TW201043959A - Extraneous agents testing - Google Patents

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TW201043959A TW099116688A TW99116688A TW201043959A TW 201043959 A TW201043959 A TW 201043959A TW 099116688 A TW099116688 A TW 099116688A TW 99116688 A TW99116688 A TW 99116688A TW 201043959 A TW201043959 A TW 201043959A
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Jeroen Kristiaan Medema
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201043959 六、發明說明: c發明戶斤屬之技術領域1 發明領域 本發明屬於製藥工業領域且涉及用於在包含至少一種 活性物質的組合物中測試外來物質的方法,並涉及通過施 行所述方法生產藥物組合物的過程。進一步地,本發明還 涉及多聚核苷酸構建物用於測試待測組合物中活性物質或 任何外來或傳染性物質存在與否的用途。此外,本發明涉 及多聚核苷酸、包含特定多聚核苷酸的多聚核苷酸構建 物,以及包含這些多聚核苷酸或多聚核苷酸構建物的用於 病毒(顯著地涉及流感病毒)抗原製備領域的宿主細胞。還提 供包含這些多聚核苷酸和/或多聚核苷酸構建物的非-人生 物體、轉基因動物或微生物體。進一步地,其涉及對由所 述多聚核苷酸編碼的多肽具有特異性的抗體以及用於生產 所述抗體的方法,還涉及針對多聚核苷酸構建物表達產物 而產生的抗體用於純化活性物質的用途。本發明還針對分 部套盒。 【先前技術3 發明背景 在製藥工業領域,有需要生產無污染物如外來或偶發 物質的組合物,因為這些可能導致不想要的副作用。此需 要在疫苗領域尤其具有挑戰性。不存在外來或偶發物質還 可能是受規章約束的問題。 為保證組合物不含有污染物,可測試各自的組合物是 3 201043959 否含有這些污染物。 通常,這些測試能基於例如檢測組合物中存在的可能 的外來物質,可選地,任選地外來物質在先前已經有擴增。 在此方面,WO 0172964 A2描述了定量PCR方法,其用 於對生物-衍生材料的樣品中活的偶發物質同時進行檢測 和定量。所述方法包括使用定量多聚酶鏈式反應(PCR)測量 樣品中多聚核苷酸的量,在允許物質複製的條件下孵育, 孵育時間段後使用定量PCR測量樣品中多聚核苷酸的量以 及比較孵育時間段前後樣品中存在的多聚核苷酸的量。多 聚核苦酸的量的增加表示樣品中有活的物質。 WO 2007/100397 A2參考對樣品中偶發污染物病毒的 存在與否鑒別和確定,包括將來自樣品的核酸與至少一個 引物對接觸以及通過質譜法確定擴增產物的分子量。 另一個可能性是在偶發物質測試之前中和待測組合物 中存在的活性物質。在中和活性物質之後,將被中和的組 合物加到特定細胞系中,或在動物模型中進行測試。如果 此細胞系顯示出病原性效應,則此組合物含有偶發物質。 在此上下文中’ US 2004/0005546 A1提供用於檢測包 含呼腸孤病毒的組合物中的偶發物質的方法,通過使用特 異性切割呼腸孤病毒基因組的核酶使病毒失活。將編碼此 核酶的質粒引入對呼腸孤病毒感染易感的細胞。轉染的細 胞通過表達此核酶能夠使呼腸孤病毒失活並因此不受該病 毒感染。核酶-表達細胞然後接受含有呼腸孤病毒的組合 物,由呼腸孤病毒製備物引起的任何病原性效應表示有偶 201043959 發物質的存在。WO 03072811 A2本質上參考了相同的原 則。 組合物中活性物質的中和還可通過使用對此活性物質 特異的抗體而實現,例如在歐洲藥典中2.6.16.章描述的。 例如,如果活性物質為疫苗病毒抗原,此疫苗病毒抗原能 被含有特異性結合於此抗原的抗體的抗血清所中和。為製 備抗血清,使用在來自不同於用於疫苗生產的種屬的細胞 培養物或其他系統(例如受精印)中生產的,且不含外來物質 的免疫抗原。 然而,儘管有上文描述的用於施行外來物質測試的方 法’仍然需要改進的測試方法,尤其需要用於對非_特異的 感染性污染物進行可能的鑒定的非-特異性測試方法,還需 要進行合適測試的有用工具,並因此需要麼藥物組合物的 改善的生產系統,尤其是在疫苗領域。 C 明内】 發明概要 本發明涉及以下方面、主題及優選的實施方式,其分 別單獨考慮或組合考慮’有助於解決本發明的目標: (1)用於在包含至少一種活性物質的組合物中測試外來 物質的方法,所述方法包括: a)將針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的抗體 與包含至少-種活性物質的組合物接觸,所述多聚 核苷酸構建物包含編碼活性物質的至少/鄯分的序 列,其中抗體結合於活性物質,以及 5 201043959 b)在步驟a)之後確定組合物中外來物質存在與否。 優選地,抗體特異性結合於活性物質。 (2) 用於在包含至少一種活性物質的組合物中測試外來 物質的方法,所述方法包括: a) 提供針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的抗 體,所述多聚核苷酸構建物包含編碼活性物質的至 少一部分的序列, b) 將此抗體與包含至少一種活性物質的組合物接觸, 其中抗體結合於活性物質,以及 c) 在步驟b)之後確定組合物中外來物質存在與否。 (3) 用於在包含至少一種活性物質得組合物中測試外來 物質的方法,所述方法包括: a) 提供通過用多聚核苷酸構建物免疫受試者而產生的 抗體, b) 將所述抗體與包含至少一種活性物質的組合物接 觸,其中抗體結合於活性物質,以及 c) 在步驟b)之後確定組合物中外來物質存在與否。 (4) 根據專案(1)-(3)中任何一項的方法,其中活性物質 在專案(1)中步驟b)或專案(2)和(3)中步驟(c)之前通過與抗 體結合,優選地特異性結合而被中和或失活。 換言之,活性物質在確定組合物中外來物質存在與否 的步驟之前通過與抗體結合而被中和或失活。 (5) 根據專案(1)-(3)中任何一項的方法,其中確定組合 物中外來物質存在與否的步驟包括: 201043959 a) 使用已經用多聚核苷酸構建物接種過(優選地,免疫 過)的非-人動物,所述多聚核苷酸構建物包含編碼活 性物質的至少一部分的序列,以及用待測組合物接 種所述的動物, b) 在特定時間段後評估活動物百分比,其中在所述時 間段内,在接種的動物中至少8 0 %存活並不顯示感染 跡象的情況下,認為組合物不含有外來物質,在所 述時間段内,在接種的動物中少於80%存活和/或至 〇 少一隻動物顯示感染跡象的情況下,認為組合物含 ' 有外來物質。 (6)根據專案(1)-(4)中任何一項的方法,其中確定組合 物中外來物質存在與否的步驟包括: a)用含有被中和或失活的活性物質的、待測組合物接 種非-人動物, b在特定時間段後評估活動物百分比,其中在所述時 間段内,在接種的動物中至少8 0 %存活並不顯示感染 ❹ 跡象的情況下,認為組合物不含有外來物質,在所 述時間段内,在接種的動物中少於80%存活和/或至 少一隻動物顯示感染跡象的情況下,認為組合物含 有外來物質。 確定待測組合物中外來物質存在與否的步驟可以例如 兩種方式施行:一個可能性是在用組合物接種測試生物體 (例如,非-人動物)之前中和待測組合物中存在的活性物質 (見例如項目(6))。此中和在體外施行,即,不在測試生物 201043959 體本身内進行。組合物被中和之後,用待測組合物接種測 試生物體在。另一個可能性(見例如項目(5))是中和步驟在 原位(例如,在測試生物體本身内)施行。這是通過用多聚核 苷酸構建物對測試生物體進行活性免疫而實現的,所述多 聚核苷酸構建物包含編碼活性物質的至少一部分的序列。 通過這種做法,測試生物體產生針對活性物質的至少一部 分的抗體。一旦用待測組合物(以及含有未中和的活性物質 的組合物)接種測試生物體,這些抗體反過來就能中和活性 物質。因此,確定待測組合物中外來物質存在與否可在相 同測試生物體中施行,沒有任何在體外進行活性物質中和 的需要。這顯著地減少了施行測試方法需要的時間、所需 的測試生物體的數量並進一步增加測試的強健性以及安全 性。 (7) 根據專案(5)或(6)的方法,其中非-人動物選自由成 年小鼠、乳小鼠和豚鼠,其中活動物百分比以及感染跡象 的發生在至少7-10天的時間段之後進行評估,可選地,在 接種動物為成年小鼠的情況下在用待測組合物接種後21天 的時間段後,在接種動物為乳小鼠的情況下在用待測組合 物接種後14天的時間段後,在接種動物為豚鼠的情況下在 用待測組合物接種後至少4 2天的時間段後。 (8) 根據專案(5)-(7)中任何一項的方法,其中接種待測 組合物是在腦内和/或腹膜内施行的。 (9) 根據前述專案中任何一項的方法,其中確定待測組 合物中外來物質存在與否的步驟根據管理要求,優選地根 201043959 據歐洲藥典,2005’26.16章的要求而施行。
(10)根據前述專案中任何 A 物為從其中生產活性物質的細胞培養其 胞培養物中衍生的產物。 “ W斤· 主進4備選地’待測組合物有可能分別為種子病 ΙΓ1ΓΓ)’或含有種子料的組合物。在本發明意義 之内:種子病毒為預期用於生產抗原或疫苗的病毒。例
培養物或蛋中生長 變錢其安全,且能夠在細胞 專案(_)中任何-項的方法,其中組合物 為樂物岭物’㈣地為疫苗製備物或其中間產物。 質為(:根:專案⑴中任何一術 ‘、’、’、選地為滅活或減毒病毒,更優選地為病毒抗 原n病毒抗原、亞病毒抗原或病毒體,或者活性物 質〇 3病讀至少_種組分或病毒顆粒,優選地活性物質 為流感病毒顆粒。 P (=根據專案(1M12)中任何一項的方法,其中活性物 質為多聚核苷酸序列編碼的抗原。 (/)根據前述專案中任何-項的方法,其中抗體通過 用多聚核苦酸構建物免疫受試者而提供。 (15) 根據前述專案中任何一項的方法,其中抗體及活 性物質不是衍生自使用相同的多聚核苷酸構建物。 (16) 根據專案(I5)的方法,其中多聚核苷酸構建物在至 少一種結構和/或功能性元件上有差異。 9 201043959 (17) 根據專案(15)或(16)的方法,其中多聚核苷酸構建 物在其編碼的多肽方面有差異。 (18) 根據前述專案中任何一項的方法,其中抗體用於 測試作為外來物質的病毒,例如選自肺炎病毒亞科 (Pneumovirinae),例如肺病毒(pneUm〇vims)屬,包括呼吸 道合胞體病毒(RSV);副黏液病毒科(paramyXOViridae)家族 的麻殄病毒(Morbilliviruse),例如麻疹病病毒;小核糖核酸 病毒科(Picornaviridae)的腸道病毒(Enteroviruse),如柯薩奇 (Coxsackie)病毒(例如柯薩奇B5,埃柯病毒,A-D型腸道病 毒和鼻病毒);哺乳動物呼腸病毒科(Reoviridae),具體而言 是正呼腸病毒(例如哺乳動物呼腸病毒如1、2、3型呼腸病 毒)和輪狀病毒;逆轉錄病毒科(Retroviridae)成員,例如正 逆轉錄病毒亞科(Orthoretrovirinae)(如逆轉錄酶病毒),副黏 液病毒科家族的偏肺病毒(Metapneumoviruse)如人偏肺病 毒(HMPV)或卜2、3、4型副流感病毒;副黏液病毒科家族 的腿腺炎病毒屬(Rubulaviruses),如肥腺炎病毒;彼膜病毒 科(Togaviridae),如風療病毒(Rubellavirus);冠狀病毒科 (Coronaviridae),如SARS冠狀病毒及其他人冠狀病毒,如 冠狀病毒OC43、229E、NL63和HKU1 ;小核糖核酸病毒科 家族的鼻病毒,例如如鼻病毒M-株;水痘帶狀皰疹病毒 (VZV),也稱為2型人皰疹病毒(HHV3);多瘤病毒科 (Polyomaviridae),如SV-40多瘤病毒、BK多瘤病毒和JC多 瘤病毒;豬圓環病毒;豬小核糖核酸病毒,如豬水皰病病 毒(SVDV)和捷申-泰法(Teschen-Talfan)病毒;細小病毒科 201043959 (Pa—)成員,例如犬細小病毒(cpv),博卡病毒或豬 細小病毒;副流感病毒(PIV);正黏液病毒科 (Orthomyxoviridae)成員,包括A*B型流感病毒;副黏液病 毒科(Paramyxoviridae)成員,包括朽乂心;皰 疹病毒科(Herpesviddae),如卜2型單純性皰疹病毒,6、7、 8型人單純性皰療病毒,巨細胞病毒和四病毒;腺病毒科 (Adenoviddae),例如腺病毒,包括人、猿、鳥腺病毒,如丄 型鳥腺病毒;鳥圓環病毒;鳥呼腸病毒科,具體而言是正 呼腸病毒,如鳥呼腸孤病毒;乳頭狀瘤病毒科 (Papillomaviridae)成員,包括人乳頭狀瘤病毒;黃病毒科 (Flaviviridae)成員,如西尼羅河病毒;以及雙核糖核酸病毒 科(Bimaviddae),例如傳染性法式囊病毒(也稱為甘布羅鎮 病毋)’及/或其中抗體用於測試作為外來物質的細菌,例如 衣原體(Chlamydia),包括沙眼衣原體(C trach〇matis)、肺炎 衣原體(C.pnemnoniae)和鸚鵡熱衣原體(Cpsittaci);以及支 原體(Mycoplasma)。 (19)根據前述專案中任何一項的方法,其中多聚核普 酸構建物包含HA(血凝素)和/或NA(神經氨酸酶)編碼序列。 在一個優選的實施方式中’多聚核苷酸構建物單獨地 或相互組合地包含任何這些ΗΑ^σ/4ΝΑ編碼序列。多聚核 苷酸構建物還可能只包含這些序列的多個部分。優選地, 多聚核苷酸構建物單獨地或相互組合地包含編碼H1、Η2、 H3、H5、H6、Η7、Nl、N2、N34N7(優選地單獨編碼H5) 的序列的完整序列或一部分。在一個進一步優選的實施方 11 201043959 式中’多聚核賊構建物包含編碼H1N1、細2、H3N2、 臓1、疆3或讎7的序列或序列的一部分優選地包含 編碼H5N1的序列或序列的一部分。 (20)根據刖述專案中任何_項(尤其是根據專案⑽ 的方法’其中包含多聚核替酸構建物(編碼活性物質的至少 P刀的序列)疋您碼子優化的,具體而言是通過對用於用 多聚㈣_建物免疫的受試者的密碼子優化。 ⑼根據前述專案中一 1的料,其中活性物質 包含流感抗原,並且多聚核㈣構建物包含具有與seq ι〇 ⑽、:阳所示核酸至少9〇%,優選地至少95%,更優選地 至ν' 98%的序列同一性的序列 (22) 根據前述專案中. 包含流感抗原,此多聚核:二的方法,其中活性物f 或2中描述的㈣。&構建物包含如啊則0: i (23) 用包含多聚核 一部分的序列)產生特異性= 活性物質的至少 測試任何以下條件的用途:+對所述活性物質的抗體用於 D糊組合物中活性物質的存在盘否, ι〇組合物中任何外來 其中抗體通過用多^物質的存在與否, 供,其中活性物質被所、亥錢構建物免疫受試者而提 nd. 、斤述抗體中和或失活。 (24) 根據專案(23 τ布:¾失活 性,組合物缺少任何,其中活性物質顯示感染活 質且不存在進—步的 ^抗體中和或失活的活性物 12 201043959 (25) 根據專案(23)或(24)的用途,其中活性物質為抗 原,優選地為病毒顆粒,或活性物質包含病毒顆粒的至少 一種組分,具體而言其中所述病毒顆粒為流感病毒顆粒。 (26) 根據專案(23)-(25)的用途,其中對組合物的測試為 陽性或陰性對照測試。 (27) 根據專案(23)-(26)的用途,其中對組合物的測試為 對外來物質的測試。 (28) 用於生產藥物組合物,具體而言為疫苗的方法, 包括在生產方法中至少一個時間點: al)施行根據專案(1)-(22)中任何一項的方法;或 a2)施行根據專案(23)-(27)中任何一項的用途;以及, 可選地, b)通過移除和/或失活外來物質的處理而處理藥物組 合物,具體而言是疫苗或其中間產物的步驟,和/或 處理從中衍生藥物組合物或疫苗的細胞培養物的步 驟。 (29) 專案(28)的方法,其中在已經確定病原物質的情況 下,步驟b)的處理具體地適合於移除和/或失活所述病原性 外來物質。 (30) 針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的抗體 用於純化所述活性物質的用途,所述多聚核苷酸構建物包 含編碼活性物質的至少一部分的序列,其中抗體特異性結 合於活性物質,其中抗體和活性物質不是衍生自使用相同 的多聚核苷酸構建物。 13 201043959 (31) 根據專案(30)的用途,其中所使用的抗體如項目 (14)-(22)中定義。 (32) 根據專案(3〇)或(31)的用途,其中抗體包含結合於 固相的親和標籤。 (33) 多聚核苷酸,其包含具有與SEQ iD no : 1或2所 示的核酸至少90% ’優選地至少95%,更優選地至少98%的 序列同一性的序列。 (34) 根據專案(33)的多聚核苷酸,其中此多聚核苷酸具 有如SEQ ID NO : 1或2中描述的序列。 (35) 包含根據專案(33)或(34)的多聚核苷酸的多聚核 苷酸構建物。 (36) 包含項目(33)或(34)的多聚核苷酸或項目(35)的多 聚核苷酸構建物的宿主細胞。 (37) 根據專案(36)的宿主細胞’其中宿主細胞為細菌細 胞、酵母細胞、真菌細胞、植物細胞、藻類細胞或昆蟲細 胞,優選地為細菌細胞或真菌細胞,最優選地為細菌細胞。 (38) 根據專案(36)或(37)的宿主細胞,其中宿主細胞為 大腸桿菌(Escherichia coli)細胞、鏈黴菌屬(Streptomyces) 細胞、巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)細胞或裂殖酵母屬 (Schizosaccharomyces)細胞,優選地為大腸桿菌細胞。 (39) 非-人生物體、轉基因動物或微生物體,其含有根 據專案(33)或(34)的多聚核苷酸或根據專案(35)的多聚核苷 酸構建物。 (40) 對由根據專案(33)或(34)的多聚核苷酸編碼的多 201043959 肽特異性的抗體。 (41) 用於生產根據專案(40)的抗體的方法,其包括: a) 提供根據專案(35)的多聚核苷酸構建物,以及 b) 用所述多聚核苷酸構建物免疫合適的受試者,優選 地為合適的動物,如小鼠、大鼠或兔,更優選地為 兔。 (42) 分部套盒用於測試組合物中外來物質的用途,試 劑盒包括 a)多聚核苷酸構建物,其包含編碼活性物質的至少一 部分的序列,以及 c) 宿主細胞 (43) 分部套盒,包括 a) 包含編碼具有與SEQ ID NO : 1或2所示的核酸至少 90%,優選地至少95%,更優選地至少98%的序列同 一性的活性物質的至少一部分的序列的多聚核苷酸 構建物,或包含如SEQ ID NO : 1或2中描述的序列 的構建物,以及 b) 宿主細胞。 I:實施方式3 實施例之發明詳述 現在通過優選的實施方式和實施例更詳細地描述本發 明,其僅僅為闡述性目的而提供,不應被理解為以任何方 式限制本發明的範圍。 本發明提供了有效、快速、可靠的方法用於檢測組合 15 201043959 物中的污染物,通過使用特異性結合於組合物中存在的活 性物質的抗體,條件是所述的抗體是針對多聚核苷酸構建 物的表達產物而產生的抗體,所述多聚核苷酸構建物包含 編碼活性物質的至少一部分的序列。據發現,已經通過重 組多聚核苷酸構建物用於免疫而製備的抗體對於測試外來 或偶發物質之前中和或失活活性物質尤其有利且有用。這 些抗體尤其適合於測試含有蛋白質性物質如活性物質的組 合物中的外來物質。由於待用於製備抗體的多聚核苷酸構 建物為通過合成製備的並包含編碼指定活性物質中存在的 氨基酸序列的至少一部分的多聚核苷酸,此多聚核苷酸構 建物編碼待中和或失活的靶標的同源序列,但在測試期間 將抗體加到組合物中時沒有被外來或偶發物質所污染。與 此相反,使用通過用抗體(其是通過用給定活性物質本身被 免疫的動物而產生的)的其他免疫學外來物質測試可能很 好地導致特異於組合物中存在的外來物質的抗體形成,這 樣產生了假陰性結果的風險。這種在動物中這些抗體的不 想要的產生可例如通過從在其中生產活性物質的細胞培養 物系統所產生的污染物誘導。然而,結果是,不像根據本 發明使用多聚核苷酸構建物免疫用於抗體的生產,隨後對 外來物質有特異性的抗體會在測試過程中中和外來物質, 從而導致分析中的錯誤。根據本發明的方法允許避免或至 少減少特異於污染物的抗體形成。因此5例如,可避免假 陰性外來物質測試結果。進一步地,降低發生交叉反應性 的風險。此外,多聚核苷酸構建物能在適當的測試系統中 16 201043959 直接測試,以顯示污染性外來物質不存在,例如構建物巧* 通過PCR或歐洲藥典2·6· 16_中描述的方法就廣泛的一系列 潛在污染物直接進行測試。 具體而言,已經發現通過用編碼例如病毒抗原(如流感 病毒抗原)的多聚核苷酸構建物直接免疫受試者,可能迅速 產生特異性結合於此流感病毒抗原的抗體,目標是隨後的 測試主要地不對流感病毒本身回應。因此,通過使用根據 本發明的方法,不再需要產生特異性的抗體,例如,通過 用野生型病毒或在疫苗製備過程中獲得的病毒顆粒本身被 免疫的動物,這顯著減少了要用於後續測試階段的抗體_產 生所需要的時間。此外,不再需要依賴於交叉_反應株的鑒 別和培養,因為(潛在的)流行性或季節性流感病毒株一經鑒 別就能製備出多聚核苷酸構建物。這在流行性或季節性流 感爆發的情況下尤其有用,因為需要將流行性或季節性疫 田快速投放市場。通過應用根據本發明的方法,針對這些 流感抗原的特異性抗體能迅速產生並用於測試及可選的流 感疫苗製備物過程中進一步處理目的。因此,本發明減少 了疫苗投放前置時間。由於所產生的抗體還能用於品質測 試,疫苗或其中間產物接受如外來物質測試,本發明還產 生改善的疫苗品質。此外,通過應用本發明的教導,可能 在外來物質已經被檢測之後通過將此批次經過特殊處理以 失活或去除檢測到的偶發物質而進一步使用昂貴的生產批 次。 總而言之,通過應用根據本發明的方法,可實現所測 17 201043959 試組合物的改善的品質和安全性以及偶發物質測試的改善 的支出。因此,所測試組合物投放前置時間能夠減少。 在一個具體的方面,本發明涉及用於測試包含至少一 種活性物質的組合物中外來物質的方法,所述方法包括以 下步驟 a) 將針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的抗體 與包含至少一種活性物質的組合物接觸,所述多聚核脊酸 構建物包含編碼活性物質的至少一部分的序列,其中抗體 結合於活性物質,以及 b) 在步驟a)之後確定組合物中外來物質存在與否。 在本法意義之内,術語“外來物質”或“偶發物質’’涉及 待測組合物中可能存在的污染物。偶發或外來物質為不預 期包括在組合物中並會對含有此組合物產品屬性有不利影 響的物質。例如,如果組合物構成藥物製備物或將為此使 用,偶發物質會例如為傳染性物質(病原體),即能夠傳染人 或動物的物質。這種傳染性物質可為微生物體,例如,細 菌、真菌、藻類、病毒或其部分。病毒常常能夠在用於生 物學製品生產的系統如細胞培養物中生長。進一步地,組 合物還可為宿主DNA污染物。 用於生物學製品生產,具體而言用於生產病毒顆粒的 典型細胞系,為哺乳動物細胞系,包括MDCK、CHO、BHK、 Vero、MRC-5、PER.C6、WI-38等等。可能無意中感染這些 細胞並因此顯示了根據本發明的待測試的潛在外來或偶發 物質的感染性病毒和細菌的實例包括例如選自由以下的病 18 201043959 肺炎病毒亞科,例如肺 毒(RSV);副黏液病毒科家族的麻相毒,例如麻疼= 毒;小核糖核酸病毒科的腸道 Li病病 ..* , U,, ^ t,如柯薩奇病毒(例如柯 陸奇B5=柯病毋’ A姻腸道病毒和鼻病毒);飢動物 呼腸’具體而言是正呼腸病毒(例如哺乳動物呼腸病 毒如"鳇3型呼腸病毒)和輪狀病毒 例如正逆_病毒亞科(如__
族的偏肺病毒如人偏肺病毒—或丄 病毒』黏液病毒科家族_腺炎病毒屬,如㈣炎病毒; 彼膜病毒科’如風瘡病毒;冠妝怯主士丨 尥狀病,科,如SARS冠狀病毒 及其他人冠狀病毒,如冠狀病毒〇C43、229e、NU3和 HKU1 ·’小核糖核酸病毒科家族的鼻病毒’例如如鼻病毒 M-株;水痘帶狀皰疹病毒(VZV),也稱為2型人皰疹病毒 (HHV3);多瘤病毒科,如SV_40多瘤病毒、Βκ多瘤病毒和 JC多瘤病毒;豬圓環病毒;豬小核糖核酸病毒,如豬水皰 病病毒(SVDV)和捷申-泰法病毒;細小病毒科成員,例如犬 細小病毒(CPV),博卡病毒或豬細小病毒;副流感病毒 (PIV);正黏液病毒科成員,包括A和B型流感病毒;副黏液 病毒科成員,包括PIV-I、PIV-2和PIV-3;皰疹病毒科,如工' 2型單純性皰疹病毒,6、7、8型人單純性皰疹病毒,巨細 胞病毒和EB病毒;腺病毒科 ,例如腺病毒,包括人、猿、 鳥腺病毒,如1型烏腺病毒;鳥圓環病毒;鳥呼腸病毒科, 具體而言是正呼腸病毒,如鳥呼腸孤病毒;乳頭狀瘤病毒 科成員’包括人乳頭狀瘤病毒;黃病毒科成員,如西尼羅 19 201043959 河病毒;以及雙核糖核酸病毒科,例如傳染性法式囊病毒, 及/或其中抗體用於測試作為外來物質的細菌,例如衣原 體,包括沙眼衣原體、肺炎衣原體和鸚鵡熱衣原體;以及 支原體。 通過應用根據本發明的方法,組合物中外來或偶發物 質的存在各自可以以有效、迅捷、可靠的方式進行測試。 這種待測試的組合物可為任何滿足特定品質要求的組合物 或其上游樣品。這些組合物可用於測試試劑盒例如用於在 任何人或動物的體液或樣品中檢測疾病或傳染性物質。根 據本發明的方法還適合於測試用於任何實驗室用途(如分 析或製備目的)的組合物。在本發明意義之内的進一步待測 試組合物可為例如從中產生活性物質的細胞培養物樣品, 或者其分離-或純化產品或任何中間產物。這些樣品可取自 任何過程步驟。組合物還可為衍生自此細胞培養物的產 品。再一次地,此產品可為在任何階段衍生自細胞培養物 的產品,這意味著此產品可為終產品的前體或終產品本 身,或任何二者之間的產品。進一步地,備選地,待測組 合物可能分別為種子病毒,或含有種子病毒的組合物。種 子病毒在本發明意義内為預期用於生產抗原或疫苗的病 毒。 本發明意義之内的其他組合物為藥物組合物。優選 地,組合物為藥物組合物。藥物組合物可用在身體之内或 之上,以預防、診斷、減輕、處理或治癒人或動物的疾病。 優選地,這種藥物組合物為疫苗製備物或其中間產物。在 20 201043959 藥物組合物為疫苗製備物的情 的特定# σ # /下,還可能测試疫苗批次 的特疋樣品。其他制組合物 物或疫苗產品的過程階段中的樣品“㈤終產生辦 活性物質的細胞培養物的樣品或任何中:產:自從中何生 由於具有偶發物質的污染物可朗針 間發生或合適地進行測試,根據本發明=== 合物製備中的任何階段施行。 ’ 了在所通、、且
❹ =測組合物包含至少—種活性物質。活性物質在本發 明的思義之内指的是任何化學或生物學材料或化合物,其 為組合物巾有效成分。在藥物組合物的情況下,活性物質 可以為藥物化合物,如生物製藥藥物,尤其是表達的多狀。 優選地’活性物質為抗原,優選地,抗原為失活或減毒的 病毒,更優選地,抗原為病毒抗原。這些病毒抗原的實例 為例如病毒顆粒,如部分破壞的病毒顆粒如裂解病毒抗 原、純化的包膜抗原如亞基病毒抗原或病毒體。病毒體為 具有合適平均直徑的單層磷脂雙層囊泡,例如範圍為從大 約70nm-大約150ηιη。本質上,病毒體代表重構的空病毒包 膜,去除了包括來源病毒的遺傳物質的核殼體。病毒體不 能夠複製但是是純的融合-活性囊泡,其含有插入磷脂雙分 子層膜中的功能性病毒包膜糠蛋白如流感病毒血凝素(ΗΑ) 及神經氨酸酶(ΝΑ)。還優選地是,活性物質包含病毒或病 毒顆粒至少的一種組分,優選地活性物質為流感病毒顆粒。 由於根據本發明的方法在生產流行性疫苗領域中尤其 有用,根據一個優選的實施方式,活性物質為衍生自在流 21 201043959 感疫苗中存在的流感病毒顆粒的抗原或疫苗組分。這些流 感疫苗可基於任何合適的流感株。流感疫苗通常包括來自 流感A、B和C病毒株中至少一種的抗原,優選地來自流感A 或B中的至少一株。建議的用於疫苗的株可隨季節變化。還 可月b疫田基於超過·一種合適的流感株。例如,流感疫苗可 包括兩種流感A株及一種流感B株。進一步地可能疫苗不僅 為單-,還可以是雙-,三-或多價疫苗,優選地疫苗為三價 疫苗。包含活性物質優選地為衍生自流感病毒顆粒的抗原 或疫苗組分的流感疫苗可通過任何對本領域技術人員已知 的技術製備。例如,疫苗可通過使用編碼活性物質或活性 物質的部分的多聚核苷酸構建物或通過用活的病毒製備物 感染蛋或細胞而製備。優選地,通過用活的病毒製備物感 染蛋或細胞而製備疫苗。在疫苗的製備基於細胞的情況 下使用胃b夠接納生長病毒的細胞,例如哺乳動物細胞如 MDCK(Madin-Darby狗腎細胞),CH〇(中國倉鼠卵巢細 胞)’ BHK(倉鼠嬰腎細胞),yero (衍生自非洲綠猴腎上皮細 胞的細胞),MRC-5(次級人肺成纖維細胞),PER C6 (衍生 自人胚胎視網膜細胞的細胞),WI_38(來自人胎兒肺組織的 細胞)等等。通常,病毒或活病毒製備物分別注射入細胞, 並在其中擴增。然後移除、收集、純化並失活細胞外壁。 在基於蛋的製備中,通常病毒或活病毒製備物分別注射入 蛋並在胚胎周圍液體中積累。胚胎被感染,這樣病毒可擴 增。在特定時間段之後,病毒經收集、純化並進行化學失 活。此病毒或病毒部分被用於生產疫苗。 22 201043959 如本文使用的,術語“多聚核苷酸”應理解為指雙鏈或 單鏈核酸分子,例如,DNA,cDNA,基因組dna、rna 和/或mRNA分子料。賴分子可作為_鏈或互補鏈存 在。多聚核«可為天絲源或通過基因技術或化學過程 及合成方法產生,或可能從其衍生而來。優選地,多聚核 苷酸序列編碼作為活性物質的抗原。 根據本發明的方法,在步驟a)t,將針對多聚核苷酸 構建物的表達產物而產生的抗體與包含至少一種活性物質 的組合物接觸,所述多聚核苷酸構建物包含編碼活性物質 的至少一部分的序列,其中抗體特異性結合於活性物質, 例如,通過形成抗原-抗體複合物。 在下文中,詳細描述了本發明中使用的抗體。其衍生 自多聚核苷酸構建物或載體。術語“多聚核苷酸構建物,,或 “載體”分別指用於將外來多聚核苷酸(或插入片段,分別地) 引入宿主細胞或宿主生物體中的分子。多聚核苷酸構建物 包含如上文描述的多聚核苷酸,優選地多聚核苷酸構建物 或載體是DNA或RNA序列,更優選地是DNA序列。多聚核 苷酸構建物分別包含多聚核苷酸序列,或插入片段,其編 碼一種或多種(多)肽或蛋白質。此多聚核苷酸或插入片段分 別可為雙鏈或單鏈核酸分子,例如,DNA、cDNA、基因組 DNA、RNA和/或mRNA分子等等。核酸分子可以以編碼鏈 或互補鏈存在。多聚核苷酸可為天然來源或通過基因技術 或化學過程或合成手段產生’或可能由其衍生而來。優選 地’多聚核苷酸序列編碼代表活性物質的至少一部分的(多) 23 201043959 肽或蛋白質。 在本發明的意義之内,表述 表達產物而產生的抗體 述針對多聚核苷酸構建物的 構建物免疫合適的生物體;==過用多刪酸 抗體而獲得的抗,^ 、,、田胞或細胞系統中產生 選地為分離的抗體產生的獲自此特定免疫的抗體,可 聚核細_^===⑽)肽,其由多 質的至少一部分。 ^、中(夕)肽代表活性物 優選地’根據本發 包含a)啟動子_,bKj錢構建物或載體分別 本文八門“ 酸或插入片段,分別地,如 、可操作性地連接至啟動子區域,以及c)可 選地,可操作性連接於其上的調控序列,其以轉錄、終止 和^多聚腺㈣化錢而起仙,增強子序列和/或編碼先 導信號的序列,和/或確保有效的核糖體結合的序列,例如 Kozak保寸序列。合適的啟動子和/或調控序列是分子生物 學領域技術人員熟知的。在任何情況下,本領域技術人員 可在文獻中找到合適的啟動子和/或調控序列,例如在相關 科學雜誌和基因資料庫中,或可將其從任何理想的生物體 中分離出來,使用標準方法如在Sambrook等人Molecular
Cloning : A Laboratory Manual,3rd edition,Cold Spring Harbor Press,(2000)中描述的。 適合於根據本發明使用的多聚核苷酸構建物的多聚核 苷酸序列或插入片段,分別地,可由本領域技術人員基於 編碼形成活性物質的至少一部分的多肽的序列而確定。在 24 201043959 病毒抗原作為活性物質的情況下,編碼此病毒抗原的核普 酸序列通常是已知的,例如在通過“逆向遺傳學”手段(見例 如 Neumann等人,“Reverse Genetics of Influenza Virus,’
Minireview,Virology 287,243-250,2001,其中引用的參 考文獻以及之後的逆向遺傳學技術)製備病毒或疫苗的情 況下。編碼合適多肽的整個多聚核苷酸序列或其片段可由 本領域技術人員選擇並引入多聚核苷酸構建物。合適的多 肽是能夠在被免疫的受試者中引發有效抗體應答的多肽。 合適的多肽可在例如本領域技術人員已知資料庫中找到, 如 PubMed 資料庫(例如 http : //www.ncbi.nlm.nih.gov/,http · //www.ncbi.nlm.nih.gov/genomcs/FLU/FLU.html ,http : //www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/145284465?〇rdinalp〇s=l&itool =EntrezSystem2.PEntrez.Sequence.Sequence ResultsPanel.Seau ence—RVDocSum及http · //www.ncbi.ώΙιώ.nih.gov/nuccorc)。優 選地’多肽包含一種或多種抗原決定簇(表位)。還可能的是 多聚核苷酸構建物含有的多肽不僅編碼一種活性物質或活 性物質的一部分,還編碼一種或多種其他活性物質或其他 活性物質的多個部分。還可能使用分別包含不同多聚核普 酸和插入片段的不同多聚核苦酸構建物。然而,這可能取 決於組合物中存在的不同活性物質的存在和數量。因此, 如果存在不同類型活性物質,便製備不同類型多聚核苷酸 構建物,每種類型包含編碼代表至少一種類型活性物質的 一部分的多肽的序列。 優選地,用於本發明的多聚核苷酸構建物或載體是表 25 201043959 達載體。表達載體是能夠控制其含有的基因表達(即,轉錄 和翻譯)的載體。甚至更優選地,載體為哺乳動物質粒表達 載體。這種載體的一個實例為質粒(p)pCMV。優選地,用 於本發明之内的載體含有以下特徵:a)巨細胞病毒(cMV) 啟動子,b)Kozak保守序列,其被置於atG起始密碼子之前 以保證有效的核糖體結合和因此蛋白質翻譯的最高水準, 以及c)轉錄終止信號、p〇ly(A)信號,其置於編碼代表活性 物質的至少一部分的(多)肽或蛋白質的序列末端以保證合 適的轉錄終止。編碼序列(即,多聚核苷酸)可亞克隆到載體 中合適限制性位點處。所得的質粒(多聚核苷酸構建物或载 體,分別地,優選地為DNA構建物或載體)然後可用於轉化 合適的宿主細胞,如細菌細胞、酵母細胞、真菌細胞、藻 類細胞、植物細胞或昆蟲細胞,優選地為細菌細胞如大腸 桿菌細胞。轉化的宿主細胞在合適的培養基中培養然後被 收集、裂解,並回收質粒。對於先前提到的步驟的合適操 作流程可在例如 Sambrook,等人,Molecular Cloning : A Laboratory Manual,3rd edition,Cold Spring Harbor Press, (2000) ’ Davis,等人,Basic Methods in Molecular Biology, Elsevier (1986),及Ausubel ’ 等人,Current Protocols in
Molecular Biology,Wiley Interscience (1988)中找到。 為表徵所產生的質粒多聚核苷酸,在一般限制性分析 中,凝膠電泳以及進一步的生化和分子生物學方法可用作 分析方法。這些方法以及用於產生上文描述的多聚核苷酸 構建物的方法都是熟知的,已經發表了許多關於重組多聚 26 201043959 核苦酸方法的論述,包括Sambrook,等人,Molecular Cloning : A Laboratory Manual,3rd edition,Cold Spring Harbor Press,(2000),Davis,等人,Basic Methods in
Molecular Biology,Elsevier (1986),及Ausubel,等人,
Current Protocols in Molecular Biology > Wiley Interscience (1988)。 宿主細胞的轉化可用於擴增表達載體。擴增的表達載 體能在之後反過來用於例如如下文描述的,免疫受試者。 為產生特異性結合於存在於待測組合物中的活性物質 的抗體或抗血清’在本發明一個優選的實施方式中,用分 別包含多聚核苷酸或插入片段的多聚核苷酸構建物免疫受 試者’所述多聚核苷酸或插入片段編碼活性物質的至少一 部分。用所述多聚核苷酸構建物直接免疫合適的受試者導 致針對所述表達產物的抗體更迅速的產生,例如,可避免 在用活性物質(例如’(多)肽)本身施行免疫的情況下可能必 需的工序。這些否則便是需要的工序可為例如費勁的(多) 肽純化。根據本發明的省時間、迅捷的方法在活性物質為 病毒抗原、病毒顆粒、病毒體或前面提到的任何部分的情 況中尤其有利,因為可更迅速地提供對安全、高品質疫苗 的測s式。這在流感的流行性或季節性爆發的情況下尤其有 利’因為需要將流行性或季節性疫苗快速投放市場。通過 應用根據本發日⑽方法,針對朗源於這倾感抗原的當 前流行性或季節性株的特異性抗魏迅速產生並用於產生 流感疫苗製備物。類似的情況可制於其他疫苗製備物。 27 201043959 進一步地,由於免疫可用合成的多聚核苷酸施行,合適動 物被污染物免疫的風險基本被減少。因此,產生針對這些 污染物的抗體的風險得以避免,或至少減少,由此避免了 例如假陰性外來物質測試結果。這會顯著地增強所測試組 合物的安全性和品質。 受試者還可用兩種或多種不同類型多聚核苷酸構建物 進行免疫,每種類型帶有不同多聚核苷酸。被免疫的受試 者為非-人受試者,如合適的動物,例如綿羊、山羊、兔、 大鼠、小鼠、狗或豚鼠,優選地為兔、小鼠、豚鼠或大鼠, 更優選地為兔。合適的動物的免疫可依照熟知的標準步驟 施行。通常,可選地純化的多聚核苷酸構建物優選地通過 大量的遞送方法被引入動物組織中,如使用標準皮下注射 針注射鹽水中的多聚核苷酸構建物、基因搶遞送或氣動注 射(pneumatic injection)。此外,遞送可通過局部應用的方 法施行,或者可施行細胞轉染劑-介導的遞送。被免疫的動 物之後產生特異於至少部分或整個表達的(多)肽或蛋白質 的抗體。所產生的抗體存在於被免疫的受試者的血液中, 並可通過技術人員熟知的標準步驟進行回收。還可能從被 免疫的受試者中所收集的血液中製備血清樣品。抗體可以 為單克隆的或多克隆的,這取決於表達的(多)肽或蛋白質的 性質。術語“單克隆抗體’’在本發明的意義之内指的是具有 相同抗原特異性的抗體’即^均對相同表位(抗原決定叙) 特異的抗體。其意味著,如果表達的(多)肽對應於單個表 位,那麼抗體在本發明術語之内為“單克隆抗體”。在表達 28 201043959 的(多)肽或蛋白質包含超過一種表位元的情況下,由被免疫 的動物產生的特異性抗體在本發明術語之内為“多克降於 體' ^ 在特定時間段之後,例如在免疫後多至1〇〇天,通常多 至70天或多至50天,優選地大約70天,由被免疫的動物產 生的抗體可根據本領域技術人員熟知的方法獲得。優選 地’對動物進行抽血並獲得含有抗體的血清樣品。 仕—個 優選的實施方式中,要用於步驟a)的抗體可簡單地為獲自 被免疫的動物的血清樣品。 在步驟b)之前,活性物質優選地通過抗體結合而被中 和或失活。優選地,此結合為特異的。 術語“特異性結合”在本發明意義之内指的是根據本發 明的抗體顯示出對於存在於待測組合物中的活性物質的特 異性,並且,因此選擇性地結合於所述活性物質但不結合 於潛在存在於待測組合物中的外來物質。在本發明一個優 選的實施方式中,根據本發明的抗體專門地結合於所述活 性物質而完全不結合於潛在存在的外來物質。在活性物質 為如上文描述的抗原的情況下,抗體對活性物質的特異性 、·口 口還可此為父又-反應,這意味著根據本發明的抗體顯示 出交叉·反應性。術語“交叉反應性,,在本發明意義之内指的 是特定抗體與兩種❹種具有共同或高度同源性的表位的 抗原反應的ι力。例如兩種或多種活性物質,或兩種或多 種抗原,分別存在於待測組合物的情況就是這樣。 被中和的活性物質在本發明意義之内為與此特異性抗 29 201043959 體相互反應的活性物質,例如,與特異性抗體形成複合物, 因此其基本上不能再有任何作用。在一個優選的實施方式 中’被中和的活性物質是完全失效的◦失效的活性物質在 本發明意義之内為例如不能施行其功能,如其藥學功能。 還可能為當與活性物質_敏感性檢測細胞系接觸時或當施 用於測鋪物時’失效的活性物質不再能夠引起病原性效 應。通過以上提到的各種測量,確保了偶發物質測試至少 主要地不與活性物質本身產生應答。 在本發明—個優選的實施方式中,特異性抗體與病毒 抗原或病I顆粒,或者病毒抗原或病毒顆粒的只要一個組 分反應,並因此破壞或抑制了其病原性,例如,其感染性 和/或母力。所述特異性抗體的巾和效力可選地可在進行步 驟b)之前進行測試。可進行本領域技術人員熟知的中和測 試。這種中和測試的―個實例為將獲得的特異性抗體或含 此特異抗體的血清和與特異性抗體交又_反應的參考株混 合。反應的參考株可隨後接著種於對參考_錢敏感的 檢測細胞系中,如v⑽、MRC_5$MDC.胞系。然後觀 察這些檢測細料—段合適㈣間,例如切14天,並檢 查病原性效應的存在。另—個測試抗體中和效力的可能是 測試通過測試蛋模型中的感染性而測試被中和的製⑩的 感染性(此測試在例如歐洲藥典2.6,16章中有㈣•病原 性效應為對於細胞生長或維持不㈣作用具體而言是與 微生物和/或録錢相_作用。㈣域應包糾不限 於致細胞病變效應(CPE)、細胞破裂、生長抑制、蛋白質八 30 201043959 成抑制或凋亡。CPE是細胞結構的可觀察變化,其可以隨 細胞類型而變化,引起死亡,並且能根據本領域建立的知 識進行確定。例如,一些病毒感染的最常見效應為形態學 變化,如細胞變圓及脫離基質、細胞裂解、合胞體形成及 内涵體形成。中和活性通過CPE減少和血凝素抑制,或者 減少的紅細胞向被感染細胞的血球吸附而表徵。中和活性 還通過對細胞上清進行血凝測試而表徵。 然而,這些中和測試為參考測試。這意味著一旦抗體 中和效力對給定開發的系統進行顯示,此中和測試不必對 此系統持續施行。 如果未發現測試的血清或抗體,分別地具有足夠的中 和活性,可以分別進行關於載體設計、用於免疫的種屬、 此DNA構建物或載體的施用劑量和途徑、免疫和血液收集 日程以及中和效力測試的形式的進一步的優化。“足夠的中 和效力”在本發明意義之内指的是抗體/活性物質複合物在 施行合適的中和測試時不能引起可檢測的效應。 根據本發明的方法,步驟b)中分別確定外來或偶發物 質的存在與否。這些測試可在成年小鼠、乳小鼠、豚鼠中 根據管理要求施行,例如根據歐洲藥典2005,2.6.16章(病 毒種批)的要求。對於在鳥類組織中繁殖的病毒,鳥類病毒 的測試如歐洲藥典2005,2.6.16章中所描述的而施行(病毒 種批和病毒收集)。 進一步地,此構建物還可用於在如歐洲藥典,2005, 2.6.16章(2.6.16.)描述的用待測組合物接種之前的動物測試 31 201043959 系統的活性免疫。這會使得先前的種病毒中和不再需要, 不會改變動物測試模型對污染物質應答的能力。這會進一 步增加測試系統的穩健性,減少根據2.6.16在測試框架中使 用的動物的數量,並顯著地減少依從2.6.16所需的時間. 優選地,在本發明上述實施方式中,抗體和活性物質 不是使用相同多聚核苷酸(優選地DNA)構建物衍生而來 的。多聚核苷酸構建物可用於不同的目的:產生針對活性 物質的抗體用於根據本發明偶發物質測試,或生產製備性 規模的活性物質,這意味著用於生產活性物質,例如病毒 抗原或病毒顆粒的多聚核苷酸構建物不是用於產生中和或 失活此活性物質的特異性抗體。 在本發明之内,詞句“不是衍生自使用相同多聚核苷酸 構建物”指的是多聚核苷酸構建物在至少一種結構和/或功 能性組分上有差異,例如,有關整個構建物的特定部分或 已經在一個不同的系統中製備。例如,對技術人員已知的 是多聚核苷酸構建物或載體,分別可在其含有的功能性元 件方面有差異,取決於其預期為何種用途。如果載體為例 如,僅僅用於在合適的宿主細胞中分別擴增多聚核苷酸或 插入片段,其應當至少包含允許載體和所包含的插入片段 在宿主細胞中半-獨立複製的複製起點(ori)。此外,這些載 體可能含有其他功能性元件,如多克隆位點(MCS),其包括 核苷酸突出用於插入片段的插入,或限制性酶共有位點, 其允許多聚核苷酸的插入。如果需要插入片段的轉錄,那 麼載體應當另外含有啟動子序列。然而,這些載體通常缺 32 201043959 乏夕¾^核音酸表達必須的功能性序列。在需要多聚核苦酸 表達以引起增強的針對所表達多肽的抗體產生的情況下, 載體另外包含多聚腺苷酸化序列,其在轉錄的前 端產生多聚腺苷酸尾巴,保護mRNA不受核酸外切酶降解 並確保轉錄及翻譯終止。進一步地,此多聚腺苷酸尾巴穩 定mRNA的生產。此外,有利的是只有最短長度的不翻譯 區(UTR)或完全沒有UTR,因為UTR含有可能有礙轉錄或翻 譯的特異特徵。此外’這些載體還應當在成熟中包含 Kozak序列,其組裝核糖體以轉錄mRNa。 在存在於待測組合物中的活性物質為通過使用多聚核 苦酸構建物產生的病毒抗原或病毒顆粒的情況下,從而病 毒抗原或病毒顆粒如下產生:通過優選地不同於用於免疫 合適的動物(即用於產生步驟a)的抗體,其優選地特異結合 於用於免疫的多聚核苷酸構建物所包含的多聚核苷酸序列 的表達產物)的多聚核苷酸構建物的多聚核苷酸構建物。例 如,这些多聚核苷酸構建物可能在多聚腺苷酸序列、不翻 譯區或啟動子區的存在±有差異,更優選地是在多聚腺普 酸序列的存在上有差異。 如果另外地,用於生產活性物質的多聚核苷酸構建物 不僅編碼此活性物質的序列,還編碼污染物的序列,那麼 在用此多聚核:¾:酸構建物免疫受試者時,此污染物編碼序 列與活性物質編碼序列在賴受試者中表達。這樣,被免 疫的受試者會產生不僅對活性物質,而且對污染性(多)肽有 特異性的抗體。因此,這些污染物特異性抗雜中和污染 33 201043959 物,因此導致假陰性測試結果。 然而,通過使用不同的多聚核苦酸構建物,在外來物 質測試中避免了假陰性測試結果,因為沒有產生針對此污 染性多肽的抗體。如上文描述的,所述多聚核苷酸構建物 可在結構和/或功能性元件上有差異,取決於其預期用於何 種目的:根據本發明,在多聚核苷酸用於產生特異性抗體 情況下,優選地使用表達載體,因為需要在被免疫的受試 者中表達編碼活性物質的至少一部分的多聚核苷酸。備選 地,還可能是多聚核苷酸構建物在其各自編碼的多聚核苷 酸方面相異:通過應用本發明,例如,用於免疫受試者的 表達載體不必需攜帶編碼整個活性物質的多聚核苷酸序 列。為在被免疫的受試者中產生特異性抗體,表達載體只 攜帶編碼活性物質一部分,例如編碼活性物質的一個或多 個保守區域的多聚核苷酸序列也是合適的。 進一步地,在本發明的一個優選的實施方式中,編碼 活性物質的至少一部分的多聚核苷酸序列可進行密碼子優 化,具體而言根據用於用多聚核苷酸構建物免疫的受試者 進行密碼子優化(見下文)。通過施行上文概述的修飾—使 用不同結構和/或功能性元件、表達只編碼例如活性物質的 一部分的多聚核苷酸序列及多聚核苷酸序列的密碼子優 化——另外表達編碼污染物的序列的風險幾乎不存在。如 果待測組合物要滿足高品質要求,例如用於藥物組合物如 疫苗,這尤其有利。此外,上文-提到的多聚核苷酸修飾可 能另外產生顯著改善的表達速率,因此產生增強的抗體生 34 201043959 產,及因此增強的中和能力。 在一個進一步優選的實施方式中,多聚核苷酸構建物 包含編碼活性物質的至少一部分的序列進行了密碼子優 化’尤其根據用於用多聚核苷酸構建物免疫的受試者進行 密碼子優化。如本領域技術人員已知的,各個特定氨基酸 最少被一個密碼子,最多被六個密碼子編碼。之前的研究 已經顯示編碼細胞的多肽的基因中密碼子的使用在種屬之 間是有偏好的(Kanaya,S,Y· Yamada,Y. Kudo 和 T. Ikemura (1999),“Studies of codon usage and tRNA genes at 18 unicellular organisms and quantification of Bacillus subtilis tRNAs : gene expression level and species-specific diversity of codon usage based on multivariate analysis.”,Gene 238 : 143-155)。遺傳密碼的簡並性為本領域技術人員提供了根據 靶宿主細胞的密碼子偏好調整多聚核苷酸序列的可能性以 及其他,這樣優化了所需要的本發明的抗原結合多肽的表 達。本領域技術人員已知如何根據用多聚核苷酸構建物免 疫的靶宿主細胞或生物體的密碼子偏好調整多聚核苷酸序 列。例如,如果被免疫的生物體為合適的動物如兔、綿羊、 山羊、大鼠或小鼠時,多聚核苷酸序列可根據各動物的密 碼子偏好調整。有一些針對生物體_特異性密碼子使用和生 物體-特異性密碼子對使用而優化各基因設計的軟體工具 (演算法),例如CODA基因組的“Protein Translation Engineering® technologies" ° 在本發明一個進一步優選的實施方式中’抗體用於中 35 201043959 和或失u的活性物質,接著作為外來物質的病毒和/或 ’田菌進行K這些測試的病毒和/或細菌能夠例如選自: 肺炎病·#_’例如肺病毒屬,包括呼吸道合胞體病毒 (RSV);副黏液病毒科家族的麻療病毒,例如麻瘳病病毒; 小核糖核科的腸道病毒,如柯薩奇病毒(例如柯薩奇 埃柯病母AD型腸道病毒和鼻病毒);哺乳動物呼腸 病#·科’具體而言是正呼腸病毒(例如哺乳動物呼腸病毒如 1 ' 2 ' 毒)和輪狀病毒;逆轉錄病毒科成員’例 如正逆轉錄病毒亞科(如逆轉錄酶病毒),副黏液病毒科家族 〇 的偏肺病毒如人偏肺病毒(HMPV)或1、2、3、4型副流感病 · 毒;副黏液鱗科家族的⑽炎病毒屬,祕腺炎病毒; 彼膜病毒科’如風疹病毒;冠狀病毒科,如SARSg狀病毒 及其他人訄狀病毒,如冠狀病毒〇C43 、229E、NL63 和 HKU1 ;小核糖核酸病毒科家族的鼻病毒,例如如鼻病毒 M-株;水痘帶狀皰疹病毒(vzv),也稱為2型人皰疹病毒 (HHV3);多瘤病毒科,如sv_40多瘤病毒、BK多瘤病毒和
Jc多瘤病毒;豬圓環病毒;豬小核糖核酸病毒,如豬水皰 1 病病毒(SVDV)和捷申-泰法病毒;細小病毒科成員,例如犬 細小病毒(CPV) ’博卡病毒或豬細小病毒;副流感病毒 (PIV);正黏液病毒科成員,包括A和B型流感病毒;副黏液 - 病毒科成員,包括PIV-I、PIV-2和PIV-3;皰疹病毒科,如1、 2型單純性皰疹病毒,6、7、8型人單純性皰疹病毒,巨細 胞病毒和EB病毒;腺病毒科,例如腺病毒,包括人、猿、 鳥腺病毒,如1型鳥腺病毒;鳥圓環病毒;鳥呼腸病毒科, 36 201043959 具體而言是正呼腸病毒’如鳥呼腸孤病毒;乳頭狀瘤病毒 科成員,包括人乳頭狀瘤病毒;黃病毒科成員,如西尼羅 河病毒;以及雙核糖核酸病毒科,例如傳染性法式囊病毒, 及/或其中抗體用於測試作為外來物質的細菌,例如衣原 體,包括沙眼衣原體、肺炎衣原體和鸚鵡熱衣原體;以及 支原體。 在根據本發明一個進一步優選的實施方式中,在多聚 核苷酸構建物中包含的多肽含有血凝素(HA)和/或神經氨 〇 酸酶(NA)編碼序列。血凝素可在例如流感病毒的表面上找 • 到。其為抗原性糖蛋白’負責病毒結合於正感染的細胞。 迄今’已知至少16種不同的流感ha抗原。這些亞型即所謂 H1至H16。NA為切割神經氨酸的糖苷連接的酶。迄今,至 少已知九種流感神經氨酸酶亞型。這些亞型可在例如本領 域技術人員已知的資料庫,如PubMed資料庫中找到(例如 http : "www.ncbi.nlm.nilv gov/ , http : // www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/FLU.htm1 , httD : ◎ _____ //www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore_和 http_ //www.ncbi.nlm.nih.g〇v/nuccore/145284465?ordinalpos=l&i tool=EntrezSvstem2.PEntrez.Sequence.Sequence ResultsPan el.Sequence—RVDocSurr^ 〇在一個優選的實施方式中,多聚 核苷酸構建物單獨或相互組合包含任何這些HA和/或ΝΑ編 碼序列。也可能多聚核苷酸構建物只含有這些序列的部 分。優選地,多聚核苷酸構建物單獨或相互組合包含編碼 HI、Η2、Η3、Η5、Η6、Η7、Nl、Ν2、Ν3或Ν7的序列的 37 201043959 完整序列或一部分’優選地是H5。在一個進一步優選的實 施方式中,多聚核苷酸構建物包含編碼H1N1、H2N2、 H3N2、H6m、H7N3或H7N7的序列或序列的部分,優選地 包含編碼H5N1的序列或序列的部分。 在根據本發明的一個進一步優選的實施方式中,活性 物質包含流感抗原,多聚核苷酸構建物包含具有與SEQ ID NO : 1或2所示的核酸例如至少90%,優選地例如至少95%, 最優選地例如100%的序列同一性的多聚核苷酸序列。這些 多聚核苦酸序列進行密碼子優化以進行有效的表達,並由 此在哺乳動物受試者中進行流感抗原的基於DNA載體的免 疫概念’優選地對於流感HA和NA編碼序列中任何一種或 二者,更優選地是分別與H5和N1相關的序列。多聚核苷酸 構建物可還包括例如與上文提到的核苷酸序列(SEQ ID NO: 1或2中顯示的核酸)的互補鏈雜交的多聚核苷酸序列, 或為上文提到核苷酸序列的簡並物。術語“相雜交,,或“雜 交”描述了這樣的過程,通過此過程單鏈多聚核苷酸與互補 多聚核苷酸鏈進行域基-配對。在本發明的上下文中,術語 “雜交’’指的是在常規雜交條件下,尤其在嚴謹的條件下, 例如如 Sambrook 等人(2000),Molecular Cloning : A Laboratory Manual,3rd edition,Cold Spring Harbour Laboratory Press,Cold Spring Harbour,NY中描述的條件 下的雜交。合適的嚴謹的條件包括溫度為35攝氏度-65攝氏 度,0.9摩爾鹽溶液。嚴謹的雜交條件可包括以下條件: 38 201043959
雜交緩衝液: 7% SOS 250 mM NaCl
250 mM K-磷酸緩衝液pH 7.0 1 mM EDTA 雜交溫度: 58攝氏度-60攝氏度 雜交時間: 過夜
洗滌緩衝液: (I) 2 X SSC,0.1% SDS
(II) 0.2 X SSC,0.1% SDS
洗滌溫度和時間:55攝氏度-60攝氏度下各自2x30min 上文描述的、具有與SEQ ID NO : 1或2所示的核酸例 如至少90%,優選地例如至少95%,最優選地例如100%的 序列同一性的多聚核普酸還包括此多聚核普酸序列的片 段、衍生物、類似物或部分。片段、衍生物、類似物或部 分可能也都是天然發生的變異或突變,其中這些突變可能 天然發生或通過例如靶向誘變而引入。此外,這些變異能 進一步包括合成序列。 術語“片段”應當理解為多聚核苷酸序列的部分,其足 夠長以編碼所描述的多肽之一。術語“衍生物”在此上下文 中指的是與上文描述的多聚核苷酸序列在一個或數個位置 不同的序列,但與這些序列有高度同源性。這裏同源性指 的是至少40%的序列同一性,優選地為至少60%或70%的同 一性,優選地至少8〇%、82%、84%、86%或88%的同一性, 尤其優選地具有至少9〇%、92%、94%、96%或98%的同一 性。從上文描述的核苷酸序列的變異是例如通過刪除、置 39 201043959 換、插入或重組引起的。 為確定兩條氨基酸或核苷酸序列之間的同源(=同一性) 性百分比’比對這兩條序列,比較在每個位置上的氨基酸 或核苷酸。如果序列中一個位置被相同氨基酸或相同核苷 酸所伯據’則分子在此位置為同源的(=同一的)。這兩條序 列之間的同源性百分比為同一的共同位置的數量的函數 (即,同源性=位置總數量中的同一的位置的數量X100)。 同源性是在總氨基酸或核苷酸序列區域中計算的。為 了比較不同序列,大量基於不同演算法的程式對本領域技 術人員可得。Needleman和Wunsch或Smith和Waterman的演 算法提供了尤其可靠的結果。對於序列比對和比較,可使 用程式“PileUp”( J. Mol. Evolution.,25,351-360,1987, Higgins 等人,CABIOS,5 1989 : 151 153 )或 “Gap” 和 "BestFir [Needleman and Wunsch (J. Mol. Biol. 48 ; 443-453(1970)以及Smith和Waterman (Adv· Appl. Math. 2 ; 482-489(1981)) ’ 包括在 GCG 套裝軟體内[Genetics Computer Group,575 Science Drive,Madison,Wisconsin, USA 53711 (1991)]。上文提到的序列同源性值作為百分比 可通過“Gap”程式的方式在總序列區域上綠定,作出以下調 整:缺口加權:50,長度加權:3,平均匹配:10.000,平 均錯配:0.000。這些調整能用作序列同源性分析的標準調 整。 本發明退涉及含有編碼活性物質的至少/部分的序列 的多聚核苷酸構建物用於產生特異性針對所述活性物質的 40 201043959 抗體以測試以下任何條件的用途·· i)待測組合物中活性物質的存在與否 η)組合物巾任何外來或傳祕物質的存在與否, 其中通過用所述多聚核苦酸構建物免疫受試者提财 體,且其中活性物質被所述的抗體中和或失活。 ’、几 根據本發明的多聚核普酸構建物的用途允許提供對含 有活性物質的組合㈣行快速、有效並可㈣職。通過 使用由用多聚«酸構建物免疫受試者而提供的抗體,避 免了用活錄質本身免疫受試者時可能出現的污染物。因 此’使用發明的多聚核賊構建物避免了假陰性的測試結 果。此外,能加快在各自的測試中使用的抗體的產生。這 樣,測試變得更快速。這在如果待測組合物巾的活性物質 由病毒顆粒構成或衍生自病毒顆粒時尤其有利,因為疫苗 投放的別置時間可能顯著減少。這對於基於細胞培養技術 生產的疫苗尤其重要。 通常,通過使用包含編碼活性物質的至少一部分的序 列的多聚核賊構建物來產生特異性針對所述活性物質的 抗體’組合物沒有任何活性表示抗體失活或巾和了活性物 質’且沒有進-步的抗原存在於制組合物中。 對待測組合物之内給定活性物質沒有任何活性反應意 味著組合物中存在的活性物質已經通過抗體與活性物質的 特異性結合而被中和或失活了。被中和的活性物質與特異 性抗體相互作用,例如,與抗體形成複合物,因此基本上 不忐再有任何效果,優選地,被中和的活性物質為完全失 41 201043959 效的。失效的活性物質在本發明的意義之内為例如不再能 施行其功能,如其藥學或免疫學功能。還可能是失活的活 性物質在與活性物質-敏感性檢測細胞系接觸時不再能引 起病原效應。抗體的中和效力可如上文描述的而測試。然 而,被發現有活性的組合物仍然含有活性物質,因此,是 有效的。 上文描述了多聚核苷酸構建物、活性物質、待測組合 物和外來或傳染性物質,以及對合適受試者的免疫及活性 物質的中和。優選地,活性物質為抗原,更優選地為病毒 抗原或病毒顆粒,或者,活性物質包含病毒或病毒顆粒的 至少一種組分,優選地,活性物質為流感病毒顆粒。優選 地,待測組合物為來自從中生產活性物質的細胞培養物的 樣品,或來自此細胞培養物的產物,還優選地待測組合物 為藥物組合物,優選地為疫苗製備物或其中間產物。還優 選地,待測組合物分別為種子病毒或含有種子病毒的組合 物。 進一步優選地,外來或傳染性物質為如上文描述的病 毒。 通過使用含有編碼活性物質的至少一部分的序列的多 聚核苷酸構建物以產生特異性針對所述活性物質的抗體, 例如可施行(陰性或陽性)對照測試。在這樣的對照測試中, 具體而言關於活性物質(抗體針對的部分)是否在組合物中 存在對組合物進行測試。為此,將通過用多聚核苷酸構建 物免疫合適的受試者而提供的抗體與待測組合物接觸。所 42 201043959 測試組合物在加入特異性抗體後不再顯示任何活性的情況 下,此活性物質存在於該組合物中。可選地,在將待測植 合物與此特異性抗體接觸之前,抗體的中和效力可如上文 描述的進行測試。 在-個進-步優選的實施方式中,通過使用含有編碼 活性物質的至少-部分的序列的多聚核苦酸構建物以產生 特異性針對所述活性物質的抗體,例如可進行外源物質的 〇 測試。外源物質測試可如上文描述的施行。 本發明還涉及生產藥物組合具體而言為疫苗的過程, 其中在生產過程中至少一個時間點施行根據如上文描述的 用於測試組合物中外來物質的方法。外來物質測試可分別 在藥物組合物生產或製備過程中任何階段施行。優選地測 忒可在種批或病毒收穫物上施行,更優選地測試在種批上 鈿行。進一步地,還可一次施行或重複施行,例如,在細 胞培養的開始和/或結束時或二者之間施行。外源物質測試 Q 還可在現成的疫苗製備物上施行,包括例如從一個產品批 次中測試一個或多個樣品。 可選地’施行處理藥物組合物(具體而言是疫苗或其中 間產物)和/或從中衍生藥物組合物或疫苗的細胞培養物的 步驟’這樣外來物質被移除和/或失活。適合於從各組合物 或細胞培養物中移除外來物質的方法是本領域技術人員已 知的,且包括化學和/或物理失活或移除方法,例如,過濾 方法、吸附方法、化學處理例如甲醛或β-丙内酯,物理處 理如加熱和/或電磁輻射(例如uv-c處理或γ射線輻射),或 43 201043959 諸如此類。本發明使用的方法其進一步的益處在於’一旦 證實外來物質的存在’即能特異性調整外來物質移除步驟 以移除和/或失活所述的外來物質。例如’如果存在於待測 組合物中的外來物質被(可選地)鑒定’可使用特異性移除和 /或失活方法,這些已知可以特別地移除和/或失活所述的外 來物質。通過移除和/或失活所述外來物質’例如可避免丟 棄全部組合物批次,因此節約時間和金錢。 進一步地,本發明涉及針對多聚核苷酸構建物的表達 產物而產生的抗體的用途,所述多聚核苷酸構建物包含編 碼活性物質的至少一部分的序列,其中抗體特異性結合於 活性物質,用於純化所述活性物質,並且其中抗體和活性 物質不是衍生自使用相同的多聚核苷酸構建物。術語“針對 多聚核普酸構建物的表達產物而產生的抗體”和“抗體和活 性物質不是衍生自使用相同的多聚核苷酸構建物’’在上文 有所描述。如本文使用的,術語“純化,’包括但不限於,親 和純化,其通過利用蛋白質與其他已經固定在固相支持物 (例如,柱子)上的蛋白質(如抗體,如本文描述所產生)的親 和力保留在柱子上而純化蛋白質並將其分離(例如’不同抗 原的分離)。優選地,活性物質為病毒抗原,具體而言為流 感抗原。使用根據本發明的抗體使得能夠快速、高度特異 性地純化源自或代表需要純化的病毒株的病毒,因為用於 純化的抗體是針對此病毒株的表達產物特異性產生的。 優選地’用於純化活性物質的抗體為如上文定義的抗 體。進-步優選地是用於純化目的的抗體另外包括結合於 44 201043959 固相的親和標籤。 進一步地,本發明涉及包含具有與SEq ID N〇 : 1或2 所示的核酸例如至少9 0 %,優選地例如至少9 5 %的序列同一 性的序列的多聚核苷酸。最優選地,多聚核苷酸具有如SEq ID NO : 1或2所示的序列。有關所述多聚核苷酸,參考上文 的描述。 本發明還涉及包含具有與SEq ID NO : 1或2所示的核 酸例如至少90%,優選地例如至少95%的序列同一性的序列 的多t核苷酸構建物。最優選地,多聚核苷酸構建物具有 如SEQ ID NO . 1或2中描述的序列。關於所述的多聚核苷 酸,參考上文的描述。多聚核苷酸構建物也在上文有所描 述。 本發明另一個方面提供原核或真核宿主細胞,其包含 如上文所述的根據本發明的多聚核苷酸或包含所述多聚核 苷酸的多聚核苷酸構建物。優選地,宿主細胞是用上文_描 述的本發明多聚核苷酸構建物進行穩定或暫態轉化。關於 轉化步驟,注意到轉化可根據標準操作流程施行。然而, 參考的是 Sambrook 等人(2000),Molecular Cloning : A Laboratory Manual,3rd Ed.,Cold Spring Harbour Laboratory Press,Cold Spring Harbour,NY。本發明另一個方面提供 非-人生物體、轉基因動物及轉基因微生物體,其分別含有 本發明的上文-描述的多聚核苷酸或上文-描述的載體或多 聚核普酸構建物。 優選地,本發明的宿主細胞或動物或微生物體表達併 45 201043959 合成本發明的抗原—結合多肽。 逆些佰主細胞可以為任何原核或真核細胞,優選地為 微生物細胞,更優選地為細菌、酵母、真菌和藻類細胞。 在微生物細胞中特別優選地為大腸埃希氏菌(Escherichia coll)細胞、鏈黴菌屬(Streptomyces)細胞、畢赤酵母(Pichia pastons)細胞或裂殖酵母(Schizosaccharomyces)細胞,最優 選地為大腸埃希氏菌細胞。 進一步地,本發明提供特異於由根據本發明的多聚核 普酸編碼的多肽的抗體,以及生產所述抗體的方法,其中 方法包括以下步驟: a) 提供本發明的多聚核苷酸構建物,以及 b) 用所述的多聚核苷酸構建物免疫合適的受試者,優 選地為合適的非-人動物如小鼠、大氣、山羊、綿羊、 豚鼠或兔,更優選地為兔。 多聚核苷酸構建物及對合適受試者的免疫在上文描 述。這些抗體可通過技術人員已知的任何標準步驟進行回 收。這些抗體可例如用於中和或純化特定抗原。 進一步地,本發明還涉及用於測試組合物中外來物質 的分部套盒的用途,所述試劑盒包括 a)含有編碼活性物質的至少一部分的序列的多聚核苷 酸構建物’以及 C)宿主細胞 關於術語外來物質、多聚核苷酸構建物、活性物質和 宿主細胞,以及關於用於測試外來物質的方法,爹考上文 46 201043959 描述。 在個進一步的實施方式中,本發明還涉及分部套 盒,包括 a) 包3具有HSEQ NO : 1或2所示的核酸至少9〇%, 優選地至少95% ’更優選地至少98%的序列同一性的 序列的多聚核苦峻構建物,或包含士 口 SEQ ID NO : 1 或2中描述的序列的多聚核棘構建物 ,以及
b) 伤主細胞。 關於術語活性物質、多聚核苷酸構建物和宿 主細胞, 參考上文描述。 包含具有與SEQ ID NO : 1或2所示的核酸至少90 %, 優選地至少95%,更優選地至少98%的序列同一性的序列的 夕聚核苷酸構建物,或包含如SEQ ID N〇 : 中描述的 序列的多聚核苷酸構建物用於轉化合適的宿主細胞,如細 菌細胞、酵母細胞、真菌細胞、藻類細胞、植物細胞或昆 蟲細胞,優選地為細菌細胞如大腸桿菌細胞。轉化的宿主 細胞在合適的培養基中培養,然後收集並裂解,並且回收 多聚核苷酸構建物。如上文描述的,擴增的多聚核苷酸構 建物然後用於免疫受試者。免疫的受試者反過來產生針對 多聚核苷酸構建物的表達產物的抗體,例如在這種情況下 針對為活性物質的至少一部分的蛋白質。抗體然後可用於 測試包含至少一種活性物質的組合物中的外來物質其中 活性物質至少部分地由如下序列編碼,所述序列具有與 SEQ ID NO : 1或2所示序列至少90%,優選地至少95%,更 47 201043959 優選地至少98%的序列同一性,或其中活性物質至少部分 地由如SEQ ID NO : 1或2中描述的序列編碼。 關於在組合物中測試所述外來物質的方法,參考上文 描述。 以下附圖及實施例更洋細地闡述了本發明,然而其只 為闡述性目的提出,不應理解為會以任何方式限制本發明 的範圍。 實施例 1.編碼HA和NA的多聚核苷酸及DNA構建物的製備 分別從流感病毒A/Viet Nam/1194/2〇04 (H5N1)的血凝 素(HA)和神經氨酸酶(ΝΑ)蛋白質的已知序列製備DNA載 體(編碼HA和NA的序列分別在pubMed資料庫中公開,見 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,http: //www.ncbi.nlm.nih.gov /nuccore/145284463 ?ordinalp〇s=l&itool=EntrezSystem2.PEntr igz.Sequence.Sequence ResultsPanel.Sequence RYDocSum » 和 http : "www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore /145284406?ordinalpos =l&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Sequence.Sequence ResultsP anel.Sequence RVDrtdmi、〇 如例如 Roth,D. A.等人’“Translational Engineering and Synthetic Biology”,Landes Bioscience,2007 中描述的,對 HA和NA編碼序列進行電腦優化。具體地,ha和NA編碼序 列的密碼子使用和密碼子-對使用根據家兔(〇ryct〇lagus cuniculus)而優化。在上文說明書中描述的合理的同源性變 異範圍之内,同樣地可對其他要通過所提供的HA和NA編 48 201043959 碼序列免疫的受試者施行密碼子優化。上游5’非翻f筆區t 被優化以避免可能阻礙翻譯起始的不想要的二 構。將用CODA演算法優化的HA和NA基因組裝並克降到 pCMV載體中,所述載體可從大量供應者商購得到,如
Clontech Laboratories > Inc. ° 兩種pCMV構建物都有以下特 徵: -巨細胞病毒(CMV)啟動子驅動的哺乳動物表達载 體,其用於生產高水準RNA轉錄物,
-置於ATG起始密碼子前的Kozak共有序列以確保有 效的核糖體結合,以及因此的最高水準的蛋白質翻譯, -轉錄終止信號’ poly(A)信號被置於基因末端以破保 合適的轉錄終止。 使用限制性酶(Nhe I和Xba I)將CODA演算法優化的 HA和NA基因亞-克隆至CMV啟動子驅動的載體中,分別命 名為pCMV-HA和pCMV-NA。通過限制性酶消化和DNA測 序證實正確的序列。載體圖譜和DNA序列列於第3-6圖。 DNA構建物分開轉染入大腸桿菌細胞,從中製備主細 胞庫(Master Cell Bank,MCB)。根據技術人員已知的標準 方法就無菌性、噬菌體、質粒標誌物保持以及質粒鑒別測 試MCB。 2.質粒生產 從大腸桿菌培養物中進行大批量質粒生產,隨後進行 質粒分離、純化和鑒定。根據技術人員已知的標準方法就 DNA完整性、OD 260/280比、瓊脂糖凝膠分析、限制性分 49 201043959 析、DNA序列、污染性蛋白質、内毒素測試純化的大批量 質粒。 3. 動物的免疫及抗jk清的產生 隨後通過免疫2組各6隻兔產生抗血清。在研究第〇、28 和56天用0.5ml DNA材料(即質粒)接種每隻兔。每次劑量 由l.Omg總DNA構成。一組兔用單價HADNA免疫,另一組 兔用HA和NA DNA的一價1 : 1混合物免疫。在第〇、28、%、 42和56天從所有動物中收集免疫前、後的血液樣品。在研 究第70天,放血處死所有動物。所有兔皆為健康、活力並 在整個觀察期沒有任何臨床象徵顯示劑量或測試樣品相關 問題。所有兔為健康,並在整個研究階段存活,並且不顯 示任何對抗原的不利反應。 獲得的含有所產生的抗體的血液可被激發,以例如獲 得含有特異性中和抗體的血清樣品,或獲得特異於質粒/載 體表達產物的分離的抗體。 4. 中和測試 可以從收集的血液中製備血清樣品,並施行針對流行 參考株NIBRG-14的工作種子病毒(w〇rking Seed , wsv)的中和效力測試。NIBRG_14為用於疫苗製備的重組 A/Viet Nam/1194/2004-樣株系;該株系可獲自Nmsc(見 http · //www.nibsc.ac.uk/ 和 http : //www.nibsc.ac.uk /flu 8他/ pandemic.html)。這些血清中和測試可如下文進行: 將2倍稀釋的W S V與12個最終兔血的一系列四組3倍稀 釋液混合。這些血清稀釋液可在分開的燒瓶中製備,並在 50 201043959 燒瓶中輕輕搖晃溶液以均質化和包被瓶邊緣。可直接在血 清稀釋液中用槍頭吹吸WSV ,所得的稀釋液可輕柔地均質 化。然後,可將稀釋液轉移到新的乾淨燒瓶中,並通過二 晃板上輕柔搖晃在37°c孵育2小時。 接種細胞丽一天,準備含有每種細胞系的75cm2燒瓶: 6瓶用於中和的WSV’ -瓶用於陽性和抑制對照,—瓶用於 陰性對照。 陽性對照 陽性對照對應於接種大約1000 TClD50 (“組織培養感 染劑量”;會在50%細胞培養物中產生病理學變化的病原性 物貝的量)的人副流感3病毒。一個陽性對照可在第〇天接種 並用作第14天血細胞吸附和/或血凝測試的陽性對照。 抑制對照 靶標細胞可與待測樣品一同接種,先以大約1〇〇〇 TCID50的人副流感3病毒入侵。 陰性對照 用於陰性對照,特異於各細胞系的稀釋液培養基可每 瓶接種。此對照可在與待測樣品相同條件下進行處理。 接種 反應的,即潛在地被中和的WSV稀釋液可隨後接種在 三個檢測細胞系上(Vero細胞(獲自美國典型培養物保藏中
心(American Type Culture Collection,ATTC) CCL-81 ; Yasumunra Y.等人,1962) , MRC-5 細胞(獲自 ATCC
CCL-171 ; Jacobs J. p.等人,和 MDCK細胞(ECACC 51 201043959 84121903 ; S. H. Darby,1958))。3 ml 每種溶液(稀釋液培 養基,待測樣品)可接種在用於潛在地被中和的WSV和對照 的各自培養瓶中。37°C+/-2。(:下70分鐘+/- 10分鐘後, 可移除接種體。然後加入存活培養基以獲得20ml的終體 積。培養瓶可在5+/-0.5 % C02下置於37°C+/- 2。(:。 接種的細胞在倒置顯微鏡下有規律地觀察14天,並就 細胞病理效應(CPE)的存在和血凝活性進行檢查。中和效力 可通過觀察CPE,通過血細胞吸附測試和通過血凝測試而 檢測。 4.1 CPE觀察 細胞可在測試期間在倒置顯微鏡下有規律地觀察。 4.2血細胞吸附測試 血細胞吸附測試可在測試期末進行(第丨4天)。單層細胞 可用PBS緩衝液洗滌一次或兩次。接著,將於pBS中製備的 含有0.4%二種類型(人、Hartley豚鼠和公雞)紅細胞的溶液 加入各孔。紅細胞吸附是病毒感染特異性的,並且當—種 紅細胞類型固定於細胞上時為陽性的。在於5°c+/_ rc下孵 育大約30分鐘之後,對細胞進行顯微鏡檢查。在第二次觀 察之前,平板可接著在37\:+/-2。(:下再孵育大約30分鐘。 4.3血凝測試 第14天,可在用於血細胞吸附血凝測試的燒瓶中的細 胞培養物上清上進行血凝測試。上清可通過低速離心回收 和澄清。澄清的上清可接著置於6孔板。然後將於pBS中製 備的含有〇 · 2 5 %三種類型(人、H a打丨e y豚鼠和公雞)紅細胞的 52 201043959 溶液加入各孔。在於5°c+/- 3°C下孵育大約30分鐘之後,對 細胞進行顯微鏡檢查。在第二次觀察之前,6孔板可接著在 37°C+/-2°C下再孵育大約30分鐘。 使用特定細胞系,觀察到不存在病毒CPE且不存在特 異性血細胞吸附和/或血凝活性,認為測試樣品沒有病毒污 染物。 ❹ Ο 此外,可根據相同步驟測試48份過渡血液,除了只使 用一種細胞系(MDCK)。結果可與使用失活重組A/Viet Nam/1203/2004-樣病毒(一種已知在雪貂中誘導針對A/Viet Nam/1194/2004的交又反應抗體的病毒株)接種兔之後製備 的血清獲得的結果進行比較。 4.4母雞受精卵 根據歐洲藥典第6版,2.6.16章,可使用母雞受精蛋施 行J&L凝測試。 簡言之,可使用SPF(無特定病原體)蛋(蛋來源:c_ir
如 C—哪,彻,domaine de Cerv— 382i〇 W F職e),其從收職至_育,—聽存在取 畔育可在3心/1、魏7_度下進行。 樣品製備 《料抗血清崎巾和。 中加入1 %以避免細_蛋的 办飞 的注射針注射人蛋。 ,、、、後’可將樣品用合適 卵的預-解育 在收到時,預-畔育之前 祖略觀察蛋,丟棄損壞的 53 201043959 卵。然後,卵可名τ J在37C下預-孵育9_u天。在 可在冷光下觀察這此蛋 予月期末, 活的胚胎的蛋。避免加熱,丟棄未受精蛋或沒有 接種 對於刀析相樣品(潛在被中和的WSV),可在r =後經尿囊掏種3〇顆蛋,並且對於測試對昭,= 25顆蛋。 I、、、,可接種 顆蛋),幻以, 關充有抗生素的咖(例如H) 、, 稀釋的抗血清(例如5顆蛋),及單獨兩種麵刑 綿平抗血清(例如每種類型5顆蛋)進行接種。 、' 丨卞两陰性對照 作為血凝測試的陽性對照,可使用仙台病毒(未稀釋)。 可按如下方法進行接種: 在蛋殼料之後,可在殼上打孔,Q 5mi待測樣品可經 。途後接種於55顆蛋。可填充蛋殼的孔,蛋在3rc+/ 2 °C下孵育7天。 在孵育末期,可在觀察後收集活胚胎中的尿囊液體。 在觀察到死亡胚胎的情況下,可將各胚胎的液體分別储存 於< 70 C與5 C +/-3°C之間(防止細菌污染)用於進一步 究。 血凝測試 在孵育期末,可按如下方法進行血凝測試: 液體可通過離心(2500g ’ 10分鐘)進行澄清,並將2〇〇μ1 液體分配到四個96孔板中(50μ1每孔)以進行血凝測試。簡言 之’在兩塊96孔板的孔中加入50μ1含0.5%紅血球(豚鼠;購 54 201043959 自 Charles River Laboratory,France)的溶液,在另外兩塊% 孔板的孔中加入50 μΐ含〇·5 %紅細胞(母雞)的溶液。一半平 板在5°C+/-3°C下孵育,另一半則孵育於室溫下。在兩小時 粹育後,檢查平板的血凝活性。 如果在從接種的蛋中收集的液體中没有特異性血凝活 性,則認為待測樣品沒有病毒污染。 5.測試偶發/外來物質
中和血清然後可用於外來物質測試。這些測試可根據 管理要求(歐洲藥典2.6.16章)施行。這些測試可在成年小 鼠、乳小鼠和豚乳中根據管理要求,例如,根據歐洲藥典, 2〇05,2.6.16章(病毒種批)施行。關於可在乳小鼠中施行的 測έ式’注思到乳小机也可以在1 -2天大時用待測組合物進行 接種。對於在鳥組織中繁殖的病毒’如歐洲藥典2005,2 6 16 章(病毒種批和病毒收集)中描述的施行鳥病毒測試。 5.1成年小鼠:CD1小鼠 二組例如10隻成年CD1小鼠(15-20g,例如講自Charles River Laboratory)可至少適應新環境48小時。一組可以接受 中和的血清(腦内(Ic)注射30μ1 ’腹膜内注射(ΐρ)5〇〇μΐ),一 組保留以防觀察期内發生死亡,一組可用作陰性對照。 可在測試期有規律地觀察小鼠(一天一次或兩次)。 如果在觀察期末(21天)80%來自接受中和的樣品組的 小鼠存活,則在待測樣品中沒有病毒存在。 5.2 CD1乳小鼠 30隻1-2天大的小鼠(講自例如Charles River Laboratory) 55 201043959 用中和的血清進行接種,1G隻小鼠用作陰性_。每隻乳 小鼠接受仙·和副μ1 IP待測血清。可在測試期内^規 律地觀察小鼠(一天一次或兩次)。 如果在觀察期細天)_來自接受中和的樣品組的 小鼠存活,則在待測樣品中沒有病毒存在。 5.3 Hartley 豚鼠 9隻豚I、中(350-450g ’ _自例如⑽以Ri爾 Labor迦y,France),5隻動物的一組叩注射觸^的待 測樣品。4隻動物可作為陰性對照在42天的測試期内觀察。 如果在測試期沒有病毒感染的跡象(即,死亡或肉眼可 見的病理)被檢剩,狀有病毒存在於待測樣品中。 【圖式簡單說明】
第1圖顯示了密碼子優化的血凝素抗原(ΗΑ ; SEQ ID NO. 1)的核苷酸序列。第一個和最後一個三核苷酸(下劃線) 为別代表了起始和終止密碼子。 第2圖顯不了密碼子優化的神經氨酸酶抗原(NA ; SEQ IE> NO : 2)的核苷酸序列。第一個和最後一個三核苷酸(下 劃線)分別代表了起始和終止密碼子。 第3圖顯示pCMV-HA的DNA構建物圖譜,包含編碼HA 的密碼子優化的序列。 第4圖顯示pCMV-NA的DNA構建物圖譜,包含編碼NA 的密碼子優化的序列。 第5圖顯示pCMV-HA的整個質粒DNA序列。用於質粒 構建的限制性酶加上下劃線,CODA演算法優化的HA基 56 201043959 因序列以粗體表示。 第6圖顯示pCMV-NA的整個質粒DNA序列。用於質粒 構建的限制性酶加上下劃線,CODA演算法優化的NA基因 序列以粗體表示。 【主要元件符號說明】 (無)
57 序列表 <110> Solvay Pharmaceuticals B.V. <120>外來物質測試 <130> WK 1280 <160> 4 <170> Patent In version 3.3 <210> 1 <211> 1698 <212> DNA <213> 天工 g纪密嗎子優化的ώΐ^(ΗΆ)抗原 <400> 1 atggagaaaa ttgtgctgct gttcgccatt gtgtccctgg tgaagtccga ccagatctgc 60 atcggctatc acgccaacaa ctccaccgag caggtcgaca ccattatgga aaagaatgtg 120 accgtgaccc atgcacaaga catcctggaa aagacccaca acggcaaact gtgcgacctg 180 gacggcgtga agcccctgat cctgcgcgac tgctccgtgg ctgggtggct gctgggaaac 240 cctatgtgcg acgagttcat caatgtgccc gagtggtcct acatcgttga gaaagccaac 300 cccgtcaacg acctgtgtta ccccggtgac ttcaacgact acgaggagct caagcacctg 360 ctctcccgga tcaaccactt cgagaaaatc cagatcatcc ccaaatcctc ctggtccagc 420 cacgaagcct ccctcggcgt gtcctccgct tgtccctacc agggcaagtc ctccttcttc 480 cgcaacgtcg tgtggctgat caaaaagaac tccacctacc ccaccattaa gcggtcctac 540 aacaacacca accaggaaga cctgctggtg ctgtggggca tccaccatcc caacgacgcc 600 gctgagcaga ccaagctgta ccagaaccct accacctaca tctccgtcgg gacatccaca 660 ctgaaccagc gcctcgtgcc ccgcattgcc acccgcagca aggtgaatgg gcagtccggc 720 cgcatggagt tcttctggac aatcctgaag cccaacgacg ctatcaactt cgagtccaac 780 ggcaacttca tcgctcccga gtatgcctac aagatcgtta aaaagggcga ctccacaatc 840 atgaagtccg agttggagta cggcaactgc aacaccaagt gccagacacc catgggcgct 900 atcaactcct ccatgccctt ccacaacatc catcccctga ccattggcga gtgccccaag 960 tacgtcaagt ccaaccggct ggtcctggct accggcctcc gcaactcccc tcaaagggaa 1020 cgcaggcgca aaaagagagg cctgttcgga gccatagctg ggttcattga gggagggtgg 1080 cagggcatgg tggatgggtg gtacggctac catcactcca acgagcaggg ctccgggtat 1140 gccgccgaca aggagtccac ccagaaggcc attgacggcg tgaccaacaa ggtgaacagc 1200 atcatcgaca agatgaacac ccagttcgag gctgttggcc gggagttcaa caacttggag 1260 cgccgcatcg agaacctgaa caaaaagatg gaggacggct tcctggatgt gtggacctac 1320 aacgctgagc tcctggtgct gatggagaac gagcggaccc tggacttcca cgactccaac 1380 gtcaagaacc tgtacgacaa agtgcgcctc cagctgcggg acaacgccaa ggagctcggg 1440 aatggctgct tcgagttcta ccacaagtgc gacaacgagt gtatgaagtc cgtgcgcaat 1500 ggcacctacg actatcccca gtactccgaa gaggcccgcc tgaagcgcga agagatctcc 1560 ggggtgaagt tggagtccat tggcatctac cagatcctga gcatctactc caccgtggct 1620 tcctccctcg ccctcgccat tatggtggct ggcctgtccc tgtggatgtg ctccaacggc 1680 tccctgcaat gtcgctaa 1698 2 1350
<210> <211> <212> <213> <223> 勸1刊[化的神鰱滕酶(HA>碰 <400> 2 atgaacccca accagaagat catcaccatt ggcagcatct gcatggtgac cgggatcgtt 60 agcctgatgc tgcagatcgg caacatgatc agcatctggg tgtcccacag catccatacc 120 ggcaaccagc accagtccga gcccatctcc aacaccaacc tgctgaccga gaaagctgtc 180 gcctccgtga agctggctgg caactcctcc ctgtgtccta tcaatgggtg ggctgtgtac 240 tccaaggaca actccattcg catcggcagc aaaggggatg tcttcgtgat ccgcgagcct 300 ttcatctcct gtagccacct cgaatgccgg accttcttcc tgacacaagg agccctgctg 360 aacgacaagc actccaacgg caccgtgaag gaccgctctc cccaccgcac cctgatgtcc 420 tgccccgtcg gcgaagcccc tagcccctac aactcccggt tcgagtccgt cgcctggagc 480 gcctctgcct gtcatgatgg gacctcttgg ctgaccattg gcatctccgg ccctgataat 540 ggagcagtgg ctgtgctgaa gtacaacggc atcatcaccg ataccattaa gtcctggcgc 600 aacaacatcc tccgcaccca ggagtccgag tgtgcctgtg tcaatggctc gtgctttacc 660 gtgatgaccg atgggccaag caatggacaa gcctcccaca agatcttcaa gatggaaaag 720 ggcaaggtgg tgaagtccgt cgagttggac gcccctaatt accactacga ggagtgcagc 780 tgttaccctg acgctgggga gatcacctgt gtgtgcaggg acaactggca cgggagcaac 840 aggccttggg tctccttcaa ccagaacttg gagtaccaga tcggctacat ctgttccggg 900 gtgttcgggg ataatcccag gcctaacgat ggcaccgggt cctgtggccc tgtgagctcc 960 aacggcgcag gcggggtcaa gggcttctcg ttcaaatatg gcaatggcgt gtggatcggg 1020 cgcaccaagt ccacaaactc ccggtccggc ttcgagatga tctgggaccc caatggatgg 1080 accgagacag acagctcctt ctccgtcaag caggacattg tggctatcac cgactggagc 1140 gggtacagcg gcagcttcgt gcagcacccc gagctcacag gcctcgactg cattcggccc 1200 tgcttttggg tggaactgat ccggggacgg cctaaggaga gcacaatctg gacctccggc 1260 tccagcatct ccttctgcgg cgtgaactcc gacacagtgg ggtggtcctg gcctgacgga 1320 gctgaactgc ccttcaccat tgacaagtaa 1350 <210> 3 <211> 5687 <212> DNA. <213> 人工 <220> <223> pCMV-HA的 粒DHAj?列 <400> 3 tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60 ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120 aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180 201043959
gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240 gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300 agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360 ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420 cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480 gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540 caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600 caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaataaccc 660 cgccccgttg acgcaaatgg gcggtaggcg tgtacggtgg gaggtctata taagcagagc 720 tcgtttagtg aaccgtcaga tcactagaag ctttattgcg gtagtttatc acagttaaat 780 tgctaacgca gtcagtgctt ctgacacaac agtctcgaac ttaagctgca gaagttggtc 840 gtgaggcact gggcaggtaa gtatcaaggt tacaagacag gtttaaggag accaatagaa 900 actgggcttg tcgagacaga gaagactctt gcgtttctga taggcaccta ttggtcttac 960 tgacatccac tttgcctttc tctccacagg tgtccactcc cagttcaatt acagctctta 1020 aggctagagt acttaatacg actcactata ggctagcgcc accatggaga aaattgtgct 1080 gctgttcgcc attgtgtccc tggtgaagtc cgaccagatc tgcatcggct atcacgccaa 1140 caactccacc gagcaggtcg acaccattat ggaaaagaat gtgaccgtga cccatgcaca 1200 agacatcctg gaaaagaccc acaacggcaa actgtgcgac ctggacggcg tgaagcccct 1260 gatcctgcgc gactgctccg tggctgggtg gctgctggga aaccctatgt gcgacgagtt 1320 catcaatgtg cccgagtggt cctacatcgt tgagaaagcc aaccccgtca acgacctgtg 1380 ttaccccggt gacttcaacg actacgagga gctcaagcac ctgctctccc ggatcaacca 1440 cttcgagaaa atccagatca tccccaaatc ctcctggtcc agccacgaag cctccctcgg 1500 cgtgtcctcc gcttgtccct accagggcaa gtcctccttc ttccgcaacg tcgtgtggct 1560 gatcaaaaag aactccacct accccaccat taagcggtcc tacaacaaca ccaaccagga 1620 agacctgctg gtgctgtggg gcatccacca tcccaacgac gccgctgagc agaccaagct 1680 gtaccagaac cctaccacct acatctccgt cgggacatcc acactgaacc agcgcctcgt 1740 gccccgcatt gccacccgca gcaaggtgaa tgggcagtcc ggccgcatgg agttcttctg 1800 gacaatcctg aagcccaacg acgctatcaa cttcgagtcc aacggcaact tcatcgctcc 1860 cgagtatgcc tacaagatcg ttaaaaaggg cgactccaca atcatgaagt ccgagttgga 1920 gtacggcaac tgcaacacca agtgccagac acccatgggc gctatcaact cctccatgcc 1980 cttccacaac atccatcccc tgaccattgg cgagtgcccc aagtacgtca agtccaaccg 2040 gctggtcctg gctaccggcc tccgcaactc ccctcaaagg gaacgcaggc gcaaaaagag 2100 aggcctgttc ggagccatag ctgggttcat tgagggaggg tggcagggca tggtggatgg 2160 gtggtacggc taccatcact ccaacgagca gggctccggg tatgccgccg acaaggagtc 2220 cacccagaag gccattgacg gcgtgaccaa caaggtgaac agcatcatcg acaagatgaa 2280 cacccagttc gaggctgttg gccgggagtt caacaacttg gagcgccgca tcgagaacct 2340 gaacaaaaag atggaggacg gcttcctgga tgtgtggacc tacaacgctg agctcctggt 2400 3
201043959 gctgatggag aacgagcgga ccctggactt ccacgactcc aacgtcaaga acctgtacga caaagtgcgc ctccagctgc gggacaacgc caaggagctc gggaatggct gcttcgagtt ctaccacaag tgcgacaacg agtgtatgga gtccgtgcgc aatggcacct acgactatcc ccagtactcc gaagaggccc gcctgaagcg cgaagagatc tccggggtga agttggagtc cattggcatc taccagatcc tgagcatcta ctccaccgtg gcttcctccc tcgccctcgc cattatggtg gctggcctgt ccctgtggat gtgctccaac ggctccctgc aatgtcgcta atctagagtc gacctgggcg gccgcttcga gcagacatga taagatacat tgatgagttt ggacaaacca caactagaat gcagtgaaaa aaatgcttta tttgtgaaat ttgtgatgct attgctttat ttgtaaccat tataagctgc aataaacaag ttaacaacaa caattgcatt cattttatgt ttcaggttca gggggagatg tgggaggttt tttaaagcaa gtaaaacctc tacaaatgtg gtaaaatcga taagtatccg ggctggcgta atagcgaaga ggcccgcacc gatcgccctt cccaacagtt gcgcagcctg aatggcgaat ggacgcgccc tgtagcggcg cattaagcgc ggcgggtgtg gtggttacgc gcagcgtgac cgctacactt gccagcgccc tagcgcccgc tcctttcgct ttcttccctt cctttctcgc cacgttcgcc ggctttcccc gtcaagctct aaatcggggg ctccctttag ggttccgatt tagtgcttta cggcacctcg accccaaaaa acttgattag ggtgatggtt cacgtagtgg gccatcgccc tgatagacgg tttttcgccc tttgacgttg gagtccacgt tctttaatag tggactcttg ttccaaactg gaacaacact caaccctatc tcggtctatt cttttgattt ataagggatt ttgccgattt cggcctattg gttaaaaaat gagctgattt aacaaaaatt taacgcgaat tttaacaaaa tattaacgct tacaatttcc tgatgcggta ttttctcctt acgcatctgt gcggtatttc acaccgcata tggtgcactc tcagtacaat ctgctctgat gccgcatagt taagccagcc ccgacacccg ccaacacccg ctgacgcgcc ctgacgggct tgtctgctcc cggcatccgc ttacagacaa gctgtgaccg tctccgggag ctgcatgtgt cagaggtttt caccgtcatc accgaaacgc gcgagacgaa agggcctcgt gatacgccta tttttatagg ttaatgtcat gataataatg gtttcttaga cgtcaggtgg cacttttcgg ggaaatgtgc gcggaacccc tatttgttta tttttctaaa tacattcaaa tatgtatccg ctcatgagac aataaccctg ataaatgctt caataatatt gaaaaaggaa gagtatgagt attcaacatt tccgtgtcgc ccttattccc ttttttgcgg cattttgcct tcctgttttt gctcacccag aaacgctggt gaaagtaaaa gatgctgaag atcagttggg tgcacgagtg ggttacatcg aactggatct caacagcggt aagatccttg agagttttcg ccccgaagaa cgttttccaa tgatgagcac ttttaaagtt ctgctatgtg gcgcggtatt atcccgtatt gacgccgggc aagagcaact cggtcgccgc atacactatt ctcagaatga cttggttgag tactcaccag tcacagaaaa gcatcttacg gatggcatga cagtaagaga attatgcagt gctgccataa ccatgagtga taacactgcg gccaacttac ttctgacaac gatcggagga ccgaaggagc taaccgcttt tttgcacaac atgggggatc atgtaactcg ccttgatcgt tgggaaccgg agctgaatga agccatacca aacgacgagc gtgacaccac gatgcctgta gcaatggcaa caacgttgcg caaactatta actggcgaac tacttactct agcttcccgg caacaattaa tagactggat ggaggcggat aaagttgcag gaccacttct gcgctcggcc cttccggctg gctggtttat 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 3000 3060 3120 3180 3240 3300 3360 3420 3480 3540 3600 3660 3720 3780 3840 3900 3960 4020 4080 4140 4200 4260 4320 4380 4440 4500 4560 4620 4680 4 201043959
tgctgataaa tctggagccg gtgagcgtgg gtctcgcggt atcattgcag cactggggcc 4740 agatggtaag ccctcccgta tcgtagttat ctacacgacg gggagtcagg caactatgga 4800 tgaacgaaat agacagatcg ctgagatagg tgcctcactg attaagcatt ggtaactgtc 4860 agaccaagtt tactcatata tactttagat tgatttaaaa cttcattttt aatttaaaag 4920 gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac gtgagttttc 4980 gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt 5040 tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt 5100 gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat 5160 accaaatact gttcttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc 5220 accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa 5280 gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg 5340 ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag 5400 atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag 5460 gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa 5520 cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt 5580 gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg 5640 gttcctggcc ttttgctggc cttttgctca catggctcga cagatct 5687 <210> 4 <211> 5339 <212> DNA <213> 人工 <220> <223> pCMV- HA的粒DHA序列 <400> 4 tcaatattgg ccattagcca tattattcat tggttatata gcataaatca atattggcta 60 ttggccattg catacgttgt atctatatca taatatgtac atttatattg gctcatgtcc 120
aatatgaccg ccatgttggc attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg 180 gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc 240 gcctggctga ccgcccaacg acccccgccc attgacgtca ataatgacgt atgttcccat 300 agtaacgcca atagggactt tccattgacg tcaatgggtg gagtatttac ggtaaactgc 360 ccacttggca gtacatcaag tgtatcatat gccaagtccg ccccctattg acgtcaatga 420 cggtaaatgg cccgcctggc attatgccca gtacatgacc ttacgggact ttcctacttg 480 gcagtacatc tacgtattag tcatcgctat taccatggtg atgcggtttt ggcagtacac 540 caatgggcgt ggatagcggt ttgactcacg gggatttcca agtctccacc ccattgacgt 600 caatgggagt ttgttttggc accaaaatca acgggacttt ccaaaatgtc gtaataaccc 660 cgccccgttg acgcaaatgg gcggtaggcg tgtacggtgg gaggtctata taagcagagc 720 tcgtttagtg aaccgtcaga tcactagaag ctttattgcg gtagtttatc acagttaaat 780 tgctaacgca gtcagtgctt ctgacacaac agtctcgaac ttaagctgca gaagttggtc 840 gtgaggcact gggcaggtaa gtatcaaggt tacaagacag gtttaaggag accaatagaa 900 5 960 actgggcttg tcgagacaga gaagactctt gcgtttctga taggcaccta ttggtcttac tgacatccac tttgcctttc tctccacagg tgtccactcc cagttcaatt acagctctta aggctagagt acttaatacg actcactata ggctagcgcc accatgaacc ccaaccagaa gatcatcacc attggcagca tctgcatggt gaccgggatc gttagcctga tgctgcagat cggcaacatg atcagcatct gggtgtccca cagcatccat accggcaacc agcaccagtc cgagcccatc tccaacacca acctgctgac cgagaaagct gtcgcctccg tgaagctggc tggcaactcc tccctgtgtc ctatcaatgg gtgggctgtg tactccaagg acaactccat tcgcatcggc agcaaagggg atgtcttcgt gatccgcgag cctttcatct cctgtagcca cctcgaatgc cggaccttct tcctgacaca aggagccctg ctgaacgaca agcactccaa cggcaccgtg aaggaccgct ctccccaccg caccctgatg tcctgccccg tcggcgaagc ccctagcccc tacaactccc ggttcgagtc cgtcgcctgg agcgcctctg cctgtcatga tgggacctct tggctgacca ttggcatctc cggccctgat aatggagcag tggctgtgct gaagtacaac ggcatcatca ccgataccat taagtcctgg cgcaacaaca tcctccgcac ccaggagtcc gagtgtgcct gtgtcaatgg ctcgtgcttt accgtgatga ccgatgggcc aagcaatgga caagcctccc acaagatctt caagatggaa aagggcaagg tggtgaagtc cgtcgagttg gacgccccta attaccacta cgaggagtgc agctgttacc ctgacgctgg ggagatcacc tgtgtgtgca gggacaactg gcacgggagc aacaggcctt gggtctcctt caaccagaac ttggagtacc agatcggcta catctgttcc ggggtgttcg gggataatcc caggcctaac gatggcaccg ggtcctgtgg ccctgtgagc tccaacggcg caggcggggt caagggcttc tcgttcaaat atggcaatgg cgtgtggatc gggcgcacca agtccacaaa ctcccggtcc ggcttcgaga tgatctggga ccccaatgga tggaccgaga cagacagctc cttctccgtc aagcaggaca ttgtggctat caccgactgg agcgggtaca gcggcagctt cgtgcagcac cccgagctca caggcctcga ctgcattcgg ccctgctttt gggtggaact gatccgggga cggcctaagg agagcacaat ctggacctcc ggctccagca tctccttctg cggcgtgaac tccgacacag tggggtggtc ctggcctgac ggagctgaac tgcccttcac cattgacaag taatctagag tcgacctggg cggccgcttc gagcagacat gataagatac attgatgagt ttggacaaac cacaactaga atgcagtgaa aaaaatgctt tatttgtgaa atttgtgatg ctattgcttt atttgtaacc attataagct gcaataaaca agttaacaac aacaattgca ttcattttat gtttcaggtt cagggggaga tgtgggaggt tttttaaagc aagtaaaacc tctacaaatg tggtaaaatc gataagtatc cgggctggcg taatagcgaa gaggcccgca ccgatcgccc ttcccaacag ttgcgcagcc tgaatggcga atggacgcgc cctgtagcgg cgcattaagc gcggcgggtg tggtggttac gcgcagcgtg accgctacac ttgccagcgc cctagcgccc gctcctttcg ctttcttccc ttcctttctc gccacgttcg ccggctttcc ccgtcaagct ctaaatcggg ggctcccttt agggttccga tttagtgctt tacggcacct cgaccccaaa aaacttgatt agggtgatgg ttcacgtagt gggccatcgc cctgatagac ggtttttcgc cctttgacgt tggagtccac gttctttaat agtggactct tgttccaaac tggaacaaca ctcaacccta tctcggtcta ttcttttgat ttataaggga ttttgccgat ttcggcctat tggttaaaaa atgagctgat ttaacaaaaa tttaacgcga 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 3000 3060 3120 3180 attttaacaa aatattaacg cttacaattt cctgatgcgg tattttctcc ttacgcatct gtgcggtatt tcacaccgca tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg atgccgcata gttaagccag ccccgacacc cgccaacacc cgctgacgcg ccctgacggg cttgtctgct cccggcatcc gcttacagac aagctgtgac cgtctccggg agctgcatgt gtcagaggtt ttcaccgtca tcaccgaaac gcgcgagacg aaagggcctc gtgatacgcc tatttttata ggttaatgtc atgataataa tggtttctta gacgtcaggt ggcacttttc ggggaaatgt gcgcggaacc cctatttgtt tatttttcta aatacattca aatatgtatc cgctcatgag acaataaccc tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg aagagtatga gtattcaaca tttccgtgtc gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc cttcctgttt ttgctcaccc agaaacgctg gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg ggtgcacgag tgggttacat cgaactggat ctcaacagcg gtaagatcct tgagagtttt cgccccgaag aacgttttcc aatgatgagc acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta ttatcccgta ttgacgccgg gcaagagcaa ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat gacttggttg agtactcacc agtcacagaa aagcatctta cggatggcat gacagtaaga gaattatgca gtgctgccat aaccatgagt gataacactg cggccaactt acttctgaca acgatcggag gaccgaagga gctaaccgct tttttgcaca acatggggga tcatgtaact cgccttgatc gttgggaacc ggagctgaat gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc acgatgcctg tagcaatggc aacaacgttg cgcaaactat taactggcga actacttact ctagcttccc ggcaacaatt aatagactgg atggaggcgg ataaagttgc aggaccactt ctgcgctcgg cccttccggc tggctggttt attgctgata aatctggagc cggtgagcgt gggtctcgcg gtatcattgc agcactgggg ccagatggta agccctcccg tatcgtagtt atctacacga cggggagtca ggcaactatg gatgaacgaa atagacagat cgctgagata ggtgcctcac tgattaagca ttggtaactg tcagaccaag tttactcata tatactttag attgatttaa aacttcattt ttaatttaaa aggatctagg tgaagatcct ttttgataat ctcatgacca aaatccctta acgtgagttt tcgttccact gagcgtcaga ccccgtagaa aagatcaaag gatcttcttg agatcctttt tttctgcgcg taatctgctg cttgcaaaca aaaaaaccac cgctaccagc ggtggtttgt ttgccggatc aagagctacc aactcttttt ccgaaggtaa ctggcttcag cagagcgcag ataccaaata ctgttcttct agtgtagccg tagttaggcc accacttcaa gaactctgta gcaccgccta catacctcgc tctgctaatc ctgttaccag tggctgctgc cagtggcgat aagtcgtgtc ttaccgggtt ggactcaaga cgatagttac cggataaggc gcagcggtcg ggctgaacgg ggggttcgtg cacacagccc agcttggagc gaacgaccta caccgaactg agatacctac agcgtgagct atgagaaagc gccacgcttc ccgaagggag aaaggcggac aggtatccgg taagcggcag ggtcggaaca ggagagcgca cgagggagct tccaggggga aacgcctggt atctttatag tcctgtcggg tttcgccacc tctgacttga gcgtcgattt ttgtgatgct cgtcaggggg gcggagccta tggaaaaacg ccagcaacgc ggccttttta cggttcctgg ccttttgctg gccttttgct cacatggctc gacagatct 3240 3300 3360 3420 3480 3540 3600 3660 3720 3780 3840 3900 3960 4020 4080 4140 4200 4260 4320 4380 4440 4500 4560 4620 4680 4740 4800 4860 4920 4980 5040 5100 5160 5220 5280 5339

Claims (1)

  1. 201043959 七、申請專利範圍: 1. 一種用於在包含至少一種活性物質的組合物中測試外 來物質的方法,所述方法包括: a) 將針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的 抗體與包含至少一種活性物質的組合物接觸,所述多聚 核苷酸構建物包含編碼活性物質的至少一部分的序 列,其中抗體結合於活性物質,以及 b) 在步驟a)之後確定組合物中外來物質存在與否。 2. 如申請專利範圍第1項的用於測試外來物質的方法,其 中步驟a)包括: a-Ι)提供針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生 的抗體,所述多聚核苷酸構建物包含編碼活性物質的至 少一部分的序列,以及 a-2)將所述抗體與包含至少一種活性物質的組合物 接觸。 3. 如申請專利範圍第1項的用於測試外來物質的方法,其 中步驟a)包括: a-Ι)提供通過用多聚核苷酸構建物免疫受試者而產 生的抗體,以及 a-2)將所述抗體與包含至少一種活性物質的組合物 接觸。 4. 如申請專利範圍第1-3項中任何一項的方法,其中活性 物質在步驟b)之前通過與抗體的結合而被中和或失活。 如申請專利範圍第1-3項中任何一項的方法,其中確定 1 5. 201043959 組合物中外來物質存在與否的步驟包括: a) 使用已經用多聚核苷酸構建物接種過的非-人動 物,所述多聚核苷酸構建物包含編碼活性物質的至少一 部分的序列,以及用待測組合物接種所述的動物, b) 在特定時間段後評估活動物百分比,其中在所述 時間段内’接種的動物中至少80%存活並不顯示感染跡 象的情況下’認為組合物不含有外來物質,並且在所述 時間段内,接種的動物中少於80%存活和/或至少一隻動 物顯示感染跡象的情況下’認為組合物含有外來物質。 6. 如申請專利範圍第I-4項中任何一項的方法,其中確定 組合物中外來物質存在與否的步驟包括: a) 用含有被中和或失活的活性物質的待測組合物 接種非-人動物, b) 在特定時間段後評估活動物百分比,其中在所述 時間段内,接種的動物中至少80%存活並不顯示感染跡 象的情況下’認為組合物不含有外來物質,在所述時間 段内’接種的動物中少於80%存活和/或至少有—隻動物 顯不感染跡象的情況下’ 5忍為組合物含有外來物質。 7. 如申請專利範圍第5或6項的方法,其中非_人動物選自 成年小鼠、乳小鼠和豚鼠,其中活動物百分比以及感染 跡象的發生在至少7-10天的時間段之後進行評估,可選 地,在接種動物為成年小鼠的情況下在用待測組合物接 種後21天的時間段後,在接種動物為乳小鼠的情況下在 用待測組合物接種後Η天的時間段後,和在接種動物為 2 201043959 豚鼠的情況下在用待測組合物接種後至少4 2天的時間 段後。 8·如申請專利範圍第5-7項中中任何一項的方法,其中接 種待測組合物是在腦内和/或腹膜内施行的。 9. 如申請專利範圍中任何一項的方法,其中確定組合物中 外來物質存在與否的步驟根據管理要求,優選地根據欧 洲藥典,2〇〇5,2.6.16章的要求而施行。 10. 如申請專利範圍中任何一項的方法,其中待測組合物分 別是從其中生產活性物質的細胞培養物樣品,或從所述 細胞培養物中衍生的產物,或者種子病毒或含有種子病 毒的組合物。 11. 如申請專利範圍中任何一工員的方法,纟中組合物是榮物 組合物,優選地是疫苗製備物或其中間產物。 12.如申4專利範圍中任何—項的方法,其中活性物質是抗 原,優選地是病毒抗原,或其中活性物質包含病毒顆粒 的至少一種組分, ,優選地活性物質是流感病毒顆粒。 13·如申請專利範圍中任何-項的方法,其中抗體 其中抗體通過用多 聚核皆酸構建物免疫受試者而提供。 14.如申請專利範圍中任何一項的方法,
    作為外來物質的病毒。 ’其中抗體用於測試
    201043959 17. 如申請專利範圍中任何—項的方法,其中多聚核替酸構 建物是密碼子優化的,㈣㈣是通過針對用於用多聚 ㈣酸構建物進行免疫的受試者的密碼子優化,戶斤述多 聚核苦酸構建物包含編石馬活性物質的至少一部分的序 列。 18. 如申請專利範财任何—項的方法,其中活性物質包含 流感抗原’並且多聚核*酸構建物包含具有與SEQ ϊΡ NO : 1或2所示的核酸至少9〇%,優選地至少9挪,更優 選地至少娜的序列同—性料列,甚至更優選地,潘 性物質包含流感抗原,並且多聚核皆酸構建物包含如 SEQIDNO : 1或2中描述的序列。 19·-翻多聚核微構建細產生特異性針對所述淨性 物質的抗體用於測試任何以下條件的用途,所述多聚核 苷酸構建物包含編碼活性物質的至少一部分的序列: i) 待測組合物中活性物質的存在與否, ii) 組合物中任何外來或傳染性物質的存在齊否, 其中抗體通過用多聚核苷酸構建物免疫受試者而 提供,並且其中活性物質被所述抗體中和或失活。 2〇·—種用於生產藥物組合物,具體而言為疫苗的方法,包 括在生產方法中至少一個時間點: 丑1)施Ί亍如申凊專利範圍第1 _ 18項中任何/須的方 法;或 丑2)施行如申請專利範圍第19項中的用途;以及, 可選地, 201043959 b)通過能夠移除和/或失活外來物質的處理而處理 藥物組合物,具體而言是疫苗或其中間產物的步驟,和 /或處理從中衍生藥物組合物或疫苗的細胞培養物的步 驟。 21. —種針對多聚核苷酸構建物的表達產物而產生的抗體 用於純化所述活性物質的用途,所述多聚核苷酸構建物 包含編碼活性物質的至少一部分的序列,其中抗體特異 性結合於活性物質,其中抗體和活性物質不是衍生自使 ® 用相同的多聚核苷酸構建物。 ~ 22. —種多聚核苷酸,其包含具有與SEQ ID NO : 1或2所示 的核酸至少90%,優選地至少95%,更優選地至少98% 的序列同一性的序列,或具有如SEQ ID NO : 1或2中描 述的序列。 23. —種多聚核苷酸構建物,其包含如申請專利範圍第22項 的多聚核苦酸。 24_ —種宿主細胞,其包含如申請專利範圍第22項的多聚核 ❹ 苷酸或如申請專利範圍第2 3項的多聚核苷酸構建物。 25. —種非-人生物體、轉基因動物或微生物體,其包含如 申請專利範圍第22或23項的多聚核苷酸或根據權利要 求23的多聚核苷酸構建物。 26. —種抗體,其特異於由如申請專利範圍第22項的多聚核 皆酸編碼的多肽。 27. —種用於產生根據如申請專利範圍第26項的抗體的方 法,包括: 5 201043959 a) 提供根據如申請專利範圍第23項的多聚核苷酸 構建物,以及 b) 用所述多聚核苷酸構建物免疫合適的受試者。 28. —種分部套盒用於測試組合物中外來物質的用途,試劑 盒包括 a)多聚核苷酸構建物,其包含編碼活性物質的至少 一部分的序列,以及 c) 宿主細胞。 29. —種分部套盒,包括: a)多聚核苷酸構建物,其包含編碼具有與SEQ ID NO : 1或2所示的核酸至少90%,優選地至少95%,更優 選地至少98%的序列同一性的活性物質的至少一部分 的序列,或包含如SEQ ID NO : 1或2中描述的序列,以 及 b)宿主細胞。
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