WO2007074185A1 - Antimicrobial cyclic peptides - Google Patents

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WO2007074185A1
WO2007074185A1 PCT/ES2006/000686 ES2006000686W WO2007074185A1 WO 2007074185 A1 WO2007074185 A1 WO 2007074185A1 ES 2006000686 W ES2006000686 W ES 2006000686W WO 2007074185 A1 WO2007074185 A1 WO 2007074185A1
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plants
peptides
group
peptide
phe
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PCT/ES2006/000686
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Inventor
Eduard BARDAJÍ RODRÍGUEZ
Emili MONTESINOS SEGUÍ
Marta Planas Grabuleda
Esther Badosa Romacho
Lidia Feliu Soley
Sylvie Martine Colette Monroc
Original Assignee
Universitat De Girona
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    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01NPRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N43/00Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing heterocyclic compounds
    • A01N43/713Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing heterocyclic compounds having rings with four or more nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
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    • A61P31/10Antimycotics
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/12Cyclic peptides with only normal peptide bonds in the ring
    • C07K5/126Tetrapeptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/64Cyclic peptides containing only normal peptide links
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Definitions

  • Agriculture is a process for food production by growing certain plants.
  • a common problem in agriculture is the reduction in yield caused by attacks by pathogenic microorganisms for plants, for example bacteriosis caused by the bacteria Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria, or Clavibacter michiganensis, or mycosis caused by various fungi as Fusarium oxysporum.
  • pathogenic microorganisms for plants for example bacteriosis caused by the bacteria Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria, or Clavibacter michiganensis, or mycosis
  • Another object of the invention is the use of said peptides as antimicrobial agents.
  • a phytosanitary composition comprising the peptides of the invention is also the subject of the invention.
  • Also part of the object of the invention is a method for preventing and treating infections and diseases of plants caused by bacteria and fungi.
  • Lys means L-lysine
  • Leu is L-leucine
  • Phe is L-phenylalanine
  • D-Phe is D-phenylalanine
  • GIn is L-glutamine.
  • Fmoc-Rink-Linker (CAS number: 145469-56-3) marketed by Senn Chemicals (Switzerland).
  • Said spacer once linked with its carboxylic group to an amino group of the MBHA resin, has a free amino group that allows the anchoring of an amino acid having a free carboxylic group.
  • the amino acid has a free carboxylic group in the side chain, such as glutamic acid or aspartic acid, then it can be attached to the solid support through said side chain, keeping the other carboxylic group and the amino group available for the formation of new peptide bonds.
  • a free carboxylic group in the side chain such as glutamic acid or aspartic acid
  • the Fmoc protecting group is then removed from the ⁇ -amino group of glutamic acid, and the next amino acid of the peptide having the ⁇ -amino group protected by the Fmoc group is incorporated.
  • the bond is established between the carboxylic group of the new amino acid and the amino group of glutamic acid.
  • the cleavage of the solid support peptide is carried out under acidic conditions and involves breaking the bond between the amino group and the benzidrile group of the linker, leading to the formation of the glutamine residue (CiIn), which is present in the peptide of the invention, as can be seen in the general formula (I).
  • the Boc groups are removed from the lysine residues.
  • the peptides of the invention are obtained in good yield, usually between 70% and 80%, in the form of powder solids, and are characterized by HPLC analysis, mass spectrometry (ESI- MS, MALDI-TOF or FAB-MS).
  • the peptides of the invention have an antimicrobial activity, which is particularly effective against plant pathogenic microorganisms such as the Fusarium oxysporum fungus, and the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
  • Erwinia amylovora is a gram-negative bacterium that causes the disease known as Bacterial Fire that affects plants of the Rosaceae family, among which are fruit trees of great economic importance such as apple and pear, and ornamental plants such as rowan , hawthorn, mustard, etc.
  • Pseudomonas syringae is a gram-negative bacterium that causes a large number of diseases called bacterial necrosis in horticultural and woody crop plants such as fruit trees.
  • the pathogenicity of P. syringae resides in many cases in its ice nucleating activity (INA +) that enhances frost damage and the production of various phytotoxins such as syringomycins.
  • Said auxiliary agent can be selected from the group consisting of: solvents, diluents, inert fillers, wetting surfactants, buffering agents, dispersing agents, anti-caking agents, lubricants, ultraviolet radiation filters, and / or mixtures thereof.
  • auxiliary agent is selected from the group consisting of solvents, surfactants, buffering agents, ultraviolet radiation filters and / or mixtures thereof.
  • compositions may be presented in liquid form or in solid form.
  • the composition of the invention can be presented in the form of a diluted composition ready to be used, or in the form of a concentrated composition, which requires dilution before being used, usually with water.
  • the hemolytic activity of the peptides is a characteristic that is generally determined for those compounds that may come into contact with the human body. This would be the case if fruits or vegetables treated with the peptides of the invention contained traces thereof and were consumed by people, or when manipulated by operators during their application or preparation.
  • the said hemolytic activity has been evaluated by determining the release of hemoglobin that is produced by contacting a solution of said peptides in TRIS buffer with 5% volume / volume red blood cell suspensions from fresh human blood. The result of this determination is expressed as the percentage of hemolysis that occurs for a given concentration of peptide.
  • the Lantern fragment was then placed in a closed container containing 1 ml of a 49 mg NMP solution of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg of HBTU (120 mM), and 42 ⁇ l DIEA (240 mM). After 24 hours, the fragment was washed with NMP (3 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min). The following coupling steps with the rest of the amino acids were carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling and washing, as already described above.
  • the vial was placed in an appropriate container for microwave radiation.
  • a microwave radiation ramp was applied for a maximum of 500 watts for 5 minutes, to reach a temperature of 50 ° C.
  • the power of the microwave radiation was regulated by a thermostat that was set at a maximum temperature of 50 ° C. Irradiation was continued to maintain the temperature at 50 ° C for 15 minutes.
  • the reaction mass was cooled to room temperature, and two 15 minute cycles of microwave radiation were applied.
  • Lantern fragments were marked with spindles and colored cogs, marketed by Mimotopes, to identify positions that contained a leucine residue.
  • E. amylovora PMV6076 and P. syringae were obtained after 24 hour growth at 25 ° C, and the X.vesicatoria sample 2323-3 was collected after 48 hours at 25 ° C on LB agar. In all cases, they were resuspended in sterile water to obtain a suspension adjusted to an absorbance of 0.2 to 600 nm, corresponding to approximately 10 8 colony forming units / ml.
  • the peptides were solubilized in sterile milli-Q water to a final concentration of 1000 ⁇ M and filtered through a 0.22 ⁇ m pore filter.
  • the strain of the fungus Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici FOL 3 race 2 (ATCC 201829, isolated in Spain), first in the middle of agar-potato-dextrose (PDA).
  • the microspores were obtained after a growth in dextrose and potato broth (PDB) for 7 days at 25 ° C on a rotary shaker at 125 rpm.
  • the spore suspension was filtered and adjusted to 10 4 microspores / ml using the Thoma counting chamber.
  • the peptides of the invention inhibit the growth of the pathogenic fungus for Fusarium oxysporum plants.
  • H 1 OQxKQp-ObV (Om-Ob)] where Op was the optical density measured for a given peptide concentration, Ob was the optical density of the buffer solution, and Om was the optical density for the positive control with melitin.

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Abstract

The invention relates to novel cyclic peptides with antimicrobial properties. The inventive peptides contain an even number of between 4 and 10 amino acids and a have a molar lysine concentration of between 40 % and 60 %. The invention also relates to the synthesis and use of the aforementioned peptides as antimicrobial agents against bacterial and fungi that are pathogenic to plants. The invention further relates to compositions containing said peptides and an auxiliary agent and to a method for preventing and treating infections and diseases in plants caused by pathogenic bacteria and fungi.

Description

PÉPTIDOS CÍCLICOS ANTIMICROBIANOS ANTIMICROBIAL CYCLIC PEPTIDES
Campo de la técnicaTechnical field
La presente invención se refiere a péptidos cíclicos que son tienen propiedades antimicrobianas, y que son particularmente eficaces frente a bacterias y hongos patógenos para las plantas.The present invention relates to cyclic peptides that are have antimicrobial properties, and that are particularly effective against pathogenic bacteria and fungi for plants.
Estado de la técnica anteriorPrior art
La agricultura es un proceso para la producción de alimentos mediante el cultivo de ciertas plantas. El paso de la agricultura de subsistencia en la que se producía solamente lo necesario para satisfacer las necesidades del agricultor y de su familia, a la agricultura industrial que implica la existencia de grandes extensiones cultivadas, ha conducido a la necesidad de controlar las enfermedades de las plantas de forma efectiva a gran escala. Un problema común en la agricultura es la reducción en el rendimiento causada por los ataques por microorganismos patogénicos para las plantas, por ejemplo las bacteriosis causadas por las bacterias Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria, o Clavibacter michiganensis, o micosis causadas por diversos hongos como Fusarium oxysporum. Actualmente en Europa solamente están autorizados algunos productos para la protección de las plantas contra enfermedades bacterianas basados principalmente en derivados cúpricos con una eficacia de control insuficiente.Agriculture is a process for food production by growing certain plants. The transition from subsistence agriculture in which only what was necessary to meet the needs of the farmer and his family was produced, to industrial agriculture that implies the existence of large cultivated areas, has led to the need to control the diseases of Plants effectively on a large scale. A common problem in agriculture is the reduction in yield caused by attacks by pathogenic microorganisms for plants, for example bacteriosis caused by the bacteria Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria, or Clavibacter michiganensis, or mycosis caused by various fungi as Fusarium oxysporum. Currently in Europe only some products are authorized for the protection of plants against bacterial diseases based mainly on cupric derivatives with insufficient control efficacy.
Antibióticos, como kasugamicina o estreptomicina, que hasta hace pocos años estaban autorizados en algunos países, en la actualidad no están autorizados en Europa. Los antibióticos estreptomicina y tetraciclina sí que están autorizados en países como los EE.UU., pero en numerosos casos se ha puesto de manifiesto la aparición de cepas resistentes del patógeno que hacen su uso inefectivo, o que pueden suponer un riesgo de transferencia de dicha resistencia a otras bacterias patógenas. En el caso de las micosis causadas por hongos fitopatógenos, si bien existen materias activas disponibles, se requieren continuamente nuevos fungicidas, en parte por la aparición de resistencias con una cierta frecuencia. Además, muchos de los compuestos antifungicos y antibacterianos conocidos más efectivos presentan una persistencia en el medio ambiente que no es deseable.Antibiotics, such as kasugamycin or streptomycin, which until a few years ago were authorized in some countries, are currently not authorized in Europe. The antibiotics streptomycin and tetracycline are authorized in countries such as the US, but in many cases the emergence of resistant strains of the pathogen that make their use ineffective, or that may pose a risk of transfer of such resistance to other pathogenic bacteria. In the case of mycoses caused by phytopathogenic fungi, although there are active substances available, new fungicides are continually required, partly due to the occurrence of resistance with a certain frequency. In addition, many of the most effective known antifungal and antibacterial compounds have a persistence in the environment that is undesirable.
Otra forma de controlar las enfermedades causadas por los microorganismos patógenos de los vegetales consiste en el empleo de compuestos aislados de la propia naturaleza, por ejemplo los péptidos, que están presentes en plantas y animales, y algunos de los cuales presentan propiedades antimicrobianas.Another way of controlling the diseases caused by the pathogenic microorganisms of plants is the use of isolated compounds of their own nature, for example peptides, which are present in plants and animals, and some of which have antimicrobial properties.
En Broekaert et al, Plant. Physiol., 1995, 108, 1353-1358, se describeIn Broekaert et al, Plant. Physiol., 1995, 108, 1353-1358, is described
' una familia de péptidos denominados defensinas vegetales que tienen una actividad antifungica elevada. Dichos péptidos están constituidos por secuencias que comprenden entre 45 y 54 aminoácidos, y presentan puentes disulfuro formados entre dos aminoácidos cisteína situados en distintos puntos de la estructura.'a family of peptides called plant defensins that have a high antifungal activity. Said peptides are constituted by sequences comprising between 45 and 54 amino acids, and have disulfide bridges formed between two cysteine amino acids located at different points of the structure.
En la solicitud de patente WO-A-95/11306 se describe un péptido de 30 aminoácidos aislado de la remolacha, que presenta propiedades bactericidas y fungicidas frente a microorganismos patógenos de los vegetales.Patent application WO-A-95/11306 describes a 30 amino acid peptide isolated from beet, which has bactericidal and fungicidal properties against pathogenic microorganisms of plants.
En la solicitud de patente WO-A-99/59412 se describe un péptido extraído de Poenibacillus polymyxa que inhibe las enfermedades causadas por hongos en plantas. Dicho péptido consta de un anillo formado por seis aminoácidos, y de una cadena lateral formada por dos aminoácidos. En la solicitud de patente WO-A-97/30082 se describe la aplicación para el empleo en agricultura de un péptido formado por 25 aminoácidos aislado de un escorpión.In patent application WO-A-99/59412 a peptide extracted from Poenibacillus polymyxa is described which inhibits fungal diseases in plants. Said peptide consists of a ring formed by six amino acids, and a side chain formed by two amino acids. Patent application WO-A-97/30082 describes the application for use in agriculture of a peptide formed by 25 amino acids isolated from a scorpion.
Otra forma de actuar contra los microorganismos patógenos de las plantas consiste en el empleo de compuestos resultantes de la modificación de péptidos o proteínas antimicrobianos aislados de la naturaleza. Por ejemplo como se describe en:Another way of acting against plant pathogenic microorganisms is the use of compounds resulting from the modification of peptides or antimicrobial proteins isolated from nature. For example as described in:
- la solicitud de patente EP-A-0472987, que se refiere a péptidos lineales de 23 aminoácidos, que son modificaciones de péptidos naturales pertenecientes al grupo de la magainina, la solicitud de patente WO-A-02/06324, que se refiere a péptidos lineales de 44 aminoácidos derivados del péptido natural denominado heliomicina, o- patent application EP-A-0472987, which refers to linear peptides of 23 amino acids, which are modifications of natural peptides belonging to the magainin group, patent application WO-A-02/06324, which refers to linear peptides of 44 amino acids derived from the natural peptide called heliomycin, or
- la patente norteamericana US6015941, que se refiere a péptidos lineales formados por 17 aminoácidos derivados de la taquiplesina. Como se describe en WO-A-96/008264, uno de los problemas de la utilización de compuestos antifüngicos y antibacterianos de origen natural es la limitación en cuanto a las cantidades comerciales disponibles, en parte debido a problemas de obtención y purificación. Otra aproximación para disponer de péptidos antimicrobianos consiste en prepararlos por vía sintética.- US patent US6015941, which refers to linear peptides formed by 17 amino acids derived from taquiplesin. As described in WO-A-96/008264, one of the problems of the use of antifungal and antibacterial compounds of natural origin is the limitation as to the commercial quantities available, partly due to problems of obtaining and purification. Another approach to dispose of antimicrobial peptides is to prepare them synthetically.
En el contexto del desarrollo de péptidos con actividad antimicrobiana de amplio espectro, en la solicitud de patente WO-A-98/03192 se describen péptidos cíclicos formados por un número de aminoácidos comprendido entre 10 y 30, que pueden aplicarse para el tratamiento de infecciones y enfermedades microbianas en plantas causadas por bacterias y hongos. Los péptidos formados por secuencias de 10 aminoácidos comprenden combinaciones de los aminoácidos: alanina, arginina, cisterna, fenilalanina, glicina, leucina, lisina, ornitina, prolina, serina, tirosina, treonina, triptófano, valina y D-arginina. Sin embargo, los ensayos de actividad antimicrobiana sólo se realizan frente a bacterias patógenas para el ser humano, y no se describe su actividad frente a bacterias y/o hongos patógenos para las plantas.In the context of the development of peptides with broad spectrum antimicrobial activity, in the patent application WO-A-98/03192 cyclic peptides formed by an amino acid number between 10 and 30, which can be applied for the treatment of infections are described and microbial diseases in plants caused by bacteria and fungi. Peptides formed by sequences of 10 amino acids comprise combinations of the amino acids: alanine, arginine, cistern, phenylalanine, glycine, leucine, lysine, ornithine, proline, serine, tyrosine, threonine, tryptophan, valine and D-arginine. However, antimicrobial activity tests are only carried out against pathogenic bacteria for humans, and their activity against pathogenic bacteria and / or fungi for plants is not described.
En el marco de diseñar nuevos péptidos antimicrobianos, en Frecer et al, Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 3349-3357, se describen péptidos constituidos por 19 aminoácidos, que comprenden la agrupación de aminoácidos glicina-serina-glicina en el centro de la molécula, y tienen estructura cíclica debido a la formación de un puente disulfuro entre los aminoácidos cisterna que se encuentran en posición terminal. Dichos péptidos presentan una buena eficacia frente a bacterias gram- positivas, que los hace susceptibles de ser aplicados en medicina, pero no se describe su actividad frente a hongos o a bacterias patógenas de los vegetales. Subsiste pues la necesidad de disponer de compuestos que sean efectivos frente a infecciones y enfermedades de las plantas provocadas por microorganismos como bacterias y hongos, y que sean fáciles de sintetizar.Within the framework of designing new antimicrobial peptides, in Frecer et al, Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 3349-3357, peptides consisting of 19 amino acids are described, which comprise the glycine-serine-glycine amino acid cluster at the center of the molecule, and have cyclic structure due to the formation of a disulfide bridge between the cistern amino acids that are in the terminal position. These peptides have a good efficacy against gram-positive bacteria, which makes them susceptible to being applied in medicine, but their activity against fungi or pathogenic bacteria of plants is not described. There remains a need for compounds that are effective against infections and diseases of plants caused by microorganisms such as bacteria and fungi, and that are easy to synthesize.
Los autores de la presente invención han desarrollado péptidos que resultan de fácil preparación y que presentan una elevada eficacia para inhibir el crecimiento de microorganismos patógenos de las plantas. Objeto de la invenciónThe authors of the present invention have developed peptides that are easy to prepare and have a high efficacy to inhibit the growth of plant pathogenic microorganisms. Object of the invention
El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos cíclicos que presentan propiedades antimicrobianas.The object of the present invention is to provide cyclic peptides that have antimicrobial properties.
Otro objeto de la invención es la utilización de dichos péptidos como agentes antimicrobianos.Another object of the invention is the use of said peptides as antimicrobial agents.
También es objeto de la invención una composición fítosanitaria que comprende los péptidos de la invención.A phytosanitary composition comprising the peptides of the invention is also the subject of the invention.
Forma parte también del objeto de la invención un método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de las plantas causadas por bacterias y hongos.Also part of the object of the invention is a method for preventing and treating infections and diseases of plants caused by bacteria and fungi.
Descripción de las figurasDescription of the figures
Figura 1Figure 1
En la Figura 1 se muestra la estructura de los 56 decapéptidos cíclicos pertenecientes a la quimioteca preparada empleando el procedimiento Multipin™, en el que se emplean las SynPhase™ Lanterns comercializadas por la empresa Mimotopes (Australia), como soporte sólido.Figure 1 shows the structure of the 56 cyclic decapeptides belonging to the library prepared using the Multipin ™ procedure, in which the SynPhase ™ Lanterns marketed by the company Mimotopes (Australia) are used as solid support.
Descripción detallada de la invenciónDetailed description of the invention
Péptidos El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos cíclicos que tienen un contenido molar de Usina comprendido entre el 40% y el 60%, y que responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn)] (I) donde: X es Lys o Leu, Y es Phe o D-Phe, n = 1, 3, o 5, m = 1, 3, o 5, y n + m = 2, 4, 6 o 8.Peptides The object of the present invention is to provide cyclic peptides that have a Usine molar content between 40% and 60%, and that respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X ) m - GIn)] (I) where: X is Lys or Leu, Y is Phe or D-Phe, n = 1, 3, or 5, m = 1, 3, or 5, and n + m = 2, 4 , 6 or 8.
El término "ciclo" que se encuentra al principio de la secuencia de aminoácidos en la fórmula general (I) significa que el péptido es cíclico, de modo que el grupo α-carboxílico del aminoácido GIn está unido mediante un enlace peptídico con el grupo α-amino del primer aminoácido X perteneciente al grupo (X)n. Las abreviaturas empleadas para los aminoácidos en esta descripción siguen la normativa de la Comisión para la Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-The term "cycle" found at the beginning of the amino acid sequence in the general formula (I) means that the peptide is cyclic, so that the α-carboxylic group of the amino acid GIn is linked by a peptide bond with the α group -amino of the first amino acid X belonging to group (X) n . The abbreviations used for the amino acids in this description follow the regulations of the Commission for the Biochemical Nomenclature of the IUPAC-
IUB, según se describe en J. Biol. Chem., 1972, 247, 977-983. De esta forma, Lys significa L-lisina, Leu es L-leucina, Phe es L-fenilalanina, D-Phe es D-fenilalanina, y GIn es L-glutamina.IUB, as described in J. Biol. Chem., 1972, 247, 977-983. In this way, Lys means L-lysine, Leu is L-leucine, Phe is L-phenylalanine, D-Phe is D-phenylalanine, and GIn is L-glutamine.
Los compuestos que pertenecen a este grupo de péptidos presentan actividad antimicrobiana.Compounds belonging to this group of peptides have antimicrobial activity.
Dicha actividad es particularmente efectiva frente a microorganismos patógenos de las plantas como por ejemplo el hongo Fusarium oxysporum, y las bacterias Erwinia amylovora, Clavihacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.This activity is particularly effective against plant pathogenic microorganisms such as the fungus Fusarium oxysporum, and the bacteria Erwinia amylovora, Clavihacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu, Y es Phe, y m = l, yn = l, o m = 3, yn = 1, 3, o 5. Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu,Preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X) m -GIn] (I) where: X is Lys or Leu, Y is Phe, ym = l, and n = l , om = 3, and n = 1, 3, or 5. More preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X) m -GIn] (I) where: X is Lys or Leu,
Y es Phe, y m = 3, yn = 5.Y is Phe, and m = 3, and n = 5.
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 23, y cuya estructura se muestra en la Tabla I:Among the peptides of the invention that are preferred are those defined by the amino acid sequences SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 23, and whose structure is shown in Table I:
TABLA ITABLE I
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Los péptidos objeto de la invención son cíclicos y comprenden entre 4 y aminoácidos, y tienen un contenido molar de Usina comprendido entre el 40% y el %. Esto significa que en el caso de un péptido de 4, 6 o 8 aminoácidos, el péptido contiene dos, tres o cuatro residuos de lisina respectivamente, que representa el 50% molar de lisina en todos los casos.The peptides object of the invention are cyclic and comprise between 4 and amino acids, and have a Usine molar content of between 40% and%. This means that in the case of a 4, 6 or 8 amino acid peptide, the peptide contains two, three or four lysine residues respectively, which represents 50% molar lysine in all cases.
En el caso de un péptido de 10 aminoácidos, el péptido puede contener 4, 5 o 6 residuos de lisina, que responde respectivamente al 40%, 50% o 60% molar de lisina.In the case of a 10 amino acid peptide, the peptide may contain 4, 5 or 6 lysine residues, which respond respectively to 40%, 50% or 60% molar lysine.
Para describir la estructura de los péptidos de la invención se va a emplear como ejemplo el péptido ciclo(Lys-Phe-Lys-Gln), que corresponde a la fórmula general (I) en la que n = m = 1, n+m = 2, X es Lys, e Y es Phe. Se trata de un péptido cíclico que comprende 4 aminoácidos. Los enlaces peptídicos que forman la estructura de este péptido en el sentido de izquierda a derecha son los siguientes:To describe the structure of the peptides of the invention, the peptide cycle (Lys-Phe-Lys-Gln), which corresponds to the general formula (I) in which n = m = 1, n + m, will be used as an example = 2, X is Lys, and Y is Phe. It is a cyclic peptide comprising 4 amino acids. The peptide bonds that form the structure of this peptide in the direction from left to right are the following:
- El grupo α-carboxílico de la primera lisina está unido con el grupo α-amino de la fenilalanina. - El grupo α-carboxílico de la fenilalanina está enlazado con el grupo α-amino de la segunda lisina.- The α-carboxylic group of the first lysine is linked to the α-amino group of phenylalanine. - The α-carboxylic group of phenylalanine is linked to the α-amino group of the second lysine.
- El grupo α-carboxílico de la segunda lisina está unido al grupo α-amino de la glutamina.- The α-carboxylic group of the second lysine is linked to the α-amino group of glutamine.
El grupo α-carboxílico de la glutamina forma un enlace peptídico con el grupo α-amino de la primera lisina, cerrando de esta forma el anillo.The α-carboxylic group of glutamine forms a peptide bond with the α-amino group of the first lysine, thereby closing the ring.
Una característica de los péptidos de la invención es su estructura cíclica. Según se describe en WO-A-98/03192, los péptidos cíclicos son más resistentes a los procesos proteolíticos en comparación con sus homólogos lineales. De este modo se puede prolongar más tiempo su presencia en la planta y también su actividad antimicrobiana. Este hecho no se traduce en una persistencia negativa en el medio ambiente, ya que dichos péptidos acaban degradándose finalmente por las rutas biológicas habituales.A characteristic of the peptides of the invention is their cyclic structure. As described in WO-A-98/03192, cyclic peptides are more resistant to proteolytic processes compared to their linear counterparts. In this way, its presence in the plant and also its antimicrobial activity can be prolonged. This fact does not translate into a negative persistence in the environment, since these peptides eventually degrade by the usual biological routes.
En la fórmula general (I) de los péptidos de la presente invención, el aminoácido Y puede ser Phe o D-Phe, es decir, L-fenilalanina o D-fenilalanina. Según se describe en WO-A-96/08264, la introducción de aminoácidos de la serie D en un péptido contribuye a incrementar la estabilidad de dicho péptido, ya que es menos sensible a las rutas biológicas que degradan los aminoácidos de la serie L. No obstante, existen otras rutas alternativas que incluso degradan aminoácidos de la serie D, por lo que esta mayor estabilidad no implica una persistencia de dichos péptidos en el medio ambiente.In the general formula (I) of the peptides of the present invention, the amino acid Y may be Phe or D-Phe, that is, L-phenylalanine or D-phenylalanine. As described in WO-A-96/08264, the introduction of D-series amino acids into a peptide contributes to increasing the stability of said peptide, since it is less sensitive to the biological pathways that degrade the L-series amino acids. However, there are other alternative routes that even degrade amino acids from the D series, so this greater stability does not imply a persistence of said peptides in the environment.
Los péptidos descritos en la invención tienen una longitud comprendida entre 4 y 10 aminoácidos que los hace apropiados para ser preparados empleando los procedimientos habituales de síntesis de péptidos en fase sólida. Entre dichos procedimientos se pueden mencionar:The peptides described in the invention have a length between 4 and 10 amino acids which makes them suitable for being prepared using the usual methods of solid phase peptide synthesis. Among these procedures can be mentioned:
- el procedimiento que usa la resina 4-metilbencidrilamina (MBHA) funcionalizada con grupos amino, como soporte sólido para llevar a cabo las reacciones sucesivas de acoplamiento entre los diferentes aminoácidos que integran el péptido y la etapa de ciclación, y- the process using the 4-methylbenzydrylamine resin (MBHA) functionalized with amino groups, as a solid support to carry out the successive coupling reactions between the different amino acids that make up the peptide and the cyclization step, and
- el procedimiento Multipin™, en el que se emplean las SynPhase™ Lanterns comercializadas por la empresa Mimotopes (Australia). En la página web http://www.mimotopes.com/, se puede encontrar información sobre dicha técnica. Ambos procedimientos son bien conocidos por el experto en la materia y se encuentran descritos por ejemplo en S.A.Kates, F.Albericio Eds., Solid-Phase Synthesis. A practical guide, Marcel Dekker, New York, 2000 (ISBN: 0-8247-0359-6), o en K. Burguess Eds., Solid-Phase Organic Synthesis, Wiley, John & Sons, New York, 1999 (ISBN: 0471318256). En la técnica que emplea la resina MBHA como soporte sólido, habitualmente se incorpora a la resina un espaciador bifuncional sensible al medio ácido, que permite el desanclaje del péptido sintetizado en condiciones suaves.- the Multipin ™ procedure, in which SynPhase ™ Lanterns marketed by the company Mimotopes (Australia) are used. On the website http://www.mimotopes.com/, information on this technique can be found. Both procedures are well known to those skilled in the art and are described for example in S.A. Kates, F. Albericio Eds., Solid-Phase Synthesis. A practical guide, Marcel Dekker, New York, 2000 (ISBN: 0-8247-0359-6), or in K. Burguess Eds., Solid-Phase Organic Synthesis, Wiley, John & Sons, New York, 1999 (ISBN: 0471318256). In the technique that uses the MBHA resin as a solid support, a bifunctional spacer sensitive to the acid medium is usually incorporated into the resin, which allows the peptide synthesized to be synthesized under mild conditions.
Por ejemplo un espaciador bifuncional apropiado es el Fmoc-Rink- Linker (número CAS: 145469-56-3) comercializado por la empresa Senn Chemicals (Suiza).For example, an appropriate bifunctional spacer is Fmoc-Rink-Linker (CAS number: 145469-56-3) marketed by Senn Chemicals (Switzerland).
Dicho espaciador, una vez se ha unido con su grupo carboxílico a un grupo amino de la resina MBHA, presenta un grupo amino libre que permite el anclaje de un aminoácido que tenga un grupo carboxílico libre.Said spacer, once linked with its carboxylic group to an amino group of the MBHA resin, has a free amino group that allows the anchoring of an amino acid having a free carboxylic group.
Las SynPhase™ Lanterns comerciales utilizadas son del tipo Rink amida y ya llevan incorporadas este espaciador bifuncional.The commercial SynPhase ™ Lanterns used are of the Rink amide type and already have this bifunctional spacer incorporated.
Si el aminoácido tiene un grupo carboxílico libre en la cadena lateral, como por ejemplo el ácido glutámico o el ácido aspártico, entonces se puede unir al soporte sólido a través de dicha cadena lateral, manteniendo disponibles el otro grupo carboxílico y el grupo amino para la formación de nuevos enlaces peptídicos.If the amino acid has a free carboxylic group in the side chain, such as glutamic acid or aspartic acid, then it can be attached to the solid support through said side chain, keeping the other carboxylic group and the amino group available for the formation of new peptide bonds.
La técnica Multipin™ se puede emplear para la construcción de quimiotecas de péptidos de forma muy conveniente, como se describe en los Ejemplos. Un procedimiento para la preparación de los péptidos de la invención puede ser por ejemplo el que se describe a continuación.The Multipin ™ technique can be used to construct peptide libraries in a very convenient manner, as described in the Examples. A process for the preparation of the peptides of the invention may be, for example, the one described below.
En dicho procedimiento se utiliza la química del grupo Fmoc (9- fluorenilmetoxicarbonilo) como protector del grupo α-amino de los aminoácidos que se emplean para preparar los péptidos de la invención. En la primera etapa se procede al anclaje del ácido glutámico a la resina, o a la SynPhase™ Lantern, a través del grupo carboxílico libre de su cadena lateral. Los otros dos grupos reactivos del ácido glutámico se mantienen protegidos para evitar reacciones secundarias: por ejemplo, el grupo α-carboxílico en forma de éster alílico, y el grupo α-amino protegido por el grupo Fmoc. A continuación se elimina el grupo protector Fmoc del grupo α-amino del ácido glutámico, y se incorpora el siguiente aminoácido del péptido que tiene el grupo α-amino protegido por el grupo Fmoc. El enlace se establece entre el grupo carboxílico del nuevo aminoácido y el grupo amino del ácido glutámico.In this process, the chemistry of the Fmoc group (9-fluorenylmethoxycarbonyl) is used as a protector of the α-amino group of the amino acids used to prepare the peptides of the invention. In the first stage, the glutamic acid is anchored to the resin, or to the SynPhase ™ Lantern, through the free carboxylic group of its side chain. The other two reactive groups of glutamic acid are kept protected to avoid side reactions: for example, the α-carboxylic group in the form of an allyl ester, and the α-amino group protected by the Fmoc group. The Fmoc protecting group is then removed from the α-amino group of glutamic acid, and the next amino acid of the peptide having the α-amino group protected by the Fmoc group is incorporated. The bond is established between the carboxylic group of the new amino acid and the amino group of glutamic acid.
Este proceso de eliminación del grupo protector Fmoc y la incorporación del nuevo aminoácido se repite hasta que se completa un péptido con una estructura lineal.This process of elimination of the Fmoc protective group and the incorporation of the new amino acid is repeated until a peptide with a linear structure is completed.
En el caso del aminoácido lisina, el grupo amino de la cadena lateral está protegido por el grupo Boc (t-butiloxicarbonilo), que es estable a las condiciones de eliminación del grupo Fmoc. Una vez finalizados los acoplamientos se elimina el éster alílico que protege el grupo α-carboxílico del ácido glutámico, y se elimina el grupo Fmoc que protege el grupo α-amino del último aminoácido incorporado.In the case of the amino acid lysine, the amino group of the side chain is protected by the Boc (t-butyloxycarbonyl) group, which is stable to the removal conditions of the Fmoc group. Once the couplings are finished, the allyl ester that protects the α-carboxylic group from glutamic acid is removed, and the Fmoc group that protects the α-amino group of the last incorporated amino acid is removed.
Seguidamente se procede a la ciclación entre el grupo α-carboxílico del ácido glutámico y el grupo α-amino del último aminoácido incorporado. De esta forma se obtiene un péptido cíclico unido al soporte sólido, bien sea la resina o la SynPhase™ Lantern.Next, the cyclization between the α-carboxylic group of glutamic acid and the α-amino group of the last amino acid incorporated is carried out. In this way a cyclic peptide bound to the solid support is obtained, either the resin or the SynPhase ™ Lantern.
La escisión del péptido del soporte sólido se realiza en condiciones acidas e implica la ruptura del enlace entre el grupo amino y el grupo bencidrilo del linker, conduciendo a la formación del residuo de glutamina (CiIn), que se encuentra presente en el péptido de la invención, como se puede observar en la fórmula general (I). Al mismo tiempo que se libera el péptido del soporte sólido se eliminan los grupos Boc de los residuos de lisina. Tras un proceso convencional de aislamiento, los péptidos de la invención se obtienen con un buen rendimiento, habitualmente comprendido entre el 70% y el 80%, en forma de sólidos pulverulentos, y se caracterizan mediante análisis por HPLC, espectrometría de masas (ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS).The cleavage of the solid support peptide is carried out under acidic conditions and involves breaking the bond between the amino group and the benzidrile group of the linker, leading to the formation of the glutamine residue (CiIn), which is present in the peptide of the invention, as can be seen in the general formula (I). At the same time that the peptide is released from the solid support, the Boc groups are removed from the lysine residues. After a conventional isolation process, the peptides of the invention are obtained in good yield, usually between 70% and 80%, in the form of powder solids, and are characterized by HPLC analysis, mass spectrometry (ESI- MS, MALDI-TOF or FAB-MS).
Sorprendentemente se ha comprobado que los péptidos de la invención presentan una actividad antimicrobiana, que es particularmente efectiva frente a microorganismos patógenos de las plantas como son el hongo Fusarium oxysporum, y las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.Surprisingly, it has been proven that the peptides of the invention have an antimicrobial activity, which is particularly effective against plant pathogenic microorganisms such as the Fusarium oxysporum fungus, and the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
También forma parte de la invención la utilización de los péptidos cíclicos que tienen un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60% y que responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu,Also part of the invention is the use of cyclic peptides that have a lysine molar content of between 40% and 60% and that respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X ) m - GIn] (I) where: X is Lys or Leu,
Y es Phe o D-Phe, n = l, 3, o 5, m = l, 3, o 5, y n + m = 2, 4, 6 o 8 como agentes antimicrobianos.Y is Phe or D-Phe, n = 1, 3, or 5, m = 1, 3, or 5, and n + m = 2, 4, 6 or 8 as antimicrobial agents.
Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu,Preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X) m -GIn] (I) where: X is Lys or Leu,
Y es Phe, y m = l, yn = 1, o m = 3, yn = I, 3, o 5 Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu,Y is Phe, ym = l, yn = 1, om = 3, and n = I, 3, or 5 More preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n - Y - (X) m - GIn] (I) where: X is Lys or Leu,
Y es Phe, y m = 3, y n = 5And it's Phe, and m = 3, and n = 5
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los péptidos definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 23. Preferiblemente los péptidos de la invención se utilizan como agentes antimicrobianos frente a bacterias y a hongos patógenos para las plantas.Among the peptides of the invention that are preferred are the peptides defined by the amino acid sequences SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 23. Preferably the peptides of the invention are used as antimicrobial agents against bacteria and fungi for plants.
Preferiblemente las bacterias patógenas para las plantas se seleccionan entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae. Estas bacterias resultan ser indicadores apropiados para determinar la actividad antimicrobiana de compuestos que son susceptibles de ser empleados para combatir infecciones y enfermedades causadas por bacterias en plantas.Preferably, the pathogenic bacteria for the plants are selected from the group consisting of Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae. These bacteria turn out to be appropriate indicators to determine the antimicrobial activity of compounds that are likely to be used to fight infections and diseases caused by bacteria in plants.
Erwinia amylovora es una bacteria gram negativa que causa la enfermedad conocida como Fuego Bacteriano que afecta a las plantas de la familia de las rosáceas, entre las que se encuentran árboles frutales de gran importancia económica como el manzano y el peral, y plantas ornamentales como serbal, espino, mostajo, etc.Erwinia amylovora is a gram-negative bacterium that causes the disease known as Bacterial Fire that affects plants of the Rosaceae family, among which are fruit trees of great economic importance such as apple and pear, and ornamental plants such as rowan , hawthorn, mustard, etc.
En Europa está catalogada como una bacteria de cuarentena en agricultura. El fuego bacteriano puede afectar a prácticamente todos los órganos de la planta y con frecuencia implica la muerte de los árboles o arbustos enfermos. Actualmente no hay métodos efectivos para el control del fuego bacteriano y es necesario combinar distintas medidas encaminadas a eliminar o reducir el inoculo.In Europe it is listed as a quarantine bacterium in agriculture. Bacterial fire can affect virtually all organs of the plant and often involves the death of sick trees or shrubs. Currently there are no effective methods for the control of bacterial fire and it is necessary to combine different measures aimed at eliminating or reducing inoculum.
Clavibacter michiganensis es una bacteria gram positiva que causa la podredumbre angular de la patata (C. michiganensis subsp. sepedonicum) y el chancro bacteriano del tomate (C. michiganensis subsp. michiganensis). Se trata de enfermedades de cuarentena de muy difícil control, ya que el patógeno se mantiene viable en el suelo en restos de material infectados y se transmite por semillas.Clavibacter michiganensis is a gram-positive bacterium that causes the potato's angular rot (C. michiganensis subsp. Sepedonicum) and the bacterial chancre of tomato (C. michiganensis subsp. Michiganensis). These are quarantine diseases that are very difficult to control, since the pathogen remains viable in the soil in remains of infected material and is transmitted by seeds.
Xanthomonas vesicatoria es una bacteria gram negativa que provoca la enfermedad denominada Mancha Bacteriana en plantas de la familia de las solanáceas que tienen una gran importancia económica como el tomate y el pimiento. Esta enfermedad afecta a hojas, tallos y frutos provocando su marchitez o muerte.Xanthomonas vesicatoria is a gram-negative bacterium that causes the disease called Bacterial Spot in plants of the Solanaceae family that have great economic importance such as tomatoes and peppers. This disease affects leaves, stems and fruits causing wilt or death.
Pseudomonas syringae es una bacteria gram negativa que causa un gran número de enfermedades denominadas necrosis bacterianas en plantas de cultivos hortícolas y leñosos como frutales. La patogenicidad de P. syringae reside en muchos casos en su actividad nucleadora del hielo (INA+) que potencia los daños por helada y a la producción de diversas fitotoxinas como las siringomicinas.Pseudomonas syringae is a gram-negative bacterium that causes a large number of diseases called bacterial necrosis in horticultural and woody crop plants such as fruit trees. The pathogenicity of P. syringae resides in many cases in its ice nucleating activity (INA +) that enhances frost damage and the production of various phytotoxins such as syringomycins.
De forma preferida el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum. Fusarium constituye un género de hongos habitantes del suelo y ubicuos, en el que se incluyen muchas razas y especies fitopatógenas causantes de numerosas enfermedades de importancia económica principalmente en cultivos hortícolas. Las enfermedades vasculares que provocan causan la pérdida de turgencia de la planta y con frecuencia su muerte debido al colapso del sistema conductor. Las principales enfermedades están causadas por el género Fusarium oxysporum que se subdivide en diversas formas especiales o razas atendiendo a la planta huésped afectada, como lycopersici que afecta a tomate, melonis al melón, conglutinans a diversas cucurbitáceas, cúbense a platanera, dianthi al clavel, etc. Al ser un patógeno de suelo es de muy difícil control, principalmente debido a que los métodos clásicos se basan en la desinfección mediante bromuro de metilo, cuyo uso está prohibido en la actualidad, y a que en general los fungicidas existentes son poco eficaces en el control de dicho patógeno.Preferably, the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum. Fusarium is a genus of soil and ubiquitous fungi, which includes many races and phytopathogenic species that cause numerous diseases of economic importance mainly in horticultural crops. The vascular diseases they cause cause loss of plant turgidity and often death due to the collapse of the conductive system. The main diseases are caused by the genus Fusarium oxysporum that is subdivided into various special forms or races attending to the affected host plant, such as lycopersici that affects tomato, melonis to melon, conglutinans to various cucurbits, cover banana, dianthi to carnation, etc. Being a soil pathogen it is very difficult to control, mainly because the classical methods are based on disinfection by methyl bromide, whose use is currently prohibited, since in general existing fungicides are ineffective in the control of said pathogen.
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.Preferably the plants that can be treated with the peptides of the invention are selected from the group consisting of fruit trees, horticultural plants, and ornamental plants.
Entre los árboles frutales se pueden mencionar los de pepita (manzano, peral), y hueso (melocotonero, albaricoquero, ciruelo, cerezo) y el platanero.Among the fruit trees can be mentioned those of pepita (apple tree, pear tree), and bone (peach tree, apricot tree, plum tree, cherry tree) and the banana tree.
Entre las plantas hortícolas se encuentran las solanáceas (tomate, pimiento, patata) y cucurbitáceas (melón, sandía). Ejemplos de plantas ornamentales son serbal, clavel, espino albar y mostajo.Among the horticultural plants are the Solanaceae (tomato, pepper, potato) and cucurbitaceae (melon, watermelon). Examples of ornamental plants are rowan, carnation, sea-buckthorn and mustard.
Composiciones fitosanitariasPhytosanitary compositions
También forma parte del objeto de la invención una composición fitosanitaria que comprende:Also part of the object of the invention is a phytosanitary composition comprising:
- un péptido que tiene un contenido molar de Usina comprendido entre el 40% y el 60%, y que está definido por la fórmula general (I) ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu, Y es Phe o D-Phe, m = l, 3, o 5, n = 1, 3, o 5, y n + m = 2, 4, 6 o 8, y un agente auxiliar.- a peptide having a molar content of Usina between 40% and 60%, and which is defined by the general formula (I) cycle [(X) n - Y - (X) m - GIn] (I) where: X is Lys or Leu, Y is Phe or D-Phe, m = l, 3, or 5, n = 1, 3, or 5, and n + m = 2, 4, 6 or 8, and an auxiliary agent .
Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m - GIn] (I) donde: X es Lys o Leu, Y es Phe, y m = l, y n = 1, o m = 3, y n = 1, 3, o 5 Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)m- Gln] (I) donde: X es Lys o Leu,Preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X) m -GIn] (I) where: X is Lys or Leu, Y is Phe, ym = l, and n = 1 , om = 3, and n = 1, 3, or 5 More preferably the peptides respond to the general formula (I): cycle [(X) n -Y- (X) m -Gln] (I) where: X is Lys or Leu,
Y es Phe, y m = 3, yn = 5Y is Phe, and m = 3, and n = 5
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los péptidos definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 23.Among the peptides of the invention that are preferred are peptides defined by amino acid sequences SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 23.
Hábitualmente, en las composiciones antimicrobianas se combinan varios principios activos para obtener una mayor eficacia o un espectro más amplio de actuación. En este caso, las composiciones fitosanitarias de la invención también pueden comprender otros agentes antibacterianos o antifúngicos para conseguir mayor eficacia antimicrobiana, como por ejemplo la combinación de varios péptidos de la invención, o su combinación con otras materias activas distintas.Typically, several active ingredients are combined in the antimicrobial compositions to obtain greater efficacy or a wider spectrum of action. In this case, the phytosanitary compositions of the invention may also comprise other antibacterial or antifungal agents to achieve greater antimicrobial efficacy, such as for example the combination of several peptides of the invention, or their combination with other different active substances.
La cantidad de péptido que forma parte de la composición fitosanitaria puede ser variable en función de factores tales como el tipo de planta, la concentración de las bacterias y hongos patógenos en la planta, la extensión de la enfermedad, etc. La concentración efectiva del péptido se puede determinar y ajustar fácilmente mediante métodos de rutina bien conocidos en microbiología por el experto en la materia. Hábitualmente la concentración en materia activa se encuentra comprendida entre 0,1 y 0,5 g/1. El agente auxiliar que acompaña los peptiαos αe la invención en dichas composiciones fitosanitarias puede tener varias funciones, como por ejemplo, facilitar la dosificación del péptido, proporcionar un producto fácilmente manipulable, mejorar el mojado de las plantas. Dicho agente auxiliar puede ser seleccionado entre el grupo formado por: disolventes, diluyentes, cargas inertes, agentes tensioactivos humectantes, agentes tamponantes, agentes dispersantes, agentes antiapelmazantes, lubricantes, filtros de la radiación ultravioleta, y/o mezclas de los mismos.The amount of peptide that is part of the phytosanitary composition can vary depending on factors such as the type of plant, the concentration of pathogenic bacteria and fungi in the plant, the extent of the disease, etc. The effective concentration of the peptide can be easily determined and adjusted by routine methods well known in microbiology by the person skilled in the art. Usually the concentration in active matter is between 0.1 and 0.5 g / 1. The auxiliary agent that accompanies the α peptides of the invention in said phytosanitary compositions can have several functions, such as facilitating the dosage of the peptide, providing an easily manipulated product, improving wetting of plants. Said auxiliary agent can be selected from the group consisting of: solvents, diluents, inert fillers, wetting surfactants, buffering agents, dispersing agents, anti-caking agents, lubricants, ultraviolet radiation filters, and / or mixtures thereof.
Preferiblemente el agente auxiliar se selecciona entre el grupo formado por disolventes, tensioactivos, agentes tamponantes, filtros de la radiación ultravioleta y/o sus mezclas.Preferably the auxiliary agent is selected from the group consisting of solvents, surfactants, buffering agents, ultraviolet radiation filters and / or mixtures thereof.
Más preferiblemente el disolvente es agua.More preferably the solvent is water.
Las composiciones pueden presentarse en forma líquida o en forma sólida. Por ejemplo, en el caso de formulaciones líquidas, la composición de la invención puede presentarse en forma de una composición diluida lista para ser empleada, o bien en forma de una composición concentrada, que requiere su dilución antes de ser usada, habitualmente con agua.The compositions may be presented in liquid form or in solid form. For example, in the case of liquid formulations, the composition of the invention can be presented in the form of a diluted composition ready to be used, or in the form of a concentrated composition, which requires dilution before being used, usually with water.
En el caso de composiciones líquidas acuosas, la presencia de agentes tensioactivos humectantes facilita el mojado de las plantas cuando se pulverizan con dicha composición.In the case of aqueous liquid compositions, the presence of wetting surfactants facilitates wetting of the plants when sprayed with said composition.
Una ventaja de los péptidos de la invención es que se pueden disolver en agua con facilidad, y se pueden formular generalmente como disoluciones acuosas sin necesidad de emplear disolventes orgánicos adicionales.An advantage of the peptides of the invention is that they can be dissolved in water with ease, and can generally be formulated as aqueous solutions without the need for additional organic solvents.
Las composiciones en forma sólida pueden ser en forma de granulos, o polvos, en las que los péptidos de la invención se mezclan con cargas inertes finamente divididas como, por ejemplo, caolín, tierra de diatomeas, dolomita, carbonato calcico, o talco. También pueden presentarse en forma de polvos o granulos dispersables, que comprenden un agente humectante para facilitar la dispersión del polvo o de los granulos en el líquido. También forma parte del objeto de la invención un método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de plantas causadas por bacterias y hongos que comprende poner en contacto la planta con una composición fitosanitaria que incluye los péptidos de la invención. La composición fitosanitaria de la invención se puede aplicar de forma preventiva a las plantas para evitar la aparición de las infecciones y enfermedades causadas por bacterias y hongos. El tratamiento preventivo tiene su base en que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de bacterias y hongos patógenos para las plantas.Compositions in solid form may be in the form of granules, or powders, in which the peptides of the invention are mixed with finely divided inert fillers such as, for example, kaolin, diatomaceous earth, dolomite, calcium carbonate, or talc. They can also be presented in the form of dispersible powders or granules, which comprise a wetting agent to facilitate dispersion of the powder or granules in the liquid. Also part of the object of the invention is a method for preventing and treating infections and diseases of plants caused by bacteria and fungi which comprises contacting the plant with a phytosanitary composition that includes the peptides of the invention. The phytosanitary composition of the invention can be applied preventively to plants to prevent the occurrence of infections and diseases caused by bacteria and fungi. Preventive treatment is based on the fact that the peptides of the invention inhibit the growth of pathogenic bacteria and fungi for plants.
También se puede emplear para tratar dichas infecciones y enfermedades una vez se ha detectado su presencia en las plantas, ya que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de las bacterias y hongos causantes de dichas infecciones y enfermedades. En esta descripción el término infección se refiere a la invasión y destrucción de un órgano, por ejemplo, hojas, flores, o frutos, por parte de los microorganismos patógenos. Por tanto, se trata de un proceso localizado. En cambio, el término enfermedad se refiere a un proceso que afecta a toda la planta, dando lugar a síntomas. Preferiblemente el método de la invención se emplea para prevenir y tratar infecciones y enfermedades provocadas por bacterias patógenas para las plantas seleccionadas entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.It can also be used to treat such infections and diseases once its presence in plants has been detected, since the peptides of the invention inhibit the growth of the bacteria and fungi causing said infections and diseases. In this description the term infection refers to the invasion and destruction of an organ, for example, leaves, flowers, or fruits, by pathogenic microorganisms. Therefore, it is a localized process. Instead, the term disease refers to a process that affects the entire plant, giving rise to symptoms. Preferably the method of the invention is used to prevent and treat infections and diseases caused by pathogenic bacteria for plants selected from the group formed by Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
De forma preferida el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum.Preferably, the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum.
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.Preferably the plants that can be treated with the peptides of the invention are selected from the group consisting of fruit trees, horticultural plants, and ornamental plants.
En el método de la invención, la composición se puede poner en contacto con las partes de las plantas seleccionadas entre el grupo formado por semillas, raíces, tallos, hojas, o frutos, o con el suelo o cualquier medio de crecimiento que rodee las raíces de las plantas.In the method of the invention, the composition can be contacted with the selected plant parts among the group consisting of seeds, roots, stems, leaves, or fruits, or with the soil or any growth medium surrounding the roots. of the plants.
En el método de la invención, la composición fitosanitaria se puede poner en contacto con la planta por cualquier técnica convencional, entre las que destacan, la pulverización, la inmersión o el riego.In the method of the invention, the phytosanitary composition can be contacted with the plant by any conventional technique, among which, spraying, immersion or irrigation.
Por ejemplo se puede preparar una disolución acuosa de los péptidos de la invención y proceder a la pulverización de las partes de la planta afectadas o susceptibles de ser afectadas. Si se trata de los frutos de un árbol frutal, por ejemplo, también se puede realizar el tratamiento de los mismos por pulverización o por inmersión antes de su cosecha o en post-cosecha.For example, an aqueous solution of the peptides of the invention can be prepared and spraying the affected or susceptible parts of the plant. If it's the fruits of a fruit tree, for example, They can also be treated by spraying or immersion before harvesting or post-harvest.
El tratamiento de las raíces puede llevarse a cabo por ejemplo empleando una composición sólida en la que los péptidos se encuentran dispersos en una carga inerte, o por pulverización con la mencionada disolución acuosa, o mediante su aplicación por riego.Root treatment can be carried out, for example, by using a solid composition in which the peptides are dispersed in an inert filler, or by spraying with said aqueous solution, or by applying it by irrigation.
Ensayos biológicosBiological tests
La actividad antimicrobiana de los péptidos de la invención frente a bacterias y a hongos patógenos para plantas se ha evaluado mediante la determinación de la concentración de péptido mínima necesaria para inhibir el crecimiento de los microorganismos. Habitualmente dicha concentración se denomina concentración inhibitoria mínima (CIM).The antimicrobial activity of the peptides of the invention against bacteria and pathogenic fungi for plants has been evaluated by determining the minimum peptide concentration necessary to inhibit the growth of microorganisms. This concentration is usually called the minimum inhibitory concentration (MIC).
Este tipo de ensayos es habitual en microbiología y es bien conocido por el experto en la materia. Una descripción de la metodología empleada se encuentra por ejemplo en MJ.Pelczar Jr, E.C.S.Chan, N.R.Krieg, Microbiology: Concepts andThis type of assay is common in microbiology and is well known to the person skilled in the art. A description of the methodology used is found for example in MJ.Pelczar Jr, E.C.S.Chan, N.R. Krieg, Microbiology: Concepts and
Applications. New York: McGraw-Hill, 1997.Applications New York: McGraw-Hill, 1997.
Se ha comprobado que las composiciones que comprenden los péptidos de la invención disueltos en agua a concentraciones comprendidas entre 3,12 y 6,25 μM son efectivas para inhibir el crecimiento de bacterias como Xanthomonas vesicatoria, yIt has been found that compositions comprising the peptides of the invention dissolved in water at concentrations between 3.12 and 6.25 μM are effective in inhibiting the growth of bacteria such as Xanthomonas vesicatoria, and
Pseudomonas syringae, a concentraciones entre 6,25 y 12,5 μM inhiben el crecimiento de las bacterias Erwinia amylovora y Clavibacter michiganensis, y a concentraciones inferiores a 6,25 μM inhiben el crecimiento de hongos como Fusarium oxysporum.Pseudomonas syringae, at concentrations between 6.25 and 12.5 μM inhibit the growth of the bacteria Erwinia amylovora and Clavibacter michiganensis, and at concentrations below 6.25 μM inhibit the growth of fungi such as Fusarium oxysporum.
Estos resultados demuestran la eficacia de la actividad antimicrobiana de los péptidos de la invención, ya que en Avrahami et al, Biochemistry, 2001, 40, 12591-These results demonstrate the efficacy of the antimicrobial activity of the peptides of the invention, since in Avrahami et al, Biochemistry, 2001, 40, 12591-
12603, se describe que una concentración inhibitoria mínima inferior a 50 μM es considerada como significativa.12603, it is described that a minimum inhibitory concentration of less than 50 μM is considered significant.
La actividad hemolítica de los péptidos es una característica que generalmente se determina para aquellos compuestos que pueden llegar a entrar en contacto con el cuerpo humano. Este sería el caso si frutas u hortalizas tratadas con los péptidos de la invención contuvieran restos de los mismos y fuesen consumidos por las personas, o al ser manipulados por operarios durante su aplicación o preparación. La mencionada actividad hemolítica se ha evaluado mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de dichos péptidos en tampón de TRIS con suspensiones de eritrocitos al 5% en volumen/volumen procedentes de sangre humana fresca. El resultado de dicha determinación se expresa como el porcentaje de hemolisis que se produce para una determinada concentración de péptido. Una descripción de la metodología empleada para la determinación de la actividad hemolítica se encuentra en Oren et al, Biochemistry, 2000, 39, 6103-6114, y en Raguse et al, J. Am. Chem. Soc, 2002, 124, 12774-12785. Se ha comprobado que los péptidos de la invención presentan una actividad hemolítica que se puede clasificar como baja, ya que la mayoría de ellos presentan una HD50 superior a 375 μM. HD50 es la concentración de péptido a la que se produce la liberación del 50% de la hemoglobina en el bioensayo referido. Se observa, pues, que la concentración a la que los péptidos tendrían una actividad hemolítica significativa es entre diez y cien veces superior a la concentración a la que son activos para inhibir el crecimiento de bacterias y hongos patógenos para las plantas.The hemolytic activity of the peptides is a characteristic that is generally determined for those compounds that may come into contact with the human body. This would be the case if fruits or vegetables treated with the peptides of the invention contained traces thereof and were consumed by people, or when manipulated by operators during their application or preparation. The said hemolytic activity has been evaluated by determining the release of hemoglobin that is produced by contacting a solution of said peptides in TRIS buffer with 5% volume / volume red blood cell suspensions from fresh human blood. The result of this determination is expressed as the percentage of hemolysis that occurs for a given concentration of peptide. A description of the methodology used for the determination of hemolytic activity is found in Oren et al, Biochemistry, 2000, 39, 6103-6114, and in Raguse et al, J. Am. Chem. Soc, 2002, 124, 12774- 12785. It has been found that the peptides of the invention have a hemolytic activity that can be classified as low, since most of them have an HD 50 greater than 375 μM. HD 50 is the concentration of peptide at which 50% release of hemoglobin occurs in the referred bioassay. It is observed, then, that the concentration at which the peptides would have a significant hemolytic activity is between ten and one hundred times higher than the concentration at which they are active to inhibit the growth of pathogenic bacteria and fungi for plants.
Los ejemplos que se exponen a continuación se deben interpretar como un medio auxiliar para una mejor comprensión de la invención, y no como limitaciones al objeto de la misma.The examples set forth below should be interpreted as an auxiliary means for a better understanding of the invention, and not as limitations on the object thereof.
EjemplosExamples
En los ejemplos que siguen se emplean las siguientes abreviaciones: Al: alilo; Boc: tert-butiloxicarbonilo; DIEA: N,N-diisopropiletilamina; DMF: N5N- dimetilformamida; EDTA, ácido etilendiaminotetracético; ESI-MS: espectrometría de masas con ionización por electrospray; FAB-MS: espectrometría de masas por bombardeo con átomos rápidos (Fast Atom Bombardment - Mass Spectrometry); Fmoc: 9-fluorenihnetoxicarbonilo; HBTU: hexafluorofosfato de N-óxido de N-[(1H- benzotriazol-l-il)(dimetilamino)metilen]-N-metilmetanaminio; HOBt: 1-hidroxibenzo- triazol; HPLC: cromatografía líquida de alta resolución; MALDI-TOF: ionización desorción por láser asistida por una matriz - Tiempo de vuelo (Matrix-Assisted Láser Desorption Ionization - Time-of-Flight); MBHA: 4-metilbencidrilamina; MWI: radiación por microondas; NMM: N-metilmorfolina; NMP: N-metilpirrolidona; Ph: fenilo; PyBOP: hexafluorofosfato de benzotriazol-l-il-N-oxitris(pirrolidino)fosfonio; TFA: ácido trifluoroacético; THF: tetraMdrofurano; TlS: trisisopropilsilano; UV: ultravioleta.The following abbreviations are used in the following examples: Al: allyl; Boc: tert-butyloxycarbonyl; DIEA: N, N-diisopropylethylamine; DMF: N 5 N-dimethylformamide; EDTA, ethylenediaminetetraacetic acid; ESI-MS: mass spectrometry with electrospray ionization; FAB-MS: fast atom bombardment mass spectrometry (Fast Atom Bombardment - Mass Spectrometry); Fmoc: 9-fluorenihnetoxycarbonyl; HBTU: N - [(1 H- benzotriazol-l-yl) (dimethylamino) methylene] -N-methylmethanamine N-oxide hexafluorophosphate; HOBt: 1-hydroxybenzotriazole; HPLC: high performance liquid chromatography; MALDI-TOF: matrix-assisted laser desorption ionization - Flight time (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization - Time-of-Flight); MBHA: 4-methylbenzydrylamine; MWI: microwave radiation; NMM: N-methylmorpholine; NMP: N-methylpyrrolidone; Ph: phenyl; PyBOP: benzotriazol-l-yl-N-oxitris (pyrrolidine) phosphonium hexafluorophosphate; TFA: trifluoroacetic acid; THF: tetraMdrofuran; TlS: trisisopropylsilane; UV: ultraviolet.
Los productos Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Phe-OH, Fmoc-Glu-OAl, Fmoc-Leu-OH, la resina MBHA funcionalizada con grupos amino, el espaciador bifuncional Fmoc-Rink-Fmoc-Lys (Boc) -OH, Fmoc-Phe-OH, Fmoc-Glu-OAl, Fmoc-Leu-OH products, MBHA resin functionalized with amino groups, Fmoc-Rink bifunctional spacer
Linker (número CAS: 145469-56-3), HBTU5 PyBOP, y HOBt se obtuvieron de SennLinker (CAS number: 145469-56-3), HBTU 5 PyBOP, and HOBt were obtained from Senn
Chemicals. Las SynPhase™ Lanterns del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D se obtuvieron de la empresa Mimotopes (Clayton, Australia). Los productos TFA,Chemicals SynPhase ™ Lanterns of the Rink polystyrene amide type D series were obtained from Mimotopes (Clayton, Australia). TFA products,
NMP, Pd(PPh3)4, N,N-dietilditiocarbamato sódico, y TIS se obtuvieron de Aldrich. Los productos piperidina, NMM, y DIEA se obtuvieron de Fluka.NMP, Pd (PPh 3 ) 4 , N, sodium N-diethyldithiocarbamate, and TIS were obtained from Aldrich. Piperidine, NMM, and DIEA products were obtained from Fluka.
Las siguientes indicaciones sobre el procedimiento para la preparación de los péptidos son de carácter general:The following indications on the procedure for the preparation of the peptides are of a general nature:
- Se han empleado aminoácidos que tienen el grupo α-amino protegido con el grupo Fmoc.- Amino acids having the α-amino group protected with the Fmoc group have been used.
- Para la protección de la cadena lateral de la lisina se ha empleado el grupo tert- butiloxicarbonilo (Boc).- The tert-butyloxycarbonyl (Boc) group has been used to protect the lysine side chain.
- En las reacciones llevadas a cabo sobre soporte de resina se emplearon jeringas de 5 o 10 mi que tenían incorporado un filtro microporoso de polipropileno. - En las reacciones llevadas a cabo con las SynPhase™ Lanterns del tipo Rmk amida de la empresa Mimotopes, se emplearon recipientes de vidrio de 5 a 50 mi, y jeringas de plástico de 10 a 50 mi.- In the reactions carried out on resin support, syringes of 5 or 10 ml were used which had a microporous polypropylene filter incorporated. - In the reactions carried out with the SynPhase ™ Lanterns of the Rmk amide type of the Mimotopes company, glass containers of 5 to 50 ml, and plastic syringes of 10 to 50 ml were used.
- Todas las transformaciones y lavados se llevaron a cabo a 25° C, a no ser que se indique lo contrario. - Los experimentos con radiación de microondas se llevaron a cabo en el aparato- All transformations and washes were carried out at 25 ° C, unless otherwise indicated. - The experiments with microwave radiation were carried out in the apparatus
Ethos SEL de la empresa Milestone, equipado con un sistema de magnetrón dual de 1.600 vatios. El tiempo, la temperatura de reacción, y la potencia se controlaron mediante el paquete informático EasyControl que va incorporado al equipo de microondas. La temperatura se controlaba a través de un sistema automático de control de la temperatura por fibra óptica, ATC-400FO, sumergido en un recipiente de referencia Milestone.Ethos SEL from Milestone, equipped with a 1,600-watt dual magnetron system. Time, reaction temperature, and power were controlled by the EasyControl computer package that is incorporated into the microwave equipment. The temperature was controlled by an automatic fiber optic temperature control system, ATC-400FO, immersed in a Milestone reference vessel.
- El análisis por HPLC se llevó a cabo a 1,0 ml/min empleando una columna de fase reversa Kromasil (4,6 x 40 mm; tamaño de partículas de 3,5 μm). Se emplearon gradientes lineales con TFA acuoso al 0,1% y TFA en acetonitrilo al 0,1%, con una relación comprendida entre 0,98:0,02 y 0,98:0,1 durante un período de tiempo de 7 minutos con detección UV a una longitud de onda de 220 nm. - Los espectros ESI-MS fueron adquiridos empleando un instrumento quadrupolo- HPLC analysis was carried out at 1.0 ml / min using a Kromasil reverse phase column (4.6 x 40 mm; particle size of 3.5 μm). Be they used linear gradients with 0.1% aqueous TFA and 0.1% acetonitrile TFA, with a ratio between 0.98: 0.02 and 0.98: 0.1 over a period of 7 minutes with UV detection at a wavelength of 220 nm. - ESI-MS spectra were acquired using a quadrupole instrument
Navigator; el instrumento se operó en el modo positivo de iones (ES+) con un voltaje en la muestra de 3 kV. - Los espectros MALDI-TOF fueron adquiridos mediante un instrumentoNavigator; The instrument was operated in the positive ion mode (ES +) with a voltage in the sample of 3 kV. - MALDI-TOF spectra were acquired through an instrument
Ultraflex de la empresa Bruker. - Todas las relaciones entre los disolventes son volumen/volumen, a no ser que se especifique otra cosa.Ultraflex of the Bruker company. - All relationships between solvents are volume / volume, unless otherwise specified.
Ejemplo 1.- Preparación de cicloCLvs-Leu-Lvs-Leu-Lvs-Phe-Lys-Leu-Lvs-Example 1.- Preparation of cycleCLvs-Leu-Lvs-Leu-Lvs-Phe-Lys-Leu-Lvs-
GIn) en fase sólida empleando como soporte sólido resina MBHAGIn) in solid phase using MBHA resin as solid support
En una jeringa de 5 mi de capacidad, equipada con un filtro microporoso en la parte inferior, se colocaron 200 mg de resina MBHA con una funcionalización de 0,3 mmol/g, equivalentes a 0,06 mmoles de grupos amino, y se llenó la jeringa con disolvente para hinchar-lavar la resina de acuerdo con la siguiente secuencia: CH2Cl2 (5 x 0,5 min), una mezcla de TFA y CH2Cl2 (4:6, 1 x 20 min), CH2Cl2 (5 x 0,5 min), una mezcla de DIEA y CH2Cl2 (5:95, 3 x 1 min), CH2Cl2 (5 x 0,5 min), y NMP (5 x 0,5 min). La expresión CH2Cl2 (5 x 0,5 min) se refiere a que se realizaron 5 lavados con cloruro de metileno de 0,5 minutos cada uno. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple (Vac Man Laboratory Vacuum Manifold de Promega Distribuidora).In a syringe of 5 ml capacity, equipped with a microporous filter at the bottom, 200 mg of MBHA resin with a functionalization of 0.3 mmol / g, equivalent to 0.06 mmol of amino groups, were placed and filled the syringe with solvent to swell-wash the resin according to the following sequence: CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), a mixture of TFA and CH 2 Cl 2 (4: 6, 1 x 20 min), CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), a mixture of DIEA and CH 2 Cl 2 (5:95, 3 x 1 min), CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), and NMP (5 x 0.5 min). The expression CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min) refers to 5 washes with methylene chloride of 0.5 minutes each. After each washing step the solvent is removed by a multiple vacuum filter (Vac Man Laboratory Vacuum Manifold from Promega Distribuidora).
El espaciador bifuncional se acopló a la resina por tratamiento con 97 mg de Fmoc-Rink-Linker (0,18 mmoles), 68 mg de HBTU (0,18 mmoles) y 31 μl de DIEA (0,18 mmoles) en 1 mi de NMP. Se mantuvo durante toda la noche y se comprobó que el test de ninhidrina era negativo (Kaiser et al, Anal. Biochem., 1970, 34, 595-598). Después de lavar la resina con NMP (5 x 2 min), ésta se trató con una mezcla de piperidina y NMP (3:7, 2 x 8 min) para eliminar el grupo Fmoc presente en el grupo amino del espaciador bifuncional, y, a continuación, se lavó con NMP (5 x 2 min). Seguidamente la resina se trató con 74 mg de Fmoc-Glu-OAl (0,18 inmoles), 68 mg de HBTU (0,18 mmoles) y 31 μl de DIEA (0,18 mmoles) en 1 mi de NMP. Después de 4 h se comprobó que el test de ninhidrina era negativo. A continuación se lavó con NMP (5 x 2 min). La eliminación del grupo Fmoc y los lavados subsiguientes se realizaron como ya se ha descrito anteriormente.The bifunctional spacer was coupled to the resin by treatment with 97 mg of Fmoc-Rink-Linker (0.18 mmol), 68 mg of HBTU (0.18 mmol) and 31 µl of DIEA (0.18 mmol) in 1 mL of NMP. It was maintained overnight and the ninhydrin test was found to be negative (Kaiser et al, Anal. Biochem., 1970, 34, 595-598). After washing the resin with NMP (5 x 2 min), it was treated with a mixture of piperidine and NMP (3: 7, 2 x 8 min) to remove the Fmoc group present in the amino group of the bifunctional spacer, and, then washed with NMP (5 x 2 min). The resin was then treated with 74 mg of Fmoc-Glu-OAl (0.18 immoles), 68 mg of HBTU (0.18 mmol) and 31 µl of DIEA (0.18 mmol) in 1 ml of NMP. After 4 h it was found that the ninhydrin test was negative. It was then washed with NMP (5 x 2 min). The removal of the Fmoc group and subsequent washes were performed as previously described.
El ciclo de acoplamiento-desprotección se repitió para el resto de los aminoácidos protegidos con el grupo Nα-Fmoc: Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Phe-OH, yThe coupling-deprotection cycle was repeated for the rest of the amino acids protected with the group N α -Fmoc: Fmoc-Lys (Boc) -OH, Fmoc-Phe-OH, and
Fmoc-Leu-OH. En cada etapa se procedió al lavado con NMP (5 x 2 min). El éster alílico C-terminal del ácido glutámico incorporado al péptido fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento con 347 mg de Pd(PPh3)4 (0,3 mmoles) en 3 mi de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1) durante 5 h bajo agitación. Pasado este tiempo la resina fue lavada con THF (3 x 2 min), NMP (3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH2Cl2 (1:19, 3 x 2 min), N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (10 x 1 min), CH2Cl2 (3 x 2 min), y NMPFmoc-Leu-OH. In each stage the NMP was washed (5 x 2 min). The C-terminal allyl ester of glutamic acid incorporated into the peptide was removed under a nitrogen atmosphere by treatment with 347 mg of Pd (PPh 3 ) 4 (0.3 mmol) in 3 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM ( 37: 2: 1) for 5 h under stirring. After this time the resin was washed with THF (3 x 2 min), NMP (3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH 2 Cl 2 (1:19, 3 x 2 min), N, N-diethyldithiocarbamate sodium (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (10 x 1 min), CH 2 Cl 2 (3 x 2 min), and NMP
(3 x 1 min).(3 x 1 min).
Después de eliminar el grupo Fmoc del último aminoácido acoplado y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo el péptido linealAfter removing the Fmoc group from the last coupled amino acid and proceeding to the washes as described above, the linear peptide was obtained.
Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Leu-Lys-Glu unido a la resina. En este estadio, el péptido contiene aún el residuo de ácido glutámico, ya que la glutamina no se forma hasta la escisión del péptido cíclico de la resina.Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Leu-Lys-Glu bonded to the resin. At this stage, the peptide still contains the glutamic acid residue, since glutamine is not formed until the excision of the cyclic peptide from the resin.
La ciclación del péptido se llevó a cabo mediante tratamiento con 156 mg de PyBOP (0,3 mmoles), 40 mg de HOBt (0,3 mmoles), y 104 μl de DIEA (0,6 mmoles) en 1 mi de NMP. Después de 24 horas a 25° C, el test de ninhidrina fue negativo.Peptide cyclization was carried out by treatment with 156 mg of PyBOP (0.3 mmol), 40 mg of HOBt (0.3 mmol), and 104 µl of DIEA (0.6 mmol) in 1 mL of NMP. After 24 hours at 25 ° C, the ninhydrin test was negative.
A continuación se lavó la resina con NMP (6 x 1 min) y CH2Cl2 (6 x 1 min), y se escindió el péptido cíclico de la resina mediante un tratamiento con 2 mi de una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 2 horas. Se recogieron los filtrados en un vial mediante una presión positiva de nitrógeno. La resina se lavó con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5, 2 x 0,5 mi). Los filtrados se combinaron y se evaporaron casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente, el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofílizó.The resin was then washed with NMP (6 x 1 min) and CH 2 Cl 2 (6 x 1 min), and the resin cyclic peptide was cleaved by a 2 ml treatment of a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 2 hours. The filtrates were collected in a vial by a positive nitrogen pressure. The resin was washed with a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5, 2 x 0.5 ml). The filtrates were combined and evaporated almost to dryness under a stream of nitrogen until an oil was obtained. Said oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was decanted. This process was repeated 3 or 4 times. Finally, the solid product obtained was dissolved in water, and lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.A powdery solid was obtained whose structure was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS.
Ejemplo 2.- Preparación de ciclofLvs-Leu-Lvs-Leu-Lys-Phe-Lvs-Leu-Lys-Example 2.- Preparation of cycloofLvs-Leu-Lvs-Leu-Lys-Phe-Lvs-Leu-Lys-
GIn) en fase sólida empleando como soporte sólido una SvnPhase™ LanternGIn) in solid phase using a SvnPhase ™ Lantern as solid support
Se partió de una SynPhase™ Lantern del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D formada por nueve discos unidos entre sí, equivalentes a 35 μmoles. Se cortó un fragmento de Lantern que comprendía cinco discos, equivalente a 19,44 μmoles, que se colocó en un recipiente provisto con un tapón y se hinchó con CH2Cl2 (5 rnin). La eliminación del grupo protector Fmoc presente en el soporte sólido se llevó a cabo por tratamiento con 1 mi de una mezcla de piperidina, CH2Cl2 y NMP (1 :2:2, 2 x 45 min). Los lavados se llevaron a cabo en jeringas de 10 mi, cubriendo el fragmento con NMP (3 x 5 min) y CH2CI2 (2 x 5 min). Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple.It was based on a SynPhase ™ Lantern of the Rink amide type polystyrene D series consisting of nine disks joined together, equivalent to 35 μmoles. A fragment of Lantern comprising five discs, equivalent to 19.44 μmoles, was cut into a container provided with a cap and swollen with CH 2 Cl 2 (5 rnin). The removal of the Fmoc protecting group present in the solid support was carried out by treatment with 1 ml of a mixture of piperidine, CH 2 Cl 2 and NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min). The washings were carried out in 10 ml syringes, covering the fragment with NMP (3 x 5 min) and CH 2 CI 2 (2 x 5 min). After each washing step the solvent is removed by a multiple vacuum filter.
El fragmento de Lantern se colocó a continuación en un recipiente cerrado que contenía 1 mi de una solución en NMP de 49 mg de Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg de HBTU (120 mM), y 42 μl DIEA (240 mM). Después de 24 horas, el fragmento de Lantern se lavó con NMP (3 x 5 min), y CH2Cl2 (2 x 5 min).The Lantern fragment was then placed in a closed container containing 1 ml of a 49 mg NMP solution of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg of HBTU (120 mM), and 42 μl DIEA (240 mM). After 24 hours, the Lantern fragment was washed with NMP (3 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min).
Las siguientes etapas de acoplamiento con los aminoácidos restantes se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento y lavados, como ya se ha descrito anteriormente.The following coupling steps with the remaining amino acids were carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling and washing, as already described above.
Una vez finalizadas las etapas de acoplamiento, el éster alílico C-terminal fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento durante 6 h con 87 mg de Pd(PPh3)4 (75 mM) en 1 mi de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1). El fragmento de Lantern fue lavado con una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1, 3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH2Cl2 (1:19, 3 x 5 min), N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), y CH2Cl2 (5 x 5 min). Después de eliminar el grupo Fmoc y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo un péptido lineal unido a la SynPhase™ Lantern.Once the coupling steps were completed, the C-terminal allyl ester was removed under nitrogen atmosphere by treatment for 6 h with 87 mg of Pd (PPh 3 ) 4 (75 mM) in 1 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1). The Lantern fragment was washed with a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1, 3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH 2 Cl 2 (1:19, 3 x 5 min), N , Sodium N-diethyldithiocarbamate (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (5 x 5 min). After removing the Fmoc group and proceeding to the washes as described above, a linear peptide bound to the SynPhase ™ Lantern was obtained.
La ciclación del péptido se llevó a cabo mediante tratamiento con 162 mg de PyBOP (311 μmoles), 42 mg de HOBt (311 μmoles), y 109 μl de DIEA (622 μmoles) en 1 mi de NMP. Después de 24 horas a 25° C, se lavó el fragmento de Lantern con NMP (3 x 5 min) y CH2Cl2 (3 x 5 min), y se escindió el péptido cíclico de dicho fragmento mediante un tratamiento con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 1 hora. El fragmento de Lantern se sacó con unas pinzas y la mezcla acidolítica se evaporó casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.Peptide cyclization was carried out by treatment with 162 mg of PyBOP (311 μmoles), 42 mg of HOBt (311 μmoles), and 109 μl of DIEA (622 μmoles) in 1 ml of NMP. After 24 hours at 25 ° C, the Lantern fragment was washed with NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (3 x 5 min), and the cyclic peptide of said fragment was cleaved by treatment with a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 1 hour. The Lantern fragment was removed with tweezers and the acidolytic mixture was evaporated almost to dryness under a stream of nitrogen until an oil was obtained. Said oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was decanted. This process was repeated 3 or 4 times. Finally, the solid product obtained was dissolved in water, and lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento, cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.A powdery solid was obtained, the structure of which was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS.
Ejemplo 3.- Preparación de cicloCLvs-Leu-Lvs-Leu-Lvs-Phe-Lys-Leu-Lvs-Example 3.- Preparation of the cycleCLvs-Leu-Lvs-Leu-Lvs-Phe-Lys-Leu-Lvs-
GIn) en fase sólida empleando como soporte sólido una SvnPhase™ Lantern y realizando la ciclación empleando radiación de microondasGIn) in solid phase using a SvnPhase ™ Lantern as a solid support and cycling using microwave radiation
Se partió de una SynPhase™ Lantern de 35 μmoles del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D, de la que se cortó un fragmento que comprendía cinco discos unidos entre sí, equivalente a 19,44 μmoles, que se colocó en un recipiente de vidrio provisto con un tapón y se hinchó con CH2Cl2 (5 min). La eliminación del grupo protector Fmoc se llevó a cabo por tratamiento con 1 mi de una mezcla de piperidina, CH2Cl2 y NMP (1 :2:2, 2 x 45 min). Los lavados se llevaron a cabo sumergiendo el fragmento en NMP (3 x 5 min) y CH2CI2 (2 x 5 min) empleando jeringas de 10 mi. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple. El fragmento de Lantern se colocó a continuación en un recipiente cerrado que contenía 1 mi de una solución en NMP de 49 mg de Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg de HBTU (120 mM), y 42 μl DIEA (240 mM). Después de 24 horas, el fragmento se lavó con NMP (3 x 5 min), y CH2Cl2 (2 x 5 min). Las siguientes etapas de acoplamiento con el resto de los aminoácidos se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento y lavados, como ya se ha descrito anteriormente.It was split from a SynPhase ™ Lantern of 35 μmoles of the Rink amide type polystyrene D series, from which a fragment comprising five disks joined together, equivalent to 19.44 μmoles, was cut into a container of glass provided with a stopper and swollen with CH 2 Cl 2 (5 min). The removal of the Fmoc protecting group was carried out by treatment with 1 ml of a mixture of piperidine, CH 2 Cl 2 and NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min). Washing was carried out by immersing the fragment in NMP (3 x 5 min) and CH 2 CI 2 (2 x 5 min) using 10 ml syringes. After each washing step the solvent is removed by a multiple vacuum filter. The Lantern fragment was then placed in a closed container containing 1 ml of a 49 mg NMP solution of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg of HBTU (120 mM), and 42 μl DIEA (240 mM). After 24 hours, the fragment was washed with NMP (3 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min). The following coupling steps with the rest of the amino acids were carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling and washing, as already described above.
Una vez finalizadas las etapas de acoplamiento, el éster alílico C-terminal fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento durante 6 h con 87 mg deAfter completion of the coupling steps, the C-terminal allyl ester was removed under a nitrogen atmosphere by treatment for 6 h with 87 mg of
Pd(PPh3)4 (75 mM) en 1 mi de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMMPd (PPh 3 ) 4 (75 mM) in 1 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM
(37:2:1). El fragmento de Lantern fue lavado con una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1, 3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH2Cl2 (1:19, 3 x 5 min),(37: 2: 1). The Lantern fragment was washed with a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1, 3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH 2 Cl 2 (1:19, 3 x 5 min),
N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), y CH2Cl2 (5 x 5 min).N, sodium N-diethyldithiocarbamate (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (5 x 5 min).
Después de eliminar el grupo Fmoc y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo un péptido lineal unido a la SynPhase™ Lantern.After removing the Fmoc group and proceeding to the washes as described above, a linear peptide bound to the SynPhase ™ Lantern was obtained.
La ciclación del péptido se llevó a cabo colocando el fragmento de Lantern en un vial de vidrio y tratándolo con 162 mg de PyBOP (311 μmoles), 42 mg de HOBt (311 μmoles), y 109 μl de DIEA (622 μmoles) en 1 mi de NMP.Peptide cyclization was carried out by placing the Lantern fragment in a glass vial and treating it with 162 mg of PyBOP (311 μmoles), 42 mg of HOBt (311 μmoles), and 109 μl of DIEA (622 μmoles) in 1 My from NMP.
El vial se colocó en un recipiente apropiado para la radiación de microondas. Primeramente se aplicó durante 5 minutos una rampa de radiación de microondas hasta un máximo de 500 vatios, para llegar a una temperatura de 50° C. La potencia de la radiación de microondas se regulaba mediante un termostato que se fijó a una temperatura máxima de 50° C. Se continuó la irradiación para mantener la temperatura a 50° C durante 15 minutos. La masa de la reacción se enfrió a temperatura ambiente, y se aplicaron dos ciclos de 15 minutos de radiación de microondas.The vial was placed in an appropriate container for microwave radiation. First, a microwave radiation ramp was applied for a maximum of 500 watts for 5 minutes, to reach a temperature of 50 ° C. The power of the microwave radiation was regulated by a thermostat that was set at a maximum temperature of 50 ° C. Irradiation was continued to maintain the temperature at 50 ° C for 15 minutes. The reaction mass was cooled to room temperature, and two 15 minute cycles of microwave radiation were applied.
Una vez finalizado el período de irradiación, se eliminó el disolvente y el fragmento de Lantern se lavó en NMP (3 x 5 min) y CH2Cl2 (3 x 5 min). El péptido cíclico se escindió del fragmento de Lantern mediante un tratamiento con una mezcla deOnce the irradiation period was over, the solvent was removed and the Lantern fragment was washed in NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (3 x 5 min). The cyclic peptide was cleaved from the Lantern fragment by treatment with a mixture of
TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 1 hora. El fragmento de Lantern se sacó con unas pinzas y la mezcla acidolítica se evaporó casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 1 hour. The Lantern fragment was removed with tweezers and the acidolytic mixture was evaporated almost to dryness under a stream of nitrogen until an oil was obtained. Said oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was decanted. This process was repeated 3 or 4 times. Finally, the solid product obtained was dissolved in water, and lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento, cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS. Ejemplos 4 a 6.- Preparación de péptidos de la invención en fase sólida empleando como soporte sólido una SynPhase™ Lantern y realizando la ciclación empleando radiación de microondasA powdery solid was obtained, the structure of which was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS. Examples 4 to 6.- Preparation of peptides of the invention in solid phase using a SynPhase ™ Lantern as solid support and cyclizing using microwave radiation
Siguiendo un procedimiento análogo al descrito en el Ejemplo 3, se prepararon los péptidos cíclicos que muestra la Tabla II:Following a procedure analogous to that described in Example 3, the cyclic peptides shown in Table II were prepared:
TABLA IITABLE II
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En todos los casos los péptidos cíclicos se analizaron por HPLC y se confirmó su estructura por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS .In all cases the cyclic peptides were analyzed by HPLC and their structure was confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS.
Ejemplo 7.- Preparación de una quimioteca de péptidos cíclicos en fase sólida empleando como soporte sólido SvnPhase™ LanternsExample 7.- Preparation of a solid phase cyclic peptide library using SvnPhase ™ Lanterns as solid support
Se preparó una quimioteca de 56 péptidos cíclicos de 10 aminoácidos a partir de 28 SynPhase™ Lanterns del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D comerciales, cada una de las cuales se dividió en dos.A library of 56 cyclic peptides of 10 amino acids was prepared from 28 SynPhase ™ Lanterns of the commercial R-type polystyrene Rink amide type, each of which was divided into two.
Los fragmentos de Lantern se marcaron con "spindles" y "cogs" de colores, comercializados por Mimotopes, para identificar las posiciones que contenían un residuo de leucina.Lantern fragments were marked with spindles and colored cogs, marketed by Mimotopes, to identify positions that contained a leucine residue.
Todos los fragmentos de Lantern se colocaron en un único recipiente de vidrio provisto con un tapón y se cubrieron con CH2Cl2 durante 5 minutos para hincharlos. Para eliminar el grupo protector Fmoc se trataron con 30 mi de una mezcla de piperidina-CH2Cl2-NMP (1:2:2, 2 x 45 min). Los lavados se llevaron a cabo sumergiendo los fragmentos en NMP (3 x 5 min) y CH2Cl2 (2 x 5 min) empleando jeringas de plástico. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple.All Lantern fragments were placed in a single glass container provided with a stopper and covered with CH 2 Cl 2 for 5 minutes to swell them. To remove the Fmoc protecting group, they were treated with 30 ml of a mixture of piperidine-CH 2 Cl 2 -NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min). Washing was carried out by immersing the fragments in NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min) using plastic syringes. After each washing step the solvent is removed by a multiple vacuum filter.
A continuación los fragmentos de Lantern se colocaron en un recipiente provisto de un tapón que contenía 30 mi de una solución de 1,47 g de Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 1,36 g de HBTU (120 mM), y 1,25 mi de DIEA (240 mM) en NMP. Al cabo de 24 horas, se lavaron los fragmentos con NMP (3 x 5 min) y CH2Cl2 (2 x 5 min).The Lantern fragments were then placed in a container provided with a cap containing 30 ml of a solution of 1.47 g of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 1.36 g of HBTU (120 mM), and 1.25 ml of DIEA (240 mM) in NMP. After 24 hours, the fragments were washed with NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min).
Los acoplamientos subsiguientes se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento con un nuevo aminoácido, y lavados, tal como ya se ha descrito anteriormente.Subsequent couplings were carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling with a new amino acid, and washes, as already described above.
Para cada acoplamiento con Fmoc-Lys(Boc)-OH y Fmoc-Leu-OH, los fragmentos de Lantern se clasificaron y se separaron en dos grupos, de modo que 21 fragmentos se trataron con una solución que contenía Fmoc-Leu-OH, y 35 fragmentos con Fmoc-Lys(Boc)-OH. Después de cada etapa de acoplamiento, los fragmentos de Lantern se introducían en una única jeringa de plástico para realizar los lavados.For each coupling with Fmoc-Lys (Boc) -OH and Fmoc-Leu-OH, the Lantern fragments were classified and separated into two groups, so that 21 fragments were treated with a solution containing Fmoc-Leu-OH, and 35 fragments with Fmoc-Lys (Boc) -OH. After each stage of coupling, the Lantern fragments were introduced into a single plastic syringe to perform the washes.
A continuación se separaban nuevamente en dos grupos para el acoplamiento subsiguiente de Fmoc-Lys(Boc)-OH o Fmoc-Leu-OH, o se colocaban en un mismo recipiente para el acoplamiento de Fmoc-Phe-OH. Una vez finalizados todos los acoplamientos para obtener péptidos lineales de 10 aminoácidos, se procedió a la eliminación del éster alílico C-terminal, a la eliminación del grupo protector Fmoc, y a los lavados siguiendo el procedimiento descrito en el Ejemplo 2. Todas estas etapas se realizaron colocando todos los fragmentos de Lantern en un único recipiente o jeringa. La ciclación de cada uno de los péptidos se llevó a cabo en recipientes individuales siguiendo el fratamiento descrito en el Ejemplo 2.They were then separated again into two groups for the subsequent coupling of Fmoc-Lys (Boc) -OH or Fmoc-Leu-OH, or placed in the same container for the coupling of Fmoc-Phe-OH. Once all the couplings were finished to obtain linear peptides of 10 amino acids, the C-terminal allyl ester was removed, the Fmoc protective group was removed, and the washes were followed following the procedure described in Example 2. All these steps were They performed by placing all the Lantern fragments in a single container or syringe. The cyclization of each of the peptides was carried out in individual containers following the treatment described in Example 2.
A continuación se procedió a la escisión del péptido cíclico del soporte sólido, y al aislamiento de cada uno de los péptidos siguiendo el procedimiento descrito en el Ejemplo 2. Para ello, cada fragmento de Lantern se colocó en un recipiente individual.Subsequently, the cyclic peptide was excised from the solid support, and the isolation of each of the peptides following the procedure described in Example 2. For this, each Lantern fragment was placed in an individual container.
Los péptidos obtenidos se analizaron por HPLC y se confirmó su estructura por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS. En la Figura 1 se incluyen las estructuras de los 56 decapéptidos cíclicos sintetizados en este Ejemplo 7.The peptides obtained were analyzed by HPLC and their structure was confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS. The structures of the 56 cyclic decapeptides synthesized in this Example 7 are included in Figure 1.
Ejemplo 8.- Ensayos de actividad antimicrobianaExample 8.- Antimicrobial activity assays
Para evaluar el efecto antimicrobiano de los péptidos de la invención se emplearon las siguientes cepas de bacterias patógenas: Erwinia amylovora PMW6076The following strains of pathogenic bacteria were used to assess the antimicrobial effect of the peptides of the invention: Erwinia amylovora PMW6076
(INRA, Angers, Francia), Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria 2323-3(INRA, Angers, France), Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria 2323-3
(IVIA, Valencia, España), y Pseudomonas syringae 94 (INTEA, Universitat de Girona, España).(IVIA, Valencia, Spain), and Pseudomonas syringae 94 (INTEA, University of Girona, Spain).
Todas las bacterias se conservaron a una temperatura de -80° C en medio Luria-Bertani (LB) complementado con glicerina al 20% en volumen/volumen.All bacteria were stored at a temperature of -80 ° C in Luria-Bertani (LB) medium supplemented with 20% glycerin in volume / volume.
Las muestras de E. amylovora PMV6076 y P. syringae se obtuvieron después de un crecimiento de 24 horas a 25° C, y la muestra de X.vesicatoria 2323-3 se recogió después de 48 horas a 25° C en agar LB. En todos los casos se resuspendieron en agua estéril para obtener una suspensión ajustada a una absorbancia de 0,2 a 600 nm, que correspondía aproximadamente a 108 unidades formadoras de colonias/ml.Samples of E. amylovora PMV6076 and P. syringae were obtained after 24 hour growth at 25 ° C, and the X.vesicatoria sample 2323-3 was collected after 48 hours at 25 ° C on LB agar. In all cases, they were resuspended in sterile water to obtain a suspension adjusted to an absorbance of 0.2 to 600 nm, corresponding to approximately 10 8 colony forming units / ml.
Para determinar la concentración inhibitoria mínima (CIM), los péptidos se solubilizaron en agua estéril milli-Q hasta una concentración final de 1000 μM y se filtraron a través de un filtro de 0,22 μm de poro.To determine the minimum inhibitory concentration (MIC), the peptides were solubilized in sterile milli-Q water to a final concentration of 1000 μM and filtered through a 0.22 μm pore filter.
Se realizaron diluciones de los péptidos de la invención para obtener soluciones a las concentraciones 750, 500, 250, 125, 62,5, y 31,2 μM.Dilutions of the peptides of the invention were made to obtain solutions at concentrations 750, 500, 250, 125, 62.5, and 31.2 µM.
Se mezclaron 20 μl de cada dilución con 20 μl de la suspensión del indicador bacteriano correspondiente, 160 μl de medio líquido TSB (Triptone Soy Broth), hasta un volumen total de 200 μl en cada pocilio de una microplaca. Así las concentraciones efectivas a las que se sometían las suspensiones de bacterias fueron 75,20 μl of each dilution was mixed with 20 μl of the corresponding bacterial indicator suspension, 160 μl of TSB liquid medium (Triptone Soy Broth), to a total volume of 200 μl in each well of a microplate. Thus the effective concentrations to which the bacterial suspensions were subjected were 75,
50, 25, 12,5, 6,25 y 3,12 μM.50, 25, 12.5, 6.25 and 3.12 μM.
Se llevaron a cabo tres replicados para cada cepa, concentración y péptido en ensayo. Los controles positivos contenían agua en lugar de péptido, y los controles negativos contenían los péptidos sin la suspensión bacteriana. El crecimiento microbiano se determinó automáticamente mediante la medida de la densidad óptica a 600 nm empleando el Microbiology Analyser Bioscreen C (Labsystems).Three replicates were carried out for each strain, concentration and peptide tested. Positive controls contained water instead of peptide, and negative controls contained peptides without bacterial suspension. Microbial growth was determined automatically by measuring the optical density at 600 nm using the Microbiology Analyzer Bioscreen C (Labsystems).
Las microplacas se incubaron a 25° C durante 48 horas con una agitación de 20 segundos antes de la medida de la absorbencia cada hora. Cada experimento se realizó por triplicado. Como CIM se tomó la concentración de péptido más baja a la que no se producía crecimiento bacteriano al final del experimento.The microplates were incubated at 25 ° C for 48 hours with a shaking of 20 seconds before measuring the absorbency every hour. Each experiment was performed in triplicate. As CIM, the lowest peptide concentration at which no bacterial growth occurred at the end of the experiment was taken.
En la Tabla III se presenta el rango de concentraciones entre las que se encuentra la CIM, expresada en μM, después de 48 horas de incubación a 25° C, para diferentes péptidos de la invención frente a las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensi$,Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae:Table III shows the range of concentrations between the MIC, expressed in μM, after 48 hours of incubation at 25 ° C, for different peptides of the invention against the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensi $, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae:
TABLA IIITABLE III
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(N.D. : No determinado)(N.D.: Not determined)
Se puede observar que los péptidos de la invención presentan una buena eficacia para inhibir el crecimiento de las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, que son representativas de bacterias patógenas para las plantas.It can be seen that the peptides of the invention have a good efficacy to inhibit the growth of the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae, which are representative of pathogenic bacteria for plants.
Además de los resultados de actividad antibacteriana que presentan los péptidos de la Tabla 3, el resto de decapéptidos de la quimioteca preparada en el Ejemplo 7, y cuya estructura se encuentra en la Figura 1, se ha ensayado frente a Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, y se ha comprobado que todos inhiben el crecimiento de al menos dos de dichas especies bacterianas.In addition to the results of antibacterial activity presented by the peptides of Table 3, the rest of the decapeptides of the library prepared in Example 7, and whose structure is in Figure 1, has been tested against Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae, and all have been shown to inhibit the growth of at least two of said bacterial species.
Para la determinación de la actividad antifungica se cultivó la cepa del hongo Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici FOL 3 raza 2 (ATCC 201829, aislado en España), primero en medio de agar-patata-dextrosa (PDA). Las microesporas se obtuvieron después de un crecimiento en caldo de dextrosa y patata (PDB) durante 7 días a 25° C en un agitador rotatorio a 125 rpm. La suspensión de las esporas se filtró y se ajustó a 104 microesporas/ml empleando la cámara de contaje Thoma.To determine the antifungal activity, the strain of the fungus Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici FOL 3 race 2 (ATCC 201829, isolated in Spain), first in the middle of agar-potato-dextrose (PDA). The microspores were obtained after a growth in dextrose and potato broth (PDB) for 7 days at 25 ° C on a rotary shaker at 125 rpm. The spore suspension was filtered and adjusted to 10 4 microspores / ml using the Thoma counting chamber.
Los péptidos de la invención se solubilizaron en agua estéril milli-Q hasta una concentración final de 1000 μM y se filtraron a través de un filtro de 0,22 μm de poro. Con dicha solución se realizaron diluciones de los péptidos para obtener soluciones a las concentraciones 750, 500, 250, 125, 62,5, y 31,2 μM.The peptides of the invention were solubilized in sterile milli-Q water to a final concentration of 1000 μM and filtered through a 0.22 μm pore filter. With said solution dilutions of the peptides were made to obtain solutions at concentrations 750, 500, 250, 125, 62.5, and 31.2 μM.
A continuación se mezclaron 20 μl de cada dilución de péptido con 80 μl de la suspensión de hongo, y con 100 μl de medio PDB a doble concentración, hasta obtener un volumen total de 200 μl en un pocilio de una placa. De este modo se obtuvieron suspensiones de esporas expuestas a las concentraciones de 75, 50, 25, 12,5, 6,25 y 3,12 μM. Las placas se incubaron a 22° C durante 144 horas con series de 1 minuto de agitación seguido de 9 minutos de reposo.Then 20 µl of each dilution of peptide was mixed with 80 µl of the mushroom suspension, and with 100 µl of PDB medium at double concentration, until a total volume of 200 µl was obtained in a well of a plate. In this way spore suspensions exposed to the concentrations of 75, 50, 25, 12.5, 6.25 and 3.12 µM were obtained. The plates were incubated at 22 ° C for 144 hours with 1 minute series of stirring followed by 9 minutes of rest.
Los controles positivos contenían agua en lugar de péptido, y los controles negativos contenían los péptidos sin la suspensión de esporas.Positive controls contained water instead of peptide, and negative controls contained peptides without spore suspension.
La intensidad de crecimiento se determinó mediante el área bajo la curva y los cálculos se realizaron siguiendo los procedimientos descritos en KX.Reynolds, y D.A.Enher, Statistical comparison of epidemics pág. 34-37, en D.A. Franclch Neher (Eds.), Exercises inplant disease epidemiology. APS. Press. 1997, Minnesotta. En la Tabla IV se presenta el rango de concentraciones entre los que se encuentra la concentración inhibitoria mínima (CIM), expresada en μM, después de 144 horas de incubación para varios péptidos de la invención frente al hongo patógeno para las plantas Fusarium oxysporum:The intensity of growth was determined by the area under the curve and the calculations were performed following the procedures described in KX.Reynolds, and D.A. Enher, Statistical comparison of epidemics p. 34-37, in D.A. Franclch Neher (Eds.), Exercises inplant disease epidemiology. APS Press 1997, Minnesotta. Table IV shows the range of concentrations among which is the minimum inhibitory concentration (MIC), expressed in μM, after 144 hours of incubation for several peptides of the invention against the pathogenic fungus for Fusarium oxysporum plants:
TABLA IVTABLE IV
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Se puede observar que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento del hongo patógeno para las plantas Fusarium oxysporum.
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It can be seen that the peptides of the invention inhibit the growth of the pathogenic fungus for Fusarium oxysporum plants.
Ejemplo 8.- Ensayos de actividad hemolíticaExample 8.- Hemolytic activity tests
La actividad hemolítica de los péptidos de la invención se evaluó mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de los péptidos con una suspensión de eritrocitos al 5% en volumen procedentes de sangre humana fresca. La sangre se recogió asépticamente empleando un sistema Vacuntainer® The hemolytic activity of the peptides of the invention was evaluated by determining the release of hemoglobin that occurs upon contacting a solution of the peptides with a 5% volume red cell suspension from fresh human blood. Blood was collected aseptically using a Vacuntainer ® system
K2E (Belliver, Gran Bretaña) con EDTA, y se almacenó a 4o C durante un período inferior a 2 horas.K2E (Belliver, Great Britain) with EDTA, and was stored at 4 o C for a period of less than 2 hours.
La sangre se centrifugó a 6.000 g durante 5 minutos para separar los eritrocitos. Éstos se lavaron tres veces con tampón TRIS (10 mM TRIS, 150 mM NaCl, pH 7,2), y se suspendieron en tampón TRIS hasta obtener una suspensión que contenía un 10% en volumen de eritrocitos.The blood was centrifuged at 6,000 g for 5 minutes to separate the erythrocytes. These were washed three times with TRIS buffer (10 mM TRIS, 150 mM NaCl, pH 7.2), and suspended in TRIS buffer until a suspension containing 10% by volume of erythrocytes was obtained.
Los péptidos se solubilizaron en tampón TRIS hasta una concentración final 125, 250, 500 y 750 μM.The peptides were solubilized in TRIS buffer to a final concentration 125, 250, 500 and 750 µM.
Se emplearon tres replicados para cada péptido y concentración. Se mezclaron 65 μl de la suspensión de eritrocitos al 10% en volumen con 65 μl de la solución de péptido en cada pocilio de una placa de 96 pocilios Micro- Amp® (Applied Biosystems, EE.UU.) (5% en volumen de eritrocitos), y se incubó la mezcla durante 1 h a 37° C bajo agitación. De este modo las suspensiones de eritrocitos se sometieron a concentraciones de péptidos de 62,5, 125, 250 y 375 μM. A continuación se centrifugaron las placas a 3.500 g durante 10 minutos, y se transfirieron alícuotas de 80 μl del sobrenadante a microplacas de 100 pocilios (Bioscreen), que se diluyeron con 80 μl de agua milli-Q.Three replicates were used for each peptide and concentration. 65 µl of the 10% volume red cell suspension was mixed with 65 µl of the peptide solution in each well of a 96-well Micro-Amp ® plate (Applied Biosystems, USA) (5% by volume of erythrocytes), and the mixture was incubated for 1 h at 37 ° C with stirring. Thus the erythrocyte suspensions were subjected to peptide concentrations of 62.5, 125, 250 and 375 μM. The plates were then centrifuged at 3,500 g for 10 minutes, and 80 μl aliquots of the supernatant were transferred to 100-well microplates (Bioscreen), which were diluted with 80 μl of milli-Q water.
El grado de hemolisis se determinó a partir de la absorbancia a 540 nm con un lector de placas Bioscreen. El control positivo de hemolisis completa se determinó en una solución de tampón TRIS que contenía melitina (Sigma-Aldrich, España).The degree of hemolysis was determined from the absorbance at 540 nm with a Bioscreen plate reader. The positive control of complete hemolysis was determined in a TRIS buffer solution containing melitin (Sigma-Aldrich, Spain).
El porcentaje de hemolisis (H) se determinó empleando la ecuación: H = 1 OQxKQp-ObV(Om-Ob)] donde Op era la densidad óptica medida para una concentración de péptido determinada, Ob era la densidad óptica de la solución tampón, y Om era la densidad óptica para el control positivo con melitina.The percentage of hemolysis (H) was determined using the equation: H = 1 OQxKQp-ObV (Om-Ob)] where Op was the optical density measured for a given peptide concentration, Ob was the optical density of the buffer solution, and Om was the optical density for the positive control with melitin.
La Tabla V presenta los resultados de actividad hemolítica para diferentes concentraciones de péptidos de la invención, expresada como el porcentaje de hemolisis calculado según la ecuación anterior:Table V presents the results of hemolytic activity for different concentrations of peptides of the invention, expressed as the percentage of hemolysis calculated according to the previous equation:
TABLA VTABLE V
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En todos los casos se observa que la concentración en la que se llegaría a producir una hemolisis significativa es entre 10 y 100 veces superior a la concentración en la que el péptido presenta actividad antimicrobiana. In all cases it is observed that the concentration in which a significant hemolysis would occur is between 10 and 100 times higher than the concentration in which the peptide exhibits antimicrobial activity.

Claims

REΓVINDICACIOΓNESREΓVINDICACIOΓNES
L- Péptidos cíclicos caracterizados porque tienen un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60%, y que responden a la fórmula general (I): ciclo[(X)n - Y - (X)1n - GIn)] (I) donde: X es Lys y/o Leu,L- Cyclic peptides characterized in that they have a lysine molar content between 40% and 60%, and that they respond to the general formula (I): cycle [(X) n - Y - (X) 1n - GIn)] (I) where: X is Lys and / or Leu,
Y es Phe o D-Phe, n=l,3,o5, m= 1,3, o 5, y n + m = 2,4,6o8.Y is Phe or D-Phe, n = 1, 3, o5, m = 1.3, or 5, and n + m = 2.4.6o8.
2.- Péptidos cíclicos según la reivindicación 1 caracterizados porque en la fórmula general (I)2. Cyclic peptides according to claim 1 characterized in that in the general formula (I)
X es Lys y/o Leu, Y es Phe, y m= l,yn= l,o m = 3,yn=l,3,o5.X is Lys and / or Leu, Y is Phe, and m = l, and n = 1, or m = 3, and n = 1, 3, or 5.
3.- Péptidos cíclicos según la reivindicación 2 caracterizados porque en la fórmula general (I)3. Cyclic peptides according to claim 2 characterized in that in the general formula (I)
X es Lys y/o Leu,X is Lys and / or Leu,
Y es Phe, y m = 3,yn=5.Y is Phe, and m = 3, and n = 5.
4.- Péptidos cíclicos según las reivindicaciones 1 y 2 caracterizados porque están definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 3.4. Cyclic peptides according to claims 1 and 2 characterized in that they are defined by the amino acid sequences SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 3.
5.- Péptidos cíclicos según las reivindicaciones 1 a 3 caracterizados porque están definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 4 a SEQ_ID_NO: 23. 5. Cyclic peptides according to claims 1 to 3 characterized in that they are defined by the amino acid sequences SEQ_ID_NO: 4 to SEQ_ID_NO: 23.
6.- Utilización de los péptidos según las reivindicaciones 1 a 5 para la preparación de una composición antimicrobiana.6. Use of the peptides according to claims 1 to 5 for the preparation of an antimicrobial composition.
7.- Utilización según la reivindicación 6 como agentes antimicrobianos frente a bacterias y a hongos patógenos para las plantas.7. Use according to claim 6 as antimicrobial agents against bacteria and fungi pathogenic to plants.
8.- Utilización según la reivindicación 7 caracterizado porque las bacterias patógenas para las plantas se seleccionan entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.8. Use according to claim 7, characterized in that the pathogenic bacteria for the plants are selected from the group formed by Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
9.- Utilización según la reivindicación 7 caracterizado porque el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum.9. Use according to claim 7, characterized in that the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum.
10.- Utilización según las reivindicaciones 6 a 9 caracterizado porque las plantas se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.10. Use according to claims 6 to 9 characterized in that the plants are selected from the group consisting of fruit trees, horticultural plants, and ornamental plants.
11.- Composición fitosanitaria caracterizada porque comprende un péptido según las reivindicaciones 1 a 5, y un agente auxiliar.11. Phytosanitary composition characterized in that it comprises a peptide according to claims 1 to 5, and an auxiliary agent.
12.- Composición según la reivindicación 11 caracterizada porque el péptido se encuentra a una concentración comprendida entre 0,1 g/1 y 0,5 g/1.12. Composition according to claim 11 characterized in that the peptide is at a concentration between 0.1 g / 1 and 0.5 g / 1.
13.- Composición según las reivindicaciones 11 y 12 caracterizada porque el agente auxiliar se selecciona entre el grupo formado por disolventes, tensioactivos, agentes tamponantes, filtros de la radiación ultravioleta y/o sus mezclas.13. Composition according to claims 11 and 12 characterized in that the auxiliary agent is selected from the group consisting of solvents, surfactants, buffering agents, ultraviolet radiation filters and / or mixtures thereof.
14.- Composición según la reivindicación 13 caracterizada porque el disolvente es agua.14. Composition according to claim 13 characterized in that the solvent is water.
15.- Método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de plantas causadas por bacterias y hongos caracterizado porque comprende poner en contacto la planta con una composición fitosanitaria según las reivindicaciones 11 a 14. 15. Method for preventing and treating infections and diseases of plants caused by bacteria and fungi characterized in that it comprises contacting the plant with a phytosanitary composition according to claims 11 to 14.
16.- Método según la reivindicación 15 caracterizado porque las bacterias patógenas para las plantas se seleccionan entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavihacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.16. Method according to claim 15 characterized in that the pathogenic bacteria for the plants are selected from the group formed by Erwinia amylovora, Clavihacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, and Pseudomonas syringae.
17.-Método según la reivindicación 15 caracterizado porque el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum.17. Method according to claim 15 characterized in that the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum.
18.- Método según las reivindicaciones 15 a 17 caracterizado porque las plantas se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.18. Method according to claims 15 to 17 characterized in that the plants are selected from the group consisting of fruit trees, horticultural plants, and ornamental plants.
19.- Método según las reivindicaciones 15 a 18 caracterizado porque la composición se pone en contacto con las partes de las plantas seleccionadas entre el grupo formado por semillas, raíces, tallos, hojas, o frutos, o con el suelo o cualquier medio de crecimiento que rodee las raíces de las plantas.19. Method according to claims 15 to 18, characterized in that the composition is contacted with the parts of the plants selected from the group consisting of seeds, roots, stems, leaves, or fruits, or with the soil or any growth medium surrounding the roots of plants.
20.- Método según las reivindicaciones 15 a 19 caracterizado porque la composición se pone en contacto con la planta por pulverización, por inmersión o riego. 20. Method according to claims 15 to 19 characterized in that the composition is brought into contact with the plant by spraying, immersion or irrigation.
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