ES2281274B2 - ANTIMICROBIAL CYCLIC PEPTIDES. - Google Patents
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Abstract
La presente invención se refiere a nuevos péptidos cíclicos que tienen propiedades antimicrobianas. Dichos péptidos tienen un número par de aminoácidos comprendido entre 4 y 10, y un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60%. La invención describe la síntesis y la utilización de los mencionados péptidos como agentes antimicrobianos frente a bacterias y hongos patógenos para plantas. También se refiere a composiciones que comprenden dichos péptidos y un agente auxiliar, y a un método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de las plantas provocadas por bacterias y hongos patógenos.The present invention relates to new cyclic peptides that have antimicrobial properties. Said peptides have an even number of amino acids between 4 and 10, and a molar lysine content between 40% and 60%. The invention describes the synthesis and use of the aforementioned peptides as antimicrobial agents against pathogenic bacteria and fungi for plants. It also refers to compositions comprising said peptides and an auxiliary agent, and a method for preventing and treating infections and diseases of plants caused by pathogenic bacteria and fungi.
Description
Péptidos cíclicos antimicrobianos.Antimicrobial cyclic peptides.
La presente invención se refiere a péptidos cíclicos que son tienen propiedades antimicrobianas, y que son particularmente eficaces frente a bacterias y hongos patógenos para las plantas.The present invention relates to peptides cyclics that are have antimicrobial properties, and that are particularly effective against pathogenic bacteria and fungi to the plants.
La agricultura es un proceso para la producción de alimentos mediante el cultivo de ciertas plantas. El paso de la agricultura de subsistencia en la que se producía solamente lo necesario para satisfacer las necesidades del agricultor y de su familia, a la agricultura industrial que implica la existencia de grandes extensiones cultivadas, ha conducido a la necesidad de controlar las enfermedades de las plantas de forma efectiva a gran escala.Agriculture is a process for production of food by growing certain plants. The passage of the subsistence agriculture in which only what was produced necessary to meet the needs of the farmer and his family, to industrial agriculture that implies the existence of large cultivated extensions, has led to the need for control plant diseases effectively to large scale.
Un problema común en la agricultura es la reducción en el rendimiento causada por los ataques por microorganismos patogénicos para las plantas, por ejemplo las bacteriosis causadas por las bacterias Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria, o Clavibacter michiganensis, o micosis causadas por diversos hongos como Fusarium oxysporum.A common problem in agriculture is the reduction in yield caused by attacks by pathogenic microorganisms for plants, for example bacteriosis caused by the bacteria Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, Xanthomonas vesicatoria , or Clavibacter michiganensis , or mycosis caused by various fungi as Fusarium oxysporum .
Actualmente en Europa solamente están autorizados algunos productos para la protección de las plantas contra enfermedades bacterianas basados principalmente en derivados cúpricos con una eficacia de control insuficiente.Currently in Europe they are only authorized some products for plant protection against bacterial diseases based mainly on derivatives Cupric with insufficient control efficacy.
Antibióticos, como kasugamicina o estreptomicina, que hasta hace pocos años estaban autorizados en algunos países, en la actualidad no están autorizados en Europa. Los antibióticos estreptomicina y tetraciclina sí que están autorizados en países como los EE.UU., pero en numerosos casos se ha puesto de manifiesto la aparición de cepas resistentes del patógeno que hacen su uso inefectivo, o que pueden suponer un riesgo de transferencia de dicha resistencia a otras bacterias patógenas. En el caso de las micosis causadas por hongos fitopatógenos, si bien existen materias activas disponibles, se requieren continuamente nuevos fungicidas, en parte por la aparición de resistencias con una cierta frecuencia.Antibiotics, such as kasugamycin or streptomycin, which until a few years ago were authorized in Some countries are currently not authorized in Europe. The antibiotics streptomycin and tetracycline are authorized in countries like the US, but in many cases it has revealed the emergence of resistant strains of pathogens that make their use ineffective, or that may involve a risk of transfer of said resistance to other bacteria pathogens In the case of fungal mycoses phytopathogens, although there are active substances available, continually require new fungicides, partly because of the appearance of resistances with a certain frequency.
Además, muchos de los compuestos antifúngicos y antibacterianos conocidos más efectivos presentan una persistencia en el medio ambiente que no es deseable.In addition, many of the antifungal compounds and most effective known antibacterials have persistence in the environment that is not desirable.
Otra forma de controlar las enfermedades causadas por los microorganismos patógenos de los vegetales consiste en el empleo de compuestos aislados de la propia naturaleza, por ejemplo los péptidos, que están presentes en plantas y animales, y algunos de los cuales presentan propiedades antimicrobianas.Another way to control diseases caused by plant pathogenic microorganisms it consists of the use of compounds isolated from the own nature, for example peptides, which are present in plants and animals, and some of which have properties antimicrobial
En Broekaert et al, Plant. Physiol., 1995, 108, 1353-1358, se describe una familia de péptidos denominados defensinas vegetales que tienen una actividad antifúngica elevada. Dichos péptidos están constituidos por secuencias que comprenden entre 45 y 54 aminoácidos, y presentan puentes disulfuro formados entre dos aminoácidos cisteína situados en distintos puntos de la estructura.In Broekaert et al , Plant. Physiol., 1995, 108, 1353-1358, describes a family of peptides called plant defensins that have a high antifungal activity. Said peptides are constituted by sequences comprising between 45 and 54 amino acids, and have disulfide bridges formed between two cysteine amino acids located at different points of the structure.
En la solicitud de patente WO-A-95/11306 se describe un péptido de 30 aminoácidos aislado de la remolacha, que presenta propiedades bactericidas y fungicidas frente a microorganismos patógenos de los vegetales.In the patent application WO-A-95/11306 describes a peptide of 30 amino acids isolated from beet, which has properties bactericides and fungicides against pathogenic microorganisms of vegetables.
En la solicitud de patente WO-A-99/59412 se describe un péptido extraído de Poenibacillus polymyxa que inhibe las enfermedades causadas por hongos en plantas. Dicho péptido consta de un anillo formado por seis aminoácidos, y de una cadena lateral formada por dos aminoácidos.In patent application WO-A-99/59412 a peptide extracted from Poenibacillus polymyxa is described which inhibits fungal diseases in plants. Said peptide consists of a ring formed by six amino acids, and a side chain formed by two amino acids.
En la solicitud de patente WO-A-97/30082 se describe la aplicación para el empleo en agricultura de un péptido formado por 25 aminoácidos aislado de un escorpión.In the patent application WO-A-97/30082 describes the application for the use in agriculture of a peptide formed by 25 amino acids isolated from a scorpion.
Otra forma de actuar contra los microorganismos patógenos de las plantas consiste en el empleo de compuestos resultantes de la modificación de péptidos o proteínas antimicrobianos aislados de la naturaleza. Por ejemplo como se describe en:Another way to act against microorganisms Plant pathogens consist of the use of compounds resulting from the modification of peptides or proteins antimicrobials isolated from nature. For example how to described in:
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- la solicitud de patente EP-A-0472987, que se refiere a péptidos lineales de 23 aminoácidos, que son modificaciones de péptidos naturales pertenecientes al grupo de la magainina,the patent application EP-A-0472987, which refers to linear peptides of 23 amino acids, which are modifications of natural peptides belonging to the group of the magainin,
- --
- la solicitud de patente WO-A-02/06324, que se refiere a péptidos lineales de 44 aminoácidos derivados del péptido natural denominado heliomicina, othe patent application WO-A-02/06324, which refers to linear peptides of 44 amino acids derived from natural peptide called heliomycin, or
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- la patente norteamericana US6015941, que se refiere a péptidos lineales formados por 17 aminoácidos derivados de la taquiplesina.the US patent US6015941, which refers to linear peptides formed by 17 amino acids derived from taquiplesin.
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Como se describe en WO-A-96/008264, uno de los problemas de la utilización de compuestos antifúngicos y antibacterianos de origen natural es la limitación en cuanto a las cantidades comerciales disponibles, en parte debido a problemas de obtención y purificación.As described in WO-A-96/008264, one of the problems of the use of antifungal and antibacterial compounds of natural origin is the limitation in terms of quantities commercials available, in part due to procurement problems and purification.
Otra aproximación para disponer de péptidos antimicrobianos consiste en prepararlos por vía sintética.Another approach to dispose of peptides Antimicrobials consist of preparing them synthetically.
En el contexto del desarrollo de péptidos con actividad antimicrobiana de amplio espectro, en la solicitud de patente WO-A-98/03192 se describen péptidos cíclicos formados por un número de aminoácidos comprendido entre 10 y 30, que pueden aplicarse para el tratamiento de infecciones y enfermedades microbianas en plantas causadas por bacterias y hongos. Los péptidos formados por secuencias de 10 aminoácidos comprenden combinaciones de los aminoácidos: alanina, arginina, cisteína, fenilalanina, glicina, leucina, lisina, ornitina, prolina, serina, tirosina, treonina, triptófano, valina y D-arginina. Sin embargo, los ensayos de actividad antimicrobiana sólo se realizan frente a bacterias patógenas para el ser humano, y no se describe su actividad frente a bacterias y/o hongos patógenos para las plantas.In the context of the development of peptides with broad spectrum antimicrobial activity, in the application for WO-A-98/03192 patent are described cyclic peptides formed by a number of amino acids comprised between 10 and 30, which can be applied for the treatment of infections and microbial diseases in plants caused by bacteria and fungi Peptides formed by sequences of 10 amino acids comprise combinations of amino acids: alanine, arginine, cysteine, phenylalanine, glycine, leucine, lysine, Ornithine, proline, serine, tyrosine, threonine, tryptophan, valine and D-arginine However, activity tests antimicrobial are only performed against pathogenic bacteria to the human being, and its activity against bacteria and / or is not described pathogenic fungi for plants.
En el marco de diseñar nuevos péptidos antimicrobianos, en Frecer et al, Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 3349-3357, se describen péptidos constituidos por 19 aminoácidos, que comprenden la agrupación de aminoácidos glicina-serinaglicina en el centro de la molécula, y tienen estructura cíclica debido a la formación de un puente disulfuro entre los aminoácidos cisteína que se encuentran en posición terminal. Dichos péptidos presentan una buena eficacia frente a bacterias gram-positivas, que los hace susceptibles de ser aplicados en medicina, pero no se describe su actividad frente a hongos o a bacterias patógenas de los vegetales.Within the framework of designing new antimicrobial peptides, in Frecer et al , Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 3349-3357, peptides consisting of 19 amino acids are described, which comprise the glycine-serinaglycine amino acid cluster at the center of the molecule, and have a cyclic structure due to the formation of a disulfide bridge between the Cysteine amino acids that are in the terminal position. These peptides have a good efficacy against gram-positive bacteria, which makes them susceptible to being applied in medicine, but their activity against fungi or pathogenic bacteria of plants is not described.
Subsiste pues la necesidad de disponer de compuestos que sean efectivos frente a infecciones y enfermedades de las plantas provocadas por microorganismos como bacterias y hongos, y que sean fáciles de sintetizar.The need to have compounds that are effective against infections and diseases of plants caused by microorganisms such as bacteria and fungi, and that are easy to synthesize.
Los autores de la presente invención han desarrollado péptidos que resultan de fácil preparación y que presentan una elevada eficacia para inhibir el crecimiento de microorganismos patógenos de las plantas.The authors of the present invention have developed peptides that are easy to prepare and that they have a high efficacy to inhibit the growth of pathogenic microorganisms of plants.
El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos cíclicos que presentan propiedades antimicrobianas.The object of the present invention is provide cyclic peptides that have properties antimicrobial
Otro objeto de la invención es la utilización de dichos péptidos como agentes antimicrobianos.Another object of the invention is the use of said peptides as antimicrobial agents.
También es objeto de la invención una composición fitosanitaria que comprende los péptidos de la invención.It is also the object of the invention a phytosanitary composition comprising the peptides of the invention.
Forma parte también del objeto de la invención un método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de las plantas causadas por bacterias y hongos.It is also part of the object of the invention a method to prevent and treat infections and diseases of the Plants caused by bacteria and fungi.
Figura 1Figure one
En la Figura 1 se muestra la estructura de los 56 decapéptidos cíclicos pertenecientes a la quimioteca preparada empleando el procedimiento Multipin^{TM}, en el que se emplean las SynPhase^{TM} Lanterns comercializadas por la empresa Mimotopes (Australia), como soporte sólido.Figure 1 shows the structure of the 56 cyclic decapeptides belonging to the prepared library using the Multipin ™ procedure, in which they are used SynPhase? Lanterns marketed by the company Mimotopes (Australia), as solid support.
El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos cíclicos que tienen un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60%, y que responden a la fórmula general (I):The object of the present invention is provide cyclic peptides that have a molar content of lysine between 40% and 60%, and that respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln)](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln)]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe o D-Phe,And it's Phe or D-Phe,
n = 1, 3, o 5,n = 1, 3, or 5,
m = 1, 3, o 5, ym = 1, 3, or 5, and
n + m = 2, 4, 6 o 8.n + m = 2, 4, 6 or 8.
El término "ciclo" que se encuentra al principio de la secuencia de aminoácidos en la fórmula general (I) significa que el péptido es cíclico, de modo que el grupo \alpha-carboxílico del aminoácido Gln está unido mediante un enlace peptídico con el grupo \alpha-amino del primer aminoácido X perteneciente al grupo (X)_{n}.The term "cycle" found at principle of the amino acid sequence in the general formula (I) means that the peptide is cyclic, so that the group α-carboxylic acid amino acid Gln is linked through a peptide bond with the group α-amino of the first amino acid X belonging to the group (X) n.
Las abreviaturas empleadas para los aminoácidos en esta descripción siguen la normativa de la Comisión para la Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-IUB, según se describe en J. Biol. Chem., 1972, 247, 977-983. De esta forma, Lys significa L-lisina, Leu es L-leucina, Phe es L-fenilalanina, D-Phe es D-fenilalanina, y Gln es L-glutamina.Abbreviations used for amino acids in this description they follow the regulations of the Commission for the Biochemical Nomenclature of the IUPAC-IUB, as described in J. Biol. Chem., 1972, 247, 977-983. From this way, Lys means L-lysine, Leu is L-leucine, Phe is L-phenylalanine, D-Phe is D-phenylalanine, and Gln is L-Glutamine
Los compuestos que pertenecen a este grupo de péptidos presentan actividad antimicrobiana.Compounds that belong to this group of Peptides have antimicrobial activity.
Dicha actividad es particularmente efectiva frente a microorganismos patógenos de las plantas como por ejemplo el hongo Fusarium oxysporum, y las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.This activity is particularly effective against pathogenic microorganisms of plants such as the fungus Fusarium oxysporum , and the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae .
Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):Preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m = 1, y n = 1, om = 1, and n = 1, or
m = 3, y n = 1, 3, o 5.m = 3, and n = 1, 3, or 5.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):More preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m = 3, y n = 5.m = 3, and n = 5.
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 23, y cuya estructura se muestra en la Tabla I:Among the peptides of the invention that result be preferred are those defined by the sequences of amino acids SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 23, and whose structure is Sample in Table I:
Los péptidos objeto de la invención son cíclicos y comprenden entre 4 y 10 aminoácidos, y tienen un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60%.The peptides object of the invention are cyclic and comprise between 4 and 10 amino acids, and have a molar content of lysine between 40% and 60%.
Esto significa que en el caso de un péptido de 4, 6 o 8 aminoácidos, el péptido contiene dos, tres o cuatro residuos de lisina respectivamente, que representa el 50% molar de lisina en todos los casos.This means that in the case of a peptide of 4, 6 or 8 amino acids, the peptide contains two, three or four lysine residues respectively, which represents 50% molar of Lysine in all cases.
En el caso de un péptido de 10 aminoácidos, el péptido puede contener 4, 5 o 6 residuos de lisina, que responde respectivamente al 40%, 50% o 60% molar de lisina.In the case of a 10 amino acid peptide, the peptide may contain 4, 5 or 6 lysine residues, which responds respectively 40%, 50% or 60% molar lysine.
Para describir la estructura de los péptidos de la invención se va a emplear como ejemplo el péptido ciclo(Lys-Phe-Lys-Gln), que corresponde a la fórmula general (I) en la que n = m = 1, n+m = 2, X es Lys, e Y es Phe.To describe the structure of the peptides of the invention will be used as an example the peptide cycle (Lys-Phe-Lys-Gln), which corresponds to the general formula (I) in which n = m = 1, n + m = 2, X is Lys, and Y is Phe.
Se trata de un péptido cíclico que comprende 4 aminoácidos. Los enlaces peptídicos que forman la estructura de este péptido en el sentido de izquierda a derecha son los siguientes:It is a cyclic peptide comprising 4 amino acids. The peptide bonds that form the structure of this peptide in the direction from left to right are the following:
- --
- El grupo \alpha-carboxílico de la primera lisina está unido con el grupo \alpha-amino de la fenilalanina.He α-carboxylic group of the first lysine is bound with the α-amino group of the phenylalanine
- --
- El grupo \alpha-carboxlico de la fenilalanina está enlazado con el grupo \alpha-amino de la segunda lisina.He α-carboxylic group of phenylalanine is linked to the α-amino group of the second lysine
- --
- El grupo \alpha-carboxlico de la segunda lisina está unido al grupo \alpha-amino de la glutamina.He α-carboxylic group of the second lysine is bound to the α-amino group of the glutamine
- --
- El grupo \alpha-carboxílico de la glutamina forma un enlace peptídico con el grupo \alpha-amino de la primera lisina, cerrando de esta forma el anillo.He α-carboxylic group of glutamine forms a peptide bond with the α-amino group of the first lysine, thus closing the ring.
Una característica de los péptidos de la invención es su estructura cíclica. Según se describe en WO-A-98/03192, los péptidos cíclicos son más resistentes a los procesos proteolíticos en comparación con sus homólogos lineales. De este modo se puede prolongar más tiempo su presencia en la planta y también su actividad antimicrobiana. Este hecho no se traduce en una persistencia negativa en el medio ambiente, ya que dichos péptidos acaban degradándose finalmente por las rutas biológicas habituales.A characteristic of the peptides of the Invention is its cyclic structure. As described in WO-A-98/03192, cyclic peptides they are more resistant to proteolytic processes compared to its linear counterparts. This way you can extend more time its presence in the plant and also its antimicrobial activity. This fact does not translate into a negative persistence in the middle environment, since these peptides eventually degrade by the usual biological routes.
En la fórmula general (I) de los péptidos de la presente invención, el aminoácido Y puede ser Phe o D-Phe, es decir, L-fenilalanina o D-fenilalanina.In the general formula (I) of the peptides of the In the present invention, amino acid Y can be Phe or D-Phe, that is, L-phenylalanine or D-phenylalanine
Según se describe en WO-A-96/08264, la introducción de aminoácidos de la serie D en un péptido contribuye a incrementar la estabilidad de dicho péptido, ya que es menos sensible a las rutas biológicas que degradan los aminoácidos de la serie L. No obstante, existen otras rutas alternativas que incluso degradan aminoácidos de la serie D, por lo que esta mayor estabilidad no implica una persistencia de dichos péptidos en el medio ambiente.As described in WO-A-96/08264, the introduction of D-series amino acids in a peptide contribute to increase the stability of said peptide, since it is less sensitive to routes biological factors that degrade the amino acids of the L series. However, there are other alternative routes that even degrade amino acids from the D series, so this greater stability does not imply a persistence of said peptides in the environment.
Los péptidos descritos en la invención tienen una longitud comprendida entre 4 y 10 aminoácidos que los hace apropiados para ser preparados empleando los procedimientos habituales de síntesis de péptidos en fase sólida. Entre dichos procedimientos se pueden mencionar:The peptides described in the invention have a length between 4 and 10 amino acids that makes them appropriate to be prepared using the procedures usual solid phase peptide synthesis. Among sayings Procedures can be mentioned:
- --
- el procedimiento que usa la resina 4-metilbencidrilamina (MBHA) funcionalizada con grupos amino, como soporte sólido para llevar a cabo las reacciones sucesivas de acoplamiento entre los diferentes aminoácidos que integran el péptido y la etapa de ciclación, yhe resin using procedure 4-methylbenzydrylamine (MBHA) functionalized with amino groups, as a solid support to carry out the reactions successive coupling between the different amino acids that they integrate the peptide and the cyclization stage, and
- --
- el procedimiento Multipin^{TM}, en el que se emplean las SynPhase^{TM} Lanterns comercializadas por la empresa Mimotopes (Australia). En la página web http://www.mimotopes.com/, se puede encontrar información sobre dicha técnica.the Multipin? process, in which the SynPhase? Lanterns marketed by the company Mimotopes (Australia) are used. On the website http://www.mimotopes.com/ , information on this technique can be found.
Ambos procedimientos son bien conocidos por el experto en la materia y se encuentran descritos por ejemplo en S.A.Kates, F.Albericio Eds., Solid-Phase Synthesis. A practical guide, Marcel Dekker, New York, 2000 (ISBN: 0-8247-0359-6), o en K. Burguess Eds., Solid-Phase Organic Synthesis, Wiley, John & Sons, New York, 1999 (ISBN: 0471318256).Both procedures are well known by the expert in the field and are described for example in S.A. Kates, F. Albericio Eds., Solid-Phase Synthesis. A practical guide, Marcel Dekker, New York, 2000 (ISBN: 0-8247-0359-6), or in K. Burguess Eds., Solid-Phase Organic Synthesis, Wiley, John & Sons, New York, 1999 (ISBN: 0471318256).
En la técnica que emplea la resina MBHA como soporte sólido, habitualmente se incorpora a la resina un espaciador bifuncional sensible al medio ácido, que permite el desanclaje del péptido sintetizado en condiciones suaves.In the technique that uses MBHA resin as solid support, a resin is usually incorporated into the resin acid-sensitive bifunctional spacer, which allows the de-anchoring of the peptide synthesized under mild conditions.
Por ejemplo un espaciador bifuncional apropiado es el Fmoc-Rink-Linker (número CAS: 145469-56-3) comercializado por la empresa Senn Chemicals (Suiza).For example an appropriate bifunctional spacer is the Fmoc-Rink-Linker (CAS number: 145469-56-3) marketed by the Senn Chemicals company (Switzerland).
Dicho espaciador, una vez se ha unido con su grupo carboxílico a un grupo amino de la resina MBHA, presenta un grupo amino libre que permite el anclaje de un aminoácido que tenga un grupo carboxílico libre.Said spacer, once you have joined with your carboxylic group to an amino group of the MBHA resin, has a free amino group that allows the anchoring of an amino acid that has a free carboxylic group.
Las SynPhase^{TM} Lanterns comerciales utilizadas son del tipo Rink amida y ya llevan incorporadas este espaciador bifuncional.The commercial SynPhase? Lanterns used are of the Rink amida type and have already incorporated this bifunctional spacer.
Si el aminoácido tiene un grupo carboxílico libre en la cadena lateral, como por ejemplo el ácido glutámico o el ácido aspártico, entonces se puede unir al soporte sólido a través de dicha cadena lateral, manteniendo disponibles el otro grupo carboxílico y el grupo amino para la formación de nuevos enlaces peptídicos.If the amino acid has a carboxylic group free in the side chain, such as glutamic acid or aspartic acid, then it can be attached to the solid support to through said side chain, keeping the other available carboxylic group and the amino group for the formation of new peptide bonds.
La técnica Multipin^{TM} se puede emplear para la construcción de quimiotecas de péptidos de forma muy conveniente, como se describe en los Ejemplos.The Multipin ™ technique can be used to building peptide libraries so very convenient, as described in the Examples.
Un procedimiento para la preparación de los péptidos de la invención puede ser por ejemplo el que se describe a continuación.A procedure for the preparation of peptides of the invention may be for example the one described in continuation.
En dicho procedimiento se utiliza la química del grupo Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonilo) como protector del grupo \alpha-amino de los aminoácidos que se emplean para preparar los péptidos de la invención.In this procedure the chemistry of the Fmoc group (9-fluorenylmethoxycarbonyl) as α-amino group protector of amino acids that are used to prepare the peptides of the invention.
En la primera etapa se procede al anclaje del ácido glutámico a la resina, o a la SynPhase^{TM} Lantern, a través del grupo carboxflico libre de su cadena lateral. Los otros dos grupos reactivos del ácido glutámico se mantienen protegidos para evitar reacciones secundarias: por ejemplo, el grupo \alpha-carboxílico en forma de éster alílico, y el grupo \alpha-amino protegido por el grupo Fmoc.In the first stage we proceed to anchor the glutamic acid to the resin, or to SynPhase? Lantern, to through the free carboxylic group of its side chain. The others two reactive groups of glutamic acid remain protected to avoid side reactions: for example, the group α-carboxylic acid in the form of an allyl ester, and the α-amino group protected by the group Fmoc.
A continuación se elimina el grupo protector Fmoc del grupo \alpha-amino del ácido glutámico, y se incorpora el siguiente aminoácido del péptido que tiene el grupo \alpha-amino protegido por el grupo Fmoc. El enlace se establece entre el grupo carboxflico del nuevo aminoácido y el grupo amino del ácido glutámico.The protective group is then removed Fmoc of the α-amino group of glutamic acid, and the next amino acid of the peptide having the α-amino group protected by the Fmoc group. He link is established between the carboxylic group of the new amino acid and the glutamic acid amino group.
Este proceso de eliminación del grupo protector Fmoc y la incorporación del nuevo aminoácido se repite hasta que se completa un péptido con una estructura lineal.This process of eliminating the protective group Fmoc and the incorporation of the new amino acid is repeated until it is complete a peptide with a linear structure.
En el caso del aminoácido lisina, el grupo amino de la cadena lateral está protegido por el grupo Boc (t-butiloxicarbonilo), que es estable a las condiciones de eliminación del grupo Fmoc.In the case of the amino acid lysine, the amino group of the side chain is protected by the Boc group (t-butyloxycarbonyl), which is stable at conditions of elimination of the Fmoc group.
Una vez finalizados los acoplamientos se elimina el éster alílico que protege el grupo \alpha-carboxílico del ácido glutámico, y se elimina el grupo Fmoc que protege el grupo \alpha-amino del último aminoácido incorporado.Once the couplings are finished, it is eliminated the allyl ester that protects the group α-carboxylic acid glutamic acid, and delete the Fmoc group that protects the group α-amino of the last amino acid Incorporated.
Seguidamente se procede a la ciclación entre el grupo \alpha-carboxflico del ácido glutámico y el grupo \alpha-amino del último aminoácido incorporado. De esta forma se obtiene un péptido cíclico unido al soporte sólido, bien sea la resina o la SynPhase^{TM} Lantern.Then the cyclization between the α-carboxylic group of glutamic acid and the α-amino group of the last amino acid Incorporated. In this way a cyclic peptide bound to the solid support, either resin or SynPhase ™ Lantern.
La escisión del péptido del soporte sólido se realiza en condiciones ácidas e implica la ruptura del enlace entre el grupo amino y el grupo bencidrilo del linker, conduciendo a la formación del residuo de glutamina (Gln), que se encuentra presente en el péptido de la invención, como se puede observar en la fórmula general (I). Al mismo tiempo que se libera el péptido del soporte sólido se eliminan los grupos Boc de los residuos de lisina.The cleavage of the solid support peptide is performs in acidic conditions and implies the breaking of the link between the amino group and the benzidrile group of the linker, leading to the formation of the glutamine residue (Gln), which is present in the peptide of the invention, as can be seen in the formula general (I). At the same time that the support peptide is released Solid Boc groups are removed from lysine residues.
Tras un proceso convencional de aislamiento, los péptidos de la invención se obtienen con un buen rendimiento, habitualmente comprendido entre el 70% y el 80%, en forma de sólidos pulverulentos, y se caracterizan mediante análisis por HPLC, espectrometría de masas (ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS).After a conventional isolation process, the Peptides of the invention are obtained in good yield, usually between 70% and 80%, in the form of powdery solids, and are characterized by analysis by HPLC, mass spectrometry (ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS).
Sorprendentemente se ha comprobado que los péptidos de la invención presentan una actividad antimicrobiana, que es particularmente efectiva frente a mi- croorganismos patógenos de las plantas como son el hongo Fusarium oxysporum, y las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.Surprisingly, it has been found that the peptides of the invention have an antimicrobial activity, which is particularly effective against pathogenic microorganisms of plants such as the fungus Fusarium oxysporum , and the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae .
También forma parte de la invención la utilización de los péptidos cíclicos que tienen un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60% y que responden a la fórmula general (I):Also part of the invention is the use of cyclic peptides that have a molar content of lysine between 40% and 60% and that respond to general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe o D-Phe,And it's Phe or D-Phe,
n = 1, 3, o 5,n = 1, 3, or 5,
m = 1, 3, o 5, ym = 1, 3, or 5, and
n + m = 2, 4, 6 o 8n + m = 2, 4, 6 or 8
como agentes antimicrobianos.as agents antimicrobials
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Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):Preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m = 1, y n = 1, om = 1, and n = 1, or
m = 3, y n = 1, 3, o 5m = 3, and n = 1, 3, or 5
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Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):More preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m = 3, y n = 5m = 3, and n = 5
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los péptidos definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ D_NO: 23.Among the peptides of the invention that result be preferred the peptides defined by the sequences are counted of amino acids SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ D_NO: 23.
Preferiblemente los péptidos de la invención se utilizan como agentes antimicrobianos frente a bacterias y a hongos patógenos para las plantas.Preferably the peptides of the invention are used as antimicrobial agents against bacteria and fungi pathogens for plants.
Preferiblemente las bacterias patógenas para las plantas se seleccionan entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.Preferably, the pathogenic bacteria for the plants are selected from the group consisting of Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae .
Estas bacterias resultan ser indicadores apropiados para determinar la actividad antimicrobiana de compuestos que son susceptibles de ser empleados para combatir infecciones y enfermedades causadas por bacterias en plantas.These bacteria turn out to be indicators appropriate for determining the antimicrobial activity of compounds that are likely to be used to fight infections and diseases caused by bacteria in plants.
Erwinia amylovora es una bacteria gram negativa que causa la enfermedad conocida como Fuego Bacteriano que afecta a las plantas de la familia de las rosáceas, entre las que se encuentran árboles frutales de gran importancia económica como el manzano y el peral, y plantas ornamentales como serbal, espino, mostajo, etc. En Europa está catalogada como una bacteria de cuarentena en agricultura. El fuego bacteriano puede afectar a prácticamente todos los órganos de la planta y con frecuencia implica la muerte de los árboles o arbustos enfermos. Actualmente no hay métodos efectivos para el control del fuego bacteriano y es necesario combinar distintas medidas encaminadas a eliminar o reducir el inóculo. Erwinia amylovora is a gram-negative bacterium that causes the disease known as Bacterial Fire that affects plants of the Rosaceae family, among which are fruit trees of great economic importance such as apple and pear, and ornamental plants such as rowan , hawthorn, mustard, etc. In Europe it is listed as a quarantine bacterium in agriculture. Bacterial fire can affect virtually all organs of the plant and often involves the death of sick trees or shrubs. Currently there are no effective methods for the control of bacterial fire and it is necessary to combine different measures aimed at eliminating or reducing the inoculum.
Clavibacter michiganensis es una bacteria gram positiva que causa la podredumbre angular de la patata (C. michiganensis subsp. sepedonicum) y el chancro bacteriano del tomate (C. michiganensis subsp. michiganensis). Se trata de enfermedades de cuarentena de muy difícil control, ya que el patógeno se mantiene viable en el suelo en restos de material infectados y se transmite por semillas. Clavibacter michiganensis is a gram-positive bacterium that causes the potato's angular rot ( C. michiganensis subsp. Sepedonicum ) and the bacterial chancre of tomato ( C. michiganensis subsp. Michiganensis ). These are quarantine diseases that are very difficult to control, since the pathogen remains viable in the soil in remains of infected material and is transmitted by seeds.
Xanthomonas vesicatoria es una bacteria gram negativa que provoca la enfermedad denominada Mancha Bacteriana en plantas de la familia de las solanáceas que tienen una gran importancia económica como el tomate y el pimiento. Esta enfermedad afecta a hojas, tallos y frutos provocando su marchitez o muerte. Xanthomonas vesicatoria is a gram-negative bacterium that causes the disease called Bacterial Spot in plants of the Solanaceae family that have great economic importance such as tomatoes and peppers. This disease affects leaves, stems and fruits causing wilt or death.
Pseudomonas syringae es una bacteria gram negativa que causa un gran número de enfermedades denominadas necrosis bacterianas en plantas de cultivos hortícolas y leñosos como frutales. La patogenicidad de P. syringae reside en muchos casos en su actividad nucleadora del hielo (INA+) que potencia los danos por helada y a la producción de diversas fitotoxinas como las siringomicinas. Pseudomonas syringae is a gram-negative bacterium that causes a large number of diseases called bacterial necrosis in horticultural and woody crop plants such as fruit trees. The pathogenicity of P. syringae resides in many cases in its ice nucleating activity (INA +) that enhances frost damage and the production of various phytotoxins such as syringomycins.
De forma preferida el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum.Preferably, the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum .
Fusarium constituye un género de hongos habitantes del suelo y ubicuos, en el que se incluyen muchas razas y especies fitopatógenas causantes de numerosas enfermedades de importancia económica principalmente en cultivos hortícolas. Las enfermedades vasculares que provocan causan la pérdida de turgencia de la planta y con frecuencia su muerte debido al colapso del sistema conductor. Las principales enfermedades están causadas por el género Fusarium oxysporum que se subdivide en diversas formas especiales o razas atendiendo a la planta huésped afectada, como lycopersici que afecta a tomate, melonis al melón, conglutinans a diversas cucurbitáceas, cubense a platanera, dianthi al clavel, etc. Al ser un patógeno de suelo es de muy difícil control, principalmente debido a que los métodos clásicos se basan en la desinfección mediante bromuro de metilo, cuyo uso está prohibido en la actualidad, y a que en general los fungicidas existentes son poco eficaces en el control de dicho patógeno. Fusarium is a genus of soil and ubiquitous fungi, which includes many races and phytopathogenic species that cause numerous diseases of economic importance mainly in horticultural crops. The vascular diseases they cause cause loss of plant turgidity and often death due to the collapse of the conductive system. The main diseases are caused by the genus Fusarium oxysporum that is subdivided into various special forms or races attending to the affected host plant, such as lycopersici that affects tomato, melonis to melon, conglutinans to various cucurbitaceae, cubense to banana, dianthi to carnation, etc. Being a soil pathogen it is very difficult to control, mainly because the classical methods are based on disinfection by methyl bromide, whose use is currently prohibited, since in general existing fungicides are ineffective in the control of said pathogen.
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.Preferably the plants that can be treated with the peptides of the invention are selected from the group formed by fruit trees, horticultural plants, and plants Ornamental
Entre los árboles frutales se pueden mencionar los de pepita (manzano, peral), y hueso (melocotonero, albaricoquero, ciruelo, cerezo) y el platanero.Among the fruit trees can be mentioned those of pepita (apple tree, pear tree), and bone (peach tree, apricot tree, plum, cherry) and banana.
Entre las plantas hortícolas se encuentran las solánaceas (tomate, pimiento, patata) y cucurbitáceas (melón, sandía).Among the horticultural plants are the solánaceas (tomato, pepper, potato) and cucurbitaceae (melon, watermelon).
Ejemplos de plantas ornamentales son serbal, clavel, espino albar y mostajo.Examples of ornamental plants are rowan, Carnation, hawthorn and mustard.
También forma parte del objeto de la invención una composición fitosanitaria que comprende:It is also part of the object of the invention a phytosanitary composition comprising:
- --
- un péptido que tiene un contenido molar de lisina comprendido entre el 40% y el 60%, y que está definido por la fórmula general (I)a peptide having a lysine molar content comprised between the 40% and 60%, and that is defined by the general formula (I)
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
- donde:where:
- X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
- Y es Phe o D-Phe,And it's Phe or D-Phe,
- m = 1, 3, o 5,m = 1, 3, or 5,
- n = 1, 3, o 5, yn = 1, 3, or 5, Y
- n + m = 2, 4, 6 o 8, yn + m = 2, 4, 6 or 8, and
- un agente auxiliar.an agent assistant.
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Preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):Preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y - (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m = 1, y n = 1,om = 1, and n = 1, or
m = 3, y n = 1, 3, o 5m = 3, and n = 1, 3, or 5
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Más preferiblemente los péptidos responden a la fórmula general (I):More preferably the peptides respond to the general formula (I):
(I)ciclo[(X)_{n} - Y – (X)_{m} - Gln](I) cycle [(X) n - Y - (X) m - Gln]
donde:where:
X es Lys o Leu,X is Lys or Leu,
Y es Phe, yAnd it's Phe, and
m=3, y n = 5m = 3, and n = 5
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos se cuentan los péptidos definidos por las secuencias de aminoácidos SEQ_ID_NO: 1 a SEQ_ID_NO: 23.Among the peptides of the invention that result be preferred the peptides defined by the sequences are counted of amino acids SEQ_ID_NO: 1 to SEQ_ID_NO: 23.
Habitualmente, en las composiciones antimicrobianas se combinan varios principios activos para obtener una mayor eficacia o un espectro más amplio de actuación. En este caso, las composiciones fitosanitarias de la invención también pueden comprender otros agentes antibacterianos o antifúngicos para conseguir mayor eficacia antimicrobiana, como por ejemplo la combinación de varios péptidos de la invención, o su combinación con otras materias activas distintas.Usually in the compositions antimicrobials combine several active ingredients to obtain greater efficiency or a wider spectrum of action. In this case, the phytosanitary compositions of the invention also may comprise other antibacterial or antifungal agents for achieve greater antimicrobial efficacy, such as combination of several peptides of the invention, or their combination with other different active matters.
La cantidad de péptido que forma parte de la composición fitosanitaria puede ser variable en función de factores tales como el tipo de planta, la concentración de las bacterias y hongos patógenos en la planta, la extensión de la enfermedad, etc. La concentración efectiva del péptido se puede determinar y ajustar fácilmente mediante métodos de rutina bien conocidos en microbiología por el experto en la materia. Habitualmente la concentración en materia activa se encuentra comprendida entre 0,1 y 0,5 g/l.The amount of peptide that is part of the phytosanitary composition can be variable depending on factors such as the type of plant, the concentration of bacteria and pathogenic fungi in the plant, the extent of the disease, etc. The effective peptide concentration can be determined and adjusted. easily by well-known routine methods in Microbiology by the expert in the field. Usually the concentration in active matter is between 0.1 and 0.5 g / l
El agente auxiliar que acompaña los péptidos de la invención en dichas composiciones fitosanitarias puede tener varias funciones, como por ejemplo, facilitar la dosificación del péptido, proporcionar un producto fácilmente manipulable, mejorar el mojado de las plantas.The auxiliary agent that accompanies the peptides of the invention in said phytosanitary compositions may have several functions, such as facilitating the dosing of peptide, provide an easily manipulated product, improve the Wet plants.
Dicho agente auxiliar puede ser seleccionado entre el grupo formado por: disolventes, diluyentes, cargas inertes, agentes tensioactivos humectantes, agentes tamponantes, agentes dispersantes, agentes antiapelmazantes, lubricantes, filtros de la radiación ultravioleta, y/o mezclas de los mismos.Said auxiliary agent can be selected. among the group consisting of: solvents, diluents, fillers inert, wetting surfactants, buffering agents, dispersing agents, anti-caking agents, lubricants, filters of ultraviolet radiation, and / or mixtures thereof.
Preferiblemente el agente auxiliar se selecciona entre el grupo formado por disolventes, tensioactivos, agentes tamponantes, filtros de la radiación ultravioleta y/o sus mezclas.Preferably the auxiliary agent is selected between the group consisting of solvents, surfactants, agents buffers, ultraviolet radiation filters and / or their mixtures
Más preferiblemente el disolvente es agua.More preferably the solvent is water.
Las composiciones pueden presentarse en forma líquida o en forma sólida. Por ejemplo, en el caso de formulaciones líquidas, la composición de la invención puede presentarse en forma de una composición diluida lista para ser empleada, o bien en forma de una composición concentrada, que requiere su dilución antes de ser usada, habitualmente con agua.The compositions can be presented in form liquid or in solid form. For example, in the case of formulations liquid, the composition of the invention can be presented in the form of a diluted composition ready to be used, or in form of a concentrated composition, which requires dilution before be used, usually with water.
En el caso de composiciones líquidas acuosas, la presencia de agentes tensioactivos humectantes facilita el mojado de las plantas cuando se pulverizan con dicha composición.In the case of aqueous liquid compositions, the presence of wetting surfactants facilitates wetting of plants when sprayed with said composition.
Una ventaja de los péptidos de la invención es que se pueden disolver en agua con facilidad, y se pueden formular generalmente como disoluciones acuosas sin necesidad de emplear disolventes orgánicos adicionales.An advantage of the peptides of the invention is that can be dissolved in water easily, and can be formulated generally as aqueous solutions without using additional organic solvents.
Las composiciones en forma sólida pueden ser en forma de gránulos, o polvos, en las que los péptidos de la invención se mezclan con cargas inertes finamente divididas como, por ejemplo, caolín, tierra de diatomeas, dolomita, carbonato cálcico, o talco. También pueden presentarse en forma de polvos o gránulos dispersables, que comprenden un agente humectante para facilitar la dispersión del polvo o de los gránulos en el líquido.Compositions in solid form may be in form of granules, or powders, in which the peptides of the invention are mixed with finely divided inert loads such as, for example, kaolin, diatomaceous earth, dolomite, carbonate Calcium, or talc. They can also be presented in the form of powders or dispersible granules, comprising a wetting agent for facilitate the dispersion of dust or granules in the liquid.
También forma parte del objeto de la invención un método para prevenir y tratar infecciones y enfermedades de plantas causadas por bacterias y hongos que comprende poner en contacto la planta con una composición fitosanitaria que incluye los péptidos de la invención.It is also part of the object of the invention a method to prevent and treat infections and diseases of plants caused by bacteria and fungi comprising putting in contact the plant with a phytosanitary composition that includes the peptides of the invention.
La composición fitosanitaria de la invención se puede aplicar de forma preventiva a las plantas para evitar la aparición de las infecciones y enfermedades causadas por bacterias y hongos. El tratamiento preventivo tiene su base en que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de bacterias y hongos patógenos para las plantas.The phytosanitary composition of the invention is You can apply preventively to plants to avoid occurrence of infections and diseases caused by bacteria and mushrooms. Preventive treatment is based on the fact that peptides of the invention inhibit the growth of bacteria and fungi pathogens for plants.
También se puede emplear para tratar dichas infecciones y enfermedades una vez se ha detectado su presencia en las plantas, ya que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de las bacterias y hongos causantes de dichas infecciones y enfermedades.It can also be used to treat these infections and diseases once its presence has been detected in plants, since the peptides of the invention inhibit the growth of bacteria and fungi causing these infections and diseases
En esta descripción el término infección se refiere a la invasión y destrucción de un órgano, por ejemplo, hojas, flores, o frutos, por parte de los microorganismos patógenos. Por tanto, se trata de un proceso localizado. En cambio, el término enfermedad se refiere a un proceso que afecta a toda la planta, dando lugar a síntomas.In this description the term infection is refers to the invasion and destruction of an organ, for example, leaves, flowers, or fruits, by pathogenic microorganisms. Therefore, it is a localized process. Instead, the term disease refers to a process that affects the entire plant, leading to symptoms.
Preferiblemente el método de la invención se emplea para prevenir y tratar infecciones y enfermedades provocadas por bacterias patógenas para las plantas seleccionadas entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.Preferably the method of the invention is used to prevent and treat infections and diseases caused by pathogenic bacteria for plants selected from the group formed by Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae .
De forma preferida el hongo patógeno para las plantas es Fusarium oxysporum.Preferably, the pathogenic fungus for plants is Fusarium oxysporum .
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.Preferably the plants that can be treated with the peptides of the invention are selected from the group formed by fruit trees, horticultural plants, and plants Ornamental
En el método de la invención, la composición se puede poner en contacto con las partes de las plantas seleccionadas entre el grupo formado por semillas, raíces, tallos, hojas, o frutos, o con el suelo o cualquier medio de crecimiento que rodee las raíces de las plantas.In the method of the invention, the composition is can put in contact with the parts of the selected plants between the group consisting of seeds, roots, stems, leaves, or fruits, or with the soil or any means of growth that surrounds The roots of the plants.
En el método de la invención, la composición fitosanitaria se puede poner en contacto con la planta por cualquier técnica convencional, entre las que destacan, la pulverización, la inmersión o el riego.In the method of the invention, the composition phytosanitary can be contacted with the plant by any conventional technique, among which, the spraying, the immersion or irrigation.
Por ejemplo se puede preparar una disolución acuosa de los péptidos de la invención y proceder a la pulverización de las partes de la planta afectadas o susceptibles de ser afectadas. Si se trata de los frutos de un árbol frutal, por ejemplo, también se puede realizar el tratamiento de los mismos por pulverización o por inmersión antes de su cosecha o en post-cosecha.For example, a solution can be prepared aqueous of the peptides of the invention and proceed to the spraying of affected or susceptible parts of the plant be affected If it's the fruits of a fruit tree, then For example, they can also be treated by spraying or immersion before harvesting or in post-harvest
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El tratamiento de las raíces puede llevarse a cabo por ejemplo empleando una composición sólida en la que los péptidos se encuentran dispersos en una carga inerte, o por pulverización con la mencionada disolución acuosa, o mediante su aplicación por riego.Root treatment can lead to carried out for example using a solid composition in which peptides are dispersed in an inert load, or by spraying with said aqueous solution, or by means of its irrigation application.
La actividad antimicrobiana de los péptidos de
la invención frente a bacterias y a hongos patógenos para plantas se
ha evaluado mediante la determinación de la concentración de
péptido mínima necesaria para inhibir el crecimiento de los
microorganismos. Habitualmente dicha concentración se denomina
concentración inhibitoria mínima
(CIM).The antimicrobial activity of the peptides of the invention against bacteria and pathogenic fungi for plants has been evaluated by determining the minimum peptide concentration necessary to inhibit the growth of microorganisms. Usually such concentration is called the minimum inhibitory concentration.
(CIM).
Este tipo de ensayos es habitual en microbiología y es bien conocido por el experto en la materia. Una descripción de la metodología empleada se encuentra por ejemplo en M.J.Pelczar Jr, E.C.S.Chan, N.R.Krieg, Microbiology: Concepts and Applications. New York: McGraw-Hill, 1997.This type of test is common in microbiology and is well known to the person skilled in the art. A description of the methodology used is for example in M.J. Pelczar Jr, E.C.S. Chan, N.R. Krieg, Microbiology: Concepts and Applications New York: McGraw-Hill, 1997.
Se ha comprobado que las composiciones que comprenden los péptidos de la invención disueltos en agua a concentraciones comprendidas entre 3,12 y 6,25 \muM son efectivas para inhibir el crecimiento de bacterias como Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, a concentraciones entre 6,25 y 12,5 \muM inhiben el crecimiento de las bacterias Erwinia amylovora y Clavibacter michiganensis, y a concentraciones inferiores a 6,25 \muM inhiben el crecimiento de hongos como Fusarium oxysporum.It has been found that the compositions comprising the peptides of the invention dissolved in water at concentrations between 3.12 and 6.25 µM are effective in inhibiting the growth of bacteria such as Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae , at concentrations between 6, 25 and 12.5 µM inhibit the growth of the bacteria Erwinia amylovora and Clavibacter michiganensis , and at concentrations below 6.25 µM they inhibit the growth of fungi such as Fusarium oxysporum .
Estos resultados demuestran la eficacia de la actividad antimicrobiana de los péptidos de la invención, ya que en Avrahami et al, Biochemistry, 2001, 40, 12591-12603, se describe que una concentración inhibitoria mínima inferior a 50 \muM es considerada como significativa.These results demonstrate the efficacy of the antimicrobial activity of the peptides of the invention, since in Avrahami et al. , Biochemistry, 2001, 40, 12591-12603, it is described that a minimum inhibitory concentration of less than 50 µM is considered significant.
La actividad hemolítica de los péptidos es una característica que generalmente se determina para aquellos compuestos que pueden llegar a entrar en contacto con el cuerpo humano. Este sería el caso si frutas u hortalizas tratadas con los péptidos de la invención contuvieran restos de los mismos y fuesen consumidos por las personas, o al ser manipulados por operarios durante su aplicación o preparación.The hemolytic activity of the peptides is a characteristic that is usually determined for those compounds that may come into contact with the body human. This would be the case if fruits or vegetables treated with peptides of the invention contained residues thereof and were consumed by people, or when manipulated by operators during its application or preparation.
La mencionada actividad hemolítica se ha evaluado mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de dichos péptidos en tampón de TRIS con suspensiones de eritrocitos al 5% en volumen/volumen procedentes de sangre humana fresca. El resultado de dicha determinación se expresa como el porcentaje de hemólisis que se produce para una determinada concentración de péptido. Una descripción de la metodología empleada para la determinación de la actividad hemolítica se encuentra en Oren et al, Biochemistry, 2000, 39, 6103-6114, y en Raguse et al, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 12774-12785.The said hemolytic activity has been evaluated by determining the release of hemoglobin that is produced by contacting a solution of said peptides in TRIS buffer with 5% volume / volume red blood cell suspensions from fresh human blood. The result of this determination is expressed as the percentage of hemolysis that occurs for a given concentration of peptide. A description of the methodology used to determine hemolytic activity is found in Oren et al , Biochemistry, 2000, 39, 6103-6114, and in Raguse et al , J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 12774 -12785.
Se ha comprobado que los péptidos de la invención presentan una actividad hemolítica que se puede clasificar como baja, ya que la mayoría de ellos presentan una HD_{50} superior a 375 \muM. HD50 es la concentración de péptido a la que se produce la liberación del 50% de la hemoglobina en el bioensayo referido. Se observa, pues, que la concentración a la que los péptidos tendrían una actividad hemolítica significativa es entre diez y cien veces superior a la concentración a la que son activos para inhibir el crecimiento de bacterias y hongos patógenos para las plantas.It has been proven that the peptides of the invention have a hemolytic activity that can be classified as low, since most of them have an HD_ {50} greater than 375 µM. HD50 is the concentration of peptide at which 50% release of hemoglobin occurs in the bioassay referred. It is observed, then, that the concentration at which peptides would have a significant hemolytic activity is between ten hundred times higher than the concentration at which they are active to inhibit the growth of pathogenic bacteria and fungi to the plants.
Los ejemplos que se exponen a continuación se deben interpretar como un medio auxiliar para una mejor comprensión de la invención, y no como limitaciones al objeto de la misma.The examples set out below are they must interpret as an auxiliary means for a better understanding of the invention, and not as limitations to the object thereof.
En los ejemplos que siguen se emplean las siguientes abreviaciones: Al: alilo; Boc: tert-butiloxicarbonilo; DIEA: N,N-diisopropiletilamina; DMF: N,N-dimetilformamida; EDTA, ácido etilendiaminotetracético; ESI-MS: espectrometr a de masas con ionización por electrospray; FAB-MS: espectromet fa de masas por bombardeo con átomos rápidos (Fast Atom Bombardment - Mass Spectrometry); Fmoc: 9-fluorenilmetoxicarbonilo; HBTU: hexafluorofosfato de N-óxido de N-[(1H-benzotriazol-1-il)(dimetilamino)metilen]-N-metilmetanaminio; HOBt: 1-hidroxibenzo-triazol; HPLC: cromatografía líquida de alta resolución; MALDI-TOF: ionización desorción por láser asistida por una matriz - Tiempo de vuelo (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time-of-Flight); MBHA: 4-metilbencidrilamina; MWI: radiación por microondas; NMM: N-metilmorfolina; NMP: N-metilpirrolidona; Ph: fenilo; Py-BOP: hexafluorofosfato de benzotriazol-1-il-N-oxitris(pirrolidino)fosfonio; TFA: ácido trifluoroacético; THF: tetrahidrofurano; TIS: trisisopropilsilano; UV: ultravioleta.The following examples use the following abbreviations: Al: allyl; Boc: tert-butyloxycarbonyl; DIEA: N, N-diisopropylethylamine; DMF: N, N-dimethylformamide; EDTA, acid ethylenediaminetetraacetic; ESI-MS: spectrometry of electrospray ionization masses; FAB-MS: mass spectromet fa by rapid atom bombardment (Fast Atom Bombardment - Mass Spectrometry); Fmoc: 9-fluorenylmethoxycarbonyl; HBTU: hexafluorophosphate of N-oxide N - [(1 H -benzotriazol-1-yl) (dimethylamino) methylene] -N-methylmethanamine; HOBt: 1-hydroxybenzo-triazole; HPLC: high performance liquid chromatography; MALDI-TOF: ionization laser desorption assisted by a matrix - Time of flight (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time-of-Flight); MBHA: 4-methylbenzydrylamine; MWI: radiation by microwave; NMM: N-methylmorpholine; NMP: N-methylpyrrolidone; Ph: phenyl; Py-BOP: hexafluorophosphate benzotriazol-1-yl-N-oxitris (pyrrolidino) phosphonium; TFA: trifluoroacetic acid; THF: tetrahydrofuran; TIS: trisisopropylsilane; UV: ultraviolet.
Los productos Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Phe-OH, Fmoc-Glu-OAI, Fmoc-Leu-OH, la resina MBHA funcionalizada con grupos amino, el espaciador bifuncional Fmoc-Rink- Linker (número CAS: 145469-56-3), HBTU, PyBOP, y HOBt se obtuvieron de Senn Chemicals. Las SynPhase^{TM} Lanterns del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D se obtuvieron de la empresa Mimotopes (Clayton, Australia). Los productos TFA, NMP, Pd(PPh3)4, N,N-dietilditiocarbamato sódico, y TIS se obtuvieron de Aldrich. Los productos piperidina, NMM, y DIEA se obtuvieron de Fluka.The products Fmoc-Lys (Boc) -OH, Fmoc-Phe-OH, Fmoc-Glu-OAI, Fmoc-Leu-OH, MBHA resin functionalized with amino groups, the bifunctional spacer Fmoc-Rink- Linker (CAS number: 145469-56-3), HBTU, PyBOP, and HOBt se obtained from Senn Chemicals. SynPhase? Lanterns of the type Rink polystyrene amide D series were obtained from the company Mimotopes (Clayton, Australia). The products TFA, NMP, Pd (PPh3) 4, N, N-diethyldithiocarbamate sodium, and TIS were obtained from Aldrich. Piperidine products, NMM, and DIEA were obtained from Fluka.
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Las siguientes indicaciones sobre el procedimiento para la preparación de los péptidos son de carácter general:The following indications about the procedure for the preparation of the peptides are of a character general:
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- Se han empleado aminoácidos que tienen el grupo \alpha-amino protegido con el grupo Fmoc.They have employed amino acids that have the group α-amino protected with the Fmoc group.
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- Para la protección de la cadena lateral de la lisina se ha empleado el grupo tert-butiloxicarbonilo (Boc).The tert- butyloxycarbonyl (Boc) group has been used to protect the lysine side chain.
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- En las reacciones llevadas a cabo sobre soporte de resina se emplearon jeringas de 5 o 10 ml que tenían incorporado un filtro microporoso de polipropileno.In the reactions carried out on resin support were used 5 or 10 ml syringes that had a microporous filter incorporated Polypropylene
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- En las reacciones llevadas a cabo con las SynPhase^{TM} Lanterns del tipo Rink amida de la empresa Mimotopes, se emplearon recipientes de vidrio de 5 a 50 ml, y jeringas de plástico de 10 a 50 ml.In the reactions carried out with the SynPhase ™ Lanterns of the type Rink amida of the company Mimotopes, containers of 5 to 50 ml glass, and 10 to 50 ml plastic syringes.
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- Todas las transformaciones y lavados se llevaron a cabo a 25ºC, a no ser que se indique lo contrario.All transformations and washes were carried out at 25 ° C, unless otherwise indicated.
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- Los experimentos con radiación de microondas se llevaron a cabo en el aparato Ethos SEL de la empresa Milestone, equipado con un sistema de magnetrón dual de 1.600 vatios. El tiempo, la temperatura de reacción, y la potencia se controlaron mediante el paquete informático EasyControl que va incorporado al equipo de microondas. La temperatura se controlaba a través de un sistema automático de control de la temperatura por fibra óptica, ATC-400F0, sumergido en un recipiente de referencia Milestone.The microwave radiation experiments were carried out in the Ethos SEL device from Milestone, equipped with a system 1,600 watt dual magnetron. The weather, the temperature of reaction, and the power was controlled by the package EasyControl software that is incorporated into the microwave equipment. The temperature was controlled through an automatic system of fiber optic temperature control, ATC-400F0, submerged in a reference vessel Milestone
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- El análisis por HPLC se llevó a cabo a 1,0 mllmin empleando una columna de fase reversa Kromasil (4,6 x 40 mm; tamaño de partículas de 3,5 p.m). Se emplearon gradientes lineales con TFA acuoso al 0,1% y TFA en acetonitrilo al 0,1%, con una relación comprendida entre 0,98:0,02 y 0,98:0,1 durante un período de tiempo de 7 minutos con detección UV a una longitud de onda de 220 nm.He HPLC analysis was carried out at 1.0 mllmin using a column Kromasil reverse phase (4.6 x 40 mm; 3.5 particle size p.m). Linear gradients with 0.1% aqueous TFA and TFA were used in 0.1% acetonitrile, with a ratio between 0.98: 0.02 and 0.98: 0.1 over a period of 7 minutes with UV detection at a wavelength of 220 nm.
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- Los espectros ESI-MS fueron adquiridos empleando un instrumento quadrupolo Navigator; el instrumento se operó en el modo positivo de iones (ES+) con un voltaje en la muestra de 3 kV.The ESI-MS spectra were acquired using a Quadrupole Navigator instrument; the instrument was operated on the positive ion mode (ES +) with a sample voltage of 3 kV
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- Los espectros MALDI-TOF fueron adquiridos mediante un instrumento Ultra-flex de la empresa Bruker.The MALDI-TOF spectra were acquired through a Ultra-flex company instrument Bruker
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- Todas las relaciones entre los disolventes son volumen/volumen, a no ser que se especifique otra cosa.All the relationships between solvents are volume / volume, unless otherwise specified
En una jeringa de 5 ml de capacidad, equipada con un filtro microporoso en la parte inferior, se colocaron 200 mg de resina MBHA con una funcionalización de 0,3 mmol/g, equivalentes a 0,06 mmoles de grupos amino, y se llenó la jeringa con di- solvente para hinchar-lavar la resina de acuerdo con la siguiente secuencia: CH_{2}Cl_{2} (5 x 0,5 min), una mezcla de TFA y CH_{2}Cl_{2} (4:6, 1 x 20 min), CH_{2}Cl_{2} (5 x 0,5 min), una mezcla de DIEA y CH_{2}Cl_{2} (5:95, 3 x 1 min), CH_{2}Cl_{2} (5 x 0,5 min), y NMP (5 x 0,5 min). La expresión CH_{2}Cl_{2} (5 x 0,5 min) se refiere a que se realizaron 5 lavados con cloruro de metileno de 0,5 minutos cada uno. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple (Vac Man Laboratory Vacuum Manifold de Promega Distribuidora).In a syringe of 5 ml capacity, equipped with a microporous filter at the bottom, 200 mg were placed MBHA resin with a functionalization of 0.3 mmol / g, equivalent at 0.06 mmol of amino groups, and the syringe was filled with di- solvent to swell-wash the resin according to the following sequence: CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), a mixture of TFA and CH 2 Cl 2 (4: 6, 1 x 20 min), CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), a mixture of DIEA and CH 2 Cl 2 (5:95, 3 x 1 min), CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min), and NMP (5 x 0.5 min). The expression CH 2 Cl 2 (5 x 0.5 min) refers to the fact that 5 washed with methylene chloride of 0.5 minutes each. After each washing step the solvent is removed by a filter Vacuum Manifold Vacuum Manifold by Promega Distributor).
El espaciador bifuncional se acopló a la resina por tratamiento con 97 mg de Fmoc-Rink-Linker (0,18 mmoles), 68 mg de HBTU (0,18 mmoles) y 31 \mul de DIEA (0,18 mmoles) en 1 ml de NMP. Se mantuvo durante toda la noche y se comprobó que el test de ninhidrina era negativo (Kaiser et al, Anal. Biochem., 1970, 34, 595-598).The bifunctional spacer was coupled to the resin by treatment with 97 mg of Fmoc-Rink-Linker (0.18 mmol), 68 mg of HBTU (0.18 mmol) and 31 µl of DIEA (0.18 mmol) in 1 ml of NMP. It was maintained overnight and the ninhydrin test was found to be negative (Kaiser et al , Anal. Biochem., 1970, 34, 595-598).
Después de lavar la resina con NMP (5 x 2 min), ésta se trató con una mezcla de piperidina y NMP (3:7, 2 x 8 min) para eliminar el grupo Fmoc presente en el grupo amino del espaciador bifuncional, y, a continuación, se lavó con NMP (5 x 2 min).After washing the resin with NMP (5 x 2 min), This was treated with a mixture of piperidine and NMP (3: 7, 2 x 8 min) to eliminate the Fmoc group present in the amino group of the bifunctional spacer, and then washed with NMP (5 x 2 min)
Seguidamente la resina se trató con 74 mg de Fmoc-Glu-OA1(0,18 mmoles), 68 mg de HBTU (0,18 mmoles) y 31 \mul de DIEA (0,18 mmoles) en 1 ml de NMP. Después de 4 h se comprobó que el test de ninhidrina era negativo. A continuación se lavó con NMP (5 x 2 min).The resin was then treated with 74 mg of Fmoc-Glu-OA1 (0.18 mmol), 68 mg of HBTU (0.18 mmol) and 31 µl of DIEA (0.18 mmol) in 1 ml of NMP. After 4 h it was found that the ninhydrin test was negative. It was then washed with NMP (5 x 2 min).
La eliminación del grupo Fmoc y los lavados subsiguientes se realizaron como ya se ha descrito anteriormente.The elimination of the Fmoc group and washes Subsequent were performed as already described previously.
El ciclo de acoplamiento-desprotección se repitió para el resto de los aminoácidos protegidos con el grupo N^{\alpha}-Fmoc: Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Phe-OH, y Fmoc-Leu-OH. En cada etapa se procedió al lavado con NMP (5 x 2 min).The cycle of coupling-checkout was repeated for the rest of the amino acids protected with the group N? -Fmoc: Fmoc-Lys (Boc) -OH, Fmoc-Phe-OH, and Fmoc-Leu-OH. At each stage it proceeded to wash with NMP (5 x 2 min).
El éster alílico C-terminal del ácido glutámico incorporado al péptido fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento con 347 mg de Pd(PPh_{3})_{4} (0,3 mmoles) en 3 ml de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1) durante 5 h bajo agitación. Pasado este tiempo la resina fue lavada con THF (3 x 2 min), NMP (3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH_{2}Cl_{2} (1:19, 3 x 2 min), N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (10 x 1 min), CH_{2}Cl_{2} (3 x 2 min), y NMP (3 x 1 min).The C-terminal allyl ester of glutamic acid incorporated into the peptide was removed under atmosphere of nitrogen per treatment with 347 mg of Pd (PPh3) 4 (0.3 mmol) in 3 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1) for 5 h under agitation. After this time the resin was washed with THF (3 x 2 min), NMP (3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH2Cl2 (1:19, 3 x 2 min), N, sodium N-diethyldithiocarbamate (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (10 x 1 min), CH 2 Cl 2 (3 x 2 min), and NMP (3 x 1 min).
Después de eliminar el grupo Fmoc del último aminoácido acoplado y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo el péptido lineal Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Leu-Lys-Glu unido a la resina. En este estadio, el péptido contiene aún el residuo de ácido glutámico, ya que la glutamina no se forma hasta la escisión del péptido cíclico de la resina.After removing the last Fmoc group amino acid coupled and proceed to washings as already described previously, the linear peptide was obtained Lys-Leu-Lys-Leu-Lys-Phe-Lys-Leu-Lys-Glu bonded to the resin. At this stage, the peptide still contains the glutamic acid residue, since glutamine does not form until excision of the cyclic peptide from the resin.
La ciclación del péptido se llevó a cabo mediante tratamiento con 156 mg de PyBOP (0,3 mmoles), 40 mg de HOBt (0,3 mmoles), y 104 \mul de DIEA (0,6 mmoles) en 1 ml de NMP. Después de 24 horas a 25ºC, el test de ninhidrina fue negativo.Peptide cyclization was carried out by treatment with 156 mg of PyBOP (0.3 mmol), 40 mg of HOBt (0.3 mmol), and 104 µl of DIEA (0.6 mmol) in 1 ml of NMP. After 24 hours at 25 ° C, the ninhydrin test was negative.
A continuación se lavó la resina con NMP (6 x 1 min) y CH_{2}Cl_{2} (6 x 1 min), y se escindió el péptido cíclico de la resina mediante un tratamiento con 2 ml de una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 2 horas. Se recogieron los filtrados en un vial mediante una presión positiva de nitrógeno. La resina se lavó con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5, 2 x 0,5 ml). Los filtrados se combinaron y se evaporaron casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente, el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.The resin was then washed with NMP (6 x 1 min) and CH 2 Cl 2 (6 x 1 min), and the peptide was cleaved cyclic of the resin by a treatment with 2 ml of a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 2 hours. The ones were collected filtered in a vial by a positive nitrogen pressure. The resin was washed with a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5, 2 x 0.5 ml) The filtrates were combined and evaporated almost to dryness. under a stream of nitrogen until an oil is obtained. Saying oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was of singing. This process was repeated 3 or 4 times. Finally the Solid product obtained was dissolved in water, and lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.A powdery solid was obtained whose structure was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS.
Se partió de una SynPhase^{TM} Lantern del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D formada por nueve discos unidos entre sí, equivalentes a 35 \mumoles. Se cortó un fragmento de Lantern que comprendía cinco discos, equivalente a 19,44 \mumoles, que se colocó en un recipiente provisto con un tapón y se hinchó con CH_{2}Cl_{2} (5 min). La eliminación del grupo protector Fmoc presente en el soporte sólido se llevó a cabo por tratamiento con 1 ml de una mezcla de piperidina, CH_{2}Cl_{2} y NMP (1:2:2, 2 x 45 min). Los lavados se llevaron a cabo en jeringas de 10 ml, cubriendo el fragmento con NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min). Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple.It was split from a SynPhase? Lantern of the Rink type polystyrene amide D series consisting of nine disks joined together, equivalent to 35 µmoles. He cut a fragment of Lantern that included five discs, equivalent to 19.44 µmoles, which was placed in a container provided with a stopper and swelled with CH2Cl2 (5 min). The elimination of Fmoc protecting group present in the solid support was carried out by treatment with 1 ml of a mixture of piperidine, CH 2 Cl 2 and NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min). The washes were taken out in 10 ml syringes, covering the fragment with NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min). After each washing stage the solvent is removed by a vacuum filter multiple.
El fragmento de Lantern se colocó a continuación en un recipiente cenado que contenía 1 ml de una solución en NMP de 49 mg de Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg de HBTU (120 mM), y 42 \mul DIEA (240 mM). Después de 24 horas, el fragmento de Lantern se lavó con NMP (3 x 5 min), y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min).The Lantern fragment was placed next in a dinner vessel containing 1 ml of a solution in NMP of 49 mg of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 46 mg of HBTU (120 mM), and 42 µL DIEA (240 mM). After 24 hours, the Lantern fragment was washed with NMP (3 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min).
Las siguientes etapas de acoplamiento con los aminoácidos restantes se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento y lavados, como ya se ha descrito anteriormente.The following stages of coupling with the remaining amino acids were carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling and washing, as already described above
Una vez finalizadas las etapas de acoplamiento, el éster alnico C-terminal fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento durante 6 h con 87 mg de Pd(PPh_{3})_{4} (75 mM) en 1 ml de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1). El fragmento de Lantern fue lavado con una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1, 3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH_{2}Cl_{2} (1:19, 3 x 5 min), N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), y CH_{2}Cl_{2} (5 x 5 min).Once the coupling stages are finished, the C-terminal alnico ester was removed under nitrogen atmosphere per treatment for 6 h with 87 mg of Pd (PPh3) 4 (75 mM) in 1 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1). Lantern's fragment it was washed with a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1, 3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH2Cl2 (1:19, 3 x 5 min), N, sodium N-diethyldithiocarbamate (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (5 x 5 min)
Después de eliminar el grupo Fmoc y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo un péptido lineal unido a la SynPhase^{TM} Lantern.After removing the Fmoc group and proceed to the washes as described above, a linear peptide bound to SynPhase? Lantern.
La ciclación del péptido se llevó a cabo mediante tratamiento con 162 mg de PyBOP (311 \mumoles), 42 mg de HOBt (311 \mumoles), y 109 \mul de DIEA (622 \mumoles) en 1 ml de NMP. Después de 24 horas a 25ºC, se lavó el fragmento de Lantern con NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (3 x 5 min), y se escindió el péptido cíclico de dicho fragmento mediante un tratamiento con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 1 hora. El fragmento de Lantern se sacó con unas pinzas y la mezcla acidolítica se evaporó casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.Peptide cyclization was carried out by treatment with 162 mg of PyBOP (311 µmoles), 42 mg of HOBt (311 µmoles), and 109 µl of DIEA (622 µmoles) in 1 ml of NMP. After 24 hours at 25 ° C, the Lantern fragment was washed with NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (3 x 5 min), and it was cleaved the cyclic peptide of said fragment by treatment with a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 1 hour. He Lantern fragment was removed with tweezers and the acidolytic mixture evaporated almost to dryness under a stream of nitrogen until Get an oil. Said oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was decanted. This process was repeated 3 or 4 times. Finally, the solid product obtained was dissolved in water, and It was lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento, cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.A powdery solid was obtained, whose structure was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS
Se partió de una SynPhase^{TM} Lantern de 35 \mumoles del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D, de la que se cortó un fragmento que comprendía cinco discos unidos entre sí, equivalente a 19,44 \mumoles, que se colocó en un recipiente de vidrio provisto con un tapón y se hinchó con CH_{2}Cl_{2} (5 min). La eliminación del grupo protector Fmoc se llevó a cabo por tratamiento con 1 ml de una mezcla de piperidina, CH_{2}Cl_{2} y NMP (1:2:2, 2 x 45 min). Los lavados se llevaron a cabo sumergiendo el fragmento en NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min) empleando jeringas de 10 ml. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple.It was split from a SynPhase? Lantern of 35 Rink type amide polystyrene D series, of the that a fragment was cut comprising five disks joined between yes, equivalent to 19.44 µmol, which was placed in a container of glass provided with a plug and swelled with CH2Cl2 (5 min) The removal of the Fmoc protective group was carried out by treatment with 1 ml of a mixture of piperidine, CH2Cl2 and NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min). The washes were carried out immersing the fragment in NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min) using 10 ml syringes. After each washing stage the solvent is removed by a vacuum filter multiple.
El fragmento de Lantern se colocó a continuación en un recipiente cenado que contenía 1 ml de una solución en NMP de 49 mg de Fmoc-Glu-OAI (120 mM), 46 mg de HBTU (120 mM), y 42 \mul DIEA (240 mM). Después de 24 horas, el fragmento se lavó con NMP (3 x 5 min), y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min).The Lantern fragment was placed next in a dinner vessel containing 1 ml of a solution in NMP of 49 mg of Fmoc-Glu-OAI (120 mM), 46 mg of HBTU (120 mM), and 42 µL DIEA (240 mM). After 24 hours, the fragment was washed with NMP (3 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min)
Las siguientes etapas de acoplamiento con el resto de los aminoácidos se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento y lavados, como ya se ha descrito anteriormente.The following stages of coupling with the rest of the amino acids were carried out by cycles repeated elimination of the Fmoc group, coupling and washing, as described above.
Una vez finalizadas las etapas de acoplamiento, el éster alílico C-terminal fue eliminado bajo atmósfera de nitrógeno por tratamiento durante 6 h con 87 mg de Pd(PPh_{3})_{4} (75 mM) en 1 ml de una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1). El fragmento de Lantern fue lavado con una mezcla de cloroformo, ácido acético y NMM (37:2:1, 3 x 2 min), una mezcla de DIEA y CH_{2}Cl_{2} (1:19, 3 x 5 min), N,N-dietilditiocarbamato sódico (0,03 M en NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), y CH_{2}Cl_{2} (5 x 5 min).Once the coupling stages are finished, the C-terminal allyl ester was removed under nitrogen atmosphere per treatment for 6 h with 87 mg of Pd (PPh3) 4 (75 mM) in 1 ml of a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1). Lantern's fragment it was washed with a mixture of chloroform, acetic acid and NMM (37: 2: 1, 3 x 2 min), a mixture of DIEA and CH2Cl2 (1:19, 3 x 5 min), N, sodium N-diethyldithiocarbamate (0.03 M in NMP, 3 x 15 min), NMP (5 x 5 min), and CH 2 Cl 2 (5 x 5 min)
Después de eliminar el grupo Fmoc y proceder a los lavados como ya se ha descrito anteriormente, se obtuvo un péptido lineal unido a la SynPhase^{TM} Lantern.After removing the Fmoc group and proceed to the washes as described above, a linear peptide bound to SynPhase? Lantern.
La ciclación del péptido se llevó a cabo colocando el fragmento de Lantern en un vial de vidrio y tratándolo con 162 mg de PyBOP (311 \mumoles), 42 mg de HOBt (311 \mumoles), y 109 \mul de DIEA (622 \mumoles) en 1 ml de NMP.Peptide cyclization was carried out placing the Lantern fragment in a glass vial and treating it with 162 mg of PyBOP (311 µmoles), 42 mg of HOBt (311 µmoles), and 109 µl of DIEA (622 µmoles) in 1 ml of NMP
El vial se colocó en un recipiente apropiado para la radiación de microondas. Primeramente se aplicó durante 5 minutos una rampa de radiación de microondas hasta un máximo de 500 vatios, para llegar a una temperatura de 50ºC. La potencia de la radiación de microondas se regulaba mediante un termostato que se fijó a una temperatura máxima de 50ºC. Se continuó la irradiación para mantener la temperatura a 50ºC durante 15 minutos. La masa de la reacción se enfrió a temperatura ambiente, y se aplicaron dos ciclos de 15 minutos de radiación de microondas.The vial was placed in an appropriate container for microwave radiation. It was first applied for 5 minutes a microwave radiation ramp up to a maximum of 500 watts, to reach a temperature of 50ºC. The power of the microwave radiation was regulated by a thermostat that set at a maximum temperature of 50 ° C. Irradiation was continued to maintain the temperature at 50 ° C for 15 minutes. The mass of the reaction was cooled to room temperature, and two were applied 15 minute cycles of microwave radiation.
Una vez finalizado el periodo de irradiación, se eliminó el disolvente y el fragmento de Lantern se lavó en NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (3 x 5 min). El péptido cíclico se escindió del fragmento de Lantern mediante un tratamiento con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5) durante 1 hora. El fragmento de Lantern se sacó con unas pinzas y la mezcla acidolítica se evaporó casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.Once the irradiation period is over, The solvent was removed and the Lantern fragment was washed in NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (3 x 5 min). The cyclic peptide is excised the Lantern fragment by treatment with a mixture of TFA, water and TIS (95: 2.5: 2.5) for 1 hour. The fragment de Lantern was removed with tweezers and the acidolytic mixture was evaporated almost to dryness under a stream of nitrogen until Get an oil. Said oil was precipitated with diethyl ether, centrifuged, and the ether was decanted. This process was repeated 3 or 4 times. Finally, the solid product obtained was dissolved in water, and It was lyophilized.
Se obtuvo un sólido pulverulento, cuya estructura se analizó por HPLC y se confirmó por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.A powdery solid was obtained, whose structure was analyzed by HPLC and confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS
Ejemplos 4 a 6Examples 4 to 6
Siguiendo un procedimiento análogo al descrito en el Ejemplo 3, se prepararon los péptidos cíclicos que muestra la Tabla II:Following a procedure similar to that described in Example 3, the cyclic peptides showing the Table II:
En todos los casos los péptidos cíclicos se analizaron por HPLC y se confirmó su estructura por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.In all cases the cyclic peptides are analyzed by HPLC and its structure was confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS
Se preparó una quimioteca de 56 péptidos cíclicos de 10 aminoácidos a partir de 28 SynPhase^{TM} Lanterns del tipo Rink amida de poliestireno de la serie D comerciales, cada una de las cuales se dividió en dos.A 56 peptide library was prepared cyclic 10 amino acids from 28 SynPhase? Lanterns Rink type polystyrene amide D series commercial, each one of which was divided into two.
Los fragmentos de Lantern se marcaron con "spindles" y "cogs" de colores, comercializados por Mimotopes, para identificar las posiciones que contenían un residuo de leucina.Lantern fragments were marked with "spindles" and "cogs" of colors, marketed by Mimotopes, to identify the positions that contained a residue of leucine.
Todos los fragmentos de Lantern se colocaron en un único recipiente de vidrio provisto con un tapón y se cubrieron con CH_{2}Cl_{2} durante 5 minutos para hincharlos. Para eliminar el grupo protector Fmoc se trataron con 30 ml de una mezcla de piperidina-CH_{2}Cl_{2}-NMP (1:2:2, 2 x 45 min).All Lantern fragments were placed in a single glass container provided with a cap and covered with CH 2 Cl 2 for 5 minutes to swell them. For remove the Fmoc protecting group were treated with 30 ml of a mixture of piperidine-CH 2 Cl 2 -NMP (1: 2: 2, 2 x 45 min).
Los lavados se llevaron a cabo sumergiendo los fragmentos en NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min) empleando jeringas de plástico. Después de cada etapa de lavado se elimina el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple.The washings were carried out by submerging the fragments in NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min) using plastic syringes. After each washing stage Remove the solvent using a multiple vacuum filter.
A continuación los fragmentos de Lantern se colocaron en un recipiente provisto de un tapón que contenía 30 ml de una solución de 1,47 g de Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 1,36 g de HBTU (120 mM), y 1,25 ml de DIEA (240 mM) en NMP. Al cabo de 24 horas, se lavaron los fragmentos con NMP (3 x 5 min) y CH_{2}Cl_{2} (2 x 5 min).Next the Lantern fragments are placed in a container with a cap containing 30 ml of a solution of 1.47 g of Fmoc-Glu-OAl (120 mM), 1.36 g of HBTU (120 mM), and 1.25 ml of DIEA (240 mM) in NMP. After 24 hours, the fragments were washed with NMP (3 x 5 min) and CH 2 Cl 2 (2 x 5 min).
Los acoplamientos subsiguientes se llevaron a cabo mediante ciclos repetidos de eliminación del grupo Fmoc, acoplamiento con un nuevo aminoácido, y lavados, tal como ya se ha descrito anteriormente.Subsequent links were taken to carried out by repeated cycles of elimination of the Fmoc group, coupling with a new amino acid, and washes, as already previously described.
Para cada acoplamiento con Fmoc-Lys(Boc)-OH y Fmoc-Leu-OH, los fragmentos de Lantern se clasificaron y se separaron en dos grupos, de modo que 21 fragmentos se trataron con una solución que contenía Fmoc-Leu-OH, y 35 fragmentos con Fmoc-Lys(Boc)-OH.For each link with Fmoc-Lys (Boc) -OH and Fmoc-Leu-OH, the fragments of Lantern were classified and separated into two groups, so that 21 fragments were treated with a solution containing Fmoc-Leu-OH, and 35 fragments with Fmoc-Lys (Boc) -OH.
Después de cada etapa de acoplamiento, los fragmentos de Lantern se introducían en una única jeringa de plástico para realizar los lavados.After each coupling stage, the Lantern fragments were introduced into a single syringe of plastic for washing.
A continuación se separaban nuevamente en dos grupos para el acoplamiento subsiguiente de Fmoc-Lys(Boc)-OH o Fmoc-Leu-OH, o se colocaban en un mismo recipiente para el acoplamiento de Fmoc-Phe-OH.Then they separated again into two groups for subsequent coupling of Fmoc-Lys (Boc) -OH or Fmoc-Leu-OH, or were placed in a same vessel for coupling Fmoc-Phe-OH.
Una vez finalizados todos los acoplamientos para obtener péptidos lineales de 10 aminoácidos, se procedió a la eliminación del éster alílico C-terminal, a la eliminación del grupo protector Fmoc, y a los lavados siguiendo el procedimiento descrito en el Ejemplo 2. Todas estas etapas se realizaron colocando todos los fragmentos de Lantern en un único recipiente o jeringa.Once all the couplings are finished for to obtain linear peptides of 10 amino acids, we proceeded to removal of the C-terminal allyl ester, at removal of the Fmoc protective group, and washings following the procedure described in Example 2. All these steps are performed by placing all the Lantern fragments in a single container or syringe
La ciclación de cada uno de los péptidos se llevó a cabo en recipientes individuales siguiendo el tratamiento descrito en el Ejemplo 2.The cyclization of each of the peptides is carried out in individual containers following the treatment described in Example 2.
A continuación se procedió a la escisión del péptido cíclico del soporte sólido, y al aislamiento de cada uno de los péptidos siguiendo el procedimiento descrito en el Ejemplo 2. Para ello, cada fragmento de Lantern se colocó en un recipiente individual.Then the excision of the cyclic peptide of the solid support, and to the isolation of each of the peptides following the procedure described in Example 2. To do this, each fragment of Lantern was placed in a container individual.
Los péptidos obtenidos se analizaron por HPLC y se confirmó su estructura por ESI-MS, MALDI-TOF o FAB-MS.The peptides obtained were analyzed by HPLC and its structure was confirmed by ESI-MS, MALDI-TOF or FAB-MS.
En la Figura 1 se incluyen las estructuras de los 56 decapéptidos cíclicos sintetizados en este Ejemplo 7.Figure 1 includes the structures of the 56 cyclic decapeptides synthesized in this Example 7.
Para evaluar el efecto antimicrobiano de los péptidos de la invención se emplearon las siguientes cepas de bacterias patógenas: Erwinia amylovora PMW6076 (INRA, Angers, Francia), Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria 2323-3 (IVIA, Valencia, España), y Pseudomonas syringae 94 (INTEA, Universitat de Girona, España).The following strains of pathogenic bacteria were used to assess the antimicrobial effect of the peptides of the invention: Erwinia amylovora PMW6076 (INRA, Angers, France), Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria 2323-3 (IVIA, Valencia, Spain), and Pseudomonas syringae 94 (INTEA, University of Girona, Spain).
Todas las bacterias se conservaron a una temperatura de -80ºC en medio Luria-Bertani (LB) complementado con glicerina al 20% en volumen/volumen.All bacteria were conserved at one temperature of -80ºC in Luria-Bertani medium (LB) supplemented with 20% glycerin in volume / volume.
Las muestras de E. amylovora PMV6076 y P. syringae se obtuvieron después de un crecimiento de 24 horas a 25ºC, y la muestra de X. vesicatoria 2323-3 se recogió después de 48 horas a 25ºC en agar LB. En todos los casos se resuspendieron en agua estéril para obtener una suspensión ajustada a una absorbancia de 0,2 a 600 nm, que correspondía aproximadamente a 10^{8} unidades formadoras de colonias/ml.The samples of E. amylovora PMV6076 and P. syringae were obtained after 24 hour growth at 25 ° C, and the sample of X. vesicatoria 2323-3 was collected after 48 hours at 25 ° C on LB agar. In all cases they were resuspended in sterile water to obtain a suspension adjusted to an absorbance of 0.2 to 600 nm, corresponding to approximately 10 8 colony forming units / ml.
Para determinar la concentración inhibitoria mínima (CIM), los péptidos se solubilizaron en agua estéril milli-Q hasta una concentración final de 1000 \muM y se filtraron a través de un filtro de 0,22 \mum de poro.To determine the inhibitory concentration minimum (MIC), the peptides were solubilized in sterile water milli-Q to a final concentration of 1000 µM and filtered through a 0.22 µm pore filter.
Se realizaron diluciones de los péptidos de la invención para obtener soluciones a las concentraciones 750, 500, 250, 125, 62,5, y 31,2 \muM.Dilutions of the peptides of the invention to obtain solutions at concentrations 750, 500, 250, 125, 62.5, and 31.2 µM.
Se mezclaron 20 \mul de cada dilución con 20 \mul de la suspensión del indicador bacteriano correspondiente, 160 \mul de medio líquido TSB (Triptone Soy Broth), hasta un volumen total de 200 \mul en cada pocillo de una microplaca. Así las concentraciones efectivas a las que se sometían las suspensiones de bacterias fueron 75, 50, 25, 12,5, 6,25 y 3,12 \muM.20 µl of each dilution was mixed with 20 µl of the suspension of the corresponding bacterial indicator, 160 µL of TSB (Triptone Soy Broth) liquid medium, up to total volume of 200 µl in each well of a microplate. So the effective concentrations to which the suspensions were subjected of bacteria were 75, 50, 25, 12.5, 6.25 and 3.12 µM.
Se llevaron a cabo tres replicados para cada cepa, concentración y péptido en ensayo.Three replicates were carried out for each strain, concentration and peptide in assay.
Los controles positivos contenían agua en lugar de péptido, y los controles negativos contenían los péptidos sin la suspensión bacteriana.Positive controls contained water instead of peptide, and the negative controls contained the peptides without the bacterial suspension
El crecimiento microbiano se determinó automáticamente mediante la medida de la densidad óptica a 600 rim empleando el Microbiology Analyser Bioscreen C (Labsystems).Microbial growth was determined automatically by measuring the optical density at 600 rim using the Microbiology Analyzer Bioscreen C (Labsystems).
Las microplacas se incubaron a 25ºC durante 48 horas con una agitación de 20 segundos antes de la medida de la absorbancia cada hora. Cada experimento se realizó por triplicado. Como CIM se tomó la concentración de péptido más baja a la que no se producía crecimiento bacteriano al final del experimento.The microplates were incubated at 25 ° C for 48 hours with a stirring of 20 seconds before measuring the absorbance every hour. Each experiment was performed in triplicate. As CIM, the lowest peptide concentration at which no Bacterial growth occurred at the end of the experiment.
En la Tabla III se presenta el rango de concentraciones entre las que se encuentra la CIM, expresada en \muM, después de 48 horas de incubación a 25ºC, para diferentes péptidos de la invención frente a las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae:Table III shows the range of concentrations between the MIC, expressed in µM, after 48 hours of incubation at 25 ° C, for different peptides of the invention against the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae :
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(Tabla pasa a página siguiente)(Table goes to page next)
Se puede observar que los péptidos de la invención presentan una buena eficacia para inhibir el crecimiento de las bacterias Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, que son representativas de bacterias patógenas para las plantas.It can be seen that the peptides of the invention have a good efficacy to inhibit the growth of the bacteria Erwinia amylovora, Clavibacter michiganensis, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae , which are representative of pathogenic bacteria for plants.
Además de los resultados de actividad antibacteriana que presentan los péptidos de la Tabla 3, el resto de decapéptidos de la quimioteca preparada en el Ejemplo 7, y cuya estructura se encuentra en la Figura 1, se ha ensayado frente a Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, y se ha comprobado que todos inhiben el crecimiento de al menos dos de dichas especies bacterianas.In addition to the results of antibacterial activity presented by the peptides of Table 3, the rest of the decapeptides of the library prepared in Example 7, and whose structure is in Figure 1, has been tested against Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria , and Pseudomonas syringae , and all have been shown to inhibit the growth of at least two of said bacterial species.
Para la determinación de la actividad antifúngica se cultivó la cepa del hongo Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici FOL 3 raza 2 (ATCC 201829, aislado en España), primero en medio de agar-patata-dextrosa (PDA). Las microesporas se obtuvieron después de un crecimiento en caldo de dextrosa y patata (PDB) durante 7 días a 25ºC en un agitador rotatorio a 125 rpm. La suspensión de las esporas se filtró y se ajustó a 10^{4} microesporas/mi empleando la cámara de contaje Thoma.To determine the antifungal activity, the strain of the fungus Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici FOL 3 race 2 (ATCC 201829, isolated in Spain), first in the middle of agar-potato-dextrose (PDA). The microspores were obtained after a growth in dextrose and potato broth (PDB) for 7 days at 25 ° C on a rotary shaker at 125 rpm. The spore suspension was filtered and adjusted to 10 4 microspores / mi using the Thoma counting chamber.
Los péptidos de la invención se solubilizaron en agua estéril milli-Q hasta una concentración final de 1000 \muM y se filtraron a través de un filtro de 0,22 \mum de poro.The peptides of the invention were solubilized in sterile milli-Q water to a final concentration 1000 µM and filtered through a 0.22 µm filter of pore.
Con dicha solución se realizaron diluciones de los péptidos para obtener soluciones a las concentraciones 750, 500, 250, 125, 62,5, y 31,2 \muM.With this solution dilutions of the peptides to obtain solutions at concentrations 750, 500, 250, 125, 62.5, and 31.2 µM.
A continuación se mezclaron 20 \mul de cada dilución de péptido con 80 \mul de la suspensión de hongo, y con 100 \mul de medio PDB a doble concentración, hasta obtener un volumen total de 200 \mul en un pocillo de una placa. De este modo se obtuvieron suspensiones de esporas expuestas a las concentraciones de 75, 50, 25, 12,5, 6,25 y 3,12 \muM. Las placas se incubaron a 22ºC durante 144 horas con series de 1 minuto de agitación seguido de 9 minutos de reposo.Then 20 µl of each was mixed dilution of peptide with 80 µl of the fungus suspension, and with 100 µl of double concentration PDB medium, until obtaining a total volume of 200 µl in a well of a plate. In this way spore suspensions exposed to the concentrations of 75, 50, 25, 12.5, 6.25 and 3.12 µM. Plates they were incubated at 22 ° C for 144 hours with 1 minute series of stirring followed by 9 minutes of rest.
Los controles positivos contenían agua en lugar de péptido, y los controles negativos contenían los péptidos sin la suspensión de esporas.Positive controls contained water instead of peptide, and the negative controls contained the peptides without the spore suspension.
La intensidad de crecimiento se determinó mediante el área bajo la curva y los cálculos se realizaron siguiendo los procedimientos descritos en K.L.Reynolds, y D.A.Enher, Statistical comparison of epidemics pág. 34-37, en D.A. Francich Neher (Eds.), Exercises in plant disease epidemiology. APS. Press. 1997, Minnesotta.The intensity of growth was determined using the area under the curve and the calculations were performed following the procedures described in K.L. Reynolds, and D.A. Enher, Statistical comparison of epidemics p. 34-37, in D.A. Francich Neher (Eds.), Exercises in plant disease epidemiology. APS Press 1997, Minnesotta.
En la Tabla IV se presenta el rango de concentraciones entre los que se encuentra la concentración inhibitoria mínima (CIM), expresada en \muM, después de 144 horas de incubación para varios péptidos de la invención frente al hongo patógeno para las plantas Fusarium oxysporum:Table IV shows the range of concentrations among which is the minimum inhibitory concentration (MIC), expressed in µM, after 144 hours of incubation for several peptides of the invention against the pathogenic fungus for Fusarium oxysporum plants:
Se puede observar que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento del hongo patógeno para las plantas Fusarium oxysporum.It can be seen that the peptides of the invention inhibit the growth of the pathogenic fungus for Fusarium oxysporum plants.
La actividad hemolítica de los péptidos de la invención se evaluó mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de los péptidos con una suspensión de eritrocitos al 5% en volumen procedentes de sangre humana fresca.The hemolytic activity of the peptides of the invention was evaluated by determining the release of hemoglobin that is produced by contacting a solution of the peptides with a 5% volume red cell suspension from fresh human blood.
La sangre se recogió asépticamente empleando un sistema Vacuntainer® K2E (Belliver, Gran Bretaña) con EDTA, y se almacenó a 4ºC durante un período inferior a 2 horas.Blood was collected aseptically using a Vacuntainer® K2E system (Belliver, Great Britain) with EDTA, and stored at 4 ° C for a period of less than 2 hours.
La sangre se centrifugó a 6.000 g durante 5 minutos para separar los eritrocitos. Éstos se lavaron tres veces con tampón TRIS (10 mM TRIS, 150 mM NaCl, pH 7,2), y se suspendieron en tampón TRIS hasta obtener una suspensión que contenía un 10% en volumen de eritrocitos.The blood was centrifuged at 6,000 g for 5 minutes to separate the erythrocytes. These were washed three times. with TRIS buffer (10 mM TRIS, 150 mM NaCl, pH 7.2), and were suspended in TRIS buffer until a suspension containing 10% in erythrocyte volume
Los péptidos se solubilizaron en tampón TRIS hasta una concentración final 125, 250, 500 y 750 \muM.The peptides were solubilized in TRIS buffer to a final concentration 125, 250, 500 and 750 µM.
Se emplearon tres replicados para cada péptido y concentración.Three replicates were used for each peptide and concentration.
Se mezclaron 65 \mul de la suspensión de eritrocitos al 10% en volumen con 65 \mul de la solución de péptido en cada pocillo de una placa de 96 pocillos Micro-Amp® (Applied Biosystems, EE.UU.) (5% en volumen de eritrocitos), y se incubó la mezcla durante 1 h a 37ºC bajo agitación. De este modo las suspensiones de eritrocitos se sometieron a concentraciones de péptidos de 62,5, 125, 250 y 375 \muM.65 µl of the suspension of 10% erythrocytes by volume with 65 µl of the solution of peptide in each well of a 96-well plate Micro-Amp® (Applied Biosystems, USA) (5% in erythrocyte volume), and the mixture was incubated for 1 h at 37 ° C under agitation Thus the erythrocyte suspensions are subjected to peptide concentrations of 62.5, 125, 250 and 375 µM.
A continuación se centrifugaron las placas a 3.500 g durante 10 minutos, y se transfirieron alícuotas de 80 \mul del sobrenadante a microplacas de 100 pocillos (Bioscreen), que se diluyeron con 80 \mul de agua milli-Q.The plates were then centrifuged at 3,500 g for 10 minutes, and 80 aliquots were transferred µl of the supernatant to 100-well microplates (Bioscreen), which were diluted with 80 µl of milli-Q water.
El grado de hemólisis se determinó a partir de la absorbancia a 540 nm con un lector de placas Bioscreen.The degree of hemolysis was determined from the absorbance at 540 nm with a Bioscreen plate reader.
El control positivo de hemólisis completa se determinó en una solución de tampón TRIS que contenía melitina (Sigma-Aldrich, España).The positive complete hemolysis control is determined in a TRIS buffer solution containing melitin (Sigma-Aldrich, Spain).
El porcentaje de hemólisis (H) se determinó empleando la ecuación:The percentage of hemolysis (H) was determined using the equation:
H = 100x[(Op-Ob)/(Om-Ob)]H = 100x [(Op-Ob) / (Om-Ob)]
donde Op era la densidad óptica medida para una concentración de péptido determinada, Ob era la densidad óptica de la solución tampón, y Om era la densidad óptica para el control positivo con melitina.where Op was the optical density measured for a given peptide concentration, Ob was the optical density of the buffer solution, and Om was the optical density for positive control with melitina
La Tabla V presenta los resultados de actividad hemolfica para diferentes concentraciones de péptidos de la invención, expresada como el porcentaje de hemólisis calculado según la ecuación anterior:Table V presents the activity results hemolphic for different concentrations of peptides from the invention, expressed as the percentage of hemolysis calculated according to the previous equation:
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En todos los casos se observa que la concentración en la que se llegaría a producir una hemólisis significativa es entre 10 y 100 veces superior a la concentración en la que el péptido presenta actividad antimicrobiana.In all cases it is observed that the concentration at which hemolysis would occur significant is between 10 and 100 times higher than the concentration in which the peptide has antimicrobial activity.
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