TH19989U - ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อปิโกโมไวรัสโดยใช้ชุดไพรเมอร์ดังกล่าว - Google Patents
ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อปิโกโมไวรัสโดยใช้ชุดไพรเมอร์ดังกล่าวInfo
- Publication number
- TH19989U TH19989U TH2003002096U TH2003002096U TH19989U TH 19989 U TH19989 U TH 19989U TH 2003002096 U TH2003002096 U TH 2003002096U TH 2003002096 U TH2003002096 U TH 2003002096U TH 19989 U TH19989 U TH 19989U
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- primer
- begonia
- reverse primer
- kit
- identification
- Prior art date
Links
Abstract
การประดิษฐ์นี้ได้พัฒนาชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง และ กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสโดยใช้ชุดไพรเมอร์ โดยชุดไพรเมอร์ดังกล่าวตรวจจำแนกเชื้อบีโกโม ไวรัสได้ 3 ชนิดคือ เชื้อ SLCCNV SLCuYV และ ToLCNDV ซึ่งเป็นเชื้อบีโกโมไวรัส 3 ชนิดหลักที่พบในพืช ตระกูลแตงในประเทศไทย โดยชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ประกอบด้วย ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (Beg-Cu-F) รีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่หนึ่ง (SLC1314-R) รีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่สอง (SYN955- R) และรีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่สาม (TOLC1524-R) โดยชุดไพรเมอร์ดังกล่าวนี้สามารถนำไปใช้ตรวจหาเชื้อบี โกโมไวรัสชนิด SLCCNV SLCuYV หรือ ToLCNDV อย่างใดอย่างหนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน ด้วยวิธีพีซีอาร์ หรือ วิธีมัลติเพล็กซ์-พีซีอาร์ได้ โดยสามารถตรวจจำแนกเชื้อได้ 3 ชนิดในคราวเดียวกันโดยไม่เกิดปฏิกิริยาข้าม กันเองหรือกับสารสกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างพืชที่ไม่เป็นโรค และมีความไวในการตรวจเชื้อทั้ง 3 ชนิดเทียบเท่า กับการตรวจด้วยวิธีพีซีอาร์มาตรฐาน วิธีการ มัลติเพล็กซ์-พีซีอาร์ โดยสามารถตรวจสอบพืชจากแปลงปลูกที่ติด เชื้อ SLCCNV SLCuYV หรือ ToLCNDV ทั้งในลักษณะที่เป็นการติดเชื้อชนิดเดียว และในลักษณะที่มีการติด เชื้อพร้อมกันมากกว่า 1 ชนิด ในรูปแบบต่างๆ
Claims (8)
1. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ประกอบด้วย ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ (Beg-Cu-F) มีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ 5’- GAA CTA TGK CGA AGC GWC CA -3’ รีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่หนึ่ง (SLC1314-R) มีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ 5’- GTC AAG GTG CAG GTA ATG TTC-3’ รีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่สอง (SYN955-R) มีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ 5’- CTT CCC TGC TTC CTG GTG AT-3’ รีเวิร์สไพรเมอร์เส้นที่สาม (TOLC1524-R) มีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ 5’- AAG AGC ATT CGC AGG AGG CGA G-3’
2. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ฟอร์เวิร์ด ไพรเมอร์ดังกล่าว มีความจำเพาะต่อเชื้อ SLCCNV SLCuYV และ ToLCNDV
3. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง รีเวิร์สไพรเมอร์ เส้นที่หนึ่งดังกล่าว มีความจำเพาะต่อเชื้อ SLCCNV
4. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง รีเวิร์สไพรเมอร์ เส้นที่สอง ที่มีความจำเพาะต่อเชื้อ SLCuYV
5. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง รีเวิร์สไพรเมอร์ เส้นที่สาม ที่มีความจำเพาะต่อเชื้อ ToLCNDV
6. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ชุดไพรเมอร์ ดังกล่าว สามารถนำไปใช้ตรวจหาเชื้อบีโกโมไวรัสชนิด SLCCNV SLCuYV หรือ ToLCNDV อย่างใดอย่าง หนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน ด้วยวิธีพีซีอาร์ หรือ วิธีมัลติเพล็กซ์-พีซีอาร์
7. กรรมวิธีการตรวจจำแนกชนิดของเชื้อบีโกโมไวรัส โดยใช้ไพรเมอร์ตามข้อถือสิทธิที่ 1 มีองค์ประกอบของ ส่วนผสมและสภาวะที่ใช้ในการทำปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์-พีซีอาร์ ดังนี้ ก. ส่วนผสมของปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์-พืซีอาร์ ประกอบด้วย บัฟเฟอร์สำหรับเอ็นไซม์ดีเอ็นเอโพลีเมอเรส ที่ความเข้มข้นเท่ากับ 1X สารละลายแมกนีเซียมคลอไรด์ ที่ความเข้มข้นเท่ากับ 1.5 มิลลิโมลาร์ ดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ไตรฟอสเฟท (dNTPs) ที่ประกอบด้วย dATP, dCTP, dGTP ที่ ความเข้มข้นตัวละ 0.3 มิลลิโมลาร์ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ Beg-Cu-F ที่ความเข้มข้น 0.3 ไมโครโมลาร์ รีเวิร์สไพรเมอร์ SLC1314-R ที่ความเข้มข้น 0.2 ไมโครโมลาร์ รีเวิร์สไพรเมอร์ TOLC1524-R ที่ความเข้มข้น 0.2 ไมโครโมลาร์ รีเวิร์สไพรเมอร์ SYN955-R ที่ความเข้มข้น 0.1 ไมโครโมลาร์ ดีเอ็นเอโพลีเมอเรส ในปริมาณ 0.625 ยูนิต สารสกัดดีเอ็นเอของตัวอย่างที่ต้องการตรวจสอบ ปริมาณ 2 ถึง 5 ไมโครลิตร นํ้ากลั่นที่ปราศจากเอ็นไซม์ดีเอ็นเอสและอาร์เอ็นเอส เพื่อปรับปริมาตรรวมของปฏิกิริยาให้ เป็น 50 ไมโครลิตร ข. สภาวะที่ใช้โนการทำปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์-พีซีอาร์ ประกอบด้วยการใช้เวลาและอุณหภูมิ ดังนี้ ปฏิกิริยาอินนิเชียล ดีแนทเขอเรชั่น ที่ 95 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 30 วินาที ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส ประกอบด้วยการบ่มที่ 95 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 30 วินาที ที่ 60 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 50 วินาที และที่ 68 องศาเซลเซียส หรือ 72 องศา เซลเซียส เป็นเวลา 1 นาที 10 วินาที เป็นจำนวนทั้งสิ้น 30 รอบ ปฏิกิริยาต่อสายดีเอ็นเอขั้นสุดท้าย ที่ 68 องศาเซลเซียส หรือ 72 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 5 นาที
8. กรรมวิธีการตรวจจำแนกชนิดของเชื้อบีโกโมไวรัส ตามข้อถือสิทธิที่ 7 ที่ซึ่ง ตัวอย่างที่ใช้ในการตรวจสอบ เลือกได้จาก สารสกัดจากพืชกตระกูลแตง หรือสารสกัดดีเอ็นเอจากแมลงหวี่ขาว
Publications (4)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH19989C3 TH19989C3 (th) | 2022-07-21 |
| TH19989A3 TH19989A3 (th) | 2022-07-21 |
| TH19989Y TH19989Y (th) | 2022-07-21 |
| TH19989U true TH19989U (th) | 2022-07-21 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Lanham et al. | Genetic characterization of gooseberry (Ribes grossularia subgenus Grossularia) germplasm using RAPD, ISSR and AFLP markers | |
| Shock et al. | Diversity of piroplasms detected in blood-fed and questing ticks from several states in the United States | |
| CN102016030B (zh) | 从木片中提取松材线虫的dna的方法、松材线虫的lamp引物组和从木片中检出松材线虫的方法 | |
| WO2004072230A2 (en) | Real-time polymerase chain reaction using large target amplicons | |
| Jeszke et al. | A fast and sensitive method for the simultaneous identification of three important nematode species of the genus Ditylenchus | |
| Thanarajoo et al. | Detection of Coconut cadang-cadang viroid (CCCVd) in oil palm by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) | |
| Liu et al. | Development and evaluation of a one-step reverse transcription loop-mediated isothermal amplification for detection of Citrus leaf blotch virus | |
| Leal et al. | Development of two reverse transcription‐PCR methods to detect living pinewood nematode, B ursaphelenchus xylophilus, in wood | |
| CN105331743A (zh) | 一步快速检测甜瓜多种病毒的试剂盒及其快速检测方法 | |
| Filipiak et al. | The use of real-time polymerase chain reaction with high resolution melting (real-time PCR-HRM) analysis for the detection and discrimination of nematodes Bursaphelenchus xylophilus and Bursaphelenchus mucronatus | |
| Kai et al. | Development of single-cell PCR methods for the Raphidophyceae | |
| TH19989Y (th) | ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อบีโกโมไวรัสในพืชตระกูลแตง และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อปิโกโมไวรัสโดยใช้ชุดไพรเมอร์ดังกล่าว | |
| ES2821751T3 (es) | Procedimientos y kits para la detección del mildiú pulverulento | |
| DE50213026D1 (de) | Tifikation in einer probe | |
| Hussein et al. | Genetic analysis in some Citrus accessions using microsatellites and AFLP-based markers | |
| RU2006118406A (ru) | Способ детекции бактерий рода yersinia и дифференциации патогенных для человека видов иерсиний методом полимеразной цепной реакции (пцр), олигонуклеотидные праймеры и набор реагентов для его осуществления | |
| Aslan et al. | Nucleic Acid–Based Methods in the Detection of Foodborne Pathogens | |
| Simoncini et al. | Real-time PCR for quantification of the bacterial endosymbionts (Wolbachia) of filarial nematodes | |
| 竹内祐子 et al. | Diagnosis and quantification of the pine wood nematode, Bursaphelenchus xylophilus (Steiner & Buhner), in wood of Pinus thunbergii with real-time PCR | |
| Sheikina | PCR-RFLP analysis of rbcL chloroplast gene | |
| WO2016114675A1 (en) | Method and kit for identification of nematodes, forest plant pests, by real-time pcr | |
| JP2007174973A (ja) | Ｓｓｒプライマーを用いるマルチプレックスｐｃｒによる品種識別法。 | |
| Callejas et al. | A contribution to the genetic characterization of some species of the genus Gobio (Cyprinidae) | |
| Fariya et al. | Development and standardization of PCR technique for detection of ciliate parasite Ichthyophthirius multifiliis from freshwater exotic carp Cyprinus carpio and Indian major carp Labeo rohita | |
| JP2022145579A (ja) | プライマーセット及び判別方法 |