WO2016146764A1 - Production de synthons glycosyles par voie enzymatique - Google Patents

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WO2016146764A1
WO2016146764A1 PCT/EP2016/055843 EP2016055843W WO2016146764A1 WO 2016146764 A1 WO2016146764 A1 WO 2016146764A1 EP 2016055843 W EP2016055843 W EP 2016055843W WO 2016146764 A1 WO2016146764 A1 WO 2016146764A1
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amino acid
seq
identity
group
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PCT/EP2016/055843
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Inventor
Isabelle Andre
Stéphane GRELIER
David GUIEYSSE
Alvaro LAFRAYA
Pierre Monsan
Claire Moulis
Frédéric PERUCH
Magali Remaud-Simeon
Marlène VUILLEMIN
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Institut National De La Recherche Agronomique (Inra)
Institut National Des Sciences Appliquees De Toulouse (Insat)
Centre National De La Recherche Scientifique
Universite de Bordeaux
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Publication date
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    • C12P19/44—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
    • C12P19/60—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
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    • C08F—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED BY REACTIONS ONLY INVOLVING CARBON-TO-CARBON UNSATURATED BONDS
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Definitions

  • the present invention relates to the field of enzymatic glycosylation of hydroxylated synthons to obtain glycosylated monomers.
  • the present invention also relates to novel chemo-enzymatic glyco (co) polymer synthesis pathways based on chemical polymerization or on a chemical coupling reaction of glycosylated monomers obtained enzymatically.
  • Glyco (co) polymers have attracted increasing interest in recent years because of their wide potential in many biotechnology and industrial sectors.
  • carbohydrate units in synthetic macromolecules can give polymers new physicochemical properties, for example to increase their solubilities, modify their hydrophobic characteristics, and thus open the way to new industrial applications.
  • these glyco (co) polymers are of great interest in the manufacture of biomaterials for the repair of lesions, tissue engineering (Cho et al., Biomaterials, 2006 Feb; 27 (4): 576- 85. Epub 2005 Aug 8), the vectorization of active principles (Ahmes and Narain, Biomaterials 201 1 Aug, 32 (22): 5279-90), or to modify and make a hydrophobic surface biocompatible.
  • glyco (co) polymers are of particular interest in the field of biological diagnosis (Abraham et al., Biomaterials, 2005 Aug; 26 (23): 4767-78), as a support for covalent coupling of biomolecules, or as multivalent architectures favoring recognition processes with certain proteins (Spain et al., Polym Chem, 2011,2, 60-68, Vasquez-Dorbatt et al., Chembiochem 2012 Nov 26; 13 (17): 2478-87 ).
  • hybrid glycopolymers differing from natural polysaccharides, and formed of a synthetic part, of (meth) acrylate, (meth) acrylamide, styrene, norbornenyl, vinyl acetate, peptide, .. and a carbohydrate moiety.
  • the reactive functions carried by the polymer must be removed from the polymer backbone in order to increase the reactivity while decreasing the steric hindrance generated by the grafting of the pendant saccharide sequences.
  • glycomonomers In general, the synthesis of glycomonomers is often very painful, requiring time-consuming steps of protection and deprotection as well as the use of metal catalysts or toxic solvents. In addition, the diversity of saccharide structures accessible by these routes is still limited. Finally, in some cases, Mixtures of undesirable structures are obtained and make it difficult to control the polymerization reaction and subsequently the structure and properties of the polymers.
  • HEMA glucosylated 2- (hydroxy) ethyl methacrylate
  • MEGlc 2-methacryloyloxyethyl- ⁇ -D-glucopyranoside
  • Kitazawa Korean et al., Chem Lett, 1990, 19, No. 9, 1733-1736
  • glucose donor such as methylglucoside
  • phosphomolybdic acid as a catalyst
  • 2,4-dinitrochlorobenzene as inhibitor
  • Nakaya Nakaya et al., Makromol Chem., Rapid Commun, 1993, 14, 77-83 synthesized another glucopolymer in 1993 by reacting HEMA with 2,3-bromide. 4,6-tetra-O-acetyl- ⁇ -D-glucopyranose in the presence of silver oxide or mercury cyanide, according to the method of Helferich (Helferich and Weis, Chem., Ber., 1956, 89, 314-321) .
  • the enzymatic processes are very favorably positioned because of the specificity and selectivity of the action of the enzymes to circumvent the difficulties of chemical synthesis and to propose an "eco-compatible" alternative, decreasing not only the use harmful products (metal catalysts, organic solvents) but also the costs and production times of the glycosylated monomers.
  • Kobayashi described the use of ⁇ -galactosidase with 4-nitrophenyl N-acetyl- ⁇ -Dglucosaminide and lactose as substrates for p-Nitrophenyl N-acetyl- ⁇ -lactosaminide (Kobayashi et al., J Carbohydr Chem, 1994, 13, 753-766). This enzymatic step is followed by a reduction of the nitro function in amine function to then hook an acrylate function.
  • lipases were used for the esterification of various sugars with (meth) acrylates, but with limited yields and selectivities (Albertin et al, Macromolecules, 2004, 37 (20), pp 7530-7537 Miura et al., Polym Poli Part A-Polym Chem, 2004, 42, 4598-4606, Park et al., J Biomed Mater Res A. 2004 Dec 1; 71 (3): 497-507; Kulshrestha et al, ACS; Symp Ser, 2005, 900, pp. 327-342, Tsukamoto et al., J Chem Technol Biotechnol, 2008, 83, 1486-1492).
  • the present invention provides a method of manufacturing a glycosylated synthon, or monomer, comprising at least one step of bringing at least one glycan-saccharase into contact with at least one hydroxylated synthon and at least one sucrose, wherein :
  • R1 represents a hydrogen atom or a C1-C3 alkyl
  • R 2 represents a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) n , where n is an integer of 1 to 10;
  • Xi represents - (O) -, - (NH) -, - (S) - or - (NR ' 2 (OH)) -, preferably - (O) -, - (NH) -, or - (NR' 2 (OH)) -, with R '2 is an alkylene group Ci-C 2 o; or a group - (C 2 H 4 O) m -, with m being an integer of 1 to 10;
  • R 3 represents a covalent bond; alkylene Ci-C 2 o; or a group (C 2 H 4 O) n , where n is an integer of 1 to 10;
  • R 4 represents a covalent bond; alkylene Ci-C 2 o; or a group (C 2 H 4 O) n , where n is an integer of 1 to 10;
  • R 5 represents a covalent bond; alkylene Ci-C 2 o; or a group (C 2 H 4 O) m , with m being an integer of 1 to 10;
  • n an integer from 1 to 20;
  • X 2 represents - (O) -, - (NH) - or - (S) -;
  • R O represents hydrogen or an alkyl group Ci-C 2 o
  • R 7 represents a C 1 -C 20 alkylene group
  • the hydroxylated synthon is chosen from the group consisting of:
  • R 1 represents a hydrogen atom or a C 1 -C 3 alkyl
  • R 2 represents a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) n , where n is an integer of 1 to 10;
  • Xi represents - (O) -, - (NH) -, - (S) - or - (NR ' 2 (OH)) -, preferably - (O) -, - (NH) -, or - (NR' 2 (OH)) -, with R '2 is an alkylene group Ci-C 2 o; or a group - (C 2 H 4 O) m -, with m being an integer of 1 to 10; (ii) styrenic synthons of formula (II):
  • R 3 represents a covalent bond; a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) N , where n is an integer of 1 to 10;
  • R 4 represents a covalent bond; a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) N , where n is an integer of 1 to 10;
  • R 5 represents a covalent bond; a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) M , with m being an integer between 1 and 10;
  • n an integer from 1 to 20;
  • X 2 represents - (O) -, - (NH) - or - (S) -;
  • R O represents hydrogen or an alkyl group C 1 -C 2 0;
  • the glycan-sucrase is chosen from the group comprising:
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 mutated once at any of the positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 and R446 which can be chosen from:
  • R226Xi said sequence having an amino acid X1 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W and Y.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 ASNP I228X 2
  • said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X 3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G , H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394X "), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, G , H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y; and
  • R.446X 9 said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S , T, V, W and Y.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 mutated once at any of the R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 and R446 positions may be chosen from: a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of C, H, K, M, N, Q, S, T and V;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of H, L, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W and Y, in particular of C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W and Y, and more preferably of M and Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , M, N, P, Q, S, T, V and W and more particularly selected from the group consisting of F, M, N, P, Q, S and T;
  • SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V and W, more preferably A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V and W, in particular A, C, I, L, V, S, T and W;
  • SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V and Y, in particular A and C, more preferably A;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W and Y, more preferably C, D, E, F, G, N, R, S, T, W and Y , in particular E, T and W;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394X "), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, E, F, G, H I, K and L, especially A and E; a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, G, K, L, M, N, and S, especially A, N, and M.
  • the hydroxylated synthon used is more particularly chosen from the group consisting of HEMA, NHAM, HEAA, VP, VBA, HMNCA, AHMCL, MVL, BME. , allyl alcohol and NNHEA.
  • HEMA high-tension polymer
  • NHAM high-tension polymer
  • HEAA high-tension polymer
  • allyl alcohol e.g., ethylene glycol
  • NNHEA e.g., ethylene glycol
  • BME e.g., ethylene glycol
  • a hydroxylated synthon according to the invention implemented in an enzymatic glycosylation process of the invention is glucosylated or fructosylated at the end of this process, preferably glucosylated.
  • the subject of the invention is also a process for the manufacture of a glyco (co) polymer comprising the polymerization of at least 2 monomers obtained, independently, at the end of the enzymatic glycosylation process according to the invention.
  • the method of manufacturing a glyco (co) polymer according to the invention comprises, in order, the following steps:
  • the method of manufacturing a (co) polymer glyco according to this embodiment may furthermore comprise, independently:
  • the subject of the invention is also a process for producing a glyco (co) polymer, preferably in block form, comprising the coupling of at least 2 monomers obtained, independently, at the end of the enzymatic glycosylation process according to US Pat. invention, preferably monomers obtained from the synthons of formula (V) and / or (VI) according to the invention.
  • alkyl a linear or branched saturated hydrocarbon aliphatic group comprising from 1 to 20, especially from 1 to 10, preferably from 1 to 6 carbon atoms;
  • alkylene a linear or branched divalent alkylene group comprising from 1 to
  • glycoside units are known to those skilled in the art.
  • a glycoside unit according to the invention is chosen from one or more glucose (s), one or more fructose (s) or a mixture of glucose. (s) and fructose (s).
  • the inventors have developed an enzymatic method for the glycosylation of hydroxylated synthons using specific glucan-saccharases identified by the applicant, capable of effecting such glycosylation, in particular glucosylation or fructosylation.
  • glycosylated synthons, or monomers are advantageously used in a chemical process for preparing glyco (co) polymers of controlled structures and functionalities.
  • the inventors have developed a method for the chemo-enzymatic synthesis of glyco (co) polymers based on chemical polymerization or a coupling reaction of glycosylated monomers obtained enzymatically.
  • the methods according to the present invention advantageously make it possible to better control the degrees of glycosylation of the synthons and the structures as well as their distribution.
  • these methods advantageously provide access to a greater diversity of macro-molecular architectures for different fields of application, such as biomaterials, implant equipment, tissue engineering, biological diagnosis and principles delivery. assets.
  • the present invention relates in the first place to a process for manufacturing a glycosylated synthon, or monomer, comprising at least one step of placing at least one glycan-saccharase of the invention in contact with at least one hydroxylated synthon according to the invention. invention and at least one sucrose.
  • the enzymes of the invention are advantageously able to glycosylate synthons at their hydroxyl function.
  • the enzymes according to the invention are capable of glucosylating or fructosylating the synthons of the invention.
  • glycansucrase is chosen from the group consisting of glycoside hydrolases belonging to families 13, 68 and 70 of glycoside hydrolases (GH13, GH68 and GH70).
  • glycoside hydrolases belonging to the 13 family are naturally occurring amylosaccharases produced by the bacteria of the Deinococcus, Neisseria or Alteromonas genera.
  • glycoside hydrolases belonging to the 70 family are in turn glucan saccharases naturally produced by lactic acid bacteria of the genera Leuconostoc, Lactobacillus, Streptococcus or Weissela sp.
  • Bacillus subtilis fructosyltransferase is also used in a glycosylation process according to the invention and belongs to the 68 family of glycoside hydrolases.
  • the enzymes of the invention are all capable of transferring glucose or fructose from sucrose to the hydroxylated synthons of the invention.
  • the nucleotide sequence of the wild-type form of the ASNp (Neisseria polysaccharea amylosucrose) (GH13 family) gene is GenBank LA11781.1, while its polypeptide sequence is Uniprot Q9ZEU2 (SEQ ID NO: 1).
  • the nucleotide sequence of the wild form of the DSR-S enzyme (derived from the strain Leuconostoc mesenteroides B-512F) is GenBank reference 109598.
  • the nucleotide sequence of the wild form of the DSR-E enzyme (from Leuconostoc mesenteroides strain NRRL B-1299) is GenBank AJ430204.1 and reference Uniprot Q8G9Q2.
  • the enzyme GBD-CD2 (sequence SEQ ID NO: 13) is a truncated form of the aforementioned DSR-E enzyme as described in Brison et al., J. Biol. Chem., 2012, 287, 7915-24.
  • an enzyme according to the invention can be synthesized by conventional methods of synthetic chemistry, or homogeneous chemical syntheses in solution or in solid phase.
  • those skilled in the art can use the polypeptide synthesis techniques in solution described by HOUBEN WEIL (1974, In the method of Organizational Chemistry, E. Wunsh ed., Volume 15-1 and 15-11, Thieme , Stuttgart.).
  • An enzyme according to the invention may also be chemically synthesized in the liquid or solid phase by successive couplings of the different amino acid residues (from the N-terminal end to the C-terminal end in the liquid phase, or from the C-terminus towards the N-terminus in solid phase).
  • an enzyme according to the invention can be synthesized by genetic recombination, for example according to a production method comprising the following steps:
  • step (b) transfecting a host cell with the recombinant vector obtained in step (a);
  • step b) culturing the host cell transfected in step b) in a suitable culture medium
  • glycan-saccharase used in a process of the invention are chosen from a group comprising:
  • the mutation of a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 in position R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 or R446 is a mutation. by substitution.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position R226, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid X1 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W and Y.
  • X 1 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of C, H, K, M, N, Q, S, T and V.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position 1228, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P , Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 2 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of H, L, T, V, W and Y.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position F229, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P , Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 3 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W and Y, in particular of C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W and Y, and more preferably of M and Y.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position A289, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an X amino acid 4 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 4 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, M, NP, Q, S, T, V and W, and more particularly chosen from the group consisting of of F, M, N, P, Q, S and T.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position F290, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F29OX 5 ), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 5 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V and W, more preferably A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V and W, in particular A, C, I, L, V, S, T and W.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position 1330, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N , P, Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 6 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V and Y, in particular A and C, more preferably A.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position V331, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of a, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M , N, P, Q, R, S, T, W and Y.
  • X 7 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W and Y, more preferably C, D, E, F, G, N, R, S, T, W and Y, in particular E, T and W;
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position D394, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P , Q, R, S, T, V, W and Y.
  • X 8 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of A, E, F, G, H, I, K and L, particularly A and E.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 when mutated once at position R446, it is chosen from a sequence having at least 80% identity with the SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N , Q, S, T, V, W and Y.
  • X 9 preferably represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, G, K, L, M, N, and S, especially A, N, and M.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 mutated once at any one of the positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 and R446 is selected from any one of SEQ ID NO: 2 to 10 defined above.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 mutated once at any of the positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 and R446 is selected from:
  • R226Xi said sequence having an amino acid X1 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W and Y.
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y; - a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y; and
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W and Y.
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 mutated once at any of the positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 and R446 is selected from:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of C, H, K, M, N, Q, S, T and V;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP H28X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of H, L, T, V, W and Y;
  • F229X3 said X3 amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W and Y, especially C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W and Y, and more preferably M and Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , M, NP, Q, S, T, V and W, and more particularly selected from the group consisting of F, M, N, P, Q, S and T;
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V and W, more preferably A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V and W, in particular A, C, I, L, V, S, T and W; a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V and Y, in particular A and C, more preferably A;
  • V331X 7 said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W and Y, more preferably C, D, E, G, F, N, R, S, T, W and Y, in particular E, T and W;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, E, F, G, H, I, K and L, in particular A and E;
  • sequence having an amino acid X9 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, G, K , L, M, N, and S, especially A, N, and M.
  • all the enzymes possessing one of these peptide sequences have a capacity that is statistically greater or even much greater than that of the wild-type enzyme to glucosylate the hydroxylated synthons of the invention.
  • hydroxylated synthon used in a process of the invention is HEMA
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain only mono-glucosylated HEMA, such as, for example, a sequence enzyme having at least 80 % identity with SEQ ID NO: 13 (ANi 23 -GBD-CD2).
  • hydroxylated synthon used in a process of the invention is HEMA
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain only mono-glucosylated HEMA and di-glucosylated HEMA, such as, for example, selected enzymes in the group:
  • FH9X3 said sequence having an amino acid X3 representing W; a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing A;
  • hydroxylated synthon used in a process of the invention is HEMA
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain a mixture of mono-glucosylated, di-glucosylated and triglucosylated HEMA, such as, for example the enzymes selected in the group:
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, I, K, L, M and V;
  • enzymes selected from the group:
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing A;
  • hydroxylated synthon used in a process of the invention is NHAM
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain only mono-glucosylated NHAMs, such as, for example, the enzymes chosen from the group:
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain only mono-glucosyl NHAMs and di-glucosylated NHAMs, such as, for example, selected enzymes in the group:
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of N, P and Q;
  • SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing N;
  • hydroxylated synthon used in a process of the invention is NHAM
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain a mixture of mono-glucosylated, di-glucosylated and tri-glucosylated NHAMs, such as, for example the enzymes selected in the group:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D and E;
  • hydroxylated synthon used in a method of the invention is NNHEA
  • certain enzymes advantageously make it possible to obtain only mono-glucosyl NNHEAs, such as, for example, the enzymes chosen from the group:
  • NNHEA hydroxylated synthon used in a process of the invention
  • other enzymes also make it possible to advantageously obtain only mono-glucosyl NNHEAs, namely:
  • SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 Q represents; a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of C, L and V representative; and
  • the present invention also encompasses sequences having an amino acid sequence of at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% of amino acid identity with one of SEQ ID NO: 1 to 18 such as previously defined and a biological activity of the same nature.
  • the "percentage of identity" between two nucleic acid or amino acid sequences is determined by comparing the two optimally aligned sequences, through a comparison window.
  • the part of the nucleotide sequence in the comparison window may thus comprise additions or deletions (for example "gaps") with respect to the reference sequence (which does not include these additions or deletions) so as to obtain a optimal alignment between the two sequences.
  • the percent identity is calculated by determining the number of positions at which an identical nucleotide base (or identical amino acid) is observed for the two compared sequences, and then dividing the number of positions at which there is identity between the two nucleic bases. (or between the two amino acids) by the total number of positions in the comparison window, then multiplying the result by one hundred in order to obtain the percentage of nucleotide (or amino acid) identity of the two sequences between them.
  • the optimal alignment of the sequences for the comparison can be performed in a computer manner using known algorithms.
  • the present invention also relates to sequences whose amino acid sequence has 100% amino acid identity with amino acids 225 to 450 of SEQ ID NO: 2 to 10 and at least 80%, 81%. 82% 83% 84% 85% 86% 87% 88% 89% 90% 91% 92% 93% 94% 95% 96% 97% 98 %, 99% or 100% of amino acid identity with the rest of the sequences SEQ ID NO: 2 to 10 as defined above, and a biological activity of the same kind.
  • the enzymes according to the invention make it possible to produce glycosylated or monomeric synthons which can be mono- or poly-glycosylated.
  • hydroxylated synthons specifically used in an enzymatic process for the manufacture of monomers of the invention are chosen from the compounds of formulas (I) to (VI).
  • the hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (I): (i) (meth) acrylate / (meth) acrylamide synthons of formula (I):
  • R 1 represents a hydrogen atom or a C 1 -C 3 alkyl
  • R 2 represents a C 1 -C 20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 O) n , where n is an integer of 1 to 10;
  • Xi represents - (O) -, - (NH) -, - (S) - or - (NR ' 2 (OH)) -, preferably - (O) -, - (NH) -, or - (NR' 2 (OH)) -, with R ' 2 representing a C 1 -C 20 alkylene group; or a group - (C 2 H 4 O) m -, with m being an integer of 1 to 10;
  • R 1 represents a hydrogen atom. According to another embodiment, R 1 represents a C 1 -C 3 alkyl, preferably a methyl.
  • R 2 is alkylene C 1 -C 20, especially C 1 -C 10, in particular Ci-C 5. More particularly, R 2 may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, and is preferably methylene or ethylene.
  • X 1 represents - (O) -, - (NH) - or - (NR ' 2 (OH)), preferably - (O) - or - (NH) -.
  • R '2 is alkylene C 1 -C 20, especially C 1 -C 10, in particular Ci-C 5. More particularly, R ' 2 may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, and is preferably methylene or ethylene.
  • a synthon of formula (I) of the invention is such that:
  • R 1 represents a hydrogen atom or a C 1 -C 3 alkyl, preferably a hydrogen or a methyl
  • R 2 represents an alkyl group C 1 -C 20, preferably a C 10 -C alkylene, in particular C 1 -C 5, more particularly a methylene or ethylene;
  • Xi represents - (O) -, - (NH) - or - (NR ' 2 (OH)) -, preferably - (O) - or - (NH) -.
  • a synthon of formula (I) of the invention is such that:
  • Xi represents - (O) -
  • R 1 represents a hydrogen atom or a C 1 -C 3 alkyl, preferably a C 1 -C 3 alkyl, in particular a methyl;
  • R 2 represents a C 1 -C 20 alkyl group, preferably a C 1 -C 10 , in particular C 1 -C 5 , alkylene, more particularly a methylene or an ethylene, preferentially an ethylene.
  • Such a synthon of formula (I) may in particular be a 2- (hydroxy) ethyl methacrylate (HEMA):
  • a synthon of formula (I) of the invention is such that:
  • Xi represents - (NH) -
  • R 1 represents a hydrogen atom or a C 1 -C 3 alkyl, preferably a hydrogen or a methyl
  • R 2 represents a C 1 -C 20 alkyl group, preferably a C 1 -C 10 , in particular C 1 -C 5 , alkylene, more particularly a methylene or an ethylene.
  • Such a synthon of formula (I) may in particular be an N- (hydroxy) methyl acrylamide (NHAM) or an N- (hydroxy) ethyl acrylamide (HEAA):
  • a synthon of formula (I) of the invention is such that:
  • Xi is - (NR '2 (OH)) -, wherein R' 2 represents an alkylene group Ci-C 2 o, in particular C 1 -C 10, in particular to C 5, more particularly a methylene, an ethylene, a propylene, a butylene or a pentylene, preferably a methylene or an ethylene, more preferably an ethylene;
  • Ri represents a hydrogen atom
  • R 2 represents an alkyl group Ci-C 2 o, preferably Cl- Cio alkylene, in particular C 1 -C 5, more particularly a methylene or ethylene, in particular ethylene.
  • Such a synthon of formula (I) may in particular be an N, N-bis (2-hydroxyethyl) acrylamide (NNHEA):
  • a synthon of the invention of formula (I) is chosen from 2- (hydroxy) ethylmethacrylate (HEMA), N- (hydroxy) methyl acrylamide (NHAM), N- (hydroxy) ethylacrylamide (HEAA) and N, N-bis (2-hydroxyethyl) acrylamide (NNHEA), preferably from HEMA, NHAM and HEAA.
  • the hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (II):
  • R 3 represents a covalent bond; a C1-C20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 0) n, with n being an integer between 1 and 10.
  • R 3 represents a covalent bond or an alkylene group
  • Such an alkylene group may in particular be C1-C10, especially C1-C5. More particularly, R 3 may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, and is preferably methylene or ethylene.
  • R 3 represents a covalent bond, a methylene or an ethylene.
  • a synthon of formula (II) can in particular be a 4-vinylphenol (VP) or a 4-vinyl benzyl alcohol (VBA):
  • hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (III):
  • R 4 represents a covalent bond; a C1-C20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 0) n, with n being an integer between 1 and 10.
  • R4 represents a C1-C20 alkylene, in particular C1-C10, especially C1-C5, alkylene group.
  • R4 may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, and is preferably methylene or ethylene, more particularly methylene.
  • a synthon of formula (III) may in particular be a 4- (hydroxy) methyl oxazolidine-2,5-dione (HMNCA):
  • hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (IV):
  • R 5 represents a covalent bond; a C1-C20 alkylene group; or a group (C 2 H 4 0) m, with m being an integer between 1 and 10;
  • n an integer from 1 to 20;
  • X 2 represents - (O) -, - (NH) - or - (S) -;
  • R O represents hydrogen, alkyl C1 -C20.
  • X 2 represents - (O) -.
  • n is between 1 and 10, in particular between 1 and
  • n is in particular chosen from 1, 2, 3, 4 and 5, and preferably represents the value 1 or 2.
  • R 5 represents a covalent bond or a C 1 -C 10 alkylene group, in particular a C 1 -C 5 alkylene group.
  • the alkylene group may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, preferably methylene or ethylene, more particularly methylene. .
  • R 5 represents a covalent bond or methylene.
  • R 5 represents a hydrogen or a C 1 -C 10 alkyl group, in particular a C 1 -C 5 alkyl group.
  • the alkyl group can be chosen from the group consisting of a methyl, an ethyl, a propyl, a butyl and a pentyl, preferably a methyl or an ethyl, more particularly a methyl .
  • Re represents hydrogen or methyl
  • a compound of formula (IV) is such that:
  • R 5 represents a C 1 -C 10 alkylene group, especially a C 1 -C 5 alkylene group, and is in particular a methylene;
  • n represents an integer from 1 to 5; and preferably represents the value 1 or 2, in particular the value 2;
  • X 2 represents - (O) -
  • R D represents hydrogen
  • Such a synthon of formula (IV) may in particular - (hydroxy) methyl caprolactone (AHMCL):
  • a compound of formula (IV) is such that:
  • R5 represents a covalent bond
  • n represents an integer from 1 to 5; and preferably represents the value 1 or 2, in particular the value 1;
  • X 2 represents - (O) -
  • R represents a C 1 -C 10 alkyl group, in particular a C 1 -C 5 alkyl group, and is in particular methyl.
  • Such a synthon of formula (IV) may in particular be a ( ⁇ ) - mevalonolactone
  • a synthon of the invention of formula (IV) is chosen from ⁇ - (hydroxy) methyl caprolactone (AHMCL) and i-mevalonolactone (MVL).
  • hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (V):
  • R 7 represents a C 1 -C 20 alkylene group.
  • R 7 represents a C 1 -C 10 alkylene group, especially a C 1 -C 5 alkylene group. More particularly, R 7 may be selected from the group consisting of methylene, ethylene, propylene, butylene and pentylene, preferably methylene or ethylene, more particularly ethylene.
  • Such a synthon of formula (V) may in particular be a 2-mercaptoethanol (BME):
  • hydroxylated synthons of the invention may be compounds of formula (VI):
  • Rs is alkylene C 1 -C 10, especially C 1 -C 5. More particularly, R 8 may be selected from the group consisting of methylene, an ethylene, a propylene, a butylene and a pentylene, preferably a methylene n ethylene, more particularly a methylene.
  • a synthon of the invention may be selected from the group consisting of 2 (hydroxy) ethylmethacrylate (HEMA), N- (hydroxy) methyl acrylamide (NHAM), N- (hydroxy) ethylacrylamide (HEAA ), 4-vinylphenol (VP),
  • VBA 4-vinyl benzyl alcohol
  • HNCA 4- (hydroxy) methyl oxazolidine-2,5-dione
  • HMCL ⁇ - (hydroxy) methyl caprolactone
  • MVL ⁇ - mevalonolactone
  • NHEA N, N-bis (2-hydroxyethyl) acrylamide
  • a synthon according to the invention is in particular chosen from the group consisting of
  • HEMA hydroxyethylmethacrylate
  • NHAM N- (hydroxy) methyl acrylamide
  • HEAA N- (hydroxy) ethylacrylamide
  • VBA 4-vinyl benzyl alcohol
  • the enzymatic glycosylation of the hydroxylated and in particular monohydroxylated synthons of the invention is in the presence of sucrose.
  • glycosylated synthons and “monomers” are used interchangeably to designate the glycosylated synthons obtained from the enzymatic process according to the invention for the glycosylation of hydroxylated synthons.
  • the synthons of the invention are more particularly glucosylated or fructosylated during the enzymatic glycosylation process according to the invention.
  • the process according to the invention for manufacturing a glycosylated synthon, or monomer, of the invention may in particular be implemented under the conditions set forth in Example 1, point 1.3 below.
  • the monomers of the invention may be mono- or multi-glycosylated, as illustrated in the examples of the present application.
  • the enzyme can advantageously be inactivated. This inactivation may, for illustrative purposes, be carried out by thermal inactivation, for example at a temperature greater than 60 ° C., in particular greater than 80 ° C., preferably greater than 90 ° C.
  • the reaction medium containing the glycosylated synthons according to the invention is concentrated by lyophilization, in particular in anticipation of a subsequent purification step.
  • reaction medium containing the glycosylated synthons according to the invention is not concentrated by freeze-drying.
  • the glycosylated synthons according to the invention are purified after their preparation.
  • This purification step when it is carried out, can take place after a step of inactivation of the enzyme used and / or after a lyophilization step.
  • a purification step occurs after a step of inactivation of the enzyme, in the absence of a lyophilization step.
  • This purification step may advantageously also comprise a liquid / liquid extraction step in order to eliminate the residual synthon.
  • the glucan-saccharase used can advantageously be chosen from the group comprising:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, N, P, S and T, preferably C;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of P, T and V, preferably T;
  • F229X 3 said sequence having an amino acid X3 representing W; - a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 is H, I, K, L, M and W, preferably H and L;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, H, I, K, L, M, N, P, Q, V and W, preferably A, C, I, K, L, M, P and V, in particular A, C, I, K, L, M and V, and in particular A, C, I, L and V;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, especially C, D, E, G, H, and especially E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394X 8), said sequence having an amino acid representing Xs A, C, E, G, H, I, L, M and N, in particular A;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M and N, preferably C, G, K, L and N, especially N;
  • SEQ ID NO: 17 ASR-C-del-bis
  • SEQ ID NO: 18 Bacillus substrilis fructosyltransferase
  • the glucansucrase used in a method of the invention may be chosen from the group comprising:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of C, E, L, M, N, P, Q, R, T, V and Y;
  • F229X3 said X3 amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of A, C, I, L, M, N, P, Q, V, W and Y, preferably M;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F G, H, I, L, M, N, P, Q, S, T and V, preferably N, P, Q, S, and V, especially N, P and Q;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, G, L, M, N, P, Q, V, W and Y;
  • SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, M, N and V, preferably N;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, R, S, T and Y, preferably C, D, E, N, and T, especially E; a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of C, E, G and N, preferably E;
  • sequence having an amino acid X9 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, F, G, K L, M, N, Q, S, T and Y;
  • SEQ ID NO: 18 Bacillus subtilis fructosyltransferase
  • a process for producing a glycosylated synthon, or monomer comprises at least one step of placing at least one glycan-saccharase with at least 2-mercaptoethanol (BME) as a synthon hydroxyl and at least one sucrose, wherein the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 (ASNP WT); a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, E, F, H, L, M, N, Q, R, V, W and Y, preferably L, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X 3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, I, L, M , P, Q, R, V, W and Y, preferably C, M, P, Q, V, W and Y, in particular C, M, P, V and Y, especially Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , G, H, I, M, N, P, Q, R, S, T, V and W, preferably C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V and W , and especially F, M, N, P, Q, S and T;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably A, C, D, E, G, I, M, P, Q, S, T, V and W, especially D, Q, S, T and W, and especially S, T and W;
  • sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, N, Q, S, T, V and W, preferably Q and V;
  • V331X 7 said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W and Y, preferably A, C, D, E, F, G, H, I, N, Q, R, S, T, W and Y, in particular C, D, E, F, N, R, S, T, W and Y, and especially E, T, and W;
  • said Xs amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of A, E and S, preferably E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X 9 ), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, Q, S and T, preferably S;
  • a process for producing a glycosylated synthon, or monomer comprises at least one step of placing at least one glycan-saccharase with at least one propen-1-ol (allylic alcohol) at least one as hydroxylated synthon and at least one sucrose, wherein the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • R226Xi said sequence having an amino acid X1 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of D, E, F, G, H, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably H;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably D, E, G, H, I, K and M, in particular D, E, G, I, K and M;
  • SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an X amino acid 4 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, P , Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, I, K, L, MW and Y;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, G, H, I, K, L, M and W, in particular C and H; a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, K, L, M, S and Y, especially C;
  • V331X 7 said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, I, K, L, N and W;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably E, F, G, H, I, K and L, in particular E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, S, T, V, W and Y, preferably M;
  • SEQ ID NO: 18 Bacillus subtilis fructosyltransferase
  • a process for manufacturing a glycosylated synthon, or monomer comprises at least one step of placing at least one glycan-saccharase with at least one VBA as a hydroxylated synthon and at least one sucrose, wherein the glycan-sucrase is selected from the group consisting of
  • WT a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of H, K, M, N, Q, S, T, V and Y, in particular H, K, M, N, Q, S, T and V, preferably H, K, M, N, Q, T and V;
  • I228X 2 said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of V;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of M, N, P, Q S, T and V, preferably M, N, P, Q, S and T, and especially P, Q and S;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of V and W;
  • V331X 7 said X 7 amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of C, D, G, S, T and Y, preferably C, G, S, T and Y;
  • a process for producing a glycosylated synthon, or monomer comprises at least one step of placing at least one glycan-saccharase with at least one NNHEA as a hydroxylated synthon and at least one sucrose, wherein the glycan-sucrase is selected from the group consisting of
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 (ASNP WT), a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, D, E, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, H, L, M, N, P, Q, S, T, V, W and Y, preferably V;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of C, I, L, M, N, Q, R, V, W and Y, preferably M;
  • SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an X amino acid 4 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N , P, Q, R, S, T, V and W, preferably C, G, M, N, Q, S, T and V, in particular Q;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably A, C, G, I, K, L, M, Q, S, T, V and W, especially C, L, V and W;
  • sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of C, K, M, Q, T, V and Y, preferably V;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, W and Y, preferably D, E, G, N, S, T and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T and Y;
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 12 may also be used in a glycosylated synthon production method according to the invention when NNHEA is the hydroxylated synthon to be glycosylated, especially to glucosylate.
  • a process for producing a glycosylated synthon, or monomer comprises at least one step of bringing at least one glycan-sucrase into contact with at least HEAA as a hydroxylated synthon and at least one sucrose, wherein the glycan-sucrase is selected from the group consisting of
  • SEQ ID NO: 18 Bacillus subtilis fructosyltransferase
  • the present invention more preferably relates to a process for manufacturing a glycosylated synthon, or monomer, comprising at least one step of placing at least one glycan-saccharase in contact with at least one hydroxylated synthon and at least one sucrose, in which :
  • glycosylated synthon is HEMA and the glycansucrase used is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, N, P, S and T, preferably C;
  • a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of P, T and V, preferably T;
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 is H, I, K, L, M and W, preferably H and L;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, H, I, K, L, M, N, P, Q, V and W, preferably A, C, I, K, L, M, P and V, in particular A, C, I, K, L, M and V, and in particular A, C, I, L and V;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, especially C, D, E, G, H, and especially E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394X 8), said sequence having an amino acid representing Xs A, C, E, G, H, I, L, M and N, in particular A;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X 9 ), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E , F, G, H, I, K, L, M and N, preferably C, G, K, L and N, especially N;
  • GBD-CD2 a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 14
  • the hydroxylated synthon is NHAM and the glucan-saccharase used in a method of the invention is chosen from the group comprising:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of C, E, L, M, N, P, Q, R, T, V and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, I, L, M, N, P, Q, V, W and Y, preferably M;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F G, H, I, L, M, N, P, Q, S, T and V, preferably N, P, Q, S, and V, especially N, P and Q;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, G, L, M, N, P, Q, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, M, N and V, preferably N; - a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, R, S, T and Y, preferably C, D, E, N, and T, especially E;
  • D394Xs said Xs amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of C, E, G and N, preferably E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T and Y;
  • the glycosylated synthon is 2-mercaptoethanol (BME) and the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 1 (ASNP WT); a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, E, F, H, L, M, N, Q, R, V, W and Y, preferably L, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X 3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, I, L, M , P, Q, R, V, W and Y, preferably C, M, P, Q, V, W and Y, in particular C, M, P, V and Y, especially Y;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , G, H, I, M, N, P, Q, R, S, T, V and W, preferably C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V and W , and especially F, M, N, P, Q, S and T;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably A, C, D, E, G, I, M, P, Q, S, T, V and W, especially D, Q, S, T and W, and especially S, T and W;
  • sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, N, Q, S, T, V and W, preferably Q and V;
  • V331X 7 said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W and Y, preferably A, C, D, E, F, G, H, I, N, Q, R, S, T, W and Y, in particular C, D, E, F, N, R, S, T, W and Y, and especially E, T, and W;
  • said Xs amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of A, E and S, preferably E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X 9 ), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, Q, S and T, preferably S;
  • the hydroxylated synthon is propen-1-ol (allyl alcohol) and the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of D, E, F, G, H, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably H;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably D, E, G, H, I, K and M, in particular D, E, G, I, K and M;
  • sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F , G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, I, K, L, MW and Y;
  • SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, G, H, I, K, L, M and W, especially C and H;
  • sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, K, L, M, S and Y, especially C; - a sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 8 (ASNP V331X 7), said sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W and Y, preferably C, D, E, F, G, H, I, K, L, N and W;
  • D394Xs said Xs amino acid sequence being an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably E, F, G, H, I, K and L, in particular E;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R.446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, S, T, V, W and Y, preferably M;
  • the glycosylated synthon is VBA and the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of H, K, M, N, Q, S, T, V and Y, in particular H, K, M, N, Q, S, T and V, preferably H, K, M, N, Q, T and V;
  • sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of V; - a sequence having at least 80% identity with the sequence SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 represents an amino acid selected from the group consisting of M, N, P, Q S, T and V, preferably M, N, P, Q, S and T, and especially P, Q and S;
  • SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of V and W;
  • sequence having an amino acid X 7 represents an amino acid selected from the group consisting of C, D, G, S, T and Y, preferably C, G, S, T and Y;
  • glycosylated synthon is NNHEA and the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 2 (ASNP R226Xi), said sequence having an amino acid Xi representing an amino acid selected from the group consisting of A, D, E, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 3 (ASNP I228X 2 ), said sequence having an amino acid X 2 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, E, F, H, L, M, N, P, Q, S, T, V, W and Y, preferably V;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 4 (ASNP F229X3), said sequence having an amino acid X3 representing an amino acid selected from the group consisting of C, I, L, M, N, Q, R, V, W and Y, preferably M;
  • SEQ ID NO: 5 (ASNP A289X 4), said sequence having an amino acid X 4 representing a amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V and W, preferably C, G, M, N, Q, S, T and V, especially Q;
  • sequence SEQ ID NO: 6 (ASNP F290Xs), said sequence having an amino acid X 5 representing an amino acid selected from the group consisting of A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W and Y, preferably A, C, G, I, K, L, M, Q, S, T, V and W, especially C, L, V and W;
  • sequence SEQ ID NO: 7 (ASNP ⁇ 330 ⁇ ), said sequence having an amino acid X 6 representing an amino acid selected from the group consisting of C, K, M, Q, T, V and Y, preferably V;
  • V331X 7 said sequence having an amino X 7 acid representing an amino acid selected from the group consisting of C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, W and Y, preferably D, E, G, N, S, T and Y;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 9 (ASNP D394Xs), said sequence having an amino acid Xs representing an amino acid selected from the group consisting of E, G, R and S;
  • sequence having at least 80% identity with SEQ ID NO: 10 (ASNP R446X9), said sequence having an amino acid X9 representing an amino acid selected from the group consisting of C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T and Y;
  • glycosylated synthon is HEAA and the glycan-sucrase is selected from the group consisting of:
  • the monomers of the invention are polymerizable and / or can be coupled by coupling reaction, and can be implemented in a process for producing a glyco (co) polymer according to the invention, comprising the polymerization and / or a coupling reaction of at least two of these monomers.
  • a chemo-enzymatic process according to the invention is advantageous with regard to many aspects, such as in particular the very short reaction time allowing, within a few hours, in particular in the space of 24 hours, to pass hydroxylated synthons at glyco (co) polymers of interest.
  • the polymerization and the coupling reaction according to the invention also make it possible to access original molecular architectures, such as comb or block (co) polymers, which can be evaluated for the development of new hydrophilic balance materials. hydrophobic modulable.
  • Such a method can in particular be implemented under the conditions set forth in Example 6 below.
  • a method of manufacturing by polymerization of a glyco (co) polymer according to the invention comprises, in order, the following steps:
  • such a polymerization process may further comprise, independently:
  • step c ' after any one of the steps c), in which the monomer chain obtained at the end of the preceding step is polymerized with at least one non-glycosylated synthon.
  • a library comprising 8 wild-type enzymes (belonging to the GH70 families and 13 glycoside hydrolases) and 171 single mutants (positions 226, 228, 229, 289, 290, 330, 331, 394 and 446) constructed from the amylosucrase of Neisseria polysaccharea (ASNp) (GH13 family) were tested for their ability to glucosylate F HEMA, and NHAM.
  • ASNp Neisseria polysaccharea
  • Table 1 illustrates a number of the glucansucrases tested in the examples of the present text and specifies: column 1: the organism from which the enzyme originates; column 2: the various wild-type enzymes tested as well as the mutated positions of the active site of these wild-type enzymes in the mutated glucan-saccharases also tested; column 3: the bibliographic references in which these enzymes, both in wild and mutated forms, have been described in the state of the art.
  • the set of Escherichia coli strains, overexpressing hetero-glucan saccharases of the wild-type GH13 and GH70 families or mutants thereof (Table 1), are stored in 96-well microplate format to facilitate future steps of synthon glucosylation screening. hydroxylated.
  • precultures are in turn used to seed the "deep-well" microplates, each well containing 1 ml per well of self-inducing medium ZYM5052 containing in particular 0.2% (w / v) -lactose, 0.05% (w / v) D-glucose, 0.5% (w / v) glycerol and 0.05% (w / v) L-arabinose (Studier et al., Protein Expr Purif 2005 May, 41 (1): 207-34.).
  • the cell suspension is centrifuged for 20 min at 3000 g at 4 ° C.
  • Cell pellets are resuspended in 96-well deep-well microplates, with 300 ⁇ l of phosphate buffered saline (24 mM sodium / potassium phosphate and 274 mM NaCl) containing 0.5 g / L lysozyme and 5 mg / L Bovine pancreatic RNAse.
  • microplates are then stored overnight at -80 ° C. After thawing, the microplates are vigorously stirred and then centrifuged for 20 min at 3000 g at 4 ° C.
  • the centrifuged supernatants containing the recombinant enzymes are transferred into deep-well 96-well microplates to carry out the acceptor reactions.
  • the enzymatic activity is evaluated in microplate format end point after 30 minutes of incubation of 146 mM final sucrose by assaying reducing sugars by 3,5-dinitrosalicylic acid (DNS).
  • DNS 3,5-dinitrosalicylic acid
  • the absorbance is read at 540 nm.
  • the acceptor reactions are carried out in deep-well microplates in a volume of 300 ⁇ l, in the presence of 73 mM sucrose, 73 mM acceptor ( HEMA, NHAM, or other ...) in final concentrations and 150 of centrifuged cell lysate.
  • microplates are incubated at 30 ° C. and 700 rpm.
  • the enzymes are denatured at 95 ° C for 10 minutes.
  • microplates are stored at -20 ° C for rapid analysis of glucosylation by HPLC / MS.
  • the acceptor reactions are carried out in tubes in a volume of 1 ml, in the presence of 146 mM sucrose, 438 mM acceptor (HEMA or NHAM) in final concentrations of 1 U / mL. enzymatic activity.
  • the tubes are incubated at 30 ° C. and shaken at 500 rpm.
  • the enzymes are denatured at 95 ° C for 10 minutes, the reaction media are centrifuged, filtered, diluted and analyzed by LC / MS.
  • a first short HPLC analysis on a hypercarb column (6 minutes) is carried out to identify the presence or absence of glucosylation products.
  • the second Hypercarb or Amino HPLC analysis (30 minutes) allows separation and identification of all components of the reaction mixture.
  • the Dionex HPLC system is coupled to a mass spectrometer, single quadrupole MSQPlus, Thermo S cientific.
  • the amount of glycosylation products (in g / L) was estimated based on the response coefficient of the acceptor in UV detection.
  • Example 2 Determination of Glucosylation Efficiencies of HEMA and NHAM by the Enzymes of Example 1
  • Tables 3 and 4 show the conversion rate of sucrose and the three main glucosylation products obtained in the presence, respectively, of HEMA and NHAM in g / L, characterized by MS and respectively corresponding to the mono-glucosyl acceptor (Acceptor -Glcl), di-glucosylated (Acceptor-Glc2) and tri-glucosylated (Acceptor-Glc3). Products in smaller amounts are also detected, corresponding to tetra-, penta-, hexa- and heptaglucosylated forms.
  • the structure of the di- and tri-glucosylated products may differ depending on the specificity of the enzyme and the structure of the products can not be determined without ambiguity only by NMR analysis.
  • ASR synthesizes a significantly higher level of glucosylated HEMA (21 g / L). With ASR, the products formed are distributed in equivalent proportions between the mono-, di- and tri-glucosylated forms of HEMA.
  • GBD-CD2 enzyme leads only to mono-glucosyl HEMA.
  • this enzyme advantageously makes it possible to obtain only mono-glucosyl HEMA.
  • Glucosylated NHAM with levels of the order of 2 g / L.
  • HEMA and NHAM were then assayed as an acceptor reaction using Neisseria polysaccharea amylosucrase (ASNP) and its library of mono-mutants identified in Table 1.
  • ASNP Neisseria polysaccharea amylosucrase
  • glucosylation reactions carried out in the presence of acceptor were analyzed initially using a short HPLC method (6 min) in order to quickly identify the enzymes effective in glucosylation of the acceptor.
  • the ASNp wild-type enzyme as well as 69 mono-mutated enzymes were found to be able to glucosylate HEMA, as shown in Table 5.
  • 25 mutants appeared to glucosylate HEMA more efficiently than the parental wild-type enzyme, namely R226C, I228T, F229W, A289H, A289L, F290A, F290C, F290I, F290K, F290L, F290M, F290P, F290V, I330A, V331C.
  • the wild-type ASNp enzyme as well as 103 mono-mutated enzymes were found to be able to glucosylate NHAM, as shown in Table 6.
  • 13 mutants appeared to glucosylate NHAM at least as efficiently as the parental wild-type enzyme, namely F229M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289V, I330N, V331C, V331D, V331E, V331N, V331T and D394E.
  • Example 3 Following the screening, a number of mutants tested in Example 3 were analyzed more finely by LC-MS (detection UV 21 0 for HEMA, detection UV215 for NHAM), according to the protocol indicated in the example 1 to analyze the glucosylation products obtained.
  • HEMA was glucosylated by the enzymes described in Table 7, resulting from the screening presented in Example 3. HEMA mono-, di- and / or triglucosyl compounds were thus obtained.
  • Example 5 Gram-scale production of glucosylation products of HEMA and NHAM using the selected enzymes
  • the reactions are carried out in a final volume of 500 ml, in the presence of 143 mM sucrose, 438 mM acceptors and 1 U / ml of enzyme. After total consumption of the sucrose, the enzyme is deactivated at 95 ° C. and the reaction medium is concentrated by lyophilization for a subsequent purification step.
  • Purification aims to eliminate residual sugars.
  • the purification is carried out by flash chromatography on a C18 Reveleris column of 80 g to 120 g (Alltech, Epernon, France) using a water / acetonitrile gradient.
  • ATRP Atom Transfer Radical Polymerization
  • RAFT Reversible Addition Fragmentation Transfer
  • a typical ATRP polymerization proceeds as follows.
  • the solution is then degassed by bubbling argon and the bipyridine (ligand, 15.7 mg, 100 ⁇ ., 2 eq.) And CuIBr (catalyst, 7.1 mg, 50 ⁇ ., 1 eq.) Are added in this order.
  • 20 ml of a degassed solution of the glucosylated monomer-HEMA mixture are added (0.78 g, 2.0 mmol, 40 eq.).
  • the polymerization then takes place for 8 hours at room temperature.
  • the reaction is stopped by air oxidation of the CuII Cu (the solution changes from brown to blue).
  • the solution is then passed through a silica column to get rid of the Cuil.
  • the reaction medium is then lyophilized to recover the polymer in the form of a white powder.
  • the polymerization yield is generally greater than 90%.
  • Example 7 Implementation of the glucosylation method on 2-propenol
  • 60 mutants appeared to glucosylate allyl alcohol at least as efficiently as the parental wild-type enzyme, namely I228H, F229D, F229E, F229G, F229H, F229I, F229K, F229M, A289C, A289D, A289E, A289F, A289G, A289H, A289I, A289K, A289L, A289M, A289W, A289Y, F290C, F290D, F290E, F290G, F290H, F290I, F290K, F290L, F290M, F290W, I330C, I330D, I330E, I330F, I330G, I330H, I330K, I330L, I330M, I330S, I330Y, V331C, V331D, V331E, V331F, V331G, V331H, V331I, V331K, V331
  • Wild ASNp and 89 mono-mutants are also shown to be able to glucosylate BME, as shown in Table 13.
  • 59 mutants appeared to glucosylate BME at least as efficiently as the parental wild-type enzyme, namely:
  • VBA was assayed as an acceptor reaction using Neisseria polysaccharea amylosucrase (ASNp), its mono mutant library identified in Table 1, as described in Example 3, and also in a-l, 2-BrS and ASR.
  • ASNp Neisseria polysaccharea amylosucrase
  • VBA can be glucosylated by wild-type ASNp as well as by 26 of its mono-mutants tested, namely: R226H, R226K, R226M, R226N, R226Q, R226S, R226T, R226V, R226Y, I228V, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289T, A289V, F290V, F290W, V331C, V331D, V331G, V331S, V331T, V331Y and R446A.
  • Example 9 Determination of the glucosylation efficiencies of N, N-bis (2-hydroxyethyl) acrylamide (NNHEA) by N. polysaccharea amylosucrase (ASNp), its mutants and certain enzymes of Example 1
  • NNHEA was assayed as an acceptor reaction using Neisseria polysaccharea amylosucrase (ASNp), its mono-mutant library identified in Table 1, as described in Example 3, and also in a-1, 2-BrS, a-1,3-BrS and ASR.
  • ASNp Neisseria polysaccharea amylosucrase
  • the results obtained for NNHEA with the enzymes al, 2-BrS, ⁇ 1, 3-BrS and ASR are shown in Table 16, whereas the results obtained for NNHEA with ASNp and its mono-mutants are summarized in Table 1.
  • Table 17 Glucosylation results of NNHEA
  • ⁇ -1,2-BrS, ⁇ -1,3-BrS and ASR enzymes can glucosylate NNHEA and lead only to the production of mono-glucosyl NNHEA. Traces of di-glucosylated NNHEA have also been detected.
  • traces of a compound is meant in the sense of the invention that this compound is present in a sample in an amount sufficient to be detected by a measurement method such as that implemented in the present examples, but in a quantity too weak to be measured.
  • the value of 0 given in the tables of this document means that the compound concerned is either absent or present in such a small quantity that it is not detectable by a measurement method such as that implemented in the present examples.
  • NNHEA can be glucosylated by wild-type ASNp as well as by 113 of its mono-mutants tested, as shown in Table 17.
  • the HEAA was fructosylated, 1, 4, 5, 6 and even 7 times. Since these acceptors have only one reactive hydroxyl group, only one type of each fructosylation level of these molecules is obtained.
  • sucrose consumption of the fructosyltransferase implemented and the production rates (in g / L) of the tested fructosylated acceptors were measured.
  • Example 9 The glucosylation products obtained in Example 9 with some of the enzymes tested were analyzed more finely by LC-MS (UV204 detection for NNHEA), according to the protocol indicated in Example 1.
  • NNHEA mono-glucosylated by the enzymes tested, in particular by wild-type ASNp and its mutants A289Q, F290C, F290L, and F290V. Traces of di-glucosylated NNHEA were also detected with the monomers F290C, F290L and F290V.
  • Example 12 Determination of Glucosylation Efficacy of HEAA by Certain Enzymes of Example 1
  • acceptor reactions were performed with a panel of 3 wild Glycansucrases, namely: ASR, ⁇ -1,3-BrS and Bacillus subtilis fructosyltransferase shown in Table I.
  • reaction medium is analyzed by HPLC-MS on a Hypercarb column (30 min) to identify the glucosylation products.
  • Table 19 shows the conversion rate of sucrose and the total glucosylation of each of these enzymes.
  • ASR provides mono-glycosylated HEAA, di-glucosylated HEAA, and tri-glucosylated HEAA.
  • ⁇ -1,3-BrS and the D394E mono-mutant of wild-type ASNp only make it possible to obtain mono-glucosylated HEAAs. Only traces of di-glucosylated HEAA are observed with these two enzymes.
  • GBD-CD2 23.7 2.168 2.168 0 0
  • DSR-OK> 95 0.149 0.149 0 0 a-1.2-BrS> 95 1.886 1.781 0.054 0.050 a-1.3-BrS> 95 2.078 1.918 0.160 0
  • SEQ ID NO: 8 series: (Proteins mutated sequences of glucan-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysaccharea) V331X 7

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Abstract

La présente invention est relative à un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, comprenant au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins un synthon hydroxylé et au moins un saccharose. Elle concerne également un procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère comprenant la polymérisation d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention ainsi qu'un procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère, de préférence à blocs, comprenant le couplage d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention.

Description

PRODUCTION DE SYNTHONS GLYCOSYLES PAR VOIE ENZYMATIQUE
DOMAINE DE L'INVENTION
La présente invention se rapporte au domaine de la glycosylation par voie enzymatique de synthons hydroxylés afin d'obtenir des monomères glycosylés.
La présente invention se rapporte également à de nouvelles voies de synthèse chimio-enzymatiques de glyco(co)polymères fondées sur la polymérisation chimique ou sur une réaction de couplage chimique des monomères glycosylés obtenus par voie enzymatique.
ART ANTERIEUR
Les glyco(co)polymères suscitent un intérêt croissant ces dernières années de par leur large potentiel dans de nombreux secteurs biotechnologiques et industriels.
L'introduction d'unités glucidiques dans des macromolécules synthétiques peut conférer aux polymères de nouvelles propriétés physico-chimiques, par exemple accroître leurs solubilités, modifier leurs caractères hydrophobes, et ouvrir ainsi la voie à de nouvelles applications industrielles. Dans les secteurs biomédicaux, ces glyco(co)polymères suscitent un vif intérêt pour la fabrication de biomatériaux destinés à la réparation de lésions, à l'ingénierie tissulaire (Cho et al., Biomaterials. 2006 Feb;27(4):576-85. Epub 2005 Aug 8), à la vectorisation de principes actifs (Ahmes et Narain, Biomaterials. 201 1 Aug;32(22):5279-90), ou encore pour modifier et rendre biocompatible une surface hydrophobe. De même, les glyco(co)polymères sont particulièrement intéressants dans le domaine du diagnostic biologique (Abraham et al., Biomaterials. 2005 Aug;26(23):4767- 78), comme support pour le couplage covalent de biomolécules, ou comme architectures multivalentes favorisant les processus de reconnaissance avec certaines protéines (Spain et al., Polym. Chem., 2011,2, 60-68 ; Vasquez-Dorbatt et al., Chembiochem. 2012 Nov 26;13(17):2478-87).
Au vu du large panel d'utilisation de cette classe de macromolécules, le développement de voies de synthèse efficaces permettant d'accéder à des glyco(co)polymères de structures et fonctionnalités contrôlées ainsi qu'à des architectures macro moléculaires complexes et inédites est un enjeu majeur. Ces dernières années, des efforts notables ont été consacrés au développement de voies chimiques de synthèse de plus en plus sophistiquées permettant de mieux contrôler la glycosylation des polymères synthétiques.
En effet, un intérêt croissant est exprimé pour des glycopolymères hybrides, différant des polysaccharides naturels, et formés d'une partie synthétique, de type (méth)acrylate, (méth)acrylamide, styrène, norbornényle, acétate de vinyle, peptide,... et d'une partie glucidique.
Différentes méthodes de synthèse de glyco(co)polymères comprenant un squelette synthétique décoré par des groupements glucidiques ont été explorées par le passé (Ladmiral et al, Eur Polym J, 2004, 40, 431-449 ; Spain et al, J. Polym. Sci. Part. A-Polym. Chem, 2007,45, 2059-2072) qui consistent en :
- la glycosylation chimique de polymères synthétiques.
Toutefois, cette méthode présente l'inconvénient de conduire souvent à de faibles degrés de fonctionnalisation liés à des problèmes d'encombrement stérique.
Pour contourner ce problème, les fonctions réactives portées par le polymère doivent être éloignées du squelette du polymère afin d'augmenter la réactivité tout en diminuant l'encombrement stérique généré par le greffage des séquences saccharidiques pendantes.
Là encore, cela nécessite la production de synthons réactifs et la polymérisation de monomères non conventionnels (Slavin et al, Eur Polym J, 2011, 47, 435-446).
- la polymérisation (anionique, radicalaire ou par ouverture de cycles) de monomères glycosylés, obtenus principalement par voie chimique, après plusieurs étapes et en particulier des étapes de protection/déprotection sélectives des fonctions hydroxyle des sucres.
La glycosylation des synthons est aujourd'hui principalement effectuée par voie chimique, requérant donc des procédés multi-étapes fastidieux et difficilement contrôlables.
Cette voie d'obtention est la plus répandue.
De façon générale, la synthèse des glycomonomères se révèle souvent très pénible, nécessitant des étapes de protection et déprotection coûteuses en temps ainsi que l'emploi de catalyseurs métalliques ou solvants toxiques. De plus, la diversité des structures saccharidiques accessibles par ces voies reste encore limitée. Enfin, dans certains cas, des mélanges de structures indésirables sont obtenus et rendent difficile le contrôle de la réaction de polymérisation et par la suite de la structure et des propriétés des polymères.
Par exemple, la synthèse du 2-(hydroxy)ethyl methacrylate (HEMA) glucosylé, le 2-methacryloyloxyethyl-a-D-glucopyranoside (MEGlc), concerné par la présente invention, n'a jusqu'à présent été réalisée que par voie chimique.
En particulier, Kitazawa (Kitazawa et al., Chem Lett, 1990, 19, No. 9, 1733- 1736) ont proposé une synthèse basée sur l'utilisation de donneur de glucose comme le méthylglucoside, de l'acide phosphomolybdique comme catalyseur et du 2,4-dinitrochlorobenzène comme inhibiteur. Cependant, la stéréosélectivité de cette méthode est faible.
De même, Nakaya (Nakaya et al., Makromol. Chem., Rapid. Commun., 1993, 14, 77-83) ont, en 1993, synthétisé un autre glucopolymère en faisant réagir le HEMA avec du bromure de 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-a-D-glucopyranose en présence d'oxyde d'argent ou de cyanure de mercure, selon la méthode de Helferich (Helferich et Weis, Chem. Ber., 1956, 89, 314-321).
Afin d'améliorer les rendements et d'éviter l'utilisation des sels de mercure, toxiques, une autre voie chimique a été proposée par Ambrosi en 2002 (Ambrosi et al. J. Chem. Soc, Perkin Trans. 1, 2002, 45-52). La glucosylation était alors faite en couplant le donneur de glucose, le bromure de 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-a-D-glucopyranose à l'accepteur, le HEMA, dans du dichlorométhane anhydre, en utilisant du trif uorométhanesulfonate d'argent comme catalyseur. La réaction dure toutefois 6 jours et le rendement est de 80 %. Le polymère est ensuite obtenu par polymérisation radicalaire.
Face aux divers problèmes précédemment énoncés, les procédés enzymatiques se positionnent très favorablement en raison de la spécificité et sélectivité d'action des enzymes pour contourner les difficultés de la synthèse chimique et proposer une alternative « éco-compatible », diminuant non seulement l'utilisation de produits nocifs (catalyseurs métalliques, solvants organiques) mais également les coûts et les temps de production des monomères glycosylés.
Un grand nombre d'enzymes responsables de la synthèse, la dégradation et la modification des glucides sont aujourd'hui répertoriées dans la nature. De surcroît, cette diversité peut être étendue de façon considérable à l'aide de techniques d'ingénierie enzymatique permettant de concevoir à façon ou d'améliorer les biocatalyseurs. Pourtant, malgré un fort potentiel d'innovation, les voies de production enzymatique de synthons glycosylés n'ont été que peu explorées à ce jour.
Dans les années 90, Kobayashi a décrit l'utilisation d'une β-galactosidase avec comme substrats le 4-nitrophenyl N-acetyl-P-Dglucosaminide et du lactose pour conduire à la p-Nitrophenyl N-acetyl-P-lactosaminide (Kobayashi et al, J Carbohydr Chem, 1994, 13, 753-766). Cette étape enzymatique est suivie d'une réduction de la fonction nitro en fonction aminé pour ensuite accrocher une fonction acrylate.
Dans les années 2000, des lipases ont été utilisées pour l'estérifïcation de différents sucres avec des (méth)acrylates, avec toutefois des rendements et des sélectivités limitées (Albertin et al, Macromolecules, 2004, 37 (20), pp 7530-7537 ; Miura et al, J Polym Sci Part A-Polym Chem, 2004, 42, 4598-4606; Park et al, J Biomed Mater Res A. 2004 Dec l;71(3):497-507 ; Kulshrestha et al, ACS Symp Ser, 2005, vol. 900, pp. 327-342; Tsukamoto et al, J Chem Technol Biotechnol, 2008, 83, 1486-1492).
Très récemment, il a été proposé des voies de production enzymatique de glycosides insaturés de type vinyle à l'aide de glycoside-hydrolases utilisées en synthèse soit en réaction d'hydrolyse inverse par contrôle thermodynamique, soit en réaction de transglycosylation par contrôle cinétique (Kloosterman et al, Green Chem., 2014,16, 203- 210; Kloosterman et al, Green Chem., 2014,16, 1837-1846; Kloosterman et al, Macromol Biosci, 2014, 14 (9), 1268-1279; US2012/0028308 ; US2012/0028307 ; Mazzocchetti et al, Macromol Biosci. 2014 Feb; 14(2): 186-94).
Toutefois, l'ensemble de ces procédés présentent un rendement, une vitesse de réaction ainsi qu'une sélectivité insuffisants. La diversité ainsi que la taille des sucres pouvant être obtenus à l'issus de ces procédés sont également limitées. II existe en conséquence un besoin, dans l'état de la technique, pour un procédé enzymatique permettant la glycosylation de synthons hydroxylés structurellement très variables.
Il existe un besoin pour un procédé de glycosylation de synthons hydroxylés qui permette d'économiser du temps et des coûts dans la production de synthons glycosylés, ou monomères.
Il existe également un besoin pour un procédé permettant de mieux contrôler les degrés de glycosylation des synthons et les structures ainsi que leur distribution. Il existe ainsi en outre un besoin pour des enzymes aptes à glycosyler des synthons hydroxylés de différentes natures, permettant ainsi d'aboutir à une grande diversité de synthons glycosylés, ou monomères, polymérisables ou pouvant être couplés par réaction de couplage.
Il existe de plus un besoin pour un procédé de synthèse de glyco(co)polymères, permettant avantageusement d'accéder à une plus grande diversité d'architectures macro moléculaires pour différents domaines d'applications (biomatériaux, matériel d'implant, ingénierie tissulaire, diagnostic biologique, délivrance de principes actifs, ...).
II existe un besoin pour un procédé de synthèse de glyco(co)polymères qui permette d'économiser du temps et des coûts dans la production de glyco(co)polymères.
Il existe en outre un besoin pour des procédés limitant l'utilisation de produits jugés toxiques. La présente invention permet avantageusement de répondre à l'ensemble de ces besoins.
RESUME DE L'INVENTION
Ainsi, la présente invention fournit un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, comprenant au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins un synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel :
(A) ledit synthon hydroxylé est choisi dans le groupe constitué :
(i) des synthons (méth)acrylates/(méth)acrylamides de formule (I) :
Figure imgf000006_0001
dans laquelle :
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3 ; R2 représente un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ; et
Xi représente -(O)-, -(NH)-, -(S)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)-, -(NH)-, ou -(NR'2(OH))-, avec R'2 représentant un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement -(C2H40)m-, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(ii) des synthons styréni ues de formule (II) :
Figure imgf000007_0001
dans laquelle R3 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(iii) des synthons N-Carbox anhydride (NCA) de formule (III) :
Figure imgf000007_0002
dans laquelle R4 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(iv) des synthons lactones/lactames/thiolactones de formule (IV) :
Figure imgf000007_0003
dans laquelle :
R5 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)m, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
n représente un entier compris entre 1 et 20 ; X2 représente -(O)-, -(NH)- ou -(S)- ; et
RÔ représente un hydrogène ou un groupement alkyle en Ci-C2o ;
(v) des synthons de formule (V) :
HS^ 7^O (v)
dans laquelle R7 représente un groupement alkylène en Ci-C2o ; et
(vi) des synthons de formule (VI) :
-OH
^ ¾' (VI)
dans laquelle Rs représente un groupement alkylène en Ci-C2o.
Selon un mode de réalisation particulier, le synthon hydroxylé est choisi dans le groupe constitué :
(i) des synthons (méth)acrylates/(méth)acrylamides de formule (I) :
Figure imgf000008_0001
dans laquelle :
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3 ;
R2 représente un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ; et
Xi représente -(O)-, -(NH)-, -(S)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)-, - (NH)-, ou -(NR'2(OH))-, avec R'2 représentant un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement -(C2H40)m-, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ; (ii) des synthons styréni ues de formule (II) :
Figure imgf000009_0001
dans laquelle R3 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)N, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(iii) des synthons N-Carbox anhydride (NCA) de formule (III) :
Figure imgf000009_0002
dans laquelle R4 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)N, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(iv) des synthons lactones/lactames/thiolactones de formule (IV) :
Figure imgf000009_0003
dans laquelle :
R5 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)M, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
n représente un entier compris entre 1 et 20 ;
X2 représente -(O)-, -(NH)- ou -(S)- ; et
RÔ représente un hydrogène ou un groupement alkylé en C1-C20 ; et
(vi) des synthons de formule (VI) :
Figure imgf000009_0004
dans laquelle Rs représente un groupement alkylène en C1-C20.
Selon un mode de réalisation préféré, la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASA¾)
WT) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 11 (DSR-S vardelA4N - S512C);
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15 (DSR-S-OK) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subiilis).
Plus particulièrement, une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 pouvant être choisie parmi :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP
R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y. - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP
R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y.
En particulier, une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331 , D394 et R446 peut être choisie parmi : - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, H, K, M, N, Q, S, T et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, L, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W et Y, en particulier de C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W et Y, et plus préférentiellement de M et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V et W et plus particulièrement choisi dans le groupe constitué de F, M, N, P, Q, S et T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V et W, plus préférentiellement de A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier de A, C, I, L, V, S, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V et Y, en particulier de A et C, plus préférentiellement de A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, plus préférentiellement de C, D, E, F, G, N, R, S ,T, W et Y, en particulier de E, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, G, H, I, K et L, en particulier de A et E ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, K, L, M, N, et S, en particulier de A, N et M.
Selon un mode de réalisation de l'invention, le synthon hydroxylé mis en œuvre est plus particulièrement choisi dans le groupe constitué du HEMA, du NHAM, du HEAA, du VP, du VBA, du HMNCA, du AHMCL, du MVL, du BME, de l'alcool allylique et du NNHEA.
Selon ce mode de réalisation, il est de préférence choisi parmi le HEMA, le NHAM, le HEAA, l'alcool allylique, le NNHEA et le BME, en particulier le HEMA et le NHAM.
Selon un mode de réalisation, un synthon hydroxylé selon l'invention mis en œuvre dans un procédé de glycosylation enzymatique de l'invention est glucosylé ou fructosylé à l'issu de ce procédé, de préférence glucosylé. L'invention a également pour objet un procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère comprenant la polymérisation d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention.
Selon un mode de réalisation, le procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère selon l'invention comprend, dans l'ordre, les étapes suivantes :
a) la polymérisation de deux monomères obtenus, indépendamment l'un de l'autre, à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention, permettant d'aboutir à une chaîne de 2 monomères ;
b) la polymérisation de la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère obtenu à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention ; puis
c) une ou plusieurs étapes successives, et indépendantes, consistant à polymériser la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère obtenu à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention.
Le procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère selon ce mode de réalisation peut en outre également comprendre, indépendamment :
au moins une étape a') entre les étapes a) et b) ;
au moins une étape b') entre les étapes b) et c) ; et/ou au moins une étape c') après l'une quelconque des étapes c), dans lesquelles la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente est polymérisée avec au moins un synthon non-glycosylé. L'invention a également pour objet un procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère, de préférence à blocs, comprenant le couplage d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention, de préférence de monomères obtenus à partir des synthons de formule (V) et/ou (VI) selon l'invention.
Dans le cadre de la présente invention, et sauf mention différente dans le texte, on entend par :
- alkyle : un groupe aliphatique hydrocarboné saturé, linéaire ou ramifié, comprenant de 1 à 20, notamment de 1 à 10, de préférence de 1 à 6 atomes de carbone ; et
- alkylène : un groupe alkylène divalent, linéaire ou ramifié, comprenant de 1 à
20, notamment de 1 à 10, de préférence de 1 à 6, atomes de carbone ;
Les motifs glycoside sont connus de l'homme du métier.
Dans la mesure où le saccharose est mis en œuvre dans les procédés de glycosylation selon l'invention, un motif glycoside selon l'invention est choisi parmi un ou plusieurs glucose(s), un ou plusieurs fructose(s) ou un mélange de glucose(s) et de fructose(s).
DESCRIPTION DETAILLEE DE L'INVENTION
Les inventeurs ont mis au point un procédé enzymatique de glycosylation de synthons hydroxylés mettant en œuvre des glycane-saccharases spécifiques identifiées par le demandeur, aptes à effectuer une telle glycosylation, en particulier glucosylation ou fructosylation.
Ces enzymes spécifiques ne nécessitent pour cela que la présence de saccharose, une agro -ressource renouvelable et bon marché. A ce titre, un procédé selon l'invention est avantageusement peu coûteux. Ces synthons glycosylés, ou monomères, sont avantageusement mis en œuvre dans un procédé chimique de préparation de glyco(co)polymères de structures et fonctionnalités contrôlées.
Ainsi, les inventeurs ont mis au point un procédé de synthèse chimio- enzymatique de glyco(co)polymères fondé sur la polymérisation chimique ou une réaction de couplage des monomères glycosylés obtenus par voie enzymatique.
Les procédés selon la présente invention permettent avantageusement de mieux contrôler les degrés de glycosylation des synthons et les structures ainsi que leur distribution.
Ils permettent en outre de contourner les difficultés liées à la chimie des sucres et de limiter l'utilisation de produits toxiques.
Ils s'avèrent également avantageux en termes de diminution des coûts et temps de production des synthons glycosylés.
Enfin, ces procédés permettent avantageusement d'accéder à une plus grande diversité d'architectures macro moléculaires pour différents domaines d'applications, tels que les biomatériaux, le matériel d'implant, l'ingénierie tissulaire, le diagnostic biologique et la délivrance de principes actifs.
Glycane-saccharases de l'invention
La présente invention concerne en premier lieu un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, comprenant au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase de l'invention avec au moins un synthon hydroxylé selon l'invention et au moins un saccharose.
Comme indiqué précédemment, les enzymes de l'invention sont avantageusement aptes à glycosyler des synthons au niveau de leur fonction hydroxylé.
En particulier, les enzymes selon l'invention sont aptes à glucosyler ou à fructosyler les synthons de l'invention.
Ainsi, certaines de ces enzymes consistent plus particulièrement en des glycoside-hydrolases appartenant aux familles 13 et 70 des glycoside-hydrolases (GH13 et GH70). Notamment, selon un mode de réalisation préféré, une glycane-saccharase selon l'invention est choisi dans le groupe constitué des glycoside-hydrolases appartenant aux familles 13, 68 et 70 des glycoside-hydrolases (GH13, GH68 et GH70).
Les glycoside-hydrolases appartenant à la famille 13 sont des amylosaccharases naturellement produites par les bactéries des genres Deinococcus, Neisseria ou Alteromonas.
Les glycoside-hydrolases appartenant à la famille 70 sont quant à elles des glucane-saccharases naturellement produites par des bactéries lactiques des genres Leuconostoc, Lactobacillus, Streptococcus ou Weissela sp..
En outre, la fructosyltransférase de Bacillus subtilis est également mise en œuvre dans un procédé de glycosylation selon l'invention et appartient à la famille 68 des glycoside-hydrolases.
Les enzymes de l'invention sont toutes capables de transférer le glucose ou le fructose provenant du saccharose sur les synthons hydroxylés de l'invention.
L'ensemble des enzymes sauvages ou mutées décrites dans la présente demande, connues de l'homme du métier, n'avait à ce jour jamais été mises en œuvre afin de glucosyler des synthons hydroxylés de l'invention.
La séquence nucléotidique de la forme sauvage de l'enzyme ASNp (AmyloSaccharase de Neisseria polysaccharea) (famille GH13) a pour référence GenBank AJO 11781.1 tandis que sa séquence polypeptidique a pour référence Uniprot Q9ZEU2 (SEQ ID NO : 1).
La séquence nucléotidique de la forme sauvage de l'enzyme DSR-S (issue de la souche Leuconostoc mesenteroides B-512F) a pour référence GenBank 109598.
La séquence nucléotidique de la forme sauvage de l'enzyme DSR-E (issue de la souche Leuconostoc mesenteroides NRRL B-1299) a pour référence GenBank AJ430204.1 et la référence Uniprot Q8G9Q2.
L'enzyme GBD-CD2 (séquence SEQ ID NO : 13) est une forme tronquée de l'enzyme DSR-E susmentionnée, comme décrit dans Brison et al, J. Biol. Chem., 2012, 287, 7915-24.
Des références bibliographiques décrivant les enzymes sauvages et mutées selon la présente invention sont indiquées dans le Tableau 1. En outre, la méthode d'obtention des enzymes mutées est décrite dans les demandes de brevet européen EP 2 100 966 et EP 2 100 965. Les séquences peptides des différentes enzymes sauvages ou mutées selon l'invention sont indiquées dans la présente demande.
Ainsi, une enzyme selon l'invention peut être synthétisée par des méthodes classiques de chimie de synthèse, soit des synthèses chimiques homogènes en solution ou en phase solide. A titre illustratif, l'homme de l'art peut utiliser les techniques de synthèse de polypeptide en solution décrite par HOUBEN WEIL (1974, In méthode der Organischen Chemie, E. Wunsh éd., volume 15-1 et 15-11, Thieme, Stuttgart.). Une enzyme selon l'invention peut être également synthétisée chimiquement en phase liquide ou solide par des couplages successifs des différents résidus d'acides aminés (de l'extrémité N-terminale vers l'extrémité C-terminale en phase liquide, ou de l'extrémité C-terminale vers l'extrémité N- terminale en phase solide). L'homme de l'art peut notamment utiliser la technique de synthèse peptidique en phase solide décrite par Merrifïeld (MERRIFIELD RB, (1965a), Nature, vol.207 (996): 522-523 ; MERRIFIELD RB, (1965b), Science, vol.150 (693): 178- 185.)
Selon un autre aspect, une enzyme selon l'invention peut être synthétisée par recombinaison génétique, par exemple selon un procédé de production comprenant les étapes suivantes :
(a) préparer un vecteur d'expression dans lequel a été inséré un acide nucléique codant la séquence peptidique d'une enzyme de l'invention, ledit vecteur comprenant également les séquences régulatrices nécessaires à l'expression dudit acide nucléique dans une cellule hôte choisie ;
(b) transfecter une cellule hôte avec le vecteur recombinant obtenu à l'étape (a) ;
(c) cultiver la cellule hôte transfectée à l'étape b) dans un milieu de culture approprié;
(d) récupérer le surnageant de culture des cellules transfectées ou le lysat cellulaire desdites cellules, par exemple par sonication ou par choc osmotique ; et
(e) séparer ou purifier, à partir dudit milieu de culture, ou à partir du culot de lysat cellulaire, l'enzyme de l'invention ainsi obtenue.
Pour purifier une enzyme selon l'invention qui a été produite par des cellules hôtes transfectées ou infectées par un vecteur recombinant codant ladite enzyme, l'homme de l'art peut avantageusement mettre en œuvre des techniques de purification décrites par Molinier-Frenkel (2002, J. Viral. 76, 127-135), par Karayan et al. (1994, Virology 782-795) ou par Novelli et al. (1991, Virology 185, 365-376).
Ainsi, les glycane-saccharase utilisables dans un procédé de l'invention sont choisies dans un groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 11 (DSR-S vardelA4N - S512C) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123-
GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15 (DSR-S-OK) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18
(fructosyltransférase de Bacillus subtilis).
Selon un mode de réalisation particulier, la mutation d'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 en position R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 ou R446 est une mutation par substitution.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position R226, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, Xi représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, H, K, M, N, Q, S, T et V.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position 1228, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X2 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, L, T, V, W et Y.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position F229, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X3 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W et Y, en particulier de C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W et Y, et plus préférentiellement de M et Y.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position A289, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X4 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, M, N P, Q, S, T, V et W, et plus particulièrement choisi dans le groupe constitué de F, M, N, P, Q, S et T.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position F290, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F29OX5), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y. Selon ce mode de réalisation, X5 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V et W, plus préférentiellement de A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier de A, C, I, L, V, S, T et W.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position 1330, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X6 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V et Y, en particulier de A et C, plus préférentiellement de A.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position V331, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X7 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, plus préférentiellement de C, D, E, F, G, N, R, S ,T, W et Y, en particulier de E, T et W ;
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position D394, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y.
Selon ce mode de réalisation, X8 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, G, H, I, K et L, en particulier de A et E.
Selon un mode de réalisation, lorsqu'une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 est mutée une seule fois en position R446, elle est choisie parmi une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y. Selon ce mode de réalisation, X9 représente de préférence un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, K, L, M, N, et S, en particulier de A, N et M.
Selon un mode de réalisation, une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 est choisie parmi l'une quelconque des séquences SEQ ID NO : 2 à 10 définies ci-dessus.
Selon un mode de réalisation particulier, une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 est choisie parmi :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP
R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y.
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y.
Selon un mode de réalisation particulier, une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 est choisie parmi :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, H, K, M, N, Q, S, T et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP H28X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, L, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W et Y, en particulier de C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W et Y, et plus préférentiellement de M et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, M, N P, Q, S, T, V et W, et plus particulièrement choisi dans le groupe constitué de F, M, N, P, Q, S et T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V et W, plus préférentiellement de A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier de A, C, I, L, V, S, T et W ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V et Y, en particulier de A et C, plus préférentiellement de A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, plus préférentiellement de C, D, E, G, F, N, R, S ,T, W et Y, en particulier de E, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, G, H, I, K et L, en particulier de A et E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, K, L, M, N, et S, en particulier de A, N et M.
Comme montré dans les exemples, toutes les enzymes possédant l'une de ces séquences peptidiques présentent une capacité statistiquement supérieure, voire très supérieure, à celle de l'enzyme sauvage à glucosyler les synthons hydroxylés de l'invention.
En outre, il peut être avantageux d'utiliser certaines des enzymes sauvages et/ou mutantes selon l'invention selon la nature du synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention.
Ainsi, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le HEMA, certaines enzymes permettent avantageusement de n'obtenir que des HEMA mono-glucosylés, telles que par exemple une enzyme de séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ANi23-GBD-CD2).
De plus, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le HEMA, certaines enzymes permettent avantageusement de n'obtenir que des HEMA mono-glucosylés et des HEMA di-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
FH9X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant W ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha- 1,2 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS).
Enfin, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le HEMA, certaines enzymes permettent avantageusement d'obtenir un mélange de HEMA mono-glucosylés, di-glucosylés et tri-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, I, K, L, M et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant G ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis).
En particulier, les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant A ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis) ; permettent avantageusement d'obtenir une proportion très proche de HEMA mono-glucosylés et de HEMA tri-glucosylés.
De même, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le NHAM, certaines enzymes permettent avantageusement de n'obtenir que des NHAM mono-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 11 (DSR-S vardelA4N - S512C); et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15 (DSR-S-OK).
De plus, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le NHAM, certaines enzymes permettent avantageusement de n'obtenir que des NHAM mono-glucosylés et des NHAM di-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
FH9X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant N ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de N, P et Q ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant N ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS).
Enfin, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le NHAM, certaines enzymes permettent avantageusement d'obtenir un mélange de NHAM mono-glucosylés, di-glucosylés et tri-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
FH9X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D et E ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS).
En outre, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le NNHEA, certaines enzymes permettent avantageusement de n'obtenir que des NNHEA mono-glucosylés, telles que par exemple les enzymes choisies dans le groupe :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS).
Lorsque le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le NNHEA, d'autres enzymes permettent également de n'obtenir avantageusement que des NNHEA mono-glucosylés, à savoir :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant Q ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de représentant C, L et V ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha- 1,2 BrS).
Il doit être compris de ces formulations que les acides aminés définis comme étant respectivement Xl s X2, X3, ¾, X5, ¾, X7, Xs et X9 sont présents et tels que définis ci- dessus dans les glucane-saccharases de l'invention ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 1.
La présente invention englobe également les séquences dont la séquence d'acides aminés a au moins 80 %, 81 %, 82 %, 83 %, 84 %, 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou 100 % d'identité en acides aminés avec l'une des séquences SEQ ID NO : 1 à 18 telles que définies précédemment et une activité biologique de même nature.
Par activité biologique de même nature en ce qui concerne les séquences peptidiques 1 à 18, on entend une même capacité à glycosyler les synthons hydroxylés de l'invention.
Le « pourcentage d'identité » entre deux séquences d'acides nucléiques ou d'acides aminés, au sens de la présente invention, est déterminé en comparant les deux séquences alignées de manière optimale, à travers une fenêtre de comparaison.
La partie de la séquence nucléotidique dans la fenêtre de comparaison peut ainsi comprendre des additions ou des délétions (par exemple des « gaps ») par rapport à la séquence de référence (qui ne comprend pas ces additions ou ces délétions) de manière à obtenir un alignement optimal entre les deux séquences.
Le pourcentage d'identité est calculé en déterminant le nombre de positions auxquelles une base nucléique identique (ou un acide aminé identique) est observé pour les deux séquences comparées, puis en divisant le nombre de positions auxquelles il y a identité entre les deux bases nucléiques (ou entre les deux acides aminés) par le nombre total de positions dans la fenêtre de comparaison, puis en multipliant le résultat par cent afin d'obtenir le pourcentage d'identité en nucléotides (ou en acides aminés) des deux séquences entre elles. L'alignement optimal des séquences pour la comparaison peut être réalisé de manière informatique à l'aide d'algorithmes connus.
De manière tout à fait préférée, le pourcentage d'identité de séquence est déterminé à l'aide du logiciel CLUSTAL W (version 1.82) les paramètres étant fixés comme suit : (1) CPU MODE = ClustalW mp ; (2) ALIGNMENT = « l » ; (3) OUTPUT FORMAT = « aln w/numbers » ; (4) OUTPUT ORDER = « aligned » ; (5) COLOR ALIGNMENT = « no » ; (6) KTUP (word size) = « default » ; (7) WINDOW LENGTH = « default » ; (8) SCORE TYPE = « percent » ; (9) TOPDIAG = « default » ; (10) PAIRGAP = « default » ; (11) PHYLOGENETIC TREE/TREE TYPE = « none » ; (12) MATRIX = « default » ; (13) GAP OPEN = « default » ; (14) END GAPS = « default » ; (15) GAP EXTENSION = « default » ; (16) GAP DISTANCES = « default » ; (17) TREE TYPE = « cladogram » et (18) TREE GRAP DISTANCES = « hide ».
Plus particulièrement, la présente invention concerne également les séquences dont la séquence d'acides aminés a 100 % d'identité en acides aminés avec les acides aminés 225 à 450 des séquences SEQ ID NO : 2 à 10 et au moins 80 %, 81 %, 82 %, 83 %, 84 %, 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou 100 % d'identité en acides aminés avec le reste des séquences SEQ ID NO : 2 à 10 telles que définies précédemment, et une activité biologique de même nature.
Les enzymes selon l'invention permettent d'aboutir à des synthons glycosylés, ou monomères, pouvant être mono- ou poly-glycosylés.
Ainsi, comme illustré dans les exemples de la présente demande, les spécificités des différentes enzymes de l'invention permettent avantageusement d'aboutir à façon à des monomères de structure donnée.
A titre d'exemple, et comme illustré dans les exemples, et en particulier dans le Tableau 3, lorsque le HEMA est glucosylé à l'aide de l'enzyme GBD-CD2, la totalité des monomères obtenus sont mono-glucosylés. Au contraire, la mise en œuvre de l'enzyme ASR en présence de HEMA permet d'aboutir à une répartition homogène de HEMA mono-, di- et tri-glucosylés. Synthons hydroxylés et mises en œuyre
a) Synthons hydroxylés mis en œuyre dans un procédé enzymatigue de glycosylation de l'invention
Les synthons hydroxylés spécifiquement mis en œuvre dans un procédé enzymatique de fabrication de monomères de l'invention sont choisis parmi les composés de formules (I) à (VI).
Ainsi, selon un premier aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (I) : (i) des synthons (méth)acrylates/(méth)acrylamides de formule (I) :
Figure imgf000029_0001
dans laquelle :
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3 ;
R2 représente un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ; et
Xi représente -(O)-, -(NH)-, -(S)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)-, - (NH)-, ou -(NR'2(OH))-, avec R'2 représentant un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement -(C2H40)m-, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
Selon un mode de réalisation, Ri représente un atome d'hydrogène. Selon un autre mode de réalisation, Ri représente un alkyle en C1-C3, de préférence un méthyle.
Selon un mode de réalisation, R2 représente un groupement alkylène en C1-C20, en particulier en C1-C10, notamment de Ci à C5. Plus particulièrement, R2 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, un éthylène, un propylène, un butylène et un pentylène, et représente de préférence un méthylène ou un éthylène.
Selon un mode de réalisation, Xi représente -(O)-, -(NH)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)- ou -(NH)-. Selon un mode de réalisation, R'2 représente un groupement alkylène en C1-C20, en particulier en C1-C10, notamment de Ci à C5. Plus particulièrement, R'2 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, un éthylène, un propylène, un butylène et un pentylène, et représente de préférence un méthylène ou un éthylène.
Selon un mode de réalisation particulier, un synthon de formule (I) de l'invention est tel que :
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3, de préférence un hydrogène ou un méthyle ;
R2 représente un groupement alkyle en C1-C20, de préférence un alkylène en Ci- C10, en particulier en C1-C5, plus particulièrement un méthylène ou un éthylène ; et
Xi représente -(O)-, -(NH)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)- ou -(NH)-.
Selon un mode de réalisation préféré, un synthon de formule (I) de l'invention est tel que :
Xi représente -(O)- ;
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3, de préférence un alkyle en C1-C3, en particulier un méthyle ; et
R2 représente un groupement alkyle en C1-C20, de préférence un alkylène en Ci- C10, en particulier en C1-C5, plus particulièrement un méthylène ou un éthylène, préférentiellement un éthylène.
Un tel synthon de formule (I) peut en particulier être un 2-(hydroxy)ethyl methacrylate (HEMA) :
Figure imgf000030_0001
Selon un autre mode de réalisation préféré, un synthon de formule (I) de l'invention est tel que :
Xi représente -(NH)- ;
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3, de préférence un hydrogène ou un méthyl ; et
R2 représente un groupement alkyle en C1-C20, de préférence un alkylène en Ci- C10, en particulier en C1-C5, plus particulièrement un méthylène ou un éthylène. Un tel synthon de formule (I) peut en particulier être un N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM) ou un N-(hydroxy)ethyl acrylamide (HEAA) :
Figure imgf000031_0001
Selon un autre mode de réalisation préféré, un synthon de formule (I) de l'invention est tel que :
Xi représente -(NR'2(OH))-, dans lequel R'2 représente un groupement alkylène en Ci-C2o, en particulier en C1-C10, notamment de Ci à C5, plus particulièrement un méthylène, un éthylène, un propylène, un butylène ou un pentylène, de préférence un méthylène ou un éthylène, plus préférentiellement un éthylène ;
Ri représente un atome d'hydrogène ; et
R2 représente un groupement alkyle en Ci-C2o, de préférence un alkylène en Ci- Cio, en particulier en C1-C5, plus particulièrement un méthylène ou un éthylène, notamment un éthylène.
Un tel synthon de formule (I) peut en particulier être un N,N-bis(2- hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA) :
Figure imgf000031_0002
Selon un mode de réalisation particulier, un synthon de l'invention de formule (I) est choisi parmi le 2-(hydroxy)ethylmethacrylate (HEMA), le N- (hydroxy)methyl acrylamide (NHAM), le N-(hydroxy)ethylacrylamide (HEAA) et le N,N- bis(2-hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA), de préférence parmi le HEMA, LE NHAM et le HEAA. Selon un autre aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (II) :
Figure imgf000032_0001
dans laquelle R3 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10.
De préférence, R3 représente une liaison covalente ou un groupement alkylène
Un tel groupement alkylène peut en particulier être en C1-C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, R3 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, un éthylène, un propylène, un butylène et un pentylène, et est de préférence un méthylène ou un éthylène.
Ainsi, selon un mode de réalisation particulier, R3 représente une liaison covalente, un méthylène ou un éthylène.
Un synthon de formule (II) peut en particulier être un 4-vinylphenol (VP) ou un 4-vinyl benzylalcool (VBA) :
Figure imgf000032_0002
Selon un autre aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (III) :
Figure imgf000032_0003
dans laquelle R4 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10. De préférence, R4 représente un groupement alkylène en C1 -C20, en particulier en C1 -C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, R4 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, un éthylène, un propylène, un butylène et un pentylène, et est de préférence un méthylène ou un éthylène, plus particulièrement un méthylène.
Un synthon de formule (III) peut en particulier être un 4-(hydroxy)methyl oxazolidine-2,5-dione (HMNCA) :
Figure imgf000033_0001
Selon un autre aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (IV) :
Figure imgf000033_0002
dans laquelle :
R5 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1 -C20 ; ou un groupement (C2H40)m, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
n représente un entier compris entre 1 et 20 ;
X2 représente -(O)-, -(NH)- ou -(S)- ; et
RÔ représente un hydrogène ou un groupement alkyle en C1 -C20.
Selon un mode de réalisation préféré, X2 représente -(O)-.
Selon un mode de réalisation, n est compris entre 1 et 10, notamment entre 1 et
5. n est en particulier choisi parmi 1, 2, 3, 4 et 5, et représente de préférence la valeur 1 ou 2.
De préférence, R5 représente une liaison covalente ou un groupement alkylène en C1 -C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, le groupement alkylène peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, d'un éthylène, d'un propylène, d'un butylène et d'un pentylène, de préférence un méthylène ou un éthylène, plus particulièrement un méthylène.
Ainsi, de façon particulièrement préférée, R5 représente une liaison covalente ou un méthylène. Selon un mode de réalisation, R<5 représente un hydrogène ou un groupement alkyle en C1-C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, le groupement alkyle peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthyle, d'un éthyle, d'un propyle, d'un butyle et d'un pentyle, de préférence un méthyle ou un éthyle, plus particulièrement un méthyle.
Ainsi, de façon particulièrement préférée, Re représente un hydrogène ou un méthyle.
Selon un mode de réalisation particulier, un composé de formule (IV) est tel que :
R5 représente un groupement alkylène en C1-C10, notamment en C1-C5, et est en particulier un méthylène ;
n représente un entier compris entre 1 et 5 ; et représente de préférence la valeur 1 ou 2, en particulier la valeur 2 ;
X2 représente -(O)- ; et
Ré représente un hydrogène.
Un tel synthon de formule (IV) peut en particulier ,-(hydroxy)methyl caprolactone (AHMCL) :
Figure imgf000034_0001
Selon un autre mode de réalisation particulier, un composé de formule (IV) est tel que :
R5 représente une liaison covalente ;
n représente un entier compris entre 1 et 5 ; et représente de préférence la valeur 1 ou 2, en particulier la valeur 1 ;
X2 représente -(O)- ; et
Ré représente un groupement alkyle en C1-C10, notamment en C1-C5 et est en particulier un méthyle. Un tel synthon de formule ( IV) peut en particulier être un (±)- mevalonolactone
(MVL) :
Figure imgf000035_0001
Selon un mode de réalisation particulier, un synthon de l'invention de formule (IV) est choisi parmi l'a-(hydroxy)methyl caprolactone (AHMCL) et le i- mevalonolactone (MVL).
Selon un autre aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (V) :
Figure imgf000035_0002
dans laquelle R7 représente un groupement alkylène en C1-C20.
De préférence, R7 représente un groupement alkylène en C1-C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, R7 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, d'un éthylène, d'un propylène, d'un butylène et d'un pentylène, de préférence un méthylène ou un éthylène, plus particulièrement un éthylène.
Un tel synthon de formule (V) peut en particulier être un 2-mercaptoéthanol (BME) :
Figure imgf000035_0003
Selon un autre aspect, les synthons hydroxylés de l'invention peuvent être des composés de formule (VI) :
Figure imgf000035_0004
dans laquelle Rs représente un groupement alkylène en C1-C20.
De préférence, Rs représente un groupement alkylène en C1-C10, notamment en C1-C5. Plus particulièrement, R8 peut être choisi dans le groupe constitué d'un méthylène, d'un éthylène, d'un propylène, d'un butylène et d'un pentylène, de préférence un méthylène n éthylène, plus particulièrement un méthylène.
Figure imgf000036_0001
Selon un mode de réalisation, un synthon de l'invention peut être choisi dans le groupe constitué du 2(hydroxy)ethylmethacrylate (HEMA), du N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM), du N-(hydroxy)ethylacrylamide (HEAA), du 4-vinylphenol (VP), du
4-vinyl benzylalcool (VBA), du 4-(hydroxy)methyl oxazolidine-2,5-dione (HMNCA), du a- (hydroxy)methyl caprolactone (AHMCL), du (±)- mevalonolactone (MVL), du
2-mercaptoéthanol (BME), du 2 propène-l-ol (alcool allylique) et du
N,N-bis(2-hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA) .
Un synthon selon l'invention est en particulier choisi dans le groupe constitué du
2(hydroxy)ethylmethacrylate (HEMA), du N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM), du N-(hydroxy)ethylacrylamide (HEAA), du 4-vinyl benzylalcool (VBA), du 2 propène-l-ol
(alcool allylique) et du 2-mercaptoéthanol (BME). b) Synthons glycosylés ou monomères
La glycosylation enzymatique des synthons hydroxylés, et en particulier mono- hydroxylés, de l'invention se fait en présence de saccharose.
Dans la présente demande, les termes « synthons glycosylés » et « monomères » sont utilisés de manière interchangeable pour désigner les synthons glycosylés obtenus à l'issu du procédé enzymatique selon l'invention de glycosylation des synthons hydroxylés.
Ainsi, les synthons de l'invention sont plus particulièrement glucosylés ou fructosylés durant le procédé de glycosylation enzymatique selon l'invention.
Le procédé selon l'invention de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, de l'invention peut notamment être mis en œuvre dans les conditions énoncées à l'exemple 1, point 1.3 ci-après.
Les monomères de l'invention peuvent être mono- ou pluri-glycosylés, comme illustré dans les exemples de la présente demande. A l'issue de cette glycosylation des synthons de l'invention, l'enzyme peut avantageusement être inactivée. Cette inactivation peut à titre illustratif être réalisée en par inactivation thermique, par exemple à une température supérieure à 60°C, notamment supérieure à 80°C, de préférence supérieure à 90°C.
Selon un mode de réalisation particulier, le milieu réactionnel contenant les synthons glycosylés selon l'invention est concentré par lyophilisation, notamment en prévision d'une étape de purification ultérieure.
Selon un autre mode de réalisation, le milieu réactionnel contenant les synthons glycosylés selon l'invention n'est pas concentré par lyophilisation.
Selon un mode de réalisation, les synthons glycosylés selon l'invention sont purifiés après leur préparation. Cette étape de purification, lorsqu'elle est réalisée, peut intervenir après une étape d' inactivation de l'enzyme mise en œuvre et/ou après une étape de lyophilisation. De préférence, une telle étape de purification intervient après une étape d' inactivation de l'enzyme, en l'absence d'une étape de lyophilisation.
Cette étape de purification peut avantageusement également comprendre une étape d'extraction liquide/liquide afin d'éliminer le synthon résiduel.
Modes de réalisation préférés
Dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre dans un procédé de l'invention est le HEMA, la glycane-saccharase mise en œuvre peut avantageusement être choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, N, P, S et T, de préférence C ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de P, T et V, de préférence T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant W ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant H, I, K, L, M et W, de préférence H et L ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, H, I, K, L, M, N, P, Q, V et W, de préférence A, C, I, K, L, M, P et V, en particulier A, C, I, K, L, M et V, et notamment A, C, I, L et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant A, C,
E, F, G, H, K, L, M et N, de préférence A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, en particulier C, D, E, G, H, et notamment E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant A, C, E, G, H, I, L, M et N, en particulier A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M et N, de préférence C, G, K, L et N, notamment N ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1,2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123-
GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha- 1,3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subiilis).
En outre, dans le cas où le synthon hydroxylé mis en œuvre est le NHAM, la glycane-saccharase mise en œuvre dans un procédé de l'invention peut être choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, E, L, M, N, P, Q, R, T, V et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP
F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, I, L, M, N, P, Q, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, S, T et V, de préférence N, P, Q, S, et V, notamment N, P et Q ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, L, M, N, P, Q, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, M, N et V, de préférence N ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, R, S, T et Y, de préférence C, D, E, N, et T, notamment E ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, E, G et N, de préférence E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 1 (DSR-S vardelA4N - S512C);
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha- 1,2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15
(DSR-S-OK) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subtilis).
Selon un mode de réalisation particulier, un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère comprend au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins du 2-mercaptoéthanol (BME) à titre de synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, H, L, M, N, Q, R, V, W et Y, de préférence L, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, I, L, M, P, Q, R, V, W et Y, de préférence C, M, P, Q, V, W et Y, en particulier C, M, P, V et Y, notamment Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, M, N, P, Q, R, S, T, V et W, de préférence C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V et W, et notamment F, M, N, P, Q, S et T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence A, C, D, E, G, I, M, P, Q, S, T, V et W, en particulier D, Q, S, T et W, et notamment S, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, N, Q, S, T, V et W, de préférence Q et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, de préférence A, C, D, E, F, G, H, I, N, Q, R, S, T, W et Y, en particulier C, D, E, F, N, R, S, T, W et Y, et notamment E, T, et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E et S, de préférence E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, Q, S et T, de préférence S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1,2 BrS) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS).
Selon un mode de réalisation particulier, un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère comprend au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins du propèn-l-ol (alcool allylique) à titre de synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP
R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de D, E, F, G, H, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence H ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence D, E, G, H, I, K et M, en particulier D, E, G, I, K et M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, I, K, L, M W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, G, H, I, K, L, M et W, en particulier C et H ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, K, L, M, S et Y, en particulier C ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, I, K, L, N et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence E, F, G, H, I, K et L, en particulier E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, S, T, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subtilis).
Selon un mode de réalisation particulier, un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère comprend au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins du VBA à titre de synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT), - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, K, M, N, Q, S, T, V et Y, en particulier H, K, M, N, Q, S, T et V, de préférence H, K, M, N, Q, T et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP
I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de M, N, P, Q, S, T et V, de préférence M, N, P, Q, S et T, et notamment P, Q et S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de V et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, G, S, T et Y, de préférence C, G, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant l'acide aminé A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1,2 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis). Selon un mode de réalisation particulier, un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère comprend au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins du NNHEA à titre de synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT), - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, D, E, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, H, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y, de préférence V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, I, L, M, N, Q, R, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V et W , de préférence C, G, M, N, Q, S, T et V, en particulier Q ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence A, C, G, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier C, L, V et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, K, M, Q, T, V et Y, de préférence V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, W et Y, de préférence D, E, G, N, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de E, G, R et S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha- 1,3 BrS) ; et - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis).
Une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha- 1,2 BrS) peut également être utilisée dans un procédé de fabrication de synthon glycosylé selon l'invention lorsque NNHEA est le synthon hydroxylé à glycosyler, en particulier à glucosyler.
Selon un mode de réalisation particulier, un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère comprend au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins du HEAA à titre de synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha- 1,3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subtilis).
Ainsi, la présente invention concerne plus préférentiellement un procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, comprenant au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins un synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel :
(i) le synthon glycosylé est le HEMA et la glycane-saccharase mise en œuvre est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, N, P, S et T, de préférence C ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de P, T et V, de préférence T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant H, I, K, L, M et W, de préférence H et L ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, H, I, K, L, M, N, P, Q, V et W, de préférence A, C, I, K, L, M, P et V, en particulier A, C, I, K, L, M et V, et notamment A, C, I, L et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant A, C,
E, F, G, H, K, L, M et N, de préférence A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, en particulier C, D, E, G, H, et notamment E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant A, C, E, G, H, I, L, M et N, en particulier A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M et N, de préférence C, G, K, L et N, notamment N ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1,2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123-
GBD-CD2) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subiilis) ;
(ii) le synthon hydroxylé est le NHAM et la glycane-saccharase mise en œuvre dans un procédé de l'invention est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, E, L, M, N, P, Q, R, T, V et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, I, L, M, N, P, Q, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, S, T et V, de préférence N, P, Q, S, et V, notamment N, P et Q ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, L, M, N, P, Q, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, M, N et V, de préférence N ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, R, S, T et Y, de préférence C, D, E, N, et T, notamment E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, E, G et N, de préférence E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 11 (DSR-S vardelA4N - S512C);
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123-
GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15 (DSR-S-OK) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18
(fructosyltransférase de Bacillus subiilis) ;
(iii) le synthon glycosylé est le 2-mercaptoéthanol (BME) et la glycane- saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, H, L, M, N, Q, R, V, W et Y, de préférence L, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, I, L, M, P, Q, R, V, W et Y, de préférence C, M, P, Q, V, W et Y, en particulier C, M, P, V et Y, notamment Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, M, N, P, Q, R, S, T, V et W, de préférence C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V et W, et notamment F, M, N, P, Q, S et T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence A, C, D, E, G, I, M, P, Q, S, T, V et W, en particulier D, Q, S, T et W, et notamment S, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, N, Q, S, T, V et W, de préférence Q et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, de préférence A, C, D, E, F, G, H, I, N, Q, R, S, T, W et Y, en particulier C, D, E, F, N, R, S, T, W et Y, et notamment E, T, et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E et S, de préférence E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, Q, S et T, de préférence S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1,2 BrS) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS) ;
(iv) le synthon hydroxylé est le propèn-l-ol (alcool allylique) et la glycane- saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de D, E, F, G, H, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence H ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence D, E, G, H, I, K et M, en particulier D, E, G, I, K et M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, I, K, L, M W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, G, H, I, K, L, M et W, en particulier C et H ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, K, L, M, S et Y, en particulier C ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y, de préférence C, D, E, F, G, H, I, K, L, N et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP
D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence E, F, G, H, I, K et L, en particulier E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, Q, S, T, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14
(ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18
(fructosyltransférase de Bacillus subiilis) ;
(v) le synthon glycosylé est le VBA et la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, K, M, N, Q, S, T, V et Y, en particulier H, K, M, N, Q, S, T et V, de préférence H, K, M, N, Q, T et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP
I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de V ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de M, N, P, Q, S, T et V, de préférence M, N, P, Q, S et T, et notamment P, Q et S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de V et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, G, S, T et Y, de préférence C, G, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant l'acide aminé A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha- 1,2 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis) ;
(vi) le synthon glycosylé est le NNHEA et la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, D, E, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, H, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y, de préférence V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, I, L, M, N, Q, R, V, W et Y, de préférence M ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V et W , de préférence C, G, M, N, Q, S, T et V, en particulier Q ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T, V, W et Y, de préférence A, C, G, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier C, L, V et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, K, M, Q, T, V et Y, de préférence V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP
V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, R, S, T, W et Y, de préférence D, E, G, N, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394Xs), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de E, G, R et S ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, F, G, K, L, M, N, Q, S, T et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; ou
(vii) le synthon glycosylé est le HEAA et la glycane-saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X8), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant E ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1,3 BrS) ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR- C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subtilis). c) Mise en œuyre des monomères de l'invention
Les monomères de l'invention sont polymérisables et/ou peuvent être couplés par réaction de couplage, et peuvent être mis en œuvre dans un procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère selon l'invention, comprenant la polymérisation et/ou une réaction de couplage d'au moins deux de ces monomères.
Un procédé chimio-enzymatique selon l'invention est avantageux au regard de nombreux aspects, tel notamment le temps de réaction très court permettant, en l'espace de quelques heures, notamment en l'espace de 24 heures, de passer des synthons hydroxylés au glyco(co)polymères d'intérêt.
En outre, la détermination par les inventeurs (i) de synthons de structures variables aptes à être glycosylé dans un procédé selon l'invention et (ii) d'enzymes de spécificités différentes, permet la production « à façon » de glyco(co)polymères d'une grande variabilité.
La polymérisation et la réaction de couplage selon l'invention permettent en outre d'accéder à des architectures moléculaires originales, telles que des (co)polymères en peigne ou à bloc, qui pourront être évalués pour le développement de nouveaux matériaux de balance hydrophile/hydrophobe modulable.
Un tel procédé peut notamment être mis en œuvre dans les conditions énoncées à l'exemple 6 ci-après.
Selon un mode de réalisation, un procédé de fabrication par polymérisation d'un glyco(co)polymère selon l'invention comprend dans l'ordre, les étapes suivantes :
a) la polymérisation de deux monomères de l'invention, permettant d'aboutir à une chaîne de 2 monomères ;
b) la polymérisation de la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère de l'invention ; puis c) une ou plusieurs étapes successives, et indépendantes, consistant à polymériser la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère de l'invention.
Selon un mode de réalisation, un tel procédé de polymérisation peut en outre comprendre, indépendamment :
au moins une étape a') entre les étapes a) et b) ;
au moins une étape b') entre les étapes b) et c) ; et/ou
au moins une étape c') après l'une quelconque des étapes c), dans lesquelles la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente est polymérisée avec au moins un synthon non-glycosylé.
EXEMPLES
Exemple 1 : Production et mise en œuyre de glucane-saccharases pour la glucosylation du 2-(hydroxy)ethyl methacrylate (HEMA) et du N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM)
Une librairie comprenant 8 enzymes sauvages (appartenant aux familles GH70 et 13 des glycoside-hydrolases) et 171 mutants simples (positions 226, 228, 229, 289, 290, 330, 331, 394 et 446) construits à partir de l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea (ASNp) (famille GH13) ont été testés pour leur aptitude à glucosyler F HEMA, et le NHAM.
Les glucane-saccharases sélectionnées pour l'étude, ainsi que leur origine, sont indiquées dans le Tableau 1.
Le Tableau 1 illustre en effet un certain nombre des glucane-saccharases testées dans les exemples du présent texte et précise : colonne 1 : l'organisme dont l'enzyme est originaire ; colonne 2 : les différentes enzymes sauvages testées ainsi que les positions mutées du site actif de ces enzymes sauvages dans les glucane-saccharases mutées également testées ; colonne 3 : les références bibliographiques dans lesquelles ces enzymes, aussi bien sous formes sauvages que mutées, ont été décrites dans l'état de la technique.
Ces enzymes ont été utilisées sous forme recombinante et sont exprimées chez Escherichia coll.
1.1. Production des enzymes en microplaques
L'ensemble des souches & Escherichia coli, surexprimant les glucane- saccharases hétéro logues des familles GH13 et GH70, sauvages ou leurs mutants (Tableau 1), sont stockées au format microplaque 96 puits afin de faciliter les futures étapes de criblage de glucosylation des synthons hydroxylés.
A partir des microplaques sources, une pré-culture de ces souches d'E. coli est menée pendant 22 h à 30°C, 700 rpm dans des microplaques 96 puits, dans 200 de milieu de culture Luria-Bertani supplémenté avec 100 μg/mL d'ampicilline.
Ces précultures sont utilisées à leur tour pour ensemencer les microplaques « deep-well » dont chaque puits contient 1 mL par puits de milieu auto-inductible ZYM5052 contenant notamment 0,2 % (p/v) d' -lactose, 0,05 % (p/v) de D-glucose, 0,5 % (p/v) de glycérol et 0,05 % (p/v) de L-arabinose (Studier et al., Protein Expr Purif. 2005 May;41(l):207-34.).
Après 22 h de culture à 30°C et à 700 rpm, la suspension cellulaire est centrifugée pendant 20 min à 3 000 g à 4°C. Les culots cellulaires sont re-suspendus dans les microplaques deep-well 96 puits, avec 300 μΐ, de tampon phosphate salin (24 mM phosphate de sodium/potassium et 274 mM NaCl) contenant 0,5 g/L de lysozyme et 5 mg/L de RNAse pancréatique bovine.
S'en suit une incubation de 30 min à 30°C sous agitation, ces microplaques sont ensuite stockées une nuit à -80°C. Après décongélation, les microplaques sont vigoureusement agitées puis centrifugées pendant 20 min à 3 000 g à 4°C.
Les surnageants centrifugés contenant les enzymes recombinantes sont transférés dans des microplaques 96 puits deep-well propres pour réaliser la mise en œuvre des réactions d'accepteur. 1.2. Test d'activité enzymatique sur saccharose
Avant de réaliser les réactions de criblage enzymatique de glucosylation, 50 des surnageants sont utilisés pour réaliser un test d'activité enzymatique sur saccharose.
L'activité enzymatique est évaluée au format microplaque en point final après 30 minutes d'incubation de 146 mM final de saccharose par dosage des sucres réducteurs par l'acide 3,5-dinitrosalicylique (DNS).
Après dilution au demi dans de l'eau, l'absorbance est lue à 540 nm.
1.3. Conditions de mise en œuyre des tests d'activité enzymatique sur les accepteurs
Pour le criblage de la banque de mutants de l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea, les réactions d'accepteur sont réalisées en microplaques deep-well dans un volume de 300 μί, en présence de 73 mM de saccharose, de 73 mM d'accepteur (HEMA, NHAM, ou autre ...) en concentrations finales et de 150 de lysat cellulaire centrifugé.
Les microplaques sont incubées à 30 °C et à 700 rpm.
Après 24h de réaction, les enzymes sont dénaturées à 95 °C pendant 10 minutes.
Ces microplaques sont stockées à -20 °C en vue d'une analyse rapide de la glucosylation par HPLC/MS. Pour le criblage des enzymes sauvages, les réactions d'accepteur sont réalisées en tube dans un volume de 1 mL, en présence de 146 mM de saccharose, de 438 mM d'accepteur (HEMA ou NHAM) en concentrations finales de 1 U/mL d'activité enzymatique.
Les tubes sont incubés à 30 °C et agité à 500 rpm.
Après 24h de réaction, les enzymes sont dénaturées à 95 °C pendant 10 minutes, les milieux réactionnels sont centrifugés, filtrés, dilués et analysées par LC/MS.
1.4. Méthodes analytiques LC et LC/MS des produits de réaction d'accepteurs L'analyse des réactions d'accepteurs est réalisée en deux temps.
Une première analyse HPLC courte sur colonne hypercarb (6 minutes) est réalisée pour identifier la présence ou non de produits de glucosylation.
La deuxième analyse HPLC sur colonne Hypercarb ou Amino (30 minutes) permet une séparation et une identification de tous les constituants du mélange réactionnel.
Dans le cas d'une analyse LC-MS, le système HPLC Dionex est couplé à un spectromètre de masse, simple quadrupole MSQPlus, Thermo S cientifîc.
Les conditions utilisées sont résumées dans le Tableau 2.
La quantité des produits de glycosylation (en g/L) a été estimée sur la base du coefficient de réponse de l'accepteur en détection UV.
Exemple 2 : Détermination des efficacités de glucosylation du HEMA et du NHAM par les enzymes de l'Exemple 1
Les réactions en présence d'accepteur ont été mises en œuvre en appliquant les conditions décrites dans l'exemple 1.
Dans un premier temps, ces réactions d'accepteurs ont été mises en œuvre avec un panel de 7 Glycane-saccharases sauvages de spécificités distinctes, ces enzymes étant indiquées dans le Tableau 1, à savoir : ASDg, ASR, GBD-CD2, DSR-S-A4N, DSR-OK, a-l,2-BrS et a-l,3-BrS.
Après 24h de réaction, le milieu réactionnel est analysé par HPLC-MS sur colonne Hypercarb (30 min) pour identifier les produits de glucosylation. Les Tableaux 3 et 4 présentent le taux de conversion du saccharose et les trois principaux produits de glucosylation obtenus en présence, respectivement, du HEMA et du NHAM en g/L, caractérisés par MS et correspondant respectivement à l'accepteur mono- glucosylé (Accepteur-Glcl), di-glucosylé (Accepteur-Glc2) et tri-glucosylé (Accepteur- Glc3). Des produits en plus faibles quantités sont également détectés, correspondant à des formes tetra-, penta-, hexa- et heptaglucosylées.
Etant donnée la présence d'un seul groupe hydroxyle réactif sur la molécule, un seul type de mono-glycosylation de la molécule est attendu, et donc le même produit mono- glucosylé quelle que soit l'enzyme.
En revanche, la structure des produits di- et tri-glucosylés peut différer en fonction de la spécificité de l'enzyme et la structure des produits ne pourra être déterminée sans ambiguïté que par analyse RMN.
Résultats de glucosylation
A l'exception de DSR-S-A4N et DSR-OK, qui ne reconnaissent pas le HEMA, toutes les glycane-saccharases sauvages testées glucosylent les accepteurs HEMA et NHAM avec des efficacités variables et des tailles de produits de glucosylation variables.
Résultats de glucosylation du HEMA
Les réactions réalisées en présence des enzymes ASR et ASDg ont conduit à des taux de conversion du saccharose particulièrement élevés (95 %) accompagnés de production de produits d'accepteurs glucosylés variant de 2,7 à 21 g/L.
Parmi ces enzymes, l'ASR synthétise un taux significativement plus élevé de HEMA glucosylé (21 g/L). Avec l'ASR, les produits formés se répartissent dans des proportions équivalentes entre les formes mono-, di- et tri-glucosylées du HEMA.
Il est en outre observé que l'utilisation de l'enzyme GBD-CD2 ne conduit qu'à des HEMA mono-glucosylés. Ainsi, l'utilisation de cette enzyme permet avantageusement de n'obtenir que des HEMA mono-glucosylés.
En ce sens, on observe que l'utilisation des enzymes a-l,2-BrS et a-l,3-BrS, démontrent un taux de conversion du saccharose également très élevé (respectivement 93 % et 84 %) conduit majoritairement à la production de HEMA mono-glucosylés. Résultats de glucosylation du NHAM
Toutes les glycane-saccharases s'avèrent capables de reconnaître le NHAM et de le glucosyler, mais dans des proportions 2,5 à 5 fois inférieures aux taux observés pour le HEMA.
Les enzymes GBD-CD2, a-l,2-BrS et a-l,3-BrS sont les plus productrices de
NHAM glucosylé avec des taux de l'ordre de 2 g/L.
La forme mono-glucosylée du NHAM demeure le produit observé en plus large quantité. Exemple 3 : Détermination des efficacités de glucosylation du HEMA et du
NHAM par l'amylosaccharase de TV. polysaccharea ( ASNp) et par ses mutants
Le HEMA et le NHAM ont ensuite été testés en réaction d'accepteur à l'aide de l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea (ASNP) et de sa banque de mono-mutants identifiés dans le Tableau 1.
Les réactions de glucosylation mises en œuvre en présence d'accepteur ont été analysées dans un premier temps en utilisant une méthode HPLC courte (6 min) dans l'objectif d'identifier rapidement les enzymes efficaces en glucosylation de l'accepteur.
Les résultats obtenus pour le HEMA sont résumés dans le Tableau 5. Les valeurs données représentent les productions en g/L calculées à partir des aires relatives issues de la détection par DEDL des produits de glucosylation du HEMA par rapport à l'enzyme sauvage (dont l'aire relative est de 1).
Les résultats obtenus pour le NHAM sont résumés dans le Tableau 6. La quantité des produits de glycosylation (en g/L) a été estimée sur la base du coefficient de réponse de l'accepteur en détection UV.
Résultats de glucosylation du HEMA
L'enzyme sauvage ASNp ainsi que 69 enzymes mono-mutées se sont avérés aptes à glucosyler le HEMA, comme représenté dans le Tableau 5.
Plus particulièrement, 25 mutants sont apparus glucosyler le HEMA plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir R226C, I228T, F229W, A289H, A289L, F290A, F290C, F290I, F290K, F290L, F290M, F290P, F290V, I330A, V331C, V331D, V331E, V331G, V331H, D394A, R446C, R446G, R446K, R446L et R446N, et notamment les mutants F290A, F290C, F290I, F290K, F290L, F290M, F290V, I330A, V331E, D394A et R446N, en particulier F290A, F290C, F290I, F290L, F290V et I330A.
Parmi ces mutants, ceux ciblant la position 290 se sont avérés être les plus performants en termes de glucosylation du HEMA.
Résultats de glucosylation du NHAM
L'enzyme sauvage ASNp ainsi que 103 enzymes mono-mutées se sont avérées aptes à glucosyler le NHAM, comme représenté dans le Tableau 6.
Plus particulièrement, 13 mutants sont apparus glucosyler le NHAM au moins aussi efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir F229M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289V, I330N, V331C, V331D, V331E, V331N, V331T et D394E.
En particulier, 11 d'entre eux sont apparus glucosyler le NHAM plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir F229M, A289N, A289P, A289Q, I330N, V331C, V331D, V331E, V331N, V331T et D394E, et notamment les mutants F229M, V331E et D394E.
Exemple 4 : Etude des produits de glucosylation du HEMA et du NHAM de l'exemple 3
A la suite du criblage, un certain nombre de mutants testés à l'Exemple 3 ont été analysés plus finement par LC-MS (détection UV210 pour le HEMA, détection UV215 pour le NHAM), selon le protocole indiqué à l'exemple 1 afin d'analyser les produits de glucosylation obtenus.
Ainsi, le HEMA a été glucosylé par les enzymes décrites dans le Tableau 7, résultant du criblage présenté à l'exemple 3. Des composés HEMA mono-, di- et/ou tri- glucosylés ont ainsi été obtenus.
Dans d'autres essais similaires, des composés HEMA tetra-glucosylés, voire des composés HEMA glucosylés jusqu'à 10 fois, ont également été obtenus.
Le NHAM a quant à lui été glucosylé par les enzymes décrites dans le Tableau 8, résultant du criblage présenté à l'exemple 3. Des composés NHAM mono-, di- et/ou tri-glucosylés ont ainsi été obtenus. Exemple 5 : Production à l'échelle du gramme de produits de glucosylation du HEMA et du NHAM à l'aide des enzymes sélectionnées
1. Production à l 'échelle du gramme
A partir des glycane-saccharases les plus efficaces identifiées, 1ASR et l'a-l,3-BrS, ainsi que les mono-mutants F290C et D394E de lASNp, des lots de HEMA- glucosylé et de NHAM-glucosylé ont été produits à l'échelle du gramme afin de réaliser les tests de polymérisation.
Les réactions sont réalisées dans un volume final de 500 mL, en présence de 143 mM de saccharose, de 438 mM d'accepteurs et d' 1 U/mL d'enzyme. Après consommation totale du saccharose, l'enzyme est désactivée à 95 °C et le milieu réactionnel est concentré par lyophilisation pour une étape de purification ultérieure.
Les niveaux de production estimés sont donnés en Tableau 9.
2. Purification des produits de glucosylation
La purification a pour objectif d'éliminer les sucres résiduels.
La purification est réalisée par flash chromatographie sur une colonne C18 Reveleris de 80 g à 120 g (Alltech, Epernon, France) utilisant un gradient eau/acétonitrile.
Exemple 6 : Mise en œuyre des réactions de polymérisation à partir des HEMA glucosylés
Des mélanges de monomères glycosylés ont été polymérisés. Typiquement, la polymérisation radicalaire d'un mélange molaire HEMA-Glc/HEMA-(Glc)2/HEMA-(Glc)3 61/18/21 a été réalisée.
Les techniques de polymérisation radicalaire contrôlée de type ATRP (Atom Transfer Radical Polymerization) et RAFT (Réversible Addition Fragmentation Transfer) ont été privilégiées.
Une polymérisation typique par ATRP se déroule comme suit.
L'acide 4-(bromométhyl) benzoïque (amorceur de la polymérisation, 10,7 mg, 50 μιηοΐ., 1 éq.) est versée dans 10 mL d'eau (milliQ) et une solution de NaOH aqueuse (0,5 mL, 0,1 M) est ajoutée. L'ensemble est agité jusqu'à dissolution complète.
La solution est ensuite dégazée par bullage d'argon et la bipyridine (ligand, 15,7 mg, 100 μιηοΐ., 2 éq.) et CuIBr (catalyseur, 7,1 mg, 50 μιηοΐ., 1 éq.) sont ajoutés dans cet ordre. 20 mL d'une solution dégazée du mélange de monomères glucosylés-HEMA sont ajoutés (0.78 g, 2.0 mmol., 40 éq.).
La polymérisation se déroule alors pendant 8h à température ambiante.
La réaction est arrêtée par oxydation à l'air du Cul en CuII (la solution passe de marron à bleu). La solution est ensuite passée sur une colonne de silice pour se débarrasser du Cuil. Le milieu réactionnel est alors lyophilisé pour récupérer le polymère sous la forme d'une poudre blanche.
Le rendement de polymérisation est généralement supérieur à 90 %. Exemple 7 : Mise en œuyre de la méthode de glucosylation sur le 2-propènol
(alcool allylique) et sur le 2-mercaptoéthanol (BME)
Glucosylation de l 'alcool allylique et du BME
Le procédé décrit dans les exemples précédents a été utilisé afin de glucosyler d'autres synthons hydroxylés convenant à l'invention en vue de réaliser des réactions de couplage.
Ainsi, le 2-propènol (alcool allylique) et le 2-mercaptoéthanol (BME), ont été testés en suivant le même protocole décrit ci-avant à l'aide des glycane-saccharases sauvages et mutées précédemment mises en œuvre avec le HEM A et le NHAM. Résultats
Les résultats relatifs à l'alcool allylique sont présentés dans les Tableaux 10 et 12. Les résultats relatifs au BME sont présentés dans les Tableaux 11 et 13.
Les résultats indiquent que 4 des enzymes sauvages testées sont capables de glucosyler les molécules acceptrices, à savoir l'ASDg, la GBD-CD2, l'a-l,2-BrS et l'a-l,3-BrS.
A l'instar de ce qui a été observé pour le HEMA et le NHAM, nous observons que les a-l,2-BrS et a-l,3-BrS sont les enzymes les plus efficaces pour réaliser la glucosylation de ces deux accepteurs.
En outre, l'ASNp sauvage ainsi que la très grande majorité des mutants testés s'avèrent aptes à glucosyler le 2-propènol, comme illustré dans le Tableau 12.
Plus particulièrement, 60 mutants sont apparus glucosyler l'alcool allylique au moins aussi efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir I228H, F229D, F229E, F229G, F229H, F229I, F229K, F229M, A289C, A289D, A289E, A289F, A289G, A289H, A289I, A289K, A289L, A289M, A289W, A289Y, F290C, F290D, F290E, F290G, F290H, F290I, F290K, F290L, F290M, F290W, I330C, I330D, I330E, I330F, I330G, I330H, I330K, I330L, I330M, I330S, I330Y, V331C, V331D, V331E, V331F, V331G, V331H, V331I, V331K, V33 IL, V33 IN, V331 W, D394E, D394F, D394G, D394H, D394I, D394K, D394L et R446M.
En particulier, à l'exception de F229H, tous ces mono-mutants sont apparus glucosyler l'alcool allylique plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, et notamment F290C, F290H, I330C, D394E et R446M.
L'ASNp sauvage ainsi que 89 mono-mutants s'avèrent également apte à glucosyler le BME, comme illustré dans le Tableau 13.
Plus particulièrement, 59 mutants sont apparus glucosyler le BME au moins aussi efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir :
I228L, I228V, I228W, I228Y, F229C, F229M, F229P, F229Q, F229V, F229Y,
A289C, A289D, A289E, A289F, A289G, A289H, A289I, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289R, A289S, A289T, A289V, A289W, F290A, F290C, F290D, F290E, F290G, F290I, F290K, F290M, F290P, F290Q, F290S, F290T, F290V, F290W, I330Q, I330V, V331A, V331C, V331D, V331E, V331F, V331G, V331H, V331I, V331N, V331Q, V331R, V331S, V331T, V331 W, V331 Y, D394E et R446S.
En particulier, 57 d'entre eux sont apparus glucosyler le BME plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir :
I228L, I228V, I228W, I228Y, F229C, F229M, F229P, F229V, F229Y, A289C, A289D, A289E, A289F, A289G, A289H, A289I, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289R, A289S, A289T, A289V, A289W, F290A, F290C, F290D, F290E, F290G, F290I, F290M, F290P, F290Q, F290S, F290T, F290V, F290W, I330Q, I330V, V331A, V331C, V331D, V331E, V331F, V331G, V331H, V331I, V331N, V331Q, V331R, V331 S, V331T, V331W, V331Y, D394E et R446S, et en particulier F229Y, A289C, A289D, A289E, A289F, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289T, A289V, A289W, F290D, F290Q, F290S, F290T, F290W, V331C, V331D, V331E, V331F, V331N, V331R, V331S, V331T, V331W et V331Y, et notamment A289F, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289T, F290S, F290T, F290W, V331E, V331T et V331 W. Exemple 8 : Détermination des efficacités de glucosylation du 4-vinyl benzylalcool (VBA) par l'amylosaccharase de TV. polysaccharea (ASNp), par ses mutants et par certaines enzymes de l'exemple 1
Le VBA a été testé en réaction d'accepteur à l'aide de l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea (ASNp), de sa banque de mono-mutants identifiés dans le Tableau 1, comme décrit dans l'exemple 3, et également à l'aide de l'a-l,2-BrS et de l'ASR.
Les résultats obtenus pour le VBA avec les enzymes a-l,2-BrS et ASR sont représentés dans le Tableau 14, tandis que les résultats obtenus pour le VBA avec l'ASNP et ses mono-mutants sont résumés dans le Tableau 15.
Résultats de glucosylation du VBA
Tout d'abord, il est observé que les enzymes a-l,2-BrS et ASR peuvent glucosyler le VBA.
En outre, le VBA peut être glucosylé par l'ASNp sauvage, ainsi que par 26 de ses mono-mutants testés, à savoir : R226H, R226K, R226M, R226N, R226Q, R226S, R226T, R226V, R226Y, I228V, A289M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289T, A289V, F290V, F290W, V331C, V331D, V331G, V331S, V331T, V331Y et R446A.
En particulier, tous ces mono-mutants à l'exception du R226S, sont apparus glucosyler le VBA plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, et notamment A289M, A289N, A289P, A289Q, A289S, A289T, V331C, V331G, V331S, V331T, V331Y et R446A, en particulier A289P, A289Q, A289S et R446A.
Exemple 9 : Détermination des efficacités de glucosylation du N,N-bis(2- hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA) par l'amylosaccharase de N. polysaccharea (ASNp), par ses mutants et par certaines enzymes de l'exemple 1
Le NNHEA a été testé en réaction d'accepteur à l'aide de l'amylosaccharase de Neisseria polysaccharea (ASNp), de sa banque de mono-mutants identifiés dans le Tableau 1, comme décrit dans l'exemple 3, et également à l'aide de l'a-l,2-BrS, l'a-l,3-BrS et de l'ASR. Les résultats obtenus pour le NNHEA avec les enzymes a-l,2-BrS, a-l,3-BrS et ASR sont représentés dans le Tableau 16, tandis que les résultats obtenus pour le NNHEA avec l'ASNp et ses mono-mutants sont résumés dans le Tableau 17. Résultats de glucosylation du NNHEA
Tout d'abord, il est observé que les enzymes a-l,2-BrS, a-l,3-BrS et ASR peuvent glucosyler le NNHEA et conduisent uniquement à la production de NNHEA mono-glucosylés. Des traces de NNHEA di-glucosylé ont également été détectées.
Par traces d'un composé, on entend au sens de l'invention que ce composé est présent dans un échantillon dans une quantité suffisante pour être détectée par une méthode de mesure telle que celle mise en œuvre dans les présents exemples, mais en une quantité trop faible pour pouvoir être mesurée.
De même, la valeur de 0 indiquée dans les tableaux du présent document signifie que le composé concerné est soit absent, soit présent en une quantité tellement faible qu'elle n'est pas détectable par une méthode de mesure telle que celle mise en œuvre dans les présents exemples.
En outre, le NNHEA peut être glucosylé par l'ASNp sauvage, ainsi que par 113 de ses mono-mutants testés, comme illustré dans le Tableau 17.
En particulier, 30 d'entre eux sont apparus glucosyler le NNHEA plus efficacement que l'enzyme sauvage parentale, à savoir :
I228V, F229M, A289C, A289G, A289M, A289N, A289Q, A289S, A289T, A289V, F290A, F290C, F290G, F290I, F290K, F290L, F290M, F290Q, F290S, F290T, F290V, F290W, I330V, V331D, V331E, V331G, V331N, V331S, V331T et V331Y. Exemple 10 : Glycosylation d'accepteurs catalysée par une fructosyltransférase
Afin de varier la nature du sucre transféré sur les accepteurs, le potentiel d'une fructosyltransférase commercial a été évalué sur le HEMA, le NHAM et le HEAA (N-(hydro)ethyl acrylamide), dans des conditions similaires à celles mises en œuvre précédemment avec les glucane-saccharases.
Ces accepteurs ont ainsi été fructosylés par la fructosyltransférase de Bacillus subtilis (voir Tableau 1). Résultats
Les chromatogrammes obtenus sur colonne Hypercarb et amino, comme décrit précédemment, après réaction de fructosylation à partir de la fructosyltransférase de B. subtilis, ont permis d'observer une fructosylation de l'ensemble des accepteurs testés.
Plus particulièrement, la fructosylation totale observée pour le HEMA est de
32,5 mg/L, pour le HEAA de 84,8 mg/L et pour le NHAM de 21,1 mg/L.
Plus particulièrement, tandis que seuls des HEMA et NHAM mono-fructosylés ont été obtenus, le HEAA a été fructosylés, 1 , 4, 5, 6 et même 7 fois. Dans la mesure où ces accepteurs ne possèdent qu'un seul groupe hydroxyle réactif, un seul type de chaque niveau de fructosylation de ces molécules est obtenu.
En outre, la consommation de saccharose de la fructosyltransférase mise en œuvre et les taux de production (en g/L) des accepteurs testés fructosylés ont été mesurés.
On observe que dans tous les cas, plus de 98 % du saccharose a été consommé par l'enzyme. En outre, on observe une production de HEAA fructosylés 3 à 4 fois supérieure à celle observée avec le NHAM et le HEMA.
Exemple 11 : Etude des produits de glucosylation du NNHEA de l'exemple 9
Les produits de glucosylation obtenus à l'exemple 9 avec certaines des enzymes testées ont été analysés plus finement par LC-MS (détection UV204 pour le NNHEA), selon le protocole indiqué à l'exemple 1.
Les résultats ainsi obtenus sont représentés dans le Tableau 18.
Ainsi, le NNHEA a très majoritairement été uniquement mono-glucosylé par les enzymes testées, en particulier par l'ASNp sauvage et ses mutants A289Q, F290C, F290L, et F290V. Des traces de NNHEA di-glucosylé ont également été détectées avec les monomutants F290C, F290L et F290V.
Le mutant F290W a quant à lui permis d'obtenir à la fois des NNHEA mono-glucosylés et des NNHEA di-glucosylés. Exemple 12 : Détermination des efficacités de glucosylation du HEAA par certaines enzymes de l'Exemple 1
Les réactions en présence de HEAA ont été mises en œuvre en appliquant les conditions décrites dans l'exemple 1.
Ces réactions d'accepteurs ont été mises en œuvre avec un panel de 3 Glycane- saccharases sauvages, à savoir : ASR, a-l,3-BrS et la fructosyltransférase de Bacillus subtilis indiquée dans le Tableau I.
L'un des mono-mutants de l'ASNp sauvage, le mono-mutant D394E, a également été testé.
Après 24h de réaction, le milieu réactionnel est analysé par HPLC-MS sur colonne Hypercarb (30 min) pour identifier les produits de glucosylation.
Le Tableau 19 présente le taux de conversion du saccharose et la glucosylation totale de chacune de ces enzymes.
En outre, les produits de glucosylation obtenus avec l'ASR, l'a-l,3-BrS et le mono-mutant D394E de l'ASNp ont été analysés plus finement par LC-MS (détection UV215 pour le HEAA), selon le protocole indiqué dans les exemples précédents. Les résultats obtenus sont indiqués dans le Tableau 20.
Ainsi, l'ASR permet d'obtenir des HEAA mono-glycosylés, des HEAA di-glucosylés et des HEAA tri-glucosylés.
Dans d'autres expériences similaires réalisées par les inventeurs, des HEAA glucosylés 4, 5, 6, 7 ou 8 fois ont également pu être observés.
A l'inverse, l'a-l,3-BrS et le mono-mutant D394E de l'ASNp sauvage ne permettent d'obtenir que des HEAA mono-glucosylés. Seules des traces de HEAA di-glucosylés sont observées avec ces deux enzymes.
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(EC 2.4.1.4)
290, 330, 331, 394, 446) Champion C. et al., J. Am. Glucane-saccharases Chem. Soc, 2009, 131, 7379- 7389
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Glucane-saccharase
Dextrane-saccharase
Oenococcus kitaharae
(DSR-S-OK) FR1301402 DSM17330
Glucane-saccharase
Leuconostoc citreum a- 1,3 BrS
FR1301402 NRRL B -742 Glucane-saccharase
Leuconostoc citreum a- 1,2 BrS FR1301402
NRRL B-1299 Glucane-saccharase WO/2002/074943
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Biotechnology, Volume 116, Issue 4, 6 April 2005, Pages 347-357
Tableau 1 HPLC Dionex
U3000 Hypercarb
Hypercarb (6 min.) Amino (30 min) C18
(Thermo scientific) (30 min.)
Hypercarb 5μηι Hypercarb 5μηι
Sperisorb Amino, 5um Cl 8 SB ZORBAX,
Colonne (100x2,1mm) - (100x2.1mm) - (250x4.0mm) - 5μηι
Eluent Thermo Thermo
Bischoff (250x4.6mm) - Débit / ACN 10 % / H2O 90 Gradient H20-
ACN 80 % / H20 20 % Agilent Température % ACN
1 ml/min ; 30°C Gradient H20-ACN
0,5 ml/min ; 8°C 0,5 ml/min ; 8°C
1 ml/min ; 30°C
DEDL
(Détecteur
Evaporatif à
Détection LC UV210/2i5„m + DEDL UV204„m + DEDL
Diffusion de
Lumière)
Ionisation Electrospray positif (ESI+) ; source à
Détection LC-MS - 450°C. Tension capillaire : 3kV ; Tension cône : 50 V
Tableau 2
Ratio : saccharose 143 mM / HEMA
Glucosylation du HEMA (g/L)
438 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes HEMA-Glcl HEMA-Glc2 HEMA-Glc3 saccharose (%) totale
ASDg 95,0 2,709 1,306 1,403 0
ASR 95,0 21,030 6,745 7,046 7,240
GBD-CD2 23,7 2,168 2,168 0 0
DSR-S-A4N 39,0 0 0 0 0
DSR-OK 29,0 0 0 0 0 a-l,2-BrS 93,2 10,635 10,421 0,215 0 a-l,3-BrS 84,4 13,486 12,628 0,858 0
Tableau 3
Ratio : saccharose 143 mM / NHAM
Glucosylation du NHAM (g/L)
438 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes NHAM-Glcl NHAM-Glc2 NHAM-Glc3 saccharose (%) totale
ASDg 12 0,136 0,136 0 0
ASR >95 0,340 0,135 0,205 0
GBD-CD2 42 2,201 1,517 0,684 0
DSR-S-A4N 60 0,062 0,062 0 0
DSR-OK >95 0,149 0,149 0 0 a-l,2-BrS >95 1,886 1,781 0,054 0,050 a-l,3-BrS >95 2,078 1,918 0,160 0
Tableau 4
= 0,079 g/L Mutants positifs
Figure imgf000074_0001
Tableau 5
Figure imgf000075_0001
Ratio : saccharose 73 mM / HEMA 73
Glucosylation du HEMA (g/L)
mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes HEMA-Glcl HEMA-Glc2 HEMA-Glc3 saccharose (%) totale
ASNp sauvage 87 0,141 0,079 0,062 Traces
F229W 92,5 0,121 0,069 0,052 0
F290A 73,5 4,532 1,961 0,486 2,084
F290C 83 8,966 6,064 1,734 1,167
F290I 69 3,134 2,377 0,420 0,337
F290K 57 0,795 0,616 0,179 Traces
F290L 92 2,197 1,531 0,621 0,045
F290M 92 0,793 0,544 0,249 Traces
F290V 40 5,938 4,535 0,704 0,699
I330A 4 0,287 0,188 0,099 0
V331E 88 0,444 0,299 0,145 0
D394A 23 0,236 0,149 0,087 0
R446G 14,5 0,191 0,094 0,041 0,055
Tableau 7 Ratio : saccharose 73 mM / NHAM 73
Glucosylation du NHAM (g/L)
mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes NHAM-Glcl NHAM-Glc2 NHAM-Glc3 saccharose (%) totale
ASNp sauvage 76,5 0,101 0,025 0,076 0
F229M 73,7 0,169 0,130 0,033 0,007
F229N 2,5 0,100 0,051 0,049 0
A289N 90,8 0,211 0,126 0,084 0
A289P 81,0 0,127 0,032 0,096 0
A289Q 52,1 0,083 0,037 0,045 0
133 ON 0,6 0,096 0,033 0,063 0
V331C 75,0 0,065 0,031 0,029 0,004
V331D 17,7 0,077 0,039 0,032 0,007
V331E 64,2 0,145 0,097 0,038 0,010
V331T 86,9 0,100 0,031 0,069 0
D394E 86,6 0,187 0,137 0,050 0
Tableau 8 Production
Accepteur Enzyme Volume Lyophilisé g/L estimée (g)
F290C 500 oui 38,8 19,4
HEMA ASR 500 oui 29,7 14,8 a-l,3-BrS 500 oui 15,1 7,5
D394E 500 oui 1 0,5
NHAM ASR 500 non 1 0,5 a-l,3-BrS 500 oui 2,5 1,25
Tableau 9
Ratio : saccharose 143 mM / 2-
Glucosylation de l'alcool allylique (g/L) propèn-ol 438 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes
saccharose (%) totale
ASDg 82,6 0,166
ASR 91,5 0
GBD-CD2 46,3 1,225
DSR-S-A4N 76,1 0
DSR-OK 97,4 0 a-l,2-BrS 88,8 1,908 a-l,3-BrS 76,6 1,207
Tableau 10
Ratio : saccharose 143 mM /
Glucosylation du BME (g/L) BME 438 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes
saccharose (%) totale
ASDg 80,4 1,849
ASR 91,3 0
GBD-CD2 3,0 1,674
DSR-S-A4N 5,5 0
DSR-OK 97,2 0 a-l,2-BrS 89,1 2,848 a-l,3-BrS 81,9 2,736
Tableau 11
Sil i = 0,619 g/L Mutants positifs
production estimée en tj/L
Figure imgf000081_0001
Tableau 12
>%ι·.ντ| = D.OZl g/L Mulets positifs
production estimés m g/L
Figure imgf000082_0001
Tableau 13
Ratio : saccharose 73 mM / VBA
Glucosylation du VBA 73 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes
saccharose (%) totale (g/L) a-l,2-BrS 63,1 7,9
ASR 95,3 2,5
Tableau 14
= 0.5 mgih MlÉM fWSiÎÏS
production estimée en mg> A-
Figure imgf000084_0001
Tableau 15
Ratio : saccharose 73 mM / NNHEA
Glucosylation du NNHEA (g/L)
73 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes NNHEA-Glcl NNHEA-Glc2 NNHEA-Glc3 saccharose (%) totale
ASR >98 0,86 0,86 Traces 0 a-l,2-BrS 90 1,76 1,76 Traces 0 a-l,3-BrS >98 1,47 1,47 Traces 0
Tableau 16
= l6 g/L Mutants positifs
Figure imgf000086_0001
Tableau 17
Ratio : saccharose 73 mM / NNHEA
Glucosylation du NNHEA (g/L)
73 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes NNHEA-Glcl NNHEA-Glc2 NNHEA-Glc3 saccharose (%) totale
ASNp sauvage 98 1,7 1,7 0 0
A289Q 99 5,1 5,1 0 0
F290C 69 7,2 7,2 Traces 0
F290L 89 6,6 6,6 Traces 0
F290V 99 9,0 9,0 Traces 0
F290W 68 5,3 3,0 2,3 0
Tableau 18
Ratio : saccharose 146 mM /
Glucosylation du HEAA (g/L) HEAA 438 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes
saccharose (%) totale
ASR 92 2,8 a-l,3-BrS 97 2,4
D394E 81 3,9
Fructosyltransférase de Bacillus
subtilis du 99,2 0,08 Tableau I
Tableau 19
Ratio : saccharose 146 mM / HEAA
Glucosylation du HEAA (g/L)
348 mM
Conversion du Glucosylation
Enzymes HEAA-Glcl HEAA-Glc2 HEAA-Glc3 saccharose (%) totale
ASR 92 2,823 0,851 1,54 0,431 a-l,3-BrS 97 2,441 2,441 Traces 0
D394E 81 3,883 3,883 Traces 0
Tableau 20
SEQUENCES :
Série SEQ ID NO : 1 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase ASNp sauvage (Amylosucrase Neisseria polysacchareà))
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEHT AWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQY NPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLND DD WS QD SNKSDD SRWAHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SNP RFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIGG KTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA
Série SEQ ID NO : 2 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) R226Xi
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLXiEIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEHT AWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQY NPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLND DD WS QD SNKSDD SRWAHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SNP RFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIGG KTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA Série SEQ ID NO : 3 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) I228X2)
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREX2FPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGE MLFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKS EAIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEH TAWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ YNPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDDWSQDSNKSDDSRWAHRPRYNEALYAQRNDPSTAAGQIYQDLRHMIAVRQSN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA
Série SEQ ID NO : 4 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) F229Xa>
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIX3PDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGE MLFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKS EAIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEH TAWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ YNPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDDWSQDSNKSDDSRWAHRPRYNEALYAQRNDPSTAAGQIYQDLRHMIAVRQSN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA SEQ ID NO : 5 : (Protéine = séquence mutée de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) A289X4)
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVX4FIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKS EAIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEH TAWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ YNPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDD WS QD SNKSDD SRW AHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIR NALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA
Série SEQ ID NO : 6 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) F290Xs,)
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAX5IWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKS EAIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEH TAWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ YNPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDD WS QD SNKSDD SRW AHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA Série SEQ ID NO : 7 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) Ι330Χβ,
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AXeVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEH TAWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ YNPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDD WS QD SNKSDD SRW AHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA
Série SEQ ID NO : 8 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysacchareà) V331X7
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AIX7HPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEHT AWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQY NPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLND DDWSQDSNKSDDSRWAHRPRYNEALYAQRNDPSTAAGQIYQDLRHMIAVRQSNP RFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIGG KTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA Série SEQ ID NO : 9 : (Protéines = séquences mutées de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysaccharea) D394X8)
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEHT AWVNYVRSHDX8IGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQ Y NPSTGDCRVSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLND DDWSQDSNKSDDSRWAHRPRYNEALYAQRNDPSTAAGQIYQDLRHMIAVRQSNP RFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIGG KTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA
SEQ ID NO : 10 : (Protéine = séquence mutée de la glucane-saccharase ASNp (Amylosucrase Neisseria polysaccharea) R446X¾
SPNSQYLKTRILDIYTPEQRAGIEKSEDWRQFSRRMDTHFPKLMNELDSV YGNNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQRNSSLKDIDIARENNPDWILSNKQVGGVCYV DLFAGDLKGLKDKIPYFQELGLTYLHLMPLFKCPEGKSDGGYAVSSYRDVNPALGT IGDLREVIAALHEAGISAVVDFIFNHTSNEHEWAQRCAAGDPLFDNFYYIFPDRRMP DQYDRTLREIFPDQHPGGFSQLEDGRWVWTTFNSFQWDLNYSNPWVFRAMAGEM LFLANLGVDILRMDAVAFIWKQMGTSCENLPQAHALIRAFNAVMRIAAPAVFFKSE AIVHPDQVVQYIGQDECQIGYNPLQMALLWNTLATREVNLLHQALTYRHNLPEHT AWVNYVRSHDDIGWTFADEDAAYLGISGYDHRQFLNRFFVNRFDGSFARGVPFQY NPSTGDCX9VSGTAAALVGLAQDDPHAVDRIKLLYSIALSTGGLPLIYLGDEVGTLN DDD WS QD SNKSDD SRW AHRPRYNE AL Y AQRNDP ST AAGQI YQDLRHMI AVRQ SN PRFDGGRLVTFNTNNKHIIGYIRNNALLAFGNFSEYPQTVTAHTLQAMPFKAHDLIG GKTVSLNQDLTLQPYQVMWLEIA Série SEQ ID NO : 11 : (Protéine = séquence de la DSR-S-A4N (Dextrane- saccharase tronquée DSR-S vardelA4N ù Leuconostoc mesenteroides B-512F))
TQQVSGKYVEKDGSWYYYFDDGKNAKGLSTIDNNIQYFYESGKQAKG QYVTIDNQTYYFDKGSGDELTGLQSIDGNIVAFNDEGQQIFNQYYQSENGTTYYFD DKGHAATGIKNIEGKNYYFDNLGQLK GFSGVIDGQIMTFDQETGQEVSNTTSEIKE GLTTQNTDYSEHNAAHGTDAEDFENIDGYLTASSWYRPTGILRNGTDWEPSTDTDF RPILSVWWPDKNTQVNYLNYMADLGFISNADSFETGDSQSLLNEASNYVQKSIEMK ISAQQSTEWLKDAMAAFIVAQPQWNETSEDMSNDHLQNGALTYVNSPLTPDANSN FRLLNRTPTNQTGEQAYNLDNSKGGFELLLANQEDNSNVVVEAEQLNWLYYLMNF GTITANDADANFDGIRVDAVDNVDADLLQIAADYFKLAYGVDQND ATANQHLSIL EDWSHNDPLYVTDQGSNQLTMDDYVHTQLIWSLTKSSDIRGTMQRFVDYYMVDR SNDSTENEAIPNYSFVRAHDSEVQTVIAQIVSDLYPDVENSLAPTTEQLAAAFKVYN EDEKLADK YTQYNMASAYAMLLTNKDTVPRVYYGDLYTDDGQYMATKSPYYD AINTLLKARVQYVAGGQSMSVDSNDVLTSVRYGKDAMTASDTGTSETRTEGIGVIV SNNAELQLEDGHTVTLHMGAAHKNQAYRALLSTTADGLAYYDTDENAPVAYTDA NGDLIFTNESIYGVQNPQVSGYLAVWVPVGAQQDQDARTASDTTTNTSDKVFHSN AALDSQVIYEGFSNFQAFATDSSEYTNVVIAQNADQFKQWGVTSFQLAPQYRSSTD TSFLDSIIQNGYAFTDRYDLGYGTPTKYGTADQLRDAIKALHASGIQAIADWVPDQI YNLPEQELATVTRTNSFGDDDTDSDIDNALYVVQSRGGGQYQEMYGGAFLEELQA LYPSLFKVNQISTGVPIDGSVKITEWAAKYFNGSNIQGKGAGYVLKDMGSNKYFKV VSNTEDGDYLPKQLTNDLSETGFTHDDKGIIYYTLSGYRAQNAFIQDDDNNYYYFD KTGHLVTGLQKINNHTYFFLPNGIELVKSFLQNEDGTIVYFDK GHQVFDQYITDQN GNAYYFDDAGVMLKSGLATIDGHQQYFDQNGVQVKDKFVIGTDGYKYYFEPGSG NLAILRYVQNSKNQWFYFDGNGHAVTGFQTINGK QYFYNDGHQSKGEFIDADGD TFYTSATDGRLVTGVQKINGITYAFDNTGNLITNQYYQLADGKYMLLDDSGRAKT GFVLQDGVLRYFDQNGEQVKDAIIVDPDTNLS
Série SEQ ID NO : 12 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase a-1,2 BrS {a-1,2 BrS de Leuconostoc citreum NRRL B-1299))
MRQKETITRK LYKSGKSWVAAATAFAVMGVSAVTTVSADTQTPVGT TQSQQDLTGQRGQDKPTTKEVIDKKEPVPQVSAQNAGDLSADAKTTKADDKQDTQ PTNAQLPDQGNKQTNSNSDKGVKESTTAPVKTTDVPSKSVTPETNTSINGGQYVEK DGQFVYIDQSGKQVSGLQNIEGHTQYFDPKTGYQTKGELK IDDNAYYFDKNSGN GRTFTKISNGSYSEKDGMWQYVDSHDKQPVKGLYDVEGNLQYFDLSTGNQAKHQI RSVDGVTYYFDADSGNATAFKAVTNGRYAEQTTKDKDGNETSYWAYLDNQGNAI KGLNDVNGEIQYFDEHTGEQLKGHTATLDGTTYYFEGNKGNLVSVVNTAPTGQYK INGDNVYYLD NNEAIKGLYGINGNLNYFDLATGIQLKGQAK IDGIGYYFDKDTG NGSYQYTLMAPSNK DYTQHNVV NLSESNFK LVDGFLTAETWYRPAQILSHGT DWVASTDKDFRPLITVWWPNKDIQVNYLRLMQNEGVLNQSAVYDLNTDQLLLNE AAQQAQIGIEKKISQTGNTDWL NVLFTTHDGQPSFIKQQYLWNSDSEYHTGPFQG GYLKYQNSDLTPNVNSKYRNADNSLDFLLANDVDNSNPIVQAEDLNWLYYLLNFG SITTQGKE NSNFDSIRIDAVDFVSNDLIQRTYD YLRAAYGVDK DKEANAHLSLVE AGLDAGTTTIHQDALIESDIREAMK SLTNGPGSNISLSNLIQDKEGDKLIADRA NS TENVAIPNYSIIHAHDKDIQDKVGAAITDATGADWTNFTPEQLQKGLSLYYEDQRKI EK YNQYNIPSAYALLLTNKDTVPRVYYGDMYQDDGQYMQKQSLYFDTITALME ARKQFVAGGQTINVDDNGVLTSVRFGKGAMTANDIGTNETRTQGIGVVIANDPSLK L SKD SKVTLHMG AAHRNQN YRALLLTTDNGID S YS S SK AP VIKTDDNGDL VF SNQ DINDQLNTKVHGFLNSEVSGYLSAWVPLDATEQQDARTLPSEKSVNDGKVLHSNA ALDSNLIYEAFSNFQPMPTNRNEYTNVVIADKADTFKSWGITSFEMAPQYRSSQDKT FLDSTIDNGYAFTDRYDLGFEKPTKYGNDEDLRQAIKQLHSSGMQVMADVVANQI YNLPGKEVASTNRVDWNG NLSTPFGTQMYVVNTVGGGKYQNKYGGEFLDKLK AAYPDIFRSK YEYDVK YGGNGTGSVYYTVDSKTRAELDTDTKIKEWSAKYMN GTNVLGLGMGYVLKDWQTGQYFNVSNQNMKFLLPSDLISNDITVQLGVPVTDKKII FDPASAYNMYSNLPEDMQVMDYQDDK STPSIKPLSSY NKQVQVTRQYTDSKGV SWNLITFAGGDLQGQKLWVDSRALTMTPFKTMNQISFISYANRNDGLFLNAPYQVK GYQLAGMSNQYKGQQVTIAGVANVSGKDWSLISFNGTQYWIDSQALNTNFTHDM NQKVFVNTTSNLDGLFLNAPYRQPGYKLAGLAK Y NQTVTVSQQYFDDQGTVW SQVVLGGQTVWVDNHALAQMQVRDTNQQLYVNSNGRNDGLFLNAPYRGQGSQLI GMTADYNGQHVQVTKQGQDAYGAQWRLITL NQQVWVDSRALSTTIMQAMNDD MYVNSSQRTDGLWLNAPYTMSGAKWAGDTRSANGRYVHISKAYSNEVGNTYYLT NLNGQSTWIDKRAFTATFDQVVALNATIVARQRPDGMFKTAPYGEAGAQFVDYVT NYNQQTVPVTKQHSDAQGNQWYLATVNGTQYWIDQRSFSPVVTKVVDYQAKIVP RTTRDGVFSGAPYGEVNAKLVNMATAYQNQVVHATGEYTNASGITWSQFALSGQ EDKLWIDKRALQA Série SEQ ID NO : 13 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase GBD-CD2 (Dextrane-sucrase tronquée DSR-E de Leuconostoc mesenteroides NRRL B-1299))
MAHHHHHHVTSLYKKAGSAAAPFTMAQAGHYITKNGNDWQYDTNGE LAKGLRQDSNGKLRYFDLTTGIQAKGQFVTIGQETYYFSKDHGDAQLLPMVTEGH YGTITLKQGQDTKTAWVYRDQNNTILKGLQNINGTLQFFDPYTGEQLKGGVAKYD DKLFYFESGKGNLVSTVAGDYQDGHYISQDGQTRYADKQNQLVKGLVTVNGALQ YFDNATGNQIKNQQVIVDGKTYYFDDKGNGEYLFTNTLDMSTNAFSTKNVAFNHD SSSFDHTVDGFLTADTWYRPKSILANGTTWRDSTDKDMRPLITVWWPNKNVQVNY LNFMKANGLLTTAAQYTLHSDQYDLNQAAQD VQVAIERRIASEHGTDWLQKLLFE SQNNNPSFVKQQFIWNKDSEYHGGGDAWFQGGYLKYGNNPLTPTTNSDYRQPGN AFDFLLANDVDNSNPVVQAENLNWLHYLMNFGTITAGQDDANFDSIRIDAVDFIHN DTIQRTYDYLRDAYQVQQSEAKANQHISLVEAGLDAGTSTIHNDALIESNLREAATL SLTNEPGKNKPLTNMLQDVDGGTLITDHTQNSTENQATPNYSIIHAHDKGVQEKVG AAITDATGADWTNFTDEQLKAGLELFYKDQRATNKKYNS YNIPSIYALMLTNKDT VPRMYYGDMYQDDGQYMANKSIYYDALVSLMTARKSYVSGGQTMSVDNHGLLK SVRFGKDAMTANDLGTSATRTEGLGVIIGNDPKLQLNDSDKVTLDMGAAHKNQKY RAVILTTRDGLATFNSDQAPTAWTNDQGTLTFSNQEINGQDNTQIRGVANPQVSGY LAVWVPVGASDNQDARTAATTTENHDGKVLHSNAALDSNLIYEGFSNFQPKATTH DELTNVVIAKNADVFNNWGITSFEMAPQYRSSGDHTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGF NTPTKYGTDGDLRATIQALHHANMQVMADVVDNQVYNLPGKEVVSATRAGVYG NDDATGFGTQLYVTNSVGGGQYQEKYAGQYLEALKAKYPDLFEGKAYDYWYKN YANDGSNPYYTLSHGDRESIPADVAIKQWSAKYMNGTNVLGNGMGYVLKDWHN GQYFKLDGDKSTLPKGGRADPAFLYKVVSAWSHPQFEK
Série SEQ ID NO : 14 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase ASDg (Amylosaccharase de Deinococcus geothermalis))
MLKDVLTSELAAQVRDAFDDDRDAETFLLRLERYGEDLWESLRAVYGD QVRALPGRLLEVMLHAYHARPAELRRLDEARLLRPDWLQRPEMVGYVAYTDRFA GTLKGVEERLDYLEGLGVKYLHLMPLLRPREGENDGGYAVQDYRAVRPDLGTMD DLSALARALRGRGISLVLDLVLNHVAREHAWAQKARAGDPKYRAYFHLFPDRRGP DAFEATLPEIFPDFAPGNFSWDEEIGEGEGGWVWTTFNSYQWDLNWANPDVFLEFV DIILYLANRGVEVFRLDAIAFIWKRLGTDCQNQPEVHHLTRALRAAARIVAPAVAFK AEAIVAPADLIHYLGTRAHHGKVSDMAYHNSLMVQLWSSLASRNTRLFEEALRAFP PKPTSTTWGLYVRCHDDIGWAISDEDAARAGLNGAAHRHFLSDFYSGQFPGSFARG LVFQYNPVNGDRRISGSAASLAGLEAALETGDPGRIEDAVRRLLLLHTVILGFGGVP LLYMGDELALLNDYAFEDVPEHAPDNRWVHRPQMDWALAERVRQEPSSPAGRVN TGLRHLLRVRRDTPQLHASIESQVLPSPDSRALLLRRDHPLGGMVQVYNFSEETVM LPSHVLRDVLGDHVQDRLSGSAFRLDRPTVRLEGYRALWLTAGEAPA
Série SEQ ID NO : 15 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase DSR-S-OK (Dextrane-saccharase de Oenococcus kitaharae DSM17330))
MMATGSNLITAQADDLNQEGTAAQSVSPSTAAANQSESSAQSTEQSATQ AATDGEASTVSTAVTTITPHYVQQAGKWLYMGSDGEFVKGPQTIDGNLQFFDEQGI QIKGSFETVDGSSYYFDSQSGNAVTGFKIINNDLHYFEEDGKETV NYATDKQGNIF YFDENGQMATGVKTIQGQSYYFDQDGHMRKGYSGVFDNQVLYFDKTTGALANTN VSSIKEGLTAQNDDFTAHNAVYSTKSESFTNIDGYLTAEAWYRPADILENGTDWRA SRADEFRPILTTWWPDKQTEVNYLNYMKTQGFITNDQDFKLSDDQLLLNHAAQSV QGEIEKKISQQGSTDWLKTLLQTFINQQPSWNGESEDPGSDHLQGGALTFVNSPLTP DSNSNFRLLNRTPTNQTGTPQYDTDASLGGFELLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLY YLLNFGSITADDPNANFDGIRIDAVDNVDADLLQIAAAYFKDAFKSGSNDQTTNQH LSILEDWSHNDPEYMKAQGYPQLTMDDYMHTQLIWSLTKPDNIRGTMQRFMDYY LVNRANDST NEAVANYSFVRAHDSEVQTVIAQIISDLYPNSGSGLIPTTDQLQAAF EVYNADMKSDVK YTQYNIPSAYAMLLTNKDTVPRVYYGDMYTDDGDYMANKS PYFDAISTLLKARVKYAAGGQSMAVDK DILTSVRFGQNAMLASDSGDNQTRQEG IGVIVS NSHLKLAENDQVVLHMGAAHK QAFRALLLTIESGLENFDTDLQAPVKY TDANGDLIFTAAELAGYLNPEVSGYLSAWVPVGAADNQDARTAADSATSTDGNVF HSNAALDSNVIFEGFSNFQSIPTAEQHDDFTNVKIAENAGLFKDWGITSFQLAPQYRS STDSTFLDSIIQNGYAFTDRYDLGFDTPTKYGDVDDLRAAIKALHA NIQVMADWV PDQIYNLQNPEIITVNRTDSYGQPIAGSDLQNDLYLAYTNGGGQYQTKFGGAFLEKL QQLYPDLFTKTQISTGQTIDPSQKITEWSAKYFNGSNIQGRGAYYVLRDSGTDQYFK VISNDENEAFLPKQLTNQPGETGFSQDDQGIIFFSTSGYQAK AFVQGDDGNYYYFD NTGHMVTGPQTINGRHYLFFPNGVEAQNVFVQNDRGETYYYDQRGRQVANQYVT DTNGNSFRFDENGIMLANQLAQVDGHWQFFKSSGVQAKDAFILGSDGKLRYFESG NGNMAVNEFKGSENGRYYYFGADGQAVSGLQTINGRQLYFDDHGQQMKDAFYTN QSGQRFYFNALTGDLVKGNFIYTSASSSFTPDNDSSDSYQGDSHLWYYADSQGQIV TGFQTINGHLQYFDDISGQMITNRFMRRADGNWIYLDENGEAVRGMRVINGLTNYF RDDFTQVKDGFAQDPNSGERHYFNGTNGAMVTNDYFSPDQIHWYYADDSGQPVT GFQTIKGQVQYFDQDGIQLKGGSQTDPVTKQTYYFDDKFGNGQIL
Série SEQ ID NO : 16 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase a-1,3 BrS {a-1,3 BrS de Leuconostoc citreum NRRL B-742))
MEMKETITRKKLYKSGKSWVAAATAFAVMGVSAVTTVSADTQTPVGT TQSQQDLTGQTGQDKPTTKEVIDKKEPVPQVS AQNVGDLS ADAKTPKADDKQDTQ PTNAQLPDQGNKQTNSNSDKGVKESTTAPVKTTDVPSKSVAPETNTSINGGQYVEK DGQFVYIDQSGKQVSGLQNIEGHTQYFDPKTGYQTKGELK IDDNAYYFDK SGN GRTFTKISNGSYSEKDGMWQYVDSHDKQPVKGLYDVEGNLQYFDLSTGNQAKHQI RSVDGVTYYFDADSGNATAFKAVTNGRYAEQTTKDKDGNETSYWAYLDNQGNAI KGLNDVNGEIQYFDEHTGEQLKGHTATVDGTTYYFEGNKGNLVS VVNTAPTGQYK INGDNVYYLD NNEAIKGLYGINGNLNYFDLATGIQLKGQAK IDGIGYYFDQ NG NGEYRYSLTGPVVKDVYSQHNAV NLSA NFK LVDGFLTAETWYRPAQILSHGT DWVASTDKDFRPLITVWWPNKDIQVNYLKLMQQIGILDNSVVFDTNNDQLVLNKG AESAQIGIEK VSETGNTDWLNELLFAPNGNQPSFIKQQYLWNVDSEYPGGWFQGG YLAYQNSDLTPYANTNPDYRTHNGLEFLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLYYLMNF GQITANDSNANFDSMRIDAISFVDPQIAKKAYDLLDKMYGLTDNEAVANQHISIVEA PKGETPITVEKQSALVESNWRDRMKQSLSK ATLDKLDPDPAINSLEKLVADDLVN RSQSSDKDSSTIPNYSIVHAHDKDIQDTVIHIMKIV NNPNISMSDFTMQQLQNGLK AFYEDQHQSVK YNQYNIPSAYALLLTNKDTVPRVFYGDMYQDYGDDLDGGQYM ATKSIYYNAIEQMMKARLKYVAGGQIMAVTKIK DGINKDGTNKSGEVLTSVRFG KDIMDAQGQGTAESRNQGIGVIVSNSSGLELK SDSITLHMGIAHK QAYRALMLT NDKGIVNYDQD NAPIAWTNDHGDLIFTNQMINGQSDTAVKGYLNPEVAGYLAV WVPVGANDNQDARTVTTNQK TDGKVLHTNAALDSKLMYEGFSNFQKMPTRGN QYANVVITK IDLFKSWGITDFELAPQYRSSDGKDITDRFLDSIVQNGYGLSDRYDL GFKTPTKYGTDQDLRKAIERLHQAGMSVMADFVANQIYGLHADKEVVSAQHVNIN GDTKLVVDPRYGTQMTVVNSVGGGDYQAKYGGEYLDTISKLYPGLLLDSNGQKID LSTKIKEWSAKYLNGSNIPQVGMGYVLKDW NGQYFHILDKEGQYSLPTQLVSND PETQIGESVNYKYFIGNSDATYNMYHNLPNTVSLINSQEGQIKTQQSGVTSDYEGQQ VQ VTRQ YTD SKG VS WNLITF AGGDLQ GQKL W VD SRALTMTPFKTMNQI SFI S Y AN RNDGLFLNAPYQVKGYQLAGMSNQYKGQQVTIAGVANVSGKDWSLISFNGTQYW IDSQALNTNFTHDMNQKVFVNTTSNLDGLFLNAPYRQPGYKLAGLAKNYNNQTVT VSQQYFDDQGTVWSEVVLGGQTVWVDNHALAQMQVSDTSQQLYVNSNGRNDGL FLNAPYRGQGSQLIGMTADYNGQHVQVTKQGQDAYGAQWRLITLNNQQVWVDS RALSTTIVQAMNDDMYVNSNQRTDGLWLNAPYTMSGAKWAGDTRSANGRYVHIS KAYSNEVGNTYYLTNLNGQSTWIDKRAFTATFDQVVALNATIVARQRPDGMFKTA PYGEAGAQFVDYVTNYNQQTVPVTKQHSDAQGNQWYLATVNGTQYWIDQRSFSP VVTKVVDYQAKIVPRTTRDGVFSGAPYGEVNAKLVNMATAYQNQVVHATGEYTN ASGITWSQFALSGQEDKLWIDKRALQA
Série SEQ ID NO : 17 : (Protéine = séquence de la glucane-saccharase ASR- C-del-bis (Alternane-saccharase tronquée de Leuconostoc mesenteroides NRRL B- 1355))
MEQQETVTRKKLYKSGKVWVAAATAFAVLGVSTVTTVHADTNSNVAV KQINNTGTNDSGEK VPVPSTNNDSLKQGTDGFWYDSDGNRVDQKTNQILLTAEQ LKKNNEKNLSVISDDTSKKDDENISKQTKIANQQTVDTAKGLTTSNLSDPITGGHYE NHNGYFVYIDASGKQVTGLQNIDGNLQYFDDNGYQVKGSFRDVNGKHIYFDSVTG KASSNVDIVNGKAQGYDAQGNQLKKSYVADSSGQTYYFDGNGQPLIGLQTIDGNL QYFNQQGVQIKGGFQDVNNKRIYFAPNTGNAVANTEIINGKLQGRDANGNQVKNA FSKDVAGNTFYFDANGVMLTGLQTISGKTYYLDEQGHLRKNYAGTFNNQFMYFDA DTGAGKTAIEYQFDQGLVSQSNENTPHNAAKSYDKSSFENVDGYLTADTWYRPTDI LKNGDTWTASTETDMRPLLMTWWPDKQTQANYLNFMSSKGLGITTTYTAATSQK TLNDAAFVIQTAIEQQISLK STEWLRDAIDSFVKTQANWNKQTEDEAFDGLQWLQ GGFLAYQDDSHRTPNTDSGNNRKLGRQPINIDGSKDTTDGKGSEFLLANDIDNSNPI VQAEQLNWLHYLMNFGSITGNNDNANFDGIRVDAVDNVDADLLKIAGDYFKALY GTDKSDANANKHLSILEDWNGKDPQYVNQQGNAQLTMDYTVTSQFGNSLTHGAN NRSNMWYFLDTGYYLNGDLNKKIVDKNRPNSGTLVNRIANSGDTKVIPNYSFVRA HDYDAQDPIRKAMIDHGIIKNMQDTFTFDQLAQGMEFYYKDQENPSGFK YNDYN LPSAYAMLLTNKDTVPRVYYGDMYLEGGQYMEKGTIYNPVISALLKARIKYVSGG QTMATDSSGKDLKDGETDLLTSVRFGKGIMTSDQTTTQDNSQDYKNQGIGVIVGN NPDLKL NDKTITLHMGKAHK QLYRALVLSNDSGIDVYDSDDKAPTLRTNDNGD LIFHKTNTFVKQDGTIINYEMKGSLNALISGYLGVWVPVGASDSQDARTVATESSSS NDGSVFHSNAALDSNVIYEGFSNFQAMPTSPEQSTNVVIATKANLFKELGITSFELAP QYRSSGDTNYGGMSFLDSFLNNGYAFTDRYDLGFNKADGNPNPTKYGTDQDLRNA IEALHK GMQAIADWVPDQIYALPGKEVVTATRVDERGNQLKDTDFVNLLYVANT KSSGVDYQAKYGGEFLDKLREEYPSLFKQNQVSTGQPIDASTKIKQWSAKYMNGT NILHRGAYYVLKDWATNQYFNIAKTNEVFLPLQLQNKDAQTGFISDASGVKYYSIS GYQAKDTFIEDGNGNWYYFDKDGYMVRSQQGENPIRTVETSVNTRNGNYYFMPN GVELRKGFGTDNSGNVYYFDDQGKMVRDKYINDDANNFYHLNVDGTMSRG
Série SEQ ID NO : 18 : (Protéine = séquence de la fructosyltransferase de Bacillus subtilis NCIMB 11871)
MNIKKFAKQATVLTFTTALLAGGATQAFAKETNQKPYKETYGISHITRH DMLQIPEQQK EKYQVPEFDSSTIK ISSAKGLDVWDSWPLQNADGTVANYHGYHI VFALAGDPK ADDTSIYMFYQKVGETSIDSWK AGRVFKDSDKFDANDSILKDQT QEWSGSATFTSDGKIRLFYTDFSGKHYGKQTLTTAQVNVSASDSSLNINGVEDYKSI FDGDGKTYQNVQQFIDEGNYSSGDNHTLRDPHYVEDKGHKYLVFEANTGTEDGYQ GEESLFNKAYYGKSTSFFRQESQKLLQSDKKRTAELANGALGMIELNDDYTLK V MKPLIASNTVTDEIERANVFKMNGKWYLFTDSRGSKMTIDGITSNDIYMLGYVSNS LTGPYKPLNKTGLVLKMDLDPNDVTFTYSHFAVPQAKG NVVITSYMTNRGFYAD KQSTFAPSFLLNIKGK TSVVKDSILEQGQLTVNK

Claims

REVENDICATIONS
1. Procédé de fabrication d'un synthon glycosylé, ou monomère, comprenant au moins une étape de mise en présence d'au moins une glycane-saccharase avec au moins un synthon hydroxylé et au moins un saccharose, dans lequel :
(A) ledit synthon hydroxylé est choisi dans le groupe constitué :
(i) des synthons (méth)acrylates/(méth)acrylamides de formule (I) :
Figure imgf000102_0001
dans laquelle :
Ri représente un atome d'hydrogène ou un alkyle en C1-C3 ;
R2 représente un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ; et
Xi représente -(O)-, -(NH)-, -(S)- ou -(NR'2(OH))-, de préférence -(O)-, -(NH)- ou -(NR'2(OH))-, avec R'2 représentant un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement -(C2H40)m-, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(ii) des synthons styréni ues de formule (II)
Figure imgf000102_0002
dans laquelle R3 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en Ci-C2o ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ; (iii) des synthons N-Carbox anhydride (NCA) de formule (III) :
Figure imgf000103_0001
dans laquelle R4 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)n, avec n étant un entier compris entre 1 et 10 ;
(iv) des synthons lactones/lactames/thiolactones de formule (IV) :
Figure imgf000103_0002
dans laquelle :
R5 représente une liaison covalente ; un groupement alkylène en C1-C20 ; ou un groupement (C2H40)m, avec m étant un entier compris entre 1 et 10 ;
n représente un entier compris entre 1 et 20 ;
X2 représente -(O)-, -(NH)- ou -(S)- ; et
Re représente un hydrogène ou un groupement alkyle en C1-C20 ;
(v) des synthons de formule (V) :
HS-"" 7^"OH (y)
dans laquelle R7 représente un groupement alkylène en C1-C20 ; et
(vi) des synthons de formule VI) :
Figure imgf000103_0003
dans laquelle Rs représente un groupement alkylène en C1-C20 ; et
(B) ladite glycane-saccharase est choisi dans le groupe constitué des glycoside- hydrolases appartenant aux familles 13, 68 et 70 des glycoside-hydrolases.
2. Procédé selon la revendication 1 , dans lequel la glycane saccharase est choisie dans le groupe comprenant :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 (ASNP
WT),
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331 , D394 et R446 ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 1 (DSR-S vardelA4N - S512C);
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 12 (alpha-
1.2 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 13 (ΔΝ123- GBD-CD2) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14 (ASDg) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 15 (DSR-S-OK) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 16 (alpha-
1.3 BrS) ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 17 (ASR-
C-del-bis) ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 18 (fructosyltransférase de Bacillus subtilis).
3. Procédé selon la revendication 2, dans lequel la séquence ayant au moins
80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331 , D394 et R446 est choisie parmi :
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, S, T, V, W et Y. - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, E, F, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W et Y ; et
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP
R446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, M, N, Q, S, T, V, W et Y.
4. Procédé selon la revendication 2 ou 3, dans lequel la séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 1 mutée une seule fois à l'une quelconque des positions R226, 1228, F229, A289, F290, 1330, V331, D394 et R446 est choisie parmi : - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 2 (ASNP R226Xi), ladite séquence ayant un acide aminé Xi représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, H, K, M, N, Q, S, T et V ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 3 (ASNP I228X2), ladite séquence ayant un acide aminé X2 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de H, L, T, V, W et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 4 (ASNP F229X3), ladite séquence ayant un acide aminé X3 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, G, H, I, K, M, N, P, Q, V, W et Y, en particulier de C, D, E, G, I, K, M, N, P, V, W et Y, et plus préférentiellement de M et Y ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 (ASNP A289X4), ladite séquence ayant un acide aminé X4 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de C, D, E, F, M, N, P, Q, S, T, V et W, et plus particulièrement choisi dans le groupe constitué de F, M, N, P, Q, S et T ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 6 (ASNP F290Xs), ladite séquence ayant un acide aminé X5 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, G, H, I, K, L, M, P, Q, S, T, V et W, plus préférentiellement de A, C, D, H, I, K, L, M, Q, S, T, V et W, en particulier de A, C, I, L, V, S, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence
SEQ ID NO : 7 (ASNP Ι330Χβ), ladite séquence ayant un acide aminé X6 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, K, L, M, N, Q, S, V et Y, en particulier de A et C, plus préférentiellement de A ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 8 (ASNP V331X7), ladite séquence ayant un acide aminé X7 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, D, E, F, G, H, I, K, L, N, Q, R, S, T, W et Y, plus préférentiellement de C, D, E, F, G, N, R, S ,T, W et Y, en particulier de E, T et W ;
- une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 9 (ASNP D394X»), ladite séquence ayant un acide aminé Xs représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, E, F, G, H, I, K et L, en particulier de A et E ; - une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la SEQ ID NO : 10 (ASNP R.446X9), ladite séquence ayant un acide aminé X9 représentant un acide aminé choisi dans le groupe constitué de A, C, G, K, L, M, N, et S, en particulier de A, N et M. 5. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le synthon hydroxylé est choisi dans le groupe constitué du 2(hydroxy)ethylmethacrylate (HEMA), du N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM), du
N-(hydroxy)ethylacrylamide (HEAA), du 4-vinylphenol (VP), du 4-vinylbenzyl alcohol (VBA), du 4-(hydroxy)methyl oxazolidine-2,
5-dione (HMNCA), du a-(hydroxy)methyl caprolactone (AHMCL), du (±)- mevalonolactone (MVL), du 2-mercaptoéthano 1 (BME), du 2 propène-l-ol (alcool allylique) et du N,N-bis(2-hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA).
6. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le synthons hydroxylé est choisi dans le groupe constitué du 2(hydroxy)ethylmethacrylate (HEMA), du N-(hydroxy)methyl acrylamide (NHAM), du
N-(hydroxy)ethylacrylamide (HEAA), du 4-vinyl benzylalcool (VBA), du 2 propène-l-ol (alcool allylique) et du 2-mercaptoéthano 1 (BME) et du N,N-bis(2-hydroxyethyl)acrylamide (NNHEA).
7. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le synthon hydroxylé est glucosylé ou fructosylé à l'issu du procédé.
8. Procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère comprenant la polymérisation d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé tel que revendiqué dans l'une quelconque des revendications 1 à 7.
9. Procédé selon la revendication 8, comprenant, dans l'ordre, les étapes suivantes :
a) la polymérisation de deux monomères obtenus, indépendamment l'un de l'autre, à l'issue du procédé tel que revendiqué dans l'une quelconque des revendications 1 à 8, permettant d'aboutir à une chaîne de 2 monomères ; b) la polymérisation de la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère obtenu à l'issue du procédé tel que revendiqué dans l'une quelconque des revendications 1 à 7 ; puis
c) une ou plusieurs étapes successives, et indépendantes, consistant à polymériser la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente avec un monomère obtenu à l'issue du procédé tel que revendiqué dans l'une quelconque des revendications 1 à 7.
10. Procédé selon la revendication 9, comprenant, indépendamment : au moins une étape a') entre les étapes a) et b) ;
au moins une étape b') entre les étapes b) et c) ; et/ou
au moins une étape c') après l'une quelconque des étapes c), dans lesquelles la chaîne de monomères obtenue à l'issue de l'étape précédente est polymérisée avec au moins un synthon non-glycosylé.
11. Procédé de fabrication d'un glyco(co)polymère, de préférence à blocs, comprenant le couplage d'au moins 2 monomères obtenus, indépendamment, à l'issue du procédé tel que revendiqué dans l'une quelconque des revendications 1 à 7, de préférence de monomères obtenus à partir des synthons de formule (V) et/ou (VI) tels que définies en revendication 1.
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