TH14564C3 - ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อนิวคลีโอแคปสิดยีนของทอสโพไวรัสชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoV - Google Patents
ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อนิวคลีโอแคปสิดยีนของทอสโพไวรัสชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoVInfo
- Publication number
- TH14564C3 TH14564C3 TH1303000841U TH1303000841U TH14564C3 TH 14564 C3 TH14564 C3 TH 14564C3 TH 1303000841 U TH1303000841 U TH 1303000841U TH 1303000841 U TH1303000841 U TH 1303000841U TH 14564 C3 TH14564 C3 TH 14564C3
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- types
- genes
- tnrv
- wsmov
- mysv
- Prior art date
Links
- 241000354343 Capsicum chlorosis virus Species 0.000 title claims abstract 4
- 241000030956 Melon yellow spot virus Species 0.000 title claims abstract 4
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 title claims abstract 4
- 241000015557 Watermelon silver mottle orthotospovirus Species 0.000 title claims abstract 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract 4
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 abstract 3
- 241000712894 Orthotospovirus Species 0.000 abstract 2
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 abstract 1
- 235000009849 Cucumis sativus Nutrition 0.000 abstract 1
- 240000008067 Cucumis sativus Species 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 abstract 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 abstract 1
- 241000758706 Piperaceae Species 0.000 abstract 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 abstract 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 abstract 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 abstract 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 abstract 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 abstract 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 abstract 1
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract 1
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 abstract 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract 1
Abstract
DC60 (30/07/56) การประดิษฐ์นี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนายูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ (universal primer) สำหรับใช้ในการตรวจหานิวคลีโอแคปสิดยีน (nucleocapsid (N) gene) ของทอสโพไวรัส 4 ชนิด ที่พบระบาดและสร้างความเสียหายในแปลงพืชเศรษฐกิจในกลุ่มพริก มะเขือเทศ และพืช ตระกูลแตง ได้แก่ เชื้อทอสโพไวรัสชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoV โดยการนำ ลำดับเบสของดีเอ็นเอ (DNA sequence) ของยีน N ของทอสโพไวรัสทั้ง 4 ชนิดดังกล่าวมาทำ การอะไลน์เมนท์ (alignment) เพื่อตรวจหาบริเวณที่มีลำดับเบสอนุรักษ์ (conserve) ระหว่าง ทอสโพไวรัสทั้ง 4 ชนิดนี้ และทำการสังเคราะห์ไพรเมอร์ที่มีลำดับเบสเป็นคู่สมกับบริเวณ ดังกล่าวเพื่อนำมาทดสอบความสามารถในการตรวจหาทอสโพไวรัสทั้ง 4 ชนิด ในตัวอย่างที่ ต้องการทดสอบการติดเชื้อไวรัส 4 ชนิดนี้โดยวิธีอาร์ที-พีซีอาร์ เพื่อให้ได้ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์คู่ ใหม่ที่มีความจำเพาะกับยีน N ของทอสโพไวรัสทั้ง 4 ชนิดนี้ ซึ่งปัจจุบันยังไม่เคยมีรายงานถึง ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ที่ใช้ในการเพิ่มจำนวนยีน N ของ CaCV, MYSV , TNRV และ WSMoV ได้ พร้อมกันมาก่อน ซึ่งยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ดังกล่าวสามารถนำไปใช้ประโยชน์ทั้งในแง่การเพิ่ม ความไวในการตรวจสกรีน (screen) ทอสโพไวรัสเบื้องต้นด้วยวิธีอาร์ที-พีซีอาร์ หรือ นำไปใช้ ร่วมกับเทคโนโลยีอื่น อาทิเช่น อาร์เอฟแอลพี หรือ ดีเอ็นเอไฮบริไดเซชั่น ซึ่งรวมเรียกว่า อาร์ที- พีซีอาร์ อาร์เอฟแอลพี หรือ อาร์ที-พีซีอาร์-อีไลซ่า ตามลำดับ เพื่อประโยชน์ในการจำแนกชนิด ของทอสโพไวรัสทั้ง 4 ชนิดดังกล่าวได้พร้อมกันอย่างจำเพาะเจาะจง
Claims (1)
1.ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์(universal primer)ที่จำเพาะต่อนิวคลีโอแคปสิดยีนของทอสโพไวรัส ชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoV ซึ่งมีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ UD1F (5\'-3\'):AGCAGATTTTTGCAGCYTGCAA รีเวิร์สไพรเมอร์ UD5R(5\'-3\'):TGYTCATAKGTAGAGaaGTTYTTKAT
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH14564C3 true TH14564C3 (th) | 2018-11-08 |
| TH14564A3 TH14564A3 (th) | 2018-11-08 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP4303314A3 (en) | Polypeptide tagged nucleotides and use thereof in nucleic acid sequencing by nanopore detection | |
| WO2015123430A3 (en) | Single molecule electronic multiplex snp assay and pcr analysis | |
| WO2016064894A3 (en) | Compositions and methods for detecting an rna virus | |
| RU2017101353A (ru) | Набор или устройство для обнаружения рака пищевода и способ обнаружения | |
| WO2013152264A3 (en) | Proteins toxic to hemipteran insect species | |
| WO2015200717A3 (en) | Pcr-activated sorting (pas) | |
| WO2015070187A3 (en) | Systems and methods for universal tail-based indexing strategies for amplicon sequencing | |
| WO2014052487A8 (en) | Two-primer pcr for microrna multiplex assay | |
| EP3543362A3 (en) | Pcr primer set for bacterial dna amplification, kit for detecting and/or identifying bacterial species, and method for detecting and/or identifying bacterial species | |
| HK1251023A1 (zh) | 检测一个或多个病原体 | |
| EA201792405A1 (ru) | Обнаружение целевой нуклеиновой кислоты и ее вариантов | |
| WO2014143714A3 (en) | Methods for one step nucleic acid amplification of non-eluted samples | |
| WO2014136124A3 (en) | Multiplex real time pcr testing kit for the simultaneous detection of hepatitis virus | |
| ES2722900T3 (es) | Portaobjetos para micromatrices y método para detectar algas tóxicas | |
| WO2016073255A8 (en) | Detection of hiv-1 nucleic acids by reverse-transcription loop-mediated isothermal amplication | |
| JP2014083052A5 (th) | ||
| TH14564A3 (th) | ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อนิวคลีโอแคปสิดยีนของทอสโพไวรัสชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoV | |
| TH14564C3 (th) | ยูนิเวอร์แซลไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อนิวคลีโอแคปสิดยีนของทอสโพไวรัสชนิด CaCV, MYSV, TNRV และ WSMoV | |
| AR105291A1 (es) | Métodos y conjuntos de elementos para la detección del oídio | |
| CN105112409B (zh) | 检测转基因玉米mon810和mir604的多重dpo-pcr引物组合及方法 | |
| CN104152565B (zh) | 一种鉴别硬叶兜兰的核苷酸序列、分子探针和方法 | |
| JP2014018092A5 (th) | ||
| WO2016071925A3 (en) | Integration of beta-actin gene for sample quality check in hsv-1 and hsv-2 diagnostic kit | |
| WO2017116219A3 (fr) | Amorces et sondes pour l'amplification, la détection et/ou la quantification du génome du virus de l'hépatite c | |
| WO2012177739A3 (en) | Reagents and methods for detecting hcv |