TW202000199A - Irf4 表現之調節劑 - Google Patents

Abstract

本發明實施例提供實用於抑制IRF4表現之方法、化合物、及組成物，其可實用於治療、預防、或改善與IRF4相關聯之癌症。

Description

IRF4表現之調節劑

本發明實施例提供實用於抑制IRF4表現之方法、化合物、及組成物，其可實用於治療、預防、或改善與IRF4相關聯之癌症。

干擾素調控因子4(IRF4)為參與正常B細胞及T細胞中免疫反應的轉錄因子，並且強烈涉及血液惡性腫瘤，尤其是多發性骨髓瘤(MM)之發展。高IRF4水準與MM患者之總體存活之不良預後相關聯。cereblon/IRF4途徑之上調導致來那度胺(lenalidomide)治療的失敗，來那度胺為經批准用於MM及B細胞惡性腫瘤的IMiD。IRF4為MM細胞中超級增強子之組成部分，在MM細胞中，致癌基因MYC與IRF4之間的正向自我調節回饋迴路(positive auto-regulatory loop)維持MM之存活。IRF4亦牽涉皮膚退行性大細胞淋巴瘤DLBCL、B細胞非霍奇金氏淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin's lymphoma)、ALL、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及周邊T細胞淋巴瘤。儘管IRF4在許多癌症中起作用，但習知治療方法將IRF4視為無藥可靶。

本文所提供之某些實施例係關於實用於抑制IRF4表現之有效且可耐受之化合物及組成物，該等化合物及組成物可實用於治療、預防、改善與IRF4相關聯之癌症或減慢該癌症之進展。

序列表

本申請案正連同呈電子格式之序列表一起申請。序列表係提供為 2019年1月14日創建、大小為712kb、標題為BIOL0332TWSEQ.txt之文件。該序列表之電子格式中的資訊以全文引用之方式併入本文。

應理解上文一般性描述及下文詳細描述僅具有示範性及說明性且不限制實施例，如所主張。在本文中，除非另外明確陳述，否則單數之使用包括複數。如本文所用，除非另外陳述，否則「或」之使用意謂「及/或」。此外，術語「包括(including)」以及其他形式(諸如「包括(includes)」及「包括(included)」)之使用不具有限制性。

本文所用之章節標題僅用於組織目的而不視為限制所述標的物。本申請案中引用之所有文獻或文獻之部分(包括但不限於專利、專利申請案、文章、書籍、論文、以及GenBank及NCBI參考序列記錄)係針對本文所討論之文獻部分明確地以引用方式併入本文以及以全文引用方式併入本文。

應理解，本文含有之實例中之各SEQ ID NO中闡述之序列與糖部分、核苷間鍵聯、或核鹼基之任何修飾無關。因此，由SEQ ID NO定義之化合物可獨立地包含糖部分、核苷間鍵聯、或核鹼基之一或多處修飾。由ION編號描述之化合物指示核鹼基序列、化學修飾、及模體之組合。

除非另外指示，否則以下術語具有以下含義：

「2'-去氧核苷」意謂包含2'-H(H)呋喃醣基糖部分之核苷，如在天然存在之去氧核糖核酸(DNA)中所見。在某些實施例中，2'-去氧核苷可包含經經修飾之核鹼基或可包含RNA核鹼基(尿嘧啶)。

「2'-O-甲氧基乙基」(亦為2'-MOE及2'-O(CH₂ )₂ -OCH₃ )係指在呋喃醣基環之2'位處的O-甲氧基-乙基修飾。2'-O-甲氧基乙基修飾糖為經修飾之糖。

「2'-MOE核苷」(亦為2'-O-甲氧基乙基核苷)意謂包含2'-MOE修飾糖部分之核苷。

「2'-取代核苷」或「2-修飾核苷」意謂包含2'-取代糖部分或2'-修飾 糖部分之核苷。如本文所用，關於糖部分之「2'-取代」或「2-修飾」意謂糖部分包含至少一個除H或OH之外的2'-取代基團。

「3'目標位點」係指目標核酸中與具體化合物之3'-最近核苷酸互補的核苷酸。

「5'目標位點」係指目標核酸中與具體化合物之5'-最近核苷酸互補的核苷酸。

「5-甲基胞嘧啶」意謂具有連接於5位之甲基的胞嘧啶。

「約」意謂在值之±10%內。例如，若說明「化合物實現對IRF4之約70%抑制」，則意味在60%及80%之範圍內的IRF4水準受到抑制。

「投與(administration或administering)」係指向個體引入本文所提供之化合物或組成物以執行其預期功能的途徑。可使用之投與途徑之實例包括但不限於腸胃外投與，諸如皮下、靜脈內、或肌肉內注射或輸注。

「伴隨投與」或「共同投與」意謂二或更多種化合物以其兩者之藥理學作用均在患者體內顯現之任何方式投與。伴隨投與不需要兩種化合物於單一醫藥組成物中、以相同劑型、藉由相同投與途徑、或同時投與。兩種化合物之作用本身無需同時顯現。該等作用僅需重疊一段時間而無需共同延長。伴隨投與或共同投與涵蓋並行或依序投與。

「改善」係指改進或減輕相關聯之疾病、病症、或病狀之至少一種指標、徵象、或症狀。在某些實施例中，改善包括延遲或減慢病狀或疾病之一或多種指標的進展或嚴重程度。指標之進展或嚴重程度可藉由熟習此項技術者已知之主觀或客觀量度來確定。

「動物」係指人類或非人類動物，包括但不限於小鼠、大鼠、兔、狗、貓、豬、及非人類靈長類動物包括但不限於猴及黑猩猩。

「反義活性」意謂可歸因於反義化合物與其目標核酸雜交的任何可 偵測及/或可量測活性。在某些實施例中，反義活性為目標核酸或由此類目標核酸編碼之蛋白之量或表現與不存在針對該靶標的反義化合物時目標核酸水準或目標蛋白水準相比減少。

「反義化合物」意謂包含寡核苷酸及視情況一或多種額外特徵(諸如綴合基團或末端基)之化合物。反義化合物之實例包括單股及雙股化合物，諸如寡核苷酸、核酶(ribozyme)、siRNA、shRNA、ssRNA、及基於佔位之化合物。

「反義抑制」意謂在與目標核酸互補之反義化合物存在下目標核酸水準相較於在不存在反義化合物下之目標核酸水準有所減少。

「反義機制」為所有涉及化合物與目標核酸雜交之機制，其中雜交之結果或效應為標靶降解或標靶佔有，伴隨阻礙涉及例如轉錄或剪接之細胞機構。

「反義寡核苷酸」意謂具有與目標核酸或其區域或區段互補的核鹼基序列之寡核苷酸。在某些實施例中，反義寡核苷酸可與目標核酸或其區域或區段特異性雜交。

「雙環核苷」或「BNA」意謂包含雙環糖部分之核苷。「雙環糖」或「雙環糖部分」意謂包含兩個環的經修飾之糖部分，其中第二環係經由橋連接第一環中之兩個原子而形成，從而形成雙環結構。在某些實施例中，雙環糖部分之第一環為呋喃醣基部分。在某些實施例中，雙環糖部分不包含呋喃醣基部分。

「分支基團」意謂具有能夠與至少3個基團形成共價鍵聯的至少3個位置的原子團。在某些實施例中，分支基團提供複數個反應性位點，該複數個反應性位點用於經由綴合連接基及/或可裂解部分將繫留配位基連接至寡核苷酸。

「細胞靶向部分」意謂能夠結合至一或多種具體細胞型的綴合基團 或綴合基團之一部分。

「cEt」或「限制性乙基(constrained ethyl)」意謂包含連接4'-碳與2'-碳之橋的雙環呋喃醣基糖部分，其中該橋有式：4'-CH(CH₃ )-O-2'。

「cEt核苷」意謂包含cEt修飾糖部分之核苷。

化合物中之「化學修飾」描述化合物中之任何單元相對於此類單元之原始狀態的透過化學反應的取代或變化。「經修飾之核苷」意謂獨立地具有經修飾之糖部分及/或經修飾之核鹼基的核苷。「經修飾之寡核苷酸」意謂包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、經修飾之糖、及/或經修飾之核鹼基的寡核苷酸。

「化學相異區」係指化合物中以某種方式在化學上不同於同一化合物之另一區域的區域。例如，具有2'-O-甲氧基乙基核苷酸之區域在化學上異於具有無2'-O-甲氧基乙基修飾之核苷酸的區域。

「嵌合反義化合物」意謂具有至少2個化學相異區之反義化合物，各位置具有複數個次單元。

「掌性濃化群體」意謂複數個具有相同分子式之分子，其中群體內在特定掌性中心含有特定立體化學組態的分子之數目或百分比大於當該特定掌性中心為無規立構時預期群體內在相同特定掌性中心含有相同特定立體化學組態的分子之數目或百分比。在各分子內具有多個掌性中心的掌性濃化分子群體可含有一或多個無規立構掌性中心。在某些實施例中，分子為經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，分子為包含經修飾之寡核苷酸之化合物。

「可裂解鍵」意謂能夠分裂的任何化學鍵。在某些實施例中，可裂解鍵係選自：醯胺鍵、聚醯胺鍵、酯鍵、醚鍵、磷酸二酯鍵之一或兩者、磷酸酯鍵、胺甲酸酯鍵、二硫鍵、或肽鍵。

「可裂解部分」意謂在生理條件下(例如在細胞、動物、或人體內)裂解的鍵或原子團。

關於寡核苷酸之「互補」意謂當在相反方向上對齊兩個核鹼基序列時，此類寡核苷酸或其一或多個區域之核鹼基序列與另一寡核苷酸或核酸或其一或多個區域之核鹼基序列匹配。除非另外指定，否則如本文所述之核鹼基匹配或互補核鹼基不限於以下各對：腺嘌呤(A)及胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)及尿嘧啶(U)、胞嘧啶(G)及鳥嘌呤(G)、以及5-甲基胞嘧啶(^m C)及鳥嘌呤(G)。互補寡核苷酸及/或核酸不必在各核苷均具有核鹼基互補性且可包括一或多處核鹼基錯配。相反，關於寡核苷酸之「完全互補」或「100%互補」意謂此類寡核苷酸在各核苷處均具有核鹼基匹配而無任何核鹼基錯配。

「綴合基團」意謂連接至寡核苷酸之原子團。綴合基團包括綴合部分及將綴合部分連接至寡核苷酸的綴合連接基。

「綴合連接基」意謂包含至少一個將綴合部分連接至寡核苷酸的鍵之原子團。

「綴合部分」意謂經由綴合連接基連接至寡核苷酸的原子團。

在寡核苷酸之情境中之「連續」係指核苷、核鹼基、糖部分、或核苷間鍵聯彼此緊鄰。例如，「連續核鹼基」意謂在序列中彼此緊鄰的核鹼基。

「設計」或「經設計」係指設計與所選核酸分子特異性雜交之化合物的方法。

「稀釋劑」意謂組成物中缺乏藥理學活性，但為醫藥學上必需或所需之成分。例如，注射組成物中之稀釋劑可為液體，例如鹽水溶液。

「經不同修飾」意謂彼此不同的化學修飾或化學取代基，包括不存在修飾。因此，例如，MOE核苷及未經修飾之DNA核苷為「經不同修飾」，儘管DNA核苷未經修飾。同樣地，DNA及RNA為「經不同修飾」，儘管兩者均為天然存在之未經修飾之核苷。若非包含不同核鹼基便相同的核苷不為經不同修飾。例如，包含2'-OMe修飾之糖與未經修飾之腺嘌呤之核苷及包含2'-OMe 修飾之糖與未經修飾之胸腺嘧啶核鹼基之核苷不為經不同修飾。

「劑量」意謂單次投與中或指定時段內提供之化合物或醫藥藥劑之指定量。在某些實施例中，可以二或更多次推注、錠劑、或注射投與劑量。例如，在某些實施例中，在需要皮下投與時，所要劑量可需要不易由單次注射提供之體積。在此類實施例中，可使用二或更多次注射來達成所要劑量。在某些實施例中，可以二或更多次注射投與劑量以使個體之注射部位反應減至最小。在其他實施例中，化合物或醫藥藥劑係藉由經長時間段或連續輸注來投與。劑量可規定為每小時、每天、每週、或每個月之醫藥藥劑之量。

「給藥方案」為經設計以達成一或多種所需效應之劑量組合。

「雙股反義化合物」意謂包含兩種彼此互補且形成雙螺旋的寡聚化合物的反義化合物，且其中該兩種寡聚化合物之一包含寡核苷酸。

「有效量」意謂足以在需要該化合物之個體中達成所要的生理結果的化合物之量。在個體之中，有效量可視以下因素而變化：欲治療個體之健康及身體狀況、欲治療個體之分類學群組、組成合物之調配物、個體之醫學病狀之評估、及其他相關因素。

「功效」意謂產生所要效應的能力。

「表現」包括基因之編碼資訊藉以轉化成細胞中存在且運作的結構的所有功能。此類結構包括但不限於轉錄及轉譯之產物。

「間隔體(gapmer)」意謂一種寡核苷酸，其包含具有複數個核苷的內部區域，該複數個核苷支持位於具有一或多個核苷的外部區域之間的核糖核酸酶H裂解，其中包含內部區域的核苷酸在化學上異於包含外部區域的一或多個核苷。內部區域可稱為「間隔」且外部區域可稱為「側翼」。

「雜交」意謂寡核苷酸及/或核酸之黏著。儘管不限於特定機制，但是最常見的雜交機制涉及互補核鹼基之間的氫鍵結，其可為瓦生-克立克 (Watson-Crick)氫鍵結、胡思町(Hoogsteen)氫鍵結、或反向胡思町氫鍵結。在某些實施例中，互補核酸分子包括但不限於反義化合物及核酸標靶。在某些實施例中，互補核酸分子包括但不限於寡核苷酸及核酸標靶。

「緊鄰」意謂直接相鄰的相同類型要素之間不存在介入要素(例如，緊鄰核鹼基之間無介入核鹼基)。

「個體」意謂經選擇用於治療或療法之人類或非人類動物。

「抑制表現或活性」係指相對於未治療或對照樣品中之表現或活性降低或阻斷表現或活性且不一定指示完全消除表現或活性。

「核苷間鍵聯」意謂在寡核苷酸中之相鄰核苷之間形成共價鍵聯的基團或鍵。「經修飾之核苷間鍵聯」意謂除天然存在之磷酸酯核苷間鍵聯之外的任何核苷間鍵聯。非磷酸酯鍵聯在本文稱為經修飾之核苷間鍵聯。

「延長寡核苷酸」為相對於本文所揭示之寡核苷酸(例如親體寡核苷酸)具有一或多個額外核苷的寡核苷酸。

「連接之核苷」意謂由核苷間鍵聯連接於一起的相鄰核苷。

「連接基-核苷」意謂核苷將寡核苷酸連接至綴合部分。連接基-核苷位於化合物之綴合連接基內。連接基-核苷不視為化合物之寡核苷酸部分之一部分，即使其與寡核苷酸連續亦如此。

「錯配」或「非互補」意謂當將第一寡核苷酸及第二寡核苷酸對齊時第一寡核苷酸之核鹼基不與第二寡核苷酸或目標核酸之對應核鹼基互補。例如，核鹼基包括但不限於通用核鹼基、肌苷、及次黃嘌呤，能夠與至少一個核鹼基雜交但相對於與其雜交之核鹼基仍為錯配或非互補的。作為另一實例，當第一寡核苷酸及第二寡核苷酸對齊時，第一核苷酸之不能與第二寡核苷酸或目標核酸之對應核鹼基雜交的核鹼基為錯配或非互補核鹼基。

「調節」係指改變或調整細胞、組織、器官、或有機體中之特徵。 例如，調節IRF4 RNA可意謂增加或降低細胞、組織、器官、或有機體中IRF4 RNA及/或IRF4蛋白之水準。「調節劑」影響細胞、組織、器官、或有機體中之變化。例如，IRF4化合物可為降低細胞、組織、器官、或有機體中IRF4 RNA及/或IRF4蛋白之量的調節劑。

「MOE」意謂甲氧基乙基。

「單體」係指寡聚物之單個單元。單體包括但不限於核苷及核苷酸。

「模體」意謂寡核苷酸中未修飾及/或經修飾之糖部分、核鹼基、及/或核苷間鍵聯之模式。

「天然」或「天然存在之」意謂在自然界中可見。

「非雙環經修飾之糖」或「非雙環經修飾之糖部分」意謂包含不在糖之兩個原子之間形成橋以形成第二環的修飾(諸如取代)的經修飾之糖部分。

「核酸」係指由單體核苷酸構成的分子。核酸包括但不限於核糖核酸(RNA)、去氧核糖核酸(DNA)、單股核酸、及雙股核酸。

「核鹼基」意謂能夠與另一核酸之鹼基配對的雜環部分。如本文所用，「天然存在之核鹼基」為腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)、及鳥嘌呤(G)。「經修飾之核鹼基」為經化學修飾的天然存在之核鹼基。「通用鹼基」或「通用核鹼基」為除天然存在之核鹼基及經修飾之核鹼基之外的核鹼基，且能夠與任一核鹼基配對。

「核鹼基序列」意謂核酸或寡核苷酸中與任何糖或核苷間鍵聯修飾無關的連續核鹼基之次序。

「核苷」意謂包含核鹼基及糖部分之化合物。核鹼基及糖部分各獨立地未經修飾或經修飾。「經修飾之核苷」意謂包含經修飾之核鹼基及/或經修飾之糖部分之核苷。經修飾之核苷包括缺乏核鹼基的無鹼基核苷。

「寡聚化合物」意謂包含單個寡核苷酸及視情況一或多種額外特徵 (諸如綴合基團或末端基)之化合物。

「寡核苷酸」意謂具有各自可彼此獨立地經修飾或未經修飾連接之核苷的聚合物。除非另外指示，否則寡核苷酸由8-80個連接之核苷組成。「經修飾之寡核苷酸」意謂一寡核苷酸，其中至少一個糖、核鹼基、或核苷間鍵聯經修飾。「未修飾之寡核苷酸」意謂不包含任何糖、核鹼基、或核苷間修飾的寡核苷酸。

「親體寡核苷酸」意謂一寡核苷酸，其序列用作針對更多具有類似序列但具有不同長度、模體、及/或化學性質的寡核苷酸的設計基礎。新設計的寡核苷酸可具有與親體寡核苷酸相同或重疊的序列。

「腸胃外投與」意謂透過注射或輸注的投與。腸胃外投與包括皮下投與、靜脈內投與、肌肉內投與、動脈內投與、腹膜內投與、或顱內投與例如鞘內或腦室內投與。

「醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑」意謂合適於用於向個體投與之任何物質。例如，醫藥學上可接受之載劑可為無菌水溶液，諸如PBS或注射用水。

「醫藥學上可接受之鹽」意謂化合物(諸如寡聚化合物或寡核苷酸)之生理學上及醫藥學上可接受之鹽，即保留親體化合物之所要生物活性且不賦予其非所要毒理學作用的鹽。

「醫藥藥劑」意謂當向個體投與時提供治療益處之化合物。

「醫藥組成物」意謂合適於向個體投與之物質之混合物。例如，醫藥組成物可包含一或多種化合物或其鹽及無菌水溶液。

「硫代磷酸酯鍵聯」意謂其中非橋聯氧原子之一經硫原子置換的經修飾之磷酸酯鍵聯。硫代磷酸酯核苷間鍵聯為經修飾之核苷間鍵聯。

「磷部分」意謂包含磷原子之原子團。在某些實施例中，磷部分包 含單磷酸酯、二磷酸酯、或三磷酸酯、或者硫代磷酸酯。

「部分」意謂核酸中確定數目之連續(即連接)核鹼基。在某些實施例中，部分為目標核酸中確定數目之連續核鹼基。在某些實施例中，部分為寡聚化合物中確定數目之連續核鹼基。

「預防」係指延遲或預先阻止疾病、病症、或病狀發作、發展、或進展達數分鐘至無限期之時間段。

「前藥」意謂在體外以一形式、在體內或其細胞內代謝成另一形式的化合物。在某些實施例中，代謝之形式為化合物(例如，藥物)之活性或更具活性的形式。一般而言，前藥在體內的轉化係藉由細胞或組織中存在之一或多種酶(例如，內源酶或病毒酶)或一或多種化學物之作用及/或藉由生理學條件促進。

「降低」意謂降至較小程度、大小、量、或數目。

「RefSeq No.」為分配給序列以指示該序列之具體目標轉錄物(例如，目標基因)的字母及數字之獨特組合。關於目標基因之此類序列及訊息(統稱為基因記錄)可見於遺傳序列資料庫。遺傳序列資料庫包括NCBI參考序列資料庫、GenBank、歐洲核苷酸檔案庫(European Nucleotide Archive)、及日本DNA資料庫(後三者形成國際核苷酸序列資料庫合作(International Nucleotide Sequence Database Collaboration)或INSDC)。

「區域」定義為目標核酸中具有至少一個可識別結構、功能、或特徵的部分。

「RNAi化合物」意謂至少部分透過RISC或Ago2但不透過核糖核酸酶H起作用以調節目標核酸及/或目標核酸所編碼之蛋白的反義化合物。RNAi化合物包括但不限於雙股siRNA、單股RNA(ssRNA)、及微小RNA(包括微小RNA模擬物)。

「區段」定義為核酸內區域之較小部分或子部分。

「副作用」意謂除所要作用以外的可歸因於治療之生理疾病及/或病狀。在某些實施例中，副作用包括注射部位反應、肝功能測試異常、腎功能異常、肝中毒、腎中毒、中樞神經系統異常、肌病、及不適。例如，血清中之轉胺酶水準增加可指示肝毒性或肝功能異常。例如，膽紅素增加可指示肝毒性或肝功能異常。

關於化合物之「單股」意謂該化合物僅具有一個寡核苷酸。「自身互補」意謂寡核苷酸至少部分地與自身雜交。由一個寡核苷酸組成之化合物為單股化合物，其中該化合物之寡核苷酸為自身互補。單股化合物可以能夠結合至互補化合物以形成雙螺旋。

「位點」定義為目標核酸內之獨特核鹼基位置。

「可特異性雜交」係指寡核苷酸在該寡核苷酸與目標核酸之間具有足夠程度的互補性以誘導所要作用，同時對非目標核酸表現出最小作用或沒有作用。在某些實施例中，特異性雜交在生理條件下發生。

關於目標核酸之「特異性抑制」意謂降低或阻斷目標核酸之表現，同時對非目標核酸表現出較少作用、最小作用、或沒有作用。降低不一定指示完全消除目標核酸之表現。

「標準細胞檢定」意謂實例中所述之一或多項檢定及其合理的變化。

「標準體內實驗」意謂一或多個實例中所述之一或多個項程序及其合理的變化。

在具有相同分子式之分子群體之情境下，「無規立構掌性中心」意謂具有隨機立體化學組態之掌性中心。例如，在包含無規立構掌性中心之分子群體中，具有無規立構掌性中心之(S)組態之分子數可與具有無規立構掌性中心之(R)組態之分子數相同但不是必要的。當掌性中心之立體化學組態為未設計成控制立體化學組態的合成方法之結果時，其被視為隨機的。在某些實施例中， 無規立構掌性中心為無規立構硫代磷酸酯核苷間鍵聯。

「糖部分」意謂未修飾之糖部分或經修飾之糖部分。「未修飾之糖部分」或「未修飾之糖」意謂2'-OH(H)呋喃醣基部分，如見於RNA(「未修飾之RNA糖部分」)；或2'-H(H)部分，如見於DNA(「未修飾之DNA糖部分」)。未修飾之糖部分在1'、3'、及4'位中之各者具有一個氫，在3'位具有氧，且在5'位具有兩個氫。「經修飾之糖部分」或「經修飾之糖」意謂經修飾之呋喃醣基糖部分或糖替代物。「經修飾之呋喃醣基糖部分」意謂包含非氫取代基代替未修飾之糖部分之至少一個氫的呋喃醣基糖。在某些實施例中，經修飾之呋喃醣基糖部分為2'-取代糖部分。此類經修飾之呋喃醣基糖部分包括雙環糖及非雙環糖。

「糖替代物」意謂除呋喃醣基部分之外具有可將核鹼基連接至另一基團的部分(諸如核苷間鍵聯、綴合基團、或寡核苷酸之末端基)的經修飾之糖部分。包含糖替代物之經修飾之核苷可併入至寡核苷酸內之一或多個位置，且此類寡核苷酸能夠與互補化合物或核酸雜交。

「協同(synergy)」或「協同(synergize)」係指大於在相同劑量下各組分單獨之作用之加成的組合作用。

「IRF4」意謂IRF4之任何核酸或蛋白。「IRF4核酸」意謂任何編碼IRF4之核酸。例如，在某些實施例中，IRF4核酸包括編碼IRF4之DNA序列、自編碼IRF4之DNA(包括包含內含子及外顯子之基因組DNA)轉錄之RNA序列、及編碼IRF4之mRNA序列。「IRF4 mRNA」意謂編碼IRF4蛋白之mRNA。靶標可以大寫或小寫之形式提及。

「IRF4特異性抑制劑」係指能夠在分子水準上特異性抑制IRF4 RNA及/或IRF4蛋白表現或活性的任何藥劑。例如，IRF4特異性抑制劑包括能夠抑制IRF4 RNA及/或IRF4蛋白之核酸(包括反義化合物)、肽、抗體、小分子、及 其他藥劑。

「目標基因」係指編碼標靶之基因。

「靶向」係指化合物與目標核酸特異性雜交以誘導所要作用。

「目標核酸」、「目標RNA」、「目標RNA轉錄物」、及「核酸標靶」皆意謂能夠由本文所述之化合物靶向之核酸。

「目標區域」意謂目標核酸中由一或多種化合物所靶向之部分。

「目標區段」意謂目標核酸中由化合物所靶向之核苷酸序列。「5'目標位點」係指目標區段之5'-最近核苷酸。「3'目標位點」係指目標區段之3'-最近核苷酸。

「末端基」意謂共價連接至寡核苷酸之末端的化學基團或原子團。

「治療有效量」意謂向個體提供治療益處的化合物、醫藥藥劑、或組成物之量。

「治療」係指向動物投與化合物或醫藥組成物以影響動物之疾病、病症、或病狀之改變或改進。

某些實施例

某些實施例提供用於抑制IRF4表現之方法、化合物、及組成物。

某些實施例提供靶向IRF4核酸之化合物。在某些實施例中，IRF4核酸具有RefSeq或GENBANK登錄號NM_002460.3或NT_034880.3_TRUNC_328000_354000(以引用方式併入本文，本文分別揭示為SEQ ID NO：1及SEQ ID NO：2)中所闡述之序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO： 3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為9至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少9個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為10至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為11至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少11個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為11至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為12至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO： 3-3383中任一者之至少12個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為12至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

某些實施例提供一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷酸且至少具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、或16個連續的核鹼基部分，該部分與SEQ ID NO：1之3'UTR內之相等長度部分互補。在某些實施例中，3'UTR對應於SEQ ID NO：1之核苷酸1483至5332。在某些實施例中，化合物包含長度為10至30個連接之核苷酸的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有在其整個長度上與SEQ ID NO：1之3'UTR內的核鹼基序列至少85%、至少90%、至少95%、或至少100%互補的核鹼基。在某些實施例中，3'UTR對應於SEQ ID NO：1之核苷酸1483至5332。在某些實施例中，化合物包含長度為16至30個連接之核苷酸的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有在其整個長度上與SEQ ID NO：1 之3'UTR內的核鹼基序列至少85%、至少90%、至少95%、或至少100%互補的核鹼基。在某些實施例中，3'UTR對應於SEQ ID NO：1之核苷酸1483至5332。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷酸且至少具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、或16個連續的核鹼基部分，該部分與SEQ ID NO：1之核苷酸4227-4244、4227-4242、4228-4243、或4229-4244內之相等長度部分互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷酸且至少具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、或16個連續的核鹼基部分，該部分與SEQ ID NO：2之核苷酸9667-9682、11411-11426、或18090-18105內之相等長度部分互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且在SEQ ID NO：1之核苷酸4227-4244、4227-4242、4228-4243、或4229-4244內互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且在SEQ ID NO：2之核苷酸9667-9682、11411-11426、或18090-18105內互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有至少包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、或16個連續核鹼基部分之核鹼基序列。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成之核鹼基序列。

在某些實施例中，靶向IRF4之化合物為ION 935918。在如以下實例章節中所述所篩選出的超過3,000種化合物中，ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834脫穎而出成為前導化合物。特定言之，在超過3,000種化合物中，就效力及耐受性而言，ION 935918表現出最佳性質組合。

在某些實施例中，任何前述經修飾之寡核苷酸包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、至少一個經修飾之糖、及/或至少一個經修飾之核鹼基。

在某些實施例中，前述經修飾之寡核苷酸之任一者包含至少一個經修飾之糖。在某些實施例中，至少一個經修飾之糖包含2'-O-甲氧基乙基。在某些實施例中，至少一個經修飾之糖為雙環糖，諸如4'-CH(CH₃ )-O-2'基團、4'-CH₂ -O-2'基團、或4'-(CH₂ )₂ -O-2'基團。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯，諸如硫代磷酸酯核苷間鍵聯。

在某些實施例中，前述經修飾之寡核苷酸中任一者包含至少一個經修飾之核鹼基，諸如5-甲基胞嘧啶。

在某些實施例中，前述經修飾之寡核苷酸之任一者包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者所述之序列之核鹼基序列。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16至30個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者所述之序列之核鹼基序列。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷且具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者所述之序列組成之核鹼基序列。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核 苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：1330或3303中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由3個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由3個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間，其中各側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：559或560中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含： 間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由1個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：1330或2021中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由4個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：560所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成； 5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：2021所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：1540所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成； 5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16-80個連接之核鹼基且具有包含SEQ ID NO：560所述之序列之核鹼基序列，其中經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在某些實施例中，化合物包含ION 935918或其鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在某些實施例中，化合物包含ION 935918之鈉鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在某些實施例中，化合物包含ION 935968或其鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在某些實施例中，化合物包含ION 935968之鈉鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在前述實施例中任一項中，化合物或寡核苷酸可與編碼IRF4之核酸至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%、或100%互補。

在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物。在某些實施例中，化合物包含去氧核糖核苷酸。在某些實施例中，化合物為雙股化合物。在某些實施例中，化合物為雙股化合物且包含核糖核苷酸。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

在前述實施例中任一項中，化合物之長度可為8至80個、10至30個、12至50個、13至30個、13至50個、14至30個、14至50個、15至30個、15至50個、16至30個、16至50個、17至30個、17至50個、18至22個、18至24個、18至30個、18至50個、19至22個、19至30個、19至50個、或20至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物包含寡核苷酸或由其組 成。

在某些實施例中，本文提供之化合物或組成物包含經修飾之寡核苷酸之鹽。在某些實施例中，鹽為鈉鹽。在某些實施例中，鹽為鉀鹽。

在某些實施例中，如本文所述之化合物或組成物具有高度可耐受性，如藉由以下至少一者所表明：與鹽水治療動物相比丙胺酸轉胺酶(ALT)或天冬胺酸轉胺酶(AST)值增加不多於4倍、3倍、或2倍或與對照治療動物相比肝、脾、或腎重量增加不多於30%、20%、15%、12%、10%、5%、或2%。在某些實施例中，如本文所述之化合物或組成物具有高度可耐受性，如藉由與對照治療動物相比ALT或AST未增加所表明。在某些實施例中，如本文所述之化合物或組成物具有高度可耐受性，如藉由與對照動物相比肝、脾、或腎重量未增加所表明。

某些實施例提供一種組成物，其包含前述實施例之任一項之化合物或其鹽及至少一種醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑。在某些實施例中，組成物之黏度小於約40厘泊(cP)、小於約30厘泊(cP)、小於約20厘泊(cP)、小於約15厘泊(cP)、或小於約10厘泊(cP)。在某些實施例中，具有前述黏度之任一者之組成物包含在約100mg/mL、約125mg/mL、約150mg/mL、約175mg/mL、約200mg/mL、約225mg/mL、約250mg/mL、約275mg/mL、或約300mg/mL之濃度下的本文所提供之化合物。在某些實施例中，具有前述黏度及/或化合物濃度之任一者之組成物之溫度為室溫或約20℃、約21℃、約22℃、約23℃、約24℃、約25℃、約26℃、約27℃、約28℃、約29℃、或約30℃。

某些適應症

本文所提供之某些實施例係關於藉由投與靶向IRF4之化合物抑制IRF4表現之方法，其可實用於治療、預防、或改善個體之與IRF4相關聯之癌症。在某些實施例中，化合物可為IRF4特異性抑制劑。在某些實施例中，化合物可 為反義化合物、寡聚化合物、或靶向IRF4之寡核苷酸。

可用本文所提供之方法治療、預防、及/或改善的與IRF4相關聯之癌症之實例包括血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症(Waldenström macroglobulinemia)、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。

在某些實施例中，治療、預防、或改善個體之與IRF4相關聯之癌症之方法包含向該個體投與包含IRF4特異性抑制劑之化合物，從而治療、預防、或改善該癌症。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一 者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物係以腸胃外方式向個體投與。在某些實施例中，投與該化合物抑制或減少癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。

在某些實施例中，治療、預防、或改善癌症之方法包含向該個體投與包含IRF4特異性抑制劑之化合物，從而治療或改善該癌症。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在 某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物係以腸胃外方式向個體投與。在某些實施例中，投與該化合物抑制或減少癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。在某些實施例中，個體經識別為患有與IRF4相關聯之癌症或處於患有該癌症之風險。

在某些實施例中，抑制患有與IRF4相關聯之癌症或處於患有該癌症之風險的個體之IRF4表現的方法包含向該個體投與包含IRF4特異性抑制劑之化合物，從而抑制個體之IRF4表現。在某些實施例中，投與該化合物抑制骨髓、淋巴組織、或淋巴結中IRF4之表現。在某些實施例中，該個體患有血癌、骨髓 瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病或處於患有該等癌症之風險。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中， 經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物係以腸胃外方式向個體投與。在某些實施例中，投與該化合物抑制或減少癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。在某些實施例中，個體經識別為患有與IRF4相關聯之癌症或處於患有該癌症之風險。

在某些實施例中，抑制細胞之IRF4表現之方法包含將該細胞與包含IRF4特異性抑制劑之化合物接觸，從而抑制該細胞之IRF4表現。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，細胞為骨髓細胞、淋巴組織細胞、或淋巴結細胞。在某些實施例中，細胞在骨髓、淋巴組織、或淋巴結中。在某些實施例中，細胞在患有癌症(諸如血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病)或處於患有該等癌症之風險之個體之骨髓、淋巴組織、或淋巴結中。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO： 2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

在某些實施例中，降低或抑制患有與IRF4相關聯之癌症或處於患有該癌症之風險的個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移的方法包含向該個體投與包含IRF4特異性抑制劑之化合物，從而降低或抑制個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。在某些實施例中，該個體患有血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病或處於患有該等癌症之風險。可用本文所提供之方法治療、預防、及/或改善的與IRF4相關聯之癌症之實例包括血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病 包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物係以腸胃外方式向個體投與。在某些實施例中，個體經識別為患有與IRF4相關聯之癌症或處於患有該癌症之風險。

某些實施例係關於包含IRF4特異性抑制劑之化合物，其用於治療癌症。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

某些實施例係關於一種包含IRF4特異性抑制劑之化合物，其用於降低或抑制患有癌症之個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

某些實施例係關於包含IRF4特異性抑制劑之化合物之用途，其用於製造或製備用於治療癌症之藥物。某些實施例係關於包含IRF4特異性抑制劑之化合物之用途，其用於製備用於治療與IRF4相關聯之癌症之藥物。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、 B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，可用本文所提供之化合物治療的白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物 為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

某些實施例係關於包含IRF4特異性抑制劑之化合物之用途，其用於製造或製備用於降低或抑制患有癌症之個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移之藥物。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。某些實施例係關於包含IRF4特異性抑制劑之化合物之用途，其用於製備用於降低或抑制患有癌症之個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移之藥物。在某些實施例中，該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例之非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之反義化合物。在某些實施例中，化合物包含靶向IRF4之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為8至80個連接之核苷且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中， 化合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含由SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列組成的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，化合物包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸，其具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成的核鹼基序列。在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為10至30個連接之核苷。在某些實施例中，化合物為ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834。在前述實施例中任一項中，化合物可為單股化合物或雙股化合物。在前述實施例中任一項中，化合物可為反義化合物或寡聚化合物。

在前述方法或用途之任一者中，化合物可靶向IRF4。在某些實施例中，化合物包含經修飾之核苷酸或由其組成，例如長度為8至80個連接之核苷、長度為10至30個連接之核苷、長度為12至30個連接之核苷、或長度為20個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1-2中所述之任一核鹼基序列至少80%、85%、90%、95%、或100%互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、至少一個經修飾之糖、及/或至少一個經修飾之核鹼基。在某些實施例中，經修飾之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，經修飾之糖為雙環糖或2'-O-甲氧基乙基，且經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成，其中該間隔段位於緊鄰該5'側翼段及該3'側翼段且在兩者之間，且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。

在前述實施例中任一項中，經修飾之寡核苷酸之長度可為12至30個、15至30個、15至25個、15至24個、16至24個、17至24個、18至24個、19至24個、20至24個、19至22個、20至22個、16至20個、或17或20個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1-2中所述之任一核鹼基序列至少80%、85%、90%、95%、或100%互補。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、至少一個經修飾之糖、及/或至少一個經修飾之核鹼基。在某些實施例中，經修飾之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，經修飾之糖為雙環糖或2'-O-甲氧基乙基，且經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之2'-去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成，其中該間隔段位於緊鄰該5'側翼段及該3'側翼段且在兩者之間，且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸之長度為16至80個連接之核苷且具有包含SEQ ID NO：3-3383之任一者之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之2'-去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者所述之序列的核鹼基序 列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1330或3303中任一者所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由3個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由3個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間，其中各側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：559或560中任一者所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由1個連接之核苷組成；及 3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1330或2021中任一者所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由4個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：560所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成； 5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：2021所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1540所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸 包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途中任一者中，化合物可包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸或由其組成，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：560所述之序列的核鹼基序列的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之長度為16個連接之核苷。

在前述方法或用途之任一者中，化合物可包含ION 935918或其鹽或 由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在前述方法或用途之任一者中，化合物可包含ION 935918之鈉鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在前述方法或用途之任一者中，化合物可包含ION 935968或其鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在前述方法或用途之任一者中，化合物可包含ION 935968之鈉鹽或由其組成，該鹽具有以下化學結構：

在前述方法或用途中任一者中，化合物可以腸胃外方式投與。例如，在某些實施例中，化合物可透過注射或輸注投與。腸胃外投與包括皮下投與、靜脈內投與、肌肉內投與、動脈內投與、腹膜內投與、或顱內投與例如鞘內或腦室內投與。

某些組合及組合療法

在某些實施例中，包含本文所述之化合物之第一藥劑係與一或多種二級藥劑共同投與。在某些實施例中，此類第二藥劑經設計以治療與本文所述之第一藥劑相同的疾病、病症、或病狀。在某些實施例中，此類第二藥劑經設計以治療與本文所述之第一藥劑不同的疾病、病症、或病狀。在某些實施例中，第一藥劑經設計以處理第二藥劑之非所要副作用。在某些實施例中，第二藥劑係與第一藥劑共同投與以處理第一藥劑之非所要作用。在某些實施例中，此等 第二藥劑經設計以處理一或多種如本文所述之醫藥組合物之非所要副作用。在某些實施例中，第二藥劑係與第一藥劑共同投與以產生組合效應。在某些實施例中，第二藥劑係與第一藥劑共同投與以產生協同效應。在某些實施例中，與作為獨立療法投與藥劑時達成治療或防治作用所需劑量相比，第一藥劑及第二藥劑之共同投與允許使用較低劑量。

在某些實施例中，一或多種本文所提供之化合物或組成物係與一或多種二級藥劑共同投與。在某些實施例中，一或多種本文所提供之化合物或組成物及一或多種二級藥劑係在不同時間投與。在某些實施例中，一或多種本文所提供之化合物或組成物及一或多種二級藥劑係一起製備成單一調配物。在某些實施例中，一或多種本文所提供之化合物或組成物及一或多種二級藥劑係分開製備。在某些實施例中，二級藥劑係選自：蛋白酶體抑制劑，包括但不限於硼替佐米(bortezomib)、卡非佐米(carfilzomib)、及伊沙佐米(ixazomib)；BTK抑制劑，包括但不限於依魯替尼(ibrutinib)；IMiD，包括但不限於沙利度胺(thalidomide)、來那度胺、及泊馬度胺(pomalidomide)；BCL2抑制劑，包括但不限於維奈托克(venetoclax)；HDAC抑制劑，包括但不限於帕比司他(panobinostat)；CDK抑制劑，包括但不限於地那西利(dinaciclib)；XPOI抑制劑，包括但不限於selinexor；BET抑制劑，包括但不限於CPI-0610；抗CD38抗體，包括但不限於達雷木單抗(daratumumab)、伊莎妥昔單抗(isatuximab)、及MOR202；抗CD319或抗SLAMF7抗體，包括但不限於埃羅妥珠單抗(elotuzumab)；地塞米松、順鉑、多柔比星、環磷醯胺、及依託泊苷。

某些實施例係關於與二級藥劑組合的如本文所述之靶向IRF4之化合物之用途。在具體實施例中，此類用途在於治療罹患癌症之患者之方法，癌症包括但不限於血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，此類用途在於製備 或製造用於治療癌症之藥物，癌症包括但不限於血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。在某些實施例中，B細胞淋巴瘤為非霍奇金氏B細胞淋巴瘤。某些實施例中可用本文所提供之化合物治療的非霍奇金氏B細胞淋巴瘤之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、活化B細胞淋巴瘤(ABC-DLBCL)、生發中心B細胞淋巴瘤(GCB DLBCL)、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、慢性淋巴球性白血病、外膜細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、結節性邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)、脾臟邊緣區淋巴瘤(SMZL)、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、及淋巴瘤樣肉芽腫。在某些實施例中，T細胞淋巴瘤包括但不限於周邊T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、及退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)。在某些實施例中，白血病包括但不限於急性淋巴球性白血病(ALL)。在某些實施例中，二級藥劑係選自：蛋白酶體抑制劑，包括但不限於硼替佐米、卡非佐米、及伊沙佐米；BTK抑制劑，包括但不限於依魯替尼；IMiD，包括但不限於沙利度胺、來那度胺、及泊馬度胺；BCL2抑制劑，包括但不限於維奈托克；HDAC抑制劑，包括但不限於帕比司他；CDK抑制劑，包括但不限於地那西利；XPO1抑制劑，包括但不限於selinexor；BET抑制劑，包括但不限於CPI-0610；抗CD38抗體，包括但不限於達雷木單抗、伊莎妥昔單抗、及MOR202；抗CD319或抗SLAMF7抗體，包括但不限於埃羅妥珠單抗；地塞米松、順鉑、多柔比星、環磷醯胺、及依託泊苷。

某些實施例係關於如本文所述之靶向IRF4之化合物與二級藥劑之組合，諸如選自以下之二級藥劑：蛋白酶體抑制劑，包括但不限於硼替佐米、卡非佐米、及伊沙佐米；BTK抑制劑，包括但不限於依魯替尼；IMiD，包括但不限於沙利度胺、來那度胺、及泊馬度胺；BCL2抑制劑，包括但不限於維奈托 克；HDAC抑制劑，包括但不限於帕比司他；CDK抑制劑，包括但不限於地那西利；XPO1抑制劑，包括但不限於selinexor；BET抑制劑，包括但不限於CPI-0610；地塞米松、沙利度胺、順鉑、多柔比星、環磷醯胺、及依託泊苷。在某些實施例中，如本文所述之靶向IRF4之化合物及二級藥劑之此一組合，諸如選自以下之二級藥劑：蛋白酶體抑制劑，包括但不限於硼替佐米、卡非佐米、及伊沙佐米；BTK抑制劑，包括但不限於依魯替尼；IMiD，包括但不限於來那度胺；BCL2抑制劑，包括但不限於維奈托克；HDAC抑制劑，包括但不限於帕比司他；CDK抑制劑，包括但不限於地那西利；XPO1抑制劑，包括但不限於selinexor；BET抑制劑，包括但不限於CPI-0610；抗CD38抗體，包括但不限於達雷木單抗、伊莎妥昔單抗、及MOR202；抗CD319或抗SLAMF7抗體，包括但不限於埃羅妥珠單抗；地塞米松、順鉑、多柔比星、環磷醯胺、及依託泊苷。此類組合可實用於降低或抑制癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移及/或治療癌症，癌症包括但不限於血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性腫瘤、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。

在某些實施例中，如本文所述之包含靶向IRF4之化合物及二級藥劑係藉由同時、分開、或依序投與該兩種藥劑來用於組合治療中。在某些實施例中，該兩種藥劑經調配成固定劑量組合產品。在其他實施例中，該兩種藥劑係呈單獨的單元向患者提供，該等單獨的單元然後可同時或連續(依序)使用。

某些化合物

在某些實施例中，本文所述之化合物可為反義化合物。在某些實施例中，反義化合物包含寡聚化合物或由其組成。在某些實施例中，寡聚化合物包含經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸具有與目標核酸的核鹼基序列互補的核鹼基序列。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其 組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸具有與目標核酸的核鹼基序列互補的核鹼基序列。

在某些實施例中，化合物或反義化合物為單股化合物。此一單股化合物或反義化合物包含寡聚化合物或由其組成。在某些實施例中，此一寡聚化合物包含寡核苷酸及視情況綴合基團或由其組成。在某些實施例中，寡核苷酸為反義寡核苷酸。在某些實施例中，寡核苷酸係經修飾。在某些實施例中，單股反義化合瓦或寡聚化合物之寡核苷酸包含自身互補的核鹼基序列。

在某些實施例中，化合物為雙股化合物。此類雙股化合物包含第一經修飾之寡核苷酸及第二經修飾之寡核苷酸，該第一經修飾之寡核苷酸具有與目標核酸互補之區域，該第二經修飾之寡核苷酸具有與該第一經修飾之寡核苷酸互補之區域。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸為RNA寡核苷酸。在此類實施例中，經修飾之寡核苷酸中之胸腺嘧啶核鹼基由尿嘧啶核鹼基置換。在某些實施例中，化合物包含綴合基團。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之一經綴合。在某些實施例中，兩種經修飾之寡核苷酸經綴合。在某些實施例中，第一經修飾之寡核苷酸經綴合。在某些實施例中，第二經修飾之寡核苷酸經綴合。在某些實施例中，第一經修飾之寡核苷酸之長度為12-30個連接之核苷，且第二經修飾之寡核苷酸之長度為12-30個連接之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之一具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。

在某些實施例中，反義化合物為雙股化合物。此類雙股反義化合物包含第一寡聚化合物及第二寡聚化合物，該第一寡聚化合物具有與目標核酸互補之區域，該第二寡聚化合物具有與該第一寡聚化合物互補之區域。此類雙股反義化合物之第一寡聚化合物通常包含經修飾之寡核苷酸及視情況綴合基團或由其組成。此類雙股反義化合物之第二寡聚化合物之寡核苷酸可經修飾或未經 修飾。雙股反義化合物之任一或兩種寡聚化合物可包含綴合基團。雙股反義化合物之寡聚化合物可包括非互補懸突核苷。

單股化合物及雙股化合物之實例包括但不限於寡核苷酸、siRNA、微小RNA靶向寡核苷酸、及單股RNAi化合物，諸如小髮夾RNA(shRNA)、單股siRNA(ssRNA)、及微小RNA模擬物。

在某些實施例中，本文所述之化合物具有以下核鹼基序列，該核鹼基序列當以5'至3'方向書寫時包含其所靶向之目標核酸之目標段之反向補體。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為10至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為12至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為12至22個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為14至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為14至20個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為15至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為15至20個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為16至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為16至20個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為17至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為17至20個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為18至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為18至21個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為18至20個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為20至30個連接之亞單元的寡核苷酸。換言之，此類寡核苷酸之長度分別 為12至30個連接之亞單元、14至30個連接之亞單元、14至20個亞單元、15至30個亞單元、15至20個亞單元、16至30個亞單元、16至20個亞單元、17至30個亞單元、17至20個亞單元、18至30個亞單元、18至20個亞單元、18至21個亞單元、20至30個亞單元、或12至22個連接之亞單元。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為14個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為16個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為17個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為18個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為19個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些實施例中，本文所述之化合物包含長度為20個連接之亞單元的寡核苷酸。在其他實施例中，本文所述之化合物包含8至80、12至50、13至30、13至50、14至30、14至50、15至30、15至50、16至30、16至50、17至30、17至50、18至22、18至24、18至30、18至50、19至22、19至30、19至50、或20至30個連接之亞單元的寡核苷酸。在某些此類實施例中，本文所述之化合物包含長度為以下的寡核苷酸：8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、或80個連接之亞單元、或上述值之任何兩者所界定之範圍。在一些實施例中，連接之亞單元為核苷酸、核苷、或核鹼基。

在某些實施例中，化合物可進一步包含連接至寡核苷酸的額外特徵或元件，諸如綴合基團。在某些實施例中，此類化合物為反義化合物。在某些實施例中，此類化合物為寡聚化合物。在綴合基團包含核苷(即，將綴合基團連 接至寡核苷酸的核苷)的實施例中，綴合基團之核苷不計入寡核苷酸之長度。

在某些實施例中，化合物可經縮短或截斷。例如，單個亞單元可自5'端缺失(5'截短)，或替代地自3'端缺失(3'截斷)。靶向IRF4核酸之縮短或截斷化合物可具有兩個自化合物之5'端缺失的亞單元，或替代地可具有兩個自化合物之3'端缺失的亞單元。替代地，缺失之核苷可遍及化合物分散。

當單個額外亞單元存在於延長化合物中時，該額外亞單元可位於化合物之5'端或3'端。當存在二或更多個額外亞單元時，添加之亞單元可彼此相鄰，例如在兩個亞單元添加至化合物之5'端(5'添加)或替代地添加至化合物之3'端(3'添加)的化合物中。替代地，添加之亞單元可遍及化合物分散。

有可能增加或減小化合物(諸如寡核苷酸)之長度，及/或引入錯配鹼基而不消除活性(Woolf等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1992,89：7305-7309；Gautschi等人 ，J.Natl.Cancer Inst. 2001年3月，93：463-471；Maher及DolnickNuc.Acid.Res .1998,16：3341-3358)。然而，寡核苷酸序列、化學性質、及模體中看上去小的改變可在臨床發展所需之許多性質中之一或多者方面產生很大差異(Seth等人，J.Med.Chem. 2009,52,10；Egli等人，J.Am.Chem.Soc. 2011,133,16642)。

在某些實施例中，本文所述之化合物為干擾型RNA化合物(RNAi)，其包括雙股RNA化合物(亦稱為短干擾型RNA或siRNA)及單股RNAi化合物(或ssRNA)。此類化合物至少部分地透過RISC途徑起作用以降解和/或螯合目標RISC核酸(因此，包括微小RNA/微小RNA-模擬物化合物)。如本文所述，術語siRNA意謂等效於其他用於描述能夠介導序列特異性RNAi的核酸分子的術語，例如短干擾型RNA(siRNA)、雙股RNA(dsRNA)、微小RNA(miRNA)、短髮夾RNA(shRNA)、短干擾型寡核苷酸、短干擾型核酸、短干擾型經修飾之寡核苷酸、經化學修飾之siRNA、轉錄後基因靜默RNA(ptgsRNA)等等。此外，如本文所用，術語「RNAi」意謂等效於其他用於描述序列特異性RNA干擾的 術語，諸如轉錄後基因靜默、轉錄抑制、或表觀遺傳學。

在某些實施例中，本文所述之化合物可包含本文所述之靶向IRF4之任一寡核苷酸序列。在某些實施例中，化合物可為雙股化合物。在某些實施例中，化合物包含第一股及第二股，該第一股至少包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基的部分。在某些實施例中，化合物包含第一股及第二股，該第一股包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含核糖核苷酸，在該等核糖核苷酸中第一股在SEQ ID NO：3-3383中任一者中具有尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)。在某些實施例中，化合物包含：(i)第一股，其包含與SEQ ID NO：3-3383中之任一者所靶向之IRF4上的位點互補的核鹼基序列；及(ii)第二股。在某些實施例中，化合物包含一或多個經修飾之核苷酸，在該一或多個經修飾之核苷酸中糖中的2'位含有鹵素(諸如氟基；2'-F)或含有烷氧基(諸如甲氧基；2'-OMe)。在某些實施例中，化合物包含至少兩個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾。在某些實施例中，該至少一個2'-F糖修飾和該至少一個2'-OMe糖修飾係沿著dsRNA化合物之股以交替的模式排列至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基。在某些實施例中，化合物在相鄰核苷酸之間包含一或多個除天然存在之磷酸二酯鍵聯之外的鍵聯。此類鍵聯之實例包括磷醯胺、硫代磷酸酯、及二硫代磷酸酯鍵聯。化合物亦可為經化學修飾之核酸，如美國專利第6,673,661號所教示。在其他實施例中，化合物含有一或兩個加帽股，如例如2000年4月19日提交之WO 00/63364所揭示。

在某些實施例中，化合物之第一股為siRNA，且化合物之第二股為siRNA隨從股。在某些實施例中，化合物之第二股與第一股互補。在某些實施例中，化合物之各股之長度為16、17、18、19、20、21、22、或23個連接之核 苷。在某些實施例中，化合物之第一股或第二股可包含共軛基團。

在某些實施例中，本文所述之化合物可包含本文所述之靶向IRF4之任一寡核苷酸序列。在某些實施例中，化合物為單股化合物。在某些實施例中，此一化合物為單股RNAi(ssRNAi)化合物。在某些實施例中，化合物至少包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基的部分。在某些實施例中，化合物包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基序列。在某些實施例中，化合物包含核糖核苷酸，在該等核糖核苷酸中在SEQ ID NO：3-3383中任一者中尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)。在某些實施例中，化合物包含核鹼基序列，其與SEQ ID NO：3-3383上任一者所靶向之IRF4上的位點互補。在某些實施例中，化合物包含一或多個經修飾之核苷酸，在該一或多個經修飾之核苷酸中糖中的2'位含有鹵素(諸如氟基；2'-F)或含有烷氧基(諸如甲氧基；2'-OMe)。在某些實施例中，化合物包含至少兩個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾。在某些實施例中，該至少一個2'-F糖修飾和該至少一個2'-OMe糖修飾係沿著化合物之股以交替的模式排列至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續核鹼基。在某些實施例中，化合物在相鄰核苷酸之間包含一或多個除天然存在之磷酸二酯鍵聯之外的鍵聯。此類鍵聯之實例包括磷醯胺、硫代磷酸酯、及二硫代磷酸酯鍵聯。化合物亦可為經化學修飾之核酸，如美國專利第6,673,661號所教示。在其他實施例中，化合物含有加帽股，如例如2000年4月19日提交之WO 00/63364所揭示。在某些實施例中，化合物由16、17、18、19、20、21、22、或23個連接之核苷組成。在某些實施例中，化合物可包含綴合基團。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸。某些經修飾之寡核苷酸具有一或多個不對稱中心且因此產生鏡像異構物、非鏡像異構物、及其他立體異構組態，其可定義為(R)或(S)(就絕對立體化學而言)、α或 β(諸如就糖變旋異構物而言)、或(D)或(L)(諸如就胺基酸而言)等等。除非另外指定，否則本文所提供之經修飾之寡核苷酸包括所有此類可能的異構物，包括其外消旋及視情況純形式。同樣地，亦包括所有順式及反式異構物以及互變異構形式。

本文所述之化合物包括以下變化，其中一或多個原子經指示元素之非放射同位素或放射同位素置換。例如，本文包含氫原子之化合物涵蓋每個¹ H氫原子之所有可能的氘取代。本文化合物所涵蓋之同位素取代包括但不限於：² H或³ H代替¹ H；¹³ C或¹⁴ C代替¹² C；¹⁵ N代替¹⁴ N；¹⁷ O或¹⁸ O代替¹⁶ O；及³³ S、³⁴ S、³⁵ S、或³⁶ S代替³² S。在某些實施例中，非放射同位素取代可對化合物賦予新的有利於用作治療或研究工具的性質。在某些實施例中，放射同位素取代可製備合適於研究或診斷目的諸如成像檢定的化合物。

某些機制

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成。在某些實施例中，本文所述之化合物為反義化合物。在某些實施例中，化合物包含寡聚化合物。在某些實施例中，本文所述之化合物能夠與目標核酸雜交，得到至少一種反義活性。在某些實施例中，本文所述之化合物選擇性地影響一或多種目標核酸。此類化合物包含核鹼基序列，該核鹼基序列與一或多種目標核酸雜交，得到一或多種所要的反義活性，且不與一或多種非目標核酸雜交或不與一或多種以此一方式產生顯著非所要的反義活性的非目標核酸雜交。

在某些反義活性中，本文所述之化合物與目標核酸之雜交導致裂解目標核酸的蛋白之補充。例如，本文所述之某些化合物導致目標核酸之核糖核酸酶H介導之裂解。核糖核酸酶H為裂解RNA：DNA雙螺旋之RNA股的細胞內切酶。此一RNA：DNA雙螺旋中之DNA不必為未修飾之DNA。在某些實施例 中，本文所述之化合物足夠「像DNA」以引出核糖核酸酶H活性。此外，在某些實施例中，間隔體之間隔中一或多個不像DNA的核苷是耐受的。

在某些反義活性中，本文所述之化合物或化合物之一部分經加載至RNA誘導之靜默複合物(RISC)中，最終導致目標核酸之裂解。例如，本文所述之某些化合物導致目標核酸由Argonaute裂解。加載至RISC中的化合物為RNAi化合物。RNAi化合物可為雙股化合物(siRNA)或單股化合物(ssRNA)。

在某些實施例中，本文所述之化合物與目標核酸之雜交不導致裂解目標核酸的蛋白之補充。在某些此類實施例中，化合物與目標核酸之雜交導致目標核酸之剪接之改變。在某些實施例中，化合物與目標核酸之雜交導致目標核酸與蛋白或另一核酸之間的結合相互作用之抑制。在某些此類實施例中，化合物與目標核酸之雜交導致目標核酸之轉譯之改變。

可直接或間接觀察到反義活性。在某些實施例中，觀察或偵測反義活性涉及觀察或偵測目標核酸或此類目標核酸所編碼之蛋白之量、核酸或蛋白之剪接變異體之比率、及/或細胞或動物之表現型變化。

目標核酸、目標區域、及核苷酸序列

在某些實施例中，本文所述之化合物包含以下寡核苷酸或由其組成，該核苷酸包含與目標核酸互補的區域。在某些實施例中，目標核酸為內源性RNA分子。在某些實施例中，目標核酸編碼蛋白。在某些此類實施例中，目標核酸分子係選自：mRNA及前驅mRNA，包括內含子區域、外顯子區域、及未轉譯區域。在某些實施例中，目標RNA為mRNA。在某些實施例中，目標核酸為前驅mRNA。在某些此類實施例中，目標區域完全在內含子內。在某些實施例中，目標區域跨越內含子/外顯子接點。在某些實施例中，目標區域至少50%在內含子內。

編碼IRF4之核苷酸序列包括但不限於以下：RefSEQ No. NM_002460.3和NT_034880.3_TRUNC_328000_354000。

雜交

在一些實施例中，在本文所揭示之化合物與IRF4核酸之間進行雜交。雜交之最常見機制涉及核酸分子之互補核鹼基之間的氫鍵結(例如，瓦生-克立克、胡思町或反向胡思町氫鍵結)。

可在不同條件下進行雜交。雜交條件具有序列依賴性且由欲雜交之核酸分子之性質及組成確定。

確定序列是否可與目標核酸特異性雜交的方法在此項技術中為熟知的。在某些實施例中，本文所提供之化合物可與IRF4核酸特異性雜交。

互補性

當在相反方向上對齊兩個核鹼基序列時，寡核苷酸或其一或多個區域之核鹼基序列與另一寡核苷酸或核酸或其一或多個區域之核鹼基序列匹配時，稱寡核苷酸與另一核酸互補。除非另外指定，否則如本文所述之核鹼基匹配或互補核鹼基不限於以下各對：腺嘌呤(A)及胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)及尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)及鳥嘌呤(G)、以及5-甲基胞嘧啶(mC)及鳥嘌呤(G)。互補寡核苷酸及/或核酸不必在各核苷均具有核鹼基互補性且可包括一或多處核鹼基錯配。當此類寡核苷酸在各核苷處具均具有核鹼基匹配而無任何核鹼基錯配時，寡核苷酸為完全互補或100%互補。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成。在某些實施例中，本文所述之化合物為反義化合物。在某些實施例中，化合物包含寡聚化合物。可容許化合物與IRF4核酸之間的非互補性核鹼基，限制條件為該化合物仍能夠與目標核酸特異性雜交。此外，化合物可在IRF4核酸之一或多個區段上雜交，使得介入或相鄰區段不涉及雜交事件(例如，環結構、錯配、或髮夾結構)。

在某些實施例中，本文所提供之化合物或其指定部分與IRF4核酸、其目標區域、目標段、或指定部分為、為至少、或為至多70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%互補。在某些實施例中，本文所提供之化合物或其指定部分與IRF4核酸、其目標區域、目標段、或指定部分為70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%、95%至100%、或這些範圍中之任何數字互補。化合物與目標核酸之互補性百分比可使用常規方法確定。

例如，化合物中化合物之20個核鹼基中有18個核鹼基與目標區域互補且因此特異性雜交將表示90%互補性。在此實例中，其餘非互補核鹼基可與互補核鹼基叢集或交替且不必彼此鄰接或與互補核鹼基鄰接。因此，長度為18個核鹼基並具有4個非互補核鹼基且該等非互補核鹼基由與目標核酸完全互補之兩個區域側接的化合物與目標核酸應具有77.8%總體互補性。化合物與目標核酸之區域的互補性百分比可常規地使用此項技術中已知之BLAST程式(基本局部比對搜尋工具(basic local alignment search tool))及PowerBLAST程式來確定(Altschul等人 ，J.Mol.Biol .,1990,215,403410；Zhang及Madden,Genome Res.,1997,7,649656)。同源性、序列一致性、或互補性百分比可藉由例如使用Smith及Waterman(Adv.Appl.Math.,1981,2,482 489)之演算法的Gap程式(威斯康星序列分析套件(Wisconsin Sequence Analysis Package)，用於Unix之版本8，Genetics Computer Group,University Research Park,Madison Wis.)使用預設設置來確定。

在某些實施例中，本文所述之化合物或其指定部分與目標核酸或其指定部分完全互補(即，100%互補)。例如，化合物可與IRF4核酸或其目標區域、或目標段、或目標序列完全互補。如本文所用，「完全互補」意謂化合物之各核鹼基均與目標核酸之對應的核鹼基互補。例如，具有20個核鹼基之化合物與 長400個核鹼基之目標序列完全互補，只要目標核酸中有對應的具有20個核鹼基之部分與化合物完全互補即可。完全互補亦可關於第一核酸及/或第二核酸之指定部分使用。例如，具有30個核鹼基之化合物中具有20個核鹼基之部分可與長400個核鹼基之目標序列「完全互補」。具有30個核鹼基之化合物中具有20個核鹼基之部分在目標序列具有對應的具有20個核鹼基之部分，其中各核鹼基與化合物中該具有20個核鹼基之部分互補的情況下與目標序列完全互補。同時，整個具有30個核鹼基之化合物與目標序列可完全互補或未必完全互補，視化合物之其餘10個核鹼基是否亦與目標序列互補而定。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含一或多個相對於目標序列錯配的核鹼基。在某些此類實施例中，對目標的反義活性因此類錯配而減小，但是對於非目標的活性減少較大量。因此，在某些此類實施例中，化合物之選擇性經改良。在某些實施例中，錯配特別定位於具有間隔體模體之寡核苷酸中。在某些此類實施例中，錯配位於自間隔區之5'端之1、2、3、4、5、6、7、或8位。在某些此類實施例中，錯配位於自間隔區之3'端之9、8、7、6、5、4、3、2、1位。在某些此類實施例中，錯配位於自側翼區之5'端之1、2、3、或4位。在某些此類實施例中，錯配位於自側翼區之3'端之4、3、2、或1位。在某些實施例中，錯配特別定位於不具有間隔體模體之寡核苷酸中。在某些此類實施例中，錯配位於自寡核苷酸之5'端之1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12位。在某些此類實施例中，錯配位於自寡核苷酸之3'端之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12位。

非互補核鹼基之位置可位於化合物之5'端或3'端。替代地，該或該等非互補核鹼基可位於化合物之內部位置。當存在二或更多個非互補核鹼基時，其可為連續(即連接)或不連續的。在一個實施例中，非互補核鹼基位於間隔體寡核苷酸之側翼段中。

在某些實施例中，長度為或為至多11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、或20個核鹼基的化合物相對於目標核酸(諸如IRF4核酸)或其指定部分包含不多於4個、不多於3個、不多於2個、或不多於1個非互補核鹼基。

在某些實施例中，長度為或為至多11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、或30個核鹼基的本文所述化合物相對於目標核酸(諸如IRF4核酸)或其指定部分包含不多於6個、不多於5個、不多於4個、不多於3個、不多於2個、或不多於1個非互補核鹼基。

在某些實施例中，本文所述之化合物亦包括與目標核酸之一部分互補的化合物。如本文所用之「部分」係指目標核酸之區域或區段內確定數目之連續(亦即連接)核鹼基。「部分」亦可指化合物中經定義數目之連續核鹼基。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少8個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少9個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少10個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少11個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少12個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少13個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少14個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少15個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，化合物與目標段中具有至少16個核鹼基之部分互補。亦涵蓋與目標段中具有至少9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、或更多(或由此等值中之任何兩者所界定之範圍)核鹼基之部分互補的化合物。

一致性

本文所提供之化合物亦可與具體核苷酸序列SEQ ID NO或由特定ION編號表示之化合物或其部分具有經定義之一致性百分比。在某些實施例中，本文所述之化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，本文所述之化合物為經修飾之寡核苷酸。如本文所用，若化合物具有相同核鹼基配對能力，則其與本文所揭示之序列一致。例如，在所揭示之DNA序列中含有尿嘧啶而非胸腺嘧啶的RNA將視作與DNA序列一致，因為尿嘧啶及胸腺嘧啶皆與腺嘌呤配對。亦涵蓋本文所述之化合物之縮短及延長型式以及相對於本文所以提供之反義化合物具有不一致鹼基的化合物。不一致鹼基可彼此相鄰或分散於整個化合物中。化合物之一致性百分比係根據相對於與其比較之序列具有一致鹼基配對之鹼基的數目來計算。

在某些實施例中，本文所述之化合物或其部分與本文所揭示之一或多種化合物、或SEQ ID NO、或其部分具有至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%一致性。在某些實施例中，本文所述之化合物與具體核苷酸序列SEQ ID NO或由特定ION編號表示之化合物或其部分具有約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%一致性，其中該等化合物包含具有一或多個錯配核鹼基之寡核苷酸。在某些此類實施例中，錯配位於自寡核苷酸之5'端之1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12位。在某些此類實施例中，錯配位於自寡核苷酸之3'端之2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、或12位。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含反義化合物或由其組成。在某些實施例中，將反義化合物之一部分與目標核酸之等長部分相比較。在某些實施例中，將具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個或25個核鹼基之 部分與目標核酸之等長部分相比較。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸或由其組成。在某些實施例中，將寡核苷酸之一部分與目標核酸之等長部分相比較。在某些實施例中，將具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個或25個核鹼基之部分與目標核酸之等長部分相比較。

某些經修飾之化合物

在某些實施例中，本文所述之化合物包含由連接之核苷組成之寡核苷酸或由其組成。寡核苷酸可為未修飾之寡核苷酸(RNA或DNA)或可為經修飾之寡核苷酸。經修飾之寡核苷酸未修飾之RNA或DNA包含至少一個修飾(即包含至少一個經修飾之核苷(包含經修飾之糖部分及/或經修飾之核鹼基)及/或至少一個經修飾之核苷間鍵聯)。

A. 經修飾之核苷

經修飾之核苷包含經修飾之糖部分、或經修飾之核鹼基、或經修飾之糖部分及經修飾之核鹼基兩者。

1. 經修飾之糖部分

在某些實施例中，糖部分為非雙環經修飾之糖部分。在某些實施例中，經修飾之糖部分為雙環或三環糖部分。在某些實施例中，經修飾之糖部分為糖替代物。此類糖替代物可包含一或多個對應於其他類型經修飾之糖部分之取代的取代。

在某些實施例中，經修飾之糖部分為包含具有一或多個非環取代基之呋喃醣基環之非雙環經修飾之糖部分，該一或多個非環取代基包括但不限於在2'、4'、及/或5'位之取代基。在某些實施例中，非雙環經修飾之糖部分之一或多個非環取代基為具支鏈的。合適於非雙環經修飾之糖部分之2'取代基之實例 包括但不限於：2'-F、2'-OCH₃ (「OMe」或「O-甲基」)、及2'-O(CH₂ )₂ OCH₃ (「MOE」)。在某些實施例中，2'-取代基係選自以下：鹵基、烯丙基、胺基、疊氮基、SH、CN、OCN、CF₃ 、OCF₃ 、O-C₁ -C₁₀ 烷氧基、O-C₁ -C₁₀ 經取代烷氧基、O-C₁ -C₁₀ 烷基、O-C₁ -C₁₀ 經取代烷基、S-烷基、N(R_m )-烷基、O-烯基、S-烯基、N(R_m )-烯基、O-炔基、S-炔基、N(R_m )-炔基、O-伸烷基-O-烷基、炔基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基、O-芳烷基、O(CH₂ )₂ SCH₃ 、O(CH₂ )₂ ON(R_m )(R_n )、或OCH₂ C(=O)-N(R_m )(R_n )，其中各R_m 及R_n 獨立地為H、胺基保護基、或經取代或未經取代之C₁ -C₁₀ 烷基、以及以下中所述之2'-取代基：Cook等人，U.S.6,531,584；Cook等人，U.S.5,859,221；及Cook等人，U.S.6,005,087。此等2'-取代基之某些實施例可進一步經一或多個獨立地選自以下之取代基取代：羥基、胺基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基(NO₂ )、硫醇、硫烷氧基、硫烷基、鹵素、烷基、芳基、烯基、及炔基。合適於線性非雙環經修飾之糖部分之4'-取代基之實例包括但不限於烷氧基(例如'甲氧基)、烷基、及Manoharan等人，WO 2015/106128中所述者。合適於非雙環經修飾之糖部分之5'-取代基之實例包括但不限於：5'-甲基(R或S)、5'-乙烯基、及5'-甲氧基。在某些實施例中，非雙環經修飾之糖包含多於一種非橋聯糖取代基，例如2'-F-5'-甲基糖部分以及以下中所述之經修飾之糖部分及經修飾之核苷：Migawa等人，US2010/190837及Rajeev等人，US2013/0203836。

在某些實施例中，2'-取代核苷或2'-非雙環經修飾之核苷包含糖部分，該糖部分包含選自以下之線性2'-取代基：F、NH₂ 、N₃ 、OCF₃ 、OCH₃ 、O(CH₂ )₃ NH₂ 、CH₂ CH=CH₂ 、OCH₂ CH=CH₂ 、OCH₂ CH₂ OCH₃ 、O(CH₂ )₂ SCH₃ 、O(CH₂ )₂ ON(R_m )(R_n )、O(CH₂ )₂ O(CH₂ )₂ N(CH₃ )₂ 、及N-取代乙醯胺(OCH₂ C(=O)-N(R_m )(R_n ))，其中各Rm及R_n 獨立地為H、胺基保護基、或經取代或未經取代之C₁ -C₁₀ 烷基。

在某些實施例中，2'-取代核苷或2'-非雙環經修飾之核苷包含糖部分，該糖部分包含選自以下之線性2'-取代基：F、OCF₃ 、OCH₃ 、OCH₂ CH₂ OCH₃ 、O(CH₂ )₂ SCH₃ 、O(CH₂ )₂ ON(CH₃ )₂ 、O(CH₂ )₂ O(CH₂ )₂ N(CH₃ )₂ 、及OCH₂ C(=O)-N(H)CH₃ (「NMA」)。

在某些實施例中，2'-取代核苷或2'-非雙環經修飾之核苷包含糖部分，該糖部分包含選自以下之線性2'-取代基：F、OCH₃ 、及OCH₂ CH₂ OCH₃ 。

包含經修飾之糖部分(諸如非雙環經修飾之糖部分)之核苷係根據核苷之糖部分上之一或多個取代基之一或多個位置來指代。例如，包含2'-取代或2-經修飾之糖部分之核苷被稱為2'-取代核苷或2-經修飾之核苷。

某些經修飾之糖部分包含形成第二環從而得到雙環糖部分的橋聯糖取代基。在某些此類實施例中，雙環糖部分在4'與2'呋喃糖環原子之間包含橋。此類4'至2'橋聯糖取代基之實例包括但不限於：4'-CH₂ -2'、4'-(CH₂ )₂ -2'、4'-(CH₂ )₃ -2'、4'-CH₂ -O-2'(「LNA」)、4'-CH₂ -S-2'、4'-(CH₂ )₂ -O-2'(「ENA」)、4'-CH(CH₃ )-O-2'(稱為「限制性乙基」或「cEt」，當處於S 組態時)、4'-CH₂ -O-CH₂ -2'、4'-CH₂ -N(R)-2'、4'-CH(CH₂ OCH₃ )-O-2'(「限制性MOE」或「cMOE」)及其類似物(參見例如 Seth等人，U.S.7,399,845；Bhat等人，U.S.7,569,686；Swayze等人.,U.S.7,741,457；及Swayze等人，U.S.8,022,193)、4'-C(CH₃ )(CH₃ )-O-2'及其類似物(參見例如 Seth等人，U.S.8,278,283)、4'-CH₂ -N(OCH₃ )-2'及其類似物(參見例如 Prakash等人，U.S.8,278,425)、4'-CH₂ -O-N(CH₃ )-2'(參見例如 Allerson等人，U.S.7,696,345及Allerson等人，U.S.8,124,745)、4'-CH₂ -C(H)(CH₃ )-2'(參見例如 Zhou等人 .,J.Org.Chem.,2009,74 ,118-134)、4'-CH₂ -C(=CH₂ )-2'及其類似物(參見例如 Seth等人，U.S.8,278,426)、4'-C(R_a R_b )-N(R)-O-2'、4'-C(R_a R_b )-O-N(R)-2'、4'-CH₂ -O-N(R)-2'、及4'-CH₂ -N(R)-O-2'，其中各R、R_a 、及R_b 獨立地為H、保護基、或C₁ -C₁₂ 烷基(參 見例如 Imanishi等人，U.S.7,427,672)。

在某些實施例中，此類4'至2'橋獨立地包含1至4個獨立地選自以下之連接之基團：-[C(R_a )(R_b )]_n -、-[C(R_a )(R_b )]_n -O-、-C(R_a )=C(R_b )-、-C(R_a )=N-、-C(=NR_a )-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(R_a )₂ -、-S(=O)_x -、及-N(R_a )-；其中：x為0、1、或2；n為1、2、3、或4；各R_a 及R_b 獨立地為H、保護基、羥基、C₁ -C₁₂ 烷基、經取代之C₁ -C₁₂ 烷基、C₂ -C₁₂ 烯基、經取代之C₂ -C₁₂ 烯基、C₂ -C₁₂ 炔基、經取代之C₂ -C₁₂ 炔基、C₅ -C₂₀ 芳基、經取代之C₅ -C₂₀ 芳基、雜環基、經取代之雜環基、雜芳基、經取代之雜芳基、C₅ -C₇ 脂環基、經取代之C₅ -C₇ 脂環基、鹵素、OJ₁ 、NJ₁ J₂ 、SJ₁ 、N₃ 、COOJ₁ 、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、CN、磺醯基(S(=O)₂ -J₁ )、或亞磺醯基(S(=O)-J₁ )；且各J₁ 及J₂ 獨立地為H、C₁ -C₁₂ 烷基、經取代之C₁ -C₁₂ 烷基、C₂ -C₁₂ 烯基、經取代之C₂ -C₁₂ 烯基、C₂ -C₁₂ 炔基、經取代之C₂ -C₁₂ 炔基、C₅ -C₂₀ 芳基、經取代之C₅ -C₂₀ 芳基、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、雜環基、經取代之雜環基、C₁ -C₁₂ 胺基烷基、經取代之C₁ -C₁₂ 胺基烷基、或保護基。

額外雙環糖部分為此項技術中已知的，參見例如：Freier等人 ，Nucleic Acids Research ,1997,25 (22 ),4429-4443；Albaek等人 ，J.Org.Chem .,2006,71 ,7731-7740；Singh等人，Chem.Commun .,1998,4 ,455-456；Koshkin等人，Tetrahedron ,1998,54 ,3607-3630；Wahlestedt等人，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A .,2000,97 ,5633-5638；Kumar等人，Bioorg.Med.Chem.Lett .,1998,8 ,2219-2222；Singh等人，J.Org.Chem .,1998,63 ,10035-10039；Srivastava等人，J.Am.Chem.Soc .,2007,129, 8362-8379；Elayadi等人，Curr.Opinion Invens.Drugs, 2001,2 ,558-561；Braasch等人 ，Chem.Biol. ,2001,8 ,1-7；Orum等人 ，Curr.Opinion Mol. Ther. ,2001,3 ,239-243；Wengel等人，U.S.7,053,207；Imanishi等人，U.S.6,268,490；Imanishi等人，U.S.6,770,748；Imanishi等人，U.S.RE44,779；Wengel等人，U.S.6,794,499；Wengel等人，U.S.6,670,461；Wengel等人，U.S.7,034,133；Wengel等人，U.S.8,080,644；Wengel等人，U.S.8,034,909；Wengel等人，U.S.8,153,365；Wengel等人，U.S.7,572,582；以及Ramasamy等人，U.S.6,525,191；Torsten等人，WO 2004/106356；Wengel等人，WO 1999/014226；Seth等人，WO 2007/134181；Seth等人，U.S.7,547,684；Seth等人，U.S.7,666,854；Seth等人，U.S.8,088,746；Seth等人，U.S.7,750,131；Seth等人，U.S.8,030,467；Seth等人，U.S.8,268,980；Seth等人，U.S.8,546,556；Seth等人，U.S.8,530,640；Migawa等人，U.S.9,012,421；Seth等人，U.S.8,501,805；Allerson等人，US2008/0039618；及Migawa等人，US2015/0191727。

在某些實施例中，雙環糖部分及併入此類雙糖部分之核苷進一步由異構組態定義。例如，LNA核苷(本文所述)可處於α-L組態或處於β-D組態。

α-L-亞甲氧基(4'-CH₂ -O-2')或α-L-LNA雙環核苷已併入顯示反義活性之寡核苷酸中(Frieden等人，Nucleic Acids Research, 2003,21 ,6365-6372)。因此，雙環核苷之一般描述包括兩種異構組態。除非另外指定，否則當在本文例示性實施例中識別具體雙環核苷(例如，LNA或cEt)之位置時，其處於β-D組態。

在某些實施例中，經修飾之糖部分包含一或多個非橋聯糖取代基及一或多個橋聯糖取代基(例如，5'-經取代及4'-2'橋聯之糖)。

在某些實施例中，經修飾之糖部分為糖替代物。在某些此類實施例中，糖部分之氧原子經例如硫、碳、或氮原子置換。在某些此類實施例中，此 類經修飾之糖部分亦包含如本文所述之橋聯及/或非橋聯取代基。例如，某些糖替代物包含4'-硫原子及在2'-位(參見例如 ，Bhat等人，U.S.7,875,733及Bhat等人，U.S.7,939,677)及/或5'位之取代。

在某些實施例中，糖替代物包含具有除5個原子之外的環。例如，在某些實施例中，糖替代物包含六員四氫哌喃(「THP」)。此類四氫哌喃可進一步經修飾或取代。包含此類經修飾之四氫哌喃之核苷包括但不限於己醣醇核酸(「HNA」)、anitol核酸(「ANA」)、manitol核酸(「MNA」)(參見 例如，Leumann,CJ.Bioorg.& Med.Chem .2002,10 ,841-854)、氟HNA：

(「F-HNA」，參見例如 Swayze等人，U.S.8,088,904；Swayze等人，U.S.8,440,803；及Swayze等人，U.S.9,005,906；F-HNA亦可稱為F-THP或3'-氟四氫哌喃)、及包含額外具有下式之經修飾THP化合物之核苷：

其中，對於該經修飾之THP核苷之各者，獨立地：Bx為核鹼基部分；T₃ 及T₄ 各自獨立地為將經修飾之THP核苷連接至寡核苷酸之其餘部分的核苷間連接基，或T₃ 及T₄ 之一為將經修飾之THP核苷連接至寡核苷酸之其餘部分的核苷間連接基且T₃ 及T₄ 之另一者為H、羥基保護基、連接之綴合基團、或5'或3'-末端基；q₁ 、q₂ 、q₃ 、q₄ 、q₅ 、q₆ 、及q₇ 各自獨立地為H、C₁ -C₆ 烷基、經取 代之C₁ -C₆ 烷基、C₂ -C₆ 烯基、經取代之C₂ -C₆ 烯基、C₂ -C₆ 炔基、或經取代之C₂ -C₆ 炔基；且R₁ 及R₂ 之各者獨立地選自：氫、鹵素、經取代或未經取代之烷氧基、NJ₁ J₂ 、SJ₁ 、N₃ 、OC(=X)J₁ 、OC(=X)NJ₁ J₂ 、NJ₃ C(=X)NJ₁ J₂ 、及CN，其中X為O、S、或NJ₁ ，且各J₁ 、J₂ 、及J₃ 獨立地為H或C₁ -C₆ 烷基。

在某些實施例中，提供經修飾之THP核苷，其中q₁ 、q₂ 、q₃ 、q₄ 、q₅ 、q₆ 、及q₇ 各自為H。在某些實施例中，q₁ 、q₂ 、q₃ 、q₄ 、q₅ 、q₆ 、及q₇ 中之至少一者不為H。在某些實施例中，q₁ 、q₂ 、q₃ 、q₄ 、q₅ 、q₆ 、及q₇ 中之至少一者為甲基。在某些實施例中，提供經修飾之THP核苷，其中R₁ 及R₂ 之一為F。在某些實施例中，R₁ 為F且R₂ 為H，在某些實施例中，R₁ 為甲氧基且R₂ 為H，且在某些實施例中，R₁ 為甲氧基乙氧基且R₂ 為H。

在某些實施例中，糖替代物包含具有多於5個原子及多於一個雜原子之環。例如，已報導包含N-嗎啉基糖部分之糖苷及其在寡核苷酸中之使用(參見例如 ，Braasch等人，Biochemistry,2002,41 ,4503-4510及Summerton等人，U.S.5,698,685；Summerton等人，U.S.5,166,315；Summerton等人，U.S.5,185,444；及Summerton等人，U.S.5,034,506)。如此處所用，術語「N-嗎啉基」意謂具有以下結構之糖替代物：

在某些實施例中，N-嗎啉基可例如藉由添加或改變來自以上N-嗎啉基結構之各種取代基來修飾。此類糖替代物在本文中稱為「經修飾之N-嗎啉基」。

在某些實施例中，糖替代物包含非環部分。包含此類非環糖替代物之核苷及寡核苷酸之實例包括但不限於：肽核酸(「PNA」)、非環丁基核酸(參見例如 ，Kumar等人，Org.Biomol.Chem .,2013,11 ,5853-5865)、以及Manoharan等人，US2013/130378中所述之核苷及寡核苷酸。

許多其他雙環及三環糖及糖替代物環體系為可用於經修飾之核苷之技術中已知的。

2. 經修飾之核鹼基

核鹼基(或鹼基)修飾或取代在結構上可與天然存在或合成之未經修飾核鹼基區分，但在功能上可與天然存在或合成之未經修飾核鹼基互換。天然核鹼基與經修飾核鹼基兩者均能夠參與氫鍵結。此等核鹼基修飾可對反義化合物賦予核酸酶穩定性、結合親和力或一些其他有益生物學性質。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個包含未修飾之核鹼基之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個包含經修飾之核鹼基之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個不包含核鹼基之核苷，稱為無鹼基核苷。

在某些實施例中，經修飾之核鹼基係選自：5-取代嘧啶、6-氮嘧啶、烷基或炔基取代之嘧啶、烷基取代之嘌呤、以及N-2、N-6、及O-6取代之嘌呤。在某些實施例中，經修飾之核鹼基係選自：2-胺基丙基腺嘌呤；5-羥基甲基胞嘧啶；5-甲基胞嘧啶；黃嘌呤；次黃嘌呤、；2-胺基腺嘌呤；6-N-甲基鳥嘌呤；6-N-甲基腺嘌呤；2-丙基腺嘌呤；2-硫尿嘧啶；2-硫胸腺嘧啶；及2-硫胞嘧啶；5-丙炔基(C≡C-CH3)尿嘧啶；5-丙炔基胞嘧啶；6-偶氮尿嘧啶；6-偶氮胞嘧啶；6-偶氮胸腺嘧啶；5-核糖基尿嘧啶(偽尿嘧啶)；4-硫尿嘧啶；8-鹵基、8-胺基、8-硫醇、8-硫烷基、8-羥基、8-氮雜、及其他8-取代之嘌呤；5-鹵基特別是5-溴、5-三氟甲基、5-鹵基尿嘧啶及5-鹵基胞嘧啶；7-甲基鳥嘌呤；7-甲基腺嘌呤；2-F-腺嘌呤；2-胺基腺嘌呤；7-去氮鳥嘌呤；7-去氮腺嘌呤；3-去氮鳥嘌呤；3-去氮腺嘌呤；6-N-苯甲醯基腺嘌呤；2-N-異丁醯基鳥嘌呤；4-N-苯甲醯基胞嘧啶；4-N-苯甲醯基尿嘧啶；5-甲基4-N-苯甲醯基胞嘧啶；5-甲基4-N-苯甲醯基尿嘧啶；通 用鹼基；疏水性鹼基；雜亂鹼基；大小擴大的鹼基；及氟化鹼基。另外經修飾之核鹼基包括三環嘧啶，諸如1,3-疏水性吩噁嗪-2-酮、1,3-疏水性吩噻嗪-2-酮、及9-(2-胺基乙氧基)-1,3-疏水性吩噁嗪-2-酮(G-clamp)。經修飾之核鹼基亦可包括其中嘌呤或嘧啶鹼基經其他雜環置換者，例如7-去氮-腺嘌呤、7-去氮鳥苷、2-胺基吡啶、及2-吡啶酮。另外的核鹼基包括以下中所揭示者：Merigan等人，U.S.3,687,808；The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering,Kroschwitz,J.I.編，John Wiley & Sons,1990,858-859；Englisch等人，Angewandte Chemie，國際版，1991,30,613；Sanghvi,Y.S.，第15章，Antisense Research and Applications,Crooke,S.T.及Lebleu,B.編，CRC Press,1993,273-288；及第6及15章，Antisense Drug Technology,Crooke S.T.編，CRC Press,2008,163-166及442-443。

教導某些上文所說明之經修飾之核鹼基以及其他經修飾之核鹼基之製備的公開案包括但不限於：Manoharan等人，US2003/0158403；Manoharan等人，US2003/0175906；Dinh等人，U.S.4,845,205；Spielvogel等人，U.S.5,130,302；Rogers等人，U.S.5,134,066；Bischofberger等人，U.S.5,175,273；Urdea等人，U.S.5,367,066；Benner等人，U.S.5,432,272；Matteucci等人，U.S.5,434,257；Gmeiner等人，U.S.5,457,187；Cook等人，U.S.5,459,255；Froehler等人，U.S.5,484,908；Matteucci等人，U.S.5,502,177；Hawkins等人，U.S.5,525,711；Haralambidis等人，U.S.5,552,540；Cook等人，U.S.5,587,469；Froehler等人，U.S.5,594,121；Switzer等人，U.S.5,596,091；Cook等人，U.S.5,614,617；Froehler等人，U.S.5,645,985；Cook等人，U.S.5,681,941；Cook等人，U.S.5,811,534；Cook等人，U.S.5,750,692；Cook等人，U.S.5,948,903；Cook等人，U.S.5,587,470；Cook等人，U.S.5,457,191；Matteucci等人，U.S.5,763,588；Froehler等人，U.S.5,830,653；Cook等人，U.S.5,808,027；Cook等人，U.S.6,166,199；及Matteucci等人，U.S.6,005,096。

在某些實施例中，靶向IRF4核酸之化合物包含一或多個經修飾之核鹼基。在某些實施例中，經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。在某些實施例中，各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。

3. 經修飾之核苷間鍵聯

RNA及DNA之天然存在之核苷間鍵聯為3'至5'磷酸二酯鍵聯。在某些實施例中，相較於具有天然存在之核苷間鍵聯的化合物，經常優先選擇本文所述之具有一或多個經修飾之(即非天然存在之)核苷間鍵聯的化合物，因為其具有所要性質諸如，例如細胞吸收增強、對目標核酸之親和力增強、及在核酸酶存在下之穩定性增加。

具有掌性中心之代表性核苷間鍵聯包括但不限於烷基磷酸酯及硫代磷酸酯。包含具有掌性中心之核苷間鍵聯之經修飾之寡核苷酸可製備成包含無規立構核苷間鍵聯之經修飾之寡核苷酸群體或包含處於特定立體化學組態之硫代磷酸酯鍵聯之經修飾之寡核苷酸群體。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸群體包含硫代磷酸酯核苷間鍵聯，其中所有硫代磷酸酯核苷間鍵聯為無規立構。此類經修飾之寡核苷酸可使用導致任意選擇各硫代磷酸酯鍵聯之立體化學組態的合成方法生成。然而，如熟習此項技術者所理解，各個別寡核苷酸分子之各個別硫代磷酸酯具有定義之立體組態。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸群體富含包含一或多個處於特定獨立選擇之立體化學組態之特定硫代磷酸酯核苷間鍵聯之經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，特定硫代磷酸酯鍵聯之特定組態存在於群體中至少65%的分子中。在某些實施例中，特定硫代磷酸酯鍵聯之特定組態存在於群體中至少70%的分子中。在某些實施例中，特定硫代磷酸酯鍵聯之特定組態存在於群體中至少80%的分子中。在某些實施例中，特定硫代磷酸酯鍵聯之特定組態存在於群體中至少90%的分子中。在某些實施例中，特定硫代磷酸酯鍵聯之特定組態存在於群體中至少99%的分子中。經修飾 之寡核苷酸之此類掌性濃化群體可使用此項技術中已知的合成方法生成，例如以下中所述之方法：Oka等人，JACS 125,8307(2003)；Wan等人，Nuc.Acid.Res. 42,13456(2014)；及WO 2017/015555。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸群體富含具有至少一個處於(S p)組態之指示之硫代磷酸酯之經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸群體富含具有至少一個處於(R p)組態之硫代磷酸酯之經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，包含(R p)及/或(S p)硫代磷酸酯之經修飾之寡核苷酸分別包含下式之一或多者，其中「B」指示核鹼基：

除非另外指示，否則本文所述之經修飾之寡核苷酸之掌性核苷間鍵聯可為無規立構或處於特定立體化學組態。

在某些實施例中，靶向IRF4核酸之化合物包含一或多個經修飾之核苷間鍵聯。在某些實施例中，經修飾之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。在某些實施例中，反義化合物之各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯。

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸。具有經修飾之核苷間鍵聯的寡核苷酸包括保留磷原子之核苷間鍵聯以及不具磷原子之核苷間鍵聯。代表性含磷核苷間鍵聯包括但不限於磷酸二酯、磷酸三酯、甲基磷酸酯、胺基磷酸酯、及硫代磷酸酯。製備含磷鍵聯及不含磷鍵聯之方法為熟知的。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之核苷可使用任何核苷間鍵聯連接在一起。兩種主要類別的核苷間連接基係藉由存在或不存在磷原子來界定。代表性含磷核苷間鍵聯包括但不限於磷酸酯(其含有磷酸二酯鍵(「P=O」)(亦 稱為未修飾或天然存在之鍵聯))、磷酸三酯、甲基磷酸酯、磷醯胺酯、及硫代磷酸酯(「P=S」)、以及二硫代磷酸酯(「HS-P=S」)。代表性非含磷核苷間連接基包括但不限於亞甲基甲基亞胺基(-CH2-N(CH3)-O-CH2-)、硫二酯、硫羰胺基甲酸酯(-O-C(=O)(NH)-S-)；矽氧烷(-O-SiH2-O-)；及N,N'-二甲基肼(-CH2-N(CH3)-N(CH3)-)。與天然存在之磷酸酯鍵聯相比，經修飾之核苷間鍵聯可用於改變(通常增加)寡核苷酸之核酸酶抗性。在某些實施例中，具有掌性原子之核苷間鍵聯可呈外消旋混合物或呈單獨鏡像異構物來製備。代表性掌性核苷間鍵聯包括但不限於烷基磷酸酯及硫代磷酸酯。製備含磷及非含磷核苷間鍵聯之方法為熟習此項技術者熟知的。

中性核苷間鍵聯包括但不限於磷酸三酯、甲基磷酸酯、MMI(3'-CH2-N(CH3)-O-5')、醯胺-3(3'-CH2-C(=O)-N(H)-5')、醯胺-4(3'-CH2-N(H)-C(=O)-5')、甲乙縮醛(formacetal)(3'-O-CH2-O-5')、甲氧基丙基、及硫甲乙縮醛(3'-S-CH2-O-5')。另外的中性核苷間鍵聯包括包含矽氧烷(二烷基矽氧烷)、羧酸酯、羧醯胺、硫化物、磺酸酯、及醯胺之非離子型鍵聯(參見例如：Carbohydrate Modifications in Antisense Research；Y.S.Sanghvi及P.D.Cook編，ACS Symposium Series 580；第3及4章，40-65)。另外的中性核苷間鍵聯包括包含混合之N、O、S、及CH2組分部分之非離子型鍵聯。

在某些實施例中，寡核苷酸包含以定義之模式或經修飾之核苷間鍵聯模體之形式沿寡核苷酸或其區域排列的經修飾之核苷間鍵聯。在某些實施例中，核苷間鍵聯係以間隔模體之形式排列。在此類實施例中，兩個側翼區之各者中的核苷間鍵聯不同於間隔區中的核苷間鍵聯。在某些實施例中，側翼中的核苷間鍵聯為磷酸二酯，且間隔中的核苷間鍵聯為硫代磷酸酯。核苷模體經獨立選擇，所以具有間隔核苷間鍵聯模體之寡核苷酸可具有或不具有間隔核苷模體，且若其不具有間隔核苷模體，則側翼長度及間隔長度可相同或不同。

在某些實施例中，寡核苷酸包含具有交替核苷間鍵聯模體之區域。在某些實施例中，寡核苷酸包含均勻經修飾之核苷間鍵聯之區域。在某些此類實施例中，寡核苷酸包含藉由硫代磷酸酯核苷間鍵聯均一連接的區域。在某些實施例中，寡核苷酸藉由硫代磷酸酯均一連接。在某些實施例中，寡核苷酸之各核苷間鍵聯係選自磷酸二酯及硫代磷酸酯。在某些實施例中，寡核苷酸之各核苷間鍵聯係選自磷酸二酯及硫代磷酸酯，且至少一個核苷間鍵聯為硫代磷酸酯。

在某些實施例中，寡核苷酸包含至少6個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少8個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少10個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少6個連續硫代磷酸酯核苷間鍵聯之至少一個區塊。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少8個連續硫代磷酸酯核苷間鍵聯之至少一個區塊。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少10個連續硫代磷酸酯核苷間鍵聯之至少一個區塊。在某些實施例中，寡核苷酸包含至少12個連續硫代磷酸酯核苷間鍵聯之至少一個區塊。在某些此類實施例中，至少一個此類區塊位於寡核苷酸之3'端。在某些此類實施例中，至少一個此類區塊位於寡核苷酸之3'端之3個核苷內。

在某些實施例中，寡核苷酸包含一或多個甲基磷酸酯鍵聯。在某些實施例中，具有間隔體核苷模體之寡核苷酸包含除一或兩個甲基磷酸酯鍵聯之外包含全部硫代磷酸酯鍵聯之鍵聯模體。在某些實施例中，一個甲基磷酸酯鍵聯在具有間隔體核苷模體之寡核苷酸之中心間隔中。

在某些實施例中，期望配置硫代磷酸酯核苷間鍵聯及磷酸二酯核苷間鍵聯之數目以維持核酸酶抗性。在某些實施例中，期望配置硫代磷酸酯核苷間鍵聯之數目及位置以及磷酸二酯核苷間鍵聯之數目及位置以維持核酸酶抗性。在某些實施例中，可減少硫代磷酸酯核苷間鍵聯之數目，且可增加磷酸二 酯核苷間鍵聯之數目。在某些實施例中，可減少硫代磷酸酯核苷間鍵聯之數目，且可增加磷酸二酯核苷間鍵聯之數目，同時仍維持核酸酶抗性。在某些實施例中，期望減少硫代磷酸酯核苷間鍵聯之數目，同時保留核酸酶抗性。在某些實施例中，期望增加磷酸二酯核苷間鍵聯之數目，同時保留核酸酶抗性。

某些模體

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸。寡核苷酸可具有模體，例如未修飾及/或經修飾之糖部分、核鹼基s、及/或核苷間鍵聯之模式。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個包含經修飾之糖之經修飾之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個包含經修飾之核鹼基之經修飾之核苷。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含一或多個經修飾之核苷間鍵聯。在此類實施例中，經修飾之寡核苷酸之經修飾、未經修飾、及經不同修飾之糖部分、核鹼基、及/或核苷間鍵聯界定模式或模體。在某些實施例中，糖部分、核鹼基、及核苷間鍵聯之模式各自彼此獨立。因此，經修飾之寡核苷酸可藉由其糖模體、核鹼基模體、及/或核苷間鍵聯模體進行描述(如本文所用，核鹼基模體描述獨立於核鹼基序列對核鹼基進行之修飾)。

a. 某些糖模體

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸。在某些實施例中，寡核苷酸包含一或多種類型的以定義之模式或糖模體之形式沿寡核苷酸或其區域排列的經修飾之糖及/或未修飾之糖部分。在某些情況下，此類糖模體包括但不限於本文所討論之任何糖修飾。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含具有間隔體模體之區域或由其組成，該間隔體模體包含兩個外部區域或「側翼」及中心或內部區域或「間隔」。間隔體模體之三個區域(5'-側翼區、間隔區、及3'-側翼區)形成連續的核苷序列，其中各側翼之核苷之至少一些糖部分不同於間隔之核苷之至少一些糖 部分。特定言之，至少各側翼之最靠近間隔之核苷(5'-側翼之3'-最近核苷及3'-側翼之5'-最近核苷)的糖部分不同於相鄰間隔核苷之糖部分，由此界定側翼與間隔之間的邊界(即，側翼/間隔接點)。在某些實施例中，間隔內之糖部分彼此相同。在某些實施例中，間隔包括一或多個具有不同於間隔之一或多個其他核苷之糖部分的糖部分之核苷。在某些實施例中，兩個側翼之糖模體彼此相同(對稱間隔體)。在某些實施例中，5'-側翼之糖模體不同於3'-側翼之糖模體(不對稱間隔體)。

在某些實施例中，間隔體之側翼包含1-5個核苷。在某些實施例中，間隔體之側翼包含2-5個核苷。在某些實施例中，間隔體之側翼包含3-5個核苷。在某些實施例中，間隔體之核苷全部為經修飾之核苷。

在某些實施例中，間隔體之間隔包含7-12個核苷。在某些實施例中，間隔體之間隔包含7-10個核苷。在某些實施例中，間隔體之間隔包含8-10個核苷。在某些實施例中，間隔體之間隔包含10個核苷。在某一實施例中，間隔體之間隔之各核苷為未修飾之2'-去氧核苷。

在某些實施例中，間隔體為去氧間隔體。在此類實施例中，各側翼/間隔接點之間隔側的核苷為未修飾之2'-去氧核苷，且各側翼/間隔接點之側翼側的核苷為經修飾之核苷。在某些此類實施例中，間隔之各核苷為未修飾之2'-去氧核苷。在某些此類實施例中，各側翼之各核苷為經修飾之核苷。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸具有完全經修飾之糖模體，其中各經修飾之寡核苷酸之各核苷包含經修飾之糖部分。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含具有完全經修飾之糖模體之區域或由其組成，其中該區域之各核苷包含經修飾之糖部分。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含具有完全經修飾之糖模體之區域或由其組成，其中完全經修飾之區域內之各核苷包含相同經修飾之糖部分，本文中稱為均勻經修飾之糖模體。在某些實施例中，完 全經修飾之寡核苷酸為均勻經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，均勻修飾之寡核苷酸之各核苷包含相同2'-修飾。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸可包含以下中所述之糖模體：Swayze等人，US2010/0197762；Freier等人，US2014/0107330；Freier等人，US2015/0184153；及Seth等人，US2015/0267195，其各自以全文引用之方式併入本文。

本文所提供之某些實施例係關於實用於抑制目標核酸表現之經修飾之寡聚化合物，其可實用於治療、預防、改善與此一目標核酸相關聯之疾病或減慢該疾病之進展。在某些實施例中，經修飾之寡聚化合物包含作為具有某些糖模體之間隔體的反義寡核苷酸。在某些實施例中，本文所提供之間隔體糖模體可與任何核鹼基序列及任何核苷間鍵聯模體組合以形成有效的反義寡核苷酸。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體ekk-d9-kkee，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體k-d9-kekeke，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具 有模體kkk-d8-kekek，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體kkk-d9-keke，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體kk-d9-kdkdk，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體kk-d9-eeekk，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體kk-d9-eeekk，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

在某些實施例中，一種方法包含將細胞與化合物接觸或向受試者投與該化合物，該化合物包含長度為16個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，其具有模體kk-d9-ekeke，其中『d』表示2'-去氧核糖，『k』表示cEt核苷，且『e』 表示2'-MOE核苷。在某些實施例中，細胞為癌細胞。在某些實施例中，受試者患有癌症。在某些實施例中，向受試者投與化合物治療該受試者之癌症。

b. 某些核達基模體

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸。在某些實施例中，寡核苷酸包含以定義之模式或模體之形式沿寡核苷酸或其區域排列的經修飾及/或未修飾之核鹼基。在某些實施例中，各核鹼基係經修飾。在某些實施例中，沒有核鹼基係經修飾。在某些實施例中，各嘌呤或各嘧啶係經修飾。在某些實施例中，各腺嘌呤係經修飾。在某些實施例中，各鳥嘌呤係經修飾。在某些實施例中，各胸腺嘧啶係經修飾。在某些實施例中，各尿嘧啶係經修飾。在某些實施例中，各胞嘧啶係經修飾。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸中之一些或全部胞嘧啶核鹼基為5-甲基胞嘧啶。

在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含經修飾之核鹼基之區塊。在某些此類實施例中，區塊位於寡核苷酸之3'-端。在某些實施例中，區塊在寡核苷酸之3'-端之3個核苷內。在某些實施例中，區塊位於寡核苷酸之5'-端。在某些實施例中，區塊在寡核苷酸之5'-端之3個核苷內。

在某些實施例中，具有間隔體模體之寡核苷酸包含有包含經修飾之核鹼基之核苷。在某些此類實施例中，一個包含經修飾之核鹼基之核苷在具有間隔體模體之寡核苷酸之中心間隔中。在某些此類實施例中，該核苷之糖部分為2'-去氧核糖基部分。在某些實施例中，經修飾之核鹼基係選自：2-硫嘧啶及5-丙炔嘧啶。

c. 某些核苷間鍵聯模體

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸。在某些實施例中，寡核苷酸包含以定義之模式或模體之形式沿寡核苷酸或其區域排列的經修飾及/或未修飾之核苷間鍵聯。在某些實施例中，基本上各核苷間連接基為磷酸 酯核苷間鍵聯(P=O)。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之各核苷間連接基為硫代磷酸酯(P=S)。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之各核苷間連接基獨立地選自硫代磷酸酯核苷間鍵聯及磷酸酯核苷間鍵聯。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸之糖模體為間隔體，且間隔內之核苷間鍵聯全部係經修飾。在某些此類實施例中，側翼中之一些或全部核苷間鍵聯為未修飾之磷酸酯鍵聯。在某些實施例中，末端核苷間鍵聯係經修飾。

4. 某些經修飾之寡核苷酸

在某些實施例中，本文所述之化合物包含經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，將上文修飾(糖、核鹼基、核苷間鍵聯)併入至經修飾之寡核苷酸中。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸係藉由其修飾、模體、及總體長度來表徵。在某些實施例中，此類參數各自彼此獨立。因此，除非另外指示，否則具有間隔體糖模體之寡核苷酸之各核苷間鍵聯可係經修飾或未修飾，且可遵循或不遵循糖修飾之間隔體修飾模式。例如，糖間隔體之側翼區內的核苷間鍵聯可彼此相同或不同，且可與糖模體之間隔區之核苷間鍵聯相同或不同。同樣，此類間隔體寡核苷酸可包含一或多個獨立於躺修飾之間隔體模式的經修飾之核鹼基。此外，在某些情況下，藉由總體長度或範圍及藉由二或更多個區域(例如，具有指定糖修飾之核苷區域)之長度或長度範圍描述寡核苷酸，在此類情形下，有可能選擇各範圍之數目，該等數目得到總體長度落在指定範圍之外的寡核苷酸。在此類情形下，兩種要素必須均滿足。例如，在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由15-20個連接之核苷組成且具有由三個區域A、B、及C組成之糖模體，其中區域A由2-6個具有指定糖模體之連接之核苷組成，區域B由6-10個具有指定糖模體之連接之核苷組成，且區域C由2-6個具有指定糖模體之連接之核苷組成。此類實施例不包括以下經修飾之寡核苷酸，在該等經修飾之寡核苷酸中A及C各自由6個連接之核苷組成且B由10個連接之核苷組成(即使允許那些數 目的核苷在A、B、及C之要求內)，因為此類寡核苷酸之總體長度為22，其超過經修飾之寡核苷酸之總體長度之上限(20)。在本文中，若寡核苷酸之描述為關於一或多個參數為緘默的，則此類參數不受限制。因此，僅描述為具有間隔體糖模體而無進一步描述的經修飾之寡核苷酸可具有任何長度、核苷間鍵聯模體、及核鹼基模體。除非另外指示，否則所有修飾均與核鹼基序列無關。

某些綴合化合物

在某些實施例中，本文所述之化合物包含寡核苷酸(經修飾或未修飾)及視情況一或多個綴合基團及/或末端基或由其組成。綴合基團由一或多個綴合部分及將綴合部分連接至寡核苷酸的綴合連接基組成。綴合基團可連接至寡核苷酸之任一端或兩端及/或在任何內部位置。在某些實施例中，綴合基團連接至經修飾之寡核苷酸之核苷之2'-位。在某些實施例中，連接至寡核苷酸之任一端或兩端的綴合基團為末端基。在某些此類實施例中，綴合基團或末端基連接在寡核苷酸之3'-端及/或5'-端。在某些此類實施例中，綴合基團(或末端基)連在寡核苷酸之3'-端。在某些實施例中，綴合基團連接在寡核苷酸之3'-端附近。在某些實施例中，綴合基團(或末端基)連在寡核苷酸之5'-端。在某些實施例中，綴合基團連接在寡核苷酸之5'-端附近。

在某些實施例中，寡核苷酸係經修飾。在某些實施例中，化合物之寡核苷酸具有與目標核酸互補的核鹼基序列。在某些實施例中，寡核苷酸與信使RNA(mRNA)互補。在某些實施例中，寡核苷酸與有義轉錄物互補。

末端基之實例包括但不限於綴合基團、加帽基團、磷酸酯部分、保護基、經修飾或未修飾之核苷、及二或更多個獨立地經修飾或未經修飾的核苷。

A. 某些綴合基團

在某些實施例中，寡核苷酸共價連接至一或多個綴合基團。在某些實施例中，綴合基團修改所連接之寡核苷酸之一或多個性質，包括但不限於藥 效學性質、藥物動力學性質、穩定性、結合性、吸收性、組織分佈、細胞分佈、細胞吸收、電荷、及清除率。在某些實施例中，綴合基團為所連接之寡核苷酸賦予新的性質，例如螢光團或信息基團能夠偵測寡核苷酸。

先前已描述某些綴合基團及綴合部分，例如：膽固醇部分(Letsinger等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1989,86,6553-6556)；膽酸(Manoharan等人，Bioorg.Med.Chem.Lett. ,1994,4 ,1053-1060)；硫醚，例如己基-S-三苯甲基硫醇(Manoharan等人，Ann.N.Y.Acad.Sci., 1992,660 ,306-309；Manoharan等人，Bioorg.Med.Chem.Lett., 1993,3 ,2765-2770)；硫膽固醇(Oberhauser等人，Nucl.Acids Res .,1992,20 ,533-538)；脂族鏈，例如十二烷二醇或十一基(Saison-Behmoaras等人，EMBO J .,1991,10,1111-1118；Kabanov等人，FEBS Lett. ,1990,259,327-330；Svinarchuk等人，Biochimie ,1993,75 ,49-54)；磷脂，例如二-十六基-外消旋-甘油或1,2-二-O-十六基-外消旋-甘油-3-H-磷酸三乙銨(Manoharan等人，Tetrahedron Lett. ,1995,36 ,3651-3654；Shea等人，Nucl.Acids Res., 1990,18,3777-3783)；多胺或聚乙二醇鏈(Manoharan等人，Nucleosides & Nucleotides ,1995,14,969-973)；或金剛烷乙酸，棕櫚基部分(Mishra等人，Biochim.Biophys.Acta ,1995,1264,229-237)；十八胺或己胺基-羰基-氧基膽固醇部分(Crooke等人，J.Pharmacol.Exp.Ther., 1996,i ,923-937)；生育酚基團(Nishina等人，Molecular Therapy Nucleic Acids ,2015,4 ,e220；doi：10.1038/mtna.2014.72及Nishina等人，Molecular Therapy, 2008,16,734-740)；或GalNAc集群(例如，WO2014/179620)。

1. 綴合部分

綴合部分包括但不限於嵌入物、報告分子、多胺、聚醯胺、肽、醣(例如，GalNAc)、維生素部分、聚乙二醇、硫醚、聚醚、膽固醇、硫膽固醇、膽酸部分、葉酸、脂質、磷脂、生物素、吩嗪、啡啶、蒽醌、金剛烷、吖啶、螢光素、羅丹明、香豆素、螢光團、及染料。

在某些實施例中，綴合部分包含活性原料藥，例如阿司匹靈、華法林、丁二苯吡唑二酮、伊布洛芬、舒洛芬、芬布芬、可洛酚、(S )-(+)-普拉洛芬、卡普芬、丹醯基肌胺酸、2,3,5-三碘苯甲酸、芬戈莫德、氟芳鈉蜜酸、亞葉酸、苯丙噻二嗪(benzothiadiazide)、氯噻嗪(chlorothiazide)、二氮呯、吲哚美辛(indo-methicin)、巴比妥酸鹽、頭孢菌素、磺胺藥、抗糖尿病藥、抗菌劑、或抗生素。

2. 綴合連接基

綴合部分透過綴合連接基連接到寡核苷酸。在某些化合物中，綴合基團為單一化學鍵(即綴合部分經由綴合連接基透過單鍵連接到寡核苷酸)。在某些實施例中，綴合連接基包含鏈結構，諸如烴基鏈；或重複單元之寡聚物，重複單元諸如乙二醇、核苷、或胺基酸單元。

在某些實施例中，綴合連接基包含一或多個選自以下之基團：烷基、胺基、側氧基、醯胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚、及羥胺基。在某些此類實施例中，綴合連接基包含選自以下之基團：烷基、胺基、側氧基、醯胺、及醚基團。在某些實施例中，綴合連接基包含選自以下之基團：烷基及醯胺基團。在某些實施例中，綴合連接基包含選自以下之基團：烷基及醚基團。在某些實施例中，綴合連接基包含至少一個磷部分。在某些實施例中，綴合連接基包含至少一個磷酸酯部分。在某些實施例中，綴合連接基包括至少一個中性連接基。

在某些實施例中，包括上文所述之綴合連接基之綴合連接基為雙官能連接部分，例如，此項技術中已知實用於將綴合基團連接至親體化合物的綴合連接基，諸如本文所提供之寡核苷酸。一般而言，雙官能連接部分包含至少兩個官能基。官能團之一經選擇以結合至化合物之特定位點，且另一官能團經選擇以結合至綴合基團。雙官能連接部分中所用之官能團之實例包括但不限於 用於與親核基團反應的親電子劑及用於與親電子基團反應的親核劑。在某些實施例中，雙官能連接部分包含一或多個選自以下之基團：胺基、羥基、羧酸、硫醇、烷基、烯基、及炔基。

綴合連接基之實例包括但不限於吡咯啶、8-胺基-3,6-二噁辛酸(ADO)、琥珀醯亞胺基4-(N-馬來醯亞胺甲基)環己烷-1-甲酸酯(SMCC)、及6-胺基己酸(AHEX或AHA)。其他綴合連接基包括但不限於經取代或未取代之C₁ -C₁₀ 烷基、經取代或未取代之C₂ -C₁₀ 烯基、或經取代或未取代之C₂ -C₁₀ 炔基，其中較佳取代基之非限制性清單包括羥基、胺基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基、硫醇、硫烷氧基、鹵素、烷基、芳基、烯基、及炔基。

在某些實施例中，綴合連接基包含1-10個連接基-核苷。在某些實施例中，此類連接基-核苷為經修飾之核苷。在某些實施例中，此類連接基-核苷包含經修飾之糖部分。在某些實施例中，連接基-核苷未經修飾。在某些實施例中，連接基-核苷包含視情況經保護之雜環鹼基，其選自嘌呤、經取代之嘌呤、嘧啶、或經取代之嘧啶。在某些實施例中，可裂解部分未選自以下之核苷：尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、4-N-苯甲醯基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、4-N-苯甲醯基-5-甲基胞嘧啶、腺嘌呤、6-N-苯甲醯基腺嘌呤、鳥嘌呤、及2-N-異丁醯基鳥嘌呤。通常期望連接基-核苷在化合物到達目標組織之後從化合物裂解。據此，連接基-核苷通常連接彼此連接且透過可裂解鍵連接到化合物之其餘部分。在某些實施例中，此類可裂解鍵為磷酸二酯鍵。

在本文中，連接基-核苷不視為寡核苷酸之一部分。據此，在化合物包含由指定數目或範圍的連接之核苷組成及/或與參考核酸具有指定互補性百分比的寡核苷酸且化合物亦包含連接基-核苷的實施例中，那些連接基-核苷不計入寡核苷酸之長度且不用於確定參考核酸之寡核苷酸之互補性百分比。例如，化合物可包含(1)由8-30個核苷組成的經修飾之寡核苷酸及(2)包含1-10個與經修 飾之寡核苷酸之核苷鄰接的連接基-核苷。此一化合物中連續連接之核苷之總數多於30。替代地，化合物可包含由8-30個核苷組成且無綴合基團的經修飾之寡核苷酸。此一化合物中連續連接之核苷之綜述為不多於30。除非另外指示，否則綴合連接基包含不多於10個連接基-核苷。在某些實施例中，綴合連接基包含不多於5個連接基-核苷。在某些實施例中，綴合連接基包含不多於3個連接基-核苷。在某些實施例中，綴合連接基包含不多於2個連接基-核苷。在某些實施例中，綴合連接基包含不多於1個連接基-核苷。

在某些實施例中，期望綴合基團自寡核苷酸裂解。例如，在某些情形下，包含特定綴合部分之化合物較佳由特定細胞型吸收，但是一旦化合物經吸收，期望該綴合基團裂解以釋放未綴合或親體寡核苷酸。因此，某些綴合可包含一或多個可裂解部分，通常在綴合連接基內。在某些實施例中，可裂解部分為可裂解鍵。在某些實施例中，可裂解部分未包含至少一個可裂解鍵之原子團。在某些實施例中，可裂解部分包含具有一個、兩個、三個、四個、或多於四個可裂解鹼之原子團。在某些實施例中，可裂解部分在細胞或亞細胞區室諸如溶酶體內選擇性裂解。在某些實施例中，可裂解部分由內源性酶諸如核酸酶選擇性裂解。

在某些實施例中，可裂解鍵係選自：醯胺鍵、酯鍵、醚鍵、磷酸二酯鍵之一或兩者、磷酸酯鍵、胺甲酸酯鍵、或二硫鍵。在某些實施例中，可裂解鍵為磷酸二酯鍵之一或兩者。在某些實施例中，可裂解部分包含磷酸酯或磷酸二酯。在某些實施例中，可裂解部分為寡核苷酸與綴合部分或綴合基團之間的磷酸酯鍵聯。

在某些實施例中，可裂解部分包含一或多個連接基-核苷或由其組成。在某些此類實施例中，一或多個連接基-核苷彼此連接及/或透過可裂解鍵連接到化合物之其餘部分。在某些實施例中，此類可裂解鍵為未修飾之磷酸二酯 鍵。在某些實施例中，可裂解部分為藉由磷酸酯核苷間鍵聯連接至寡核苷酸之3'或5'-末端核苷且藉由磷酸酯或硫代磷酸酯鍵聯共價連接至綴合連接基或綴合部分之其餘部分的2'-去氧核苷。在某些此類實施例中，可裂解部分為2'-去氧腺苷。

組成物及調配醫藥組成物之方法

本文所述之化合物可與醫藥學上可接受之活性或惰性物質混合以用於製備醫藥組成物或調配物。組成物及調配醫藥組成物之方法視許多準則而定，包括但不限於投與途徑、疾病程度、或所投與之劑量。

某些實施例提供包含一或多種化合物或其鹽之醫藥組成物。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成。在某些此類實施例中，醫藥組成物包含合適之醫藥學上可接受之稀釋劑或載劑。在某些實施例中，醫藥組成物包含無菌鹽水溶液及一或多種化合物。在某些實施例中，此類醫藥組成物由無菌鹽水溶液及一或多種化合物組成。在某些實施例中，無菌鹽水為醫藥級鹽水。在某些實施例中，醫藥組成物包含一或多種化合物及無菌水。在某些實施例中，醫藥組成物由一種化合物及無菌水組成。在某些實施例中，無菌水為醫藥級水。在某些實施例中，醫藥組成物包含一或多種化合物及磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。在某些實施例中，醫藥組成物由一或多種化合物及無菌PBS組成。在某些實施例中，無菌PBS為醫藥級PBS。組成物及調配醫藥組成物之方法視許多準則而定，包括但不限於投與途徑、疾病程度、或所投與之劑量。

靶向IRF4核酸之本文所述之化合物可藉由將化合物與合適的醫藥學上可接受之稀釋劑或載劑組合來用於醫藥組成物中。在某些實施例中，醫藥學上可接受之稀釋劑為水，諸如合適於注射之無菌水。據此，在一個實施例中，在本文所述之方法中採用包含靶向IRF4核酸之化合物及醫藥學上可接受之稀釋 劑的醫藥組成物。在某些實施例中，醫藥學上可接受之稀釋劑為水。在某些實施例中，化合物包含本文所提供之經修飾之核苷酸或由其組成。

包含本文所提供之化合物之醫藥組成物涵蓋在向動物(包括人類)投與之後能夠提供(直接或間接)其生物活性代謝物或殘餘物的任何醫藥學上可接受之鹽、酯、或此類酯之鹽、或任何其他寡核苷酸。在某些實施例中，化合物為反義化合物或寡聚化合物。在某些實施例中，化合物包含經修飾之寡核苷酸或由其組成。據此，例如，本揭露亦關於反合物之醫藥學上可接受之鹽、前藥、此類前藥之醫藥學上可接受之鹽、及其他生物等效物。合適之醫藥學上可接受之鹽包括但不限於鈉鹽及鉀鹽。

前藥可包括在化合物之一端或兩端併入可由體內內源性核酸酶裂解而形成活性化合物的額外核苷。

在某些實施例中，化合物或組成物進一步包含醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑。

實例

以下實例描述識別靶向IRF4之前導化合物的篩選過程。在篩選的超過3,000種寡核苷酸中，ION 690890、935658、935696、935762、935918、935968、882800、1012795、1014095、及1014834脫穎而出成為前導化合物。特定言之，在超過3,000種寡核苷酸中，就效力及耐受性而言，ION 935918表現出最佳性質組合。

非限制性揭露及以引用的方式併入

儘管隨附於此申請之序列表根據需要將各序列鑑別為「RNA」或「DNA」，但實際上，彼等序列可用任何化學修飾組合修飾。熟習此項技術者將易於瞭解諸如「RNA」或「DNA」之用以描經修飾寡核苷酸之名稱在某些情況下為隨意的。例如，包含有包含2'-OH糖部分及胸腺嘧啶鹼基之核苷之寡核苷 酸可描述為具有經修飾之糖(2'-OH，針對DNA之天然2'-H)之DNA或具有經修飾之鹼基(胸腺嘧啶(甲基化尿嘧啶)，針對RNA之天然尿嘧啶)之RNA。

據此，本文所提供之核酸序列(包括但不限於序列表中之核酸序列)意欲涵蓋含有天然或經修飾之RNA及/或DNA之任何組合之核酸，包括但不限於具有經修飾之核苷鹼基之此類核酸。進一步舉例且不加限制，具有核苷鹼基序列「ATCGATCG」之寡核苷酸涵蓋具有此核苷鹼基序列(無論經修飾或未經修飾)之任何寡核苷酸，包括但不限於包含RNA鹼基之此類化合物，諸如具有序列「AUCGAUCG」者及具有一些DNA鹼基及一些RNA鹼基者(諸如「AUCGATCG」)及具有其他經修飾之核鹼基之化合物，諸如「AT^m CGAUCG」，其中^m C指示在5位包含甲基之胞嘧啶鹼基。

儘管本文所述之某些化合物、組成物及方法已根據某些實施例特地描述，但以下實例僅用於說明本文所述之化合物且不意欲限制本文所述之化合物。本申請案中敘述之參考文獻各自以全文引用的方式併入本文中。

實例1：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之5-10-5 MOE間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用20,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔60,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(正向序列AAGCCTTGGCGTTCTCAGACT，在本文中指定為SEQ ID NO：3386；逆向序列TCAGCTCCTTCACGAGGATTTC，在本文中指定為SEQ ID NO：3387；探針序列CCGGCTGCACATCTGCCTGTACTACC，在本文中指定為SEQ ID NO：3388) 用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表1中經修飾之寡核苷酸為5-10-5 MOE間隔體。間隔體之長度為20個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含5個2'-MOE核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：eeeeeddddddddddeeeee；其中『d』表示2'-去氧核糖且『e』表示2'-MOE經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表1中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例2：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用4,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔20,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表2及3中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表2及3中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷 酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例3：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之4-8-4 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用4,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔20,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表4中經修飾之寡核苷酸為4-8-4 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含8個2'-去氧核苷且在5'末端及包含4個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkkddddddddkkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表4中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例4：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用4,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔20,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表5至12中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表5至12中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核 苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

表8人類IRF4 mRNA與具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體之對照百分比

實例5：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用4,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔20,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表13至24中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起 始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表13至24中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

表16

實例6：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

使用電穿孔，用4,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔20,000個細胞之密度下之培養的SK-MEL-28細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表25至36中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表25至36中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例7：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之混合MOE及cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

藉由自由吸收，用1,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔5,000個細胞之密度下之培養的MM.1R細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組hIRF4_LTS34726(正向序列GGCAAAGAAAGCTCATCACAG，在本文中指定為SEQ ID NO：3389；逆向序列GGATTGCTGATGTGTTCTGGTA，在本文中指定為SEQ ID NO：3390；探針序列TAGCCCCTCAGGAAATGTCCACTG，在本文中指定為SEQ ID NO：3391)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表37中經修飾之寡核苷酸為含有cEt及/或MOE之間隔體。經修飾之寡核苷酸具有包含2'-去氧核苷之中心間隔段，該中心間隔段在5'方向及3'方向上側接側翼段。5'側翼段中之至少一個核苷及/或3'側翼段中之一個核苷具有MOE及/或cEt糖修飾。「模體」欄描述各寡核苷酸之糖修飾。「k」指示cEt糖修飾；「d」指示去氧核糖；且「e」指示MOE修飾。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表37中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列 SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例8：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之混合MOE及cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對 IRF4 mRNA的作用。

藉由自由吸收，用1,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔5,000個細胞之密度下之培養的MM.1R細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表38至42中經修飾之寡核苷酸為含有cEt及/或MOE之間隔體。經修飾之寡核苷酸具有包含2'-去氧核苷之中心間隔段，該中心間隔段在5'方向及3'方向上側接側翼段。5'側翼段中之至少一個核苷及/或3'側翼段中之一個核苷具有MOE及/或cEt糖修飾。「模體」欄描述各寡核苷酸之糖修飾。「k」指示cEt糖修飾；「d」指示去氧核糖；且「e」指示MOE修飾。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表38至42中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

表41

實例9：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

藉由自由吸收，用1,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔5,000個細胞之密度下之培養的MM.1R細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表43至52中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個 cEt核苷的3'末端側接側翼段。間隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表43至52中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例10：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之混合MOE及cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

藉由自由吸收，用1,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔5,000個細胞之密度下之培養的MM.1R細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表53至58中經修飾之寡核苷酸為含有cEt及/或MOE之間隔體。經 修飾之寡核苷酸具有包含2'-去氧核苷之中心間隔段，該中心間隔段在5'方向及3'方向上側接側翼段。5'側翼段中之至少一個核苷及/或3'側翼段中之一個核苷具有MOE及/或cEt糖修飾。「模體」欄描述各寡核苷酸之糖修飾。「k」指示cEt糖修飾；「d」指示去氧核糖；且「e」指示MOE修飾。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表53至58中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例11：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之混合MOE及cEt間隔體體外對人類IRF4之作用，單一劑量

與人類IRF4核酸互補的經修飾之寡核苷酸經設計且測試其體外對IRF4 mRNA的作用。

藉由自由吸收，用1,000nM濃度經修飾之寡核苷酸或針對未處理對照無經修飾之寡核苷酸轉染處於每孔5,000個細胞之密度下之培養的MM.1R細胞。在約24小時之後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測IRF4 mRNA水準。人類引物探針組RTS4522(正向序列CGGAAATCCCGTACCAATGT，在本文中指定為SEQ ID NO：3392；逆向序列TGGCAACCATTTTCACAAGCT，在本文中指定為SEQ ID NO：3393；探針序列TTTGGACCCCGCGGCCAC，在本文中指定為SEQ ID NO：3394)用於量測mRNA水準。根據如藉由 RIBOGREEN®量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果在下表中顯示為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA之量的對照百分比。

表59至64中經修飾之寡核苷酸為含有cEt及/或MOE之間隔體。經修飾之寡核苷酸具有包含2'-去氧核苷之中心間隔段，該中心間隔段在5'方向及3'方向上側接側翼段。5'側翼段中之至少一個核苷及/或3'側翼段中之一個核苷具有MOE及/或cEt糖修飾。「模體」欄描述各寡核苷酸之糖修飾。「k」指示cEt糖修飾；「d」指示去氧核糖；且「e」指示MOE修飾。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表59至64中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。如以下所示，與人類IRF4互補之經修飾之寡核苷酸減少人類IRF4 mRNA之量。

實例12：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於SK-MEL-28細胞中進行測試。將細胞在每孔20,000個細胞之密度下塗鋪且使用電穿孔，用如下表中指定之185nM、555nM、1,666nM、5,000nM、及15,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

表66 藉由經修飾之寡核苷酸的人類IRF4 mRNA之劑量依賴性減少

實例13：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於SK-MEL-28細胞中進行測試。將細胞在每孔20,000個細胞之密度下塗鋪且使用電穿孔，用如下表中指定之500nM、1,000nM、2,000nM、4,000nM、及8,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例14：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於SK-MEL-28 細胞中進行測試。將細胞在每孔20,000個細胞之密度下塗鋪且使用電穿孔，用如下表中指定之296nM、888nM、2,666nM、及8,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS3114(本文上文在實例1中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

表77

實例15：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之74nM、222nM、666nM、及2,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例16：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之74nM、222nM、666nM、及2,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

表91

實例17：具有硫代磷酸酯核苷間鍵聯之3-10-3 cEt間隔體之設計

設計與人類IRF4核酸互補之經修飾之寡核苷酸。表95中經修飾之寡核苷酸為3-10-3 cEt間隔體。間隔體之長度為16個核鹼基，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核苷且在5'末端及包含3個cEt核苷的3'末端側接側翼段。間 隔體之糖模體為(自5'至3')：kkkddddddddddkkk；其中『d』表示2'-去氧核糖且『k』表示cEt經修飾之糖。各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯，且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。「起始位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之5'-最近核苷。「停止位點」指示人類核酸序列中與間隔體互補之3'-最近核苷。

以下表95中所列舉之各經修飾之寡核苷酸與人類IRF4核酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2互補，如所指示。『N/A』指示經修飾之寡核苷酸不以100%互補性與彼具體核酸序列互補。

實例18：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之62.5nM、250nM、1,000nM、及4,000nM濃度之經修飾之寡核苷 酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例19：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之62.5nM、250nM、1,000nM、及4,000nM濃度之經修飾之寡核苷 酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4523(正向序列AAGCCTTGGCGTTCTCAGACT，在本文中指定為SEQ ID NO：3386；逆向序列TCAGCTCCTTCACGAGGATTTC，在本文中指定為SEQ ID NO：3387；探針序列CCGGCTGCACATCTGCCTGTACTACC，在本文中指定為SEQ ID NO：3388)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例20：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞 中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之62.5nM、250nM、1,000nM、及4,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組hIRF4_LTS34726(本文上文在實例7中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例21：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之62.5nM、250nM、1,000nM、及4,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4523(本文上文在實例19中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例22：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於MM.1R細胞中進行測試。將細胞在每孔5,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之62.5nM、250nM、1,000nM、及4,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約24小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

實例23：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於KMS11細胞中測試其對目標敲落及對細胞株增殖的作用。

目標敲落

將KMS11細胞在每孔10,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之8nM、40nM、200nM、及1,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約48小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

增殖

將KMS11細胞在每孔2,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之8nM、40nM、200nM、及1,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。七天之後，添加CellTiterGlo-2.0(Promega)且在Glomax(Promega)上量測發光。

表112

實例24：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於H929細胞中測試其對目標敲落及對細胞株增殖的作用。

目標敲落

將H929細胞在每孔10,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之8nM、40nM、200nM、及1,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸或0.67nM、2nM、6.67nM、或20nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約48小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞之IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

表117

增殖

將H929細胞在每孔2,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之8nM、40nM、200nM、及1,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。七天之後，添加CellTiterGlo-2.0(Promega)且在Glomax(Promega)上量測發光。

實例25：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於ABC-DLBCL株U2932及TMD8中測試其對目標敲落及對細胞株增殖的作用。

目標敲落

將細胞在每孔10,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之50nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。亦包括對照寡核苷酸ION 792169，即具有序列CGCCGATAAGGTACAC(SEQ ID NO：3384)之3-10-3 cEt間隔體。在約48小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

增殖

將細胞在每孔2,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之50nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。七天之後，添加CellTiterGlo-2.0(Promega)且在Glomax(Promega)上量測發光。

實例26：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於ALCL細胞株中測試其對目標敲落及對細胞株增殖的作用。

目標敲落

將細胞在每孔10,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之16nM、80nM、或400nM濃度之經修飾之寡核苷酸或40nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。在約48小時之處 理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。亦包括對照寡核苷酸549148，即具有序列GGCTACTACGCCGTCA(SEQ ID NO：3385)之3-10-3 cEt間隔體。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

增殖

將細胞在每孔2,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之50nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。七天之後，添加CellTiterGlo-2.0(Promega)且在Glomax(Promega)上量測發光。

實例27：經修飾之寡核苷酸體外對人類IRF4之作用，多個劑量

將選自上文實例之經修飾之寡核苷酸在各種劑量下於外膜細胞淋巴瘤(MCL)株MAVER1、JVM2、Granta519、Mino、及Z138中測試其對目標敲落及對細胞株增殖的作用。

目標敲落

將細胞在每孔10,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之40nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。亦包括對照寡核苷酸549148，即具有序列GGCTACTACGCCGTCA(SEQ ID NO：3385)之3-10-3 cEt間隔體。在約48小時之處理期之後，自細胞分離RNA且藉由RT-qPCR量測IRF4 mRNA水準。人類IRF4引物探針組RTS4522(本文上文在實例11中描述)用於量測mRNA水準。根據如藉由RiboGreen量測之總RNA含量調節IRF4 mRNA水準。結果呈現為相對於未處理對照(UTC)細胞的IRF4 mRNA轉錄物之水準百分比。如以下各表中所說明，用經修飾之寡核苷酸處理之細胞中IRF4 mRNA水準以劑量依賴性方式減少。

增殖

將細胞在每孔2,000個細胞之密度下塗鋪且藉由自由吸收，用如下表中指定之50nM、200nM、1,000nM、或5,000nM濃度之經修飾之寡核苷酸轉染。七天之後，添加CellTiterGlo-2.0(Promega)且在Glomax(Promega)上量測發 光。

實例28：MM1.R異種移植模型中之體內活性

異種移植MM1.R模型用於評估靶向人類IRF4之經修飾之寡核苷酸之活性。將4-6週齡之雌性NOD/SCID小鼠(JAX)給予皮下注射6百萬個MM1.R細胞以形成異種移植腫瘤。兩週之後，藉由皮下注射將3只小鼠之組每日一次投與25、50、或100mg/kg/劑量之經修飾之寡核苷酸達三天。一組小鼠接受每天一次皮下注射PBS達三天。注射鹽水之組充當與寡核苷酸處理組相比較的對照組。最後一次劑量之後48小時將小鼠殺死且收集腫瘤以供進一步分析。

RNA分析

自腫瘤組織提取RNA以供RT-PCR分析，如上文所述執行該分析。用上文在實例7中描述之引物探針組34726或者特異性偵測人類IRF4之引物探針組35624(正向序列TCCCGTGTTGCTTCAAACT，在本文中指定為SEQ ID NO：3395；逆向序列TACCTGCTGGCAGTTCTTTC，在本文中指定為SEQ ID NO：3396；探針序列ACAGATGGGACTTAACAGGCAATGGG，在本文中指定為SEQ ID：3397)分析數據，如下表中所指示。結果呈現為mRNA相對於PBS對照的變化百分比，將其以使用人類特定引物探針組(正向序列CGGACTATGACTTAGTTGCGTTAC，在本文中指定為SEQ ID NO：3398；逆向序列GCCATGCCAATCTCATCTTGT，在本文中指定為SEQ ID NO：3399；探針序列CCTTTCTTGACAAAACCTAACTTGCGCAGA，在本文中指定為SEQ ID NO：3400)之人類腫瘤細胞及小鼠基質細胞的人類B-肌動蛋白水準正規化。

蛋白分析

在WES系統(ProteinSimple)上，藉由人類特異性IRF4抗體(abcam EP5699)，於異種移植腫瘤中量測hIRF4蛋白水準。

亦在WES系統上量測Igλ水準，即MM之臨床相關生物標記物。觀察到hIRF4及Igλ減少。

實例29：MM1.R異種移植模型中經修飾之寡核苷酸之抗腫瘤活性

異種移植MM1.R模型用於評估靶向人類IRF4之經修飾之寡核苷酸之活性。將5-6週齡之雌性NOD-SCID小鼠給予皮下注射3百萬個MM1.R細胞以形成異種移植腫瘤。23天之後，藉由皮下注射將8只小鼠之組每週五次投與50mg/kg/劑量之經修飾之寡核苷酸達3.5週。一組小鼠接受每週五次皮下注射PBS。注射鹽水之組充當與寡核苷酸處理組相比較的對照組。藉由卡尺量測評估 腫瘤體積。最後一次劑量之後24小時將小鼠殺死且收集組織以供RNA及蛋白分析。

腫瘤體積

體重

在整個研究中量測體重作為耐受性之量度。

*值表示3-7只動物之平均值

肝功能

為評估經修飾之寡核苷酸對肝功能的影響，使用自動臨床化學分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)量測轉胺酶之血漿水準。量測ALT(丙胺酸轉胺酶)之血漿水準且結果呈現於下表中，以IU/L表示。

RNA及蛋白分析

使用上文所述之PP組RTS34726藉由RT-PCR量測腫瘤樣品中之IRF4 mRNA。如上文實例28中所述藉由西方墨點法確定腫瘤樣品中之IRF4蛋白。

實例30：具有骨髓涉及之全身散佈型MM1.R模型中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之功效

全身散佈型MM1.R模型用於評估靶向人類IRF4之經修飾之寡核苷酸之活性。首先在第0天將4-6週齡雌性nod-scid IL2Rγ^無效 小鼠投與50mg/kg環磷醯胺，且在第1天經由靜脈內注射投與1千萬個MM1.R細胞。在第14天，藉由ELISA測試血漿人類Igλ，且基於此等結果將小鼠隨機化至各組。在第21天開始，將4只小鼠之組每天一次投與50mg/kg/天經修飾之寡核苷酸達三天，且在最後一次劑量之後48小時殺死。量測骨髓中hIRF4 mRNA水準。藉由量測h肌動蛋白mRNA水準來量測腫瘤負荷。結果呈現為相對於PBS對照處理小鼠的mRNA之變化百分比。

實例31：具有骨髓涉及之全身散佈型MM1.R模型中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之功效

全身散佈型MM1.R模型用於評估靶向人類IRF4之經修飾之寡核苷酸之活性。首先在第0天將4-6週齡雌性NOD-SCID IL2Rγ^無效 小鼠投與50mg/kg環磷醯胺，且在第1天經由靜脈內注射投與1千萬個MM1.R細胞。在第14天，藉由ELISA測試血清人類Igλ，且基於此等結果將小鼠隨機化至各組。在第15 天開始，將10只小鼠之組以50mg/kg/天之速效劑量投與經修飾之寡核苷酸達1週，然後繼續以50mg/kg/天投與一週3個劑量，直至動物死亡、體重下降<20%、或麻痹。將一組10只小鼠投與PBS作為對照，且另一組投與對照寡核苷酸792169。

實例32：TMD8人類ABC-DLBCL腫瘤模型中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之活性

異種移植腫瘤模型用於評估靶向人類IRF4之經修飾之寡核苷酸之活性。將4百萬個ABC-DLBCL TMD8細胞植入至5週齡雌性NOD/SCID小鼠之側腹中。當腫瘤達到平均體積100mm³ 時，植入後約兩週，將8只小鼠之組投與50mg/kg/天之經修飾之寡核苷酸達兩週。最後一次劑量之後將小鼠殺死且收集腫瘤以供mRNA分析。

用卡尺量測評估腫瘤體積。測量腫瘤組織中hIRF4 mRNA水準且正規化至對照動物。

實例33：Balb/c小鼠中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之耐受性

Balb/c常用於安全性及功效測試。用選自上文所述之研究的反義寡核苷酸處理小鼠且評估各種血漿化學性質標記物之水準的變化。

處理

將4-6週齡雄性Balb/c小鼠之組每週兩次皮下注射50mg/kg之經修飾之寡核苷酸達4週(100mg/kg/週劑量)。將一組雄性Balb/c小鼠每週兩次皮下注射PBS達4週。在最後一次給藥後48小時將小鼠安樂死，且收集器官及血漿以供進一步分析。

血漿化學性質標記物

為評估經修飾之寡核苷酸對肝及腎功能的作用，使用自動臨床化學分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)量測轉胺酶、膽紅素、及BUN之血漿水準。結果呈現在下表中。進一步研究中不包括引起在經修飾之寡核苷酸之預期範圍之外的任何肝或腎功能標記物水準變化的經修飾之寡核苷酸。

器官重量

在研究結束時量測肝、腎、及脾重量，且於下表中呈現為與PBS處理動物相比的變化百分比。進一步研究中不包括引起在經修飾之寡核苷酸之預期範圍之外的器官重量之任何變化的經修飾之寡核苷酸。

實例34：CD1小鼠中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之耐受性

CD1®小鼠(Charles River,MA)常用於安全性及功效測試。用選自上文所述之研究的反義寡核苷酸處理小鼠且評估各種血漿化學性質標記物之水準的變化。

處理

將4-6週齡雄性CD1小鼠之組每週兩次皮下注射50mg/kg之經修飾 之寡核苷酸達4週(100mg/kg/週劑量)。將一組雄性CD1小鼠每週兩次皮下注射PBS達4週。在最後一次給藥後48小時將小鼠安樂死，且收集器官及血漿以供進一步分析。

血漿化學性質標記物

為評估經修飾之寡核苷酸對肝及腎功能的作用，使用自動臨床化學分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)量測轉胺酶、膽紅素、及BUN之血漿水準。結果呈現在下表中。進一步研究中不包括引起在經修飾之寡核苷酸之預期範圍之外的任何肝或腎功能標記物水準變化的經修飾之寡核苷酸。

器官重量

在研究結束時量測肝、腎、及脾重量，且於下表中呈現為與PBS處理動物相比的變化百分比。進一步研究中不包括引起在經修飾之寡核苷酸之預期範圍之外的器官重量之任何變化的經修飾之寡核苷酸。

實例35：史-道二氏大鼠中靶向hIRF4之經修飾之寡核苷酸之耐受性

史-道二氏大鼠為用於安全性及功效評估的多目的模型。用上文實例中所述之研究的經修飾之反義寡核苷酸處理大鼠且評估各種血漿化學性質標記物之水準的變化。

處理

將雄性史-道二氏大鼠維持12小時明/暗循環且隨意餵食Purina正常大鼠食物，膳食5001。將4只史-道二氏大鼠之組各每週一次皮下注射50mg/kg之ISIS寡核苷酸達6週(50mg/kg每週劑量)。最後一次給藥後48小時，將大鼠安樂死，且收集器官及血漿以供進一步分析。

肝及腎功能

為評估經修飾之寡核苷酸對肝功能的影響，使用自動臨床化學分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)量測轉胺酶之血漿水準。量測ALT(丙胺酸轉胺酶)、AST(天冬胺酸轉胺酶)、血尿素氮(BUN)、及T.膽紅素之血漿水 準並呈現於下表中。亦使用相同的臨床化學分析器量測膽紅素之血漿水準且結果亦呈現於下表中。值表示正規化至PBS處理動物的變化%。進一步研究中不包括引起在反義寡核苷酸之預期範圍之外的任何肝功能標記物水準變化的經修飾之寡核苷酸。

表179

血液學檢定

將獲自所有大鼠組的血液送至Antech Diagnostics以供血容比(HCT)量測及分析，以及各種血細胞之量測，諸如WBC、RBC、及總血紅素含量。結果呈現在下表中。進一步研究中不包括引起在反義寡核苷酸之預期範圍之外的任何血液學標記物水準變化的經修飾之寡核苷酸。

表182 史-道二氏大鼠中之血液學標記物

器官重量

在研究結束時量測肝、心臟、脾、及腎重量，且呈現於下表中。進一步研究中不包括引起在反義寡核苷酸之預期範圍之外的器官重量之任何變化的經修飾之寡核苷酸。

實例36：非人類靈長類動物中經修飾之寡核苷酸之耐受性

進一步評估上文所述之經修飾之寡核苷酸在非人類靈長類動物中的效力。

處理

將雄性食蟹獼猴分成各4只非人類靈長類動物(NHP)之組。各組在第1、3、5、及7天藉由皮下注射接受40mg/kg經修飾之寡核苷酸，然後每週一次達六週。一組NHP接受PBS劑量。注射PBS之組充當與寡核苷酸處理組相比較的對照組。六週之後，將NHP殺死且收集組織以供分析。

耐受性

為了評估此等反義寡核苷酸對肝及腎功能之作用，在第44天自所有研究組收集血液、血漿、血清、及尿液樣品。在給藥後48小時，經由股靜脈穿刺收集血液樣品。在血液收集之前，將猴子禁食隔夜。自各動物收集約1.5mL 血液至沒有抗凝血劑的管中以供血清分離。使用自動化臨床化學分析器(Hitachi Olympus AU400e,Melville,NY)量測各種標記物水準。量測總尿蛋白及尿肌酸酐水準，並確定總尿蛋白與肌酸酐之比(P/C比)。

為了評估反義寡核苷酸對肝功能之作用，量測轉胺酶(ALT、AST)、白蛋白(Alb)、及總膽紅素(「T.Bil」)之血漿濃度。為了評估反義寡核苷酸對腎功能之作用，量測血尿素氮(BUN)及肌酸酐(Cre)之血漿濃度。量測白蛋白(Alb)、肌酸酐(Cre)、及總尿蛋白(微量總蛋白(MTP))之尿液水準，並確定總尿蛋白與肌酸酐之比(P/C比)。

為了評估ISIS寡核苷酸在食蟹猴中的任何發炎作用，在第44天量測在肝中合成且充當發炎標記物的C反應蛋白(CRP)。為此，自禁食的猴子取得血液樣品，將管在室溫下保持最少90min，並在室溫下以3,000rpm離心10min以獲得血清。結果呈現於下表中且指示大多數靶向人IRF4的反義寡核苷酸在食蟹獼猴中耐受良好。ION 935918及935968耐受良好。

表189體重

RNA分析

如先前實例自各種組織提取RNA以供IRF4之mRNA表現之即時PCR分析。結果呈現為相對於PBS對照的mRNA之變化百分比，將其以NHP Cyclophylin A正規化。如下表所示，與PBS對照與一些處理組相比，以經修飾之寡核苷酸進行的處理導致IRF4 mRNA之減少。

實例37：黏度

量測經修飾之寡核苷酸溶液之黏度。935918之黏度合適於每週皮下注射，且935918及935968之黏度合適於IV給藥。

表191

<110> 美商IONIS製藥公司

<120> IRF4表現之調節劑

<130> BIOL0332WO

<150> 62/637,981

<151> 2018-03-02

<160> 3400

<170> PatentIn 3.5版

<210> 1

<211> 5332

<212> DNA

<213> 智人

<400> 1

<210> 2

<211> 26001

<212> DNA

<213> 智人

<400> 2

<210> 3

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3

<210> 4

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 4

<210> 5

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 5

<210> 6

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 6

<210> 7

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 7

<210> 8

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 8

<210> 9

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 9

<210> 10

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 10

<210> 11

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 11

<210> 12

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 12

<210> 13

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 13

<210> 14

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 14

<210> 15

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 15

<210> 16

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 16

<210> 17

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 17

<210> 18

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 18

<210> 19

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 19

<210> 20

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 20

<210> 21

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 21

<210> 22

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 22

<210> 23

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 23

<210> 24

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 24

<210> 25

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 25

<210> 26

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 26

<210> 27

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 27

<210> 28

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 28

<210> 29

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 29

<210> 30

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

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<220>

<223> 合成寡核苷酸

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<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 150

<210> 151

<211> 16

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<213> 人工序列

<220>

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<400> 151

<210> 152

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<220>

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<400> 152

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<220>

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<400> 153

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<220>

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<400> 154

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<211> 16

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<211> 16

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<220>

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<211> 16

<212> DNA

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<220>

<223> 合成寡核苷酸

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<220>

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<212> DNA

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<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 615

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<220>

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<400> 854

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<220>

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

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<220>

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<220>

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<220>

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<223> 合成寡核苷酸

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<220>

<223> 合成寡核苷酸

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<220>

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<220>

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<223> 合成寡核苷酸

<400> 3348

<210> 3349

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3349

<210> 3350

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3350

<210> 3351

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3351

<210> 3352

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3352

<210> 3353

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3353

<210> 3354

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3354

<210> 3355

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3355

<210> 3356

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3356

<210> 3357

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3357

<210> 3358

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3358

<210> 3359

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3359

<210> 3360

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3360

<210> 3361

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3361

<210> 3362

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3362

<210> 3363

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3363

<210> 3364

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3364

<210> 3365

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3365

<210> 3366

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3366

<210> 3367

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3367

<210> 3368

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3368

<210> 3369

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3369

<210> 3370

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3370

<210> 3371

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3371

<210> 3372

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3372

<210> 3373

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3373

<210> 3374

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3374

<210> 3375

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3375

<210> 3376

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3376

<210> 3377

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3377

<210> 3378

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3378

<210> 3379

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3379

<210> 3380

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3380

<210> 3381

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3381

<210> 3382

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3382

<210> 3383

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3383

<210> 3384

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3384

<210> 3385

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 合成寡核苷酸

<400> 3385

<210> 3386

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3386

<210> 3387

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3387

<210> 3388

<211> 26

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 探針

<400> 3388

<210> 3389

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3389

<210> 3390

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3390

<210> 3391

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 探針

<400> 3391

<210> 3392

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3392

<210> 3393

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3393

<210> 3394

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 探針

<400> 3394

<210> 3395

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3395

<210> 3396

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3396

<210> 3397

<211> 26

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 探針

<400> 3397

<210> 3398

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3398

<210> 3399

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 3399

<210> 3400

<211> 30

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 探針

<400> 3400

Claims (65)

1. 一種化合物，其包含長度為8至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。
2. 一種化合物，其包含長度為9至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少9個連續核鹼基的核鹼基序列。
3. 一種化合物，其包含長度為10至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。
4. 一種化合物，其包含長度為11至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少11個連續核鹼基的核鹼基序列。
5. 一種化合物，其包含長度為12至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：3-3383中任一者之至少12個連續核鹼基的核鹼基序列。
6. 一種化合物，其包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：3-3383中任一者之核鹼基 序列的核鹼基序列。
7. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有由SEQ ID NO：3-3383中任一者組成之核鹼基序列。
8. 一種化合物，其包含長度為8至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸在SEQ ID NO：1之核苷酸4227-4244、4227-4242、4228-4243、或4229-4244內或在SEQ ID NO：2之核苷酸9667-9682、11411-11426、或18090-18105內互補。
9. 一種化合物，其包含長度為8至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列。
10. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有由SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者組成之核鹼基序列。
11. 如請求項1至10中任一項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、至少一個經修飾之糖、或至少一個經修飾之核鹼基。
12. 如請求項11之化合物，其中該經修飾之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯。
13. 如請求項11或12之化合物，其中該經修飾之糖為雙環糖。
14. 如請求項13之化合物，其中該雙環糖係選自由以下組成之群：4'-(CH ₂ )-O-2'(LNA)、4'-(CH ₂ ) ₂ -O-2'(ENA)、及4'-CH(CH ₃ )-O-2'(cEt)。
15. 如請求項11或12之化合物，其中該經修飾之糖為2'-O-甲氧基乙基。
16. 如請求項11至15中任一項之化合物，其中該經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。
17. 如請求項1至16中任一項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。
18. 一種化合物，其包含長度為16至80個連接之核苷的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：2021、560、559、1330、1540、或3303中任一者之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由連接之核苷組成；及 3'側翼段，其由連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間且其中各側翼段之各核苷包含經修飾之糖。
19. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1330或3303中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由3個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由3個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間，其中各側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
20. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：559或560中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由1個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧 啶。
21. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1330或2021中任一者所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由10個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由4個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
22. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：560所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5- 甲基胞嘧啶。
23. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：2021所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
24. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：1540所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及cEt核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各 胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
25. 一種化合物，其包含長度為16-80個連接之核鹼基的經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：560所述之序列之核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸包含：間隔段，其由9個連接之去氧核苷組成；5'側翼段，其由2個連接之核苷組成；及3'側翼段，其由5個連接之核苷組成；其中該間隔段位於該5'側翼段與該3'側翼段之間；其中該5'側翼段之各核苷包含cEt核苷；其中該3'側翼段在5'至3'方向上包含2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、2'-O-甲氧基乙基核苷、cEt核苷、及2'-O-甲氧基乙基核苷；其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯；且其中各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
26. 如請求項1至25中任一項之化合物，其中該寡核苷酸與SEQ ID NO：1或2至少80%、85%、90%、95%、或100%互補。
27. 如請求項1至26中任一項之化合物，其中該化合物為單股化合物。
28. 如請求項1至26中任一項之化合物，其中該化合物為雙股化合物。
29. 如請求項1至28中任一項之化合物，其中該化合物包含核糖核苷酸。
30. 如請求項1至28中任一項之化合物，其中該化合物包含去氧核糖核苷 酸。
31. 如請求項1至30中任一項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸由16至30個連接之核苷組成。
32. 如前述請求項中任一項之化合物，其中該化合物由經修飾之寡核苷酸組成。
33. 一種化合物，其由如請求項1至32中任一化合物之醫藥學上可接受之鹽組成。
34. 如請求項33之化合物，其中該醫藥學上可接受之鹽為鈉鹽。
35. 如請求項33之化合物，其中該醫藥學上可接受之鹽為鉀鹽。
36. 一種具有下式之化合物：

    

    或其鹽。
37. 一種具有下式之化合物：

    
38. 一種具有下式之化合物：

    

    或其鹽。
39. 一種具有下式之化合物：

    
40. 一種組成物，其包含如請求項1至39中任一項之化合物及醫藥學上可接受之載劑。
41. 一種組成物，其包含如前述請求項中任一項之化合物或經修飾之寡核苷酸，該組成物用於療法。
42. 一種治療或改善個體之癌症之方法，其包括向該個體投與靶向IRF4之化合物，從而治療或改善該癌症。
43. 如請求項42之方法，其中該化合物為靶向IRF4之反義化合物。
44. 如請求項42或43之方法，其中該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
45. 如請求項42至44中任一項之方法，其中投與該化合物抑制或減少癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。
46. 一種抑制細胞之IRF4表現之方法，其包括由該細胞與靶向IRF4之化合物接觸，從而抑制該細胞之IRF4表現。
47. 如請求項48之方法，其中該細胞為癌細胞。
48. 如請求項47之方法，其中該個體患有血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
49. 一種減少或抑制患有癌症之個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移之方法，其包括向該個體投與靶向IRF4之化合物，從而減少或抑制該個體之癌細胞增殖、腫瘤生長、或轉移。
50. 如請求項49之方法，其中該個體患有血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
51. 如請求項46至50中任一項之方法，其中該化合物為靶向IRF4之反義化合物。
52. 如請求項46至51中任一項之方法，其中該化合物為如請求項1至39中任一項之化合物或如請求項40或41之組成物。
53. 如請求項42至52中任一項之方法，其中該化合物係非經腸式投與。
54. 一種靶向IRF4之化合物之用途，其用於治療、預防、或改善與IRF4相關聯之癌症。
55. 如請求項54項之用途，其中該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
56. 如請求項54或55之用途，其中該化合物為靶向IRF4之反義化合物。
57. 如請求項54至56中任一項之用途，其中該化合物為如請求項1至39中任一項之化合物或如請求項40或41之組成物。
58. 一種靶向IRF4之化合物之用途，其用於製造用於治療或改善與IRF4相關聯之癌症之藥物。
59. 如請求項58之用途，其中該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
60. 如請求項58或59之用途，其中該化合物為靶向IRF4之反義化合物。
61. 如請求項58至60中任一項之用途，其中該化合物為如請求項1至39中任一項之化合物或如請求項40或41之組成物。
62. 一種靶向IRF4之化合物之用途，其用於製備用於治療或改善與IRF4相關聯之癌症之藥物。
63. 如請求項62之用途，其中該癌症為血癌、骨髓瘤、多發性骨髓瘤(MM)、B細胞惡性病、淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、或白血病。
64. 如請求項62或63之用途，其中該化合物為靶向IRF4之反義化合物。
65. 如請求項62至64中任一項之用途，其中該化合物為如請求項1至39中任一項之化合物或如請求項40或41之組成物。