WO2007099852A1 - 固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法及び検査キット - Google Patents

固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法及び検査キット Download PDF

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Kazuto Nishio
Hideharu Kimura
Tomohide Tamura
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Definitions

  • the present invention relates to a method and a test kit for testing the sensitivity of a solid cancer to a tyrosine kinase inhibitor.
  • Lung cancer is the leading cause of death by organ in Japan due to malignant tumors, and the number of deaths due to lung cancer is increasing year by year.
  • Non-small cell lung cancer accounts for about 90% of lung cancer.
  • As a treatment only about one third of surgically resectable cases are found, and the remaining two thirds are found as locally advanced or metastatic advanced lung cancer.
  • Early detection Needless to say, early treatment is important, but even with recent advances in diagnostic imaging technology, the proportion of early lung cancer has increased, but it is necessary to advance treatment of advanced lung cancer. Sex is screaming.
  • Conventional anti-cancer drugs with cytotoxicity have an obvious life-prolonging effect on metastatic lung cancer and an improvement in symptoms caused by lung cancer, but the results are at the peak and new therapeutic strategies are needed.
  • Gefitiv Iressa TM was developed as an inhibitor of epidermal growth factor receptor (EGFR), and as a treatment for lung cancer with a new mechanism of action in 2002, it was the first in the world in Japan. First commercially available. Gefitinib has a dramatic effect in certain cases, but in some cases it causes drug-induced acute lung injury, and it has also become a new social issue as a social problem. Furthermore, this drug has been reported to be highly useful for 1) women, 2) adenocarcinoma, 3) non-smokers, 4) Japanese and other Orientals.
  • EGFR epidermal growth factor receptor
  • Tyrosine kinase inhibitors other than gefitinib particularly epidermal growth factor receptor inhibitors, have the same problems as gefitinib.
  • Non-patent Document 1 EGFR gene mutations in lung cancer tumor tissues have been reported as factors defining the antitumor effect of gefitib (Non-patent Document 1). E of tumor cells It has been suggested that cases in which GFR gene is overexpressed are also important as determinants of the antitumor effect of EGFR inhibitors such as gefitinib (Non-patent Document 2).
  • Non-Patent Document 1 N Engl J Med. 2004; 350 (21): 2129-2139
  • Non-Patent Document 2 J Natl Cancer Inst. 2005; 97 (9): 643-655
  • An object of the present invention is to provide a method and test kit for testing the sensitivity of a solid cancer to a tyrosine kinase inhibitor typified by getivib by using a sample that can be collected more easily, such as blood or normal tissue. Is to provide.
  • the gist of the present invention is as follows.
  • a continuous oligonucleotide primer having a length of at least 15 bases for specifically amplifying the HLA-DQA1 gene or a continuous polynucleotide having a length of at least 15 bases that specifically hybridizes to the HLA-DQA1 gene A test kit for susceptibility of a solid cancer containing a probe to a tyrosin kinase inhibitor.
  • a test kit for sensitivity to a tyrosine kinase inhibitor of a solid cancer comprising the antibody according to (10).
  • a cancer patient comprising a tyrosine kinase inhibitor and determined to be sensitive to a tyrosine kinase inhibitor for solid cancer by the method according to any one of (1) to (8) above.
  • a solid cancer therapeutic agent for application
  • a method and a test kit for examining the sensitivity of a solid cancer to a tyrosine kinase inhibitor can be provided, and an appropriate solid cancer treatment method can be selected.
  • the solid cancer that is the subject of the present invention is not particularly limited, for example, lung cancer (for example, adenocarcinoma, squamous cell carcinoma, large cell carcinoma), breast cancer, head and neck cancer, mesothelioma, colon cancer, ovary Cancer is mentioned
  • the HLA gene of the present invention includes DNA encoding HLA and mRNA transcribed from the DNA.
  • the diagnosis of solid cancer can be performed by an ordinary method. Diagnosis (Computed tomography, CT), positron emission tomography (PET), sputum cytology, transbronchial lung biopsy, percutaneous lung biopsy are performed.
  • HLA-DQa1 antigen or HLA-DQA1 gene in a sample derived from a subject was measured, and for a subject who showed a high value, a tyrosine kinase inhibitor was administered.
  • subjects with low levels can be treated with other therapies, such as anti-cancer drug treatment with cytotoxicity (e.g., cisplatin) to enable more appropriate solid cancer treatment.
  • cytotoxicity e.g., cisplatin
  • Examples of the subject include solid cancer patients, patients with precancerous symptoms, subjective symptoms, and patients suspected of having cancer by various tests.
  • a blood sample for example, a peripheral blood mononuclear cell separated from blood, a sample from which normal tissue force such as oral mucosa, hair, etc. is separated can be used.
  • Analyzing HLA-DQa1 antigen or HLA-DQA1 gene 'Measurement methods include, for example, ELISA, Western blotting, bioassay, radioimmunoassay, Enzymimmunoassay, immunoagglutination Method, fluorescent antibody method, electrophoresis method, DNA microarray method or quantitative RT (reverse transcriptase) PCR method, and preferably gene analysis using DNA microarray method.
  • an antibody for measuring HLA-DQa1 antigen for example, an antibody that specifically recognizes HLA-DQa1 antigen, or an antibody that recognizes entire HLA-DQ and an HLA-DQa1 antigen. Combination with non-antibody.
  • a method for measuring the expression level of the HLA-DQA1 gene it is preferable to use a continuous oligonucleotide primer or a HLA-DQA1 gene having a length of at least 15 bases for specifically amplifying the HLA-DQ A1 gene. Generating the HLA-DQA1 gene using a polynucleotide probe that is at least 15 bases long that specifically hybridizes. A method for measuring the current amount is mentioned.
  • Units and measurement values of the expression level of HLA-DQa1 antigen or HLA-DQA1 gene vary depending on the measurement method used.
  • solids administered with a tyrosine kinase inhibitor typified by gefitinib
  • data is usually collected on more than 10 cases, preferably more than 20 cases, and the response rate is better than the correlation between the effect of tyrosine kinase inhibitor and the expression level of HLA-DQa1 antigen or HLA-DQA1 gene in each case.
  • the cut-off value is preferably determined for each cancer of the same type. In addition, it is preferable to determine the cut-off value after measuring so that the bias is reduced in consideration of background factors and individual differences of solid cancer cases.
  • the tyrosine kinase inhibitor that is the subject of the present invention is preferably an epidermal growth factor receptor inhibitor, such as Gefitiv (Iressa TM ), Elguchitibu (Tarceno TM ;), ZD64 74 (Zatatima). TM ), lapatib and the like.
  • epidermal growth factor receptor inhibitor such as Gefitiv (Iressa TM ), Elguchitibu (Tarceno TM ;), ZD64 74 (Zatatima). TM ), lapatib and the like.
  • the test method of the present invention Prior to administration of the tyrosine kinase inhibitor, the test method of the present invention is performed, and as a result, only cancer patients whose solid cancer is determined to be sensitive to the tyrosine kinase inhibitor are treated with the tyrosine kinase inhibitor. By targeting, the effective rate can be increased and the number of side effects can be reduced.
  • test method of the present invention be performed prior to administration in product instructions such as package inserts of tyrosine kinase inhibitors and administered only to cancer patients determined to be sensitive as a result.
  • product instructions such as package inserts of tyrosine kinase inhibitors
  • the effective rate can be increased and the incidence of side effects can be decreased.
  • the immunoassay kit is composed of, for example, reagents such as a buffer solution (labeled antibody solution) containing a labeled antibody, a solid-phased antibody, a standard substance, etc. It includes a buffer solution for reacting the immobilized antibody, a color developing solution and a reaction stopping solution for enzyme reaction, a washing solution for washing the solid phase, a sample pretreatment agent, and the like. When these constituent reagents are lyophilized products, a solution for restoration may be attached.
  • reagents such as a buffer solution (labeled antibody solution) containing a labeled antibody, a solid-phased antibody, a standard substance, etc. It includes a buffer solution for reacting the immobilized antibody, a color developing solution and a reaction stopping solution for enzyme reaction, a washing solution for washing the solid phase, a sample pretreatment agent, and the like.
  • a solution for restoration may be attached.
  • the type and shape of the solid phase are not limited. Any known immunoassay kit may be used.
  • solid phases are plastic test tubes, polystyrene beads, polystyrene particles, polystyrene microplates, polyethylene terephthalate microphone port plates, polychlorinated bur microplates, magnetic particles, glass beads, cellulose particles, nitrocellulose membrane, cellulose Examples include paper and nylon film. It is also possible to use a test piece of a simple measurement kit based on the principle of Imunoguchi Matography.
  • a test kit for testing the sensitivity of HLA-DQA1 gene contained in a cancer patient sample is specific to the HLA-DQA1 gene.
  • the test kit preferably includes a continuous oligonucleotide primer having a length of at least 15 bases or a continuous polynucleotide probe having a length of at least 15 bases that specifically hybridizes to the HLA-DQA1 gene.
  • a continuous oligonucleotide primer having a length of at least 15 bases for example, those shown in SEQ ID NOs: 1 to L 1 can be selected, and at least 15 that specifically hybridize to the HLA-DQA1 gene can be selected.
  • the polynucleotide probe having a continuous base length include those shown in SEQ ID NOs: 1 to L1.
  • FIG. 1 is a graph showing the average expression value of each gene by antitumor effect.
  • FIG. 2 is a graph showing HLA-DQA1 expression levels by antitumor effect.
  • FIG. 3 is a diagram showing the results of survival analysis based on HLA-DQA1 levels.
  • HLA-DQA1 The average expression level of HLA-DQA1 gene with high expression level was 1374. 6 (259. 0 to 2928. 6) in the SDZPD group and 3493. 3 (2797. 7 to 4532. 2) in the PR group (Table 4). 1, Figure 2).
  • an expression value of 3,000 was determined as a cut-off value and examined in two groups. In that case, the sensitivity of PR was 75% and the specificity was 100% (Table 2).
  • survival analysis was performed in two groups with an expression level of 3,000 or more and less, both the recurrence-free survival period (Figure 3A) and overall survival period (Figure 3B) were significantly prolonged in the group with an expression value of 3,000 or more. It was. Based on these findings, we concluded that HLA-DQA1 expression level could be a predictor of the efficacy of Gefitiv against lung cancer.
  • HLA-DQA1 and gefitib sensitivity. Although there are not many reports on HLA gene expression and malignant tumors, the relationship with the HLA gene is considered interesting given that Gehitiv is highly effective for Orientals. The ability to predict susceptibility prior to administration allows the selection of patients suitable for getivib and leads to safe and effective treatment of gefitiv. Since this method uses peripheral blood, sample collection is safe and easy, and the burden on the subject patient is low. Also, small-molecule compounds (such as tyrosine kinase inhibitors, especially epidermal growth factor) that have similar mechanisms of action, such as L-Tube (Tarceva TM), ZD6474 (Zatatima TM ), and Lavativ (lapatib). It can also be applied to predict the therapeutic effect of receptors (EGFR) inhibitors. Since the expression level of the HLA-DQA1 gene is high, analysis at the level of this gene product (HLA-DQa1 antigen) is also possible.
  • EGFR receptors
  • the present invention is useful as a method and a test kit for testing the sensitivity of a solid cancer to a cancer therapeutic agent.

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Abstract

　より簡便に採取可能な検体、例えば血液、正常組織を用いることにより、ゲフィチニブに代表される固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法及び検査キットを提供する。 　癌患者の試料中に含まれるＨＬＡ－ＤＱＡ１遺伝子又はＨＬＡ－ＤＱα１抗原の発現量を測定し、当該発現量に応じて感受性を検査する。

Description

明 細 書
固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法及び 検査キット
技術分野
[0001] 本発明は、固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法及び 検査キットに関する。
背景技術
[0002] 肺癌は本邦の悪性腫瘍による臓器別の死因の第 1位であり、肺癌による死亡数は 年々増加しつつある。非小細胞肺癌は肺癌のうち約 90%を占める。その治療法とし て、外科的に切除可能な症例は約 3分の 1に過ぎず、残りの約 3分の 2は局所進行も しくは転移性の進行肺癌として発見される。早期発見 ·早期治療が重要であることは いうまでもないが、近年の画像診断技術の進歩をもってしても早期肺癌の比率は増 カロしたとはいいがたぐ進行肺癌の治療を進歩させる必要性が叫ばれている。細胞 毒性を有する従来の抗癌剤は転移性肺癌に対して明らかな延命効果と、肺癌による 症状を改善する効果を持つが、その成績は頭打ちであり、新しい治療戦略が必要と されてさた。
[0003] ゲフイチ-ブ（ィレッサ TM)は上皮成長因子受容体 (epidermal growth factor recepto r, EGFR)の阻害剤として開発され、新しい作用機序を持つ肺癌治療薬として 2002 年に世界に先立ち本邦で始めて市販された。ゲフイチニブはある特定の症例には劇 的な効果をもたらすが、薬剤性の急性肺障害を起こす症例もあり、社会問題にもなつ たことは記憶にも新しい。更に、本剤は 1)女性、 2)腺癌、 3)非喫煙者、 4)日本人を はじめとする東洋人に有用性が高いことが報告されている。
[0004] ゲフイチニブ以外のチロシンキナーゼ阻害剤、特に上皮成長因子受容体阻害剤も ゲフイチニブと同様の問題がある。
[0005] したがって、チロシンキナーゼ阻害剤をより有効に臨床応用するには適切な症例選 択が必要である。現在までにゲフイチ-ブの抗腫瘍効果規定因子として肺癌腫瘍組 織における EGFR遺伝子変異が報告されている（非特許文献 1)。また腫瘍細胞の E GFR遺伝子の過剰発現症例もゲフイチニブをはじめとする EGFR阻害剤の抗腫瘍 効果の規定因子として重要であることが示唆されて 、る (非特許文献 2)。
[0006] し力しながら、進行した非小細胞肺癌でこれらの遺伝子検査に耐えうるような十分 な腫瘍組織を採取することは容易ではな ヽ。本発明者らもこれらの解析を試みたが 実際に解析しえた症例は約 40%に過ぎな力つた。
非特許文献 1 : N Engl J Med. 2004; 350(21): 2129-2139
非特許文献 2 : J Natl Cancer Inst. 2005; 97(9): 643-655
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0007] 本発明の課題は、より簡便に採取可能な検体、例えば血液、正常組織を用いること により、固形癌のゲフイチ-ブに代表されるチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性 を検査する方法及び検査キットを提供することにある。
課題を解決するための手段
[0008] 本発明の要旨は以下のとおりである。
[0009] (1) 固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法であり、被 検者
由来の試料中に含まれる HLA—DQA1遺伝子又は HLA—DQ a 1抗原により感受 性を検査する方法。
[0010] (2) 被検者由来の試料中に含まれる HLA— DQA1遺伝子又は HLA— DQ a l抗 原の発現量を測定することを含む前記（1)記載の方法。
[0011] (3) チロシンキナーゼ阻害剤が上皮成長因子受容体阻害剤である前記（1)又は (2
)記載の方法。
[0012] (4) 上皮成長因子受容体阻害剤が、ゲフイチ-ブ (ィレッサ TM)、エル口チ-ブ (タル セバ TM)、 ZD6474 (ザタティマ TM)又はラパチ-ブ (lapati b)である前記（3)記載の 方法。
[0013] (5) 被検者由来の試料が血液試料である前記（1)〜 (4)のいずれか 1つに記載の 方法。
[0014] (6) 血液試料が被検者由来の血液から分離された末梢血単核球である前記（5)記 載の方法。
[0015] (7) 固形癌が肺癌である前記（1)〜（6)のいずれか 1つに記載の方法。
[0016] (8) HLA—DQA1遺伝子を特異的に増幅するための、少なくとも 15塩基長の連続 したオリゴヌクレオチドプライマー又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィ ズする少なくとも 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブを用 、て HLA— DQ
A1遺伝子の発現量を測定する前記（2)記載の方法。
[0017] (9) HLA—DQA1遺伝子を特異的に増幅するための、少なくとも 15塩基長の連続 したオリゴヌクレオチドプライマー又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィ ズする少なくとも 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブを含む固形癌のチロ シンキナーゼ阻害剤に対する感受性の検査キット。
[0018] (10) 前記（2)に記載の方法において使用するための、 HLA— DQ a l抗原に対 する抗体。
[0019] (11) 前記（10)に記載の抗体を含む固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感 受性の検査キット。
[0020] (12) チロシンキナーゼ阻害剤を含有し、前記（1)〜（8)のいずれか 1つに記載の 方法により固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性があると判定された癌 患者に適用するための固形癌治療剤。
発明の効果
[0021] 本発明によれば、固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方 法及び検査キットを提供することができ、適切な固形癌治療法を選択することができ る。
発明を実施するための最良の形態
[0022] 本発明の対象となる固形癌としては、特に制限はなぐ例えば、肺癌 (例えば、腺癌 、扁平上皮癌、大細胞癌）、乳癌、頭頸部癌、中皮腫、大腸癌、卵巣癌が挙げられる
[0023] 本発明の HLA遺伝子とは、 HLAをコードする DNA,当該 DNAを転写した mRN Aを含む。
[0024] 固形癌の診断は、通常の方法により行うことができ、例えば、肺癌の診断は、画像 診断（Computed tomography, CT)、ポジトロンェミッショントモグラフィー（PET)、喀 痰細胞診、経気管支肺生検、経皮的肺生検など力 行われる。
[0025] 本発明者らは、ゲフイチ-ブに代表されるチロシンキナーゼ阻害剤を投与された固 开癌症例のうち、治療に奏効した症例（partial response, PR)では、不変であった症 例及び増悪した症例（stable disease, SD及び progressive disease, PD)に比較して、 末梢血単核球に含まれる HLA—DQAl遺伝子の発現量が有意に高いことを見出し た。
[0026] したがって、被検者由来の試料中の HLA— DQ a 1抗原又は HLA— DQA1遺伝 子の発現量を測定し、高値を示した被検者にっ 、てはチロシンキナーゼ阻害剤の投 与により治療を行い、一方、低値を示した被検者については他の治療法、例えば細 胞毒性を有する抗癌剤治療 (例えば、シスブラチンなど)を行えば、より適切な固形癌 治療が可能になる。
[0027] 前記被検者としては、固形癌患者、前癌症状の患者、自覚症状、各種検査で癌と 疑われる患者が挙げられる。
[0028] 前記試料としては、血液試料、例えば血液から分離された末梢血単核球の他、口 腔粘膜、毛髪等の正常組織力も分離された試料を用いることができる。
[0029] HLA-DQ a 1抗原又は HLA— DQA1遺伝子を解析 '測定する手法としては、例 えば、 ELISA法、ウェスタンブロット法、バイオアツセィ、ラジオィムノアツセィ、ェンザ ィムィムノアツセィ、免疫凝集法、蛍光抗体法、電気泳動法、 DNAマイクロアレイ法 又は定量的 RT (reverse transcriptase) PCR法を用いた遺伝子解析が挙げられ、 好ましくは DNAマイクロアレイ法を用いた遺伝子解析が挙げられる。また、 HLA— D Q a 1抗原測定用の抗体としては、例えば、 HLA-DQ a 1抗原を特異的に認識す る抗体、又は HLA— DQ全体を認識する抗体と HLA— DQ a 1抗原を認識しない抗 体との組み合わせが挙げられる。
[0030] HLA— DQA1遺伝子の発現量を測定する手法としては、好ましくは、 HLA-DQ A1遺伝子を特異的に増幅するための、少なくとも 15塩基長の連続したオリゴヌタレ ォチドプライマ一又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィズする少なくと も 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブを用いて HLA— DQA1遺伝子の発 現量を測定する方法が挙げられる。
[0031] HLA-DQ a 1抗原又は HLA— DQA1遺伝子の発現量の単位及び測定値は、 用いる測定方法により異なる力 いずれの測定方法においても、ゲフイチニブに代表 されるチロシンキナーゼ阻害剤を投与した固形癌症例について、通常 10症例以上、 好ましくは 20症例以上のデータを集め、各症例のチロシンキナーゼ阻害剤の効果と HLA-DQ a 1抗原又は HLA— DQA1遺伝子の発現量の相関より例えば奏効率 が 80%となるように発現量の Cut off値を定めて、当該 cut off値よりも高値を示す患者 は、チロシンキナーゼ阻害剤の投与により治療を行い、当該 cut off値よりも低値を示 す患者は、他の治療法により治療を行うことにより効果的な固形癌治療が可能になる 。前記の cut off値を上げるに従い、チロシンキナーゼ阻害剤による治療対象は減少 するが、チロシンキナーゼ阻害剤による治療の有効率は向上する。 cut off値の決定 は同種の癌ごとに行うことが好ましい。また、固形癌症例の背景因子や個体差等を考 慮してバイアスが少なくなるように測定した上で、 cut off値を定めることが好ましい。
[0032] 例えば、 DNAマイクロアレイを用いることにより測定された HLA—DQA1遺伝子の 発現値を指標する場合には、発現値 3, 000を cut off値として、発現値が 3, 000以 上の患者は、チロシンキナーゼ阻害剤の投与により治療を行い、発現値が 3, 000未 満の患者は、他の治療法により治療を行うことにより効果的な肺癌治療が可能になる
[0033] また、ゲフイチ-ブに代表されるチロシンキナーゼ阻害剤を投与された肺癌症例の うち、治療に奏効した症例（partial response, PR)では、不変であった症例及び増悪 した症例（stable disease, SD及び progressive disease, PD)に比較して、末梢血単核 球に含まれる C2orf33、 GLS、 KIAA1117、 ALDH6A1、 PDCD5及び DKFZp7 61A078の発現量は、 HLA— DQA1遺伝子とは逆に、低値を示す傾向にあるので 、これらの遺伝子の発現量も併せて指標とすれば、より精度が向上する。
[0034] 本発明の対象となるチロシンキナーゼ阻害剤としては、好ましくは上皮成長因子受 容体阻害剤、例えばゲフイチ-ブ (ィレッサ TM)、エル口チ-ブ (タルセノ TM；)、 ZD64 74 (ザタティマ TM)、ラパチ-ブ (lapati b)などが挙げられる。
[0035] これらのチロシンキナーゼ阻害剤の用法 ·用量は、それぞれの一般的な用法'用量 に従えばよぐ例えばゲフイチ-ブ (ィレッサ TM)の場合、通常、成人にはゲフイチ-ブ として 250mgを 1日 1回、経口投与する。
[0036] チロシンキナーゼ阻害剤の投与前に、本発明の検査方法を実施して、その結果、 固形癌がチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性があると判定された癌患者のみを チロシンキナーゼ阻害剤による治療対象とすることにより、有効率が増加し、副作用 の発生数を減少させることができる。
[0037] また、チロシンキナーゼ阻害剤の添付文書等の製品説明書に、投与前に本発明の 検査方法を実施し、その結果、感受性があると判定された癌患者にのみ投与すること を推奨する旨を表示することにより、有効率が増加し、副作用の発生率を減少させる ことができる。
[0038] HLA-DQ a 1抗原の発現量の測定を、 ELISA法又はウェスタンブロット法を用 いて定量する場合には、 HLA— DQひ 1抗原に対する抗体を含む検査キットが用い られる。
[0039] 前記免疫測定キットは、例えば、標識抗体を含有する緩衝液 (標識抗体液)、固相 化抗体、標準物質などの試薬から構成され、更に必要に応じて、サンドイッチ法で検 体と固相化抗体を反応させるための緩衝液、酵素反応のための発色液や反応停止 液、固相を洗浄するための洗浄液、検体の前処理剤などを含んで構成される。これら の構成試薬が凍結乾燥品の場合、復元のための溶液も添付される場合がある。
[0040] 固相法に基づくキットの場合、固相の種類や形状は問わない。公知の通常免疫測 定キットに使われるものでよい。固相の例としてはプラスチック試験管、ポリスチレンビ ーズ、ポリスチレン粒子、ポリスチレンマイクロプレート、ポリエチレンテレフタレートマ イク口プレート、ポリ塩化ビュルマイクロプレート、磁性粒子、ガラスビーズ、セルロー ス粒子、ニトロセルロース膜、セルロース據紙、ナイロン膜などが挙げられる。ィムノク 口マトグラフィーなどを原理とする簡易測定キットの試験片を使用することも可能であ る。
[0041] 固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する検査キットであり、癌 患者の試料中に含まれる HLA—DQA1遺伝子により感受性を検査するキットとして は、例えば、 HLA— DQA1遺伝子に特異的なプライマーの対と、遺伝子増幅を行う ために必要とされる試薬とを含むキットが挙げられる。
[0042] 前記の検査キットは、好ましくは、少なくとも 15塩基長の連続したオリゴヌクレオチド プライマー又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィズする少なくとも 15塩 基長の連続したポリヌクレオチドプローブを含む。前記少なくとも 15塩基長の連続し たオリゴヌクレオチドプライマーとしては、例えば配列番号 1〜： L 1に示したもの力 選 択することができ、前記 HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィズする少なくと も 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブとしては、例えば配列番号 1〜： L 1に 示したものが挙げられる。
図面の簡単な説明
[0043] [図 1]抗腫瘍効果別にみた各遺伝子の平均発現値を示す図である。
[図 2]抗腫瘍効果別による HLA— DQA1発現値を示す図である。
[図 3]HLA— DQA1レベルによる生存解析の結果を示す図である。
実施例
[0044] 以下、実施例を挙げて本発明を更に具体的に説明するが、本発明の範囲は下記 の実施例に限定されるものではない。
[0045] (実施例 1)
1.症例と方法
今回検討したのは金沢大学医学部附属病院呼吸器内科でゲフイチニブを投与さ れた非小細胞肺癌症例である。治療に先立ち、病名や他の治療法、予後などについ て説明し、更に末梢血単核球を用いた検討を行うことに同意を得た症例を対象とした
[0046] 末梢血単核球は治療前に採血し、直ちに比重遠心法を用いて、単核球を分離した 。分離した単核球から RNAを既法（T- L. Fongら， J. Clin. Invest., 88, 1058, 1991)に 従って抽出し、逆転写酵素を用いて DNAを合成した。この DNAを、 Alfymetrix社製 DNAマイクロアレイ（HG-U133 Plus 2.0)を用いて約 55000の遺伝子を網羅的に解 祈した。解析可能であった 24症例を、治療に奏効した症例 (partial response, PR)と 、不変であった症例及び増悪した症例（stable disease, SD及び progressive disease, PD)とに分類し、 tテストで統計解析した。有意水準は 0. 001未満とした。 [0047] 2.結果
1)解析した 24症例中 8例が PR、 16例が SD及び PD (SDZPD)と判定した。網羅的 遺伝子解析の発現結果と抗腫瘍効果との相関を解析した。その結果、 7遺伝子で抗 腫瘍効果と相関が得られた (表 1、図 1)。 7つの遺伝子のうち HLA—DQA1遺伝子 以外は発現量が少なく DNAマイクロアレイの検出限界以下と判断した。そこで、 HL A—DQA1遺伝子に注目し、更に解析を行った。
[表 1] 抗腫瘍効果関連遺伝子
平均発現値
Rank Symool p-value Ratio* Description
SD PD PR
1 C2orf33 0.00024 48.6 28.8 1.688 Chromosome 2 open reading frame
33
2 HLA-DQA1 0.00032 1374.6 3493.3 0.393 Major histocompatibility complex,
class II, DQ alpha 1
3 GLS 0.00049 40.5 19.5 2.077 Glutaminase
4 ΚΙΑΑ1Π7 0.00051 32.8 19.5 1.682 KIAA1117
5 ALDH6A1 0.00064 31.7 19.6 1.617 Aldehyde dehydrogenase 6 family,
member A 1
6 PDCD5 0.00072 52.9 35.4 1.494 Programmed cell death 5
7 DKFZp761A078 0.00084 38.2 24.4 1.579 Hypothetical protein
DKFZp761A078
8 HLA-DQA2 0.7863 4668.7 4204.6 1.110 Major histocompatibility complex,
class II, DQ alpha 2
9 HLA-DQB1 0.1932 2831.4 1276.3 2.218 Major histocompatibility complex,
class II, DQ beta 1
10 HLA-DRA1 0.1925 14441.6 11544.4 1.251 Major histocompatibility complex,
class II, DR alpha 1
11 HLA-DRB4 0.8734 8197.9 7747.5 1.058 Major liistocompatibility complex.
class II, D beta 4
* [SD/PD] PR
[0048] 2) HLA— DQA1遺伝子の検討
発現量の高かった HLA— DQA1遺伝子の平均発現値は SDZPD群で 1374. 6 ( 259. 0〜2928. 6)、 PR群で 3493. 3 (2797. 7〜4532. 2)であった（表 1、図 2)。 その結果から、発現値の 3, 000を cut off値に定めて 2群に分けて検討した。その場 合、 PRの感度は 75%、特異度は 100%であった (表 2)。発現値 3, 000以上と未満 の 2群で生存分析を行った場合、無再発生存期間（図 3A)、全生存期間（図 3B)とも に有意に発現値 3, 000以上の群で延長していた。 これらのことより、 HLA— DQA1発現レベルはゲフイチ-ブの肺癌に対する有効性 の予測因子となりうると結論付けた。
[表 2]
HLA-DQA1発現と抗腫瘍効果
PR SD/PD
HLA-DQA1発現
>3000 6 0
く 3000 2 16
[0050] 3.考察
現在のところ、ゲフイチ-ブ投与患者における感受性予測因子として確立したもの はない。前記のごとく EGFR遺伝子変異や遺伝子増幅は感受性予測因子となりうる 可能性は高いが実際の臨床現場においては、その手技の複雑さから標準的な手法 とはなりえない。また肺癌の腫瘍組織は採取が困難である。進行肺癌の症例では診 断のため気管支鏡を用いた組織採取が行われるが、採取可能な組織は極めて少量 (l〜3mm大)であり、また採取された組織は腫瘍以外の間質 (血管や支持組織)を 含むため、腫瘍組織の解析は困難を極めるのが現状である。またこれらの組織すら 採取できな!/ヽこともまれではな ヽ。今回本発明者らが行った末梢血単核球を用いた 検討は、特別な設備を要することなくどこでも採取可能であるというメリットがある。
[0051] HLA—DQA1とゲフイチ-ブ感受性に関して報告されたものはない。 HLA遺伝子 発現と悪性腫瘍に関しても報告は多くないが、ゲフイチ-ブが東洋人に有効性が高 いことを考えると、 HLA遺伝子との関連は興味深いと考える。投与前に感受性を予 測できることは、ゲフイチ-ブ投与に適した患者を選択できることになり、ゲフイチ-ブ の治療を安全で有効に行うことにつながる。本方法は末梢血を用いるため、検体の 採取が安全かつ容易であり対象患者の負担は少ない。また、エル口チ-ブ (タルセバ ™；)、 ZD6474 (ザタティマ TM)、ラバチ-ブ (lapati b)など、同様の作用機序を有す る小分子化合物 (チロシンキナーゼ阻害剤、特に上皮成長因子受容体 (EGFR)阻 害剤）の治療効果予測にも適用できる。 HLA—DQA1遺伝子の発現量が高いこと から、本遺伝子産物（HLA— DQ a 1抗原）レベルでの解析も可能である。
[0052] 本明細書中で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願をそのまま参考として本 明細書中に取り入れるものとする。
産業上の利用可能性
本発明は、固形癌の癌治療薬に対する感受性を検査する方法及び検査キットとし て有用である。

Claims

請求の範囲
[I] 固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性を検査する方法であり、被検者 由来の試料中に含まれる HLA—DQA1遺伝子又は HLA—DQ a 1抗原により感受 性を検査する方法。
[2] 被検者由来の試料中に含まれる HLA— DQA1遺伝子又は HLA— DQ a 1抗原 の発現量を測定することを含む請求項 1記載の方法。
[3] チロシンキナーゼ阻害剤が上皮成長因子受容体阻害剤である請求項 1又は 2記載 の方法。
[4] 上皮成長因子受容体阻害剤が、ゲフイチ-ブ (ィレッサ TM)、エル口チ-ブ (タルセ バ ）、 ZD6474 (ザタティマ TM)又はラパチ-ブ (lapati b)である請求項 3記載の方 法。
[5] 被検者由来の試料が血液試料である請求項 1〜4の 、ずれか 1項に記載の方法。
[6] 血液試料が被検者由来の血液から分離された末梢血単核球である請求項 5記載 の方法。
[7] 固形癌が肺癌である請求項 1〜6のいずれか 1項に記載の方法。
[8] HLA— DQA1遺伝子を特異的に増幅するための、少なくとも 15塩基長の連続し たオリゴヌクレオチドプライマー又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィズ する少なくとも 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブを用 、て HLA— DQA
1遺伝子の発現量を測定する請求項 2記載の方法。
[9] HLA— DQA1遺伝子を特異的に増幅するための、少なくとも 15塩基長の連続し たオリゴヌクレオチドプライマー又は HLA— DQA1遺伝子に特異的にハイブリダィズ する少なくとも 15塩基長の連続したポリヌクレオチドプローブを含む固形癌のチロシ ンキナーゼ阻害剤に対する感受性の検査キット。
[10] 請求項 2に記載の方法において使用するための、 HLA— DQ a 1抗原に対する抗 体。
[I I] 請求項 10に記載の抗体を含む固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性 の検査キット。
[12] チロシンキナーゼ阻害剤を含有し、請求項 1〜8のいずれか 1項に記載の方法によ り固形癌のチロシンキナーゼ阻害剤に対する感受性があると判定された癌患者に適 用するための固形癌治療剤。
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