspartner (56') aufweist. 10. Laser microdissection method according to claim 9, wherein the cut parts (510, 510 ') of the first and second samples are separated from each other by additionally feeding them to a second separation point spatially separated from the first separation point, the second separation point being at least has a second specific binding partner (56') corresponding to the second label (55').
1 1. Lasermikrodissektionsverfahren nach Anspruch 9 oder 10, wobei nach dem Trennen der ausgeschnittenen Teile (510, 510') der ersten und zweiten Probe diese Teile getrennt voneinander einer Analyseeinrichtung zugeführt werden. 1 1. Laser microdissection method according to claim 9 or 10, wherein after separating the cut out parts (510, 510 ') of the first and second samples, these parts are fed separately from one another to an analysis device.
12. Lasermikrodissektionsverfahren nach einem der Ansprüche 8 bis 1 1 , wobei die erste und die zweite Probe (51 , 51') auf einer Vorderseite der ersten Trägermembran (54) aufgebracht werden. 12. Laser microdissection method according to one of claims 8 to 1 1, wherein the first and second samples (51, 51 ') are applied to a front side of the first carrier membrane (54).
13. Laserrnikrodissektionverfahren nach Anspruch 12, wobei auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der ersten Trägermembran (54) ein erstes Label (55) derart auf der ersten Trägermembran (54) aufgebracht ist oder wird, dass der zusammen mit dem Teil (510) der ersten Probe (51 ) ausgeschnittene Teil (540) der ersten Trägermembran (54) dieses erste Label (55) enthält. 13. Laser microdissection method according to claim 12, wherein on a back side of the first carrier membrane (54) facing away from the front, a first label (55) is or is applied to the first carrier membrane (54) in such a way that it is together with the part (510) of the first Sample (51) cut out part (540) of the first carrier membrane (54) contains this first label (55).
14. Laserrnikrodissektionverfahren nach Anspruch 12 oder 13, wobei ein zweites Label (55') auf der Rückseite der ersten Trägermembran (54) derart aufgebracht ist oder wird, dass der zusammen mit dem Teil (510') der zweiten Probe (51 ') ausgeschnittene Teil (540) der ersten Trägermembran (54) dieses zweite Label (55') enthält. 14. Laser microdissection method according to claim 12 or 13, wherein a second label (55 ') is or is applied to the back of the first carrier membrane (54) in such a way that it is cut out together with the part (510') of the second sample (51 '). Part (540) of the first carrier membrane (54) contains this second label (55 ').
15. Lasermikrodissektionsverfahren nach einem der Ansprüche 8 bis 1 1 , wobei die erste Probe (51 ) auf einer Vorderseite der ersten Trägermembran (54) und die zweite Probe (51') auf einer Vorderseite der zweiten Trägermembran (54') aufgebracht wird. 15. Laser microdissection method according to one of claims 8 to 1 1, wherein the first sample (51) is applied to a front side of the first carrier membrane (54) and the second sample (51 ') is applied to a front side of the second carrier membrane (54').
16. Lasermikrodissektionsverfahren nach Anspruch 15, wobei auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der ersten Trägermembran (54) das erste Label (55) aufgebracht ist oder wird. 16. Laser microdissection method according to claim 15, wherein the first label (55) is or is applied to a back side of the first carrier membrane (54) facing away from the front side.
17. Lasermikrodissektionsverfahren nach Anspruch 15 oder 16, wobei auf einer der Vorderseite abgewandten Rückseite der zweiten Trägermembran (54') das zweite Label (55') aufgebracht ist oder wird. 17. Laser microdissection method according to claim 15 or 16, wherein the second label (55') is or is applied to a back side of the second carrier membrane (54 ') facing away from the front side.
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