WO1995009247A1 - Procede pour effectuer un test biologique destine a identifier et a doser des genes, des proteines et autres molecules - Google Patents

Procede pour effectuer un test biologique destine a identifier et a doser des genes, des proteines et autres molecules Download PDF

Info

Publication number
WO1995009247A1
WO1995009247A1 PCT/FR1994/001106 FR9401106W WO9509247A1 WO 1995009247 A1 WO1995009247 A1 WO 1995009247A1 FR 9401106 W FR9401106 W FR 9401106W WO 9509247 A1 WO9509247 A1 WO 9509247A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
cyclodextrin
membrane
dna
detection solution
proteins
Prior art date
Application number
PCT/FR1994/001106
Other languages
English (en)
Inventor
Bertrand Rihn
Original Assignee
Institut National De Recherche Et De Securite Pourla Prevention Des Accidents Du Travail Et Des Maladies Professionnelles
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institut National De Recherche Et De Securite Pourla Prevention Des Accidents Du Travail Et Des Maladies Professionnelles filed Critical Institut National De Recherche Et De Securite Pourla Prevention Des Accidents Du Travail Et Des Maladies Professionnelles
Priority to AU77858/94A priority Critical patent/AU7785894A/en
Publication of WO1995009247A1 publication Critical patent/WO1995009247A1/fr

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means

Definitions

  • the present invention relates to a method for performing a biological test for identifying and assaying genes, proteins and other molecules.
  • Phosphatase is also widely used to detect genes or proteins of organisms pathogenic to humans or, for another example, to detect genetic abnormalities that are constitutional or acquired in particular by non-radioactive sequencing techniques.
  • the phosphatase substrates are either colorigenic (such as bromo-chloro-indoyl-phosphate in the presence of tetrazolium nitroblue) or chemiluminescent such as for example dioxetane derivatives (AMPPD TM: or 3- (2 '-spiroadamantane) -4- 4-methoxy (3 "-phophoryloxy) phenyl-1,2-dioxetane, Tropix) whose enzymatic hydrolysis produces photons detected by blackening of an autoradiographic film or counted by a luminometer.
  • Chemiluminescent substrates allow a lower detection threshold to colorigenic substrates but have the drawback of high background noise, thereby decreasing their performance. The object of the present invention is to improve the accuracy of these tests.
  • the invention thus relates to a method for carrying out a biological test in which chemiluminescent molecular probes and a detection solution containing a phosphatase-based compound are used to identify and assay genes, proteins or other molecules.
  • this method is characterized in that a detection solution is added to the detection solution. cyclodextrin.
  • said cyclodextrin is ⁇ -cyclodextrin.
  • the compound hydrolyzed by phosphatase is a derivative of dioxetane, such as 3- (2'-spiroadamantane) -4-methoxy- 4 (3 "-phophoryloxy) phenyl-l, 2- dioxetane.
  • the method comprises the following steps:
  • DNA is separated by 2.5% agarose gel electrophoresis. DNA concentrations are 800, 400, 80, 40, 8, 4, 0.8 pg of DNA.
  • the DNA is transferred to a polyamide membrane (type Nytran 13 TM, Schleicher & Schuell) under vacuum by alkaline transfer (NaCl 1.5 mol / I, NaOH 0.25 mol / I) but any other transfer is also effective, in particular neutral transfer.
  • the membrane is then fixed by UV irradiation at a rate of 1.2 -mJoule / c 2 .
  • DNA corresponds to homologous DNA of 208 bp labeled with the Kleenow enzyme using digoxigenin-11-dUTP TM (or digoxigenin-3-O- methylcarbonyl-e-aminocaproyl- [5- (3 -aminoallyl) -2'- deoxyuridine-5'-triphosphate], Boehringer Mannheim), but any other labeling process can be used (terminal labeling, labeling by "nick translation” or labeling with derivatives of biotin-dUTP, or any other dNTP, modified ddNTP recognized by an antibody labeled with phosphatase).
  • the detection of the target DNA fragments is carried out as follows:
  • the membrane is drained, placed in a transparent plastic film (Saran TM type), placed against an autoradiographic film (XAR Kodack TM type) for variable periods (from 5 minutes to 5 hours).
  • Saran TM type transparent plastic film
  • XAR Kodack TM type autoradiographic film
  • the autoradiographs are evaluated using a Schimadzu CS 9000 type transmission laser densitometer with a beam 5 mm wide and 0.5 mm thick at 550 nm wavelength so as to obtain electropherograms for each migration profile. This allows the integration of absorbance values at 550 nm as a function of the migration distance (70 cm on average).
  • Four main parameters are analyzed:
  • this mean surface represents a reflection of the background noise, that is to say of the blackening of the film in the presence and in the absence of cyclodextrin;
  • FIG. 1 shows an example of transfer using the Southern method in the absence (bottom) and in the presence (top) of ⁇ -cyclodextrin: the background noise is much less significant in the presence of ⁇ -cyclodextrin, likewise on other electropherograms, it has been noted that the parasitic spots of film blackening are significantly less numerous in the presence of cyclodextrin.
  • the DNA dilutions are increasing from left to right and indicated in the "Experimentation" paragraph above.
  • the electropherogram shown on the left was obtained in the presence of ⁇ -cyclodextrin while that shown on the right was obtained in the absence of ⁇ -cyclodextrin.
  • the absorbance value at 550 nm (on the ordinate) is represented in the presence of ⁇ -cyclodextrin (part of the electro ⁇ phoregram between 10 and 86 mm, on the abscissa) and in the absence of ⁇ -cyclodextrin (part of the electro ⁇ phoregram between 94 and 170 mm, on the abscissa): the arrows represent the specific DNA peak.
  • PIC SPEC the value of the area under the peak sought. These two values are expressed in arbitrary units.
  • PIC NOT SPEC corresponds to the ratio of the value of the summed area of the non-specific peaks (or parasites of the 1 electropherogram) to the total area. The latter value is expressed as a percentage.
  • FIG. 3 represents the action of ⁇ -cyclodextrin on the mean value of the baseline.
  • the expression "BASELINE” represents the average value of the baseline of the electropherogram expressed in absorbance units at 550 n.
  • the parameter studied here corresponds to the mean value of the baseline in the 3 independent experiments noted R2E2, R3E3 and R3E2.
  • the exact values of this parameter appear in table I under the column “BASE” at the level of the lines “WITHOUT CD” (either in the absence of cyclodextrin) or "WITH CD” (in the presence of cyclodextrin).
  • the two-by-two comparisons of these values appear in the "COMPARISON (- / +) " line when the report of the values "WITHOUT CD” / "WITH CD” is made and "COMPARISON (+/-)" when it is a question of the reverse ratio.
  • FIG. 4 represents the action of ⁇ -cyclodextrin on the surface located below the baseline.
  • the expression "SURFACE” represents the average surface located below the baseline. This parameter evolves in parallel with the previous one.
  • the area under the baseline (given in mm * absorbance) is the reflection of the average darkening of the film (or average background noise) in the presence and in the absence of ⁇ -cyclodextrin.
  • the average darkening is 1.89 times (EOl value, Table I) to 17.82 times (E02 value, Table I) greater in the absence of ⁇ -cyclodextrin.
  • FIG. 5 represents the action of ⁇ -cyclodextrin on the total surface of the non-specific peaks.
  • the expression "PIC NOT SPEC” represents the ratio of the summed area of all the parasitic peaks of the electropherogram to the total area (expressed in%).
  • PIC SPEC represents the area of the target DNA peak expressed in arbitrary units.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Dans le procédé pour effectuer un test biologique, on utilise des sondes moléculaires chimioluminescentes et une solution de détection renfermant un composé à base de phosphatase pour identifier et doser des gènes, des protéines ou autres molécules. Suivant l'invention, on ajoute à la solution de détection un cyclodestrine. Utilisation pour améliorer la précision et la fiabilité des tests biologiques mettant en oeuvre des réactions chimioluminescentes.

Description

"Procédé pour effectuer un test biologique destiné à identifier et à doser des gènes, des protéines et autres molécules"
La présente invention concerne un procédé pour effectuer un test biologique destiné à identifier et à doser des gènes, des protéines et autres molécules.
De nombreux tests pratiqués en biologie clinique ou en biologie moléculaire (recherche et industrie) font intervenir la phosphatase et ses substrats pour identifier et doser des substances ayant un intérêt biologique comme des métabolites, des hormones. La phosphatase est aussi largement utilisée pour détecter des gènes ou des protéines d'organismes pathogènes pour l'homme ou, autre exemple, pour détecter les anomalies génétiques constitutionnelles ou acquises notamment par des techniques de séquençage non radioactif.
Les substrats de la phosphatase sont soit colorigeniques (comme le bromo-chloro-indoyl-phosphate en présence de nitrobleu de tétrazolium) soit chimioluminescents comme par exemple les dérivés du dioxétane (AMPPD™: soit 3- (2' -spiroadamantane)-4- méthoxy-4(3"-phophoryloxy)phényl-l,2-dioxetane, Tropix) dont 1'hydrolyse enzymatique produit des photons détectés par noircissement d'un film autoradiographique ou comptés par un luminomètre. Les substrats chimioluminescents permettent un seuil de détection inférieur aux substrats colorigeniques mais présentent l'inconvénient d'un bruit de fond important diminuant d'autant leurs performances. Le but de la présente invention est d'améliorer la précision de ces tests.
L'invention vise ainsi un procédé pour effectuer un test biologique dans lequel on utilise des sondes moléculaires chimioluminescentes et une solution de détection renfermant un composé à base de phosphatase pour identifier et doser des gènes, des protéines ou autres molécules.
Suivant l'invention, ce procédé est caractérisé en ce qu'on ajoute à la solution de détection une cyclodextrine.
Il a été constaté que l'ajout d'une cyclodextrine à la solution de détection permet d'améliorer la détection des gènes, protéines et autres molécules, notamment d'améliorer de façon sensible le rapport signal/bruit de la réaction chi ioluminescente mise en oeuvre dans le test.
Selon une version préférée de l'invention, ladite cyclodextrine est la β-cyclodextrine. Selon une version avantageuse de l'invention, le composé hydrolyse par la phosphatase est un dérivé du dioxétane, tel que le 3-(2'-spiroadamantane)-4-méthoxy- 4(3"-phophoryloxy)phényl-l,2-dioxétane.
Dans le cas de la détection d'un fragment d'ADN cible, le procédé comprend les étapes suivantes:
- séparation de l'ADN;
- transfert et fixation de l'ADN sur une membrane;
- hybridation de 1'ADN au moyen d'une sonde marquée par la phosphatase;
- lavage de la membrane;
- incubation de la membrane dans une solution de détection renfermant un réactif chimioluminescent hydrolyse par les phosphatases et de la β-cyclodextrine; - application de la membrane contre un film radiographique;
- révélation du film radiographique;
- mesures denstométriques sur le film.
On donne ci-après, un exemple non limitatif, illustrant le procédé conforme à l'invention.
Description d'une application de type "Southern": détection d'un fragment d'ADN du gène ras de 208 paires de bases.
1. Expérimentation L'ADN est séparé par électrophorèse en gel d'agarose à 2,5%. Les concentrations d'ADN sont de 800, 400, 80, 40, 8, 4, 0,8pg d'ADN.
Après électrophorèse, l'ADN est transféré sur une membrane de polyamide (type Nytran 13™, Schleicher & Schuell) sous vide par transfert alcalin (NaCl 1,5 mol/I, NaOH 0,25 mol/I) mais tout autre transfert est aussi efficace notamment le transfert neutre. La membrane est ensuite fixée par irradiation UV à raison de 1,2 -mJoule/c 2.
L'étape de préhybridation est réalisée en immergeant la membrane dans la solution suivante (NaCl 0,75 mol/I, citrate trisodique 0,075 mol/I, pH = 0,7, N-lauroylsarcosine 0,1% [p/v], sodium dodécylsulfate 0,02% [p/v] et réactif bloquant de la membrane à raison de 1% [p/v], réactif qui peut être semblable au réactif bloquant du kit Dig™ de Boehringer Mannheim. La sonde permettant de détecter l'ADN correspond à de l'ADN homologue de 208 pb marqué par l'enzyme de Kleenow à l'aide de la digoxigénine-11-dUTP™ (ou digoxigenin-3-O- méthylcarbonyl-e-aminocaproyl-[5-(3-aminoallyl)-2'- déoxyuridine-5'-triphosphate] , Boehringer Mannheim), mais tout autre processus de marquage peut être utilisé (marquage terminal, marquage par "nick translation" ou marquage par les dérivés de la biotine-dUTP, ou tout autre dNTP, ddNTP modifiés reconnus par un anticorps marqué à la phosphatase).
Après 4 heures de préhybridation, 30 ng de sonde marquée sont ajoutés à la solution de préhybridation et l'ensemble est agité à 69°C pendant 18 heures dans une étuve à hybridation. Après cette étape, la membrane est lavée deux fois 5 minutes dans une solution contenant NaCl 0,3 mol/I, citrate trisodique 30 mmol/I, sodium dodécylsulfate 0,1% [p/v], pH = 7,0 à température ambiante avant d'être immergée deux fois 15 minutes dans une solution de NaCl 15 mmol/I, citrate trisodique
1,5 mmol/I, sodium dodécylsulfate 0,1% [p/v], pH = 7,0 à 65 °C .
La détection des fragments d'ADN cible (fragment de 208 pb) est réalisée de la manière suivante:
- lavage de la membrane dans le tampon NaCl 150 mMol/I, Tris.HCl 100 mMol/I, pH ≈ 7,5;
- incubation de la membrane dans ce même tampon contenant 0;5% [p/v] d'agent bloquant (semblable au réactif bloquant du kit Dig™ de Boehringer Mannheim), pendant 30 minutes; - lavage de la membrane pendant 2 minutes dans le tampon Tris.HCl 100 mMol/I, pH = 7,5.
- incubation dans ce même tampon pendant
30 minutes en présence d'un anticorps anti-digoxigénine dilué au l/5000e (Boehringer Mannheim); - double lavage de 5 minutes dans le tampon suivant: diéthanolaminé 100 mMol/I, MgCl2 2 mMol/I, azide de sodium 3 mMol/I, pH = 10.
Puis la membrane est incubée 5 minutes dans la solution de détection: diéthanolaminé 100 mMol/I, MgCl2 2 mMol/I, azide de sodium 3 mMol/I, AMPPD™ 1,3 μMol/I (3- (2*-spiroadamantane)-4-méthoxy-4(3"-phophoryloxy)-phény1- 1,2-dioxetane, Tropix) voire n'importe quel autre réactif chimioluminescent hydrolyse par les phosphatases, β- cyclodextrine substituée ou non à raison de 400 μMol/I pH = 10 et à 37°C. Cependant des concentrations de 10 à 500 μMol/I s'avèrent efficaces.
Puis la membrane est égouttée, placée dans un film plastique transparent (type Saran™), placée contre un film autoradiographique (type XAR Kodack™) durant des périodes variables (de 5 minutes à 5 heures).
Après la révélation, les autoradiographies sont évaluées à l'aide d'un densitomètre laser à transmission type Schimadzu CS 9000 avec un faisceau de 5 mm de large et 0,5 mm d'épaisseur de 550 nm de longueur d'onde de manière à obtenir des électrophorégrammes pour chaque profil de migration. Ceci permet l'intégration des valeurs d'absorbance à 550 nm en fonction de la distance de migration (70 cm en moyenne). Quatre paramètres principaux sont analysés:
1. le niveau moyen de 1'absorbance sur toute la distance de migration: il correspond à la ligne de base;
2. la surface moyenne représentée par la distance (en millimètres) multipliée par la valeur de
1'absorbance: cette surface moyenne représente un reflet du bruit de fond, c'est-à-dire du noircissement du film en présence et en l'absence de cyclodextrine;
3. la surface du pic spécifique qui correspond au fragment d'ADN recherché;
4. la surface totale des pics non spécifiques correspondant aux taches additionnelles détectées sur les pistes d'électrophorèse.
Ces quatre paramètres, variables en fonction de l'absence ou de la présence de cyclodextrines, sont des indicateurs du bruit de fond et permettent de quantifier le rapport signal/bruit. Trois expériences indépendantes ont été réalisées.
2. Résultats
La figure 1 montre un exemple de transfert en méthode de Southern en l'absence (en bas) et en présence (en haut) de β-cyclodextrine: le bruit de fond est nettement moins important en présence de β-cyclodextrine, de même sur d'autres électrophorégrammes, il a été noté que les taches parasites de noircissement de film sont significative ent moins nombreuses en présence de cyclodextrine. Sur la figure 1, les dilutions d'ADN sont croissantes de gauche à droite et indiquées dans le paragraphe "Expérimentation" ci-dessus.
Afin de quantifier le nombre et l'intensité des taches parasites ainsi que le niveau de la ligne de base, les courbes d'absorbances en fonction de la distance ont été établies avec un spectrophotomètre laser (Shimadzu CS 9000) . Un électrophorégramme type est montré à la figure 2.
L'électrophorégramme représenté à gauche a été obtenu en présence de β-cyclodextrine tandis que celui représenté à droite a été obtenu en l'absence de β-cyclodextrine.
Dans une même expérience, la valeur de l'absorbance à 550 nm (en ordonnée) est représentée en présence de β-cyclodextrine (partie de l'électro¬ phorégramme comprise entre 10 et 86 mm, en abscisse) et en l'absence de β-cyclodextrine (partie de l'électro¬ phorégramme comprise entre 94 et 170 mm, en abscisse) : les flèches représentent le pic d'ADN spécifique.
Trois êlectrophorégrammes ont été réalisés et les paramètres mesurés par 1'intégrateur ont été reportés dans le tableau I ci-dessous. Les trois expériences sont notées R2E2, R3E3, R3E2 et les valeurs respectives de la ligne de base, de la surface sous la ligne de base, de la valeur du pic spécifique et de la valeur des pics non spécifiques sont représentées pour chaque expérience.
TABLEAU I: Valeurs des principaux paramètres analysés par 1'intégrateur
BASE SURFACE PIC SPEC PIC NON SPEC
R2E2 0.375 27,13 118705.8 28.2
SANS CD R3E3 1.120 78.40 75911,5 13.8
R3E2 1.200 83.80 1417093 16.6
R2E2 0.194 1434 172112,1 21,5
AVEC CD R3E3 0,060 4,40 155768,9 4.8
R3E2 0,078 5,73 323246,1 4.1
E01 1,93 1.89 0.69 1.31
COMPARAISONS (-/+) E02 18,67 17,82 0.49 2,88
E03 15,38 14,62 0,44 4,05
EH 0,52 0.53 1.45 0,76
COMPARAISONS (+/-) E12 0.05 0.06 2.05 0,35
E13 0.07 0,07 2.28 0,25
Trois expériences indépendantes sont à l'origine des électrophorégrammes R2E2, R3E3 et R3E2 en l'absence ("SANS CD") et en présence ("AVEC CD") de cyclodextrine. "BASE" représente la valeur moyenne de la ligne de base (en unité d'asborbance à 550 nm), "SURFACE" la valeur moyenne de la surface sous la ligne de base,
"PIC SPEC" la valeur de la surface sous le pic recherché. Ces deux valeurs sont exprimées en unité arbitraire. "PIC NON SPEC" correspond au rapport de la valeur de la surface sommée des pics non spécifiques (ou parasites de l1électrophorégramme) à la surface totale. Cette dernière valeur est exprimée en pourcentage.
"COMPARAISONS (-/+)" représente pour chaque expérience, le rapport des valeurs de la variable considérée et "COMPARAISONS (-/+)" représente le rapport inverse.
La figure 3 représente 1 'action de la β-cyclodextrine sur la valeur moyenne de la ligne de base. L'expression "LIGNE DE BASE" représente la valeur moyenne de la ligne de base de 1 'électrophorégramme exprimée en unité d'absorbance à 550 n .
Le paramètre étudié ici correspond à la valeur moyenne de la ligne de base dans les 3 expériences indépendantes notées R2E2, R3E3 et R3E2. Les valeurs exactes de ce paramètre apparaissent dans le tableau I sous la colonne "BASE" au niveau des lignes "SANS CD" (soit en l'absence de cyclodextrine) ou "AVEC CD" (en présence de cyclodextrine). Les comparaisons deux à deux de ces valeurs apparaissent dans la ligne "COMPARAISONS (-/+)» quand le rapport des valeurs "SANS CD"/"AVEC CD" est réalisé et "COMPARAISONS (+/-)" quand il s'agit du rapport inverse.
On note une augmentation importante, dans les trois expériences, de la valeur moyenne de la ligne de base en l'absence de β-cyclodextrine: cette augmentation varie de 1,93 à 18,67 fois (valeurs EOl et E02 du tableau I). La figure 4 représente 1'action de la β- cyclodextrine sur la surface située sous la ligne de base. L'expression "SURFACE" représente la surface moyenne située sous la ligne de base. Ce paramètre évolue de manière parallèle au précédent. La surface sous la ligne de base (donnée en mm*absorbance) est le reflet du noircissement moyen du film (ou bruit de fond moyen) en présence et en l'absence de β-cyclodextrine. Le noircissement moyen est de 1,89 fois (valeur EOl, tableau I) à 17,82 fois (valeur E02, tableau I) plus important en 1'absence de β- cyclodextrine.
La figure 5 représente 1'action de la β-cyclodextrine sur la surface totale des pics non spécifiques. L'expression "PIC NON SPEC" représente le rapport de la surface sommée de tous les pics parasites de l'électrophorégramme à la surface totale (exprimé en %) .
Les pics situés à des temps de rétention différents des pics spécifiques ont été comptés et leur surface sommée. Leur valeur apparaît dans le tableau I sous la colonne "PIC NON SPEC". En comparant les valeurs trouvées pour les trois expériences, on remarque une diminution des surfaces cumulées correspondant à des pics non spécifiques d'un facteur de 1,31 (EOl) à 4/05 (E02). Ces pics non spécifiques correspondent en fait à des taches de noircissement de film, taches qui se réalisent de manière spontanée en l'absence de cyclodextrine. La figure 6 représente 1'action de la β-cyclodextrine sur la surface du pic spécifique.
L'expression "PIC SPEC" représente la surface du pic d'ADN cible exprimée en unité arbitraire.
Cette figure montre l'évolution de la surface du pic recherché en 1'absence et en présence de cyclodextrine. Les valeurs correspondantes sont indiquées dans la colonne "PIC SPEC" du tableau I. En présence de cyclodextrine ("AVEC CD"), la surface du pic recherché est augmentée d'une manière significative de 1,45 (Eli) à 2,28 (E13) fois.
Les gains totaux des rapports signal/bruit sont de 1,90 à 9,12 fois plus importants en présence de cyclodextrine. Ces gains sont mesurés pour chaque valeur par les rapports des valeurs Eli, E12 et E13 "PIC SPEC"/"PIC NON SPEC" (tableau I). 3. Conclusions L'ajout de cyclodextrines au milieu réactionnel des détections non radioactives basées sur la chimioluminescence et utilisant les phosphatases afin de mettre en évidence ou de doser des acides nucléiques, des protéines ou toute autre molécule, permet une diminution sensible du bruit de fond et une amélioration subséquente du rapport signal/bruit. Ces effets se manifestent par un noircissement moindre des films, une diminution du nombre des taches parasites et finalement un gain de 1,90 à 9,12 fois du rapport signal sur bruit. De tels effets sont également constatés quand les dosages sont réalisés en phase liquide et les photons comptés au luminomètre. Cette amélioration est importante lors de la mise en oeuvre de techniques basées sur une détection non radioactive et notamment pour les tests biologiques basés sur la chimioluminescence. Cette technique permet l'amélioration de la fiabilité des tests biologiques basés sur la chimioluminescence, l'extraction de l'information des "biokits" et finalement la détection de résultats faiblement positifs.

Claims

REVENDICATIONS
1. Procédé pour effectuer un test biologique dans lequel on utilise des sondes moléculaires chimioluminescentes et une solution de détection renfermant un composé à base de phosphatase pour identifier et doser des gènes, des protéines ou autres molécules, caractérisé en ce qu'on ajoute à la solution de détection une cyclodextrine.
2. Procédé conforme à la revendication 1, caractérisé en ce que ladite cyclodextrine est la β-cyclodextrine.
3. Procédé conforme à 1'une des revendications
1 ou 2, caractérisé en ce que le composé hydrolyse par la phosphatase est un dérivé du dioxétane.
4. Procédé conforme à la revendication 3, caractérisé en ce que le dérivé du dioxétane est du
3-(2'-spiroadamantane)-4-méthoxy-4(3"-phophoryloxy)- phényl-1,2-dioxetane.
5. Procédé conforme à 1'une des revendications 1 à 4, appliqué à la détection d'un fragment d'ADN cible, caractérisé par les étapes suivantes:
- séparation de l'ADN;
- transfert et fixation de l'ADN sur une membrane; - hybridation de l'ADN au moyen d'une sonde marquée;
- lavage de la membrane;
- incubation de la membrane dans une solution de détection renfermant un réactif chimioluminescent hydrolyse par les phosphatases et de la β-cyclodextrine;
- application de la membrane contre un film radiographique;
- révélation du film radiographique;
- mesures densitométriques sur le film.
6. Procédé conforme à l'une des revendications
1 à 5, caractérisé en ce que la solution de détection renferme entre 10 et 500 μMol/I de β-cyclodextrine.
PCT/FR1994/001106 1993-09-29 1994-09-21 Procede pour effectuer un test biologique destine a identifier et a doser des genes, des proteines et autres molecules WO1995009247A1 (fr)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AU77858/94A AU7785894A (en) 1993-09-29 1994-09-21 Method for performing a bioassay for identifying and assaying genes, proteins and other molecules

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR93/11611 1993-09-29
FR9311611A FR2710655B1 (fr) 1993-09-29 1993-09-29 Procédé pour effectuer un test biologique destiné à identifier et à doser des gènes, des protéines et autres molécules.

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO1995009247A1 true WO1995009247A1 (fr) 1995-04-06

Family

ID=9451374

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/FR1994/001106 WO1995009247A1 (fr) 1993-09-29 1994-09-21 Procede pour effectuer un test biologique destine a identifier et a doser des genes, des proteines et autres molecules

Country Status (3)

Country Link
AU (1) AU7785894A (fr)
FR (1) FR2710655B1 (fr)
WO (1) WO1995009247A1 (fr)

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0411159A1 (fr) * 1989-02-23 1991-02-06 Iatron Laboratories, Inc. Procede de determination d'activite enzymatique
WO1991001492A1 (fr) * 1989-07-20 1991-02-07 Tropix, Inc. Procede de detection d'une substance par decomposition induite de maniere enzymatique de dioxetanes
WO1991002040A1 (fr) * 1989-08-04 1991-02-21 Kosak Kenneth M Etiquette de cyclodextrine pour acide nucleique et analyse biochimique
EP0510721A2 (fr) * 1988-07-27 1992-10-28 Tropix, Inc. Méthode et compositions pour provoquer une chémiluminescence augmentée de 1,2-dioxétanes
WO1993003380A1 (fr) * 1991-07-31 1993-02-18 E.I. Du Pont De Nemours And Company Procede destine a intensifier la chimioluminescence de dioxetanes-1,2 declenches par une enzyme et applications
WO1993013405A1 (fr) * 1991-12-23 1993-07-08 Tropix, Inc. Membrane amelioree pour des applications a effet buvard chimioluminescentes
EP0561033A1 (fr) * 1992-03-20 1993-09-22 Lumigen, Inc. Sels polymères de phosphonium qui produisent une chemiluminescence plus forte des 1,2-dioxetanes

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0510721A2 (fr) * 1988-07-27 1992-10-28 Tropix, Inc. Méthode et compositions pour provoquer une chémiluminescence augmentée de 1,2-dioxétanes
EP0411159A1 (fr) * 1989-02-23 1991-02-06 Iatron Laboratories, Inc. Procede de determination d'activite enzymatique
WO1991001492A1 (fr) * 1989-07-20 1991-02-07 Tropix, Inc. Procede de detection d'une substance par decomposition induite de maniere enzymatique de dioxetanes
WO1991002040A1 (fr) * 1989-08-04 1991-02-21 Kosak Kenneth M Etiquette de cyclodextrine pour acide nucleique et analyse biochimique
WO1993003380A1 (fr) * 1991-07-31 1993-02-18 E.I. Du Pont De Nemours And Company Procede destine a intensifier la chimioluminescence de dioxetanes-1,2 declenches par une enzyme et applications
WO1993013405A1 (fr) * 1991-12-23 1993-07-08 Tropix, Inc. Membrane amelioree pour des applications a effet buvard chimioluminescentes
EP0561033A1 (fr) * 1992-03-20 1993-09-22 Lumigen, Inc. Sels polymères de phosphonium qui produisent une chemiluminescence plus forte des 1,2-dioxetanes

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
STRATTAN, C.: "cyclodextrins and biological macromolecules", BIOPHARM, vol. 4, no. 10, October 1991 (1991-10-01), US, pages 44 - 51 *
WOOLF, E. ET AL.: "effect of cyclodextrin solutions on chemiluminesence of 10,10'-dimethyl-9,9'biacridium nitrate", JOURNAL OF LUMINESCENSE, vol. 33, 1985, AMSTERDAM, HOLLAND, pages 115 - 121 *

Also Published As

Publication number Publication date
FR2710655B1 (fr) 1995-12-01
FR2710655A1 (fr) 1995-04-07
AU7785894A (en) 1995-04-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Mansfield et al. Nucleic acid detection using non-radioactive labelling methods
Xu et al. Immobilization and hybridization of DNA on an aluminum (III) alkanebisphosphonate thin film with electrogenerated chemiluminescent detection
Kim et al. Ultrafast colorimetric detection of nucleic acids based on the inhibition of the oxidase activity of cerium oxide nanoparticles
EP0350073A2 (fr) Essai d'hybridisation utilisant la diffraction de la lumière
Xu et al. An electrochemical biosensor based on nucleic acids enzyme and nanochannels for detecting copper (II) ion
Christopoulos Nucleic acid analysis
US7659089B2 (en) Chemical sensor enhanced by direct coupling of redox enzyme to conductive surface
EP0245206A1 (fr) Méthode analytique de détection et de mesure d'un acide nucléique spécifiquement séquencé
US20040023293A1 (en) Biochips for characterizing biological processes
Liang et al. Electrochemiluminescence resonance energy transfer between graphene quantum dots and graphene oxide for sensitive protein kinase activity and inhibitor sensing
Ramos et al. Enhanced chemiluminescence biosensor for the determination of phenolic compounds and hydrogen peroxide
US9170227B2 (en) Multi-analyte system and method based on impedimetric measurements
Kadadou et al. Detection of SARS-CoV-2 in clinical and environmental samples using highly sensitive reduced graphene oxide (rGO)-based biosensor
Garcia-Mendiola et al. Dyes as bifunctional markers of DNA hybridization on surfaces and mutation detection
JP4607507B2 (ja) 高比重リポタンパク質コレステロールのためのワンステップ・アッセイ
KR100459394B1 (ko) 인터컬레이터를 이용한 핵산의 전기화학발광 검출방법
CA2345381C (fr) Sondes fluorescentes de peinture chromosomique
EP1706509B1 (fr) Puce d'analyse avec gamme etalon, trousses et procedes d'analyse
FR2674254A1 (fr) Detection non radioactive de la presence d'un acide nucleique determine dans un echantillon biologique.
WO1995009247A1 (fr) Procede pour effectuer un test biologique destine a identifier et a doser des genes, des proteines et autres molecules
Lu et al. Electrochemical determination of the activity of DNA methyltransferase based on the methyl binding domain protein and a customized modular detector
Marquette et al. Design of luminescent biochips based on enzyme, antibody, or DNA composite layers
Dai et al. Quantitative detection of tumor necrosis factor-α by single molecule counting based on a hybridization chain reaction
FR2799281A1 (fr) Procede et dispositif de detection d'une reaction de reconnaissance moleculaire
JP3289907B2 (ja) dsDNA抗体の化学発光アッセイ法

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AM AU BB BG BR BY CA CN CZ EE FI GE HU JP KG KP KR KZ LK LR LT LV MD MG MN MW NO NZ PL RO RU SD SE SI SK TJ TT UA US UZ VN

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): KE MW SD SZ AT BE CH DE DK ES FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE BF BJ CF CG CI CM GA GN ML MR NE SN TD TG

DFPE Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed before 20040101)
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
122 Ep: pct application non-entry in european phase
NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: CA