WO2011019533A3 - Mesure de capacitance des nucléotides pour un séquençage d'adn à faible coût - Google Patents

Mesure de capacitance des nucléotides pour un séquençage d'adn à faible coût Download PDF

Info

Publication number
WO2011019533A3
WO2011019533A3 PCT/US2010/044091 US2010044091W WO2011019533A3 WO 2011019533 A3 WO2011019533 A3 WO 2011019533A3 US 2010044091 W US2010044091 W US 2010044091W WO 2011019533 A3 WO2011019533 A3 WO 2011019533A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
capacitance
nucleotide
dna
strand
low cost
Prior art date
Application number
PCT/US2010/044091
Other languages
English (en)
Other versions
WO2011019533A2 (fr
Inventor
Xiaoguang Zhang
Jun-qiang LU
Original Assignee
Ut-Battelle, Llc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ut-Battelle, Llc filed Critical Ut-Battelle, Llc
Publication of WO2011019533A2 publication Critical patent/WO2011019533A2/fr
Publication of WO2011019533A3 publication Critical patent/WO2011019533A3/fr

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/483—Physical analysis of biological material
    • G01N33/487—Physical analysis of biological material of liquid biological material
    • G01N33/48707—Physical analysis of biological material of liquid biological material by electrical means
    • G01N33/48721—Investigating individual macromolecules, e.g. by translocation through nanopores

Abstract

La mesure de capacitance à haute fréquence sur un acide désoxyribonucléique (ADN) simple brin ou un acide ribonucléique (ARN) est utilisée pour procurer l'identification des nucléotides dans le brin. L'effet des variations de la capacitance des nucléotides peut être minimisé en utilisant des quantités statistiques générées à partir de plusieurs valeurs de mesure sur un brin d'ADN ou d'ARN, ou en utilisant un programme qui identifie positivement un nucléotide de grande capacitance par détection d'une grande capacitance. Les données de capacitance sur un brin d'ADN peuvent être utilisées comme critère pour identifier la séquence d'ADN en association avec d'autres procédés d'identification de la séquence d'ADN.
PCT/US2010/044091 2009-08-13 2010-08-02 Mesure de capacitance des nucléotides pour un séquençage d’adn à faible coût WO2011019533A2 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US23366209P 2009-08-13 2009-08-13
US61/233,662 2009-08-13

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2011019533A2 WO2011019533A2 (fr) 2011-02-17
WO2011019533A3 true WO2011019533A3 (fr) 2011-06-16

Family

ID=43586744

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/US2010/044091 WO2011019533A2 (fr) 2009-08-13 2010-08-02 Mesure de capacitance des nucléotides pour un séquençage d’adn à faible coût

Country Status (2)

Country Link
US (1) US20110037486A1 (fr)
WO (1) WO2011019533A2 (fr)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107828877A (zh) * 2012-01-20 2018-03-23 吉尼亚科技公司 基于纳米孔的分子检测与测序
US9551682B2 (en) 2012-06-29 2017-01-24 Intel Corporation High throughput biochemical detection using single molecule fingerprinting arrays
CN104713932B (zh) * 2015-03-24 2017-03-29 清华大学 一种交流模式的多参数纳米孔单分子分析仪
US20180074006A1 (en) * 2015-05-11 2018-03-15 Hitachi, Ltd. Analysis device and analysis method
US10859562B2 (en) 2016-02-29 2020-12-08 Iridia, Inc. Methods, compositions, and devices for information storage
US10640822B2 (en) 2016-02-29 2020-05-05 Iridia, Inc. Systems and methods for writing, reading, and controlling data stored in a polymer
US10438662B2 (en) 2016-02-29 2019-10-08 Iridia, Inc. Methods, compositions, and devices for information storage
US11837302B1 (en) 2020-08-07 2023-12-05 Iridia, Inc. Systems and methods for writing and reading data stored in a polymer using nano-channels

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6905586B2 (en) * 2002-01-28 2005-06-14 Ut-Battelle, Llc DNA and RNA sequencing by nanoscale reading through programmable electrophoresis and nanoelectrode-gated tunneling and dielectric detection
US7279337B2 (en) * 2004-03-10 2007-10-09 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for sequencing polymers through tunneling conductance variation detection

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2003510034A (ja) * 1999-08-26 2003-03-18 ザ トラスティーズ オブ プリンストン ユニバーシティ 流体の静電容量の変化を検出するためのマイクロ流体およびナノ流体電子素子並びに使用方法
CA2941139C (fr) * 2002-12-26 2021-07-20 Meso Scale Technologies, Llc. Cartouches d'essai et procedes d'utilisation

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6905586B2 (en) * 2002-01-28 2005-06-14 Ut-Battelle, Llc DNA and RNA sequencing by nanoscale reading through programmable electrophoresis and nanoelectrode-gated tunneling and dielectric detection
US7279337B2 (en) * 2004-03-10 2007-10-09 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for sequencing polymers through tunneling conductance variation detection

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
LU, J.-Q. ET AL.: "Nucleotide capacitance calculation for DNA sequencing", BIOPHYSICAL J., vol. 95, no. 9, 1 November 2008 (2008-11-01), pages L60 - L62 *
SIGALOV, G. ET AL.: "Detection of DNA sequences using an alternating electric field in a nanopore capacitor", NANO LETT., vol. 8, no. 1, January 2008 (2008-01-01), pages 5 6 - 63 *

Also Published As

Publication number Publication date
US20110037486A1 (en) 2011-02-17
WO2011019533A2 (fr) 2011-02-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2011019533A3 (fr) Mesure de capacitance des nucléotides pour un séquençage d'adn à faible coût
MX342195B (es) Nucleótidos de terminación de rápida fotodescomposición 5-metoxi, 3' -oh no bloqueados y métodos para secuenciación de ácido nucleico.
WO2010026488A3 (fr) Procédés et kits de séquençage d'acides nucléiques
WO2015095226A3 (fr) Conservation des informations de connectivité génomique dans des échantillons d'adn génomiques fragmentés
GB201319347D0 (en) Compositions and kits for molecular counting
WO2012110899A3 (fr) Procédé de détection d'arnm in situ
WO2010048337A3 (fr) Préservation d'informations liées à une méthylation d'adn génomique
WO2010086622A8 (fr) Adaptateurs pour des constructions d'acide nucléique dans le séquençage de séquences transmembranaires
WO2007087310A3 (fr) Analyses d'acides nucléiques au moyen de marques de séquences
SG194722A1 (en) Probe based nucleic acid detection
WO2012162267A3 (fr) Réactions d'encodage d'acide nucléique
WO2010059731A3 (fr) Cartographie et séquences de polynucléotide
WO2007130519A3 (fr) Microréseau d'acide nucléique viral et procédé d'utilisation
MX2020003113A (es) Sistemas y metodos para secuenciar acido nucleico.
WO2009151691A3 (fr) Polymorphismes génétiques associés à une thrombose veineuse, leurs procédés de détection et leurs utilisations
WO2015083001A3 (fr) Sonde d'acides nucléiques et procédé de détection de fragments génomiques
WO2015073978A3 (fr) Procédés de détection multiplex d'allèles associés à des affections ophtalmiques
WO2014030066A3 (fr) Procédés pour identifier des séquences d'acide nucléique
WO2012135658A3 (fr) Conversion d'adn à séquence préservée pour séquençage optique par nanopore
WO2014152281A3 (fr) Hybridation d'acide ribonucléique ribosomal pour l'identification d'un organisme
WO2010109463A3 (fr) Procédés de prévision de capacité d'appariement et structures secondaires de molécules d'arn
WO2011153354A8 (fr) Procédés et kits de détection in situ de séquences de nucléotides
WO2009132126A4 (fr) Procédé de prédiction du risque de métastase
WO2012174119A3 (fr) Compositions et procédés de détection d'espèces et souches de cronobacter spp. et de cronobacter
WO2009086428A3 (fr) Procédés et compositions destinés à augmenter l'expression génique

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 10808527

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 10808527

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2