WO2015166184A1 - Utilisation d'un acide dicarboxylique pour lutter contre la croissance de plantes holoparasites ou hémiparasites - Google Patents

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Gilles Comte
Jacques BERNILLON
Floriant BELLVERT
Claire PRIGENT-COMBARET
Zo-Norosoa ANDRIANJAKA-CAMPS
Robin Duponnois
Florence WISNIEWSKI-DYE
Cédric BERTRAND
Lucie MICHE
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Universite Claude Bernard Lyon I
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Definitions

  • the present invention relates to the technical field of the protection of agricultural crops (poaceae, solanaceae, brassicaceae, asteraceae) vis-à-vis holoparasites plants and epirhized hemiparasites (that is to say that develop on the roots of their plant host), of the order Scrophulariales, and in particular Striga and Orobanche. More specifically, the invention relates to the use of a dicarboxylic acid having 2 to 5 carbon atoms or a strain Azospirillum brasilense L4 deposited under the number 1-4830 with the CNCM to fight against the growth of holo plants or hemiparasites.
  • Holoparasite plants are non-chlorophyllian parasitic plants in nature and therefore need to take their organic matter from a host plant.
  • the hemiparasitic plants are chlorophyllian parasitic plants that provide only part of the synthesis of the carbonaceous substances necessary for their development. These parasitic plants develop at the expense of their host by becoming attached to their roots via the formation of a haustorium (sucker ) which results in the establishment of a connection between the xylem conducting vessels of the host plant and the parasitic plant (Bouwmeester et al., 2003, Curr Opin Plant Plant, 6: 358-364).
  • parasitic plants will pump sap from the host plant, slow down the development of aerial parts, induce chlorosis and reduce photosynthesis (Ejeta and Butler, 2000. Parasitic plants, Irr RA Frederiksen and GN Odvody (eds) Compendium of Sorghum Diseases, 2nd Edition, APS Press, The American Phytopathological Society, pp. 53-56). To survive, these parasitic plants must produce a large amount of seeds. Thus, as soon as the aerial parts emerge, the parasitic plant flowers and produces enormous quantities of seeds that may remain viable in the soil for several years (Haussmann et al., 2000, Reld Crop Res., 66: 195-211). .
  • the plants of the Striga and Orobanche genera belong to the same order, that of the Scrophulariales, but do not belong to the same family (the plants of the genus Striga belong to the family Scrophulariaceae and are hemiparasites, while plants of the genus Orobanche belong to the family Orobanchaceae and are holoparasites). These plants have many points in common: small seeds facilitating their dissemination, germination dependent on the presence of strigolactone elicitors, trophic spoliation of the host plant via the development of a haustorium.
  • Striga in all tropical and subtropical regions of the world and in particular in sub-Saharan Africa and Orobanche, mainly in the temperate countries of Asia and Central Europe and in particular around the Mediterranean. They affect the growth of a very wide variety of plants of agronomic interest (maize, rice, sorghum, millet, sunflower, rapeseed, tobacco, tomato, etc.), whether in temperate (Orobanche), or tropical (Striga ). They cause significant yield losses on a large number of crops.
  • the seeds of these parasitic plants are of very small size which favors their propagation over long distances by the wind, the animals, or by contaminated agricultural machinery.
  • the transport of seed from infected host plants is also a source of dissemination.
  • crop protection against Orobanche or Striga plants involves the use of non-selective herbicides, coupled with the use of cereal varieties resistant to these herbicides (De Groote et al., 2008, Agric. System 97: 83-94).
  • These chemical control means in addition to their toxicity to the environment, are expensive.
  • the use of plant protection products including herbicides will be greatly reduced.
  • Strigae or Fusarium art rosporioides that produce mycotoxins (ie fusaric acid, fumonisins, and deoxynivalenol (DON)) (Amsellem et al., 2001, BioControl 46: 211-228, Abuelgasim and roschel, 2003, FAO plant production and protection. Paper IMo.120. Addendum 1, 109-144; Lendzemo et al. 2004 Field Crop es. 91: 51-61; Venne et al., 2009, PesL Manag. Sci. 65: 572-580).
  • Mycotoxins are able to inhibit the germination of Striga and Orobanche seeds, but they can trigger health problems in mammals. In particular, they represent a risk for cattle and human food and therefore can not be considered as completely harmless substances.
  • the present invention proposes to use a dicarboxylic acid containing from 2 to 5 carbon atoms to combat growth of holo plants or hemiparasites, and in particular to control the growth of plants of the genus Striga and / or plants of the genus Orobanche. It is also possible to use combinations of several dicarboxylic acids, having 2 to 5 carbon atoms, to control the growth of holo plants or hemiparasites, to obtain the desired effect.
  • the active agents proposed for inhibiting the development of holo or hemiparasite plants are chosen from dicarboxylic acids (hereinafter also called diacids) comprising from 2 to 5 atoms. of carbon.
  • diacids comprise two carboxylic acid functions that are directly linked together, in the case of oxalic acid, or linked by a saturated or unsaturated carbon chain comprising 1, 2 or 3 carbon atoms.
  • This carbon chain is preferably linear and may be unsubstituted or substituted with one or more substituents, in particular of OH, OCH 3 and CH 2 OCH 3 type .
  • oxalic acid By way of example of such diacids, mention may be made of oxalic acid, malonic acid, maleic acid, malic acid, glutaric acid, and acetylene dicarboxylic acid.
  • L-form malic acid which has been shown to be particularly active in inhibiting the growth of Striga or Orobanche plants, is preferred.
  • Malic acid in L form could be isolated, by the inventors, from culture supernatant of a bacterial strain, Azospirillum brasilense L4, deposited, in accordance with the Budapest Treaty of 1977, under the number 1-4830, the December 18, 2013, at the CNCM, National Collection of Cultures of Microorganisms, Institut Pasteur, 25 rue Dondel Roux, 75724 Paris Cedex 15, FRANCE. This strain was isolated in 1995 from a sorghum field infested with a Striga parasitic plant in Mali.
  • the Azospirillum brasilense strain L4 that has been reported as having the ability to inhibit in vitro the growth of Striga hermonù AC and Orobanche ramosa and in soil microcosms, protect vis-a-vis sorghum and Striga to stimulate the growth of the cereal (Bouillant et al., 1997, CR Acad III Life Sci 320: 159-162, Miche et al., 2000, Eur J. Plant Pathol. 106: 347-351) has now been filed under the number 1-4830 with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France).
  • This strain produces in culture very specific metabolites, compared with other strains of Azospirillum brasilense (and especially with respect to that reported by Dadon et al., 2004: Isr. J. Plant Sci. 52: 83-86). .
  • the inventors have analyzed the culture supernatant of the strain Azospirillum brasilense L4, deposited under the number 1-4830, with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France) and have was able to demonstrate that malic acid in L form is responsible for the herbicidal activity observed with holo or hemiparasite plants.
  • the malic acid in L form is not the major component present in the culture supernatant of the bacterial strain, Azospirillum brasilense L4, deposited under the number 1-4830 with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France).
  • the inventors have also demonstrated that this herbicidal activity observed with respect to holo or hemiparasite plants is generalizable to the chemical class of dicarboxylic acids comprising from 2 to 5 carbon atoms.
  • the invention therefore proposes using active agents of natural origin, with a low environmental impact, to limit, inhibit the growth of parasitic plants.
  • dicarboxylic acids comprising from 2 to 5 carbon atoms are also capable of inhibiting the elongation of procaulomas or radicles. from germinated seeds of the parasitic plant, and, therefore, to block the growth of the parasitic plant, as is apparent in particular from the data presented in Table 1 below.
  • the dicarboxylic acid may be brought into contact with at least one holo plant seed or hemiparasite to be eradicated.
  • the dicarboxylic acid will be used in sufficient quantity to obtain the desired effect, and in particular to block the seed germination and / or to inhibit the elongation of procaulomas or radicles from seeds germinated holo plants or hemiparasites, the Scrophulariales, and in particular Striga and / or Orobanche.
  • from 30 to 300 kg of dicarboxylic acid per hectare of treated soil may be used.
  • a solution comprising from 1 to 20 g of dicarboxylic acid per liter of solution may be used.
  • the dicarboxylic acid can be applied to seeds and / or plant plants or crops to be protected.
  • the herbicidal compositions containing a dicarboxylic acid according to the invention may in particular be in the form of aqueous solutions or granules. These compositions may contain, in addition to the active dicarboxylic acid, ions derived from K 2 HPO 4 or KH 2 PO 4 , one or more fillers such as silica, clay, kaolin or talc and one or more surfactants. such as dodecylbenzene or calcium lignosulfonate.
  • malic acid in L form the latter may be produced by chemical synthesis or directly by the bacterial strain, Azospirillum brasilense L4, deposited under number 1-4830 with the CM (National Collection of Cultures of France). Microorganisms, France).
  • the acid may be isolated or the herbicidal composition may directly contain the culture supernatant of the bacteria.
  • the culture supernatant can be obtained by placing the bacteria in any suitable culture medium.
  • the growth conditions of Azospirillum brasilense bacteria known to those skilled in the art and especially described in (Nelson and Knowles, 1978, Can J. Microbiol24: 1395-1403) may be used. In particular, the growth will be carried out at a temperature of 26 to 32.degree.
  • Buffered aqueous medium containing salts, nutrients and a source of carbon for the growth of the bacteria.
  • salts include NaCl, 2 ⁇ O 4, H 2 PO 4, MgSO 4, NaCl, CaCl 2, NH 4 Cl.
  • nutrients mention may be made of Na 2 MoO 4 , MnSO 4 , H 3 BO 3 , CuSO 4 , ZnSO 4 , FeEDTA, yeast extract, and biotin.
  • carbon sources mention may be made of glucose, malate and fructose in particular. Examples of such media include Nfb and Nfb * media described in particular Nelson and Knowles, 1978, Can. J. Microbiol. 24: 1395-1403 and Vial et al., 2006, J. Bacteriol. 188: 5364-5373.
  • the Azospirillum brasilense strain deposited under the number I-4830, with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France) and used in the context of the invention to inhibit the growth of holo or hemiparasitic plants, the order of the Scrophulariales, and in particular Striga and / or Orobanche, presents another advantage for crop improvement, since it is also capable of stimulating plant growth, and is capable of producing a phytostimulatory agent for with respect to plants of agronomic interest (Bouillant et al., 1997, CR Acad Sci 320: 159-162).
  • the invention proposes to use bacteria of the strain Azospirillum brasilense L4, deposited under the number 1-4830, with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France) also to produce a phytostimulatory agent vis-à-vis -vis agricultural crops or plants of agronomic interest to protect against the growth of holo plants or hemiparasites.
  • phytostimulatory agent is meant a growth promoter of the plants of interest.
  • bacteria of the strain Azospirillum brasilense deposited under the number 1-4830, with the CNCM (National Collection of Cultures of Microorganisms, France) can be used to coat seeds of such agricultural crops or plants of interest agronomic.
  • the bacteria are incorporated in a matrix constituting a coating of the seeds of agricultural crops or plants of agronomic interest.
  • This coating may contain one or more constituents such as peat, periite, gum arabic, carboxymethyl cellulose, polyvinylpyrrolidone, chitosan or alginate.
  • the bacteria will be used in sufficient quantity to obtain the desired effect, and in particular to block the germination of seeds of holo plants or hemiparasites, of the order of Scrophulariales, and in particular of Striga and / or Orobanche, and / or to to inhibit the elongation of procaulomas or radicles from germinated seeds of holo or hemiparasite plants, of the order Scrophulariales, and in particular of Striga and / or Orobanche, and / or to stimulate the growth of agricultural crops or plant species; agronomic interest.
  • 3 ⁇ 10 7 bacterial cells per gram of seed of agricultural crops or plants of agronomic interest to be protected and / or phytostimulated will be used.
  • the dicarboxylic acids comprising from 2 to 5 carbon atoms proposed in the context of the invention for combating the growth of holo or hemiparasite plants, of the order of Scrophulariales, and in particular of Striga and / or Orobanche can therefore be used , by seed companies, to coat their seeds, but also by companies Phytopharmacy, both in the field of conventional agriculture (synthesis of dicarboxylic acids comprising from 2 to 5 carbon atoms by chemical processes) and in the field of organic farming (production of active agents by living organisms, in the case of malic acid in L form, in particular).
  • FIG. 1 presents representative photographs of the effect obtained on the growth of Striga hermontica, in a microtiter box, in the presence of the supernatant of A. brasilense strain L4 grown in Nfb * medium and L-malic acid at 2mg / mL in 50mM phosphate buffer.
  • Figure 2 shows the effect of the A. brasilense L4 supernatant on the seed germination percentage of Striga hermontica and Orobanche ramosa (A) and on the length of procauloma of the seeds of Striga hermontica and Orobanche ramosa (B).
  • the activity of diacids on Striga and Orobanche parasitic plants was tested by preparing solutions of the selected diacid in water or in 50 mM phosphate buffer pH 7 at concentrations of 1 to 20 mg / ml.
  • filter papers (Whatmann 3) are placed at the bottom of the wells and soaked with sterile water. Thirty sterilized seeds (rinsing with 70% ethanol, then Ca (CIO) 21 % (m / v) and Tween® 20, then with plenty of water) of the holo or hemipasite plants are arranged, in each well, on the surface of the filter papers. After 10 days of incubation at 30 ° C. and in the dark, increasing doses of a diacid or culture supernatant are added, in the presence of a germination inducer, GR24.
  • Figure 1 shows the representative photographs of the effects obtained on the growth of Striga hermontica in a microtiter box in the presence of the supernatant of the Nfb * cultured L4 brasilense strain L-malic acid at 2 mg / ml in phosphate buffer and highlights their inhibitory effect on the growth of procululi of holo or hemiparasitic plants.
  • Figure 2 shows the impact of the A. brasilense L4 supernatant on the seed germination percentage of Striga hermontica and Orobanche ramosa (A) and the length of the procauloma of the seeds of Striga hermontica and Orobanche ramosa (B ).
  • Striga and Orobanche in vitro (microtiter box bioassays, Figures 1 and 2) and to inhibit Striga growth in sorghum cultures in microcosms under controlled conditions ((Bouillant et al., 1997, CR Acad Sci 320
  • the molecules involved in this effect have been isolated by an appropriate chromatographic method and then identified by mass spectrometry compared to chemical standards.It has also been shown that different dicarboxylic acids are effective, to control the growth of holo or hemiparasite plants of the order Scrophulariales, and in particular Striga and / or Orobanche (T ableau 1).
  • Striga plants The emergence of Striga plants is visually estimated after 2 months of incubation. Phytotoxicity is estimated by comparison with a control without malic acid or culture supernatant. A 22% reduction in the number of Striga plants that emerged compared to the control condition, is observed in the presence of malic acid 2 g / L and 90% in the presence of malic acid 20 g / L In the presence of the supernatant bacterial, a 58% decrease in the number of Striga compared to the control condition was observed.

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Abstract

L'Invention concerne l'utilisation d'un acide dicarboxylique comportant de 2 à 5 atomes de carbone pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites, ainsi que la souche Azospirillum brasiliense L4, déposée, sous le numéro I-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de MicrOorganismes, France) capable de produire un acide dicarboxylique ayant une activité bioherbicide vis-à-vis du Striga et de l'orobanche.

Description

Utilisation d'un acide dicarboxylique pour lutter contre la croissance de plantes holoparasites ou hémiparasites
La présente invention concerne le domaine technique de la protection des cultures agricoles (poaceae, solanaceae, brassicaceae, asteraceae) vis-à- vis de plantes holoparasites et hémiparasites épirhizes (c'est-à-dire qui se développent sur les racines de leur plante hôte), de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et Orobanche. Plus précisément, l'invention concerne l'utilisation d'un acide dicarboxylique comportant de 2 à 5 atomes de carbone ou d'une souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites.
Les plantes holoparasites sont des plantes parasites non chlorophylliennes par nature et qui doivent donc prélever leur matière organique sur une plante hôte. Les plantes hémiparasites sont des plantes parasites chlorophylliennes qui assurent une partie seulement de la synthèse des substances carbonées nécessaires à leur développement Ces plantes parasites se développent aux dépens de leur hôte en s'at achant à leurs racines via la formation d'un haustorium (suçoir) qui aboutit à l'établissement d'une connexion entre les vaisseaux conducteurs du xylème de la plante hôte et de la plante parasite (Bouwmeester et al., 2003, Curr. Opin. Plant Bîol. 6:358-364). Une fois connectée, les plantes parasites vont pomper la sève de la plante hôte, ralentir le développement des parties aériennes, induire des chloroses et réduire la photosynthèse (Ejeta and Butler, 2000. Parasitic plants. Irr. R.A. Frederiksen and G.N. Odvody (eds). Compendium of Sorghum Diseases, 2nd édition. APS Press, The American Phytopathological Society, pp. 53-56). Pour survivre, ces plantes parasites doivent produire une grande quantité de graines. Ainsi, dès l'émergence des parties aériennes, la plante parasite fleurit et produit d'énormes quantités de graines qui pourront rester viables dans le sol pendant plusieurs années (Haussmann et al., 2000, Reld Crop Res. 66:195-211). Les plantes des genres Striga et Orobanche appartiennent au même ordre, celui des Scrophulariales, mais n'appartiennent pas à la même famille (les plantes du genre Striga appartiennent à la famille des Scrophulariaceae et sont des hémiparasites, alors que les plantes du genre Orobanche appartiennent à la famille des Orobanchaceae et sont des holoparasites). Ces plantes ont de nombreux points en commun : graines de petite taille facilitant leur dissémination, germination dépendante de la présence d'éliciteurs de type strigolactones, spoliation trophique de la plante hôte via le développement d'un haustorium. Par contre, leurs aires de répartition sont différentes : Striga dans toutes les régions tropicales et subtropicales du monde et notamment en Afrique subsaharienne et Orobanche principalement dans les pays tempérés d'Asie et d'Europe centrale et notamment du pourtour méditerranéen. Elles affectent la croissance d'une très large variété de plantes d'intérêt agronomique (maïs, riz, sorgho, millet, tournesol, colza, tabac, tomate, etc), que ce soit en zones tempérées (Orobanche), ou tropicales (Striga). Elles occasionnent d'importantes pertes de rendement sur un grand nombre de cultures. Sur le continent africain : environ 50 millions d'hectares sont infestés par Striga, résultant en la perte de plus de 10 millions de tonnes de céréales (Gressel et al., 2004, Crop Prot. 23:661-689). Les pertes de rendement en grains, du fait de l'infestation par Striga, peuvent varier de 5 à 100 %, en fonction des conditions agroclimatiques, du niveau dlnfestation de la parcelle et de la vulnérabilité de la céréale (Haussmann et al., 2000, Field Crop Res. 66:195- 211). En Europe, notamment dans le bassin méditerranéen, 16 millions d'hectares sont infestés par l'Orobanche, avec des pertes annuelles estimées à 50 millions d'euros pour le tournesol, 175 millions d'euros pour le tabac, et 200 millions d'euros pour la tomate (Bulbul et al., 2009, Helia 32:141-152).
Les graines de ces plantes parasites sont de très petite taille ce qui favorise leur propagation sur de longues distances par le vent, les animaux, ou par des machines agricoles contaminées. Le transport de semences de plantes hôtes contaminées est également une source de dissémination. La production de graines par une plante parasite étant énorme (jusqu'à 100 000 graines par plante), les terrains infestés doivent généralement être abandonnés. Jusqu'à présent, la protection des cultures contre les plantes Orobanche ou Striga implique l'utilisation d'herbicides non-sélectifs, couplée à l'utilisation de variétés de céréales résistantes à ces herbicides (De Groote et al., 2008, Agric. Syst. 97:83-94). Ces moyens de lutte chimique, outre leur toxicité pour l'environnement, présentent un coût élevé. De plus, dans le cadre du plan Ecophyto 2018, l'usage des produits phytopharmaceutïques dont des herbicides va être fortement réduit.
Il est également possible de stimuler la germination des graines de Striga en absence de la plante hôte. Comme S. her ontiiica est un hémiparasite, cette stimulation en absence de la plante hôte peut conduire à la mort du parasite en 2-3 jours et in fine à la diminution des réserves de graines du parasite epirhize dans les sols. Ceci peut être obtenu grâce à l'utilisation d'éthylène (Logan et Ste art, 1991, Plant Physiol. 97:1435-1438). L'éthylène est une phytohormone qui peut induire la germination des graines de Striga, mais l'application d'éthylène sur les sols présente un coût prohibitif, ne permettant pas l'utilisation de cette technologie en agriculture (Berner et al., 1999, Biological Control 15:274-282).
D'autres moyens de lutte existent tel l'arrachage manuel ou l'utilisation de rotations avec des plantes non-hôtes, mais leur efficacité est réduite. La sélection variétale de lignées de céréales résistantes aux plantes phyto- parasites est également une solution alternative, mais les coûts sont élevés.
Il n'y a, à l'heure actuelle, aucun produit de lutte alternative, comme l'utilisation de molécules d'origine naturelle, contre Striga ou Orobanche disponible sur le marché.
Dans la littérature, différents travaux ont révélé la capacité de différents agents biologiques à limiter la croissance des plantes parasites Striga ou Orobanche. Cela inclut des larves d'insectes herbivores monophages comme Phytomyza orobanchia, Eulocastra argentisparsa, des champignons comme Fusarium oxysporum f. sp. Ort oceras, F. oxysporum f. sp. Strigae, ou Fusarium art rosporioides qui produisent des mycotoxines (i.e. l'acide fusarique, les fumonisines, et le déoxynivalénol (DON)) (Amsellem et al., 2001, BioControl 46:211-228; Abuelgasim et roschel, 2003, FAO plant production and protection. Paper IMo.120. Addendum 1, 109-144; Lendzemo et al. 2004 Field Crop es. 91:51-61; Venne et al., 2009, PesL Manag. Sci. 65:572-580). Les mycotoxines (notamment le DON) sont capables d'inhiber la germination des graines de Striga et d'Orobanche, mais elles peuvent déclencher des problèmes de santé chez les mammifères. En particulier, elles représentent un risque pour l'alimentation du bétail et humaine et ne peuvent donc pas être considérées comme des substances totalement inoffensives.
On peut également citer les travaux de Dadon et al., 2004 (Isr. J. Plant Sci. 52:83-86) intitulés « A factor from Azospirillum brasilense inhibits germination and radide growth of Ombanche aegyptiaca Tïkva », décrivant l'activité antagoniste d'un rnétabolite produit par une souche Azospirillum brasilense sur l'Orobanche. Dans cette publication, la molécule active produite par cette souche (dont le nom n'est pas cité) a été identifiée comme étant un oligopeptide présent dans une fraction éthanolique du surnageant De plus, seule une activité inhibitrice de la germination des graines d'Orobanche a été mise en évidence pour cette souche. Par ailleurs, il a été rapporté par Bouillant et al., 1997 (C. R. Acad. ΠΙ Sci. Vie 320:159-162) que toutes les souches (X Azospirillum brasilense ne présentent pas une telle activité inhibitrice de la germination et de la croissance des plantes parasites. Dans cette dernière publication, il est également rapporté que sur les deux souches Azospirillum brasilense qui présentent une telle activité inhibitrice de la germination et la croissance de Striga en microcosmes, seule une de ces souches, Azospirillum brasilense L4, présente un effet phytostimulateur sur le sorgho.
Il est donc urgent, étant donné la multiplication rapide de ces plantes parasites dans le monde, de développer de nouvelles solutions durables, respectueuses de l'environnement, pour lutter contre les plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, qui engendrent des ravages importants sur les cultures agricoles et des plantes d'intérêt agronomique.
Dans ce contexte, la présente invention propose d'utiliser un acide dicarboxylique, comportant de 2 à 5 atomes de carbone, pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites, et en particulier pour lutter contre la croissance de plantes du genre Striga et/ou de plantes du genre Orobanche. Il est également possible d'utiliser des combinaisons de plusieurs acides dicarboxyliques, comportant de 2 à 5 atomes de carbone, pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites, pour obtenir l'effet souhaité.
Dans le cadre de l'invention, les agents actifs proposés pour inhiber le développement de plantes holo ou hémiparasites, telles que des plantes Striga ou Orobanche, sont choisis parmi les acides dicarboxyliques (nommés dans la suite aussi diacides) comprenant de 2 à 5 atomes de carbone. De tels diacides comprennent deux fonctions acide car oxylique soit directement liées entre elles, dans le cas de l'acide oxalique, soit liées par une chaîne carbonée saturée ou insaturée comprenant 1, 2 ou 3 atomes de carbone. Cette chaîne carbonée est, de préférence, linéaire et pourra être non substituée ou substituée par un ou plusieurs substituants, notamment de type OH, OCH3 et CH2OCH3. A titre d'exemple de tels diacides, on peut citer, l'acide oxalique, l'acide malonique, l'acide maléique, l'acide malique, l'acide glutarique, et l'acide acétylène dicarboxylique. L'utilisation de l'acide malique sous forme L, qui s'est montré particulièrement actif sur l'inhibition de la croissance de plantes Striga ou Orobanche, est préférée.
L'acide malique sous forme L a pu être isolé, par les inventeurs, à partir de surnageant de culture d'une souche bactérienne, Azospirillum brasilense L4, déposée, conformément au Traité de Budapest de 1977, sous le numéro 1-4830, le 18 décembre 2013, auprès de la CNCM, Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15, FRANCE. Cette souche a été isolée, en 1995 à partir d'un champ de sorgho infesté par une plante parasite Striga au Mali. La souche Azospirillum brasilense L4 qui a été rapportée comme ayant la capacité d'inhiber, in vitro, la croissance de Striga hermonù'ca et de Orobanche ramosa et, en microcosmes de sol, de protéger le sorgho vis-a-vis du Striga et de stimuler la croissance de la céréale (Bouillant et al., 1997, C. R. Acad. III Sci. Vie 320:159-162; Miche et al., 2000, Eur. J. Plant Pathol. 106:347-351) a maintenant fait l'objet d'un dépôt, sous le numéro 1-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France). Cette souche produit en culture des métabolites bien spécifiques, par rapport à d'autres souches d'Azospirillum brasilense (et notamment par rapport à celui rapporté par Dadon et al., 2004: Isr. J. Plant Sci. 52:83-86). En effet, au vu de l'activité constatée, les inventeurs ont analysé le surnageant de culture de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée sous le numéro 1-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) et ont pu mettre en évidence que l'acide malique sous forme L est responsable de l'activité herbicide constatée vis-à-vis des plantes holo ou hémiparasites. Il s'avère cependant que l'acide malique sous forme L n'est pas le composant majoritaire présent dans le surnageant de culture de la souche bactérienne, Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France). Les inventeurs ont également mis en évidence que cette activité herbicide constatée vis-à-vis des plantes holo ou hémiparasites était généralisable à la classe chimique des acides dicarboxyliques comprenant de 2 à 5 atomes de carbone.
L'invention propose donc d'utiliser des agents actifs d'origine naturelle, à faible impact environnemental, pour limiter, inhiber la croissance des plantes parasites. Contrairement à d'autres agents biologiques qui agissent principalement en inhibant la germination des graines d'Orobanche et de Striga, les acides dicarboxyliques comprenant de 2 à 5 atomes de carbone sont, de plus, capables d'inhiber l'allongement des procaulômes ou radicules à partir de graines germées de la plante parasite, et, par conséquent, de bloquer la croissance de la plante parasite, comme cela ressort notamment des données présentées dans le Tableau 1 ci-après. Ceci devrait permettre de diminuer de façon significative les stocks de graines viables des holo ou hémiparasites dans les sols infestés, effet qui ne peut être complètement obtenu par la seule inhibition de l'étape de germination. En effet, en absence de conditions favorables à la germination des plantes parasites (notamment, en l'absence de strigolactones), les graines peuvent rester viables dans le sol pendant plusieurs années.
Dans le cadre de l'invention, l'acide dicarboxylique pourra être mis en contact avec au moins une graine de plante holo ou hémiparasite à éradiquer. L'acide dicarboxylique sera utilisé en quantité suffisante pour obtenir l'effet souhaité, et en particulier pour bloquer la germination de graines et/ou pour inhiber l'allongement des procaulômes ou radicules à partir de graines germées de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche. De préférence, on pourra utiliser de 30 à 300 kg d'acide dicarboxylique par hectare de sol traité. Dans le cas, où l'acide dicarboxylique est appliqué sous la forme d'une solution aqueuse, on pourra utiliser une solution comprenant de 1 à 20 g d'acide dicarboxylique par litre de solution.
L'acide dicarboxylique peut être appliqué sur des graines et/ou plant des plantes ou cultures à protéger. Les compositions herbicides contenant un acide dicarboxylique conforme à l'invention pourront notamment se présenter sous la forme de solutions aqueuses ou de granulés. Ces compositions pourront contenir, outre l'acide dicarboxylique actif, des ions issus de K2HPO4 ou KH2PO4, une ou plusieurs charges telles que la silice, l'argile, le kaolin ou le talc et un ou plusieurs agents tensioactifs comme le dodécylbenzène ou le lignosulfonate de calcium. Dans le cas de l'acide malique sous forme L, ce dernier pourra être produit par synthèse chimique ou directement par la souche bactérienne, Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la C CM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France). Dans ce cas, l'acide pourra être isolé ou la composition herbicide pourra directement contenir le surnageant de culture des bactéries. Le surnageant de culture peut être obtenu en plaçant les bactéries dans tout milieu de culture approprié. Les conditions de croissance de bactéries Azospirillum brasilense connues de l'homme du métier et notamment décrites dans (Nelson et Knowles, 1978, Can J. Microbiol24: 1395-1403) pourront être utilisées. En particulier, la croissance sera réalisée à une température de 26 à 32°C, typiquement à 28°C, dans un milieu aqueux tamponné, contenant des sels, des nutriments et une source de carbone pour la croissance de la bactérie. A titre d'exemples de sels, on peut citer NaCI, 2ΗΡO4, H2PO4, MgSO4, NaCl, CaCI2, NH4CI. A titre d'exemples de nutriments, on peut citer Na2MoO4, MnSO4, H3BO3, CuSO4, ZnSO4, FeEDTA, de l'extrait de levure, de la biotine. A titre d'exemples de sources de carbone, on peut citer le glucose, le malate et le fructose notamment. A titre d'exemples de tels milieux, on peut citer les milieux Nfb et Nfb* notamment décrits dans Nelson et Knowles, 1978, Can. J. Microbiol. 24:1395-1403 et Vial et al., 2006, J. Bacteriol. 188:5364-5373.
Il est également possible d'appliquer des bactéries de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) et produisant un des acides dicarboxyliques actifs, directement sur les graines ou cultures de la plante à protéger ou sur les sols à protéger contre la croissance de plantes holo et hémiparasites, et ainsi produire directement in situ l'acide dicarboxylique. De plus, la souche Azospirillum brasilense, déposée sous le numéro I-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) et utilisée dans le cadre de l'invention pour inhiber la croissance de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche, présente un autre avantage pour l'amélioration des cultures, puisqu'elle est également capable de stimuler la croissance des plantes, et est capable de produire un agent phytostimulateur vis-à-vis des plantes d'intérêt agronomique (Bouillant et al., 1997, C. R. Acad. Sci. 320: 159-162). Par conséquent, l'invention propose d'utiliser des bactéries de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée sous le numéro 1-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) également pour produire un agent phytostimulateur vis-à-vis de cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique à protéger contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites. Par « agent phytostimulateur », on entend un agent favorisant la croissance des plantes d'intérêt. Un tel effet de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée sous le numéro I-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) a été mis en évidence par la modification de l'architecture du système racinaire de la plante d'intérêt, et est décrit dans la publication (Souillant et al., 1997, C. R. Acad. Sci. 320: 159-162. En particulier, l'effet phytostimulateur pourra être obtenu vis-à-vis de cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique choisies notamment parmi le maïs, le riz, le blé, le sorgho, le niébé, le tabac, le tournesol, le colza, le choux, la tomate, l'aubergine, la pomme de terre, le piment, le céleri, le haricot ...
En particulier, des bactéries de la souche Azospirillum brasilense, déposée sous le numéro 1-4830, auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) pourront être utilisées pour enrober des graines de telles cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique. Dans un tel cas, les bactéries sont incorporées dans une matrice constituant un enrobage des graines des cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique. Cet enrobage pourra contenir un ou plusieurs constituants tels que la tourbe, la periite, la gomme arabique, le carboxyméthyl cellulose, la polyvinylpyrrolidone, le chitosan ou l'alginate. Les bactéries seront utilisées en quantité suffisante pour obtenir l'effet souhaité, et en particulier pour bloquer la germination de graines de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche, et/ou pour inhiber l'allongement des procaulômes ou radicules à partir de graines germées de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche, et/ou pour stimuler la croissance des cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique. On utilisera, de préférence 3.107 cellules bactériennes par gramme de graines des cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique à protéger et/ou phytostimuler.
Les acides dicarboxyliques comprenant de 2 à 5 atomes de carbone proposés dans le cadre de l'invention pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche peuvent donc être utilisés, par les semenciers, pour enrober leurs graines, mais également par les entreprises de phytopharmacie, aussi bien dans le domaine de l'agriculture conventionnelle (synthèse des acides dicar oxyliques comprenant de 2 à 5 atomes de carbone par procédés chimiques) que dans le domaine de l'agriculture biologique (production des agents actifs par des organismes vivants, dans le cas de l'acide malique sous forme L, notamment).
Les exemples de préparation et d'application ci-après mentionnés, en référence aux Figures annexées, permettent d'illustrer l'invention, mais n'ont aucun caractère limitatif.
La Figure 1 présente des photographies représentatives de l'effet obtenu sur la croissance de Striga hermontica, en boîte de microtitration, en présence du surnageant de la souche A. brasilense L4 cultivé dans du milieu Nfb* et de l'acide L-malique à 2mg/mL dans du tampon phosphate 50mM.
La Figure 2 présente l'effet du surnageant de la souche A. brasilense L4 sur le pourcentage de germination des graines de Striga hermontica et Orobanche ramosa (A) et sur la longueur du procaulôme des graines de Striga hermontica et Orobanche ramosa (B).
L'activité des diacides et du surnageant de culture de la souche bactérienne, Azospirillum brasilense, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la C CM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France), nommée L4 sur les Figures, a été démontrée in vitro et/ou en microcosmes de sol sur les plantes parasites Striga et Orobanche.
• Préparation des produits:
Pour le surnageant de culture : culture de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro I-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) dans le milieu de culture Nfb* (MgSO4, 7H2O 100 mg/L, CaCl2, 2HzO 13 mg/L, NaCI 175 mg/L, Na2MoO4, 2H2O 1 mg/L, MnCl2, 4H2O 3,5 mg/L, H2PO4 600 mg/L, K2HPO4 900 mg/L, biotine 1 mg/L, Fe-EDTA 65,6 mg/L, tryptone 250 mg/L, extrait de levure 125 mg/L) (Nelson et Knowles, 1978, Can J. Microbiol24: 1395-1403, Vial et al., 2006, 1 Bacteriol. 188:5364-5373) pendant 16 heures à 28°C; centrifugation de la culture, récupération du surnageant et stérilisation par filtration sur filtre à 0,2μm. Une purification bioguidée (fractionnement par chromatographie couplé à un test biologique de l'activité herbicide des fractions vis-à-vis de Striga) du surnageant de la souche A. brasilense L4 a été réalisée. Au sein de la fraction présentant une activité herbicide, un acide dicarboxylique en C4 a été identifié par spectrométrie de masse en comparaison à un standard chimique. L'identité des spectres de masse du composé purifié et de l'acide malique (standard chimique) a permis d'identifier que la molécule active est de l'acide malique. Un détecteur à dichroïsme circulaire a révélé la présence d'acide L-malique.
L'activité des diacides sur les plantes parasites Striga et Orobanche a été testée en préparant des solutions du diacide sélectionné dans de l'eau ou dans un tampon phosphate 50 mM pH 7 à des concentrations de 1 à 20 mg/ml.
• Effet herbicide testé sur les plantes holo ou hémipasitaires Striga heimontica et Orobanche ramosa:
1. Dans une boîte de microtitration 12 puits, des papiers filtres (Whatmann 3) sont déposés au fond des puits et sont imbibés avec de l'eau stérile. Une trentaine de graines stérilisées (rinçage avec de l'éthanol 70%, puis du Ca(CIO)2 1% (m/v) et du tween® 20, puis abondamment à l'eau) des plantes holo ou hémipasites est disposée, dans chaque puits, à la surface des papiers filtres. Après 10 jours d'incubation à 30°C et dans l'obscurité, des doses croissantes d'un diacide ou de surnageant de culture sont ajoutées, en présence d'un inducteur de germination, le GR24. Après 3 jours d'incubation à 30°C, le développement des plantes parasites en présence d'un diacide ou du surnageant de culture est comparé au témoin négatif (eau, tampon phosphate ou milieu de culture stérile), avec un macroscope couplé à une caméra. La longueur des procaulômes (radicules) des plantes holo ou hémipasites est mesurée afin d'exprimer le pouvoir phytotoxique des produits testés. L'ensemble des résultats sont présentés dans le Tableau 1 ci-après.
Tableau 1 : Impact de différents acides dicarboxyliques sur la croissance de Striga hermontica en boite de micratitration
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La Figure 1 présente les photographies représentatives des effets obtenus sur la croissance de Striga hermontica en boîte de microtitration en présence du surnageant de la souche A brasilense L4 cultivée en Nfb* et d'acide L-malique à 2mg/mL dans du tampon phosphate et met en évidence leur effet inhibiteur sur la croissance des procaulômes des plantes holo ou hémiparasites. La Figure 2 met en évidence l'impact du surnageant de la souche A. brasilense L4 sur le pourcentage de germination des graines de Striga hermontica et Orobanche ramosa (A) et sur la longueur du procaulôme des graines de Striga hermontica et Orobanche ramosa (B).
Conclusion : La capacité du surnageant de culture de la souche bactérienne, Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France), à stopper l'élongation des procaulômes des plantes holoparasites Striga et Orobanche in vitro (bioessais en boîtes de microtitration, Figures 1 et 2) et à inhiber la croissance de Striga dans des cultures de sorgho dans des microcosmes en conditions contrôlées ((Bouillant et al., 1997, C. R. Acad. Sci. 320: 159-162) a été observée. Les molécules impliquées dans cet effet ont été isolées, par une méthode chromatographique appropriée, puis identifiées par spectrométrie de masse par comparaison à des standards chimiques. Il a également été démontré que différents acides dicarboxyliques sont efficaces, pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites, de l'ordre des Scrophulariales, et en particulier de Striga et/ou Orobanche (Tableau 1).
2. Des graines de Striga hermontica (environ 100 graines/pot) et de sorgho (1 graine/pot) ont été introduites simultanément dans des mésocosmes de sol, en présence de doses croissantes d'acide malique (2 et 20 g/L) ou du surnageant de culture, puis mises en culture en serre ou sur parcelle.
L'émergence des plants de Striga est estimée visuellement, après 2 mois d'incubation. Le pouvoir phytotoxique est estimé par comparaison avec un témoin sans apport d'acide malique ou de surnageant de culture. Une réduction de 22% du nombre de plants de Striga ayant émergé par rapport à la condition témoin, est observée en présence d'acide malique 2 g/L et de 90% en présence d'acide malique 20 g/L En présence du surnageant bactérien, une diminution de 58% du nombre de Striga par rapport à la condition témoin a été observée.
3. RESULTATS SUR L'EFFET PHYTOSTIMULANT
L'effet phytostimulateur de la souche bactérienne, Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) est présenté dans Bouillant et al., 1997 C. R. Acad. III Sri. Vie 320:159-162.

Claims

REVENDICATIONS
1 - Utilisation d'un ou plusieurs acide dicarboxylique comportent de 2 à 5 atomes de carbone pour lutter contre la croissance de plantes hoio ou hémiparasites.
2 - Utilisation selon la revendication 1 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique est choisi parmi l'acide oxalique, l'acide malonique, l'acide malique, l'acide glutarique, l'acide maléique et l'acide acétylène dicarboxilique.
3 - Utilisation selon la revendication 1 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique est l'acide malique sous forme L
4 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 3 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique est mis en contact avec au moins une graine de plante holo ou hémiparasite.
5 - Utilisation selon la revendication 4 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique est utilisé en quantité suffisante pour bloquer la germination de la graine et/ou pour inhiber l'allongement des procaulômes ou radicules à partir de la graine germée.
6 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 pour lutter contre la croissance de plantes du genre Striga.
7 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 pour lutter contre la croissance de plantes du genre Orobanche.
8 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 7 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique est appliqué sur des graines et/ou plant de plantes agronomiques à protéger, notamment choisies parmi le maïs, le riz, le blé, le sorgho, le niébé, le tabac, le tournesol, le colza, le choux, la tomate, l'aubergine, la pomme de terre, le piment, le céleri et le haricot.
9 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 8 caractérisée en ce que l'acide dicarboxylique utilisé est produit par la souche Azospiri!lum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France). 10 - Utilisation selon l'une quelconque des revendications 1 à 9 caractérisée en ce qu'une souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la C C (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France), est appliquée directement sur les cultures ou sols à protéger contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites et produit directement in situ l'acide dicarboxylique.
11 - Utilisation de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France) pour produire un agent phytostimulateur vis-à-vis de cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique à protéger contre la croissance de plantes holoparasites, notamment choisies parmi le maïs, le riz, le blé, le sorgho, le niébé, le tabac, le tournesol, le colza, le choux, la tomate, l'aubergine, la pomme de terre, le piment, le céleri et le haricot.
12 - Souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes,
France).
13 - Compositions herbicides pour lutter contre la croissance de plantes holo ou hémiparasites contenant un acide dicarboxylique comportant de 2 à 5 atomes de carbone, et des ions issus de K2HPO4 ou KH2PO4, une ou plusieurs charges telles que la silice, l'argile, le kaolin ou talc et un ou plusieurs agents tensioactifs comme le dodécylbenzène ou le lignosulfonate de calcium.
14 - Compositions selon la revendication 13 caractérisées en ce que l'acide dicarboxylique est choisi parmi l'acide oxalique, l'acide malonique, l'acide malique, l'acide glutarique, l'acide maléique et l'acide acétylène dicarboxilique.
15 - Compositions selon la revendication 13 caractérisées en ce que l'acide dicarboxylique est l'acide malique sous forme L.
16 - Compositions selon l'une des revendications 13 à 15 caractérisées en ce qu'elles se présentent sous la forme d'une solution comprenant de 1 à
20 g d'acide dicarboxylique par litre de solution. 17 - Enrobage pour graines de cultures agricoles ou de plantes d'intérêt agronomique comprenant des bactéries de la souche Azospirillum brasilense L4, déposée, sous le numéro 1-4830 auprès de la CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes, France).
18 - Enrobage selon la revendication 17 caractérisé en ce qull comprend, en outre, un ou plusieurs constituants choisis parmi la tourbe, la perlite, la gomme arabique, la carboxymét yl cellulose, la polyvinylpyrrolidone, le chitosane et l'alginate.
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