WO2008027912A3 - Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus - Google Patents

Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus Download PDF

Info

Publication number
WO2008027912A3
WO2008027912A3 PCT/US2007/077022 US2007077022W WO2008027912A3 WO 2008027912 A3 WO2008027912 A3 WO 2008027912A3 US 2007077022 W US2007077022 W US 2007077022W WO 2008027912 A3 WO2008027912 A3 WO 2008027912A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
agent
agents
patient
activity
prediction
Prior art date
Application number
PCT/US2007/077022
Other languages
English (en)
Other versions
WO2008027912A2 (fr
Inventor
Dan Theodorescu
Jae Kyun Lee
Original Assignee
Dan Theodorescu
Jae Kyun Lee
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Dan Theodorescu, Jae Kyun Lee filed Critical Dan Theodorescu
Priority to EP07841494A priority Critical patent/EP2062181A2/fr
Publication of WO2008027912A2 publication Critical patent/WO2008027912A2/fr
Publication of WO2008027912A3 publication Critical patent/WO2008027912A3/fr

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G16B20/20Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • G16B25/10Gene or protein expression profiling; Expression-ratio estimation or normalisation
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

L'invention porte sur un nouvel algorithme utilisant les signatures de profils moléculaires pour extrapoler le processus physiologique d'un type d'ensemble de cellules (par exemple lignée de cellules ou tissu sain ou malade) et prédire l'activité d'un ou de plusieurs agents contre un autre ensemble de cellules n'ayant jamais été exposé à l'agent en question (prédiction de l'efficacité de médicaments). Le nouvel algorithme permet également de prédire la réponse thérapeutique d'un patient à une thérapie même s'il n'a jamais été exposé antérieurement audit agent. On peut ainsi sélectionner le ou les agents thérapeutiques les mieux adaptés au cas du patient (médecine personnalisée). L'invention porte également sur des méthodes d'utilisation d'agents identifiés par le nouvel algorithme pour traiter différentes maladies dont le cancer.
PCT/US2007/077022 2006-08-28 2007-08-28 Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus WO2008027912A2 (fr)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP07841494A EP2062181A2 (fr) 2006-08-28 2007-08-28 Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US84064406P 2006-08-28 2006-08-28
US60/840,644 2006-08-28
US84083406P 2006-11-22 2006-11-22
US60/840,834 2006-11-22

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2008027912A2 WO2008027912A2 (fr) 2008-03-06
WO2008027912A3 true WO2008027912A3 (fr) 2008-10-09

Family

ID=39136803

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/US2007/077022 WO2008027912A2 (fr) 2006-08-28 2007-08-28 Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus

Country Status (2)

Country Link
EP (1) EP2062181A2 (fr)
WO (1) WO2008027912A2 (fr)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010016011A1 (fr) * 2008-08-05 2010-02-11 University Of Cape Town Composés d’organosoufre, procédé de fabrication de composés d’organosoufre et leur utilisation pour inhiber la croissance de cellules tumorales
US8802702B2 (en) * 2009-01-15 2014-08-12 The General Hospital Corporation Compounds for reducing drug resistance and uses thereof
US8051947B2 (en) * 2009-03-12 2011-11-08 E.I. Du Pont De Nemours And Company Energy absorbing thermoplastic elastomer
EP2433232A1 (fr) 2009-05-20 2012-03-28 Koninklijke Philips Electronics N.V. Biomarqueurs bases sur des ensembles de signatures moleculaires
EP2461806A4 (fr) 2009-07-31 2012-12-26 Us Health Petites molécules anti-angiogéniques et procédés d utilisation
WO2011081970A2 (fr) * 2009-12-31 2011-07-07 Corning Incorporated Molécules associées à des canaux ioniques herg et leur utilisation
WO2013020024A2 (fr) * 2011-08-03 2013-02-07 Karyopharm Therapeutics, Inc. Composés de maléimide et méthodes de traitement
ES2740323T3 (es) * 2013-05-28 2020-02-05 Five3 Genomics Llc Redes de respuesta a paradigma de fármaco
AU2014316783A1 (en) * 2013-09-09 2016-04-28 Glionova Ab Compounds and use for treating cancer
BR112016019549B1 (pt) 2014-02-25 2022-08-02 Ecolab Usa Inc Composição e solução de limpeza sanitária aquosa, método para limpar uma superfície sanitária, e, uso de uma composição de limpeza sanitária ou uma solução de limpeza sanitária aquosa
CN104610207B (zh) * 2014-07-15 2017-05-10 云南西力生物技术股份有限公司 大黄栀子素a及其制备方法和在药物上的应用
WO2016210289A1 (fr) * 2015-06-24 2016-12-29 Duke University Modulateurs chimiques des voies de signalisation et utilisation thérapeutique
WO2017017004A1 (fr) * 2015-07-24 2017-02-02 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Composés de thiazole sulfonamide de benzène hydrophobe substitué utilisables dans le traitement du cancer
GB201514018D0 (en) * 2015-08-07 2015-09-23 Arnér Elias S J And United States Of America Asrepresented By The Sec Dep Of Health And Human Servic Novel tricyclic compounds and their use in the treatment of cancer
EP3436625A4 (fr) * 2016-03-28 2019-11-06 The Regents of The University of California Procédés et systèmes de prédiction d'effets induits par un agent in silicio
US10510010B1 (en) 2017-10-11 2019-12-17 Liquid Biosciences, Inc. Methods for automatically generating accurate models in reduced time
WO2019074504A1 (fr) * 2017-10-11 2019-04-18 Liquid Biosciences, Inc. Procédés de génération automatique de modèles précis en temps réduit
CN111153948B (zh) * 2018-11-07 2022-10-18 华北制药集团新药研究开发有限责任公司 动孢菌素类化合物及其用途
CN112461915A (zh) * 2020-12-08 2021-03-09 杭州汇健科技有限公司 一种与药物敏感相关的特征分子筛选、药敏程度检测、细胞亚型检测的方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020042681A1 (en) * 2000-10-03 2002-04-11 International Business Machines Corporation Characterization of phenotypes by gene expression patterns and classification of samples based thereon
US6647341B1 (en) * 1999-04-09 2003-11-11 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods for classifying samples and ascertaining previously unknown classes

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6647341B1 (en) * 1999-04-09 2003-11-11 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods for classifying samples and ascertaining previously unknown classes
US20020042681A1 (en) * 2000-10-03 2002-04-11 International Business Machines Corporation Characterization of phenotypes by gene expression patterns and classification of samples based thereon

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ISHIKAWA ET AL.: "Expression of MDA-7/IL-24 and Its Clinical Significance in Resected Non-Small Cell Lung Cancer", CLINICAL CANCER RESEARCH, vol. 11, pages 1198 - 1202, XP008131333 *
MA ET AL.: "Predicting Cancer Drug Response by Proteomic Profiling", CLINICAL CANCER RESEARCH, vol. 12, no. 15, 1 August 2006 (2006-08-01), pages 4583 - 4589, XP003025615 *
PAL ET AL.: "Boolean relationships among genes responsive to ionizing radiation in the NCI 60 ACDS", BIOINFORMATICS, vol. 21, no. 8, 2005, pages 1542 - 1549, XP008131353 *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2008027912A2 (fr) 2008-03-06
EP2062181A2 (fr) 2009-05-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2008027912A3 (fr) Prédiction de l'activité d'agents sur différents types de cellules et de tissus
NO20074999L (no) Metode og preparat for behandling av perifere vaskulaere sykdommer
WO2007009894A3 (fr) Nouveaux peptides utilises dans le traitement de l'obesite
EP3150204A3 (fr) Traitement du diabète chez des patients dont la régulation glycémique est insuffisante malgré une thérapie par un médicament antidiabétique oral ou non oral
WO2007109571A3 (fr) Procédés de prédiction et de suivi de la thérapie par l'inhibiteur de la tyrosine kinase
EP1558220A4 (fr) Compositions orales pour le traitement de maladies
WO2007146229A3 (fr) Marqueurs associés à des événements artério-vasculaires et procédés d'utilisation de ces marqueurs
RS20150135A1 (en) TREATMENT WITH ANTI-VEGF ANTIBODIES
BRPI0519656A2 (pt) terapia de combinaÇço compreendendo telmisartan e hidroclorotiazida
WO2005027839A3 (fr) Procedes et reactifs pour le traitement des troubles immuno-inflammatoires
WO2008021113A3 (fr) Méthodes transdermiques et systèmes pour traiter la maladie d'alzheimer
EP2331095A4 (fr) Certains inhibiteurs de kynurénine-3-monooxygénase, compositions pharmaceutiques, et procédés d'utilisation de ceux-ci
WO2003082078A3 (fr) Procede et compositions pour le diagnostic et le traitement du cancer bronchopulmonaire 'non a petites cellules' au moyen de profiles d'expression genique
WO2005116088A3 (fr) Methodes et compositions pour traiter des maladies et des troubles associes a des cellules exprimant siglec-8
CY1112184T1 (el) Πυριδοξαμινη για χρηση στην αγωγη της διαβητικης nεφροπαθειας στο διαβητη τυπου ii
WO2006048452A3 (fr) Nouveaux peptides utiles dans le traitement de l'obesite
WO2007011955A3 (fr) Implants contenant un medicament et leur procede d'utilisation
WO2008133928A3 (fr) Utilisation de glycoprotéines mucines en combinaison avec des agents thérapeutiques pour traiter les lésions épithéliales et les troubles d'altération de la fonction de la mucine
WO2007145992A8 (fr) Base génétique de la réponse au traitement chez des patients dépressifs
MXPA05008461A (es) Equipo para aplicar revestimiento de farmaco a un dispositivo medico en un cuarto del cirujano.
WO2007092427A3 (fr) Traitement de l'endotoxemie a l'aide d'agents neutralisant l'endotoxine
BRPI0610780A2 (pt) formulação farmacéutica em tablete desintegrante, e, métodos para tratar um paciente em necessidade de tratamento com olanzapina, e para produzir a formulação farmacêutica em tablete
WO2007081486A3 (fr) Administration orale de defensines pour traiter des maladies intestinales
WO2008016640A3 (fr) Traitement de l'insuffisance cardiaque progressive chronique
WO2007025229A3 (fr) Compositions et utilisations contre hsp27

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 07841494

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2007841494

Country of ref document: EP

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: RU

DPE1 Request for preliminary examination filed after expiration of 19th month from priority date (pct application filed from 20040101)