TW202140537A - 針對含有g12v突變之ras之hla第ii類限制性t細胞受體 - Google Patents
針對含有g12v突變之ras之hla第ii類限制性t細胞受體 Download PDFInfo
- Publication number
- TW202140537A TW202140537A TW110106886A TW110106886A TW202140537A TW 202140537 A TW202140537 A TW 202140537A TW 110106886 A TW110106886 A TW 110106886A TW 110106886 A TW110106886 A TW 110106886A TW 202140537 A TW202140537 A TW 202140537A
- Authority
- TW
- Taiwan
- Prior art keywords
- seq
- acid sequence
- amino acid
- chain
- val
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
- A61K35/14—Blood; Artificial blood
- A61K35/17—Lymphocytes; B-cells; T-cells; Natural killer cells; Interferon-activated or cytokine-activated lymphocytes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
- A61K39/001102—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- A61K39/001111—Immunoglobulin superfamily
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/5748—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving oncogenic proteins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Pathology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
Abstract
本發明揭示經分離或經純化T細胞受體(TCR),其中該等TCR對由人類白血球抗原(HLA)第II類分子呈現之突變RAS胺基酸序列具有抗原特異性。亦提供相關之多肽及蛋白質,以及相關之核酸、重組表現載體、宿主細胞、細胞群及醫藥組合物。亦揭示偵測哺乳動物中癌症之存在的方法及治療或預防哺乳動物之癌症的方法。
Description
一些癌症之治療選項可能非常有限,在癌症變成轉移性且不可切除時尤為如此。儘管在諸如手術、化學療法及放射療法之治療中取得進展,但諸如胰臟癌、大腸直腸癌、肺癌、子宮內膜癌、卵巢癌及前列腺癌之許多癌症的預後可能不良。因此,對癌症之額外治療存在未滿足之需求。
本發明之一實施例提供一種經分離或經純化T細胞受體(TCR),其包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 1-3、(b) SEQ ID NO: 4-6、(c) SEQ ID NO: 31-33、(d) SEQ ID NO: 34-36、(e) SEQ ID NO: 1-6或(f) SEQ ID NO: 31-36,其中該TCR對由人類白血球抗原(HLA)第II類分子呈現的位置12處之甘胺酸經纈胺酸取代的突變人類RAS胺基酸序列具有抗原特異性,且其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)或突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列,且其中位置12係藉由分別參考野生型人類KRAS、野生型人類HRAS或野生型人類NRAS蛋白而定義。
本發明之另一實施例提供一種經分離或經純化多肽,其包含本發明TCR之功能部分,其中該功能部分包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 1-3全部,(b) SEQ ID NO: 4-6全部,(c) SEQ ID NO: 31-33全部,(d) SEQ ID NO: 34-36全部,(e) SEQ ID NO: 1-6全部,或(f) SEQ ID NO: 31-36全部。
本發明之又一實施例提供一種經分離或經純化蛋白質,其包含本發明多肽中之至少一者。
本發明之其他實施例提供與本發明TCR、多肽及蛋白質相關之核酸、重組表現載體、宿主細胞、細胞群及醫藥組合物。
本發明之一實施例提供一種經分離或經純化核酸,其自5'端至3'端包含第一核酸序列及第二核苷酸序列,其中該第一核苷酸序列及該第二核苷酸序列分別對以下之胺基酸序列進行編碼:SEQ ID NO: 7及8;7及64;63及8;63及64;7及65;63及65;7及66;63及66;8及7;64及7;8及63;64及63;65及7;65及63;66及7;66及63;129及8;129及64;129及65;129及66;8及129;64及129;65及129;66及129;130及8;130及64;130及65;130及66;8及130;64及130;65及130;66及130;37及38;37及69;37及70;37及71;38及37;69及37;70及37;71及37;23及24;23及84;83及24;83及84;23及87;83及87;23及90;83及90;24及23;84及23;24及83;84及83;87及23;87及83;90及23;90及83;133及24;133及84;133及87;133及90;24及133;84及133;87及133;90及133;39及40;39及107;39及112;39及115;40及39;107及39;112及39;115及39;136及24;136及84;136及87;136及90;24及136;84及136;87及136;90及136;21及22;21及80;79及22;79及80;21及85;21及88;79及85;79及88;22及21;80及21;22及79;80及79;85及21;88及21;85及79;88及79;131及22;131及80;131及85;131及88;22及131;80及131;85及131;88及131;134及22;134及80;134及85;134及88;22及134;80及134;85及134;88及134;77及78;77及82;81及78;81及82;77及86;81及86;78及77;82及77;78及81;82及81;86及77;86及81;132及78;132及82;132及86;78及132;82及132;86及132;135及78;135及82;135及86;78及135;82及135;86及135;77及89;81及89;89及77;89及81;132及89;89及132;135及89;89及135;41及42;41及105;41及110;41及113;42及41;105及41;110及41;113及41;103及104;103及111;103及114;104及103;111及103;114及103;103及106;106及103;47及48;48及47;67及68;67及76;68及67;76及67;49及50;50及49;72及73;72及102;73及72;102及72;51及52;52及51;53及54;54及53;55及56;56及55;57及58;58及57;91及92;92及91;108及109;109及108;93及94;93及99;94及93;99及93;97及98;97及101;98及97;101及97;95及96;95及100;96及95;100及95;116及117;116及122;117及116;122及116;120及121;120及124;121及120;124及120;118及119;118及123;119及118或123及118。
本發明之實施例進一步提供偵測哺乳動物中癌症之存在的方法、治療或預防哺乳動物之癌症的方法、在哺乳動物中誘導針對癌症之免疫反應的方法、產生表現對SEQ ID NO: 30之肽具有抗原特異性之TCR的宿主細胞的方法及產生本發明TCR、多肽及蛋白質之方法。
額外實施例如本文中所描述。
相關申請案之交叉參考
本專利申請案主張於2020年2月26日申請之美國臨時專利申請案第62/981,856號之權益,其以全文引用之方式併入本文中。
關於聯邦政府獎助研究或開發之聲明
本發明係在政府支援之情況下,藉由國立衛生研究院(National Institutes of Health)、國立癌症研究院(National Cancer Institute)以項目編號ZIABC010984進行。政府享有本發明之某些權利。
以引用的方式併入以電子方式提交之材料
與本申請案同時提交且如下標識之電腦可讀核苷酸/胺基酸序列表以全文引用之方式併入本文中:一個266,276位元組ASCII (文字)檔案,其命名為「752134_ST25.txt」,創建於2021年2月22日。
RAS家族蛋白屬於小GTP酶之大家族。不受特定理論或機制之束縛,咸信當突變時,RAS蛋白可參與許多人類癌症之瘤形成早期的訊息轉導。單個胺基酸取代可活化蛋白質。突變RAS蛋白產物可經組成性活化。突變RAS蛋白可表現於多種人類癌症中之任一者中,諸如胰臟癌(例如胰臟癌瘤)、大腸直腸癌、肺癌(例如肺腺癌)、子宮內膜癌、卵巢癌(例如上皮卵巢癌)及前列腺癌。人類RAS家族蛋白包括Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)及神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)。
KRAS亦稱為GTP酶KRas、V-Ki-Ras2 Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因或KRAS2。存在KRAS之兩種轉錄變體:KRAS變體A及KRAS變體B。野生型(WT) KRAS變體A具有SEQ ID NO: 9之胺基酸序列。野生型(WT) KRAS變體B具有SEQ ID NO: 10之胺基酸序列。在下文中,除非另外規定,否則提及「KRAS」(突變或未突變(WT))係指變體A及變體B兩者。在活化時,突變KRAS與鳥苷-5'-三磷酸(GTP)結合且將GTP轉化為鳥苷5'-二磷酸(GDP)。
HRAS為RAS蛋白家族之另一成員。HRAS亦稱為Harvey大鼠肉瘤病毒致癌蛋白、V-Ha-Ras Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物或Ras家族小GTP結合蛋白H-Ras。WT HRAS具有SEQ ID NO: 11之胺基酸序列。
NRAS為RAS蛋白家族之又一成員。NRAS亦稱為GTP酶NRas、V-Ras神經母細胞瘤RAS病毒致癌基因同源物或NRAS1。WT NRAS具有SEQ ID NO: 12之胺基酸序列。
本發明之一實施例提供一種經分離或經純化TCR,其對由人類白血球抗原(HLA)第II類分子呈現的位置12處之甘胺酸經纈胺酸取代的突變人類RAS胺基酸序列(在下文中,為「突變RAS」)具有抗原特異性,其中突變人類RAS胺基酸序列為突變人類KRAS、突變人類HRAS或突變人類NRAS胺基酸序列,且其中位置12係藉由分別參考WT人類KRAS、WT人類HRAS或WT人類NRAS蛋白而定義。在下文中,除非另外規定,否則提及「TCR」亦係指TCR之功能部分及功能變體。
本發明TCR可對任何突變人類RAS蛋白、多肽或肽胺基酸序列具有抗原特異性。在本發明之實施例中,突變人類RAS胺基酸序列為突變人類KRAS胺基酸序列、突變人類HRAS胺基酸序列或突變人類NRAS胺基酸序列。WT人類KRAS、NRAS及HRAS蛋白之胺基酸序列之長度各為188至189個胺基酸殘基且高度彼此一致。舉例而言,WT人類NRAS蛋白之胺基酸序列與WT人類KRAS蛋白之胺基酸序列86.8%一致。WT人類NRAS蛋白及WT人類KRAS蛋白之胺基酸殘基1-86為100%一致。WT人類HRAS蛋白之胺基酸序列與WT人類KRAS蛋白之胺基酸序列86.3%一致。WT人類HRAS蛋白及WT人類KRAS蛋白之胺基酸殘基1-94為100%一致。在下文中,除非另外規定,否則提及「RAS」(突變或未突變(WT))總體係指KRAS、HRAS及NRAS。
在本發明之實施例中,突變人類RAS胺基酸序列包含在位置12處具有甘胺酸取代之WT RAS胺基酸序列,其中位置12係藉由分別參考WT RAS蛋白來定義。WT RAS蛋白可為以下中之任一者:WT KRAS蛋白(SEQ ID NO: 9或10)、WT HRAS蛋白(SEQ ID NO: 11)或WT NRAS蛋白(SEQ ID NO: 12),因為如上文所解釋,WT人類NRAS蛋白及WT人類KRAS蛋白之胺基酸殘基1-86為100%一致,且WT人類HRAS蛋白及WT人類KRAS蛋白之胺基酸殘基1-94為100%一致。因此,WT KRAS、WT HRAS及WT NRAS蛋白中之每一者的在位置12處之胺基酸殘基為相同的,亦即甘胺酸。
WT RAS胺基酸序列之位置12處之甘胺酸可經除甘胺酸外之任何胺基酸殘基取代。在本發明之實施例中,取代為用纈胺酸取代WT RAS胺基酸序列之位置12處之甘胺酸。就此而言,本發明之實施例提供對含有G12V突變的任何WT RAS蛋白、多肽或肽胺基酸序列具有抗原特異性之TCR。
RAS之突變及取代在本文中係藉由參考WT RAS蛋白之胺基酸序列而定義。因此,RAS之突變及取代在本文中係藉由參考存在於WT RAS蛋白中之特定位置處的胺基酸殘基,之後加上位置編號,之後為所論述之特定突變或取代中用以置換彼殘基的胺基酸殘基來描述。RAS胺基酸序列(例如,RAS肽)可包含少於全長WT RAS蛋白之所有胺基酸殘基。因此,位置12在本文中係參考WT全長RAS蛋白(亦即,SEQ ID NO: 9-12中之任一者)來定義,同時理解RAS胺基酸序列之特定實例中對應殘基之實際位置可能不同。當位置係藉由SEQ ID NO: 9-12中之任一者來定義時,術語「G12」係指通常存在於SEQ ID NO: 9-12中之任一者之位置12處之甘胺酸,且「G12V」表示通常存在於SEQ ID NO: 9-12中之任一者之位置12處之甘胺酸經纈胺酸置換。舉例而言,當RAS胺基酸序列之特定實例為例如TEYKLVVVGA G
GVGKSALTIQLI (SEQ ID NO: 28) (對應於SEQ ID NO: 9之連續胺基酸殘基2至24的例示性WT RAS肽)時,「G12V」係指SEQ ID NO: 28中加底線之甘胺酸經纈胺酸取代,即使SEQ ID NO: 28中加底線之甘胺酸之實際位置為11。含有G12V突變之人類RAS胺基酸序列在下文中稱為「G12V RAS」
含有G12V突變之全長RAS蛋白之實例闡述於下表1中。
表1
突變全長RAS 蛋白 | SEQ ID NO: |
G12V KRAS變體A | 13 |
G12V KRAS變體B | 14 |
G12V HRAS | 15 |
G12V NRAS | 16 |
在本發明之實施例中,TCR對含有上文所描述之G12V突變的RAS肽具有抗原特異性,其中突變RAS肽具有任何長度。在本發明之實施例中,突變RAS肽具有適合於與本文所描述之任何HLA第II類分子結合的任何長度。舉例而言,TCR可對含有G12V突變之RAS肽具有抗原特異性,RAS肽之長度為約24個胺基酸殘基。突變RAS肽可包含包括G12V突變之突變RAS蛋白之任何連續胺基酸殘基。在本發明之實施例中,TCR可對含有G12V突變的RAS肽具有抗原特異性,突變RAS肽之長度為約24個胺基酸殘基。可由本發明G12V TCR識別的含有G12V之特定肽之實例為24-mer MTEYKLVVVGAVGVGKSALTIQLI (SEQ ID NO: 30),其SEQ ID NO: 27為該肽之WT型式。在本發明之實施例中,TCR對SEQ ID NO: 30之突變人類RAS胺基酸序列具有抗原特異性。在本發明之一實施例中,TCR對SEQ ID NO: 27之野生型人類RAS胺基酸序列不具有抗原特異性。不希望受理論所束縛,24-mer之SEQ ID NO: 30可經加工且以較小區段呈現。
在本發明之實施例中,本發明TCR能夠識別由HLA第II類分子呈現之突變RAS。就此而言,TCR可在於HLA第II類分子之環境內與突變RAS結合後引發免疫反應。除突變RAS以外,本發明TCR可與HLA第II類分子結合。
在本發明之一實施例中,HLA第II類分子為HLA-DP分子。HLA-DP分子為α鏈(DPA)及β鏈(DPB)之異二聚體。HLA-DPA鏈可為任何HLA-DPA鏈。HLA-DPB鏈可為任何HLA-DPB鏈。在本發明之一實施例中,HLA第II類分子為HLA-DPA1鏈及HLA-DPB1鏈之異二聚體。HLA-DPA1分子之實例可包括但不限於由HLA-DPA1* 01:03或02:02等位基因編碼的分子。HLA-DPB1分子之實例可包括但不限於由HLA-DPB1* 03:01等位基因編碼之分子。較佳地,HLA第II類分子為HLA-DPA1* 01:03或02:02鏈及HLA-DPB1*03:01鏈之異二聚體。
本發明之TCR可提供多種優點中之任一或多者,包括在由細胞表現時用於過繼細胞轉移。突變RAS由癌細胞表現且不由正常非癌細胞表現。不受特定理論或機制束縛,咸信本發明TCR有利地靶向癌細胞之破壞,同時使正常非癌細胞之破壞減至最少或使其消除,從而降低毒性。此外,本發明之TCR可有利地成功治療或預防對諸如化學療法、手術或放射之其他類型之治療無反應的突變RAS陽性癌症。RASG12
突變為發現於許多癌症類型中之最常見熱點突變。舉例而言,KRAS G12V突變分別表現於約27%之胰臟癌患者及約9%之大腸直腸癌患者中。此外,RAS家族成員在不同癌症類型中共有G12熱點突變(例如黑素瘤中之NRAS)。另外,本發明TCR可提供對突變RAS之高度親合識別,其可提供識別未經操縱之腫瘤細胞(例如,尚未用干擾素(IFN)-γ處理、用編碼突變RAS及HLA-DPB1*03:01中之一或兩者的載體轉染、用含有G12V突變之RAS肽脈衝之腫瘤細胞或其組合)之能力。此外,HLA-DPB1*03:01等位基因表現於美國的約19%之白種人中。因此,本發明TCR可增加符合免疫療法條件的癌症患者之數目以包括彼等表現HLA-DPB1*03:01等位基因之患者,該等患者可能不符合使用識別由其他MHC分子呈現之RAS的TCR進行免疫療法的條件。此外,本發明TCR、多肽及蛋白質包含人類胺基酸序列,與例如包含小鼠胺基酸序列之TCR、多肽及蛋白質相比,本發明TCR、多肽及蛋白質可降低人類免疫系統排斥之風險。
如本文所用之片語「抗原特異性」意謂TCR可以高親合力特異性結合於突變RAS且免疫識別突變RAS。舉例而言,若表現TCR之約1×104
至約1×105
個T細胞在與(a)用低濃度之突變RAS肽(例如,約0.05 ng/mL至約10 ng/mL、1 ng/mL、2 ng/mL、5 ng/mL、8 ng/mL、10 ng/mL或由任何兩個前述值定義之範圍)脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞或(b)其中已引入編碼突變RAS之核苷酸序列以使得目標細胞表現突變RAS之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養後分泌至少約200 pg/mL或更高(例如,200 pg/mL或更高、300 pg/mL或更高、400 pg/mL或更高、500 pg/mL或更高、600 pg/mL或更高、700 pg/mL或更高、1000 pg/mL或更高、5,000 pg/mL或更高、7,000 pg/mL或更高、10,000 pg/mL或更高、20,000 pg/mL或更高或由任何兩個前述值定義之範圍)之IFN-γ,則TCR可被視為對突變RAS具有「抗原特異性」。表現本發明TCR的細胞亦可在與用較高濃度之突變RAS肽脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養後分泌IFN-γ。HLA第II類分子可為本文所描述之HLA第II類分子中之任一者(例如HLA-DPB1*03:01分子)。
或者或另外,若與由陰性對照表現之IFN-γ的量相比,表現TCR之T細胞在與(a)用低濃度之突變RAS肽脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞或(b)其中已引入編碼突變RAS之核苷酸序列以使得目標細胞表現突變RAS的抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養後分泌至少兩倍之IFN-γ,則TCR可被視為對突變RAS具有「抗原特異性」。陰性對照可為例如(i)表現TCR之T細胞,其與(a)用相同濃度之不相關肽(例如,與突變RAS肽具有不同序列之某一其他肽)脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞或(b)其中已引入編碼不相關肽之核苷酸序列以使得目標細胞表現不相關肽的抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養;或(ii)未經轉導之T細胞(例如,來源於PBMC,其不表現TCR),其與(a)用相同濃度之突變RAS肽脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞或(b)其中已引入編碼突變RAS之核苷酸序列以使得目標細胞表現突變RAS之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養。由陰性對照之目標細胞表現之HLA第II類分子將為由與所測試T細胞共培養之目標細胞表現之相同HLA第II類分子。HLA第II類分子可為本文所描述之HLA第II類分子中之任一者(例如HLA-DPB1*03:01分子)。IFN-γ分泌可藉由此項技術中已知之方法來量測,諸如酶聯免疫吸附分析(ELISA)。
或者或另外,若與分泌IFN-γ之陰性對照T細胞的數目相比,表現TCR之T細胞在與(a)用低濃度之突變RAS肽脈衝之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞或(b)其中已引入編碼突變RAS之核苷酸序列以使得目標細胞表現突變RAS之抗原陰性、HLA第II類分子陽性目標細胞共培養後分泌至少兩倍數目之IFN-γ,則TCR可被視為對突變RAS具有「抗原特異性」。HLA第II類分子、肽之濃度及陰性對照可如本文中關於本發明之其他態樣所描述。分泌IFN-γ之細胞的數目可藉由此項技術中已知之方法來量測,諸如ELISPOT。
或者或另外,若表現TCR之T細胞如例如在用表現突變RAS之目標細胞刺激後藉由流式細胞量測術所量測上調一或多種T細胞活化標記之表現,則TCR可被視為對突變RAS具有「抗原特異性」。T細胞活化標記之實例包括4-1BB、OX40、CD107a、CD69及在抗原刺激後上調之細胞介素(例如,腫瘤壞死因子(TNF)、介白素(IL)-2等)。
本發明之一實施例提供一種TCR,其包含兩種多肽(亦即多肽鏈),諸如TCR之α鏈、TCR的β鏈、TCR之γ鏈、TCR的δ鏈或其組合。本發明TCR之多肽可包含任何胺基酸序列,其限制條件為TCR對突變RAS具有抗原特異性。在一些實施例中,TCR為非天然存在的。
在本發明之一實施例中,TCR包含兩個多肽鏈,其中之每一者包含可變區,該可變區包含TCR之互補決定區(CDR) 1、CDR2及CDR3。在本發明之一實施例中,TCR包含:第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含含有SEQ ID NO: 1之胺基酸序列的CDR1 (α鏈之CDR1)、含有SEQ ID NO: 2之胺基酸序列的CDR2 (α鏈之CDR2)及含有SEQ ID NO: 3之胺基酸序列的CDR3 (α鏈之CDR3);及第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含含有SEQ ID NO: 4之胺基酸序列的CDR1 (β鏈之CDR1)、含有SEQ ID NO: 5之胺基酸序列的CDR2 (β鏈之CDR2)及含有SEQ ID NO: 6之胺基酸序列的CDR3 (β鏈之CDR3)。
在本發明之另一實施例中,TCR包含第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含含有SEQ ID NO: 31之胺基酸序列的CDR1 (α鏈之CDR1)、含有SEQ ID NO: 32之胺基酸序列的CDR2 (α鏈之CDR2)及含有SEQ ID NO: 33之胺基酸序列的CDR3 (α鏈之CDR3);及第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含含有SEQ ID NO: 34之胺基酸序列的CDR1 (β鏈之CDR1)、含有SEQ ID NO: 35之胺基酸序列的CDR2(β鏈之CDR2)及含有SEQ ID NO: 36之胺基酸序列的CDR3 (β鏈之CDR3)。
就此而言,本發明TCR可包含選自SEQ ID NO: 1-6及31-36之任何一或多個胺基酸序列。在本發明之一實施例中,TCR包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 1-3全部,(b) SEQ ID NO: 4-6全部,(c) SEQ ID NO: 31-33全部,(d) SEQ ID NO: 34-36全部,(e) SEQ ID NO: 1-6全部,或(f) SEQ ID NO: 31-36全部。在一尤佳實施例中,TCR包含以下之胺基酸序列:(i) SEQ ID NO: 1-6全部或(ii) SEQ ID NO: 31-36全部。
SEQ ID NO: 3、6、33或36中之任一或多者(亦即α鏈或β鏈或兩者)之CDR3可進一步包含緊接CDR之第一胺基酸之N端的半胱胺酸或緊接最終胺基酸之C端的苯丙胺酸或兩者。
在本發明之實施例中,TCR包含含有上述CDR的TCR之可變區之胺基酸序列。TCR可包含人類可變區,例如人類α鏈可變區及人類β鏈可變區。就此而言,TCR可包含以下胺基酸序列:SEQ ID NO: 7 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 129 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 8 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1β鏈之可變區);SEQ ID NO: 37 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 38 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 47 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 48 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 49 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 50 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 63 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 130 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 64 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 67 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 68 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 72 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 73 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 65 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 66 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 69 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 70 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 71 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 76 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之替代可變區);SEQ ID NO: 102 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之替代可變區);SEQ ID NO: 7及8兩者;SEQ ID NO: 129及8兩者;SEQ ID NO: 63及8兩者;SEQ ID NO: 130及8兩者;SEQ ID NO: 7及64兩者;SEQ ID NO: 129及64兩者;SEQ ID NO: 63及64兩者;SEQ ID NO: 130及64兩者;SEQ ID NO: 7及65兩者;SEQ ID NO: 129及65兩者;SEQ ID NO: 63及65兩者;SEQ ID NO: 130及65兩者;SEQ ID NO: 7及66兩者;SEQ ID NO: 129及66兩者;SEQ ID NO: 63及66兩者;SEQ ID NO: 130及66兩者;SEQ ID NO: 37及38兩者;SEQ ID NO: 37及69兩者;SEQ ID NO: 37及70兩者;SEQ ID NO: 37及71兩者;SEQ ID NO: 47及48兩者;SEQ ID NO: 67及68兩者;SEQ ID NO: 67及76兩者;SEQ ID NO: 49及50兩者;SEQ ID NO: 72及73兩者;或SEQ ID NO: 72及102兩者。較佳地,TCR包含以下之胺基酸序列:(i) SEQ ID NO: 7及8兩者;(ii) SEQ ID NO: 63及64兩者;(iii) SEQ ID NO: 7及65兩者;(iv) SEQ ID NO: 63及66兩者;(v) SEQ ID NO: 37及38兩者;(vi) SEQ ID NO: 37及70兩者;(vii) SEQ ID NO: 47及48兩者;(viii) SEQ ID NO: 67及68兩者;(ix) SEQ ID NO: 67及76兩者;(x) SEQ ID NO: 49及50兩者;(xi) SEQ ID NO: 72及73兩者;或(xii) SEQ ID NO: 72及102兩者。
本發明TCR可進一步包含α鏈恆定區及β鏈恆定區。恆定區可來源於諸如人類或小鼠之任何適合物種。在本發明之實施例中,TCR進一步包含鼠類α鏈恆定區及β鏈恆定區或人類α鏈恆定區及β鏈恆定區。如本文所用,當提及本文所描述之TCR或TCR之任何組分(例如互補決定區(CDR)、可變區、恆定區、α鏈及/或β鏈)時,術語「鼠類」或「人類」分別意謂來源於小鼠或人類的TCR (或其組分),亦即分別來源於小鼠T細胞或人類T細胞或曾經由小鼠T細胞或人類T細胞表現之TCR (或其組分)。
本發明之一實施例提供一種嵌合TCR,其包含人類可變區及鼠類恆定區,其中TCR對由HLA第II類分子呈現之突變人類RAS胺基酸序列具有抗原特異性。鼠類恆定區可提供任何一或多個優點。舉例而言,鼠類恆定區可減少本發明TCR與引入有本發明TCR之宿主細胞的內源性TCR之間的錯配。或者或另外,與具有人類恆定區之相同TCR相比,鼠類恆定區可增加本發明TCR的表現。嵌合TCR可包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列(野生型(WT)鼠類α鏈恆定區)、SEQ ID NO: 20 (WT鼠類β鏈恆定區)、SEQ ID NO: 74之胺基酸序列(變體鼠類α鏈恆定區)、SEQ ID NO: 75 (變體鼠類β鏈恆定區)或SEQ ID NO: 19及20兩者或74及75兩者。較佳地,本發明TCR包含SEQ ID NO: 19及20兩者或74及75兩者之胺基酸序列。嵌合TCR可包含本文所描述之鼠類恆定區中之任一者與如本文中關於本發明之其他態樣所描述之CDR區中之任一者的組合。就此而言,TCR例如可包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 1-3及19全部;(b) SEQ ID NO: 4-6及20全部;(c) SEQ ID NO: 1-3及74全部;(d) SEQ ID NO: 4-6及75全部;(e) SEQ ID NO: 31-33及19全部;(f) SEQ ID NO: 34-36及20全部;(g) SEQ ID NO: 31-33及74全部;(h) SEQ ID NO: 34-36及75全部;(i) SEQ ID NO: 1-6及19-20全部;(j) SEQ ID NO: 1-6及74-75全部;(k) SEQ ID NO: 31-36及19-20全部;或(l) SEQ ID NO: 31-36及74-75全部。在本發明之另一實施例中,嵌合TCR可包含本文所描述之鼠類恆定區中之任一者與本文中關於本發明之其他態樣所描述之可變區中之任一者的組合。就此而言,TCR例如可包含以下之胺基酸序列:(i) SEQ ID NO: 7及19兩者;(ii) SEQ ID NO: 129及19兩者;(iii) SEQ ID NO: 8及20兩者;(iv) SEQ ID NO: 7及74兩者;(v) SEQ ID NO: 129及74兩者;(vi) SEQ ID NO: 8及75兩者;(vii) SEQ ID NO: 37及19兩者;(viii) SEQ ID NO: 38及20兩者;(ix) SEQ ID NO: 37及74兩者;(x) SEQ ID NO: 38及75兩者;(xi) SEQ ID NO: 7-8及19-20全部;(xii) SEQ ID NO: 129、8及19-20全部;(xiii) SEQ ID NO: 37-38及19-20全部;(xiv) SEQ ID NO: 7-8及74-75全部;(xv) SEQ ID NO: 129、8及74-75全部;或(xvi) SEQ ID NO: 37-38及74-75全部。
在本發明之另一實施例中,TCR包含以下之胺基酸序列:SEQ ID NO: 23 (含有WT鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 133 (含有WT鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 24 (含有WT鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 39 (含有WT鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 40 (含有WT鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 51 (如使用IMGT預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 52 (如使用IMGT預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 53 (如使用IMGT預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 54 (如使用IMGT預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 77 (含有經取代之鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 132 (含有經取代之鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 78 (含有WT鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 81 (含有經取代之鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 135 (含有經取代之鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 82 (含有經取代之鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 83 (含有WT鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 136 (含有WT鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 84 (含有WT鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 91 (如使用IMGT預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 92 (如使用IMGT預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 95 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 96 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 97 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈)、SEQ ID NO: 98 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 86 (含有經取代之鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 87 (含有WT鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 89 (含有經取代之鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 90 (含有WT鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈)、SEQ ID NO: 100 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之替代β鏈)、SEQ ID NO: 101 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR1之替代β鏈)、SEQ ID NO: 103 (含有經取代之鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 104 (含有經取代之鼠類恆定區及變體N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 106 (含有經取代之鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 107 (含有WT鼠類恆定區及WT N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 108 (如使用IMGT預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 109 (如使用IMGT預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 118 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 119 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 120 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈)、SEQ ID NO: 121 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 111 (含有經取代之鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 112 (含有WT鼠類恆定區及替代變體N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 114 (含有經取代之鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 115 (含有鼠類恆定區及替代WT N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈)、SEQ ID NO: 123 (如使用SignalP預測的含有經取代之鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之替代β鏈)、SEQ ID NO: 124 (如使用SignalP預測的含有WT鼠類恆定區且不含N端訊息肽之4360 TCR5之替代β鏈)、SEQ ID NO: 23-24兩者、SEQ ID NO: 133-24兩者、SEQ ID NO: 39-40兩者、SEQ ID NO: 51-52兩者、SEQ ID NO: 53-54兩者、SEQ ID NO: 77-78兩者、SEQ ID NO: 132-78兩者、SEQ ID NO: 81-82兩者、SEQ ID NO: 135-82兩者、SEQ ID NO: 83-84兩者、SEQ ID NO: 136-84兩者、SEQ ID NO: 91-92兩者、SEQ ID NO: 95-96兩者、SEQ ID NO: 97-98兩者、SEQ ID NO: 103-104兩者、SEQ ID NO: 108-109兩者、SEQ ID NO: 118-119兩者、SEQ ID NO: 120-121兩者、SEQ ID NO: 23及90兩者、SEQ ID NO: 133及90、SEQ ID NO: 23及87兩者、SEQ ID NO: 133及87兩者、SEQ ID NO: 83及90兩者、SEQ ID NO: 136及90兩者、SEQ ID NO: 83及87兩者、SEQ ID NO: 136及87兩者、SEQ ID NO: 77及86兩者、SEQ ID NO: 132及86兩者、SEQ ID NO: 77及89兩者、SEQ ID NO: 132及89兩者、SEQ ID NO: 81及89兩者、SEQ ID NO: 135及89兩者、SEQ ID NO: 81及86兩者、SEQ ID NO: 135及86兩者、SEQ ID NO: 97及101兩者、SEQ ID NO: 95及100兩者、SEQ ID NO: 39及106兩者、SEQ ID NO: 39及112兩者、SEQ ID NO: 39及115兩者、SEQ ID NO: 103及107兩者、SEQ ID NO: 103及111兩者、SEQ ID NO: 103及114兩者、SEQ ID NO: 120及124兩者或SEQ ID NO: 118及123兩者。
在本發明之實施例中,TCR包含含有可變區及恆定區之α鏈及含有可變區及恆定區之β鏈。就此而言,TCR例如可包含:(a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的α鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的α鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈),其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys;(d)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的α鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(e)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈),其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys;(f) (a)及(c)兩者;(g) (b)及(c)兩者;(h) (d)及(e)兩者;(i)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的α鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(j)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的β鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈),其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys;(k)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的α鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(l)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的β鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈),其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys;(m) (i)及(j)兩者;(n) (k)及(l)兩者;(o)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的α鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(p)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的α鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(q)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈),其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys;(r)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈),其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys;(s) (o)及(q)兩者;(t) (p)及(q)兩者;(u) (d)及(r)兩者;(v)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的α鏈(如SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(w)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的β鏈(如SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1之β鏈),其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys;(x)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的α鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5之α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(y)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5之β鏈),其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys;(z) (v)及(w)兩者;(aa) (x)及(y)兩者;(bb)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys;(cc)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1之替代β鏈),其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys;(dd)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys;(ee) (a)及(bb)兩者;(ff) (b)及(bb)兩者;(gg) (o)及(cc)兩者;(hh) (p)及(cc)兩者;(ii) (v)及(dd)兩者;(jj)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5之替代β鏈),其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys;(kk)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5之替代β鏈),其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys;(ll)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5之替代β鏈),其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys;(mm) (d)及(jj)兩者;(nn) (d)及(kk)兩者;或(oo) (x)及(ll)兩者。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 21之TCR不包含SEQ ID NO: 23 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 131之TCR不包含SEQ ID NO: 133 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 22之TCR不包含SEQ ID NO: 24 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 41之TCR不包含SEQ ID NO: 39 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 42之TCR不包含SEQ ID NO: 40 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 55之TCR不包含SEQ ID NO: 51 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 56之TCR不包含SEQ ID NO: 52 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 57之TCR不包含SEQ ID NO: 53 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 58之TCR不包含SEQ ID NO: 54 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 79之TCR不包含SEQ ID NO: 83 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 134之TCR不包含SEQ ID NO: 136 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 80之TCR不包含SEQ ID NO: 84 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 93之TCR不包含SEQ ID NO: 97 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 94之TCR不包含SEQ ID NO: 98 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 85之TCR不包含SEQ ID NO: 87 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 88之TCR不包含SEQ ID NO: 90 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 99之TCR不包含SEQ ID NO: 101 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 116之TCR不包含SEQ ID NO: 120 (未經取代之α鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 117之TCR不包含SEQ ID NO: 121 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 105之TCR不包含SEQ ID NO: 107 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 110之TCR不包含SEQ ID NO: 112 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 113之TCR不包含SEQ ID NO: 115 (未經取代之β鏈)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 122之TCR不包含SEQ ID NO: 124 (未經取代之β鏈)。
本文所描述之小鼠α恆定區中之任一者之第一胺基酸可不同於如SEQ ID NO: 17及19中所提供之N。舉例而言,在如本文所描述之任何TCR構築體、多肽、蛋白質等中,此第一胺基酸可由分裂密碼子(具有來自可變區及恆定區兩者之核苷酸)編碼,使得鼠類α恆定區中之任一者可在彼位置具有不同胺基酸。類似地,本文所描述之小鼠β恆定區中之任一者之第一胺基酸可不同於如SEQ ID NO: 18及20中所提供之E,例如此第一胺基酸可由分裂密碼子編碼。
在本發明之實施例中,TCR包含經取代之恆定區。就此而言,TCR例如可包含在α鏈及β鏈中之一或兩者的恆定區中具有一個、二個、三個或四個胺基酸取代的本文所描述之任何TCR之胺基酸序列。較佳地,TCR包含在α鏈及β鏈中之一或兩者的鼠類恆定區中具有一個、二個、三個或四個胺基酸取代之鼠類恆定區。在一尤佳實施例中,TCR包含在α鏈之鼠類恆定區中具有一個、二個、三個或四個胺基酸取代且在β鏈之鼠類恆定區中具有一個胺基酸取代的鼠類恆定區。在一些實施例中,與包含未經取代之(野生型)恆定區的親本TCR相比,包含經取代之恆定區的TCR有利地提供以下中之一或多者:突變RAS+
目標之識別增加、宿主細胞之表現增加、與內源性TCR之錯配減少及抗腫瘤活性增加。一般而言,TCR α鏈及β鏈之鼠類恆定區之經取代胺基酸序列(SEQ ID NO: 17及18)分別對應於未經取代之鼠類恆定區胺基酸序列SEQ ID NO: 19及20之全部或部分,SEQ ID NO: 17與SEQ ID NO: 19相比具有一個、兩個三個或四個胺基酸取代,且SEQ ID NO: 18與SEQ ID NO: 20相比具有一個胺基酸取代。就此而言,本發明之一實施例提供一種TCR,其包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 17 (α鏈之恆定區),其中(i)位置48處之X為Thr或Cys;(ii)位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii)位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及(iv)位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b) SEQ ID NO: 18 (β鏈之恆定區),其中位置57處之X為Ser或Cys;或(c) SEQ ID NO: 17及18兩者。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 17之TCR不包含SEQ ID NO: 19 (α鏈之未經取代鼠類恆定區)。在本發明之實施例中,包含SEQ ID NO: 18之TCR不包含SEQ ID NO: 20 (β鏈之未經取代鼠類恆定區)。
在本發明之實施例中,經取代恆定區包括α鏈及β鏈中之一或兩者的恆定區中之半胱胺酸取代,以提供半胱胺酸經取代之TCR。α鏈及β鏈中相對之半胱胺酸提供二硫鍵,該二硫鍵將經取代TCR之α鏈及β鏈的恆定區彼此鍵聯且其不存在於包含未經取代鼠類恆定區之TCR中。就此而言,TCR可為經半胱胺酸取代TCR,其中SEQ ID NO: 19之位置48處之原生Thr (Thr48)及SEQ ID NO: 20之位置57處之原生Ser (Ser57)中之一或兩者可經Cys取代。較佳地,SEQ ID NO: 19之原生Thr48及SEQ ID NO: 20之原生Ser57兩者經Cys取代。經半胱胺酸取代之TCR恆定區序列之實例闡述於表2中。在本發明之實施例中,經半胱胺酸取代之TCR包含(i) SEQ ID NO: 17、(ii) SEQ ID NO: 18或(iii) SEQ ID NO: 17及18兩者,其中SEQ ID NO: 17及18兩者如表2中所定義。除本文所描述之任何CDR或可變區以外,本發明之經半胱胺酸取代之TCR亦可包括經取代之恆定區。
在本發明之實施例中,經半胱胺酸取代之嵌合TCR包含全長α鏈及全長β鏈。經半胱胺酸取代之嵌合TCR α鏈及β鏈序列之實例闡述於表2中。在本發明之實施例中,TCR包含:(i) SEQ ID NO: 21、(ii) SEQ ID NO: 131、(iii) SEQ ID NO: 22、(iv) SEQ ID NO: 41、(v) SEQ ID NO: 42、(vi) SEQ ID NO: 21及22兩者、(vii) SEQ ID NO: 131及22兩者、(viii) SEQ ID NO: 41及42兩者、(ix) SEQ ID NO: 55、(x) SEQ ID NO: 56、(xi) SEQ ID NO: 57、(xii) SEQ ID NO: 58、(xiii) SEQ ID NO: 55及56兩者或(xiv) SEQ ID NO: 57及58兩者、(xv) SEQ ID NO: 79、(xvi) SEQ ID NO: 134、(xvii) SEQ ID NO: 80、(xviii) SEQ ID NO: 105、(xix) SEQ ID NO: 79及80兩者、(xx) SEQ ID NO: 134及80兩者、(xxi) SEQ ID NO: 41及105兩者、(xxii) SEQ ID NO: 93、(xxiii) SEQ ID NO: 94、(xxiv) SEQ ID NO: 116、(xxv) SEQ ID NO: 117、(xxvi) SEQ ID NO: 93及94兩者、(xxvii) SEQ ID NO: 116及117兩者、(xxviii) SEQ ID NO: 85、(xxix) SEQ ID NO: 88、(xxx) SEQ ID NO: 99、(xxxi) SEQ ID NO: 21及85兩者、(xxxii) SEQ ID NO: 131及85兩者、(xxxiii) SEQ ID NO: 79及88兩者、(xxxiv) SEQ ID NO: 134及88兩者、(xxxv) SEQ ID NO: 93及99兩者、(xxxvi) SEQ ID NO: 110、(xxxvii) SEQ ID NO: 113、(xxxviii) SEQ ID NO: 122、(xxxix) SEQ ID NO: 41及110兩者、(xl) SEQ ID NO: 41及113兩者、(xli) SEQ ID NO: 116及122兩者,其中SEQ ID NO: 17、18、21、22、41、42、55-58、79、80、85、88、93、94、99、105、110、113、116、117、122、131及134全部如表2中所定義。
表2
SEQ ID NO: | 「X 」在一些實施例中之定義 |
SEQ ID NO: 17 (恆定區α鏈) | 位置48處之X為Cys, 位置112處之X為Ser, 位置114處之X為Met,且 位置115處之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 18 (恆定區β鏈) | 位置57處之X為Cys |
SEQ ID NO: 21 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置179處之X為Cys, 位置243處之X為Ser, 位置245處之X為Met,且 位置246處之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 131 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置180處之X為Cys, 位置244處之X為Ser, 位置246處之X為Met,且 位置247處之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 22 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置198處之X為Cys |
SEQ ID NO: 85 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置187處之X為Cys |
SEQ ID NO: 79 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置處179之X為Cys, 位置處243之X為Ser, 位置處245之X為Met,且 位置處246之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 134 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置處180之X為Cys, 位置處244之X為Ser, 位置處246之X為Met,且 位置處247之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 80 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置處198之X為Cys |
SEQ ID NO: 88 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置處187之X為Cys |
SEQ ID NO: 41 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置處179之X為Cys, 位置處243之X為Ser, 位置處245之X為Met,且 位置處246之X為Gly。 |
SEQ ID NO:42 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置處197之X為Cys |
SEQ ID NO:110 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置處186之X為Cys |
SEQ ID NO:105 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置處197之X為Cys |
SEQ ID NO:113 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置處186之X為Cys |
SEQ ID NO: 55 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置處160之X為Cys, 位置處224之X為Ser, 位置處226之X為Met,且 位置處227之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 56 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置處173之X為Cys |
SEQ ID NO: 57 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置處159之X為Cys, 位置處223之X為Ser, 位置處225之X為Met,且 位置處226之X為Gly。 |
SEQ ID NO:58 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置處172之X為Cys |
SEQ ID NO: 93 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置處159之X為Cys, 位置處223之X為Ser, 位置處225之X為Met,且 位置處226之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 94 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置處177之X為Cys |
SEQ ID NO: 99 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置處172之X為Cys |
SEQ ID NO: 116 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置處158之X為Cys, 位置處222之X為Ser, 位置處224之X為Met,且 位置處225之X為Gly。 |
SEQ ID NO: 117 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置處176之X為Cys |
SEQ ID NO: 122 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置處171之X為Cys |
在本發明之實施例中,經取代之胺基酸序列包括用疏水性胺基酸取代α鏈之恆定區之跨膜(TM)域中的一個、兩個或三個胺基酸,以提供經疏水性胺基酸取代之TCR(在本文中亦稱為「經LVL修飾之TCR」)。與TM域中沒有疏水性胺基酸取代之TCR相比,TCR之TM域中之疏水性胺基酸取代可以增加TCR之TM域之疏水性。就此而言,TCR為經LVL修飾之TCR,其中SEQ ID NO: 19之原生Ser112、Met114及Gly115中之一者、兩者或三者可獨立地經Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp取代;較佳經Leu、Ile或Val取代;且SEQ ID NO: 20之原生Ser57可經Cys取代。較佳地,SEQ ID NO: 19之全部三個原生Ser112、Met114及Gly115可獨立地經Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;較佳地經Leu、Ile或Val取代。在本發明之實施例中,經LVL修飾之TCR包含(i) SEQ ID NO: 17、(ii) SEQ ID NO: 18或(iii) SEQ ID NO: 17及18兩者,其中SEQ ID NO: 17及18兩者如表3中所定義。除本文所描述之任何CDR或可變區以外,本發明之經LVL修飾之TCR亦可包括經取代之恆定區。
在本發明之實施例中,經LVL修飾之TCR包含全長α鏈及全長β鏈。經LVL修飾之TCR α鏈及β鏈序列之實例闡述於表3中。在本發明之實施例中,經LVL修飾之TCR包含(i) SEQ ID NO: 21、(ii) SEQ ID NO: 131、(iii) SEQ ID NO: 22、(iv) SEQ ID NO: 41、(v) SEQ ID NO: 42、(vi) SEQ ID NO: 21及22兩者、(vii) SEQ ID NO: 131及22兩者、(viii) SEQ ID NO: 41及42兩者、(ix) SEQ ID NO: 55、(x) SEQ ID NO: 56、(xi) SEQ ID NO: 57、(xii) SEQ ID NO: 58、(xiii) SEQ ID NO: 55及56兩者或(xiv) SEQ ID NO: 57及58兩者、(xv) SEQ ID NO: 79、(xvi) SEQ ID NO: 134、(xvii) SEQ ID NO: 80、(xviii) SEQ ID NO: 105、(xix) SEQ ID NO: 79及80兩者、(xx) SEQ ID NO: 134及80兩者、(xxi) SEQ ID NO: 41及105兩者、(xxii) SEQ ID NO: 93、(xxiii) SEQ ID NO: 94、(xxiv) SEQ ID NO: 116、(xxv) SEQ ID NO: 117、(xxvi) SEQ ID NO: 93及94兩者、(xxvii) SEQ ID NO: 116及117兩者、(xxviii) SEQ ID NO: 85、(xxix) SEQ ID NO: 88、(xxx) SEQ ID NO: 99、(xxxi) SEQ ID NO: 21及85兩者、(xxxii) SEQ ID NO: 131及85兩者、(xxxiii) SEQ ID NO: 79及88兩者、(xxxiv) SEQ ID NO: 134及88兩者、(xxxv) SEQ ID NO: 93及99兩者、(xxxvi) SEQ ID NO: 110、(xxxvii) SEQ ID NO: 113、(xxxviii) SEQ ID NO: 122、(xxxix) SEQ ID NO: 41及110兩者、(xl) SEQ ID NO: 41及113兩者、(xli) SEQ ID NO: 116及122兩者,其中SEQ ID NO: 17、18、21、22、41、42、55-58、79、80、85、88、93、94、99、105、110、113、116、117、122、131及134全部如表3中所定義。
表3
SEQ ID NO: | 「X 」在一些實施例中之定義 |
SEQ ID NO: 17 (恆定區α鏈) | 位置48處之X為Thr; 位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置112處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置112處之X為Leu; 位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置114處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置114處之X為Ile;且 位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置115處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置115處之X為Val; 其中SEQ ID NO: 17不包含SEQ ID NO: 19 (α鏈之未經取代恆定區) |
SEQ ID NO: 18 (恆定區β鏈) | 位置57處之X為Ser |
SEQ ID NO: 21 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置179處之X為Thr; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 21不包含SEQ ID NO: 23 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 131 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置180處之X為Thr; 位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 131不包含SEQ ID NO: 133 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 22 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置198處之X為Ser |
SEQ ID NO: 85 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置187處之X為Ser |
SEQ ID NO: 79 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置179處之X為Thr; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 79不包含SEQ ID NO: 83 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 134 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置180處之X為Thr; 位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 134不包含SEQ ID NO: 136 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 80 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置198處之X為Ser |
SEQ ID NO: 88 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置187處之X為Ser |
SEQ ID NO: 41 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置179處之X為Thr; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 41不包含SEQ ID NO: 39 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 42 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置197處之X為Ser |
SEQ ID NO:110 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置186處之X為Ser |
SEQ ID NO:105 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置197處之X為Ser |
SEQ ID NO:113 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置186處之X為Ser |
SEQ ID NO: 55 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置160處之X為Thr; 位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置224處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置224處之X為Leu; 位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置226處之X為Ile;且 位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置227處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置227處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 55不包含SEQ ID NO: 51 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 56 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置173處之X為Ser |
SEQ ID NO: 57 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置159處之X為Thr; 位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 57不包含SEQ ID NO: 53 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 58 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置172處之X為Ser |
SEQ ID NO: 93 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置159處之X為Thr; 位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 93不包含SEQ ID NO: 95 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 94 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置177處之X為Ser |
SEQ ID NO: 99 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置172處之X為Ser |
SEQ ID NO: 116 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置158處之X為Thr; 位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 116不包含SEQ ID NO: 120 (未經取代之α鏈) |
SEQ ID NO: 117 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置176處之X為Ser |
SEQ ID NO: 122 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置177處之X為Ser |
在本發明之實施例中,經取代之胺基酸序列包括α鏈及β鏈中之一者或兩者之恆定區中的半胱胺酸取代與α鏈之恆定區的跨膜(TM)域中的一個、兩個或三個胺基酸經疏水性胺基酸取代的組合(在本文中亦稱為「經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR」)。就此而言,TCR為經半胱胺酸取代、經LVL修飾之嵌合TCR,其中SEQ ID NO: 19之原生Thr48經Cys取代;SEQ ID NO: 19之原生Ser112、Met114及Gly115中之一者、二者或三者獨立地經Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;較佳地經Leu、Ile或Val取代;且SEQ ID NO: 20之原生Ser57經Cys取代。較佳地,SEQ ID NO: 19之全部三個原生Ser112、Met114及Gly115可獨立地經Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;較佳地經Leu、Ile或Val取代。在本發明之實施例中,經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR包含(i) SEQ ID NO: 17、(ii) SEQ ID NO: 18或(iii) SEQ ID NO: 17及18兩者,其中SEQ ID NO: 17及18兩者如表4中所定義。除本文所描述之任何CDR或可變區以外,本發明之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR亦可包括經取代之恆定區。
在實施例中,經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR包含全長α鏈及全長β鏈。在本發明之實施例中,經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR包含:(i) SEQ ID NO: 21、(ii) SEQ ID NO: 131、(iii) SEQ ID NO: 22、(iv) SEQ ID NO: 41、(v) SEQ ID NO: 42、(vi) SEQ ID NO: 21及22兩者、(vii) SEQ ID NO: 131及22兩者、(viii) SEQ ID NO: 41及42兩者、(ix) SEQ ID NO: 55、(x) SEQ ID NO: 56、(xi) SEQ ID NO: 57、(xii) SEQ ID NO: 58、(xiii) SEQ ID NO: 55及56兩者或(xiv) SEQ ID NO: 57及58兩者、(xv) SEQ ID NO: 79、(xvi) SEQ ID NO: 134、(xvii) SEQ ID NO: 80、(xviii) SEQ ID NO: 105、(xix) SEQ ID NO: 79及80兩者、(xx) SEQ ID NO: 134及80兩者、(xxi) SEQ ID NO: 41及105、(xxii) SEQ ID NO: 93、(xxiii) SEQ ID NO: 94、(xxiv) SEQ ID NO: 116、(xxv) SEQ ID NO: 117、(xxvi) SEQ ID NO: 93及94兩者、(xxvii) SEQ ID NO: 116及117兩者、(xxviii) SEQ ID NO: 85、(xxix) SEQ ID NO: 88、(xxx) SEQ ID NO: 99、(xxxi) SEQ ID NO: 21及85兩者、(xxxii) SEQ ID NO: 131及85兩者、(xxxiii) SEQ ID NO: 79及88兩者、(xxxiv) SEQ ID NO: 134及88兩者、(xxxv) SEQ ID NO: 93及99兩者、(xxxvi) SEQ ID NO: 110、(xxxvii) SEQ ID NO: 113、(xxxviii) SEQ ID NO: 122、(xxxix) SEQ ID NO: 41及110兩者、(xl) SEQ ID NO: 41及113兩者、(xli) SEQ ID NO: 116及122兩者,其中SEQ ID NO: 17、18、21、22、41、42、55-58、79、80、85、88、93、94、99、105、110、113、116、117、122、131及134全部如表4中所定義。
表4
SEQ ID NO: | 「X 」在一些實施例中之定義 |
SEQ ID NO: 17 (恆定區α鏈) | 位置48處之X為Cys; 位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置112處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置112處之X為Leu; 位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置114處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置114處之X為Ile;且 位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置115處之X為Leu、Ile或Val; 及尤佳地其中位置115處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 17不同時包含以下全部:位置112處之Ser、位置114處之Met及位置115處之Gly。 |
SEQ ID NO: 18 (恆定區β鏈) | 位置57處之X為Cys |
SEQ ID NO: 21 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置179處之X為Cys; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 21不同時包含以下全部:位置243處之Ser、位置245處之Met及位置246處之Gly。 |
SEQ ID NO: 131 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置180處之X為Cys; 位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 131不同時包含以下全部:位置244處之Ser、位置246處之Met及位置247處之Gly。 |
SEQ ID NO: 22 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置198處之X為Cys |
SEQ ID NO: 85 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置187處之X為Cys |
SEQ ID NO: 79 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置179處之X為Cys; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 79不同時包含以下全部:位置243處之Ser、位置245處之Met及位置246處之Gly。 |
SEQ ID NO: 134 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置180處之X為Cys; 位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 134不同時包含以下全部:位置244處之Ser、位置246處之Met及位置247處之Gly。 |
SEQ ID NO: 80 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置198處之X為Cys |
SEQ ID NO: 88 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置187處之X為Cys |
SEQ ID NO: 41 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置179處之X為Cys; 位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置243處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置243處之X為Leu; 位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置245處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置245處之X為Ile;且 位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置246處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置246處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 41不同時包含以下全部:位置243處之Ser、位置245處之Met及位置246處之Gly。 |
SEQ ID NO: 42 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置197處之X為Cys |
SEQ ID NO:110 (含有變體N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置186處之X為Cys |
SEQ ID NO:105 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置197處之X為Cys |
SEQ ID NO:113 (含有WT N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置186處之X為Cys |
SEQ ID NO: 55 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置160處之X為Cys; 位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置224處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置224處之X為Leu; 位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置226處之X為Ile;且 位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置227處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置227處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 55不同時包含以下全部:位置224處之Ser、位置226處之Met及位置227處之Gly。 |
SEQ ID NO: 56 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置173處之X為Cys |
SEQ ID NO: 57 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置159處之X為Cys; 位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 57不同時包含以下全部:位置223處之Ser、位置225處之Met及位置226處之Gly。 |
SEQ ID NO: 58 (如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置172處之X為Cys |
SEQ ID NO: 93 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈) | 位置159處之X為Cys; 位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 93不同時包含以下全部:位置223處之Ser、位置225處之Met及位置226處之Gly。 |
SEQ ID NO: 94 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈) | 位置177處之X為Cys |
SEQ ID NO: 99 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR1 β鏈) | 位置172處之X為Cys |
SEQ ID NO: 116 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈) | 位置158處之X為Cys; 位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置223處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置223處之X為Leu; 位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp; 較佳地其中位置225處之X為Leu、Ile或Val; 尤佳地其中位置225處之X為Ile;且 位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; 較佳地其中位置226處之X為Leu、Ile或Val; 且尤佳地其中位置226處之X為Val, 其中SEQ ID NO: 116不同時包含以下全部:位置223處之Ser、位置225處之Met及位置226處之Gly。 |
SEQ ID NO: 117 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈) | 位置176處之X為Cys |
SEQ ID NO: 122 (如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之替代4360 TCR5 β鏈) | 位置171處之X為Cys |
在本發明之一實施例中,經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR包含:(a) SEQ ID NO: 74 (經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR之α鏈恆定區);(b) SEQ ID NO: 75 (經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR之β鏈恆定區);(c) SEQ ID NO: 77 (含有WT N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(d) SEQ ID NO: 78 (含有變體N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(e) SEQ ID NO: 91 (藉由IMGT預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(f) SEQ ID NO: 92 (藉由IMGT預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(g) SEQ ID NO: 95 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(h) SEQ ID NO: 96 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(i) SEQ ID NO: 81 (含有變體N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(j) SEQ ID NO: 82 (含有WT N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(k) SEQ ID NO: 89 (含有WT N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的替代β鏈);(l) SEQ ID NO: 86 (含有變體N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(m) SEQ ID NO: 100 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的β鏈);(n) SEQ ID NO: 132 (含有替代WT N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(o) SEQ ID NO: 135 (含有替代變體N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR1的α鏈);(p) (a)及(b)兩者;(q) (c)及(d)兩者;(r) (e)及(f)兩者;(s) (g)及(h)兩者;(t) (i)及(j)兩者;(u) (i)及(k)兩者;(v) (c)及(l)兩者;(w) (g)及(m)兩者;(x) (n)及(d)兩者;或(o)及(j)兩者。
在本發明之一實施例中,經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR包含:(a) SEQ ID NO: 74 (經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR的α鏈恆定區);(b) SEQ ID NO: 75 (經半胱胺酸取代、經LVL修飾之TCR的β鏈恆定區);(c) SEQ ID NO: 103 (含有WT N端訊息序列的經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的α鏈);(d) SEQ ID NO: 104 (含有變體N端訊息序列的經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的β鏈);(e) SEQ ID NO: 108 (藉由IMGT預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的α鏈);(f) SEQ ID NO : 109 (藉由IMGT預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的β鏈);(g) SEQ ID NO: 118 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的α鏈);(h) SEQ ID NO: 119 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的β鏈);(j) SEQ ID NO: 106 (含有WT N端訊息序列的經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的β鏈);(k) SEQ ID NO: 114 (含有WT N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的替代β鏈);(l) SEQ ID NO: 111 (含有變體N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的替代β鏈);(m) SEQ ID NO: 123 (藉由SignalP預測的不含N端訊息序列之經半胱胺酸取代、經LVL修飾之4360 TCR5的替代β鏈);(n) (a)及(b)兩者;(o) (c)及(d)兩者;(p) (e)及(f)兩者;(q) (g)及(h)兩者;(r) (c)及(j)兩者;(s) (c)及(k)兩者;(t) (c)及(l)兩者;或(u) (g)及(m)兩者。
亦藉由本發明之一實施例提供一種多肽,其包含本文所描述之任何TCR之功能部分。如本文所用,術語「多肽」包括寡肽且係指由一或多個肽鍵連接之單個胺基酸鏈。
關於本發明之多肽,功能部分可為包含其作為組成部分之TCR的連續胺基酸之任何部分,其限制條件為功能部分特異性結合於突變RAS。術語「功能部分」當在提及TCR時使用時,係指本發明TCR之任何部分或片段,該部分或片段保留其作為組成部分之TCR (親本TCR)之生物活性。功能部分涵蓋例如TCR的保留以與親本TCR類似之程度、相同之程度或更高之程度特異性結合於突變RAS (例如,在HLA-DPB1*03:01分子之上下文中)或偵測、治療或預防癌症之能力的彼等部分。關於親本TCR,功能部分可包含親本TCR之例如約10%、約25%、約30%、約50%、約70%、約80%、約90%、約95%或更多。
功能部分可在該部分之胺基或羧基端或在兩個端處包含額外胺基酸,該等額外胺基酸在親本TCR之胺基酸序列中未發現。理想地,該等額外胺基酸不干擾功能部分之生物功能,例如特異性結合於突變RAS;及/或能夠偵測癌症、治療或預防癌症等。更理想地,與親本TCR之生物活性相比,該等額外胺基酸增強生物活性。
多肽可包含本發明TCR之α鏈及β鏈中的任一者或兩者之功能部分,諸如包含本發明TCR之α鏈及/或β鏈之可變區的CDR1、CDR2及CDR3中之一或多者的功能部分。在本發明之一實施例中,多肽可包含SEQ ID NO: 1 (α鏈之CDR1)、SEQ ID NO: 2 (α鏈之CDR2)、SEQ ID NO: 3 (α鏈之CDR3)、SEQ ID NO: 4 (β鏈之CDR1)、SEQ ID NO: 5 (β鏈之CDR2)、SEQ ID NO: 6 (β鏈之CDR3)或其組合之胺基酸序列。在本發明之另一實施例中,多肽可包含SEQ ID NO: 31 (α鏈之CDR1)、SEQ ID NO: 32 (α鏈之CDR2)、SEQ ID NO: 33 (α鏈之CDR3)、SEQ ID NO: 34 (β鏈之CDR1)、SEQ ID NO: 35 (β鏈之CDR2)、SEQ ID NO: 36 (β鏈之CDR3)或其組合之胺基酸序列。
就此而言,本發明多肽可包含選自SEQ ID NO: 1-6及31-36之胺基酸序列中之任一者或多者。在本發明之一實施例中,TCR包含以下之胺基酸序列:(a) SEQ ID NO: 1-3全部,(b) SEQ ID NO: 4-6全部,(c) SEQ ID NO: 31-33全部,(d) SEQ ID NO:34-36全部,(e) SEQ ID NO: 1-6全部,或(f) SEQ ID NO: 31-36全部。在一較佳實施例中,多肽包含以下之胺基酸序列:(i) SEQ ID NO: 1-6全部或(ii) SEQ ID NO: 31-36全部。SEQ ID NO: 3、6、33或36中之任一或多者(亦即α鏈或β鏈或兩者)之CDR3可進一步包含緊接CDR之第一胺基酸之N端的半胱胺酸或緊接最終胺基酸之C端的苯丙胺酸或兩者。
在本發明之一實施例中,本發明多肽可包含例如本發明TCR的可變區,該可變區包含上文闡述之CDR區的組合。就此而言,TCR可包含以下胺基酸序列:SEQ ID NO: 7 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 129 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 8 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1β鏈之可變區);SEQ ID NO: 37 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 38 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 47 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 48 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 49 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 50 (使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 63 (含有變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 130 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 64 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 67 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 68 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 72 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 α鏈之可變區);SEQ ID NO: 73 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 65 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 66 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 69 (含有替代變體N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 70 (含有WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 71 (含有替代WT N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之可變區);SEQ ID NO: 76 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1 β鏈之替代可變區);SEQ ID NO: 102 (使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5 β鏈之替代可變區);SEQ ID NO: 7及8兩者;SEQ ID NO: 129及8兩者;SEQ ID NO: 63及8兩者;SEQ ID NO: 130及8兩者;SEQ ID NO: 7及64兩者;SEQ ID NO: 129及64兩者;SEQ ID NO: 63及64兩者;SEQ ID NO: 130及64兩者;SEQ ID NO: 7及65兩者;SEQ ID NO: 129及65兩者;SEQ ID NO: 63及65兩者;SEQ ID NO: 130及65兩者;SEQ ID NO: 7及66兩者;SEQ ID NO: 129及66兩者;SEQ ID NO: 63及66兩者;SEQ ID NO: 130及66兩者;SEQ ID NO: 37及38兩者;SEQ ID NO: 37及69兩者;SEQ ID NO: 37及70兩者;SEQ ID NO: 37及71兩者;SEQ ID NO: 47及48兩者;SEQ ID NO: 67及68兩者;SEQ ID NO: 67及76兩者;SEQ ID NO: 49及50兩者;SEQ ID NO: 72及73兩者;或SEQ ID NO: 72及102兩者。較佳地,TCR包含以下之胺基酸序列:(i) SEQ ID NO: 7及8兩者;(ii) SEQ ID NO: 63及64兩者;(iii) SEQ ID NO: 7及65兩者;(iv) SEQ ID NO: 63及66兩者;(v) SEQ ID NO: 37及38兩者;(vi) SEQ ID NO: 37及70兩者;(vii) SEQ ID NO: 47及48兩者;(viii) SEQ ID NO: 67及68兩者;(ix) SEQ ID NO: 67及76兩者;(x) SEQ ID NO: 49及50兩者;(xi) SEQ ID NO: 72及73兩者;或(xii) SEQ ID NO: 72及102兩者。
在本發明之實施例中,本發明多肽可進一步包含上文闡述之本發明TCR之恆定區。就此而言,多肽可進一步包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列(α鏈之WT鼠類恆定區)、SEQ ID NO: 20 (β鏈之WT鼠類恆定區)、SEQ ID NO: 17 (α鏈之經取代之鼠類恆定區)、SEQ ID NO: 18 (β鏈之經取代之鼠類恆定區)、SEQ ID NO: 74之胺基酸序列(變體鼠類α鏈恆定區)、SEQ ID NO: 75 (變體鼠類β鏈恆定區)、SEQ ID NO: 19及20兩者、SEQ ID NO: 17及18兩者或SEQ ID NO: 74及75兩者。較佳地,多肽進一步包含SEQ ID NO: 19及20兩者、SEQ ID NO: 17及18兩者或SEQ ID NO: 74及75兩者之胺基酸序列與本文關於本發明之其他態樣所描述的任何CDR區或可變區的組合。
在本發明之實施例中,多肽包含:(a) SEQ ID NO: 17之胺基酸序列,其中:(i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b) SEQ ID NO: 18之胺基酸序列,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或(c) (a)及(b)兩者。在本發明之實施例中,多肽之SEQ ID NO: 17及18中之一者或兩者如表2至表4中之任一者中所定義。本文所提供之α鏈恆定區經展示含有N端天冬醯胺。在一些實施例中,本文所描述之α鏈恆定區之N端胺基酸為天冬胺酸。
在本發明之實施例中,本發明多肽可包含本文所描述之TCR的α或β鏈之整個長度。就此而言,本發明多肽可包含以下之胺基酸序列:SEQ ID NO: 21、SEQ ID NO: 22、SEQ ID NO: 23、SEQ ID NO: 24、SEQ ID NO: 77、SEQ ID NO: 78、SEQ ID NO: 79、SEQ ID NO: 80、SEQ ID NO: 81、SEQ ID NO: 82、SEQ ID NO: 83、SEQ ID NO: 84、SEQ ID NO: 85、SEQ ID NO: 86、SEQ ID NO: 87、SEQ ID NO: 88、SEQ ID NO: 89、SEQ ID NO: 90、SEQ ID NO: 131、SEQ ID NO: 132、SEQ ID NO: 133、SEQ ID NO: 134、SEQ ID NO: 135、SEQ ID NO: 136、SEQ ID NO: 21及22兩者、SEQ ID NO: 131及22兩者、SEQ ID NO: 23及24兩者、SEQ ID NO: 133及24兩者、SEQ ID NO: 77及78兩者、SEQ ID NO: 132及78兩者、SEQ ID NO: 79及80兩者、SEQ ID NO: 134及80兩者、SEQ ID NO: 81及82兩者、SEQ ID NO: 135及82兩者、SEQ ID NO: 83及84兩者、SEQ ID NO: 136及84兩者、SEQ ID NO: 21及85兩者、SEQ ID NO: 131及85兩者、SEQ ID NO: 23及87兩者、SEQ ID NO: 133及87兩者、SEQ ID NO: 77及86兩者、SEQ ID NO: 132及86兩者、SEQ ID NO: 79及88兩者、SEQ ID NO: 134及88兩者、SEQ ID NO: 83及90兩者、SEQ ID NO: 136及90兩者、SEQ ID NO: 81及89兩者、SEQ ID NO: 135及89兩者、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO: 56、SEQ ID NO: 51、SEQ ID NO: 52、SEQ ID NO: 91、SEQ ID NO: 92、SEQ ID NO: 93、SEQ ID NO: 94、SEQ ID NO: 95、SEQ ID NO: 96、SEQ ID NO: 97、SEQ ID NO: 98、SEQ ID NO: 99、SEQ ID NO: 100、SEQ ID NO: 101、SEQ ID NO: 55及56兩者、SEQ ID NO: 51及52兩者、SEQ ID NO: 91及92兩者、SEQ ID NO: 93及94兩者、SEQ ID NO: 95及96兩者、SEQ ID NO: 97及98兩者、SEQ ID NO: 93及99兩者、SEQ ID NO: 95及100兩者或SEQ ID NO: 97及101兩者。就此而言,本發明多肽可包含以下之胺基酸序列:SEQ ID NO: 41、SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 39、SEQ ID NO: 40、SEQ ID NO: 103、SEQ ID NO: 104、SEQ ID NO: 105、SEQ ID NO: 106、SEQ ID NO: 107、SEQ ID NO: 110、SEQ ID NO: 111、SEQ ID NO: 112、SEQ ID NO: 113、SEQ ID NO: 114、SEQ ID NO: 115、SEQ ID NO: 41及42兩者、SEQ ID NO: 39及40兩者、SEQ ID NO: 103及104兩者、SEQ ID NO: 41及105兩者、SEQ ID NO: 103及106兩者、SEQ ID NO: 39及107兩者、SEQ ID NO: 41及110兩者、SEQ ID NO: 39及112兩者、SEQ ID NO: 103及111兩者、SEQ ID NO: 41及113兩者、SEQ ID NO: 39及115兩者、SEQ ID NO: 103及114兩者、SEQ ID NO: 57、SEQ ID NO: 58、SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 54、SEQ ID NO: 108、SEQ ID NO: 109、SEQ ID NO: 116、SEQ ID NO: 117、SEQ ID NO: 118、SEQ ID NO: 119、SEQ ID NO: 120、SEQ ID NO: 121、SEQ ID NO: 122、SEQ ID NO: 123、SEQ ID NO: 124兩者、SEQ ID NO: 57及58兩者或SEQ ID NO: 53及54兩者、SEQ ID NO: 108及109兩者、SEQ ID NO: 116及117兩者、SEQ ID NO: 118及119兩者、SEQ ID NO: 120及121兩者、SEQ ID NO: 116及122兩者、SEQ ID NO: 120及124兩者或SEQ ID NO: 118及123兩者。或者,本發明之多肽可包含本文所描述之TCR之兩條鏈。
在本發明之實施例中,多肽包含:(a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的α鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的α鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys;(d)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的α鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(e)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys;(f) (a)及(c)兩者;(g) (b)及(c)兩者;或(h) (d)及(e)兩者;(i)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的α鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(j)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的β鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys;(k)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的α鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(l)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的β鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys;(m) (i)及(j)兩者;或(n) (k)及(l)兩者;(o)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的α鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(p)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的α鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(q)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys;(r)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys;(s) (o)及(q)兩者;(t) (p)及(q)兩者;(u) (d)及(r)兩者;(v)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的α鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(w)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys;(x)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的α鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(y)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys;(z) (v)及(w)兩者;(aa) (x)及(y)兩者;(bb)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys;(cc)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys;(dd)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys;(ee) (a)及(bb)兩者;(ff) (b)及(bb)兩者;(gg) (o)及(cc)兩者;(hh) (p)及(cc)兩者;(ii) (v)及(dd)兩者;(jj)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的β鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys;(kk)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的β鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys;(ll)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的β鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys;(mm) (d)及(jj)兩者;(nn) (d)及(kk)兩者;或(oo) (x)及(ll)兩者。在本發明之一實施例中,多肽之SEQ ID NO: 21、22、41、42、55-58、79、80、85、88、93、94、99、105、110、113、116、117、122、131或134中之任一者或多者如表2至表4中之任一者中所定義。
本發明之一實施例進一步提供一種蛋白質,其包含本文所描述之多肽中之至少一者。「蛋白質」意謂包含一或多條多肽鏈之分子。
在一實施例中,本發明之蛋白質可包含:(a)包含SEQ ID NO: 1-3之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 4-6之胺基酸序列的第二多肽鏈;或(b)包含SEQ ID NO: 31-33之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 34-36之胺基酸序列的第二多肽鏈。SEQ ID NO: 3、6、33或36中之任一或多者(亦即α鏈或β鏈或兩者)之CDR3可進一步包含緊接CDR之第一胺基酸之N端的半胱胺酸或緊接最終胺基酸之C端的苯丙胺酸或兩者。
在本發明之另一實施例中,蛋白質可包含:(i)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈;(ii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈;(iii)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈;(iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈;(v)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈;(vi)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈;(vii)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈;(viii)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈;(ix)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈;(x)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xi)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xii)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xiii)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xiv)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xv)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xvi)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xvii)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 38之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xviii)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 69之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xix)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 70之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xx)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 71之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xxi)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 48之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xxii)包含SEQ ID NO: 67之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 68之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xxiii)包含SEQ ID NO: 67之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 76之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xxiv)包含SEQ ID NO: 49之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 50之胺基酸序列的第二多肽鏈;(xxv)包含SEQ ID NO: 72之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 73之胺基酸序列的第二多肽鏈;或(xxvi)包含SEQ ID NO: 72之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 102之胺基酸序列的第二多肽鏈。
本發明蛋白質可進一步包含本文關於本發明之其他態樣所描述之任何恆定區。就此而言,在本發明之實施例中,第一多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列,且第二多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列。在本發明之實施例中,第一多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列,且第二多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 20之胺基酸序列。在本發明之實施例中,第一多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 74之胺基酸序列,且第二多肽鏈可進一步包含SEQ ID NO: 75之胺基酸序列。
在本發明之實施例中,蛋白質包含:(a)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中:(i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b)包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或(c) (a)及(b)兩者。在本發明之實施例中,蛋白質之SEQ ID NO: 17及18中之一者或兩者為如表2至表4中之任一者中所定義。
或者或另外,本發明之一實施例之蛋白質可包含:(a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的第一多肽鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的第一多肽鏈(含有野生型N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys;(d)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的第一多肽鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(e)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys;(f) (a)及(c)兩者;(g) (b)及(c)兩者;或(h) (d)及(e)兩者;(i)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的第一多肽鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(j)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys;(k)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的第一多肽鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(l)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用IMGT預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys;(m) (i)及(j)兩者;或(n) (k)及(l)兩者;(o)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的第一多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(p)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的第一多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(q)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys;(r)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys;(s) (o)及(q)兩者;(t) (p)及(q)兩者;(u) (d)及(r)兩者;(v)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的第一多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(w)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的β鏈),其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys;(x)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的第一多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的α鏈),其中:(i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys;(ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser Ala Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile Pro、Phe、或Trp;且(iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;(y)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的β鏈),其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys;(z) (v)及(w)兩者;(aa) (x)及(y)兩者;(bb)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys;(cc)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys;(dd)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR1的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys;(ee) (a)及(bb)兩者;(ff) (b)及(bb)兩者;(gg) (o)及(cc)兩者;(hh) (p)及(cc)兩者;(ii) (v)及(dd)兩者;(jj)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有變體N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys;(kk)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的第二多肽鏈(含有WT N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys;(ll)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的第二多肽鏈(如使用SignalP預測的不含N端訊息肽之4360 TCR5的替代β鏈),其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys;(mm) (d)及(jj)兩者;(nn) (d)及(kk)兩者;或(oo) (x)及(ll)兩者。在本發明之一實施例中,SEQ ID NO: 21、22、41、42、55-58、79、80、85、88、93、94、99、105、110、113、116、117及122中之一或多者如表2至表4中之任一者中所定義。
本發明之蛋白質可為TCR。或者,若例如蛋白質包含單一多肽鏈且該單一多肽鏈包含以下之胺基酸序列:SEQ ID NO: 21及22兩者、SEQ ID NO: 131及22、SEQ ID NO: 23及24兩者、SEQ ID NO: 133及24兩者、SEQ ID NO: 77及78兩者、SEQ ID NO: 132及78兩者、SEQ ID NO: 79及80兩者、SEQ ID NO: 134及80兩者、SEQ ID NO: 81及82兩者、SEQ ID NO: 135及82兩者、SEQ ID NO: 83及84兩者、SEQ ID NO: 136及84兩者、SEQ ID NO: 21及85兩者、SEQ ID NO: 131及85兩者、SEQ ID NO: 23及87兩者、SEQ ID NO: 133及87兩者、SEQ ID NO: 77及86兩者、SEQ ID NO: 132及86兩者、SEQ ID NO: 79及88兩者、SEQ ID NO: 134及88兩者、SEQ ID NO: 83及90兩者、SEQ ID NO: 136及90兩者、SEQ ID NO: 81及89兩者、SEQ ID NO: 135及89兩者,或若蛋白質之第一及/或第二多肽鏈進一步包含其他胺基酸序列,例如編碼免疫球蛋白或其部分之胺基酸序列,則本發明蛋白質可為融合蛋白。就此而言,本發明之一實施例亦提供一種融合蛋白,其包含本文所描述之本發明多肽中之至少一者以及至少一另一種多肽。另一種多肽可以融合蛋白之獨立多肽之形式存在,或可以多肽之形式存在,其與本文所描述之本發明多肽中之一者同框(以串聯方式)表現。另一種多肽可編碼任何肽或蛋白質分子或其部分,包括但不限於免疫球蛋白、CD3、CD4、CD8、MHC分子、CD1分子,例如CD1a、CD1b、CD1c、CD1d等。
融合蛋白可包含本發明多肽之一或多個複本及/或另一種多肽之一或多個複本。舉例而言,融合蛋白可包含本發明多肽及/或另一種多肽之1、2、3、4、5或更多個複本。製備融合蛋白質之適合方法為此項技術中已知的,且包括例如重組方法。
在本發明之一些實施例中,本發明之TCR、多肽及蛋白質可表現為包含連接α鏈及β鏈之連接子肽的單個蛋白質。就此而言,本發明之TCR、多肽及蛋白質可進一步包含連接子肽。連接子肽可有利地促進重組TCR、多肽及/或蛋白質在宿主細胞中之表現。連接子肽可包含任何適合之胺基酸序列。舉例而言,連接子肽可為包含SEQ ID NO: 25之胺基酸序列的弗林蛋白酶-SGSG-P2A連接子。當藉由宿主細胞表現包括連接子肽之構築體時,連接子肽可經裂解,產生分離之α鏈及β鏈。在本發明之實施例中,TCR、多肽或蛋白可包含胺基酸序列,該胺基酸序列包含全長α鏈、全長β鏈及位於α鏈與β鏈之間的連接子肽,例如α鏈-連接子-β鏈或β鏈-連接子-α鏈。
在本發明之一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 125中所闡述之胺基酸序列,其自N端至C端包含β鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及α鏈。變體包含如SEQ ID NO: 8中所闡述之β鏈可變區(含有變體訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 78中。變體亦包含如SEQ ID NO: 7中所闡述之α鏈可變區(含有WT訊息肽)及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 77中。
在本發明之另一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 126中所闡述之胺基酸序列,其自N端至C端包含α鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及β鏈。變體包含如SEQ ID NO: 63中所闡述之α鏈可變區(含有變體訊息肽)及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 81中。變體亦包含如SEQ ID NO: 64中所闡述之β鏈可變區(含有WT訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 82中。
在本發明之一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 127中所闡述之胺基酸序列,其自N端至C端包含β鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及α鏈。變體包含如SEQ ID NO: 38中所闡述之β鏈可變區(含有變體訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 104中。變體亦包含如SEQ ID NO: 37中所闡述之α鏈可變區及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 103中。
在本發明之另一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 128中所闡述之胺基酸序列,其自N端至C端包含α鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及β鏈。變體包含如SEQ ID NO: 37中所闡述之α鏈可變區及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 103中。變體亦包含如SEQ ID NO: 70中所闡述之β鏈可變區(含有WT訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 106中。
在本發明之一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 137中所闡述之替代胺基酸序列,其自N端至C端包含β鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及α鏈。變體包含如SEQ ID NO: 8中所闡述之β鏈可變區(含有變體訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 78中。變體亦包含如SEQ ID NO: 129中所闡述之α鏈可變區及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 132中。
在本發明之另一實施例中,TCR、多肽或蛋白質可包含如SEQ ID NO: 138中所闡述之替代胺基酸序列,其自N端至C端包含α鏈、連接子(SEQ ID NO: 25)及β鏈。變體包含如SEQ ID NO: 130中所闡述之替代α鏈可變區及如SEQ ID NO: 74中所闡述之經修飾α恆定域。變體之全長α鏈闡述於SEQ ID NO: 135中。變體亦包含如SEQ ID NO: 64中所闡述之β鏈可變區(含有WT訊息肽)及如SEQ ID NO: 75中所闡述之經修飾β恆定域。變體之全長β鏈闡述於SEQ ID NO: 82中。
在一些實施例中,本文所揭示之TCR、多肽或蛋白質包含如本文所揭示的包含訊息肽之α鏈及/或β鏈。在一些實施例中,本文所揭示之α鏈及/或β鏈中的任一者之訊息肽的序列包含在位置2處取代野生型殘基之丙胺酸或組胺酸殘基。
在一些實施例中,本文所揭示之TCR、多肽或蛋白質包含如本文所揭示之α鏈及/或β鏈的缺乏訊息肽之成熟型式。訊息肽之序列或α鏈及/或β鏈之成熟型式可根據此項技術中已知之任何方法(包括IMGT及SignalP)進行。
本發明之蛋白質可為重組抗體或其抗原結合部分,其包含本文所描述之本發明多肽中之至少一者。如本文所用,「重組抗體」係指包含本發明之多肽中之至少一者及抗體或其抗原結合部分之多肽鏈的重組(例如經基因工程改造)蛋白。抗體或其抗原結合部分之多肽可為抗體之重鏈、輕鏈、重鏈或輕鏈之可變區或恆定區、單鏈可變片段(scFv)或Fc、Fab或F(ab)2
'片段等。抗體或其抗原結合部分之多肽鏈可以重組抗體之獨立多肽形式存在。或者,抗體或其抗原結合部分之多肽鏈可以多肽之形式存在,其與本發明之多肽同框(以串聯方式)表現。抗體或其抗原結合部分之多肽可為任何抗體或任何抗體片段(包括本文所描述之任何抗體及抗體片段)之多肽。
本文所描述之本發明TCR、多肽或蛋白質之功能變體包括於本發明之範疇中。如本文所用,術語「功能變體」係指與親本TCR、多肽或蛋白質具有實質或顯著序列一致性或類似性之TCR、多肽或蛋白質,該功能變體保留其作為變體之TCR、多肽或蛋白質的生物活性。功能變體涵蓋例如本文所描述之TCR、多肽或蛋白質(親本TCR、多肽或蛋白質)之彼等變體,其保留以與親本TCR、多肽或蛋白質類似之程度、相同之程度或更高之程度特異性結合於親本TCR對其具有抗原特異性或親本多肽或蛋白質所特異性結合之突變RAS的能力。關於親本TCR、多肽或蛋白質,功能變體之胺基酸序列可例如分別與親本TCR、多肽或蛋白質具有至少約30%、約50%、約75%、約80%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高一致性。
功能變體可例如包含具有至少一個保守胺基酸取代之親本TCR、多肽或蛋白質之胺基酸序列。保守胺基酸取代為此項技術中已知的且包括其中一個具有某些物理及/或化學特性之胺基酸經另一個具有相同化學或物理特性之胺基酸交換的胺基酸取代。舉例而言,保守胺基酸取代可為酸性胺基酸取代成另一酸性胺基酸(例如Asp或Glu)、具有非極性側鏈之胺基酸取代成另一具有非極性側鏈之胺基酸(例如Ala、Gly、Val、Ile、Leu、Met、Phe、Pro、Trp、Val等)、鹼性胺基酸取代成另一鹼性胺基酸(Lys、Arg等)、具有極性側鏈之胺基酸取代成另一具有極性側鏈之胺基酸(Asn、Cys、Gln、Ser、Thr、Tyr等),等等。
或者或另外,功能變體可包含具有至少一個非保守胺基酸取代之親本TCR、多肽或蛋白質之胺基酸序列。在此情況下,非保守胺基酸取代不干擾或抑制功能變體之生物活性較佳。較佳地,非保守胺基酸取代增強功能變體之生物活性,使得與親本TCR、多肽或蛋白質相比,功能變體之生物活性增加。
本文所描述之TCR、多肽、蛋白質、功能變體及功能部分之各訊息肽(若存在)可為任何適合之TCR訊息肽,只要TCR、多肽、蛋白質或功能變體經表現且對突變人類RAS胺基酸序列具有抗原特異性即可,該突變人類RAS胺基酸序列在位置12處之甘胺酸被由HLA第II類分子呈現之纈胺酸取代。
TCR、多肽或蛋白質可基本上由本文所描述之指定胺基酸序列或序列組成,使得TCR、多肽或蛋白質的其他組分(例如其他胺基酸)不實質上改變TCR、多肽或蛋白質之生物活性。就此而言,本發明TCR、多肽或蛋白質可例如基本上由以下之胺基酸序列組成:SEQ ID NO: 21、SEQ ID NO: 22、SEQ ID NO: 23、SEQ ID NO: 24、SEQ ID NO: 21-22兩者或SEQ ID NO: 23-24兩者、SEQ ID NO: 41、SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 39、SEQ ID NO: 40、SEQ ID NO: 41-42兩者或SEQ ID NO: 39-40兩者。此外,舉例而言,本發明TCR、多肽或蛋白質可基本上由以下之胺基酸序列組成:(i) SEQ ID NO: 7、(ii) SEQ ID NO: 8、(iii) SEQ ID NO: 37、(iv) SEQ ID NO: 38、(v) SEQ ID NO: 7及8兩者或(vi) SEQ ID NO: 37及38兩者。此外,本發明TCR、多肽或蛋白質可基本上由以下之胺基酸序列組成:(a) SEQ ID NO: 1-6及31-36中之任一者或多者;(b) SEQ ID NO: 1-3全部;(c) SEQ ID NO: 4-6全部;(d) SEQ ID NO: 31-33全部;(e) SEQ ID NO: 34-36全部;(f) SEQ ID NO: 1-6全部;或(g) SEQ ID NO: 31-36全部。
本發明之TCR、多肽及蛋白質可具有任何長度,亦即可包含任何數目之胺基酸,其限制條件為TCR、多肽或蛋白質保留其生物活性,例如能夠特異性結合於突變RAS;偵測哺乳動物中之癌症;或治療或預防哺乳動物之癌症等。舉例而言,多肽長度可在約50至約5000個胺基酸之範圍內,諸如長度為約50、約70、約75、約100、約125、約150、約175、約200、約300、約400、約500、約600、約700、約800、約900、約1000或更多個胺基酸。就此而言,本發明之多肽亦包括寡肽。
本發明之TCR、多肽及蛋白質可包含代替一或多種天然存在之胺基酸的合成胺基酸。此類合成胺基酸為此項技術中已知的,且包括例如胺基環己烷甲酸、正白胺酸、α-胺基正癸酸、高絲胺酸、S-乙醯胺基甲基-半胱胺酸、反式-3-羥脯胺酸及反式-4-羥脯胺酸、4-胺基苯丙胺酸、4-硝基苯丙胺酸、4-氯苯丙胺酸、4-羧基苯丙胺酸、β-苯基絲胺酸β-羥基苯基丙胺酸、苯基甘胺酸、α-萘基丙胺酸、丙胺酸環己酯、環己基甘胺酸、吲哚啉-2-甲酸、1,2,3,4-四氫異喹啉-3-甲酸、胺基丙二酸、胺基丙二酸單醯胺、N'-苯甲基-N'-甲基-離胺酸、N',N'-二苯甲基-離胺酸、6-羥基離胺酸、鳥胺酸、α-胺基環戊烷甲酸、α-胺基環己烷甲酸、α-胺基環庚烷甲酸、α-(2-胺基-2-降莰烷)-甲酸、α,γ-二胺基丁酸、α,β-二胺基丙酸、高苯丙胺酸及α-三級丁基甘胺酸。
本發明之TCR、多肽及蛋白質可經糖基化、醯胺化、羧化、磷酸化、酯化、正醯基化、經由例如二硫橋鍵環化或轉化成酸加成鹽及/或視情況二聚合或聚合,或結合。
本發明之TCR、多肽及/或蛋白質可藉由此項技術中已知之方法獲得,諸如重新合成。此外,多肽及蛋白質可使用本文所描述之核酸、使用標準重組方法以重組方式產生。參見例如Green及Sambrook,Molecular Cloning: A Laboratory Manual
,第4版,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY (2012)。或者,本文所描述之TCR、多肽及/或蛋白質可由商業實體商業合成。就此而言,本發明TCR、多肽及蛋白質可為合成的、重組的、分離的及/或純化的。本發明之一實施例提供一種經分離或經純化TCR、多肽或蛋白質,其由本文關於本發明之其他態樣所描述之核酸或載體中之任一者編碼。本發明之另一實施例提供一種經分離或經純化TCR、多肽或蛋白質,其由本文關於本發明之其他態樣所描述之核酸或載體中之任一者在細胞中表現而產生。本發明之又一實施例提供一種產生本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者的方法,該方法包含培養本文所描述之宿主細胞或宿主細胞群中的任一者,以產生TCR、多肽或蛋白質。
結合物(例如生物結合物)包括於本發明之範疇中,該等結合物包含本發明TCR、多肽或蛋白質(包括其功能部分或變體中之任一者)、核酸、重組表現載體、宿主細胞、宿主細胞群或抗體或其抗原結合部分中之任一者。結合物以及合成結合物之方法一般而言為此項技術中已知的。
本發明之一實施例提供一種核酸,其包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者的核苷酸序列。如本文所用,「核酸」包括「聚核苷酸」、「寡核苷酸」及「核酸分子」,且通常意謂可為單股或雙股之DNA或RNA之聚合物,其可含有天然、非天然或改變之核苷酸,且其可含有天然、非天然或改變之核苷酸間鍵,諸如磷醯胺酸鍵或硫代磷酸酯鍵而非未經修飾之寡核苷酸之核苷酸之間發現的磷酸二酯。在實施例中,核酸包含互補DNA (cDNA)。通常,核酸不包含任何插入、缺失、倒位及/或取代較佳。然而,在一些情況下,如本文所論述,核酸包含一或多個插入、缺失、倒位及/或取代可為適合的。
較佳地,本發明之核酸為重組的。如本文所用,術語「重組」係指(i)藉由將天然或合成之核酸片段接合至可在活細胞中複製之核酸分子而在活細胞外部構築之分子,或(ii)由上文(i)中描述之彼等分子之複製產生的分子。出於本文之目的,複製可為活體外複製或活體內複製。
核酸可使用此項技術中已知之程序基於化學合成及/或酶連接反應進行構築。參見例如前述Green及Sambrook等人。舉例而言,核酸可使用天然存在之核苷酸或不同地經修飾之核苷酸化學合成,該等經修飾之核苷酸經設計以增加分子之生物穩定性或增加雜交時形成之雙螺旋的物理穩定性(例如,經硫代磷酸酯衍生物及吖啶取代之核苷酸)。可用以產生核酸的經修飾核苷酸之實例包括但不限於5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黃嘌呤、黃嘌呤、4-乙醯胞嘧啶、5-(羧基羥甲基)尿嘧啶、5-羧甲基胺基甲基-2-硫代尿苷、5-羧甲基胺基甲基尿嘧啶、二氫尿嘧啶、β-D-半乳糖苷基Q核苷、肌苷、N6
-異戊烯基腺嘌呤、1-甲基鳥嘌呤、1-甲基肌苷、2,2-二甲基鳥嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鳥嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、經N6
取代之腺嘌呤、7-甲基鳥嘌呤、5-甲胺基甲基尿嘧啶、5-甲氧基胺甲基-2-硫尿嘧啶、β-D-甘露糖苷基Q核苷、5'-甲氧基羧基甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲硫基-N6
-異戊烯基腺嘌呤、尿嘧啶-5-氧基乙酸(v)、懷丁氧苷(wybutoxosine)、假尿嘧啶、Q核苷、2-硫胞嘧啶、5-甲基-2-硫尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧基乙酸甲酯、3-(3-胺基-3-N-2-羧丙基)尿嘧啶及2,6-二胺基嘌呤。或者,本發明之核酸中之一或多者可購自商業實體。
核酸可包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者的任何核苷酸序列。在本發明之實施例中,核酸可包含SEQ ID NO: 43-46中之任一者之核苷酸序列(表5)。在本發明之實施例中,核酸包含SEQ ID NO: 43-44兩者或SEQ ID NO: 45-46兩者之核苷酸序列。
表5
TCR 鏈 | 核苷酸序列 |
4360 TCR1 α | SEQ ID NO: 43 |
4360 TCR1 β | SEQ ID NO: 44 |
4360 TCR5 α | SEQ ID NO: 45 |
4360 TCR5 β | SEQ ID NO: 46 |
在本發明之實施例中,核酸包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者的密碼子最佳化核苷酸序列。不受任何特定理論或機制束縛,咸信核苷酸序列之密碼子最佳化增加mRNA轉錄物之轉譯效率。核苷酸序列之密碼子最佳化可涉及用另一密碼子取代原生密碼子,該另一密碼子編碼相同胺基酸但可由細胞內更容易獲得之tRNA轉譯,因此增加轉譯效率。核苷酸序列之最佳化亦可減少會干擾轉譯之二級mRNA結構,因此增加轉譯效率。
本發明亦提供一種核酸,其包含與本文所描述之核酸中之任一者之核苷酸序列互補的核苷酸序列或在嚴格條件下與本文所描述之核酸中之任一者之核苷酸序列雜合的核苷酸序列。
核苷酸序列在嚴格條件下雜合,較佳地在高嚴格度條件下雜合。「高嚴格度條件」意謂以比非特異性雜合之可偵測性更強之量將核苷酸序列特異性雜合至目標序列(本文所描述之核酸中之任一者之核苷酸序列)。較高嚴格度條件包括會將具有確切互補序列之聚核苷酸,或僅含有少量分散錯配之聚核苷酸與碰巧具有匹配核苷酸序列之少量小區域(例如3至10個鹼基)之隨機序列進行區分的條件。此類具有互補性之小區域比具有14至17個或更多個鹼基之全長互補序列更易於解鏈,且高嚴格度雜合使其可易於區分。相對高嚴格度條件將包括例如低鹽及/或高溫條件,諸如在約50至70℃之溫度下藉由約0.02至0.1 M NaCl或等效物提供。此類高嚴格度條件容許核苷酸序列與模板或目標股之間的少量(若存在)錯配,且尤其適合於偵測本發明TCR中之任一者的表現。通常應瞭解,藉由添加漸增量之甲醯胺,可使條件更嚴格。
本發明亦提供一種核酸,其包含與本文中所描述的核酸中之任一者至少約70%或更高,例如約80%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%或約99%一致的核苷酸序列。就此而言,核酸可基本上由本文所描述之核苷酸序列中之任一者組成。
本發明之一實施例提供一種經分離或經純化核酸,其自5'端至3'端包含第一核酸序列及第二核苷酸序列,其中該第一核苷酸序列及該第二核苷酸序列分別對以下之胺基酸序列進行編碼:7及8;7及64;63及8;63及64;7及65;63及65;7及66;63及66;8及7;64及7;8及63;64及63;65及7;65及63;66及7;66及63;129及8;129及64;129及65;129及66;8及129;64及129;65及129;66及129;130及8;130及64;130及65;130及66;8及130;64及130;65及130;66及130;37及38;37及69;37及70;37及71;38及37;69及37;70及37;71及37;23及24;23及84;83及24;83及84;23及87;83及87;23及90;83及90;24及23;84及23;24及83;84及83;87及23;87及83;90及23;90及83;133及24;133及84;133及87;133及90;24及133;84及133;87及133;90及133;39及40;39及107;39及112;39及115;40及39;107及39;112及39;115及39;136及24;136及84;136及87;136及90;24及136;84及136;87及136;90及136;21及22;21及80;79及22;79及80;21及85;21及88;79及85;79及88;22及21;80及21;22及79;80及79;85及21;88及21;85及79;88及79;131及22;131及80;131及85;131及88;22及131;80及131;85及131;88及131;134及22;134及80;134及85;134及88;22及134;80及134;85及134;88及134;77及78;77及82;81及78;81及82;77及86;81及86;78及77;82及77;78及81;82及81;86及77;86及81;132及78;132及82;132及86;78及132;82及132;86及132;135及78;135及82;135及86;78及135;82及135;86及135;77及89;81及89;89及77;89及81;132及89;89及132;135及89;89及135;41及42;41及105;41及110;41及113;42及41;105及41;110及41;113及41;103及104;103及111;103及114;104及103;111及103;114及103;103及106;106及103;47及48;48及47;67及68;67及76;68及67;76及67;49及50;50及49;72及73;72及102;73及72;102及72;51及52;52及51;53及54;54及53;55及56;56及55;57及58;58及57;91及92;92及91;108及109;109及108;93及94;93及99;94及93;99及93;97及98;97及101;98及97;101及97;95及96;95及100;96及95;100及95;116及117;116及122;117及116;122及116;120及121;120及124;121及120;124及120;118及119;118及123;119及118;或123及118。
在本發明之一實施例中,經分離或經純化之核酸進一步包含插入於第一與第二核苷酸序列之間的第三核苷酸序列,其中該第三核苷酸序列編碼可裂解連接子肽。在本發明之一實施例中,可裂解連接子肽包含SEQ ID NO: 25之胺基酸序列。
本發明之核酸可併入至重組表現載體中。就此而言,本發明提供一種重組表現載體,其包含本發明之核酸中之任一者。在本發明之實施例中,重組表現載體包含編碼α鏈、β鏈及連接子肽的核苷酸序列。
出於本文之目的,術語「重組表現載體」意謂經基因修飾之寡核苷酸或聚核苷酸構築體,當構築體包含編碼mRNA、蛋白質、多肽或肽之核苷酸序列,且載體在足以使mRNA、蛋白質、多肽或肽在細胞內表現之條件下與細胞接觸時,允許藉由宿主細胞表現mRNA、蛋白質、多肽或肽。本發明之載體整體上不為天然存在的。然而,載體之部分可為天然存在的。本發明之重組表現載體可包含任何類型的核苷酸,其包括但不限於可為單股或雙股、合成的或部分自天然來源中獲得且可含有天然、非天然或改變之核苷酸的DNA及RNA。重組表現載體可包含天然存在之、非天然存在之核苷酸間鍵或兩種類型的鍵。較佳地,非天然存在或改變之核苷酸或核苷酸間鍵不阻礙載體之轉錄或複製。
本發明之重組表現載體可為任何適合之重組表現載體,且可用以轉化或轉染任何適合之宿主細胞。適合載體包括設計成用於增殖及擴增或用於表現或用於此兩者的彼等載體,諸如質體及病毒。載體可選自pUC系列(Fermentas Life Sciences)、pBluescript系列(Stratagene, LaJolla, CA)、pET系列(Novagen, Madison, WI)、pGEX系列(Pharmacia Biotech, Uppsala, Sweden)及pEX系列(Clontech, Palo Alto, CA)。亦可使用噬菌體載體,諸如λGT10、λGT11、λZapII (Stratagene)、λEMBL4及λNM1149。植物表現載體之實例包括pBI01、pBI101.2、pBI101.3、pBI121及pBIN19 (Clontech)。動物表現載體之實例包括pEUK-Cl、pMAM及pMAMneo (Clontech)。較佳地,重組表現載體為病毒載體,例如反轉錄病毒載體。在一尤佳實施例中,重組表現載體為MSGV1載體。在本發明之一實施例中,重組表現載體為轉位子或慢病毒載體。
本發明之重組表現載體可使用描述於例如前述Green及Sambrook等人中之標準重組DNA技術製備。環形或線形之表現載體構築體可經製備以含有在原核或真核宿主細胞中起作用之複製系統。複製系統可來源於例如ColEl、2 μ質體、λ、SV40、牛乳突狀瘤病毒及類似者。
理想地,重組表現載體包含諸如轉錄及轉譯起始及終止密碼子之調節序列,該等調節序列按需要且考慮載體係基於DNA抑或基於RNA而對將引入載體之寄主細胞類型(例如細菌、真菌、植物或動物)具特異性。
重組表現載體可包括一或多個標記基因,其允許選擇經轉化或經轉染宿主細胞。標記基因包括殺生物劑耐性(例如,對抗生素、重金屬等具有耐性)、營養缺陷型宿主細胞中用以提供原營養的補充物及類似者。用於本發明表現載體之適合的標記基因包括例如耐新黴素/G418基因、耐潮黴素基因、耐組胺醇基因、耐四環素基因及耐安比西林(ampicillin)基因。
重組表現載體可包含可操作地連接於編碼TCR、多肽或蛋白質之核苷酸序列或連接於與編碼TCR、多肽或蛋白質之核苷酸序列互補或雜合之核苷酸序列的原生或非原生啟動子。啟動子(例如強、弱、誘導性、組織特異性及發育特異性啟動子)之選擇在技術人員之普通技能內。類似地,核苷酸序列與啟動子之合併亦在技術人員之技能內。啟動子可為非病毒啟動子或病毒啟動子,諸如巨細胞病毒(CMV)啟動子、SV40啟動子、RSV啟動子及發現於鼠類幹細胞病毒之長末端重複序列中之啟動子。
本發明重組表現載體可經設計用於短暫表現、用於穩定表現或用於兩者。此外,重組表現載體可經製備用於組成性表現或用於誘導性表現。
此外,重組表現載體可經製備為包括自殺基因。如本文所用,術語「自殺基因」係指使表現自殺基因之細胞死亡之基因。自殺基因可為對在其中表現基因之細胞賦予針對藥劑(例如藥物)之敏感性的基因,且當細胞與藥劑接觸或暴露於藥劑時,該基因使細胞死亡。自殺基因為此項技術中已知的且包括例如單純疱疹病毒(HSV)胸苷激酶(TK)基因、胞嘧啶脫胺酶、嘌呤核苷磷酸化酶、硝基還原酶及誘導性凋亡蛋白酶9基因系統。
本發明之另一實施例進一步提供一種宿主細胞,其包含本文所描述之重組表現載體中之任一者。如本文所用,術語「宿主細胞」係指可含有本發明重組表現載體之任何類型的細胞。宿主細胞可為真核細胞(例如植物、動物、真菌或藻類)或可為原核細胞(例如細菌或原蟲)。宿主細胞可為經培養細胞或原代細胞,亦即直接自生物體(例如人類或小鼠)分離。宿主細胞可為黏附細胞或懸浮細胞,亦即在懸浮液中生長之細胞。適合之宿主細胞為此項技術中已知的且包括例如DH5α大腸桿菌細胞、中國倉鼠卵巢細胞、猴VERO細胞、COS細胞、HEK293細胞及其類似者。出於擴增或複製重組表現載體之目的,宿主細胞較佳為原核細胞,例如DH5α細胞。出於產生重組TCR、多肽或蛋白質之目的,宿主細胞較佳為哺乳動物細胞。最佳地,宿主細胞為人類細胞。雖然宿主細胞可為任何細胞類型,可來源於任何類型的組織,且可為任何發育階段,但宿主細胞較佳為周邊血液淋巴細胞(PBL)或周邊血液單核細胞(PBMC)。更佳地,宿主細胞為T細胞。在本發明之一實施例中,宿主細胞為人類淋巴細胞。在本發明之另一實施例中,宿主細胞係選自T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、恆定型自然殺手T (iNKT)細胞及自然殺手(NK)細胞。本發明之又一實施例提供一種產生表現TCR之宿主細胞的方法,該TCR對SEQ ID NO: 30之肽具有抗原特異性,該方法包含在允許將本文所描述之載體中之任一者引入至細胞中之條件下使該細胞與該載體接觸。
出於本文之目的,T細胞可為任何T細胞,諸如經培養T細胞(例如原代T細胞),或來自經培養T細胞株之T細胞(例如Jurkat,SupT1等),或獲自哺乳動物之T細胞。若自哺乳動物獲得,則T細胞可自眾多來源獲得,包括但不限於血液、骨髓、淋巴結、胸腺或其他組織或體液。T細胞亦可經富集或純化。較佳地,T細胞為人類T細胞。T細胞可為任何類型的T細胞且可為任何發育階段,其包括但不限於CD4+
/CD8+
雙陽性T細胞、CD4+
輔助T細胞(例如Th1
及Th2
細胞)、CD4+
T細胞、CD8+
T細胞(例如細胞毒性T細胞)、腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、記憶體T細胞(例如中樞記憶T細胞及效應記憶T細胞)、原生T細胞及類似者。
本發明亦提供一種細胞群,其包含至少一種本文所描述之宿主細胞。細胞群可為包含宿主細胞之異質群,除了不包含重組表現載體中之任一者的至少一種其他細胞,例如宿主細胞(例如T細胞)或並非T細胞之細胞(例如B細胞、巨噬細胞、嗜中性球、紅血球、肝細胞、內皮細胞、上皮細胞、肌肉細胞、大腦細胞等)以外,該宿主細胞亦包含所描述之重組表現載體中之任一者。或者,細胞群可為實質上均質群,其中該群體包含主要包含重組表現載體(例如基本上由重組表現載體組成)之宿主細胞。該群體亦可為純系細胞群,其中群體中之所有細胞為包含重組表現載體之單一宿主細胞的純系,使得群體中之所有細胞包含重組表現載體。在本發明之一個實施例中,細胞群為包含宿主細胞之純系群體,該等宿主細胞包含如本文所描述之重組表現載體。
在本發明之實施例中,群體中細胞之數目可快速擴增。如例如美國專利8,034,334;美國專利8,383,099;美國專利申請公開案第2012/0244133號;Dudley等人,J. Immunother.
, 26:332-42 (2003);及Riddell等人,J. Immunol. Methods
, 128:189-201 (1990)中所描述,可藉由如此項技術中已知之許多方法中之任一者實現T細胞之數目的擴增。在實施例中,藉由用OKT3抗體、IL-2及供給PBMC (例如經輻射同種異體PBMC)培養T細胞來進行T細胞之數目之擴增。
本發明TCR、多肽、蛋白質、核酸、重組表現載體及宿主細胞(包括其群體)可經分離及/或經純化。如本文所用,術語「經分離」意謂已自其自然環境移除。如本文所用,術語「經純化」意謂純度已增加,其中「純度」為相對術語,且不必理解為絕對純度。舉例而言,純度可為至少約50%,可大於約60%、約70%、約80%、約90%、約95%或可為約100%。
本發明TCR、多肽、蛋白質、核酸、重組表現載體及宿主細胞(包括其群體)在下文中皆統稱為「本發明TCR物質」,其可調配成組合物,諸如醫藥組合物。就此而言,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之TCR、多肽、蛋白質、核酸、表現載體及宿主細胞(包括其群體)中之任一者及醫藥學上可接受之載劑。含有本發明TCR物質中之任一者的本發明醫藥組合物可包含超過一種本發明TCR物質,例如多肽及核酸或兩種或更多種不同TCR。或者,醫藥組合物可包含本發明TCR物質與另一醫藥活性劑或藥物之組合,該醫藥活性劑或藥物諸如化學治療劑,例如天冬醯胺酶、硫酸布他卡因(busulfan)、卡鉑(carboplatin)、順鉑(cisplatin)、道諾黴素(daunorubicin)、阿黴素(doxorubicin)、氟尿嘧啶、吉西他濱(gemcitabine)、羥基脲、甲胺喋呤、太平洋紫杉醇、利妥昔單抗(rituximab)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)等。
較佳地,載劑為醫藥學上可接受之載劑。關於醫藥組合物,載劑可為習知用於考慮中之特定本發明TCR物質的彼等載劑中之任一者。用於製備可投與組合物之方法對熟習此項技術者為已知的或顯而易見的且更詳細地描述於例如Remington: The Science and Practice of Pharmacy
, 第22版,Pharmaceutical Press (2012)中。較佳地,醫藥學上可接受之載劑為在使用條件下不具有有害副作用或毒性之載劑。
載劑之選擇將部分由特定本發明TCR物質以及用於投與本發明TCR物質的特定方法決定。因此,存在本發明之醫藥組合物的多種適合調配物。適合之調配物可包括用於非經腸、皮下、靜脈內、肌內、動脈內、鞘內、瘤內或腹膜內投與之彼等調配物中之任一者。可使用超過一種途徑來投與本發明TCR物質,且在某些情況下,特定途徑可提供比另一種途徑更直接且更有效之反應。
較佳地,本發明TCR物質係藉由注射(例如經靜脈內注射)投與。當本發明TCR物質為表現本發明TCR的宿主細胞(或其群體)時,用於注射之細胞的醫藥學上可接受之載劑可包括任何等張載劑,諸如標準生理鹽水(約0.90% w/v之NaCl於水中、約300 mOsm/L NaCl於水中或每公升水約9.0 g NaCl)、NORMOSOL R電解質溶液(Abbott,Chicago,IL)、PLASMA-LYTE A (Baxter,Deerfield,IL)、約5%右旋糖於水中或林格氏乳酸鹽(Ringer's lactate)。在實施例中,醫藥學上可接受之載劑補充有人類血清白蛋白。
出於本發明之目的,投與的本發明TCR物質之量或劑量(例如當本發明TCR物質為一或多種細胞時,為細胞之數目)應足以在合理時段內在個體或動物中實現例如治療性或預防性反應。舉例而言,本發明TCR物質之劑量應足以在自投與之時間起約2小時或更長(例如12至24或更多個小時)之時段中結合於癌症抗原(例如突變RAS),或偵測、治療或預防癌症。在某些實施例中,該時段可更長。劑量將由特定本發明TCR物質之功效及待治療的動物(例如人類)之病況以及動物(例如人類)的體重決定。
用於確定投與劑量之諸多分析為此項技術中已知的。出於本發明之目的,可使用分析來測定待向哺乳動物投與之起始劑量,該分析包含在向各自被給予不同劑量之表現本發明TCR、多肽或蛋白質之T細胞的一組哺乳動物當中之一哺乳動物投與給定劑量之T細胞後,對此等T細胞溶解目標細胞或分泌IFN-γ的程度進行比較。在投與某一劑量後溶解目標細胞或分泌IFN-γ之程度可藉由此項技術中已知之方法分析。
本發明TCR物質之劑量亦將由可能伴隨特定本發明TCR物質之投與的任何不良副作用之存在、性質及程度決定。通常,主治醫師將考慮多種諸如年齡、體重、一般健康狀況、膳食、性別、待投與之本發明TCR物質、投與途徑及所治療癌症之嚴重程度的因素來決定用以治療各個別患者之本發明TCR物質的劑量。在本發明TCR物質為細胞群之實施例中,每次輸注投與之細胞的數目可例如自約1×106
至約1×1012
個細胞或更多變化。在某些實施例中,可投與少於1×106
個細胞。
一般熟習此項技術者將容易瞭解本發明之TCR物質可以多種方式進行修飾,使得經由修飾來提高本發明TCR物質之治療或預防功效。舉例而言,本發明TCR物質可直接地或間接地經由橋鍵與化學治療劑結合。將化合物與化學治療劑結合之實踐為此項技術中已知。一般熟習此項技術者認識到,本發明TCR物質上對於本發明TCR物質之功能並非必需之位點為適合用於連接橋鍵及/或化學治療劑之位點,其限制條件為橋鍵及/或化學治療劑在連接至本發明TCR物質後不干擾本發明TCR物質之功能,亦即結合於突變RAS或偵測、治療或預防癌症之能力。
預期本發明醫藥組合物、TCR、多肽、蛋白質、核酸、重組表現載體、宿主細胞及細胞群可用於治療或預防癌症之方法中。不受特定理論之束縛,咸信本發明TCR特異性結合於突變RAS,使得TCR (或相關之本發明多肽或蛋白質)在由細胞表現時,能夠介導針對表現突變RAS之目標細胞的免疫反應。就此而言,本發明提供一種治療或預防哺乳動物之癌症的方法,其包含以治療或預防哺乳動物之癌症有效之量向哺乳動物投與本文所描述之醫藥組合物、TCR、多肽或蛋白質中之任一者,包含編碼本文所描述之TCR、多肽、蛋白質中之任一者之核苷酸序列的任何核酸或重組表現載體,或包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之重組載體的任何宿主細胞或細胞群。
本發明之一實施例提供一種誘導哺乳動物中針對癌症之免疫反應的方法,其包含以誘導哺乳動物中針對癌症之免疫反應有效之量向哺乳動物投與本文所描述之醫藥組合物、TCR、多肽或蛋白質中之任一者,包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之核苷酸序列的任何核酸或重組表現載體,或包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之重組載體的任何宿主細胞或細胞群。
本發明之一實施例提供用於治療或預防哺乳動物之癌症的本文所描述之醫藥組合物、TCR、多肽或蛋白質中之任一者,包含編碼本文所描述之TCR、多肽、蛋白質中之任一者之核苷酸序列的任何核酸或重組表現載體,或包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之重組載體的任何宿主細胞或細胞群。
本發明之一實施例提供用於誘導哺乳動物中針對癌症之免疫反應的本文所描述之醫藥組合物、TCR、多肽或蛋白質中之任一者,包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之核苷酸序列的任何核酸或重組表現載體,或包含編碼本文所描述之TCR、多肽或蛋白質中之任一者之重組載體的任何宿主細胞或細胞群。
如本文所用,術語「治療」及「預防」以及自其衍生之字組不一定暗示100%或完全治療或預防。實際上,一般熟習此項技術者識別為具有潛在益處或治療作用的治療或預防存在變化之程度。就此而言,本發明方法可提供任何量的對哺乳動物之癌症的任何水準之治療或預防。此外,藉由本發明方法提供之治療或預防可包括治療或預防所治療或預防之癌症的一或多種病況或症狀。舉例而言,治療或預防可包括促進腫瘤之消退。此外,出於本文之目的,「預防」可涵蓋延緩癌症或其症狀或病況之發作。或者或另外,「預防」可涵蓋預防或延緩癌症或其症狀或病況之復發。
亦提供一種偵測哺乳動物中癌症之存在的方法。方法包含:(i)將包含來自哺乳動物之一或多個細胞之樣本與本文所描述之本發明TCR、多肽、蛋白質、核酸、重組表現載體、宿主細胞、細胞群或醫藥組合物中之任一者進行接觸,藉此形成複合物;及(ii)偵測複合物,其中複合物之偵測指示哺乳動物中癌症之存在。
關於偵測哺乳動物之癌症的本發明方法,細胞之樣本可為包含全細胞、其溶解物,或全細胞溶解物之一部分(例如核或細胞質部分、全蛋白部分或核酸部分)之樣本。
出於偵測癌症之本發明方法之目的,關於哺乳動物,接觸可活體外或活體內進行。較佳地,接觸係在活體外。
此外,複合物之偵測可經由此項技術中已知之許多方式進行。舉例而言,可用可偵測標記來標記本文所描述之本發明TCR、多肽、蛋白質、核酸、重組表現載體、宿主細胞或細胞群,該可偵測標記諸如放射性同位素、螢光團(例如異硫氰酸螢光素(FITC)、藻紅素(PE))、酶(例如鹼性磷酸酶、辣根過氧化酶)及元素粒子(例如金粒子)。
出於本發明方法之目的,其中投與宿主細胞或細胞群,細胞可為對於哺乳動物而言同種異體或自體之細胞。較佳地,細胞為對於哺乳動物而言自體的。
關於本發明方法,癌症可為任何癌症,包括例如急性淋巴球性癌症、急性骨髓性白血病、齒槽橫紋肌肉瘤、骨癌、腦癌、乳癌、肛門癌、肛管癌或肛腸癌、眼癌、肝內膽管癌、關節癌、頸癌、膽囊癌或胸膜癌、鼻癌、鼻腔癌或中耳癌、口腔癌、陰道癌、外陰癌、慢性淋巴球性白血病、慢性骨髓癌、大腸癌、大腸直腸癌、子宮內膜癌、食道癌、子宮頸癌、胃腸類癌瘤、神經膠質瘤、霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin lymphoma)、喉咽癌、腎臟癌、喉癌、肝癌、肺癌、惡性間皮瘤、黑素瘤、多發性骨髓瘤、鼻咽癌、非霍奇金氏淋巴瘤、口咽癌、卵巢癌、陰莖癌、胰臟癌、腹膜癌、腸網膜癌及腸系膜癌、咽癌、前列腺癌、直腸癌、腎癌、皮膚癌、小腸癌、軟組織癌、胃癌、睾丸癌、甲狀腺癌、子宮癌、尿管癌及膀胱癌中之任一者。較佳之癌症為胰臟癌、大腸直腸癌、肺癌、子宮內膜癌、卵巢癌或前列腺癌。較佳地,肺癌為肺腺癌,卵巢癌為上皮卵巢癌,且胰臟癌為胰臟腺癌。在本發明之實施例中,癌症表現突變人類RAS胺基酸序列,其中突變人類RAS胺基酸序列為突變人類KRAS胺基酸序列、突變人類HRAS胺基酸序列或突變人類NRAS胺基酸序列。由癌症表現之突變人類KRAS、突變人類HRAS及突變人類NRAS可如本文關於本發明之其他態樣所描述。
在本發明方法中所提及之哺乳動物可為任何哺乳動物。如本文所用,術語「哺乳動物」係指任何哺乳動物,包括但不限於嚙齒目之哺乳動物(諸如小鼠及倉鼠)及兔形目之哺乳動物(諸如兔)。較佳地,哺乳動物來自食肉目,包括貓科動物(貓)及犬科動物(狗)。更佳地,哺乳動物來自偶蹄目,包括牛科動物(奶牛)及豬科動物(豬);或奇蹄目,包括馬科動物(馬)。最佳地,哺乳動物為靈長目、猿目或猴目(猴)或類人猿目(人類及猿)。尤佳之哺乳動物為人類。
應注意,前述僅為實施例之實例。其他例示性實施例自本文中之全部描述顯而易見。一般熟習此項技術者亦應理解,此等實施例中之每一者可以各種組合與本文中所提供之其他實施例一起使用。
以下實例進一步說明本發明,但當然不應解釋為以任何方式限制其範疇。
實例1
此實例展現對RASG12V
具反應性的周邊血液淋巴細胞(PBL)的鑑別。
將PBL分選為CD4或CD8記憶T細胞及效應T細胞。
對富集CD4或CD8細胞之患者4360之PBL分開進行活體外刺激(IVS)。用載有10 µg/ml RASG12V
長肽(LP)(MTEYKLVVVGAVGVGKSALTIQLI,SEQ ID NO: 30)之DC刺激PBL。刺激兩周後,對T細胞進行再刺激及FACS分選。圖1A展示流式細胞測量術分析點陣圖,其展示閘控策略,其中對高度表現OX40及41BB表面標記之CD4淋巴T細胞進行分選,之後進行RASG12V
LP IVS (用DMSO處理之DC用作陰性對照)。隨後如圖1A所指示,對經分選細胞進行分選,且使用快速擴增(REP)擴增14天。
隨後用載有10 µg/ml RASG12V
LP之DC或用DMSO處理之DC刺激經擴增細胞。如圖1B中所指示,隨後將高度表現OX40及41BB表面標記之CD4淋巴T細胞分選至96孔盤中以供單細胞定序。
藉由與經WT/突變串聯袖珍基因(TMG)轉染或載有1 µg/ml的RASG12V
LP (SEQ ID NO: 30)或RASWT
LP (MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLI,SEQ ID NO: 27)或用當量DMSO處理之DC共培養來測試上文IVS之後的細胞針對RAS之反應性。將經刺激且隨後使用REP擴增,但並未如上文及圖1A中所描述進行分選的細胞(「未分選」細胞)或僅與IL2一起生長且並未用攜帶RAS抗原之DC刺激的細胞(「未IVS」細胞)用作對照。此外,分別將含有及不含有抗CD28/CD3珠粒之T細胞用作陰性及陽性對照。隔夜共培養後,藉由IFN-γ ELISpot (圖1C)且藉由流式細胞測量術針對活/CD3+
/CD4+
閘控群體中之41BB/OX40表面標記上調(圖1D)分析細胞。
實例2
此實例展現實例1之PBL之表徵。
在RASG12V
LP IVS (包括分選後之一次REP)之後,如圖1B中84.2%之細胞中所示,對實例1之CD4 PBL細胞進行測試。將細胞與載有各種濃度的RASG12V
LP或RASWT
LP之DC共培養。隔夜共培養後,使用IFN-γ ELISpot (圖2A)及流式細胞測量術(圖2B,活/CD3+
/CD4+
閘控群體中之41BB/OX40表面標記上調)分析細胞。觀測到對RASG12V
之強親合力(下至約10 pg/mL LP)。
使用IFN-γ ELISpot (圖3 ,左軸及條柱)及41BB/OX40流式細胞測量術分析(圖3,右軸及圓圈)鑑別由經歷RASG12V
LP IVS之CD4 PBL識別的MHC-II限制元件。將細胞與經含有患者之MHC-II α鏈及β鏈之不同組合的DNA質體轉染且載有RASG12V
LP之COS7共培養。發現細胞針對由DPB1*03:01限制之RASG12V
的反應性。
實例3
此實例展現根據本發明之實施例鑑別實例2之PBL之TCR。
對藉由自LP IVS (在如圖1B中所示及實例1中所說明的細胞之84.2%內)後之患者4360 CD4 PBL進行單細胞定序而鑑別的兩種TCR (TCR1,TCR2)進行定序。
表6展示4360 TCR1之序列,CDR序列加底線。
表6
TCR 名稱 | TCR 鏈 | 胺基酸序列 |
4360 TCR1 | α鏈可變區(TRAV17*01+TRAJ58*01)(含有WT N端訊息肽) | METLLGVSLVILWLQLAVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 7) 或 METLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 129) |
α鏈可變區(TRAV17*01+TRAJ58*01)(含有變體N端訊息肽) | MATLLGVSLVILWLQLAVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 63) 或 MATLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 130) | |
β鏈可變區(TRBV20-1*03 + TRBJ1-5*01 + TRBD1*01)(含有變體N端訊息肽) | MALLLLLLGPGISLLLPGSLAGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL(SEQ ID NO: 8) 或 MALLLLLLGPGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL (SEQ ID NO: 65) | |
β鏈可變區(TRBV20-1*03 + TRBJ1-5*01 + TRBD1*01)(含有WT N端訊息肽) | MLLLLLLLGPGISLLLPGSLAGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL(SEQ ID NO: 64) 或 MLLLLLLLGPGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL (SEQ ID NO: 66) | |
α (TRAV17*01+TRAJ58*01)(不含N端訊息肽之IMGT預測序列) | SQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 47) | |
β (TRBV20-1*03 + TRBJ1-5*01 + TRBD1*01)(不含N端訊息肽之IMGT預測序列) | GAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL(SEQ ID NO: 48) | |
α (TRAV17*01+TRAJ58*01) (不含N端訊息肽之SignalP預測序列) | QQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINN LQWYRQNSGRGLVHLILIRSNERE KHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDGETSGSRLT FGEGTQLTVNP(SEQ ID NO: 67) | |
β (TRBV20-1*03 + TRBJ1-5*01 + TRBD1*01)(不含N端訊息肽之SignalP預測序列) | GSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL(SEQ ID NO: 68) 或 AVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASRGATGQPQH FGDGTRLSIL (SEQ ID NO: 76) |
發現TCR2具有CDR3β序列ASSSGTGVAEAF (SEQ ID NO: 26)。亦發現該序列具有在第一胺基酸(丙胺酸)之N端的半胱胺酸及在最後胺基酸(苯丙胺酸)之C端的苯丙胺酸。
來自四個腫瘤片段的DNA提取物之深度定序(Adaptive Biotechnologies, Seattle, WA, USA)揭露TCR1存在於此等片段中之一者中(100,000個細胞中之5.7個重複),但TCR2不存在於任何片段中。
實例4
此實例展現根據本發明之實施例構築編碼TCR1及TCR2之反轉錄病毒載體。
構築基於MSGV1之反轉錄病毒載體,其編碼TCR1之TCR α鏈及β鏈可變區,不同之處在於β鏈之N端訊息肽之位置2處的胺基酸殘基變成丙胺酸以便有助於選殖至載體中。如下文更詳細地描述進行野生型TCR之額外修飾。
如先前描述進行CD22特異性TCR之構築(Jin等人, JCI Insight, 3(8): e99488 (2018),以全文引用之方式併入本文中)。簡言之,使TCRβ VDJ區與小鼠TCRβ恆定鏈融合,且使TCRα VJ區與小鼠TCRα恆定鏈融合。不受特定理論或機制束縛,咸信使用鼠類恆定區可改善TCR表現及功能(Cohen等人, Cancer Res., 66(17): 8878-8886 (2006))。
另外,鼠類TCRα及TCRβ恆定鏈經半胱胺酸修飾,且將跨膜疏水性突變引入至鼠類TCRα恆定鏈中。不受特定理論或機制束縛,咸信此等修飾使得所引入之TCR鏈優先配對且TCR表面表現及功能增強(Cohen等人, Cancer Res., 67(8):3898-903 (2007);Haga-Friedman等人, J. Immu., 188: 5538-5546 (2012))。
TCRβ鏈及TCRα鏈藉由Furin SGSG P2A連接子(RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP)(SEQ ID NO: 25)分隔開,以確保兩個鏈之表現效率相當(Szymczak等人, Nat. Biotechnol., 22(5):589-94 (2004))。
為允許將TCR表現卡匣選殖至MSGV1載體5'NcoI位點中,將TCRVβ鏈中之第二胺基酸(N端訊息肽內之第二胺基酸)變成丙胺酸(A)。表現卡匣具有以下構形:5'NcoI-VDJβ-mCβ-Furin/SGSG/P2A-VJα-mCα-SalI3'。TCR之核苷酸序列藉由Genscript密碼子最佳化工具經密碼子最佳化以進行人類T細胞表現。此實例描述以5'TCRβ至TCRα 3'定向合成雙順反子載體,但TCRβ至TCRα之次序可逆轉。載體插入序列經密碼子最佳化以表現於人類組織中。
實例5
此實例展現根據本發明之實施例使用實例4之反轉錄病毒載體表徵如實例中3所鑑別的實例2之PBL之TCR。
TCR1及TCR2中之每一者經病毒轉導至Jurkat-CD4-NFAT-螢光素酶細胞株中,且隨後與載有1 µg/ml的RASG12V
LP、RASWT
LP之DC或用當量DMSO處理之DC共培養。量測螢光素酶活性(圖4A)。
患者4360之PBL經TCR1或TCR2轉導,或用於陰性對照,經WT GFP、空質體(模擬物)轉導或未經轉導。用於陽性對照,使用LP IVS之後的PBL(來自實例1,圖1及圖2)。隨後使細胞與載有RASG12V
LP或RASWT
LP之自體DC共培養或與經RASG12V
全長(FL)(SEQ ID NO:14)或RASWT
FL(SEQ ID NO: 10)轉染之自體DC mRNA共培養。將單獨培養之T細胞及與DMSO一起培養之PBL用作陰性對照。將用結合抗CD3/抗CD28抗體之戴諾磁珠活化的PBL用作陽性對照。此外,將LP IVS後之PBL用作陽性對照。藉由流式細胞測量術分析針對CD3+
/CD8+
閘控細胞(圖4B)或CD3+
/CD4+
閘控細胞(圖4C)之4-1BB及OX40 (4-1BB+/OX40+百分比)表現評定TCR反應性。
實例6
此實例展現,發現IVS後之TIL對RASG12V
具反應性且識別與TCR1相同之MHC-II限制。
將TIL片段用作細胞來源且藉由IVS刺激。使TIL與用RASG12V
LP肽脈衝之自體DC共培養或與經RASG12V
FL轉染之自體DC RNA共培養。在IVS之任何階段,若細胞不足,則將一些片段與其他片段合併一起。將單獨培養及與載有DMSO之DC共培養之T細胞(TIL)用作陰性對照。將用結合抗CD3/抗CD28抗體之戴諾磁珠培養的TIL用作陽性對照。藉由利用流式細胞測量術(圖5A)量測41BB及OX40之表現及藉由IFN-γ ELISPOT量測IFN-γ分泌(表7)來測試IVS後之TIL的反應性。
表7
* 合併之TIL
每3×104 個細胞之斑點數 | ||||
F4 LP | *F3 LP | *F22 LP | *F6 FL | |
RASWT FL | 47 | 58 | 593 | 68 |
RASG12V FL | 1108 | 371 | 1278 | 240 |
RASWT LP | 55 | 93 | 742 | 61 |
RASG12V LP | 1070 | 393 | 1508 | 286 |
DMSO | 14 | 91 | 708 | 55 |
T cell only | 9 | 22 | 527 | 51 |
CD3/CD28 戴諾磁珠 | 715 | 795 | 994 | 446 |
使用IFN-γ ELISpot測定藉由IVS之後的4360 CD4 TIL識別的MHC-II限制元件。將細胞與經含有患者之MHC-II α鏈及β鏈之不同組合的DNA質體轉染且載有RASG12V
LP之COS7共培養。將經TCR 1病毒轉導之PBL用作陽性對照。結果在圖5B中。發現IVS後之TIL識別與TCR1相同之MHC-II限制。
實例7
此實例展現發現於TIL中之TCR留存於腫瘤片段中。
使用單細胞定序,如實例6中所描述自IVS後之TIL發現六個額外TCR序列(TCR 5至10)。
表8展示4360 TCR5之序列,CDR序列加底線。
表8
TCR 名稱 | TCR 鏈 | 胺基酸序列 |
4360 TCR5 | α鏈可變區(TRAV13-2*01 + TRAJ23*01)(含有WT N端訊息肽) | MAGIRALFMYLWLQLDWVSRGESVGLHLPTLSVQEGDNSIINCAYSNSASDY FIWYKQESGKGPQFIIDIRSNMDK RQGQRVTVLLNKTVKHLSLQIAATQPGDSAVYFCAERGRGGKLI FGQGTELSVKP(SEQ ID NO: 37) |
β鏈可變區(TRBV20-1*01 + TRBJ2-3*01 + TRBD1*01)(含有變體N端訊息肽) | MALLLLLLGPGISLLLPGSLAGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 38) 或 MALLLLLLGPGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 69) | |
β鏈可變區(TRBV20-1*01 + TRBJ2-3*01 + TRBD1*01)(含有WT N端訊息肽) | MLLLLLLLGPGISLLLPGSLAGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 70) 或 MLLLLLLLGPGSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 71) | |
α (TRAV13-2*01 + TRAJ23*01)(不含N端訊息肽之IMGT預測序列) | GESVGLHLPTLSVQEGDNSIINCAYSNSASDY FIWYKQESGKGPQFIIDIRSNMDK RQGQRVTVLLNKTVKHLSLQIAATQPGDSAVYFCAERGRGGKLI FGQGTELSVKP(SEQ ID NO: 49) | |
β (TRBV20-1*01 + TRBJ2-3*01 + TRBD1*01) )(不含N端訊息肽之IMGT預測序列) | GAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 50) | |
α (TRAV13-2*01 + TRAJ23*01) )(不含N端訊息肽之SignalP預測序列) | ESVGLHLPTLSVQEGDNSIINCAYSNSASDY FIWYKQESGKGPQFIIDIRSNMDK RQGQRVTVLLNKTVKHLSLQIAATQPGDSAVYFCAERGRGGKLI FGQGTELSVKP(SEQ ID NO: 72) | |
β (TRBV20-1*01 + TRBJ2-3*01 + TRBD1*01) (不含N端訊息肽之SignalP預測序列) | GSGLGAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 73) 或 AVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATT MFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKA TYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSAGRASTDTQY FGPGTRLTVL(SEQ ID NO: 102) |
發現TCR 6-10具有以下CDR3β序列。TCR 6:ASTLQGRAGANVLT (SEQ ID NO: 29);TCR 7:ASSQPGLAGGGDTQY (SEQ ID NO: 59);TCR 8:ASSQSTSGSGSSIQY (SEQ ID NO: 60);TCR 9:ATSRDVGSVEQY (SEQ ID NO: 61);TCR10:ASSPNAGNTEAF (SEQ ID NO: 62)。發現TCR 5-10具有第一胺基酸(絲胺酸/丙胺酸)之N端的半胱胺酸,且發現TCR 5-9具有最後胺基酸(酪胺酸/苯丙胺酸)之C端的苯丙胺酸。
自患者4360之四個不同腫瘤片段(FrTu)的深度定序之結果顯示,TCR 5存在於所有所測試片段中,TCR 6、8及9存在於一個片段中,TCR 7存在於兩個片段中,且TCR 10不存在。
藉由與載有RASG12V
或RASWT
LP之自體DC共培養來測試經TCR病毒轉導之PBL的反應性。將載有DMSO之DC用作陰性對照。將用結合抗CD3/抗CD28抗體之戴諾磁珠培養的PBL用作陽性對照。進行IFN-γ ELISPOT量測(圖6)。TCR 6、7、9或10中未偵測到反應性。TCR8在所有實驗中展現反應性且不進一步進行。
實例8
此實例展現根據本發明之實施例構築編碼TCR5之反轉錄病毒載體。
構築基於MSGV1之反轉錄病毒載體,其編碼TCR1之TCR α鏈及β鏈可變區,不同之處在於β鏈之N端訊息肽之位置2處的胺基酸殘基變成丙胺酸以便有助於選殖至載體中。如下文更詳細地描述進行野生型TCR之額外修飾。
如先前描述進行CD22特異性TCR之構築(Jin等人, JCI Insight, 3(8): e99488 (2018),以全文引用之方式併入本文中)。簡言之,使TCRβ VDJ區與小鼠TCRβ恆定鏈融合,且使TCRα VJ區與小鼠TCRα恆定鏈融合。不受特定理論或機制束縛,咸信使用鼠類恆定區可改善TCR表現及功能(Cohen等人, Cancer Res., 66(17): 8878-8886 (2006))。
另外,鼠類TCRα及TCRβ恆定鏈經半胱胺酸修飾,且將跨膜疏水性突變引入至鼠類TCRα恆定鏈中。不受特定理論或機制束縛,咸信此等修飾使得所引入之TCR鏈優先配對且TCR表面表現及功能增強(Cohen等人, Cancer Res., 67(8):3898-903 (2007);Haga-Friedman等人, J. Immu., 188: 5538-5546 (2012))。
TCRβ鏈及TCRα鏈藉由Furin SGSG P2A連接子(RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP)(SEQ ID NO: 25)分隔開,以確保兩個鏈之表現效率相當(Szymczak等人, Nat. Biotechnol., 22(5):589-94 (2004))。
為允許將TCR表現卡匣選殖至MSGV1載體5'NcoI位點中,將TCRVβ鏈中之第二胺基酸(N端訊息肽內之第二胺基酸)變成丙胺酸(A)。表現卡匣具有以下構形:5'NcoI-VDJβ-mCβ-Furin/SGSG/P2A-VJα-mCα-SalI3'。TCR之核苷酸序列藉由Genscript密碼子最佳化工具經密碼子最佳化以進行人類T細胞表現。此實例描述以5'TCRβ至TCRα 3'定向合成雙順反子載體,但TCRβ至TCRα之次序可逆轉。載體插入序列經密碼子最佳化以表現於人類組織中。
實例9
此實例展現根據本發明之實施例的TCR1及TCR5之親合力。
使用實例4及8中所描述之反轉錄病毒載體將TCR1及TCR5病毒轉導至PBL中,隨後將PBL與載有不同濃度之RASG12V
LP或RASWT
LP的自體DC共培養。4-1BB及OX40 (4-1BB+/OX40+百分比)表現之流式細胞測量術分析及IFN-γ分泌之ELISPOT量測的結果(每3×104
個細胞的斑點數目)展示於圖7A至圖7G中。
本文所引用之所有參考文獻(包括公開案、專利申請案及專利)以引用之方式併入本文中,該引用程度就如同個別及特定地指示各參考文獻以引用之方式併入且於本文中全文闡述一般。
除非本文另外指示或明顯與上下文矛盾,否則在描述本發明之上下文中(尤其在以下申請專利範圍的上下文中),使用術語「一」及「該」以及「至少一者」及類似提及物應解釋為涵蓋單數及複數兩者。除非本文另外指示或明顯與上下文矛盾,否則使用接一或多個項目之清單之術語「至少一者」(例如「A及B中之至少一者」)應解釋為意謂選自所列項目之一個項目(A或B)或所列項目中之兩者或更多者之任何組合(A及B)。除非另外指出,否則術語「包含」、「具有」、「包括」及「含有」應解釋為開放式術語(亦即,意謂「包括但不限於」)。除非本文另外指示,否則本文之值範圍之列舉僅意欲充當個別地提及屬於該範圍內之各獨立值的簡寫方法,且各獨立值併入至本說明書中,如同在本文中單獨列舉一般。除非本文另外指示或以其他方式明顯與上下文相矛盾,否則本文所描述之所有方法可以任何適合之次序執行。除非另外主張,否則使用本文所提供之任何及所有實例或例示性語言(例如,「諸如」)僅意欲較佳地闡明本發明而不對本發明之範疇造成限制。本說明書中之語言不應理解為指示實踐本發明所必需之任何未主張要素。
本文描述本發明之較佳實施例,包括本發明人已知用於實施本發明之最佳模式。在閱讀前述描述之後,彼等較佳實施例之變化形式對於一般熟習此項技術者可變得顯而易見。本發明人期望熟習此項技術者適當時採用該等變化形式,且本發明人意欲以不同於本文中特定描述之其他方式來實施本發明。因此,若適用法律准許,則本發明包括在隨附於本文之申請專利範圍中所敍述之主題之所有修改及等效物。此外,除非本文另外指示或以其他方式明顯與上下文矛盾,否則本發明涵蓋上文所描述之要素以其所有可能變化形式之任何組合。
圖1A呈現流式細胞測量術點陣圖,展示在用於選擇進行擴增之T細胞的活體外刺激(IVS)方案期間的細胞分選。REP為快速擴增方案。
圖1B呈現流式細胞測量術點陣圖,展示在如圖1A中所示選擇及擴增T細胞之後的活體外刺激(IVS)方案期間的細胞分選。
圖1C為展示如圖1B中所示分選之細胞的IFN-γ ELISpot分析結果的曲線圖。
圖1D為展示如圖1B中所示分選的細胞中之41BB/OX40表面標記上調的分析結果的曲線圖。
圖2A為展示與載有RASG12V
LP或RASWT
LP之DC共培養之細胞的IFN-γ ELISpot分析結果的曲線圖。
圖2B為展示與載有RASG12V
LP或RASWT
LP之DC共培養之細胞中的41BB/OX40表面標記上調之分析結果的曲線圖。
圖3為展示用於鑑別由TCR識別之MHC-II限制元件的IFN-γ ELISpot及41BB/OX40流式細胞測量術分析結果的曲線圖。
圖4A為展示針對Jurkat-CD4-NFAT-螢光素酶細胞株量測且隨後與載有RASG12V
、RASWT
LP或等量DMSO之DC共培養的螢光素酶活性的條形圖。
圖4B及圖4C為展示藉由針對CD3+
/CD8+
閘控細胞(圖4B)或CD3+
/CD4+
閘控細胞(圖4C)之4-1BB及OX40 (4-1BB+/OX40+百分比)表現之流式細胞測量術分析評定的TCR反應性的曲線圖。(-)為未經轉導。
圖5A為展示藉由指定片段之TIL之流式細胞測量術量測的41BB及OX40表現的曲線圖,該等指定片段經IVS刺激且與用RASG12V
LP肽脈衝之自體DC或經RASG12V
FL轉染之RNA共培養。陰性對照:單獨共培養之T細胞,用載有DMSO之DC培養的PBL。陽性對照:用抗CD3/抗CD28抗體結合戴諾磁珠(Dynabead)培養的PBL。*表示細胞之合併。
圖5B呈現用於鑑別由TIL識別之MHC-II限制元件的IFN-γ ELISpot結果。
圖6呈現TCR 65至10與TCR1比較之IFN-γ ELISpot結果。
圖7A至圖7D呈現展示針對CD4 (圖7A)或CD8 (圖7B)閘控的經TCR1轉導之PBL及針對CD4 (圖7C)或CD8 (圖7D)閘控的經TCR5轉導之PBL的4-1BB及OX40 (4-1BB+/OX40+百分比)表現的流式細胞測量術分析結果的曲線圖。
圖7E至圖7G呈現展示富集CD4細胞(圖7E)或CD8細胞(圖7F)的經TCR1轉導PBL及分離成CD4或CD8細胞(圖7G)的經TCR5轉導PBL之IFN-γ分泌之ELISPOT量測結果的曲線圖。
Claims (60)
- 一種經分離或經純化T細胞受體(TCR),其包含以下之胺基酸序列: (a) SEQ ID NO: 1-3全部, (b) SEQ ID NO: 4-6全部, (c) SEQ ID NO: 31-33全部, (d) SEQ ID NO: 34-36全部, (e) SEQ ID NO: 1-6全部,或 (f) SEQ ID NO: 31-36全部, 其中該TCR對由人類白血球抗原(HLA)第II類分子呈現之突變人類RAS胺基酸序列具有抗原特異性,且 其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)或突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列。
- 如請求項1之經分離或經純化TCR,其中該突變人類RAS胺基酸序列為SEQ ID NO: 30。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其中該TCR對SEQ ID NO: 27之野生型人類RAS胺基酸序列不具有抗原特異性。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其中該HLA第II類分子為HLA-DP分子。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其中該HLA第II類分子為HLA-DPB1分子。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其中該HLA第II類分子為HLA-DPB1*03:01分子。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其包含以下之胺基酸序列: (i)與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (ii)與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (iii)與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (iv)與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (v)與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (vi)與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (vii)與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (viii)與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (ix)與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (x)與SEQ ID NO: 38之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xi)與SEQ ID NO: 69之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xii)與SEQ ID NO: 70之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xiii)與SEQ ID NO: 71之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xiv)與SEQ ID NO: 47之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xv)與SEQ ID NO: 48之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xvi)與SEQ ID NO: 49之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xvii)與SEQ ID NO: 50之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xviii)與SEQ ID NO: 67之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xix)與SEQ ID NO: 68之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xx)與SEQ ID NO: 76之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxi)與SEQ ID NO: 72之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxii)與SEQ ID NO: 73之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxiii)與SEQ ID NO: 102之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列,或 (xxxix) (i)及(iii)兩者;(i)及(vi)兩者;(i)及(vii)兩者;(i)及(viii)兩者;(ii)及(iii)兩者;(ii)及(vi)兩者;(ii)及(vii)兩者;(ii)及(viii)兩者;(iii)及(iv)兩者;(iii)及(v)兩者;(iv)及(vi)兩者;(iv)及(vii)兩者;(iv)及(viii)兩者;(v)及(vi)兩者;(v)及(vii)兩者;(v)及(viii)兩者;(ix)及(x)兩者;(ix)及(xi)兩者;(ix)及(xii)兩者;(ix)及(xiii)兩者;(xiv)及(xv)兩者;(xvi)及(xvii)兩者;(xviii)及(xix)兩者;(xviii)及(xx)兩者;(xxi)及(xxii)兩者;或(xxi)及(xxiii)兩者。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其包含以下之胺基酸序列: (i) SEQ ID NO: 7, (ii) SEQ ID NO: 129, (iii) SEQ ID NO: 8, (iv) SEQ ID NO: 63, (v) SEQ ID NO: 130, (vi) SEQ ID NO: 64, (vii) SEQ ID NO: 65, (viii) SEQ ID NO: 66, (ix) SEQ ID NO: 37, (x) SEQ ID NO: 38, (xi) SEQ ID NO: 69, (xii) SEQ ID NO: 70, (xiii) SEQ ID NO: 71, (xiv) SEQ ID NO: 47, (xv) SEQ ID NO: 48, (xvi) SEQ ID NO: 49, (xvii) SEQ ID NO: 50, (xviii) SEQ ID NO: 67, (xix) SEQ ID NO: 68, (xx) SEQ ID NO: 76, (xxi) SEQ ID NO: 72, (xxii) SEQ ID NO: 73, (xxiii) SEQ ID NO: 102,或 (xxxix) (i)及(iii)兩者;(i)及(vi)兩者;(i)及(vii)兩者;(i)及(viii)兩者;(ii)及(iii)兩者;(ii)及(vi)兩者;(ii)及(vii)兩者;(ii)及(viii)兩者;(iii)及(iv)兩者;(iii)及(v)兩者;(iv)及(vi)兩者;(iv)及(vii)兩者;(iv)及(viii)兩者;(v)及(vi)兩者;(v)及(vii)兩者;(v)及(viii)兩者;(ix)及(x)兩者;(ix)及(xi)兩者;(ix)及(xii)兩者;(ix)及(xiii)兩者;(xiv)及(xv)兩者;(xvi)及(xvii)兩者;(xviii)及(xix)兩者;(xviii)及(xx)兩者;(xxi)及(xxii)兩者;或(xxi)及(xxiii)兩者。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其進一步包含: (a) α鏈恆定區,其包含與SEQ ID NO: 17之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b) β鏈恆定區,其包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其進一步包含: (a)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列的α鏈恆定區,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列的β鏈恆定區,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其包含: (a)包含與SEQ ID NO: 21之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含與SEQ ID NO: 131之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含與SEQ ID NO: 22之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含與SEQ ID NO: 79之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含與SEQ ID NO: 80之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含與SEQ ID NO: 85之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含與SEQ ID NO: 88之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含與SEQ ID NO: 41之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含與SEQ ID NO: 42之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含與SEQ ID NO: 105之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含與SEQ ID NO: 110之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含與SEQ ID NO: 113之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含與SEQ ID NO: 55之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含與SEQ ID NO: 56之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含與SEQ ID NO: 93之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含與SEQ ID NO: 94之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含與SEQ ID NO: 99之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含與SEQ ID NO: 57之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含與SEQ ID NO: 58之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含與SEQ ID NO: 116之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含與SEQ ID NO: 117之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含與SEQ ID NO: 122之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含與SEQ ID NO: 23之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (cc)包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (dd)包含與SEQ ID NO: 24之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ee)包含與SEQ ID NO: 83之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ff)包含與SEQ ID NO: 136之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (gg)包含與SEQ ID NO: 84之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (hh)包含與SEQ ID NO: 87之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ii)包含與SEQ ID NO: 90之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (jj)包含與SEQ ID NO: 77之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (kk)包含與SEQ ID NO: 132之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ll)包含與SEQ ID NO: 78之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (mm)包含與SEQ ID NO: 81之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (nn)包含與SEQ ID NO: 135之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (oo)包含與SEQ ID NO: 82之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (pp)包含與SEQ ID NO: 86之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (qq)包含與SEQ ID NO: 89之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (rr)包含與SEQ ID NO: 39之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ss)包含與SEQ ID NO: 40之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (tt)包含與SEQ ID NO: 107之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (uu)包含與SEQ ID NO: 112之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (vv)包含與SEQ ID NO: 115之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ww)包含與SEQ ID NO: 103之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (xx)包含與SEQ ID NO: 104之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (yy)包含與SEQ ID NO: 106之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (zz)包含與SEQ ID NO: 111之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (aaa)包含與SEQ ID NO: 114之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含與SEQ ID NO: 51之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ggg)包含與SEQ ID NO: 52之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (hhh)包含與SEQ ID NO: 97之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (iii)包含與SEQ ID NO: 98之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (jjj)包含與SEQ ID NO: 101之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (kkk)包含與SEQ ID NO: 91之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (lll)包含與SEQ ID NO: 92之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (mmm)包含與SEQ ID NO: 95之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (nnn)包含與SEQ ID NO: 96之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ooo)包含與SEQ ID NO: 100之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ppp)包含與SEQ ID NO: 53之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (qqq)包含與SEQ ID NO: 54之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (rrr)包含與SEQ ID NO: 120之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (sss)包含與SEQ ID NO: 121之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ttt)包含與SEQ ID NO: 124之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (uuu)包含與SEQ ID NO: 108之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (vvv)包含與SEQ ID NO: 109之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (www)包含與SEQ ID NO: 118之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (xxx)包含與SEQ ID NO: 119之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (yyy)包含與SEQ ID NO: 123之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 如請求項1或2之經分離或經純化TCR,其包含: (a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含SEQ ID NO: 23之胺基酸序列的α鏈; (cc)包含SEQ ID NO: 133之胺基酸序列的α鏈; (dd)包含SEQ ID NO: 24之胺基酸序列的β鏈; (ee)包含SEQ ID NO: 83之胺基酸序列的α鏈; (ff)包含SEQ ID NO: 136之胺基酸序列的α鏈; (gg)包含SEQ ID NO: 84之胺基酸序列的β鏈; (hh)包含SEQ ID NO: 87之胺基酸序列的β鏈; (ii)包含SEQ ID NO: 90之胺基酸序列的β鏈; (jj)包含SEQ ID NO: 77之胺基酸序列的α鏈; (kk)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列的α鏈; (ll)包含SEQ ID NO: 78之胺基酸序列的β鏈; (mm)包含SEQ ID NO: 81之胺基酸序列的α鏈; (nn)包含SEQ ID NO: 135之胺基酸序列的α鏈; (oo)包含SEQ ID NO: 82之胺基酸序列的β鏈; (pp)包含SEQ ID NO: 86之胺基酸序列的β鏈; (qq)包含SEQ ID NO: 89之胺基酸序列的β鏈; (rr)包含SEQ ID NO: 39之胺基酸序列的α鏈; (ss)包含SEQ ID NO: 40之胺基酸序列的β鏈; (tt)包含SEQ ID NO: 107之胺基酸序列的β鏈; (uu)包含SEQ ID NO: 112之胺基酸序列的β鏈; (vv)包含SEQ ID NO: 115之胺基酸序列的β鏈; (ww)包含SEQ ID NO: 103之胺基酸序列的α鏈; (xx)包含SEQ ID NO: 104之胺基酸序列的β鏈; (yy)包含SEQ ID NO: 106之胺基酸序列的β鏈; (zz)包含SEQ ID NO: 111之胺基酸序列的β鏈; (aaa)包含SEQ ID NO: 114之胺基酸序列的β鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列的α鏈; (ggg)包含SEQ ID NO: 52之胺基酸序列的β鏈; (hhh)包含SEQ ID NO: 97之胺基酸序列的α鏈; (iii)包含SEQ ID NO: 98之胺基酸序列的β鏈; (jjj)包含SEQ ID NO: 101之胺基酸序列的β鏈; (kkk)包含SEQ ID NO: 91之胺基酸序列的α鏈; (lll)包含SEQ ID NO: 92之胺基酸序列的β鏈; (mmm)包含SEQ ID NO: 95之胺基酸序列的α鏈; (nnn)包含SEQ ID NO: 96之胺基酸序列的β鏈; (ooo)包含SEQ ID NO: 100之胺基酸序列的β鏈; (ppp)包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列的α鏈; (qqq)包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列的β鏈; (rrr)包含SEQ ID NO: 120之胺基酸序列的α鏈; (sss)包含SEQ ID NO: 121之胺基酸序列的β鏈; (ttt)包含SEQ ID NO: 124之胺基酸序列的β鏈; (uuu)包含SEQ ID NO: 108之胺基酸序列的α鏈; (vvv)包含SEQ ID NO: 109之胺基酸序列的β鏈; (www)包含SEQ ID NO: 118之胺基酸序列的α鏈; (xxx)包含SEQ ID NO: 119之胺基酸序列的β鏈; (yyy)包含SEQ ID NO: 123之胺基酸序列的β鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 一種經分離或經純化多肽,其包含如請求項1至12中任一項之TCR之功能部分,其中該功能部分包含以下之胺基酸序列: (a) SEQ ID NO: 1-3全部, (b) SEQ ID NO: 4-6全部, (c) SEQ ID NO: 31-33全部, (d) SEQ ID NO: 34-36全部, (e) SEQ ID NO: 1-6全部,或 (f) SEQ ID NO: 31-36全部。
- 如請求項13之經分離或經純化多肽,其中該功能部分包含以下之胺基酸序列: (i)與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (ii)與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (iii)與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (iv)與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (v)與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (vi)與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (vii)與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (viii)與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (ix)與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (x)與SEQ ID NO: 38之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xi)與SEQ ID NO: 69之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xii)與SEQ ID NO: 70之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xiii)與SEQ ID NO: 71之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xiv)與SEQ ID NO: 47之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xv)與SEQ ID NO: 48之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xvi)與SEQ ID NO: 49之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xvii)與SEQ ID NO: 50之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xviii)與SEQ ID NO: 67之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xix)與SEQ ID NO: 68之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xx)與SEQ ID NO: 76之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxi)與SEQ ID NO: 72之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxii)與SEQ ID NO: 73之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列, (xxiii)與SEQ ID NO: 102之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列,或 (xxxix) (i)及(iii)兩者;(i)及(vi)兩者;(i)及(vii)兩者;(i)及(viii)兩者;(ii)及(iii)兩者;(ii)及(vi)兩者;(ii)及(vii)兩者;(ii)及(viii)兩者;(iii)及(iv)兩者;(iii)及(v)兩者;(iv)及(vi)兩者;(iv)及(vii)兩者;(iv)及(viii)兩者;(v)及(vi)兩者;(v)及(vii)兩者;(v)及(viii)兩者;(ix)及(x)兩者;(ix)及(xi)兩者;(ix)及(xii)兩者;(ix)及(xiii)兩者;(xiv)及(xv)兩者;(xvi)及(xvii)兩者;(xviii)及(xix)兩者;(xviii)及(xx)兩者;(xxi)及(xxii)兩者;或(xxi)及(xxiii)兩者。
- 如請求項13之經分離或經純化多肽,其中該功能部分包含以下之胺基酸序列: (i) SEQ ID NO: 7, (ii) SEQ ID NO: 129, (iii) SEQ ID NO: 8, (iv) SEQ ID NO: 63, (v) SEQ ID NO: 130, (vi) SEQ ID NO: 64, (vii) SEQ ID NO: 65, (viii) SEQ ID NO: 66, (ix) SEQ ID NO: 37, (x) SEQ ID NO: 38, (xi) SEQ ID NO: 69, (xii) SEQ ID NO: 70, (xiii) SEQ ID NO: 71, (xiv) SEQ ID NO: 47, (xv) SEQ ID NO: 48, (xvi) SEQ ID NO: 49, (xvii) SEQ ID NO: 50, (xviii) SEQ ID NO: 67, (xix) SEQ ID NO: 68, (xx) SEQ ID NO: 76, (xxi) SEQ ID NO: 72, (xxii) SEQ ID NO: 73, (xxiii) SEQ ID NO: 102,或 (xxxix) (i)及(iii)兩者;(i)及(vi)兩者;(i)及(vii)兩者;(i)及(viii)兩者;(ii)及(iii)兩者;(ii)及(vi)兩者;(ii)及(vii)兩者;(ii)及(viii)兩者;(iii)及(iv)兩者;(iii)及(v)兩者;(iv)及(vi)兩者;(iv)及(vii)兩者;(iv)及(viii)兩者;(v)及(vi)兩者;(v)及(vii)兩者;(v)及(viii)兩者;(ix)及(x)兩者;(ix)及(xi)兩者;(ix)及(xii)兩者;(ix)及(xiii)兩者;(xiv)及(xv)兩者;(xvi)及(xvii)兩者;(xviii)及(xix)兩者;(xviii)及(xx)兩者;(xxi)及(xxii)兩者;或(xxi)及(xxiii)兩者。
- 如請求項13至15中任一項之經分離或經純化多肽,其進一步包含: (a)與SEQ ID NO: 17之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少99%一致的胺基酸序列,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項13至15中任一項之經分離或經純化多肽,其進一步包含: (a) SEQ ID NO: 17之胺基酸序列,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b) SEQ ID NO: 18之胺基酸序列,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項13至15中任一項之經分離或經純化多肽,其包含: (a)包含與SEQ ID NO: 21之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含與SEQ ID NO: 131之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含與SEQ ID NO: 22之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含與SEQ ID NO: 79之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含與SEQ ID NO: 80之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含與SEQ ID NO: 85之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含與SEQ ID NO: 88之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含與SEQ ID NO: 41之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含與SEQ ID NO: 42之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含與SEQ ID NO: 105之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含與SEQ ID NO: 110之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含與SEQ ID NO: 113之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含與SEQ ID NO: 55之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含與SEQ ID NO: 56之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含與SEQ ID NO: 93之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含與SEQ ID NO: 94之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含與SEQ ID NO: 99之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含與SEQ ID NO: 57之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含與SEQ ID NO: 58之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含與SEQ ID NO: 116之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含與SEQ ID NO: 117之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含與SEQ ID NO: 122之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含與SEQ ID NO: 23之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (cc)包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (dd)包含與SEQ ID NO: 24之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ee)包含與SEQ ID NO: 83之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ff)包含與SEQ ID NO: 136之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (gg)包含與SEQ ID NO: 84之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (hh)包含與SEQ ID NO: 87之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ii)包含與SEQ ID NO: 90之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (jj)包含與SEQ ID NO: 77之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (kk)包含與SEQ ID NO: 132之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ll)包含與SEQ ID NO: 78之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (mm)包含與SEQ ID NO: 81之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (nn)包含與SEQ ID NO: 135之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (oo)包含與SEQ ID NO: 82之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (pp)包含與SEQ ID NO: 86之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (qq)包含與SEQ ID NO: 89之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (rr)包含與SEQ ID NO: 39之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ss)包含與SEQ ID NO: 40之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (tt)包含與SEQ ID NO: 107之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (uu)包含與SEQ ID NO: 112之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (vv)包含與SEQ ID NO: 115之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ww)包含與SEQ ID NO: 103之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (xx)包含與SEQ ID NO: 104之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (yy)包含與SEQ ID NO: 106之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (zz)包含與SEQ ID NO: 111之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (aaa)包含與SEQ ID NO: 114之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含與SEQ ID NO: 51之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (ggg)包含與SEQ ID NO: 52之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (hhh)包含與SEQ ID NO: 97之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (iii)包含與SEQ ID NO: 98之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (jjj)包含與SEQ ID NO: 101之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (kkk)包含與SEQ ID NO: 91之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (lll)包含與SEQ ID NO: 92之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (mmm)包含與SEQ ID NO: 95之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (nnn)包含與SEQ ID NO: 96之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ooo)包含與SEQ ID NO: 100之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ppp)包含與SEQ ID NO: 53之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (qqq)包含與SEQ ID NO: 54之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (rrr)包含與SEQ ID NO: 120之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (sss)包含與SEQ ID NO: 121之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (ttt)包含與SEQ ID NO: 124之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (uuu)包含與SEQ ID NO: 108之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (vvv)包含與SEQ ID NO: 109之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (www)包含與SEQ ID NO: 118之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的α鏈; (xxx)包含與SEQ ID NO: 119之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (yyy)包含與SEQ ID NO: 123之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的β鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 如請求項13至15中任一項之經分離或經純化多肽,其包含: (a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的α鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的β鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含SEQ ID NO: 23之胺基酸序列的α鏈; (cc)包含SEQ ID NO: 133之胺基酸序列的α鏈; (dd)包含SEQ ID NO: 24之胺基酸序列的β鏈; (ee)包含SEQ ID NO: 83之胺基酸序列的α鏈; (ff)包含SEQ ID NO: 136之胺基酸序列的α鏈; (gg)包含SEQ ID NO: 84之胺基酸序列的β鏈; (hh)包含SEQ ID NO: 87之胺基酸序列的β鏈; (ii)包含SEQ ID NO: 90之胺基酸序列的β鏈; (jj)包含SEQ ID NO: 77之胺基酸序列的α鏈; (kk)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列的α鏈; (ll)包含SEQ ID NO: 78之胺基酸序列的β鏈; (mm)包含SEQ ID NO: 81之胺基酸序列的α鏈; (nn)包含SEQ ID NO: 135之胺基酸序列的α鏈; (oo)包含SEQ ID NO: 82之胺基酸序列的β鏈; (pp)包含SEQ ID NO: 86之胺基酸序列的β鏈; (qq)包含SEQ ID NO: 89之胺基酸序列的β鏈; (rr)包含SEQ ID NO: 39之胺基酸序列的α鏈; (ss)包含SEQ ID NO: 40之胺基酸序列的β鏈; (tt)包含SEQ ID NO: 107之胺基酸序列的β鏈; (uu)包含SEQ ID NO: 112之胺基酸序列的β鏈; (vv)包含SEQ ID NO: 115之胺基酸序列的β鏈; (ww)包含SEQ ID NO: 103之胺基酸序列的α鏈; (xx)包含SEQ ID NO: 104之胺基酸序列的β鏈; (yy)包含SEQ ID NO: 106之胺基酸序列的β鏈; (zz)包含SEQ ID NO: 111之胺基酸序列的β鏈; (aaa)包含SEQ ID NO: 114之胺基酸序列的β鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列的α鏈; (ggg)包含SEQ ID NO: 52之胺基酸序列的β鏈; (hhh)包含SEQ ID NO: 97之胺基酸序列的α鏈; (iii)包含SEQ ID NO: 98之胺基酸序列的β鏈; (jjj)包含SEQ ID NO: 101之胺基酸序列的β鏈; (kkk)包含SEQ ID NO: 91之胺基酸序列的α鏈; (lll)包含SEQ ID NO: 92之胺基酸序列的β鏈; (mmm)包含SEQ ID NO: 95之胺基酸序列的α鏈; (nnn)包含SEQ ID NO: 96之胺基酸序列的β鏈; (ooo)包含SEQ ID NO: 100之胺基酸序列的β鏈; (ppp)包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列的α鏈; (qqq)包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列的β鏈; (rrr)包含SEQ ID NO: 120之胺基酸序列的α鏈; (sss)包含SEQ ID NO: 121之胺基酸序列的β鏈; (ttt)包含SEQ ID NO: 124之胺基酸序列的β鏈; (uuu)包含SEQ ID NO: 108之胺基酸序列的α鏈; (vvv)包含SEQ ID NO: 109之胺基酸序列的β鏈; (www)包含SEQ ID NO: 118之胺基酸序列的α鏈; (xxx)包含SEQ ID NO: 119之胺基酸序列的β鏈; (yyy)包含SEQ ID NO: 123之胺基酸序列的β鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 一種經分離或經純化蛋白質,其包含如請求項13至19中任一項之多肽中的至少一者。
- 如請求項20之經分離或經純化蛋白質,其包含: (a)包含SEQ ID NO: 1-3之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 4-6之胺基酸序列的第二多肽鏈;或 (b)包含SEQ ID NO: 31-33之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 34-36之胺基酸序列的第二多肽鏈。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其包含: (i)包含與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ii)包含與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (iii)包含與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (iv)包含與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 8之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (v)包含與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vi)包含與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vii)包含與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (viii)包含與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 64之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ix)包含與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (x)包含與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xi)包含與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xii)包含與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 65之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xiii)包含與SEQ ID NO: 7之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xiv)包含與SEQ ID NO: 129之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xv)包含與SEQ ID NO: 63之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xvi)包含與SEQ ID NO: 130之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 66之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xvii)包含與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 38之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xviii)包含與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 69之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xix)包含與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 70之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xx)包含與SEQ ID NO: 37之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 71之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxi)包含與SEQ ID NO: 47之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 48之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxii)包含與SEQ ID NO: 67之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 68之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxiii)包含與SEQ ID NO: 67之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 76之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxiv)包含與SEQ ID NO: 49之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 50之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxv)包含與SEQ ID NO: 72之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 73之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈;或 (xxvi)包含與SEQ ID NO: 72之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含與SEQ ID NO: 102之胺基酸序列至少99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其包含: (i)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈; (iii)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈; (iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列的第二多肽鏈; (v)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vi)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vii)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈; (viii)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 64之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ix)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈; (x)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xi)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xii)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xiii)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xiv)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xv)包含SEQ ID NO: 63之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xvi)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 66之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xvii)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 38之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xviii)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 69之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xix)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 70之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xx)包含SEQ ID NO: 37之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 71之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxi)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 48之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxii)包含SEQ ID NO: 67之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 68之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxiii)包含SEQ ID NO: 67之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 76之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxiv)包含SEQ ID NO: 49之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 50之胺基酸序列的第二多肽鏈; (xxv)包含SEQ ID NO: 72之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 73之胺基酸序列的第二多肽鏈;或 (xxvi)包含SEQ ID NO: 72之胺基酸序列的第一多肽鏈及包含SEQ ID NO: 102之胺基酸序列的第二多肽鏈。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其進一步包含: (a)包含與SEQ ID NO: 17之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其進一步包含: (a)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 17之位置48處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 17之位置112處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 17之位置114處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 17之位置115處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 18之位置57處之X為Ser或Cys;或 (c) (a)及(b)兩者。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其包含: (a)包含與SEQ ID NO: 21之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含與SEQ ID NO: 131之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含與SEQ ID NO: 22之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含與SEQ ID NO: 79之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含與SEQ ID NO: 80之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含與SEQ ID NO: 85之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含與SEQ ID NO: 88之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含與SEQ ID NO: 41之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含與SEQ ID NO: 42之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含與SEQ ID NO: 105之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含與SEQ ID NO: 110之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含與SEQ ID NO: 113之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含與SEQ ID NO: 55之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含與SEQ ID NO: 56之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含與SEQ ID NO: 93之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含與SEQ ID NO: 94之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含與SEQ ID NO: 99之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含與SEQ ID NO: 57之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含與SEQ ID NO: 58之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含與SEQ ID NO: 116之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含與SEQ ID NO: 117之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含與SEQ ID NO: 122之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含與SEQ ID NO: 23之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (cc)包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (dd)包含與SEQ ID NO: 24之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ee)包含與SEQ ID NO: 83之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ff)包含與SEQ ID NO: 136之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (gg)包含與SEQ ID NO: 84之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (hh)包含與SEQ ID NO: 87之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ii)包含與SEQ ID NO: 90之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (jj)包含與SEQ ID NO: 77之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (kk)包含與SEQ ID NO: 132之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ll)包含與SEQ ID NO: 78之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (mm)包含與SEQ ID NO: 81之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (nn)包含與SEQ ID NO: 135之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (oo)包含與SEQ ID NO: 82之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (pp)包含與SEQ ID NO: 86之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (qq)包含與SEQ ID NO: 89之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (rr)包含與SEQ ID NO: 39之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ss)包含與SEQ ID NO: 40之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (tt)包含與SEQ ID NO: 107之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (uu)包含與SEQ ID NO: 112之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vv)包含與SEQ ID NO: 115之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ww)包含與SEQ ID NO: 103之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (xx)包含與SEQ ID NO: 104之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (yy)包含與SEQ ID NO: 106之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (zz)包含與SEQ ID NO: 111之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (aaa)包含與SEQ ID NO: 114之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含與SEQ ID NO: 51之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ggg)包含與SEQ ID NO: 52之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (hhh)包含與SEQ ID NO: 97之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (iii)包含與SEQ ID NO: 98之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (jjj)包含與SEQ ID NO: 101之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (kkk)包含與SEQ ID NO: 91之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (lll)包含與SEQ ID NO: 92之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (mmm)包含與SEQ ID NO: 95之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (nnn)包含與SEQ ID NO: 96之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ooo)包含與SEQ ID NO: 100之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ppp)包含與SEQ ID NO: 53之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (qqq)包含與SEQ ID NO: 54之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (rrr)包含與SEQ ID NO: 120之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (sss)包含與SEQ ID NO: 121之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ttt)包含與SEQ ID NO: 124之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (uuu)包含與SEQ ID NO: 108之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (vvv)包含與SEQ ID NO: 109之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (www)包含與SEQ ID NO: 118之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第一多肽鏈; (xxx)包含與SEQ ID NO: 119之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (yyy)包含與SEQ ID NO: 123之胺基酸序列99%一致之胺基酸序列的第二多肽鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 如請求項20或21之經分離或經純化蛋白質,其包含: (a)包含SEQ ID NO: 21之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 21之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 21之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 21之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 21之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (b)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 131之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 131之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 131之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 131之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (c)包含SEQ ID NO: 22之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 22之位置198處之X為Ser或Cys; (d)包含SEQ ID NO: 79之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 79之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 79之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 79之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 79之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (e)包含SEQ ID NO: 134之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 134之位置180處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 134之位置244處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 134之位置246處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 134之位置247處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (f)包含SEQ ID NO: 80之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 80之位置198處之X為Ser或Cys; (g)包含SEQ ID NO: 85之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 85之位置187處之X為Ser或Cys; (h)包含SEQ ID NO: 88之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 88之位置187處之X為Ser或Cys; (i)包含SEQ ID NO: 41之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 41之位置179處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 41之位置243處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 41之位置245處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 41之位置246處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 42之位置197處之X為Ser或Cys; (k)包含SEQ ID NO: 105之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 105之位置197處之X為Ser或Cys; (l)包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 110之位置186處之X為Ser或Cys; (m)包含SEQ ID NO: 113之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 113之位置186處之X為Ser或Cys; (n) (a)及(c)兩者;(a)及(g)兩者;(b)及(c)兩者;(b)及(g)兩者;(d)及(f)兩者;(d)及(h)兩者;(e)及(f)兩者;或(e)及(h)兩者; (o) (i)及(j)兩者;(i)及(k)兩者;(i)及(l)兩者;或(i)及(m)兩者; (p)包含SEQ ID NO: 55之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 55之位置160處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 55之位置224處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 55之位置226處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 55之位置227處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (q)包含SEQ ID NO: 56之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 56之位置173處之X為Ser或Cys; (r)包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 93之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 93之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 93之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 93之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (s)包含SEQ ID NO: 94之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 94之位置177處之X為Ser或Cys; (t)包含SEQ ID NO: 99之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 99之位置172處之X為Ser或Cys; (u)包含SEQ ID NO: 57之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 57之位置159處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 57之位置223處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 57之位置225處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 57之位置226處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (v)包含SEQ ID NO: 58之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 58之位置172處之X為Ser或Cys; (w)包含SEQ ID NO: 116之胺基酸序列的第一多肽鏈,其中: (i) SEQ ID NO: 116之位置158處之X為Thr或Cys; (ii) SEQ ID NO: 116之位置222處之X為Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (iii) SEQ ID NO: 116之位置224處之X為Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;且 (iv) SEQ ID NO: 116之位置225處之X為Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp; (x)包含SEQ ID NO: 117之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 117之位置176處之X為Ser或Cys; (y)包含SEQ ID NO: 122之胺基酸序列的第二多肽鏈,其中SEQ ID NO: 122之位置171處之X為Ser或Cys; (z) (p)及(q)兩者;(r)及(s)兩者;或(r)及(t)兩者; (aa) (u)及(v)兩者;(w)及(x)兩者;或(w)及(y)兩者; (bb)包含SEQ ID NO: 23之胺基酸序列的第一多肽鏈; (cc)包含SEQ ID NO: 133之胺基酸序列的第一多肽鏈; (dd)包含SEQ ID NO: 24之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ee)包含SEQ ID NO: 83之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ff)包含SEQ ID NO: 136之胺基酸序列的第一多肽鏈; (gg)包含SEQ ID NO: 84之胺基酸序列的第二多肽鏈; (hh)包含SEQ ID NO: 87之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ii)包含SEQ ID NO: 90之胺基酸序列的第二多肽鏈; (jj)包含SEQ ID NO: 77之胺基酸序列的第一多肽鏈; (kk)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ll)包含SEQ ID NO: 78之胺基酸序列的第二多肽鏈; (mm)包含SEQ ID NO: 81之胺基酸序列的第一多肽鏈; (nn)包含SEQ ID NO: 135之胺基酸序列的第一多肽鏈; (oo)包含SEQ ID NO: 82之胺基酸序列的第二多肽鏈; (pp)包含SEQ ID NO: 86之胺基酸序列的第二多肽鏈; (qq)包含SEQ ID NO: 89之胺基酸序列的第二多肽鏈; (rr)包含SEQ ID NO: 39之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ss)包含SEQ ID NO: 40之胺基酸序列的第二多肽鏈; (tt)包含SEQ ID NO: 107之胺基酸序列的第二多肽鏈; (uu)包含SEQ ID NO: 112之胺基酸序列的第二多肽鏈; (vv)包含SEQ ID NO: 115之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ww)包含SEQ ID NO: 103之胺基酸序列的第一多肽鏈; (xx)包含SEQ ID NO: 104之胺基酸序列的第二多肽鏈; (yy)包含SEQ ID NO: 106之胺基酸序列的第二多肽鏈; (zz)包含SEQ ID NO: 111之胺基酸序列的第二多肽鏈; (aaa)包含SEQ ID NO: 114之胺基酸序列的第二多肽鏈; (bbb) (bb)及(dd)兩者;(cc)及(dd)兩者;(ee)及(gg)兩者;(ff)及(gg)兩者;(bb)及(hh)兩者;(cc)及(hh)兩者;(ee)及(ii)兩者;或(ff)及(ii)兩者; (ccc) (jj)及(ll)兩者;(kk)及(ll)兩者;(mm)及(oo)兩者;(nn)及(oo)兩者;(jj)及(pp)兩者;(kk)及(pp)兩者;(mm)及(qq)兩者;或(nn)及(qq)兩者; (ddd) (rr)及(ss)兩者;(rr)及(tt)兩者;(rr)及(uu)兩者;或(rr)及(vv)兩者; (eee) (ww)及(xx)兩者;(ww)及(yy)兩者;(ww)及(zz)兩者;或(ww)及(aaa)兩者; (fff)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列的第一多肽鏈; (ggg)包含SEQ ID NO: 52之胺基酸序列的第二多肽鏈; (hhh)包含SEQ ID NO: 97之胺基酸序列的第一多肽鏈; (iii)包含SEQ ID NO: 98之胺基酸序列的第二多肽鏈; (jjj)包含SEQ ID NO: 101之胺基酸序列的第二多肽鏈; (kkk)包含SEQ ID NO: 91之胺基酸序列的第一多肽鏈; (lll)包含SEQ ID NO: 92之胺基酸序列的第二多肽鏈; (mmm)包含SEQ ID NO: 95之胺基酸序列的第一多肽鏈; (nnn)包含SEQ ID NO: 96之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ooo)包含SEQ ID NO: 100之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ppp)包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列的第一多肽鏈; (qqq)包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列的第二多肽鏈; (rrr)包含SEQ ID NO: 120之胺基酸序列的第一多肽鏈; (sss)包含SEQ ID NO: 121之胺基酸序列的第二多肽鏈; (ttt)包含SEQ ID NO: 124之胺基酸序列的第二多肽鏈; (uuu)包含SEQ ID NO: 108之胺基酸序列的第一多肽鏈; (vvv)包含SEQ ID NO: 109之胺基酸序列的第二多肽鏈; (www)包含SEQ ID NO: 118之胺基酸序列的第一多肽鏈; (xxx)包含SEQ ID NO: 119之胺基酸序列的第二多肽鏈; (yyy)包含SEQ ID NO: 123之胺基酸序列的第二多肽鏈; (zzz) (fff)及(ggg)兩者;(hhh)及(iii)兩者;或(hhh)及(jjj)兩者; (aaaa) (kkk)及(lll)兩者;(mmm)及(nnn)兩者;或(mmm)及(ooo)兩者; (bbbb) (ppp)及(qqq)兩者;(rrr)及(sss)兩者;或(rrr)及(ttt)兩者;或 (cccc) (uuu)及(vvv)兩者;(www)及(xxx)兩者;或(www)及(yyy)兩者。
- 一種經分離或經純化核酸,其包含編碼如請求項1至12中任一項之TCR、如請求項13至19中任一項之多肽或如請求項20至27中任一項之蛋白質的核苷酸序列。
- 一種經分離或經純化核酸,其自5'端至3'端包含第一核酸序列及第二核苷酸序列,其中該第一核苷酸序列及該第二核苷酸序列分別編碼以下之胺基酸序列:SEQ ID NO: 7及8;7及64;63及8;63及64;7及65;63及65;7及66;63及66;8及7;64及7;8及63;64及63;65及7;65及63;66及7;66及63;129及8;129及64;129及65;129及66;8及129;64及129;65及129;66及129;130及8;130及64;130及65;130及66;8及130;64及130;65及130;66及130;37及38;37及69;37及70;37及71;38及37;69及37;70及37;71及37;23及24;23及84;83及24;83及84;23及87;83及87;23及90;83及90;24及23;84及23;24及83;84及83;87及23;87及83;90及23;90及83;133及24;133及84;133及87;133及90;24及133;84及133;87及133;90及133;39及40;39及107;39及112;39及115;40及39;107及39;112及39;115及39;136及24;136及84;136及87;136及90;24及136;84及136;87及136;90及136;21及22;21及80;79及22;79及80;21及85;21及88;79及85;79及88;22及21;80及21;22及79;80及79;85及21;88及21;85及79;88及79;131及22;131及80;131及85;131及88;22及131;80及131;85及131;88及131;134及22;134及80;134及85;134及88;22及134;80及134;85及134;88及134;77及78;77及82;81及78;81及82;77及86;81及86;78及77;82及77;78及81;82及81;86及77;86及81;132及78;132及82;132及86;78及132;82及132;86及132;135及78;135及82;135及86;78及135;82及135;86及135;77及89;81及89;89及77;89及81;132及89;89及132;135及89;89及135;41及42;41及105;41及110;41及113;42及41;105及41;110及41;113及41;103及104;103及111;103及114;104及103;111及103;114及103;103及106;106及103;47及48;48及47;67及68;67及76;68及67;76及67;49及50;50及49;72及73;72及102;73及72;102及72;51及52;52及51;53及54;54及53;55及56;56及55;57及58;58及57;91及92;92及91;108及109;109及108;93及94;93及99;94及93;99及93;97及98;97及101;98及97;101及97;95及96;95及100;96及95;100及95;116及117;116及122;117及116;122及116;120及121;120及124;121及120;124及120;118及119;118及123;119及118;或123及118。
- 如請求項29之經分離或經純化核酸,其進一步包含插入於該第一核苷酸序列與該第二核苷酸序列之間的第三核苷酸序列,其中該第三核苷酸序列編碼可裂解連接子肽。
- 如請求項30之經分離或經純化核酸,其中該可裂解連接子肽包含SEQ ID NO: 25之胺基酸序列。
- 一種重組表現載體,其包含如請求項28至31中任一項之核酸。
- 如請求項32之重組表現載體,其為轉位子或慢病毒載體。
- 一種經分離或經純化TCR、多肽或蛋白質,其由如請求項28至31中任一項之核酸或如請求項32或33之載體編碼。
- 一種經分離或經純化TCR、多肽或蛋白質,其由在細胞中表現如請求項28至31中任一項之核酸或如請求項32或33之載體產生。
- 一種產生表現TCR之宿主細胞的方法,該TCR對SEQ ID NO: 30之肽具有抗原特異性,該方法包含在允許將如請求項32或33之載體引入細胞中之條件下使該細胞與該載體接觸。
- 一種經分離或經純化宿主細胞,其包含如請求項28至31中任一項之核酸或如請求項32或33之重組表現載體。
- 如請求項37之宿主細胞,其中該細胞為人類淋巴細胞。
- 如請求項37或38之宿主細胞,其中該細胞係選自T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、恆定型自然殺手T (iNKT)細胞及自然殺手(NK)細胞。
- 一種經分離或經純化細胞群,其包含如請求項37至39中任一項之宿主細胞。
- 一種產生如請求項1至12、34或35中任一項之TCR、如請求項13至19、34或35中任一項之多肽或如請求項20至27、34或35中任一項之蛋白質的方法,該方法包含培養如請求項37至39中任一項之宿主細胞或如請求項40之宿主細胞群,從而產生該TCR、多肽或蛋白質。
- 一種醫藥組合物,其包含:(a)如請求項1至12、34或35中任一項之TCR、如請求項13至19、34或35中任一項之多肽或如請求項20至27、34或35中任一項之蛋白質、如請求項28至31中任一項之核酸、如請求項32或33之重組表現載體、如請求項37至39中任一項之宿主細胞或如請求項40之細胞群,及(b)醫藥學上可接受之載劑。
- 一種偵測哺乳動物中癌症之存在之方法,該方法包含: (a)使包含該癌症之細胞的樣本與如請求項1至12、34或35中任一項之TCR、如請求項13至19、34或35中任一項之多肽或如請求項20至27、34或35中任一項之蛋白質、如請求項28至31中任一項之核酸、如請求項32或33之重組表現載體、如請求項37至39中任一項之宿主細胞、如請求項40之細胞群或如請求項42之醫藥組合物活體外接觸,從而形成複合物;及 (b)偵測該複合物, 其中偵測到該複合物指示該哺乳動物中癌症之存在。
- 如請求項43之方法,其中該癌症表現位置12處之甘胺酸經纈胺酸取代的突變人類RAS胺基酸序列, 其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)或突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列,且 其中位置12係藉由分別參考野生型人類KRAS、野生型人類HRAS或野生型人類NRAS蛋白而定義。
- 如請求項44之方法,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)胺基酸序列。
- 如請求項44之方法,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列。
- 如請求項44之方法,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)胺基酸序列。
- 如請求項43至47中任一項之方法,其中該癌症為胰臟癌、大腸直腸癌、肺癌、子宮內膜癌、卵巢癌或前列腺癌。
- 一種如請求項1至12、34或35中任一項之TCR、如請求項13至19、34或35中任一項之多肽或如請求項20至27、34或35中任一項之蛋白質、如請求項28至31中任一項之核酸、如請求項32或33之重組表現載體、如請求項37至39中任一項之宿主細胞、如請求項40之細胞群或如請求項42之醫藥組合物的用途,其用於製造供在哺乳動物中誘導針對癌症之免疫反應的藥物。
- 如請求項49之用途,其中該癌症表現位置12處之甘胺酸經纈胺酸取代的突變人類RAS胺基酸序列, 其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)或突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列,且 其中位置12係藉由分別參考野生型人類KRAS、野生型人類HRAS或野生型人類NRAS蛋白而定義。
- 如請求項50之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)胺基酸序列。
- 如請求項50之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列。
- 如請求項50之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)胺基酸序列。
- 如請求項50之用途,其中該癌症為胰臟癌、大腸直腸癌、肺癌、子宮內膜癌、卵巢癌或前列腺癌。
- 一種如請求項1至12、34或35中任一項之TCR、如請求項13至19、34或35中任一項之多肽或如請求項20至27、34或35中任一項之蛋白質、如請求項28至31中任一項之核酸、如請求項32或33之重組表現載體、如請求項37至39中任一項之宿主細胞、如請求項40之細胞群或如請求項42之醫藥組合物的用途,其用於製造供治療或預防哺乳動物之癌症的藥物。
- 如請求項55之用途,其中該癌症表現位置12處之甘胺酸經纈胺酸取代的突變人類RAS胺基酸序列, 其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)或突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列,且 其中位置12係藉由分別參考野生型人類KRAS、野生型人類HRAS或野生型人類NRAS蛋白而定義。
- 如請求項56之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)胺基酸序列。
- 如請求項55之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類神經母細胞瘤大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(NRAS)胺基酸序列。
- 如請求項55之用途,其中該突變人類RAS胺基酸序列為突變人類Harvey大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(HRAS)胺基酸序列。
- 如請求項55之用途,其中該癌症為胰臟癌、大腸直腸癌、肺癌、子宮內膜癌、卵巢癌或前列腺癌。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US202062981856P | 2020-02-26 | 2020-02-26 | |
US62/981,856 | 2020-02-26 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
TW202140537A true TW202140537A (zh) | 2021-11-01 |
Family
ID=74885105
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
TW110106886A TW202140537A (zh) | 2020-02-26 | 2021-02-26 | 針對含有g12v突變之ras之hla第ii類限制性t細胞受體 |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20230159614A1 (zh) |
EP (1) | EP4110804A1 (zh) |
JP (1) | JP2023527613A (zh) |
KR (1) | KR20220143939A (zh) |
CN (1) | CN115244075A (zh) |
AU (1) | AU2021225872A1 (zh) |
BR (1) | BR112022016661A2 (zh) |
CA (1) | CA3169086A1 (zh) |
GB (1) | GB2610069A (zh) |
MX (1) | MX2022010157A (zh) |
TW (1) | TW202140537A (zh) |
WO (1) | WO2021173902A1 (zh) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP4253410A1 (en) * | 2020-11-24 | 2023-10-04 | Shanghai Genbase Biotechnology Co., Ltd. | Ras mutant epitope peptide and t cell receptor recognizing ras mutant |
CA3209732A1 (en) | 2021-02-25 | 2022-09-01 | Drew Caldwell DENIGER | Recombinant vectors comprising polycistronic expression cassettes and methods of use thereof |
MX2023012902A (es) | 2021-05-05 | 2023-11-08 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Proteinas de union a antigenos que se unen especificamente a prame. |
WO2023150562A1 (en) | 2022-02-01 | 2023-08-10 | Alaunos Therapeutics, Inc. | Methods for activation and expansion of t cells |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1545204B1 (en) | 2002-09-06 | 2016-08-10 | THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES | Immunotherapy with in vitro-selected antigen-specific lymphocytes after nonmyeloablative lymphodepleting chemotherapy |
US8383099B2 (en) | 2009-08-28 | 2013-02-26 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Adoptive cell therapy with young T cells |
WO2012129201A1 (en) | 2011-03-22 | 2012-09-27 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods of growing tumor infiltrating lymphocytes in gas-permeable containers |
EP3684799A1 (en) * | 2017-09-20 | 2020-07-29 | The U.S.A. as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services | Hla class ii restricted t cell receptors against mutated ras |
MX2020005765A (es) * | 2017-12-04 | 2020-09-25 | Us Health | Receptores de celulas t restringidos a antigeno leucocitario humano (hla) clase i contra sarcoma de rata (ras) mutado. |
GB201804724D0 (en) * | 2018-03-23 | 2018-05-09 | Univ Oslo Hf | Method of diagnosing cceliac disease |
WO2019231326A1 (en) * | 2018-05-31 | 2019-12-05 | ACADEMISCH ZIEKENHUIS LEIDEN (h.o.d.n.LUMC) | Teipp neoantigens and uses thereof |
CA3209732A1 (en) * | 2021-02-25 | 2022-09-01 | Drew Caldwell DENIGER | Recombinant vectors comprising polycistronic expression cassettes and methods of use thereof |
-
2021
- 2021-02-26 CA CA3169086A patent/CA3169086A1/en active Pending
- 2021-02-26 CN CN202180016761.4A patent/CN115244075A/zh active Pending
- 2021-02-26 AU AU2021225872A patent/AU2021225872A1/en active Pending
- 2021-02-26 GB GB2212195.8A patent/GB2610069A/en active Pending
- 2021-02-26 TW TW110106886A patent/TW202140537A/zh unknown
- 2021-02-26 MX MX2022010157A patent/MX2022010157A/es unknown
- 2021-02-26 WO PCT/US2021/019775 patent/WO2021173902A1/en unknown
- 2021-02-26 BR BR112022016661A patent/BR112022016661A2/pt unknown
- 2021-02-26 JP JP2022551537A patent/JP2023527613A/ja active Pending
- 2021-02-26 US US17/802,464 patent/US20230159614A1/en active Pending
- 2021-02-26 KR KR1020227033222A patent/KR20220143939A/ko unknown
- 2021-02-26 EP EP21712694.5A patent/EP4110804A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20220143939A (ko) | 2022-10-25 |
US20230159614A1 (en) | 2023-05-25 |
MX2022010157A (es) | 2022-10-18 |
CA3169086A1 (en) | 2021-09-02 |
WO2021173902A1 (en) | 2021-09-02 |
CN115244075A (zh) | 2022-10-25 |
GB2610069A (en) | 2023-02-22 |
JP2023527613A (ja) | 2023-06-30 |
EP4110804A1 (en) | 2023-01-04 |
BR112022016661A2 (pt) | 2022-10-11 |
AU2021225872A1 (en) | 2022-09-15 |
GB202212195D0 (en) | 2022-10-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11466071B2 (en) | HLA class I-restricted t cell receptors against mutated RAS | |
JP7256794B2 (ja) | 変異型rasに対するhlaクラスii拘束性t細胞受容体 | |
TW202140537A (zh) | 針對含有g12v突變之ras之hla第ii類限制性t細胞受體 | |
US20230080742A1 (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with g12d mutation | |
TW202140535A (zh) | 針對含有g12v突變之ras之hla第i類限制性t細胞受體 | |
TW202029971A (zh) | 針對突變ras之hla-a3–限制性t細胞受體 | |
US20210115108A1 (en) | T cell receptors which recognize mutated egfr | |
JP2022523024A (ja) | G12r変異を有するrasに対するhlaクラスii拘束性t細胞受容体 | |
TW202227477A (zh) | 識別p53中r273c或y220c突變的t細胞受體 | |
US20230272038A1 (en) | Hla class ii-restricted drb t cell receptors against ras with g12d mutation | |
US20240190940A1 (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with q61k mutation | |
US20230257440A1 (en) | Hla class ii-restricted drb t cell receptors against ras with g12v mutation | |
JP2023544592A (ja) | G13d変異を有するrasに対するhlaクラスii拘束性dq t細胞受容体 |