WO2016137137A1 - 난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법 - Google Patents

난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법 Download PDF

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WO2016137137A1
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ovarian cancer
colon
low mass
diagnosing
mass ion
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PCT/KR2016/001232
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유병철
이준화
김경희
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국립암센터
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Definitions

  • the present invention relates to an apparatus for diagnosing ovarian cancer and a method for providing ovarian cancer diagnostic information.
  • Cancer is a disease in which cells multiply indefinitely and interfere with normal cell function.
  • Lung cancer, gastric cancer (GC), breast cancer (BRC), colorectal cancer (CRC), and ovarian cancer OVC) and the like are representative, but can occur in virtually any tissue.
  • biopsy has a disadvantage in that it causes a great pain for the patient, which is expensive and takes a long time to diagnose.
  • the patient actually has cancer there is a risk of cancer metastasis during the biopsy, and in the case where the biopsy can not obtain a tissue sample, the tissue suspected by surgical surgery.
  • the diagnosis of the disease is impossible until the extraction of.
  • cancer is determined based on an X-ray image or a nuclear magnetic resonance (NMR) image obtained using a contrast agent to which a disease target is attached.
  • NMR nuclear magnetic resonance
  • an imaging diagnosis may be misdiagnosed according to the clinician's or readout's proficiency, and has a disadvantage in that it depends heavily on the precision of a device for obtaining an image.
  • the finest instruments are unable to detect tumors of several millimeters or less, which makes them difficult to detect in the early stages of development.
  • a patient or a disease-bearing person is exposed to high-energy electromagnetic waves that may cause mutation of genes to obtain an image, it may cause another disease as well as a limitation in the number of diagnosis through the image. .
  • An object of the present invention is to provide a device for diagnosing ovarian cancer and a method for providing ovarian cancer diagnostic information through biostatistical analysis of low mass ions extracted from biological samples.
  • An object of the present invention is an ovarian cancer diagnostic apparatus, comprising: an input unit for inputting mass spectrum data of low mass ions detected in a biological sample; A diagnostic unit for determining ovarian cancer diagnostic information on the mass spectrum data input from the input unit by using a low mass ion group for diagnosing ovarian cancer, wherein the low mass ion group for diagnosing ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, It is achieved by including at least one low mass ion of 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%).
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least three low mass ions.
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least five low mass ions.
  • the diagnosis unit further determines ovarian cancer diagnostic information based on the mass spectrum data using the second low mass ion group for diagnosing ovarian cancer, and the second low mass ion group for diagnosing ovarian cancer is 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z. (However, the error range is ⁇ 0.1%) may include at least one low mass ion.
  • the second low mass ion group for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%).
  • the object of the present invention is an ovarian cancer diagnosis device, comprising: a diagnosis unit for determining ovarian cancer diagnostic information on mass spectrum data of low mass ions detected in a biological sample by using a first low mass ion group for ovarian cancer diagnosis; And an output unit for outputting a diagnosis result of the diagnosis unit, wherein the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197, and 709.7879 m It is achieved by including at least one low mass ion of / z (the error range is ⁇ 0.1%).
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least three low mass ions.
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least five low mass ions.
  • the diagnosis unit further determines ovarian cancer diagnostic information based on the mass spectrum data using the second low mass ion group for diagnosing ovarian cancer, and the second low mass ion group for diagnosing ovarian cancer is 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z. (However, the error range is ⁇ 0.1%) may include at least one low mass ion.
  • the second low mass ion group for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%).
  • the object of the present invention is to provide information for diagnosing ovarian cancer, the method comprising: obtaining mass spectrum data of low mass ions in a biological sample; And providing ovarian cancer diagnostic information for providing ovarian cancer diagnostic information on the mass spectrum data using a low mass ion group for diagnosing ovarian cancer, wherein the low mass ion group for diagnosing ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, It is achieved by including at least one low mass ion of 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%).
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least three low mass ions.
  • the low mass ion group for diagnosing the first ovarian cancer is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%). It may comprise at least five low mass ions.
  • the ovarian cancer diagnosis information providing step may further provide ovarian cancer diagnostic information on the mass spectrum data by further using a second low mass ion group for diagnosing ovarian cancer, and the low mass ion group for diagnosing the second ovarian cancer is 496.5220, 524.5837. And 1466.7073 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%) of at least one low mass ion.
  • the second low mass ion group for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of ⁇ 0.1%).
  • a device for diagnosing ovarian cancer and a method for providing ovarian cancer diagnostic information through biostatistical analysis on low mass ions extracted from a biological sample.
  • FIG. 1 is a block diagram of an ovarian cancer diagnostic apparatus according to an embodiment of the present invention
  • FIG. 2 is a distribution chart of the discriminant scores of the reference mass spectrum according to principal component analysis-based linear discriminant analysis (PCA-DA).
  • PCA-DA principal component analysis-based linear discriminant analysis
  • 3 is a distribution chart of the discrimination scores of the reference mass spectrum calculated by the first group candidate
  • Figure 7 shows the diagnosis result of the training set A 1 using the first group and the second group
  • biological sample refers to whole blood, serum, plasma, urine, stool, sputum, saliva, tissue, cells, cells. Samples such as extracts, in vitro cell cultures, and the like, are not limited thereto. In the examples described below, serum from patients or non-patients was used as biological samples.
  • the mass to charge ratio (m / z) measured by a matrix assisted laser desorption / ionization-time of fight (MALDI-TOF) mass spectrometer includes an error range of " ⁇ 0.1%". This is because some errors may occur in the measurement of the mass value according to the experimental environment, and as the mass value increases, the error increases.
  • low mass ion means an ion having a mass value of less than 1500 m / z obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer or the like.
  • some of the diagnostic low-mass ions have a higher mass value than this range, but most of them fall within this range, and in this case, the name is also used.
  • the limit of 1500 m / z is used in the sense of approximate value, not definite value.
  • each low mass ion is represented by the mass value of the corresponding low mass ion measured in a MALDI-TOF mass spectrometer.
  • the mass value measured by the MALDI-TOF mass spectrometer is a value obtained in the positive mode of the MALDI-TOF mass spectrometer.
  • the mass value is a value of H + adduct form of each low mass ion measured by a MALDI-TOF mass spectrometer, and the actual mass value of the low mass ion is 1 m / z smaller than this.
  • mass intensity refers to a value measured with a MALDI-TOF mass spectrometer and has a correlation with the amount of low mass ions.
  • normalization refers to matching the range of data or making the distribution similar, and may be normalized using a mean value, a median, and the like, but is not limited thereto. In some cases, various known methods may be applied.
  • the subtotals of the mass intensities of each sample are obtained, the subtotals of the samples are averaged, and normalized by multiplying each of the mass intensities by the sample magnification factor so that the subtotals of the mass intensities of each sample coincide with this average. .
  • the subtotal of the mass intensities for each sample becomes the same.
  • pareto scaling means subtracting the mean value for each mass ion from each normalized mass intensity and dividing by the square root of the standard deviation.
  • Autoscaling a more common scaling method, completely cancels the size information of the data by dividing it by the standard deviation, whereas in Pareto scaling, the amplification of the noise is avoided by partially maintaining the data size information. It has the advantage that it can.
  • weighting factor refers to a factor that adjusts the numerical size of the data after multiplying the weight is proportional to the importance from the statistical point of view, the factor loading value by mass ion obtained from the PCA-DA analysis results Factor loading is an example of weighting.
  • first group candidate a process for deriving a first low mass ion group candidate (hereinafter referred to as "first group candidate") for diagnosing a first ovarian cancer from a primitive low mass ion group (hereinafter referred to as "raw group") of a biological sample
  • first group a primitive low mass ion group
  • second group a process for determining the positive / negative can refer to the applicant's other application, for example, Korea Patent Publication No. 2013-0079988.
  • FIG. 1 illustrates an apparatus for diagnosing ovarian cancer according to an embodiment of the present invention.
  • the input unit 100 inputs mass spectrum data (hereinafter referred to as "diagnostic data") of low mass ions detected from a biological sample.
  • the input unit 100 may be subjected to a preprocessing process such as alignment, normalization, and / or scaling of the diagnosis target data, or input the diagnosis target data which has been pre-processed in advance to the input unit 100.
  • the diagnosis target data may include only data corresponding to the first group or data corresponding to the first group and the second group.
  • Multiple diagnosis target data may be input to the input unit 100 even for one patient.
  • the diagnosis unit 200 generates ovarian cancer diagnosis information on the diagnosis target data input using only the first group or both the first group and the second group. That is, the diagnosis unit 200 determines ovarian cancer positive or ovarian cancer negative for the diagnosis target data.
  • the diagnosis unit 200 determines whether ovarian cancer is positive / negative using data corresponding to the first group and the second group included in the input diagnosis target data. For example, a discrimination score is derived using the scaled mass intensity and weights of the low mass ions corresponding to the first group and the second group, and the positive / negative ovarian cancer is determined according to a predetermined criterion for the discrimination score. can do.
  • the low mass ions corresponding to the first group can be selected from 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z. At least one, at least two, at least three, at least four, at least five, at least six, at least seven, at least eight, at least nine, at least ten, at least eleven of these thirteen low mass ions Or at least 12 may be used. It is also possible to use all 13 low mass ions.
  • the low mass ions corresponding to the second group can be selected from 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z. At least one, at least two, or all three of these three low mass ions may be used.
  • 496.5220 m / z corresponds to lysophosphatidylcholine (LPC) 16: 0, 524.5837 m / z corresponds to 18: 0 lysophosphatidylcholine (LPC), and 1466.7073 m / z Corresponds to the fibrinogen alpha chain.
  • the second group of low-mass ions are low-mass ions that are statistically significant when analyzed in matters in the blood using Triple-TOF mass spectrometry and quantitatively different from the normal control group.
  • the first group is selected from the first group candidate. First, a process of deriving the first group candidate from the primitive group will be described.
  • the mass spectrum can be measured repeatedly for one sample.
  • the mass spectrum was measured by repeating six times for one sample.
  • the mass spectrum was measured six times for the samples selected as the training set, and then the PCA-DA analysis was applied to select the mass spectrum showing the best discriminating performance among the six as the reference mass spectrum.
  • the factor loading value obtained by PCA-DA analysis of this reference mass spectrum becomes the weight of each low mass ion.
  • mass ions having a greater than 0.1 absolute value were obtained by multiplying the Pareto scaled mass intensity by the weight.
  • P mass ions commonly present in 50% or more of all samples constituting the reference mass spectrum were selected as the first group candidates.
  • the low-mass ions of the first group are selected based on the diagnostic performance of the low-mass ion combination that can be configured as the first group candidate, rather than the individual low-mass ions.
  • the diagnostic performance means the diagnostic performance of the training set obtained by adding the new training set (set A 2 ) to the training set (set A 1 ) used when selecting the first group candidate and calculating the weight of the low mass ions.
  • the training set was thus expanded to mitigate overfitting.
  • the discrimination score was calculated by averaging the remaining five mass spectra that were not selected as the reference mass spectrum among the six repeated mass spectra, and the mass spectrum measured six times for the training set A 2 .
  • the discriminant score was calculated by averaging five randomly selected mass spectra. In order to reduce the random error which is unavoidable in the experiment of measuring the mass spectrum, the diagnostic performance was evaluated based on the mean discrimination score.
  • the first step is to compare the diagnostic performance of all combinations ( P C 2 and P C 3 ) that can be composed of two or three low-mass ions among the first group candidates of P. Choose a large combination. If there is more than one combination with the same sensitivity and specificity, the combination with the smallest number of low mass ions is chosen. If the number of low mass ions is the same, the combination with the largest Fisher's discriminant ratio is selected.
  • the above procedure is repeated with the remaining first group candidates minus the two or three low mass ions derived, and the process is repeated until only one low mass ion remains or no one remains in the first group candidate.
  • the combination of two or three low mass ions formed in the first step is considered to be one low mass ion, and the same process as in the first step is repeated.
  • the low mass ion combination constructed in the previous step is regarded as one low mass ion in the next step, and the same process is repeated.
  • the seed set is chosen as the low mass ion combination with the highest sensitivity and specificity, regardless of the stage at which the low mass ion combination was constructed.
  • the last updated seed set is selected as the final group for diagnosing ovarian cancer, that is, the first group.
  • Table 1 shows the number of samples and their age according to the patient group.
  • Control is a normal control group
  • BUT is a benign uterine tumor
  • BOT is a benign ovarian tumor
  • PCL is a precancerous cervical lesion
  • BBT is a breast benign tumor.
  • tumor UCC stands for uterine cervical cancer
  • EMC stands for endometrial cancer.
  • Colon cancer patient sample information from set A 1 (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma) Set A 1 Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type A001 48 IIB T-colon AC A041 58 IIIB Colon A002 50 IIIA Rectum AC A042 56 IIIB Rectum A003 73 IIIA Rectum AC A043 67 IIA Colon A004 70 I A-colon AC A044 70 IIA Colon A005 41 I HF-colon AC A045 53 IIA Colon A006 51 IIIB A-colon AC A046 47 I Colon A007 33 IIIB S-colon AC A047 70 IIA Colon A008 58 I RS-colon A048 58 IIA Colon A009 53 IIIB HF-colon AC A049 71 IIA Colon A010 58 I S-colon AC A050 80 IIIB Colon A011
  • Colon cancer patient sample information from set A 2 (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma) Set A 2 Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type A080 71 I RS-colon A120 41 I Colon A081 45 IIA S-colon AC A121 68 I Rectum A082 36 IIIB S-colon AC A122 76 II Colon A083 73 IIA S-colon AC A123 72 I Rectum A084 86 IIA Rectum AC A124 47 I Colon A085 68 IIIB A-colon AC A125 52 IIA Colon A086 71 I S-colon AC A126 40 IIIC Colon A087 84 IIIB A-colon AC A127 62 IIIC Colon A088 69 IIA Rectum AC A128 72 IIIA Rectum A089 39 IIA Rectum AC A129 50 IIIB Colon A090 42 IIIB A-colon AC
  • Sample information for colon cancer patients in set B (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma) Set B Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type B001 73 IIIB S-colon AC B041 71 I Colon B002 45 IIIC A-colon AC B042 67 IIA Rectum B003 52 I S-colon AC B043 52 I Rectum B004 58 IIIB S-colon AC B044 72 IIIB Colon B005 53 I A-colon AC B045 74 IIIB Colon B006 70 I Rectum AC B046 74 IIA Colon B007 66 IIIA S-colon AC B047 75 IIB Colon B008 75 IIIB S-colon AC B048 69 IIIB Colon B009 54 I Rectum AC B049 75 I Colon B010 70 IIIB S-colon AC B050 58 I Colon B011 72 IIIB A
  • Ageyear Pathology Sampleno. Ageyear Pathology B001 42 Leiomyoma B015 47 Endometrial polyp B002 36 Leiomyoma B016 32 Leiomyoma B003 50 Leiomyoma B017 50 Leiomyoma B004 48 Adenomyosis B018 56 Leiomyoma B005 41 Adenomyosis B019 46 Endometrial polyp B006 46 Chronic inflammation with squamous metaplasia B020 49 Leiomyoma B007 39 Leiomyoma B021 39 Leiomyoma B008 46 Leiomyoma B022 36 Leiomyoma B009 43 Leiomyoma B023 48 Leiomyoma B010 40 Leiomyoma B024 59 Leiomyoma B011 50 Leiomyoma B025 44 Leiomy
  • Endometrial Cancer Patient Sample Information Set B Sampleno. Ageyear Stage Pathology B001 58 IIIC Endometrioid adenocarcinoma B002 66 IA Endometrioid adenocarcinoma B003 49 IA Endometrioid adenocarcinoma B004 64 IIIC2 Metastatic carcinoma B005 54 IA Endometrioid adenocarcinoma B006 52 IA Endometrioid adenocarcinoma B007 54 IA Endometrioidadenocarcinoma B008 54 IA Endometrioid adenocarcinoma B009 40 IA Endometrioid adenocarcinoma B010 45 IA Endometrioid adenocarcinoma
  • DS means a discriminant score. If the discrimination score is 0 (horizontal dotted line) as a reference, low specificity may be obtained depending on the patient group.However, if the threshold is changed to the horizontal solid line of FIG. It is very good.
  • the diagnostic performance of the training set A 1 and A 2 is shown in Table 21 and Table 22, and it can be confirmed that the sensitivity and specificity are excellent.
  • Training Set Diagnosis Performance Using the First Group-1 Training set A 1 TrueOVC TrueNon-OVC PredictedOVC 30 3 Sensitivity 100.00% Specificity 99.15% PredictedNon-OVC 0 348 PPV 90.91% NPV 100.0% Training set A 2 TrueOVC TrueNon-OVC PredictedOVC 30 0 Sensitivity 100.00% Specificity 100.00% PredictedNon-OVC 0 350 PPV 100.00% NPV 100.00%
  • Training Set Diagnosis Performance Using the First Group-2 Training set A 1 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT PredictedOVC 30 0 0 0 One 0 0 2 0 PredictedNon-OVC 0 92 79 47 26 23 30 29 22 Training set A 2 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT PredictedOVC 30 0 0 0 0 0 0 0 PredictedNon-OVC 0 92 79 46 28 24 29 31 21
  • test set B The diagnostic performance of the test set B is shown in Table 23 and Table 24, and it can be confirmed that the sensitivity and specificity of the test set B are excellent.
  • the diagnostic performance for training sets A 1 and A 2 is shown in Table 25 and Table 26, and it can be confirmed that the sensitivity and specificity are excellent.
  • a sample having a positive discrimination score was positive for ovarian cancer
  • a sample having a negative discrimination score was negative for ovarian cancer. That is, the threshold value of the discrimination score for determining whether ovarian cancer is positive or negative was 0.
  • the threshold value (the horizontal solid line of FIGS. 7 and 8) of the discrimination score was determined to maximize the diagnostic performance of the training set. The threshold value of the discrimination scores thus selected is applied to the judgment of the verification set as it is.
  • Training Set Diagnosis Performance Using the First Group and the Second Group-1 Training set A 1 TrueOVC TrueNon-OVC PredictedOVC 27 10 Sensitivity 90.00% Specificity 97.15% PredictedNon-OVC 3 341 PPV 72.97% NPV 99.13% Training set A 2 TrueOVC TrueNon-OVC PredictedOVC 27 12 Sensitivity 90.00% Specificity 96.57% PredictedNon-OVC 3 338 PPV 69.23% NPV 99.12%
  • Training Set Diagnosis Performance Using the First Group and the Second Group-2 Training set A 1 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT PredictedOVC 27 2 One One 0 0 0 3 3 PredictedNon-OVC 3 90 78 46 27 23 30 28 19 Training set A 2 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT PredictedOVC 27 9 One 0 0 0 0 2 0 PredictedNon-OVC 3 83 78 46 28 24 29 29 21
  • the verification result of the verification set B using 13 low mass ions of the first group and 3 low mass ions of the second group is shown in FIG. 9.
  • test set B The diagnostic performance of the test set B is shown in Tables 27 and 28, and it can be seen that the sensitivity and specificity of the test set B are excellent. In particular, it showed high specificity for cervical cancer and endometrial cancer, which were not included in the training set when compared with only 13 low-mass ions of the first group.

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Abstract

본 발명은 난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 난소암 진단 장치는 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 입력하는 입력부; 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 입력부에서 입력한 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함한다.

Description

난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법
본 발명은 난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법에 관한 것이다.
암은 세포가 무한히 증식해 정상적인 세포의 기능을 방해하는 질병으로, 폐암, 위암(gastric cancer, GC), 유방암(breast cancer, BRC), 대장암(colorectal cancer, CRC) 및 난소암(ovarian cancer, OVC) 등이 대표적이나, 실질적으로는 어느 조직(tissue)에서나 발생할 수 있다.
초창기 암 진단은 암 세포의 성장에 따른 생체 조직의 외적 변화에 근거하였으나, 근래에 들어 혈액, 당쇄(glyco chain), 디엔에이(DNA) 등 생물의 조직 또는 세포에 존재하는 미량의 생체 분자를 이용한 진단 및 검출이 시도되고 있다. 그러나 가장 보편적으로 사용되는 암 진단 방법은 생체 조직 검사를 통해 얻어진 조직 샘플을 이용하거나, 영상을 이용한 진단이다.
그 중 생체 조직 검사는 환자에게 큰 고통을 야기하며, 고비용이 들뿐만 아니라, 진단까지 긴 시간이 소요되는 단점이 있다. 또한, 환자가 실제 암에 걸린 경우, 생체 조직 검사 과정 중 암의 전이가 유발될 수 있는 위험이 있으며, 생체 조직 검사를 통해 조직 샘플을 얻을 수 없는 부위의 경우, 외과적인 수술을 통해 의심되는 조직의 적출이 이루어지기 전에는 질병의 진단이 불가능한 단점이 있다.
영상을 이용한 진단에서는 엑스레이(X-ray) 영상, 질병 표적 물질이 부착된 조영제를 사용하여 획득한 핵자기 공명(nuclear magnetic resonance, NMR) 영상 등을 기반으로 암을 판정한다. 그러나 이러한 영상 진단은 임상의 또는 판독의의 숙련도에 따라 오진의 가능성이 있으며, 영상을 얻는 기기의 정밀도에 크게 의존하는 단점이 있다. 더 나아가, 가장 정밀한 기기조차도 수 mm 이하의 종양은 검출이 불가능하여, 발병 초기 단계에서는 검출이 어려운 단점이 있다. 또한, 영상을 얻기 위해 환자 또는 질병 보유 가능자가 유전자의 돌연변이를 유발할 수 있는 고에너지의 전자기파에 노출되므로, 또 다른 질병을 야기할 수 있을 뿐만 아니라, 영상을 통한 진단 횟수에 제한이 있는 단점이 있다.
한편, 최근 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 암을 진단하는 방법이 제시되고 있다.
본 발명의 목적은 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 난소암을 진단하는 장치와 난소암 진단 정보를 제공하는 방법을 제시하는 것이다.
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단 장치에 있어서, 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 입력하는 입력부; 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 입력부에서 입력한 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단 장치에 있어서, 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부와; 상기 진단부의 진단결과를 출력하는 출력부를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 있어서, 생물학적 시료에서 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 얻는 단계; 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대한 난소암 진단 정보를 제공하는 난소암 진단 정보 제공단계를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 난소암 진단 정보 제공단계는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 제공하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.
본 발명에 따르면 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 난소암을 진단하는 장치와 난소암 진단 정보를 제공하는 방법이 제시된다.
도 1은 본 발명의 실시 예에 따른 난소암 진단 장치의 블록도이고,
도 2는 주성분 분석 기반의 선형 판별 분석(principal component analysis-based linear discriminant analysis, PCA-DA)에 따른 기준 질량스펙트럼의 판별점수 분포도이고,
도 3은 제1 그룹후보로 계산한 기준 질량스펙트럼의 판별점수 분포도이고,
도 4는 제1 그룹을 이용한 훈련집합 A1의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 5는 제1 그룹을 이용한 훈련집합 A2의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 6은 제1 그룹을 이용한 검증집합 B의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 7은 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 A1의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 8은 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 A2의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 9는 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 검증집합 B의 진단 결과를 나타낸 것이다.
본 발명에서, "생물학적 시료"는 전혈(whole blood), 혈청(serum), 혈장(plasma), 요(urine), 분변(stool), 객담(sputum), 타액(saliva), 조직, 세포, 세포 추출물, 체외 세포 배양물 등과 같은 시료들을 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 아래에 기술되는 실시 예에서는 환자 또는 비환자의 혈청을 생물학적 시료로 사용하였다.
본 발명에서, MALDI-TOF(matrix assisted laser desorption/ionization -time of fight) 질량분석기에 의해 측정된 질량값(mass to charge ratio, m/z)은 "±0.1%"의 오차범위를 포함한다. 이는 실험 환경에 따라 질량값 측정치에 다소의 오차가 발생할 수 있으며 질량값이 커질수록 오차가 커지기 때문이다.
본 발명에서, "저질량 이온"은 MALDI-TOF 질량분석기 등을 이용하여 획득한 질량값이 1500 m/z보다 작은 이온을 의미한다. 경우에 따라 진단용 저질량 이온들 중 일부는 이 범위보다 더 높은 질량값을 가지기도 하나, 대부분이 이 범위 내에 들어오므로 이 경우에도 저질량 이온이라는 명칭을 그대로 사용하려고 한다. 즉, 1500 m/z이라는 한계는 확정적인 값이 아니라 대략적인 값의 의미로 사용된 것이다.
본 발명에서, 각 저질량 이온은 MALDI-TOF 질량분석기에서 측정되는 해당 저질량 이온의 질량값으로 표현되었다. 본 발명에서 MALDI-TOF 질량분석기에 의해 측정된 질량값은 MALDI-TOF 질량분석기의 포지티브 모드(positive mode)에서 획득된 값이다. 본 발명에서 질량값은 MALDI-TOF 질량분석기에 의해 측정되는 각 저질량 이온의 H+ adduct 형태의 값으로, 실제 저질량 이온의 질량값은 이보다 1 m/z만큼 작다.
본 발명에서, "질량 강도"는 MALDI-TOF 질량분석기로 측정되는 값을 말하며, 저질량 이온의 양과 상관 관계를 가진다.
본 발명에서, "정규화"는 데이터(data)의 범위를 일치시키거나 분포를 유사하게 만들어 주는 것을 말하며, 평균값(mean), 중간값(median) 등을 이용하여 정규화할 수 있으나 이에 제한되지 않고, 경우에 따라 다양한 공지의 방법들이 적용될 수 있다. 본 실시 예에서는 각 시료별 질량 강도들의 소계를 구하고, 시료별 소계들의 평균을 구한 후, 각 시료별 질량 강도들의 소계가 이 평균과 일치하도록 각 질량 강도에 시료별 배율 인자를 곱하는 방식으로 정규화하였다. 즉, 이와 같이 정규화한 후에는 각 시료별 질량 강도들의 소계가 같아진다.
본 발명에서, "파레토 스케일링"은 정규화한 각 질량 강도에서 질량 이온별 평균값을 뺀 후 표준편차의 제곱근으로 나누는 것을 말한다. 더 일반적인 스케일링 방법인 오토스케일링(autoscaling)에서는 표준편차로 나누는 것을 통해 데이터의 크기 정보를 완전히 상쇄시키는 것에 비해, 파레토 스케일링에서는 데이터의 크기 정보를 부분적으로 유지하는 것을 통해 노이즈(noise)의 증폭을 피할 수 있다는 장점이 있다.
본 발명에서, "가중치(weighting factor)"는 가중치를 곱한 후의 데이터의 수치적 크기가 통계적 관점에서의 중요성에 비례하도록 조정하는 인자를 말하는데, PCA-DA 분석 결과로 획득되는 질량 이온별 인자적재값(factor loading)을 가중치의 일례라 할 수 있다.
본 발명에 있어서, 생물학적 시료의 원시 저질량 이온 그룹(이하 "원시 그룹"이라 함)에서 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹 후보(이하 "제1 그룹후보"라 함)를 도출하는 과정과 최종 도출된 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹(이하 "제1 그룹"이라 함) 및/또는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹(이하 "제2 그룹"이라 함)을 이용하여 난소암에 대한 양성/음성을 판단하는 과정은 본 출원인의 다른 출원, 예를 들어 한국특허공개 제2013-0079988호를 참조할 수 있다.
이하 도면을 참조하여 본 발명을 더욱 상세히 설명한다.
첨부된 도면은 본 발명의 기술적 사상을 더욱 구체적으로 설명하기 위하여 도시한 일례에 불과하므로 본 발명의 사상이 첨부된 도면에 한정되는 것은 아니다.
도 1은 본 발명의 실시 예에 따른 난소암 진단 장치를 나타낸 것이다.
입력부(100)에서는 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터(이하 "진단대상 데이터"라 한다)를 입력한다. 입력부(100)에서 진단대상 데이터에 대해 정렬, 정규화 및/또는 스케일링과 같은 전처리 과정을 거치게 하거나, 미리 전처리 과정을 마친 진단대상 데이터를 입력부(100)에 입력할 수 있다. 또한 진단대상 데이터는 경우에 따라 제1 그룹에 해당하는 데이터나 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 데이터만을 포함할 수도 있다.
환자 한 명에 대해서도 여러 개의 진단대상 데이터를 입력부(100)에 입력할 수 있다.
진단부(200)는 제1 그룹만을 이용하거나 제1 그룹과 제2 그룹을 모두 이용하여 입력한 진단대상 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 생성한다. 즉, 진단부(200)에서는 진단대상 데이터에 대해 난소암 양성 또는 난소암 음성을 판정한다.
진단부(200)는 입력한 진단대상 데이터에 포함되어 있는 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 데이터를 이용하여 난소암 양성/음성 여부를 판단한다. 예를 들어, 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 저질량 이온의 스케일링된 질량 강도와 가중치를 이용하여 판별점수를 도출하고, 판별점수에 대한 소정의 기준에 따라 난소암 양성/음성 여부를 판단할 수 있다.
제1 그룹에 해당하는 저질량 이온은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z 가운데 선택할 수 있다. 이 13개 저질량 이온 가운데 적어도 1개, 적어도 2개, 적어도 3개, 적어도 4개, 적어도 5개, 적어도 6개, 적어도 7개, 적어도 8개, 적어도 9개, 적어도 10개, 적어도 11개 또는 적어도 12개를 사용할 수 있다. 13개 저질량 이온을 모두 사용하는 것도 가능하다.
제2 그룹에 해당하는 저질량 이온은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z 가운데 선택할 수 있다. 이 3개 저질량 이온 가운데 적어도 1개 또는 적어도 2개를 사용하거나 3개를 모두 사용할 수 있다. 제2 그룹의 저질량 이온을 구체적으로 설명하면, 496.5220 m/z는 LPC(lysophosphatidylcholine) 16:0에 해당하며, 524.5837 m/z는 LPC(lysophosphatidylcholine) 18:0에 해당하며, 1466.7073 m/z는 피브리노겐 알파 체인에 해당한다.
제2 그룹의 저질량 이온들은 Triple-TOF 질량분석기를 이용하여 혈액 내의 물질을 분석했을 때 통계학적(P value)으로 매우 유의하며 정상대조군과 견주었을 때 양적 차이를 분명히 보인 저질량 이온들이다.
이하에서는 제1 그룹을 도출하는 방법에 대해 설명한다.
제1 그룹은 제1 그룹후보에서 선발하는데, 원시 그룹에서 제1 그룹후보를 도출하는 과정을 먼저 설명하면 다음과 같다.
한 개 시료에 대해 질량스펙트럼을 되풀이하여 측정할 수 있다. 이후 예시되는 실시 예에서는 한 개 시료에 대해 여섯 번 되풀이하여 질량스펙트럼을 측정하였다. 훈련집합으로 선정한 시료들에 대해 여섯 번 되풀이하여 질량스펙트럼을 측정한 다음 PCA-DA 분석을 각각 적용하여 여섯 개 가운데 가장 우수한 판별 성능을 보인 질량스펙트럼을 기준 질량스펙트럼으로 선택했다. 이 기준 질량스펙트럼에 대한 PCA-DA 분석으로 얻게 되는 인자적재값이 각 저질량 이온의 가중치가 된다.
다음으로 기준 질량스펙트럼의 각 시료마다 파레토 스케일링한 질량강도에 가중치를 곱한 값의 절댓값이 0.1보다 큰 질량 이온들을 선정했다. 이렇게 시료마다 선택한 질량 이온들 가운데 기준 질량스펙트럼을 구성하는 전체 시료의 50 % 이상에서 공통으로 나타나는 P개 질량 이온들을 제1 그룹후보로 선택했다.
다음으로 제1 그룹후보에서 제1 그룹을 도출하는 과정을 설명한다.
본 과정에서는 개별 저질량 이온이 아니라 제1 그룹후보로 구성할 수 있는 저질량 이온 조합의 진단성능을 바탕으로 제1 그룹의 저질량 이온들을 선택한다. 이 때 진단성능은 제1 그룹후보를 선정하고 저질량 이온의 가중치를 계산할 때 쓴 훈련집합(집합 A1)에 새로운 훈련집합(집합 A2)을 더한 훈련집합에 대한 진단성능을 뜻한다. 과적합(overfitting) 현상을 완화하기 위해 이와 같이 훈련집합을 확장했다. 훈련집합 A1에 대해서는 여섯 번 되풀이하여 측정한 질량스펙트럼 가운데 기준 질량스펙트럼으로 선정되지 않은 나머지 다섯 개의 질량스펙트럼을 평균하여 판별점수를 계산하였고, 훈련집합 A2에 대해서는 여섯 번 되풀이하여 측정한 질량스펙트럼 가운데 임의로 선정한 다섯 개의 질량스펙트럼을 평균하여 판별점수를 계산하였다. 질량스펙트럼을 측정하는 실험에서 피할 수 없는 랜덤 오차(random error)를 줄이기 위해 이와 같이 평균 판별점수를 기준으로 진단성능을 평가했다.
첫 번째 단계에서는 P개 제1 그룹후보 가운데 2개 또는 3개의 저질량 이온으로 구성할 수 있는 모든 조합(PC2와 PC3)의 진단성능을 비교하여 민감도와 특이도를 더한 값이 가장 큰 조합을 선정한다. 민감도와 특이도를 더한 값이 같은 조합이 하나 이상일 때는 그 조합들 가운데 가장 작은 개수의 저질량 이온을 가진 조합을 선택한다. 저질량 이온의 개수까지 같은 경우에는 피셔의 판별비(Fisher's discriminant ratio)가 가장 큰 조합을 선택한다.
도출된 2개 또는 3개 저질량 이온을 뺀 나머지 제1 그룹후보를 가지고 위 과정을 되풀이하며, 이 과정은 제1 그룹후보에서 저질량 이온이 하나만 남거나 하나도 남지 않을 때까지 반복한다.
두 번째 단계에서는 첫 번째 단계에서 구성한 2개 또는 3개 저질량 이온을 가지는 조합들을 마치 1개의 저질량 이온인 것처럼 생각하고 첫 번째 단계와 같은 과정을 되풀이한다.
즉, 앞 단계에서 구성한 저질량 이온 조합을 다음 단계에서는 1개의 저질량 이온인 것처럼 간주하고 같은 과정을 되풀이하는 것이다. 씨앗집합은 저질량 이온 조합이 몇 번째 단계에서 구성되었는지에 상관없이 민감도와 특이도를 더한 값이 가장 큰 저질량 이온 조합으로 선정한다.
S개 저질량 이온이 씨앗집합으로 선정되었다고 하면 제1 그룹후보는 R(= P - S)개가 남게 된다. 남은 제1 그룹후보 가운데 1개, 2개, 3개의 저질량 이온으로 구성할 수 있는 모든 조합(RC1, RC2, RC3)을 씨앗집합에 더한 후 그 진단성능(민감도와 특이도를 더한 값)을 견주어 진단성능이 가장 좋은 조합이 원래 씨앗집합의 진단성능보다 낫다면 씨앗집합을 갱신한다.
씨앗집합을 갱신한 다음 남은 제1 그룹후보를 가지고 이 과정을 되풀이한다. 이러한 반복 과정을 거쳐 마지막으로 갱신한 씨앗집합을 난소암을 진단하기 위한 최종 그룹, 즉 제1 그룹으로 선정한다.
실시 예 - 제1 그룹 도출
이하에서는 위에서 설명한 방법을 이용하여 제1 그룹을 도출한 과정을 설명한다.
총 1,184개의 여성 혈청 시료를 사용하였는데, 환자군에 따른 시료 개수와 나이 정보를 표 1에 나타내었다.
시료정보
개수 나이
평균 ± 표준편차 범위
Control 276 50.3 ± 10.7 19 - 86
OVC 89 55.5 ± 10.3 27 - 77
CRC 237 63.4 ± 11.8 30 - 87
GC 139 59.1 ± 13.8 28 - 86
BUT 83 45.8 ± 8.2 25 - 70
BOT 71 42.0 ± 13.4 20 - 83
PCL 88 42.1 ± 11.9 22 - 79
BRC 93 47.8 ± 9.2 29 - 69
BBT 65 45.4 ± 10.0 19 - 62
UCC 33 50.7 ± 14.8 26 - 82
EMC 10 53.6 ± 7.9 40 - 66
표 1에서 Control은 정상대조군, BUT는 자궁 양성종양(benign uterine tumor), BOT는 난소 양성종양(benign ovarian tumor), PCL는 자궁경부암 전암병변(precancerous cervical lesion), BBT는 유방 양성종양(benign breast tumor), UCC는 자궁경부암(uterine cervical cancer), EMC는 자궁내막암(endometrial cancer)을 뜻한다.
어느 병원에서 어떤 시료를 몇 개씩 모았는가 하는 정보는 표 2에 나타내었다.
시료 정보 2
개수 병원 개수 병원
Control 193 국립암센터 GC 139 동아대병원
83 동아대병원 BUT 83 이대목동병원
OVC 8 서울대병원 BOT 71
22 삼성서울병원 PCL 88
31 국립암센터 BRC 93 국립암센터
28 이대목동병원 BBT 65
CRC 74 국립암센터 UCC 33 이대목동병원
32 대항병원 EMC 10
131 동아대병원
시료들을 대략 삼등분하여 표 3과 같이 훈련집합과 검증집합으로 나누었다. 표 3에 나타낸 것과 같이 자궁경부암과 자궁내막암 시료는 개수가 많지 않아 훈련집합으로 사용하지 않았고, 나머지 시료들로 구성한 저질량 이온 판별식을 적용하였을 때 난소암이 아닌 것으로 판정되는지 살펴보는 용도로만 사용하였다.
훈련집합과 검증집합
합계 훈련집합 검증집합
집합 A1 집합 A2 집합 B
Control 276 92 92 92
OVC 89 30 30 29
CRC 237 79 79 79
GC 139 47 46 46
BUT 83 27 28 28
BOT 71 23 24 24
PCL 88 30 29 29
BRC 93 31 31 31
BBT 65 22 21 22
UCC 33 33
EMC 10 10
환자군에 따른 시료 정보를 표 4 - 표 20에 정리하였다.
집합 A1의 정상대조군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
A001 37 A024 49 A047 40 A070 63
A002 55 A025 52 A048 86 A071 38
A003 54 A026 52 A049 41 A072 50
A004 49 A027 55 A050 62 A073 52
A005 47 A028 70 A051 47 A074 33
A006 46 A029 37 A052 35 A075 57
A007 63 A030 55 A053 55 A076 59
A008 60 A031 54 A054 36 A077 66
A009 49 A032 49 A055 53 A078 48
A010 61 A033 47 A056 48 A079 59
A011 69 A034 46 A057 56 A080 64
A012 70 A035 63 A058 44 A081 46
A013 50 A036 60 A059 46 A082 61
A014 37 A037 49 A060 54 A083 28
A015 38 A038 61 A061 47 A084 40
A016 54 A039 41 A062 35 A085 31
A017 50 A040 54 A063 43 A086 53
A018 56 A041 47 A064 57 A087 30
A019 54 A042 45 A065 60 A088 36
A020 57 A043 52 A066 60 A089 32
A021 69 A044 43 A067 45 A090 52
A022 59 A045 56 A068 48 A091 49
A023 54 A046 57 A069 64 A092 34
집합 A2의 정상대조군 시료 정보
집합 A2
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
A093 57 A116 38 A139 39 A162 50
A094 69 A117 54 A140 38 A163 55
A095 59 A118 50 A141 50 A164 56
A096 54 A119 56 A142 52 A165 52
A097 49 A120 54 A143 58 A166 43
A098 52 A121 57 A144 44 A167 38
A099 52 A122 69 A145 42 A168 67
A100 55 A123 59 A146 61 A169 42
A101 70 A124 54 A147 36 A170 49
A102 37 A125 49 A148 61 A171 55
A103 55 A126 52 A149 31 A172 32
A104 54 A127 52 A150 55 A173 52
A105 49 A128 55 A151 46 A174 32
A106 47 A129 70 A152 55 A175 46
A107 46 A130 50 A153 64 A176 42
A108 63 A131 59 A154 33 A177 68
A109 60 A132 55 A155 56 A178 57
A110 49 A133 35 A156 51 A179 43
A111 61 A134 50 A157 51 A180 43
A112 69 A135 43 A158 48 A181 43
A113 70 A136 43 A159 32 A182 68
A114 50 A137 44 A160 57 A183 36
A115 37 A138 49 A161 63 A184 54
집합 B의 정상대조군 시료 정보
집합 B
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
B001 69 B024 46 B047 30 B070 46
B002 70 B025 63 B048 52 B071 65
B003 50 B026 60 B049 62 B072 38
B004 37 B027 49 B050 33 B073 33
B005 38 B028 61 B051 46 B074 35
B006 54 B029 69 B052 57 B075 63
B007 50 B030 70 B053 38 B076 75
B008 56 B031 50 B054 47 B077 47
B009 54 B032 37 B055 43 B078 63
B010 57 B033 38 B056 51 B079 41
B011 69 B034 54 B057 30 B080 49
B012 59 B035 50 B058 41 B081 62
B013 54 B036 56 B059 48 B082 28
B014 49 B037 54 B060 42 B083 51
B015 52 B038 47 B061 34 B084 48
B016 52 B039 40 B062 38 B085 52
B017 55 B040 35 B063 45 B086 50
B018 70 B041 57 B064 39 B087 43
B019 37 B042 48 B065 42 B088 36
B020 55 B043 59 B066 51 B089 54
B021 54 B044 46 B067 36 B090 27
B022 49 B045 52 B068 30 B091 19
B023 47 B046 40 B069 43 B092 73
집합 A1의 난소암 환자군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Stage Histology
A001 52 IIA Endometrioid adenocarcinoma
A002 63 IV Papillary serous adenocarcinoma
A003 55 IA Malignant Brenner tumour
A004 50 IC Clear cell carcinoma
A005 44 IIIC Papillary serous adenocarcinoma
A006 53 IIIB Serous carcinoma
A007 77 IIIC Transitional cell carcinoma
A008 57 IIIC Clear cell carcinoma
A009 51 IIB Serous carcinoma
A010 74 IV Serous carcinoma
A011 56 IIIC Serous carcinoma
A012 50 IIIC Serous carcinoma
A013 54 IIIC Serous carcinoma
A014 66 IIIC Serous carcinoma
A015 55 IA Clear cell carcinoma
A016 58 IIIC Serous carcinoma
A017 42 IIIC Serous carcinoma
A018 44 IIA Clear cell carcinoma
A019 54 IIIC Serous carcinoma
A020 34 IA Serous carcinoma
A021 41 IA Clear cell carcinoma
A022 61 IIIC Serous carcinoma
A023 65 IIIC Endometrioid carcinoma
A024 52 IIIC Serous carcinoma
A025 53 IC Serous carcinoma
A026 57 IIIC Metastatic papillary serous carcinoma
A027 57 IV Papillary serous carcinoma
A028 48 IIIA2 Clear cell carcinoma
A029 55 IIIC Papillary serous carcinoma
A030 52 IV Serous adenocarcinoma
집합 A2의 난소암 환자군 시료 정보
집합 A2
Sampleno. Ageyear Stage Histology
A031 73 IIIC Serous adenocarcinoma
A032 47 IIIC Papillary serous adenocarcinoma
A033 58 IIC Serous adenocarcinoma
A034 57 IB Mixed cell adenocarcinoma
A035 68 IA Mucinous carcinoma
A036 67 IIIC Serous carcinoma
A037 74 IIIC Serous carcinoma
A038 67 IV Serous carcinoma
A039 57 IIIC Serous carcinoma
A040 57 IIIC Serous carcinoma
A041 61 IIIA Endometrioid carcinoma
A042 58 IIA Serous carcinoma
A043 55 IV Serous carcinoma
A044 51 IIIC Serous carcinoma
A045 57 IV Serous carcinoma
A046 52 IC Serous carcinoma
A047 27 IA Mucinous carcinoma
A048 52 IA Mucinous carcinoma
A049 41 IIIC Serous carcinoma
A050 46 IIIC Serous carcinoma
A051 69 IIIC Serous carcinoma
A052 57 IIIC Serous carcinoma
A053 62 IIIC Serous carcinoma
A054 73 IIIB Serous carcinoma
A055 71 IIB Serous carcinoma
A056 61 IC1 Serous carcinoma
A057 60 IIIC Papillary serous carcinoma
A058 51 IIIC Papillary serous carcinoma
A059 41 IVB Metastatic papillary serous carcinoma
A060 68 IIIC Serous carcinoma
집합 B의 난소암 환자군 시료 정보
집합 B
Sampleno. Ageyear Stage Histology
B001 72 IIIC Serous adenocarcinoma
B002 54 IIIC Papillary serous adenocarcinoma
B003 40 IC Papillary serous adenocarcinoma
B004 74 IIB Transitional cell carcinoma
B005 47 IV Serous adenocarcinoma
B006 67 IA Mucinous carcinoma
B007 49 IIIC Serous carcinoma
B008 59 IIIC Serous carcinoma
B009 46 IIA Endometrioid carcinoma
B010 44 IV Mucinous carcinoma
B011 49 IIIC Serous carcinoma
B012 44 IIIC Serous carcinoma
B013 53 IIIC Serous carcinoma
B014 52 IIIC Serous carcinoma
B015 49 IA Endometrioid carcinoma
B016 64 IIA Serous carcinoma
B017 55 IA Serous carcinoma
B018 52 IIIC Endometrioid carcinoma
B019 43 IC Serous carcinoma
B020 49 IIIC Serous carcinoma
B021 37 IIIC Serous carcinoma
B022 54 IIIA Serous carcinoma
B023 48 IIIC Serous carcinoma
B024 76 IIIB Mucinous carcinoma
B025 75 IIIA Serous carcinoma
B026 45 IC1 Clear cell carcinoma
B027 51 IIIC Serous carcinoma
B028 56 IIIC Papillary serous carcinoma
B029 67 IV Serous carcinoma
집합 A1의 대장암 환자군 시료 정보 (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma)
집합 A1
Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type
A001 48 IIB T-colon AC A041 58 IIIB Colon
A002 50 IIIA Rectum AC A042 56 IIIB Rectum
A003 73 IIIA Rectum AC A043 67 IIA Colon
A004 70 I A-colon AC A044 70 IIA Colon
A005 41 I HF-colon AC A045 53 IIA Colon
A006 51 IIIB A-colon AC A046 47 I Colon
A007 33 IIIB S-colon AC A047 70 IIA Colon
A008 58 I RS-colon A048 58 IIA Colon
A009 53 IIIB HF-colon AC A049 71 IIA Colon
A010 58 I S-colon AC A050 80 IIIB Colon
A011 82 IIIB Rectum AC A051 77 IIA Colon
A012 44 IIIB S-colon AC A052 73 IVB Colon
A013 70 IIIB S-colon AC A053 72 I Rectum
A014 84 IIB S-colon AC A054 50 I Rectum
A015 79 0 S-colon AC A055 71 IIA Rectum
A016 59 IIIB Rectum AC A056 56 IIIA Colon
A017 48 I Rectum A057 56 IIIB Colon
A018 52 IIIC S-colon AC A058 56 IIA Colon
A019 53 IIA RS-colon AC A059 55 I Rectum
A020 78 I Rectum AC A060 75 IIIB Colon
A021 43 IIA RS-colon MAC A061 71 I Colon
A022 66 IIA S-colon AC A062 69 I Rectum
A023 73 IIA HF-colon AC A063 63 IIIB Colon
A024 68 Ⅳ S-colon AC A064 74 IVB Rectum
A025 74 IVA Rectum AC A065 71 IIIA Colon
A026 55 IIIB RS-colon AC A066 66 IIA Colon
A027 53 I D-colon AC A067 73 IIB Colon
A028 74 I Rectum AC A068 78 IIA Colon
A029 80 IIIB S-colon AC A069 63 IIA Rectum
A030 82 IIIB Rectum AC A070 73 I Colon
A031 53 IIIC S-colon AC A071 72 I Colon
A032 46 IIIB RS-colon AC A072 55 IIIB Rectum
A033 81 IIA D-colon AC A073 47 I Colon
A034 56 IIIB S-colon MAC A074 71 IIA Colon
A035 75 I A-colon AC A075 43 I Rectum
A036 50 IIA S-colon AC A076 55 IIIA Colon
A037 71 IIIA Colon A077 55 I Rectum
A038 67 IIIB Colon A078 74 IIA Rectum
A039 51 IIIA Rectum A079 71 I Colon 　
A040 79 I Colon
집합 A2의 대장암 환자군 시료 정보 (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma)
집합 A2
Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type
A080 71 I RS-colon A120 41 I Colon
A081 45 IIA S-colon AC A121 68 I Rectum
A082 36 IIIB S-colon AC A122 76 II Colon
A083 73 IIA S-colon AC A123 72 I Rectum
A084 86 IIA Rectum AC A124 47 I Colon
A085 68 IIIB A-colon AC A125 52 IIA Colon
A086 71 I S-colon AC A126 40 IIIC Colon
A087 84 IIIB A-colon AC A127 62 IIIC Colon
A088 69 IIA Rectum AC A128 72 IIIA Rectum
A089 39 IIA Rectum AC A129 50 IIIB Colon
A090 42 IIIB A-colon AC A130 68 IIA Colon
A091 49 IIIA A-colon AC A131 62 IIIA Rectum
A092 47 IIIC S-colon AC A132 75 IIIA Colon
A093 78 IIIB RS-colon AC A133 56 I Rectum
A094 65 I Rectum AC A134 52 IIA Rectum
A095 54 I S-colon AC A135 65 I Rectum
A096 59 I S-colon A136 74 IIIB Rectum
A097 78 IIA S-colon AC A137 81 II Colon
A098 72 IIIB Rectum AC A138 70 IIIC Colon
A099 54 IIIB S-colon AC A139 76 IIA Colon
A100 73 I A-colon AC A140 59 IVA Colon
A101 54 IVA A-colon AC A141 70 IIIB Rectum
A102 73 IIIB T-colon AC A142 65 III Colon
A103 69 I A-colon AC A143 56 IIIC Colon
A104 62 IIIB A-colon 　 A144 63 II Colon
A105 79 IIA RS-colon AC A145 51 I Rectum
A106 57 IIIC A-colon AC A146 30 II Rectum
A107 66 IIA S-colon AC A147 65 I Colon
A108 65 IIIB Rectum AC A148 46 II Rectum
A109 48 IIIC RS-colon AC A149 56 I Colon
A110 63 I Rectum AC A150 62 IIIC Colon
A111 55 IIIB RS-colon AC A151 78 I Colon
A112 60 I S-colon AC A152 49 IIA Colon
A113 46 IIIC Rectum AC A153 55 IIC Colon
A114 38 I S-colon AC A154 78 IIIB Rectum
A115 77 II Rectum A155 85 IIA Colon
A116 82 II Colon A156 73 I Rectum
A117 76 IVA Colon A157 76 IIA Rectum
A118 74 IIC Colon A158 63 I Colon 　
A119 72 I Colon
집합 B의 대장암 환자군 시료 정보 (AC: adenocarcinoma; MAC: mucinous adenocarcinoma)
집합 B
Sample no. Ageyear Stage Location Cell type Sample no. Ageyear Stage Location Cell type
B001 73 IIIB S-colon AC B041 71 I Colon
B002 45 IIIC A-colon AC B042 67 IIA Rectum
B003 52 I S-colon AC B043 52 I Rectum
B004 58 IIIB S-colon AC B044 72 IIIB Colon
B005 53 I A-colon AC B045 74 IIIB Colon
B006 70 I Rectum AC B046 74 IIA Colon
B007 66 IIIA S-colon AC B047 75 IIB Colon
B008 75 IIIB S-colon AC B048 69 IIIB Colon
B009 54 I Rectum AC B049 75 I Colon
B010 70 IIIB S-colon AC B050 58 I Colon
B011 72 IIIB A-colon AC B051 40 IIA Colon
B012 73 IIA AC B052 66 I Colon
B013 63 I S-colon AC B053 59 II Colon
B014 49 IIA S-colon AC B054 51 IIA Rectum
B015 74 IIB HF-colon AC B055 59 IIB Colon
B016 76 IIIB HF-colon AC B056 72 IIC Colon
B017 58 I Rectum AC B057 74 I Colon
B018 64 IIIC RS-colon AC B058 71 IIA Rectum
B019 58 IIA S-colon AC B059 76 IIIB Colon
B020 65 0 Rectum AC B060 54 I Rectum
B021 66 IIB T-colon AC B061 43 II Colon
B022 62 IIA T-colon AC B062 57 I Rectum
B023 48 IIIB S-colon AC B063 65 I Rectum
B024 53 IVA Rectum AC B064 70 IIIB Rectum
B025 79 IVB A-colon AC B065 76 IVB Colon
B026 54 IIIB A-colon MAC B066 68 I Colon
B027 65 IIIB RS-colon AC B067 72 IIA Rectum
B028 87 IIA RS-colon AC B068 68 IIIB Rectum
B029 82 IIA Rectum AC B069 72 IIIB Rectum
B030 59 I RS-colon AC B070 55 I Rectum
B031 73 IIIA RS-colon AC B071 44 I Colon
B032 64 IIIB S-colon AC B072 73 I Colon
B033 53 IIIB S-colon AC B073 70 IIIC Rectum
B034 65 I Rectum AC B074 69 IIIC Colon
B035 78 I Rectum AC B075 43 III Rectum
B036 58 IVB Colon B076 63 IIIC Rectum
B037 54 IIA Colon B077 49 IIIA Colon
B038 67 IIA Colon B078 72 IIIC Rectum
B039 74 II Colon B079 56 IIIB Rectum 　
B040 69 IIA Colon
위암 환자군 시료 정보
집합 A1
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
A001 62 IA A017 73 IA A033 62 IA
A002 67 IA A018 59 IB A034 54 IA
A003 64 IB A019 81 IV A035 67 IA
A004 41 IB A020 86 IV A036 64 IA
A005 81 IIIB A021 45 IV A037 82 IIA
A006 79 IA A022 60 IIB A038 52 IV
A007 42 IA A023 81 IA A039 35 IA
A008 42 IB A024 70 IA A040 44 IA
A009 54 IA A025 55 IA A041 40 IA
A010 45 IIIC A026 54 IA A042 66 IA
A011 56 IA A027 56 IA A043 38 IV
A012 61 IA A028 72 IIIA A044 74 IA
A013 70 IA A029 76 IA A045 77 IA
A014 72 IA A030 82 IIA A046 55 IIIB
A015 64 IA A031 49 IIIA A047 56 0
A016 36 IA A032 35 IIB
집합 A2
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
A048 62 IA A064 60 IIIB A079 42 IA
A049 65 IA A065 60 IA A080 46 IB
A050 54 IA A066 63 IA A081 59 IA
A051 58 IIB A067 48 IA A082 69 IA
A052 40 IA A068 64 IB A083 60 IB
A053 74 IV A069 75 IIIA A084 46 IA
A054 77 IV A070 80 IA A085 42 IA
A055 28 IA A071 72 IA A086 77 IIA
A056 70 IIIB A072 53 IA A087 69 IIIB
A057 38 IV A073 70 IA A088 79 IB
A058 72 IA A074 57 IB A089 52 IIB
A059 62 IA A075 50 IA A090 50 IV
A060 67 IA A076 40 IV A091 62 IA
A061 58 IIIA A077 71 IA A092 63 IA
A062 75 IA A078 48 IIB A093 41 IA
A063 68 IA
집합 B
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
B001 66 IV B017 78 IA B032 74 IIA
B002 75 IB B018 37 IA B033 81 IB
B003 65 IA B019 57 IA B034 58 IA
B004 71 IA B020 58 IA B035 69 IA
B005 68 IA B021 42 IA B036 46 IA
B006 43 IA B022 56 IIIB B037 77 IA
B007 50 IA B023 50 IA B038 76 IA
B008 59 IA B024 53 IIIB B039 51 IA
B009 63 IA B025 57 IA B040 35 IA
B010 66 IA B026 39 IA B041 49 IA
B011 30 IA B027 63 IV B042 57 IA
B012 47 IA B028 45 IA B043 81 IIIA
B013 39 IA B029 58 IV B044 36 IIIB
B014 76 IIA B030 41 IIIA B045 33 IV
B015 71 IV B031 76 IIB B046 63 0
B016 56 IA
자궁 양성종양 환자군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Pathology Sampleno. Ageyear Pathology
A001 41 Leiomyoma A015 34 Leiomyoma
A002 52 Adenomyosis A016 51 Leiomyoma
A003 42 Adenomyosis A017 42 Leiomyoma
A004 32 Leiomyoma A018 65 Leiomyoma
A005 41 Leiomyoma A019 47 Leiomyoma
A006 45 Leiomyoma A020 44 Leiomyoma
A007 51 Leiomyoma A021 39 Leiomyoma
A008 42 Leiomyoma A022 38 Leiomyoma
A009 49 Leiomyoma A023 32 Leiomyoma
A010 39 Leiomyoma A024 45 Leiomyoma
A011 48 Leiomyoma A025 47 Leiomyoma
A012 38 Leiomyoma A026 35 Leiomyoma
A013 57 Leiomyoma A027 45 Leiomyoma
A014 41 Leiomyoma
집합 A2
Sampleno. Ageyear Pathology Sampleno. Ageyear Pathology
A028 70 Leiomyoma A042 48 Leiomyoma
A029 56 Leiomyoma A043 42 Leiomyoma
A030 50 Leiomyoma A044 51 Leiomyoma
A031 48 Adenomyosis A045 48 Leiomyoma
A032 51 Leiomyoma A046 51 Leiomyoma
A033 47 Leiomyoma A047 48 Leiomyoma
A034 50 Leiomyoma A048 45 Leiomyoma
A035 47 Leiomyoma A049 56 Adenomyosis
A036 67 Leiomyoma A050 40 Leiomyoma
A037 57 Leiomyoma A051 44 Leiomyoma
A038 44 Leiomyoma A052 44 Leiomyoma
A039 29 Leiomyoma A053 47 Leiomyoma
A040 25 Leiomyoma A054 45 Leiomyoma
A041 69 Leiomyoma A055 40 Leiomyoma
집합 B
Sampleno. Ageyear Pathology Sampleno. Ageyear Pathology
B001 42 Leiomyoma B015 47 Endometrial polyp
B002 36 Leiomyoma B016 32 Leiomyoma
B003 50 Leiomyoma B017 50 Leiomyoma
B004 48 Adenomyosis B018 56 Leiomyoma
B005 41 Adenomyosis B019 46 Endometrial polyp
B006 46 Chronic inflammation with squamous metaplasia B020 49 Leiomyoma
B007 39 Leiomyoma B021 39 Leiomyoma
B008 46 Leiomyoma B022 36 Leiomyoma
B009 43 Leiomyoma B023 48 Leiomyoma
B010 40 Leiomyoma B024 59 Leiomyoma
B011 50 Leiomyoma B025 44 Leiomyoma
B012 50 Leiomyoma B026 40 Leiomyoma
B013 49 Leiomyoma B027 47 Leiomyoma
B014 39 Leiomyoma B028 45 Leiomyoma
난소 양성종양 환자군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Pathology
A001 45 Chronic salpingitis
A002 26 Cystic teratoma
A003 62 Serous cystadenoma
A004 53 Chronic salpingitis
A005 45 Mucinous cystadenoma
A006 36 Endometriosis
A007 38 Acute serositis, Chronic endometritis, Cervicitis
A008 29 Endometriosis
A009 25 Mature cystic teratoma
A010 54 Fibrothecoma
A011 57 Mucinous cystadenoma
A012 41 Serous cystadenoma
A013 36 Endometriotic cyst
A014 23 Mature cystic teratoma
A015 51 Endometriotic cyst
A016 42 Serous cystadenofibroma
A017 33 Endometriotic cyst
A018 31 Endometriotic cyst
A019 30 Mature cystic teratoma
A020 49 Endometriotic cyst
A021 56 Serous cystadenoma
A022 26 Mature cystic teratoma
A023 29 Endometriosis
집합 A2
Sampleno. Ageyear Pathology
A024 45 Mucinous cystadenoma
A025 73 Solitary fibrous tumor
A026 43 Endometriosis
A027 42 Endometriosis
A028 52 Pseudomyxoma peritonei, Small serous cystadenoma
A029 62 Serous cystadenoma
A030 55 Serous cystadenoma
A031 36 Endometriotic cyst
A032 29 Cystic teratoma
A033 24 Endometriotic cyst
A034 36 Endometriosis
A035 24 Multilocular peritoneal inclusion cyst
A036 45 Endometriosis
A037 42 Endometriosis
A038 36 Serous cystadenoma
A039 43 Serous cystadenoma
A040 34 Mucinous cystadenoma
A041 54 Mucinous cystadenoma
A042 30 Serous cystadenofibroma
A043 43 Endometriosis
A044 30 Mature cystic teratoma
A045 72 Simple mesothelial cyst
A046 25 Mature cystic teratoma
A047 42 Endometriosis
집합 B
Sampleno. Ageyear Pathology
B001 55 Mature cystic teratoma
B002 83 Serous cystadenoma
B003 41 Endometriosis
B004 39 Endometriosis
B005 71 Abscess
B006 49 Endometriosis
B007 48 Paratubal cyst
B008 49 Adenofibroma, Paratubal cyst
B009 34 Endometriosis
B010 43 Ovarian and adnexal tissue with endometriosis
B011 45 Endometriosis
B012 21 Serous papillary adenofibroma
B013 32 Endometriotic cyst
B014 60 Serous cystadenoma
B015 31 Mature cystic teratoma
B016 41 Endometriosis
B017 58 Serous cystadenoma
B018 31 Endometriosis with focal degenerative atypia
B019 52 Simple cyst with atrophic ovary
B020 26 Mature cystic teratoma
B021 42 Endometriotic cyst
B022 34 Endometriosis
B023 46 Serous cystadenoma
B024 20 Cystic teratoma
자궁경부암 전암병변 환자군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Pathology
A001 40 Adenocarcinoma in situ
A002 44 Cervical intraepithelial neoplasia III
A003 50 Carcinoma in situ
A004 71 Cervical intraepithelial neoplasia I
A005 47 Atypical squamous cells of undetermined significance
A006 29 Cervical intraepithelial neoplasia I
A007 46 Cervical intraepithelial neoplasia I
A008 54 Atypical squamous cells, cannot rule out high-grade squamous intraepithelial lesion
A009 33 Cervical intraepithelial neoplasia III
A010 50 Carcinoma in situ
A011 71 Cervical intraepithelial neoplasia II
A012 42 Cervical intraepithelial neoplasia III
A013 36 Cervical intraepithelial neoplasia III
A014 45 Cervical intraepithelial neoplasia I
A015 52 Cervical intraepithelial neoplasia I
A016 64 Cervical intraepithelial neoplasia II
A017 45 Cervical intraepithelial neoplasia I
A018 40 Cervical intraepithelial neoplasia II
A019 48 Cervical intraepithelial neoplasia I
A020 34 Cervical intraepithelial neoplasia III
A021 50 Cervical intraepithelial neoplasia III
A022 33 Cervical intraepithelial neoplasia II
A023 42 Carcinoma in situ
A024 70 Cervical intraepithelial neoplasia III
A025 74 Carcinoma in situ
A026 31 Cervical intraepithelial neoplasia II
A027 30 Cervical intraepithelial neoplasia III
A028 39 Cervical intraepithelial neoplasia II
A029 48 Cervical intraepithelial neoplasia III
A030 41 Carcinoma in situ
집합 A2
Sampleno. Ageyear Pathology
A031 32 Cervical intraepithelial neoplasia II
A032 52 Cervical intraepithelial neoplasia I-II
A033 45 Cervical intraepithelial neoplasia II
A034 51 Cervical intraepithelial neoplasia III
A035 41 Cervical intraepithelial neoplasia II-III
A036 32 Cervical intraepithelial neoplasia III
A037 36 Cervical intraepithelial neoplasia II
A038 29 Cervical intraepithelial neoplasia III
A039 32 Cervical intraepithelial neoplasia III
A040 36 Carcinoma in situ
A041 33 Cervical intraepithelial neoplasia III
A042 34 Cervical intraepithelial neoplasia I
A043 40 Carcinoma in situ
A044 47 Cervical intraepithelial neoplasia I
A045 46 Cervical intraepithelial neoplasia I
A046 42 Cervical intraepithelial neoplasia I
A047 31 Cervical intraepithelial neoplasia I
A048 60 Carcinoma in situ
A049 47 Cervical intraepithelial neoplasia II
A050 36 Cervical intraepithelial neoplasia III
A051 31 Cervical intraepithelial neoplasia III
A052 25 Cervical intraepithelial neoplasia III
A053 44 Carcinoma in situ
A054 37 Cervical intraepithelial neoplasia III
A055 44 Cervical intraepithelial neoplasia II
A056 42 Cervical intraepithelial neoplasia III
A057 28 Cervical intraepithelial neoplasia III
A058 49 Cervical intraepithelial neoplasia I
A059 51 Carcinoma in situ
집합 B
Sampleno. Ageyear Pathology
B001 34 Cervical intraepithelial neoplasia III
B002 58 Cervical intraepithelial neoplasia III
B003 26 Cervical intraepithelial neoplasia III
B004 41 Carcinoma in situ
B005 39 Cervical intraepithelial neoplasia II
B006 41 Adenocarcinoma in situ
B007 36 Cervical intraepithelial neoplasia III
B008 51 Cervical intraepithelial neoplasia I
B009 32 Cervical intraepithelial neoplasia III
B010 54 Cervical intraepithelial neoplasia II-III
B011 25 Cervical intraepithelial neoplasia II
B012 79 Cervical intraepithelial neoplasia II
B013 31 Cervical intraepithelial neoplasia II
B014 33 Cervical intraepithelial neoplasia II
B015 30 Adenocarcinoma in situ
B016 48 Carcinoma in situ
B017 22 Carcinoma in situ
B018 24 Cervical intraepithelial neoplasia III
B019 37 Cervical intraepithelial neoplasia III
B020 58 Cervical intraepithelial neoplasia III
B021 39 Cervical intraepithelial neoplasia II
B022 48 Cervical intraepithelial neoplasia II
B023 38 Cervical intraepithelial neoplasia I
B024 27 Cervical intraepithelial neoplasia III
B025 40 Cervical intraepithelial neoplasia I
B026 30 Carcinoma in situ
B027 29 Carcinoma in situ
B028 49 Cervical intraepithelial neoplasia II
B029 53 Cervical intraepithelial neoplasia I
유방암 환자군 시료 정보
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
A001 52 IIA A012 45 IB A022 50 IIA
A002 52 IIA A013 42 IA A023 46 IIA
A003 40 IA A014 41 IA A024 57 IIA
A004 40 IA A015 67 IA A025 38 IIA
A005 51 IIA A016 40 IIB A026 40 IIIA
A006 64 IA A017 68 IA A027 52 IIA
A007 57 IA A018 53 IA A028 50 0
A008 69 0 A019 41 0 A029 47 0
A009 33 IIA A020 49 IA A030 47 IIIA
A010 44 IA A021 42 IIA A031 42 IIIA
A011 29 IA
집합 A2
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
A032 58 IIB A043 57 IIB A053 37 IIIA
A033 51 IIA A044 33 0 A054 69 IIB
A034 46 IIA A045 40 IA A055 49 IIA
A035 41 IIB A046 42 0 A056 54 IIA
A036 45 IA A047 52 IA A057 39 IA
A037 35 IB A048 40 IIIA A058 44 IA
A038 41 IIB A049 67 IA A059 69 IA
A039 56 IA A050 43 IIB A060 30 IA
A040 55 IA A051 50 IA A061 38 IIA
A041 41 IIB A052 46 IIIA A062 41 0
A042 52 IA
집합 B
Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage Sample no. Age year Stage
B001 46 IA B012 57 IA B022 51 IIA
B002 50 IA B013 50 IA B023 51 IIA
B003 55 IA B014 44 IIA B024 48 IIB
B004 66 IA B015 46 IIA B025 47 IIB
B005 42 IIA B016 42 IA B026 64 IIIC
B006 45 IA B017 59 IA B027 52 0
B007 33 IB B018 41 IA B028 31 IIIA
B008 51 IIA B019 51 IIA B029 37 0
B009 57 IA B020 54 IA B030 43 0
B010 52 IIA B021 46 IIA B031 42 0
B011 46 IA
유방 양성종양 환자군 시료 정보
집합 A1
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
A001 42 A007 62 A013 40 A018 21
A002 62 A008 19 A014 55 A019 41
A003 22 A009 42 A015 54 A020 46
A004 47 A010 42 A016 52 A021 49
A005 55 A011 46 A017 48 A022 48
A006 56 A012 39
집합 A2
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
A023 58 A029 55 A034 38 A039 46
A024 22 A030 45 A035 49 A040 32
A025 42 A031 53 A036 33 A041 54
A026 46 A032 48 A037 36 A042 52
A027 27 A033 39 A038 32 A043 50
A028 39
집합 B
Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear Sampleno. Ageyear
B001 49 B007 46 B013 41 B018 61
B002 53 B008 38 B014 46 B019 40
B003 42 B009 41 B015 54 B020 46
B004 46 B010 38 B016 42 B021 59
B005 53 B011 54 B017 52 B022 60
B006 59 B012 47
자궁경부암 환자군 시료 정보
집합 B
Sampleno. Ageyear Stage Pathology
B001 26 IIB Squamous cell carcinoma
B002 32 IB2 Squamous cell carcinoma
B003 71 IIB Squamous cell carcinoma
B004 34 IA1 Microinvasive squamous cell carcinoma
B005 50 IB1 Adenocarcinoma
B006 52 IB Squamous cell carcinoma
B007 55 IB1 Adenosquamous carcinoma
B008 45 IIB 　
B009 40 I Endocervical adenocarcinoma
B010 43 IB1 Squamous cell carcinoma
B011 40 IB1 Squamous cell carcinoma
B012 43 IB1 Squamous cell carcinoma
B013 40 IV Squamous cell carcinoma
B014 45 I Squamous cell carcinoma
B015 46 IB1 Adenosquamous carcinoma
B016 64 IB1 Squamous cell carcinoma
B017 44 IB1 Mucinous adenocarcinoma
B018 43 IIB Squamouscellcarcinoma
B019 44 IA1 Squamous cell carcinoma
B020 47 IIB Squamous cell carcinoma
B021 44 IA1 Microinvasive squamous cell carcinoma
B022 30 IV Adenosquamouscellcarcinoma
B023 51 IB1 Squamous cell carcinoma
B024 50 IB1 Squamous cell carcinoma
B025 67 IB1 Squamous cell carcinoma
B026 70 IIA Squamous cell carcinoma
B027 74 IIB Squamous cell carcinoma
B028 74 IIB Squamous cell carcinoma
B029 73 IB1 Squamous cell carcinoma
B030 82 IIB Squamous cell carcinoma
B031 49 IIIB Squamous cell carcinoma
B032 72 IIB Microinvasive papillary squamous cell carcinoma
B033 32 IA1 Microinvasive squamous cell carcinoma
자궁내막암 환자군 시료 정보
집합 B
Sampleno. Ageyear Stage Pathology
B001 58 IIIC Endometrioid adenocarcinoma
B002 66 IA Endometrioid adenocarcinoma
B003 49 IA Endometrioid adenocarcinoma
B004 64 IIIC2 Metastatic carcinoma
B005 54 IA Endometrioid adenocarcinoma
B006 52 IA Endometrioid adenocarcinoma
B007 54 IA Endometrioidadenocarcinoma
B008 54 IA Endometrioid adenocarcinoma
B009 40 IA Endometrioid adenocarcinoma
B010 45 IA Endometrioid adenocarcinoma
훈련집합 A1의 기준 질량스펙트럼에 대해 PCA-DA를 적용한 결과를 도 2에 나타내었다. 도 2에서 DS는 판별점수(discriminant score)를 뜻한다. 판별점수 0점(수평 점선)을 기준으로 하면 환자군에 따라 낮은 특이도를 얻게 되기도 하지만, 판별점수 문턱값을 도 2의 수평 실선과 같이 바꾸면 기준 질량스펙트럼에 대한 판별결과는 민감도와 특이도가 모두 매우 우수하다는 것을 알 수 있다.
제1 그룹후보 도출 과정을 통해 176개의 제1 그룹후보가 선발되었다. 176개의 제1 그룹후보만으로 기준 질량스펙트럼을 판별한 결과를 도 3에 나타내었다. 10,000개의 저질량 이온으로 판별한 도 2에 견주었을 때 민감도와 특이도가 모두 그대로 유지되었을 뿐만 아니라 전체 저질량 이온의 2%도 되지 않는 저질량 이온만을 사용했는데도 판별점수의 범위가 크게 달라지지 않았음을 확인할 수 있다.
위에서 설명한 방법을 이용하여 제1 그룹후보에서 13개의 제1 그룹을 도출하였다.
실시 예 - 난소암 판정 - 제1 그룹 이용
훈련집합 A1과 A2에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온을 이용하여 판정한 결과를 각각 도 4와 도 5에 나타내었다.
훈련집합 A1과 A2에 대한 진단성능은 표 21 및 표 22와 같으며, 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다.
제1 그룹을 이용한 훈련집합 진단성능-1
훈련집합 A1 TrueOVC TrueNon-OVC
PredictedOVC 30 3 Sensitivity 100.00%
Specificity 99.15%
PredictedNon-OVC 0 348 PPV 90.91%
NPV 100.0%
훈련집합 A2 TrueOVC TrueNon-OVC
PredictedOVC 30 0 Sensitivity 100.00%
Specificity 100.00%
PredictedNon-OVC 0 350 PPV 100.00%
NPV 100.00%
제1 그룹을 이용한 훈련집합 진단성능-2
훈련집합 A1 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT
PredictedOVC 30 0 0 0 1 0 0 2 0
PredictedNon-OVC 0 92 79 47 26 23 30 29 22
훈련집합 A2 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT
PredictedOVC 30 0 0 0 0 0 0 0 0
PredictedNon-OVC 0 92 79 46 28 24 29 31 21
검증집합 B에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온을 이용하여 검증한 결과를 도 6에 나타내었다.
검증집합 B에 대한 진단성능은 표 23 및 표 24와 같으며, 검증집합에 대해서도 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다.
제1 그룹을 이용한 검증 집합 진단성능-1
검증집합 B TrueOVC TrueNon-OVC UCC Specificity 48.48%
EMC Specificity 50.00%
PredictedOVC 27 0 Sensitivity 93.10%
Specificity 100.0%
PredictedNon-OVC 2 351 PPV 100.0%
NPV 99.43%
제1 그룹을 이용한 검증 집합 진단성능-2
검증집합 B TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT TrueUCC TrueEMC
PredictedOVC 27 0 0 0 0 0 0 0 0 17 5
PredictedNon-OVC 2 92 79 46 28 24 29 31 22 16 5
실시 예 - 난소암 판정 - 제1 그룹과 제2 그룹 이용
훈련집합 A1과 A2에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온과 제2 그룹의 3개 저질량 이온을 이용하여 판정한 결과를 각각 도 7과 도 8에 나타내었다.
훈련집합 A1과 A2에 대한 진단성능은 표 25 및 표 26과 같으며, 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다. 제1 그룹만 이용한 경우 양수 판별점수를 갖는 시료는 난소암 양성으로, 음수 판별점수를 갖는 시료는 난소암 음성으로 판정했다. 즉, 난소암 양성/음성 여부를 판정하는 판별점수의 문턱값은 0점이었다. 제1 그룹과 제2 그룹을 이용한 경우에는 훈련집합에 대한 진단성능이 최대가 되도록 판별점수의 문턱값(도 7과 도 8의 수평 실선)을 결정했다. 이와 같이 선정한 판별점수의 문턱값을 이후 검증집합에 대한 판정에 그대로 적용하였다.
제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 진단성능-1
훈련집합 A1 TrueOVC TrueNon-OVC
PredictedOVC 27 10 Sensitivity 90.00%
Specificity 97.15%
PredictedNon-OVC 3 341 PPV 72.97%
NPV 99.13%
훈련집합 A2 TrueOVC TrueNon-OVC
PredictedOVC 27 12 Sensitivity 90.00%
Specificity 96.57%
PredictedNon-OVC 3 338 PPV 69.23%
NPV 99.12%
제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 진단성능-2
훈련집합 A1 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT
PredictedOVC 27 2 1 1 0 0 0 3 3
PredictedNon-OVC 3 90 78 46 27 23 30 28 19
훈련집합 A2 TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT
PredictedOVC 27 9 1 0 0 0 0 2 0
PredictedNon-OVC 3 83 78 46 28 24 29 29 21
검증집합 B에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온과 제2 그룹의 3개 저질량 이온을 이용하여 검증한 결과를 도 9에 나타내었다.
검증집합 B에 대한 진단성능은 표 27 및 표 28과 같으며, 검증집합에 대해서도 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다. 특히, 제1 그룹의 13개 저질량 이온만 이용한 경우와 견주었을 때 훈련집합에 포함되지 않았던 자궁경부암과 자궁내막암에 대해서도 높은 특이도를 나타내었다.
제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 검증집합 진단성능-1
검증집합 B TrueOVC TrueNon-OVC UCC Specificity 90.91%
EMC Specificity 100.0%
PredictedOVC 26 7 Sensitivity 89.66%
Specificity 98.01%
PredictedNon-OVC 3 344 PPV 78.79%
NPV 99.14%
제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 검증집합 진단성능-2
검증집합 B TrueOVC TrueCONT TrueCRC TrueGC TrueBUT TrueBOT TruePCL TrueBRC TrueBBT TrueUCC TrueEMC
PredictedOVC 26 6 1 0 0 0 0 0 0 3 0
PredictedNon-OVC 3 86 78 46 28 24 29 31 22 30 10
전술한 실시 예들은 본 발명을 설명하기 위한 예시로서, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 이로부터 다양하게 변형하여 본 발명을 실시하는 것이 가능할 것이므로, 본 발명의 기술적 보호범위는 첨부된 특허청구범위에 의해 정해져야 할 것이다.

Claims (15)

  1. 난소암 진단 장치에 있어서,
    생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 입력하는 입력부;
    제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 입력부에서 입력한 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부를 포함하며,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  3. 제1항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  5. 제4항에 있어서,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  6. 난소암 진단 장치에 있어서,
    제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부와;
    상기 진단부의 진단결과를 출력하는 출력부를 포함하며,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  7. 제6항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  8. 제6항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  9. 제6항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.
  11. 난소암 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 있어서,
    생물학적 시료에서 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 얻는 단계;
    제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대한 난소암 진단 정보를 제공하는 난소암 진단 정보 제공단계를 포함하며,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
  12. 제11항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
  13. 제11항에 있어서,
    상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 난소암 진단 정보 제공단계는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 제공하며,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
  15. 제14항에 있어서,
    상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
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