TW201913431A - 對於類視色素之副作用之感受性之決定方法 - Google Patents
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Abstract
本發明提供一種藉由SNP分析基於遺傳要素決定對象的對於類視色素之副作用之感受性之方法、決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦及控制該電腦之程式。基於所決定之對象的對於類視色素之副作用之感受性,要求開發緩和感受性之方法,且開發美容之指導服務、化妝料之選擇法。可基於檢測選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP,而決定對於類視色素之副作用之感受性。
Description
本發明係關於一種藉由SNP(single-nucleotide polymorphism,單核苷酸多態性)分析基於遺傳要素決定對象的對於類視色素之副作用之感受性之方法、決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦及控制該電腦之程式。基於所決定之對象的對於類視色素之副作用之感受性,緩和感受性之方法之開發、美容之指導服務、化妝料之選擇成為可能。
天然維生素A之一之視黃醇係人體中天然存在之內源性物質,經過轉換成視黃醛或視黃酸,而參與生長、生殖、視覺、感染予防等廣泛之生理功能。作為發揮作為維生素A之作用之化合物,除視黃醇以外,已知視黃醛或視黃酸、進而該等之衍生物,將該等總稱為類視色素。作為類視色素對皮膚之作用,已知由角質層剝離作用所致之代謝回轉之促進、由角質形成細胞之增殖促進及分化誘導所致之表皮肥厚、真皮纖維芽細胞中之膠原蛋白或彈力蛋白等彈性纖維之產生亢進、由抑制皮脂腺功能所致之皮脂分泌降低、及由排出黑色素顆粒所致之色素沈積之改善。因此,類視色素係以抗皺作用、美白作用、抗斑作用等為目的而調配至化妝料或醫藥品中。
一方面,類視色素具有對皮膚之刺激性,作為其副作用,有產生發紅、表皮增生、浮腫、水泡、紅斑、燒傷、瘙癢、燒傷感受性、表皮剝離等情形。該等副作用尤其大多於使用調配有高濃度之類視色素、或生理活性較強之類視色素例如維生素A酸等之皮膚外用劑時產生。另一方面,對於類視色素之副作用之感受性根據使用對象有較大不同。(非專利文獻1:J Drugs in Dermatology(2011),vol.10,Issue 5,page 483-489) [先前技術文獻] [非專利文獻]
[非專利文獻1]J Drugs in Dermatology(2011),vol.10,Issue 5,page 483-489 [非專利文獻2]J. Clin Invest.2013;123(9):3941-3951 [非專利文獻3]Plos One 2013;8(10):e78203 [非專利文獻4]綜合基因分型分析(SNP)日本藥理學雜誌(2005),125,148-152頁
[發明所欲解決之問題]
類視色素之抗皺作用、美白作用及抗斑作用係於美容及醫療上極為有用,故而預先決定對於類視色素之副作用之感受性有用。因此,要求開發決定對於類視色素之副作用之感受性之方法。 [解決問題之技術手段]
本發明者等人以決定對於類視色素之副作用之感受性為目的,對受驗者進行SNP分析。其結果為,鑑定了與對於類視色素之副作用之感受性有關的55種SNP,從而完成了本發明。
因此,本發明為以下之發明: 一種對於類視色素之副作用之感受性之決定方法,其包含: 檢測選自由rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP之步驟;及 基於所檢測到之SNP,決定對於類視色素之副作用之感受性之步驟。
進而其他態樣中,本發明係關於一種電腦,其係決定對於類視色素之副作用之感受性者,其包含: 記憶部,其記憶有與選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP有關之資訊; 輸入部,其輸入利用者之DNA(deoxyribonucleic acid,脫氧核糖核酸)資訊; 處理部,其於所輸入之DNA資訊中,檢測所記憶之SNP之存在;及 輸出部,其基於所檢測到之SNP,輸出對於類視色素之副作用之感受性。 本發明之另一態樣中,亦係關於一種控制此種電腦之方法及/或控制程式,進而亦係關於一種儲存有該控制程式之記憶媒體。此種記憶媒體較佳為非揮發性之媒體。
進而其他態樣中,本發明亦係關於一種用於決定對於類視色素之副作用之感受性的套組,其包含:用於檢測選自由rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP的核酸試劑。
進而,本發明亦係關於一種對於類視色素之副作用之感受性的決定方法;或基於由決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦所決定之感受性,提供化妝料、醫藥品及美容法之方法。
進而,本發明亦係關於以下之候補藥劑之篩選方法: 應用候補藥劑之步驟; 於所應用之細胞中,決定選自由下述之CAPN2、OR14I1、LYPD8、OSTN、LOC643675、FHDC1、TENM2、LOC105375854、SHC3、KCNMA1、ST3GAL4、LINGO1、NSMCE1及LOC105372121所組成之群中之至少1個基因之表現變化之步驟;以及評價自基因轉譯之功能蛋白質之作用變化之步驟; 基於上述表現變化、功能變化,決定候補藥劑之類視色素感受性之控制。 [發明之效果]
根據本發明,可決定對於類視色素之副作用之感受性,可基於所決定之感受性而提供化妝料及醫藥品、與美容法及治療法。
本發明係關於一種對於類視色素之副作用之感受性之決定方法,其包含:檢測與對於類視色素之副作用之感受性有關聯的SNP之步驟、及基於所檢測到之SNP決定對於類視色素之副作用之感受性之步驟。其中,作為與對於類視色素之副作用之感受性有關聯的SNP,使用選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少一個SNP。
於本發明中,類視色素係指視黃醇、視黃醛及視黃酸等維生素A及其衍生物。衍生物只要具有維生素A活性則可為任意衍生物,可列舉視黃醇乙酸酯、棕櫚酸視黃醇酯、視黃酯等。視黃酸中,已知全反式視黃酸(維生素A酸)、9-順式視黃酸、13-順式視黃酸等立體異構物,尤其已知維生素A酸具有較高效力。
作為類視色素之副作用,可列舉致畸性、誘發炎症、角質層剝離、炎症誘發性色素沈積等。本發明係關於一種該等副作用中尤其用作皮膚外用劑之情形時之副作用,即誘發炎症、角質層剝離、炎症誘發性色素沈積。作為皮膚炎症,可能產生脫屑、紅斑、發紅、皮膚炎。
對於類視色素之副作用之感受性可任意分類。例如,可如有感受性之群與無感受性之群般分類為2個以上,視情形而有時可分類為高、低、無之3個群或更多之群,例如4群或5群。感受性可根據所檢測之SNP之種類及數量決定。作為一例,於分類為3群之情形時,55種類之SNP中,於檢測到某一定數量以上之SNP之情形時,可判定為感受性較高,於未檢測到某一定數量之SNP之情形時,可判定為感受性較低。例如,於檢測到20以上、有時為30以上、進而為40以上之SNP之情形時,可判定為感受性較高。又,55種SNP中,rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887及rs2247880係參與第10染色體之KCNMA1基因之控制區域之SNP。其中,KCNMA1基因係與K離子通道有關,已知抑制由類視色素活化之被稱為TRPV1之刺激受體之作用(非專利文獻2:J. Clin Invest.2013;123(9):3941-3951,非專利文獻3:Plos One 2013;8(10):e78203)。因此,有關KCNMA1基因之控制的基因係有助於類視色素之副作用之可能性較高。因此,於檢測到1個以上、較佳為5以上、進而較佳為8以上之該等SNP之情形時,可判定為對於類視色素之副作用之感受性較高。對於類視色素之副作用之感受性可由醫生以外者決定,例如美容師、美容部成員、生活顧問等非醫療從事者或臨床檢查技師等醫療從事者亦可決定。本發明之方法亦可稱為非診斷方法。
於本發明中,SNP係由rs編號(Reference SNP ID number)表示。關於與各rs編號對應之SNP之詳細資訊(染色體上之位置或變異),由美國國家生物技術資訊中心(NCBI)管理,於NCBI之主頁(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中可參照。
於本發明中所特定的參與對於類視色素之副作用之感受性之SNP之詳情如下所述: [表1]
SNP之檢測可藉由公知之任意方法進行。作為一例,自受驗者之生物樣本例如唾液、血液、黏膜、組織片、毛髮等基於慣例而純化受驗者之核酸,於所純化之核酸中檢測SNP。因此,於本發明之對於類視色素之副作用之感受性之決定方法中,可進而包含試樣製備步驟、核酸純化步驟。於SNP檢測步驟中,只要為於所純化之核酸中可進行SNP之檢測之方法,則可使用任意方法。亦可進行成為對象之SNP之位置周邊之序列測定而檢測SNP,亦可使用將PCR(polymerase chain reaction,聚合酶鏈反應)法作為基礎之方法、使用了DNA探針之方法、使用了質量分析之方法進行檢測。作為將PCR作為基礎之方法,可列舉SNP分型法、TaqMan PCR法、單鹼基延伸法、Pyrosequencing法、Exonuclease Cycling Assay法等。作為使用了DNA探針之方法,可列舉Invader法等(綜合基因分型分析(SNP)日本藥理學雜誌,125,148-152,2005)。SNP存在伴隨有處於連鎖不平衡之其他SNP之情形。藉由檢測與目標SNP處於連鎖不平衡之SNP,可檢測目標SNP。因此,於本發明中,SNP之檢測不限定於直接檢測目標SNP,亦包括藉由檢測處於連鎖不平衡之SNP而檢測目標SNP。
又,亦可基於已進行了序列測定之個人之鹼基序列、或由該鹼基序列決定之個人之SNP之清單,而檢測參與對於類視色素之副作用之感受性的SNP之存在。於該情形時,於已決定之鹼基序列之資料內調查SNP所在位置之序列,由此可檢測SNP之存在,又,可於個人之SNP清單中,決定參與對於類視色素之副作用之感受性的SNP是否存在。因此,該情形之SNP之檢測亦可藉由將鹼基序列資料或個人之SNP清單輸入至記憶有SNP資訊之電腦而進行。更佳之態樣中,輸入可自終端經由因特網輸入,且於伺服器上檢測SNP,並將檢測結果經由因特網輸出至該終端。
根據本發明,檢測對於類視色素之副作用之感受性的對象可為任意人種。更佳為成為對象之人種為黃色人種(蒙古人種)。
本發明之其他態樣中,本發明係關於一種決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦。該電腦可實行上述對於類視色素之副作用之感受性之決定方法。本發明之另一方法中,本發明亦係關於一種對本發明之決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦進行控制之方法或進行控制之程式、以及儲存該程式之記憶媒體。本發明之電腦包含記憶部、輸入部、輸出部及處理部。
記憶部具有RAM(Random Access Memory,隨機存取記憶體)、ROM(Read Only Memory,唯讀記憶體)、快閃記憶體等記憶體裝置,硬碟驅動器等固定碟片裝置,或軟碟、光碟等可移動之記憶裝置等。記憶部除了記憶自輸入部輸入之資料及指示、處理部所進行之運算處理結果等以外,還記憶用於電腦之各種處理之程式、資料庫等。電腦程式可經由例如CD-ROM(Compact Disc-Read Only Memory,唯讀光碟)、DVD-ROM(Digital Versatile Disc-Read Only Memory,唯讀數位多功能光碟)等電腦可讀記錄媒體、或因特網而安裝。電腦程式係使用公知之設置程式等而安裝於記憶部。於本發明中,記憶部記憶與選自由rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP有關的資訊。於與該等SNP有關之資訊中,亦可進而記憶與該SNP處於連鎖不平衡之SNP之資訊。於與SNP有關之資訊中,可包含序列資訊。
輸入部包含介面。介面可連接於例如鍵盤、滑鼠等操作部,LAN(Local Area Network,區域網路)或連接埠等之通信部、CD-ROM、DVD-ROM、BD-ROM(Blu-ray Disc Read-Only Memory,藍光光碟唯讀記憶體)、記憶棒等外部記憶裝置。與SNP有關之資訊亦可自輸入部輸入,並記憶於記憶部。又,對象之序列資訊或SNP清單係自輸入部輸入。所輸入之序列資訊或SNP清單可暫且記憶於記憶部,亦可直接送至處理部。對象之序列資訊可為對象之全基因組序列,亦可僅為目標之一部分序列。可自輸入部經由操作部給予處理部中之處理之指示。
處理部檢測對象之序列資訊中之SNP之存在。更具體而言,處理部可自記憶於記憶部之SNP之序列資訊、與自輸入部輸入之對象之序列資訊,檢測對象之序列資訊中所含的與對於類視色素之副作用之感受性有關的SNP之存在。可藉由將記憶於記憶部之SNP之序列資訊、與自輸入部輸入之對象之序列資訊比較,或於自輸入部輸入之對象之序列資訊中檢索記憶於記憶部之SNP之序列資訊,而檢測與對於類視色素之副作用之感受性有關的SNP之存在。又,處理部亦可於所輸入之對象之SNP清單中,檢測與對於類視色素之副作用之感受性有關的SNP是否存在。處理部根據記憶於記憶部之程式實行各種運算處理。運算處理係由包含於處理部之CPU或處理器進行。該CPU或處理器包含控制輸入部、記憶部及輸出部之功能模組,可進行各種控制。該等各部亦可分別由獨立之積體電路、微處理器、韌體等構成。由處理部檢測到之SNP之存在的相關資訊可暫且記憶於記憶部,亦可由處理部直接顯示於輸出部。又,於存在複數個SNP之情形時,亦可根據SNP之數量或種類而決定對於類視色素之副作用之感受性之強弱。
輸出部係構成為對於由資料處理部進行運算處理所檢測到之SNP,輸出記憶於記憶部的對於類視色素之副作用之感受性之強弱的相關資訊。輸出部亦可對於被判定為感受性較高的對象,除了感受性之強弱的相關資訊以外或取而代之,而輸出停止使用含類視色素之化妝料之主旨之警告。輸出部亦可除了感受性之強弱的相關資訊以外或取而代之,而根據對於類視色素之副作用之感受性,提示適合之類視色素含量之化妝料。輸出部可為直接顯示運算處理之結果之液晶顯示器等顯示裝置、印表機等輸出手段,亦可為用於向外部記憶裝置輸出或經由網路輸出之介面部。進而其他態樣中,亦可構成為可將購入按鈕與所提示之化妝料合併而一起顯示,對象藉由點擊購入按鈕而可購入商品。
本發明之較佳之態樣中,本發明之電腦構成伺服器,輸入部及輸出部分別經由介面部而連接於網路。於該情形時,可自連接於網路之個別終端提供基因組資訊或基因組之一部分序列資訊,於伺服器中對所提供之序列資訊進行處理。可於伺服器中,檢測與對於類視色素之副作用之感受性有關的SNP之存在,並將與檢測到之SNP之數量或種類對應的對於類視色素之副作用之感受性,與檢測到之SNP一起通過網路而輸出至終端。
亦可藉由檢測單一之SNP而決定對於類視色素之副作用之感受性,但就達成更優異之感度之觀點而言,較佳為檢測複數個SNP而決定感受性。為了基於複數個SNP之檢測而決定感受性,作為一例而藉由以下方式進行:查明該SNP對該感受性是給予正作用還是負作用,並根據其存在而評分,由此算出SNP得分。藉由預先決定SNP得分與感受性之關聯,而可根據SNP得分決定感受性。
於藉由本發明之對於類視色素之副作用之感受性之決定方法而決定了感受性之情形時,可基於感受性的相關資訊進行諮詢。因此,本發明之一態樣亦係關於一種諮詢方法。於此種諮詢中,可對使用之化妝料或醫藥品提供建議。作為一例,對於被判定為對於類視色素之副作用之感受性較高的對象,可進行含類視色素之化妝料之使用之注意提醒。又,對於此種對象,可與注意提醒一起或有別於注意提醒而另提供不含或減少了類視色素之化妝料。對於被判定為對於類視色素之副作用之感受性較低的對象,可提供含有類視色素之化妝料。類視色素之含量及使用量可根據類視色素之感受性而變更提供。其他態樣中,對於被判定為對於類視色素之副作用之感受性較高的對象,可提供緩和類視色素感受性之方法,或選擇用於緩和感受性之美容之指導服務、用於緩和感受性之化妝料的方法。為了緩和感受性,亦可提供大量含有類視色素之刺激緩和劑之化妝料或醫藥品。因此,本發明係關於一種美容或治療方法,其包含藉由對於類視色素之副作用之感受性之決定方法而決定感受性,並基於感受性而選擇並提供合適之化妝料或醫藥品。
本發明之其他態樣中,亦係關於一種用於決定對於類視色素之副作用之感受性的套組。該套組包含:用於檢測選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP、或其處於連鎖不平衡之SNP的核酸試劑。該套組亦可進而包含核酸提取試劑及純化試劑。又,亦可包含對檢測到之SNP與感受性之關係進行說明的使用說明書。
作為此種核酸試劑,作為一例,包含可選擇性地擴增SNP之引子、DNA聚合酶、dNTP(deoxy-ribonucleotide triphosphate,脫氧核糖核苷三磷酸),另外視情形而包含擴增緩衝液。可擴增SNP之引子可對各SNP任意設計。
於使用核酸探針作為核酸試劑之情形時,上述套組亦可進而包含探針檢測試劑。該核酸探針可使用未固定之探針,亦可使用固定於DNA晶片上者,同時檢測複數個SNP。此種核酸探針亦可以可檢測特定SNP之方式進行標記。
存在本發明中經特定之與對於類視色素之副作用之感受性有關的SNP之基因亦可特定出。作為此種基因,可列舉選自由CAPN2、OR14I1、LYPD8、OSTN、LOC643675、FHDC1、TENM2、LOC105375854、SHC3、KCNMA1、ST3GAL4、LINGO1、NSMCE1及LOC105372121所組成之群中之至少1個基因。該等基因係與對於類視色素之副作用之感受性有關的基因,故而藉由以應用候補藥劑後之該等基因之表現變化作為指標,可用於可對類視色素感受性發揮作用的藥劑之篩選。又,亦可評價自基因轉譯之功能蛋白質之作用變化,並篩選調整該變化之候補藥劑。作為對於類視色素感受性之作用,可列舉類視色素感受性之緩和作用、或其相反之類視色素感受性之增加作用。關於可使上述基因表現變動而被篩選之候補藥劑具有類視色素感受性之緩和作用、或其相反之類視色素感受性之增加作用之哪個,可根據基因之種類及其機制決定,或亦可藉由進而進行2次篩選而容易地決定。又,功能蛋白質之作用變化表示類視色素感受性之緩和作用、或其相反之類視色素感受性之增加作用,可控制該作用之變化者成為候補藥劑。作為2次篩選,作為一例,可藉由於受驗者中並用含類視色素之化妝品而決定。
作為篩選方法之一例,係關於下述候補藥劑之篩選方法,其包含: 應用包含候補藥劑之溶液之步驟; 於所應用之細胞中決定基因之表現變化之步驟;及 基於上述表現變化,決定候補藥劑對於類視色素感受性之作用之步驟。
又,作為篩選方法之其他例,係關於下述候補藥劑之篩選方法,其包含: 應用包含候補藥劑之溶液之步驟; 於所應用之細胞中評價對功能蛋白質之作用之影響之步驟;及 基於功能蛋白質之作用變化,決定候補藥劑對於類視色素感受性之作用之步驟。
進而,作為篩選方法之另一例,係關於下述候補藥劑之篩選方法,其包含: 應用包含候補藥劑之溶液之步驟; 於所應用之細胞中決定基因之表現之步驟; 於所應用之細胞中評價對功能蛋白質之作用之影響之步驟;及 基於上述表現變化及功能蛋白質之作用變化,決定候補藥劑對於類視色素感受性之作用之步驟。
包含候補藥劑之溶液之應用步驟可對培養細胞應用,亦可對皮膚應用。關於基因之表現,可對個別基因藉由RT-PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,反轉錄聚合酶鏈反應)等方法測定基因表現量,亦可使用陣列確定基因表現之變化。可測定使用了僅不含候補藥劑之溶液等之情形時之基因表現、或功能蛋白質之作用作為對照,於應用了包含候補藥劑之溶液之細胞中,與基因表現或蛋白質之作用比較,藉此決定表現變化或作用變化。對照之測定值可藉由預先進行實驗而預先決定,亦可同時進行。
關於功能蛋白質之作用之變化,可基於定量地評價各功能之評價系統而確定變化。於功能蛋白質為酵素之情形時,可藉由測定酵素活性之變化而評價功能蛋白質之作用之變化。於該情形時,例如可使用酵素之特異受質並以分解活性為指標,來評價候補藥劑之類視色素感受性。於功能蛋白質作用於其他物質(特別是蛋白質)而影響細胞功能之情形時,可將與其他物質之相互作用作為指標而評價功能蛋白質之作用變化。功能蛋白質亦存在因改變定域而發揮功能之情形,亦可將定域之變化作為指標而評價功能蛋白質之作用變化。於該情形時,例如可根據核或高爾基體等特定之細胞小器官、細胞膜、細胞質內、或細胞外等定域位置而評價功能蛋白質之作用變化,藉此可評價候補藥劑之類視色素感受性。又,作為與其他蛋白質之相互作用、或定域變化之結果,可將產生之細胞增殖或細胞內離子濃度之變化等表現型變化作為指標。
本說明書所提及之全部文獻係其整體藉由引用而併入至本說明書中。
以下說明之本發明之實施例僅以例示為目的,並不限定本發明之技術範圍。本發明之技術範圍僅由申請專利範圍之記載進行限定。可於不脫離本發明主旨之條件下進行本發明之變更,例如本發明之構成要件之追加、刪除及置換。 [實施例]
試驗1 對於150名受驗者,除日常護膚之保養以外,將調配有視黃醇之美容液以左右之外眼角及頰部為中心於全臉1天2次(早晚)塗抹2週。2週之連用塗抹後,攝影外觀照片,進行問診且判定皮膚所見。
試驗2 對於80名受驗者,除日常護膚之保養以外,將調配有視黃醇之美容液作為待測試樣,將自待測試樣僅除去視黃醇之製劑作為對照試樣,基於半臉法進行試驗。具體而言,將安慰劑對照隨機化之待測試樣及對照試樣分別分左臉及右臉1天2次(早晚)塗抹9週。於試驗開始前及9週後,攝影外觀照片,進行問診且判定皮膚所見。
試驗3 對於360名受驗者,除日常護膚之保養以外,將調配有視黃醇之美容液以左右之外眼角及頰部為中心於全臉1天2次(早晚)塗抹4週。4週之連用塗抹後,攝影外觀照片,進行問診且判定皮膚所見。
視黃醇感受性之判定 基於試驗1、試驗2及試驗3所得之結果,視黃醇感受性分類為反應群與健康群。具體而言,健康群係關於對視黃醇試樣之投予完全未見困擾之受驗者之群。反應群係關於明顯看到副作用,經歷了對於視黃醇之皮膚困擾之受驗者之群。
自受驗者採取唾液,純化DNA,供SNP陣列分析。作為SNP陣列分析,使用Japonica Array(東芝股份有限公司)進行基因分型。將基因分型結果進行填補,綜合取得受驗者之SNP結果。將基因分型結果與填補後之SNP結果以視黃醇反應群與健康群實施全基因組關聯分析,製作將該結果作為縱軸而表示統計學顯著性(p值之對數表示),將橫軸設為染色體編號之曼哈頓曲線(圖3)。作為成為p值<10-5
之SNP,確定了下述表2所列舉之55種。
[表2]
圖1係表示對決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦進行控制之程式之處理流程之圖。 圖2係決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦之構成圖。 圖3係評價與類視色素感受性相關聯之SNP的表示全基因組關聯分析{Genome-Wide Association Study(GWAS)}之結果之曼哈頓曲線圖。
Claims (17)
- 一種對於類視色素之副作用之感受性之決定方法,其包含: 檢測選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP之步驟; 及基於所檢測到之SNP,決定對於類視色素之副作用之感受性之步驟。
- 如請求項1之決定方法,其中上述SNP係選自由以下之rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887及rs2247880所組成之群中。
- 一種諮詢方法,其係基於藉由如請求項1或2之方法所決定的對於類視色素之副作用之感受性。
- 一種化妝料之提供方法,其特徵在於:基於藉由如請求項1或2之方法所決定的對於類視色素之副作用之感受性而選擇化妝料。
- 一種電腦,其係決定對於類視色素之副作用之感受性者,其包含: 記憶部,其記憶與選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP有關的資訊; 輸入部,其輸入利用者之DNA資訊; 處理部,其於所輸入之DNA資訊中,檢測所記憶之SNP之存在;及 輸出部,其基於所檢測到之SNP,輸出對於類視色素之副作用之感受性。
- 如請求項5之電腦,其中上述電腦為伺服器,輸入部為通信部,輸出部為通信部。
- 如請求項5或6之電腦,其中上述SNP係選自由以下之rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887及rs2247880所組成之群中。
- 一種程式,其係對包含記憶部、輸入部、處理部及輸出部的決定對於類視色素之副作用之感受性的電腦進行控制者, 其將與選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP有關的資訊、及與該SNP相關聯之對於類視色素之副作用之感受性之資訊記憶於記憶部, 自輸入部輸入利用者之DNA資訊, 使處理部於所輸入之DNA資訊中檢測所記憶之SNP之存在, 使處理部基於所檢測到之SNP,決定對於類視色素之副作用之感受性, 使輸出部輸出對於類視色素之副作用之感受性資訊。
- 如請求項8之程式,其中上述電腦為伺服器,輸入部為通信部,輸出部為通信部。
- 如請求項8或9之程式,其中上述SNP係選自由以下之rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887及rs2247880所組成之群中。
- 一種用於決定對於類視色素之副作用之感受性的套組,其包含:用於檢測選自由以下之rs117761959、rs35515429、rs35736558、rs61840347、rs12754142、rs9290978、rs28501222、rs117675886、rs117758125、rs875705、rs58310152、rs58286474、rs112273273、rs73380909、rs73380910、rs73380913、rs12655922、rs17068781、rs278015、rs17068796、rs73381002、rs59490468、rs117142738、rs10086126、rs145653129、rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887、rs2247880、rs814014、rs137908383、rs186198501、rs7933887、rs80067170、rs78606856、rs12100559、rs150171951、rs2060609、rs2060608、rs1349250、rs145745344、rs57595200、rs8008945、rs12907778、rs151092710、rs28363677、rs16948876、rs17753299、rs150302670及rs763038所組成之群中之至少1個SNP的核酸試劑。
- 如請求項11之套組,其中上述套組進而包含核酸提取及純化試劑。
- 如請求項11或12之套組,其中上述核酸試劑為可選擇性地擴增SNP之引子,上述套組進而包含聚合酶、dNTP。
- 如請求項11或12之套組,其中上述核酸試劑為核酸探針,上述套組進而包含探針檢測試劑。
- 如請求項11至14中任一項之套組,其中上述SNP係選自由以下之rs1903895、rs2574810、rs6480852、rs497578、rs562187、rs531402、rs2574801、rs2247887及rs2247880所組成之群中。
- 一種候補藥劑之篩選方法,其係: 應用候補藥劑之步驟; 於所應用之細胞中,決定選自由下述之CAPN2、OR14I1、LYPD8、OSTN、LOC643675、FHDC1、TENM2、LOC105375854、SHC3、KCNMA1、ST3GAL4、LINGO1、NSMCE1及LOC105372121所組成之群中之至少1個基因之表現變化之步驟; 基於上述表現之變化,決定候補藥劑之針對類視色素感受性之作用; 針對對於類視色素感受性之作用,篩選候補藥劑。
- 一種候補藥劑之篩選方法,其係 應用候補藥劑之步驟; 於所應用之細胞中,決定自選自由下述之CAPN2、OR14I1、LYPD8、OSTN、LOC643675、FHDC1、TENM2、LOC105375854、SHC3、KCNMA1、ST3GAL4、LINGO1、NSMCE1及LOC105372121所組成之群中之至少1個基因所轉譯的功能蛋白質之作用變化之步驟; 基於上述功能蛋白質之作用變化,決定候補藥劑之針對類視色素感受性之作用; 針對對於類視色素感受性之作用,篩選候補藥劑。
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