相關申請案的交叉參考
本申請案主張於2016年2月17日提出申請之美國臨時申請案第US 62/296,594號及於2016年9月16日提出申請之美國臨時申請案第62/396,084號之權益,出於所有目的,兩個案件皆係全文皆以引用方式併入本文中。
參考序列表
本申請案中所揭示之序列含於與本案一起提出申請之序列表中。
定義
「經分離」抗體係指已經鑑別且自其天然環境之組分分離及/或回收之抗體及/或重組產生之抗體。「純化抗體」係對於自其產生或純化產生之干擾蛋白質及其他污染物通常至少50% w/w純之抗體,但不排除單株抗體與過量之意欲促進其使用之醫藥上可接受之載劑或其他媒劑組合之可能性。干擾蛋白質及其他污染物可包括例如自其分離或重組產生抗體之細胞中之細胞組分。有時,單株抗體對於來自產生或純化之干擾蛋白質及污染物至少60%、70%、80%、90%、95%或99% w/w純。本文所述抗體包括大鼠、嵌合、飾面及人類化抗體,可以經分離及/或純化形式來提供。 「單克隆抗體」係指從實質上同質之抗體群獲得之抗體,即構成該群之個別抗體除了可少量存在之可能的天然突變以外係相同的。修飾詞「單株」指示抗體之特徵係自實質上同質之抗體群獲得,且不應理解為需要藉由任一特定方法來產生該抗體。舉例而言,欲根據本發明使用之單株抗體可藉由首先闡述於Kohler等人(1975)
Nature
256:495中之雜交瘤方法製得,或可藉由重組體DNA方法製得(例如,參見美國專利第4816567號)。「單株抗體」亦可例如使用Clackson等人(1991)
Nature,
352:624-628及Marks等人(1991)
J. Mol. Biol.,
222:581-597中所述之技術自噬菌體抗體庫分離,或可藉由其他方法製得。本文所述抗體係單株抗體。 單株抗體與其靶抗原之特異性結合意指至少10
6
、10
7
、10
8
、10
9
或10
10
M
-1
之親和性。特異性結合之量值可檢測地較高且可與對至少一種無關靶發生之非特異性結合相區別。特異性結合可為在特定官能基之間形成鍵或特定空間配合(例如,鎖鑰型)之結果,而非特異性結合通常係凡得瓦力(van der Waals force)之結果。 基礎抗體結構單元係亞單元之四聚體。各四聚物包括兩對相同多肽鏈,每對具有一條「輕」鏈(約25 kDa)及一條「重」鏈(約50 - 70 kDa)。各鏈之胺基端部分包括主要負責抗原識別之約100至110個或更多胺基酸之可變區。此可變區最初經表現連接至可裂解信號肽。無信號肽之可變區有時成為成熟可變區。因此,例如,輕鏈成熟可變區意指無輕鏈信號肽之輕鏈可變區。各鏈之羧基端部分界定主要負責效應物功能之恆定區。 將輕鏈歸類為κ或λ。將重鏈歸類為γ、μ、α、δ或ε,且將抗體之同型分別定義為IgG、IgM、IgA、IgD及IgE。在輕鏈及重鏈內,可變區及恆定區係藉由約12個或更多胺基酸之「J」區接合,且重鏈亦包括約10個或更多胺基酸之「D」區。(一般參見
Fundamental Immunology
(Paul, W.編輯,第2版,Raven Press, N.Y., 1989,第7章),出於所有目的,其係全文以引用方式併入)。 每一輕鏈/重鏈對之成熟可變區形成抗體結合位點。因此,完整抗體具有兩個結合位點。除了在雙功能或雙特異性抗體中以外,兩個結合位點相同。該等鏈皆呈現藉由三個超變區(亦稱為互補決定區或CDR)接合之相對保守框架區(FR)之相同通用結構。來自各對之兩條鏈之CDR係藉由框架區對齊,使得能夠結合至特異性表位。輕鏈及重鏈二者自N末端至C末端包含結構域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4。將胺基酸根據以下之定義分配至各結構域:Kabat,
Sequences of Proteins of Immunological Interest
(National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1987及1991),或Chothia及Lesk,
J. Mol. Biol
. 196:901-917 (1987);Chothia等人,
Nature
342:878-883 (1989),或Kabat與Chothia之組合,或IMGT、AbM或Contact或CDR之其他習用定義。Kabat亦提供廣泛使用之編號慣例(Kabat編號),其中不同重鏈之間或不同輕鏈之間之相應殘基分配相同編號。除非上下文另有明確說明,否則使用Kabat編號指明胺基酸在可變區中之位置。除非上下文另有明確說明,否則使用EU編號指明在恆定區中之位置。 術語「抗體」包括完整抗體及其結合片段。通常,抗體片段與產生其之完整抗體競爭特異性結合至靶,該等片段包括單獨的重鏈、輕鏈Fab、Fab'、F(ab')
2
、F(ab)c、雙價抗體、Dab、奈米抗體及Fv。片段可藉由重組DNA技術或藉由完整免疫球蛋白之酶促或化學分離來產生。術語「抗體」亦包括雙價抗體(同二聚Fv片段)或微小抗體(V
L
-V
H
-C
H
3)、雙特異性抗體或諸如此類。雙特異性或雙功能抗體係具有兩個不同重鏈/輕鏈對及兩個不同結合位點之人工雜合抗體(例如,參見Songsivilai及Lachmann, Clin. Exp. Immunol., 79:315-321 (1990);Kostelny等人,J. Immunol., 148:1547-53 (1992))。 術語「抗體」包括抗體自身(裸抗體)或偶聯至細胞毒性或細胞生長抑制藥物之抗體。 嵌合抗體係其中非人類抗體(例如,小鼠)之輕鏈及重鏈之成熟可變區與人類輕鏈及重鏈恆定區組合之抗體。該等抗體實質上或完全保留小鼠抗體之結合特異性,且為人類序列之約三分之二。 飾面抗體係一類人類化抗體,其保留非人類抗體之一些且通常所有CDR及一些非人類可變區框架殘基,但用來自人類抗體序列之相應位置之殘基替代可有助於B細胞或T細胞表位之其他可變區框架殘基,例如暴露殘基(Padlan, Mol. Immunol. 28:489, 1991)。從而得到其中CDR完全或實質上來自非人類抗體且藉由取代使非人類抗體之可變區框架更接近人類之抗體。 術語「表位」係指抗原上與抗體結合之位點。表位可自鄰接胺基酸或藉由一或多個蛋白質之三級摺疊相鄰之非鄰接胺基酸形成。自鄰接胺基酸形成之表位通常在暴露於變性溶劑時保留,而藉由三級摺疊形成之表位通常在用變性溶劑處理時丟失。表位通常在唯一空間構象中包括至少3個、且更通常至少5個或8-10個胺基酸。測定表位空間構象之方法包括例如x射線結晶學及二維核磁共振。例如,參見Epitope Mapping Protocols,Methods in Molecular Biology,第66卷,Glenn E. Morris編輯(1996)。 識別相同或重疊表位之抗體可在顯示一種抗體與另一種抗體競爭結合至靶抗原之能力之簡單免疫分析中鑑別。抗體之表位亦可藉由結合至其抗原以鑑別接觸殘基之抗體之X射線結晶學來界定。或者,若抗原中降低或消除一種抗體之結合之所有胺基酸突變皆降低或消除另一種抗體之結合,則該兩種抗體具有相同表位。若降低或消除一種抗體之結合之一些胺基酸突變降低或消除另一種抗體之結合,則該兩種抗體具有重疊表位。 抗體之間之競爭係藉由分析來測定,其中所測試抗體抑制參考抗體與共同抗原之特異性結合(例如,參見Junghans等人,
Cancer Res.
50:1495, 1990)。若如在競爭性結合分析中所量測,過量測試抗體(例如,至少2x、5x、10x、20x或100x)將參考抗體之結合抑制至少50%、但較佳75%、90%或99%,則測試抗體與參考抗體競爭。藉由競爭分析鑑別之抗體(競爭抗體)包括與參考抗體結合至相同表位之抗體及由於存在立體阻礙而結合至足夠靠近參考抗體所結合表位之毗鄰表位之抗體。與h2H12抗體競爭結合至人類BCMA蛋白之抗體包括在本發明中。 術語「患者」包括接受預防性或治療性治療之人類及其他哺乳動物個體。 出於將胺基酸取代歸類為保守或非保守之目的,將胺基酸分組如下:組I (疏水側鏈):met、ala、val、leu、ile;組II (中性親水側鏈):cys、ser、thr;組III (酸性側鏈):asp、glu;組IV (鹼性側鏈):asn、gln、his、lys、arg;組V (影響鏈取向之殘基):gly、pro;及組VI (芳香族側鏈):trp、tyr、phe。保守取代涉及同一類別中胺基酸之間之取代。非保守取代係指用該等類別中一者之成員與另一類別之成員交換。 序列一致性百分比係用藉由Kabat編號慣例最大對齊之抗體序列來測定。在對齊後,若將受試抗體區域(例如,重鏈或輕鏈之完整成熟可變區)與參考抗體之相同區域相比,則受試抗體區域與參考抗體區域之間之序列一致性百分比係將受試抗體區域與參考抗體區域二者中相同胺基酸所佔據之位置數除以兩個區域之對齊位置總數(不計數空位),乘以100以轉化為百分比。 「包含」一或多個所列舉要素之組合物或方法可包括未明確列舉之其他要素。舉例而言,包含抗體之組合物可含有單獨或與其他成分組合之該抗體。 值之範圍之指定包括該範圍內或界定該範圍之所有整數。 抗體效應物功能係指由Ig之Fc結構域貢獻之功能。該等功能可為例如抗體依賴性細胞毒性、抗體依賴性細胞吞噬作用或補體依賴性細胞毒性。該功能可藉由(例如) Fc效應物結構域與具有吞噬或溶解活性之免疫細胞上之Fc受體之結合或藉由Fc效應物結構域與補體系統之組分之結合來實現。通常,由Fc結合細胞或補體組分介導之效應導致BCMA靶向細胞之抑制及/或耗竭。抗體之Fc區可招募Fc受體(FcR)表現細胞並使其與經抗體覆蓋之靶細胞相鄰。表現針對IgG之表面FcR (包括FcgRIII (CD16)、FcgRII (CD32)及FcgRIII (CD64))之細胞可用作破壞經IgG覆蓋之細胞之效應細胞。該等效應細胞包括單核球、巨噬細胞、天然殺手(NK)細胞、嗜中性球及嗜酸性球。IgG嚙合FcgR活化抗體依賴性細胞毒性(ADCC)或抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)。ADCC係由CD16
+
效應細胞經由分泌膜成孔蛋白及蛋白酶來介導,而吞噬作用係由CD32
+
及CD64
+
效應細胞介導(參見
Fundamental Immunology
,第4版,Paul編輯,Lippincott-Raven, N.Y., 1997,第3、17及30章;Uchida等人,2004,
J. Exp. Med.
199:1659-69;Akewanlop等人,2001,
Cancer Res.
61:4061-65;Watanabe等人,1999,
Breast Cancer Res. Treat.
53:199-207)。除了ADCC及ADCP以外,細胞結合抗體之Fc區亦可活化補體古典路徑以引發補體依賴性細胞毒性(CDC)。補體系統之C1q在抗體與抗原複合時結合至該等抗體之Fc區。C1q與細胞結合抗體之結合可起始涉及C4及C2之蛋白水解活化之一系列事件以生成C3轉化酶。C3藉由C3轉化酶裂解為C3b使得能活化末端補體組分,包括C5b、C6、C7、C8及C9。該等蛋白質在經抗體覆蓋之細胞上共同形成攻膜複合物孔。該等孔破壞細胞膜完整性,從而殺死靶細胞(參見
Immunobiology
,第6版,Janeway等人,Garland Science, N. Y., 2005,第2章)。 術語「抗體依賴性細胞毒性」或ADCC係誘導細胞死亡之機制,其依賴於經抗體覆蓋之靶細胞與具有溶解活性之免疫細胞(亦稱為效應細胞)之相互作用。該等效應細胞包括天然殺手細胞、單核球/巨噬細胞及嗜中性球。效應細胞附著至經由其抗原組合位點結合至靶細胞之Ig之Fc效應物結構域。經抗體覆蓋之靶細胞因效應細胞活性而死亡。 術語「抗體依賴性細胞吞噬作用」(簡稱「ADCP」)係指經抗體覆蓋之細胞由結合至Ig之Fc效應物結構域之吞噬性免疫細胞(例如巨噬細胞、嗜中性球及樹突細胞)完全或部分內化之過程。 術語「補體依賴性細胞毒性」或CDC係指誘導細胞死亡之機制,其中靶結合抗體之Fc效應物結構域活化一系列酶促反應,最終在靶細胞膜上形成孔洞。通常,抗原-抗體複合物(例如在經抗體覆蓋之靶細胞上之彼等)結合並活化補體組分C1q,其進而活化補體級聯,從而導致靶細胞死亡。活化補體亦可導致補體組分沈積於靶細胞表面上,從而藉由結合白血球上之補體受體(例如,CR3)來促進ADCC。 「細胞毒性效應」係指耗竭、消除及/或殺死靶細胞。「細胞毒性劑」係指對細胞具有細胞毒性效應之試劑。 細胞毒性劑可偶聯至抗體或與抗體組合投與。 「細胞生長抑制效應」係指抑制細胞增殖。「細胞生長抑制劑」係指對細胞具有細胞生長抑制效應,由此抑制特定細胞亞組之生長及/或擴增之試劑。細胞生長抑制劑可偶聯至抗體或與抗體組合投與。 術語「醫藥上可接受之」意指已由或可由聯邦或州政府管理機構批准或已列於美國藥典(U.S. Pharmacopeia)或其他公認藥典中可用於動物、且更具體而言用於人類中。術語「醫藥上相容之成分」係指與抗BCMA抗體一起投與個體之醫藥上可接受之稀釋劑、佐劑、賦形劑或媒劑。 片語「醫藥上可接受之鹽」係指醫藥上可接受之抗BCMA-1抗體或其偶聯物或與抗BCMA-1抗體一起投與之試劑之有機或無機鹽。實例性鹽包括硫酸鹽、檸檬酸鹽、乙酸鹽、草酸鹽、鹽酸鹽、溴化物、碘化物、硝酸鹽、硫酸氫鹽、磷酸鹽、酸式磷酸鹽、異菸鹼酸鹽、乳酸鹽、柳酸鹽、酸式檸檬酸鹽、酒石酸鹽、油酸鹽、鞣酸鹽、泛酸鹽、酒石酸氫鹽、抗壞血酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、龍膽酸鹽、富馬酸鹽、葡糖酸鹽、葡糖醛酸鹽、糖質酸鹽、甲酸鹽、苯甲酸鹽、麩胺酸鹽、甲磺酸鹽、乙磺酸鹽、苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽及雙羥萘酸鹽(即1,1’-亞甲基雙-(2-羥基3-萘酸鹽))。醫藥上可接受之鹽可涉及引入另一分子,例如乙酸根離子、琥珀酸根離子或其他相對離子。相對離子可為使母化合物上之電荷穩定之任何有機或無機部分。此外,醫藥上可接受之鹽可在其結構中具有一個以上帶電原子。其中多個帶電原子係醫藥上可接受之鹽之部分之情況可具有多個相對離子。因此,醫藥上可接受之鹽可具有一或多個帶電原子及/或一或多個相對離子。 除非上下文另有明確說明,否則術語「約」涵蓋對功能性質無顯著效應之非實質性差異(例如,在誤差邊際或實驗量測內)。 I.
概述
本發明提供特異性結合至BCMA之單株抗體。該等抗體可用於治療及診斷多種癌症及免疫病症以及檢測BCMA。 II.
靶分子
除非另外指示,否則BCMA意指人類BCMA。實例性人類核酸及胺基酸序列係由SEQ ID NO:1及2提供。除非上下文另有明確說明,否則提及BMCA時意指蛋白質之至少細胞外結構域(SEQ ID NO: 2之大約殘基1-54)且有時意指完整蛋白質。同樣,除非上下文另有明確說明,否則提及BAFF及APRIL及其除BCMA以外的受體時係指野生型人類序列,例如如在Swiss Prot資料庫中所提供。 III.
本發明抗體
A.
結合特異性及功能性質
SG16.17抗體係特異性結合至人類BCMA之大鼠單株抗體,如實例中所述。ATCC保藏物係於2005年8月15日根據布達佩斯條約(Budapest Treaty)製得。ATCC位於10801 University Boulevard, Manassas, Va. 20110-2209, USA。ATCC保藏物經分配登錄號為PTA-6937。SG16.17抗體抑制BCMA與其配體APRIL及BAFF二者之結合。SG16.17抗體在連接至人類IgG1時引發ADCC,結合至Fcγ受體並經由Fcγ受體引發信號傳導。亦可將SG16.17抗體納入抗體-藥物偶聯物中以將所連接藥物遞送至表現BCMA之細胞之內部。SG16.45抗體係另一大鼠單株抗體,其特異性結合至人類BCMA,抑制其與其配體之結合且可將所連接藥物遞送至表現BCMA之細胞之內部。 本發明提供SG16.17抗體(命名為hSG16.17、cSG16.17或vSG16.17)及SG16.45 (以類似方式命名)之人類化、嵌合及飾面形式。該等抗體通常保留上文所述SG16.17或SG16.45之一些或全部性質。對於任一給定性質,人類化、嵌合或飾面抗體可以在實驗誤差內或大於或小於大鼠SG16.17或SG16.45之相同程度展現該性質。對於人類BCMA,大鼠SG16.17抗體之人類化、嵌合或飾面形式之親和性(即,Ka)可大於大鼠SG16.17抗體,或在大鼠SG16.17抗體之5的因數或2的因數內(即,大於或小於)。較佳人類化、嵌合或飾面SG16.17抗體與大鼠SG16.17抗體結合至相同表位及/或競爭結合至人類BCMA。對於人類BCMA,大鼠SG16.45抗體之人類化、嵌合或飾面形式之親和性(即,Ka)可大於大鼠SG16.45抗體,或在大鼠SG16.45抗體之5的因數或2的因數內(即,大於或小於)。較佳人類化、嵌合或飾面SG16.45抗體與大鼠SG16.45抗體結合至相同表位及/或競爭結合至人類BCMA。 較佳人類化、嵌合及飾面抗體抑制癌症(例如,細胞生長、轉移及/或對生物體之致死性)或B細胞介導之免疫病症,如在活體外、在動物模型或臨床試驗中所顯示。 B.
抗體
人類化抗體係遺傳改造抗體,其中將來自非人類「供體」抗體之CDR移植至人類「接受體」抗體序列中(例如,參見Queen, US 5,530,101及5,585,089;Winter, US 5,225,539;Carter, US 6,407,213;Adair, US 5,859,205;及Foote, US 6,881,557)。接受體抗體序列可為例如成熟人類抗體序列、該等序列之複合物、人類抗體序列之共有序列或種系區域序列。對於SG16.17之人類化,重鏈之較佳接受體序列係種系V
H
外顯子V
H
1-2及外顯子J
H
-3 (對於J外顯子(J
H
))。對於輕鏈,較佳接受體序列係外顯子V
L
1-12及J外顯子J
K
5。對於SG16.45之人類化,較佳重鏈接受體序列係HV3-23/HJ3 (SEQ ID NO: 24)且較佳輕鏈接受體序列係KV3-20/KJ2 (SEQ ID NO: 34)。 因此,人類化抗體係具有至少4個完全或實質上來自非人類供體抗體之CDR及完全或實質上來自人類抗體序列之可變區框架序列及恆定區(若存在)之抗體。類似地,人類化重鏈具有至少兩個且通常全部三個完全或實質上來自供體抗體重鏈之CDR及實質上來自人類重鏈可變區框架及恆定區序列之重鏈可變區框架序列及重鏈恆定區(若存在)。類似地,人類化輕鏈具有至少兩個且通常全部三個完全或實質上來自供體抗體輕鏈之CDR及實質上來自人類輕鏈可變區框架及恆定區序列之輕鏈可變區框架序列及輕鏈恆定區(若存在)。除了奈米抗體及dAb以外,人類化抗體包含人類化重鏈及人類化輕鏈。在各別CDR之間至少60%、85%、90%、95%或100%之相應殘基(如藉由Kabat所定義)一致時,人類化或人類抗體中之CDR實質上來自非人類抗體中之相應CDR或與其實質上一致。在至少70%、80%、85%、90%、95%或100%之藉由Kabat所定義之相應殘基一致時,抗體鏈之可變區框架序列或抗體鏈之恆定區分別實質上來自人類可變區框架序列或人類恆定區。 儘管人類化抗體通常納入全部6個來自小鼠抗體之CDR (較佳如藉由Kabat所定義,但替代地如藉由IMGT、Chothia、組合Kabat-Chothia、AbM或Contact或其他習用定義所定義),但亦可使其具有少於全部來自小鼠抗體之CDR (例如,至少4個或5個CDR) (例如,Pascalis等人,
J. Immunol
. 169:3076, 2002;Vajdos等人,
Journal of Molecular Biology
, 320: 415-428, 2002;Iwahashi等人,
Mol. Immunol
. 36:1079-1091, 1999;Tamura等人,
Journal of Immunolog
y, 164:1432-1441, 2000)。 某些來自人類可變區框架殘基之胺基酸可基於其對CDR構象及/或與抗原之結合之可能影響經選擇用於取代。對該等可能影響之研究係藉由建模、檢查特定位置的胺基酸之特徵或憑經驗觀察特定胺基酸之取代或誘變之效應來進行。 舉例而言,在鼠類可變區框架殘基與所選人類可變區框架殘基之間之胺基酸不同時,在合理地預期該胺基酸有如下情況時,人類框架胺基酸可經來自小鼠抗體之等效框架胺基酸取代: (1) 直接非共價結合抗原, (2) 毗鄰CDR區域, (3) 以其他方式與CDR區域相互作用(例如在CDR區域之約6 Å內);或 (4) 介導重鏈與輕鏈之間之相互作用。 本發明提供大鼠SG16.17抗體之人類化形式,其包括
6
個所例示人類化重鏈成熟可變區(hSG16.17 VH1-6) ( SEQ ID No: 11-16)及4個所例示人類化輕鏈成熟可變區(hSG16.17 VK2-5) (SEQ ID NO: 19-22)。重鏈及輕鏈可以任何排列組合,且包括hSG16.17 VH1、VH3或VH5中之任一者之排列較佳。具有結合親和性、與人類種系之序列一致性百分比、表現及單體含量百分比之最佳組合之排列係hSG16.17 VH3 VK2。此抗體顯示在實驗誤差內與大鼠SG16.17類似之親和性、在重鏈及輕鏈可變區二者中與人類種系之大於85%序列一致性(由此,根據新INN準則具有「人類化」名稱之資格)、在CHO細胞中之高表現及高單體比例。與大多數其他人類化抗體相比,hSG16.17 VH3 VK2之獨特之處在於具有大量可變區框架突變,其中人類接受體殘基變為相應大鼠殘基(13),但亦具有大量「正向」CDR突變,其中Kabat CDR中之大鼠殘基變為人類接受體序列中之相應殘基,使得整體上該抗體與人類種系序列具有足夠序列一致性而根據INN準則歸類為人類化。大多數先前人類化抗體具有完全來自供體抗體之Kabat CDR。 本發明提供抗體,其中重鏈可變區顯示與hSG16.17 VH3 (SEQ ID NO: 13)至少90%一致且輕鏈可變區顯示與hSG16.17 VK2 (SEQ ID NO: 19)至少90%一致。一些抗體顯示與HV3之至少95%、96%、97%、98%或99%序列一致性及與VK2之至少95%、96%、97%、98%或99%序列一致性。一些該等抗體包括hSG16.17 VH3 (SEQ ID NO: 13)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 60-62)及hSG16.17 VK2 (SEQ ID NO: 19)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 90-92)。一些該等抗體包括hSG16.17 VH3 (SEQ ID NO: 13)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 60-62)及hSG16.17 VK2 (SEQ ID NO: 19)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 90-92),條件係位置H58可由N或K佔據,位置H60可由A或N佔據,位置H61可由Q或E佔據,位置H62可由K或N佔據,位置H64可由Q或K佔據,位置H65可由G或T佔據,位置L24可由R或L佔據且位置L53可由S或R佔據。較佳地,位置H58、H60、H61、H62、H64及H65分別由N、A、Q、K、Q及G佔據且L24及L53分別由R及S佔據。所列舉之該等殘基代表佔據Kabat CDR內之位置之來自人類接受體序列之胺基酸。一些抗體在人類Kabat CDR內有至少1、2、3、4、5、6、7或8個大鼠殘基由來自人類接受體序列之相應殘基替代。在一些抗體中,位置H58、H60、H61、H62、H64及H65分別由N、A、Q、K、Q及G佔據,且L24及L53分別由R及S佔據。一些抗體包括至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個回復突變,代表可變區人類接受體序列殘基經相應大鼠殘基替代。 在一些抗體中,位置H20、H48、H69、H71、H73、H76、H80、H88、H91及H93中之至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11個分別由L、I、M、A、K、N、V、A、F及T佔據。在一些抗體中,位置L46、L48及L87中之至少1、2或3個分別由V、V及F佔據。在一些抗體中,位置H20、H48、H69、H71、H73、H76、H80、H88、H91及H93各自分別由L、I、M、A、K、N、V、A、F及T佔據且L46、L48及L87各自分別由V、V及F佔據。 在人類化抗體顯示自所例示hSG16.17 VH3 VK2人類化抗體之任何變異之範圍內,該額外變異之一種可能性係可變區框架中之額外回復突變。在其他所例示人類化重鏈或輕鏈成熟可變區中發生回復突變之任一或所有位置亦可由如下組成:由R佔據之H8、由A佔據之H67及由A佔據之H78;由S佔據之L40、由M佔據之L78及由D佔據之L85 (即,其中之1、2、3、4、5或所有6個),或重鏈中由N佔據之H38、由R佔據之H40、由K佔據之H73、由S佔據之H82A及由T佔據之H83中之所有5個,及輕鏈中由K佔據之L3及由I佔據之L20中之1個或兩個。然而,該等額外回復突變並非較佳,此乃因其一般不改良親和性且引入更多小鼠殘基可增加免疫原性之風險。 另一可能變異係用來自人類CDR序列、通常來自用於設計所例示人類化抗體之人類接受體序列CDR之相應殘基取代小鼠抗體CDR中之更多或更少殘基。在一些抗體中,僅需要部分CDR (即結合所需CDR殘基亞組,稱為SDR)來保持人類化抗體中之結合。不接觸抗原且不在SDR中之CDR殘基可基於根據其他定義(例如Chothia超變環(Chothia,
J. Mol. Biol.
196:901, 1987))位於CDR外部之Kabat CDR區域、藉由分子建模及/或憑經驗或如Gonzales等人,Mol. Immunol. 41: 863 (2004)中所述來鑑別。在該等人類化抗體中在其中一或多個供體CDR殘基不存在或其中整個供體CDR被省略之位置,佔據該位置之胺基酸可為佔據接受體抗體序列中之相應位置(依照Kabat編號)之胺基酸。欲包括CDR中接受體取代供體胺基酸之該等取代數反映競爭考慮因素之平衡。該等取代在減少人類化抗體中之小鼠胺基酸數且因此降低潛在免疫原性方面可能係有利的。然而,取代亦可引起親和性變化,且較佳避免親和性顯著降低。CDR內之取代位置及欲取代之胺基酸亦可憑經驗來選擇。 儘管並非較佳,但可進行其他胺基酸取代,例如在不與CDR接觸之框架殘基中,或甚至CDR內一些潛在的CDR接觸殘基胺基酸。通常在變體人類化序列中進行之替代關於所替代hSG16.17 VH3 VK2胺基係保守的。較佳地,關於hSG16.17 VH3 VK2之替代(保守抑或不保守)對人類化mAb之結合親和性或功效、亦即其結合人類BCMA並抑制癌細胞生長之能力不具有顯著效應。 變體通常與hSG16.17 VH3 VK2之重鏈及輕鏈成熟可變區序列相差少量(例如,輕鏈或重鏈成熟可變區或二者中通常不多於1、2、3、5或10個)替代、缺失或插入。 人類化重鏈及輕鏈之其他較佳組合包括以下中之任一者:hSG16.17 VH1 VK2、VH1 VK3、VH1 VK4、VH1 VK4、VH3 VK2、VH3 VK3、VH3 VK4及VH3 VK5及VH5 VK2、VH5 VK3、VH5 VK4、VH5 VK5,以及其中重鏈及輕鏈可變區與任一該等抗體之重鏈及輕鏈可變區顯示至少90、95、96、97、98或99%一致性之人類化抗體。 本發明提供大鼠SG16.45抗體之人類化形式,其包括6個所例示人類化重鏈成熟可變區(hSG16.45 VH1-6) (SEQ ID NO: 27-32)及4個所例示人類化輕鏈成熟可變區(hSG16.45 VK1、2、3及5) (SEQ ID NO: 35-38)。重鏈及輕鏈可以任何排列組合,且排列hSG16.45 VH5 VK2、VH1 VK1及VH1 VK5較佳。hSG16.45 HV5 VK2顯示在重鏈及輕鏈可變區二者中與人類種系之大於85%序列一致性(由此,根據新INN準則具有「人類化」名稱之資格)、在CHO細胞中之高表現、高單體比例及足夠結合(即使略低於大鼠或嵌合SG16.45)。hSG16.45 VH5 VK2具有3個可變區回復突變(皆在重鏈中)及3個Kabat CDR正向突變,其中Kabat CDR中之大鼠殘基變為人類接受體序列中之相應殘基,使得整體上該抗體與人類種系序列具有足夠序列一致性以根據INN準則歸類為人類化。 本發明提供抗體,其中重鏈可變區顯示與hSG16.45 VH5 (SEQ ID NO: 31)至少90%一致且輕鏈可變區顯示與hSG16.45 VK2至少90%一致。一些抗體顯示與hSG16.45 VH5之至少95%、96%、97%、98%或99%序列一致性及與VK2之至少95%、96%、97%、98%或99%序列一致性。一些該等抗體包括hSG16.45 VH5 (SEQ ID NO: 31)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 152-154)及hSG16.45 VK2 (SEQ ID NO: 36)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 179-181)。一些該等抗體包括hSG16.45 VH5 (SEQ ID NO: 31)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 152-154)及hSG16.45 VK2 (SEQ ID NO: 36)之三個Kabat CDR (SEQ ID NO: 179-181),條件係位置H50可由A或S佔據且位置L24可由R或L佔據且位置L26可由S或T佔據。較佳地,位置H50由A佔據且位置L24及L26由R及S佔據。所列舉之該等殘基代表佔據Kabat CDR內之位置之來自人類接受體序列之胺基酸。一些抗體在人類Kabat CDR中有至少1、2或3個大鼠殘基經來自人類接受體序列之相應殘基替代。在一些抗體中,位置H50、L24及L26分別由A、R及S佔據。一些抗體包括至少1、2或3個回復突變,代表可變區人類接受體序列殘基經相應大鼠殘基替代。 在一些抗體中,位置H30、H93及H94中之至少1、2或3個分別由N、T及S佔據。在一些抗體中,位置H30、H93及H94各自分別由N、T及S佔據。 在人類化抗體顯示自所例示hSG16.45 VH5 VK2人類化抗體之任何變異之範圍內,該額外變異之一種可能性係可變區框架中之額外回復突變。在其他所例示人類化重鏈或輕鏈成熟可變區中回復突變之任一或所有位置亦可由如下組成:分別由I、I、N及V佔據之H37、H48、H76、H107 (即,其中之1、2、3或4個)及/或分別由A、V、I、H、V、Y及M佔據之L14、L19、L21、L38、L58、L71及L78中之1、2、3、4、5、6或7個。然而,該等額外回復突變並非較佳,此乃因其一般不改良親和性且引入更多小鼠殘基可增加免疫原性之風險。 另一可能變異係用來自人類CDR序列、通常來自用於設計所例示人類化抗體之人類接受體序列CDR之相應殘基取代小鼠抗體CDR中之更多或更少殘基。在一些抗體中,僅需要部分CDR (即結合所需CDR殘基亞組,稱為SDR)以保持人類化抗體中之結合。不接觸抗原且不在SDR中之CDR殘基可基於根據其他定義(例如Chothia超變環(Chothia,
J. Mol. Biol.
196:901, 1987))位於CDR外部之Kabat CDR區域、藉由分子建模及/或憑經驗或如Gonzales等人,Mol. Immunol. 41: 863 (2004)中所述來鑑別。在該等人類化抗體中在其中一或多個供體CDR殘基不存在或其中整個供體CDR被省略之位置,佔據該位置之胺基酸可為佔據接受體抗體序列中之相應位置(依照Kabat編號)之胺基酸。欲包括CDR中接受體取代供體胺基酸之該等取代數反映競爭考慮因素之平衡。該等取代在減少人類化抗體中之小鼠胺基酸數且因此降低潛在免疫原性方面可能係有利的。然而,取代亦可引起親和性變化,且較佳避免親和性顯著降低。CDR內之取代位置及欲取代之胺基酸亦可憑經驗來選擇。 儘管並非較佳,但可進行其他胺基酸取代,例如在不與CDR接觸之框架殘基中,或甚至CDR內一些潛在的CDR接觸殘基胺基酸。通常在變體人類化序列中進行的替代關於所替代hSG16.45 VH3 VK2係保守的。較佳地,關於hSG16.45 VH5 VK2之替代(保守抑或不保守)對人類化mAb之結合親和性或功效、亦即其結合人類BCMA並抑制癌細胞生長之能力不具有顯著效應。 變體通常與SG16.45 VH5 VK2之重鏈及輕鏈成熟可變區序列相差少量(例如,在輕鏈或重鏈成熟可變區或二者中通常不多於1、2、3、5或10個)替代、缺失或插入。 人類化重鏈及輕鏈之其他較佳組合包括以下中之任一者:hSG16.45 VH1 VK1及VH1 VK5,以及其中重鏈及輕鏈可變區與任一該等抗體之重鏈及輕鏈可變區顯示至少90、95、96、97、98或99%一致性之人類化抗體。 C.
恆定區之選擇
人類化抗體之重鏈及輕鏈可變區可連接至人類恆定區之至少一部分。恆定區之選擇部分依賴於是否期望抗體依賴性細胞介導之細胞毒性、抗體依賴性細胞吞噬作用及/或補體依賴性細胞毒性。舉例而言,人類同型IgG1及IgG3具有強補體依賴性細胞毒性、人類同型IgG2具有弱補體依賴性細胞毒性,且人類IgG4缺少補體依賴性細胞毒性。人類IgG1及IgG3亦誘導強於人類IgG2及IgG4之細胞介導之效應物功能。輕鏈恆定區可為λ或κ。抗體可表現為含有兩條重鏈及兩條重鏈之四聚體,表現為單獨重鏈、輕鏈,表現為Fab、Fab'、F(ab')2及Fv,或表現為其中重鏈及輕鏈可變結構域經由間隔體連接之單鏈抗體。 人類恆定區顯示不同個體之間之同種異型變異及同族同種異型變異,亦即恆定區可在不同個體之間在一或多個多態性位置不同。同族同種異型與同種異型(allotype)之差異在於識別同族同種異型(isoallotype)之血清結合至一或多個其他同型之非多態性區域。實例性野生型人類κ及IgG1恆定區序列(後者具有或不具有C-末端離胺酸)係於SEQ ID NO: 3-5中提供。 輕鏈及/或重鏈之胺基或羧基末端之一或多個胺基酸、例如重鏈之C-末端離胺酸可在一部分或所有分子中丟失或衍生。可在恆定區中進行取代以降低或增加效應物功能,例如補體介導之細胞毒性或ADCC (例如,參見Winter等人,美國專利第5,624,821號;Tso等人,美國專利第5,834,597號;及Lazar等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103:4005, 2006),或延長在人類中之半衰期(例如,參見Hinton等人,J. Biol. Chem. 279:6213, 2004)。 實例性取代包括在胺基酸位置234、235、237、239、267、298、299、326、330或332引入之天然胺基酸至半胱胺酸殘基之胺基酸取代,較佳人類IgG1同型中之S239C突變(根據EU索引編號(Kabat,
Sequences of Proteins of Immunological Interest
(國立衛生研究院, Bethesda, MD, 1987及1991);參見US 20100158909,其係以引用方式併入本文中)。具有及不具有C-末端離胺酸之具有S239C之重鏈恆定區之序列由SEQ ID NO: 6及7提供。額外半胱胺酸殘基之存在容許形成鏈間二硫鍵。該鏈間二硫鍵形成可造成立體阻礙,從而降低Fc區-FcγR結合相互作用之親和性。在IgG恆定區之Fc區中或在其附近引入之半胱胺酸殘基亦可用作偶聯至治療劑之位點(即,使用硫醇特異性試劑偶合細胞毒性藥物,例如藥物之馬來醯亞胺衍生物)。治療劑之存在造成立體阻礙,從而進一步降低Fc區-FcγR結合相互作用之親和性。在位置234、235、236及/或237中任一處之其他取代降低對Fcγ受體、尤其FcγRI受體之親和性(例如,參見US 6,624,821、US 5,624,821)。突變之較佳組合係S239D、A330L及I332E,其增加Fc結構域對FcγRIIIA之親和性且因此增加ADCC。 抗體之活體內半衰期亦可影響其效應物功能。抗體之半衰期可延長或縮短以改變其治療活性。FcRn係結構類似於與β2-微球蛋白非共價結合之MHC I類抗原之受體。FcRn調節IgG之分解代謝及其跨越組織之胞吞轉送作用(Ghetie及Ward, 2000,
Annu. Rev. Immunol.
18:739-766;Ghetie及Ward, 2002,
Immunol. Res.
25:97-113)。IgG-FcRn相互作用在pH 6.0 (細胞內囊泡之pH)下發生,但在pH 7.4 (血液pH)下不發生;此相互作用使得IgG能再循環回至循環中(Ghetie及Ward, 2000,
Ann. Rev. Immunol.
18:739-766;Ghetie及Ward, 2002,
Immunol. Res.
25:97-113)。人類IgG1上參與FcRn結合之區域已經定位(Shields等人,2001,
J. Biol. Chem.
276:6591-604)。在人類IgG1之位置Pro238、Thr256、Thr307、Gln311、Asp312、Glu380、Glu382或Asn434之丙胺酸取代增強FcRn結合(Shields等人,2001,
J. Biol. Chem.
276:6591-604)。具有該等取代之IgG1分子具有較長血清半衰期。因此,與未修飾IgG1相比,該等經修飾IgG1分子可在較長時間段期間能夠實施其效應物功能,且因此發揮其治療功效。用於增加與FcRn之結合之其他實例性取代包括在位置250之Gln及/或在位置428之Leu。恆定區中之所有位置皆使用EU編號。 IgG之Fc區結合FcgR之能力涉及共價附接至保守Asn297之寡醣(Lund等人,1996,
J. Immunol.
157:4963-69;Wright及Morrison, 1997,
Trends Biotechnol.
15:26-31)。IgG上此糖型之工程化可顯著改良IgG介導之ADCC。將平分型N-乙醯基葡糖胺修飾(Umana等人,1999,
Nat. Biotechnol.
17:176-180;Davies等人,2001,
Biotech. Bioeng.
74:288-94)添加至此糖型或自此糖型移除岩藻糖(Shields等人,2002,
J. Biol. Chem.
277:26733-40;Shinkawa等人,2003,
J. Biol. Chem.
278:6591-604;Niwa等人,2004,
Cancer Res.
64:2127-33)係改良IgG Fc與FcgR之間之結合,從而增強Ig介導之ADCC活性之IgG Fc工程化之兩個實例。 人類IgG1 Fc區之溶劑暴露胺基酸之系統性取代生成具有改變FcgR結合親和性之IgG變體(Shields等人,2001,
J. Biol. Chem.
276:6591-604)。在與親代IgG1相比時,包括Thr256/Ser298、Ser298/Glu333、Ser298/Lys334或Ser298/Glu333/Lys334至Ala之取代之該等變體之亞組顯示對FcgR之結合親和性及ADCC活性二者增加(Shields等人,2001,
J. Biol. Chem.
276:6591-604;Okazaki等人,2004,
J. Mol. Biol.
336:1239-49)。 抗體之補體結合活性(C1q結合及CDC活性二者)可藉由Lys326及Glu333之取代而改良(Idusogie等人,2001,
J. Immunol.
166:2571-2575)。人類IgG2主鏈上之相同取代可將對C1q結合較差且嚴重缺乏補體活化活性之抗體同型轉化為既可結合C1q亦可介導CDC之抗體同型(Idusogie等人,2001,
J. Immunol.
166:2571-75)。亦可應用若干種其他方法來改良抗體之補體結合活性。舉例而言,將IgM之18個胺基酸之羧基-末端尾段移植至IgG之羧基-末端顯著增強其CDC活性。此即使在使用通常不具有可檢測CDC活性之IgG4時亦可觀察到(Smith等人,1995,
J. Immunol.
154:2226-36)。同樣,用Cys取代位置接近IgG1重鏈之羧基末端之Ser444誘導IgG1之尾對尾二聚化,且使CDC活性相對於單體IgG1增加200倍(Shopes等人,1992,
J. Immunol.
148:2918-22)。另外,具有對C1q之特異性之雙特異性雙價抗體構築體亦賦予CDC活性(Kontermann等人,1997,
Nat. Biotech.
15:629-31)。 補體活性可藉由使重鏈之胺基酸殘基318、320及322中之至少一者突變為具有不同側鏈之殘基(例如Ala)來降低。代替該三個殘基中之任一者之其他烷基取代之非離子殘基(例如Gly、Ile、Leu或Val)或芳香族非極性殘基(例如Phe、Tyr、Trp及Pro)亦降低或消除C1q結合。Ser、Thr、Cys及Met可在殘基320及322而非318用於降低或消除C1q結合活性。用極性殘基替代318 (Glu)殘基可改變但不消除C1q結合活性。用Ala替代殘基297 (Asn)導致溶解活性移除,但僅略微降低(降低約3倍)對C1q之親和性。此改變破壞醣基化位點及為補體活化所需之碳水化合物之存在。在此位點之任何其他取代亦破壞醣基化位點。以下突變及其任何組合亦降低C1q結合:D270A、K322A、P329A及P311S (參見WO 06/036291)。 在提及人類恆定區時包括具有任何天然同種異型或佔據天然同種異型中之多態性位置之殘基之任何排列之恆定區。同樣,相對於天然人類恆定區可存在至多1、2、5或10個突變,例如上文所指示之彼等,以降低Fcγ受體結合或增加與FcRN之結合。 D.
重組體抗體之表現
人類化、嵌合或飾面抗體通常係藉由重組體表現來產生。重組體多核苷酸構築體通常包括可操作連接至抗體鏈之編碼序列之表現控制序列,包括天然相關之或異源啟動子區域。較佳地,表現控制序列係能轉變或轉染真核宿主細胞之載體中之真核啟動子系統。一旦已將載體納入適當宿主中,即將宿主維持在適於核苷酸序列之高水平表現及交叉反應抗體之收集及純化之條件下。 哺乳動物細胞係用於表現編碼免疫球蛋白或其片段之核苷酸區段之較佳宿主。參見Winnacker
, From Genes to Clones
, (VCH Publishers, NY, 1987)。業內已研發出多種能分泌完整異源蛋白質之適宜宿主細胞系,且包括CHO細胞系(例如,DG44)、多種COS細胞系、HeLa細胞、HEK293細胞、L細胞及不產生抗體之骨髓瘤(包括Sp2/0及NS0)。較佳地,該等細胞係非人類細胞。用於該等細胞之表現載體可包括表現控制序列,例如複製起點、啟動子、增強子(Queen等人,
Immunol. Rev.
89:49 (1986))及所需處理資訊位點(例如核糖體結合位點、RNA剪接位點、多聚腺苷酸化位點及轉錄終止子序列)。較佳表現控制序列係源自內源基因、巨細胞病毒、SV40、腺病毒、牛乳頭瘤病毒及諸如此類之啟動子。參見Co等人,
J. Immunol.
148:1149 (1992)。 一旦經表現,抗體可根據業內標準程序來純化,包括HPLC純化、管柱層析、凝膠電泳及諸如此類(通常參見Scopes,
Protein Purification
(Springer-Verlag, NY, 1982))。 E.
醣基化 變體
抗體可在其恆定區中之保守位置醣基化(Jefferis及Lund, (1997) Chem. Immunol. 65:111-128;Wright及Morrison, (1997) TibTECH 15:26-32)。免疫球蛋白之寡醣側鏈影響蛋白質功能(Boyd等人,(1996) Mol. Immunol. 32:1311-1318;Wittwe及Howard, (1990) Biochem. 29:4175-4180)以及醣蛋白各部分之間之分子內相互作用,其可影響醣蛋白之構象及所呈現之三維表面(Hefferis及Lund,上文文獻;Wyss及Wagner, (1996) Current Opin. Biotech. 7:409-416)。寡醣亦可用於基於特異性識別結構將給定醣蛋白靶向某些分子。舉例而言,已報導在無半乳糖基化IgG中,寡醣部分「翻轉」出CH2間空間且末端N-乙醯基葡糖胺殘基變得可用於結合甘露糖結合蛋白(Malhotra等人,(1995) Nature Med. 1:237-243)。藉由糖肽酶自中國倉鼠卵巢(CHO)細胞中產生之CAMPATH-1H (重組體人類化鼠類單株IgG1抗體,其識別人類淋巴球之CDw52抗原)移除寡醣導致完全降低補體介導之溶解(CMCL) (Boyd等人,(1996) Mol. Immunol. 32:1311-1318),而使用神經胺酸酶選擇性移除唾液酸殘基不導致DMCL損失。亦已報導抗體醣基化影響抗體依賴性細胞毒性(ADCC)。具體而言,報導具有四環素調節之b(1,4)-N-乙醯基葡糖胺基轉移酶III (GnTIII,催化平分型GlcNAc形成之醣基轉移酶)表現之CHO細胞具有改良之ADCC活性(Umana等人(1999) Mature Biotech. 17:176-180)。 抗體之醣基化通常係N-連接或O-連接。N-連接係指碳水化合物部分附接至天冬醯胺殘基之側鏈。三肽序列天冬醯胺-X-絲胺酸及天冬醯胺-X-蘇胺酸(其中X係除脯胺酸外之任何胺基酸)係將碳水化合物部分酶促附接至天冬醯胺側鏈之識別序列。因此,多肽中該等三肽序列中之任一者之存在皆產生潛在醣基化位點。O-連接醣基化係指糖N-乙醯半乳糖胺、半乳糖或木糖中之一者附接至羥基胺基酸,最常見為絲胺酸或蘇胺酸,但亦可使用5-羥基脯胺酸或5-羥基離胺酸。 抗體之醣基化變體係其中抗體之醣基化模式改變之變體。改變意指缺失一或多個發現於抗體中之碳水化合物部分,將一或多個碳水化合物部分添加至抗體,改變醣基化之組成(醣基化模式)、醣基化程度等。 將醣基化位點添加至抗體可藉由改變胺基酸序列使得其含有上述三肽序列中之一或多者來完成(對於N-連接醣基化位點)。該改變亦可藉由在將一或多個絲胺酸或蘇胺酸殘基添加至初始抗體序列中或藉由該一或多個絲胺酸或蘇胺酸殘基取代來達成(對於O-連接醣基化位點)。類似地,移除醣基化位點可藉由改變抗體天然醣基化位點內之胺基酸來完成。 胺基酸序列通常藉由改變基礎核酸序列來改變。該等方法包括自天然來源分離(在天然胺基酸序列變體情形中)或藉由抗體之較早製備之變體或非變體形式之寡核苷酸介導之(或定點)誘變、PCR誘變及盒式誘變來製備。 抗體之醣基化(包括醣基化模式)亦可在不改變胺基酸序列或基礎核苷酸序列之情況下改變。醣基化主要依賴於用於表現抗體之宿主細胞。由於用於表現作為潛在治療劑之重組體醣蛋白(例如抗體)之細胞類型很少為天然細胞,故可預期抗體醣基化模式之顯著變異。例如,參見Hse等人,(1997) J. Biol. Chem. 272:9062-9070。除了宿主細胞之選擇以外,在抗體之重組體產生期間影響醣基化之因素包括生長模式、培養基配方、培養密度、加氧作用、pH、純化方案及諸如此類。已提出多種改變在特定宿主生物體中達成之醣基化模式之方法,包括引入或過表現某些參與寡醣產生之酶(美國專利第5047335號;第5510261號;第5278299號)。醣基化或某些醣基化類型可以酶促方式自醣蛋白移除,例如使用內切醣苷酶H (Endo H)移除。另外,重組體宿主細胞可經遺傳改造,例如使得某些類型多醣之處理有缺陷。該等及類似技術為業內所熟知。 抗體之醣基化結構可容易地藉由習用碳水化合物分析技術來分析,包括凝集素層析、NMR、質譜、HPLC、GPC、單醣組成分析、連續酶消化及HPAEC-PAD (其使用高pH陰離子交換層析基於電荷來分離寡醣)。出於分析目的釋放寡醣之方法亦為人已知,且包括(但不限於)酶處理(通常使用肽-N-醣苷酶F/內切-b-半乳糖苷酶來實施)、使用嚴苛的鹼性環境消除以主要釋放O-連接結構及使用無水肼釋放N-及O-連接寡醣二者之化學方法。 抗體醣基化修飾之較佳形式係還原核心岩藻醣基化。「核心岩藻醣基化」係指將岩藻糖(「岩藻醣基化」)添加至N-連接聚醣之還原性末端之N-乙醯基葡糖胺(「GlcNAc」)。 「複合N-醣苷連接之糖鏈」通常結合至天冬醯胺297 (根據Kabat編號)。如本文所用複合N-醣苷連接之糖鏈具有主要具有以下結構之二天線複合糖鏈:
其中±指示糖分子可存在或不存在,且數字指示糖分子之間之連接位置。在上文結構中,結合至天冬醯胺之糖鏈末端稱為還原性末端(在右側),且對側稱為非還原性末端。岩藻糖通常結合至還原性末端之N-乙醯基葡糖胺(「GlcNAc」),通常藉由α1,6鍵(GlcNAc之6位連接至岩藻糖之1位)結合。「Gal」係指半乳糖,且「Man」係指甘露糖。 「複合N-醣苷連接之糖鏈」包括1) 複合型,其中核心結構之非還原性末端側具有半乳糖-N-乙醯基葡糖胺(亦稱為「gal-GlcNAc」)之一或多個分支,且Gal-GlcNAc之非還原性末端側視情況具有唾液酸、平分型N-乙醯基葡糖胺或諸如此類;或2) 雜合型,其中核心結構之非還原性末端側具有高甘露糖N-醣苷連接之糖鏈及複合N-醣苷連接之糖鏈之兩個分支。 在一些實施例中,「複合N-醣苷連接之糖鏈」包括複合型,其中核心結構之非還原性末端側具有0個、1個或多個半乳糖-N-乙醯基葡糖胺(亦稱為「gal-GlcNAc」)之分支,且Gal-GlcNAc之非還原性末端側視情況進一步具有例如唾液酸、平分型N-乙醯基葡糖胺或諸如此類之結構。 根據本發明方法,通常僅少量岩藻糖納入人類化、嵌合或飾面SG16.17或SG16.45抗體之複合N-醣苷連接之糖鏈中。舉例而言,在多個實施例中,少於60%、少於50%、少於40%、少於30%、少於20%、少於15%、少於10%、少於5%或少於3%之抗體分子具有岩藻糖之核心岩藻醣基化。在一些實施例中,約2%之抗體分子具有岩藻糖之核心岩藻醣基化。 在某些實施例中,僅少量岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之代謝物或產物)納入複合N-醣苷連接之糖鏈中。舉例而言,在多個實施例中,少於約60%、少於約50%、少於約40%、少於約30%、少於約20%、少於約15%、少於約10%、少於約5%或少於約3%之人類化、嵌合或飾面SG16.17或SG16.45抗體具有岩藻糖類似物或岩藻糖類似物之代謝物或產物之核心岩藻醣基化。在一些實施例中,約2%之人類化、嵌合或飾面SG16.17抗體具有岩藻糖類似物或岩藻糖類似物之代謝物或產物之核心岩藻醣基化。 藉由用岩藻糖類似物培育產生抗體之細胞來製備非岩藻糖基化抗體之方法闡述於例如WO2009/135181中。簡言之,在岩藻糖類似物或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物之存在下培育已經工程化以表現人類化、嵌合或飾面SG16.17抗體之細胞。細胞內代謝物可為例如GDP修飾之類似物或完全或部分去酯化類似物。產物可為例如完全或部分去酯化類似物。在一些實施例中,岩藻糖類似物可抑制岩藻糖再利用路徑中之酶。舉例而言,岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物)可抑制岩藻糖激酶(fucokinase)或GDP-岩藻糖-焦磷酸化酶之活性。在一些實施例中,岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物)抑制岩藻糖基轉移酶(較佳1,6-岩藻糖基轉移酶,例如FUT8蛋白質)。在一些實施例中,岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物)可抑制岩藻糖之重新合成路徑中之酶之活性。舉例而言,岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物)可抑制GDP-甘露糖4,6-去水酶及/或GDP-岩藻糖合成酶之活性。在一些實施例中,岩藻糖類似物(或岩藻糖類似物之細胞內代謝物或產物)可抑制岩藻糖運輸蛋白(例如,GDP-岩藻糖運輸蛋白)。 在一個實施例中,岩藻糖類似物係2-氟岩藻糖。使用生長培養基中之岩藻糖類似物及其他岩藻糖類似物之方法揭示於例如WO/2009/135181中,其係以引用方式併入本文中。 用於工程化細胞系以降低核心岩藻醣基化之其他方法包括基因剔除、基因敲入及RNA干擾(RNAi)。在基因剔除中,使編碼FUT8 (α 1,6-岩藻糖基轉移酶)之基因不活化。FUT8催化將岩藻糖基殘基自GDP-岩藻糖轉移至N-聚醣之Asn連接(N-連接) GlcNac之位置6。報導FUT8係唯一負責將岩藻糖添加至Asn297之N-連接二天線碳水化合物之酶。基因敲入添加編碼酶(例如GNTIII或高爾基體α甘露糖苷酶II)之基因。細胞中該等酶之含量增加使單株抗體自岩藻醣基化路徑轉向(導致核心岩藻醣基化減少),且具有增加量之平分型N-乙醯基葡糖胺。RNAi通常亦靶向FUT8基因表現,導致降低mRNA轉錄物含量或完全敲除基因表現。該等方法中之任一者可用於生成能產生非岩藻糖基化抗體(例如人類化、嵌合或飾面SG16.17抗體)之細胞系。 可使用多種方法測定抗體上之岩藻醣基化之量。方法包括例如經由PLRP-S層析之LC-MS及電噴霧離子化四極TOF MS。 IV.
核酸
本發明進一步提供編碼上文所述人類化重鏈及輕鏈中之任一者之核酸。通常,核酸亦編碼融合至成熟重鏈及輕鏈之信號肽。核酸上之編碼序列可與調節序列可操作連接以確保編碼序列(例如啟動子、增強子、核糖體結合位點、轉錄終止信號及諸如此類)之表現。編碼重鏈及輕鏈之核酸可以經分離形式存在或可選殖至一或多個載體中。核酸可藉由例如固態合成或重疊寡核苷酸之PCR來合成。編碼重鏈及輕鏈之核酸可例如在表現載體內接合為一個鄰接核酸,或可分開,例如各自選殖至其自有表現載體中。 V.
抗體藥物偶聯物
抗MCMA抗體可偶聯至細胞毒性部分以形成抗體-藥物偶聯物(ADC)。用於偶聯至抗體之尤其適宜部分係細胞毒性劑(例如,化學治療劑)、前藥轉化酶、放射性同位素或化合物或毒素(該等部分被統稱為治療劑或藥物)。舉例而言,抗BCMA抗體可偶聯至細胞毒性劑,例如化學治療劑或毒素(例如,細胞生長抑制或殺細胞劑,例如相思子素、蓖麻毒蛋白A、假單胞菌屬(pseudomonas)外毒素或白喉毒素)。可用細胞毒性劑類別之實例包括例如DNA小溝黏合劑、DNA烷基化劑及微管蛋白抑制劑。實例性細胞毒性劑包括例如奧裡斯他汀(auristatin)、喜樹鹼(camptothecin)、多卡米星(duocarmycin)、依託泊苷(etoposide)、美登素(maytansine)及類美登素(maytansinoid,例如,DM1及DM4)、紫杉烷、苯并二氮呯(例如,吡咯并[1,4]苯并二氮呯(PBD)、吲哚啉基苯并二氮呯及噁唑啶基苯并二氮呯)及長春花生物鹼。用於將治療劑偶聯至蛋白質、且尤其偶聯至抗體之技術眾所周知。(例如,參見Alley等人,
Current Opinion in Chemical Biology
2010 14:1-9;Senter,
Cancer J
., 2008, 14(3):154-169。) 治療劑(例如,細胞毒性劑)可以除非其自抗體脫離(例如,藉由水解、藉由抗體降解或藉由裂解劑)否則降低抗體活性之方式偶聯至抗體。該治療劑可經由連接體附接至抗體。偶聯至連接體之治療劑在本文中亦稱為藥物連接體。連接體之性質可廣泛變化。構成連接體之組分可基於其特徵來選擇,此可部分取決於將偶聯物遞送至其之位點之條件。 治療劑可經對表現抗BCMA之癌細胞之細胞內環境中之裂解敏感但對細胞外環境顯著不敏感之可裂解連接體附接至抗體,使得偶聯物在其由表現抗BCMA之癌細胞內化(例如,在胞內體中,或例如由於pH敏感性或蛋白酶敏感性,在溶酶體環境中或在胞膜窖環境中)時自抗體裂解。治療劑亦可以不可裂解連接體附接至抗體。 如所指示,連接體可包含可裂解單元。在一些所述實施例中,可裂解單元之結構及/或序列經選擇使得其由存在於靶位點(例如,靶細胞)之酶的作用而被裂解。在其他實施例中,亦可使用可藉由pH變化(例如酸或鹼不穩定)、溫度或在輻照後(例如光不穩定)裂解之可裂解單元。 在一些實施例中,可裂解單元可包含一個胺基酸或胺基酸之鄰接序列。胺基酸序列可為酶之靶受質。 在一些態樣中,可裂解單元係肽基單元且長為至少兩個胺基酸。裂解劑可包括細胞自溶酶B及D及胞漿素(例如,參見Dubowchik及Walker, 1999,
Pharm
.
Therapeutics
83:67-123)。更典型者係可藉由存在於表現抗BCMA之細胞中之酶裂解之可裂解單元,即酶可裂解連接體。因此,連接體可藉由細胞內肽酶或蛋白酶(包括溶酶體或胞內體蛋白酶)裂解。舉例而言,可使用可藉由在癌性組織中大量表現之硫醇依賴性蛋白酶細胞自溶酶-B裂解之連接體(例如,包含Phe-Leu或Val-Cit肽或Val-Ala肽之連接體)。 在一些實施例中,連接體將包含可裂解單元(例如,肽基單元)且可裂解單元將直接偶聯至治療劑。在其他實施例中,可裂解單元將經由額外功能性單元(例如自消性間隔體單元或非自消性間隔體單元)偶聯至治療劑。非自消性間隔體單元係其中一部分或全部間隔體單元在可裂解單元(例如胺基酸)自抗體藥物偶聯物裂解後仍保持結合至藥物單元之間隔體單元。為釋放藥物,在靶細胞內發生獨立水解反應以自藥物裂解間隔體單元。 使用自消性間隔體單元,無需藥物之單獨水解步驟即可釋放藥物。在一個實施例中,其中連接體包含可裂解單元及自消性基團,可裂解單元可藉由酶作用裂解,且在可裂解單元裂解後,自消性基團釋放治療劑。在一些實施例中,連接體之可裂解單元將在一端直接或間接偶聯至治療劑且在另一端將直接或間接偶聯至抗體。在一些所述實施例中,可裂解單元將在一端直接或間接(例如,經由自消性或非自消性間隔體單元)偶聯至治療劑且在另一端將經由延伸體單元偶聯至抗體。延伸體單元將抗體連接至藥物其餘部分及/或藥物連接體。在一個實施例中,抗體與藥物其餘部分或藥物連接體之連接係經由馬來醯亞胺基團、例如經由馬來醯亞胺基己醯基連接體進行。在一些實施例中,抗體將經由二硫化物連接至藥物,例如二硫化物連接之類美登素偶聯物SPDB-DM4及SPP-DM1。 抗體與連接體之間之連接可經由多種不同途徑(例如經由硫醚鍵、經由二硫鍵、經由醯胺鍵或經由酯鍵)來進行。在一個實施例中,抗BCMA抗體與連接體之間之連接係在抗體之半胱胺酸殘基之硫醇基團與連接體之馬來醯亞胺之間形成。在一些實施例中,在與連接體之官能基反應之前,抗體之鏈間鍵轉化為游離硫醇基團。在一些實施例中,將半胱胺酸殘基引入抗體重鏈或輕鏈中並與連接體反應。藉由抗體重鏈或輕鏈中之取代插入半胱胺酸之位置包括闡述於以下文獻中之彼等:已公開美國申請案第2007-0092940號及國際專利公開案WO2008070593,其各自以全文且出於所有目的以引用方式併入本文中。 在一些實施例中,抗體-藥物偶聯物具有下式I: L - (LU-D)
p
(I) 其中L係抗BCMA抗體,LU係連接體單元且D係藥物單元(即,治療劑)。下標p在1至20範圍內。該等偶聯物包含經由連接體共價連接至至少一種藥物之抗BCMA抗體。連接體單元在一端連接至抗體且在另一端連接至藥物。 載藥量表示為p,即每抗體之藥物分子數。載藥量可在1至20個藥物單元(D)/抗體範圍內。在一些態樣中,下標p將在1至20範圍內(即,1至20之整數及非整數值二者)。在一些態樣中,下標p將為1至20之整數,且將表示單一抗體上之藥物-連接體數。在其他態樣中,p表示每抗體之藥物-連接體分子之平均數,例如反應混合物或組合物(例如,醫藥組合物)中每抗體之藥物-連接體之平均數,且可為整數或非整數值。因此,在一些態樣中,對於組合物(例如,醫藥組合物),p代表組合物中抗體-藥物偶聯物之平均載藥量,且p在1至20範圍內。 在一些實施例中,p為約1至約8個藥物/抗體。在一些實施例中,p為1。在一些實施例中,p為2。在一些實施例中,p為約2至約8個藥物/抗體。在一些實施例中,p為約2至約6、2至約5、或2至約4個藥物/抗體。在一些實施例中,p為約2、約4、約6或約8個藥物/抗體。 來自偶聯反應之製劑中每個抗體單元之藥物平均數可藉由習用方式來表徵,例如質譜術、ELISA分析、HIC及HPLC。亦可測定以p表示之偶聯物之定量分佈。 實例性抗體-藥物偶聯物包括基於奧裡斯他汀之抗體-藥物偶聯物,即其中藥物組分係奧裡斯他汀藥物之偶聯物。奧裡斯他汀結合微管蛋白,已顯示可干擾微管動力學及細胞核及細胞分裂,且具有抗癌活性。通常,基於奧裡斯他汀之抗體-藥物偶聯物包含奧裡斯他汀藥物與抗BCMA抗體之間之連接體。奧裡斯他汀可在適於偶聯至連接體之任一位置連接至抗BCMA抗體。連接體可為例如可裂解連接體(例如,肽基連接體)或不可裂解連接體(例如,藉由抗體降解而釋放之連接體)。奧裡斯他汀可為奧裡斯他汀E或其衍生物。奧裡斯他汀可為(例如)在奧裡斯他汀E與酮酸之間形成之酯。例如,可使奧裡斯他汀E與對乙醯基苯甲酸或苯甲醯基戊酸反應以分別產生AEB及AEVB。其他典型奧裡斯他汀包括MMAF (單甲基奧裡斯他汀F)及MMAE (單甲基奧裡斯他汀E)。實例性奧裡斯他汀之合成及結構闡述於美國公開案第7,659,241號、第7,498,298號、第2009-0111756號、第2009-0018086號及第7,968,687號中,其各自以其全文且出於所有目的以引用方式併入本文中。 實例性基於奧裡斯他汀之抗體-藥物偶聯物包括如下文所示之vcMMAE、vcMMAF及mcMMAF抗體-藥物偶聯物,其中Ab係如本文所述之抗體且val-cit代表纈胺酸-瓜胺酸二肽:
Ab-vcMMAE
Ab-vcMMAF
Ab-mcMMAF 或其醫藥上可接受之鹽。載藥量表示為p,即每抗體之藥物-連接體分子數。端視情況,p可表示每抗體之藥物-連接體分子之平均數,亦稱為平均載藥量。變量p在1至20範圍內且較佳為1至8。在一些較佳實施例中,在p表示平均載藥量時,p在約2至約5範圍內。在一些實施例中,p為約2、約3、約4或約5。在一些態樣中,抗體經由半胱胺酸殘基之硫原子偶聯至連接體。在一些態樣中,半胱胺酸殘基係工程化至抗體中之殘基。在其他態樣中,半胱胺酸殘基係鏈間二硫化物半胱胺酸殘基。 實例性抗體-藥物偶聯物包括基於PBD之抗體-藥物偶聯物;即其中藥物組分係PBD藥物之抗體-藥物偶聯物。 PBD具有以下通用結構:
。 其不同之處在於其芳香族A環及吡咯并C環中取代基之數目、類型及位置以及C環之飽和度。在B環中在N10-C11位置存在亞胺(N=C)、甲醇胺(NH-CH(OH))或甲醇胺甲醚(NH-CH(OMe)),該位置係負責烷基化DNA之親電子中心。所有已知天然產物皆在手性C11a位置具有(S)構形,此使其在自C環朝向A環觀看時具有右撚。此使其具有對於等螺旋性適當之具有B型DNA小溝之三維形狀,從而在結合位點導致適貼配合。PBD在小溝中形成加成物之能力使得其能干擾DNA處理,因此使得其能用作抗腫瘤劑。 該等分子之生物活性可藉由將兩個PBD單元藉助其C8/C’-羥基官能基經由撓性伸烷基連接體接合在一起來強化。認為PBD二聚體可形成序列選擇性DNA損傷,例如復發性5’-Pu-GATC-Py-3’鏈間交聯,認為該鏈間交聯主要負責其生物活性。 在一些實施例中,基於PBD之抗體-藥物偶聯物包含連接至抗BCMA抗體之PBD二聚體。形成PBD二聚體之單體可相同或不同,即對稱或不對稱。PBD二聚體可在適於偶聯至連接體之任一位置連接至抗BCMA抗體。舉例而言,在一些實施例中,PBD二聚體將具有在C2位置之取代基,其為將化合物連接至抗BCMA抗體提供錨。在替代實施例中,PBD二聚體之N10位置將為將化合物連接至抗BCMA抗體提供錨。 通常,基於PBD之抗體-藥物偶聯物包含PBD藥物與抗BCMA抗體之間之連接體。連接體可包含可裂解單元(例如,胺基酸或胺基酸之鄰接序列,其係酶之靶受質)或不可裂解連接體(例如,藉由抗體降解而釋放之連接體)。連接體可進一步包含用於連接至抗體之馬來醯亞胺基團,例如馬來醯亞胺基己醯基。在一些實施例中,連接體可進一步包含自消性基團,例如對胺基苄醇(PAB)單元。 用作偶聯物之實例性PBD闡述於國際申請案第WO 2011/130613號中且如下所示,其中波形線指示附接至連接體之位點:
或其醫藥上可接受之鹽。實例性連接體如下所示,其中波形線指示附接至藥物之位點,且抗體係經由馬來醯亞胺基團連接。
。 實例性基於PBD之抗體-藥物偶聯物包括如下所示之抗體-藥物偶聯物,其中Ab係如本文所述之抗體:
或其醫藥上可接受之鹽。載藥量表示為p,即每抗體之藥物-連接體分子數。端視情況,p可表示每抗體之藥物-連接體分子之平均數,亦稱為平均載藥量。變量p在1至20範圍內且較佳為1至8。在一些較佳實施例中,在p表示平均載藥量時,p在約2至約5範圍內。在一些實施例中,p為約2、約3、約4或約5。在一些態樣中,抗體經由工程化至抗體中之半胱胺酸殘基之硫原子偶聯至藥物連接體。在一些態樣中,半胱胺酸殘基在位置239工程化至抗體中(IgG1),如藉由EU索引所確定(Kabat,
Sequences of Proteins of Immunological Interest
(國立衛生研究院, Bethesda, MD, 1987及1991))。 VI.
免疫病症或表現 BCMA 之癌症之動物模型
可在免疫病症或表現BCMA之癌症之動物模型中測試或驗證抗BCMA抗體或衍生物。全身性及器官特異性自體免疫疾病(包括糖尿病、狼瘡、全身性硬化、薛格連氏症候群、實驗性自體免疫腦脊髓炎(多發性硬化)、甲狀腺炎、重症肌無力、關節炎、眼色素層炎、發炎性腸病)之動物模型之實例已闡述於以下文獻中:Bigazzi, 「Animal Models of Autoimmunity: Spontaneous and Induced」,The Autoimmune Diseases (Rose及Mackay編輯,Academic Press, 1998)及「Animal Models for Autoimmune and Inflammatory Disease」,Current Protocols in Immunology (Coligan等人編輯,Wiley and Sons, 1997)。 過敏性病況(例如氣喘及皮膚炎)亦可在齧齒類動物中建模。氣道過敏性可在小鼠中藉由卵白蛋白(Tomkinson等人,2001, J. Immunol. 166:5792-800)或曼森氏住血吸蟲(Schistosoma mansoni)卵抗原(Tesciuba等人,2001, J. Immunol. 167:1996-2003)誘導。小鼠之Nc/Nga品系顯示血清IgE之顯著增加且自發發展異位性皮膚炎樣病灶(Vestergaard等人,2000, Mol. Med. Today 6:209-10;Watanabe等人,1997, Int. Immunol. 9:461-66;Saskawa等人,2001, Int. Arch. Allergy Immunol. 126:239-47)。 將免疫勝任之供體淋巴球注射至經致死輻照之組織不相容宿主中係在小鼠中誘導GVHD之古典方法。或者,親代B6D2F1鼠類模型提供系統以誘導急性及慢性GVHD二者。在此模型中,B6D2F1小鼠係來自C57BL/6及DBA/2小鼠之親代品系之間之雜交之F1後代。將DBA/2淋巴樣細胞轉移至未經輻照之B6D2F1小鼠引起慢性GVHD,而轉移C57BL/6、C57BL/10或B10.D2淋巴樣細胞引起急性GVHD (Slayback等人,2000, Bone Marrow Transpl. 26:931-938;Kataoka等人,2001, Immunology 103:310-318)。 另外,可將人類造血幹細胞及成熟末梢血淋巴樣細胞植入SCID小鼠中,且該等人類淋巴造血細胞在SCID小鼠中保持功能(McCune等人,1988, Science 241:1632-1639;Kamel-Reid及Dick, 1988, Science 242:1706-1709;Mosier等人,1988, Nature 335:256-259)。此提供小型動物模型系統用於直接測試對人類淋巴樣細胞之潛在治療劑。(例如,參見Tournoy等人,2001, J. Immunol. 166:6982-6991)。 此外,可藉由將表現BCMA之人類腫瘤細胞系植入適當免疫缺陷齧齒類動物品系(例如,無胸腺裸小鼠或SCID小鼠)中來創建小型動物模型以檢查抗BCMA抗體或衍生物之活體內功效。表現BCMA之人類淋巴瘤細胞系之實例包括例如Daudi (Ghetie等人,1994, Blood 83:1329-36;Ghetie等人,1990, Int. J. Cancer 15:481-85;de Mont等人,2001, Cancer Res. 61:7654-59)、Ramos (Ma等人,2002, Leukemia 16:60-6;Press等人,2001, Blood 98:2535-43)、HS-Sultan (Cattan及Maung, 1996, Cancer Chemother. Pharmacol. 38:548-52;Cattan及Douglas, 1994, Leuk. Res. 18:513-22)、Raji (Ochakovskaya等人,2001, Clin. Cancer Res. 7:1505-10;Breisto等人,1999, Cancer Res. 59:2944-49)及CA46 (Kreitman等人,1999, Int. J. Cancer 81:148-55)。表現BCMA之霍奇金氏淋巴瘤譜系之非限制性實例係L540cy (Barth等人,2000, Blood 95:3909-14;Wahl等人,2002, Cancer Res. 62:3736-42)。表現BCMA之人類腎細胞癌細胞系之非限制性實例包括786-O (Ananth等人,1999, Cancer Res. 59:2210-16;Datta等人,2001, Cancer Res. 61:1768-75)、ACHN (Hara等人,2001, J. Urol. 166:2491-94;Miyake等人,2002, J. Urol. 167:2203-08)、Caki-1 (Prewett等人,1998, Clin. Cancer Res. 4:2957-66;Shi及Siemann, 2002, Br. J. Cancer 87:119-26)及Caki-2 (Zellweger等人,2001, Neoplasia 3:360-67)。表現BCMA之鼻咽癌細胞系之非限制性實例包括C15及C17 (Busson等人,1988, Int. J. Cancer 42:599-606;Bernheim等人,1993, Cancer Genet. Cytogenet. 66:11-5)。表現BCMA之人類神經膠質瘤細胞系之非限制性實例包括U373 (Palma等人,2000, Br. J. Cancer 82:480-7)及U87MG (Johns等人,2002, Int. J. Cancer 98:398-408)。該等腫瘤細胞系可作為實體腫瘤藉由皮下注射或作為播散性腫瘤藉由靜脈內注射在免疫缺陷齧齒類動物宿主中建立。在宿主內建立後,可將該等腫瘤模型應用於評估如本文所述之抗BCMA抗體或衍生物對調節活體內腫瘤生長之治療功效。 VII.
治療應用
本發明抗BCMA抗體可用於治療癌症。一些該等癌症顯示在蛋白質(例如,藉由免疫分析使用所例示抗體之一)或mRNA層面上量測之可檢測含量之BCMA。一些該等癌症顯示相對於相同類型、較佳來自相同患者之非癌性組織含量升高之BCMA。適於治療之癌細胞上之BCMA之實例性含量係5000-150000個BCMA分子/細胞,但可治療更高或更低含量。視情況,癌症中之BCMA含量係在實施治療前量測。 可用本發明抗體治療之癌症包括實體腫瘤及血液癌症,例如白血病及淋巴瘤。該等抗體尤其適用於B細胞之癌症。可用該等抗體治療之癌症的實例包括:成人及兒童急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、急性淋巴球性白血病(ALL)、慢性淋巴球性白血病(CLL)及繼發性白血病;非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)及霍奇金氏病;骨髓發育不良症候群(MDS)、骨髓增生性症候群(MPS)、多發性骨髓瘤、華氏巨球蛋白血症或柏基特淋巴瘤、惡性漿細胞瘤、BCMA+高惡性度淋巴瘤、卡勒氏病(Kahler's disease)及骨髓瘤病;漿細胞白血病;漿細胞瘤;B細胞幼淋巴球性白血病;毛細胞白血病;濾泡性淋巴瘤(包括濾泡性非霍奇金氏淋巴瘤類型);柏基特淋巴瘤(地方性柏基特淋巴瘤;散發性柏基特淋巴瘤);邊緣區淋巴瘤(黏膜相關淋巴樣組織;MALT 1 MALToma;單核細胞樣B細胞淋巴瘤;具有伴絨毛淋巴球之脾淋巴瘤);外套細胞淋巴瘤;大細胞淋巴瘤(瀰漫性大細胞;瀰漫性混合細胞;免疫母細胞淋巴瘤;原發性縱膈B細胞淋巴瘤;血管中心性淋巴瘤肺B細胞);小淋巴球性淋巴瘤(SLL);前體B-淋巴母細胞性淋巴瘤;骨髓性白血病(顆粒球;骨髓性;急性骨髓性白血病;慢性骨髓性白血病;亞急性骨髓性白血病;骨髓性肉瘤;綠色瘤;顆粒球型肉瘤;急性前骨髓細胞性白血病;急性骨髓單核球性白血病);瓦登斯特隆巨球蛋白血症(Waldenstrom's macroglobulinemia)或其他B細胞白血病或淋巴瘤。 本發明抗體亦可用於由表現BCMA之免疫細胞介導之免疫病症、尤其B細胞介導病症。該等疾病之實例包括類風濕性關節炎、全身性紅斑狼瘡(SLE)、I型糖尿病、氣喘、異位性皮膚炎、過敏性鼻炎、血小板減少紫斑症、多發性硬化、牛皮癬、薛格連氏症候群、橋本氏甲狀腺炎、格雷氏病、原發性膽汁性肝硬化、韋格納肉芽腫、結核症及移植物抗宿主病、免疫介導之血小板減少症、溶血性貧血、大皰性類天皰瘡、重症肌無力、格雷氏病(Graves' disease)、艾迪森氏病(Addison's disease)、落葉型天皰瘡、牛皮癬、牛皮癬關節炎及關節黏連性脊椎炎。 單獨的或作為其藥物偶聯物之抗BCMA抗體係以延遲癌症之至少一個體徵或症狀之發作、降低其嚴重性、抑制其進一步劣化及/或加以改善之有效方案(意指劑量、投與途徑及投與頻率)投與。若患者已患有癌症,則該方案可稱為治療有效方案。若患者相對於一般群體具有升高之癌症風險但尚未經歷症狀,則該方案可稱為預防有效方案。在一些情況下,治療或預防效能可在個別患者中相對於歷史對照或相同患者之過去經歷而觀察到。在其他情況下,治療或預防效能可在經治療患者群體之臨床前或臨床試驗中相對於未經治療患者之對照群體來證實。 單株抗體之實例性劑量係0.1 mg/kg至50 mg/kg患者體重,更通常1 mg/kg至30 mg/kg、1 mg/kg至20 mg/kg、1 mg/kg至15 mg/kg、1 mg/kg至12 mg/kg、或1 mg/kg至10 mg/kg、或2 mg/kg至30 mg/kg、2 mg/kg至20 mg/kg、2 mg/kg至15 mg/kg、2 mg/kg至12 mg/kg、或2 mg/kg至10 mg/kg、或3 mg/kg至30 mg/kg、3 mg/kg至20 mg/kg、3 mg/kg至15 mg/kg、3 mg/kg至12 mg/kg、或3 mg/kg至10 mg/kg。作為固定劑量,其活性單株抗體-藥物偶聯物(例如奧裡斯他汀)之實例性劑量係1 mg/kg至7.5 mg/kg、或2 mg/kg至7.5 mg/kg或3 mg/kg至7.5 mg/kg個體體重,或0.1-20或0.5-5 mg/kg體重(例如,0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10 mg/kg)或10-1500或200-1500 mg。其高活性單株抗體-藥物偶聯物(例如PBD)之實例性劑量係1.0 µg/kg至1.0 mg/kg、或1.0 µg/kg至500.0 µg/kg個體體重。在一些方法中,隨後每兩週、每三週或每四週向患者投與抗體或ADC。除其他因素外,劑量尤其取決於投與頻率、患者之狀況及對先前治療(若存在)之反應、治療係預防性抑或治療性、及病症係急性抑或慢性。 投與可為非經腸、靜脈內、經口、皮下、動脈內、顱內、鞘內、腹膜內、局部、鼻內或肌內。投與亦可直接集中於腫瘤中。藉由靜脈內或皮下投與來投與至體循環中較佳。靜脈內投與可例如藉由經例如30-90 min時段輸注或藉由單次濃注注射來實施。 除其他因素外,投與頻率尤其取決於抗體或抗體-藥物偶聯物在循環中之半衰期、患者之狀況及投與途徑。頻率可為每天、每週、每月、每季或因應患者狀況或所治療癌症之進展以不規律間隔投與。靜脈內投與之實例性頻率介於在連續療程期間一週兩次與每季之間,但較高或較低頻率之給藥亦係可能的。靜脈內投與之其他實例性頻率介於在連續療程期間每週一次或每月一次之間,但較高或較低頻率之給藥亦係可能的。對於皮下投與,實例性給藥頻率係每天至每月,但較高或較低頻率之給藥亦係可能的。 所投與劑量數取決於癌症或自體免疫疾病之性質(例如,呈現急性抑或慢性症狀)及病症對治療之反應。對於急性病症或慢性病症之急性惡化,介於1次劑量與10次劑量之間通常足夠。有時視情況呈分開形式之單次濃注劑量對於急性病症或慢性病症之急性惡化係足夠的。對於急性病症或急性惡化之復發可重複治療。對於慢性病症,抗體可以規律間隔投與,例如每週、每兩週、每月、每季、每六個月,持續至少1、5或10年或患者之生命。 非經腸投與之醫藥組合物較佳無菌且實質上等滲且在GMP條件下製造。醫藥組合物可以單位劑型(即,用於單次投與之劑量)提供。醫藥組合物可使用一或多種生理上可接受之載劑、稀釋劑、賦形劑或輔助劑來調配。調配取決於所選投與途徑。對於注射,抗體可在水溶液中、較佳在生理相容緩衝液(例如漢克氏溶液(Hank’s solution)、林格氏溶液(Ringer’s solution)或生理鹽水或乙酸鹽緩衝液)中調配(以降低注射部位的不適感)。溶液可含有調配劑,例如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑。或者,抗體可呈凍乾形式用於在使用前用適宜媒劑(例如無菌無熱原水)構成。抗體在液體調配物中之濃度可為例如0.01-10 mg/ml,例如1.0 mg/ml。 用本發明抗體治療可與化學療法、輻射、幹細胞治療、手術或針對所治療病症有效之其他治療組合。可與針對BCMA之抗體一起投與之其他藥劑之有用類別包括例如針對癌細胞上表現之其他受體之抗體、抗微管蛋白劑(例如,奧裡斯他汀)、DNA小溝黏合劑(例如,PBD)、DNA複製抑制劑、烷基化劑(例如,鉑錯合物,例如順鉑、單(鉑)、雙(鉑)及三核鉑錯合物及卡鉑)、蒽環、抗生素、抗葉酸劑、抗代謝物、化學療法敏化劑、多卡米星、依託泊苷、氟化嘧啶、離子載體、來西托辛(lexitropsin)、亞硝基脲、鉑帝爾(platinol)、預成型化合物、嘌呤抗代謝物、嘌呤黴素、輻射敏化劑、類固醇、紫杉烷、拓樸異構酶抑制劑、長春花生物鹼及諸如此類。剛剛提及之用於癌症之相同其他治療亦可用於免疫介導病症。用於免疫介導病症之其他藥劑包括免疫抑制劑,例如肥胖細胞去粒化抑制劑、抗組織胺、皮質類固醇、NSAID、硫唑嘌呤、環磷醯胺、瘤克寧(leukeran)及環孢素;及生物抗炎劑,例如Tysabri®或Humira®。 與不使用抗BCMA抗體之相同治療(例如,化學療法)相比,視情況與上述任何其他藥劑或方案組合之使用單獨或作為抗體-藥物偶聯物之抗BCMA抗體之治療可將癌症患者(尤其在復發或難治時)之中值無進展存活或總體存活時間增加至少30%或40%,但較佳50%、60%至70%或甚至100%或更長。另外或或者,與不使用抗BCMA抗體之相同治療(例如,化學療法)相比,包括單獨或作為抗體-藥物偶聯物之抗BCMA抗體之治療(例如,標準化學療法)可將腫瘤患者之完全反應率、部分反應率或客觀反應率(完全+部分)增加至少30%或40%,但較佳50%、60%至70%或甚至100%。 通常,在臨床試驗(例如,II期、II/III期或III期試驗)中,相對於僅接受標準療法(或加安慰劑)之患者之對照組,經標準療法加抗BCMA抗體治療之患者之上文所提及之中值無進展存活及/或反應率之增加在統計學上顯著,例如在p = 0.05或0.01或甚至0.001程度。完全及部分反應率係藉由癌症臨床試驗中常用之客觀準則來測定,例如如國家癌症研究院及/或食品藥品管理局所列示或認可之客觀準則。 VIII.
其他應用
本文所揭示之抗BCMA抗體可用於在臨床診斷或治療情況下或研究中檢測BCMA。癌症中BCMA之表現提供指示,該癌症適於用本發明抗體來治療。抗體亦可作為研究試劑來出售,用於實驗室研究中檢測攜帶BCMA之細胞及其對各種刺激之反應。在該等應用中,單株抗體可經螢光分子、自旋標記分子、酶或放射性同型標記,且可以含有實施BCMA分析之所有所需試劑之套組形式來提供。抗體亦可用於例如藉由親和層析純化BCMA蛋白。 除非另有明確指示,否則本發明之任何特徵、步驟、要素、實施例或態樣可與任何其他特徵、步驟、要素、實施例或態樣組合使用。儘管已出於清晰理解之目的藉助闡釋及實例略微詳細地闡述了本發明,但顯而易見,可在隨附申請專利範圍之範疇內實踐某些變化及修改。
實例 實例 1 :抗體研發 重組體 BCMA 細胞外結構域 (BCMA ECD) 之製備
人類(胺基酸1-51)及小鼠BCMA (胺基酸1-46)之細胞外結構域(ECD)經選殖並表現為GST融合蛋白(pGEX4T1;Amersham Biosciences)。純化BCMA ECD係藉由用麩胱甘肽-瓊脂糖捕獲BCMA融合蛋白且藉由用凝血酶進行蛋白酶消化釋放BCMA ECD來獲得。隨後藉由苯甲脒瓊脂糖移除凝血酶。
惡性 B 細胞系上 BCMA 表現之鑑別
使用Vicky-1對多發性骨髓瘤細胞系實施定量流式細胞術,該Vicky-1係針對BCMA之市售抗體(Alexis Biotechnology)。結果顯示,BCMA在所測試骨髓瘤系中普遍存在。NCI H929顯示針對BCMA之陽性細胞表面染色,但缺少BR3或TACI之表現。由於NCI H929表現BCMA但不表現BR3或TACI,故其可用於BCMA雜交瘤之基於細胞之篩選。
經轉染 BCMA 細胞系之研發 .
藉由用全長BCMA純系或空載體轉染HEK 293細胞來研發穩定細胞系。流式細胞術確認BCMA在BCMA轉染(293: BCMA)而非載體空對照質體(293: 載體)之表面上之陽性表現。隨後使用該等細胞系作為工具確認經選殖BCMA抗體之特異性。
實例 2 :未經選殖雜交瘤孔之免疫及篩選 抗血清之免疫及篩選
本發明免疫策略使用BCMA ECD之胺基酸1-50,使得抗體可靶向配體結合結構域內部及外部之表位(圖1A及1B)。KLH偶聯之BCMA ECD係自商業來源(Alexis Biochemicals)生成。用KLH偶聯之BCMA使用Titermax佐劑對大鼠進行免疫,直至藉由ELISA檢測到最大免疫反應為止。在基於板之分析中亦針對阻斷APRIL結合之能力篩選經免疫大鼠血清。選擇大鼠2-3用於融合,此乃因抗血清具有人類BCMA抗體之顯著效價且其顯示穩健阻斷活性。 如所述採集來自大鼠2-3之脾細胞,融合至X-63.Ag8.653.3.12.11小鼠骨髓瘤細胞並加以選擇(Goding, 1989)。藉由ELISA使用純化hBCMA-GST篩選來自所得雜交瘤之培養上清液(見圖2中之流程圖)。鑑別並選擇80個陽性孔用於擴增。藉由擴增後之ELISA,80個陽性孔中的60個孔繼續顯示OD > 0.5。然後在二次分析中針對基於細胞之結合、配體阻斷活性及與小鼠BCMA之交叉反應性篩選該60個未選殖雜交瘤孔。此導致鑑別12個主要BCMA雜交瘤孔。來自該12個主要孔之細胞結合資料及配體阻斷活性歸納於圖3中。雜交瘤孔17顯示代替市售單株Vicky-1 (Alexis Biochemicals)之細胞結合及配體阻斷活性。採用8個孔(在圖3中以紅色星號指示)用於基於其結合BCMA陽性細胞或阻斷配體結合之能力進行選殖。
實例 3 :純系雜交瘤之表徵 細胞結合及配體阻斷活性 .
取雜交瘤孔11、17、20、29、40、45及70經過2輪有限稀釋選殖。自此時起,抗體將以表1中所示之正式純系ID命名。抗體與293:BCMA細胞而非與293:載體對照細胞之特異性結合確認,該等抗體結合至BCMA。
表 1 :正式純系 ID.
使用來自未選殖母孔之上清液、來自經選殖孔之上清液及來自經選殖孔之純化抗體比較新BCMA抗體之配體阻斷活性(圖4)。使用市售抗體作為陽性對照。SG-16.17使用來自經選殖雜交瘤孔之培養上清液給予對APRIL結合之顯著阻斷。在單獨實驗中使用純化SG16.17及市售抗體實施對APRIL結合之SG16.17阻斷之滴定(圖5)。在與市售抗體相比時,純化SG16.17在類似濃度之間顯示改良阻斷活性。SG-16.45顯示對April結合之劑量依賴性抑制,但並非如同SG-16.17一般強。其餘BCMA抗體(SG-16.11、SG16.20、SG16.29、SG16.40及SG16.70)之配體阻斷活性更弱。某些阻斷性BCMA抗體顯示對APRIL結合之>75%抑制,如使用SG-16.17所觀察。包括SG-16.11、SG-16.20、SG-16.29、SG-16.40及SG-16.70之更「弱」阻斷性抗體顯示對APRIL結合之約30%抑制(圖4)。 亦在純化BCMA抗體之存在及不存在下分析BAFF結合經固定BCMA之能力。用BCMA抗體SG16.17、SG16.40、SG16.20及SG17.70預處理皆導致對BAFF與BCMA之結合之可滴定抑制(圖6)。藉由在抗體處理不存在下使BAFF結合至經固定BCMA來測定相對抑制(圖6,星號)。綜上所述,圖5及6中之資料顯示,BCMA抗體可阻斷APRIL及BAFF與BCMA之配體結合且由此干擾B細胞存活信號。
實例 4 :測試 SG16.17 及 SG16.45 抗體作為 ADC 之 ADCC 及細胞毒性
藉由將大鼠V
H
及V
L
結構域分別融合至野生型人類IgG1重鏈及κ輕鏈恆定結構域中來將SG16.17抗體轉化至大鼠-人類嵌合IgG中。命名為cSG16.17野生型之嵌合抗體在與親代抗體SG16.17相比時顯示類似抗原結合性質。隨後,設置已知可增強ADCC之Fc突變S239D:A330L:I332E以生成cSG16.17突變體。與cSG16.17野生型類似,Fc三重突變體之生成不改變cSG16.17突變體之抗原結合性質。在使用純化天然殺手細胞之ADCC分析中評估cSG16.17野生型及cSG16.17突變體導致JJN3及U266細胞之劑量依賴性溶解,而使用非結合性人類IgG對照未觀察到顯著溶解。cSG16.17野生型抗體顯示對JJN3細胞之有限ADCC活性,cSG16.17突變體使其功效增加約100倍且效能增加>2倍(最大溶解)。類似地,對於U266細胞,與親代嵌合抗體相比,cSG16.17突變體之ADCC活性之功效增強約100倍且效能增強2倍。JJN3及U266細胞二者之最大溶解所需cSG16.17突變體之濃度為約100 pmol/L。與之相比, cSG16.17對JJN3及U266細胞之解離常數(
K D
)分別估計為15 nmol/L及10 nmol/L。因此,在遠低於達到飽和結合所需濃度之濃度下達成藉由cSG16.17突變體之最大溶解。 本發明使用vcMMAF以8個藥物/抗體之化學計量學評價SG16.17及SG16.45作為ADC誘導細胞毒性之能力。SG16.17或SG16.45-vcMMAF8具有針對H929細胞之潛在細胞毒性。使用非結合性對照ADC或未偶聯抗體未觀察到細胞存活率下降。亦檢查SG16.17 ADC在其他MM細胞系(包括JJN3及U266細胞系)中之功效。SG16.17-vcMMAF8在所有三個MM細胞系中顯示恆定高功效(IC
50
值≤130 pmol/L),而SG16.45-vcMMAF8顯示更高可變性及較低總體功效。
實例 5 :測試 SG16.17 抗體與 Fc
γ
RIIIa 之結合及經由 Fc
γ
RIIIa 之信號傳導
對於結合分析,用FcγRIIIa (hCD16)轉染CHO細胞且在與具有野生型IgG1及IgG1 S239D、A330L、I332E基因型之嵌合SG16.17及多種IgG1對照抗體之競爭下量測經標記h00抗體之結合。圖12顯示,嵌合SG16.17較兩種對照抗體利妥昔單抗(rituximab)及cOKT9更強地競爭。SG16.17之突變體形式較野生型IgG1形式更強地競爭。信號傳導分析使用表現BCMA之U266靶細胞、表現FcγRIIIa且經工程化以表現來自NFAT反應元件之螢光素酶報導基因之Jurkat效應細胞及Bio-Glo指示劑。cSG16.17 G1 WT及S239D、A330L、I332E二者皆引發FcγRIIIa信號傳導,且來自S239D、A330L、I332E形式之FcγRIIIa信號傳導更強(圖13)。
實例 6 : SG16.17 之人類化 表 2 : hSG16.17 重鏈變體中之人類化突變 表 3 : hSG16.17 κ 輕鏈變體中之人類化突變 表 4 : hSG16.17 重鏈變體中之特異性框架突變
*大鼠殘基
表 5 : hSG16.17 κ 輕鏈變體中之特異性框架突變
*大鼠殘基 對表現SG16.17之大鼠雜交瘤之大鼠重鏈及輕鏈可變區進行測序。使用HV1-2/HJ3 (SEQ ID NO: 9)或HV1-46/HJ3 (SEQ ID NO: 10)作為重鏈之人類接受體序列且使用KV1-12/KJ5 (SEQ ID NO: 18)作為輕鏈之人類接受體序列。 大鼠供體與人類接受體序列之間不同之位置包括H8、H20、H48、H67、H69、H71、H76、H78、H80、H88、H91、H93、L40、L46、L48、L78、L85及L87。不同人類化重鏈及輕鏈序列中包括該等殘基之不同排列作為回復突變。亦針對用人類接受體序列中之相應殘基替代來測試Kabat CDR中之若干個大鼠殘基。該等殘基之位置係H34、H50、H58、H60、H61、H62、H64及H65以及L24及L53。設計並表現6個人類化重鏈變體及4個人類化輕鏈變體。表2及3指示每一人類化變體鏈中之人類接受體序列、回復突變(供體框架殘基)及CDR取代(接受體CDR殘基)。表4及5指示在每一人類化變體鏈中佔據認為用於回復突變之每一位置之胺基酸。該等表格亦指示與最接近之人類種系序列一致之殘基百分比。根據最新INN導則,盡在重鏈及輕鏈二者中具有與人類種系序列至少85%一致性之抗體可稱為經人類化。圖7-9顯示人類化重鏈可變區與大鼠可變區及人類接受體序列之比對。圖10及11顯示人類化輕鏈可變區與大鼠可變區及人類接受體序列之比對。可變輕鏈之C-末端精胺酸(R)可替代地視為輕鏈恆定區之N-末端精胺酸。 以所有24個可能排列測試6個人類化重鏈及4個人類化輕鏈與NCI-H929細胞上表現之BCMA之結合,該等NCI-H929細胞表現約50,000個BCMA分子/細胞。結果顯示於下表6中。簡言之,所有人類化輕鏈皆顯示良好結合。在人類化重鏈中,變體VH1、VH3及VH5皆顯示與嵌合或大鼠SG16.17抗體相比改良之結合。
表 6 :結合至 NCI-H929 細胞上表現之 BCMA 之人類化抗體 hSG16.17
在全範圍濃度點下進一步測試在NCI-H929分析中表現最佳之人類化抗體(即,含有VH1、VH3或VH5重鏈之彼等)與U266細胞之結合。在此分析中,含有VH1重鏈(不管包括何種人類化輕鏈變體)之人類化抗體顯示相對於大鼠或嵌合SG16.17增強之結合。含有VH3或VH5重鏈(不管包括何種人類化輕鏈變體)之人類化抗體顯示在實驗誤差內與大鼠或嵌合SG16.17結合相同之結合。含有VH2或VH6可變區之人類化抗體(不管包括何種人類化輕鏈變體)顯示相對於大鼠或嵌合SG16.17降低之結合。 亦針對蛋白質表現程度、單體含量及與人類種系之序列一致性百分比來比較在NCI-H929分析中表現最佳之人類化抗體,如下表7中所示。
表 7 :
選擇VH3 VK2人類化抗體作為主要人類化抗體,此係基於其與大鼠及小鼠SG16.17抗體對人類BCMA具有相同結合親和性(在實驗誤差內);在重鏈及輕鏈可變區二者中與人類種系序列之大於85%一致性、良好表現及高單體百分比。
實例 7 : SG16.45 之人類化 表 8 : hSG16.45 重鏈變體中之人類化突變 表 9 : hSG16.45 κ 輕鏈變體中之人類化突變 表 10 : hSG16.45 重鏈變體中之特異性框架突變
*大鼠殘基
表 11 : hSG16.45 κ 輕鏈變體中之特異性框架突變
*大鼠殘基 對表現SG16.45之大鼠雜交瘤之大鼠重鏈及輕鏈可變區進行測序。使用HV3-23/HJ3 (SEQ ID NO: 24)作為重鏈之人類接受體序列且使用KV3-20/KJ2 (SEQ ID NO: 34)作為輕鏈之人類接受體序列。 在大鼠供體與人類接受體序列之間不同之可變區框架位置包括H30、H37、H48、H67、H93、H94及H107以及位置L14、L19、L21、L38、L58、L71及L78。不同人類化重鏈及輕鏈序列中包括該等殘基之不同排列作為回復突變。亦針對用人類接受體序列中之相應殘基替代來測試Kabat CDR中之若干大鼠殘基。該等殘基之位置係H50、H60、L24及L26。設計並表現6個人類化重鏈變體及4個人類化輕鏈變體。表8及9指示每一人類化變體鏈中之人類接受體序列、回復突變(供體框架殘基)及CDR取代(接受體CDR殘基)。表10及11指示在每一人類化變體鏈中佔據認為用於回復突變之每一位置之胺基酸。該等表格亦指示與最接近之人類種系序列一致之殘基之百分比。根據最新INN導則,盡在重鏈及輕鏈二者中與人類種系序列具有至少85%一致性之抗體可稱為經人類化。圖14-17顯示人類化重鏈可變區與大鼠可變區及人類接受體序列之比對。圖18及19顯示輕鏈可變區之比對。可變輕鏈之C-末端精胺酸(R)可替代地視為輕鏈恆定區之N-末端精胺酸。 以所有24種可能排列針對與NCI-H929細胞上表現之BCMA之結合測試6個人類化重鏈及4個人類化輕鏈,該等NCI-H929細胞表現約50,000個BCMA分子/細胞。結果顯示於下表12中。
表 12 :結合至 NCI-H929 細胞上表現之 BCMA 之人類化抗體 hSG16.45
在全範圍濃度點下進一步測試在NCI-H929分析中表現最佳之人類化抗體與U266細胞之結合、以及表現及單體含量、以及與人類種系之序列一致性(表13)。
表 13 :
總體上基於對人類之結合親和性、在重鏈及輕鏈可變區二者中與人類種系序列之序列一致性、良好表現及高單體百分比,VH5 VK2、VH1 VK1及VH1 VK3係最佳抗體。VH1 VK1及VH1 VK3具有略高結合(在實驗誤差內與大鼠或嵌合相同)但與人類種系之序列一致性較低。
實例 8 :減少岩藻糖基化 hSG16.17 或 hSG16.45 抗體之合成
在CHO細胞中表現hSG16.17 VH3 VK2或hSG16.45 VH5 VK2抗體。在抗體產生期間在細胞培養基中包括岩藻醣基化抑制劑2-氟岩藻糖得到非岩藻糖基化抗體。例如,參見Okeley等人,
Proc. Nat’l Acad. Sci.
110:5404-55409 (2013)。用於細胞生長之基礎培養基不含岩藻糖且將2-氟岩藻糖添加至培養基以抑制蛋白質岩藻醣基化。同上。將岩藻糖納入抗體中係藉由LC-MS經由PLRP-S層析及電噴霧離子化四極桿TOF MS來量測。同上。
實例 9 : hSG16.17-SEA 在 SCID 或 NSG 小鼠中之活體內活性
圖20A-C顯示多次投藥之hSG16.17-SEA在SCID小鼠之MM1S播散性腫瘤模型中之活體內活性。在動物中植入MM1S細胞IV,且在植入後9天起始抗體給藥。隨時間跟蹤動物存活。N=8隻動物/組。BCMA拷貝數=7,000,CD38拷貝數= 14,000。A) 1mg/kg每週ip持續5週,B) 3mg/kg每週ip持續5週,及C) 10 mg/kg每週ip持續5週。SCID動物含有效應細胞以介導ADCC及ADCP。此圖中之資料顯示,hSG16.17 SEA改良與達雷木單抗(daratumumab,CD38靶向Ab)相當之存活。非結合性h00對照顯示無活性。 圖21A-C顯示單次投藥之hSG16.17-SEA在NSG小鼠之EJM播散性腫瘤模型中之活體內活性。NSG動物不含NK細胞且含有活性極小之巨噬細胞。在動物中植入EJM細胞IV,且在植入後5天ip給予單一劑量之抗體。隨時間跟蹤動物存活。N=8隻動物/組。BCMA拷貝數=45,000。CD38拷貝數=47,000。CS1拷貝數= 14,000。A) 1mg/kg劑量,B) 3mg/kg劑量,C) 10 mg/kg劑量。此圖中之資料顯示,hSG16.17 SEA增加存活至等於或大於達雷木單抗(CD38靶向Ab)及埃羅妥珠單抗(elotuzumab,CS1靶向Ab)之程度。WT SG16.17亦可誘導存活增加。非結合性h00對照在最高劑量下顯示無活性。由於該等動物中效應細胞極少,WT及SEA hSG16.17抗體之活性可能係由於阻斷APRIL及BAFF增殖信號所致。 圖22顯示多次投藥之hSG16.17-SEA在NSG小鼠之NCI-H929-螢光素酶播散性腫瘤模型中之活體內活性。在NSG動物中植入NCI-H929螢光素酶細胞。在植入後21天在骨髓中觀察到生物發光時起始抗體給藥。每週ip給藥總計5次劑量。N=5隻動物/組。BCMA拷貝數=25,000。CD38拷貝數=45,000。CS1拷貝數= 3,000。與未經治療且首次用於實驗之動物相比較繪製平均發光相對於時間之圖。hSG16.17 SEA顯示與達雷木單抗(CD38靶向Ab)及埃羅妥珠單抗(CS1靶向Ab)相比顯著更佳之活性。在hSG16.17-SEA 10mg/kg組中觀察到之增加之發光係由單一動物驅動。 圖23A及23B顯示單次投藥之hSG16.17-SEA在NSG小鼠之NCI-H929-螢光素酶播散性腫瘤模型中之活體內活性。在NSG動物中植入NCI-H929螢光素酶細胞。在注射後21天在骨髓中觀察到生物發光時起始抗體給藥。IP給藥一次。N=5隻動物/組。A) 3mg/kg WT相對於SEA抗體。B) hSG16.17 SEA之劑量範圍。此圖中之資料顯示,hSG16.17 SEA可在0.3mg/kg單一劑量下具有活性,且hSG16.17SEA之活性可高於其WT (岩藻糖基化)對應體。 圖23A及23B顯示單次投藥之hSG16.17-SEA在NSG小鼠之NCI-H929-螢光素酶播散性腫瘤模型中之活體內活性。在NSG動物中植入NCI-H929螢光素酶細胞。在注射後21天在骨髓中觀察到生物發光時起始抗體給藥。IP給藥一次。N=5隻動物/組。A) 3mg/kg WT相對於SEA抗體。B) hSG16.17 SEA之劑量範圍。此圖中之資料顯示,hSG16.17 SEA可在0.3mg/kg單一劑量下具有活性且hSG16.17SEA之活性可高於其WT (岩藻糖基化)對應體。對發光之效應轉化為延長的動物存活(數據未顯示)。 圖24單次投藥之hSG16.17-SEA在SCID小鼠之MOLP-8-螢光素酶播散性腫瘤模型中之活體內活性。在SCID動物中IV植入MOLP-8螢光素酶細胞。在注射後13天在骨髓中觀察到生物發光時起始抗體給藥。IP給藥一次。N=5隻動物/組。BCMA拷貝數=2,000。繪製發光相對於時間之圖。該等資料顯示,即使僅使用2000個BCMA拷貝,hSG16.17-SEA亦顯示顯著抗腫瘤活性。不結合FcγRII或FcγRIII之去醣基化SEA BCMA抗體顯示無活性,與h00 SEA非結合性對照類似。此揭示Fc介導活性在此模型中之重要性。 圖25 SG16.17 SEA抗體顯示與WT抗體相比在活體外改良之對MM1R靶細胞之ADCC活性。NK細胞係經由負向選擇使用EasySep人類NK細胞富集套組自PBMC分離,且對所得CD16+細胞進行定量。用鉻-51將多發性骨髓瘤MM1R ADCC靶細胞標記1 hr。將一系列抗體稀釋物添加至分析板,之後以13:1 E:T比率添加靶細胞(T)及NK效應細胞(E)。在37℃下4hr後基於總計及自發釋放對照來計算溶解。該等資料顯示無岩藻醣基化SEA SG16.17抗體之ADCC活性相對於WT抗體以及臨床抗體(達雷木單抗及埃羅妥珠單抗)顯著改良。 儘管已出於清晰理解之目的詳細闡述本發明,但在隨附申請專利範圍之範疇內可實踐某些修改。在本申請案中引用之所有出版物(包括登記號、網站及諸如此類)及專利文件係出於所有目的全文以引用方式併入本文中,其併入程度如同各自如此個別指明一般。在序列、網站或其他參考文獻在不同時間可存在不同版本之情形下,意指在有效申請日與該參考文獻相關之版本。有效申請日期意指揭示所述登錄號之最早優先日期。除非上下文另有明確說明,否則本發明之任何要素、實施例、步驟、特徵或態樣可與任何其他要素、實施例、步驟、特徵或態樣組合實施。