WO2009127394A2 - Automatische vorrichtung zur durchführung von nachweisreaktionen und verfahren zur dosierung von reagenzien auf objektträgern - Google Patents

Automatische vorrichtung zur durchführung von nachweisreaktionen und verfahren zur dosierung von reagenzien auf objektträgern Download PDF

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WO2009127394A2
WO2009127394A2 PCT/EP2009/002729 EP2009002729W WO2009127394A2 WO 2009127394 A2 WO2009127394 A2 WO 2009127394A2 EP 2009002729 W EP2009002729 W EP 2009002729W WO 2009127394 A2 WO2009127394 A2 WO 2009127394A2
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Kay Van Der Wolk
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    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/28Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
    • G01N1/30Staining; Impregnating ; Fixation; Dehydration; Multistep processes for preparing samples of tissue, cell or nucleic acid material and the like for analysis
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    • G01N35/1081Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices characterised by the means for relatively moving the transfer device and the containers in an horizontal plane
    • G01N35/109Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices characterised by the means for relatively moving the transfer device and the containers in an horizontal plane with two horizontal degrees of freedom

Definitions

  • the present invention relates to an automated apparatus for dispensing reagents on slides, the slides each containing a plurality of distinct wells suitable for receiving cell or tissue specimens.
  • the apparatus includes a positionable dosing head for applying suitable liquid reagents to the wells of the slides.
  • the invention further relates to a detachable dosing head which can be inserted into the device and to a method for the automatic dosing of reagents into the distinct wells of slides.
  • tissue samples are examined directly or indirectly or by means of tumor-specific chips to determine whether certain genes are switched on or off or whether gene modifications (eg mutations) are present.
  • This tissue or cell samples can be treated with antibodies or DNA or RNA probes, which then lead to a specific detection of genes, gene products (mRNA or antigens) via staining.
  • a standard immunohistochemical staining method is, for example, the so-called avidin-biotin complex (ABC) method described in Hsu, SM et al., J. Histochem. Cytochem, 29, 577-580.
  • the primary antibody binds to the corresponding tissue antigen.
  • a biotinylated secondary antibody After one or more washing steps, the binding of a biotinylated secondary antibody to the primary antibody takes place. Subsequent to one or more further washing steps, a preformed avidin-biotin-enzyme complex is applied which is highly affine to the biotin molecule of the secondary Antibody attaches. Again, one or more washes are followed, and then a chromogen is applied which reacts in a staining reaction with the avidin-biotin-enzyme complex to form a visible, colored reaction product.
  • Molecular biological methods include in situ hybridization (ISH) and fluorescence in situ hybridization (FISH), in which nucleic acids, ie RNA or DNA, eg in tissues or individual cells are detected. For this purpose, artificially prepared probes are used from a nucleic acid, which hybridize via base pairs and the nucleic acid to be detected. In the FISH method, the probe is detected by means of a fluorescent dye.
  • Gene expression analysis exploits the fact that thousands or even all of the approximately 25,000 to 30,000 genes in a cell are analyzed simultaneously. It is assumed that only about half of the approximately 25,000 genes are active simultaneously in one cell and that only a few hundred genes of a cell are tumor- or disease-specific or relevant. For example, with about 200 genes, mantle cell lymphomas can be specifically differentiated from all other lymphomas (about 40 different entities are known, which in turn can be grouped into numerous subgroups). For example, mantle cell lymphomas can be separated from all other tumors with a comparable number of quite different genes. And likewise, with a number of a few hundred genes, it is possible to distinguish between reactive lymphocytes and neoplastic lymphocytes of a mantle cell lymphoma.
  • tissue analyzes are mainly carried out on so-called FFPE tissue (formalin fixed and paraffin embedded).
  • FFPE tissue formalin fixed and paraffin embedded
  • Tumors are first examined conventionally morphologically with standard stains. The pathologist then comes to a suspected diagnosis or to various differential diagnostic considerations, in which, for example, 3 or 4 different diagnoses are taken into account. In order to arrive at a final diagnosis, a variable number of immunohistochemical or molecular biological staining reactions is then performed.
  • an algorithmic antibody panel may contain four to six antibodies.
  • Different antibody panels can be in a logical (eg hierarchical) relationship to each other or even for certain diseases in groups.
  • the pathologist or the pathologist processes the diagnostic problem more and more differentiated from panel to panel until finally the diagnosis is established.
  • tissue material of a patient e.g. between 10 and 50 examinations (for example in the context of so-called tumor-specific diagnosis or prognosis panels) and must be evaluated.
  • these examinations need to be conducted in a timely and cost-effective manner.
  • stainer devices For performing such tissue analyzes, automatic staining devices (also referred to as stainer devices) have been proposed.
  • US Pat. No. 6,495,106 describes an automatic dyeing device which has a three-dimensionally movable arm which carries a head provided with a recess.
  • This head comprises a reagent head with a tip which serves to apply the reagents.
  • the head further includes a wash tip and a blow tip to perform the various steps of a typical detection reaction.
  • a similar device is also described in US 5,948,359, wherein the reagent head for applying the reagents can be provided with disposable pipette tips, which are held in a corresponding holding device.
  • US 2008 / 0,038,836 A discloses a staining apparatus suitable for a large number of slides which has a plurality of work stations arranged vertically in a magazine.
  • the apparatus further includes a tray having a plurality of slides disposed horizontally in a plane and spaced from one another.
  • the tray with slides can be moved by a transport system between the individual workstations and moved in and out of the workstations.
  • the apparatus includes, for example, one or more work stations for drying or heating, a work station for dewaxing and de-waxing FFPE tissue samples, and one or more staining workstations.
  • the staining workstation has a series of nozzles connected to staining reagents for rinse reagents and for applying these reagents to the slides.
  • the device described in US 2008 / 0,038,836 A is very complex, and the transport of the tray with slides between the individual workstations is time consuming. Furthermore, a limited number of eg there are two nozzles that must be changed when using other reagents.
  • the reagents are pumped from storage tanks via tubing into the nozzles, which makes handling the XYZ positioning system difficult.
  • US 2006 / 0,269,447 discloses a robot for applying liquids to microtiter plates, e.g. be used as ELISA plates (enzyme-linked immunosorbent assay).
  • the plates have e.g. 96 or 384 microwells on.
  • the robot includes a pipetting head attached to a positioning system.
  • the pipetting head picks up a tray with pipette tips at a parking station and then drives it, with the aid of the positioning device, to the microtiter plate, where the reagents are metered into the microwells of the plate.
  • the pipette tips which have a volume of 50 to 250 ⁇ l, can be discarded after the liquid dosage.
  • the pipetting head then moves to the parking station and takes over a new tray with pipette tips. Similar devices are disclosed in DE 100 40 849 and in US 2004 / 0,097,010.
  • the present invention is further based on the object to provide a device for dispensing reagents on slides, with the detection reactions on a variety of tissue samples that are located on a variety of slides, can be carried out effectively and time-saving, to meet the increased demand to be able to handle immunohistochemical and molecular biological examinations of cells and tissues in the health care system in a resource-conserving manner. Further objects of the present invention will become apparent to the person skilled in the art directly from the following description of the invention. making.
  • the present invention relates to an automatic apparatus for dispensing reagents to a plurality of slides, comprising
  • Holding devices for a plurality of slides each having a plurality of distinct recesses suitable for receiving cells of the tissue samples
  • a dosing head having a plurality of reservoirs adapted to receive liquid reagents and at the end facing the reaction zones.
  • Side have a metering valve for metering and application of the reagents in the wells, and a positioning device for positioning the reservoir of the dosing over the respective reaction zones of the slides.
  • the present invention further relates to a dosing head for use in an automatic apparatus for dispensing reagents to a plurality of slides, comprising a plurality of reservoirs adapted for receiving liquid reagents and having at one end / side a metering valve for metering and applying the Have reagents on the slides, and which have at the opposite end of the metering valves a gas-tight cover, wherein the average volume of the reservoir is at least 1, 5 ml and preferably at least 2.5 ml.
  • the present invention further relates to a method for metering reagents on a plurality of slides by means of an automatic device according to the invention, wherein the slides are inserted into the device, the reservoirs are filled with reagents, the dosing head by means of the positioning device on the respective wells of the Slide is positioned, and the reagent is metered into the well, wherein the volume of the reagent is smaller than the volume of the well.
  • the present invention relates to an automatic apparatus for metering reagents on a plurality of slides, each having a plurality of distinct wells.
  • the wells are suitable for receiving tissue or cell reactions, at which then, in particular, immunohistochemical or molecular-biological detection reactions are carried out by the reagents added.
  • reaction zones Wells that are loaded with tissue or cell samples are referred to as reaction zones.
  • plurality in the context of this invention means at least three, preferably at least six and in particular at least eighteen.
  • Microscope slides suitable for use in the present invention include e.g. a preferably transparent, flat base plate on which a e.g. uniform grid of webs is arranged to provide delimited wells.
  • the slide should be made of a homogeneous, transparent material, e.g. consist of glass or polyethylene, a Teflon layer or a layer of another preferably hydrophobic polymer material in which the recesses are embedded.
  • the depressions in an originally homogeneous thick layer e.g. may be introduced by drilling or milling, or the slides may be made in one piece e.g. be produced by injection molding.
  • the slide may also have a preferably uniformly thick base layer, to which grid-shaped webs are applied, in which a suitable hydrophobic, polymerizable precursor of a polymer, e.g. applied by a screen printing process and then polymerized.
  • the slides have a multiplicity of, for example, 6, 18, 24, 72 or even more depressions.
  • the cross-sectional areas of the recesses may be both regular and irregular, with regular cross-sectional areas such as squares, rectangles or circles being preferred.
  • the recess depth of the recesses may optionally over the cross-sectional area vary, but is preferably constant. Preferably, all wells of a slide have the same shape.
  • standard slides can also be used in the device according to the invention.
  • the dimensions of the cross-sectional area and the recess depth of the depressions are chosen such that the depressions preferably have a volume of between 5 and 150 ⁇ l.
  • the dimensions of a square or rectangular cross-section can be e.g. preferably between 3 to 10 mm x 3 to 10 mm, and the depth can vary between 0.1 and 2.0 mm.
  • the recesses on the slides are separated by webs which may be regular or irregular in shape and may have a uniform or uneven thickness.
  • the webs preferably form a regular grid, e.g. in recesses with a rectangular or square cross-section is preferably formed by substantially mutually perpendicular webs.
  • the dimensions of the slides preferably correspond to those of commercially available formats.
  • the slide dimensions are more preferably about 26 mm x 75 mm.
  • At one of the ends of the slide is preferably provided a label or identification field, e.g. be labeled or provided with one or two-dimensional code labels, RFID chips or the like.
  • a slide 18 has recesses.
  • the pits are arranged in a regular matrix of 3 columns and 6 rows.
  • the depressions are arranged equidistantly in the lines. The distance between each row is the same.
  • a preferred design of a 6-well slide can be derived from the aforementioned 18-well slide advantageously by combining the 3 wells arranged in a row into a well. This results in a strip design of 6 mutually parallel strip-shaped recesses.
  • the recess on the slide is formed by webs and a base plate, wherein the webs have a height corresponding to the Auspa- depth of the recesses. The height of the webs is higher than the height of the carrier film and the tissue or cell sample arranged thereon.
  • the ratio of these Dimensions are preferably at least 1, 2, in particular at least 1, 3 and more preferably not smaller than 1, 4.
  • the volume of the well exceeds the sum of the volumes of tissue or cell sample and carrier sheet segment at least 1.5 times and more preferably at least 2 times.
  • FFPE tissue or cell materials are preferably used, of which flat tissue or cell sections with a thickness of e.g. 0.5 to 5 microns and especially about 0.5 to 2.5 microns are obtained.
  • the sheet-like tissue sections are preferably reinforced mechanically by being applied to a particularly deformable carrier foil, such as e.g. a Polycarbonat natfolie be applied.
  • cell or tissue segments from the flat tissue section e.g. be punched out with a punching device.
  • the extent of the tissue segments in the plane perpendicular to their thickness is selected so that the tissue segments can be picked up by a separating unit and placed in the depressions in a subsequent step.
  • the tissue segments may be in the wells e.g. be fixed with the aid of a UV-curable adhesive.
  • the volumes of tissue and foil and adhesive may also be nearly the same (almost flat surface), because the applied fluids would eventually remain bulging over the tissue in the reaction field due to the surface tension of the hydrophobic forces no contamination occurs.
  • An almost flat surface has the advantage that relatively little mounting medium must be used during the final covering process (permanent covering of the slides); the latter contains solvent which evaporates over time causing shrinkage artifacts, the slide then draws air and can no longer be microscoped. Air has a different refractive index than glass or mounting medium, while the mounting medium has a glass-like refractive index.
  • tissue or cell segments will preferably be multiple flat tissue sections of the same tissue or cell material punched and transferred into wells of slides. This will ensure that a representative tives image of the tissue sample is examined.
  • the flat tissue or cell sections before the punching of tissue or cell segments by the pathologist to be visually inspected for example, flat sections containing only paraffin and virtually no tissue or cell material, or planar tissue sections that in the essentially contain only healthy tissue or cell material, weed out.
  • WO 2007/134, 814 discloses an automatically operating device for the reproducible production of tissue samples to be examined arranged on microscope slides.
  • this application which are taken in particular Figures 1 and 2 of the present application, reference is made in the present application in its entirety.
  • the apparatus has holding means for receiving a plurality, i. from one to 200 slides.
  • the holding devices may preferably be attached to one or more trays, which are then e.g. loaded outside the device with slides and can be used in the device.
  • the holding devices or the trays are firmly connected to the device, so that the slides are then inserted directly into these holding devices located in the device.
  • the trays can be formed, for example, in one piece or in several pieces. Integrally formed, substantially rectangular trays may for example have a substantially rectangular frame having a plurality of parallel juxtaposed strips or a grid-like grid on which the slides are attached. If the size of such a one-piece tray corresponds to the size of the reaction space of the device, only one tray must be inserted into the device per analysis process, whereby the handling of the device is facilitated. In multi-piece trays, for example, the frame of the tray and the individual strips or grid-shaped grid or grid parts are not fixed, but releasably connected to each other.
  • the loading of the tray parts can be facilitated, while only one tray must be inserted into the device.
  • two or more trays may be inserted into the device. This may be advantageous, for example, when slides are loaded at different workstations with cell or tissue samples.
  • the slides are detachably connected by the holding devices with the one or more trays or with the device, wherein in particular mechanical holding devices are used.
  • the slides can be attached, for example, by clips or similar fixtures.
  • Mechanical fastener systems with female and male fasteners may also be used, with one fastener type disposed on the slide and the other on the tray or device.
  • the slides may have circular through-holes which engage corresponding pins on the tray or device.
  • the slides may, for example, also have mushroom-shaped micro-hooks on the lower side facing the reaction zones, for example, which engage in a fibrous non-woven fabric which is arranged on the tray or device.
  • conditional on the arrangement of the holding devices arrangement of the slide on the tray or in the device may be regular or irregular, with a regular arrangement is preferred.
  • the arrangement of the holding devices is selected such that the slides form a regular, rectangular matrix with rows and columns.
  • the slides are preferably used in such a way that the labeling fields, e.g. contain a code or similar identification elements, always pointing in the same direction.
  • the device preferably comprises a device with which individual slides or groups of slides can be moved by vibration, whereby reagents metered into the reaction zones can be mixed. This can further promote uniform wetting of the tissue and cell samples in the reaction zones with the reagents. Furthermore, rinsing agent residues, if appropriate also after rotation of the rotatably mounted microscope slides by e.g. 180 ° mechanically shaken off.
  • the apparatus preferably further comprises means for heating individual slides or groups of slides.
  • the heating can, for example, in the simplest case by a room air heating or even by more complex devices such Eg arranged in the vicinity of the slide electrical heaters or by exposure to IR radiation done. Heating the slides and thus the reaction zones is advantageous because it can shorten the time required for the incubation of the tissue or cell samples with antibodies, the temperature by the denaturation of the antibody at about 42 ° C or the separation the hybrid is above the melting temperature-limited.
  • the FISH analysis -for are operating temperatures of about 37-42 0 C beneficial. By contrast, higher temperatures can be used for ISH analyzes.
  • An acceleration of the reactions can also be achieved by increasing the concentration of the reagents.
  • Immunohistochemical antibody incubations typically take a period of 20 to 60 minutes (30 minutes on average), while molecular biology hybridizations typically take many hours or days. Therefore, the simultaneous performance of immunohistochemical and molecular analyzes usually makes no sense. Furthermore, for immunohistochemical analyzes typically between 100 and 200 antibodies should be available, while for FISH and ISH analyzes typically only 10 to 30 probes are needed. Therefore, different dosing heads are preferably used for immunohistochemical or molecular analyzes. In view of these differences, it may be advantageous to use different devices according to the invention optimized for the respective requirements for immunohistochemical or molecular analyzes. Also preferred is a device according to the invention with two submodules, whereby parts of the hardware and the software can preferably be used in parallel.
  • the holding devices are preferably arranged such that the tops of the slides with the depressions / reaction zones are substantially in one plane. This has the advantage that the positioning device, which carries the dosing, only two-dimensional movements must allow.
  • the positioning device is preferably a conventional Cartesian X / Y system, e.g. Has stepper motors. Typically, a positioning accuracy of ⁇ 0.25 mm is sufficient.
  • the device according to the invention further comprises a dosing head attached to the positioning device with a multiplicity of storage containers which contain suitable liquid reagents for carrying out reactions such as eg dyeing detection reactions.
  • the dosing head preferably comprises between 1 to 288, preferably a multiple of 6, storage containers.
  • the reservoirs each have an end facing the wells of the underlying slide, each having at least one metering valve with an outlet device for metering and introducing the reagents into the wells or reaction zones.
  • the reservoirs preferably have gas-tight closures or lids.
  • the reservoir can be provided individually with a gas-tight lid, or more or preferably all reservoirs may have a common gas-tight lid.
  • the cover or the covers preferably have connections provided with inlet valves, to which a gas overpressure can be applied via one or possibly a plurality of lines.
  • the reagents in the storage containers are preferably subjected to a constant gas overpressure, so that the liquid reagents can be dispensed into the depressions or reaction zones at a constant rate upon opening of the metering valves at the other end of the storage container.
  • a constant gas overpressure air or an inert gas such as N 2 can be used.
  • the dosing head has, according to an advantageous development, a dosing control.
  • the dosing is controlled by the interruption of a light beam, in particular infrared light beam, on the one hand dosing itself, ie, whether the dosing was successfully started and completed.
  • a light beam in particular infrared light beam
  • the increase volume over time (dV / dt)
  • a / D converter analog-to-digital converter
  • a temporal evaluation of the dosing process is also possible, wherein the time interval of the interruption of the light beam is measured and thus the volume dispensed is calculated on the basis of the measured interruption time and the set and monitored system pressure. This is advantageous in that it increases the operational reliability of the device and provides feedback. tion of the respective filling level of the individual storage container can be made possible.
  • the metering valves are preferably arranged in a valve block at the lower end of the reservoir.
  • the metering valves are preferably not provided with metering tips, since otherwise a dead space volume (namely that of the metering tip) would arise.
  • the dosage is thus preferably via the holes of a perforated plate, which is indicated under the valves.
  • the outlet opening of the metering valve may comprise micro- or metering needles whose diameter is significantly smaller than the cross-section of the reaction zones or the reservoir of the metering head in order to limit the dead space volume.
  • an optical bubble control may be provided to detect unwanted air bubbles in the eluate.
  • the storage container of the dosing head have a cross-sectional area and a height substantially perpendicular thereto between the two ends, which have the metering valve or the gas-tight lid.
  • the arrangement of the storage container in the dosing head is preferably to be selected in adaptation to the respective present design of the slide so that adjacent storage containers can be positioned over at least two preferably adjacent depressions or reaction zones of the slide.
  • the cross-sectional area of adjacent reservoirs in adaptation to the dimensions of the reaction zones and the intermediate webs is to be selected such that two depressions or reaction zones can be acted upon by the two adjacent reservoirs simultaneously with reagents, wherein the two reaction zones are preferably adjacent to each other.
  • the arrangement of the storage container in the dosing head is particularly preferably to be selected so that at least three, preferably at least four, and more particularly at least six adjacent depressions or reaction zones can be charged simultaneously from storage containers with detection reagents.
  • Devices according to the invention which enable such multiparallel metering of reagents into different depressions or reaction zones of one or more slides arranged in the reaction space are particularly preferred. Due to the multiparallel operation, a significant acceleration of the analysis time and thus a significant reduction of the analysis costs is achieved.
  • the multiparallel-applied reagents can preferably be combined in algorithmic panels, which enables particularly effective and targeted pathological diagnostics. The device according to the invention is thus much better suited than previously available in the prior art pipetting machines for screening in healthcare.
  • the device according to the invention also makes it possible to process "standard slides" with only one sample without restriction and at significantly lower costs, whereby only one valve is opened and dosed over the sample material so that complete flexibility is added to the mentioned advantages. For example, it might be necessary that a very heterogeneous tissue can not be divided and the cut must be processed "as a whole”; or it could be that foreign cuts had to be processed that can not be further manipulated.
  • the volume of the reservoir is determined by its cross-sectional area and its height, ie the distance between the preferably provided with a gas-tight lid end and the opposite, limited by a metering valve end.
  • the volume of the reservoir is dimensioned so that it allows the implementation of preferably one to 200 individual reactions such as ABC dyeing detection reaction cycles, without a re-filling of the reservoir would be required. This represents a further considerable advantage over devices known from the prior art, in which the pipette tips are typically dropped after the single-use metering and new pipette tips have to be charged for the next pipetting procedure.
  • the devices according to the invention thus eliminates the extremely time-consuming driving of the pipetting head to the afterloading station after each dosing and disposing of disposable pipette tips, which is undesirable for cost and environmental reasons.
  • the device according to the invention can thus be operated much more time-effectively and thus more cost-effectively than conventional pipetting devices.
  • the device according to the invention is thus very much better than previously available in the prior art pipetting machines for screening in healthcare suitable
  • the storage containers of the pipetting head are preferably dimensioned so that all slides, which may be clamped into the apparatus with at least one tray, can be exposed to detection reagents which are removed from the storage containers without requiring an intermediate filling of the storage containers.
  • the device can hold a tray with 96 (8 x 12) slides, that each slide has 18 (3 x 6) reaction zones with a volume of approximately 10 to 20 ⁇ l and that per reaction zone - without consideration of the rinses - Reagents must be applied in up to 6 steps, resulting for the total volume of the dosing, ie for the sum of the volumes of all reservoirs, a volume of about 100 to 200 ml.
  • the 6-slide slides are about 30 to 50 ul used.
  • the reservoirs are preferably designed so that their average volume is at least 1.5 ml, in particular at least 2.5 ml, more preferably at least 4 ml and most preferably at least 5 ml.
  • the reservoir can all have the same volume.
  • the required larger volumes of the detection reagents can be passed through several hoses, the hoses via drag chains through the Cartesian system up to a position be pulled near the dosing.
  • the dosing head itself _
  • valve head optionally with dosing control at the outlet of the tube, via which the dosage of the required volumes of detection reagents (secondary and optionally tertiary reagent) as well as substrate, counterstaining reagent or rinsing solution can take place.
  • the valve head it is also conceivable to arrange the valve head on the reservoir itself, in particular in order to keep the weight to be transported by the dosing head low. It should preferably be provided that these hose systems can be rinsed.
  • the smallest storage container preferably has a volume of about 5 ml or more.
  • the dosing head can be constructed in a particularly advantageous development as a 'sandwich' with exchangeable plates or blocks and, e.g. a sealing lid, a unitized block of reservoirs, a block of metering valves and / or a block of flow sensors. If necessary, the individual plates or blocks can be exchanged for other plates or blocks, for example if the valves are worn or storage containers permanently soiled by deposits. This allows a high degree of serviceability and a modularity for possible extensions.
  • the dosing head is preferably detachably inserted into a dosing head holder. Thereby an exchange of e.g. emptied dosing heads or the introduction of a dosing head with other reagents easily possible. Also, the dosing head itself can be marked by means of preferably machine-readable codes and thus be identifiable.
  • the storage vessels can be provided with a fill level sensor.
  • the entire system may have a level detection device, for example in the form of a triangulation sensor.
  • held and partially emptied or completely emptied dosing heads or the holders held in the dosing head can be moved from the positioning system to a refilling station in the dosing head holder.
  • the refilling station is preferably operable in an automated manner and is supported by appropriate software.
  • the dosing head mounted on the Cartesian system is thereby moved under a fixed refilling station, which is provided with larger storage containers of the reagents used. The individual storage containers in the dosing head are then filled again automatically and individually.
  • the previously metered from the individual reservoirs volumes of the control of the device are known (remanent stored), in particular by detecting the outflow through the metering and / or the level sensors in the individual storage containers. Before this filling process, only the upper seal of the reservoir (lid) would be removed, which in principle can also be done automatically.
  • the storage containers of the dosing head are preferably numbered.
  • the individual storage containers each have identification elements and can be controlled individually or in groups.
  • Immunohistochemical or molecular biological detection reactions are usually multi-step reactions, with a rinsing step typically following each reaction step.
  • the standard immunohistochemical staining reaction the so-called ABC method (avidin-biotin complex method), at least 3 reaction steps (dosing with primary antibody, secondary antibodies and tertiary reagent), wherein after the individual reaction steps, for example, 3 rinsing steps take place and at each rinsing step each preferably followed by a light drying step (not drying).
  • the molecular biological standard methods ISH (in situ hybridization) and FISH (fluorescence in situ hybridization) are also multi-step methods.
  • the device of the present invention is to carry out the rinsing steps below the slide level with a rinsing liquid filled Spülwanne provided.
  • the slides are optionally arranged in trays individually and / or together with other slides from a first, suitable for performing the detection reactions position in a second, located in the container position can be transferred.
  • the slides are arranged in a matrix-like arrangement of 'rows and columns, wherein the strips with slides that form the columns, are individually lowered and can be brought into contact with the rinsing liquid.
  • other portions of the slide matrix such as e.g. Rows, parts of columns, etc. be arranged lowered.
  • the slide bars, the Spaltenz. Form rows may alternatively or additionally be rotatably mounted, so that the slides can be converted by rotation in the rinsing liquid.
  • it is advantageous that individual slides or groups of slides or the slides can be lowered, since then non-lowered slides can still be controlled by the dosing and treated with reagent.
  • the exposure time of the reagents to the tissue or cell samples in the individual reaction zones should be substantially the same.
  • the rinsing pan which is arranged below the slide level, can be made, for example, from stainless steel (VA steel). It preferably has an inlet and outlet for the rinsing liquid in order to avoid contamination of the reaction zones by contaminated rinsing solution.
  • the rinse solution may consist essentially of water containing detergents to prevent nucleation and e.g. NaAcid can be added. The constant replacement of the rinsing solution serves to avoid nucleation.
  • a level sensor is used to set a preferably constant liquid level of the rinsing liquid in the rinsing tank.
  • the level height is adjustable and may be e.g. be adapted to the position of the 180 ° rotated slides with the then pointing towards the wash tub reaction zones.
  • the inventively proposed flushing mechanism by transferring one or more slides into the washing tub with a large excess of washing liquid represents a significant acceleration and simplification of the flushing process.
  • a contamination by entrainment of the individual reagents from one slide to another in this type of rinsing process was not observed when the volume of the washing tub is dimensioned sufficiently large.
  • the volume of the wash tub is preferably at least 100 times the volume of the purged reaction zones. Assuming that 10 slides each having 18 reaction zones each having a volume of 50 ⁇ l are rinsed simultaneously, the volume of the rinse tub should be at least about 1000 ml. Regardless of this estimate, the rinse tub may preferably have a volume of at least 500 ml, in particular of at least 1 l and more particularly of at least 1.5 l.
  • the reaction zones typically have residues of rinsing liquid, which are preferably removed to avoid unwanted dilution of the reagent in the subsequent reaction step or even flooding of the reaction zone; the latter could lead to contamination of other reaction zones of the slide.
  • a stream of air or a particularly inert rinsing gas such as, for example, N 2 can preferably be generated above the slides.
  • the application of air or a purge gas is preferably carried out so that a laminar flow of air or gas is formed. However, it is important that the reaction zones never completely dry out, which could lead to denaturation of the cell or tissue samples.
  • the reaction space preferably has a cover for closing the entire reaction space of the device.
  • the cover is used particularly advantageously in combination with the flushing trough disposed below the level of the slide.
  • the device preferably has a central control panel such as a Vi or 1/1 VGA touch panel.
  • a software interface to higher-level pathology software is not absolutely necessary because the device performs the analyzes autonomously, without the need for data transfer from existing systems is required.
  • a USB / Ethernet interface for eventual logging and interaction with a higher-level software (pathology software or patho-link and / or the like.), Which, for example, requirements / orders of a verifier could be entered directly on the microscope in the system, then in the laboratory and to be processed by the machine after appropriate coding without confusion.
  • the Ethernet interface can be designed as a TCP / IP interface for connecting the device according to the invention with peripheral devices, such as a printer or other data-related devices.
  • An ISDN / Analog / Ethernet interface for remote maintenance.
  • the FFPE microtome sections must be pretreated prior to immunohistochemical or molecular biological analysis.
  • the sections are first dewaxed by a solvent (for example 3 x 10 min xylene bath), transferred via a descending alcoholic series (eg, 100% -96% -70% -70% ethanol for 1 min) in an aqueous solution to then finally treated with a heat process in a buffer solution (this may be microwave treatment, steam pot or steamer).
  • a solvent for example 3 x 10 min xylene bath
  • a descending alcoholic series eg, 100% -96% -70% -70% ethanol for 1 min
  • a buffer solution this may be microwave treatment, steam pot or steamer.
  • This pretreatment of the sections or the tissue or cell samples deposited in the recesses can take place in the device according to the invention.
  • the necessary reagents are to be introduced into the storage container of the dosing head, and to provide corresponding device for heat treatment of the cuts. It has been found that such an extension of the device according to the invention tends to increase the complexity and therefore the cost of the device and to reduce the robustness of the device.
  • the cuts are preferably partially exposed to a different heat treatment with regard to the primary antibody to be used (eg in the microwave, in the steam cooker or in the steam pot) and preferably different buffer solutions are used.
  • the primary antibody to be used eg in the microwave, in the steam cooker or in the steam pot
  • HSP 90 10 min. Proteinase K: 1 Trpf. PK (DAKO cytomation, Code No. S 2019) in 2 ml dilution medium (DAKO Cytomation, Code No. S 2032) at RT.
  • Cyclin A Boil for 45 min in a steamer (MultiGourmet, Braun company) with citric acid (2 g Citric Acid Monohydrate / 1, 0 l A.d., pH6).
  • Jaw 1 / Ki-67 20/15 min. Pressure cooker with citric acid (2g Citric Acid Monohydrate / 1, 0 l A.d., pH 6).
  • the reagents for immunohistochemical and molecular biological detection reactions are commercially available and are selected in view of the desired assay method.
  • immunohistochemical investigations there are currently about 250 established antibodies available that can be used in particular for carrying out the standard immunohistochemical staining method, the so-called avidin-biotin-complex (ABC) method.
  • ABSC avidin-biotin-complex
  • the dosing head or the dosing head holder of the device is preferably provided with a cooling device formed, for example, by Peltier elements. This ensures that the reagents in the reservoirs of the dosing head are stable over a longer period of time.
  • a cooling station into which the dosing head can be moved by means of the positioning device. This is advantageous in that the mass of the dosing to be moved compared to the variant with cooling device exhibiting dosing considerably reduced and thus the positioning device can be dimensioned correspondingly cheaper.
  • the dosing head is automatically moved to the cooling station after completion of a dyeing run and the remaining reagents in the dosing hopper are cooled to extend the period of use.
  • the primary and secondary antibodies required for the ABC method and the tertiary reagent in a suitable buffer solution are relatively stable and can when refrigerated over a period of 1 to 4 weeks to 6 or 12 months.
  • a draining or storage function It is after completion of a dyeing run and after removal of the slide from the Device preferably used in the slide holders or other suitable receptacles (trays) storage containers, in which there is a complete emptying of the still located in the reservoirs of the dosing head reagents using the metering valves.
  • these containers are provided with identification elements, for example 1 D or 2D codes, which can be read out by means of the reading device provided on the dosing head. This ensures that the dosing head emits the residual reagents in the appropriate storage containers. Following this, the storage containers can be removed and stored in a separate cooling device.
  • the primary antibody binds to the corresponding tissue antigen.
  • Suitable primary antibodies are e.g. Cyclin A (Novocastra Laboratories Ldt., Clone 6E6): 1:50
  • Ki-67 (Clone Mib-1, DAKO Cytomation, M7240, Denmark): 1: 100
  • the reaction time of the primary antibody is, for example, 20-30 minutes.
  • the reaction time of the secondary antibody is e.g. 10 to 20 min.
  • a blocking step can be carried out in which the endogenous peroxidase activity according to the principle of an excess of H 2 O 2 in the absence of electron donor with: a peroxidized blocking agent (Biocare Medical, Cat # PX968MM ) is blocked.
  • the reaction time of the blocking reaction is, for example, 3 ⁇ 5 min.
  • the preformed avidin-biotin-enzyme complex is then applied as tertiary reagent (used as enzyme: horseradish peroxidase (horseradish peroxidase (HRP) or alkaline phosphatase (AP)) and its high affinity Attachment to the biotin molecule of the secondary antibody.
  • tertiary reagent used as enzyme: horseradish peroxidase (horseradish peroxidase (HRP) or alkaline phosphatase (AP)
  • the reaction time of the tertiary reagent is e.g. 10 to 20 min.
  • a chromogenic substrate solution eg 3.3 '-.
  • DAB Diaminobenzidine tetrahydrochloride
  • the chromogen solution may preferably be a 'buffer medium containing (e.g., DAB substrate buffer (Biocare Medical, Ref DS854MM; chromogen to buffer medium in a ratio of 1:.. 20).
  • the reaction time of the chromogen is e.g. 5 - 10 min.
  • reaction zones of the slides can be treated with hematoxylin (reaction time eg 1 min.) To complete the staining reaction.
  • hematoxylin reaction time eg 1 min.
  • Slides may then be dehydrated (ascending alcohol series: 70% - 70% - 96% - 100% ethanol for 1 min each) and treated with xylene. The slides can then be closed with a lid for storage.
  • the reagents described by way of example and, if desired, further reagents are filled into the storage container of the dosing head in ready-to-use form, the reagents in the storage containers preferably being arranged so that a simultaneous dosing of reagents is possible depending on the respective analytical task.
  • the reagents may be e.g. in blocks of 6, i. e.g. arranged in rows of 6 antibodies in a defined sequence, resulting in meaningful panels.
  • the following table shows, by way of example, compilations of in each case 6 reagents (antibodies) in panels, which are matched to one another in staining algorithms and can advantageously be used for the pathological diagnosis of the respectively indicated lesions / tumor.
  • the antibodies can be diluted in the usual way and filled in a defined sequence in the reservoir of the dosing head.
  • the resulting algorithmic panel can be connected to a separately manageable Dosierkopfsegment, which is used separately from other Dosierkopfsegmenten in the Dosierkopfhalterung and is thus completed to a dosing.
  • the panels combined in dosing head segments are preferably labeled or mechanically and / or electrically coded. Further coloring algorithmic panels can be found in Table 1 below.
  • the device according to the invention is particularly suitable for carrying out a method for metering reagents onto a slide or into the wells of microscope slides.
  • the slides are inserted into the device.
  • the slides are placed outside the device on one or more trays and the trays are then inserted into the device.
  • the slides are preferably mounted on the trays with mechanical fasteners, preferably a mechanical fastener system with male and female fasteners.
  • the slides preferably have labeling fields on which identification means such as e.g. Labels with 1D or 2D codes, RFID chips or the like can be attached.
  • identification means such as e.g. Labels with 1D or 2D codes, RFID chips or the like can be attached.
  • the orientation of the slides is preferably always the same, so that a glance of the user is sufficient to check whether all labeling fields of the slide point in the same direction.
  • the order of the slides on the device according to the invention is arbitrary, since all slides are first read out via the integrated scanner. This means that the device can also check immediately if a slide has possibly been placed, to which no panel with reagents (in the dosing head) currently fits. Incorrect processing of this slide is thus excluded. Furthermore, if necessary, an optimized travel for the dosing head can be calculated.
  • the method further comprises filling the reservoir of the dosing head with the appropriate reagents.
  • the dosing head is then attached to the positioning system or inserted into the dosing head holder attached to the positioning system.
  • the dosing head or the dosing head holder preferably have a cooling device, which is formed, for example, by Peltier elements. If the device comprises a refilling station for the reagents, at which the dosing head can be refilled after it has been emptied, it is also filled with the reagents.
  • both the reservoir of the dosing and the reservoir of the Refill provided with identification means to control the automatic control of the analysis, ie the metering of the reagents in the wells or the reaction zones, and the refilling of the dosing by the software. It is further preferably ensured that the reagent volume in the dosing head or in the refilling station correlates with the total number of reaction zones.
  • the dosing head with the reading device for the identification means preferably first removes the slides in order to read the information on the identification means and to record the position of the slides and the depressions / reaction zones provided by them.
  • the dosing head begins to meter reagents into the wells / reaction zones, wherein the volume of the metered reagent is smaller than the volume of the well / reaction zone.
  • the dosing head then preferably works by the respective analysis method such as. the above-described ABC method predetermined sequence of reaction steps with intermediate rinsing steps etc. from.
  • the method preferably furthermore comprises a step in which the slides or the depressions / reaction zones located thereon are covered with a covering film in order to be used for subsequent analysis steps, such as e.g. to protect microscopic analyzes.
  • FIG. 1 is a plan view of a slide according to the invention
  • FIG. 2 is a cross-sectional view of the slide of FIG. 1 along the dashed line A - A,
  • FIG. 3 is a perspective overall view of a device according to the invention with a closed lid
  • Fig. 4 is an overall perspective view of the device of FIG. 3 with opened
  • Fig. 5 is an overall perspective view of the dosing of the device according to the
  • FIG. 6 shows a perspective detail view of the dosing head according to FIG. 5
  • FIG. 7 shows a further overall perspective view of the dosing head
  • FIG. 8 shows a view of the dosing head from below.
  • the slide 50 shown in FIG. 1 has recesses 52 with a square cross-sectional area arranged in a regular 3 ⁇ 6 matrix.
  • the recesses 52 are each arranged equidistantly in the 3-row and the 6-row columns, the spacing between the rows being greater than between the recesses 52 in a row itself.
  • the recesses 52 are each provided with a tissue or cell sample 53, 53a, 53b provided.
  • the recesses 52 in this case form the reaction zones 58.
  • the slide 50 has at one end a labeling field 51 in which e.g. a 1D or 2D code label identifying the slide 50 can be glued on.
  • FIG. 2 is a cross-sectional view through a reaction zone 58 taken along the line A-A in FIG. 1.
  • FIG. 1 shows a square depression 52 without a tissue or cell sample 53, while in FIG Tissue or cell sample 53 is located.
  • the tissue or cell sample 53 is located on a carrier film 56 made of a polycarbonate film and is adhesively bonded to the base plate 55 of the slide 50.
  • the slide 50 is coated, for example, with a sprayed-on frame made of a hydrophobic material, a teflon foil or a foil made of another hydrophobic material (reference numeral 54) into which the recesses 52 and the reaction zones 58 are embedded.
  • the frame or foil 54 has a thickness d2 that is greater than the sum d1 of the thicknesses of the cell or tissue sample 53 and the carrier foil 56, such that the tissue or cell sample is located within the well 52 and is supplied with reagents there can be, without causing contamination of adjacent wells 52.
  • the ratio of the dimensions d2 / d1 is preferably at least 1, 2, in particular at least 1, 3 and particularly preferably not smaller than 1, 4.
  • the volume of the The sum of the volumes of tissue or cell sample 53 and carrier foil segment 56 is at least 1, 5-fold and particularly preferably at least 2-fold.
  • the slide 50 may be provided with a cover sheet 57 (of thickness d3) prior to initiating the reactions to ensure that the cell or tissue sample 53 does not dry out.
  • the cover sheet 57 is removed before performing the detection reactions.
  • Figures 3 and 4 show overall perspective views of an exemplary embodiment of a device 10 according to the invention.
  • the device 10 is loaded with a plurality of slides 50 arranged in a regular matrix (12 rows x 8 columns).
  • the twelve slides 50 of a column are each mounted on a strip-shaped tray 51.
  • the one end of the tray 51 is designed to be lowered and immersed in the lowered state in the washing tub, which is located below the arranged in a plane slides 50.
  • the rinse tub is located in the housing of the device 10 and is not seen in Figs. 3 and 4.
  • the device 10 can be closed at the top with a transparent cover 15, whereby a moist space is created in the reaction space 19 above the plane of the microscope slides 50, by which a continuous moistening of the cell or tissue samples 53 in the reaction zones of the slides 50 is ensured.
  • the cover 15 is shown in Fig. 3 in the closed and in Fig. 4 in the open state.
  • the apparatus 10 further includes a dosing head 30 which is disposed on an arm of a XY-type cartographic positioning system 14 and thereby may be positioned over the slides 50.
  • the two arms of the Cartesian system 14 are each mounted on two sides, whereby a robust positioning system is obtained. The operation of the device via the control panel 17.
  • FIG. 5 shows a perspective view of the dosing head 30, which is inserted into a dosing head holder 40, which is fastened to an arm of the X / Y Cartesian positioning system 14.
  • the dosing head contains a multiplicity of storage containers 31, which have a square cross-sectional area and are arranged in a square see matrix (11 x 11) are arranged.
  • the holder 40 of the dosing head 30 is equipped with pellet cooling elements 33 and has on the side facing the reaction space 19 a bar code reader 32 with which the bar code labels arranged in the labeling fields 51 of the microscope slides 50 can be read.
  • Fig. 6 shows the basic structure of the dosing head 30 with square storage containers 31, which are arranged in a square 12 x 12 matrix.
  • the metering head 30 comprises a total of 144 storage containers 31, each having a square cross-section and the same volume.
  • the individual storage containers 31 on the two sides of the dosing head are each numbered 1 to 12.
  • the square cross-sectional area of a storage container 31 with the side lengths 31a, 31b is shown.
  • a metering valve 33 is arranged at the opposite end of each storage tank 31 .
  • the metering valves 33 are combined in a metering block.
  • the metering valves 33 have an outlet device for the reagents in the respective storage containers.
  • the metering valves 33 are followed by a block of flow sensors 34 for metering control.
  • the height of the reservoir 31 between the upper open ends, which are provided with a gas-tight lid 32, and arranged in a dosing 30 metering valves 33 is designated 31c.
  • the reservoir 31 are provided at the opposite end of the metering valves 33 with a gas-tight lid, wherein the connection for the gas line in the schematic representation of FIG. 6 is not shown. With the aid of the gas-tight lid 32, the storage containers 31 can e.g. be acted upon with compressed air or an inert gas. Below the metering valve block is the block 34 with the flow sensors for flow or metering control.
  • the dosing block 30 has a labeling field 35 in order to facilitate the exchange of dosing heads 30 in the dosing head holder 40.
  • the reservoir of FIG. 6 has side lengths 31a, 31b of 9 mm each and a height 31c of about 45 mm. This results in a volume of about 3.6 ml per reservoir 31 and a total volume of the dosing 30 of about 525 ml.
  • the dosing head 30 is constructed as a 'sandwich' with replaceable plates or blocks and is composed of a sealing lid 32, a unitary block of reservoirs 31, a block of dosing valves 34 and / or have a block of flow sensors. This allows a high degree of serviceability and modularity for possible expansions.
  • the dosing head 30 shown in FIGS. 7 and 8 is inserted into the dosing head holder 40.
  • the metering head 30 also contains electronics 110 for controlling the valves of the metering head -30 and for controlling the additionally required valves 120 for the liquids, which are consumed in larger quantities per slide 50.
  • the electronics 110 also includes a pressure sensor for monitoring the system pressure (not shown).
  • the scanner 130 shown in FIG. 7 and FIG. 8 serves to detect and evaluate the 2D codes arranged on the microscope slides 50.
  • the lid 32 is secured in its closed position against unintentional opening with a closure mechanism 140 arranged on both sides in the upper area.
  • Table 1 Staining algorithmic panels for the pathological diagnosis of the indicated carcinomas

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Abstract

Die Erfindung betrifft eine automatische Vorrichtung 10 zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern 50 umfassend Haltevorrichtungen für eine Vielzahl von Objektträgern 50, welche jeweils eine Vielzahl von voneinander abgegrenzten Vertiefungen 52 enthalten, die zur Aufnahme von Zell- oder Gewebeproben 53 geeignet sind, einen Dosierkopf 30 mit einer Vielzahl von Vorratsbehältern 31, welche zur Aufnahme von flüssigen Reagenzien geeignet sind und an dem den Vertiefungen 52 zugewandten Ende/ Seite ein Dosierventil 33 zur Dosierung und Aufbringung der Reagenzien in die Vertiefungen 52 aufweisen, und eine Positionierungsvorrichtung 14 zur Positionierung der Vorratsbehälter 31 des Dosierkopfes 30 über den jeweiligen Vertiefungen 52 der Objektträger 50.

Description

Automatische Vorrichtung zur Durchführung von
Nachweisreaktionen und Verfahren zur Dosierung von
Reagenzien auf Objektträgern
Gebiet der Erfindung
Die vorliegende Erfindung betrifft eine automatische Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf Objektträgern, wobei die Objektträger jeweils eine Vielzahl von voneinander abgegrenzten Vertiefungen enthalten, die zur Aufnahme von Zell- oder Gewebeproben geeignet sind. Die Vorrichtung enthält einen positionierbaren Dosierkopf zur Aufbringung von geeigneten flüssigen Reagenzien in die Vertiefungen der Objektträger. Die Erfindung betrifft weiterhin einen abnehmbaren Dosierkopf, der in die Vorrichtung eingesetzt werden kann, und ein Verfahren zur automatischen Dosierung von Reagenzien in die voneinander abgegrenzten Vertiefungen von Objektträgern.
Stand der Technik
In der jüngeren Vergangenheit ist durch die Verbesserung immunhistochemischer und molekularbiologischer Analyseverfahren ein erhöhter Bedarf an Gewebeuntersuchungen entstanden. Insbesondere wird im Rahmen der Onkologie bei der Diagnose und Behandlung von Krebserkrankungen vermehrt auf die Genexpressionsanalyse gesetzt.
Dabei werden Gewebeproben direkt oder indirekt oder mittels tumorspezifischer Chips daraufhin untersucht, ob bestimmte Gene ein- oder ausgeschaltet sind bzw. ob Genveränderungen (z.B. Mutationen) vorhanden sind. Dabei können Gewebe- oder Zellproben mit Antikörpern bzw. DNA- oder RNA-Sonden behandelt werden, die dann über Färbeverfahren zu einem spezifischen Nachweis der Gene, Genprodukte (mRNA oder Antigene) führen. Eine immunhistochemische Standard-Färbemethode ist z.B. die sogenannte Avidin- Biotin-Complex (ABC) Methode, die in Hsu, S.M. et al., J. Histochem. Cytochem, 29, 577 - 580 beschrieben ist. Im ersten Schritt dieser Methode bindet der Primär-Antikörper an das entsprechende Gewebe-Antigen. Nach einem oder mehreren Waschschritten erfolgt die Bindung eines biotinylierten Sekundär-Antikörpers an den primären Antikörper. Im An- schluss an einen oder mehrere weitere Waschschritte wird ein vorgeformter Avidin-Biotin- Enzym-Komplex aufgebracht, der sich hochaffin an das Biotin-Molekükl des Sekundär- Antikörpers anlagert. Es folgen erneut ein oder mehrere Waschschritte, und dann wird ein Chromogen aufgebracht, das in einer Färbereaktion mit dem Avidin-Biotin-Enzym-Komplex unter Bildung eines sichtbaren, gefärbten Reaktionsproduktes reagiert. Molekularbiologische Verfahren umfassen die In-situ-Hybridisierung (ISH) und die Fluoreszenz-in-situ- Hybridisierung (FISH), bei denen Nukleinsäuren, also RNA oder DNA, z.B. in Geweben oder einzelnen Zellen nachgewiesen werden. Dazu werden künstlich hergestellte Sonden aus einer Nukleinsäure eingesetzt, die über Basenpaare and die nachzuweisende Nukleinsäure hybridisieren. Bei der FISH-Methode wird die Sonde mit Hilfe eines fluoreszierenden Farbstoffes nachgewiesen.
Bei Genexpressionsanalysen wird die Tatsache ausgenutzt, dass von den etwa 25.000 bis 30.000 Genen einer Zelle Tausende oder auch alle gleichzeitig analysiert werden. Man nimmt an, dass von den ca. 25.000 Genen nur etwa die Hälfte gleichzeitig in einer Zelle aktiv ist und dass davon nur einige Hundert Gene einer Zelle tumor- oder krankheitsspezifisch bzw. relevant sind. So lassen sich beispielsweise mit ca. 200 Genen Mantelzellen- lymphome von allen anderen Lymphomen (ca. 40 unterschiedliche Entitäten sind bekannt, die sich wiederum in zahlreiche Untergruppen gruppieren lassen) spezifisch unterscheiden. Mit einer vergleichbaren Anzahl von durchaus anderen Genen lassen sich beispielsweise Mantelzellenlymphome von allen anderen Tumoren abtrennen. Und ebenso gelingt mit einer Anzahl von einigen hundert Genen die Unterscheidung von reaktiven Lymphozyten und neoplastischen Lymphozyten eines Mantelzellenlymphoms.
Durch statistische Analysen solcher globaler Expressionsanalysen gelingt häufig eine signifikante Datenreduktion, und es werden sogenannte genetische Fingerabdrücke z.B. von Tumoren oder Krankheitsprozessen erzeugt, die sich dann im Weiteren als diagnostische Marker verwenden lassen. Dabei wird in der Regel keine signifikante Verschlechterung der Aussagekraft der Analysen beobachtet. So können z.B. von etwa 30 Genen, die für hochmaligne B-Zellen Lymphome bedeutsam sind, je drei Gene ausgewählt werden, die am stärksten mit einer guten bzw. die am stärksten mit einer schlechten Prognose korrelieren. Bringt man nun diese sechs Gene mit einem positiven bzw. negativen Faktor in eine mathematische Prognoseformel ein, lässt sich damit eine sehr gute statistische Aussage zum Überleben des Patienten erzielen. Diese Vorhersage kann dann mit signifikantem Mehrwert für den Patienten in die klinischen therapeutischen Überlegungen integriert werden. Da Gewebe und Zellen nach der Entnahme aus dem Organismus sehr schnell absterben und in dem Prozess der Nekrose zerfallen, wobei Organellen, Zellstrukturen und auch Gewebearchitektur zerstört werden können, werden Gewebeanalysen vor allem an sogenanntem FFPE-Gewebe (formalin fixed and paraffin embedded) durchgeführt. Für die Diagnostik an FFPE-Material stehen zur Zeit etwa 250 etablierte Antikörper zur Verfügung, wobei man zur Analyse häufig so genannte Algorithmen verwendet. Dabei werden Tumore zunächst konventionell morphologisch mit Standardfärbungen untersucht. Der Pathologe bzw. die Pathologin kommt dann zu einer Verdachtsdiagnose oder zu verschiedenen differentialdiagnostischen Überlegungen, bei denen zum Beispiel 3 oder 4 verschiedene Diagnosen berücksichtigt werden. Um zu einer endgültigen Diagnose zu kommen, wird dann eine variable Anzahl von immunhistochemischen oder molekularbiologischen Färbungsreaktionen durchgeführt. Um dies möglichst ökonomisch zu gestalten, färbt man mit so genannten algorithmischen Antikörper- Panels, d.h. sinnvoll zusammengestellten Gruppen von Antikörpern. Ein algorithmisches Antikörper- Panel kann z.B. vier bis sechs Antikörper beinhalten. Verschiedene Antikörper- Panels können in einem logischen (z.B. hierarchischen) Verhältnis zueinander stehen oder auch für bestimmte Erkrankungen in Gruppen zusammengestellt werden. Der Pathologe bzw. die Pathologin bearbeitet die diagnostische Fragestellung von Panel zu Panel immer differenzierter, bis schließlich die Diagnose feststeht.
Damit ergibt sich, dass an dem Gewebematerial eines Patienten z.B. zwischen 10 und 50 Untersuchungen (z.B. im Rahmen so genannter tumorspezifischer Diagnose- oder Prognose- Panels) durchgeführt und ausgewertet werden müssen. Im Hinblick auf den Kostendruck im Gesundheitswesen müssen diese Untersuchungen möglichst zeit- und kosteneffektiv durchgeführt werden.
Zur Durchführung derartiger Gewebeanalysen sind automatische Färbevorrichtungen (auch als Stainer- Vorrichtungen bezeichnet) vorgeschlagen worden.
So wird in der US 6,495,106 eine automatische Färbevorrichtung beschrieben, die einen in drei Dimensionen beweglichen Arm hat, der einen mit einer Aussparung versehenen Kopf trägt. Dieser Kopf umfasst einen Reagenzien-Kopf mit einer Spitze, die zum Aufbringen der Reagenzien dient. Der Kopf umfasst weiter eine Waschspitze und eine Blasspitze, um die verschiedene Schritte einer typischen Nachweisreaktion durchführen zu können. Eine ähnliche Vorrichtung wird auch in der US 5,948,359 beschrieben, wobei der Reagenzien-Kopf zum Aufbringen der Reagenzien mit Einmal-Pipettenspitzen versehen werden kann, die in einer entsprechenden Haltevorrichtung vorgehalten werden.
Diese Vorrichtungen sind zur Durchführung von Nachweisreaktionen an einer Vielzahl von Objektträgern, welche jeweils eine Vielzahl von zur Aufnahme von Zell- oder Gewebeproben geeigneten Reaktionszonen aufweisen, weniger gut geeignet, da die Analyse insgesamt einen sehr langen Zeitraum beanspruchen würde, da nur eine Reagenzien-Spitze vorhanden ist. Weiterhin besteht aus diagnostischen Erwägungen ein hoher Bedarf daran, für einen bestimmten Patienten eine Vielzahl von Analysen an Gewebeproben ein und desselben Gewebes durchzuführen, um nach dem oben beschriebenen algorithmischen Verfahren eine Diagnose ermitteln und verifizieren zu können. Dazu müssen jedoch die Gewebeproben ein und desselben Patientenmaterials mit unterschiedlichen Antikörpern oder Sonden versetzt werden, um auf diese Weise den spezifischen Tumor bzw. das Krankheitsbild einkreisen und letztlich diagnostizieren zu können. Bei den in der US 6,495,106 und in der US 5,948,359 beschriebenen Vorrichtungen muss bei einem Wechsel des Nachweisreagenzes die Pipetten-Spitze der Reagenzien-Spitze gewechselt werden, was zum einen zu einem erhöhten Verbrauch an Pipetten-Wegwerfspitzen führt und zum anderen den Zeitbedarf der Gesamtanalyse - und damit letztendlich die Kosten für die Gesamtanalyse - nochmals erhöht.
Die US 2008/0,038,836 A offenbart eine für eine große Zahl von Objektträgern geeignete Färbevorrichtung, die eine Vielzahl von Arbeitsstationen aufweist, die senkrecht in einem Magazin angeordnet sind. Die Vorrichtung enthält weiterhin ein Tablett mit einer Vielzahl von Objektträgern, die horizontal in einer Ebene angeordnet sind und voneinander beabstandet sind. Dabei kann das Tablett mit Objektträgern von einem Transportsystem zwischen den einzelnen Arbeitsstationen bewegt und in die Arbeitsstationen hinein- und wieder herausbewegt werden. Die Vorrichtung beinhaltet z.B. eine oder mehrere Arbeitsstationen zum Trocknen oder Heizen, eine Arbeitsstation zum Entwachsen und Ent- Paraffinieren von FFPE-Gewebeproben und eine oder mehrere Färbe-Arbeitsstationen. Die Färbe-Arbeitsstation weist eine Reihe von Düsen auf, die mit Vorratsbehältern für Färbereagenzien bzw. Spülagenzien verbunden sind und zur Aufbringung dieser Reagenzien bzw. Agenzien auf die Objektträger dienen. Die in der US 2008/0,038,836 A beschriebene Vorrichtung ist sehr komplex, und der Transport des Tabletts mit Objektträgern zwischen den einzelnen Arbeitsstationen ist zeitaufwendig. Weiterhin ist eine begrenzte Zahl von z.B. zwei Düsen vorhanden, die bei Verwendung anderer Reagenzien gewechselt werden müssen. Die Reagenzien werden aus Vorratsbehältern über Schlauchleitungen in die Düsen gepumpt, was die Handhabung des X-Y-Z-Positioniersystems erschwert.
Die US 2006/0,269,447 offenbart einen Roboter für die Aufbringung von Flüssigkeiten auf Microtiter-Platten, die z.B. als ELISA-Platten (enzyme-linked immunosorbent assay)-ver- wendet werden. Die Platten weisen z.B. 96 oder 384 Mikrovertiefungen auf. Der Roboter umfasst einen Pipettierkopf, der an einem Positionierungssystem befestigt ist. Der Pipet- tierkopf nimmt an einer Parkstation ein Tablett mit Pipettenspitzen auf und fährt dieses dann mit Hilfe der Positionierungsvorrichtung zur Mikrotiter-Platte, wo die Reagenzien in die Mikrovertiefungen der Platte eindosiert werden. Die Pipettenspitzen, die ein Volumen von 50 bis 250 μl aufweisen, können nach der Flüssigkeitsdosierung abgeworfen werden. Der Pipettierkopf fährt dann zur Parkstation und übernimmt ein neues Tablett mit Pipettenspitzen. Ähnliche Vorrichtungen sind in der DE 100 40 849 und in der US 2004/0,097,010 offenbart.
Derartige aus dem Stand der Technik bekannte Vorrichtungen sind nicht zur Durchführung von Nachweisreaktionen an einer Vielzahl von auf Objektträgern angeordneten Zell- oder Gewebeproben geeignet. Die Neubeladung des Tabletts mit Pipetten-Spitzen nach jedem einzelnen Dosiervorgang über einer einzelnen Mikrotiter-Platte ist extrem zeitaufwendig. Bei der Neubeladung werden die Pipetten-Spitzen abgeworfen und durch neue ersetzt, wodurch die Kosten des Verfahrens deutlich erhöht werden.
In Anbetracht des vorgenannten Standes der Technik besteht eine Aufgabe der vorliegenden Erfindung in der Bereitstellung einer automatischen Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern, wobei oben beschriebenen Nachteile vollständig bzw. weitestgehend möglich beseitigt werden sollen. Der vorliegenden Erfindung liegt weiterhin die Aufgabe zu Grunde, eine Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf Objektträger bereitzustellen, mit der Nachweisreaktionen an einer Vielzahlzahl von Gewebeproben, die sich auf einer Vielzahl von Objektträgern befinden, effektiv und zeitsparend durchgeführt werden können, um den erhöhten Bedarf an immunhistochemischen und molekularbiologischen Untersuchungen an Zellen und Geweben im Gesundheitssystem Res- sourcen-schonend bewältigen zu können. Weitere Aufgaben der vorliegenden Erfindung ergeben sich für den Fachmann unmittelbar aus der nachfolgenden Beschreibung der Er- findung.
Kurze Beschreibung der Erfindung
Die vorliegende Erfindung betrifft eine automatische Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern, umfassend
Haltevorrichtungen für eine Vielzahl von Objektträgern, welche jeweils eine Vielzahl von voneinander abgegrenzten Vertiefungen aufweisen, die zur Aufnahme von Zelloder Gewebeproben geeignet sind, einen Dosierkopf mit einer Vielzahl von Vorratsbehältern, welche zur Aufnahme von flüssigen Reagenzien geeignet sind und an dem den Reaktionszonen zugewandten Ende / Seite ein Dosierventil zur Dosierung und Aufbringung der Reagenzien in die Vertiefungen aufweisen, und eine Positionierungsvorrichtung zur Positionierung der Vorratsbehälter des Dosierkopfes über den jeweiligen Reaktionszonen der Objektträger.
Die vorliegende Erfindung betrifft weiterhin einen Dosierkopf zur Verwendung in einer automatischen Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern, umfassend eine Vielzahl von Vorratsbehältern, welche zur Aufnahme von flüssigen Reagenzien geeignet sind und an einem Ende / Seite ein Dosierventil zur Dosierung und Aufbringung der Reagenzien auf die Objektträger aufweisen, und welche an dem den Dosierventilen gegenüberliegenden Ende eine gasdichte Abdeckung aufweisen, wobei das mittlere Volumen der Vorratsbehälter mindestens 1 ,5 ml und vorzugsweise mindestens 2,5 ml ist.
Die vorliegende Erfindung betrifft weiterhin ein Verfahren zur Dosierung von Reagenzien auf einer Vielzahl von Objektträgern mit Hilfe einer erfindungsgemäßen automatischen Vorrichtung, worin die Objektträger in die Vorrichtung eingesetzt werden, die Vorratsbehälter mit Reagenzien befüllt werden, der Dosierkopf mit Hilfe der Positionierungsvorrichtung über den jeweiligen Vertiefungen des Objektträgers positioniert wird, und das Reagenz in die Vertiefung eindosiert wird, wobei das Volumen des Reagenz kleiner ist als das Volumen der Vertiefung.
Detaillierte Beschreibung der Erfindung
Die vorliegende Erfindung betrifft eine automatische Vorrichtung zur Dosierung von Reagenzien auf einer Vielzahl von Objektträgern, welche jeweils eine Vielzahl an voneinander abgegrenzten Vertiefungen aufweisen. Die Vertiefungen sind zur Aufnahme von Gewebeoder Zellreaktionen geeignet, an denen dann durch die zudosierten Reagenzien insbesondere immunhistochemische oder molekurlarbiologische Nachweisreaktionen durchgeführt werden.
Vertiefungen, welche mit einer Gewebe- oder Zellproben bestückt sind, werden als Reaktionszonen bezeichnet. Der Begriff „Vielzahl" bedeutet im Rahmen dieser Erfindung mindestens drei, vorzugsweise mindestens sechs und insbesondere mindestens achtzehn.
Objektträger, die zur Verwendung in der vorliegenden Erfindung geeignet sind, umfassen z.B. eine vorzugsweise transparente, ebene Basisplatte, auf der ein z.B. gleichmäßiges Raster von Stegen angeordnet ist, um voneinander abgegrenzte Vertiefungen bereit zu stellen. Der Objektträger sollte aus einem homogenen, transparenten Material wie z.B. aus Glas oder Polyethylen, einer Teflonschicht oder einer Schicht aus einem anderen vorzugsweise hydrophoben Polymermaterial bestehen, in die die Vertiefungen eingelassen sind. Dabei können die Vertiefungen in eine ursprünglich homogen dicke Schicht z.B. durch Bohrungen oder Fräsungen eingebracht werden, oder die Objektträger können einstückig z.B. durch Spritzgussverfahren hergestellt werden. Der Objektträger kann aber auch eine vorzugsweise gleichmäßig dicke Basisschicht aufweisen, auf die rasterförmige Stege aufgebracht werden, in dem ein geeigneter hydrophober, polymerisierbarer Precursor eines Polymers z.B. durch ein Siebdruckverfahren aufgebracht und anschließend polymerisiert wird.
Die Objektträger weisen eine Vielzahl von z.B. 6, 18, 24, 72 oder auch mehr Vertiefungen auf. Die Querschnittsflächen der Vertiefungen können sowohl regelmäßig als auch unregelmäßig sein, wobei regelmäßige Querschnittsflächen wie z.B. Quadrate, Rechtecke oder Kreise bevorzugt sind. Die Aussparungstiefe der Vertiefungen kann gegebenenfalls über die Querschnittsfläche variieren, ist aber vorzugsweise konstant. Vorzugsweise weisen alle Vertiefungen eines Objektträgers die gleiche Form auf. Darüber hinaus können in der erfindungsgemäßen Vorrichtung auch Standart-Objektträger verwendet werden.
Die Abmessungen der Querschnittsfläche und der Aussparungstiefe der Vertiefungen wird so gewählt, dass die Vertiefungen vorzugsweise ein Volumen zwischen 5 und 150 μl aufweisen.
Die Abmessungen einer Vertiefung mit quadratischem oder rechteckigem Querschnitt können z.B. vorzugsweise zwischen 3 bis 10 mm x 3 bis 10 mm betragen, und die Tiefe kann zwischen 0,1 und 2,0 mm variieren.
Die Vertiefungen auf den Objektträgern sind durch Stege voneinander abgetrennt, die regelmäßig oder unregelmäßig geformt sein können und eine gleichmäßige oder ungleichmäßige Dicke aufweisen können. Die Stege bilden vorzugsweise ein regelmäßiges Raster, das z.B. bei Vertiefungen mit rechteckigem oder quadratischem Querschnitt vorzugsweise von im Wesentlichen senkrecht aufeinander stehenden Stegen gebildet wird.
Die Abmessungen der Objektträger entsprechen vorzugsweise denen handelsüblicher Formate. Die Objektträgerabmessungen sind besonders bevorzugt etwa 26 mm x 75 mm. An einem der Enden des Objektträgers ist vorzugsweise ein Beschriftungs- oder Identifikationsfeld vorgesehen, das z.B. beschriftet werden oder mit ein- oder zweidimensionalen Code-Etiketten, RFID-Chips oder dgl. versehen werden kann.
Beispielsweise weist ein Objektträger 18 Vertiefungen auf. Die Vertiefungen sind in einer regelmäßigen Matrix aus 3 Spalten und 6 Reihen angeordnet. Die Vertiefungen sind in den Zeilen äquidistant angeordnet. Der Abstand zwischen den einzelnen Reihen ist jeweils gleich. Ein bevorzugtes Design eines Objektträgers mit 6 Vertiefungen kann von dem vorgenannten Objektträger mit 18 Vertiefungen in vorteilhafter weise dadurch abgeleitet werden, dass die in einer Zeile angeordneten 3 Vertiefungen zu einen Vertiefung zusammen- gefasst werden. Dadurch ergibt sich ein Streifen-Design von 6 zueinander parallel angeordneten streifenförmigen Vertiefungen. Die Vertiefung auf dem Objektträger wird von Stegen und einer Basisplatte gebildet, wobei die Stege eine Höhe aufweisen, die der Auspa- rungstiefe der Vertiefungen entspricht. Die Höhe der Stege ist höher als die Höhe der Trägerfolie und der darauf angeordneten Gewebe- oder Zellprobe. Das Verhältnis aus diesen Abmessungen ist vorzugsweise mindestens 1 ,2, insbesondere mindestens 1 ,3 und besonders bevorzugt nicht kleiner als 1 ,4. Vorzugsweise übersteigt das Volumen der Vertiefung die Summe der das Volumina aus Gewebe- oder Zellprobe und Trägerfoliensegment mindestens um das 1,5-fache und besonders bevorzugt mindestens um das 2-fache.
Zur Herstellung flächiger Gewebeschnitte werden vorzugsweise FFPE-Gewebe- oder Zellmaterialien verwendet, von denen mit Hilfe eines Mikrotoms flächige Gewebe- oder Zellschnitte mit einer Dicke von z.B. 0,5 bis 5 μm und insbesondere etwa 0,5 bis 2,5 μm erhalten werden. Die flächigen Gewebeschnitte werden vorzugsweise mechanisch verstärkt, indem sie auf eine insbesondere verformbare Trägerfolie wie z.B. eine Polycarbo- natfolie aufgebracht werden. Anschließend können Zell- bzw. Gewebesegmente aus dem flächigen Gewebeschnitt z.B. mit einer Stanzvorrichtung ausgestanzt werden. Dabei wird die Ausdehnung der Gewebesegmente in der Ebene senkrecht zur ihrer Dicke so gewählt, dass die Gewebesegmente in einem nachfolgenden Schritt von einer Separiereinheit aufgenommen und in den Vertiefungen platziert werden können. Die Gewebesegmente können in den Vertiefungen z.B. mit Hilfe eines UV-härtbaren Klebstoffs fixiert werden.
Unter Verwendung eines geeigneten hydrophoben Rasters können die Volumina aus Gewebe und Folie und Kleber auch nahezu gleich sein (fast ebene Fläche), denn die aufgebrachten Flüssigkeiten würden durch die hydrophoben Kräfte aufgrund der Oberflächenspannung immer über dem Gewebe im Reaktionsfeld möglicherweise vorgewölbt verbleiben, so dass es zu keiner Kontamination kommt. Eine nahezu plane Fläche hat den Vorteil, dass beim abschließenden Eindeckvorgang (Permanenteindeckung der Objektträger) relativ wenig Eindeckmedium verwendet werden muss; letzteres enthält Lösungsmittel, welches mit der Zeit verdampft, wodurch Schrumpfungsartefakte entstehen, der Objektträger zieht dann Luft und kann nicht mehr mikroskopiert werden. Luft weist einen anderen Brechungsindex als Glas bzw. Eindeckmedium auf, während das Eindeckmedium einen glasähnlichen Brechungsindex besitzt.
Da die in der Paraffin-Matrix eingebetteten, Formalin-fixierten Gewebe- oder Zellmaterialien, aus denen die flächigen Gewebeschnitte erhalten werden, typischerweise inhomogen sind, d.h. in drei Dimensionen unregelmäßig geformte kranke bzw. gesunde Bereiche aufweisen, werden vorzugsweise Gewebe- oder Zellsegmente aus mehreren flächigen Gewebeschnitten ein und desselben Gewebe- oder Zellmaterials ausgestanzt und in Vertiefungen von Objektträgern überführt. Auf diese Weise wird sichergestellt, dass ein repräsenta- tives Bild der Gewebeprobe untersucht wird. Gegebenenfalls können die flächigen Gewebe- oder Zellschnitte vor der Ausstanzung von Gewebe- oder Zellsegmenten von der Pathologin bzw. dem Pathologen visuell inspiziert werden, um z.B. flächige Schnitte, die lediglich Paraffin und praktisch keinerlei Gewebe- oder Zellmaterial enthalten, oder flächige Gewebeschnitte, die im wesentlichen nur gesundes Gewebe- oder Zellmaterial enthalten, auszusondern.
In der WO 2007/134,814 wird beispielsweise eine automatisch arbeitende Vorrichtung zur reproduzierbaren Herstellung von auf Objektträgern angeordneten zu untersuchenden Zelloder Gewebeproben offenbart. Auf diese Anmeldung, der insbesondere die Figuren 1 und 2 der vorliegenden Anmeldung entnommen sind, wird in der vorliegenden Anmeldung vollumfänglich Bezug genommen.
Die Vorrichtung weist Haltevorrichtungen zur Aufnahme einer Vielzahl, d.h. von einem bis 200 Objektträgern auf. Die Haltevorrichtungen können vorzugsweise an einem oder mehreren Tabletts befestigt sein, die dann z.B. außerhalb der Vorrichtung mit Objektträgern beladen und in die Vorrichtung eingesetzt werden können. Es ist natürlich auch möglich, dass die Haltevorrichtungen bzw. die Tabletts fest mit der Vorrichtung verbunden sind, sodass die Objektträger dann direkt in diese in der Vorrichtung befindlichen Haltevorrichtungen eingesetzt werden.
Die Größe, Form und Ausgestaltung der Tabletts ist variabel. So können die Tabletts z.B. einstückig oder mehrstückig ausgebildet sein. Einstückig ausgebildete, im wesentlichen rechteckige Tabletts können z.B. einen im wesentlichen rechteckigen Rahmen aufweisen, der mehrere parallel nebeneinander angeordnete Leisten oder ein rasterförmiges Gitter aufweist, auf denen die Objektträger befestigt werden. Wenn die Größe eines solchen einstückigen Tabletts der Größe des Reaktionsraums der Vorrichtung entspricht, muss pro Analysevorgang nur ein Tablett in die Vorrichtung eingesetzt werden, wodurch die Handhabung der Vorrichtung erleichtert wird. Bei mehrstückig ausgebildeten Tabletts sind z.B. der Rahmen des Tabletts und die einzelnen Leisten oder gitterförmigen Raster oder Rasterteile nicht fest, sondern lösbar miteinander verbunden. Dadurch kann die Beladung der Tablettteile erleichtert werden, während nur ein Tablett in die Vorrichtung eingesetzt werden muss. In einer anderen Ausführungsform können zwei oder mehr Tabletts in die Vorrichtung eingesetzt werden. Dies kann z.B. vorteilhaft sein, wenn Objektträger an verschiedenen Arbeitsplätzen mit Zell- oder Gewebeproben beladen werden. Die Objektträger werden durch die Haltevorrichtungen lösbar mit dem einen oder mehreren Tabletts bzw. mit der Vorrichtung verbunden, wobei insbesondere mechanische Haltevorrichtungen zum Einsatz kommen. Die Objektträger können dabei z.B. durch Clips oder ähnliche Haltevorrichtungen befestigt werden. Es können weiterhin mechanische Befestigungssysteme mit weiblichen und männlichen Befestigungselementen zum Einsatz kommen, wobei ein Befestigungselementtyp auf dem Objektträger und der andere auf dem oder den Tabletts bzw. der Vorrichtung angeordnet sind. So können die Objektträger z.B. kreisförmige Durchgangslöcher aufweisen, die in entsprechende Stifte auf dem oder den Tabletts bzw. der Vorrichtung eingreifen. Die Objektträger können z.B. auch auf der unteren, den Reaktionszonen gegenüberliegen Seite z.B. pilzförmige Mikrohaken aufweisen, die in einer faserförmiges Vlies eingreifen, das auf dem oder den Tabletts bzw. der Vorrichtung angeordnet ist. Durch entsprechende Positionierungs- oder Leitelemente kann dabei vorzugsweise sichergestellt werden, dass die Objektträger im Wesentlichen immer in der gleichen Orientierung auf der Vorrichtung befestigt werden.
Die durch die Anordnung der Haltevorrichtungen bedingte Anordnung der Objektträger auf dem oder den Tabletts oder in der Vorrichtung kann regelmäßig oder unregelmäßig sein, wobei eine regelmäßige Anordnung bevorzugt ist. In einer besonders bevorzugten Ausführungsform ist die Anordnung der Haltevorrichtungen so gewählt, dass die Objektträger eine regelmäßige, rechtwinklige Matrix mit Reihen und Spalten bilden. Dabei werden die Objektträger vorzugsweise so eingesetzt, dass die Beschriftungsfelder, die z.B. einen Code oder ähnliche Identifizierungselemente enthalten können, immer in die gleiche Richtung zeigen.
Die Vorrichtung umfasst vorzugsweise eine Vorrichtung, mit der einzelne Objektträger bzw. Gruppen von Objektträgern durch Vibration bewegt werden können, wodurch in die Reaktionszonen eindosierte Reagenzien durchmischt werden können. Dadurch kann weiterhin eine gleichmäßige Benetzung der Gewebe- und Zellproben in den Reaktionszonen mit den Reagenzien befördert werden. Weiterhin können so auch Spülmittelreste, ggf. auch nach Drehung der drehbar gelagerten Objektträger um z.B. etwa 180° mechanisch abgeschüttelt werden.
Die Vorrichtung weist weiterhin bevorzugt eine Vorrichtung auf, um einzelne Objektträger oder Gruppen von Objektträgern zu erwärmen. Die Erwärmung kann z.B. im einfachsten Fall durch eine Raumluftbeheizung oder aber auch durch komplexere Vorrichtungen wie z.B. in der Nähe der Objektträger angeordnete elektrische Heizungen oder durch Beaufschlagung mit IR-Strahlung erfolgen. Eine Erwärmung der Objektträger und damit der Reaktionszonen ist vorteilhaft, da dadurch die für die Inkubationen der Gewebe- oder Zeil- Proben mit Antikörpern benötigt Zeit verkürzt werden kann, wobei die Temperatur durch die Denaturierung der Antikörper bei ca. 42°C bzw. die Ablösung der Hybride oberhalb der Schmelztemperatur-begrenzt ist. Für die Immunhistochemie und in der Regel -für die FISH- Analysen sind Betriebstemperaturen von ca. 37-42 0C vorteilhaft. Bei ISH-Analysen können demgegenüber höhere Temperaturen gefahren werden. Eine Beschleunigung der Reaktionen kann auch durch eine Erhöhung der Konzentration der Reagenzien erzielt werden.
Immunhistochemische Antikörperinkubationen benötigen typischerweise einen Zeitraum von 20 bis 60 min (durchschnittlich 30 min), während molekularbiologische Hybridisierungen typischerweise viele Stunden oder Tage benötigen. Daher ist die gleichzeitige Durchführung von immunhistochemischen und molekularen Analysen in der Regel nicht sinnvoll. Weiterhin sollten für immunhistochemische Analysen typischerweise zwischen 100 und 200 Antikörper verfügbar sein, während für FISH- und ISH-Analysen lediglich typischerweise 10 bis 30 Sonden benötigt werden. Daher werden für immunhistochemische bzw. molekulare Analysen vorzugsweise verschiedene Dosierköpfe verwendet. Im Hinblick auf diese Unterschiede ist es ggf. vorteilhaft, für immunhistochemische bzw. molekulare Analysen verschiedene, im Hinblick auf die jeweiligen Erfordernisse optimierte erfindungsgemäße Vorrichtungen zu verwenden. Bevorzugt ist auch eine erfindungsgemäße Vorrichtung mit zwei Submodulen, wobei Teile der Hardware und die Software vorzugsweise parallel genutzt werden können.
Die Haltevorrichtungen sind vorzugsweise so angeordnet, dass sich die Oberseiten der Objektträger mit den Vertiefungen/ Reaktionszonen im Wesentlichen in einer Ebene befinden. Dies hat den Vorteil, dass die Positionierungsvorrichtung, die den Dosierkopf trägt, lediglich zweidimensionale Bewegungen ermöglichen muss. Die Positionierungsvorrichtung ist vorzugsweise ein herkömmliches kartesisches X/Y-System, das z.B. Schrittmotoren aufweist. Typischerweise ist eine Positioniergenauigkeit von ± 0,25 mm ausreichend.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung umfasst weiterhin einen an der Positionierungsvorrichtung befestigten Dosierkopf mit einer Vielzahl von Vorratsbehältern, welche zur Durchführung von Reaktionen wie z.B. Färbe- Nachweisreaktionen geeignete flüssige Reagenzien enthalten. Der Dosierkopf umfasst vorzugsweise zwischen 1 bis 288, vorzugsweise ein Vielfaches von 6, Vorratbehälter auf.
Die Vorratsbehälter weisen jeweils ein den Vertiefungen des darunter befindlichen Objektträger zugewandtes Ende auf, das jeweils mindestens ein Dosierventil mit einer Auslassvorrichtung zur Dosierung und Einbringung der Reagenzien in die Vertiefungen bzw. Reaktionszonen aufweist. An dem den Dosierventilen gegenüberliegenden Ende weisen die Vorratsbehälter vorzugsweise gasdichte Verschlüsse oder Deckel auf. Dabei können die Vorratsbehälter individuell mit einem gasdichten Deckel versehen sein, oder mehrere oder vorzugsweise alle Vorratsbehälter können einen gemeinsamen gasdichten Deckel aufweisen. Der Deckel bzw. die Deckel weisen vorzugsweise mit Einlassventilen versehene Anschlüsse auf, an die über eine bzw. ggf. mehrere Leitungen ein Gasüberdruck angelegt werden kann. Dabei werden die Reagenzien in den Vorratsbehältern vorzugsweise mit einem konstanten Gasüberdruck beaufschlagt, sodass die flüssigen Reagenzien bei Öffnung der Dosierventile an dem anderen Ende der Vorratsbehälter mit konstanter Geschwindigkeit in die Vertiefungen bzw. Reaktionszonen abgegeben werden können. Als Gas kann Luft oder ein inertes Gas wie z.B. N2 verwendet werden. Dadurch kann die gewünschte zu dosierende Menge des Reagenzes bei entsprechender Eichung durch die Öffnungszeit des Dosierventils bestimmt werden.
Der Dosierkopf weist nach einer vorteilhaften Weiterbildung eine Dosierkontrolle auf.
Dabei wird vorgeschlagen am oder unterhalb des Ausgangs der Dosierventile insbesondere mit optischen Sensoren zu prüfen, ob das abdosierte Reagenz auch tatsächlich abgegeben wurde. Dabei wird über die Unterbrechung eines Lichtstrahls, insbesondere Infrarot- Lichtstrahls, bei einsetzender Abdosierung zum einen das Abdosieren selbst kontrolliert, d.h., ob der Dosiervorgang erfolgreich in Gang gesetzt und beendet wurde. Um ein sicheres beispielsweise farbunabhängiges Ausgangssignal zu erhalten wird dabei der Anstieg (Volumen über Zeit( dV/dt)) beispielsweise mittels eines A/D- Wandlers (Analog-Digital- Wandlers) ausgewertet. Zudem ist zusätzlich auch eine zeitliche Auswertung des Dosierungsvorgangs möglich, wobei die Zeitspanne der Unterbrechung des Lichtstrahls gemessen wird und so anhand der gemessenen Unterbrechungsdauer und dem eingestellte und überwachten Systemdruck das abgegebene Volumen berechnet wird. Dies ist insofern vorteilhaft, da dadurch die Betriebssicherheit der Vorrichtung erhöht wird und eine Rückmel- dung des jeweiligen Befüllungsstandes des einzelnen Vorratsbehälters ermöglicht werden kann.
Alternativ ist auch denkbar, anstelle der optischen Durchflusskontrolle ein kapazitives Durchflussmesssystem vorzusehen, bei welchem eine messbare Kapazitätsänderung erkannt und zur Kontrolle des Dosiervorgangs eingesetzt wird.
Die Dosierventile sind vorzugsweise in einem Ventilblock am unteren Ende der Vorratsbehälter angeordnet. Die Dosierventile sind vorzugsweise nicht mit Dosierspitzen versehen, da sonst ein Totraum-Volumen (nämlich das der Dosierspitze) entstünde. Die Dosierung erfolgt also vorzugsweise über die Löcher einer Lochplatte, die unter den Ventilen angegeben ist. Gegebenenfalls kann die Auslassöffnung des Dosierventils Mikro- oder Dosiernadeln aufweisen, deren Durchmesser deutlich kleiner als der Querschnitt der Reaktionszonen bzw. der Vorratsbehälter des Dosierkopfes ist, um das Totraumvolumen zu begrenzen.
Ferner kann eine optische Blasenkontrolle vorgesehen sein, um nicht erwünschte Luftblasen im Eluat zu ermitteln.
Die Vorratsbehälter des Dosierkopfes weisen eine Querschnittsfläche und eine dazu im Wesentlichen senkrechte Höhe zwischen den beiden Enden auf, die das Dosierventil bzw. den gasdichten Deckel aufweisen. Die Anordnung der Vorratsbehälter in dem Dosierkopf ist vorzugsweise in Anpassung an das jeweils vorliegende Design der Objektträger so zu wählen, dass einander benachbarte Vorratsbehälter über mindestens zwei vorzugsweise benachbarten Vertiefungen bzw. Reaktionszonen der Objektträger positioniert werden können. Dabei ist weiter die Querschnittsfläche benachbarter Vorratsbehälter in Anpassung an die Dimensionen der Reaktionszonen und der dazwischen liegenden Stege so zu wählen, dass zwei Vertiefungen bzw. Reaktionszonen von den beiden benachbarten Vorratsbehältern simultan mit Reagenzien beaufschlagt werden können, wobei die beiden Reaktionszonen einander vorzugsweise benachbart sind. Gegebenenfalls kommt aber auch eine simultane Beaufschlagung von versetzt angeordneten Reaktionszonen in Betracht. Dabei ist die Anordnung der Vorratsbehälter in dem Dosierkopf besonders bevorzugt so zu wählen, dass mindestens drei, vorzugsweise mindestens vier und ganz besonders mindestens sechs benachbarte Vertiefungen bzw. Reaktionszonen simultan von Vorratbehältern mit Nachweisreagenzien beaufschlagt werden können. Erfindungsgemäße Vorrichtungen, die ein solches multiparalleles Dosieren von Reagenzien in verschiedene Vertiefungen bzw. Reaktionszonen von einem oder mehreren, im Reaktionsraum angeordneten Objektträgern ermöglichen, sind besonders bevorzugt. Durch die multiparallele Betriebsweise wird eine erhebliche Beschleunigung der Analysenzeit und damit eine deutliche Verringerung der Analysenkosten erreicht. Darüber hinaus können die multiparallel applizierten Reagenzien vorzugsweise in algorithmischen Panels zusammen- gefasst werden, wodurch eine besonders effektive und zielgerichtete pathologische Diagnostik ermöglicht wird. Die erfindungsgemäße Vorrichtung ist damit sehr viel besser als bisher im Stand der Technik verfügbare Pipettier-Automaten für Reihenuntersuchungen im Gesundheitswesen geeignet.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung erlaubt es aber auch, „Standart-Objektträger" mit jeweils nur einer Probe ohne Einschränkung und bei deutlich geringeren Kosten zu bearbeiten. Dabei wird über dem Probenmaterial nur ein Ventil geöffnet und abdosiert, so dass zu den erwähnten Vorteilen vollständige Flexibilität hinzukommt. So könnte es beispielsweise notwendig sein, dass ein sehr heterogenes Gewebe nicht geteilt werden kann und der Schnitt „im Ganzen" bearbeitet werden muss; öder es könnte sein, dass Fremdschnitte bearbeitet werden müssten, die nicht weiter manipuliert werden können.
Das Volumen der Vorratsbehälter wird durch deren Querschnittsfläche und deren Höhe, d.h. den Abstand zwischen dem vorzugsweise mit einem gasdichten Deckel versehenen Ende und dem gegenüberliegenden, von einem Dosierventil begrenzten Ende, bestimmt. Das Volumen der Vorratsbehälter ist dabei so dimensioniert, dass es die Durchführung von vorzugsweise einer bis 200 einzelnen Reaktionen wie z.B. ABC-Färbe- Nachweisreaktionszyklen gestattet, ohne dass eine erneute Befüllung des Vorratsbehälters erforderlich wäre. Dies stellt einen weiteren erheblichen Vorteil gegenüber aus dem Stand der Technik bekannten Vorrichtungen dar, bei denen die Pipettenspitzen typischerweise nach erfolgter Einmal-Dosierung abgeworfen werden und für den nächsten Pipettiervor- gang neue Pipetten-Spitzen geladen werden müssen. Bei den erfindungsgemäßen Vorrichtungen entfällt damit das extrem zeitaufwendige Fahren des Pipettierkopfes an die Nachladestation nach jedem Dosiervorgang und das Wegwerfen der Einmal-Pipettenspitzen, das aus Kosten- und Umweltgründen unerwünscht ist. Die erfindungsgemäße Vorrichtung kann damit erheblich zeiteffektiver und damit auch kostengünstiger betrieben werden als herkömmliche Pipettier-Vorrichtungen. Die erfindungsgemäße Vorrichtung ist damit sehr viel besser als bisher im Stand der Technik verfügbare Pipettier-Automaten für Reihenuntersuchungen im Gesundheitswesen geeignet
Die Vorratsbehälter des Pipettierkopfes werden vorzugsweise so dimensioniert, dass alle ggf. mit mindestens einem Tablett in die Vorrichtung eingespannten Objektträger mit Nachweisreagenzien beaufschlagt werden können, die aus den Vorratsbehältern entnommen werden, ohne dass eine zwischenzeitliche Befüllung der Vorratbehälter erforderlich wäre. Nimmt man z.B. an, dass die Vorrichtung ein Tablett mit 96 (8 x 12) Objektträgern aufnehmen kann, dass jeder Objektträger 18 (3 x 6) Reaktionszonen mit einem Volumen von jeweils ca. 10 bis 20 μl hat und dass pro Reaktionszone - ohne Berücksichtigung der Spülvorgänge - Reagenzien in bis zu 6 Schritten aufgebracht werden müssen, ergibt sich für das Gesamtvolumen des Dosierkopfes, d.h. für die Summe der Volumina aller Vorratsbehälter ein Volumen von etwa 100 bis 200 ml. Geht man davon aus, dass etwa 120 Reagenzien in 120 Vorratsbehältern benötigt werden, ergibt sich bei Annahme eines gleichmäßigen Verbrauchs aller Reagenzien ein Volumen pro Vorratsbehälter von etwa 5 ml. Bei den 6er Objektträgern werden ca. 30 bis 50 μl verwendet.
Unabhängig von diesen Betrachtungen werden die Vorratsbehälter vorzugsweise so ausgelegt, dass ihr mittleres Volumen mindestens 1 ,5 ml, insbesondere mindestens 2,5 ml, besonders bevorzugt mindestens 4 ml und ganz besonders bevorzugt mindestens 5 ml beträgt. Die Vorratsbehälter können dabei alle das gleiche Volumen aufweisen.
Da einzelne Reagenzien wie z.B. das Sekundärantikörper-Reagenz und z.B. die Spülflüssigkeit, die im wesentlichen für alle Färbereaktionen gleich sind, häufiger und in größeren Volumina benötigt werden als andere Reagenzien (wie z.B. die Primär-Reagenzien bei der ABC-Methode), können die häufiger benötigten Reagenzien mehrfach im Dosierkopf oder in größeren Gefäßen im Außenbereich des Dosierkopfes untergebracht werden. Beispielsweise ist denkbar, größere Volumina aufnehmende Vorratsbehälter im oder am Gehäuse der Vorrichtung selbst anzuordnen, so dass diese und die darin bevorratete Sekundärantikörper- oder Spülflüssigkeit nicht mit dem Dosierkopf selbst mitbewegt werden müssen. Um die geforderten größeren Volumina an den Nachweisreagenzien (Sekundär- und ggf. Tertiärreagenz) sowie Substrat, Gegenfärbungs-Reagenz oder Spüllösung dosieren zu können, können diese über mehrere Schläuche geführt werden, wobei die Schläuche über Schleppketten durch das kartesische System bis hin zu einer Position nahe dem Dosierkopf gezogen werden. Insbesondere wird dabei vorgeschlagen, am Dosierkopf selbst ent- _
sprechende Halterungen für die Schlauchauslässe vorzusehen, so dass diese mit dem Dosierkopf über die darunter befindlichen Objektträger geführt werden können. Es ist denkbar, am Schlauchauslass selbst wiederum einen Ventilkopf gegebenenfalls mit Dosierkontrolle vorzusehen, über welchen die Dosierung der benötigten Volumina an Nachweisreagenzien (Sekundär- und ggf. Tertiärreagenz) sowie Substrat, Gegenfärbungs- Reagenz oder Spüllösung erfolgen kann. Alternativ ist auch denkbar, den Ventilkopf am Vorratsbehälter selbst anzuordnen, insbesondere um das durch den Dosierkopf zu transportierende Gewicht gering zu halten. Dabei ist vorzugsweise vorzusehen, dass diese Schlauchsysteme gespült werden können.
Falls die Vorratsbehälter nicht alle das gleiche Volumen haben, weist der kleinste Vorratsbehälter vorzugsweise ein Volumen von ca. 5 ml oder mehr auf.
Der Dosierkopf kann in einer besonders vorteilhaften Weiterbildung als .Sandwich' mit wechselbaren Platten bzw. Blöcken aufgebaut sein und z.B. einen abdichtenden Deckel, einen zu einer Einheit zusammengefassten Block aus Vorratsbehältern, einen Block aus Dosierventilen und/ oder einen Block aus Durchflusssensoren aufweisen. Die einzelnen Platten bzw. Blöcke können bei Bedarf, beispielsweise bei verschlissenen Ventilen oder bei durch Ablagerungen dauerhaft verschmutzten Vorratsbehältern gegen andere Platten bzw. -blocke ausgetauscht werden. Dies erlaubt eine hohe Wartungsfreundlichkeit und eine Mo- dularität für eventuelle Erweiterungen. Auch ermöglicht diese modulare Austauschmöglichkeit der einzelnen Platten bzw. Blöcke des Dosierkopfes einen kostensparenden Betrieb der erfindungsgemäßen Vorrichtung, da insbesondere bei einer Verschmutzung der Vorratsbehälter des Dosierkopfes lediglich diese, aber nicht die kostenintensiven Dosierventile ausgetauscht werden müssen.
Der Dosierkopf ist vorzugsweise lösbar in eine Dosierkopfhalterung eingesetzt. Dadurch wird ein Austausch von z.B. entleerten Dosierköpfen oder die Einbringung eines Dosierkopfes mit anderen Reagenzien leicht möglich. Auch der Dosierkopf selbst kann mittels vorzugsweise maschinenlesbarer Codes markiert und damit identifizierbar sein.
Die Vorratsgefäße können bei Bedarf mit einem Füllstandssensor versehen sein. Alternativ dazu kann das Gesamtsystem über einen Füllstandserfassungsvorrichtung verfügen, beispielsweise in Form eines Triangulationssensors. Nach Entfernen der oberen Abdichtung der Vorratsbehälter des Dosierkopfes (Deckel), können die einzelnen Vorratsbehälter des Dosierkopfes unter der Füllstandserfassungsvorrichtung hindurch gefahren werden und der Füllstand der einzelnen Vorratsbehälter auf einfache und effektive Weise ermittelt werden.
In einer bevorzugten Ausführungsform können in der Dosierkopfhalterung gehalterte und teilentleerte oder vollständig entleerte Dosierköpfe bzw. die im Dosierkopf gehalterten Vorratsbehälter von dem Positionierungssystem zu einer Nachfüllstation gefahren werden. Um ein manuelles Nachfüllen der relativ kleinen Volumina im Dosierkopf und damit eine Fehlerquelle (Vertauschen von Reagenzien bei dem manuellen Nachfüllen) zu vermeiden, ist die Nachfüllstation vorzugsweise automatisiert betreibbar und wird von einer entsprechenden Software unterstützt. Der auf dem kartesischen System montierte Dosierkopf wird dabei unter eine feststehende Nachfüllstation bewegt, welche mit größeren Vorratsbehältern der verwendeten Reagenzien versehen ist. Automatisiert und individuell werden dann die einzelnen Vorratsbehälter im Dosierkopf wieder befüllt. Dabei sind die zuvor aus den einzelnen Vorratsbehältern abdosierten Volumina der Steuerung der Vorrichtung bekannt (remanent gespeichert), insbesondere durch Erfassung des Abflusses durch die Dosierkontrolle und/ oder die Füllstandssensoren in den einzelnen Vorratsbehältern. Vor diesem Füllvorgang wäre dabei lediglich die obere Abdichtung der Vorratsbehälter (Deckel) zu entfernen, was grundsätzlich auch automatisch erfolgen kann.
Die Vorratsbehälter des Dosierkopfes sind vorzugsweise nummeriert. In einer bevorzugten Ausführungsform weisen die einzelnen Vorratsbehälter jeweils Identifikationselemente auf und können einzeln oder in Gruppen angesteuert werden.
Immunhistochemische oder molekularbiologische Nachweisreaktionen sind in der Regel Mehrschritt-Reaktionen, wobei nach jedem Reaktionsschritt typischerweise ein Spülschritt folgt. So weist z.B. die immunhistochemische Standard-Färbereaktion, die sogenannte ABC-Methode (Avidin-Biotin-Complex-Methode), mindestens 3 Reaktionsschritte auf (Dosieren mit Primärantikörper, Sekundärantikörper und Tertiärreagenz), wobei nach den einzelnen Reaktionsschritten jeweils beispielsweise 3 Spülschritte erfolgen und sich an jeden Spülschritt jeweils vorzugsweise ein leichter Trocknungsschritt (nicht Austrocknen) anschließt. Auch die molekularbioligischen Standardverfahren ISH (In-situ Hybridisierung) bzw. FISH (Fluoreszenz In-situ Hybridisierung) sind Mehrschrittverfahren.
In einer vorteilhaften Ausgestaltung der Vorrichtung der vorliegenden Erfindung ist zur Durchführung der Spülschritte unterhalb der Objektträgerebene eine mit Spülflüssigkeit gefüllte Spülwanne vorgesehen. In dieser Ausgestaltung sind die gegebenenfalls in Tabletts angeordneten Objektträger einzeln und/ oder zusammen mit anderen Objektträgern von einer ersten, zur Durchführung der Nachweisreaktionen geeigneten Position in eine zweite, in dem Behälter befindliche Position überführbar.
Vorteilhafterweise sind die Objektträger in einer matrixförmigen Anordnung aus' Reihen und Spalten angeordnet, wobei die Leisten mit Objektträgern, die die Spalten bilden, einzeln absenkbar sind und dadurch in Kontakt mit der Spülflüssigkeit gebracht werden können. Es können natürlich auch andere Teilbereiche der Objektträger-Matrix wie z.B. Reihen, Teile von Spalten etc. absenkbar angeordnet sein. Die Objektträger-Leisten, die die Spaltenbzw. Reihen bilden, können alternativ oder zusätzlich auch drehbar gelagert sein, so dass die Objektträger durch Drehen in die Spülflüssigkeit überführt werden können. Aus zeitökonomischen Gründen ist es vorteilhaft, dass einzelne Objektträger oder Gruppen von Objektträger bzw. der Objektträgern abgesenkt werden können, da dann nicht abgesenkte Objektträger weiterhin von dem Dosierkopf angesteuert und mit Reagenz beaufschlagt werden können. Zudem sollte vorzugsweise für einen bestimmten Reaktionsschritt die Einwirkzeit der Reagenzien auf die Gewebe- oder Zellproben in den einzelnen Reaktionszonen im Wesentlichen gleich sein.
Die unter der Objektträger-Ebene angeordnete Spülwanne kann beispielsweise aus rostfreiem Stahl (VA-Stahl) gefertigt sein. Sie besitzt vorzugsweise einen Zu- und Ablauf für die Spülflüssigkeit, um eine Kontamination der Reaktionszonen durch verunreinigte Spüllösung zu vermeiden. Die Spüllösung kann beispielsweise im Wesentlichen aus Wasser bestehen, dem zur Vermeidung von Keimbildung Detergentien und z.B. NaAcid zugesetzt werden können. Auch der ständige Austausch der Spüllösung dient der Vermeidung von Keimbildung.
Über einen Pegelsensor wir ein vorzugsweise konstanter Flüssigkeitspegel der Spülflüssigkeit in der Spülwanne eingestellt. Die Pegelhöhe ist einstellbar und kann z.B. an die Position der um 180° gedrehten Objektträgern mit den dann in Richtung Spülwanne zeigenden Reaktionszonen angepasst werden.
Der erfindungsgemäß vorgeschlagene Spülmechanismus mittels Überführen von einem oder mehreren Objektträgern in die Spülwanne mit einem großen Überschuss an Spülflüssigkeit stellt eine erhebliche Beschleunigung und Vereinfachung des Spülvorganges dar. Eine Kontamination durch Verschleppen der einzelnen Reagenzien von einem Objektträger auf einen anderen bei dieser Art des Spülvorganges wurde dabei nicht beobachtet, wenn das Volumen der Spülwanne ausreichend groß dimensioniert wird. Das Volumen der Spülwanne beträgt vorzugsweise mindestens das 100-fache des Volumens der gespülten Reaktionszonen. Nimmt man an, dass 10 Objektträger mit jeweils 18 Reaktionszonen, die jeweils ein Volumen von 50 μl aufweisen- gleichzeitig gespült werden, sollte das Volumen der Spülwanne mindestens etwa 1000 ml betragen. Unabhängig von dieser Abschätzung, kann die Spülwanne vorzugsweise ein Volumen von mindestens 500 ml, insbesondere von mindestens 1 I und ganz besonders von mindestens 1 ,5 I aufweisen.
Nach jedem Spülvorgang weisen die Reaktionszonen typischerweise Reste von Spülflüssigkeit auf, die vorzugsweise entfernt werden, um eine unerwünschte Verdünnung des Reagenz im nachfolgenden Reaktionsschritt oder gar ein Überflutung der Reaktionszone zu vermeiden; letzteres könnte zu einer Kontamination anderer Reaktionszonen des Objektträgers führen. Zur Entfernung der Spülflüssigkeit kann vorzugsweise ein Strom mit Luft oder einem insbesondere inerten Spülgas wie z.B. N2 über den Objektträgern erzeugt werden. Die Beaufschlagung mit Luft oder einem Spülgas wird vorzugsweise so durchgeführt, dass ein laminarer Luft- oder Gasstrom entsteht. Dabei ist allerdings wichtig, dass die Reaktionszonen nie komplett austrocknen, was zu einer Denaturierung der Zell- oder Gewebeproben führen könnte.
Um ein Austrocknen der Zell- oder Gewebeproben zu vermeiden, weist der Reaktionsraum vorzugsweise eine Abdeckung zum Verschließen des gesamten Reaktionsraums der Vorrichtung auf. Die Abdeckung wird besonders vorteilhaft in Kombination mit der unter der Ebene der Objektträger angeordneten Spülwanne eingesetzt. Durch eine leichte Erwärmung der Spülflüssigkeit in der Spülwanne verdampft etwas Spülflüssigkeit und gelangt in den Luft- bzw. Gasraum über der Ebene der Objektträger, wodurch eine temperierte, feuchte Reaktionskammer entsteht.
Die Vorrichtung weist vorzugsweise ein zentrales Bedienungspanel wie beispielsweise ein Vi oder 1/1 VGA-Touch-Panel auf. Eine Software-Schnittstelle zu übergeordneter Pathologie-Software ist nicht zwingend erforderlich, da die Vorrichtung die Analysen autark durchführt, ohne dass dazu eine Datenübergabe aus bestehenden Systemen erforderlich ist.
Es werden dennoch vorzugsweise folgende Schnittstellen vorgesehen: Eine USB/ Ethernet-Schnittstelle für eine eventuelle Protokollierung und Interaktion mit einer übergeordneten Software (Pathologiesoftware oder z.B. auch Patho-Link und/oder dgl.), wodurch z.B. Anforderungen/Aufträge eines Gutachters direkt am Mikroskop in das System eingepflegt werden könnten, um dann im Labor und von der Maschine nach entsprechender Codierung verwechslungsfrei abgearbeitet zu werden. Dadurch könnten logistische Vorteile erzielt werden. Dabei kann die Ethernet- Schnittstelle als TCP/ IP-Schnittstelle zur Verbindung der erfindungsgemäßen Vorrichtung mit Peripheriegeräten, wie beispielsweise einem Drucker oder anderen datentechnischen Geräten ausgebildet sein. Eine ISDN/Analog/Ethernet - Schnittstelle für die Fernwartung.
Insbesondere werden dabei neben den herkömmlichen bekannten bidirektionalen kabelbasierten Verbindungen auch moderne bidirektionale kabellose Datenverbindungen, insbesondere per Funkverbindung herstellbare Datenverbindungen, vorgeschlagen.
Die FFPE-Mikrotom-Schnitte müssen vor der immuhistochemischen oder molekularbiologischen Analyse vorbehandelt werden. Dazu werden die Schnitte zunächst durch ein Lösungsmittel entparaffiniert (z.B. 3 x 10 min. Xylolbad), über eine absteigende alkoholische Reihe (z.B. 100%-96%-70%-70% Ethanol für jeweils 1 min) in eine wässrige Lösung überführt, um schließlich dann mit einem Wärmeverfahren in einer Pufferlösung behandelt zu werden (hierzu können Mikrowellenbehandlung, Dampftopf oder Dampfgarer eingesetzt werden).
Diese Vorbehandlung der Schnitte bzw. der in den Vertiefungen abgelegten Gewebe- oder Zellproben kann in der erfindungsgemäßen Vorrichtung erfolgen. Hierzu sind in die Vorratsbehälter des Dosierkopfes die erforderlichen Reagenzien einzubringen, und entsprechende Vorrichtung zur Wärmebehandlung der Schnitte vorzusehen. Es wurde gefunden, dass eine derartige Erweiterung der erfindungsgemäßen Vorrichtung tendenziell die Komplexität und damit die Kosten der Vorrichtung erhöht und die Robustheit der Vorrichtung erniedrigt. Hinzu kommt, dass in der Praxis die Schnitte im Hinblick auf den einzusetzenden Primärantikörper vorzugsweise z.T. einer unterschiedlichen Wärmebehandlung ausgesetzt werden (z.B. in der Mikrowelle, im Dampfgarer oder im Dampftopf) und vorzugsweise unterschiedliche Pufferlösungen verwendet werden. Als Beispiele für eine bevorzugte verschiedene Behandlung von Schnitten bei Einsatz verschiedener Primär-Antikörper seien genannt:
HSP 90: 10 min. Proteinase K: 1 Trpf. PK (DAKO Cytomation, Code No.S 2019) in 2ml Dilutionsmedium (DAKO Cytomation, Code No. S 2032) bei RT.
CyclinA: 45 min kochen im Dampfgarer (MultiGourmet, Firma Braun) mit Zitronensäure (2g Citric Acid Monohydrate/ 1 ,0 I A.d., pH6).
Jaw 1/Ki-67: 20/15 min. Druck-Kochtopf mit Zitronensäure (2g Citric Acid Monohydrate/ 1 ,0 I A.d. , pH 6).
Bevorzugt sind daher erfindungsgemäße Vorrichtungen, die nicht zur Vorbehandlung von Gewebe- oder Zellschnitten ausgelegt sind.
Die Reagenzien für immunhistochemische und molekularbiologische Nachweisreaktionen sind kommerziell verfügbar und werden im Hinblick auf die gewünschte Untersuchungsmethode ausgewählt. Für immunhistochemische Untersuchungen stehen derzeit etwa 250 etablierte Antikörper zur Verfügung, die insbesondere zur Durchführung der immunhisto- chemischen Standard-Färbemethode, der sogenannten Avidin-Biotin-Complex- (ABC-) Methode, verwendet werden können.
Der Dosierkopf bzw. die Dosierkopfhalterung der Vorrichtung ist vorzugsweise mit einer z.B. von Peltier-Elementen gebildeten Kühlvorrichtung versehen. Dadurch wird gewährleistet, dass die in den Vorratsbehältern des Dosierkopfes befindlichen Reagenzien über einen längeren Zeitraum stabil sind. Alternativ wird auch vorgeschlagen, ähnlich der Nachfüllstation, eine Kühlstation vorzusehen, in die der Dosierkopf mittels der Positionierungsvorrichtung bewegt werden kann. Dies ist insofern vorteilhaft, da die Masse des zu bewegenden Dosierkopfes gegenüber der Variante mit Kühlvorrichtung aufweisendem Dosierkopf erheblich reduziert und somit die Positionierungsvorrichtung entsprechend günstiger dimensioniert werden kann. Dabei wird der Dosierkopf nach Beendigung eines Färbedurchlaufs automatisch in die Kühlstation verfahren und die noch in den Vorratsbehältern des Dosierkopfes befindlichen Reagenzien werden zur Verlängerung Ihres Verwendungszeitraums gekühlt. Im Allgemeinen sind z.B. die für die ABC-Methode benötigten Primär- und Sekundärantiköper und das Tertiärreagenz in einer geeigneten Pufferlösung relativ stabil und kön- nen bei Kühlung über einen Zeitraum von 1 bis 4 Wochen bis 6 oder 12 Monaten aufbewahrt werden.
Bei einer erfindungsgemäßen Weiterbildung der Vorrichtung, welche keine Kühlvorrichtung am Dosierkopf oder eine Kühlstation, in die der Dosierkopf bewegt werden kann, aufweist, kann-eine Ablass- bzw. Aufbewahrungsfunktion vorgesehen sein: Dabei werden nach Beendigung eines Färbedurchlaufs und nach Entnahme der Objektträger aus der Vorrichtung vorzugsweise in die Objektträgeraufnahmen oder andere geeignete Aufnahmen (Trays) Vorratsbehältnisse eingesetzt, in welche eine vollständige Entleerung der noch in den Vorratsbehältern des Dosierkopfes befindlichen Reagenzien mit Hilfe der Dosierventile erfolgt. Vorzugsweise sind diese Behältnisse mit Identifikationselementen, beispielsweise 1 D- oder 2D- Codes, versehen, die mittels des am Dosierkopf vorgesehenen Lesegerät ausgelesene werden können. Damit wird sichergestellt, dass der Dosierkopf die Restreagenzien in die dafür vorgesehenen Vorratsbehältnisse abgibt. Im Anschluss daran können die Vorratsbehältnisse entnommen und in einer separaten Kühlvorrichtung gelagert werden.
Bei der ABC- Methode bindet im ersten Schritt der Primär-Antikörper an das entsprechende Gewebe-Antigen. Geeignete Primärantikörper sind z.B. CyclinA (Novocastra Laboratories Ldt., Klon 6E6): 1 :50
Hsp90 α/ß (N-17, sc-1055, Santa Cruz Biotechnology, Inc.): 1 :150 Jaw1 (E-19, sc-11688, Santa Cruz Biotechnology, Ine): 1 :150
Ki-67(Clone Mib-1 ,DAKO Cytomation, M7240, Denmark): 1 :100
wobei die Verdünnung des Primär-Antikörpers auf die angegebene Konzentration z.B. mit „ChemMate" Antibody Diluent (z.B. DAKO Cytomation S 2022) erfolgt. Der entsprechend verdünnte Primärantikörper kann dann in die entsprechenden Reaktionszonen der Objektträger eindosiert werden. Die Reaktionszeit des Primär-Antikörpers beträgt z.B. 20 - 30 min.
Danach erfolgen ein oder mehrerer Spülschritte, an die sich jeweils vorzugsweise ein leichter Trocknungsvorgang anschließt, der jedoch nicht zur Austrocknung der Zell- oder Gewebeprobe in den Reaktionszonen führen darf.
Im nächsten Schritt erfolgt die Bindung eines biotinylierten Sekundär-Antikörpers an den primären Antikörper. Als Sekundär-Antikörper-Reagenzien seien beispielhaft genannt: Bei Maus-Primär-Antikörper (CyclinA):
Goat-anti-Mouse IgG Plus (Biocare Medical, Cat# GM601 MMplus), gebrauchsfertig
Bei Ziegen-Primär-Antikö rper (HSP90 & Jaw1 ):
Mouse-anti-Goat IgG (Jackson Immuno Research Laboratories Inc., 205-065-108), zu verdünnen mit ChemMate Antibody Diluent (DAKO Cytomation S 2022) auf 1 :50
Die Reaktionszeit des Sekundär-Antikörpers beträgt z.B. 10 bis 20 min.
Im Anschluss an mehrerer Spül- und vorzugsweise nachfolgende Trocknungsschritte kann ein Blockierungsschritt erfolgen, bei dem die endogene Peroxidase-Aktivität nach dem Prinzip eines Überschusses an H2O2 bei fehlendem Elektronendonor mit: einem Peroxida- zed Blocking Agent (Biocare Medical, Cat# PX968MM) blockiert wird. Die Reaktionszeit der Blockierungsreaktion beträgt z.B. 3 x 5 min.
Im Anschluss an mehrere Spül- und vorzugsweise nachfolgende Trocknungsschritte erfolgt dann das Aufbringen des vorgeformten Avidin-Biotin-Enzym-Komplexes als Tertiärreagenz (als Enzym verwendet: Meerrettich-Peroxidase/horseradish peroxidase (HRP) bzw. Alkalische Phosphatase (AP)) und dessen hochaffine Anlagerung an das Biotin-Molekül des Sekundär-Antikörpers.
Die Reaktionszeit des Tertiär-Reagenzes beträgt z.B. 10 bis 20 min.
Im Anschluss an mehrere Spül- und vorzugsweise nachfolgende Trocknungsschritte erfolgt dann die Inkubation mit einer chromogenen Substratlösung, wobei z.B. 3.3'- Diaminobenzidin-Tetrahydrochlorid (DAB) ( DAB Chromogen (Biocare Medical, Cat# DB851-60). bzw. Neufuchsin als Chromogen unter Bildung eines sichtbaren braunen bzw. roten Reaktionsproduktes verwendet werden können. Die Chromogen-Lösung kann vorzugsweise ein 'Puffermedium enthalten (z. B. DAB Substrate Buffer (Biocare Medical, Ref DS854MM; Chromogen zu Puffermedium im Verhältnis 1 :20).
Die Reaktionszeit des Chromogens beträgt z.B. 5 - 10 min.
Im Anschluss an mehrerer Spül- und vorzugsweise nachfolgende Trocknungsschritte können die Reaktionszonen der Objektträger zur Beendigung der Färbereaktion mit Hämatoxy- Nn (Reaktionszeit z.B. 1 min.) behandelt werden. Die Zell- und Gewebeproben in den Re- - -
aktionszonen der Objektträger können dann anschließend entwässert (aufsteigende Alkoholreihe: 70% - 70% - 96% - 100% Ethanol für jeweils 1 min) und mit XyIoI behandelt werden. Die Objektträger können dann zur Aufbewahrung mit einem Deckel verschlossen werden.
Die beispielhaft beschriebenen Reagenzien und gewünschtenfalls weitere Reagenzien werden in gebrauchsfertiger Form in die Vorratsbehälter des Dosierkopfes gefüllt, wobei die Reagenzien in den Vorratsbehältern vorzugsweise so angeordnet werden, dass ein zeitgleiches Dosieren von Reagenzien in Abhängigkeit von der jeweiligen Analyseaufgabe möglich ist. Dabei können die Reagenzien z.B. in 6-er Blöcken, d.h. z.B. in Reihen von 6 Antikörpern in definierter Abfolge, angeordnet werden, so dass sich sinnvolle Panels ergeben.
In der nachfolgenden Tabelle sind beispielhaft Zusammenstellungen von jeweils 6 Reagenzien (Antikörpern) in Panels angegeben, die in Färbealgorithmen aufeinander abgestimmt sind und vorteilhaft zur pathologischen Diagnostik des jeweils angegebenen Läsionen/ Tumors eingesetzt werden können.
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Die angegebenen Abkürzungen sind übliche Bezeichnungen für kommerziell verfügbare Antikörper. Die Antikörper können ggf. in üblicher Weise verdünnt und in definierter Abfolge in Vorratsbehälter des Dosierkopfes eingefüllt werden. Das dadurch erhaltene algorithmische Panel kann zu einem separat handhabbaren Dosierkopfsegment verbunden werden, das getrennt von anderen Dosierkopfsegmenten in die Dosierkopfhalterung eingesetzt wird und so zu einem Dosierkopf vervollständigt wird. Um Verwechselungen zu vermeiden, werden die in Dosierkopfsegmenten zusammengefassten Panels vorzugsweise beschriftet bzw. mechanisch und/oder elektrisch codiert. Weitere färbealgorithmische Panels können der unten angegebenen Tabelle 1 entnommen werden.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung eignet sich in besonderer Weise zur Durchführung eines Verfahrens zur Dosierung von Reagenzien auf einen Objektträger bzw. in die Vertiefungen von Objektträgern.
Dazu werden die Objektträger in die Vorrichtung eingesetzt. Vorzugsweise werden die Objektträger außerhalb der Vorrichtung auf einem oder mehreren Tabletts angeordnet, und die Tabletts werden dann in die Vorrichtung eingesetzt. Die Objektträger werden vorzugsweise auf den Tabletts mit mechanischen Befestigungsmitteln, vorzugsweise einem mechanischen Befestigungssystem mit männlichen und weiblichen Befestigungselementen befestigt. Die Objektträger weisen vorzugsweise Beschriftungsfelder auf, auf denen Identifikationsmittel wie z.B. Etiketten mit 1D- oder 2D- Codes, RFID-Chips oder dergleichen angebracht werden können. Die Ausrichtung der Objektträger ist dabei vorzugsweise immer gleich, so dass ein Blick des Anwenders genügt, um zu prüfen, ob alle Beschriftungsfelder der Objektträger in die gleiche Richtung zeigen.
Ob die Objektträger mit dem Schnitt nach oben und die Beschriftungsfelder der Objektträger alle in die gleiche Richtung zeigen, ist für den Anwender an dieser Stelle die einzige vorzunehmende Kontrolle. Die Reihenfolge der Objektträger auf erfindungsgemäßen Vorrichtung ist beliebig, da alle Objektträger zunächst über den integrierten Scanner ausgelesen werden. Damit kann die Vorrichtung auch sofort überprüfen, ob eventuell ein Objektträger aufgelegt wurde, zu dem aktuell kein Panel mit Reagenzien (im Dosierkopf) passt. Eine falsche Verarbeitung dieses Objektträgers ist somit ausgeschlossen. Weiter kann ggf. ein optimierter Verfahrweg für den Dosierkopf errechnet werden.
Das Verfahren umfasst weiterhin die Befüllung der Vorratsbehälter des Dosierkopfes mit den geeigneten Reagenzien. Der Dosierkopf wird dann an dem Positionierungssystem befestigt bzw. in die an dem Positionierungssystem befestigte Dosierkopfhalterung eingesetzt. Der Dosierkopf bzw. die Dosierkopfhalterung weisen vorzugsweise eine Kühlvorrichtung auf, die z.B. von Peltier-Elementen gebildet wird. Wenn die Vorrichtung eine Nachfüllstation für die Reagenzien umfasst, an der der Dosierkopf nach dessen Entleerung wieder befüllt werden kann, wird diese ebenfalls mit den Reagenzien befüllt. Dabei werden vorzugsweise sowohl die Vorratsbehälter des Dosierkopfes als auch die Vorratsbehälter der Nachfüllstation mit Identifikationsmitteln versehen, um die automatische Steuerung der Analyse, d.h. der Eindosierung der Reagenzien in die Vertiefungen bzw. die Reaktionszonen, und die Wiederbefüllung des Dosierkopfes durch die Software steuern zu können. Es wird weiterhin vorzugsweise sichergestellt, dass das Reagenzien-Volumen in dem Dosierkopf bzw. in der Nachfüllstation mit der Gesamtzahl an Reaktionszonen korreliert.
Nach Abschluss dieser Vorbereitungen wird der Analyse-Durchlauf gestartet. Hierzu fährt der Dosierkopf mit dem Lesegerät für die Identifikationsmittel vorzugsweise zunächst die Objektträger ab, um die Information auf den Identifikationsmitteln abzulesen und um die Position der Objektträger und der von ihnen bereitgestellten Vertiefungen/ Reaktionszonen aufzunehmen.
Danach beginnt der Dosierkopf damit, Reagenzien in die Vertiefungen/Reaktionszonen einzudosieren, wobei das Volumen des zudosierten Reagenzes kleiner ist als das Volumen der Vertiefung/ Reaktionszone. Dabei arbeitet der Dosierkopf dann vorzugsweise die durch die jeweilige Analyse-Methode wie z.B. die oben beschriebene ABC-Methode vorgegebene Sequenz an Reaktionsschritten mit dazwischen geschalteten Spülschritten etc. ab.
Das Verfahren umfasst vorzugsweise weiterhin einen Schritt, bei dem die Objektträger bzw. die darauf befindlichen Vertiefungen/ Reaktionszonen mit einer Abdeckfolie abgedeckt werden, um diese für nachfolgende Analyseschritte wie z.B. mikroskopische Analysen zu schützen.
Kurze Beschreibung der Figuren
Eine spezielle Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung sowie des Dosierkopfes wird anhand der beifügten Figuren beschrieben, wobei
Fig. 1 eine Draufsicht auf einen erfindungsgemäß verwendbaren Objektträger,
Fig. 2 eine Querschnittsansicht des Objektträgers aus Fig. 1 längs der dort gestrichelt eingezeichneten Linie A - A,
Fig. 3 eine perspektivische Gesamtansicht einer erfindungsgemäßen Vorrichtung mit geschlossenem Deckel, Fig. 4 eine perspektivische Gesamtansicht der Vorrichtung gemäß Fig. 3 mit geöffnetem
Deckel, Fig. 5 eine perspektivische Gesamtansicht des Dosierkopfes der Vorrichtung gemäß den
Figuren 3 und 4,
Fig. 6 eine perspektivische Detailansicht des Dosierkopfes gemäß Fig. 5 zeigt, Fig. 7 eine weitere perspektivische Gesamtansicht des Dosierkopfes, und - Fig. 8 eine Ansicht des Dosierkopfes von unten.
Detaillierte Beschreibung der Figuren
Der in Fig. 1 gezeigte Objektträger 50 weist Vertiefungen 52 mit einer quadratischen Querschnittfläche auf, die in einer regelmäßigen 3 x 6-Matrix angeordnet sind. Die Vertiefungen 52 sind in den 3er-Reihen und den 6-er Spalten jeweils äquidistant angeordnet, wobei der Abstand zwischen den Reihen größer ist als zwischen den Vertiefungen 52 in einer Reihe selbst. Die Vertiefungen 52 sind jeweils mit einer Gewebe- oder Zellprobe 53, 53a, 53b versehen. Die Vertiefungen 52 bilden dabei die Reaktionszonen 58. Der Objektträger 50 weist an einem Ende ein Beschriftungsfeld 51 auf, in dem z.B. ein den Objektträger 50 i- dentifizierendes 1D- oder 2D-Code-Etikett aufgeklebt werden kann.
Fig. 2 ist eine Querschnittsansicht durch eine Reaktionszone 58 entlang der in Fig. 1 gestrichelt eingezeichneten Linie A - A. Dabei ist in Fig. 1 eine quadratische Vertiefung 52 ohne eine Gewebe- oder Zellprobe 53 gezeigt, während in Fig. 2 zur Verdeutlichung eine Gewebe- oder Zellprobe 53 eingezeichnet ist. Die Gewebe- oder Zellprobe 53 befindet sich auf einer Trägerfolie 56 aus einer Polycarbonatfolie und ist mit einem Kleber auf die Basisplatte 55 des Objektträgers 50 aufgeklebt. Der Objektträger 50 ist beispielsweise mit einem aufgespritzten Rahmen aus einem hydrophoben Material, einer Teflonfolie oder einer Folie aus einem anderen hydrophoben Material (Bezugszeichen 54) beschichtet, in die die Vertiefungen 52 bzw. die Reaktionszonen 58 eingelassen sind. Der Rahmen bzw. die Folie 54 weist eine Dicke d2 auf, die größer ist als die Summe d1 der Dicken der Zell- oder Gewebeprobe 53 und der Trägerfolie 56, sodass die Gewebe- oder Zellprobe sich innerhalb der Vertiefung 52 befindet und dort mit Reagenzien beaufschlagt werden kann, ohne dass es zu einer Kontamination von benachbarten Vertiefungen 52 kommt. Das Verhältnis aus den Abmessungen d2/d1 ist vorzugsweise mindestens 1 ,2, insbesondere mindestens 1 ,3 und besonders bevorzugt nicht kleiner als 1 ,4. Vorzugsweise übersteigt das Volumen der Ver- tiefung die Summe der das Volumina aus Gewebe- oder Zellprobe 53 und Trägerfoliensegment 56 mindestens um das 1 ,5-fache und besonders bevorzugt mindestens um das 2- fache.
Gewünschtenfalls kann der Objektträger 50 vor Beginn der Reaktionen mit einer Abdeckfolie 57 (mit der Dicke d3) versehen sein, um sicherzustellen, dass die Zell- oder Gewebeprobe 53 nicht austrocknet. Die Abdeckfolie 57 wird vor der Durchführung der Nachweisreaktionen entfernt.
Fig. 3 und Fig. 4 zeigen perspektivische Gesamtansichten einer beispielhaften Ausgestaltung einer erfindungsgemäßen Vorrichtung 10. Die Vorrichtung 10 ist mit einer Vielzahl von Objektträgern 50 beladen, die in einer regelmäßigen Matrix (12 Zeilen x 8 Spalten) angeordnet sind. Die zwölf Objektträger 50 einer Spalte sind jeweils auf einem leistenförmigen Tablett 51 befestigt. Das eine Ende des Tabletts 51 ist absenkbar ausgestaltet und taucht in abgesenktem Zustand in die Spülwanne ein, die sich unter den in einer Ebene angeordneten Objektträgern 50 befindet. Die Spülwanne befindet sich in dem Gehäuse der Vorrichtung 10 und ist in den Fig. 3 und 4 nicht zu sehen.
Hinter der Klappe 18 befinden sich die Anschlüsse für die Zu- und Ableitung der Spülflüssigkeit. Die Vorrichtung 10 kann oben mit einer transparenten Abdeckung 15 verschlossen werden, wodurch in dem Reaktionsraum 19 oberhalb der Ebene der Objektträger 50 ein Feuchtraum erzeugt wird, durch den eine kontinuierliche Befeuchtung der Zell- oder Gewebeproben 53 in den Reaktionszonen der Objektträger 50 sichergestellt wird. Die Abdeckung 15 ist in Fig. 3 in geschlossenem und in Fig. 4 in geöffnetem Zustand gezeigt.
Die Vorrichtung 10 weist weiterhin einen Dosierkopf 30 auf, der an einem Arm eines karte- sischen X/Y-Positionierungssystems 14 angeordnet ist und dadurch über den Objektträgern 50 positioniert werden kann. Die beiden Arme des kartesischen Systems 14 sind jeweils auf zwei Seiten gelagert, wodurch ein robustes Positionierungssystem erhalten wird. Die Bedienung der Vorrichtung erfolgt über das Bedienungs-Panel 17.
Fig. 5 zeigt eine perspektivische Darstellung des Dosierkopfes 30, der in eine Dosierkopf- halterung 40 eingesetzt ist, die an einem Arm des kartesischen X/Y- Positionierungssystems 14 befestigt ist. Der Dosierkopf enthält eine Vielzahl von Vorratsbehältern 31 , die eine quadratische Querschnittsfläche aufweisen und in einer quadrati- sehen Matrix (11 x 11 ) angeordnet sind. Die Halterung 40 des Dosierkopfes 30 ist mit PeI- tier-Kühlelementen 33 ausgerüstet und weist an der dem Reaktionsraum 19 zugewandten Seite einen Barcode-Leser 32 auf, mit dem die in den Beschriftungsfeldern 51 der Objektträger 50 angeordneten Barcode-Etiketten gelesen werden können.
Fig. 6 zeigt den prinzipiellen Aufbau des Dosierkopfes 30 mit quadratischen Vorratbehältern 31 , die in einer quadratischen 12 x 12-Matrix angeordnet sind. Der Dosierkopf 30 um- fasst insgesamt 144 Vorratsbehälter 31 , die jeweils einen quadratischen Querschnitt und das gleiche Volumen aufweisen. Die einzelnen Vorratbehälter 31 an den beiden Seiten des Dosierkopfs sind jeweils mit den Zahlen 1 bis 12 durchnumeriert. In der gezeigten Detailansicht ist die quadratische Querschnittsfläche eines Vorratsbehälters 31 mit den Seitenlängen 31a, 31 b gezeigt. Am gegenüberliegenden Ende eines jeden Vorratsbehälters 31 ist ein Dosierventil 33 angeordnet. Die Dosierventile 33 sind in einem Dosierblock zusam- mengefasst. Die Dosierventile 33 haben eine Auslassvorrichtung für die in den jeweiligen Vorratsbehältern befindlichen Reagenzien. An die Dosierventile 33 schließt sich ein Block von Durchflusssensoren 34 zur Dosierkontrolle an. Die Höhe der Vorratsbehälter 31 zwischen den oberen, offenen Enden, die mit einem gasdichten Deckel 32 versehen sind, und den in einem Dosierblock 30 angeordneten Dosierventilen 33 ist mit 31c bezeichnet.
Die Vorratsbehälter 31 sind an dem den Dosierventilen 33 gegenüberliegenden Ende mit einem gasdichten Deckel versehen, wobei der Anschluss für die Gasleitung in der schematischen Darstellung der Fig. 6 nicht gezeigt ist. Mit Hilfe des gasdichten Deckels 32 können die Vorratsbehälter 31 z.B. mit Druckluft oder einem Inertgas beaufschlagt werden. Unterhalb des Dosierventilblockes befindet sich der Block 34 mit den Durchflusssensoren zur Durchfluss- bzw. Dosierkontrolle.
Der Dosierblock 30 weist ein Beschriftungsfeld 35 auf, um das Wechseln von Dosierköpfen 30 in der Dosierkopfhalterung 40 zu erleichtern. In einer beispielhaften Dimensionierung weist der Vorratsbehälter der Fig. 6 Seitenlängen 31a, 31 b von jeweils 9 mm und eine Höhe 31c von etwa 45 mm aus. Damit ergibt sich ein Volumen von etwa 3,6 ml pro Vorratsbehälter 31 und ein Gesamtvolumen des Dosierkopfes 30 von etwa 525 ml.
Wie in Fig. 6 gezeigt ist, ist der Dosierkopf 30 als .Sandwich' mit wechselbaren Platten bzw. Blöcken aufgebaut und ist aus einem abdichtenden Deckel 32, einem zu einer Einheit zusammengefassten Block aus Vorratsbehältern 31 , einen Block aus Dosierventilen 34 und/oder einen Block aus Durchflusssensoren aufweisen. Dies erlaubt eine hohe Wartungsfreundlichkeit und eine Modularität für eventuelle Erweiterungen.
Der in den Fig. 7 und Fig. 8 gezeigte Dosierkopf 30 ist in die Dosierkopfhalterung 40 eingesetzt. Der Dosierkopf 30 enthält neben der Dosierkontrolle 100 auch eine Elektronik 110 für die Ansteuerung der Ventile des Dosierkopfs -30 und die Ansteuerung der zusätzlich erforderlichen Ventile 120 für die Flüssigkeiten, welche in größeren Mengen je Objektträger 50 verbraucht werden. Weiter enthält die Elektronik 110 auch einen Drucksensor für die Ü- berwachung des Systemdruckes (nicht gezeigt). Der in Fig.7 und Fig. 8 gezeigte Scanner 130 dient der Erkennung und Auswertung der auf den Objektträgern 50 angeordneten 2D- Codes. Der Deckel 32 ist mit einer im oberen Bereich beidseitig angeordneter Verschlussmechanik 140 in seiner geschlossenen Position gegen ungewolltes Öffnen gesichert.
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Tabelle 1: Färbealgorithmische Panels zur pathologischen Diagnostik der angegebenen Karzinome
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Claims

PATENTANSPRÜCHE
1. Automatische Vorrichtung (10) zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern (50) umfassend
Haltevorrichtungen für eine Vielzahl von Objektträgern (50), welche jeweils eine Vielzahl von voneinander abgegrenzten Vertiefungen (52) enthalten, die zur Aufnahme von Zell- oder Gewebeproben (53) geeignet sind, einen Dosierkopf (30) mit einer Vielzahl von Vorratsbehältern (31 ), welche zur Aufnahme von flüssigen Reagenzien geeignet sind und an dem den Vertiefungen (52) zugewandten Ende/ Seite ein Dosierventil (33) zur Dosierung und Aufbringung der Reagenzien in die Vertiefungen (52) aufweisen, und eine Positionierungsvorrichtung (14) zur Positionierung der Vorratsbehälter (31 ) des Dosierkopfes (30) über den jeweiligen Vertiefungen (52) der Objektträger (50).
2. Vorrichtung nach Anspruch 1 , wobei der Quotient aus dem mittleren Volumen der Vorratsbehälter (31 ) und dem mittleren Volumen der Vertiefungen (52) mindestens 50 ist.
3. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das mittlere Volumen der Vertiefungen (52) zwischen 5 und 500 μl beträgt
4. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vertiefungen (52) eine mittlere Tiefe von weniger als 2 mm haben und eine Querschnittsfläche von weniger als 100 mm2 aufweisen.
5. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das mittlere Volumen der Vorratsbehälter (31 ) mindestens 1 ,5 ml und vorzugsweise mindestens 2,5 ml ist.
6. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vertiefungen (52) durch Stege umrandet und voneinander getrennt sind.
7. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vertiefungen (52) ein regelmäßiges Array bilden.
8. Vorrichtung nach Anspruch 7, wobei die Vertiefungen (52) in Streifen oder einer regelmäßigen Matrix angeordnet sind.
9. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei in den Vertiefungen (52) jeweils eine Zell- oder Gewebeprobe (53) angeordnet ist.
10. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Objektträger (50) im Wesentlichen in einer Ebene angeordnet sind.
11. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Objektträger (50) abnehmbar auf einem oder mehreren Tabletts (51) angeordnet sind.
12. Vorrichtung nach Anspruch 11 , wobei die Objektträger (50) durch ein mechanisches Verschlusssystem mit männlichen und weiblichen Verschlusselementen auf dem Tablett (51 ) lösbar befestigt sind.
13. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Tabletts (51 ) abnehmbar in die Vorrichtung (10) eingesetzt werden können.
14. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, bei der die Querschnittsfläche benachbarter Vorratsbehälter (31 ) in Anpassung an die Querschnittsflächen der Vertiefungen (52) so gewählt ist, dass zwei Vertiefungen (52) von zwei benachbarten Vorratsbehältern (31 ) simultan mit Reagenzien beaufschlagt werden können.
15. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorratsbehälter (31) so dimensioniert sind, dass mindestens drei, vorzugsweise sechs benachbarte Vertiefungen (52) simultan von Vorratbehältern (31 ) mit Nachweisreagenzien beaufschlagt werden können.
16. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 14 bis 15, wobei die Vorratsbehälter (31 ) mit Reagenzien eines färbelogarithmischen Panels befüllt sind.
17. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorratsbehälter (31 ) eine mittlere Querschnittsfläche von vorzugsweise weniger als 1 cm2 aufweisen.
18. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Auslass der Dosierventile (33) über den Löchern einer Lochplatte angeordnet ist.
19. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Auslass der Dosierventile (33) mit einer Dosiernadel versehen ist.
20. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Dosierkopf (30) Durchflusssensoren (34) zur Messung des Volumens der abdosierten Reagenzien umfasst.
21. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das einzelne Dosierventil (33) und/oder die Dosiernadel eine Vorrichtung zur Blasenkontrolle umfasst.
22. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das den Dosierventilen (33) gegenüberliegende Ende der Vorratsbehälter (31 ) gasdicht verschließbar ist.
23. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine Dosierkopfhalterung (40) enthält, in die eine oder mehrere Dosierköpfe (30) einsetzbar sind.
24. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Dosierkopf (30) lösbar mit der Dosierkopfhalterung (40) verbunden ist.
25. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Dosierkopf (30) und/ oder die Dosierkopfhalterung (40) mit Kühlelementen versehen ist.
26. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 25, wobei die Vorrichtung (10) eine vorzugsweise automatische Kühlstation aufweist, in die der Dosierkopf (30) mittels der Positioniereinrichtung (14) zur Kühlung der in den Vorratsbehältern (31) befindlichen Reagenzien verfahren werden kann.
27. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine vorzugsweise automatische Entleerungsstation aufweist, in die der Dosierkopf (30) mittels der Positioniereinrichtung (14) zur Vollständigen Entleerung des Dosierkopfes (30) und zur Einlagerung der aus dem Dosierkopf (30) abgelassenen Restreagenzien verfahren werden kann.
28. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei der Dosierkopf (30) und/ oder die Dosierkopfhalterung (40) eine Lesevorrichtung (32) für auf den Objektträgern (50) angebrachte Identifikationselemente enthält.
29. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine unter den Objektträgern (50) angeordnete Spülwanne zur Aufnahme einer Spülflüssigkeit umfasst.
30. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei ein Objektträger (50) einzeln oder zusammen mit anderen Objektträgern (50) von einer ersten, zur Einbringung der Reagenzien in die Vertiefung (52) geeigneten Position in eine zweite, in der Spülwanne befindliche Position überführbar ist.
31. Vorrichtung nach Anspruch 30, wobei das die Objektträger tragenden Tablett (51) einzeln oder zusammen mit weiteren Tabletts (51 ) von einer ersten, zur Durchführung der Nachweisreaktionen geeigneten Position in eine zweite, in der Spülwanne befindliche Position überführbar ist.
32. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine über den Objektträgern (50) angeordnete Abdeckhaube (15) aufweist.
33. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das Positionierungssystem (14) ein kartesisches X/Y-System ist.
34. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine Dosierkopfhalterung (40) enthält, in die eine oder mehrere Dosierköpfe (30) einsetzbar sind.
35. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Vorrichtung (10) eine vorzugsweise automatische Befüllungsstation aufweist, in die der Dosierkopf (30) mit den teilweise oder vollständig entleerten Vorratsbehältern (31) mittels der Positioniereinrichtung (14) verfahren werden kann, um die Vorratsbehälter (31 ) mit den jeweiligen Reagenzien zu befüllen.
36. Dosierkopf (30) zur Verwendung in einer automatischen Vorrichtung (10) zur Dosierung von Reagenzien auf einer Vielzahl von Objektträgern (50), umfassend eine Vielzahl von Vorratsbehältern (31 ), welche zur Aufnahme von flüssigen Reagenzien geeignet sind und an einem Ende/ Seite ein Dosierventil (33) zur Dosierung und Aufbringung der Reagenzien auf die Objektträger (50) aufweisen, und welche an dem den Dosierventilen (33) gegenüberliegenden Ende eine gasdichte Abdeckung (32) aufweisen, wobei das mittlere Volumen der Vorratsbehälter (31 ) mindestens 1 ,5 ml und vorzugsweise mindestens 2,5 ml ist.
37. Dosierkopf nach Anspruch 36, wobei das mittlere Volumen der Vorratsbehälter (31 ) vorzugsweise mindestens 5 oder 7 ml ist.
38. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 oder 37, wobei die Vorratsbehälter (31 ) mit Reagenzien eines färbelogarithmischen Panels befüllt sind.
39. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 38, wobei die Vorratsbehälter (31 ) eine mittlere Querschnittsfläche von vorzugsweise weniger als 1 cm2 aufweisen.
40. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 39, wobei der Auslass der Dosierventile (33) über den Löchern einer Lochplatte angeordnet ist.
41. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 40, wobei der Auslass der Dosierventile (33) mit einer Dosiernadel versehen ist.
42. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 41 , wobei der Dosierkopf (30) eine Dosierkontrolle zur Messung des Volumens der abdosierten Reagenzien aufweist, wobei die Dosierkontrolle vorzugsweise aus optischen Durchflusssensoren (34) oder einem kapazitiven Durchflussmesssystem gebildet ist.
43. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 42, wobei das einzelne Dosierventi! (33) und/ oder die Dosiernadel eine Vorrichtung zur Blasenkontrolle umfasst.
44. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 43, wobei der Dosierkopf eine Halte- rung zur Aufnahme von flüssigkeits- und insbesondere Nachweisreagenzien wie Sekundär- und/ oder Tertiärreagenzien führenden Leitungen aufweist, wobei die Halte- rung vorzugsweise Dosierventile und/ oder eine Dosierkontrolle aufweist.
45. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 44, wobei ein oder mehrere Dosierköpfe (30) derart ausgebildet sind, dass sie lösbar in eine Dosierkopfhalterung (40) der automatischen Vorrichtung (10) zur Dosierung von Reagenzien auf einer Vielzahl von Objektträgern (50) einsetzbar sind.
46. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 45, wobei der Dosierkopf (30) mit Kühlelementen versehen ist.
47. Dosierkopf nach einem der Ansprüche 36 bis 46, wobei der Dosierkopf (30) eine Lesevorrichtung (32) für auf den Objektträgern (50) angebrachte Identifikationselemente enthält.
48. Verfahren zur Dosierung von Reagenzien auf eine Vielzahl von Objektträgern (50) mit Hilfe einer automatischen Vorrichtung (10) nach einem der Ansprüche 1 bis 35, worin die Objektträger (50) in die Vorrichtung (10) eingesetzt werden, die Vorratsbehälter (31 ) mit Reagenzien befüllt werden, der Dosierkopf (30) mit Hilfe der Positionierungsvorrichtung (14) über den jeweiligen Vertiefungen (52) des Objektträgers (50) positioniert wird, und das Reagenz in die Vertiefung (52) eindosiert wird, wobei das Volumen des Reagenz kleiner ist als das Volumen der Vertiefung (52).
49. Verfahren nach Anspruch 48 worin die Objektträger (52) mit Identifikationselementen gekennzeichnet sind und der Dosierkopf (30) oder die Dosierkopfhalterung (40) der Vorrichtung ein Lesegerät (32) zum Lesen der Identifikationselemente beinhaltet, wobei der Dosierkopf (30) die Objektträger (50) vor Beginn der Abdosierung der Reagenzien abfährt, um die Information auf den Identifikationsmitteln abzulesen und um die Position der Objektträger (50) und der von den Objektträgern (50) bereitgestellten Vertiefungen (52) aufzunehmen.
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